Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of other vertebrates only.

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base AGP
gap		 all
gaps		 assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 gap
Overlap		 tandem
Dups		 cpg
unmasked		 cpg
island
1 Abingdon island giant tortoise
GCF_003597395.1		 50,402
(2.95 %)		 n/a 14,990
(1.01 %)		 19,565
(1.58 %)		 34,846
(1.54 %)		 43.71
(94.31 %)		 0
(0 %)		 63,430
(5.70 %)		 10,618
(100.00 %)		 1,553,204
(12.95 %)		 274,155
(1.11 %)		 12,664,684
(27.42 %)		 1,230
(0.10 %)		 193,101
(0.91 %)		 62,829
(1.59 %)		 28,727
(0.78 %)
2 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1		 n/a n/a 2,101
(1.18 %)		 5,350
(2.76 %)		 n/a 43.70
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3
(0.00 %)		 4,811
(100.00 %)		 103,373
(4.27 %)		 58,480
(3.90 %)		 895,535
(27.44 %)		 0
(0 %)		 59,204
(2.84 %)		 10,399
(2.84 %)		 3,340
(1.02 %)
3 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1		 57,514
(4.49 %)		 n/a 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 0
(0 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 2
(0.00 %)		 631,733
(3.50 %)		 94,745
(2.70 %)		 19,879
(0.76 %)
4 African bullfrog (1538 2019)
GCA_004786255.1		 n/a n/a 13,258
(1.31 %)		 15,309
(2.28 %)		 n/a 38.30
(89.51 %)		 0
(0 %)		 121,461
(10.52 %)		 5,411
(100.00 %)		 491,540
(1.54 %)		 401,074
(2.30 %)		 8,595,741
(27.94 %)		 3,986
(0.11 %)		 262,314
(1.70 %)		 14,854
(0.31 %)		 5,895
(0.13 %)
5 African clawed frog (2021)
GCF_017654675.1		 80,912
(3.89 %)		 n/a 23,666
(1.59 %)		 32,527
(2.45 %)		 112,506
(5.21 %)		 39.34
(99.94 %)		 0
(0 %)		 667
(0.06 %)		 55
(100.00 %)		 4,269,095
(35.49 %)		 1,028,861
(6.46 %)		 14,246,823
(43.67 %)		 2
(0.00 %)		 1,679,057
(4.83 %)		 108,774
(1.25 %)		 16,813
(0.23 %)
6 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1		 60,799
(4.33 %)		 n/a 14,383
(0.98 %)		 18,600
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 0
(0 %)		 161
(0.70 %)		 195
(100.00 %)		 3,322,624
(43.19 %)		 478,208
(1.77 %)		 12,316,424
(32.01 %)		 0
(0 %)		 334,854
(1.31 %)		 49,792
(2.45 %)		 29,504
(1.51 %)
7 American alligator (KSC_2009_1 2016)
GCF_000281125.3		 51,013
(3.53 %)		 n/a 14,424
(1.06 %)		 19,690
(1.51 %)		 n/a 44.30
(97.86 %)		 0
(0 %)		 236,641
(2.19 %)		 7,094
(100.00 %)		 2,842,761
(36.86 %)		 291,584
(0.69 %)		 12,464,318
(27.91 %)		 1,962
(0.01 %)		 63,947
(0.23 %)		 35,531
(1.28 %)		 26,988
(0.99 %)
8 American eel (EN2019 2024)
GCF_018555375.3		 67,474
(10.58 %)		 n/a 17,131
(2.21 %)		 34,322
(5.40 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 0
(0 %)		 985
(0.01 %)		 967
(100.00 %)		 766,696
(5.03 %)		 756,877
(7.81 %)		 5,766,995
(27.42 %)		 2
(0.00 %)		 698,797
(4.41 %)		 133,933
(8.63 %)		 97,367
(4.31 %)
9 Asian vine snake (Xishuangbanna 2023)
GCF_028640845.1		 47,555
(4.15 %)		 n/a 13,005
(1.05 %)		 17,560
(1.65 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 0
(0 %)		 331
(0.00 %)		 748
(100.00 %)		 1,484,082
(7.70 %)		 1,033,385
(5.12 %)		 8,266,544
(48.89 %)		 0
(0 %)		 1,020,982
(6.70 %)		 105,815
(4.08 %)		 21,180
(0.68 %)
10 Asiatic toad (SCDJY-AF-19 2020)
GCF_014858855.1		 42,994
(1.39 %)		 n/a 14,061
(0.43 %)		 43,525
(1.76 %)		 36,577
(1.09 %)		 44.37
(98.21 %)		 0
(0 %)		 3,874
(1.79 %)		 748
(100.00 %)		 1,577,809
(1.79 %)		 2,975,473
(12.67 %)		 18,834,930
(58.75 %)		 12
(0.00 %)		 4,966,158
(8.81 %)		 415,605
(4.12 %)		 69,684
(0.72 %)
11 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1		 60,922
(2.51 %)		 n/a 12,544
(0.38 %)		 28,250
(1.22 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,989
(100.00 %)		 8,579,099
(49.81 %)		 831,222
(15.75 %)		 21,718,178
(51.79 %)		 9
(0.00 %)		 4,445,369
(7.00 %)		 105,821
(2.42 %)		 35,197
(0.42 %)
12 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1		 n/a n/a 11,960
(0.40 %)		 25,618
(1.25 %)		 n/a 42.94
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,633
(0.01 %)		 1,412
(100.00 %)		 7,453,535
(49.31 %)		 686,063
(13.00 %)		 19,985,605
(50.32 %)		 8
(0.00 %)		 3,309,683
(5.86 %)		 86,138
(2.16 %)		 30,350
(0.41 %)
13 Australian saltwater crocodile
GCF_001723895.1		 34,090
(2.80 %)		 n/a 12,481
(1.05 %)		 13,920
(1.38 %)		 n/a 43.90
(94.72 %)		 0
(0 %)		 97,039
(5.30 %)		 70
(100.00 %)		 2,480,154
(36.88 %)		 215,190
(0.56 %)		 11,196,176
(26.22 %)		 1,753
(0.04 %)		 50,116
(0.79 %)		 26,647
(0.98 %)		 20,860
(0.80 %)
14 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3		 n/a n/a 16,280
(0.07 %)		 186,628
(1.11 %)		 n/a 46.01
(99.99 %)		 0
(0 %)		 184,422
(0.01 %)		 27,157
(100.00 %)		 28,291,633
(68.19 %)		 7,299,053
(4.96 %)		 211,579
(99.99 %)		 189
(0.00 %)		 n/a 2,388,998
(5.24 %)		 429,355
(0.66 %)
15 Blainville's horned lizard (alternate hap 2022)
GCA_026167975.1		 n/a n/a 12,696
(0.93 %)		 14,818
(1.50 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 64
(0.00 %)		 52
(100.00 %)		 1,468,805
(6.73 %)		 739,796
(3.28 %)		 10,900,584
(40.56 %)		 1
(0.00 %)		 625,575
(2.40 %)		 76,786
(1.60 %)		 9,543
(0.21 %)
16 Blainville's horned lizard (primary hap 2022)
GCA_026167985.1		 n/a n/a 13,944
(0.92 %)		 16,009
(1.45 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 78
(100.00 %)		 1,636,825
(6.67 %)		 826,053
(3.24 %)		 12,398,166
(40.90 %)		 0
(0 %)		 690,267
(2.36 %)		 86,825
(1.61 %)		 10,396
(0.20 %)
17 blonde ray (primary hap 2023)
GCA_963514005.1		 n/a n/a 11,900
(0.54 %)		 27,568
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,647
(100.00 %)		 8,972,805
(66.20 %)		 1,061,811
(8.11 %)		 11,599,498
(58.72 %)		 6
(0.00 %)		 2,430,580
(6.13 %)		 278,499
(6.42 %)		 59,922
(2.12 %)
18 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1		 n/a n/a 13,813
(1.89 %)		 27,088
(4.55 %)		 n/a 40.60
(100.00 %)		 0
(0 %)		 80
(0.00 %)		 297
(100.00 %)		 886,999
(13.24 %)		 358,077
(7.37 %)		 4,625,277
(36.22 %)		 0
(0 %)		 529,249
(5.78 %)		 43,764
(2.79 %)		 26,363
(1.18 %)
19 brown anole (Geneva1000 2022 refseq)
GCF_025583915.1		 38,099
(3.25 %)		 n/a 14,028
(1.05 %)		 19,932
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 114,440
(1.64 %)		 118,178
(98.36 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 261
(0.01 %)		 1,132,418
(4.31 %)		 46,291
(1.18 %)		 17,324
(0.40 %)
20 Brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176765.1		 n/a n/a 14,463
(1.05 %)		 20,625
(1.90 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 0
(0 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 0
(0 %)		 1,512,000
(5.23 %)		 44,738
(1.08 %)		 17,370
(0.40 %)
21 Brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1		 n/a n/a 12,479
(1.04 %)		 16,886
(1.81 %)		 n/a 41.00
(100.00 %)		 0
(0 %)		 172
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 1,249,920
(6.94 %)		 941,401
(5.42 %)		 8,402,482
(44.77 %)		 1
(0.00 %)		 1,126,727
(4.44 %)		 37,299
(1.02 %)		 14,196
(0.37 %)
22 brown house snake (FMNH 251328 2023)
GCA_027560395.1		 n/a n/a 11,753
(1.00 %)		 29,468
(1.83 %)		 n/a 40.67
(98.13 %)		 169,987
(1.84 %)		 169,987
(1.84 %)		 753,655
(98.16 %)		 1,167,225
(5.67 %)		 768,909
(2.88 %)		 8,825,109
(34.93 %)		 2,464
(0.05 %)		 n/a 53,035
(1.80 %)		 31,929
(1.11 %)
23 brown spotted pit viper
GCF_001527695.2		 24,323
(2.63 %)		 n/a 14,045
(1.20 %)		 27,133
(2.20 %)		 n/a 39.97
(92.15 %)		 115,571
(7.86 %)		 115,571
(7.86 %)		 167,851
(92.14 %)		 1,227,118
(8.97 %)		 819,247
(3.70 %)		 8,328,674
(35.16 %)		 11,808
(0.68 %)		 791,775
(4.53 %)		 68,858
(2.06 %)		 27,809
(0.90 %)
24 Burmese python
GCF_000186305.1		 35,663
(4.16 %)		 n/a 13,718
(1.31 %)		 20,498
(2.06 %)		 n/a 39.61
(96.54 %)		 235,132
(3.52 %)		 235,132
(3.52 %)		 274,244
(96.48 %)		 727,874
(3.19 %)		 409,033
(2.06 %)		 8,318,382
(25.30 %)		 21,222
(0.52 %)		 167,510
(1.87 %)		 29,212
(1.10 %)		 21,586
(0.80 %)
25 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 alternate hap 2022)
GCA_022578425.1		 n/a n/a 13,973
(0.70 %)		 47,231
(2.71 %)		 n/a 41.26
(99.97 %)		 5,955
(0.03 %)		 5,955
(0.03 %)		 60,824
(99.97 %)		 1,793,416
(10.43 %)		 1,374,078
(8.30 %)		 10,043,407
(46.03 %)		 154
(0.01 %)		 1,546,579
(5.96 %)		 89,437
(4.63 %)		 31,854
(0.83 %)
26 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 primary hap 2022)
GCA_022577455.1		 n/a n/a 13,386
(1.04 %)		 21,767
(2.35 %)		 n/a 40.56
(100.00 %)		 0
(0 %)		 256
(0.00 %)		 140
(100.00 %)		 1,354,500
(9.93 %)		 998,712
(8.21 %)		 8,504,468
(46.70 %)		 1
(0.00 %)		 1,050,266
(4.14 %)		 78,768
(3.37 %)		 28,516
(0.88 %)
27 Caribbean electric ray (hap1 2024)
GCA_036971445.1		 n/a n/a 11,967
(0.44 %)		 20,851
(1.23 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,443
(0.01 %)		 596
(100.00 %)		 4,902,656
(34.96 %)		 1,040,893
(17.82 %)		 16,403,253
(54.79 %)		 2
(0.00 %)		 3,888,884
(8.11 %)		 113,936
(1.69 %)		 22,323
(0.31 %)
28 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1		 n/a n/a 11,692
(0.46 %)		 19,961
(1.22 %)		 n/a 42.79
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,507
(0.01 %)		 445
(100.00 %)		 4,781,152
(36.16 %)		 876,063
(14.65 %)		 16,060,040
(52.49 %)		 7
(0.00 %)		 2,994,548
(6.81 %)		 101,598
(1.64 %)		 21,263
(0.33 %)
29 central bearded dragon
GCF_900067755.1		 42,304
(3.53 %)		 n/a 13,856
(1.19 %)		 17,956
(1.96 %)		 n/a 41.81
(96.03 %)		 0
(0 %)		 90,546
(3.99 %)		 13,749
(100.00 %)		 821,868
(3.44 %)		 570,849
(3.46 %)		 9,494,309
(29.78 %)		 161
(0.03 %)		 346,792
(2.81 %)		 48,137
(1.31 %)		 23,199
(0.67 %)
30 Chinese alligator
GCF_000455745.1		 49,884
(3.04 %)		 n/a 14,431
(1.00 %)		 15,854
(1.43 %)		 n/a 44.49
(96.86 %)		 167,965
(3.17 %)		 167,965
(3.17 %)		 177,282
(96.83 %)		 2,919,372
(38.76 %)		 346,310
(1.06 %)		 12,332,417
(29.19 %)		 95
(0.01 %)		 116,160
(0.98 %)		 46,638
(1.19 %)		 26,168
(0.73 %)
31 Chinese soft-shelled turtle
GCF_000230535.1		 45,441
(3.08 %)		 n/a 13,715
(0.96 %)		 16,798
(1.50 %)		 n/a 44.42
(95.68 %)		 185,476
(4.35 %)		 185,476
(4.35 %)		 205,380
(95.65 %)		 1,193,608
(10.92 %)		 455,163
(3.06 %)		 11,234,886
(32.34 %)		 126
(0.01 %)		 282,804
(2.81 %)		 95,997
(2.06 %)		 44,456
(1.00 %)
32 coelacanth
GCF_000225785.1		 40,763
(2.63 %)		 n/a 13,493
(0.78 %)		 17,640
(1.50 %)		 n/a 41.15
(76.37 %)		 269,010
(23.67 %)		 269,010
(23.67 %)		 291,829
(76.33 %)		 2,026,776
(9.13 %)		 571,917
(1.19 %)		 14,630,157
(34.87 %)		 2,038
(0.03 %)		 261,629
(0.61 %)		 42,857
(0.54 %)		 8,573
(0.11 %)
33 coelacanth (fLatCha1 primary hap 2024)
GCF_037176945.1		 40,046
(2.75 %)		 n/a 13,820
(0.63 %)		 17,285
(1.40 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 0
(0 %)		 154
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 2,064,326
(2.75 %)		 1,047,267
(3.01 %)		 15,613,479
(54.45 %)		 1
(0.00 %)		 1,146,128
(3.27 %)		 140,027
(2.34 %)		 11,143
(0.16 %)
34 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1		 n/a n/a 13,999
(1.21 %)		 18,145
(2.02 %)		 n/a 44.85
(100.00 %)		 0
(0 %)		 286
(0.00 %)		 827
(100.00 %)		 844,126
(6.57 %)		 462,086
(2.56 %)		 8,237,807
(37.72 %)		 0
(0 %)		 573,955
(2.91 %)		 30,098
(0.96 %)		 16,208
(0.52 %)
35 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1		 n/a n/a 13,266
(1.21 %)		 16,750
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 0
(0 %)		 506,831
(2.74 %)		 28,089
(0.98 %)		 14,987
(0.51 %)
36 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1		 n/a n/a 13,073
(0.44 %)		 43,036
(1.95 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 14
(0.00 %)		 12,033
(100.00 %)		 1,489,788
(2.18 %)		 2,621,157
(9.04 %)		 17,154,926
(55.44 %)		 0
(0 %)		 3,161,179
(6.09 %)		 581,115
(7.68 %)		 54,845
(0.65 %)
37 common garter snake
GCF_001077635.1		 26,656
(3.83 %)		 n/a 11,623
(1.25 %)		 17,501
(2.23 %)		 n/a 39.92
(78.84 %)		 168,047
(21.21 %)		 246,220
(21.21 %)		 175,977
(78.79 %)		 606,040
(3.22 %)		 543,646
(2.36 %)		 6,946,141
(27.08 %)		 3,234
(0.23 %)		 224,609
(2.22 %)		 36,264
(1.27 %)		 18,972
(0.73 %)
38 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1		 45,869
(6.34 %)		 n/a 14,279
(1.46 %)		 19,710
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 0
(0 %)		 683
(0.01 %)		 48
(100.00 %)		 4,128,183
(45.62 %)		 513,318
(3.73 %)		 7,172,928
(37.61 %)		 7
(0.00 %)		 477,389
(3.08 %)		 92,858
(2.90 %)		 22,863
(0.95 %)
39 common spadefoot toad (aPelFus1 2024)
GCA_036172605.1		 n/a n/a 14,564
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 349
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 1,677,382
(3.51 %)		 3,229,435
(13.31 %)		 15,027,089
(51.43 %)		 12
(0.00 %)		 3,799,247
(9.03 %)		 282,389
(3.86 %)		 79,263
(0.96 %)
40 common spadefoot toad (aPelFus1 2024)
GCF_036172605.1		 42,170
(1.55 %)		 n/a 14,560
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 0
(0 %)		 349
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 1,677,374
(3.51 %)		 3,229,434
(13.31 %)		 15,027,049
(51.43 %)		 12
(0.00 %)		 3,799,232
(9.03 %)		 282,389
(3.86 %)		 79,263
(0.96 %)
41 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1		 n/a n/a 12,074
(0.39 %)		 46,329
(1.82 %)		 n/a 44.48
(99.99 %)		 156
(0.01 %)		 156
(0.01 %)		 24,351
(99.99 %)		 1,186,360
(1.65 %)		 2,279,941
(13.33 %)		 14,665,548
(61.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,594,926
(9.74 %)		 405,097
(4.49 %)		 61,648
(0.70 %)
42 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1		 45,085
(1.10 %)		 n/a 14,240
(0.38 %)		 46,470
(1.68 %)		 37,594
(0.91 %)		 44.49
(99.80 %)		 0
(0 %)		 4,199
(0.20 %)		 1,306
(100.00 %)		 1,658,204
(1.79 %)		 3,099,513
(13.49 %)		 19,236,510
(62.70 %)		 18
(0.00 %)		 6,217,888
(10.17 %)		 539,919
(4.45 %)		 78,985
(0.67 %)
43 common wall lizard
GCF_004329235.1		 56,506
(4.85 %)		 n/a 14,453
(1.36 %)		 20,529
(2.31 %)		 n/a 44.18
(99.81 %)		 0
(0 %)		 4,085
(0.19 %)		 2,161
(100.00 %)		 1,089,164
(8.31 %)		 506,669
(2.12 %)		 7,474,116
(36.15 %)		 2
(0.00 %)		 623,437
(4.37 %)		 122,507
(3.69 %)		 21,388
(0.79 %)
44 corn snake (Columbia U 2023)
GCF_029531705.1		 53,076
(4.72 %)		 n/a 13,697
(1.21 %)		 20,819
(2.22 %)		 n/a 40.33
(96.60 %)		 3,553
(3.40 %)		 3,553
(3.40 %)		 4,019
(96.60 %)		 4,116,616
(49.72 %)		 917,455
(3.96 %)		 8,460,248
(40.76 %)		 143
(0.00 %)		 602,278
(2.72 %)		 64,946
(2.08 %)		 20,725
(0.74 %)
45 corn snake (EG266 2020)
GCF_001185365.1		 48,995
(3.92 %)		 n/a 13,316
(1.14 %)		 23,595
(2.17 %)		 29,466
(2.61 %)		 40.35
(95.32 %)		 0
(0 %)		 84,947
(4.70 %)		 34,268
(100.00 %)		 1,243,828
(6.50 %)		 884,533
(3.25 %)		 8,373,398
(40.31 %)		 4,035
(0.07 %)		 377,287
(1.66 %)		 66,926
(2.14 %)		 25,639
(0.86 %)
46 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1		 n/a n/a 14,955
(0.23 %)		 n/a n/a 45.61
(99.80 %)		 2,431
(0.20 %)		 2,431
(0.20 %)		 5,958
(99.80 %)		 20,007,151
(76.28 %)		 5,951,819
(19.40 %)		 5,958
(99.80 %)		 49
(0.00 %)		 n/a 991,009
(4.86 %)		 91,447
(0.54 %)
47 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1		 140,657
(1.12 %)		 n/a 15,461
(0.24 %)		 54,344
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 0
(0 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 3,521,281
(2.88 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 5,826
(99.76 %)		 23
(0.00 %)		 n/a 990,274
(4.84 %)		 952,582
(4.53 %)
48 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1		 n/a n/a 13,192
(1.36 %)		 19,293
(2.32 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,936
(100.00 %)		 808,341
(4.31 %)		 467,532
(2.91 %)		 6,418,809
(38.02 %)		 0
(0 %)		 518,786
(3.19 %)		 107,080
(3.15 %)		 17,213
(0.72 %)
49 Cretan wall lizard (primary hap 2023)
GCA_951804945.1		 n/a n/a 14,249
(1.37 %)		 19,304
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 47
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 882,564
(4.30 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,363
(38.65 %)		 2
(0.00 %)		 586,225
(3.38 %)		 117,222
(3.18 %)		 18,707
(0.71 %)
50 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1		 50,318
(3.53 %)		 n/a 15,109
(1.08 %)		 19,280
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 0
(0 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 0
(0 %)		 407,696
(1.71 %)		 110,838
(2.71 %)		 30,093
(0.82 %)
51 diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023)
GCA_027887205.1		 n/a n/a 15,081
(1.08 %)		 19,115
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.98 %)		 0
(0 %)		 127
(0.02 %)		 59
(100.00 %)		 4,093,707
(46.36 %)		 404,046
(1.70 %)		 11,113,266
(33.78 %)		 1
(0.01 %)		 405,600
(1.68 %)		 111,129
(2.68 %)		 30,307
(0.82 %)
52 eastern brown snake
GCF_900518735.1		 34,614
(3.30 %)		 n/a 13,625
(1.22 %)		 21,795
(2.00 %)		 n/a 39.84
(97.54 %)		 0
(0 %)		 59,472
(2.47 %)		 28,550
(100.00 %)		 1,020,240
(5.86 %)		 663,810
(2.41 %)		 8,140,554
(39.61 %)		 3,387
(0.06 %)		 230,860
(1.32 %)		 52,895
(2.12 %)		 20,320
(0.72 %)
53 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1		 n/a n/a 13,413
(1.19 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 553
(0.01 %)		 771
(99.99 %)		 1,003,504
(9.02 %)		 621,617
(3.54 %)		 8,327,948
(30.44 %)		 3
(0.00 %)		 583,206
(2.41 %)		 117,734
(4.05 %)		 30,498
(1.01 %)
54 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1		 n/a n/a 13,632
(0.43 %)		 35,630
(1.52 %)		 n/a 46.77
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,773
(0.01 %)		 590
(100.00 %)		 1,759,193
(1.98 %)		 2,013,186
(16.21 %)		 16,138,898
(60.55 %)		 17
(0.00 %)		 5,811,499
(9.67 %)		 614,432
(5.85 %)		 72,993
(0.75 %)
55 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1		 n/a n/a 13,882
(0.43 %)		 35,323
(1.46 %)		 n/a 46.78
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,745
(0.01 %)		 1,002
(100.00 %)		 1,769,293
(1.99 %)		 2,023,109
(16.33 %)		 16,148,710
(60.55 %)		 22
(0.00 %)		 5,852,023
(9.72 %)		 618,204
(5.89 %)		 74,394
(0.76 %)
56 elephant shark (2021)
GCF_018977255.1		 32,553
(4.75 %)		 n/a 11,542
(1.51 %)		 18,900
(3.25 %)		 n/a 42.85
(99.99 %)		 2,060
(0.01 %)		 14,404
(0.01 %)		 3,822
(99.99 %)		 1,971,730
(36.60 %)		 433,955
(3.92 %)		 5,654,656
(37.91 %)		 11
(0.00 %)		 553,756
(3.85 %)		 41,081
(3.43 %)		 17,151
(0.98 %)
57 epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021)
GCA_020745765.1		 n/a n/a 12,650
(0.38 %)		 20,614
(1.06 %)		 n/a 42.75
(97.99 %)		 0
(0 %)		 3,552
(2.01 %)		 4,000
(100.00 %)		 9,489,793
(70.34 %)		 976,827
(6.97 %)		 21,183,330
(44.32 %)		 1
(0.00 %)		 3,092,395
(4.62 %)		 42,917
(1.08 %)		 13,522
(0.16 %)
58 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1		 43,156
(1.65 %)		 n/a 12,749
(0.40 %)		 19,519
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 0
(0 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,962
(100.00 %)		 9,420,365
(63.82 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,566
(43.88 %)		 0
(0 %)		 2,903,280
(4.44 %)		 41,682
(1.08 %)		 16,895
(0.30 %)
59 European common frog (2021)
GCF_905171775.1		 51,633
(1.57 %)		 n/a 13,864
(0.46 %)		 39,978
(1.88 %)		 57,578
(1.85 %)		 44.15
(99.36 %)		 0
(0 %)		 1,860
(0.64 %)		 554
(100.00 %)		 1,804,642
(3.42 %)		 2,925,830
(9.39 %)		 18,921,726
(55.43 %)		 8
(0.00 %)		 3,384,162
(6.05 %)		 641,799
(7.66 %)		 62,649
(0.67 %)
60 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1		 54,631
(7.46 %)		 n/a 17,072
(1.89 %)		 34,801
(5.07 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,009
(0.02 %)		 380
(100.00 %)		 761,522
(5.99 %)		 913,306
(13.25 %)		 5,767,879
(35.48 %)		 3
(0.00 %)		 1,603,437
(8.94 %)		 120,990
(6.12 %)		 81,342
(2.93 %)
61 European eel (alternate hap 2020)
GCA_013347865.1		 n/a n/a 17,177
(2.21 %)		 36,037
(5.58 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 2,338
(100.00 %)		 811,567
(5.37 %)		 759,871
(7.97 %)		 5,672,321
(27.30 %)		 0
(0 %)		 731,152
(4.88 %)		 127,837
(8.05 %)		 92,776
(4.12 %)
62 European eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013347855.1		 64,143
(9.57 %)		 n/a 17,054
(2.22 %)		 34,278
(5.56 %)		 79,684
(7.37 %)		 43.64
(99.61 %)		 0
(0 %)		 640
(0.40 %)		 54
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,521
(8.15 %)		 5,700,890
(27.40 %)		 2
(0.00 %)		 774,914
(5.14 %)		 130,346
(8.19 %)		 94,446
(4.12 %)
63 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1		 24,643
(2.02 %)		 n/a 14,238
(1.16 %)		 21,782
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 0
(0 %)		 153
(0.23 %)		 591
(100.00 %)		 1,174,615
(6.99 %)		 436,937
(2.95 %)		 8,308,817
(39.80 %)		 0
(0 %)		 824,335
(3.45 %)		 83,089
(2.82 %)		 33,674
(0.93 %)
64 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1		 n/a n/a 14,220
(1.16 %)		 21,979
(2.19 %)		 n/a 44.64
(99.68 %)		 0
(0 %)		 177
(0.32 %)		 381
(100.00 %)		 1,169,660
(6.57 %)		 432,998
(2.45 %)		 8,403,791
(39.55 %)		 1
(0.00 %)		 711,098
(3.13 %)		 82,695
(2.80 %)		 33,414
(0.92 %)
65 European pond turtle (hap1 2023 genbank)
GCA_028017835.1		 n/a n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 0
(0 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 5
(0.00 %)		 495,884
(2.08 %)		 136,002
(2.92 %)		 30,671
(0.72 %)
66 European pond turtle (hap1 2023 refseq)
GCF_028017835.1		 27,890
(1.81 %)		 n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 0
(0 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 5
(0.00 %)		 495,938
(2.08 %)		 136,002
(2.92 %)		 30,671
(0.72 %)
67 European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017845.1		 n/a n/a 14,971
(1.00 %)		 20,099
(1.61 %)		 n/a 44.79
(99.77 %)		 0
(0 %)		 130
(0.23 %)		 156
(100.00 %)		 1,536,611
(12.44 %)		 471,903
(2.16 %)		 11,129,943
(35.50 %)		 1
(0.00 %)		 522,759
(2.15 %)		 138,047
(2.94 %)		 31,391
(0.73 %)
68 Far Eastern brook lamprey (LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.1		 37,946
(7.32 %)		 n/a 7,797
(0.72 %)		 39,285
(4.37 %)		 n/a 48.80
(98.99 %)		 0
(0 %)		 3,287
(1.01 %)		 1,946
(100.00 %)		 716,804
(6.02 %)		 1,192,268
(15.54 %)		 5,304,945
(47.85 %)		 5
(0.00 %)		 1,949,540
(10.82 %)		 170,623
(43.14 %)		 128,479
(5.62 %)
69 fence lizard
GCF_019175285.1		 48,391
(3.65 %)		 n/a 14,000
(1.07 %)		 17,384
(1.71 %)		 n/a 41.25
(97.53 %)		 0
(0 %)		 48,138
(2.47 %)		 45,012
(100.00 %)		 1,357,856
(6.95 %)		 596,824
(1.92 %)		 11,090,372
(34.38 %)		 926
(0.05 %)		 356,377
(1.59 %)		 67,007
(1.51 %)		 13,181
(0.35 %)
70 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1		 n/a n/a 2,936
(0.15 %)		 17,722
(1.38 %)		 n/a 38.51
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 13,751
(100.00 %)		 919,882
(3.50 %)		 1,443,294
(10.50 %)		 7,705,012
(57.28 %)		 0
(0 %)		 2,148,861
(9.45 %)		 74,669
(1.25 %)		 7,295
(0.13 %)
71 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1		 38,238
(0.68 %)		 n/a 15,452
(0.21 %)		 47,500
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 0
(0 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,467
(100.00 %)		 4,258,941
(3.44 %)		 7,150,261
(12.27 %)		 9,476
(98.01 %)		 3
(0.00 %)		 n/a n/a n/a
72 Fleay's barred frog (hap1 2024)
GCA_038048845.1		 n/a n/a 14,321
(0.67 %)		 22,672
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 0
(0 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,578
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,293,397
(46.37 %)		 2
(0.00 %)		 3,318,438
(8.11 %)		 63,677
(0.85 %)		 12,950
(0.19 %)
73 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1		 n/a n/a 14,224
(0.69 %)		 22,406
(1.57 %)		 n/a 40.75
(99.89 %)		 0
(0 %)		 1,383
(0.12 %)		 914
(100.00 %)		 1,300,452
(3.37 %)		 1,495,355
(10.56 %)		 13,385,401
(44.67 %)		 1
(0.00 %)		 2,540,687
(7.06 %)		 64,121
(0.88 %)		 13,021
(0.20 %)
74 Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035715.1		 n/a n/a 14,392
(0.90 %)		 17,909
(1.50 %)		 n/a 42.86
(99.84 %)		 213
(0.16 %)		 213
(0.16 %)		 836
(99.84 %)		 1,440,070
(7.19 %)		 620,131
(2.54 %)		 10,919,950
(45.21 %)		 2
(0.00 %)		 523,070
(2.35 %)		 47,933
(1.03 %)		 18,609
(0.43 %)
75 Florida worm lizard (hap2 2023)
GCF_030035675.1		 65,314
(3.47 %)		 n/a 14,331
(0.90 %)		 17,853
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 0
(0 %)		 242
(0.28 %)		 76
(100.00 %)		 1,426,827
(7.17 %)		 616,687
(2.63 %)		 10,819,019
(45.31 %)		 1
(0.00 %)		 531,660
(2.36 %)		 47,453
(1.03 %)		 18,399
(0.42 %)
76 Florida worm lizard (hap2 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035675.1		 n/a n/a 14,331
(0.90 %)		 17,854
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 1
(0.00 %)		 242
(0.28 %)		 78
(100.00 %)		 1,426,833
(7.17 %)		 616,690
(2.63 %)		 10,819,054
(45.31 %)		 1
(0.00 %)		 531,662
(2.36 %)		 47,454
(1.03 %)		 18,400
(0.42 %)
77 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1		 n/a n/a 12,821
(0.47 %)		 30,612
(1.44 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,651
(100.00 %)		 1,139,595
(1.64 %)		 1,170,215
(3.77 %)		 17,091,511
(52.44 %)		 0
(0 %)		 995,544
(2.57 %)		 235,170
(4.50 %)		 33,394
(0.50 %)
78 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2		 n/a n/a 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 0
(0 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,331,879
(1.68 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,806
(52.85 %)		 3
(0.00 %)		 1,182,995
(2.68 %)		 270,923
(4.52 %)		 38,622
(0.50 %)
79 gharial (Ggan-Ray 2016)
GCF_001723915.1		 32,284
(2.61 %)		 n/a 12,194
(1.03 %)		 12,758
(1.30 %)		 n/a 43.95
(73.60 %)		 0
(0 %)		 248,526
(26.44 %)		 81
(100.00 %)		 2,589,103
(36.89 %)		 243,334
(0.51 %)		 11,279,606
(20.80 %)		 29,443
(5.09 %)		 125,202
(1.53 %)		 26,651
(0.60 %)		 20,614
(0.47 %)
80 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1		 n/a n/a 14,254
(0.94 %)		 23,016
(2.00 %)		 n/a 45.13
(99.95 %)		 0
(0 %)		 61
(0.05 %)		 298
(100.00 %)		 1,230,357
(13.08 %)		 350,230
(2.85 %)		 11,854,314
(33.03 %)		 2
(0.00 %)		 335,615
(1.39 %)		 39,919
(1.95 %)		 26,198
(0.77 %)
81 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1		 n/a n/a 14,151
(0.94 %)		 23,338
(1.95 %)		 n/a 45.15
(99.95 %)		 0
(0 %)		 118
(0.05 %)		 160
(100.00 %)		 1,232,693
(12.81 %)		 332,737
(2.19 %)		 11,907,298
(32.91 %)		 3
(0.00 %)		 284,469
(1.22 %)		 40,660
(1.87 %)		 25,990
(0.77 %)
82 giant manta (hap1 2023)
GCA_030028105.1		 n/a n/a 12,432
(0.38 %)		 24,821
(1.16 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 0
(0 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 7,913,208
(49.68 %)		 969,352
(14.22 %)		 20,235,210
(54.42 %)		 17
(0.00 %)		 4,636,724
(7.12 %)		 110,678
(1.74 %)		 30,504
(0.36 %)
83 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1		 n/a n/a 12,198
(0.42 %)		 23,127
(1.17 %)		 n/a 42.85
(98.49 %)		 0
(0 %)		 1,742
(1.51 %)		 1,558
(100.00 %)		 7,431,472
(52.41 %)		 716,951
(7.28 %)		 19,456,793
(50.99 %)		 9
(0.01 %)		 2,419,836
(4.27 %)		 91,414
(1.45 %)		 65,413
(0.90 %)
84 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2		 57,442
(3.17 %)		 n/a 14,852
(1.00 %)		 18,125
(1.49 %)		 31,841
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 0
(0 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,271
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 0
(0 %)		 474,978
(1.73 %)		 71,687
(2.29 %)		 21,793
(0.54 %)
85 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1		 n/a n/a 13,359
(0.95 %)		 19,347
(1.51 %)		 n/a 44.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 8,736
(100.00 %)		 1,404,513
(13.79 %)		 334,726
(2.35 %)		 9,735,007
(33.33 %)		 0
(0 %)		 468,758
(1.89 %)		 61,680
(2.32 %)		 18,869
(0.54 %)
86 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023)
GCA_029215685.1		 n/a n/a 12,291
(1.06 %)		 19,125
(2.02 %)		 n/a 40.55
(100.00 %)		 584
(0.00 %)		 584
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 1,259,781
(7.92 %)		 925,571
(7.56 %)		 7,739,320
(45.92 %)		 3
(0.00 %)		 840,495
(4.04 %)		 73,681
(2.81 %)		 26,366
(0.92 %)
87 gopher snake (HBS135680 primary hap 2023)
GCA_029215655.1		 n/a n/a 13,289
(1.09 %)		 20,513
(2.09 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 603
(0.00 %)		 603
(0.00 %)		 1,029
(100.00 %)		 1,325,747
(8.26 %)		 973,338
(7.56 %)		 8,352,703
(45.38 %)		 4
(0.00 %)		 888,155
(3.86 %)		 72,941
(2.59 %)		 27,387
(0.91 %)
88 graceful crag lizard (Gifberg primary hap 2022)
GCF_027244095.1		 86,666
(4.30 %)		 n/a 14,269
(0.91 %)		 18,195
(1.57 %)		 n/a 44.82
(100.00 %)		 0
(0 %)		 42
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 1,644,976
(6.04 %)		 823,058
(3.00 %)		 11,991,046
(41.43 %)		 0
(0 %)		 489,782
(1.69 %)		 80,718
(1.90 %)		 27,916
(0.61 %)
89 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1		 n/a n/a 14,094
(1.03 %)		 17,875
(1.65 %)		 n/a 41.62
(99.95 %)		 0
(0 %)		 28
(0.05 %)		 30
(100.00 %)		 1,100,228
(6.21 %)		 423,695
(1.33 %)		 11,521,828
(32.55 %)		 2
(0.00 %)		 258,014
(1.05 %)		 62,978
(2.00 %)		 24,755
(0.81 %)
90 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1		 n/a n/a 13,758
(1.02 %)		 16,909
(1.62 %)		 n/a 41.53
(99.01 %)		 19
(0.99 %)		 19
(0.99 %)		 52
(99.01 %)		 1,069,189
(6.12 %)		 410,262
(1.25 %)		 11,390,195
(32.28 %)		 0
(0 %)		 233,593
(0.96 %)		 60,835
(1.92 %)		 23,191
(0.77 %)
91 gray bichir
GCF_016835505.1		 48,178
(1.88 %)		 n/a 12,963
(0.44 %)		 24,479
(1.21 %)		 n/a 39.32
(99.96 %)		 0
(0 %)		 3,166
(0.04 %)		 9,856
(100.00 %)		 1,765,862
(2.54 %)		 1,017,723
(2.38 %)		 20,924,763
(47.66 %)		 2
(0.00 %)		 997,434
(2.53 %)		 98,862
(1.64 %)		 24,750
(0.32 %)
92 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1		 n/a n/a 20
(0.30 %)		 63
(2.06 %)		 n/a 45.02
(99.98 %)		 0
(0 %)		 28
(0.02 %)		 39
(100.00 %)		 8,165
(60.43 %)		 2,740
(27.09 %)		 15,863
(31.63 %)		 0
(0 %)		 16,359
(15.02 %)		 167
(5.51 %)		 65
(0.61 %)
93 great white shark (primary hap 2021)
GCF_017639515.1		 49,865
(1.46 %)		 n/a 13,010
(0.37 %)		 19,263
(0.92 %)		 46,152
(1.30 %)		 45.21
(99.55 %)		 0
(0 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 1,046,023
(4.00 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,563
(52.42 %)		 11
(0.00 %)		 8,687,289
(11.05 %)		 77,021
(1.94 %)		 14,712
(0.15 %)
94 green anole (JA03-04 2024)
GCF_035594765.1		 56,324
(5.85 %)		 n/a 14,020
(1.12 %)		 20,096
(1.86 %)		 n/a 40.60
(98.38 %)		 0
(0 %)		 841
(1.62 %)		 211
(100.00 %)		 4,859,635
(53.14 %)		 909,429
(5.19 %)		 8,304,332
(44.07 %)		 5
(0.00 %)		 1,056,606
(4.88 %)		 56,404
(1.78 %)		 20,393
(0.51 %)
95 green anole (v1 2011)
GCF_000090745.1		 38,096
(3.63 %)		 n/a 13,021
(1.08 %)		 20,780
(1.86 %)		 38,266
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 35,533
(5.44 %)		 41,987
(94.56 %)		 2,415,433
(28.92 %)		 702,538
(2.99 %)		 8,199,653
(39.69 %)		 25
(0.00 %)		 674,365
(3.47 %)		 42,151
(1.18 %)		 15,374
(0.36 %)
96 green anole (v2 2010)
GCF_000090745.2		 38,096
(3.63 %)		 n/a 13,140
(1.11 %)		 20,772
(1.86 %)		 38,229
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 35,530
(5.44 %)		 41,986
(94.56 %)		 4,455,733
(51.37 %)		 702,537
(2.99 %)		 8,199,580
(39.69 %)		 25
(0.00 %)		 674,353
(3.47 %)		 42,151
(1.18 %)		 15,935
(0.39 %)
97 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2		 n/a n/a 13,635
(1.05 %)		 19,414
(1.61 %)		 n/a 44.16
(99.95 %)		 60
(0.05 %)		 60
(0.05 %)		 6,797
(99.95 %)		 3,221,668
(44.97 %)		 275,275
(1.28 %)		 9,802,895
(32.14 %)		 2
(0.00 %)		 394,278
(1.72 %)		 45,469
(1.48 %)		 25,997
(0.89 %)
98 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2		 84,366
(4.63 %)		 n/a 14,725
(1.06 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 0
(0 %)		 298
(0.56 %)		 93
(100.00 %)		 1,701,640
(14.83 %)		 304,306
(1.25 %)		 11,135,147
(31.96 %)		 0
(0 %)		 429,994
(1.68 %)		 49,025
(1.44 %)		 26,933
(0.68 %)
99 High Himalaya frog
GCF_000935625.1		 26,109
(1.87 %)		 n/a 13,695
(0.94 %)		 28,085
(2.39 %)		 n/a 42.55
(96.32 %)		 122,325
(3.70 %)		 122,325
(3.70 %)		 147,513
(96.30 %)		 536,058
(1.39 %)		 794,563
(5.48 %)		 11,465,450
(37.44 %)		 1,716
(0.17 %)		 725,825
(4.49 %)		 219,772
(3.92 %)		 32,652
(0.67 %)
100 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1		 n/a n/a 15,006
(0.28 %)		 22,481
(0.80 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 225
(0.03 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,532
(99.97 %)		 1,344,546
(5.76 %)		 2,364,825
(28.34 %)		 5,088
(99.53 %)		 5
(0.00 %)		 14,350,128
(14.12 %)		 89,340
(2.10 %)		 82,092
(1.20 %)
101 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1		 n/a n/a 12,766
(0.30 %)		 21,591
(0.87 %)		 n/a 44.88
(99.43 %)		 0
(0 %)		 2,790
(0.57 %)		 1,496
(100.00 %)		 1,008,880
(5.19 %)		 1,596,129
(22.32 %)		 22,180,341
(62.98 %)		 2
(0.00 %)		 9,762,254
(11.27 %)		 82,276
(1.85 %)		 14,696
(0.13 %)
102 hourglass treefrog (maternal 2023)
GCA_027789725.1		 n/a n/a 14,359
(0.89 %)		 32,575
(2.67 %)		 n/a 43.88
(95.18 %)		 788
(4.82 %)		 788
(4.82 %)		 3,358
(95.18 %)		 922,807
(2.38 %)		 1,744,603
(15.45 %)		 10,318,168
(48.47 %)		 0
(0 %)		 3,525,571
(8.67 %)		 244,270
(5.02 %)		 29,547
(0.61 %)
103 hourglass treefrog (paternal 2023)
GCA_027789765.1		 n/a n/a 14,058
(0.89 %)		 31,050
(2.69 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 0
(0 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 3
(0.00 %)		 3,539,111
(9.05 %)		 235,277
(5.56 %)		 28,414
(0.63 %)
104 Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024)
GCA_036172795.1		 n/a n/a 14,141
(0.97 %)		 22,232
(2.16 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 262
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 944,742
(4.86 %)		 1,927,659
(22.26 %)		 8,988,510
(49.29 %)		 1
(0.00 %)		 3,465,509
(10.62 %)		 77,721
(1.73 %)		 13,802
(0.30 %)
105 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022)
GCA_026652325.1		 n/a 139,896
(0.54 %)		 15,136
(0.10 %)		 n/a n/a 45.95
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 922
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 4,478,794
(1.33 %)		 6,452,537
(8.86 %)		 1,189
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 n/a 1,581,360
(4.00 %)		 144,588
(0.32 %)
106 Indian cobra (NN01 2019)
GCA_009733165.1		 n/a 25,817
(1.78 %)		 13,028
(1.10 %)		 17,854
(1.73 %)		 n/a 40.46
(93.80 %)		 0
(0 %)		 11,910
(6.20 %)		 1,897
(100.00 %)		 1,114,498
(5.61 %)		 671,854
(2.20 %)		 8,205,261
(40.40 %)		 3
(0.02 %)		 n/a 47,381
(1.37 %)		 19,640
(0.65 %)
107 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1		 n/a n/a 17,858
(2.43 %)		 32,738
(5.46 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 0
(0 %)		 3
(0.00 %)		 4,333
(100.00 %)		 583,632
(3.71 %)		 418,411
(3.74 %)		 5,198,155
(21.50 %)		 1
(0.00 %)		 276,314
(1.94 %)		 76,879
(3.71 %)		 57,281
(2.37 %)
108 Komodo dragon (SLA01 2019)
GCF_004798865.1		 43,331
(4.33 %)		 n/a 13,543
(1.31 %)		 18,081
(2.11 %)		 n/a 44.04
(99.03 %)		 0
(0 %)		 19,737
(0.97 %)		 1,411
(100.00 %)		 753,603
(4.91 %)		 263,965
(1.41 %)		 8,061,012
(24.65 %)		 582
(0.01 %)		 130,387
(0.66 %)		 49,808
(4.28 %)		 39,034
(2.67 %)
109 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1		 n/a n/a 13,155
(1.15 %)		 22,239
(2.06 %)		 n/a 41.01
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 6,800
(100.00 %)		 1,155,093
(7.75 %)		 707,777
(4.25 %)		 7,071,611
(44.00 %)		 0
(0 %)		 701,636
(4.02 %)		 104,556
(4.39 %)		 22,349
(0.88 %)
110 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1		 n/a n/a 13,350
(1.17 %)		 18,904
(1.93 %)		 n/a 40.96
(99.78 %)		 0
(0 %)		 769
(0.22 %)		 56
(100.00 %)		 1,209,793
(7.69 %)		 762,735
(5.06 %)		 7,424,674
(44.80 %)		 4
(0.00 %)		 794,949
(4.07 %)		 110,631
(4.07 %)		 23,739
(0.88 %)
111 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2		 n/a n/a 11,035
(1.05 %)		 16,064
(1.50 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 7
(0.00 %)		 9,006
(100.00 %)		 2,685,200
(47.08 %)		 208,060
(1.19 %)		 7,184,246
(33.31 %)		 0
(0 %)		 442,748
(2.46 %)		 25,133
(1.42 %)		 15,054
(0.75 %)
112 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq G10K)
GCF_009764565.3		 73,318
(3.97 %)		 n/a 14,610
(1.03 %)		 16,358
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 0
(0 %)		 668
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,694,449
(14.90 %)		 304,773
(1.14 %)		 11,121,962
(34.21 %)		 3
(0.00 %)		 670,729
(2.51 %)		 35,485
(1.36 %)		 19,615
(0.51 %)
113 leopard gecko (TG4126 2023)
GCF_028583425.1		 37,120
(2.89 %)		 n/a 14,358
(0.93 %)		 23,080
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 0
(0 %)		 62
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 969,188
(4.21 %)		 557,245
(2.88 %)		 11,096,222
(37.91 %)		 0
(0 %)		 608,752
(2.77 %)		 82,956
(2.56 %)		 27,406
(0.84 %)
114 lesser devil ray (2024)
GCF_963921235.1		 49,601
(2.40 %)		 n/a 12,335
(0.44 %)		 22,690
(1.20 %)		 n/a 42.91
(100.00 %)		 0
(0 %)		 697
(0.00 %)		 200
(100.00 %)		 7,453,775
(54.11 %)		 677,453
(5.15 %)		 18,943,414
(51.98 %)		 4
(0.00 %)		 1,957,188
(3.59 %)		 87,750
(1.43 %)		 61,592
(0.87 %)
115 Lilford's wall lizard (2023)
GCA_947686815.1		 n/a 469,920
(50.83 %)		 14,239
(1.41 %)		 19,740
(2.33 %)		 n/a 43.80
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,346
(0.02 %)		 2,149
(100.00 %)		 830,790
(4.33 %)		 445,450
(2.12 %)		 7,171,057
(36.69 %)		 79
(0.00 %)		 484,294
(2.64 %)		 86,200
(2.56 %)		 19,378
(0.77 %)
116 little skate (New England 2023)
GCF_028641065.1		 40,008
(3.35 %)		 n/a 11,836
(0.67 %)		 25,770
(1.80 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 0
(0 %)		 862
(0.00 %)		 1,769
(100.00 %)		 8,221,960
(66.45 %)		 1,044,111
(3.71 %)		 10,050,264
(53.79 %)		 1
(0.00 %)		 1,424,247
(4.33 %)		 205,567
(4.36 %)		 21,218
(0.48 %)
117 lizards E.multicarinata webbii (San Diego HBS135686 primary hap 2024)
GCF_023053635.1		 33,415
(3.07 %)		 n/a 14,091
(1.15 %)		 19,337
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 1,577,747
(7.81 %)		 774,112
(3.78 %)		 9,248,016
(40.42 %)		 1
(0.00 %)		 823,646
(3.44 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,586
(0.82 %)
118 loggerhead turtle (SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.1		 61,631
(3.99 %)		 n/a 14,678
(1.05 %)		 17,405
(1.52 %)		 42,180
(2.89 %)		 44.04
(99.90 %)		 0
(0 %)		 745
(0.10 %)		 2,008
(100.00 %)		 1,279,721
(12.58 %)		 319,729
(1.29 %)		 10,705,612
(33.91 %)		 4
(0.00 %)		 545,387
(2.26 %)		 49,015
(1.39 %)		 25,064
(0.63 %)
119 mainland tiger snake
GCF_900518725.1		 34,251
(3.18 %)		 n/a 13,445
(1.15 %)		 23,410
(1.90 %)		 n/a 39.72
(95.17 %)		 0
(0 %)		 79,478
(4.84 %)		 52,414
(100.00 %)		 1,081,503
(6.00 %)		 711,408
(2.47 %)		 8,047,065
(40.24 %)		 3,772
(0.08 %)		 265,750
(1.48 %)		 61,669
(2.47 %)		 18,916
(0.65 %)
120 many-banded krait (BM01 2022)
GCA_023653725.1		 n/a n/a 13,269
(1.19 %)		 18,533
(1.94 %)		 n/a 39.87
(99.25 %)		 0
(0 %)		 1,631
(0.75 %)		 448
(100.00 %)		 1,104,569
(6.42 %)		 703,174
(3.07 %)		 8,451,422
(40.97 %)		 0
(0 %)		 395,083
(2.25 %)		 65,260
(2.74 %)		 19,850
(0.80 %)
121 marbled whiptail (SIMRID8450 2020)
GCA_014337955.1		 n/a n/a 13,646
(1.27 %)		 18,378
(2.09 %)		 n/a 42.67
(94.37 %)		 0
(0 %)		 166,840
(5.67 %)		 3,826
(100.00 %)		 809,278
(4.31 %)		 439,020
(1.66 %)		 8,665,254
(33.02 %)		 23,254
(0.24 %)		 223,741
(0.91 %)		 41,638
(1.70 %)		 20,448
(0.83 %)
122 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1		 n/a n/a 10,549
(1.13 %)		 20,171
(2.08 %)		 n/a 41.02
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 12
(0.00 %)		 9,587
(100.00 %)		 889,533
(7.84 %)		 565,831
(6.37 %)		 5,968,624
(41.74 %)		 0
(0 %)		 615,578
(4.07 %)		 73,632
(3.80 %)		 21,339
(1.17 %)
123 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1		 n/a n/a 13,282
(1.16 %)		 18,653
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 1,187,501
(7.72 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,428,147
(45.35 %)		 13
(0.00 %)		 770,603
(3.87 %)		 101,007
(3.95 %)		 24,179
(0.84 %)
124 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1		 n/a n/a 14,442
(0.44 %)		 24,630
(1.28 %)		 n/a 41.94
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,032
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 1,928,361
(2.22 %)		 2,955,095
(11.97 %)		 25,178,773
(53.55 %)		 7
(0.00 %)		 5,022,575
(7.68 %)		 165,699
(1.23 %)		 16,842
(0.16 %)
125 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1		 n/a n/a 13,824
(0.44 %)		 23,296
(1.27 %)		 n/a 41.86
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,009
(0.01 %)		 656
(100.00 %)		 1,860,053
(2.17 %)		 2,751,941
(10.76 %)		 24,252,866
(53.00 %)		 11
(0.00 %)		 4,329,852
(7.13 %)		 157,012
(1.21 %)		 15,742
(0.15 %)
126 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1		 62,007
(3.15 %)		 n/a 14,883
(0.96 %)		 18,524
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 0
(0 %)		 1,866
(3.64 %)		 621
(100.00 %)		 1,372,189
(11.32 %)		 472,501
(3.42 %)		 11,362,604
(34.69 %)		 1
(0.00 %)		 910,675
(2.73 %)		 73,700
(2.04 %)		 22,443
(0.52 %)
127 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1		 n/a n/a 15,425
(0.94 %)		 20,005
(1.48 %)		 n/a 44.46
(95.51 %)		 1,790
(4.49 %)		 1,790
(4.49 %)		 4,782
(95.51 %)		 1,404,726
(11.28 %)		 453,302
(2.47 %)		 11,996,092
(34.08 %)		 3
(0.00 %)		 712,154
(2.19 %)		 77,167
(2.14 %)		 23,282
(0.51 %)
128 mimic poison frog (primary hap 2023)
GCA_032444005.1		 n/a n/a 14,957
(0.34 %)		 n/a n/a 44.95
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,686
(100.00 %)		 1,716,760
(1.89 %)		 4,088,695
(23.45 %)		 2,437
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 10,590,500
(14.66 %)		 n/a n/a
129 Mississippi paddlefish
GCF_017654505.1		 66,226
(6.17 %)		 n/a 21,806
(1.85 %)		 31,525
(3.80 %)		 n/a 39.02
(99.89 %)		 2,957
(0.11 %)		 2,963
(0.11 %)		 7,192
(99.89 %)		 1,126,936
(3.66 %)		 877,525
(6.33 %)		 9,039,918
(36.85 %)		 1
(0.00 %)		 775,360
(3.40 %)		 29,954
(1.06 %)		 14,005
(0.40 %)
130 Northern rubber boa (HBS 135849 alternate hap 2022)
GCA_023362785.1		 n/a n/a 12,816
(1.09 %)		 18,099
(1.83 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 0
(0 %)		 84
(0.00 %)		 224
(100.00 %)		 1,081,107
(4.01 %)		 728,703
(4.64 %)		 6,961,724
(42.46 %)		 1
(0.00 %)		 702,049
(3.73 %)		 128,617
(3.90 %)		 25,981
(1.05 %)
131 Northern rubber boa (HBS 135849 primary hap 2022)
GCA_023362775.1		 n/a n/a 13,531
(1.08 %)		 18,971
(1.81 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 0
(0 %)		 85
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 1,138,891
(3.99 %)		 798,941
(5.00 %)		 7,476,142
(42.85 %)		 1
(0.00 %)		 757,393
(3.80 %)		 135,874
(3.88 %)		 27,035
(1.02 %)
132 Northwestern pond turtle (WTP2003 alternate hap 2022)
GCA_022086895.1		 n/a n/a 14,212
(1.00 %)		 20,203
(1.65 %)		 n/a 44.72
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,800
(0.01 %)		 2,508
(100.00 %)		 4,246,095
(48.91 %)		 442,393
(1.88 %)		 10,453,096
(35.71 %)		 43
(0.00 %)		 450,873
(2.62 %)		 134,572
(3.12 %)		 28,350
(0.78 %)
133 Northwestern pond turtle (WTP2003 primary hap 2022)
GCA_022086475.1		 n/a n/a 14,862
(1.02 %)		 19,830
(1.62 %)		 n/a 44.76
(100.00 %)		 0
(0 %)		 148
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 4,413,681
(48.88 %)		 459,701
(1.92 %)		 11,014,102
(35.89 %)		 1
(0.00 %)		 468,618
(2.09 %)		 141,800
(3.08 %)		 30,071
(0.78 %)
134 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1		 n/a n/a 13,448
(1.31 %)		 17,745
(2.07 %)		 n/a 40.20
(99.98 %)		 73
(0.02 %)		 73
(0.02 %)		 116
(99.98 %)		 741,052
(2.98 %)		 411,477
(3.31 %)		 7,668,994
(30.14 %)		 0
(0 %)		 318,343
(2.06 %)		 34,560
(2.18 %)		 21,974
(1.10 %)
135 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1		 n/a n/a 13,421
(1.31 %)		 17,659
(2.08 %)		 n/a 40.15
(99.66 %)		 93
(0.34 %)		 93
(0.34 %)		 158
(99.66 %)		 733,358
(2.95 %)		 403,552
(3.04 %)		 7,746,871
(29.97 %)		 0
(0 %)		 294,855
(1.92 %)		 34,363
(2.08 %)		 21,752
(1.10 %)
136 one-colored caecilian (2021)
GCA_901765095.2		 n/a n/a 14,569
(0.43 %)		 30,498
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 0
(0 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,894,383
(1.68 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,143
(52.43 %)		 5
(0.00 %)		 1,718,803
(3.44 %)		 414,828
(3.91 %)		 47,796
(0.38 %)
137 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1		 n/a n/a 7,223
(0.52 %)		 11,927
(1.11 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 76
(0.00 %)		 4,081
(100.00 %)		 988,792
(3.99 %)		 1,766,202
(10.24 %)		 9,974,001
(52.99 %)		 0
(0 %)		 1,733,898
(6.80 %)		 64,462
(1.33 %)		 4,213
(0.08 %)
138 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1		 n/a n/a 14,522
(0.54 %)		 21,861
(1.14 %)		 n/a 39.52
(98.39 %)		 0
(0 %)		 3,681
(1.61 %)		 1,318
(100.00 %)		 1,928,844
(4.34 %)		 3,684,477
(13.44 %)		 19,091,818
(55.21 %)		 1
(0.00 %)		 4,715,600
(8.73 %)		 127,760
(1.34 %)		 9,458
(0.10 %)
139 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1		 n/a n/a 13,365
(1.26 %)		 17,388
(1.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 99
(0.00 %)		 279
(100.00 %)		 726,428
(2.81 %)		 331,756
(2.05 %)		 7,184,711
(33.57 %)		 2
(0.00 %)		 316,815
(2.51 %)		 51,973
(2.70 %)		 19,565
(0.92 %)
140 Papuan ground boa (hap2 2024)
GCA_035149785.1		 n/a n/a 13,390
(1.26 %)		 17,496
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 101
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 728,574
(2.82 %)		 348,605
(2.13 %)		 7,199,124
(33.55 %)		 1
(0.00 %)		 318,788
(2.43 %)		 51,807
(2.69 %)		 19,758
(0.92 %)
141 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501915.1		 n/a n/a 21,977
(1.55 %)		 31,925
(2.52 %)		 n/a 39.40
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,072
(0.01 %)		 1,183
(100.00 %)		 825,817
(1.86 %)		 1,047,172
(7.89 %)		 12,996,911
(44.48 %)		 3
(0.00 %)		 1,701,385
(5.28 %)		 99,118
(1.26 %)		 15,547
(0.21 %)
142 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501925.1		 n/a n/a 23,766
(1.52 %)		 34,093
(2.42 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 500
(0.00 %)		 897
(100.00 %)		 919,152
(1.89 %)		 1,157,711
(8.01 %)		 14,217,996
(45.44 %)		 0
(0 %)		 1,995,399
(5.51 %)		 108,139
(1.26 %)		 16,761
(0.21 %)
143 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023)
GCA_033958435.1		 n/a n/a 14,675
(1.05 %)		 16,697
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 0
(0 %)		 12
(0.00 %)		 134
(100.00 %)		 3,772,260
(47.94 %)		 322,081
(1.52 %)		 11,123,166
(34.14 %)		 0
(0 %)		 448,027
(1.56 %)		 129,645
(3.29 %)		 28,529
(1.18 %)
144 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2		 n/a n/a 10,906
(1.98 %)		 19,820
(4.33 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,516
(100.00 %)		 390,896
(3.25 %)		 482,493
(7.83 %)		 4,361,670
(34.36 %)		 0
(0 %)		 491,019
(5.12 %)		 52,508
(3.70 %)		 21,519
(1.51 %)
145 plains spadefoot toad (primary hap 2022)
GCF_027358695.1		 41,009
(4.67 %)		 n/a 13,912
(2.00 %)		 25,745
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 0
(0 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 497,976
(3.84 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,342
(36.26 %)		 1
(0.00 %)		 748,493
(5.83 %)		 72,598
(4.35 %)		 32,385
(1.89 %)
146 prickly gecko (False Entrance Well CCM8104 2023)
GCF_032191835.1		 35,366
(2.07 %)		 n/a 14,394
(0.79 %)		 23,371
(1.60 %)		 n/a 44.78
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,608
(0.01 %)		 661
(100.00 %)		 1,995,033
(8.75 %)		 823,022
(6.51 %)		 12,116,860
(46.84 %)		 9
(0.00 %)		 1,818,752
(4.81 %)		 117,191
(3.14 %)		 39,240
(0.76 %)
147 Puerto Rican coqui (hap1 2024)
GCA_035609145.1		 n/a n/a 13,881
(0.57 %)		 32,313
(1.67 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 659
(0.00 %)		 963
(100.00 %)		 1,044,181
(1.98 %)		 1,442,189
(16.51 %)		 14,710,175
(54.00 %)		 6
(0.00 %)		 4,070,195
(8.73 %)		 501,931
(8.81 %)		 49,483
(0.82 %)
148 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1		 n/a n/a 13,892
(0.57 %)		 32,011
(1.64 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 16
(0.00 %)		 685
(0.00 %)		 843
(100.00 %)		 1,042,636
(2.00 %)		 1,430,690
(16.22 %)		 14,621,029
(53.91 %)		 19
(0.00 %)		 4,063,379
(8.75 %)		 503,166
(8.84 %)		 49,100
(0.82 %)
149 red-eared slider turtle
GCF_013100865.1		 47,272
(3.27 %)		 n/a 13,909
(1.05 %)		 16,674
(1.54 %)		 n/a 43.81
(96.14 %)		 0
(0 %)		 25,390
(3.86 %)		 138
(100.00 %)		 1,686,633
(15.06 %)		 271,837
(0.81 %)		 10,802,900
(30.74 %)		 1,247
(0.04 %)		 155,059
(0.69 %)		 93,811
(1.90 %)		 24,960
(0.62 %)
150 reedfish (alternate hap 2021)
GCA_900700845.3		 n/a n/a 11,382
(0.41 %)		 28,399
(1.33 %)		 n/a 39.39
(99.99 %)		 17
(0.01 %)		 17
(0.01 %)		 17,099
(99.99 %)		 6,708,926
(37.23 %)		 883,916
(2.81 %)		 16,745,782
(46.94 %)		 0
(0 %)		 963,655
(2.45 %)		 74,951
(1.15 %)		 20,227
(0.32 %)
151 Reeves's turtle
GCF_016161935.1		 86,238
(3.40 %)		 n/a 15,165
(0.98 %)		 21,405
(1.66 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 0
(0 %)		 398
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,854,279
(14.68 %)		 448,403
(2.11 %)		 11,329,581
(34.64 %)		 0
(0 %)		 644,654
(2.20 %)		 119,002
(2.82 %)		 35,167
(0.87 %)
152 Ringneck snake (HBS135679 primary hap 2022)
GCA_023053685.1		 n/a n/a 13,357
(1.06 %)		 20,426
(1.94 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 0
(0 %)		 723
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 1,451,537
(9.36 %)		 1,095,484
(10.35 %)		 7,870,309
(48.66 %)		 4
(0.00 %)		 1,107,317
(4.55 %)		 142,495
(4.04 %)		 27,514
(0.84 %)
153 royal ground snake (hap1 2023)
GCA_031021105.1		 n/a n/a 13,327
(0.96 %)		 20,347
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 1,983,903
(10.40 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,707
(53.44 %)		 11
(0.00 %)		 1,523,664
(5.77 %)		 130,852
(4.47 %)		 27,815
(0.70 %)
154 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1		 n/a n/a 13,845
(0.96 %)		 23,108
(1.86 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,128
(100.00 %)		 2,008,682
(10.16 %)		 1,718,408
(7.36 %)		 9,467,451
(52.99 %)		 0
(0 %)		 1,513,596
(5.45 %)		 140,557
(4.65 %)		 29,439
(0.71 %)
155 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1		 n/a n/a 12,606
(0.83 %)		 22,421
(1.62 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,543
(100.00 %)		 2,080,172
(11.19 %)		 1,814,619
(9.22 %)		 8,889,119
(57.36 %)		 0
(0 %)		 1,825,733
(6.19 %)		 145,328
(4.63 %)		 28,523
(0.67 %)
156 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1		 n/a n/a 13,727
(0.84 %)		 24,896
(2.06 %)		 n/a 42.95
(99.51 %)		 0
(0 %)		 973
(0.49 %)		 2,266
(100.00 %)		 729,332
(2.15 %)		 1,402,564
(24.45 %)		 8,156,596
(55.96 %)		 4
(0.00 %)		 3,523,739
(10.10 %)		 175,180
(3.64 %)		 18,584
(0.40 %)
157 rufous frog (hap2 2023)
GCA_031893055.1		 n/a n/a 13,538
(0.88 %)		 24,311
(2.15 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 0
(0 %)		 976
(0.93 %)		 1,266
(100.00 %)		 711,895
(2.18 %)		 1,219,160
(21.56 %)		 7,988,458
(54.14 %)		 3
(0.00 %)		 3,097,457
(9.48 %)		 170,920
(3.48 %)		 17,791
(0.40 %)
158 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1		 n/a n/a 14,039
(1.09 %)		 19,528
(1.85 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 31
(0.00 %)		 122
(100.00 %)		 1,307,065
(5.31 %)		 672,219
(3.50 %)		 9,949,858
(39.30 %)		 0
(0 %)		 671,520
(3.09 %)		 83,890
(3.97 %)		 26,657
(0.80 %)
159 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1		 n/a n/a 14,065
(1.09 %)		 19,430
(1.84 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 21
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 1,307,771
(5.32 %)		 672,054
(3.42 %)		 9,846,806
(39.03 %)		 0
(0 %)		 665,794
(3.10 %)		 83,805
(3.99 %)		 26,762
(0.80 %)
160 San Diegan tiger whiptail (alternate hap HBS 135688 2022)
GCA_023333555.1		 n/a n/a 13,288
(1.15 %)		 18,137
(1.98 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 0
(0 %)		 44
(0.00 %)		 227
(100.00 %)		 909,096
(6.37 %)		 544,302
(5.70 %)		 8,280,652
(39.20 %)		 3
(0.00 %)		 970,374
(3.95 %)		 51,923
(2.21 %)		 19,861
(0.82 %)
161 San Diegan tiger whiptail (HBS 135688 2022)
GCA_023333525.1		 n/a n/a 10,727
(1.18 %)		 14,669
(1.99 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 39
(0.00 %)		 113
(100.00 %)		 741,937
(6.29 %)		 448,194
(5.60 %)		 7,227,870
(36.97 %)		 0
(0 %)		 769,111
(3.76 %)		 42,621
(2.15 %)		 17,889
(0.90 %)
162 San Diego alligator lizard (HBS135686 alternate hap 2022)
GCA_023053675.1		 n/a n/a 14,107
(1.14 %)		 19,600
(1.95 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 27
(0.00 %)		 627
(100.00 %)		 1,563,836
(7.79 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,810
(40.44 %)		 0
(0 %)		 884,432
(3.64 %)		 81,126
(2.79 %)		 27,960
(0.83 %)
163 San Diego alligator lizard (HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1		 n/a n/a 14,075
(1.15 %)		 19,587
(1.99 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 23
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 1,577,744
(7.81 %)		 774,690
(3.78 %)		 9,248,062
(40.42 %)		 0
(0 %)		 832,326
(3.45 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,587
(0.82 %)
164 San Diego ringneck snake (HBS135679 alternate hap 2022)
GCA_023053665.1		 n/a n/a 10,911
(1.00 %)		 17,586
(1.79 %)		 n/a 41.17
(100.00 %)		 0
(0 %)		 572
(0.00 %)		 2,064
(100.00 %)		 1,265,045
(10.30 %)		 989,149
(13.38 %)		 6,503,035
(50.62 %)		 0
(0 %)		 1,261,338
(5.60 %)		 123,274
(4.17 %)		 23,159
(0.83 %)
165 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1		 n/a n/a 14,226
(1.28 %)		 25,396
(2.33 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 12,662
(100.00 %)		 1,001,433
(5.27 %)		 445,157
(1.79 %)		 7,227,826
(34.26 %)		 0
(0 %)		 365,558
(2.38 %)		 80,300
(2.76 %)		 22,848
(0.87 %)
166 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1		 41,701
(3.64 %)		 n/a 14,350
(1.48 %)		 19,231
(2.45 %)		 32,804
(4.14 %)		 43.75
(99.75 %)		 0
(0 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,414
(1.76 %)		 7,135,165
(34.49 %)		 0
(0 %)		 365,268
(2.50 %)		 76,053
(2.68 %)		 21,615
(0.85 %)
167 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1		 108,406
(1.98 %)		 n/a 13,959
(0.46 %)		 n/a n/a 43.90
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,474
(100.00 %)		 1,903,654
(2.85 %)		 2,970,691
(16.56 %)		 15,354,577
(64.31 %)		 20
(0.00 %)		 n/a 652,708
(8.36 %)		 43,665
(0.45 %)
168 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1		 n/a n/a 14,077
(0.47 %)		 36,608
(1.60 %)		 n/a 43.86
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,097
(0.01 %)		 2,802
(100.00 %)		 1,819,971
(2.73 %)		 2,865,173
(16.12 %)		 15,335,602
(63.85 %)		 14
(0.00 %)		 6,125,585
(10.74 %)		 651,438
(8.09 %)		 43,492
(0.45 %)
169 Schlegel's Japanese gecko
GCF_001447785.1		 25,177
(1.78 %)		 n/a 14,549
(0.82 %)		 28,002
(1.69 %)		 n/a 45.48
(96.46 %)		 143,970
(3.54 %)		 143,970
(3.54 %)		 335,470
(96.46 %)		 889,760
(2.21 %)		 666,492
(2.83 %)		 12,865,811
(39.14 %)		 291
(0.01 %)		 n/a 160,022
(2.80 %)		 49,172
(0.87 %)
170 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1		 n/a n/a 6,180
(0.71 %)		 31,191
(4.14 %)		 n/a 48.30
(100.00 %)		 0
(0 %)		 11
(0.00 %)		 4,064
(100.00 %)		 1,494,745
(38.42 %)		 891,392
(20.02 %)		 4,259,383
(49.70 %)		 0
(0 %)		 2,135,388
(12.73 %)		 147,499
(35.87 %)		 97,808
(5.62 %)
171 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1		 41,241
(6.50 %)		 n/a 7,638
(0.70 %)		 36,336
(4.06 %)		 83,714
(10.03 %)		 48.31
(98.62 %)		 0
(0 %)		 930
(1.38 %)		 1,434
(100.00 %)		 1,920,851
(39.36 %)		 1,194,165
(21.47 %)		 5,320,620
(50.50 %)		 4
(0.00 %)		 2,982,736
(13.77 %)		 178,590
(35.88 %)		 120,128
(5.32 %)
172 sharpnose sevengill shark (hap1 2024)
GCA_035084215.1		 n/a n/a 12,780
(0.49 %)		 24,543
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,880
(100.00 %)		 597,122
(2.28 %)		 1,112,137
(17.97 %)		 12,108,056
(57.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,824,033
(9.23 %)		 117,585
(3.42 %)		 24,151
(0.35 %)
173 sharpnose sevengill shark (hap2 2024)
GCA_035084135.1		 n/a n/a 12,603
(0.52 %)		 23,419
(1.42 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,695
(0.01 %)		 1,695
(0.01 %)		 2,889
(99.99 %)		 559,171
(2.08 %)		 973,228
(15.01 %)		 11,768,442
(55.69 %)		 2
(0.00 %)		 3,991,721
(8.15 %)		 108,468
(3.25 %)		 22,750
(0.36 %)
174 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2		 n/a n/a 11,589
(0.31 %)		 32,603
(1.10 %)		 n/a 47.54
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 6
(0.00 %)		 26,655
(100.00 %)		 1,346,532
(1.83 %)		 1,273,326
(5.35 %)		 19,727,443
(51.55 %)		 0
(0 %)		 2,678,114
(4.31 %)		 427,693
(8.25 %)		 27,178
(0.30 %)
175 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2		 n/a n/a 12,587
(0.36 %)		 23,986
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 0
(0 %)		 7,146
(1.52 %)		 645
(100.00 %)		 1,451,634
(1.94 %)		 1,448,619
(6.25 %)		 20,884,741
(51.41 %)		 10
(0.00 %)		 3,334,909
(4.99 %)		 456,658
(8.18 %)		 31,096
(0.32 %)
176 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1		 n/a n/a 9,086
(0.58 %)		 20,468
(1.57 %)		 n/a 42.65
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 10,892
(100.00 %)		 315,695
(1.23 %)		 320,148
(1.73 %)		 8,305,059
(38.33 %)		 0
(0 %)		 382,745
(1.57 %)		 37,147
(1.43 %)		 15,419
(0.42 %)
177 smalltooth sawfish (primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1		 40,257
(2.94 %)		 n/a 12,157
(0.69 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 0
(0 %)		 698
(0.91 %)		 172
(100.00 %)		 4,824,261
(54.91 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,260
(38.19 %)		 0
(0 %)		 471,344
(1.50 %)		 45,398
(1.34 %)		 18,410
(0.41 %)
178 snake C.aspera (hap2 2024)
GCF_035149785.1		 31,826
(3.55 %)		 n/a 13,389
(1.26 %)		 17,495
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 101
(0.00 %)		 149
(100.00 %)		 728,567
(2.82 %)		 348,603
(2.13 %)		 7,199,026
(33.55 %)		 1
(0.00 %)		 318,786
(2.43 %)		 51,807
(2.69 %)		 19,758
(0.92 %)
179 Southern alligator lizard (San Diego HBS135686 primary hap 2024)
GCA_023053635.2		 n/a n/a 14,093
(1.15 %)		 19,338
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 35
(100.00 %)		 1,577,751
(7.81 %)		 774,117
(3.78 %)		 9,248,069
(40.42 %)		 1
(0.00 %)		 823,656
(3.44 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,586
(0.82 %)
180 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 alternate hap 2022)
GCA_024509165.1		 n/a n/a 13,381
(1.17 %)		 19,541
(1.96 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 0
(0 %)		 34
(0.00 %)		 340
(100.00 %)		 1,137,408
(8.97 %)		 740,163
(7.59 %)		 7,520,676
(44.43 %)		 0
(0 %)		 1,047,648
(4.87 %)		 47,268
(1.61 %)		 21,885
(0.78 %)
181 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 primary hap 2022)
GCA_024509115.1		 n/a n/a 12,626
(1.16 %)		 18,965
(1.95 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 443
(0.01 %)		 443
(0.01 %)		 1,139
(99.99 %)		 1,095,605
(9.34 %)		 713,734
(8.45 %)		 6,942,208
(44.93 %)		 3
(0.00 %)		 1,092,536
(5.56 %)		 46,378
(2.04 %)		 21,510
(0.80 %)
182 Southwestern pond turtle (HBS135687 alternate hap 2022)
GCA_023634275.1		 n/a n/a 14,998
(0.98 %)		 20,146
(1.60 %)		 n/a 44.84
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 64
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 1,562,785
(12.68 %)		 484,638
(2.00 %)		 11,089,433
(36.29 %)		 0
(0 %)		 512,269
(2.30 %)		 143,601
(3.21 %)		 30,649
(0.71 %)
183 Southwestern pond turtle (HBS135687 primary hap 2022)
GCA_023634205.1		 n/a n/a 14,971
(0.99 %)		 19,756
(1.60 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 53
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 1,545,155
(12.63 %)		 465,697
(1.95 %)		 11,181,681
(36.13 %)		 0
(0 %)		 476,831
(2.14 %)		 142,383
(3.05 %)		 30,737
(0.72 %)
184 spotted gar
GCF_000242695.1		 45,681
(8.02 %)		 n/a 13,054
(1.95 %)		 46,362
(15.00 %)		 n/a 39.59
(91.93 %)		 43,274
(8.08 %)		 43,276
(8.08 %)		 45,199
(91.92 %)		 203,614
(1.02 %)		 123,247
(0.80 %)		 5,837,321
(22.82 %)		 2,079
(0.10 %)		 77,276
(0.87 %)		 38,507
(2.24 %)		 31,972
(1.68 %)
185 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1		 n/a n/a 10,920
(1.26 %)		 14,403
(2.60 %)		 n/a 43.46
(99.96 %)		 0
(0 %)		 2,088
(0.04 %)		 1,042
(100.00 %)		 3,325,883
(44.48 %)		 604,780
(8.87 %)		 5,926,808
(44.92 %)		 2
(0.00 %)		 1,077,982
(5.77 %)		 64,249
(4.00 %)		 11,419
(0.43 %)
186 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1		 n/a n/a 10,694
(1.38 %)		 13,221
(2.62 %)		 n/a 42.85
(99.96 %)		 0
(0 %)		 1,952
(0.04 %)		 532
(100.00 %)		 3,108,151
(44.68 %)		 498,592
(6.00 %)		 5,634,132
(43.16 %)		 4
(0.00 %)		 685,165
(4.19 %)		 50,785
(2.94 %)		 25,542
(1.57 %)
187 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1		 110,154
(7.62 %)		 n/a 25,364
(1.76 %)		 40,715
(4.06 %)		 n/a 40.11
(100.00 %)		 0
(0 %)		 433
(0.00 %)		 1,731
(100.00 %)		 4,055,215
(43.14 %)		 1,124,096
(10.13 %)		 9,426,172
(41.81 %)		 10
(0.00 %)		 1,593,747
(6.87 %)		 64,522
(2.85 %)		 21,984
(0.89 %)
188 sterlet (paternal fAciRut3.2 2022)
GCA_902713435.2		 n/a n/a 24,717
(1.73 %)		 40,151
(4.13 %)		 74,807
(5.54 %)		 40.09
(99.99 %)		 0
(0 %)		 475
(0.01 %)		 1,517
(100.00 %)		 1,844,596
(9.77 %)		 1,119,340
(9.88 %)		 9,372,934
(41.58 %)		 8
(0.00 %)		 1,582,556
(6.83 %)		 65,007
(2.74 %)		 17,761
(0.38 %)
189 sterlet (v2 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.2		 73,195
(5.77 %)		 n/a 24,716
(1.77 %)		 39,692
(3.97 %)		 n/a 39.75
(99.93 %)		 0
(0 %)		 6,251
(0.07 %)		 3,368
(100.00 %)		 3,869,521
(43.26 %)		 1,093,425
(6.82 %)		 9,976,052
(39.33 %)		 5
(0.00 %)		 1,354,766
(6.14 %)		 60,325
(1.97 %)		 17,242
(0.48 %)
190 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1		 n/a n/a 14,713
(1.06 %)		 18,602
(1.60 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 290
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 1,352,115
(12.17 %)		 388,630
(1.94 %)		 10,550,154
(33.42 %)		 0
(0 %)		 470,790
(2.03 %)		 113,023
(3.09 %)		 33,031
(0.84 %)
191 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1		 n/a n/a 12,226
(1.01 %)		 14,117
(1.42 %)		 n/a 43.77
(100.00 %)		 0
(0 %)		 361
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 1,202,345
(11.93 %)		 304,674
(1.45 %)		 9,752,924
(32.81 %)		 0
(0 %)		 314,037
(1.63 %)		 92,993
(2.75 %)		 20,902
(0.60 %)
192 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1		 n/a n/a 5,885
(0.35 %)		 24,457
(1.45 %)		 n/a 44.61
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(0.00 %)		 21,995
(100.00 %)		 553,415
(2.65 %)		 761,469
(4.53 %)		 6,043,769
(57.75 %)		 0
(0 %)		 1,079,506
(5.75 %)		 159,552
(5.54 %)		 20,611
(0.66 %)
193 thorny skate (primary hap CabotCenter1 v1.1 2020)
GCF_010909765.2		 45,968
(2.40 %)		 n/a 11,437
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 0
(0 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 888,163
(2.58 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 26
(0.00 %)		 1,634,606
(4.98 %)		 242,676
(4.73 %)		 31,030
(0.57 %)
194 three-toed box turtle
GCF_002925995.2		 35,807
(2.28 %)		 n/a 16,429
(1.00 %)		 26,460
(1.60 %)		 33,673
(1.75 %)		 44.26
(94.87 %)		 0
(0 %)		 53,635
(5.13 %)		 48,497
(100.00 %)		 2,007,347
(15.00 %)		 351,871
(0.86 %)		 12,385,245
(31.74 %)		 3,613
(0.05 %)		 161,525
(0.66 %)		 138,405
(2.40 %)		 33,334
(0.68 %)
195 tiger rattlesnake
GCF_016545835.1		 58,085
(4.72 %)		 n/a 13,597
(1.18 %)		 20,553
(2.03 %)		 n/a 39.88
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 4,228
(100.00 %)		 1,142,521
(7.92 %)		 739,406
(5.17 %)		 7,749,366
(42.91 %)		 0
(0 %)		 1,005,717
(4.66 %)		 45,588
(1.61 %)		 21,457
(0.80 %)
196 tiny Cayenne caecilian
GCF_901765095.1		 41,333
(1.27 %)		 n/a 14,569
(0.43 %)		 30,499
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 0
(0 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,835,191
(1.59 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,145
(52.43 %)		 5
(0.00 %)		 1,513,727
(3.00 %)		 414,828
(3.91 %)		 47,796
(0.38 %)
197 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1		 n/a n/a 12,197
(0.36 %)		 33,747
(1.15 %)		 n/a 43.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 23,871
(100.00 %)		 1,453,442
(1.57 %)		 1,309,062
(3.23 %)		 17,953,416
(52.19 %)		 0
(0 %)		 1,274,743
(3.12 %)		 326,452
(3.86 %)		 38,711
(0.39 %)
198 Townsend's dwarf sphaero (gecko TG3544 2022)
GCF_021028975.2		 41,266
(3.35 %)		 n/a 13,505
(1.05 %)		 19,294
(1.78 %)		 n/a 45.92
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,590
(0.01 %)		 1,742
(100.00 %)		 938,800
(8.81 %)		 627,869
(5.78 %)		 9,306,892
(38.57 %)		 33
(0.00 %)		 185,826
(0.70 %)		 91,919
(2.91 %)		 28,760
(0.80 %)
199 tropical clawed frog
GCF_000004195.4		 50,557
(4.71 %)		 n/a 14,679
(1.97 %)		 20,138
(2.76 %)		 52,028
(5.20 %)		 40.73
(99.80 %)		 0
(0 %)		 684
(0.20 %)		 167
(100.00 %)		 2,289,618
(34.82 %)		 708,472
(13.14 %)		 6,816,377
(41.73 %)		 4
(0.00 %)		 1,594,381
(7.39 %)		 52,647
(1.35 %)		 10,639
(0.28 %)
200 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1		 n/a n/a 13,456
(0.33 %)		 47,486
(1.34 %)		 n/a 44.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 27,233
(100.00 %)		 1,968,437
(1.91 %)		 1,716,136
(3.97 %)		 25,847,315
(43.76 %)		 0
(0 %)		 1,707,112
(2.84 %)		 523,234
(6.59 %)		 83,004
(0.82 %)
201 two-lined caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_901001135.2		 n/a n/a 14,449
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 0
(0 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,274,606
(1.91 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,400,957
(44.09 %)		 9
(0.01 %)		 2,193,249
(3.24 %)		 602,911
(6.66 %)		 94,934
(0.82 %)
202 valley gartersnake (HBS 135685 alternate hap 2023)
GCA_029207655.1		 n/a n/a 13,267
(1.12 %)		 21,667
(2.38 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 0
(0 %)		 403
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 1,344,601
(8.29 %)		 1,035,785
(7.00 %)		 8,436,473
(45.10 %)		 2
(0.00 %)		 993,545
(4.30 %)		 82,750
(2.69 %)		 24,526
(0.78 %)
203 valley gartersnake (HBS 135685 primary hap 2023)
GCA_029207665.1		 n/a n/a 12,430
(1.10 %)		 20,286
(2.36 %)		 n/a 41.12
(100.00 %)		 0
(0 %)		 446
(0.00 %)		 413
(100.00 %)		 1,299,478
(9.62 %)		 1,018,398
(8.41 %)		 7,790,758
(46.28 %)		 2
(0.00 %)		 1,063,878
(4.69 %)		 81,352
(2.71 %)		 23,653
(0.79 %)
204 viviparous/common lizard
GCF_011800845.1		 47,034
(5.17 %)		 n/a 14,311
(1.43 %)		 20,571
(2.35 %)		 32,442
(3.15 %)		 43.97
(97.04 %)		 0
(0 %)		 51,275
(2.97 %)		 25,252
(100.00 %)		 949,801
(5.41 %)		 498,048
(1.91 %)		 7,668,731
(34.21 %)		 726
(0.06 %)		 389,679
(2.77 %)		 88,947
(2.62 %)		 22,474
(0.81 %)
205 West African lungfish
GCF_019279795.1		 41,847
(0.19 %)		 n/a n/a n/a n/a 40.21
(97.52 %)		 0
(0 %)		 n/a 12,668
(100.00 %)		 16,163,808
(2.67 %)		 13,992,750
(5.30 %)		 n/a 26
(0.00 %)		 183,320
(0.03 %)		 502,751
(0.52 %)		 14,687
(0.01 %)
206 western fence lizard (IW3139 2022)
GCA_023333635.1		 n/a n/a 26,067
(1.12 %)		 46,795
(2.72 %)		 n/a 41.28
(100.00 %)		 0
(0 %)		 51
(0.00 %)		 1,771
(100.00 %)		 2,075,491
(6.60 %)		 1,603,401
(7.34 %)		 15,565,775
(40.61 %)		 0
(0 %)		 1,972,426
(5.50 %)		 184,134
(3.16 %)		 51,018
(0.93 %)
207 western fence lizard (IW3139 primary hap 2022)
GCA_023333645.1		 n/a n/a 24,835
(1.20 %)		 42,146
(2.78 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 51
(0.00 %)		 659
(100.00 %)		 1,842,497
(6.34 %)		 1,335,245
(6.14 %)		 15,103,683
(37.84 %)		 1
(0.00 %)		 1,360,948
(3.93 %)		 158,311
(2.92 %)		 45,330
(0.92 %)
208 western painted turtle (R12L10 2023)
GCF_011386835.1		 101,708
(5.23 %)		 n/a 15,332
(1.01 %)		 21,055
(1.60 %)		 n/a 44.88
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,270
(0.02 %)		 9,850
(100.00 %)		 4,178,966
(47.39 %)		 457,400
(2.29 %)		 11,325,467
(35.43 %)		 3
(0.00 %)		 758,530
(2.85 %)		 127,896
(2.94 %)		 35,401
(0.99 %)
209 western painted turtle (v5 RCT428 2020)
GCF_000241765.5		 64,782
(3.76 %)		 n/a 15,184
(1.08 %)		 21,463
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 184,311
(12.48 %)		 259,085
(87.52 %)		 4,079,404
(44.68 %)		 316,232
(0.93 %)		 11,848,718
(27.60 %)		 6,323
(0.15 %)		 313,464
(1.39 %)		 103,623
(1.74 %)		 31,959
(0.68 %)
210 western red-tailed skink (HBS 135693 alternate hap 2022)
GCA_026170595.1		 n/a n/a 14,019
(1.31 %)		 17,620
(2.13 %)		 n/a 45.76
(100.00 %)		 0
(0 %)		 15
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 862,216
(4.87 %)		 557,627
(3.17 %)		 8,002,559
(36.95 %)		 0
(0 %)		 377,483
(2.25 %)		 183,292
(4.74 %)		 24,223
(0.81 %)
211 western red-tailed skink (HBS 135693 primary hap 2022)
GCA_026170395.1		 n/a n/a 13,064
(1.32 %)		 16,407
(2.16 %)		 n/a 45.81
(100.00 %)		 0
(0 %)		 12
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 794,996
(4.86 %)		 514,021
(3.46 %)		 7,339,914
(37.02 %)		 1
(0.00 %)		 359,036
(2.32 %)		 168,847
(4.76 %)		 22,885
(0.83 %)
212 western spadefoot toad (hap1 HBS 135690 2023)
GCA_029215705.1		 n/a n/a 13,914
(1.72 %)		 27,496
(4.28 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 198
(0.00 %)		 677
(100.00 %)		 600,622
(4.04 %)		 783,931
(10.70 %)		 5,362,245
(41.82 %)		 0
(0 %)		 1,069,443
(8.38 %)		 100,334
(5.41 %)		 37,012
(1.96 %)
213 western spadefoot toad (hap2 HBS 135690 2023)
GCA_029215755.1		 n/a n/a 13,991
(1.72 %)		 27,685
(4.24 %)		 n/a 40.90
(100.00 %)		 190
(0.00 %)		 190
(0.00 %)		 541
(100.00 %)		 620,188
(5.00 %)		 800,411
(11.19 %)		 5,338,766
(42.25 %)		 1
(0.00 %)		 1,135,530
(8.81 %)		 101,603
(5.32 %)		 37,398
(1.95 %)
214 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1		 n/a n/a 13,101
(0.94 %)		 24,980
(1.75 %)		 n/a 41.02
(99.93 %)		 19
(0.07 %)		 19
(0.07 %)		 13,642
(99.93 %)		 1,410,212
(7.70 %)		 1,080,385
(4.56 %)		 9,112,844
(43.96 %)		 0
(0 %)		 886,410
(3.61 %)		 91,606
(2.53 %)		 24,845
(0.74 %)
215 western terrestrial garter snake (primary hap 2019)
GCF_009769535.1		 33,492
(3.42 %)		 n/a 13,074
(1.13 %)		 18,807
(1.93 %)		 31,660
(2.61 %)		 40.95
(97.72 %)		 0
(0 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,271,255
(7.73 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,396,200
(42.63 %)		 0
(0 %)		 801,068
(3.60 %)		 81,829
(2.47 %)		 23,152
(0.75 %)
216 whale shark (14 2022 Squalomix)
GCF_021869965.1		 42,052
(2.43 %)		 n/a 12,059
(0.52 %)		 18,460
(1.22 %)		 38,963
(1.77 %)		 41.51
(91.61 %)		 0
(0 %)		 95,208
(8.40 %)		 16,684
(100.00 %)		 402,747
(0.97 %)		 389,119
(1.49 %)		 15,298,245
(34.14 %)		 7,133
(0.13 %)		 472,644
(1.14 %)		 21,050
(0.30 %)		 10,334
(0.16 %)
217 whale shark (Ralph 2017 Emory U)
GCF_001642345.1		 31,857
(1.52 %)		 n/a 11,884
(0.43 %)		 28,482
(1.15 %)		 n/a 41.78
(100.00 %)		 0
(0 %)		 900,650
(0.03 %)		 57,334
(100.00 %)		 413,201
(1.16 %)		 426,542
(2.75 %)		 16,418,143
(38.85 %)		 315
(0.00 %)		 994,713
(2.86 %)		 35,192
(0.95 %)		 11,001
(0.17 %)
218 whitespotted bambooshark
GCF_004010195.1		 54,886
(2.03 %)		 n/a 12,065
(0.44 %)		 19,805
(1.08 %)		 n/a 42.06
(94.27 %)		 0
(0 %)		 156,554
(5.74 %)		 101,977
(100.00 %)		 559,291
(0.96 %)		 641,094
(3.66 %)		 19,566,199
(38.21 %)		 151
(0.01 %)		 1,627,864
(2.86 %)		 28,353
(0.49 %)		 12,756
(0.18 %)
219 yellowpond turtle (Southern MM-2020 2021)
GCF_020497125.1		 65,526
(3.36 %)		 n/a 15,560
(0.99 %)		 21,233
(1.66 %)		 n/a 45.17
(96.24 %)		 0
(0 %)		 1,041
(3.76 %)		 595
(100.00 %)		 1,904,996
(14.25 %)		 468,779
(2.21 %)		 11,403,005
(33.86 %)		 13
(0.00 %)		 681,375
(2.23 %)		 135,646
(3.23 %)		 34,785
(0.79 %)
220 zebra shark (6-17 2022 Squalomix)
GCF_022316705.1		 48,447
(2.64 %)		 n/a 11,974
(0.57 %)		 15,459
(1.26 %)		 n/a 41.78
(93.81 %)		 0
(0 %)		 87,372
(6.20 %)		 1,266
(100.00 %)		 392,676
(0.96 %)		 348,115
(1.22 %)		 15,176,805
(32.93 %)		 151
(0.01 %)		 584,622
(1.29 %)		 20,647
(0.38 %)		 10,977
(0.18 %)
221 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1		 58,105
(2.61 %)		 n/a 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 0
(0 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 4
(0.00 %)		 2,946,119
(5.37 %)		 45,284
(1.67 %)		 14,105
(0.37 %)
222 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1		 n/a n/a 12,516
(0.44 %)		 17,465
(1.05 %)		 n/a 44.66
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(0.35 %)		 2,136
(99.65 %)		 8,278,458
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(0.38 %)
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