Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of other vertebrates only.

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count	common name link to genome browser	ncbiRefSeq	ncbiGene	xenoRefGene	augustus genes	Ensembl genes	gc5 base	AGP gap	all gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	gap Overlap	tandem Dups	cpg unmasked	cpg island
1	Abingdon island giant tortoise GCF_003597395.1	50,402 (2.95 %)	n/a	14,990 (1.01 %)	19,565 (1.58 %)	34,846 (1.54 %)	43.71 (94.31 %)	0 (0 %)	63,430 (5.70 %)	10,618 (100.00 %)	1,553,204 (12.95 %)	274,155 (1.11 %)	12,664,684 (27.42 %)	1,230 (0.10 %)	193,101 (0.91 %)	62,829 (1.59 %)	28,727 (0.78 %)
2	adder (hap1 2024) GCA_964194415.1	n/a	n/a	13,898 (1.18 %)	20,039 (1.94 %)	n/a	41.09 (99.99 %)	1 (0.00 %)	1,057 (0.01 %)	480 (100.00 %)	3,740,180 (50.44 %)	792,731 (6.25 %)	7,621,640 (45.94 %)	0 (0 %)	n/a	116,506 (4.68 %)	23,244 (0.88 %)
3	adder (hap2 2024) GCA_964194405.1	n/a	n/a	12,344 (1.22 %)	17,320 (1.89 %)	n/a	41.00 (99.99 %)	908 (0.01 %)	908 (0.01 %)	1,256 (99.99 %)	3,221,370 (48.42 %)	681,209 (5.18 %)	6,734,253 (44.26 %)	2 (0.00 %)	n/a	99,366 (4.44 %)	20,272 (0.89 %)
4	Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022) GCA_027172095.1	n/a	n/a	2,101 (1.18 %)	5,350 (2.76 %)	n/a	43.70 (99.99 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	4,811 (100.00 %)	103,373 (4.27 %)	58,480 (3.90 %)	895,535 (27.44 %)	0 (0 %)	59,204 (2.84 %)	10,399 (2.84 %)	3,340 (1.02 %)
5	Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq) GCF_027172205.1	57,514 (4.49 %)	n/a	14,340 (1.37 %)	20,053 (2.31 %)	n/a	43.81 (100.00 %)	0 (0 %)	30 (0.00 %)	27 (100.00 %)	832,937 (4.17 %)	474,203 (4.04 %)	7,020,288 (38.29 %)	2 (0.00 %)	631,733 (3.50 %)	94,745 (2.70 %)	19,879 (0.76 %)
6	African bullfrog (1538 2019) GCA_004786255.1	n/a	n/a	13,258 (1.31 %)	15,309 (2.28 %)	n/a	38.30 (89.51 %)	0 (0 %)	121,461 (10.52 %)	5,411 (100.00 %)	491,540 (1.54 %)	401,074 (2.30 %)	8,595,741 (27.94 %)	3,986 (0.11 %)	262,314 (1.70 %)	14,854 (0.31 %)	5,895 (0.13 %)
7	African bullfrog (2023) GCF_032062135.1	39,241 (5.22 %)	n/a	13,325 (1.31 %)	16,015 (2.29 %)	n/a	38.30 (97.16 %)	0 (0 %)	40,350 (2.85 %)	8,090 (100.00 %)	490,197 (1.53 %)	403,071 (2.55 %)	8,536,428 (30.37 %)	335 (0.01 %)	271,401 (1.85 %)	16,231 (0.36 %)	5,949 (0.15 %)
8	African clawed frog (2021) GCF_017654675.1	80,899 (3.89 %)	n/a	23,666 (1.59 %)	32,527 (2.45 %)	112,506 (5.21 %)	39.34 (99.94 %)	0 (0 %)	667 (0.06 %)	55 (100.00 %)	4,269,095 (35.49 %)	1,028,861 (6.46 %)	14,246,823 (43.67 %)	2 (0.00 %)	1,679,057 (4.83 %)	108,774 (1.25 %)	16,813 (0.23 %)
9	American alligator (2023 refseq) GCF_030867095.1	60,799 (4.33 %)	n/a	14,383 (0.98 %)	18,600 (1.45 %)	n/a	45.01 (99.30 %)	0 (0 %)	161 (0.70 %)	195 (100.00 %)	3,322,624 (43.19 %)	478,208 (1.77 %)	12,316,424 (32.01 %)	0 (0 %)	334,854 (1.31 %)	49,792 (2.45 %)	29,504 (1.51 %)
10	American alligator (KSC_2009_1 2016) GCF_000281125.3	51,013 (3.53 %)	n/a	14,424 (1.06 %)	19,690 (1.51 %)	n/a	44.30 (97.86 %)	0 (0 %)	236,641 (2.19 %)	7,094 (100.00 %)	2,842,761 (36.86 %)	291,584 (0.69 %)	12,464,318 (27.91 %)	1,962 (0.01 %)	63,947 (0.23 %)	35,531 (1.28 %)	26,988 (0.99 %)
11	American bullfrog (primary hap 2024) GCA_037953035.1	n/a	n/a	14,830 (0.29 %)	47,571 (1.22 %)	n/a	43.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4,071 (100.00 %)	3,008,729 (2.34 %)	4,764,040 (10.52 %)	28,440,050 (58.60 %)	0 (0 %)	6,524,240 (7.19 %)	446,366 (2.65 %)	51,797 (0.28 %)
12	American eel (EN2019 2024) GCF_018555375.3	67,474 (10.58 %)	n/a	17,131 (2.21 %)	34,322 (5.40 %)	n/a	43.73 (99.99 %)	0 (0 %)	985 (0.01 %)	967 (100.00 %)	766,696 (5.03 %)	756,877 (7.81 %)	5,766,995 (27.42 %)	2 (0.00 %)	698,797 (4.41 %)	133,933 (8.63 %)	97,367 (4.31 %)
13	Asian vine snake (Xishuangbanna 2023) GCF_028640845.1	47,555 (4.15 %)	n/a	13,005 (1.05 %)	17,560 (1.65 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	0 (0 %)	331 (0.00 %)	748 (100.00 %)	1,484,082 (7.70 %)	1,033,385 (5.12 %)	8,266,544 (48.89 %)	0 (0 %)	1,020,982 (6.70 %)	105,815 (4.08 %)	21,180 (0.68 %)
14	Asiatic toad (SCDJY-AF-19 2020) GCF_014858855.1	42,994 (1.39 %)	n/a	14,061 (0.43 %)	43,525 (1.76 %)	36,577 (1.09 %)	44.37 (98.21 %)	0 (0 %)	3,874 (1.79 %)	748 (100.00 %)	1,577,809 (1.79 %)	2,975,473 (12.67 %)	18,834,930 (58.75 %)	12 (0.00 %)	4,966,158 (8.81 %)	415,605 (4.12 %)	69,684 (0.72 %)
15	Atlantic hagfish (MG_SS 2024) GCF_040869285.1	46,374 (1.72 %)	n/a	7,719 (0.19 %)	59,788 (2.68 %)	n/a	44.23 (99.94 %)	0 (0 %)	4,876 (0.06 %)	4,270 (100.00 %)	2,094,143 (3.54 %)	3,212,025 (29.83 %)	8,998,320 (75.15 %)	43 (0.00 %)	n/a	408,391 (12.65 %)	60,671 (0.82 %)
16	Atlantic hagfish (primary hap 2024) GCA_964187855.1	n/a	n/a	6,662 (0.20 %)	45,484 (2.63 %)	n/a	44.32 (99.97 %)	0 (0 %)	4,412 (0.03 %)	4,004 (100.00 %)	1,698,449 (3.61 %)	2,644,659 (27.70 %)	7,620,145 (74.29 %)	43 (0.00 %)	n/a	331,404 (12.87 %)	49,019 (0.82 %)
17	Atlantic ridley (rLepKem1 hap1 2025) GCA_965140285.1	n/a	26,407 (1.93 %)	14,835 (1.03 %)	17,938 (1.53 %)	n/a	44.16 (100.00 %)	219 (0.00 %)	219 (0.00 %)	273 (100.00 %)	1,346,135 (12.58 %)	326,849 (2.26 %)	10,620,784 (34.46 %)	0 (0 %)	636,273 (2.45 %)	46,936 (1.44 %)	25,019 (0.62 %)
18	Atlantic ridley (rLepKem1 hap2 2025 refseq) GCF_965140265.1	67,187 (3.84 %)	n/a	14,601 (1.02 %)	17,367 (1.50 %)	n/a	44.08 (100.00 %)	245 (0.00 %)	245 (0.00 %)	332 (100.00 %)	1,335,525 (12.58 %)	314,640 (2.13 %)	10,517,469 (34.27 %)	2 (0.00 %)	609,926 (2.40 %)	45,940 (1.37 %)	24,119 (0.60 %)
19	Atlantic stingray (hap1 2023 refseq) GCF_030144855.1	60,922 (2.51 %)	n/a	12,544 (0.38 %)	28,250 (1.22 %)	n/a	43.35 (99.99 %)	0 (0 %)	1,648 (0.01 %)	2,989 (100.00 %)	8,579,099 (49.81 %)	831,222 (15.75 %)	21,718,178 (51.79 %)	9 (0.00 %)	4,445,369 (7.00 %)	105,821 (2.42 %)	35,197 (0.42 %)
20	Atlantic stingray (hap2 2023) GCA_030144785.1	n/a	n/a	11,960 (0.40 %)	25,618 (1.25 %)	n/a	42.94 (99.99 %)	0 (0 %)	1,633 (0.01 %)	1,412 (100.00 %)	7,453,535 (49.31 %)	686,063 (13.00 %)	19,985,605 (50.32 %)	8 (0.00 %)	3,309,683 (5.86 %)	86,138 (2.16 %)	30,350 (0.41 %)
21	Australian saltwater crocodile GCF_001723895.1	34,103 (2.80 %)	n/a	12,481 (1.05 %)	13,920 (1.38 %)	n/a	43.90 (94.72 %)	0 (0 %)	97,039 (5.30 %)	70 (100.00 %)	2,480,154 (36.88 %)	215,190 (0.56 %)	11,196,176 (26.22 %)	1,753 (0.04 %)	50,116 (0.79 %)	26,647 (0.98 %)	20,860 (0.80 %)
22	axolotl (DD151 2021) GCA_002915635.3	n/a	n/a	16,280 (0.07 %)	186,628 (1.11 %)	n/a	46.01 (99.99 %)	0 (0 %)	184,422 (0.01 %)	27,157 (100.00 %)	28,291,633 (68.19 %)	7,299,053 (4.96 %)	134,345,177 (46.63 %)	189 (0.00 %)	n/a	2,388,998 (5.24 %)	429,355 (0.66 %)
23	axolotl (Mex_15411 2024) GCF_040938575.1	96,841 (0.40 %)	n/a	18,564 (0.07 %)	184,527 (1.17 %)	n/a	46.34 (100.00 %)	0 (0 %)	2,095 (0.00 %)	221 (100.00 %)	27,951,551 (67.11 %)	8,561,025 (9.70 %)	126,532,504 (50.15 %)	25 (0.00 %)	1,448,410 (0.36 %)	2,452,305 (5.31 %)	417,603 (0.63 %)
24	basking shark (sCetMax3.hap1.1 2024) GCA_964194155.1	n/a	n/a	13,757 (0.41 %)	22,690 (1.04 %)	n/a	44.49 (99.99 %)	0 (0 %)	2,778 (0.01 %)	5,088 (100.00 %)	6,693,687 (65.70 %)	1,238,350 (12.60 %)	21,698,294 (51.34 %)	20 (0.00 %)	5,335,615 (7.60 %)	113,759 (1.90 %)	28,476 (0.65 %)
25	basking shark (sCetMax3.hap2.1 2024) GCA_964194165.1	n/a	n/a	13,515 (0.42 %)	21,374 (1.06 %)	n/a	44.47 (99.99 %)	2,740 (0.01 %)	2,740 (0.01 %)	6,569 (99.99 %)	6,483,403 (66.87 %)	1,041,828 (9.99 %)	21,142,745 (50.24 %)	31 (0.00 %)	4,014,149 (6.09 %)	107,555 (1.88 %)	26,392 (0.67 %)
26	Bellinger river turtle (v2 BRST_UC0152H_USYD 2025) GCA_040894355.2	n/a	n/a	14,713 (1.14 %)	18,959 (1.77 %)	n/a	43.21 (100.00 %)	1 (0.00 %)	77 (0.00 %)	110 (100.00 %)	1,130,167 (11.21 %)	213,193 (1.80 %)	11,049,207 (26.48 %)	1 (0.00 %)	311,436 (1.26 %)	53,921 (2.09 %)	34,762 (1.11 %)
27	beluga (Lower Danube River Hh-F2 2024) GCA_036884735.1	n/a	37,075 (3.19 %)	24,635 (1.65 %)	38,296 (3.71 %)	n/a	39.96 (99.90 %)	0 (0 %)	3,967 (0.10 %)	1,383 (100.00 %)	1,315,442 (3.30 %)	1,268,850 (7.99 %)	10,595,211 (41.03 %)	4 (0.00 %)	1,845,276 (6.54 %)	65,207 (2.45 %)	19,259 (0.43 %)
28	Blainville's horned lizard (alternate hap 2022) GCA_026167975.1	n/a	n/a	12,696 (0.93 %)	14,818 (1.50 %)	n/a	41.27 (100.00 %)	0 (0 %)	64 (0.00 %)	52 (100.00 %)	1,468,805 (6.73 %)	739,796 (3.28 %)	10,900,584 (40.56 %)	1 (0.00 %)	625,575 (2.40 %)	76,786 (1.60 %)	9,543 (0.21 %)
29	Blainville's horned lizard (primary hap 2022) GCA_026167985.1	n/a	n/a	13,944 (0.92 %)	16,009 (1.45 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	0 (0 %)	73 (0.00 %)	78 (100.00 %)	1,636,825 (6.67 %)	826,053 (3.24 %)	12,398,166 (40.90 %)	0 (0 %)	690,267 (2.36 %)	86,825 (1.61 %)	10,396 (0.20 %)
30	blonde ray (primary hap 2023) GCA_963514005.1	n/a	n/a	11,900 (0.54 %)	27,568 (1.55 %)	n/a	44.98 (99.98 %)	0 (0 %)	2,269 (0.02 %)	1,647 (100.00 %)	8,972,805 (66.20 %)	1,061,811 (8.11 %)	11,599,498 (58.72 %)	6 (0.00 %)	2,430,580 (6.13 %)	278,499 (6.42 %)	59,922 (2.12 %)
31	brown anole (Geneva1000 2022 refseq) GCF_025583915.1	38,099 (3.25 %)	n/a	14,028 (1.05 %)	19,932 (1.81 %)	n/a	41.14 (98.37 %)	114,440 (1.64 %)	114,440 (1.64 %)	118,178 (98.36 %)	1,376,455 (6.78 %)	1,094,843 (5.18 %)	9,127,396 (44.98 %)	261 (0.01 %)	1,132,418 (4.31 %)	46,291 (1.18 %)	17,324 (0.40 %)
32	brown anole (maternal hap 2024 genbank) GCA_037176765.1	n/a	n/a	14,463 (1.05 %)	20,625 (1.90 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	0 (0 %)	191 (0.00 %)	29 (100.00 %)	1,456,556 (7.33 %)	1,162,200 (6.85 %)	9,275,690 (46.71 %)	0 (0 %)	1,512,000 (5.23 %)	44,738 (1.08 %)	17,370 (0.40 %)
33	Brown anole (maternal hap 2024 refseq) GCF_037176765.1	41,782 (3.73 %)	n/a	14,463 (1.05 %)	20,186 (1.84 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	0 (0 %)	191 (0.00 %)	29 (100.00 %)	1,456,556 (7.33 %)	1,162,200 (6.85 %)	9,275,690 (46.71 %)	0 (0 %)	1,512,000 (5.23 %)	44,738 (1.08 %)	17,370 (0.40 %)
34	Brown anole (rAnoSag1 2024) GCA_037176775.1	n/a	n/a	12,479 (1.04 %)	16,886 (1.81 %)	n/a	41.00 (100.00 %)	0 (0 %)	172 (0.00 %)	41 (100.00 %)	1,249,920 (6.94 %)	941,401 (5.42 %)	8,402,482 (44.77 %)	1 (0.00 %)	1,126,727 (4.44 %)	37,299 (1.02 %)	14,196 (0.37 %)
35	brown house snake (FMNH 251328 2023) GCA_027560395.1	n/a	n/a	11,753 (1.00 %)	29,468 (1.83 %)	n/a	40.67 (98.13 %)	169,987 (1.84 %)	169,987 (1.84 %)	753,655 (98.16 %)	1,167,225 (5.67 %)	768,909 (2.88 %)	8,825,109 (34.93 %)	2,464 (0.05 %)	n/a	53,035 (1.80 %)	31,929 (1.11 %)
36	brown spotted pit viper GCF_001527695.2	24,336 (2.63 %)	n/a	14,045 (1.20 %)	27,133 (2.20 %)	n/a	39.97 (92.15 %)	115,571 (7.86 %)	115,571 (7.86 %)	167,851 (92.14 %)	1,227,118 (8.97 %)	819,247 (3.70 %)	8,328,674 (35.16 %)	11,808 (0.68 %)	791,775 (4.53 %)	68,858 (2.06 %)	27,809 (0.90 %)
37	brownbanded bambooshark (Juve2018m 2025) GCF_047496795.1	60,935 (1.72 %)	n/a	12,494 (0.29 %)	21,756 (0.89 %)	n/a	44.10 (99.99 %)	0 (0 %)	2,891 (0.01 %)	1,989 (100.00 %)	1,123,600 (4.34 %)	1,904,298 (18.02 %)	24,059,272 (54.04 %)	4 (0.00 %)	4,685,329 (5.17 %)	56,396 (1.81 %)	13,464 (0.13 %)
38	Burmese python GCF_000186305.1	35,676 (4.16 %)	n/a	13,718 (1.31 %)	20,498 (2.06 %)	n/a	39.61 (96.54 %)	235,132 (3.52 %)	235,132 (3.52 %)	274,244 (96.48 %)	727,874 (3.19 %)	409,033 (2.06 %)	8,318,382 (25.30 %)	21,222 (0.52 %)	167,510 (1.87 %)	29,212 (1.10 %)	21,586 (0.80 %)
39	California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 alternate hap 2022) GCA_022578425.1	n/a	n/a	13,973 (0.70 %)	47,231 (2.71 %)	n/a	41.26 (99.97 %)	5,955 (0.03 %)	5,955 (0.03 %)	60,824 (99.97 %)	1,793,416 (10.43 %)	1,374,078 (8.30 %)	10,043,407 (46.03 %)	154 (0.01 %)	1,546,579 (5.96 %)	89,437 (4.63 %)	31,854 (0.83 %)
40	California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 primary hap 2022) GCA_022577455.1	n/a	n/a	13,386 (1.04 %)	21,767 (2.35 %)	n/a	40.56 (100.00 %)	0 (0 %)	256 (0.00 %)	140 (100.00 %)	1,354,500 (9.93 %)	998,712 (8.21 %)	8,504,468 (46.70 %)	1 (0.00 %)	1,050,266 (4.14 %)	78,768 (3.37 %)	28,516 (0.88 %)
41	Caribbean electric ray (hap1 2024 refseq) GCF_036971445.1	77,919 (2.56 %)	n/a	11,965 (0.44 %)	20,833 (1.25 %)	n/a	43.35 (99.99 %)	0 (0 %)	1,443 (0.01 %)	595 (100.00 %)	4,902,644 (34.96 %)	1,040,891 (17.82 %)	16,403,243 (54.79 %)	2 (0.00 %)	1,425,690 (2.88 %)	113,936 (1.69 %)	22,323 (0.31 %)
42	Caribbean electric ray (hap2 2024) GCA_036971175.1	n/a	n/a	11,692 (0.46 %)	19,961 (1.22 %)	n/a	42.79 (99.99 %)	0 (0 %)	1,507 (0.01 %)	445 (100.00 %)	4,781,152 (36.16 %)	876,063 (14.65 %)	16,060,040 (52.49 %)	7 (0.00 %)	2,994,548 (6.81 %)	101,598 (1.64 %)	21,263 (0.33 %)
43	central bearded dragon (2017) GCF_900067755.1	42,304 (3.53 %)	n/a	13,856 (1.19 %)	17,956 (1.96 %)	n/a	41.81 (96.03 %)	0 (0 %)	90,546 (3.99 %)	13,749 (100.00 %)	821,868 (3.44 %)	570,849 (3.46 %)	9,494,309 (29.78 %)	161 (0.03 %)	346,792 (2.81 %)	48,137 (1.31 %)	23,199 (0.67 %)
44	central bearded dragon (2025) GCF_047335585.1	55,907 (5.04 %)	n/a	13,840 (1.12 %)	18,038 (1.85 %)	n/a	42.21 (100.00 %)	26 (0.00 %)	26 (0.00 %)	42 (100.00 %)	985,251 (3.91 %)	586,669 (2.40 %)	9,004,514 (35.92 %)	0 (0 %)	346,099 (2.04 %)	67,220 (2.06 %)	24,883 (0.78 %)
45	Chinese alligator GCF_000455745.1	49,884 (3.04 %)	n/a	14,431 (1.00 %)	15,854 (1.43 %)	n/a	44.49 (96.86 %)	167,965 (3.17 %)	167,965 (3.17 %)	177,282 (96.83 %)	2,919,372 (38.76 %)	346,310 (1.06 %)	12,332,417 (29.19 %)	95 (0.01 %)	116,160 (0.98 %)	46,638 (1.19 %)	26,168 (0.73 %)
46	Chinese crocodile lizard (Guangxi GXDGS128 2021) GCA_021292165.1	n/a	n/a	15,365 (1.01 %)	20,233 (1.64 %)	n/a	44.88 (100.00 %)	0 (0 %)	852 (0.00 %)	1,553 (100.00 %)	2,058,732 (7.85 %)	845,208 (2.04 %)	11,639,209 (43.21 %)	5 (0.00 %)	745,074 (3.17 %)	116,459 (3.04 %)	33,234 (0.76 %)
47	Chinese soft-shelled turtle GCF_000230535.1	45,454 (3.08 %)	n/a	13,715 (0.96 %)	16,798 (1.50 %)	n/a	44.42 (95.68 %)	185,476 (4.35 %)	185,476 (4.35 %)	205,380 (95.65 %)	1,193,608 (10.92 %)	455,163 (3.06 %)	11,234,886 (32.34 %)	126 (0.01 %)	282,804 (2.81 %)	95,997 (2.06 %)	44,456 (1.00 %)
48	cloudy catshark (Kashiwa2021f 2025) GCF_047496885.1	69,529 (1.56 %)	n/a	13,335 (0.25 %)	28,473 (0.76 %)	n/a	49.26 (99.99 %)	0 (0 %)	4,654 (0.01 %)	2,007 (100.00 %)	1,668,127 (2.89 %)	2,316,011 (21.50 %)	22,209,447 (67.48 %)	20 (0.00 %)	9,556,969 (9.03 %)	706,094 (13.30 %)	37,469 (0.24 %)
49	coelacanth GCF_000225785.1	40,763 (2.63 %)	n/a	13,493 (0.78 %)	17,640 (1.50 %)	n/a	41.15 (76.37 %)	269,010 (23.67 %)	269,010 (23.67 %)	291,829 (76.33 %)	2,026,776 (9.13 %)	571,917 (1.19 %)	14,630,157 (34.87 %)	2,038 (0.03 %)	261,629 (0.61 %)	42,857 (0.54 %)	8,573 (0.11 %)
50	coelacanth (fLatCha1 primary hap 2024) GCF_037176945.1	40,046 (2.75 %)	n/a	13,820 (0.63 %)	17,285 (1.40 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	0 (0 %)	154 (0.00 %)	197 (100.00 %)	2,064,326 (2.75 %)	1,047,267 (3.01 %)	15,613,479 (54.45 %)	1 (0.00 %)	1,146,128 (3.27 %)	140,027 (2.34 %)	11,143 (0.16 %)
51	Columbretes wall lizard (hap1.1 2025) GCA_965112155.1	n/a	n/a	14,276 (1.31 %)	20,158 (2.24 %)	n/a	44.06 (99.99 %)	0 (0 %)	921 (0.01 %)	290 (100.00 %)	871,508 (4.31 %)	539,525 (6.79 %)	7,116,593 (40.00 %)	2 (0.00 %)	754,520 (4.30 %)	97,685 (3.45 %)	20,472 (0.73 %)
52	Columbretes wall lizard (hap2.1 2025) GCA_965178375.1	n/a	n/a	13,776 (1.35 %)	19,389 (2.28 %)	n/a	43.97 (99.99 %)	867 (0.01 %)	867 (0.01 %)	1,011 (99.99 %)	816,540 (4.18 %)	497,364 (6.95 %)	6,729,569 (39.28 %)	3 (0.00 %)	694,995 (4.18 %)	89,601 (3.31 %)	19,420 (0.74 %)
53	common blue-tongued skink (hap1 2024) GCA_035046495.1	n/a	n/a	13,999 (1.21 %)	18,145 (2.02 %)	n/a	44.85 (100.00 %)	0 (0 %)	286 (0.00 %)	827 (100.00 %)	844,126 (6.57 %)	462,086 (2.56 %)	8,237,807 (37.72 %)	0 (0 %)	573,955 (2.91 %)	30,098 (0.96 %)	16,208 (0.52 %)
54	common blue-tongued skink (hap2 2024) GCA_035046505.1	n/a	n/a	13,266 (1.21 %)	16,750 (1.98 %)	n/a	44.73 (100.00 %)	0 (0 %)	372 (0.00 %)	350 (100.00 %)	782,672 (6.46 %)	434,795 (2.20 %)	7,788,697 (37.04 %)	0 (0 %)	506,831 (2.74 %)	28,089 (0.98 %)	14,987 (0.51 %)
55	common frog (alternate hap 2021) GCA_905171725.1	n/a	n/a	13,073 (0.44 %)	43,036 (1.95 %)	n/a	44.07 (100.00 %)	14 (0.00 %)	14 (0.00 %)	12,033 (100.00 %)	1,489,788 (2.18 %)	2,621,157 (9.04 %)	17,154,926 (55.44 %)	0 (0 %)	3,161,179 (6.09 %)	581,115 (7.68 %)	54,845 (0.65 %)
56	common garter snake GCF_001077635.1	26,656 (3.83 %)	n/a	11,623 (1.25 %)	17,501 (2.23 %)	n/a	39.92 (78.84 %)	168,047 (21.21 %)	246,220 (21.21 %)	175,977 (78.79 %)	606,040 (3.22 %)	543,646 (2.36 %)	6,946,141 (27.08 %)	3,234 (0.23 %)	224,609 (2.22 %)	36,264 (1.27 %)	18,972 (0.73 %)
57	common lizard Z.vivipara (primary hap 2023) GCF_963506605.1	45,869 (6.34 %)	n/a	14,279 (1.46 %)	19,710 (2.38 %)	n/a	44.05 (99.99 %)	0 (0 %)	683 (0.01 %)	48 (100.00 %)	4,128,183 (45.62 %)	513,318 (3.73 %)	7,172,928 (37.61 %)	7 (0.00 %)	477,389 (3.08 %)	92,858 (2.90 %)	22,863 (0.95 %)
58	common lizard Z.vivipara (hap1.1 2025) GCA_965207765.1	n/a	n/a	14,100 (1.43 %)	19,472 (2.36 %)	n/a	43.99 (100.00 %)	0 (0 %)	108 (0.00 %)	61 (100.00 %)	884,631 (4.70 %)	507,148 (3.64 %)	7,206,478 (37.26 %)	2 (0.00 %)	449,058 (2.96 %)	89,393 (2.87 %)	21,776 (0.82 %)
59	common lizard Z.vivipara (hap2.1 2025) GCA_965208345.1	n/a	n/a	14,258 (1.44 %)	19,379 (2.37 %)	n/a	43.99 (100.00 %)	102 (0.00 %)	102 (0.00 %)	169 (100.00 %)	884,140 (4.69 %)	506,524 (3.53 %)	7,214,124 (37.18 %)	1 (0.00 %)	445,202 (2.93 %)	89,651 (2.88 %)	21,910 (0.82 %)
60	common newt (primary hap 2024) GCA_964263255.1	n/a	n/a	17,972 (0.09 %)	229,830 (1.61 %)	n/a	45.06 (100.00 %)	0 (0 %)	4,030 (0.00 %)	15,265 (100.00 %)	4,807,454 (1.50 %)	10,258,109 (12.52 %)	101,185,912 (47.58 %)	27 (0.00 %)	3,799,915 (1.53 %)	2,684,793 (7.99 %)	2,631,420 (7.74 %)
61	common spadefoot toad (primary hap 2024 genbank) GCA_036172605.1	n/a	n/a	14,564 (0.56 %)	46,435 (2.21 %)	n/a	42.04 (100.00 %)	1 (0.00 %)	349 (0.00 %)	161 (100.00 %)	1,677,382 (3.51 %)	3,229,435 (13.31 %)	15,027,089 (51.43 %)	12 (0.00 %)	3,799,247 (9.03 %)	282,389 (3.86 %)	79,263 (0.96 %)
62	common spadefoot toad (primary hap 2024 refseq) GCF_036172605.1	42,170 (1.55 %)	n/a	14,560 (0.56 %)	46,435 (2.21 %)	n/a	42.04 (100.00 %)	0 (0 %)	349 (0.00 %)	159 (100.00 %)	1,677,374 (3.51 %)	3,229,434 (13.31 %)	15,027,049 (51.43 %)	12 (0.00 %)	3,799,232 (9.03 %)	282,389 (3.86 %)	79,263 (0.96 %)
63	common toad (alternate hap 2021) GCA_905171715.1	n/a	n/a	12,074 (0.39 %)	46,329 (1.82 %)	n/a	44.48 (99.99 %)	156 (0.01 %)	156 (0.01 %)	24,351 (99.99 %)	1,186,360 (1.65 %)	2,279,941 (13.33 %)	14,665,548 (61.48 %)	2 (0.00 %)	4,594,926 (9.74 %)	405,097 (4.49 %)	61,648 (0.70 %)
64	common toad (primary hap 2021) GCF_905171765.1	45,085 (1.10 %)	n/a	14,240 (0.38 %)	46,470 (1.68 %)	37,594 (0.91 %)	44.49 (99.80 %)	0 (0 %)	4,199 (0.20 %)	1,306 (100.00 %)	1,658,204 (1.79 %)	3,099,513 (13.49 %)	19,236,510 (62.70 %)	18 (0.00 %)	6,217,888 (10.17 %)	539,919 (4.45 %)	78,985 (0.67 %)
65	common wall lizard (hap1 2024) GCA_964188315.1	n/a	n/a	14,322 (1.36 %)	19,700 (2.31 %)	n/a	44.23 (99.99 %)	0 (0 %)	827 (0.01 %)	185 (100.00 %)	868,785 (4.15 %)	544,999 (4.79 %)	7,097,077 (38.69 %)	10 (0.00 %)	713,068 (4.14 %)	120,725 (3.71 %)	20,707 (0.76 %)
66	common wall lizard (hap2 2024) GCA_964188365.1	n/a	n/a	13,838 (1.39 %)	19,262 (2.35 %)	n/a	44.17 (99.99 %)	734 (0.01 %)	734 (0.01 %)	825 (99.99 %)	815,808 (4.07 %)	494,366 (4.53 %)	6,739,651 (37.84 %)	6 (0.00 %)	648,489 (3.96 %)	113,458 (3.63 %)	19,621 (0.77 %)
67	common wall lizard (yellow 2019) GCF_004329235.1	56,519 (4.85 %)	n/a	14,453 (1.36 %)	20,529 (2.31 %)	n/a	44.18 (99.81 %)	0 (0 %)	4,085 (0.19 %)	2,161 (100.00 %)	1,089,164 (8.31 %)	506,669 (2.12 %)	7,474,116 (36.15 %)	2 (0.00 %)	623,437 (4.37 %)	122,507 (3.69 %)	21,388 (0.79 %)
68	corn snake (Columbia U 2023) GCF_029531705.1	53,076 (4.72 %)	n/a	13,697 (1.21 %)	20,819 (2.22 %)	n/a	40.33 (96.60 %)	3,553 (3.40 %)	3,553 (3.40 %)	4,019 (96.60 %)	4,116,616 (49.72 %)	917,455 (3.96 %)	8,460,248 (40.76 %)	143 (0.00 %)	602,278 (2.72 %)	64,946 (2.08 %)	20,725 (0.74 %)
69	corn snake (EG266 2020) GCF_001185365.1	48,995 (3.92 %)	n/a	13,316 (1.14 %)	23,595 (2.17 %)	29,466 (2.61 %)	40.35 (95.32 %)	0 (0 %)	84,947 (4.70 %)	34,268 (100.00 %)	1,243,828 (6.50 %)	884,533 (3.25 %)	8,373,398 (40.31 %)	4,035 (0.07 %)	377,287 (1.66 %)	66,926 (2.14 %)	25,639 (0.86 %)
70	corroboree frog (hap1 2023) GCA_028390055.1	n/a	n/a	14,955 (0.23 %)	n/a	n/a	45.61 (99.80 %)	2,431 (0.20 %)	2,431 (0.20 %)	5,958 (99.80 %)	20,007,151 (76.28 %)	5,951,819 (19.40 %)	24,118,603 (71.52 %)	49 (0.00 %)	n/a	991,009 (4.86 %)	91,447 (0.54 %)
71	corroboree frog (hap2 2023 refseq) GCF_028390025.1	140,657 (1.12 %)	n/a	15,461 (0.24 %)	54,344 (1.07 %)	n/a	45.66 (99.76 %)	0 (0 %)	2,699 (0.24 %)	3,127 (100.00 %)	3,521,281 (2.88 %)	5,902,115 (18.63 %)	24,178,131 (71.23 %)	23 (0.00 %)	n/a	990,274 (4.84 %)	952,582 (4.53 %)
72	Cretan wall lizard (alternate hap 2023) GCA_951804955.1	n/a	n/a	13,192 (1.36 %)	19,293 (2.32 %)	n/a	43.88 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,936 (100.00 %)	808,341 (4.31 %)	467,532 (2.91 %)	6,418,809 (38.02 %)	0 (0 %)	518,786 (3.19 %)	107,080 (3.15 %)	17,213 (0.72 %)
73	Cretan wall lizard (primary hap 2023) GCA_951804945.1	n/a	n/a	14,249 (1.37 %)	19,304 (2.27 %)	n/a	43.87 (100.00 %)	4 (0.00 %)	47 (0.00 %)	55 (100.00 %)	882,564 (4.30 %)	511,174 (3.24 %)	7,094,363 (38.65 %)	2 (0.00 %)	586,225 (3.38 %)	117,222 (3.18 %)	18,707 (0.71 %)
74	crested gecko (US Hobby MAA-2024a 2024) GCA_040207535.1	n/a	n/a	13,876 (1.22 %)	18,274 (2.01 %)	n/a	45.06 (100.00 %)	11 (0.00 %)	11 (0.00 %)	162 (100.00 %)	1,021,810 (6.04 %)	410,843 (1.76 %)	8,147,007 (34.90 %)	0 (0 %)	557,983 (2.92 %)	79,154 (2.34 %)	20,951 (0.68 %)
75	diamondback terrapin (hap1 2023 refseq) GCF_027887155.1	50,318 (3.53 %)	n/a	15,109 (1.08 %)	19,280 (1.62 %)	n/a	44.46 (99.92 %)	0 (0 %)	141 (0.08 %)	76 (100.00 %)	4,088,064 (46.33 %)	403,943 (1.72 %)	11,014,504 (33.74 %)	0 (0 %)	407,696 (1.71 %)	110,838 (2.71 %)	30,093 (0.82 %)
76	diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023) GCA_027887205.1	n/a	n/a	15,081 (1.08 %)	19,115 (1.62 %)	n/a	44.46 (99.98 %)	0 (0 %)	127 (0.02 %)	59 (100.00 %)	4,093,707 (46.36 %)	404,046 (1.70 %)	11,113,266 (33.78 %)	1 (0.01 %)	405,600 (1.68 %)	111,129 (2.68 %)	30,307 (0.82 %)
77	dyeing poison frog (UK_male_01 2024) GCF_039654945.1	65,453 (1.48 %)	n/a	14,300 (0.31 %)	45,268 (1.22 %)	n/a	44.70 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	830 (100.00 %)	1,777,277 (2.39 %)	4,029,040 (19.38 %)	20,561,178 (70.58 %)	0 (0 %)	7,794,071 (9.52 %)	683,383 (5.67 %)	60,543 (0.43 %)
78	eastern brown snake GCF_900518735.1	34,614 (3.30 %)	n/a	13,625 (1.22 %)	21,795 (2.00 %)	n/a	39.84 (97.54 %)	0 (0 %)	59,472 (2.47 %)	28,550 (100.00 %)	1,020,240 (5.86 %)	663,810 (2.41 %)	8,140,554 (39.61 %)	3,387 (0.06 %)	230,860 (1.32 %)	52,895 (2.12 %)	20,320 (0.72 %)
79	eastern musk turtle (primary hap 2023) GCA_032164245.1	n/a	n/a	13,413 (1.19 %)	18,038 (1.85 %)	n/a	44.58 (99.99 %)	553 (0.01 %)	553 (0.01 %)	771 (99.99 %)	1,003,504 (9.02 %)	621,617 (3.54 %)	8,327,948 (30.44 %)	3 (0.00 %)	583,206 (2.41 %)	117,734 (4.05 %)	30,498 (1.01 %)
80	eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023) GCA_027917415.1	n/a	n/a	13,632 (0.43 %)	35,630 (1.52 %)	n/a	46.77 (99.99 %)	0 (0 %)	1,773 (0.01 %)	590 (100.00 %)	1,759,193 (1.98 %)	2,013,186 (16.21 %)	16,138,898 (60.55 %)	17 (0.00 %)	5,811,499 (9.67 %)	614,432 (5.85 %)	72,993 (0.75 %)
81	eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023) GCA_027917425.1	n/a	n/a	13,882 (0.43 %)	35,323 (1.46 %)	n/a	46.78 (99.99 %)	0 (0 %)	1,745 (0.01 %)	1,002 (100.00 %)	1,769,293 (1.99 %)	2,023,109 (16.33 %)	16,148,710 (60.55 %)	22 (0.00 %)	5,852,023 (9.72 %)	618,204 (5.89 %)	74,394 (0.76 %)
82	elephant shark (2021) GCF_018977255.1	32,553 (4.75 %)	n/a	11,542 (1.51 %)	18,900 (3.25 %)	n/a	42.85 (99.99 %)	2,060 (0.01 %)	14,404 (0.01 %)	3,822 (99.99 %)	1,971,730 (36.60 %)	433,955 (3.92 %)	5,654,656 (37.91 %)	11 (0.00 %)	553,756 (3.85 %)	41,081 (3.43 %)	17,151 (0.98 %)
83	epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021) GCA_020745765.1	n/a	n/a	12,650 (0.38 %)	20,614 (1.06 %)	n/a	42.75 (97.99 %)	0 (0 %)	3,552 (2.01 %)	4,000 (100.00 %)	9,489,793 (70.34 %)	976,827 (6.97 %)	21,183,330 (44.32 %)	1 (0.00 %)	3,092,395 (4.62 %)	42,917 (1.08 %)	13,522 (0.16 %)
84	epaulette shark (primary hap 2021 refseq) GCF_020745735.1	43,156 (1.65 %)	n/a	12,749 (0.40 %)	19,519 (1.06 %)	n/a	42.76 (98.05 %)	0 (0 %)	3,716 (1.95 %)	1,962 (100.00 %)	9,420,365 (63.82 %)	935,037 (6.51 %)	20,660,566 (43.88 %)	0 (0 %)	2,903,280 (4.44 %)	41,682 (1.08 %)	16,895 (0.30 %)
85	European common frog (2021) GCF_905171775.1	51,633 (1.57 %)	n/a	13,864 (0.46 %)	39,978 (1.88 %)	57,578 (1.85 %)	44.15 (99.36 %)	0 (0 %)	1,860 (0.64 %)	554 (100.00 %)	1,804,642 (3.42 %)	2,925,830 (9.39 %)	18,921,726 (55.43 %)	8 (0.00 %)	3,384,162 (6.05 %)	641,799 (7.66 %)	62,649 (0.67 %)
86	European eel (alternate hap 2020) GCA_013347865.1	n/a	n/a	17,177 (2.21 %)	36,037 (5.58 %)	n/a	43.55 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,338 (100.00 %)	811,567 (5.37 %)	759,871 (7.97 %)	5,672,321 (27.30 %)	0 (0 %)	731,152 (4.88 %)	127,837 (8.05 %)	92,776 (4.12 %)
87	European eel (primary hap 2020 refseq) GCF_013347855.1	64,143 (9.57 %)	n/a	17,054 (2.22 %)	34,278 (5.56 %)	79,684 (7.37 %)	43.64 (99.61 %)	0 (0 %)	640 (0.40 %)	54 (100.00 %)	831,037 (5.48 %)	786,521 (8.15 %)	5,700,890 (27.40 %)	2 (0.00 %)	774,914 (5.14 %)	130,346 (8.19 %)	94,446 (4.12 %)
88	European leaf-toed gecko (hap1 2023) GCF_029931775.1	24,643 (2.02 %)	n/a	14,238 (1.16 %)	21,782 (2.17 %)	n/a	44.68 (99.77 %)	0 (0 %)	153 (0.23 %)	591 (100.00 %)	1,174,615 (6.99 %)	436,937 (2.95 %)	8,308,817 (39.80 %)	0 (0 %)	824,335 (3.45 %)	83,089 (2.82 %)	33,674 (0.93 %)
89	European leaf-toed gecko (hap2 2023) GCA_029931755.1	n/a	n/a	14,220 (1.16 %)	21,979 (2.19 %)	n/a	44.64 (99.68 %)	0 (0 %)	177 (0.32 %)	381 (100.00 %)	1,169,660 (6.57 %)	432,998 (2.45 %)	8,403,791 (39.55 %)	1 (0.00 %)	711,098 (3.13 %)	82,695 (2.80 %)	33,414 (0.92 %)
90	European pond turtle (hap1 2023 genbank) GCA_028017835.1	n/a	n/a	14,802 (0.99 %)	19,772 (1.60 %)	n/a	44.74 (99.86 %)	0 (0 %)	148 (0.14 %)	106 (100.00 %)	1,526,737 (12.44 %)	460,562 (2.12 %)	11,130,580 (35.42 %)	5 (0.00 %)	495,884 (2.08 %)	136,002 (2.92 %)	30,671 (0.72 %)
91	European pond turtle (hap1 2023 refseq) GCF_028017835.1	27,890 (1.81 %)	n/a	14,802 (0.99 %)	19,772 (1.60 %)	n/a	44.74 (99.86 %)	0 (0 %)	148 (0.14 %)	106 (100.00 %)	1,526,737 (12.44 %)	460,562 (2.12 %)	11,130,580 (35.42 %)	5 (0.00 %)	495,938 (2.08 %)	136,002 (2.92 %)	30,671 (0.72 %)
92	European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023) GCA_028017845.1	n/a	n/a	14,971 (1.00 %)	20,099 (1.61 %)	n/a	44.79 (99.77 %)	0 (0 %)	130 (0.23 %)	156 (100.00 %)	1,536,611 (12.44 %)	471,903 (2.16 %)	11,129,943 (35.50 %)	1 (0.00 %)	522,759 (2.15 %)	138,047 (2.94 %)	31,391 (0.73 %)
93	European river lamprey (primary hap 2024) GCA_964198595.1	n/a	n/a	7,757 (0.73 %)	36,797 (4.29 %)	n/a	49.25 (99.97 %)	0 (0 %)	1,795 (0.03 %)	1,497 (100.00 %)	657,405 (7.80 %)	1,165,422 (20.23 %)	4,931,883 (50.78 %)	4 (0.00 %)	2,442,653 (12.79 %)	149,123 (44.61 %)	116,679 (5.22 %)
94	Far Eastern brook lamprey (LAM-NWPU_2019-01 2020) GCF_015708825.1	37,946 (7.32 %)	n/a	7,797 (0.72 %)	39,285 (4.37 %)	n/a	48.80 (98.99 %)	0 (0 %)	3,287 (1.01 %)	1,946 (100.00 %)	716,804 (6.02 %)	1,192,268 (15.54 %)	5,304,945 (47.85 %)	5 (0.00 %)	1,949,540 (10.82 %)	170,623 (43.14 %)	128,479 (5.62 %)
95	fence lizard GCF_019175285.1	48,391 (3.65 %)	n/a	14,000 (1.07 %)	17,384 (1.71 %)	n/a	41.25 (97.53 %)	0 (0 %)	48,138 (2.47 %)	45,012 (100.00 %)	1,357,856 (6.95 %)	596,824 (1.92 %)	11,090,372 (34.38 %)	926 (0.05 %)	356,377 (1.59 %)	67,007 (1.51 %)	13,181 (0.35 %)
96	Filfola wall lizard (rPodFil1.hap1.1 2024) GCA_964270895.1	n/a	n/a	14,292 (1.37 %)	20,325 (2.33 %)	n/a	43.79 (99.99 %)	4 (0.00 %)	872 (0.01 %)	353 (100.00 %)	840,209 (4.04 %)	484,479 (4.00 %)	7,010,158 (37.94 %)	7 (0.00 %)	632,285 (3.51 %)	87,924 (2.61 %)	19,744 (0.76 %)
97	Filfola wall lizard (rPodFil1.hap2.1 2024) GCA_964270875.1	n/a	n/a	13,804 (1.42 %)	19,450 (2.39 %)	n/a	43.73 (99.99 %)	795 (0.01 %)	795 (0.01 %)	937 (99.99 %)	782,998 (3.95 %)	448,089 (3.61 %)	6,735,032 (36.83 %)	3 (0.00 %)	546,833 (3.23 %)	81,312 (2.54 %)	18,612 (0.77 %)
98	fire-bellied toad (alternate hap 2023) GCA_027579415.1	n/a	n/a	2,936 (0.15 %)	17,722 (1.38 %)	n/a	38.51 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	13,751 (100.00 %)	919,882 (3.50 %)	1,443,294 (10.50 %)	7,705,012 (57.28 %)	0 (0 %)	2,148,861 (9.45 %)	74,669 (1.25 %)	7,295 (0.13 %)
99	fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq) GCF_027579735.1	38,236 (0.68 %)	n/a	15,452 (0.21 %)	47,500 (0.88 %)	n/a	38.98 (98.02 %)	0 (0 %)	7,009 (1.99 %)	2,467 (100.00 %)	4,258,941 (3.44 %)	7,150,261 (12.27 %)	34,823,806 (63.74 %)	3 (0.00 %)	n/a	n/a	n/a
100	flatback sea turtle (hap1 2025) GCA_965152275.1	n/a	26,709 (2.00 %)	15,046 (1.09 %)	18,089 (1.57 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	2 (0.00 %)	171 (0.00 %)	43 (100.00 %)	4,516,775 (43.62 %)	319,645 (1.38 %)	10,785,223 (32.95 %)	3 (0.00 %)	442,908 (1.94 %)	52,168 (1.81 %)	27,004 (0.88 %)
101	flatback sea turtle (hap2 2025) GCA_965152195.1	n/a	25,064 (1.90 %)	14,229 (1.06 %)	16,514 (1.49 %)	n/a	43.97 (100.00 %)	261 (0.00 %)	261 (0.00 %)	322 (100.00 %)	4,567,737 (43.65 %)	288,964 (1.17 %)	10,681,579 (32.83 %)	2 (0.00 %)	394,529 (1.77 %)	47,249 (1.62 %)	22,587 (0.73 %)
102	Fleay's barred frog (hap1 2024) GCA_038048845.1	n/a	n/a	14,321 (0.67 %)	22,672 (1.51 %)	n/a	40.32 (99.87 %)	0 (0 %)	1,421 (0.13 %)	2,806 (100.00 %)	1,320,578 (5.87 %)	1,506,550 (13.49 %)	13,293,397 (46.37 %)	2 (0.00 %)	3,318,438 (8.11 %)	63,677 (0.85 %)	12,950 (0.19 %)
103	Fleay's barred frog (hap2 2024) GCA_038048865.1	n/a	n/a	14,224 (0.69 %)	22,406 (1.57 %)	n/a	40.75 (99.89 %)	0 (0 %)	1,383 (0.12 %)	914 (100.00 %)	1,300,452 (3.37 %)	1,495,355 (10.56 %)	13,385,401 (44.67 %)	1 (0.00 %)	2,540,687 (7.06 %)	64,121 (0.88 %)	13,021 (0.20 %)
104	Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023) GCA_030035715.1	n/a	n/a	14,392 (0.90 %)	17,909 (1.50 %)	n/a	42.86 (99.84 %)	213 (0.16 %)	213 (0.16 %)	836 (99.84 %)	1,440,070 (7.19 %)	620,131 (2.54 %)	10,919,950 (45.21 %)	2 (0.00 %)	523,070 (2.35 %)	47,933 (1.03 %)	18,609 (0.43 %)
105	Florida worm lizard (hap2 2023 genbank) GCA_030035675.1	n/a	n/a	14,331 (0.90 %)	17,854 (1.51 %)	n/a	42.86 (99.72 %)	1 (0.00 %)	242 (0.28 %)	78 (100.00 %)	1,426,833 (7.17 %)	616,690 (2.63 %)	10,819,054 (45.31 %)	1 (0.00 %)	531,662 (2.36 %)	47,454 (1.03 %)	18,400 (0.42 %)
106	Florida worm lizard (hap2 2023 refseq) GCF_030035675.1	65,314 (3.47 %)	n/a	14,331 (0.90 %)	17,853 (1.51 %)	n/a	42.86 (99.72 %)	0 (0 %)	242 (0.28 %)	76 (100.00 %)	1,426,827 (7.17 %)	616,687 (2.63 %)	10,819,019 (45.31 %)	1 (0.00 %)	531,660 (2.36 %)	47,453 (1.03 %)	18,399 (0.42 %)
107	frog A.baeobatrachus (hap1 2025) GCA_048569485.1	n/a	n/a	13,963 (0.31 %)	43,460 (1.20 %)	n/a	46.27 (99.99 %)	0 (0 %)	3,772 (0.01 %)	3,642 (100.00 %)	2,033,935 (2.50 %)	4,040,311 (20.45 %)	20,439,907 (69.96 %)	60 (0.00 %)	7,481,063 (9.87 %)	1,159,163 (12.74 %)	63,455 (0.51 %)
108	frog A.baeobatrachus (hap2 2025) GCA_048569465.1	n/a	n/a	13,992 (0.31 %)	43,409 (1.27 %)	n/a	46.36 (99.99 %)	0 (0 %)	3,799 (0.01 %)	2,426 (100.00 %)	1,997,963 (2.50 %)	4,002,458 (19.16 %)	20,517,633 (69.30 %)	47 (0.00 %)	8,117,501 (10.97 %)	1,152,817 (12.93 %)	63,273 (0.52 %)
109	Gaboon caecilian (alternate hap 2019) GCA_902459495.1	n/a	n/a	12,821 (0.47 %)	30,612 (1.44 %)	n/a	43.23 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	9,651 (100.00 %)	1,139,595 (1.64 %)	1,170,215 (3.77 %)	17,091,511 (52.44 %)	0 (0 %)	995,544 (2.57 %)	235,170 (4.50 %)	33,394 (0.50 %)
110	Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank) GCA_902459505.2	n/a	n/a	14,269 (0.51 %)	29,026 (1.40 %)	n/a	43.24 (99.85 %)	0 (0 %)	433 (0.15 %)	164 (100.00 %)	1,331,879 (1.68 %)	1,364,597 (3.83 %)	19,589,806 (52.85 %)	3 (0.00 %)	1,182,995 (2.68 %)	270,923 (4.52 %)	38,622 (0.50 %)
111	gharial (Ggan-Ray 2016) GCF_001723915.1	32,297 (2.61 %)	n/a	12,194 (1.03 %)	12,758 (1.30 %)	n/a	43.95 (73.60 %)	0 (0 %)	248,526 (26.44 %)	81 (100.00 %)	2,589,103 (36.89 %)	243,334 (0.51 %)	11,279,606 (20.80 %)	29,443 (5.09 %)	125,202 (1.53 %)	26,651 (0.60 %)	20,614 (0.47 %)
112	gharial (hap1 2023) GCA_030020385.1	n/a	n/a	14,254 (0.94 %)	23,016 (2.00 %)	n/a	45.13 (99.95 %)	0 (0 %)	61 (0.05 %)	298 (100.00 %)	1,230,357 (13.08 %)	350,230 (2.85 %)	11,854,314 (33.03 %)	2 (0.00 %)	335,615 (1.39 %)	39,919 (1.95 %)	26,198 (0.77 %)
113	gharial (hap2 2023) GCA_030020295.1	n/a	n/a	14,151 (0.94 %)	23,338 (1.95 %)	n/a	45.15 (99.95 %)	0 (0 %)	118 (0.05 %)	160 (100.00 %)	1,232,693 (12.81 %)	332,737 (2.19 %)	11,907,298 (32.91 %)	3 (0.00 %)	284,469 (1.22 %)	40,660 (1.87 %)	25,990 (0.77 %)
114	giant manta (hap1 2023 refseq) GCF_030028105.1	53,223 (2.04 %)	n/a	12,432 (0.38 %)	25,243 (1.14 %)	n/a	43.26 (99.23 %)	0 (0 %)	1,810 (0.77 %)	4,715 (100.00 %)	863,834 (1.59 %)	947,015 (13.41 %)	20,234,736 (54.42 %)	17 (0.00 %)	4,636,741 (7.12 %)	110,678 (1.74 %)	30,504 (0.36 %)
115	giant manta (hap2 2023) GCA_030035685.1	n/a	n/a	12,198 (0.42 %)	23,127 (1.17 %)	n/a	42.85 (98.49 %)	0 (0 %)	1,742 (1.51 %)	1,558 (100.00 %)	7,431,472 (52.41 %)	716,951 (7.28 %)	19,456,793 (50.99 %)	9 (0.01 %)	2,419,836 (4.27 %)	91,414 (1.45 %)	65,413 (0.90 %)
116	giant South American river turtle (hap1 2024) GCA_045364785.1	n/a	n/a	14,628 (0.85 %)	18,382 (1.34 %)	n/a	44.78 (100.00 %)	0 (0 %)	260 (0.00 %)	2,039 (100.00 %)	1,254,940 (9.13 %)	434,666 (6.73 %)	12,070,445 (35.52 %)	1 (0.00 %)	1,002,897 (2.92 %)	51,563 (1.91 %)	16,484 (0.36 %)
117	giant South American river turtle (hap2 2024) GCA_045364815.1	n/a	n/a	14,571 (0.87 %)	18,363 (1.38 %)	n/a	44.25 (100.00 %)	0 (0 %)	224 (0.00 %)	725 (100.00 %)	1,243,321 (10.35 %)	434,716 (4.30 %)	12,200,714 (33.86 %)	2 (0.00 %)	769,881 (2.27 %)	51,411 (1.88 %)	16,569 (0.37 %)
118	golden mantella (hap1 2025) GCA_048565345.1	n/a	n/a	13,675 (0.56 %)	30,568 (1.85 %)	n/a	41.00 (99.98 %)	0 (0 %)	4,138 (0.02 %)	3,088 (100.00 %)	1,225,842 (2.74 %)	2,478,484 (16.71 %)	14,761,187 (53.21 %)	51 (0.00 %)	5,379,974 (9.98 %)	164,021 (2.52 %)	33,788 (0.51 %)
119	golden mantella (hap2 2025) GCA_048565335.1	n/a	n/a	13,400 (0.55 %)	28,454 (1.70 %)	n/a	40.91 (99.98 %)	0 (0 %)	3,921 (0.02 %)	2,611 (100.00 %)	1,203,975 (3.36 %)	2,447,119 (16.68 %)	14,661,554 (53.34 %)	45 (0.00 %)	5,276,975 (9.84 %)	160,856 (2.46 %)	32,812 (0.49 %)
120	Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019) GCF_007399415.2	57,455 (3.18 %)	n/a	14,852 (1.00 %)	18,125 (1.49 %)	31,841 (1.80 %)	44.14 (98.71 %)	0 (0 %)	562 (1.29 %)	383 (100.00 %)	1,630,271 (13.86 %)	387,796 (2.00 %)	11,572,827 (33.36 %)	0 (0 %)	474,978 (1.73 %)	71,687 (2.29 %)	21,793 (0.54 %)
121	Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019) GCA_007399395.1	n/a	n/a	13,359 (0.95 %)	19,347 (1.51 %)	n/a	44.27 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8,736 (100.00 %)	1,404,513 (13.79 %)	334,726 (2.35 %)	9,735,007 (33.33 %)	0 (0 %)	468,758 (1.89 %)	61,680 (2.32 %)	18,869 (0.54 %)
122	gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 refseq) GCF_029215685.1	28,358 (2.73 %)	n/a	12,291 (1.06 %)	19,125 (2.02 %)	n/a	40.55 (100.00 %)	584 (0.00 %)	584 (0.00 %)	1,233 (100.00 %)	1,259,792 (7.92 %)	925,571 (7.56 %)	7,739,127 (45.92 %)	3 (0.00 %)	840,459 (4.04 %)	73,681 (2.81 %)	26,366 (0.92 %)
123	gopher snake (HBS135680 primary hap 2023) GCA_029215655.1	n/a	n/a	13,289 (1.09 %)	20,513 (2.09 %)	n/a	40.35 (100.00 %)	603 (0.00 %)	603 (0.00 %)	1,029 (100.00 %)	1,325,747 (8.26 %)	973,338 (7.56 %)	8,352,703 (45.38 %)	4 (0.00 %)	888,155 (3.86 %)	72,941 (2.59 %)	27,387 (0.91 %)
124	graceful crag lizard (Gifberg primary hap 2022) GCF_027244095.1	86,664 (4.30 %)	n/a	14,269 (0.91 %)	18,195 (1.57 %)	n/a	44.82 (100.00 %)	0 (0 %)	42 (0.00 %)	44 (100.00 %)	1,644,976 (6.04 %)	823,058 (3.00 %)	11,991,046 (41.43 %)	0 (0 %)	489,782 (1.69 %)	80,718 (1.90 %)	27,916 (0.61 %)
125	Grand Cayman blue iguana (hap1 2023) GCA_030412105.1	n/a	n/a	14,094 (1.03 %)	17,875 (1.65 %)	n/a	41.62 (99.95 %)	0 (0 %)	28 (0.05 %)	30 (100.00 %)	1,100,228 (6.21 %)	423,695 (1.33 %)	11,521,828 (32.55 %)	2 (0.00 %)	258,014 (1.05 %)	62,978 (2.00 %)	24,755 (0.81 %)
126	Grand Cayman blue iguana (hap2 2023) GCA_030412085.1	n/a	n/a	13,758 (1.02 %)	16,909 (1.62 %)	n/a	41.53 (99.01 %)	19 (0.99 %)	19 (0.99 %)	52 (99.01 %)	1,069,189 (6.12 %)	410,262 (1.25 %)	11,390,195 (32.28 %)	0 (0 %)	233,593 (0.96 %)	60,835 (1.92 %)	23,191 (0.77 %)
127	gray bichir GCF_016835505.1	48,165 (1.88 %)	n/a	12,963 (0.44 %)	24,479 (1.21 %)	n/a	39.32 (99.96 %)	0 (0 %)	3,166 (0.04 %)	9,856 (100.00 %)	1,765,862 (2.54 %)	1,017,723 (2.38 %)	20,924,763 (47.66 %)	2 (0.00 %)	997,434 (2.53 %)	98,862 (1.64 %)	24,750 (0.32 %)
128	great white shark (alternate hap 2021) GCA_017639455.1	n/a	n/a	20 (0.30 %)	63 (2.06 %)	n/a	45.02 (99.98 %)	0 (0 %)	28 (0.02 %)	39 (100.00 %)	8,165 (60.43 %)	2,740 (27.09 %)	15,863 (31.63 %)	0 (0 %)	16,359 (15.02 %)	167 (5.51 %)	65 (0.61 %)
129	great white shark (primary hap 2021) GCF_017639515.1	49,865 (1.46 %)	n/a	13,010 (0.37 %)	19,263 (0.92 %)	46,152 (1.30 %)	45.21 (99.55 %)	0 (0 %)	2,645 (0.45 %)	719 (100.00 %)	1,046,023 (4.00 %)	1,584,100 (21.25 %)	23,278,563 (52.42 %)	11 (0.00 %)	8,687,289 (11.05 %)	77,021 (1.94 %)	14,712 (0.15 %)
130	green anole (JA03-04 2024) GCF_035594765.1	56,324 (5.85 %)	n/a	14,020 (1.12 %)	20,096 (1.86 %)	n/a	40.60 (98.38 %)	0 (0 %)	841 (1.62 %)	211 (100.00 %)	4,859,635 (53.14 %)	909,429 (5.19 %)	8,304,332 (44.07 %)	5 (0.00 %)	1,056,606 (4.88 %)	56,404 (1.78 %)	20,393 (0.51 %)
131	green anole (v1 2011) GCF_000090745.1	38,109 (3.63 %)	n/a	13,021 (1.08 %)	20,780 (1.86 %)	38,266 (3.08 %)	40.32 (94.57 %)	35,530 (5.44 %)	35,533 (5.44 %)	41,987 (94.56 %)	2,415,433 (28.92 %)	702,538 (2.99 %)	8,199,653 (39.69 %)	25 (0.00 %)	674,365 (3.47 %)	42,151 (1.18 %)	15,374 (0.36 %)
132	green anole (v2 2010) GCF_000090745.2	38,096 (3.63 %)	n/a	13,140 (1.11 %)	20,772 (1.86 %)	38,229 (3.08 %)	40.32 (94.57 %)	35,530 (5.44 %)	35,530 (5.44 %)	41,986 (94.56 %)	4,455,733 (51.37 %)	702,537 (2.99 %)	8,199,580 (39.69 %)	25 (0.00 %)	674,353 (3.47 %)	42,151 (1.18 %)	15,935 (0.39 %)
133	green sea turtle (v2 alternate hap 2021) GCA_015220195.2	n/a	n/a	13,635 (1.05 %)	19,414 (1.61 %)	n/a	44.16 (99.95 %)	60 (0.05 %)	60 (0.05 %)	6,797 (99.95 %)	3,221,668 (44.97 %)	275,275 (1.28 %)	9,802,895 (32.14 %)	2 (0.00 %)	394,278 (1.72 %)	45,469 (1.48 %)	25,997 (0.89 %)
134	green sea turtle (v2 primary hap 2021) GCF_015237465.2	84,353 (4.63 %)	n/a	14,725 (1.06 %)	17,444 (1.56 %)	n/a	44.01 (99.44 %)	0 (0 %)	298 (0.56 %)	93 (100.00 %)	1,701,640 (14.83 %)	304,306 (1.25 %)	11,135,147 (31.96 %)	0 (0 %)	429,994 (1.68 %)	49,025 (1.44 %)	26,933 (0.68 %)
135	hawksbill sea turtle (B2_1 2023) GCA_030012505.1	n/a	n/a	14,897 (1.00 %)	18,251 (1.51 %)	n/a	44.13 (100.00 %)	0 (0 %)	95 (0.00 %)	208 (100.00 %)	1,315,164 (12.07 %)	347,678 (3.60 %)	10,892,216 (35.32 %)	2 (0.00 %)	683,881 (2.59 %)	49,532 (1.65 %)	26,297 (0.62 %)
136	hawksbill sea turtle (hap1 2025) GCA_965152235.1	n/a	25,702 (1.84 %)	14,710 (1.02 %)	17,589 (1.52 %)	n/a	44.04 (99.88 %)	6 (0.00 %)	131 (0.12 %)	63 (100.00 %)	1,289,035 (12.18 %)	310,918 (1.75 %)	10,994,433 (33.64 %)	0 (0 %)	544,623 (2.10 %)	46,532 (1.40 %)	25,322 (0.62 %)
137	hawksbill sea turtle (hap2 2025) GCA_965152285.1	n/a	25,779 (1.85 %)	14,843 (1.02 %)	18,006 (1.54 %)	n/a	44.04 (99.88 %)	132 (0.12 %)	132 (0.12 %)	173 (99.88 %)	1,288,292 (12.14 %)	318,803 (2.15 %)	11,148,397 (34.07 %)	1 (0.00 %)	573,455 (2.17 %)	46,922 (1.41 %)	25,789 (0.63 %)
138	High Himalaya frog GCF_000935625.1	26,122 (1.87 %)	n/a	13,695 (0.94 %)	28,085 (2.39 %)	n/a	42.55 (96.32 %)	122,325 (3.70 %)	122,325 (3.70 %)	147,513 (96.30 %)	536,058 (1.39 %)	794,563 (5.48 %)	11,465,450 (37.44 %)	1,716 (0.17 %)	725,825 (4.49 %)	219,772 (3.92 %)	32,652 (0.67 %)
139	horn shark (hap1 2024) GCA_036365525.1	n/a	n/a	15,006 (0.28 %)	22,481 (0.80 %)	n/a	45.05 (99.53 %)	225 (0.03 %)	2,781 (0.47 %)	2,532 (99.97 %)	1,344,546 (5.76 %)	2,364,825 (28.34 %)	5,088 (99.53 %)	5 (0.00 %)	14,350,128 (14.12 %)	89,340 (2.10 %)	82,092 (1.20 %)
140	horn shark (hap2 2024) GCA_036365495.1	n/a	n/a	12,766 (0.30 %)	21,591 (0.87 %)	n/a	44.88 (99.43 %)	0 (0 %)	2,790 (0.57 %)	1,496 (100.00 %)	1,008,880 (5.19 %)	1,596,129 (22.32 %)	22,180,341 (62.98 %)	2 (0.00 %)	9,762,254 (11.27 %)	82,276 (1.85 %)	14,696 (0.13 %)
141	horn shark (sHetFra1hap1 2024) GCF_036365525.1	60,844 (1.44 %)	n/a	15,004 (0.28 %)	22,510 (0.76 %)	n/a	45.05 (99.53 %)	0 (0 %)	2,781 (0.47 %)	2,306 (100.00 %)	1,344,541 (5.76 %)	2,364,824 (28.34 %)	20,630,058 (68.85 %)	5 (0.00 %)	14,350,134 (14.12 %)	89,340 (2.10 %)	82,092 (1.20 %)
142	hourglass treefrog (maternal 2023 genbank) GCA_027789725.1	n/a	n/a	14,359 (0.89 %)	32,575 (2.67 %)	n/a	43.88 (95.18 %)	788 (4.82 %)	788 (4.82 %)	3,358 (95.18 %)	922,807 (2.38 %)	1,744,603 (15.45 %)	10,318,168 (48.47 %)	0 (0 %)	3,525,571 (8.67 %)	244,270 (5.02 %)	29,547 (0.61 %)
143	hourglass treefrog (paternal 2023 refseq) GCF_027789765.1	50,542 (2.91 %)	n/a	14,058 (0.89 %)	30,599 (2.64 %)	n/a	43.97 (99.70 %)	0 (0 %)	804 (0.30 %)	2,200 (100.00 %)	906,816 (2.43 %)	1,710,859 (17.48 %)	10,069,798 (51.41 %)	3 (0.00 %)	1,978,464 (5.31 %)	235,277 (5.56 %)	28,414 (0.63 %)
144	Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024) GCA_036172795.1	n/a	n/a	14,141 (0.97 %)	22,232 (2.16 %)	n/a	39.73 (100.00 %)	0 (0 %)	262 (0.00 %)	99 (100.00 %)	944,742 (4.86 %)	1,927,659 (22.26 %)	8,988,510 (49.29 %)	1 (0.00 %)	3,465,509 (10.62 %)	77,721 (1.73 %)	13,802 (0.30 %)
145	Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022 genbank) GCA_026652325.1	n/a	139,896 (0.54 %)	15,136 (0.10 %)	n/a	n/a	45.95 (100.00 %)	29 (0.00 %)	922 (0.00 %)	296 (100.00 %)	4,478,794 (1.33 %)	6,452,537 (8.86 %)	81,311,590 (56.46 %)	26 (0.00 %)	n/a	1,581,360 (4.00 %)	144,588 (0.32 %)
146	Iberian ribbed newt (hap1 20211129_DDA 2024 refseq) GCF_031143425.1	57,032 (0.47 %)	n/a	15,184 (0.10 %)	72,314 (0.62 %)	n/a	45.93 (100.00 %)	0 (0 %)	1,829 (0.00 %)	616 (100.00 %)	4,343,624 (1.32 %)	6,295,886 (8.29 %)	2,445 (100.00 %)	38 (0.00 %)	736,440 (0.34 %)	1,546,882 (4.02 %)	1,545,477 (3.92 %)
147	Indian cobra (NN01 2019) GCA_009733165.1	n/a	25,817 (1.78 %)	13,028 (1.10 %)	17,854 (1.73 %)	n/a	40.46 (93.80 %)	0 (0 %)	11,910 (6.20 %)	1,897 (100.00 %)	1,114,498 (5.61 %)	671,854 (2.20 %)	8,205,261 (40.40 %)	3 (0.02 %)	n/a	47,381 (1.37 %)	19,640 (0.65 %)
148	Indian roofed turtle (hap1 2024) GCA_045781095.1	n/a	n/a	14,623 (1.04 %)	18,405 (1.58 %)	n/a	44.24 (100.00 %)	0 (0 %)	205 (0.00 %)	629 (100.00 %)	1,283,544 (11.43 %)	298,912 (1.85 %)	10,728,482 (32.52 %)	1 (0.00 %)	413,036 (2.00 %)	72,908 (2.13 %)	26,854 (0.71 %)
149	Indian roofed turtle (hap2 2024) GCA_045781085.1	n/a	n/a	14,682 (1.03 %)	18,600 (1.58 %)	n/a	44.26 (100.00 %)	0 (0 %)	260 (0.00 %)	449 (100.00 %)	1,290,818 (11.46 %)	301,464 (1.79 %)	10,704,595 (32.71 %)	0 (0 %)	436,958 (2.04 %)	74,354 (2.05 %)	27,125 (0.71 %)
150	Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020) GCA_013368575.1	n/a	n/a	17,858 (2.43 %)	32,738 (5.46 %)	n/a	43.05 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	4,333 (100.00 %)	583,632 (3.71 %)	418,411 (3.74 %)	5,198,155 (21.50 %)	1 (0.00 %)	276,314 (1.94 %)	76,879 (3.71 %)	57,281 (2.37 %)
151	Italian wall lizard (rPodSic1.hap1.1 2024) GCA_964188175.1	n/a	n/a	14,241 (1.31 %)	20,399 (2.26 %)	n/a	44.32 (99.99 %)	2 (0.00 %)	762 (0.01 %)	296 (100.00 %)	832,389 (5.27 %)	530,449 (8.28 %)	6,937,083 (40.38 %)	2 (0.00 %)	908,580 (4.73 %)	106,667 (3.79 %)	20,531 (0.75 %)
152	Italian wall lizard (rPodSic1.hap2.1 2024) GCA_964188395.1	n/a	n/a	13,696 (1.37 %)	19,278 (2.32 %)	n/a	44.15 (99.99 %)	690 (0.01 %)	690 (0.01 %)	842 (99.99 %)	763,893 (4.21 %)	451,861 (6.69 %)	6,696,380 (38.71 %)	4 (0.00 %)	740,272 (4.24 %)	98,815 (3.65 %)	19,565 (0.77 %)
153	Japanese sawshark (hap1 2024 refseq) GCF_044704955.1	54,879 (1.24 %)	n/a	12,978 (0.27 %)	30,195 (0.79 %)	n/a	47.02 (99.98 %)	0 (0 %)	5,985 (0.02 %)	4,318 (100.00 %)	11,412,024 (71.47 %)	2,399,500 (18.16 %)	20,051,385 (71.80 %)	38 (0.00 %)	11,403,077 (11.92 %)	503,637 (6.56 %)	48,183 (0.32 %)
154	Japanese sawshark (hap2 2024) GCA_044704965.1	n/a	n/a	14,833 (0.26 %)	30,853 (0.75 %)	n/a	47.12 (99.98 %)	0 (0 %)	5,953 (0.02 %)	5,626 (100.00 %)	1,238,549 (4.06 %)	2,718,867 (21.85 %)	20,608,860 (73.38 %)	42 (0.00 %)	7,882,680 (7.20 %)	518,286 (6.88 %)	502,936 (6.32 %)
155	Komodo dragon (SLA01 2019) GCF_004798865.1	43,331 (4.33 %)	n/a	13,543 (1.31 %)	18,081 (2.11 %)	n/a	44.04 (99.03 %)	0 (0 %)	19,737 (0.97 %)	1,411 (100.00 %)	753,603 (4.91 %)	263,965 (1.41 %)	8,061,012 (24.65 %)	582 (0.01 %)	130,387 (0.66 %)	49,808 (4.28 %)	39,034 (2.67 %)
156	Lataste's viper (alternate hap 2022) GCA_024294605.1	n/a	n/a	13,155 (1.15 %)	22,239 (2.06 %)	n/a	41.01 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	6,800 (100.00 %)	1,155,093 (7.75 %)	707,777 (4.25 %)	7,071,611 (44.00 %)	0 (0 %)	701,636 (4.02 %)	104,556 (4.39 %)	22,349 (0.88 %)
157	Lataste's viper (primary hap 2022) GCA_024294585.1	n/a	n/a	13,350 (1.17 %)	18,904 (1.93 %)	n/a	40.96 (99.78 %)	0 (0 %)	769 (0.22 %)	56 (100.00 %)	1,209,793 (7.69 %)	762,735 (5.06 %)	7,424,674 (44.80 %)	4 (0.00 %)	794,949 (4.07 %)	110,631 (4.07 %)	23,739 (0.88 %)
158	leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020) GCA_009762595.2	n/a	n/a	11,035 (1.05 %)	16,064 (1.50 %)	n/a	43.52 (100.00 %)	7 (0.00 %)	7 (0.00 %)	9,006 (100.00 %)	2,685,200 (47.08 %)	208,060 (1.19 %)	7,184,246 (33.31 %)	0 (0 %)	442,748 (2.46 %)	25,133 (1.42 %)	15,054 (0.75 %)
159	leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq) GCF_009764565.3	73,318 (3.97 %)	n/a	14,610 (1.03 %)	16,358 (1.45 %)	n/a	43.35 (99.74 %)	0 (0 %)	668 (0.26 %)	40 (100.00 %)	1,694,449 (14.90 %)	304,773 (1.14 %)	11,121,962 (34.21 %)	3 (0.00 %)	670,729 (2.51 %)	35,485 (1.36 %)	19,615 (0.51 %)
160	leopard gecko (TG4126 2023) GCF_028583425.1	37,133 (2.89 %)	n/a	14,358 (0.93 %)	23,080 (1.92 %)	n/a	44.06 (100.00 %)	0 (0 %)	62 (0.00 %)	76 (100.00 %)	969,188 (4.21 %)	557,245 (2.88 %)	11,096,222 (37.91 %)	0 (0 %)	608,752 (2.77 %)	82,956 (2.56 %)	27,406 (0.84 %)
161	lesser devil ray (2024) GCF_963921235.1	49,601 (2.40 %)	n/a	12,335 (0.44 %)	22,690 (1.20 %)	n/a	42.91 (100.00 %)	0 (0 %)	697 (0.00 %)	200 (100.00 %)	7,453,775 (54.11 %)	677,453 (5.15 %)	18,943,414 (51.98 %)	4 (0.00 %)	1,957,188 (3.59 %)	87,750 (1.43 %)	61,592 (0.87 %)
162	Lilford's wall lizard (2023) GCA_947686815.1	n/a	469,920 (50.83 %)	14,239 (1.41 %)	19,740 (2.33 %)	n/a	43.80 (99.98 %)	0 (0 %)	2,346 (0.02 %)	2,149 (100.00 %)	830,790 (4.33 %)	445,450 (2.12 %)	7,171,057 (36.69 %)	79 (0.00 %)	484,294 (2.64 %)	86,200 (2.56 %)	19,378 (0.77 %)
163	little skate (New England 2023) GCF_028641065.1	40,021 (3.35 %)	n/a	11,836 (0.67 %)	25,770 (1.80 %)	n/a	44.13 (100.00 %)	0 (0 %)	862 (0.00 %)	1,769 (100.00 %)	8,221,960 (66.45 %)	1,044,111 (3.71 %)	10,050,264 (53.79 %)	1 (0.00 %)	1,424,247 (4.33 %)	205,567 (4.36 %)	21,218 (0.48 %)
164	lizards B.pumilum (Western Cape Province JTBG20231 2024) GCA_035047305.1	n/a	n/a	13,670 (0.79 %)	19,028 (1.31 %)	n/a	45.00 (100.00 %)	18 (0.00 %)	18 (0.00 %)	39 (100.00 %)	1,040,467 (4.86 %)	924,221 (6.37 %)	9,015,048 (56.81 %)	1 (0.00 %)	1,768,582 (6.35 %)	248,142 (10.84 %)	19,296 (0.34 %)
165	lizards D.cf. smithi (hap1 2024) GCA_046126795.1	n/a	n/a	14,308 (0.91 %)	19,761 (1.58 %)	n/a	45.95 (100.00 %)	2 (0.00 %)	274 (0.00 %)	329 (100.00 %)	1,376,454 (8.31 %)	744,560 (3.94 %)	11,383,198 (44.04 %)	5 (0.00 %)	843,674 (3.07 %)	208,005 (7.18 %)	27,218 (0.55 %)
166	lizards D.cf. smithi (hap2 2024) GCA_046126825.1	n/a	n/a	12,359 (0.99 %)	16,644 (1.66 %)	n/a	45.69 (100.00 %)	6 (0.00 %)	197 (0.00 %)	726 (100.00 %)	1,109,222 (8.21 %)	607,835 (4.09 %)	9,080,052 (42.56 %)	8 (0.00 %)	670,217 (2.85 %)	158,727 (6.84 %)	21,844 (0.57 %)
167	lizards F.pardalis (Fpa_1 2023) GCA_030440675.1	n/a	n/a	13,625 (1.22 %)	18,049 (1.96 %)	n/a	41.96 (100.00 %)	12 (0.00 %)	12 (0.00 %)	23 (100.00 %)	833,693 (2.81 %)	607,040 (2.82 %)	7,939,139 (42.05 %)	0 (0 %)	421,243 (2.11 %)	52,987 (2.59 %)	18,249 (0.61 %)
168	lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap1.1 2024) GCA_964188305.1	n/a	n/a	14,091 (1.26 %)	20,552 (2.20 %)	n/a	44.36 (99.99 %)	2 (0.00 %)	1,005 (0.01 %)	509 (100.00 %)	932,842 (5.02 %)	555,337 (4.34 %)	6,595,536 (41.39 %)	10 (0.00 %)	772,110 (4.54 %)	119,467 (4.32 %)	20,701 (0.72 %)
169	lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap2.1 2024) GCA_964188325.1	n/a	n/a	13,653 (1.34 %)	19,764 (2.32 %)	n/a	44.23 (99.99 %)	817 (0.01 %)	817 (0.01 %)	1,444 (99.99 %)	857,503 (4.68 %)	507,819 (4.16 %)	6,632,822 (39.41 %)	4 (0.00 %)	653,978 (4.13 %)	103,858 (4.10 %)	19,626 (0.75 %)
170	lizards P.erhardii (rPodErh1.hap1.1 2024) GCA_964252035.1	n/a	n/a	13,858 (1.33 %)	19,727 (2.31 %)	n/a	43.80 (99.99 %)	0 (0 %)	836 (0.01 %)	326 (100.00 %)	885,596 (4.43 %)	527,127 (3.30 %)	7,008,185 (38.56 %)	2 (0.00 %)	527,173 (3.21 %)	89,737 (2.87 %)	18,878 (0.71 %)
171	lizards P.erhardii (rPodErh1.hap2.1 2024) GCA_964251985.1	n/a	n/a	13,817 (1.35 %)	21,024 (2.50 %)	n/a	43.77 (99.99 %)	811 (0.01 %)	811 (0.01 %)	1,458 (99.99 %)	890,080 (4.42 %)	526,749 (3.38 %)	7,001,691 (37.94 %)	9 (0.00 %)	538,033 (3.26 %)	89,526 (2.96 %)	20,250 (0.75 %)
172	lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap1.1 2024) GCA_964234715.1	n/a	n/a	14,289 (1.31 %)	20,112 (2.23 %)	n/a	44.03 (99.99 %)	1 (0.00 %)	823 (0.01 %)	387 (100.00 %)	830,352 (7.87 %)	552,452 (8.32 %)	6,838,068 (40.20 %)	2 (0.00 %)	932,658 (4.44 %)	90,074 (2.82 %)	20,501 (0.74 %)
173	lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap2.1 2024) GCA_964234825.1	n/a	n/a	13,759 (1.39 %)	19,452 (2.34 %)	n/a	43.90 (99.99 %)	754 (0.01 %)	754 (0.01 %)	954 (99.99 %)	768,595 (5.31 %)	448,816 (5.54 %)	6,722,284 (37.88 %)	3 (0.00 %)	638,565 (3.67 %)	82,575 (2.83 %)	19,444 (0.76 %)
174	lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap1.2 2024) GCA_964106645.2	n/a	n/a	14,314 (1.36 %)	20,522 (2.35 %)	n/a	43.98 (99.98 %)	1 (0.00 %)	1,506 (0.02 %)	337 (100.00 %)	858,648 (4.22 %)	473,134 (2.71 %)	7,061,380 (38.21 %)	40 (0.00 %)	544,982 (3.43 %)	96,600 (3.21 %)	19,808 (0.82 %)
175	lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap2.2 2024) GCA_964106635.2	n/a	n/a	13,828 (1.41 %)	19,048 (2.34 %)	n/a	43.89 (99.98 %)	1,365 (0.02 %)	1,365 (0.02 %)	1,548 (99.98 %)	803,451 (4.16 %)	440,340 (2.30 %)	6,774,254 (37.14 %)	34 (0.00 %)	471,503 (3.14 %)	89,229 (3.04 %)	18,652 (0.77 %)
176	lizards B.pumilum (Western Cape Province hap1 2025) GCA_047715975.1	n/a	n/a	13,605 (0.80 %)	18,928 (1.32 %)	n/a	44.97 (100.00 %)	0 (0 %)	109 (0.00 %)	73 (100.00 %)	1,038,607 (4.70 %)	891,233 (5.94 %)	9,004,935 (56.47 %)	1 (0.00 %)	1,639,727 (6.17 %)	245,845 (10.83 %)	19,287 (0.34 %)
177	lizards B.pumilum (Western Cape Province hap2 2025) GCA_047715955.1	n/a	n/a	13,631 (0.79 %)	18,935 (1.32 %)	n/a	44.98 (100.00 %)	0 (0 %)	120 (0.00 %)	82 (100.00 %)	1,037,146 (4.72 %)	933,676 (6.26 %)	9,009,528 (56.65 %)	1 (0.00 %)	1,759,246 (6.36 %)	246,553 (10.79 %)	19,416 (0.34 %)
178	lizards P.vaucheri (hap1.1 2025) GCA_965113315.1	n/a	n/a	14,329 (1.28 %)	20,152 (2.19 %)	n/a	44.23 (99.99 %)	0 (0 %)	949 (0.01 %)	285 (100.00 %)	893,567 (5.89 %)	524,077 (6.62 %)	7,052,308 (41.37 %)	8 (0.00 %)	922,684 (4.86 %)	109,507 (3.61 %)	21,052 (0.73 %)
179	lizards P.vaucheri (hap2.1 2025) GCA_965113305.1	n/a	n/a	13,794 (1.32 %)	19,189 (2.22 %)	n/a	44.16 (99.99 %)	0 (0 %)	852 (0.01 %)	151 (100.00 %)	841,282 (5.59 %)	483,392 (6.01 %)	6,750,191 (40.39 %)	6 (0.00 %)	792,951 (4.56 %)	101,153 (3.51 %)	19,899 (0.74 %)
180	lizards T.scincoides (rTilSci1hap2 2024) GCF_035046505.1	33,280 (3.42 %)	n/a	13,266 (1.21 %)	16,752 (1.98 %)	n/a	44.73 (100.00 %)	0 (0 %)	372 (0.00 %)	350 (100.00 %)	782,672 (6.46 %)	434,795 (2.20 %)	7,788,697 (37.04 %)	0 (0 %)	506,831 (2.74 %)	28,089 (0.98 %)	14,987 (0.51 %)
181	loggerhead turtle (SJ_126:Eziel1 2022) GCF_023653815.1	61,644 (3.99 %)	n/a	14,678 (1.05 %)	17,405 (1.52 %)	42,180 (2.89 %)	44.04 (99.90 %)	0 (0 %)	745 (0.10 %)	2,008 (100.00 %)	1,279,721 (12.58 %)	319,729 (1.29 %)	10,705,612 (33.91 %)	4 (0.00 %)	545,387 (2.26 %)	49,015 (1.39 %)	25,064 (0.63 %)
182	loggerhead turtle (hap1 2025) GCA_965140235.1	n/a	24,360 (1.83 %)	14,764 (1.02 %)	17,699 (1.53 %)	n/a	44.12 (99.97 %)	61 (0.03 %)	61 (0.03 %)	97 (99.97 %)	1,308,886 (12.45 %)	334,985 (1.41 %)	10,765,956 (34.66 %)	1 (0.00 %)	593,928 (2.38 %)	54,290 (1.49 %)	25,037 (0.61 %)
183	loggerhead turtle (hap2 2025) GCA_965140275.1	n/a	26,024 (1.93 %)	14,889 (1.04 %)	17,867 (1.54 %)	n/a	44.11 (99.97 %)	52 (0.03 %)	52 (0.03 %)	85 (99.97 %)	1,300,553 (12.44 %)	332,623 (1.45 %)	10,721,628 (34.40 %)	1 (0.00 %)	604,146 (2.41 %)	53,746 (1.50 %)	25,360 (0.62 %)
184	mainland tiger snake GCF_900518725.1	34,251 (3.18 %)	n/a	13,445 (1.15 %)	23,410 (1.90 %)	n/a	39.72 (95.17 %)	0 (0 %)	79,478 (4.84 %)	52,414 (100.00 %)	1,081,503 (6.00 %)	711,408 (2.47 %)	8,047,065 (40.24 %)	3,772 (0.08 %)	265,750 (1.48 %)	61,669 (2.47 %)	18,916 (0.65 %)
185	many-banded krait (BM01 2022) GCA_023653725.1	n/a	n/a	13,269 (1.19 %)	18,533 (1.94 %)	n/a	39.87 (99.25 %)	0 (0 %)	1,631 (0.75 %)	448 (100.00 %)	1,104,569 (6.42 %)	703,174 (3.07 %)	8,451,422 (40.97 %)	0 (0 %)	395,083 (2.25 %)	65,260 (2.74 %)	19,850 (0.80 %)
186	marbled whiptail (SIMRID8450 2020) GCA_014337955.1	n/a	n/a	13,646 (1.27 %)	18,378 (2.09 %)	n/a	42.67 (94.37 %)	0 (0 %)	166,840 (5.67 %)	3,826 (100.00 %)	809,278 (4.31 %)	439,020 (1.66 %)	8,665,254 (33.02 %)	23,254 (0.24 %)	223,741 (0.91 %)	41,638 (1.70 %)	20,448 (0.83 %)
187	meadow viper (alternate hap 2022) GCA_947247025.1	n/a	n/a	10,549 (1.13 %)	20,171 (2.08 %)	n/a	41.02 (100.00 %)	12 (0.00 %)	12 (0.00 %)	9,587 (100.00 %)	889,533 (7.84 %)	565,831 (6.37 %)	5,968,624 (41.74 %)	0 (0 %)	615,578 (4.07 %)	73,632 (3.80 %)	21,339 (1.17 %)
188	meadow viper (primary hap 2022) GCA_947247035.1	n/a	n/a	13,282 (1.16 %)	18,653 (1.90 %)	n/a	40.93 (99.98 %)	0 (0 %)	1,819 (0.02 %)	384 (100.00 %)	1,187,501 (7.72 %)	762,639 (6.28 %)	7,428,147 (45.35 %)	13 (0.00 %)	770,603 (3.87 %)	101,007 (3.95 %)	24,179 (0.84 %)
189	Mexican burrowing toad (hap1 2024) GCA_037306005.1	n/a	n/a	14,442 (0.44 %)	24,630 (1.28 %)	n/a	41.94 (99.99 %)	0 (0 %)	2,032 (0.01 %)	464 (100.00 %)	1,928,361 (2.22 %)	2,955,095 (11.97 %)	25,178,773 (53.55 %)	7 (0.00 %)	5,022,575 (7.68 %)	165,699 (1.23 %)	16,842 (0.16 %)
190	Mexican burrowing toad (hap2 2024) GCA_037306015.1	n/a	n/a	13,824 (0.44 %)	23,296 (1.27 %)	n/a	41.86 (99.99 %)	0 (0 %)	2,009 (0.01 %)	656 (100.00 %)	1,860,053 (2.17 %)	2,751,941 (10.76 %)	24,252,866 (53.00 %)	11 (0.00 %)	4,329,852 (7.13 %)	157,012 (1.21 %)	15,742 (0.15 %)
191	Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022) GCF_025201925.1	62,007 (3.15 %)	n/a	14,883 (0.96 %)	18,524 (1.48 %)	n/a	44.69 (96.36 %)	0 (0 %)	1,866 (3.64 %)	621 (100.00 %)	1,372,189 (11.32 %)	472,501 (3.42 %)	11,362,604 (34.69 %)	1 (0.00 %)	910,675 (2.73 %)	73,700 (2.04 %)	22,443 (0.52 %)
192	Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022) GCA_025201965.1	n/a	n/a	15,425 (0.94 %)	20,005 (1.48 %)	n/a	44.46 (95.51 %)	1,790 (4.49 %)	1,790 (4.49 %)	4,782 (95.51 %)	1,404,726 (11.28 %)	453,302 (2.47 %)	11,996,092 (34.08 %)	3 (0.00 %)	712,154 (2.19 %)	77,167 (2.14 %)	23,282 (0.51 %)
193	mimic poison frog (primary hap 2023 genbank) GCA_032444005.1	n/a	n/a	14,957 (0.34 %)	n/a	n/a	44.95 (100.00 %)	13 (0.00 %)	765 (0.00 %)	1,686 (100.00 %)	1,716,760 (1.89 %)	4,088,695 (23.45 %)	2,437 (100.00 %)	14 (0.00 %)	10,590,500 (14.66 %)	n/a	n/a
194	mimic poison frog (primary hap 2023 refseq) GCF_032444005.1	53,268 (1.27 %)	n/a	14,955 (0.34 %)	42,108 (1.16 %)	n/a	44.95 (100.00 %)	0 (0 %)	765 (0.00 %)	1,672 (100.00 %)	1,716,755 (1.89 %)	4,088,682 (23.45 %)	16,441,719 (72.26 %)	14 (0.00 %)	4,114,618 (5.60 %)	694,865 (6.34 %)	674,154 (5.93 %)
195	Mississippi paddlefish GCF_017654505.1	66,213 (6.17 %)	n/a	21,806 (1.85 %)	31,525 (3.80 %)	n/a	39.02 (99.89 %)	2,957 (0.11 %)	2,963 (0.11 %)	7,192 (99.89 %)	1,126,936 (3.66 %)	877,525 (6.33 %)	9,039,918 (36.85 %)	1 (0.00 %)	775,360 (3.40 %)	29,954 (1.06 %)	14,005 (0.40 %)
196	Murray river turtle (Brisbane River MOO-44397 2024) GCF_026122565.2	48,414 (3.72 %)	n/a	14,988 (1.18 %)	20,316 (1.85 %)	n/a	43.01 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,735 (100.00 %)	1,108,636 (10.97 %)	229,329 (1.01 %)	11,088,528 (25.43 %)	0 (0 %)	192,826 (0.74 %)	49,188 (1.67 %)	36,282 (1.24 %)
197	Northern rubber boa (HBS 135849 alternate hap 2022) GCA_023362785.1	n/a	n/a	12,816 (1.09 %)	18,099 (1.83 %)	n/a	41.86 (100.00 %)	0 (0 %)	84 (0.00 %)	224 (100.00 %)	1,081,107 (4.01 %)	728,703 (4.64 %)	6,961,724 (42.46 %)	1 (0.00 %)	702,049 (3.73 %)	128,617 (3.90 %)	25,981 (1.05 %)
198	Northern rubber boa (HBS 135849 primary hap 2022) GCA_023362775.1	n/a	n/a	13,531 (1.08 %)	18,971 (1.81 %)	n/a	41.83 (100.00 %)	0 (0 %)	85 (0.00 %)	289 (100.00 %)	1,138,891 (3.99 %)	798,941 (5.00 %)	7,476,142 (42.85 %)	1 (0.00 %)	757,393 (3.80 %)	135,874 (3.88 %)	27,035 (1.02 %)
199	Northwestern pond turtle (WTP2003 alternate hap 2022) GCA_022086895.1	n/a	n/a	14,212 (1.00 %)	20,203 (1.65 %)	n/a	44.72 (99.99 %)	0 (0 %)	1,800 (0.01 %)	2,508 (100.00 %)	4,246,095 (48.91 %)	442,393 (1.88 %)	10,453,096 (35.71 %)	43 (0.00 %)	450,873 (2.62 %)	134,572 (3.12 %)	28,350 (0.78 %)
200	Northwestern pond turtle (WTP2003 primary hap 2022) GCA_022086475.1	n/a	n/a	14,862 (1.02 %)	19,830 (1.62 %)	n/a	44.76 (100.00 %)	0 (0 %)	148 (0.00 %)	48 (100.00 %)	4,413,681 (48.88 %)	459,701 (1.92 %)	11,014,102 (35.89 %)	1 (0.00 %)	468,618 (2.09 %)	141,800 (3.08 %)	30,071 (0.78 %)
201	olive python (hap1 2023) GCA_030867105.1	n/a	n/a	13,448 (1.31 %)	17,745 (2.07 %)	n/a	40.20 (99.98 %)	73 (0.02 %)	73 (0.02 %)	116 (99.98 %)	741,052 (2.98 %)	411,477 (3.31 %)	7,668,994 (30.14 %)	0 (0 %)	318,343 (2.06 %)	34,560 (2.18 %)	21,974 (1.10 %)
202	olive python (hap2 2023) GCA_030867085.1	n/a	n/a	13,421 (1.31 %)	17,659 (2.08 %)	n/a	40.15 (99.66 %)	93 (0.34 %)	93 (0.34 %)	158 (99.66 %)	733,358 (2.95 %)	403,552 (3.04 %)	7,746,871 (29.97 %)	0 (0 %)	294,855 (1.92 %)	34,363 (2.08 %)	21,752 (1.10 %)
203	Pacific lamprey (Columbia River large-bodied, stream-maturing ecotype CRITFC18_GStd-0006 2020) GCA_014621495.2	n/a	n/a	6,827 (0.82 %)	38,010 (4.29 %)	n/a	48.07 (86.05 %)	0 (0 %)	63,604 (13.95 %)	141,124 (100.00 %)	2,948,140 (52.71 %)	971,264 (7.81 %)	4,836,103 (36.27 %)	7,699 (0.31 %)	n/a	186,153 (29.43 %)	141,969 (7.00 %)
204	Pacific ridley (hap1 2025) GCA_965140295.1	n/a	21,497 (1.67 %)	14,698 (1.03 %)	17,429 (1.50 %)	n/a	44.13 (99.98 %)	0 (0 %)	69 (0.02 %)	44 (100.00 %)	1,340,389 (12.41 %)	313,433 (2.43 %)	10,832,333 (34.73 %)	1 (0.00 %)	642,980 (2.58 %)	47,256 (1.42 %)	24,677 (0.61 %)
205	Pacific ridley (hap2 2025) GCA_965140255.1	n/a	24,067 (1.82 %)	14,883 (1.03 %)	17,736 (1.52 %)	n/a	44.14 (99.96 %)	76 (0.04 %)	76 (0.04 %)	115 (99.96 %)	1,337,786 (12.39 %)	317,205 (2.38 %)	10,851,496 (34.73 %)	1 (0.00 %)	652,074 (2.60 %)	47,955 (1.47 %)	25,100 (0.62 %)
206	painted frog (alternate hap 2022) GCA_027410455.1	n/a	n/a	7,223 (0.52 %)	11,927 (1.11 %)	n/a	38.96 (100.00 %)	76 (0.00 %)	76 (0.00 %)	4,081 (100.00 %)	988,792 (3.99 %)	1,766,202 (10.24 %)	9,974,001 (52.99 %)	0 (0 %)	1,733,898 (6.80 %)	64,462 (1.33 %)	4,213 (0.08 %)
207	painted frog (primary hap 2022) GCA_027410445.1	n/a	n/a	14,522 (0.54 %)	21,861 (1.14 %)	n/a	39.52 (98.39 %)	0 (0 %)	3,681 (1.61 %)	1,318 (100.00 %)	1,928,844 (4.34 %)	3,684,477 (13.44 %)	19,091,818 (55.21 %)	1 (0.00 %)	4,715,600 (8.73 %)	127,760 (1.34 %)	9,458 (0.10 %)
208	palmate newt (primary hap 2024) GCA_964261635.1	n/a	n/a	17,611 (0.09 %)	227,382 (1.73 %)	n/a	45.09 (100.00 %)	0 (0 %)	5,245 (0.00 %)	448 (100.00 %)	4,668,195 (1.49 %)	9,253,372 (10.94 %)	95,073,160 (47.58 %)	48 (0.00 %)	1,460,718 (0.63 %)	2,493,727 (7.98 %)	2,437,739 (7.71 %)
209	Papuan ground boa (hap1 2024) GCA_035125265.1	n/a	n/a	13,365 (1.26 %)	17,388 (1.98 %)	n/a	41.07 (100.00 %)	99 (0.00 %)	99 (0.00 %)	279 (100.00 %)	726,428 (2.81 %)	331,756 (2.05 %)	7,184,711 (33.57 %)	2 (0.00 %)	316,815 (2.51 %)	51,973 (2.70 %)	19,565 (0.92 %)
210	Papuan ground boa (hap2 2024 genbank) GCA_035149785.1	n/a	n/a	13,390 (1.26 %)	17,496 (1.99 %)	n/a	41.07 (100.00 %)	0 (0 %)	101 (0.00 %)	150 (100.00 %)	728,574 (2.82 %)	348,605 (2.13 %)	7,199,124 (33.55 %)	1 (0.00 %)	318,788 (2.43 %)	51,807 (2.69 %)	19,758 (0.92 %)
211	Papuan ground boa (hap2 2024 refseq) GCF_035149785.1	31,826 (3.55 %)	n/a	13,389 (1.26 %)	17,495 (1.99 %)	n/a	41.07 (100.00 %)	0 (0 %)	101 (0.00 %)	149 (100.00 %)	728,567 (2.82 %)	348,603 (2.13 %)	7,199,026 (33.55 %)	1 (0.00 %)	318,786 (2.43 %)	51,807 (2.69 %)	19,758 (0.92 %)
212	Peter's clawed frog (aXenPet1 2024) GCA_038501915.1	n/a	n/a	21,977 (1.55 %)	31,925 (2.52 %)	n/a	39.40 (99.99 %)	0 (0 %)	1,072 (0.01 %)	1,183 (100.00 %)	825,817 (1.86 %)	1,047,172 (7.89 %)	12,996,911 (44.48 %)	3 (0.00 %)	1,701,385 (5.28 %)	99,118 (1.26 %)	15,547 (0.21 %)
213	Peter's clawed frog (aXenPet1 2024) GCA_038501925.1	n/a	n/a	23,766 (1.52 %)	34,093 (2.42 %)	n/a	39.52 (100.00 %)	9 (0.00 %)	500 (0.00 %)	897 (100.00 %)	919,152 (1.89 %)	1,157,711 (8.01 %)	14,217,996 (45.44 %)	0 (0 %)	1,995,399 (5.51 %)	108,139 (1.26 %)	16,761 (0.21 %)
214	pitted-shelled turtle (YL-2023 2023) GCA_033958435.1	n/a	n/a	14,675 (1.05 %)	16,697 (1.47 %)	n/a	45.55 (100.00 %)	0 (0 %)	12 (0.00 %)	134 (100.00 %)	3,772,260 (47.94 %)	322,081 (1.52 %)	11,123,166 (34.14 %)	0 (0 %)	448,027 (1.56 %)	129,645 (3.29 %)	28,529 (1.18 %)
215	plains spadefoot toad (alternate hap 2022) GCA_027382365.2	n/a	n/a	10,906 (1.98 %)	19,820 (4.33 %)	n/a	40.04 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,516 (100.00 %)	390,896 (3.25 %)	482,493 (7.83 %)	4,361,670 (34.36 %)	0 (0 %)	491,019 (5.12 %)	52,508 (3.70 %)	21,519 (1.51 %)
216	plains spadefoot toad (primary hap 2022) GCF_027358695.1	41,009 (4.67 %)	n/a	13,912 (2.00 %)	25,745 (4.50 %)	n/a	40.45 (99.61 %)	0 (0 %)	102 (0.39 %)	17 (100.00 %)	497,976 (3.84 %)	645,915 (10.08 %)	5,232,342 (36.26 %)	1 (0.00 %)	748,493 (5.83 %)	72,598 (4.35 %)	32,385 (1.89 %)
217	pool frog (hap1 2025) GCA_965119305.1	n/a	n/a	14,446 (0.34 %)	39,585 (1.24 %)	n/a	43.75 (99.99 %)	33 (0.00 %)	3,044 (0.01 %)	1,361 (100.00 %)	2,734,844 (2.59 %)	3,759,979 (13.10 %)	24,289,849 (60.22 %)	22 (0.00 %)	6,436,651 (8.33 %)	558,423 (4.11 %)	48,365 (0.35 %)
218	pool frog (hap2 2025) GCA_965119315.1	n/a	n/a	14,335 (0.34 %)	39,545 (1.24 %)	n/a	43.73 (99.99 %)	2,703 (0.01 %)	2,703 (0.01 %)	3,680 (99.99 %)	2,706,037 (2.56 %)	3,712,706 (12.97 %)	23,911,913 (60.10 %)	18 (0.00 %)	6,326,504 (8.24 %)	553,381 (4.05 %)	47,813 (0.35 %)
219	prickly gecko (False Entrance Well CCM8104 2023) GCF_032191835.1	35,381 (2.07 %)	n/a	14,394 (0.79 %)	23,371 (1.60 %)	n/a	44.78 (99.99 %)	0 (0 %)	1,608 (0.01 %)	661 (100.00 %)	1,995,033 (8.75 %)	823,022 (6.51 %)	12,116,860 (46.84 %)	9 (0.00 %)	1,818,752 (4.81 %)	117,191 (3.14 %)	39,240 (0.76 %)
220	Puerto Rican coqui (hap1 2024 refseq) GCF_035609145.1	44,598 (2.13 %)	n/a	13,879 (0.57 %)	31,890 (1.61 %)	n/a	44.91 (100.00 %)	0 (0 %)	659 (0.00 %)	956 (100.00 %)	1,044,176 (1.98 %)	1,442,184 (16.51 %)	14,710,122 (54.00 %)	6 (0.00 %)	4,070,191 (8.73 %)	501,931 (8.81 %)	49,483 (0.82 %)
221	Puerto Rican coqui (hap2 2024) GCA_035609135.1	n/a	n/a	13,892 (0.57 %)	32,011 (1.64 %)	n/a	44.93 (100.00 %)	16 (0.00 %)	685 (0.00 %)	843 (100.00 %)	1,042,636 (2.00 %)	1,430,690 (16.22 %)	14,621,029 (53.91 %)	19 (0.00 %)	4,063,379 (8.75 %)	503,166 (8.84 %)	49,100 (0.82 %)
222	red stingray (2025) GCF_048418815.1	55,797 (2.16 %)	n/a	12,249 (0.37 %)	26,981 (1.23 %)	n/a	43.17 (94.93 %)	0 (0 %)	2,066 (5.07 %)	261 (100.00 %)	832,690 (1.45 %)	801,096 (12.24 %)	21,031,370 (49.66 %)	4 (0.00 %)	1,705,095 (2.86 %)	108,035 (1.85 %)	34,244 (0.37 %)
223	red-eared slider turtle GCF_013100865.1	47,272 (3.27 %)	n/a	13,909 (1.05 %)	16,674 (1.54 %)	n/a	43.81 (96.14 %)	0 (0 %)	25,390 (3.86 %)	138 (100.00 %)	1,686,633 (15.06 %)	271,837 (0.81 %)	10,802,900 (30.74 %)	1,247 (0.04 %)	155,059 (0.69 %)	93,811 (1.90 %)	24,960 (0.62 %)
224	reedfish (v3 alternate hap 2021) GCA_900700845.3	n/a	n/a	11,382 (0.41 %)	28,399 (1.33 %)	n/a	39.39 (99.99 %)	17 (0.01 %)	17 (0.01 %)	17,099 (99.99 %)	6,708,926 (37.23 %)	883,916 (2.81 %)	16,745,782 (46.94 %)	0 (0 %)	963,655 (2.45 %)	74,951 (1.15 %)	20,227 (0.32 %)
225	Reeves's turtle GCF_016161935.1	86,238 (3.40 %)	n/a	15,165 (0.98 %)	21,405 (1.66 %)	n/a	44.98 (100.00 %)	0 (0 %)	398 (0.00 %)	230 (100.00 %)	1,854,279 (14.68 %)	448,403 (2.11 %)	11,329,581 (34.64 %)	0 (0 %)	644,654 (2.20 %)	119,002 (2.82 %)	35,167 (0.87 %)
226	Riggenbach's reed frog (aHypRig1 alternate hap 2024) GCA_040937895.1	n/a	n/a	26,401 (0.36 %)	90,909 (1.63 %)	n/a	44.93 (100.00 %)	19 (0.00 %)	19 (0.00 %)	14,096 (100.00 %)	4,036,529 (2.70 %)	6,299,339 (18.78 %)	14,096 (100.00 %)	1 (0.00 %)	13,301,439 (10.32 %)	1,426,030 (6.65 %)	1,371,517 (5.63 %)
227	Riggenbach's reed frog (aHypRig1 primary hap 2024) GCF_040937935.1	62,635 (1.63 %)	n/a	14,072 (0.39 %)	44,953 (1.74 %)	n/a	44.98 (99.99 %)	0 (0 %)	3,039 (0.01 %)	477 (100.00 %)	2,058,700 (2.53 %)	3,206,511 (15.84 %)	20,407,989 (60.26 %)	40 (0.00 %)	n/a	741,520 (6.10 %)	65,051 (0.49 %)
228	Ringneck snake (HBS135679 primary hap 2022) GCA_023053685.1	n/a	n/a	13,357 (1.06 %)	20,426 (1.94 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	0 (0 %)	723 (0.00 %)	444 (100.00 %)	1,451,537 (9.36 %)	1,095,484 (10.35 %)	7,870,309 (48.66 %)	4 (0.00 %)	1,107,317 (4.55 %)	142,495 (4.04 %)	27,514 (0.84 %)
229	royal ground snake (hap1 2023 refseq) GCF_031021105.1	45,143 (3.26 %)	n/a	13,488 (0.98 %)	20,353 (1.68 %)	n/a	41.25 (99.99 %)	0 (0 %)	1,391 (0.01 %)	400 (100.00 %)	6,118,914 (59.42 %)	1,698,731 (7.29 %)	9,084,283 (53.44 %)	11 (0.00 %)	1,523,662 (5.77 %)	130,852 (4.47 %)	24,852 (0.74 %)
230	royal ground snake (hap2 2023) GCA_031021085.1	n/a	n/a	13,845 (0.96 %)	23,108 (1.86 %)	n/a	41.26 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,128 (100.00 %)	2,008,682 (10.16 %)	1,718,408 (7.36 %)	9,467,451 (52.99 %)	0 (0 %)	1,513,596 (5.45 %)	140,557 (4.65 %)	29,439 (0.71 %)
231	royal ground snake (hap3 2023) GCA_031001685.1	n/a	n/a	12,606 (0.83 %)	22,421 (1.62 %)	n/a	41.63 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,543 (100.00 %)	2,080,172 (11.19 %)	1,814,619 (9.22 %)	8,889,119 (57.36 %)	0 (0 %)	1,825,733 (6.19 %)	145,328 (4.63 %)	28,523 (0.67 %)
232	rufous frog (hap1 2023) GCA_031893025.1	n/a	n/a	13,727 (0.84 %)	24,896 (2.06 %)	n/a	42.95 (99.51 %)	0 (0 %)	973 (0.49 %)	2,266 (100.00 %)	729,332 (2.15 %)	1,402,564 (24.45 %)	8,156,596 (55.96 %)	4 (0.00 %)	3,523,739 (10.10 %)	175,180 (3.64 %)	18,584 (0.40 %)
233	rufous frog (hap2 2023) GCA_031893055.1	n/a	n/a	13,538 (0.88 %)	24,311 (2.15 %)	n/a	42.96 (99.07 %)	0 (0 %)	976 (0.93 %)	1,266 (100.00 %)	711,895 (2.18 %)	1,219,160 (21.56 %)	7,988,458 (54.14 %)	3 (0.00 %)	3,097,457 (9.48 %)	170,920 (3.48 %)	17,791 (0.40 %)
234	San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023) GCA_029215795.1	n/a	n/a	14,039 (1.09 %)	19,528 (1.85 %)	n/a	43.71 (100.00 %)	31 (0.00 %)	31 (0.00 %)	122 (100.00 %)	1,307,065 (5.31 %)	672,219 (3.50 %)	9,949,858 (39.30 %)	0 (0 %)	671,520 (3.09 %)	83,890 (3.97 %)	26,657 (0.80 %)
235	San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023) GCA_029215775.1	n/a	n/a	14,065 (1.09 %)	19,430 (1.84 %)	n/a	43.71 (100.00 %)	21 (0.00 %)	21 (0.00 %)	155 (100.00 %)	1,307,771 (5.32 %)	672,054 (3.42 %)	9,846,806 (39.03 %)	0 (0 %)	665,794 (3.10 %)	83,805 (3.99 %)	26,762 (0.80 %)
236	San Diegan tiger whiptail (alternate hap HBS 135688 2022) GCA_023333555.1	n/a	n/a	13,288 (1.15 %)	18,137 (1.98 %)	n/a	43.29 (100.00 %)	0 (0 %)	44 (0.00 %)	227 (100.00 %)	909,096 (6.37 %)	544,302 (5.70 %)	8,280,652 (39.20 %)	3 (0.00 %)	970,374 (3.95 %)	51,923 (2.21 %)	19,861 (0.82 %)
237	San Diegan tiger whiptail (v1.1 HBS 135688 primary hap 2025) GCA_023333525.2	n/a	n/a	13,255 (1.15 %)	17,876 (1.96 %)	n/a	43.28 (100.00 %)	0 (0 %)	110 (0.00 %)	186 (100.00 %)	907,854 (6.31 %)	539,629 (5.57 %)	8,277,961 (39.11 %)	3 (0.00 %)	940,971 (3.87 %)	51,910 (2.22 %)	19,860 (0.82 %)
238	San Diego alligator lizard (HBS135686 alternate hap 2022) GCA_023053675.1	n/a	n/a	14,107 (1.14 %)	19,600 (1.95 %)	n/a	43.58 (100.00 %)	0 (0 %)	27 (0.00 %)	627 (100.00 %)	1,563,836 (7.79 %)	758,521 (4.15 %)	9,213,810 (40.44 %)	0 (0 %)	884,432 (3.64 %)	81,126 (2.79 %)	27,960 (0.83 %)
239	San Diego alligator lizard (v1.0 HBS135686 primary hap 2022) GCA_023053635.1	n/a	n/a	14,075 (1.15 %)	19,587 (1.99 %)	n/a	43.52 (100.00 %)	0 (0 %)	23 (0.00 %)	85 (100.00 %)	1,577,744 (7.81 %)	774,690 (3.78 %)	9,248,062 (40.42 %)	0 (0 %)	832,326 (3.45 %)	80,183 (2.48 %)	27,587 (0.82 %)
240	San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 genbank) GCA_023053635.2	n/a	n/a	14,093 (1.15 %)	19,338 (1.96 %)	n/a	43.52 (100.00 %)	0 (0 %)	73 (0.00 %)	35 (100.00 %)	1,577,751 (7.81 %)	774,117 (3.78 %)	9,248,069 (40.42 %)	1 (0.00 %)	823,656 (3.44 %)	80,183 (2.48 %)	27,586 (0.82 %)
241	San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 refseq) GCF_023053635.1	33,415 (3.07 %)	n/a	14,091 (1.15 %)	19,337 (1.96 %)	n/a	43.52 (100.00 %)	0 (0 %)	73 (0.00 %)	34 (100.00 %)	1,577,747 (7.81 %)	774,112 (3.78 %)	9,248,016 (40.42 %)	1 (0.00 %)	823,646 (3.44 %)	80,183 (2.48 %)	27,586 (0.82 %)
242	San Diego ringneck snake (HBS135679 alternate hap 2022) GCA_023053665.1	n/a	n/a	10,911 (1.00 %)	17,586 (1.79 %)	n/a	41.17 (100.00 %)	0 (0 %)	572 (0.00 %)	2,064 (100.00 %)	1,265,045 (10.30 %)	989,149 (13.38 %)	6,503,035 (50.62 %)	0 (0 %)	1,261,338 (5.60 %)	123,274 (4.17 %)	23,159 (0.83 %)
243	sand lizard (alternate hap 2019) GCA_009819545.1	n/a	n/a	14,226 (1.28 %)	25,396 (2.33 %)	n/a	43.80 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	12,662 (100.00 %)	1,001,433 (5.27 %)	445,157 (1.79 %)	7,227,826 (34.26 %)	0 (0 %)	365,558 (2.38 %)	80,300 (2.76 %)	22,848 (0.87 %)
244	sand lizard (primary hap 2019) GCF_009819535.1	41,714 (3.65 %)	n/a	14,350 (1.48 %)	19,231 (2.45 %)	32,804 (4.14 %)	43.75 (99.75 %)	0 (0 %)	379 (0.25 %)	29 (100.00 %)	975,474 (5.32 %)	425,414 (1.76 %)	7,135,165 (34.49 %)	0 (0 %)	365,268 (2.50 %)	76,053 (2.68 %)	21,615 (0.85 %)
245	Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq) GCF_029499605.1	108,406 (1.98 %)	n/a	13,959 (0.46 %)	n/a	n/a	43.90 (99.99 %)	0 (0 %)	2,297 (0.01 %)	3,474 (100.00 %)	1,903,654 (2.85 %)	2,970,691 (16.56 %)	15,354,577 (64.31 %)	20 (0.00 %)	n/a	652,708 (8.36 %)	43,665 (0.45 %)
246	Sardinian treefrog (hap2 2023) GCA_029493135.1	n/a	n/a	14,077 (0.47 %)	36,608 (1.60 %)	n/a	43.86 (99.99 %)	0 (0 %)	2,097 (0.01 %)	2,802 (100.00 %)	1,819,971 (2.73 %)	2,865,173 (16.12 %)	15,335,602 (63.85 %)	14 (0.00 %)	6,125,585 (10.74 %)	651,438 (8.09 %)	43,492 (0.45 %)
247	Schlegel's Japanese gecko GCF_001447785.1	25,190 (1.78 %)	n/a	14,549 (0.82 %)	28,002 (1.69 %)	n/a	45.48 (96.46 %)	143,970 (3.54 %)	143,970 (3.54 %)	335,470 (96.46 %)	889,760 (2.21 %)	666,492 (2.83 %)	12,865,811 (39.14 %)	291 (0.01 %)	n/a	160,022 (2.80 %)	49,172 (0.87 %)
248	sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 alternate hap 2025) GCA_048941845.1	n/a	n/a	6,576 (0.51 %)	43,825 (3.94 %)	n/a	47.88 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7,128 (100.00 %)	4,390,525 (64.21 %)	1,225,707 (31.71 %)	4,578,596 (61.04 %)	0 (0 %)	3,495,471 (18.01 %)	190,615 (29.92 %)	115,142 (4.58 %)
249	sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025) GCA_048934315.1	n/a	n/a	8,243 (0.45 %)	53,092 (3.72 %)	n/a	48.10 (99.99 %)	0 (0 %)	992 (0.01 %)	1,203 (100.00 %)	813,148 (7.99 %)	1,963,193 (37.59 %)	5,212,133 (68.09 %)	1 (0.00 %)	5,897,424 (20.47 %)	252,648 (29.41 %)	139,919 (3.83 %)
250	sea lamprey (alternate hap 2020) GCA_010993595.1	n/a	n/a	6,180 (0.71 %)	31,191 (4.14 %)	n/a	48.30 (100.00 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	4,064 (100.00 %)	1,494,745 (38.42 %)	891,392 (20.02 %)	4,259,383 (49.70 %)	0 (0 %)	2,135,388 (12.73 %)	147,499 (35.87 %)	97,808 (5.62 %)
251	sea lamprey (primary hap 2020) GCF_010993605.1	41,241 (6.50 %)	n/a	7,638 (0.70 %)	36,336 (4.06 %)	83,714 (10.03 %)	48.31 (98.62 %)	0 (0 %)	930 (1.38 %)	1,434 (100.00 %)	1,920,851 (39.36 %)	1,194,165 (21.47 %)	5,320,620 (50.50 %)	4 (0.00 %)	2,982,736 (13.77 %)	178,590 (35.88 %)	120,128 (5.32 %)
252	sharpnose sevengill shark (hap1 2024 genbank) GCF_035084215.1	51,418 (2.53 %)	n/a	12,778 (0.49 %)	24,541 (1.38 %)	n/a	44.37 (99.99 %)	0 (0 %)	1,834 (0.01 %)	1,879 (100.00 %)	597,115 (2.28 %)	1,112,121 (17.97 %)	12,108,003 (57.48 %)	2 (0.00 %)	4,823,993 (9.23 %)	117,585 (3.42 %)	24,151 (0.35 %)
253	sharpnose sevengill shark (hap1 2024 refseq) GCA_035084215.1	n/a	n/a	12,780 (0.49 %)	24,543 (1.38 %)	n/a	44.37 (99.99 %)	0 (0 %)	1,834 (0.01 %)	1,880 (100.00 %)	597,122 (2.28 %)	1,112,137 (17.97 %)	12,108,056 (57.48 %)	2 (0.00 %)	4,824,033 (9.23 %)	117,585 (3.42 %)	24,151 (0.35 %)
254	sharpnose sevengill shark (hap2 2024) GCA_035084135.1	n/a	n/a	12,603 (0.52 %)	23,419 (1.42 %)	n/a	44.36 (99.99 %)	1,695 (0.01 %)	1,695 (0.01 %)	2,889 (99.99 %)	559,171 (2.08 %)	973,228 (15.01 %)	11,768,442 (55.69 %)	2 (0.00 %)	3,991,721 (8.15 %)	108,468 (3.25 %)	22,750 (0.36 %)
255	Shaw's sea snake (ss_UAE728 2024) GCA_037043045.1	n/a	n/a	13,255 (0.98 %)	17,598 (1.51 %)	n/a	40.56 (99.93 %)	641 (0.07 %)	641 (0.07 %)	1,450 (99.93 %)	1,165,384 (5.77 %)	720,981 (3.46 %)	8,068,978 (51.52 %)	30 (0.00 %)	825,482 (4.02 %)	120,786 (6.16 %)	15,953 (0.50 %)
256	Skyros wall lizard (rPodGai1.hap2.1 2024) GCA_964106785.1	n/a	n/a	13,756 (1.40 %)	19,148 (2.33 %)	n/a	43.77 (99.99 %)	0 (0 %)	783 (0.01 %)	127 (100.00 %)	790,266 (3.86 %)	448,558 (4.00 %)	6,780,108 (37.51 %)	3 (0.00 %)	534,737 (3.25 %)	86,165 (2.71 %)	18,444 (0.74 %)
257	Skyros wall lizard (v1 hap1 2024) GCA_964106915.1	n/a	n/a	14,245 (1.36 %)	19,892 (2.29 %)	n/a	43.82 (99.99 %)	0 (0 %)	883 (0.01 %)	211 (100.00 %)	838,357 (3.88 %)	479,922 (4.42 %)	7,039,963 (38.21 %)	7 (0.00 %)	598,615 (3.50 %)	93,005 (2.80 %)	19,317 (0.73 %)
258	Skyros wall lizard (v2 hap1 2024) GCA_964106915.2	n/a	n/a	14,245 (1.36 %)	19,892 (2.29 %)	n/a	43.82 (99.99 %)	0 (0 %)	883 (0.01 %)	211 (100.00 %)	838,357 (3.88 %)	479,922 (4.42 %)	7,039,963 (38.21 %)	7 (0.00 %)	598,611 (3.50 %)	93,005 (2.80 %)	19,317 (0.73 %)
259	smaller spotted catshark (alternate hap 2021) GCA_902713625.2	n/a	n/a	11,589 (0.31 %)	32,603 (1.10 %)	n/a	47.54 (100.00 %)	6 (0.00 %)	6 (0.00 %)	26,655 (100.00 %)	1,346,532 (1.83 %)	1,273,326 (5.35 %)	19,727,443 (51.55 %)	0 (0 %)	2,678,114 (4.31 %)	427,693 (8.25 %)	27,178 (0.30 %)
260	smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank) GCA_902713615.2	n/a	n/a	12,587 (0.36 %)	23,986 (1.08 %)	n/a	47.65 (98.48 %)	0 (0 %)	7,146 (1.52 %)	645 (100.00 %)	1,451,634 (1.94 %)	1,448,619 (6.25 %)	20,884,741 (51.41 %)	10 (0.00 %)	3,334,909 (4.99 %)	456,658 (8.18 %)	31,096 (0.32 %)
261	smalltooth sawfish (alternate hap 2019) GCA_009764485.1	n/a	n/a	9,086 (0.58 %)	20,468 (1.57 %)	n/a	42.65 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	10,892 (100.00 %)	315,695 (1.23 %)	320,148 (1.73 %)	8,305,059 (38.33 %)	0 (0 %)	382,745 (1.57 %)	37,147 (1.43 %)	15,419 (0.42 %)
262	smalltooth sawfish (v2.1 primary hap 2019 refseq) GCF_009764475.1	40,257 (2.94 %)	n/a	12,157 (0.69 %)	18,627 (1.55 %)	n/a	42.38 (99.09 %)	0 (0 %)	698 (0.91 %)	172 (100.00 %)	4,824,261 (54.91 %)	391,531 (1.52 %)	11,282,260 (38.19 %)	0 (0 %)	471,344 (1.50 %)	45,398 (1.34 %)	18,410 (0.41 %)
263	snake N.helvetica (rNatHel1.hap1.1 2024) GCA_964273705.1	n/a	n/a	13,534 (1.08 %)	19,681 (1.86 %)	n/a	41.70 (99.98 %)	7 (0.00 %)	2,010 (0.02 %)	494 (100.00 %)	1,264,981 (8.07 %)	885,992 (7.35 %)	8,475,795 (46.16 %)	10 (0.00 %)	746,296 (3.32 %)	117,174 (4.31 %)	24,893 (0.73 %)
264	snake N.helvetica (rNatHel1.hap2.1 2024) GCA_964273795.1	n/a	n/a	11,975 (1.14 %)	16,941 (1.86 %)	n/a	41.42 (99.98 %)	1,674 (0.02 %)	1,674 (0.02 %)	2,176 (99.98 %)	1,088,721 (8.03 %)	743,110 (5.43 %)	7,446,281 (43.88 %)	11 (0.00 %)	634,247 (3.33 %)	96,764 (4.19 %)	20,864 (0.74 %)
265	Southern dwarf chameleon (Gauteng JTBG20232 2024) GCA_035047345.1	n/a	n/a	13,671 (0.83 %)	18,931 (1.39 %)	n/a	44.53 (100.00 %)	22 (0.00 %)	22 (0.00 %)	135 (100.00 %)	1,004,404 (4.81 %)	870,596 (5.97 %)	9,017,362 (54.42 %)	0 (0 %)	1,622,797 (5.80 %)	217,977 (8.25 %)	19,831 (0.36 %)
266	Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 alternate hap 2022) GCA_024509165.1	n/a	n/a	13,381 (1.17 %)	19,541 (1.96 %)	n/a	39.82 (100.00 %)	0 (0 %)	34 (0.00 %)	340 (100.00 %)	1,137,408 (8.97 %)	740,163 (7.59 %)	7,520,676 (44.43 %)	0 (0 %)	1,047,648 (4.87 %)	47,268 (1.61 %)	21,885 (0.78 %)
267	Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 primary hap 2022) GCA_024509115.1	n/a	n/a	12,626 (1.16 %)	18,965 (1.95 %)	n/a	40.05 (99.99 %)	443 (0.01 %)	443 (0.01 %)	1,139 (99.99 %)	1,095,605 (9.34 %)	713,734 (8.45 %)	6,942,208 (44.93 %)	3 (0.00 %)	1,092,536 (5.56 %)	46,378 (2.04 %)	21,510 (0.80 %)
268	Southwestern pond turtle (HBS135687 alternate hap 2022) GCA_023634275.1	n/a	n/a	14,998 (0.98 %)	20,146 (1.60 %)	n/a	44.84 (100.00 %)	64 (0.00 %)	64 (0.00 %)	324 (100.00 %)	1,562,785 (12.68 %)	484,638 (2.00 %)	11,089,433 (36.29 %)	0 (0 %)	512,269 (2.30 %)	143,601 (3.21 %)	30,649 (0.71 %)
269	Southwestern pond turtle (HBS135687 primary hap 2022) GCA_023634205.1	n/a	n/a	14,971 (0.99 %)	19,756 (1.60 %)	n/a	44.77 (100.00 %)	53 (0.00 %)	53 (0.00 %)	106 (100.00 %)	1,545,155 (12.63 %)	465,697 (1.95 %)	11,181,681 (36.13 %)	0 (0 %)	476,831 (2.14 %)	142,383 (3.05 %)	30,737 (0.72 %)
270	spotted gar GCF_000242695.1	45,681 (8.02 %)	n/a	13,054 (1.95 %)	46,362 (15.00 %)	n/a	39.59 (91.93 %)	43,274 (8.08 %)	43,276 (8.08 %)	45,199 (91.92 %)	203,614 (1.02 %)	123,247 (0.80 %)	5,837,321 (22.82 %)	2,079 (0.10 %)	77,276 (0.87 %)	38,507 (2.24 %)	31,972 (1.68 %)
271	spotted gar (fLepOcu1hap1 2024) GCA_040954845.1	n/a	n/a	13,777 (1.63 %)	24,910 (4.29 %)	n/a	40.54 (100.00 %)	0 (0 %)	76 (0.00 %)	831 (100.00 %)	1,218,814 (33.09 %)	230,177 (10.66 %)	5,685,909 (34.46 %)	0 (0 %)	606,189 (4.68 %)	52,438 (3.69 %)	36,888 (1.75 %)
272	spotted gar (fLepOcu1hap2 2024) GCF_040954835.1	64,638 (7.15 %)	n/a	13,839 (1.51 %)	23,965 (3.48 %)	n/a	40.66 (100.00 %)	0 (0 %)	95 (0.00 %)	816 (100.00 %)	1,319,033 (34.80 %)	245,717 (12.50 %)	5,536,919 (38.20 %)	0 (0 %)	787,990 (5.83 %)	57,935 (3.78 %)	37,077 (1.64 %)
273	spotted ratfish (hap1 2024) GCA_035084065.1	n/a	n/a	10,920 (1.26 %)	14,403 (2.60 %)	n/a	43.46 (99.96 %)	0 (0 %)	2,088 (0.04 %)	1,042 (100.00 %)	3,325,883 (44.48 %)	604,780 (8.87 %)	5,926,808 (44.92 %)	2 (0.00 %)	1,077,982 (5.77 %)	64,249 (4.00 %)	11,419 (0.43 %)
274	spotted ratfish (hap2 2024) GCA_035084275.1	n/a	n/a	10,694 (1.38 %)	13,221 (2.62 %)	n/a	42.85 (99.96 %)	0 (0 %)	1,952 (0.04 %)	532 (100.00 %)	3,108,151 (44.68 %)	498,592 (6.00 %)	5,634,132 (43.16 %)	4 (0.00 %)	685,165 (4.19 %)	50,785 (2.94 %)	25,542 (1.57 %)
275	starry smooth-hound (sMusAst1.hap1.1 2024) GCA_964213995.1	n/a	n/a	12,755 (0.42 %)	23,706 (1.15 %)	n/a	45.69 (99.98 %)	0 (0 %)	3,590 (0.02 %)	5,314 (100.00 %)	1,153,000 (3.16 %)	1,250,073 (11.36 %)	14,207,513 (54.93 %)	42 (0.00 %)	4,695,339 (7.91 %)	114,313 (3.65 %)	15,576 (0.19 %)
276	starry smooth-hound (sMusAst1.hap2.1 2024) GCA_964214025.1	n/a	n/a	12,414 (0.43 %)	22,037 (1.15 %)	n/a	45.49 (99.98 %)	3,505 (0.02 %)	3,505 (0.02 %)	7,908 (99.98 %)	1,083,980 (2.93 %)	1,065,586 (9.57 %)	13,986,241 (53.49 %)	32 (0.00 %)	3,881,332 (7.02 %)	105,379 (3.46 %)	14,226 (0.18 %)
277	sterlet (v2 Gen_M01 2020) GCF_010645085.2	73,208 (5.77 %)	n/a	24,716 (1.77 %)	39,692 (3.97 %)	n/a	39.75 (99.93 %)	0 (0 %)	6,251 (0.07 %)	3,368 (100.00 %)	3,869,521 (43.26 %)	1,093,425 (6.82 %)	9,976,052 (39.33 %)	5 (0.00 %)	1,354,766 (6.14 %)	60,325 (1.97 %)	17,242 (0.48 %)
278	Suwannee snapping turtle (hap1 2023) GCA_033296515.1	n/a	n/a	14,713 (1.06 %)	18,602 (1.60 %)	n/a	44.58 (100.00 %)	0 (0 %)	290 (0.00 %)	366 (100.00 %)	1,352,115 (12.17 %)	388,630 (1.94 %)	10,550,154 (33.42 %)	0 (0 %)	470,790 (2.03 %)	113,023 (3.09 %)	33,031 (0.84 %)
279	Suwannee snapping turtle (hap2 2023) GCA_033349115.1	n/a	n/a	12,226 (1.01 %)	14,117 (1.42 %)	n/a	43.77 (100.00 %)	0 (0 %)	361 (0.00 %)	199 (100.00 %)	1,202,345 (11.93 %)	304,674 (1.45 %)	9,752,924 (32.81 %)	0 (0 %)	314,037 (1.63 %)	92,993 (2.75 %)	20,902 (0.60 %)
280	tailed frog (A.truei hap1 2024) GCA_040206685.1	n/a	n/a	14,490 (0.54 %)	41,227 (1.77 %)	n/a	44.92 (99.97 %)	0 (0 %)	6,020 (0.03 %)	3,549 (100.00 %)	1,783,455 (4.78 %)	3,426,339 (20.31 %)	15,662,323 (55.70 %)	33 (0.00 %)	5,614,148 (11.20 %)	442,764 (6.61 %)	73,225 (0.88 %)
281	tailed frog (A.truei hap2 2024) GCA_040206675.1	n/a	n/a	14,405 (0.55 %)	41,584 (1.88 %)	n/a	44.89 (99.97 %)	0 (0 %)	6,023 (0.03 %)	2,779 (100.00 %)	1,770,524 (4.86 %)	3,429,564 (18.94 %)	15,718,939 (55.22 %)	37 (0.00 %)	5,484,397 (11.18 %)	441,543 (6.61 %)	73,027 (0.90 %)
282	thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020) GCA_010909745.1	n/a	n/a	5,885 (0.35 %)	24,457 (1.45 %)	n/a	44.61 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	21,995 (100.00 %)	553,415 (2.65 %)	761,469 (4.53 %)	6,043,769 (57.75 %)	0 (0 %)	1,079,506 (5.75 %)	159,552 (5.54 %)	20,611 (0.66 %)
283	thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020) GCF_010909765.2	45,968 (2.40 %)	n/a	11,437 (0.60 %)	26,341 (1.72 %)	n/a	44.30 (92.54 %)	0 (0 %)	3,753 (7.46 %)	957 (100.00 %)	888,163 (2.58 %)	1,176,348 (3.79 %)	9,964,038 (52.25 %)	26 (0.00 %)	1,634,606 (4.98 %)	242,676 (4.73 %)	31,030 (0.57 %)
284	three-toed box turtle GCF_002925995.2	35,807 (2.28 %)	n/a	16,429 (1.00 %)	26,460 (1.60 %)	33,673 (1.75 %)	44.26 (94.87 %)	0 (0 %)	53,635 (5.13 %)	48,497 (100.00 %)	2,007,347 (15.00 %)	351,871 (0.86 %)	12,385,245 (31.74 %)	3,613 (0.05 %)	161,525 (0.66 %)	138,405 (2.40 %)	33,334 (0.68 %)
285	tiger rattlesnake GCF_016545835.1	58,085 (4.72 %)	n/a	13,597 (1.18 %)	20,553 (2.03 %)	n/a	39.88 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4,228 (100.00 %)	1,142,521 (7.92 %)	739,406 (5.17 %)	7,749,366 (42.91 %)	0 (0 %)	1,005,717 (4.66 %)	45,588 (1.61 %)	21,457 (0.80 %)
286	tiny Cayenne caecilian (v2 2021) GCA_901765095.2	n/a	n/a	14,569 (0.43 %)	30,498 (1.16 %)	n/a	44.01 (98.99 %)	0 (0 %)	2,452 (1.01 %)	1,081 (100.00 %)	1,894,383 (1.68 %)	1,670,443 (3.30 %)	22,207,143 (52.43 %)	5 (0.00 %)	1,718,803 (3.44 %)	414,828 (3.91 %)	47,796 (0.38 %)
287	tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019) GCA_901765105.1	n/a	n/a	12,197 (0.36 %)	33,747 (1.15 %)	n/a	43.95 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	23,871 (100.00 %)	1,453,442 (1.57 %)	1,309,062 (3.23 %)	17,953,416 (52.19 %)	0 (0 %)	1,274,743 (3.12 %)	326,452 (3.86 %)	38,711 (0.39 %)
288	Townsend's dwarf sphaero (gecko TG3544 2022) GCF_021028975.2	41,266 (3.35 %)	n/a	13,505 (1.05 %)	19,294 (1.78 %)	n/a	45.92 (99.99 %)	0 (0 %)	2,590 (0.01 %)	1,742 (100.00 %)	938,800 (8.81 %)	627,869 (5.78 %)	9,306,892 (38.57 %)	33 (0.00 %)	185,826 (0.70 %)	91,919 (2.91 %)	28,760 (0.80 %)
289	tropical clawed frog GCF_000004195.4	50,570 (4.71 %)	n/a	14,679 (1.97 %)	20,138 (2.76 %)	52,028 (5.20 %)	40.73 (99.80 %)	0 (0 %)	684 (0.20 %)	167 (100.00 %)	2,289,618 (34.82 %)	708,472 (13.14 %)	6,816,377 (41.73 %)	4 (0.00 %)	1,594,381 (7.39 %)	52,647 (1.35 %)	10,639 (0.28 %)
290	Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 refseq) GCF_040894005.1	55,552 (3.50 %)	n/a	13,678 (0.88 %)	29,722 (2.41 %)	n/a	43.19 (100.00 %)	0 (0 %)	436 (0.00 %)	936 (100.00 %)	734,279 (2.54 %)	1,217,326 (21.42 %)	8,925,807 (52.53 %)	6 (0.00 %)	3,231,587 (10.49 %)	211,590 (5.08 %)	23,983 (0.47 %)
291	Tungara frog (aEngPut4 paternal hap 2024) GCA_040894015.1	n/a	n/a	13,192 (0.88 %)	29,242 (2.52 %)	n/a	43.08 (100.00 %)	0 (0 %)	507 (0.00 %)	819 (100.00 %)	736,700 (2.60 %)	1,165,044 (20.79 %)	8,671,642 (52.60 %)	3 (0.00 %)	1,462,012 (5.01 %)	207,553 (4.71 %)	22,911 (0.46 %)
292	two-lined caecilian (alternate hap 2019) GCA_901001175.1	n/a	n/a	13,456 (0.33 %)	47,486 (1.34 %)	n/a	44.33 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	27,233 (100.00 %)	1,968,437 (1.91 %)	1,716,136 (3.97 %)	25,847,315 (43.76 %)	0 (0 %)	1,707,112 (2.84 %)	523,234 (6.59 %)	83,004 (0.82 %)
293	two-lined caecilian (v1.2 2021 genbank) GCA_901001135.2	n/a	n/a	14,449 (0.38 %)	40,573 (1.31 %)	n/a	44.40 (99.36 %)	0 (0 %)	3,573 (0.64 %)	1,330 (100.00 %)	2,274,606 (1.91 %)	2,036,107 (4.34 %)	29,400,957 (44.09 %)	9 (0.01 %)	2,193,249 (3.24 %)	602,911 (6.66 %)	94,934 (0.82 %)
294	Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025) GCA_965153285.1	n/a	n/a	14,267 (1.41 %)	20,319 (2.40 %)	n/a	44.04 (99.99 %)	0 (0 %)	1,024 (0.01 %)	258 (100.00 %)	833,273 (4.46 %)	456,881 (4.04 %)	6,995,048 (37.06 %)	8 (0.00 %)	625,845 (3.64 %)	97,620 (3.04 %)	19,840 (0.78 %)
295	Tyrrhenian wall lizard (hap2 2025) GCA_965153305.1	n/a	n/a	13,496 (1.42 %)	18,862 (2.37 %)	n/a	43.96 (99.99 %)	0 (0 %)	983 (0.01 %)	306 (100.00 %)	780,565 (4.36 %)	422,625 (4.27 %)	6,551,041 (36.66 %)	9 (0.00 %)	570,142 (3.57 %)	89,693 (2.97 %)	18,244 (0.76 %)
296	valley gartersnake (HBS 135685 alternate hap 2023) GCA_029207655.1	n/a	n/a	13,267 (1.12 %)	21,667 (2.38 %)	n/a	41.05 (100.00 %)	0 (0 %)	403 (0.00 %)	226 (100.00 %)	1,344,601 (8.29 %)	1,035,785 (7.00 %)	8,436,473 (45.10 %)	2 (0.00 %)	993,545 (4.30 %)	82,750 (2.69 %)	24,526 (0.78 %)
297	valley gartersnake (HBS 135685 primary hap 2023) GCA_029207665.1	n/a	n/a	12,430 (1.10 %)	20,286 (2.36 %)	n/a	41.12 (100.00 %)	0 (0 %)	446 (0.00 %)	413 (100.00 %)	1,299,478 (9.62 %)	1,018,398 (8.41 %)	7,790,758 (46.28 %)	2 (0.00 %)	1,063,878 (4.69 %)	81,352 (2.71 %)	23,653 (0.79 %)
298	viviparous/common lizard GCF_011800845.1	47,034 (5.17 %)	n/a	14,311 (1.43 %)	20,571 (2.35 %)	32,442 (3.15 %)	43.97 (97.04 %)	0 (0 %)	51,275 (2.97 %)	25,252 (100.00 %)	949,801 (5.41 %)	498,048 (1.91 %)	7,668,731 (34.21 %)	726 (0.06 %)	389,679 (2.77 %)	88,947 (2.62 %)	22,474 (0.81 %)
299	warty newt (primary hap 2024) GCA_964204655.1	n/a	n/a	16,124 (0.09 %)	186,006 (1.43 %)	n/a	45.53 (100.00 %)	118 (0.00 %)	4,698 (0.00 %)	1,422 (100.00 %)	4,239,451 (1.37 %)	8,714,648 (13.78 %)	84,859,372 (50.88 %)	38 (0.00 %)	10,611,791 (4.91 %)	2,159,665 (8.20 %)	541,086 (1.34 %)
300	West African lungfish (Aquariam Glaser DD20220218a primary hap 2024) GCA_040939525.1	n/a	n/a	14,330 (0.04 %)	83,285 (0.50 %)	n/a	39.97 (99.99 %)	0 (0 %)	24,438 (0.01 %)	7,125 (100.00 %)	17,253,560 (4.05 %)	15,370,489 (7.85 %)	180,606,722 (55.17 %)	127 (0.00 %)	2,868,526 (0.33 %)	548,408 (0.58 %)	524,351 (0.55 %)
301	West African lungfish (FY-2018-M 2021) GCF_019279795.1	41,847 (0.19 %)	n/a	n/a	n/a	n/a	40.21 (97.52 %)	0 (0 %)	n/a	12,668 (100.00 %)	16,163,808 (2.67 %)	13,992,750 (5.30 %)	n/a	26 (0.00 %)	183,320 (0.03 %)	502,751 (0.52 %)	14,687 (0.01 %)
302	western fence lizard (IW3139 2022) GCA_023333635.1	n/a	n/a	26,067 (1.12 %)	46,795 (2.72 %)	n/a	41.28 (100.00 %)	0 (0 %)	51 (0.00 %)	1,771 (100.00 %)	2,075,491 (6.60 %)	1,603,401 (7.34 %)	15,565,775 (40.61 %)	0 (0 %)	1,972,426 (5.50 %)	184,134 (3.16 %)	51,018 (0.93 %)
303	western fence lizard (IW3139 primary hap 2022) GCA_023333645.1	n/a	n/a	24,835 (1.20 %)	42,146 (2.78 %)	n/a	41.16 (100.00 %)	51 (0.00 %)	51 (0.00 %)	659 (100.00 %)	1,842,497 (6.34 %)	1,335,245 (6.14 %)	15,103,683 (37.84 %)	1 (0.00 %)	1,360,948 (3.93 %)	158,311 (2.92 %)	45,330 (0.92 %)
304	western painted turtle (R12L10 2023) GCF_011386835.1	101,708 (5.23 %)	n/a	15,332 (1.01 %)	21,055 (1.60 %)	n/a	44.88 (99.98 %)	0 (0 %)	1,270 (0.02 %)	9,850 (100.00 %)	4,178,966 (47.39 %)	457,400 (2.29 %)	11,325,467 (35.43 %)	3 (0.00 %)	758,530 (2.85 %)	127,896 (2.94 %)	35,401 (0.99 %)
305	western painted turtle (v5 RCT428 2020) GCF_000241765.5	64,782 (3.76 %)	n/a	15,184 (1.08 %)	21,463 (1.64 %)	n/a	44.19 (87.54 %)	184,311 (12.48 %)	184,311 (12.48 %)	259,085 (87.52 %)	4,079,404 (44.68 %)	316,232 (0.93 %)	11,848,718 (27.60 %)	6,323 (0.15 %)	313,464 (1.39 %)	103,623 (1.74 %)	31,959 (0.68 %)
306	western red-tailed skink (HBS 135693 alternate hap 2022) GCA_026170595.1	n/a	n/a	14,019 (1.31 %)	17,620 (2.13 %)	n/a	45.76 (100.00 %)	0 (0 %)	15 (0.00 %)	39 (100.00 %)	862,216 (4.87 %)	557,627 (3.17 %)	8,002,559 (36.95 %)	0 (0 %)	377,483 (2.25 %)	183,292 (4.74 %)	24,223 (0.81 %)
307	western red-tailed skink (HBS 135693 primary hap 2022) GCA_026170395.1	n/a	n/a	13,064 (1.32 %)	16,407 (2.16 %)	n/a	45.81 (100.00 %)	0 (0 %)	12 (0.00 %)	50 (100.00 %)	794,996 (4.86 %)	514,021 (3.46 %)	7,339,914 (37.02 %)	1 (0.00 %)	359,036 (2.32 %)	168,847 (4.76 %)	22,885 (0.83 %)
308	western spadefoot toad (hap1 HBS 135690 2023) GCA_029215705.1	n/a	n/a	13,914 (1.72 %)	27,496 (4.28 %)	n/a	40.81 (100.00 %)	198 (0.00 %)	198 (0.00 %)	677 (100.00 %)	600,622 (4.04 %)	783,931 (10.70 %)	5,362,245 (41.82 %)	0 (0 %)	1,069,443 (8.38 %)	100,334 (5.41 %)	37,012 (1.96 %)
309	western spadefoot toad (hap2 HBS 135690 2023) GCA_029215755.1	n/a	n/a	13,991 (1.72 %)	27,685 (4.24 %)	n/a	40.90 (100.00 %)	190 (0.00 %)	190 (0.00 %)	541 (100.00 %)	620,188 (5.00 %)	800,411 (11.19 %)	5,338,766 (42.25 %)	1 (0.00 %)	1,135,530 (8.81 %)	101,603 (5.32 %)	37,398 (1.95 %)
310	western terrestrial garter snake (alternate hap 2019) GCA_009769695.1	n/a	n/a	13,101 (0.94 %)	24,980 (1.75 %)	n/a	41.02 (99.93 %)	19 (0.07 %)	19 (0.07 %)	13,642 (99.93 %)	1,410,212 (7.70 %)	1,080,385 (4.56 %)	9,112,844 (43.96 %)	0 (0 %)	886,410 (3.61 %)	91,606 (2.53 %)	24,845 (0.74 %)
311	western terrestrial garter snake (primary hap 2019) GCF_009769535.1	33,492 (3.42 %)	n/a	13,074 (1.13 %)	18,807 (1.93 %)	31,660 (2.61 %)	40.95 (97.72 %)	0 (0 %)	1,518 (2.28 %)	365 (100.00 %)	1,271,255 (7.73 %)	979,057 (4.48 %)	8,396,200 (42.63 %)	0 (0 %)	801,068 (3.60 %)	81,829 (2.47 %)	23,152 (0.75 %)
312	whale shark (14 2022 Squalomix) GCF_021869965.1	42,052 (2.43 %)	n/a	12,059 (0.52 %)	18,460 (1.22 %)	38,963 (1.77 %)	41.51 (91.61 %)	0 (0 %)	95,208 (8.40 %)	16,684 (100.00 %)	402,747 (0.97 %)	389,119 (1.49 %)	15,298,245 (34.14 %)	7,133 (0.13 %)	472,644 (1.14 %)	21,050 (0.30 %)	10,334 (0.16 %)
313	whale shark (Ralph 2017 Emory U) GCF_001642345.1	31,857 (1.52 %)	n/a	11,884 (0.43 %)	28,482 (1.15 %)	n/a	41.78 (100.00 %)	0 (0 %)	900,650 (0.03 %)	57,334 (100.00 %)	413,201 (1.16 %)	426,542 (2.75 %)	16,418,143 (38.85 %)	315 (0.00 %)	994,713 (2.86 %)	35,192 (0.95 %)	11,001 (0.17 %)
314	whitespotted bambooshark GCF_004010195.1	54,886 (2.03 %)	n/a	12,065 (0.44 %)	19,805 (1.08 %)	n/a	42.06 (94.27 %)	0 (0 %)	156,554 (5.74 %)	101,977 (100.00 %)	559,291 (0.96 %)	641,094 (3.66 %)	19,566,199 (38.21 %)	151 (0.01 %)	1,627,864 (2.86 %)	28,353 (0.49 %)	12,756 (0.18 %)
315	yellow-bellied toad (maternal hap 2024) GCA_964205305.1	n/a	n/a	14,756 (0.22 %)	45,590 (0.94 %)	n/a	38.94 (99.99 %)	6,811 (0.01 %)	6,811 (0.01 %)	10,308 (99.99 %)	18,937,194 (70.69 %)	7,201,985 (14.20 %)	30,457,322 (66.19 %)	64 (0.00 %)	9,555,405 (8.40 %)	412,512 (1.53 %)	27,003 (0.11 %)
316	yellow-bellied toad (paternal hap 2024) GCA_964205295.1	n/a	n/a	15,637 (0.22 %)	46,444 (0.92 %)	n/a	38.93 (99.99 %)	130 (0.00 %)	6,671 (0.01 %)	4,887 (100.00 %)	19,544,300 (70.77 %)	7,435,469 (14.36 %)	31,317,575 (66.35 %)	51 (0.00 %)	13,007,996 (11.33 %)	423,705 (1.55 %)	26,794 (0.11 %)
317	yellowpond turtle (Southern MM-2020 2021) GCF_020497125.1	65,539 (3.36 %)	n/a	15,560 (0.99 %)	21,233 (1.66 %)	n/a	45.17 (96.24 %)	0 (0 %)	1,041 (3.76 %)	595 (100.00 %)	1,904,996 (14.25 %)	468,779 (2.21 %)	11,403,005 (33.86 %)	13 (0.00 %)	681,375 (2.23 %)	135,646 (3.23 %)	34,785 (0.79 %)
318	zebra shark (6-17 2022 Squalomix) GCF_022316705.1	48,447 (2.64 %)	n/a	11,974 (0.57 %)	15,459 (1.26 %)	n/a	41.78 (93.81 %)	0 (0 %)	87,372 (6.20 %)	1,266 (100.00 %)	392,676 (0.96 %)	348,115 (1.22 %)	15,176,805 (32.93 %)	151 (0.01 %)	584,622 (1.29 %)	20,647 (0.38 %)	10,977 (0.18 %)
319	zebra shark (hap1 2023 refseq) GCF_030684315.1	58,105 (2.61 %)	n/a	12,291 (0.48 %)	16,769 (1.14 %)	n/a	43.41 (99.47 %)	0 (0 %)	1,159 (0.53 %)	835 (100.00 %)	8,087,543 (64.92 %)	798,373 (9.17 %)	14,838,773 (42.39 %)	4 (0.00 %)	2,946,119 (5.37 %)	45,284 (1.67 %)	14,105 (0.37 %)
320	zebra shark (hap2 2023) GCA_030684295.1	n/a	n/a	12,516 (0.44 %)	17,465 (1.05 %)	n/a	44.66 (99.65 %)	1,203 (0.35 %)	1,203 (0.35 %)	2,136 (99.65 %)	8,278,458 (59.68 %)	903,434 (18.42 %)	14,975,344 (48.25 %)	2 (0.00 %)	4,704,292 (7.66 %)	48,378 (1.60 %)	15,577 (0.38 %)
TOTALS:	total assembly count 320

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	598 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	680 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	434 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	501 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	320 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	1194 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	325 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	922 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	707 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	322 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	682 assemblies	assembly stats	track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project	1303 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	464 assemblies	assembly stats	track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center	1633 assemblies	assembly stats	track stats

Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

See also: hub access, assembly statistics

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