Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of other vertebrates only.

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base AGP
gap		 all
gaps		 assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 gap
Overlap		 tandem
Dups		 cpg
unmasked		 cpg
island
1 Abingdon island giant tortoise (Lonesome George 2018)
GCF_003597395.1		 50,402
(2.95 %)		 n/a 14,990
(1.01 %)		 19,565
(1.58 %)		 34,846
(1.54 %)		 43.71
(94.31 %)		 0
(0 %)		 63,430
(5.70 %)		 10,618
(100.00 %)		 1,553,204
(12.95 %)		 274,155
(1.11 %)		 12,664,684
(27.42 %)		 1,230
(0.10 %)		 193,101
(0.91 %)		 62,829
(1.59 %)		 28,727
(0.78 %)
2 Abingdon island giant tortoise (Lonesome George 2025)
GCF_003597395.2		 45,809
(3.10 %)		 n/a 14,668
(1.02 %)		 17,810
(1.52 %)		 n/a 43.77
(96.56 %)		 0
(0 %)		 39,154
(3.45 %)		 3,850
(100.00 %)		 1,222,218
(10.47 %)		 272,032
(1.07 %)		 12,528,821
(28.39 %)		 381
(0.03 %)		 199,341
(0.95 %)		 63,912
(1.75 %)		 28,613
(0.78 %)
3 adder (hap1 2024)
GCA_964194415.1		 n/a n/a 13,898
(1.18 %)		 20,039
(1.94 %)		 n/a 41.09
(99.99 %)		 1
(0.00 %)		 1,057
(0.01 %)		 480
(100.00 %)		 3,740,180
(50.44 %)		 792,731
(6.25 %)		 7,621,640
(45.94 %)		 0
(0 %)		 n/a 116,506
(4.68 %)		 23,244
(0.88 %)
4 adder (hap1.1 2024)
GCF_964194415.1		 38,942
(3.52 %)		 n/a 13,890
(1.18 %)		 20,037
(1.94 %)		 n/a 41.09
(99.99 %)		 1,057
(0.01 %)		 1,057
(0.01 %)		 1,535
(99.99 %)		 3,498,446
(50.64 %)		 792,729
(6.25 %)		 7,621,218
(45.94 %)		 5
(0.00 %)		 795,577
(4.29 %)		 116,506
(4.68 %)		 23,736
(0.91 %)
5 adder (hap2 2024)
GCA_964194405.1		 n/a n/a 12,344
(1.22 %)		 17,320
(1.89 %)		 n/a 41.00
(99.99 %)		 908
(0.01 %)		 908
(0.01 %)		 1,256
(99.99 %)		 3,221,370
(48.42 %)		 681,209
(5.18 %)		 6,734,253
(44.26 %)		 2
(0.00 %)		 n/a 99,366
(4.44 %)		 20,272
(0.89 %)
6 Adriatic sturgeon (hap1 F7M8 2026)
GCA_055691345.2		 n/a n/a 20,098
(1.33 %)		 37,942
(3.78 %)		 n/a 40.71
(99.97 %)		 299
(0.00 %)		 2,714
(0.03 %)		 2,382
(100.00 %)		 4,085,077
(45.81 %)		 1,195,562
(15.56 %)		 8,443,108
(46.99 %)		 5
(0.00 %)		 2,368,647
(10.04 %)		 78,180
(4.69 %)		 15,545
(0.35 %)
7 Adriatic sturgeon (hap2 F7M8 2026)
GCA_055691285.1		 n/a n/a 20,124
(1.49 %)		 36,410
(4.04 %)		 n/a 40.53
(99.97 %)		 3,327
(0.04 %)		 3,327
(0.04 %)		 5,697
(99.96 %)		 3,667,553
(45.24 %)		 1,048,673
(13.73 %)		 7,864,141
(44.81 %)		 2
(0.00 %)		 1,863,639
(8.88 %)		 69,458
(4.21 %)		 18,405
(0.99 %)
8 Adriatic sturgeon (hap3 F7M8 2026)
GCA_055691255.1		 n/a n/a 19,683
(1.55 %)		 35,408
(4.15 %)		 n/a 40.38
(99.96 %)		 3,793
(0.04 %)		 3,793
(0.04 %)		 5,674
(99.96 %)		 3,521,733
(44.95 %)		 947,487
(11.83 %)		 7,840,137
(43.35 %)		 4
(0.00 %)		 1,554,477
(7.76 %)		 65,008
(3.89 %)		 16,847
(0.92 %)
9 Adriatic sturgeon (hap4 F7M8 2026)
GCA_055691465.1		 n/a n/a 22,119
(1.53 %)		 41,296
(4.20 %)		 n/a 40.48
(99.96 %)		 4,779
(0.04 %)		 4,779
(0.04 %)		 8,217
(99.96 %)		 3,962,795
(44.66 %)		 1,085,414
(12.53 %)		 8,556,153
(43.56 %)		 6
(0.00 %)		 1,791,244
(8.22 %)		 72,066
(4.06 %)		 20,614
(1.01 %)
10 Aegean wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964252035.1		 60,400
(5.15 %)		 n/a 13,944
(1.37 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 0
(0 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 4,972,179
(51.37 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,007,850
(38.56 %)		 2
(0.00 %)		 527,173
(3.21 %)		 89,737
(2.87 %)		 20,021
(0.86 %)
11 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1		 n/a n/a 2,101
(1.18 %)		 5,350
(2.76 %)		 n/a 43.70
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3
(0.00 %)		 4,811
(100.00 %)		 103,373
(4.27 %)		 58,480
(3.90 %)		 895,535
(27.44 %)		 0
(0 %)		 59,204
(2.84 %)		 10,399
(2.84 %)		 3,340
(1.02 %)
12 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1		 57,514
(4.49 %)		 n/a 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 0
(0 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 2
(0.00 %)		 631,733
(3.50 %)		 94,745
(2.70 %)		 19,879
(0.76 %)
13 African bullfrog (1538 2019)
GCA_004786255.1		 n/a n/a 13,258
(1.31 %)		 15,309
(2.28 %)		 n/a 38.30
(89.51 %)		 0
(0 %)		 121,461
(10.52 %)		 5,411
(100.00 %)		 491,540
(1.54 %)		 401,074
(2.30 %)		 8,595,741
(27.94 %)		 3,986
(0.11 %)		 262,314
(1.70 %)		 14,854
(0.31 %)		 5,895
(0.13 %)
14 African bullfrog (2023)
GCF_032062135.1		 39,241
(5.22 %)		 n/a 13,325
(1.31 %)		 16,015
(2.29 %)		 n/a 38.30
(97.16 %)		 0
(0 %)		 40,350
(2.85 %)		 8,090
(100.00 %)		 490,197
(1.53 %)		 403,071
(2.55 %)		 8,536,428
(30.37 %)		 335
(0.01 %)		 271,401
(1.85 %)		 16,231
(0.36 %)		 5,949
(0.15 %)
15 African clawed frog (2021)
GCF_017654675.1		 80,899
(3.89 %)		 n/a 23,666
(1.59 %)		 32,527
(2.45 %)		 112,506
(5.21 %)		 39.34
(99.94 %)		 0
(0 %)		 667
(0.06 %)		 55
(100.00 %)		 4,269,095
(35.49 %)		 1,028,861
(6.46 %)		 14,246,823
(43.67 %)		 2
(0.00 %)		 1,679,057
(4.83 %)		 108,774
(1.25 %)		 16,813
(0.23 %)
16 alligator gar (hap1 2026)
GCA_055471065.1		 n/a n/a 13,707
(1.53 %)		 23,913
(3.61 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 0
(0 %)		 64
(0.00 %)		 356
(100.00 %)		 1,306,252
(35.92 %)		 239,317
(13.52 %)		 5,624,757
(36.27 %)		 1
(0.00 %)		 691,612
(5.24 %)		 50,268
(3.81 %)		 36,298
(1.61 %)
17 alligator gar (hap2 2026)
GCA_055504755.1		 n/a n/a 13,844
(1.62 %)		 23,436
(3.73 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 81
(0.00 %)		 234
(100.00 %)		 1,286,170
(34.39 %)		 223,198
(11.10 %)		 5,672,865
(34.23 %)		 2
(0.00 %)		 623,240
(4.87 %)		 49,009
(3.64 %)		 39,210
(2.02 %)
18 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1		 60,799
(4.33 %)		 n/a 14,383
(0.98 %)		 18,600
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 0
(0 %)		 161
(0.70 %)		 195
(100.00 %)		 3,322,624
(43.19 %)		 478,208
(1.77 %)		 12,316,424
(32.01 %)		 0
(0 %)		 334,854
(1.31 %)		 49,792
(2.45 %)		 29,504
(1.51 %)
19 American alligator (hap1 2026)
GCA_057657785.1		 n/a n/a 14,447
(0.97 %)		 18,772
(1.45 %)		 n/a 45.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 144
(0.00 %)		 310
(100.00 %)		 3,387,982
(42.95 %)		 644,426
(2.34 %)		 12,507,993
(32.71 %)		 1
(0.00 %)		 377,548
(1.43 %)		 49,984
(3.01 %)		 29,368
(2.11 %)
20 American alligator (hap2 2026)
GCA_057657805.1		 n/a n/a 14,449
(0.98 %)		 18,986
(1.47 %)		 n/a 44.99
(100.00 %)		 0
(0 %)		 139
(0.00 %)		 136
(100.00 %)		 3,389,572
(43.14 %)		 480,395
(1.63 %)		 12,514,775
(32.21 %)		 1
(0.00 %)		 309,599
(1.22 %)		 50,383
(2.34 %)		 29,845
(1.49 %)
21 American alligator (KSC_2009_1 2016)
GCF_000281125.3		 51,013
(3.53 %)		 n/a 14,424
(1.06 %)		 19,690
(1.51 %)		 n/a 44.30
(97.86 %)		 0
(0 %)		 236,641
(2.19 %)		 7,094
(100.00 %)		 2,842,761
(36.86 %)		 291,584
(0.69 %)		 12,464,318
(27.91 %)		 1,962
(0.01 %)		 63,947
(0.23 %)		 35,531
(1.28 %)		 26,988
(0.99 %)
22 American bullfrog (2022-GZ 2024)
GCF_042186555.1		 56,135
(1.53 %)		 n/a 14,245
(0.30 %)		 40,001
(1.08 %)		 n/a 43.44
(99.96 %)		 4,770
(0.04 %)		 4,773
(0.04 %)		 5,033
(99.96 %)		 2,922,485
(2.38 %)		 4,625,082
(10.64 %)		 27,250,040
(58.60 %)		 46
(0.00 %)		 n/a 429,691
(2.65 %)		 49,673
(0.28 %)
23 American bullfrog (primary hap 2024)
GCA_037953035.1		 n/a n/a 14,830
(0.29 %)		 47,571
(1.22 %)		 n/a 43.44
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 4,071
(100.00 %)		 3,008,729
(2.34 %)		 4,764,040
(10.52 %)		 28,440,050
(58.60 %)		 0
(0 %)		 6,524,240
(7.19 %)		 446,366
(2.65 %)		 51,797
(0.28 %)
24 American eel (EN2019 2024)
GCF_018555375.3		 67,474
(10.58 %)		 n/a 17,131
(2.21 %)		 34,322
(5.40 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 0
(0 %)		 985
(0.01 %)		 967
(100.00 %)		 766,696
(5.03 %)		 756,877
(7.81 %)		 5,766,995
(27.42 %)		 2
(0.00 %)		 698,797
(4.41 %)		 133,933
(8.63 %)		 97,367
(4.31 %)
25 Andalusian wall lizard (hap1.1 2025)
GCF_965113315.1		 64,111
(5.17 %)		 n/a 14,387
(1.31 %)		 20,338
(2.18 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 0
(0 %)		 949
(0.01 %)		 285
(100.00 %)		 5,139,265
(54.13 %)		 524,077
(6.62 %)		 7,052,308
(41.37 %)		 8
(0.00 %)		 721,762
(3.83 %)		 109,507
(3.61 %)		 21,264
(0.84 %)
26 angelshark (IRGN 9GIWDBWNYT 2023)
GCA_031763465.1		 n/a n/a 5,514
(0.36 %)		 13,241
(0.85 %)		 n/a 44.21
(86.22 %)		 226,036
(13.68 %)		 226,036
(13.68 %)		 1,378,695
(86.32 %)		 204,591
(1.55 %)		 649,587
(7.45 %)		 7,948,984
(32.06 %)		 68
(0.00 %)		 n/a 83,350
(2.20 %)		 16,089
(0.39 %)
27 Arctic lamprey (IMCB_JLM_01 2021)
GCA_018977245.1		 n/a n/a 7,773
(0.68 %)		 37,576
(3.58 %)		 n/a 48.75
(99.99 %)		 1,157
(0.01 %)		 578,345
(0.06 %)		 4,710
(99.99 %)		 3,940,419
(60.65 %)		 1,287,992
(15.83 %)		 6,017,598
(47.20 %)		 501
(0.00 %)		 2,086,168
(10.49 %)		 172,876
(42.56 %)		 159,071
(7.14 %)
28 Argentine snake-necked turtle (alternate hap 2025)
GCA_049999975.1		 n/a n/a 14,806
(1.27 %)		 19,639
(1.89 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 624
(100.00 %)		 3,247,149
(41.23 %)		 168,104
(0.62 %)		 10,457,354
(26.26 %)		 0
(0 %)		 201,885
(1.04 %)		 47,683
(1.86 %)		 30,179
(1.13 %)
29 Argentine snake-necked turtle (primary hap 2025)
GCA_049999965.1		 n/a n/a 14,773
(1.27 %)		 19,240
(1.84 %)		 n/a 42.94
(99.98 %)		 1
(0.00 %)		 114
(0.02 %)		 40
(100.00 %)		 3,245,307
(41.27 %)		 167,125
(0.63 %)		 10,246,975
(25.86 %)		 0
(0 %)		 209,727
(1.09 %)		 47,799
(1.87 %)		 30,284
(1.14 %)
30 Asian narrow-headed softshell turtle (alternate hap 2025)
GCA_052575425.1		 n/a n/a 449
(0.60 %)		 896
(1.17 %)		 n/a 44.87
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 940
(100.00 %)		 181,438
(48.98 %)		 15,458
(1.40 %)		 479,760
(25.10 %)		 0
(0 %)		 18,354
(2.23 %)		 3,011
(2.57 %)		 1,308
(1.20 %)
31 Asian narrow-headed softshell turtle (primary hap 2025)
GCA_052575445.1		 n/a n/a 14,806
(1.06 %)		 19,069
(1.59 %)		 n/a 45.16
(100.00 %)		 0
(0 %)		 25
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 3,923,051
(46.22 %)		 376,799
(1.35 %)		 11,484,179
(34.72 %)		 0
(0 %)		 271,513
(1.05 %)		 77,209
(2.05 %)		 41,430
(1.24 %)
32 Asian spadefoot toad (hap1 2026)
GCA_060175755.1		 n/a n/a 13,691
(0.76 %)		 26,981
(1.84 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 519
(0.00 %)		 183
(100.00 %)		 4,957,171
(42.46 %)		 1,021,404
(10.29 %)		 11,309,051
(52.32 %)		 16
(0.00 %)		 1,747,774
(5.42 %)		 218,366
(4.93 %)		 37,490
(0.86 %)
33 Asian vine snake (Xishuangbanna 2023)
GCF_028640845.1		 47,555
(4.15 %)		 n/a 13,005
(1.05 %)		 17,560
(1.65 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 0
(0 %)		 331
(0.00 %)		 748
(100.00 %)		 1,484,082
(7.70 %)		 1,033,385
(5.12 %)		 8,266,544
(48.89 %)		 0
(0 %)		 1,020,982
(6.70 %)		 105,815
(4.08 %)		 21,180
(0.68 %)
34 Asiatic toad (SCDJY-AF-19 2020)
GCF_014858855.1		 42,994
(1.39 %)		 n/a 14,061
(0.43 %)		 43,525
(1.76 %)		 36,577
(1.09 %)		 44.37
(98.21 %)		 0
(0 %)		 3,874
(1.79 %)		 748
(100.00 %)		 1,577,809
(1.79 %)		 2,975,473
(12.67 %)		 18,834,930
(58.75 %)		 12
(0.00 %)		 4,966,158
(8.81 %)		 415,605
(4.12 %)		 69,684
(0.72 %)
35 Atlantic hagfish (alternate hap 2024)
GCA_964187825.1		 n/a n/a 6,253
(0.19 %)		 56,915
(3.08 %)		 n/a 44.52
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 24,878
(100.00 %)		 1,607,558
(3.68 %)		 2,446,041
(23.93 %)		 7,370,810
(72.27 %)		 0
(0 %)		 5,137,223
(14.48 %)		 307,758
(13.12 %)		 47,226
(0.88 %)
36 Atlantic hagfish (MG_SS 2024)
GCF_040869285.1		 46,374
(1.72 %)		 n/a 7,719
(0.19 %)		 59,788
(2.68 %)		 n/a 44.23
(99.94 %)		 0
(0 %)		 4,876
(0.06 %)		 4,270
(100.00 %)		 2,094,143
(3.54 %)		 3,212,025
(29.83 %)		 8,998,320
(75.15 %)		 43
(0.00 %)		 n/a 408,391
(12.65 %)		 60,671
(0.82 %)
37 Atlantic hagfish (primary hap 2024 genbank)
GCA_964187855.1		 n/a n/a 6,662
(0.20 %)		 45,484
(2.63 %)		 n/a 44.32
(99.97 %)		 0
(0 %)		 4,412
(0.03 %)		 4,004
(100.00 %)		 1,698,449
(3.61 %)		 2,644,659
(27.70 %)		 7,620,145
(74.29 %)		 43
(0.00 %)		 n/a 331,404
(12.87 %)		 49,019
(0.82 %)
38 Atlantic hagfish (primary hap 2024 refseq)
GCF_964187855.1		 47,605
(1.95 %)		 n/a 6,660
(0.20 %)		 45,489
(2.63 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 4,412
(0.03 %)		 4,003
(100.00 %)		 1,712,039
(3.61 %)		 2,644,653
(27.70 %)		 7,619,436
(74.29 %)		 43
(0.00 %)		 1,415,278
(3.30 %)		 331,404
(12.87 %)		 49,019
(0.82 %)
39 Atlantic ridley (rLepKem1 hap1 2025)
GCA_965140285.1		 n/a 26,407
(1.93 %)		 14,835
(1.03 %)		 17,938
(1.53 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 219
(0.00 %)		 273
(100.00 %)		 1,346,135
(12.58 %)		 326,849
(2.26 %)		 10,620,784
(34.46 %)		 0
(0 %)		 636,273
(2.45 %)		 46,936
(1.44 %)		 25,019
(0.62 %)
40 Atlantic ridley (rLepKem1 hap2 2025 refseq)
GCF_965140265.1		 67,187
(3.84 %)		 n/a 14,601
(1.02 %)		 17,367
(1.50 %)		 n/a 44.08
(100.00 %)		 245
(0.00 %)		 245
(0.00 %)		 332
(100.00 %)		 1,335,525
(12.58 %)		 314,640
(2.13 %)		 10,517,469
(34.27 %)		 2
(0.00 %)		 609,926
(2.40 %)		 45,940
(1.37 %)		 24,119
(0.60 %)
41 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1		 60,922
(2.51 %)		 n/a 12,544
(0.38 %)		 28,250
(1.22 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,989
(100.00 %)		 8,579,099
(49.81 %)		 831,222
(15.75 %)		 21,718,178
(51.79 %)		 9
(0.00 %)		 4,445,369
(7.00 %)		 105,821
(2.42 %)		 35,197
(0.42 %)
42 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1		 n/a n/a 11,960
(0.40 %)		 25,618
(1.25 %)		 n/a 42.94
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,633
(0.01 %)		 1,412
(100.00 %)		 7,453,535
(49.31 %)		 686,063
(13.00 %)		 19,985,605
(50.32 %)		 8
(0.00 %)		 3,309,683
(5.86 %)		 86,138
(2.16 %)		 30,350
(0.41 %)
43 Australian saltwater crocodile
GCF_001723895.1		 34,103
(2.80 %)		 n/a 12,481
(1.05 %)		 13,920
(1.38 %)		 n/a 43.90
(94.72 %)		 0
(0 %)		 97,039
(5.30 %)		 70
(100.00 %)		 2,480,154
(36.88 %)		 215,190
(0.56 %)		 11,196,176
(26.22 %)		 1,753
(0.04 %)		 50,116
(0.79 %)		 26,647
(0.98 %)		 20,860
(0.80 %)
44 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3		 n/a n/a 16,280
(0.07 %)		 186,628
(1.11 %)		 n/a 46.01
(99.99 %)		 0
(0 %)		 184,422
(0.01 %)		 27,157
(100.00 %)		 28,291,633
(68.19 %)		 7,299,053
(4.96 %)		 134,345,177
(46.63 %)		 189
(0.00 %)		 n/a 2,388,998
(5.24 %)		 429,355
(0.66 %)
45 axolotl (Mex_15411 2024 refseq)
GCF_040938575.1		 96,841
(0.40 %)		 n/a 18,564
(0.07 %)		 184,527
(1.17 %)		 n/a 46.34
(100.00 %)		 0
(0 %)		 2,095
(0.00 %)		 221
(100.00 %)		 27,951,551
(67.11 %)		 8,561,025
(9.70 %)		 126,532,504
(50.15 %)		 25
(0.00 %)		 1,448,410
(0.36 %)		 2,452,305
(5.31 %)		 417,603
(0.63 %)
46 barred grass snake (hap1.1 2024)
GCF_964273705.1		 43,483
(3.75 %)		 n/a 13,680
(1.11 %)		 19,683
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,010
(0.02 %)		 487
(100.00 %)		 4,187,944
(53.38 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,184
(46.16 %)		 10
(0.00 %)		 746,296
(3.32 %)		 117,174
(4.31 %)		 21,520
(0.75 %)
47 basking shark (hap1.1 2024)
GCF_964194155.1		 49,591
(1.78 %)		 n/a 13,754
(0.41 %)		 22,698
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,087
(100.00 %)		 6,782,578
(65.71 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,697,546
(51.34 %)		 20
(0.00 %)		 5,335,601
(7.60 %)		 113,759
(1.90 %)		 28,457
(0.65 %)
48 basking shark (sCetMax3.hap1.1 2024)
GCA_964194155.1		 n/a n/a 13,757
(0.41 %)		 22,690
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,088
(100.00 %)		 6,693,687
(65.70 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,698,294
(51.34 %)		 20
(0.00 %)		 5,335,615
(7.60 %)		 113,759
(1.90 %)		 28,476
(0.65 %)
49 basking shark (sCetMax3.hap2.1 2024)
GCA_964194165.1		 n/a n/a 13,515
(0.42 %)		 21,374
(1.06 %)		 n/a 44.47
(99.99 %)		 2,740
(0.01 %)		 2,740
(0.01 %)		 6,569
(99.99 %)		 6,483,403
(66.87 %)		 1,041,828
(9.99 %)		 21,142,745
(50.24 %)		 31
(0.00 %)		 4,014,149
(6.09 %)		 107,555
(1.88 %)		 26,392
(0.67 %)
50 Bellinger river turtle (v2 BRST_UC0152H_USYD 2025)
GCA_040894355.2		 n/a n/a 14,713
(1.14 %)		 18,959
(1.77 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 77
(0.00 %)		 110
(100.00 %)		 1,130,167
(11.21 %)		 213,193
(1.80 %)		 11,049,207
(26.48 %)		 1
(0.00 %)		 311,436
(1.26 %)		 53,921
(2.09 %)		 34,762
(1.11 %)
51 beluga (Lower Danube River Hh-F2 2024)
GCA_036884735.1		 n/a 37,075
(3.19 %)		 24,635
(1.65 %)		 38,296
(3.71 %)		 n/a 39.96
(99.90 %)		 0
(0 %)		 3,967
(0.10 %)		 1,383
(100.00 %)		 1,315,442
(3.30 %)		 1,268,850
(7.99 %)		 10,595,211
(41.03 %)		 4
(0.00 %)		 1,845,276
(6.54 %)		 65,207
(2.45 %)		 19,259
(0.43 %)
52 big-headed turtle (DO16091913 2018)
GCA_003942145.1		 n/a 21,529
(29.91 %)		 15,845
(1.05 %)		 56,185
(2.12 %)		 n/a 44.63
(100.70 %)		 109,876
(1.58 %)		 109,876
(1.58 %)		 469,569
(98.42 %)		 4,392,283
(44.70 %)		 468,071
(2.04 %)		 12,128,150
(32.03 %)		 2,775
(0.14 %)		 n/a 156,196
(2.96 %)		 78,187
(1.59 %)
53 big-headed turtle (hap1 2026)
GCA_057946115.1		 n/a n/a 14,847
(1.07 %)		 19,128
(1.60 %)		 n/a 44.64
(100.00 %)		 0
(0 %)		 187
(0.00 %)		 114
(100.00 %)		 4,043,109
(46.63 %)		 482,481
(2.68 %)		 10,707,787
(34.65 %)		 5
(0.00 %)		 569,983
(2.25 %)		 112,432
(2.96 %)		 32,137
(1.09 %)
54 big-headed turtle (hap2 2026)
GCA_057946265.1		 n/a n/a 14,614
(1.05 %)		 18,669
(1.58 %)		 n/a 44.54
(100.00 %)		 0
(0 %)		 173
(0.00 %)		 81
(100.00 %)		 4,114,841
(46.68 %)		 464,722
(2.78 %)		 10,645,107
(34.66 %)		 0
(0 %)		 577,610
(2.27 %)		 110,978
(2.80 %)		 30,376
(1.00 %)
55 Blainville's horned lizard (alternate hap 2022)
GCA_026167975.1		 n/a n/a 12,696
(0.93 %)		 14,818
(1.50 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 64
(0.00 %)		 52
(100.00 %)		 1,468,805
(6.73 %)		 739,796
(3.28 %)		 10,900,584
(40.56 %)		 1
(0.00 %)		 625,575
(2.40 %)		 76,786
(1.60 %)		 9,543
(0.21 %)
56 Blainville's horned lizard (primary hap 2022)
GCA_026167985.1		 n/a n/a 13,944
(0.92 %)		 16,009
(1.45 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 78
(100.00 %)		 1,636,825
(6.67 %)		 826,053
(3.24 %)		 12,398,166
(40.90 %)		 0
(0 %)		 690,267
(2.36 %)		 86,825
(1.61 %)		 10,396
(0.20 %)
57 blonde ray (alternate hap 2023)
GCA_963513955.1		 n/a n/a 11,554
(0.52 %)		 31,983
(1.58 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 10,683
(100.00 %)		 8,320,120
(69.63 %)		 991,438
(7.00 %)		 11,337,728
(57.98 %)		 0
(0 %)		 2,099,308
(5.51 %)		 262,962
(6.35 %)		 21,206
(0.44 %)
58 blonde ray (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514005.1		 n/a n/a 11,900
(0.54 %)		 27,568
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,647
(100.00 %)		 8,972,805
(66.20 %)		 1,061,811
(8.11 %)		 11,599,498
(58.72 %)		 6
(0.00 %)		 2,430,580
(6.13 %)		 278,499
(6.42 %)		 59,922
(2.12 %)
59 blonde ray (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514005.1		 40,007
(2.48 %)		 n/a 11,887
(0.54 %)		 27,557
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,646
(100.00 %)		 8,552,615
(70.14 %)		 1,061,810
(8.11 %)		 11,598,911
(58.72 %)		 6
(0.00 %)		 1,999,113
(5.15 %)		 278,499
(6.42 %)		 22,977
(0.46 %)
60 Bocage's wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964188305.1		 64,048
(5.17 %)		 n/a 14,155
(1.28 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,005
(0.01 %)		 507
(100.00 %)		 5,192,766
(54.55 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,204
(41.39 %)		 10
(0.00 %)		 772,114
(4.54 %)		 119,467
(4.32 %)		 21,499
(0.85 %)
61 brilliant-thighed poison frog (Ecuador 8001 2023)
GCA_033576535.1		 n/a n/a 13,834
(0.34 %)		 48,455
(1.58 %)		 n/a 45.66
(99.96 %)		 21,710
(0.04 %)		 21,710
(0.04 %)		 28,356
(99.96 %)		 9,462,827
(38.75 %)		 4,882,500
(15.53 %)		 25,372,114
(54.97 %)		 37
(0.00 %)		 2,433,101
(2.74 %)		 734,430
(7.27 %)		 78,640
(0.66 %)
62 brown anole (Geneva1000 2022 refseq)
GCF_025583915.1		 38,099
(3.25 %)		 n/a 14,028
(1.05 %)		 19,932
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 114,440
(1.64 %)		 118,178
(98.36 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 261
(0.01 %)		 1,132,418
(4.31 %)		 46,291
(1.18 %)		 17,324
(0.40 %)
63 brown anole (maternal hap 2024 genbank)
GCA_037176765.1		 n/a n/a 14,463
(1.05 %)		 20,625
(1.90 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 0
(0 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 0
(0 %)		 1,512,000
(5.23 %)		 44,738
(1.08 %)		 17,370
(0.40 %)
64 brown anole (maternal hap 2024 refseq)
GCF_037176765.1		 41,782
(3.73 %)		 n/a 14,463
(1.05 %)		 20,186
(1.84 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 0
(0 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 0
(0 %)		 1,512,000
(5.23 %)		 44,738
(1.08 %)		 17,370
(0.40 %)
65 brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1		 n/a n/a 12,479
(1.04 %)		 16,886
(1.81 %)		 n/a 41.00
(100.00 %)		 0
(0 %)		 172
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 1,249,920
(6.94 %)		 941,401
(5.42 %)		 8,402,482
(44.77 %)		 1
(0.00 %)		 1,126,727
(4.44 %)		 37,299
(1.02 %)		 14,196
(0.37 %)
66 brown hagfish (PATA_SCHIZ_1 2024)
GCA_035128595.1		 n/a n/a 6,299
(0.25 %)		 35,377
(2.04 %)		 n/a 43.49
(94.65 %)		 58,226
(0.53 %)		 706,165
(5.46 %)		 64,533
(99.47 %)		 1,452,558
(4.27 %)		 1,950,334
(8.89 %)		 14,106,206
(47.44 %)		 1,221
(0.01 %)		 4,052,105
(15.46 %)		 224,843
(9.74 %)		 69,320
(1.51 %)
67 brown house snake (FMNH 251328 2023)
GCA_027560395.1		 n/a n/a 11,753
(1.00 %)		 29,468
(1.83 %)		 n/a 40.67
(98.13 %)		 169,987
(1.84 %)		 169,987
(1.84 %)		 753,655
(98.16 %)		 1,167,225
(5.67 %)		 768,909
(2.88 %)		 8,825,109
(34.93 %)		 2,464
(0.05 %)		 n/a 53,035
(1.80 %)		 31,929
(1.11 %)
68 brown spotted pit viper
GCF_001527695.2		 24,336
(2.63 %)		 n/a 14,045
(1.20 %)		 27,133
(2.20 %)		 n/a 39.97
(92.15 %)		 115,571
(7.86 %)		 115,571
(7.86 %)		 167,851
(92.14 %)		 1,227,118
(8.97 %)		 819,247
(3.70 %)		 8,328,674
(35.16 %)		 11,808
(0.68 %)		 791,775
(4.53 %)		 68,858
(2.06 %)		 27,809
(0.90 %)
69 brownbanded bambooshark (Juve2018m 2025)
GCF_047496795.1		 60,935
(1.72 %)		 n/a 12,494
(0.29 %)		 21,756
(0.89 %)		 n/a 44.10
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,891
(0.01 %)		 1,989
(100.00 %)		 1,123,600
(4.34 %)		 1,904,298
(18.02 %)		 24,059,272
(54.04 %)		 4
(0.00 %)		 4,685,329
(5.17 %)		 56,396
(1.81 %)		 13,464
(0.13 %)
70 Burmese python
GCF_000186305.1		 35,676
(4.16 %)		 n/a 13,718
(1.31 %)		 20,498
(2.06 %)		 n/a 39.61
(96.54 %)		 235,132
(3.52 %)		 235,132
(3.52 %)		 274,244
(96.48 %)		 727,874
(3.19 %)		 409,033
(2.06 %)		 8,318,382
(25.30 %)		 21,222
(0.52 %)		 167,510
(1.87 %)		 29,212
(1.10 %)		 21,586
(0.80 %)
71 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 alternate hap 2022)
GCA_022578425.1		 n/a n/a 13,973
(0.70 %)		 47,231
(2.71 %)		 n/a 41.26
(99.97 %)		 5,955
(0.03 %)		 5,955
(0.03 %)		 60,824
(99.97 %)		 1,793,416
(10.43 %)		 1,374,078
(8.30 %)		 10,043,407
(46.03 %)		 154
(0.01 %)		 1,546,579
(5.96 %)		 89,437
(4.63 %)		 31,854
(0.83 %)
72 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 primary hap 2022)
GCA_022577455.1		 n/a n/a 13,386
(1.04 %)		 21,767
(2.35 %)		 n/a 40.56
(100.00 %)		 0
(0 %)		 256
(0.00 %)		 140
(100.00 %)		 1,354,500
(9.93 %)		 998,712
(8.21 %)		 8,504,468
(46.70 %)		 1
(0.00 %)		 1,050,266
(4.14 %)		 78,768
(3.37 %)		 28,516
(0.88 %)
73 Cape dwarf chameleon (Western Cape Province JTBG20231 hap1 2025)
GCA_047715975.2		 n/a n/a 13,605
(0.80 %)		 18,926
(1.32 %)		 n/a 44.97
(100.00 %)		 0
(0 %)		 109
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 3,492,668
(30.18 %)		 891,233
(5.94 %)		 9,004,935
(56.47 %)		 1
(0.00 %)		 793,804
(3.28 %)		 245,845
(10.83 %)		 19,287
(0.34 %)
74 Cape dwarf chameleon (Western Cape Province JTBG20231 hap2 2025)
GCA_047715955.2		 n/a n/a 13,631
(0.79 %)		 18,934
(1.32 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 0
(0 %)		 120
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 3,500,548
(30.07 %)		 933,676
(6.26 %)		 9,009,528
(56.65 %)		 1
(0.00 %)		 1,759,246
(6.36 %)		 246,553
(10.79 %)		 19,416
(0.34 %)
75 Caribbean electric ray (hap1 2024 refseq)
GCF_036971445.1		 77,919
(2.56 %)		 n/a 11,965
(0.44 %)		 20,833
(1.25 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,443
(0.01 %)		 595
(100.00 %)		 4,902,644
(34.96 %)		 1,040,891
(17.82 %)		 16,403,243
(54.79 %)		 2
(0.00 %)		 1,425,690
(2.88 %)		 113,936
(1.69 %)		 22,323
(0.31 %)
76 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1		 n/a n/a 11,692
(0.46 %)		 19,961
(1.22 %)		 n/a 42.79
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,507
(0.01 %)		 445
(100.00 %)		 4,781,152
(36.16 %)		 876,063
(14.65 %)		 16,060,040
(52.49 %)		 7
(0.00 %)		 2,994,548
(6.81 %)		 101,598
(1.64 %)		 21,263
(0.33 %)
77 Catalonian wall lizard (hap1.1 2025)
GCF_965112155.1		 76,765
(6.15 %)		 n/a 14,333
(1.34 %)		 20,157
(2.24 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 0
(0 %)		 921
(0.01 %)		 290
(100.00 %)		 5,086,552
(52.93 %)		 539,525
(6.79 %)		 7,116,595
(40.00 %)		 2
(0.00 %)		 754,520
(4.30 %)		 97,685
(3.45 %)		 21,686
(0.86 %)
78 central bearded dragon (Pit_001003342236 2025 genbank)
GCA_051106095.1		 n/a n/a 13,804
(1.14 %)		 17,976
(1.89 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 26
(0.00 %)		 91
(100.00 %)		 940,145
(4.00 %)		 525,574
(2.47 %)		 8,960,484
(34.90 %)		 1
(0.00 %)		 343,104
(1.95 %)		 60,425
(2.00 %)		 24,527
(0.77 %)
79 central bearded dragon (Pit_001003342236 2025 refseq)
GCF_051106095.1		 67,761
(7.72 %)		 n/a 13,968
(1.18 %)		 17,955
(1.90 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 0
(0 %)		 26
(0.00 %)		 90
(100.00 %)		 3,462,868
(44.39 %)		 525,574
(2.47 %)		 8,960,488
(34.90 %)		 1
(0.00 %)		 343,105
(1.95 %)		 60,425
(2.00 %)		 27,249
(1.01 %)
80 central bearded dragon (v1 2017)
GCF_900067755.1		 42,304
(3.53 %)		 n/a 13,856
(1.19 %)		 17,956
(1.96 %)		 n/a 41.81
(96.03 %)		 0
(0 %)		 90,546
(3.99 %)		 13,749
(100.00 %)		 821,868
(3.44 %)		 570,849
(3.46 %)		 9,494,309
(29.78 %)		 161
(0.03 %)		 346,792
(2.81 %)		 48,137
(1.31 %)		 23,199
(0.67 %)
81 central bearded dragon (v2 2025)
GCF_047335585.1		 55,907
(5.04 %)		 n/a 13,840
(1.12 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 26
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 985,251
(3.91 %)		 586,669
(2.40 %)		 9,004,514
(35.92 %)		 0
(0 %)		 346,099
(2.04 %)		 67,220
(2.06 %)		 24,883
(0.78 %)
82 Chile mountains false toad (hap1 2026)
GCA_060712405.1		 n/a n/a 14,336
(0.42 %)		 27,367
(1.07 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 2,470
(0.01 %)		 823
(100.00 %)		 9,080,556
(47.42 %)		 3,920,854
(20.34 %)		 16,577,137
(63.23 %)		 13
(0.00 %)		 837,442
(1.28 %)		 220,660
(2.16 %)		 22,457
(0.21 %)
83 Chinese alligator
GCF_000455745.1		 49,884
(3.04 %)		 n/a 14,431
(1.00 %)		 15,854
(1.43 %)		 n/a 44.49
(96.86 %)		 167,965
(3.17 %)		 167,965
(3.17 %)		 177,282
(96.83 %)		 2,919,372
(38.76 %)		 346,310
(1.06 %)		 12,332,417
(29.19 %)		 95
(0.01 %)		 116,160
(0.98 %)		 46,638
(1.19 %)		 26,168
(0.73 %)
84 Chinese crocodile lizard (Guangxi GXDGS128 2021)
GCA_021292165.1		 n/a n/a 15,365
(1.01 %)		 20,233
(1.64 %)		 n/a 44.88
(100.00 %)		 0
(0 %)		 852
(0.00 %)		 1,553
(100.00 %)		 2,058,732
(7.85 %)		 845,208
(2.04 %)		 11,639,209
(43.21 %)		 5
(0.00 %)		 745,074
(3.17 %)		 116,459
(3.04 %)		 33,234
(0.76 %)
85 Chinese soft-shelled turtle (Daiwa-1 2012)
GCF_000230535.1		 45,454
(3.08 %)		 n/a 13,715
(0.96 %)		 16,798
(1.50 %)		 n/a 44.42
(95.68 %)		 185,476
(4.35 %)		 185,476
(4.35 %)		 205,380
(95.65 %)		 1,193,608
(10.92 %)		 455,163
(3.06 %)		 11,234,886
(32.34 %)		 126
(0.01 %)		 282,804
(2.81 %)		 95,997
(2.06 %)		 44,456
(1.00 %)
86 Chinese soft-shelled turtle (JC-2024 2025)
GCF_049634645.1		 71,700
(4.67 %)		 n/a 14,353
(0.98 %)		 21,113
(1.70 %)		 n/a 45.70
(100.00 %)		 0
(0 %)		 57
(0.00 %)		 276
(100.00 %)		 1,130,433
(10.15 %)		 509,375
(2.85 %)		 10,803,789
(36.98 %)		 0
(0 %)		 683,886
(2.46 %)		 142,416
(4.34 %)		 57,853
(1.75 %)
87 cloudy catshark (Kashiwa2021f 2025)
GCF_047496885.1		 69,529
(1.56 %)		 n/a 13,335
(0.25 %)		 28,473
(0.76 %)		 n/a 49.26
(99.99 %)		 0
(0 %)		 4,654
(0.01 %)		 2,007
(100.00 %)		 1,668,127
(2.89 %)		 2,316,011
(21.50 %)		 22,209,447
(67.48 %)		 20
(0.00 %)		 9,556,969
(9.03 %)		 706,094
(13.30 %)		 37,469
(0.24 %)
88 coelacanth
GCF_000225785.1		 40,763
(2.63 %)		 n/a 13,493
(0.78 %)		 17,640
(1.50 %)		 n/a 41.15
(76.37 %)		 269,010
(23.67 %)		 269,010
(23.67 %)		 291,829
(76.33 %)		 2,026,776
(9.13 %)		 571,917
(1.19 %)		 14,630,157
(34.87 %)		 2,038
(0.03 %)		 261,629
(0.61 %)		 42,857
(0.54 %)		 8,573
(0.11 %)
89 coelacanth (alternate hap 2024)
GCA_037215105.1		 n/a n/a 6,557
(0.42 %)		 33,169
(3.43 %)		 n/a 42.50
(99.99 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 34,012
(100.00 %)		 3,932,420
(65.13 %)		 507,198
(3.35 %)		 6,831,314
(53.31 %)		 0
(0 %)		 569,290
(4.38 %)		 66,510
(2.53 %)		 12,920
(0.39 %)
90 coelacanth (fLatCha1 primary hap 2024)
GCF_037176945.1		 40,046
(2.75 %)		 n/a 13,820
(0.63 %)		 17,285
(1.40 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 0
(0 %)		 154
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 2,064,326
(2.75 %)		 1,047,267
(3.01 %)		 15,613,479
(54.45 %)		 1
(0.00 %)		 1,146,128
(3.27 %)		 140,027
(2.34 %)		 11,143
(0.16 %)
91 coelacanth (primary hap 2024)
GCA_037176945.1		 n/a n/a 14,050
(0.65 %)		 28,429
(2.77 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 0
(0 %)		 154
(0.00 %)		 198
(100.00 %)		 8,627,529
(65.90 %)		 1,047,268
(3.01 %)		 15,613,476
(54.44 %)		 1
(0.00 %)		 1,044,220
(2.96 %)		 140,027
(2.34 %)		 20,584
(0.27 %)
92 collared eel (2026)
GCA_978019975.1		 n/a n/a 16,771
(1.95 %)		 29,104
(4.65 %)		 n/a 42.54
(100.00 %)		 0
(0 %)		 91
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 2,469,340
(30.58 %)		 621,719
(7.65 %)		 6,463,607
(28.25 %)		 0
(0 %)		 572,994
(3.49 %)		 90,015
(4.18 %)		 72,304
(2.91 %)
93 Columbretes wall lizard (hap1.1 2025)
GCA_965112155.1		 n/a n/a 14,276
(1.31 %)		 20,158
(2.24 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 0
(0 %)		 921
(0.01 %)		 290
(100.00 %)		 871,508
(4.31 %)		 539,525
(6.79 %)		 7,116,593
(40.00 %)		 2
(0.00 %)		 754,520
(4.30 %)		 97,685
(3.45 %)		 20,472
(0.73 %)
94 Columbretes wall lizard (hap2.1 2025)
GCA_965178375.1		 n/a n/a 13,776
(1.35 %)		 19,389
(2.28 %)		 n/a 43.97
(99.99 %)		 867
(0.01 %)		 867
(0.01 %)		 1,011
(99.99 %)		 816,540
(4.18 %)		 497,364
(6.95 %)		 6,729,569
(39.28 %)		 3
(0.00 %)		 694,995
(4.18 %)		 89,601
(3.31 %)		 19,420
(0.74 %)
95 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1		 n/a n/a 13,999
(1.21 %)		 18,145
(2.02 %)		 n/a 44.85
(100.00 %)		 0
(0 %)		 286
(0.00 %)		 827
(100.00 %)		 844,126
(6.57 %)		 462,086
(2.56 %)		 8,237,807
(37.72 %)		 0
(0 %)		 573,955
(2.91 %)		 30,098
(0.96 %)		 16,208
(0.52 %)
96 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1		 n/a n/a 13,266
(1.21 %)		 16,750
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 0
(0 %)		 506,831
(2.74 %)		 28,089
(0.98 %)		 14,987
(0.51 %)
97 common eastern froglet (primary hap 2026)
GCF_055691185.1		 75,766
(2.52 %)		 n/a 14,208
(0.61 %)		 40,998
(2.50 %)		 n/a 44.69
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,804
(0.01 %)		 872
(100.00 %)		 4,569,042
(21.79 %)		 2,371,776
(18.54 %)		 14,121,769
(49.79 %)		 5
(0.00 %)		 2,370,213
(6.14 %)		 487,488
(7.45 %)		 67,597
(0.83 %)
98 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1		 n/a n/a 13,073
(0.44 %)		 43,036
(1.95 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 14
(0.00 %)		 12,033
(100.00 %)		 1,489,788
(2.18 %)		 2,621,157
(9.04 %)		 17,154,926
(55.44 %)		 0
(0 %)		 3,161,179
(6.09 %)		 581,115
(7.68 %)		 54,845
(0.65 %)
99 common garter snake
GCF_001077635.1		 26,656
(3.83 %)		 n/a 11,623
(1.25 %)		 17,501
(2.23 %)		 n/a 39.92
(78.84 %)		 168,047
(21.21 %)		 246,220
(21.21 %)		 175,977
(78.79 %)		 606,040
(3.22 %)		 543,646
(2.36 %)		 6,946,141
(27.08 %)		 3,234
(0.23 %)		 224,609
(2.22 %)		 36,264
(1.27 %)		 18,972
(0.73 %)
100 common lizard (alternate hap 2023)
GCA_963506595.1		 n/a n/a 12,464
(1.37 %)		 21,834
(2.42 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 n/a 8,057
(100.00 %)		 3,484,058
(44.97 %)		 434,014
(3.31 %)		 6,610,967
(35.30 %)		 0
(0 %)		 369,914
(2.82 %)		 78,299
(2.87 %)		 19,249
(0.95 %)
101 common lizard (primary hap 2023)
GCA_963506605.1		 n/a n/a 14,281
(1.46 %)		 19,707
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 0
(0 %)		 683
(0.01 %)		 49
(100.00 %)		 4,263,449
(45.66 %)		 513,321
(3.73 %)		 7,172,746
(37.61 %)		 7
(0.00 %)		 477,390
(3.08 %)		 92,858
(2.90 %)		 22,852
(0.95 %)
102 common lizard Z.vivipara (hap1.1 2025)
GCA_965207765.1		 n/a n/a 14,100
(1.43 %)		 19,472
(2.36 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 0
(0 %)		 108
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 884,631
(4.70 %)		 507,148
(3.64 %)		 7,206,478
(37.26 %)		 2
(0.00 %)		 449,058
(2.96 %)		 89,393
(2.87 %)		 21,776
(0.82 %)
103 common lizard Z.vivipara (hap2.1 2025)
GCA_965208345.1		 n/a n/a 14,258
(1.44 %)		 19,379
(2.37 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 102
(0.00 %)		 102
(0.00 %)		 169
(100.00 %)		 884,140
(4.69 %)		 506,524
(3.53 %)		 7,214,124
(37.18 %)		 1
(0.00 %)		 445,202
(2.93 %)		 89,651
(2.88 %)		 21,910
(0.82 %)
104 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1		 45,869
(6.34 %)		 n/a 14,279
(1.46 %)		 19,710
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 0
(0 %)		 683
(0.01 %)		 48
(100.00 %)		 4,128,183
(45.62 %)		 513,318
(3.73 %)		 7,172,928
(37.61 %)		 7
(0.00 %)		 477,389
(3.08 %)		 92,858
(2.90 %)		 22,863
(0.95 %)
105 common musk turtle (alternate hap 2023)
GCA_032164215.1		 n/a n/a 14,229
(1.29 %)		 18,555
(1.90 %)		 n/a 44.57
(99.99 %)		 1,045
(0.01 %)		 1,045
(0.01 %)		 1,120
(99.99 %)		 3,408,527
(40.89 %)		 590,538
(3.26 %)		 8,678,744
(30.12 %)		 4
(0.00 %)		 512,571
(2.20 %)		 118,052
(4.00 %)		 33,328
(1.40 %)
106 common newt (v1 primary hap 2024 genbank)
GCA_964263255.1		 n/a n/a 17,972
(0.09 %)		 229,830
(1.61 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 0
(0 %)		 4,030
(0.00 %)		 15,265
(100.00 %)		 4,807,454
(1.50 %)		 10,258,109
(12.52 %)		 101,185,912
(47.58 %)		 27
(0.00 %)		 3,799,915
(1.53 %)		 2,684,793
(7.99 %)		 2,631,420
(7.74 %)
107 common newt (v2 primary hap 2026 refseq)
GCF_964263255.1		 64,379
(0.42 %)		 n/a 16,999
(0.08 %)		 229,922
(1.61 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 4,030
(0.00 %)		 15,248
(100.00 %)		 4,839,266
(1.50 %)		 10,251,753
(12.52 %)		 101,183,555
(47.58 %)		 27
(0.00 %)		 4,090,610
(1.67 %)		 2,684,759
(7.99 %)		 723,506
(1.49 %)
108 common newt (v1 alternate hap 2024)
GCA_964261385.1		 n/a n/a 14,340
(0.07 %)		 256,786
(1.73 %)		 n/a 44.95
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 62
(0.00 %)		 191,351
(100.00 %)		 4,242,242
(1.64 %)		 8,703,969
(13.90 %)		 85,122,310
(47.86 %)		 0
(0 %)		 n/a 2,255,303
(7.95 %)		 618,398
(1.48 %)
109 common newt (v2 alternate hap 2026)
GCA_964261385.2		 n/a n/a 14,340
(0.07 %)		 258,898
(1.73 %)		 n/a n/a 62
(0.00 %)		 62
(0.00 %)		 191,351
(100.00 %)		 4,242,242
(1.64 %)		 8,703,969
(13.90 %)		 85,122,310
(47.86 %)		 0
(0 %)		 n/a 2,255,303
(7.95 %)		 618,398
(1.48 %)
110 common spadefoot toad (primary hap 2024 genbank)
GCA_036172605.1		 n/a n/a 14,564
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 349
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 1,677,382
(3.51 %)		 3,229,435
(13.31 %)		 15,027,089
(51.43 %)		 12
(0.00 %)		 3,799,247
(9.03 %)		 282,389
(3.86 %)		 79,263
(0.96 %)
111 common spadefoot toad (primary hap 2024 refseq)
GCF_036172605.1		 42,170
(1.55 %)		 n/a 14,560
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 0
(0 %)		 349
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 1,677,374
(3.51 %)		 3,229,434
(13.31 %)		 15,027,049
(51.43 %)		 12
(0.00 %)		 3,799,232
(9.03 %)		 282,389
(3.86 %)		 79,263
(0.96 %)
112 common stingray (2026)
GCA_987106705.1		 n/a n/a 12,606
(0.38 %)		 26,958
(1.17 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 1,662
(0.00 %)		 929
(100.00 %)		 10,190,334
(68.59 %)		 952,015
(14.78 %)		 20,089,208
(55.29 %)		 8
(0.00 %)		 1,467,384
(2.51 %)		 115,829
(2.54 %)		 29,863
(0.71 %)
113 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1		 n/a n/a 12,074
(0.39 %)		 46,329
(1.82 %)		 n/a 44.48
(99.99 %)		 156
(0.01 %)		 156
(0.01 %)		 24,351
(99.99 %)		 1,186,360
(1.65 %)		 2,279,941
(13.33 %)		 14,665,548
(61.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,594,926
(9.74 %)		 405,097
(4.49 %)		 61,648
(0.70 %)
114 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1		 45,085
(1.10 %)		 n/a 14,240
(0.38 %)		 46,470
(1.68 %)		 37,594
(0.91 %)		 44.49
(99.80 %)		 0
(0 %)		 4,199
(0.20 %)		 1,306
(100.00 %)		 1,658,204
(1.79 %)		 3,099,513
(13.49 %)		 19,236,510
(62.70 %)		 18
(0.00 %)		 6,217,888
(10.17 %)		 539,919
(4.45 %)		 78,985
(0.67 %)
115 common wall lizard (hap1 2024 genbank)
GCA_964188315.1		 n/a n/a 14,322
(1.36 %)		 19,700
(2.31 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 0
(0 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 868,785
(4.15 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,097,077
(38.69 %)		 10
(0.00 %)		 713,068
(4.14 %)		 120,725
(3.71 %)		 20,707
(0.76 %)
116 common wall lizard (hap1 2024 refseq)
GCF_964188315.1		 58,901
(5.59 %)		 n/a 14,352
(1.39 %)		 20,013
(2.30 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 0
(0 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 4,727,760
(49.94 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,096,752
(38.69 %)		 10
(0.00 %)		 713,068
(4.14 %)		 120,725
(3.71 %)		 21,367
(0.89 %)
117 common wall lizard (hap2 2024)
GCA_964188365.1		 n/a n/a 13,838
(1.39 %)		 19,262
(2.35 %)		 n/a 44.17
(99.99 %)		 734
(0.01 %)		 734
(0.01 %)		 825
(99.99 %)		 815,808
(4.07 %)		 494,366
(4.53 %)		 6,739,651
(37.84 %)		 6
(0.00 %)		 648,489
(3.96 %)		 113,458
(3.63 %)		 19,621
(0.77 %)
118 common wall lizard (yellow 2019)
GCF_004329235.1		 56,519
(4.85 %)		 n/a 14,453
(1.36 %)		 20,529
(2.31 %)		 n/a 44.18
(99.81 %)		 0
(0 %)		 4,085
(0.19 %)		 2,161
(100.00 %)		 1,089,164
(8.31 %)		 506,669
(2.12 %)		 7,474,116
(36.15 %)		 2
(0.00 %)		 623,437
(4.37 %)		 122,507
(3.69 %)		 21,388
(0.79 %)
119 corn snake (Columbia U 2023)
GCF_029531705.1		 53,076
(4.72 %)		 n/a 13,697
(1.21 %)		 20,819
(2.22 %)		 n/a 40.33
(96.60 %)		 3,553
(3.40 %)		 3,553
(3.40 %)		 4,019
(96.60 %)		 4,116,616
(49.72 %)		 917,455
(3.96 %)		 8,460,248
(40.76 %)		 143
(0.00 %)		 602,278
(2.72 %)		 64,946
(2.08 %)		 20,725
(0.74 %)
120 corn snake (EG266 2020)
GCF_001185365.1		 48,995
(3.92 %)		 n/a 13,316
(1.14 %)		 23,595
(2.17 %)		 29,466
(2.61 %)		 40.35
(95.32 %)		 0
(0 %)		 84,947
(4.70 %)		 34,268
(100.00 %)		 1,243,828
(6.50 %)		 884,533
(3.25 %)		 8,373,398
(40.31 %)		 4,035
(0.07 %)		 377,287
(1.66 %)		 66,926
(2.14 %)		 25,639
(0.86 %)
121 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1		 n/a n/a 14,955
(0.23 %)		 n/a n/a 45.61
(99.80 %)		 2,431
(0.20 %)		 2,431
(0.20 %)		 5,958
(99.80 %)		 20,007,151
(76.28 %)		 5,951,819
(19.40 %)		 24,118,603
(71.52 %)		 49
(0.00 %)		 n/a 991,009
(4.86 %)		 91,447
(0.54 %)
122 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1		 140,657
(1.12 %)		 n/a 15,461
(0.24 %)		 54,344
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 0
(0 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 3,521,281
(2.88 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 24,178,131
(71.23 %)		 23
(0.00 %)		 n/a 990,274
(4.84 %)		 952,582
(4.53 %)
123 Couch's spadefoot toad (hap1 2026)
GCA_054954225.1		 n/a n/a 13,528
(1.90 %)		 19,914
(3.61 %)		 n/a 39.98
(98.72 %)		 0
(0 %)		 605
(1.28 %)		 578
(100.00 %)		 2,481,494
(34.56 %)		 623,950
(10.48 %)		 5,737,146
(34.46 %)		 2
(0.02 %)		 719,129
(5.38 %)		 42,554
(2.79 %)		 18,689
(0.90 %)
124 Couch's spadefoot toad (hap2 2026)
GCA_054954145.1		 n/a n/a 13,481
(1.82 %)		 21,941
(3.80 %)		 n/a 39.97
(99.23 %)		 0
(0 %)		 620
(0.77 %)		 494
(100.00 %)		 2,625,418
(35.92 %)		 713,292
(13.02 %)		 5,588,085
(36.90 %)		 1
(0.00 %)		 755,457
(5.53 %)		 42,871
(2.71 %)		 18,320
(0.86 %)
125 crested gecko (US Hobby MAA-2024a 2024)
GCA_040207535.1		 n/a n/a 13,876
(1.22 %)		 18,274
(2.01 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 11
(0.00 %)		 162
(100.00 %)		 1,021,810
(6.04 %)		 410,843
(1.76 %)		 8,147,007
(34.90 %)		 0
(0 %)		 557,983
(2.92 %)		 79,154
(2.34 %)		 20,951
(0.68 %)
126 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1		 n/a n/a 13,192
(1.36 %)		 19,293
(2.32 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,936
(100.00 %)		 808,341
(4.31 %)		 467,532
(2.91 %)		 6,418,809
(38.02 %)		 0
(0 %)		 518,786
(3.19 %)		 107,080
(3.15 %)		 17,213
(0.72 %)
127 Cretan wall lizard (primary hap 2023 genbank)
GCA_951804945.1		 n/a n/a 14,249
(1.37 %)		 19,304
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 47
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 882,564
(4.30 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,363
(38.65 %)		 2
(0.00 %)		 586,225
(3.38 %)		 117,222
(3.18 %)		 18,707
(0.71 %)
128 Cretan wall lizard (primary hap 2023 refseq)
GCF_951804945.1		 62,110
(5.47 %)		 n/a 14,322
(1.40 %)		 19,303
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 0
(0 %)		 47
(0.00 %)		 51
(100.00 %)		 3,986,518
(46.26 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,353
(38.65 %)		 2
(0.00 %)		 586,134
(3.38 %)		 117,222
(3.18 %)		 19,941
(0.85 %)
129 cuckoo ray (2025)
GCA_965643135.1		 n/a n/a 11,948
(0.63 %)		 26,240
(1.77 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,173
(0.01 %)		 1,503
(100.00 %)		 9,829,377
(67.19 %)		 1,120,890
(8.92 %)		 10,135,837
(56.08 %)		 26
(0.00 %)		 2,633,128
(6.95 %)		 194,688
(3.92 %)		 20,551
(0.51 %)
130 Dalmatian wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964234715.1		 61,269
(4.93 %)		 n/a 14,329
(1.34 %)		 20,474
(2.25 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 0
(0 %)		 823
(0.01 %)		 386
(100.00 %)		 4,958,256
(53.05 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,837,755
(40.20 %)		 2
(0.00 %)		 929,035
(4.42 %)		 90,074
(2.82 %)		 20,789
(0.84 %)
131 Darwin's frog (hap1 2025)
GCF_050947455.1		 75,763
(2.00 %)		 n/a 13,808
(0.52 %)		 34,029
(1.59 %)		 n/a 43.01
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,606
(0.01 %)		 2,942
(100.00 %)		 1,105,374
(2.22 %)		 2,251,358
(18.25 %)		 13,843,878
(63.42 %)		 22
(0.00 %)		 4,287,495
(9.30 %)		 443,624
(6.38 %)		 33,964
(0.44 %)
132 Darwin's frog (hap2 2025)
GCA_050947465.1		 n/a n/a 13,442
(0.54 %)		 32,134
(1.61 %)		 n/a 42.92
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,648
(0.01 %)		 1,374
(100.00 %)		 10,591,581
(59.76 %)		 2,041,017
(15.35 %)		 13,574,848
(62.16 %)		 17
(0.00 %)		 n/a 428,658
(6.43 %)		 32,064
(0.42 %)
133 Delalande's beaked blind snake (hap1 2026)
GCA_057127545.1		 n/a n/a 13,330
(1.11 %)		 17,807
(1.86 %)		 n/a 41.60
(99.99 %)		 0
(0 %)		 642
(0.01 %)		 125
(100.00 %)		 4,372,440
(36.86 %)		 631,618
(2.38 %)		 8,665,237
(37.98 %)		 14
(0.00 %)		 445,213
(2.32 %)		 70,554
(2.23 %)		 24,051
(0.94 %)
134 Delalande's beaked blind snake (hap2 2026)
GCA_057127535.1		 n/a n/a 13,373
(1.12 %)		 17,783
(1.85 %)		 n/a 41.60
(99.99 %)		 0
(0 %)		 624
(0.01 %)		 111
(100.00 %)		 4,361,437
(36.83 %)		 631,970
(2.38 %)		 8,688,526
(38.15 %)		 12
(0.00 %)		 446,217
(2.31 %)		 70,030
(2.21 %)		 23,978
(0.94 %)
135 diablito poison frog (Paru LO004 2023)
GCA_033576555.1		 n/a n/a 11,147
(0.26 %)		 39,500
(1.20 %)		 n/a 44.55
(99.89 %)		 56,659
(0.11 %)		 56,659
(0.11 %)		 71,942
(99.89 %)		 9,076,667
(51.42 %)		 3,074,045
(13.04 %)		 16,014,353
(69.89 %)		 50
(0.00 %)		 2,475,206
(4.50 %)		 606,993
(6.09 %)		 56,271
(0.56 %)
136 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1		 50,318
(3.53 %)		 n/a 15,109
(1.08 %)		 19,280
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 0
(0 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 0
(0 %)		 407,696
(1.71 %)		 110,838
(2.71 %)		 30,093
(0.82 %)
137 diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023)
GCA_027887205.1		 n/a n/a 15,081
(1.08 %)		 19,115
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.98 %)		 0
(0 %)		 127
(0.02 %)		 59
(100.00 %)		 4,093,707
(46.36 %)		 404,046
(1.70 %)		 11,113,266
(33.78 %)		 1
(0.01 %)		 405,600
(1.68 %)		 111,129
(2.68 %)		 30,307
(0.82 %)
138 dyeing poison frog (UK_male_01 2024 genbank)
GCA_039654945.1		 n/a n/a 14,300
(0.31 %)		 45,262
(1.22 %)		 n/a 44.70
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 830
(100.00 %)		 10,980,035
(47.79 %)		 4,029,040
(19.38 %)		 20,561,178
(70.58 %)		 0
(0 %)		 8,584,989
(10.52 %)		 683,383
(5.67 %)		 60,543
(0.43 %)
139 dyeing poison frog (UK_male_01 2024 refseq)
GCF_039654945.1		 65,453
(1.48 %)		 n/a 14,300
(0.31 %)		 45,268
(1.22 %)		 n/a 44.70
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 830
(100.00 %)		 1,777,277
(2.39 %)		 4,029,040
(19.38 %)		 20,561,178
(70.58 %)		 0
(0 %)		 7,794,071
(9.52 %)		 683,383
(5.67 %)		 60,543
(0.43 %)
140 eastern brown snake
GCF_900518735.1		 34,614
(3.30 %)		 n/a 13,625
(1.22 %)		 21,795
(2.00 %)		 n/a 39.84
(97.54 %)		 0
(0 %)		 59,472
(2.47 %)		 28,550
(100.00 %)		 1,020,240
(5.86 %)		 663,810
(2.41 %)		 8,140,554
(39.61 %)		 3,387
(0.06 %)		 230,860
(1.32 %)		 52,895
(2.12 %)		 20,320
(0.72 %)
141 eastern musk turtle (MuskTurtle02 alternate hap 2026)
GCA_032164215.2		 n/a n/a 13,592
(1.23 %)		 18,011
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 553
(0.01 %)		 769
(99.99 %)		 3,417,560
(41.81 %)		 621,567
(3.54 %)		 8,327,641
(30.43 %)		 3
(0.00 %)		 582,192
(2.40 %)		 117,733
(4.04 %)		 30,312
(1.34 %)
142 Eastern musk turtle (MuskTurtle02 primary hap 2026)
GCA_032164245.2		 n/a n/a 14,208
(1.29 %)		 18,423
(1.89 %)		 n/a 44.57
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,079
(0.01 %)		 74
(100.00 %)		 3,408,591
(40.89 %)		 590,719
(3.26 %)		 8,678,800
(30.12 %)		 4
(0.00 %)		 508,354
(2.20 %)		 118,053
(4.00 %)		 33,381
(1.40 %)
143 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1		 n/a n/a 13,413
(1.19 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 553
(0.01 %)		 771
(99.99 %)		 1,003,504
(9.02 %)		 621,617
(3.54 %)		 8,327,948
(30.44 %)		 3
(0.00 %)		 583,206
(2.41 %)		 117,734
(4.05 %)		 30,498
(1.01 %)
144 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1		 n/a n/a 13,632
(0.43 %)		 35,630
(1.52 %)		 n/a 46.77
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,773
(0.01 %)		 590
(100.00 %)		 1,759,193
(1.98 %)		 2,013,186
(16.21 %)		 16,138,898
(60.55 %)		 17
(0.00 %)		 5,811,499
(9.67 %)		 614,432
(5.85 %)		 72,993
(0.75 %)
145 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1		 n/a n/a 13,882
(0.43 %)		 35,323
(1.46 %)		 n/a 46.78
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,745
(0.01 %)		 1,002
(100.00 %)		 1,769,293
(1.99 %)		 2,023,109
(16.33 %)		 16,148,710
(60.55 %)		 22
(0.00 %)		 5,852,023
(9.72 %)		 618,204
(5.89 %)		 74,394
(0.76 %)
146 elephant shark (2021)
GCF_018977255.1		 32,553
(4.75 %)		 n/a 11,542
(1.51 %)		 18,900
(3.25 %)		 n/a 42.85
(99.99 %)		 2,060
(0.01 %)		 14,404
(0.01 %)		 3,822
(99.99 %)		 1,971,730
(36.60 %)		 433,955
(3.92 %)		 5,654,656
(37.91 %)		 11
(0.00 %)		 553,756
(3.85 %)		 41,081
(3.43 %)		 17,151
(0.98 %)
147 elongated tortoise (hap1 2025)
GCA_050000095.2		 n/a n/a 14,769
(1.01 %)		 18,561
(1.53 %)		 n/a 44.25
(100.00 %)		 0
(0 %)		 169
(0.00 %)		 207
(100.00 %)		 5,015,434
(53.77 %)		 367,754
(2.17 %)		 10,980,259
(34.90 %)		 1
(0.00 %)		 510,858
(1.89 %)		 82,369
(2.28 %)		 21,589
(0.61 %)
148 elongated tortoise (hap2 2025)
GCA_050000115.1		 n/a n/a 14,858
(1.00 %)		 18,820
(1.51 %)		 n/a 44.35
(100.00 %)		 0
(0 %)		 171
(0.00 %)		 586
(100.00 %)		 5,006,492
(53.37 %)		 397,554
(3.24 %)		 10,915,197
(35.50 %)		 4
(0.00 %)		 709,573
(2.34 %)		 82,579
(2.28 %)		 22,004
(0.63 %)
149 Emei moustache toad (SX-2025 2025)
GCA_054131545.1		 n/a n/a 13,782
(0.57 %)		 40,311
(2.03 %)		 n/a 43.92
(100.00 %)		 1,479
(0.00 %)		 1,479
(0.00 %)		 1,492
(100.00 %)		 9,232,515
(76.18 %)		 2,040,137
(11.03 %)		 12,972,928
(60.26 %)		 8
(0.00 %)		 n/a 511,382
(8.34 %)		 37,686
(0.74 %)
150 epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021)
GCA_020745765.1		 n/a n/a 12,650
(0.38 %)		 20,614
(1.06 %)		 n/a 42.75
(97.99 %)		 0
(0 %)		 3,552
(2.01 %)		 4,000
(100.00 %)		 9,489,793
(70.34 %)		 976,827
(6.97 %)		 21,183,330
(44.32 %)		 1
(0.00 %)		 3,092,395
(4.62 %)		 42,917
(1.08 %)		 13,522
(0.16 %)
151 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1		 43,156
(1.65 %)		 n/a 12,749
(0.40 %)		 19,519
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 0
(0 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,962
(100.00 %)		 9,420,365
(63.82 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,566
(43.88 %)		 0
(0 %)		 2,903,280
(4.44 %)		 41,682
(1.08 %)		 16,895
(0.30 %)
152 Erhard's wall lizard (hap1.2 2026)
GCA_964252035.2		 n/a n/a 13,941
(1.37 %)		 19,666
(2.30 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 0
(0 %)		 836
(0.01 %)		 316
(100.00 %)		 4,971,098
(51.39 %)		 526,603
(3.30 %)		 7,004,419
(38.57 %)		 2
(0.00 %)		 526,924
(3.21 %)		 89,692
(2.87 %)		 19,984
(0.86 %)
153 Erhard's wall lizard (hap2.2 2026)
GCA_964251985.2		 n/a n/a 13,878
(1.40 %)		 20,097
(2.41 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 811
(0.01 %)		 811
(0.01 %)		 1,202
(99.99 %)		 4,873,253
(50.27 %)		 516,963
(3.38 %)		 6,833,738
(37.92 %)		 9
(0.00 %)		 532,173
(3.27 %)		 87,923
(2.92 %)		 20,712
(0.90 %)
154 European brook lamprey (2025)
GCF_965212315.1		 37,400
(7.69 %)		 n/a 8,181
(0.85 %)		 37,330
(4.57 %)		 n/a 48.46
(99.98 %)		 873
(0.02 %)		 873
(0.02 %)		 3,066
(99.98 %)		 3,708,295
(61.62 %)		 873,872
(14.29 %)		 4,763,033
(46.24 %)		 1
(0.00 %)		 1,502,884
(9.74 %)		 139,528
(43.10 %)		 128,123
(6.34 %)
155 European common frog (2021)
GCF_905171775.1		 51,633
(1.57 %)		 n/a 13,864
(0.46 %)		 39,978
(1.88 %)		 57,578
(1.85 %)		 44.15
(99.36 %)		 0
(0 %)		 1,860
(0.64 %)		 554
(100.00 %)		 1,804,642
(3.42 %)		 2,925,830
(9.39 %)		 18,921,726
(55.43 %)		 8
(0.00 %)		 3,384,162
(6.05 %)		 641,799
(7.66 %)		 62,649
(0.67 %)
156 European conger (alternate hap 2023)
GCA_963514125.1		 n/a n/a 16,952
(1.95 %)		 37,050
(5.24 %)		 n/a 43.65
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,769
(100.00 %)		 2,413,696
(36.12 %)		 866,233
(11.37 %)		 5,685,752
(33.48 %)		 0
(0 %)		 1,335,314
(7.76 %)		 112,201
(5.57 %)		 88,788
(3.60 %)
157 European eel (alternate hap 2020)
GCA_013347865.1		 n/a n/a 17,177
(2.21 %)		 36,037
(5.58 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 2,338
(100.00 %)		 811,567
(5.37 %)		 759,871
(7.97 %)		 5,672,321
(27.30 %)		 0
(0 %)		 731,152
(4.88 %)		 127,837
(8.05 %)		 92,776
(4.12 %)
158 European eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013347855.1		 64,143
(9.57 %)		 n/a 17,054
(2.22 %)		 34,278
(5.56 %)		 79,684
(7.37 %)		 43.64
(99.61 %)		 0
(0 %)		 640
(0.40 %)		 54
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,521
(8.15 %)		 5,700,890
(27.40 %)		 2
(0.00 %)		 774,914
(5.14 %)		 130,346
(8.19 %)		 94,446
(4.12 %)
159 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1		 24,643
(2.02 %)		 n/a 14,238
(1.16 %)		 21,782
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 0
(0 %)		 153
(0.23 %)		 591
(100.00 %)		 1,174,615
(6.99 %)		 436,937
(2.95 %)		 8,308,817
(39.80 %)		 0
(0 %)		 824,335
(3.45 %)		 83,089
(2.82 %)		 33,674
(0.93 %)
160 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1		 n/a n/a 14,220
(1.16 %)		 21,979
(2.19 %)		 n/a 44.64
(99.68 %)		 0
(0 %)		 177
(0.32 %)		 381
(100.00 %)		 1,169,660
(6.57 %)		 432,998
(2.45 %)		 8,403,791
(39.55 %)		 1
(0.00 %)		 711,098
(3.13 %)		 82,695
(2.80 %)		 33,414
(0.92 %)
161 European pond turtle (hap1 2023 genbank)
GCA_028017835.1		 n/a n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 0
(0 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 5
(0.00 %)		 495,884
(2.08 %)		 136,002
(2.92 %)		 30,671
(0.72 %)
162 European pond turtle (hap1 2023 refseq)
GCF_028017835.1		 27,890
(1.81 %)		 n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 0
(0 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 5
(0.00 %)		 495,938
(2.08 %)		 136,002
(2.92 %)		 30,671
(0.72 %)
163 European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017845.1		 n/a n/a 14,971
(1.00 %)		 20,099
(1.61 %)		 n/a 44.79
(99.77 %)		 0
(0 %)		 130
(0.23 %)		 156
(100.00 %)		 1,536,611
(12.44 %)		 471,903
(2.16 %)		 11,129,943
(35.50 %)		 1
(0.00 %)		 522,759
(2.15 %)		 138,047
(2.94 %)		 31,391
(0.73 %)
164 European river lamprey (alternate hap 2024)
GCA_964198585.1		 n/a n/a 7,082
(0.70 %)		 37,019
(4.34 %)		 n/a 49.03
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 9
(0.00 %)		 5,726
(100.00 %)		 3,762,664
(64.70 %)		 1,005,839
(17.80 %)		 4,592,233
(49.09 %)		 0
(0 %)		 1,959,703
(11.40 %)		 153,841
(41.42 %)		 125,989
(6.43 %)
165 European river lamprey (primary hap 2024 genbank)
GCA_964198595.1		 n/a n/a 7,757
(0.73 %)		 36,797
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 0
(0 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,497
(100.00 %)		 657,405
(7.80 %)		 1,165,422
(20.23 %)		 4,931,883
(50.78 %)		 4
(0.00 %)		 2,442,653
(12.79 %)		 149,123
(44.61 %)		 116,679
(5.22 %)
166 European river lamprey (primary hap 2024 refseq)
GCF_964198595.1		 36,555
(6.20 %)		 n/a 7,604
(0.70 %)		 36,803
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 0
(0 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,496
(100.00 %)		 4,068,759
(65.84 %)		 1,165,417
(20.23 %)		 4,931,505
(50.78 %)		 4
(0.00 %)		 2,442,578
(12.79 %)		 149,123
(44.61 %)		 134,673
(6.12 %)
167 Far Eastern brook lamprey (v1 LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.1		 37,946
(7.32 %)		 n/a 7,797
(0.72 %)		 39,285
(4.37 %)		 n/a 48.80
(98.99 %)		 0
(0 %)		 3,287
(1.01 %)		 1,946
(100.00 %)		 716,804
(6.02 %)		 1,192,268
(15.54 %)		 5,304,945
(47.85 %)		 5
(0.00 %)		 1,949,540
(10.82 %)		 170,623
(43.14 %)		 128,479
(5.62 %)
168 Far Eastern brook lamprey (v2 LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.2		 37,933
(7.32 %)		 n/a 7,858
(0.72 %)		 39,278
(4.37 %)		 n/a 48.80
(98.99 %)		 0
(0 %)		 3,287
(1.01 %)		 1,945
(100.00 %)		 4,065,593
(61.75 %)		 1,192,260
(15.54 %)		 5,304,096
(47.85 %)		 5
(0.00 %)		 1,949,540
(10.82 %)		 170,623
(43.14 %)		 152,034
(6.80 %)
169 fence lizard
GCF_019175285.1		 48,391
(3.65 %)		 n/a 14,000
(1.07 %)		 17,384
(1.71 %)		 n/a 41.25
(97.53 %)		 0
(0 %)		 48,138
(2.47 %)		 45,012
(100.00 %)		 1,357,856
(6.95 %)		 596,824
(1.92 %)		 11,090,372
(34.38 %)		 926
(0.05 %)		 356,377
(1.59 %)		 67,007
(1.51 %)		 13,181
(0.35 %)
170 Filfola wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964270895.1		 74,789
(6.22 %)		 n/a 14,358
(1.40 %)		 20,324
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 0
(0 %)		 872
(0.01 %)		 349
(100.00 %)		 4,963,872
(50.70 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,009,851
(37.94 %)		 7
(0.00 %)		 632,285
(3.51 %)		 87,924
(2.61 %)		 20,205
(0.86 %)
171 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap1.1 2024)
GCA_964270895.1		 n/a n/a 14,292
(1.37 %)		 20,325
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 4
(0.00 %)		 872
(0.01 %)		 353
(100.00 %)		 840,209
(4.04 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,010,158
(37.94 %)		 7
(0.00 %)		 632,285
(3.51 %)		 87,924
(2.61 %)		 19,744
(0.76 %)
172 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap2.1 2024)
GCA_964270875.1		 n/a n/a 13,804
(1.42 %)		 19,450
(2.39 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 795
(0.01 %)		 795
(0.01 %)		 937
(99.99 %)		 782,998
(3.95 %)		 448,089
(3.61 %)		 6,735,032
(36.83 %)		 3
(0.00 %)		 546,833
(3.23 %)		 81,312
(2.54 %)		 18,612
(0.77 %)
173 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1		 n/a n/a 2,936
(0.15 %)		 17,722
(1.38 %)		 n/a 38.51
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 13,751
(100.00 %)		 919,882
(3.50 %)		 1,443,294
(10.50 %)		 7,705,012
(57.28 %)		 0
(0 %)		 2,148,861
(9.45 %)		 74,669
(1.25 %)		 7,295
(0.13 %)
174 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1		 38,236
(0.68 %)		 n/a 15,452
(0.21 %)		 47,500
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 0
(0 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,467
(100.00 %)		 4,258,941
(3.44 %)		 7,150,261
(12.27 %)		 34,823,806
(63.74 %)		 3
(0.00 %)		 n/a n/a n/a
175 flapper skate (hap1.1 2026)
GCA_983203515.1		 n/a n/a 12,020
(0.45 %)		 32,606
(1.57 %)		 n/a 44.88
(99.98 %)		 0
(0 %)		 4,961
(0.02 %)		 3,667
(100.00 %)		 11,646,386
(74.12 %)		 2,050,507
(10.64 %)		 12,597,039
(62.58 %)		 50
(0.00 %)		 3,811,960
(7.89 %)		 337,808
(5.43 %)		 31,387
(0.50 %)
176 flapper skate (hap2.1 2026)
GCA_983203605.1		 n/a n/a 11,699
(0.49 %)		 29,667
(1.60 %)		 n/a 44.55
(99.99 %)		 0
(0 %)		 4,331
(0.02 %)		 2,143
(100.00 %)		 10,758,595
(73.15 %)		 1,664,028
(8.60 %)		 11,722,103
(60.48 %)		 33
(0.00 %)		 2,892,312
(6.72 %)		 299,094
(5.16 %)		 25,733
(0.44 %)
177 flatback sea turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965152275.1		 48,321
(3.34 %)		 n/a 14,858
(1.05 %)		 18,090
(1.57 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 171
(0.00 %)		 171
(0.00 %)		 211
(100.00 %)		 1,289,321
(12.22 %)		 319,643
(1.38 %)		 10,785,197
(32.95 %)		 3
(0.00 %)		 442,903
(1.94 %)		 52,168
(1.81 %)		 26,151
(0.65 %)
178 flatback sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152195.1		 n/a 25,064
(1.90 %)		 14,229
(1.06 %)		 16,514
(1.49 %)		 n/a 43.97
(100.00 %)		 261
(0.00 %)		 261
(0.00 %)		 322
(100.00 %)		 4,567,737
(43.65 %)		 288,964
(1.17 %)		 10,681,579
(32.83 %)		 2
(0.00 %)		 394,529
(1.77 %)		 47,249
(1.62 %)		 22,587
(0.73 %)
179 Fleay's barred frog (hap1 2024 genbank)
GCA_038048845.1		 n/a n/a 14,321
(0.67 %)		 22,672
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 0
(0 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,578
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,293,397
(46.37 %)		 2
(0.00 %)		 3,318,438
(8.11 %)		 63,677
(0.85 %)		 12,950
(0.19 %)
180 Fleay's barred frog (hap1 2024 refseq)
GCF_038048845.1		 56,722
(2.42 %)		 n/a 14,321
(0.67 %)		 22,670
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 0
(0 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,683
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,292,724
(46.37 %)		 2
(0.00 %)		 3,318,438
(8.11 %)		 63,677
(0.85 %)		 12,950
(0.19 %)
181 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1		 n/a n/a 14,224
(0.69 %)		 22,406
(1.57 %)		 n/a 40.75
(99.89 %)		 0
(0 %)		 1,383
(0.12 %)		 914
(100.00 %)		 1,300,452
(3.37 %)		 1,495,355
(10.56 %)		 13,385,401
(44.67 %)		 1
(0.00 %)		 2,540,687
(7.06 %)		 64,121
(0.88 %)		 13,021
(0.20 %)
182 Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035715.1		 n/a n/a 14,392
(0.90 %)		 17,909
(1.50 %)		 n/a 42.86
(99.84 %)		 213
(0.16 %)		 213
(0.16 %)		 836
(99.84 %)		 1,440,070
(7.19 %)		 620,131
(2.54 %)		 10,919,950
(45.21 %)		 2
(0.00 %)		 523,070
(2.35 %)		 47,933
(1.03 %)		 18,609
(0.43 %)
183 Florida worm lizard (hap2 2023 genbank)
GCA_030035675.1		 n/a n/a 14,331
(0.90 %)		 17,854
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 1
(0.00 %)		 242
(0.28 %)		 78
(100.00 %)		 1,426,833
(7.17 %)		 616,690
(2.63 %)		 10,819,054
(45.31 %)		 1
(0.00 %)		 531,662
(2.36 %)		 47,454
(1.03 %)		 18,400
(0.42 %)
184 Florida worm lizard (hap2 2023 refseq)
GCF_030035675.1		 65,314
(3.47 %)		 n/a 14,331
(0.90 %)		 17,853
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 0
(0 %)		 242
(0.28 %)		 76
(100.00 %)		 1,426,827
(7.17 %)		 616,687
(2.63 %)		 10,819,019
(45.31 %)		 1
(0.00 %)		 531,660
(2.36 %)		 47,453
(1.03 %)		 18,399
(0.42 %)
185 frog A.baeobatrachus (hap1 2025 genbank)
GCA_048569485.1		 n/a n/a 13,963
(0.31 %)		 43,460
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3,772
(0.01 %)		 3,642
(100.00 %)		 2,033,935
(2.50 %)		 4,040,311
(20.45 %)		 20,439,907
(69.96 %)		 60
(0.00 %)		 7,481,063
(9.87 %)		 1,159,163
(12.74 %)		 63,455
(0.51 %)
186 frog A.baeobatrachus (hap1 2025 refseq)
GCF_048569485.1		 69,304
(1.30 %)		 n/a 13,964
(0.31 %)		 43,453
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3,773
(0.01 %)		 3,643
(100.00 %)		 2,033,939
(2.50 %)		 4,040,312
(20.45 %)		 20,439,939
(69.96 %)		 60
(0.00 %)		 n/a 1,159,163
(12.74 %)		 63,455
(0.51 %)
187 frog A.baeobatrachus (hap2 2025)
GCA_048569465.1		 n/a n/a 13,992
(0.31 %)		 43,409
(1.27 %)		 n/a 46.36
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3,799
(0.01 %)		 2,426
(100.00 %)		 1,997,963
(2.50 %)		 4,002,458
(19.16 %)		 20,517,633
(69.30 %)		 47
(0.00 %)		 8,117,501
(10.97 %)		 1,152,817
(12.93 %)		 63,273
(0.52 %)
188 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1		 n/a n/a 12,821
(0.47 %)		 30,612
(1.44 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,651
(100.00 %)		 1,139,595
(1.64 %)		 1,170,215
(3.77 %)		 17,091,511
(52.44 %)		 0
(0 %)		 995,544
(2.57 %)		 235,170
(4.50 %)		 33,394
(0.50 %)
189 Gaboon caecilian (primary hap 2021)
GCF_902459505.2		 54,715
(1.72 %)		 n/a 14,269
(0.52 %)		 29,024
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 433
(0.15 %)		 596
(99.85 %)		 11,725,554
(74.57 %)		 1,364,596
(3.83 %)		 19,589,602
(52.85 %)		 3
(0.00 %)		 1,182,977
(2.68 %)		 270,923
(4.52 %)		 16,611
(0.19 %)
190 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2		 n/a n/a 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 0
(0 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,331,879
(1.68 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,806
(52.85 %)		 3
(0.00 %)		 1,182,995
(2.68 %)		 270,923
(4.52 %)		 38,622
(0.50 %)
191 gharial (Ggan-Ray 2016)
GCF_001723915.1		 32,297
(2.61 %)		 n/a 12,194
(1.03 %)		 12,758
(1.30 %)		 n/a 43.95
(73.60 %)		 0
(0 %)		 248,526
(26.44 %)		 81
(100.00 %)		 2,589,103
(36.89 %)		 243,334
(0.51 %)		 11,279,606
(20.80 %)		 29,443
(5.09 %)		 125,202
(1.53 %)		 26,651
(0.60 %)		 20,614
(0.47 %)
192 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1		 n/a n/a 14,254
(0.94 %)		 23,016
(2.00 %)		 n/a 45.13
(99.95 %)		 0
(0 %)		 61
(0.05 %)		 298
(100.00 %)		 1,230,357
(13.08 %)		 350,230
(2.85 %)		 11,854,314
(33.03 %)		 2
(0.00 %)		 335,615
(1.39 %)		 39,919
(1.95 %)		 26,198
(0.77 %)
193 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1		 n/a n/a 14,151
(0.94 %)		 23,338
(1.95 %)		 n/a 45.15
(99.95 %)		 0
(0 %)		 118
(0.05 %)		 160
(100.00 %)		 1,232,693
(12.81 %)		 332,737
(2.19 %)		 11,907,298
(32.91 %)		 3
(0.00 %)		 284,469
(1.22 %)		 40,660
(1.87 %)		 25,990
(0.77 %)
194 giant manta (hap1 2023 refseq)
GCF_030028105.1		 53,223
(2.04 %)		 n/a 12,432
(0.38 %)		 25,243
(1.14 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 0
(0 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 863,834
(1.59 %)		 947,015
(13.41 %)		 20,234,736
(54.42 %)		 17
(0.00 %)		 4,636,741
(7.12 %)		 110,678
(1.74 %)		 30,504
(0.36 %)
195 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1		 n/a n/a 12,198
(0.42 %)		 23,127
(1.17 %)		 n/a 42.85
(98.49 %)		 0
(0 %)		 1,742
(1.51 %)		 1,558
(100.00 %)		 7,431,472
(52.41 %)		 716,951
(7.28 %)		 19,456,793
(50.99 %)		 9
(0.01 %)		 2,419,836
(4.27 %)		 91,414
(1.45 %)		 65,413
(0.90 %)
196 giant South American river turtle (hap1 2024)
GCA_045364785.1		 n/a n/a 14,628
(0.85 %)		 18,382
(1.34 %)		 n/a 44.78
(100.00 %)		 0
(0 %)		 260
(0.00 %)		 2,039
(100.00 %)		 1,254,940
(9.13 %)		 434,666
(6.73 %)		 12,070,445
(35.52 %)		 1
(0.00 %)		 1,002,897
(2.92 %)		 51,563
(1.91 %)		 16,484
(0.36 %)
197 giant South American river turtle (hap2 2024)
GCA_045364815.1		 n/a n/a 14,571
(0.87 %)		 18,363
(1.38 %)		 n/a 44.25
(100.00 %)		 0
(0 %)		 224
(0.00 %)		 725
(100.00 %)		 1,243,321
(10.35 %)		 434,716
(4.30 %)		 12,200,714
(33.86 %)		 2
(0.00 %)		 769,881
(2.27 %)		 51,411
(1.88 %)		 16,569
(0.37 %)
198 Gila monster (Gila_16-S 2026)
GCF_057233095.1		 66,395
(3.96 %)		 n/a 14,385
(0.86 %)		 17,870
(1.34 %)		 n/a 45.51
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 20
(100.00 %)		 6,454,936
(49.83 %)		 703,981
(7.97 %)		 11,888,999
(48.87 %)		 0
(0 %)		 142,123
(0.50 %)		 165,685
(5.15 %)		 139,847
(3.83 %)
199 golden mantella (hap1 2025)
GCA_048565345.1		 n/a n/a 13,675
(0.56 %)		 30,568
(1.85 %)		 n/a 41.00
(99.98 %)		 0
(0 %)		 4,138
(0.02 %)		 3,088
(100.00 %)		 1,225,842
(2.74 %)		 2,478,484
(16.71 %)		 14,761,187
(53.21 %)		 51
(0.00 %)		 5,379,974
(9.98 %)		 164,021
(2.52 %)		 33,788
(0.51 %)
200 golden mantella (hap2 2025)
GCA_048565335.1		 n/a n/a 13,400
(0.55 %)		 28,454
(1.70 %)		 n/a 40.91
(99.98 %)		 0
(0 %)		 3,921
(0.02 %)		 2,611
(100.00 %)		 1,203,975
(3.36 %)		 2,447,119
(16.68 %)		 14,661,554
(53.34 %)		 45
(0.00 %)		 5,276,975
(9.84 %)		 160,856
(2.46 %)		 32,812
(0.49 %)
201 golden poison dart frog (yellow primary hap 2024)
GCF_046119375.1		 128,151
(0.97 %)		 n/a 15,383
(0.19 %)		 56,843
(1.14 %)		 n/a 44.28
(100.00 %)		 0
(0 %)		 1,234
(0.00 %)		 9,343
(100.00 %)		 2,355,255
(2.05 %)		 5,350,104
(37.88 %)		 20,333,848
(81.77 %)		 14
(0.00 %)		 n/a 874,818
(5.79 %)		 57,347
(0.28 %)
202 goldentail moray (2026)
GCA_987191265.1		 n/a n/a 15,751
(0.97 %)		 40,333
(3.49 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 76
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 5,191,739
(59.75 %)		 765,480
(6.84 %)		 9,935,402
(42.21 %)		 1
(0.00 %)		 1,049,297
(3.72 %)		 116,467
(2.57 %)		 59,376
(1.14 %)
203 goldspotted eel (2025)
GCA_975146105.1		 n/a n/a 16,879
(1.43 %)		 38,748
(4.22 %)		 n/a 42.81
(100.00 %)		 0
(0 %)		 147
(0.00 %)		 38
(100.00 %)		 3,198,550
(33.91 %)		 741,217
(8.84 %)		 7,140,094
(39.50 %)		 1
(0.00 %)		 1,118,823
(5.29 %)		 136,266
(4.25 %)		 73,448
(2.01 %)
204 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2		 57,455
(3.18 %)		 n/a 14,852
(1.00 %)		 18,125
(1.49 %)		 31,841
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 0
(0 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,271
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 0
(0 %)		 474,978
(1.73 %)		 71,687
(2.29 %)		 21,793
(0.54 %)
205 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1		 n/a n/a 13,359
(0.95 %)		 19,347
(1.51 %)		 n/a 44.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 8,736
(100.00 %)		 1,404,513
(13.79 %)		 334,726
(2.35 %)		 9,735,007
(33.33 %)		 0
(0 %)		 468,758
(1.89 %)		 61,680
(2.32 %)		 18,869
(0.54 %)
206 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan lineage primary hap 2019)
GCA_007399415.1		 n/a n/a 14,852
(1.00 %)		 18,597
(1.55 %)		 31,974
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 0
(0 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,268
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 0
(0 %)		 474,978
(1.73 %)		 71,687
(2.29 %)		 21,793
(0.54 %)
207 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 refseq)
GCF_029215685.1		 28,358
(2.73 %)		 n/a 12,291
(1.06 %)		 19,125
(2.02 %)		 n/a 40.55
(100.00 %)		 584
(0.00 %)		 584
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 1,259,792
(7.92 %)		 925,571
(7.56 %)		 7,739,127
(45.92 %)		 3
(0.00 %)		 840,459
(4.04 %)		 73,681
(2.81 %)		 26,366
(0.92 %)
208 gopher snake (HBS135680 primary hap 2023)
GCA_029215655.1		 n/a n/a 13,289
(1.09 %)		 20,513
(2.09 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 603
(0.00 %)		 603
(0.00 %)		 1,029
(100.00 %)		 1,325,747
(8.26 %)		 973,338
(7.56 %)		 8,352,703
(45.38 %)		 4
(0.00 %)		 888,155
(3.86 %)		 72,941
(2.59 %)		 27,387
(0.91 %)
209 graceful crag lizard (Gifberg primary hap 2022)
GCF_027244095.1		 86,664
(4.30 %)		 n/a 14,269
(0.91 %)		 18,195
(1.57 %)		 n/a 44.82
(100.00 %)		 0
(0 %)		 42
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 1,644,976
(6.04 %)		 823,058
(3.00 %)		 11,991,046
(41.43 %)		 0
(0 %)		 489,782
(1.69 %)		 80,718
(1.90 %)		 27,916
(0.61 %)
210 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1		 n/a n/a 14,094
(1.03 %)		 17,875
(1.65 %)		 n/a 41.62
(99.95 %)		 0
(0 %)		 28
(0.05 %)		 30
(100.00 %)		 1,100,228
(6.21 %)		 423,695
(1.33 %)		 11,521,828
(32.55 %)		 2
(0.00 %)		 258,014
(1.05 %)		 62,978
(2.00 %)		 24,755
(0.81 %)
211 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1		 n/a n/a 13,758
(1.02 %)		 16,909
(1.62 %)		 n/a 41.53
(99.01 %)		 19
(0.99 %)		 19
(0.99 %)		 52
(99.01 %)		 1,069,189
(6.12 %)		 410,262
(1.25 %)		 11,390,195
(32.28 %)		 0
(0 %)		 233,593
(0.96 %)		 60,835
(1.92 %)		 23,191
(0.77 %)
212 gray bichir
GCF_016835505.1		 48,165
(1.88 %)		 n/a 12,963
(0.44 %)		 24,479
(1.21 %)		 n/a 39.32
(99.96 %)		 0
(0 %)		 3,166
(0.04 %)		 9,856
(100.00 %)		 1,765,862
(2.54 %)		 1,017,723
(2.38 %)		 20,924,763
(47.66 %)		 2
(0.00 %)		 997,434
(2.53 %)		 98,862
(1.64 %)		 24,750
(0.32 %)
213 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1		 n/a n/a 20
(0.30 %)		 63
(2.06 %)		 n/a 45.02
(99.98 %)		 0
(0 %)		 28
(0.02 %)		 39
(100.00 %)		 8,165
(60.43 %)		 2,740
(27.09 %)		 15,863
(31.63 %)		 0
(0 %)		 16,359
(15.02 %)		 167
(5.51 %)		 65
(0.61 %)
214 great white shark (primary hap 2021 genbank)
GCA_017639515.1		 n/a n/a 13,511
(0.38 %)		 19,263
(0.92 %)		 n/a 45.21
(99.55 %)		 0
(0 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 7,178,936
(64.10 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,189
(52.42 %)		 11
(0.00 %)		 3,864,165
(4.83 %)		 77,057
(2.22 %)		 27,667
(0.85 %)
215 great white shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_017639515.1		 49,865
(1.46 %)		 n/a 13,010
(0.37 %)		 19,263
(0.92 %)		 46,152
(1.30 %)		 45.21
(99.55 %)		 0
(0 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 1,046,023
(4.00 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,563
(52.42 %)		 11
(0.00 %)		 8,687,289
(11.05 %)		 77,021
(1.94 %)		 14,712
(0.15 %)
216 green anole (JA03-04 2024)
GCF_035594765.1		 56,324
(5.85 %)		 n/a 14,020
(1.12 %)		 20,096
(1.86 %)		 n/a 40.60
(98.38 %)		 0
(0 %)		 841
(1.62 %)		 211
(100.00 %)		 4,859,635
(53.14 %)		 909,429
(5.19 %)		 8,304,332
(44.07 %)		 5
(0.00 %)		 1,056,606
(4.88 %)		 56,404
(1.78 %)		 20,393
(0.51 %)
217 green anole (v1 2011)
GCF_000090745.1		 38,109
(3.63 %)		 n/a 13,021
(1.08 %)		 20,780
(1.86 %)		 38,266
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 35,533
(5.44 %)		 41,987
(94.56 %)		 2,415,433
(28.92 %)		 702,538
(2.99 %)		 8,199,653
(39.69 %)		 25
(0.00 %)		 674,365
(3.47 %)		 42,151
(1.18 %)		 15,374
(0.36 %)
218 green anole (v2 2010)
GCF_000090745.2		 38,096
(3.63 %)		 n/a 13,140
(1.11 %)		 20,772
(1.86 %)		 38,229
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 35,530
(5.44 %)		 41,986
(94.56 %)		 4,455,733
(51.37 %)		 702,537
(2.99 %)		 8,199,580
(39.69 %)		 25
(0.00 %)		 674,353
(3.47 %)		 42,151
(1.18 %)		 15,935
(0.39 %)
219 green sea turtle (primary hap 2021)
GCA_015237465.2		 n/a n/a 15,016
(1.11 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 0
(0 %)		 298
(0.56 %)		 92
(100.00 %)		 3,631,238
(44.71 %)		 304,302
(1.25 %)		 11,135,013
(31.96 %)		 0
(0 %)		 429,994
(1.68 %)		 49,025
(1.44 %)		 28,087
(0.87 %)
220 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2		 n/a n/a 13,635
(1.05 %)		 19,414
(1.61 %)		 n/a 44.16
(99.95 %)		 60
(0.05 %)		 60
(0.05 %)		 6,797
(99.95 %)		 3,221,668
(44.97 %)		 275,275
(1.28 %)		 9,802,895
(32.14 %)		 2
(0.00 %)		 394,278
(1.72 %)		 45,469
(1.48 %)		 25,997
(0.89 %)
221 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2		 84,353
(4.63 %)		 n/a 14,725
(1.06 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 0
(0 %)		 298
(0.56 %)		 93
(100.00 %)		 1,701,640
(14.83 %)		 304,306
(1.25 %)		 11,135,147
(31.96 %)		 0
(0 %)		 429,994
(1.68 %)		 49,025
(1.44 %)		 26,933
(0.68 %)
222 Greenland sleeper shark (2025)
GCF_052327205.1		 60,259
(1.57 %)		 n/a 13,227
(0.25 %)		 29,200
(0.79 %)		 n/a 47.75
(99.91 %)		 0
(0 %)		 11,933
(0.09 %)		 2,111
(100.00 %)		 1,160,455
(2.60 %)		 2,624,716
(21.03 %)		 16,338,792
(75.59 %)		 33
(0.00 %)		 3,017,009
(3.04 %)		 668,934
(10.22 %)		 35,841
(0.25 %)
223 Greenland sleeper shark (GS21.2 2025)
GCA_052327205.1		 n/a n/a 13,229
(0.25 %)		 29,200
(0.79 %)		 n/a 47.75
(99.91 %)		 2,349
(0.02 %)		 11,933
(0.09 %)		 4,461
(99.98 %)		 1,160,458
(2.60 %)		 2,624,716
(21.03 %)		 16,338,819
(75.59 %)		 33
(0.00 %)		 2,173,995
(2.22 %)		 668,934
(10.22 %)		 35,841
(0.25 %)
224 grey reef shark (hapA 2025)
GCF_965287045.1		 42,414
(2.31 %)		 n/a 13,005
(0.55 %)		 18,669
(1.27 %)		 n/a 43.98
(100.00 %)		 0
(0 %)		 883
(0.00 %)		 1,521
(100.00 %)		 7,459,423
(58.87 %)		 658,213
(6.81 %)		 13,646,347
(46.40 %)		 20
(0.00 %)		 2,395,472
(5.07 %)		 36,259
(1.07 %)		 19,338
(0.46 %)
225 grey reef shark (hapB 2025)
GCA_965295155.1		 n/a n/a 12,988
(0.54 %)		 18,753
(1.27 %)		 n/a 44.00
(100.00 %)		 876
(0.00 %)		 876
(0.00 %)		 2,410
(100.00 %)		 7,462,980
(58.92 %)		 660,217
(6.95 %)		 13,645,872
(46.47 %)		 20
(0.00 %)		 2,444,197
(5.14 %)		 36,662
(1.11 %)		 19,380
(0.47 %)
226 hawksbill sea turtle (B2_1 2023)
GCA_030012505.1		 n/a n/a 14,897
(1.00 %)		 18,251
(1.51 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 0
(0 %)		 95
(0.00 %)		 208
(100.00 %)		 1,315,164
(12.07 %)		 347,678
(3.60 %)		 10,892,216
(35.32 %)		 2
(0.00 %)		 683,881
(2.59 %)		 49,532
(1.65 %)		 26,297
(0.62 %)
227 hawksbill sea turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965152235.1		 n/a 25,702
(1.84 %)		 14,710
(1.02 %)		 17,589
(1.52 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 6
(0.00 %)		 131
(0.12 %)		 63
(100.00 %)		 1,289,035
(12.18 %)		 310,918
(1.75 %)		 10,994,433
(33.64 %)		 0
(0 %)		 544,623
(2.10 %)		 46,532
(1.40 %)		 25,322
(0.62 %)
228 hawksbill sea turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965152235.1		 41,141
(2.68 %)		 n/a 14,805
(1.06 %)		 17,460
(1.51 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 0
(0 %)		 131
(0.12 %)		 57
(100.00 %)		 4,249,522
(49.54 %)		 310,918
(1.75 %)		 10,994,437
(33.64 %)		 0
(0 %)		 544,624
(2.10 %)		 46,532
(1.40 %)		 25,096
(0.84 %)
229 hawksbill sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152285.1		 n/a 25,779
(1.85 %)		 14,843
(1.02 %)		 18,006
(1.54 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 132
(0.12 %)		 132
(0.12 %)		 173
(99.88 %)		 1,288,292
(12.14 %)		 318,803
(2.15 %)		 11,148,397
(34.07 %)		 1
(0.00 %)		 573,455
(2.17 %)		 46,922
(1.41 %)		 25,789
(0.63 %)
230 hellbender (hap1 2026)
GCA_060551615.1		 n/a n/a 16,634
(0.04 %)		 215,099
(0.73 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 24,119
(0.00 %)		 15,812
(100.00 %)		 42,614,233
(21.00 %)		 82,063,457
(21.73 %)		 159,296,257
(65.08 %)		 348
(0.00 %)		 24,698,345
(3.04 %)		 2,185,612
(3.11 %)		 682,488
(0.55 %)
231 hickatee (hap1 2025)
GCA_054099655.1		 n/a n/a 14,920
(1.21 %)		 18,649
(1.75 %)		 n/a 43.67
(100.00 %)		 0
(0 %)		 132
(0.00 %)		 151
(100.00 %)		 3,220,305
(41.80 %)		 325,597
(8.20 %)		 9,635,325
(31.95 %)		 2
(0.00 %)		 983,137
(3.15 %)		 49,601
(1.77 %)		 29,917
(1.30 %)
232 hickatee (hap2 2025)
GCA_054099715.1		 n/a n/a 14,893
(1.22 %)		 18,699
(1.80 %)		 n/a 43.79
(100.00 %)		 0
(0 %)		 137
(0.00 %)		 162
(100.00 %)		 3,212,991
(39.89 %)		 328,796
(6.89 %)		 9,501,793
(30.78 %)		 1
(0.00 %)		 1,068,712
(3.40 %)		 49,575
(1.79 %)		 29,774
(1.29 %)
233 High Himalaya frog
GCF_000935625.1		 26,122
(1.87 %)		 n/a 13,695
(0.94 %)		 28,085
(2.39 %)		 n/a 42.55
(96.32 %)		 122,325
(3.70 %)		 122,325
(3.70 %)		 147,513
(96.30 %)		 536,058
(1.39 %)		 794,563
(5.48 %)		 11,465,450
(37.44 %)		 1,716
(0.17 %)		 725,825
(4.49 %)		 219,772
(3.92 %)		 32,652
(0.67 %)
234 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1		 n/a n/a 15,006
(0.28 %)		 22,481
(0.80 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 225
(0.03 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,532
(99.97 %)		 1,344,546
(5.76 %)		 2,364,825
(28.34 %)		 5,088
(99.53 %)		 5
(0.00 %)		 14,350,128
(14.12 %)		 89,340
(2.10 %)		 82,092
(1.20 %)
235 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1		 n/a n/a 12,766
(0.30 %)		 21,591
(0.87 %)		 n/a 44.88
(99.43 %)		 0
(0 %)		 2,790
(0.57 %)		 1,496
(100.00 %)		 1,008,880
(5.19 %)		 1,596,129
(22.32 %)		 22,180,341
(62.98 %)		 2
(0.00 %)		 9,762,254
(11.27 %)		 82,276
(1.85 %)		 14,696
(0.13 %)
236 horn shark (sHetFra1hap1 2024)
GCF_036365525.1		 60,844
(1.44 %)		 n/a 15,004
(0.28 %)		 22,510
(0.76 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 0
(0 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,306
(100.00 %)		 1,344,541
(5.76 %)		 2,364,824
(28.34 %)		 20,630,058
(68.85 %)		 5
(0.00 %)		 14,350,134
(14.12 %)		 89,340
(2.10 %)		 82,092
(1.20 %)
237 hourglass treefrog (maternal 2023 genbank)
GCA_027789725.1		 n/a n/a 14,359
(0.89 %)		 32,575
(2.67 %)		 n/a 43.88
(95.18 %)		 788
(4.82 %)		 788
(4.82 %)		 3,358
(95.18 %)		 922,807
(2.38 %)		 1,744,603
(15.45 %)		 10,318,168
(48.47 %)		 0
(0 %)		 3,525,571
(8.67 %)		 244,270
(5.02 %)		 29,547
(0.61 %)
238 hourglass treefrog (paternal 2023 refseq)
GCF_027789765.1		 50,542
(2.91 %)		 n/a 14,058
(0.89 %)		 30,599
(2.64 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 0
(0 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 3
(0.00 %)		 1,978,464
(5.31 %)		 235,277
(5.56 %)		 28,414
(0.63 %)
239 Hungarian meadow viper (primary hap 2022)
GCF_947247035.1		 36,135
(3.46 %)		 n/a 13,432
(1.20 %)		 18,654
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 3,633,666
(50.97 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,427,621
(45.35 %)		 13
(0.00 %)		 678,804
(3.40 %)		 101,007
(3.95 %)		 21,924
(0.87 %)
240 Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024)
GCA_036172795.1		 n/a n/a 14,141
(0.97 %)		 22,232
(2.16 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 262
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 944,742
(4.86 %)		 1,927,659
(22.26 %)		 8,988,510
(49.29 %)		 1
(0.00 %)		 3,465,509
(10.62 %)		 77,721
(1.73 %)		 13,802
(0.30 %)
241 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022 genbank)
GCA_026652325.1		 n/a 139,896
(0.54 %)		 15,136
(0.10 %)		 n/a n/a 45.95
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 922
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 4,478,794
(1.33 %)		 6,452,537
(8.86 %)		 81,311,590
(56.46 %)		 26
(0.00 %)		 n/a 1,581,360
(4.00 %)		 144,588
(0.32 %)
242 Iberian ribbed newt (hap1 20211129_DDA 2024 refseq)
GCF_031143425.1		 57,032
(0.47 %)		 n/a 15,184
(0.10 %)		 72,314
(0.62 %)		 n/a 45.93
(100.00 %)		 0
(0 %)		 1,829
(0.00 %)		 616
(100.00 %)		 4,343,624
(1.32 %)		 6,295,886
(8.29 %)		 2,445
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 736,440
(0.34 %)		 1,546,882
(4.02 %)		 1,545,477
(3.92 %)
243 Ibiza wall lizard (hap1.3 2026)
GCA_964106645.3		 n/a n/a 14,358
(1.39 %)		 20,037
(2.30 %)		 n/a 43.97
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,505
(0.02 %)		 305
(100.00 %)		 4,977,258
(51.04 %)		 473,070
(2.71 %)		 7,060,127
(38.23 %)		 40
(0.00 %)		 544,621
(3.43 %)		 96,567
(3.15 %)		 20,418
(0.87 %)
244 Ibiza wall lizard (hap2.3 2026)
GCA_964106635.3		 n/a n/a 13,838
(1.44 %)		 19,052
(2.34 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,541
(99.98 %)		 4,712,744
(49.63 %)		 440,320
(2.30 %)		 6,773,549
(37.14 %)		 34
(0.00 %)		 471,501
(3.14 %)		 89,220
(3.03 %)		 19,563
(0.88 %)
245 Indian cobra (NN01 2019)
GCA_009733165.1		 n/a 25,817
(1.78 %)		 13,028
(1.10 %)		 17,854
(1.73 %)		 n/a 40.46
(93.80 %)		 0
(0 %)		 11,910
(6.20 %)		 1,897
(100.00 %)		 1,114,498
(5.61 %)		 671,854
(2.20 %)		 8,205,261
(40.40 %)		 3
(0.02 %)		 n/a 47,381
(1.37 %)		 19,640
(0.65 %)
246 Indian roofed turtle (hap1 2024)
GCA_045781095.1		 n/a n/a 14,623
(1.04 %)		 18,405
(1.58 %)		 n/a 44.24
(100.00 %)		 0
(0 %)		 205
(0.00 %)		 629
(100.00 %)		 1,283,544
(11.43 %)		 298,912
(1.85 %)		 10,728,482
(32.52 %)		 1
(0.00 %)		 413,036
(2.00 %)		 72,908
(2.13 %)		 26,854
(0.71 %)
247 Indian roofed turtle (hap2 2024)
GCA_045781085.1		 n/a n/a 14,682
(1.03 %)		 18,600
(1.58 %)		 n/a 44.26
(100.00 %)		 0
(0 %)		 260
(0.00 %)		 449
(100.00 %)		 1,290,818
(11.46 %)		 301,464
(1.79 %)		 10,704,595
(32.71 %)		 0
(0 %)		 436,958
(2.04 %)		 74,354
(2.05 %)		 27,125
(0.71 %)
248 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1		 n/a n/a 17,858
(2.43 %)		 32,738
(5.46 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 0
(0 %)		 3
(0.00 %)		 4,333
(100.00 %)		 583,632
(3.71 %)		 418,411
(3.74 %)		 5,198,155
(21.50 %)		 1
(0.00 %)		 276,314
(1.94 %)		 76,879
(3.71 %)		 57,281
(2.37 %)
249 Indo-Pacific tarpon (primary hap 2020)
GCA_013368585.1		 n/a n/a 18,305
(2.47 %)		 29,764
(5.45 %)		 n/a 43.02
(99.97 %)		 0
(0 %)		 63
(0.03 %)		 207
(100.00 %)		 603,530
(3.71 %)		 433,446
(4.32 %)		 5,341,961
(22.07 %)		 0
(0 %)		 319,597
(2.18 %)		 78,561
(3.69 %)		 58,460
(2.33 %)
250 inshore hagfish (2023)
GCA_900186335.3		 n/a n/a 6,137
(0.40 %)		 23,364
(2.60 %)		 n/a 46.68
(54.88 %)		 332,729
(45.17 %)		 332,729
(45.17 %)		 342,008
(54.83 %)		 1,099,633
(8.08 %)		 1,181,678
(6.90 %)		 7,860,245
(28.44 %)		 1,110
(0.12 %)		 576,977
(1.98 %)		 142,778
(3.95 %)		 27,927
(0.48 %)
251 inshore hagfish (2026)
GCF_056783735.1		 69,177
(4.47 %)		 n/a 6,275
(0.30 %)		 31,017
(2.64 %)		 n/a 42.67
(99.92 %)		 0
(0 %)		 3,288
(0.08 %)		 3,194
(100.00 %)		 1,279,433
(8.97 %)		 1,549,601
(15.25 %)		 8,247,316
(62.71 %)		 1
(0.00 %)		 1,741,135
(4.70 %)		 168,414
(11.99 %)		 31,179
(0.77 %)
252 Italian wall lizard (rPodSic1.hap1.1 2024)
GCA_964188175.1		 n/a n/a 14,241
(1.31 %)		 20,399
(2.26 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 2
(0.00 %)		 762
(0.01 %)		 296
(100.00 %)		 832,389
(5.27 %)		 530,449
(8.28 %)		 6,937,083
(40.38 %)		 2
(0.00 %)		 908,580
(4.73 %)		 106,667
(3.79 %)		 20,531
(0.75 %)
253 Italian wall lizard (rPodSic1.hap2.1 2024)
GCA_964188395.1		 n/a n/a 13,696
(1.37 %)		 19,278
(2.32 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 690
(0.01 %)		 690
(0.01 %)		 842
(99.99 %)		 763,893
(4.21 %)		 451,861
(6.69 %)		 6,696,380
(38.71 %)		 4
(0.00 %)		 740,272
(4.24 %)		 98,815
(3.65 %)		 19,565
(0.77 %)
254 Japanese eel (BU-2020EF 2022)
GCA_025169545.1		 n/a n/a 17,160
(2.12 %)		 34,420
(5.19 %)		 n/a 43.64
(99.43 %)		 0
(0 %)		 725
(0.57 %)		 86
(100.00 %)		 902,705
(5.61 %)		 903,851
(8.80 %)		 5,865,906
(28.58 %)		 5
(0.00 %)		 978,853
(5.89 %)		 131,092
(7.95 %)		 94,676
(3.97 %)
255 Japanese sawshark (hap1 2024 refseq)
GCF_044704955.1		 54,879
(1.24 %)		 n/a 12,978
(0.27 %)		 30,195
(0.79 %)		 n/a 47.02
(99.98 %)		 0
(0 %)		 5,985
(0.02 %)		 4,318
(100.00 %)		 11,412,024
(71.47 %)		 2,399,500
(18.16 %)		 20,051,385
(71.80 %)		 38
(0.00 %)		 11,403,077
(11.92 %)		 503,637
(6.56 %)		 48,183
(0.32 %)
256 Japanese sawshark (hap2 2024)
GCA_044704965.1		 n/a n/a 14,833
(0.26 %)		 30,853
(0.75 %)		 n/a 47.12
(99.98 %)		 0
(0 %)		 5,953
(0.02 %)		 5,626
(100.00 %)		 1,238,549
(4.06 %)		 2,718,867
(21.85 %)		 20,608,860
(73.38 %)		 42
(0.00 %)		 7,882,680
(7.20 %)		 518,286
(6.88 %)		 502,936
(6.32 %)
257 Kemp's ridley sea turtle (hap1 2025)
GCF_965140285.1		 65,480
(3.90 %)		 n/a 14,975
(1.06 %)		 17,809
(1.52 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 219
(0.00 %)		 273
(100.00 %)		 4,215,923
(50.05 %)		 326,849
(2.26 %)		 10,620,784
(34.46 %)		 0
(0 %)		 636,273
(2.45 %)		 46,936
(1.44 %)		 25,200
(0.84 %)
258 Kenyan clawed frog (NASCO 2022)
GCA_024363595.1		 n/a n/a 21,451
(1.69 %)		 23,652
(2.05 %)		 n/a 38.65
(79.93 %)		 0
(0 %)		 233,029
(20.10 %)		 23,435
(100.00 %)		 5,285,530
(44.53 %)		 579,815
(1.62 %)		 12,925,637
(32.47 %)		 840
(0.04 %)		 407,940
(1.09 %)		 63,201
(0.69 %)		 7,140
(0.09 %)
259 Komodo dragon (SLA01 2019)
GCF_004798865.1		 43,331
(4.33 %)		 n/a 13,543
(1.31 %)		 18,081
(2.11 %)		 n/a 44.04
(99.03 %)		 0
(0 %)		 19,737
(0.97 %)		 1,411
(100.00 %)		 753,603
(4.91 %)		 263,965
(1.41 %)		 8,061,012
(24.65 %)		 582
(0.01 %)		 130,387
(0.66 %)		 49,808
(4.28 %)		 39,034
(2.67 %)
260 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1		 n/a n/a 13,155
(1.15 %)		 22,239
(2.06 %)		 n/a 41.01
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 6,800
(100.00 %)		 1,155,093
(7.75 %)		 707,777
(4.25 %)		 7,071,611
(44.00 %)		 0
(0 %)		 701,636
(4.02 %)		 104,556
(4.39 %)		 22,349
(0.88 %)
261 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1		 n/a n/a 13,350
(1.17 %)		 18,904
(1.93 %)		 n/a 40.96
(99.78 %)		 0
(0 %)		 769
(0.22 %)		 56
(100.00 %)		 1,209,793
(7.69 %)		 762,735
(5.06 %)		 7,424,674
(44.80 %)		 4
(0.00 %)		 794,949
(4.07 %)		 110,631
(4.07 %)		 23,739
(0.88 %)
262 leatherback sea turtle (primary hap 2021)
GCA_009764565.4		 n/a n/a 14,844
(1.08 %)		 16,357
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 0
(0 %)		 668
(0.26 %)		 41
(100.00 %)		 4,070,850
(47.24 %)		 304,774
(1.14 %)		 11,121,781
(34.21 %)		 3
(0.00 %)		 670,729
(2.51 %)		 35,485
(1.36 %)		 20,361
(0.69 %)
263 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2		 n/a n/a 11,035
(1.05 %)		 16,064
(1.50 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 7
(0.00 %)		 9,006
(100.00 %)		 2,685,200
(47.08 %)		 208,060
(1.19 %)		 7,184,246
(33.31 %)		 0
(0 %)		 442,748
(2.46 %)		 25,133
(1.42 %)		 15,054
(0.75 %)
264 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq)
GCF_009764565.3		 73,318
(3.97 %)		 n/a 14,610
(1.03 %)		 16,358
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 0
(0 %)		 668
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,694,449
(14.90 %)		 304,773
(1.14 %)		 11,121,962
(34.21 %)		 3
(0.00 %)		 670,729
(2.51 %)		 35,485
(1.36 %)		 19,615
(0.51 %)
265 Leishan spiny toad (GZLS1 2019)
GCA_009667805.1		 n/a n/a 14,385
(0.55 %)		 44,355
(2.02 %)		 n/a 43.74
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3,282
(0.01 %)		 5,302
(100.00 %)		 1,177,889
(2.23 %)		 2,229,424
(11.42 %)		 13,846,381
(60.05 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 527,079
(7.98 %)		 88,118
(1.38 %)
266 Leopard gecko (TG4126 2023)
GCA_028583425.1		 n/a n/a 14,382
(0.95 %)		 23,083
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 0
(0 %)		 61
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 5,522,949
(40.69 %)		 557,242
(2.88 %)		 11,096,121
(37.91 %)		 0
(0 %)		 608,741
(2.77 %)		 82,956
(2.56 %)		 64,350
(1.54 %)
267 leopard gecko (TG4126 2023)
GCF_028583425.1		 37,133
(2.89 %)		 n/a 14,358
(0.93 %)		 23,080
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 0
(0 %)		 62
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 969,188
(4.21 %)		 557,245
(2.88 %)		 11,096,222
(37.91 %)		 0
(0 %)		 608,752
(2.77 %)		 82,956
(2.56 %)		 27,406
(0.84 %)
268 lesser devil ray (2024)
GCF_963921235.1		 49,601
(2.40 %)		 n/a 12,335
(0.44 %)		 22,690
(1.20 %)		 n/a 42.91
(100.00 %)		 0
(0 %)		 697
(0.00 %)		 200
(100.00 %)		 7,453,775
(54.11 %)		 677,453
(5.15 %)		 18,943,414
(51.98 %)		 4
(0.00 %)		 1,957,188
(3.59 %)		 87,750
(1.43 %)		 61,592
(0.87 %)
269 Lilford's wall lizard (2023)
GCA_947686815.1		 n/a 469,920
(50.82 %)		 14,239
(1.41 %)		 19,740
(2.33 %)		 n/a 43.80
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,346
(0.02 %)		 2,149
(100.00 %)		 830,790
(4.33 %)		 445,450
(2.12 %)		 7,171,057
(36.69 %)		 79
(0.00 %)		 484,294
(2.64 %)		 86,200
(2.56 %)		 19,378
(0.77 %)
270 little skate (New England 2023)
GCF_028641065.1		 40,021
(3.35 %)		 n/a 11,836
(0.67 %)		 25,770
(1.80 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 0
(0 %)		 862
(0.00 %)		 1,769
(100.00 %)		 8,221,960
(66.45 %)		 1,044,111
(3.71 %)		 10,050,264
(53.79 %)		 1
(0.00 %)		 1,424,247
(4.33 %)		 205,567
(4.36 %)		 21,218
(0.48 %)
271 lizards A.tigris stejnegeri (HBS 135688 alternate hap 2025)
GCA_023333555.2		 n/a n/a 11,547
(1.21 %)		 15,609
(1.97 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 42
(0.00 %)		 42
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 3,683,979
(51.31 %)		 480,268
(5.67 %)		 7,021,351
(38.84 %)		 0
(0 %)		 846,378
(3.82 %)		 45,241
(2.12 %)		 18,784
(1.04 %)
272 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap1 2025)
GCA_047715975.1		 n/a n/a 13,605
(0.80 %)		 18,928
(1.32 %)		 n/a 44.97
(100.00 %)		 0
(0 %)		 109
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 1,038,607
(4.70 %)		 891,233
(5.94 %)		 9,004,935
(56.47 %)		 1
(0.00 %)		 1,639,727
(6.17 %)		 245,845
(10.83 %)		 19,287
(0.34 %)
273 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap2 2025)
GCA_047715955.1		 n/a n/a 13,631
(0.79 %)		 18,935
(1.32 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 0
(0 %)		 120
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 1,037,146
(4.72 %)		 933,676
(6.26 %)		 9,009,528
(56.65 %)		 1
(0.00 %)		 1,759,246
(6.36 %)		 246,553
(10.79 %)		 19,416
(0.34 %)
274 lizards B.pumilum (Western Cape Province JTBG20231 2024)
GCA_035047305.1		 n/a n/a 13,670
(0.79 %)		 19,028
(1.31 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 18
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 1,040,467
(4.86 %)		 924,221
(6.37 %)		 9,015,048
(56.81 %)		 1
(0.00 %)		 1,768,582
(6.35 %)		 248,142
(10.84 %)		 19,296
(0.34 %)
275 lizards D.cf. smithi (hap1 2024)
GCA_046126795.1		 n/a n/a 14,308
(0.91 %)		 19,761
(1.58 %)		 n/a 45.95
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 274
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 1,376,454
(8.31 %)		 744,560
(3.94 %)		 11,383,198
(44.04 %)		 5
(0.00 %)		 843,674
(3.07 %)		 208,005
(7.18 %)		 27,218
(0.55 %)
276 lizards D.cf. smithi (hap2 2024)
GCA_046126825.1		 n/a n/a 12,359
(0.99 %)		 16,644
(1.66 %)		 n/a 45.69
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 197
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 1,109,222
(8.21 %)		 607,835
(4.09 %)		 9,080,052
(42.56 %)		 8
(0.00 %)		 670,217
(2.85 %)		 158,727
(6.84 %)		 21,844
(0.57 %)
277 lizards E.multicarinata webbii (San Diego HBS135686 alternate hap 2024)
GCA_023053675.2		 n/a n/a 14,236
(1.17 %)		 19,573
(1.94 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 28
(0.00 %)		 28
(0.00 %)		 655
(100.00 %)		 6,106,640
(52.43 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,804
(40.44 %)		 0
(0 %)		 884,432
(3.64 %)		 81,126
(2.79 %)		 28,794
(0.93 %)
278 lizards F.pardalis (Fpa_1 2023)
GCA_030440675.1		 n/a n/a 13,625
(1.22 %)		 18,049
(1.96 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 12
(0.00 %)		 23
(100.00 %)		 833,693
(2.81 %)		 607,040
(2.82 %)		 7,939,139
(42.05 %)		 0
(0 %)		 421,243
(2.11 %)		 52,987
(2.59 %)		 18,249
(0.61 %)
279 lizards L.agilis (primary hap 2019)
GCA_009819535.1		 n/a n/a 14,350
(1.48 %)		 19,235
(2.45 %)		 n/a 43.75
(99.75 %)		 0
(0 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,417
(1.76 %)		 7,135,058
(34.49 %)		 0
(0 %)		 365,270
(2.50 %)		 76,055
(2.68 %)		 21,617
(0.85 %)
280 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap1.1 2024)
GCA_964188305.1		 n/a n/a 14,091
(1.26 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 2
(0.00 %)		 1,005
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 932,842
(5.02 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,536
(41.39 %)		 10
(0.00 %)		 772,110
(4.54 %)		 119,467
(4.32 %)		 20,701
(0.72 %)
281 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap2.1 2024)
GCA_964188325.1		 n/a n/a 13,653
(1.34 %)		 19,764
(2.32 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 817
(0.01 %)		 817
(0.01 %)		 1,444
(99.99 %)		 857,503
(4.68 %)		 507,819
(4.16 %)		 6,632,822
(39.41 %)		 4
(0.00 %)		 653,978
(4.13 %)		 103,858
(4.10 %)		 19,626
(0.75 %)
282 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap1.1 2024)
GCA_964252035.1		 n/a n/a 13,858
(1.33 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 0
(0 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 885,596
(4.43 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,008,185
(38.56 %)		 2
(0.00 %)		 527,173
(3.21 %)		 89,737
(2.87 %)		 18,878
(0.71 %)
283 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap2.1 2024)
GCA_964251985.1		 n/a n/a 13,817
(1.35 %)		 21,024
(2.50 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 811
(0.01 %)		 811
(0.01 %)		 1,458
(99.99 %)		 890,080
(4.42 %)		 526,749
(3.38 %)		 7,001,691
(37.94 %)		 9
(0.00 %)		 538,033
(3.26 %)		 89,526
(2.96 %)		 20,250
(0.75 %)
284 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap1.1 2024)
GCA_964234715.1		 n/a n/a 14,289
(1.31 %)		 20,112
(2.23 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 1
(0.00 %)		 823
(0.01 %)		 387
(100.00 %)		 830,352
(7.87 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,838,068
(40.20 %)		 2
(0.00 %)		 932,658
(4.44 %)		 90,074
(2.82 %)		 20,501
(0.74 %)
285 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap2.1 2024)
GCA_964234825.1		 n/a n/a 13,759
(1.39 %)		 19,452
(2.34 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 754
(0.01 %)		 754
(0.01 %)		 954
(99.99 %)		 768,595
(5.31 %)		 448,816
(5.54 %)		 6,722,284
(37.88 %)		 3
(0.00 %)		 638,565
(3.67 %)		 82,575
(2.83 %)		 19,444
(0.76 %)
286 lizards P.pityusensis (hap1.2 2024)
GCF_964106645.1		 68,289
(5.99 %)		 n/a 14,362
(1.39 %)		 20,488
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,506
(0.02 %)		 336
(100.00 %)		 4,977,407
(51.01 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,060,761
(38.21 %)		 40
(0.00 %)		 544,983
(3.43 %)		 96,600
(3.21 %)		 20,448
(0.93 %)
287 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap1.2 2024)
GCA_964106645.2		 n/a n/a 14,314
(1.36 %)		 20,522
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 1
(0.00 %)		 1,506
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 858,648
(4.22 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,061,380
(38.21 %)		 40
(0.00 %)		 544,982
(3.43 %)		 96,600
(3.21 %)		 19,808
(0.82 %)
288 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap2.2 2024)
GCA_964106635.2		 n/a n/a 13,828
(1.41 %)		 19,048
(2.34 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,548
(99.98 %)		 803,451
(4.16 %)		 440,340
(2.30 %)		 6,774,254
(37.14 %)		 34
(0.00 %)		 471,503
(3.14 %)		 89,229
(3.04 %)		 18,652
(0.77 %)
289 lizards P.tiliguerta (hap2.2 2025)
GCA_965153305.2		 n/a n/a 13,808
(1.46 %)		 19,314
(2.39 %)		 n/a 44.01
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,003
(0.01 %)		 307
(100.00 %)		 4,685,494
(49.03 %)		 429,388
(4.28 %)		 6,635,321
(36.92 %)		 9
(0.00 %)		 590,226
(3.64 %)		 92,746
(3.04 %)		 21,518
(0.94 %)
290 lizards P.vaucheri (hap1.1 2025)
GCA_965113315.1		 n/a n/a 14,329
(1.28 %)		 20,152
(2.19 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 0
(0 %)		 949
(0.01 %)		 285
(100.00 %)		 893,567
(5.89 %)		 524,077
(6.62 %)		 7,052,308
(41.37 %)		 8
(0.00 %)		 922,684
(4.86 %)		 109,507
(3.61 %)		 21,052
(0.73 %)
291 lizards P.vaucheri (hap2.1 2025)
GCA_965113305.1		 n/a n/a 13,794
(1.32 %)		 19,189
(2.22 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 0
(0 %)		 852
(0.01 %)		 151
(100.00 %)		 841,282
(5.59 %)		 483,392
(6.01 %)		 6,750,191
(40.39 %)		 6
(0.00 %)		 792,951
(4.56 %)		 101,153
(3.51 %)		 19,899
(0.74 %)
292 lizards T.scincoides (rTilSci1hap2 2024)
GCF_035046505.1		 33,280
(3.42 %)		 n/a 13,266
(1.21 %)		 16,752
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 0
(0 %)		 506,831
(2.74 %)		 28,089
(0.98 %)		 14,987
(0.51 %)
293 loggerhead turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965140235.1		 n/a 24,360
(1.83 %)		 14,764
(1.02 %)		 17,699
(1.53 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 1
(0.00 %)		 593,928
(2.38 %)		 54,290
(1.49 %)		 25,037
(0.61 %)
294 loggerhead turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965140235.1		 65,475
(4.14 %)		 n/a 14,764
(1.02 %)		 17,658
(1.52 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 1
(0.00 %)		 593,928
(2.38 %)		 54,290
(1.49 %)		 25,037
(0.61 %)
295 loggerhead turtle (hap2 2025)
GCA_965140275.1		 n/a 26,024
(1.93 %)		 14,889
(1.04 %)		 17,867
(1.54 %)		 n/a 44.11
(99.97 %)		 52
(0.03 %)		 52
(0.03 %)		 85
(99.97 %)		 1,300,553
(12.44 %)		 332,623
(1.45 %)		 10,721,628
(34.40 %)		 1
(0.00 %)		 604,146
(2.41 %)		 53,746
(1.50 %)		 25,360
(0.62 %)
296 loggerhead turtle (v1 SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.1		 61,644
(3.99 %)		 n/a 14,678
(1.05 %)		 17,405
(1.52 %)		 42,180
(2.89 %)		 44.04
(99.90 %)		 0
(0 %)		 745
(0.10 %)		 2,008
(100.00 %)		 1,279,721
(12.58 %)		 319,729
(1.29 %)		 10,705,612
(33.91 %)		 4
(0.00 %)		 545,387
(2.26 %)		 49,015
(1.39 %)		 25,064
(0.63 %)
297 loggerhead turtle (v2 SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.2		 61,631
(3.99 %)		 n/a 14,676
(1.05 %)		 17,408
(1.52 %)		 n/a 44.04
(99.90 %)		 0
(0 %)		 744
(0.10 %)		 2,007
(100.00 %)		 1,254,882
(12.49 %)		 319,728
(1.29 %)		 10,705,331
(33.91 %)		 4
(0.00 %)		 545,387
(2.26 %)		 49,015
(1.39 %)		 25,064
(0.63 %)
298 Madagascar ground gecko (Pp20150507F 2025)
GCF_049243985.1		 63,376
(4.98 %)		 n/a 14,114
(1.20 %)		 21,281
(2.04 %)		 n/a 44.75
(98.94 %)		 0
(0 %)		 2,618
(1.06 %)		 80
(100.00 %)		 4,103,102
(50.19 %)		 494,624
(8.01 %)		 8,310,560
(39.86 %)		 0
(0 %)		 891,743
(3.93 %)		 87,981
(3.16 %)		 38,416
(1.39 %)
299 mainland tiger snake
GCF_900518725.1		 34,251
(3.18 %)		 n/a 13,445
(1.15 %)		 23,410
(1.90 %)		 n/a 39.72
(95.17 %)		 0
(0 %)		 79,478
(4.84 %)		 52,414
(100.00 %)		 1,081,503
(6.00 %)		 711,408
(2.47 %)		 8,047,065
(40.24 %)		 3,772
(0.08 %)		 265,750
(1.48 %)		 61,669
(2.47 %)		 18,916
(0.65 %)
300 many-banded krait (BM01 2022)
GCA_023653725.1		 n/a n/a 13,269
(1.19 %)		 18,533
(1.94 %)		 n/a 39.87
(99.25 %)		 0
(0 %)		 1,631
(0.75 %)		 448
(100.00 %)		 1,104,569
(6.42 %)		 703,174
(3.07 %)		 8,451,422
(40.97 %)		 0
(0 %)		 395,083
(2.25 %)		 65,260
(2.74 %)		 19,850
(0.80 %)
301 marbled electric ray (2025)
GCA_977017645.1		 n/a n/a 12,155
(0.24 %)		 25,844
(0.70 %)		 n/a 43.83
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3,402
(0.01 %)		 4,566
(100.00 %)		 10,762,422
(61.06 %)		 1,754,113
(25.79 %)		 13,259,628
(78.62 %)		 19
(0.00 %)		 10,867,629
(11.00 %)		 445,127
(7.22 %)		 27,366
(0.20 %)
302 marbled whiptail (SIMRID8450 2020)
GCA_014337955.1		 n/a n/a 13,646
(1.27 %)		 18,378
(2.09 %)		 n/a 42.67
(94.37 %)		 0
(0 %)		 166,840
(5.67 %)		 3,826
(100.00 %)		 809,278
(4.31 %)		 439,020
(1.66 %)		 8,665,254
(33.02 %)		 23,254
(0.24 %)		 223,741
(0.91 %)		 41,638
(1.70 %)		 20,448
(0.83 %)
303 marine toad (2024)
GCA_900303285.2		 n/a n/a 14,493
(0.58 %)		 34,827
(1.87 %)		 n/a 43.75
(99.75 %)		 6,072
(0.25 %)		 6,072
(0.25 %)		 13,196
(99.75 %)		 7,310,953
(73.85 %)		 2,117,104
(17.81 %)		 13,354,560
(61.28 %)		 4
(0.00 %)		 5,624,176
(10.95 %)		 255,756
(3.08 %)		 29,018
(0.39 %)
304 McCord's box turtle (ISIS_951048 2018)
GCA_003846335.1		 n/a n/a 16,317
(1.05 %)		 26,320
(1.64 %)		 n/a 44.69
(94.58 %)		 50,040
(5.43 %)		 50,040
(5.43 %)		 141,912
(94.57 %)		 4,185,106
(47.48 %)		 331,791
(1.03 %)		 11,180,962
(31.97 %)		 3,878
(0.08 %)		 197,942
(0.76 %)		 126,459
(3.07 %)		 32,569
(0.77 %)
305 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1		 n/a n/a 10,549
(1.13 %)		 20,171
(2.08 %)		 n/a 41.02
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 12
(0.00 %)		 9,587
(100.00 %)		 889,533
(7.84 %)		 565,831
(6.37 %)		 5,968,624
(41.74 %)		 0
(0 %)		 615,578
(4.07 %)		 73,632
(3.80 %)		 21,339
(1.17 %)
306 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1		 n/a n/a 13,282
(1.16 %)		 18,653
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 1,187,501
(7.72 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,428,147
(45.35 %)		 13
(0.00 %)		 770,603
(3.87 %)		 101,007
(3.95 %)		 24,179
(0.84 %)
307 Mediterranean moray (2026)
GCA_978019965.1		 n/a n/a 16,427
(1.01 %)		 45,776
(4.00 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 0
(0 %)		 58
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 3,557,255
(27.83 %)		 801,510
(11.48 %)		 9,376,875
(41.09 %)		 1
(0.00 %)		 1,288,639
(5.04 %)		 125,556
(2.63 %)		 62,231
(1.17 %)
308 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1		 n/a n/a 14,442
(0.44 %)		 24,630
(1.28 %)		 n/a 41.94
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,032
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 1,928,361
(2.22 %)		 2,955,095
(11.97 %)		 25,178,773
(53.55 %)		 7
(0.00 %)		 5,022,575
(7.68 %)		 165,699
(1.23 %)		 16,842
(0.16 %)
309 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1		 n/a n/a 13,824
(0.44 %)		 23,296
(1.27 %)		 n/a 41.86
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,009
(0.01 %)		 656
(100.00 %)		 1,860,053
(2.17 %)		 2,751,941
(10.76 %)		 24,252,866
(53.00 %)		 11
(0.00 %)		 4,329,852
(7.13 %)		 157,012
(1.21 %)		 15,742
(0.15 %)
310 Mexican gopher tortoise (maternal hap 2022)
GCA_025201925.1		 n/a n/a 14,970
(1.00 %)		 18,525
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 0
(0 %)		 1,866
(3.64 %)		 622
(100.00 %)		 4,639,733
(52.18 %)		 472,502
(3.42 %)		 11,362,004
(34.69 %)		 1
(0.00 %)		 910,548
(2.73 %)		 73,700
(2.04 %)		 20,818
(0.58 %)
311 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1		 62,007
(3.15 %)		 n/a 14,883
(0.96 %)		 18,524
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 0
(0 %)		 1,866
(3.64 %)		 621
(100.00 %)		 1,372,189
(11.32 %)		 472,501
(3.42 %)		 11,362,604
(34.69 %)		 1
(0.00 %)		 910,675
(2.73 %)		 73,700
(2.04 %)		 22,443
(0.52 %)
312 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1		 n/a n/a 15,425
(0.94 %)		 20,005
(1.48 %)		 n/a 44.46
(95.51 %)		 1,790
(4.49 %)		 1,790
(4.49 %)		 4,782
(95.51 %)		 1,404,726
(11.28 %)		 453,302
(2.47 %)		 11,996,092
(34.08 %)		 3
(0.00 %)		 712,154
(2.19 %)		 77,167
(2.14 %)		 23,282
(0.51 %)
313 Mexican spadefoot toad (hap1 2026)
GCA_054668525.1		 n/a n/a 13,828
(2.09 %)		 25,439
(4.41 %)		 n/a 40.23
(100.00 %)		 0
(0 %)		 267
(0.00 %)		 504
(100.00 %)		 2,096,085
(40.85 %)		 598,367
(11.73 %)		 5,067,467
(36.37 %)		 3
(0.00 %)		 726,175
(6.14 %)		 61,483
(4.17 %)		 27,970
(1.87 %)
314 Mexican spadefoot toad (hap2 2026)
GCA_054668515.1		 n/a n/a 13,495
(2.09 %)		 25,018
(4.52 %)		 n/a 40.14
(100.00 %)		 0
(0 %)		 264
(0.00 %)		 292
(100.00 %)		 2,067,301
(40.12 %)		 572,672
(10.63 %)		 4,990,706
(35.30 %)		 3
(0.00 %)		 667,170
(5.72 %)		 60,199
(4.15 %)		 26,967
(1.84 %)
315 mimic poison frog (alternate hap 2023)
GCA_032442605.1		 n/a n/a 25
(0.76 %)		 202
(6.98 %)		 n/a 51.33
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 4,414
(23.25 %)		 1,907
(64.24 %)		 6,592
(56.32 %)		 0
(0 %)		 12,497
(20.91 %)		 305
(4.46 %)		 221
(2.55 %)
316 mimic poison frog (primary hap 2023 genbank)
GCA_032444005.1		 n/a n/a 14,957
(0.34 %)		 n/a n/a 44.95
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,686
(100.00 %)		 1,716,760
(1.89 %)		 4,088,695
(23.45 %)		 2,437
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 10,590,500
(14.66 %)		 n/a n/a
317 mimic poison frog (primary hap 2023 refseq)
GCF_032444005.1		 53,268
(1.27 %)		 n/a 14,955
(0.34 %)		 42,108
(1.16 %)		 n/a 44.95
(100.00 %)		 0
(0 %)		 765
(0.00 %)		 1,672
(100.00 %)		 1,716,755
(1.89 %)		 4,088,682
(23.45 %)		 16,441,719
(72.26 %)		 14
(0.00 %)		 4,114,618
(5.60 %)		 694,865
(6.34 %)		 674,154
(5.93 %)
318 Mississippi paddlefish
GCF_017654505.1		 66,213
(6.17 %)		 n/a 21,806
(1.85 %)		 31,525
(3.80 %)		 n/a 39.02
(99.89 %)		 2,957
(0.11 %)		 2,963
(0.11 %)		 7,192
(99.89 %)		 1,126,936
(3.66 %)		 877,525
(6.33 %)		 9,039,918
(36.85 %)		 1
(0.00 %)		 775,360
(3.40 %)		 29,954
(1.06 %)		 14,005
(0.40 %)
319 Murray river turtle (Brisbane River MOO-44397 2024)
GCF_026122565.2		 48,414
(3.72 %)		 n/a 14,988
(1.18 %)		 20,316
(1.85 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,735
(100.00 %)		 1,108,636
(10.97 %)		 229,329
(1.01 %)		 11,088,528
(25.43 %)		 0
(0 %)		 192,826
(0.74 %)		 49,188
(1.67 %)		 36,282
(1.24 %)
320 natterjack toad (hap1.1 2026)
GCA_978041865.1		 n/a n/a 14,208
(0.53 %)		 29,948
(1.62 %)		 n/a 43.26
(100.00 %)		 0
(0 %)		 566
(0.00 %)		 549
(100.00 %)		 10,491,328
(76.75 %)		 2,105,613
(18.02 %)		 15,911,863
(60.52 %)		 4
(0.00 %)		 965,564
(1.93 %)		 227,983
(2.30 %)		 26,189
(0.34 %)
321 natterjack toad (hap2.1 2026)
GCA_978041805.1		 n/a n/a 14,163
(0.53 %)		 29,749
(1.58 %)		 n/a 43.25
(100.00 %)		 0
(0 %)		 542
(0.00 %)		 535
(100.00 %)		 10,527,100
(76.82 %)		 2,103,391
(17.75 %)		 15,923,083
(60.50 %)		 8
(0.00 %)		 568,226
(1.17 %)		 227,482
(2.26 %)		 25,709
(0.31 %)
322 Nile crocodile (hap1 2026)
GCA_054954115.1		 n/a n/a 14,644
(0.99 %)		 19,094
(1.48 %)		 n/a 45.35
(100.00 %)		 0
(0 %)		 36
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 3,197,557
(41.29 %)		 411,882
(3.33 %)		 12,292,120
(32.84 %)		 0
(0 %)		 489,331
(1.80 %)		 41,659
(2.72 %)		 31,913
(1.65 %)
323 Nile crocodile (hap2 2026)
GCA_054825085.1		 n/a n/a 14,603
(0.98 %)		 18,975
(1.46 %)		 n/a 45.39
(100.00 %)		 0
(0 %)		 51
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 3,204,046
(41.22 %)		 450,353
(3.49 %)		 12,134,419
(32.77 %)		 2
(0.00 %)		 457,093
(1.60 %)		 42,362
(2.73 %)		 32,635
(1.64 %)
324 Northern rubber boa (HBS 135849 alternate hap 2022)
GCA_023362785.1		 n/a n/a 12,816
(1.09 %)		 18,099
(1.83 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 0
(0 %)		 84
(0.00 %)		 224
(100.00 %)		 1,081,107
(4.01 %)		 728,703
(4.64 %)		 6,961,724
(42.46 %)		 1
(0.00 %)		 702,049
(3.73 %)		 128,617
(3.90 %)		 25,981
(1.05 %)
325 Northern rubber boa (HBS 135849 primary hap 2022)
GCA_023362775.1		 n/a n/a 13,531
(1.08 %)		 18,971
(1.81 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 0
(0 %)		 85
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 1,138,891
(3.99 %)		 798,941
(5.00 %)		 7,476,142
(42.85 %)		 1
(0.00 %)		 757,393
(3.80 %)		 135,874
(3.88 %)		 27,035
(1.02 %)
326 Northwestern pond turtle (WTP2003 alternate hap 2022)
GCA_022086895.1		 n/a n/a 14,212
(1.00 %)		 20,203
(1.65 %)		 n/a 44.72
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,800
(0.01 %)		 2,508
(100.00 %)		 4,246,095
(48.91 %)		 442,393
(1.88 %)		 10,453,096
(35.71 %)		 43
(0.00 %)		 450,873
(2.62 %)		 134,572
(3.12 %)		 28,350
(0.78 %)
327 Northwestern pond turtle (WTP2003 primary hap 2022)
GCA_022086475.1		 n/a n/a 14,862
(1.02 %)		 19,830
(1.62 %)		 n/a 44.76
(100.00 %)		 0
(0 %)		 148
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 4,413,681
(48.88 %)		 459,701
(1.92 %)		 11,014,102
(35.89 %)		 1
(0.00 %)		 468,618
(2.09 %)		 141,800
(3.08 %)		 30,071
(0.78 %)
328 nurse shark (FLO180531 2022)
GCA_024137785.1		 n/a n/a 11,376
(0.58 %)		 14,375
(1.25 %)		 n/a 41.63
(56.77 %)		 68,882
(43.24 %)		 68,882
(43.24 %)		 69,171
(56.76 %)		 8,181,216
(65.52 %)		 260,159
(0.44 %)		 14,324,615
(20.45 %)		 7,261
(0.09 %)		 316,372
(0.55 %)		 13,165
(0.13 %)		 7,539
(0.08 %)
329 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1		 n/a n/a 13,448
(1.31 %)		 17,745
(2.07 %)		 n/a 40.20
(99.98 %)		 73
(0.02 %)		 73
(0.02 %)		 116
(99.98 %)		 741,052
(2.98 %)		 411,477
(3.31 %)		 7,668,994
(30.14 %)		 0
(0 %)		 318,343
(2.06 %)		 34,560
(2.18 %)		 21,974
(1.10 %)
330 olive python (hap1 2026)
GCA_057929095.1		 n/a n/a 13,636
(1.36 %)		 17,657
(2.07 %)		 n/a 40.20
(100.00 %)		 0
(0 %)		 40
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 2,869,112
(39.35 %)		 413,970
(3.27 %)		 7,686,808
(30.21 %)		 1
(0.00 %)		 316,706
(2.06 %)		 34,733
(2.18 %)		 21,435
(1.17 %)
331 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1		 n/a n/a 13,421
(1.31 %)		 17,659
(2.08 %)		 n/a 40.15
(99.66 %)		 93
(0.34 %)		 93
(0.34 %)		 158
(99.66 %)		 733,358
(2.95 %)		 403,552
(3.04 %)		 7,746,871
(29.97 %)		 0
(0 %)		 294,855
(1.92 %)		 34,363
(2.08 %)		 21,752
(1.10 %)
332 olive python (hap2 2026)
GCA_057929265.1		 n/a n/a 13,629
(1.36 %)		 17,640
(2.07 %)		 n/a 40.19
(100.00 %)		 0
(0 %)		 39
(0.00 %)		 45
(100.00 %)		 2,868,493
(39.34 %)		 413,676
(3.27 %)		 7,686,615
(30.20 %)		 1
(0.00 %)		 316,145
(2.04 %)		 34,728
(2.16 %)		 21,432
(1.17 %)
333 Pacific lamprey (Columbia River large-bodied, stream-maturing ecotype CRITFC18_GStd-0006 2020)
GCA_014621495.2		 n/a n/a 6,827
(0.82 %)		 38,010
(4.29 %)		 n/a 48.07
(86.05 %)		 0
(0 %)		 63,604
(13.95 %)		 141,124
(100.00 %)		 2,948,140
(52.71 %)		 971,264
(7.81 %)		 4,836,103
(36.27 %)		 7,699
(0.31 %)		 n/a 186,153
(29.43 %)		 141,969
(7.00 %)
334 Pacific ridley (hap1 2025 genbank)
GCA_965140295.1		 n/a 21,497
(1.67 %)		 14,698
(1.03 %)		 17,429
(1.50 %)		 n/a 44.13
(99.98 %)		 0
(0 %)		 69
(0.02 %)		 44
(100.00 %)		 1,340,389
(12.41 %)		 313,433
(2.43 %)		 10,832,333
(34.73 %)		 1
(0.00 %)		 642,980
(2.58 %)		 47,256
(1.42 %)		 24,677
(0.61 %)
335 Pacific ridley (hap1 2025 refseq)
GCF_965140295.1		 48,786
(3.33 %)		 n/a 14,876
(1.07 %)		 17,430
(1.50 %)		 n/a 44.13
(99.98 %)		 69
(0.02 %)		 69
(0.02 %)		 112
(99.98 %)		 4,157,740
(50.14 %)		 313,430
(2.43 %)		 10,832,284
(34.73 %)		 1
(0.00 %)		 642,979
(2.58 %)		 47,256
(1.42 %)		 24,651
(0.82 %)
336 Pacific ridley (hap2 2025)
GCA_965140255.1		 n/a 24,067
(1.82 %)		 14,883
(1.03 %)		 17,736
(1.52 %)		 n/a 44.14
(99.96 %)		 76
(0.04 %)		 76
(0.04 %)		 115
(99.96 %)		 1,337,786
(12.39 %)		 317,205
(2.38 %)		 10,851,496
(34.73 %)		 1
(0.00 %)		 652,074
(2.60 %)		 47,955
(1.47 %)		 25,100
(0.62 %)
337 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1		 n/a n/a 7,223
(0.52 %)		 11,927
(1.11 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 76
(0.00 %)		 4,081
(100.00 %)		 988,792
(3.99 %)		 1,766,202
(10.24 %)		 9,974,001
(52.99 %)		 0
(0 %)		 1,733,898
(6.80 %)		 64,462
(1.33 %)		 4,213
(0.08 %)
338 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1		 n/a n/a 14,522
(0.54 %)		 21,861
(1.14 %)		 n/a 39.52
(98.39 %)		 0
(0 %)		 3,681
(1.61 %)		 1,318
(100.00 %)		 1,928,844
(4.34 %)		 3,684,477
(13.44 %)		 19,091,818
(55.21 %)		 1
(0.00 %)		 4,715,600
(8.73 %)		 127,760
(1.34 %)		 9,458
(0.10 %)
339 palmate newt (alternate hap 2024)
GCA_964258895.1		 n/a n/a 13,011
(0.06 %)		 269,650
(1.87 %)		 n/a 44.94
(100.00 %)		 123
(0.00 %)		 123
(0.00 %)		 233,842
(100.00 %)		 4,147,487
(1.62 %)		 8,364,812
(13.65 %)		 78,522,792
(49.21 %)		 2
(0.00 %)		 n/a 2,116,175
(7.96 %)		 612,854
(1.67 %)
340 palmate newt (primary hap 2024)
GCA_964261635.1		 n/a n/a 17,611
(0.09 %)		 227,382
(1.73 %)		 n/a 45.09
(100.00 %)		 0
(0 %)		 5,245
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,668,195
(1.49 %)		 9,253,372
(10.94 %)		 95,073,160
(47.58 %)		 48
(0.00 %)		 1,460,718
(0.63 %)		 2,493,727
(7.98 %)		 2,437,739
(7.71 %)
341 palmate newt (primary hap 2026)
GCA_964261635.2		 n/a n/a 16,530
(0.09 %)		 227,377
(1.73 %)		 n/a 45.09
(100.00 %)		 0
(0 %)		 5,245
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,696,508
(1.49 %)		 9,253,372
(10.94 %)		 95,073,160
(47.58 %)		 48
(0.00 %)		 1,461,716
(0.63 %)		 2,493,727
(7.98 %)		 723,217
(1.70 %)
342 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1		 n/a n/a 13,365
(1.26 %)		 17,388
(1.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 99
(0.00 %)		 279
(100.00 %)		 726,428
(2.81 %)		 331,756
(2.05 %)		 7,184,711
(33.57 %)		 2
(0.00 %)		 316,815
(2.51 %)		 51,973
(2.70 %)		 19,565
(0.92 %)
343 Papuan ground boa (hap2 2024 genbank)
GCA_035149785.1		 n/a n/a 13,390
(1.26 %)		 17,496
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 101
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 728,574
(2.82 %)		 348,605
(2.13 %)		 7,199,124
(33.55 %)		 1
(0.00 %)		 318,788
(2.43 %)		 51,807
(2.69 %)		 19,758
(0.92 %)
344 Papuan ground boa (hap2 2024 refseq)
GCF_035149785.1		 31,826
(3.55 %)		 n/a 13,389
(1.26 %)		 17,495
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 101
(0.00 %)		 149
(100.00 %)		 728,567
(2.82 %)		 348,603
(2.13 %)		 7,199,026
(33.55 %)		 1
(0.00 %)		 318,786
(2.43 %)		 51,807
(2.69 %)		 19,758
(0.92 %)
345 Peter's clawed frog (maternal hap 2024)
GCA_038501915.1		 n/a n/a 21,977
(1.55 %)		 31,925
(2.52 %)		 n/a 39.40
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,072
(0.01 %)		 1,183
(100.00 %)		 825,817
(1.86 %)		 1,047,172
(7.89 %)		 12,996,911
(44.48 %)		 3
(0.00 %)		 1,701,385
(5.28 %)		 99,118
(1.26 %)		 15,547
(0.21 %)
346 Peter's clawed frog (paternal hap 2024)
GCA_038501925.1		 n/a n/a 23,766
(1.52 %)		 34,093
(2.42 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 500
(0.00 %)		 897
(100.00 %)		 919,152
(1.89 %)		 1,157,711
(8.01 %)		 14,217,996
(45.44 %)		 0
(0 %)		 1,995,399
(5.51 %)		 108,139
(1.26 %)		 16,761
(0.21 %)
347 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023 genbank)
GCA_033958435.1		 n/a n/a 14,675
(1.05 %)		 16,697
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 0
(0 %)		 12
(0.00 %)		 134
(100.00 %)		 3,772,260
(47.94 %)		 322,081
(1.52 %)		 11,123,166
(34.14 %)		 0
(0 %)		 448,027
(1.56 %)		 129,645
(3.29 %)		 28,529
(1.18 %)
348 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023 refseq)
GCF_033958435.1		 49,040
(3.30 %)		 n/a 14,310
(1.00 %)		 16,693
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 0
(0 %)		 12
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 987,712
(8.97 %)		 322,082
(1.52 %)		 11,123,189
(34.14 %)		 0
(0 %)		 448,027
(1.56 %)		 129,645
(3.29 %)		 27,654
(0.89 %)
349 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2		 n/a n/a 10,906
(1.98 %)		 19,820
(4.33 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,516
(100.00 %)		 390,896
(3.25 %)		 482,493
(7.83 %)		 4,361,670
(34.36 %)		 0
(0 %)		 491,019
(5.12 %)		 52,508
(3.70 %)		 21,519
(1.51 %)
350 plains spadefoot toad (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358695.2		 n/a n/a 13,760
(2.05 %)		 25,743
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 0
(0 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 2,153,589
(42.02 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,323
(36.26 %)		 1
(0.00 %)		 748,493
(5.83 %)		 72,598
(4.35 %)		 27,953
(1.65 %)
351 plains spadefoot toad (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358695.1		 41,009
(4.67 %)		 n/a 13,912
(2.00 %)		 25,745
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 0
(0 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 497,976
(3.84 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,342
(36.26 %)		 1
(0.00 %)		 748,493
(5.83 %)		 72,598
(4.35 %)		 32,385
(1.89 %)
352 pool frog (hap1 2025 genbank)
GCA_965119305.1		 n/a n/a 14,446
(0.34 %)		 39,585
(1.24 %)		 n/a 43.75
(99.99 %)		 33
(0.00 %)		 3,044
(0.01 %)		 1,361
(100.00 %)		 2,734,844
(2.59 %)		 3,759,979
(13.10 %)		 24,289,849
(60.22 %)		 22
(0.00 %)		 6,436,651
(8.33 %)		 558,423
(4.11 %)		 48,365
(0.35 %)
353 pool frog (hap1 2025 refseq)
GCF_965119305.1		 35,542
(0.88 %)		 n/a 14,446
(0.34 %)		 39,587
(1.24 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 3,044
(0.01 %)		 1,328
(100.00 %)		 2,757,940
(2.59 %)		 3,759,979
(13.10 %)		 24,289,848
(60.22 %)		 22
(0.00 %)		 1,957,532
(2.40 %)		 558,423
(4.11 %)		 48,365
(0.35 %)
354 pool frog (hap2 2025)
GCA_965119315.1		 n/a n/a 14,335
(0.34 %)		 39,545
(1.24 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 2,703
(0.01 %)		 2,703
(0.01 %)		 3,680
(99.99 %)		 2,706,037
(2.56 %)		 3,712,706
(12.97 %)		 23,911,913
(60.10 %)		 18
(0.00 %)		 6,326,504
(8.24 %)		 553,381
(4.05 %)		 47,813
(0.35 %)
355 Potamotrygon marinae (hap2 2026)
GCA_055471215.1		 n/a n/a 11,848
(0.34 %)		 21,950
(0.94 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 1,012
(0.00 %)		 759
(100.00 %)		 9,567,782
(73.65 %)		 740,953
(13.73 %)		 20,017,437
(57.75 %)		 4
(0.00 %)		 1,832,498
(3.19 %)		 52,576
(0.65 %)		 19,318
(0.25 %)
356 prickly gecko (False Entrance Well CCM8104 2023)
GCF_032191835.1		 35,381
(2.07 %)		 n/a 14,394
(0.79 %)		 23,371
(1.60 %)		 n/a 44.78
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,608
(0.01 %)		 661
(100.00 %)		 1,995,033
(8.75 %)		 823,022
(6.51 %)		 12,116,860
(46.84 %)		 9
(0.00 %)		 1,818,752
(4.81 %)		 117,191
(3.14 %)		 39,240
(0.76 %)
357 prickly shark (hap1 2026)
GCA_057877045.1		 n/a n/a 13,126
(0.23 %)		 29,347
(0.82 %)		 n/a 48.18
(99.99 %)		 0
(0 %)		 5,153
(0.01 %)		 3,906
(100.00 %)		 1,289,061
(6.83 %)		 3,350,270
(36.32 %)		 16,573,834
(77.52 %)		 28
(0.00 %)		 5,794,211
(5.45 %)		 662,154
(10.72 %)		 33,421
(0.21 %)
358 prickly shark (hap2 2026)
GCA_057876775.1		 n/a n/a 12,978
(0.26 %)		 28,116
(0.88 %)		 n/a 48.35
(99.98 %)		 0
(0 %)		 4,924
(0.02 %)		 2,205
(100.00 %)		 1,101,970
(5.16 %)		 2,769,674
(32.64 %)		 15,562,460
(75.20 %)		 12
(0.00 %)		 3,668,757
(3.84 %)		 617,230
(10.59 %)		 31,551
(0.22 %)
359 Puerto Rican coqui (hap1 2024 refseq)
GCF_035609145.1		 44,598
(2.13 %)		 n/a 13,879
(0.57 %)		 31,890
(1.61 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 0
(0 %)		 659
(0.00 %)		 956
(100.00 %)		 1,044,176
(1.98 %)		 1,442,184
(16.51 %)		 14,710,122
(54.00 %)		 6
(0.00 %)		 4,070,191
(8.73 %)		 501,931
(8.81 %)		 49,483
(0.82 %)
360 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1		 n/a n/a 13,892
(0.57 %)		 32,011
(1.64 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 16
(0.00 %)		 685
(0.00 %)		 843
(100.00 %)		 1,042,636
(2.00 %)		 1,430,690
(16.22 %)		 14,621,029
(53.91 %)		 19
(0.00 %)		 4,063,379
(8.75 %)		 503,166
(8.84 %)		 49,100
(0.82 %)
361 Puget Sound dogfish (hap1 2025)
GCA_050613905.1		 n/a n/a 13,335
(0.31 %)		 32,914
(1.25 %)		 n/a 46.84
(99.98 %)		 0
(0 %)		 4,275
(0.02 %)		 3,203
(100.00 %)		 996,444
(5.35 %)		 1,697,611
(29.47 %)		 16,252,127
(70.13 %)		 12
(0.00 %)		 6,495,224
(7.46 %)		 372,462
(5.80 %)		 41,897
(0.34 %)
362 Puget Sound dogfish (sSquSuc3hap2 2025)
GCA_050613895.1		 n/a n/a 13,151
(0.34 %)		 29,417
(1.19 %)		 n/a 46.65
(99.98 %)		 0
(0 %)		 4,144
(0.02 %)		 1,862
(100.00 %)		 887,790
(4.65 %)		 1,380,618
(26.09 %)		 14,838,724
(67.96 %)		 14
(0.00 %)		 3,842,903
(5.01 %)		 333,223
(5.63 %)		 37,016
(0.35 %)
363 ray-finned fishes P.merretti (hap1 2026)
GCA_057931045.1		 n/a n/a 17,686
(1.81 %)		 37,595
(4.88 %)		 n/a 43.72
(100.00 %)		 0
(0 %)		 278
(0.00 %)		 126
(100.00 %)		 3,118,708
(34.41 %)		 852,554
(9.08 %)		 6,259,550
(34.71 %)		 3
(0.00 %)		 920,658
(5.34 %)		 144,915
(6.52 %)		 90,537
(3.13 %)
364 ray-finned fishes P.merretti (hap2 2026)
GCA_057931065.1		 n/a n/a 16,169
(1.87 %)		 33,742
(4.94 %)		 n/a 43.63
(100.00 %)		 0
(0 %)		 236
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 2,757,145
(33.55 %)		 765,151
(8.12 %)		 5,640,514
(33.63 %)		 6
(0.00 %)		 729,239
(4.76 %)		 130,213
(6.47 %)		 82,744
(3.22 %)
365 red stingray (2025)
GCF_048418815.1		 55,797
(2.16 %)		 n/a 12,249
(0.37 %)		 26,981
(1.23 %)		 n/a 43.17
(94.93 %)		 0
(0 %)		 2,066
(5.07 %)		 261
(100.00 %)		 832,690
(1.45 %)		 801,096
(12.24 %)		 21,031,370
(49.66 %)		 4
(0.00 %)		 1,705,095
(2.86 %)		 108,035
(1.85 %)		 34,244
(0.37 %)
366 red-eared slider turtle
GCF_013100865.1		 47,272
(3.27 %)		 n/a 13,909
(1.05 %)		 16,674
(1.54 %)		 n/a 43.81
(96.14 %)		 0
(0 %)		 25,390
(3.86 %)		 138
(100.00 %)		 1,686,633
(15.06 %)		 271,837
(0.81 %)		 10,802,900
(30.74 %)		 1,247
(0.04 %)		 155,059
(0.69 %)		 93,811
(1.90 %)		 24,960
(0.62 %)
367 reedfish (primary hap 2021)
GCA_900747795.4		 n/a n/a 13,335
(0.48 %)		 23,159
(1.29 %)		 n/a 39.37
(99.18 %)		 0
(0 %)		 1,431
(0.82 %)		 169
(100.00 %)		 8,317,123
(62.67 %)		 1,069,641
(2.91 %)		 19,980,246
(47.52 %)		 17
(0.00 %)		 1,256,071
(2.69 %)		 89,023
(1.13 %)		 18,273
(0.25 %)
368 reedfish (v3 alternate hap 2021)
GCA_900700845.3		 n/a n/a 11,382
(0.41 %)		 28,399
(1.33 %)		 n/a 39.39
(99.99 %)		 17
(0.01 %)		 17
(0.01 %)		 17,099
(99.99 %)		 6,708,926
(37.23 %)		 883,916
(2.81 %)		 16,745,782
(46.94 %)		 0
(0 %)		 963,655
(2.45 %)		 74,951
(1.15 %)		 20,227
(0.32 %)
369 Reeves's turtle
GCF_016161935.1		 86,238
(3.40 %)		 n/a 15,165
(0.98 %)		 21,405
(1.66 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 0
(0 %)		 398
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,854,279
(14.68 %)		 448,403
(2.11 %)		 11,329,581
(34.64 %)		 0
(0 %)		 644,654
(2.20 %)		 119,002
(2.82 %)		 35,167
(0.87 %)
370 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 alternate hap 2024)
GCA_040937895.1		 n/a n/a 26,401
(0.36 %)		 90,909
(1.63 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 19
(0.00 %)		 14,096
(100.00 %)		 4,036,529
(2.70 %)		 6,299,339
(18.78 %)		 14,096
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 13,301,439
(10.32 %)		 1,426,030
(6.65 %)		 1,371,517
(5.63 %)
371 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 primary hap 2024)
GCF_040937935.1		 62,635
(1.63 %)		 n/a 14,072
(0.39 %)		 44,953
(1.74 %)		 n/a 44.98
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3,039
(0.01 %)		 477
(100.00 %)		 2,058,700
(2.53 %)		 3,206,511
(15.84 %)		 20,407,989
(60.26 %)		 40
(0.00 %)		 n/a 741,520
(6.10 %)		 65,051
(0.49 %)
372 Riggenbach's reed frog (primary hap 2024)
GCA_040937935.1		 n/a n/a 14,072
(0.39 %)		 44,953
(1.74 %)		 n/a 44.98
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3,039
(0.01 %)		 477
(100.00 %)		 4,172,191
(12.59 %)		 3,206,511
(15.84 %)		 20,407,114
(60.26 %)		 40
(0.00 %)		 n/a 741,520
(6.10 %)		 65,051
(0.49 %)
373 Ringneck snake (HBS135679 primary hap 2022)
GCA_023053685.1		 n/a n/a 13,357
(1.06 %)		 20,426
(1.94 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 0
(0 %)		 723
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 1,451,537
(9.36 %)		 1,095,484
(10.35 %)		 7,870,309
(48.66 %)		 4
(0.00 %)		 1,107,317
(4.55 %)		 142,495
(4.04 %)		 27,514
(0.84 %)
374 roundjaw bonefish (hap1 2026)
GCA_056783665.1		 n/a n/a 17,717
(2.33 %)		 24,251
(4.97 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 0
(0 %)		 65
(0.00 %)		 146
(100.00 %)		 1,315,104
(19.20 %)		 421,651
(7.42 %)		 5,642,373
(24.02 %)		 0
(0 %)		 521,990
(3.39 %)		 30,976
(1.25 %)		 22,142
(0.79 %)
375 roundjaw bonefish (hap2 2026)
GCA_056776265.1		 n/a n/a 17,768
(2.35 %)		 24,154
(4.96 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 0
(0 %)		 57
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 1,309,049
(18.64 %)		 417,246
(7.24 %)		 5,611,567
(23.57 %)		 1
(0.00 %)		 514,408
(3.35 %)		 30,644
(1.20 %)		 22,133
(0.79 %)
376 royal ground snake (hap1 2023 refseq)
GCF_031021105.1		 45,143
(3.26 %)		 n/a 13,488
(0.98 %)		 20,353
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 6,118,914
(59.42 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,283
(53.44 %)		 11
(0.00 %)		 1,523,662
(5.77 %)		 130,852
(4.47 %)		 24,852
(0.74 %)
377 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1		 n/a n/a 13,845
(0.96 %)		 23,108
(1.86 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,128
(100.00 %)		 2,008,682
(10.16 %)		 1,718,408
(7.36 %)		 9,467,451
(52.99 %)		 0
(0 %)		 1,513,596
(5.45 %)		 140,557
(4.65 %)		 29,439
(0.71 %)
378 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1		 n/a n/a 12,606
(0.83 %)		 22,421
(1.62 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,543
(100.00 %)		 2,080,172
(11.19 %)		 1,814,619
(9.22 %)		 8,889,119
(57.36 %)		 0
(0 %)		 1,825,733
(6.19 %)		 145,328
(4.63 %)		 28,523
(0.67 %)
379 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1		 n/a n/a 13,727
(0.84 %)		 24,896
(2.06 %)		 n/a 42.95
(99.51 %)		 0
(0 %)		 973
(0.49 %)		 2,266
(100.00 %)		 729,332
(2.15 %)		 1,402,564
(24.45 %)		 8,156,596
(55.96 %)		 4
(0.00 %)		 3,523,739
(10.10 %)		 175,180
(3.64 %)		 18,584
(0.40 %)
380 rufous frog (hap2 2023 genbank)
GCA_031893055.1		 n/a n/a 13,538
(0.88 %)		 24,311
(2.15 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 0
(0 %)		 976
(0.93 %)		 1,266
(100.00 %)		 711,895
(2.18 %)		 1,219,160
(21.56 %)		 7,988,458
(54.14 %)		 3
(0.00 %)		 3,097,457
(9.48 %)		 170,920
(3.48 %)		 17,791
(0.40 %)
381 rufous frog (hap2 2023 refseq)
GCF_031893055.1		 36,767
(2.51 %)		 n/a 13,536
(0.88 %)		 24,404
(2.13 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 0
(0 %)		 976
(0.93 %)		 1,265
(100.00 %)		 712,068
(2.18 %)		 1,219,159
(21.56 %)		 7,988,199
(54.14 %)		 3
(0.00 %)		 2,044,758
(6.18 %)		 170,920
(3.48 %)		 17,791
(0.40 %)
382 rufous frog (hap2 2026)
GCA_031893055.2		 n/a n/a 13,549
(0.89 %)		 24,388
(2.13 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 0
(0 %)		 976
(0.93 %)		 1,265
(100.00 %)		 5,738,417
(62.95 %)		 1,219,306
(21.56 %)		 7,988,200
(54.14 %)		 4
(0.00 %)		 1,117,776
(3.19 %)		 170,920
(3.48 %)		 15,024
(0.53 %)
383 Sabana Surinam toad (BJE4294 2021)
GCA_019650415.1		 n/a n/a 11,460
(0.68 %)		 39,132
(1.41 %)		 n/a 37.70
(99.38 %)		 67,859
(0.60 %)		 67,859
(0.60 %)		 351,451
(99.40 %)		 1,112,793
(9.46 %)		 523,672
(3.31 %)		 8,542,740
(36.81 %)		 460
(0.01 %)		 n/a 42,115
(0.79 %)		 2,918
(0.07 %)
384 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1		 n/a n/a 14,039
(1.09 %)		 19,528
(1.85 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 31
(0.00 %)		 122
(100.00 %)		 1,307,065
(5.31 %)		 672,219
(3.50 %)		 9,949,858
(39.30 %)		 0
(0 %)		 671,520
(3.09 %)		 83,890
(3.97 %)		 26,657
(0.80 %)
385 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1		 n/a n/a 14,065
(1.09 %)		 19,430
(1.84 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 21
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 1,307,771
(5.32 %)		 672,054
(3.42 %)		 9,846,806
(39.03 %)		 0
(0 %)		 665,794
(3.10 %)		 83,805
(3.99 %)		 26,762
(0.80 %)
386 San Diegan tiger whiptail (alternate hap HBS 135688 2022)
GCA_023333555.1		 n/a n/a 13,288
(1.15 %)		 18,137
(1.98 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 0
(0 %)		 44
(0.00 %)		 227
(100.00 %)		 909,096
(6.37 %)		 544,302
(5.70 %)		 8,280,652
(39.20 %)		 3
(0.00 %)		 970,374
(3.95 %)		 51,923
(2.21 %)		 19,861
(0.82 %)
387 San Diegan tiger whiptail (v1.1 HBS 135688 primary hap 2025)
GCA_023333525.2		 n/a n/a 13,255
(1.15 %)		 17,876
(1.96 %)		 n/a 43.28
(100.00 %)		 0
(0 %)		 110
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 907,854
(6.31 %)		 539,629
(5.57 %)		 8,277,961
(39.11 %)		 3
(0.00 %)		 940,971
(3.87 %)		 51,910
(2.22 %)		 19,860
(0.82 %)
388 San Diego alligator lizard (HBS135686 alternate hap 2022)
GCA_023053675.1		 n/a n/a 14,107
(1.14 %)		 19,600
(1.95 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 27
(0.00 %)		 627
(100.00 %)		 1,563,836
(7.79 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,810
(40.44 %)		 0
(0 %)		 884,432
(3.64 %)		 81,126
(2.79 %)		 27,960
(0.83 %)
389 San Diego alligator lizard (v1.0 HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1		 n/a n/a 14,075
(1.15 %)		 19,587
(1.99 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 23
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 1,577,744
(7.81 %)		 774,690
(3.78 %)		 9,248,062
(40.42 %)		 0
(0 %)		 832,326
(3.45 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,587
(0.82 %)
390 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 genbank)
GCA_023053635.2		 n/a n/a 14,093
(1.15 %)		 19,338
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 35
(100.00 %)		 1,577,751
(7.81 %)		 774,117
(3.78 %)		 9,248,069
(40.42 %)		 1
(0.00 %)		 823,656
(3.44 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,586
(0.82 %)
391 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 refseq)
GCF_023053635.1		 33,415
(3.07 %)		 n/a 14,091
(1.15 %)		 19,337
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 1,577,747
(7.81 %)		 774,112
(3.78 %)		 9,248,016
(40.42 %)		 1
(0.00 %)		 823,646
(3.44 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,586
(0.82 %)
392 San Diego ringneck snake (HBS135679 alternate hap 2022)
GCA_023053665.1		 n/a n/a 10,911
(1.00 %)		 17,586
(1.79 %)		 n/a 41.17
(100.00 %)		 0
(0 %)		 572
(0.00 %)		 2,064
(100.00 %)		 1,265,045
(10.30 %)		 989,149
(13.38 %)		 6,503,035
(50.62 %)		 0
(0 %)		 1,261,338
(5.60 %)		 123,274
(4.17 %)		 23,159
(0.83 %)
393 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1		 n/a n/a 14,226
(1.28 %)		 25,396
(2.33 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 12,662
(100.00 %)		 1,001,433
(5.27 %)		 445,157
(1.79 %)		 7,227,826
(34.26 %)		 0
(0 %)		 365,558
(2.38 %)		 80,300
(2.76 %)		 22,848
(0.87 %)
394 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1		 41,714
(3.65 %)		 n/a 14,350
(1.48 %)		 19,231
(2.45 %)		 32,804
(4.14 %)		 43.75
(99.75 %)		 0
(0 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,414
(1.76 %)		 7,135,165
(34.49 %)		 0
(0 %)		 365,268
(2.50 %)		 76,053
(2.68 %)		 21,615
(0.85 %)
395 sand tiger shark (hap2 2026)
GCA_055471145.1		 n/a n/a 13,439
(0.36 %)		 20,564
(0.93 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 1,534
(0.23 %)		 1,171
(100.00 %)		 7,357,217
(66.76 %)		 1,982,014
(16.60 %)		 23,066,008
(54.15 %)		 5
(0.00 %)		 4,866,278
(6.22 %)		 113,116
(2.53 %)		 24,932
(0.78 %)
396 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1		 108,406
(1.98 %)		 n/a 13,959
(0.46 %)		 n/a n/a 43.90
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,474
(100.00 %)		 1,903,654
(2.85 %)		 2,970,691
(16.56 %)		 15,354,577
(64.31 %)		 20
(0.00 %)		 n/a 652,708
(8.36 %)		 43,665
(0.45 %)
397 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1		 n/a n/a 14,077
(0.47 %)		 36,608
(1.60 %)		 n/a 43.86
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,097
(0.01 %)		 2,802
(100.00 %)		 1,819,971
(2.73 %)		 2,865,173
(16.12 %)		 15,335,602
(63.85 %)		 14
(0.00 %)		 6,125,585
(10.74 %)		 651,438
(8.09 %)		 43,492
(0.45 %)
398 Schlegel's Japanese gecko
GCF_001447785.1		 25,190
(1.78 %)		 n/a 14,549
(0.82 %)		 28,002
(1.69 %)		 n/a 45.48
(96.46 %)		 143,970
(3.54 %)		 143,970
(3.54 %)		 335,470
(96.46 %)		 889,760
(2.21 %)		 666,492
(2.83 %)		 12,865,811
(39.14 %)		 291
(0.01 %)		 n/a 160,022
(2.80 %)		 49,172
(0.87 %)
399 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1		 n/a n/a 6,180
(0.71 %)		 31,191
(4.14 %)		 n/a 48.30
(100.00 %)		 0
(0 %)		 11
(0.00 %)		 4,064
(100.00 %)		 1,494,745
(38.42 %)		 891,392
(20.02 %)		 4,259,383
(49.70 %)		 0
(0 %)		 2,135,388
(12.73 %)		 147,499
(35.87 %)		 97,808
(5.62 %)
400 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 alternate hap 2025)
GCA_048941845.1		 n/a n/a 6,576
(0.51 %)		 43,825
(3.94 %)		 n/a 47.88
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 7,128
(100.00 %)		 4,390,525
(64.21 %)		 1,225,707
(31.71 %)		 4,578,596
(61.04 %)		 0
(0 %)		 3,495,471
(18.01 %)		 190,615
(29.92 %)		 115,142
(4.58 %)
401 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025 genbank)
GCA_048934315.1		 n/a n/a 8,243
(0.45 %)		 53,092
(3.72 %)		 n/a 48.10
(99.99 %)		 0
(0 %)		 992
(0.01 %)		 1,203
(100.00 %)		 813,148
(7.99 %)		 1,963,193
(37.59 %)		 5,212,133
(68.09 %)		 1
(0.00 %)		 5,897,424
(20.47 %)		 252,648
(29.41 %)		 139,919
(3.83 %)
402 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025 refseq)
GCF_048934315.1		 67,315
(6.94 %)		 n/a 8,244
(0.45 %)		 45,418
(3.02 %)		 n/a 48.10
(99.99 %)		 0
(0 %)		 992
(0.01 %)		 1,204
(100.00 %)		 813,154
(7.99 %)		 1,963,197
(37.59 %)		 5,212,175
(68.09 %)		 1
(0.00 %)		 5,609,023
(19.47 %)		 252,648
(29.41 %)		 139,919
(3.83 %)
403 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1		 41,241
(6.50 %)		 n/a 7,638
(0.70 %)		 36,336
(4.06 %)		 83,714
(10.03 %)		 48.31
(98.62 %)		 0
(0 %)		 930
(1.38 %)		 1,434
(100.00 %)		 1,920,851
(39.36 %)		 1,194,165
(21.47 %)		 5,320,620
(50.50 %)		 4
(0.00 %)		 2,982,736
(13.77 %)		 178,590
(35.88 %)		 120,128
(5.32 %)
404 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 genbank)
GCA_035084215.1		 n/a n/a 12,780
(0.49 %)		 24,543
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,880
(100.00 %)		 597,122
(2.28 %)		 1,112,137
(17.97 %)		 12,108,056
(57.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,824,033
(9.23 %)		 117,585
(3.42 %)		 24,151
(0.35 %)
405 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 refseq)
GCF_035084215.1		 51,418
(2.53 %)		 n/a 12,778
(0.49 %)		 24,541
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,879
(100.00 %)		 597,115
(2.28 %)		 1,112,121
(17.97 %)		 12,108,003
(57.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,823,993
(9.23 %)		 117,585
(3.42 %)		 24,151
(0.35 %)
406 sharpnose sevengill shark (v1 hap2 2024)
GCA_035084135.1		 n/a n/a 12,603
(0.52 %)		 23,419
(1.42 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,695
(0.01 %)		 1,695
(0.01 %)		 2,889
(99.99 %)		 559,171
(2.08 %)		 973,228
(15.01 %)		 11,768,442
(55.69 %)		 2
(0.00 %)		 3,991,721
(8.15 %)		 108,468
(3.25 %)		 22,750
(0.36 %)
407 sharpnose sevengill shark (v2 hap2 2024)
GCA_035084135.2		 n/a n/a 12,605
(0.51 %)		 23,661
(1.48 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,771
(0.01 %)		 1,143
(100.00 %)		 559,424
(2.10 %)		 990,550
(15.48 %)		 11,850,173
(56.04 %)		 3
(0.00 %)		 1,987,036
(3.91 %)		 109,272
(3.30 %)		 22,717
(0.35 %)
408 Shaw's sea snake (ss_UAE728 2024)
GCA_037043045.1		 n/a n/a 13,255
(0.98 %)		 17,598
(1.51 %)		 n/a 40.56
(99.93 %)		 641
(0.07 %)		 641
(0.07 %)		 1,450
(99.93 %)		 1,165,384
(5.77 %)		 720,981
(3.46 %)		 8,068,978
(51.52 %)		 30
(0.00 %)		 825,482
(4.02 %)		 120,786
(6.16 %)		 15,953
(0.50 %)
409 shortnose gar (hap1 2026)
GCA_059453375.1		 n/a n/a 13,777
(1.48 %)		 24,433
(3.52 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 45
(0.00 %)		 270
(100.00 %)		 1,368,384
(36.80 %)		 257,444
(13.92 %)		 5,510,116
(38.49 %)		 1
(0.00 %)		 595,765
(4.55 %)		 58,068
(3.96 %)		 37,486
(1.62 %)
410 shortnose gar (hap2 2026)
GCA_059453405.1		 n/a n/a 13,581
(1.54 %)		 23,444
(3.57 %)		 n/a 40.67
(100.00 %)		 0
(0 %)		 53
(0.00 %)		 214
(100.00 %)		 1,307,157
(34.74 %)		 226,116
(11.39 %)		 5,488,729
(36.58 %)		 0
(0 %)		 544,314
(4.50 %)		 55,305
(3.72 %)		 36,026
(1.63 %)
411 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap1.2 2024)
GCF_964106915.1		 72,774
(5.99 %)		 n/a 14,298
(1.39 %)		 19,900
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 0
(0 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 4,985,535
(51.28 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,654
(38.21 %)		 7
(0.00 %)		 598,611
(3.50 %)		 93,005
(2.80 %)		 20,306
(0.85 %)
412 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap2.1 2024)
GCA_964106785.1		 n/a n/a 13,756
(1.40 %)		 19,148
(2.33 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 0
(0 %)		 783
(0.01 %)		 127
(100.00 %)		 790,266
(3.86 %)		 448,558
(4.00 %)		 6,780,108
(37.51 %)		 3
(0.00 %)		 534,737
(3.25 %)		 86,165
(2.71 %)		 18,444
(0.74 %)
413 Skyros wall lizard (v1 hap1 2024)
GCA_964106915.1		 n/a n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 0
(0 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 7
(0.00 %)		 598,615
(3.50 %)		 93,005
(2.80 %)		 19,317
(0.73 %)
414 Skyros wall lizard (v2 hap1 2024)
GCA_964106915.2		 n/a n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 0
(0 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 7
(0.00 %)		 598,611
(3.50 %)		 93,005
(2.80 %)		 19,317
(0.73 %)
415 small-eyed ray (hap1.1 2026)
GCA_982319585.1		 n/a n/a 12,092
(0.49 %)		 29,267
(1.46 %)		 n/a 45.49
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,689
(0.01 %)		 4,225
(100.00 %)		 8,804,118
(72.17 %)		 1,666,575
(13.33 %)		 11,928,381
(61.47 %)		 17
(0.00 %)		 3,669,885
(7.85 %)		 300,552
(6.69 %)		 25,008
(0.45 %)
416 small-eyed ray (hap2.1 2026)
GCA_982319545.1		 n/a n/a 11,972
(0.50 %)		 28,154
(1.47 %)		 n/a 45.48
(99.99 %)		 2,688
(0.01 %)		 2,688
(0.01 %)		 5,516
(99.99 %)		 8,685,236
(71.77 %)		 1,478,950
(12.77 %)		 11,816,313
(60.96 %)		 20
(0.00 %)		 3,371,127
(7.41 %)		 295,247
(6.93 %)		 24,095
(0.45 %)
417 small-spotted catshark (primary hap 2021)
GCF_902713615.2		 55,748
(1.62 %)		 n/a 13,022
(0.37 %)		 23,990
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 0
(0 %)		 7,146
(1.52 %)		 646
(100.00 %)		 10,880,918
(73.26 %)		 1,448,620
(6.25 %)		 20,883,361
(51.41 %)		 10
(0.00 %)		 3,334,912
(4.99 %)		 456,658
(8.18 %)		 26,923
(0.53 %)
418 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2		 n/a n/a 11,589
(0.31 %)		 32,603
(1.10 %)		 n/a 47.54
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 6
(0.00 %)		 26,655
(100.00 %)		 1,346,532
(1.83 %)		 1,273,326
(5.35 %)		 19,727,443
(51.55 %)		 0
(0 %)		 2,678,114
(4.31 %)		 427,693
(8.25 %)		 27,178
(0.30 %)
419 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2		 n/a n/a 12,587
(0.36 %)		 23,986
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 0
(0 %)		 7,146
(1.52 %)		 645
(100.00 %)		 1,451,634
(1.94 %)		 1,448,619
(6.25 %)		 20,884,741
(51.41 %)		 10
(0.00 %)		 3,334,909
(4.99 %)		 456,658
(8.18 %)		 31,096
(0.32 %)
420 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1		 n/a n/a 9,086
(0.58 %)		 20,468
(1.57 %)		 n/a 42.65
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 10,892
(100.00 %)		 315,695
(1.23 %)		 320,148
(1.73 %)		 8,305,059
(38.33 %)		 0
(0 %)		 382,745
(1.57 %)		 37,147
(1.43 %)		 15,419
(0.42 %)
421 smalltooth sawfish (primary hap 2019)
GCA_009764475.2		 n/a n/a 12,158
(0.69 %)		 18,625
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 0
(0 %)		 698
(0.91 %)		 173
(100.00 %)		 4,923,143
(54.93 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,054
(38.19 %)		 0
(0 %)		 471,290
(1.50 %)		 45,398
(1.34 %)		 18,393
(0.41 %)
422 smalltooth sawfish (v2.1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1		 40,257
(2.94 %)		 n/a 12,157
(0.69 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 0
(0 %)		 698
(0.91 %)		 172
(100.00 %)		 4,824,261
(54.91 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,260
(38.19 %)		 0
(0 %)		 471,344
(1.50 %)		 45,398
(1.34 %)		 18,410
(0.41 %)
423 snake N.helvetica (rNatHel1.hap1.1 2024)
GCA_964273705.1		 n/a n/a 13,534
(1.08 %)		 19,681
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 7
(0.00 %)		 2,010
(0.02 %)		 494
(100.00 %)		 1,264,981
(8.07 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,795
(46.16 %)		 10
(0.00 %)		 746,296
(3.32 %)		 117,174
(4.31 %)		 24,893
(0.73 %)
424 snake N.helvetica (rNatHel1.hap2.1 2024)
GCA_964273795.1		 n/a n/a 11,975
(1.14 %)		 16,941
(1.86 %)		 n/a 41.42
(99.98 %)		 1,674
(0.02 %)		 1,674
(0.02 %)		 2,176
(99.98 %)		 1,088,721
(8.03 %)		 743,110
(5.43 %)		 7,446,281
(43.88 %)		 11
(0.00 %)		 634,247
(3.33 %)		 96,764
(4.19 %)		 20,864
(0.74 %)
425 Somali helmeted turtle (alternate hap 2025)
GCA_051311595.1		 n/a n/a 14,771
(1.19 %)		 18,963
(1.80 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,298
(100.00 %)		 3,524,256
(40.68 %)		 362,743
(1.52 %)		 9,689,320
(29.55 %)		 0
(0 %)		 275,713
(1.19 %)		 52,961
(1.73 %)		 21,975
(0.76 %)
426 Somali helmeted turtle (primary hap 2025)
GCA_051311615.1		 n/a n/a 14,695
(1.19 %)		 17,959
(1.73 %)		 n/a 43.06
(99.89 %)		 0
(0 %)		 85
(0.11 %)		 67
(100.00 %)		 3,529,920
(40.73 %)		 365,058
(1.57 %)		 9,712,608
(29.62 %)		 1
(0.00 %)		 282,503
(1.22 %)		 53,463
(1.75 %)		 22,030
(0.76 %)
427 South American lungfish (Aquarium Glaser DD20211129a alternate hap 2024)
GCA_040438655.1		 n/a n/a 4,310
(0.01 %)		 72,538
(0.22 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,072,861
(100.00 %)		 16,794,805
(3.28 %)		 13,423,198
(21.65 %)		 196,414,313
(59.02 %)		 0
(0 %)		 n/a 218,171
(0.23 %)		 4,422
(0.00 %)
428 Southern California legless lizard (HBS135921 hap1 2026)
GCA_051312515.2		 n/a 45,700
(3.62 %)		 14,187
(1.12 %)		 19,489
(1.86 %)		 n/a 43.68
(100.00 %)		 0
(0 %)		 67
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 5,909,632
(46.54 %)		 670,448
(3.31 %)		 9,944,808
(39.15 %)		 1
(0.00 %)		 532,336
(2.48 %)		 83,929
(3.91 %)		 65,650
(2.49 %)
429 Southern California legless lizard (HBS135921 hap2 2026)
GCA_051312545.2		 n/a n/a 14,225
(1.12 %)		 19,592
(1.86 %)		 n/a 43.72
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 83
(0.00 %)		 97
(100.00 %)		 5,913,300
(46.41 %)		 672,138
(3.61 %)		 9,957,324
(39.35 %)		 0
(0 %)		 642,718
(2.91 %)		 83,771
(3.97 %)		 65,586
(2.47 %)
430 southern Darwin's frog (hap1 2025)
GCA_050947455.1		 n/a n/a 13,810
(0.52 %)		 34,024
(1.59 %)		 n/a 43.01
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,606
(0.01 %)		 2,943
(100.00 %)		 11,010,271
(59.26 %)		 2,251,360
(18.25 %)		 13,843,971
(63.42 %)		 22
(0.00 %)		 n/a 443,624
(6.38 %)		 33,964
(0.44 %)
431 Southern dwarf chameleon (Gauteng JTBG20232 2024)
GCA_035047345.1		 n/a n/a 13,671
(0.83 %)		 18,931
(1.39 %)		 n/a 44.53
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 22
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 1,004,404
(4.81 %)		 870,596
(5.97 %)		 9,017,362
(54.42 %)		 0
(0 %)		 1,622,797
(5.80 %)		 217,977
(8.25 %)		 19,831
(0.36 %)
432 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 alternate hap 2022)
GCA_024509165.1		 n/a n/a 13,381
(1.17 %)		 19,541
(1.96 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 0
(0 %)		 34
(0.00 %)		 340
(100.00 %)		 1,137,408
(8.97 %)		 740,163
(7.59 %)		 7,520,676
(44.43 %)		 0
(0 %)		 1,047,648
(4.87 %)		 47,268
(1.61 %)		 21,885
(0.78 %)
433 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 primary hap 2022)
GCA_024509115.1		 n/a n/a 12,626
(1.16 %)		 18,965
(1.95 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 443
(0.01 %)		 443
(0.01 %)		 1,139
(99.99 %)		 1,095,605
(9.34 %)		 713,734
(8.45 %)		 6,942,208
(44.93 %)		 3
(0.00 %)		 1,092,536
(5.56 %)		 46,378
(2.04 %)		 21,510
(0.80 %)
434 Southwestern pond turtle (HBS135687 alternate hap 2022)
GCA_023634275.1		 n/a n/a 14,998
(0.98 %)		 20,146
(1.60 %)		 n/a 44.84
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 64
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 1,562,785
(12.68 %)		 484,638
(2.00 %)		 11,089,433
(36.29 %)		 0
(0 %)		 512,269
(2.30 %)		 143,601
(3.21 %)		 30,649
(0.71 %)
435 Southwestern pond turtle (HBS135687 primary hap 2022)
GCA_023634205.1		 n/a n/a 14,971
(0.99 %)		 19,756
(1.60 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 53
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 1,545,155
(12.63 %)		 465,697
(1.95 %)		 11,181,681
(36.13 %)		 0
(0 %)		 476,831
(2.14 %)		 142,383
(3.05 %)		 30,737
(0.72 %)
436 spotted gar
GCF_000242695.1		 45,681
(8.02 %)		 n/a 13,054
(1.95 %)		 46,362
(15.00 %)		 n/a 39.59
(91.93 %)		 43,274
(8.08 %)		 43,276
(8.08 %)		 45,199
(91.92 %)		 203,614
(1.02 %)		 123,247
(0.80 %)		 5,837,321
(22.82 %)		 2,079
(0.10 %)		 77,276
(0.87 %)		 38,507
(2.24 %)		 31,972
(1.68 %)
437 spotted gar (fLepOcu1hap1 2024)
GCA_040954845.1		 n/a n/a 13,777
(1.63 %)		 24,910
(4.29 %)		 n/a 40.54
(100.00 %)		 0
(0 %)		 76
(0.00 %)		 831
(100.00 %)		 1,218,814
(33.09 %)		 230,177
(10.66 %)		 5,685,909
(34.46 %)		 0
(0 %)		 606,189
(4.68 %)		 52,438
(3.69 %)		 36,888
(1.75 %)
438 spotted gar (fLepOcu1hap2 2024)
GCF_040954835.1		 64,638
(7.15 %)		 n/a 13,839
(1.51 %)		 23,965
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 0
(0 %)		 95
(0.00 %)		 816
(100.00 %)		 1,319,033
(34.80 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,919
(38.20 %)		 0
(0 %)		 787,990
(5.83 %)		 57,935
(3.78 %)		 37,077
(1.64 %)
439 spotted gar (hap2 2024)
GCA_040954835.1		 n/a n/a 13,842
(1.51 %)		 23,963
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 0
(0 %)		 95
(0.00 %)		 817
(100.00 %)		 1,332,243
(34.81 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,951
(38.20 %)		 0
(0 %)		 748,099
(5.52 %)		 57,935
(3.78 %)		 37,077
(1.64 %)
440 spotted moray (2026)
GCA_978019835.1		 n/a n/a 16,348
(1.04 %)		 38,313
(3.53 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 0
(0 %)		 71
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 3,160,132
(28.09 %)		 585,769
(10.39 %)		 9,925,217
(38.87 %)		 1
(0.00 %)		 1,994,277
(6.61 %)		 80,015
(1.64 %)		 46,762
(0.88 %)
441 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1		 n/a n/a 10,920
(1.26 %)		 14,403
(2.60 %)		 n/a 43.46
(99.96 %)		 0
(0 %)		 2,088
(0.04 %)		 1,042
(100.00 %)		 3,325,883
(44.48 %)		 604,780
(8.87 %)		 5,926,808
(44.92 %)		 2
(0.00 %)		 1,077,982
(5.77 %)		 64,249
(4.00 %)		 11,419
(0.43 %)
442 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1		 n/a n/a 10,694
(1.38 %)		 13,221
(2.62 %)		 n/a 42.85
(99.96 %)		 0
(0 %)		 1,952
(0.04 %)		 532
(100.00 %)		 3,108,151
(44.68 %)		 498,592
(6.00 %)		 5,634,132
(43.16 %)		 4
(0.00 %)		 685,165
(4.19 %)		 50,785
(2.94 %)		 25,542
(1.57 %)
443 spotted ray (hap1.1 2026)
GCA_980250545.1		 n/a n/a 11,917
(0.53 %)		 29,784
(1.58 %)		 n/a 44.55
(99.98 %)		 0
(0 %)		 3,030
(0.02 %)		 4,542
(100.00 %)		 9,023,837
(69.78 %)		 1,317,538
(6.25 %)		 12,219,735
(58.18 %)		 27
(0.00 %)		 2,272,645
(5.78 %)		 278,007
(5.45 %)		 26,095
(0.49 %)
444 spotted ray (hap2.1 2026)
GCA_980251185.1		 n/a n/a 12,027
(0.53 %)		 30,226
(1.61 %)		 n/a 44.56
(99.98 %)		 2,873
(0.02 %)		 2,873
(0.02 %)		 6,791
(99.98 %)		 9,053,482
(69.77 %)		 1,277,399
(6.17 %)		 12,285,515
(58.11 %)		 35
(0.00 %)		 2,244,737
(5.72 %)		 279,307
(5.47 %)		 26,315
(0.49 %)
445 spotted thorius (hap1 2026)
GCA_060511645.1		 n/a n/a 16,308
(0.08 %)		 281,976
(2.00 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 1,347
(0.00 %)		 6,194
(100.00 %)		 7,654,632
(1.67 %)		 8,183,789
(8.39 %)		 92,968,603
(55.54 %)		 22
(0.00 %)		 2,854,515
(1.49 %)		 2,686,800
(7.14 %)		 724,688
(1.25 %)
446 starry smooth-hound (sMusAst1.hap1.1 2024)
GCA_964213995.1		 n/a n/a 12,755
(0.42 %)		 23,706
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 0
(0 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,314
(100.00 %)		 1,153,000
(3.16 %)		 1,250,073
(11.36 %)		 14,207,513
(54.93 %)		 42
(0.00 %)		 4,695,339
(7.91 %)		 114,313
(3.65 %)		 15,576
(0.19 %)
447 starry smooth-hound (sMusAst1.hap2.1 2024)
GCA_964214025.1		 n/a n/a 12,414
(0.43 %)		 22,037
(1.15 %)		 n/a 45.49
(99.98 %)		 3,505
(0.02 %)		 3,505
(0.02 %)		 7,908
(99.98 %)		 1,083,980
(2.93 %)		 1,065,586
(9.57 %)		 13,986,241
(53.49 %)		 32
(0.00 %)		 3,881,332
(7.02 %)		 105,379
(3.46 %)		 14,226
(0.18 %)
448 starry smooth-hound shark (hap1.1 2024)
GCF_964213995.1		 50,247
(1.97 %)		 n/a 12,752
(0.42 %)		 23,720
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 0
(0 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,313
(100.00 %)		 1,161,214
(3.17 %)		 1,250,068
(11.36 %)		 14,206,585
(54.93 %)		 42
(0.00 %)		 4,584,096
(7.69 %)		 114,313
(3.65 %)		 15,576
(0.19 %)
449 sterlet (v2 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.2		 73,208
(5.77 %)		 n/a 24,716
(1.77 %)		 39,692
(3.97 %)		 n/a 39.75
(99.93 %)		 0
(0 %)		 6,251
(0.07 %)		 3,368
(100.00 %)		 3,869,521
(43.26 %)		 1,093,425
(6.82 %)		 9,976,052
(39.33 %)		 5
(0.00 %)		 1,354,766
(6.14 %)		 60,325
(1.97 %)		 17,242
(0.48 %)
450 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1		 n/a n/a 14,713
(1.06 %)		 18,602
(1.60 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 290
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 1,352,115
(12.17 %)		 388,630
(1.94 %)		 10,550,154
(33.42 %)		 0
(0 %)		 470,790
(2.03 %)		 113,023
(3.09 %)		 33,031
(0.84 %)
451 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1		 n/a n/a 12,226
(1.01 %)		 14,117
(1.42 %)		 n/a 43.77
(100.00 %)		 0
(0 %)		 361
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 1,202,345
(11.93 %)		 304,674
(1.45 %)		 9,752,924
(32.81 %)		 0
(0 %)		 314,037
(1.63 %)		 92,993
(2.75 %)		 20,902
(0.60 %)
452 tailed frog (A.truei hap1 2024 genbank)
GCA_040206685.1		 n/a n/a 14,490
(0.54 %)		 41,227
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 0
(0 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,455
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,662,323
(55.70 %)		 33
(0.00 %)		 5,614,148
(11.20 %)		 442,764
(6.61 %)		 73,225
(0.88 %)
453 tailed frog (A.truei hap1 2024 refseq)
GCF_040206685.1		 69,065
(2.29 %)		 n/a 14,490
(0.54 %)		 41,218
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 0
(0 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,526
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,660,933
(55.70 %)		 33
(0.00 %)		 3,121,712
(5.50 %)		 442,764
(6.61 %)		 73,225
(0.88 %)
454 tailed frog (A.truei hap2 2024)
GCA_040206675.1		 n/a n/a 14,405
(0.55 %)		 41,584
(1.88 %)		 n/a 44.89
(99.97 %)		 0
(0 %)		 6,023
(0.03 %)		 2,779
(100.00 %)		 1,770,524
(4.86 %)		 3,429,564
(18.94 %)		 15,718,939
(55.22 %)		 37
(0.00 %)		 5,484,397
(11.18 %)		 441,543
(6.61 %)		 73,027
(0.90 %)
455 tarantolino (hap1 2023)
GCA_029931775.1		 n/a n/a 14,318
(1.18 %)		 21,784
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 0
(0 %)		 153
(0.23 %)		 592
(100.00 %)		 5,383,621
(53.79 %)		 436,945
(2.95 %)		 8,308,761
(39.80 %)		 0
(0 %)		 824,338
(3.45 %)		 83,089
(2.82 %)		 29,169
(0.90 %)
456 thornback ray (hap1.1 2026)
GCA_980434695.1		 n/a n/a 12,036
(0.55 %)		 29,375
(1.65 %)		 n/a n/a 0
(0 %)		 2,667
(0.01 %)		 1,860
(100.00 %)		 9,097,652
(68.82 %)		 1,275,313
(5.43 %)		 12,306,520
(57.27 %)		 32
(0.00 %)		 2,135,416
(5.58 %)		 270,118
(5.25 %)		 27,336
(0.53 %)
457 thornback ray (hap2.1 2026)
GCA_980432155.1		 n/a n/a 12,145
(0.53 %)		 30,300
(1.62 %)		 n/a 44.68
(99.99 %)		 2,703
(0.01 %)		 2,703
(0.01 %)		 5,935
(99.99 %)		 9,407,764
(69.49 %)		 1,383,362
(6.40 %)		 12,478,479
(58.39 %)		 33
(0.00 %)		 2,459,986
(6.17 %)		 282,238
(5.47 %)		 28,776
(0.55 %)
458 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1		 n/a n/a 5,885
(0.35 %)		 24,457
(1.45 %)		 n/a 44.61
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(0.00 %)		 21,995
(100.00 %)		 553,415
(2.65 %)		 761,469
(4.53 %)		 6,043,769
(57.75 %)		 0
(0 %)		 1,079,506
(5.75 %)		 159,552
(5.54 %)		 20,611
(0.66 %)
459 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank)
GCA_010909765.2		 n/a n/a 11,697
(0.61 %)		 26,344
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 0
(0 %)		 3,753
(7.46 %)		 958
(100.00 %)		 8,789,521
(68.75 %)		 1,176,350
(3.79 %)		 9,963,149
(52.25 %)		 26
(0.00 %)		 1,634,656
(4.98 %)		 242,676
(4.73 %)		 21,251
(0.41 %)
460 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020 refseq)
GCF_010909765.2		 45,968
(2.40 %)		 n/a 11,437
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 0
(0 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 888,163
(2.58 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 26
(0.00 %)		 1,634,606
(4.98 %)		 242,676
(4.73 %)		 31,030
(0.57 %)
461 three-toed box turtle
GCF_002925995.2		 35,807
(2.28 %)		 n/a 16,429
(1.00 %)		 26,460
(1.60 %)		 33,673
(1.75 %)		 44.26
(94.87 %)		 0
(0 %)		 53,635
(5.13 %)		 48,497
(100.00 %)		 2,007,347
(15.00 %)		 351,871
(0.86 %)		 12,385,245
(31.74 %)		 3,613
(0.05 %)		 161,525
(0.66 %)		 138,405
(2.40 %)		 33,334
(0.68 %)
462 tiger rattlesnake
GCF_016545835.1		 58,085
(4.72 %)		 n/a 13,597
(1.18 %)		 20,553
(2.03 %)		 n/a 39.88
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 4,228
(100.00 %)		 1,142,521
(7.92 %)		 739,406
(5.17 %)		 7,749,366
(42.91 %)		 0
(0 %)		 1,005,717
(4.66 %)		 45,588
(1.61 %)		 21,457
(0.80 %)
463 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1		 n/a n/a 12,197
(0.36 %)		 33,747
(1.15 %)		 n/a 43.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 23,871
(100.00 %)		 1,453,442
(1.57 %)		 1,309,062
(3.23 %)		 17,953,416
(52.19 %)		 0
(0 %)		 1,274,743
(3.12 %)		 326,452
(3.86 %)		 38,711
(0.39 %)
464 tiny cayenne caecilian (primary hap 2021)
GCF_901765095.2		 41,335
(1.27 %)		 n/a 14,580
(0.44 %)		 30,499
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 2,452
(1.01 %)		 3,532
(98.99 %)		 13,578,410
(71.92 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,206,278
(52.43 %)		 5
(0.00 %)		 1,475,941
(2.93 %)		 414,828
(3.91 %)		 20,855
(0.18 %)
465 tiny Cayenne caecilian (v2 2021)
GCA_901765095.2		 n/a n/a 14,569
(0.43 %)		 30,498
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 0
(0 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,894,383
(1.68 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,143
(52.43 %)		 5
(0.00 %)		 1,718,803
(3.44 %)		 414,828
(3.91 %)		 47,796
(0.38 %)
466 tope shark (hap1 2025)
GCA_977071755.1		 n/a n/a 12,861
(0.32 %)		 25,525
(1.16 %)		 n/a 47.84
(99.98 %)		 3,659
(0.02 %)		 3,659
(0.02 %)		 10,777
(99.98 %)		 1,356,606
(3.72 %)		 1,445,979
(23.88 %)		 14,153,835
(65.90 %)		 12
(0.00 %)		 9,113,405
(12.43 %)		 141,501
(5.85 %)		 13,856
(0.13 %)
467 tope shark (hap2 2025)
GCA_977071745.1		 n/a n/a 9,480
(0.44 %)		 12,818
(1.02 %)		 n/a 45.32
(99.99 %)		 1,556
(0.01 %)		 1,556
(0.01 %)		 1,593
(99.99 %)		 844,596
(2.20 %)		 605,996
(6.77 %)		 10,856,611
(52.57 %)		 8
(0.00 %)		 2,125,368
(5.44 %)		 83,694
(4.14 %)		 7,036
(0.11 %)
468 Townsend's dwarf sphaero (gecko TG3544 2022)
GCF_021028975.2		 41,266
(3.35 %)		 n/a 13,505
(1.05 %)		 19,294
(1.78 %)		 n/a 45.92
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,590
(0.01 %)		 1,742
(100.00 %)		 938,800
(8.81 %)		 627,869
(5.78 %)		 9,306,892
(38.57 %)		 33
(0.00 %)		 185,826
(0.70 %)		 91,919
(2.91 %)		 28,760
(0.80 %)
469 tropical clawed frog
GCF_000004195.4		 50,570
(4.71 %)		 n/a 14,679
(1.97 %)		 20,138
(2.76 %)		 52,028
(5.20 %)		 40.73
(99.80 %)		 0
(0 %)		 684
(0.20 %)		 167
(100.00 %)		 2,289,618
(34.82 %)		 708,472
(13.14 %)		 6,816,377
(41.73 %)		 4
(0.00 %)		 1,594,381
(7.39 %)		 52,647
(1.35 %)		 10,639
(0.28 %)
470 Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 refseq)
GCF_040894005.1		 55,552
(3.50 %)		 n/a 13,678
(0.88 %)		 29,722
(2.41 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 0
(0 %)		 436
(0.00 %)		 936
(100.00 %)		 734,279
(2.54 %)		 1,217,326
(21.42 %)		 8,925,807
(52.53 %)		 6
(0.00 %)		 3,231,587
(10.49 %)		 211,590
(5.08 %)		 23,983
(0.47 %)
471 Tungara frog (aEngPut4 paternal hap 2024)
GCA_040894015.1		 n/a n/a 13,192
(0.88 %)		 29,242
(2.52 %)		 n/a 43.08
(100.00 %)		 0
(0 %)		 507
(0.00 %)		 819
(100.00 %)		 736,700
(2.60 %)		 1,165,044
(20.79 %)		 8,671,642
(52.60 %)		 3
(0.00 %)		 1,462,012
(5.01 %)		 207,553
(4.71 %)		 22,911
(0.46 %)
472 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1		 n/a n/a 13,456
(0.33 %)		 47,486
(1.34 %)		 n/a 44.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 27,233
(100.00 %)		 1,968,437
(1.91 %)		 1,716,136
(3.97 %)		 25,847,315
(43.76 %)		 0
(0 %)		 1,707,112
(2.84 %)		 523,234
(6.59 %)		 83,004
(0.82 %)
473 two-lined caecilian (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_901001135.2		 n/a n/a 14,449
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 0
(0 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,274,606
(1.91 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,400,957
(44.09 %)		 9
(0.01 %)		 2,193,249
(3.24 %)		 602,911
(6.66 %)		 94,934
(0.82 %)
474 two-lined caecilian (v1.2 primary hap 2021 refseq)
GCF_901001135.2		 56,619
(1.50 %)		 n/a 14,447
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 3,573
(0.64 %)		 4,902
(99.36 %)		 7,642,637
(30.35 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,399,636
(44.09 %)		 9
(0.01 %)		 2,193,249
(3.24 %)		 602,911
(6.66 %)		 94,934
(0.82 %)
475 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025 genbank)
GCA_965153285.1		 n/a n/a 14,267
(1.41 %)		 20,319
(2.40 %)		 n/a 44.04
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,024
(0.01 %)		 258
(100.00 %)		 833,273
(4.46 %)		 456,881
(4.04 %)		 6,995,048
(37.06 %)		 8
(0.00 %)		 625,845
(3.64 %)		 97,620
(3.04 %)		 19,840
(0.78 %)
476 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025 refseq)
GCF_965153285.1		 74,360
(6.29 %)		 n/a 14,315
(1.44 %)		 20,248
(2.40 %)		 n/a 44.04
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,024
(0.01 %)		 258
(100.00 %)		 4,922,311
(49.66 %)		 456,881
(4.04 %)		 6,995,048
(37.06 %)		 8
(0.00 %)		 625,845
(3.64 %)		 97,620
(3.04 %)		 22,181
(0.93 %)
477 Tyrrhenian wall lizard (hap2 2025)
GCA_965153305.1		 n/a n/a 13,496
(1.42 %)		 18,862
(2.37 %)		 n/a 43.96
(99.99 %)		 0
(0 %)		 983
(0.01 %)		 306
(100.00 %)		 780,565
(4.36 %)		 422,625
(4.27 %)		 6,551,041
(36.66 %)		 9
(0.00 %)		 570,142
(3.57 %)		 89,693
(2.97 %)		 18,244
(0.76 %)
478 undulate ray (2026)
GCA_980436725.1		 n/a n/a 12,010
(0.50 %)		 27,362
(1.45 %)		 n/a 45.05
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,543
(0.01 %)		 1,253
(100.00 %)		 9,070,711
(71.40 %)		 1,216,218
(10.82 %)		 12,098,252
(61.01 %)		 30
(0.00 %)		 2,889,862
(6.54 %)		 281,244
(5.52 %)		 25,183
(0.65 %)
479 valley gartersnake (HBS 135685 alternate hap 2023)
GCA_029207655.1		 n/a n/a 13,267
(1.12 %)		 21,667
(2.38 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 0
(0 %)		 403
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 1,344,601
(8.29 %)		 1,035,785
(7.00 %)		 8,436,473
(45.10 %)		 2
(0.00 %)		 993,545
(4.30 %)		 82,750
(2.69 %)		 24,526
(0.78 %)
480 valley gartersnake (HBS 135685 primary hap 2023)
GCA_029207665.1		 n/a n/a 12,430
(1.10 %)		 20,286
(2.36 %)		 n/a 41.12
(100.00 %)		 0
(0 %)		 446
(0.00 %)		 413
(100.00 %)		 1,299,478
(9.62 %)		 1,018,398
(8.41 %)		 7,790,758
(46.28 %)		 2
(0.00 %)		 1,063,878
(4.69 %)		 81,352
(2.71 %)		 23,653
(0.79 %)
481 viviparous/common lizard
GCF_011800845.1		 47,034
(5.17 %)		 n/a 14,311
(1.43 %)		 20,571
(2.35 %)		 32,442
(3.15 %)		 43.97
(97.04 %)		 0
(0 %)		 51,275
(2.97 %)		 25,252
(100.00 %)		 949,801
(5.41 %)		 498,048
(1.91 %)		 7,668,731
(34.21 %)		 726
(0.06 %)		 389,679
(2.77 %)		 88,947
(2.62 %)		 22,474
(0.81 %)
482 warty newt (alternate hap 2024)
GCA_964204665.1		 n/a n/a 7,653
(0.05 %)		 165,170
(1.80 %)		 n/a 45.74
(100.00 %)		 338
(0.00 %)		 338
(0.00 %)		 179,793
(100.00 %)		 2,367,930
(1.81 %)		 4,993,795
(17.70 %)		 40,385,667
(52.18 %)		 2
(0.00 %)		 n/a 1,135,490
(8.29 %)		 292,761
(1.44 %)
483 warty newt (primary hap 2024 genbank)
GCA_964204655.1		 n/a n/a 16,124
(0.09 %)		 186,006
(1.43 %)		 n/a 45.53
(100.00 %)		 118
(0.00 %)		 4,698
(0.00 %)		 1,422
(100.00 %)		 4,239,451
(1.37 %)		 8,714,648
(13.78 %)		 84,859,372
(50.88 %)		 38
(0.00 %)		 10,611,791
(4.91 %)		 2,159,665
(8.20 %)		 541,086
(1.34 %)
484 warty newt (primary hap 2024 refseq)
GCF_964204655.1		 78,096
(0.50 %)		 n/a 16,122
(0.09 %)		 186,007
(1.43 %)		 n/a n/a 4,698
(0.00 %)		 4,698
(0.00 %)		 6,001
(100.00 %)		 4,239,416
(1.37 %)		 8,725,286
(13.72 %)		 84,859,339
(50.88 %)		 38
(0.00 %)		 1,139,624
(0.38 %)		 2,159,664
(8.20 %)		 541,095
(1.34 %)
485 West African lungfish (Aquarium Glaser DD20220218a alternate hap 2024)
GCA_040939495.1		 n/a n/a 5,770
(0.02 %)		 51,747
(0.50 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 65,665
(100.00 %)		 8,636,983
(3.97 %)		 7,822,314
(7.96 %)		 97,649,351
(57.33 %)		 0
(0 %)		 17,158,019
(5.48 %)		 262,729
(0.56 %)		 7,633
(0.01 %)
486 West African lungfish (Aquarium Glaser DD20220218a primary hap 2024)
GCA_040939525.1		 n/a n/a 14,330
(0.04 %)		 83,285
(0.50 %)		 n/a 39.97
(99.99 %)		 0
(0 %)		 24,438
(0.01 %)		 7,125
(100.00 %)		 17,253,560
(4.05 %)		 15,370,489
(7.85 %)		 180,606,722
(55.17 %)		 127
(0.00 %)		 2,868,526
(0.33 %)		 548,408
(0.58 %)		 524,351
(0.55 %)
487 West African lungfish (FY-2018-M 2021)
GCF_019279795.1		 41,847
(0.19 %)		 n/a n/a n/a n/a 40.21
(97.52 %)		 0
(0 %)		 n/a 12,668
(100.00 %)		 16,163,808
(2.67 %)		 13,992,750
(5.30 %)		 n/a 26
(0.00 %)		 183,320
(0.03 %)		 502,751
(0.52 %)		 14,687
(0.01 %)
488 western chorus frog (Ontario Canada JT22Mhap1 2026)
GCA_053478255.2		 n/a n/a 14,324
(0.49 %)		 42,410
(2.02 %)		 n/a 45.04
(100.00 %)		 0
(0 %)		 1,837
(0.00 %)		 1,100
(100.00 %)		 14,993,900
(65.43 %)		 3,145,831
(17.41 %)		 15,399,943
(62.39 %)		 9
(0.00 %)		 1,521,731
(2.92 %)		 575,163
(6.40 %)		 151,987
(1.55 %)
489 western chorus frog (Ontario Canada JT22Mhap2 2026)
GCA_056512365.2		 n/a n/a 13,981
(0.49 %)		 42,035
(2.07 %)		 n/a 45.01
(100.00 %)		 0
(0 %)		 1,846
(0.00 %)		 759
(100.00 %)		 14,873,941
(65.52 %)		 3,092,457
(17.13 %)		 15,388,764
(62.36 %)		 11
(0.00 %)		 694,484
(1.41 %)		 569,249
(6.37 %)		 149,389
(1.53 %)
490 western fence lizard (IW3139 2022)
GCA_023333635.1		 n/a n/a 26,067
(1.12 %)		 46,795
(2.72 %)		 n/a 41.28
(100.00 %)		 0
(0 %)		 51
(0.00 %)		 1,771
(100.00 %)		 2,075,491
(6.60 %)		 1,603,401
(7.34 %)		 15,565,775
(40.61 %)		 0
(0 %)		 1,972,426
(5.50 %)		 184,134
(3.16 %)		 51,018
(0.93 %)
491 western fence lizard (IW3139 primary hap 2022)
GCA_023333645.1		 n/a n/a 24,835
(1.20 %)		 42,146
(2.78 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 51
(0.00 %)		 659
(100.00 %)		 1,842,497
(6.34 %)		 1,335,245
(6.14 %)		 15,103,683
(37.84 %)		 1
(0.00 %)		 1,360,948
(3.93 %)		 158,311
(2.92 %)		 45,330
(0.92 %)
492 western painted turtle (hap1 R12L10 2024)
GCA_035221575.1		 n/a n/a 15,110
(1.01 %)		 20,192
(1.60 %)		 n/a 44.79
(99.98 %)		 2,300
(0.02 %)		 2,300
(0.02 %)		 7,676
(99.98 %)		 4,166,116
(47.33 %)		 435,101
(2.23 %)		 11,124,856
(35.21 %)		 18
(0.00 %)		 718,286
(2.84 %)		 124,359
(2.87 %)		 33,282
(0.92 %)
493 western painted turtle (hap2 R12L10 2024)
GCA_035221595.1		 n/a n/a 15,098
(1.02 %)		 20,450
(1.60 %)		 n/a 44.76
(99.98 %)		 1,992
(0.02 %)		 1,992
(0.02 %)		 11,363
(99.98 %)		 4,160,368
(47.32 %)		 430,205
(2.07 %)		 11,110,552
(34.96 %)		 18
(0.00 %)		 690,347
(2.68 %)		 124,000
(2.80 %)		 33,305
(0.90 %)
494 western painted turtle (R12L10 2023 refseq)
GCF_011386835.1		 101,708
(5.23 %)		 n/a 15,332
(1.01 %)		 21,055
(1.60 %)		 n/a 44.88
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,270
(0.02 %)		 9,850
(100.00 %)		 4,178,966
(47.39 %)		 457,400
(2.29 %)		 11,325,467
(35.43 %)		 3
(0.00 %)		 758,530
(2.85 %)		 127,896
(2.94 %)		 35,401
(0.99 %)
495 western painted turtle (v5 RCT428 2020)
GCF_000241765.5		 64,782
(3.76 %)		 n/a 15,184
(1.08 %)		 21,463
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 184,311
(12.48 %)		 259,085
(87.52 %)		 4,079,404
(44.68 %)		 316,232
(0.93 %)		 11,848,718
(27.60 %)		 6,323
(0.15 %)		 313,464
(1.39 %)		 103,623
(1.74 %)		 31,959
(0.68 %)
496 western red-tailed skink (HBS 135693 alternate hap 2022)
GCA_026170595.1		 n/a n/a 14,019
(1.31 %)		 17,620
(2.13 %)		 n/a 45.76
(100.00 %)		 0
(0 %)		 15
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 862,216
(4.87 %)		 557,627
(3.17 %)		 8,002,559
(36.95 %)		 0
(0 %)		 377,483
(2.25 %)		 183,292
(4.74 %)		 24,223
(0.81 %)
497 western red-tailed skink (HBS 135693 primary hap 2022)
GCA_026170395.1		 n/a n/a 13,064
(1.32 %)		 16,407
(2.16 %)		 n/a 45.81
(100.00 %)		 0
(0 %)		 12
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 794,996
(4.86 %)		 514,021
(3.46 %)		 7,339,914
(37.02 %)		 1
(0.00 %)		 359,036
(2.32 %)		 168,847
(4.76 %)		 22,885
(0.83 %)
498 western spadefoot toad (hap1 HBS 135690 2023)
GCA_029215705.1		 n/a n/a 13,914
(1.72 %)		 27,496
(4.28 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 198
(0.00 %)		 677
(100.00 %)		 600,622
(4.04 %)		 783,931
(10.70 %)		 5,362,245
(41.82 %)		 0
(0 %)		 1,069,443
(8.38 %)		 100,334
(5.41 %)		 37,012
(1.96 %)
499 western spadefoot toad (hap2 HBS 135690 2023)
GCA_029215755.1		 n/a n/a 13,991
(1.72 %)		 27,685
(4.24 %)		 n/a 40.90
(100.00 %)		 190
(0.00 %)		 190
(0.00 %)		 541
(100.00 %)		 620,188
(5.00 %)		 800,411
(11.19 %)		 5,338,766
(42.25 %)		 1
(0.00 %)		 1,135,530
(8.81 %)		 101,603
(5.32 %)		 37,398
(1.95 %)
500 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1		 n/a n/a 13,101
(0.94 %)		 24,980
(1.75 %)		 n/a 41.02
(99.93 %)		 19
(0.07 %)		 19
(0.07 %)		 13,642
(99.93 %)		 1,410,212
(7.70 %)		 1,080,385
(4.56 %)		 9,112,844
(43.96 %)		 0
(0 %)		 886,410
(3.61 %)		 91,606
(2.53 %)		 24,845
(0.74 %)
501 western terrestrial garter snake (primary hap 2019 genbank)
GCA_009769535.1		 n/a n/a 13,074
(1.13 %)		 18,806
(1.93 %)		 n/a 40.95
(97.72 %)		 0
(0 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,274,580
(7.75 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,395,695
(42.63 %)		 0
(0 %)		 801,068
(3.60 %)		 81,829
(2.47 %)		 23,152
(0.75 %)
502 western terrestrial garter snake (primary hap 2019 refseq)
GCF_009769535.1		 33,492
(3.42 %)		 n/a 13,074
(1.13 %)		 18,807
(1.93 %)		 31,660
(2.61 %)		 40.95
(97.72 %)		 0
(0 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,271,255
(7.73 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,396,200
(42.63 %)		 0
(0 %)		 801,068
(3.60 %)		 81,829
(2.47 %)		 23,152
(0.75 %)
503 whale shark (14 2022 Squalomix)
GCF_021869965.1		 42,052
(2.43 %)		 n/a 12,059
(0.52 %)		 18,460
(1.22 %)		 38,963
(1.77 %)		 41.51
(91.61 %)		 0
(0 %)		 95,208
(8.40 %)		 16,684
(100.00 %)		 402,747
(0.97 %)		 389,119
(1.49 %)		 15,298,245
(34.14 %)		 7,133
(0.13 %)		 472,644
(1.14 %)		 21,050
(0.30 %)		 10,334
(0.16 %)
504 whale shark (Ralph 2017 Emory U)
GCF_001642345.1		 31,857
(1.52 %)		 n/a 11,884
(0.43 %)		 28,482
(1.15 %)		 n/a 41.78
(100.00 %)		 0
(0 %)		 900,650
(0.03 %)		 57,334
(100.00 %)		 413,201
(1.16 %)		 426,542
(2.75 %)		 16,418,143
(38.85 %)		 315
(0.00 %)		 994,713
(2.86 %)		 35,192
(0.95 %)		 11,001
(0.17 %)
505 white-bellied softnose skate (Sanriku21f 2025)
GCF_053455715.1		 41,159
(3.03 %)		 n/a 11,907
(0.66 %)		 24,004
(1.82 %)		 n/a 44.94
(99.88 %)		 0
(0 %)		 5,336
(0.12 %)		 3,942
(100.00 %)		 9,274,458
(62.02 %)		 1,451,144
(6.73 %)		 8,696,026
(55.50 %)		 13
(0.00 %)		 2,783,248
(8.61 %)		 191,431
(5.50 %)		 42,667
(1.04 %)
506 whitespotted bambooshark
GCF_004010195.1		 54,886
(2.03 %)		 n/a 12,065
(0.44 %)		 19,805
(1.08 %)		 n/a 42.06
(94.27 %)		 0
(0 %)		 156,554
(5.74 %)		 101,977
(100.00 %)		 559,291
(0.96 %)		 641,094
(3.66 %)		 19,566,199
(38.21 %)		 151
(0.01 %)		 1,627,864
(2.86 %)		 28,353
(0.49 %)		 12,756
(0.18 %)
507 whitespotted bambooshark (BGI_BamShark_2017 2019)
GCA_004010195.1		 n/a n/a 12,118
(0.41 %)		 20,659
(1.02 %)		 n/a 42.30
(94.58 %)		 0
(0 %)		 159,245
(5.41 %)		 601,049
(100.00 %)		 577,652
(1.03 %)		 935,689
(4.73 %)		 21,034,123
(39.29 %)		 159
(0.00 %)		 n/a 37,965
(0.55 %)		 14,538
(0.18 %)
508 yellow-bellied toad (maternal hap 2024)
GCA_964205305.1		 n/a n/a 14,756
(0.22 %)		 45,590
(0.94 %)		 n/a 38.94
(99.99 %)		 6,811
(0.01 %)		 6,811
(0.01 %)		 10,308
(99.99 %)		 18,937,194
(70.69 %)		 7,201,985
(14.20 %)		 30,457,322
(66.19 %)		 64
(0.00 %)		 9,555,405
(8.40 %)		 412,512
(1.53 %)		 27,003
(0.11 %)
509 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205295.1		 n/a n/a 15,637
(0.22 %)		 46,444
(0.92 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 130
(0.00 %)		 6,671
(0.01 %)		 4,887
(100.00 %)		 19,544,300
(70.77 %)		 7,435,469
(14.36 %)		 31,317,575
(66.35 %)		 51
(0.00 %)		 13,007,996
(11.33 %)		 423,705
(1.55 %)		 26,794
(0.11 %)
510 yellow-spotted Amazon River turtle (alternate hap 2025)
GCA_050000025.1		 n/a n/a 14,891
(1.27 %)		 19,639
(1.89 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 624
(100.00 %)		 2,747,806
(34.14 %)		 168,104
(0.62 %)		 10,457,354
(26.26 %)		 0
(0 %)		 201,885
(1.04 %)		 47,683
(1.86 %)		 34,730
(1.25 %)
511 yellow-spotted Amazon River turtle (alternate hap 2026)
GCA_050000025.2		 n/a n/a 14,811
(0.94 %)		 30,371
(2.41 %)		 n/a 43.83
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 2,436
(100.00 %)		 4,676,532
(48.44 %)		 412,438
(1.17 %)		 12,237,450
(31.63 %)		 0
(0 %)		 222,134
(0.92 %)		 48,675
(1.65 %)		 15,134
(0.41 %)
512 yellow-spotted Amazon River turtle (primary hap 2025)
GCA_050000005.1		 n/a n/a 14,852
(1.27 %)		 19,245
(1.84 %)		 n/a 42.94
(99.98 %)		 34
(0.01 %)		 114
(0.02 %)		 73
(99.99 %)		 2,745,424
(34.17 %)		 167,125
(0.63 %)		 10,246,975
(25.86 %)		 0
(0 %)		 209,727
(1.09 %)		 47,799
(1.87 %)		 34,827
(1.25 %)
513 yellow-spotted Amazon River turtle (primary hap 2026)
GCA_050000005.2		 n/a n/a 14,683
(0.95 %)		 17,589
(1.40 %)		 n/a 43.85
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 214
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 4,687,675
(48.54 %)		 412,242
(1.19 %)		 12,305,782
(31.82 %)		 0
(0 %)		 157,930
(0.66 %)		 48,972
(1.67 %)		 15,170
(0.41 %)
514 yellowpond turtle (Southern MM-2020 2021)
GCF_020497125.1		 65,539
(3.36 %)		 n/a 15,560
(0.99 %)		 21,233
(1.66 %)		 n/a 45.17
(96.24 %)		 0
(0 %)		 1,041
(3.76 %)		 595
(100.00 %)		 1,904,996
(14.25 %)		 468,779
(2.21 %)		 11,403,005
(33.86 %)		 13
(0.00 %)		 681,375
(2.23 %)		 135,646
(3.23 %)		 34,785
(0.79 %)
515 zebra shark (6-17 2022 Squalomix)
GCF_022316705.1		 48,447
(2.64 %)		 n/a 11,974
(0.57 %)		 15,459
(1.26 %)		 n/a 41.78
(93.81 %)		 0
(0 %)		 87,372
(6.20 %)		 1,266
(100.00 %)		 392,676
(0.96 %)		 348,115
(1.22 %)		 15,176,805
(32.93 %)		 151
(0.01 %)		 584,622
(1.29 %)		 20,647
(0.38 %)		 10,977
(0.18 %)
516 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1		 58,105
(2.61 %)		 n/a 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 0
(0 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 4
(0.00 %)		 2,946,119
(5.37 %)		 45,284
(1.67 %)		 14,105
(0.37 %)
517 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1		 n/a n/a 12,516
(0.44 %)		 17,465
(1.05 %)		 n/a 44.66
(99.65 %)		 1,203
(0.35 %)		 1,203
(0.35 %)		 2,136
(99.65 %)		 8,278,458
(59.68 %)		 903,434
(18.42 %)		 14,975,344
(48.25 %)		 2
(0.00 %)		 4,704,292
(7.66 %)		 48,378
(1.60 %)		 15,577
(0.38 %)
518 Zimmermann's poison frog (aRanVar5hap2 2025)
GCA_051348885.1		 n/a n/a 14,010
(0.34 %)		 42,101
(1.22 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 0
(0 %)		 227
(0.00 %)		 275
(100.00 %)		 10,423,157
(48.22 %)		 3,754,386
(17.74 %)		 16,835,345
(70.24 %)		 3
(0.00 %)		 4,878,224
(7.68 %)		 658,843
(7.16 %)		 55,890
(0.44 %)
519 Zimmermann's poison frog (hap1 2025 genbank)
GCA_051348905.1		 n/a n/a 13,951
(0.34 %)		 41,627
(1.23 %)		 n/a 44.89
(100.00 %)		 0
(0 %)		 209
(0.00 %)		 287
(100.00 %)		 10,342,480
(47.98 %)		 3,714,881
(17.24 %)		 16,808,875
(70.04 %)		 18
(0.00 %)		 284,430
(0.32 %)		 639,443
(7.04 %)		 55,275
(0.44 %)
520 Zimmermann's poison frog (hap1 2025 refseq)
GCF_051348905.1		 63,511
(1.45 %)		 n/a 13,949
(0.34 %)		 41,407
(1.21 %)		 n/a 44.89
(100.00 %)		 0
(0 %)		 209
(0.00 %)		 286
(100.00 %)		 10,342,474
(47.98 %)		 3,714,877
(17.24 %)		 16,808,822
(70.04 %)		 18
(0.00 %)		 651,953
(0.89 %)		 639,443
(7.04 %)		 55,275
(0.44 %)
TOTALS:total assembly count 520

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 627 assemblies assembly stats track stats
Mammals 986 assemblies assembly stats track stats
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Invertebrates 1999 assemblies assembly stats track stats
Plants 466 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5522 assemblies assembly stats track stats