Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of other vertebrates only.

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base AGP
gap		 all
gaps		 assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 gap
Overlap		 tandem
Dups		 cpg
unmasked		 cpg
island
1 Abingdon island giant tortoise
GCF_003597395.1		 50,402
(2.95 %)		 n/a 14,990
(1.01 %)		 19,565
(1.58 %)		 34,846
(1.54 %)		 43.71
(94.31 %)		 0
(0 %)		 63,430
(5.70 %)		 10,618
(100.00 %)		 1,553,204
(12.95 %)		 274,155
(1.11 %)		 12,664,684
(27.42 %)		 1,230
(0.10 %)		 193,101
(0.91 %)		 62,829
(1.59 %)		 28,727
(0.78 %)
2 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1		 n/a n/a 2,101
(1.18 %)		 5,350
(2.76 %)		 n/a 43.70
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3
(0.00 %)		 4,811
(100.00 %)		 103,373
(4.27 %)		 58,480
(3.90 %)		 895,535
(27.44 %)		 0
(0 %)		 59,204
(2.84 %)		 10,399
(2.84 %)		 3,340
(1.02 %)
3 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1		 57,514
(4.49 %)		 n/a 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 0
(0 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 2
(0.00 %)		 631,733
(3.50 %)		 94,745
(2.70 %)		 19,879
(0.76 %)
4 African bullfrog (1538 2019)
GCA_004786255.1		 n/a n/a 13,258
(1.31 %)		 15,309
(2.28 %)		 n/a 38.30
(89.51 %)		 0
(0 %)		 121,461
(10.52 %)		 5,411
(100.00 %)		 491,540
(1.54 %)		 401,074
(2.30 %)		 8,595,741
(27.94 %)		 3,986
(0.11 %)		 262,314
(1.70 %)		 14,854
(0.31 %)		 5,895
(0.13 %)
5 African clawed frog (2021)
GCF_017654675.1		 80,912
(3.89 %)		 n/a 23,666
(1.59 %)		 32,527
(2.45 %)		 112,506
(5.21 %)		 39.34
(99.94 %)		 0
(0 %)		 667
(0.06 %)		 55
(100.00 %)		 4,269,095
(35.49 %)		 1,028,861
(6.46 %)		 14,246,823
(43.67 %)		 2
(0.00 %)		 1,679,057
(4.83 %)		 108,774
(1.25 %)		 16,813
(0.23 %)
6 American alligator (KSC_2009_1 2016)
GCF_000281125.3		 51,013
(3.53 %)		 n/a 14,424
(1.06 %)		 19,690
(1.51 %)		 n/a 44.30
(97.86 %)		 0
(0 %)		 236,641
(2.19 %)		 7,094
(100.00 %)		 2,842,761
(36.86 %)		 291,584
(0.69 %)		 12,464,318
(27.91 %)		 1,962
(0.01 %)		 63,947
(0.23 %)		 35,531
(1.28 %)		 26,988
(0.99 %)
7 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1		 60,799
(4.33 %)		 n/a 14,383
(0.98 %)		 18,600
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 0
(0 %)		 161
(0.70 %)		 195
(100.00 %)		 3,322,624
(43.19 %)		 478,208
(1.77 %)		 12,316,424
(32.01 %)		 0
(0 %)		 334,854
(1.31 %)		 49,792
(2.45 %)		 29,504
(1.51 %)
8 Asian vine snake (Xishuangbanna 2023)
GCF_028640845.1		 47,555
(4.15 %)		 n/a 13,005
(1.05 %)		 17,560
(1.65 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 0
(0 %)		 331
(0.00 %)		 748
(100.00 %)		 1,484,082
(7.70 %)		 1,033,385
(5.12 %)		 8,266,544
(48.89 %)		 0
(0 %)		 1,020,982
(6.70 %)		 105,815
(4.08 %)		 21,180
(0.68 %)
9 Asiatic toad (SCDJY-AF-19 2020)
GCF_014858855.1		 42,994
(1.39 %)		 n/a 14,061
(0.43 %)		 43,525
(1.76 %)		 36,577
(1.09 %)		 44.37
(98.21 %)		 0
(0 %)		 3,874
(1.79 %)		 748
(100.00 %)		 1,577,809
(1.79 %)		 2,975,473
(12.67 %)		 18,834,930
(58.75 %)		 12
(0.00 %)		 4,966,158
(8.81 %)		 415,605
(4.12 %)		 69,684
(0.72 %)
10 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1		 60,922
(2.51 %)		 n/a 12,544
(0.38 %)		 28,250
(1.22 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,989
(100.00 %)		 8,579,099
(49.81 %)		 831,222
(15.75 %)		 21,718,178
(51.79 %)		 9
(0.00 %)		 4,445,369
(7.00 %)		 105,821
(2.42 %)		 35,197
(0.42 %)
11 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1		 n/a n/a 11,960
(0.40 %)		 25,618
(1.25 %)		 n/a 42.94
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,633
(0.01 %)		 1,412
(100.00 %)		 7,453,535
(49.31 %)		 686,063
(13.00 %)		 19,985,605
(50.32 %)		 8
(0.00 %)		 3,309,683
(5.86 %)		 86,138
(2.16 %)		 30,350
(0.41 %)
12 Australian saltwater crocodile
GCF_001723895.1		 34,090
(2.80 %)		 n/a 12,481
(1.05 %)		 13,920
(1.38 %)		 n/a 43.90
(94.72 %)		 0
(0 %)		 97,039
(5.30 %)		 70
(100.00 %)		 2,480,154
(36.88 %)		 215,190
(0.56 %)		 11,196,176
(26.22 %)		 1,753
(0.04 %)		 50,116
(0.79 %)		 26,647
(0.98 %)		 20,860
(0.80 %)
13 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3		 n/a n/a 16,280
(0.07 %)		 186,628
(1.11 %)		 n/a 46.01
(99.99 %)		 0
(0 %)		 184,422
(0.01 %)		 27,157
(100.00 %)		 28,291,633
(68.19 %)		 7,299,053
(4.96 %)		 211,579
(99.99 %)		 189
(0.00 %)		 n/a 2,388,998
(5.24 %)		 429,355
(0.66 %)
14 Blainville's horned lizard (primary hap 2022)
GCA_026167985.1		 n/a n/a 13,944
(0.92 %)		 16,009
(1.45 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 78
(100.00 %)		 1,636,825
(6.67 %)		 826,053
(3.24 %)		 12,398,166
(40.90 %)		 0
(0 %)		 690,267
(2.36 %)		 86,825
(1.61 %)		 10,396
(0.20 %)
15 Blainville's horned lizard (alternate hap 2022)
GCA_026167975.1		 n/a n/a 12,696
(0.93 %)		 14,818
(1.50 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 64
(0.00 %)		 52
(100.00 %)		 1,468,805
(6.73 %)		 739,796
(3.28 %)		 10,900,584
(40.56 %)		 1
(0.00 %)		 625,575
(2.40 %)		 76,786
(1.60 %)		 9,543
(0.21 %)
16 blonde ray (primary hap 2023)
GCA_963514005.1		 n/a n/a 11,900
(0.54 %)		 27,568
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,647
(100.00 %)		 8,972,805
(66.20 %)		 1,061,811
(8.11 %)		 11,599,498
(58.72 %)		 6
(0.00 %)		 2,430,580
(6.13 %)		 278,499
(6.42 %)		 59,922
(2.12 %)
17 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1		 n/a n/a 13,813
(1.89 %)		 27,088
(4.55 %)		 n/a 40.60
(100.00 %)		 0
(0 %)		 80
(0.00 %)		 297
(100.00 %)		 886,999
(13.24 %)		 358,077
(7.37 %)		 4,625,277
(36.22 %)		 0
(0 %)		 529,249
(5.78 %)		 43,764
(2.79 %)		 26,363
(1.18 %)
18 brown anole (Geneva1000 2022 refseq)
GCF_025583915.1		 38,099
(3.25 %)		 n/a 14,028
(1.05 %)		 19,932
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 114,440
(1.64 %)		 118,178
(98.36 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 261
(0.01 %)		 1,132,418
(4.31 %)		 46,291
(1.18 %)		 17,324
(0.40 %)
19 brown house snake (FMNH 251328 2023)
GCA_027560395.1		 n/a n/a 11,753
(1.00 %)		 29,468
(1.83 %)		 n/a 40.67
(98.13 %)		 169,987
(1.84 %)		 169,987
(1.84 %)		 753,655
(98.16 %)		 1,167,225
(5.67 %)		 768,909
(2.88 %)		 8,825,109
(34.93 %)		 2,464
(0.05 %)		 n/a 53,035
(1.80 %)		 31,929
(1.11 %)
20 brown spotted pit viper
GCF_001527695.2		 24,323
(2.63 %)		 n/a 14,045
(1.20 %)		 27,133
(2.20 %)		 n/a 39.97
(92.15 %)		 115,571
(7.86 %)		 115,571
(7.86 %)		 167,851
(92.14 %)		 1,227,118
(8.97 %)		 819,247
(3.70 %)		 8,328,674
(35.16 %)		 11,808
(0.68 %)		 791,775
(4.53 %)		 68,858
(2.06 %)		 27,809
(0.90 %)
21 Burmese python
GCF_000186305.1		 35,663
(4.16 %)		 n/a 13,718
(1.31 %)		 20,498
(2.06 %)		 n/a 39.61
(96.54 %)		 235,132
(3.52 %)		 235,132
(3.52 %)		 274,244
(96.48 %)		 727,874
(3.19 %)		 409,033
(2.06 %)		 8,318,382
(25.30 %)		 21,222
(0.52 %)		 167,510
(1.87 %)		 29,212
(1.10 %)		 21,586
(0.80 %)
22 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 alternate hap 2022)
GCA_022578425.1		 n/a n/a 13,973
(0.70 %)		 47,231
(2.71 %)		 n/a 41.26
(99.97 %)		 5,955
(0.03 %)		 5,955
(0.03 %)		 60,824
(99.97 %)		 1,793,416
(10.43 %)		 1,374,078
(8.30 %)		 10,043,407
(46.03 %)		 154
(0.01 %)		 1,546,579
(5.96 %)		 89,437
(4.63 %)		 31,854
(0.83 %)
23 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 primary hap 2022)
GCA_022577455.1		 n/a n/a 13,386
(1.04 %)		 21,767
(2.35 %)		 n/a 40.56
(100.00 %)		 0
(0 %)		 256
(0.00 %)		 140
(100.00 %)		 1,354,500
(9.93 %)		 998,712
(8.21 %)		 8,504,468
(46.70 %)		 1
(0.00 %)		 1,050,266
(4.14 %)		 78,768
(3.37 %)		 28,516
(0.88 %)
24 central bearded dragon
GCF_900067755.1		 42,304
(3.53 %)		 n/a 13,856
(1.19 %)		 17,956
(1.96 %)		 n/a 41.81
(96.03 %)		 0
(0 %)		 90,546
(3.99 %)		 13,749
(100.00 %)		 821,868
(3.44 %)		 570,849
(3.46 %)		 9,494,309
(29.78 %)		 161
(0.03 %)		 346,792
(2.81 %)		 48,137
(1.31 %)		 23,199
(0.67 %)
25 Chinese alligator
GCF_000455745.1		 49,884
(3.04 %)		 n/a 14,431
(1.00 %)		 15,854
(1.43 %)		 n/a 44.49
(96.86 %)		 167,965
(3.17 %)		 167,965
(3.17 %)		 177,282
(96.83 %)		 2,919,372
(38.76 %)		 346,310
(1.06 %)		 12,332,417
(29.19 %)		 95
(0.01 %)		 116,160
(0.98 %)		 46,638
(1.19 %)		 26,168
(0.73 %)
26 Chinese soft-shelled turtle
GCF_000230535.1		 45,441
(3.08 %)		 n/a 13,715
(0.96 %)		 16,798
(1.50 %)		 n/a 44.42
(95.68 %)		 185,476
(4.35 %)		 185,476
(4.35 %)		 205,380
(95.65 %)		 1,193,608
(10.92 %)		 455,163
(3.06 %)		 11,234,886
(32.34 %)		 126
(0.01 %)		 282,804
(2.81 %)		 95,997
(2.06 %)		 44,456
(1.00 %)
27 coelacanth
GCF_000225785.1		 40,763
(2.63 %)		 n/a 13,493
(0.78 %)		 17,640
(1.50 %)		 n/a 41.15
(76.37 %)		 269,010
(23.67 %)		 269,010
(23.67 %)		 291,829
(76.33 %)		 2,026,776
(9.13 %)		 571,917
(1.19 %)		 14,630,157
(34.87 %)		 2,038
(0.03 %)		 261,629
(0.61 %)		 42,857
(0.54 %)		 8,573
(0.11 %)
28 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1		 n/a n/a 13,999
(1.21 %)		 18,145
(2.02 %)		 n/a 44.85
(100.00 %)		 0
(0 %)		 286
(0.00 %)		 827
(100.00 %)		 844,126
(6.57 %)		 462,086
(2.56 %)		 8,237,807
(37.72 %)		 0
(0 %)		 573,955
(2.91 %)		 30,098
(0.96 %)		 16,208
(0.52 %)
29 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1		 n/a n/a 13,266
(1.21 %)		 16,750
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 0
(0 %)		 506,831
(2.74 %)		 28,089
(0.98 %)		 14,987
(0.51 %)
30 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1		 n/a n/a 13,073
(0.44 %)		 43,036
(1.95 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 14
(0.00 %)		 12,033
(100.00 %)		 1,489,788
(2.18 %)		 2,621,157
(9.04 %)		 17,154,926
(55.44 %)		 0
(0 %)		 3,161,179
(6.09 %)		 581,115
(7.68 %)		 54,845
(0.65 %)
31 common garter snake
GCF_001077635.1		 26,656
(3.83 %)		 n/a 11,623
(1.25 %)		 17,501
(2.23 %)		 n/a 39.92
(78.84 %)		 168,047
(21.21 %)		 246,220
(21.21 %)		 175,977
(78.79 %)		 606,040
(3.22 %)		 543,646
(2.36 %)		 6,946,141
(27.08 %)		 3,234
(0.23 %)		 224,609
(2.22 %)		 36,264
(1.27 %)		 18,972
(0.73 %)
32 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1		 45,869
(6.34 %)		 n/a 14,279
(1.46 %)		 19,710
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 0
(0 %)		 683
(0.01 %)		 48
(100.00 %)		 4,128,183
(45.62 %)		 513,318
(3.73 %)		 7,172,928
(37.61 %)		 7
(0.00 %)		 477,389
(3.08 %)		 92,858
(2.90 %)		 22,863
(0.95 %)
33 common spadefoot toad (aPelFus1 2024)
GCA_036172605.1		 n/a n/a 14,564
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 349
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 1,677,382
(3.51 %)		 3,229,435
(13.31 %)		 15,027,089
(51.43 %)		 12
(0.00 %)		 3,799,247
(9.03 %)		 282,389
(3.86 %)		 79,263
(0.96 %)
34 common wall lizard
GCF_004329235.1		 56,506
(4.85 %)		 n/a 14,453
(1.36 %)		 20,529
(2.31 %)		 n/a 44.18
(99.81 %)		 0
(0 %)		 4,085
(0.19 %)		 2,161
(100.00 %)		 1,089,164
(8.31 %)		 506,669
(2.12 %)		 7,474,116
(36.15 %)		 2
(0.00 %)		 623,437
(4.37 %)		 122,507
(3.69 %)		 21,388
(0.79 %)
35 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1		 n/a n/a 12,074
(0.39 %)		 46,329
(1.82 %)		 n/a 44.48
(99.99 %)		 156
(0.01 %)		 156
(0.01 %)		 24,351
(99.99 %)		 1,186,360
(1.65 %)		 2,279,941
(13.33 %)		 14,665,548
(61.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,594,926
(9.74 %)		 405,097
(4.49 %)		 61,648
(0.70 %)
36 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1		 45,085
(1.10 %)		 n/a 14,240
(0.38 %)		 46,470
(1.68 %)		 37,594
(0.91 %)		 44.49
(99.80 %)		 0
(0 %)		 4,199
(0.20 %)		 1,306
(100.00 %)		 1,658,204
(1.79 %)		 3,099,513
(13.49 %)		 19,236,510
(62.70 %)		 18
(0.00 %)		 6,217,888
(10.17 %)		 539,919
(4.45 %)		 78,985
(0.67 %)
37 corn snake (Columbia U 2023)
GCF_029531705.1		 53,076
(4.72 %)		 n/a 13,697
(1.21 %)		 20,819
(2.22 %)		 n/a 40.33
(96.60 %)		 3,553
(3.40 %)		 3,553
(3.40 %)		 4,019
(96.60 %)		 4,116,616
(49.72 %)		 917,455
(3.96 %)		 8,460,248
(40.76 %)		 143
(0.00 %)		 602,278
(2.72 %)		 64,946
(2.08 %)		 20,725
(0.74 %)
38 corn snake (EG266 2020)
GCF_001185365.1		 48,995
(3.92 %)		 n/a 13,316
(1.14 %)		 23,595
(2.17 %)		 29,466
(2.61 %)		 40.35
(95.32 %)		 0
(0 %)		 84,947
(4.70 %)		 34,268
(100.00 %)		 1,243,828
(6.50 %)		 884,533
(3.25 %)		 8,373,398
(40.31 %)		 4,035
(0.07 %)		 377,287
(1.66 %)		 66,926
(2.14 %)		 25,639
(0.86 %)
39 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1		 n/a n/a 14,955
(0.23 %)		 n/a n/a 45.61
(99.80 %)		 2,431
(0.20 %)		 2,431
(0.20 %)		 5,958
(99.80 %)		 20,007,151
(76.28 %)		 5,951,819
(19.40 %)		 5,958
(99.80 %)		 49
(0.00 %)		 n/a 991,009
(4.86 %)		 91,447
(0.54 %)
40 corroboree frog (hap2 2023)
GCA_028390025.1		 n/a n/a n/a 54,346
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 0
(0 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 18,782,633
(75.22 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 5,826
(99.76 %)		 23
(0.00 %)		 n/a 990,274
(4.84 %)		 90,184
(0.51 %)
41 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1		 n/a n/a 13,192
(1.36 %)		 19,293
(2.32 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,936
(100.00 %)		 808,341
(4.31 %)		 467,532
(2.91 %)		 6,418,809
(38.02 %)		 0
(0 %)		 518,786
(3.19 %)		 107,080
(3.15 %)		 17,213
(0.72 %)
42 Cretan wall lizard (primary hap 2023)
GCA_951804945.1		 n/a n/a 14,249
(1.37 %)		 19,304
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 47
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 882,564
(4.30 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,363
(38.65 %)		 2
(0.00 %)		 586,225
(3.38 %)		 117,222
(3.18 %)		 18,707
(0.71 %)
43 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1		 50,318
(3.53 %)		 n/a 15,109
(1.08 %)		 19,280
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 0
(0 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 0
(0 %)		 407,696
(1.71 %)		 110,838
(2.71 %)		 30,093
(0.82 %)
44 diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023)
GCA_027887205.1		 n/a n/a 15,081
(1.08 %)		 19,115
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.98 %)		 0
(0 %)		 127
(0.02 %)		 59
(100.00 %)		 4,093,707
(46.36 %)		 404,046
(1.70 %)		 11,113,266
(33.78 %)		 1
(0.01 %)		 405,600
(1.68 %)		 111,129
(2.68 %)		 30,307
(0.82 %)
45 eastern brown snake
GCF_900518735.1		 34,614
(3.30 %)		 n/a 13,625
(1.22 %)		 21,795
(2.00 %)		 n/a 39.84
(97.54 %)		 0
(0 %)		 59,472
(2.47 %)		 28,550
(100.00 %)		 1,020,240
(5.86 %)		 663,810
(2.41 %)		 8,140,554
(39.61 %)		 3,387
(0.06 %)		 230,860
(1.32 %)		 52,895
(2.12 %)		 20,320
(0.72 %)
46 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1		 n/a n/a 13,413
(1.19 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 553
(0.01 %)		 771
(99.99 %)		 1,003,504
(9.02 %)		 621,617
(3.54 %)		 8,327,948
(30.44 %)		 3
(0.00 %)		 583,206
(2.41 %)		 117,734
(4.05 %)		 30,498
(1.01 %)
47 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1		 n/a n/a 13,882
(0.43 %)		 35,323
(1.46 %)		 n/a 46.78
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,745
(0.01 %)		 1,002
(100.00 %)		 1,769,293
(1.99 %)		 2,023,109
(16.33 %)		 16,148,710
(60.55 %)		 22
(0.00 %)		 5,852,023
(9.72 %)		 618,204
(5.89 %)		 74,394
(0.76 %)
48 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1		 n/a n/a 13,632
(0.43 %)		 35,630
(1.52 %)		 n/a 46.77
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,773
(0.01 %)		 590
(100.00 %)		 1,759,193
(1.98 %)		 2,013,186
(16.21 %)		 16,138,898
(60.55 %)		 17
(0.00 %)		 5,811,499
(9.67 %)		 614,432
(5.85 %)		 72,993
(0.75 %)
49 elephant shark (2021)
GCF_018977255.1		 32,553
(4.75 %)		 n/a 11,542
(1.51 %)		 18,900
(3.25 %)		 n/a 42.85
(99.99 %)		 2,060
(0.01 %)		 14,404
(0.01 %)		 3,822
(99.99 %)		 1,971,730
(36.60 %)		 433,955
(3.92 %)		 5,654,656
(37.91 %)		 11
(0.00 %)		 553,756
(3.85 %)		 41,081
(3.43 %)		 17,151
(0.98 %)
50 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1		 43,156
(1.65 %)		 n/a 12,749
(0.40 %)		 19,519
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 0
(0 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,962
(100.00 %)		 9,420,365
(63.82 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,566
(43.88 %)		 0
(0 %)		 2,903,280
(4.44 %)		 41,682
(1.08 %)		 16,895
(0.30 %)
51 epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021)
GCA_020745765.1		 n/a n/a 12,650
(0.38 %)		 20,614
(1.06 %)		 n/a 42.75
(97.99 %)		 0
(0 %)		 3,552
(2.01 %)		 4,000
(100.00 %)		 9,489,793
(70.34 %)		 976,827
(6.97 %)		 21,183,330
(44.32 %)		 1
(0.00 %)		 3,092,395
(4.62 %)		 42,917
(1.08 %)		 13,522
(0.16 %)
52 European common frog (2021)
GCF_905171775.1		 51,633
(1.57 %)		 n/a 13,864
(0.46 %)		 39,978
(1.88 %)		 57,578
(1.85 %)		 44.15
(99.36 %)		 0
(0 %)		 1,860
(0.64 %)		 554
(100.00 %)		 1,804,642
(3.42 %)		 2,925,830
(9.39 %)		 18,921,726
(55.43 %)		 8
(0.00 %)		 3,384,162
(6.05 %)		 641,799
(7.66 %)		 62,649
(0.67 %)
53 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1		 54,631
(7.46 %)		 n/a 17,072
(1.89 %)		 34,801
(5.07 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,009
(0.02 %)		 380
(100.00 %)		 761,522
(5.99 %)		 913,306
(13.25 %)		 5,767,879
(35.48 %)		 3
(0.00 %)		 1,603,437
(8.94 %)		 120,990
(6.12 %)		 81,342
(2.93 %)
54 European eel (alternate hap 2020)
GCA_013347865.1		 n/a n/a 17,177
(2.21 %)		 36,037
(5.58 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 2,338
(100.00 %)		 811,567
(5.37 %)		 759,871
(7.97 %)		 5,672,321
(27.30 %)		 0
(0 %)		 731,152
(4.88 %)		 127,837
(8.05 %)		 92,776
(4.12 %)
55 European eel (primary hap 2020)
GCF_013347855.1		 64,143
(9.57 %)		 n/a 17,054
(2.22 %)		 34,278
(5.56 %)		 79,684
(7.37 %)		 43.64
(99.61 %)		 0
(0 %)		 640
(0.40 %)		 54
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,521
(8.15 %)		 5,700,890
(27.40 %)		 2
(0.00 %)		 774,914
(5.14 %)		 130,346
(8.19 %)		 94,446
(4.12 %)
56 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1		 24,643
(2.02 %)		 n/a 14,238
(1.16 %)		 21,782
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 0
(0 %)		 153
(0.23 %)		 591
(100.00 %)		 1,174,615
(6.99 %)		 436,937
(2.95 %)		 8,308,817
(39.80 %)		 0
(0 %)		 824,335
(3.45 %)		 83,089
(2.82 %)		 33,674
(0.93 %)
57 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1		 n/a n/a 14,220
(1.16 %)		 21,979
(2.19 %)		 n/a 44.64
(99.68 %)		 0
(0 %)		 177
(0.32 %)		 381
(100.00 %)		 1,169,660
(6.57 %)		 432,998
(2.45 %)		 8,403,791
(39.55 %)		 1
(0.00 %)		 711,098
(3.13 %)		 82,695
(2.80 %)		 33,414
(0.92 %)
58 European pond turtle (hap1 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017835.1		 n/a n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 0
(0 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 5
(0.00 %)		 495,884
(2.08 %)		 136,002
(2.92 %)		 30,671
(0.72 %)
59 European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017845.1		 n/a n/a 14,971
(1.00 %)		 20,099
(1.61 %)		 n/a 44.79
(99.77 %)		 0
(0 %)		 130
(0.23 %)		 156
(100.00 %)		 1,536,611
(12.44 %)		 471,903
(2.16 %)		 11,129,943
(35.50 %)		 1
(0.00 %)		 522,759
(2.15 %)		 138,047
(2.94 %)		 31,391
(0.73 %)
60 fence lizard
GCF_019175285.1		 48,391
(3.65 %)		 n/a 14,000
(1.07 %)		 17,384
(1.71 %)		 n/a 41.25
(97.53 %)		 0
(0 %)		 48,138
(2.47 %)		 45,012
(100.00 %)		 1,357,856
(6.95 %)		 596,824
(1.92 %)		 11,090,372
(34.38 %)		 926
(0.05 %)		 356,377
(1.59 %)		 67,007
(1.51 %)		 13,181
(0.35 %)
61 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1		 n/a n/a 2,936
(0.15 %)		 17,722
(1.38 %)		 n/a 38.51
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 13,751
(100.00 %)		 919,882
(3.50 %)		 1,443,294
(10.50 %)		 7,705,012
(57.28 %)		 0
(0 %)		 2,148,861
(9.45 %)		 74,669
(1.25 %)		 7,295
(0.13 %)
62 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1		 38,238
(0.68 %)		 n/a 15,452
(0.21 %)		 47,500
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 0
(0 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,467
(100.00 %)		 4,258,941
(3.44 %)		 7,150,261
(12.27 %)		 9,476
(98.01 %)		 3
(0.00 %)		 n/a n/a n/a
63 Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035715.1		 n/a n/a 14,392
(0.90 %)		 17,909
(1.50 %)		 n/a 42.86
(99.84 %)		 213
(0.16 %)		 213
(0.16 %)		 836
(99.84 %)		 1,440,070
(7.19 %)		 620,131
(2.54 %)		 10,919,950
(45.21 %)		 2
(0.00 %)		 523,070
(2.35 %)		 47,933
(1.03 %)		 18,609
(0.43 %)
64 Florida worm lizard (hap2 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035675.1		 n/a n/a 14,331
(0.90 %)		 17,854
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 1
(0.00 %)		 242
(0.28 %)		 78
(100.00 %)		 1,426,833
(7.17 %)		 616,690
(2.63 %)		 10,819,054
(45.31 %)		 1
(0.00 %)		 531,662
(2.36 %)		 47,454
(1.03 %)		 18,400
(0.42 %)
65 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1		 n/a n/a 12,821
(0.47 %)		 30,612
(1.44 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,651
(100.00 %)		 1,139,595
(1.64 %)		 1,170,215
(3.77 %)		 17,091,511
(52.44 %)		 0
(0 %)		 995,544
(2.57 %)		 235,170
(4.50 %)		 33,394
(0.50 %)
66 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2		 n/a n/a 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 0
(0 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,331,879
(1.68 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,806
(52.85 %)		 3
(0.00 %)		 1,182,995
(2.68 %)		 270,923
(4.52 %)		 38,622
(0.50 %)
67 gharial (Ggan-Ray 2016)
GCF_001723915.1		 32,284
(2.61 %)		 n/a 12,194
(1.03 %)		 12,758
(1.30 %)		 n/a 43.95
(73.60 %)		 0
(0 %)		 248,526
(26.44 %)		 81
(100.00 %)		 2,589,103
(36.89 %)		 243,334
(0.51 %)		 11,279,606
(20.80 %)		 29,443
(5.09 %)		 125,202
(1.53 %)		 26,651
(0.60 %)		 20,614
(0.47 %)
68 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1		 n/a n/a 14,254
(0.94 %)		 23,016
(2.00 %)		 n/a 45.13
(99.95 %)		 0
(0 %)		 61
(0.05 %)		 298
(100.00 %)		 1,230,357
(13.08 %)		 350,230
(2.85 %)		 11,854,314
(33.03 %)		 2
(0.00 %)		 335,615
(1.39 %)		 39,919
(1.95 %)		 26,198
(0.77 %)
69 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1		 n/a n/a 14,151
(0.94 %)		 23,338
(1.95 %)		 n/a 45.15
(99.95 %)		 0
(0 %)		 118
(0.05 %)		 160
(100.00 %)		 1,232,693
(12.81 %)		 332,737
(2.19 %)		 11,907,298
(32.91 %)		 3
(0.00 %)		 284,469
(1.22 %)		 40,660
(1.87 %)		 25,990
(0.77 %)
70 giant manta (hap1 2023)
GCA_030028105.1		 n/a n/a 12,432
(0.38 %)		 24,821
(1.16 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 0
(0 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 7,913,208
(49.68 %)		 969,352
(14.22 %)		 20,235,210
(54.42 %)		 17
(0.00 %)		 4,636,724
(7.12 %)		 110,678
(1.74 %)		 30,504
(0.36 %)
71 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1		 n/a n/a 12,198
(0.42 %)		 23,127
(1.17 %)		 n/a 42.85
(98.49 %)		 0
(0 %)		 1,742
(1.51 %)		 1,558
(100.00 %)		 7,431,472
(52.41 %)		 716,951
(7.28 %)		 19,456,793
(50.99 %)		 9
(0.01 %)		 2,419,836
(4.27 %)		 91,414
(1.45 %)		 65,413
(0.90 %)
72 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2		 57,442
(3.17 %)		 n/a 14,852
(1.00 %)		 18,125
(1.49 %)		 31,841
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 0
(0 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,271
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 0
(0 %)		 474,978
(1.73 %)		 71,687
(2.29 %)		 21,793
(0.54 %)
73 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1		 n/a n/a 13,359
(0.95 %)		 19,347
(1.51 %)		 n/a 44.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 8,736
(100.00 %)		 1,404,513
(13.79 %)		 334,726
(2.35 %)		 9,735,007
(33.33 %)		 0
(0 %)		 468,758
(1.89 %)		 61,680
(2.32 %)		 18,869
(0.54 %)
74 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023)
GCA_029215685.1		 n/a n/a 12,291
(1.06 %)		 19,125
(2.02 %)		 n/a 40.55
(100.00 %)		 584
(0.00 %)		 584
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 1,259,781
(7.92 %)		 925,571
(7.56 %)		 7,739,320
(45.92 %)		 3
(0.00 %)		 840,495
(4.04 %)		 73,681
(2.81 %)		 26,366
(0.92 %)
75 gopher snake (HBS135680 primary hap 2023)
GCA_029215655.1		 n/a n/a 13,289
(1.09 %)		 20,513
(2.09 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 603
(0.00 %)		 603
(0.00 %)		 1,029
(100.00 %)		 1,325,747
(8.26 %)		 973,338
(7.56 %)		 8,352,703
(45.38 %)		 4
(0.00 %)		 888,155
(3.86 %)		 72,941
(2.59 %)		 27,387
(0.91 %)
76 graceful crag lizard (Gifberg primary hap 2022)
GCF_027244095.1		 86,666
(4.30 %)		 n/a 14,269
(0.91 %)		 18,195
(1.57 %)		 n/a 44.82
(100.00 %)		 0
(0 %)		 42
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 1,644,976
(6.04 %)		 823,058
(3.00 %)		 11,991,046
(41.43 %)		 0
(0 %)		 489,782
(1.69 %)		 80,718
(1.90 %)		 27,916
(0.61 %)
77 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1		 n/a n/a 14,094
(1.03 %)		 17,875
(1.65 %)		 n/a 41.62
(99.95 %)		 0
(0 %)		 28
(0.05 %)		 30
(100.00 %)		 1,100,228
(6.21 %)		 423,695
(1.33 %)		 11,521,828
(32.55 %)		 2
(0.00 %)		 258,014
(1.05 %)		 62,978
(2.00 %)		 24,755
(0.81 %)
78 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1		 n/a n/a 13,758
(1.02 %)		 16,909
(1.62 %)		 n/a 41.53
(99.01 %)		 19
(0.99 %)		 19
(0.99 %)		 52
(99.01 %)		 1,069,189
(6.12 %)		 410,262
(1.25 %)		 11,390,195
(32.28 %)		 0
(0 %)		 233,593
(0.96 %)		 60,835
(1.92 %)		 23,191
(0.77 %)
79 gray bichir
GCF_016835505.1		 48,178
(1.88 %)		 n/a 12,963
(0.44 %)		 24,479
(1.21 %)		 n/a 39.32
(99.96 %)		 0
(0 %)		 3,166
(0.04 %)		 9,856
(100.00 %)		 1,765,862
(2.54 %)		 1,017,723
(2.38 %)		 20,924,763
(47.66 %)		 2
(0.00 %)		 997,434
(2.53 %)		 98,862
(1.64 %)		 24,750
(0.32 %)
80 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1		 n/a n/a 20
(0.30 %)		 63
(2.06 %)		 n/a 45.02
(99.98 %)		 0
(0 %)		 28
(0.02 %)		 39
(100.00 %)		 8,165
(60.43 %)		 2,740
(27.09 %)		 15,863
(31.63 %)		 0
(0 %)		 16,359
(15.02 %)		 167
(5.51 %)		 65
(0.61 %)
81 great white shark (primary hap 2021)
GCF_017639515.1		 49,865
(1.46 %)		 n/a 13,010
(0.37 %)		 19,263
(0.92 %)		 46,152
(1.30 %)		 45.21
(99.55 %)		 0
(0 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 1,046,023
(4.00 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,563
(52.42 %)		 11
(0.00 %)		 8,687,289
(11.05 %)		 77,021
(1.94 %)		 14,712
(0.15 %)
82 green anole (JA03-04 2024)
GCF_035594765.1		 56,324
(5.85 %)		 n/a 14,020
(1.12 %)		 20,096
(1.86 %)		 n/a 40.60
(98.38 %)		 0
(0 %)		 841
(1.62 %)		 211
(100.00 %)		 4,859,635
(53.14 %)		 909,429
(5.19 %)		 8,304,332
(44.07 %)		 5
(0.00 %)		 1,056,606
(4.88 %)		 56,404
(1.78 %)		 20,393
(0.51 %)
83 green anole (v1 2011)
GCF_000090745.1		 38,096
(3.63 %)		 n/a 13,021
(1.08 %)		 20,780
(1.86 %)		 38,266
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 35,533
(5.44 %)		 41,987
(94.56 %)		 2,415,433
(28.92 %)		 702,538
(2.99 %)		 8,199,653
(39.69 %)		 25
(0.00 %)		 674,365
(3.47 %)		 42,151
(1.18 %)		 15,374
(0.36 %)
84 green anole (v2 2010)
GCF_000090745.2		 38,096
(3.63 %)		 n/a 13,140
(1.11 %)		 20,772
(1.86 %)		 38,229
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 35,530
(5.44 %)		 41,986
(94.56 %)		 4,455,733
(51.37 %)		 702,537
(2.99 %)		 8,199,580
(39.69 %)		 25
(0.00 %)		 674,353
(3.47 %)		 42,151
(1.18 %)		 15,935
(0.39 %)
85 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2		 n/a n/a 13,635
(1.05 %)		 19,414
(1.61 %)		 n/a 44.16
(99.95 %)		 60
(0.05 %)		 60
(0.05 %)		 6,797
(99.95 %)		 3,221,668
(44.97 %)		 275,275
(1.28 %)		 9,802,895
(32.14 %)		 2
(0.00 %)		 394,278
(1.72 %)		 45,469
(1.48 %)		 25,997
(0.89 %)
86 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2		 84,366
(4.63 %)		 n/a 14,725
(1.06 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 0
(0 %)		 298
(0.56 %)		 93
(100.00 %)		 1,701,640
(14.83 %)		 304,306
(1.25 %)		 11,135,147
(31.96 %)		 0
(0 %)		 429,994
(1.68 %)		 49,025
(1.44 %)		 26,933
(0.68 %)
87 High Himalaya frog
GCF_000935625.1		 26,109
(1.87 %)		 n/a 13,695
(0.94 %)		 28,085
(2.39 %)		 n/a 42.55
(96.32 %)		 122,325
(3.70 %)		 122,325
(3.70 %)		 147,513
(96.30 %)		 536,058
(1.39 %)		 794,563
(5.48 %)		 11,465,450
(37.44 %)		 1,716
(0.17 %)		 725,825
(4.49 %)		 219,772
(3.92 %)		 32,652
(0.67 %)
88 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1		 n/a n/a 15,006
(0.28 %)		 22,481
(0.80 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 225
(0.03 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,532
(99.97 %)		 1,344,546
(5.76 %)		 2,364,825
(28.34 %)		 5,088
(99.53 %)		 5
(0.00 %)		 14,350,128
(14.12 %)		 89,340
(2.10 %)		 82,092
(1.20 %)
89 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1		 n/a n/a 12,766
(0.30 %)		 21,591
(0.87 %)		 n/a 44.88
(99.43 %)		 0
(0 %)		 2,790
(0.57 %)		 1,496
(100.00 %)		 1,008,880
(5.19 %)		 1,596,129
(22.32 %)		 22,180,341
(62.98 %)		 2
(0.00 %)		 9,762,254
(11.27 %)		 82,276
(1.85 %)		 14,696
(0.13 %)
90 hourglass treefrog (maternal 2023)
GCA_027789725.1		 n/a n/a 14,359
(0.89 %)		 32,575
(2.67 %)		 n/a 43.88
(95.18 %)		 788
(4.82 %)		 788
(4.82 %)		 3,358
(95.18 %)		 922,807
(2.38 %)		 1,744,603
(15.45 %)		 10,318,168
(48.47 %)		 0
(0 %)		 3,525,571
(8.67 %)		 244,270
(5.02 %)		 29,547
(0.61 %)
91 hourglass treefrog (paternal 2023)
GCA_027789765.1		 n/a n/a 14,058
(0.89 %)		 31,050
(2.69 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 0
(0 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 3
(0.00 %)		 3,539,111
(9.05 %)		 235,277
(5.56 %)		 28,414
(0.63 %)
92 Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024)
GCA_036172795.1		 n/a n/a 14,141
(0.97 %)		 22,232
(2.16 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 262
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 944,742
(4.86 %)		 1,927,659
(22.26 %)		 8,988,510
(49.29 %)		 1
(0.00 %)		 3,465,509
(10.62 %)		 77,721
(1.73 %)		 13,802
(0.30 %)
93 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022)
GCA_026652325.1		 n/a 139,896
(0.54 %)		 15,136
(0.10 %)		 n/a n/a 45.95
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 922
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 4,478,794
(1.33 %)		 6,452,537
(8.86 %)		 1,189
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 n/a 1,581,360
(4.00 %)		 144,588
(0.32 %)
94 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1		 n/a n/a 17,858
(2.43 %)		 32,738
(5.46 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 0
(0 %)		 3
(0.00 %)		 4,333
(100.00 %)		 583,632
(3.71 %)		 418,411
(3.74 %)		 5,198,155
(21.50 %)		 1
(0.00 %)		 276,314
(1.94 %)		 76,879
(3.71 %)		 57,281
(2.37 %)
95 Komodo dragon (SLA01 2019)
GCF_004798865.1		 43,331
(4.33 %)		 n/a 13,543
(1.31 %)		 18,081
(2.11 %)		 n/a 44.04
(99.03 %)		 0
(0 %)		 19,737
(0.97 %)		 1,411
(100.00 %)		 753,603
(4.91 %)		 263,965
(1.41 %)		 8,061,012
(24.65 %)		 582
(0.01 %)		 130,387
(0.66 %)		 49,808
(4.28 %)		 39,034
(2.67 %)
96 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1		 n/a n/a 13,155
(1.15 %)		 22,239
(2.06 %)		 n/a 41.01
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 6,800
(100.00 %)		 1,155,093
(7.75 %)		 707,777
(4.25 %)		 7,071,611
(44.00 %)		 0
(0 %)		 701,636
(4.02 %)		 104,556
(4.39 %)		 22,349
(0.88 %)
97 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1		 n/a n/a 13,350
(1.17 %)		 18,904
(1.93 %)		 n/a 40.96
(99.78 %)		 0
(0 %)		 769
(0.22 %)		 56
(100.00 %)		 1,209,793
(7.69 %)		 762,735
(5.06 %)		 7,424,674
(44.80 %)		 4
(0.00 %)		 794,949
(4.07 %)		 110,631
(4.07 %)		 23,739
(0.88 %)
98 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq G10K)
GCF_009764565.3		 73,318
(3.97 %)		 n/a 14,610
(1.03 %)		 16,358
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 0
(0 %)		 668
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,694,449
(14.90 %)		 304,773
(1.14 %)		 11,121,962
(34.21 %)		 3
(0.00 %)		 670,729
(2.51 %)		 35,485
(1.36 %)		 19,615
(0.51 %)
99 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2		 n/a n/a 11,035
(1.05 %)		 16,064
(1.50 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 7
(0.00 %)		 9,006
(100.00 %)		 2,685,200
(47.08 %)		 208,060
(1.19 %)		 7,184,246
(33.31 %)		 0
(0 %)		 442,748
(2.46 %)		 25,133
(1.42 %)		 15,054
(0.75 %)
100 leopard gecko (TG4126 2023)
GCF_028583425.1		 37,120
(2.89 %)		 n/a 14,358
(0.93 %)		 23,080
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 0
(0 %)		 62
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 969,188
(4.21 %)		 557,245
(2.88 %)		 11,096,222
(37.91 %)		 0
(0 %)		 608,752
(2.77 %)		 82,956
(2.56 %)		 27,406
(0.84 %)
101 Lilford's wall lizard (2023)
GCA_947686815.1		 n/a 469,920
(50.83 %)		 14,239
(1.41 %)		 19,740
(2.33 %)		 n/a 43.80
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,346
(0.02 %)		 2,149
(100.00 %)		 830,790
(4.33 %)		 445,450
(2.12 %)		 7,171,057
(36.69 %)		 79
(0.00 %)		 484,294
(2.64 %)		 86,200
(2.56 %)		 19,378
(0.77 %)
102 little skate (New England 2023)
GCF_028641065.1		 40,008
(3.35 %)		 n/a 11,836
(0.67 %)		 25,770
(1.80 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 0
(0 %)		 862
(0.00 %)		 1,769
(100.00 %)		 8,221,960
(66.45 %)		 1,044,111
(3.71 %)		 10,050,264
(53.79 %)		 1
(0.00 %)		 1,424,247
(4.33 %)		 205,567
(4.36 %)		 21,218
(0.48 %)
103 loggerhead turtle (SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.1		 61,631
(3.99 %)		 n/a 14,678
(1.05 %)		 17,405
(1.52 %)		 42,180
(2.89 %)		 44.04
(99.90 %)		 0
(0 %)		 745
(0.10 %)		 2,008
(100.00 %)		 1,279,721
(12.58 %)		 319,729
(1.29 %)		 10,705,612
(33.91 %)		 4
(0.00 %)		 545,387
(2.26 %)		 49,015
(1.39 %)		 25,064
(0.63 %)
104 mainland tiger snake
GCF_900518725.1		 34,251
(3.18 %)		 n/a 13,445
(1.15 %)		 23,410
(1.90 %)		 n/a 39.72
(95.17 %)		 0
(0 %)		 79,478
(4.84 %)		 52,414
(100.00 %)		 1,081,503
(6.00 %)		 711,408
(2.47 %)		 8,047,065
(40.24 %)		 3,772
(0.08 %)		 265,750
(1.48 %)		 61,669
(2.47 %)		 18,916
(0.65 %)
105 many-banded krait (BM01 2022)
GCA_023653725.1		 n/a n/a 13,269
(1.19 %)		 18,533
(1.94 %)		 n/a 39.87
(99.25 %)		 0
(0 %)		 1,631
(0.75 %)		 448
(100.00 %)		 1,104,569
(6.42 %)		 703,174
(3.07 %)		 8,451,422
(40.97 %)		 0
(0 %)		 395,083
(2.25 %)		 65,260
(2.74 %)		 19,850
(0.80 %)
106 marbled whiptail (SIMRID8450 2020)
GCA_014337955.1		 n/a n/a 13,646
(1.27 %)		 18,378
(2.09 %)		 n/a 42.67
(94.37 %)		 0
(0 %)		 166,840
(5.67 %)		 3,826
(100.00 %)		 809,278
(4.31 %)		 439,020
(1.66 %)		 8,665,254
(33.02 %)		 23,254
(0.24 %)		 223,741
(0.91 %)		 41,638
(1.70 %)		 20,448
(0.83 %)
107 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1		 n/a n/a 13,282
(1.16 %)		 18,653
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 1,187,501
(7.72 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,428,147
(45.35 %)		 13
(0.00 %)		 770,603
(3.87 %)		 101,007
(3.95 %)		 24,179
(0.84 %)
108 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1		 n/a n/a 10,549
(1.13 %)		 20,171
(2.08 %)		 n/a 41.02
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 12
(0.00 %)		 9,587
(100.00 %)		 889,533
(7.84 %)		 565,831
(6.37 %)		 5,968,624
(41.74 %)		 0
(0 %)		 615,578
(4.07 %)		 73,632
(3.80 %)		 21,339
(1.17 %)
109 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1		 62,007
(3.15 %)		 n/a 14,883
(0.96 %)		 18,524
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 0
(0 %)		 1,866
(3.64 %)		 621
(100.00 %)		 1,372,189
(11.32 %)		 472,501
(3.42 %)		 11,362,604
(34.69 %)		 1
(0.00 %)		 910,675
(2.73 %)		 73,700
(2.04 %)		 22,443
(0.52 %)
110 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1		 n/a n/a 15,425
(0.94 %)		 20,005
(1.48 %)		 n/a 44.46
(95.51 %)		 1,790
(4.49 %)		 1,790
(4.49 %)		 4,782
(95.51 %)		 1,404,726
(11.28 %)		 453,302
(2.47 %)		 11,996,092
(34.08 %)		 3
(0.00 %)		 712,154
(2.19 %)		 77,167
(2.14 %)		 23,282
(0.51 %)
111 mimic poison frog (primary hap 2023)
GCA_032444005.1		 n/a n/a 14,957
(0.34 %)		 n/a n/a 44.95
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,686
(100.00 %)		 1,716,760
(1.89 %)		 4,088,695
(23.45 %)		 2,437
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 10,590,500
(14.66 %)		 n/a n/a
112 Mississippi paddlefish
GCF_017654505.1		 66,226
(6.17 %)		 n/a 21,806
(1.85 %)		 31,525
(3.80 %)		 n/a 39.02
(99.89 %)		 2,957
(0.11 %)		 2,963
(0.11 %)		 7,192
(99.89 %)		 1,126,936
(3.66 %)		 877,525
(6.33 %)		 9,039,918
(36.85 %)		 1
(0.00 %)		 775,360
(3.40 %)		 29,954
(1.06 %)		 14,005
(0.40 %)
113 Northern rubber boa (HBS 135849 alternate hap 2022)
GCA_023362785.1		 n/a n/a 12,816
(1.09 %)		 18,099
(1.83 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 0
(0 %)		 84
(0.00 %)		 224
(100.00 %)		 1,081,107
(4.01 %)		 728,703
(4.64 %)		 6,961,724
(42.46 %)		 1
(0.00 %)		 702,049
(3.73 %)		 128,617
(3.90 %)		 25,981
(1.05 %)
114 Northern rubber boa (HBS 135849 primary hap 2022)
GCA_023362775.1		 n/a n/a 13,531
(1.08 %)		 18,971
(1.81 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 0
(0 %)		 85
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 1,138,891
(3.99 %)		 798,941
(5.00 %)		 7,476,142
(42.85 %)		 1
(0.00 %)		 757,393
(3.80 %)		 135,874
(3.88 %)		 27,035
(1.02 %)
115 Northwestern pond turtle (WTP2003 alternate hap 2022)
GCA_022086895.1		 n/a n/a 14,212
(1.00 %)		 20,203
(1.65 %)		 n/a 44.72
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,800
(0.01 %)		 2,508
(100.00 %)		 4,246,095
(48.91 %)		 442,393
(1.88 %)		 10,453,096
(35.71 %)		 43
(0.00 %)		 450,873
(2.62 %)		 134,572
(3.12 %)		 28,350
(0.78 %)
116 Northwestern pond turtle (WTP2003 primary hap 2022)
GCA_022086475.1		 n/a n/a 14,862
(1.02 %)		 19,830
(1.62 %)		 n/a 44.76
(100.00 %)		 0
(0 %)		 148
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 4,413,681
(48.88 %)		 459,701
(1.92 %)		 11,014,102
(35.89 %)		 1
(0.00 %)		 468,618
(2.09 %)		 141,800
(3.08 %)		 30,071
(0.78 %)
117 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1		 n/a n/a 13,448
(1.31 %)		 17,745
(2.07 %)		 n/a 40.20
(99.98 %)		 73
(0.02 %)		 73
(0.02 %)		 116
(99.98 %)		 741,052
(2.98 %)		 411,477
(3.31 %)		 7,668,994
(30.14 %)		 0
(0 %)		 318,343
(2.06 %)		 34,560
(2.18 %)		 21,974
(1.10 %)
118 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1		 n/a n/a 13,421
(1.31 %)		 17,659
(2.08 %)		 n/a 40.15
(99.66 %)		 93
(0.34 %)		 93
(0.34 %)		 158
(99.66 %)		 733,358
(2.95 %)		 403,552
(3.04 %)		 7,746,871
(29.97 %)		 0
(0 %)		 294,855
(1.92 %)		 34,363
(2.08 %)		 21,752
(1.10 %)
119 one-colored caecilian (2021)
GCA_901765095.2		 n/a n/a 14,569
(0.43 %)		 30,498
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 0
(0 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,894,383
(1.68 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,143
(52.43 %)		 5
(0.00 %)		 1,718,803
(3.44 %)		 414,828
(3.91 %)		 47,796
(0.38 %)
120 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1		 n/a n/a 7,223
(0.52 %)		 11,927
(1.11 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 76
(0.00 %)		 4,081
(100.00 %)		 988,792
(3.99 %)		 1,766,202
(10.24 %)		 9,974,001
(52.99 %)		 0
(0 %)		 1,733,898
(6.80 %)		 64,462
(1.33 %)		 4,213
(0.08 %)
121 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1		 n/a n/a 14,522
(0.54 %)		 21,861
(1.14 %)		 n/a 39.52
(98.39 %)		 0
(0 %)		 3,681
(1.61 %)		 1,318
(100.00 %)		 1,928,844
(4.34 %)		 3,684,477
(13.44 %)		 19,091,818
(55.21 %)		 1
(0.00 %)		 4,715,600
(8.73 %)		 127,760
(1.34 %)		 9,458
(0.10 %)
122 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1		 n/a n/a 13,365
(1.26 %)		 17,388
(1.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 99
(0.00 %)		 279
(100.00 %)		 726,428
(2.81 %)		 331,756
(2.05 %)		 7,184,711
(33.57 %)		 2
(0.00 %)		 316,815
(2.51 %)		 51,973
(2.70 %)		 19,565
(0.92 %)
123 Papuan ground boa (hap2 2024)
GCA_035149785.1		 n/a n/a 13,390
(1.26 %)		 17,496
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 101
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 728,574
(2.82 %)		 348,605
(2.13 %)		 7,199,124
(33.55 %)		 1
(0.00 %)		 318,788
(2.43 %)		 51,807
(2.69 %)		 19,758
(0.92 %)
124 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023)
GCA_033958435.1		 n/a n/a 14,675
(1.05 %)		 16,697
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 0
(0 %)		 12
(0.00 %)		 134
(100.00 %)		 3,772,260
(47.94 %)		 322,081
(1.52 %)		 11,123,166
(34.14 %)		 0
(0 %)		 448,027
(1.56 %)		 129,645
(3.29 %)		 28,529
(1.18 %)
125 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2		 n/a n/a 10,906
(1.98 %)		 19,820
(4.33 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,516
(100.00 %)		 390,896
(3.25 %)		 482,493
(7.83 %)		 4,361,670
(34.36 %)		 0
(0 %)		 491,019
(5.12 %)		 52,508
(3.70 %)		 21,519
(1.51 %)
126 plains spadefoot toad (primary hap 2022)
GCF_027358695.1		 41,009
(4.67 %)		 n/a 13,912
(2.00 %)		 25,745
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 0
(0 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 497,976
(3.84 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,342
(36.26 %)		 1
(0.00 %)		 748,493
(5.83 %)		 72,598
(4.35 %)		 32,385
(1.89 %)
127 prickly gecko (False Entrance Well CCM8104 2023)
GCF_032191835.1		 35,366
(2.07 %)		 n/a 14,394
(0.79 %)		 23,371
(1.60 %)		 n/a 44.78
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,608
(0.01 %)		 661
(100.00 %)		 1,995,033
(8.75 %)		 823,022
(6.51 %)		 12,116,860
(46.84 %)		 9
(0.00 %)		 1,818,752
(4.81 %)		 117,191
(3.14 %)		 39,240
(0.76 %)
128 Puerto Rican coqui (hap1 2024)
GCA_035609145.1		 n/a n/a 13,881
(0.57 %)		 32,313
(1.67 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 659
(0.00 %)		 963
(100.00 %)		 1,044,181
(1.98 %)		 1,442,189
(16.51 %)		 14,710,175
(54.00 %)		 6
(0.00 %)		 4,070,195
(8.73 %)		 501,931
(8.81 %)		 49,483
(0.82 %)
129 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1		 n/a n/a 13,892
(0.57 %)		 32,011
(1.64 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 16
(0.00 %)		 685
(0.00 %)		 843
(100.00 %)		 1,042,636
(2.00 %)		 1,430,690
(16.22 %)		 14,621,029
(53.91 %)		 19
(0.00 %)		 4,063,379
(8.75 %)		 503,166
(8.84 %)		 49,100
(0.82 %)
130 red-eared slider turtle
GCF_013100865.1		 47,272
(3.27 %)		 n/a 13,909
(1.05 %)		 16,674
(1.54 %)		 n/a 43.81
(96.14 %)		 0
(0 %)		 25,390
(3.86 %)		 138
(100.00 %)		 1,686,633
(15.06 %)		 271,837
(0.81 %)		 10,802,900
(30.74 %)		 1,247
(0.04 %)		 155,059
(0.69 %)		 93,811
(1.90 %)		 24,960
(0.62 %)
131 reedfish (alternate hap 2021)
GCA_900700845.3		 n/a n/a 11,382
(0.41 %)		 28,399
(1.33 %)		 n/a 39.39
(99.99 %)		 17
(0.01 %)		 17
(0.01 %)		 17,099
(99.99 %)		 6,708,926
(37.23 %)		 883,916
(2.81 %)		 16,745,782
(46.94 %)		 0
(0 %)		 963,655
(2.45 %)		 74,951
(1.15 %)		 20,227
(0.32 %)
132 Reeves's turtle
GCF_016161935.1		 86,238
(3.40 %)		 n/a 15,165
(0.98 %)		 21,405
(1.66 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 0
(0 %)		 398
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,854,279
(14.68 %)		 448,403
(2.11 %)		 11,329,581
(34.64 %)		 0
(0 %)		 644,654
(2.20 %)		 119,002
(2.82 %)		 35,167
(0.87 %)
133 Ringneck snake (HBS135679 primary hap 2022)
GCA_023053685.1		 n/a n/a 13,357
(1.06 %)		 20,426
(1.94 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 0
(0 %)		 723
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 1,451,537
(9.36 %)		 1,095,484
(10.35 %)		 7,870,309
(48.66 %)		 4
(0.00 %)		 1,107,317
(4.55 %)		 142,495
(4.04 %)		 27,514
(0.84 %)
134 royal ground snake (hap1 2023)
GCA_031021105.1		 n/a n/a 13,327
(0.96 %)		 20,347
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 1,983,903
(10.40 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,707
(53.44 %)		 11
(0.00 %)		 1,523,664
(5.77 %)		 130,852
(4.47 %)		 27,815
(0.70 %)
135 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1		 n/a n/a 13,845
(0.96 %)		 23,108
(1.86 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,128
(100.00 %)		 2,008,682
(10.16 %)		 1,718,408
(7.36 %)		 9,467,451
(52.99 %)		 0
(0 %)		 1,513,596
(5.45 %)		 140,557
(4.65 %)		 29,439
(0.71 %)
136 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1		 n/a n/a 12,606
(0.83 %)		 22,421
(1.62 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,543
(100.00 %)		 2,080,172
(11.19 %)		 1,814,619
(9.22 %)		 8,889,119
(57.36 %)		 0
(0 %)		 1,825,733
(6.19 %)		 145,328
(4.63 %)		 28,523
(0.67 %)
137 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1		 n/a n/a 13,727
(0.84 %)		 24,896
(2.06 %)		 n/a 42.95
(99.51 %)		 0
(0 %)		 973
(0.49 %)		 2,266
(100.00 %)		 729,332
(2.15 %)		 1,402,564
(24.45 %)		 8,156,596
(55.96 %)		 4
(0.00 %)		 3,523,739
(10.10 %)		 175,180
(3.64 %)		 18,584
(0.40 %)
138 rufous frog (hap2 2023)
GCA_031893055.1		 n/a n/a 13,538
(0.88 %)		 24,311
(2.15 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 0
(0 %)		 976
(0.93 %)		 1,266
(100.00 %)		 711,895
(2.18 %)		 1,219,160
(21.56 %)		 7,988,458
(54.14 %)		 3
(0.00 %)		 3,097,457
(9.48 %)		 170,920
(3.48 %)		 17,791
(0.40 %)
139 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1		 n/a n/a 14,039
(1.09 %)		 19,528
(1.85 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 31
(0.00 %)		 122
(100.00 %)		 1,307,065
(5.31 %)		 672,219
(3.50 %)		 9,949,858
(39.30 %)		 0
(0 %)		 671,520
(3.09 %)		 83,890
(3.97 %)		 26,657
(0.80 %)
140 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1		 n/a n/a 14,065
(1.09 %)		 19,430
(1.84 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 21
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 1,307,771
(5.32 %)		 672,054
(3.42 %)		 9,846,806
(39.03 %)		 0
(0 %)		 665,794
(3.10 %)		 83,805
(3.99 %)		 26,762
(0.80 %)
141 San Diegan tiger whiptail (HBS 135688 2022)
GCA_023333525.1		 n/a n/a 10,727
(1.18 %)		 14,669
(1.99 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 39
(0.00 %)		 113
(100.00 %)		 741,937
(6.29 %)		 448,194
(5.60 %)		 7,227,870
(36.97 %)		 0
(0 %)		 769,111
(3.76 %)		 42,621
(2.15 %)		 17,889
(0.90 %)
142 San Diegan tiger whiptail (alternate hap HBS 135688 2022)
GCA_023333555.1		 n/a n/a 13,288
(1.15 %)		 18,137
(1.98 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 0
(0 %)		 44
(0.00 %)		 227
(100.00 %)		 909,096
(6.37 %)		 544,302
(5.70 %)		 8,280,652
(39.20 %)		 3
(0.00 %)		 970,374
(3.95 %)		 51,923
(2.21 %)		 19,861
(0.82 %)
143 San Diego alligator lizard (HBS135686 alternate hap 2022)
GCA_023053675.1		 n/a n/a 14,107
(1.14 %)		 19,600
(1.95 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 27
(0.00 %)		 627
(100.00 %)		 1,563,836
(7.79 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,810
(40.44 %)		 0
(0 %)		 884,432
(3.64 %)		 81,126
(2.79 %)		 27,960
(0.83 %)
144 San Diego alligator lizard (HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1		 n/a n/a 14,075
(1.15 %)		 19,587
(1.99 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 23
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 1,577,744
(7.81 %)		 774,690
(3.78 %)		 9,248,062
(40.42 %)		 0
(0 %)		 832,326
(3.45 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,587
(0.82 %)
145 San Diego ringneck snake (HBS135679 alternate hap 2022)
GCA_023053665.1		 n/a n/a 10,911
(1.00 %)		 17,586
(1.79 %)		 n/a 41.17
(100.00 %)		 0
(0 %)		 572
(0.00 %)		 2,064
(100.00 %)		 1,265,045
(10.30 %)		 989,149
(13.38 %)		 6,503,035
(50.62 %)		 0
(0 %)		 1,261,338
(5.60 %)		 123,274
(4.17 %)		 23,159
(0.83 %)
146 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1		 n/a n/a 14,226
(1.28 %)		 25,396
(2.33 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 12,662
(100.00 %)		 1,001,433
(5.27 %)		 445,157
(1.79 %)		 7,227,826
(34.26 %)		 0
(0 %)		 365,558
(2.38 %)		 80,300
(2.76 %)		 22,848
(0.87 %)
147 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1		 41,701
(3.64 %)		 n/a 14,350
(1.48 %)		 19,231
(2.45 %)		 32,804
(4.14 %)		 43.75
(99.75 %)		 0
(0 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,414
(1.76 %)		 7,135,165
(34.49 %)		 0
(0 %)		 365,268
(2.50 %)		 76,053
(2.68 %)		 21,615
(0.85 %)
148 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1		 108,406
(1.98 %)		 n/a 13,959
(0.46 %)		 n/a n/a 43.90
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,474
(100.00 %)		 1,903,654
(2.85 %)		 2,970,691
(16.56 %)		 15,354,577
(64.31 %)		 20
(0.00 %)		 n/a 652,708
(8.36 %)		 43,665
(0.45 %)
149 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1		 n/a n/a 14,077
(0.47 %)		 36,608
(1.60 %)		 n/a 43.86
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,097
(0.01 %)		 2,802
(100.00 %)		 1,819,971
(2.73 %)		 2,865,173
(16.12 %)		 15,335,602
(63.85 %)		 14
(0.00 %)		 6,125,585
(10.74 %)		 651,438
(8.09 %)		 43,492
(0.45 %)
150 Schlegel's Japanese gecko
GCF_001447785.1		 25,177
(1.78 %)		 n/a 14,549
(0.82 %)		 28,002
(1.69 %)		 n/a 45.48
(96.46 %)		 143,970
(3.54 %)		 143,970
(3.54 %)		 335,470
(96.46 %)		 889,760
(2.21 %)		 666,492
(2.83 %)		 12,865,811
(39.14 %)		 291
(0.01 %)		 n/a 160,022
(2.80 %)		 49,172
(0.87 %)
151 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1		 n/a n/a 6,180
(0.71 %)		 31,191
(4.14 %)		 n/a 48.30
(100.00 %)		 0
(0 %)		 11
(0.00 %)		 4,064
(100.00 %)		 1,494,745
(38.42 %)		 891,392
(20.02 %)		 4,259,383
(49.70 %)		 0
(0 %)		 2,135,388
(12.73 %)		 147,499
(35.87 %)		 97,808
(5.62 %)
152 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1		 41,241
(6.50 %)		 n/a 7,638
(0.70 %)		 36,336
(4.06 %)		 83,714
(10.03 %)		 48.31
(98.62 %)		 0
(0 %)		 930
(1.38 %)		 1,434
(100.00 %)		 1,920,851
(39.36 %)		 1,194,165
(21.47 %)		 5,320,620
(50.50 %)		 4
(0.00 %)		 2,982,736
(13.77 %)		 178,590
(35.88 %)		 120,128
(5.32 %)
153 sharpnose sevengill shark (hap1 2024)
GCA_035084215.1		 n/a n/a 12,780
(0.49 %)		 24,543
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,880
(100.00 %)		 597,122
(2.28 %)		 1,112,137
(17.97 %)		 12,108,056
(57.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,824,033
(9.23 %)		 117,585
(3.42 %)		 24,151
(0.35 %)
154 sharpnose sevengill shark (hap2 2024)
GCA_035084135.1		 n/a n/a 12,603
(0.52 %)		 23,419
(1.42 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,695
(0.01 %)		 1,695
(0.01 %)		 2,889
(99.99 %)		 559,171
(2.08 %)		 973,228
(15.01 %)		 11,768,442
(55.69 %)		 2
(0.00 %)		 3,991,721
(8.15 %)		 108,468
(3.25 %)		 22,750
(0.36 %)
155 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2		 n/a n/a 11,589
(0.31 %)		 32,603
(1.10 %)		 n/a 47.54
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 6
(0.00 %)		 26,655
(100.00 %)		 1,346,532
(1.83 %)		 1,273,326
(5.35 %)		 19,727,443
(51.55 %)		 0
(0 %)		 2,678,114
(4.31 %)		 427,693
(8.25 %)		 27,178
(0.30 %)
156 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2		 n/a n/a 12,587
(0.36 %)		 23,986
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 0
(0 %)		 7,146
(1.52 %)		 645
(100.00 %)		 1,451,634
(1.94 %)		 1,448,619
(6.25 %)		 20,884,741
(51.41 %)		 10
(0.00 %)		 3,334,909
(4.99 %)		 456,658
(8.18 %)		 31,096
(0.32 %)
157 smalltooth sawfish (primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1		 40,257
(2.94 %)		 n/a 12,157
(0.69 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 0
(0 %)		 698
(0.91 %)		 172
(100.00 %)		 4,824,261
(54.91 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,260
(38.19 %)		 0
(0 %)		 471,344
(1.50 %)		 45,398
(1.34 %)		 18,410
(0.41 %)
158 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1		 n/a n/a 9,086
(0.58 %)		 20,468
(1.57 %)		 n/a 42.65
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 10,892
(100.00 %)		 315,695
(1.23 %)		 320,148
(1.73 %)		 8,305,059
(38.33 %)		 0
(0 %)		 382,745
(1.57 %)		 37,147
(1.43 %)		 15,419
(0.42 %)
159 Southern alligator lizard (San Diego HBS135686 primary hap 2024)
GCA_023053635.2		 n/a n/a 14,093
(1.15 %)		 19,338
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 35
(100.00 %)		 1,577,751
(7.81 %)		 774,117
(3.78 %)		 9,248,069
(40.42 %)		 1
(0.00 %)		 823,656
(3.44 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,586
(0.82 %)
160 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 alternate hap 2022)
GCA_024509165.1		 n/a n/a 13,381
(1.17 %)		 19,541
(1.96 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 0
(0 %)		 34
(0.00 %)		 340
(100.00 %)		 1,137,408
(8.97 %)		 740,163
(7.59 %)		 7,520,676
(44.43 %)		 0
(0 %)		 1,047,648
(4.87 %)		 47,268
(1.61 %)		 21,885
(0.78 %)
161 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 primary hap 2022)
GCA_024509115.1		 n/a n/a 12,626
(1.16 %)		 18,965
(1.95 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 443
(0.01 %)		 443
(0.01 %)		 1,139
(99.99 %)		 1,095,605
(9.34 %)		 713,734
(8.45 %)		 6,942,208
(44.93 %)		 3
(0.00 %)		 1,092,536
(5.56 %)		 46,378
(2.04 %)		 21,510
(0.80 %)
162 Southwestern pond turtle (HBS135687 alternate hap 2022)
GCA_023634275.1		 n/a n/a 14,998
(0.98 %)		 20,146
(1.60 %)		 n/a 44.84
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 64
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 1,562,785
(12.68 %)		 484,638
(2.00 %)		 11,089,433
(36.29 %)		 0
(0 %)		 512,269
(2.30 %)		 143,601
(3.21 %)		 30,649
(0.71 %)
163 Southwestern pond turtle (HBS135687 primary hap 2022)
GCA_023634205.1		 n/a n/a 14,971
(0.99 %)		 19,756
(1.60 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 53
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 1,545,155
(12.63 %)		 465,697
(1.95 %)		 11,181,681
(36.13 %)		 0
(0 %)		 476,831
(2.14 %)		 142,383
(3.05 %)		 30,737
(0.72 %)
164 spotted gar
GCF_000242695.1		 45,681
(8.02 %)		 n/a 13,054
(1.95 %)		 46,362
(15.00 %)		 n/a 39.59
(91.93 %)		 43,274
(8.08 %)		 43,276
(8.08 %)		 45,199
(91.92 %)		 203,614
(1.02 %)		 123,247
(0.80 %)		 5,837,321
(22.82 %)		 2,079
(0.10 %)		 77,276
(0.87 %)		 38,507
(2.24 %)		 31,972
(1.68 %)
165 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1		 n/a n/a 10,920
(1.26 %)		 14,403
(2.60 %)		 n/a 43.46
(99.96 %)		 0
(0 %)		 2,088
(0.04 %)		 1,042
(100.00 %)		 3,325,883
(44.48 %)		 604,780
(8.87 %)		 5,926,808
(44.92 %)		 2
(0.00 %)		 1,077,982
(5.77 %)		 64,249
(4.00 %)		 11,419
(0.43 %)
166 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1		 n/a n/a 10,694
(1.38 %)		 13,221
(2.62 %)		 n/a 42.85
(99.96 %)		 0
(0 %)		 1,952
(0.04 %)		 532
(100.00 %)		 3,108,151
(44.68 %)		 498,592
(6.00 %)		 5,634,132
(43.16 %)		 4
(0.00 %)		 685,165
(4.19 %)		 50,785
(2.94 %)		 25,542
(1.57 %)
167 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1		 110,154
(7.62 %)		 n/a 25,364
(1.76 %)		 40,715
(4.06 %)		 n/a 40.11
(100.00 %)		 0
(0 %)		 433
(0.00 %)		 1,731
(100.00 %)		 4,055,215
(43.14 %)		 1,124,096
(10.13 %)		 9,426,172
(41.81 %)		 10
(0.00 %)		 1,593,747
(6.87 %)		 64,522
(2.85 %)		 21,984
(0.89 %)
168 sterlet (paternal fAciRut3.2 2022)
GCA_902713435.2		 n/a n/a 24,717
(1.73 %)		 40,151
(4.13 %)		 74,807
(5.54 %)		 40.09
(99.99 %)		 0
(0 %)		 475
(0.01 %)		 1,517
(100.00 %)		 1,844,596
(9.77 %)		 1,119,340
(9.88 %)		 9,372,934
(41.58 %)		 8
(0.00 %)		 1,582,556
(6.83 %)		 65,007
(2.74 %)		 17,761
(0.38 %)
169 sterlet (v2 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.2		 73,195
(5.77 %)		 n/a 24,716
(1.77 %)		 39,692
(3.97 %)		 n/a 39.75
(99.93 %)		 0
(0 %)		 6,251
(0.07 %)		 3,368
(100.00 %)		 3,869,521
(43.26 %)		 1,093,425
(6.82 %)		 9,976,052
(39.33 %)		 5
(0.00 %)		 1,354,766
(6.14 %)		 60,325
(1.97 %)		 17,242
(0.48 %)
170 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1		 n/a n/a 14,713
(1.06 %)		 18,602
(1.60 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 290
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 1,352,115
(12.17 %)		 388,630
(1.94 %)		 10,550,154
(33.42 %)		 0
(0 %)		 470,790
(2.03 %)		 113,023
(3.09 %)		 33,031
(0.84 %)
171 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1		 n/a n/a 12,226
(1.01 %)		 14,117
(1.42 %)		 n/a 43.77
(100.00 %)		 0
(0 %)		 361
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 1,202,345
(11.93 %)		 304,674
(1.45 %)		 9,752,924
(32.81 %)		 0
(0 %)		 314,037
(1.63 %)		 92,993
(2.75 %)		 20,902
(0.60 %)
172 thorny skate (primary hap CabotCenter1 v1.1 2020)
GCF_010909765.2		 45,968
(2.40 %)		 n/a 11,437
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 0
(0 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 888,163
(2.58 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 26
(0.00 %)		 1,634,606
(4.98 %)		 242,676
(4.73 %)		 31,030
(0.57 %)
173 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1		 n/a n/a 5,885
(0.35 %)		 24,457
(1.45 %)		 n/a 44.61
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(0.00 %)		 21,995
(100.00 %)		 553,415
(2.65 %)		 761,469
(4.53 %)		 6,043,769
(57.75 %)		 0
(0 %)		 1,079,506
(5.75 %)		 159,552
(5.54 %)		 20,611
(0.66 %)
174 three-toed box turtle
GCF_002925995.2		 35,807
(2.28 %)		 n/a 16,429
(1.00 %)		 26,460
(1.60 %)		 33,673
(1.75 %)		 44.26
(94.87 %)		 0
(0 %)		 53,635
(5.13 %)		 48,497
(100.00 %)		 2,007,347
(15.00 %)		 351,871
(0.86 %)		 12,385,245
(31.74 %)		 3,613
(0.05 %)		 161,525
(0.66 %)		 138,405
(2.40 %)		 33,334
(0.68 %)
175 tiger rattlesnake
GCF_016545835.1		 58,085
(4.72 %)		 n/a 13,597
(1.18 %)		 20,553
(2.03 %)		 n/a 39.88
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 4,228
(100.00 %)		 1,142,521
(7.92 %)		 739,406
(5.17 %)		 7,749,366
(42.91 %)		 0
(0 %)		 1,005,717
(4.66 %)		 45,588
(1.61 %)		 21,457
(0.80 %)
176 tiny Cayenne caecilian
GCF_901765095.1		 41,333
(1.27 %)		 n/a 14,569
(0.43 %)		 30,499
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 0
(0 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,835,191
(1.59 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,145
(52.43 %)		 5
(0.00 %)		 1,513,727
(3.00 %)		 414,828
(3.91 %)		 47,796
(0.38 %)
177 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1		 n/a n/a 12,197
(0.36 %)		 33,747
(1.15 %)		 n/a 43.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 23,871
(100.00 %)		 1,453,442
(1.57 %)		 1,309,062
(3.23 %)		 17,953,416
(52.19 %)		 0
(0 %)		 1,274,743
(3.12 %)		 326,452
(3.86 %)		 38,711
(0.39 %)
178 Townsend's dwarf sphaero (gecko TG3544 2022)
GCF_021028975.2		 41,266
(3.35 %)		 n/a 13,505
(1.05 %)		 19,294
(1.78 %)		 n/a 45.92
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,590
(0.01 %)		 1,742
(100.00 %)		 938,800
(8.81 %)		 627,869
(5.78 %)		 9,306,892
(38.57 %)		 33
(0.00 %)		 185,826
(0.70 %)		 91,919
(2.91 %)		 28,760
(0.80 %)
179 tropical clawed frog
GCF_000004195.4		 50,557
(4.71 %)		 n/a 14,679
(1.97 %)		 20,138
(2.76 %)		 52,028
(5.20 %)		 40.73
(99.80 %)		 0
(0 %)		 684
(0.20 %)		 167
(100.00 %)		 2,289,618
(34.82 %)		 708,472
(13.14 %)		 6,816,377
(41.73 %)		 4
(0.00 %)		 1,594,381
(7.39 %)		 52,647
(1.35 %)		 10,639
(0.28 %)
180 two-lined caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_901001135.2		 n/a n/a 14,449
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 0
(0 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,274,606
(1.91 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,400,957
(44.09 %)		 9
(0.01 %)		 2,193,249
(3.24 %)		 602,911
(6.66 %)		 94,934
(0.82 %)
181 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1		 n/a n/a 13,456
(0.33 %)		 47,486
(1.34 %)		 n/a 44.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 27,233
(100.00 %)		 1,968,437
(1.91 %)		 1,716,136
(3.97 %)		 25,847,315
(43.76 %)		 0
(0 %)		 1,707,112
(2.84 %)		 523,234
(6.59 %)		 83,004
(0.82 %)
182 valley gartersnake (HBS 135685 alternate hap 2023)
GCA_029207655.1		 n/a n/a 13,267
(1.12 %)		 21,667
(2.38 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 0
(0 %)		 403
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 1,344,601
(8.29 %)		 1,035,785
(7.00 %)		 8,436,473
(45.10 %)		 2
(0.00 %)		 993,545
(4.30 %)		 82,750
(2.69 %)		 24,526
(0.78 %)
183 valley gartersnake (HBS 135685 primary hap 2023)
GCA_029207665.1		 n/a n/a 12,430
(1.10 %)		 20,286
(2.36 %)		 n/a 41.12
(100.00 %)		 0
(0 %)		 446
(0.00 %)		 413
(100.00 %)		 1,299,478
(9.62 %)		 1,018,398
(8.41 %)		 7,790,758
(46.28 %)		 2
(0.00 %)		 1,063,878
(4.69 %)		 81,352
(2.71 %)		 23,653
(0.79 %)
184 viviparous/common lizard
GCF_011800845.1		 47,034
(5.17 %)		 n/a 14,311
(1.43 %)		 20,571
(2.35 %)		 32,442
(3.15 %)		 43.97
(97.04 %)		 0
(0 %)		 51,275
(2.97 %)		 25,252
(100.00 %)		 949,801
(5.41 %)		 498,048
(1.91 %)		 7,668,731
(34.21 %)		 726
(0.06 %)		 389,679
(2.77 %)		 88,947
(2.62 %)		 22,474
(0.81 %)
185 West African lungfish
GCF_019279795.1		 41,847
(0.19 %)		 n/a n/a n/a n/a 40.21
(97.52 %)		 0
(0 %)		 n/a 12,668
(100.00 %)		 16,163,808
(2.67 %)		 13,992,750
(5.30 %)		 n/a 26
(0.00 %)		 183,320
(0.03 %)		 502,751
(0.52 %)		 14,687
(0.01 %)
186 western fence lizard (IW3139 2022)
GCA_023333635.1		 n/a n/a 26,067
(1.12 %)		 46,795
(2.72 %)		 n/a 41.28
(100.00 %)		 0
(0 %)		 51
(0.00 %)		 1,771
(100.00 %)		 2,075,491
(6.60 %)		 1,603,401
(7.34 %)		 15,565,775
(40.61 %)		 0
(0 %)		 1,972,426
(5.50 %)		 184,134
(3.16 %)		 51,018
(0.93 %)
187 western fence lizard (IW3139 primary hap 2022)
GCA_023333645.1		 n/a n/a 24,835
(1.20 %)		 42,146
(2.78 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 51
(0.00 %)		 659
(100.00 %)		 1,842,497
(6.34 %)		 1,335,245
(6.14 %)		 15,103,683
(37.84 %)		 1
(0.00 %)		 1,360,948
(3.93 %)		 158,311
(2.92 %)		 45,330
(0.92 %)
188 western painted turtle (v5 RCT428 2020)
GCF_000241765.5		 64,782
(3.76 %)		 n/a 15,184
(1.08 %)		 21,463
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 184,311
(12.48 %)		 259,085
(87.52 %)		 4,079,404
(44.68 %)		 316,232
(0.93 %)		 11,848,718
(27.60 %)		 6,323
(0.15 %)		 313,464
(1.39 %)		 103,623
(1.74 %)		 31,959
(0.68 %)
189 western red-tailed skink (HBS 135693 alternate hap 2022)
GCA_026170595.1		 n/a n/a 14,019
(1.31 %)		 17,620
(2.13 %)		 n/a 45.76
(100.00 %)		 0
(0 %)		 15
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 862,216
(4.87 %)		 557,627
(3.17 %)		 8,002,559
(36.95 %)		 0
(0 %)		 377,483
(2.25 %)		 183,292
(4.74 %)		 24,223
(0.81 %)
190 western red-tailed skink (HBS 135693 primary hap 2022)
GCA_026170395.1		 n/a n/a 13,064
(1.32 %)		 16,407
(2.16 %)		 n/a 45.81
(100.00 %)		 0
(0 %)		 12
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 794,996
(4.86 %)		 514,021
(3.46 %)		 7,339,914
(37.02 %)		 1
(0.00 %)		 359,036
(2.32 %)		 168,847
(4.76 %)		 22,885
(0.83 %)
191 western spadefoot toad (hap1 HBS 135690 2023)
GCA_029215705.1		 n/a n/a 13,914
(1.72 %)		 27,496
(4.28 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 198
(0.00 %)		 677
(100.00 %)		 600,622
(4.04 %)		 783,931
(10.70 %)		 5,362,245
(41.82 %)		 0
(0 %)		 1,069,443
(8.38 %)		 100,334
(5.41 %)		 37,012
(1.96 %)
192 western spadefoot toad (hap2 HBS 135690 2023)
GCA_029215755.1		 n/a n/a 13,991
(1.72 %)		 27,685
(4.24 %)		 n/a 40.90
(100.00 %)		 190
(0.00 %)		 190
(0.00 %)		 541
(100.00 %)		 620,188
(5.00 %)		 800,411
(11.19 %)		 5,338,766
(42.25 %)		 1
(0.00 %)		 1,135,530
(8.81 %)		 101,603
(5.32 %)		 37,398
(1.95 %)
193 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1		 n/a n/a 13,101
(0.94 %)		 24,980
(1.75 %)		 n/a 41.02
(99.93 %)		 19
(0.07 %)		 19
(0.07 %)		 13,642
(99.93 %)		 1,410,212
(7.70 %)		 1,080,385
(4.56 %)		 9,112,844
(43.96 %)		 0
(0 %)		 886,410
(3.61 %)		 91,606
(2.53 %)		 24,845
(0.74 %)
194 western terrestrial garter snake (primary hap 2019)
GCF_009769535.1		 33,492
(3.42 %)		 n/a 13,074
(1.13 %)		 18,807
(1.93 %)		 31,660
(2.61 %)		 40.95
(97.72 %)		 0
(0 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,271,255
(7.73 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,396,200
(42.63 %)		 0
(0 %)		 801,068
(3.60 %)		 81,829
(2.47 %)		 23,152
(0.75 %)
195 whale shark (Ralph 2017 Emory U)
GCF_001642345.1		 31,857
(1.52 %)		 n/a 11,884
(0.43 %)		 28,482
(1.15 %)		 n/a 41.78
(100.00 %)		 0
(0 %)		 900,650
(0.03 %)		 57,334
(100.00 %)		 413,201
(1.16 %)		 426,542
(2.75 %)		 16,418,143
(38.85 %)		 315
(0.00 %)		 994,713
(2.86 %)		 35,192
(0.95 %)		 11,001
(0.17 %)
196 whale shark (14 2022 Squalomix)
GCF_021869965.1		 42,052
(2.43 %)		 n/a 12,059
(0.52 %)		 18,460
(1.22 %)		 38,963
(1.77 %)		 41.51
(91.61 %)		 0
(0 %)		 95,208
(8.40 %)		 16,684
(100.00 %)		 402,747
(0.97 %)		 389,119
(1.49 %)		 15,298,245
(34.14 %)		 7,133
(0.13 %)		 472,644
(1.14 %)		 21,050
(0.30 %)		 10,334
(0.16 %)
197 whitespotted bambooshark
GCF_004010195.1		 54,886
(2.03 %)		 n/a 12,065
(0.44 %)		 19,805
(1.08 %)		 n/a 42.06
(94.27 %)		 0
(0 %)		 156,554
(5.74 %)		 101,977
(100.00 %)		 559,291
(0.96 %)		 641,094
(3.66 %)		 19,566,199
(38.21 %)		 151
(0.01 %)		 1,627,864
(2.86 %)		 28,353
(0.49 %)		 12,756
(0.18 %)
198 yellowpond turtle (Southern MM-2020 2021)
GCF_020497125.1		 65,526
(3.36 %)		 n/a 15,560
(0.99 %)		 21,233
(1.66 %)		 n/a 45.17
(96.24 %)		 0
(0 %)		 1,041
(3.76 %)		 595
(100.00 %)		 1,904,996
(14.25 %)		 468,779
(2.21 %)		 11,403,005
(33.86 %)		 13
(0.00 %)		 681,375
(2.23 %)		 135,646
(3.23 %)		 34,785
(0.79 %)
199 zebra shark (6-17 2022 Squalomix)
GCF_022316705.1		 48,447
(2.64 %)		 n/a 11,974
(0.57 %)		 15,459
(1.26 %)		 n/a 41.78
(93.81 %)		 0
(0 %)		 87,372
(6.20 %)		 1,266
(100.00 %)		 392,676
(0.96 %)		 348,115
(1.22 %)		 15,176,805
(32.93 %)		 151
(0.01 %)		 584,622
(1.29 %)		 20,647
(0.38 %)		 10,977
(0.18 %)
200 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1		 58,105
(2.61 %)		 n/a 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 0
(0 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 4
(0.00 %)		 2,946,119
(5.37 %)		 45,284
(1.67 %)		 14,105
(0.37 %)
201 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1		 n/a n/a 12,516
(0.44 %)		 17,465
(1.05 %)		 n/a 44.66
(99.65 %)		 1,203
(0.35 %)		 1,203
(0.35 %)		 2,136
(99.65 %)		 8,278,458
(59.68 %)		 903,434
(18.42 %)		 14,975,344
(48.25 %)		 2
(0.00 %)		 4,704,292
(7.66 %)		 48,378
(1.60 %)		 15,577
(0.38 %)
TOTALS:total assembly count 201

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 207 assemblies assembly stats track stats
Mammals 508 assemblies assembly stats track stats
Birds 327 assemblies assembly stats track stats
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other vertebrates 201 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 644 assemblies assembly stats track stats
Plants 252 assemblies assembly stats track stats
Fungi 612 assemblies assembly stats track stats
Viruses 265 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 74 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 437 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 798 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats