Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of other vertebrates only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base AGP
gap		 all
gaps		 assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 gap
Overlap		 tandem
Dups		 cpg
unmasked		 cpg
island
1 Abingdon island giant tortoise
GCF_003597395.1		 50,402
(2.95 %)		 n/a 14,990
(1.01 %)		 19,565
(1.58 %)		 34,846
(1.54 %)		 43.71
(94.31 %)		 0
(0 %)		 63,430
(5.70 %)		 10,618
(100.00 %)		 1,553,204
(12.95 %)		 274,155
(1.11 %)		 12,664,684
(27.42 %)		 1,230
(0.10 %)		 193,101
(0.91 %)		 62,829
(1.59 %)		 28,727
(0.78 %)
2 adder (hap1 2024)
GCA_964194415.1		 n/a n/a 13,898
(1.18 %)		 20,039
(1.94 %)		 n/a 41.09
(99.99 %)		 1
(0.00 %)		 1,057
(0.01 %)		 480
(100.00 %)		 3,740,180
(50.44 %)		 792,731
(6.25 %)		 7,621,640
(45.94 %)		 0
(0 %)		 n/a 116,506
(4.68 %)		 23,244
(0.88 %)
3 adder (hap2 2024)
GCA_964194405.1		 n/a n/a 12,344
(1.22 %)		 17,320
(1.89 %)		 n/a 41.00
(99.99 %)		 908
(0.01 %)		 908
(0.01 %)		 1,256
(99.99 %)		 3,221,370
(48.42 %)		 681,209
(5.18 %)		 6,734,253
(44.26 %)		 2
(0.00 %)		 n/a 99,366
(4.44 %)		 20,272
(0.89 %)
4 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1		 n/a n/a 2,101
(1.18 %)		 5,350
(2.76 %)		 n/a 43.70
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3
(0.00 %)		 4,811
(100.00 %)		 103,373
(4.27 %)		 58,480
(3.90 %)		 895,535
(27.44 %)		 0
(0 %)		 59,204
(2.84 %)		 10,399
(2.84 %)		 3,340
(1.02 %)
5 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1		 57,514
(4.49 %)		 n/a 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 0
(0 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 2
(0.00 %)		 631,733
(3.50 %)		 94,745
(2.70 %)		 19,879
(0.76 %)
6 African bullfrog (1538 2019)
GCA_004786255.1		 n/a n/a 13,258
(1.31 %)		 15,309
(2.28 %)		 n/a 38.30
(89.51 %)		 0
(0 %)		 121,461
(10.52 %)		 5,411
(100.00 %)		 491,540
(1.54 %)		 401,074
(2.30 %)		 8,595,741
(27.94 %)		 3,986
(0.11 %)		 262,314
(1.70 %)		 14,854
(0.31 %)		 5,895
(0.13 %)
7 African clawed frog (2021)
GCF_017654675.1		 80,912
(3.89 %)		 n/a 23,666
(1.59 %)		 32,527
(2.45 %)		 112,506
(5.21 %)		 39.34
(99.94 %)		 0
(0 %)		 667
(0.06 %)		 55
(100.00 %)		 4,269,095
(35.49 %)		 1,028,861
(6.46 %)		 14,246,823
(43.67 %)		 2
(0.00 %)		 1,679,057
(4.83 %)		 108,774
(1.25 %)		 16,813
(0.23 %)
8 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1		 60,799
(4.33 %)		 n/a 14,383
(0.98 %)		 18,600
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 0
(0 %)		 161
(0.70 %)		 195
(100.00 %)		 3,322,624
(43.19 %)		 478,208
(1.77 %)		 12,316,424
(32.01 %)		 0
(0 %)		 334,854
(1.31 %)		 49,792
(2.45 %)		 29,504
(1.51 %)
9 American alligator (KSC_2009_1 2016)
GCF_000281125.3		 51,013
(3.53 %)		 n/a 14,424
(1.06 %)		 19,690
(1.51 %)		 n/a 44.30
(97.86 %)		 0
(0 %)		 236,641
(2.19 %)		 7,094
(100.00 %)		 2,842,761
(36.86 %)		 291,584
(0.69 %)		 12,464,318
(27.91 %)		 1,962
(0.01 %)		 63,947
(0.23 %)		 35,531
(1.28 %)		 26,988
(0.99 %)
10 American eel (EN2019 2024)
GCF_018555375.3		 67,474
(10.58 %)		 n/a 17,131
(2.21 %)		 34,322
(5.40 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 0
(0 %)		 985
(0.01 %)		 967
(100.00 %)		 766,696
(5.03 %)		 756,877
(7.81 %)		 5,766,995
(27.42 %)		 2
(0.00 %)		 698,797
(4.41 %)		 133,933
(8.63 %)		 97,367
(4.31 %)
11 Asian vine snake (Xishuangbanna 2023)
GCF_028640845.1		 47,555
(4.15 %)		 n/a 13,005
(1.05 %)		 17,560
(1.65 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 0
(0 %)		 331
(0.00 %)		 748
(100.00 %)		 1,484,082
(7.70 %)		 1,033,385
(5.12 %)		 8,266,544
(48.89 %)		 0
(0 %)		 1,020,982
(6.70 %)		 105,815
(4.08 %)		 21,180
(0.68 %)
12 Asiatic toad (SCDJY-AF-19 2020)
GCF_014858855.1		 42,994
(1.39 %)		 n/a 14,061
(0.43 %)		 43,525
(1.76 %)		 36,577
(1.09 %)		 44.37
(98.21 %)		 0
(0 %)		 3,874
(1.79 %)		 748
(100.00 %)		 1,577,809
(1.79 %)		 2,975,473
(12.67 %)		 18,834,930
(58.75 %)		 12
(0.00 %)		 4,966,158
(8.81 %)		 415,605
(4.12 %)		 69,684
(0.72 %)
13 Atlantic hagfish (MG_SS 2024)
GCF_040869285.1		 46,374
(1.72 %)		 n/a 7,719
(0.19 %)		 59,788
(2.68 %)		 n/a 44.23
(99.94 %)		 0
(0 %)		 4,876
(0.06 %)		 4,270
(100.00 %)		 2,094,143
(3.54 %)		 3,212,025
(29.83 %)		 8,998,320
(75.15 %)		 43
(0.00 %)		 n/a 408,391
(12.65 %)		 60,671
(0.82 %)
14 Atlantic hagfish (primary hap 2024)
GCA_964187855.1		 n/a n/a 6,662
(0.20 %)		 45,484
(2.63 %)		 n/a 44.32
(99.97 %)		 0
(0 %)		 4,412
(0.03 %)		 4,004
(100.00 %)		 1,698,449
(3.61 %)		 2,644,659
(27.70 %)		 7,620,145
(74.29 %)		 43
(0.00 %)		 n/a 331,404
(12.87 %)		 49,019
(0.82 %)
15 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1		 60,922
(2.51 %)		 n/a 12,544
(0.38 %)		 28,250
(1.22 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,989
(100.00 %)		 8,579,099
(49.81 %)		 831,222
(15.75 %)		 21,718,178
(51.79 %)		 9
(0.00 %)		 4,445,369
(7.00 %)		 105,821
(2.42 %)		 35,197
(0.42 %)
16 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1		 n/a n/a 11,960
(0.40 %)		 25,618
(1.25 %)		 n/a 42.94
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,633
(0.01 %)		 1,412
(100.00 %)		 7,453,535
(49.31 %)		 686,063
(13.00 %)		 19,985,605
(50.32 %)		 8
(0.00 %)		 3,309,683
(5.86 %)		 86,138
(2.16 %)		 30,350
(0.41 %)
17 Australian saltwater crocodile
GCF_001723895.1		 34,090
(2.80 %)		 n/a 12,481
(1.05 %)		 13,920
(1.38 %)		 n/a 43.90
(94.72 %)		 0
(0 %)		 97,039
(5.30 %)		 70
(100.00 %)		 2,480,154
(36.88 %)		 215,190
(0.56 %)		 11,196,176
(26.22 %)		 1,753
(0.04 %)		 50,116
(0.79 %)		 26,647
(0.98 %)		 20,860
(0.80 %)
18 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3		 n/a n/a 16,280
(0.07 %)		 186,628
(1.11 %)		 n/a 46.01
(99.99 %)		 0
(0 %)		 184,422
(0.01 %)		 27,157
(100.00 %)		 28,291,633
(68.19 %)		 7,299,053
(4.96 %)		 211,579
(99.99 %)		 189
(0.00 %)		 n/a 2,388,998
(5.24 %)		 429,355
(0.66 %)
19 axolotl (Mex_15411 2024)
GCF_040938575.1		 96,841
(0.40 %)		 n/a 18,564
(0.07 %)		 184,527
(1.17 %)		 n/a 46.34
(100.00 %)		 0
(0 %)		 2,095
(0.00 %)		 221
(100.00 %)		 27,951,551
(67.11 %)		 8,561,025
(9.70 %)		 2,316
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 1,448,410
(0.36 %)		 2,452,305
(5.31 %)		 417,603
(0.63 %)
20 basking shark (sCetMax3.hap1.1 2024)
GCA_964194155.1		 n/a n/a 13,757
(0.41 %)		 22,690
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,088
(100.00 %)		 6,693,687
(65.70 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,698,294
(51.34 %)		 20
(0.00 %)		 5,335,615
(7.60 %)		 113,759
(1.90 %)		 28,476
(0.65 %)
21 basking shark (sCetMax3.hap2.1 2024)
GCA_964194165.1		 n/a n/a 13,515
(0.42 %)		 21,374
(1.06 %)		 n/a 44.47
(99.99 %)		 2,740
(0.01 %)		 2,740
(0.01 %)		 6,569
(99.99 %)		 6,483,403
(66.87 %)		 1,041,828
(9.99 %)		 21,142,745
(50.24 %)		 31
(0.00 %)		 4,014,149
(6.09 %)		 107,555
(1.88 %)		 26,392
(0.67 %)
22 Bellinger river turtle (v2 BRST_UC0152H_USYD 2025)
GCA_040894355.2		 n/a n/a 14,713
(1.14 %)		 18,959
(1.77 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 77
(0.00 %)		 110
(100.00 %)		 1,130,167
(11.21 %)		 213,193
(1.80 %)		 11,049,207
(26.48 %)		 1
(0.00 %)		 311,436
(1.26 %)		 53,921
(2.09 %)		 34,762
(1.11 %)
23 beluga (Lower Danube River Hh-F2 2024)
GCA_036884735.1		 n/a 37,075
(3.19 %)		 24,635
(1.65 %)		 38,296
(3.71 %)		 n/a 39.96
(99.90 %)		 0
(0 %)		 3,967
(0.10 %)		 1,383
(100.00 %)		 1,315,442
(3.30 %)		 1,268,850
(7.99 %)		 10,595,211
(41.03 %)		 4
(0.00 %)		 1,845,276
(6.54 %)		 65,207
(2.45 %)		 19,259
(0.43 %)
24 Blainville's horned lizard (alternate hap 2022)
GCA_026167975.1		 n/a n/a 12,696
(0.93 %)		 14,818
(1.50 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 64
(0.00 %)		 52
(100.00 %)		 1,468,805
(6.73 %)		 739,796
(3.28 %)		 10,900,584
(40.56 %)		 1
(0.00 %)		 625,575
(2.40 %)		 76,786
(1.60 %)		 9,543
(0.21 %)
25 Blainville's horned lizard (primary hap 2022)
GCA_026167985.1		 n/a n/a 13,944
(0.92 %)		 16,009
(1.45 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 78
(100.00 %)		 1,636,825
(6.67 %)		 826,053
(3.24 %)		 12,398,166
(40.90 %)		 0
(0 %)		 690,267
(2.36 %)		 86,825
(1.61 %)		 10,396
(0.20 %)
26 blonde ray (primary hap 2023)
GCA_963514005.1		 n/a n/a 11,900
(0.54 %)		 27,568
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,647
(100.00 %)		 8,972,805
(66.20 %)		 1,061,811
(8.11 %)		 11,599,498
(58.72 %)		 6
(0.00 %)		 2,430,580
(6.13 %)		 278,499
(6.42 %)		 59,922
(2.12 %)
27 brown anole (Geneva1000 2022 refseq)
GCF_025583915.1		 38,099
(3.25 %)		 n/a 14,028
(1.05 %)		 19,932
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 114,440
(1.64 %)		 118,178
(98.36 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 261
(0.01 %)		 1,132,418
(4.31 %)		 46,291
(1.18 %)		 17,324
(0.40 %)
28 brown anole (maternal hap 2024 genbank)
GCA_037176765.1		 n/a n/a 14,463
(1.05 %)		 20,625
(1.90 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 0
(0 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 0
(0 %)		 1,512,000
(5.23 %)		 44,738
(1.08 %)		 17,370
(0.40 %)
29 Brown anole (maternal hap 2024 refseq)
GCF_037176765.1		 41,782
(3.73 %)		 n/a 14,463
(1.05 %)		 20,186
(1.84 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 0
(0 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 0
(0 %)		 1,512,000
(5.23 %)		 44,738
(1.08 %)		 17,370
(0.40 %)
30 Brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1		 n/a n/a 12,479
(1.04 %)		 16,886
(1.81 %)		 n/a 41.00
(100.00 %)		 0
(0 %)		 172
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 1,249,920
(6.94 %)		 941,401
(5.42 %)		 8,402,482
(44.77 %)		 1
(0.00 %)		 1,126,727
(4.44 %)		 37,299
(1.02 %)		 14,196
(0.37 %)
31 brown house snake (FMNH 251328 2023)
GCA_027560395.1		 n/a n/a 11,753
(1.00 %)		 29,468
(1.83 %)		 n/a 40.67
(98.13 %)		 169,987
(1.84 %)		 169,987
(1.84 %)		 753,655
(98.16 %)		 1,167,225
(5.67 %)		 768,909
(2.88 %)		 8,825,109
(34.93 %)		 2,464
(0.05 %)		 n/a 53,035
(1.80 %)		 31,929
(1.11 %)
32 brown spotted pit viper
GCF_001527695.2		 24,323
(2.63 %)		 n/a 14,045
(1.20 %)		 27,133
(2.20 %)		 n/a 39.97
(92.15 %)		 115,571
(7.86 %)		 115,571
(7.86 %)		 167,851
(92.14 %)		 1,227,118
(8.97 %)		 819,247
(3.70 %)		 8,328,674
(35.16 %)		 11,808
(0.68 %)		 791,775
(4.53 %)		 68,858
(2.06 %)		 27,809
(0.90 %)
33 Burmese python
GCF_000186305.1		 35,663
(4.16 %)		 n/a 13,718
(1.31 %)		 20,498
(2.06 %)		 n/a 39.61
(96.54 %)		 235,132
(3.52 %)		 235,132
(3.52 %)		 274,244
(96.48 %)		 727,874
(3.19 %)		 409,033
(2.06 %)		 8,318,382
(25.30 %)		 21,222
(0.52 %)		 167,510
(1.87 %)		 29,212
(1.10 %)		 21,586
(0.80 %)
34 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 alternate hap 2022)
GCA_022578425.1		 n/a n/a 13,973
(0.70 %)		 47,231
(2.71 %)		 n/a 41.26
(99.97 %)		 5,955
(0.03 %)		 5,955
(0.03 %)		 60,824
(99.97 %)		 1,793,416
(10.43 %)		 1,374,078
(8.30 %)		 10,043,407
(46.03 %)		 154
(0.01 %)		 1,546,579
(5.96 %)		 89,437
(4.63 %)		 31,854
(0.83 %)
35 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 primary hap 2022)
GCA_022577455.1		 n/a n/a 13,386
(1.04 %)		 21,767
(2.35 %)		 n/a 40.56
(100.00 %)		 0
(0 %)		 256
(0.00 %)		 140
(100.00 %)		 1,354,500
(9.93 %)		 998,712
(8.21 %)		 8,504,468
(46.70 %)		 1
(0.00 %)		 1,050,266
(4.14 %)		 78,768
(3.37 %)		 28,516
(0.88 %)
36 Caribbean electric ray (hap1 2024 refseq)
GCF_036971445.1		 77,919
(2.56 %)		 n/a 11,965
(0.44 %)		 20,833
(1.25 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,443
(0.01 %)		 595
(100.00 %)		 4,902,644
(34.96 %)		 1,040,891
(17.82 %)		 16,403,243
(54.79 %)		 2
(0.00 %)		 1,425,690
(2.88 %)		 113,936
(1.69 %)		 22,323
(0.31 %)
37 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1		 n/a n/a 11,692
(0.46 %)		 19,961
(1.22 %)		 n/a 42.79
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,507
(0.01 %)		 445
(100.00 %)		 4,781,152
(36.16 %)		 876,063
(14.65 %)		 16,060,040
(52.49 %)		 7
(0.00 %)		 2,994,548
(6.81 %)		 101,598
(1.64 %)		 21,263
(0.33 %)
38 central bearded dragon
GCF_900067755.1		 42,304
(3.53 %)		 n/a 13,856
(1.19 %)		 17,956
(1.96 %)		 n/a 41.81
(96.03 %)		 0
(0 %)		 90,546
(3.99 %)		 13,749
(100.00 %)		 821,868
(3.44 %)		 570,849
(3.46 %)		 9,494,309
(29.78 %)		 161
(0.03 %)		 346,792
(2.81 %)		 48,137
(1.31 %)		 23,199
(0.67 %)
39 Chinese alligator
GCF_000455745.1		 49,884
(3.04 %)		 n/a 14,431
(1.00 %)		 15,854
(1.43 %)		 n/a 44.49
(96.86 %)		 167,965
(3.17 %)		 167,965
(3.17 %)		 177,282
(96.83 %)		 2,919,372
(38.76 %)		 346,310
(1.06 %)		 12,332,417
(29.19 %)		 95
(0.01 %)		 116,160
(0.98 %)		 46,638
(1.19 %)		 26,168
(0.73 %)
40 Chinese soft-shelled turtle
GCF_000230535.1		 45,441
(3.08 %)		 n/a 13,715
(0.96 %)		 16,798
(1.50 %)		 n/a 44.42
(95.68 %)		 185,476
(4.35 %)		 185,476
(4.35 %)		 205,380
(95.65 %)		 1,193,608
(10.92 %)		 455,163
(3.06 %)		 11,234,886
(32.34 %)		 126
(0.01 %)		 282,804
(2.81 %)		 95,997
(2.06 %)		 44,456
(1.00 %)
41 coelacanth
GCF_000225785.1		 40,763
(2.63 %)		 n/a 13,493
(0.78 %)		 17,640
(1.50 %)		 n/a 41.15
(76.37 %)		 269,010
(23.67 %)		 269,010
(23.67 %)		 291,829
(76.33 %)		 2,026,776
(9.13 %)		 571,917
(1.19 %)		 14,630,157
(34.87 %)		 2,038
(0.03 %)		 261,629
(0.61 %)		 42,857
(0.54 %)		 8,573
(0.11 %)
42 coelacanth (fLatCha1 primary hap 2024)
GCF_037176945.1		 40,046
(2.75 %)		 n/a 13,820
(0.63 %)		 17,285
(1.40 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 0
(0 %)		 154
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 2,064,326
(2.75 %)		 1,047,267
(3.01 %)		 15,613,479
(54.45 %)		 1
(0.00 %)		 1,146,128
(3.27 %)		 140,027
(2.34 %)		 11,143
(0.16 %)
43 Columbretes wall lizard (hap1.1 2025)
GCA_965112155.1		 n/a n/a 14,276
(1.31 %)		 20,158
(2.24 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 0
(0 %)		 921
(0.01 %)		 290
(100.00 %)		 871,508
(4.31 %)		 539,525
(6.79 %)		 7,116,593
(40.00 %)		 2
(0.00 %)		 754,520
(4.30 %)		 97,685
(3.45 %)		 20,472
(0.73 %)
44 Columbretes wall lizard (hap2.1 2025)
GCA_965178375.1		 n/a n/a 13,776
(1.35 %)		 19,389
(2.28 %)		 n/a 43.97
(99.99 %)		 867
(0.01 %)		 867
(0.01 %)		 1,011
(99.99 %)		 816,540
(4.18 %)		 497,364
(6.95 %)		 6,729,569
(39.28 %)		 3
(0.00 %)		 694,995
(4.18 %)		 89,601
(3.31 %)		 19,420
(0.74 %)
45 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1		 n/a n/a 13,999
(1.21 %)		 18,145
(2.02 %)		 n/a 44.85
(100.00 %)		 0
(0 %)		 286
(0.00 %)		 827
(100.00 %)		 844,126
(6.57 %)		 462,086
(2.56 %)		 8,237,807
(37.72 %)		 0
(0 %)		 573,955
(2.91 %)		 30,098
(0.96 %)		 16,208
(0.52 %)
46 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1		 n/a n/a 13,266
(1.21 %)		 16,750
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 0
(0 %)		 506,831
(2.74 %)		 28,089
(0.98 %)		 14,987
(0.51 %)
47 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1		 n/a n/a 13,073
(0.44 %)		 43,036
(1.95 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 14
(0.00 %)		 12,033
(100.00 %)		 1,489,788
(2.18 %)		 2,621,157
(9.04 %)		 17,154,926
(55.44 %)		 0
(0 %)		 3,161,179
(6.09 %)		 581,115
(7.68 %)		 54,845
(0.65 %)
48 common garter snake
GCF_001077635.1		 26,656
(3.83 %)		 n/a 11,623
(1.25 %)		 17,501
(2.23 %)		 n/a 39.92
(78.84 %)		 168,047
(21.21 %)		 246,220
(21.21 %)		 175,977
(78.79 %)		 606,040
(3.22 %)		 543,646
(2.36 %)		 6,946,141
(27.08 %)		 3,234
(0.23 %)		 224,609
(2.22 %)		 36,264
(1.27 %)		 18,972
(0.73 %)
49 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1		 45,869
(6.34 %)		 n/a 14,279
(1.46 %)		 19,710
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 0
(0 %)		 683
(0.01 %)		 48
(100.00 %)		 4,128,183
(45.62 %)		 513,318
(3.73 %)		 7,172,928
(37.61 %)		 7
(0.00 %)		 477,389
(3.08 %)		 92,858
(2.90 %)		 22,863
(0.95 %)
50 common lizard Z.vivipara (hap1.1 2025)
GCA_965207765.1		 n/a n/a 14,100
(1.43 %)		 19,472
(2.36 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 0
(0 %)		 108
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 884,631
(4.70 %)		 507,148
(3.64 %)		 7,206,478
(37.26 %)		 2
(0.00 %)		 449,058
(2.96 %)		 89,393
(2.87 %)		 21,776
(0.82 %)
51 common lizard Z.vivipara (hap2.1 2025)
GCA_965208345.1		 n/a n/a 14,258
(1.44 %)		 19,379
(2.37 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 102
(0.00 %)		 102
(0.00 %)		 169
(100.00 %)		 884,140
(4.69 %)		 506,524
(3.53 %)		 7,214,124
(37.18 %)		 1
(0.00 %)		 445,202
(2.93 %)		 89,651
(2.88 %)		 21,910
(0.82 %)
52 common newt (primary hap 2024)
GCA_964263255.1		 n/a n/a 17,972
(0.09 %)		 229,830
(1.61 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 0
(0 %)		 4,030
(0.00 %)		 15,265
(100.00 %)		 4,807,454
(1.50 %)		 10,258,109
(12.52 %)		 19,295
(100.00 %)		 27
(0.00 %)		 3,799,915
(1.53 %)		 2,684,793
(7.99 %)		 2,631,420
(7.74 %)
53 common spadefoot toad (primary hap 2024 genbank)
GCA_036172605.1		 n/a n/a 14,564
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 349
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 1,677,382
(3.51 %)		 3,229,435
(13.31 %)		 15,027,089
(51.43 %)		 12
(0.00 %)		 3,799,247
(9.03 %)		 282,389
(3.86 %)		 79,263
(0.96 %)
54 common spadefoot toad (primary hap 2024 refseq)
GCF_036172605.1		 42,170
(1.55 %)		 n/a 14,560
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 0
(0 %)		 349
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 1,677,374
(3.51 %)		 3,229,434
(13.31 %)		 15,027,049
(51.43 %)		 12
(0.00 %)		 3,799,232
(9.03 %)		 282,389
(3.86 %)		 79,263
(0.96 %)
55 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1		 n/a n/a 12,074
(0.39 %)		 46,329
(1.82 %)		 n/a 44.48
(99.99 %)		 156
(0.01 %)		 156
(0.01 %)		 24,351
(99.99 %)		 1,186,360
(1.65 %)		 2,279,941
(13.33 %)		 14,665,548
(61.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,594,926
(9.74 %)		 405,097
(4.49 %)		 61,648
(0.70 %)
56 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1		 45,085
(1.10 %)		 n/a 14,240
(0.38 %)		 46,470
(1.68 %)		 37,594
(0.91 %)		 44.49
(99.80 %)		 0
(0 %)		 4,199
(0.20 %)		 1,306
(100.00 %)		 1,658,204
(1.79 %)		 3,099,513
(13.49 %)		 19,236,510
(62.70 %)		 18
(0.00 %)		 6,217,888
(10.17 %)		 539,919
(4.45 %)		 78,985
(0.67 %)
57 common wall lizard (hap1 2024)
GCA_964188315.1		 n/a n/a 14,322
(1.36 %)		 19,700
(2.31 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 0
(0 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 868,785
(4.15 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,097,077
(38.69 %)		 10
(0.00 %)		 713,068
(4.14 %)		 120,725
(3.71 %)		 20,707
(0.76 %)
58 common wall lizard (hap2 2024)
GCA_964188365.1		 n/a n/a 13,838
(1.39 %)		 19,262
(2.35 %)		 n/a 44.17
(99.99 %)		 734
(0.01 %)		 734
(0.01 %)		 825
(99.99 %)		 815,808
(4.07 %)		 494,366
(4.53 %)		 6,739,651
(37.84 %)		 6
(0.00 %)		 648,489
(3.96 %)		 113,458
(3.63 %)		 19,621
(0.77 %)
59 common wall lizard (yellow 2019)
GCF_004329235.1		 56,506
(4.85 %)		 n/a 14,453
(1.36 %)		 20,529
(2.31 %)		 n/a 44.18
(99.81 %)		 0
(0 %)		 4,085
(0.19 %)		 2,161
(100.00 %)		 1,089,164
(8.31 %)		 506,669
(2.12 %)		 7,474,116
(36.15 %)		 2
(0.00 %)		 623,437
(4.37 %)		 122,507
(3.69 %)		 21,388
(0.79 %)
60 corn snake (Columbia U 2023)
GCF_029531705.1		 53,076
(4.72 %)		 n/a 13,697
(1.21 %)		 20,819
(2.22 %)		 n/a 40.33
(96.60 %)		 3,553
(3.40 %)		 3,553
(3.40 %)		 4,019
(96.60 %)		 4,116,616
(49.72 %)		 917,455
(3.96 %)		 8,460,248
(40.76 %)		 143
(0.00 %)		 602,278
(2.72 %)		 64,946
(2.08 %)		 20,725
(0.74 %)
61 corn snake (EG266 2020)
GCF_001185365.1		 48,995
(3.92 %)		 n/a 13,316
(1.14 %)		 23,595
(2.17 %)		 29,466
(2.61 %)		 40.35
(95.32 %)		 0
(0 %)		 84,947
(4.70 %)		 34,268
(100.00 %)		 1,243,828
(6.50 %)		 884,533
(3.25 %)		 8,373,398
(40.31 %)		 4,035
(0.07 %)		 377,287
(1.66 %)		 66,926
(2.14 %)		 25,639
(0.86 %)
62 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1		 n/a n/a 14,955
(0.23 %)		 n/a n/a 45.61
(99.80 %)		 2,431
(0.20 %)		 2,431
(0.20 %)		 5,958
(99.80 %)		 20,007,151
(76.28 %)		 5,951,819
(19.40 %)		 5,958
(99.80 %)		 49
(0.00 %)		 n/a 991,009
(4.86 %)		 91,447
(0.54 %)
63 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1		 140,657
(1.12 %)		 n/a 15,461
(0.24 %)		 54,344
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 0
(0 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 3,521,281
(2.88 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 5,826
(99.76 %)		 23
(0.00 %)		 n/a 990,274
(4.84 %)		 952,582
(4.53 %)
64 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1		 n/a n/a 13,192
(1.36 %)		 19,293
(2.32 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,936
(100.00 %)		 808,341
(4.31 %)		 467,532
(2.91 %)		 6,418,809
(38.02 %)		 0
(0 %)		 518,786
(3.19 %)		 107,080
(3.15 %)		 17,213
(0.72 %)
65 Cretan wall lizard (primary hap 2023)
GCA_951804945.1		 n/a n/a 14,249
(1.37 %)		 19,304
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 47
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 882,564
(4.30 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,363
(38.65 %)		 2
(0.00 %)		 586,225
(3.38 %)		 117,222
(3.18 %)		 18,707
(0.71 %)
66 crested gecko (US Hobby MAA-2024a 2024)
GCA_040207535.1		 n/a n/a 13,876
(1.22 %)		 18,274
(2.01 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 11
(0.00 %)		 162
(100.00 %)		 1,021,810
(6.04 %)		 410,843
(1.76 %)		 8,147,007
(34.90 %)		 0
(0 %)		 557,983
(2.92 %)		 79,154
(2.34 %)		 20,951
(0.68 %)
67 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1		 50,318
(3.53 %)		 n/a 15,109
(1.08 %)		 19,280
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 0
(0 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 0
(0 %)		 407,696
(1.71 %)		 110,838
(2.71 %)		 30,093
(0.82 %)
68 diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023)
GCA_027887205.1		 n/a n/a 15,081
(1.08 %)		 19,115
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.98 %)		 0
(0 %)		 127
(0.02 %)		 59
(100.00 %)		 4,093,707
(46.36 %)		 404,046
(1.70 %)		 11,113,266
(33.78 %)		 1
(0.01 %)		 405,600
(1.68 %)		 111,129
(2.68 %)		 30,307
(0.82 %)
69 eastern brown snake
GCF_900518735.1		 34,614
(3.30 %)		 n/a 13,625
(1.22 %)		 21,795
(2.00 %)		 n/a 39.84
(97.54 %)		 0
(0 %)		 59,472
(2.47 %)		 28,550
(100.00 %)		 1,020,240
(5.86 %)		 663,810
(2.41 %)		 8,140,554
(39.61 %)		 3,387
(0.06 %)		 230,860
(1.32 %)		 52,895
(2.12 %)		 20,320
(0.72 %)
70 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1		 n/a n/a 13,413
(1.19 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 553
(0.01 %)		 771
(99.99 %)		 1,003,504
(9.02 %)		 621,617
(3.54 %)		 8,327,948
(30.44 %)		 3
(0.00 %)		 583,206
(2.41 %)		 117,734
(4.05 %)		 30,498
(1.01 %)
71 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1		 n/a n/a 13,632
(0.43 %)		 35,630
(1.52 %)		 n/a 46.77
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,773
(0.01 %)		 590
(100.00 %)		 1,759,193
(1.98 %)		 2,013,186
(16.21 %)		 16,138,898
(60.55 %)		 17
(0.00 %)		 5,811,499
(9.67 %)		 614,432
(5.85 %)		 72,993
(0.75 %)
72 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1		 n/a n/a 13,882
(0.43 %)		 35,323
(1.46 %)		 n/a 46.78
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,745
(0.01 %)		 1,002
(100.00 %)		 1,769,293
(1.99 %)		 2,023,109
(16.33 %)		 16,148,710
(60.55 %)		 22
(0.00 %)		 5,852,023
(9.72 %)		 618,204
(5.89 %)		 74,394
(0.76 %)
73 elephant shark (2021)
GCF_018977255.1		 32,553
(4.75 %)		 n/a 11,542
(1.51 %)		 18,900
(3.25 %)		 n/a 42.85
(99.99 %)		 2,060
(0.01 %)		 14,404
(0.01 %)		 3,822
(99.99 %)		 1,971,730
(36.60 %)		 433,955
(3.92 %)		 5,654,656
(37.91 %)		 11
(0.00 %)		 553,756
(3.85 %)		 41,081
(3.43 %)		 17,151
(0.98 %)
74 epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021)
GCA_020745765.1		 n/a n/a 12,650
(0.38 %)		 20,614
(1.06 %)		 n/a 42.75
(97.99 %)		 0
(0 %)		 3,552
(2.01 %)		 4,000
(100.00 %)		 9,489,793
(70.34 %)		 976,827
(6.97 %)		 21,183,330
(44.32 %)		 1
(0.00 %)		 3,092,395
(4.62 %)		 42,917
(1.08 %)		 13,522
(0.16 %)
75 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1		 43,156
(1.65 %)		 n/a 12,749
(0.40 %)		 19,519
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 0
(0 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,962
(100.00 %)		 9,420,365
(63.82 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,566
(43.88 %)		 0
(0 %)		 2,903,280
(4.44 %)		 41,682
(1.08 %)		 16,895
(0.30 %)
76 European common frog (2021)
GCF_905171775.1		 51,633
(1.57 %)		 n/a 13,864
(0.46 %)		 39,978
(1.88 %)		 57,578
(1.85 %)		 44.15
(99.36 %)		 0
(0 %)		 1,860
(0.64 %)		 554
(100.00 %)		 1,804,642
(3.42 %)		 2,925,830
(9.39 %)		 18,921,726
(55.43 %)		 8
(0.00 %)		 3,384,162
(6.05 %)		 641,799
(7.66 %)		 62,649
(0.67 %)
77 European eel (alternate hap 2020)
GCA_013347865.1		 n/a n/a 17,177
(2.21 %)		 36,037
(5.58 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 2,338
(100.00 %)		 811,567
(5.37 %)		 759,871
(7.97 %)		 5,672,321
(27.30 %)		 0
(0 %)		 731,152
(4.88 %)		 127,837
(8.05 %)		 92,776
(4.12 %)
78 European eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013347855.1		 64,143
(9.57 %)		 n/a 17,054
(2.22 %)		 34,278
(5.56 %)		 79,684
(7.37 %)		 43.64
(99.61 %)		 0
(0 %)		 640
(0.40 %)		 54
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,521
(8.15 %)		 5,700,890
(27.40 %)		 2
(0.00 %)		 774,914
(5.14 %)		 130,346
(8.19 %)		 94,446
(4.12 %)
79 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1		 24,643
(2.02 %)		 n/a 14,238
(1.16 %)		 21,782
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 0
(0 %)		 153
(0.23 %)		 591
(100.00 %)		 1,174,615
(6.99 %)		 436,937
(2.95 %)		 8,308,817
(39.80 %)		 0
(0 %)		 824,335
(3.45 %)		 83,089
(2.82 %)		 33,674
(0.93 %)
80 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1		 n/a n/a 14,220
(1.16 %)		 21,979
(2.19 %)		 n/a 44.64
(99.68 %)		 0
(0 %)		 177
(0.32 %)		 381
(100.00 %)		 1,169,660
(6.57 %)		 432,998
(2.45 %)		 8,403,791
(39.55 %)		 1
(0.00 %)		 711,098
(3.13 %)		 82,695
(2.80 %)		 33,414
(0.92 %)
81 European pond turtle (hap1 2023 genbank)
GCA_028017835.1		 n/a n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 0
(0 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 5
(0.00 %)		 495,884
(2.08 %)		 136,002
(2.92 %)		 30,671
(0.72 %)
82 European pond turtle (hap1 2023 refseq)
GCF_028017835.1		 27,890
(1.81 %)		 n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 0
(0 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 5
(0.00 %)		 495,938
(2.08 %)		 136,002
(2.92 %)		 30,671
(0.72 %)
83 European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017845.1		 n/a n/a 14,971
(1.00 %)		 20,099
(1.61 %)		 n/a 44.79
(99.77 %)		 0
(0 %)		 130
(0.23 %)		 156
(100.00 %)		 1,536,611
(12.44 %)		 471,903
(2.16 %)		 11,129,943
(35.50 %)		 1
(0.00 %)		 522,759
(2.15 %)		 138,047
(2.94 %)		 31,391
(0.73 %)
84 European river lamprey (primary hap 2024)
GCA_964198595.1		 n/a n/a 7,757
(0.73 %)		 36,797
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 0
(0 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,497
(100.00 %)		 657,405
(7.80 %)		 1,165,422
(20.23 %)		 4,931,883
(50.78 %)		 4
(0.00 %)		 2,442,653
(12.79 %)		 149,123
(44.61 %)		 116,679
(5.22 %)
85 Far Eastern brook lamprey (LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.1		 37,946
(7.32 %)		 n/a 7,797
(0.72 %)		 39,285
(4.37 %)		 n/a 48.80
(98.99 %)		 0
(0 %)		 3,287
(1.01 %)		 1,946
(100.00 %)		 716,804
(6.02 %)		 1,192,268
(15.54 %)		 5,304,945
(47.85 %)		 5
(0.00 %)		 1,949,540
(10.82 %)		 170,623
(43.14 %)		 128,479
(5.62 %)
86 fence lizard
GCF_019175285.1		 48,391
(3.65 %)		 n/a 14,000
(1.07 %)		 17,384
(1.71 %)		 n/a 41.25
(97.53 %)		 0
(0 %)		 48,138
(2.47 %)		 45,012
(100.00 %)		 1,357,856
(6.95 %)		 596,824
(1.92 %)		 11,090,372
(34.38 %)		 926
(0.05 %)		 356,377
(1.59 %)		 67,007
(1.51 %)		 13,181
(0.35 %)
87 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap1.1 2024)
GCA_964270895.1		 n/a n/a 14,292
(1.37 %)		 20,325
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 4
(0.00 %)		 872
(0.01 %)		 353
(100.00 %)		 840,209
(4.04 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,010,158
(37.94 %)		 7
(0.00 %)		 632,285
(3.51 %)		 87,924
(2.61 %)		 19,744
(0.76 %)
88 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap2.1 2024)
GCA_964270875.1		 n/a n/a 13,804
(1.42 %)		 19,450
(2.39 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 795
(0.01 %)		 795
(0.01 %)		 937
(99.99 %)		 782,998
(3.95 %)		 448,089
(3.61 %)		 6,735,032
(36.83 %)		 3
(0.00 %)		 546,833
(3.23 %)		 81,312
(2.54 %)		 18,612
(0.77 %)
89 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1		 n/a n/a 2,936
(0.15 %)		 17,722
(1.38 %)		 n/a 38.51
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 13,751
(100.00 %)		 919,882
(3.50 %)		 1,443,294
(10.50 %)		 7,705,012
(57.28 %)		 0
(0 %)		 2,148,861
(9.45 %)		 74,669
(1.25 %)		 7,295
(0.13 %)
90 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1		 38,238
(0.68 %)		 n/a 15,452
(0.21 %)		 47,500
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 0
(0 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,467
(100.00 %)		 4,258,941
(3.44 %)		 7,150,261
(12.27 %)		 9,476
(98.01 %)		 3
(0.00 %)		 n/a n/a n/a
91 flatback sea turtle (hap1 2025)
GCA_965152275.1		 n/a 26,709
(2.00 %)		 15,046
(1.09 %)		 18,089
(1.57 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 171
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 4,516,775
(43.62 %)		 319,645
(1.38 %)		 10,785,223
(32.95 %)		 3
(0.00 %)		 442,908
(1.94 %)		 52,168
(1.81 %)		 27,004
(0.88 %)
92 flatback sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152195.1		 n/a 25,064
(1.90 %)		 14,229
(1.06 %)		 16,514
(1.49 %)		 n/a 43.97
(100.00 %)		 261
(0.00 %)		 261
(0.00 %)		 322
(100.00 %)		 4,567,737
(43.65 %)		 288,964
(1.17 %)		 10,681,579
(32.83 %)		 2
(0.00 %)		 394,529
(1.77 %)		 47,249
(1.62 %)		 22,587
(0.73 %)
93 Fleay's barred frog (hap1 2024)
GCA_038048845.1		 n/a n/a 14,321
(0.67 %)		 22,672
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 0
(0 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,578
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,293,397
(46.37 %)		 2
(0.00 %)		 3,318,438
(8.11 %)		 63,677
(0.85 %)		 12,950
(0.19 %)
94 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1		 n/a n/a 14,224
(0.69 %)		 22,406
(1.57 %)		 n/a 40.75
(99.89 %)		 0
(0 %)		 1,383
(0.12 %)		 914
(100.00 %)		 1,300,452
(3.37 %)		 1,495,355
(10.56 %)		 13,385,401
(44.67 %)		 1
(0.00 %)		 2,540,687
(7.06 %)		 64,121
(0.88 %)		 13,021
(0.20 %)
95 Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035715.1		 n/a n/a 14,392
(0.90 %)		 17,909
(1.50 %)		 n/a 42.86
(99.84 %)		 213
(0.16 %)		 213
(0.16 %)		 836
(99.84 %)		 1,440,070
(7.19 %)		 620,131
(2.54 %)		 10,919,950
(45.21 %)		 2
(0.00 %)		 523,070
(2.35 %)		 47,933
(1.03 %)		 18,609
(0.43 %)
96 Florida worm lizard (hap2 2023 genbank)
GCA_030035675.1		 n/a n/a 14,331
(0.90 %)		 17,854
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 1
(0.00 %)		 242
(0.28 %)		 78
(100.00 %)		 1,426,833
(7.17 %)		 616,690
(2.63 %)		 10,819,054
(45.31 %)		 1
(0.00 %)		 531,662
(2.36 %)		 47,454
(1.03 %)		 18,400
(0.42 %)
97 Florida worm lizard (hap2 2023 refseq)
GCF_030035675.1		 65,314
(3.47 %)		 n/a 14,331
(0.90 %)		 17,853
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 0
(0 %)		 242
(0.28 %)		 76
(100.00 %)		 1,426,827
(7.17 %)		 616,687
(2.63 %)		 10,819,019
(45.31 %)		 1
(0.00 %)		 531,660
(2.36 %)		 47,453
(1.03 %)		 18,399
(0.42 %)
98 frog A.baeobatrachus (hap1 2025)
GCA_048569485.1		 n/a n/a 13,963
(0.31 %)		 43,460
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3,772
(0.01 %)		 3,642
(100.00 %)		 2,033,935
(2.50 %)		 4,040,311
(20.45 %)		 20,439,907
(69.96 %)		 60
(0.00 %)		 7,481,063
(9.87 %)		 1,159,163
(12.74 %)		 63,455
(0.51 %)
99 frog A.baeobatrachus (hap2 2025)
GCA_048569465.1		 n/a n/a 13,992
(0.31 %)		 43,409
(1.27 %)		 n/a 46.36
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3,799
(0.01 %)		 2,426
(100.00 %)		 1,997,963
(2.50 %)		 4,002,458
(19.16 %)		 20,517,633
(69.30 %)		 47
(0.00 %)		 8,117,501
(10.97 %)		 1,152,817
(12.93 %)		 63,273
(0.52 %)
100 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1		 n/a n/a 12,821
(0.47 %)		 30,612
(1.44 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,651
(100.00 %)		 1,139,595
(1.64 %)		 1,170,215
(3.77 %)		 17,091,511
(52.44 %)		 0
(0 %)		 995,544
(2.57 %)		 235,170
(4.50 %)		 33,394
(0.50 %)
101 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2		 n/a n/a 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 0
(0 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,331,879
(1.68 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,806
(52.85 %)		 3
(0.00 %)		 1,182,995
(2.68 %)		 270,923
(4.52 %)		 38,622
(0.50 %)
102 gharial (Ggan-Ray 2016)
GCF_001723915.1		 32,284
(2.61 %)		 n/a 12,194
(1.03 %)		 12,758
(1.30 %)		 n/a 43.95
(73.60 %)		 0
(0 %)		 248,526
(26.44 %)		 81
(100.00 %)		 2,589,103
(36.89 %)		 243,334
(0.51 %)		 11,279,606
(20.80 %)		 29,443
(5.09 %)		 125,202
(1.53 %)		 26,651
(0.60 %)		 20,614
(0.47 %)
103 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1		 n/a n/a 14,254
(0.94 %)		 23,016
(2.00 %)		 n/a 45.13
(99.95 %)		 0
(0 %)		 61
(0.05 %)		 298
(100.00 %)		 1,230,357
(13.08 %)		 350,230
(2.85 %)		 11,854,314
(33.03 %)		 2
(0.00 %)		 335,615
(1.39 %)		 39,919
(1.95 %)		 26,198
(0.77 %)
104 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1		 n/a n/a 14,151
(0.94 %)		 23,338
(1.95 %)		 n/a 45.15
(99.95 %)		 0
(0 %)		 118
(0.05 %)		 160
(100.00 %)		 1,232,693
(12.81 %)		 332,737
(2.19 %)		 11,907,298
(32.91 %)		 3
(0.00 %)		 284,469
(1.22 %)		 40,660
(1.87 %)		 25,990
(0.77 %)
105 giant manta (hap1 2023)
GCA_030028105.1		 n/a n/a 12,432
(0.38 %)		 24,821
(1.16 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 0
(0 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 7,913,208
(49.68 %)		 969,352
(14.22 %)		 20,235,210
(54.42 %)		 17
(0.00 %)		 4,636,724
(7.12 %)		 110,678
(1.74 %)		 30,504
(0.36 %)
106 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1		 n/a n/a 12,198
(0.42 %)		 23,127
(1.17 %)		 n/a 42.85
(98.49 %)		 0
(0 %)		 1,742
(1.51 %)		 1,558
(100.00 %)		 7,431,472
(52.41 %)		 716,951
(7.28 %)		 19,456,793
(50.99 %)		 9
(0.01 %)		 2,419,836
(4.27 %)		 91,414
(1.45 %)		 65,413
(0.90 %)
107 giant South American river turtle (hap1 2024)
GCA_045364785.1		 n/a n/a 14,628
(0.85 %)		 18,382
(1.34 %)		 n/a 44.78
(100.00 %)		 0
(0 %)		 260
(0.00 %)		 2,039
(100.00 %)		 1,254,940
(9.13 %)		 434,666
(6.73 %)		 12,070,445
(35.52 %)		 1
(0.00 %)		 1,002,897
(2.92 %)		 51,563
(1.91 %)		 16,484
(0.36 %)
108 giant South American river turtle (hap2 2024)
GCA_045364815.1		 n/a n/a 14,571
(0.87 %)		 18,363
(1.38 %)		 n/a 44.25
(100.00 %)		 0
(0 %)		 224
(0.00 %)		 725
(100.00 %)		 1,243,321
(10.35 %)		 434,716
(4.30 %)		 12,200,714
(33.86 %)		 2
(0.00 %)		 769,881
(2.27 %)		 51,411
(1.88 %)		 16,569
(0.37 %)
109 golden mantella (hap1 2025)
GCA_048565345.1		 n/a n/a 13,675
(0.56 %)		 30,568
(1.85 %)		 n/a 41.00
(99.98 %)		 0
(0 %)		 4,138
(0.02 %)		 3,088
(100.00 %)		 1,225,842
(2.74 %)		 2,478,484
(16.71 %)		 14,761,187
(53.21 %)		 51
(0.00 %)		 5,379,974
(9.98 %)		 164,021
(2.52 %)		 33,788
(0.51 %)
110 golden mantella (hap2 2025)
GCA_048565335.1		 n/a n/a 13,400
(0.55 %)		 28,454
(1.70 %)		 n/a 40.91
(99.98 %)		 0
(0 %)		 3,921
(0.02 %)		 2,611
(100.00 %)		 1,203,975
(3.36 %)		 2,447,119
(16.68 %)		 14,661,554
(53.34 %)		 45
(0.00 %)		 5,276,975
(9.84 %)		 160,856
(2.46 %)		 32,812
(0.49 %)
111 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2		 57,442
(3.17 %)		 n/a 14,852
(1.00 %)		 18,125
(1.49 %)		 31,841
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 0
(0 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,271
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 0
(0 %)		 474,978
(1.73 %)		 71,687
(2.29 %)		 21,793
(0.54 %)
112 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1		 n/a n/a 13,359
(0.95 %)		 19,347
(1.51 %)		 n/a 44.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 8,736
(100.00 %)		 1,404,513
(13.79 %)		 334,726
(2.35 %)		 9,735,007
(33.33 %)		 0
(0 %)		 468,758
(1.89 %)		 61,680
(2.32 %)		 18,869
(0.54 %)
113 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 refseq)
GCF_029215685.1		 28,358
(2.73 %)		 n/a 12,291
(1.06 %)		 19,125
(2.02 %)		 n/a 40.55
(100.00 %)		 584
(0.00 %)		 584
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 1,259,792
(7.92 %)		 925,571
(7.56 %)		 7,739,127
(45.92 %)		 3
(0.00 %)		 840,459
(4.04 %)		 73,681
(2.81 %)		 26,366
(0.92 %)
114 gopher snake (HBS135680 primary hap 2023)
GCA_029215655.1		 n/a n/a 13,289
(1.09 %)		 20,513
(2.09 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 603
(0.00 %)		 603
(0.00 %)		 1,029
(100.00 %)		 1,325,747
(8.26 %)		 973,338
(7.56 %)		 8,352,703
(45.38 %)		 4
(0.00 %)		 888,155
(3.86 %)		 72,941
(2.59 %)		 27,387
(0.91 %)
115 graceful crag lizard (Gifberg primary hap 2022)
GCF_027244095.1		 86,666
(4.30 %)		 n/a 14,269
(0.91 %)		 18,195
(1.57 %)		 n/a 44.82
(100.00 %)		 0
(0 %)		 42
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 1,644,976
(6.04 %)		 823,058
(3.00 %)		 11,991,046
(41.43 %)		 0
(0 %)		 489,782
(1.69 %)		 80,718
(1.90 %)		 27,916
(0.61 %)
116 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1		 n/a n/a 14,094
(1.03 %)		 17,875
(1.65 %)		 n/a 41.62
(99.95 %)		 0
(0 %)		 28
(0.05 %)		 30
(100.00 %)		 1,100,228
(6.21 %)		 423,695
(1.33 %)		 11,521,828
(32.55 %)		 2
(0.00 %)		 258,014
(1.05 %)		 62,978
(2.00 %)		 24,755
(0.81 %)
117 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1		 n/a n/a 13,758
(1.02 %)		 16,909
(1.62 %)		 n/a 41.53
(99.01 %)		 19
(0.99 %)		 19
(0.99 %)		 52
(99.01 %)		 1,069,189
(6.12 %)		 410,262
(1.25 %)		 11,390,195
(32.28 %)		 0
(0 %)		 233,593
(0.96 %)		 60,835
(1.92 %)		 23,191
(0.77 %)
118 gray bichir
GCF_016835505.1		 48,178
(1.88 %)		 n/a 12,963
(0.44 %)		 24,479
(1.21 %)		 n/a 39.32
(99.96 %)		 0
(0 %)		 3,166
(0.04 %)		 9,856
(100.00 %)		 1,765,862
(2.54 %)		 1,017,723
(2.38 %)		 20,924,763
(47.66 %)		 2
(0.00 %)		 997,434
(2.53 %)		 98,862
(1.64 %)		 24,750
(0.32 %)
119 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1		 n/a n/a 20
(0.30 %)		 63
(2.06 %)		 n/a 45.02
(99.98 %)		 0
(0 %)		 28
(0.02 %)		 39
(100.00 %)		 8,165
(60.43 %)		 2,740
(27.09 %)		 15,863
(31.63 %)		 0
(0 %)		 16,359
(15.02 %)		 167
(5.51 %)		 65
(0.61 %)
120 great white shark (primary hap 2021)
GCF_017639515.1		 49,865
(1.46 %)		 n/a 13,010
(0.37 %)		 19,263
(0.92 %)		 46,152
(1.30 %)		 45.21
(99.55 %)		 0
(0 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 1,046,023
(4.00 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,563
(52.42 %)		 11
(0.00 %)		 8,687,289
(11.05 %)		 77,021
(1.94 %)		 14,712
(0.15 %)
121 green anole (JA03-04 2024)
GCF_035594765.1		 56,324
(5.85 %)		 n/a 14,020
(1.12 %)		 20,096
(1.86 %)		 n/a 40.60
(98.38 %)		 0
(0 %)		 841
(1.62 %)		 211
(100.00 %)		 4,859,635
(53.14 %)		 909,429
(5.19 %)		 8,304,332
(44.07 %)		 5
(0.00 %)		 1,056,606
(4.88 %)		 56,404
(1.78 %)		 20,393
(0.51 %)
122 green anole (v1 2011)
GCF_000090745.1		 38,096
(3.63 %)		 n/a 13,021
(1.08 %)		 20,780
(1.86 %)		 38,266
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 35,533
(5.44 %)		 41,987
(94.56 %)		 2,415,433
(28.92 %)		 702,538
(2.99 %)		 8,199,653
(39.69 %)		 25
(0.00 %)		 674,365
(3.47 %)		 42,151
(1.18 %)		 15,374
(0.36 %)
123 green anole (v2 2010)
GCF_000090745.2		 38,096
(3.63 %)		 n/a 13,140
(1.11 %)		 20,772
(1.86 %)		 38,229
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 35,530
(5.44 %)		 41,986
(94.56 %)		 4,455,733
(51.37 %)		 702,537
(2.99 %)		 8,199,580
(39.69 %)		 25
(0.00 %)		 674,353
(3.47 %)		 42,151
(1.18 %)		 15,935
(0.39 %)
124 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2		 n/a n/a 13,635
(1.05 %)		 19,414
(1.61 %)		 n/a 44.16
(99.95 %)		 60
(0.05 %)		 60
(0.05 %)		 6,797
(99.95 %)		 3,221,668
(44.97 %)		 275,275
(1.28 %)		 9,802,895
(32.14 %)		 2
(0.00 %)		 394,278
(1.72 %)		 45,469
(1.48 %)		 25,997
(0.89 %)
125 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2		 84,366
(4.63 %)		 n/a 14,725
(1.06 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 0
(0 %)		 298
(0.56 %)		 93
(100.00 %)		 1,701,640
(14.83 %)		 304,306
(1.25 %)		 11,135,147
(31.96 %)		 0
(0 %)		 429,994
(1.68 %)		 49,025
(1.44 %)		 26,933
(0.68 %)
126 hawksbill sea turtle (B2_1 2023)
GCA_030012505.1		 n/a n/a 14,897
(1.00 %)		 18,251
(1.51 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 0
(0 %)		 95
(0.00 %)		 208
(100.00 %)		 1,315,164
(12.07 %)		 347,678
(3.60 %)		 10,892,216
(35.32 %)		 2
(0.00 %)		 683,881
(2.59 %)		 49,532
(1.65 %)		 26,297
(0.62 %)
127 hawksbill sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152285.1		 n/a 25,779
(1.85 %)		 14,843
(1.02 %)		 18,006
(1.54 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 132
(0.12 %)		 132
(0.12 %)		 173
(99.88 %)		 1,288,292
(12.14 %)		 318,803
(2.15 %)		 11,148,397
(34.07 %)		 1
(0.00 %)		 573,455
(2.17 %)		 46,922
(1.41 %)		 25,789
(0.63 %)
128 High Himalaya frog
GCF_000935625.1		 26,109
(1.87 %)		 n/a 13,695
(0.94 %)		 28,085
(2.39 %)		 n/a 42.55
(96.32 %)		 122,325
(3.70 %)		 122,325
(3.70 %)		 147,513
(96.30 %)		 536,058
(1.39 %)		 794,563
(5.48 %)		 11,465,450
(37.44 %)		 1,716
(0.17 %)		 725,825
(4.49 %)		 219,772
(3.92 %)		 32,652
(0.67 %)
129 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1		 n/a n/a 15,006
(0.28 %)		 22,481
(0.80 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 225
(0.03 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,532
(99.97 %)		 1,344,546
(5.76 %)		 2,364,825
(28.34 %)		 5,088
(99.53 %)		 5
(0.00 %)		 14,350,128
(14.12 %)		 89,340
(2.10 %)		 82,092
(1.20 %)
130 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1		 n/a n/a 12,766
(0.30 %)		 21,591
(0.87 %)		 n/a 44.88
(99.43 %)		 0
(0 %)		 2,790
(0.57 %)		 1,496
(100.00 %)		 1,008,880
(5.19 %)		 1,596,129
(22.32 %)		 22,180,341
(62.98 %)		 2
(0.00 %)		 9,762,254
(11.27 %)		 82,276
(1.85 %)		 14,696
(0.13 %)
131 horn shark (sHetFra1hap1 2024)
GCF_036365525.1		 60,844
(1.44 %)		 n/a 15,004
(0.28 %)		 22,510
(0.76 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 0
(0 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,306
(100.00 %)		 1,344,541
(5.76 %)		 2,364,824
(28.34 %)		 5,087
(99.53 %)		 5
(0.00 %)		 14,350,134
(14.12 %)		 89,340
(2.10 %)		 82,092
(1.20 %)
132 hourglass treefrog (maternal 2023 genbank)
GCA_027789725.1		 n/a n/a 14,359
(0.89 %)		 32,575
(2.67 %)		 n/a 43.88
(95.18 %)		 788
(4.82 %)		 788
(4.82 %)		 3,358
(95.18 %)		 922,807
(2.38 %)		 1,744,603
(15.45 %)		 10,318,168
(48.47 %)		 0
(0 %)		 3,525,571
(8.67 %)		 244,270
(5.02 %)		 29,547
(0.61 %)
133 hourglass treefrog (paternal 2023 refseq)
GCF_027789765.1		 50,542
(2.91 %)		 n/a 14,058
(0.89 %)		 30,599
(2.64 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 0
(0 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 3
(0.00 %)		 1,978,464
(5.31 %)		 235,277
(5.56 %)		 28,414
(0.63 %)
134 Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024)
GCA_036172795.1		 n/a n/a 14,141
(0.97 %)		 22,232
(2.16 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 262
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 944,742
(4.86 %)		 1,927,659
(22.26 %)		 8,988,510
(49.29 %)		 1
(0.00 %)		 3,465,509
(10.62 %)		 77,721
(1.73 %)		 13,802
(0.30 %)
135 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022 genbank)
GCA_026652325.1		 n/a 139,896
(0.54 %)		 15,136
(0.10 %)		 n/a n/a 45.95
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 922
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 4,478,794
(1.33 %)		 6,452,537
(8.86 %)		 1,189
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 n/a 1,581,360
(4.00 %)		 144,588
(0.32 %)
136 Iberian ribbed newt (hap1 20211129_DDA 2024 refseq)
GCF_031143425.1		 57,032
(0.47 %)		 n/a 15,184
(0.10 %)		 72,314
(0.62 %)		 n/a 45.93
(100.00 %)		 0
(0 %)		 1,829
(0.00 %)		 616
(100.00 %)		 4,343,624
(1.32 %)		 6,295,886
(8.29 %)		 2,445
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 736,440
(0.34 %)		 1,546,882
(4.02 %)		 1,545,477
(3.92 %)
137 Indian cobra (NN01 2019)
GCA_009733165.1		 n/a 25,817
(1.78 %)		 13,028
(1.10 %)		 17,854
(1.73 %)		 n/a 40.46
(93.80 %)		 0
(0 %)		 11,910
(6.20 %)		 1,897
(100.00 %)		 1,114,498
(5.61 %)		 671,854
(2.20 %)		 8,205,261
(40.40 %)		 3
(0.02 %)		 n/a 47,381
(1.37 %)		 19,640
(0.65 %)
138 Indian roofed turtle (hap1 2024)
GCA_045781095.1		 n/a n/a 14,623
(1.04 %)		 18,405
(1.58 %)		 n/a 44.24
(100.00 %)		 0
(0 %)		 205
(0.00 %)		 629
(100.00 %)		 1,283,544
(11.43 %)		 298,912
(1.85 %)		 10,728,482
(32.52 %)		 1
(0.00 %)		 413,036
(2.00 %)		 72,908
(2.13 %)		 26,854
(0.71 %)
139 Indian roofed turtle (hap2 2024)
GCA_045781085.1		 n/a n/a 14,682
(1.03 %)		 18,600
(1.58 %)		 n/a 44.26
(100.00 %)		 0
(0 %)		 260
(0.00 %)		 449
(100.00 %)		 1,290,818
(11.46 %)		 301,464
(1.79 %)		 10,704,595
(32.71 %)		 0
(0 %)		 436,958
(2.04 %)		 74,354
(2.05 %)		 27,125
(0.71 %)
140 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1		 n/a n/a 17,858
(2.43 %)		 32,738
(5.46 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 0
(0 %)		 3
(0.00 %)		 4,333
(100.00 %)		 583,632
(3.71 %)		 418,411
(3.74 %)		 5,198,155
(21.50 %)		 1
(0.00 %)		 276,314
(1.94 %)		 76,879
(3.71 %)		 57,281
(2.37 %)
141 Italian wall lizard (rPodSic1.hap1.1 2024)
GCA_964188175.1		 n/a n/a 14,241
(1.31 %)		 20,399
(2.26 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 2
(0.00 %)		 762
(0.01 %)		 296
(100.00 %)		 832,389
(5.27 %)		 530,449
(8.28 %)		 6,937,083
(40.38 %)		 2
(0.00 %)		 908,580
(4.73 %)		 106,667
(3.79 %)		 20,531
(0.75 %)
142 Italian wall lizard (rPodSic1.hap2.1 2024)
GCA_964188395.1		 n/a n/a 13,696
(1.37 %)		 19,278
(2.32 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 690
(0.01 %)		 690
(0.01 %)		 842
(99.99 %)		 763,893
(4.21 %)		 451,861
(6.69 %)		 6,696,380
(38.71 %)		 4
(0.00 %)		 740,272
(4.24 %)		 98,815
(3.65 %)		 19,565
(0.77 %)
143 Japanese sawshark (hap1 2024 refseq)
GCF_044704955.1		 54,879
(1.24 %)		 n/a 12,978
(0.27 %)		 30,195
(0.79 %)		 n/a 47.02
(99.98 %)		 0
(0 %)		 5,985
(0.02 %)		 4,318
(100.00 %)		 11,412,024
(71.47 %)		 2,399,500
(18.16 %)		 20,051,385
(71.80 %)		 38
(0.00 %)		 11,403,077
(11.92 %)		 503,637
(6.56 %)		 48,183
(0.32 %)
144 Japanese sawshark (hap2 2024)
GCA_044704965.1		 n/a n/a 14,833
(0.26 %)		 30,853
(0.75 %)		 n/a 47.12
(99.98 %)		 0
(0 %)		 5,953
(0.02 %)		 5,626
(100.00 %)		 1,238,549
(4.06 %)		 2,718,867
(21.85 %)		 11,579
(99.98 %)		 42
(0.00 %)		 7,882,680
(7.20 %)		 518,286
(6.88 %)		 502,936
(6.32 %)
145 Komodo dragon (SLA01 2019)
GCF_004798865.1		 43,331
(4.33 %)		 n/a 13,543
(1.31 %)		 18,081
(2.11 %)		 n/a 44.04
(99.03 %)		 0
(0 %)		 19,737
(0.97 %)		 1,411
(100.00 %)		 753,603
(4.91 %)		 263,965
(1.41 %)		 8,061,012
(24.65 %)		 582
(0.01 %)		 130,387
(0.66 %)		 49,808
(4.28 %)		 39,034
(2.67 %)
146 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1		 n/a n/a 13,155
(1.15 %)		 22,239
(2.06 %)		 n/a 41.01
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 6,800
(100.00 %)		 1,155,093
(7.75 %)		 707,777
(4.25 %)		 7,071,611
(44.00 %)		 0
(0 %)		 701,636
(4.02 %)		 104,556
(4.39 %)		 22,349
(0.88 %)
147 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1		 n/a n/a 13,350
(1.17 %)		 18,904
(1.93 %)		 n/a 40.96
(99.78 %)		 0
(0 %)		 769
(0.22 %)		 56
(100.00 %)		 1,209,793
(7.69 %)		 762,735
(5.06 %)		 7,424,674
(44.80 %)		 4
(0.00 %)		 794,949
(4.07 %)		 110,631
(4.07 %)		 23,739
(0.88 %)
148 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2		 n/a n/a 11,035
(1.05 %)		 16,064
(1.50 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 7
(0.00 %)		 9,006
(100.00 %)		 2,685,200
(47.08 %)		 208,060
(1.19 %)		 7,184,246
(33.31 %)		 0
(0 %)		 442,748
(2.46 %)		 25,133
(1.42 %)		 15,054
(0.75 %)
149 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq)
GCF_009764565.3		 73,318
(3.97 %)		 n/a 14,610
(1.03 %)		 16,358
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 0
(0 %)		 668
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,694,449
(14.90 %)		 304,773
(1.14 %)		 11,121,962
(34.21 %)		 3
(0.00 %)		 670,729
(2.51 %)		 35,485
(1.36 %)		 19,615
(0.51 %)
150 leopard gecko (TG4126 2023)
GCF_028583425.1		 37,120
(2.89 %)		 n/a 14,358
(0.93 %)		 23,080
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 0
(0 %)		 62
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 969,188
(4.21 %)		 557,245
(2.88 %)		 11,096,222
(37.91 %)		 0
(0 %)		 608,752
(2.77 %)		 82,956
(2.56 %)		 27,406
(0.84 %)
151 lesser devil ray (2024)
GCF_963921235.1		 49,601
(2.40 %)		 n/a 12,335
(0.44 %)		 22,690
(1.20 %)		 n/a 42.91
(100.00 %)		 0
(0 %)		 697
(0.00 %)		 200
(100.00 %)		 7,453,775
(54.11 %)		 677,453
(5.15 %)		 18,943,414
(51.98 %)		 4
(0.00 %)		 1,957,188
(3.59 %)		 87,750
(1.43 %)		 61,592
(0.87 %)
152 Lilford's wall lizard (2023)
GCA_947686815.1		 n/a 469,920
(50.83 %)		 14,239
(1.41 %)		 19,740
(2.33 %)		 n/a 43.80
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,346
(0.02 %)		 2,149
(100.00 %)		 830,790
(4.33 %)		 445,450
(2.12 %)		 7,171,057
(36.69 %)		 79
(0.00 %)		 484,294
(2.64 %)		 86,200
(2.56 %)		 19,378
(0.77 %)
153 little skate (New England 2023)
GCF_028641065.1		 40,008
(3.35 %)		 n/a 11,836
(0.67 %)		 25,770
(1.80 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 0
(0 %)		 862
(0.00 %)		 1,769
(100.00 %)		 8,221,960
(66.45 %)		 1,044,111
(3.71 %)		 10,050,264
(53.79 %)		 1
(0.00 %)		 1,424,247
(4.33 %)		 205,567
(4.36 %)		 21,218
(0.48 %)
154 lizards B.pumilum (Western Cape Province JTBG20231 2024)
GCA_035047305.1		 n/a n/a 13,670
(0.79 %)		 19,028
(1.31 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 18
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 1,040,467
(4.86 %)		 924,221
(6.37 %)		 9,015,048
(56.81 %)		 1
(0.00 %)		 1,768,582
(6.35 %)		 248,142
(10.84 %)		 19,296
(0.34 %)
155 lizards D.cf. smithi (hap1 2024)
GCA_046126795.1		 n/a n/a 14,308
(0.91 %)		 19,761
(1.58 %)		 n/a 45.95
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 274
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 1,376,454
(8.31 %)		 744,560
(3.94 %)		 11,383,198
(44.04 %)		 5
(0.00 %)		 843,674
(3.07 %)		 208,005
(7.18 %)		 27,218
(0.55 %)
156 lizards D.cf. smithi (hap2 2024)
GCA_046126825.1		 n/a n/a 12,359
(0.99 %)		 16,644
(1.66 %)		 n/a 45.69
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 197
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 1,109,222
(8.21 %)		 607,835
(4.09 %)		 9,080,052
(42.56 %)		 8
(0.00 %)		 670,217
(2.85 %)		 158,727
(6.84 %)		 21,844
(0.57 %)
157 lizards F.pardalis (Fpa_1 2023)
GCA_030440675.1		 n/a n/a 13,625
(1.22 %)		 18,049
(1.96 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 12
(0.00 %)		 23
(100.00 %)		 833,693
(2.81 %)		 607,040
(2.82 %)		 7,939,139
(42.05 %)		 0
(0 %)		 421,243
(2.11 %)		 52,987
(2.59 %)		 18,249
(0.61 %)
158 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap1.1 2024)
GCA_964188305.1		 n/a n/a 14,091
(1.26 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 2
(0.00 %)		 1,005
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 932,842
(5.02 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,536
(41.39 %)		 10
(0.00 %)		 772,110
(4.54 %)		 119,467
(4.32 %)		 20,701
(0.72 %)
159 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap2.1 2024)
GCA_964188325.1		 n/a n/a 13,653
(1.34 %)		 19,764
(2.32 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 817
(0.01 %)		 817
(0.01 %)		 1,444
(99.99 %)		 857,503
(4.68 %)		 507,819
(4.16 %)		 6,632,822
(39.41 %)		 4
(0.00 %)		 653,978
(4.13 %)		 103,858
(4.10 %)		 19,626
(0.75 %)
160 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap1.1 2024)
GCA_964252035.1		 n/a n/a 13,858
(1.33 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 0
(0 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 885,596
(4.43 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,008,185
(38.56 %)		 2
(0.00 %)		 527,173
(3.21 %)		 89,737
(2.87 %)		 18,878
(0.71 %)
161 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap2.1 2024)
GCA_964251985.1		 n/a n/a 13,817
(1.35 %)		 21,024
(2.50 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 811
(0.01 %)		 811
(0.01 %)		 1,458
(99.99 %)		 890,080
(4.42 %)		 526,749
(3.38 %)		 7,001,691
(37.94 %)		 9
(0.00 %)		 538,033
(3.26 %)		 89,526
(2.96 %)		 20,250
(0.75 %)
162 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap1.1 2024)
GCA_964234715.1		 n/a n/a 14,289
(1.31 %)		 20,112
(2.23 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 1
(0.00 %)		 823
(0.01 %)		 387
(100.00 %)		 830,352
(7.87 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,838,068
(40.20 %)		 2
(0.00 %)		 932,658
(4.44 %)		 90,074
(2.82 %)		 20,501
(0.74 %)
163 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap2.1 2024)
GCA_964234825.1		 n/a n/a 13,759
(1.39 %)		 19,452
(2.34 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 754
(0.01 %)		 754
(0.01 %)		 954
(99.99 %)		 768,595
(5.31 %)		 448,816
(5.54 %)		 6,722,284
(37.88 %)		 3
(0.00 %)		 638,565
(3.67 %)		 82,575
(2.83 %)		 19,444
(0.76 %)
164 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap1.2 2024)
GCA_964106645.2		 n/a n/a 14,314
(1.36 %)		 20,522
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 1
(0.00 %)		 1,506
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 858,648
(4.22 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,061,380
(38.21 %)		 40
(0.00 %)		 544,982
(3.43 %)		 96,600
(3.21 %)		 19,808
(0.82 %)
165 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap2.2 2024)
GCA_964106635.2		 n/a n/a 13,828
(1.41 %)		 19,048
(2.34 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,548
(99.98 %)		 803,451
(4.16 %)		 440,340
(2.30 %)		 6,774,254
(37.14 %)		 34
(0.00 %)		 471,503
(3.14 %)		 89,229
(3.04 %)		 18,652
(0.77 %)
166 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap1 2025)
GCA_047715975.1		 n/a n/a 13,605
(0.80 %)		 18,928
(1.32 %)		 n/a 44.97
(100.00 %)		 0
(0 %)		 109
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 1,038,607
(4.70 %)		 891,233
(5.94 %)		 9,004,935
(56.47 %)		 1
(0.00 %)		 1,639,727
(6.17 %)		 245,845
(10.83 %)		 19,287
(0.34 %)
167 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap2 2025)
GCA_047715955.1		 n/a n/a 13,631
(0.79 %)		 18,935
(1.32 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 0
(0 %)		 120
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 1,037,146
(4.72 %)		 933,676
(6.26 %)		 9,009,528
(56.65 %)		 1
(0.00 %)		 1,759,246
(6.36 %)		 246,553
(10.79 %)		 19,416
(0.34 %)
168 lizards P.vaucheri (hap1.1 2025)
GCA_965113315.1		 n/a n/a 14,329
(1.28 %)		 20,152
(2.19 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 0
(0 %)		 949
(0.01 %)		 285
(100.00 %)		 893,567
(5.89 %)		 524,077
(6.62 %)		 7,052,308
(41.37 %)		 8
(0.00 %)		 922,684
(4.86 %)		 109,507
(3.61 %)		 21,052
(0.73 %)
169 lizards P.vaucheri (hap2.1 2025)
GCA_965113305.1		 n/a n/a 13,794
(1.32 %)		 19,189
(2.22 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 0
(0 %)		 852
(0.01 %)		 151
(100.00 %)		 841,282
(5.59 %)		 483,392
(6.01 %)		 6,750,191
(40.39 %)		 6
(0.00 %)		 792,951
(4.56 %)		 101,153
(3.51 %)		 19,899
(0.74 %)
170 lizards T.scincoides (rTilSci1hap2 2024)
GCF_035046505.1		 33,280
(3.42 %)		 n/a 13,266
(1.21 %)		 16,752
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 0
(0 %)		 506,831
(2.74 %)		 28,089
(0.98 %)		 14,987
(0.51 %)
171 loggerhead turtle (SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.1		 61,631
(3.99 %)		 n/a 14,678
(1.05 %)		 17,405
(1.52 %)		 42,180
(2.89 %)		 44.04
(99.90 %)		 0
(0 %)		 745
(0.10 %)		 2,008
(100.00 %)		 1,279,721
(12.58 %)		 319,729
(1.29 %)		 10,705,612
(33.91 %)		 4
(0.00 %)		 545,387
(2.26 %)		 49,015
(1.39 %)		 25,064
(0.63 %)
172 loggerhead turtle (hap1 2025)
GCA_965140235.1		 n/a 24,360
(1.83 %)		 14,764
(1.02 %)		 17,699
(1.53 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 1
(0.00 %)		 593,928
(2.38 %)		 54,290
(1.49 %)		 25,037
(0.61 %)
173 loggerhead turtle (hap2 2025)
GCA_965140275.1		 n/a 26,024
(1.93 %)		 14,889
(1.04 %)		 17,867
(1.54 %)		 n/a 44.11
(99.97 %)		 52
(0.03 %)		 52
(0.03 %)		 85
(99.97 %)		 1,300,553
(12.44 %)		 332,623
(1.45 %)		 10,721,628
(34.40 %)		 1
(0.00 %)		 604,146
(2.41 %)		 53,746
(1.50 %)		 25,360
(0.62 %)
174 mainland tiger snake
GCF_900518725.1		 34,251
(3.18 %)		 n/a 13,445
(1.15 %)		 23,410
(1.90 %)		 n/a 39.72
(95.17 %)		 0
(0 %)		 79,478
(4.84 %)		 52,414
(100.00 %)		 1,081,503
(6.00 %)		 711,408
(2.47 %)		 8,047,065
(40.24 %)		 3,772
(0.08 %)		 265,750
(1.48 %)		 61,669
(2.47 %)		 18,916
(0.65 %)
175 many-banded krait (BM01 2022)
GCA_023653725.1		 n/a n/a 13,269
(1.19 %)		 18,533
(1.94 %)		 n/a 39.87
(99.25 %)		 0
(0 %)		 1,631
(0.75 %)		 448
(100.00 %)		 1,104,569
(6.42 %)		 703,174
(3.07 %)		 8,451,422
(40.97 %)		 0
(0 %)		 395,083
(2.25 %)		 65,260
(2.74 %)		 19,850
(0.80 %)
176 marbled whiptail (SIMRID8450 2020)
GCA_014337955.1		 n/a n/a 13,646
(1.27 %)		 18,378
(2.09 %)		 n/a 42.67
(94.37 %)		 0
(0 %)		 166,840
(5.67 %)		 3,826
(100.00 %)		 809,278
(4.31 %)		 439,020
(1.66 %)		 8,665,254
(33.02 %)		 23,254
(0.24 %)		 223,741
(0.91 %)		 41,638
(1.70 %)		 20,448
(0.83 %)
177 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1		 n/a n/a 10,549
(1.13 %)		 20,171
(2.08 %)		 n/a 41.02
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 12
(0.00 %)		 9,587
(100.00 %)		 889,533
(7.84 %)		 565,831
(6.37 %)		 5,968,624
(41.74 %)		 0
(0 %)		 615,578
(4.07 %)		 73,632
(3.80 %)		 21,339
(1.17 %)
178 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1		 n/a n/a 13,282
(1.16 %)		 18,653
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 1,187,501
(7.72 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,428,147
(45.35 %)		 13
(0.00 %)		 770,603
(3.87 %)		 101,007
(3.95 %)		 24,179
(0.84 %)
179 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1		 n/a n/a 14,442
(0.44 %)		 24,630
(1.28 %)		 n/a 41.94
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,032
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 1,928,361
(2.22 %)		 2,955,095
(11.97 %)		 25,178,773
(53.55 %)		 7
(0.00 %)		 5,022,575
(7.68 %)		 165,699
(1.23 %)		 16,842
(0.16 %)
180 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1		 n/a n/a 13,824
(0.44 %)		 23,296
(1.27 %)		 n/a 41.86
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,009
(0.01 %)		 656
(100.00 %)		 1,860,053
(2.17 %)		 2,751,941
(10.76 %)		 24,252,866
(53.00 %)		 11
(0.00 %)		 4,329,852
(7.13 %)		 157,012
(1.21 %)		 15,742
(0.15 %)
181 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1		 62,007
(3.15 %)		 n/a 14,883
(0.96 %)		 18,524
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 0
(0 %)		 1,866
(3.64 %)		 621
(100.00 %)		 1,372,189
(11.32 %)		 472,501
(3.42 %)		 11,362,604
(34.69 %)		 1
(0.00 %)		 910,675
(2.73 %)		 73,700
(2.04 %)		 22,443
(0.52 %)
182 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1		 n/a n/a 15,425
(0.94 %)		 20,005
(1.48 %)		 n/a 44.46
(95.51 %)		 1,790
(4.49 %)		 1,790
(4.49 %)		 4,782
(95.51 %)		 1,404,726
(11.28 %)		 453,302
(2.47 %)		 11,996,092
(34.08 %)		 3
(0.00 %)		 712,154
(2.19 %)		 77,167
(2.14 %)		 23,282
(0.51 %)
183 mimic poison frog (primary hap 2023 genbank)
GCA_032444005.1		 n/a n/a 14,957
(0.34 %)		 n/a n/a 44.95
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,686
(100.00 %)		 1,716,760
(1.89 %)		 4,088,695
(23.45 %)		 2,437
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 10,590,500
(14.66 %)		 n/a n/a
184 mimic poison frog (primary hap 2023 refseq)
GCF_032444005.1		 53,268
(1.27 %)		 n/a 14,955
(0.34 %)		 42,108
(1.16 %)		 n/a 44.95
(100.00 %)		 0
(0 %)		 765
(0.00 %)		 1,672
(100.00 %)		 1,716,755
(1.89 %)		 4,088,682
(23.45 %)		 2,436
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 4,114,618
(5.60 %)		 694,865
(6.34 %)		 674,154
(5.93 %)
185 Mississippi paddlefish
GCF_017654505.1		 66,226
(6.17 %)		 n/a 21,806
(1.85 %)		 31,525
(3.80 %)		 n/a 39.02
(99.89 %)		 2,957
(0.11 %)		 2,963
(0.11 %)		 7,192
(99.89 %)		 1,126,936
(3.66 %)		 877,525
(6.33 %)		 9,039,918
(36.85 %)		 1
(0.00 %)		 775,360
(3.40 %)		 29,954
(1.06 %)		 14,005
(0.40 %)
186 Murray river turtle (Brisbane River MOO-44397 2024)
GCF_026122565.2		 48,414
(3.72 %)		 n/a 14,988
(1.18 %)		 20,316
(1.85 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,735
(100.00 %)		 1,108,636
(10.97 %)		 229,329
(1.01 %)		 11,088,528
(25.43 %)		 0
(0 %)		 192,826
(0.74 %)		 49,188
(1.67 %)		 36,282
(1.24 %)
187 Northern rubber boa (HBS 135849 alternate hap 2022)
GCA_023362785.1		 n/a n/a 12,816
(1.09 %)		 18,099
(1.83 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 0
(0 %)		 84
(0.00 %)		 224
(100.00 %)		 1,081,107
(4.01 %)		 728,703
(4.64 %)		 6,961,724
(42.46 %)		 1
(0.00 %)		 702,049
(3.73 %)		 128,617
(3.90 %)		 25,981
(1.05 %)
188 Northern rubber boa (HBS 135849 primary hap 2022)
GCA_023362775.1		 n/a n/a 13,531
(1.08 %)		 18,971
(1.81 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 0
(0 %)		 85
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 1,138,891
(3.99 %)		 798,941
(5.00 %)		 7,476,142
(42.85 %)		 1
(0.00 %)		 757,393
(3.80 %)		 135,874
(3.88 %)		 27,035
(1.02 %)
189 Northwestern pond turtle (WTP2003 alternate hap 2022)
GCA_022086895.1		 n/a n/a 14,212
(1.00 %)		 20,203
(1.65 %)		 n/a 44.72
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,800
(0.01 %)		 2,508
(100.00 %)		 4,246,095
(48.91 %)		 442,393
(1.88 %)		 10,453,096
(35.71 %)		 43
(0.00 %)		 450,873
(2.62 %)		 134,572
(3.12 %)		 28,350
(0.78 %)
190 Northwestern pond turtle (WTP2003 primary hap 2022)
GCA_022086475.1		 n/a n/a 14,862
(1.02 %)		 19,830
(1.62 %)		 n/a 44.76
(100.00 %)		 0
(0 %)		 148
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 4,413,681
(48.88 %)		 459,701
(1.92 %)		 11,014,102
(35.89 %)		 1
(0.00 %)		 468,618
(2.09 %)		 141,800
(3.08 %)		 30,071
(0.78 %)
191 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1		 n/a n/a 13,448
(1.31 %)		 17,745
(2.07 %)		 n/a 40.20
(99.98 %)		 73
(0.02 %)		 73
(0.02 %)		 116
(99.98 %)		 741,052
(2.98 %)		 411,477
(3.31 %)		 7,668,994
(30.14 %)		 0
(0 %)		 318,343
(2.06 %)		 34,560
(2.18 %)		 21,974
(1.10 %)
192 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1		 n/a n/a 13,421
(1.31 %)		 17,659
(2.08 %)		 n/a 40.15
(99.66 %)		 93
(0.34 %)		 93
(0.34 %)		 158
(99.66 %)		 733,358
(2.95 %)		 403,552
(3.04 %)		 7,746,871
(29.97 %)		 0
(0 %)		 294,855
(1.92 %)		 34,363
(2.08 %)		 21,752
(1.10 %)
193 one-colored caecilian (2021)
GCA_901765095.2		 n/a n/a 14,569
(0.43 %)		 30,498
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 0
(0 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,894,383
(1.68 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,143
(52.43 %)		 5
(0.00 %)		 1,718,803
(3.44 %)		 414,828
(3.91 %)		 47,796
(0.38 %)
194 Pacific lamprey (Columbia River large-bodied, stream-maturing ecotype CRITFC18_GStd-0006 2020)
GCA_014621495.2		 n/a n/a 6,827
(0.82 %)		 38,010
(4.29 %)		 n/a 48.07
(86.05 %)		 0
(0 %)		 63,604
(13.95 %)		 141,124
(100.00 %)		 2,948,140
(52.71 %)		 971,264
(7.81 %)		 4,836,103
(36.27 %)		 7,699
(0.31 %)		 n/a 186,153
(29.43 %)		 141,969
(7.00 %)
195 Pacific ridley (hap1 2025)
GCA_965140295.1		 n/a 21,497
(1.67 %)		 14,698
(1.03 %)		 17,429
(1.50 %)		 n/a 44.13
(99.98 %)		 0
(0 %)		 69
(0.02 %)		 44
(100.00 %)		 1,340,389
(12.41 %)		 313,433
(2.43 %)		 10,832,333
(34.73 %)		 1
(0.00 %)		 642,980
(2.58 %)		 47,256
(1.42 %)		 24,677
(0.61 %)
196 Pacific ridley (hap2 2025)
GCA_965140255.1		 n/a 24,067
(1.82 %)		 14,883
(1.03 %)		 17,736
(1.52 %)		 n/a 44.14
(99.96 %)		 76
(0.04 %)		 76
(0.04 %)		 115
(99.96 %)		 1,337,786
(12.39 %)		 317,205
(2.38 %)		 10,851,496
(34.73 %)		 1
(0.00 %)		 652,074
(2.60 %)		 47,955
(1.47 %)		 25,100
(0.62 %)
197 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1		 n/a n/a 7,223
(0.52 %)		 11,927
(1.11 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 76
(0.00 %)		 4,081
(100.00 %)		 988,792
(3.99 %)		 1,766,202
(10.24 %)		 9,974,001
(52.99 %)		 0
(0 %)		 1,733,898
(6.80 %)		 64,462
(1.33 %)		 4,213
(0.08 %)
198 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1		 n/a n/a 14,522
(0.54 %)		 21,861
(1.14 %)		 n/a 39.52
(98.39 %)		 0
(0 %)		 3,681
(1.61 %)		 1,318
(100.00 %)		 1,928,844
(4.34 %)		 3,684,477
(13.44 %)		 19,091,818
(55.21 %)		 1
(0.00 %)		 4,715,600
(8.73 %)		 127,760
(1.34 %)		 9,458
(0.10 %)
199 palmate newt (primary hap 2024)
GCA_964261635.1		 n/a n/a 17,611
(0.09 %)		 227,382
(1.73 %)		 n/a 45.09
(100.00 %)		 0
(0 %)		 5,245
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,668,195
(1.49 %)		 9,253,372
(10.94 %)		 5,693
(100.00 %)		 48
(0.00 %)		 1,460,718
(0.63 %)		 2,493,727
(7.98 %)		 2,437,739
(7.71 %)
200 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1		 n/a n/a 13,365
(1.26 %)		 17,388
(1.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 99
(0.00 %)		 279
(100.00 %)		 726,428
(2.81 %)		 331,756
(2.05 %)		 7,184,711
(33.57 %)		 2
(0.00 %)		 316,815
(2.51 %)		 51,973
(2.70 %)		 19,565
(0.92 %)
201 Papuan ground boa (hap2 2024 genbank)
GCA_035149785.1		 n/a n/a 13,390
(1.26 %)		 17,496
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 101
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 728,574
(2.82 %)		 348,605
(2.13 %)		 7,199,124
(33.55 %)		 1
(0.00 %)		 318,788
(2.43 %)		 51,807
(2.69 %)		 19,758
(0.92 %)
202 Papuan ground boa (hap2 2024 refseq)
GCF_035149785.1		 31,826
(3.55 %)		 n/a 13,389
(1.26 %)		 17,495
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 101
(0.00 %)		 149
(100.00 %)		 728,567
(2.82 %)		 348,603
(2.13 %)		 7,199,026
(33.55 %)		 1
(0.00 %)		 318,786
(2.43 %)		 51,807
(2.69 %)		 19,758
(0.92 %)
203 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501915.1		 n/a n/a 21,977
(1.55 %)		 31,925
(2.52 %)		 n/a 39.40
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,072
(0.01 %)		 1,183
(100.00 %)		 825,817
(1.86 %)		 1,047,172
(7.89 %)		 12,996,911
(44.48 %)		 3
(0.00 %)		 1,701,385
(5.28 %)		 99,118
(1.26 %)		 15,547
(0.21 %)
204 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501925.1		 n/a n/a 23,766
(1.52 %)		 34,093
(2.42 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 500
(0.00 %)		 897
(100.00 %)		 919,152
(1.89 %)		 1,157,711
(8.01 %)		 14,217,996
(45.44 %)		 0
(0 %)		 1,995,399
(5.51 %)		 108,139
(1.26 %)		 16,761
(0.21 %)
205 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023)
GCA_033958435.1		 n/a n/a 14,675
(1.05 %)		 16,697
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 0
(0 %)		 12
(0.00 %)		 134
(100.00 %)		 3,772,260
(47.94 %)		 322,081
(1.52 %)		 11,123,166
(34.14 %)		 0
(0 %)		 448,027
(1.56 %)		 129,645
(3.29 %)		 28,529
(1.18 %)
206 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2		 n/a n/a 10,906
(1.98 %)		 19,820
(4.33 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,516
(100.00 %)		 390,896
(3.25 %)		 482,493
(7.83 %)		 4,361,670
(34.36 %)		 0
(0 %)		 491,019
(5.12 %)		 52,508
(3.70 %)		 21,519
(1.51 %)
207 plains spadefoot toad (primary hap 2022)
GCF_027358695.1		 41,009
(4.67 %)		 n/a 13,912
(2.00 %)		 25,745
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 0
(0 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 497,976
(3.84 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,342
(36.26 %)		 1
(0.00 %)		 748,493
(5.83 %)		 72,598
(4.35 %)		 32,385
(1.89 %)
208 pool frog (hap1 2025)
GCA_965119305.1		 n/a n/a 14,446
(0.34 %)		 39,585
(1.24 %)		 n/a 43.75
(99.99 %)		 33
(0.00 %)		 3,044
(0.01 %)		 1,361
(100.00 %)		 2,734,844
(2.59 %)		 3,759,979
(13.10 %)		 24,289,849
(60.22 %)		 22
(0.00 %)		 6,436,651
(8.33 %)		 558,423
(4.11 %)		 48,365
(0.35 %)
209 pool frog (hap2 2025)
GCA_965119315.1		 n/a n/a 14,335
(0.34 %)		 39,545
(1.24 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 2,703
(0.01 %)		 2,703
(0.01 %)		 3,680
(99.99 %)		 2,706,037
(2.56 %)		 3,712,706
(12.97 %)		 23,911,913
(60.10 %)		 18
(0.00 %)		 6,326,504
(8.24 %)		 553,381
(4.05 %)		 47,813
(0.35 %)
210 prickly gecko (False Entrance Well CCM8104 2023)
GCF_032191835.1		 35,366
(2.07 %)		 n/a 14,394
(0.79 %)		 23,371
(1.60 %)		 n/a 44.78
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,608
(0.01 %)		 661
(100.00 %)		 1,995,033
(8.75 %)		 823,022
(6.51 %)		 12,116,860
(46.84 %)		 9
(0.00 %)		 1,818,752
(4.81 %)		 117,191
(3.14 %)		 39,240
(0.76 %)
211 Puerto Rican coqui (aEleCoq1hap1 2024)
GCF_035609145.1		 44,598
(2.13 %)		 n/a 13,879
(0.57 %)		 31,890
(1.61 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 0
(0 %)		 659
(0.00 %)		 956
(100.00 %)		 1,044,176
(1.98 %)		 1,442,184
(16.51 %)		 14,710,122
(54.00 %)		 6
(0.00 %)		 4,070,191
(8.73 %)		 501,931
(8.81 %)		 49,483
(0.82 %)
212 Puerto Rican coqui (hap1 2024)
GCA_035609145.1		 n/a n/a 13,881
(0.57 %)		 32,313
(1.67 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 659
(0.00 %)		 963
(100.00 %)		 1,044,181
(1.98 %)		 1,442,189
(16.51 %)		 14,710,175
(54.00 %)		 6
(0.00 %)		 4,070,195
(8.73 %)		 501,931
(8.81 %)		 49,483
(0.82 %)
213 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1		 n/a n/a 13,892
(0.57 %)		 32,011
(1.64 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 16
(0.00 %)		 685
(0.00 %)		 843
(100.00 %)		 1,042,636
(2.00 %)		 1,430,690
(16.22 %)		 14,621,029
(53.91 %)		 19
(0.00 %)		 4,063,379
(8.75 %)		 503,166
(8.84 %)		 49,100
(0.82 %)
214 red-eared slider turtle
GCF_013100865.1		 47,272
(3.27 %)		 n/a 13,909
(1.05 %)		 16,674
(1.54 %)		 n/a 43.81
(96.14 %)		 0
(0 %)		 25,390
(3.86 %)		 138
(100.00 %)		 1,686,633
(15.06 %)		 271,837
(0.81 %)		 10,802,900
(30.74 %)		 1,247
(0.04 %)		 155,059
(0.69 %)		 93,811
(1.90 %)		 24,960
(0.62 %)
215 reedfish (v3 alternate hap 2021)
GCA_900700845.3		 n/a n/a 11,382
(0.41 %)		 28,399
(1.33 %)		 n/a 39.39
(99.99 %)		 17
(0.01 %)		 17
(0.01 %)		 17,099
(99.99 %)		 6,708,926
(37.23 %)		 883,916
(2.81 %)		 16,745,782
(46.94 %)		 0
(0 %)		 963,655
(2.45 %)		 74,951
(1.15 %)		 20,227
(0.32 %)
216 Reeves's turtle
GCF_016161935.1		 86,238
(3.40 %)		 n/a 15,165
(0.98 %)		 21,405
(1.66 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 0
(0 %)		 398
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,854,279
(14.68 %)		 448,403
(2.11 %)		 11,329,581
(34.64 %)		 0
(0 %)		 644,654
(2.20 %)		 119,002
(2.82 %)		 35,167
(0.87 %)
217 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 alternate hap 2024)
GCA_040937895.1		 n/a n/a 26,401
(0.36 %)		 90,909
(1.63 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 19
(0.00 %)		 14,096
(100.00 %)		 4,036,529
(2.70 %)		 6,299,339
(18.78 %)		 14,096
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 13,301,439
(10.32 %)		 1,426,030
(6.65 %)		 1,371,517
(5.63 %)
218 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 primary hap 2024)
GCF_040937935.1		 62,635
(1.63 %)		 n/a 14,072
(0.39 %)		 44,953
(1.74 %)		 n/a 44.98
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3,039
(0.01 %)		 477
(100.00 %)		 2,058,700
(2.53 %)		 3,206,511
(15.84 %)		 20,407,989
(60.26 %)		 40
(0.00 %)		 n/a 741,520
(6.10 %)		 65,051
(0.49 %)
219 Ringneck snake (HBS135679 primary hap 2022)
GCA_023053685.1		 n/a n/a 13,357
(1.06 %)		 20,426
(1.94 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 0
(0 %)		 723
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 1,451,537
(9.36 %)		 1,095,484
(10.35 %)		 7,870,309
(48.66 %)		 4
(0.00 %)		 1,107,317
(4.55 %)		 142,495
(4.04 %)		 27,514
(0.84 %)
220 royal ground snake (hap1 2023 refseq)
GCF_031021105.1		 45,143
(3.26 %)		 n/a 13,488
(0.98 %)		 20,353
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 6,118,914
(59.42 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,283
(53.44 %)		 11
(0.00 %)		 1,523,662
(5.77 %)		 130,852
(4.47 %)		 24,852
(0.74 %)
221 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1		 n/a n/a 13,845
(0.96 %)		 23,108
(1.86 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,128
(100.00 %)		 2,008,682
(10.16 %)		 1,718,408
(7.36 %)		 9,467,451
(52.99 %)		 0
(0 %)		 1,513,596
(5.45 %)		 140,557
(4.65 %)		 29,439
(0.71 %)
222 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1		 n/a n/a 12,606
(0.83 %)		 22,421
(1.62 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,543
(100.00 %)		 2,080,172
(11.19 %)		 1,814,619
(9.22 %)		 8,889,119
(57.36 %)		 0
(0 %)		 1,825,733
(6.19 %)		 145,328
(4.63 %)		 28,523
(0.67 %)
223 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1		 n/a n/a 13,727
(0.84 %)		 24,896
(2.06 %)		 n/a 42.95
(99.51 %)		 0
(0 %)		 973
(0.49 %)		 2,266
(100.00 %)		 729,332
(2.15 %)		 1,402,564
(24.45 %)		 8,156,596
(55.96 %)		 4
(0.00 %)		 3,523,739
(10.10 %)		 175,180
(3.64 %)		 18,584
(0.40 %)
224 rufous frog (hap2 2023)
GCA_031893055.1		 n/a n/a 13,538
(0.88 %)		 24,311
(2.15 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 0
(0 %)		 976
(0.93 %)		 1,266
(100.00 %)		 711,895
(2.18 %)		 1,219,160
(21.56 %)		 7,988,458
(54.14 %)		 3
(0.00 %)		 3,097,457
(9.48 %)		 170,920
(3.48 %)		 17,791
(0.40 %)
225 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1		 n/a n/a 14,039
(1.09 %)		 19,528
(1.85 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 31
(0.00 %)		 122
(100.00 %)		 1,307,065
(5.31 %)		 672,219
(3.50 %)		 9,949,858
(39.30 %)		 0
(0 %)		 671,520
(3.09 %)		 83,890
(3.97 %)		 26,657
(0.80 %)
226 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1		 n/a n/a 14,065
(1.09 %)		 19,430
(1.84 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 21
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 1,307,771
(5.32 %)		 672,054
(3.42 %)		 9,846,806
(39.03 %)		 0
(0 %)		 665,794
(3.10 %)		 83,805
(3.99 %)		 26,762
(0.80 %)
227 San Diegan tiger whiptail (alternate hap HBS 135688 2022)
GCA_023333555.1		 n/a n/a 13,288
(1.15 %)		 18,137
(1.98 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 0
(0 %)		 44
(0.00 %)		 227
(100.00 %)		 909,096
(6.37 %)		 544,302
(5.70 %)		 8,280,652
(39.20 %)		 3
(0.00 %)		 970,374
(3.95 %)		 51,923
(2.21 %)		 19,861
(0.82 %)
228 San Diegan tiger whiptail (HBS 135688 2022)
GCA_023333525.1		 n/a n/a 10,727
(1.18 %)		 14,669
(1.99 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 39
(0.00 %)		 113
(100.00 %)		 741,937
(6.29 %)		 448,194
(5.60 %)		 7,227,870
(36.97 %)		 0
(0 %)		 769,111
(3.76 %)		 42,621
(2.15 %)		 17,889
(0.90 %)
229 San Diego alligator lizard (HBS135686 alternate hap 2022)
GCA_023053675.1		 n/a n/a 14,107
(1.14 %)		 19,600
(1.95 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 27
(0.00 %)		 627
(100.00 %)		 1,563,836
(7.79 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,810
(40.44 %)		 0
(0 %)		 884,432
(3.64 %)		 81,126
(2.79 %)		 27,960
(0.83 %)
230 San Diego alligator lizard (v1.0 HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1		 n/a n/a 14,075
(1.15 %)		 19,587
(1.99 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 23
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 1,577,744
(7.81 %)		 774,690
(3.78 %)		 9,248,062
(40.42 %)		 0
(0 %)		 832,326
(3.45 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,587
(0.82 %)
231 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 genbank)
GCA_023053635.2		 n/a n/a 14,093
(1.15 %)		 19,338
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 35
(100.00 %)		 1,577,751
(7.81 %)		 774,117
(3.78 %)		 9,248,069
(40.42 %)		 1
(0.00 %)		 823,656
(3.44 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,586
(0.82 %)
232 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 refseq)
GCF_023053635.1		 33,415
(3.07 %)		 n/a 14,091
(1.15 %)		 19,337
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 1,577,747
(7.81 %)		 774,112
(3.78 %)		 9,248,016
(40.42 %)		 1
(0.00 %)		 823,646
(3.44 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,586
(0.82 %)
233 San Diego ringneck snake (HBS135679 alternate hap 2022)
GCA_023053665.1		 n/a n/a 10,911
(1.00 %)		 17,586
(1.79 %)		 n/a 41.17
(100.00 %)		 0
(0 %)		 572
(0.00 %)		 2,064
(100.00 %)		 1,265,045
(10.30 %)		 989,149
(13.38 %)		 6,503,035
(50.62 %)		 0
(0 %)		 1,261,338
(5.60 %)		 123,274
(4.17 %)		 23,159
(0.83 %)
234 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1		 n/a n/a 14,226
(1.28 %)		 25,396
(2.33 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 12,662
(100.00 %)		 1,001,433
(5.27 %)		 445,157
(1.79 %)		 7,227,826
(34.26 %)		 0
(0 %)		 365,558
(2.38 %)		 80,300
(2.76 %)		 22,848
(0.87 %)
235 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1		 41,701
(3.64 %)		 n/a 14,350
(1.48 %)		 19,231
(2.45 %)		 32,804
(4.14 %)		 43.75
(99.75 %)		 0
(0 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,414
(1.76 %)		 7,135,165
(34.49 %)		 0
(0 %)		 365,268
(2.50 %)		 76,053
(2.68 %)		 21,615
(0.85 %)
236 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1		 108,406
(1.98 %)		 n/a 13,959
(0.46 %)		 n/a n/a 43.90
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,474
(100.00 %)		 1,903,654
(2.85 %)		 2,970,691
(16.56 %)		 15,354,577
(64.31 %)		 20
(0.00 %)		 n/a 652,708
(8.36 %)		 43,665
(0.45 %)
237 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1		 n/a n/a 14,077
(0.47 %)		 36,608
(1.60 %)		 n/a 43.86
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,097
(0.01 %)		 2,802
(100.00 %)		 1,819,971
(2.73 %)		 2,865,173
(16.12 %)		 15,335,602
(63.85 %)		 14
(0.00 %)		 6,125,585
(10.74 %)		 651,438
(8.09 %)		 43,492
(0.45 %)
238 Schlegel's Japanese gecko
GCF_001447785.1		 25,177
(1.78 %)		 n/a 14,549
(0.82 %)		 28,002
(1.69 %)		 n/a 45.48
(96.46 %)		 143,970
(3.54 %)		 143,970
(3.54 %)		 335,470
(96.46 %)		 889,760
(2.21 %)		 666,492
(2.83 %)		 12,865,811
(39.14 %)		 291
(0.01 %)		 n/a 160,022
(2.80 %)		 49,172
(0.87 %)
239 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1		 n/a n/a 6,180
(0.71 %)		 31,191
(4.14 %)		 n/a 48.30
(100.00 %)		 0
(0 %)		 11
(0.00 %)		 4,064
(100.00 %)		 1,494,745
(38.42 %)		 891,392
(20.02 %)		 4,259,383
(49.70 %)		 0
(0 %)		 2,135,388
(12.73 %)		 147,499
(35.87 %)		 97,808
(5.62 %)
240 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1		 41,241
(6.50 %)		 n/a 7,638
(0.70 %)		 36,336
(4.06 %)		 83,714
(10.03 %)		 48.31
(98.62 %)		 0
(0 %)		 930
(1.38 %)		 1,434
(100.00 %)		 1,920,851
(39.36 %)		 1,194,165
(21.47 %)		 5,320,620
(50.50 %)		 4
(0.00 %)		 2,982,736
(13.77 %)		 178,590
(35.88 %)		 120,128
(5.32 %)
241 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 genbank)
GCF_035084215.1		 51,418
(2.53 %)		 n/a 12,778
(0.49 %)		 24,541
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,879
(100.00 %)		 597,115
(2.28 %)		 1,112,121
(17.97 %)		 12,108,003
(57.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,823,993
(9.23 %)		 117,585
(3.42 %)		 24,151
(0.35 %)
242 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 refseq)
GCA_035084215.1		 n/a n/a 12,780
(0.49 %)		 24,543
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,880
(100.00 %)		 597,122
(2.28 %)		 1,112,137
(17.97 %)		 12,108,056
(57.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,824,033
(9.23 %)		 117,585
(3.42 %)		 24,151
(0.35 %)
243 sharpnose sevengill shark (hap2 2024)
GCA_035084135.1		 n/a n/a 12,603
(0.52 %)		 23,419
(1.42 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,695
(0.01 %)		 1,695
(0.01 %)		 2,889
(99.99 %)		 559,171
(2.08 %)		 973,228
(15.01 %)		 11,768,442
(55.69 %)		 2
(0.00 %)		 3,991,721
(8.15 %)		 108,468
(3.25 %)		 22,750
(0.36 %)
244 Shaw's sea snake (ss_UAE728 2024)
GCA_037043045.1		 n/a n/a 13,255
(0.98 %)		 17,598
(1.51 %)		 n/a 40.56
(99.93 %)		 641
(0.07 %)		 641
(0.07 %)		 1,450
(99.93 %)		 1,165,384
(5.77 %)		 720,981
(3.46 %)		 8,068,978
(51.52 %)		 30
(0.00 %)		 825,482
(4.02 %)		 120,786
(6.16 %)		 15,953
(0.50 %)
245 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap2.1 2024)
GCA_964106785.1		 n/a n/a 13,756
(1.40 %)		 19,148
(2.33 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 0
(0 %)		 783
(0.01 %)		 127
(100.00 %)		 790,266
(3.86 %)		 448,558
(4.00 %)		 6,780,108
(37.51 %)		 3
(0.00 %)		 534,737
(3.25 %)		 86,165
(2.71 %)		 18,444
(0.74 %)
246 Skyros wall lizard (v1 hap1 2024)
GCA_964106915.1		 n/a n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 0
(0 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 7
(0.00 %)		 598,615
(3.50 %)		 93,005
(2.80 %)		 19,317
(0.73 %)
247 Skyros wall lizard (v2 hap1 2024)
GCA_964106915.2		 n/a n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 0
(0 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 7
(0.00 %)		 598,611
(3.50 %)		 93,005
(2.80 %)		 19,317
(0.73 %)
248 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2		 n/a n/a 11,589
(0.31 %)		 32,603
(1.10 %)		 n/a 47.54
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 6
(0.00 %)		 26,655
(100.00 %)		 1,346,532
(1.83 %)		 1,273,326
(5.35 %)		 19,727,443
(51.55 %)		 0
(0 %)		 2,678,114
(4.31 %)		 427,693
(8.25 %)		 27,178
(0.30 %)
249 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2		 n/a n/a 12,587
(0.36 %)		 23,986
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 0
(0 %)		 7,146
(1.52 %)		 645
(100.00 %)		 1,451,634
(1.94 %)		 1,448,619
(6.25 %)		 20,884,741
(51.41 %)		 10
(0.00 %)		 3,334,909
(4.99 %)		 456,658
(8.18 %)		 31,096
(0.32 %)
250 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1		 n/a n/a 9,086
(0.58 %)		 20,468
(1.57 %)		 n/a 42.65
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 10,892
(100.00 %)		 315,695
(1.23 %)		 320,148
(1.73 %)		 8,305,059
(38.33 %)		 0
(0 %)		 382,745
(1.57 %)		 37,147
(1.43 %)		 15,419
(0.42 %)
251 smalltooth sawfish (v2.1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1		 40,257
(2.94 %)		 n/a 12,157
(0.69 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 0
(0 %)		 698
(0.91 %)		 172
(100.00 %)		 4,824,261
(54.91 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,260
(38.19 %)		 0
(0 %)		 471,344
(1.50 %)		 45,398
(1.34 %)		 18,410
(0.41 %)
252 snake N.helvetica (rNatHel1.hap1.1 2024)
GCA_964273705.1		 n/a n/a 13,534
(1.08 %)		 19,681
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 7
(0.00 %)		 2,010
(0.02 %)		 494
(100.00 %)		 1,264,981
(8.07 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,795
(46.16 %)		 10
(0.00 %)		 746,296
(3.32 %)		 117,174
(4.31 %)		 24,893
(0.73 %)
253 snake N.helvetica (rNatHel1.hap2.1 2024)
GCA_964273795.1		 n/a n/a 11,975
(1.14 %)		 16,941
(1.86 %)		 n/a 41.42
(99.98 %)		 1,674
(0.02 %)		 1,674
(0.02 %)		 2,176
(99.98 %)		 1,088,721
(8.03 %)		 743,110
(5.43 %)		 7,446,281
(43.88 %)		 11
(0.00 %)		 634,247
(3.33 %)		 96,764
(4.19 %)		 20,864
(0.74 %)
254 Southern dwarf chameleon (Gauteng JTBG20232 2024)
GCA_035047345.1		 n/a n/a 13,671
(0.83 %)		 18,931
(1.39 %)		 n/a 44.53
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 22
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 1,004,404
(4.81 %)		 870,596
(5.97 %)		 9,017,362
(54.42 %)		 0
(0 %)		 1,622,797
(5.80 %)		 217,977
(8.25 %)		 19,831
(0.36 %)
255 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 alternate hap 2022)
GCA_024509165.1		 n/a n/a 13,381
(1.17 %)		 19,541
(1.96 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 0
(0 %)		 34
(0.00 %)		 340
(100.00 %)		 1,137,408
(8.97 %)		 740,163
(7.59 %)		 7,520,676
(44.43 %)		 0
(0 %)		 1,047,648
(4.87 %)		 47,268
(1.61 %)		 21,885
(0.78 %)
256 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 primary hap 2022)
GCA_024509115.1		 n/a n/a 12,626
(1.16 %)		 18,965
(1.95 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 443
(0.01 %)		 443
(0.01 %)		 1,139
(99.99 %)		 1,095,605
(9.34 %)		 713,734
(8.45 %)		 6,942,208
(44.93 %)		 3
(0.00 %)		 1,092,536
(5.56 %)		 46,378
(2.04 %)		 21,510
(0.80 %)
257 Southwestern pond turtle (HBS135687 alternate hap 2022)
GCA_023634275.1		 n/a n/a 14,998
(0.98 %)		 20,146
(1.60 %)		 n/a 44.84
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 64
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 1,562,785
(12.68 %)		 484,638
(2.00 %)		 11,089,433
(36.29 %)		 0
(0 %)		 512,269
(2.30 %)		 143,601
(3.21 %)		 30,649
(0.71 %)
258 Southwestern pond turtle (HBS135687 primary hap 2022)
GCA_023634205.1		 n/a n/a 14,971
(0.99 %)		 19,756
(1.60 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 53
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 1,545,155
(12.63 %)		 465,697
(1.95 %)		 11,181,681
(36.13 %)		 0
(0 %)		 476,831
(2.14 %)		 142,383
(3.05 %)		 30,737
(0.72 %)
259 spotted gar
GCF_000242695.1		 45,681
(8.02 %)		 n/a 13,054
(1.95 %)		 46,362
(15.00 %)		 n/a 39.59
(91.93 %)		 43,274
(8.08 %)		 43,276
(8.08 %)		 45,199
(91.92 %)		 203,614
(1.02 %)		 123,247
(0.80 %)		 5,837,321
(22.82 %)		 2,079
(0.10 %)		 77,276
(0.87 %)		 38,507
(2.24 %)		 31,972
(1.68 %)
260 spotted gar (fLepOcu1hap1 2024)
GCA_040954845.1		 n/a n/a 13,777
(1.63 %)		 24,910
(4.29 %)		 n/a 40.54
(100.00 %)		 0
(0 %)		 76
(0.00 %)		 831
(100.00 %)		 1,218,814
(33.09 %)		 230,177
(10.66 %)		 5,685,909
(34.46 %)		 0
(0 %)		 606,189
(4.68 %)		 52,438
(3.69 %)		 36,888
(1.75 %)
261 spotted gar (fLepOcu1hap2 2024)
GCF_040954835.1		 64,638
(7.15 %)		 n/a 13,839
(1.51 %)		 23,965
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 0
(0 %)		 95
(0.00 %)		 816
(100.00 %)		 1,319,033
(34.80 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,919
(38.20 %)		 0
(0 %)		 787,990
(5.83 %)		 57,935
(3.78 %)		 37,077
(1.64 %)
262 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1		 n/a n/a 10,920
(1.26 %)		 14,403
(2.60 %)		 n/a 43.46
(99.96 %)		 0
(0 %)		 2,088
(0.04 %)		 1,042
(100.00 %)		 3,325,883
(44.48 %)		 604,780
(8.87 %)		 5,926,808
(44.92 %)		 2
(0.00 %)		 1,077,982
(5.77 %)		 64,249
(4.00 %)		 11,419
(0.43 %)
263 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1		 n/a n/a 10,694
(1.38 %)		 13,221
(2.62 %)		 n/a 42.85
(99.96 %)		 0
(0 %)		 1,952
(0.04 %)		 532
(100.00 %)		 3,108,151
(44.68 %)		 498,592
(6.00 %)		 5,634,132
(43.16 %)		 4
(0.00 %)		 685,165
(4.19 %)		 50,785
(2.94 %)		 25,542
(1.57 %)
264 starry smooth-hound (sMusAst1.hap1.1 2024)
GCA_964213995.1		 n/a n/a 12,755
(0.42 %)		 23,706
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 0
(0 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,314
(100.00 %)		 1,153,000
(3.16 %)		 1,250,073
(11.36 %)		 14,207,513
(54.93 %)		 42
(0.00 %)		 4,695,339
(7.91 %)		 114,313
(3.65 %)		 15,576
(0.19 %)
265 starry smooth-hound (sMusAst1.hap2.1 2024)
GCA_964214025.1		 n/a n/a 12,414
(0.43 %)		 22,037
(1.15 %)		 n/a 45.49
(99.98 %)		 3,505
(0.02 %)		 3,505
(0.02 %)		 7,908
(99.98 %)		 1,083,980
(2.93 %)		 1,065,586
(9.57 %)		 13,986,241
(53.49 %)		 32
(0.00 %)		 3,881,332
(7.02 %)		 105,379
(3.46 %)		 14,226
(0.18 %)
266 sterlet (v2 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.2		 73,195
(5.77 %)		 n/a 24,716
(1.77 %)		 39,692
(3.97 %)		 n/a 39.75
(99.93 %)		 0
(0 %)		 6,251
(0.07 %)		 3,368
(100.00 %)		 3,869,521
(43.26 %)		 1,093,425
(6.82 %)		 9,976,052
(39.33 %)		 5
(0.00 %)		 1,354,766
(6.14 %)		 60,325
(1.97 %)		 17,242
(0.48 %)
267 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1		 n/a n/a 14,713
(1.06 %)		 18,602
(1.60 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 290
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 1,352,115
(12.17 %)		 388,630
(1.94 %)		 10,550,154
(33.42 %)		 0
(0 %)		 470,790
(2.03 %)		 113,023
(3.09 %)		 33,031
(0.84 %)
268 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1		 n/a n/a 12,226
(1.01 %)		 14,117
(1.42 %)		 n/a 43.77
(100.00 %)		 0
(0 %)		 361
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 1,202,345
(11.93 %)		 304,674
(1.45 %)		 9,752,924
(32.81 %)		 0
(0 %)		 314,037
(1.63 %)		 92,993
(2.75 %)		 20,902
(0.60 %)
269 tailed frog (A.truei hap1 2024)
GCA_040206685.1		 n/a n/a 14,490
(0.54 %)		 41,227
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 0
(0 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,455
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,662,323
(55.70 %)		 33
(0.00 %)		 5,614,148
(11.20 %)		 442,764
(6.61 %)		 73,225
(0.88 %)
270 tailed frog (A.truei hap2 2024)
GCA_040206675.1		 n/a n/a 14,405
(0.55 %)		 41,584
(1.88 %)		 n/a 44.89
(99.97 %)		 0
(0 %)		 6,023
(0.03 %)		 2,779
(100.00 %)		 1,770,524
(4.86 %)		 3,429,564
(18.94 %)		 15,718,939
(55.22 %)		 37
(0.00 %)		 5,484,397
(11.18 %)		 441,543
(6.61 %)		 73,027
(0.90 %)
271 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1		 n/a n/a 5,885
(0.35 %)		 24,457
(1.45 %)		 n/a 44.61
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(0.00 %)		 21,995
(100.00 %)		 553,415
(2.65 %)		 761,469
(4.53 %)		 6,043,769
(57.75 %)		 0
(0 %)		 1,079,506
(5.75 %)		 159,552
(5.54 %)		 20,611
(0.66 %)
272 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020)
GCF_010909765.2		 45,968
(2.40 %)		 n/a 11,437
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 0
(0 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 888,163
(2.58 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 26
(0.00 %)		 1,634,606
(4.98 %)		 242,676
(4.73 %)		 31,030
(0.57 %)
273 three-toed box turtle
GCF_002925995.2		 35,807
(2.28 %)		 n/a 16,429
(1.00 %)		 26,460
(1.60 %)		 33,673
(1.75 %)		 44.26
(94.87 %)		 0
(0 %)		 53,635
(5.13 %)		 48,497
(100.00 %)		 2,007,347
(15.00 %)		 351,871
(0.86 %)		 12,385,245
(31.74 %)		 3,613
(0.05 %)		 161,525
(0.66 %)		 138,405
(2.40 %)		 33,334
(0.68 %)
274 tiger rattlesnake
GCF_016545835.1		 58,085
(4.72 %)		 n/a 13,597
(1.18 %)		 20,553
(2.03 %)		 n/a 39.88
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 4,228
(100.00 %)		 1,142,521
(7.92 %)		 739,406
(5.17 %)		 7,749,366
(42.91 %)		 0
(0 %)		 1,005,717
(4.66 %)		 45,588
(1.61 %)		 21,457
(0.80 %)
275 tiny Cayenne caecilian
GCF_901765095.1		 41,333
(1.27 %)		 n/a 14,569
(0.43 %)		 30,499
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 0
(0 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,835,191
(1.59 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,145
(52.43 %)		 5
(0.00 %)		 1,513,727
(3.00 %)		 414,828
(3.91 %)		 47,796
(0.38 %)
276 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1		 n/a n/a 12,197
(0.36 %)		 33,747
(1.15 %)		 n/a 43.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 23,871
(100.00 %)		 1,453,442
(1.57 %)		 1,309,062
(3.23 %)		 17,953,416
(52.19 %)		 0
(0 %)		 1,274,743
(3.12 %)		 326,452
(3.86 %)		 38,711
(0.39 %)
277 Townsend's dwarf sphaero (gecko TG3544 2022)
GCF_021028975.2		 41,266
(3.35 %)		 n/a 13,505
(1.05 %)		 19,294
(1.78 %)		 n/a 45.92
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,590
(0.01 %)		 1,742
(100.00 %)		 938,800
(8.81 %)		 627,869
(5.78 %)		 9,306,892
(38.57 %)		 33
(0.00 %)		 185,826
(0.70 %)		 91,919
(2.91 %)		 28,760
(0.80 %)
278 tropical clawed frog
GCF_000004195.4		 50,557
(4.71 %)		 n/a 14,679
(1.97 %)		 20,138
(2.76 %)		 52,028
(5.20 %)		 40.73
(99.80 %)		 0
(0 %)		 684
(0.20 %)		 167
(100.00 %)		 2,289,618
(34.82 %)		 708,472
(13.14 %)		 6,816,377
(41.73 %)		 4
(0.00 %)		 1,594,381
(7.39 %)		 52,647
(1.35 %)		 10,639
(0.28 %)
279 Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 refseq)
GCF_040894005.1		 55,552
(3.50 %)		 n/a 13,678
(0.88 %)		 29,722
(2.41 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 0
(0 %)		 436
(0.00 %)		 936
(100.00 %)		 734,279
(2.54 %)		 1,217,326
(21.42 %)		 8,925,807
(52.53 %)		 6
(0.00 %)		 3,231,587
(10.49 %)		 211,590
(5.08 %)		 23,983
(0.47 %)
280 Tungara frog (aEngPut4 paternal hap 2024)
GCA_040894015.1		 n/a n/a 13,192
(0.88 %)		 29,242
(2.52 %)		 n/a 43.08
(100.00 %)		 0
(0 %)		 507
(0.00 %)		 819
(100.00 %)		 736,700
(2.60 %)		 1,165,044
(20.79 %)		 8,671,642
(52.60 %)		 3
(0.00 %)		 1,462,012
(5.01 %)		 207,553
(4.71 %)		 22,911
(0.46 %)
281 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1		 n/a n/a 13,456
(0.33 %)		 47,486
(1.34 %)		 n/a 44.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 27,233
(100.00 %)		 1,968,437
(1.91 %)		 1,716,136
(3.97 %)		 25,847,315
(43.76 %)		 0
(0 %)		 1,707,112
(2.84 %)		 523,234
(6.59 %)		 83,004
(0.82 %)
282 two-lined caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_901001135.2		 n/a n/a 14,449
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 0
(0 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,274,606
(1.91 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,400,957
(44.09 %)		 9
(0.01 %)		 2,193,249
(3.24 %)		 602,911
(6.66 %)		 94,934
(0.82 %)
283 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025)
GCA_965153285.1		 n/a n/a 14,267
(1.41 %)		 20,319
(2.40 %)		 n/a 44.04
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,024
(0.01 %)		 258
(100.00 %)		 833,273
(4.46 %)		 456,881
(4.04 %)		 6,995,048
(37.06 %)		 8
(0.00 %)		 625,845
(3.64 %)		 97,620
(3.04 %)		 19,840
(0.78 %)
284 Tyrrhenian wall lizard (hap2 2025)
GCA_965153305.1		 n/a n/a 13,496
(1.42 %)		 18,862
(2.37 %)		 n/a 43.96
(99.99 %)		 0
(0 %)		 983
(0.01 %)		 306
(100.00 %)		 780,565
(4.36 %)		 422,625
(4.27 %)		 6,551,041
(36.66 %)		 9
(0.00 %)		 570,142
(3.57 %)		 89,693
(2.97 %)		 18,244
(0.76 %)
285 valley gartersnake (HBS 135685 alternate hap 2023)
GCA_029207655.1		 n/a n/a 13,267
(1.12 %)		 21,667
(2.38 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 0
(0 %)		 403
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 1,344,601
(8.29 %)		 1,035,785
(7.00 %)		 8,436,473
(45.10 %)		 2
(0.00 %)		 993,545
(4.30 %)		 82,750
(2.69 %)		 24,526
(0.78 %)
286 valley gartersnake (HBS 135685 primary hap 2023)
GCA_029207665.1		 n/a n/a 12,430
(1.10 %)		 20,286
(2.36 %)		 n/a 41.12
(100.00 %)		 0
(0 %)		 446
(0.00 %)		 413
(100.00 %)		 1,299,478
(9.62 %)		 1,018,398
(8.41 %)		 7,790,758
(46.28 %)		 2
(0.00 %)		 1,063,878
(4.69 %)		 81,352
(2.71 %)		 23,653
(0.79 %)
287 viviparous/common lizard
GCF_011800845.1		 47,034
(5.17 %)		 n/a 14,311
(1.43 %)		 20,571
(2.35 %)		 32,442
(3.15 %)		 43.97
(97.04 %)		 0
(0 %)		 51,275
(2.97 %)		 25,252
(100.00 %)		 949,801
(5.41 %)		 498,048
(1.91 %)		 7,668,731
(34.21 %)		 726
(0.06 %)		 389,679
(2.77 %)		 88,947
(2.62 %)		 22,474
(0.81 %)
288 warty newt (primary hap 2024)
GCA_964204655.1		 n/a n/a 16,124
(0.09 %)		 186,006
(1.43 %)		 n/a 45.53
(100.00 %)		 118
(0.00 %)		 4,698
(0.00 %)		 1,422
(100.00 %)		 4,239,451
(1.37 %)		 8,714,648
(13.78 %)		 84,859,372
(50.88 %)		 38
(0.00 %)		 10,611,791
(4.91 %)		 2,159,665
(8.20 %)		 541,086
(1.34 %)
289 West African lungfish (Aquariam Glaser DD20220218a primary hap 2024)
GCA_040939525.1		 n/a n/a 14,330
(0.04 %)		 83,285
(0.50 %)		 n/a 39.97
(99.99 %)		 0
(0 %)		 24,438
(0.01 %)		 7,125
(100.00 %)		 17,253,560
(4.05 %)		 15,370,489
(7.85 %)		 31,563
(99.99 %)		 127
(0.00 %)		 2,868,526
(0.33 %)		 548,408
(0.58 %)		 524,351
(0.55 %)
290 West African lungfish (FY-2018-M 2021)
GCF_019279795.1		 41,847
(0.19 %)		 n/a n/a n/a n/a 40.21
(97.52 %)		 0
(0 %)		 n/a 12,668
(100.00 %)		 16,163,808
(2.67 %)		 13,992,750
(5.30 %)		 n/a 26
(0.00 %)		 183,320
(0.03 %)		 502,751
(0.52 %)		 14,687
(0.01 %)
291 western fence lizard (IW3139 2022)
GCA_023333635.1		 n/a n/a 26,067
(1.12 %)		 46,795
(2.72 %)		 n/a 41.28
(100.00 %)		 0
(0 %)		 51
(0.00 %)		 1,771
(100.00 %)		 2,075,491
(6.60 %)		 1,603,401
(7.34 %)		 15,565,775
(40.61 %)		 0
(0 %)		 1,972,426
(5.50 %)		 184,134
(3.16 %)		 51,018
(0.93 %)
292 western fence lizard (IW3139 primary hap 2022)
GCA_023333645.1		 n/a n/a 24,835
(1.20 %)		 42,146
(2.78 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 51
(0.00 %)		 659
(100.00 %)		 1,842,497
(6.34 %)		 1,335,245
(6.14 %)		 15,103,683
(37.84 %)		 1
(0.00 %)		 1,360,948
(3.93 %)		 158,311
(2.92 %)		 45,330
(0.92 %)
293 western painted turtle (R12L10 2023)
GCF_011386835.1		 101,708
(5.23 %)		 n/a 15,332
(1.01 %)		 21,055
(1.60 %)		 n/a 44.88
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,270
(0.02 %)		 9,850
(100.00 %)		 4,178,966
(47.39 %)		 457,400
(2.29 %)		 11,325,467
(35.43 %)		 3
(0.00 %)		 758,530
(2.85 %)		 127,896
(2.94 %)		 35,401
(0.99 %)
294 western painted turtle (v5 RCT428 2020)
GCF_000241765.5		 64,782
(3.76 %)		 n/a 15,184
(1.08 %)		 21,463
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 184,311
(12.48 %)		 259,085
(87.52 %)		 4,079,404
(44.68 %)		 316,232
(0.93 %)		 11,848,718
(27.60 %)		 6,323
(0.15 %)		 313,464
(1.39 %)		 103,623
(1.74 %)		 31,959
(0.68 %)
295 western red-tailed skink (HBS 135693 alternate hap 2022)
GCA_026170595.1		 n/a n/a 14,019
(1.31 %)		 17,620
(2.13 %)		 n/a 45.76
(100.00 %)		 0
(0 %)		 15
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 862,216
(4.87 %)		 557,627
(3.17 %)		 8,002,559
(36.95 %)		 0
(0 %)		 377,483
(2.25 %)		 183,292
(4.74 %)		 24,223
(0.81 %)
296 western red-tailed skink (HBS 135693 primary hap 2022)
GCA_026170395.1		 n/a n/a 13,064
(1.32 %)		 16,407
(2.16 %)		 n/a 45.81
(100.00 %)		 0
(0 %)		 12
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 794,996
(4.86 %)		 514,021
(3.46 %)		 7,339,914
(37.02 %)		 1
(0.00 %)		 359,036
(2.32 %)		 168,847
(4.76 %)		 22,885
(0.83 %)
297 western spadefoot toad (hap1 HBS 135690 2023)
GCA_029215705.1		 n/a n/a 13,914
(1.72 %)		 27,496
(4.28 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 198
(0.00 %)		 677
(100.00 %)		 600,622
(4.04 %)		 783,931
(10.70 %)		 5,362,245
(41.82 %)		 0
(0 %)		 1,069,443
(8.38 %)		 100,334
(5.41 %)		 37,012
(1.96 %)
298 western spadefoot toad (hap2 HBS 135690 2023)
GCA_029215755.1		 n/a n/a 13,991
(1.72 %)		 27,685
(4.24 %)		 n/a 40.90
(100.00 %)		 190
(0.00 %)		 190
(0.00 %)		 541
(100.00 %)		 620,188
(5.00 %)		 800,411
(11.19 %)		 5,338,766
(42.25 %)		 1
(0.00 %)		 1,135,530
(8.81 %)		 101,603
(5.32 %)		 37,398
(1.95 %)
299 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1		 n/a n/a 13,101
(0.94 %)		 24,980
(1.75 %)		 n/a 41.02
(99.93 %)		 19
(0.07 %)		 19
(0.07 %)		 13,642
(99.93 %)		 1,410,212
(7.70 %)		 1,080,385
(4.56 %)		 9,112,844
(43.96 %)		 0
(0 %)		 886,410
(3.61 %)		 91,606
(2.53 %)		 24,845
(0.74 %)
300 western terrestrial garter snake (primary hap 2019)
GCF_009769535.1		 33,492
(3.42 %)		 n/a 13,074
(1.13 %)		 18,807
(1.93 %)		 31,660
(2.61 %)		 40.95
(97.72 %)		 0
(0 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,271,255
(7.73 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,396,200
(42.63 %)		 0
(0 %)		 801,068
(3.60 %)		 81,829
(2.47 %)		 23,152
(0.75 %)
301 western whiptail (HBS 135688 primary hap 2025)
GCA_023333525.2		 n/a n/a 13,255
(1.15 %)		 17,876
(1.96 %)		 n/a 43.28
(100.00 %)		 0
(0 %)		 110
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 907,854
(6.31 %)		 539,629
(5.57 %)		 8,277,961
(39.11 %)		 3
(0.00 %)		 940,971
(3.87 %)		 51,910
(2.22 %)		 19,860
(0.82 %)
302 whale shark (14 2022 Squalomix)
GCF_021869965.1		 42,052
(2.43 %)		 n/a 12,059
(0.52 %)		 18,460
(1.22 %)		 38,963
(1.77 %)		 41.51
(91.61 %)		 0
(0 %)		 95,208
(8.40 %)		 16,684
(100.00 %)		 402,747
(0.97 %)		 389,119
(1.49 %)		 15,298,245
(34.14 %)		 7,133
(0.13 %)		 472,644
(1.14 %)		 21,050
(0.30 %)		 10,334
(0.16 %)
303 whale shark (Ralph 2017 Emory U)
GCF_001642345.1		 31,857
(1.52 %)		 n/a 11,884
(0.43 %)		 28,482
(1.15 %)		 n/a 41.78
(100.00 %)		 0
(0 %)		 900,650
(0.03 %)		 57,334
(100.00 %)		 413,201
(1.16 %)		 426,542
(2.75 %)		 16,418,143
(38.85 %)		 315
(0.00 %)		 994,713
(2.86 %)		 35,192
(0.95 %)		 11,001
(0.17 %)
304 whitespotted bambooshark
GCF_004010195.1		 54,886
(2.03 %)		 n/a 12,065
(0.44 %)		 19,805
(1.08 %)		 n/a 42.06
(94.27 %)		 0
(0 %)		 156,554
(5.74 %)		 101,977
(100.00 %)		 559,291
(0.96 %)		 641,094
(3.66 %)		 19,566,199
(38.21 %)		 151
(0.01 %)		 1,627,864
(2.86 %)		 28,353
(0.49 %)		 12,756
(0.18 %)
305 yellow-bellied toad (maternal hap 2024)
GCA_964205295.1		 n/a n/a 16,029
(0.23 %)		 46,442
(0.92 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 130
(0.00 %)		 6,671
(0.01 %)		 4,887
(100.00 %)		 4,307,097
(3.52 %)		 7,435,469
(14.36 %)		 11,428
(99.99 %)		 51
(0.00 %)		 2,406,047
(1.89 %)		 423,705
(1.55 %)		 414,271
(1.46 %)
306 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205305.1		 n/a n/a 16,306
(0.23 %)		 45,587
(0.94 %)		 n/a 38.94
(99.99 %)		 6,811
(0.01 %)		 6,811
(0.01 %)		 10,308
(99.99 %)		 4,195,244
(3.50 %)		 7,201,985
(14.20 %)		 10,308
(99.99 %)		 64
(0.00 %)		 2,258,072
(1.80 %)		 412,512
(1.53 %)		 403,504
(1.46 %)
307 yellowpond turtle (Southern MM-2020 2021)
GCF_020497125.1		 65,526
(3.36 %)		 n/a 15,560
(0.99 %)		 21,233
(1.66 %)		 n/a 45.17
(96.24 %)		 0
(0 %)		 1,041
(3.76 %)		 595
(100.00 %)		 1,904,996
(14.25 %)		 468,779
(2.21 %)		 11,403,005
(33.86 %)		 13
(0.00 %)		 681,375
(2.23 %)		 135,646
(3.23 %)		 34,785
(0.79 %)
308 zebra shark (6-17 2022 Squalomix)
GCF_022316705.1		 48,447
(2.64 %)		 n/a 11,974
(0.57 %)		 15,459
(1.26 %)		 n/a 41.78
(93.81 %)		 0
(0 %)		 87,372
(6.20 %)		 1,266
(100.00 %)		 392,676
(0.96 %)		 348,115
(1.22 %)		 15,176,805
(32.93 %)		 151
(0.01 %)		 584,622
(1.29 %)		 20,647
(0.38 %)		 10,977
(0.18 %)
309 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1		 58,105
(2.61 %)		 n/a 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 0
(0 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 4
(0.00 %)		 2,946,119
(5.37 %)		 45,284
(1.67 %)		 14,105
(0.37 %)
310 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1		 n/a n/a 12,516
(0.44 %)		 17,465
(1.05 %)		 n/a 44.66
(99.65 %)		 1,203
(0.35 %)		 1,203
(0.35 %)		 2,136
(99.65 %)		 8,278,458
(59.68 %)		 903,434
(18.42 %)		 14,975,344
(48.25 %)		 2
(0.00 %)		 4,704,292
(7.66 %)		 48,378
(1.60 %)		 15,577
(0.38 %)
TOTALS:total assembly count 310

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Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 223 assemblies assembly stats track stats
Mammals 674 assemblies assembly stats track stats
Birds 428 assemblies assembly stats track stats
Fishes 471 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 310 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1154 assemblies assembly stats track stats
Plants 311 assemblies assembly stats track stats
Fungi 921 assemblies assembly stats track stats
Viruses 291 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 120 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 558 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1186 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 778 assemblies assembly stats track stats