Birds Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of birds only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Abyssinian ground-hornbill (alternate hap 2019)
GCA_009769595.1
n/a n/a 11,948
(1.86 %)
22,509
(2.24 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,527
(100.00 %)
361,147
(5.36 %)
125,372
(0.75 %)
5,917,083
(18.51 %)
0
(0 %)
53,587
(0.56 %)
38,787
(3.82 %)
33,644
(2.37 %)
2 Abyssinian ground-hornbill (primary hap 2019)
GCA_009769605.1
n/a n/a 12,926
(1.90 %)
23,453
(2.26 %)
n/a 43.30
(99.29 %)
0
(0 %)
204
(0.71 %)
112
(100.00 %)
401,839
(5.61 %)
145,540
(0.78 %)
6,556,090
(19.22 %)
0
(0 %)
65,601
(0.62 %)
40,986
(3.65 %)
34,700
(2.27 %)
3 acorn woodpecker (bairdi alternate hap 2022)
GCA_026170555.1
n/a n/a 12,415
(1.42 %)
23,266
(1.78 %)
n/a 46.76
(99.99 %)
0
(0 %)
1,555
(0.01 %)
2,294
(100.00 %)
1,077,039
(17.72 %)
548,450
(13.79 %)
4,965,697
(43.00 %)
4
(0.00 %)
1,763,118
(7.89 %)
29,460
(3.04 %)
18,848
(0.92 %)
4 acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022)
GCA_026170545.1
n/a n/a 11,832
(1.45 %)
22,508
(1.87 %)
n/a 46.81
(99.99 %)
1,317
(0.01 %)
1,317
(0.01 %)
4,491
(99.99 %)
980,493
(17.23 %)
496,946
(14.39 %)
5,155,337
(42.38 %)
5
(0.00 %)
1,619,528
(7.89 %)
28,236
(3.22 %)
18,285
(0.96 %)
5 acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022)
GCF_026170545.1
41,049
(4.47 %)
n/a 11,830
(1.45 %)
22,522
(1.87 %)
n/a 46.81
(99.99 %)
1,317
(0.01 %)
1,317
(0.01 %)
4,489
(99.99 %)
980,471
(17.23 %)
496,933
(14.40 %)
5,155,020
(42.38 %)
5
(0.00 %)
1,619,526
(7.89 %)
28,236
(3.22 %)
18,285
(0.96 %)
6 Adelie penguin
GCF_000699105.1
17,638
(3.05 %)
n/a 11,763
(1.71 %)
10,671
(1.99 %)
n/a 41.51
(95.58 %)
95,109
(4.45 %)
95,110
(4.45 %)
114,374
(95.55 %)
360,323
(4.64 %)
126,490
(0.70 %)
6,900,013
(18.31 %)
42
(0.01 %)
38,535
(0.66 %)
27,176
(0.96 %)
23,037
(0.76 %)
7 African ostrich
GCF_000698965.1
29,026
(4.42 %)
n/a 12,011
(1.64 %)
17,852
(1.82 %)
34,707
(3.37 %)
41.05
(96.74 %)
72,649
(3.29 %)
72,649
(3.29 %)
79,564
(96.71 %)
321,765
(3.17 %)
152,444
(0.82 %)
7,196,207
(17.79 %)
19
(0.00 %)
23,609
(0.42 %)
33,542
(1.33 %)
29,839
(1.10 %)
8 African ostrich (bStrCam1hap1 2024)
GCF_040807025.1
70,988
(5.69 %)
n/a 14,024
(1.60 %)
24,944
(1.95 %)
n/a 44.34
(100.00 %)
0
(0 %)
116
(0.00 %)
262
(100.00 %)
710,321
(8.33 %)
473,161
(7.22 %)
5,692,215
(24.23 %)
1
(0.00 %)
627,732
(4.53 %)
46,493
(8.90 %)
36,805
(2.48 %)
9 African ostrich (bStrCam1hap2 2024)
GCA_040807015.1
n/a n/a 13,036
(1.56 %)
32,740
(2.89 %)
n/a 45.71
(100.00 %)
0
(0 %)
82
(0.00 %)
250
(100.00 %)
651,979
(9.34 %)
459,653
(10.08 %)
4,547,348
(28.27 %)
0
(0 %)
835,180
(5.97 %)
49,261
(10.50 %)
34,040
(2.42 %)
10 American crow
GCF_000691975.1
36,379
(6.32 %)
n/a 12,151
(1.86 %)
11,346
(2.24 %)
n/a 41.85
(96.40 %)
79,099
(3.62 %)
79,099
(3.62 %)
89,646
(96.38 %)
416,990
(6.08 %)
224,964
(1.60 %)
6,343,680
(18.42 %)
41
(0.01 %)
91,630
(1.03 %)
20,148
(0.77 %)
15,464
(0.55 %)
11 American flamingo (alternate hap 2019)
GCA_009819805.1
n/a n/a 12,384
(1.73 %)
23,611
(2.05 %)
n/a 43.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,529
(100.00 %)
496,877
(7.22 %)
162,522
(0.74 %)
6,684,675
(20.14 %)
0
(0 %)
75,413
(0.70 %)
51,895
(5.89 %)
50,715
(3.23 %)
12 American flamingo (primary hap 2019)
GCA_009819775.1
n/a n/a 13,100
(1.79 %)
23,372
(2.04 %)
n/a 43.27
(99.31 %)
0
(0 %)
280
(0.69 %)
90
(100.00 %)
538,004
(7.73 %)
183,346
(0.79 %)
7,056,270
(20.92 %)
0
(0 %)
91,554
(0.80 %)
52,012
(5.96 %)
50,946
(3.06 %)
13 American kestrel (FMNH 100283 2023)
GCA_034782035.1
n/a n/a 12,381
(1.73 %)
24,701
(2.09 %)
n/a 42.11
(85.58 %)
492,459
(14.58 %)
492,459
(14.58 %)
507,420
(85.42 %)
366,772
(2.72 %)
158,507
(0.60 %)
6,543,446
(15.57 %)
4,136
(0.07 %)
40,151
(0.26 %)
31,184
(1.76 %)
25,884
(1.18 %)
14 Anna's hummingbird (alternate hap BGI_N300 2018)
GCA_003957575.1
n/a n/a 11,084
(1.90 %)
19,321
(2.14 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
3,803
(100.00 %)
475,493
(7.41 %)
223,791
(1.37 %)
5,585,250
(20.30 %)
0
(0 %)
113,614
(1.01 %)
14,903
(1.46 %)
13,444
(1.06 %)
15 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq)
GCF_003957555.1
31,091
(4.24 %)
n/a 12,257
(1.95 %)
14,633
(2.35 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
0
(0 %)
429
(1.52 %)
159
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,055
(1.51 %)
6,092,276
(20.84 %)
0
(0 %)
152,103
(1.27 %)
17,130
(1.48 %)
15,125
(1.04 %)
16 bald eagle
GCF_000737465.1
26,869
(3.49 %)
n/a 13,007
(1.88 %)
15,874
(2.35 %)
n/a 41.68
(98.38 %)
30,763
(1.63 %)
30,862
(1.63 %)
31,786
(98.37 %)
355,319
(3.99 %)
119,526
(0.44 %)
6,923,742
(18.48 %)
14
(0.00 %)
16,099
(0.20 %)
33,353
(1.97 %)
30,190
(1.55 %)
17 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 refseq)
GCF_036971685.1
36,326
(4.04 %)
n/a 13,317
(1.60 %)
25,993
(2.05 %)
n/a 43.83
(99.41 %)
0
(0 %)
219
(0.59 %)
452
(100.00 %)
700,166
(13.18 %)
457,543
(13.85 %)
4,522,973
(31.73 %)
2
(0.00 %)
1,089,421
(5.57 %)
42,686
(7.00 %)
31,415
(1.62 %)
18 band-tailed pigeon (v2 hap2 2025)
GCA_036971685.2
n/a n/a 12,277
(1.73 %)
24,050
(2.22 %)
n/a 43.61
(99.61 %)
0
(0 %)
64
(0.39 %)
441
(100.00 %)
468,593
(5.54 %)
342,626
(9.43 %)
5,110,790
(27.39 %)
0
(0 %)
646,906
(4.40 %)
38,807
(6.05 %)
29,198
(1.74 %)
19 bar-tailed trogon
GCF_000703405.1
15,393
(2.18 %)
n/a 11,432
(1.52 %)
23,733
(1.98 %)
n/a 41.38
(99.58 %)
50,921
(0.42 %)
50,921
(0.42 %)
105,649
(99.58 %)
386,871
(6.20 %)
142,825
(0.82 %)
6,474,942
(19.87 %)
0
(0 %)
24,291
(0.21 %)
18,662
(0.63 %)
15,678
(0.50 %)
20 barn owl (U. Lausanne 2021)
GCF_018691265.1
46,583
(5.22 %)
n/a 13,036
(1.82 %)
22,849
(2.14 %)
n/a 41.65
(95.89 %)
0
(0 %)
259
(4.11 %)
70
(100.00 %)
610,994
(5.59 %)
254,870
(1.12 %)
7,109,716
(19.00 %)
1
(0.00 %)
90,972
(0.72 %)
38,384
(2.94 %)
34,588
(1.70 %)
21 Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021)
GCA_015227815.3
n/a n/a 11,132
(1.94 %)
20,993
(2.40 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
2,476
(100.00 %)
550,072
(10.78 %)
282,378
(2.00 %)
5,634,117
(20.43 %)
0
(0 %)
161,076
(1.17 %)
30,305
(2.79 %)
25,208
(1.64 %)
22 barn swallow (v3 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.2
41,925
(5.13 %)
n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,661
(1.56 %)
36,548
(2.85 %)
29,760
(1.66 %)
23 Bengalese finch
GCF_005870125.1
32,857
(5.06 %)
n/a 12,604
(1.98 %)
23,707
(2.41 %)
n/a 41.59
(97.06 %)
0
(0 %)
37,862
(2.95 %)
2,015
(100.00 %)
507,898
(7.97 %)
424,913
(2.80 %)
6,456,852
(20.03 %)
1,817
(0.10 %)
257,331
(2.35 %)
29,692
(2.46 %)
22,678
(1.20 %)
24 bird A.albertisi (hap1 2024)
GCA_039906565.1
n/a n/a 13,007
(1.87 %)
23,375
(2.27 %)
n/a 42.52
(99.99 %)
0
(0 %)
439
(0.01 %)
592
(100.00 %)
467,217
(6.83 %)
273,604
(2.43 %)
6,154,114
(21.83 %)
4
(0.00 %)
268,509
(1.94 %)
23,203
(2.12 %)
18,788
(1.00 %)
25 bird A.albertisi (hap2 2024)
GCA_039906465.1
n/a n/a 12,101
(1.93 %)
21,258
(2.30 %)
n/a 42.52
(99.99 %)
0
(0 %)
344
(0.01 %)
525
(100.00 %)
412,944
(6.30 %)
232,333
(2.21 %)
5,715,517
(21.35 %)
7
(0.00 %)
210,485
(1.75 %)
20,873
(2.13 %)
17,066
(0.97 %)
26 bird A.imberbis (Cuckoo-Finch-1a 21T00152 2023)
GCF_031753505.1
53,868
(5.67 %)
n/a 12,992
(1.79 %)
25,575
(2.33 %)
n/a 43.43
(99.99 %)
0
(0 %)
431
(0.01 %)
1,370
(100.00 %)
437,810
(3.71 %)
484,607
(8.45 %)
5,614,533
(25.04 %)
2
(0.00 %)
724,927
(4.69 %)
45,374
(4.99 %)
25,087
(1.27 %)
27 bird E.chinensis (hap1 2024)
GCA_039878515.1
n/a n/a 12,607
(2.39 %)
22,429
(2.59 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
0
(0 %)
331
(0.01 %)
425
(100.00 %)
521,486
(5.26 %)
266,418
(2.40 %)
5,305,054
(20.63 %)
0
(0 %)
184,194
(1.95 %)
19,590
(2.16 %)
16,404
(1.36 %)
28 bird E.chinensis (hap2 2024)
GCA_039878825.1
n/a n/a 12,731
(2.42 %)
22,580
(2.63 %)
n/a 41.64
(99.99 %)
0
(0 %)
330
(0.01 %)
191
(100.00 %)
520,888
(5.33 %)
274,030
(2.07 %)
5,360,112
(20.48 %)
0
(0 %)
186,943
(1.97 %)
19,673
(2.18 %)
16,622
(1.40 %)
29 bird P.flaviventris (CSIRO_AGI_PZ_B2104156 2023)
GCF_033815535.1
46,130
(4.40 %)
n/a 13,292
(1.73 %)
24,384
(2.16 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 993
(100.00 %)
514,287
(6.54 %)
355,123
(8.64 %)
5,531,059
(27.22 %)
0
(0 %)
594,881
(3.58 %)
28,362
(1.86 %)
21,623
(1.25 %)
30 bird Z.leucophrys gambelii (GWCS_2022_RI 2023)
GCF_028769735.1
42,284
(5.19 %)
n/a 12,694
(1.84 %)
25,490
(2.39 %)
n/a 42.81
(100.00 %)
0
(0 %)
339
(0.00 %)
3,792
(100.00 %)
398,368
(3.10 %)
569,232
(5.31 %)
6,675,899
(23.29 %)
2
(0.00 %)
575,630
(3.04 %)
31,995
(2.37 %)
23,024
(1.21 %)
31 black swan (v2 Queensland, Australia AKBS03 2022)
GCF_013377495.2
41,421
(4.72 %)
n/a 13,027
(1.98 %)
22,616
(2.25 %)
n/a 41.96
(99.99 %)
0
(0 %)
130
(0.01 %)
568
(100.00 %)
636,501
(5.67 %)
297,964
(1.45 %)
6,820,083
(21.47 %)
0
(0 %)
88,663
(0.80 %)
31,725
(3.49 %)
30,089
(2.00 %)
32 black-capped chickadee (hap1 2023)
GCF_030490865.1
44,388
(4.96 %)
n/a 13,738
(1.81 %)
26,691
(2.34 %)
n/a 42.41
(99.92 %)
0
(0 %)
404
(0.08 %)
307
(100.00 %)
730,165
(12.91 %)
566,529
(6.51 %)
6,499,984
(24.36 %)
2
(0.00 %)
632,539
(3.23 %)
42,650
(2.59 %)
24,153
(1.20 %)
33 black-capped chickadee (hap2 2023)
GCA_030490855.1
n/a n/a 11,495
(1.90 %)
22,202
(2.49 %)
n/a 42.77
(99.94 %)
0
(0 %)
240
(0.06 %)
157
(100.00 %)
560,436
(11.20 %)
441,102
(7.11 %)
5,126,888
(23.42 %)
1
(0.00 %)
485,675
(2.99 %)
35,457
(2.90 %)
20,157
(1.24 %)
34 black-headed gull (Kunming 2023)
GCA_030820635.1
n/a n/a 12,902
(1.75 %)
23,180
(2.09 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
297
(100.00 %)
498,044
(5.37 %)
199,557
(4.44 %)
6,843,616
(23.12 %)
3
(0.00 %)
184,280
(1.44 %)
42,444
(3.62 %)
37,532
(1.85 %)
35 black-headed gull (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924245.1
n/a n/a 13,244
(1.58 %)
25,111
(1.96 %)
n/a 44.66
(99.99 %)
0
(0 %)
462
(0.01 %)
729
(100.00 %)
516,350
(4.84 %)
268,175
(14.83 %)
5,880,256
(31.31 %)
1
(0.00 %)
746,095
(4.07 %)
45,313
(4.92 %)
37,372
(1.57 %)
36 black-headed gull (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924245.1
46,133
(4.67 %)
n/a 13,243
(1.58 %)
24,048
(1.89 %)
n/a 44.66
(99.99 %)
0
(0 %)
462
(0.01 %)
728
(100.00 %)
516,346
(4.84 %)
268,169
(14.83 %)
5,880,218
(31.31 %)
1
(0.00 %)
746,091
(4.07 %)
45,313
(4.92 %)
37,373
(1.57 %)
37 black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq)
GCF_028500815.1
51,115
(5.11 %)
n/a 13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
0
(0 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
8
(0.00 %)
651,837
(3.67 %)
45,318
(4.71 %)
36,668
(1.67 %)
38 black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023)
GCA_028501385.1
n/a n/a 12,650
(1.68 %)
22,959
(2.02 %)
n/a 44.62
(99.95 %)
0
(0 %)
223
(0.05 %)
733
(100.00 %)
483,413
(5.25 %)
221,284
(9.35 %)
6,264,499
(27.26 %)
4
(0.00 %)
646,822
(3.82 %)
42,776
(4.88 %)
36,156
(1.75 %)
39 black-throated flowerpiercer
GCA_019023105.1
n/a n/a 12,249
(1.86 %)
23,692
(2.34 %)
n/a 42.36
(99.99 %)
0
(0 %)
970
(0.01 %)
600
(100.00 %)
491,914
(6.04 %)
365,884
(2.89 %)
6,453,998
(20.73 %)
0
(0 %)
273,794
(1.91 %)
30,076
(2.44 %)
22,199
(1.28 %)
40 blackcap (alternate hap 2019)
GCA_009819715.1
n/a n/a 11,586
(1.87 %)
22,618
(2.41 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,566
(100.00 %)
473,456
(5.97 %)
308,518
(2.29 %)
5,987,640
(19.64 %)
0
(0 %)
201,989
(1.45 %)
25,451
(2.38 %)
21,377
(1.34 %)
41 blackcap (primary hap 2019 refseq)
GCF_009819655.1
31,610
(4.74 %)
n/a 12,379
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
0
(0 %)
413
(1.12 %)
190
(100.00 %)
582,016
(10.36 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,626
(19.76 %)
0
(0 %)
190,212
(1.30 %)
26,838
(2.34 %)
22,667
(1.33 %)
42 blue tit
GCF_002901205.1
42,986
(5.81 %)
n/a 12,162
(1.76 %)
16,442
(2.29 %)
n/a 41.18
(92.58 %)
0
(0 %)
24,797
(7.42 %)
29,297
(100.00 %)
486,455
(6.02 %)
423,142
(2.68 %)
6,777,615
(18.84 %)
21
(0.00 %)
335,169
(2.34 %)
26,565
(0.98 %)
20,262
(0.69 %)
43 blue jay (hap1 2024)
GCA_046129655.1
n/a n/a 13,064
(1.75 %)
25,241
(2.27 %)
n/a 43.65
(99.99 %)
0
(0 %)
393
(0.01 %)
316
(100.00 %)
727,985
(19.18 %)
342,327
(5.00 %)
5,822,377
(25.13 %)
2
(0.00 %)
387,058
(3.06 %)
40,586
(3.99 %)
25,543
(1.21 %)
44 blue jay (hap2 2024)
GCA_046129645.1
n/a n/a 12,260
(1.70 %)
24,683
(2.22 %)
n/a 44.48
(99.99 %)
0
(0 %)
333
(0.01 %)
309
(100.00 %)
878,243
(23.54 %)
375,593
(6.42 %)
4,946,505
(29.07 %)
1
(0.00 %)
485,371
(4.00 %)
43,182
(4.25 %)
23,048
(1.12 %)
45 blue-and-yellow macaw (hap1 2023)
GCA_028858755.1
n/a n/a 12,919
(1.77 %)
22,770
(2.15 %)
n/a 42.69
(99.92 %)
0
(0 %)
107
(0.08 %)
246
(100.00 %)
711,670
(17.55 %)
242,430
(5.04 %)
5,545,074
(24.84 %)
0
(0 %)
506,592
(3.20 %)
25,153
(2.06 %)
19,988
(1.21 %)
46 blue-and-yellow macaw (hap2 2023)
GCA_028858555.1
n/a n/a 13,216
(1.69 %)
23,855
(2.07 %)
n/a 43.30
(99.92 %)
0
(0 %)
130
(0.08 %)
274
(100.00 %)
746,174
(21.96 %)
291,116
(9.91 %)
5,424,976
(28.69 %)
1
(0.00 %)
907,315
(4.95 %)
26,750
(2.02 %)
20,655
(1.17 %)
47 blue-crowned manakin
GCF_001604755.1
42,586
(5.25 %)
n/a 12,442
(1.93 %)
16,972
(2.49 %)
n/a 41.74
(97.93 %)
18,889
(2.07 %)
22,456
(2.07 %)
23,501
(97.93 %)
470,567
(6.92 %)
226,975
(1.27 %)
6,395,476
(19.17 %)
590
(0.04 %)
96,778
(0.89 %)
24,084
(1.85 %)
20,271
(1.08 %)
48 blue-fronted amazon (AMXYW 2021)
GCA_017639355.1
n/a n/a 12,250
(1.92 %)
19,607
(2.10 %)
n/a 41.72
(93.42 %)
0
(0 %)
3,560,856
(6.92 %)
1,498
(100.00 %)
559,187
(10.05 %)
144,509
(0.66 %)
5,883,053
(17.90 %)
129
(0.02 %)
100,095
(1.28 %)
18,581
(1.17 %)
16,977
(0.99 %)
49 blue-fronted amazon (FVVF132 2015)
GCA_001420675.1
n/a 16,315
(2.39 %)
12,339
(1.91 %)
20,350
(2.13 %)
n/a 41.72
(93.49 %)
0
(0 %)
3,559,082
(6.85 %)
3,232
(100.00 %)
501,831
(8.21 %)
144,313
(0.66 %)
5,882,906
(17.92 %)
126
(0.02 %)
90,905
(0.87 %)
18,584
(1.17 %)
16,979
(0.99 %)
50 Bourke's parrot (Australia Nb327-2 2023)
GCF_033783945.1
43,924
(4.72 %)
n/a 13,092
(1.91 %)
23,195
(2.31 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
37
(0.00 %)
37
(0.00 %)
1,864
(100.00 %)
469,079
(6.31 %)
205,954
(1.49 %)
5,911,944
(20.89 %)
0
(0 %)
212,512
(1.40 %)
22,555
(1.70 %)
19,712
(1.31 %)
51 Brazilian merganser (hap1 2024)
GCA_036873955.1
n/a n/a 13,202
(1.80 %)
24,416
(2.14 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
0
(0 %)
327
(0.00 %)
569
(100.00 %)
832,469
(7.06 %)
531,644
(7.37 %)
6,294,434
(28.49 %)
0
(0 %)
618,430
(3.89 %)
34,786
(3.61 %)
27,553
(1.39 %)
52 Brazilian merganser (hap2 2024)
GCA_036850655.1
n/a n/a 12,578
(1.76 %)
23,066
(2.06 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
0
(0 %)
244
(0.00 %)
720
(100.00 %)
773,452
(7.75 %)
522,491
(10.88 %)
5,592,104
(31.80 %)
0
(0 %)
820,340
(5.03 %)
33,981
(4.60 %)
26,728
(1.37 %)
53 bronzed cowbird (106 2024)
GCF_037042795.1
30,276
(4.54 %)
n/a 12,775
(1.77 %)
24,737
(2.30 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
0
(0 %)
67
(0.00 %)
528
(100.00 %)
410,661
(3.03 %)
498,610
(9.50 %)
6,332,690
(26.06 %)
0
(0 %)
457,778
(2.79 %)
33,278
(2.51 %)
23,177
(1.17 %)
54 brown eared-pheasant
GCA_019593555.1
n/a n/a 13,027
(2.37 %)
22,748
(2.48 %)
n/a 41.03
(98.67 %)
0
(0 %)
114,232
(1.35 %)
2,408
(100.00 %)
523,649
(0.00 %)
228,783
(1.17 %)
6,134,418
(20.24 %)
558
(0.02 %)
63,695
(0.75 %)
19,702
(2.00 %)
17,753
(1.34 %)
55 brown headed cowbird (v1.1 BHLD 08-10-18 2022)
GCF_012460135.2
31,871
(5.31 %)
n/a 12,561
(1.89 %)
24,218
(2.41 %)
n/a 42.40
(99.99 %)
318
(0.01 %)
318
(0.01 %)
692
(99.99 %)
598,355
(12.36 %)
420,712
(3.73 %)
6,496,704
(21.26 %)
0
(0 %)
354,123
(2.17 %)
28,568
(2.41 %)
22,560
(1.23 %)
56 brown kiwi
GCF_001039765.1
26,121
(3.23 %)
n/a 12,909
(1.54 %)
23,267
(1.91 %)
n/a 41.28
(86.08 %)
0
(0 %)
368,297
(13.97 %)
24,718
(100.00 %)
367,446
(2.94 %)
316,602
(7.36 %)
7,164,456
(14.67 %)
15,742
(0.83 %)
282,005
(10.95 %)
59,756
(2.40 %)
55,040
(2.06 %)
57 brown roatelo
GCF_000695765.1
16,756
(2.26 %)
n/a 12,208
(1.55 %)
27,079
(2.12 %)
n/a 41.32
(99.66 %)
51,602
(0.35 %)
51,602
(0.35 %)
119,122
(99.65 %)
345,102
(5.17 %)
194,444
(1.21 %)
6,441,258
(19.39 %)
4
(0.00 %)
52,863
(0.41 %)
19,018
(0.67 %)
16,283
(0.55 %)
58 budgerigar (maternal 2020)
GCA_012275265.1
n/a n/a 12,659
(1.89 %)
22,063
(2.28 %)
n/a 41.89
(94.20 %)
0
(0 %)
388
(5.80 %)
930
(100.00 %)
504,677
(9.95 %)
268,616
(3.12 %)
5,481,198
(20.78 %)
1
(0.00 %)
317,306
(2.01 %)
20,278
(1.55 %)
16,758
(1.05 %)
59 budgerigar (maternal Z 2020 refseq)
GCF_012275295.1
32,026
(4.32 %)
n/a 13,239
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
26,324
(3.11 %)
41.80
(99.72 %)
0
(0 %)
284
(0.28 %)
864
(100.00 %)
538,374
(10.19 %)
279,504
(3.12 %)
5,874,531
(22.08 %)
1
(0.00 %)
324,793
(2.05 %)
21,155
(1.61 %)
17,590
(1.10 %)
60 budgerigar (paternal hap 2020)
GCA_012275275.1
n/a n/a 13,127
(1.94 %)
22,492
(2.30 %)
n/a 41.84
(98.98 %)
0
(0 %)
737
(1.02 %)
330
(100.00 %)
505,478
(9.66 %)
231,633
(2.15 %)
5,778,405
(20.30 %)
0
(0 %)
277,857
(1.78 %)
20,205
(1.61 %)
17,519
(1.14 %)
61 budgerigar (v6.3 2021 WashU)
GCF_000238935.1
25,525
(4.05 %)
n/a 12,188
(1.82 %)
15,819
(2.26 %)
n/a 41.25
(97.26 %)
45,651
(2.75 %)
51,022
(2.75 %)
70,863
(97.25 %)
465,974
(9.37 %)
127,353
(0.54 %)
5,864,264
(19.05 %)
39
(0.00 %)
99,875
(0.89 %)
15,886
(0.88 %)
14,271
(0.75 %)
62 burrowing owl
GCF_003259725.1
30,559
(4.30 %)
n/a 11,741
(1.72 %)
10,976
(2.04 %)
n/a 40.92
(98.92 %)
0
(0 %)
33,737
(1.09 %)
445
(100.00 %)
492,320
(6.21 %)
182,281
(0.73 %)
6,811,984
(19.35 %)
54
(0.00 %)
43,342
(0.69 %)
22,840
(1.08 %)
20,669
(0.90 %)
63 California black rail (168171201 alternate hap 2022)
GCA_022605925.1
n/a n/a 11,551
(1.57 %)
22,390
(2.09 %)
n/a 44.21
(99.99 %)
0
(0 %)
1,672
(0.01 %)
3,563
(100.00 %)
465,417
(6.39 %)
218,050
(11.40 %)
4,588,632
(30.42 %)
22
(0.00 %)
672,136
(5.44 %)
22,622
(2.16 %)
17,533
(1.11 %)
64 California black rail (168171201 primary hap 2022)
GCA_022605575.1
n/a n/a 12,725
(1.54 %)
24,572
(2.13 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
319
(0.00 %)
319
(0.00 %)
964
(100.00 %)
522,782
(6.36 %)
226,563
(14.09 %)
5,497,483
(32.27 %)
2
(0.00 %)
642,907
(3.88 %)
24,529
(1.77 %)
18,290
(0.98 %)
65 California condor (v2 813 2022 refseq)
GCF_018139145.2
27,527
(3.38 %)
n/a 12,653
(1.75 %)
21,924
(1.97 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
0
(0 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
434,141
(3.82 %)
177,389
(0.88 %)
7,171,770
(20.32 %)
6
(0.00 %)
116,183
(1.12 %)
34,918
(3.00 %)
32,351
(1.75 %)
66 California quail (MVZ:Bird:193975 alternate hap 2022)
GCA_023055725.1
n/a n/a 12,948
(1.71 %)
24,838
(2.01 %)
n/a 43.36
(100.00 %)
0
(0 %)
248
(0.00 %)
1,601
(100.00 %)
1,359,516
(35.69 %)
599,039
(11.78 %)
3,454,101
(36.94 %)
0
(0 %)
1,581,379
(8.33 %)
36,496
(2.55 %)
20,012
(1.18 %)
67 California quail (MVZ:Bird:193975 primary hap 2022)
GCA_023055505.1
n/a n/a 12,718
(2.12 %)
23,363
(2.40 %)
n/a 42.23
(100.00 %)
287
(0.00 %)
287
(0.00 %)
608
(100.00 %)
881,563
(19.85 %)
308,707
(5.50 %)
5,409,060
(25.34 %)
1
(0.00 %)
573,425
(4.09 %)
25,268
(2.42 %)
19,569
(1.39 %)
68 California towhee (CALT 2023)
GCF_028551555.1
28,823
(3.21 %)
n/a 12,791
(1.50 %)
26,511
(2.06 %)
n/a 44.24
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 627
(100.00 %)
473,712
(3.18 %)
586,987
(10.80 %)
4,965,312
(32.86 %)
0
(0 %)
794,819
(4.53 %)
48,369
(2.73 %)
24,095
(1.04 %)
69 Canada goose (SJ_97 2019)
GCA_006130075.1
n/a n/a 13,061
(1.95 %)
24,149
(2.23 %)
n/a 42.13
(98.37 %)
14,797
(1.64 %)
15,389
(1.64 %)
28,876
(98.36 %)
715,113
(7.61 %)
319,386
(1.67 %)
6,810,836
(21.27 %)
444
(0.03 %)
73,747
(0.48 %)
40,389
(4.15 %)
35,329
(2.42 %)
70 carmine bee-eater (alternate hap 2019)
GCA_009819585.1
n/a n/a 12,381
(1.76 %)
28,865
(2.78 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,296
(100.00 %)
542,765
(7.77 %)
204,389
(1.06 %)
6,415,832
(21.53 %)
0
(0 %)
133,280
(1.22 %)
31,638
(2.54 %)
23,845
(1.27 %)
71 carmine bee-eater (primary hap 2019)
GCA_009819595.1
n/a n/a 12,740
(1.82 %)
28,031
(2.77 %)
n/a 42.88
(99.47 %)
0
(0 %)
269
(0.53 %)
109
(100.00 %)
556,926
(7.87 %)
213,180
(1.09 %)
6,641,077
(21.58 %)
0
(0 %)
132,076
(1.14 %)
30,881
(2.41 %)
23,550
(1.23 %)
72 chaffinch (primary hap 2023)
GCA_963513975.1
n/a n/a 12,708
(1.72 %)
24,978
(2.26 %)
n/a 44.06
(99.99 %)
7
(0.00 %)
573
(0.01 %)
467
(100.00 %)
495,590
(3.15 %)
493,628
(13.34 %)
6,163,336
(28.37 %)
2
(0.00 %)
729,875
(4.06 %)
39,042
(6.25 %)
24,111
(1.21 %)
73 chestnut-breasted malkoha (KB17595 2023)
GCF_032191515.1
36,882
(4.04 %)
n/a 13,316
(1.67 %)
25,480
(2.15 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
0
(0 %)
181
(0.00 %)
587
(100.00 %)
486,715
(8.57 %)
476,696
(11.88 %)
6,153,538
(29.89 %)
1
(0.00 %)
1,315,869
(6.16 %)
33,146
(2.23 %)
20,484
(0.88 %)
74 chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022)
GCA_027408205.1
n/a n/a 11,740
(2.36 %)
21,473
(2.56 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
2,263
(100.00 %)
551,116
(10.78 %)
241,638
(4.43 %)
4,973,260
(21.77 %)
0
(0 %)
285,039
(2.53 %)
21,151
(2.71 %)
18,001
(1.56 %)
75 chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022)
GCA_027408225.1
n/a n/a 13,037
(2.20 %)
23,550
(2.37 %)
n/a 42.31
(99.81 %)
0
(0 %)
460
(0.19 %)
252
(100.00 %)
681,166
(12.04 %)
381,093
(7.09 %)
5,610,806
(24.65 %)
3
(0.00 %)
489,064
(3.62 %)
25,664
(2.75 %)
21,023
(1.48 %)
76 chicken (GRCg6a 2018)
GCF_000002315.6
62,183
(8.40 %)
n/a 13,099
(2.32 %)
18,797
(2.76 %)
73,407
(9.29 %)
42.23
(99.08 %)
942
(0.92 %)
952
(0.92 %)
2,380
(99.08 %)
684,052
(12.74 %)
307,144
(2.92 %)
5,863,131
(21.16 %)
0
(0 %)
346,400
(2.34 %)
24,405
(2.72 %)
20,871
(1.54 %)
77 chicken (Huxu 2023)
GCA_024206055.2
n/a n/a 13,405
(2.26 %)
24,435
(2.45 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
41
(100.00 %)
704,190
(12.54 %)
502,701
(5.74 %)
5,731,097
(23.50 %)
0
(0 %)
573,152
(3.69 %)
27,781
(2.90 %)
22,282
(1.53 %)
78 chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022)
GCA_027408255.1
n/a n/a 11,339
(2.33 %)
20,588
(2.51 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,684
(100.00 %)
537,847
(10.84 %)
217,964
(3.81 %)
4,879,985
(21.43 %)
0
(0 %)
236,343
(2.20 %)
19,653
(2.66 %)
17,140
(1.52 %)
79 chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023)
GCA_027557775.1
n/a n/a 12,855
(2.22 %)
23,147
(2.37 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
566
(0.26 %)
246
(100.00 %)
672,973
(12.00 %)
342,156
(6.53 %)
5,690,712
(23.98 %)
5
(0.00 %)
438,910
(3.29 %)
24,413
(2.63 %)
20,581
(1.48 %)
80 chicken (Silkie 2023)
GCA_034509865.1
n/a n/a 13,116
(2.18 %)
24,675
(2.43 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,100
(100.00 %)
539,764
(6.24 %)
361,584
(6.68 %)
5,543,095
(24.80 %)
0
(0 %)
576,465
(4.06 %)
27,013
(3.08 %)
20,971
(1.45 %)
81 chicken white leghorn layer X broiler (v2 broiler haplotype 2021 2021)
GCF_016699485.2
74,716
(9.14 %)
n/a 13,128
(2.33 %)
23,484
(2.48 %)
72,013
(9.34 %)
42.20
(99.68 %)
463
(0.32 %)
463
(0.32 %)
677
(99.68 %)
697,827
(12.53 %)
290,892
(2.63 %)
5,887,021
(21.30 %)
1
(0.00 %)
268,636
(2.17 %)
24,469
(2.59 %)
20,885
(1.55 %)
82 Chilean tinamou
GCF_003342845.1
24,894
(4.16 %)
n/a 12,545
(2.09 %)
18,167
(2.87 %)
n/a 42.04
(98.74 %)
0
(0 %)
1,226,739
(1.39 %)
2,217
(100.00 %)
496,518
(5.43 %)
290,573
(1.50 %)
5,870,743
(19.53 %)
591
(0.02 %)
54,224
(0.39 %)
44,640
(5.21 %)
41,581
(3.09 %)
83 chimney swift (M959 v1.1 2014)
GCF_000747805.2
15,969
(2.53 %)
n/a 12,045
(1.82 %)
18,580
(2.07 %)
n/a 41.40
(96.00 %)
65,471
(4.02 %)
65,471
(4.02 %)
84,174
(95.98 %)
469,979
(5.99 %)
194,781
(2.21 %)
6,361,618
(19.70 %)
135
(0.03 %)
104,662
(2.61 %)
12,438
(0.41 %)
8,502
(0.26 %)
84 chuck-will's-widow (BGI_N321 v2 2014)
GCF_000700745.2
17,193
(2.21 %)
n/a 12,092
(1.49 %)
28,685
(1.89 %)
n/a 40.76
(99.62 %)
56,333
(0.39 %)
56,333
(0.39 %)
125,214
(99.61 %)
516,189
(5.36 %)
202,882
(1.12 %)
6,588,198
(20.47 %)
4
(0.00 %)
63,719
(0.48 %)
8,029
(0.24 %)
6,615
(0.19 %)
85 collared flycatcher
GCF_000247815.1
28,360
(4.07 %)
n/a 12,200
(1.78 %)
14,028
(2.24 %)
33,113
(3.87 %)
44.22
(98.57 %)
9,415
(1.43 %)
11,403
(1.43 %)
30,843
(98.57 %)
559,053
(7.88 %)
597,207
(11.39 %)
6,656,400
(23.61 %)
632
(0.03 %)
1,129,694
(1.66 %)
29,879
(1.50 %)
22,107
(0.96 %)
86 common buzzard (bButBut1.hap1.1 2024)
GCA_964188355.1
n/a n/a 13,512
(1.75 %)
24,417
(2.13 %)
n/a 43.17
(99.99 %)
2
(0.00 %)
471
(0.01 %)
546
(100.00 %)
439,018
(4.62 %)
244,865
(6.73 %)
6,778,625
(23.94 %)
2
(0.00 %)
258,825
(1.67 %)
43,400
(4.80 %)
34,405
(1.72 %)
87 common buzzard (bButBut1.hap2.1 2024)
GCA_964188375.1
n/a n/a 13,593
(1.72 %)
24,541
(2.09 %)
n/a 43.49
(99.99 %)
471
(0.01 %)
471
(0.01 %)
929
(99.99 %)
439,011
(4.19 %)
247,629
(8.40 %)
6,711,875
(25.06 %)
4
(0.00 %)
284,874
(1.81 %)
49,141
(4.61 %)
34,440
(1.72 %)
88 common canary (domestic yellow sc_yellow_7_cibi 2019)
GCF_007115625.1
32,985
(4.99 %)
n/a 12,248
(1.89 %)
15,910
(2.38 %)
n/a 42.17
(98.21 %)
0
(0 %)
47,138
(1.81 %)
3,536
(100.00 %)
477,249
(6.30 %)
313,951
(2.10 %)
6,525,604
(19.58 %)
196
(0.01 %)
211,121
(1.94 %)
25,722
(1.90 %)
21,345
(1.21 %)
89 common canary (serCan28SL12 2022)
GCF_022539315.1
41,390
(5.57 %)
n/a 12,314
(1.93 %)
23,133
(2.37 %)
n/a 42.36
(99.95 %)
0
(0 %)
1,055
(0.05 %)
685
(100.00 %)
553,077
(10.89 %)
322,311
(2.75 %)
6,543,183
(20.47 %)
2
(0.00 %)
235,671
(1.53 %)
26,268
(2.31 %)
21,696
(1.31 %)
90 common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021)
GCA_017976305.1
n/a n/a 12,464
(1.91 %)
24,623
(2.50 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
505,582
(10.93 %)
292,484
(2.48 %)
6,061,828
(21.38 %)
0
(0 %)
303,976
(1.80 %)
24,010
(1.80 %)
19,613
(1.10 %)
91 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq)
GCF_017976375.1
50,206
(6.30 %)
n/a 13,190
(1.85 %)
24,284
(2.29 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
0
(0 %)
296
(0.42 %)
150
(100.00 %)
566,161
(11.56 %)
310,430
(2.36 %)
6,712,791
(21.76 %)
0
(0 %)
326,395
(1.83 %)
25,268
(1.73 %)
20,672
(1.05 %)
92 common goldeneye (primary hap 2024)
GCA_964059595.1
n/a n/a 13,374
(1.90 %)
24,308
(2.28 %)
n/a 42.07
(99.99 %)
6
(0.00 %)
454
(0.01 %)
544
(100.00 %)
751,865
(6.78 %)
400,294
(3.80 %)
6,184,781
(24.97 %)
4
(0.00 %)
321,327
(2.30 %)
35,712
(2.66 %)
29,614
(1.59 %)
93 common mallard (Pekin duck 2017)
GCA_002743455.1
n/a n/a 12,871
(1.94 %)
25,038
(2.26 %)
n/a 41.42
(95.05 %)
202
(0.00 %)
25,623
(4.96 %)
21,442
(100.00 %)
760,634
(7.52 %)
360,866
(1.37 %)
6,710,465
(20.25 %)
265
(0.02 %)
45,616
(0.34 %)
32,823
(2.15 %)
27,194
(1.37 %)
94 common moorhen (bGalChl1.hap1.1 2024)
GCA_964237585.1
n/a n/a 12,976
(1.68 %)
23,758
(2.12 %)
n/a 44.70
(99.99 %)
27
(0.00 %)
603
(0.01 %)
845
(100.00 %)
499,923
(5.57 %)
250,214
(7.38 %)
6,350,978
(25.68 %)
9
(0.00 %)
537,046
(3.31 %)
27,790
(2.32 %)
21,858
(1.17 %)
95 common moorhen (bGalChl1.hap2.1 2024)
GCA_964237395.1
n/a n/a 12,745
(1.75 %)
23,052
(2.18 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
536
(0.01 %)
536
(0.01 %)
931
(99.99 %)
483,812
(5.59 %)
210,131
(3.30 %)
6,332,994
(22.33 %)
3
(0.00 %)
308,952
(2.24 %)
26,285
(2.20 %)
21,379
(1.23 %)
96 common myna (bArcTri1 alternate hap 2023)
GCA_027559525.1
n/a n/a 10,692
(1.77 %)
20,925
(2.29 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,221
(100.00 %)
328,602
(4.16 %)
604,057
(8.02 %)
5,233,128
(25.06 %)
0
(0 %)
479,200
(3.38 %)
25,210
(3.70 %)
18,123
(1.22 %)
97 common myna (bArcTri1 primary hap 2023)
GCA_027559615.1
n/a n/a 12,560
(1.73 %)
23,740
(2.16 %)
n/a 42.32
(99.80 %)
0
(0 %)
435
(0.20 %)
455
(100.00 %)
395,254
(5.40 %)
937,774
(11.00 %)
6,145,808
(28.07 %)
2
(0.00 %)
825,681
(4.71 %)
32,293
(3.87 %)
21,576
(1.15 %)
98 common pochard (bAytFer1.hap1.1 2024)
GCA_964211825.1
n/a n/a 13,505
(1.83 %)
24,961
(2.21 %)
n/a 42.19
(99.99 %)
8
(0.00 %)
474
(0.01 %)
870
(100.00 %)
833,892
(8.17 %)
576,230
(8.04 %)
6,149,355
(27.84 %)
14
(0.00 %)
632,907
(3.94 %)
34,089
(2.69 %)
28,890
(1.45 %)
99 common pochard (bAytFer1.hap2.1 2024)
GCA_964211795.1
n/a n/a 12,828
(1.96 %)
23,534
(2.35 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
405
(0.01 %)
405
(0.01 %)
767
(99.99 %)
725,169
(7.34 %)
472,156
(5.81 %)
5,786,296
(25.35 %)
16
(0.00 %)
412,441
(2.96 %)
30,917
(2.80 %)
26,828
(1.51 %)
100 common starling
GCF_001447265.1
28,711
(4.57 %)
n/a 12,585
(2.01 %)
17,785
(2.59 %)
n/a 41.49
(97.70 %)
20,305
(2.31 %)
23,392
(2.31 %)
22,666
(97.69 %)
427,543
(5.30 %)
310,445
(1.74 %)
6,482,337
(19.49 %)
590
(0.05 %)
102,603
(0.86 %)
23,883
(1.99 %)
19,986
(1.21 %)
101 common swift (bApuApu2 alternate hap 2021)
GCA_020740585.1
n/a n/a 11,653
(1.89 %)
19,731
(2.20 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
1,697
(100.00 %)
443,384
(6.09 %)
185,968
(1.18 %)
5,916,553
(20.88 %)
0
(0 %)
109,215
(0.89 %)
18,864
(1.75 %)
15,032
(0.87 %)
102 common swift (primary hap 2021 refseq)
GCF_020740795.1
39,986
(4.95 %)
n/a 12,292
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
0
(0 %)
256
(0.16 %)
110
(100.00 %)
499,695
(6.70 %)
199,749
(1.12 %)
6,354,003
(21.19 %)
1
(0.00 %)
113,872
(0.91 %)
20,393
(1.74 %)
16,313
(0.88 %)
103 common tern (alternate hap 2019)
GCA_009819645.1
n/a n/a 12,773
(1.79 %)
24,751
(2.23 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,235
(100.00 %)
549,460
(7.58 %)
204,051
(1.02 %)
6,880,566
(20.70 %)
0
(0 %)
116,485
(1.17 %)
47,352
(3.95 %)
42,123
(2.18 %)
104 common tern (primary hap 2019)
GCA_009819605.1
n/a n/a 13,103
(1.81 %)
24,044
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.16 %)
0
(0 %)
205
(0.84 %)
123
(100.00 %)
570,312
(7.91 %)
216,895
(1.04 %)
7,043,151
(20.98 %)
1
(0.00 %)
112,065
(1.02 %)
45,694
(3.73 %)
41,720
(2.13 %)
105 common yellowthroat (alternate hap 2019)
GCA_009764545.1
n/a n/a 10,611
(1.77 %)
21,125
(2.21 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
4,976
(100.00 %)
422,889
(5.99 %)
294,928
(2.71 %)
5,928,421
(19.76 %)
0
(0 %)
245,763
(1.64 %)
21,397
(1.91 %)
17,659
(1.14 %)
106 common yellowthroat (primary hap 2019)
GCA_009764595.1
n/a n/a 11,741
(1.82 %)
22,382
(2.29 %)
n/a 42.01
(98.73 %)
0
(0 %)
1,479
(1.27 %)
278
(100.00 %)
476,049
(6.38 %)
367,108
(3.16 %)
6,576,957
(20.43 %)
0
(0 %)
333,263
(2.08 %)
25,004
(2.02 %)
20,494
(1.18 %)
107 Cory's shearwater (bCalBor7.hap1.1 2024)
GCA_964195595.1
n/a n/a 13,703
(1.71 %)
26,310
(2.10 %)
n/a 43.29
(99.99 %)
59
(0.00 %)
525
(0.01 %)
414
(100.00 %)
479,045
(5.03 %)
336,466
(4.95 %)
5,910,298
(24.89 %)
4
(0.00 %)
487,078
(3.38 %)
48,046
(4.19 %)
40,252
(2.00 %)
108 Cory's shearwater (bCalBor7.hap2.1 2024)
GCA_964196065.1
n/a n/a 12,750
(1.85 %)
23,191
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.99 %)
477
(0.01 %)
477
(0.01 %)
726
(99.99 %)
403,846
(4.59 %)
252,125
(3.30 %)
6,206,493
(22.07 %)
2
(0.00 %)
286,848
(2.45 %)
41,821
(4.50 %)
38,197
(2.23 %)
109 crested eagle (hap1 2024)
GCA_045345505.1
n/a n/a 12,782
(1.65 %)
24,376
(2.35 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
0
(0 %)
105
(0.00 %)
548
(100.00 %)
675,525
(20.31 %)
325,345
(11.43 %)
5,483,869
(28.16 %)
0
(0 %)
643,247
(4.20 %)
52,371
(8.51 %)
30,804
(1.52 %)
110 crested eagle (hap2 2024)
GCA_045345515.1
n/a n/a 13,656
(1.49 %)
27,669
(2.31 %)
n/a 44.30
(100.00 %)
0
(0 %)
164
(0.00 %)
544
(100.00 %)
765,672
(26.88 %)
431,376
(14.19 %)
5,221,201
(33.63 %)
0
(0 %)
1,019,182
(5.63 %)
63,565
(10.48 %)
31,804
(1.32 %)
111 crested ibis (BGI_Y956 2014)
GCF_000708225.1
17,134
(2.52 %)
n/a 12,801
(1.77 %)
14,062
(2.19 %)
n/a 41.83
(97.20 %)
70,475
(2.81 %)
70,475
(2.81 %)
130,030
(97.19 %)
395,055
(4.53 %)
182,744
(0.97 %)
7,244,849
(18.69 %)
41
(0.01 %)
32,623
(0.58 %)
39,156
(2.06 %)
34,170
(1.57 %)
112 cuckoo roller (BGI_N330 2014)
GCF_000691785.1
16,484
(2.21 %)
n/a 12,195
(1.53 %)
24,940
(1.96 %)
n/a 41.82
(99.74 %)
56,010
(0.27 %)
56,010
(0.27 %)
113,170
(99.73 %)
349,912
(4.65 %)
131,678
(0.66 %)
6,778,773
(18.46 %)
1
(0.00 %)
16,795
(0.12 %)
35,090
(1.44 %)
30,368
(1.17 %)
113 cuckoo roller (hap1 2023)
GCA_034619455.1
n/a n/a 13,157
(1.67 %)
30,413
(2.59 %)
n/a 43.53
(100.00 %)
18
(0.00 %)
290
(0.00 %)
353
(100.00 %)
609,076
(8.83 %)
331,584
(6.01 %)
5,966,458
(23.99 %)
1
(0.00 %)
520,291
(3.07 %)
45,694
(7.05 %)
36,809
(2.18 %)
114 cuckoo roller (hap2 2023)
GCA_034619465.1
n/a n/a 13,044
(1.66 %)
30,275
(2.65 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
17
(0.00 %)
271
(0.00 %)
295
(100.00 %)
603,184
(8.76 %)
324,082
(7.37 %)
6,147,876
(25.10 %)
0
(0 %)
633,504
(3.50 %)
44,051
(8.95 %)
36,565
(2.19 %)
115 Dalmatian pelican (alternate hap 2023)
GCA_030449815.1
n/a n/a 12,766
(1.68 %)
26,055
(2.18 %)
n/a 43.44
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,284
(100.00 %)
607,561
(13.23 %)
239,649
(4.41 %)
6,086,519
(23.21 %)
0
(0 %)
260,915
(1.93 %)
38,398
(5.49 %)
35,285
(2.09 %)
116 Dalmatian pelican (BGI_N334 2014)
GCF_000687375.1
16,438
(2.13 %)
n/a 11,927
(1.44 %)
25,409
(1.84 %)
n/a 41.39
(99.65 %)
57,580
(0.36 %)
57,580
(0.36 %)
121,562
(99.64 %)
394,453
(5.19 %)
159,315
(0.83 %)
6,832,864
(19.52 %)
3
(0.00 %)
42,891
(0.31 %)
25,648
(0.91 %)
22,079
(0.75 %)
117 Dalmatian pelican (primary hap 2023)
GCA_030463565.1
n/a n/a 13,457
(1.72 %)
25,299
(2.10 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
0
(0 %)
390
(0.01 %)
311
(100.00 %)
660,747
(14.47 %)
294,268
(5.22 %)
6,840,996
(24.63 %)
5
(0.00 %)
318,407
(2.04 %)
39,705
(5.14 %)
36,802
(1.98 %)
118 Domestic goose (bAnsAns1.hap1.1 2024)
GCA_964211835.1
n/a n/a 13,401
(1.75 %)
24,999
(2.15 %)
n/a 43.53
(99.99 %)
0
(0 %)
930
(0.01 %)
819
(100.00 %)
685,992
(5.59 %)
452,303
(8.91 %)
5,976,185
(28.48 %)
16
(0.00 %)
797,996
(5.01 %)
43,672
(4.38 %)
36,919
(2.25 %)
119 Domestic goose (bAnsAns1.hap2.1 2024)
GCA_964211785.1
n/a n/a 12,473
(1.84 %)
22,849
(2.21 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
754
(0.01 %)
754
(0.01 %)
1,135
(99.99 %)
594,136
(5.06 %)
375,813
(7.54 %)
5,497,978
(26.76 %)
11
(0.00 %)
630,693
(4.47 %)
39,164
(4.55 %)
34,203
(2.32 %)
120 Downy woodpecker (alternate hap 2020)
GCA_014839825.1
n/a n/a 11,732
(1.74 %)
22,080
(2.25 %)
n/a 45.44
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,342
(100.00 %)
921,959
(20.95 %)
334,804
(3.26 %)
5,352,773
(31.27 %)
0
(0 %)
702,756
(4.12 %)
24,105
(1.81 %)
19,021
(1.21 %)
121 downy woodpecker (primary hap 2020)
GCF_014839835.1
25,483
(3.24 %)
n/a 12,410
(1.70 %)
22,416
(2.11 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
0
(0 %)
187
(0.34 %)
180
(100.00 %)
1,259,627
(26.52 %)
378,533
(3.38 %)
5,846,661
(32.04 %)
0
(0 %)
791,075
(4.25 %)
26,005
(1.75 %)
19,919
(1.16 %)
122 East African grey crowned-crane
GCF_000709895.1
16,274
(2.23 %)
n/a 12,032
(1.55 %)
26,131
(1.84 %)
n/a 41.21
(99.65 %)
58,359
(0.36 %)
58,359
(0.36 %)
111,850
(99.64 %)
374,845
(4.51 %)
130,655
(0.66 %)
6,753,184
(18.86 %)
5
(0.00 %)
17,937
(0.17 %)
26,202
(0.96 %)
22,836
(0.79 %)
123 East African grey crowned-crane (alternate hap 2020)
GCA_011004865.1
n/a n/a 11,799
(1.88 %)
22,122
(2.30 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
971
(100.00 %)
457,930
(6.40 %)
150,544
(0.85 %)
6,074,490
(20.16 %)
0
(0 %)
65,996
(0.78 %)
33,323
(3.81 %)
32,972
(2.41 %)
124 East African grey crowned-crane (primary hap 2020)
GCA_011004875.1
n/a n/a 13,276
(1.84 %)
25,393
(2.30 %)
n/a 42.38
(99.61 %)
0
(0 %)
144
(0.39 %)
105
(100.00 %)
548,862
(7.06 %)
187,966
(0.97 %)
7,004,597
(21.19 %)
0
(0 %)
102,622
(1.00 %)
36,626
(3.69 %)
36,347
(2.31 %)
125 Eastern black-eared wheatear (GR-GAL-2019-014 2023)
GCF_029582105.1
38,171
(5.79 %)
n/a 12,559
(1.96 %)
23,642
(2.48 %)
n/a 42.01
(99.99 %)
0
(0 %)
582
(0.01 %)
587
(100.00 %)
599,051
(9.46 %)
453,954
(3.77 %)
6,287,657
(20.75 %)
0
(0 %)
382,912
(2.31 %)
27,831
(2.52 %)
21,991
(1.27 %)
126 emperor penguin
GCF_000699145.1
20,055
(3.28 %)
n/a 12,513
(1.77 %)
11,986
(2.13 %)
n/a 41.62
(94.30 %)
72,501
(5.72 %)
72,501
(5.72 %)
83,173
(94.28 %)
478,239
(5.68 %)
200,181
(2.24 %)
7,154,684
(17.95 %)
109
(0.03 %)
107,781
(2.12 %)
31,615
(1.38 %)
27,702
(1.11 %)
127 emu (2018)
GCF_003342905.1
36,047
(5.11 %)
n/a 12,857
(1.77 %)
17,727
(2.32 %)
n/a 41.63
(99.02 %)
0
(0 %)
1,408,082
(1.11 %)
2,778
(100.00 %)
440,224
(4.29 %)
175,539
(0.70 %)
7,218,815
(17.59 %)
289
(0.01 %)
22,204
(0.15 %)
43,752
(4.64 %)
41,501
(3.53 %)
128 emu (hap1 2024)
GCF_036370855.1
54,479
(5.65 %)
n/a 13,972
(1.59 %)
25,695
(1.97 %)
n/a 43.79
(100.00 %)
0
(0 %)
129
(0.00 %)
271
(100.00 %)
713,839
(12.11 %)
418,774
(7.08 %)
5,668,105
(24.04 %)
2
(0.00 %)
825,273
(5.02 %)
51,137
(7.32 %)
43,488
(2.92 %)
129 emu (hap2 2024)
GCA_036417515.1
n/a n/a 12,839
(1.57 %)
24,113
(1.98 %)
n/a 44.40
(100.00 %)
4
(0.00 %)
101
(0.00 %)
242
(100.00 %)
657,460
(14.23 %)
397,600
(8.84 %)
4,824,789
(26.94 %)
0
(0 %)
967,271
(6.15 %)
48,081
(7.49 %)
39,730
(2.99 %)
130 emu (v2 ZJU1.0 2023)
GCA_016128335.2
n/a n/a 13,213
(1.74 %)
24,562
(2.10 %)
n/a 42.41
(99.99 %)
0
(0 %)
539
(0.01 %)
767
(100.00 %)
567,285
(7.79 %)
258,030
(2.59 %)
7,108,005
(19.16 %)
9
(0.00 %)
314,931
(1.79 %)
41,752
(6.24 %)
41,181
(3.35 %)
131 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap1.1 2024)
GCA_964273445.1
n/a n/a 13,292
(1.69 %)
25,387
(2.13 %)
n/a 41.80
(99.99 %)
0
(0 %)
696
(0.01 %)
2,451
(100.00 %)
489,065
(4.78 %)
331,025
(13.58 %)
6,196,233
(29.98 %)
13
(0.00 %)
727,368
(4.14 %)
37,567
(3.51 %)
32,763
(1.74 %)
132 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap2.1 2024)
GCA_964273585.1
n/a n/a 13,051
(1.80 %)
24,815
(2.25 %)
n/a 42.33
(99.99 %)
0
(0 %)
683
(0.01 %)
584
(100.00 %)
482,819
(5.02 %)
292,761
(7.61 %)
6,282,928
(25.46 %)
9
(0.00 %)
449,304
(2.98 %)
35,630
(3.58 %)
31,844
(1.85 %)
133 Eurasian crane (hap1 2024)
GCA_964106855.1
n/a n/a 13,457
(1.70 %)
24,519
(2.05 %)
n/a 44.24
(99.99 %)
0
(0 %)
593
(0.01 %)
754
(100.00 %)
516,462
(4.57 %)
262,941
(8.12 %)
5,356,948
(26.79 %)
2
(0.00 %)
400,278
(3.09 %)
48,488
(7.36 %)
38,193
(2.16 %)
134 Eurasian curlew (hap1 2024)
GCA_964106895.1
n/a n/a 13,239
(1.66 %)
24,512
(2.02 %)
n/a 43.98
(99.99 %)
15
(0.00 %)
785
(0.01 %)
1,834
(100.00 %)
600,399
(6.45 %)
616,756
(7.75 %)
5,607,190
(28.35 %)
45
(0.00 %)
483,497
(3.48 %)
39,863
(3.53 %)
26,424
(1.08 %)
135 Eurasian curlew (hap2 2024)
GCA_964059295.1
n/a n/a 12,728
(1.78 %)
23,645
(2.18 %)
n/a 43.53
(99.99 %)
693
(0.01 %)
693
(0.01 %)
1,504
(99.99 %)
544,959
(6.24 %)
393,773
(4.49 %)
5,839,698
(24.52 %)
33
(0.00 %)
281,233
(2.53 %)
35,759
(3.26 %)
26,342
(1.23 %)
136 Eurasian nightjar (alternate hap 2021)
GCA_907165095.1
n/a n/a 12,266
(1.90 %)
22,091
(2.30 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
0
(0 %)
25
(0.00 %)
2,502
(100.00 %)
458,278
(5.64 %)
212,205
(1.54 %)
6,032,224
(21.16 %)
0
(0 %)
151,625
(1.15 %)
21,942
(1.89 %)
19,235
(1.33 %)
137 Eurasian nightjar (primary hap 2021)
GCA_907165065.1
n/a n/a 13,040
(1.86 %)
22,823
(2.21 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
153
(0.00 %)
121
(100.00 %)
595,803
(8.38 %)
248,128
(1.78 %)
6,744,611
(22.18 %)
2
(0.00 %)
193,177
(1.31 %)
24,805
(1.90 %)
20,997
(1.31 %)
138 Eurasian tree sparrow
GCF_014805655.1
43,477
(5.70 %)
n/a 12,550
(1.95 %)
24,541
(2.43 %)
n/a 42.02
(99.82 %)
0
(0 %)
4,765
(0.18 %)
18,975
(100.00 %)
464,973
(6.08 %)
492,684
(3.98 %)
6,663,773
(20.49 %)
9
(0.00 %)
224,959
(2.45 %)
28,741
(2.30 %)
22,134
(1.26 %)
139 European golden plover (primary hap 2021)
GCA_017639485.1
n/a n/a 12,984
(1.78 %)
22,854
(2.04 %)
n/a 42.70
(99.01 %)
0
(0 %)
268
(0.99 %)
107
(100.00 %)
558,587
(8.35 %)
180,400
(0.83 %)
7,132,381
(21.18 %)
0
(0 %)
102,461
(0.84 %)
40,661
(3.41 %)
37,600
(2.03 %)
140 European robin (alternate hap 2021)
GCA_903797565.2
n/a n/a 11,359
(1.98 %)
21,437
(2.45 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
0
(0 %)
18
(0.00 %)
3,668
(100.00 %)
346,477
(2.88 %)
283,542
(2.49 %)
5,597,130
(19.71 %)
0
(0 %)
200,268
(1.37 %)
22,977
(2.32 %)
18,454
(1.24 %)
141 European robin (primary hap 2021)
GCA_903797595.2
n/a n/a 12,344
(1.85 %)
23,934
(2.37 %)
n/a 42.10
(99.97 %)
0
(0 %)
990
(0.03 %)
1,119
(100.00 %)
532,973
(5.96 %)
401,820
(3.43 %)
6,320,210
(21.42 %)
0
(0 %)
338,954
(2.13 %)
30,391
(2.60 %)
21,664
(1.21 %)
142 European shag (alternate hap 2023)
GCA_949628205.1
n/a n/a 11,681
(1.64 %)
22,195
(2.04 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,752
(100.00 %)
363,092
(4.61 %)
347,630
(2.63 %)
5,664,392
(21.56 %)
0
(0 %)
227,084
(1.83 %)
32,162
(3.60 %)
24,702
(1.39 %)
143 European shag (primary hap 2023)
GCA_949628215.1
n/a n/a 13,203
(1.74 %)
22,959
(2.04 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
3
(0.00 %)
222
(0.00 %)
356
(100.00 %)
436,838
(4.84 %)
471,070
(3.20 %)
6,601,537
(22.79 %)
1
(0.00 %)
334,549
(2.25 %)
37,247
(3.95 %)
29,099
(1.42 %)
144 European turtle dove (v1.2 2021)
GCA_901699155.2
n/a n/a 12,391
(1.76 %)
23,333
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
0
(0 %)
940
(0.33 %)
311
(100.00 %)
550,895
(7.50 %)
227,532
(1.16 %)
6,767,530
(21.05 %)
4
(0.00 %)
181,526
(1.65 %)
34,682
(2.57 %)
30,656
(1.68 %)
145 European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021)
GCA_901699165.2
n/a n/a 11,276
(1.79 %)
21,210
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,334
(100.00 %)
426,785
(4.89 %)
182,446
(0.97 %)
6,038,491
(20.24 %)
0
(0 %)
110,767
(1.11 %)
29,692
(2.35 %)
26,119
(1.59 %)
146 Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021)
GCA_017639475.1
n/a n/a 11,836
(1.83 %)
21,119
(2.12 %)
n/a 42.78
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
1,147
(100.00 %)
443,887
(6.00 %)
149,233
(0.76 %)
6,328,128
(20.72 %)
0
(0 %)
76,306
(0.71 %)
37,413
(3.59 %)
34,823
(2.10 %)
147 garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020)
GCA_014839765.1
n/a n/a 12,359
(1.95 %)
23,228
(2.46 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 775
(100.00 %)
485,213
(6.08 %)
333,505
(2.21 %)
6,358,327
(19.87 %)
0
(0 %)
180,073
(1.19 %)
26,594
(2.34 %)
22,492
(1.32 %)
148 garden warbler (primary hap 2020)
GCA_014839755.1
n/a n/a 12,520
(1.95 %)
23,459
(2.46 %)
n/a 42.08
(99.82 %)
0
(0 %)
134
(0.18 %)
176
(100.00 %)
491,810
(6.09 %)
376,746
(2.55 %)
6,461,292
(20.23 %)
0
(0 %)
225,297
(1.39 %)
27,799
(2.40 %)
23,088
(1.32 %)
149 golden eagle (v1.4 2021)
GCF_900496995.4
60,920
(5.98 %)
n/a 13,334
(1.84 %)
23,261
(2.12 %)
n/a 42.16
(99.58 %)
0
(0 %)
228
(0.42 %)
144
(100.00 %)
544,341
(5.93 %)
186,461
(0.80 %)
7,090,610
(20.01 %)
1
(0.00 %)
68,348
(0.66 %)
38,495
(3.10 %)
35,039
(1.94 %)
150 golden eagle (v1.4 alternate hap 2021)
GCA_902153765.2
n/a n/a 9,172
(1.85 %)
16,917
(2.12 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,855
(100.00 %)
377,153
(8.49 %)
117,959
(0.78 %)
4,418,970
(18.34 %)
0
(0 %)
37,962
(0.63 %)
27,767
(3.57 %)
25,543
(2.23 %)
151 golden pheasant
GCA_003413605.1
n/a n/a 12,891
(2.28 %)
21,429
(2.37 %)
n/a 40.87
(97.55 %)
51,170
(2.47 %)
51,170
(2.47 %)
65,464
(97.53 %)
541,931
(8.01 %)
249,405
(2.01 %)
6,173,989
(19.98 %)
21
(0.01 %)
102,705
(1.24 %)
22,227
(1.31 %)
19,552
(1.02 %)
152 golden-collared manakin
GCF_001715985.3
27,575
(4.33 %)
n/a 11,806
(1.85 %)
13,267
(2.32 %)
n/a 41.42
(97.44 %)
0
(0 %)
20,874
(2.57 %)
3,619
(100.00 %)
447,084
(7.00 %)
197,843
(1.19 %)
6,198,932
(18.50 %)
145
(0.01 %)
84,481
(0.69 %)
18,804
(1.03 %)
15,737
(0.74 %)
153 golden parakeet (hap1 2024)
GCA_045345405.1
n/a n/a 13,156
(1.63 %)
23,633
(1.97 %)
n/a 43.34
(100.00 %)
0
(0 %)
173
(0.00 %)
216
(100.00 %)
515,745
(6.36 %)
283,125
(12.39 %)
4,289,389
(30.87 %)
1
(0.00 %)
868,953
(4.79 %)
27,612
(1.85 %)
20,022
(1.11 %)
154 golden parakeet (hap2 2024)
GCA_045519325.1
n/a n/a 12,035
(1.69 %)
21,430
(2.05 %)
n/a 43.38
(100.00 %)
0
(0 %)
132
(0.00 %)
267
(100.00 %)
447,782
(6.26 %)
211,075
(11.12 %)
4,868,563
(29.39 %)
0
(0 %)
716,927
(4.36 %)
24,821
(1.87 %)
18,862
(1.18 %)
155 great cormorant (BGI_N336 2014)
GCF_000708925.1
15,472
(2.07 %)
n/a 11,547
(1.44 %)
22,727
(1.73 %)
n/a 41.28
(99.25 %)
98,475
(0.77 %)
98,475
(0.77 %)
162,787
(99.23 %)
324,530
(4.59 %)
144,409
(1.43 %)
6,724,538
(18.06 %)
2
(0.00 %)
41,541
(0.34 %)
14,330
(0.42 %)
12,388
(0.35 %)
156 great cormorant (primary hap 2024 genbank)
GCA_963921805.1
n/a n/a 13,434
(1.76 %)
30,619
(3.17 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
0
(0 %)
493
(0.01 %)
351
(100.00 %)
556,740
(10.18 %)
303,279
(3.45 %)
6,599,611
(22.65 %)
1
(0.00 %)
355,900
(2.29 %)
38,341
(5.45 %)
31,913
(1.57 %)
157 great cormorant (primary hap 2024 refseq)
GCF_963921805.1
46,253
(5.46 %)
n/a 13,432
(1.76 %)
23,419
(2.08 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
0
(0 %)
493
(0.01 %)
350
(100.00 %)
556,733
(10.18 %)
303,277
(3.45 %)
6,599,550
(22.65 %)
1
(0.00 %)
355,894
(2.29 %)
38,340
(5.45 %)
31,912
(1.57 %)
158 great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020)
GCA_013368595.1
n/a n/a 11,630
(1.85 %)
20,866
(2.20 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
1,395
(100.00 %)
421,187
(9.08 %)
159,172
(0.96 %)
5,602,689
(22.75 %)
0
(0 %)
169,408
(1.60 %)
29,548
(2.77 %)
25,299
(1.70 %)
159 great potoo (primary hap 2020 genbank)
GCA_013368605.1
n/a n/a 13,116
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
0
(0 %)
243
(0.49 %)
191
(100.00 %)
514,142
(9.71 %)
210,381
(1.13 %)
6,501,989
(23.95 %)
0
(0 %)
244,232
(1.92 %)
35,785
(2.69 %)
29,281
(1.64 %)
160 great potoo (primary hap 2020 refseq)
GCF_013368605.1
33,115
(3.89 %)
n/a 13,120
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
0
(0 %)
243
(0.49 %)
190
(100.00 %)
610,506
(15.46 %)
210,373
(1.13 %)
6,501,918
(23.95 %)
0
(0 %)
244,223
(1.92 %)
35,788
(2.78 %)
29,280
(1.65 %)
161 great tit
GCF_001522545.3
46,201
(6.78 %)
n/a 12,250
(2.00 %)
16,577
(2.52 %)
n/a 41.37
(98.24 %)
22,369
(1.76 %)
24,615
(1.76 %)
24,044
(98.24 %)
447,566
(5.89 %)
249,384
(1.36 %)
6,330,291
(19.11 %)
759
(0.02 %)
82,711
(0.62 %)
23,876
(1.88 %)
20,619
(1.25 %)
162 greater honeyguide (239-I01 2023)
GCF_027791375.1
20,607
(2.63 %)
n/a 12,184
(1.76 %)
21,560
(2.12 %)
n/a 43.63
(100.00 %)
556
(0.00 %)
556
(0.00 %)
1,452
(100.00 %)
804,583
(12.49 %)
291,451
(3.14 %)
5,887,349
(28.34 %)
2
(0.00 %)
453,161
(2.56 %)
19,623
(1.55 %)
16,889
(1.11 %)
163 greater prairie chicken
GCA_001870855.1
n/a n/a 12,923
(2.36 %)
24,062
(2.50 %)
n/a 41.23
(99.63 %)
48,408
(0.39 %)
48,408
(0.39 %)
60,594
(99.61 %)
544,139
(7.50 %)
214,682
(0.99 %)
6,153,628
(19.86 %)
72
(0.00 %)
42,409
(0.26 %)
23,154
(2.26 %)
21,062
(1.67 %)
164 greater rhea
GCA_003343005.1
n/a n/a 12,895
(1.81 %)
20,976
(2.06 %)
n/a 40.79
(98.79 %)
0
(0 %)
2,075,293
(1.40 %)
2,162
(100.00 %)
509,589
(0.00 %)
196,258
(0.73 %)
6,982,184
(18.70 %)
270
(0.01 %)
33,188
(0.25 %)
41,811
(3.95 %)
39,225
(2.81 %)
165 greater sage-grouse
GCF_019232065.1
36,656
(5.50 %)
n/a 12,419
(2.36 %)
21,319
(2.40 %)
n/a 41.16
(96.34 %)
0
(0 %)
9,894
(3.66 %)
1,502
(100.00 %)
574,006
(8.05 %)
196,630
(0.72 %)
5,996,002
(19.65 %)
599
(0.05 %)
23,316
(0.20 %)
18,807
(1.81 %)
17,489
(1.38 %)
166 green peafowl
GCA_016647715.1
n/a n/a 12,897
(2.25 %)
23,427
(2.41 %)
n/a 41.73
(98.15 %)
0
(0 %)
32,668
(1.85 %)
2,446
(100.00 %)
481,865
(6.04 %)
188,685
(1.04 %)
6,268,032
(20.57 %)
209
(0.01 %)
107,708
(4.26 %)
22,330
(1.85 %)
20,111
(1.39 %)
167 grey parrot (MU2MI4XJKV 2020)
GCA_009867235.1
n/a n/a 13,159
(1.57 %)
41,528
(2.68 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
4,777
(0.03 %)
4,777
(0.03 %)
54,154
(99.97 %)
525,535
(7.07 %)
222,932
(1.16 %)
6,301,005
(19.38 %)
2,287
(0.05 %)
107,096
(0.57 %)
28,978
(2.14 %)
26,830
(1.66 %)
168 ground parrot (Strahan ANWC-B61680 2023)
GCF_028554395.1
41,746
(4.05 %)
n/a 13,173
(1.89 %)
24,269
(2.31 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,090
(100.00 %)
468,845
(6.23 %)
261,918
(2.42 %)
5,956,005
(21.98 %)
0
(0 %)
327,033
(1.83 %)
25,573
(1.77 %)
20,975
(1.31 %)
169 gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020)
GCA_015220155.1
n/a n/a 6,534
(1.74 %)
12,152
(1.97 %)
n/a 42.70
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,370
(100.00 %)
179,674
(3.19 %)
76,165
(0.79 %)
2,908,228
(16.85 %)
0
(0 %)
20,525
(0.41 %)
11,838
(2.15 %)
9,707
(1.04 %)
170 gyrfalcon (primary hap 2020)
GCF_015220075.1
47,961
(5.90 %)
n/a 13,016
(1.82 %)
21,266
(2.02 %)
n/a 42.20
(99.55 %)
0
(0 %)
635
(0.45 %)
133
(100.00 %)
484,104
(5.60 %)
186,430
(0.85 %)
7,162,723
(18.83 %)
0
(0 %)
59,799
(0.59 %)
24,760
(2.03 %)
20,013
(0.97 %)
171 Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022)
GCA_026419925.1
n/a n/a 11,838
(1.64 %)
24,014
(2.16 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,969
(100.00 %)
405,109
(3.51 %)
220,222
(6.17 %)
4,708,177
(25.30 %)
0
(0 %)
436,752
(2.86 %)
58,446
(5.44 %)
28,571
(1.65 %)
172 Harpy eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_026419915.1
51,641
(5.08 %)
n/a 13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
0
(0 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
1
(0.00 %)
480,025
(2.70 %)
60,606
(5.66 %)
30,636
(1.52 %)
173 Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021)
GCA_020740675.1
n/a n/a 7,477
(1.92 %)
14,094
(2.40 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,762
(100.00 %)
296,732
(12.20 %)
135,408
(4.08 %)
3,123,655
(20.92 %)
0
(0 %)
142,659
(1.84 %)
23,288
(3.74 %)
13,506
(1.30 %)
174 Hawaiian crow (primary hap 2021 refseq)
GCF_020740725.1
51,593
(6.18 %)
n/a 12,739
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
0
(0 %)
294
(0.16 %)
188
(100.00 %)
409,129
(0.00 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,375
(23.59 %)
3
(0.00 %)
336,844
(2.41 %)
46,118
(3.85 %)
24,228
(1.26 %)
175 helmeted guineafowl
GCF_002078875.1
55,435
(7.96 %)
n/a 12,866
(2.29 %)
18,391
(2.68 %)
n/a 41.73
(98.08 %)
273
(0.00 %)
15,598
(1.93 %)
2,739
(100.00 %)
486,655
(7.97 %)
173,056
(0.98 %)
6,144,176
(20.18 %)
552
(0.06 %)
67,642
(0.52 %)
26,577
(2.39 %)
23,891
(1.68 %)
176 herring gull (bLarArg3.hap2.1 2024)
GCA_964417125.1
n/a n/a 12,602
(1.69 %)
23,925
(2.13 %)
n/a 44.52
(99.99 %)
456
(0.01 %)
456
(0.01 %)
989
(99.99 %)
483,098
(5.09 %)
245,440
(9.57 %)
6,076,469
(27.75 %)
6
(0.00 %)
468,109
(3.13 %)
42,842
(5.92 %)
36,129
(1.71 %)
177 hoatzin (BGI_N306 2014)
GCF_000692075.1
14,928
(2.31 %)
n/a 11,454
(1.65 %)
11,717
(2.07 %)
n/a 42.42
(94.92 %)
99,371
(5.11 %)
99,371
(5.11 %)
109,627
(94.89 %)
360,821
(6.34 %)
145,440
(1.01 %)
6,679,356
(18.72 %)
80
(0.02 %)
75,782
(1.05 %)
40,581
(1.42 %)
34,631
(1.15 %)
178 hoatzin (hap1 2023)
GCA_030867145.1
n/a n/a 13,089
(1.50 %)
29,621
(2.22 %)
n/a 45.56
(100.00 %)
268
(0.00 %)
268
(0.00 %)
683
(100.00 %)
610,333
(22.07 %)
252,997
(12.56 %)
5,154,598
(31.67 %)
3
(0.00 %)
1,034,232
(5.77 %)
58,754
(5.54 %)
47,065
(2.35 %)
179 hoatzin (hap2 2023)
GCA_030867165.1
n/a n/a 12,349
(1.54 %)
27,206
(2.21 %)
n/a 45.91
(100.00 %)
212
(0.00 %)
212
(0.00 %)
535
(100.00 %)
529,757
(21.69 %)
235,999
(14.32 %)
4,845,810
(31.86 %)
0
(0 %)
1,017,817
(5.90 %)
53,781
(5.77 %)
44,601
(2.35 %)
180 hooded crow (v6 S_Up_H32 2022)
GCF_000738735.6
42,787
(6.57 %)
n/a 11,856
(1.93 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
0
(0 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
458,399
(8.32 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
0
(0 %)
77,475
(0.63 %)
25,266
(2.09 %)
20,747
(1.24 %)
181 house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022)
GCA_027406555.1
n/a n/a 12,027
(1.89 %)
23,973
(2.49 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
385,230
(3.05 %)
398,497
(5.70 %)
5,772,203
(22.69 %)
0
(0 %)
478,308
(3.12 %)
28,740
(2.98 %)
21,451
(1.28 %)
182 house finch (primary hap 2022 refseq)
GCF_027477595.1
43,228
(5.71 %)
n/a 12,702
(1.83 %)
24,568
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
0
(0 %)
296
(0.98 %)
184
(100.00 %)
440,384
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,138
(23.47 %)
1
(0.00 %)
573,830
(3.39 %)
30,897
(2.53 %)
22,852
(1.24 %)
183 house sparrow (hap1 2024 genbank)
GCA_036417665.1
n/a n/a 12,831
(1.61 %)
26,124
(2.26 %)
n/a 43.99
(100.00 %)
0
(0 %)
202
(0.00 %)
334
(100.00 %)
647,396
(12.37 %)
646,615
(14.14 %)
5,906,524
(30.36 %)
2
(0.00 %)
873,292
(5.23 %)
36,193
(2.91 %)
24,212
(1.05 %)
184 house sparrow (hap1 2024 refseq)
GCF_036417665.1
75,216
(7.36 %)
n/a 12,832
(1.61 %)
26,124
(2.26 %)
n/a 43.99
(100.00 %)
0
(0 %)
204
(0.00 %)
335
(100.00 %)
647,402
(12.37 %)
646,615
(14.14 %)
5,906,561
(30.36 %)
2
(0.00 %)
873,292
(5.23 %)
36,193
(2.91 %)
24,212
(1.05 %)
185 house sparrow (hap2 2024)
GCA_036417895.1
n/a n/a 12,201
(1.59 %)
24,721
(2.19 %)
n/a 44.46
(100.00 %)
0
(0 %)
182
(0.00 %)
482
(100.00 %)
629,688
(12.73 %)
644,409
(14.12 %)
5,103,050
(31.93 %)
0
(0 %)
899,607
(5.60 %)
33,424
(2.42 %)
23,096
(1.05 %)
186 Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022)
GCA_027474345.1
n/a n/a 11,806
(1.66 %)
21,429
(1.97 %)
n/a 43.73
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,343
(100.00 %)
508,803
(10.25 %)
162,918
(5.44 %)
6,029,969
(24.67 %)
0
(0 %)
224,585
(1.75 %)
27,953
(3.83 %)
24,431
(1.47 %)
187 Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022)
GCA_027474245.1
n/a n/a 13,233
(1.67 %)
23,010
(1.93 %)
n/a 43.91
(99.92 %)
0
(0 %)
253
(0.08 %)
136
(100.00 %)
610,144
(11.51 %)
214,393
(5.75 %)
6,069,916
(25.74 %)
1
(0.00 %)
314,812
(2.19 %)
33,172
(3.38 %)
26,788
(1.37 %)
188 hyacinth macaw (LEKZKR9XQ3 2022)
GCA_009936445.2
n/a n/a 12,424
(1.21 %)
43,440
(2.06 %)
n/a 41.86
(99.95 %)
1,098
(0.00 %)
1,098
(0.00 %)
260,829
(100.00 %)
497,886
(5.29 %)
184,967
(0.96 %)
6,167,538
(20.22 %)
44
(0.00 %)
n/a 33,529
(1.55 %)
29,190
(1.30 %)
189 jackdaw
GCA_013407035.1
n/a n/a 12,072
(1.93 %)
20,925
(2.08 %)
n/a 42.15
(99.72 %)
0
(0 %)
511
(0.28 %)
41
(100.00 %)
428,760
(6.13 %)
173,436
(1.02 %)
6,231,317
(19.25 %)
0
(0 %)
90,287
(0.72 %)
26,177
(2.17 %)
21,211
(1.28 %)
190 Japanese quail
GCF_001577835.2
49,210
(7.77 %)
n/a 12,864
(2.54 %)
22,540
(2.69 %)
37,604
(4.36 %)
41.28
(98.88 %)
7,630
(1.12 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
559,601
(7.91 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
628
(0.03 %)
160,342
(1.32 %)
17,977
(1.86 %)
15,897
(1.26 %)
191 kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023)
GCA_027595965.1
n/a n/a 8,732
(1.74 %)
16,473
(2.17 %)
n/a 45.10
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,819
(100.00 %)
314,902
(10.49 %)
133,061
(10.84 %)
3,656,435
(25.68 %)
0
(0 %)
519,192
(4.55 %)
32,592
(5.25 %)
26,472
(3.09 %)
192 kagu (bRhyJub1 primary hap 2023)
GCA_027574665.1
n/a n/a 13,042
(1.63 %)
24,142
(2.01 %)
n/a 45.07
(99.96 %)
0
(0 %)
300
(0.04 %)
148
(100.00 %)
563,851
(12.90 %)
270,861
(12.36 %)
6,191,106
(28.24 %)
2
(0.00 %)
905,468
(5.08 %)
54,426
(4.92 %)
40,156
(2.73 %)
193 kakapo (Jane alternate hap 2019)
GCA_004011185.1
n/a n/a 3,256
(1.65 %)
6,220
(1.98 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
3,728
(100.00 %)
127,817
(7.83 %)
53,447
(1.21 %)
1,502,789
(18.09 %)
0
(0 %)
44,014
(1.40 %)
5,487
(1.71 %)
4,787
(1.19 %)
194 kakapo (v2 Jane 2020 refseq)
GCF_004027225.2
49,757
(5.76 %)
n/a 13,110
(1.92 %)
22,782
(2.26 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
0
(0 %)
373
(0.92 %)
89
(100.00 %)
507,148
(7.85 %)
208,178
(1.08 %)
6,258,087
(20.50 %)
0
(0 %)
165,530
(1.34 %)
22,278
(1.77 %)
19,230
(1.21 %)
195 kea
GCF_000696875.1
15,953
(2.35 %)
n/a 11,985
(1.66 %)
22,107
(2.01 %)
n/a 41.09
(99.60 %)
51,381
(0.42 %)
51,381
(0.42 %)
93,561
(99.58 %)
368,226
(5.60 %)
138,157
(0.75 %)
5,905,331
(18.06 %)
11
(0.00 %)
49,630
(0.40 %)
7,218
(0.22 %)
6,071
(0.18 %)
196 killdeer
GCF_000708025.1
16,480
(2.43 %)
n/a 12,356
(1.72 %)
12,853
(2.15 %)
n/a 41.88
(97.24 %)
63,995
(2.78 %)
63,995
(2.78 %)
79,162
(97.22 %)
424,095
(5.93 %)
167,406
(0.94 %)
7,070,701
(19.44 %)
47
(0.01 %)
53,430
(0.75 %)
37,082
(1.57 %)
31,772
(1.21 %)
197 king vulture (hap1 2024)
GCA_037962945.1
n/a n/a 13,641
(1.52 %)
24,293
(1.78 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
6
(0.00 %)
154
(0.00 %)
130
(100.00 %)
484,661
(3.34 %)
252,569
(16.01 %)
5,595,734
(32.51 %)
1
(0.00 %)
776,309
(4.15 %)
77,942
(3.59 %)
33,020
(1.50 %)
198 king vulture (hap2 2024)
GCA_037950955.1
n/a n/a 12,764
(1.49 %)
23,033
(1.77 %)
n/a 44.67
(100.00 %)
0
(0 %)
128
(0.00 %)
140
(100.00 %)
432,536
(3.01 %)
230,315
(20.91 %)
4,960,923
(35.56 %)
0
(0 %)
872,545
(4.75 %)
86,907
(3.76 %)
31,074
(1.47 %)
199 lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023)
GCA_028017155.1
n/a n/a 10,584
(1.75 %)
19,112
(2.09 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,892
(100.00 %)
363,564
(3.53 %)
235,220
(7.22 %)
5,072,834
(23.83 %)
0
(0 %)
224,788
(1.89 %)
24,909
(2.64 %)
22,061
(1.41 %)
200 lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023)
GCA_028022735.1
n/a n/a 13,529
(1.69 %)
23,672
(1.98 %)
n/a 43.50
(99.85 %)
0
(0 %)
259
(0.15 %)
232
(100.00 %)
491,653
(3.53 %)
349,011
(9.83 %)
5,955,030
(26.51 %)
5
(0.00 %)
404,016
(2.60 %)
32,237
(2.61 %)
27,504
(1.23 %)
201 lance-tailed manakin (2020)
GCF_009829145.1
46,366
(5.56 %)
n/a 12,594
(1.91 %)
22,763
(2.31 %)
26,057
(3.91 %)
41.97
(99.70 %)
0
(0 %)
206
(0.30 %)
93
(100.00 %)
485,121
(7.13 %)
247,189
(1.64 %)
6,498,294
(20.04 %)
0
(0 %)
149,431
(1.05 %)
25,377
(1.97 %)
21,424
(1.14 %)
202 lance-tailed manakin (alternate hap 2020)
GCA_009829205.1
n/a n/a 12,282
(1.85 %)
23,867
(2.36 %)
n/a 42.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,269
(100.00 %)
472,384
(7.01 %)
237,680
(1.65 %)
6,121,661
(19.48 %)
0
(0 %)
146,408
(1.08 %)
25,589
(2.05 %)
21,299
(1.17 %)
203 lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022)
GCA_023634305.1
n/a n/a 12,458
(1.70 %)
22,259
(2.05 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,090
(100.00 %)
413,301
(3.46 %)
189,449
(5.28 %)
5,962,597
(22.07 %)
0
(0 %)
384,018
(2.74 %)
31,611
(2.72 %)
19,364
(0.92 %)
204 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023638135.1
48,561
(5.70 %)
n/a 12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
0
(0 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
2
(0.00 %)
479,269
(2.67 %)
32,398
(2.65 %)
19,870
(0.89 %)
205 lesser black-backed gull (primary hap 2024)
GCA_963932225.1
n/a n/a 13,333
(1.68 %)
24,731
(2.05 %)
n/a 44.40
(99.99 %)
15
(0.00 %)
537
(0.01 %)
1,382
(100.00 %)
509,160
(5.11 %)
266,609
(9.64 %)
6,827,304
(27.15 %)
3
(0.00 %)
575,179
(3.19 %)
44,108
(6.34 %)
37,502
(1.70 %)
206 lesser kestrel (alternate hap 2021)
GCA_017639645.1
n/a n/a 12,578
(1.83 %)
22,257
(2.16 %)
n/a 42.51
(98.97 %)
0
(0 %)
258
(1.03 %)
551
(100.00 %)
431,717
(3.61 %)
201,876
(1.38 %)
6,620,060
(19.16 %)
0
(0 %)
121,154
(0.99 %)
27,552
(2.26 %)
21,049
(1.02 %)
207 lesser kestrel (v2 2021)
GCF_017639655.2
47,420
(5.64 %)
n/a 13,098
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
0
(0 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,499
(5.58 %)
210,234
(1.26 %)
7,133,934
(19.19 %)
1
(0.00 %)
132,967
(0.79 %)
27,558
(2.21 %)
21,862
(1.03 %)
208 lesser prairie-chicken (F22 2022)
GCF_026119805.1
51,352
(6.92 %)
n/a 12,689
(2.35 %)
22,377
(2.51 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
0
(0 %)
58
(0.00 %)
206
(100.00 %)
498,179
(5.36 %)
218,390
(1.80 %)
6,038,211
(20.76 %)
4
(0.00 %)
129,285
(1.09 %)
20,648
(2.33 %)
19,128
(1.58 %)
209 lesser rhea (206185 2018)
GCA_003342835.1
n/a n/a 13,105
(1.81 %)
25,654
(2.45 %)
n/a 40.86
(98.66 %)
0
(0 %)
1,039,616
(1.43 %)
3,019
(100.00 %)
522,333
(5.61 %)
208,867
(0.79 %)
7,080,214
(19.15 %)
351
(0.01 %)
36,716
(0.28 %)
42,016
(4.35 %)
39,294
(3.14 %)
210 lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023)
GCA_028389885.1
n/a n/a 10,465
(1.71 %)
19,083
(2.16 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 910
(100.00 %)
520,125
(6.78 %)
251,547
(4.21 %)
5,321,207
(21.53 %)
0
(0 %)
171,609
(1.68 %)
34,698
(5.69 %)
30,309
(2.73 %)
211 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028389875.1
39,024
(4.18 %)
n/a 13,360
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
0
(0 %)
128
(0.11 %)
180
(100.00 %)
674,149
(6.73 %)
329,124
(5.34 %)
6,820,245
(22.78 %)
1
(0.00 %)
266,226
(1.85 %)
45,073
(5.83 %)
38,575
(2.59 %)
212 little egret
GCF_000687185.1
25,843
(3.55 %)
n/a 12,162
(1.73 %)
10,954
(2.03 %)
n/a 42.25
(95.99 %)
88,871
(4.04 %)
88,871
(4.04 %)
100,662
(95.96 %)
490,997
(6.84 %)
165,380
(1.23 %)
6,955,585
(18.98 %)
112
(0.02 %)
74,371
(1.60 %)
31,136
(1.15 %)
26,032
(0.88 %)
213 long-tailed duck (primary hap 2024)
GCA_963989345.1
n/a n/a 13,329
(1.88 %)
23,888
(2.25 %)
n/a 42.30
(99.99 %)
0
(0 %)
544
(0.01 %)
272
(100.00 %)
784,647
(6.78 %)
501,860
(7.36 %)
6,388,957
(26.13 %)
53
(0.00 %)
600,275
(3.74 %)
34,028
(3.04 %)
29,568
(1.51 %)
214 long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022)
GCA_023637925.1
n/a n/a 12,264
(2.01 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 40.99
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 230
(100.00 %)
498,393
(5.07 %)
266,700
(1.49 %)
6,131,743
(20.45 %)
0
(0 %)
94,007
(0.79 %)
15,809
(1.43 %)
13,620
(0.94 %)
215 long-tailed hermit (v2 PSU5 primary hap 2025)
GCA_023637945.2
n/a n/a 12,322
(2.02 %)
20,234
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
12
(0.00 %)
140
(0.37 %)
77
(100.00 %)
497,376
(5.06 %)
265,823
(1.51 %)
6,044,278
(20.09 %)
0
(0 %)
100,037
(0.84 %)
15,921
(1.43 %)
13,767
(0.94 %)
216 Macqueen's bustard (BGI_N324 2014)
GCF_000695195.1
15,790
(2.21 %)
n/a 11,632
(1.52 %)
24,790
(1.96 %)
n/a 41.10
(99.68 %)
56,130
(0.33 %)
56,130
(0.33 %)
115,823
(99.67 %)
391,856
(4.80 %)
148,075
(0.90 %)
6,682,530
(20.03 %)
5
(0.00 %)
28,454
(0.32 %)
27,675
(1.15 %)
24,593
(0.96 %)
217 Macqueen's bustard (maternal hap 2024)
GCA_036417535.1
n/a n/a 13,082
(1.73 %)
27,150
(2.44 %)
n/a 43.25
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
329
(100.00 %)
669,243
(14.71 %)
211,387
(6.69 %)
6,514,716
(27.07 %)
0
(0 %)
589,996
(3.41 %)
47,331
(8.09 %)
32,791
(2.71 %)
218 Macqueen's bustard (paternal 2024)
GCA_036418225.1
n/a n/a 11,814
(1.80 %)
23,161
(2.38 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
343
(100.00 %)
586,864
(13.28 %)
184,036
(5.91 %)
5,606,205
(25.25 %)
0
(0 %)
453,525
(2.87 %)
42,560
(7.71 %)
29,282
(2.77 %)
219 maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021)
GCA_017639665.1
n/a n/a 10,658
(1.74 %)
18,941
(1.98 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
4,278
(100.00 %)
326,479
(4.02 %)
141,715
(0.74 %)
5,600,372
(19.59 %)
0
(0 %)
41,184
(0.48 %)
27,330
(3.35 %)
26,330
(2.05 %)
220 maguari stork (primary hap 2021)
GCA_017639555.1
n/a n/a 12,905
(1.81 %)
22,204
(2.01 %)
n/a 42.12
(98.21 %)
0
(0 %)
232
(1.79 %)
153
(100.00 %)
485,318
(6.35 %)
184,992
(0.78 %)
7,064,965
(19.56 %)
0
(0 %)
58,168
(0.52 %)
31,653
(3.02 %)
31,174
(1.88 %)
221 mallard (CAU_Wild1.0 2019)
GCA_008746955.1
n/a n/a 13,260
(1.85 %)
25,071
(2.17 %)
n/a 42.41
(99.90 %)
0
(0 %)
318
(0.10 %)
1,665
(100.00 %)
849,782
(8.18 %)
438,622
(5.10 %)
6,729,782
(25.03 %)
1
(0.00 %)
510,566
(3.07 %)
34,670
(3.03 %)
27,835
(1.39 %)
222 mallard (hap1 2024)
GCA_964188345.1
n/a n/a 13,680
(1.77 %)
26,845
(2.33 %)
n/a 42.87
(99.99 %)
0
(0 %)
571
(0.01 %)
936
(100.00 %)
941,876
(15.92 %)
570,703
(9.50 %)
6,169,980
(28.67 %)
58
(0.00 %)
840,239
(5.08 %)
41,791
(3.18 %)
29,249
(1.36 %)
223 mallard (hap2 2024)
GCA_964188335.1
n/a n/a 12,715
(1.89 %)
24,338
(2.42 %)
n/a 42.70
(99.99 %)
485
(0.01 %)
485
(0.01 %)
972
(99.99 %)
795,168
(13.44 %)
445,147
(7.71 %)
5,728,430
(26.21 %)
53
(0.00 %)
572,559
(4.02 %)
35,679
(3.13 %)
26,930
(1.43 %)
224 mallard (Pekin duck Z2 2020 Zhejiang U)
GCF_015476345.1
59,854
(7.33 %)
n/a 12,988
(1.87 %)
23,709
(2.20 %)
86,787
(8.80 %)
42.27
(99.64 %)
0
(0 %)
905
(0.36 %)
756
(100.00 %)
803,558
(8.04 %)
417,575
(5.02 %)
6,627,843
(24.59 %)
5
(0.00 %)
487,092
(3.05 %)
35,030
(3.06 %)
27,683
(1.41 %)
225 mallard PBH1.5
GCF_003850225.1
54,114
(7.47 %)
n/a 12,199
(1.86 %)
15,363
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.77 %)
0
(0 %)
71,703
(0.26 %)
2,150
(100.00 %)
770,322
(8.16 %)
357,617
(3.09 %)
6,587,406
(21.92 %)
10,779
(0.50 %)
178,434
(3.20 %)
29,913
(2.33 %)
25,669
(1.40 %)
226 Mariana crow
GCF_017639235.1
48,460
(7.00 %)
n/a 12,506
(1.97 %)
22,580
(2.35 %)
n/a 42.14
(98.94 %)
0
(0 %)
10,579
(1.06 %)
1,443
(100.00 %)
434,280
(5.91 %)
169,629
(0.82 %)
6,323,058
(18.94 %)
1,090
(0.02 %)
53,595
(0.38 %)
27,390
(2.04 %)
22,460
(1.27 %)
227 Mauritius kestrel (alternate hap 2023)
GCA_963210275.1
n/a n/a 4,774
(1.89 %)
8,695
(2.32 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,259
(100.00 %)
135,092
(3.67 %)
112,042
(8.63 %)
1,739,144
(22.50 %)
0
(0 %)
103,391
(2.09 %)
12,908
(3.26 %)
7,476
(1.06 %)
228 Mauritius kestrel (primary hap 2023)
GCA_963210335.1
n/a n/a 13,064
(1.72 %)
22,269
(1.98 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
0
(0 %)
407
(0.01 %)
316
(100.00 %)
459,578
(3.87 %)
315,686
(6.19 %)
6,650,507
(22.84 %)
0
(0 %)
244,086
(1.64 %)
36,076
(2.82 %)
21,430
(0.96 %)
229 Mauritius parakeet (alternate hap 2023)
GCA_963243765.1
n/a n/a 8,873
(1.81 %)
16,175
(2.24 %)
n/a 42.92
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,130
(100.00 %)
331,293
(6.89 %)
161,393
(5.94 %)
3,516,196
(24.86 %)
0
(0 %)
323,514
(3.25 %)
16,659
(1.74 %)
13,876
(1.32 %)
230 Mauritius parakeet (primary hap 2023)
GCA_963264785.1
n/a n/a 13,133
(1.81 %)
23,396
(2.19 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
358
(0.01 %)
172
(100.00 %)
511,156
(7.05 %)
238,915
(5.05 %)
5,764,523
(25.19 %)
2
(0.00 %)
442,454
(2.96 %)
24,675
(1.70 %)
20,376
(1.26 %)
231 medium ground-finch
GCF_000277835.1
22,226
(4.24 %)
n/a 11,887
(1.83 %)
11,438
(2.19 %)
n/a 41.61
(97.77 %)
68,589
(2.25 %)
68,589
(2.25 %)
95,828
(97.75 %)
433,244
(5.91 %)
322,831
(2.24 %)
6,548,136
(19.49 %)
32
(0.01 %)
113,187
(1.09 %)
18,135
(0.69 %)
13,605
(0.48 %)
232 monk parakeet
GCA_017639245.1
n/a n/a 13,067
(1.85 %)
n/a n/a 42.29
(99.99 %)
0
(0 %)
352
(0.01 %)
291
(100.00 %)
582,436
(9.49 %)
253,709
(2.79 %)
5,820,920
(22.52 %)
1
(0.00 %)
272,189
(1.90 %)
23,101
(1.75 %)
20,766
(1.33 %)
233 Montezuma quail (F1298 2024)
GCF_038088225.1
28,327
(3.95 %)
n/a 12,793
(2.29 %)
22,305
(2.47 %)
n/a 41.36
(100.00 %)
234
(0.00 %)
234
(0.00 %)
521
(100.00 %)
458,084
(6.03 %)
243,493
(3.14 %)
5,553,010
(22.13 %)
2
(0.00 %)
287,030
(2.36 %)
22,147
(2.41 %)
18,738
(1.51 %)
234 mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021)
GCA_009769485.2
n/a n/a 10,145
(1.98 %)
18,617
(2.30 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
14
(0.00 %)
14
(0.00 %)
5,640
(100.00 %)
533,330
(9.11 %)
213,518
(1.29 %)
4,813,886
(20.16 %)
0
(0 %)
52,896
(0.73 %)
25,667
(3.86 %)
24,229
(2.21 %)
235 mute swan (v2 primary hap 2021)
GCF_009769625.2
59,524
(6.76 %)
n/a 12,983
(1.98 %)
22,400
(2.22 %)
33,839
(5.17 %)
41.92
(99.13 %)
0
(0 %)
451
(0.87 %)
171
(100.00 %)
700,051
(7.55 %)
301,579
(1.34 %)
6,791,838
(21.30 %)
1
(0.00 %)
78,712
(0.74 %)
31,278
(3.07 %)
30,009
(2.01 %)
236 Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023)
GCA_027579665.1
n/a n/a 11,687
(1.78 %)
24,169
(2.43 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,834
(100.00 %)
414,780
(3.26 %)
491,012
(10.03 %)
5,570,475
(26.24 %)
0
(0 %)
495,689
(3.67 %)
29,485
(4.55 %)
21,361
(1.22 %)
237 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579445.1
31,033
(4.42 %)
n/a 12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
0
(0 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
5
(0.00 %)
478,923
(3.35 %)
31,693
(3.88 %)
22,817
(1.16 %)
238 New Caledonian crow (alternate hap 2019)
GCA_009651025.1
n/a n/a 11,097
(1.99 %)
20,436
(2.45 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 894
(100.00 %)
377,050
(6.03 %)
178,064
(1.53 %)
5,305,126
(19.49 %)
0
(0 %)
132,677
(1.13 %)
26,107
(2.52 %)
20,600
(1.37 %)
239 New Caledonian crow (primary hap 2019)
GCF_009650955.1
50,821
(6.95 %)
n/a 12,747
(1.94 %)
23,372
(2.37 %)
30,299
(3.60 %)
42.57
(97.41 %)
0
(0 %)
289
(2.59 %)
105
(100.00 %)
452,690
(6.21 %)
231,546
(1.70 %)
6,265,995
(19.54 %)
0
(0 %)
191,789
(1.34 %)
31,909
(2.48 %)
24,362
(1.33 %)
240 Nicobar pigeon (hap1 2024 genbank)
GCA_036013445.1
n/a n/a 13,359
(1.72 %)
24,921
(2.13 %)
n/a 44.64
(100.00 %)
0
(0 %)
117
(0.00 %)
807
(100.00 %)
705,078
(18.28 %)
342,299
(9.55 %)
6,410,095
(28.06 %)
0
(0 %)
778,929
(4.34 %)
38,589
(9.40 %)
31,814
(1.47 %)
241 Nicobar pigeon (hap1 2024 refseq)
GCF_036013445.1
34,506
(4.09 %)
n/a 13,358
(1.72 %)
24,851
(2.13 %)
n/a 44.64
(100.00 %)
0
(0 %)
117
(0.00 %)
806
(100.00 %)
705,074
(18.28 %)
342,297
(9.55 %)
6,410,054
(28.06 %)
0
(0 %)
778,929
(4.34 %)
38,589
(9.40 %)
31,815
(1.47 %)
242 Nicobar pigeon (hap2 2024)
GCA_036010745.1
n/a n/a 13,270
(1.84 %)
24,753
(2.28 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
118
(0.00 %)
226
(100.00 %)
675,092
(12.72 %)
313,111
(3.64 %)
6,547,843
(23.22 %)
1
(0.00 %)
382,235
(2.71 %)
37,728
(3.88 %)
31,602
(1.56 %)
243 night parrot (Australia 2023)
GCF_034315485.1
48,921
(5.26 %)
n/a 12,986
(1.89 %)
22,892
(2.24 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
3,593
(100.00 %)
487,881
(6.13 %)
259,865
(3.37 %)
5,961,641
(22.88 %)
0
(0 %)
361,836
(1.95 %)
24,673
(1.77 %)
20,231
(1.29 %)
244 North Island brown kiwi (hap1 2024 genbank)
GCA_036417845.1
n/a n/a 13,670
(1.52 %)
33,383
(2.64 %)
n/a 44.01
(100.00 %)
0
(0 %)
170
(0.00 %)
409
(100.00 %)
713,271
(8.42 %)
603,937
(6.25 %)
5,379,113
(27.65 %)
1
(0.00 %)
501,455
(3.32 %)
50,913
(9.74 %)
40,971
(3.07 %)
245 North Island brown kiwi (hap1 2024 refseq)
GCF_036417845.1
39,806
(3.75 %)
n/a 13,668
(1.52 %)
25,226
(1.90 %)
n/a 44.01
(100.00 %)
0
(0 %)
170
(0.00 %)
408
(100.00 %)
713,264
(8.42 %)
603,930
(6.25 %)
5,379,069
(27.65 %)
1
(0.00 %)
501,448
(3.32 %)
50,913
(9.74 %)
40,971
(3.07 %)
246 North Island brown kiwi (hap2 2024)
GCA_036417975.1
n/a n/a 13,664
(1.44 %)
37,696
(2.80 %)
n/a 44.42
(100.00 %)
0
(0 %)
155
(0.00 %)
349
(100.00 %)
760,455
(8.84 %)
626,528
(6.85 %)
5,029,822
(30.45 %)
1
(0.00 %)
604,936
(3.67 %)
54,278
(9.43 %)
41,382
(3.03 %)
247 northern bobwhite
GCA_008692595.2
n/a n/a 12,584
(2.37 %)
22,327
(2.53 %)
n/a 41.41
(99.04 %)
33,134
(0.97 %)
33,134
(0.97 %)
39,169
(99.03 %)
460,369
(4.63 %)
213,800
(1.34 %)
5,813,961
(19.54 %)
3,119
(0.09 %)
78,915
(0.74 %)
22,156
(2.37 %)
19,264
(1.49 %)
248 northern fulmar
GCF_000690835.1
16,383
(2.20 %)
n/a 11,965
(1.51 %)
24,294
(1.87 %)
n/a 41.17
(99.50 %)
54,825
(0.51 %)
54,825
(0.51 %)
112,214
(99.49 %)
330,541
(3.74 %)
146,735
(0.83 %)
6,838,937
(18.42 %)
8
(0.00 %)
20,338
(0.20 %)
24,859
(0.79 %)
21,301
(0.66 %)
249 northern gannet (hap1 2023)
GCA_031468805.1
n/a n/a 13,367
(1.65 %)
24,403
(2.00 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
263
(0.00 %)
829
(100.00 %)
498,574
(4.51 %)
273,984
(5.20 %)
5,544,122
(27.29 %)
25
(0.00 %)
496,388
(3.06 %)
34,879
(3.83 %)
24,416
(1.00 %)
250 northern gannet (hap2 2023)
GCA_031468815.1
n/a n/a 13,477
(1.77 %)
23,613
(2.08 %)
n/a 42.44
(100.00 %)
6
(0.00 %)
248
(0.00 %)
427
(100.00 %)
474,930
(4.45 %)
237,604
(2.75 %)
5,847,260
(21.07 %)
30
(0.00 %)
226,420
(1.83 %)
30,873
(3.03 %)
26,071
(1.23 %)
251 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v1 2022 refseq)
GCF_929443795.1
50,663
(4.74 %)
n/a 13,528
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
183
(0.00 %)
454
(100.00 %)
521,768
(3.86 %)
325,987
(9.82 %)
5,542,269
(27.30 %)
4
(0.00 %)
458,030
(3.08 %)
43,070
(4.44 %)
32,753
(1.47 %)
252 northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022)
GCA_929447715.1
n/a n/a 12,115
(1.73 %)
22,764
(2.15 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
4,484
(100.00 %)
417,395
(3.68 %)
231,908
(7.24 %)
5,424,533
(24.05 %)
0
(0 %)
253,718
(2.12 %)
35,691
(4.26 %)
29,357
(1.67 %)
253 northern goshawk (v2 primary hap 2022 genbank)
GCA_929443795.2
n/a n/a 13,527
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
183
(0.00 %)
455
(100.00 %)
511,000
(3.76 %)
325,992
(9.82 %)
5,542,342
(27.30 %)
4
(0.00 %)
458,026
(3.08 %)
43,070
(4.44 %)
32,753
(1.47 %)
254 northern pintail (primary hap 2024 genbank)
GCA_963932015.1
n/a n/a 13,218
(1.88 %)
23,888
(2.27 %)
n/a 42.56
(99.99 %)
0
(0 %)
631
(0.01 %)
395
(100.00 %)
734,763
(5.74 %)
422,947
(7.08 %)
6,491,165
(25.88 %)
10
(0.00 %)
474,751
(3.08 %)
34,601
(2.98 %)
28,080
(1.42 %)
255 northern pintail (primary hap 2024 refseq)
GCF_963932015.1
61,479
(7.27 %)
n/a 13,217
(1.88 %)
23,886
(2.27 %)
n/a 42.56
(99.99 %)
0
(0 %)
631
(0.01 %)
394
(100.00 %)
734,760
(5.74 %)
422,946
(7.08 %)
6,491,116
(25.88 %)
10
(0.00 %)
474,748
(3.08 %)
34,601
(2.98 %)
28,080
(1.42 %)
256 Obi paradise-crow (lycPyr6 2020)
GCA_014706295.1
n/a n/a 12,592
(1.89 %)
24,002
(2.35 %)
n/a 42.94
(99.48 %)
0
(0 %)
1,602
(0.52 %)
1,695
(100.00 %)
466,546
(6.40 %)
235,283
(1.98 %)
6,371,421
(20.17 %)
15
(0.01 %)
202,970
(1.78 %)
34,247
(3.02 %)
26,600
(1.39 %)
257 Okarito brown kiwi
GCF_003343035.1
43,838
(4.59 %)
n/a 13,232
(1.76 %)
18,641
(2.35 %)
n/a 41.52
(98.49 %)
0
(0 %)
696,987
(1.57 %)
4,120
(100.00 %)
482,272
(4.98 %)
178,540
(0.70 %)
7,407,982
(18.33 %)
311
(0.01 %)
26,294
(0.18 %)
43,081
(4.88 %)
40,596
(3.66 %)
258 Oriental scops-owl (oso-nibr-517 2020)
GCA_010365825.1
n/a n/a 12,953
(1.76 %)
25,275
(2.07 %)
24,636
(2.89 %)
41.70
(98.42 %)
42,691
(1.58 %)
42,691
(1.58 %)
151,517
(98.42 %)
494,677
(6.28 %)
222,654
(1.07 %)
7,211,171
(19.25 %)
79
(0.00 %)
63,569
(0.39 %)
41,048
(2.24 %)
31,487
(1.49 %)
259 peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022)
GCA_023634185.1
n/a n/a 12,529
(1.75 %)
24,654
(2.25 %)
n/a 42.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,745
(100.00 %)
517,204
(7.95 %)
218,606
(4.15 %)
6,216,533
(21.16 %)
0
(0 %)
237,835
(2.15 %)
26,313
(2.41 %)
19,163
(0.91 %)
260 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634155.1
49,100
(5.64 %)
n/a 13,021
(1.66 %)
21,794
(1.95 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
0
(0 %)
241
(0.31 %)
125
(100.00 %)
586,320
(11.83 %)
335,218
(8.05 %)
7,038,851
(24.65 %)
0
(0 %)
405,474
(2.46 %)
26,085
(2.25 %)
20,023
(0.87 %)
261 peregrine falcon (BGI 2013)
GCF_000337955.1
37,506
(5.42 %)
n/a 12,670
(1.80 %)
11,311
(2.11 %)
n/a 41.77
(98.44 %)
76,060
(1.58 %)
76,069
(1.58 %)
83,081
(98.42 %)
437,234
(5.32 %)
170,160
(0.93 %)
7,157,857
(18.38 %)
6
(0.00 %)
32,904
(0.44 %)
22,325
(0.89 %)
17,778
(0.64 %)
262 pin-tailed whydah (BioBank_ID:100142 2022)
GCF_024509145.1
41,770
(4.95 %)
n/a 12,712
(1.86 %)
24,157
(2.37 %)
n/a 42.69
(100.00 %)
338
(0.00 %)
338
(0.00 %)
484
(100.00 %)
641,523
(14.11 %)
414,142
(6.03 %)
6,230,412
(23.70 %)
3
(0.00 %)
424,462
(3.05 %)
49,402
(3.94 %)
24,827
(1.35 %)
263 pink pigeon (alternate hap 2023)
GCA_963082445.1
n/a n/a 10,425
(1.96 %)
20,219
(2.49 %)
n/a 42.52
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,277
(100.00 %)
344,711
(4.99 %)
225,902
(3.41 %)
4,563,425
(21.61 %)
0
(0 %)
303,874
(2.37 %)
28,391
(3.74 %)
24,938
(2.03 %)
264 pink pigeon (primary hap 2023)
GCA_963082525.1
n/a n/a 13,140
(1.85 %)
25,111
(2.31 %)
n/a 42.27
(99.99 %)
0
(0 %)
509
(0.01 %)
143
(100.00 %)
488,313
(5.48 %)
331,962
(3.50 %)
6,243,204
(22.87 %)
0
(0 %)
441,492
(2.54 %)
36,343
(3.63 %)
31,102
(1.89 %)
265 pink-footed goose (primary hap 2024)
GCA_964034855.1
n/a n/a 13,275
(1.76 %)
24,103
(2.11 %)
n/a 43.68
(99.98 %)
0
(0 %)
1,137
(0.02 %)
715
(100.00 %)
792,215
(9.76 %)
471,286
(10.34 %)
6,448,623
(29.48 %)
7
(0.00 %)
821,367
(5.38 %)
49,485
(4.41 %)
36,058
(2.18 %)
266 plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021)
GCA_020745805.1
n/a n/a 11,774
(1.90 %)
20,857
(2.20 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
749
(100.00 %)
356,053
(4.37 %)
157,695
(0.93 %)
5,995,637
(19.60 %)
0
(0 %)
70,223
(0.74 %)
30,478
(4.03 %)
30,200
(2.16 %)
267 plumbeous ibis (primary hap 2021)
GCA_020745775.1
n/a n/a 13,028
(1.84 %)
22,722
(2.10 %)
n/a 42.37
(99.81 %)
0
(0 %)
104
(0.19 %)
88
(100.00 %)
488,030
(6.66 %)
188,606
(1.01 %)
6,982,793
(20.08 %)
0
(0 %)
89,388
(0.77 %)
32,920
(3.37 %)
32,773
(1.95 %)
268 Puerto Rican parrot (LU 182127 2020)
GCA_000332375.2
n/a n/a 12,000
(1.69 %)
22,393
(2.01 %)
n/a 41.66
(74.61 %)
137,572
(25.41 %)
137,572
(25.41 %)
200,284
(74.59 %)
536,198
(8.55 %)
200,698
(0.96 %)
5,147,882
(14.30 %)
1,355
(0.24 %)
127,559
(0.77 %)
14,572
(0.41 %)
12,696
(0.35 %)
269 razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658365.1
n/a n/a 12,787
(1.83 %)
22,839
(2.13 %)
n/a 42.67
(99.70 %)
0
(0 %)
227
(0.30 %)
95
(100.00 %)
543,517
(7.16 %)
212,546
(1.12 %)
6,930,708
(20.10 %)
0
(0 %)
103,901
(0.79 %)
38,960
(3.02 %)
35,213
(1.80 %)
270 razorbill (alternate hap 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658355.1
n/a n/a 12,937
(1.75 %)
24,253
(2.09 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,309
(100.00 %)
562,549
(7.14 %)
210,852
(1.04 %)
7,264,995
(20.26 %)
0
(0 %)
100,265
(0.74 %)
40,926
(2.91 %)
36,166
(1.76 %)
271 red-backed fairy wren (Western Australia 2023)
GCF_030028575.1
29,027
(5.08 %)
n/a 12,371
(2.00 %)
24,297
(2.42 %)
n/a 41.70
(96.94 %)
0
(0 %)
3,337,637
(3.40 %)
10,634
(100.00 %)
349,349
(2.76 %)
398,866
(2.71 %)
6,299,092
(18.40 %)
577
(0.03 %)
174,938
(1.04 %)
27,078
(2.11 %)
22,887
(1.40 %)
272 red-billed tropicbird (maternal hap 2024)
GCA_964289735.1
n/a n/a 13,231
(1.68 %)
24,060
(2.00 %)
n/a 43.15
(99.98 %)
3
(0.00 %)
1,269
(0.02 %)
660
(100.00 %)
440,963
(5.78 %)
187,847
(3.22 %)
6,601,610
(24.99 %)
24
(0.00 %)
232,304
(1.91 %)
54,002
(5.24 %)
46,380
(3.01 %)
273 red-billed tropicbird (paternal hap 2024)
GCA_964289755.1
n/a n/a 11,989
(1.71 %)
21,527
(2.03 %)
n/a 43.19
(99.98 %)
1,072
(0.02 %)
1,072
(0.02 %)
1,572
(99.98 %)
383,852
(5.39 %)
164,123
(3.45 %)
5,859,520
(24.45 %)
20
(0.00 %)
189,600
(1.73 %)
48,825
(5.37 %)
42,685
(3.12 %)
274 red-crested pochard (primary hap 2024)
GCA_964035555.1
n/a n/a 13,234
(1.92 %)
23,753
(2.26 %)
n/a 42.08
(99.99 %)
0
(0 %)
714
(0.01 %)
141
(100.00 %)
772,537
(6.34 %)
437,831
(4.05 %)
6,488,340
(24.52 %)
27
(0.00 %)
332,911
(2.45 %)
31,577
(2.49 %)
28,022
(1.51 %)
275 red-crested turaco (alternate hap 2019)
GCA_009764505.1
n/a n/a 11,247
(1.70 %)
23,705
(2.27 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,476
(100.00 %)
482,817
(8.51 %)
153,169
(0.81 %)
5,919,109
(21.87 %)
0
(0 %)
121,371
(1.16 %)
39,766
(3.41 %)
32,044
(2.04 %)
276 red-crested turaco (primary hap 2019)
GCA_009769465.1
n/a n/a 12,744
(1.75 %)
25,706
(2.29 %)
n/a 42.60
(97.89 %)
0
(0 %)
344
(2.11 %)
140
(100.00 %)
551,885
(8.95 %)
176,530
(0.80 %)
6,805,042
(22.19 %)
0
(0 %)
138,426
(1.12 %)
43,051
(3.40 %)
34,997
(2.03 %)
277 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020)
GCA_015220175.1
n/a n/a 11,434
(1.65 %)
21,710
(2.11 %)
n/a 46.12
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
2,748
(100.00 %)
859,899
(15.52 %)
319,622
(3.85 %)
5,367,970
(34.63 %)
0
(0 %)
960,530
(5.66 %)
23,381
(1.81 %)
19,537
(1.27 %)
278 red-fronted tinkerbird (primary hap 2020 genbank)
GCA_015220805.1
n/a n/a 12,345
(1.60 %)
23,206
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
0
(0 %)
307
(0.47 %)
253
(100.00 %)
1,082,064
(22.90 %)
378,866
(4.28 %)
6,003,548
(35.88 %)
0
(0 %)
1,148,448
(6.01 %)
26,519
(1.76 %)
21,399
(1.21 %)
279 red-fronted tinkerbird (primary hap 2020 refseq)
GCF_015220805.1
44,843
(4.51 %)
n/a 12,341
(1.60 %)
23,205
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
0
(0 %)
307
(0.47 %)
252
(100.00 %)
981,758
(15.82 %)
378,855
(4.28 %)
6,003,474
(35.88 %)
0
(0 %)
1,148,439
(6.01 %)
26,519
(1.76 %)
21,399
(1.21 %)
280 red-legged partridge
GCA_019345075.1
n/a n/a 12,441
(2.23 %)
20,933
(2.29 %)
n/a 41.44
(96.96 %)
18,534
(3.05 %)
18,534
(3.05 %)
29,132
(96.95 %)
543,702
(6.02 %)
222,583
(0.97 %)
5,978,744
(20.17 %)
1,104
(0.06 %)
43,686
(0.36 %)
19,970
(0.97 %)
17,237
(0.77 %)
281 red-legged seriema (alternate hap 2019)
GCA_009819485.1
n/a n/a 10,131
(1.78 %)
19,775
(2.21 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,840
(100.00 %)
366,591
(6.01 %)
117,928
(0.90 %)
5,340,048
(18.90 %)
0
(0 %)
66,176
(0.68 %)
26,293
(2.86 %)
24,338
(1.93 %)
282 red-legged seriema (primary hap 2019)
GCA_009819825.1
n/a n/a 13,229
(1.84 %)
25,580
(2.35 %)
n/a 42.20
(99.59 %)
0
(0 %)
194
(0.41 %)
110
(100.00 %)
483,784
(6.50 %)
160,481
(0.73 %)
6,960,060
(19.71 %)
0
(0 %)
64,843
(0.56 %)
32,899
(2.77 %)
30,208
(1.91 %)
283 red-throated loon (BGI_N328 2014)
GCF_000690875.1
15,829
(2.14 %)
n/a 11,589
(1.46 %)
22,840
(1.76 %)
n/a 41.12
(99.40 %)
64,882
(0.61 %)
64,882
(0.61 %)
126,713
(99.39 %)
293,224
(3.50 %)
123,593
(0.80 %)
6,849,573
(18.22 %)
5
(0.00 %)
24,295
(0.23 %)
17,100
(0.51 %)
14,526
(0.42 %)
284 red-throated loon (hap1 2023)
GCA_030936125.1
n/a n/a 13,357
(1.64 %)
29,603
(2.35 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
260
(0.00 %)
260
(0.00 %)
3,225
(100.00 %)
549,694
(8.44 %)
246,171
(10.46 %)
5,258,356
(27.36 %)
2
(0.00 %)
671,693
(3.75 %)
39,810
(3.37 %)
34,456
(1.67 %)
285 red-throated loon (hap2 2023 refseq)
GCF_030936135.1
25,173
(3.02 %)
n/a 13,216
(1.71 %)
24,050
(2.10 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
1,185
(100.00 %)
544,422
(8.81 %)
223,672
(5.77 %)
6,669,433
(23.63 %)
3
(0.00 %)
398,584
(2.64 %)
38,305
(3.37 %)
35,068
(1.78 %)
286 red-winged blackbird (BioBank_ID:100140 2023)
GCF_020745825.1
29,994
(3.93 %)
n/a 12,687
(1.75 %)
25,287
(2.30 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
106
(0.00 %)
106
(0.00 %)
516
(100.00 %)
785,960
(17.62 %)
522,256
(9.27 %)
6,371,580
(25.40 %)
0
(0 %)
496,798
(2.87 %)
32,643
(2.66 %)
23,497
(1.27 %)
287 rhinoceros hornbill
GCF_000710305.1
15,595
(2.24 %)
n/a 11,495
(1.55 %)
25,766
(1.88 %)
n/a 42.65
(98.44 %)
118,543
(1.60 %)
118,543
(1.60 %)
180,800
(98.40 %)
271,331
(3.93 %)
134,645
(1.25 %)
6,383,631
(17.75 %)
31
(0.00 %)
43,210
(0.62 %)
24,531
(0.79 %)
18,987
(0.58 %)
288 rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021)
GCA_016880875.1
n/a n/a 9,867
(1.89 %)
19,635
(2.52 %)
n/a 42.54
(100.00 %)
0
(0 %)
20
(0.00 %)
2,879
(100.00 %)
394,769
(10.00 %)
186,556
(1.91 %)
4,428,687
(19.09 %)
0
(0 %)
192,997
(1.66 %)
15,730
(1.88 %)
12,474
(0.91 %)
289 rifleman (primary hap 2021)
GCA_016904835.1
n/a n/a 12,620
(1.92 %)
24,568
(2.61 %)
n/a 42.41
(99.61 %)
0
(0 %)
195
(0.39 %)
206
(100.00 %)
495,673
(9.14 %)
253,008
(2.04 %)
5,936,177
(19.93 %)
0
(0 %)
269,642
(1.76 %)
20,145
(1.83 %)
15,953
(0.89 %)
290 ring-necked pheasant
GCF_004143745.1
33,221
(6.38 %)
n/a 13,027
(2.35 %)
19,960
(2.74 %)
n/a 41.21
(99.22 %)
0
(0 %)
19,995
(0.78 %)
39,678
(100.00 %)
586,827
(8.20 %)
291,437
(1.68 %)
6,237,616
(20.77 %)
5
(0.00 %)
110,611
(0.64 %)
22,365
(2.11 %)
18,900
(1.36 %)
291 rock pigeon (Danish tumbler 2013 BGI)
GCF_000337935.1
52,369
(6.40 %)
n/a 12,577
(1.87 %)
14,272
(2.42 %)
n/a 41.48
(98.13 %)
85,176
(1.90 %)
85,176
(1.90 %)
100,099
(98.10 %)
480,221
(6.94 %)
268,561
(1.86 %)
6,408,260
(19.42 %)
19
(0.00 %)
139,510
(1.01 %)
29,801
(1.43 %)
25,584
(1.09 %)
292 rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024)
GCA_036010775.2
n/a n/a 12,450
(1.75 %)
23,660
(2.21 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
23
(0.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
2
(0.00 %)
1,046,187
(5.37 %)
33,479
(3.29 %)
29,158
(1.73 %)
293 rock pigeon (racing homer maternal 2024)
GCA_036010775.1
n/a n/a 12,450
(1.75 %)
25,274
(2.35 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
23
(0.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
2
(0.00 %)
1,046,190
(5.37 %)
33,479
(3.29 %)
29,158
(1.73 %)
294 rock pigeon (v1 racing homer paternal W 2024)
GCA_036013475.1
n/a n/a 13,145
(1.66 %)
28,883
(2.53 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
248
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,923
(11.76 %)
412,678
(12.92 %)
6,047,578
(29.90 %)
0
(0 %)
1,266,126
(5.89 %)
36,847
(3.12 %)
31,114
(1.65 %)
295 rock pigeon (v2 racing homer 2024 genbank)
GCA_036013475.2
n/a n/a 13,146
(1.66 %)
25,463
(2.12 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,969
(11.76 %)
412,670
(12.92 %)
6,047,584
(29.90 %)
0
(0 %)
1,266,456
(5.89 %)
36,847
(3.12 %)
31,115
(1.65 %)
296 rock pigeon (v2 racing homer 2024 refseq)
GCF_036013475.1
70,874
(7.24 %)
n/a 13,145
(1.66 %)
25,462
(2.12 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
869
(100.00 %)
656,963
(11.76 %)
412,665
(12.92 %)
6,047,535
(29.90 %)
0
(0 %)
1,266,447
(5.89 %)
36,847
(3.12 %)
31,115
(1.65 %)
297 rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022)
GCA_023344045.1
n/a n/a 12,090
(2.36 %)
21,910
(2.57 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,212
(100.00 %)
585,577
(10.45 %)
202,342
(1.61 %)
5,390,780
(20.38 %)
0
(0 %)
122,512
(1.28 %)
19,210
(2.23 %)
17,189
(1.48 %)
298 rock ptarmigan (primary hap 2022 refseq)
GCF_023343835.1
51,619
(7.29 %)
n/a 12,832
(2.31 %)
23,047
(2.56 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
0
(0 %)
210
(0.01 %)
165
(100.00 %)
526,839
(5.87 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,345
(21.73 %)
0
(0 %)
216,565
(1.89 %)
21,346
(2.37 %)
19,067
(1.48 %)
299 ruddy duck
GCF_011077185.1
50,326
(5.76 %)
n/a 13,124
(1.98 %)
23,592
(2.23 %)
n/a 41.82
(97.27 %)
18,437
(2.73 %)
18,437
(2.73 %)
28,026
(97.27 %)
808,998
(7.97 %)
389,509
(1.34 %)
6,722,581
(21.16 %)
886
(0.04 %)
50,273
(0.33 %)
34,567
(3.30 %)
31,746
(2.24 %)
300 ruff
GCF_001431845.1
34,257
(4.61 %)
n/a 12,979
(1.79 %)
15,969
(2.42 %)
n/a 42.45
(96.26 %)
30,404
(3.75 %)
30,404
(3.75 %)
34,157
(96.25 %)
308,688
(1.08 %)
337,661
(3.70 %)
7,220,063
(20.45 %)
152
(0.04 %)
344,206
(7.21 %)
27,939
(1.42 %)
21,232
(0.89 %)
301 rufous-necked snowfinch
GCF_017590135.1
35,381
(4.92 %)
n/a 12,603
(1.95 %)
24,965
(2.42 %)
n/a 42.00
(99.80 %)
0
(0 %)
5,524
(0.20 %)
24,055
(100.00 %)
514,274
(6.32 %)
411,146
(2.77 %)
6,584,761
(19.85 %)
14
(0.00 %)
134,703
(1.55 %)
29,372
(2.28 %)
23,101
(1.33 %)
302 rusty-margined flycatcher (MyiCay16 2022)
GCF_022539395.1
40,473
(5.86 %)
n/a 12,903
(1.96 %)
23,477
(2.35 %)
n/a 42.26
(99.87 %)
0
(0 %)
181
(0.13 %)
1,692
(100.00 %)
439,625
(4.09 %)
338,042
(2.23 %)
6,366,832
(20.27 %)
1
(0.00 %)
207,451
(1.26 %)
28,572
(2.11 %)
22,109
(1.15 %)
303 saffron-crested tyrant-manakin
GCF_003984885.1
45,898
(5.06 %)
n/a 12,908
(1.86 %)
21,103
(2.48 %)
n/a 42.28
(99.01 %)
0
(0 %)
15,342
(0.99 %)
38,089
(100.00 %)
496,308
(7.14 %)
333,391
(1.97 %)
6,646,625
(20.87 %)
2,379
(0.07 %)
129,596
(0.85 %)
32,671
(2.19 %)
23,444
(1.15 %)
304 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 alternate hap 2022)
GCA_021966175.1
n/a n/a 16,893
(1.07 %)
43,426
(1.70 %)
n/a 44.67
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
43,047
(100.00 %)
1,180,596
(3.55 %)
1,932,696
(16.57 %)
6,340,063
(43.85 %)
0
(0 %)
3,356,221
(11.63 %)
66,996
(3.45 %)
35,172
(0.95 %)
305 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 primary hap 2022)
GCA_021963965.1
n/a n/a 12,804
(1.50 %)
25,425
(1.97 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
200
(0.00 %)
1,339
(100.00 %)
699,755
(3.36 %)
1,030,540
(15.69 %)
5,226,748
(36.13 %)
1
(0.00 %)
1,577,345
(8.39 %)
36,539
(2.71 %)
22,856
(0.98 %)
306 Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022)
GCA_023634115.1
n/a n/a 12,258
(1.66 %)
25,579
(2.30 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
4,162
(100.00 %)
506,343
(6.77 %)
182,589
(7.22 %)
5,435,776
(23.60 %)
0
(0 %)
383,493
(2.65 %)
29,420
(2.47 %)
19,384
(0.92 %)
307 Saker falcon (BGI 2013)
GCF_000337975.1
36,497
(5.34 %)
n/a 12,572
(1.79 %)
10,629
(2.08 %)
27,857
(3.09 %)
41.71
(98.00 %)
70,035
(2.03 %)
70,035
(2.03 %)
75,898
(97.97 %)
433,484
(5.29 %)
166,251
(1.03 %)
7,121,848
(18.23 %)
27
(0.00 %)
33,448
(0.49 %)
19,927
(0.72 %)
15,588
(0.52 %)
308 Saker falcon (primary hap 2022 refseq)
GCF_023634085.1
50,290
(5.75 %)
n/a 12,973
(1.67 %)
21,670
(1.90 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
0
(0 %)
258
(0.30 %)
283
(100.00 %)
548,090
(7.21 %)
201,488
(8.55 %)
7,030,877
(24.94 %)
0
(0 %)
469,777
(2.60 %)
31,791
(2.57 %)
20,215
(0.89 %)
309 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023)
GCA_027887135.1
n/a n/a 12,826
(1.74 %)
26,019
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,054
(100.00 %)
482,850
(3.37 %)
523,437
(10.15 %)
6,386,315
(26.20 %)
0
(0 %)
535,497
(3.35 %)
32,734
(4.25 %)
23,206
(1.19 %)
310 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887145.1
27,528
(4.03 %)
n/a 12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
0
(0 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
1
(0.00 %)
651,029
(4.07 %)
35,549
(5.05 %)
23,802
(1.15 %)
311 Savannah sparrow (FMNH 499929 alternate hap 2022)
GCA_022578375.1
n/a n/a 16,954
(1.37 %)
46,692
(2.27 %)
n/a 43.66
(99.99 %)
1,822
(0.01 %)
1,822
(0.01 %)
31,565
(99.99 %)
680,766
(3.36 %)
930,904
(8.76 %)
7,502,726
(27.96 %)
14
(0.00 %)
1,172,923
(6.11 %)
56,390
(5.99 %)
34,310
(1.12 %)
312 Savannah sparrow (FMNH 499929 primary hap 2022)
GCA_022577445.1
n/a n/a 12,665
(1.79 %)
25,654
(2.40 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
0
(0 %)
339
(0.00 %)
337
(100.00 %)
428,675
(3.22 %)
588,040
(7.38 %)
6,466,447
(24.39 %)
1
(0.00 %)
659,720
(4.05 %)
33,599
(4.75 %)
24,129
(1.22 %)
313 Savannah sparrow (primary hap 2023)
GCA_031885435.1
n/a n/a 12,986
(1.66 %)
27,028
(2.29 %)
n/a 43.66
(99.78 %)
0
(0 %)
249
(0.22 %)
110
(100.00 %)
464,600
(3.28 %)
681,402
(9.28 %)
6,314,744
(26.92 %)
0
(0 %)
939,361
(5.26 %)
39,406
(5.26 %)
25,911
(1.19 %)
314 scrub jay (FSJ_1873_10779 2024)
GCF_041296385.1
51,624
(5.10 %)
n/a 13,318
(1.64 %)
26,496
(2.22 %)
n/a 44.31
(100.00 %)
0
(0 %)
140
(0.00 %)
660
(100.00 %)
879,188
(16.59 %)
506,206
(7.16 %)
5,626,321
(29.85 %)
3
(0.00 %)
604,489
(4.47 %)
44,942
(4.68 %)
26,369
(1.14 %)
315 seaside sparrow (bAmmMar1 primary hap 2024)
GCA_036010785.1
n/a n/a 12,858
(1.52 %)
25,777
(2.02 %)
n/a 44.04
(99.85 %)
0
(0 %)
365
(0.15 %)
501
(100.00 %)
580,376
(4.24 %)
636,266
(12.18 %)
4,804,433
(34.52 %)
0
(0 %)
1,048,820
(7.41 %)
48,871
(4.18 %)
23,097
(1.00 %)
316 small tree finch (2019)
GCF_901933205.1
30,090
(4.91 %)
n/a 12,645
(1.95 %)
17,146
(2.49 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
182
(0.01 %)
185
(0.01 %)
1,527
(99.99 %)
457,266
(6.02 %)
477,426
(4.49 %)
6,482,932
(22.03 %)
0
(0 %)
391,606
(2.09 %)
27,271
(2.40 %)
21,429
(1.25 %)
317 small tree finch (2020)
GCA_902806625.1
n/a n/a 12,662
(1.93 %)
23,695
(2.34 %)
25,763
(3.61 %)
42.49
(99.99 %)
195
(0.01 %)
224
(0.01 %)
1,951
(99.99 %)
458,154
(6.01 %)
482,974
(4.97 %)
6,466,067
(22.21 %)
2
(0.00 %)
449,266
(2.28 %)
27,890
(2.42 %)
21,523
(1.23 %)
318 song sparrow (gouldii PMB2087b alternate hap 2022)
GCA_022749775.1
n/a n/a 15,672
(1.16 %)
40,690
(1.82 %)
n/a 45.19
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
34,693
(100.00 %)
1,068,703
(34.46 %)
796,004
(19.02 %)
6,315,990
(40.22 %)
0
(0 %)
2,681,702
(10.34 %)
57,647
(3.95 %)
31,590
(0.98 %)
319 song sparrow (gouldii PMB2087b primary hap 2022)
GCA_022749695.1
n/a n/a 12,580
(1.53 %)
24,737
(2.00 %)
n/a 44.45
(100.00 %)
0
(0 %)
323
(0.00 %)
501
(100.00 %)
697,818
(28.44 %)
510,301
(17.90 %)
5,319,400
(34.64 %)
0
(0 %)
1,574,309
(8.28 %)
36,632
(3.59 %)
22,552
(0.99 %)
320 song sparrow (primary hap 2024 genbank)
GCA_035770615.1
n/a n/a 12,940
(1.39 %)
26,698
(1.87 %)
n/a 44.96
(99.93 %)
0
(0 %)
299
(0.07 %)
354
(100.00 %)
515,857
(3.07 %)
681,436
(15.73 %)
5,004,880
(39.23 %)
1
(0.00 %)
1,925,221
(9.14 %)
47,269
(3.90 %)
25,118
(0.99 %)
321 song sparrow (primary hap 2024 refseq)
GCF_035770615.1
41,069
(3.95 %)
n/a 12,946
(1.39 %)
26,698
(1.87 %)
n/a 44.96
(99.93 %)
0
(0 %)
299
(0.07 %)
353
(100.00 %)
515,851
(3.07 %)
681,436
(15.73 %)
5,004,851
(39.23 %)
1
(0.00 %)
1,925,213
(9.14 %)
47,268
(3.90 %)
25,117
(0.99 %)
322 South Island takahe (alternate hap 2021)
GCA_020801775.1
n/a n/a 12,655
(1.70 %)
n/a n/a 43.63
(99.16 %)
0
(0 %)
238
(0.84 %)
178
(100.00 %)
554,912
(9.42 %)
230,808
(4.34 %)
6,406,358
(24.83 %)
0
(0 %)
352,693
(2.60 %)
22,941
(1.98 %)
19,559
(1.17 %)
323 South Island takahe (primary hap 2021)
GCA_020800305.1
n/a n/a 12,942
(1.69 %)
23,221
(2.13 %)
n/a 43.74
(99.58 %)
0
(0 %)
327
(0.42 %)
174
(100.00 %)
577,553
(9.77 %)
259,017
(5.20 %)
6,430,968
(25.90 %)
1
(0.00 %)
437,634
(2.97 %)
23,810
(2.02 %)
20,060
(1.16 %)
324 speckled mousebird (bColStr4 hap2 2023)
GCA_028858625.2
n/a n/a 12,332
(1.76 %)
22,895
(2.24 %)
n/a 42.74
(99.53 %)
0
(0 %)
136
(0.47 %)
242
(100.00 %)
521,023
(11.26 %)
304,406
(7.39 %)
5,319,571
(25.46 %)
0
(0 %)
589,925
(3.69 %)
27,299
(2.35 %)
19,827
(1.22 %)
325 speckled mousebird (BGI_N325 2014)
GCF_000690715.1
15,894
(2.09 %)
n/a 11,566
(1.44 %)
25,387
(1.84 %)
n/a 40.95
(99.65 %)
44,462
(0.35 %)
44,462
(0.35 %)
114,650
(99.65 %)
345,458
(6.87 %)
154,693
(1.27 %)
6,152,475
(19.42 %)
5
(0.00 %)
55,406
(0.53 %)
7,821
(0.23 %)
6,630
(0.19 %)
326 speckled mousebird (hap1 2023 genbank)
GCA_028858725.1
n/a n/a 11,956
(1.78 %)
25,177
(2.60 %)
n/a 42.38
(99.48 %)
0
(0 %)
143
(0.52 %)
189
(100.00 %)
523,056
(12.47 %)
243,547
(3.72 %)
5,408,003
(23.43 %)
1
(0.00 %)
397,635
(2.78 %)
25,552
(2.34 %)
19,232
(1.18 %)
327 speckled mousebird (hap1 2023 refseq)
GCF_028858725.1
37,067
(4.23 %)
n/a 12,815
(1.76 %)
23,175
(2.17 %)
n/a 42.29
(99.52 %)
0
(0 %)
161
(0.48 %)
191
(100.00 %)
572,944
(12.88 %)
256,368
(3.55 %)
5,868,966
(23.42 %)
1
(0.00 %)
412,827
(2.70 %)
27,158
(2.30 %)
20,935
(1.20 %)
328 speckled mousebird (hap2 2023)
GCA_028858625.1
n/a n/a 13,169
(1.74 %)
26,896
(2.47 %)
n/a 42.62
(99.56 %)
0
(0 %)
151
(0.44 %)
243
(100.00 %)
570,907
(11.75 %)
317,226
(6.96 %)
5,854,600
(25.51 %)
0
(0 %)
605,114
(3.54 %)
28,905
(2.31 %)
21,335
(1.22 %)
329 Steller's jay (frontalis alternate hap 2022)
GCA_026168045.1
n/a n/a 12,217
(1.73 %)
25,261
(2.32 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
0
(0 %)
200
(0.00 %)
957
(100.00 %)
423,239
(3.30 %)
362,061
(4.83 %)
4,954,262
(27.09 %)
1
(0.00 %)
401,578
(3.63 %)
42,188
(4.05 %)
23,201
(1.15 %)
330 Steller's jay (frontalis primary hap 2022)
GCA_026167965.1
n/a n/a 12,789
(1.82 %)
24,509
(2.35 %)
n/a 43.18
(100.00 %)
0
(0 %)
223
(0.00 %)
352
(100.00 %)
413,598
(3.28 %)
318,919
(3.99 %)
5,977,564
(23.65 %)
3
(0.00 %)
301,786
(2.41 %)
33,675
(3.21 %)
24,057
(1.25 %)
331 sun parakeet (2019)
GCA_902168055.1
n/a n/a 12,871
(1.88 %)
22,508
(2.20 %)
n/a 42.01
(96.97 %)
0
(0 %)
578,921
(3.08 %)
1,570
(100.00 %)
554,367
(10.05 %)
180,644
(0.89 %)
6,158,602
(21.14 %)
962
(0.08 %)
166,361
(1.21 %)
21,695
(1.62 %)
19,571
(1.23 %)
332 sunbittern
GCF_000690775.1
15,772
(2.11 %)
n/a 11,564
(1.45 %)
25,522
(1.98 %)
n/a 42.33
(99.55 %)
52,471
(0.46 %)
52,471
(0.46 %)
115,170
(99.54 %)
346,556
(5.38 %)
117,881
(0.88 %)
6,391,987
(18.82 %)
2
(0.00 %)
48,033
(0.44 %)
32,970
(1.31 %)
28,939
(1.10 %)
333 Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021)
GCA_020746095.1
n/a n/a 11,628
(1.91 %)
21,635
(2.31 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
17
(0.00 %)
1,535
(100.00 %)
421,231
(6.57 %)
146,070
(1.11 %)
5,727,350
(21.91 %)
0
(0 %)
105,678
(1.04 %)
37,752
(3.68 %)
32,944
(2.17 %)
334 Suruca trogon (primary hap 2021)
GCA_020746105.1
n/a n/a 12,884
(1.85 %)
23,805
(2.23 %)
n/a 42.80
(99.12 %)
0
(0 %)
253
(0.88 %)
182
(100.00 %)
539,771
(9.26 %)
181,564
(1.14 %)
6,538,228
(22.49 %)
1
(0.00 %)
138,653
(1.22 %)
41,376
(3.37 %)
36,105
(2.01 %)
335 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020)
GCA_009819505.2
n/a n/a 13,403
(1.85 %)
27,669
(2.52 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
704,976
(13.16 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
0
(0 %)
505,741
(2.66 %)
49,076
(3.54 %)
23,486
(1.21 %)
336 Swainson's thrush (v2 primary hap 2020)
GCF_009819885.2
40,121
(5.41 %)
n/a 13,004
(1.87 %)
24,795
(2.41 %)
n/a 42.48
(98.86 %)
0
(0 %)
429
(1.14 %)
160
(100.00 %)
493,071
(5.80 %)
589,858
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
1
(0.00 %)
449,511
(2.41 %)
49,404
(3.53 %)
22,206
(1.16 %)
337 swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023)
GCA_028019105.1
n/a n/a 12,160
(1.83 %)
24,622
(2.46 %)
n/a 43.37
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 862
(100.00 %)
383,634
(3.06 %)
527,550
(8.40 %)
5,916,654
(24.97 %)
0
(0 %)
665,809
(4.29 %)
31,261
(3.21 %)
22,337
(1.23 %)
338 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018845.1
29,544
(4.27 %)
n/a 12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
0
(0 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
1
(0.00 %)
578,723
(3.93 %)
32,064
(3.27 %)
22,996
(1.19 %)
339 Swan (goose HZ-2024a 2024)
GCF_040182565.1
68,379
(7.95 %)
n/a 13,715
(1.90 %)
24,704
(2.28 %)
n/a 43.07
(100.00 %)
0
(0 %)
42
(0.00 %)
75
(100.00 %)
780,603
(10.80 %)
463,894
(5.65 %)
6,593,404
(24.63 %)
0
(0 %)
490,134
(3.23 %)
41,265
(4.48 %)
36,805
(2.27 %)
340 swan goose (Sichuan white goose 2017)
GCF_002166845.1
62,728
(8.50 %)
n/a 12,903
(1.98 %)
21,943
(2.24 %)
n/a 41.68
(97.40 %)
63,061
(2.62 %)
63,061
(2.62 %)
64,863
(97.38 %)
590,350
(4.68 %)
253,525
(1.38 %)
6,926,961
(19.71 %)
1,420
(0.08 %)
82,724
(1.10 %)
40,011
(3.69 %)
37,150
(2.50 %)
341 swan goose (Tianfu 2020)
GCA_013030995.1
n/a n/a 12,965
(1.97 %)
25,182
(2.35 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
0
(0 %)
716
(0.01 %)
2,119
(100.00 %)
650,271
(7.44 %)
270,668
(1.26 %)
6,776,820
(21.19 %)
1
(0.00 %)
89,151
(0.88 %)
35,560
(4.27 %)
34,560
(2.39 %)
342 swan goose (Zhedong 2015)
GCF_000971095.1
43,215
(5.89 %)
n/a 12,148
(1.89 %)
19,386
(2.07 %)
29,870
(3.24 %)
41.36
(96.87 %)
84,351
(3.16 %)
84,351
(3.16 %)
91,944
(96.84 %)
481,707
(5.57 %)
230,143
(1.26 %)
6,665,312
(19.42 %)
11
(0.00 %)
27,715
(0.46 %)
38,930
(2.06 %)
34,119
(1.62 %)
343 swift parrot (hap1 2024)
GCF_037157495.1
50,082
(5.09 %)
n/a 12,974
(1.75 %)
22,545
(2.07 %)
n/a 42.67
(99.82 %)
0
(0 %)
186
(0.18 %)
367
(100.00 %)
541,918
(6.97 %)
347,387
(6.90 %)
5,657,314
(26.08 %)
2
(0.01 %)
468,943
(3.28 %)
25,816
(2.01 %)
22,033
(1.31 %)
344 Swift parrot (hap2 2024)
GCA_037157625.1
n/a n/a 11,928
(1.78 %)
20,879
(2.12 %)
n/a 42.78
(99.75 %)
0
(0 %)
122
(0.25 %)
413
(100.00 %)
481,463
(6.65 %)
359,572
(7.59 %)
5,094,615
(26.27 %)
2
(0.00 %)
449,659
(3.37 %)
23,296
(2.08 %)
20,233
(1.32 %)
345 tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023)
GCA_028020675.1
n/a n/a 11,432
(1.95 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
911
(100.00 %)
470,125
(9.51 %)
140,846
(3.57 %)
5,002,695
(22.08 %)
0
(0 %)
231,594
(1.85 %)
22,424
(2.33 %)
19,010
(1.39 %)
346 tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023)
GCA_028020825.1
n/a n/a 13,321
(1.76 %)
24,102
(2.15 %)
n/a 42.35
(99.83 %)
0
(0 %)
203
(0.17 %)
1,038
(100.00 %)
593,409
(10.51 %)
202,463
(9.29 %)
6,160,173
(27.65 %)
1
(0.00 %)
529,082
(2.97 %)
25,785
(2.35 %)
21,960
(1.26 %)
347 tawny owl (hap1 2023)
GCA_031877795.1
n/a n/a 13,204
(1.60 %)
23,981
(1.99 %)
n/a 42.70
(99.70 %)
9
(0.15 %)
281
(0.30 %)
212
(99.85 %)
443,228
(4.74 %)
272,738
(10.86 %)
5,812,837
(27.42 %)
1
(0.00 %)
406,171
(2.45 %)
30,602
(2.52 %)
26,399
(1.26 %)
348 tawny owl (hap2 2023)
GCA_031877785.1
n/a n/a 12,367
(1.72 %)
21,445
(2.03 %)
n/a 42.53
(99.88 %)
0
(0 %)
206
(0.12 %)
184
(100.00 %)
392,959
(4.59 %)
235,300
(7.72 %)
6,437,772
(24.82 %)
0
(0 %)
298,804
(2.06 %)
27,952
(2.71 %)
25,864
(1.43 %)
349 tawny-flanked prinia (Zambia CZ2003 2024)
GCF_021018805.1
40,939
(5.96 %)
n/a 12,510
(1.84 %)
24,378
(2.37 %)
n/a 42.64
(99.99 %)
0
(0 %)
378
(0.01 %)
538
(100.00 %)
384,533
(3.09 %)
345,667
(4.24 %)
6,199,979
(21.86 %)
2
(0.00 %)
303,724
(2.22 %)
33,587
(2.53 %)
24,243
(1.25 %)
350 Tibetan ground-tit
GCF_000331425.1
28,736
(4.57 %)
n/a 12,828
(2.02 %)
17,743
(2.65 %)
n/a 41.69
(98.76 %)
21,646
(1.24 %)
21,646
(1.24 %)
27,052
(98.76 %)
443,797
(5.51 %)
346,281
(2.29 %)
6,423,932
(19.90 %)
775
(0.09 %)
140,033
(1.18 %)
27,086
(2.31 %)
22,331
(1.32 %)
351 tourmaline sunangel (hap1 2024)
GCA_036169615.1
n/a n/a 12,509
(1.97 %)
21,020
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.99 %)
0
(0 %)
437
(0.01 %)
131
(100.00 %)
532,267
(5.46 %)
332,284
(2.69 %)
6,084,978
(21.20 %)
0
(0 %)
215,264
(1.71 %)
19,080
(1.72 %)
15,764
(1.09 %)
352 tourmaline sunangel (hap2 2024)
GCA_036172335.1
n/a n/a 11,697
(2.00 %)
19,544
(2.34 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
0
(0 %)
370
(0.01 %)
200
(100.00 %)
480,724
(5.14 %)
292,213
(3.66 %)
5,608,823
(21.79 %)
2
(0.00 %)
199,789
(1.65 %)
17,191
(1.69 %)
14,460
(1.07 %)
353 tree swallow (Ithaca 2401-50270 2024)
GCA_007636935.2
n/a n/a 13,272
(1.53 %)
31,390
(2.16 %)
n/a 42.14
(98.29 %)
2,123,840
(1.89 %)
2,123,840
(1.89 %)
2,173,118
(98.11 %)
581,418
(3.41 %)
593,688
(3.21 %)
7,518,639
(20.56 %)
385
(0.01 %)
302,676
(1.62 %)
40,631
(3.03 %)
34,634
(1.73 %)
354 tricolored blackbird (1412-34295 alternate hap 2022)
GCA_023055385.1
n/a n/a 12,203
(1.76 %)
25,216
(2.40 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
0
(0 %)
97
(0.00 %)
450
(100.00 %)
430,792
(3.25 %)
542,908
(5.67 %)
5,289,916
(24.99 %)
1
(0.00 %)
493,641
(3.34 %)
36,805
(3.52 %)
22,961
(1.19 %)
355 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022)
GCA_023055355.1
n/a n/a 12,867
(1.81 %)
26,393
(2.48 %)
n/a 42.85
(100.00 %)
97
(0.00 %)
97
(0.00 %)
311
(100.00 %)
429,011
(3.16 %)
564,849
(5.52 %)
6,336,716
(23.32 %)
0
(0 %)
439,278
(2.62 %)
33,378
(2.70 %)
23,687
(1.26 %)
356 tufted duck (2019)
GCF_009819795.1
29,492
(4.02 %)
n/a 12,972
(1.98 %)
22,757
(2.27 %)
n/a 41.66
(99.16 %)
0
(0 %)
163
(0.84 %)
105
(100.00 %)
826,451
(8.47 %)
411,356
(1.71 %)
6,691,445
(22.36 %)
1
(0.00 %)
93,916
(0.94 %)
29,882
(2.41 %)
27,027
(1.51 %)
357 tufted duck (alternate hap 2019)
GCA_009819845.1
n/a n/a 12,117
(2.03 %)
21,464
(2.36 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
780
(100.00 %)
732,317
(7.82 %)
353,660
(1.57 %)
6,119,549
(21.70 %)
0
(0 %)
66,459
(0.74 %)
27,920
(2.56 %)
25,192
(1.55 %)
358 tundra swan (primary hap 2025)
GCA_965151615.1
n/a n/a 13,371
(1.77 %)
23,897
(2.09 %)
n/a 45.04
(99.99 %)
5
(0.00 %)
540
(0.01 %)
608
(100.00 %)
745,129
(5.82 %)
484,265
(9.62 %)
6,249,520
(28.78 %)
0
(0 %)
756,733
(4.48 %)
46,110
(11.14 %)
32,575
(1.93 %)
359 turkey (Aviagen NT-WF06-2002-E0010 2014)
GCF_000146605.3
38,427
(6.01 %)
31,063
(4.70 %)
13,095
(1.96 %)
23,974
(2.27 %)
30,549
(3.14 %)
41.35
(96.83 %)
65,045
(3.16 %)
65,045
(3.16 %)
250,220
(96.84 %)
609,750
(9.03 %)
243,534
(1.26 %)
6,043,889
(21.06 %)
84
(0.01 %)
92,729
(0.60 %)
31,818
(1.42 %)
22,389
(0.99 %)
360 turkey (WU_HG_1 2021)
GCA_905368555.1
n/a n/a 12,910
(2.37 %)
23,038
(2.58 %)
53,269
(6.57 %)
41.12
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
151
(100.00 %)
618,023
(8.91 %)
227,783
(1.43 %)
6,123,721
(21.03 %)
0
(0 %)
115,410
(0.98 %)
20,379
(2.19 %)
18,358
(1.45 %)
361 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 genbank)
GCA_026979565.1
n/a n/a 12,819
(1.94 %)
24,247
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
0
(0 %)
458
(0.02 %)
178
(100.00 %)
616,749
(11.96 %)
411,917
(3.56 %)
6,385,102
(20.91 %)
6
(0.00 %)
306,942
(1.90 %)
37,940
(2.83 %)
24,967
(1.41 %)
362 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 refseq)
GCF_026979565.1
44,961
(5.49 %)
n/a 12,817
(1.94 %)
24,245
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
0
(0 %)
458
(0.02 %)
177
(100.00 %)
616,746
(11.96 %)
411,917
(3.57 %)
6,385,057
(20.91 %)
6
(0.00 %)
306,942
(1.90 %)
37,940
(2.83 %)
24,967
(1.41 %)
363 village indigobird (purged dups hap OUT-0048 2022)
GCA_026979555.1
n/a n/a 2,176
(1.79 %)
7,719
(4.37 %)
n/a 49.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,939
(100.00 %)
136,312
(29.31 %)
157,341
(15.03 %)
648,725
(34.67 %)
0
(0 %)
221,251
(9.52 %)
15,490
(8.23 %)
7,383
(2.86 %)
364 Virginia rail (171378401 alternate hap 2022)
GCA_022605895.1
n/a n/a 12,732
(1.51 %)
23,395
(1.91 %)
n/a 44.28
(99.99 %)
0
(0 %)
668
(0.00 %)
4,450
(100.00 %)
526,500
(5.75 %)
269,598
(14.29 %)
4,825,913
(32.19 %)
7
(0.00 %)
893,612
(4.56 %)
27,465
(2.18 %)
19,393
(1.06 %)
365 Virginia rail (171378401 primary hap 2022)
GCA_022605955.1
n/a n/a 12,760
(1.53 %)
23,262
(2.16 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
197
(0.00 %)
197
(0.00 %)
1,299
(100.00 %)
497,104
(5.09 %)
271,530
(15.72 %)
5,291,065
(32.37 %)
3
(0.00 %)
655,677
(3.62 %)
24,669
(1.78 %)
19,147
(1.06 %)
366 western capercaillie (alternate hap 2023)
GCA_951394355.1
n/a n/a 11,226
(2.33 %)
20,526
(2.54 %)
n/a 41.53
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,463
(100.00 %)
436,894
(5.48 %)
209,008
(1.73 %)
4,790,071
(20.27 %)
0
(0 %)
86,858
(1.22 %)
17,864
(2.58 %)
16,116
(1.50 %)
367 western capercaillie (primary hap 2023)
GCA_951394365.1
n/a n/a 12,775
(2.33 %)
22,516
(2.50 %)
n/a 41.49
(99.98 %)
0
(0 %)
973
(0.02 %)
318
(100.00 %)
518,194
(5.54 %)
276,294
(2.21 %)
5,866,033
(21.12 %)
9
(0.00 %)
148,912
(1.44 %)
21,287
(2.50 %)
19,248
(1.54 %)
368 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536645.1
n/a n/a 12,480
(1.72 %)
22,915
(2.17 %)
n/a 44.29
(100.00 %)
0
(0 %)
168
(0.00 %)
1,631
(100.00 %)
394,733
(2.99 %)
364,498
(6.04 %)
4,803,453
(27.52 %)
4
(0.00 %)
428,688
(5.10 %)
42,022
(4.90 %)
23,813
(1.19 %)
369 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536675.1
n/a n/a 13,128
(1.62 %)
25,648
(2.11 %)
n/a 44.58
(100.00 %)
0
(0 %)
272
(0.00 %)
1,393
(100.00 %)
449,314
(3.08 %)
505,129
(6.52 %)
4,634,925
(31.99 %)
1
(0.00 %)
648,800
(6.06 %)
51,884
(4.81 %)
24,198
(1.04 %)
370 whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021)
GCA_020745695.1
n/a n/a 11,632
(1.83 %)
20,659
(2.18 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,405
(100.00 %)
553,633
(11.80 %)
147,999
(0.81 %)
5,825,472
(20.55 %)
0
(0 %)
89,546
(1.06 %)
20,481
(1.61 %)
16,521
(1.13 %)
371 whiskered treeswift (primary hap 2021)
GCA_020745705.1
n/a n/a 12,681
(1.84 %)
21,784
(2.14 %)
n/a 42.12
(99.13 %)
0
(0 %)
218
(0.87 %)
146
(100.00 %)
520,200
(9.32 %)
170,778
(0.83 %)
6,455,910
(21.44 %)
0
(0 %)
98,619
(0.96 %)
24,061
(1.62 %)
17,982
(1.11 %)
372 white leghorn X broiler chicken (v2 leghorn haplotype 2021)
GCF_016700215.2
83,834
(10.16 %)
n/a 13,005
(2.32 %)
23,329
(2.48 %)
72,360
(9.39 %)
42.16
(99.57 %)
409
(0.43 %)
409
(0.43 %)
685
(99.57 %)
536,869
(6.00 %)
268,230
(2.28 %)
5,845,184
(20.93 %)
2
(0.00 %)
247,373
(2.08 %)
24,409
(2.60 %)
20,761
(1.55 %)
373 white wagtail
GCF_015832195.1
47,145
(6.80 %)
n/a 12,127
(1.86 %)
22,301
(2.31 %)
n/a 42.72
(99.92 %)
0
(0 %)
906
(0.08 %)
619
(100.00 %)
479,546
(6.15 %)
349,751
(5.62 %)
6,384,256
(22.41 %)
2
(0.00 %)
491,922
(3.00 %)
28,008
(2.68 %)
22,699
(1.28 %)
374 white-collared manakin (Guabito, Panama 608988 2022)
GCF_025592945.1
53,731
(6.26 %)
n/a 12,981
(1.91 %)
23,916
(2.40 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 643
(100.00 %)
417,020
(3.98 %)
366,209
(3.55 %)
5,992,950
(21.48 %)
0
(0 %)
332,121
(2.21 %)
28,964
(2.22 %)
21,678
(1.08 %)
375 white-crowned manakin (hap1 2024 genbank)
GCA_036250125.1
n/a n/a 12,807
(1.82 %)
25,568
(2.46 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
323
(0.01 %)
697
(100.00 %)
429,646
(4.10 %)
293,431
(3.59 %)
6,059,494
(21.89 %)
0
(0 %)
366,430
(2.74 %)
29,574
(2.42 %)
21,946
(1.07 %)
376 white-crowned manakin (hap1 2024 refseq)
GCF_036250125.1
55,558
(6.99 %)
n/a 12,807
(1.82 %)
23,359
(2.28 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
323
(0.01 %)
696
(100.00 %)
429,643
(4.10 %)
293,428
(3.59 %)
6,059,402
(21.89 %)
0
(0 %)
366,452
(2.74 %)
29,574
(2.42 %)
21,946
(1.07 %)
377 white-crowned manakin (hap2 2024)
GCA_036250135.1
n/a n/a 12,135
(1.94 %)
21,591
(2.38 %)
n/a 42.49
(99.99 %)
0
(0 %)
307
(0.01 %)
595
(100.00 %)
375,468
(3.93 %)
263,979
(3.93 %)
5,786,346
(21.36 %)
0
(0 %)
353,429
(2.50 %)
25,275
(2.50 %)
20,066
(1.10 %)
378 white-ruffed manakin
GCF_003945725.1
45,894
(5.34 %)
n/a 12,730
(1.91 %)
19,044
(2.50 %)
n/a 41.81
(99.24 %)
0
(0 %)
13,527
(0.76 %)
9,068
(100.00 %)
489,252
(7.14 %)
246,346
(1.38 %)
6,500,956
(19.79 %)
1,774
(0.05 %)
92,543
(0.62 %)
25,941
(1.84 %)
21,611
(1.12 %)
379 white-rumped munia (maternal hap 2024)
GCA_046129695.1
n/a n/a 12,487
(1.71 %)
29,990
(2.73 %)
n/a 43.26
(100.00 %)
0
(0 %)
176
(0.00 %)
161
(100.00 %)
427,385
(3.06 %)
507,421
(10.23 %)
5,759,740
(27.66 %)
1
(0.00 %)
704,704
(4.47 %)
36,849
(5.10 %)
23,680
(1.12 %)
380 white-rumped munia (paternal hap 2024)
GCA_046129705.1
n/a n/a 12,130
(1.67 %)
29,443
(2.72 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
0
(0 %)
228
(0.00 %)
202
(100.00 %)
420,085
(3.06 %)
494,379
(10.27 %)
5,496,878
(27.56 %)
0
(0 %)
694,220
(4.56 %)
36,269
(5.17 %)
22,893
(1.12 %)
381 white-rumped snowfinch
GCF_017590055.1
34,717
(4.88 %)
n/a 12,599
(1.97 %)
24,083
(2.44 %)
n/a 42.03
(99.81 %)
0
(0 %)
4,869
(0.19 %)
11,576
(100.00 %)
502,151
(6.20 %)
449,641
(3.22 %)
6,554,257
(20.25 %)
8
(0.00 %)
182,741
(1.65 %)
28,891
(2.32 %)
23,122
(1.37 %)
382 white-tailed eagle (BGI_N329 2014)
GCF_000691405.1
20,744
(2.82 %)
n/a 11,490
(1.49 %)
22,258
(1.77 %)
n/a 40.90
(99.56 %)
60,579
(0.45 %)
60,579
(0.45 %)
111,484
(99.55 %)
325,669
(3.74 %)
116,707
(0.60 %)
6,725,133
(18.14 %)
11
(0.00 %)
13,685
(0.12 %)
11,615
(0.32 %)
9,835
(0.26 %)
383 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022)
GCA_947461935.1
n/a n/a 7,755
(1.71 %)
16,331
(2.39 %)
n/a 43.66
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,971
(100.00 %)
304,566
(13.21 %)
116,307
(6.64 %)
3,407,853
(22.91 %)
0
(0 %)
142,427
(1.75 %)
34,573
(4.56 %)
18,414
(1.62 %)
384 white-tailed eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_947461875.1
52,797
(5.74 %)
n/a 13,736
(1.76 %)
24,846
(2.12 %)
n/a 43.15
(99.99 %)
0
(0 %)
424
(0.01 %)
189
(100.00 %)
585,279
(12.89 %)
291,297
(6.10 %)
6,474,102
(23.66 %)
0
(0 %)
238,727
(1.67 %)
54,851
(4.05 %)
31,757
(1.50 %)
385 white-tailed ptarmigan
GCF_019238085.1
39,072
(5.37 %)
n/a 12,919
(2.36 %)
23,624
(2.48 %)
n/a 41.37
(97.63 %)
0
(0 %)
10,501
(2.38 %)
7,343
(100.00 %)
587,593
(8.19 %)
231,665
(1.12 %)
6,007,601
(20.08 %)
935
(0.05 %)
58,646
(0.40 %)
21,298
(2.05 %)
19,249
(1.48 %)
386 white-tailed tropicbird
GCF_000687285.1
16,342
(2.18 %)
n/a 12,040
(1.50 %)
26,704
(1.97 %)
n/a 41.51
(99.50 %)
65,286
(0.51 %)
65,286
(0.51 %)
132,071
(99.49 %)
353,892
(5.61 %)
125,195
(0.74 %)
6,873,137
(19.59 %)
14
(0.00 %)
26,611
(0.28 %)
41,005
(1.45 %)
36,518
(1.24 %)
387 white-throated dipper (primary hap 2023 genbank)
GCA_963662255.1
n/a n/a 12,856
(1.79 %)
23,827
(2.25 %)
n/a 42.82
(99.99 %)
0
(0 %)
658
(0.01 %)
278
(100.00 %)
431,536
(3.38 %)
345,533
(10.59 %)
5,840,462
(26.59 %)
1
(0.00 %)
617,894
(3.85 %)
29,711
(3.56 %)
21,555
(1.20 %)
388 white-throated dipper (primary hap 2023 refseq)
GCF_963662255.1
29,618
(3.60 %)
n/a 12,854
(1.79 %)
23,825
(2.25 %)
n/a 42.82
(99.99 %)
0
(0 %)
658
(0.01 %)
277
(100.00 %)
431,531
(3.38 %)
345,532
(10.59 %)
5,840,421
(26.59 %)
1
(0.00 %)
617,892
(3.85 %)
29,711
(3.56 %)
21,555
(1.20 %)
389 white-throated sparrow
GCF_000385455.1
31,167
(5.71 %)
n/a 11,241
(1.81 %)
13,429
(2.26 %)
n/a 41.52
(95.61 %)
31,643
(4.40 %)
41,460
(4.40 %)
37,661
(95.60 %)
439,216
(5.96 %)
364,202
(2.52 %)
6,300,584
(19.09 %)
538
(0.02 %)
220,251
(1.26 %)
15,091
(0.85 %)
11,891
(0.58 %)
390 white-throated tinamou
GCF_000705375.1
18,997
(2.72 %)
n/a 12,287
(1.75 %)
20,132
(2.48 %)
n/a 41.41
(97.88 %)
59,853
(2.12 %)
59,853
(2.12 %)
142,367
(97.88 %)
366,311
(3.62 %)
226,347
(1.35 %)
6,300,683
(18.94 %)
18
(0.00 %)
43,210
(0.47 %)
47,608
(2.60 %)
42,944
(2.08 %)
391 whooping crane (maternal hap 2023 refseq)
GCF_028858705.1
55,408
(5.57 %)
n/a 13,574
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
0
(0 %)
262
(0.37 %)
930
(100.00 %)
616,300
(10.57 %)
211,558
(2.90 %)
6,785,192
(22.11 %)
0
(0 %)
591,955
(1.89 %)
42,795
(4.66 %)
39,036
(2.34 %)
392 whooping crane (paternal hap 2023)
GCA_028858595.1
n/a n/a 13,284
(1.87 %)
23,528
(2.20 %)
n/a 42.47
(99.50 %)
0
(0 %)
586
(0.50 %)
395
(100.00 %)
569,940
(8.69 %)
162,569
(0.98 %)
7,021,319
(20.20 %)
1
(0.00 %)
186,281
(0.89 %)
38,582
(3.77 %)
37,390
(2.40 %)
393 willow flycatcher
GCF_003031625.1
37,909
(4.43 %)
n/a 12,708
(1.90 %)
19,591
(2.57 %)
n/a 42.01
(95.33 %)
0
(0 %)
39,319
(4.68 %)
7,791
(100.00 %)
550,172
(7.15 %)
242,394
(1.27 %)
6,421,292
(18.87 %)
11,152
(0.76 %)
135,623
(1.79 %)
27,080
(1.82 %)
21,989
(1.09 %)
394 wire-tailed manakin (2020)
GCF_003945595.2
42,551
(5.86 %)
n/a 12,535
(1.90 %)
23,300
(2.38 %)
n/a 42.06
(99.73 %)
0
(0 %)
758
(0.26 %)
1,768
(100.00 %)
480,705
(7.12 %)
240,463
(1.87 %)
6,316,566
(20.20 %)
2
(0.00 %)
189,188
(1.32 %)
25,317
(2.02 %)
20,876
(1.12 %)
395 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 alternate hap 2023)
GCA_029207785.1
n/a n/a 13,053
(1.78 %)
24,963
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
0
(0 %)
342
(0.00 %)
1,350
(100.00 %)
444,809
(3.08 %)
473,154
(7.96 %)
5,336,472
(25.82 %)
4
(0.00 %)
848,335
(5.29 %)
37,198
(3.14 %)
26,590
(1.31 %)
396 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 refseq)
GCF_029207755.1
40,944
(5.15 %)
n/a 13,050
(1.78 %)
24,948
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
353
(0.00 %)
353
(0.00 %)
1,694
(100.00 %)
444,856
(3.08 %)
473,471
(7.97 %)
5,336,456
(25.82 %)
4
(0.00 %)
847,255
(5.29 %)
37,210
(3.14 %)
26,586
(1.31 %)
397 Xingu scale-backed antbird (hap1 2024)
GCA_045364795.1
n/a n/a 12,848
(1.71 %)
24,293
(2.19 %)
n/a 43.77
(99.99 %)
0
(0 %)
773
(0.01 %)
1,510
(100.00 %)
688,169
(20.12 %)
440,901
(9.03 %)
5,858,667
(26.62 %)
8
(0.00 %)
932,948
(5.28 %)
39,419
(4.07 %)
19,631
(0.96 %)
398 Xingu scale-backed antbird (hap2 2024)
GCA_045364805.1
n/a n/a 12,157
(1.85 %)
22,615
(2.35 %)
n/a 43.36
(99.99 %)
0
(0 %)
533
(0.01 %)
743
(100.00 %)
575,863
(14.81 %)
371,492
(6.11 %)
5,580,275
(23.05 %)
3
(0.00 %)
577,013
(3.67 %)
28,593
(3.34 %)
17,849
(1.01 %)
399 yellow warbler (LACM:Birds122168 alternate hap 2022)
GCA_024372515.1
n/a n/a 12,426
(1.63 %)
27,565
(2.37 %)
n/a 43.59
(100.00 %)
246
(0.00 %)
246
(0.00 %)
776
(100.00 %)
447,274
(3.06 %)
612,008
(10.28 %)
5,606,168
(28.79 %)
1
(0.00 %)
796,032
(4.97 %)
39,449
(2.66 %)
23,987
(1.17 %)
400 yellow warbler (LACM:Birds122168 primary hap 2022)
GCA_024362935.1
n/a n/a 12,556
(1.69 %)
26,545
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
284
(0.00 %)
284
(0.00 %)
971
(100.00 %)
440,673
(3.12 %)
581,112
(9.17 %)
6,158,372
(26.15 %)
2
(0.00 %)
739,193
(4.60 %)
35,577
(2.57 %)
23,767
(1.19 %)
401 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap1 2024)
GCA_039720435.1
n/a n/a 13,169
(1.63 %)
23,545
(1.98 %)
n/a 43.42
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
1,679
(100.00 %)
579,903
(8.32 %)
295,345
(9.90 %)
4,361,776
(30.37 %)
1
(0.00 %)
776,875
(4.65 %)
28,647
(1.82 %)
20,581
(1.14 %)
402 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap2 2024)
GCA_039720425.1
n/a n/a 12,079
(1.50 %)
21,895
(1.84 %)
n/a 44.31
(100.00 %)
0
(0 %)
138
(0.00 %)
2,468
(100.00 %)
514,155
(7.08 %)
298,648
(19.26 %)
3,943,979
(37.27 %)
0
(0 %)
1,068,366
(5.88 %)
27,272
(1.79 %)
18,908
(1.05 %)
403 yellow-legged gull (bLarMic1.1_alternate_haplotype 2024)
GCA_964199725.1
n/a n/a 12,692
(1.61 %)
24,720
(2.07 %)
n/a 44.79
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,673
(100.00 %)
486,967
(5.03 %)
248,816
(10.71 %)
6,176,494
(29.58 %)
0
(0 %)
541,267
(4.20 %)
44,101
(6.72 %)
36,321
(1.69 %)
404 yellow-legged gull (primary hap 2024)
GCA_964199755.1
n/a n/a 13,396
(1.62 %)
25,176
(2.03 %)
n/a 44.64
(99.99 %)
0
(0 %)
500
(0.01 %)
618
(100.00 %)
521,539
(5.15 %)
267,365
(11.68 %)
5,827,639
(29.76 %)
3
(0.00 %)
655,588
(3.77 %)
44,532
(6.28 %)
37,224
(1.61 %)
405 yellow-throated sandgrouse (alternate hap 2019)
GCA_009769505.1
n/a n/a 11,788
(1.85 %)
23,306
(2.45 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,958
(100.00 %)
467,960
(6.96 %)
182,645
(0.99 %)
6,050,545
(20.78 %)
0
(0 %)
88,543
(0.80 %)
26,357
(2.20 %)
23,111
(1.43 %)
406 yellow-throated sandgrouse (primary hap 2019)
GCA_009769525.1
n/a n/a 12,697
(1.89 %)
25,289
(2.53 %)
n/a 42.40
(99.62 %)
0
(0 %)
242
(0.38 %)
89
(100.00 %)
510,633
(7.10 %)
213,742
(1.12 %)
6,627,716
(21.17 %)
0
(0 %)
113,802
(0.93 %)
28,848
(2.23 %)
25,343
(1.45 %)
407 zebra finch (alternate hap Black17 2018)
GCA_003957525.1
n/a n/a 11,340
(1.85 %)
22,921
(2.37 %)
n/a 41.73
(99.98 %)
45
(0.01 %)
45
(0.01 %)
5,381
(99.99 %)
480,647
(8.44 %)
365,668
(2.89 %)
5,859,698
(20.27 %)
0
(0 %)
235,418
(1.48 %)
24,649
(2.35 %)
19,753
(1.21 %)
408 zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020)
GCA_009859025.1
n/a n/a 10,734
(1.84 %)
19,978
(2.21 %)
n/a 41.07
(99.99 %)
0
(0 %)
16
(0.01 %)
4,677
(100.00 %)
436,071
(7.44 %)
217,580
(1.43 %)
5,800,691
(19.24 %)
0
(0 %)
96,414
(0.71 %)
19,512
(1.90 %)
16,561
(1.08 %)
409 zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021)
GCA_003957525.2
n/a n/a 11,213
(2.01 %)
21,533
(2.54 %)
n/a 41.92
(100.00 %)
0
(0 %)
10
(0.00 %)
1,646
(100.00 %)
470,860
(9.54 %)
387,943
(3.32 %)
5,428,128
(20.68 %)
0
(0 %)
254,906
(1.64 %)
23,838
(2.47 %)
18,868
(1.23 %)
410 zebra finch (Blue55 female 2020 genbank)
GCA_009859065.2
n/a n/a 12,796
(1.92 %)
24,658
(2.44 %)
n/a 41.91
(98.03 %)
0
(0 %)
789
(1.97 %)
541
(100.00 %)
554,338
(9.67 %)
339,851
(2.27 %)
6,613,146
(20.04 %)
1
(0.00 %)
220,583
(1.45 %)
28,678
(2.32 %)
22,455
(1.18 %)
411 zebra finch (Blue55 paternal 2019)
GCA_008822125.1
n/a n/a 12,384
(1.97 %)
23,021
(2.44 %)
n/a 41.74
(98.02 %)
0
(0 %)
828
(1.98 %)
202
(100.00 %)
511,324
(8.38 %)
351,624
(2.53 %)
6,328,918
(19.99 %)
1
(0.00 %)
233,403
(1.42 %)
25,871
(2.29 %)
20,873
(1.18 %)
412 zebra finch (Blue55 paternal W 2020)
GCF_008822105.2
50,407
(7.20 %)
n/a 12,470
(1.95 %)
23,352
(2.42 %)
n/a 41.81
(97.98 %)
0
(0 %)
857
(2.02 %)
205
(100.00 %)
529,829
(9.55 %)
357,586
(2.56 %)
6,359,599
(20.12 %)
3
(0.00 %)
246,785
(1.53 %)
27,755
(2.36 %)
21,477
(1.19 %)
413 zebra finch (v1.4 Blue55 female primary hap 2021 refseq)
GCF_003957565.2
49,311
(7.41 %)
n/a 12,747
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
0
(0 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
544,577
(9.57 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,748
(20.92 %)
3
(0.00 %)
312,137
(1.80 %)
29,202
(2.47 %)
22,084
(1.22 %)
414 zebra finch (v3 Blue55 maternal 2020)
GCA_008822115.3
n/a n/a 11,950
(2.00 %)
22,828
(2.51 %)
n/a 42.06
(98.45 %)
0
(0 %)
583
(1.55 %)
206
(100.00 %)
494,110
(9.54 %)
347,933
(2.80 %)
5,875,448
(20.29 %)
0
(0 %)
249,341
(1.71 %)
27,387
(2.57 %)
20,823
(1.23 %)
TOTALS:total assembly count 414

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Primates 221 assemblies assembly stats track stats
Mammals 641 assemblies assembly stats track stats
Birds 414 assemblies assembly stats track stats
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Plants 309 assemblies assembly stats track stats
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Viruses 291 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 113 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1067 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
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