Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1
n/a n/a 22,095
(0.63 %)
44,942
(0.68 %)
n/a 40.25
(99.86 %)
15,429
(0.03 %)
15,429
(0.03 %)
2,690,873
(99.97 %)
8,755,250
(34.47 %)
869,360
(1.26 %)
22,002,517
(59.65 %)
146
(0.00 %)
n/a 39,239
(0.49 %)
27,849
(0.37 %)
2 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024 genbank)
GCA_043250625.1
n/a n/a 15,735
(2.44 %)
50,184
(6.16 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
0
(0 %)
471
(0.01 %)
203
(100.00 %)
1,781,283
(37.65 %)
444,047
(7.93 %)
4,765,080
(37.01 %)
6
(0.00 %)
706,869
(5.97 %)
39,918
(2.01 %)
18,319
(0.92 %)
3 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank)
GCA_027172205.1
57,514
(54.61 %)
n/a 14,340
(1.37 %)
20,053
(2.31 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
0
(0 %)
30
(0.00 %)
27
(100.00 %)
832,937
(4.17 %)
474,203
(4.04 %)
7,020,288
(38.29 %)
2
(0.00 %)
631,733
(3.50 %)
94,745
(2.70 %)
19,879
(0.76 %)
4 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1
61,159
(3.82 %)
n/a 23,424
(1.78 %)
27,990
(2.23 %)
n/a 38.98
(88.63 %)
216,028
(11.39 %)
216,028
(11.39 %)
324,061
(88.61 %)
1,726,079
(12.81 %)
680,428
(2.28 %)
13,887,586
(35.94 %)
2,660
(0.08 %)
n/a 85,680
(0.94 %)
12,234
(0.16 %)
5 African grass rat (v1 paternal X 2020 genbank)
GCA_011762505.1
45,963
(36.56 %)
n/a 20,933
(2.00 %)
19,613
(1.43 %)
37,929
(2.32 %)
41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,940,083
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
2
(0.00 %)
1,027,357
(2.09 %)
17,767
(0.51 %)
16,848
(0.46 %)
6 African malaria mosquito (PEST 2006)
GCA_000005575.1
n/a 14,608
(8.95 %)
5,478
(2.34 %)
30,482
(13.88 %)
n/a 44.27
(95.26 %)
55
(0.21 %)
8,735
(4.75 %)
8,115
(99.79 %)
241,805
(14.48 %)
72,702
(2.39 %)
1,434,880
(21.28 %)
6
(0.01 %)
77,560
(3.59 %)
25,507
(8.25 %)
24,151
(5.88 %)
7 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1
46,043
(34.84 %)
n/a 19,181
(1.25 %)
19,665
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,337,637
(57.82 %)
365,796
(0.88 %)
16,073,052
(44.89 %)
11
(0.00 %)
417,291
(1.06 %)
33,513
(0.68 %)
24,486
(0.51 %)
8 alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018)
GCF_003710045.1
27,736
(10.71 %)
n/a 4,020
(1.34 %)
42,185
(10.12 %)
n/a 40.41
(94.37 %)
0
(0 %)
14,031
(5.59 %)
95,883
(100.00 %)
112,828
(2.21 %)
95,886
(3.63 %)
2,006,114
(27.47 %)
1
(0.00 %)
49,074
(1.16 %)
23,832
(3.81 %)
20,331
(3.23 %)
9 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1
n/a n/a 18,513
(1.97 %)
19,112
(1.70 %)
31,905
(1.94 %)
41.46
(99.38 %)
23,458
(0.62 %)
23,458
(0.62 %)
75,733
(99.38 %)
3,095,742
(36.41 %)
314,508
(1.07 %)
12,365,152
(25.46 %)
83
(0.00 %)
120,145
(0.60 %)
53,956
(1.50 %)
49,211
(1.30 %)
10 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3
55,001
(3.56 %)
n/a 18,437
(1.94 %)
18,446
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
0
(0 %)
166,280
(4.17 %)
77,390
(100.00 %)
3,150,224
(36.21 %)
315,108
(1.36 %)
12,461,739
(24.88 %)
1,213
(0.03 %)
207,655
(1.22 %)
54,502
(1.38 %)
49,324
(1.18 %)
11 Alpine marmot (2015)
GCF_001458135.1
35,350
(2.23 %)
n/a 20,139
(1.58 %)
18,286
(1.41 %)
n/a 39.80
(96.07 %)
0
(0 %)
89,362
(3.94 %)
14,543
(100.00 %)
n/a 747,129
(1.83 %)
14,077,162
(30.27 %)
494
(0.01 %)
202,989
(0.77 %)
30,224
(0.63 %)
24,261
(0.48 %)
12 American alligator (2023 genbank)
GCA_030867065.1
n/a n/a 14,487
(0.97 %)
20,444
(1.61 %)
n/a 45.04
(99.81 %)
136
(0.19 %)
136
(0.19 %)
806
(99.81 %)
3,380,365
(43.12 %)
560,127
(2.00 %)
12,524,244
(32.47 %)
1
(0.00 %)
370,300
(1.41 %)
50,852
(2.67 %)
30,117
(1.71 %)
13 American alligator (chrom assembly 2023 genbank)
GCA_030867095.1
60,799
(51.66 %)
n/a 14,382
(0.98 %)
18,601
(1.45 %)
n/a 45.01
(99.30 %)
0
(0 %)
161
(0.70 %)
194
(100.00 %)
3,322,619
(43.19 %)
478,206
(1.77 %)
12,316,391
(32.01 %)
0
(0 %)
334,854
(1.31 %)
49,792
(2.45 %)
29,504
(1.51 %)
14 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1
n/a n/a 22,515
(1.25 %)
34,527
(1.17 %)
n/a 39.58
(99.92 %)
5,769
(0.02 %)
5,769
(0.02 %)
837,916
(99.98 %)
5,101,904
(34.46 %)
552,100
(1.02 %)
15,150,706
(34.57 %)
36
(0.00 %)
n/a 24,558
(0.63 %)
21,525
(0.51 %)
15 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1
38,686
(33.79 %)
n/a 20,215
(1.44 %)
20,845
(1.20 %)
n/a 41.99
(93.39 %)
341,984
(6.63 %)
341,984
(6.63 %)
792,165
(93.37 %)
6,006,931
(47.67 %)
495,106
(1.11 %)
13,902,115
(39.01 %)
8,184
(0.08 %)
978,698
(2.61 %)
90,767
(1.29 %)
43,651
(0.72 %)
16 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1
26,240
(36.96 %)
n/a 17,569
(1.60 %)
20,092
(1.69 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
122,542
(12.82 %)
132,961
(87.18 %)
2,829,934
(29.80 %)
414,895
(1.07 %)
10,968,663
(26.71 %)
1,958
(0.04 %)
269,478
(1.11 %)
44,651
(1.14 %)
26,757
(0.80 %)
17 amphioxus (hap2 2024 genbank)
GCA_035083965.1
n/a n/a 5,217
(0.97 %)
41,736
(12.73 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
0
(0 %)
103
(0.00 %)
34
(100.00 %)
128,505
(1.65 %)
182,123
(8.03 %)
2,157,899
(27.45 %)
0
(0 %)
274,077
(4.65 %)
44,261
(5.21 %)
29,041
(2.94 %)
18 amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016)
GCF_000764305.1
24,008
(8.48 %)
n/a 3,331
(0.47 %)
38,201
(8.97 %)
24,453
(8.50 %)
38.47
(99.52 %)
5,426
(0.48 %)
23,726
(0.48 %)
23,426
(99.52 %)
161,274
(1.72 %)
432,436
(8.89 %)
3,517,080
(28.92 %)
149
(0.01 %)
409,772
(5.41 %)
50,987
(4.44 %)
35,313
(2.58 %)
19 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1
33,668
(37.51 %)
n/a 18,213
(1.58 %)
15,093
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
155,553
(2.44 %)
157,031
(97.56 %)
4,832,679
(42.49 %)
831,134
(1.67 %)
13,654,373
(31.78 %)
59
(0.00 %)
289,887
(0.97 %)
65,229
(1.60 %)
55,104
(1.18 %)
20 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2
n/a n/a 12,258
(1.95 %)
20,580
(2.26 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
0
(0 %)
429
(1.52 %)
160
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,056
(1.51 %)
6,092,351
(20.84 %)
0
(0 %)
152,105
(1.27 %)
17,130
(1.48 %)
15,125
(1.04 %)
21 ant C.costatus (v1 MS0001 2016)
GCF_001594065.1
16,082
(8.44 %)
n/a 4,038
(1.42 %)
32,856
(9.80 %)
n/a 34.73
(95.75 %)
10,626
(4.26 %)
10,626
(4.26 %)
26,005
(95.74 %)
203,498
(3.41 %)
100,483
(2.15 %)
2,221,362
(35.19 %)
127
(0.11 %)
43,690
(1.77 %)
18,108
(3.49 %)
18,662
(3.08 %)
22 ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019)
GCF_005281655.1
28,261
(10.34 %)
n/a 4,915
(1.27 %)
40,257
(10.17 %)
n/a 35.18
(99.51 %)
0
(0 %)
1,076
(0.49 %)
2,869
(100.00 %)
322,753
(4.92 %)
245,412
(6.65 %)
1,952,946
(43.11 %)
0
(0 %)
252,395
(6.75 %)
17,048
(6.08 %)
17,349
(3.45 %)
23 ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI)
GCF_001594075.1
22,023
(8.25 %)
n/a 4,211
(1.25 %)
37,113
(9.30 %)
n/a 35.01
(91.82 %)
40,822
(8.21 %)
40,822
(8.21 %)
60,583
(91.79 %)
218,162
(3.24 %)
139,385
(2.26 %)
2,347,922
(34.62 %)
136
(0.08 %)
54,250
(1.47 %)
23,814
(3.66 %)
21,810
(2.96 %)
24 apicomplexans C.sp. chipmunk genotype I (37763 2021 genbank)
GCA_004936735.2
n/a 3,783
(76.65 %)
426
(3.03 %)
203
(12.39 %)
n/a 32.03
(100.00 %)
0
(0 %)
10
(0.00 %)
50
(100.00 %)
3,358
(1.88 %)
1,257
(0.81 %)
67,711
(20.74 %)
1
(0.00 %)
458
(0.29 %)
4
(0.02 %)
3
(0.01 %)
25 apicomplexans E.tenella (Houghton 2013)
GCA_000499545.1
n/a 38,608
(25.51 %)
326
(0.37 %)
1,632
(4.94 %)
n/a 51.33
(98.72 %)
8,063
(1.32 %)
8,063
(1.32 %)
12,727
(98.68 %)
127,265
(17.42 %)
148,397
(16.77 %)
326,694
(37.33 %)
20
(0.03 %)
37,723
(6.57 %)
12,417
(22.22 %)
4,790
(5.71 %)
26 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank)
GCA_002114115.1
n/a n/a 22,542
(3.52 %)
67,060
(16.20 %)
n/a 38.04
(88.95 %)
0
(0 %)
7,175
(11.05 %)
806
(100.00 %)
692,611
(50.80 %)
322,540
(4.42 %)
3,033,193
(35.58 %)
2
(0.00 %)
451,430
(6.86 %)
25,871
(1.75 %)
13,877
(0.88 %)
27 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1
n/a n/a 18,452
(1.96 %)
16,975
(1.61 %)
n/a 41.29
(98.88 %)
72,775
(1.13 %)
72,775
(1.13 %)
105,347
(98.87 %)
3,079,920
(34.79 %)
319,928
(0.96 %)
12,281,845
(25.28 %)
43
(0.00 %)
88,463
(0.39 %)
48,638
(1.17 %)
44,009
(1.01 %)
28 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1
n/a n/a 22,910
(1.42 %)
31,985
(1.20 %)
35,342
(1.47 %)
41.93
(99.87 %)
9,604
(0.04 %)
9,604
(0.04 %)
1,272,949
(99.96 %)
6,096,013
(44.89 %)
1,265,350
(2.67 %)
14,617,986
(39.29 %)
19
(0.00 %)
594,304
(1.21 %)
64,716
(1.93 %)
61,195
(1.72 %)
29 ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006)
GCF_000149645.2
10,388
(48.16 %)
n/a 1,538
(3.76 %)
6,155
(25.19 %)
n/a 49.56
(99.97 %)
90
(0.03 %)
90
(0.03 %)
466
(99.97 %)
5,026
(0.77 %)
2,256
(0.38 %)
68,790
(5.94 %)
0
(0 %)
710
(0.23 %)
2,846
(42.44 %)
3,973
(22.95 %)
30 ascomycetes A.nidulans (FGSC A4 2012 genbank)
GCA_000149205.2
n/a 35,369
(50.73 %)
1,524
(3.90 %)
5,275
(23.90 %)
n/a 50.30
(99.43 %)
158
(0.58 %)
158
(0.58 %)
249
(99.42 %)
5,218
(3.22 %)
2,452
(0.41 %)
51,693
(4.64 %)
1
(0.00 %)
625
(0.60 %)
1,128
(90.37 %)
1,810
(9.92 %)
31 ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007)
GCF_000002855.3
10,609
(51.05 %)
n/a 1,481
(3.36 %)
5,692
(22.11 %)
n/a 50.35
(99.87 %)
449
(0.13 %)
662
(0.13 %)
469
(99.87 %)
9,986
(1.32 %)
2,619
(0.36 %)
106,480
(7.71 %)
1
(0.00 %)
262
(0.07 %)
5,568
(53.86 %)
6,938
(24.44 %)
32 ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019)
GCF_004011695.1
11,257
(41.02 %)
n/a 1,596
(2.91 %)
8,283
(26.43 %)
n/a 49.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 34
(100.00 %)
14,775
(2.01 %)
16,031
(2.34 %)
103,256
(17.19 %)
0
(0 %)
7,380
(1.61 %)
805
(44.28 %)
832
(32.41 %)
33 ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank)
GCA_000003525.2
n/a 11,865
(30.24 %)
1,516
(1.76 %)
5,714
(11.07 %)
n/a 37.07
(99.50 %)
566
(0.51 %)
566
(0.51 %)
593
(99.49 %)
38,696
(2.74 %)
27,571
(2.05 %)
270,617
(48.64 %)
2
(0.00 %)
31,958
(3.92 %)
8,002
(10.69 %)
7,438
(8.47 %)
34 ascomycetes B.gilchristii (SLH14081 2009 genbank)
GCA_000003855.2
n/a 11,799
(26.55 %)
1,518
(1.57 %)
5,702
(9.73 %)
n/a 35.75
(98.67 %)
1,691
(1.34 %)
1,691
(1.34 %)
1,794
(98.66 %)
42,930
(2.67 %)
27,826
(1.78 %)
328,698
(50.87 %)
0
(0 %)
32,248
(3.50 %)
7,943
(9.35 %)
7,488
(7.50 %)
35 ascomycetes C.auris (B8441 2017)
GCA_002759435.2
n/a 5,586
(65.70 %)
1,944
(12.45 %)
4,981
(62.59 %)
n/a 45.21
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
15
(100.00 %)
3,395
(1.46 %)
2,375
(0.85 %)
48,902
(8.34 %)
0
(0 %)
331
(0.29 %)
1,576
(6.87 %)
1,185
(4.24 %)
36 ascomycetes C.posadasii (C735 delta SOWgp 2009 genban)
GCA_000151335.1
n/a 7,255
(49.92 %)
1,479
(4.26 %)
5,283
(25.22 %)
n/a 46.59
(100.00 %)
33
(0.00 %)
33
(0.00 %)
88
(100.00 %)
10,463
(5.97 %)
5,206
(0.91 %)
74,027
(11.89 %)
0
(0 %)
3,254
(0.84 %)
4,784
(34.49 %)
4,865
(16.04 %)
37 ascomycetes F.oxysporum (NRRL 32931 2014 genbank)
GCA_000271745.2
n/a 24,097
(64.91 %)
1,503
(2.37 %)
11,741
(30.20 %)
n/a 47.63
(98.55 %)
377
(1.46 %)
377
(1.46 %)
545
(98.54 %)
8,453
(2.23 %)
3,560
(0.37 %)
129,150
(7.65 %)
11
(0.00 %)
1,096
(0.18 %)
14,398
(29.11 %)
11,860
(16.53 %)
38 ascomycetes P.destructans (20631-21 2010 genbank)
GCA_000184105.1
n/a 9,303
(55.05 %)
1,446
(3.95 %)
5,635
(25.84 %)
n/a 50.12
(92.42 %)
1,732
(7.59 %)
2,066
(7.59 %)
3,579
(92.41 %)
11,499
(5.71 %)
11,754
(2.10 %)
87,648
(13.51 %)
22
(0.03 %)
2,836
(0.73 %)
4,483
(54.70 %)
4,759
(18.94 %)
39 ascomycetes P.digitatum (Pd1 2012 genbank)
GCA_000315645.2
n/a 8,963
(49.28 %)
1,461
(4.51 %)
5,599
(29.85 %)
n/a 48.91
(95.53 %)
508
(4.48 %)
516
(4.48 %)
562
(95.52 %)
3,575
(0.59 %)
2,210
(0.38 %)
66,810
(6.03 %)
8
(0.02 %)
344
(0.13 %)
7,344
(38.10 %)
6,767
(25.05 %)
40 ascomycetes P.pennisetigena (Br36 2019 genbank)
GCA_004337985.1
n/a 11,430
(33.47 %)
1,482
(2.32 %)
7,302
(20.85 %)
n/a 47.48
(99.41 %)
0
(0 %)
1,281
(0.60 %)
108
(100.00 %)
24,268
(1.88 %)
11,049
(1.23 %)
163,225
(20.20 %)
5
(0.01 %)
7,142
(1.57 %)
764
(17.56 %)
1,559
(15.28 %)
41 ascomycetes P.rubens (Wisconsin 54-1255 2008 genbank)
GCA_000226395.1
n/a 13,922
(56.71 %)
1,550
(3.72 %)
7,756
(30.06 %)
n/a 48.96
(99.94 %)
0
(0 %)
775
(0.06 %)
49
(100.00 %)
5,678
(0.78 %)
4,560
(0.81 %)
73,645
(5.86 %)
1
(0.01 %)
1,650
(0.43 %)
7,807
(50.55 %)
7,905
(32.71 %)
42 ascomycetes R.enersibuu (CBS 393.64 2015 genbank)
GCA_000968595.1
n/a 9,843
(50.65 %)
1,499
(4.04 %)
3,608
(17.47 %)
n/a 50.55
(99.99 %)
76
(0.00 %)
76
(0.00 %)
938
(100.00 %)
12,877
(1.80 %)
4,459
(0.56 %)
116,737
(10.53 %)
0
(0 %)
117
(0.03 %)
2,561
(81.62 %)
2,992
(17.71 %)
43 ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012)
GCF_000182805.2
9,903
(39.44 %)
n/a 1,311
(2.58 %)
4,612
(17.66 %)
n/a 52.11
(99.64 %)
0
(0 %)
978
(0.36 %)
1,583
(100.00 %)
16,540
(1.85 %)
7,316
(0.76 %)
171,684
(11.10 %)
0
(0 %)
371
(0.08 %)
1,770
(49.40 %)
6,766
(16.80 %)
44 ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank)
GCA_000961545.1
10,279
(51.22 %)
10,434
(48.46 %)
1,134
(2.55 %)
2,026
(10.60 %)
n/a 54.96
(100.00 %)
57
(0.00 %)
57
(0.00 %)
73
(100.00 %)
15,846
(2.28 %)
8,000
(0.94 %)
169,678
(13.75 %)
0
(0 %)
339
(0.06 %)
22
(99.61 %)
22
(0.11 %)
45 ascomycetes T.marneffei (ATCC 18224 2008 genbank)
GCA_000001985.1
n/a 10,749
(60.97 %)
1,532
(4.18 %)
7,679
(34.14 %)
n/a 46.67
(99.38 %)
137
(0.62 %)
137
(0.62 %)
589
(99.38 %)
6,404
(1.04 %)
2,594
(0.58 %)
61,594
(6.70 %)
0
(0 %)
951
(0.36 %)
5,746
(15.84 %)
5,169
(10.66 %)
46 ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank)
GCA_000219625.1
10,941
(44.32 %)
10,965
(38.50 %)
1,451
(2.81 %)
6,906
(25.36 %)
n/a 52.14
(99.98 %)
3
(0.02 %)
3
(0.02 %)
24
(99.98 %)
8,941
(1.69 %)
8,367
(1.51 %)
99,818
(11.14 %)
0
(0 %)
6,612
(1.57 %)
27
(96.31 %)
89
(4.28 %)
47 Asian corn borer (v1 ACB-3 2019)
GCF_004193835.1
25,266
(7.93 %)
n/a 4,931
(1.05 %)
28,608
(7.16 %)
n/a 37.50
(100.00 %)
0
(0 %)
34,722
(0.01 %)
7,722
(100.00 %)
146,974
(1.35 %)
89,987
(2.68 %)
2,666,250
(38.74 %)
899
(0.07 %)
268,435
(6.89 %)
39,696
(5.22 %)
19,418
(2.22 %)
48 Asian corn borer (v2 ACB-3 2019)
GCF_004193835.2
25,169
(7.95 %)
n/a 4,867
(1.05 %)
28,255
(7.08 %)
n/a 37.49
(100.00 %)
0
(0 %)
34,702
(0.01 %)
6,269
(100.00 %)
150,783
(1.53 %)
89,885
(2.69 %)
2,627,296
(38.56 %)
899
(0.07 %)
268,390
(6.92 %)
39,511
(5.22 %)
19,307
(2.21 %)
49 Asian swallowtail (v1 2015)
GCF_000836235.1
22,417
(13.18 %)
n/a 5,290
(2.15 %)
13,925
(7.00 %)
n/a 33.81
(97.56 %)
5,205
(2.44 %)
5,205
(2.44 %)
10,777
(97.56 %)
122,491
(2.29 %)
27,169
(0.71 %)
2,130,840
(38.92 %)
27
(0.01 %)
39,978
(1.31 %)
11,899
(2.85 %)
8,383
(1.82 %)
50 Asian tiger mosquito (C6/36 2017 genbank)
GCA_001876365.2
n/a n/a 10,893
(0.53 %)
128,502
(8.33 %)
n/a 40.42
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,434
(100.00 %)
605,350
(2.88 %)
921,761
(7.40 %)
11,169,474
(57.07 %)
0
(0 %)
1,146,944
(4.60 %)
220,674
(10.38 %)
117,106
(3.58 %)
51 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 genbank
GCA_006496715.1
n/a n/a 10,347
(0.43 %)
138,311
(7.69 %)
n/a 40.40
(99.93 %)
0
(0 %)
3,359
(0.07 %)
2,196
(100.00 %)
691,302
(2.69 %)
1,084,185
(7.47 %)
12,619,495
(57.66 %)
0
(0 %)
1,197,283
(4.46 %)
250,421
(10.15 %)
127,434
(3.51 %)
52 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 refseq)
GCF_006496715.1
49,254
(2.57 %)
n/a 10,500
(0.44 %)
138,307
(7.69 %)
n/a 40.40
(99.93 %)
0
(0 %)
3,359
(0.07 %)
2,197
(100.00 %)
6,821,491
(69.74 %)
1,084,205
(7.47 %)
12,619,646
(57.66 %)
0
(0 %)
1,197,291
(4.46 %)
250,420
(10.13 %)
139,292
(3.15 %)
53 Asiatic tapir (BS100 BIUU 2019)
GCA_004024905.1
n/a n/a 20,854
(1.73 %)
28,046
(1.39 %)
n/a 40.91
(99.96 %)
4,333
(0.02 %)
4,333
(0.02 %)
284,468
(99.98 %)
3,802,671
(39.88 %)
335,521
(0.73 %)
15,053,564
(30.25 %)
11
(0.00 %)
n/a 39,691
(1.17 %)
36,849
(1.05 %)
54 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1
48,976
(40.12 %)
n/a 18,884
(1.76 %)
19,296
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
0
(0 %)
69,593
(1.38 %)
2,166
(100.00 %)
3,855,699
(41.69 %)
289,735
(0.96 %)
14,695,257
(28.58 %)
5,680
(0.23 %)
136,343
(0.85 %)
40,025
(1.06 %)
36,402
(0.92 %)
55 Atlantic halibut (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819705.1
52,117
(66.34 %)
n/a 14,960
(3.20 %)
45,365
(7.48 %)
69,625
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
0
(0 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,421
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,979
(24.13 %)
0
(0 %)
240,110
(3.16 %)
31,325
(2.25 %)
20,749
(1.34 %)
56 Atlantic herring (v1)
GCF_900700415.1
46,216
(9.88 %)
n/a 15,249
(2.65 %)
25,664
(6.68 %)
n/a 44.24
(99.88 %)
1,963
(0.12 %)
1,963
(0.12 %)
1,990
(99.88 %)
1,175,759
(12.03 %)
1,231,613
(13.39 %)
3,511,276
(32.20 %)
2
(0.00 %)
1,037,723
(8.32 %)
33,465
(1.97 %)
20,325
(1.10 %)
57 Atlantic ridley (rLepKem1 hap2 2025 genbank)
GCA_965140265.1
n/a 25,966
(1.91 %)
14,601
(1.02 %)
17,367
(1.50 %)
n/a 44.08
(100.00 %)
245
(0.00 %)
245
(0.00 %)
332
(100.00 %)
1,335,525
(12.58 %)
314,640
(2.13 %)
10,517,469
(34.27 %)
2
(0.00 %)
609,926
(2.40 %)
45,940
(1.37 %)
24,119
(0.60 %)
58 Atlantic salmon (genbank 2021)
GCA_905237065.2
n/a n/a 28,077
(1.40 %)
120,383
(3.99 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
4,501,521
(48.00 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
0
(0 %)
4,866,269
(10.20 %)
77,089
(1.86 %)
20,127
(0.31 %)
59 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1
60,922
(45.62 %)
n/a 12,545
(0.38 %)
29,428
(1.34 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,648
(0.01 %)
2,990
(100.00 %)
8,579,105
(49.81 %)
831,224
(15.75 %)
21,718,213
(51.79 %)
9
(0.00 %)
4,445,293
(7.00 %)
105,821
(2.42 %)
35,197
(0.42 %)
60 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3
11,460
(14.87 %)
n/a 2,843
(2.29 %)
3,797
(4.95 %)
n/a 30.21
(92.98 %)
2,303
(6.97 %)
58,744
(7.04 %)
26,881
(93.03 %)
147,614
(11.55 %)
54,885
(7.91 %)
647,155
(33.62 %)
55
(0.02 %)
69,072
(5.04 %)
509
(0.15 %)
126
(0.04 %)
61 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1
52,178
(47.52 %)
n/a 18,330
(1.96 %)
17,094
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
31,980
(0.69 %)
67,434
(99.31 %)
3,072,373
(34.88 %)
306,996
(0.95 %)
12,209,895
(25.43 %)
58
(0.01 %)
73,572
(0.41 %)
49,789
(1.25 %)
45,112
(1.08 %)
62 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 genbank)
GCA_036971685.1
n/a n/a 13,319
(1.60 %)
25,993
(2.05 %)
n/a 43.83
(99.41 %)
0
(0 %)
219
(0.59 %)
453
(100.00 %)
700,173
(13.18 %)
457,546
(13.85 %)
4,523,003
(31.73 %)
2
(0.00 %)
1,089,353
(5.57 %)
42,686
(7.00 %)
31,415
(1.62 %)
63 banded archerfish (primary hap 2021 genbank)
GCA_017976425.1
42,399
(57.52 %)
n/a 15,312
(3.18 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
0
(0 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
811,892
(18.19 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
1
(0.00 %)
297,728
(3.49 %)
15,089
(0.96 %)
9,304
(0.55 %)
64 barn owl (2020)
GCF_902150015.1
37,361
(4.54 %)
n/a 12,958
(1.72 %)
22,922
(1.99 %)
26,976
(3.04 %)
41.55
(99.23 %)
0
(0 %)
177,340
(0.79 %)
21,504
(100.00 %)
585,627
(5.48 %)
367,764
(2.44 %)
7,399,161
(19.58 %)
6,614
(0.13 %)
188,767
(2.21 %)
47,061
(3.25 %)
41,356
(2.24 %)
65 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1
15,006
(2.07 %)
n/a 11,133
(1.44 %)
21,138
(1.69 %)
n/a 40.21
(99.24 %)
109,223
(0.79 %)
109,223
(0.79 %)
171,345
(99.21 %)
413,761
(3.90 %)
181,353
(0.91 %)
6,776,326
(18.43 %)
2
(0.00 %)
15,140
(0.13 %)
10,575
(0.29 %)
9,101
(0.25 %)
66 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021)
GCA_015227805.2
n/a n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,546
(2.82 %)
29,760
(1.66 %)
67 barn swallow (v2 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.1
43,374
(5.14 %)
n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,546
(2.82 %)
29,760
(1.66 %)
68 barn swallow (v3 primary hap 2021 genbank)
GCA_015227805.3
n/a n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,548
(2.85 %)
29,760
(1.66 %)
69 barramundi perch (ASB-BC8 2016)
GCF_001640805.1
50,205
(13.10 %)
n/a 16,166
(3.05 %)
25,084
(6.20 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
110
(0.00 %)
3,808
(100.00 %)
465,997
(3.11 %)
237,955
(4.36 %)
4,027,027
(23.91 %)
0
(0 %)
248,089
(3.21 %)
16,276
(1.04 %)
9,104
(0.52 %)
70 basidiomycetes A.bisporus (H97 2012)
GCF_000300575.1
10,448
(49.20 %)
n/a 1,066
(2.53 %)
5,238
(16.95 %)
n/a 46.48
(99.32 %)
225
(0.68 %)
225
(0.68 %)
254
(99.32 %)
4,921
(0.90 %)
2,352
(0.47 %)
62,603
(9.90 %)
0
(0 %)
7,487
(2.92 %)
5,244
(15.19 %)
4,407
(9.08 %)
71 basidiomycetes C.cinerea (okayama7#130 2010 genbank)
GCA_000182895.1
n/a 13,661
(52.73 %)
1,050
(2.04 %)
3,917
(10.89 %)
n/a 51.64
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
68
(100.00 %)
n/a 3,805
(0.81 %)
107,373
(7.81 %)
0
(0 %)
2,879
(1.50 %)
81
(99.54 %)
135
(0.47 %)
72 basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7841 2024 genbank)
GCA_001720195.2
n/a 6,409
(59.64 %)
921
(4.16 %)
4,119
(24.79 %)
n/a 44.80
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8
(100.00 %)
2,424
(0.66 %)
1,011
(0.30 %)
56,356
(7.99 %)
0
(0 %)
901
(0.80 %)
1,869
(7.30 %)
1,482
(5.65 %)
73 basidiomycetes C.neoformans (JEC21 2005 genbank)
GCA_000091045.1
n/a 6,999
(68.28 %)
957
(3.66 %)
3,784
(19.12 %)
n/a 48.54
(99.99 %)
85
(0.01 %)
85
(0.01 %)
99
(99.99 %)
4,944
(5.25 %)
1,808
(0.52 %)
68,717
(8.41 %)
2
(0.00 %)
1,433
(1.21 %)
5,128
(28.73 %)
3,532
(11.09 %)
74 basidiomycetes K.bestiolae (CBS 10118 2024 genbank)
GCA_000512585.3
n/a 9,175
(54.34 %)
918
(2.66 %)
4,907
(18.38 %)
n/a 47.29
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8
(100.00 %)
7,245
(1.32 %)
2,141
(0.47 %)
97,927
(9.78 %)
0
(0 %)
863
(0.56 %)
4,995
(11.17 %)
3,011
(4.94 %)
75 basidiomycetes K.bestiolae (v1 CBS 10118 2016)
GCF_000512585.1
9,187
(54.88 %)
n/a 867
(2.56 %)
4,441
(17.03 %)
n/a 47.25
(99.94 %)
30
(0.06 %)
30
(0.06 %)
42
(99.94 %)
7,231
(1.31 %)
1,919
(0.32 %)
110,288
(10.48 %)
3
(0.00 %)
63
(0.02 %)
4,972
(10.95 %)
2,807
(4.52 %)
76 basidiomycetes K.dejecticola (CBS 10117 2024 genbank)
GCA_000512565.3
n/a 8,696
(55.58 %)
910
(2.69 %)
4,861
(19.78 %)
n/a 48.39
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11
(100.00 %)
7,778
(1.42 %)
2,452
(0.43 %)
86,630
(7.97 %)
0
(0 %)
812
(0.23 %)
3,644
(14.24 %)
3,514
(7.22 %)
77 basidiomycetes K.dejecticola (v1 CBS 10117 2016)
GCF_000512565.1
8,645
(55.47 %)
n/a 908
(2.72 %)
4,862
(19.87 %)
n/a 48.38
(99.98 %)
56
(0.02 %)
56
(0.02 %)
69
(99.98 %)
7,816
(1.43 %)
2,425
(0.42 %)
85,868
(7.91 %)
14
(0.01 %)
48
(0.02 %)
3,698
(15.12 %)
3,518
(7.28 %)
78 basidiomycetes K.mangroviensis (v1 CBS 8507 2016 refseq)
GCF_000507465.1
8,471
(55.95 %)
n/a 884
(2.79 %)
5,418
(21.48 %)
n/a 44.88
(99.73 %)
43
(0.27 %)
43
(0.27 %)
105
(99.73 %)
6,509
(1.21 %)
1,529
(0.25 %)
101,733
(9.98 %)
2
(0.00 %)
24
(0.01 %)
2,326
(4.59 %)
1,405
(2.26 %)
79 basidiomycetes K.mangroviensis (v2 CBS 8507 2024 genbank)
GCA_000507465.4
n/a 8,582
(55.68 %)
886
(2.74 %)
5,392
(21.25 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4
(100.00 %)
6,585
(1.21 %)
1,546
(0.27 %)
104,495
(10.38 %)
0
(0 %)
1,321
(0.50 %)
2,335
(5.10 %)
1,396
(2.19 %)
80 basidiomycetes K.pini (v1 CBS 10737 2016)
GCF_000512605.1
7,854
(58.26 %)
n/a 816
(2.92 %)
5,392
(23.35 %)
n/a 40.23
(99.94 %)
24
(0.06 %)
24
(0.06 %)
42
(99.94 %)
6,502
(1.34 %)
1,847
(0.36 %)
99,393
(12.25 %)
3
(0.00 %)
46
(0.02 %)
1,191
(2.91 %)
956
(2.10 %)
81 basidiomycetes K.shandongensis (v1 CBS 12478 2019)
GCF_008629635.1
7,454
(55.86 %)
n/a 893
(2.94 %)
3,348
(15.13 %)
n/a 49.82
(99.99 %)
0
(0 %)
11
(0.01 %)
132
(100.00 %)
5,510
(1.13 %)
1,598
(0.33 %)
81,983
(9.00 %)
2
(0.00 %)
105
(0.05 %)
512
(39.06 %)
1,900
(4.96 %)
82 basidiomycetes M.globosa (v1 CBS 7966 2007)
GCF_000181695.1
4,286
(69.39 %)
n/a 1,060
(8.79 %)
2,585
(44.95 %)
n/a 52.06
(100.00 %)
22
(0.00 %)
22
(0.00 %)
89
(100.00 %)
1,777
(0.93 %)
720
(0.48 %)
22,182
(4.73 %)
0
(0 %)
252
(0.26 %)
124
(60.74 %)
105
(31.95 %)
83 basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010)
GCF_000143185.1
13,192
(49.72 %)
n/a 894
(1.60 %)
973
(2.80 %)
n/a 57.50
(98.57 %)
316
(1.43 %)
316
(1.43 %)
352
(98.57 %)
7,478
(4.11 %)
7,640
(1.13 %)
176,404
(11.51 %)
1
(0.00 %)
5,378
(1.90 %)
38
(40.33 %)
55
(0.23 %)
84 bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016)
GCF_001652005.1
25,020
(17.94 %)
n/a 4,205
(2.34 %)
27,352
(12.83 %)
n/a 41.09
(91.93 %)
0
(0 %)
19,248
(8.05 %)
50,565
(100.00 %)
57,833
(1.39 %)
27,440
(2.49 %)
1,173,760
(18.39 %)
416
(0.39 %)
14,577
(3.60 %)
10,942
(2.61 %)
10,587
(2.22 %)
85 bee E.mexicana (v1 0111107269 2016)
GCF_001483705.1
16,406
(4.01 %)
n/a 4,087
(0.75 %)
46,846
(6.53 %)
16,764
(4.04 %)
40.92
(95.72 %)
25,039
(4.23 %)
25,039
(4.23 %)
212,650
(95.77 %)
641,987
(7.51 %)
360,406
(11.43 %)
3,411,951
(46.01 %)
306
(0.12 %)
259,979
(5.86 %)
40,540
(3.99 %)
18,218
(1.75 %)
86 beet (2015)
GCF_000511025.2
37,803
(8.76 %)
n/a 12,044
(2.14 %)
63,283
(17.52 %)
n/a 36.14
(91.40 %)
30,962
(8.61 %)
30,962
(8.61 %)
71,208
(91.39 %)
288,084
(4.25 %)
299,650
(4.72 %)
3,021,571
(30.10 %)
1,360
(0.22 %)
218,658
(4.15 %)
32,547
(2.39 %)
20,111
(1.55 %)
87 Bellinger river turtle (v1 BRST_UC0152H_USYD 2024)
GCA_040894355.1
n/a n/a 14,732
(1.14 %)
18,988
(1.77 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
0
(0 %)
57
(0.00 %)
129
(100.00 %)
1,130,950
(11.22 %)
213,212
(1.80 %)
11,049,280
(26.48 %)
1
(0.00 %)
312,478
(1.26 %)
53,923
(2.09 %)
34,762
(1.11 %)
88 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017)
GCA_002288925.2
n/a n/a 18,686
(1.78 %)
20,378
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.66 %)
28,398
(1.35 %)
28,398
(1.35 %)
35,369
(98.65 %)
4,001,688
(43.72 %)
542,326
(1.10 %)
12,806,249
(34.24 %)
954
(0.02 %)
386,729
(1.71 %)
59,279
(1.53 %)
42,903
(1.24 %)
89 Betapolyomavirus macacae (2000)
GCA_000837645.1
n/a 18
(99.29 %)
n/a n/a n/a 40.76
(99.94 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(4.54 %)
15
(4.33 %)
0
(0 %)
0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
90 bighorn sheep (v1 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.1
75,387
(2.66 %)
n/a 18,667
(1.37 %)
20,248
(1.35 %)
n/a 44.07
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
41
(100.00 %)
3,081,260
(20.10 %)
796,298
(12.14 %)
12,235,764
(46.75 %)
0
(0 %)
703,302
(1.83 %)
50,538
(11.18 %)
38,494
(0.86 %)
91 black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018)
GCF_000002775.4
59,636
(15.47 %)
n/a 20,361
(4.67 %)
44,177
(15.83 %)
n/a 33.75
(97.43 %)
6,871
(2.58 %)
6,871
(2.58 %)
8,318
(97.42 %)
402,600
(27.63 %)
177,746
(4.65 %)
2,639,214
(36.04 %)
34
(0.01 %)
246,517
(5.54 %)
4,559
(0.56 %)
1,801
(0.17 %)
92 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 genbank)
GCA_022577435.1
n/a n/a 14,991
(3.02 %)
47,106
(6.98 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
0
(0 %)
234
(0.00 %)
230
(100.00 %)
1,017,149
(18.99 %)
360,899
(8.75 %)
3,761,526
(28.91 %)
0
(0 %)
469,043
(4.64 %)
48,360
(4.43 %)
30,659
(2.05 %)
93 black rhinoceros (primary hap 2021 genbank)
GCA_020826845.1
56,255
(36.51 %)
n/a 18,774
(1.38 %)
22,346
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
0
(0 %)
215
(0.05 %)
1,075
(100.00 %)
4,200,385
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,639
(40.14 %)
2
(0.00 %)
984,722
(2.61 %)
43,525
(1.14 %)
33,963
(0.76 %)
94 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016)
GCA_001698545.1
59,197
(39.21 %)
n/a 21,244
(1.88 %)
23,681
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
0
(0 %)
149,843
(5.88 %)
105,030
(100.00 %)
5,600,915
(50.57 %)
991,762
(2.45 %)
16,353,992
(34.26 %)
4,262
(0.14 %)
867,902
(3.08 %)
81,205
(1.19 %)
29,129
(0.68 %)
95 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016)
GCF_001698545.1
59,210
(2.48 %)
n/a 21,256
(1.89 %)
23,679
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
0
(0 %)
149,843
(5.88 %)
105,031
(100.00 %)
5,602,009
(50.58 %)
991,745
(2.45 %)
16,354,078
(34.26 %)
4,262
(0.14 %)
n/a 81,205
(1.19 %)
29,123
(0.68 %)
96 black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020)
GCF_013377495.1
41,255
(4.77 %)
n/a 12,955
(1.98 %)
22,656
(2.28 %)
31,476
(5.07 %)
41.95
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 396
(100.00 %)
680,976
(7.66 %)
296,152
(1.44 %)
6,797,141
(21.40 %)
0
(0 %)
86,777
(0.79 %)
31,750
(3.32 %)
30,007
(2.00 %)
97 black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020)
GCF_015228065.1
35,910
(2.41 %)
n/a 3,903
(0.15 %)
39,667
(2.27 %)
40,959
(2.59 %)
36.64
(83.75 %)
0
(0 %)
1,158,725
(16.44 %)
26,876
(100.00 %)
5,488,723
(29.98 %)
7,028,944
(21.91 %)
10,445,796
(49.62 %)
239
(0.01 %)
4,167,031
(8.98 %)
178,205
(3.43 %)
77,006
(1.37 %)
98 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1
51,115
(48.16 %)
n/a 13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
0
(0 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
8
(0.00 %)
651,836
(3.67 %)
45,318
(4.71 %)
36,668
(1.67 %)
99 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1
41,018
(2.61 %)
n/a 4,064
(0.14 %)
135,587
(7.67 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,977
(100.00 %)
1,153,773
(4.93 %)
754,711
(7.52 %)
10,964,182
(43.13 %)
0
(0 %)
805,883
(3.13 %)
138,831
(8.38 %)
232,611
(7.21 %)
100 black-legged tick (Wikel colony 2008 genbank)
GCA_000208615.1
n/a 24,903
(1.43 %)
3,432
(0.19 %)
108,471
(5.13 %)
n/a 45.22
(78.65 %)
201,145
(21.35 %)
201,145
(21.35 %)
570,637
(78.65 %)
656,957
(3.38 %)
365,918
(1.61 %)
8,574,437
(27.02 %)
124
(0.01 %)
n/a 345,141
(14.15 %)
189,691
(5.45 %)
101 blackcap (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819655.1
n/a n/a 12,378
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
0
(0 %)
413
(1.12 %)
189
(100.00 %)
506,242
(6.14 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,567
(19.76 %)
0
(0 %)
190,210
(1.30 %)
26,838
(2.34 %)
22,667
(1.33 %)
102 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 genbank)
GCA_025265405.1
47,540
(38.02 %)
n/a 19,042
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
0
(0 %)
97
(0.03 %)
73
(100.00 %)
3,964,035
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,162
(41.78 %)
1
(0.00 %)
1,795,618
(5.01 %)
70,851
(1.80 %)
37,949
(0.93 %)
103 bloodfluke planorb (v1 BB02 2013 refseq)
GCF_000457365.1
42,216
(5.95 %)
n/a 3,558
(0.29 %)
24,115
(2.96 %)
n/a 35.99
(98.05 %)
76,921
(1.91 %)
76,921
(1.91 %)
408,322
(98.09 %)
629,362
(4.20 %)
749,383
(9.40 %)
6,932,184
(43.02 %)
435
(0.03 %)
800,142
(5.40 %)
16,970
(0.64 %)
6,405
(0.27 %)
104 bloodfluke planorb (v2 BB02 2013 genbank)
GCA_000457365.2
n/a n/a 3,378
(0.29 %)
23,684
(2.94 %)
n/a 35.99
(98.05 %)
76,903
(1.91 %)
76,903
(1.91 %)
406,924
(98.09 %)
587,583
(3.57 %)
749,212
(9.41 %)
6,921,847
(43.04 %)
434
(0.03 %)
n/a 16,561
(0.63 %)
6,013
(0.25 %)
105 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2
n/a n/a 19,164
(1.81 %)
20,546
(1.41 %)
34,210
(1.86 %)
40.88
(98.91 %)
0
(0 %)
936
(1.09 %)
130
(100.00 %)
3,999,202
(44.22 %)
581,540
(1.22 %)
12,900,977
(34.62 %)
2
(0.00 %)
424,951
(1.36 %)
67,189
(1.73 %)
46,700
(1.41 %)
106 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1
47,312
(59.52 %)
n/a 14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
0
(0 %)
455,135
(4.01 %)
29,050
(1.48 %)
14,672
(0.63 %)
107 blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq)
GCF_900634775.1
47,312
(7.12 %)
n/a 14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
0
(0 %)
455,135
(4.01 %)
29,050
(1.48 %)
14,672
(0.63 %)
108 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021)
GCF_016699345.1
53,030
(2.41 %)
n/a 20,599
(1.98 %)
21,182
(1.34 %)
46,441
(1.87 %)
40.95
(99.56 %)
1,074
(0.44 %)
1,074
(0.44 %)
2,790
(99.56 %)
5,098,799
(47.87 %)
946,231
(3.04 %)
14,608,771
(36.99 %)
14
(0.00 %)
1,335,352
(2.84 %)
37,273
(1.03 %)
32,351
(0.89 %)
109 Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011)
GCF_000235385.1
39,820
(2.33 %)
n/a 20,222
(2.04 %)
18,404
(1.34 %)
49,071
(2.26 %)
40.77
(94.98 %)
148,728
(5.04 %)
148,728
(5.04 %)
151,414
(94.96 %)
4,710,420
(46.30 %)
767,602
(1.48 %)
14,489,703
(32.96 %)
1,541
(0.02 %)
526,235
(1.31 %)
32,474
(0.75 %)
29,285
(0.67 %)
110 Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028885525.1
n/a n/a 19,820
(1.76 %)
20,399
(1.15 %)
n/a 40.98
(99.88 %)
36
(0.12 %)
36
(0.12 %)
251
(99.88 %)
5,232,617
(54.01 %)
1,003,539
(10.19 %)
14,858,575
(42.10 %)
0
(0 %)
2,511,941
(4.39 %)
42,467
(1.24 %)
29,563
(0.80 %)
111 Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023 refseq)
GCF_028885625.1
81,966
(2.93 %)
n/a 20,794
(1.72 %)
21,307
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.86 %)
39
(0.14 %)
39
(0.14 %)
1,593
(99.86 %)
5,651,267
(54.21 %)
1,155,151
(9.33 %)
16,242,823
(42.82 %)
0
(0 %)
2,513,241
(4.25 %)
52,294
(2.02 %)
36,160
(1.02 %)
112 boutu (BS63 2019)
GCA_004363515.1
n/a n/a 21,835
(1.38 %)
35,087
(1.18 %)
n/a 42.09
(99.89 %)
5,072
(0.02 %)
5,072
(0.02 %)
1,218,682
(99.98 %)
5,098,108
(45.85 %)
856,878
(2.32 %)
13,046,921
(40.74 %)
29
(0.00 %)
n/a 63,992
(1.47 %)
47,092
(1.19 %)
113 bowfin (hap1 2024 genbank)
GCA_036373705.1
n/a n/a 13,851
(1.83 %)
27,058
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
97
(0.00 %)
390
(100.00 %)
953,497
(13.69 %)
387,700
(7.91 %)
4,552,410
(37.72 %)
4
(0.00 %)
613,799
(6.38 %)
46,301
(2.99 %)
26,437
(1.15 %)
114 Brazilian free-tailed bat (US034 2019)
GCA_004025005.1
n/a n/a 23,562
(1.20 %)
51,200
(1.27 %)
n/a 42.40
(99.91 %)
4,243
(0.02 %)
4,243
(0.02 %)
1,071,858
(99.98 %)
4,884,584
(32.93 %)
777,032
(1.49 %)
14,195,446
(36.38 %)
31
(0.00 %)
n/a 89,940
(1.88 %)
76,243
(1.50 %)
115 brown anole (Geneva1000 2022 genbank)
GCA_025583915.1
38,099
(52.40 %)
n/a 14,028
(1.05 %)
19,927
(1.81 %)
n/a 41.14
(98.37 %)
0
(0 %)
114,440
(1.64 %)
3,738
(100.00 %)
1,376,455
(6.78 %)
1,094,843
(5.18 %)
9,127,396
(44.98 %)
261
(0.01 %)
1,132,418
(4.31 %)
46,291
(1.18 %)
17,324
(0.40 %)
116 brown argus (genbank 2021)
GCA_905147365.1
23,611
(63.03 %)
n/a 4,734
(1.03 %)
24,267
(6.80 %)
24,237
(6.16 %)
36.86
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
26
(100.00 %)
264,378
(2.90 %)
144,255
(3.35 %)
2,651,028
(48.44 %)
0
(0 %)
205,174
(4.19 %)
35,431
(4.56 %)
15,409
(1.89 %)
117 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1
53,993
(3.19 %)
n/a 18,811
(1.78 %)
21,058
(1.52 %)
39,408
(1.98 %)
41.84
(99.31 %)
15,552
(0.70 %)
17,380
(0.70 %)
21,814
(99.30 %)
4,283,780
(41.29 %)
567,588
(1.23 %)
13,807,277
(30.86 %)
760
(0.01 %)
325,786
(0.96 %)
62,126
(1.80 %)
56,003
(1.56 %)
118 brown bear (v1.0 2022 WashU)
GCF_023065955.1
60,162
(4.01 %)
n/a 18,920
(1.66 %)
21,641
(1.49 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
0
(0 %)
215
(0.00 %)
902
(100.00 %)
4,166,472
(34.00 %)
659,124
(5.14 %)
13,282,996
(33.88 %)
0
(0 %)
788,951
(2.62 %)
68,113
(2.27 %)
61,162
(1.99 %)
119 brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020)
GCF_013339695.1
39,606
(2.36 %)
n/a 3,965
(0.13 %)
116,426
(5.96 %)
45,849
(2.46 %)
46.86
(99.96 %)
0
(0 %)
10,359
(0.04 %)
2,329
(100.00 %)
1,064,424
(3.53 %)
716,579
(3.47 %)
10,608,171
(42.78 %)
1
(0.00 %)
n/a 13,204
(0.97 %)
233,049
(6.32 %)
120 brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020)
GCF_012460135.1
31,379
(5.19 %)
n/a 12,572
(1.89 %)
24,442
(2.44 %)
26,137
(3.13 %)
42.40
(99.99 %)
278
(0.01 %)
278
(0.01 %)
691
(99.99 %)
504,872
(6.53 %)
420,620
(3.73 %)
6,496,619
(21.26 %)
0
(0 %)
353,680
(2.15 %)
28,576
(2.39 %)
22,561
(1.23 %)
121 brown planthopper (v1 BPH 2020 genbank)
GCA_014356525.1
36,936
(60.13 %)
n/a 4,416
(0.37 %)
22,354
(3.57 %)
37,534
(4.91 %)
34.69
(99.96 %)
0
(0 %)
4,529
(0.04 %)
7,093
(100.00 %)
597,351
(3.69 %)
564,076
(6.64 %)
6,601,703
(47.48 %)
11
(0.00 %)
905,418
(9.48 %)
39,697
(1.55 %)
15,292
(0.62 %)
122 brown planthopper (v1 BPH 2020 refseq)
GCF_014356525.1
36,949
(4.89 %)
n/a 4,427
(0.37 %)
22,417
(3.57 %)
37,573
(4.91 %)
34.69
(99.96 %)
0
(0 %)
4,529
(0.04 %)
7,094
(100.00 %)
597,178
(3.69 %)
564,092
(6.64 %)
6,601,918
(47.49 %)
11
(0.00 %)
905,421
(9.48 %)
39,697
(1.55 %)
15,292
(0.62 %)
123 budding yeast C.auris (6684 2015 genbank)
GCA_001189475.1
n/a 7,564
(65.02 %)
1,948
(12.61 %)
4,664
(59.90 %)
n/a 45.12
(98.69 %)
0
(0 %)
689
(1.33 %)
99
(100.00 %)
3,478
(1.23 %)
2,281
(0.83 %)
48,703
(8.19 %)
27
(0.12 %)
258
(0.23 %)
1,579
(6.36 %)
1,147
(4.11 %)
124 budding yeast C.auris (B11221 2017 genbank)
GCA_002775015.1
n/a 5,715
(64.44 %)
2,030
(12.92 %)
4,702
(58.30 %)
n/a 45.32
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
20
(100.00 %)
3,464
(2.27 %)
2,436
(0.80 %)
28,524
(6.96 %)
0
(0 %)
1,194
(1.58 %)
1,757
(7.37 %)
1,331
(4.92 %)
125 budding yeast C.lusitaniae (ATCC 42720 2009 genbank)
GCA_000003835.1
n/a 6,153
(65.84 %)
1,956
(12.86 %)
4,335
(54.85 %)
n/a 44.50
(99.71 %)
79
(0.29 %)
79
(0.29 %)
88
(99.71 %)
2,272
(1.18 %)
4,036
(1.77 %)
48,188
(8.66 %)
0
(0 %)
697
(0.55 %)
1,474
(15.82 %)
1,218
(9.79 %)
126 budding yeast C.oxycetoniae (v1 CBS 10844 2022)
GCF_023343755.1
4,917
(62.59 %)
n/a 1,845
(11.42 %)
4,476
(56.70 %)
n/a 37.84
(99.95 %)
0
(0 %)
167
(0.05 %)
148
(100.00 %)
14,118
(4.93 %)
19,713
(8.99 %)
82,014
(21.64 %)
3
(0.01 %)
4,249
(2.09 %)
201
(0.52 %)
34
(0.08 %)
127 budding yeast K.marxianus (DMKU3-1042 2014 genbank)
GCA_001417885.1
n/a 5,342
(68.28 %)
3,349
(28.79 %)
4,665
(66.28 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 9
(100.00 %)
7,406
(3.43 %)
3,781
(1.46 %)
51,732
(11.80 %)
0
(0 %)
614
(0.85 %)
742
(4.91 %)
562
(2.75 %)
128 budding yeast L.elongisporus (NRRL YB-4239 2007 genbank)
GCA_000149685.1
n/a 5,905
(57.07 %)
1,905
(9.82 %)
5,004
(52.37 %)
n/a 36.94
(99.45 %)
117
(0.56 %)
117
(0.56 %)
145
(99.44 %)
30,880
(10.91 %)
18,155
(4.10 %)
100,210
(23.18 %)
0
(0 %)
1,604
(1.36 %)
22
(0.04 %)
19
(0.04 %)
129 budding yeast N.glabratus (CBS 138 2008 genbank)
GCA_000002545.2
n/a 5,552
(64.50 %)
3,553
(27.93 %)
4,799
(61.37 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
16
(100.00 %)
3,047
(1.32 %)
2,546
(1.58 %)
59,567
(11.20 %)
0
(0 %)
804
(0.77 %)
635
(3.11 %)
567
(2.52 %)
130 budding yeast Y.lipolytica (CLIB122 2004 genbank)
GCA_000002525.1
n/a 8,157
(46.30 %)
1,755
(6.59 %)
4,802
(37.76 %)
n/a 49.05
(99.99 %)
28
(0.01 %)
28
(0.01 %)
34
(99.99 %)
7,553
(2.98 %)
9,578
(2.12 %)
81,595
(9.59 %)
0
(0 %)
960
(0.42 %)
6,216
(33.42 %)
5,390
(18.49 %)
131 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1
32,026
(47.01 %)
n/a 13,250
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
26,324
(3.11 %)
41.80
(99.72 %)
0
(0 %)
284
(0.28 %)
865
(100.00 %)
539,059
(10.20 %)
279,511
(3.12 %)
5,874,608
(22.08 %)
1
(0.00 %)
324,823
(2.05 %)
21,155
(1.61 %)
17,590
(1.10 %)
132 butterfly L.sinapis (2021 genbank)
GCA_905404315.1
25,882
(55.17 %)
n/a 4,722
(0.65 %)
16,896
(3.62 %)
47,660
(8.03 %)
35.73
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
50
(100.00 %)
272,738
(1.92 %)
98,053
(6.01 %)
4,662,765
(51.79 %)
0
(0 %)
376,611
(5.06 %)
43,150
(4.96 %)
13,298
(1.08 %)
133 butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021)
GCA_905475465.1
n/a n/a 4,588
(1.37 %)
11,218
(5.90 %)
42,925
(13.84 %)
33.95
(100.00 %)
0
(0 %)
41
(0.00 %)
43
(100.00 %)
143,323
(2.19 %)
45,473
(3.23 %)
2,501,939
(42.55 %)
0
(0 %)
106,106
(3.41 %)
11,070
(2.07 %)
6,650
(1.23 %)
134 cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147795.1
21,844
(65.09 %)
n/a 4,557
(1.68 %)
9,253
(6.32 %)
30,285
(15.57 %)
33.23
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
40
(100.00 %)
116,781
(2.12 %)
30,577
(1.24 %)
2,300,336
(39.04 %)
0
(0 %)
40,164
(2.03 %)
6,783
(2.24 %)
5,041
(1.33 %)
135 California condor (v1 813 2021 genbank)
GCA_018139145.1
n/a n/a 12,650
(1.75 %)
21,946
(1.95 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
0
(0 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
518,393
(6.41 %)
177,329
(0.88 %)
7,168,675
(20.31 %)
6
(0.00 %)
116,410
(1.11 %)
34,926
(2.94 %)
32,355
(1.72 %)
136 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1
n/a n/a 23,668
(1.61 %)
29,709
(1.32 %)
n/a 41.56
(99.92 %)
10,276
(0.04 %)
10,276
(0.04 %)
582,272
(99.96 %)
4,952,087
(44.00 %)
651,744
(1.26 %)
13,644,805
(35.79 %)
27
(0.00 %)
376,234
(0.87 %)
62,245
(1.50 %)
57,048
(1.32 %)
137 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1
n/a n/a 21,020
(1.79 %)
20,045
(1.39 %)
45,176
(2.15 %)
41.40
(99.28 %)
0
(0 %)
122
(0.72 %)
43
(100.00 %)
4,529,949
(43.67 %)
589,962
(1.24 %)
13,266,465
(33.77 %)
0
(0 %)
491,959
(1.43 %)
51,989
(1.50 %)
48,284
(1.32 %)
138 California two-spot octopus (v1 UCB-OBI-ISO-001 male 2015)
GCF_001194135.1
26,135
(1.83 %)
n/a 3,125
(0.12 %)
17,875
(1.29 %)
27,144
(1.85 %)
36.03
(84.95 %)
548,450
(15.13 %)
548,450
(15.13 %)
700,124
(84.87 %)
3,498,348
(13.19 %)
3,005,729
(6.50 %)
13,687,022
(41.09 %)
20,815
(0.26 %)
912,571
(2.22 %)
22,984
(0.34 %)
4,782
(0.07 %)
139 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1
50,094
(2.69 %)
n/a 18,283
(1.66 %)
19,326
(1.35 %)
38,985
(1.96 %)
41.70
(99.88 %)
0
(0 %)
848
(0.12 %)
66
(100.00 %)
5,016,399
(43.75 %)
904,986
(1.75 %)
13,476,288
(34.20 %)
0
(0 %)
572,992
(1.64 %)
66,822
(2.52 %)
60,494
(2.02 %)
140 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1
n/a n/a 25,543
(0.55 %)
52,506
(0.63 %)
n/a 40.04
(99.84 %)
4,876
(0.01 %)
4,876
(0.01 %)
3,432,954
(99.99 %)
7,363,240
(21.82 %)
876,677
(2.53 %)
25,446,677
(58.18 %)
62
(0.00 %)
n/a 25,319
(0.31 %)
19,908
(0.25 %)
141 capsicum (Zunla-1 2015 genbank)
GCA_000710875.1
n/a n/a 16,133
(0.56 %)
62,445
(2.92 %)
n/a 34.93
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
107,172
(3.23 %)
108,797
(96.77 %)
1,171,727
(3.54 %)
948,641
(4.39 %)
21,533,236
(46.16 %)
331
(0.03 %)
1,512,400
(5.05 %)
16,621
(0.21 %)
4,972
(0.06 %)
142 Caribbean electric ray (hap1 2024 genbank)
GCA_036971445.1
n/a n/a 11,967
(0.44 %)
20,851
(1.23 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,443
(0.01 %)
596
(100.00 %)
4,902,656
(34.96 %)
1,040,893
(17.82 %)
16,403,253
(54.79 %)
2
(0.00 %)
3,888,884
(8.11 %)
113,936
(1.69 %)
22,323
(0.31 %)
143 carmine bee-eater (2014 BGI)
GCF_000691845.1
15,520
(2.12 %)
n/a 11,303
(1.45 %)
24,758
(1.84 %)
n/a 41.67
(99.59 %)
50,632
(0.42 %)
50,632
(0.42 %)
104,131
(99.58 %)
405,042
(5.66 %)
161,525
(1.05 %)
6,445,961
(19.27 %)
2
(0.00 %)
37,279
(0.40 %)
11,477
(0.36 %)
9,158
(0.28 %)
144 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1
48,199
(10.95 %)
n/a 18,537
(3.62 %)
45,536
(13.17 %)
n/a 35.94
(85.14 %)
37,896
(14.88 %)
37,896
(14.88 %)
39,916
(85.12 %)
295,656
(2.88 %)
266,527
(3.40 %)
2,434,269
(42.34 %)
26
(0.02 %)
352,557
(6.54 %)
30,963
(1.41 %)
4,126
(0.23 %)
145 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6
n/a n/a 19,803
(1.54 %)
21,001
(1.30 %)
n/a 41.83
(99.57 %)
39,124
(0.44 %)
41,517
(0.44 %)
42,578
(99.56 %)
5,725,274
(49.24 %)
459,535
(1.33 %)
12,905,109
(41.11 %)
628
(0.03 %)
1,325,981
(3.97 %)
43,324
(1.28 %)
37,641
(0.94 %)
146 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA)
GCF_002263795.1
76,369
(2.97 %)
n/a 19,669
(1.56 %)
21,999
(1.33 %)
n/a 41.93
(100.00 %)
0
(0 %)
386
(0.00 %)
2,211
(100.00 %)
5,643,592
(49.67 %)
545,256
(2.90 %)
13,085,601
(41.79 %)
1
(0.00 %)
1,556,737
(4.07 %)
44,357
(1.24 %)
37,714
(0.98 %)
147 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA)
GCF_002263795.2
76,306
(2.98 %)
n/a 19,325
(1.49 %)
21,665
(1.32 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
386
(0.00 %)
1,957
(100.00 %)
3,550,686
(24.18 %)
544,595
(2.90 %)
13,050,221
(41.81 %)
1
(0.00 %)
1,554,173
(4.07 %)
44,208
(1.24 %)
37,290
(0.87 %)
148 Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad)
GCA_004024745.1
n/a n/a 21,372
(1.41 %)
34,453
(1.31 %)
n/a 42.35
(99.87 %)
10,534
(0.04 %)
10,534
(0.04 %)
1,240,696
(99.96 %)
5,244,572
(43.13 %)
2,503,015
(4.45 %)
12,961,004
(41.69 %)
59
(0.00 %)
n/a 173,264
(3.70 %)
153,887
(3.31 %)
149 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1
40,788
(61.50 %)
n/a 14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
0
(0 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
0
(0 %)
452,303
(4.62 %)
20,453
(1.39 %)
10,802
(0.65 %)
150 channel catfish (USDA103 v1 2016)
GCF_001660625.1
53,920
(9.58 %)
n/a 15,712
(2.71 %)
25,639
(5.25 %)
n/a 39.70
(98.56 %)
25,203
(1.45 %)
25,203
(1.45 %)
34,544
(98.55 %)
871,222
(5.75 %)
585,250
(4.19 %)
5,150,651
(33.94 %)
63
(0.01 %)
258,935
(2.61 %)
31,438
(1.87 %)
20,402
(1.03 %)
151 channel catfish (USDA103 v1.2 2019)
GCF_001660625.2
57,087
(10.27 %)
n/a 16,253
(2.68 %)
44,936
(5.15 %)
n/a 39.70
(98.57 %)
25,203
(1.39 %)
25,285
(1.44 %)
34,545
(98.61 %)
900,327
(5.55 %)
614,695
(4.28 %)
5,348,266
(33.81 %)
63
(0.01 %)
281,774
(2.67 %)
32,840
(1.87 %)
21,251
(1.03 %)
152 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1
n/a n/a 18,264
(1.57 %)
14,665
(1.26 %)
n/a 41.30
(98.26 %)
0
(0 %)
183,260
(1.77 %)
14,382
(100.00 %)
4,777,041
(42.51 %)
784,368
(1.53 %)
13,503,827
(31.65 %)
42
(0.00 %)
261,774
(0.78 %)
57,657
(1.31 %)
48,632
(1.00 %)
153 chevron butterflyfish (hap1 2024 genbank)
GCA_039877785.1
n/a n/a 15,255
(2.94 %)
48,037
(7.05 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
0
(0 %)
49
(0.00 %)
37
(100.00 %)
465,710
(3.82 %)
254,015
(3.62 %)
3,657,999
(23.28 %)
1
(0.00 %)
186,571
(2.20 %)
30,971
(2.02 %)
18,241
(1.05 %)
154 chimney swift (M959 v1.0 2014)
GCF_000747805.1
15,979
(2.53 %)
n/a 12,065
(1.82 %)
10,050
(2.07 %)
n/a 41.40
(95.99 %)
65,523
(4.03 %)
65,523
(4.03 %)
84,595
(95.97 %)
453,775
(7.30 %)
194,988
(2.21 %)
6,363,949
(19.70 %)
135
(0.03 %)
104,994
(2.61 %)
12,486
(0.42 %)
8,538
(0.26 %)
155 chimpanzee (Clint C0471 2018 genbank)
GCA_002880755.3
n/a 162,869
(3.61 %)
20,378
(1.83 %)
21,427
(1.19 %)
n/a 40.71
(98.98 %)
693
(1.02 %)
693
(1.02 %)
5,037
(98.98 %)
5,409,980
(53.76 %)
984,231
(7.31 %)
15,896,744
(39.56 %)
4
(0.00 %)
2,559,246
(4.40 %)
45,870
(0.97 %)
28,273
(0.73 %)
156 chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028858805.1
n/a n/a 20,001
(1.79 %)
21,230
(1.19 %)
n/a 40.62
(99.78 %)
22
(0.22 %)
22
(0.22 %)
141
(99.78 %)
5,092,768
(48.83 %)
946,933
(11.75 %)
14,844,947
(42.39 %)
0
(0 %)
3,140,392
(5.61 %)
47,662
(1.21 %)
29,340
(0.82 %)
157 chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023 refseq)
GCF_028858775.1
111,282
(4.36 %)
n/a 20,990
(1.75 %)
21,705
(1.15 %)
n/a 40.94
(99.90 %)
29
(0.10 %)
29
(0.10 %)
1,500
(99.90 %)
5,581,205
(50.06 %)
1,158,792
(10.59 %)
15,972,274
(43.09 %)
0
(0 %)
3,093,549
(5.27 %)
61,901
(2.29 %)
38,043
(1.17 %)
158 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1
60,293
(11.65 %)
n/a 15,433
(2.84 %)
67,310
(21.70 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
45
(100.00 %)
273,992
(2.25 %)
228,466
(3.97 %)
2,261,888
(35.14 %)
0
(0 %)
273,738
(7.11 %)
37,317
(4.18 %)
22,576
(1.74 %)
159 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1
55,529
(3.00 %)
n/a 19,755
(1.76 %)
20,017
(1.50 %)
n/a 41.51
(99.88 %)
0
(0 %)
4,356
(0.12 %)
1,830
(100.00 %)
4,544,603
(29.89 %)
1,095,407
(2.92 %)
12,942,232
(32.27 %)
20
(0.00 %)
553,246
(1.59 %)
19,343
(0.58 %)
15,755
(0.43 %)
160 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank)
GCA_018296145.1
92,370
(51.48 %)
n/a 27,141
(1.63 %)
113,328
(4.52 %)
157,545
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,313
(0.01 %)
2,333
(0.01 %)
9,977
(99.99 %)
4,892,399
(55.31 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,870
(54.55 %)
10
(0.00 %)
5,031,323
(11.16 %)
62,726
(1.40 %)
18,444
(0.39 %)
161 chub mackerel (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409825.1
34,390
(49.60 %)
n/a 15,350
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
0
(0 %)
1,572
(0.08 %)
361
(100.00 %)
1,669,327
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,422
(32.38 %)
3
(0.00 %)
927,880
(7.23 %)
16,290
(0.85 %)
8,913
(0.42 %)
162 chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014)
GCF_000700745.1
17,196
(2.21 %)
n/a 12,140
(1.50 %)
25,641
(1.91 %)
n/a 40.76
(99.61 %)
56,667
(0.39 %)
56,667
(0.39 %)
126,789
(99.61 %)
560,317
(7.62 %)
203,204
(1.12 %)
6,593,712
(20.47 %)
4
(0.00 %)
63,810
(0.48 %)
8,105
(0.24 %)
6,684
(0.19 %)
163 chytrid fungus B.dendrobatidis (v1 JAM81 2011)
GCF_000203795.1
8,677
(50.60 %)
n/a 1,251
(4.00 %)
7,681
(34.45 %)
n/a 39.25
(99.25 %)
383
(0.76 %)
383
(0.76 %)
510
(99.24 %)
2,585
(1.13 %)
3,424
(1.20 %)
81,225
(12.02 %)
0
(0 %)
5,784
(3.45 %)
161
(0.21 %)
141
(0.19 %)
164 ciliates Oxytricha trifallax (v1 JRB310 2012)
GCA_000295675.1
n/a 24,578
(70.50 %)
1,065
(1.03 %)
1,781
(1.87 %)
n/a 31.32
(99.93 %)
1,347
(0.00 %)
1,347
(0.00 %)
23,709
(100.00 %)
29,228
(1.96 %)
22,291
(1.48 %)
550,667
(25.14 %)
6
(0.00 %)
1,285
(0.43 %)
20
(0.01 %)
20
(0.01 %)
165 climbing perch (v1.1 2018 refseq)
GCF_900324465.1
42,930
(13.31 %)
n/a 15,237
(3.47 %)
22,710
(7.34 %)
37,043
(11.25 %)
40.40
(98.65 %)
0
(0 %)
292
(1.35 %)
70
(100.00 %)
329,586
(2.67 %)
133,519
(1.94 %)
3,418,470
(21.84 %)
0
(0 %)
182,187
(2.87 %)
10,698
(0.86 %)
7,641
(0.56 %)
166 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2
42,746
(63.74 %)
n/a 15,239
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
50
(100.00 %)
324,479
(2.66 %)
130,248
(1.89 %)
3,324,960
(21.31 %)
0
(0 %)
169,785
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
167 climbing perch (v1.2 2018 refseq)
GCF_900324465.2
42,759
(13.53 %)
n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
324,324
(2.66 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,009
(21.31 %)
0
(0 %)
169,785
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
168 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018385.1
81,219
(51.66 %)
n/a 18,516
(1.55 %)
20,363
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
0
(0 %)
181
(0.06 %)
34
(100.00 %)
4,798,634
(33.91 %)
992,669
(2.08 %)
13,618,933
(34.42 %)
3
(0.00 %)
647,740
(1.89 %)
67,831
(2.45 %)
58,578
(1.71 %)
169 clouded yellow (genbank 2021)
GCA_905220415.1
23,070
(64.23 %)
n/a 4,767
(1.38 %)
15,869
(7.12 %)
34,699
(13.48 %)
33.59
(100.00 %)
0
(0 %)
9
(0.00 %)
33
(100.00 %)
161,872
(2.42 %)
73,892
(2.86 %)
2,544,844
(42.14 %)
0
(0 %)
134,497
(3.68 %)
15,663
(2.98 %)
9,943
(1.81 %)
170 coho salmon (150728-3 2017)
GCF_002021735.1
64,032
(4.29 %)
n/a 24,727
(1.43 %)
46,926
(3.38 %)
n/a 43.33
(95.39 %)
1,566
(0.01 %)
265,291
(4.63 %)
22,810
(99.99 %)
1,185,308
(5.22 %)
2,455,045
(15.99 %)
11,710,855
(46.53 %)
9,333
(0.29 %)
4,110,586
(10.80 %)
72,061
(1.46 %)
24,530
(0.46 %)
171 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1
67,207
(45.84 %)
n/a 18,772
(1.77 %)
20,527
(1.42 %)
35,815
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
0
(0 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,067,521
(46.14 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,896
(35.29 %)
1
(0.00 %)
597,652
(1.78 %)
65,551
(1.90 %)
43,161
(1.35 %)
172 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1
45,962
(43.27 %)
n/a 17,254
(1.68 %)
17,112
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
0
(0 %)
114,003
(0.57 %)
2,647
(100.00 %)
3,845,214
(43.88 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,013
(32.18 %)
466
(0.01 %)
284,934
(0.89 %)
48,030
(1.35 %)
31,891
(1.03 %)
173 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1
37,661
(35.20 %)
n/a 18,681
(0.81 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,697
(38.92 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,301
(40.56 %)
0
(0 %)
455,834
(1.17 %)
17,762
(0.38 %)
13,986
(0.24 %)
174 common buzzard (bButBut1.hap1.1 2024 genbank)
GCA_964188355.1
n/a n/a 13,512
(1.75 %)
24,417
(2.13 %)
n/a 43.17
(99.99 %)
2
(0.00 %)
471
(0.01 %)
546
(100.00 %)
439,018
(4.62 %)
244,865
(6.73 %)
6,778,625
(23.94 %)
2
(0.00 %)
258,825
(1.67 %)
43,400
(4.80 %)
34,405
(1.72 %)
175 common carp (2014)
GCF_000951615.1
75,414
(5.81 %)
n/a 27,632
(2.17 %)
59,950
(5.28 %)
n/a 37.00
(97.48 %)
0
(0 %)
57,940
(2.53 %)
9,378
(100.00 %)
1,460,282
(5.17 %)
987,356
(7.88 %)
9,900,821
(37.41 %)
8
(0.00 %)
1,320,956
(12.02 %)
48,702
(1.38 %)
28,063
(0.71 %)
176 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1
50,206
(57.28 %)
n/a 13,179
(1.84 %)
25,859
(2.41 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
0
(0 %)
296
(0.42 %)
151
(100.00 %)
521,043
(9.61 %)
310,469
(2.36 %)
6,712,849
(21.76 %)
0
(0 %)
326,521
(1.83 %)
25,267
(1.71 %)
20,672
(1.05 %)
177 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1
16,827
(2.53 %)
n/a 12,599
(1.80 %)
12,623
(2.28 %)
n/a 41.52
(97.64 %)
56,977
(2.38 %)
56,977
(2.38 %)
71,907
(97.62 %)
418,870
(8.06 %)
192,437
(2.08 %)
6,576,259
(19.85 %)
113
(0.02 %)
126,008
(2.66 %)
18,002
(0.74 %)
15,128
(0.57 %)
178 common house spider (v2 Geottingen 2017)
GCF_000365465.2
30,064
(3.79 %)
n/a 3,347
(0.23 %)
7,571
(1.48 %)
n/a 29.46
(81.63 %)
247,375
(18.44 %)
247,378
(18.44 %)
263,908
(81.56 %)
587,943
(2.23 %)
464,643
(2.90 %)
10,795,253
(40.31 %)
12,788
(0.38 %)
474,681
(4.16 %)
10,480
(0.23 %)
1,791
(0.05 %)
179 common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank)
GCA_000365465.3
37,121
(48.05 %)
n/a 3,276
(0.22 %)
9,098
(1.38 %)
38,273
(4.24 %)
29.40
(98.45 %)
24,382
(1.54 %)
124,228
(1.55 %)
84,235
(98.46 %)
637,694
(2.45 %)
527,781
(4.43 %)
11,553,196
(51.16 %)
299
(0.01 %)
477,709
(3.61 %)
11,998
(0.33 %)
2,762
(0.10 %)
180 common limpet (v1 primary hap 2022)
GCF_932274485.1
41,888
(9.21 %)
n/a 3,611
(0.43 %)
13,244
(4.58 %)
44,721
(6.30 %)
36.11
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
13
(100.00 %)
239,042
(1.40 %)
359,961
(7.89 %)
4,399,053
(45.69 %)
5
(0.00 %)
629,372
(7.98 %)
33,411
(1.94 %)
2,344
(0.13 %)
181 common sole (primary hap 2023 genbank)
GCA_958295425.1
55,359
(63.58 %)
n/a 14,846
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
243
(100.00 %)
1,149,249
(19.12 %)
342,239
(9.71 %)
3,906,839
(32.84 %)
2
(0.00 %)
440,509
(5.18 %)
27,772
(2.71 %)
15,561
(0.92 %)
182 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1
39,986
(53.94 %)
n/a 12,277
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
0
(0 %)
256
(0.16 %)
109
(100.00 %)
533,758
(8.66 %)
199,748
(1.12 %)
6,353,957
(21.19 %)
1
(0.00 %)
113,872
(0.91 %)
20,393
(1.74 %)
16,313
(0.88 %)
183 common vampire bat (v1 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.1
n/a n/a 17,520
(1.75 %)
18,995
(1.67 %)
n/a 42.89
(99.99 %)
0
(0 %)
580
(0.01 %)
430
(100.00 %)
2,597,497
(28.17 %)
356,620
(2.88 %)
10,797,225
(31.23 %)
25
(0.00 %)
271,481
(1.34 %)
61,931
(2.30 %)
43,396
(1.30 %)
184 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1
58,054
(45.51 %)
n/a 18,280
(1.71 %)
19,514
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
611
(0.01 %)
572
(100.00 %)
2,761,820
(28.38 %)
427,940
(3.89 %)
11,250,492
(32.57 %)
37
(0.00 %)
360,489
(1.62 %)
70,700
(2.48 %)
44,288
(1.24 %)
185 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.1
58,067
(3.40 %)
n/a 18,280
(1.71 %)
19,515
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
611
(0.01 %)
573
(100.00 %)
2,761,826
(28.38 %)
427,942
(3.89 %)
11,250,529
(32.57 %)
37
(0.00 %)
360,489
(1.62 %)
70,701
(2.48 %)
44,289
(1.24 %)
186 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2
n/a n/a 18,511
(1.87 %)
18,170
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
54,308
(2.23 %)
84,108
(97.77 %)
2,860,991
(29.93 %)
275,245
(1.03 %)
11,798,152
(28.19 %)
237
(0.03 %)
174,536
(2.84 %)
51,833
(1.38 %)
47,411
(1.21 %)
187 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1
51,047
(3.24 %)
n/a 18,506
(1.88 %)
18,166
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
54,308
(2.23 %)
84,109
(97.77 %)
2,861,697
(29.93 %)
275,247
(1.03 %)
11,798,198
(28.19 %)
237
(0.03 %)
174,536
(2.84 %)
51,834
(1.38 %)
47,410
(1.21 %)
188 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.2
n/a n/a 18,311
(1.71 %)
19,456
(1.59 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
0
(0 %)
615
(0.01 %)
573
(100.00 %)
2,767,071
(28.35 %)
431,575
(3.90 %)
11,286,853
(32.63 %)
37
(0.00 %)
330,061
(1.50 %)
71,506
(2.50 %)
45,001
(1.26 %)
189 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1
29,369
(33.72 %)
n/a 19,335
(2.10 %)
21,769
(1.63 %)
n/a 41.24
(74.51 %)
276,531
(25.53 %)
276,544
(25.53 %)
299,069
(74.47 %)
3,513,698
(39.82 %)
304,033
(0.59 %)
13,333,842
(21.06 %)
1,491
(0.03 %)
288,329
(2.06 %)
56,694
(1.59 %)
52,345
(1.34 %)
190 cork oak (v1 HL8 2018)
GCF_002906115.1
65,969
(8.84 %)
n/a 20,226
(1.95 %)
89,703
(16.66 %)
n/a 36.19
(97.99 %)
0
(0 %)
26,139
(2.01 %)
23,344
(100.00 %)
865,884
(3.63 %)
491,126
(5.95 %)
6,119,503
(36.10 %)
267
(0.02 %)
690,224
(9.50 %)
21,505
(3.50 %)
10,784
(2.71 %)
191 corroboree frog (hap2 2023 genbank)
GCA_028390025.1
n/a n/a n/a 54,346
(1.07 %)
n/a 45.66
(99.76 %)
0
(0 %)
2,699
(0.24 %)
3,127
(100.00 %)
18,782,633
(75.22 %)
5,902,115
(18.63 %)
5,826
(99.76 %)
23
(0.00 %)
n/a 990,274
(4.84 %)
90,184
(0.51 %)
192 Cory's shearwater (hap1.1 2024)
GCA_964195595.1
n/a n/a 13,703
(1.71 %)
26,310
(2.10 %)
n/a 43.29
(99.99 %)
59
(0.00 %)
525
(0.01 %)
414
(100.00 %)
479,045
(5.03 %)
336,466
(4.95 %)
5,910,298
(24.89 %)
4
(0.00 %)
487,078
(3.38 %)
48,046
(4.19 %)
40,252
(2.00 %)
193 Cory's shearwater (hap2.1 2024)
GCA_964196065.1
n/a n/a 12,750
(1.85 %)
23,191
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.99 %)
477
(0.01 %)
477
(0.01 %)
726
(99.99 %)
403,846
(4.59 %)
252,125
(3.30 %)
6,206,493
(22.07 %)
2
(0.00 %)
286,848
(2.45 %)
41,821
(4.50 %)
38,197
(2.23 %)
194 cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank)
GCA_002156985.1
21,972
(59.55 %)
17,082
(10.65 %)
4,839
(1.54 %)
21,045
(8.01 %)
n/a 36.13
(89.02 %)
23,558
(11.01 %)
26,910
(11.01 %)
24,551
(88.99 %)
115,046
(2.97 %)
31,900
(0.85 %)
2,230,382
(25.45 %)
1,738
(0.70 %)
33,991
(1.55 %)
15,851
(2.18 %)
9,912
(1.25 %)
195 cowpea (IT97K-499-35 v1 2019)
GCF_004118075.1
48,678
(10.56 %)
n/a 16,927
(3.30 %)
44,814
(13.06 %)
54,348
(11.30 %)
32.98
(99.48 %)
0
(0 %)
68
(0.52 %)
682
(100.00 %)
352,238
(4.22 %)
283,949
(8.14 %)
3,092,021
(41.64 %)
1
(0.00 %)
420,724
(7.56 %)
24,513
(2.40 %)
11,823
(1.16 %)
196 crab-eating macaque (v1 582-1 2024)
GCF_037993035.1
100,896
(3.93 %)
n/a 20,528
(1.79 %)
21,741
(1.19 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 21
(100.00 %)
5,357,498
(52.90 %)
1,017,190
(8.58 %)
15,617,344
(40.74 %)
0
(0 %)
2,146,978
(4.41 %)
94,759
(1.56 %)
30,541
(0.76 %)
197 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1
76,183
(45.03 %)
n/a 20,283
(1.90 %)
20,544
(1.22 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,163
(4.85 %)
80,474
(4.85 %)
87,763
(95.15 %)
5,351,207
(51.35 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,449
(35.74 %)
1,138
(0.05 %)
1,213,705
(2.53 %)
76,963
(1.14 %)
28,050
(0.65 %)
198 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1
76,196
(3.30 %)
n/a 20,209
(1.91 %)
51,427
(6.84 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,163
(4.85 %)
80,474
(4.85 %)
87,764
(95.15 %)
5,251,819
(50.85 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,510
(35.74 %)
1,138
(0.05 %)
1,213,705
(2.53 %)
76,963
(1.14 %)
27,520
(0.64 %)
199 crucian carp (primary hap 2023 genbank)
GCA_963082965.1
90,094
(55.93 %)
n/a 29,389
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
0
(0 %)
832
(0.01 %)
278
(100.00 %)
3,481,389
(45.81 %)
802,775
(6.54 %)
8,190,816
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,003,533
(5.09 %)
83,696
(3.82 %)
26,039
(0.81 %)
200 crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022)
GCF_022539665.1
22,915
(28.69 %)
n/a 3,621
(2.94 %)
11,430
(17.96 %)
n/a 40.34
(99.47 %)
0
(0 %)
2
(0.53 %)
227
(100.00 %)
81,008
(2.67 %)
29,625
(4.98 %)
609,395
(25.66 %)
0
(0 %)
39,313
(3.92 %)
6,559
(5.05 %)
5,546
(3.62 %)
201 crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank)
GCA_003990815.1
n/a n/a 3,519
(2.64 %)
12,174
(17.22 %)
n/a 40.54
(93.29 %)
0
(0 %)
13,228
(6.75 %)
4,192
(100.00 %)
63,254
(2.07 %)
22,325
(1.44 %)
728,942
(20.81 %)
35
(0.03 %)
32,114
(3.20 %)
8,375
(4.98 %)
6,466
(3.39 %)
202 crustacean P.pollicipes (v2 AB1234 2020)
GCF_011947565.2
30,025
(5.21 %)
n/a 3,968
(0.39 %)
56,084
(8.02 %)
32,834
(5.48 %)
52.34
(98.93 %)
0
(0 %)
10,786
(1.08 %)
1,254
(100.00 %)
361,409
(3.23 %)
533,046
(8.92 %)
3,456,307
(19.29 %)
27
(0.01 %)
627,943
(7.18 %)
6,722
(54.88 %)
103,043
(9.72 %)
203 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank)
GCA_021462225.2
n/a n/a 15,131
(1.68 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
0
(0 %)
409
(0.54 %)
73
(100.00 %)
2,175,293
(47.80 %)
176,956
(1.87 %)
6,142,692
(38.35 %)
4
(0.00 %)
383,249
(3.60 %)
32,973
(1.28 %)
10,198
(0.33 %)
204 Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_963259705.1
64,558
(45.64 %)
n/a 19,142
(1.72 %)
22,139
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
0
(0 %)
1,099
(0.01 %)
122
(100.00 %)
3,040,239
(24.03 %)
796,913
(6.38 %)
10,478,261
(38.84 %)
9
(0.00 %)
756,430
(2.76 %)
64,921
(2.50 %)
57,806
(1.88 %)
205 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1
48,152
(35.39 %)
n/a 22,240
(1.40 %)
22,108
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,770
(15.68 %)
252,770
(15.68 %)
259,903
(84.32 %)
4,890,270
(27.82 %)
898,943
(1.50 %)
14,281,942
(29.30 %)
2,582
(0.03 %)
313,025
(1.02 %)
40,135
(0.82 %)
36,410
(0.69 %)
206 denticle herring (v1 2019)
GCF_900700375.1
59,645
(12.74 %)
n/a 16,556
(3.78 %)
37,861
(8.42 %)
72,719
(10.66 %)
43.69
(99.18 %)
0
(0 %)
464
(0.82 %)
460
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,282
(4.61 %)
2,948,671
(28.79 %)
0
(0 %)
306,165
(4.31 %)
64,661
(9.49 %)
52,867
(4.93 %)
207 diamondback terrapin (hap1 2023 genbank)
GCA_027887155.1
50,318
(52.07 %)
n/a 15,109
(1.08 %)
19,281
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.92 %)
0
(0 %)
141
(0.08 %)
76
(100.00 %)
4,088,064
(46.33 %)
403,943
(1.72 %)
11,014,504
(33.74 %)
0
(0 %)
407,696
(1.71 %)
110,838
(2.71 %)
30,093
(0.82 %)
208 diplomonads (v1 WB C6 WB C6 2008)
GCF_000002435.1
6,502
(71.82 %)
n/a 251
(1.29 %)
2,079
(62.62 %)
n/a 49.25
(99.82 %)
214
(0.19 %)
242
(0.19 %)
306
(99.81 %)
697
(1.34 %)
335
(0.65 %)
20,634
(5.24 %)
19
(0.14 %)
859
(1.76 %)
2,275
(23.86 %)
2,064
(18.94 %)
209 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1
n/a n/a 22,343
(1.53 %)
28,525
(1.27 %)
n/a 41.66
(99.91 %)
10,428
(0.04 %)
10,428
(0.04 %)
667,170
(99.96 %)
5,598,608
(45.38 %)
1,220,686
(2.58 %)
14,079,363
(36.37 %)
28
(0.00 %)
n/a 62,881
(2.13 %)
53,176
(1.80 %)
210 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1
55,980
(3.39 %)
n/a 18,440
(1.59 %)
19,474
(1.48 %)
n/a 41.47
(94.51 %)
109,700
(5.51 %)
109,700
(5.51 %)
117,442
(94.49 %)
n/a 606,818
(1.04 %)
13,503,550
(29.63 %)
1,009
(0.02 %)
309,552
(0.86 %)
53,376
(1.90 %)
51,864
(1.65 %)
211 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1
44,762
(33.07 %)
n/a 18,297
(1.33 %)
20,107
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
58,460
(2.20 %)
61,603
(97.80 %)
4,257,412
(38.85 %)
658,532
(1.25 %)
14,547,631
(34.19 %)
3
(0.00 %)
423,409
(1.39 %)
37,092
(0.85 %)
27,299
(0.63 %)
212 domestic silkworm (genbank 2020)
GCA_014905235.2
n/a n/a 5,227
(1.28 %)
18,795
(5.67 %)
n/a 38.55
(99.90 %)
0
(0 %)
30
(0.10 %)
696
(100.00 %)
615,428
(29.26 %)
86,179
(1.65 %)
2,607,325
(47.66 %)
0
(0 %)
297,922
(5.59 %)
44,022
(10.06 %)
15,414
(1.64 %)
213 domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank)
GCA_904849725.1
63,294
(3.74 %)
n/a 18,050
(0.43 %)
260,902
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
0
(0 %)
162
(0.03 %)
290
(100.00 %)
1,274,894
(2.42 %)
1,726,303
(5.40 %)
14,010,542
(72.58 %)
0
(0 %)
5,823,193
(14.08 %)
732,828
(17.24 %)
271,779
(4.92 %)
214 dorado (hap2 2023 genbank)
GCA_030463535.1
n/a n/a 16,799
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
0
(0 %)
726
(0.85 %)
104
(100.00 %)
2,693,928
(34.60 %)
805,807
(14.65 %)
5,615,731
(36.69 %)
2
(0.00 %)
1,425,798
(8.96 %)
30,083
(1.31 %)
21,157
(0.81 %)
215 downy mildews (GKB4 2021 genbank)
GCA_018691715.1
n/a 21,334
(23.20 %)
1,641
(1.07 %)
33,976
(44.50 %)
n/a 54.16
(99.69 %)
0
(0 %)
80
(0.31 %)
133
(100.00 %)
18,997
(0.80 %)
16,094
(2.84 %)
200,994
(27.68 %)
0
(0 %)
68,037
(10.52 %)
232
(99.71 %)
2,904
(21.16 %)
216 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1
25,483
(48.39 %)
n/a 12,405
(1.70 %)
23,073
(2.18 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
0
(0 %)
187
(0.34 %)
181
(100.00 %)
1,008,118
(21.51 %)
378,537
(3.38 %)
5,846,717
(32.04 %)
0
(0 %)
791,076
(4.25 %)
26,005
(1.75 %)
19,919
(1.16 %)
217 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1
15,850
(2.33 %)
n/a 11,864
(1.67 %)
11,795
(1.99 %)
n/a 44.51
(96.31 %)
96,471
(3.72 %)
96,471
(3.72 %)
127,725
(96.28 %)
842,281
(18.63 %)
310,018
(2.09 %)
5,822,687
(27.83 %)
59
(0.01 %)
397,798
(2.49 %)
17,379
(0.69 %)
13,913
(0.52 %)
218 E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank)
GCA_000750555.1
n/a 4,501
(88.85 %)
n/a n/a n/a 50.78
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 90
(0.38 %)
19,508
(7.44 %)
0
(0 %)
189
(0.40 %)
1
(99.99 %)
0
(0.00 %)
219 East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019)
GCF_008831285.1
39,088
(10.61 %)
n/a 11,569
(2.49 %)
38,114
(15.67 %)
n/a 38.59
(99.98 %)
625
(0.02 %)
627
(0.02 %)
1,425
(99.98 %)
230,165
(2.88 %)
153,929
(4.02 %)
2,160,647
(26.81 %)
1
(0.00 %)
233,651
(6.36 %)
24,567
(4.41 %)
18,177
(2.46 %)
220 eastern European house mouse (PWK_PhJ v1 2016)
GCA_001624775.1
n/a n/a 21,013
(2.21 %)
18,237
(1.40 %)
101,394
(4.09 %)
41.76
(90.89 %)
26,578
(1.66 %)
904,107
(9.24 %)
30,233
(98.34 %)
5,250,349
(40.55 %)
1,508,787
(2.97 %)
13,823,341
(28.09 %)
246,352
(1.73 %)
681,079
(2.29 %)
16,695
(0.43 %)
15,885
(0.40 %)
221 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1
57,628
(9.59 %)
n/a 15,348
(2.22 %)
28,518
(6.29 %)
42,170
(8.31 %)
41.07
(99.87 %)
115
(0.00 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
527,486
(5.98 %)
217,915
(1.89 %)
4,547,443
(30.78 %)
2
(0.00 %)
212,425
(2.79 %)
33,005
(1.88 %)
16,748
(0.95 %)
222 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1
n/a n/a 20,133
(1.87 %)
36,361
(1.80 %)
n/a 40.23
(99.96 %)
4,332
(0.02 %)
4,332
(0.02 %)
226,086
(99.98 %)
2,985,622
(32.66 %)
475,311
(1.11 %)
12,612,081
(27.34 %)
15
(0.00 %)
n/a 81,930
(5.75 %)
81,575
(4.78 %)
223 Egyptian rousette (v1 2020 genbank)
GCA_014176215.1
65,163
(51.34 %)
61,105
(4.04 %)
17,637
(2.08 %)
22,318
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
0
(0 %)
242
(1.41 %)
30
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,415
(1.02 %)
12,031,652
(26.52 %)
0
(0 %)
65,562
(0.33 %)
53,604
(6.69 %)
57,305
(5.33 %)
224 electric eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013358815.1
n/a n/a 15,954
(3.67 %)
48,976
(7.25 %)
n/a 42.49
(98.20 %)
0
(0 %)
227
(1.80 %)
90
(100.00 %)
567,621
(7.41 %)
564,288
(10.86 %)
2,935,361
(24.79 %)
1
(0.00 %)
630,046
(5.96 %)
44,501
(3.93 %)
34,390
(2.63 %)
225 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1
30,695
(4.95 %)
n/a 11,306
(1.54 %)
18,189
(3.03 %)
n/a 42.34
(96.16 %)
46,217
(3.85 %)
46,232
(3.85 %)
67,421
(96.15 %)
1,405,480
(27.29 %)
330,698
(2.60 %)
5,549,534
(36.65 %)
31
(0.01 %)
365,912
(2.44 %)
35,561
(2.16 %)
11,961
(0.52 %)
226 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1
n/a n/a 13,181
(1.74 %)
24,708
(2.10 %)
33,433
(3.99 %)
42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
512
(0.00 %)
802
(100.00 %)
504,527
(4.38 %)
259,276
(2.59 %)
7,105,965
(19.15 %)
8
(0.00 %)
316,149
(1.79 %)
41,784
(5.52 %)
41,105
(3.30 %)
227 epaulette shark (2021 genbank)
GCA_020745735.1
43,156
(39.58 %)
n/a 12,439
(0.39 %)
19,520
(1.06 %)
n/a 42.76
(98.05 %)
0
(0 %)
3,716
(1.95 %)
1,963
(100.00 %)
9,211,963
(69.93 %)
935,037
(6.51 %)
20,660,613
(43.88 %)
0
(0 %)
2,903,274
(4.44 %)
41,682
(1.08 %)
13,048
(0.16 %)
228 eudicots lettuce (Salinas v7 2020)
GCF_002870075.2
65,115
(2.96 %)
n/a 16,271
(0.65 %)
102,071
(6.37 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
3,138
(0.29 %)
353,389
(7.60 %)
11,454
(99.71 %)
1,109,875
(4.83 %)
983,866
(3.64 %)
12,335,790
(52.95 %)
2,249
(0.09 %)
1,828,920
(9.42 %)
117,743
(2.02 %)
19,959
(0.28 %)
229 Euphrates poplar (v1 2014)
GCF_000495115.1
56,539
(12.93 %)
n/a 20,844
(4.28 %)
41,664
(12.47 %)
n/a 32.08
(95.31 %)
23,174
(4.71 %)
23,174
(4.71 %)
32,789
(95.29 %)
332,532
(5.23 %)
246,766
(4.06 %)
2,679,673
(43.30 %)
21
(0.01 %)
283,121
(6.41 %)
2,781
(0.47 %)
1,761
(0.21 %)
230 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1
57,151
(2.48 %)
n/a 19,265
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,487,951
(32.73 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,723
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,258
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
54,563
(1.83 %)
231 Eurasian red squirrel (v1.1 2019)
GCA_902686455.1
n/a n/a 21,298
(1.58 %)
21,024
(1.36 %)
36,645
(1.54 %)
40.08
(94.33 %)
0
(0 %)
1,177
(5.67 %)
638
(100.00 %)
4,680,964
(35.76 %)
704,218
(1.42 %)
14,991,981
(31.49 %)
5
(0.00 %)
419,662
(1.29 %)
48,159
(1.04 %)
45,455
(0.95 %)
232 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1
45,658
(2.52 %)
n/a 19,724
(1.77 %)
19,069
(1.47 %)
34,561
(2.01 %)
42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
872
(0.26 %)
216
(100.00 %)
4,098,151
(26.75 %)
1,088,237
(2.91 %)
12,853,776
(32.42 %)
5
(0.00 %)
518,686
(1.69 %)
19,000
(0.58 %)
16,851
(0.46 %)
233 European conger (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514075.1
54,631
(54.17 %)
n/a 17,073
(1.89 %)
34,794
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
13
(0.00 %)
1,009
(0.02 %)
394
(100.00 %)
761,527
(5.99 %)
913,328
(13.25 %)
5,768,003
(35.48 %)
3
(0.00 %)
1,603,442
(8.94 %)
120,990
(6.12 %)
81,342
(2.93 %)
234 European eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013347855.1
n/a n/a 17,048
(2.22 %)
34,271
(5.56 %)
n/a 43.64
(99.61 %)
0
(0 %)
640
(0.40 %)
53
(100.00 %)
831,037
(5.48 %)
786,520
(8.15 %)
5,700,818
(27.40 %)
2
(0.00 %)
774,914
(5.14 %)
130,345
(8.19 %)
94,445
(4.12 %)
235 European mink (primary hap 2023 genbank)
GCA_030435805.1
69,556
(45.15 %)
n/a 18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
26
(100.00 %)
4,237,797
(30.90 %)
792,898
(2.69 %)
13,417,248
(36.59 %)
0
(0 %)
894,273
(2.55 %)
67,133
(2.54 %)
51,333
(1.62 %)
236 European peacock (2021 genbank)
GCA_905147045.1
22,557
(62.12 %)
n/a 4,716
(1.16 %)
12,599
(4.34 %)
26,251
(7.81 %)
33.70
(100.00 %)
0
(0 %)
10
(0.00 %)
42
(100.00 %)
212,528
(2.58 %)
60,682
(1.18 %)
3,127,157
(46.89 %)
0
(0 %)
154,469
(3.96 %)
24,620
(4.88 %)
7,312
(0.89 %)
237 European plaice (primary hap 2022 genbank)
GCA_947347685.1
46,467
(52.27 %)
n/a 14,820
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
0
(0 %)
1,072
(0.03 %)
356
(100.00 %)
476,317
(3.63 %)
520,730
(13.27 %)
3,283,400
(33.55 %)
2
(0.00 %)
525,277
(6.36 %)
47,051
(4.45 %)
21,879
(1.29 %)
238 European snow vole (primary hap 2023 genbank)
GCA_950005125.1
47,025
(39.90 %)
n/a 20,576
(1.75 %)
21,171
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
197
(0.00 %)
161
(100.00 %)
3,580,811
(22.71 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,125
(34.97 %)
4
(0.00 %)
954,164
(3.20 %)
20,725
(0.63 %)
17,303
(0.45 %)
239 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1
n/a n/a 11,276
(1.79 %)
21,238
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,333
(100.00 %)
466,567
(7.08 %)
182,345
(0.97 %)
6,037,183
(20.24 %)
0
(0 %)
110,549
(1.11 %)
29,648
(2.35 %)
26,084
(1.59 %)
240 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1
n/a n/a 12,415
(1.77 %)
23,484
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
0
(0 %)
894
(0.33 %)
357
(100.00 %)
539,737
(7.60 %)
227,500
(1.16 %)
6,768,805
(21.05 %)
4
(0.00 %)
181,333
(1.65 %)
34,729
(2.65 %)
30,692
(1.70 %)
241 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1
54,113
(34.13 %)
n/a 19,960
(1.65 %)
19,954
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
0
(0 %)
1,129
(0.01 %)
498
(100.00 %)
4,863,656
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,786
(40.58 %)
17
(0.00 %)
2,516,599
(5.37 %)
23,961
(0.53 %)
17,318
(0.36 %)
242 fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank)
GCA_011064685.1
32,738
(63.63 %)
n/a 5,744
(1.12 %)
26,631
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
0
(0 %)
525
(0.01 %)
91
(100.00 %)
168,479
(1.60 %)
72,876
(1.70 %)
3,384,083
(37.35 %)
0
(0 %)
128,947
(2.55 %)
30,753
(4.27 %)
12,571
(1.35 %)
243 fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020)
GCF_011064685.1
32,751
(9.65 %)
n/a 5,744
(1.12 %)
26,632
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
0
(0 %)
525
(0.01 %)
92
(100.00 %)
169,122
(1.61 %)
72,892
(1.70 %)
3,384,365
(37.36 %)
0
(0 %)
128,947
(2.55 %)
30,753
(4.27 %)
12,571
(1.35 %)
244 fire-bellied toad (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579735.1
n/a n/a 15,456
(0.21 %)
47,501
(0.88 %)
n/a 38.98
(98.02 %)
0
(0 %)
7,009
(1.99 %)
2,468
(100.00 %)
20,643,710
(70.75 %)
7,150,262
(12.27 %)
9,477
(98.01 %)
3
(0.00 %)
n/a 365,066
(1.20 %)
29,706
(0.10 %)
245 fission yeast (v1 972h- 2007 refseq)
GCF_000002945.1
12,393
(87.51 %)
n/a 5,085
(73.29 %)
3,403
(39.29 %)
n/a 36.05
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
4
(100.00 %)
3,336
(2.63 %)
1,034
(0.58 %)
80,458
(16.22 %)
1
(0.01 %)
411
(0.72 %)
105
(0.31 %)
95
(0.28 %)
246 fission yeast (v2 972h- 2019 genbank)
GCA_000002945.3
n/a 17,791
(77.29 %)
5,084
(73.46 %)
3,394
(39.28 %)
n/a 36.06
(100.00 %)
6
(0.00 %)
6
(0.00 %)
9
(100.00 %)
3,053
(1.03 %)
1,034
(0.58 %)
79,714
(16.06 %)
1
(0.01 %)
411
(0.72 %)
105
(0.31 %)
95
(0.28 %)
247 flatback sea turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965152275.1
n/a 26,709
(2.00 %)
15,046
(1.09 %)
18,089
(1.57 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
2
(0.00 %)
171
(0.00 %)
43
(100.00 %)
4,516,775
(43.62 %)
319,645
(1.38 %)
10,785,223
(32.95 %)
3
(0.00 %)
442,908
(1.94 %)
52,168
(1.81 %)
27,004
(0.88 %)
248 flatworm S.haematobium (v2 2020)
GCF_000699445.2
8,934
(5.16 %)
n/a 1,548
(0.29 %)
4,070
(2.36 %)
8,934
(5.16 %)
34.53
(99.76 %)
0
(0 %)
15,128
(0.26 %)
666
(100.00 %)
124,259
(1.58 %)
35,312
(1.17 %)
2,638,150
(34.10 %)
31
(0.01 %)
69,190
(3.97 %)
3,957
(0.38 %)
906
(0.11 %)
249 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2
n/a n/a 15,436
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
0
(0 %)
744
(1.81 %)
189
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,037
(2.21 %)
5,305,987
(30.67 %)
0
(0 %)
227,443
(2.84 %)
24,130
(1.26 %)
11,082
(0.48 %)
250 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1
39,651
(35.92 %)
n/a 18,302
(1.36 %)
20,592
(1.23 %)
32,831
(1.38 %)
40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
160,167
(10.78 %)
166,489
(89.22 %)
5,109,822
(37.03 %)
389,314
(0.74 %)
14,633,007
(38.46 %)
5,748
(0.06 %)
244,060
(0.64 %)
27,461
(0.64 %)
25,464
(0.54 %)
251 fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019)
GCF_009650485.1
24,196
(18.66 %)
n/a 10,065
(8.48 %)
14,473
(13.61 %)
n/a 38.15
(100.00 %)
0
(0 %)
7
(0.00 %)
11
(100.00 %)
298,709
(14.86 %)
80,048
(3.56 %)
1,317,733
(33.56 %)
0
(0 %)
69,521
(4.49 %)
18,849
(8.62 %)
11,752
(5.15 %)
252 fly D.santomea (v1.0 2021)
GCF_016746245.1
25,550
(21.64 %)
n/a 13,354
(17.52 %)
20,540
(17.87 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
104
(100.00 %)
169,365
(23.08 %)
64,316
(3.47 %)
791,743
(23.14 %)
0
(0 %)
69,581
(6.26 %)
27,794
(16.15 %)
20,742
(10.27 %)
253 fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine)
GCF_004382195.1
26,658
(22.06 %)
n/a 13,461
(17.65 %)
21,781
(17.83 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
38
(0.00 %)
402
(100.00 %)
145,818
(25.16 %)
34,869
(4.31 %)
719,811
(25.74 %)
0
(0 %)
87,076
(8.91 %)
30,130
(16.11 %)
22,906
(10.22 %)
254 fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017)
GCF_002093755.1
21,759
(15.21 %)
n/a 12,488
(9.92 %)
21,269
(14.06 %)
n/a 39.11
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,356
(100.00 %)
314,594
(25.90 %)
82,446
(12.33 %)
1,113,448
(37.00 %)
0
(0 %)
199,881
(8.53 %)
27,493
(12.03 %)
20,330
(8.62 %)
255 fly D.simulans (w501 v3.0 2021)
GCF_016746395.1
28,582
(26.45 %)
n/a 13,448
(20.44 %)
18,989
(18.34 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
96
(100.00 %)
126,424
(16.72 %)
32,595
(4.31 %)
759,296
(23.70 %)
0
(0 %)
46,993
(4.17 %)
27,530
(17.02 %)
20,622
(10.65 %)
256 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2
5,431
(4.09 %)
n/a 13,713
(15.95 %)
22,613
(16.71 %)
n/a 42.28
(98.12 %)
5,317
(1.88 %)
5,400
(1.88 %)
13,440
(98.12 %)
180,908
(22.48 %)
68,911
(3.75 %)
897,353
(23.94 %)
85
(0.04 %)
85,136
(6.91 %)
31,387
(14.91 %)
22,960
(9.55 %)
257 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1
27,925
(24.59 %)
n/a 13,343
(17.86 %)
20,029
(17.64 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
54
(100.00 %)
169,559
(23.47 %)
60,591
(3.64 %)
837,616
(23.40 %)
0
(0 %)
64,895
(6.52 %)
28,204
(16.22 %)
22,365
(10.80 %)
258 Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank)
GCA_902459505.1
54,713
(61.19 %)
n/a 14,267
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
163
(100.00 %)
1,311,113
(1.64 %)
1,364,596
(3.83 %)
19,589,738
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,977
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
259 Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_902459505.1
54,726
(1.72 %)
n/a 14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,310,970
(1.64 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,802
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,977
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
260 giant manta (hap1 2023 genbank)
GCA_030028105.1
n/a n/a 12,432
(0.38 %)
24,821
(1.16 %)
n/a 43.26
(99.23 %)
0
(0 %)
1,810
(0.77 %)
4,715
(100.00 %)
7,913,208
(49.68 %)
969,352
(14.22 %)
20,235,210
(54.42 %)
17
(0.00 %)
4,636,724
(7.12 %)
110,678
(1.74 %)
30,504
(0.36 %)
261 giant panda (2009 BGI)
GCF_000004335.2
40,432
(2.55 %)
n/a 18,884
(1.76 %)
18,919
(1.46 %)
n/a 41.60
(97.66 %)
119,126
(2.36 %)
119,126
(2.36 %)
200,593
(97.64 %)
4,236,423
(40.48 %)
503,179
(1.10 %)
13,781,487
(28.85 %)
48
(0.00 %)
252,804
(0.90 %)
53,465
(1.34 %)
45,835
(1.12 %)
262 giant panda (Jingjing v1 2017)
GCA_002007445.1
n/a n/a 20,110
(1.71 %)
22,288
(1.49 %)
n/a 41.69
(98.08 %)
186,846
(1.93 %)
186,846
(1.93 %)
244,258
(98.07 %)
4,464,041
(41.66 %)
614,896
(2.00 %)
14,294,774
(30.62 %)
9,506
(0.14 %)
580,134
(4.39 %)
59,340
(1.50 %)
49,319
(1.23 %)
263 giant panda (Jingjing v2 genbank 2020)
GCA_002007445.2
n/a n/a 20,381
(1.71 %)
21,979
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
0
(0 %)
190,364
(1.92 %)
77,287
(100.00 %)
4,484,597
(41.53 %)
618,595
(2.00 %)
14,236,406
(30.39 %)
9,762
(0.14 %)
583,295
(4.39 %)
59,945
(1.50 %)
49,872
(1.23 %)
264 giant panda (Jingjing v2 refseq 2020)
GCF_002007445.1
67,162
(3.32 %)
n/a 20,374
(1.71 %)
21,965
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
0
(0 %)
190,364
(1.92 %)
77,288
(100.00 %)
4,476,689
(41.47 %)
618,596
(2.00 %)
14,236,463
(30.39 %)
9,762
(0.14 %)
583,300
(4.39 %)
59,946
(1.50 %)
49,916
(1.23 %)
265 gilthead seabream (v1 2019)
GCF_900880675.1
59,040
(10.97 %)
n/a 15,412
(2.36 %)
31,802
(6.47 %)
73,197
(7.97 %)
41.94
(99.96 %)
0
(0 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
531,360
(3.04 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,694
(25.69 %)
0
(0 %)
355,475
(3.53 %)
47,327
(2.41 %)
23,697
(1.07 %)
266 Glanville fritillary (genbank 2021)
GCA_905220565.1
17,520
(43.15 %)
n/a 4,738
(0.89 %)
16,197
(5.05 %)
35,235
(7.97 %)
34.09
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.01 %)
32
(100.00 %)
343,193
(3.25 %)
144,286
(3.46 %)
3,683,956
(48.60 %)
0
(0 %)
198,815
(3.74 %)
30,200
(4.54 %)
11,245
(1.52 %)
267 globe artichoke (v1 2C 2018)
GCF_001531365.1
42,119
(6.72 %)
n/a 15,804
(2.23 %)
49,721
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
5,305
(0.07 %)
310,473
(9.77 %)
13,588
(99.93 %)
394,687
(2.79 %)
364,361
(3.37 %)
4,191,676
(39.48 %)
3,050
(0.15 %)
283,546
(3.56 %)
12,198
(0.64 %)
7,326
(0.39 %)
268 goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1
0
(0.00 %)
n/a 19,842
(1.43 %)
22,426
(1.24 %)
52,608
(1.64 %)
43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
790
(0.00 %)
29,906
(100.00 %)
5,669,868
(50.59 %)
760,836
(7.07 %)
13,024,386
(44.85 %)
0
(0 %)
2,571,292
(5.65 %)
125,682
(4.01 %)
44,489
(1.09 %)
269 goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1
47,206
(2.31 %)
n/a 19,859
(1.44 %)
22,429
(1.24 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
790
(0.00 %)
29,907
(100.00 %)
5,670,600
(50.59 %)
760,837
(7.07 %)
13,024,197
(44.85 %)
0
(0 %)
2,571,343
(5.65 %)
125,682
(4.01 %)
44,489
(1.09 %)
270 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1
55,164
(5.86 %)
n/a 13,226
(1.87 %)
23,033
(2.15 %)
25,921
(3.22 %)
42.11
(99.61 %)
0
(0 %)
191
(0.39 %)
142
(100.00 %)
519,341
(5.86 %)
180,990
(0.79 %)
7,005,531
(19.25 %)
1
(0.00 %)
53,053
(0.51 %)
37,343
(3.12 %)
34,701
(1.97 %)
271 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1
n/a n/a 9,334
(1.82 %)
17,594
(2.12 %)
n/a 42.53
(99.93 %)
0
(0 %)
39
(0.07 %)
3,860
(100.00 %)
356,284
(6.03 %)
123,430
(0.80 %)
4,417,887
(19.25 %)
0
(0 %)
53,254
(0.85 %)
28,919
(3.52 %)
25,970
(2.20 %)
272 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1
0
(0.00 %)
n/a 18,965
(1.82 %)
19,339
(1.52 %)
n/a 42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
216,216
(17.12 %)
237,699
(82.88 %)
3,724,142
(27.19 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,866
(24.29 %)
3,589
(0.05 %)
254,929
(0.76 %)
18,591
(0.51 %)
17,093
(0.42 %)
273 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1
n/a n/a 21,341
(1.86 %)
22,492
(1.24 %)
n/a 40.87
(98.50 %)
61,291
(1.50 %)
61,291
(1.50 %)
196,804
(98.50 %)
5,673,299
(51.36 %)
1,080,627
(3.06 %)
16,205,827
(36.77 %)
187
(0.01 %)
1,068,178
(2.78 %)
79,387
(1.14 %)
27,171
(0.63 %)
274 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 genbank)
GCA_029215685.1
n/a n/a 12,291
(1.06 %)
19,125
(2.02 %)
n/a 40.55
(100.00 %)
584
(0.00 %)
584
(0.00 %)
1,233
(100.00 %)
1,259,781
(7.92 %)
925,571
(7.56 %)
7,739,320
(45.92 %)
3
(0.00 %)
840,495
(4.04 %)
73,681
(2.81 %)
26,366
(0.92 %)
275 grape phylloxera (Bord-2020 2022 genbank)
GCA_025091365.1
n/a n/a 2,982
(0.90 %)
5,710
(2.77 %)
n/a 27.24
(97.73 %)
0
(0 %)
41,970
(2.29 %)
8,544
(100.00 %)
195,538
(3.32 %)
65,664
(2.79 %)
2,529,566
(54.06 %)
4,954
(0.23 %)
100,935
(4.52 %)
4,357
(1.18 %)
3,416
(0.91 %)
276 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3
n/a n/a 20,031
(1.89 %)
22,619
(1.50 %)
n/a 40.98
(95.94 %)
43,305
(4.06 %)
43,363
(4.06 %)
50,982
(95.94 %)
4,082,873
(41.60 %)
582,430
(1.47 %)
14,808,558
(30.05 %)
325
(0.02 %)
1,168,690
(4.77 %)
74,772
(2.61 %)
69,260
(2.12 %)
277 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887165.1
73,383
(42.66 %)
n/a 16,638
(0.72 %)
16,171
(0.86 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
0
(0 %)
2,255
(0.89 %)
14
(100.00 %)
5,562,366
(25.40 %)
1,096,625
(2.60 %)
22,322,798
(43.37 %)
13
(0.00 %)
n/a 28,894
(0.57 %)
22,987
(0.42 %)
278 great fruit-eating bat (v1 hap1 2024)
GCA_038363095.1
n/a n/a 18,022
(1.56 %)
20,018
(1.52 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
419
(100.00 %)
2,827,417
(26.82 %)
371,479
(4.97 %)
11,603,093
(34.64 %)
1
(0.00 %)
522,672
(1.87 %)
71,574
(2.28 %)
54,020
(1.50 %)
279 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1
50,937
(43.78 %)
n/a 19,011
(2.00 %)
19,882
(1.66 %)
41,741
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
0
(0 %)
172,751
(12.60 %)
7,570
(100.00 %)
3,078,210
(32.07 %)
495,290
(1.05 %)
11,588,202
(25.43 %)
2,116
(0.03 %)
193,024
(1.10 %)
33,101
(0.97 %)
30,240
(0.87 %)
280 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1
50,950
(3.26 %)
n/a 18,992
(2.00 %)
19,880
(1.66 %)
41,778
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
0
(0 %)
172,751
(12.60 %)
7,571
(100.00 %)
3,285,971
(33.14 %)
495,292
(1.05 %)
11,588,248
(25.43 %)
2,116
(0.03 %)
193,024
(1.10 %)
33,101
(0.97 %)
29,553
(0.86 %)
281 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1
n/a 41,563
(2.11 %)
18,531
(1.97 %)
20,309
(1.67 %)
n/a 40.52
(99.19 %)
0
(0 %)
292
(0.81 %)
50
(100.00 %)
3,284,473
(35.00 %)
559,653
(1.29 %)
12,043,562
(29.15 %)
0
(0 %)
155,142
(0.71 %)
32,047
(1.05 %)
30,235
(0.96 %)
282 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2
53,353
(46.77 %)
n/a 18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,301,020
(34.99 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,069
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,625
(0.98 %)
283 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1
53,352
(3.13 %)
n/a 18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,300,836
(34.99 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,627
(0.98 %)
284 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1
n/a n/a 23,153
(1.31 %)
51,642
(1.43 %)
n/a 43.16
(99.88 %)
8,133
(0.04 %)
8,133
(0.04 %)
1,053,330
(99.96 %)
3,675,075
(25.48 %)
938,700
(2.73 %)
12,027,923
(39.01 %)
44
(0.00 %)
n/a 80,955
(2.31 %)
64,379
(1.67 %)
285 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1
n/a n/a 13,467
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,442
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
0
(0 %)
112,918
(3.25 %)
46,340
(13.40 %)
32,897
(5.93 %)
286 greater sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850765.1
n/a n/a 18,322
(1.40 %)
21,049
(1.35 %)
n/a 41.71
(98.73 %)
102
(0.41 %)
468
(1.27 %)
359
(99.59 %)
4,247,148
(29.53 %)
1,031,385
(2.50 %)
12,465,194
(43.30 %)
3
(0.00 %)
1,113,639
(2.95 %)
101,620
(2.01 %)
44,590
(1.04 %)
287 greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank)
GCA_003640425.2
20,814
(51.89 %)
n/a 4,346
(0.99 %)
12,930
(3.50 %)
21,226
(7.60 %)
33.06
(99.10 %)
0
(0 %)
27,314
(0.92 %)
13,303
(100.00 %)
270,925
(3.18 %)
86,050
(1.20 %)
3,416,162
(48.29 %)
102
(0.01 %)
135,364
(1.95 %)
11,043
(1.07 %)
7,092
(0.63 %)
288 green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007)
GCF_000002595.1
14,410
(22.17 %)
n/a 987
(0.55 %)
11,299
(59.37 %)
n/a 63.87
(87.58 %)
9,827
(12.45 %)
10,425
(12.45 %)
11,385
(87.55 %)
167,652
(16.23 %)
100,391
(4.60 %)
734,057
(30.38 %)
3
(0.00 %)
37,459
(3.99 %)
3,154
(63.45 %)
17,305
(12.08 %)
289 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank)
GCA_000002595.3
n/a 19,528
(53.99 %)
988
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
171,684
(17.03 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
26
(0.03 %)
48,564
(5.08 %)
106
(99.48 %)
15,883
(12.21 %)
290 green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank)
GCA_000147415.1
9,780
(62.01 %)
9,780
(32.79 %)
743
(1.01 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,396
(8.55 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
65,787
(8.35 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
0
(0 %)
6,856
(2.06 %)
776
(95.90 %)
9,593
(9.00 %)
291 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2
76,037
(46.89 %)
n/a 20,079
(1.94 %)
20,246
(1.25 %)
n/a 40.81
(98.67 %)
160,731
(1.35 %)
178,925
(1.35 %)
163,017
(98.65 %)
5,382,039
(50.20 %)
980,479
(2.63 %)
16,076,172
(35.62 %)
23,631
(0.16 %)
934,122
(2.70 %)
50,033
(1.04 %)
27,104
(0.75 %)
292 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1
31,773
(2.57 %)
n/a 14,548
(1.02 %)
15,297
(1.46 %)
n/a 43.49
(95.57 %)
134,344
(4.44 %)
134,344
(4.44 %)
274,367
(95.56 %)
1,615,553
(13.87 %)
317,600
(2.08 %)
11,732,990
(28.32 %)
129
(0.02 %)
n/a 36,782
(0.70 %)
21,797
(0.42 %)
293 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1
56,904
(3.63 %)
n/a 14,729
(1.06 %)
17,439
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
0
(0 %)
294
(0.56 %)
99
(100.00 %)
1,641,730
(15.08 %)
304,356
(1.25 %)
11,136,918
(31.96 %)
0
(0 %)
429,794
(1.68 %)
49,035
(1.44 %)
26,943
(0.68 %)
294 harbor porpoise (BS71 2019)
GCA_004363495.1
n/a n/a 21,044
(1.46 %)
30,072
(1.23 %)
n/a 41.83
(99.88 %)
7,114
(0.03 %)
7,114
(0.03 %)
1,338,272
(99.97 %)
5,359,537
(46.83 %)
772,736
(1.54 %)
13,705,428
(42.29 %)
44
(0.00 %)
n/a 80,965
(1.65 %)
55,941
(1.28 %)
295 Harpy eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_026419915.1
51,641
(50.37 %)
n/a 13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
0
(0 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
1
(0.00 %)
480,042
(2.70 %)
60,606
(5.66 %)
30,636
(1.52 %)
296 Hawaiian crow (2021 genbank)
GCA_020740725.1
51,593
(54.67 %)
n/a 12,737
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
0
(0 %)
294
(0.16 %)
187
(100.00 %)
502,844
(6.10 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,316
(23.59 %)
3
(0.00 %)
336,844
(2.41 %)
46,108
(3.49 %)
24,228
(1.26 %)
297 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank)
GCA_002201575.1
0
(0.00 %)
n/a 19,385
(1.74 %)
20,265
(1.41 %)
33,375
(1.66 %)
41.41
(97.77 %)
0
(0 %)
38,833
(2.24 %)
7,871
(100.00 %)
4,629,031
(43.70 %)
573,328
(1.09 %)
13,374,887
(33.10 %)
882
(0.03 %)
587,399
(1.58 %)
50,379
(1.45 %)
46,745
(1.27 %)
298 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq)
GCF_002201575.1
29,897
(1.95 %)
n/a 19,380
(1.75 %)
20,272
(1.41 %)
n/a 41.41
(97.77 %)
0
(0 %)
38,833
(2.24 %)
7,872
(100.00 %)
4,629,766
(43.70 %)
573,335
(1.09 %)
13,369,616
(33.10 %)
882
(0.03 %)
587,410
(1.58 %)
50,380
(1.45 %)
46,744
(1.27 %)
299 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v1 hap1 2024)
GCA_040954625.1
n/a n/a 4,944
(1.30 %)
35,031
(15.53 %)
n/a 39.72
(99.96 %)
0
(0 %)
254
(0.04 %)
77
(100.00 %)
87,841
(1.67 %)
119,697
(13.20 %)
1,309,907
(29.40 %)
5
(0.00 %)
336,770
(8.96 %)
21,623
(4.17 %)
15,834
(2.51 %)
300 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v1 hap2 2024)
GCA_040954595.1
n/a n/a 4,919
(1.33 %)
34,873
(16.02 %)
n/a 39.72
(99.96 %)
0
(0 %)
254
(0.04 %)
56
(100.00 %)
84,495
(1.58 %)
118,073
(13.23 %)
1,301,514
(28.77 %)
3
(0.00 %)
317,532
(8.60 %)
20,511
(4.03 %)
15,567
(2.64 %)
301 hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank)
GCA_030028045.1
64,153
(41.00 %)
n/a 20,337
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
0
(0 %)
226
(0.00 %)
356
(100.00 %)
3,783,435
(35.17 %)
567,796
(3.38 %)
13,462,481
(35.48 %)
2
(0.00 %)
396,368
(1.55 %)
48,365
(1.91 %)
44,048
(1.34 %)
302 Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.1
49,894
(2.81 %)
n/a 18,317
(1.66 %)
19,991
(1.63 %)
n/a 42.33
(99.79 %)
0
(0 %)
38,823
(0.21 %)
27,486
(100.00 %)
2,844,834
(29.10 %)
367,443
(1.49 %)
11,805,151
(31.26 %)
151
(0.00 %)
330,522
(1.83 %)
59,262
(1.70 %)
48,287
(1.35 %)
303 honeybee mite (v1 2017)
GCF_002443255.1
35,641
(12.86 %)
n/a 2,741
(0.61 %)
28,868
(8.05 %)
n/a 40.92
(99.93 %)
0
(0 %)
3,073
(0.07 %)
1,426
(100.00 %)
117,879
(1.26 %)
43,685
(1.30 %)
1,858,762
(15.09 %)
11
(0.00 %)
32,482
(0.75 %)
31,400
(5.04 %)
28,693
(3.46 %)
304 hooded crow (v2 S_Up_H32 2017)
GCF_000738735.2
35,874
(6.47 %)
n/a 11,298
(1.84 %)
17,627
(2.12 %)
n/a 41.48
(97.07 %)
0
(0 %)
27,795
(2.94 %)
113
(100.00 %)
392,199
(5.95 %)
139,126
(0.76 %)
6,141,002
(18.21 %)
16
(0.00 %)
38,866
(0.37 %)
12,943
(0.48 %)
10,321
(0.36 %)
305 hooded crow (v5 S_Up_H32 2021)
GCF_000738735.5
42,799
(6.57 %)
n/a 11,845
(1.92 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
0
(0 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
421,463
(6.12 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
0
(0 %)
77,475
(0.63 %)
25,266
(2.09 %)
20,747
(1.24 %)
306 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1
n/a n/a 18,575
(1.67 %)
17,121
(1.34 %)
n/a 41.50
(98.14 %)
45,680
(1.86 %)
45,680
(1.86 %)
55,316
(98.14 %)
3,941,878
(45.17 %)
381,229
(1.99 %)
14,674,265
(29.80 %)
3
(0.00 %)
384,525
(1.12 %)
45,521
(1.52 %)
36,682
(0.85 %)
307 hourglass treefrog (paternal 2023 genbank)
GCA_027789765.1
n/a n/a 14,058
(0.89 %)
31,050
(2.69 %)
n/a 43.97
(99.70 %)
0
(0 %)
804
(0.30 %)
2,200
(100.00 %)
906,816
(2.43 %)
1,710,859
(17.48 %)
10,069,798
(51.41 %)
3
(0.00 %)
3,539,111
(9.05 %)
235,277
(5.56 %)
28,414
(0.63 %)
308 house finch (primary hap 2022 genbank)
GCA_027477595.1
43,228
(49.63 %)
n/a 12,700
(1.83 %)
24,567
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
0
(0 %)
295
(0.98 %)
183
(100.00 %)
440,379
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,100
(23.47 %)
1
(0.00 %)
573,829
(3.39 %)
30,897
(2.53 %)
22,852
(1.24 %)
309 house fly (aabys 2013 genbank)
GCA_000371365.1
n/a n/a 7,825
(1.36 %)
12,819
(3.07 %)
n/a 35.11
(92.22 %)
83,567
(7.82 %)
102,610
(7.82 %)
104,053
(92.18 %)
415,874
(2.30 %)
376,409
(8.80 %)
4,931,104
(52.61 %)
1,284
(0.11 %)
575,203
(6.40 %)
7,139
(0.35 %)
3,214
(0.17 %)
310 house mouse (AKR_J v1 2016)
GCA_001624295.1
n/a n/a 21,299
(2.19 %)
18,730
(1.41 %)
102,168
(4.09 %)
41.70
(86.82 %)
34,083
(4.00 %)
314,064
(13.22 %)
40,550
(96.00 %)
5,186,721
(40.97 %)
1,485,719
(3.05 %)
13,610,761
(27.42 %)
18,106
(1.03 %)
469,625
(2.17 %)
16,745
(0.41 %)
15,817
(0.38 %)
311 house mouse (A_J v1 2016)
GCA_001624215.1
n/a n/a 21,171
(2.20 %)
18,776
(1.40 %)
102,254
(4.12 %)
41.70
(89.34 %)
28,597
(3.99 %)
365,877
(10.71 %)
33,692
(96.01 %)
5,186,523
(40.90 %)
1,483,826
(3.06 %)
13,614,266
(28.13 %)
38,843
(1.02 %)
487,933
(2.04 %)
16,590
(0.42 %)
15,701
(0.39 %)
312 house mouse (BALB_cJ v1 2016)
GCA_001632525.1
n/a n/a 21,337
(2.21 %)
18,682
(1.41 %)
102,138
(4.14 %)
41.74
(88.91 %)
32,984
(4.16 %)
361,689
(11.14 %)
37,453
(95.84 %)
5,096,953
(40.72 %)
1,407,754
(2.90 %)
13,416,041
(27.66 %)
15,793
(0.80 %)
453,227
(1.90 %)
16,788
(0.42 %)
15,890
(0.39 %)
313 house mouse (C3H_HeJ v1 2016)
GCA_001632575.1
n/a n/a 21,177
(2.22 %)
18,550
(1.42 %)
101,710
(4.15 %)
41.74
(85.90 %)
32,785
(4.09 %)
369,499
(14.15 %)
37,497
(95.91 %)
5,089,496
(40.41 %)
1,399,438
(2.72 %)
13,485,480
(26.52 %)
19,436
(0.94 %)
427,663
(1.66 %)
16,675
(0.41 %)
15,897
(0.38 %)
314 house mouse (CBA_J v1 2016)
GCA_001624475.1
n/a n/a 21,259
(2.23 %)
18,593
(1.42 %)
101,632
(4.14 %)
41.78
(79.43 %)
36,013
(3.86 %)
410,639
(20.63 %)
42,242
(96.14 %)
5,081,543
(40.40 %)
1,393,763
(2.54 %)
13,472,532
(24.46 %)
24,180
(1.46 %)
418,702
(1.72 %)
16,809
(0.38 %)
15,953
(0.35 %)
315 house mouse (DBA_2J v1 2016)
GCA_001624505.1
n/a n/a 21,156
(2.23 %)
18,610
(1.43 %)
101,908
(4.18 %)
41.80
(88.67 %)
37,461
(4.86 %)
409,306
(11.39 %)
42,324
(95.14 %)
5,028,217
(40.37 %)
1,364,702
(2.73 %)
13,540,805
(27.33 %)
13,245
(0.55 %)
420,635
(1.47 %)
16,544
(0.42 %)
15,786
(0.39 %)
316 house mouse (FVB_NJ v1 2016)
GCA_001624535.1
n/a n/a 21,195
(2.22 %)
18,615
(1.42 %)
101,520
(4.15 %)
41.75
(89.39 %)
61,976
(6.27 %)
380,840
(10.66 %)
67,805
(93.73 %)
5,037,447
(40.28 %)
1,381,859
(2.89 %)
13,440,164
(27.32 %)
14,811
(0.71 %)
426,149
(1.81 %)
16,625
(0.42 %)
15,829
(0.39 %)
317 house mouse (GRCm38.p6 2017)
GCF_000001635.26
123,654
(4.49 %)
n/a 24,134
(2.09 %)
22,855
(1.67 %)
n/a 41.73
(97.18 %)
676
(2.82 %)
904
(2.82 %)
21,179
(97.18 %)
5,554,281
(45.50 %)
1,695,255
(3.40 %)
13,041,229
(35.91 %)
3
(0.00 %)
889,196
(2.45 %)
25,014
(0.54 %)
16,961
(0.40 %)
318 house mouse (LP_J v1 2016)
GCA_001632615.1
n/a n/a 21,012
(2.23 %)
18,555
(1.43 %)
101,892
(4.18 %)
41.78
(84.14 %)
34,444
(4.11 %)
402,247
(15.91 %)
38,542
(95.89 %)
5,032,748
(40.03 %)
1,373,374
(2.60 %)
13,411,126
(25.61 %)
18,175
(0.88 %)
405,473
(1.47 %)
16,668
(0.40 %)
15,888
(0.37 %)
319 house mouse (NOD_ShiLtJ v1 2016)
GCA_001624675.1
n/a n/a 21,291
(2.24 %)
19,697
(1.47 %)
101,562
(4.18 %)
42.00
(77.13 %)
60,087
(4.21 %)
595,433
(22.95 %)
66,154
(95.79 %)
5,059,815
(40.57 %)
1,370,443
(2.51 %)
13,251,532
(23.62 %)
36,838
(1.54 %)
452,044
(2.17 %)
18,188
(0.42 %)
17,273
(0.39 %)
320 house mouse (NZO_HlLtJ v1 2016)
GCA_001624745.1
n/a n/a 21,233
(2.22 %)
18,805
(1.43 %)
103,134
(4.18 %)
41.74
(86.47 %)
49,204
(4.63 %)
337,909
(13.58 %)
57,439
(95.37 %)
5,112,301
(40.60 %)
1,418,629
(2.92 %)
13,588,055
(27.01 %)
21,209
(1.18 %)
440,820
(2.04 %)
16,857
(0.41 %)
15,946
(0.38 %)
321 human (HG00438.mat 2021)
GCA_018471515.1
n/a n/a 20,788
(1.85 %)
22,424
(1.25 %)
233,427
(57.20 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 258
(100.00 %)
5,426,471
(53.12 %)
1,085,458
(7.66 %)
16,023,596
(40.44 %)
0
(0 %)
1,660,644
(3.30 %)
52,702
(1.17 %)
28,454
(0.75 %)
322 human (HG00438.pat 2021)
GCA_018472595.1
n/a n/a 20,627
(1.85 %)
22,176
(1.24 %)
233,698
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
276
(100.00 %)
5,419,334
(52.97 %)
1,071,302
(7.38 %)
15,894,505
(40.10 %)
0
(0 %)
1,681,408
(3.32 %)
52,377
(1.20 %)
28,532
(0.76 %)
323 human (HG00621.mat 2021)
GCA_018472605.1
n/a n/a 20,611
(1.85 %)
22,275
(1.25 %)
233,258
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 253
(100.00 %)
5,392,161
(53.03 %)
1,048,372
(7.50 %)
15,960,374
(40.31 %)
0
(0 %)
1,701,207
(3.32 %)
52,502
(1.20 %)
28,554
(0.77 %)
324 human (HG00621.pat 2021)
GCA_018472575.1
n/a n/a 19,907
(1.86 %)
21,558
(1.26 %)
227,172
(5.00 %)
40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 287
(100.00 %)
5,174,496
(52.83 %)
1,030,071
(7.85 %)
15,147,153
(40.18 %)
0
(0 %)
1,671,972
(3.41 %)
50,988
(1.20 %)
27,845
(0.76 %)
325 human (HG00673.mat 2021)
GCA_018472565.1
n/a n/a 20,805
(1.84 %)
22,193
(1.24 %)
233,975
(4.93 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 348
(100.00 %)
5,408,639
(53.33 %)
1,056,398
(8.05 %)
16,117,475
(40.76 %)
0
(0 %)
1,829,654
(3.54 %)
52,411
(1.14 %)
28,185
(0.74 %)
326 human (HG00673.pat 2021)
GCA_018472585.1
n/a n/a 19,963
(1.85 %)
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(1.25 %)
227,480
(4.97 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
420
(100.00 %)
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(8.25 %)
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0
(0 %)
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(3.59 %)
50,883
(1.20 %)
27,934
(0.76 %)
327 human (HG00733 mat 2021)
GCA_018506975.1
n/a n/a 20,626
(1.85 %)
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(4.96 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
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(0.00 %)
609
(100.00 %)
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0
(0 %)
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(3.39 %)
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(1.22 %)
28,848
(0.77 %)
328 human (HG00733 pat 2021)
GCA_018506955.1
n/a n/a 20,749
(1.85 %)
22,251
(1.24 %)
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(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
695
(100.00 %)
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(53.15 %)
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(7.72 %)
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(40.46 %)
0
(0 %)
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(3.49 %)
53,315
(1.19 %)
28,785
(0.76 %)
329 human (HG00735.mat 2021)
GCA_018472765.1
n/a n/a 20,674
(1.84 %)
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(1.25 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
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(100.00 %)
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(40.51 %)
0
(0 %)
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(3.39 %)
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(1.14 %)
28,228
(0.74 %)
330 human (HG00735.pat 2021)
GCA_018472715.1
n/a n/a 20,688
(1.84 %)
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(1.23 %)
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(4.95 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
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(100.00 %)
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(0 %)
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(3.44 %)
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(1.14 %)
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(0.74 %)
331 human (HG00741.mat 2021)
GCA_018471095.1
n/a n/a 20,654
(1.85 %)
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(4.94 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 297
(100.00 %)
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(0 %)
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(3.47 %)
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(1.14 %)
28,292
(0.75 %)
332 human (HG00741.pat 2021)
GCA_018471105.1
n/a n/a 20,657
(1.85 %)
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(1.25 %)
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(4.95 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
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(100.00 %)
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(53.08 %)
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(7.55 %)
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(40.41 %)
0
(0 %)
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(3.37 %)
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(1.20 %)
28,347
(0.75 %)
333 human (HG01071.mat 2021)
GCA_018472685.1
n/a n/a 20,742
(1.86 %)
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(1.25 %)
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(4.98 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 236
(100.00 %)
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(52.80 %)
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(7.04 %)
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(39.99 %)
0
(0 %)
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(3.18 %)
52,233
(1.13 %)
28,193
(0.74 %)
334 human (HG01071.pat 2021)
GCA_018472725.1
n/a n/a 20,694
(1.84 %)
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(1.25 %)
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(4.90 %)
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(100.00 %)
0
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1
(0.00 %)
330
(100.00 %)
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(3.60 %)
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(0.75 %)
335 human (HG01106.mat 2021)
GCA_018471345.1
n/a n/a 20,635
(1.85 %)
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(100.00 %)
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(0 %)
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(3.52 %)
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(1.18 %)
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(0.76 %)
336 human (HG01106.pat 2021)
GCA_018471075.1
n/a n/a 19,939
(1.84 %)
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(4.97 %)
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(100.00 %)
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n/a 284
(100.00 %)
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(3.55 %)
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(1.19 %)
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(0.76 %)
337 human (HG01109.mat 2021)
GCA_018504365.1
n/a n/a 20,638
(1.84 %)
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(1.25 %)
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(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
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(100.00 %)
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0
(0 %)
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(3.43 %)
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(1.22 %)
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(0.77 %)
338 human (HG01109.pat 2021)
GCA_018504645.1
n/a n/a 19,870
(1.85 %)
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(1.26 %)
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(4.98 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
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(100.00 %)
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(7.99 %)
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0
(0 %)
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(3.57 %)
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(1.20 %)
28,020
(0.77 %)
339 human (HG01123.mat 2021)
GCA_018469665.1
n/a n/a 20,643
(1.86 %)
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(1.25 %)
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(4.98 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
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(100.00 %)
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(7.16 %)
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(40.07 %)
0
(0 %)
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(3.28 %)
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(1.15 %)
28,326
(0.76 %)
340 human (HG01123.pat 2021)
GCA_018469695.1
n/a n/a 20,631
(1.86 %)
22,210
(1.24 %)
233,273
(4.97 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
436
(100.00 %)
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(52.85 %)
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(7.14 %)
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(40.09 %)
0
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(3.21 %)
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(1.16 %)
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(0.76 %)
341 human (HG01175.mat 2021)
GCA_018471085.1
n/a n/a 20,587
(1.84 %)
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(1.24 %)
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(4.93 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
315
(100.00 %)
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(53.20 %)
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(7.79 %)
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0
(0 %)
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(3.46 %)
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(1.14 %)
27,965
(0.74 %)
342 human (HG01175.pat 2021)
GCA_018471065.1
n/a n/a 20,651
(1.85 %)
22,302
(1.25 %)
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(4.94 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 365
(100.00 %)
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(53.10 %)
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(7.62 %)
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(40.44 %)
0
(0 %)
1,703,810
(3.35 %)
52,440
(1.16 %)
28,285
(0.75 %)
343 human (HG01243.mat 2021)
GCA_018504375.1
n/a n/a 20,701
(1.85 %)
22,327
(1.24 %)
232,970
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 345
(100.00 %)
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(53.11 %)
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(7.61 %)
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(40.37 %)
0
(0 %)
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(3.37 %)
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(1.16 %)
28,186
(0.75 %)
344 human (HG01243.pat 2021)
GCA_018504045.1
n/a n/a 19,886
(1.86 %)
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(1.26 %)
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(5.00 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
436
(100.00 %)
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(52.80 %)
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(7.85 %)
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(40.25 %)
0
(0 %)
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(3.44 %)
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(1.26 %)
28,132
(0.77 %)
345 human (HG01258.mat 2021)
GCA_018469405.1
n/a n/a 20,652
(1.85 %)
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(1.25 %)
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(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
346
(100.00 %)
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(53.06 %)
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(7.57 %)
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(40.29 %)
0
(0 %)
1,710,255
(3.35 %)
52,952
(1.24 %)
28,873
(0.78 %)
346 human (HG01258.pat 2021)
GCA_018469675.1
n/a n/a 19,899
(1.85 %)
21,663
(1.25 %)
227,048
(4.98 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
324
(100.00 %)
5,179,894
(52.93 %)
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(8.01 %)
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(40.34 %)
0
(0 %)
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(3.50 %)
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(1.15 %)
27,621
(0.75 %)
347 human (HG01358.mat 2021)
GCA_018469865.1
n/a n/a 20,620
(1.85 %)
22,173
(1.24 %)
232,988
(57.14 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
334
(100.00 %)
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(53.13 %)
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(7.68 %)
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(40.42 %)
0
(0 %)
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(3.46 %)
52,497
(1.15 %)
28,292
(0.75 %)
348 human (HG01358.pat 2021)
GCA_018469965.1
n/a n/a 19,983
(1.85 %)
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(1.25 %)
227,373
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
441
(100.00 %)
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(53.10 %)
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(8.29 %)
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(40.47 %)
0
(0 %)
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(3.57 %)
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(1.21 %)
28,121
(0.77 %)
349 human (HG01361.mat 2021)
GCA_018469685.1
n/a n/a 20,709
(1.85 %)
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(1.24 %)
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(4.95 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 295
(100.00 %)
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(53.06 %)
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(7.57 %)
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(40.36 %)
0
(0 %)
1,718,918
(3.41 %)
52,279
(1.19 %)
28,479
(0.76 %)
350 human (HG01361.pat 2021)
GCA_018469705.1
n/a n/a 20,643
(1.86 %)
22,265
(1.25 %)
233,156
(4.98 %)
40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
288
(100.00 %)
5,389,985
(52.82 %)
1,039,540
(7.07 %)
15,972,086
(40.01 %)
0
(0 %)
1,639,198
(3.24 %)
52,246
(1.17 %)
28,320
(0.75 %)
351 human (HG01891.mat 2021)
GCA_018467155.1
n/a n/a 20,644
(1.86 %)
22,204
(1.24 %)
233,342
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
331
(100.00 %)
5,394,888
(53.00 %)
1,057,773
(7.41 %)
16,010,248
(40.29 %)
0
(0 %)
1,698,458
(3.35 %)
52,761
(1.18 %)
28,443
(0.76 %)
352 human (HG01891.pat 2021)
GCA_018467165.1
n/a n/a 20,737
(1.84 %)
22,422
(1.25 %)
233,650
(4.94 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
427
(100.00 %)
5,403,741
(53.18 %)
1,044,828
(7.78 %)
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(40.45 %)
0
(0 %)
1,873,046
(3.60 %)
52,966
(1.19 %)
28,638
(0.76 %)
353 human (HG01928.mat 2021)
GCA_018472695.1
n/a n/a 20,608
(1.85 %)
22,133
(1.24 %)
232,837
(4.94 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 244
(100.00 %)
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(53.12 %)
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(7.67 %)
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(40.40 %)
0
(0 %)
1,763,911
(3.46 %)
51,940
(1.16 %)
28,097
(0.75 %)
354 human (HG01928.pat 2021)
GCA_018472705.1
n/a n/a 19,872
(1.85 %)
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(1.24 %)
226,741
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
317
(100.00 %)
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(53.05 %)
1,052,422
(8.21 %)
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(40.53 %)
0
(0 %)
1,685,112
(3.48 %)
50,940
(1.18 %)
27,635
(0.76 %)
355 human (HG01952.mat 2021)
GCA_018471545.1
n/a n/a 20,679
(1.86 %)
22,204
(1.25 %)
233,578
(4.98 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 307
(100.00 %)
5,393,904
(52.87 %)
1,041,237
(7.18 %)
15,894,360
(39.98 %)
0
(0 %)
1,656,772
(3.27 %)
52,866
(1.21 %)
28,673
(0.77 %)
356 human (HG01952.pat 2021)
GCA_018471555.1
n/a n/a 19,863
(1.85 %)
21,383
(1.24 %)
226,809
(4.97 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 378
(100.00 %)
5,181,545
(52.95 %)
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(8.07 %)
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(40.47 %)
0
(0 %)
1,741,906
(3.59 %)
51,292
(1.24 %)
28,192
(0.78 %)
357 human (HG01978.mat 2021)
GCA_018472865.1
n/a n/a 20,711
(1.84 %)
22,195
(1.24 %)
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(4.92 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 247
(100.00 %)
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(53.41 %)
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(40.83 %)
0
(0 %)
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(3.56 %)
52,688
(1.16 %)
28,504
(0.75 %)
358 human (HG01978.pat 2021)
GCA_018472845.1
n/a n/a 20,727
(1.84 %)
22,443
(1.25 %)
233,592
(4.92 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
286
(100.00 %)
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(53.38 %)
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(8.17 %)
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(40.68 %)
0
(0 %)
1,857,872
(3.63 %)
52,674
(1.19 %)
28,529
(0.75 %)
359 human (HG02055 mat 2021)
GCA_018506125.1
n/a n/a 20,668
(1.86 %)
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(1.26 %)
233,148
(4.96 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
306
(100.00 %)
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(52.96 %)
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(7.31 %)
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(40.18 %)
0
(0 %)
1,711,779
(3.38 %)
52,182
(1.14 %)
28,129
(0.74 %)
360 human (HG02055 pat 2021)
GCA_018505855.1
n/a n/a 19,927
(1.83 %)
21,549
(1.23 %)
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(4.93 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 367
(100.00 %)
5,216,705
(53.37 %)
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(8.82 %)
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(40.89 %)
0
(0 %)
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(3.73 %)
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(1.20 %)
27,937
(0.76 %)
361 human (HG02080.mat 2021)
GCA_018504085.1
n/a n/a 20,633
(1.85 %)
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(1.24 %)
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(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
422
(100.00 %)
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(53.12 %)
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(7.68 %)
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(40.28 %)
0
(0 %)
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(3.42 %)
52,572
(1.21 %)
28,530
(0.77 %)
362 human (HG02080.pat 2021)
GCA_018504055.1
n/a n/a 20,645
(1.85 %)
22,426
(1.26 %)
233,357
(4.96 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 485
(100.00 %)
5,400,305
(52.99 %)
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(7.39 %)
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(40.12 %)
0
(0 %)
1,695,953
(3.33 %)
52,798
(1.20 %)
28,645
(0.77 %)
363 human (HG02109 mat 2021)
GCA_018505825.1
n/a n/a 20,672
(1.85 %)
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(1.25 %)
233,217
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 445
(100.00 %)
5,404,232
(52.99 %)
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(7.38 %)
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(40.16 %)
0
(0 %)
1,773,533
(3.47 %)
52,821
(1.21 %)
28,671
(0.77 %)
364 human (HG02109 pat 2021)
GCA_018505865.1
n/a n/a 20,726
(1.85 %)
22,416
(1.25 %)
233,280
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
481
(100.00 %)
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(53.08 %)
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(7.55 %)
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(40.27 %)
0
(0 %)
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(3.39 %)
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(1.18 %)
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(0.76 %)
365 human (HG02145 mat 2021)
GCA_018852585.1
n/a n/a 20,626
(1.85 %)
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(1.25 %)
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(4.94 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
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(100.00 %)
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(0 %)
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(3.36 %)
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(1.19 %)
28,564
(0.75 %)
366 human (HG02145 pat 2021)
GCA_018852595.1
n/a n/a 19,971
(1.84 %)
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(1.40 %)
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(4.94 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
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(100.00 %)
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(53.01 %)
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(40.43 %)
0
(0 %)
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(3.61 %)
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(1.32 %)
29,473
(0.88 %)
367 human (HG02148.mat 2021)
GCA_018471535.1
n/a n/a 20,622
(1.85 %)
22,230
(1.24 %)
233,267
(4.94 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 423
(100.00 %)
5,415,368
(53.22 %)
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(7.85 %)
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(40.54 %)
0
(0 %)
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(3.35 %)
52,324
(1.14 %)
28,236
(0.74 %)
368 human (HG02148.pat 2021)
GCA_018471525.1
n/a n/a 20,675
(1.85 %)
22,449
(1.25 %)
233,621
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 487
(100.00 %)
5,408,728
(53.04 %)
1,060,811
(7.55 %)
15,818,402
(40.19 %)
0
(0 %)
1,744,671
(3.42 %)
52,717
(1.23 %)
28,850
(0.77 %)
369 human (HG02257.mat 2021)
GCA_018466845.1
n/a n/a 20,636
(1.85 %)
22,298
(1.24 %)
233,236
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
292
(100.00 %)
5,409,203
(53.10 %)
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(7.60 %)
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(40.43 %)
0
(0 %)
1,761,022
(3.44 %)
52,647
(1.16 %)
28,293
(0.75 %)
370 human (HG02257.pat 2021)
GCA_018466835.1
n/a n/a 20,659
(1.84 %)
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(1.23 %)
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(4.93 %)
40.78
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 306
(100.00 %)
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(53.29 %)
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(7.99 %)
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(40.53 %)
0
(0 %)
1,858,343
(3.60 %)
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(1.18 %)
28,403
(0.75 %)
371 human (HG02486.mat 2021)
GCA_018467015.1
n/a n/a 20,626
(1.85 %)
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(1.24 %)
232,923
(4.95 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
283
(100.00 %)
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(53.15 %)
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(7.68 %)
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(40.44 %)
0
(0 %)
1,743,020
(3.45 %)
52,593
(1.16 %)
28,402
(0.76 %)
372 human (HG02486.pat 2021)
GCA_018467005.1
n/a n/a 20,047
(1.86 %)
21,511
(1.24 %)
227,472
(4.97 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
342
(100.00 %)
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(53.10 %)
1,044,947
(8.26 %)
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(40.62 %)
0
(0 %)
1,739,327
(3.57 %)
51,172
(1.16 %)
27,863
(0.76 %)
373 human (HG02559.mat 2021)
GCA_018466985.1
n/a n/a 20,748
(1.85 %)
22,425
(1.25 %)
233,661
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 329
(100.00 %)
5,409,998
(53.11 %)
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(7.64 %)
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(40.38 %)
0
(0 %)
1,799,081
(3.49 %)
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(1.22 %)
28,800
(0.77 %)
374 human (HG02559.pat 2021)
GCA_018466855.1
n/a n/a 20,684
(1.85 %)
22,457
(1.26 %)
233,500
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
260
(100.00 %)
5,394,499
(53.00 %)
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(7.39 %)
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(40.28 %)
0
(0 %)
1,772,200
(3.48 %)
52,834
(1.17 %)
28,486
(0.76 %)
375 human (HG02572.mat 2021)
GCA_018470445.1
n/a n/a 20,823
(1.84 %)
22,634
(1.24 %)
232,547
(4.89 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
632
(100.00 %)
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(53.28 %)
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(7.96 %)
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(40.45 %)
0
(0 %)
1,808,343
(3.57 %)
53,410
(1.21 %)
28,781
(0.76 %)
376 human (HG02572.pat 2021)
GCA_018470435.1
n/a n/a 20,054
(1.85 %)
21,827
(1.25 %)
225,951
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
641
(100.00 %)
5,213,929
(53.30 %)
1,082,137
(8.76 %)
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(40.69 %)
0
(0 %)
1,884,567
(3.86 %)
51,312
(1.19 %)
27,939
(0.75 %)
377 human (HG02622.mat 2021)
GCA_018469875.1
n/a n/a 20,669
(1.84 %)
22,455
(1.24 %)
233,354
(4.93 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 292
(100.00 %)
5,446,540
(53.17 %)
1,085,576
(7.76 %)
15,975,207
(40.52 %)
0
(0 %)
1,776,427
(3.47 %)
53,535
(1.26 %)
28,986
(0.77 %)
378 human (HG02622.pat 2021)
GCA_018469925.1
n/a n/a 20,698
(1.84 %)
22,536
(1.25 %)
233,733
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
270
(100.00 %)
5,421,378
(53.22 %)
1,062,842
(7.81 %)
15,934,809
(40.46 %)
0
(0 %)
1,803,645
(3.51 %)
52,975
(1.21 %)
28,639
(0.75 %)
379 human (HG02630.mat 2021)
GCA_018469955.1
n/a n/a 20,674
(1.84 %)
22,467
(1.25 %)
233,172
(4.93 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
497
(100.00 %)
5,432,857
(53.10 %)
1,072,648
(7.64 %)
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(40.53 %)
0
(0 %)
1,722,501
(3.36 %)
54,101
(1.32 %)
29,504
(0.80 %)
380 human (HG02630.pat 2021)
GCA_018469945.1
n/a n/a 20,722
(1.83 %)
22,445
(1.24 %)
233,268
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
534
(100.00 %)
5,449,816
(53.34 %)
1,108,461
(8.05 %)
15,985,498
(40.79 %)
0
(0 %)
1,803,634
(3.57 %)
53,746
(1.28 %)
29,112
(0.77 %)
381 human (HG02717.mat 2021)
GCA_018469935.1
n/a n/a 20,621
(1.84 %)
22,396
(1.25 %)
233,096
(4.93 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
323
(100.00 %)
5,411,829
(53.22 %)
1,079,483
(7.87 %)
15,854,981
(40.43 %)
0
(0 %)
1,785,077
(3.54 %)
53,155
(1.21 %)
28,854
(0.78 %)
382 human (HG02717.pat 2021)
GCA_018470425.1
n/a n/a 19,952
(1.84 %)
21,767
(1.25 %)
227,273
(4.93 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
399
(100.00 %)
5,216,997
(53.34 %)
1,089,537
(8.70 %)
15,132,132
(40.83 %)
0
(0 %)
1,819,884
(3.72 %)
51,815
(1.21 %)
28,146
(0.76 %)
383 human (HG02723.mat 2021)
GCA_018504065.1
n/a n/a 20,697
(1.85 %)
22,322
(1.25 %)
233,152
(4.95 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
429
(100.00 %)
5,403,282
(53.05 %)
1,062,881
(7.52 %)
15,861,495
(40.19 %)
0
(0 %)
1,727,512
(3.39 %)
52,733
(1.19 %)
28,558
(0.76 %)
384 human (HG02723.pat 2021)
GCA_018504075.1
n/a n/a 20,606
(1.84 %)
22,627
(1.25 %)
233,499
(4.92 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
529
(100.00 %)
5,419,888
(53.29 %)
1,079,052
(8.00 %)
15,778,626
(40.44 %)
0
(0 %)
1,828,728
(3.61 %)
53,133
(1.23 %)
28,789
(0.77 %)
385 human (HG02818.mat 2021)
GCA_018503585.1
n/a n/a 20,695
(1.85 %)
22,489
(1.25 %)
233,161
(4.93 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
620
(100.00 %)
5,406,404
(53.21 %)
1,061,348
(7.77 %)
15,879,759
(40.38 %)
0
(0 %)
1,755,044
(3.46 %)
52,992
(1.18 %)
28,591
(0.77 %)
386 human (HG02818.pat 2021)
GCA_018503575.1
n/a n/a 20,696
(1.86 %)
22,490
(1.27 %)
233,253
(4.97 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
566
(100.00 %)
5,397,389
(52.88 %)
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(7.21 %)
16,011,018
(40.13 %)
0
(0 %)
1,663,167
(3.29 %)
52,793
(1.17 %)
28,656
(0.76 %)
387 human (HG02886.mat 2021)
GCA_018470455.1
n/a n/a 20,740
(1.84 %)
22,693
(1.25 %)
233,895
(4.94 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 461
(100.00 %)
5,448,421
(53.12 %)
1,077,973
(7.55 %)
15,956,661
(40.38 %)
0
(0 %)
1,776,179
(3.47 %)
53,701
(1.29 %)
29,198
(0.78 %)
388 human (HG02886.pat 2021)
GCA_018470465.1
n/a n/a 20,705
(1.84 %)
22,599
(1.26 %)
233,328
(4.93 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 503
(100.00 %)
5,438,367
(53.15 %)
1,090,141
(7.70 %)
16,016,158
(40.57 %)
0
(0 %)
1,803,515
(3.52 %)
53,652
(1.26 %)
29,087
(0.78 %)
389 human (HG03098 mat 2021)
GCA_018506165.1
n/a n/a 20,700
(1.83 %)
22,200
(1.24 %)
233,714
(4.91 %)
40.79
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 331
(100.00 %)
5,414,502
(53.46 %)
1,066,527
(8.36 %)
15,926,377
(40.78 %)
0
(0 %)
1,890,567
(3.67 %)
52,417
(1.18 %)
28,468
(0.76 %)
390 human (HG03098 pat 2021)
GCA_018506155.1
n/a n/a 19,900
(1.84 %)
21,567
(1.24 %)
226,998
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
445
(100.00 %)
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(53.24 %)
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(8.56 %)
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(40.64 %)
0
(0 %)
1,817,407
(3.73 %)
51,389
(1.21 %)
28,025
(0.77 %)
391 human (HG03453.mat 2021)
GCA_018472855.1
n/a n/a 20,710
(1.84 %)
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(1.25 %)
233,614
(4.93 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
439
(100.00 %)
5,436,784
(53.21 %)
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(7.82 %)
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(40.60 %)
0
(0 %)
1,790,931
(3.50 %)
53,318
(1.27 %)
29,023
(0.78 %)
392 human (HG03453.pat 2021)
GCA_018473305.1
n/a n/a 20,661
(1.84 %)
22,407
(1.25 %)
233,945
(4.93 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 480
(100.00 %)
5,418,964
(53.30 %)
1,060,724
(7.98 %)
15,795,098
(40.40 %)
0
(0 %)
1,768,342
(3.49 %)
53,149
(1.21 %)
28,793
(0.76 %)
393 human (HG03486 pat 2021)
GCA_018503245.1
n/a n/a 20,698
(1.84 %)
22,539
(1.24 %)
233,646
(4.92 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
519
(100.00 %)
5,426,413
(53.27 %)
1,068,800
(7.93 %)
15,812,092
(40.41 %)
0
(0 %)
1,763,702
(3.47 %)
53,143
(1.26 %)
28,964
(0.77 %)
394 human (HG03486.mat 2021)
GCA_018503525.1
n/a n/a 20,760
(1.85 %)
22,730
(1.26 %)
233,655
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
480
(100.00 %)
5,422,116
(53.02 %)
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(7.46 %)
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(40.27 %)
0
(0 %)
1,711,781
(3.37 %)
53,338
(1.19 %)
28,836
(0.77 %)
395 human (HG03516.mat 2021)
GCA_018469425.1
n/a n/a 20,766
(1.85 %)
22,424
(1.25 %)
233,619
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 320
(100.00 %)
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(52.96 %)
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(7.35 %)
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(40.30 %)
0
(0 %)
1,676,970
(3.29 %)
52,953
(1.18 %)
28,552
(0.75 %)
396 human (HG03516.pat 2021)
GCA_018469415.1
n/a n/a 20,820
(1.84 %)
22,672
(1.25 %)
234,068
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
369
(100.00 %)
5,451,270
(53.44 %)
1,086,645
(8.28 %)
15,991,774
(40.84 %)
0
(0 %)
1,839,829
(3.59 %)
53,435
(1.18 %)
28,828
(0.76 %)
397 human (HG03540.mat 2021)
GCA_018473295.1
n/a n/a 20,665
(1.84 %)
22,566
(1.26 %)
233,386
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
435
(100.00 %)
5,436,802
(53.34 %)
1,105,174
(8.06 %)
15,931,296
(40.72 %)
0
(0 %)
1,845,562
(3.57 %)
53,436
(1.26 %)
28,988
(0.77 %)
398 human (HG03540.pat 2021)
GCA_018473315.1
n/a n/a 20,724
(1.83 %)
22,627
(1.25 %)
233,360
(4.91 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
512
(100.00 %)
5,449,110
(53.39 %)
1,087,677
(8.16 %)
15,936,844
(40.79 %)
0
(0 %)
1,879,693
(3.62 %)
53,859
(1.30 %)
29,476
(0.80 %)
399 human (HG03579.mat 2021)
GCA_018472825.1
n/a n/a 20,702
(1.85 %)
22,327
(1.25 %)
233,403
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
456
(100.00 %)
5,423,189
(53.07 %)
1,075,620
(7.56 %)
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(40.31 %)
0
(0 %)
1,725,858
(3.40 %)
53,423
(1.24 %)
28,889
(0.78 %)
400 human (HG03579.pat 2021)
GCA_018472835.1
n/a n/a 19,942
(1.84 %)
21,710
(1.25 %)
227,313
(4.94 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 499
(100.00 %)
5,226,752
(53.28 %)
1,092,235
(8.58 %)
15,143,136
(40.79 %)
0
(0 %)
1,814,912
(3.72 %)
51,622
(1.24 %)
28,360
(0.77 %)
401 human (NA18906.mat 2021)
GCA_018503255.1
n/a n/a 20,739
(1.84 %)
22,340
(1.25 %)
233,812
(4.92 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 271
(100.00 %)
5,464,910
(53.26 %)
1,101,031
(7.88 %)
15,871,098
(40.43 %)
0
(0 %)
1,765,214
(3.46 %)
53,290
(1.27 %)
29,035
(0.78 %)
402 human (NA18906.pat 2021)
GCA_018503285.1
n/a n/a 20,765
(1.85 %)
22,414
(1.25 %)
234,102
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 304
(100.00 %)
5,443,478
(53.06 %)
1,085,707
(7.53 %)
15,888,465
(40.19 %)
0
(0 %)
1,786,732
(3.48 %)
53,328
(1.24 %)
28,936
(0.77 %)
403 human (NA19240.mat 2021)
GCA_018503275.1
n/a n/a 20,678
(1.85 %)
22,534
(1.26 %)
233,508
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
387
(100.00 %)
5,404,648
(52.98 %)
1,047,126
(7.31 %)
15,970,133
(40.15 %)
0
(0 %)
1,720,710
(3.38 %)
52,529
(1.17 %)
28,454
(0.75 %)
404 human (NA19240.pat 2021)
GCA_018503265.1
n/a n/a 20,772
(1.85 %)
22,461
(1.25 %)
233,684
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
453
(100.00 %)
5,424,224
(53.08 %)
1,063,925
(7.53 %)
15,954,132
(40.32 %)
0
(0 %)
1,771,797
(3.47 %)
53,106
(1.23 %)
28,804
(0.77 %)
405 human (NA20129 mat 2021)
GCA_018504635.1
n/a n/a 20,664
(1.84 %)
22,511
(1.24 %)
233,033
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
448
(100.00 %)
5,420,332
(53.24 %)
1,067,867
(7.86 %)
15,932,491
(40.50 %)
0
(0 %)
1,857,726
(3.61 %)
53,011
(1.20 %)
28,542
(0.76 %)
406 human (NA20129 pat 2021)
GCA_018504625.1
n/a n/a 20,706
(1.85 %)
22,365
(1.26 %)
233,543
(4.96 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 481
(100.00 %)
5,401,495
(53.02 %)
1,051,311
(7.46 %)
16,041,778
(40.34 %)
0
(0 %)
1,700,248
(3.36 %)
52,911
(1.18 %)
28,488
(0.75 %)
407 human (NA21309 pat 2021)
GCA_018504665.1
n/a n/a 20,685
(1.85 %)
22,478
(1.25 %)
233,394
(4.95 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
608
(100.00 %)
5,399,150
(53.06 %)
1,053,638
(7.58 %)
15,999,929
(40.35 %)
0
(0 %)
1,741,217
(3.44 %)
52,798
(1.17 %)
28,498
(0.75 %)
408 human (NA21309.mat 2021)
GCA_018504655.1
n/a n/a 20,635
(1.84 %)
22,458
(1.25 %)
233,555
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
508
(100.00 %)
5,389,804
(53.21 %)
1,045,498
(7.82 %)
15,862,735
(40.38 %)
0
(0 %)
1,852,080
(3.61 %)
52,479
(1.17 %)
28,460
(0.75 %)
409 human (NA24385 HG002 pri mat 2023)
GCA_018852615.2
n/a n/a 20,637
(1.85 %)
21,256
(1.20 %)
n/a 40.82
(99.23 %)
0
(0 %)
5
(0.77 %)
24
(100.00 %)
5,394,439
(53.04 %)
1,041,946
(7.44 %)
16,039,487
(40.04 %)
0
(0 %)
1,747,868
(3.36 %)
52,111
(1.11 %)
28,050
(0.73 %)
410 human (NA24385.mat 2021)
GCA_018852615.1
n/a n/a 20,744
(1.84 %)
21,968
(1.22 %)
233,779
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
445
(100.00 %)
5,435,410
(53.40 %)
1,086,871
(8.27 %)
15,970,867
(40.97 %)
0
(0 %)
1,819,917
(3.54 %)
53,581
(1.32 %)
29,359
(0.79 %)
411 human (NA24385.mat 2022)
GCA_021951015.1
n/a n/a 20,809
(1.82 %)
21,369
(1.18 %)
234,089
(4.92 %)
40.85
(99.95 %)
0
(0 %)
109
(0.05 %)
355
(100.00 %)
5,489,855
(53.93 %)
1,085,681
(8.26 %)
15,968,830
(40.95 %)
0
(0 %)
1,817,110
(3.54 %)
53,511
(1.32 %)
30,302
(0.84 %)
412 human (NA24385.pat 2021)
GCA_018852605.1
n/a n/a 19,919
(1.83 %)
21,582
(1.22 %)
227,333
(4.91 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
610
(100.00 %)
5,215,774
(53.54 %)
1,094,036
(9.09 %)
15,125,069
(41.29 %)
0
(0 %)
1,903,592
(3.87 %)
52,653
(1.34 %)
28,881
(0.81 %)
413 human (NA24385.pat 2022)
GCA_021950905.1
n/a n/a 20,014
(1.81 %)
20,716
(1.19 %)
227,278
(4.91 %)
40.87
(99.97 %)
0
(0 %)
117
(0.03 %)
514
(100.00 %)
5,293,356
(54.01 %)
1,100,786
(9.09 %)
15,122,569
(41.27 %)
2
(0.00 %)
1,900,161
(3.87 %)
52,546
(1.35 %)
29,891
(0.86 %)
414 human (NA24631 mat 2021)
GCA_018506965.1
n/a n/a 20,683
(1.85 %)
22,446
(1.25 %)
233,691
(4.96 %)
40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
503
(100.00 %)
5,423,411
(52.98 %)
1,075,094
(7.46 %)
15,897,770
(40.32 %)
0
(0 %)
1,659,982
(3.29 %)
53,731
(1.31 %)
29,377
(0.80 %)
415 human (NA24631 pat 2021)
GCA_018506945.1
n/a n/a 19,910
(1.84 %)
21,610
(1.24 %)
227,521
(4.95 %)
40.90
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
682
(100.00 %)
5,224,127
(53.12 %)
1,078,588
(8.33 %)
15,264,128
(40.95 %)
0
(0 %)
1,760,557
(3.59 %)
53,164
(1.35 %)
29,066
(0.82 %)
416 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank)
GCA_000845685.2
n/a 115
(79.56 %)
n/a n/a n/a 42.44
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
33
(1.67 %)
36
(4.27 %)
603
(9.83 %)
0
(0 %)
52
(1.87 %)
3
(13.72 %)
2
(13.38 %)
417 Iberian mole (v1 TD23 2020)
GCF_014898055.1
46,872
(2.59 %)
n/a 18,566
(1.67 %)
20,793
(1.59 %)
n/a 41.91
(99.98 %)
0
(0 %)
3,640
(0.02 %)
4,425
(100.00 %)
3,269,038
(31.47 %)
501,677
(1.32 %)
11,176,747
(32.61 %)
2
(0.00 %)
644,819
(2.55 %)
48,076
(2.80 %)
43,577
(2.14 %)
418 Iberian mole (v2 TD23 2020)
GCF_014898055.2
46,759
(2.60 %)
n/a 18,453
(1.69 %)
20,410
(1.59 %)
n/a 41.90
(99.98 %)
0
(0 %)
3,639
(0.02 %)
3,202
(100.00 %)
2,637,156
(23.36 %)
497,087
(1.30 %)
10,984,260
(32.64 %)
2
(0.00 %)
638,388
(2.54 %)
47,552
(2.89 %)
43,140
(2.46 %)
419 Indian glassy fish (v1 2019)
GCF_900634625.1
44,096
(12.32 %)
n/a 15,337
(3.60 %)
23,988
(7.92 %)
60,224
(10.41 %)
42.38
(98.08 %)
0
(0 %)
1,523
(1.92 %)
156
(100.00 %)
346,406
(3.02 %)
163,522
(3.00 %)
2,755,229
(25.07 %)
0
(0 %)
235,504
(4.25 %)
17,930
(1.47 %)
9,748
(0.74 %)
420 Indian medaka
GCF_002922805.1
47,300
(9.26 %)
n/a 14,561
(2.50 %)
31,867
(6.43 %)
n/a 39.04
(94.73 %)
0
(0 %)
51,440
(5.29 %)
8,603
(100.00 %)
319,637
(2.20 %)
208,749
(2.67 %)
5,412,794
(33.26 %)
180
(0.02 %)
209,615
(2.14 %)
40,721
(2.36 %)
28,619
(1.60 %)
421 Indianmeal moth (v1 USDA-ARS_2022_Savannah primary hap 2023)
GCF_027563975.1
28,390
(14.36 %)
n/a 4,799
(1.56 %)
15,737
(7.20 %)
n/a 35.38
(100.00 %)
0
(0 %)
26
(0.00 %)
46
(100.00 %)
136,242
(3.33 %)
48,275
(1.61 %)
2,518,372
(36.69 %)
0
(0 %)
71,420
(2.05 %)
14,106
(2.86 %)
9,147
(1.55 %)
422 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1
n/a n/a 21,188
(1.26 %)
41,550
(1.34 %)
35,477
(1.51 %)
42.19
(99.92 %)
4,324
(0.02 %)
4,324
(0.02 %)
798,700
(99.98 %)
3,297,388
(28.66 %)
476,792
(1.23 %)
13,144,912
(34.13 %)
14
(0.00 %)
n/a 81,685
(1.86 %)
59,284
(1.43 %)
423 Japanese quail
GCF_001577835.1
46,995
(7.38 %)
n/a 12,864
(2.55 %)
36,126
(11.03 %)
n/a 41.28
(98.88 %)
7,630
(1.12 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
466,141
(6.58 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
628
(0.03 %)
160,342
(1.32 %)
17,977
(1.86 %)
15,897
(1.26 %)
424 Japanese sawshark (hap1 2024 genbank)
GCA_044704955.1
n/a n/a 14,672
(0.28 %)
30,181
(0.79 %)
n/a 47.02
(99.98 %)
0
(0 %)
5,985
(0.02 %)
4,317
(100.00 %)
1,167,498
(3.08 %)
2,399,496
(18.16 %)
10,302
(99.98 %)
38
(0.00 %)
5,044,826
(4.94 %)
503,637
(6.56 %)
489,893
(6.05 %)
425 Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018)
GCF_003227715.1
29,097
(10.82 %)
n/a 4,337
(1.33 %)
43,907
(11.32 %)
n/a 44.75
(99.72 %)
0
(0 %)
499
(0.28 %)
857
(100.00 %)
439,110
(17.67 %)
262,539
(5.69 %)
1,834,301
(29.28 %)
3
(0.00 %)
159,215
(3.71 %)
6,204
(9.08 %)
5,973
(2.13 %)
426 kakapo (Jane v1 2019)
GCF_004027225.1
49,444
(5.77 %)
n/a 13,114
(1.92 %)
17,732
(2.50 %)
29,004
(4.44 %)
41.97
(97.63 %)
0
(0 %)
362
(2.37 %)
99
(100.00 %)
548,758
(10.76 %)
208,171
(1.07 %)
6,258,082
(20.20 %)
0
(0 %)
165,436
(1.31 %)
22,279
(1.75 %)
19,230
(1.19 %)
427 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2
49,757
(54.33 %)
n/a 13,112
(1.92 %)
17,637
(2.48 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
0
(0 %)
373
(0.92 %)
90
(100.00 %)
507,072
(7.85 %)
208,180
(1.08 %)
6,258,178
(20.50 %)
0
(0 %)
165,532
(1.34 %)
22,278
(1.77 %)
19,230
(1.21 %)
428 koala (Bilbo 61053 2017)
GCF_002099425.1
55,736
(2.16 %)
n/a 17,500
(0.86 %)
16,193
(0.94 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
1,907
(100.00 %)
7,814,631
(41.58 %)
1,123,545
(2.03 %)
21,796,057
(39.25 %)
0
(0 %)
405,744
(0.85 %)
15,957
(0.35 %)
15,019
(0.30 %)
429 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1
29,504
(53.56 %)
n/a 14,221
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
41,384
(6.20 %)
40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,338
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,148
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,224
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
18,380
(0.95 %)
430 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1
29,517
(6.48 %)
n/a 14,243
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
41,421
(6.20 %)
40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,274
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,142
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,224
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
18,380
(0.95 %)
431 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023638135.1
48,561
(51.20 %)
n/a 12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
0
(0 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
2
(0.00 %)
479,269
(2.67 %)
32,398
(2.65 %)
19,870
(0.89 %)
432 large cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147105.1
24,631
(60.59 %)
n/a 4,550
(1.47 %)
9,197
(5.18 %)
30,394
(12.69 %)
34.13
(100.00 %)
0
(0 %)
29
(0.00 %)
402
(100.00 %)
123,352
(2.30 %)
36,616
(6.05 %)
2,431,238
(41.04 %)
2
(0.00 %)
86,654
(3.36 %)
8,442
(2.49 %)
4,829
(1.03 %)
433 large tree shrew (BS70 2019 Broad)
GCA_004365275.1
n/a n/a 26,266
(0.71 %)
59,868
(0.81 %)
n/a 42.00
(99.77 %)
6,466
(0.02 %)
6,466
(0.02 %)
3,890,086
(99.98 %)
7,163,973
(22.64 %)
1,629,329
(2.64 %)
18,970,992
(42.82 %)
38
(0.00 %)
n/a 138,732
(1.75 %)
77,459
(1.17 %)
434 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1
n/a n/a 14,572
(1.03 %)
16,165
(1.42 %)
n/a 43.36
(99.74 %)
0
(0 %)
558
(0.26 %)
55
(100.00 %)
1,631,923
(15.09 %)
303,440
(1.14 %)
11,122,938
(34.12 %)
1
(0.00 %)
664,235
(2.49 %)
35,505
(1.37 %)
19,641
(0.51 %)
435 leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019)
GCA_009762595.1
n/a n/a 10,857
(1.01 %)
15,585
(1.46 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,982
(100.00 %)
1,090,219
(15.03 %)
206,192
(1.19 %)
7,154,939
(33.03 %)
0
(0 %)
432,559
(2.40 %)
25,155
(1.42 %)
14,585
(0.57 %)
436 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2
62,576
(3.50 %)
n/a 14,610
(1.03 %)
16,359
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
0
(0 %)
667
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,637,236
(15.13 %)
304,730
(1.14 %)
11,121,967
(34.21 %)
3
(0.00 %)
670,755
(2.51 %)
35,485
(1.36 %)
19,615
(0.51 %)
437 Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002875.2
n/a 8,389
(48.67 %)
591
(1.09 %)
4,193
(46.51 %)
n/a 59.58
(99.94 %)
0
(0 %)
454
(0.06 %)
76
(100.00 %)
24,390
(4.61 %)
4,228
(1.93 %)
243,087
(20.97 %)
1
(0.00 %)
5,939
(3.84 %)
92
(99.40 %)
72
(0.21 %)
438 Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002725.2
n/a 8,731
(48.79 %)
626
(1.15 %)
4,290
(46.53 %)
n/a 59.72
(100.00 %)
7
(0.00 %)
7
(0.00 %)
43
(100.00 %)
33,021
(5.20 %)
8,477
(2.43 %)
238,932
(20.91 %)
0
(0 %)
6,726
(4.51 %)
41
(99.80 %)
27
(0.06 %)
439 Leishmania martiniquensis (LSCM1 2021 genbank)
GCA_017916325.1
n/a 7,967
(45.66 %)
619
(1.14 %)
3,882
(44.58 %)
n/a 59.85
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
42
(100.00 %)
20,726
(2.91 %)
2,267
(2.64 %)
232,973
(20.45 %)
0
(0 %)
6,246
(4.12 %)
44
(99.29 %)
43
(0.15 %)
440 Leishmania orientalis (LSCM4 2021 genbank)
GCA_017916335.1
n/a 8,158
(45.05 %)
643
(1.12 %)
4,666
(45.26 %)
n/a 59.72
(99.99 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
98
(100.00 %)
22,632
(2.47 %)
4,241
(2.74 %)
231,120
(20.18 %)
1
(0.00 %)
10,584
(6.63 %)
100
(99.82 %)
164
(0.40 %)
441 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1
73,266
(49.50 %)
n/a 18,874
(1.62 %)
21,014
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
214,953
(3.85 %)
265,329
(96.15 %)
5,246,283
(42.87 %)
1,059,443
(5.13 %)
14,265,514
(32.20 %)
28,667
(1.17 %)
525,709
(5.63 %)
77,000
(2.45 %)
66,922
(1.91 %)
442 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1
25,978
(33.60 %)
n/a 19,393
(1.38 %)
20,311
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
326,464
(12.87 %)
337,359
(87.13 %)
6,205,858
(38.76 %)
832,823
(1.53 %)
13,661,563
(33.98 %)
2,666
(0.03 %)
430,190
(1.14 %)
26,669
(0.59 %)
23,227
(0.47 %)
443 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1
47,420
(5.64 %)
n/a 13,097
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
0
(0 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,498
(5.58 %)
210,236
(1.26 %)
7,133,927
(19.19 %)
1
(0.00 %)
132,959
(0.79 %)
27,558
(2.21 %)
21,862
(1.03 %)
444 lesser noctule (v1 hap1 2024)
GCA_964264875.1
n/a n/a 18,260
(1.53 %)
23,046
(1.60 %)
n/a 43.05
(99.99 %)
0
(0 %)
1,662
(0.01 %)
1,281
(100.00 %)
3,246,021
(21.13 %)
1,298,965
(12.06 %)
9,752,193
(42.90 %)
10
(0.00 %)
2,023,792
(5.54 %)
66,137
(2.85 %)
61,169
(1.82 %)
445 lesser noctule (v1 hap2 2024)
GCA_964264895.1
n/a n/a 17,557
(1.64 %)
22,484
(1.74 %)
n/a 43.06
(99.98 %)
1,563
(0.02 %)
1,563
(0.02 %)
2,898
(99.98 %)
2,999,553
(21.19 %)
1,122,371
(10.04 %)
9,331,392
(40.02 %)
7
(0.00 %)
1,542,388
(4.66 %)
61,834
(2.95 %)
59,536
(1.92 %)
446 lesser rhea (primary hap 2023 genbank)
GCA_028389875.1
39,024
(47.65 %)
n/a 13,358
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
0
(0 %)
128
(0.11 %)
179
(100.00 %)
674,141
(6.73 %)
329,122
(5.34 %)
6,820,211
(22.78 %)
1
(0.00 %)
266,226
(1.85 %)
45,073
(5.83 %)
38,575
(2.59 %)
447 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850995.1
n/a n/a 18,322
(1.42 %)
21,350
(1.39 %)
n/a 41.84
(99.24 %)
178
(0.49 %)
573
(0.76 %)
345
(99.51 %)
4,224,340
(28.69 %)
1,030,574
(2.60 %)
12,591,928
(42.30 %)
1
(0.00 %)
1,128,543
(2.95 %)
98,189
(2.06 %)
48,427
(1.15 %)
448 lesser salmon catfish (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579695.1
53,323
(53.05 %)
n/a 15,841
(0.90 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
5,905,868
(49.76 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
15,646
(0.27 %)
449 lettuce (Salinas v7 2018)
GCF_002870075.1
60,760
(2.83 %)
n/a 16,272
(0.65 %)
109,234
(6.86 %)
n/a 37.79
(92.71 %)
0
(0 %)
350,251
(7.33 %)
11,453
(100.00 %)
946,986
(1.96 %)
983,572
(3.65 %)
12,334,735
(53.11 %)
2,244
(0.09 %)
1,823,579
(9.42 %)
117,678
(2.02 %)
19,900
(0.28 %)
450 lettuce (Salinas v8 2020)
GCF_002870075.3
64,818
(2.94 %)
n/a 16,252
(0.65 %)
101,828
(6.36 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
3,138
(0.29 %)
351,533
(7.59 %)
9,960
(99.71 %)
945,052
(1.95 %)
983,641
(3.64 %)
12,325,371
(53.00 %)
2,249
(0.09 %)
n/a 117,703
(2.02 %)
19,916
(0.28 %)
451 live sharksucker (v1 2019)
GCF_900963305.1
40,268
(11.91 %)
n/a 14,975
(3.53 %)
22,304
(7.09 %)
56,266
(9.51 %)
41.43
(99.89 %)
0
(0 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
448,828
(3.61 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,476
(21.79 %)
0
(0 %)
109,664
(1.83 %)
16,807
(1.33 %)
12,095
(0.89 %)
452 long-finned pilot whale (v1 primary hap 2023)
GCF_963455315.1
61,810
(2.84 %)
n/a 18,712
(1.51 %)
20,920
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
0
(0 %)
1,084
(0.01 %)
993
(100.00 %)
4,125,420
(35.62 %)
1,577,899
(12.03 %)
12,347,226
(42.01 %)
10
(0.00 %)
1,284,155
(3.89 %)
71,821
(5.51 %)
41,663
(1.04 %)
453 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 genbank)
GCA_963455315.2
n/a n/a 18,726
(1.51 %)
20,948
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,084
(0.01 %)
995
(100.00 %)
4,125,459
(35.62 %)
1,577,896
(12.03 %)
12,347,226
(42.01 %)
10
(0.00 %)
1,284,155
(3.89 %)
71,822
(5.51 %)
41,663
(1.04 %)
454 long-tailed hermit (v1 PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1
n/a n/a 12,328
(2.02 %)
20,312
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
141
(0.37 %)
141
(0.37 %)
211
(99.63 %)
497,506
(5.06 %)
265,815
(1.51 %)
6,045,702
(20.10 %)
0
(0 %)
100,035
(0.84 %)
15,922
(1.43 %)
13,768
(0.94 %)
455 lumpfish (primary hap 2019 genbank)
GCA_009769545.1
41,612
(58.17 %)
n/a 14,748
(3.32 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
0
(0 %)
347
(1.78 %)
49
(100.00 %)
478,416
(6.02 %)
421,634
(11.07 %)
2,928,668
(27.98 %)
1
(0.00 %)
655,785
(6.31 %)
53,323
(5.09 %)
32,724
(2.40 %)
456 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2
55,061
(41.68 %)
n/a 21,084
(1.92 %)
22,287
(1.31 %)
n/a 40.74
(94.86 %)
83,929
(5.15 %)
83,929
(5.15 %)
112,850
(94.85 %)
5,109,404
(47.71 %)
734,754
(2.02 %)
15,854,134
(33.62 %)
2,334
(0.15 %)
767,102
(3.42 %)
36,070
(0.90 %)
31,862
(0.80 %)
457 malaria parasite P. falciparum (3D7 2016 genbank)
GCA_000002765.3
n/a 14,866
(53.86 %)
n/a n/a n/a 19.34
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 16
(100.00 %)
79,857
(19.18 %)
78,154
(15.50 %)
186,960
(66.90 %)
0
(0 %)
31,278
(6.16 %)
22
(0.04 %)
14
(0.02 %)
458 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1
48,578
(30.31 %)
n/a 19,449
(1.56 %)
24,645
(1.37 %)
41,235
(1.95 %)
40.78
(92.27 %)
0
(0 %)
984,656
(7.81 %)
80,669
(100.00 %)
3,063,619
(35.20 %)
866,306
(3.08 %)
13,310,826
(28.76 %)
389,500
(1.56 %)
884,201
(3.10 %)
35,558
(0.84 %)
33,754
(0.78 %)
459 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1
29,549
(16.44 %)
n/a 15,120
(6.45 %)
49,515
(30.69 %)
n/a 40.48
(93.32 %)
20,693
(6.71 %)
20,693
(6.71 %)
23,184
(93.29 %)
115,049
(2.29 %)
51,516
(1.90 %)
1,488,940
(24.12 %)
25
(0.03 %)
35,840
(1.56 %)
42,077
(12.05 %)
32,193
(7.48 %)
460 mangrove rivulus
GCF_001649575.1
45,293
(11.01 %)
n/a 14,510
(2.84 %)
29,750
(6.81 %)
n/a 40.03
(94.35 %)
0
(0 %)
29,388
(5.66 %)
3,073
(100.00 %)
345,930
(2.32 %)
146,268
(1.33 %)
4,717,260
(27.31 %)
231
(0.09 %)
62,480
(1.04 %)
39,557
(2.69 %)
29,549
(1.76 %)
461 meadow brown (genbank 2021)
GCA_905333055.1
29,488
(69.09 %)
n/a 4,863
(1.16 %)
19,812
(6.60 %)
27,763
(8.31 %)
36.96
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
32
(100.00 %)
227,482
(2.41 %)
107,773
(3.02 %)
2,456,144
(43.97 %)
0
(0 %)
297,573
(6.20 %)
24,873
(3.15 %)
12,170
(1.54 %)
462 meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank)
GCA_006229205.1
n/a n/a 19,020
(1.63 %)
19,812
(1.43 %)
42,441
(2.08 %)
41.68
(99.72 %)
0
(0 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,552,310
(40.02 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
5,134
(0.09 %)
236,044
(0.75 %)
64,849
(2.13 %)
63,058
(1.88 %)
463 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1
n/a n/a 21,726
(1.54 %)
31,908
(1.39 %)
n/a 41.89
(99.96 %)
4,153
(0.02 %)
4,153
(0.02 %)
354,021
(99.98 %)
4,835,157
(40.73 %)
693,037
(1.32 %)
13,779,279
(33.49 %)
21
(0.00 %)
224,239
(0.53 %)
76,740
(2.37 %)
72,844
(2.03 %)
464 melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014)
GCF_000806345.1
26,008
(10.49 %)
n/a 7,743
(3.09 %)
12,206
(6.18 %)
n/a 35.15
(84.42 %)
37,430
(15.62 %)
37,430
(15.62 %)
43,002
(84.38 %)
237,943
(3.36 %)
74,977
(1.26 %)
2,410,203
(31.96 %)
376
(0.08 %)
35,789
(1.03 %)
15,259
(2.01 %)
8,482
(1.01 %)
465 Mexican gray wolf (hap1 2025 genbank)
GCA_048164855.1
n/a n/a 19,584
(1.52 %)
20,783
(1.39 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
0
(0 %)
167
(0.00 %)
250
(100.00 %)
4,643,072
(34.73 %)
1,102,137
(4.40 %)
13,591,414
(35.18 %)
1
(0.00 %)
1,132,849
(2.70 %)
53,471
(2.24 %)
48,664
(1.52 %)
466 Microcystis aeruginosa (PCC 7806 2024 genbank)
GCA_041506625.1
n/a n/a n/a n/a n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 1,266
(2.35 %)
23,848
(10.41 %)
0
(0 %)
1,287
(2.66 %)
410
(6.99 %)
323
(3.98 %)
467 microsporidians E.bieneusi (H348 2009 genbank)
GCA_000209485.1
n/a 3,804
(69.39 %)
238
(3.03 %)
394
(8.09 %)
n/a 33.70
(99.89 %)
10
(0.03 %)
437
(0.04 %)
1,743
(99.97 %)
1,511
(2.99 %)
268
(0.36 %)
31,900
(26.59 %)
0
(0 %)
57
(0.18 %)
373
(7.62 %)
360
(7.39 %)
468 microsporidians E.cuniculi (v1 GB-M1 2002)
GCF_000091225.1
1,996
(85.79 %)
n/a 1,569
(68.26 %)
596
(33.73 %)
n/a 47.31
(99.97 %)
4
(0.03 %)
4
(0.03 %)
15
(99.97 %)
257
(0.70 %)
199
(0.40 %)
10,819
(8.68 %)
0
(0 %)
168
(0.67 %)
126
(3.52 %)
105
(3.03 %)
469 microsporidians N.ceranae (BRL01 2009 genbank)
GCA_000182985.1
n/a 2,678
(29.97 %)
348
(2.68 %)
284
(3.31 %)
n/a 25.26
(99.86 %)
0
(0 %)
n/a 5,465
(100.00 %)
3,179
(1.99 %)
1,572
(1.39 %)
85,189
(41.34 %)
0
(0 %)
432
(0.38 %)
4
(0.02 %)
4
(0.02 %)
470 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1
42,553
(41.45 %)
n/a 19,298
(1.81 %)
18,661
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
173,296
(5.96 %)
184,071
(94.04 %)
4,041,828
(42.24 %)
573,950
(1.48 %)
13,504,295
(30.96 %)
211
(0.02 %)
317,691
(1.50 %)
65,448
(1.38 %)
46,041
(1.09 %)
471 minke whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987535.1
61,711
(41.50 %)
n/a 19,544
(1.49 %)
21,502
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
0
(0 %)
1,177
(0.01 %)
1,375
(100.00 %)
4,006,932
(35.92 %)
1,058,106
(12.08 %)
12,708,154
(42.66 %)
4
(0.00 %)
1,500,515
(4.32 %)
72,756
(1.59 %)
44,094
(1.06 %)
472 mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017)
GCF_002532875.1
35,332
(12.83 %)
n/a 2,750
(0.61 %)
29,731
(8.07 %)
n/a 40.94
(99.89 %)
3,360
(0.11 %)
3,360
(0.11 %)
8,241
(99.89 %)
115,140
(1.18 %)
39,880
(0.71 %)
1,832,298
(14.55 %)
37
(0.00 %)
12,922
(0.23 %)
31,479
(5.12 %)
28,744
(3.52 %)
473 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1
n/a n/a 21,302
(1.57 %)
27,162
(1.27 %)
40,982
(1.78 %)
41.88
(99.90 %)
11,139
(0.04 %)
11,139
(0.04 %)
796,326
(99.96 %)
5,253,752
(39.29 %)
1,211,658
(3.13 %)
13,894,596
(38.35 %)
15
(0.00 %)
n/a 24,829
(0.69 %)
23,158
(0.63 %)
474 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank)
GCA_019393635.1
47,034
(41.56 %)
n/a 18,428
(0.81 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
0
(0 %)
260
(0.09 %)
18
(100.00 %)
7,426,369
(29.77 %)
1,249,638
(2.12 %)
21,135,395
(42.80 %)
0
(0 %)
1,546,316
(2.55 %)
16,598
(0.36 %)
13,911
(0.23 %)
475 moth C.splendana (v1 2021 genbank)
GCA_910591565.1
n/a n/a 4,930
(0.75 %)
38,413
(8.53 %)
35,924
(4.55 %)
38.08
(99.99 %)
0
(0 %)
150
(0.01 %)
112
(100.00 %)
261,421
(1.99 %)
175,466
(5.62 %)
3,107,482
(46.30 %)
2
(0.00 %)
358,346
(5.72 %)
58,547
(5.75 %)
28,884
(2.78 %)
476 moth S.litura (Ishihara v1 2017)
GCF_002706865.1
25,114
(8.87 %)
n/a 5,088
(1.13 %)
22,625
(7.19 %)
n/a 36.56
(97.52 %)
10,662
(2.49 %)
10,662
(2.49 %)
13,637
(97.51 %)
154,017
(1.49 %)
50,642
(0.97 %)
2,919,487
(37.00 %)
96
(0.06 %)
122,138
(2.50 %)
34,396
(3.66 %)
10,482
(1.09 %)
477 mung bean (VC1973A 2015 genbank)
GCA_000741045.2
n/a n/a 16,645
(3.88 %)
43,866
(14.64 %)
n/a 33.16
(92.79 %)
0
(0 %)
96,870
(7.25 %)
2,463
(100.00 %)
265,072
(3.32 %)
198,918
(3.34 %)
2,840,410
(34.89 %)
1,607
(0.24 %)
171,012
(3.42 %)
13,926
(1.48 %)
11,027
(1.18 %)
478 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1
n/a n/a 10,083
(1.97 %)
18,350
(2.23 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
5,616
(100.00 %)
485,827
(7.06 %)
212,892
(1.28 %)
4,756,962
(19.95 %)
0
(0 %)
53,808
(0.72 %)
25,670
(3.87 %)
24,319
(2.23 %)
479 mute swan (v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1
n/a n/a 12,973
(1.97 %)
22,300
(2.18 %)
n/a 41.92
(99.06 %)
0
(0 %)
446
(0.94 %)
181
(100.00 %)
688,720
(7.65 %)
301,358
(1.34 %)
6,775,217
(21.21 %)
1
(0.00 %)
78,646
(0.75 %)
31,271
(3.60 %)
29,996
(2.02 %)
480 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1
74,574
(44.06 %)
n/a 21,317
(1.73 %)
20,856
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
110,424
(11.59 %)
114,652
(88.41 %)
4,162,977
(32.77 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,503
(27.63 %)
595
(0.01 %)
103,053
(0.44 %)
31,950
(0.88 %)
31,054
(0.81 %)
481 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1
n/a n/a 21,418
(1.52 %)
34,189
(1.28 %)
n/a 41.35
(99.92 %)
8,600
(0.03 %)
8,600
(0.03 %)
653,473
(99.97 %)
4,512,168
(44.82 %)
592,047
(1.17 %)
13,009,453
(37.18 %)
92
(0.00 %)
n/a 63,033
(1.47 %)
45,747
(1.19 %)
482 Natterer's bat (hap1.1 2024)
GCA_964212035.1
n/a n/a 19,180
(1.72 %)
22,635
(1.71 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
0
(0 %)
1,620
(0.02 %)
343
(100.00 %)
3,081,500
(24.27 %)
797,071
(5.37 %)
10,372,159
(38.30 %)
18
(0.00 %)
729,559
(2.57 %)
64,460
(2.57 %)
57,628
(1.87 %)
483 Natterer's bat (hap2.1 2024)
GCA_964212025.1
n/a n/a 18,275
(1.81 %)
21,799
(1.80 %)
n/a 43.28
(99.99 %)
1,387
(0.01 %)
1,387
(0.01 %)
1,706
(99.99 %)
2,833,193
(23.73 %)
705,278
(5.10 %)
9,802,564
(36.67 %)
5
(0.00 %)
596,875
(2.28 %)
61,024
(2.68 %)
55,279
(1.95 %)
484 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579445.1
31,033
(46.15 %)
n/a 12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
0
(0 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
5
(0.00 %)
478,923
(3.35 %)
31,693
(3.88 %)
22,817
(1.16 %)
485 nematode C.briggsae (AF16 v1 2008)
GCF_000004555.1
19,404
(22.65 %)
n/a 12,088
(12.63 %)
7,533
(12.85 %)
n/a 37.35
(97.22 %)
595
(0.05 %)
6,713
(2.80 %)
607
(99.95 %)
116,909
(19.60 %)
45,475
(4.23 %)
820,686
(35.42 %)
82
(0.06 %)
36,018
(3.86 %)
4,887
(1.65 %)
2,967
(0.93 %)
486 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2
36,181
(5.65 %)
n/a 10,150
(1.34 %)
42,117
(8.90 %)
n/a 37.47
(94.63 %)
39,556
(5.39 %)
39,556
(5.39 %)
45,302
(94.61 %)
396,916
(3.25 %)
506,716
(6.41 %)
4,768,175
(36.07 %)
384
(0.04 %)
264,746
(2.83 %)
17,009
(0.90 %)
8,756
(0.45 %)
487 nine-banded armadillo (v1 hap1 2023)
GCA_030445055.1
n/a n/a 19,429
(1.06 %)
22,396
(1.07 %)
n/a 40.96
(99.27 %)
0
(0 %)
845
(0.73 %)
594
(100.00 %)
4,369,568
(32.83 %)
673,707
(1.55 %)
18,586,102
(42.41 %)
5
(0.00 %)
558,255
(1.38 %)
131,852
(2.78 %)
71,325
(1.75 %)
488 nine-banded armadillo (v1 hap2 2023)
GCF_030445035.1
69,043
(2.70 %)
n/a 20,516
(1.05 %)
n/a n/a 41.00
(99.68 %)
0
(0 %)
771
(0.32 %)
539
(100.00 %)
4,656,325
(32.86 %)
726,574
(1.99 %)
19,585,522
(43.65 %)
4
(0.00 %)
720,053
(1.59 %)
140,990
(2.86 %)
76,550
(1.81 %)
489 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2
n/a n/a 21,293
(1.15 %)
25,302
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,413
(9.13 %)
268,442
(9.13 %)
314,971
(90.87 %)
5,327,246
(49.09 %)
651,311
(1.26 %)
19,267,381
(38.27 %)
239
(0.00 %)
482,244
(1.17 %)
139,552
(2.47 %)
82,520
(1.71 %)
490 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1
46,131
(1.87 %)
n/a 21,316
(1.15 %)
25,308
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,413
(9.13 %)
268,442
(9.13 %)
314,972
(90.87 %)
5,328,146
(49.10 %)
651,316
(1.26 %)
19,267,438
(38.27 %)
239
(0.00 %)
482,246
(1.17 %)
139,552
(2.47 %)
82,520
(1.71 %)
491 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1
n/a n/a 19,541
(1.47 %)
21,516
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
363
(0.17 %)
779
(100.00 %)
1,361,117
(2.23 %)
836,632
(13.12 %)
12,597,969
(44.00 %)
11
(0.00 %)
1,395,565
(3.89 %)
93,862
(1.92 %)
40,806
(0.95 %)
492 northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021)
GCF_021288785.1
49,934
(2.73 %)
n/a 20,106
(1.74 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
0
(0 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,434,732
(35.01 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
2,726
(0.09 %)
n/a 52,064
(1.59 %)
49,212
(1.43 %)
493 northern goshawk (v1 primary hap 2022 refseq)
GCF_929443795.1
50,662
(4.74 %)
n/a 13,528
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
183
(0.00 %)
454
(100.00 %)
521,768
(3.86 %)
325,987
(9.82 %)
5,542,269
(27.30 %)
4
(0.00 %)
458,030
(3.08 %)
43,070
(4.44 %)
32,753
(1.47 %)
494 northern house mosquito (v1 TS 2021)
GCF_016801865.1
28,512
(7.14 %)
n/a 5,830
(1.09 %)
39,806
(8.27 %)
n/a 36.76
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,714
(100.00 %)
222,294
(5.58 %)
187,561
(9.87 %)
3,009,613
(56.49 %)
0
(0 %)
397,617
(5.35 %)
63,009
(9.78 %)
42,868
(6.50 %)
495 northern pike (primary hap 2020 genbank)
GCA_011004845.1
63,720
(60.35 %)
n/a 16,616
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,918
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
0
(0 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
1,039,521
(30.93 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,094
(32.91 %)
1
(0.00 %)
602,569
(4.43 %)
42,910
(2.52 %)
22,099
(1.02 %)
496 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3
n/a n/a 20,134
(1.89 %)
18,568
(1.14 %)
n/a 40.76
(93.09 %)
180,468
(6.94 %)
180,468
(6.94 %)
197,908
(93.06 %)
5,169,984
(51.90 %)
831,865
(4.16 %)
15,243,657
(35.77 %)
861
(0.05 %)
1,641,885
(4.15 %)
65,761
(1.00 %)
25,432
(0.56 %)
497 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2
97,432
(43.01 %)
37
(0.00 %)
21,523
(1.86 %)
19,627
(1.36 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
4,895,563
(44.53 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
4
(0.00 %)
1,172,090
(3.51 %)
19,244
(0.46 %)
16,092
(0.39 %)
498 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2
n/a n/a 20,319
(1.82 %)
21,542
(1.19 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
55,576
(0.76 %)
58,981
(0.76 %)
118,810
(99.24 %)
5,524,514
(52.78 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,031
(38.71 %)
368
(0.01 %)
1,968,093
(4.25 %)
95,595
(1.41 %)
30,263
(0.74 %)
499 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3
84,433
(3.85 %)
n/a 20,317
(1.83 %)
21,239
(1.18 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
55,576
(0.76 %)
58,981
(0.76 %)
118,811
(99.24 %)
5,525,293
(52.79 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,088
(38.71 %)
368
(0.01 %)
1,968,092
(4.25 %)
95,595
(1.41 %)
30,263
(0.74 %)
500 oriental river prawn (v1 FS-2020 2020 genbank)
GCA_015104395.1
n/a n/a 1,945
(0.08 %)
23,579
(1.88 %)
n/a 36.81
(99.60 %)
16,132
(0.41 %)
16,132
(0.41 %)
16,156
(99.59 %)
2,706,474
(10.11 %)
2,525,264
(12.75 %)
9,704,257
(48.31 %)
44
(0.00 %)
2,589,746
(7.83 %)
77,313
(3.01 %)
18,031
(0.34 %)
501 painted lady (genbank 2021)
GCA_905220365.1
20,948
(56.23 %)
n/a 4,705
(1.06 %)
15,277
(5.00 %)
29,018
(10.11 %)
33.42
(99.99 %)
0
(0 %)
91
(0.01 %)
37
(100.00 %)
209,233
(2.16 %)
56,676
(1.12 %)
3,372,591
(44.40 %)
3
(0.00 %)
131,267
(3.01 %)
13,547
(2.72 %)
8,615
(1.04 %)
502 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1
35,529
(2.39 %)
n/a 18,185
(1.70 %)
20,184
(1.64 %)
41,094
(3.29 %)
42.38
(98.92 %)
0
(0 %)
831
(1.08 %)
141
(100.00 %)
3,072,951
(30.02 %)
385,608
(0.80 %)
12,060,365
(30.47 %)
1
(0.00 %)
173,548
(0.73 %)
64,081
(4.30 %)
66,821
(4.05 %)
503 pea aphid (AL4f v1 2019)
GCF_005508785.1
31,681
(7.81 %)
n/a 4,257
(0.79 %)
16,323
(3.39 %)
n/a 29.76
(92.38 %)
0
(0 %)
46,297
(7.65 %)
21,920
(100.00 %)
768,383
(18.87 %)
135,468
(2.11 %)
4,536,093
(48.39 %)
93
(0.01 %)
158,249
(4.28 %)
16,332
(2.13 %)
13,468
(1.54 %)
504 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1
49,100
(50.44 %)
n/a 13,025
(1.67 %)
24,167
(2.02 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
0
(0 %)
232
(0.31 %)
124
(100.00 %)
586,316
(11.83 %)
335,214
(8.05 %)
7,038,700
(24.65 %)
0
(0 %)
405,444
(2.46 %)
26,085
(2.25 %)
20,023
(0.87 %)
505 pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 genbank)
GCA_043159975.1
n/a n/a 20,768
(1.76 %)
21,550
(1.18 %)
n/a 41.04
(100.00 %)
0
(0 %)
260
(0.00 %)
362
(100.00 %)
5,387,919
(53.48 %)
1,027,640
(9.31 %)
15,407,988
(41.73 %)
1
(0.00 %)
1,792,632
(3.77 %)
99,854
(1.52 %)
30,686
(0.78 %)
506 pigeon pea (v1 2016 BGI)
GCF_000340665.1
46,646
(9.41 %)
n/a 17,409
(3.12 %)
51,529
(12.74 %)
48,654
(8.33 %)
32.79
(94.21 %)
36,387
(5.81 %)
36,387
(5.81 %)
72,923
(94.19 %)
400,327
(3.60 %)
306,656
(4.69 %)
3,754,630
(39.24 %)
431
(0.18 %)
219,000
(6.77 %)
26,578
(2.89 %)
13,839
(1.14 %)
507 pike-perch
GCF_008315115.1
56,221
(8.23 %)
n/a 15,677
(2.23 %)
29,967
(5.65 %)
62,989
(6.22 %)
40.92
(100.00 %)
0
(0 %)
94
(0.00 %)
1,313
(100.00 %)
591,660
(5.05 %)
569,876
(7.39 %)
4,713,605
(36.32 %)
0
(0 %)
788,001
(5.34 %)
39,545
(1.93 %)
12,857
(0.60 %)
508 platypus (Pmale09 2018 BGI)
GCA_002966995.1
n/a n/a 15,042
(1.17 %)
19,939
(1.55 %)
n/a 46.64
(100.00 %)
0
(0 %)
476
(0.00 %)
4,568
(100.00 %)
5,326,862
(52.88 %)
879,598
(5.00 %)
9,545,961
(50.95 %)
3
(0.00 %)
1,781,446
(5.23 %)
94,468
(9.28 %)
81,476
(3.15 %)
509 platypus (Pmale09 v1 2019)
GCF_004115215.1
56,695
(3.09 %)
n/a 14,805
(1.26 %)
18,918
(1.63 %)
42,516
(2.60 %)
46.13
(99.18 %)
0
(0 %)
522
(0.82 %)
305
(100.00 %)
5,099,803
(51.62 %)
577,434
(2.88 %)
9,110,403
(48.91 %)
0
(0 %)
1,127,318
(3.58 %)
87,829
(7.91 %)
74,084
(2.86 %)
510 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3
n/a n/a 14,805
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
0
(0 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,101,303
(51.62 %)
578,617
(2.89 %)
9,113,847
(48.93 %)
0
(0 %)
1,130,252
(3.59 %)
87,861
(7.92 %)
74,107
(2.86 %)
511 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1
35,751
(39.94 %)
n/a 18,495
(1.67 %)
15,243
(1.37 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
110,343
(1.67 %)
134,161
(98.33 %)
4,221,025
(40.96 %)
553,193
(1.29 %)
13,765,526
(29.91 %)
205
(0.03 %)
311,409
(1.04 %)
54,906
(1.17 %)
47,465
(0.98 %)
512 Porcisia hertigi (C119 2021 genbank)
GCA_017918235.1
n/a 7,891
(42.07 %)
695
(1.21 %)
2,951
(42.86 %)
n/a 56.02
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
74
(100.00 %)
41,628
(4.32 %)
12,596
(4.67 %)
201,002
(23.43 %)
0
(0 %)
29,607
(10.30 %)
106
(99.30 %)
750
(1.56 %)
513 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1
45,404
(55.83 %)
n/a 14,654
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
0
(0 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,311,131
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
3
(0.00 %)
1,623,656
(7.33 %)
172,199
(5.45 %)
18,080
(0.31 %)
514 pronghorn (BS35 2019 Broad)
GCA_004027515.1
n/a n/a 24,094
(1.34 %)
35,119
(1.27 %)
n/a 41.97
(99.87 %)
6,569
(0.02 %)
6,569
(0.02 %)
1,649,700
(99.98 %)
5,613,563
(41.47 %)
652,408
(1.55 %)
13,943,055
(43.64 %)
21
(0.00 %)
n/a 61,057
(1.17 %)
39,599
(0.79 %)
515 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1
45,076
(35.88 %)
n/a 19,564
(1.68 %)
22,124
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
80,963
(0.88 %)
134,059
(99.12 %)
3,917,534
(41.44 %)
435,606
(1.73 %)
14,738,354
(28.36 %)
39
(0.00 %)
276,230
(1.12 %)
40,752
(0.94 %)
35,911
(0.79 %)
516 Puerto Rican coqui (hap1 2024 genbank)
GCA_035609145.1
n/a n/a 13,881
(0.57 %)
32,313
(1.67 %)
n/a 44.91
(100.00 %)
6
(0.00 %)
659
(0.00 %)
963
(100.00 %)
1,044,181
(1.98 %)
1,442,189
(16.51 %)
14,710,175
(54.00 %)
6
(0.00 %)
4,070,195
(8.73 %)
501,931
(8.81 %)
49,483
(0.82 %)
517 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1
25,575
(34.74 %)
n/a 17,665
(1.56 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
0
(0 %)
178,992
(4.69 %)
2,174
(100.00 %)
4,884,619
(42.70 %)
833,136
(1.76 %)
13,705,706
(31.28 %)
2,166
(0.06 %)
494,972
(1.78 %)
58,912
(1.65 %)
50,363
(1.31 %)
518 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2
59,332
(37.06 %)
26
(0.00 %)
19,951
(1.94 %)
19,039
(1.18 %)
n/a 40.74
(82.95 %)
111,087
(17.06 %)
156,797
(17.06 %)
121,337
(82.94 %)
5,136,492
(50.91 %)
775,493
(1.63 %)
15,570,612
(30.28 %)
70
(0.03 %)
729,770
(1.34 %)
43,049
(0.71 %)
26,732
(0.52 %)
519 pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023)
GCF_029289425.1
88,587
(3.87 %)
n/a 20,765
(1.73 %)
22,666
(1.18 %)
n/a 40.49
(99.96 %)
0
(0 %)
8
(0.04 %)
443
(100.00 %)
5,487,575
(50.65 %)
1,054,555
(12.79 %)
15,952,698
(43.80 %)
0
(0 %)
3,830,835
(6.42 %)
53,329
(1.37 %)
27,996
(0.60 %)
520 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank)
GCA_026419965.1
56,261
(41.31 %)
n/a 18,495
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
0
(0 %)
143
(0.19 %)
580
(100.00 %)
3,817,653
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,926
(39.96 %)
0
(0 %)
1,197,918
(3.53 %)
101,353
(2.90 %)
50,216
(1.47 %)
521 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank)
GCA_009806435.2
n/a n/a 19,480
(1.31 %)
23,335
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
0
(0 %)
18,178
(2.32 %)
3,159
(100.00 %)
4,179,975
(0.00 %)
976,271
(2.33 %)
13,766,353
(39.76 %)
85
(0.00 %)
1,275,666
(3.04 %)
113,370
(2.46 %)
70,869
(1.75 %)
522 rabbit (primary hap 2024 genbank)
GCA_964237555.1
n/a n/a 19,386
(1.31 %)
22,863
(1.35 %)
n/a 44.02
(99.98 %)
0
(0 %)
2,276
(0.02 %)
222
(100.00 %)
4,099,590
(21.20 %)
1,062,902
(3.78 %)
13,416,878
(41.72 %)
5
(0.00 %)
1,560,079
(3.77 %)
116,524
(2.66 %)
74,863
(1.94 %)
523 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1
n/a n/a 18,676
(1.38 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,884,561
(44.65 %)
883,943
(1.73 %)
13,254,559
(38.27 %)
12
(0.00 %)
1,022,805
(2.55 %)
110,338
(2.33 %)
68,466
(1.73 %)
524 radish (v1 WS10039 2015)
GCF_000801105.1
69,941
(20.66 %)
n/a 33,762
(10.20 %)
70,765
(28.80 %)
n/a 35.29
(87.22 %)
0
(0 %)
28,041
(12.80 %)
10,676
(100.00 %)
196,483
(2.53 %)
150,132
(3.32 %)
2,256,858
(26.65 %)
148
(0.08 %)
181,090
(8.85 %)
23,381
(2.80 %)
18,811
(2.08 %)
525 red admiral (genbank 2021)
GCA_905147765.2
n/a n/a 4,641
(1.20 %)
13,258
(4.79 %)
32,725
(10.42 %)
32.84
(100.00 %)
0
(0 %)
18
(0.00 %)
142
(100.00 %)
184,094
(2.52 %)
41,639
(1.23 %)
3,193,736
(41.82 %)
0
(0 %)
59,270
(1.97 %)
10,747
(2.25 %)
7,305
(0.97 %)
526 red mason bee (LIB18336 2019)
GCF_004153925.1
26,926
(16.13 %)
n/a 4,185
(2.08 %)
24,859
(11.07 %)
n/a 39.77
(99.98 %)
0
(0 %)
2,089
(0.02 %)
10,222
(100.00 %)
88,278
(1.96 %)
74,016
(3.78 %)
1,305,254
(28.61 %)
137
(0.02 %)
68,133
(2.01 %)
10,712
(6.90 %)
7,940
(2.34 %)
527 red-crested turaco (2014 BGI)
GCF_000709365.1
16,151
(2.15 %)
n/a 12,046
(1.50 %)
25,077
(1.98 %)
n/a 41.63
(99.43 %)
75,085
(0.59 %)
75,085
(0.59 %)
134,672
(99.41 %)
401,465
(6.41 %)
153,694
(0.86 %)
6,705,299
(20.45 %)
1
(0.00 %)
58,294
(0.41 %)
30,183
(1.07 %)
25,549
(0.87 %)
528 red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI)
GCF_000690535.1
16,238
(2.21 %)
n/a 12,016
(1.53 %)
23,985
(1.93 %)
n/a 41.20
(99.63 %)
59,230
(0.38 %)
59,230
(0.38 %)
112,704
(99.62 %)
322,026
(4.02 %)
121,725
(0.68 %)
6,797,850
(18.25 %)
4
(0.00 %)
20,461
(0.20 %)
18,873
(0.62 %)
16,327
(0.52 %)
529 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1
25,173
(40.74 %)
n/a 13,218
(1.71 %)
28,120
(2.39 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
9
(0.00 %)
249
(0.00 %)
1,195
(100.00 %)
544,427
(8.81 %)
223,674
(5.77 %)
6,669,469
(23.63 %)
3
(0.00 %)
398,605
(2.64 %)
38,306
(3.37 %)
35,069
(1.78 %)
530 reedfish (2019)
GCF_900747795.1
40,545
(1.73 %)
n/a 13,154
(0.46 %)
24,028
(1.29 %)
34,856
(1.34 %)
39.44
(93.75 %)
0
(0 %)
5,614
(6.25 %)
1,885
(100.00 %)
1,834,613
(2.79 %)
1,018,031
(2.36 %)
20,081,632
(44.56 %)
4
(0.00 %)
1,039,686
(2.44 %)
88,254
(1.06 %)
22,510
(0.28 %)
531 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3
n/a n/a 20,558
(1.71 %)
22,141
(1.12 %)
n/a 40.95
(97.08 %)
63,767
(2.91 %)
64,538
(2.91 %)
348,579
(97.09 %)
5,846,699
(54.61 %)
1,429,378
(9.24 %)
16,512,587
(40.26 %)
80
(0.01 %)
2,975,593
(6.12 %)
98,572
(1.29 %)
30,558
(0.68 %)
532 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1
59,888
(43.60 %)
n/a 19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
0
(0 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
4
(0.00 %)
1,071,329
(3.37 %)
73,126
(1.69 %)
43,865
(1.11 %)
533 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1
16,166
(2.37 %)
n/a 12,054
(1.65 %)
23,851
(2.04 %)
n/a 41.63
(99.55 %)
66,437
(0.46 %)
66,437
(0.46 %)
120,312
(99.54 %)
392,481
(7.69 %)
217,040
(2.27 %)
5,855,355
(18.33 %)
5
(0.00 %)
69,222
(0.63 %)
7,602
(0.24 %)
5,949
(0.18 %)
534 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1
n/a n/a 21,125
(1.90 %)
29,864
(1.51 %)
65,909
(1.91 %)
41.13
(99.93 %)
4,599
(0.02 %)
4,599
(0.02 %)
580,026
(99.98 %)
3,840,645
(39.25 %)
675,921
(1.83 %)
13,841,750
(31.45 %)
17
(0.00 %)
304,327
(0.71 %)
59,440
(1.72 %)
54,385
(1.53 %)
535 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1
25,353
(3.88 %)
n/a 14,334
(1.56 %)
58,475
(4.46 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
0
(0 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
642,988
(3.38 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
7,501
(0.17 %)
424,697
(2.96 %)
52,308
(2.11 %)
22,130
(0.71 %)
536 river trout (v1 2019)
GCF_901001165.1
102,785
(6.02 %)
n/a 27,413
(1.62 %)
51,424
(4.17 %)
121,979
(5.28 %)
43.36
(96.90 %)
0
(0 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
1,438,988
(5.72 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,761
(52.37 %)
2
(0.00 %)
3,428,195
(8.64 %)
70,821
(1.77 %)
18,627
(0.33 %)
537 rock pigeon (v1 racing homer maternal hap 2024)
GCA_036010775.1
n/a n/a 12,450
(1.75 %)
25,274
(2.35 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
23
(0.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
2
(0.00 %)
1,046,190
(5.37 %)
33,479
(3.29 %)
29,158
(1.73 %)
538 rock pigeon (v1 racing homer paternal W 2024)
GCA_036013475.1
n/a n/a 13,145
(1.66 %)
28,883
(2.53 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
248
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,923
(11.76 %)
412,678
(12.92 %)
6,047,578
(29.90 %)
0
(0 %)
1,266,126
(5.89 %)
36,847
(3.12 %)
31,114
(1.65 %)
539 rock pigeon (v2 racing homer 2024 genbank)
GCA_036013475.2
n/a n/a 13,146
(1.66 %)
25,463
(2.12 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,969
(11.76 %)
412,670
(12.92 %)
6,047,584
(29.90 %)
0
(0 %)
1,266,456
(5.89 %)
36,847
(3.12 %)
31,115
(1.65 %)
540 rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank)
GCA_023343835.1
51,619
(61.28 %)
n/a 12,831
(2.31 %)
n/a n/a 41.57
(99.99 %)
0
(0 %)
210
(0.01 %)
164
(100.00 %)
667,924
(11.59 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,274
(21.73 %)
0
(0 %)
216,565
(1.89 %)
21,346
(2.37 %)
19,067
(1.48 %)
541 rose-grain aphid (CAU 2021 genbank)
GCA_019925205.1
n/a n/a 4,332
(0.82 %)
15,532
(3.91 %)
n/a 30.24
(99.98 %)
0
(0 %)
240
(0.02 %)
67
(100.00 %)
481,097
(4.72 %)
135,266
(7.01 %)
4,093,473
(52.65 %)
2
(0.00 %)
194,054
(4.51 %)
12,709
(2.68 %)
10,994
(1.68 %)
542 rough bullseye (RE-2024b hap1 2024 genbank)
GCA_042242105.1
n/a n/a 14,592
(2.84 %)
44,299
(6.93 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
87
(0.00 %)
442
(100.00 %)
1,764,545
(30.13 %)
271,391
(5.93 %)
3,651,092
(24.53 %)
2
(0.00 %)
299,227
(3.11 %)
19,771
(1.39 %)
14,337
(0.85 %)
543 royal ground snake (hap1 2023 genbank)
GCA_031021105.1
n/a n/a 13,327
(0.96 %)
20,347
(1.68 %)
n/a 41.25
(99.99 %)
0
(0 %)
1,391
(0.01 %)
400
(100.00 %)
1,983,903
(10.40 %)
1,698,731
(7.29 %)
9,084,707
(53.44 %)
11
(0.00 %)
1,523,664
(5.77 %)
130,852
(4.47 %)
27,815
(0.70 %)
544 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2
53,779
(39.43 %)
n/a 21,304
(2.26 %)
18,211
(1.40 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
27,758
(7.29 %)
306,650
(10.98 %)
30,919
(92.71 %)
4,878,260
(40.08 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,226
(27.49 %)
6,570
(0.06 %)
398,071
(1.12 %)
16,050
(0.44 %)
15,502
(0.41 %)
545 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1
53,855
(2.85 %)
49,148
(2.43 %)
21,291
(2.26 %)
19,256
(1.49 %)
96,713
(4.05 %)
41.70
(89.05 %)
27,758
(7.29 %)
306,650
(10.98 %)
30,920
(92.71 %)
4,749,528
(39.06 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,297
(27.49 %)
6,570
(0.06 %)
398,071
(1.12 %)
16,050
(0.44 %)
15,491
(0.41 %)
546 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1
46,746
(40.70 %)
n/a 18,625
(1.49 %)
20,451
(1.28 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
0
(0 %)
968
(0.01 %)
631
(100.00 %)
4,020,682
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,818
(42.64 %)
0
(0 %)
1,785,427
(5.07 %)
66,179
(3.91 %)
41,466
(1.03 %)
547 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1
50,290
(50.75 %)
n/a 12,971
(1.67 %)
23,351
(2.02 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
0
(0 %)
258
(0.30 %)
282
(100.00 %)
548,087
(7.21 %)
201,482
(8.55 %)
7,030,761
(24.94 %)
0
(0 %)
469,777
(2.60 %)
31,791
(2.57 %)
20,215
(0.89 %)
548 salmon louse (v1.1 2020)
GCF_016086655.2
27,164
(5.26 %)
n/a 3,465
(0.45 %)
3,673
(1.75 %)
n/a 30.90
(99.99 %)
603
(0.01 %)
608
(0.01 %)
10,436
(99.99 %)
1,394,872
(53.53 %)
76,419
(1.13 %)
6,311,228
(43.85 %)
0
(0 %)
80,432
(1.10 %)
647
(0.04 %)
374
(0.03 %)
549 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887145.1
27,528
(42.80 %)
n/a 12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
0
(0 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
1
(0.00 %)
651,029
(4.07 %)
35,549
(5.05 %)
23,802
(1.15 %)
550 San Diegan tiger whiptail (v1.0 HBS 135688 primary hap 2022)
GCA_023333525.1
n/a n/a 10,727
(1.18 %)
14,669
(1.99 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
39
(0.00 %)
39
(0.00 %)
113
(100.00 %)
741,937
(6.29 %)
448,194
(5.60 %)
7,227,870
(36.97 %)
0
(0 %)
769,111
(3.76 %)
42,621
(2.15 %)
17,889
(0.90 %)
551 Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank)
GCA_029499605.1
108,406
(45.40 %)
n/a 13,961
(0.46 %)
36,603
(1.55 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
0
(0 %)
2,297
(0.01 %)
3,475
(100.00 %)
1,903,658
(2.85 %)
2,970,695
(16.56 %)
15,354,615
(64.31 %)
20
(0.00 %)
n/a 652,708
(8.36 %)
43,665
(0.45 %)
552 SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19)
GCF_009858895.2
n/a 13
(97.85 %)
n/a n/a n/a 37.98
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.24 %)
1
(0.11 %)
33
(1.38 %)
0
(0 %)
0
(0.00 %)
1
(0.73 %)
1
(0.73 %)
553 Schreibers' long-fingered bat (v1 hap1 2024)
GCA_964146895.1
n/a n/a 17,882
(1.96 %)
21,291
(1.88 %)
n/a 42.53
(99.99 %)
0
(0 %)
1,322
(0.01 %)
265
(100.00 %)
2,639,522
(28.12 %)
453,024
(5.66 %)
10,206,715
(31.11 %)
6
(0.00 %)
673,573
(2.67 %)
59,363
(2.86 %)
53,151
(1.93 %)
554 Schreibers' long-fingered bat (v1 hap2 2024)
GCA_964145185.1
n/a n/a 17,115
(2.05 %)
19,972
(1.93 %)
n/a 42.62
(99.99 %)
1,137
(0.01 %)
1,137
(0.01 %)
1,305
(99.99 %)
2,445,695
(27.61 %)
386,295
(4.40 %)
9,657,997
(29.32 %)
2
(0.00 %)
458,566
(1.76 %)
56,451
(2.93 %)
50,746
(2.02 %)
555 sea anemones (CC7 2015 genbank)
GCA_001417965.1
29,778
(59.32 %)
26,042
(31.72 %)
3,020
(1.06 %)
13,146
(12.99 %)
30,497
(24.04 %)
36.33
(82.34 %)
0
(0 %)
637,478
(17.95 %)
4,312
(100.00 %)
74,671
(1.98 %)
63,328
(2.24 %)
1,417,036
(20.33 %)
493
(0.38 %)
82,695
(5.22 %)
2,099
(0.38 %)
1,309
(0.28 %)
556 sea lamprey (kPetMar1 primary hap 2020)
GCA_010993605.1
n/a n/a 8,130
(0.73 %)
36,343
(4.06 %)
n/a 48.31
(98.62 %)
0
(0 %)
930
(1.38 %)
1,433
(100.00 %)
3,309,659
(59.73 %)
1,194,161
(21.47 %)
5,320,564
(50.50 %)
4
(0.00 %)
768,508
(3.64 %)
178,590
(35.88 %)
150,079
(6.78 %)
557 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2
n/a n/a 18,591
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
34,142
(1.77 %)
41.56
(98.79 %)
22,821
(1.21 %)
23,134
(1.21 %)
29,588
(98.79 %)
4,702,292
(41.42 %)
721,749
(1.39 %)
14,065,592
(32.89 %)
1,203
(0.02 %)
504,215
(2.00 %)
55,388
(1.87 %)
53,466
(1.67 %)
558 segmented worms (v1 2012)
GCF_000326865.1
23,426
(13.46 %)
n/a 2,741
(0.95 %)
3,156
(4.19 %)
n/a 32.82
(91.54 %)
10,301
(8.47 %)
11,185
(8.47 %)
12,292
(91.53 %)
572,062
(30.90 %)
474,390
(10.49 %)
1,741,644
(44.75 %)
9
(0.01 %)
91,780
(2.82 %)
3,489
(0.51 %)
1,342
(0.18 %)
559 siamang (v1 Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1
79,118
(2.62 %)
n/a 20,139
(1.70 %)
21,232
(1.14 %)
n/a 40.62
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
606
(100.00 %)
5,278,880
(55.89 %)
946,219
(14.68 %)
14,395,605
(46.26 %)
0
(0 %)
2,376,584
(4.99 %)
95,573
(1.75 %)
30,053
(0.74 %)
560 siamang (v2 Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.2
n/a n/a 19,572
(1.70 %)
20,107
(1.11 %)
n/a 40.45
(99.93 %)
0
(0 %)
3
(0.07 %)
40
(100.00 %)
5,057,491
(55.54 %)
869,279
(15.07 %)
14,090,400
(46.04 %)
0
(0 %)
2,292,373
(4.98 %)
87,907
(1.41 %)
26,874
(0.68 %)
561 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 genbank)
GCA_028878055.2
105,360
(44.53 %)
n/a 20,433
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
0
(0 %)
1
(0.03 %)
26
(100.00 %)
5,354,441
(55.80 %)
935,620
(14.70 %)
14,917,483
(46.01 %)
0
(0 %)
2,398,386
(4.90 %)
92,243
(1.42 %)
27,998
(0.68 %)
562 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.2
105,373
(3.05 %)
n/a 20,434
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
0
(0 %)
2
(0.03 %)
27
(100.00 %)
5,354,446
(55.80 %)
935,620
(14.70 %)
14,917,515
(46.01 %)
0
(0 %)
2,398,386
(4.90 %)
92,243
(1.42 %)
27,998
(0.68 %)
563 Siamese fighting fish (v2 primary hap 2019)
GCF_900634795.2
54,389
(16.95 %)
n/a 14,745
(4.21 %)
34,348
(10.09 %)
62,673
(13.02 %)
45.30
(99.99 %)
0
(0 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
252,955
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
0
(0 %)
232,426
(4.41 %)
72,126
(13.08 %)
55,959
(7.25 %)
564 Siamese fighting fish (v3 primary hap 2020)
GCF_900634795.3
54,864
(17.78 %)
n/a 14,745
(4.20 %)
56,808
(10.87 %)
69,466
(16.34 %)
45.30
(99.99 %)
0
(0 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
255,550
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
0
(0 %)
232,435
(4.41 %)
72,126
(13.08 %)
55,959
(7.25 %)
565 silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.1
54,238
(2.74 %)
n/a 17,887
(2.00 %)
18,517
(1.25 %)
n/a 41.17
(98.20 %)
0
(0 %)
18,567
(1.80 %)
18,392
(100.00 %)
4,399,357
(50.55 %)
711,948
(2.37 %)
12,623,705
(36.55 %)
554
(0.02 %)
851,081
(2.16 %)
67,835
(1.30 %)
23,062
(0.73 %)
566 silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.2
63,475
(2.65 %)
n/a 20,581
(1.94 %)
21,181
(1.20 %)
41,252
(1.46 %)
41.02
(97.81 %)
0
(0 %)
25,106
(2.19 %)
18,395
(100.00 %)
5,332,131
(51.09 %)
857,562
(2.26 %)
15,565,289
(36.84 %)
736
(0.02 %)
997,772
(2.11 %)
80,124
(1.26 %)
26,690
(0.70 %)
567 slow loris (BS32 2019)
GCA_004027815.1
n/a n/a 26,771
(1.11 %)
44,247
(1.00 %)
n/a 40.68
(99.86 %)
9,648
(0.03 %)
9,648
(0.03 %)
1,946,791
(99.97 %)
6,230,312
(41.68 %)
688,924
(1.23 %)
16,892,392
(43.00 %)
103
(0.00 %)
n/a 39,326
(0.65 %)
24,515
(0.47 %)
568 slow loris (primary hap 2022 genbank)
GCA_027406575.1
67,213
(41.75 %)
n/a 22,195
(1.49 %)
21,341
(1.28 %)
n/a 40.82
(99.86 %)
0
(0 %)
218
(0.14 %)
85
(100.00 %)
4,625,875
(39.88 %)
579,984
(1.59 %)
14,405,402
(40.78 %)
2
(0.00 %)
991,314
(2.40 %)
38,257
(0.77 %)
22,955
(0.54 %)
569 small Madagascar hedgehog
GCA_000313985.1
n/a n/a 19,066
(1.18 %)
19,334
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.44 %)
269,444
(11.60 %)
269,444
(11.60 %)
277,845
(88.40 %)
3,789,866
(28.89 %)
429,318
(0.87 %)
16,950,647
(32.23 %)
3,871
(0.06 %)
189,446
(0.64 %)
39,994
(0.70 %)
32,202
(0.55 %)
570 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1
55,749
(1.62 %)
n/a 12,597
(0.36 %)
23,987
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
0
(0 %)
7,146
(1.52 %)
646
(100.00 %)
1,185,832
(1.72 %)
1,448,620
(6.25 %)
20,884,767
(51.41 %)
10
(0.00 %)
3,334,926
(4.99 %)
456,658
(8.18 %)
31,096
(0.32 %)
571 smalleye Pacific opah (hap2 2023 genbank)
GCA_029633865.1
n/a n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
0
(0 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
17
(0.00 %)
n/a 143,632
(7.43 %)
65,914
(2.15 %)
572 smalltooth sawfish (v2 primary hap 2019 genbank)
GCA_009764475.1
n/a n/a 11,828
(0.66 %)
18,627
(1.55 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
0
(0 %)
698
(0.91 %)
173
(100.00 %)
405,021
(1.14 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,302
(38.19 %)
0
(0 %)
471,290
(1.50 %)
45,398
(1.34 %)
18,572
(0.38 %)
573 snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016)
GCF_001687245.1
37,836
(4.45 %)
n/a 10,526
(1.07 %)
59,331
(6.34 %)
n/a 36.53
(93.84 %)
52,913
(6.17 %)
227,684
(6.18 %)
139,583
(93.83 %)
653,914
(2.87 %)
386,956
(5.71 %)
7,364,314
(43.00 %)
22,478
(0.98 %)
443,424
(7.26 %)
60,636
(4.05 %)
36,565
(2.36 %)
574 sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019)
GCF_006149115.1
76,167
(6.12 %)
n/a 24,114
(1.71 %)
51,371
(4.08 %)
102,891
(5.24 %)
43.39
(96.16 %)
1,903
(0.01 %)
25,659
(3.84 %)
38,027
(99.99 %)
1,300,179
(8.96 %)
1,465,690
(10.81 %)
8,849,714
(48.44 %)
872
(0.04 %)
1,716,006
(5.17 %)
64,215
(1.55 %)
18,038
(0.45 %)
575 South Georgia icefish (v1 primary hap 2020)
GCF_902827115.1
41,307
(6.47 %)
n/a 14,776
(1.79 %)
68,734
(6.16 %)
61,643
(5.52 %)
42.07
(99.94 %)
0
(0 %)
2,461
(0.06 %)
1,563
(100.00 %)
498,451
(3.42 %)
474,032
(7.20 %)
3,613,731
(45.83 %)
19
(0.00 %)
763,187
(8.62 %)
88,984
(4.31 %)
17,905
(0.76 %)
576 southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank)
GCA_910596095.1
58,416
(66.24 %)
n/a 15,695
(2.61 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
95
(0.00 %)
58
(100.00 %)
1,591,314
(33.50 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,850
(26.85 %)
0
(0 %)
326,259
(3.37 %)
14,097
(0.88 %)
9,797
(0.48 %)
577 southern cattle tick (Rmic-2018 2020 genbank)
GCA_013339725.1
n/a 29,870
(1.19 %)
3,698
(0.12 %)
117,910
(5.00 %)
35,315
(1.88 %)
45.79
(99.99 %)
0
(0 %)
1,576
(0.01 %)
7,048
(100.00 %)
770,997
(2.03 %)
680,149
(3.55 %)
10,994,272
(39.37 %)
0
(0 %)
979,976
(3.85 %)
304,620
(17.03 %)
234,809
(5.42 %)
578 southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad)
GCA_004026725.1
n/a n/a 24,302
(1.12 %)
43,055
(0.98 %)
n/a 41.63
(99.82 %)
10,550
(0.03 %)
10,550
(0.03 %)
2,272,285
(99.97 %)
5,668,964
(24.75 %)
1,628,683
(5.38 %)
15,658,806
(41.85 %)
67
(0.00 %)
n/a 21,801
(0.44 %)
18,380
(0.34 %)
579 southern house mosquito (JHB 2007 genbank)
GCA_000209185.1
n/a 22,629
(4.75 %)
5,905
(1.14 %)
41,195
(8.84 %)
n/a 37.42
(93.28 %)
45,500
(6.75 %)
45,500
(6.75 %)
48,671
(93.25 %)
738,398
(35.22 %)
171,041
(5.71 %)
3,037,349
(50.41 %)
88
(0.02 %)
323,404
(5.87 %)
65,784
(9.49 %)
44,205
(6.42 %)
580 southern tamandua (Broad 2019)
GCA_004025105.1
n/a n/a 25,638
(0.82 %)
49,782
(0.86 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
5,819
(0.02 %)
5,819
(0.02 %)
2,150,023
(99.98 %)
6,033,640
(37.10 %)
708,890
(0.99 %)
22,371,532
(41.88 %)
62
(0.00 %)
n/a 80,897
(1.09 %)
48,136
(0.70 %)
581 southern two-toed sloth (US054 2019 Broad)
GCA_004027855.1
n/a n/a 25,877
(0.78 %)
56,071
(0.82 %)
n/a 39.82
(99.84 %)
5,099
(0.02 %)
5,099
(0.02 %)
2,537,432
(99.98 %)
5,384,587
(37.86 %)
724,925
(2.20 %)
19,492,096
(41.12 %)
63
(0.00 %)
n/a 55,674
(0.90 %)
46,833
(0.74 %)
582 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1
37,037
(37.57 %)
n/a 18,551
(1.79 %)
19,747
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
54,737
(3.96 %)
57,823
(96.04 %)
3,824,807
(39.33 %)
421,693
(0.97 %)
14,765,476
(28.93 %)
1,818
(0.02 %)
184,274
(0.57 %)
36,281
(1.02 %)
34,129
(0.92 %)
583 soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010)
GCF_000004515.4
82,440
(9.65 %)
n/a 27,682
(3.07 %)
77,218
(11.84 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,955
(2.35 %)
15,955
(2.35 %)
17,146
(97.65 %)
834,646
(37.35 %)
436,219
(5.65 %)
5,341,660
(45.30 %)
54
(0.01 %)
659,519
(6.22 %)
35,897
(1.56 %)
13,140
(0.58 %)
584 soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018)
GCF_000004515.5
85,123
(9.72 %)
n/a 27,647
(3.06 %)
77,190
(11.83 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,995
(2.36 %)
15,995
(2.36 %)
17,187
(97.64 %)
834,651
(37.35 %)
436,225
(5.65 %)
5,341,721
(45.30 %)
55
(0.01 %)
659,428
(6.22 %)
35,897
(1.47 %)
13,140
(0.58 %)
585 speckled mousebird (hap1 2023 genbank)
GCA_028858725.1
n/a n/a 11,956
(1.78 %)
25,177
(2.60 %)
n/a 42.38
(99.48 %)
0
(0 %)
143
(0.52 %)
189
(100.00 %)
523,056
(12.47 %)
243,547
(3.72 %)
5,408,003
(23.43 %)
1
(0.00 %)
397,635
(2.78 %)
25,552
(2.34 %)
19,232
(1.18 %)
586 speckled mousebird (v1 hap2 2023)
GCA_028858625.1
n/a n/a 13,169
(1.74 %)
26,896
(2.47 %)
n/a 42.62
(99.56 %)
0
(0 %)
151
(0.44 %)
243
(100.00 %)
570,907
(11.75 %)
317,226
(6.96 %)
5,854,600
(25.51 %)
0
(0 %)
605,114
(3.54 %)
28,905
(2.31 %)
21,335
(1.22 %)
587 speckled wood butterfly (genbank 2021)
GCA_905163445.1
21,720
(55.73 %)
n/a 4,713
(0.87 %)
17,002
(4.33 %)
29,238
(7.81 %)
35.99
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
71
(100.00 %)
304,077
(2.97 %)
110,835
(4.09 %)
3,704,355
(44.42 %)
1
(0.00 %)
144,758
(2.93 %)
28,108
(2.75 %)
11,566
(0.96 %)
588 sperm whale (SW-GA 2019)
GCF_002837175.2
60,921
(2.59 %)
n/a 19,527
(1.73 %)
25,114
(1.51 %)
n/a 41.39
(95.90 %)
128,928
(4.12 %)
128,928
(4.12 %)
143,605
(95.88 %)
4,365,057
(42.78 %)
694,673
(2.40 %)
13,518,590
(32.76 %)
1,887
(0.17 %)
521,351
(4.50 %)
94,152
(2.52 %)
63,303
(1.97 %)
589 sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF)
GCF_000090795.1
31,248
(25.26 %)
n/a 2,167
(1.08 %)
6,648
(9.22 %)
n/a 35.83
(86.92 %)
14,574
(13.10 %)
14,944
(13.10 %)
27,972
(86.90 %)
108,973
(4.04 %)
70,563
(4.66 %)
881,116
(24.58 %)
109
(0.03 %)
120,772
(5.83 %)
668
(0.62 %)
519
(0.56 %)
590 stable fly (8C7A2A5H3J4 2015 genbank)
GCA_001015335.1
n/a n/a 7,737
(1.16 %)
11,972
(2.65 %)
n/a 38.85
(84.55 %)
113,660
(15.50 %)
129,113
(15.50 %)
125,702
(84.50 %)
310,342
(1.75 %)
391,619
(8.42 %)
5,616,633
(48.71 %)
6,705
(0.32 %)
483,703
(3.74 %)
38,246
(1.55 %)
4,353
(0.18 %)
591 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.1
n/a n/a 22,306
(1.80 %)
33,366
(4.09 %)
n/a 39.56
(99.99 %)
0
(0 %)
402
(0.01 %)
245
(100.00 %)
1,126,738
(3.36 %)
889,853
(6.73 %)
8,766,715
(39.22 %)
4
(0.00 %)
1,059,859
(5.24 %)
51,356
(1.84 %)
13,633
(0.35 %)
592 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.2
n/a n/a 25,364
(1.76 %)
40,452
(4.10 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
0
(0 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
10
(0.00 %)
1,593,749
(6.87 %)
64,522
(2.85 %)
21,984
(0.89 %)
593 sterlet (v1 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.1
73,251
(5.76 %)
n/a 24,411
(1.72 %)
39,637
(3.96 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
0
(0 %)
6,283
(0.07 %)
3,404
(100.00 %)
1,269,345
(3.50 %)
1,095,665
(6.81 %)
10,007,602
(39.30 %)
5
(0.00 %)
1,356,511
(6.13 %)
60,475
(1.95 %)
17,954
(0.41 %)
594 sterlet (v1 paternal hap 2020)
GCA_902713435.1
n/a n/a 22,718
(1.81 %)
34,093
(4.15 %)
57,768
(4.88 %)
39.60
(100.00 %)
0
(0 %)
422
(0.01 %)
224
(100.00 %)
1,145,503
(3.39 %)
912,936
(6.84 %)
8,839,174
(39.17 %)
4
(0.00 %)
1,099,124
(5.35 %)
52,560
(1.82 %)
14,166
(0.36 %)
595 stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017)
GCF_002571385.1
36,135
(16.45 %)
n/a 3,324
(0.70 %)
20,909
(10.93 %)
38,198
(17.00 %)
38.54
(89.50 %)
0
(0 %)
49,077
(10.54 %)
5,688
(100.00 %)
111,077
(1.70 %)
108,732
(2.95 %)
2,009,396
(21.40 %)
206
(0.10 %)
118,773
(3.74 %)
6,012
(0.58 %)
3,703
(0.31 %)
596 striped catfish (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358585.1
53,859
(65.52 %)
n/a 16,035
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
0
(0 %)
236
(0.51 %)
59
(100.00 %)
1,870,238
(37.80 %)
605,571
(6.82 %)
5,059,499
(32.43 %)
2
(0.00 %)
531,388
(4.26 %)
17,919
(1.29 %)
12,796
(0.75 %)
597 sudden oak death agent (Pr-102 primary hap 2021 genbank)
GCA_020800215.1
n/a 15,507
(39.68 %)
1,461
(1.76 %)
22,413
(61.13 %)
n/a 54.37
(99.66 %)
0
(0 %)
50
(0.34 %)
28
(100.00 %)
8,935
(0.72 %)
9,528
(3.65 %)
117,380
(14.16 %)
0
(0 %)
17,976
(7.40 %)
34
(99.96 %)
156
(7.43 %)
598 Sumatran orangutan (Susie 2018 genbank)
GCA_002880775.3
n/a 160,726
(3.42 %)
20,174
(1.79 %)
20,994
(1.15 %)
47,806
(1.68 %)
40.80
(99.29 %)
553
(0.70 %)
553
(0.70 %)
5,813
(99.30 %)
5,497,148
(54.41 %)
1,048,361
(8.01 %)
15,948,575
(40.68 %)
0
(0 %)
2,413,946
(4.00 %)
39,481
(0.87 %)
26,385
(0.67 %)
599 Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1
98,046
(3.46 %)
n/a 21,162
(1.68 %)
21,714
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.79 %)
59
(0.21 %)
59
(0.21 %)
2,670
(99.79 %)
5,730,768
(55.05 %)
1,175,314
(11.19 %)
16,323,507
(44.05 %)
0
(0 %)
2,553,363
(4.41 %)
55,799
(2.08 %)
39,159
(1.10 %)
600 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1
n/a n/a 13,403
(1.85 %)
27,456
(2.48 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
497,374
(5.78 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
0
(0 %)
505,741
(2.66 %)
49,076
(3.54 %)
23,486
(1.21 %)
601 Swainson's thrush (v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1
40,128
(5.45 %)
n/a 13,016
(1.88 %)
24,787
(2.41 %)
30,064
(2.94 %)
42.48
(98.86 %)
0
(0 %)
428
(1.14 %)
161
(100.00 %)
483,978
(5.85 %)
589,859
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
1
(0.00 %)
449,585
(2.41 %)
49,404
(3.53 %)
22,206
(1.16 %)
602 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018845.1
29,544
(46.92 %)
n/a 12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
0
(0 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
1
(0.00 %)
578,723
(3.93 %)
32,064
(3.27 %)
22,996
(1.19 %)
603 tammar wallaby (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028372415.1
n/a n/a 17,652
(0.77 %)
15,774
(0.88 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
0
(0 %)
515
(0.19 %)
315
(100.00 %)
5,836,160
(26.14 %)
1,193,709
(2.72 %)
22,682,658
(39.52 %)
4
(0.00 %)
566,172
(1.21 %)
23,629
(0.48 %)
14,785
(0.29 %)
604 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 genbank)
GCA_028372415.2
n/a n/a 17,617
(0.77 %)
15,414
(0.86 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
0
(0 %)
515
(0.19 %)
273
(100.00 %)
5,866,321
(26.30 %)
1,193,604
(2.72 %)
22,677,517
(39.53 %)
4
(0.00 %)
565,991
(1.21 %)
23,590
(0.47 %)
14,746
(0.29 %)
605 Tasmanian devil
GCF_000189315.1
32,527
(1.79 %)
n/a 16,112
(0.84 %)
16,152
(0.94 %)
n/a 36.05
(92.36 %)
201,317
(7.66 %)
201,403
(7.66 %)
237,291
(92.34 %)
6,766,259
(42.85 %)
1,240,681
(2.07 %)
20,998,733
(36.61 %)
17,494
(0.40 %)
351,216
(1.07 %)
23,155
(0.38 %)
21,337
(0.32 %)
606 thale cress (tair10 Columbia 2011)
GCF_000001735.3
53,828
(40.09 %)
n/a 26,552
(34.12 %)
25,867
(35.78 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
0
(0 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
67,353
(16.32 %)
27,063
(2.77 %)
749,020
(22.64 %)
1
(0.00 %)
42,547
(3.36 %)
4,599
(1.63 %)
3,518
(1.15 %)
607 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1
41,886
(2.61 %)
n/a 19,165
(1.70 %)
18,102
(1.44 %)
n/a 39.91
(93.27 %)
141,005
(6.75 %)
141,005
(6.75 %)
153,488
(93.25 %)
4,378,557
(36.61 %)
640,337
(1.64 %)
14,116,066
(27.91 %)
2,964
(0.05 %)
213,421
(0.74 %)
28,321
(0.64 %)
26,464
(0.58 %)
608 thorny skate (v1 CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1
45,969
(2.40 %)
n/a 11,433
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
0
(0 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
865,711
(2.57 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
26
(0.00 %)
1,634,657
(4.98 %)
242,676
(4.73 %)
31,030
(0.57 %)
609 thorny skate (v1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank)
GCA_010909765.1
45,969
(46.35 %)
n/a 11,434
(0.60 %)
26,342
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
0
(0 %)
3,753
(7.46 %)
958
(100.00 %)
866,598
(2.58 %)
1,176,350
(3.79 %)
9,964,083
(52.25 %)
26
(0.00 %)
1,634,657
(4.98 %)
242,676
(4.73 %)
31,030
(0.57 %)
610 tick D.silvarum (v1 2020)
GCF_013339745.1
36,084
(1.94 %)
n/a 4,032
(0.13 %)
128,567
(5.82 %)
43,960
(2.05 %)
46.91
(99.95 %)
0
(0 %)
13,519
(0.05 %)
1,665
(100.00 %)
1,116,542
(2.95 %)
642,860
(3.16 %)
10,429,455
(39.18 %)
6
(0.00 %)
n/a 37,849
(2.30 %)
244,151
(6.39 %)
611 tidepool copepod (San Diego 2019 genbank)
GCA_007210705.1
23,429
(54.20 %)
15,577
(15.83 %)
3,517
(1.61 %)
18,910
(15.71 %)
n/a 42.18
(97.94 %)
0
(0 %)
14,007
(2.09 %)
459
(100.00 %)
52,042
(1.17 %)
27,065
(1.23 %)
928,666
(18.11 %)
1,035
(0.11 %)
46,898
(3.89 %)
15,823
(5.51 %)
13,041
(4.23 %)
612 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022 genbank)
GCA_026437365.1
n/a n/a 14,276
(1.78 %)
66,576
(6.32 %)
n/a 42.96
(99.99 %)
0
(0 %)
794
(0.01 %)
820
(100.00 %)
2,127,818
(38.86 %)
708,255
(30.28 %)
3,809,452
(49.66 %)
2
(0.00 %)
2,111,836
(12.18 %)
101,682
(8.04 %)
46,739
(2.13 %)
613 tiger tail seahorse (QL1 v1 2016)
GCF_001891065.1
47,041
(13.29 %)
n/a 13,817
(3.76 %)
32,943
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.04 %)
23,101
(6.97 %)
23,101
(6.97 %)
60,478
(93.03 %)
359,724
(3.91 %)
155,380
(3.35 %)
2,811,700
(24.51 %)
111
(0.08 %)
112,479
(5.30 %)
61,685
(7.72 %)
45,970
(4.19 %)
614 tiny Cayenne caecilian (v1 2019)
GCF_901765095.1
41,346
(1.27 %)
n/a 14,569
(0.43 %)
30,499
(1.16 %)
n/a 44.01
(98.99 %)
0
(0 %)
2,452
(1.01 %)
1,081
(100.00 %)
1,835,191
(1.59 %)
1,670,443
(3.30 %)
22,207,145
(52.43 %)
5
(0.00 %)
1,513,727
(3.00 %)
414,828
(3.91 %)
47,796
(0.38 %)
615 tomato (v3.0 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.4
46,014
(6.94 %)
n/a 15,396
(2.15 %)
38,462
(7.56 %)
n/a 34.12
(90.18 %)
0
(0 %)
19,634
(9.83 %)
3,150
(100.00 %)
417,162
(18.21 %)
229,803
(3.18 %)
5,370,478
(35.28 %)
224
(0.02 %)
412,060
(4.40 %)
25,279
(1.28 %)
2,409
(0.12 %)
616 tourmaline sunangel (hap1 2024 genbank)
GCA_036169615.1
n/a n/a 12,509
(1.97 %)
21,020
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.99 %)
0
(0 %)
437
(0.01 %)
131
(100.00 %)
532,267
(5.46 %)
332,284
(2.69 %)
6,084,978
(21.20 %)
0
(0 %)
215,264
(1.71 %)
19,080
(1.72 %)
15,764
(1.09 %)
617 trahira (v1 hap1 2023)
GCA_029633855.1
n/a n/a 16,039
(2.06 %)
44,287
(4.38 %)
n/a 40.99
(92.91 %)
0
(0 %)
867
(7.09 %)
597
(100.00 %)
2,228,831
(30.95 %)
687,495
(13.85 %)
5,309,097
(36.70 %)
2
(0.01 %)
1,157,952
(7.09 %)
27,070
(2.09 %)
12,077
(0.44 %)
618 trahira (v1 hap2 2023)
GCA_029633875.1
n/a n/a 16,216
(2.00 %)
45,209
(4.32 %)
n/a 41.03
(96.02 %)
0
(0 %)
907
(3.98 %)
452
(100.00 %)
2,280,303
(30.80 %)
708,327
(15.59 %)
5,394,248
(39.01 %)
7
(0.00 %)
1,246,906
(7.61 %)
28,386
(2.18 %)
12,439
(0.46 %)
619 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022 genbank)
GCA_023055355.1
n/a n/a 12,867
(1.81 %)
26,393
(2.48 %)
n/a 42.85
(100.00 %)
97
(0.00 %)
97
(0.00 %)
311
(100.00 %)
429,011
(3.16 %)
564,849
(5.52 %)
6,336,716
(23.32 %)
0
(0 %)
439,278
(2.62 %)
33,378
(2.70 %)
23,687
(1.26 %)
620 Trypanosoma equiperdum (OVI 2016 genbank)
GCA_001457755.2
n/a 10,902
(50.13 %)
576
(1.36 %)
2,999
(35.93 %)
n/a 45.94
(99.65 %)
0
(0 %)
6,447
(0.44 %)
2,026
(100.00 %)
16,807
(2.60 %)
3,925
(0.79 %)
141,656
(16.64 %)
0
(0 %)
1,684
(0.54 %)
4,877
(34.82 %)
4,352
(15.04 %)
621 Trypanosoma melophagium (St. Kilda St. Kilda 2022 genbank)
GCA_022059095.1
n/a 10,057
(64.23 %)
742
(1.83 %)
848
(40.20 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 64
(100.00 %)
39,141
(7.68 %)
14,366
(6.71 %)
131,898
(25.19 %)
0
(0 %)
9,068
(6.92 %)
4,119
(14.82 %)
3,546
(9.39 %)
622 tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020)
GCF_014805625.1
24,334
(8.13 %)
n/a 7,223
(2.32 %)
6,632
(3.62 %)
n/a 33.80
(97.46 %)
0
(0 %)
9,688
(2.55 %)
7,986
(100.00 %)
418,532
(4.76 %)
185,734
(2.26 %)
3,090,742
(35.34 %)
677
(0.08 %)
40,269
(0.93 %)
3,487
(0.58 %)
1,907
(0.28 %)
623 Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 genbank)
GCA_040894005.1
n/a n/a 13,678
(0.88 %)
29,720
(2.41 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
25
(0.00 %)
436
(0.00 %)
961
(100.00 %)
734,036
(2.54 %)
1,217,326
(21.42 %)
8,925,883
(52.53 %)
6
(0.00 %)
691,991
(2.19 %)
211,590
(5.08 %)
23,983
(0.47 %)
624 two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_901001135.1
56,630
(1.50 %)
n/a 14,448
(0.38 %)
40,572
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
0
(0 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,263,606
(1.94 %)
2,036,108
(4.34 %)
29,400,958
(44.09 %)
9
(0.01 %)
2,193,249
(3.24 %)
602,912
(6.66 %)
94,935
(0.82 %)
625 Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017)
GCA_002776525.1
n/a n/a 21,053
(1.88 %)
23,024
(1.24 %)
n/a 40.68
(96.59 %)
0
(0 %)
77,615
(3.42 %)
47,644
(100.00 %)
5,478,730
(51.13 %)
969,126
(2.63 %)
16,127,854
(36.40 %)
1,906
(0.05 %)
947,012
(1.94 %)
63,965
(1.04 %)
25,907
(0.65 %)
626 Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018)
GCF_002776525.2
66,965
(2.69 %)
n/a 21,958
(1.85 %)
24,388
(1.22 %)
55,722
(1.95 %)
40.60
(97.10 %)
0
(0 %)
63,620
(2.91 %)
47,449
(100.00 %)
5,699,639
(51.61 %)
1,066,606
(2.87 %)
16,603,622
(37.49 %)
6,170
(0.10 %)
1,075,458
(2.10 %)
71,084
(1.08 %)
26,726
(0.65 %)
627 Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019)
GCF_002776525.3
68,173
(2.68 %)
n/a 21,804
(1.85 %)
23,385
(1.18 %)
n/a 40.60
(97.10 %)
0
(0 %)
64,415
(2.91 %)
46,654
(100.00 %)
5,700,226
(51.61 %)
1,066,759
(2.88 %)
16,603,818
(37.49 %)
6,208
(0.10 %)
1,080,318
(2.10 %)
71,078
(1.08 %)
26,732
(0.65 %)
628 Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019)
GCF_002776525.4
63,704
(2.55 %)
n/a 21,347
(1.86 %)
23,056
(1.19 %)
n/a 40.84
(97.07 %)
0
(0 %)
57,757
(2.93 %)
34,372
(100.00 %)
5,504,117
(51.70 %)
961,351
(2.75 %)
16,208,033
(37.10 %)
4,987
(0.09 %)
1,064,626
(2.10 %)
71,046
(1.10 %)
29,347
(0.68 %)
629 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1
54,667
(35.81 %)
n/a 19,685
(1.25 %)
21,268
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
201,121
(4.83 %)
356,096
(95.17 %)
6,165,270
(34.95 %)
1,197,778
(2.77 %)
16,282,333
(36.21 %)
730
(0.04 %)
592,599
(1.56 %)
22,905
(0.49 %)
18,563
(0.39 %)
630 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1
63,555
(8.16 %)
n/a 16,886
(1.90 %)
72,876
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
0
(0 %)
1,674
(0.23 %)
2,010
(100.00 %)
800,389
(3.72 %)
460,244
(7.41 %)
5,439,256
(37.83 %)
3
(0.00 %)
746,332
(7.48 %)
19,635
(1.10 %)
9,142
(0.41 %)
631 vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.1
48,870
(21.91 %)
n/a 19,421
(7.41 %)
36,314
(20.76 %)
n/a 36.49
(94.25 %)
0
(0 %)
49,649
(5.76 %)
25,263
(100.00 %)
182,696
(3.35 %)
143,269
(7.40 %)
1,620,517
(29.12 %)
3,454
(0.84 %)
135,503
(7.90 %)
13,323
(2.49 %)
9,786
(1.57 %)
632 velvet spider S.dumicola (v1 Namibia, Etosha 2020)
GCF_010614865.1
34,675
(2.01 %)
n/a 3,329
(0.10 %)
24,015
(1.20 %)
n/a 33.26
(100.00 %)
0
(0 %)
7
(0.00 %)
16,531
(100.00 %)
1,258,301
(2.08 %)
828,332
(2.42 %)
17,994,342
(48.98 %)
0
(0 %)
650,236
(2.42 %)
63,015
(0.95 %)
8,586
(0.12 %)
633 wasp C.solmsi marchali (v1 2013)
GCF_000503995.1
13,201
(7.14 %)
n/a 3,474
(1.25 %)
15,142
(4.89 %)
n/a 30.36
(99.55 %)
7,471
(0.46 %)
7,471
(0.46 %)
9,928
(99.54 %)
340,841
(7.52 %)
251,386
(3.99 %)
2,448,273
(49.27 %)
11
(0.00 %)
43,154
(0.99 %)
16,346
(4.08 %)
14,983
(2.78 %)
634 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1
n/a n/a 20,245
(1.49 %)
24,230
(1.29 %)
n/a 42.11
(97.39 %)
263,385
(2.62 %)
263,385
(2.62 %)
630,367
(97.38 %)
5,997,926
(47.35 %)
466,019
(1.02 %)
13,822,739
(40.29 %)
2,383
(0.04 %)
975,519
(2.73 %)
93,080
(1.71 %)
42,806
(0.88 %)
635 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1
48,251
(30.18 %)
n/a 21,044
(1.72 %)
22,320
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
152,836
(29.58 %)
169,546
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,250
(0.66 %)
13,410,191
(22.09 %)
2,022
(0.05 %)
348,918
(1.08 %)
48,738
(1.01 %)
44,867
(0.88 %)
636 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1
29,923
(35.25 %)
n/a 18,034
(1.33 %)
19,779
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
219,764
(14.09 %)
225,566
(85.91 %)
6,527,125
(45.87 %)
1,271,531
(2.29 %)
12,374,069
(42.02 %)
3,596
(0.06 %)
861,216
(2.39 %)
28,528
(0.71 %)
23,900
(0.52 %)
637 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1
61,103
(44.10 %)
n/a 18,126
(1.16 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
0
(0 %)
3,760
(0.03 %)
1,175
(100.00 %)
4,891,344
(19.68 %)
1,507,933
(3.81 %)
12,571,193
(54.50 %)
7
(0.00 %)
1,975,693
(4.67 %)
32,667
(0.90 %)
24,067
(0.56 %)
638 western European house mouse (WSB_EiJ v1 2016)
GCA_001624835.1
n/a n/a 20,870
(2.26 %)
18,535
(1.45 %)
100,622
(4.22 %)
41.80
(84.36 %)
68,691
(5.19 %)
399,976
(15.70 %)
72,315
(94.81 %)
4,961,700
(39.53 %)
1,345,987
(2.51 %)
13,324,808
(25.23 %)
11,455
(0.66 %)
369,064
(1.23 %)
16,556
(0.40 %)
15,878
(0.38 %)
639 western flower thrips (v2 FOCC.00 2017)
GCF_000697945.2
24,277
(14.78 %)
n/a 4,066
(1.46 %)
26,743
(11.40 %)
n/a 51.10
(94.72 %)
15,747
(5.29 %)
60,375
(5.31 %)
34,226
(94.71 %)
275,482
(4.88 %)
167,812
(3.67 %)
1,832,537
(24.44 %)
729
(0.04 %)
58,278
(2.14 %)
26,406
(36.85 %)
31,568
(5.58 %)
640 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3
n/a n/a 20,323
(1.77 %)
22,069
(1.15 %)
n/a 40.71
(99.64 %)
768
(0.36 %)
768
(0.36 %)
16,065
(99.64 %)
5,373,630
(50.30 %)
1,025,389
(10.17 %)
15,954,613
(41.78 %)
0
(0 %)
3,581,997
(5.69 %)
53,557
(1.01 %)
27,578
(0.69 %)
641 western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023)
GCF_029281585.1
101,242
(3.18 %)
n/a 20,994
(1.57 %)
41,945
(1.53 %)
n/a 40.59
(99.85 %)
0
(0 %)
38
(0.15 %)
637
(100.00 %)
5,526,927
(51.16 %)
1,080,693
(20.38 %)
15,929,020
(48.46 %)
0
(0 %)
5,690,867
(9.25 %)
76,432
(1.35 %)
30,764
(0.70 %)
642 western lowland gorilla (v2.0 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.2
98,415
(41.67 %)
n/a 21,010
(1.59 %)
50,696
(1.83 %)
n/a 40.49
(99.94 %)
0
(0 %)
2
(0.06 %)
25
(100.00 %)
5,456,267
(50.77 %)
1,060,267
(19.55 %)
15,870,191
(47.77 %)
0
(0 %)
n/a 69,745
(1.19 %)
30,644
(0.70 %)
643 western lowland gorilla (v2.1 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.3
n/a n/a 21,010
(1.59 %)
50,695
(1.83 %)
n/a 40.49
(99.94 %)
0
(0 %)
2
(0.06 %)
26
(100.00 %)
5,456,271
(50.77 %)
1,060,267
(19.55 %)
15,870,225
(47.77 %)
0
(0 %)
1,391,066
(2.32 %)
69,745
(1.19 %)
30,644
(0.70 %)
644 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3
51,681
(3.25 %)
n/a 15,203
(1.04 %)
22,272
(1.67 %)
46,230
(2.32 %)
44.19
(91.88 %)
183,751
(8.14 %)
183,744
(8.14 %)
262,326
(91.86 %)
2,767,141
(30.92 %)
316,971
(0.98 %)
11,856,824
(28.95 %)
6,315
(0.16 %)
313,471
(1.46 %)
104,231
(1.84 %)
32,424
(0.69 %)
645 western painted turtle (v304 RCT428 2020)
GCF_000241765.4
64,798
(3.75 %)
n/a 15,669
(1.09 %)
21,663
(1.64 %)
n/a 44.19
(87.54 %)
184,311
(12.48 %)
184,311
(12.48 %)
260,698
(87.52 %)
3,780,252
(41.81 %)
316,422
(0.93 %)
11,852,305
(27.59 %)
6,323
(0.15 %)
313,495
(1.39 %)
103,899
(1.75 %)
33,034
(0.70 %)
646 western predatory mite (v1.0 2012)
GCF_000255335.1
12,199
(13.86 %)
n/a 2,842
(1.49 %)
27,198
(19.18 %)
n/a 51.58
(99.74 %)
1,782
(0.26 %)
1,901
(0.26 %)
3,993
(99.74 %)
33,136
(1.10 %)
13,115
(0.57 %)
612,854
(9.73 %)
4
(0.00 %)
11,929
(0.89 %)
2,003
(54.71 %)
1,569
(0.97 %)
647 western wild mouse (SPRET_EiJ v1 2016)
GCA_001624865.1
n/a n/a 21,211
(2.19 %)
17,797
(1.36 %)
100,839
(4.01 %)
41.65
(89.10 %)
23,451
(1.23 %)
334,091
(10.95 %)
29,259
(98.77 %)
5,087,807
(40.60 %)
1,402,357
(3.14 %)
13,522,663
(27.99 %)
17,567
(1.08 %)
457,523
(2.25 %)
16,888
(0.42 %)
15,748
(0.39 %)
648 wheat stem sawfly (v1 2014)
GCF_000341935.1
37,175
(25.01 %)
n/a 4,407
(2.81 %)
15,504
(11.96 %)
n/a 40.34
(98.12 %)
8,731
(1.89 %)
8,733
(1.89 %)
10,707
(98.11 %)
87,084
(2.38 %)
44,673
(2.55 %)
1,001,343
(22.18 %)
41
(0.03 %)
19,750
(1.66 %)
7,519
(2.78 %)
7,623
(2.13 %)
649 white leghorn X broiler chicken (v1 leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1
55,865
(8.86 %)
n/a 12,310
(2.41 %)
22,056
(2.57 %)
n/a 42.20
(99.65 %)
254
(0.35 %)
254
(0.35 %)
509
(99.65 %)
604,452
(10.76 %)
232,416
(2.03 %)
5,541,059
(20.23 %)
2
(0.00 %)
203,559
(1.88 %)
22,185
(2.62 %)
19,239
(1.58 %)
650 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1
59,982
(41.87 %)
n/a 18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
0
(0 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
2
(0.00 %)
1,117,804
(3.60 %)
68,551
(3.58 %)
41,698
(1.09 %)
651 white-footed mouse
GCF_004664715.1
46,167
(2.56 %)
n/a 20,406
(1.72 %)
20,857
(1.46 %)
39,081
(1.88 %)
42.23
(100.00 %)
0
(0 %)
79
(0.00 %)
1,763
(100.00 %)
5,064,597
(30.73 %)
1,258,088
(2.85 %)
14,005,845
(33.01 %)
0
(0 %)
551,791
(1.47 %)
23,475
(0.69 %)
19,781
(0.50 %)
652 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1
57,774
(39.81 %)
n/a 20,653
(1.75 %)
23,083
(1.50 %)
40,950
(1.94 %)
41.55
(99.10 %)
31,627
(0.90 %)
107,030
(0.91 %)
48,652
(99.10 %)
4,799,958
(41.28 %)
413,128
(2.59 %)
13,296,686
(34.22 %)
7,681
(0.08 %)
439,019
(2.88 %)
44,165
(1.19 %)
41,200
(1.10 %)
653 white-tailed eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_947461875.1
n/a n/a 13,735
(1.76 %)
28,993
(2.53 %)
n/a 43.15
(99.99 %)
0
(0 %)
424
(0.01 %)
188
(100.00 %)
585,276
(12.89 %)
291,289
(6.10 %)
6,474,027
(23.66 %)
0
(0 %)
312,204
(2.16 %)
54,851
(4.05 %)
31,757
(1.50 %)
654 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1
58,109
(2.92 %)
n/a 21,699
(1.91 %)
20,910
(1.24 %)
n/a 40.85
(94.45 %)
187,214
(5.57 %)
187,214
(5.57 %)
201,523
(94.43 %)
5,120,629
(48.95 %)
768,432
(2.30 %)
15,303,718
(34.75 %)
1,516
(0.02 %)
933,431
(2.31 %)
35,805
(0.79 %)
27,299
(0.64 %)
655 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1
n/a n/a 21,754
(1.86 %)
21,668
(1.22 %)
n/a 40.77
(99.67 %)
48,495
(0.33 %)
48,495
(0.33 %)
88,439
(99.67 %)
5,195,965
(48.83 %)
825,714
(3.60 %)
15,372,168
(38.05 %)
5,083
(0.10 %)
1,223,766
(2.72 %)
34,994
(0.85 %)
26,156
(0.69 %)
656 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1
n/a n/a 21,729
(1.89 %)
21,502
(1.30 %)
n/a 40.85
(98.70 %)
370
(1.30 %)
370
(1.30 %)
1,360
(98.70 %)
5,122,418
(49.40 %)
818,502
(3.68 %)
15,232,829
(38.20 %)
0
(0 %)
1,395,363
(2.77 %)
36,656
(0.90 %)
26,567
(0.71 %)
657 white-tufted-ear marmoset (v1 paternal hap 2020)
GCA_011100535.1
n/a n/a 20,939
(1.94 %)
20,416
(1.31 %)
n/a 41.04
(99.58 %)
0
(0 %)
788
(0.42 %)
336
(100.00 %)
4,869,007
(49.39 %)
746,577
(2.68 %)
14,347,286
(37.59 %)
0
(0 %)
1,026,338
(2.34 %)
35,222
(0.94 %)
25,795
(0.75 %)
658 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank)
GCA_011100555.2
n/a n/a 21,801
(1.88 %)
21,501
(1.28 %)
n/a 40.92
(99.52 %)
0
(0 %)
1,165
(0.48 %)
1,234
(100.00 %)
5,036,594
(47.71 %)
842,846
(3.25 %)
15,161,577
(38.08 %)
2
(0.00 %)
1,256,016
(2.62 %)
37,603
(0.93 %)
34,471
(0.83 %)
659 whooping crane (maternal hap 2023 genbank)
GCA_028858705.1
55,408
(53.40 %)
n/a 13,572
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
0
(0 %)
262
(0.37 %)
929
(100.00 %)
616,295
(10.57 %)
211,557
(2.90 %)
6,785,134
(22.11 %)
0
(0 %)
n/a 42,795
(4.66 %)
39,036
(2.34 %)
660 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2
n/a 20,251
(1.34 %)
18,785
(1.94 %)
17,252
(1.62 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
55,538
(1.18 %)
60,971
(1.18 %)
68,871
(98.82 %)
3,098,525
(34.75 %)
353,630
(1.23 %)
12,349,553
(25.12 %)
11
(0.00 %)
101,843
(0.63 %)
45,436
(1.02 %)
40,638
(0.87 %)
661 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019)
GCF_002162155.1
131,302
(1.34 %)
n/a 33,079
(0.33 %)
567,762
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
0
(0 %)
344,768
(3.31 %)
148,396
(100.00 %)
2,762,705
(2.81 %)
2,991,142
(3.37 %)
493,164
(96.69 %)
210
(0.02 %)
12,513,149
(13.71 %)
2,220,897
(25.33 %)
2,138,478
(24.00 %)
662 wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017)
GCF_000817695.2
69,091
(6.81 %)
n/a 16,823
(1.67 %)
75,740
(11.45 %)
n/a 35.81
(86.74 %)
1,682
(1.55 %)
133,967
(13.30 %)
3,189
(98.45 %)
588,761
(3.39 %)
493,855
(3.35 %)
5,206,772
(45.36 %)
66
(0.02 %)
710,693
(6.46 %)
48,008
(1.88 %)
21,883
(0.84 %)
663 wild strawberry (2011 genbank)
GCA_000184155.1
n/a n/a 14,001
(6.64 %)
34,562
(26.90 %)
n/a 38.40
(94.26 %)
13,412
(5.76 %)
16,253
(5.76 %)
16,459
(94.24 %)
152,427
(20.00 %)
74,539
(2.79 %)
1,032,592
(21.43 %)
25
(0.01 %)
71,241
(3.11 %)
14,802
(3.20 %)
9,026
(1.93 %)
664 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1
50,529
(5.75 %)
n/a 12,950
(1.89 %)
19,252
(2.57 %)
24,522
(2.44 %)
42.30
(100.00 %)
0
(0 %)
102
(0.00 %)
3,744
(100.00 %)
500,823
(7.17 %)
300,638
(2.31 %)
6,414,267
(20.54 %)
0
(0 %)
235,724
(1.54 %)
28,268
(2.21 %)
22,544
(1.15 %)
665 woodchuck (CNAG 2019)
GCA_901343595.1
n/a 424,165
(27.27 %)
20,813
(1.60 %)
23,199
(1.43 %)
45,153
(1.99 %)
40.00
(97.18 %)
57,045
(2.82 %)
57,045
(2.82 %)
105,556
(97.18 %)
4,756,333
(33.73 %)
836,503
(2.41 %)
14,755,960
(31.13 %)
505
(0.04 %)
358,587
(3.15 %)
34,151
(0.87 %)
32,950
(0.82 %)
666 woodchuck (v1.0 LI92 2021)
GCF_021218885.1
62,044
(2.80 %)
n/a 19,783
(1.48 %)
21,060
(1.38 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
46
(0.00 %)
46
(0.00 %)
3,381
(100.00 %)
3,884,968
(28.12 %)
912,591
(2.73 %)
14,538,767
(35.15 %)
0
(0 %)
413,043
(1.33 %)
36,919
(1.02 %)
26,677
(0.60 %)
667 worm pipefish (v1 RoL_2023-P1 2023)
GCF_033978685.1
73,681
(3.43 %)
n/a 25,892
(1.02 %)
114,154
(3.30 %)
n/a 39.45
(100.00 %)
0
(0 %)
146
(0.00 %)
630
(100.00 %)
4,795,312
(24.37 %)
2,093,730
(16.74 %)
13,132,465
(67.32 %)
0
(0 %)
5,394,148
(11.91 %)
248,526
(4.59 %)
79,895
(1.28 %)
668 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 genbank)
GCA_029207755.1
n/a n/a 13,052
(1.78 %)
24,950
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
353
(0.00 %)
353
(0.00 %)
1,695
(100.00 %)
444,866
(3.08 %)
473,471
(7.97 %)
5,336,498
(25.82 %)
4
(0.00 %)
847,256
(5.29 %)
37,210
(3.14 %)
26,585
(1.31 %)
669 Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq)
GCF_003031525.1
43,312
(2.49 %)
n/a 18,639
(1.72 %)
19,645
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
52,647
(0.72 %)
66,346
(99.28 %)
n/a 540,765
(1.65 %)
12,691,760
(32.87 %)
427
(0.03 %)
363,613
(1.97 %)
59,052
(1.48 %)
39,130
(1.07 %)
670 Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank)
GCA_003031525.1
43,299
(41.33 %)
n/a 18,726
(1.80 %)
19,644
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
52,647
(0.72 %)
66,345
(99.28 %)
3,990,044
(42.54 %)
540,765
(1.65 %)
12,691,683
(32.88 %)
427
(0.03 %)
363,612
(1.97 %)
59,052
(1.48 %)
42,519
(1.18 %)
671 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1
27,063
(35.76 %)
n/a 19,219
(1.73 %)
27,456
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
124,797
(1.33 %)
155,509
(98.67 %)
4,277,556
(44.10 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,034
(35.19 %)
292
(0.02 %)
514,863
(2.00 %)
67,035
(1.82 %)
48,666
(1.49 %)
672 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1
27,076
(1.65 %)
n/a 19,227
(1.75 %)
27,468
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
124,797
(1.33 %)
155,510
(98.67 %)
4,193,317
(43.38 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,097
(35.19 %)
292
(0.02 %)
514,863
(2.00 %)
67,035
(1.82 %)
49,158
(1.49 %)
673 yellow fever mosquito (LVP_AGWG 2017 genbank)
GCA_002204515.1
n/a 38
(0.00 %)
8,814
(0.51 %)
152,909
(17.36 %)
n/a 38.16
(100.00 %)
0
(0 %)
229
(0.00 %)
6,534
(100.00 %)
2,912,289
(46.74 %)
533,475
(4.34 %)
10,210,670
(53.65 %)
0
(0 %)
641,478
(3.84 %)
132,732
(6.12 %)
69,844
(2.30 %)
674 yellow-bellied marmot (hap1 2025 genbank)
GCA_047511675.1
n/a n/a 19,503
(1.44 %)
20,301
(1.35 %)
n/a 39.90
(100.00 %)
0
(0 %)
330
(0.00 %)
814
(100.00 %)
4,038,897
(29.07 %)
978,915
(3.28 %)
14,404,740
(34.97 %)
4
(0.00 %)
446,138
(1.44 %)
36,674
(1.05 %)
27,659
(0.61 %)
675 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019)
GCF_003676075.2
42,715
(2.16 %)
n/a 19,894
(1.62 %)
21,366
(1.40 %)
43,878
(1.99 %)
39.89
(97.96 %)
34,765
(2.04 %)
35,595
(2.04 %)
66,624
(97.96 %)
4,646,957
(34.05 %)
800,897
(1.96 %)
14,340,028
(32.63 %)
1,270
(0.04 %)
210,697
(0.69 %)
34,125
(0.91 %)
32,958
(0.85 %)
676 yellow-bellied marmot (v1 2018)
GCF_003676075.1
41,573
(2.14 %)
n/a 19,845
(1.63 %)
21,262
(1.39 %)
n/a 39.88
(97.82 %)
38,354
(2.18 %)
38,354
(2.18 %)
69,503
(97.82 %)
4,683,625
(34.38 %)
799,659
(1.95 %)
14,322,765
(32.58 %)
2,342
(0.05 %)
209,445
(0.69 %)
34,127
(0.91 %)
32,957
(0.85 %)
677 yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCA_016432865.1
n/a n/a 15,703
(0.78 %)
16,184
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
0
(0 %)
620
(0.01 %)
487
(100.00 %)
5,424,579
(25.40 %)
1,269,774
(2.59 %)
21,430,550
(42.69 %)
2
(0.00 %)
714,621
(2.20 %)
28,121
(0.66 %)
28,159
(0.56 %)
678 yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI)
GCF_000699245.1
15,990
(2.25 %)
n/a 11,775
(1.55 %)
23,935
(1.90 %)
n/a 41.36
(99.67 %)
48,553
(0.34 %)
48,553
(0.34 %)
107,160
(99.66 %)
384,032
(4.45 %)
182,309
(1.03 %)
6,529,534
(19.24 %)
1
(0.00 %)
41,594
(0.34 %)
15,660
(0.55 %)
12,721
(0.42 %)
679 yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.1
41,181
(9.96 %)
n/a 15,861
(2.76 %)
30,671
(6.00 %)
n/a 40.75
(97.79 %)
0
(0 %)
33,664
(2.20 %)
99,598
(100.00 %)
614,513
(4.16 %)
522,349
(4.83 %)
4,650,538
(24.98 %)
309
(0.03 %)
357,703
(3.09 %)
18,054
(0.96 %)
12,855
(0.67 %)
680 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 genbank)
GCA_028538775.1
n/a n/a 18,587
(1.82 %)
21,049
(1.76 %)
n/a 43.22
(100.00 %)
209
(0.00 %)
209
(0.00 %)
685
(100.00 %)
2,890,086
(24.28 %)
719,555
(4.26 %)
10,089,514
(36.35 %)
0
(0 %)
649,001
(2.37 %)
60,975
(2.61 %)
51,711
(1.75 %)
681 zebra finch (v1 Black17 2019 refseq)
GCF_003957565.1
51,472
(7.16 %)
n/a 13,211
(2.02 %)
17,812
(2.70 %)
38,655
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
0
(0 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
1
(0.00 %)
381,676
(2.04 %)
30,053
(2.58 %)
22,898
(1.24 %)
682 zebra finch (v1 Black17 male 2019 genbank)
GCA_003957565.2
n/a n/a 13,212
(2.02 %)
25,117
(2.57 %)
38,655
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
0
(0 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
1
(0.00 %)
381,676
(2.04 %)
30,053
(2.58 %)
22,898
(1.24 %)
683 zebra finch (v1.4 Blue55 primary hap 2021 genbank)
GCA_003957565.4
n/a n/a 12,755
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
0
(0 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
389,146
(3.10 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,599
(20.92 %)
3
(0.00 %)
312,137
(1.80 %)
29,203
(2.49 %)
22,084
(1.22 %)
684 zebra shark (hap1 2023 genbank)
GCA_030684315.1
n/a n/a 12,291
(0.48 %)
16,769
(1.14 %)
n/a 43.41
(99.47 %)
0
(0 %)
1,159
(0.53 %)
835
(100.00 %)
8,087,543
(64.92 %)
798,373
(9.17 %)
14,838,773
(42.39 %)
4
(0.00 %)
2,946,268
(5.37 %)
45,284
(1.67 %)
14,105
(0.37 %)
685 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2
n/a n/a 18,599
(1.58 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
253,738
(7.41 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,769
(92.59 %)
5,118,783
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,620
(36.60 %)
476
(0.01 %)
998,817
(3.00 %)
35,241
(0.84 %)
32,220
(0.75 %)
686 zig-zag eel (v1.1 2018)
GCF_900324485.1
44,813
(12.05 %)
n/a 15,028
(3.35 %)
21,782
(6.89 %)
36,982
(11.22 %)
40.66
(97.63 %)
0
(0 %)
235
(2.37 %)
126
(100.00 %)
348,517
(2.87 %)
157,776
(2.00 %)
3,182,742
(23.42 %)
0
(0 %)
175,932
(3.08 %)
12,824
(1.08 %)
8,713
(0.67 %)
TOTALS:total assembly count 687 (686 build completed, 99.85 % finished)

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 602 assemblies assembly stats track stats
Mammals 692 assemblies assembly stats track stats
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Invertebrates 1379 assemblies assembly stats track stats
Plants 345 assemblies assembly stats track stats
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Viruses 14945 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2622 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 21462 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 687 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 1965 assemblies assembly stats track stats