Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of other vertebrates only.

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base AGP
gap		 all
gaps		 assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 gap
Overlap		 tandem
Dups		 cpg
unmasked		 cpg
island
1 Abingdon island giant tortoise
GCF_003597395.1		 50,402
(2.95 %)		 n/a 14,990
(1.01 %)		 19,565
(1.58 %)		 34,846
(1.54 %)		 43.71
(94.31 %)		 0
(0 %)		 63,430
(5.70 %)		 10,618
(100.00 %)		 1,553,204
(12.95 %)		 274,155
(1.11 %)		 12,664,684
(27.42 %)		 1,230
(0.10 %)		 193,101
(0.91 %)		 62,829
(1.59 %)		 28,727
(0.78 %)
2 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1		 n/a n/a 2,101
(1.18 %)		 5,350
(2.76 %)		 n/a 43.70
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3
(0.00 %)		 4,811
(100.00 %)		 103,373
(4.27 %)		 58,480
(3.90 %)		 895,535
(27.44 %)		 0
(0 %)		 59,204
(2.84 %)		 10,399
(2.84 %)		 3,340
(1.02 %)
3 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1		 57,514
(4.49 %)		 n/a 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 0
(0 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 2
(0.00 %)		 631,733
(3.50 %)		 94,745
(2.70 %)		 19,879
(0.76 %)
4 African bullfrog (1538 2019)
GCA_004786255.1		 n/a n/a 13,258
(1.31 %)		 15,309
(2.28 %)		 n/a 38.30
(89.51 %)		 0
(0 %)		 121,461
(10.52 %)		 5,411
(100.00 %)		 491,540
(1.54 %)		 401,074
(2.30 %)		 8,595,741
(27.94 %)		 3,986
(0.11 %)		 262,314
(1.70 %)		 14,854
(0.31 %)		 5,895
(0.13 %)
5 African clawed frog (2021)
GCF_017654675.1		 80,912
(3.89 %)		 n/a 23,666
(1.59 %)		 32,527
(2.45 %)		 112,506
(5.21 %)		 39.34
(99.94 %)		 0
(0 %)		 667
(0.06 %)		 55
(100.00 %)		 4,269,095
(35.49 %)		 1,028,861
(6.46 %)		 14,246,823
(43.67 %)		 2
(0.00 %)		 1,679,057
(4.83 %)		 108,774
(1.25 %)		 16,813
(0.23 %)
6 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1		 60,799
(4.33 %)		 n/a 14,383
(0.98 %)		 18,600
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 0
(0 %)		 161
(0.70 %)		 195
(100.00 %)		 3,322,624
(43.19 %)		 478,208
(1.77 %)		 12,316,424
(32.01 %)		 0
(0 %)		 334,854
(1.31 %)		 49,792
(2.45 %)		 29,504
(1.51 %)
7 American alligator (KSC_2009_1 2016)
GCF_000281125.3		 51,013
(3.53 %)		 n/a 14,424
(1.06 %)		 19,690
(1.51 %)		 n/a 44.30
(97.86 %)		 0
(0 %)		 236,641
(2.19 %)		 7,094
(100.00 %)		 2,842,761
(36.86 %)		 291,584
(0.69 %)		 12,464,318
(27.91 %)		 1,962
(0.01 %)		 63,947
(0.23 %)		 35,531
(1.28 %)		 26,988
(0.99 %)
8 American eel (EN2019 2024)
GCF_018555375.3		 67,474
(10.58 %)		 n/a 17,131
(2.21 %)		 34,322
(5.40 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 0
(0 %)		 985
(0.01 %)		 967
(100.00 %)		 766,696
(5.03 %)		 756,877
(7.81 %)		 5,766,995
(27.42 %)		 2
(0.00 %)		 698,797
(4.41 %)		 133,933
(8.63 %)		 97,367
(4.31 %)
9 Asian vine snake (Xishuangbanna 2023)
GCF_028640845.1		 47,555
(4.15 %)		 n/a 13,005
(1.05 %)		 17,560
(1.65 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 0
(0 %)		 331
(0.00 %)		 748
(100.00 %)		 1,484,082
(7.70 %)		 1,033,385
(5.12 %)		 8,266,544
(48.89 %)		 0
(0 %)		 1,020,982
(6.70 %)		 105,815
(4.08 %)		 21,180
(0.68 %)
10 Asiatic toad (SCDJY-AF-19 2020)
GCF_014858855.1		 42,994
(1.39 %)		 n/a 14,061
(0.43 %)		 43,525
(1.76 %)		 36,577
(1.09 %)		 44.37
(98.21 %)		 0
(0 %)		 3,874
(1.79 %)		 748
(100.00 %)		 1,577,809
(1.79 %)		 2,975,473
(12.67 %)		 18,834,930
(58.75 %)		 12
(0.00 %)		 4,966,158
(8.81 %)		 415,605
(4.12 %)		 69,684
(0.72 %)
11 Atlantic hagfish (MG_SS 2024)
GCF_040869285.1		 46,374
(1.72 %)		 n/a 7,719
(0.19 %)		 59,788
(2.68 %)		 n/a 44.23
(99.94 %)		 0
(0 %)		 4,876
(0.06 %)		 4,270
(100.00 %)		 2,094,143
(3.54 %)		 3,212,025
(29.83 %)		 8,998,320
(75.15 %)		 43
(0.00 %)		 n/a 408,391
(12.65 %)		 60,671
(0.82 %)
12 Atlantic hagfish (primary hap 2024)
GCA_964187855.1		 n/a n/a 6,662
(0.20 %)		 45,484
(2.63 %)		 n/a 44.32
(99.97 %)		 0
(0 %)		 4,412
(0.03 %)		 4,004
(100.00 %)		 1,698,449
(3.61 %)		 2,644,659
(27.70 %)		 7,620,145
(74.29 %)		 43
(0.00 %)		 n/a 331,404
(12.87 %)		 49,019
(0.82 %)
13 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1		 60,922
(2.51 %)		 n/a 12,544
(0.38 %)		 28,250
(1.22 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,989
(100.00 %)		 8,579,099
(49.81 %)		 831,222
(15.75 %)		 21,718,178
(51.79 %)		 9
(0.00 %)		 4,445,369
(7.00 %)		 105,821
(2.42 %)		 35,197
(0.42 %)
14 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1		 n/a n/a 11,960
(0.40 %)		 25,618
(1.25 %)		 n/a 42.94
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,633
(0.01 %)		 1,412
(100.00 %)		 7,453,535
(49.31 %)		 686,063
(13.00 %)		 19,985,605
(50.32 %)		 8
(0.00 %)		 3,309,683
(5.86 %)		 86,138
(2.16 %)		 30,350
(0.41 %)
15 Australian saltwater crocodile
GCF_001723895.1		 34,090
(2.80 %)		 n/a 12,481
(1.05 %)		 13,920
(1.38 %)		 n/a 43.90
(94.72 %)		 0
(0 %)		 97,039
(5.30 %)		 70
(100.00 %)		 2,480,154
(36.88 %)		 215,190
(0.56 %)		 11,196,176
(26.22 %)		 1,753
(0.04 %)		 50,116
(0.79 %)		 26,647
(0.98 %)		 20,860
(0.80 %)
16 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3		 n/a n/a 16,280
(0.07 %)		 186,628
(1.11 %)		 n/a 46.01
(99.99 %)		 0
(0 %)		 184,422
(0.01 %)		 27,157
(100.00 %)		 28,291,633
(68.19 %)		 7,299,053
(4.96 %)		 211,579
(99.99 %)		 189
(0.00 %)		 n/a 2,388,998
(5.24 %)		 429,355
(0.66 %)
17 basking shark (sCetMax3.hap1.1 2024)
GCA_964194155.1		 n/a n/a 13,757
(0.41 %)		 22,690
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,088
(100.00 %)		 6,693,687
(65.70 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,698,294
(51.34 %)		 20
(0.00 %)		 5,335,615
(7.60 %)		 113,759
(1.90 %)		 28,476
(0.65 %)
18 basking shark (sCetMax3.hap2.1 2024)
GCA_964194165.1		 n/a n/a 13,515
(0.42 %)		 21,374
(1.06 %)		 n/a 44.47
(99.99 %)		 2,740
(0.01 %)		 2,740
(0.01 %)		 6,569
(99.99 %)		 6,483,403
(66.87 %)		 1,041,828
(9.99 %)		 21,142,745
(50.24 %)		 31
(0.00 %)		 4,014,149
(6.09 %)		 107,555
(1.88 %)		 26,392
(0.67 %)
19 Bellinger river turtle (BRST_UC0152H_USYD 2024)
GCA_040894355.1		 n/a n/a 14,732
(1.14 %)		 18,988
(1.77 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 0
(0 %)		 57
(0.00 %)		 129
(100.00 %)		 1,130,950
(11.22 %)		 213,212
(1.80 %)		 11,049,280
(26.48 %)		 1
(0.00 %)		 312,478
(1.26 %)		 53,923
(2.09 %)		 34,762
(1.11 %)
20 Blainville's horned lizard (alternate hap 2022)
GCA_026167975.1		 n/a n/a 12,696
(0.93 %)		 14,818
(1.50 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 64
(0.00 %)		 52
(100.00 %)		 1,468,805
(6.73 %)		 739,796
(3.28 %)		 10,900,584
(40.56 %)		 1
(0.00 %)		 625,575
(2.40 %)		 76,786
(1.60 %)		 9,543
(0.21 %)
21 Blainville's horned lizard (primary hap 2022)
GCA_026167985.1		 n/a n/a 13,944
(0.92 %)		 16,009
(1.45 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 78
(100.00 %)		 1,636,825
(6.67 %)		 826,053
(3.24 %)		 12,398,166
(40.90 %)		 0
(0 %)		 690,267
(2.36 %)		 86,825
(1.61 %)		 10,396
(0.20 %)
22 blonde ray (primary hap 2023)
GCA_963514005.1		 n/a n/a 11,900
(0.54 %)		 27,568
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,647
(100.00 %)		 8,972,805
(66.20 %)		 1,061,811
(8.11 %)		 11,599,498
(58.72 %)		 6
(0.00 %)		 2,430,580
(6.13 %)		 278,499
(6.42 %)		 59,922
(2.12 %)
23 bowfin (fAmiCal2hap1 2024)
GCF_036373705.1		 55,474
(7.85 %)		 n/a 13,848
(1.83 %)		 27,055
(4.43 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 0
(0 %)		 97
(0.00 %)		 389
(100.00 %)		 953,492
(13.69 %)		 387,699
(7.91 %)		 4,552,359
(37.72 %)		 4
(0.00 %)		 613,799
(6.38 %)		 46,301
(2.99 %)		 26,437
(1.15 %)
24 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1		 n/a n/a 13,813
(1.89 %)		 27,088
(4.55 %)		 n/a 40.60
(100.00 %)		 0
(0 %)		 80
(0.00 %)		 297
(100.00 %)		 886,999
(13.24 %)		 358,077
(7.37 %)		 4,625,277
(36.22 %)		 0
(0 %)		 529,249
(5.78 %)		 43,764
(2.79 %)		 26,363
(1.18 %)
25 brown anole (Geneva1000 2022 refseq)
GCF_025583915.1		 38,099
(3.25 %)		 n/a 14,028
(1.05 %)		 19,932
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 114,440
(1.64 %)		 118,178
(98.36 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 261
(0.01 %)		 1,132,418
(4.31 %)		 46,291
(1.18 %)		 17,324
(0.40 %)
26 Brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176765.1		 n/a n/a 14,463
(1.05 %)		 20,625
(1.90 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 0
(0 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 0
(0 %)		 1,512,000
(5.23 %)		 44,738
(1.08 %)		 17,370
(0.40 %)
27 Brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1		 n/a n/a 12,479
(1.04 %)		 16,886
(1.81 %)		 n/a 41.00
(100.00 %)		 0
(0 %)		 172
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 1,249,920
(6.94 %)		 941,401
(5.42 %)		 8,402,482
(44.77 %)		 1
(0.00 %)		 1,126,727
(4.44 %)		 37,299
(1.02 %)		 14,196
(0.37 %)
28 Brown anole (rAnoSag1 2024)
GCF_037176765.1		 41,782
(3.73 %)		 n/a 14,463
(1.05 %)		 20,186
(1.84 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 0
(0 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 0
(0 %)		 1,512,000
(5.23 %)		 44,738
(1.08 %)		 17,370
(0.40 %)
29 brown house snake (FMNH 251328 2023)
GCA_027560395.1		 n/a n/a 11,753
(1.00 %)		 29,468
(1.83 %)		 n/a 40.67
(98.13 %)		 169,987
(1.84 %)		 169,987
(1.84 %)		 753,655
(98.16 %)		 1,167,225
(5.67 %)		 768,909
(2.88 %)		 8,825,109
(34.93 %)		 2,464
(0.05 %)		 n/a 53,035
(1.80 %)		 31,929
(1.11 %)
30 brown spotted pit viper
GCF_001527695.2		 24,323
(2.63 %)		 n/a 14,045
(1.20 %)		 27,133
(2.20 %)		 n/a 39.97
(92.15 %)		 115,571
(7.86 %)		 115,571
(7.86 %)		 167,851
(92.14 %)		 1,227,118
(8.97 %)		 819,247
(3.70 %)		 8,328,674
(35.16 %)		 11,808
(0.68 %)		 791,775
(4.53 %)		 68,858
(2.06 %)		 27,809
(0.90 %)
31 Burmese python
GCF_000186305.1		 35,663
(4.16 %)		 n/a 13,718
(1.31 %)		 20,498
(2.06 %)		 n/a 39.61
(96.54 %)		 235,132
(3.52 %)		 235,132
(3.52 %)		 274,244
(96.48 %)		 727,874
(3.19 %)		 409,033
(2.06 %)		 8,318,382
(25.30 %)		 21,222
(0.52 %)		 167,510
(1.87 %)		 29,212
(1.10 %)		 21,586
(0.80 %)
32 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 alternate hap 2022)
GCA_022578425.1		 n/a n/a 13,973
(0.70 %)		 47,231
(2.71 %)		 n/a 41.26
(99.97 %)		 5,955
(0.03 %)		 5,955
(0.03 %)		 60,824
(99.97 %)		 1,793,416
(10.43 %)		 1,374,078
(8.30 %)		 10,043,407
(46.03 %)		 154
(0.01 %)		 1,546,579
(5.96 %)		 89,437
(4.63 %)		 31,854
(0.83 %)
33 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 primary hap 2022)
GCA_022577455.1		 n/a n/a 13,386
(1.04 %)		 21,767
(2.35 %)		 n/a 40.56
(100.00 %)		 0
(0 %)		 256
(0.00 %)		 140
(100.00 %)		 1,354,500
(9.93 %)		 998,712
(8.21 %)		 8,504,468
(46.70 %)		 1
(0.00 %)		 1,050,266
(4.14 %)		 78,768
(3.37 %)		 28,516
(0.88 %)
34 Caribbean electric ray (hap1 2024)
GCA_036971445.1		 n/a n/a 11,967
(0.44 %)		 20,851
(1.23 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,443
(0.01 %)		 596
(100.00 %)		 4,902,656
(34.96 %)		 1,040,893
(17.82 %)		 16,403,253
(54.79 %)		 2
(0.00 %)		 3,888,884
(8.11 %)		 113,936
(1.69 %)		 22,323
(0.31 %)
35 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1		 n/a n/a 11,692
(0.46 %)		 19,961
(1.22 %)		 n/a 42.79
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,507
(0.01 %)		 445
(100.00 %)		 4,781,152
(36.16 %)		 876,063
(14.65 %)		 16,060,040
(52.49 %)		 7
(0.00 %)		 2,994,548
(6.81 %)		 101,598
(1.64 %)		 21,263
(0.33 %)
36 central bearded dragon
GCF_900067755.1		 42,304
(3.53 %)		 n/a 13,856
(1.19 %)		 17,956
(1.96 %)		 n/a 41.81
(96.03 %)		 0
(0 %)		 90,546
(3.99 %)		 13,749
(100.00 %)		 821,868
(3.44 %)		 570,849
(3.46 %)		 9,494,309
(29.78 %)		 161
(0.03 %)		 346,792
(2.81 %)		 48,137
(1.31 %)		 23,199
(0.67 %)
37 Chinese alligator
GCF_000455745.1		 49,884
(3.04 %)		 n/a 14,431
(1.00 %)		 15,854
(1.43 %)		 n/a 44.49
(96.86 %)		 167,965
(3.17 %)		 167,965
(3.17 %)		 177,282
(96.83 %)		 2,919,372
(38.76 %)		 346,310
(1.06 %)		 12,332,417
(29.19 %)		 95
(0.01 %)		 116,160
(0.98 %)		 46,638
(1.19 %)		 26,168
(0.73 %)
38 Chinese soft-shelled turtle
GCF_000230535.1		 45,441
(3.08 %)		 n/a 13,715
(0.96 %)		 16,798
(1.50 %)		 n/a 44.42
(95.68 %)		 185,476
(4.35 %)		 185,476
(4.35 %)		 205,380
(95.65 %)		 1,193,608
(10.92 %)		 455,163
(3.06 %)		 11,234,886
(32.34 %)		 126
(0.01 %)		 282,804
(2.81 %)		 95,997
(2.06 %)		 44,456
(1.00 %)
39 coelacanth
GCF_000225785.1		 40,763
(2.63 %)		 n/a 13,493
(0.78 %)		 17,640
(1.50 %)		 n/a 41.15
(76.37 %)		 269,010
(23.67 %)		 269,010
(23.67 %)		 291,829
(76.33 %)		 2,026,776
(9.13 %)		 571,917
(1.19 %)		 14,630,157
(34.87 %)		 2,038
(0.03 %)		 261,629
(0.61 %)		 42,857
(0.54 %)		 8,573
(0.11 %)
40 coelacanth (fLatCha1 primary hap 2024)
GCF_037176945.1		 40,046
(2.75 %)		 n/a 13,820
(0.63 %)		 17,285
(1.40 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 0
(0 %)		 154
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 2,064,326
(2.75 %)		 1,047,267
(3.01 %)		 15,613,479
(54.45 %)		 1
(0.00 %)		 1,146,128
(3.27 %)		 140,027
(2.34 %)		 11,143
(0.16 %)
41 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1		 n/a n/a 13,999
(1.21 %)		 18,145
(2.02 %)		 n/a 44.85
(100.00 %)		 0
(0 %)		 286
(0.00 %)		 827
(100.00 %)		 844,126
(6.57 %)		 462,086
(2.56 %)		 8,237,807
(37.72 %)		 0
(0 %)		 573,955
(2.91 %)		 30,098
(0.96 %)		 16,208
(0.52 %)
42 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1		 n/a n/a 13,266
(1.21 %)		 16,750
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 0
(0 %)		 506,831
(2.74 %)		 28,089
(0.98 %)		 14,987
(0.51 %)
43 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1		 n/a n/a 13,073
(0.44 %)		 43,036
(1.95 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 14
(0.00 %)		 12,033
(100.00 %)		 1,489,788
(2.18 %)		 2,621,157
(9.04 %)		 17,154,926
(55.44 %)		 0
(0 %)		 3,161,179
(6.09 %)		 581,115
(7.68 %)		 54,845
(0.65 %)
44 common garter snake
GCF_001077635.1		 26,656
(3.83 %)		 n/a 11,623
(1.25 %)		 17,501
(2.23 %)		 n/a 39.92
(78.84 %)		 168,047
(21.21 %)		 246,220
(21.21 %)		 175,977
(78.79 %)		 606,040
(3.22 %)		 543,646
(2.36 %)		 6,946,141
(27.08 %)		 3,234
(0.23 %)		 224,609
(2.22 %)		 36,264
(1.27 %)		 18,972
(0.73 %)
45 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1		 45,869
(6.34 %)		 n/a 14,279
(1.46 %)		 19,710
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 0
(0 %)		 683
(0.01 %)		 48
(100.00 %)		 4,128,183
(45.62 %)		 513,318
(3.73 %)		 7,172,928
(37.61 %)		 7
(0.00 %)		 477,389
(3.08 %)		 92,858
(2.90 %)		 22,863
(0.95 %)
46 common spadefoot toad (aPelFus1 2024)
GCA_036172605.1		 n/a n/a 14,564
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 349
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 1,677,382
(3.51 %)		 3,229,435
(13.31 %)		 15,027,089
(51.43 %)		 12
(0.00 %)		 3,799,247
(9.03 %)		 282,389
(3.86 %)		 79,263
(0.96 %)
47 common spadefoot toad (aPelFus1 2024)
GCF_036172605.1		 42,170
(1.55 %)		 n/a 14,560
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 0
(0 %)		 349
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 1,677,374
(3.51 %)		 3,229,434
(13.31 %)		 15,027,049
(51.43 %)		 12
(0.00 %)		 3,799,232
(9.03 %)		 282,389
(3.86 %)		 79,263
(0.96 %)
48 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1		 n/a n/a 12,074
(0.39 %)		 46,329
(1.82 %)		 n/a 44.48
(99.99 %)		 156
(0.01 %)		 156
(0.01 %)		 24,351
(99.99 %)		 1,186,360
(1.65 %)		 2,279,941
(13.33 %)		 14,665,548
(61.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,594,926
(9.74 %)		 405,097
(4.49 %)		 61,648
(0.70 %)
49 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1		 45,085
(1.10 %)		 n/a 14,240
(0.38 %)		 46,470
(1.68 %)		 37,594
(0.91 %)		 44.49
(99.80 %)		 0
(0 %)		 4,199
(0.20 %)		 1,306
(100.00 %)		 1,658,204
(1.79 %)		 3,099,513
(13.49 %)		 19,236,510
(62.70 %)		 18
(0.00 %)		 6,217,888
(10.17 %)		 539,919
(4.45 %)		 78,985
(0.67 %)
50 common wall lizard (hap1 2024)
GCA_964188315.1		 n/a n/a 14,322
(1.36 %)		 19,700
(2.31 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 0
(0 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 868,785
(4.15 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,097,077
(38.69 %)		 10
(0.00 %)		 713,068
(4.14 %)		 120,725
(3.71 %)		 20,707
(0.76 %)
51 common wall lizard (hap2 2024)
GCA_964188365.1		 n/a n/a 13,838
(1.39 %)		 19,262
(2.35 %)		 n/a 44.17
(99.99 %)		 734
(0.01 %)		 734
(0.01 %)		 825
(99.99 %)		 815,808
(4.07 %)		 494,366
(4.53 %)		 6,739,651
(37.84 %)		 6
(0.00 %)		 648,489
(3.96 %)		 113,458
(3.63 %)		 19,621
(0.77 %)
52 common wall lizard (yellow 2019)
GCF_004329235.1		 56,506
(4.85 %)		 n/a 14,453
(1.36 %)		 20,529
(2.31 %)		 n/a 44.18
(99.81 %)		 0
(0 %)		 4,085
(0.19 %)		 2,161
(100.00 %)		 1,089,164
(8.31 %)		 506,669
(2.12 %)		 7,474,116
(36.15 %)		 2
(0.00 %)		 623,437
(4.37 %)		 122,507
(3.69 %)		 21,388
(0.79 %)
53 corn snake (Columbia U 2023)
GCF_029531705.1		 53,076
(4.72 %)		 n/a 13,697
(1.21 %)		 20,819
(2.22 %)		 n/a 40.33
(96.60 %)		 3,553
(3.40 %)		 3,553
(3.40 %)		 4,019
(96.60 %)		 4,116,616
(49.72 %)		 917,455
(3.96 %)		 8,460,248
(40.76 %)		 143
(0.00 %)		 602,278
(2.72 %)		 64,946
(2.08 %)		 20,725
(0.74 %)
54 corn snake (EG266 2020)
GCF_001185365.1		 48,995
(3.92 %)		 n/a 13,316
(1.14 %)		 23,595
(2.17 %)		 29,466
(2.61 %)		 40.35
(95.32 %)		 0
(0 %)		 84,947
(4.70 %)		 34,268
(100.00 %)		 1,243,828
(6.50 %)		 884,533
(3.25 %)		 8,373,398
(40.31 %)		 4,035
(0.07 %)		 377,287
(1.66 %)		 66,926
(2.14 %)		 25,639
(0.86 %)
55 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1		 n/a n/a 14,955
(0.23 %)		 n/a n/a 45.61
(99.80 %)		 2,431
(0.20 %)		 2,431
(0.20 %)		 5,958
(99.80 %)		 20,007,151
(76.28 %)		 5,951,819
(19.40 %)		 5,958
(99.80 %)		 49
(0.00 %)		 n/a 991,009
(4.86 %)		 91,447
(0.54 %)
56 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1		 140,657
(1.12 %)		 n/a 15,461
(0.24 %)		 54,344
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 0
(0 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 3,521,281
(2.88 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 5,826
(99.76 %)		 23
(0.00 %)		 n/a 990,274
(4.84 %)		 952,582
(4.53 %)
57 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1		 n/a n/a 13,192
(1.36 %)		 19,293
(2.32 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,936
(100.00 %)		 808,341
(4.31 %)		 467,532
(2.91 %)		 6,418,809
(38.02 %)		 0
(0 %)		 518,786
(3.19 %)		 107,080
(3.15 %)		 17,213
(0.72 %)
58 Cretan wall lizard (primary hap 2023)
GCA_951804945.1		 n/a n/a 14,249
(1.37 %)		 19,304
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 47
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 882,564
(4.30 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,363
(38.65 %)		 2
(0.00 %)		 586,225
(3.38 %)		 117,222
(3.18 %)		 18,707
(0.71 %)
59 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1		 50,318
(3.53 %)		 n/a 15,109
(1.08 %)		 19,280
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 0
(0 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 0
(0 %)		 407,696
(1.71 %)		 110,838
(2.71 %)		 30,093
(0.82 %)
60 diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023)
GCA_027887205.1		 n/a n/a 15,081
(1.08 %)		 19,115
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.98 %)		 0
(0 %)		 127
(0.02 %)		 59
(100.00 %)		 4,093,707
(46.36 %)		 404,046
(1.70 %)		 11,113,266
(33.78 %)		 1
(0.01 %)		 405,600
(1.68 %)		 111,129
(2.68 %)		 30,307
(0.82 %)
61 eastern brown snake
GCF_900518735.1		 34,614
(3.30 %)		 n/a 13,625
(1.22 %)		 21,795
(2.00 %)		 n/a 39.84
(97.54 %)		 0
(0 %)		 59,472
(2.47 %)		 28,550
(100.00 %)		 1,020,240
(5.86 %)		 663,810
(2.41 %)		 8,140,554
(39.61 %)		 3,387
(0.06 %)		 230,860
(1.32 %)		 52,895
(2.12 %)		 20,320
(0.72 %)
62 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1		 n/a n/a 13,413
(1.19 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 553
(0.01 %)		 771
(99.99 %)		 1,003,504
(9.02 %)		 621,617
(3.54 %)		 8,327,948
(30.44 %)		 3
(0.00 %)		 583,206
(2.41 %)		 117,734
(4.05 %)		 30,498
(1.01 %)
63 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1		 n/a n/a 13,632
(0.43 %)		 35,630
(1.52 %)		 n/a 46.77
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,773
(0.01 %)		 590
(100.00 %)		 1,759,193
(1.98 %)		 2,013,186
(16.21 %)		 16,138,898
(60.55 %)		 17
(0.00 %)		 5,811,499
(9.67 %)		 614,432
(5.85 %)		 72,993
(0.75 %)
64 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1		 n/a n/a 13,882
(0.43 %)		 35,323
(1.46 %)		 n/a 46.78
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,745
(0.01 %)		 1,002
(100.00 %)		 1,769,293
(1.99 %)		 2,023,109
(16.33 %)		 16,148,710
(60.55 %)		 22
(0.00 %)		 5,852,023
(9.72 %)		 618,204
(5.89 %)		 74,394
(0.76 %)
65 elephant shark (2021)
GCF_018977255.1		 32,553
(4.75 %)		 n/a 11,542
(1.51 %)		 18,900
(3.25 %)		 n/a 42.85
(99.99 %)		 2,060
(0.01 %)		 14,404
(0.01 %)		 3,822
(99.99 %)		 1,971,730
(36.60 %)		 433,955
(3.92 %)		 5,654,656
(37.91 %)		 11
(0.00 %)		 553,756
(3.85 %)		 41,081
(3.43 %)		 17,151
(0.98 %)
66 epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021)
GCA_020745765.1		 n/a n/a 12,650
(0.38 %)		 20,614
(1.06 %)		 n/a 42.75
(97.99 %)		 0
(0 %)		 3,552
(2.01 %)		 4,000
(100.00 %)		 9,489,793
(70.34 %)		 976,827
(6.97 %)		 21,183,330
(44.32 %)		 1
(0.00 %)		 3,092,395
(4.62 %)		 42,917
(1.08 %)		 13,522
(0.16 %)
67 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1		 43,156
(1.65 %)		 n/a 12,749
(0.40 %)		 19,519
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 0
(0 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,962
(100.00 %)		 9,420,365
(63.82 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,566
(43.88 %)		 0
(0 %)		 2,903,280
(4.44 %)		 41,682
(1.08 %)		 16,895
(0.30 %)
68 European common frog (2021)
GCF_905171775.1		 51,633
(1.57 %)		 n/a 13,864
(0.46 %)		 39,978
(1.88 %)		 57,578
(1.85 %)		 44.15
(99.36 %)		 0
(0 %)		 1,860
(0.64 %)		 554
(100.00 %)		 1,804,642
(3.42 %)		 2,925,830
(9.39 %)		 18,921,726
(55.43 %)		 8
(0.00 %)		 3,384,162
(6.05 %)		 641,799
(7.66 %)		 62,649
(0.67 %)
69 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1		 54,631
(7.46 %)		 n/a 17,072
(1.89 %)		 34,801
(5.07 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,009
(0.02 %)		 380
(100.00 %)		 761,522
(5.99 %)		 913,306
(13.25 %)		 5,767,879
(35.48 %)		 3
(0.00 %)		 1,603,437
(8.94 %)		 120,990
(6.12 %)		 81,342
(2.93 %)
70 European eel (alternate hap 2020)
GCA_013347865.1		 n/a n/a 17,177
(2.21 %)		 36,037
(5.58 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 2,338
(100.00 %)		 811,567
(5.37 %)		 759,871
(7.97 %)		 5,672,321
(27.30 %)		 0
(0 %)		 731,152
(4.88 %)		 127,837
(8.05 %)		 92,776
(4.12 %)
71 European eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013347855.1		 64,143
(9.57 %)		 n/a 17,054
(2.22 %)		 34,278
(5.56 %)		 79,684
(7.37 %)		 43.64
(99.61 %)		 0
(0 %)		 640
(0.40 %)		 54
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,521
(8.15 %)		 5,700,890
(27.40 %)		 2
(0.00 %)		 774,914
(5.14 %)		 130,346
(8.19 %)		 94,446
(4.12 %)
72 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1		 24,643
(2.02 %)		 n/a 14,238
(1.16 %)		 21,782
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 0
(0 %)		 153
(0.23 %)		 591
(100.00 %)		 1,174,615
(6.99 %)		 436,937
(2.95 %)		 8,308,817
(39.80 %)		 0
(0 %)		 824,335
(3.45 %)		 83,089
(2.82 %)		 33,674
(0.93 %)
73 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1		 n/a n/a 14,220
(1.16 %)		 21,979
(2.19 %)		 n/a 44.64
(99.68 %)		 0
(0 %)		 177
(0.32 %)		 381
(100.00 %)		 1,169,660
(6.57 %)		 432,998
(2.45 %)		 8,403,791
(39.55 %)		 1
(0.00 %)		 711,098
(3.13 %)		 82,695
(2.80 %)		 33,414
(0.92 %)
74 European pond turtle (hap1 2023 genbank)
GCA_028017835.1		 n/a n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 0
(0 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 5
(0.00 %)		 495,884
(2.08 %)		 136,002
(2.92 %)		 30,671
(0.72 %)
75 European pond turtle (hap1 2023 refseq)
GCF_028017835.1		 27,890
(1.81 %)		 n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 0
(0 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 5
(0.00 %)		 495,938
(2.08 %)		 136,002
(2.92 %)		 30,671
(0.72 %)
76 European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017845.1		 n/a n/a 14,971
(1.00 %)		 20,099
(1.61 %)		 n/a 44.79
(99.77 %)		 0
(0 %)		 130
(0.23 %)		 156
(100.00 %)		 1,536,611
(12.44 %)		 471,903
(2.16 %)		 11,129,943
(35.50 %)		 1
(0.00 %)		 522,759
(2.15 %)		 138,047
(2.94 %)		 31,391
(0.73 %)
77 European river lamprey (primary hap 2024)
GCA_964198595.1		 n/a n/a 7,757
(0.73 %)		 36,797
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 0
(0 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,497
(100.00 %)		 657,405
(7.80 %)		 1,165,422
(20.23 %)		 4,931,883
(50.78 %)		 4
(0.00 %)		 2,442,653
(12.79 %)		 149,123
(44.61 %)		 116,679
(5.22 %)
78 Far Eastern brook lamprey (LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.1		 37,946
(7.32 %)		 n/a 7,797
(0.72 %)		 39,285
(4.37 %)		 n/a 48.80
(98.99 %)		 0
(0 %)		 3,287
(1.01 %)		 1,946
(100.00 %)		 716,804
(6.02 %)		 1,192,268
(15.54 %)		 5,304,945
(47.85 %)		 5
(0.00 %)		 1,949,540
(10.82 %)		 170,623
(43.14 %)		 128,479
(5.62 %)
79 fence lizard
GCF_019175285.1		 48,391
(3.65 %)		 n/a 14,000
(1.07 %)		 17,384
(1.71 %)		 n/a 41.25
(97.53 %)		 0
(0 %)		 48,138
(2.47 %)		 45,012
(100.00 %)		 1,357,856
(6.95 %)		 596,824
(1.92 %)		 11,090,372
(34.38 %)		 926
(0.05 %)		 356,377
(1.59 %)		 67,007
(1.51 %)		 13,181
(0.35 %)
80 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap1.1 2024)
GCA_964270895.1		 n/a n/a 14,292
(1.37 %)		 20,325
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 4
(0.00 %)		 872
(0.01 %)		 353
(100.00 %)		 840,209
(4.04 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,010,158
(37.94 %)		 7
(0.00 %)		 632,285
(3.51 %)		 87,924
(2.61 %)		 19,744
(0.76 %)
81 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap2.1 2024)
GCA_964270875.1		 n/a n/a 13,804
(1.42 %)		 19,450
(2.39 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 795
(0.01 %)		 795
(0.01 %)		 937
(99.99 %)		 782,998
(3.95 %)		 448,089
(3.61 %)		 6,735,032
(36.83 %)		 3
(0.00 %)		 546,833
(3.23 %)		 81,312
(2.54 %)		 18,612
(0.77 %)
82 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1		 n/a n/a 2,936
(0.15 %)		 17,722
(1.38 %)		 n/a 38.51
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 13,751
(100.00 %)		 919,882
(3.50 %)		 1,443,294
(10.50 %)		 7,705,012
(57.28 %)		 0
(0 %)		 2,148,861
(9.45 %)		 74,669
(1.25 %)		 7,295
(0.13 %)
83 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1		 38,238
(0.68 %)		 n/a 15,452
(0.21 %)		 47,500
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 0
(0 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,467
(100.00 %)		 4,258,941
(3.44 %)		 7,150,261
(12.27 %)		 9,476
(98.01 %)		 3
(0.00 %)		 n/a n/a n/a
84 Fleay's barred frog (hap1 2024)
GCA_038048845.1		 n/a n/a 14,321
(0.67 %)		 22,672
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 0
(0 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,578
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,293,397
(46.37 %)		 2
(0.00 %)		 3,318,438
(8.11 %)		 63,677
(0.85 %)		 12,950
(0.19 %)
85 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1		 n/a n/a 14,224
(0.69 %)		 22,406
(1.57 %)		 n/a 40.75
(99.89 %)		 0
(0 %)		 1,383
(0.12 %)		 914
(100.00 %)		 1,300,452
(3.37 %)		 1,495,355
(10.56 %)		 13,385,401
(44.67 %)		 1
(0.00 %)		 2,540,687
(7.06 %)		 64,121
(0.88 %)		 13,021
(0.20 %)
86 Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035715.1		 n/a n/a 14,392
(0.90 %)		 17,909
(1.50 %)		 n/a 42.86
(99.84 %)		 213
(0.16 %)		 213
(0.16 %)		 836
(99.84 %)		 1,440,070
(7.19 %)		 620,131
(2.54 %)		 10,919,950
(45.21 %)		 2
(0.00 %)		 523,070
(2.35 %)		 47,933
(1.03 %)		 18,609
(0.43 %)
87 Florida worm lizard (hap2 2023)
GCF_030035675.1		 65,314
(3.47 %)		 n/a 14,331
(0.90 %)		 17,853
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 0
(0 %)		 242
(0.28 %)		 76
(100.00 %)		 1,426,827
(7.17 %)		 616,687
(2.63 %)		 10,819,019
(45.31 %)		 1
(0.00 %)		 531,660
(2.36 %)		 47,453
(1.03 %)		 18,399
(0.42 %)
88 Florida worm lizard (hap2 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035675.1		 n/a n/a 14,331
(0.90 %)		 17,854
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 1
(0.00 %)		 242
(0.28 %)		 78
(100.00 %)		 1,426,833
(7.17 %)		 616,690
(2.63 %)		 10,819,054
(45.31 %)		 1
(0.00 %)		 531,662
(2.36 %)		 47,454
(1.03 %)		 18,400
(0.42 %)
89 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1		 n/a n/a 12,821
(0.47 %)		 30,612
(1.44 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,651
(100.00 %)		 1,139,595
(1.64 %)		 1,170,215
(3.77 %)		 17,091,511
(52.44 %)		 0
(0 %)		 995,544
(2.57 %)		 235,170
(4.50 %)		 33,394
(0.50 %)
90 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2		 n/a n/a 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 0
(0 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,331,879
(1.68 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,806
(52.85 %)		 3
(0.00 %)		 1,182,995
(2.68 %)		 270,923
(4.52 %)		 38,622
(0.50 %)
91 gharial (Ggan-Ray 2016)
GCF_001723915.1		 32,284
(2.61 %)		 n/a 12,194
(1.03 %)		 12,758
(1.30 %)		 n/a 43.95
(73.60 %)		 0
(0 %)		 248,526
(26.44 %)		 81
(100.00 %)		 2,589,103
(36.89 %)		 243,334
(0.51 %)		 11,279,606
(20.80 %)		 29,443
(5.09 %)		 125,202
(1.53 %)		 26,651
(0.60 %)		 20,614
(0.47 %)
92 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1		 n/a n/a 14,254
(0.94 %)		 23,016
(2.00 %)		 n/a 45.13
(99.95 %)		 0
(0 %)		 61
(0.05 %)		 298
(100.00 %)		 1,230,357
(13.08 %)		 350,230
(2.85 %)		 11,854,314
(33.03 %)		 2
(0.00 %)		 335,615
(1.39 %)		 39,919
(1.95 %)		 26,198
(0.77 %)
93 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1		 n/a n/a 14,151
(0.94 %)		 23,338
(1.95 %)		 n/a 45.15
(99.95 %)		 0
(0 %)		 118
(0.05 %)		 160
(100.00 %)		 1,232,693
(12.81 %)		 332,737
(2.19 %)		 11,907,298
(32.91 %)		 3
(0.00 %)		 284,469
(1.22 %)		 40,660
(1.87 %)		 25,990
(0.77 %)
94 giant manta (hap1 2023)
GCA_030028105.1		 n/a n/a 12,432
(0.38 %)		 24,821
(1.16 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 0
(0 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 7,913,208
(49.68 %)		 969,352
(14.22 %)		 20,235,210
(54.42 %)		 17
(0.00 %)		 4,636,724
(7.12 %)		 110,678
(1.74 %)		 30,504
(0.36 %)
95 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1		 n/a n/a 12,198
(0.42 %)		 23,127
(1.17 %)		 n/a 42.85
(98.49 %)		 0
(0 %)		 1,742
(1.51 %)		 1,558
(100.00 %)		 7,431,472
(52.41 %)		 716,951
(7.28 %)		 19,456,793
(50.99 %)		 9
(0.01 %)		 2,419,836
(4.27 %)		 91,414
(1.45 %)		 65,413
(0.90 %)
96 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2		 57,442
(3.17 %)		 n/a 14,852
(1.00 %)		 18,125
(1.49 %)		 31,841
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 0
(0 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,271
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 0
(0 %)		 474,978
(1.73 %)		 71,687
(2.29 %)		 21,793
(0.54 %)
97 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1		 n/a n/a 13,359
(0.95 %)		 19,347
(1.51 %)		 n/a 44.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 8,736
(100.00 %)		 1,404,513
(13.79 %)		 334,726
(2.35 %)		 9,735,007
(33.33 %)		 0
(0 %)		 468,758
(1.89 %)		 61,680
(2.32 %)		 18,869
(0.54 %)
98 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023)
GCA_029215685.1		 n/a n/a 12,291
(1.06 %)		 19,125
(2.02 %)		 n/a 40.55
(100.00 %)		 584
(0.00 %)		 584
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 1,259,781
(7.92 %)		 925,571
(7.56 %)		 7,739,320
(45.92 %)		 3
(0.00 %)		 840,495
(4.04 %)		 73,681
(2.81 %)		 26,366
(0.92 %)
99 gopher snake (HBS135680 primary hap 2023)
GCA_029215655.1		 n/a n/a 13,289
(1.09 %)		 20,513
(2.09 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 603
(0.00 %)		 603
(0.00 %)		 1,029
(100.00 %)		 1,325,747
(8.26 %)		 973,338
(7.56 %)		 8,352,703
(45.38 %)		 4
(0.00 %)		 888,155
(3.86 %)		 72,941
(2.59 %)		 27,387
(0.91 %)
100 graceful crag lizard (Gifberg primary hap 2022)
GCF_027244095.1		 86,666
(4.30 %)		 n/a 14,269
(0.91 %)		 18,195
(1.57 %)		 n/a 44.82
(100.00 %)		 0
(0 %)		 42
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 1,644,976
(6.04 %)		 823,058
(3.00 %)		 11,991,046
(41.43 %)		 0
(0 %)		 489,782
(1.69 %)		 80,718
(1.90 %)		 27,916
(0.61 %)
101 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1		 n/a n/a 14,094
(1.03 %)		 17,875
(1.65 %)		 n/a 41.62
(99.95 %)		 0
(0 %)		 28
(0.05 %)		 30
(100.00 %)		 1,100,228
(6.21 %)		 423,695
(1.33 %)		 11,521,828
(32.55 %)		 2
(0.00 %)		 258,014
(1.05 %)		 62,978
(2.00 %)		 24,755
(0.81 %)
102 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1		 n/a n/a 13,758
(1.02 %)		 16,909
(1.62 %)		 n/a 41.53
(99.01 %)		 19
(0.99 %)		 19
(0.99 %)		 52
(99.01 %)		 1,069,189
(6.12 %)		 410,262
(1.25 %)		 11,390,195
(32.28 %)		 0
(0 %)		 233,593
(0.96 %)		 60,835
(1.92 %)		 23,191
(0.77 %)
103 gray bichir
GCF_016835505.1		 48,178
(1.88 %)		 n/a 12,963
(0.44 %)		 24,479
(1.21 %)		 n/a 39.32
(99.96 %)		 0
(0 %)		 3,166
(0.04 %)		 9,856
(100.00 %)		 1,765,862
(2.54 %)		 1,017,723
(2.38 %)		 20,924,763
(47.66 %)		 2
(0.00 %)		 997,434
(2.53 %)		 98,862
(1.64 %)		 24,750
(0.32 %)
104 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1		 n/a n/a 20
(0.30 %)		 63
(2.06 %)		 n/a 45.02
(99.98 %)		 0
(0 %)		 28
(0.02 %)		 39
(100.00 %)		 8,165
(60.43 %)		 2,740
(27.09 %)		 15,863
(31.63 %)		 0
(0 %)		 16,359
(15.02 %)		 167
(5.51 %)		 65
(0.61 %)
105 great white shark (primary hap 2021)
GCF_017639515.1		 49,865
(1.46 %)		 n/a 13,010
(0.37 %)		 19,263
(0.92 %)		 46,152
(1.30 %)		 45.21
(99.55 %)		 0
(0 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 1,046,023
(4.00 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,563
(52.42 %)		 11
(0.00 %)		 8,687,289
(11.05 %)		 77,021
(1.94 %)		 14,712
(0.15 %)
106 green anole (JA03-04 2024)
GCF_035594765.1		 56,324
(5.85 %)		 n/a 14,020
(1.12 %)		 20,096
(1.86 %)		 n/a 40.60
(98.38 %)		 0
(0 %)		 841
(1.62 %)		 211
(100.00 %)		 4,859,635
(53.14 %)		 909,429
(5.19 %)		 8,304,332
(44.07 %)		 5
(0.00 %)		 1,056,606
(4.88 %)		 56,404
(1.78 %)		 20,393
(0.51 %)
107 green anole (v1 2011)
GCF_000090745.1		 38,096
(3.63 %)		 n/a 13,021
(1.08 %)		 20,780
(1.86 %)		 38,266
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 35,533
(5.44 %)		 41,987
(94.56 %)		 2,415,433
(28.92 %)		 702,538
(2.99 %)		 8,199,653
(39.69 %)		 25
(0.00 %)		 674,365
(3.47 %)		 42,151
(1.18 %)		 15,374
(0.36 %)
108 green anole (v2 2010)
GCF_000090745.2		 38,096
(3.63 %)		 n/a 13,140
(1.11 %)		 20,772
(1.86 %)		 38,229
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 35,530
(5.44 %)		 41,986
(94.56 %)		 4,455,733
(51.37 %)		 702,537
(2.99 %)		 8,199,580
(39.69 %)		 25
(0.00 %)		 674,353
(3.47 %)		 42,151
(1.18 %)		 15,935
(0.39 %)
109 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2		 n/a n/a 13,635
(1.05 %)		 19,414
(1.61 %)		 n/a 44.16
(99.95 %)		 60
(0.05 %)		 60
(0.05 %)		 6,797
(99.95 %)		 3,221,668
(44.97 %)		 275,275
(1.28 %)		 9,802,895
(32.14 %)		 2
(0.00 %)		 394,278
(1.72 %)		 45,469
(1.48 %)		 25,997
(0.89 %)
110 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2		 84,366
(4.63 %)		 n/a 14,725
(1.06 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 0
(0 %)		 298
(0.56 %)		 93
(100.00 %)		 1,701,640
(14.83 %)		 304,306
(1.25 %)		 11,135,147
(31.96 %)		 0
(0 %)		 429,994
(1.68 %)		 49,025
(1.44 %)		 26,933
(0.68 %)
111 High Himalaya frog
GCF_000935625.1		 26,109
(1.87 %)		 n/a 13,695
(0.94 %)		 28,085
(2.39 %)		 n/a 42.55
(96.32 %)		 122,325
(3.70 %)		 122,325
(3.70 %)		 147,513
(96.30 %)		 536,058
(1.39 %)		 794,563
(5.48 %)		 11,465,450
(37.44 %)		 1,716
(0.17 %)		 725,825
(4.49 %)		 219,772
(3.92 %)		 32,652
(0.67 %)
112 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1		 n/a n/a 15,006
(0.28 %)		 22,481
(0.80 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 225
(0.03 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,532
(99.97 %)		 1,344,546
(5.76 %)		 2,364,825
(28.34 %)		 5,088
(99.53 %)		 5
(0.00 %)		 14,350,128
(14.12 %)		 89,340
(2.10 %)		 82,092
(1.20 %)
113 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1		 n/a n/a 12,766
(0.30 %)		 21,591
(0.87 %)		 n/a 44.88
(99.43 %)		 0
(0 %)		 2,790
(0.57 %)		 1,496
(100.00 %)		 1,008,880
(5.19 %)		 1,596,129
(22.32 %)		 22,180,341
(62.98 %)		 2
(0.00 %)		 9,762,254
(11.27 %)		 82,276
(1.85 %)		 14,696
(0.13 %)
114 horn shark (sHetFra1hap1 2024)
GCF_036365525.1		 60,844
(1.44 %)		 n/a 15,004
(0.28 %)		 22,510
(0.76 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 0
(0 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,306
(100.00 %)		 1,344,541
(5.76 %)		 2,364,824
(28.34 %)		 5,087
(99.53 %)		 5
(0.00 %)		 14,350,134
(14.12 %)		 89,340
(2.10 %)		 82,092
(1.20 %)
115 hourglass treefrog (maternal 2023)
GCA_027789725.1		 n/a n/a 14,359
(0.89 %)		 32,575
(2.67 %)		 n/a 43.88
(95.18 %)		 788
(4.82 %)		 788
(4.82 %)		 3,358
(95.18 %)		 922,807
(2.38 %)		 1,744,603
(15.45 %)		 10,318,168
(48.47 %)		 0
(0 %)		 3,525,571
(8.67 %)		 244,270
(5.02 %)		 29,547
(0.61 %)
116 hourglass treefrog (paternal 2023)
GCA_027789765.1		 n/a n/a 14,058
(0.89 %)		 31,050
(2.69 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 0
(0 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 3
(0.00 %)		 3,539,111
(9.05 %)		 235,277
(5.56 %)		 28,414
(0.63 %)
117 Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024)
GCA_036172795.1		 n/a n/a 14,141
(0.97 %)		 22,232
(2.16 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 262
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 944,742
(4.86 %)		 1,927,659
(22.26 %)		 8,988,510
(49.29 %)		 1
(0.00 %)		 3,465,509
(10.62 %)		 77,721
(1.73 %)		 13,802
(0.30 %)
118 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022)
GCA_026652325.1		 n/a 139,896
(0.54 %)		 15,136
(0.10 %)		 n/a n/a 45.95
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 922
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 4,478,794
(1.33 %)		 6,452,537
(8.86 %)		 1,189
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 n/a 1,581,360
(4.00 %)		 144,588
(0.32 %)
119 Indian cobra (NN01 2019)
GCA_009733165.1		 n/a 25,817
(1.78 %)		 13,028
(1.10 %)		 17,854
(1.73 %)		 n/a 40.46
(93.80 %)		 0
(0 %)		 11,910
(6.20 %)		 1,897
(100.00 %)		 1,114,498
(5.61 %)		 671,854
(2.20 %)		 8,205,261
(40.40 %)		 3
(0.02 %)		 n/a 47,381
(1.37 %)		 19,640
(0.65 %)
120 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1		 n/a n/a 17,858
(2.43 %)		 32,738
(5.46 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 0
(0 %)		 3
(0.00 %)		 4,333
(100.00 %)		 583,632
(3.71 %)		 418,411
(3.74 %)		 5,198,155
(21.50 %)		 1
(0.00 %)		 276,314
(1.94 %)		 76,879
(3.71 %)		 57,281
(2.37 %)
121 Italian wall lizard (rPodSic1.hap1.1 2024)
GCA_964188175.1		 n/a n/a 14,241
(1.31 %)		 20,399
(2.26 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 2
(0.00 %)		 762
(0.01 %)		 296
(100.00 %)		 832,389
(5.27 %)		 530,449
(8.28 %)		 6,937,083
(40.38 %)		 2
(0.00 %)		 908,580
(4.73 %)		 106,667
(3.79 %)		 20,531
(0.75 %)
122 Italian wall lizard (rPodSic1.hap2.1 2024)
GCA_964188395.1		 n/a n/a 13,696
(1.37 %)		 19,278
(2.32 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 690
(0.01 %)		 690
(0.01 %)		 842
(99.99 %)		 763,893
(4.21 %)		 451,861
(6.69 %)		 6,696,380
(38.71 %)		 4
(0.00 %)		 740,272
(4.24 %)		 98,815
(3.65 %)		 19,565
(0.77 %)
123 Komodo dragon (SLA01 2019)
GCF_004798865.1		 43,331
(4.33 %)		 n/a 13,543
(1.31 %)		 18,081
(2.11 %)		 n/a 44.04
(99.03 %)		 0
(0 %)		 19,737
(0.97 %)		 1,411
(100.00 %)		 753,603
(4.91 %)		 263,965
(1.41 %)		 8,061,012
(24.65 %)		 582
(0.01 %)		 130,387
(0.66 %)		 49,808
(4.28 %)		 39,034
(2.67 %)
124 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1		 n/a n/a 13,155
(1.15 %)		 22,239
(2.06 %)		 n/a 41.01
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 6,800
(100.00 %)		 1,155,093
(7.75 %)		 707,777
(4.25 %)		 7,071,611
(44.00 %)		 0
(0 %)		 701,636
(4.02 %)		 104,556
(4.39 %)		 22,349
(0.88 %)
125 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1		 n/a n/a 13,350
(1.17 %)		 18,904
(1.93 %)		 n/a 40.96
(99.78 %)		 0
(0 %)		 769
(0.22 %)		 56
(100.00 %)		 1,209,793
(7.69 %)		 762,735
(5.06 %)		 7,424,674
(44.80 %)		 4
(0.00 %)		 794,949
(4.07 %)		 110,631
(4.07 %)		 23,739
(0.88 %)
126 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2		 n/a n/a 11,035
(1.05 %)		 16,064
(1.50 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 7
(0.00 %)		 9,006
(100.00 %)		 2,685,200
(47.08 %)		 208,060
(1.19 %)		 7,184,246
(33.31 %)		 0
(0 %)		 442,748
(2.46 %)		 25,133
(1.42 %)		 15,054
(0.75 %)
127 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq G10K)
GCF_009764565.3		 73,318
(3.97 %)		 n/a 14,610
(1.03 %)		 16,358
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 0
(0 %)		 668
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,694,449
(14.90 %)		 304,773
(1.14 %)		 11,121,962
(34.21 %)		 3
(0.00 %)		 670,729
(2.51 %)		 35,485
(1.36 %)		 19,615
(0.51 %)
128 leopard gecko (TG4126 2023)
GCF_028583425.1		 37,120
(2.89 %)		 n/a 14,358
(0.93 %)		 23,080
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 0
(0 %)		 62
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 969,188
(4.21 %)		 557,245
(2.88 %)		 11,096,222
(37.91 %)		 0
(0 %)		 608,752
(2.77 %)		 82,956
(2.56 %)		 27,406
(0.84 %)
129 lesser devil ray (2024)
GCF_963921235.1		 49,601
(2.40 %)		 n/a 12,335
(0.44 %)		 22,690
(1.20 %)		 n/a 42.91
(100.00 %)		 0
(0 %)		 697
(0.00 %)		 200
(100.00 %)		 7,453,775
(54.11 %)		 677,453
(5.15 %)		 18,943,414
(51.98 %)		 4
(0.00 %)		 1,957,188
(3.59 %)		 87,750
(1.43 %)		 61,592
(0.87 %)
130 Lilford's wall lizard (2023)
GCA_947686815.1		 n/a 469,920
(50.83 %)		 14,239
(1.41 %)		 19,740
(2.33 %)		 n/a 43.80
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,346
(0.02 %)		 2,149
(100.00 %)		 830,790
(4.33 %)		 445,450
(2.12 %)		 7,171,057
(36.69 %)		 79
(0.00 %)		 484,294
(2.64 %)		 86,200
(2.56 %)		 19,378
(0.77 %)
131 little skate (New England 2023)
GCF_028641065.1		 40,008
(3.35 %)		 n/a 11,836
(0.67 %)		 25,770
(1.80 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 0
(0 %)		 862
(0.00 %)		 1,769
(100.00 %)		 8,221,960
(66.45 %)		 1,044,111
(3.71 %)		 10,050,264
(53.79 %)		 1
(0.00 %)		 1,424,247
(4.33 %)		 205,567
(4.36 %)		 21,218
(0.48 %)
132 lizards B.pumilum (Western Cape Province JTBG20231 2024)
GCA_035047305.1		 n/a n/a 13,670
(0.79 %)		 19,028
(1.31 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 18
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 1,040,467
(4.86 %)		 924,221
(6.37 %)		 9,015,048
(56.81 %)		 1
(0.00 %)		 1,768,582
(6.35 %)		 248,142
(10.84 %)		 19,296
(0.34 %)
133 lizards E.multicarinata webbii (San Diego HBS135686 primary hap 2024)
GCF_023053635.1		 33,415
(3.07 %)		 n/a 14,091
(1.15 %)		 19,337
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 1,577,747
(7.81 %)		 774,112
(3.78 %)		 9,248,016
(40.42 %)		 1
(0.00 %)		 823,646
(3.44 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,586
(0.82 %)
134 lizards F.pardalis (Fpa_1 2023)
GCA_030440675.1		 n/a n/a 13,625
(1.22 %)		 18,049
(1.96 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 12
(0.00 %)		 23
(100.00 %)		 833,693
(2.81 %)		 607,040
(2.82 %)		 7,939,139
(42.05 %)		 0
(0 %)		 421,243
(2.11 %)		 52,987
(2.59 %)		 18,249
(0.61 %)
135 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap1.1 2024)
GCA_964188305.1		 n/a n/a 14,091
(1.26 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 2
(0.00 %)		 1,005
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 932,842
(5.02 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,536
(41.39 %)		 10
(0.00 %)		 772,110
(4.54 %)		 119,467
(4.32 %)		 20,701
(0.72 %)
136 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap2.1 2024)
GCA_964188325.1		 n/a n/a 13,653
(1.34 %)		 19,764
(2.32 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 817
(0.01 %)		 817
(0.01 %)		 1,444
(99.99 %)		 857,503
(4.68 %)		 507,819
(4.16 %)		 6,632,822
(39.41 %)		 4
(0.00 %)		 653,978
(4.13 %)		 103,858
(4.10 %)		 19,626
(0.75 %)
137 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap1.1 2024)
GCA_964252035.1		 n/a n/a 13,858
(1.33 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 0
(0 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 885,596
(4.43 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,008,185
(38.56 %)		 2
(0.00 %)		 527,173
(3.21 %)		 89,737
(2.87 %)		 18,878
(0.71 %)
138 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap2.1 2024)
GCA_964251985.1		 n/a n/a 13,817
(1.35 %)		 21,024
(2.50 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 811
(0.01 %)		 811
(0.01 %)		 1,458
(99.99 %)		 890,080
(4.42 %)		 526,749
(3.38 %)		 7,001,691
(37.94 %)		 9
(0.00 %)		 538,033
(3.26 %)		 89,526
(2.96 %)		 20,250
(0.75 %)
139 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap1.1 2024)
GCA_964234715.1		 n/a n/a 14,289
(1.31 %)		 20,112
(2.23 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 1
(0.00 %)		 823
(0.01 %)		 387
(100.00 %)		 830,352
(7.87 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,838,068
(40.20 %)		 2
(0.00 %)		 932,658
(4.44 %)		 90,074
(2.82 %)		 20,501
(0.74 %)
140 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap2.1 2024)
GCA_964234825.1		 n/a n/a 13,759
(1.39 %)		 19,452
(2.34 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 754
(0.01 %)		 754
(0.01 %)		 954
(99.99 %)		 768,595
(5.31 %)		 448,816
(5.54 %)		 6,722,284
(37.88 %)		 3
(0.00 %)		 638,565
(3.67 %)		 82,575
(2.83 %)		 19,444
(0.76 %)
141 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap1.2 2024)
GCA_964106645.2		 n/a n/a 14,314
(1.36 %)		 20,522
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 1
(0.00 %)		 1,506
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 858,648
(4.22 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,061,380
(38.21 %)		 40
(0.00 %)		 544,982
(3.43 %)		 96,600
(3.21 %)		 19,808
(0.82 %)
142 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap2.2 2024)
GCA_964106635.2		 n/a n/a 13,828
(1.41 %)		 19,048
(2.34 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,548
(99.98 %)		 803,451
(4.16 %)		 440,340
(2.30 %)		 6,774,254
(37.14 %)		 34
(0.00 %)		 471,503
(3.14 %)		 89,229
(3.04 %)		 18,652
(0.77 %)
143 lizards T.scincoides (rTilSci1hap2 2024)
GCF_035046505.1		 33,280
(3.42 %)		 n/a 13,266
(1.21 %)		 16,752
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 0
(0 %)		 506,831
(2.74 %)		 28,089
(0.98 %)		 14,987
(0.51 %)
144 loggerhead turtle (SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.1		 61,631
(3.99 %)		 n/a 14,678
(1.05 %)		 17,405
(1.52 %)		 42,180
(2.89 %)		 44.04
(99.90 %)		 0
(0 %)		 745
(0.10 %)		 2,008
(100.00 %)		 1,279,721
(12.58 %)		 319,729
(1.29 %)		 10,705,612
(33.91 %)		 4
(0.00 %)		 545,387
(2.26 %)		 49,015
(1.39 %)		 25,064
(0.63 %)
145 mainland tiger snake
GCF_900518725.1		 34,251
(3.18 %)		 n/a 13,445
(1.15 %)		 23,410
(1.90 %)		 n/a 39.72
(95.17 %)		 0
(0 %)		 79,478
(4.84 %)		 52,414
(100.00 %)		 1,081,503
(6.00 %)		 711,408
(2.47 %)		 8,047,065
(40.24 %)		 3,772
(0.08 %)		 265,750
(1.48 %)		 61,669
(2.47 %)		 18,916
(0.65 %)
146 many-banded krait (BM01 2022)
GCA_023653725.1		 n/a n/a 13,269
(1.19 %)		 18,533
(1.94 %)		 n/a 39.87
(99.25 %)		 0
(0 %)		 1,631
(0.75 %)		 448
(100.00 %)		 1,104,569
(6.42 %)		 703,174
(3.07 %)		 8,451,422
(40.97 %)		 0
(0 %)		 395,083
(2.25 %)		 65,260
(2.74 %)		 19,850
(0.80 %)
147 marbled whiptail (SIMRID8450 2020)
GCA_014337955.1		 n/a n/a 13,646
(1.27 %)		 18,378
(2.09 %)		 n/a 42.67
(94.37 %)		 0
(0 %)		 166,840
(5.67 %)		 3,826
(100.00 %)		 809,278
(4.31 %)		 439,020
(1.66 %)		 8,665,254
(33.02 %)		 23,254
(0.24 %)		 223,741
(0.91 %)		 41,638
(1.70 %)		 20,448
(0.83 %)
148 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1		 n/a n/a 10,549
(1.13 %)		 20,171
(2.08 %)		 n/a 41.02
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 12
(0.00 %)		 9,587
(100.00 %)		 889,533
(7.84 %)		 565,831
(6.37 %)		 5,968,624
(41.74 %)		 0
(0 %)		 615,578
(4.07 %)		 73,632
(3.80 %)		 21,339
(1.17 %)
149 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1		 n/a n/a 13,282
(1.16 %)		 18,653
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 1,187,501
(7.72 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,428,147
(45.35 %)		 13
(0.00 %)		 770,603
(3.87 %)		 101,007
(3.95 %)		 24,179
(0.84 %)
150 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1		 n/a n/a 14,442
(0.44 %)		 24,630
(1.28 %)		 n/a 41.94
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,032
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 1,928,361
(2.22 %)		 2,955,095
(11.97 %)		 25,178,773
(53.55 %)		 7
(0.00 %)		 5,022,575
(7.68 %)		 165,699
(1.23 %)		 16,842
(0.16 %)
151 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1		 n/a n/a 13,824
(0.44 %)		 23,296
(1.27 %)		 n/a 41.86
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,009
(0.01 %)		 656
(100.00 %)		 1,860,053
(2.17 %)		 2,751,941
(10.76 %)		 24,252,866
(53.00 %)		 11
(0.00 %)		 4,329,852
(7.13 %)		 157,012
(1.21 %)		 15,742
(0.15 %)
152 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1		 62,007
(3.15 %)		 n/a 14,883
(0.96 %)		 18,524
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 0
(0 %)		 1,866
(3.64 %)		 621
(100.00 %)		 1,372,189
(11.32 %)		 472,501
(3.42 %)		 11,362,604
(34.69 %)		 1
(0.00 %)		 910,675
(2.73 %)		 73,700
(2.04 %)		 22,443
(0.52 %)
153 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1		 n/a n/a 15,425
(0.94 %)		 20,005
(1.48 %)		 n/a 44.46
(95.51 %)		 1,790
(4.49 %)		 1,790
(4.49 %)		 4,782
(95.51 %)		 1,404,726
(11.28 %)		 453,302
(2.47 %)		 11,996,092
(34.08 %)		 3
(0.00 %)		 712,154
(2.19 %)		 77,167
(2.14 %)		 23,282
(0.51 %)
154 mimic poison frog (primary hap 2023)
GCA_032444005.1		 n/a n/a 14,957
(0.34 %)		 n/a n/a 44.95
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,686
(100.00 %)		 1,716,760
(1.89 %)		 4,088,695
(23.45 %)		 2,437
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 10,590,500
(14.66 %)		 n/a n/a
155 Mississippi paddlefish
GCF_017654505.1		 66,226
(6.17 %)		 n/a 21,806
(1.85 %)		 31,525
(3.80 %)		 n/a 39.02
(99.89 %)		 2,957
(0.11 %)		 2,963
(0.11 %)		 7,192
(99.89 %)		 1,126,936
(3.66 %)		 877,525
(6.33 %)		 9,039,918
(36.85 %)		 1
(0.00 %)		 775,360
(3.40 %)		 29,954
(1.06 %)		 14,005
(0.40 %)
156 Murray river turtle (Brisbane River MOO-44397 2024)
GCF_026122565.2		 48,414
(3.72 %)		 n/a 14,988
(1.18 %)		 20,316
(1.85 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,735
(100.00 %)		 1,108,636
(10.97 %)		 229,329
(1.01 %)		 11,088,528
(25.43 %)		 0
(0 %)		 192,826
(0.74 %)		 49,188
(1.67 %)		 36,282
(1.24 %)
157 Northern rubber boa (HBS 135849 alternate hap 2022)
GCA_023362785.1		 n/a n/a 12,816
(1.09 %)		 18,099
(1.83 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 0
(0 %)		 84
(0.00 %)		 224
(100.00 %)		 1,081,107
(4.01 %)		 728,703
(4.64 %)		 6,961,724
(42.46 %)		 1
(0.00 %)		 702,049
(3.73 %)		 128,617
(3.90 %)		 25,981
(1.05 %)
158 Northern rubber boa (HBS 135849 primary hap 2022)
GCA_023362775.1		 n/a n/a 13,531
(1.08 %)		 18,971
(1.81 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 0
(0 %)		 85
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 1,138,891
(3.99 %)		 798,941
(5.00 %)		 7,476,142
(42.85 %)		 1
(0.00 %)		 757,393
(3.80 %)		 135,874
(3.88 %)		 27,035
(1.02 %)
159 Northwestern pond turtle (WTP2003 alternate hap 2022)
GCA_022086895.1		 n/a n/a 14,212
(1.00 %)		 20,203
(1.65 %)		 n/a 44.72
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,800
(0.01 %)		 2,508
(100.00 %)		 4,246,095
(48.91 %)		 442,393
(1.88 %)		 10,453,096
(35.71 %)		 43
(0.00 %)		 450,873
(2.62 %)		 134,572
(3.12 %)		 28,350
(0.78 %)
160 Northwestern pond turtle (WTP2003 primary hap 2022)
GCA_022086475.1		 n/a n/a 14,862
(1.02 %)		 19,830
(1.62 %)		 n/a 44.76
(100.00 %)		 0
(0 %)		 148
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 4,413,681
(48.88 %)		 459,701
(1.92 %)		 11,014,102
(35.89 %)		 1
(0.00 %)		 468,618
(2.09 %)		 141,800
(3.08 %)		 30,071
(0.78 %)
161 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1		 n/a n/a 13,448
(1.31 %)		 17,745
(2.07 %)		 n/a 40.20
(99.98 %)		 73
(0.02 %)		 73
(0.02 %)		 116
(99.98 %)		 741,052
(2.98 %)		 411,477
(3.31 %)		 7,668,994
(30.14 %)		 0
(0 %)		 318,343
(2.06 %)		 34,560
(2.18 %)		 21,974
(1.10 %)
162 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1		 n/a n/a 13,421
(1.31 %)		 17,659
(2.08 %)		 n/a 40.15
(99.66 %)		 93
(0.34 %)		 93
(0.34 %)		 158
(99.66 %)		 733,358
(2.95 %)		 403,552
(3.04 %)		 7,746,871
(29.97 %)		 0
(0 %)		 294,855
(1.92 %)		 34,363
(2.08 %)		 21,752
(1.10 %)
163 one-colored caecilian (2021)
GCA_901765095.2		 n/a n/a 14,569
(0.43 %)		 30,498
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 0
(0 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,894,383
(1.68 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,143
(52.43 %)		 5
(0.00 %)		 1,718,803
(3.44 %)		 414,828
(3.91 %)		 47,796
(0.38 %)
164 Pacific lamprey (Columbia River large-bodied, stream-maturing ecotype CRITFC18_GStd-0006 2020)
GCA_014621495.2		 n/a n/a 6,827
(0.82 %)		 38,010
(4.29 %)		 n/a 48.07
(86.05 %)		 0
(0 %)		 63,604
(13.95 %)		 141,124
(100.00 %)		 2,948,140
(52.71 %)		 971,264
(7.81 %)		 4,836,103
(36.27 %)		 7,699
(0.31 %)		 n/a 186,153
(29.43 %)		 141,969
(7.00 %)
165 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1		 n/a n/a 7,223
(0.52 %)		 11,927
(1.11 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 76
(0.00 %)		 4,081
(100.00 %)		 988,792
(3.99 %)		 1,766,202
(10.24 %)		 9,974,001
(52.99 %)		 0
(0 %)		 1,733,898
(6.80 %)		 64,462
(1.33 %)		 4,213
(0.08 %)
166 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1		 n/a n/a 14,522
(0.54 %)		 21,861
(1.14 %)		 n/a 39.52
(98.39 %)		 0
(0 %)		 3,681
(1.61 %)		 1,318
(100.00 %)		 1,928,844
(4.34 %)		 3,684,477
(13.44 %)		 19,091,818
(55.21 %)		 1
(0.00 %)		 4,715,600
(8.73 %)		 127,760
(1.34 %)		 9,458
(0.10 %)
167 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1		 n/a n/a 13,365
(1.26 %)		 17,388
(1.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 99
(0.00 %)		 279
(100.00 %)		 726,428
(2.81 %)		 331,756
(2.05 %)		 7,184,711
(33.57 %)		 2
(0.00 %)		 316,815
(2.51 %)		 51,973
(2.70 %)		 19,565
(0.92 %)
168 Papuan ground boa (hap2 2024)
GCA_035149785.1		 n/a n/a 13,390
(1.26 %)		 17,496
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 101
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 728,574
(2.82 %)		 348,605
(2.13 %)		 7,199,124
(33.55 %)		 1
(0.00 %)		 318,788
(2.43 %)		 51,807
(2.69 %)		 19,758
(0.92 %)
169 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501915.1		 n/a n/a 21,977
(1.55 %)		 31,925
(2.52 %)		 n/a 39.40
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,072
(0.01 %)		 1,183
(100.00 %)		 825,817
(1.86 %)		 1,047,172
(7.89 %)		 12,996,911
(44.48 %)		 3
(0.00 %)		 1,701,385
(5.28 %)		 99,118
(1.26 %)		 15,547
(0.21 %)
170 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501925.1		 n/a n/a 23,766
(1.52 %)		 34,093
(2.42 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 500
(0.00 %)		 897
(100.00 %)		 919,152
(1.89 %)		 1,157,711
(8.01 %)		 14,217,996
(45.44 %)		 0
(0 %)		 1,995,399
(5.51 %)		 108,139
(1.26 %)		 16,761
(0.21 %)
171 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023)
GCA_033958435.1		 n/a n/a 14,675
(1.05 %)		 16,697
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 0
(0 %)		 12
(0.00 %)		 134
(100.00 %)		 3,772,260
(47.94 %)		 322,081
(1.52 %)		 11,123,166
(34.14 %)		 0
(0 %)		 448,027
(1.56 %)		 129,645
(3.29 %)		 28,529
(1.18 %)
172 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2		 n/a n/a 10,906
(1.98 %)		 19,820
(4.33 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,516
(100.00 %)		 390,896
(3.25 %)		 482,493
(7.83 %)		 4,361,670
(34.36 %)		 0
(0 %)		 491,019
(5.12 %)		 52,508
(3.70 %)		 21,519
(1.51 %)
173 plains spadefoot toad (primary hap 2022)
GCF_027358695.1		 41,009
(4.67 %)		 n/a 13,912
(2.00 %)		 25,745
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 0
(0 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 497,976
(3.84 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,342
(36.26 %)		 1
(0.00 %)		 748,493
(5.83 %)		 72,598
(4.35 %)		 32,385
(1.89 %)
174 prickly gecko (False Entrance Well CCM8104 2023)
GCF_032191835.1		 35,366
(2.07 %)		 n/a 14,394
(0.79 %)		 23,371
(1.60 %)		 n/a 44.78
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,608
(0.01 %)		 661
(100.00 %)		 1,995,033
(8.75 %)		 823,022
(6.51 %)		 12,116,860
(46.84 %)		 9
(0.00 %)		 1,818,752
(4.81 %)		 117,191
(3.14 %)		 39,240
(0.76 %)
175 Puerto Rican coqui (aEleCoq1hap1 2024)
GCF_035609145.1		 44,598
(2.13 %)		 n/a 13,879
(0.57 %)		 31,890
(1.61 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 0
(0 %)		 659
(0.00 %)		 956
(100.00 %)		 1,044,176
(1.98 %)		 1,442,184
(16.51 %)		 14,710,122
(54.00 %)		 6
(0.00 %)		 4,070,191
(8.73 %)		 501,931
(8.81 %)		 49,483
(0.82 %)
176 Puerto Rican coqui (hap1 2024)
GCA_035609145.1		 n/a n/a 13,881
(0.57 %)		 32,313
(1.67 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 659
(0.00 %)		 963
(100.00 %)		 1,044,181
(1.98 %)		 1,442,189
(16.51 %)		 14,710,175
(54.00 %)		 6
(0.00 %)		 4,070,195
(8.73 %)		 501,931
(8.81 %)		 49,483
(0.82 %)
177 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1		 n/a n/a 13,892
(0.57 %)		 32,011
(1.64 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 16
(0.00 %)		 685
(0.00 %)		 843
(100.00 %)		 1,042,636
(2.00 %)		 1,430,690
(16.22 %)		 14,621,029
(53.91 %)		 19
(0.00 %)		 4,063,379
(8.75 %)		 503,166
(8.84 %)		 49,100
(0.82 %)
178 red-eared slider turtle
GCF_013100865.1		 47,272
(3.27 %)		 n/a 13,909
(1.05 %)		 16,674
(1.54 %)		 n/a 43.81
(96.14 %)		 0
(0 %)		 25,390
(3.86 %)		 138
(100.00 %)		 1,686,633
(15.06 %)		 271,837
(0.81 %)		 10,802,900
(30.74 %)		 1,247
(0.04 %)		 155,059
(0.69 %)		 93,811
(1.90 %)		 24,960
(0.62 %)
179 reedfish (alternate hap 2021)
GCA_900700845.3		 n/a n/a 11,382
(0.41 %)		 28,399
(1.33 %)		 n/a 39.39
(99.99 %)		 17
(0.01 %)		 17
(0.01 %)		 17,099
(99.99 %)		 6,708,926
(37.23 %)		 883,916
(2.81 %)		 16,745,782
(46.94 %)		 0
(0 %)		 963,655
(2.45 %)		 74,951
(1.15 %)		 20,227
(0.32 %)
180 Reeves's turtle
GCF_016161935.1		 86,238
(3.40 %)		 n/a 15,165
(0.98 %)		 21,405
(1.66 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 0
(0 %)		 398
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,854,279
(14.68 %)		 448,403
(2.11 %)		 11,329,581
(34.64 %)		 0
(0 %)		 644,654
(2.20 %)		 119,002
(2.82 %)		 35,167
(0.87 %)
181 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 alternate hap 2024)
GCA_040937895.1		 n/a n/a 26,401
(0.36 %)		 90,909
(1.63 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 19
(0.00 %)		 14,096
(100.00 %)		 4,036,529
(2.70 %)		 6,299,339
(18.78 %)		 14,096
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 13,301,439
(10.32 %)		 1,426,030
(6.65 %)		 1,371,517
(5.63 %)
182 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 primary hap 2024)
GCF_040937935.1		 62,635
(1.63 %)		 n/a 14,072
(0.39 %)		 44,953
(1.74 %)		 n/a 44.98
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3,039
(0.01 %)		 477
(100.00 %)		 2,058,700
(2.53 %)		 3,206,511
(15.84 %)		 20,407,989
(60.26 %)		 40
(0.00 %)		 n/a 741,520
(6.10 %)		 65,051
(0.49 %)
183 Ringneck snake (HBS135679 primary hap 2022)
GCA_023053685.1		 n/a n/a 13,357
(1.06 %)		 20,426
(1.94 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 0
(0 %)		 723
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 1,451,537
(9.36 %)		 1,095,484
(10.35 %)		 7,870,309
(48.66 %)		 4
(0.00 %)		 1,107,317
(4.55 %)		 142,495
(4.04 %)		 27,514
(0.84 %)
184 royal ground snake (hap1 2023)
GCA_031021105.1		 n/a n/a 13,327
(0.96 %)		 20,347
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 1,983,903
(10.40 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,707
(53.44 %)		 11
(0.00 %)		 1,523,664
(5.77 %)		 130,852
(4.47 %)		 27,815
(0.70 %)
185 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1		 n/a n/a 13,845
(0.96 %)		 23,108
(1.86 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,128
(100.00 %)		 2,008,682
(10.16 %)		 1,718,408
(7.36 %)		 9,467,451
(52.99 %)		 0
(0 %)		 1,513,596
(5.45 %)		 140,557
(4.65 %)		 29,439
(0.71 %)
186 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1		 n/a n/a 12,606
(0.83 %)		 22,421
(1.62 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,543
(100.00 %)		 2,080,172
(11.19 %)		 1,814,619
(9.22 %)		 8,889,119
(57.36 %)		 0
(0 %)		 1,825,733
(6.19 %)		 145,328
(4.63 %)		 28,523
(0.67 %)
187 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1		 n/a n/a 13,727
(0.84 %)		 24,896
(2.06 %)		 n/a 42.95
(99.51 %)		 0
(0 %)		 973
(0.49 %)		 2,266
(100.00 %)		 729,332
(2.15 %)		 1,402,564
(24.45 %)		 8,156,596
(55.96 %)		 4
(0.00 %)		 3,523,739
(10.10 %)		 175,180
(3.64 %)		 18,584
(0.40 %)
188 rufous frog (hap2 2023)
GCA_031893055.1		 n/a n/a 13,538
(0.88 %)		 24,311
(2.15 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 0
(0 %)		 976
(0.93 %)		 1,266
(100.00 %)		 711,895
(2.18 %)		 1,219,160
(21.56 %)		 7,988,458
(54.14 %)		 3
(0.00 %)		 3,097,457
(9.48 %)		 170,920
(3.48 %)		 17,791
(0.40 %)
189 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1		 n/a n/a 14,039
(1.09 %)		 19,528
(1.85 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 31
(0.00 %)		 122
(100.00 %)		 1,307,065
(5.31 %)		 672,219
(3.50 %)		 9,949,858
(39.30 %)		 0
(0 %)		 671,520
(3.09 %)		 83,890
(3.97 %)		 26,657
(0.80 %)
190 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1		 n/a n/a 14,065
(1.09 %)		 19,430
(1.84 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 21
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 1,307,771
(5.32 %)		 672,054
(3.42 %)		 9,846,806
(39.03 %)		 0
(0 %)		 665,794
(3.10 %)		 83,805
(3.99 %)		 26,762
(0.80 %)
191 San Diegan tiger whiptail (alternate hap HBS 135688 2022)
GCA_023333555.1		 n/a n/a 13,288
(1.15 %)		 18,137
(1.98 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 0
(0 %)		 44
(0.00 %)		 227
(100.00 %)		 909,096
(6.37 %)		 544,302
(5.70 %)		 8,280,652
(39.20 %)		 3
(0.00 %)		 970,374
(3.95 %)		 51,923
(2.21 %)		 19,861
(0.82 %)
192 San Diegan tiger whiptail (HBS 135688 2022)
GCA_023333525.1		 n/a n/a 10,727
(1.18 %)		 14,669
(1.99 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 39
(0.00 %)		 113
(100.00 %)		 741,937
(6.29 %)		 448,194
(5.60 %)		 7,227,870
(36.97 %)		 0
(0 %)		 769,111
(3.76 %)		 42,621
(2.15 %)		 17,889
(0.90 %)
193 San Diego alligator lizard (HBS135686 alternate hap 2022)
GCA_023053675.1		 n/a n/a 14,107
(1.14 %)		 19,600
(1.95 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 27
(0.00 %)		 627
(100.00 %)		 1,563,836
(7.79 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,810
(40.44 %)		 0
(0 %)		 884,432
(3.64 %)		 81,126
(2.79 %)		 27,960
(0.83 %)
194 San Diego alligator lizard (HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1		 n/a n/a 14,075
(1.15 %)		 19,587
(1.99 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 23
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 1,577,744
(7.81 %)		 774,690
(3.78 %)		 9,248,062
(40.42 %)		 0
(0 %)		 832,326
(3.45 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,587
(0.82 %)
195 San Diego ringneck snake (HBS135679 alternate hap 2022)
GCA_023053665.1		 n/a n/a 10,911
(1.00 %)		 17,586
(1.79 %)		 n/a 41.17
(100.00 %)		 0
(0 %)		 572
(0.00 %)		 2,064
(100.00 %)		 1,265,045
(10.30 %)		 989,149
(13.38 %)		 6,503,035
(50.62 %)		 0
(0 %)		 1,261,338
(5.60 %)		 123,274
(4.17 %)		 23,159
(0.83 %)
196 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1		 n/a n/a 14,226
(1.28 %)		 25,396
(2.33 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 12,662
(100.00 %)		 1,001,433
(5.27 %)		 445,157
(1.79 %)		 7,227,826
(34.26 %)		 0
(0 %)		 365,558
(2.38 %)		 80,300
(2.76 %)		 22,848
(0.87 %)
197 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1		 41,701
(3.64 %)		 n/a 14,350
(1.48 %)		 19,231
(2.45 %)		 32,804
(4.14 %)		 43.75
(99.75 %)		 0
(0 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,414
(1.76 %)		 7,135,165
(34.49 %)		 0
(0 %)		 365,268
(2.50 %)		 76,053
(2.68 %)		 21,615
(0.85 %)
198 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1		 108,406
(1.98 %)		 n/a 13,959
(0.46 %)		 n/a n/a 43.90
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,474
(100.00 %)		 1,903,654
(2.85 %)		 2,970,691
(16.56 %)		 15,354,577
(64.31 %)		 20
(0.00 %)		 n/a 652,708
(8.36 %)		 43,665
(0.45 %)
199 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1		 n/a n/a 14,077
(0.47 %)		 36,608
(1.60 %)		 n/a 43.86
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,097
(0.01 %)		 2,802
(100.00 %)		 1,819,971
(2.73 %)		 2,865,173
(16.12 %)		 15,335,602
(63.85 %)		 14
(0.00 %)		 6,125,585
(10.74 %)		 651,438
(8.09 %)		 43,492
(0.45 %)
200 Schlegel's Japanese gecko
GCF_001447785.1		 25,177
(1.78 %)		 n/a 14,549
(0.82 %)		 28,002
(1.69 %)		 n/a 45.48
(96.46 %)		 143,970
(3.54 %)		 143,970
(3.54 %)		 335,470
(96.46 %)		 889,760
(2.21 %)		 666,492
(2.83 %)		 12,865,811
(39.14 %)		 291
(0.01 %)		 n/a 160,022
(2.80 %)		 49,172
(0.87 %)
201 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1		 n/a n/a 6,180
(0.71 %)		 31,191
(4.14 %)		 n/a 48.30
(100.00 %)		 0
(0 %)		 11
(0.00 %)		 4,064
(100.00 %)		 1,494,745
(38.42 %)		 891,392
(20.02 %)		 4,259,383
(49.70 %)		 0
(0 %)		 2,135,388
(12.73 %)		 147,499
(35.87 %)		 97,808
(5.62 %)
202 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1		 41,241
(6.50 %)		 n/a 7,638
(0.70 %)		 36,336
(4.06 %)		 83,714
(10.03 %)		 48.31
(98.62 %)		 0
(0 %)		 930
(1.38 %)		 1,434
(100.00 %)		 1,920,851
(39.36 %)		 1,194,165
(21.47 %)		 5,320,620
(50.50 %)		 4
(0.00 %)		 2,982,736
(13.77 %)		 178,590
(35.88 %)		 120,128
(5.32 %)
203 sharpnose sevengill shark (hap1 2024)
GCA_035084215.1		 n/a n/a 12,780
(0.49 %)		 24,543
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,880
(100.00 %)		 597,122
(2.28 %)		 1,112,137
(17.97 %)		 12,108,056
(57.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,824,033
(9.23 %)		 117,585
(3.42 %)		 24,151
(0.35 %)
204 sharpnose sevengill shark (hap2 2024)
GCA_035084135.1		 n/a n/a 12,603
(0.52 %)		 23,419
(1.42 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,695
(0.01 %)		 1,695
(0.01 %)		 2,889
(99.99 %)		 559,171
(2.08 %)		 973,228
(15.01 %)		 11,768,442
(55.69 %)		 2
(0.00 %)		 3,991,721
(8.15 %)		 108,468
(3.25 %)		 22,750
(0.36 %)
205 sharpnose sevengill shark (sHepPer1hap1 2024)
GCF_035084215.1		 51,418
(2.53 %)		 n/a 12,778
(0.49 %)		 24,541
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,879
(100.00 %)		 597,115
(2.28 %)		 1,112,121
(17.97 %)		 12,108,003
(57.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,823,993
(9.23 %)		 117,585
(3.42 %)		 24,151
(0.35 %)
206 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap1.1 2024)
GCA_964106915.1		 n/a n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 0
(0 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 7
(0.00 %)		 598,615
(3.50 %)		 93,005
(2.80 %)		 19,317
(0.73 %)
207 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap1.2 2024)
GCA_964106915.2		 n/a n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 0
(0 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 7
(0.00 %)		 598,611
(3.50 %)		 93,005
(2.80 %)		 19,317
(0.73 %)
208 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap2.1 2024)
GCA_964106785.1		 n/a n/a 13,756
(1.40 %)		 19,148
(2.33 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 0
(0 %)		 783
(0.01 %)		 127
(100.00 %)		 790,266
(3.86 %)		 448,558
(4.00 %)		 6,780,108
(37.51 %)		 3
(0.00 %)		 534,737
(3.25 %)		 86,165
(2.71 %)		 18,444
(0.74 %)
209 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2		 n/a n/a 11,589
(0.31 %)		 32,603
(1.10 %)		 n/a 47.54
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 6
(0.00 %)		 26,655
(100.00 %)		 1,346,532
(1.83 %)		 1,273,326
(5.35 %)		 19,727,443
(51.55 %)		 0
(0 %)		 2,678,114
(4.31 %)		 427,693
(8.25 %)		 27,178
(0.30 %)
210 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2		 n/a n/a 12,587
(0.36 %)		 23,986
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 0
(0 %)		 7,146
(1.52 %)		 645
(100.00 %)		 1,451,634
(1.94 %)		 1,448,619
(6.25 %)		 20,884,741
(51.41 %)		 10
(0.00 %)		 3,334,909
(4.99 %)		 456,658
(8.18 %)		 31,096
(0.32 %)
211 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1		 n/a n/a 9,086
(0.58 %)		 20,468
(1.57 %)		 n/a 42.65
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 10,892
(100.00 %)		 315,695
(1.23 %)		 320,148
(1.73 %)		 8,305,059
(38.33 %)		 0
(0 %)		 382,745
(1.57 %)		 37,147
(1.43 %)		 15,419
(0.42 %)
212 smalltooth sawfish (primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1		 40,257
(2.94 %)		 n/a 12,157
(0.69 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 0
(0 %)		 698
(0.91 %)		 172
(100.00 %)		 4,824,261
(54.91 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,260
(38.19 %)		 0
(0 %)		 471,344
(1.50 %)		 45,398
(1.34 %)		 18,410
(0.41 %)
213 snake C.aspera (hap2 2024)
GCF_035149785.1		 31,826
(3.55 %)		 n/a 13,389
(1.26 %)		 17,495
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 101
(0.00 %)		 149
(100.00 %)		 728,567
(2.82 %)		 348,603
(2.13 %)		 7,199,026
(33.55 %)		 1
(0.00 %)		 318,786
(2.43 %)		 51,807
(2.69 %)		 19,758
(0.92 %)
214 snake N.helvetica (rNatHel1.hap1.1 2024)
GCA_964273705.1		 n/a n/a 13,534
(1.08 %)		 19,681
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 7
(0.00 %)		 2,010
(0.02 %)		 494
(100.00 %)		 1,264,981
(8.07 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,795
(46.16 %)		 10
(0.00 %)		 746,296
(3.32 %)		 117,174
(4.31 %)		 24,893
(0.73 %)
215 snake N.helvetica (rNatHel1.hap2.1 2024)
GCA_964273795.1		 n/a n/a 11,975
(1.14 %)		 16,941
(1.86 %)		 n/a 41.42
(99.98 %)		 1,674
(0.02 %)		 1,674
(0.02 %)		 2,176
(99.98 %)		 1,088,721
(8.03 %)		 743,110
(5.43 %)		 7,446,281
(43.88 %)		 11
(0.00 %)		 634,247
(3.33 %)		 96,764
(4.19 %)		 20,864
(0.74 %)
216 Southern alligator lizard (San Diego HBS135686 primary hap 2024)
GCA_023053635.2		 n/a n/a 14,093
(1.15 %)		 19,338
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 35
(100.00 %)		 1,577,751
(7.81 %)		 774,117
(3.78 %)		 9,248,069
(40.42 %)		 1
(0.00 %)		 823,656
(3.44 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,586
(0.82 %)
217 Southern dwarf chameleon (Gauteng JTBG20232 2024)
GCA_035047345.1		 n/a n/a 13,671
(0.83 %)		 18,931
(1.39 %)		 n/a 44.53
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 22
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 1,004,404
(4.81 %)		 870,596
(5.97 %)		 9,017,362
(54.42 %)		 0
(0 %)		 1,622,797
(5.80 %)		 217,977
(8.25 %)		 19,831
(0.36 %)
218 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 alternate hap 2022)
GCA_024509165.1		 n/a n/a 13,381
(1.17 %)		 19,541
(1.96 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 0
(0 %)		 34
(0.00 %)		 340
(100.00 %)		 1,137,408
(8.97 %)		 740,163
(7.59 %)		 7,520,676
(44.43 %)		 0
(0 %)		 1,047,648
(4.87 %)		 47,268
(1.61 %)		 21,885
(0.78 %)
219 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 primary hap 2022)
GCA_024509115.1		 n/a n/a 12,626
(1.16 %)		 18,965
(1.95 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 443
(0.01 %)		 443
(0.01 %)		 1,139
(99.99 %)		 1,095,605
(9.34 %)		 713,734
(8.45 %)		 6,942,208
(44.93 %)		 3
(0.00 %)		 1,092,536
(5.56 %)		 46,378
(2.04 %)		 21,510
(0.80 %)
220 Southwestern pond turtle (HBS135687 alternate hap 2022)
GCA_023634275.1		 n/a n/a 14,998
(0.98 %)		 20,146
(1.60 %)		 n/a 44.84
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 64
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 1,562,785
(12.68 %)		 484,638
(2.00 %)		 11,089,433
(36.29 %)		 0
(0 %)		 512,269
(2.30 %)		 143,601
(3.21 %)		 30,649
(0.71 %)
221 Southwestern pond turtle (HBS135687 primary hap 2022)
GCA_023634205.1		 n/a n/a 14,971
(0.99 %)		 19,756
(1.60 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 53
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 1,545,155
(12.63 %)		 465,697
(1.95 %)		 11,181,681
(36.13 %)		 0
(0 %)		 476,831
(2.14 %)		 142,383
(3.05 %)		 30,737
(0.72 %)
222 spotted gar
GCF_000242695.1		 45,681
(8.02 %)		 n/a 13,054
(1.95 %)		 46,362
(15.00 %)		 n/a 39.59
(91.93 %)		 43,274
(8.08 %)		 43,276
(8.08 %)		 45,199
(91.92 %)		 203,614
(1.02 %)		 123,247
(0.80 %)		 5,837,321
(22.82 %)		 2,079
(0.10 %)		 77,276
(0.87 %)		 38,507
(2.24 %)		 31,972
(1.68 %)
223 spotted gar (fLepOcu1hap1 2024)
GCA_040954845.1		 n/a n/a 13,777
(1.63 %)		 24,910
(4.29 %)		 n/a 40.54
(100.00 %)		 0
(0 %)		 76
(0.00 %)		 831
(100.00 %)		 1,218,814
(33.09 %)		 230,177
(10.66 %)		 5,685,909
(34.46 %)		 0
(0 %)		 606,189
(4.68 %)		 52,438
(3.69 %)		 36,888
(1.75 %)
224 spotted gar (fLepOcu1hap2 2024)
GCF_040954835.1		 64,638
(7.15 %)		 n/a 13,839
(1.51 %)		 23,965
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 0
(0 %)		 95
(0.00 %)		 816
(100.00 %)		 1,319,033
(34.80 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,919
(38.20 %)		 0
(0 %)		 787,990
(5.83 %)		 57,935
(3.78 %)		 37,077
(1.64 %)
225 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1		 n/a n/a 10,920
(1.26 %)		 14,403
(2.60 %)		 n/a 43.46
(99.96 %)		 0
(0 %)		 2,088
(0.04 %)		 1,042
(100.00 %)		 3,325,883
(44.48 %)		 604,780
(8.87 %)		 5,926,808
(44.92 %)		 2
(0.00 %)		 1,077,982
(5.77 %)		 64,249
(4.00 %)		 11,419
(0.43 %)
226 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1		 n/a n/a 10,694
(1.38 %)		 13,221
(2.62 %)		 n/a 42.85
(99.96 %)		 0
(0 %)		 1,952
(0.04 %)		 532
(100.00 %)		 3,108,151
(44.68 %)		 498,592
(6.00 %)		 5,634,132
(43.16 %)		 4
(0.00 %)		 685,165
(4.19 %)		 50,785
(2.94 %)		 25,542
(1.57 %)
227 starry smooth-hound (sMusAst1.hap1.1 2024)
GCA_964213995.1		 n/a n/a 12,755
(0.42 %)		 23,706
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 0
(0 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,314
(100.00 %)		 1,153,000
(3.16 %)		 1,250,073
(11.36 %)		 14,207,513
(54.93 %)		 42
(0.00 %)		 4,695,339
(7.91 %)		 114,313
(3.65 %)		 15,576
(0.19 %)
228 starry smooth-hound (sMusAst1.hap2.1 2024)
GCA_964214025.1		 n/a n/a 12,414
(0.43 %)		 22,037
(1.15 %)		 n/a 45.49
(99.98 %)		 3,505
(0.02 %)		 3,505
(0.02 %)		 7,908
(99.98 %)		 1,083,980
(2.93 %)		 1,065,586
(9.57 %)		 13,986,241
(53.49 %)		 32
(0.00 %)		 3,881,332
(7.02 %)		 105,379
(3.46 %)		 14,226
(0.18 %)
229 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1		 110,154
(7.62 %)		 n/a 25,364
(1.76 %)		 40,715
(4.06 %)		 n/a 40.11
(100.00 %)		 0
(0 %)		 433
(0.00 %)		 1,731
(100.00 %)		 4,055,215
(43.14 %)		 1,124,096
(10.13 %)		 9,426,172
(41.81 %)		 10
(0.00 %)		 1,593,747
(6.87 %)		 64,522
(2.85 %)		 21,984
(0.89 %)
230 sterlet (paternal hap 2022)
GCA_902713435.2		 n/a n/a 24,717
(1.73 %)		 40,151
(4.13 %)		 74,807
(5.54 %)		 40.09
(99.99 %)		 0
(0 %)		 475
(0.01 %)		 1,517
(100.00 %)		 1,844,596
(9.77 %)		 1,119,340
(9.88 %)		 9,372,934
(41.58 %)		 8
(0.00 %)		 1,582,556
(6.83 %)		 65,007
(2.74 %)		 17,761
(0.38 %)
231 sterlet (v2 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.2		 73,195
(5.77 %)		 n/a 24,716
(1.77 %)		 39,692
(3.97 %)		 n/a 39.75
(99.93 %)		 0
(0 %)		 6,251
(0.07 %)		 3,368
(100.00 %)		 3,869,521
(43.26 %)		 1,093,425
(6.82 %)		 9,976,052
(39.33 %)		 5
(0.00 %)		 1,354,766
(6.14 %)		 60,325
(1.97 %)		 17,242
(0.48 %)
232 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1		 n/a n/a 14,713
(1.06 %)		 18,602
(1.60 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 290
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 1,352,115
(12.17 %)		 388,630
(1.94 %)		 10,550,154
(33.42 %)		 0
(0 %)		 470,790
(2.03 %)		 113,023
(3.09 %)		 33,031
(0.84 %)
233 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1		 n/a n/a 12,226
(1.01 %)		 14,117
(1.42 %)		 n/a 43.77
(100.00 %)		 0
(0 %)		 361
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 1,202,345
(11.93 %)		 304,674
(1.45 %)		 9,752,924
(32.81 %)		 0
(0 %)		 314,037
(1.63 %)		 92,993
(2.75 %)		 20,902
(0.60 %)
234 tailed frog (A.truei hap1 2024)
GCA_040206685.1		 n/a n/a 14,490
(0.54 %)		 41,227
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 0
(0 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,455
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,662,323
(55.70 %)		 33
(0.00 %)		 5,614,148
(11.20 %)		 442,764
(6.61 %)		 73,225
(0.88 %)
235 tailed frog (A.truei hap2 2024)
GCA_040206675.1		 n/a n/a 14,405
(0.55 %)		 41,584
(1.88 %)		 n/a 44.89
(99.97 %)		 0
(0 %)		 6,023
(0.03 %)		 2,779
(100.00 %)		 1,770,524
(4.86 %)		 3,429,564
(18.94 %)		 15,718,939
(55.22 %)		 37
(0.00 %)		 5,484,397
(11.18 %)		 441,543
(6.61 %)		 73,027
(0.90 %)
236 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1		 n/a n/a 5,885
(0.35 %)		 24,457
(1.45 %)		 n/a 44.61
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(0.00 %)		 21,995
(100.00 %)		 553,415
(2.65 %)		 761,469
(4.53 %)		 6,043,769
(57.75 %)		 0
(0 %)		 1,079,506
(5.75 %)		 159,552
(5.54 %)		 20,611
(0.66 %)
237 thorny skate (primary hap CabotCenter1 v1.1 2020)
GCF_010909765.2		 45,968
(2.40 %)		 n/a 11,437
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 0
(0 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 888,163
(2.58 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 26
(0.00 %)		 1,634,606
(4.98 %)		 242,676
(4.73 %)		 31,030
(0.57 %)
238 three-toed box turtle
GCF_002925995.2		 35,807
(2.28 %)		 n/a 16,429
(1.00 %)		 26,460
(1.60 %)		 33,673
(1.75 %)		 44.26
(94.87 %)		 0
(0 %)		 53,635
(5.13 %)		 48,497
(100.00 %)		 2,007,347
(15.00 %)		 351,871
(0.86 %)		 12,385,245
(31.74 %)		 3,613
(0.05 %)		 161,525
(0.66 %)		 138,405
(2.40 %)		 33,334
(0.68 %)
239 tiger rattlesnake
GCF_016545835.1		 58,085
(4.72 %)		 n/a 13,597
(1.18 %)		 20,553
(2.03 %)		 n/a 39.88
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 4,228
(100.00 %)		 1,142,521
(7.92 %)		 739,406
(5.17 %)		 7,749,366
(42.91 %)		 0
(0 %)		 1,005,717
(4.66 %)		 45,588
(1.61 %)		 21,457
(0.80 %)
240 tiny Cayenne caecilian
GCF_901765095.1		 41,333
(1.27 %)		 n/a 14,569
(0.43 %)		 30,499
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 0
(0 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,835,191
(1.59 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,145
(52.43 %)		 5
(0.00 %)		 1,513,727
(3.00 %)		 414,828
(3.91 %)		 47,796
(0.38 %)
241 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1		 n/a n/a 12,197
(0.36 %)		 33,747
(1.15 %)		 n/a 43.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 23,871
(100.00 %)		 1,453,442
(1.57 %)		 1,309,062
(3.23 %)		 17,953,416
(52.19 %)		 0
(0 %)		 1,274,743
(3.12 %)		 326,452
(3.86 %)		 38,711
(0.39 %)
242 Townsend's dwarf sphaero (gecko TG3544 2022)
GCF_021028975.2		 41,266
(3.35 %)		 n/a 13,505
(1.05 %)		 19,294
(1.78 %)		 n/a 45.92
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,590
(0.01 %)		 1,742
(100.00 %)		 938,800
(8.81 %)		 627,869
(5.78 %)		 9,306,892
(38.57 %)		 33
(0.00 %)		 185,826
(0.70 %)		 91,919
(2.91 %)		 28,760
(0.80 %)
243 tropical clawed frog
GCF_000004195.4		 50,557
(4.71 %)		 n/a 14,679
(1.97 %)		 20,138
(2.76 %)		 52,028
(5.20 %)		 40.73
(99.80 %)		 0
(0 %)		 684
(0.20 %)		 167
(100.00 %)		 2,289,618
(34.82 %)		 708,472
(13.14 %)		 6,816,377
(41.73 %)		 4
(0.00 %)		 1,594,381
(7.39 %)		 52,647
(1.35 %)		 10,639
(0.28 %)
244 Tungara frog (aEngPut4 2024)
GCA_040894005.1		 n/a n/a 13,678
(0.88 %)		 29,720
(2.41 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 436
(0.00 %)		 961
(100.00 %)		 734,036
(2.54 %)		 1,217,326
(21.42 %)		 8,925,883
(52.53 %)		 6
(0.00 %)		 691,991
(2.19 %)		 211,590
(5.08 %)		 23,983
(0.47 %)
245 Tungara frog (aEngPut4 2024)
GCA_040894015.1		 n/a n/a 13,192
(0.88 %)		 29,242
(2.52 %)		 n/a 43.08
(100.00 %)		 0
(0 %)		 507
(0.00 %)		 819
(100.00 %)		 736,700
(2.60 %)		 1,165,044
(20.79 %)		 8,671,642
(52.60 %)		 3
(0.00 %)		 1,462,012
(5.01 %)		 207,553
(4.71 %)		 22,911
(0.46 %)
246 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1		 n/a n/a 13,456
(0.33 %)		 47,486
(1.34 %)		 n/a 44.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 27,233
(100.00 %)		 1,968,437
(1.91 %)		 1,716,136
(3.97 %)		 25,847,315
(43.76 %)		 0
(0 %)		 1,707,112
(2.84 %)		 523,234
(6.59 %)		 83,004
(0.82 %)
247 two-lined caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_901001135.2		 n/a n/a 14,449
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 0
(0 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,274,606
(1.91 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,400,957
(44.09 %)		 9
(0.01 %)		 2,193,249
(3.24 %)		 602,911
(6.66 %)		 94,934
(0.82 %)
248 valley gartersnake (HBS 135685 alternate hap 2023)
GCA_029207655.1		 n/a n/a 13,267
(1.12 %)		 21,667
(2.38 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 0
(0 %)		 403
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 1,344,601
(8.29 %)		 1,035,785
(7.00 %)		 8,436,473
(45.10 %)		 2
(0.00 %)		 993,545
(4.30 %)		 82,750
(2.69 %)		 24,526
(0.78 %)
249 valley gartersnake (HBS 135685 primary hap 2023)
GCA_029207665.1		 n/a n/a 12,430
(1.10 %)		 20,286
(2.36 %)		 n/a 41.12
(100.00 %)		 0
(0 %)		 446
(0.00 %)		 413
(100.00 %)		 1,299,478
(9.62 %)		 1,018,398
(8.41 %)		 7,790,758
(46.28 %)		 2
(0.00 %)		 1,063,878
(4.69 %)		 81,352
(2.71 %)		 23,653
(0.79 %)
250 viviparous/common lizard
GCF_011800845.1		 47,034
(5.17 %)		 n/a 14,311
(1.43 %)		 20,571
(2.35 %)		 32,442
(3.15 %)		 43.97
(97.04 %)		 0
(0 %)		 51,275
(2.97 %)		 25,252
(100.00 %)		 949,801
(5.41 %)		 498,048
(1.91 %)		 7,668,731
(34.21 %)		 726
(0.06 %)		 389,679
(2.77 %)		 88,947
(2.62 %)		 22,474
(0.81 %)
251 West African lungfish
GCF_019279795.1		 41,847
(0.19 %)		 n/a n/a n/a n/a 40.21
(97.52 %)		 0
(0 %)		 n/a 12,668
(100.00 %)		 16,163,808
(2.67 %)		 13,992,750
(5.30 %)		 n/a 26
(0.00 %)		 183,320
(0.03 %)		 502,751
(0.52 %)		 14,687
(0.01 %)
252 western fence lizard (IW3139 2022)
GCA_023333635.1		 n/a n/a 26,067
(1.12 %)		 46,795
(2.72 %)		 n/a 41.28
(100.00 %)		 0
(0 %)		 51
(0.00 %)		 1,771
(100.00 %)		 2,075,491
(6.60 %)		 1,603,401
(7.34 %)		 15,565,775
(40.61 %)		 0
(0 %)		 1,972,426
(5.50 %)		 184,134
(3.16 %)		 51,018
(0.93 %)
253 western fence lizard (IW3139 primary hap 2022)
GCA_023333645.1		 n/a n/a 24,835
(1.20 %)		 42,146
(2.78 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 51
(0.00 %)		 659
(100.00 %)		 1,842,497
(6.34 %)		 1,335,245
(6.14 %)		 15,103,683
(37.84 %)		 1
(0.00 %)		 1,360,948
(3.93 %)		 158,311
(2.92 %)		 45,330
(0.92 %)
254 western painted turtle (R12L10 2023)
GCF_011386835.1		 101,708
(5.23 %)		 n/a 15,332
(1.01 %)		 21,055
(1.60 %)		 n/a 44.88
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,270
(0.02 %)		 9,850
(100.00 %)		 4,178,966
(47.39 %)		 457,400
(2.29 %)		 11,325,467
(35.43 %)		 3
(0.00 %)		 758,530
(2.85 %)		 127,896
(2.94 %)		 35,401
(0.99 %)
255 western painted turtle (v5 RCT428 2020)
GCF_000241765.5		 64,782
(3.76 %)		 n/a 15,184
(1.08 %)		 21,463
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 184,311
(12.48 %)		 259,085
(87.52 %)		 4,079,404
(44.68 %)		 316,232
(0.93 %)		 11,848,718
(27.60 %)		 6,323
(0.15 %)		 313,464
(1.39 %)		 103,623
(1.74 %)		 31,959
(0.68 %)
256 western red-tailed skink (HBS 135693 alternate hap 2022)
GCA_026170595.1		 n/a n/a 14,019
(1.31 %)		 17,620
(2.13 %)		 n/a 45.76
(100.00 %)		 0
(0 %)		 15
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 862,216
(4.87 %)		 557,627
(3.17 %)		 8,002,559
(36.95 %)		 0
(0 %)		 377,483
(2.25 %)		 183,292
(4.74 %)		 24,223
(0.81 %)
257 western red-tailed skink (HBS 135693 primary hap 2022)
GCA_026170395.1		 n/a n/a 13,064
(1.32 %)		 16,407
(2.16 %)		 n/a 45.81
(100.00 %)		 0
(0 %)		 12
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 794,996
(4.86 %)		 514,021
(3.46 %)		 7,339,914
(37.02 %)		 1
(0.00 %)		 359,036
(2.32 %)		 168,847
(4.76 %)		 22,885
(0.83 %)
258 western spadefoot toad (hap1 HBS 135690 2023)
GCA_029215705.1		 n/a n/a 13,914
(1.72 %)		 27,496
(4.28 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 198
(0.00 %)		 677
(100.00 %)		 600,622
(4.04 %)		 783,931
(10.70 %)		 5,362,245
(41.82 %)		 0
(0 %)		 1,069,443
(8.38 %)		 100,334
(5.41 %)		 37,012
(1.96 %)
259 western spadefoot toad (hap2 HBS 135690 2023)
GCA_029215755.1		 n/a n/a 13,991
(1.72 %)		 27,685
(4.24 %)		 n/a 40.90
(100.00 %)		 190
(0.00 %)		 190
(0.00 %)		 541
(100.00 %)		 620,188
(5.00 %)		 800,411
(11.19 %)		 5,338,766
(42.25 %)		 1
(0.00 %)		 1,135,530
(8.81 %)		 101,603
(5.32 %)		 37,398
(1.95 %)
260 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1		 n/a n/a 13,101
(0.94 %)		 24,980
(1.75 %)		 n/a 41.02
(99.93 %)		 19
(0.07 %)		 19
(0.07 %)		 13,642
(99.93 %)		 1,410,212
(7.70 %)		 1,080,385
(4.56 %)		 9,112,844
(43.96 %)		 0
(0 %)		 886,410
(3.61 %)		 91,606
(2.53 %)		 24,845
(0.74 %)
261 western terrestrial garter snake (primary hap 2019)
GCF_009769535.1		 33,492
(3.42 %)		 n/a 13,074
(1.13 %)		 18,807
(1.93 %)		 31,660
(2.61 %)		 40.95
(97.72 %)		 0
(0 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,271,255
(7.73 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,396,200
(42.63 %)		 0
(0 %)		 801,068
(3.60 %)		 81,829
(2.47 %)		 23,152
(0.75 %)
262 whale shark (14 2022 Squalomix)
GCF_021869965.1		 42,052
(2.43 %)		 n/a 12,059
(0.52 %)		 18,460
(1.22 %)		 38,963
(1.77 %)		 41.51
(91.61 %)		 0
(0 %)		 95,208
(8.40 %)		 16,684
(100.00 %)		 402,747
(0.97 %)		 389,119
(1.49 %)		 15,298,245
(34.14 %)		 7,133
(0.13 %)		 472,644
(1.14 %)		 21,050
(0.30 %)		 10,334
(0.16 %)
263 whale shark (Ralph 2017 Emory U)
GCF_001642345.1		 31,857
(1.52 %)		 n/a 11,884
(0.43 %)		 28,482
(1.15 %)		 n/a 41.78
(100.00 %)		 0
(0 %)		 900,650
(0.03 %)		 57,334
(100.00 %)		 413,201
(1.16 %)		 426,542
(2.75 %)		 16,418,143
(38.85 %)		 315
(0.00 %)		 994,713
(2.86 %)		 35,192
(0.95 %)		 11,001
(0.17 %)
264 whitespotted bambooshark
GCF_004010195.1		 54,886
(2.03 %)		 n/a 12,065
(0.44 %)		 19,805
(1.08 %)		 n/a 42.06
(94.27 %)		 0
(0 %)		 156,554
(5.74 %)		 101,977
(100.00 %)		 559,291
(0.96 %)		 641,094
(3.66 %)		 19,566,199
(38.21 %)		 151
(0.01 %)		 1,627,864
(2.86 %)		 28,353
(0.49 %)		 12,756
(0.18 %)
265 yellow-bellied toad (maternal hap 2024)
GCA_964205295.1		 n/a n/a 16,029
(0.23 %)		 46,442
(0.92 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 130
(0.00 %)		 6,671
(0.01 %)		 4,887
(100.00 %)		 4,307,097
(3.52 %)		 7,435,469
(14.36 %)		 11,428
(99.99 %)		 51
(0.00 %)		 2,406,047
(1.89 %)		 423,705
(1.55 %)		 414,271
(1.46 %)
266 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205305.1		 n/a n/a 16,306
(0.23 %)		 45,587
(0.94 %)		 n/a 38.94
(99.99 %)		 6,811
(0.01 %)		 6,811
(0.01 %)		 10,308
(99.99 %)		 4,195,244
(3.50 %)		 7,201,985
(14.20 %)		 10,308
(99.99 %)		 64
(0.00 %)		 2,258,072
(1.80 %)		 412,512
(1.53 %)		 403,504
(1.46 %)
267 yellowpond turtle (Southern MM-2020 2021)
GCF_020497125.1		 65,526
(3.36 %)		 n/a 15,560
(0.99 %)		 21,233
(1.66 %)		 n/a 45.17
(96.24 %)		 0
(0 %)		 1,041
(3.76 %)		 595
(100.00 %)		 1,904,996
(14.25 %)		 468,779
(2.21 %)		 11,403,005
(33.86 %)		 13
(0.00 %)		 681,375
(2.23 %)		 135,646
(3.23 %)		 34,785
(0.79 %)
268 zebra shark (6-17 2022 Squalomix)
GCF_022316705.1		 48,447
(2.64 %)		 n/a 11,974
(0.57 %)		 15,459
(1.26 %)		 n/a 41.78
(93.81 %)		 0
(0 %)		 87,372
(6.20 %)		 1,266
(100.00 %)		 392,676
(0.96 %)		 348,115
(1.22 %)		 15,176,805
(32.93 %)		 151
(0.01 %)		 584,622
(1.29 %)		 20,647
(0.38 %)		 10,977
(0.18 %)
269 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1		 58,105
(2.61 %)		 n/a 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 0
(0 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 4
(0.00 %)		 2,946,119
(5.37 %)		 45,284
(1.67 %)		 14,105
(0.37 %)
270 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1		 n/a n/a 12,516
(0.44 %)		 17,465
(1.05 %)		 n/a 44.66
(99.65 %)		 1,203
(0.35 %)		 1,203
(0.35 %)		 2,136
(99.65 %)		 8,278,458
(59.68 %)		 903,434
(18.42 %)		 14,975,344
(48.25 %)		 2
(0.00 %)		 4,704,292
(7.66 %)		 48,378
(1.60 %)		 15,577
(0.38 %)
TOTALS:total assembly count 270

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