Birds Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of birds only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Abyssinian ground-hornbill (2019)
GCA_009769605.1
n/a n/a 12,926
(1.90 %)
23,453
(2.26 %)
n/a 43.30
(99.29 %)
0
(0 %)
204
(0.71 %)
112
(100.00 %)
401,839
(5.61 %)
145,540
(0.78 %)
6,556,090
(19.22 %)
0
(0 %)
65,601
(0.62 %)
40,986
(3.65 %)
34,700
(2.27 %)
2 Abyssinian ground-hornbill (alternate hap 2019)
GCA_009769595.1
n/a n/a 11,948
(1.86 %)
22,509
(2.24 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,527
(100.00 %)
361,147
(5.36 %)
125,372
(0.75 %)
5,917,083
(18.51 %)
0
(0 %)
53,587
(0.56 %)
38,787
(3.82 %)
33,644
(2.37 %)
3 acorn woodpecker (bairdi alternate hap 2022)
GCA_026170555.1
n/a n/a 12,415
(1.42 %)
23,266
(1.78 %)
n/a 46.76
(99.99 %)
0
(0 %)
1,555
(0.01 %)
2,294
(100.00 %)
1,077,039
(17.72 %)
548,450
(13.79 %)
4,965,697
(43.00 %)
4
(0.00 %)
1,763,118
(7.89 %)
29,460
(3.04 %)
18,848
(0.92 %)
4 acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022)
GCA_026170545.1
n/a n/a 11,832
(1.45 %)
22,508
(1.87 %)
n/a 46.81
(99.99 %)
1,317
(0.01 %)
1,317
(0.01 %)
4,491
(99.99 %)
980,493
(17.23 %)
496,946
(14.39 %)
5,155,337
(42.38 %)
5
(0.00 %)
1,619,528
(7.89 %)
28,236
(3.22 %)
18,285
(0.96 %)
5 Adelie penguin
GCF_000699105.1
17,638
(3.05 %)
n/a 11,763
(1.71 %)
10,671
(1.99 %)
n/a 41.51
(95.58 %)
95,109
(4.45 %)
95,110
(4.45 %)
114,374
(95.55 %)
360,323
(4.64 %)
126,490
(0.70 %)
6,900,013
(18.31 %)
42
(0.01 %)
38,535
(0.66 %)
27,176
(0.96 %)
23,037
(0.76 %)
6 African ostrich
GCF_000698965.1
29,026
(4.42 %)
n/a 12,011
(1.64 %)
17,852
(1.82 %)
34,707
(3.37 %)
41.05
(96.74 %)
72,649
(3.29 %)
72,649
(3.29 %)
79,564
(96.71 %)
321,765
(3.17 %)
152,444
(0.82 %)
7,196,207
(17.79 %)
19
(0.00 %)
23,609
(0.42 %)
33,542
(1.33 %)
29,839
(1.10 %)
7 American crow
GCF_000691975.1
36,379
(6.32 %)
n/a 12,151
(1.86 %)
11,346
(2.24 %)
n/a 41.85
(96.40 %)
79,099
(3.62 %)
79,099
(3.62 %)
89,646
(96.38 %)
416,990
(6.08 %)
224,964
(1.60 %)
6,343,680
(18.42 %)
41
(0.01 %)
91,630
(1.03 %)
20,148
(0.77 %)
15,464
(0.55 %)
8 American flamingo (2019)
GCA_009819775.1
n/a n/a 13,100
(1.79 %)
23,372
(2.04 %)
n/a 43.27
(99.31 %)
0
(0 %)
280
(0.69 %)
90
(100.00 %)
538,004
(7.73 %)
183,346
(0.79 %)
7,056,270
(20.92 %)
0
(0 %)
91,554
(0.80 %)
52,012
(5.96 %)
50,946
(3.06 %)
9 American flamingo (alternate hap 2019)
GCA_009819805.1
n/a n/a 12,384
(1.73 %)
23,611
(2.05 %)
n/a 43.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,529
(100.00 %)
496,877
(7.22 %)
162,522
(0.74 %)
6,684,675
(20.14 %)
0
(0 %)
75,413
(0.70 %)
51,895
(5.89 %)
50,715
(3.23 %)
10 Anna's hummingbird (alternate hap BGI_N300 2018)
GCA_003957575.1
n/a n/a 11,084
(1.90 %)
19,321
(2.14 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
3,803
(100.00 %)
475,493
(7.41 %)
223,791
(1.37 %)
5,585,250
(20.30 %)
0
(0 %)
113,614
(1.01 %)
14,903
(1.46 %)
13,444
(1.06 %)
11 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq)
GCF_003957555.1
31,091
(4.24 %)
n/a 12,257
(1.95 %)
14,633
(2.35 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
0
(0 %)
429
(1.52 %)
159
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,055
(1.51 %)
6,092,276
(20.84 %)
0
(0 %)
152,103
(1.27 %)
17,130
(1.48 %)
15,125
(1.04 %)
12 bald eagle
GCF_000737465.1
26,869
(3.49 %)
n/a 13,007
(1.88 %)
15,874
(2.35 %)
n/a 41.68
(98.38 %)
30,763
(1.63 %)
30,862
(1.63 %)
31,786
(98.37 %)
355,319
(3.99 %)
119,526
(0.44 %)
6,923,742
(18.48 %)
14
(0.00 %)
16,099
(0.20 %)
33,353
(1.97 %)
30,190
(1.55 %)
13 band-tailed pigeon (hap2 2024 genbank)
GCA_036971685.1
n/a n/a 13,319
(1.60 %)
25,993
(2.05 %)
n/a 43.83
(99.41 %)
0
(0 %)
219
(0.59 %)
453
(100.00 %)
700,173
(13.18 %)
457,546
(13.85 %)
4,523,003
(31.73 %)
2
(0.00 %)
1,089,353
(5.57 %)
42,686
(7.00 %)
31,415
(1.62 %)
14 band-tailed pigeon (hap2 2024 refseq)
GCF_036971685.1
36,326
(4.04 %)
n/a 13,317
(1.60 %)
25,993
(2.05 %)
n/a 43.83
(99.41 %)
0
(0 %)
219
(0.59 %)
452
(100.00 %)
700,166
(13.18 %)
457,543
(13.85 %)
4,522,973
(31.73 %)
2
(0.00 %)
1,089,421
(5.57 %)
42,686
(7.00 %)
31,415
(1.62 %)
15 bar-tailed trogon
GCF_000703405.1
15,393
(2.18 %)
n/a 11,432
(1.52 %)
23,733
(1.98 %)
n/a 41.38
(99.58 %)
50,921
(0.42 %)
50,921
(0.42 %)
105,649
(99.58 %)
386,871
(6.20 %)
142,825
(0.82 %)
6,474,942
(19.87 %)
0
(0 %)
24,291
(0.21 %)
18,662
(0.63 %)
15,678
(0.50 %)
16 barn owl (U. Lausanne 2021)
GCF_018691265.1
46,583
(5.22 %)
n/a 13,036
(1.82 %)
22,849
(2.14 %)
n/a 41.65
(95.89 %)
0
(0 %)
259
(4.11 %)
70
(100.00 %)
610,994
(5.59 %)
254,870
(1.12 %)
7,109,716
(19.00 %)
1
(0.00 %)
90,972
(0.72 %)
38,384
(2.94 %)
34,588
(1.70 %)
17 Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021)
GCA_015227815.3
n/a n/a 11,132
(1.94 %)
20,993
(2.40 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
2,476
(100.00 %)
550,072
(10.78 %)
282,378
(2.00 %)
5,634,117
(20.43 %)
0
(0 %)
161,076
(1.17 %)
30,305
(2.79 %)
25,208
(1.64 %)
18 Barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.2
41,925
(5.13 %)
n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,661
(1.56 %)
36,548
(2.85 %)
29,760
(1.66 %)
19 Bengalese finch
GCF_005870125.1
32,857
(5.06 %)
n/a 12,604
(1.98 %)
23,707
(2.41 %)
n/a 41.59
(97.06 %)
0
(0 %)
37,862
(2.95 %)
2,015
(100.00 %)
507,898
(7.97 %)
424,913
(2.80 %)
6,456,852
(20.03 %)
1,817
(0.10 %)
257,331
(2.35 %)
29,692
(2.46 %)
22,678
(1.20 %)
20 bird P.flaviventris (CSIRO_AGI_PZ_B2104156 2023)
GCF_033815535.1
46,130
(4.40 %)
n/a 13,292
(1.73 %)
24,384
(2.16 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 993
(100.00 %)
514,287
(6.54 %)
355,123
(8.64 %)
5,531,059
(27.22 %)
0
(0 %)
594,881
(3.58 %)
28,362
(1.86 %)
21,623
(1.25 %)
21 bird P.pipra (hap1 2024)
GCF_036250125.1
55,558
(6.99 %)
n/a 12,807
(1.82 %)
23,359
(2.28 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
323
(0.01 %)
696
(100.00 %)
429,643
(4.10 %)
293,428
(3.59 %)
6,059,402
(21.89 %)
0
(0 %)
366,452
(2.74 %)
29,574
(2.42 %)
21,946
(1.07 %)
22 bird Z.leucophrys gambelii (GWCS_2022_RI 2023)
GCF_028769735.1
42,284
(5.19 %)
n/a 12,694
(1.84 %)
25,490
(2.39 %)
n/a 42.81
(100.00 %)
0
(0 %)
339
(0.00 %)
3,792
(100.00 %)
398,368
(3.10 %)
569,232
(5.31 %)
6,675,899
(23.29 %)
2
(0.00 %)
575,630
(3.04 %)
31,995
(2.37 %)
23,024
(1.21 %)
23 black swan (v2 Queensland, Australia AKBS03 2022)
GCF_013377495.2
41,421
(4.72 %)
n/a 13,027
(1.98 %)
22,616
(2.25 %)
n/a 41.96
(99.99 %)
0
(0 %)
130
(0.01 %)
568
(100.00 %)
636,501
(5.67 %)
297,964
(1.45 %)
6,820,083
(21.47 %)
0
(0 %)
88,663
(0.80 %)
31,725
(3.49 %)
30,089
(2.00 %)
24 black-capped chickadee (hap1 2023)
GCF_030490865.1
44,388
(4.96 %)
n/a 13,738
(1.81 %)
26,691
(2.34 %)
n/a 42.41
(99.92 %)
0
(0 %)
404
(0.08 %)
307
(100.00 %)
730,165
(12.91 %)
566,529
(6.51 %)
6,499,984
(24.36 %)
2
(0.00 %)
632,539
(3.23 %)
42,650
(2.59 %)
24,153
(1.20 %)
25 black-capped chickadee (hap2 2023)
GCA_030490855.1
n/a n/a 11,495
(1.90 %)
22,202
(2.49 %)
n/a 42.77
(99.94 %)
0
(0 %)
240
(0.06 %)
157
(100.00 %)
560,436
(11.20 %)
441,102
(7.11 %)
5,126,888
(23.42 %)
1
(0.00 %)
485,675
(2.99 %)
35,457
(2.90 %)
20,157
(1.24 %)
26 black-headed gull (Kunming 2023)
GCA_030820635.1
n/a n/a 12,902
(1.75 %)
23,180
(2.09 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
297
(100.00 %)
498,044
(5.37 %)
199,557
(4.44 %)
6,843,616
(23.12 %)
3
(0.00 %)
184,280
(1.44 %)
42,444
(3.62 %)
37,532
(1.85 %)
27 black-headed gull (primary hap 2024)
GCA_963924245.1
n/a n/a 13,244
(1.58 %)
25,111
(1.96 %)
n/a 44.66
(99.99 %)
0
(0 %)
462
(0.01 %)
729
(100.00 %)
516,350
(4.84 %)
268,175
(14.83 %)
5,880,256
(31.31 %)
1
(0.00 %)
746,095
(4.07 %)
45,313
(4.92 %)
37,372
(1.57 %)
28 black-headed gull (primary hap 2024)
GCF_963924245.1
46,133
(4.67 %)
n/a 13,243
(1.58 %)
24,048
(1.89 %)
n/a 44.66
(99.99 %)
0
(0 %)
462
(0.01 %)
728
(100.00 %)
516,346
(4.84 %)
268,169
(14.83 %)
5,880,218
(31.31 %)
1
(0.00 %)
746,091
(4.07 %)
45,313
(4.92 %)
37,373
(1.57 %)
29 black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq)
GCF_028500815.1
51,115
(5.11 %)
n/a 13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
0
(0 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
8
(0.00 %)
651,837
(3.67 %)
45,318
(4.71 %)
36,668
(1.67 %)
30 black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023)
GCA_028501385.1
n/a n/a 12,650
(1.68 %)
22,959
(2.02 %)
n/a 44.62
(99.95 %)
0
(0 %)
223
(0.05 %)
733
(100.00 %)
483,413
(5.25 %)
221,284
(9.35 %)
6,264,499
(27.26 %)
4
(0.00 %)
646,822
(3.82 %)
42,776
(4.88 %)
36,156
(1.75 %)
31 black-throated flowerpiercer
GCA_019023105.1
n/a n/a 12,249
(1.86 %)
23,692
(2.34 %)
n/a 42.36
(99.99 %)
0
(0 %)
970
(0.01 %)
600
(100.00 %)
491,914
(6.04 %)
365,884
(2.89 %)
6,453,998
(20.73 %)
0
(0 %)
273,794
(1.91 %)
30,076
(2.44 %)
22,199
(1.28 %)
32 blackcap (2019)
GCA_009819655.1
n/a n/a 12,378
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
0
(0 %)
413
(1.12 %)
189
(100.00 %)
506,242
(6.14 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,567
(19.76 %)
0
(0 %)
190,210
(1.30 %)
26,838
(2.34 %)
22,667
(1.33 %)
33 blackcap (alternate hap 2019)
GCA_009819715.1
n/a n/a 11,586
(1.87 %)
22,618
(2.41 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,566
(100.00 %)
473,456
(5.97 %)
308,518
(2.29 %)
5,987,640
(19.64 %)
0
(0 %)
201,989
(1.45 %)
25,451
(2.38 %)
21,377
(1.34 %)
34 blue tit
GCF_002901205.1
42,986
(5.81 %)
n/a 12,162
(1.76 %)
16,442
(2.29 %)
n/a 41.18
(92.58 %)
0
(0 %)
24,797
(7.42 %)
29,297
(100.00 %)
486,455
(6.02 %)
423,142
(2.68 %)
6,777,615
(18.84 %)
21
(0.00 %)
335,169
(2.34 %)
26,565
(0.98 %)
20,262
(0.69 %)
35 blue-and-yellow macaw (hap1 2023)
GCA_028858755.1
n/a n/a 12,919
(1.77 %)
22,770
(2.15 %)
n/a 42.69
(99.92 %)
0
(0 %)
107
(0.08 %)
246
(100.00 %)
711,670
(17.55 %)
242,430
(5.04 %)
5,545,074
(24.84 %)
0
(0 %)
506,592
(3.20 %)
25,153
(2.06 %)
19,988
(1.21 %)
36 blue-and-yellow macaw (hap2 2023)
GCA_028858555.1
n/a n/a 13,216
(1.69 %)
23,855
(2.07 %)
n/a 43.30
(99.92 %)
0
(0 %)
130
(0.08 %)
274
(100.00 %)
746,174
(21.96 %)
291,116
(9.91 %)
5,424,976
(28.69 %)
1
(0.00 %)
907,315
(4.95 %)
26,750
(2.02 %)
20,655
(1.17 %)
37 blue-crowned manakin
GCF_001604755.1
42,586
(5.25 %)
n/a 12,442
(1.93 %)
16,972
(2.49 %)
n/a 41.74
(97.93 %)
18,889
(2.07 %)
22,456
(2.07 %)
23,501
(97.93 %)
470,567
(6.92 %)
226,975
(1.27 %)
6,395,476
(19.17 %)
590
(0.04 %)
96,778
(0.89 %)
24,084
(1.85 %)
20,271
(1.08 %)
38 blue-fronted amazon (AMXYW 2021)
GCA_017639355.1
n/a n/a 12,250
(1.92 %)
19,607
(2.10 %)
n/a 41.72
(93.42 %)
0
(0 %)
3,560,856
(6.92 %)
1,498
(100.00 %)
559,187
(10.05 %)
144,509
(0.66 %)
5,883,053
(17.90 %)
129
(0.02 %)
100,095
(1.28 %)
18,581
(1.17 %)
16,977
(0.99 %)
39 blue-fronted amazon (FVVF132 2015)
GCA_001420675.1
n/a 16,315
(2.39 %)
12,339
(1.91 %)
20,350
(2.13 %)
n/a 41.72
(93.49 %)
0
(0 %)
3,559,082
(6.85 %)
3,232
(100.00 %)
501,831
(8.21 %)
144,313
(0.66 %)
5,882,906
(17.92 %)
126
(0.02 %)
90,905
(0.87 %)
18,584
(1.17 %)
16,979
(0.99 %)
40 Bourke's parrot (Australia Nb327-2 2023)
GCF_033783945.1
43,924
(4.72 %)
n/a 13,092
(1.91 %)
23,195
(2.31 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
37
(0.00 %)
37
(0.00 %)
1,864
(100.00 %)
469,079
(6.31 %)
205,954
(1.49 %)
5,911,944
(20.89 %)
0
(0 %)
212,512
(1.40 %)
22,555
(1.70 %)
19,712
(1.31 %)
41 Brazilian merganser (hap1 2024)
GCA_036873955.1
n/a n/a 13,202
(1.80 %)
24,416
(2.14 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
0
(0 %)
327
(0.00 %)
569
(100.00 %)
832,469
(7.06 %)
531,644
(7.37 %)
6,294,434
(28.49 %)
0
(0 %)
618,430
(3.89 %)
34,786
(3.61 %)
27,553
(1.39 %)
42 Brazilian merganser (hap2 2024)
GCA_036850655.1
n/a n/a 12,578
(1.76 %)
23,066
(2.06 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
0
(0 %)
244
(0.00 %)
720
(100.00 %)
773,452
(7.75 %)
522,491
(10.88 %)
5,592,104
(31.80 %)
0
(0 %)
820,340
(5.03 %)
33,981
(4.60 %)
26,728
(1.37 %)
43 brown eared-pheasant
GCA_019593555.1
n/a n/a 13,027
(2.37 %)
22,748
(2.48 %)
n/a 41.03
(98.67 %)
0
(0 %)
114,232
(1.35 %)
2,408
(100.00 %)
523,649
(0.00 %)
228,783
(1.17 %)
6,134,418
(20.24 %)
558
(0.02 %)
63,695
(0.75 %)
19,702
(2.00 %)
17,753
(1.34 %)
44 brown headed cowbird (v1.1 BHLD 08-10-18 2022)
GCF_012460135.2
31,871
(5.31 %)
n/a 12,561
(1.89 %)
24,218
(2.41 %)
n/a 42.40
(99.99 %)
318
(0.01 %)
318
(0.01 %)
692
(99.99 %)
598,355
(12.36 %)
420,712
(3.73 %)
6,496,704
(21.26 %)
0
(0 %)
354,123
(2.17 %)
28,568
(2.41 %)
22,560
(1.23 %)
45 brown kiwi
GCF_001039765.1
26,121
(3.23 %)
n/a 12,909
(1.54 %)
23,267
(1.91 %)
n/a 41.28
(86.08 %)
0
(0 %)
368,297
(13.97 %)
24,718
(100.00 %)
367,446
(2.94 %)
316,602
(7.36 %)
7,164,456
(14.67 %)
15,742
(0.83 %)
282,005
(10.95 %)
59,756
(2.40 %)
55,040
(2.06 %)
46 brown roatelo
GCF_000695765.1
16,756
(2.26 %)
n/a 12,208
(1.55 %)
27,079
(2.12 %)
n/a 41.32
(99.66 %)
51,602
(0.35 %)
51,602
(0.35 %)
119,122
(99.65 %)
345,102
(5.17 %)
194,444
(1.21 %)
6,441,258
(19.39 %)
4
(0.00 %)
52,863
(0.41 %)
19,018
(0.67 %)
16,283
(0.55 %)
47 budgerigar (maternal 2020)
GCA_012275265.1
n/a n/a 12,659
(1.89 %)
22,063
(2.28 %)
n/a 41.89
(94.20 %)
0
(0 %)
388
(5.80 %)
930
(100.00 %)
504,677
(9.95 %)
268,616
(3.12 %)
5,481,198
(20.78 %)
1
(0.00 %)
317,306
(2.01 %)
20,278
(1.55 %)
16,758
(1.05 %)
48 budgerigar (maternal Z 2020 refseq)
GCF_012275295.1
32,026
(4.32 %)
n/a 13,239
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
26,324
(3.11 %)
41.80
(99.72 %)
0
(0 %)
284
(0.28 %)
864
(100.00 %)
538,374
(10.19 %)
279,504
(3.12 %)
5,874,531
(22.08 %)
1
(0.00 %)
324,793
(2.05 %)
21,155
(1.61 %)
17,590
(1.10 %)
49 budgerigar (paternal 2020)
GCA_012275275.1
n/a n/a 13,127
(1.94 %)
22,492
(2.30 %)
n/a 41.84
(98.98 %)
0
(0 %)
737
(1.02 %)
330
(100.00 %)
505,478
(9.66 %)
231,633
(2.15 %)
5,778,405
(20.30 %)
0
(0 %)
277,857
(1.78 %)
20,205
(1.61 %)
17,519
(1.14 %)
50 budgerigar (v6.3 2021 WashU)
GCF_000238935.1
25,525
(4.05 %)
n/a 12,188
(1.82 %)
15,819
(2.26 %)
n/a 41.25
(97.26 %)
45,651
(2.75 %)
51,022
(2.75 %)
70,863
(97.25 %)
465,974
(9.37 %)
127,353
(0.54 %)
5,864,264
(19.05 %)
39
(0.00 %)
99,875
(0.89 %)
15,886
(0.88 %)
14,271
(0.75 %)
51 burrowing owl
GCF_003259725.1
30,559
(4.30 %)
n/a 11,741
(1.72 %)
10,976
(2.04 %)
n/a 40.92
(98.92 %)
0
(0 %)
33,737
(1.09 %)
445
(100.00 %)
492,320
(6.21 %)
182,281
(0.73 %)
6,811,984
(19.35 %)
54
(0.00 %)
43,342
(0.69 %)
22,840
(1.08 %)
20,669
(0.90 %)
52 California black rail (168171201 alternate hap 2022)
GCA_022605925.1
n/a n/a 11,551
(1.57 %)
22,390
(2.09 %)
n/a 44.21
(99.99 %)
0
(0 %)
1,672
(0.01 %)
3,563
(100.00 %)
465,417
(6.39 %)
218,050
(11.40 %)
4,588,632
(30.42 %)
22
(0.00 %)
672,136
(5.44 %)
22,622
(2.16 %)
17,533
(1.11 %)
53 California black rail (168171201 primary hap 2022)
GCA_022605575.1
n/a n/a 12,725
(1.54 %)
24,572
(2.13 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
319
(0.00 %)
319
(0.00 %)
964
(100.00 %)
522,782
(6.36 %)
226,563
(14.09 %)
5,497,483
(32.27 %)
2
(0.00 %)
642,907
(3.88 %)
24,529
(1.77 %)
18,290
(0.98 %)
54 California condor (v2 813 2022 refseq)
GCF_018139145.2
27,527
(3.38 %)
n/a 12,653
(1.75 %)
21,924
(1.97 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
0
(0 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
434,141
(3.82 %)
177,389
(0.88 %)
7,171,770
(20.32 %)
6
(0.00 %)
116,183
(1.12 %)
34,918
(3.00 %)
32,351
(1.75 %)
55 California quail (MVZ:Bird:193975 alternate hap 2022)
GCA_023055725.1
n/a n/a 12,948
(1.71 %)
24,838
(2.01 %)
n/a 43.36
(100.00 %)
0
(0 %)
248
(0.00 %)
1,601
(100.00 %)
1,359,516
(35.69 %)
599,039
(11.78 %)
3,454,101
(36.94 %)
0
(0 %)
1,581,379
(8.33 %)
36,496
(2.55 %)
20,012
(1.18 %)
56 California quail (MVZ:Bird:193975 primary hap 2022)
GCA_023055505.1
n/a n/a 12,718
(2.12 %)
23,363
(2.40 %)
n/a 42.23
(100.00 %)
287
(0.00 %)
287
(0.00 %)
608
(100.00 %)
881,563
(19.85 %)
308,707
(5.50 %)
5,409,060
(25.34 %)
1
(0.00 %)
573,425
(4.09 %)
25,268
(2.42 %)
19,569
(1.39 %)
57 California towhee (CALT 2023)
GCF_028551555.1
28,823
(3.21 %)
n/a 12,791
(1.50 %)
26,511
(2.06 %)
n/a 44.24
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 627
(100.00 %)
473,712
(3.18 %)
586,987
(10.80 %)
4,965,312
(32.86 %)
0
(0 %)
794,819
(4.53 %)
48,369
(2.73 %)
24,095
(1.04 %)
58 Canada goose (SJ_97 2019)
GCA_006130075.1
n/a n/a 13,061
(1.95 %)
24,149
(2.23 %)
n/a 42.13
(98.37 %)
14,797
(1.64 %)
15,389
(1.64 %)
28,876
(98.36 %)
715,113
(7.61 %)
319,386
(1.67 %)
6,810,836
(21.27 %)
444
(0.03 %)
73,747
(0.48 %)
40,389
(4.15 %)
35,329
(2.42 %)
59 carmine bee-eater (2019)
GCA_009819595.1
n/a n/a 12,740
(1.82 %)
28,031
(2.77 %)
n/a 42.88
(99.47 %)
0
(0 %)
269
(0.53 %)
109
(100.00 %)
556,926
(7.87 %)
213,180
(1.09 %)
6,641,077
(21.58 %)
0
(0 %)
132,076
(1.14 %)
30,881
(2.41 %)
23,550
(1.23 %)
60 carmine bee-eater alternate hap pseudohaplotype 2019)
GCA_009819585.1
n/a n/a 12,381
(1.76 %)
28,865
(2.78 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,296
(100.00 %)
542,765
(7.77 %)
204,389
(1.06 %)
6,415,832
(21.53 %)
0
(0 %)
133,280
(1.22 %)
31,638
(2.54 %)
23,845
(1.27 %)
61 chaffinch (primary hap 2023)
GCA_963513975.1
n/a n/a 12,708
(1.72 %)
24,978
(2.26 %)
n/a 44.06
(99.99 %)
7
(0.00 %)
573
(0.01 %)
467
(100.00 %)
495,590
(3.15 %)
493,628
(13.34 %)
6,163,336
(28.37 %)
2
(0.00 %)
729,875
(4.06 %)
39,042
(6.25 %)
24,111
(1.21 %)
62 chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022)
GCA_027408205.1
n/a n/a 11,740
(2.36 %)
21,473
(2.56 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
2,263
(100.00 %)
551,116
(10.78 %)
241,638
(4.43 %)
4,973,260
(21.77 %)
0
(0 %)
285,039
(2.53 %)
21,151
(2.71 %)
18,001
(1.56 %)
63 chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022)
GCA_027408225.1
n/a n/a 13,037
(2.20 %)
23,550
(2.37 %)
n/a 42.31
(99.81 %)
0
(0 %)
460
(0.19 %)
252
(100.00 %)
681,166
(12.04 %)
381,093
(7.09 %)
5,610,806
(24.65 %)
3
(0.00 %)
489,064
(3.62 %)
25,664
(2.75 %)
21,023
(1.48 %)
64 chicken (GRCg6a 2018)
GCF_000002315.6
62,183
(8.40 %)
n/a 13,099
(2.32 %)
18,797
(2.76 %)
73,407
(9.29 %)
42.23
(99.08 %)
942
(0.92 %)
952
(0.92 %)
2,380
(99.08 %)
684,052
(12.74 %)
307,144
(2.92 %)
5,863,131
(21.16 %)
0
(0 %)
346,400
(2.34 %)
24,405
(2.72 %)
20,871
(1.54 %)
65 chicken (Huxu 2023)
GCA_024206055.2
n/a n/a 13,405
(2.26 %)
24,435
(2.45 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
41
(100.00 %)
704,190
(12.54 %)
502,701
(5.74 %)
5,731,097
(23.50 %)
0
(0 %)
573,152
(3.69 %)
27,781
(2.90 %)
22,282
(1.53 %)
66 chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022)
GCA_027408255.1
n/a n/a 11,339
(2.33 %)
20,588
(2.51 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,684
(100.00 %)
537,847
(10.84 %)
217,964
(3.81 %)
4,879,985
(21.43 %)
0
(0 %)
236,343
(2.20 %)
19,653
(2.66 %)
17,140
(1.52 %)
67 chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023)
GCA_027557775.1
n/a n/a 12,855
(2.22 %)
23,147
(2.37 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
566
(0.26 %)
246
(100.00 %)
672,973
(12.00 %)
342,156
(6.53 %)
5,690,712
(23.98 %)
5
(0.00 %)
438,910
(3.29 %)
24,413
(2.63 %)
20,581
(1.48 %)
68 chicken white leghorn layer X broiler (broiler haplotype 2021 v2 2021)
GCF_016699485.2
74,716
(9.14 %)
n/a 13,128
(2.33 %)
23,484
(2.48 %)
72,013
(9.34 %)
42.20
(99.68 %)
463
(0.32 %)
463
(0.32 %)
677
(99.68 %)
697,827
(12.53 %)
290,892
(2.63 %)
5,887,021
(21.30 %)
1
(0.00 %)
268,636
(2.17 %)
24,469
(2.59 %)
20,885
(1.55 %)
69 chicken white leghorn layer X broiler (leghorn haplotype v2 2021)
GCF_016700215.2
83,834
(10.16 %)
n/a 13,005
(2.32 %)
23,329
(2.48 %)
72,360
(9.39 %)
42.16
(99.57 %)
409
(0.43 %)
409
(0.43 %)
685
(99.57 %)
536,869
(6.00 %)
268,230
(2.28 %)
5,845,184
(20.93 %)
2
(0.00 %)
247,373
(2.08 %)
24,409
(2.60 %)
20,761
(1.55 %)
70 Chilean tinamou
GCF_003342845.1
24,894
(4.16 %)
n/a 12,545
(2.09 %)
18,167
(2.87 %)
n/a 42.04
(98.74 %)
0
(0 %)
1,226,739
(1.39 %)
2,217
(100.00 %)
496,518
(5.43 %)
290,573
(1.50 %)
5,870,743
(19.53 %)
591
(0.02 %)
54,224
(0.39 %)
44,640
(5.21 %)
41,581
(3.09 %)
71 chimney swift (M959 v1.1 2014)
GCF_000747805.2
15,969
(2.53 %)
n/a 12,045
(1.82 %)
18,580
(2.07 %)
n/a 41.40
(96.00 %)
65,471
(4.02 %)
65,471
(4.02 %)
84,174
(95.98 %)
469,979
(5.99 %)
194,781
(2.21 %)
6,361,618
(19.70 %)
135
(0.03 %)
104,662
(2.61 %)
12,438
(0.41 %)
8,502
(0.26 %)
72 chuck-will's-widow (BGI_N321 v2 2014)
GCF_000700745.2
17,193
(2.21 %)
n/a 12,092
(1.49 %)
28,685
(1.89 %)
n/a 40.76
(99.62 %)
56,333
(0.39 %)
56,333
(0.39 %)
125,214
(99.61 %)
516,189
(5.36 %)
202,882
(1.12 %)
6,588,198
(20.47 %)
4
(0.00 %)
63,719
(0.48 %)
8,029
(0.24 %)
6,615
(0.19 %)
73 collared flycatcher
GCF_000247815.1
28,360
(4.07 %)
n/a 12,200
(1.78 %)
14,028
(2.24 %)
33,113
(3.87 %)
44.22
(98.57 %)
9,415
(1.43 %)
11,403
(1.43 %)
30,843
(98.57 %)
559,053
(7.88 %)
597,207
(11.39 %)
6,656,400
(23.61 %)
632
(0.03 %)
1,129,694
(1.66 %)
29,879
(1.50 %)
22,107
(0.96 %)
74 common canary (domestic yellow sc_yellow_7_cibi 2019)
GCF_007115625.1
32,985
(4.99 %)
n/a 12,248
(1.89 %)
15,910
(2.38 %)
n/a 42.17
(98.21 %)
0
(0 %)
47,138
(1.81 %)
3,536
(100.00 %)
477,249
(6.30 %)
313,951
(2.10 %)
6,525,604
(19.58 %)
196
(0.01 %)
211,121
(1.94 %)
25,722
(1.90 %)
21,345
(1.21 %)
75 common canary (serCan28SL12 2022)
GCF_022539315.1
41,390
(5.57 %)
n/a 12,314
(1.93 %)
23,133
(2.37 %)
n/a 42.36
(99.95 %)
0
(0 %)
1,055
(0.05 %)
685
(100.00 %)
553,077
(10.89 %)
322,311
(2.75 %)
6,543,183
(20.47 %)
2
(0.00 %)
235,671
(1.53 %)
26,268
(2.31 %)
21,696
(1.31 %)
76 common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021)
GCA_017976305.1
n/a n/a 12,464
(1.91 %)
24,623
(2.50 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
505,582
(10.93 %)
292,484
(2.48 %)
6,061,828
(21.38 %)
0
(0 %)
303,976
(1.80 %)
24,010
(1.80 %)
19,613
(1.10 %)
77 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq)
GCF_017976375.1
50,206
(6.30 %)
n/a 13,190
(1.85 %)
24,284
(2.29 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
0
(0 %)
296
(0.42 %)
150
(100.00 %)
566,161
(11.56 %)
310,430
(2.36 %)
6,712,791
(21.76 %)
0
(0 %)
326,395
(1.83 %)
25,268
(1.73 %)
20,672
(1.05 %)
78 common mallard (Pekin duck 2017)
GCA_002743455.1
n/a n/a 12,871
(1.94 %)
25,038
(2.26 %)
n/a 41.42
(95.05 %)
202
(0.00 %)
25,623
(4.96 %)
21,442
(100.00 %)
760,634
(7.52 %)
360,866
(1.37 %)
6,710,465
(20.25 %)
265
(0.02 %)
45,616
(0.34 %)
32,823
(2.15 %)
27,194
(1.37 %)
79 common myna (bArcTri1 alternate hap 2023)
GCA_027559525.1
n/a n/a 10,692
(1.77 %)
20,925
(2.29 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,221
(100.00 %)
328,602
(4.16 %)
604,057
(8.02 %)
5,233,128
(25.06 %)
0
(0 %)
479,200
(3.38 %)
25,210
(3.70 %)
18,123
(1.22 %)
80 common myna (bArcTri1 primary hap 2023)
GCA_027559615.1
n/a n/a 12,560
(1.73 %)
23,740
(2.16 %)
n/a 42.32
(99.80 %)
0
(0 %)
435
(0.20 %)
455
(100.00 %)
395,254
(5.40 %)
937,774
(11.00 %)
6,145,808
(28.07 %)
2
(0.00 %)
825,681
(4.71 %)
32,293
(3.87 %)
21,576
(1.15 %)
81 common starling
GCF_001447265.1
28,711
(4.57 %)
n/a 12,585
(2.01 %)
17,785
(2.59 %)
n/a 41.49
(97.70 %)
20,305
(2.31 %)
23,392
(2.31 %)
22,666
(97.69 %)
427,543
(5.30 %)
310,445
(1.74 %)
6,482,337
(19.49 %)
590
(0.05 %)
102,603
(0.86 %)
23,883
(1.99 %)
19,986
(1.21 %)
82 common swift (bApuApu2 alternate hap 2021)
GCA_020740585.1
n/a n/a 11,653
(1.89 %)
19,731
(2.20 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
1,697
(100.00 %)
443,384
(6.09 %)
185,968
(1.18 %)
5,916,553
(20.88 %)
0
(0 %)
109,215
(0.89 %)
18,864
(1.75 %)
15,032
(0.87 %)
83 common swift (bApuApu2 primary hap 2021 refseq)
GCF_020740795.1
39,986
(4.95 %)
n/a 12,292
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
0
(0 %)
256
(0.16 %)
110
(100.00 %)
499,695
(6.70 %)
199,749
(1.12 %)
6,354,003
(21.19 %)
1
(0.00 %)
113,872
(0.91 %)
20,393
(1.74 %)
16,313
(0.88 %)
84 common tern (2019)
GCA_009819605.1
n/a n/a 13,103
(1.81 %)
24,044
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.16 %)
0
(0 %)
205
(0.84 %)
123
(100.00 %)
570,312
(7.91 %)
216,895
(1.04 %)
7,043,151
(20.98 %)
1
(0.00 %)
112,065
(1.02 %)
45,694
(3.73 %)
41,720
(2.13 %)
85 common tern (alternate hap 2019)
GCA_009819645.1
n/a n/a 12,773
(1.79 %)
24,751
(2.23 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,235
(100.00 %)
549,460
(7.58 %)
204,051
(1.02 %)
6,880,566
(20.70 %)
0
(0 %)
116,485
(1.17 %)
47,352
(3.95 %)
42,123
(2.18 %)
86 common yellowthroat (2019)
GCA_009764595.1
n/a n/a 11,741
(1.82 %)
22,382
(2.29 %)
n/a 42.01
(98.73 %)
0
(0 %)
1,479
(1.27 %)
278
(100.00 %)
476,049
(6.38 %)
367,108
(3.16 %)
6,576,957
(20.43 %)
0
(0 %)
333,263
(2.08 %)
25,004
(2.02 %)
20,494
(1.18 %)
87 common yellowthroat (alternate hap 2019)
GCA_009764545.1
n/a n/a 10,611
(1.77 %)
21,125
(2.21 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
4,976
(100.00 %)
422,889
(5.99 %)
294,928
(2.71 %)
5,928,421
(19.76 %)
0
(0 %)
245,763
(1.64 %)
21,397
(1.91 %)
17,659
(1.14 %)
88 crested ibis (BGI_Y956 2014)
GCF_000708225.1
17,134
(2.52 %)
n/a 12,801
(1.77 %)
14,062
(2.19 %)
n/a 41.83
(97.20 %)
70,475
(2.81 %)
70,475
(2.81 %)
130,030
(97.19 %)
395,055
(4.53 %)
182,744
(0.97 %)
7,244,849
(18.69 %)
41
(0.01 %)
32,623
(0.58 %)
39,156
(2.06 %)
34,170
(1.57 %)
89 cuckoo roller (BGI_N330 2014)
GCF_000691785.1
16,484
(2.21 %)
n/a 12,195
(1.53 %)
24,940
(1.96 %)
n/a 41.82
(99.74 %)
56,010
(0.27 %)
56,010
(0.27 %)
113,170
(99.73 %)
349,912
(4.65 %)
131,678
(0.66 %)
6,778,773
(18.46 %)
1
(0.00 %)
16,795
(0.12 %)
35,090
(1.44 %)
30,368
(1.17 %)
90 cuckoo roller (hap1 2023)
GCA_034619455.1
n/a n/a 13,157
(1.67 %)
30,413
(2.59 %)
n/a 43.53
(100.00 %)
18
(0.00 %)
290
(0.00 %)
353
(100.00 %)
609,076
(8.83 %)
331,584
(6.01 %)
5,966,458
(23.99 %)
1
(0.00 %)
520,291
(3.07 %)
45,694
(7.05 %)
36,809
(2.18 %)
91 cuckoo roller (hap2 2023)
GCA_034619465.1
n/a n/a 13,044
(1.66 %)
30,275
(2.65 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
17
(0.00 %)
271
(0.00 %)
295
(100.00 %)
603,184
(8.76 %)
324,082
(7.37 %)
6,147,876
(25.10 %)
0
(0 %)
633,504
(3.50 %)
44,051
(8.95 %)
36,565
(2.19 %)
92 Dalmatian pelican (alternate hap 2023)
GCA_030449815.1
n/a n/a 12,766
(1.68 %)
26,055
(2.18 %)
n/a 43.44
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,284
(100.00 %)
607,561
(13.23 %)
239,649
(4.41 %)
6,086,519
(23.21 %)
0
(0 %)
260,915
(1.93 %)
38,398
(5.49 %)
35,285
(2.09 %)
93 Dalmatian pelican (BGI_N334 2014)
GCF_000687375.1
16,438
(2.13 %)
n/a 11,927
(1.44 %)
25,409
(1.84 %)
n/a 41.39
(99.65 %)
57,580
(0.36 %)
57,580
(0.36 %)
121,562
(99.64 %)
394,453
(5.19 %)
159,315
(0.83 %)
6,832,864
(19.52 %)
3
(0.00 %)
42,891
(0.31 %)
25,648
(0.91 %)
22,079
(0.75 %)
94 Dalmatian pelican (primary hap 2023)
GCA_030463565.1
n/a n/a 13,457
(1.72 %)
25,299
(2.10 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
0
(0 %)
390
(0.01 %)
311
(100.00 %)
660,747
(14.47 %)
294,268
(5.22 %)
6,840,996
(24.63 %)
5
(0.00 %)
318,407
(2.04 %)
39,705
(5.14 %)
36,802
(1.98 %)
95 Downy woodpecker (alternate hap 2020)
GCA_014839825.1
n/a n/a 11,732
(1.74 %)
22,080
(2.25 %)
n/a 45.44
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,342
(100.00 %)
921,959
(20.95 %)
334,804
(3.26 %)
5,352,773
(31.27 %)
0
(0 %)
702,756
(4.12 %)
24,105
(1.81 %)
19,021
(1.21 %)
96 Downy woodpecker (primary hap 2020)
GCF_014839835.1
25,483
(3.24 %)
n/a 12,410
(1.70 %)
22,416
(2.11 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
0
(0 %)
187
(0.34 %)
180
(100.00 %)
1,259,627
(26.52 %)
378,533
(3.38 %)
5,846,661
(32.04 %)
0
(0 %)
791,075
(4.25 %)
26,005
(1.75 %)
19,919
(1.16 %)
97 East African grey crowned-crane
GCF_000709895.1
16,274
(2.23 %)
n/a 12,032
(1.55 %)
26,131
(1.84 %)
n/a 41.21
(99.65 %)
58,359
(0.36 %)
58,359
(0.36 %)
111,850
(99.64 %)
374,845
(4.51 %)
130,655
(0.66 %)
6,753,184
(18.86 %)
5
(0.00 %)
17,937
(0.17 %)
26,202
(0.96 %)
22,836
(0.79 %)
98 East African grey crowned-crane (alternate hap 2020)
GCA_011004865.1
n/a n/a 11,799
(1.88 %)
22,122
(2.30 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
971
(100.00 %)
457,930
(6.40 %)
150,544
(0.85 %)
6,074,490
(20.16 %)
0
(0 %)
65,996
(0.78 %)
33,323
(3.81 %)
32,972
(2.41 %)
99 East African grey crowned-crane (bBalReg1 2020)
GCA_011004875.1
n/a n/a 13,276
(1.84 %)
25,393
(2.30 %)
n/a 42.38
(99.61 %)
0
(0 %)
144
(0.39 %)
105
(100.00 %)
548,862
(7.06 %)
187,966
(0.97 %)
7,004,597
(21.19 %)
0
(0 %)
102,622
(1.00 %)
36,626
(3.69 %)
36,347
(2.31 %)
100 Eastern black-eared wheatear (GR-GAL-2019-014 2023)
GCF_029582105.1
38,171
(5.79 %)
n/a 12,559
(1.96 %)
23,642
(2.48 %)
n/a 42.01
(99.99 %)
0
(0 %)
582
(0.01 %)
587
(100.00 %)
599,051
(9.46 %)
453,954
(3.77 %)
6,287,657
(20.75 %)
0
(0 %)
382,912
(2.31 %)
27,831
(2.52 %)
21,991
(1.27 %)
101 emperor penguin
GCF_000699145.1
20,055
(3.28 %)
n/a 12,513
(1.77 %)
11,986
(2.13 %)
n/a 41.62
(94.30 %)
72,501
(5.72 %)
72,501
(5.72 %)
83,173
(94.28 %)
478,239
(5.68 %)
200,181
(2.24 %)
7,154,684
(17.95 %)
109
(0.03 %)
107,781
(2.12 %)
31,615
(1.38 %)
27,702
(1.11 %)
102 emu (2018)
GCF_003342905.1
36,047
(5.11 %)
n/a 12,857
(1.77 %)
17,727
(2.32 %)
n/a 41.63
(99.02 %)
0
(0 %)
1,408,082
(1.11 %)
2,778
(100.00 %)
440,224
(4.29 %)
175,539
(0.70 %)
7,218,815
(17.59 %)
289
(0.01 %)
22,204
(0.15 %)
43,752
(4.64 %)
41,501
(3.53 %)
103 emu (hap1 2024)
GCF_036370855.1
54,479
(5.65 %)
n/a 13,972
(1.59 %)
25,695
(1.97 %)
n/a 43.79
(100.00 %)
0
(0 %)
129
(0.00 %)
271
(100.00 %)
713,839
(12.11 %)
418,774
(7.08 %)
5,668,105
(24.04 %)
2
(0.00 %)
825,273
(5.02 %)
51,137
(7.32 %)
43,488
(2.92 %)
104 emu (hap2 2024)
GCA_036417515.1
n/a n/a 12,839
(1.57 %)
24,113
(1.98 %)
n/a 44.40
(100.00 %)
4
(0.00 %)
101
(0.00 %)
242
(100.00 %)
657,460
(14.23 %)
397,600
(8.84 %)
4,824,789
(26.94 %)
0
(0 %)
967,271
(6.15 %)
48,081
(7.49 %)
39,730
(2.99 %)
105 emu (v2 ZJU1.0 2023)
GCA_016128335.2
n/a n/a 13,213
(1.74 %)
24,562
(2.10 %)
n/a 42.41
(99.99 %)
0
(0 %)
539
(0.01 %)
767
(100.00 %)
567,285
(7.79 %)
258,030
(2.59 %)
7,108,005
(19.16 %)
9
(0.00 %)
314,931
(1.79 %)
41,752
(6.24 %)
41,181
(3.35 %)
106 Eurasian nightjar (alternate hap 2021)
GCA_907165095.1
n/a n/a 12,266
(1.90 %)
22,091
(2.30 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
0
(0 %)
25
(0.00 %)
2,502
(100.00 %)
458,278
(5.64 %)
212,205
(1.54 %)
6,032,224
(21.16 %)
0
(0 %)
151,625
(1.15 %)
21,942
(1.89 %)
19,235
(1.33 %)
107 Eurasian nightjar (primary hap 2021)
GCA_907165065.1
n/a n/a 13,040
(1.86 %)
22,823
(2.21 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
153
(0.00 %)
121
(100.00 %)
595,803
(8.38 %)
248,128
(1.78 %)
6,744,611
(22.18 %)
2
(0.00 %)
193,177
(1.31 %)
24,805
(1.90 %)
20,997
(1.31 %)
108 Eurasian tree sparrow
GCF_014805655.1
43,477
(5.70 %)
n/a 12,550
(1.95 %)
24,541
(2.43 %)
n/a 42.02
(99.82 %)
0
(0 %)
4,765
(0.18 %)
18,975
(100.00 %)
464,973
(6.08 %)
492,684
(3.98 %)
6,663,773
(20.49 %)
9
(0.00 %)
224,959
(2.45 %)
28,741
(2.30 %)
22,134
(1.26 %)
109 European golden plover (bPluApr1 primary hap 2021)
GCA_017639485.1
n/a n/a 12,984
(1.78 %)
22,854
(2.04 %)
n/a 42.70
(99.01 %)
0
(0 %)
268
(0.99 %)
107
(100.00 %)
558,587
(8.35 %)
180,400
(0.83 %)
7,132,381
(21.18 %)
0
(0 %)
102,461
(0.84 %)
40,661
(3.41 %)
37,600
(2.03 %)
110 European robin (alternate hap 2021)
GCA_903797565.2
n/a n/a 11,359
(1.98 %)
21,437
(2.45 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
0
(0 %)
18
(0.00 %)
3,668
(100.00 %)
346,477
(2.88 %)
283,542
(2.49 %)
5,597,130
(19.71 %)
0
(0 %)
200,268
(1.37 %)
22,977
(2.32 %)
18,454
(1.24 %)
111 European robin (primary hap 2021)
GCA_903797595.2
n/a n/a 12,344
(1.85 %)
23,934
(2.37 %)
n/a 42.10
(99.97 %)
0
(0 %)
990
(0.03 %)
1,119
(100.00 %)
532,973
(5.96 %)
401,820
(3.43 %)
6,320,210
(21.42 %)
0
(0 %)
338,954
(2.13 %)
30,391
(2.60 %)
21,664
(1.21 %)
112 European shag (alternate hap 2023)
GCA_949628205.1
n/a n/a 11,681
(1.64 %)
22,195
(2.04 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,752
(100.00 %)
363,092
(4.61 %)
347,630
(2.63 %)
5,664,392
(21.56 %)
0
(0 %)
227,084
(1.83 %)
32,162
(3.60 %)
24,702
(1.39 %)
113 European shag (primary hap 2023)
GCA_949628215.1
n/a n/a 13,203
(1.74 %)
22,959
(2.04 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
3
(0.00 %)
222
(0.00 %)
356
(100.00 %)
436,838
(4.84 %)
471,070
(3.20 %)
6,601,537
(22.79 %)
1
(0.00 %)
334,549
(2.25 %)
37,247
(3.95 %)
29,099
(1.42 %)
114 European turtle dove (v1.2 2021)
GCA_901699155.2
n/a n/a 12,391
(1.76 %)
23,333
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
0
(0 %)
940
(0.33 %)
311
(100.00 %)
550,895
(7.50 %)
227,532
(1.16 %)
6,767,530
(21.05 %)
4
(0.00 %)
181,526
(1.65 %)
34,682
(2.57 %)
30,656
(1.68 %)
115 European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021)
GCA_901699165.2
n/a n/a 11,276
(1.79 %)
21,210
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,334
(100.00 %)
426,785
(4.89 %)
182,446
(0.97 %)
6,038,491
(20.24 %)
0
(0 %)
110,767
(1.11 %)
29,692
(2.35 %)
26,119
(1.59 %)
116 Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021)
GCA_017639475.1
n/a n/a 11,836
(1.83 %)
21,119
(2.12 %)
n/a 42.78
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
1,147
(100.00 %)
443,887
(6.00 %)
149,233
(0.76 %)
6,328,128
(20.72 %)
0
(0 %)
76,306
(0.71 %)
37,413
(3.59 %)
34,823
(2.10 %)
117 garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020)
GCA_014839765.1
n/a n/a 12,359
(1.95 %)
23,228
(2.46 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 775
(100.00 %)
485,213
(6.08 %)
333,505
(2.21 %)
6,358,327
(19.87 %)
0
(0 %)
180,073
(1.19 %)
26,594
(2.34 %)
22,492
(1.32 %)
118 garden warbler (bSylBor1 primary hap 2020)
GCA_014839755.1
n/a n/a 12,520
(1.95 %)
23,459
(2.46 %)
n/a 42.08
(99.82 %)
0
(0 %)
134
(0.18 %)
176
(100.00 %)
491,810
(6.09 %)
376,746
(2.55 %)
6,461,292
(20.23 %)
0
(0 %)
225,297
(1.39 %)
27,799
(2.40 %)
23,088
(1.32 %)
119 golden eagle (v1.4 2021)
GCF_900496995.4
60,920
(5.98 %)
n/a 13,334
(1.84 %)
23,261
(2.12 %)
n/a 42.16
(99.58 %)
0
(0 %)
228
(0.42 %)
144
(100.00 %)
544,341
(5.93 %)
186,461
(0.80 %)
7,090,610
(20.01 %)
1
(0.00 %)
68,348
(0.66 %)
38,495
(3.10 %)
35,039
(1.94 %)
120 golden eagle (v1.4 alternate hap 2021)
GCA_902153765.2
n/a n/a 9,172
(1.85 %)
16,917
(2.12 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,855
(100.00 %)
377,153
(8.49 %)
117,959
(0.78 %)
4,418,970
(18.34 %)
0
(0 %)
37,962
(0.63 %)
27,767
(3.57 %)
25,543
(2.23 %)
121 golden pheasant
GCA_003413605.1
n/a n/a 12,891
(2.28 %)
21,429
(2.37 %)
n/a 40.87
(97.55 %)
51,170
(2.47 %)
51,170
(2.47 %)
65,464
(97.53 %)
541,931
(8.01 %)
249,405
(2.01 %)
6,173,989
(19.98 %)
21
(0.01 %)
102,705
(1.24 %)
22,227
(1.31 %)
19,552
(1.02 %)
122 golden-collared manakin
GCF_001715985.3
27,575
(4.33 %)
n/a 11,806
(1.85 %)
13,267
(2.32 %)
n/a 41.42
(97.44 %)
0
(0 %)
20,874
(2.57 %)
3,619
(100.00 %)
447,084
(7.00 %)
197,843
(1.19 %)
6,198,932
(18.50 %)
145
(0.01 %)
84,481
(0.69 %)
18,804
(1.03 %)
15,737
(0.74 %)
123 great cormorant (BGI_N336 2014)
GCF_000708925.1
15,472
(2.07 %)
n/a 11,547
(1.44 %)
22,727
(1.73 %)
n/a 41.28
(99.25 %)
98,475
(0.77 %)
98,475
(0.77 %)
162,787
(99.23 %)
324,530
(4.59 %)
144,409
(1.43 %)
6,724,538
(18.06 %)
2
(0.00 %)
41,541
(0.34 %)
14,330
(0.42 %)
12,388
(0.35 %)
124 great cormorant (primary hap 2024)
GCA_963921805.1
n/a n/a 13,434
(1.76 %)
30,619
(3.17 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
0
(0 %)
493
(0.01 %)
351
(100.00 %)
556,740
(10.18 %)
303,279
(3.45 %)
6,599,611
(22.65 %)
1
(0.00 %)
355,900
(2.29 %)
38,341
(5.45 %)
31,913
(1.57 %)
125 great cormorant (primary hap 2024)
GCF_963921805.1
46,253
(5.46 %)
n/a 13,432
(1.76 %)
23,419
(2.08 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
0
(0 %)
493
(0.01 %)
350
(100.00 %)
556,733
(10.18 %)
303,277
(3.45 %)
6,599,550
(22.65 %)
1
(0.00 %)
355,894
(2.29 %)
38,340
(5.45 %)
31,912
(1.57 %)
126 great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020)
GCA_013368595.1
n/a n/a 11,630
(1.85 %)
20,866
(2.20 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
1,395
(100.00 %)
421,187
(9.08 %)
159,172
(0.96 %)
5,602,689
(22.75 %)
0
(0 %)
169,408
(1.60 %)
29,548
(2.77 %)
25,299
(1.70 %)
127 great potoo (bNycGra1 primary hap 2020)
GCA_013368605.1
n/a n/a 13,116
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
0
(0 %)
243
(0.49 %)
191
(100.00 %)
514,142
(9.71 %)
210,381
(1.13 %)
6,501,989
(23.95 %)
0
(0 %)
244,232
(1.92 %)
35,785
(2.69 %)
29,281
(1.64 %)
128 great tit
GCF_001522545.3
46,201
(6.78 %)
n/a 12,250
(2.00 %)
16,577
(2.52 %)
n/a 41.37
(98.24 %)
22,369
(1.76 %)
24,615
(1.76 %)
24,044
(98.24 %)
447,566
(5.89 %)
249,384
(1.36 %)
6,330,291
(19.11 %)
759
(0.02 %)
82,711
(0.62 %)
23,876
(1.88 %)
20,619
(1.25 %)
129 greater honeyguide (239-I01 2023)
GCF_027791375.1
20,607
(2.63 %)
n/a 12,184
(1.76 %)
21,560
(2.12 %)
n/a 43.63
(100.00 %)
556
(0.00 %)
556
(0.00 %)
1,452
(100.00 %)
804,583
(12.49 %)
291,451
(3.14 %)
5,887,349
(28.34 %)
2
(0.00 %)
453,161
(2.56 %)
19,623
(1.55 %)
16,889
(1.11 %)
130 greater prairie chicken
GCA_001870855.1
n/a n/a 12,923
(2.36 %)
24,062
(2.50 %)
n/a 41.23
(99.63 %)
48,408
(0.39 %)
48,408
(0.39 %)
60,594
(99.61 %)
544,139
(7.50 %)
214,682
(0.99 %)
6,153,628
(19.86 %)
72
(0.00 %)
42,409
(0.26 %)
23,154
(2.26 %)
21,062
(1.67 %)
131 greater rhea
GCA_003343005.1
n/a n/a 12,895
(1.81 %)
20,976
(2.06 %)
n/a 40.79
(98.79 %)
0
(0 %)
2,075,293
(1.40 %)
2,162
(100.00 %)
509,589
(0.00 %)
196,258
(0.73 %)
6,982,184
(18.70 %)
270
(0.01 %)
33,188
(0.25 %)
41,811
(3.95 %)
39,225
(2.81 %)
132 greater sage-grouse
GCF_019232065.1
36,656
(5.50 %)
n/a 12,419
(2.36 %)
21,319
(2.40 %)
n/a 41.16
(96.34 %)
0
(0 %)
9,894
(3.66 %)
1,502
(100.00 %)
574,006
(8.05 %)
196,630
(0.72 %)
5,996,002
(19.65 %)
599
(0.05 %)
23,316
(0.20 %)
18,807
(1.81 %)
17,489
(1.38 %)
133 green peafowl
GCA_016647715.1
n/a n/a 12,897
(2.25 %)
23,427
(2.41 %)
n/a 41.73
(98.15 %)
0
(0 %)
32,668
(1.85 %)
2,446
(100.00 %)
481,865
(6.04 %)
188,685
(1.04 %)
6,268,032
(20.57 %)
209
(0.01 %)
107,708
(4.26 %)
22,330
(1.85 %)
20,111
(1.39 %)
134 grey parrot (MU2MI4XJKV 2020)
GCA_009867235.1
n/a n/a 13,159
(1.57 %)
41,528
(2.68 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
4,777
(0.03 %)
4,777
(0.03 %)
54,154
(99.97 %)
525,535
(7.07 %)
222,932
(1.16 %)
6,301,005
(19.38 %)
2,287
(0.05 %)
107,096
(0.57 %)
28,978
(2.14 %)
26,830
(1.66 %)
135 ground parrot (Strahan ANWC-B61680 2023)
GCF_028554395.1
41,746
(4.05 %)
n/a 13,173
(1.89 %)
24,269
(2.31 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,090
(100.00 %)
468,845
(6.23 %)
261,918
(2.42 %)
5,956,005
(21.98 %)
0
(0 %)
327,033
(1.83 %)
25,573
(1.77 %)
20,975
(1.31 %)
136 gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020)
GCA_015220155.1
n/a n/a 6,534
(1.74 %)
12,152
(1.97 %)
n/a 42.70
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,370
(100.00 %)
179,674
(3.19 %)
76,165
(0.79 %)
2,908,228
(16.85 %)
0
(0 %)
20,525
(0.41 %)
11,838
(2.15 %)
9,707
(1.04 %)
137 gyrfalcon (bFalRus1 primary hap 2020)
GCF_015220075.1
47,961
(5.90 %)
n/a 13,016
(1.82 %)
21,266
(2.02 %)
n/a 42.20
(99.55 %)
0
(0 %)
635
(0.45 %)
133
(100.00 %)
484,104
(5.60 %)
186,430
(0.85 %)
7,162,723
(18.83 %)
0
(0 %)
59,799
(0.59 %)
24,760
(2.03 %)
20,013
(0.97 %)
138 Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022)
GCA_026419925.1
n/a n/a 11,838
(1.64 %)
24,014
(2.16 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,969
(100.00 %)
405,109
(3.51 %)
220,222
(6.17 %)
4,708,177
(25.30 %)
0
(0 %)
436,752
(2.86 %)
58,446
(5.44 %)
28,571
(1.65 %)
139 Harpy eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_026419915.1
51,641
(5.08 %)
n/a 13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
0
(0 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
1
(0.00 %)
480,025
(2.70 %)
60,606
(5.66 %)
30,636
(1.52 %)
140 Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021)
GCA_020740675.1
n/a n/a 7,477
(1.92 %)
14,094
(2.40 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,762
(100.00 %)
296,732
(12.20 %)
135,408
(4.08 %)
3,123,655
(20.92 %)
0
(0 %)
142,659
(1.84 %)
23,288
(3.74 %)
13,506
(1.30 %)
141 Hawaiian crow (bCorHaw1 primary hap 2021 refseq)
GCF_020740725.1
51,593
(6.18 %)
n/a 12,739
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
0
(0 %)
294
(0.16 %)
188
(100.00 %)
409,129
(0.00 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,375
(23.59 %)
3
(0.00 %)
336,844
(2.41 %)
46,118
(3.85 %)
24,228
(1.26 %)
142 helmeted guineafowl
GCF_002078875.1
55,435
(7.96 %)
n/a 12,866
(2.29 %)
18,391
(2.68 %)
n/a 41.73
(98.08 %)
273
(0.00 %)
15,598
(1.93 %)
2,739
(100.00 %)
486,655
(7.97 %)
173,056
(0.98 %)
6,144,176
(20.18 %)
552
(0.06 %)
67,642
(0.52 %)
26,577
(2.39 %)
23,891
(1.68 %)
143 hoatzin (BGI_N306 2014)
GCF_000692075.1
14,928
(2.31 %)
n/a 11,454
(1.65 %)
11,717
(2.07 %)
n/a 42.42
(94.92 %)
99,371
(5.11 %)
99,371
(5.11 %)
109,627
(94.89 %)
360,821
(6.34 %)
145,440
(1.01 %)
6,679,356
(18.72 %)
80
(0.02 %)
75,782
(1.05 %)
40,581
(1.42 %)
34,631
(1.15 %)
144 hoatzin (hap1 2023)
GCA_030867145.1
n/a n/a 13,089
(1.50 %)
29,621
(2.22 %)
n/a 45.56
(100.00 %)
268
(0.00 %)
268
(0.00 %)
683
(100.00 %)
610,333
(22.07 %)
252,997
(12.56 %)
5,154,598
(31.67 %)
3
(0.00 %)
1,034,232
(5.77 %)
58,754
(5.54 %)
47,065
(2.35 %)
145 hoatzin (hap2 2023)
GCA_030867165.1
n/a n/a 12,349
(1.54 %)
27,206
(2.21 %)
n/a 45.91
(100.00 %)
212
(0.00 %)
212
(0.00 %)
535
(100.00 %)
529,757
(21.69 %)
235,999
(14.32 %)
4,845,810
(31.86 %)
0
(0 %)
1,017,817
(5.90 %)
53,781
(5.77 %)
44,601
(2.35 %)
146 hooded crow (v6 S_Up_H32 2022)
GCF_000738735.6
42,787
(6.57 %)
n/a 11,856
(1.93 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
0
(0 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
458,399
(8.32 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
0
(0 %)
77,475
(0.63 %)
25,266
(2.09 %)
20,747
(1.24 %)
147 house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022)
GCA_027406555.1
n/a n/a 12,027
(1.89 %)
23,973
(2.49 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
385,230
(3.05 %)
398,497
(5.70 %)
5,772,203
(22.69 %)
0
(0 %)
478,308
(3.12 %)
28,740
(2.98 %)
21,451
(1.28 %)
148 house finch (bHaeMex1 primary hap 2022 refseq)
GCF_027477595.1
43,228
(5.71 %)
n/a 12,702
(1.83 %)
24,568
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
0
(0 %)
296
(0.98 %)
184
(100.00 %)
440,384
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,138
(23.47 %)
1
(0.00 %)
573,830
(3.39 %)
30,897
(2.53 %)
22,852
(1.24 %)
149 house sparrow (hap1 2024)
GCA_036417665.1
n/a n/a 12,831
(1.61 %)
26,124
(2.26 %)
n/a 43.99
(100.00 %)
0
(0 %)
202
(0.00 %)
334
(100.00 %)
647,396
(12.37 %)
646,615
(14.14 %)
5,906,524
(30.36 %)
2
(0.00 %)
873,292
(5.23 %)
36,193
(2.91 %)
24,212
(1.05 %)
150 house sparrow (hap1 2024)
GCF_036417665.1
75,216
(7.36 %)
n/a 12,832
(1.61 %)
26,124
(2.26 %)
n/a 43.99
(100.00 %)
0
(0 %)
204
(0.00 %)
335
(100.00 %)
647,402
(12.37 %)
646,615
(14.14 %)
5,906,561
(30.36 %)
2
(0.00 %)
873,292
(5.23 %)
36,193
(2.91 %)
24,212
(1.05 %)
151 House sparrow (hap2 2024)
GCA_036417895.1
n/a n/a 12,201
(1.59 %)
24,721
(2.19 %)
n/a 44.46
(100.00 %)
0
(0 %)
182
(0.00 %)
482
(100.00 %)
629,688
(12.73 %)
644,409
(14.12 %)
5,103,050
(31.93 %)
0
(0 %)
899,607
(5.60 %)
33,424
(2.42 %)
23,096
(1.05 %)
152 Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022)
GCA_027474345.1
n/a n/a 11,806
(1.66 %)
21,429
(1.97 %)
n/a 43.73
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,343
(100.00 %)
508,803
(10.25 %)
162,918
(5.44 %)
6,029,969
(24.67 %)
0
(0 %)
224,585
(1.75 %)
27,953
(3.83 %)
24,431
(1.47 %)
153 Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022)
GCA_027474245.1
n/a n/a 13,233
(1.67 %)
23,010
(1.93 %)
n/a 43.91
(99.92 %)
0
(0 %)
253
(0.08 %)
136
(100.00 %)
610,144
(11.51 %)
214,393
(5.75 %)
6,069,916
(25.74 %)
1
(0.00 %)
314,812
(2.19 %)
33,172
(3.38 %)
26,788
(1.37 %)
154 hyacinth macaw (LEKZKR9XQ3 2022)
GCA_009936445.2
n/a n/a 12,424
(1.21 %)
43,440
(2.06 %)
n/a 41.86
(99.95 %)
1,098
(0.00 %)
1,098
(0.00 %)
260,829
(100.00 %)
497,886
(5.29 %)
184,967
(0.96 %)
6,167,538
(20.22 %)
44
(0.00 %)
n/a 33,529
(1.55 %)
29,190
(1.30 %)
155 jackdaw
GCA_013407035.1
n/a n/a 12,072
(1.93 %)
20,925
(2.08 %)
n/a 42.15
(99.72 %)
0
(0 %)
511
(0.28 %)
41
(100.00 %)
428,760
(6.13 %)
173,436
(1.02 %)
6,231,317
(19.25 %)
0
(0 %)
90,287
(0.72 %)
26,177
(2.17 %)
21,211
(1.28 %)
156 Japanese quail
GCF_001577835.2
49,210
(7.77 %)
n/a 12,864
(2.54 %)
22,540
(2.69 %)
37,604
(4.36 %)
41.28
(98.88 %)
7,630
(1.12 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
559,601
(7.91 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
628
(0.03 %)
160,342
(1.32 %)
17,977
(1.86 %)
15,897
(1.26 %)
157 kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023)
GCA_027595965.1
n/a n/a 8,732
(1.74 %)
16,473
(2.17 %)
n/a 45.10
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,819
(100.00 %)
314,902
(10.49 %)
133,061
(10.84 %)
3,656,435
(25.68 %)
0
(0 %)
519,192
(4.55 %)
32,592
(5.25 %)
26,472
(3.09 %)
158 kagu (bRhyJub1 primary hap 2023)
GCA_027574665.1
n/a n/a 13,042
(1.63 %)
24,142
(2.01 %)
n/a 45.07
(99.96 %)
0
(0 %)
300
(0.04 %)
148
(100.00 %)
563,851
(12.90 %)
270,861
(12.36 %)
6,191,106
(28.24 %)
2
(0.00 %)
905,468
(5.08 %)
54,426
(4.92 %)
40,156
(2.73 %)
159 kakapo (Jane alternate hap 2019)
GCA_004011185.1
n/a n/a 3,256
(1.65 %)
6,220
(1.98 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
3,728
(100.00 %)
127,817
(7.83 %)
53,447
(1.21 %)
1,502,789
(18.09 %)
0
(0 %)
44,014
(1.40 %)
5,487
(1.71 %)
4,787
(1.19 %)
160 kakapo (Jane v2 2020 refseq)
GCF_004027225.2
49,757
(5.76 %)
n/a 13,110
(1.92 %)
22,782
(2.26 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
0
(0 %)
373
(0.92 %)
89
(100.00 %)
507,148
(7.85 %)
208,178
(1.08 %)
6,258,087
(20.50 %)
0
(0 %)
165,530
(1.34 %)
22,278
(1.77 %)
19,230
(1.21 %)
161 kea
GCF_000696875.1
15,953
(2.35 %)
n/a 11,985
(1.66 %)
22,107
(2.01 %)
n/a 41.09
(99.60 %)
51,381
(0.42 %)
51,381
(0.42 %)
93,561
(99.58 %)
368,226
(5.60 %)
138,157
(0.75 %)
5,905,331
(18.06 %)
11
(0.00 %)
49,630
(0.40 %)
7,218
(0.22 %)
6,071
(0.18 %)
162 killdeer
GCF_000708025.1
16,480
(2.43 %)
n/a 12,356
(1.72 %)
12,853
(2.15 %)
n/a 41.88
(97.24 %)
63,995
(2.78 %)
63,995
(2.78 %)
79,162
(97.22 %)
424,095
(5.93 %)
167,406
(0.94 %)
7,070,701
(19.44 %)
47
(0.01 %)
53,430
(0.75 %)
37,082
(1.57 %)
31,772
(1.21 %)
163 king vulture (hap1 2024)
GCA_037962945.1
n/a n/a 13,641
(1.52 %)
24,293
(1.78 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
6
(0.00 %)
154
(0.00 %)
130
(100.00 %)
484,661
(3.34 %)
252,569
(16.01 %)
5,595,734
(32.51 %)
1
(0.00 %)
776,309
(4.15 %)
77,942
(3.59 %)
33,020
(1.50 %)
164 king vulture (hap2 2024)
GCA_037950955.1
n/a n/a 12,764
(1.49 %)
23,033
(1.77 %)
n/a 44.67
(100.00 %)
0
(0 %)
128
(0.00 %)
140
(100.00 %)
432,536
(3.01 %)
230,315
(20.91 %)
4,960,923
(35.56 %)
0
(0 %)
872,545
(4.75 %)
86,907
(3.76 %)
31,074
(1.47 %)
165 lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023)
GCA_028017155.1
n/a n/a 10,584
(1.75 %)
19,112
(2.09 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,892
(100.00 %)
363,564
(3.53 %)
235,220
(7.22 %)
5,072,834
(23.83 %)
0
(0 %)
224,788
(1.89 %)
24,909
(2.64 %)
22,061
(1.41 %)
166 lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023)
GCA_028022735.1
n/a n/a 13,529
(1.69 %)
23,672
(1.98 %)
n/a 43.50
(99.85 %)
0
(0 %)
259
(0.15 %)
232
(100.00 %)
491,653
(3.53 %)
349,011
(9.83 %)
5,955,030
(26.51 %)
5
(0.00 %)
404,016
(2.60 %)
32,237
(2.61 %)
27,504
(1.23 %)
167 lance-tailed manakin (2020)
GCF_009829145.1
46,366
(5.56 %)
n/a 12,594
(1.91 %)
22,763
(2.31 %)
26,057
(3.91 %)
41.97
(99.70 %)
0
(0 %)
206
(0.30 %)
93
(100.00 %)
485,121
(7.13 %)
247,189
(1.64 %)
6,498,294
(20.04 %)
0
(0 %)
149,431
(1.05 %)
25,377
(1.97 %)
21,424
(1.14 %)
168 lance-tailed manakin (alternate hap 2020)
GCA_009829205.1
n/a n/a 12,282
(1.85 %)
23,867
(2.36 %)
n/a 42.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,269
(100.00 %)
472,384
(7.01 %)
237,680
(1.65 %)
6,121,661
(19.48 %)
0
(0 %)
146,408
(1.08 %)
25,589
(2.05 %)
21,299
(1.17 %)
169 lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022)
GCA_023634305.1
n/a n/a 12,458
(1.70 %)
22,259
(2.05 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,090
(100.00 %)
413,301
(3.46 %)
189,449
(5.28 %)
5,962,597
(22.07 %)
0
(0 %)
384,018
(2.74 %)
31,611
(2.72 %)
19,364
(0.92 %)
170 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023638135.1
48,561
(5.70 %)
n/a 12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
0
(0 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
2
(0.00 %)
479,269
(2.67 %)
32,398
(2.65 %)
19,870
(0.89 %)
171 lesser black-backed gull (primary hap 2024)
GCA_963932225.1
n/a n/a 13,333
(1.68 %)
24,731
(2.05 %)
n/a 44.40
(99.99 %)
15
(0.00 %)
537
(0.01 %)
1,382
(100.00 %)
509,160
(5.11 %)
266,609
(9.64 %)
6,827,304
(27.15 %)
3
(0.00 %)
575,179
(3.19 %)
44,108
(6.34 %)
37,502
(1.70 %)
172 lesser kestrel (alternate hap 2021)
GCA_017639645.1
n/a n/a 12,578
(1.83 %)
22,257
(2.16 %)
n/a 42.51
(98.97 %)
0
(0 %)
258
(1.03 %)
551
(100.00 %)
431,717
(3.61 %)
201,876
(1.38 %)
6,620,060
(19.16 %)
0
(0 %)
121,154
(0.99 %)
27,552
(2.26 %)
21,049
(1.02 %)
173 lesser kestrel (v2 2021)
GCF_017639655.2
47,420
(5.64 %)
n/a 13,098
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
0
(0 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,499
(5.58 %)
210,234
(1.26 %)
7,133,934
(19.19 %)
1
(0.00 %)
132,967
(0.79 %)
27,558
(2.21 %)
21,862
(1.03 %)
174 lesser prairie-chicken (F22 2022)
GCF_026119805.1
51,352
(6.92 %)
n/a 12,689
(2.35 %)
22,377
(2.51 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
0
(0 %)
58
(0.00 %)
206
(100.00 %)
498,179
(5.36 %)
218,390
(1.80 %)
6,038,211
(20.76 %)
4
(0.00 %)
129,285
(1.09 %)
20,648
(2.33 %)
19,128
(1.58 %)
175 lesser rhea (206185 2018)
GCA_003342835.1
n/a n/a 13,105
(1.81 %)
25,654
(2.45 %)
n/a 40.86
(98.66 %)
0
(0 %)
1,039,616
(1.43 %)
3,019
(100.00 %)
522,333
(5.61 %)
208,867
(0.79 %)
7,080,214
(19.15 %)
351
(0.01 %)
36,716
(0.28 %)
42,016
(4.35 %)
39,294
(3.14 %)
176 lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023)
GCA_028389885.1
n/a n/a 10,465
(1.71 %)
19,083
(2.16 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 910
(100.00 %)
520,125
(6.78 %)
251,547
(4.21 %)
5,321,207
(21.53 %)
0
(0 %)
171,609
(1.68 %)
34,698
(5.69 %)
30,309
(2.73 %)
177 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028389875.1
39,024
(4.18 %)
n/a 13,360
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
0
(0 %)
128
(0.11 %)
180
(100.00 %)
674,149
(6.73 %)
329,124
(5.34 %)
6,820,245
(22.78 %)
1
(0.00 %)
266,226
(1.85 %)
45,073
(5.83 %)
38,575
(2.59 %)
178 little egret
GCF_000687185.1
25,843
(3.55 %)
n/a 12,162
(1.73 %)
10,954
(2.03 %)
n/a 42.25
(95.99 %)
88,871
(4.04 %)
88,871
(4.04 %)
100,662
(95.96 %)
490,997
(6.84 %)
165,380
(1.23 %)
6,955,585
(18.98 %)
112
(0.02 %)
74,371
(1.60 %)
31,136
(1.15 %)
26,032
(0.88 %)
179 long-tailed duck (primary hap 2024)
GCA_963989345.1
n/a n/a 13,329
(1.88 %)
23,888
(2.25 %)
n/a 42.30
(99.99 %)
0
(0 %)
544
(0.01 %)
272
(100.00 %)
784,647
(6.78 %)
501,860
(7.36 %)
6,388,957
(26.13 %)
53
(0.00 %)
600,275
(3.74 %)
34,028
(3.04 %)
29,568
(1.51 %)
180 long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022)
GCA_023637925.1
n/a n/a 12,264
(2.01 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 40.99
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 230
(100.00 %)
498,393
(5.07 %)
266,700
(1.49 %)
6,131,743
(20.45 %)
0
(0 %)
94,007
(0.79 %)
15,809
(1.43 %)
13,620
(0.94 %)
181 long-tailed hermit (PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1
n/a n/a 12,328
(2.02 %)
20,312
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
141
(0.37 %)
141
(0.37 %)
211
(99.63 %)
497,506
(5.06 %)
265,815
(1.51 %)
6,045,702
(20.10 %)
0
(0 %)
100,035
(0.84 %)
15,922
(1.43 %)
13,768
(0.94 %)
182 Macqueen's bustard (BGI_N324 2014)
GCF_000695195.1
15,790
(2.21 %)
n/a 11,632
(1.52 %)
24,790
(1.96 %)
n/a 41.10
(99.68 %)
56,130
(0.33 %)
56,130
(0.33 %)
115,823
(99.67 %)
391,856
(4.80 %)
148,075
(0.90 %)
6,682,530
(20.03 %)
5
(0.00 %)
28,454
(0.32 %)
27,675
(1.15 %)
24,593
(0.96 %)
183 Macqueen's bustard (maternal 2024)
GCA_036417535.1
n/a n/a 13,082
(1.73 %)
27,150
(2.44 %)
n/a 43.25
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
329
(100.00 %)
669,243
(14.71 %)
211,387
(6.69 %)
6,514,716
(27.07 %)
0
(0 %)
589,996
(3.41 %)
47,331
(8.09 %)
32,791
(2.71 %)
184 Macqueen's bustard (paternal 2024)
GCA_036418225.1
n/a n/a 11,814
(1.80 %)
23,161
(2.38 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
343
(100.00 %)
586,864
(13.28 %)
184,036
(5.91 %)
5,606,205
(25.25 %)
0
(0 %)
453,525
(2.87 %)
42,560
(7.71 %)
29,282
(2.77 %)
185 maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021)
GCA_017639665.1
n/a n/a 10,658
(1.74 %)
18,941
(1.98 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
4,278
(100.00 %)
326,479
(4.02 %)
141,715
(0.74 %)
5,600,372
(19.59 %)
0
(0 %)
41,184
(0.48 %)
27,330
(3.35 %)
26,330
(2.05 %)
186 maguari stork (bCicMag1 primary hap 2021)
GCA_017639555.1
n/a n/a 12,905
(1.81 %)
22,204
(2.01 %)
n/a 42.12
(98.21 %)
0
(0 %)
232
(1.79 %)
153
(100.00 %)
485,318
(6.35 %)
184,992
(0.78 %)
7,064,965
(19.56 %)
0
(0 %)
58,168
(0.52 %)
31,653
(3.02 %)
31,174
(1.88 %)
187 mallard CAU_Wild1.0
GCA_008746955.1
n/a n/a 13,260
(1.85 %)
25,071
(2.17 %)
n/a 42.41
(99.90 %)
0
(0 %)
318
(0.10 %)
1,665
(100.00 %)
849,782
(8.18 %)
438,622
(5.10 %)
6,729,782
(25.03 %)
1
(0.00 %)
510,566
(3.07 %)
34,670
(3.03 %)
27,835
(1.39 %)
188 mallard PBH1.5
GCF_003850225.1
54,114
(7.47 %)
n/a 12,199
(1.86 %)
15,363
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.77 %)
0
(0 %)
71,703
(0.26 %)
2,150
(100.00 %)
770,322
(8.16 %)
357,617
(3.09 %)
6,587,406
(21.92 %)
10,779
(0.50 %)
178,434
(3.20 %)
29,913
(2.33 %)
25,669
(1.40 %)
189 mallard ZJU1.0
GCF_015476345.1
59,854
(7.33 %)
n/a 12,988
(1.87 %)
23,709
(2.20 %)
86,787
(8.80 %)
42.27
(99.64 %)
0
(0 %)
905
(0.36 %)
756
(100.00 %)
803,558
(8.04 %)
417,575
(5.02 %)
6,627,843
(24.59 %)
5
(0.00 %)
487,092
(3.05 %)
35,030
(3.06 %)
27,683
(1.41 %)
190 Mariana crow
GCF_017639235.1
48,460
(7.00 %)
n/a 12,506
(1.97 %)
22,580
(2.35 %)
n/a 42.14
(98.94 %)
0
(0 %)
10,579
(1.06 %)
1,443
(100.00 %)
434,280
(5.91 %)
169,629
(0.82 %)
6,323,058
(18.94 %)
1,090
(0.02 %)
53,595
(0.38 %)
27,390
(2.04 %)
22,460
(1.27 %)
191 Mauritius kestrel (alternate hap 2023)
GCA_963210275.1
n/a n/a 4,774
(1.89 %)
8,695
(2.32 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,259
(100.00 %)
135,092
(3.67 %)
112,042
(8.63 %)
1,739,144
(22.50 %)
0
(0 %)
103,391
(2.09 %)
12,908
(3.26 %)
7,476
(1.06 %)
192 Mauritius kestrel (primary hap 2023)
GCA_963210335.1
n/a n/a 13,064
(1.72 %)
22,269
(1.98 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
0
(0 %)
407
(0.01 %)
316
(100.00 %)
459,578
(3.87 %)
315,686
(6.19 %)
6,650,507
(22.84 %)
0
(0 %)
244,086
(1.64 %)
36,076
(2.82 %)
21,430
(0.96 %)
193 Mauritius parakeet (alternate hap 2023)
GCA_963243765.1
n/a n/a 8,873
(1.81 %)
16,175
(2.24 %)
n/a 42.92
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,130
(100.00 %)
331,293
(6.89 %)
161,393
(5.94 %)
3,516,196
(24.86 %)
0
(0 %)
323,514
(3.25 %)
16,659
(1.74 %)
13,876
(1.32 %)
194 Mauritius parakeet (primary hap 2023)
GCA_963264785.1
n/a n/a 13,133
(1.81 %)
23,396
(2.19 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
358
(0.01 %)
172
(100.00 %)
511,156
(7.05 %)
238,915
(5.05 %)
5,764,523
(25.19 %)
2
(0.00 %)
442,454
(2.96 %)
24,675
(1.70 %)
20,376
(1.26 %)
195 medium ground-finch
GCF_000277835.1
22,226
(4.24 %)
n/a 11,887
(1.83 %)
11,438
(2.19 %)
n/a 41.61
(97.77 %)
68,589
(2.25 %)
68,589
(2.25 %)
95,828
(97.75 %)
433,244
(5.91 %)
322,831
(2.24 %)
6,548,136
(19.49 %)
32
(0.01 %)
113,187
(1.09 %)
18,135
(0.69 %)
13,605
(0.48 %)
196 monk parakeet
GCA_017639245.1
n/a n/a 13,067
(1.85 %)
n/a n/a 42.29
(99.99 %)
0
(0 %)
352
(0.01 %)
291
(100.00 %)
582,436
(9.49 %)
253,709
(2.79 %)
5,820,920
(22.52 %)
1
(0.00 %)
272,189
(1.90 %)
23,101
(1.75 %)
20,766
(1.33 %)
197 Montezuma quail (F1298 2024)
GCF_038088225.1
28,327
(3.95 %)
n/a 12,793
(2.29 %)
22,305
(2.47 %)
n/a 41.36
(100.00 %)
234
(0.00 %)
234
(0.00 %)
521
(100.00 %)
458,084
(6.03 %)
243,493
(3.14 %)
5,553,010
(22.13 %)
2
(0.00 %)
287,030
(2.36 %)
22,147
(2.41 %)
18,738
(1.51 %)
198 mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021)
GCA_009769485.2
n/a n/a 10,145
(1.98 %)
18,617
(2.30 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
14
(0.00 %)
14
(0.00 %)
5,640
(100.00 %)
533,330
(9.11 %)
213,518
(1.29 %)
4,813,886
(20.16 %)
0
(0 %)
52,896
(0.73 %)
25,667
(3.86 %)
24,229
(2.21 %)
199 mute swan (bCygOlo1 v2 primary hap 2021)
GCF_009769625.2
59,524
(6.76 %)
n/a 12,983
(1.98 %)
22,400
(2.22 %)
33,839
(5.17 %)
41.92
(99.13 %)
0
(0 %)
451
(0.87 %)
171
(100.00 %)
700,051
(7.55 %)
301,579
(1.34 %)
6,791,838
(21.30 %)
1
(0.00 %)
78,712
(0.74 %)
31,278
(3.07 %)
30,009
(2.01 %)
200 Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023)
GCA_027579665.1
n/a n/a 11,687
(1.78 %)
24,169
(2.43 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,834
(100.00 %)
414,780
(3.26 %)
491,012
(10.03 %)
5,570,475
(26.24 %)
0
(0 %)
495,689
(3.67 %)
29,485
(4.55 %)
21,361
(1.22 %)
201 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579445.1
31,033
(4.42 %)
n/a 12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
0
(0 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
5
(0.00 %)
478,923
(3.35 %)
31,693
(3.88 %)
22,817
(1.16 %)
202 New Caledonian crow (2019)
GCF_009650955.1
50,821
(6.95 %)
n/a 12,747
(1.94 %)
23,372
(2.37 %)
30,299
(3.60 %)
42.57
(97.41 %)
0
(0 %)
289
(2.59 %)
105
(100.00 %)
452,690
(6.21 %)
231,546
(1.70 %)
6,265,995
(19.54 %)
0
(0 %)
191,789
(1.34 %)
31,909
(2.48 %)
24,362
(1.33 %)
203 New Caledonian crow (alternate hap 2019)
GCA_009651025.1
n/a n/a 11,097
(1.99 %)
20,436
(2.45 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 894
(100.00 %)
377,050
(6.03 %)
178,064
(1.53 %)
5,305,126
(19.49 %)
0
(0 %)
132,677
(1.13 %)
26,107
(2.52 %)
20,600
(1.37 %)
204 Nicobar pigeon (hap1 2024 genbank)
GCA_036013445.1
n/a n/a 13,359
(1.72 %)
24,921
(2.13 %)
n/a 44.64
(100.00 %)
0
(0 %)
117
(0.00 %)
807
(100.00 %)
705,078
(18.28 %)
342,299
(9.55 %)
6,410,095
(28.06 %)
0
(0 %)
778,929
(4.34 %)
38,589
(9.40 %)
31,814
(1.47 %)
205 Nicobar pigeon (hap1 2024 refseq)
GCF_036013445.1
34,506
(4.09 %)
n/a 13,358
(1.72 %)
24,851
(2.13 %)
n/a 44.64
(100.00 %)
0
(0 %)
117
(0.00 %)
806
(100.00 %)
705,074
(18.28 %)
342,297
(9.55 %)
6,410,054
(28.06 %)
0
(0 %)
778,929
(4.34 %)
38,589
(9.40 %)
31,815
(1.47 %)
206 Nicobar pigeon (hap2 2024)
GCA_036010745.1
n/a n/a 13,270
(1.84 %)
24,753
(2.28 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
118
(0.00 %)
226
(100.00 %)
675,092
(12.72 %)
313,111
(3.64 %)
6,547,843
(23.22 %)
1
(0.00 %)
382,235
(2.71 %)
37,728
(3.88 %)
31,602
(1.56 %)
207 night parrot (Australia 2023)
GCF_034315485.1
48,921
(5.26 %)
n/a 12,986
(1.89 %)
22,892
(2.24 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
3,593
(100.00 %)
487,881
(6.13 %)
259,865
(3.37 %)
5,961,641
(22.88 %)
0
(0 %)
361,836
(1.95 %)
24,673
(1.77 %)
20,231
(1.29 %)
208 North Island brown kiwi (hap1 2024)
GCA_036417845.1
n/a n/a 13,670
(1.52 %)
33,383
(2.64 %)
n/a 44.01
(100.00 %)
0
(0 %)
170
(0.00 %)
409
(100.00 %)
713,271
(8.42 %)
603,937
(6.25 %)
5,379,113
(27.65 %)
1
(0.00 %)
501,455
(3.32 %)
50,913
(9.74 %)
40,971
(3.07 %)
209 North Island brown kiwi (hap2 2024)
GCA_036417975.1
n/a n/a 13,664
(1.44 %)
37,696
(2.80 %)
n/a 44.42
(100.00 %)
0
(0 %)
155
(0.00 %)
349
(100.00 %)
760,455
(8.84 %)
626,528
(6.85 %)
5,029,822
(30.45 %)
1
(0.00 %)
604,936
(3.67 %)
54,278
(9.43 %)
41,382
(3.03 %)
210 northern bobwhite
GCA_008692595.2
n/a n/a 12,584
(2.37 %)
22,327
(2.53 %)
n/a 41.41
(99.04 %)
33,134
(0.97 %)
33,134
(0.97 %)
39,169
(99.03 %)
460,369
(4.63 %)
213,800
(1.34 %)
5,813,961
(19.54 %)
3,119
(0.09 %)
78,915
(0.74 %)
22,156
(2.37 %)
19,264
(1.49 %)
211 northern fulmar
GCF_000690835.1
16,383
(2.20 %)
n/a 11,965
(1.51 %)
24,294
(1.87 %)
n/a 41.17
(99.50 %)
54,825
(0.51 %)
54,825
(0.51 %)
112,214
(99.49 %)
330,541
(3.74 %)
146,735
(0.83 %)
6,838,937
(18.42 %)
8
(0.00 %)
20,338
(0.20 %)
24,859
(0.79 %)
21,301
(0.66 %)
212 northern gannet (hap1 2023)
GCA_031468805.1
n/a n/a 13,367
(1.65 %)
24,403
(2.00 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
263
(0.00 %)
829
(100.00 %)
498,574
(4.51 %)
273,984
(5.20 %)
5,544,122
(27.29 %)
25
(0.00 %)
496,388
(3.06 %)
34,879
(3.83 %)
24,416
(1.00 %)
213 northern gannet (hap2 2023)
GCA_031468815.1
n/a n/a 13,477
(1.77 %)
23,613
(2.08 %)
n/a 42.44
(100.00 %)
6
(0.00 %)
248
(0.00 %)
427
(100.00 %)
474,930
(4.45 %)
237,604
(2.75 %)
5,847,260
(21.07 %)
30
(0.00 %)
226,420
(1.83 %)
30,873
(3.03 %)
26,071
(1.23 %)
214 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v1 2022 refseq)
GCF_929443795.1
50,663
(4.74 %)
n/a 13,528
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
183
(0.00 %)
454
(100.00 %)
521,768
(3.86 %)
325,987
(9.82 %)
5,542,269
(27.30 %)
4
(0.00 %)
458,030
(3.08 %)
43,070
(4.44 %)
32,753
(1.47 %)
215 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v2 2022 genbank)
GCA_929443795.2
n/a n/a 13,527
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
183
(0.00 %)
455
(100.00 %)
511,000
(3.76 %)
325,992
(9.82 %)
5,542,342
(27.30 %)
4
(0.00 %)
458,026
(3.08 %)
43,070
(4.44 %)
32,753
(1.47 %)
216 northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022)
GCA_929447715.1
n/a n/a 12,115
(1.73 %)
22,764
(2.15 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
4,484
(100.00 %)
417,395
(3.68 %)
231,908
(7.24 %)
5,424,533
(24.05 %)
0
(0 %)
253,718
(2.12 %)
35,691
(4.26 %)
29,357
(1.67 %)
217 northern pintail (primary hap 2024)
GCA_963932015.1
n/a n/a 13,218
(1.88 %)
23,888
(2.27 %)
n/a 42.56
(99.99 %)
0
(0 %)
631
(0.01 %)
395
(100.00 %)
734,763
(5.74 %)
422,947
(7.08 %)
6,491,165
(25.88 %)
10
(0.00 %)
474,751
(3.08 %)
34,601
(2.98 %)
28,080
(1.42 %)
218 Obi paradise-crow (lycPyr6 2020)
GCA_014706295.1
n/a n/a 12,592
(1.89 %)
24,002
(2.35 %)
n/a 42.94
(99.48 %)
0
(0 %)
1,602
(0.52 %)
1,695
(100.00 %)
466,546
(6.40 %)
235,283
(1.98 %)
6,371,421
(20.17 %)
15
(0.01 %)
202,970
(1.78 %)
34,247
(3.02 %)
26,600
(1.39 %)
219 Okarito brown kiwi
GCF_003343035.1
43,838
(4.59 %)
n/a 13,232
(1.76 %)
18,641
(2.35 %)
n/a 41.52
(98.49 %)
0
(0 %)
696,987
(1.57 %)
4,120
(100.00 %)
482,272
(4.98 %)
178,540
(0.70 %)
7,407,982
(18.33 %)
311
(0.01 %)
26,294
(0.18 %)
43,081
(4.88 %)
40,596
(3.66 %)
220 Oriental scops-owl (oso-nibr-517 2020)
GCA_010365825.1
n/a n/a 12,953
(1.76 %)
25,275
(2.07 %)
24,636
(2.89 %)
41.70
(98.42 %)
42,691
(1.58 %)
42,691
(1.58 %)
151,517
(98.42 %)
494,677
(6.28 %)
222,654
(1.07 %)
7,211,171
(19.25 %)
79
(0.00 %)
63,569
(0.39 %)
41,048
(2.24 %)
31,487
(1.49 %)
221 peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022)
GCA_023634185.1
n/a n/a 12,529
(1.75 %)
24,654
(2.25 %)
n/a 42.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,745
(100.00 %)
517,204
(7.95 %)
218,606
(4.15 %)
6,216,533
(21.16 %)
0
(0 %)
237,835
(2.15 %)
26,313
(2.41 %)
19,163
(0.91 %)
222 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634155.1
49,100
(5.64 %)
n/a 13,021
(1.66 %)
21,794
(1.95 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
0
(0 %)
241
(0.31 %)
125
(100.00 %)
586,320
(11.83 %)
335,218
(8.05 %)
7,038,851
(24.65 %)
0
(0 %)
405,474
(2.46 %)
26,085
(2.25 %)
20,023
(0.87 %)
223 peregrine falcon (BGI 2013)
GCF_000337955.1
37,506
(5.42 %)
n/a 12,670
(1.80 %)
11,311
(2.11 %)
n/a 41.77
(98.44 %)
76,060
(1.58 %)
76,069
(1.58 %)
83,081
(98.42 %)
437,234
(5.32 %)
170,160
(0.93 %)
7,157,857
(18.38 %)
6
(0.00 %)
32,904
(0.44 %)
22,325
(0.89 %)
17,778
(0.64 %)
224 pin-tailed whydah (BioBank_ID:100142 2022)
GCF_024509145.1
41,770
(4.95 %)
n/a 12,712
(1.86 %)
24,157
(2.37 %)
n/a 42.69
(100.00 %)
338
(0.00 %)
338
(0.00 %)
484
(100.00 %)
641,523
(14.11 %)
414,142
(6.03 %)
6,230,412
(23.70 %)
3
(0.00 %)
424,462
(3.05 %)
49,402
(3.94 %)
24,827
(1.35 %)
225 pink pigeon (alternate hap 2023)
GCA_963082445.1
n/a n/a 10,425
(1.96 %)
20,219
(2.49 %)
n/a 42.52
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,277
(100.00 %)
344,711
(4.99 %)
225,902
(3.41 %)
4,563,425
(21.61 %)
0
(0 %)
303,874
(2.37 %)
28,391
(3.74 %)
24,938
(2.03 %)
226 pink pigeon (primary hap 2023)
GCA_963082525.1
n/a n/a 13,140
(1.85 %)
25,111
(2.31 %)
n/a 42.27
(99.99 %)
0
(0 %)
509
(0.01 %)
143
(100.00 %)
488,313
(5.48 %)
331,962
(3.50 %)
6,243,204
(22.87 %)
0
(0 %)
441,492
(2.54 %)
36,343
(3.63 %)
31,102
(1.89 %)
227 plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021)
GCA_020745805.1
n/a n/a 11,774
(1.90 %)
20,857
(2.20 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
749
(100.00 %)
356,053
(4.37 %)
157,695
(0.93 %)
5,995,637
(19.60 %)
0
(0 %)
70,223
(0.74 %)
30,478
(4.03 %)
30,200
(2.16 %)
228 plumbeous ibis (bTheCae1 primary hap 2021)
GCA_020745775.1
n/a n/a 13,028
(1.84 %)
22,722
(2.10 %)
n/a 42.37
(99.81 %)
0
(0 %)
104
(0.19 %)
88
(100.00 %)
488,030
(6.66 %)
188,606
(1.01 %)
6,982,793
(20.08 %)
0
(0 %)
89,388
(0.77 %)
32,920
(3.37 %)
32,773
(1.95 %)
229 Puerto Rican parrot (LU 182127 2020)
GCA_000332375.2
n/a n/a 12,000
(1.69 %)
22,393
(2.01 %)
n/a 41.66
(74.61 %)
137,572
(25.41 %)
137,572
(25.41 %)
200,284
(74.59 %)
536,198
(8.55 %)
200,698
(0.96 %)
5,147,882
(14.30 %)
1,355
(0.24 %)
127,559
(0.77 %)
14,572
(0.41 %)
12,696
(0.35 %)
230 razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658365.1
n/a n/a 12,787
(1.83 %)
22,839
(2.13 %)
n/a 42.67
(99.70 %)
0
(0 %)
227
(0.30 %)
95
(100.00 %)
543,517
(7.16 %)
212,546
(1.12 %)
6,930,708
(20.10 %)
0
(0 %)
103,901
(0.79 %)
38,960
(3.02 %)
35,213
(1.80 %)
231 razorbill (alternate hap 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658355.1
n/a n/a 12,937
(1.75 %)
24,253
(2.09 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,309
(100.00 %)
562,549
(7.14 %)
210,852
(1.04 %)
7,264,995
(20.26 %)
0
(0 %)
100,265
(0.74 %)
40,926
(2.91 %)
36,166
(1.76 %)
232 red-backed fairy wren (Western Australia 2023)
GCF_030028575.1
29,027
(5.08 %)
n/a 12,371
(2.00 %)
24,297
(2.42 %)
n/a 41.70
(96.94 %)
0
(0 %)
3,337,637
(3.40 %)
10,634
(100.00 %)
349,349
(2.76 %)
398,866
(2.71 %)
6,299,092
(18.40 %)
577
(0.03 %)
174,938
(1.04 %)
27,078
(2.11 %)
22,887
(1.40 %)
233 red-crested turaco (2019)
GCA_009769465.1
n/a n/a 12,744
(1.75 %)
25,706
(2.29 %)
n/a 42.60
(97.89 %)
0
(0 %)
344
(2.11 %)
140
(100.00 %)
551,885
(8.95 %)
176,530
(0.80 %)
6,805,042
(22.19 %)
0
(0 %)
138,426
(1.12 %)
43,051
(3.40 %)
34,997
(2.03 %)
234 red-crested turaco (alternate hap 2019)
GCA_009764505.1
n/a n/a 11,247
(1.70 %)
23,705
(2.27 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,476
(100.00 %)
482,817
(8.51 %)
153,169
(0.81 %)
5,919,109
(21.87 %)
0
(0 %)
121,371
(1.16 %)
39,766
(3.41 %)
32,044
(2.04 %)
235 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020)
GCA_015220175.1
n/a n/a 11,434
(1.65 %)
21,710
(2.11 %)
n/a 46.12
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
2,748
(100.00 %)
859,899
(15.52 %)
319,622
(3.85 %)
5,367,970
(34.63 %)
0
(0 %)
960,530
(5.66 %)
23,381
(1.81 %)
19,537
(1.27 %)
236 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 primary hap 2020)
GCA_015220805.1
n/a n/a 12,345
(1.60 %)
23,206
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
0
(0 %)
307
(0.47 %)
253
(100.00 %)
1,082,064
(22.90 %)
378,866
(4.28 %)
6,003,548
(35.88 %)
0
(0 %)
1,148,448
(6.01 %)
26,519
(1.76 %)
21,399
(1.21 %)
237 Red-fronted tinkerbird (bPogPus1 primary hap 2020)
GCF_015220805.1
44,843
(4.51 %)
n/a 12,341
(1.60 %)
23,205
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
0
(0 %)
307
(0.47 %)
252
(100.00 %)
981,758
(15.82 %)
378,855
(4.28 %)
6,003,474
(35.88 %)
0
(0 %)
1,148,439
(6.01 %)
26,519
(1.76 %)
21,399
(1.21 %)
238 red-legged partridge
GCA_019345075.1
n/a n/a 12,441
(2.23 %)
20,933
(2.29 %)
n/a 41.44
(96.96 %)
18,534
(3.05 %)
18,534
(3.05 %)
29,132
(96.95 %)
543,702
(6.02 %)
222,583
(0.97 %)
5,978,744
(20.17 %)
1,104
(0.06 %)
43,686
(0.36 %)
19,970
(0.97 %)
17,237
(0.77 %)
239 red-legged seriema (2019)
GCA_009819825.1
n/a n/a 13,229
(1.84 %)
25,580
(2.35 %)
n/a 42.20
(99.59 %)
0
(0 %)
194
(0.41 %)
110
(100.00 %)
483,784
(6.50 %)
160,481
(0.73 %)
6,960,060
(19.71 %)
0
(0 %)
64,843
(0.56 %)
32,899
(2.77 %)
30,208
(1.91 %)
240 red-legged seriema (alternate hap 2019)
GCA_009819485.1
n/a n/a 10,131
(1.78 %)
19,775
(2.21 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,840
(100.00 %)
366,591
(6.01 %)
117,928
(0.90 %)
5,340,048
(18.90 %)
0
(0 %)
66,176
(0.68 %)
26,293
(2.86 %)
24,338
(1.93 %)
241 red-throated loon (BGI_N328 2014)
GCF_000690875.1
15,829
(2.14 %)
n/a 11,589
(1.46 %)
22,840
(1.76 %)
n/a 41.12
(99.40 %)
64,882
(0.61 %)
64,882
(0.61 %)
126,713
(99.39 %)
293,224
(3.50 %)
123,593
(0.80 %)
6,849,573
(18.22 %)
5
(0.00 %)
24,295
(0.23 %)
17,100
(0.51 %)
14,526
(0.42 %)
242 red-throated loon (hap1 2023)
GCA_030936125.1
n/a n/a 13,357
(1.64 %)
29,603
(2.35 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
260
(0.00 %)
260
(0.00 %)
3,225
(100.00 %)
549,694
(8.44 %)
246,171
(10.46 %)
5,258,356
(27.36 %)
2
(0.00 %)
671,693
(3.75 %)
39,810
(3.37 %)
34,456
(1.67 %)
243 red-throated loon (hap2 2023 refseq)
GCF_030936135.1
25,173
(3.02 %)
n/a 13,216
(1.71 %)
24,050
(2.10 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
1,185
(100.00 %)
544,422
(8.81 %)
223,672
(5.77 %)
6,669,433
(23.63 %)
3
(0.00 %)
398,584
(2.64 %)
38,305
(3.37 %)
35,068
(1.78 %)
244 red-winged blackbird (BioBank_ID:100140 2023)
GCF_020745825.1
29,994
(3.93 %)
n/a 12,687
(1.75 %)
25,287
(2.30 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
106
(0.00 %)
106
(0.00 %)
516
(100.00 %)
785,960
(17.62 %)
522,256
(9.27 %)
6,371,580
(25.40 %)
0
(0 %)
496,798
(2.87 %)
32,643
(2.66 %)
23,497
(1.27 %)
245 rhinoceros hornbill
GCF_000710305.1
15,595
(2.24 %)
n/a 11,495
(1.55 %)
25,766
(1.88 %)
n/a 42.65
(98.44 %)
118,543
(1.60 %)
118,543
(1.60 %)
180,800
(98.40 %)
271,331
(3.93 %)
134,645
(1.25 %)
6,383,631
(17.75 %)
31
(0.00 %)
43,210
(0.62 %)
24,531
(0.79 %)
18,987
(0.58 %)
246 rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021)
GCA_016880875.1
n/a n/a 9,867
(1.89 %)
19,635
(2.52 %)
n/a 42.54
(100.00 %)
0
(0 %)
20
(0.00 %)
2,879
(100.00 %)
394,769
(10.00 %)
186,556
(1.91 %)
4,428,687
(19.09 %)
0
(0 %)
192,997
(1.66 %)
15,730
(1.88 %)
12,474
(0.91 %)
247 rifleman (bAcaChl1 primary hap 2021)
GCA_016904835.1
n/a n/a 12,620
(1.92 %)
24,568
(2.61 %)
n/a 42.41
(99.61 %)
0
(0 %)
195
(0.39 %)
206
(100.00 %)
495,673
(9.14 %)
253,008
(2.04 %)
5,936,177
(19.93 %)
0
(0 %)
269,642
(1.76 %)
20,145
(1.83 %)
15,953
(0.89 %)
248 ring-necked pheasant
GCF_004143745.1
33,221
(6.38 %)
n/a 13,027
(2.35 %)
19,960
(2.74 %)
n/a 41.21
(99.22 %)
0
(0 %)
19,995
(0.78 %)
39,678
(100.00 %)
586,827
(8.20 %)
291,437
(1.68 %)
6,237,616
(20.77 %)
5
(0.00 %)
110,611
(0.64 %)
22,365
(2.11 %)
18,900
(1.36 %)
249 rock pigeon (Danish tumbler 2013 BGI)
GCF_000337935.1
52,369
(6.40 %)
n/a 12,577
(1.87 %)
14,272
(2.42 %)
n/a 41.48
(98.13 %)
85,176
(1.90 %)
85,176
(1.90 %)
100,099
(98.10 %)
480,221
(6.94 %)
268,561
(1.86 %)
6,408,260
(19.42 %)
19
(0.00 %)
139,510
(1.01 %)
29,801
(1.43 %)
25,584
(1.09 %)
250 rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024)
GCA_036010775.2
n/a n/a 12,450
(1.75 %)
23,660
(2.21 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
23
(0.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
2
(0.00 %)
1,046,187
(5.37 %)
33,479
(3.29 %)
29,158
(1.73 %)
251 rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024)
GCA_036013475.2
n/a n/a 13,146
(1.66 %)
25,463
(2.12 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,969
(11.76 %)
412,670
(12.92 %)
6,047,584
(29.90 %)
0
(0 %)
1,266,456
(5.89 %)
36,847
(3.12 %)
31,115
(1.65 %)
252 rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024)
GCF_036013475.1
70,874
(7.24 %)
n/a 13,145
(1.66 %)
25,462
(2.12 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
869
(100.00 %)
656,963
(11.76 %)
412,665
(12.92 %)
6,047,535
(29.90 %)
0
(0 %)
1,266,447
(5.89 %)
36,847
(3.12 %)
31,115
(1.65 %)
253 rock pigeon (racing homer maternal 2024)
GCA_036010775.1
n/a n/a 12,450
(1.75 %)
25,274
(2.35 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
23
(0.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
2
(0.00 %)
1,046,190
(5.37 %)
33,479
(3.29 %)
29,158
(1.73 %)
254 rock pigeon (racing homer paternal W 2024)
GCA_036013475.1
n/a n/a 13,145
(1.66 %)
28,883
(2.53 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
248
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,923
(11.76 %)
412,678
(12.92 %)
6,047,578
(29.90 %)
0
(0 %)
1,266,126
(5.89 %)
36,847
(3.12 %)
31,114
(1.65 %)
255 rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022)
GCA_023344045.1
n/a n/a 12,090
(2.36 %)
21,910
(2.57 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,212
(100.00 %)
585,577
(10.45 %)
202,342
(1.61 %)
5,390,780
(20.38 %)
0
(0 %)
122,512
(1.28 %)
19,210
(2.23 %)
17,189
(1.48 %)
256 rock ptarmigan (primary hap 2022 refseq)
GCF_023343835.1
51,619
(7.29 %)
n/a 12,832
(2.31 %)
23,047
(2.56 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
0
(0 %)
210
(0.01 %)
165
(100.00 %)
526,839
(5.87 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,345
(21.73 %)
0
(0 %)
216,565
(1.89 %)
21,346
(2.37 %)
19,067
(1.48 %)
257 ruddy duck
GCF_011077185.1
50,326
(5.76 %)
n/a 13,124
(1.98 %)
23,592
(2.23 %)
n/a 41.82
(97.27 %)
18,437
(2.73 %)
18,437
(2.73 %)
28,026
(97.27 %)
808,998
(7.97 %)
389,509
(1.34 %)
6,722,581
(21.16 %)
886
(0.04 %)
50,273
(0.33 %)
34,567
(3.30 %)
31,746
(2.24 %)
258 ruff
GCF_001431845.1
34,257
(4.61 %)
n/a 12,979
(1.79 %)
15,969
(2.42 %)
n/a 42.45
(96.26 %)
30,404
(3.75 %)
30,404
(3.75 %)
34,157
(96.25 %)
308,688
(1.08 %)
337,661
(3.70 %)
7,220,063
(20.45 %)
152
(0.04 %)
344,206
(7.21 %)
27,939
(1.42 %)
21,232
(0.89 %)
259 rufous-necked snowfinch
GCF_017590135.1
35,381
(4.92 %)
n/a 12,603
(1.95 %)
24,965
(2.42 %)
n/a 42.00
(99.80 %)
0
(0 %)
5,524
(0.20 %)
24,055
(100.00 %)
514,274
(6.32 %)
411,146
(2.77 %)
6,584,761
(19.85 %)
14
(0.00 %)
134,703
(1.55 %)
29,372
(2.28 %)
23,101
(1.33 %)
260 rusty-margined flycatcher (MyiCay16 2022)
GCF_022539395.1
40,473
(5.86 %)
n/a 12,903
(1.96 %)
23,477
(2.35 %)
n/a 42.26
(99.87 %)
0
(0 %)
181
(0.13 %)
1,692
(100.00 %)
439,625
(4.09 %)
338,042
(2.23 %)
6,366,832
(20.27 %)
1
(0.00 %)
207,451
(1.26 %)
28,572
(2.11 %)
22,109
(1.15 %)
261 saffron-crested tyrant-manakin
GCF_003984885.1
45,898
(5.06 %)
n/a 12,908
(1.86 %)
21,103
(2.48 %)
n/a 42.28
(99.01 %)
0
(0 %)
15,342
(0.99 %)
38,089
(100.00 %)
496,308
(7.14 %)
333,391
(1.97 %)
6,646,625
(20.87 %)
2,379
(0.07 %)
129,596
(0.85 %)
32,671
(2.19 %)
23,444
(1.15 %)
262 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 alternate hap 2022)
GCA_021966175.1
n/a n/a 16,893
(1.07 %)
43,426
(1.70 %)
n/a 44.67
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
43,047
(100.00 %)
1,180,596
(3.55 %)
1,932,696
(16.57 %)
6,340,063
(43.85 %)
0
(0 %)
3,356,221
(11.63 %)
66,996
(3.45 %)
35,172
(0.95 %)
263 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 primary hap 2022)
GCA_021963965.1
n/a n/a 12,804
(1.50 %)
25,425
(1.97 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
200
(0.00 %)
1,339
(100.00 %)
699,755
(3.36 %)
1,030,540
(15.69 %)
5,226,748
(36.13 %)
1
(0.00 %)
1,577,345
(8.39 %)
36,539
(2.71 %)
22,856
(0.98 %)
264 Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022)
GCA_023634115.1
n/a n/a 12,258
(1.66 %)
25,579
(2.30 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
4,162
(100.00 %)
506,343
(6.77 %)
182,589
(7.22 %)
5,435,776
(23.60 %)
0
(0 %)
383,493
(2.65 %)
29,420
(2.47 %)
19,384
(0.92 %)
265 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634085.1
50,290
(5.75 %)
n/a 12,973
(1.67 %)
21,670
(1.90 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
0
(0 %)
258
(0.30 %)
283
(100.00 %)
548,090
(7.21 %)
201,488
(8.55 %)
7,030,877
(24.94 %)
0
(0 %)
469,777
(2.60 %)
31,791
(2.57 %)
20,215
(0.89 %)
266 Saker falcon (BGI 2013)
GCF_000337975.1
36,497
(5.34 %)
n/a 12,572
(1.79 %)
10,629
(2.08 %)
27,857
(3.09 %)
41.71
(98.00 %)
70,035
(2.03 %)
70,035
(2.03 %)
75,898
(97.97 %)
433,484
(5.29 %)
166,251
(1.03 %)
7,121,848
(18.23 %)
27
(0.00 %)
33,448
(0.49 %)
19,927
(0.72 %)
15,588
(0.52 %)
267 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023)
GCA_027887135.1
n/a n/a 12,826
(1.74 %)
26,019
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,054
(100.00 %)
482,850
(3.37 %)
523,437
(10.15 %)
6,386,315
(26.20 %)
0
(0 %)
535,497
(3.35 %)
32,734
(4.25 %)
23,206
(1.19 %)
268 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887145.1
27,528
(4.03 %)
n/a 12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
0
(0 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
1
(0.00 %)
651,029
(4.07 %)
35,549
(5.05 %)
23,802
(1.15 %)
269 Savannah sparrow (FMNH 499929 alternate hap 2022)
GCA_022578375.1
n/a n/a 16,954
(1.37 %)
46,692
(2.27 %)
n/a 43.66
(99.99 %)
1,822
(0.01 %)
1,822
(0.01 %)
31,565
(99.99 %)
680,766
(3.36 %)
930,904
(8.76 %)
7,502,726
(27.96 %)
14
(0.00 %)
1,172,923
(6.11 %)
56,390
(5.99 %)
34,310
(1.12 %)
270 Savannah sparrow (FMNH 499929 primary hap 2022)
GCA_022577445.1
n/a n/a 12,665
(1.79 %)
25,654
(2.40 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
0
(0 %)
339
(0.00 %)
337
(100.00 %)
428,675
(3.22 %)
588,040
(7.38 %)
6,466,447
(24.39 %)
1
(0.00 %)
659,720
(4.05 %)
33,599
(4.75 %)
24,129
(1.22 %)
271 Savannah sparrow (primary hap 2023)
GCA_031885435.1
n/a n/a 12,986
(1.66 %)
27,028
(2.29 %)
n/a 43.66
(99.78 %)
0
(0 %)
249
(0.22 %)
110
(100.00 %)
464,600
(3.28 %)
681,402
(9.28 %)
6,314,744
(26.92 %)
0
(0 %)
939,361
(5.26 %)
39,406
(5.26 %)
25,911
(1.19 %)
272 seaside sparrow (bAmmMar1 primary hap 2024)
GCA_036010785.1
n/a n/a 12,858
(1.52 %)
25,777
(2.02 %)
n/a 44.04
(99.85 %)
0
(0 %)
365
(0.15 %)
501
(100.00 %)
580,376
(4.24 %)
636,266
(12.18 %)
4,804,433
(34.52 %)
0
(0 %)
1,048,820
(7.41 %)
48,871
(4.18 %)
23,097
(1.00 %)
273 small tree finch (2019)
GCF_901933205.1
30,090
(4.91 %)
n/a 12,645
(1.95 %)
17,146
(2.49 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
182
(0.01 %)
185
(0.01 %)
1,527
(99.99 %)
457,266
(6.02 %)
477,426
(4.49 %)
6,482,932
(22.03 %)
0
(0 %)
391,606
(2.09 %)
27,271
(2.40 %)
21,429
(1.25 %)
274 small tree finch (2020)
GCA_902806625.1
n/a n/a 12,662
(1.93 %)
23,695
(2.34 %)
25,763
(3.61 %)
42.49
(99.99 %)
195
(0.01 %)
224
(0.01 %)
1,951
(99.99 %)
458,154
(6.01 %)
482,974
(4.97 %)
6,466,067
(22.21 %)
2
(0.00 %)
449,266
(2.28 %)
27,890
(2.42 %)
21,523
(1.23 %)
275 song sparrow (bMelMel2 primary hap 2024)
GCF_035770615.1
41,069
(3.95 %)
n/a 12,946
(1.39 %)
26,698
(1.87 %)
n/a 44.96
(99.93 %)
0
(0 %)
299
(0.07 %)
353
(100.00 %)
515,851
(3.07 %)
681,436
(15.73 %)
5,004,851
(39.23 %)
1
(0.00 %)
1,925,213
(9.14 %)
47,268
(3.90 %)
25,117
(0.99 %)
276 song sparrow (gouldii PMB2087b alternate hap 2022)
GCA_022749775.1
n/a n/a 15,672
(1.16 %)
40,690
(1.82 %)
n/a 45.19
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
34,693
(100.00 %)
1,068,703
(34.46 %)
796,004
(19.02 %)
6,315,990
(40.22 %)
0
(0 %)
2,681,702
(10.34 %)
57,647
(3.95 %)
31,590
(0.98 %)
277 song sparrow (gouldii PMB2087b primary hap 2022)
GCA_022749695.1
n/a n/a 12,580
(1.53 %)
24,737
(2.00 %)
n/a 44.45
(100.00 %)
0
(0 %)
323
(0.00 %)
501
(100.00 %)
697,818
(28.44 %)
510,301
(17.90 %)
5,319,400
(34.64 %)
0
(0 %)
1,574,309
(8.28 %)
36,632
(3.59 %)
22,552
(0.99 %)
278 song sparrow (primary hap 2024)
GCA_035770615.1
n/a n/a 12,940
(1.39 %)
26,698
(1.87 %)
n/a 44.96
(99.93 %)
0
(0 %)
299
(0.07 %)
354
(100.00 %)
515,857
(3.07 %)
681,436
(15.73 %)
5,004,880
(39.23 %)
1
(0.00 %)
1,925,221
(9.14 %)
47,269
(3.90 %)
25,118
(0.99 %)
279 South Island takahe (alternate 2021)
GCA_020801775.1
n/a n/a 12,655
(1.70 %)
n/a n/a 43.63
(99.16 %)
0
(0 %)
238
(0.84 %)
178
(100.00 %)
554,912
(9.42 %)
230,808
(4.34 %)
6,406,358
(24.83 %)
0
(0 %)
352,693
(2.60 %)
22,941
(1.98 %)
19,559
(1.17 %)
280 South Island takahe (primary 2021)
GCA_020800305.1
n/a n/a 12,942
(1.69 %)
23,221
(2.13 %)
n/a 43.74
(99.58 %)
0
(0 %)
327
(0.42 %)
174
(100.00 %)
577,553
(9.77 %)
259,017
(5.20 %)
6,430,968
(25.90 %)
1
(0.00 %)
437,634
(2.97 %)
23,810
(2.02 %)
20,060
(1.16 %)
281 speckled mousebird (bColStr4 hap1 2023)
GCF_028858725.1
37,067
(4.23 %)
n/a 12,815
(1.76 %)
23,175
(2.17 %)
n/a 42.29
(99.52 %)
0
(0 %)
161
(0.48 %)
191
(100.00 %)
572,944
(12.88 %)
256,368
(3.55 %)
5,868,966
(23.42 %)
1
(0.00 %)
412,827
(2.70 %)
27,158
(2.30 %)
20,935
(1.20 %)
282 speckled mousebird (bColStr4 hap2 2023)
GCA_028858625.2
n/a n/a 12,332
(1.76 %)
22,895
(2.24 %)
n/a 42.74
(99.53 %)
0
(0 %)
136
(0.47 %)
242
(100.00 %)
521,023
(11.26 %)
304,406
(7.39 %)
5,319,571
(25.46 %)
0
(0 %)
589,925
(3.69 %)
27,299
(2.35 %)
19,827
(1.22 %)
283 speckled mousebird (BGI_N325 2014)
GCF_000690715.1
15,894
(2.09 %)
n/a 11,566
(1.44 %)
25,387
(1.84 %)
n/a 40.95
(99.65 %)
44,462
(0.35 %)
44,462
(0.35 %)
114,650
(99.65 %)
345,458
(6.87 %)
154,693
(1.27 %)
6,152,475
(19.42 %)
5
(0.00 %)
55,406
(0.53 %)
7,821
(0.23 %)
6,630
(0.19 %)
284 speckled mousebird (hap1 2023)
GCA_028858725.1
n/a n/a 11,956
(1.78 %)
25,177
(2.60 %)
n/a 42.38
(99.48 %)
0
(0 %)
143
(0.52 %)
189
(100.00 %)
523,056
(12.47 %)
243,547
(3.72 %)
5,408,003
(23.43 %)
1
(0.00 %)
397,635
(2.78 %)
25,552
(2.34 %)
19,232
(1.18 %)
285 speckled mousebird (hap2 2023)
GCA_028858625.1
n/a n/a 13,169
(1.74 %)
26,896
(2.47 %)
n/a 42.62
(99.56 %)
0
(0 %)
151
(0.44 %)
243
(100.00 %)
570,907
(11.75 %)
317,226
(6.96 %)
5,854,600
(25.51 %)
0
(0 %)
605,114
(3.54 %)
28,905
(2.31 %)
21,335
(1.22 %)
286 steelblue widowfinch (merged hap OUT-0048 2022)
GCA_026979565.1
n/a n/a 12,819
(1.94 %)
24,247
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
0
(0 %)
458
(0.02 %)
178
(100.00 %)
616,749
(11.96 %)
411,917
(3.56 %)
6,385,102
(20.91 %)
6
(0.00 %)
306,942
(1.90 %)
37,940
(2.83 %)
24,967
(1.41 %)
287 steelblue widowfinch (purged dups hap OUT-0048 2022)
GCA_026979555.1
n/a n/a 2,176
(1.79 %)
7,719
(4.37 %)
n/a 49.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,939
(100.00 %)
136,312
(29.31 %)
157,341
(15.03 %)
648,725
(34.67 %)
0
(0 %)
221,251
(9.52 %)
15,490
(8.23 %)
7,383
(2.86 %)
288 Steller's jay (frontalis alternate hap 2022)
GCA_026168045.1
n/a n/a 12,217
(1.73 %)
25,261
(2.32 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
0
(0 %)
200
(0.00 %)
957
(100.00 %)
423,239
(3.30 %)
362,061
(4.83 %)
4,954,262
(27.09 %)
1
(0.00 %)
401,578
(3.63 %)
42,188
(4.05 %)
23,201
(1.15 %)
289 Steller's jay (frontalis primary hap 2022)
GCA_026167965.1
n/a n/a 12,789
(1.82 %)
24,509
(2.35 %)
n/a 43.18
(100.00 %)
0
(0 %)
223
(0.00 %)
352
(100.00 %)
413,598
(3.28 %)
318,919
(3.99 %)
5,977,564
(23.65 %)
3
(0.00 %)
301,786
(2.41 %)
33,675
(3.21 %)
24,057
(1.25 %)
290 sun parakeet (2019)
GCA_902168055.1
n/a n/a 12,871
(1.88 %)
22,508
(2.20 %)
n/a 42.01
(96.97 %)
0
(0 %)
578,921
(3.08 %)
1,570
(100.00 %)
554,367
(10.05 %)
180,644
(0.89 %)
6,158,602
(21.14 %)
962
(0.08 %)
166,361
(1.21 %)
21,695
(1.62 %)
19,571
(1.23 %)
291 sunbittern
GCF_000690775.1
15,772
(2.11 %)
n/a 11,564
(1.45 %)
25,522
(1.98 %)
n/a 42.33
(99.55 %)
52,471
(0.46 %)
52,471
(0.46 %)
115,170
(99.54 %)
346,556
(5.38 %)
117,881
(0.88 %)
6,391,987
(18.82 %)
2
(0.00 %)
48,033
(0.44 %)
32,970
(1.31 %)
28,939
(1.10 %)
292 Suruca trogon (bRtoSur1 primary hap 2021)
GCA_020746105.1
n/a n/a 12,884
(1.85 %)
23,805
(2.23 %)
n/a 42.80
(99.12 %)
0
(0 %)
253
(0.88 %)
182
(100.00 %)
539,771
(9.26 %)
181,564
(1.14 %)
6,538,228
(22.49 %)
1
(0.00 %)
138,653
(1.22 %)
41,376
(3.37 %)
36,105
(2.01 %)
293 Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021)
GCA_020746095.1
n/a n/a 11,628
(1.91 %)
21,635
(2.31 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
17
(0.00 %)
1,535
(100.00 %)
421,231
(6.57 %)
146,070
(1.11 %)
5,727,350
(21.91 %)
0
(0 %)
105,678
(1.04 %)
37,752
(3.68 %)
32,944
(2.17 %)
294 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020)
GCA_009819505.2
n/a n/a 13,403
(1.85 %)
27,669
(2.52 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
704,976
(13.16 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
0
(0 %)
505,741
(2.66 %)
49,076
(3.54 %)
23,486
(1.21 %)
295 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 primary hap 2020)
GCF_009819885.2
40,121
(5.41 %)
n/a 13,004
(1.87 %)
24,795
(2.41 %)
n/a 42.48
(98.86 %)
0
(0 %)
429
(1.14 %)
160
(100.00 %)
493,071
(5.80 %)
589,858
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
1
(0.00 %)
449,511
(2.41 %)
49,404
(3.53 %)
22,206
(1.16 %)
296 swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023)
GCA_028019105.1
n/a n/a 12,160
(1.83 %)
24,622
(2.46 %)
n/a 43.37
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 862
(100.00 %)
383,634
(3.06 %)
527,550
(8.40 %)
5,916,654
(24.97 %)
0
(0 %)
665,809
(4.29 %)
31,261
(3.21 %)
22,337
(1.23 %)
297 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018845.1
29,544
(4.27 %)
n/a 12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
0
(0 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
1
(0.00 %)
578,723
(3.93 %)
32,064
(3.27 %)
22,996
(1.19 %)
298 swan goose (Sichuan white goose 2017)
GCF_002166845.1
62,728
(8.50 %)
n/a 12,903
(1.98 %)
21,943
(2.24 %)
n/a 41.68
(97.40 %)
63,061
(2.62 %)
63,061
(2.62 %)
64,863
(97.38 %)
590,350
(4.68 %)
253,525
(1.38 %)
6,926,961
(19.71 %)
1,420
(0.08 %)
82,724
(1.10 %)
40,011
(3.69 %)
37,150
(2.50 %)
299 swan goose (Tianfu 2020)
GCA_013030995.1
n/a n/a 12,965
(1.97 %)
25,182
(2.35 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
0
(0 %)
716
(0.01 %)
2,119
(100.00 %)
650,271
(7.44 %)
270,668
(1.26 %)
6,776,820
(21.19 %)
1
(0.00 %)
89,151
(0.88 %)
35,560
(4.27 %)
34,560
(2.39 %)
300 swan goose (Zhedong 2015)
GCF_000971095.1
43,215
(5.89 %)
n/a 12,148
(1.89 %)
19,386
(2.07 %)
29,870
(3.24 %)
41.36
(96.87 %)
84,351
(3.16 %)
84,351
(3.16 %)
91,944
(96.84 %)
481,707
(5.57 %)
230,143
(1.26 %)
6,665,312
(19.42 %)
11
(0.00 %)
27,715
(0.46 %)
38,930
(2.06 %)
34,119
(1.62 %)
301 tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023)
GCA_028020675.1
n/a n/a 11,432
(1.95 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
911
(100.00 %)
470,125
(9.51 %)
140,846
(3.57 %)
5,002,695
(22.08 %)
0
(0 %)
231,594
(1.85 %)
22,424
(2.33 %)
19,010
(1.39 %)
302 tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023)
GCA_028020825.1
n/a n/a 13,321
(1.76 %)
24,102
(2.15 %)
n/a 42.35
(99.83 %)
0
(0 %)
203
(0.17 %)
1,038
(100.00 %)
593,409
(10.51 %)
202,463
(9.29 %)
6,160,173
(27.65 %)
1
(0.00 %)
529,082
(2.97 %)
25,785
(2.35 %)
21,960
(1.26 %)
303 tawny owl (hap1 2023)
GCA_031877795.1
n/a n/a 13,204
(1.60 %)
23,981
(1.99 %)
n/a 42.70
(99.70 %)
9
(0.15 %)
281
(0.30 %)
212
(99.85 %)
443,228
(4.74 %)
272,738
(10.86 %)
5,812,837
(27.42 %)
1
(0.00 %)
406,171
(2.45 %)
30,602
(2.52 %)
26,399
(1.26 %)
304 tawny owl (hap2 2023)
GCA_031877785.1
n/a n/a 12,367
(1.72 %)
21,445
(2.03 %)
n/a 42.53
(99.88 %)
0
(0 %)
206
(0.12 %)
184
(100.00 %)
392,959
(4.59 %)
235,300
(7.72 %)
6,437,772
(24.82 %)
0
(0 %)
298,804
(2.06 %)
27,952
(2.71 %)
25,864
(1.43 %)
305 tawny-flanked prinia (Zambia CZ2003 2024)
GCF_021018805.1
40,939
(5.96 %)
n/a 12,510
(1.84 %)
24,378
(2.37 %)
n/a 42.64
(99.99 %)
0
(0 %)
378
(0.01 %)
538
(100.00 %)
384,533
(3.09 %)
345,667
(4.24 %)
6,199,979
(21.86 %)
2
(0.00 %)
303,724
(2.22 %)
33,587
(2.53 %)
24,243
(1.25 %)
306 Tibetan ground-tit
GCF_000331425.1
28,736
(4.57 %)
n/a 12,828
(2.02 %)
17,743
(2.65 %)
n/a 41.69
(98.76 %)
21,646
(1.24 %)
21,646
(1.24 %)
27,052
(98.76 %)
443,797
(5.51 %)
346,281
(2.29 %)
6,423,932
(19.90 %)
775
(0.09 %)
140,033
(1.18 %)
27,086
(2.31 %)
22,331
(1.32 %)
307 tourmaline sunangel (hap1 2024)
GCA_036169615.1
n/a n/a 12,509
(1.97 %)
21,020
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.99 %)
0
(0 %)
437
(0.01 %)
131
(100.00 %)
532,267
(5.46 %)
332,284
(2.69 %)
6,084,978
(21.20 %)
0
(0 %)
215,264
(1.71 %)
19,080
(1.72 %)
15,764
(1.09 %)
308 tourmaline sunangel (hap2 2024)
GCA_036172335.1
n/a n/a 11,697
(2.00 %)
19,544
(2.34 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
0
(0 %)
370
(0.01 %)
200
(100.00 %)
480,724
(5.14 %)
292,213
(3.66 %)
5,608,823
(21.79 %)
2
(0.00 %)
199,789
(1.65 %)
17,191
(1.69 %)
14,460
(1.07 %)
309 tricolored blackbird (1412-34295 alternate hap 2022)
GCA_023055385.1
n/a n/a 12,203
(1.76 %)
25,216
(2.40 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
0
(0 %)
97
(0.00 %)
450
(100.00 %)
430,792
(3.25 %)
542,908
(5.67 %)
5,289,916
(24.99 %)
1
(0.00 %)
493,641
(3.34 %)
36,805
(3.52 %)
22,961
(1.19 %)
310 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022)
GCA_023055355.1
n/a n/a 12,867
(1.81 %)
26,393
(2.48 %)
n/a 42.85
(100.00 %)
97
(0.00 %)
97
(0.00 %)
311
(100.00 %)
429,011
(3.16 %)
564,849
(5.52 %)
6,336,716
(23.32 %)
0
(0 %)
439,278
(2.62 %)
33,378
(2.70 %)
23,687
(1.26 %)
311 tufted duck (2019)
GCF_009819795.1
29,492
(4.02 %)
n/a 12,972
(1.98 %)
22,757
(2.27 %)
n/a 41.66
(99.16 %)
0
(0 %)
163
(0.84 %)
105
(100.00 %)
826,451
(8.47 %)
411,356
(1.71 %)
6,691,445
(22.36 %)
1
(0.00 %)
93,916
(0.94 %)
29,882
(2.41 %)
27,027
(1.51 %)
312 tufted duck (alternate hap 2019)
GCA_009819845.1
n/a n/a 12,117
(2.03 %)
21,464
(2.36 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
780
(100.00 %)
732,317
(7.82 %)
353,660
(1.57 %)
6,119,549
(21.70 %)
0
(0 %)
66,459
(0.74 %)
27,920
(2.56 %)
25,192
(1.55 %)
313 turkey (Aviagen NT-WF06-2002-E0010 2014)
GCF_000146605.3
38,427
(6.01 %)
31,063
(4.70 %)
13,095
(1.96 %)
23,974
(2.27 %)
30,549
(3.14 %)
41.35
(96.83 %)
65,045
(3.16 %)
65,045
(3.16 %)
250,220
(96.84 %)
609,750
(9.03 %)
243,534
(1.26 %)
6,043,889
(21.06 %)
84
(0.01 %)
92,729
(0.60 %)
31,818
(1.42 %)
22,389
(0.99 %)
314 turkey (WU_HG_1 2021)
GCA_905368555.1
n/a n/a 12,910
(2.37 %)
23,038
(2.58 %)
53,269
(6.57 %)
41.12
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
151
(100.00 %)
618,023
(8.91 %)
227,783
(1.43 %)
6,123,721
(21.03 %)
0
(0 %)
115,410
(0.98 %)
20,379
(2.19 %)
18,358
(1.45 %)
315 village indigobird (OUT-0048 2022)
GCF_026979565.1
44,961
(5.49 %)
n/a 12,817
(1.94 %)
24,245
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
0
(0 %)
458
(0.02 %)
177
(100.00 %)
616,746
(11.96 %)
411,917
(3.57 %)
6,385,057
(20.91 %)
6
(0.00 %)
306,942
(1.90 %)
37,940
(2.83 %)
24,967
(1.41 %)
316 Virginia rail (171378401 alternate hap 2022)
GCA_022605895.1
n/a n/a 12,732
(1.51 %)
23,395
(1.91 %)
n/a 44.28
(99.99 %)
0
(0 %)
668
(0.00 %)
4,450
(100.00 %)
526,500
(5.75 %)
269,598
(14.29 %)
4,825,913
(32.19 %)
7
(0.00 %)
893,612
(4.56 %)
27,465
(2.18 %)
19,393
(1.06 %)
317 Virginia rail (171378401 primary hap 2022)
GCA_022605955.1
n/a n/a 12,760
(1.53 %)
23,262
(2.16 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
197
(0.00 %)
197
(0.00 %)
1,299
(100.00 %)
497,104
(5.09 %)
271,530
(15.72 %)
5,291,065
(32.37 %)
3
(0.00 %)
655,677
(3.62 %)
24,669
(1.78 %)
19,147
(1.06 %)
318 western capercaillie (alternate hap 2023)
GCA_951394355.1
n/a n/a 11,226
(2.33 %)
20,526
(2.54 %)
n/a 41.53
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,463
(100.00 %)
436,894
(5.48 %)
209,008
(1.73 %)
4,790,071
(20.27 %)
0
(0 %)
86,858
(1.22 %)
17,864
(2.58 %)
16,116
(1.50 %)
319 western capercaillie (primary hap 2023)
GCA_951394365.1
n/a n/a 12,775
(2.33 %)
22,516
(2.50 %)
n/a 41.49
(99.98 %)
0
(0 %)
973
(0.02 %)
318
(100.00 %)
518,194
(5.54 %)
276,294
(2.21 %)
5,866,033
(21.12 %)
9
(0.00 %)
148,912
(1.44 %)
21,287
(2.50 %)
19,248
(1.54 %)
320 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536645.1
n/a n/a 12,480
(1.72 %)
22,915
(2.17 %)
n/a 44.29
(100.00 %)
0
(0 %)
168
(0.00 %)
1,631
(100.00 %)
394,733
(2.99 %)
364,498
(6.04 %)
4,803,453
(27.52 %)
4
(0.00 %)
428,688
(5.10 %)
42,022
(4.90 %)
23,813
(1.19 %)
321 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536675.1
n/a n/a 13,128
(1.62 %)
25,648
(2.11 %)
n/a 44.58
(100.00 %)
0
(0 %)
272
(0.00 %)
1,393
(100.00 %)
449,314
(3.08 %)
505,129
(6.52 %)
4,634,925
(31.99 %)
1
(0.00 %)
648,800
(6.06 %)
51,884
(4.81 %)
24,198
(1.04 %)
322 whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021)
GCA_020745695.1
n/a n/a 11,632
(1.83 %)
20,659
(2.18 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,405
(100.00 %)
553,633
(11.80 %)
147,999
(0.81 %)
5,825,472
(20.55 %)
0
(0 %)
89,546
(1.06 %)
20,481
(1.61 %)
16,521
(1.13 %)
323 whiskered treeswift (bHemCor1 primary hap 2021)
GCA_020745705.1
n/a n/a 12,681
(1.84 %)
21,784
(2.14 %)
n/a 42.12
(99.13 %)
0
(0 %)
218
(0.87 %)
146
(100.00 %)
520,200
(9.32 %)
170,778
(0.83 %)
6,455,910
(21.44 %)
0
(0 %)
98,619
(0.96 %)
24,061
(1.62 %)
17,982
(1.11 %)
324 white wagtail
GCF_015832195.1
47,145
(6.80 %)
n/a 12,127
(1.86 %)
22,301
(2.31 %)
n/a 42.72
(99.92 %)
0
(0 %)
906
(0.08 %)
619
(100.00 %)
479,546
(6.15 %)
349,751
(5.62 %)
6,384,256
(22.41 %)
2
(0.00 %)
491,922
(3.00 %)
28,008
(2.68 %)
22,699
(1.28 %)
325 white-collared manakin (Guabito, Panama 608988 2022)
GCF_025592945.1
53,731
(6.26 %)
n/a 12,981
(1.91 %)
23,916
(2.40 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 643
(100.00 %)
417,020
(3.98 %)
366,209
(3.55 %)
5,992,950
(21.48 %)
0
(0 %)
332,121
(2.21 %)
28,964
(2.22 %)
21,678
(1.08 %)
326 white-crowned manakin (hap1 2024)
GCA_036250125.1
n/a n/a 12,807
(1.82 %)
25,568
(2.46 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
323
(0.01 %)
697
(100.00 %)
429,646
(4.10 %)
293,431
(3.59 %)
6,059,494
(21.89 %)
0
(0 %)
366,430
(2.74 %)
29,574
(2.42 %)
21,946
(1.07 %)
327 white-crowned manakin (hap2 2024)
GCA_036250135.1
n/a n/a 12,135
(1.94 %)
21,591
(2.38 %)
n/a 42.49
(99.99 %)
0
(0 %)
307
(0.01 %)
595
(100.00 %)
375,468
(3.93 %)
263,979
(3.93 %)
5,786,346
(21.36 %)
0
(0 %)
353,429
(2.50 %)
25,275
(2.50 %)
20,066
(1.10 %)
328 white-ruffed manakin
GCF_003945725.1
45,894
(5.34 %)
n/a 12,730
(1.91 %)
19,044
(2.50 %)
n/a 41.81
(99.24 %)
0
(0 %)
13,527
(0.76 %)
9,068
(100.00 %)
489,252
(7.14 %)
246,346
(1.38 %)
6,500,956
(19.79 %)
1,774
(0.05 %)
92,543
(0.62 %)
25,941
(1.84 %)
21,611
(1.12 %)
329 white-rumped snowfinch
GCF_017590055.1
34,717
(4.88 %)
n/a 12,599
(1.97 %)
24,083
(2.44 %)
n/a 42.03
(99.81 %)
0
(0 %)
4,869
(0.19 %)
11,576
(100.00 %)
502,151
(6.20 %)
449,641
(3.22 %)
6,554,257
(20.25 %)
8
(0.00 %)
182,741
(1.65 %)
28,891
(2.32 %)
23,122
(1.37 %)
330 white-tailed eagle (BGI_N329 2014)
GCF_000691405.1
20,744
(2.82 %)
n/a 11,490
(1.49 %)
22,258
(1.77 %)
n/a 40.90
(99.56 %)
60,579
(0.45 %)
60,579
(0.45 %)
111,484
(99.55 %)
325,669
(3.74 %)
116,707
(0.60 %)
6,725,133
(18.14 %)
11
(0.00 %)
13,685
(0.12 %)
11,615
(0.32 %)
9,835
(0.26 %)
331 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 2022)
GCA_947461875.1
n/a n/a 13,735
(1.76 %)
28,993
(2.53 %)
n/a 43.15
(99.99 %)
0
(0 %)
424
(0.01 %)
188
(100.00 %)
585,276
(12.89 %)
291,289
(6.10 %)
6,474,027
(23.66 %)
0
(0 %)
312,204
(2.16 %)
54,851
(4.05 %)
31,757
(1.50 %)
332 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022)
GCA_947461935.1
n/a n/a 7,755
(1.71 %)
16,331
(2.39 %)
n/a 43.66
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,971
(100.00 %)
304,566
(13.21 %)
116,307
(6.64 %)
3,407,853
(22.91 %)
0
(0 %)
142,427
(1.75 %)
34,573
(4.56 %)
18,414
(1.62 %)
333 white-tailed ptarmigan
GCF_019238085.1
39,072
(5.37 %)
n/a 12,919
(2.36 %)
23,624
(2.48 %)
n/a 41.37
(97.63 %)
0
(0 %)
10,501
(2.38 %)
7,343
(100.00 %)
587,593
(8.19 %)
231,665
(1.12 %)
6,007,601
(20.08 %)
935
(0.05 %)
58,646
(0.40 %)
21,298
(2.05 %)
19,249
(1.48 %)
334 white-tailed tropicbird
GCF_000687285.1
16,342
(2.18 %)
n/a 12,040
(1.50 %)
26,704
(1.97 %)
n/a 41.51
(99.50 %)
65,286
(0.51 %)
65,286
(0.51 %)
132,071
(99.49 %)
353,892
(5.61 %)
125,195
(0.74 %)
6,873,137
(19.59 %)
14
(0.00 %)
26,611
(0.28 %)
41,005
(1.45 %)
36,518
(1.24 %)
335 white-throated dipper (primary hap 2023)
GCA_963662255.1
n/a n/a 12,856
(1.79 %)
23,827
(2.25 %)
n/a 42.82
(99.99 %)
0
(0 %)
658
(0.01 %)
278
(100.00 %)
431,536
(3.38 %)
345,533
(10.59 %)
5,840,462
(26.59 %)
1
(0.00 %)
617,894
(3.85 %)
29,711
(3.56 %)
21,555
(1.20 %)
336 white-throated dipper (primary hap 2023)
GCF_963662255.1
29,618
(3.60 %)
n/a 12,854
(1.79 %)
23,825
(2.25 %)
n/a 42.82
(99.99 %)
0
(0 %)
658
(0.01 %)
277
(100.00 %)
431,531
(3.38 %)
345,532
(10.59 %)
5,840,421
(26.59 %)
1
(0.00 %)
617,892
(3.85 %)
29,711
(3.56 %)
21,555
(1.20 %)
337 white-throated sparrow
GCF_000385455.1
31,167
(5.71 %)
n/a 11,241
(1.81 %)
13,429
(2.26 %)
n/a 41.52
(95.61 %)
31,643
(4.40 %)
41,460
(4.40 %)
37,661
(95.60 %)
439,216
(5.96 %)
364,202
(2.52 %)
6,300,584
(19.09 %)
538
(0.02 %)
220,251
(1.26 %)
15,091
(0.85 %)
11,891
(0.58 %)
338 white-throated tinamou
GCF_000705375.1
18,997
(2.72 %)
n/a 12,287
(1.75 %)
20,132
(2.48 %)
n/a 41.41
(97.88 %)
59,853
(2.12 %)
59,853
(2.12 %)
142,367
(97.88 %)
366,311
(3.62 %)
226,347
(1.35 %)
6,300,683
(18.94 %)
18
(0.00 %)
43,210
(0.47 %)
47,608
(2.60 %)
42,944
(2.08 %)
339 whooping crane (maternal hap 2023 refseq)
GCF_028858705.1
55,408
(5.57 %)
n/a 13,574
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
0
(0 %)
262
(0.37 %)
930
(100.00 %)
616,300
(10.57 %)
211,558
(2.90 %)
6,785,192
(22.11 %)
0
(0 %)
591,955
(1.89 %)
42,795
(4.66 %)
39,036
(2.34 %)
340 whooping crane (paternal hap 2023)
GCA_028858595.1
n/a n/a 13,284
(1.87 %)
23,528
(2.20 %)
n/a 42.47
(99.50 %)
0
(0 %)
586
(0.50 %)
395
(100.00 %)
569,940
(8.69 %)
162,569
(0.98 %)
7,021,319
(20.20 %)
1
(0.00 %)
186,281
(0.89 %)
38,582
(3.77 %)
37,390
(2.40 %)
341 willow flycatcher
GCF_003031625.1
37,909
(4.43 %)
n/a 12,708
(1.90 %)
19,591
(2.57 %)
n/a 42.01
(95.33 %)
0
(0 %)
39,319
(4.68 %)
7,791
(100.00 %)
550,172
(7.15 %)
242,394
(1.27 %)
6,421,292
(18.87 %)
11,152
(0.76 %)
135,623
(1.79 %)
27,080
(1.82 %)
21,989
(1.09 %)
342 wire-tailed manakin (2020)
GCF_003945595.2
42,551
(5.86 %)
n/a 12,535
(1.90 %)
23,300
(2.38 %)
n/a 42.06
(99.73 %)
0
(0 %)
758
(0.26 %)
1,768
(100.00 %)
480,705
(7.12 %)
240,463
(1.87 %)
6,316,566
(20.20 %)
2
(0.00 %)
189,188
(1.32 %)
25,317
(2.02 %)
20,876
(1.12 %)
343 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 alternate hap 2023)
GCA_029207785.1
n/a n/a 13,053
(1.78 %)
24,963
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
0
(0 %)
342
(0.00 %)
1,350
(100.00 %)
444,809
(3.08 %)
473,154
(7.96 %)
5,336,472
(25.82 %)
4
(0.00 %)
848,335
(5.29 %)
37,198
(3.14 %)
26,590
(1.31 %)
344 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023)
GCA_029207755.1
n/a n/a 13,052
(1.78 %)
24,950
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
353
(0.00 %)
353
(0.00 %)
1,695
(100.00 %)
444,866
(3.08 %)
473,471
(7.97 %)
5,336,498
(25.82 %)
4
(0.00 %)
847,256
(5.29 %)
37,210
(3.14 %)
26,585
(1.31 %)
345 yellow warbler (LACM:Birds122168 alternate hap 2022)
GCA_024372515.1
n/a n/a 12,426
(1.63 %)
27,565
(2.37 %)
n/a 43.59
(100.00 %)
246
(0.00 %)
246
(0.00 %)
776
(100.00 %)
447,274
(3.06 %)
612,008
(10.28 %)
5,606,168
(28.79 %)
1
(0.00 %)
796,032
(4.97 %)
39,449
(2.66 %)
23,987
(1.17 %)
346 yellow warbler (LACM:Birds122168 primary hap 2022)
GCA_024362935.1
n/a n/a 12,556
(1.69 %)
26,545
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
284
(0.00 %)
284
(0.00 %)
971
(100.00 %)
440,673
(3.12 %)
581,112
(9.17 %)
6,158,372
(26.15 %)
2
(0.00 %)
739,193
(4.60 %)
35,577
(2.57 %)
23,767
(1.19 %)
347 yellow-throated sandgrouse (2019)
GCA_009769525.1
n/a n/a 12,697
(1.89 %)
25,289
(2.53 %)
n/a 42.40
(99.62 %)
0
(0 %)
242
(0.38 %)
89
(100.00 %)
510,633
(7.10 %)
213,742
(1.12 %)
6,627,716
(21.17 %)
0
(0 %)
113,802
(0.93 %)
28,848
(2.23 %)
25,343
(1.45 %)
348 yellow-throated sandgrouse (alternate hap 2019)
GCA_009769505.1
n/a n/a 11,788
(1.85 %)
23,306
(2.45 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,958
(100.00 %)
467,960
(6.96 %)
182,645
(0.99 %)
6,050,545
(20.78 %)
0
(0 %)
88,543
(0.80 %)
26,357
(2.20 %)
23,111
(1.43 %)
349 zebra finch (alternate hap Black17 2018)
GCA_003957525.1
n/a n/a 11,340
(1.85 %)
22,921
(2.37 %)
n/a 41.73
(99.98 %)
45
(0.01 %)
45
(0.01 %)
5,381
(99.99 %)
480,647
(8.44 %)
365,668
(2.89 %)
5,859,698
(20.27 %)
0
(0 %)
235,418
(1.48 %)
24,649
(2.35 %)
19,753
(1.21 %)
350 zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020)
GCA_009859025.1
n/a n/a 10,734
(1.84 %)
19,978
(2.21 %)
n/a 41.07
(99.99 %)
0
(0 %)
16
(0.01 %)
4,677
(100.00 %)
436,071
(7.44 %)
217,580
(1.43 %)
5,800,691
(19.24 %)
0
(0 %)
96,414
(0.71 %)
19,512
(1.90 %)
16,561
(1.08 %)
351 zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021)
GCA_003957525.2
n/a n/a 11,213
(2.01 %)
21,533
(2.54 %)
n/a 41.92
(100.00 %)
0
(0 %)
10
(0.00 %)
1,646
(100.00 %)
470,860
(9.54 %)
387,943
(3.32 %)
5,428,128
(20.68 %)
0
(0 %)
254,906
(1.64 %)
23,838
(2.47 %)
18,868
(1.23 %)
352 zebra finch (Blue55 2020)
GCA_009859065.2
n/a n/a 12,796
(1.92 %)
24,658
(2.44 %)
n/a 41.91
(98.03 %)
0
(0 %)
789
(1.97 %)
541
(100.00 %)
554,338
(9.67 %)
339,851
(2.27 %)
6,613,146
(20.04 %)
1
(0.00 %)
220,583
(1.45 %)
28,678
(2.32 %)
22,455
(1.18 %)
353 zebra finch (Blue55 maternal v3 2020)
GCA_008822115.3
n/a n/a 11,950
(2.00 %)
22,828
(2.51 %)
n/a 42.06
(98.45 %)
0
(0 %)
583
(1.55 %)
206
(100.00 %)
494,110
(9.54 %)
347,933
(2.80 %)
5,875,448
(20.29 %)
0
(0 %)
249,341
(1.71 %)
27,387
(2.57 %)
20,823
(1.23 %)
354 zebra finch (Blue55 paternal 2019)
GCA_008822125.1
n/a n/a 12,384
(1.97 %)
23,021
(2.44 %)
n/a 41.74
(98.02 %)
0
(0 %)
828
(1.98 %)
202
(100.00 %)
511,324
(8.38 %)
351,624
(2.53 %)
6,328,918
(19.99 %)
1
(0.00 %)
233,403
(1.42 %)
25,871
(2.29 %)
20,873
(1.18 %)
355 zebra finch (Blue55 paternal W 2020)
GCF_008822105.2
50,407
(7.20 %)
n/a 12,470
(1.95 %)
23,352
(2.42 %)
n/a 41.81
(97.98 %)
0
(0 %)
857
(2.02 %)
205
(100.00 %)
529,829
(9.55 %)
357,586
(2.56 %)
6,359,599
(20.12 %)
3
(0.00 %)
246,785
(1.53 %)
27,755
(2.36 %)
21,477
(1.19 %)
356 zebra finch (Blue55 v1.4 primary hap 2021)
GCF_003957565.2
49,311
(7.41 %)
n/a 12,747
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
0
(0 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
544,577
(9.57 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,748
(20.92 %)
3
(0.00 %)
312,137
(1.80 %)
29,202
(2.47 %)
22,084
(1.22 %)
TOTALS:total assembly count 356

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 215 assemblies assembly stats track stats
Mammals 538 assemblies assembly stats track stats
Birds 356 assemblies assembly stats track stats
Fishes 391 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 222 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 717 assemblies assembly stats track stats
Plants 299 assemblies assembly stats track stats
Fungi 662 assemblies assembly stats track stats
Viruses 281 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 103 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 442 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 882 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats