Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

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count	common name link to genome browser	ncbiRefSeq	ncbiGene	xenoRefGene	augustus genes	Ensembl genes	gc5 base	AGP gap	all gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	gap Overlap	tandem Dups	cpg unmasked	cpg island
1	aardvark (BS58 2019 Broad) GCA_004365145.1	n/a	n/a	22,095 (0.63 %)	44,942 (0.68 %)	n/a	40.25 (99.86 %)	15,429 (0.03 %)	15,429 (0.03 %)	2,690,873 (99.97 %)	8,755,250 (34.47 %)	869,360 (1.26 %)	22,002,517 (59.65 %)	146 (0.00 %)	n/a	39,239 (0.49 %)	27,849 (0.37 %)
2	Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank) GCA_027172205.1	57,514 (54.61 %)	n/a	14,340 (1.37 %)	20,053 (2.31 %)	n/a	43.81 (100.00 %)	0 (0 %)	30 (0.00 %)	27 (100.00 %)	832,937 (4.17 %)	474,203 (4.04 %)	7,020,288 (38.29 %)	2 (0.00 %)	631,733 (3.50 %)	94,745 (2.70 %)	19,879 (0.76 %)
3	African clawed frog (2016) GCF_001663975.1	61,172 (3.82 %)	n/a	23,424 (1.78 %)	27,990 (2.23 %)	n/a	38.98 (88.63 %)	216,028 (11.39 %)	216,028 (11.39 %)	324,061 (88.61 %)	1,726,079 (12.81 %)	680,428 (2.28 %)	13,887,586 (35.94 %)	2,660 (0.08 %)	n/a	85,680 (0.94 %)	12,234 (0.16 %)
4	African grass rat (v1 paternal X 2020 genbank) GCA_011762505.1	45,963 (36.56 %)	n/a	20,933 (2.00 %)	19,613 (1.43 %)	37,929 (2.32 %)	41.39 (99.19 %)	0 (0 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	4,940,083 (37.33 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,540 (32.71 %)	2 (0.00 %)	1,027,357 (2.09 %)	17,767 (0.51 %)	16,848 (0.46 %)
5	African malaria mosquito (PEST 2006) GCA_000005575.1	n/a	14,608 (8.95 %)	5,478 (2.34 %)	30,482 (13.88 %)	n/a	44.27 (95.26 %)	55 (0.21 %)	8,735 (4.75 %)	8,115 (99.79 %)	241,805 (14.48 %)	72,702 (2.39 %)	1,434,880 (21.28 %)	6 (0.01 %)	77,560 (3.59 %)	25,507 (8.25 %)	24,151 (5.88 %)
6	African savanna elephant (2009 genbank) GCA_000001905.1	46,043 (34.84 %)	n/a	19,181 (1.25 %)	19,665 (1.10 %)	n/a	40.76 (97.57 %)	93,514 (2.45 %)	93,514 (2.45 %)	95,866 (97.55 %)	6,337,637 (57.82 %)	365,796 (0.88 %)	16,073,052 (44.89 %)	11 (0.00 %)	417,291 (1.06 %)	33,513 (0.68 %)	24,486 (0.51 %)
7	alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018) GCF_003710045.1	27,736 (10.71 %)	n/a	4,020 (1.34 %)	42,185 (10.12 %)	n/a	40.41 (94.37 %)	0 (0 %)	14,031 (5.59 %)	95,883 (100.00 %)	112,828 (2.21 %)	95,886 (3.63 %)	2,006,114 (27.47 %)	1 (0.00 %)	49,074 (1.16 %)	23,832 (3.81 %)	20,331 (3.23 %)
8	alpaca (2015 BGI) GCA_000767525.1	n/a	n/a	18,513 (1.97 %)	19,112 (1.70 %)	31,905 (1.94 %)	41.46 (99.38 %)	23,458 (0.62 %)	23,458 (0.62 %)	75,733 (99.38 %)	3,095,742 (36.41 %)	314,508 (1.07 %)	12,365,152 (25.46 %)	83 (0.00 %)	120,145 (0.60 %)	53,956 (1.50 %)	49,211 (1.30 %)
9	alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U) GCF_000164845.3	55,014 (3.56 %)	n/a	18,437 (1.94 %)	18,446 (1.63 %)	n/a	41.40 (95.85 %)	0 (0 %)	166,280 (4.17 %)	77,390 (100.00 %)	3,150,224 (36.21 %)	315,108 (1.36 %)	12,461,739 (24.88 %)	1,213 (0.03 %)	207,655 (1.22 %)	54,502 (1.38 %)	49,324 (1.18 %)
10	Alpine marmot (2015) GCF_001458135.1	35,350 (2.23 %)	n/a	20,139 (1.58 %)	18,286 (1.41 %)	n/a	39.80 (96.07 %)	0 (0 %)	89,362 (3.94 %)	14,543 (100.00 %)	n/a	747,129 (1.83 %)	14,077,162 (30.27 %)	494 (0.01 %)	202,989 (0.77 %)	30,224 (0.63 %)	24,261 (0.48 %)
11	American alligator (2023 genbank) GCA_030867065.1	n/a	n/a	14,487 (0.97 %)	20,444 (1.61 %)	n/a	45.04 (99.81 %)	136 (0.19 %)	136 (0.19 %)	806 (99.81 %)	3,380,365 (43.12 %)	560,127 (2.00 %)	12,524,244 (32.47 %)	1 (0.00 %)	370,300 (1.41 %)	50,852 (2.67 %)	30,117 (1.71 %)
12	American alligator (chrom assembly 2023 genbank) GCA_030867095.1	60,799 (51.66 %)	n/a	14,382 (0.98 %)	18,601 (1.45 %)	n/a	45.01 (99.30 %)	0 (0 %)	161 (0.70 %)	194 (100.00 %)	3,322,619 (43.19 %)	478,206 (1.77 %)	12,316,391 (32.01 %)	0 (0 %)	334,854 (1.31 %)	49,792 (2.45 %)	29,504 (1.51 %)
13	American beaver (US014 2019 Broad) GCA_004027675.1	n/a	n/a	22,515 (1.25 %)	34,527 (1.17 %)	n/a	39.58 (99.92 %)	5,769 (0.02 %)	5,769 (0.02 %)	837,916 (99.98 %)	5,101,904 (34.46 %)	552,100 (1.02 %)	15,150,706 (34.57 %)	36 (0.00 %)	n/a	24,558 (0.63 %)	21,525 (0.51 %)
14	American bison (2014 genbank) GCA_000754665.1	38,686 (33.79 %)	n/a	20,215 (1.44 %)	20,845 (1.20 %)	n/a	41.99 (93.39 %)	341,984 (6.63 %)	341,984 (6.63 %)	792,165 (93.37 %)	6,006,931 (47.67 %)	495,106 (1.11 %)	13,902,115 (39.01 %)	8,184 (0.08 %)	978,698 (2.61 %)	90,767 (1.29 %)	43,651 (0.72 %)
15	American pika 3.0 (2012 Broad genbank) GCA_000292845.1	26,240 (36.96 %)	n/a	17,569 (1.60 %)	20,092 (1.69 %)	n/a	43.35 (87.20 %)	122,542 (12.82 %)	122,542 (12.82 %)	132,961 (87.18 %)	2,829,934 (29.80 %)	414,895 (1.07 %)	10,968,663 (26.71 %)	1,958 (0.04 %)	269,478 (1.11 %)	44,651 (1.14 %)	26,757 (0.80 %)
16	amphioxus (hap2 2024 genbank) GCA_035083965.1	n/a	n/a	5,217 (0.97 %)	41,736 (12.73 %)	n/a	41.61 (100.00 %)	0 (0 %)	103 (0.00 %)	34 (100.00 %)	128,505 (1.65 %)	182,123 (8.03 %)	2,157,899 (27.45 %)	0 (0 %)	274,077 (4.65 %)	44,261 (5.21 %)	29,041 (2.94 %)
17	amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016) GCF_000764305.1	24,008 (8.48 %)	n/a	3,331 (0.47 %)	38,201 (8.97 %)	24,453 (8.50 %)	38.47 (99.52 %)	5,426 (0.48 %)	23,726 (0.48 %)	23,426 (99.52 %)	161,274 (1.72 %)	432,436 (8.89 %)	3,517,080 (28.92 %)	149 (0.01 %)	409,772 (5.41 %)	50,987 (4.44 %)	35,313 (2.58 %)
18	Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank) GCA_000464555.1	33,668 (37.51 %)	n/a	18,213 (1.58 %)	15,093 (1.29 %)	n/a	41.40 (97.59 %)	155,553 (2.44 %)	155,553 (2.44 %)	157,031 (97.56 %)	4,832,679 (42.49 %)	831,134 (1.67 %)	13,654,373 (31.78 %)	59 (0.00 %)	289,887 (0.97 %)	65,229 (1.60 %)	55,104 (1.18 %)
19	Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank) GCA_003957555.2	n/a	n/a	12,258 (1.95 %)	20,580 (2.26 %)	n/a	41.49 (98.48 %)	0 (0 %)	429 (1.52 %)	160 (100.00 %)	535,315 (7.95 %)	262,056 (1.51 %)	6,092,351 (20.84 %)	0 (0 %)	152,105 (1.27 %)	17,130 (1.48 %)	15,125 (1.04 %)
20	ant C.costatus (v1 MS0001 2016) GCF_001594065.1	16,082 (8.44 %)	n/a	4,038 (1.42 %)	32,856 (9.80 %)	n/a	34.73 (95.75 %)	10,626 (4.26 %)	10,626 (4.26 %)	26,005 (95.74 %)	203,498 (3.41 %)	100,483 (2.15 %)	2,221,362 (35.19 %)	127 (0.11 %)	43,690 (1.77 %)	18,108 (3.49 %)	18,662 (3.08 %)
21	ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019) GCF_005281655.1	28,261 (10.34 %)	n/a	4,915 (1.27 %)	40,257 (10.17 %)	n/a	35.18 (99.51 %)	0 (0 %)	1,076 (0.49 %)	2,869 (100.00 %)	322,753 (4.92 %)	245,412 (6.65 %)	1,952,946 (43.11 %)	0 (0 %)	252,395 (6.75 %)	17,048 (6.08 %)	17,349 (3.45 %)
22	ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI) GCF_001594075.1	22,023 (8.25 %)	n/a	4,211 (1.25 %)	37,113 (9.30 %)	n/a	35.01 (91.82 %)	40,822 (8.21 %)	40,822 (8.21 %)	60,583 (91.79 %)	218,162 (3.24 %)	139,385 (2.26 %)	2,347,922 (34.62 %)	136 (0.08 %)	54,250 (1.47 %)	23,814 (3.66 %)	21,810 (2.96 %)
23	apicomplexans C.sp. chipmunk genotype I (37763 2021 genbank) GCA_004936735.2	n/a	3,783 (76.65 %)	426 (3.03 %)	203 (12.39 %)	n/a	32.03 (100.00 %)	0 (0 %)	10 (0.00 %)	50 (100.00 %)	3,358 (1.88 %)	1,257 (0.81 %)	67,711 (20.74 %)	1 (0.00 %)	458 (0.29 %)	4 (0.02 %)	3 (0.01 %)
24	apicomplexans E.tenella (Houghton 2013) GCA_000499545.1	n/a	38,608 (25.51 %)	326 (0.37 %)	1,632 (4.94 %)	n/a	51.33 (98.72 %)	8,063 (1.32 %)	8,063 (1.32 %)	12,727 (98.68 %)	127,265 (17.42 %)	148,397 (16.77 %)	326,694 (37.33 %)	20 (0.03 %)	37,723 (6.57 %)	12,417 (22.22 %)	4,790 (5.71 %)
25	apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank) GCA_002114115.1	n/a	n/a	22,542 (3.52 %)	67,060 (16.20 %)	n/a	38.04 (88.95 %)	0 (0 %)	7,175 (11.05 %)	806 (100.00 %)	692,611 (50.80 %)	322,540 (4.42 %)	3,033,193 (35.58 %)	2 (0.00 %)	451,430 (6.86 %)	25,871 (1.75 %)	13,877 (0.88 %)
26	Arabian camel (2014 genbank) GCA_000767585.1	n/a	n/a	18,452 (1.96 %)	16,975 (1.61 %)	n/a	41.29 (98.88 %)	72,775 (1.13 %)	72,775 (1.13 %)	105,347 (98.87 %)	3,079,920 (34.79 %)	319,928 (0.96 %)	12,281,845 (25.28 %)	43 (0.00 %)	88,463 (0.39 %)	48,638 (1.17 %)	44,009 (1.01 %)
27	Arctic fox (US066 2019 Broad) GCA_004023825.1	n/a	n/a	22,910 (1.42 %)	31,985 (1.20 %)	35,342 (1.47 %)	41.93 (99.87 %)	9,604 (0.04 %)	9,604 (0.04 %)	1,272,949 (99.96 %)	6,096,013 (44.89 %)	1,265,350 (2.67 %)	14,617,986 (39.29 %)	19 (0.00 %)	594,304 (1.21 %)	64,716 (1.93 %)	61,195 (1.72 %)
28	ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006) GCF_000149645.2	10,390 (48.16 %)	n/a	1,538 (3.76 %)	6,155 (25.19 %)	n/a	49.56 (99.97 %)	90 (0.03 %)	90 (0.03 %)	466 (99.97 %)	5,026 (0.77 %)	2,256 (0.38 %)	68,790 (5.94 %)	0 (0 %)	710 (0.23 %)	2,846 (42.44 %)	3,973 (22.95 %)
29	ascomycetes A.nidulans (FGSC A4 2012 genbank) GCA_000149205.2	n/a	35,369 (50.73 %)	1,524 (3.90 %)	5,275 (23.90 %)	n/a	50.30 (99.43 %)	158 (0.58 %)	158 (0.58 %)	249 (99.42 %)	5,218 (3.22 %)	2,452 (0.41 %)	51,693 (4.64 %)	1 (0.00 %)	625 (0.60 %)	1,128 (90.37 %)	1,810 (9.92 %)
30	ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007) GCF_000002855.3	10,608 (51.05 %)	n/a	1,481 (3.36 %)	5,692 (22.11 %)	n/a	50.35 (99.87 %)	449 (0.13 %)	662 (0.13 %)	469 (99.87 %)	9,986 (1.32 %)	2,619 (0.36 %)	106,480 (7.71 %)	1 (0.00 %)	262 (0.07 %)	5,568 (53.86 %)	6,938 (24.44 %)
31	ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019) GCF_004011695.1	11,257 (41.02 %)	n/a	1,596 (2.91 %)	8,283 (26.43 %)	n/a	49.20 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	34 (100.00 %)	14,775 (2.01 %)	16,031 (2.34 %)	103,256 (17.19 %)	0 (0 %)	7,380 (1.61 %)	805 (44.28 %)	832 (32.41 %)
32	ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank) GCA_000003525.2	n/a	11,865 (30.24 %)	1,516 (1.76 %)	5,714 (11.07 %)	n/a	37.07 (99.50 %)	566 (0.51 %)	566 (0.51 %)	593 (99.49 %)	38,696 (2.74 %)	27,571 (2.05 %)	270,617 (48.64 %)	2 (0.00 %)	31,958 (3.92 %)	8,002 (10.69 %)	7,438 (8.47 %)
33	ascomycetes B.gilchristii (SLH14081 2009 genbank) GCA_000003855.2	n/a	11,799 (26.55 %)	1,518 (1.57 %)	5,702 (9.73 %)	n/a	35.75 (98.67 %)	1,691 (1.34 %)	1,691 (1.34 %)	1,794 (98.66 %)	42,930 (2.67 %)	27,826 (1.78 %)	328,698 (50.87 %)	0 (0 %)	32,248 (3.50 %)	7,943 (9.35 %)	7,488 (7.50 %)
34	ascomycetes C.posadasii (C735 delta SOWgp 2009 genban) GCA_000151335.1	n/a	7,255 (49.92 %)	1,479 (4.26 %)	5,283 (25.22 %)	n/a	46.59 (100.00 %)	33 (0.00 %)	33 (0.00 %)	88 (100.00 %)	10,463 (5.97 %)	5,206 (0.91 %)	74,027 (11.89 %)	0 (0 %)	3,254 (0.84 %)	4,784 (34.49 %)	4,865 (16.04 %)
35	ascomycetes F.oxysporum (NRRL 32931 2014 genbank) GCA_000271745.2	n/a	24,097 (64.91 %)	1,503 (2.37 %)	11,741 (30.20 %)	n/a	47.63 (98.55 %)	377 (1.46 %)	377 (1.46 %)	545 (98.54 %)	8,453 (2.23 %)	3,560 (0.37 %)	129,150 (7.65 %)	11 (0.00 %)	1,096 (0.18 %)	14,398 (29.11 %)	11,860 (16.53 %)
36	ascomycetes P.destructans (20631-21 2010 genbank) GCA_000184105.1	n/a	9,303 (55.05 %)	1,446 (3.95 %)	5,635 (25.84 %)	n/a	50.12 (92.42 %)	1,732 (7.59 %)	2,066 (7.59 %)	3,579 (92.41 %)	11,499 (5.71 %)	11,754 (2.10 %)	87,648 (13.51 %)	22 (0.03 %)	2,836 (0.73 %)	4,483 (54.70 %)	4,759 (18.94 %)
37	ascomycetes P.digitatum (Pd1 2012 genbank) GCA_000315645.2	n/a	8,963 (49.28 %)	1,461 (4.51 %)	5,599 (29.85 %)	n/a	48.91 (95.53 %)	508 (4.48 %)	516 (4.48 %)	562 (95.52 %)	3,575 (0.59 %)	2,210 (0.38 %)	66,810 (6.03 %)	8 (0.02 %)	344 (0.13 %)	7,344 (38.10 %)	6,767 (25.05 %)
38	ascomycetes P.pennisetigena (Br36 2019 genbank) GCA_004337985.1	n/a	11,430 (33.47 %)	1,482 (2.32 %)	7,302 (20.85 %)	n/a	47.48 (99.41 %)	0 (0 %)	1,281 (0.60 %)	108 (100.00 %)	24,268 (1.88 %)	11,049 (1.23 %)	163,225 (20.20 %)	5 (0.01 %)	7,142 (1.57 %)	764 (17.56 %)	1,559 (15.28 %)
39	ascomycetes P.rubens (Wisconsin 54-1255 2008 genbank) GCA_000226395.1	n/a	13,922 (56.71 %)	1,550 (3.72 %)	7,756 (30.06 %)	n/a	48.96 (99.94 %)	0 (0 %)	775 (0.06 %)	49 (100.00 %)	5,678 (0.78 %)	4,560 (0.81 %)	73,645 (5.86 %)	1 (0.01 %)	1,650 (0.43 %)	7,807 (50.55 %)	7,905 (32.71 %)
40	ascomycetes R.enersibuu (CBS 393.64 2015 genbank) GCA_000968595.1	n/a	9,843 (50.65 %)	1,499 (4.04 %)	3,608 (17.47 %)	n/a	50.55 (99.99 %)	76 (0.00 %)	76 (0.00 %)	938 (100.00 %)	12,877 (1.80 %)	4,459 (0.56 %)	116,737 (10.53 %)	0 (0 %)	117 (0.03 %)	2,561 (81.62 %)	2,992 (17.71 %)
41	ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012) GCF_000182805.2	9,903 (39.44 %)	n/a	1,311 (2.58 %)	4,612 (17.66 %)	n/a	52.11 (99.64 %)	0 (0 %)	978 (0.36 %)	1,583 (100.00 %)	16,540 (1.85 %)	7,316 (0.76 %)	171,684 (11.10 %)	0 (0 %)	371 (0.08 %)	1,770 (49.40 %)	6,766 (16.80 %)
42	ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank) GCA_000961545.1	10,279 (51.22 %)	10,434 (48.46 %)	1,134 (2.55 %)	2,026 (10.60 %)	n/a	54.96 (100.00 %)	57 (0.00 %)	57 (0.00 %)	73 (100.00 %)	15,846 (2.28 %)	8,000 (0.94 %)	169,678 (13.75 %)	0 (0 %)	339 (0.06 %)	22 (99.61 %)	22 (0.11 %)
43	ascomycetes T.marneffei (ATCC 18224 2008 genbank) GCA_000001985.1	n/a	10,749 (60.97 %)	1,532 (4.18 %)	7,679 (34.14 %)	n/a	46.67 (99.38 %)	137 (0.62 %)	137 (0.62 %)	589 (99.38 %)	6,404 (1.04 %)	2,594 (0.58 %)	61,594 (6.70 %)	0 (0 %)	951 (0.36 %)	5,746 (15.84 %)	5,169 (10.66 %)
44	ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank) GCA_000219625.1	10,941 (44.32 %)	10,965 (38.50 %)	1,451 (2.81 %)	6,906 (25.36 %)	n/a	52.14 (99.98 %)	3 (0.02 %)	3 (0.02 %)	24 (99.98 %)	8,941 (1.69 %)	8,367 (1.51 %)	99,818 (11.14 %)	0 (0 %)	6,612 (1.57 %)	27 (96.31 %)	89 (4.28 %)
45	Asian corn borer (v1 ACB-3 2019) GCF_004193835.1	25,279 (7.94 %)	n/a	4,931 (1.05 %)	28,608 (7.16 %)	n/a	37.50 (100.00 %)	0 (0 %)	34,722 (0.01 %)	7,722 (100.00 %)	146,974 (1.35 %)	89,987 (2.68 %)	2,666,250 (38.74 %)	899 (0.07 %)	268,435 (6.89 %)	39,696 (5.22 %)	19,418 (2.22 %)
46	Asian corn borer (v2 ACB-3 2019) GCF_004193835.2	25,169 (7.95 %)	n/a	4,867 (1.05 %)	28,255 (7.08 %)	n/a	37.49 (100.00 %)	0 (0 %)	34,702 (0.01 %)	6,269 (100.00 %)	150,783 (1.53 %)	89,885 (2.69 %)	2,627,296 (38.56 %)	899 (0.07 %)	268,390 (6.92 %)	39,511 (5.22 %)	19,307 (2.21 %)
47	Asian swallowtail (v1 2015) GCF_000836235.1	22,417 (13.18 %)	n/a	5,290 (2.15 %)	13,925 (7.00 %)	n/a	33.81 (97.56 %)	5,205 (2.44 %)	5,205 (2.44 %)	10,777 (97.56 %)	122,491 (2.29 %)	27,169 (0.71 %)	2,130,840 (38.92 %)	27 (0.01 %)	39,978 (1.31 %)	11,899 (2.85 %)	8,383 (1.82 %)
48	Asian tiger mosquito (C6/36 2017 genbank) GCA_001876365.2	n/a	n/a	10,893 (0.53 %)	128,502 (8.33 %)	n/a	40.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,434 (100.00 %)	605,350 (2.88 %)	921,761 (7.40 %)	11,169,474 (57.07 %)	0 (0 %)	1,146,944 (4.60 %)	220,674 (10.38 %)	117,106 (3.58 %)
49	Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 genbank GCA_006496715.1	n/a	n/a	10,347 (0.43 %)	138,311 (7.69 %)	n/a	40.40 (99.93 %)	0 (0 %)	3,359 (0.07 %)	2,196 (100.00 %)	691,302 (2.69 %)	1,084,185 (7.47 %)	12,619,495 (57.66 %)	0 (0 %)	1,197,283 (4.46 %)	250,421 (10.15 %)	127,434 (3.51 %)
50	Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 refseq) GCF_006496715.1	49,254 (2.57 %)	n/a	10,500 (0.44 %)	138,307 (7.69 %)	n/a	40.40 (99.93 %)	0 (0 %)	3,359 (0.07 %)	2,197 (100.00 %)	6,821,491 (69.74 %)	1,084,205 (7.47 %)	12,619,646 (57.66 %)	0 (0 %)	1,197,291 (4.46 %)	250,420 (10.13 %)	139,292 (3.15 %)
51	Asiatic tapir (BS100 BIUU 2019) GCA_004024905.1	n/a	n/a	20,854 (1.73 %)	28,046 (1.39 %)	n/a	40.91 (99.96 %)	4,333 (0.02 %)	4,333 (0.02 %)	284,468 (99.98 %)	3,802,671 (39.88 %)	335,521 (0.73 %)	15,053,564 (30.25 %)	11 (0.00 %)	n/a	39,691 (1.17 %)	36,849 (1.05 %)
52	ass (Maral har 2015 genbank) GCA_001305755.1	48,976 (40.12 %)	n/a	18,884 (1.76 %)	19,296 (1.44 %)	n/a	41.28 (98.63 %)	0 (0 %)	69,593 (1.38 %)	2,166 (100.00 %)	3,855,699 (41.69 %)	289,735 (0.96 %)	14,695,257 (28.58 %)	5,680 (0.23 %)	136,343 (0.85 %)	40,025 (1.06 %)	36,402 (0.92 %)
53	Atlantic halibut (primary hap 2019 genbank) GCA_009819705.1	52,117 (66.34 %)	n/a	14,960 (3.20 %)	45,365 (7.48 %)	69,625 (10.94 %)	42.21 (99.43 %)	0 (0 %)	290 (0.57 %)	57 (100.00 %)	428,421 (4.16 %)	256,153 (3.73 %)	3,725,979 (24.13 %)	0 (0 %)	240,110 (3.16 %)	31,325 (2.25 %)	20,749 (1.34 %)
54	Atlantic herring (v1) GCF_900700415.1	46,216 (9.88 %)	n/a	15,249 (2.65 %)	25,664 (6.68 %)	n/a	44.24 (99.88 %)	1,963 (0.12 %)	1,963 (0.12 %)	1,990 (99.88 %)	1,175,759 (12.03 %)	1,231,613 (13.39 %)	3,511,276 (32.20 %)	2 (0.00 %)	1,037,723 (8.32 %)	33,465 (1.97 %)	20,325 (1.10 %)
55	Atlantic salmon (genbank 2021) GCA_905237065.2	n/a	n/a	28,077 (1.40 %)	120,383 (3.99 %)	183,727 (7.26 %)	43.42 (100.00 %)	211 (0.00 %)	211 (0.00 %)	4,222 (100.00 %)	4,501,521 (48.00 %)	2,247,891 (25.01 %)	10,731,814 (59.31 %)	0 (0 %)	4,866,269 (10.20 %)	77,089 (1.86 %)	20,127 (0.31 %)
56	Atlantic stingray (hap1 2023 genbank) GCA_030144855.1	60,922 (45.62 %)	n/a	12,545 (0.38 %)	29,428 (1.34 %)	n/a	43.35 (99.99 %)	0 (0 %)	1,648 (0.01 %)	2,990 (100.00 %)	8,579,105 (49.81 %)	831,224 (15.75 %)	21,718,213 (51.79 %)	9 (0.00 %)	4,445,293 (7.00 %)	105,821 (2.42 %)	35,197 (0.42 %)
57	B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis) GCF_000002995.3	11,472 (14.88 %)	n/a	2,843 (2.29 %)	3,797 (4.95 %)	n/a	30.21 (92.98 %)	2,303 (6.97 %)	58,744 (7.04 %)	26,881 (93.03 %)	147,614 (11.55 %)	54,885 (7.91 %)	647,155 (33.62 %)	55 (0.02 %)	69,072 (5.04 %)	509 (0.15 %)	126 (0.04 %)
58	Bactrian camel (Alxa 2014 genbank) GCA_000767855.1	52,178 (47.52 %)	n/a	18,330 (1.96 %)	17,094 (1.64 %)	n/a	41.32 (99.32 %)	31,980 (0.69 %)	31,980 (0.69 %)	67,434 (99.31 %)	3,072,373 (34.88 %)	306,996 (0.95 %)	12,209,895 (25.43 %)	58 (0.01 %)	73,572 (0.41 %)	49,789 (1.25 %)	45,112 (1.08 %)
59	band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 genbank) GCA_036971685.1	n/a	n/a	13,319 (1.60 %)	25,993 (2.05 %)	n/a	43.83 (99.41 %)	0 (0 %)	219 (0.59 %)	453 (100.00 %)	700,173 (13.18 %)	457,546 (13.85 %)	4,523,003 (31.73 %)	2 (0.00 %)	1,089,353 (5.57 %)	42,686 (7.00 %)	31,415 (1.62 %)
60	banded archerfish (primary hap 2021 genbank) GCA_017976425.1	42,399 (57.52 %)	n/a	15,312 (3.18 %)	41,147 (7.01 %)	62,990 (9.37 %)	41.11 (99.82 %)	0 (0 %)	98 (0.18 %)	96 (100.00 %)	811,892 (18.19 %)	271,913 (9.55 %)	3,355,326 (28.08 %)	1 (0.00 %)	297,728 (3.49 %)	15,089 (0.96 %)	9,304 (0.55 %)
61	barn owl (2020) GCF_902150015.1	37,361 (4.54 %)	n/a	12,958 (1.72 %)	22,922 (1.99 %)	26,976 (3.04 %)	41.55 (99.23 %)	0 (0 %)	177,340 (0.79 %)	21,504 (100.00 %)	585,627 (5.48 %)	367,764 (2.44 %)	7,399,161 (19.58 %)	6,614 (0.13 %)	188,767 (2.21 %)	47,061 (3.25 %)	41,356 (2.24 %)
62	barn owl BGI_N341 (2014) GCF_000687205.1	15,006 (2.07 %)	n/a	11,133 (1.44 %)	21,138 (1.69 %)	n/a	40.21 (99.24 %)	109,223 (0.79 %)	109,223 (0.79 %)	171,345 (99.21 %)	413,761 (3.90 %)	181,353 (0.91 %)	6,776,326 (18.43 %)	2 (0.00 %)	15,140 (0.13 %)	10,575 (0.29 %)	9,101 (0.25 %)
63	barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021) GCA_015227805.2	n/a	n/a	12,385 (1.88 %)	23,302 (2.31 %)	n/a	42.54 (97.69 %)	0 (0 %)	1,102 (2.31 %)	617 (100.00 %)	579,928 (6.20 %)	364,636 (2.27 %)	6,198,840 (21.01 %)	0 (0 %)	237,664 (1.56 %)	36,546 (2.82 %)	29,760 (1.66 %)
64	barn swallow (v2 primary hap 2021 refseq) GCF_015227805.1	43,374 (5.14 %)	n/a	12,385 (1.88 %)	23,302 (2.31 %)	n/a	42.54 (97.69 %)	0 (0 %)	1,102 (2.31 %)	617 (100.00 %)	579,928 (6.20 %)	364,636 (2.27 %)	6,198,840 (21.01 %)	0 (0 %)	237,664 (1.56 %)	36,546 (2.82 %)	29,760 (1.66 %)
65	barn swallow (v3 primary hap 2021 genbank) GCA_015227805.3	n/a	n/a	12,395 (1.89 %)	23,302 (2.31 %)	n/a	42.54 (97.69 %)	0 (0 %)	1,102 (2.31 %)	617 (100.00 %)	664,757 (13.92 %)	364,636 (2.27 %)	6,198,840 (21.01 %)	0 (0 %)	237,664 (1.56 %)	36,548 (2.85 %)	29,760 (1.66 %)
66	barramundi perch (ASB-BC8 2016) GCF_001640805.1	50,205 (13.10 %)	n/a	16,166 (3.05 %)	25,084 (6.20 %)	n/a	40.75 (100.00 %)	0 (0 %)	110 (0.00 %)	3,808 (100.00 %)	465,997 (3.11 %)	237,955 (4.36 %)	4,027,027 (23.91 %)	0 (0 %)	248,089 (3.21 %)	16,276 (1.04 %)	9,104 (0.52 %)
67	basidiomycetes A.bisporus (H97 2012) GCF_000300575.1	10,448 (49.20 %)	n/a	1,066 (2.53 %)	5,238 (16.95 %)	n/a	46.48 (99.32 %)	225 (0.68 %)	225 (0.68 %)	254 (99.32 %)	4,921 (0.90 %)	2,352 (0.47 %)	62,603 (9.90 %)	0 (0 %)	7,487 (2.92 %)	5,244 (15.19 %)	4,407 (9.08 %)
68	basidiomycetes C.cinerea (okayama7#130 2010 genbank) GCA_000182895.1	n/a	13,661 (52.73 %)	1,050 (2.04 %)	3,917 (10.89 %)	n/a	51.64 (100.00 %)	0 (0 %)	33 (0.00 %)	68 (100.00 %)	n/a	3,805 (0.81 %)	107,373 (7.81 %)	0 (0 %)	2,879 (1.50 %)	81 (99.54 %)	135 (0.47 %)
69	basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7841 2024 genbank) GCA_001720195.2	n/a	6,409 (59.64 %)	921 (4.16 %)	4,119 (24.79 %)	n/a	44.80 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	2,424 (0.66 %)	1,011 (0.30 %)	56,356 (7.99 %)	0 (0 %)	901 (0.80 %)	1,869 (7.30 %)	1,482 (5.65 %)
70	basidiomycetes C.neoformans (JEC21 2005 genbank) GCA_000091045.1	n/a	6,999 (68.28 %)	957 (3.66 %)	3,784 (19.12 %)	n/a	48.54 (99.99 %)	85 (0.01 %)	85 (0.01 %)	99 (99.99 %)	4,944 (5.25 %)	1,808 (0.52 %)	68,717 (8.41 %)	2 (0.00 %)	1,433 (1.21 %)	5,128 (28.73 %)	3,532 (11.09 %)
71	basidiomycetes K.bestiolae (CBS 10118 2024 genbank) GCA_000512585.3	n/a	9,175 (54.34 %)	918 (2.66 %)	4,907 (18.38 %)	n/a	47.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	7,245 (1.32 %)	2,141 (0.47 %)	97,927 (9.78 %)	0 (0 %)	863 (0.56 %)	4,995 (11.17 %)	3,011 (4.94 %)
72	basidiomycetes K.bestiolae (v1 CBS 10118 2016) GCF_000512585.1	9,187 (54.88 %)	n/a	867 (2.56 %)	4,441 (17.03 %)	n/a	47.25 (99.94 %)	30 (0.06 %)	30 (0.06 %)	42 (99.94 %)	7,231 (1.31 %)	1,919 (0.32 %)	110,288 (10.48 %)	3 (0.00 %)	63 (0.02 %)	4,972 (10.95 %)	2,807 (4.52 %)
73	basidiomycetes K.dejecticola (CBS 10117 2024 genbank) GCA_000512565.3	n/a	8,696 (55.58 %)	910 (2.69 %)	4,861 (19.78 %)	n/a	48.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	7,778 (1.42 %)	2,452 (0.43 %)	86,630 (7.97 %)	0 (0 %)	812 (0.23 %)	3,644 (14.24 %)	3,514 (7.22 %)
74	basidiomycetes K.dejecticola (v1 CBS 10117 2016) GCF_000512565.1	8,645 (55.47 %)	n/a	908 (2.72 %)	4,862 (19.87 %)	n/a	48.38 (99.98 %)	56 (0.02 %)	56 (0.02 %)	69 (99.98 %)	7,816 (1.43 %)	2,425 (0.42 %)	85,868 (7.91 %)	14 (0.01 %)	48 (0.02 %)	3,698 (15.12 %)	3,518 (7.28 %)
75	basidiomycetes K.mangroviensis (v1 CBS 8507 2016 refseq) GCF_000507465.1	8,472 (55.96 %)	n/a	884 (2.79 %)	5,418 (21.48 %)	n/a	44.88 (99.73 %)	43 (0.27 %)	43 (0.27 %)	105 (99.73 %)	6,509 (1.21 %)	1,529 (0.25 %)	101,733 (9.98 %)	2 (0.00 %)	24 (0.01 %)	2,326 (4.59 %)	1,405 (2.26 %)
76	basidiomycetes K.mangroviensis (v2 CBS 8507 2024 genbank) GCA_000507465.4	n/a	8,582 (55.68 %)	886 (2.74 %)	5,392 (21.25 %)	n/a	44.92 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4 (100.00 %)	6,585 (1.21 %)	1,546 (0.27 %)	104,495 (10.38 %)	0 (0 %)	1,321 (0.50 %)	2,335 (5.10 %)	1,396 (2.19 %)
77	basidiomycetes K.pini (v1 CBS 10737 2016) GCF_000512605.1	7,854 (58.26 %)	n/a	816 (2.92 %)	5,392 (23.35 %)	n/a	40.23 (99.94 %)	24 (0.06 %)	24 (0.06 %)	42 (99.94 %)	6,502 (1.34 %)	1,847 (0.36 %)	99,393 (12.25 %)	3 (0.00 %)	46 (0.02 %)	1,191 (2.91 %)	956 (2.10 %)
78	basidiomycetes K.shandongensis (v1 CBS 12478 2019) GCF_008629635.1	7,454 (55.86 %)	n/a	893 (2.94 %)	3,348 (15.13 %)	n/a	49.82 (99.99 %)	0 (0 %)	11 (0.01 %)	132 (100.00 %)	5,510 (1.13 %)	1,598 (0.33 %)	81,983 (9.00 %)	2 (0.00 %)	105 (0.05 %)	512 (39.06 %)	1,900 (4.96 %)
79	basidiomycetes M.globosa (v1 CBS 7966 2007) GCF_000181695.1	4,286 (69.39 %)	n/a	1,060 (8.79 %)	2,585 (44.95 %)	n/a	52.06 (100.00 %)	22 (0.00 %)	22 (0.00 %)	89 (100.00 %)	1,777 (0.93 %)	720 (0.48 %)	22,182 (4.73 %)	0 (0 %)	252 (0.26 %)	124 (60.74 %)	105 (31.95 %)
80	basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010) GCF_000143185.1	13,192 (49.72 %)	n/a	894 (1.60 %)	973 (2.80 %)	n/a	57.50 (98.57 %)	316 (1.43 %)	316 (1.43 %)	352 (98.57 %)	7,478 (4.11 %)	7,640 (1.13 %)	176,404 (11.51 %)	1 (0.00 %)	5,378 (1.90 %)	38 (40.33 %)	55 (0.23 %)
81	bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016) GCF_001652005.1	25,020 (17.94 %)	n/a	4,205 (2.34 %)	27,352 (12.83 %)	n/a	41.09 (91.93 %)	0 (0 %)	19,248 (8.05 %)	50,565 (100.00 %)	57,833 (1.39 %)	27,440 (2.49 %)	1,173,760 (18.39 %)	416 (0.39 %)	14,577 (3.60 %)	10,942 (2.61 %)	10,587 (2.22 %)
82	bee E.mexicana (v1 0111107269 2016) GCF_001483705.1	16,406 (4.01 %)	n/a	4,087 (0.75 %)	46,846 (6.53 %)	16,764 (4.04 %)	40.92 (95.72 %)	25,039 (4.23 %)	25,039 (4.23 %)	212,650 (95.77 %)	641,987 (7.51 %)	360,406 (11.43 %)	3,411,951 (46.01 %)	306 (0.12 %)	259,979 (5.86 %)	40,540 (3.99 %)	18,218 (1.75 %)
83	beet (2015) GCF_000511025.2	37,939 (8.78 %)	n/a	12,044 (2.14 %)	63,283 (17.52 %)	n/a	36.14 (91.40 %)	30,962 (8.61 %)	30,962 (8.61 %)	71,208 (91.39 %)	288,084 (4.25 %)	299,650 (4.72 %)	3,021,571 (30.10 %)	1,360 (0.22 %)	218,658 (4.15 %)	32,547 (2.39 %)	20,111 (1.55 %)
84	Bellinger river turtle (v1 BRST_UC0152H_USYD 2024) GCA_040894355.1	n/a	n/a	14,732 (1.14 %)	18,988 (1.77 %)	n/a	43.21 (100.00 %)	0 (0 %)	57 (0.00 %)	129 (100.00 %)	1,130,950 (11.22 %)	213,212 (1.80 %)	11,049,280 (26.48 %)	1 (0.00 %)	312,478 (1.26 %)	53,923 (2.09 %)	34,762 (1.11 %)
85	beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017) GCA_002288925.2	n/a	n/a	18,686 (1.78 %)	20,378 (1.43 %)	n/a	41.24 (98.66 %)	28,398 (1.35 %)	28,398 (1.35 %)	35,369 (98.65 %)	4,001,688 (43.72 %)	542,326 (1.10 %)	12,806,249 (34.24 %)	954 (0.02 %)	386,729 (1.71 %)	59,279 (1.53 %)	42,903 (1.24 %)
86	Betapolyomavirus macacae (2000) GCA_000837645.1	n/a	18 (99.29 %)	n/a	n/a	n/a	40.76 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (4.54 %)	15 (4.33 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
87	bighorn sheep (v1 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024) GCF_042477335.1	75,387 (2.66 %)	n/a	18,667 (1.37 %)	20,248 (1.35 %)	n/a	44.07 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	41 (100.00 %)	3,081,260 (20.10 %)	796,298 (12.14 %)	12,235,764 (46.75 %)	0 (0 %)	703,302 (1.83 %)	50,538 (11.18 %)	38,494 (0.86 %)
88	black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018) GCF_000002775.4	59,637 (15.47 %)	n/a	20,361 (4.67 %)	44,177 (15.83 %)	n/a	33.75 (97.43 %)	6,871 (2.58 %)	6,871 (2.58 %)	8,318 (97.42 %)	402,600 (27.63 %)	177,746 (4.65 %)	2,639,214 (36.04 %)	34 (0.01 %)	246,517 (5.54 %)	4,559 (0.56 %)	1,801 (0.17 %)
89	black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 genbank) GCA_022577435.1	n/a	n/a	14,991 (3.02 %)	47,106 (6.98 %)	n/a	41.61 (100.00 %)	0 (0 %)	234 (0.00 %)	230 (100.00 %)	1,017,149 (18.99 %)	360,899 (8.75 %)	3,761,526 (28.91 %)	0 (0 %)	469,043 (4.64 %)	48,360 (4.43 %)	30,659 (2.05 %)
90	black rhinoceros (primary hap 2021 genbank) GCA_020826845.1	56,255 (36.51 %)	n/a	18,774 (1.38 %)	22,346 (1.26 %)	n/a	41.59 (99.95 %)	0 (0 %)	215 (0.05 %)	1,075 (100.00 %)	4,200,385 (36.22 %)	548,030 (8.34 %)	14,347,639 (40.14 %)	2 (0.00 %)	984,722 (2.61 %)	43,525 (1.14 %)	33,963 (0.76 %)
91	black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016) GCA_001698545.1	59,197 (39.21 %)	n/a	21,244 (1.88 %)	23,681 (1.25 %)	n/a	40.94 (94.13 %)	0 (0 %)	149,843 (5.88 %)	105,030 (100.00 %)	5,600,915 (50.57 %)	991,762 (2.45 %)	16,353,992 (34.26 %)	4,262 (0.14 %)	867,902 (3.08 %)	81,205 (1.19 %)	29,129 (0.68 %)
92	black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016) GCF_001698545.1	59,210 (2.48 %)	n/a	21,256 (1.89 %)	23,679 (1.25 %)	n/a	40.94 (94.13 %)	0 (0 %)	149,843 (5.88 %)	105,031 (100.00 %)	5,602,009 (50.58 %)	991,745 (2.45 %)	16,354,078 (34.26 %)	4,262 (0.14 %)	n/a	81,205 (1.19 %)	29,123 (0.68 %)
93	black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020) GCF_013377495.1	41,255 (4.77 %)	n/a	12,955 (1.98 %)	22,656 (2.28 %)	31,476 (5.07 %)	41.95 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	396 (100.00 %)	680,976 (7.66 %)	296,152 (1.44 %)	6,797,141 (21.40 %)	0 (0 %)	86,777 (0.79 %)	31,750 (3.32 %)	30,007 (2.00 %)
94	black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020) GCF_015228065.1	35,923 (2.41 %)	n/a	3,903 (0.15 %)	39,667 (2.27 %)	40,959 (2.59 %)	36.64 (83.75 %)	0 (0 %)	1,158,725 (16.44 %)	26,876 (100.00 %)	5,488,723 (29.98 %)	7,028,944 (21.91 %)	10,445,796 (49.62 %)	239 (0.01 %)	4,167,031 (8.98 %)	178,205 (3.43 %)	77,006 (1.37 %)
95	black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank) GCA_028500815.1	51,115 (48.16 %)	n/a	13,211 (1.67 %)	24,108 (1.99 %)	n/a	44.40 (99.94 %)	0 (0 %)	283 (0.06 %)	716 (100.00 %)	521,275 (5.36 %)	236,727 (8.62 %)	5,684,588 (26.70 %)	8 (0.00 %)	651,836 (3.67 %)	45,318 (4.71 %)	36,668 (1.67 %)
96	black-legged tick (U.Maryland v1 2021) GCF_016920785.1	41,018 (2.61 %)	n/a	4,064 (0.14 %)	135,587 (7.67 %)	n/a	46.27 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,977 (100.00 %)	1,153,773 (4.93 %)	754,711 (7.52 %)	10,964,182 (43.13 %)	0 (0 %)	805,883 (3.13 %)	138,831 (8.38 %)	232,611 (7.21 %)
97	black-legged tick (Wikel colony 2008 genbank) GCA_000208615.1	n/a	24,903 (1.43 %)	3,432 (0.19 %)	108,471 (5.13 %)	n/a	45.22 (78.65 %)	201,145 (21.35 %)	201,145 (21.35 %)	570,637 (78.65 %)	656,957 (3.38 %)	365,918 (1.61 %)	8,574,437 (27.02 %)	124 (0.01 %)	n/a	345,141 (14.15 %)	189,691 (5.45 %)
98	blackcap (primary hap 2019 genbank) GCA_009819655.1	n/a	n/a	12,378 (1.92 %)	22,970 (2.37 %)	n/a	42.00 (98.88 %)	0 (0 %)	413 (1.12 %)	189 (100.00 %)	506,242 (6.14 %)	330,354 (2.12 %)	6,410,567 (19.76 %)	0 (0 %)	190,210 (1.30 %)	26,838 (2.34 %)	22,667 (1.33 %)
99	Blainville's beaked whale (primary hap 2022 genbank) GCA_025265405.1	47,540 (38.02 %)	n/a	19,042 (1.52 %)	20,766 (1.27 %)	n/a	41.70 (99.97 %)	0 (0 %)	97 (0.03 %)	73 (100.00 %)	3,964,035 (35.29 %)	765,957 (8.74 %)	12,128,162 (41.78 %)	1 (0.00 %)	1,795,618 (5.01 %)	70,851 (1.80 %)	37,949 (0.93 %)
100	bloodfluke planorb (v1 BB02 2013 refseq) GCF_000457365.1	42,229 (5.95 %)	n/a	3,558 (0.29 %)	24,115 (2.96 %)	n/a	35.99 (98.05 %)	76,921 (1.91 %)	76,921 (1.91 %)	408,322 (98.09 %)	629,362 (4.20 %)	749,383 (9.40 %)	6,932,184 (43.02 %)	435 (0.03 %)	800,142 (5.40 %)	16,970 (0.64 %)	6,405 (0.27 %)
101	bloodfluke planorb (v2 BB02 2013 genbank) GCA_000457365.2	n/a	n/a	3,378 (0.29 %)	23,684 (2.94 %)	n/a	35.99 (98.05 %)	76,903 (1.91 %)	76,903 (1.91 %)	406,924 (98.09 %)	587,583 (3.57 %)	749,212 (9.41 %)	6,921,847 (43.04 %)	434 (0.03 %)	n/a	16,561 (0.63 %)	6,013 (0.25 %)
102	blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020) GCA_009873245.2	n/a	n/a	19,164 (1.81 %)	20,546 (1.41 %)	34,210 (1.86 %)	40.88 (98.91 %)	0 (0 %)	936 (1.09 %)	130 (100.00 %)	3,999,202 (44.22 %)	581,540 (1.22 %)	12,900,977 (34.62 %)	2 (0.00 %)	424,951 (1.36 %)	67,189 (1.73 %)	46,700 (1.41 %)
103	blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank) GCA_900634775.1	47,312 (59.52 %)	n/a	14,496 (1.97 %)	28,873 (5.58 %)	60,981 (6.13 %)	38.27 (98.47 %)	0 (0 %)	1,160 (1.53 %)	441 (100.00 %)	731,730 (4.21 %)	471,620 (4.92 %)	5,974,002 (42.88 %)	0 (0 %)	455,135 (4.01 %)	29,050 (1.48 %)	14,672 (0.63 %)
104	blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq) GCF_900634775.1	47,312 (7.12 %)	n/a	14,496 (1.97 %)	28,873 (5.58 %)	60,981 (6.13 %)	38.27 (98.47 %)	0 (0 %)	1,160 (1.53 %)	441 (100.00 %)	731,730 (4.21 %)	471,620 (4.92 %)	5,974,002 (42.88 %)	0 (0 %)	455,135 (4.01 %)	29,050 (1.48 %)	14,672 (0.63 %)
105	Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021) GCF_016699345.1	53,030 (2.41 %)	n/a	20,599 (1.98 %)	21,182 (1.34 %)	46,441 (1.87 %)	40.95 (99.56 %)	1,074 (0.44 %)	1,074 (0.44 %)	2,790 (99.56 %)	5,098,799 (47.87 %)	946,231 (3.04 %)	14,608,771 (36.99 %)	14 (0.00 %)	1,335,352 (2.84 %)	37,273 (1.03 %)	32,351 (0.89 %)
106	Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011) GCF_000235385.1	39,820 (2.33 %)	n/a	20,222 (2.04 %)	18,404 (1.34 %)	49,071 (2.26 %)	40.77 (94.98 %)	148,728 (5.04 %)	148,728 (5.04 %)	151,414 (94.96 %)	4,710,420 (46.30 %)	767,602 (1.48 %)	14,489,703 (32.96 %)	1,541 (0.02 %)	526,235 (1.31 %)	32,474 (0.75 %)	29,285 (0.67 %)
107	Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023 genbank) GCA_028885525.1	n/a	n/a	19,820 (1.76 %)	20,399 (1.15 %)	n/a	40.98 (99.88 %)	36 (0.12 %)	36 (0.12 %)	251 (99.88 %)	5,232,617 (54.01 %)	1,003,539 (10.19 %)	14,858,575 (42.10 %)	0 (0 %)	2,511,941 (4.39 %)	42,467 (1.24 %)	29,563 (0.80 %)
108	Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023 refseq) GCF_028885625.1	81,966 (2.93 %)	n/a	20,794 (1.72 %)	21,307 (1.13 %)	n/a	41.13 (99.86 %)	39 (0.14 %)	39 (0.14 %)	1,593 (99.86 %)	5,651,267 (54.21 %)	1,155,151 (9.33 %)	16,242,823 (42.82 %)	0 (0 %)	2,513,241 (4.25 %)	52,294 (2.02 %)	36,160 (1.02 %)
109	boutu (BS63 2019) GCA_004363515.1	n/a	n/a	21,835 (1.38 %)	35,087 (1.18 %)	n/a	42.09 (99.89 %)	5,072 (0.02 %)	5,072 (0.02 %)	1,218,682 (99.98 %)	5,098,108 (45.85 %)	856,878 (2.32 %)	13,046,921 (40.74 %)	29 (0.00 %)	n/a	63,992 (1.47 %)	47,092 (1.19 %)
110	bowfin (hap1 2024 genbank) GCA_036373705.1	n/a	n/a	13,851 (1.83 %)	27,058 (4.43 %)	n/a	40.75 (100.00 %)	0 (0 %)	97 (0.00 %)	390 (100.00 %)	953,497 (13.69 %)	387,700 (7.91 %)	4,552,410 (37.72 %)	4 (0.00 %)	613,799 (6.38 %)	46,301 (2.99 %)	26,437 (1.15 %)
111	Brazilian free-tailed bat (US034 2019) GCA_004025005.1	n/a	n/a	23,562 (1.20 %)	51,200 (1.27 %)	n/a	42.40 (99.91 %)	4,243 (0.02 %)	4,243 (0.02 %)	1,071,858 (99.98 %)	4,884,584 (32.93 %)	777,032 (1.49 %)	14,195,446 (36.38 %)	31 (0.00 %)	n/a	89,940 (1.88 %)	76,243 (1.50 %)
112	brown anole (Geneva1000 2022 genbank) GCA_025583915.1	38,099 (52.40 %)	n/a	14,028 (1.05 %)	19,927 (1.81 %)	n/a	41.14 (98.37 %)	0 (0 %)	114,440 (1.64 %)	3,738 (100.00 %)	1,376,455 (6.78 %)	1,094,843 (5.18 %)	9,127,396 (44.98 %)	261 (0.01 %)	1,132,418 (4.31 %)	46,291 (1.18 %)	17,324 (0.40 %)
113	brown argus (genbank 2021) GCA_905147365.1	23,611 (63.03 %)	n/a	4,734 (1.03 %)	24,267 (6.80 %)	24,237 (6.16 %)	36.86 (100.00 %)	0 (0 %)	4 (0.00 %)	26 (100.00 %)	264,378 (2.90 %)	144,255 (3.35 %)	2,651,028 (48.44 %)	0 (0 %)	205,174 (4.19 %)	35,431 (4.56 %)	15,409 (1.89 %)
114	brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018) GCF_003584765.1	54,006 (3.19 %)	n/a	18,811 (1.78 %)	21,058 (1.52 %)	39,408 (1.98 %)	41.84 (99.31 %)	15,552 (0.70 %)	17,380 (0.70 %)	21,814 (99.30 %)	4,283,780 (41.29 %)	567,588 (1.23 %)	13,807,277 (30.86 %)	760 (0.01 %)	325,786 (0.96 %)	62,126 (1.80 %)	56,003 (1.56 %)
115	brown bear (v1.0 2022 WashU) GCF_023065955.1	60,162 (4.01 %)	n/a	18,920 (1.66 %)	21,641 (1.49 %)	n/a	42.51 (100.00 %)	0 (0 %)	215 (0.00 %)	902 (100.00 %)	4,166,472 (34.00 %)	659,124 (5.14 %)	13,282,996 (33.88 %)	0 (0 %)	788,951 (2.62 %)	68,113 (2.27 %)	61,162 (1.99 %)
116	brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020) GCF_013339695.1	39,619 (2.36 %)	n/a	3,965 (0.13 %)	116,426 (5.96 %)	45,849 (2.46 %)	46.86 (99.96 %)	0 (0 %)	10,359 (0.04 %)	2,329 (100.00 %)	1,064,424 (3.53 %)	716,579 (3.47 %)	10,608,171 (42.78 %)	1 (0.00 %)	n/a	13,204 (0.97 %)	233,049 (6.32 %)
117	brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020) GCF_012460135.1	31,379 (5.19 %)	n/a	12,572 (1.89 %)	24,442 (2.44 %)	26,137 (3.13 %)	42.40 (99.99 %)	278 (0.01 %)	278 (0.01 %)	691 (99.99 %)	504,872 (6.53 %)	420,620 (3.73 %)	6,496,619 (21.26 %)	0 (0 %)	353,680 (2.15 %)	28,576 (2.39 %)	22,561 (1.23 %)
118	brown planthopper (v1 BPH 2020 genbank) GCA_014356525.1	36,936 (60.13 %)	n/a	4,416 (0.37 %)	22,354 (3.57 %)	37,534 (4.91 %)	34.69 (99.96 %)	0 (0 %)	4,529 (0.04 %)	7,093 (100.00 %)	597,351 (3.69 %)	564,076 (6.64 %)	6,601,703 (47.48 %)	11 (0.00 %)	905,418 (9.48 %)	39,697 (1.55 %)	15,292 (0.62 %)
119	brown planthopper (v1 BPH 2020 refseq) GCF_014356525.1	36,949 (4.89 %)	n/a	4,427 (0.37 %)	22,417 (3.57 %)	37,573 (4.91 %)	34.69 (99.96 %)	0 (0 %)	4,529 (0.04 %)	7,094 (100.00 %)	597,178 (3.69 %)	564,092 (6.64 %)	6,601,918 (47.49 %)	11 (0.00 %)	905,421 (9.48 %)	39,697 (1.55 %)	15,292 (0.62 %)
120	budding yeast C.auris (6684 2015 genbank) GCA_001189475.1	n/a	7,564 (65.02 %)	1,948 (12.61 %)	4,664 (59.90 %)	n/a	45.12 (98.69 %)	0 (0 %)	689 (1.33 %)	99 (100.00 %)	3,478 (1.23 %)	2,281 (0.83 %)	48,703 (8.19 %)	27 (0.12 %)	258 (0.23 %)	1,579 (6.36 %)	1,147 (4.11 %)
121	budding yeast C.auris (B11221 2017 genbank) GCA_002775015.1	n/a	5,715 (64.44 %)	2,030 (12.92 %)	4,702 (58.30 %)	n/a	45.32 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	20 (100.00 %)	3,464 (2.27 %)	2,436 (0.80 %)	28,524 (6.96 %)	0 (0 %)	1,194 (1.58 %)	1,757 (7.37 %)	1,331 (4.92 %)
122	budding yeast C.lusitaniae (ATCC 42720 2009 genbank) GCA_000003835.1	n/a	6,153 (65.84 %)	1,956 (12.86 %)	4,335 (54.85 %)	n/a	44.50 (99.71 %)	79 (0.29 %)	79 (0.29 %)	88 (99.71 %)	2,272 (1.18 %)	4,036 (1.77 %)	48,188 (8.66 %)	0 (0 %)	697 (0.55 %)	1,474 (15.82 %)	1,218 (9.79 %)
123	budding yeast C.oxycetoniae (v1 CBS 10844 2022) GCF_023343755.1	4,892 (62.35 %)	n/a	1,845 (11.42 %)	4,476 (56.70 %)	n/a	37.84 (99.95 %)	0 (0 %)	167 (0.05 %)	148 (100.00 %)	14,118 (4.93 %)	19,713 (8.99 %)	82,014 (21.64 %)	3 (0.01 %)	4,249 (2.09 %)	201 (0.52 %)	34 (0.08 %)
124	budding yeast K.marxianus (DMKU3-1042 2014 genbank) GCA_001417885.1	n/a	5,342 (68.28 %)	3,349 (28.79 %)	4,665 (66.28 %)	n/a	40.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	7,406 (3.43 %)	3,781 (1.46 %)	51,732 (11.80 %)	0 (0 %)	614 (0.85 %)	742 (4.91 %)	562 (2.75 %)
125	budding yeast L.elongisporus (NRRL YB-4239 2007 genbank) GCA_000149685.1	n/a	5,905 (57.07 %)	1,905 (9.82 %)	5,004 (52.37 %)	n/a	36.94 (99.45 %)	117 (0.56 %)	117 (0.56 %)	145 (99.44 %)	30,880 (10.91 %)	18,155 (4.10 %)	100,210 (23.18 %)	0 (0 %)	1,604 (1.36 %)	22 (0.04 %)	19 (0.04 %)
126	budding yeast N.glabratus (CBS 138 2008 genbank) GCA_000002545.2	n/a	5,552 (64.50 %)	3,553 (27.93 %)	4,799 (61.37 %)	n/a	38.65 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	16 (100.00 %)	3,047 (1.32 %)	2,546 (1.58 %)	59,567 (11.20 %)	0 (0 %)	804 (0.77 %)	635 (3.11 %)	567 (2.52 %)
127	budding yeast Y.lipolytica (CLIB122 2004 genbank) GCA_000002525.1	n/a	8,157 (46.30 %)	1,755 (6.59 %)	4,802 (37.76 %)	n/a	49.05 (99.99 %)	28 (0.01 %)	28 (0.01 %)	34 (99.99 %)	7,553 (2.98 %)	9,578 (2.12 %)	81,595 (9.59 %)	0 (0 %)	960 (0.42 %)	6,216 (33.42 %)	5,390 (18.49 %)
128	budgerigar (maternal Z 2020 genbank) GCA_012275295.1	32,026 (47.01 %)	n/a	13,250 (1.87 %)	23,063 (2.25 %)	26,324 (3.11 %)	41.80 (99.72 %)	0 (0 %)	284 (0.28 %)	865 (100.00 %)	539,059 (10.20 %)	279,511 (3.12 %)	5,874,608 (22.08 %)	1 (0.00 %)	324,823 (2.05 %)	21,155 (1.61 %)	17,590 (1.10 %)
129	butterfly L.sinapis (2021 genbank) GCA_905404315.1	25,882 (55.17 %)	n/a	4,722 (0.65 %)	16,896 (3.62 %)	47,660 (8.03 %)	35.73 (100.00 %)	0 (0 %)	13 (0.00 %)	50 (100.00 %)	272,738 (1.92 %)	98,053 (6.01 %)	4,662,765 (51.79 %)	0 (0 %)	376,611 (5.06 %)	43,150 (4.96 %)	13,298 (1.08 %)
130	butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021) GCA_905475465.1	n/a	n/a	4,588 (1.37 %)	11,218 (5.90 %)	42,925 (13.84 %)	33.95 (100.00 %)	0 (0 %)	41 (0.00 %)	43 (100.00 %)	143,323 (2.19 %)	45,473 (3.23 %)	2,501,939 (42.55 %)	0 (0 %)	106,106 (3.41 %)	11,070 (2.07 %)	6,650 (1.23 %)
131	cabbage white (genbank 2021) GCA_905147795.1	21,844 (65.09 %)	n/a	4,557 (1.68 %)	9,253 (6.32 %)	30,285 (15.57 %)	33.23 (100.00 %)	0 (0 %)	4 (0.00 %)	40 (100.00 %)	116,781 (2.12 %)	30,577 (1.24 %)	2,300,336 (39.04 %)	0 (0 %)	40,164 (2.03 %)	6,783 (2.24 %)	5,041 (1.33 %)
132	California condor (v1 813 2021 genbank) GCA_018139145.1	n/a	n/a	12,650 (1.75 %)	21,946 (1.95 %)	n/a	42.16 (99.97 %)	0 (0 %)	632 (0.03 %)	542 (100.00 %)	518,393 (6.41 %)	177,329 (0.88 %)	7,168,675 (20.31 %)	6 (0.00 %)	116,410 (1.11 %)	34,926 (2.94 %)	32,355 (1.72 %)
133	California sea lion (BS06 2019 Broad) GCA_004024565.1	n/a	n/a	23,668 (1.61 %)	29,709 (1.32 %)	n/a	41.56 (99.92 %)	10,276 (0.04 %)	10,276 (0.04 %)	582,272 (99.96 %)	4,952,087 (44.00 %)	651,744 (1.26 %)	13,644,805 (35.79 %)	27 (0.00 %)	376,234 (0.87 %)	62,245 (1.50 %)	57,048 (1.32 %)
134	California sea lion (v1 2019) GCA_009762305.1	n/a	n/a	21,020 (1.79 %)	20,045 (1.39 %)	45,176 (2.15 %)	41.40 (99.28 %)	0 (0 %)	122 (0.72 %)	43 (100.00 %)	4,529,949 (43.67 %)	589,962 (1.24 %)	13,266,465 (33.77 %)	0 (0 %)	491,959 (1.43 %)	51,989 (1.50 %)	48,284 (1.32 %)
135	California two-spot octopus (v1 UCB-OBI-ISO-001 male 2015) GCF_001194135.1	26,135 (1.83 %)	n/a	3,125 (0.12 %)	17,875 (1.29 %)	27,144 (1.85 %)	36.03 (84.95 %)	548,450 (15.13 %)	548,450 (15.13 %)	700,124 (84.87 %)	3,498,348 (13.19 %)	3,005,729 (6.50 %)	13,687,022 (41.09 %)	20,815 (0.26 %)	912,571 (2.22 %)	22,984 (0.34 %)	4,782 (0.07 %)
136	Canada lynx (LIC74 v1 2019) GCF_007474595.1	50,094 (2.69 %)	n/a	18,283 (1.66 %)	19,326 (1.35 %)	38,985 (1.96 %)	41.70 (99.88 %)	0 (0 %)	848 (0.12 %)	66 (100.00 %)	5,016,399 (43.75 %)	904,986 (1.75 %)	13,476,288 (34.20 %)	0 (0 %)	572,992 (1.64 %)	66,822 (2.52 %)	60,494 (2.02 %)
137	Cape golden mole (BS56 2019 Broad) GCA_004027935.1	n/a	n/a	25,543 (0.55 %)	52,506 (0.63 %)	n/a	40.04 (99.84 %)	4,876 (0.01 %)	4,876 (0.01 %)	3,432,954 (99.99 %)	7,363,240 (21.82 %)	876,677 (2.53 %)	25,446,677 (58.18 %)	62 (0.00 %)	n/a	25,319 (0.31 %)	19,908 (0.25 %)
138	capsicum (Zunla-1 2015 genbank) GCA_000710875.1	n/a	n/a	16,133 (0.56 %)	62,445 (2.92 %)	n/a	34.93 (96.78 %)	107,172 (3.23 %)	107,172 (3.23 %)	108,797 (96.77 %)	1,171,727 (3.54 %)	948,641 (4.39 %)	21,533,236 (46.16 %)	331 (0.03 %)	1,512,400 (5.05 %)	16,621 (0.21 %)	4,972 (0.06 %)
139	Caribbean electric ray (hap1 2024 genbank) GCA_036971445.1	n/a	n/a	11,967 (0.44 %)	20,851 (1.23 %)	n/a	43.35 (99.99 %)	0 (0 %)	1,443 (0.01 %)	596 (100.00 %)	4,902,656 (34.96 %)	1,040,893 (17.82 %)	16,403,253 (54.79 %)	2 (0.00 %)	3,888,884 (8.11 %)	113,936 (1.69 %)	22,323 (0.31 %)
140	carmine bee-eater (2014 BGI) GCF_000691845.1	15,520 (2.12 %)	n/a	11,303 (1.45 %)	24,758 (1.84 %)	n/a	41.67 (99.59 %)	50,632 (0.42 %)	50,632 (0.42 %)	104,131 (99.58 %)	405,042 (5.66 %)	161,525 (1.05 %)	6,445,961 (19.27 %)	2 (0.00 %)	37,279 (0.40 %)	11,477 (0.36 %)	9,158 (0.28 %)
141	cassava (v6 AM560-2 2016 DOE) GCF_001659605.1	48,199 (10.95 %)	n/a	18,537 (3.62 %)	45,536 (13.17 %)	n/a	35.94 (85.14 %)	37,896 (14.88 %)	37,896 (14.88 %)	39,916 (85.12 %)	295,656 (2.88 %)	266,527 (3.40 %)	2,434,269 (42.34 %)	26 (0.02 %)	352,557 (6.54 %)	30,963 (1.41 %)	4,126 (0.23 %)
142	cattle (Hereford 2015) GCA_000003205.6	n/a	n/a	19,803 (1.54 %)	21,001 (1.30 %)	n/a	41.83 (99.57 %)	39,124 (0.44 %)	41,517 (0.44 %)	42,578 (99.56 %)	5,725,274 (49.24 %)	459,535 (1.33 %)	12,905,109 (41.11 %)	628 (0.03 %)	1,325,981 (3.97 %)	43,324 (1.28 %)	37,641 (0.94 %)
143	cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA) GCF_002263795.1	76,369 (2.97 %)	n/a	19,669 (1.56 %)	21,999 (1.33 %)	n/a	41.93 (100.00 %)	0 (0 %)	386 (0.00 %)	2,211 (100.00 %)	5,643,592 (49.67 %)	545,256 (2.90 %)	13,085,601 (41.79 %)	1 (0.00 %)	1,556,737 (4.07 %)	44,357 (1.24 %)	37,714 (0.98 %)
144	cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA) GCF_002263795.2	76,293 (2.98 %)	n/a	19,325 (1.49 %)	21,665 (1.32 %)	n/a	41.94 (100.00 %)	0 (0 %)	386 (0.00 %)	1,957 (100.00 %)	3,550,686 (24.18 %)	544,595 (2.90 %)	13,050,221 (41.81 %)	1 (0.00 %)	1,554,173 (4.07 %)	44,208 (1.24 %)	37,290 (0.87 %)
145	Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad) GCA_004024745.1	n/a	n/a	21,372 (1.41 %)	34,453 (1.31 %)	n/a	42.35 (99.87 %)	10,534 (0.04 %)	10,534 (0.04 %)	1,240,696 (99.96 %)	5,244,572 (43.13 %)	2,503,015 (4.45 %)	12,961,004 (41.69 %)	59 (0.00 %)	n/a	173,264 (3.70 %)	153,887 (3.31 %)
146	channel bull blenny (2019 genbank) GCA_900634415.1	40,788 (61.50 %)	n/a	14,472 (3.02 %)	24,012 (6.59 %)	60,720 (10.43 %)	40.96 (99.58 %)	0 (0 %)	445 (0.42 %)	322 (100.00 %)	420,697 (5.49 %)	320,518 (6.91 %)	3,394,846 (28.67 %)	0 (0 %)	452,303 (4.62 %)	20,453 (1.39 %)	10,802 (0.65 %)
147	channel catfish (USDA103 v1 2016) GCF_001660625.1	53,933 (9.58 %)	n/a	15,712 (2.71 %)	25,639 (5.25 %)	n/a	39.70 (98.56 %)	25,203 (1.45 %)	25,203 (1.45 %)	34,544 (98.55 %)	871,222 (5.75 %)	585,250 (4.19 %)	5,150,651 (33.94 %)	63 (0.01 %)	258,935 (2.61 %)	31,438 (1.87 %)	20,402 (1.03 %)
148	channel catfish (USDA103 v1.2 2019) GCF_001660625.2	57,087 (10.27 %)	n/a	16,253 (2.68 %)	44,936 (5.15 %)	n/a	39.70 (98.57 %)	25,203 (1.39 %)	25,285 (1.44 %)	34,545 (98.61 %)	900,327 (5.55 %)	614,695 (4.28 %)	5,348,266 (33.81 %)	63 (0.01 %)	281,774 (2.67 %)	32,840 (1.87 %)	21,251 (1.03 %)
149	cheetah (AJU 981 2015) GCA_001443585.1	n/a	n/a	18,264 (1.57 %)	14,665 (1.26 %)	n/a	41.30 (98.26 %)	0 (0 %)	183,260 (1.77 %)	14,382 (100.00 %)	4,777,041 (42.51 %)	784,368 (1.53 %)	13,503,827 (31.65 %)	42 (0.00 %)	261,774 (0.78 %)	57,657 (1.31 %)	48,632 (1.00 %)
150	chevron butterflyfish (hap1 2024 genbank) GCA_039877785.1	n/a	n/a	15,255 (2.94 %)	48,037 (7.05 %)	n/a	42.79 (100.00 %)	0 (0 %)	49 (0.00 %)	37 (100.00 %)	465,710 (3.82 %)	254,015 (3.62 %)	3,657,999 (23.28 %)	1 (0.00 %)	186,571 (2.20 %)	30,971 (2.02 %)	18,241 (1.05 %)
151	chimney swift (M959 v1.0 2014) GCF_000747805.1	15,979 (2.53 %)	n/a	12,065 (1.82 %)	10,050 (2.07 %)	n/a	41.40 (95.99 %)	65,523 (4.03 %)	65,523 (4.03 %)	84,595 (95.97 %)	453,775 (7.30 %)	194,988 (2.21 %)	6,363,949 (19.70 %)	135 (0.03 %)	104,994 (2.61 %)	12,486 (0.42 %)	8,538 (0.26 %)
152	chimpanzee (Clint C0471 2018 genbank) GCA_002880755.3	n/a	162,869 (3.61 %)	20,378 (1.83 %)	21,427 (1.19 %)	n/a	40.71 (98.98 %)	693 (1.02 %)	693 (1.02 %)	5,037 (98.98 %)	5,409,980 (53.76 %)	984,231 (7.31 %)	15,896,744 (39.56 %)	4 (0.00 %)	2,559,246 (4.40 %)	45,870 (0.97 %)	28,273 (0.73 %)
153	chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023 genbank) GCA_028858805.1	n/a	n/a	20,001 (1.79 %)	21,230 (1.19 %)	n/a	40.62 (99.78 %)	22 (0.22 %)	22 (0.22 %)	141 (99.78 %)	5,092,768 (48.83 %)	946,933 (11.75 %)	14,844,947 (42.39 %)	0 (0 %)	3,140,392 (5.61 %)	47,662 (1.21 %)	29,340 (0.82 %)
154	chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023 refseq) GCF_028858775.1	111,282 (4.36 %)	n/a	20,990 (1.75 %)	21,705 (1.15 %)	n/a	40.94 (99.90 %)	29 (0.10 %)	29 (0.10 %)	1,500 (99.90 %)	5,581,205 (50.06 %)	1,158,792 (10.59 %)	15,972,274 (43.09 %)	0 (0 %)	3,093,549 (5.27 %)	61,901 (2.29 %)	38,043 (1.17 %)
155	China rose (Old Blush v1 2018) GCF_002994745.1	60,293 (11.65 %)	n/a	15,433 (2.84 %)	67,310 (21.70 %)	n/a	38.83 (100.00 %)	0 (0 %)	33 (0.00 %)	45 (100.00 %)	273,992 (2.25 %)	228,466 (3.97 %)	2,261,888 (35.14 %)	0 (0 %)	273,738 (7.11 %)	37,317 (4.18 %)	22,576 (1.74 %)
156	Chinese hamster (17A/GY CHO 2018) GCF_003668045.1	55,529 (3.00 %)	n/a	19,755 (1.76 %)	20,017 (1.50 %)	n/a	41.51 (99.88 %)	0 (0 %)	4,356 (0.12 %)	1,830 (100.00 %)	4,544,603 (29.89 %)	1,095,407 (2.92 %)	12,942,232 (32.27 %)	20 (0.00 %)	553,246 (1.59 %)	19,343 (0.58 %)	15,755 (0.43 %)
157	Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank) GCA_018296145.1	92,370 (51.48 %)	n/a	27,141 (1.63 %)	113,328 (4.52 %)	157,545 (6.65 %)	43.55 (99.99 %)	2,313 (0.01 %)	2,333 (0.01 %)	9,977 (99.99 %)	4,892,399 (55.31 %)	2,306,695 (23.48 %)	10,038,870 (54.55 %)	10 (0.00 %)	5,031,323 (11.16 %)	62,726 (1.40 %)	18,444 (0.39 %)
158	chub mackerel (primary hap 2022 genbank) GCA_027409825.1	34,390 (49.60 %)	n/a	15,350 (2.35 %)	46,858 (6.07 %)	n/a	40.01 (99.92 %)	0 (0 %)	1,572 (0.08 %)	361 (100.00 %)	1,669,327 (28.44 %)	638,340 (11.55 %)	4,613,422 (32.38 %)	3 (0.00 %)	927,880 (7.23 %)	16,290 (0.85 %)	8,913 (0.42 %)
159	chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014) GCF_000700745.1	17,196 (2.21 %)	n/a	12,140 (1.50 %)	25,641 (1.91 %)	n/a	40.76 (99.61 %)	56,667 (0.39 %)	56,667 (0.39 %)	126,789 (99.61 %)	560,317 (7.62 %)	203,204 (1.12 %)	6,593,712 (20.47 %)	4 (0.00 %)	63,810 (0.48 %)	8,105 (0.24 %)	6,684 (0.19 %)
160	chytrid fungus B.dendrobatidis (v1 JAM81 2011) GCF_000203795.1	8,677 (50.60 %)	n/a	1,251 (4.00 %)	7,681 (34.45 %)	n/a	39.25 (99.25 %)	383 (0.76 %)	383 (0.76 %)	510 (99.24 %)	2,585 (1.13 %)	3,424 (1.20 %)	81,225 (12.02 %)	0 (0 %)	5,784 (3.45 %)	161 (0.21 %)	141 (0.19 %)
161	ciliates Oxytricha trifallax (v1 JRB310 2012) GCA_000295675.1	n/a	24,578 (70.50 %)	1,065 (1.03 %)	1,781 (1.87 %)	n/a	31.32 (99.93 %)	1,347 (0.00 %)	1,347 (0.00 %)	23,709 (100.00 %)	29,228 (1.96 %)	22,291 (1.48 %)	550,667 (25.14 %)	6 (0.00 %)	1,285 (0.43 %)	20 (0.01 %)	20 (0.01 %)
162	climbing perch (v1.1 2018 refseq) GCF_900324465.1	42,930 (13.31 %)	n/a	15,237 (3.47 %)	22,710 (7.34 %)	37,043 (11.25 %)	40.40 (98.65 %)	0 (0 %)	292 (1.35 %)	70 (100.00 %)	329,586 (2.67 %)	133,519 (1.94 %)	3,418,470 (21.84 %)	0 (0 %)	182,187 (2.87 %)	10,698 (0.86 %)	7,641 (0.56 %)
163	climbing perch (v1.2 2018 genbank) GCA_900324465.2	42,746 (63.74 %)	n/a	15,239 (3.53 %)	39,067 (7.54 %)	63,908 (10.45 %)	40.40 (99.35 %)	0 (0 %)	266 (0.65 %)	50 (100.00 %)	324,479 (2.66 %)	130,248 (1.89 %)	3,324,960 (21.31 %)	0 (0 %)	169,785 (2.72 %)	10,500 (0.87 %)	7,574 (0.57 %)
164	climbing perch (v1.2 2018 refseq) GCF_900324465.2	42,746 (13.53 %)	n/a	15,241 (3.53 %)	39,067 (7.54 %)	63,908 (10.45 %)	40.40 (99.35 %)	0 (0 %)	266 (0.65 %)	51 (100.00 %)	324,324 (2.66 %)	130,249 (1.89 %)	3,325,009 (21.31 %)	0 (0 %)	169,785 (2.72 %)	10,500 (0.87 %)	7,574 (0.57 %)
165	clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank) GCA_028018385.1	81,219 (51.66 %)	n/a	18,516 (1.55 %)	20,363 (1.39 %)	n/a	41.79 (99.94 %)	0 (0 %)	181 (0.06 %)	34 (100.00 %)	4,798,634 (33.91 %)	992,669 (2.08 %)	13,618,933 (34.42 %)	3 (0.00 %)	647,740 (1.89 %)	67,831 (2.45 %)	58,578 (1.71 %)
166	clouded yellow (genbank 2021) GCA_905220415.1	23,070 (64.23 %)	n/a	4,767 (1.38 %)	15,869 (7.12 %)	34,699 (13.48 %)	33.59 (100.00 %)	0 (0 %)	9 (0.00 %)	33 (100.00 %)	161,872 (2.42 %)	73,892 (2.86 %)	2,544,844 (42.14 %)	0 (0 %)	134,497 (3.68 %)	15,663 (2.98 %)	9,943 (1.81 %)
167	coho salmon (150728-3 2017) GCF_002021735.1	64,032 (4.29 %)	n/a	24,727 (1.43 %)	46,926 (3.38 %)	n/a	43.33 (95.39 %)	1,566 (0.01 %)	265,291 (4.63 %)	22,810 (99.99 %)	1,185,308 (5.22 %)	2,455,045 (15.99 %)	11,710,855 (46.53 %)	9,333 (0.29 %)	4,110,586 (10.80 %)	72,061 (1.46 %)	24,530 (0.46 %)
168	common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020) GCA_011762595.1	67,207 (45.84 %)	n/a	18,772 (1.77 %)	20,527 (1.42 %)	35,815 (1.58 %)	41.44 (99.74 %)	0 (0 %)	674 (0.26 %)	362 (100.00 %)	4,067,521 (46.14 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,896 (35.29 %)	1 (0.00 %)	597,652 (1.78 %)	65,551 (1.90 %)	43,161 (1.35 %)
169	common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank) GCA_001922835.1	45,962 (43.27 %)	n/a	17,254 (1.68 %)	17,112 (1.34 %)	n/a	40.85 (99.45 %)	0 (0 %)	114,003 (0.57 %)	2,647 (100.00 %)	3,845,214 (43.88 %)	514,631 (1.06 %)	12,317,013 (32.18 %)	466 (0.01 %)	284,934 (0.89 %)	48,030 (1.35 %)	31,891 (1.03 %)
170	common brushtail (genbank 2020) GCA_011100635.1	37,661 (35.20 %)	n/a	18,681 (0.81 %)	15,375 (0.86 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	0 (0 %)	1,796 (0.56 %)	212 (100.00 %)	7,598,697 (38.92 %)	1,259,434 (1.97 %)	22,071,301 (40.56 %)	0 (0 %)	455,834 (1.17 %)	17,762 (0.38 %)	13,986 (0.24 %)
171	common carp (2014) GCF_000951615.1	75,427 (5.81 %)	n/a	27,632 (2.17 %)	59,950 (5.28 %)	n/a	37.00 (97.48 %)	0 (0 %)	57,940 (2.53 %)	9,378 (100.00 %)	1,460,282 (5.17 %)	987,356 (7.88 %)	9,900,821 (37.41 %)	8 (0.00 %)	1,320,956 (12.02 %)	48,702 (1.38 %)	28,063 (0.71 %)
172	common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank) GCA_017976375.1	50,206 (57.28 %)	n/a	13,179 (1.84 %)	25,859 (2.41 %)	n/a	42.18 (99.58 %)	0 (0 %)	296 (0.42 %)	151 (100.00 %)	521,043 (9.61 %)	310,469 (2.36 %)	6,712,849 (21.76 %)	0 (0 %)	326,521 (1.83 %)	25,267 (1.71 %)	20,672 (1.05 %)
173	common cuckoo (BGI 2014) GCF_000709325.1	16,827 (2.53 %)	n/a	12,599 (1.80 %)	12,623 (2.28 %)	n/a	41.52 (97.64 %)	56,977 (2.38 %)	56,977 (2.38 %)	71,907 (97.62 %)	418,870 (8.06 %)	192,437 (2.08 %)	6,576,259 (19.85 %)	113 (0.02 %)	126,008 (2.66 %)	18,002 (0.74 %)	15,128 (0.57 %)
174	common house spider (v2 Geottingen 2017) GCF_000365465.2	30,064 (3.79 %)	n/a	3,347 (0.23 %)	7,571 (1.48 %)	n/a	29.46 (81.63 %)	247,375 (18.44 %)	247,378 (18.44 %)	263,908 (81.56 %)	587,943 (2.23 %)	464,643 (2.90 %)	10,795,253 (40.31 %)	12,788 (0.38 %)	474,681 (4.16 %)	10,480 (0.23 %)	1,791 (0.05 %)
175	common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank) GCA_000365465.3	37,121 (48.05 %)	n/a	3,276 (0.22 %)	9,098 (1.38 %)	38,273 (4.24 %)	29.40 (98.45 %)	24,382 (1.54 %)	124,228 (1.55 %)	84,235 (98.46 %)	637,694 (2.45 %)	527,781 (4.43 %)	11,553,196 (51.16 %)	299 (0.01 %)	477,709 (3.61 %)	11,998 (0.33 %)	2,762 (0.10 %)
176	common limpet (v1 primary hap 2022) GCF_932274485.1	41,888 (9.21 %)	n/a	3,611 (0.43 %)	13,244 (4.58 %)	44,721 (6.30 %)	36.11 (100.00 %)	0 (0 %)	75 (0.00 %)	13 (100.00 %)	239,042 (1.40 %)	359,961 (7.89 %)	4,399,053 (45.69 %)	5 (0.00 %)	629,372 (7.98 %)	33,411 (1.94 %)	2,344 (0.13 %)
177	common sole (primary hap 2023 genbank) GCA_958295425.1	55,359 (63.58 %)	n/a	14,846 (2.94 %)	42,832 (6.93 %)	n/a	40.87 (99.99 %)	0 (0 %)	373 (0.01 %)	243 (100.00 %)	1,149,249 (19.12 %)	342,239 (9.71 %)	3,906,839 (32.84 %)	2 (0.00 %)	440,509 (5.18 %)	27,772 (2.71 %)	15,561 (0.92 %)
178	common swift (bApuApu2 2021 genbank) GCA_020740795.1	39,986 (53.94 %)	n/a	12,277 (1.88 %)	20,379 (2.16 %)	n/a	41.95 (99.84 %)	0 (0 %)	256 (0.16 %)	109 (100.00 %)	533,758 (8.66 %)	199,748 (1.12 %)	6,353,957 (21.19 %)	1 (0.00 %)	113,872 (0.91 %)	20,393 (1.74 %)	16,313 (0.88 %)
179	common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 genbank) GCA_022682495.1	58,054 (45.51 %)	n/a	18,280 (1.71 %)	19,514 (1.59 %)	n/a	42.98 (99.99 %)	0 (0 %)	611 (0.01 %)	572 (100.00 %)	2,761,820 (28.38 %)	427,940 (3.89 %)	11,250,492 (32.57 %)	37 (0.00 %)	360,489 (1.62 %)	70,700 (2.48 %)	44,288 (1.24 %)
180	common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 refseq) GCF_022682495.1	58,054 (3.40 %)	n/a	18,280 (1.71 %)	19,515 (1.59 %)	n/a	42.98 (99.99 %)	0 (0 %)	611 (0.01 %)	573 (100.00 %)	2,761,826 (28.38 %)	427,942 (3.89 %)	11,250,529 (32.57 %)	37 (0.00 %)	360,489 (1.62 %)	70,701 (2.48 %)	44,289 (1.24 %)
181	common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank) GCA_002940915.2	n/a	n/a	18,511 (1.87 %)	18,170 (1.68 %)	n/a	42.15 (97.78 %)	54,308 (2.23 %)	54,308 (2.23 %)	84,108 (97.77 %)	2,860,991 (29.93 %)	275,245 (1.03 %)	11,798,152 (28.19 %)	237 (0.03 %)	174,536 (2.84 %)	51,833 (1.38 %)	47,411 (1.21 %)
182	common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq) GCF_002940915.1	51,034 (3.23 %)	n/a	18,506 (1.88 %)	18,166 (1.68 %)	n/a	42.15 (97.78 %)	54,308 (2.23 %)	54,308 (2.23 %)	84,109 (97.77 %)	2,861,697 (29.93 %)	275,247 (1.03 %)	11,798,198 (28.19 %)	237 (0.03 %)	174,536 (2.84 %)	51,834 (1.38 %)	47,410 (1.21 %)
183	common vampire bat (v1 HL8 alternate hap 2022 genbank) GCA_022682395.1	n/a	n/a	17,520 (1.75 %)	18,995 (1.67 %)	n/a	42.89 (99.99 %)	0 (0 %)	580 (0.01 %)	430 (100.00 %)	2,597,497 (28.17 %)	356,620 (2.88 %)	10,797,225 (31.23 %)	25 (0.00 %)	271,481 (1.34 %)	61,931 (2.30 %)	43,396 (1.30 %)
184	common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 genbank) GCA_022682495.2	n/a	n/a	18,311 (1.71 %)	19,456 (1.59 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	0 (0 %)	615 (0.01 %)	573 (100.00 %)	2,767,071 (28.35 %)	431,575 (3.90 %)	11,286,853 (32.63 %)	37 (0.00 %)	330,061 (1.50 %)	71,506 (2.50 %)	45,001 (1.26 %)
185	Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank) GCA_000956105.1	29,369 (33.72 %)	n/a	19,335 (2.10 %)	21,769 (1.63 %)	n/a	41.24 (74.51 %)	276,531 (25.53 %)	276,544 (25.53 %)	299,069 (74.47 %)	3,513,698 (39.82 %)	304,033 (0.59 %)	13,333,842 (21.06 %)	1,491 (0.03 %)	288,329 (2.06 %)	56,694 (1.59 %)	52,345 (1.34 %)
186	cork oak (v1 HL8 2018) GCF_002906115.1	65,969 (8.84 %)	n/a	20,226 (1.95 %)	89,703 (16.66 %)	n/a	36.19 (97.99 %)	0 (0 %)	26,139 (2.01 %)	23,344 (100.00 %)	865,884 (3.63 %)	491,126 (5.95 %)	6,119,503 (36.10 %)	267 (0.02 %)	690,224 (9.50 %)	21,505 (3.50 %)	10,784 (2.71 %)
187	Cory's shearwater (hap1.1 2024) GCA_964195595.1	n/a	n/a	13,703 (1.71 %)	26,310 (2.10 %)	n/a	43.29 (99.99 %)	59 (0.00 %)	525 (0.01 %)	414 (100.00 %)	479,045 (5.03 %)	336,466 (4.95 %)	5,910,298 (24.89 %)	4 (0.00 %)	487,078 (3.38 %)	48,046 (4.19 %)	40,252 (2.00 %)
188	Cory's shearwater (hap2.1 2024) GCA_964196065.1	n/a	n/a	12,750 (1.85 %)	23,191 (2.16 %)	n/a	43.03 (99.99 %)	477 (0.01 %)	477 (0.01 %)	726 (99.99 %)	403,846 (4.59 %)	252,125 (3.30 %)	6,206,493 (22.07 %)	2 (0.00 %)	286,848 (2.45 %)	41,821 (4.50 %)	38,197 (2.23 %)
189	corroboree frog (hap2 2023 genbank) GCA_028390025.1	n/a	n/a	n/a	54,346 (1.07 %)	n/a	45.66 (99.76 %)	0 (0 %)	2,699 (0.24 %)	3,127 (100.00 %)	18,782,633 (75.22 %)	5,902,115 (18.63 %)	5,826 (99.76 %)	23 (0.00 %)	n/a	990,274 (4.84 %)	90,184 (0.51 %)
190	cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank) GCA_002156985.1	21,972 (59.55 %)	17,082 (10.65 %)	4,839 (1.54 %)	21,045 (8.01 %)	n/a	36.13 (89.02 %)	23,558 (11.01 %)	26,910 (11.01 %)	24,551 (88.99 %)	115,046 (2.97 %)	31,900 (0.85 %)	2,230,382 (25.45 %)	1,738 (0.70 %)	33,991 (1.55 %)	15,851 (2.18 %)	9,912 (1.25 %)
191	cowpea (IT97K-499-35 v1 2019) GCF_004118075.1	48,679 (10.56 %)	n/a	16,927 (3.30 %)	44,814 (13.06 %)	54,348 (11.30 %)	32.98 (99.48 %)	0 (0 %)	68 (0.52 %)	682 (100.00 %)	352,238 (4.22 %)	283,949 (8.14 %)	3,092,021 (41.64 %)	1 (0.00 %)	420,724 (7.56 %)	24,513 (2.40 %)	11,823 (1.16 %)
192	crab-eating macaque WashU 2013 genbank GCA_000364345.1	76,183 (45.03 %)	n/a	20,283 (1.90 %)	20,544 (1.22 %)	n/a	40.90 (95.16 %)	80,163 (4.85 %)	80,474 (4.85 %)	87,763 (95.15 %)	5,351,207 (51.35 %)	941,514 (3.24 %)	15,778,449 (35.74 %)	1,138 (0.05 %)	1,213,705 (2.53 %)	76,963 (1.14 %)	28,050 (0.65 %)
193	crab-eating macaque WashU 2013 refseq GCF_000364345.1	76,196 (3.30 %)	n/a	20,209 (1.91 %)	51,427 (6.84 %)	n/a	40.90 (95.16 %)	80,163 (4.85 %)	80,474 (4.85 %)	87,764 (95.15 %)	5,251,819 (50.85 %)	941,514 (3.24 %)	15,778,510 (35.74 %)	1,138 (0.05 %)	1,213,705 (2.53 %)	76,963 (1.14 %)	27,520 (0.64 %)
194	crucian carp (primary hap 2023 genbank) GCA_963082965.1	90,094 (55.93 %)	n/a	29,389 (2.81 %)	88,291 (5.37 %)	n/a	38.31 (99.99 %)	0 (0 %)	832 (0.01 %)	278 (100.00 %)	3,481,389 (45.81 %)	802,775 (6.54 %)	8,190,816 (44.41 %)	1 (0.00 %)	1,003,533 (5.09 %)	83,696 (3.82 %)	26,039 (0.81 %)
195	crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022) GCF_022539665.1	22,902 (28.68 %)	n/a	3,621 (2.94 %)	11,430 (17.96 %)	n/a	40.34 (99.47 %)	0 (0 %)	2 (0.53 %)	227 (100.00 %)	81,008 (2.67 %)	29,625 (4.98 %)	609,395 (25.66 %)	0 (0 %)	39,313 (3.92 %)	6,559 (5.05 %)	5,546 (3.62 %)
196	crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank) GCA_003990815.1	n/a	n/a	3,519 (2.64 %)	12,174 (17.22 %)	n/a	40.54 (93.29 %)	0 (0 %)	13,228 (6.75 %)	4,192 (100.00 %)	63,254 (2.07 %)	22,325 (1.44 %)	728,942 (20.81 %)	35 (0.03 %)	32,114 (3.20 %)	8,375 (4.98 %)	6,466 (3.39 %)
197	crustacean P.pollicipes (v2 AB1234 2020) GCF_011947565.2	30,025 (5.21 %)	n/a	3,968 (0.39 %)	56,084 (8.02 %)	32,834 (5.48 %)	52.34 (98.93 %)	0 (0 %)	10,786 (1.08 %)	1,254 (100.00 %)	361,409 (3.23 %)	533,046 (8.92 %)	3,456,307 (19.29 %)	27 (0.01 %)	627,943 (7.18 %)	6,722 (54.88 %)	103,043 (9.72 %)
198	dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank) GCA_021462225.2	n/a	n/a	15,131 (1.68 %)	50,084 (4.18 %)	n/a	40.18 (99.46 %)	0 (0 %)	409 (0.54 %)	73 (100.00 %)	2,175,293 (47.80 %)	176,956 (1.87 %)	6,142,692 (38.35 %)	4 (0.00 %)	383,249 (3.60 %)	32,973 (1.28 %)	10,198 (0.33 %)
199	Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank) GCA_963259705.1	64,558 (45.64 %)	n/a	19,142 (1.72 %)	22,139 (1.66 %)	n/a	43.18 (99.99 %)	0 (0 %)	1,099 (0.01 %)	122 (100.00 %)	3,040,239 (24.03 %)	796,913 (6.38 %)	10,478,261 (38.84 %)	9 (0.00 %)	756,430 (2.76 %)	64,921 (2.50 %)	57,806 (1.88 %)
200	degu (3935 2012 genbank) GCA_000260255.1	48,152 (35.39 %)	n/a	22,240 (1.40 %)	22,108 (1.46 %)	n/a	41.38 (84.36 %)	252,770 (15.68 %)	252,770 (15.68 %)	259,903 (84.32 %)	4,890,270 (27.82 %)	898,943 (1.50 %)	14,281,942 (29.30 %)	2,582 (0.03 %)	313,025 (1.02 %)	40,135 (0.82 %)	36,410 (0.69 %)
201	denticle herring (v1 2019) GCF_900700375.1	59,645 (12.74 %)	n/a	16,556 (3.78 %)	37,861 (8.42 %)	72,719 (10.66 %)	43.69 (99.18 %)	0 (0 %)	464 (0.82 %)	460 (100.00 %)	403,512 (3.23 %)	224,282 (4.61 %)	2,948,671 (28.79 %)	0 (0 %)	306,165 (4.31 %)	64,661 (9.49 %)	52,867 (4.93 %)
202	diamondback terrapin (hap1 2023 genbank) GCA_027887155.1	50,318 (52.07 %)	n/a	15,109 (1.08 %)	19,281 (1.62 %)	n/a	44.46 (99.92 %)	0 (0 %)	141 (0.08 %)	76 (100.00 %)	4,088,064 (46.33 %)	403,943 (1.72 %)	11,014,504 (33.74 %)	0 (0 %)	407,696 (1.71 %)	110,838 (2.71 %)	30,093 (0.82 %)
203	diplomonads (v1 WB C6 WB C6 2008) GCF_000002435.1	6,502 (71.82 %)	n/a	251 (1.29 %)	2,079 (62.62 %)	n/a	49.25 (99.82 %)	214 (0.19 %)	242 (0.19 %)	306 (99.81 %)	697 (1.34 %)	335 (0.65 %)	20,634 (5.24 %)	19 (0.14 %)	859 (1.76 %)	2,275 (23.86 %)	2,064 (18.94 %)
204	dog (BS72 2019 Broad) GCA_004027395.1	n/a	n/a	22,343 (1.53 %)	28,525 (1.27 %)	n/a	41.66 (99.91 %)	10,428 (0.04 %)	10,428 (0.04 %)	667,170 (99.96 %)	5,598,608 (45.38 %)	1,220,686 (2.58 %)	14,079,363 (36.37 %)	28 (0.00 %)	n/a	62,881 (2.13 %)	53,176 (1.80 %)
205	domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011) GCF_000215625.1	55,980 (3.39 %)	n/a	18,440 (1.59 %)	19,474 (1.48 %)	n/a	41.47 (94.51 %)	109,700 (5.51 %)	109,700 (5.51 %)	117,442 (94.49 %)	n/a	606,818 (1.04 %)	13,503,550 (29.63 %)	1,009 (0.02 %)	309,552 (0.86 %)	53,376 (1.90 %)	51,864 (1.65 %)
206	domestic guinea pig (2N 2008 genbank) GCA_000151735.1	44,762 (33.07 %)	n/a	18,297 (1.33 %)	20,107 (1.34 %)	n/a	39.95 (97.81 %)	58,460 (2.20 %)	58,460 (2.20 %)	61,603 (97.80 %)	4,257,412 (38.85 %)	658,532 (1.25 %)	14,547,631 (34.19 %)	3 (0.00 %)	423,409 (1.39 %)	37,092 (0.85 %)	27,299 (0.63 %)
207	domestic silkworm (genbank 2020) GCA_014905235.2	n/a	n/a	5,227 (1.28 %)	18,795 (5.67 %)	n/a	38.55 (99.90 %)	0 (0 %)	30 (0.10 %)	696 (100.00 %)	615,428 (29.26 %)	86,179 (1.65 %)	2,607,325 (47.66 %)	0 (0 %)	297,922 (5.59 %)	44,022 (10.06 %)	15,414 (1.64 %)
208	domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank) GCA_904849725.1	63,294 (3.74 %)	n/a	18,050 (0.43 %)	260,902 (9.04 %)	n/a	44.46 (99.97 %)	0 (0 %)	162 (0.03 %)	290 (100.00 %)	1,274,894 (2.42 %)	1,726,303 (5.40 %)	14,010,542 (72.58 %)	0 (0 %)	5,823,193 (14.08 %)	732,828 (17.24 %)	271,779 (4.92 %)
209	downy mildews (GKB4 2021 genbank) GCA_018691715.1	n/a	21,334 (23.20 %)	1,641 (1.07 %)	33,976 (44.50 %)	n/a	54.16 (99.69 %)	0 (0 %)	80 (0.31 %)	133 (100.00 %)	18,997 (0.80 %)	16,094 (2.84 %)	200,994 (27.68 %)	0 (0 %)	68,037 (10.52 %)	232 (99.71 %)	2,904 (21.16 %)
210	downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020) GCA_014839835.1	25,483 (48.39 %)	n/a	12,405 (1.70 %)	23,073 (2.18 %)	n/a	45.31 (99.66 %)	0 (0 %)	187 (0.34 %)	181 (100.00 %)	1,008,118 (21.51 %)	378,537 (3.38 %)	5,846,717 (32.04 %)	0 (0 %)	791,076 (4.25 %)	26,005 (1.75 %)	19,919 (1.16 %)
211	downy woodpecker (BGI 2014) GCF_000699005.1	15,850 (2.33 %)	n/a	11,864 (1.67 %)	11,795 (1.99 %)	n/a	44.51 (96.31 %)	96,471 (3.72 %)	96,471 (3.72 %)	127,725 (96.28 %)	842,281 (18.63 %)	310,018 (2.09 %)	5,822,687 (27.83 %)	59 (0.01 %)	397,798 (2.49 %)	17,379 (0.69 %)	13,913 (0.52 %)
212	E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank) GCA_000750555.1	n/a	4,501 (88.85 %)	n/a	n/a	n/a	50.78 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	90 (0.38 %)	19,508 (7.44 %)	0 (0 %)	189 (0.40 %)	1 (99.99 %)	0 (0.00 %)
213	East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019) GCF_008831285.1	39,088 (10.61 %)	n/a	11,569 (2.49 %)	38,114 (15.67 %)	n/a	38.59 (99.98 %)	625 (0.02 %)	627 (0.02 %)	1,425 (99.98 %)	230,165 (2.88 %)	153,929 (4.02 %)	2,160,647 (26.81 %)	1 (0.00 %)	233,651 (6.36 %)	24,567 (4.41 %)	18,177 (2.46 %)
214	eastern European house mouse (PWK_PhJ v1 2016) GCA_001624775.1	n/a	n/a	21,013 (2.21 %)	18,237 (1.40 %)	101,394 (4.09 %)	41.76 (90.89 %)	26,578 (1.66 %)	904,107 (9.24 %)	30,233 (98.34 %)	5,250,349 (40.55 %)	1,508,787 (2.97 %)	13,823,341 (28.09 %)	246,352 (1.73 %)	681,079 (2.29 %)	16,695 (0.43 %)	15,885 (0.40 %)
215	eastern happy (v2 2018) GCF_900246225.1	57,615 (9.59 %)	n/a	15,348 (2.22 %)	28,518 (6.29 %)	42,170 (8.31 %)	41.07 (99.87 %)	115 (0.00 %)	490 (0.13 %)	364 (100.00 %)	527,486 (5.98 %)	217,915 (1.89 %)	4,547,443 (30.78 %)	2 (0.00 %)	212,425 (2.79 %)	33,005 (1.88 %)	16,748 (0.95 %)
216	Egyptian rousette (US006 2019 Broad) GCA_004024865.1	n/a	n/a	20,133 (1.87 %)	36,361 (1.80 %)	n/a	40.23 (99.96 %)	4,332 (0.02 %)	4,332 (0.02 %)	226,086 (99.98 %)	2,985,622 (32.66 %)	475,311 (1.11 %)	12,612,081 (27.34 %)	15 (0.00 %)	n/a	81,930 (5.75 %)	81,575 (4.78 %)
217	Egyptian rousette (v1 2020 genbank) GCA_014176215.1	65,163 (51.34 %)	61,105 (4.04 %)	17,637 (2.08 %)	22,318 (1.84 %)	n/a	40.05 (98.59 %)	0 (0 %)	242 (1.41 %)	30 (100.00 %)	2,821,248 (33.05 %)	434,415 (1.02 %)	12,031,652 (26.52 %)	0 (0 %)	65,562 (0.33 %)	53,604 (6.69 %)	57,305 (5.33 %)
218	elephant shark (2013) GCF_000165045.1	30,695 (4.95 %)	n/a	11,306 (1.54 %)	18,189 (3.03 %)	n/a	42.34 (96.16 %)	46,217 (3.85 %)	46,232 (3.85 %)	67,421 (96.15 %)	1,405,480 (27.29 %)	330,698 (2.60 %)	5,549,534 (36.65 %)	31 (0.01 %)	365,912 (2.44 %)	35,561 (2.16 %)	11,961 (0.52 %)
219	emu (v1 ZJU1.0 2020) GCA_016128335.1	n/a	n/a	13,181 (1.74 %)	24,708 (2.10 %)	33,433 (3.99 %)	42.41 (100.00 %)	0 (0 %)	512 (0.00 %)	802 (100.00 %)	504,527 (4.38 %)	259,276 (2.59 %)	7,105,965 (19.15 %)	8 (0.00 %)	316,149 (1.79 %)	41,784 (5.52 %)	41,105 (3.30 %)
220	epaulette shark (2021 genbank) GCA_020745735.1	43,156 (39.58 %)	n/a	12,439 (0.39 %)	19,520 (1.06 %)	n/a	42.76 (98.05 %)	0 (0 %)	3,716 (1.95 %)	1,963 (100.00 %)	9,211,963 (69.93 %)	935,037 (6.51 %)	20,660,613 (43.88 %)	0 (0 %)	2,903,274 (4.44 %)	41,682 (1.08 %)	13,048 (0.16 %)
221	eudicots lettuce (Salinas v7 2020) GCF_002870075.2	65,115 (2.96 %)	n/a	16,271 (0.65 %)	102,071 (6.37 %)	n/a	37.79 (92.44 %)	3,138 (0.29 %)	353,389 (7.60 %)	11,454 (99.71 %)	1,109,875 (4.83 %)	983,866 (3.64 %)	12,335,790 (52.95 %)	2,249 (0.09 %)	1,828,920 (9.42 %)	117,743 (2.02 %)	19,959 (0.28 %)
222	Euphrates poplar (v1 2014) GCF_000495115.1	56,539 (12.93 %)	n/a	20,844 (4.28 %)	41,664 (12.47 %)	n/a	32.08 (95.31 %)	23,174 (4.71 %)	23,174 (4.71 %)	32,789 (95.29 %)	332,532 (5.23 %)	246,766 (4.06 %)	2,679,673 (43.30 %)	21 (0.01 %)	283,121 (6.41 %)	2,781 (0.47 %)	1,761 (0.21 %)
223	Eurasian badger (v3.1 2021) GCF_922984935.1	57,138 (2.48 %)	n/a	19,265 (1.40 %)	22,121 (1.36 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	0 (0 %)	101 (0.00 %)	538 (100.00 %)	4,487,951 (32.73 %)	821,664 (4.02 %)	13,814,723 (38.08 %)	1 (0.00 %)	1,177,258 (3.11 %)	66,524 (3.95 %)	54,563 (1.83 %)
224	Eurasian red squirrel (v1.1 2019) GCA_902686455.1	n/a	n/a	21,298 (1.58 %)	21,024 (1.36 %)	36,645 (1.54 %)	40.08 (94.33 %)	0 (0 %)	1,177 (5.67 %)	638 (100.00 %)	4,680,964 (35.76 %)	704,218 (1.42 %)	14,991,981 (31.49 %)	5 (0.00 %)	419,662 (1.29 %)	48,159 (1.04 %)	45,455 (0.95 %)
225	Eurasian water vole (v1 2020) GCF_903992535.1	45,658 (2.52 %)	n/a	19,724 (1.77 %)	19,069 (1.47 %)	34,561 (2.01 %)	42.15 (99.74 %)	0 (0 %)	872 (0.26 %)	216 (100.00 %)	4,098,151 (26.75 %)	1,088,237 (2.91 %)	12,853,776 (32.42 %)	5 (0.00 %)	518,686 (1.69 %)	19,000 (0.58 %)	16,851 (0.46 %)
226	European conger (primary hap 2023 genbank) GCA_963514075.1	54,631 (54.17 %)	n/a	17,073 (1.89 %)	34,794 (5.07 %)	n/a	43.89 (99.98 %)	13 (0.00 %)	1,009 (0.02 %)	394 (100.00 %)	761,527 (5.99 %)	913,328 (13.25 %)	5,768,003 (35.48 %)	3 (0.00 %)	1,603,442 (8.94 %)	120,990 (6.12 %)	81,342 (2.93 %)
227	European eel (primary hap 2020 genbank) GCA_013347855.1	n/a	n/a	17,048 (2.22 %)	34,271 (5.56 %)	n/a	43.64 (99.61 %)	0 (0 %)	640 (0.40 %)	53 (100.00 %)	831,037 (5.48 %)	786,520 (8.15 %)	5,700,818 (27.40 %)	2 (0.00 %)	774,914 (5.14 %)	130,345 (8.19 %)	94,445 (4.12 %)
228	European mink (primary hap 2023 genbank) GCA_030435805.1	69,556 (45.15 %)	n/a	18,706 (1.46 %)	21,193 (1.37 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	0 (0 %)	39 (0.00 %)	26 (100.00 %)	4,237,797 (30.90 %)	792,898 (2.69 %)	13,417,248 (36.59 %)	0 (0 %)	894,273 (2.55 %)	67,133 (2.54 %)	51,333 (1.62 %)
229	European peacock (2021 genbank) GCA_905147045.1	22,557 (62.12 %)	n/a	4,716 (1.16 %)	12,599 (4.34 %)	26,251 (7.81 %)	33.70 (100.00 %)	0 (0 %)	10 (0.00 %)	42 (100.00 %)	212,528 (2.58 %)	60,682 (1.18 %)	3,127,157 (46.89 %)	0 (0 %)	154,469 (3.96 %)	24,620 (4.88 %)	7,312 (0.89 %)
230	European plaice (primary hap 2022 genbank) GCA_947347685.1	46,467 (52.27 %)	n/a	14,820 (2.71 %)	51,453 (7.41 %)	n/a	42.51 (99.97 %)	0 (0 %)	1,072 (0.03 %)	356 (100.00 %)	476,317 (3.63 %)	520,730 (13.27 %)	3,283,400 (33.55 %)	2 (0.00 %)	525,277 (6.36 %)	47,051 (4.45 %)	21,879 (1.29 %)
231	European snow vole (primary hap 2023 genbank) GCA_950005125.1	47,025 (39.90 %)	n/a	20,576 (1.75 %)	21,171 (1.56 %)	n/a	41.98 (100.00 %)	0 (0 %)	197 (0.00 %)	161 (100.00 %)	3,580,811 (22.71 %)	998,537 (5.14 %)	12,204,125 (34.97 %)	4 (0.00 %)	954,164 (3.20 %)	20,725 (0.63 %)	17,303 (0.45 %)
232	European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019) GCA_901699165.1	n/a	n/a	11,276 (1.79 %)	21,238 (2.15 %)	n/a	41.73 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,333 (100.00 %)	466,567 (7.08 %)	182,345 (0.97 %)	6,037,183 (20.24 %)	0 (0 %)	110,549 (1.11 %)	29,648 (2.35 %)	26,084 (1.59 %)
233	European turtle dove (v1.1 primary hap 2019) GCA_901699155.1	n/a	n/a	12,415 (1.77 %)	23,484 (2.17 %)	n/a	41.84 (99.67 %)	0 (0 %)	894 (0.33 %)	357 (100.00 %)	539,737 (7.60 %)	227,500 (1.16 %)	6,768,805 (21.05 %)	4 (0.00 %)	181,333 (1.65 %)	34,729 (2.65 %)	30,692 (1.70 %)
234	European woodmouse (2022 genbank) GCA_947179515.1	54,113 (34.13 %)	n/a	19,960 (1.65 %)	19,954 (1.25 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	0 (0 %)	1,129 (0.01 %)	498 (100.00 %)	4,863,656 (37.41 %)	1,795,997 (8.95 %)	13,681,786 (40.58 %)	17 (0.00 %)	2,516,599 (5.37 %)	23,961 (0.53 %)	17,318 (0.36 %)
235	fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank) GCA_011064685.1	32,738 (63.63 %)	n/a	5,744 (1.12 %)	26,631 (7.08 %)	n/a	36.43 (99.99 %)	0 (0 %)	525 (0.01 %)	91 (100.00 %)	168,479 (1.60 %)	72,876 (1.70 %)	3,384,083 (37.35 %)	0 (0 %)	128,947 (2.55 %)	30,753 (4.27 %)	12,571 (1.35 %)
236	fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020) GCF_011064685.1	32,751 (9.65 %)	n/a	5,744 (1.12 %)	26,632 (7.08 %)	n/a	36.43 (99.99 %)	0 (0 %)	525 (0.01 %)	92 (100.00 %)	169,122 (1.61 %)	72,892 (1.70 %)	3,384,365 (37.36 %)	0 (0 %)	128,947 (2.55 %)	30,753 (4.27 %)	12,571 (1.35 %)
237	fire-bellied toad (primary hap 2023 genbank) GCA_027579735.1	n/a	n/a	15,456 (0.21 %)	47,501 (0.88 %)	n/a	38.98 (98.02 %)	0 (0 %)	7,009 (1.99 %)	2,468 (100.00 %)	20,643,710 (70.75 %)	7,150,262 (12.27 %)	9,477 (98.01 %)	3 (0.00 %)	n/a	365,066 (1.20 %)	29,706 (0.10 %)
238	fission yeast (v1 972h- 2007 refseq) GCF_000002945.1	6,744 (82.69 %)	n/a	5,085 (73.29 %)	3,403 (39.29 %)	n/a	36.05 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	4 (100.00 %)	3,336 (2.63 %)	1,034 (0.58 %)	80,458 (16.22 %)	1 (0.01 %)	411 (0.72 %)	105 (0.31 %)	95 (0.28 %)
239	fission yeast (v2 972h- 2019 genbank) GCA_000002945.3	n/a	17,791 (77.29 %)	5,084 (73.46 %)	3,394 (39.28 %)	n/a	36.06 (100.00 %)	6 (0.00 %)	6 (0.00 %)	9 (100.00 %)	3,053 (1.03 %)	1,034 (0.58 %)	79,714 (16.06 %)	1 (0.01 %)	411 (0.72 %)	105 (0.31 %)	95 (0.28 %)
240	flatworm S.haematobium (v2 2020) GCF_000699445.2	8,934 (5.16 %)	n/a	1,548 (0.29 %)	4,070 (2.36 %)	8,934 (5.16 %)	34.53 (99.76 %)	0 (0 %)	15,128 (0.26 %)	666 (100.00 %)	124,259 (1.58 %)	35,312 (1.17 %)	2,638,150 (34.10 %)	31 (0.01 %)	69,190 (3.97 %)	3,957 (0.38 %)	906 (0.11 %)
241	flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank) GCA_007364275.2	n/a	n/a	15,436 (2.15 %)	26,448 (5.90 %)	64,657 (6.60 %)	41.23 (98.19 %)	0 (0 %)	744 (1.81 %)	189 (100.00 %)	1,014,141 (16.95 %)	287,037 (2.21 %)	5,305,987 (30.67 %)	0 (0 %)	227,443 (2.84 %)	24,130 (1.26 %)	11,082 (0.48 %)
242	Florida manatee (Lorelei 2012 genbank) GCA_000243295.1	39,651 (35.92 %)	n/a	18,302 (1.36 %)	20,592 (1.23 %)	32,831 (1.38 %)	40.73 (89.24 %)	160,167 (10.78 %)	160,167 (10.78 %)	166,489 (89.22 %)	5,109,822 (37.03 %)	389,314 (0.74 %)	14,633,007 (38.46 %)	5,748 (0.06 %)	244,060 (0.64 %)	27,461 (0.64 %)	25,464 (0.54 %)
243	fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019) GCF_009650485.1	24,196 (18.66 %)	n/a	10,065 (8.48 %)	14,473 (13.61 %)	n/a	38.15 (100.00 %)	0 (0 %)	7 (0.00 %)	11 (100.00 %)	298,709 (14.86 %)	80,048 (3.56 %)	1,317,733 (33.56 %)	0 (0 %)	69,521 (4.49 %)	18,849 (8.62 %)	11,752 (5.15 %)
244	fly D.santomea (v1.0 2021) GCF_016746245.1	25,550 (21.64 %)	n/a	13,354 (17.52 %)	20,540 (17.87 %)	n/a	42.61 (100.00 %)	0 (0 %)	14 (0.00 %)	104 (100.00 %)	169,365 (23.08 %)	64,316 (3.47 %)	791,743 (23.14 %)	0 (0 %)	69,581 (6.26 %)	27,794 (16.15 %)	20,742 (10.27 %)
245	fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine) GCF_004382195.1	26,658 (22.06 %)	n/a	13,461 (17.65 %)	21,781 (17.83 %)	n/a	42.26 (100.00 %)	0 (0 %)	38 (0.00 %)	402 (100.00 %)	145,818 (25.16 %)	34,869 (4.31 %)	719,811 (25.74 %)	0 (0 %)	87,076 (8.91 %)	30,130 (16.11 %)	22,906 (10.22 %)
246	fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017) GCF_002093755.1	21,759 (15.21 %)	n/a	12,488 (9.92 %)	21,269 (14.06 %)	n/a	39.11 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,356 (100.00 %)	314,594 (25.90 %)	82,446 (12.33 %)	1,113,448 (37.00 %)	0 (0 %)	199,881 (8.53 %)	27,493 (12.03 %)	20,330 (8.62 %)
247	fly D.simulans (w501 v3.0 2021) GCF_016746395.1	28,595 (26.45 %)	n/a	13,448 (20.44 %)	18,989 (18.34 %)	n/a	42.47 (100.00 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	96 (100.00 %)	126,424 (16.72 %)	32,595 (4.31 %)	759,296 (23.70 %)	0 (0 %)	46,993 (4.17 %)	27,530 (17.02 %)	20,622 (10.65 %)
248	fly D.yakuba (2018) GCF_000005975.2	5,444 (4.10 %)	n/a	13,713 (15.95 %)	22,613 (16.71 %)	n/a	42.28 (98.12 %)	5,317 (1.88 %)	5,400 (1.88 %)	13,440 (98.12 %)	180,908 (22.48 %)	68,911 (3.75 %)	897,353 (23.94 %)	85 (0.04 %)	85,136 (6.91 %)	31,387 (14.91 %)	22,960 (9.55 %)
249	fly D.yakuba (v1 2021) GCF_016746365.1	27,938 (24.60 %)	n/a	13,343 (17.86 %)	20,029 (17.64 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	54 (100.00 %)	169,559 (23.47 %)	60,591 (3.64 %)	837,616 (23.40 %)	0 (0 %)	64,895 (6.52 %)	28,204 (16.22 %)	22,365 (10.80 %)
250	Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank) GCA_902459505.1	54,713 (61.19 %)	n/a	14,267 (0.51 %)	29,026 (1.40 %)	n/a	43.24 (99.85 %)	0 (0 %)	433 (0.15 %)	163 (100.00 %)	1,311,113 (1.64 %)	1,364,596 (3.83 %)	19,589,738 (52.85 %)	3 (0.00 %)	1,182,977 (2.68 %)	270,923 (4.52 %)	38,622 (0.50 %)
251	Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq) GCF_902459505.1	54,713 (1.72 %)	n/a	14,269 (0.51 %)	29,026 (1.40 %)	n/a	43.24 (99.85 %)	0 (0 %)	433 (0.15 %)	164 (100.00 %)	1,310,970 (1.64 %)	1,364,597 (3.83 %)	19,589,802 (52.85 %)	3 (0.00 %)	1,182,977 (2.68 %)	270,923 (4.52 %)	38,622 (0.50 %)
252	giant panda (2009 BGI) GCF_000004335.2	40,432 (2.55 %)	n/a	18,884 (1.76 %)	18,919 (1.46 %)	n/a	41.60 (97.66 %)	119,126 (2.36 %)	119,126 (2.36 %)	200,593 (97.64 %)	4,236,423 (40.48 %)	503,179 (1.10 %)	13,781,487 (28.85 %)	48 (0.00 %)	252,804 (0.90 %)	53,465 (1.34 %)	45,835 (1.12 %)
253	giant panda (Jingjing v1 2017) GCA_002007445.1	n/a	n/a	20,110 (1.71 %)	22,288 (1.49 %)	n/a	41.69 (98.08 %)	186,846 (1.93 %)	186,846 (1.93 %)	244,258 (98.07 %)	4,464,041 (41.66 %)	614,896 (2.00 %)	14,294,774 (30.62 %)	9,506 (0.14 %)	580,134 (4.39 %)	59,340 (1.50 %)	49,319 (1.23 %)
254	giant panda (Jingjing v2 genbank 2020) GCA_002007445.2	n/a	n/a	20,381 (1.71 %)	21,979 (1.44 %)	43,086 (2.00 %)	41.69 (98.09 %)	0 (0 %)	190,364 (1.92 %)	77,287 (100.00 %)	4,484,597 (41.53 %)	618,595 (2.00 %)	14,236,406 (30.39 %)	9,762 (0.14 %)	583,295 (4.39 %)	59,945 (1.50 %)	49,872 (1.23 %)
255	giant panda (Jingjing v2 refseq 2020) GCF_002007445.1	67,162 (3.32 %)	n/a	20,374 (1.71 %)	21,965 (1.44 %)	43,086 (2.00 %)	41.69 (98.09 %)	0 (0 %)	190,364 (1.92 %)	77,288 (100.00 %)	4,476,689 (41.47 %)	618,596 (2.00 %)	14,236,463 (30.39 %)	9,762 (0.14 %)	583,300 (4.39 %)	59,946 (1.50 %)	49,916 (1.23 %)
256	gilthead seabream (v1 2019) GCF_900880675.1	59,027 (10.96 %)	n/a	15,412 (2.36 %)	31,802 (6.47 %)	73,197 (7.97 %)	41.94 (99.96 %)	0 (0 %)	1,050 (0.04 %)	176 (100.00 %)	531,360 (3.04 %)	305,809 (3.03 %)	4,701,694 (25.69 %)	0 (0 %)	355,475 (3.53 %)	47,327 (2.41 %)	23,697 (1.07 %)
257	Glanville fritillary (genbank 2021) GCA_905220565.1	17,520 (43.15 %)	n/a	4,738 (0.89 %)	16,197 (5.05 %)	35,235 (7.97 %)	34.09 (100.00 %)	0 (0 %)	80 (0.01 %)	32 (100.00 %)	343,193 (3.25 %)	144,286 (3.46 %)	3,683,956 (48.60 %)	0 (0 %)	198,815 (3.74 %)	30,200 (4.54 %)	11,245 (1.52 %)
258	globe artichoke (v1 2C 2018) GCF_001531365.1	42,119 (6.72 %)	n/a	15,804 (2.23 %)	49,721 (11.10 %)	n/a	35.35 (90.31 %)	5,305 (0.07 %)	310,473 (9.77 %)	13,588 (99.93 %)	394,687 (2.79 %)	364,361 (3.37 %)	4,191,676 (39.48 %)	3,050 (0.15 %)	283,546 (3.56 %)	12,198 (0.64 %)	7,326 (0.39 %)
259	goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank) GCA_001704415.1	0 (0.00 %)	n/a	19,842 (1.43 %)	22,426 (1.24 %)	52,608 (1.64 %)	43.16 (100.00 %)	0 (0 %)	790 (0.00 %)	29,906 (100.00 %)	5,669,868 (50.59 %)	760,836 (7.07 %)	13,024,386 (44.85 %)	0 (0 %)	2,571,292 (5.65 %)	125,682 (4.01 %)	44,489 (1.09 %)
260	goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq) GCF_001704415.1	47,206 (2.31 %)	46,486 (2.23 %)	19,857 (1.43 %)	22,880 (1.27 %)	52,608 (1.64 %)	43.16 (100.00 %)	0 (0 %)	790 (0.00 %)	29,907 (100.00 %)	5,578,287 (50.22 %)	760,837 (7.07 %)	13,024,440 (44.85 %)	0 (0 %)	2,571,292 (5.65 %)	125,682 (4.02 %)	44,510 (1.09 %)
261	golden eagle (v1.2 2019) GCF_900496995.1	55,164 (5.86 %)	n/a	13,226 (1.87 %)	23,033 (2.15 %)	25,921 (3.22 %)	42.11 (99.61 %)	0 (0 %)	191 (0.39 %)	142 (100.00 %)	519,341 (5.86 %)	180,990 (0.79 %)	7,005,531 (19.25 %)	1 (0.00 %)	53,053 (0.51 %)	37,343 (3.12 %)	34,701 (1.97 %)
262	golden eagle (v1.2 alternate hap 2019) GCA_902153765.1	n/a	n/a	9,334 (1.82 %)	17,594 (2.12 %)	n/a	42.53 (99.93 %)	0 (0 %)	39 (0.07 %)	3,860 (100.00 %)	356,284 (6.03 %)	123,430 (0.80 %)	4,417,887 (19.25 %)	0 (0 %)	53,254 (0.85 %)	28,919 (3.52 %)	25,970 (2.20 %)
263	golden hamster (Baylor 2013 genbank) GCA_000349665.1	0 (0.00 %)	n/a	18,965 (1.82 %)	19,339 (1.52 %)	n/a	42.01 (82.92 %)	216,216 (17.12 %)	216,216 (17.12 %)	237,699 (82.88 %)	3,724,142 (27.19 %)	790,256 (1.69 %)	12,003,866 (24.29 %)	3,589 (0.05 %)	254,929 (0.76 %)	18,591 (0.51 %)	17,093 (0.42 %)
264	golden snub-nosed monkey (2014 Novogene) GCA_000769185.1	n/a	n/a	21,341 (1.86 %)	22,492 (1.24 %)	n/a	40.87 (98.50 %)	61,291 (1.50 %)	61,291 (1.50 %)	196,804 (98.50 %)	5,673,299 (51.36 %)	1,080,627 (3.06 %)	16,205,827 (36.77 %)	187 (0.01 %)	1,068,178 (2.78 %)	79,387 (1.14 %)	27,171 (0.63 %)
265	gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 genbank) GCA_029215685.1	n/a	n/a	12,291 (1.06 %)	19,125 (2.02 %)	n/a	40.55 (100.00 %)	584 (0.00 %)	584 (0.00 %)	1,233 (100.00 %)	1,259,781 (7.92 %)	925,571 (7.56 %)	7,739,320 (45.92 %)	3 (0.00 %)	840,495 (4.04 %)	73,681 (2.81 %)	26,366 (0.92 %)
266	grape phylloxera (Bord-2020 2022 genbank) GCA_025091365.1	n/a	n/a	2,982 (0.90 %)	5,710 (2.77 %)	n/a	27.24 (97.73 %)	0 (0 %)	41,970 (2.29 %)	8,544 (100.00 %)	195,538 (3.32 %)	65,664 (2.79 %)	2,529,566 (54.06 %)	4,954 (0.23 %)	100,935 (4.52 %)	4,357 (1.18 %)	3,416 (0.91 %)
267	gray mouse lemur genbank GCA_000165445.3	n/a	n/a	20,031 (1.89 %)	22,619 (1.50 %)	n/a	40.98 (95.94 %)	43,305 (4.06 %)	43,363 (4.06 %)	50,982 (95.94 %)	4,082,873 (41.60 %)	582,430 (1.47 %)	14,808,558 (30.05 %)	325 (0.02 %)	1,168,690 (4.77 %)	74,772 (2.61 %)	69,260 (2.12 %)
268	gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank) GCA_027887165.1	73,383 (42.66 %)	n/a	16,638 (0.72 %)	16,171 (0.86 %)	n/a	37.92 (99.11 %)	0 (0 %)	2,255 (0.89 %)	14 (100.00 %)	5,562,366 (25.40 %)	1,096,625 (2.60 %)	22,322,798 (43.37 %)	13 (0.00 %)	n/a	28,894 (0.57 %)	22,987 (0.42 %)
269	great fruit-eating bat (v1 hap1 2024) GCA_038363095.1	n/a	n/a	18,022 (1.56 %)	20,018 (1.52 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	0 (0 %)	81 (0.00 %)	419 (100.00 %)	2,827,417 (26.82 %)	371,479 (4.97 %)	11,603,093 (34.64 %)	1 (0.00 %)	522,672 (1.87 %)	71,574 (2.28 %)	54,020 (1.50 %)
270	great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank) GCA_001890085.1	50,937 (43.78 %)	n/a	19,011 (2.00 %)	19,882 (1.66 %)	41,741 (2.41 %)	41.11 (87.42 %)	0 (0 %)	172,751 (12.60 %)	7,570 (100.00 %)	3,078,210 (32.07 %)	495,290 (1.05 %)	11,588,202 (25.43 %)	2,116 (0.03 %)	193,024 (1.10 %)	33,101 (0.97 %)	30,240 (0.87 %)
271	great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq) GCF_001890085.1	50,937 (3.26 %)	n/a	18,992 (2.00 %)	19,880 (1.66 %)	41,778 (2.41 %)	41.11 (87.42 %)	0 (0 %)	172,751 (12.60 %)	7,571 (100.00 %)	3,285,971 (33.14 %)	495,292 (1.05 %)	11,588,248 (25.43 %)	2,116 (0.03 %)	193,024 (1.10 %)	33,101 (0.97 %)	29,553 (0.86 %)
272	greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020) GCA_014108255.1	n/a	41,563 (2.11 %)	18,531 (1.97 %)	20,309 (1.67 %)	n/a	40.52 (99.19 %)	0 (0 %)	292 (0.81 %)	50 (100.00 %)	3,284,473 (35.00 %)	559,653 (1.29 %)	12,043,562 (29.15 %)	0 (0 %)	155,142 (0.71 %)	32,047 (1.05 %)	30,235 (0.96 %)
273	greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank) GCA_004115265.2	53,353 (46.77 %)	n/a	18,647 (1.97 %)	20,359 (1.68 %)	n/a	40.54 (99.64 %)	0 (0 %)	158 (0.36 %)	135 (100.00 %)	3,301,020 (34.99 %)	564,790 (1.35 %)	12,217,069 (29.39 %)	0 (0 %)	171,202 (0.67 %)	32,445 (1.06 %)	30,625 (0.98 %)
274	greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq) GCF_004115265.1	53,352 (3.13 %)	n/a	18,647 (1.97 %)	20,359 (1.68 %)	n/a	40.54 (99.64 %)	0 (0 %)	158 (0.36 %)	134 (100.00 %)	3,300,836 (34.99 %)	564,789 (1.35 %)	12,217,020 (29.39 %)	0 (0 %)	171,202 (0.67 %)	32,445 (1.06 %)	30,627 (0.98 %)
275	greater mouse-eared bat (2019 Broad) GCA_004026985.1	n/a	n/a	23,153 (1.31 %)	51,642 (1.43 %)	n/a	43.16 (99.88 %)	8,133 (0.04 %)	8,133 (0.04 %)	1,053,330 (99.96 %)	3,675,075 (25.48 %)	938,700 (2.73 %)	12,027,923 (39.01 %)	44 (0.00 %)	n/a	80,955 (2.31 %)	64,379 (1.67 %)
276	greater pipefish (v1.1 2019) GCA_901709675.1	n/a	n/a	13,467 (5.26 %)	42,380 (12.01 %)	n/a	43.46 (100.00 %)	0 (0 %)	43 (0.00 %)	87 (100.00 %)	193,442 (3.05 %)	125,716 (4.25 %)	1,676,004 (25.93 %)	0 (0 %)	112,918 (3.25 %)	46,340 (13.40 %)	32,897 (5.93 %)
277	greater sac-winged bat (primary hap 2024 genbank) GCA_036850765.1	n/a	n/a	18,322 (1.40 %)	21,049 (1.35 %)	n/a	41.71 (98.73 %)	102 (0.41 %)	468 (1.27 %)	359 (99.59 %)	4,247,148 (29.53 %)	1,031,385 (2.50 %)	12,465,194 (43.30 %)	3 (0.00 %)	1,113,639 (2.95 %)	101,620 (2.01 %)	44,590 (1.04 %)
278	greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank) GCA_003640425.2	20,814 (51.89 %)	n/a	4,346 (0.99 %)	12,930 (3.50 %)	21,226 (7.60 %)	33.06 (99.10 %)	0 (0 %)	27,314 (0.92 %)	13,303 (100.00 %)	270,925 (3.18 %)	86,050 (1.20 %)	3,416,162 (48.29 %)	102 (0.01 %)	135,364 (1.95 %)	11,043 (1.07 %)	7,092 (0.63 %)
279	green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007) GCF_000002595.1	14,484 (22.24 %)	n/a	987 (0.55 %)	11,299 (59.37 %)	n/a	63.87 (87.58 %)	9,827 (12.45 %)	10,425 (12.45 %)	11,385 (87.55 %)	167,652 (16.23 %)	100,391 (4.60 %)	734,057 (30.38 %)	3 (0.00 %)	37,459 (3.99 %)	3,154 (63.45 %)	17,305 (12.08 %)
280	green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank) GCA_000002595.3	n/a	19,528 (53.99 %)	988 (0.56 %)	9,689 (59.71 %)	n/a	64.08 (96.36 %)	1,459 (3.65 %)	1,459 (3.65 %)	1,512 (96.35 %)	171,684 (17.03 %)	110,553 (6.12 %)	748,240 (34.06 %)	26 (0.03 %)	48,564 (5.08 %)	106 (99.48 %)	15,883 (12.21 %)
281	green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank) GCA_000147415.1	9,780 (62.01 %)	9,780 (32.79 %)	743 (1.01 %)	4,520 (67.55 %)	n/a	67.14 (91.48 %)	3,396 (8.55 %)	3,543 (8.55 %)	3,810 (91.45 %)	65,787 (8.35 %)	28,736 (2.86 %)	416,740 (37.15 %)	0 (0 %)	6,856 (2.06 %)	776 (95.90 %)	9,593 (9.00 %)
282	green monkey 1994-021 (2014 genbank) GCA_000409795.2	76,037 (46.89 %)	n/a	20,079 (1.94 %)	20,246 (1.25 %)	n/a	40.81 (98.67 %)	160,731 (1.35 %)	178,925 (1.35 %)	163,017 (98.65 %)	5,382,039 (50.20 %)	980,479 (2.63 %)	16,076,172 (35.62 %)	23,631 (0.16 %)	934,122 (2.70 %)	50,033 (1.04 %)	27,104 (0.75 %)
283	green sea turtle (BGI 2013) GCF_000344595.1	31,786 (2.57 %)	n/a	14,548 (1.02 %)	15,297 (1.46 %)	n/a	43.49 (95.57 %)	134,344 (4.44 %)	134,344 (4.44 %)	274,367 (95.56 %)	1,615,553 (13.87 %)	317,600 (2.08 %)	11,732,990 (28.32 %)	129 (0.02 %)	n/a	36,782 (0.70 %)	21,797 (0.42 %)
284	green sea turtle (v1 2020) GCF_015237465.1	56,917 (3.63 %)	n/a	14,729 (1.06 %)	17,439 (1.56 %)	n/a	44.01 (99.44 %)	0 (0 %)	294 (0.56 %)	99 (100.00 %)	1,641,730 (15.08 %)	304,356 (1.25 %)	11,136,918 (31.96 %)	0 (0 %)	429,794 (1.68 %)	49,035 (1.44 %)	26,943 (0.68 %)
285	harbor porpoise (BS71 2019) GCA_004363495.1	n/a	n/a	21,044 (1.46 %)	30,072 (1.23 %)	n/a	41.83 (99.88 %)	7,114 (0.03 %)	7,114 (0.03 %)	1,338,272 (99.97 %)	5,359,537 (46.83 %)	772,736 (1.54 %)	13,705,428 (42.29 %)	44 (0.00 %)	n/a	80,965 (1.65 %)	55,941 (1.28 %)
286	Harpy eagle (primary hap 2022 genbank) GCA_026419915.1	51,641 (50.37 %)	n/a	13,412 (1.70 %)	24,002 (2.05 %)	n/a	43.39 (99.80 %)	0 (0 %)	342 (0.20 %)	322 (100.00 %)	456,476 (3.62 %)	260,495 (7.70 %)	5,658,773 (24.81 %)	1 (0.00 %)	480,042 (2.70 %)	60,606 (5.66 %)	30,636 (1.52 %)
287	Hawaiian crow (2021 genbank) GCA_020740725.1	51,593 (54.67 %)	n/a	12,737 (1.83 %)	23,664 (2.30 %)	n/a	43.30 (99.84 %)	0 (0 %)	294 (0.16 %)	187 (100.00 %)	502,844 (6.10 %)	304,680 (5.73 %)	5,953,316 (23.59 %)	3 (0.00 %)	336,844 (2.41 %)	46,108 (3.49 %)	24,228 (1.26 %)
288	Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank) GCA_002201575.1	0 (0.00 %)	n/a	19,385 (1.74 %)	20,265 (1.41 %)	33,375 (1.66 %)	41.41 (97.77 %)	0 (0 %)	38,833 (2.24 %)	7,871 (100.00 %)	4,629,031 (43.70 %)	573,328 (1.09 %)	13,374,887 (33.10 %)	882 (0.03 %)	587,399 (1.58 %)	50,379 (1.45 %)	46,745 (1.27 %)
289	Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq) GCF_002201575.1	29,897 (1.95 %)	29,595 (1.94 %)	19,404 (1.74 %)	20,264 (1.41 %)	33,412 (1.67 %)	41.41 (97.77 %)	0 (0 %)	38,833 (2.24 %)	7,872 (100.00 %)	4,547,865 (43.29 %)	573,335 (1.09 %)	13,374,928 (33.10 %)	882 (0.03 %)	587,410 (1.58 %)	50,380 (1.45 %)	46,841 (1.28 %)
290	hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank) GCA_030028045.1	64,153 (41.00 %)	n/a	20,337 (1.62 %)	20,633 (1.37 %)	n/a	41.60 (100.00 %)	0 (0 %)	226 (0.00 %)	356 (100.00 %)	3,783,435 (35.17 %)	567,796 (3.38 %)	13,462,481 (35.48 %)	2 (0.00 %)	396,368 (1.55 %)	48,365 (1.91 %)	44,048 (1.34 %)
291	Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020) GCF_014824575.1	49,894 (2.81 %)	n/a	18,317 (1.66 %)	19,991 (1.63 %)	n/a	42.33 (99.79 %)	0 (0 %)	38,823 (0.21 %)	27,486 (100.00 %)	2,844,834 (29.10 %)	367,443 (1.49 %)	11,805,151 (31.26 %)	151 (0.00 %)	330,522 (1.83 %)	59,262 (1.70 %)	48,287 (1.35 %)
292	honeybee mite (v1 2017) GCF_002443255.1	35,654 (12.86 %)	n/a	2,741 (0.61 %)	28,868 (8.05 %)	n/a	40.92 (99.93 %)	0 (0 %)	3,073 (0.07 %)	1,426 (100.00 %)	117,879 (1.26 %)	43,685 (1.30 %)	1,858,762 (15.09 %)	11 (0.00 %)	32,482 (0.75 %)	31,400 (5.04 %)	28,693 (3.46 %)
293	hooded crow (v2 S_Up_H32 2017) GCF_000738735.2	35,874 (6.47 %)	n/a	11,298 (1.84 %)	17,627 (2.12 %)	n/a	41.48 (97.07 %)	0 (0 %)	27,795 (2.94 %)	113 (100.00 %)	392,199 (5.95 %)	139,126 (0.76 %)	6,141,002 (18.21 %)	16 (0.00 %)	38,866 (0.37 %)	12,943 (0.48 %)	10,321 (0.36 %)
294	hooded crow (v5 S_Up_H32 2021) GCF_000738735.5	42,799 (57.51 %)	n/a	11,845 (1.92 %)	20,738 (2.23 %)	n/a	42.10 (99.68 %)	0 (0 %)	425 (0.32 %)	47 (100.00 %)	421,463 (6.12 %)	164,830 (0.93 %)	6,148,741 (19.00 %)	0 (0 %)	77,475 (0.63 %)	25,266 (2.09 %)	20,747 (1.24 %)
295	horse (Twilight 2007 genbank) GCA_000002305.1	n/a	n/a	18,575 (1.67 %)	17,121 (1.34 %)	n/a	41.50 (98.14 %)	45,680 (1.86 %)	45,680 (1.86 %)	55,316 (98.14 %)	3,941,878 (45.17 %)	381,229 (1.99 %)	14,674,265 (29.80 %)	3 (0.00 %)	384,525 (1.12 %)	45,521 (1.52 %)	36,682 (0.85 %)
296	hourglass treefrog (paternal 2023 genbank) GCA_027789765.1	n/a	n/a	14,058 (0.89 %)	31,050 (2.69 %)	n/a	43.97 (99.70 %)	0 (0 %)	804 (0.30 %)	2,200 (100.00 %)	906,816 (2.43 %)	1,710,859 (17.48 %)	10,069,798 (51.41 %)	3 (0.00 %)	3,539,111 (9.05 %)	235,277 (5.56 %)	28,414 (0.63 %)
297	house finch (primary hap 2022 genbank) GCA_027477595.1	43,228 (49.63 %)	n/a	12,700 (1.83 %)	24,567 (2.38 %)	n/a	42.91 (99.02 %)	0 (0 %)	295 (0.98 %)	183 (100.00 %)	440,379 (3.17 %)	463,164 (6.37 %)	6,300,100 (23.47 %)	1 (0.00 %)	573,829 (3.39 %)	30,897 (2.53 %)	22,852 (1.24 %)
298	house fly (aabys 2013 genbank) GCA_000371365.1	n/a	n/a	7,825 (1.36 %)	12,819 (3.07 %)	n/a	35.11 (92.22 %)	83,567 (7.82 %)	102,610 (7.82 %)	104,053 (92.18 %)	415,874 (2.30 %)	376,409 (8.80 %)	4,931,104 (52.61 %)	1,284 (0.11 %)	575,203 (6.40 %)	7,139 (0.35 %)	3,214 (0.17 %)
299	house mouse (AKR_J v1 2016) GCA_001624295.1	n/a	n/a	21,299 (2.19 %)	18,730 (1.41 %)	102,168 (4.09 %)	41.70 (86.82 %)	34,083 (4.00 %)	314,064 (13.22 %)	40,550 (96.00 %)	5,186,721 (40.97 %)	1,485,719 (3.05 %)	13,610,761 (27.42 %)	18,106 (1.03 %)	469,625 (2.17 %)	16,745 (0.41 %)	15,817 (0.38 %)
300	house mouse (A_J v1 2016) GCA_001624215.1	n/a	n/a	21,171 (2.20 %)	18,776 (1.40 %)	102,254 (4.12 %)	41.70 (89.34 %)	28,597 (3.99 %)	365,877 (10.71 %)	33,692 (96.01 %)	5,186,523 (40.90 %)	1,483,826 (3.06 %)	13,614,266 (28.13 %)	38,843 (1.02 %)	487,933 (2.04 %)	16,590 (0.42 %)	15,701 (0.39 %)
301	house mouse (BALB_cJ v1 2016) GCA_001632525.1	n/a	n/a	21,337 (2.21 %)	18,682 (1.41 %)	102,138 (4.14 %)	41.74 (88.91 %)	32,984 (4.16 %)	361,689 (11.14 %)	37,453 (95.84 %)	5,096,953 (40.72 %)	1,407,754 (2.90 %)	13,416,041 (27.66 %)	15,793 (0.80 %)	453,227 (1.90 %)	16,788 (0.42 %)	15,890 (0.39 %)
302	house mouse (C3H_HeJ v1 2016) GCA_001632575.1	n/a	n/a	21,177 (2.22 %)	18,550 (1.42 %)	101,710 (4.15 %)	41.74 (85.90 %)	32,785 (4.09 %)	369,499 (14.15 %)	37,497 (95.91 %)	5,089,496 (40.41 %)	1,399,438 (2.72 %)	13,485,480 (26.52 %)	19,436 (0.94 %)	427,663 (1.66 %)	16,675 (0.41 %)	15,897 (0.38 %)
303	house mouse (CBA_J v1 2016) GCA_001624475.1	n/a	n/a	21,259 (2.23 %)	18,593 (1.42 %)	101,632 (4.14 %)	41.78 (79.43 %)	36,013 (3.86 %)	410,639 (20.63 %)	42,242 (96.14 %)	5,081,543 (40.40 %)	1,393,763 (2.54 %)	13,472,532 (24.46 %)	24,180 (1.46 %)	418,702 (1.72 %)	16,809 (0.38 %)	15,953 (0.35 %)
304	house mouse (DBA_2J v1 2016) GCA_001624505.1	n/a	n/a	21,156 (2.23 %)	18,610 (1.43 %)	101,908 (4.18 %)	41.80 (88.67 %)	37,461 (4.86 %)	409,306 (11.39 %)	42,324 (95.14 %)	5,028,217 (40.37 %)	1,364,702 (2.73 %)	13,540,805 (27.33 %)	13,245 (0.55 %)	420,635 (1.47 %)	16,544 (0.42 %)	15,786 (0.39 %)
305	house mouse (FVB_NJ v1 2016) GCA_001624535.1	n/a	n/a	21,195 (2.22 %)	18,615 (1.42 %)	101,520 (4.15 %)	41.75 (89.39 %)	61,976 (6.27 %)	380,840 (10.66 %)	67,805 (93.73 %)	5,037,447 (40.28 %)	1,381,859 (2.89 %)	13,440,164 (27.32 %)	14,811 (0.71 %)	426,149 (1.81 %)	16,625 (0.42 %)	15,829 (0.39 %)
306	house mouse (GRCm38.p6 2017) GCF_000001635.26	123,667 (4.49 %)	n/a	24,134 (2.09 %)	22,855 (1.67 %)	n/a	41.73 (97.18 %)	676 (2.82 %)	904 (2.82 %)	21,179 (97.18 %)	5,554,281 (45.50 %)	1,695,255 (3.40 %)	13,041,229 (35.91 %)	3 (0.00 %)	889,196 (2.45 %)	25,014 (0.54 %)	16,961 (0.40 %)
307	house mouse (LP_J v1 2016) GCA_001632615.1	n/a	n/a	21,012 (2.23 %)	18,555 (1.43 %)	101,892 (4.18 %)	41.78 (84.14 %)	34,444 (4.11 %)	402,247 (15.91 %)	38,542 (95.89 %)	5,032,748 (40.03 %)	1,373,374 (2.60 %)	13,411,126 (25.61 %)	18,175 (0.88 %)	405,473 (1.47 %)	16,668 (0.40 %)	15,888 (0.37 %)
308	house mouse (NOD_ShiLtJ v1 2016) GCA_001624675.1	n/a	n/a	21,291 (2.24 %)	19,697 (1.47 %)	101,562 (4.18 %)	42.00 (77.13 %)	60,087 (4.21 %)	595,433 (22.95 %)	66,154 (95.79 %)	5,059,815 (40.57 %)	1,370,443 (2.51 %)	13,251,532 (23.62 %)	36,838 (1.54 %)	452,044 (2.17 %)	18,188 (0.42 %)	17,273 (0.39 %)
309	house mouse (NZO_HlLtJ v1 2016) GCA_001624745.1	n/a	n/a	21,233 (2.22 %)	18,805 (1.43 %)	103,134 (4.18 %)	41.74 (86.47 %)	49,204 (4.63 %)	337,909 (13.58 %)	57,439 (95.37 %)	5,112,301 (40.60 %)	1,418,629 (2.92 %)	13,588,055 (27.01 %)	21,209 (1.18 %)	440,820 (2.04 %)	16,857 (0.41 %)	15,946 (0.38 %)
310	human (GRCh38.p13 2019) GCF_000001405.39	172,809 (4.43 %)	n/a	23,121 (1.97 %)	27,697 (1.78 %)	n/a	41.04 (95.07 %)	827 (4.93 %)	1,268 (4.93 %)	46,029 (95.07 %)	5,859,855 (52.78 %)	1,037,733 (4.60 %)	16,933,424 (36.88 %)	12 (0.00 %)	1,408,888 (2.55 %)	56,646 (1.06 %)	31,442 (0.75 %)
311	human (GRCh38.p14 2022) GCF_000001405.40	188,352 (5.12 %)	n/a	23,474 (1.98 %)	28,557 (1.86 %)	n/a	41.05 (95.10 %)	829 (4.90 %)	1,270 (4.90 %)	46,502 (95.10 %)	5,910,293 (52.77 %)	1,047,827 (4.59 %)	17,068,934 (36.82 %)	12 (0.00 %)	1,423,169 (2.56 %)	57,427 (1.07 %)	31,985 (0.75 %)
312	human (NA24385.mat 2021) GCA_018852615.1	n/a	n/a	20,744 (1.84 %)	21,968 (1.22 %)	233,779 (4.92 %)	40.85 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	445 (100.00 %)	5,435,410 (53.40 %)	1,086,871 (8.27 %)	15,970,867 (40.97 %)	0 (0 %)	1,819,917 (3.54 %)	53,581 (1.32 %)	29,359 (0.79 %)
313	human (NA24385.mat 2022) GCA_021951015.1	n/a	n/a	20,809 (1.82 %)	21,369 (1.18 %)	234,089 (4.92 %)	40.85 (99.95 %)	0 (0 %)	109 (0.05 %)	355 (100.00 %)	5,489,855 (53.93 %)	1,085,681 (8.26 %)	15,968,830 (40.95 %)	0 (0 %)	1,817,110 (3.54 %)	53,511 (1.32 %)	30,302 (0.84 %)
314	human (NA24385.pat 2021) GCA_018852605.1	n/a	n/a	19,919 (1.83 %)	21,582 (1.22 %)	227,333 (4.91 %)	40.87 (100.00 %)	0 (0 %)	5 (0.00 %)	610 (100.00 %)	5,215,774 (53.54 %)	1,094,036 (9.09 %)	15,125,069 (41.29 %)	0 (0 %)	1,903,592 (3.87 %)	52,653 (1.34 %)	28,881 (0.81 %)
315	human (NA24385.pat 2022) GCA_021950905.1	n/a	n/a	20,014 (1.81 %)	20,716 (1.19 %)	227,278 (4.91 %)	40.87 (99.97 %)	0 (0 %)	117 (0.03 %)	514 (100.00 %)	5,293,356 (54.01 %)	1,100,786 (9.09 %)	15,122,569 (41.27 %)	2 (0.00 %)	1,900,161 (3.87 %)	52,546 (1.35 %)	29,891 (0.86 %)
316	human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank) GCA_000845685.2	n/a	115 (79.56 %)	n/a	n/a	n/a	42.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	33 (1.67 %)	36 (4.27 %)	603 (9.83 %)	0 (0 %)	52 (1.87 %)	3 (13.72 %)	2 (13.38 %)
317	human T2T CHM13 v2.0 GCA_009914755.4	108,944 (51.73 %)	n/a	20,844 (1.79 %)	21,287 (1.16 %)	n/a	40.75 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25 (100.00 %)	5,591,082 (54.45 %)	1,155,353 (8.89 %)	16,163,340 (41.63 %)	0 (0 %)	2,006,129 (3.86 %)	52,408 (1.38 %)	30,616 (0.83 %)
318	Iberian mole (v1 TD23 2020) GCF_014898055.1	46,872 (2.59 %)	n/a	18,566 (1.67 %)	20,793 (1.59 %)	n/a	41.91 (99.98 %)	0 (0 %)	3,640 (0.02 %)	4,425 (100.00 %)	3,269,038 (31.47 %)	501,677 (1.32 %)	11,176,747 (32.61 %)	2 (0.00 %)	644,819 (2.55 %)	48,076 (2.80 %)	43,577 (2.14 %)
319	Iberian mole (v2 TD23 2020) GCF_014898055.2	46,746 (2.60 %)	n/a	18,453 (1.69 %)	20,410 (1.59 %)	n/a	41.90 (99.98 %)	0 (0 %)	3,639 (0.02 %)	3,202 (100.00 %)	2,637,156 (23.36 %)	497,087 (1.30 %)	10,984,260 (32.64 %)	2 (0.00 %)	638,388 (2.54 %)	47,552 (2.89 %)	43,140 (2.46 %)
320	Indian glassy fish (v1 2019) GCF_900634625.1	44,096 (12.32 %)	n/a	15,337 (3.60 %)	23,988 (7.92 %)	60,224 (10.41 %)	42.38 (98.08 %)	0 (0 %)	1,523 (1.92 %)	156 (100.00 %)	346,406 (3.02 %)	163,522 (3.00 %)	2,755,229 (25.07 %)	0 (0 %)	235,504 (4.25 %)	17,930 (1.47 %)	9,748 (0.74 %)
321	Indian medaka GCF_002922805.1	47,300 (9.26 %)	n/a	14,561 (2.50 %)	31,867 (6.43 %)	n/a	39.04 (94.73 %)	0 (0 %)	51,440 (5.29 %)	8,603 (100.00 %)	319,637 (2.20 %)	208,749 (2.67 %)	5,412,794 (33.26 %)	180 (0.02 %)	209,615 (2.14 %)	40,721 (2.36 %)	28,619 (1.60 %)
322	Indianmeal moth (v1 USDA-ARS_2022_Savannah primary hap 2023) GCF_027563975.1	28,377 (14.36 %)	n/a	4,799 (1.56 %)	15,737 (7.20 %)	n/a	35.38 (100.00 %)	0 (0 %)	26 (0.00 %)	46 (100.00 %)	136,242 (3.33 %)	48,275 (1.61 %)	2,518,372 (36.69 %)	0 (0 %)	71,420 (2.05 %)	14,106 (2.86 %)	9,147 (1.55 %)
323	Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad) GCA_004027435.1	n/a	n/a	21,188 (1.26 %)	41,550 (1.34 %)	35,477 (1.51 %)	42.19 (99.92 %)	4,324 (0.02 %)	4,324 (0.02 %)	798,700 (99.98 %)	3,297,388 (28.66 %)	476,792 (1.23 %)	13,144,912 (34.13 %)	14 (0.00 %)	n/a	81,685 (1.86 %)	59,284 (1.43 %)
324	Japanese quail GCF_001577835.1	47,008 (7.38 %)	n/a	12,864 (2.55 %)	36,126 (11.03 %)	n/a	41.28 (98.88 %)	7,630 (1.12 %)	11,601 (1.12 %)	9,642 (98.88 %)	466,141 (6.58 %)	321,128 (2.22 %)	5,497,911 (19.81 %)	628 (0.03 %)	160,342 (1.32 %)	17,977 (1.86 %)	15,897 (1.26 %)
325	Japanese sawshark (hap1 2024 genbank) GCA_044704955.1	n/a	n/a	14,672 (0.28 %)	30,181 (0.79 %)	n/a	47.02 (99.98 %)	0 (0 %)	5,985 (0.02 %)	4,317 (100.00 %)	1,167,498 (3.08 %)	2,399,496 (18.16 %)	10,302 (99.98 %)	38 (0.00 %)	5,044,826 (4.94 %)	503,637 (6.56 %)	489,893 (6.05 %)
326	Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018) GCF_003227715.1	29,097 (10.82 %)	n/a	4,337 (1.33 %)	43,907 (11.32 %)	n/a	44.75 (99.72 %)	0 (0 %)	499 (0.28 %)	857 (100.00 %)	439,110 (17.67 %)	262,539 (5.69 %)	1,834,301 (29.28 %)	3 (0.00 %)	159,215 (3.71 %)	6,204 (9.08 %)	5,973 (2.13 %)
327	kakapo (Jane v1 2019) GCF_004027225.1	49,444 (5.77 %)	n/a	13,114 (1.92 %)	17,732 (2.50 %)	29,004 (4.44 %)	41.97 (97.63 %)	0 (0 %)	362 (2.37 %)	99 (100.00 %)	548,758 (10.76 %)	208,171 (1.07 %)	6,258,082 (20.20 %)	0 (0 %)	165,436 (1.31 %)	22,279 (1.75 %)	19,230 (1.19 %)
328	kakapo (Jane v2 2020 genbank) GCA_004027225.2	49,757 (54.33 %)	n/a	13,112 (1.92 %)	17,637 (2.48 %)	n/a	41.97 (99.08 %)	0 (0 %)	373 (0.92 %)	90 (100.00 %)	507,072 (7.85 %)	208,180 (1.08 %)	6,258,178 (20.50 %)	0 (0 %)	165,532 (1.34 %)	22,278 (1.77 %)	19,230 (1.21 %)
329	koala (Bilbo 61053 2017) GCF_002099425.1	55,723 (2.15 %)	n/a	17,500 (0.86 %)	16,193 (0.94 %)	n/a	39.05 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	1,907 (100.00 %)	7,814,631 (41.58 %)	1,123,545 (2.03 %)	21,796,057 (39.25 %)	0 (0 %)	405,744 (0.85 %)	15,957 (0.35 %)	15,019 (0.30 %)
330	Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank) GCA_009829125.1	29,504 (53.56 %)	n/a	14,221 (2.37 %)	44,144 (5.80 %)	41,384 (6.20 %)	40.22 (99.05 %)	0 (0 %)	700 (0.95 %)	124 (100.00 %)	423,338 (4.48 %)	551,472 (7.22 %)	4,887,148 (38.97 %)	5 (0.00 %)	523,224 (4.75 %)	37,287 (2.58 %)	18,380 (0.95 %)
331	Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq) GCF_009829125.1	29,517 (6.48 %)	n/a	14,243 (2.37 %)	44,144 (5.80 %)	41,421 (6.20 %)	40.22 (99.05 %)	0 (0 %)	700 (0.95 %)	124 (100.00 %)	423,274 (4.48 %)	551,472 (7.22 %)	4,887,142 (38.97 %)	5 (0.00 %)	523,224 (4.75 %)	37,287 (2.58 %)	18,380 (0.95 %)
332	lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank) GCA_023638135.1	48,561 (51.20 %)	n/a	12,862 (1.69 %)	21,562 (1.92 %)	n/a	43.03 (99.83 %)	0 (0 %)	158 (0.17 %)	397 (100.00 %)	439,975 (3.77 %)	203,640 (6.96 %)	6,921,438 (23.57 %)	2 (0.00 %)	479,269 (2.67 %)	32,398 (2.65 %)	19,870 (0.89 %)
333	large cabbage white (genbank 2021) GCA_905147105.1	24,631 (60.59 %)	n/a	4,550 (1.47 %)	9,197 (5.18 %)	30,394 (12.69 %)	34.13 (100.00 %)	0 (0 %)	29 (0.00 %)	402 (100.00 %)	123,352 (2.30 %)	36,616 (6.05 %)	2,431,238 (41.04 %)	2 (0.00 %)	86,654 (3.36 %)	8,442 (2.49 %)	4,829 (1.03 %)
334	large tree shrew (BS70 2019 Broad) GCA_004365275.1	n/a	n/a	26,266 (0.71 %)	59,868 (0.81 %)	n/a	42.00 (99.77 %)	6,466 (0.02 %)	6,466 (0.02 %)	3,890,086 (99.98 %)	7,163,973 (22.64 %)	1,629,329 (2.64 %)	18,970,992 (42.82 %)	38 (0.00 %)	n/a	138,732 (1.75 %)	77,459 (1.17 %)
335	leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K) GCA_009764565.1	n/a	n/a	14,572 (1.03 %)	16,165 (1.42 %)	n/a	43.36 (99.74 %)	0 (0 %)	558 (0.26 %)	55 (100.00 %)	1,631,923 (15.09 %)	303,440 (1.14 %)	11,122,938 (34.12 %)	1 (0.00 %)	664,235 (2.49 %)	35,505 (1.37 %)	19,641 (0.51 %)
336	leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019) GCA_009762595.1	n/a	n/a	10,857 (1.01 %)	15,585 (1.46 %)	n/a	43.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8,982 (100.00 %)	1,090,219 (15.03 %)	206,192 (1.19 %)	7,154,939 (33.03 %)	0 (0 %)	432,559 (2.40 %)	25,155 (1.42 %)	14,585 (0.57 %)
337	leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K) GCF_009764565.2	62,576 (3.50 %)	n/a	14,610 (1.03 %)	16,359 (1.45 %)	n/a	43.35 (99.74 %)	0 (0 %)	667 (0.26 %)	40 (100.00 %)	1,637,236 (15.13 %)	304,730 (1.14 %)	11,121,967 (34.21 %)	3 (0.00 %)	670,755 (2.51 %)	35,485 (1.36 %)	19,615 (0.51 %)
338	Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank) GCA_000002875.2	n/a	8,389 (48.67 %)	591 (1.09 %)	4,193 (46.51 %)	n/a	59.58 (99.94 %)	0 (0 %)	454 (0.06 %)	76 (100.00 %)	24,390 (4.61 %)	4,228 (1.93 %)	243,087 (20.97 %)	1 (0.00 %)	5,939 (3.84 %)	92 (99.40 %)	72 (0.21 %)
339	Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank) GCA_000002725.2	n/a	8,731 (48.79 %)	626 (1.15 %)	4,290 (46.53 %)	n/a	59.72 (100.00 %)	7 (0.00 %)	7 (0.00 %)	43 (100.00 %)	33,021 (5.20 %)	8,477 (2.43 %)	238,932 (20.91 %)	0 (0 %)	6,726 (4.51 %)	41 (99.80 %)	27 (0.06 %)
340	Leishmania martiniquensis (LSCM1 2021 genbank) GCA_017916325.1	n/a	7,967 (45.66 %)	619 (1.14 %)	3,882 (44.58 %)	n/a	59.85 (100.00 %)	0 (0 %)	5 (0.00 %)	42 (100.00 %)	20,726 (2.91 %)	2,267 (2.64 %)	232,973 (20.45 %)	0 (0 %)	6,246 (4.12 %)	44 (99.29 %)	43 (0.15 %)
341	Leishmania orientalis (LSCM4 2021 genbank) GCA_017916335.1	n/a	8,158 (45.05 %)	643 (1.12 %)	4,666 (45.26 %)	n/a	59.72 (99.99 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	98 (100.00 %)	22,632 (2.47 %)	4,241 (2.74 %)	231,120 (20.18 %)	1 (0.00 %)	10,584 (6.63 %)	100 (99.82 %)	164 (0.40 %)
342	leopard (Maewha 2016 genbank) GCA_001857705.1	73,266 (49.50 %)	n/a	18,874 (1.62 %)	21,014 (1.44 %)	n/a	41.71 (96.17 %)	214,953 (3.85 %)	214,953 (3.85 %)	265,329 (96.15 %)	5,246,283 (42.87 %)	1,059,443 (5.13 %)	14,265,514 (32.20 %)	28,667 (1.17 %)	525,709 (5.63 %)	77,000 (2.45 %)	66,922 (1.91 %)
343	lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank) GCA_000280705.1	25,978 (33.60 %)	n/a	19,393 (1.38 %)	20,311 (1.35 %)	n/a	41.87 (87.17 %)	326,464 (12.87 %)	326,464 (12.87 %)	337,359 (87.13 %)	6,205,858 (38.76 %)	832,823 (1.53 %)	13,661,563 (33.98 %)	2,666 (0.03 %)	430,190 (1.14 %)	26,669 (0.59 %)	23,227 (0.47 %)
344	lesser kestrel (v1 2021) GCF_017639655.1	47,420 (5.64 %)	n/a	13,097 (1.80 %)	22,203 (2.07 %)	n/a	42.30 (99.66 %)	0 (0 %)	298 (0.34 %)	291 (100.00 %)	516,498 (5.58 %)	210,236 (1.26 %)	7,133,927 (19.19 %)	1 (0.00 %)	132,959 (0.79 %)	27,558 (2.21 %)	21,862 (1.03 %)
345	lesser rhea (primary hap 2023 genbank) GCA_028389875.1	39,024 (47.65 %)	n/a	13,358 (1.72 %)	23,870 (2.13 %)	n/a	42.45 (99.89 %)	0 (0 %)	128 (0.11 %)	179 (100.00 %)	674,141 (6.73 %)	329,122 (5.34 %)	6,820,211 (22.78 %)	1 (0.00 %)	266,226 (1.85 %)	45,073 (5.83 %)	38,575 (2.59 %)
346	lesser sac-winged bat (primary hap 2024 genbank) GCA_036850995.1	n/a	n/a	18,322 (1.42 %)	21,350 (1.39 %)	n/a	41.84 (99.24 %)	178 (0.49 %)	573 (0.76 %)	345 (99.51 %)	4,224,340 (28.69 %)	1,030,574 (2.60 %)	12,591,928 (42.30 %)	1 (0.00 %)	1,128,543 (2.95 %)	98,189 (2.06 %)	48,427 (1.15 %)
347	lesser salmon catfish (primary hap 2023 genbank) GCA_027579695.1	53,323 (53.05 %)	n/a	15,841 (0.90 %)	85,700 (3.30 %)	n/a	42.44 (99.43 %)	0 (0 %)	334 (0.57 %)	38 (100.00 %)	5,905,868 (49.76 %)	1,126,468 (6.51 %)	7,609,180 (62.74 %)	11 (0.00 %)	2,750,473 (9.00 %)	166,630 (4.38 %)	15,646 (0.27 %)
348	lettuce (Salinas v7 2018) GCF_002870075.1	60,760 (2.83 %)	n/a	16,272 (0.65 %)	109,234 (6.86 %)	n/a	37.79 (92.71 %)	0 (0 %)	350,251 (7.33 %)	11,453 (100.00 %)	946,986 (1.96 %)	983,572 (3.65 %)	12,334,735 (53.11 %)	2,244 (0.09 %)	1,823,579 (9.42 %)	117,678 (2.02 %)	19,900 (0.28 %)
349	lettuce (Salinas v8 2020) GCF_002870075.3	64,708 (2.94 %)	n/a	16,252 (0.65 %)	101,828 (6.36 %)	n/a	37.79 (92.44 %)	3,138 (0.29 %)	351,533 (7.59 %)	9,960 (99.71 %)	945,052 (1.95 %)	983,641 (3.64 %)	12,325,371 (53.00 %)	2,249 (0.09 %)	n/a	117,703 (2.02 %)	19,916 (0.28 %)
350	live sharksucker (v1 2019) GCF_900963305.1	40,255 (11.91 %)	n/a	14,975 (3.53 %)	22,304 (7.09 %)	56,266 (9.51 %)	41.43 (99.89 %)	0 (0 %)	140 (0.11 %)	38 (100.00 %)	448,828 (3.61 %)	146,353 (1.65 %)	3,204,476 (21.79 %)	0 (0 %)	109,664 (1.83 %)	16,807 (1.33 %)	12,095 (0.89 %)
351	long-tailed hermit (v1 PSU5 primary hap 2022) GCA_023637945.1	n/a	n/a	12,328 (2.02 %)	20,312 (2.34 %)	n/a	41.00 (99.63 %)	141 (0.37 %)	141 (0.37 %)	211 (99.63 %)	497,506 (5.06 %)	265,815 (1.51 %)	6,045,702 (20.10 %)	0 (0 %)	100,035 (0.84 %)	15,922 (1.43 %)	13,768 (0.94 %)
352	lumpfish (primary hap 2019 genbank) GCA_009769545.1	41,612 (58.17 %)	n/a	14,748 (3.32 %)	49,223 (8.10 %)	52,721 (8.34 %)	42.83 (98.22 %)	0 (0 %)	347 (1.78 %)	49 (100.00 %)	478,416 (6.02 %)	421,634 (11.07 %)	2,928,668 (27.98 %)	1 (0.00 %)	655,785 (6.31 %)	53,323 (5.09 %)	32,724 (2.40 %)
353	Ma's night monkey genbank GCA_000952055.2	55,061 (41.68 %)	n/a	21,084 (1.92 %)	22,287 (1.31 %)	n/a	40.74 (94.86 %)	83,929 (5.15 %)	83,929 (5.15 %)	112,850 (94.85 %)	5,109,404 (47.71 %)	734,754 (2.02 %)	15,854,134 (33.62 %)	2,334 (0.15 %)	767,102 (3.42 %)	36,070 (0.90 %)	31,862 (0.80 %)
354	malaria parasite P. falciparum (3D7 2016 genbank) GCA_000002765.3	n/a	14,866 (53.86 %)	n/a	n/a	n/a	19.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16 (100.00 %)	79,857 (19.18 %)	78,154 (15.50 %)	186,960 (66.90 %)	0 (0 %)	31,278 (6.16 %)	22 (0.04 %)	14 (0.02 %)
355	Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank) GCA_001685135.1	48,578 (30.31 %)	n/a	19,449 (1.56 %)	24,645 (1.37 %)	41,235 (1.95 %)	40.78 (92.27 %)	0 (0 %)	984,656 (7.81 %)	80,669 (100.00 %)	3,063,619 (35.20 %)	866,306 (3.08 %)	13,310,826 (28.76 %)	389,500 (1.56 %)	884,201 (3.10 %)	35,558 (0.84 %)	33,754 (0.78 %)
356	malo sina (v1 2012) GCF_000231095.1	29,549 (16.44 %)	n/a	15,120 (6.45 %)	49,515 (30.69 %)	n/a	40.48 (93.32 %)	20,693 (6.71 %)	20,693 (6.71 %)	23,184 (93.29 %)	115,049 (2.29 %)	51,516 (1.90 %)	1,488,940 (24.12 %)	25 (0.03 %)	35,840 (1.56 %)	42,077 (12.05 %)	32,193 (7.48 %)
357	mangrove rivulus GCF_001649575.1	45,306 (11.02 %)	n/a	14,510 (2.84 %)	29,750 (6.81 %)	n/a	40.03 (94.35 %)	0 (0 %)	29,388 (5.66 %)	3,073 (100.00 %)	345,930 (2.32 %)	146,268 (1.33 %)	4,717,260 (27.31 %)	231 (0.09 %)	62,480 (1.04 %)	39,557 (2.69 %)	29,549 (1.76 %)
358	meadow brown (genbank 2021) GCA_905333055.1	29,488 (69.09 %)	n/a	4,863 (1.16 %)	19,812 (6.60 %)	27,763 (8.31 %)	36.96 (100.00 %)	0 (0 %)	21 (0.00 %)	32 (100.00 %)	227,482 (2.41 %)	107,773 (3.02 %)	2,456,144 (43.97 %)	0 (0 %)	297,573 (6.20 %)	24,873 (3.15 %)	12,170 (1.54 %)
359	meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank) GCA_006229205.1	n/a	n/a	19,020 (1.63 %)	19,812 (1.43 %)	42,441 (2.08 %)	41.68 (99.72 %)	0 (0 %)	65,245 (0.28 %)	63,791 (100.00 %)	4,552,310 (40.02 %)	634,179 (1.21 %)	13,631,635 (32.17 %)	5,134 (0.09 %)	236,044 (0.75 %)	64,849 (2.13 %)	63,058 (1.88 %)
360	meerkat (BS45 2019 Broad) GCA_004023905.1	n/a	n/a	21,726 (1.54 %)	31,908 (1.39 %)	n/a	41.89 (99.96 %)	4,153 (0.02 %)	4,153 (0.02 %)	354,021 (99.98 %)	4,835,157 (40.73 %)	693,037 (1.32 %)	13,779,279 (33.49 %)	21 (0.00 %)	224,239 (0.53 %)	76,740 (2.37 %)	72,844 (2.03 %)
361	melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014) GCF_000806345.1	26,008 (10.49 %)	n/a	7,743 (3.09 %)	12,206 (6.18 %)	n/a	35.15 (84.42 %)	37,430 (15.62 %)	37,430 (15.62 %)	43,002 (84.38 %)	237,943 (3.36 %)	74,977 (1.26 %)	2,410,203 (31.96 %)	376 (0.08 %)	35,789 (1.03 %)	15,259 (2.01 %)	8,482 (1.01 %)
362	microsporidians E.bieneusi (H348 2009 genbank) GCA_000209485.1	n/a	3,804 (69.39 %)	238 (3.03 %)	394 (8.09 %)	n/a	33.70 (99.89 %)	10 (0.03 %)	437 (0.04 %)	1,743 (99.97 %)	1,511 (2.99 %)	268 (0.36 %)	31,900 (26.59 %)	0 (0 %)	57 (0.18 %)	373 (7.62 %)	360 (7.39 %)
363	microsporidians E.cuniculi (v1 GB-M1 2002) GCF_000091225.1	1,996 (85.79 %)	n/a	1,569 (68.26 %)	596 (33.73 %)	n/a	47.31 (99.97 %)	4 (0.03 %)	4 (0.03 %)	15 (99.97 %)	257 (0.70 %)	199 (0.40 %)	10,819 (8.68 %)	0 (0 %)	168 (0.67 %)	126 (3.52 %)	105 (3.03 %)
364	microsporidians N.ceranae (BRL01 2009 genbank) GCA_000182985.1	n/a	2,678 (29.97 %)	348 (2.68 %)	284 (3.31 %)	n/a	25.26 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	5,465 (100.00 %)	3,179 (1.99 %)	1,572 (1.39 %)	85,189 (41.34 %)	0 (0 %)	432 (0.38 %)	4 (0.02 %)	4 (0.02 %)
365	minke whale (2013 genbank) GCA_000493695.1	42,553 (41.45 %)	n/a	19,298 (1.81 %)	18,661 (1.42 %)	n/a	40.94 (94.06 %)	173,296 (5.96 %)	173,296 (5.96 %)	184,071 (94.04 %)	4,041,828 (42.24 %)	573,950 (1.48 %)	13,504,295 (30.96 %)	211 (0.02 %)	317,691 (1.50 %)	65,448 (1.38 %)	46,041 (1.09 %)
366	minke whale (primary hap 2023 genbank) GCA_949987535.1	61,711 (41.50 %)	n/a	19,544 (1.49 %)	21,502 (1.26 %)	n/a	41.55 (99.99 %)	0 (0 %)	1,177 (0.01 %)	1,375 (100.00 %)	4,006,932 (35.92 %)	1,058,106 (12.08 %)	12,708,154 (42.66 %)	4 (0.00 %)	1,500,515 (4.32 %)	72,756 (1.59 %)	44,094 (1.06 %)
367	mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017) GCF_002532875.1	35,332 (12.83 %)	n/a	2,750 (0.61 %)	29,731 (8.07 %)	n/a	40.94 (99.89 %)	3,360 (0.11 %)	3,360 (0.11 %)	8,241 (99.89 %)	115,140 (1.18 %)	39,880 (0.71 %)	1,832,298 (14.55 %)	37 (0.00 %)	12,922 (0.23 %)	31,479 (5.12 %)	28,744 (3.52 %)
368	Mongolian gerbil (US013 2019 Broad) GCA_004026785.1	n/a	n/a	21,302 (1.57 %)	27,162 (1.27 %)	40,982 (1.78 %)	41.88 (99.90 %)	11,139 (0.04 %)	11,139 (0.04 %)	796,326 (99.96 %)	5,253,752 (39.29 %)	1,211,658 (3.13 %)	13,894,596 (38.35 %)	15 (0.00 %)	n/a	24,829 (0.69 %)	23,158 (0.63 %)
369	monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank) GCA_019393635.1	47,034 (41.56 %)	n/a	18,428 (0.81 %)	15,519 (0.85 %)	n/a	39.11 (99.91 %)	0 (0 %)	260 (0.09 %)	18 (100.00 %)	7,426,369 (29.77 %)	1,249,638 (2.12 %)	21,135,395 (42.80 %)	0 (0 %)	1,546,316 (2.55 %)	16,598 (0.36 %)	13,911 (0.23 %)
370	moth C.splendana (v1 2021 genbank) GCA_910591565.1	n/a	n/a	4,930 (0.75 %)	38,413 (8.53 %)	35,924 (4.55 %)	38.08 (99.99 %)	0 (0 %)	150 (0.01 %)	112 (100.00 %)	261,421 (1.99 %)	175,466 (5.62 %)	3,107,482 (46.30 %)	2 (0.00 %)	358,346 (5.72 %)	58,547 (5.75 %)	28,884 (2.78 %)
371	moth S.litura (Ishihara v1 2017) GCF_002706865.1	25,114 (8.87 %)	n/a	5,088 (1.13 %)	22,625 (7.19 %)	n/a	36.56 (97.52 %)	10,662 (2.49 %)	10,662 (2.49 %)	13,637 (97.51 %)	154,017 (1.49 %)	50,642 (0.97 %)	2,919,487 (37.00 %)	96 (0.06 %)	122,138 (2.50 %)	34,396 (3.66 %)	10,482 (1.09 %)
372	mung bean (VC1973A 2015 genbank) GCA_000741045.2	n/a	n/a	16,645 (3.88 %)	43,866 (14.64 %)	n/a	33.16 (92.79 %)	0 (0 %)	96,870 (7.25 %)	2,463 (100.00 %)	265,072 (3.32 %)	198,918 (3.34 %)	2,840,410 (34.89 %)	1,607 (0.24 %)	171,012 (3.42 %)	13,926 (1.48 %)	11,027 (1.18 %)
373	mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019) GCA_009769485.1	n/a	n/a	10,083 (1.97 %)	18,350 (2.23 %)	n/a	42.22 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	5,616 (100.00 %)	485,827 (7.06 %)	212,892 (1.28 %)	4,756,962 (19.95 %)	0 (0 %)	53,808 (0.72 %)	25,670 (3.87 %)	24,319 (2.23 %)
374	mute swan (v1 primary hap 2019) GCA_009769625.1	n/a	n/a	12,973 (1.97 %)	22,300 (2.18 %)	n/a	41.92 (99.06 %)	0 (0 %)	446 (0.94 %)	181 (100.00 %)	688,720 (7.65 %)	301,358 (1.34 %)	6,775,217 (21.21 %)	1 (0.00 %)	78,646 (0.75 %)	31,271 (3.60 %)	29,996 (2.02 %)
375	naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank) GCA_000247695.1	74,574 (44.06 %)	n/a	21,317 (1.73 %)	20,856 (1.51 %)	n/a	40.21 (88.43 %)	110,424 (11.59 %)	110,424 (11.59 %)	114,652 (88.41 %)	4,162,977 (32.77 %)	484,933 (0.92 %)	13,672,503 (27.63 %)	595 (0.01 %)	103,053 (0.44 %)	31,950 (0.88 %)	31,054 (0.81 %)
376	narwhal (BS41 2019 Broad) GCA_004026685.1	n/a	n/a	21,418 (1.52 %)	34,189 (1.28 %)	n/a	41.35 (99.92 %)	8,600 (0.03 %)	8,600 (0.03 %)	653,473 (99.97 %)	4,512,168 (44.82 %)	592,047 (1.17 %)	13,009,453 (37.18 %)	92 (0.00 %)	n/a	63,033 (1.47 %)	45,747 (1.19 %)
377	Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank) GCA_027579445.1	31,033 (46.15 %)	n/a	12,385 (1.72 %)	24,339 (2.24 %)	n/a	43.01 (99.57 %)	0 (0 %)	215 (0.43 %)	77 (100.00 %)	479,994 (3.33 %)	443,098 (9.18 %)	6,350,593 (25.82 %)	5 (0.00 %)	478,923 (3.35 %)	31,693 (3.88 %)	22,817 (1.16 %)
378	nematode C.briggsae (AF16 v1 2008) GCF_000004555.1	19,404 (22.65 %)	n/a	12,088 (12.63 %)	7,533 (12.85 %)	n/a	37.35 (97.22 %)	595 (0.05 %)	6,713 (2.80 %)	607 (99.95 %)	116,909 (19.60 %)	45,475 (4.23 %)	820,686 (35.42 %)	82 (0.06 %)	36,018 (3.86 %)	4,887 (1.65 %)	2,967 (0.93 %)
379	New South Wales waratah (AGSP 2013) GCF_000471905.2	36,251 (5.66 %)	n/a	10,150 (1.34 %)	42,117 (8.90 %)	n/a	37.47 (94.63 %)	39,556 (5.39 %)	39,556 (5.39 %)	45,302 (94.61 %)	396,916 (3.25 %)	506,716 (6.41 %)	4,768,175 (36.07 %)	384 (0.04 %)	264,746 (2.83 %)	17,009 (0.90 %)	8,756 (0.45 %)
380	nine-banded armadillo (v1 hap2 2023) GCF_030445035.1	69,043 (2.70 %)	n/a	20,516 (1.05 %)	n/a	n/a	41.00 (99.68 %)	0 (0 %)	771 (0.32 %)	539 (100.00 %)	4,656,325 (32.86 %)	726,574 (1.99 %)	19,585,522 (43.65 %)	4 (0.00 %)	720,053 (1.59 %)	140,990 (2.86 %)	76,550 (1.81 %)
381	nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank) GCA_000208655.2	n/a	n/a	21,293 (1.15 %)	25,302 (1.09 %)	n/a	40.77 (90.89 %)	268,413 (9.13 %)	268,442 (9.13 %)	314,971 (90.87 %)	5,327,246 (49.09 %)	651,311 (1.26 %)	19,267,381 (38.27 %)	239 (0.00 %)	482,244 (1.17 %)	139,552 (2.47 %)	82,520 (1.71 %)
382	nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq) GCF_000208655.1	46,144 (1.87 %)	n/a	21,316 (1.15 %)	25,308 (1.09 %)	n/a	40.77 (90.89 %)	268,413 (9.13 %)	268,442 (9.13 %)	314,972 (90.87 %)	5,328,146 (49.10 %)	651,316 (1.26 %)	19,267,438 (38.27 %)	239 (0.00 %)	482,246 (1.17 %)	139,552 (2.47 %)	82,520 (1.71 %)
383	North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank) GCA_028564815.1	n/a	n/a	19,541 (1.47 %)	21,516 (1.25 %)	n/a	41.69 (99.83 %)	0 (0 %)	363 (0.17 %)	779 (100.00 %)	1,361,117 (2.23 %)	836,632 (13.12 %)	12,597,969 (44.00 %)	11 (0.00 %)	1,395,565 (3.89 %)	93,862 (1.92 %)	40,806 (0.95 %)
384	northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021) GCF_021288785.1	49,934 (2.73 %)	n/a	20,106 (1.74 %)	20,957 (1.35 %)	n/a	41.51 (99.35 %)	0 (0 %)	39,936 (0.65 %)	142,455 (100.00 %)	4,434,732 (35.01 %)	588,877 (1.19 %)	13,745,426 (32.96 %)	2,726 (0.09 %)	n/a	52,064 (1.59 %)	49,212 (1.43 %)
385	northern house mosquito (v1 TS 2021) GCF_016801865.1	28,512 (7.14 %)	n/a	5,830 (1.09 %)	39,806 (8.27 %)	n/a	36.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,714 (100.00 %)	222,294 (5.58 %)	187,561 (9.87 %)	3,009,613 (56.49 %)	0 (0 %)	397,617 (5.35 %)	63,009 (9.78 %)	42,868 (6.50 %)
386	northern pike (primary hap 2020 genbank) GCA_011004845.1	63,720 (60.35 %)	n/a	16,616 (2.41 %)	55,784 (5.64 %)	82,918 (8.82 %)	42.22 (99.89 %)	0 (0 %)	112 (0.11 %)	53 (100.00 %)	1,039,521 (30.93 %)	524,708 (7.32 %)	4,691,094 (32.91 %)	1 (0.00 %)	602,569 (4.43 %)	42,910 (2.52 %)	22,099 (1.02 %)
387	northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC) GCA_000146795.3	n/a	n/a	20,134 (1.89 %)	18,568 (1.14 %)	n/a	40.76 (93.09 %)	180,468 (6.94 %)	180,468 (6.94 %)	197,908 (93.06 %)	5,169,984 (51.90 %)	831,865 (4.16 %)	15,243,657 (35.77 %)	861 (0.05 %)	1,641,885 (4.15 %)	65,761 (1.00 %)	25,432 (0.56 %)
388	Norway rat BN7 genbank GCA_015227675.2	97,432 (43.01 %)	37 (0.00 %)	21,523 (1.86 %)	19,627 (1.36 %)	54,530 (2.79 %)	41.99 (99.19 %)	581 (0.81 %)	581 (0.81 %)	757 (99.19 %)	4,895,563 (44.53 %)	1,514,974 (3.57 %)	13,450,428 (35.83 %)	4 (0.00 %)	1,172,090 (3.51 %)	19,244 (0.46 %)	16,092 (0.39 %)
389	olive baboon (2017 HGSC genbank) GCA_000264685.2	n/a	n/a	20,319 (1.82 %)	21,542 (1.19 %)	n/a	40.99 (99.25 %)	55,576 (0.76 %)	58,981 (0.76 %)	118,810 (99.24 %)	5,524,514 (52.78 %)	1,068,912 (5.55 %)	16,068,031 (38.71 %)	368 (0.01 %)	1,968,093 (4.25 %)	95,595 (1.41 %)	30,263 (0.74 %)
390	olive baboon (2017 HGSC RefSeq) GCF_000264685.3	84,433 (3.85 %)	n/a	20,317 (1.83 %)	21,239 (1.18 %)	n/a	40.99 (99.25 %)	55,576 (0.76 %)	58,981 (0.76 %)	118,811 (99.24 %)	5,525,293 (52.79 %)	1,068,912 (5.55 %)	16,068,088 (38.71 %)	368 (0.01 %)	1,968,092 (4.25 %)	95,595 (1.41 %)	30,263 (0.74 %)
391	oriental river prawn (v1 FS-2020 2020 genbank) GCA_015104395.1	n/a	n/a	1,945 (0.08 %)	23,579 (1.88 %)	n/a	36.81 (99.60 %)	16,132 (0.41 %)	16,132 (0.41 %)	16,156 (99.59 %)	2,706,474 (10.11 %)	2,525,264 (12.75 %)	9,704,257 (48.31 %)	44 (0.00 %)	2,589,746 (7.83 %)	77,313 (3.01 %)	18,031 (0.34 %)
392	painted lady (genbank 2021) GCA_905220365.1	20,948 (56.23 %)	n/a	4,705 (1.06 %)	15,277 (5.00 %)	29,018 (10.11 %)	33.42 (99.99 %)	0 (0 %)	91 (0.01 %)	37 (100.00 %)	209,233 (2.16 %)	56,676 (1.12 %)	3,372,591 (44.40 %)	3 (0.00 %)	131,267 (3.01 %)	13,547 (2.72 %)	8,615 (1.04 %)
393	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019) GCF_004126475.1	35,529 (2.39 %)	n/a	18,185 (1.70 %)	20,184 (1.64 %)	41,094 (3.29 %)	42.38 (98.92 %)	0 (0 %)	831 (1.08 %)	141 (100.00 %)	3,072,951 (30.02 %)	385,608 (0.80 %)	12,060,365 (30.47 %)	1 (0.00 %)	173,548 (0.73 %)	64,081 (4.30 %)	66,821 (4.05 %)
394	pea aphid (AL4f v1 2019) GCF_005508785.1	31,681 (7.81 %)	n/a	4,257 (0.79 %)	16,323 (3.39 %)	n/a	29.76 (92.38 %)	0 (0 %)	46,297 (7.65 %)	21,920 (100.00 %)	768,383 (18.87 %)	135,468 (2.11 %)	4,536,093 (48.39 %)	93 (0.01 %)	158,249 (4.28 %)	16,332 (2.13 %)	13,468 (1.54 %)
395	peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank) GCA_023634155.1	49,100 (50.44 %)	n/a	13,025 (1.67 %)	24,167 (2.02 %)	n/a	42.65 (99.69 %)	0 (0 %)	232 (0.31 %)	124 (100.00 %)	586,316 (11.83 %)	335,214 (8.05 %)	7,038,700 (24.65 %)	0 (0 %)	405,444 (2.46 %)	26,085 (2.25 %)	20,023 (0.87 %)
396	pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 genbank) GCA_043159975.1	n/a	n/a	20,768 (1.76 %)	21,550 (1.18 %)	n/a	41.04 (100.00 %)	0 (0 %)	260 (0.00 %)	362 (100.00 %)	5,387,919 (53.48 %)	1,027,640 (9.31 %)	15,407,988 (41.73 %)	1 (0.00 %)	1,792,632 (3.77 %)	99,854 (1.52 %)	30,686 (0.78 %)
397	pigeon pea (v1 2016 BGI) GCF_000340665.1	46,646 (9.41 %)	n/a	17,409 (3.12 %)	51,529 (12.74 %)	48,654 (8.33 %)	32.79 (94.21 %)	36,387 (5.81 %)	36,387 (5.81 %)	72,923 (94.19 %)	400,327 (3.60 %)	306,656 (4.69 %)	3,754,630 (39.24 %)	431 (0.18 %)	219,000 (6.77 %)	26,578 (2.89 %)	13,839 (1.14 %)
398	pike-perch GCF_008315115.1	56,221 (8.23 %)	n/a	15,677 (2.23 %)	29,967 (5.65 %)	62,989 (6.22 %)	40.92 (100.00 %)	0 (0 %)	94 (0.00 %)	1,313 (100.00 %)	591,660 (5.05 %)	569,876 (7.39 %)	4,713,605 (36.32 %)	0 (0 %)	788,001 (5.34 %)	39,545 (1.93 %)	12,857 (0.60 %)
399	platypus (Pmale09 2018 BGI) GCA_002966995.1	n/a	n/a	15,042 (1.17 %)	19,939 (1.55 %)	n/a	46.64 (100.00 %)	0 (0 %)	476 (0.00 %)	4,568 (100.00 %)	5,326,862 (52.88 %)	879,598 (5.00 %)	9,545,961 (50.95 %)	3 (0.00 %)	1,781,446 (5.23 %)	94,468 (9.28 %)	81,476 (3.15 %)
400	platypus (Pmale09 v1 2019) GCF_004115215.1	56,708 (3.09 %)	n/a	14,805 (1.26 %)	18,918 (1.63 %)	42,516 (2.60 %)	46.13 (99.18 %)	0 (0 %)	522 (0.82 %)	305 (100.00 %)	5,099,803 (51.62 %)	577,434 (2.88 %)	9,110,403 (48.91 %)	0 (0 %)	1,127,318 (3.58 %)	87,829 (7.91 %)	74,084 (2.86 %)
401	platypus (Pmale09 v3 2020) GCA_004115215.3	n/a	n/a	14,805 (1.26 %)	18,888 (1.63 %)	n/a	46.14 (99.18 %)	0 (0 %)	515 (0.82 %)	322 (100.00 %)	5,101,303 (51.62 %)	578,617 (2.89 %)	9,113,847 (48.93 %)	0 (0 %)	1,130,252 (3.59 %)	87,861 (7.92 %)	74,107 (2.86 %)
402	polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank) GCA_000687225.1	35,751 (39.94 %)	n/a	18,495 (1.67 %)	15,243 (1.37 %)	n/a	41.65 (98.35 %)	110,343 (1.67 %)	110,343 (1.67 %)	134,161 (98.33 %)	4,221,025 (40.96 %)	553,193 (1.29 %)	13,765,526 (29.91 %)	205 (0.03 %)	311,409 (1.04 %)	54,906 (1.17 %)	47,465 (0.98 %)
403	prehistoric monster fish (2019 genbank) GCA_902500255.1	45,404 (55.83 %)	n/a	14,654 (0.76 %)	72,609 (2.41 %)	57,391 (2.04 %)	41.99 (99.49 %)	0 (0 %)	2,554 (0.51 %)	464 (100.00 %)	1,311,131 (2.79 %)	786,401 (3.65 %)	9,901,286 (59.90 %)	3 (0.00 %)	1,623,656 (7.33 %)	172,199 (5.45 %)	18,080 (0.31 %)
404	pronghorn (BS35 2019 Broad) GCA_004027515.1	n/a	n/a	24,094 (1.34 %)	35,119 (1.27 %)	n/a	41.97 (99.87 %)	6,569 (0.02 %)	6,569 (0.02 %)	1,649,700 (99.98 %)	5,613,563 (41.47 %)	652,408 (1.55 %)	13,943,055 (43.64 %)	21 (0.00 %)	n/a	61,057 (1.17 %)	39,599 (0.79 %)
405	Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank) GCA_000696695.1	45,076 (35.88 %)	n/a	19,564 (1.68 %)	22,124 (1.36 %)	n/a	41.27 (99.13 %)	80,963 (0.88 %)	80,963 (0.88 %)	134,059 (99.12 %)	3,917,534 (41.44 %)	435,606 (1.73 %)	14,738,354 (28.36 %)	39 (0.00 %)	276,230 (1.12 %)	40,752 (0.94 %)	35,911 (0.79 %)
406	puma (SC36_Marlon 2018 genbank) GCA_003327715.1	25,575 (34.74 %)	n/a	17,665 (1.56 %)	16,565 (1.29 %)	n/a	41.36 (95.34 %)	0 (0 %)	178,992 (4.69 %)	2,174 (100.00 %)	4,884,619 (42.70 %)	833,136 (1.76 %)	13,705,706 (31.28 %)	2,166 (0.06 %)	494,972 (1.78 %)	58,912 (1.65 %)	50,363 (1.31 %)
407	pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015) GCA_000258655.2	59,332 (37.06 %)	26 (0.00 %)	19,951 (1.94 %)	19,039 (1.18 %)	n/a	40.74 (82.95 %)	111,087 (17.06 %)	156,797 (17.06 %)	121,337 (82.94 %)	5,136,492 (50.91 %)	775,493 (1.63 %)	15,570,612 (30.28 %)	70 (0.03 %)	729,770 (1.34 %)	43,049 (0.71 %)	26,732 (0.52 %)
408	pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023) GCF_029289425.1	84,858 (3.73 %)	n/a	20,765 (1.73 %)	22,666 (1.18 %)	n/a	40.49 (99.96 %)	0 (0 %)	8 (0.04 %)	443 (100.00 %)	5,487,575 (50.65 %)	1,054,555 (12.79 %)	15,952,698 (43.80 %)	0 (0 %)	3,830,835 (6.42 %)	53,329 (1.37 %)	27,996 (0.60 %)
409	pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank) GCA_026419965.1	56,261 (41.31 %)	n/a	18,495 (1.55 %)	20,718 (1.32 %)	n/a	42.05 (99.81 %)	0 (0 %)	143 (0.19 %)	580 (100.00 %)	3,817,653 (34.51 %)	758,297 (7.42 %)	12,196,926 (39.96 %)	0 (0 %)	1,197,918 (3.53 %)	101,353 (2.90 %)	50,216 (1.47 %)
410	rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank) GCA_009806435.2	n/a	n/a	19,480 (1.31 %)	23,335 (1.31 %)	n/a	43.83 (97.68 %)	0 (0 %)	18,178 (2.32 %)	3,159 (100.00 %)	4,179,975 (0.00 %)	976,271 (2.33 %)	13,766,353 (39.76 %)	85 (0.00 %)	1,275,666 (3.04 %)	113,370 (2.46 %)	70,869 (1.75 %)
411	rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank) GCA_000003625.1	n/a	n/a	18,676 (1.38 %)	20,095 (1.24 %)	n/a	43.75 (95.14 %)	80,789 (4.88 %)	80,789 (4.88 %)	84,024 (95.12 %)	4,884,561 (44.65 %)	883,943 (1.73 %)	13,254,559 (38.27 %)	12 (0.00 %)	1,022,805 (2.55 %)	110,338 (2.33 %)	68,466 (1.73 %)
412	radish (v1 WS10039 2015) GCF_000801105.1	69,943 (20.66 %)	n/a	33,762 (10.20 %)	70,765 (28.80 %)	n/a	35.29 (87.22 %)	0 (0 %)	28,041 (12.80 %)	10,676 (100.00 %)	196,483 (2.53 %)	150,132 (3.32 %)	2,256,858 (26.65 %)	148 (0.08 %)	181,090 (8.85 %)	23,381 (2.80 %)	18,811 (2.08 %)
413	red admiral (genbank 2021) GCA_905147765.2	n/a	n/a	4,641 (1.20 %)	13,258 (4.79 %)	32,725 (10.42 %)	32.84 (100.00 %)	0 (0 %)	18 (0.00 %)	142 (100.00 %)	184,094 (2.52 %)	41,639 (1.23 %)	3,193,736 (41.82 %)	0 (0 %)	59,270 (1.97 %)	10,747 (2.25 %)	7,305 (0.97 %)
414	red mason bee (LIB18336 2019) GCF_004153925.1	26,926 (16.13 %)	n/a	4,185 (2.08 %)	24,859 (11.07 %)	n/a	39.77 (99.98 %)	0 (0 %)	2,089 (0.02 %)	10,222 (100.00 %)	88,278 (1.96 %)	74,016 (3.78 %)	1,305,254 (28.61 %)	137 (0.02 %)	68,133 (2.01 %)	10,712 (6.90 %)	7,940 (2.34 %)
415	red-crested turaco (2014 BGI) GCF_000709365.1	16,151 (2.15 %)	n/a	12,046 (1.50 %)	25,077 (1.98 %)	n/a	41.63 (99.43 %)	75,085 (0.59 %)	75,085 (0.59 %)	134,672 (99.41 %)	401,465 (6.41 %)	153,694 (0.86 %)	6,705,299 (20.45 %)	1 (0.00 %)	58,294 (0.41 %)	30,183 (1.07 %)	25,549 (0.87 %)
416	red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI) GCF_000690535.1	16,238 (2.21 %)	n/a	12,016 (1.53 %)	23,985 (1.93 %)	n/a	41.20 (99.63 %)	59,230 (0.38 %)	59,230 (0.38 %)	112,704 (99.62 %)	322,026 (4.02 %)	121,725 (0.68 %)	6,797,850 (18.25 %)	4 (0.00 %)	20,461 (0.20 %)	18,873 (0.62 %)	16,327 (0.52 %)
417	red-throated loon (hap2 2023 genbank) GCA_030936135.1	25,173 (40.74 %)	n/a	13,218 (1.71 %)	28,120 (2.39 %)	n/a	43.11 (100.00 %)	9 (0.00 %)	249 (0.00 %)	1,195 (100.00 %)	544,427 (8.81 %)	223,674 (5.77 %)	6,669,469 (23.63 %)	3 (0.00 %)	398,605 (2.64 %)	38,306 (3.37 %)	35,069 (1.78 %)
418	reedfish (2019) GCF_900747795.1	40,545 (1.73 %)	n/a	13,154 (0.46 %)	24,028 (1.29 %)	34,856 (1.34 %)	39.44 (93.75 %)	0 (0 %)	5,614 (6.25 %)	1,885 (100.00 %)	1,834,613 (2.79 %)	1,018,031 (2.36 %)	20,081,632 (44.56 %)	4 (0.00 %)	1,039,686 (2.44 %)	88,254 (1.06 %)	22,510 (0.28 %)
419	Rhesus monkey (2015 Baylor) GCA_000772875.3	n/a	n/a	20,558 (1.71 %)	22,141 (1.12 %)	n/a	40.95 (97.08 %)	63,767 (2.91 %)	64,538 (2.91 %)	348,579 (97.09 %)	5,846,699 (54.61 %)	1,429,378 (9.24 %)	16,512,587 (40.26 %)	80 (0.01 %)	2,975,593 (6.12 %)	98,572 (1.29 %)	30,558 (0.68 %)
420	Rice's whale (hap2 2023 genbank) GCA_028023285.1	59,888 (43.60 %)	n/a	19,291 (1.53 %)	21,195 (1.30 %)	n/a	41.44 (99.90 %)	0 (0 %)	334 (0.10 %)	774 (100.00 %)	3,917,923 (36.26 %)	828,521 (9.28 %)	12,518,796 (41.08 %)	4 (0.00 %)	1,071,329 (3.37 %)	73,126 (1.69 %)	43,865 (1.11 %)
421	rifleman (BGI 2014) GCF_000695815.1	16,166 (2.37 %)	n/a	12,054 (1.65 %)	23,851 (2.04 %)	n/a	41.63 (99.55 %)	66,437 (0.46 %)	66,437 (0.46 %)	120,312 (99.54 %)	392,481 (7.69 %)	217,040 (2.27 %)	5,855,355 (18.33 %)	5 (0.00 %)	69,222 (0.63 %)	7,602 (0.24 %)	5,949 (0.18 %)
422	ring-tailed lemur BS26 Broad 2019 GCA_004024665.1	n/a	n/a	21,125 (1.90 %)	29,864 (1.51 %)	65,909 (1.91 %)	41.13 (99.93 %)	4,599 (0.02 %)	4,599 (0.02 %)	580,026 (99.98 %)	3,840,645 (39.25 %)	675,921 (1.83 %)	13,841,750 (31.45 %)	17 (0.00 %)	304,327 (0.71 %)	59,440 (1.72 %)	54,385 (1.53 %)
423	Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020) GCF_014905685.1	25,353 (3.88 %)	n/a	14,334 (1.56 %)	58,475 (4.46 %)	n/a	41.06 (92.01 %)	0 (0 %)	100,521 (8.02 %)	18,998 (100.00 %)	642,988 (3.38 %)	444,158 (3.06 %)	6,203,124 (42.81 %)	7,501 (0.17 %)	424,697 (2.96 %)	52,308 (2.11 %)	22,130 (0.71 %)
424	river trout (v1 2019) GCF_901001165.1	102,772 (6.02 %)	n/a	27,413 (1.62 %)	51,424 (4.17 %)	121,979 (5.28 %)	43.36 (96.90 %)	0 (0 %)	3,941 (3.10 %)	1,441 (100.00 %)	1,438,988 (5.72 %)	1,789,507 (15.87 %)	9,819,761 (52.37 %)	2 (0.00 %)	3,428,195 (8.64 %)	70,821 (1.77 %)	18,627 (0.33 %)
425	rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank) GCA_023343835.1	51,619 (61.28 %)	n/a	12,831 (2.31 %)	n/a	n/a	41.57 (99.99 %)	0 (0 %)	210 (0.01 %)	164 (100.00 %)	667,924 (11.59 %)	268,431 (2.63 %)	5,885,274 (21.73 %)	0 (0 %)	216,565 (1.89 %)	21,346 (2.37 %)	19,067 (1.48 %)
426	rose-grain aphid (CAU 2021 genbank) GCA_019925205.1	n/a	n/a	4,332 (0.82 %)	15,532 (3.91 %)	n/a	30.24 (99.98 %)	0 (0 %)	240 (0.02 %)	67 (100.00 %)	481,097 (4.72 %)	135,266 (7.01 %)	4,093,473 (52.65 %)	2 (0.00 %)	194,054 (4.51 %)	12,709 (2.68 %)	10,994 (1.68 %)
427	rough bullseye (RE-2024b hap1 2024 genbank) GCA_042242105.1	n/a	n/a	14,592 (2.84 %)	44,299 (6.93 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	1 (0.00 %)	87 (0.00 %)	442 (100.00 %)	1,764,545 (30.13 %)	271,391 (5.93 %)	3,651,092 (24.53 %)	2 (0.00 %)	299,227 (3.11 %)	19,771 (1.39 %)	14,337 (0.85 %)
428	royal ground snake (hap1 2023 genbank) GCA_031021105.1	n/a	n/a	13,327 (0.96 %)	20,347 (1.68 %)	n/a	41.25 (99.99 %)	0 (0 %)	1,391 (0.01 %)	400 (100.00 %)	1,983,903 (10.40 %)	1,698,731 (7.29 %)	9,084,707 (53.44 %)	11 (0.00 %)	1,523,664 (5.77 %)	130,852 (4.47 %)	27,815 (0.70 %)
429	Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank) GCA_900094665.2	53,779 (39.43 %)	n/a	21,304 (2.26 %)	18,211 (1.40 %)	n/a	41.70 (89.05 %)	27,758 (7.29 %)	306,650 (10.98 %)	30,919 (92.71 %)	4,878,260 (40.08 %)	1,351,707 (2.59 %)	12,965,226 (27.49 %)	6,570 (0.06 %)	398,071 (1.12 %)	16,050 (0.44 %)	15,502 (0.41 %)
430	Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq) GCF_900094665.1	53,855 (2.85 %)	49,148 (2.43 %)	21,291 (2.26 %)	19,256 (1.49 %)	96,713 (4.05 %)	41.70 (89.05 %)	27,758 (7.29 %)	306,650 (10.98 %)	30,920 (92.71 %)	4,749,528 (39.06 %)	1,351,707 (2.59 %)	12,965,297 (27.49 %)	6,570 (0.06 %)	398,071 (1.12 %)	16,050 (0.44 %)	15,491 (0.41 %)
431	saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 genbank) GCA_949987515.1	46,746 (40.70 %)	n/a	18,625 (1.49 %)	20,451 (1.28 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	0 (0 %)	968 (0.01 %)	631 (100.00 %)	4,020,682 (35.99 %)	1,259,549 (13.09 %)	12,359,818 (42.64 %)	0 (0 %)	1,785,427 (5.07 %)	66,179 (3.91 %)	41,466 (1.03 %)
432	Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank) GCA_023634085.1	50,290 (50.75 %)	n/a	12,971 (1.67 %)	23,351 (2.02 %)	n/a	43.15 (99.70 %)	0 (0 %)	258 (0.30 %)	282 (100.00 %)	548,087 (7.21 %)	201,482 (8.55 %)	7,030,761 (24.94 %)	0 (0 %)	469,777 (2.60 %)	31,791 (2.57 %)	20,215 (0.89 %)
433	salmon louse (v1.1 2020) GCF_016086655.2	27,164 (5.26 %)	n/a	3,465 (0.45 %)	3,673 (1.75 %)	n/a	30.90 (99.99 %)	603 (0.01 %)	608 (0.01 %)	10,436 (99.99 %)	1,394,872 (53.53 %)	76,419 (1.13 %)	6,311,228 (43.85 %)	0 (0 %)	80,432 (1.10 %)	647 (0.04 %)	374 (0.03 %)
434	saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank) GCA_027887145.1	27,528 (42.80 %)	n/a	12,832 (1.69 %)	25,514 (2.23 %)	n/a	43.50 (99.76 %)	0 (0 %)	363 (0.24 %)	282 (100.00 %)	541,958 (3.43 %)	566,692 (13.38 %)	6,205,274 (28.98 %)	1 (0.00 %)	651,029 (4.07 %)	35,549 (5.05 %)	23,802 (1.15 %)
435	Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank) GCA_029499605.1	108,406 (45.40 %)	n/a	13,961 (0.46 %)	36,603 (1.55 %)	n/a	43.90 (99.99 %)	0 (0 %)	2,297 (0.01 %)	3,475 (100.00 %)	1,903,658 (2.85 %)	2,970,695 (16.56 %)	15,354,615 (64.31 %)	20 (0.00 %)	n/a	652,708 (8.36 %)	43,665 (0.45 %)
436	SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19) GCF_009858895.2	n/a	13 (97.85 %)	n/a	n/a	n/a	37.98 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.24 %)	1 (0.11 %)	33 (1.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (0.73 %)	1 (0.73 %)
437	sea anemones (CC7 2015 genbank) GCA_001417965.1	29,778 (59.32 %)	26,042 (31.72 %)	3,020 (1.06 %)	13,146 (12.99 %)	30,497 (24.04 %)	36.33 (82.34 %)	0 (0 %)	637,478 (17.95 %)	4,312 (100.00 %)	74,671 (1.98 %)	63,328 (2.24 %)	1,417,036 (20.33 %)	493 (0.38 %)	82,695 (5.22 %)	2,099 (0.38 %)	1,309 (0.28 %)
438	sea lamprey (kPetMar1 primary hap 2020) GCA_010993605.1	n/a	n/a	8,130 (0.73 %)	36,343 (4.06 %)	n/a	48.31 (98.62 %)	0 (0 %)	930 (1.38 %)	1,433 (100.00 %)	3,309,659 (59.73 %)	1,194,161 (21.47 %)	5,320,564 (50.50 %)	4 (0.00 %)	768,508 (3.64 %)	178,590 (35.88 %)	150,079 (6.78 %)
439	sea otter (GAN:26980312 2017 genbank) GCA_002288905.2	n/a	n/a	18,591 (1.64 %)	20,913 (1.44 %)	34,142 (1.77 %)	41.56 (98.79 %)	22,821 (1.21 %)	23,134 (1.21 %)	29,588 (98.79 %)	4,702,292 (41.42 %)	721,749 (1.39 %)	14,065,592 (32.89 %)	1,203 (0.02 %)	504,215 (2.00 %)	55,388 (1.87 %)	53,466 (1.67 %)
440	segmented worms (v1 2012) GCF_000326865.1	23,426 (13.46 %)	n/a	2,741 (0.95 %)	3,156 (4.19 %)	n/a	32.82 (91.54 %)	10,301 (8.47 %)	11,185 (8.47 %)	12,292 (91.53 %)	572,062 (30.90 %)	474,390 (10.49 %)	1,741,644 (44.75 %)	9 (0.01 %)	91,780 (2.82 %)	3,489 (0.51 %)	1,342 (0.18 %)
441	siamang (v1 Jambi primary hap 2023) GCF_028878055.1	79,118 (2.62 %)	n/a	20,139 (1.70 %)	21,232 (1.14 %)	n/a	40.62 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	606 (100.00 %)	5,278,880 (55.89 %)	946,219 (14.68 %)	14,395,605 (46.26 %)	0 (0 %)	2,376,584 (4.99 %)	95,573 (1.75 %)	30,053 (0.74 %)
442	siamang (v2 Jambi primary hap 2024 genbank) GCA_028878055.2	105,360 (44.53 %)	n/a	20,433 (1.69 %)	21,357 (1.12 %)	n/a	40.42 (99.97 %)	0 (0 %)	1 (0.03 %)	26 (100.00 %)	5,354,441 (55.80 %)	935,620 (14.70 %)	14,917,483 (46.01 %)	0 (0 %)	2,398,386 (4.90 %)	92,243 (1.42 %)	27,998 (0.68 %)
443	siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq) GCF_028878055.2	105,373 (3.05 %)	n/a	20,434 (1.69 %)	21,357 (1.12 %)	n/a	40.42 (99.97 %)	0 (0 %)	2 (0.03 %)	27 (100.00 %)	5,354,446 (55.80 %)	935,620 (14.70 %)	14,917,515 (46.01 %)	0 (0 %)	2,398,386 (4.90 %)	92,243 (1.42 %)	27,998 (0.68 %)
444	Siamese fighting fish (v2 primary hap 2019) GCF_900634795.2	54,389 (16.95 %)	n/a	14,745 (4.21 %)	34,348 (10.09 %)	62,673 (13.02 %)	45.30 (99.99 %)	0 (0 %)	328 (0.01 %)	70 (100.00 %)	252,955 (3.51 %)	184,269 (4.62 %)	2,010,934 (23.88 %)	0 (0 %)	232,426 (4.41 %)	72,126 (13.08 %)	55,959 (7.25 %)
445	Siamese fighting fish (v3 primary hap 2020) GCF_900634795.3	54,864 (17.78 %)	n/a	14,745 (4.20 %)	56,808 (10.87 %)	69,466 (16.34 %)	45.30 (99.99 %)	0 (0 %)	328 (0.01 %)	70 (100.00 %)	255,550 (3.51 %)	184,269 (4.62 %)	2,010,934 (23.88 %)	0 (0 %)	232,435 (4.41 %)	72,126 (13.08 %)	55,959 (7.25 %)
446	silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz) GCF_009828535.1	54,238 (2.74 %)	n/a	17,887 (2.00 %)	18,517 (1.25 %)	n/a	41.17 (98.20 %)	0 (0 %)	18,567 (1.80 %)	18,392 (100.00 %)	4,399,357 (50.55 %)	711,948 (2.37 %)	12,623,705 (36.55 %)	554 (0.02 %)	851,081 (2.16 %)	67,835 (1.30 %)	23,062 (0.73 %)
447	silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz) GCF_009828535.2	63,475 (2.65 %)	n/a	20,581 (1.94 %)	21,181 (1.20 %)	41,252 (1.46 %)	41.02 (97.81 %)	0 (0 %)	25,106 (2.19 %)	18,395 (100.00 %)	5,332,131 (51.09 %)	857,562 (2.26 %)	15,565,289 (36.84 %)	736 (0.02 %)	997,772 (2.11 %)	80,124 (1.26 %)	26,690 (0.70 %)
448	slow loris (BS32 2019) GCA_004027815.1	n/a	n/a	26,771 (1.11 %)	44,247 (1.00 %)	n/a	40.68 (99.86 %)	9,648 (0.03 %)	9,648 (0.03 %)	1,946,791 (99.97 %)	6,230,312 (41.68 %)	688,924 (1.23 %)	16,892,392 (43.00 %)	103 (0.00 %)	n/a	39,326 (0.65 %)	24,515 (0.47 %)
449	slow loris (primary hap 2022 genbank) GCA_027406575.1	67,213 (41.75 %)	n/a	22,195 (1.49 %)	21,341 (1.28 %)	n/a	40.82 (99.86 %)	0 (0 %)	218 (0.14 %)	85 (100.00 %)	4,625,875 (39.88 %)	579,984 (1.59 %)	14,405,402 (40.78 %)	2 (0.00 %)	991,314 (2.40 %)	38,257 (0.77 %)	22,955 (0.54 %)
450	small Madagascar hedgehog GCA_000313985.1	n/a	n/a	19,066 (1.18 %)	19,334 (1.31 %)	n/a	43.01 (88.44 %)	269,444 (11.60 %)	269,444 (11.60 %)	277,845 (88.40 %)	3,789,866 (28.89 %)	429,318 (0.87 %)	16,950,647 (32.23 %)	3,871 (0.06 %)	189,446 (0.64 %)	39,994 (0.70 %)	32,202 (0.55 %)
451	smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq) GCF_902713615.1	55,762 (1.62 %)	n/a	12,597 (0.36 %)	23,987 (1.08 %)	n/a	47.65 (98.48 %)	0 (0 %)	7,146 (1.52 %)	646 (100.00 %)	1,185,832 (1.72 %)	1,448,620 (6.25 %)	20,884,767 (51.41 %)	10 (0.00 %)	3,334,926 (4.99 %)	456,658 (8.18 %)	31,096 (0.32 %)
452	smalleye Pacific opah (hap2 2023 genbank) GCA_029633865.1	n/a	n/a	13,617 (1.10 %)	74,639 (4.12 %)	n/a	44.94 (99.96 %)	0 (0 %)	3,115 (0.04 %)	544 (100.00 %)	4,603,649 (53.23 %)	1,009,241 (18.00 %)	5,236,063 (51.65 %)	17 (0.00 %)	n/a	143,632 (7.43 %)	65,914 (2.15 %)
453	smalltooth sawfish (v2 primary hap 2019 genbank) GCA_009764475.1	n/a	n/a	11,828 (0.66 %)	18,627 (1.55 %)	n/a	42.38 (99.09 %)	0 (0 %)	698 (0.91 %)	173 (100.00 %)	405,021 (1.14 %)	391,531 (1.52 %)	11,282,302 (38.19 %)	0 (0 %)	471,290 (1.50 %)	45,398 (1.34 %)	18,572 (0.38 %)
454	snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016) GCF_001687245.1	37,836 (4.45 %)	n/a	10,526 (1.07 %)	59,331 (6.34 %)	n/a	36.53 (93.84 %)	52,913 (6.17 %)	227,684 (6.18 %)	139,583 (93.83 %)	653,914 (2.87 %)	386,956 (5.71 %)	7,364,314 (43.00 %)	22,478 (0.98 %)	443,424 (7.26 %)	60,636 (4.05 %)	36,565 (2.36 %)
455	sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019) GCF_006149115.1	76,167 (6.12 %)	n/a	24,114 (1.71 %)	51,371 (4.08 %)	102,891 (5.24 %)	43.39 (96.16 %)	1,903 (0.01 %)	25,659 (3.84 %)	38,027 (99.99 %)	1,300,179 (8.96 %)	1,465,690 (10.81 %)	8,849,714 (48.44 %)	872 (0.04 %)	1,716,006 (5.17 %)	64,215 (1.55 %)	18,038 (0.45 %)
456	South Georgia icefish (v1 primary hap 2020) GCF_902827115.1	41,307 (6.47 %)	n/a	14,776 (1.79 %)	68,734 (6.16 %)	61,643 (5.52 %)	42.07 (99.94 %)	0 (0 %)	2,461 (0.06 %)	1,563 (100.00 %)	498,451 (3.42 %)	474,032 (7.20 %)	3,613,731 (45.83 %)	19 (0.00 %)	763,187 (8.62 %)	88,984 (4.31 %)	17,905 (0.76 %)
457	southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank) GCA_910596095.1	58,416 (66.24 %)	n/a	15,695 (2.61 %)	42,730 (5.74 %)	n/a	39.73 (100.00 %)	0 (0 %)	95 (0.00 %)	58 (100.00 %)	1,591,314 (33.50 %)	247,764 (2.94 %)	5,176,850 (26.85 %)	0 (0 %)	326,259 (3.37 %)	14,097 (0.88 %)	9,797 (0.48 %)
458	southern cattle tick (Rmic-2018 2020 genbank) GCA_013339725.1	n/a	29,870 (1.19 %)	3,698 (0.12 %)	117,910 (5.00 %)	35,315 (1.88 %)	45.79 (99.99 %)	0 (0 %)	1,576 (0.01 %)	7,048 (100.00 %)	770,997 (2.03 %)	680,149 (3.55 %)	10,994,272 (39.37 %)	0 (0 %)	979,976 (3.85 %)	304,620 (17.03 %)	234,809 (5.42 %)
459	southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad) GCA_004026725.1	n/a	n/a	24,302 (1.12 %)	43,055 (0.98 %)	n/a	41.63 (99.82 %)	10,550 (0.03 %)	10,550 (0.03 %)	2,272,285 (99.97 %)	5,668,964 (24.75 %)	1,628,683 (5.38 %)	15,658,806 (41.85 %)	67 (0.00 %)	n/a	21,801 (0.44 %)	18,380 (0.34 %)
460	southern house mosquito (JHB 2007 genbank) GCA_000209185.1	n/a	22,629 (4.75 %)	5,905 (1.14 %)	41,195 (8.84 %)	n/a	37.42 (93.28 %)	45,500 (6.75 %)	45,500 (6.75 %)	48,671 (93.25 %)	738,398 (35.22 %)	171,041 (5.71 %)	3,037,349 (50.41 %)	88 (0.02 %)	323,404 (5.87 %)	65,784 (9.49 %)	44,205 (6.42 %)
461	southern tamandua (Broad 2019) GCA_004025105.1	n/a	n/a	25,638 (0.82 %)	49,782 (0.86 %)	n/a	39.53 (99.88 %)	5,819 (0.02 %)	5,819 (0.02 %)	2,150,023 (99.98 %)	6,033,640 (37.10 %)	708,890 (0.99 %)	22,371,532 (41.88 %)	62 (0.00 %)	n/a	80,897 (1.09 %)	48,136 (0.70 %)
462	southern two-toed sloth (US054 2019 Broad) GCA_004027855.1	n/a	n/a	25,877 (0.78 %)	56,071 (0.82 %)	n/a	39.82 (99.84 %)	5,099 (0.02 %)	5,099 (0.02 %)	2,537,432 (99.98 %)	5,384,587 (37.86 %)	724,925 (2.20 %)	19,492,096 (41.12 %)	63 (0.00 %)	n/a	55,674 (0.90 %)	46,833 (0.74 %)
463	southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank) GCA_000283155.1	37,037 (37.57 %)	n/a	18,551 (1.79 %)	19,747 (1.44 %)	n/a	40.90 (96.05 %)	54,737 (3.96 %)	54,737 (3.96 %)	57,823 (96.04 %)	3,824,807 (39.33 %)	421,693 (0.97 %)	14,765,476 (28.93 %)	1,818 (0.02 %)	184,274 (0.57 %)	36,281 (1.02 %)	34,129 (0.92 %)
464	soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010) GCF_000004515.4	82,440 (9.65 %)	n/a	27,682 (3.07 %)	77,218 (11.84 %)	n/a	34.77 (97.65 %)	15,955 (2.35 %)	15,955 (2.35 %)	17,146 (97.65 %)	834,646 (37.35 %)	436,219 (5.65 %)	5,341,660 (45.30 %)	54 (0.01 %)	659,519 (6.22 %)	35,897 (1.56 %)	13,140 (0.58 %)
465	soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018) GCF_000004515.5	85,123 (9.72 %)	n/a	27,647 (3.06 %)	77,190 (11.83 %)	n/a	34.77 (97.65 %)	15,995 (2.36 %)	15,995 (2.36 %)	17,187 (97.64 %)	834,651 (37.35 %)	436,225 (5.65 %)	5,341,721 (45.30 %)	55 (0.01 %)	659,428 (6.22 %)	35,897 (1.47 %)	13,140 (0.58 %)
466	speckled wood butterfly (genbank 2021) GCA_905163445.1	21,720 (55.73 %)	n/a	4,713 (0.87 %)	17,002 (4.33 %)	29,238 (7.81 %)	35.99 (100.00 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	71 (100.00 %)	304,077 (2.97 %)	110,835 (4.09 %)	3,704,355 (44.42 %)	1 (0.00 %)	144,758 (2.93 %)	28,108 (2.75 %)	11,566 (0.96 %)
467	sperm whale (SW-GA 2019) GCF_002837175.2	60,921 (2.59 %)	n/a	19,527 (1.73 %)	25,114 (1.51 %)	n/a	41.39 (95.90 %)	128,928 (4.12 %)	128,928 (4.12 %)	143,605 (95.88 %)	4,365,057 (42.78 %)	694,673 (2.40 %)	13,518,590 (32.76 %)	1,887 (0.17 %)	521,351 (4.50 %)	94,152 (2.52 %)	63,303 (1.97 %)
468	sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF) GCF_000090795.1	31,248 (25.26 %)	n/a	2,167 (1.08 %)	6,648 (9.22 %)	n/a	35.83 (86.92 %)	14,574 (13.10 %)	14,944 (13.10 %)	27,972 (86.90 %)	108,973 (4.04 %)	70,563 (4.66 %)	881,116 (24.58 %)	109 (0.03 %)	120,772 (5.83 %)	668 (0.62 %)	519 (0.56 %)
469	stable fly (8C7A2A5H3J4 2015 genbank) GCA_001015335.1	n/a	n/a	7,737 (1.16 %)	11,972 (2.65 %)	n/a	38.85 (84.55 %)	113,660 (15.50 %)	129,113 (15.50 %)	125,702 (84.50 %)	310,342 (1.75 %)	391,619 (8.42 %)	5,616,633 (48.71 %)	6,705 (0.32 %)	483,703 (3.74 %)	38,246 (1.55 %)	4,353 (0.18 %)
470	sterlet (maternal hap 2022 genbank) GCA_902713425.1	n/a	n/a	22,306 (1.80 %)	33,366 (4.09 %)	n/a	39.56 (99.99 %)	0 (0 %)	402 (0.01 %)	245 (100.00 %)	1,126,738 (3.36 %)	889,853 (6.73 %)	8,766,715 (39.22 %)	4 (0.00 %)	1,059,859 (5.24 %)	51,356 (1.84 %)	13,633 (0.35 %)
471	sterlet (maternal hap 2022 genbank) GCA_902713425.2	n/a	n/a	25,364 (1.76 %)	40,452 (4.10 %)	n/a	40.11 (100.00 %)	0 (0 %)	433 (0.00 %)	1,731 (100.00 %)	4,055,215 (43.14 %)	1,124,096 (10.13 %)	9,426,172 (41.81 %)	10 (0.00 %)	1,593,749 (6.87 %)	64,522 (2.85 %)	21,984 (0.89 %)
472	sterlet (v1 paternal hap 2020) GCA_902713435.1	n/a	n/a	22,718 (1.81 %)	34,093 (4.15 %)	57,768 (4.88 %)	39.60 (100.00 %)	0 (0 %)	422 (0.01 %)	224 (100.00 %)	1,145,503 (3.39 %)	912,936 (6.84 %)	8,839,174 (39.17 %)	4 (0.00 %)	1,099,124 (5.35 %)	52,560 (1.82 %)	14,166 (0.36 %)
473	sterlet (v1 Gen_M01 2020) GCF_010645085.1	73,251 (5.76 %)	n/a	24,411 (1.72 %)	39,637 (3.96 %)	n/a	39.76 (99.93 %)	0 (0 %)	6,283 (0.07 %)	3,404 (100.00 %)	1,269,345 (3.50 %)	1,095,665 (6.81 %)	10,007,602 (39.30 %)	5 (0.00 %)	1,356,511 (6.13 %)	60,475 (1.95 %)	17,954 (0.41 %)
474	stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017) GCF_002571385.1	36,135 (16.45 %)	n/a	3,324 (0.70 %)	20,909 (10.93 %)	38,198 (17.00 %)	38.54 (89.50 %)	0 (0 %)	49,077 (10.54 %)	5,688 (100.00 %)	111,077 (1.70 %)	108,732 (2.95 %)	2,009,396 (21.40 %)	206 (0.10 %)	118,773 (3.74 %)	6,012 (0.58 %)	3,703 (0.31 %)
475	striped catfish (primary hap 2022 genbank) GCA_027358585.1	53,859 (65.52 %)	n/a	16,035 (2.86 %)	41,619 (5.48 %)	n/a	38.99 (99.49 %)	0 (0 %)	236 (0.51 %)	59 (100.00 %)	1,870,238 (37.80 %)	605,571 (6.82 %)	5,059,499 (32.43 %)	2 (0.00 %)	531,388 (4.26 %)	17,919 (1.29 %)	12,796 (0.75 %)
476	sudden oak death agent (Pr-102 primary hap 2021 genbank) GCA_020800215.1	n/a	15,507 (39.68 %)	1,461 (1.76 %)	22,413 (61.13 %)	n/a	54.37 (99.66 %)	0 (0 %)	50 (0.34 %)	28 (100.00 %)	8,935 (0.72 %)	9,528 (3.65 %)	117,380 (14.16 %)	0 (0 %)	17,976 (7.40 %)	34 (99.96 %)	156 (7.43 %)
477	Sumatran orangutan (Susie 2018 genbank) GCA_002880775.3	n/a	160,726 (3.42 %)	20,174 (1.79 %)	20,994 (1.15 %)	47,806 (1.68 %)	40.80 (99.29 %)	553 (0.70 %)	553 (0.70 %)	5,813 (99.30 %)	5,497,148 (54.41 %)	1,048,361 (8.01 %)	15,948,575 (40.68 %)	0 (0 %)	2,413,946 (4.00 %)	39,481 (0.87 %)	26,385 (0.67 %)
478	Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023) GCF_028885655.1	98,046 (3.46 %)	n/a	21,162 (1.68 %)	21,714 (1.13 %)	n/a	41.13 (99.79 %)	59 (0.21 %)	59 (0.21 %)	2,670 (99.79 %)	5,730,768 (55.05 %)	1,175,314 (11.19 %)	16,323,507 (44.05 %)	0 (0 %)	2,553,363 (4.41 %)	55,799 (2.08 %)	39,159 (1.10 %)
479	Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019) GCA_009819505.1	n/a	n/a	13,403 (1.85 %)	27,456 (2.48 %)	n/a	42.86 (100.00 %)	0 (0 %)	13 (0.00 %)	3,601 (100.00 %)	497,374 (5.78 %)	649,859 (4.89 %)	6,740,713 (22.65 %)	0 (0 %)	505,741 (2.66 %)	49,076 (3.54 %)	23,486 (1.21 %)
480	Swainson's thrush (v1 primary hap 2019) GCF_009819885.1	40,128 (5.45 %)	n/a	13,016 (1.88 %)	24,787 (2.41 %)	30,064 (2.94 %)	42.48 (98.86 %)	0 (0 %)	428 (1.14 %)	161 (100.00 %)	483,978 (5.85 %)	589,859 (4.32 %)	6,708,638 (22.44 %)	1 (0.00 %)	449,585 (2.41 %)	49,404 (3.53 %)	22,206 (1.16 %)
481	swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank) GCA_028018845.1	29,544 (46.92 %)	n/a	12,375 (1.75 %)	24,577 (2.31 %)	n/a	43.08 (99.89 %)	0 (0 %)	236 (0.11 %)	40 (100.00 %)	419,473 (3.09 %)	439,909 (7.61 %)	6,077,743 (24.47 %)	1 (0.00 %)	578,723 (3.93 %)	32,064 (3.27 %)	22,996 (1.19 %)
482	Tasmanian devil GCF_000189315.1	32,527 (1.79 %)	n/a	16,112 (0.84 %)	16,152 (0.94 %)	n/a	36.05 (92.36 %)	201,317 (7.66 %)	201,403 (7.66 %)	237,291 (92.34 %)	6,766,259 (42.85 %)	1,240,681 (2.07 %)	20,998,733 (36.61 %)	17,494 (0.40 %)	351,216 (1.07 %)	23,155 (0.38 %)	21,337 (0.32 %)
483	thale cress (tair10 Columbia 2011) GCF_000001735.3	54,010 (40.19 %)	n/a	26,552 (34.12 %)	25,867 (35.78 %)	n/a	36.06 (99.85 %)	0 (0 %)	357 (0.16 %)	7 (100.00 %)	67,353 (16.32 %)	27,063 (2.77 %)	749,020 (22.64 %)	1 (0.00 %)	42,547 (3.36 %)	4,599 (1.63 %)	3,518 (1.15 %)
484	thirteen-lined ground squirrel (2011) GCF_000236235.1	41,886 (2.61 %)	n/a	19,165 (1.70 %)	18,102 (1.44 %)	n/a	39.91 (93.27 %)	141,005 (6.75 %)	141,005 (6.75 %)	153,488 (93.25 %)	4,378,557 (36.61 %)	640,337 (1.64 %)	14,116,066 (27.91 %)	2,964 (0.05 %)	213,421 (0.74 %)	28,321 (0.64 %)	26,464 (0.58 %)
485	thorny skate (v1 CabotCenter1 v1 2020 refseq) GCF_010909765.1	45,969 (2.40 %)	n/a	11,433 (0.60 %)	26,341 (1.72 %)	32,017 (1.87 %)	44.30 (92.54 %)	0 (0 %)	3,753 (7.46 %)	957 (100.00 %)	865,711 (2.57 %)	1,176,348 (3.79 %)	9,964,038 (52.25 %)	26 (0.00 %)	1,634,657 (4.98 %)	242,676 (4.73 %)	31,030 (0.57 %)
486	thorny skate (v1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank) GCA_010909765.1	45,969 (46.35 %)	n/a	11,434 (0.60 %)	26,342 (1.72 %)	32,017 (1.87 %)	44.30 (92.54 %)	0 (0 %)	3,753 (7.46 %)	958 (100.00 %)	866,598 (2.58 %)	1,176,350 (3.79 %)	9,964,083 (52.25 %)	26 (0.00 %)	1,634,657 (4.98 %)	242,676 (4.73 %)	31,030 (0.57 %)
487	tick D.silvarum (v1 2020) GCF_013339745.1	36,084 (1.94 %)	n/a	4,032 (0.13 %)	128,567 (5.82 %)	43,960 (2.05 %)	46.91 (99.95 %)	0 (0 %)	13,519 (0.05 %)	1,665 (100.00 %)	1,116,542 (2.95 %)	642,860 (3.16 %)	10,429,455 (39.18 %)	6 (0.00 %)	n/a	37,849 (2.30 %)	244,151 (6.39 %)
488	tidepool copepod (San Diego 2019 genbank) GCA_007210705.1	23,429 (54.20 %)	15,577 (15.83 %)	3,517 (1.61 %)	18,910 (15.71 %)	n/a	42.18 (97.94 %)	0 (0 %)	14,007 (2.09 %)	459 (100.00 %)	52,042 (1.17 %)	27,065 (1.23 %)	928,666 (18.11 %)	1,035 (0.11 %)	46,898 (3.89 %)	15,823 (5.51 %)	13,041 (4.23 %)
489	tiger tail seahorse (QL1 v1 2016) GCF_001891065.1	47,041 (13.29 %)	n/a	13,817 (3.76 %)	32,943 (8.81 %)	n/a	43.30 (93.04 %)	23,101 (6.97 %)	23,101 (6.97 %)	60,478 (93.03 %)	359,724 (3.91 %)	155,380 (3.35 %)	2,811,700 (24.51 %)	111 (0.08 %)	112,479 (5.30 %)	61,685 (7.72 %)	45,970 (4.19 %)
490	tomato (v3.0 Heinz 1706 2018) GCF_000188115.4	46,015 (6.94 %)	n/a	15,396 (2.15 %)	38,462 (7.56 %)	n/a	34.12 (90.18 %)	0 (0 %)	19,634 (9.83 %)	3,150 (100.00 %)	417,162 (18.21 %)	229,803 (3.18 %)	5,370,478 (35.28 %)	224 (0.02 %)	412,060 (4.40 %)	25,279 (1.28 %)	2,409 (0.12 %)
491	trahira (v1 hap1 2023) GCA_029633855.1	n/a	n/a	16,039 (2.06 %)	44,287 (4.38 %)	n/a	40.99 (92.91 %)	0 (0 %)	867 (7.09 %)	597 (100.00 %)	2,228,831 (30.95 %)	687,495 (13.85 %)	5,309,097 (36.70 %)	2 (0.01 %)	1,157,952 (7.09 %)	27,070 (2.09 %)	12,077 (0.44 %)
492	trahira (v1 hap2 2023) GCA_029633875.1	n/a	n/a	16,216 (2.00 %)	45,209 (4.32 %)	n/a	41.03 (96.02 %)	0 (0 %)	907 (3.98 %)	452 (100.00 %)	2,280,303 (30.80 %)	708,327 (15.59 %)	5,394,248 (39.01 %)	7 (0.00 %)	1,246,906 (7.61 %)	28,386 (2.18 %)	12,439 (0.46 %)
493	tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022 genbank) GCA_023055355.1	n/a	n/a	12,867 (1.81 %)	26,393 (2.48 %)	n/a	42.85 (100.00 %)	97 (0.00 %)	97 (0.00 %)	311 (100.00 %)	429,011 (3.16 %)	564,849 (5.52 %)	6,336,716 (23.32 %)	0 (0 %)	439,278 (2.62 %)	33,378 (2.70 %)	23,687 (1.26 %)
494	Trypanosoma equiperdum (OVI 2016 genbank) GCA_001457755.2	n/a	10,902 (50.13 %)	576 (1.36 %)	2,999 (35.93 %)	n/a	45.94 (99.65 %)	0 (0 %)	6,447 (0.44 %)	2,026 (100.00 %)	16,807 (2.60 %)	3,925 (0.79 %)	141,656 (16.64 %)	0 (0 %)	1,684 (0.54 %)	4,877 (34.82 %)	4,352 (15.04 %)
495	Trypanosoma melophagium (St. Kilda St. Kilda 2022 genbank) GCA_022059095.1	n/a	10,057 (64.23 %)	742 (1.83 %)	848 (40.20 %)	n/a	41.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	64 (100.00 %)	39,141 (7.68 %)	14,366 (6.71 %)	131,898 (25.19 %)	0 (0 %)	9,068 (6.92 %)	4,119 (14.82 %)	3,546 (9.39 %)
496	tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020) GCF_014805625.1	24,334 (8.13 %)	n/a	7,223 (2.32 %)	6,632 (3.62 %)	n/a	33.80 (97.46 %)	0 (0 %)	9,688 (2.55 %)	7,986 (100.00 %)	418,532 (4.76 %)	185,734 (2.26 %)	3,090,742 (35.34 %)	677 (0.08 %)	40,269 (0.93 %)	3,487 (0.58 %)	1,907 (0.28 %)
497	Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 genbank) GCA_040894005.1	n/a	n/a	13,678 (0.88 %)	29,720 (2.41 %)	n/a	43.19 (100.00 %)	25 (0.00 %)	436 (0.00 %)	961 (100.00 %)	734,036 (2.54 %)	1,217,326 (21.42 %)	8,925,883 (52.53 %)	6 (0.00 %)	691,991 (2.19 %)	211,590 (5.08 %)	23,983 (0.47 %)
498	two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq) GCF_901001135.1	56,617 (1.50 %)	n/a	14,448 (0.38 %)	40,572 (1.31 %)	n/a	44.40 (99.36 %)	0 (0 %)	3,573 (0.64 %)	1,330 (100.00 %)	2,263,606 (1.94 %)	2,036,108 (4.34 %)	29,400,958 (44.09 %)	9 (0.01 %)	2,193,249 (3.24 %)	602,912 (6.66 %)	94,935 (0.82 %)
499	Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017) GCA_002776525.1	n/a	n/a	21,053 (1.88 %)	23,024 (1.24 %)	n/a	40.68 (96.59 %)	0 (0 %)	77,615 (3.42 %)	47,644 (100.00 %)	5,478,730 (51.13 %)	969,126 (2.63 %)	16,127,854 (36.40 %)	1,906 (0.05 %)	947,012 (1.94 %)	63,965 (1.04 %)	25,907 (0.65 %)
500	Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018) GCF_002776525.2	66,965 (2.69 %)	n/a	21,958 (1.85 %)	24,388 (1.22 %)	55,722 (1.95 %)	40.60 (97.10 %)	0 (0 %)	63,620 (2.91 %)	47,449 (100.00 %)	5,699,639 (51.61 %)	1,066,606 (2.87 %)	16,603,622 (37.49 %)	6,170 (0.10 %)	1,075,458 (2.10 %)	71,084 (1.08 %)	26,726 (0.65 %)
501	Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019) GCF_002776525.3	68,173 (2.68 %)	n/a	21,804 (1.85 %)	23,385 (1.18 %)	n/a	40.60 (97.10 %)	0 (0 %)	64,415 (2.91 %)	46,654 (100.00 %)	5,700,226 (51.61 %)	1,066,759 (2.88 %)	16,603,818 (37.49 %)	6,208 (0.10 %)	1,080,318 (2.10 %)	71,078 (1.08 %)	26,732 (0.65 %)
502	Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019) GCF_002776525.4	63,704 (2.55 %)	n/a	21,347 (1.86 %)	23,056 (1.19 %)	n/a	40.84 (97.07 %)	0 (0 %)	57,757 (2.93 %)	34,372 (100.00 %)	5,504,117 (51.70 %)	961,351 (2.75 %)	16,208,033 (37.10 %)	4,987 (0.09 %)	1,064,626 (2.10 %)	71,046 (1.10 %)	29,347 (0.68 %)
503	Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank) GCA_000622305.1	54,667 (35.81 %)	n/a	19,685 (1.25 %)	21,268 (1.20 %)	n/a	41.26 (95.18 %)	201,121 (4.83 %)	201,121 (4.83 %)	356,096 (95.17 %)	6,165,270 (34.95 %)	1,197,778 (2.77 %)	16,282,333 (36.21 %)	730 (0.04 %)	592,599 (1.56 %)	22,905 (0.49 %)	18,563 (0.39 %)
504	valley oak (v3.0 2019) GCF_001633185.1	63,555 (8.16 %)	n/a	16,886 (1.90 %)	72,876 (14.48 %)	n/a	35.38 (99.77 %)	0 (0 %)	1,674 (0.23 %)	2,010 (100.00 %)	800,389 (3.72 %)	460,244 (7.41 %)	5,439,256 (37.83 %)	3 (0.00 %)	746,332 (7.48 %)	19,635 (1.10 %)	9,142 (0.41 %)
505	vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017) GCF_002806865.1	48,870 (21.91 %)	n/a	19,421 (7.41 %)	36,314 (20.76 %)	n/a	36.49 (94.25 %)	0 (0 %)	49,649 (5.76 %)	25,263 (100.00 %)	182,696 (3.35 %)	143,269 (7.40 %)	1,620,517 (29.12 %)	3,454 (0.84 %)	135,503 (7.90 %)	13,323 (2.49 %)	9,786 (1.57 %)
506	velvet spider S.dumicola (v1 Namibia, Etosha 2020) GCF_010614865.1	34,675 (2.01 %)	n/a	3,329 (0.10 %)	24,015 (1.20 %)	n/a	33.26 (100.00 %)	0 (0 %)	7 (0.00 %)	16,531 (100.00 %)	1,258,301 (2.08 %)	828,332 (2.42 %)	17,994,342 (48.98 %)	0 (0 %)	650,236 (2.42 %)	63,015 (0.95 %)	8,586 (0.12 %)
507	wasp C.solmsi marchali (v1 2013) GCF_000503995.1	13,201 (7.14 %)	n/a	3,474 (1.25 %)	15,142 (4.89 %)	n/a	30.36 (99.55 %)	7,471 (0.46 %)	7,471 (0.46 %)	9,928 (99.54 %)	340,841 (7.52 %)	251,386 (3.99 %)	2,448,273 (49.27 %)	11 (0.00 %)	43,154 (0.99 %)	16,346 (4.08 %)	14,983 (2.78 %)
508	water buffalo (Mediterranean 2013) GCA_000471725.1	n/a	n/a	20,245 (1.49 %)	24,230 (1.29 %)	n/a	42.11 (97.39 %)	263,385 (2.62 %)	263,385 (2.62 %)	630,367 (97.38 %)	5,997,926 (47.35 %)	466,019 (1.02 %)	13,822,739 (40.29 %)	2,383 (0.04 %)	975,519 (2.73 %)	93,080 (1.71 %)	42,806 (0.88 %)
509	Weddell seal (WS11-02 2013 genbank) GCA_000349705.1	48,251 (30.18 %)	n/a	21,044 (1.72 %)	22,320 (1.43 %)	n/a	41.39 (70.44 %)	152,836 (29.58 %)	152,836 (29.58 %)	169,546 (70.42 %)	4,420,479 (41.72 %)	471,250 (0.66 %)	13,410,191 (22.09 %)	2,022 (0.05 %)	348,918 (1.08 %)	48,738 (1.01 %)	44,867 (0.88 %)
510	western European hedgehog (2012 genbank) GCA_000296755.1	29,923 (35.25 %)	n/a	18,034 (1.33 %)	19,779 (1.35 %)	n/a	41.54 (85.94 %)	219,764 (14.09 %)	219,764 (14.09 %)	225,566 (85.91 %)	6,527,125 (45.87 %)	1,271,531 (2.29 %)	12,374,069 (42.02 %)	3,596 (0.06 %)	861,216 (2.39 %)	28,528 (0.71 %)	23,900 (0.52 %)
511	western European hedgehog (primary hap 2023 genbank) GCA_950295315.1	61,103 (44.10 %)	n/a	18,126 (1.16 %)	21,345 (1.28 %)	n/a	42.00 (99.97 %)	0 (0 %)	3,760 (0.03 %)	1,175 (100.00 %)	4,891,344 (19.68 %)	1,507,933 (3.81 %)	12,571,193 (54.50 %)	7 (0.00 %)	1,975,693 (4.67 %)	32,667 (0.90 %)	24,067 (0.56 %)
512	western European house mouse (WSB_EiJ v1 2016) GCA_001624835.1	n/a	n/a	20,870 (2.26 %)	18,535 (1.45 %)	100,622 (4.22 %)	41.80 (84.36 %)	68,691 (5.19 %)	399,976 (15.70 %)	72,315 (94.81 %)	4,961,700 (39.53 %)	1,345,987 (2.51 %)	13,324,808 (25.23 %)	11,455 (0.66 %)	369,064 (1.23 %)	16,556 (0.40 %)	15,878 (0.38 %)
513	western flower thrips (v2 FOCC.00 2017) GCF_000697945.2	24,277 (14.78 %)	n/a	4,066 (1.46 %)	26,743 (11.40 %)	n/a	51.10 (94.72 %)	15,747 (5.29 %)	60,375 (5.31 %)	34,226 (94.71 %)	275,482 (4.88 %)	167,812 (3.67 %)	1,832,537 (24.44 %)	729 (0.04 %)	58,278 (2.14 %)	26,406 (36.85 %)	31,568 (5.58 %)
514	western lowland gorilla (Susie 2016) GCA_900006655.3	n/a	n/a	20,323 (1.77 %)	22,069 (1.15 %)	n/a	40.71 (99.64 %)	768 (0.36 %)	768 (0.36 %)	16,065 (99.64 %)	5,373,630 (50.30 %)	1,025,389 (10.17 %)	15,954,613 (41.78 %)	0 (0 %)	3,581,997 (5.69 %)	53,557 (1.01 %)	27,578 (0.69 %)
515	western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023) GCF_029281585.1	101,242 (3.18 %)	n/a	20,994 (1.57 %)	41,945 (1.53 %)	n/a	40.59 (99.85 %)	0 (0 %)	38 (0.15 %)	637 (100.00 %)	5,526,927 (51.16 %)	1,080,693 (20.38 %)	15,929,020 (48.46 %)	0 (0 %)	5,690,867 (9.25 %)	76,432 (1.35 %)	30,764 (0.70 %)
516	western lowland gorilla (v2 KB3781 2024 genbank) GCA_029281585.2	98,415 (41.67 %)	n/a	21,010 (1.59 %)	50,696 (1.83 %)	n/a	40.49 (99.94 %)	0 (0 %)	2 (0.06 %)	25 (100.00 %)	5,456,267 (50.77 %)	1,060,267 (19.55 %)	15,870,191 (47.77 %)	0 (0 %)	n/a	69,745 (1.19 %)	30,644 (0.70 %)
517	western painted turtle (v303 2014) GCF_000241765.3	51,681 (3.25 %)	n/a	15,203 (1.04 %)	22,272 (1.67 %)	46,230 (2.32 %)	44.19 (91.88 %)	183,751 (8.14 %)	183,744 (8.14 %)	262,326 (91.86 %)	2,767,141 (30.92 %)	316,971 (0.98 %)	11,856,824 (28.95 %)	6,315 (0.16 %)	313,471 (1.46 %)	104,231 (1.84 %)	32,424 (0.69 %)
518	western painted turtle (v304 RCT428 2020) GCF_000241765.4	64,798 (3.75 %)	n/a	15,669 (1.09 %)	21,663 (1.64 %)	n/a	44.19 (87.54 %)	184,311 (12.48 %)	184,311 (12.48 %)	260,698 (87.52 %)	3,780,252 (41.81 %)	316,422 (0.93 %)	11,852,305 (27.59 %)	6,323 (0.15 %)	313,495 (1.39 %)	103,899 (1.75 %)	33,034 (0.70 %)
519	western predatory mite (v1.0 2012) GCF_000255335.1	12,199 (13.86 %)	n/a	2,842 (1.49 %)	27,198 (19.18 %)	n/a	51.58 (99.74 %)	1,782 (0.26 %)	1,901 (0.26 %)	3,993 (99.74 %)	33,136 (1.10 %)	13,115 (0.57 %)	612,854 (9.73 %)	4 (0.00 %)	11,929 (0.89 %)	2,003 (54.71 %)	1,569 (0.97 %)
520	western wild mouse (SPRET_EiJ v1 2016) GCA_001624865.1	n/a	n/a	21,211 (2.19 %)	17,797 (1.36 %)	100,839 (4.01 %)	41.65 (89.10 %)	23,451 (1.23 %)	334,091 (10.95 %)	29,259 (98.77 %)	5,087,807 (40.60 %)	1,402,357 (3.14 %)	13,522,663 (27.99 %)	17,567 (1.08 %)	457,523 (2.25 %)	16,888 (0.42 %)	15,748 (0.39 %)
521	wheat stem sawfly (v1 2014) GCF_000341935.1	37,175 (25.01 %)	n/a	4,407 (2.81 %)	15,504 (11.96 %)	n/a	40.34 (98.12 %)	8,731 (1.89 %)	8,733 (1.89 %)	10,707 (98.11 %)	87,084 (2.38 %)	44,673 (2.55 %)	1,001,343 (22.18 %)	41 (0.03 %)	19,750 (1.66 %)	7,519 (2.78 %)	7,623 (2.13 %)
522	white leghorn X broiler chicken (v1 leghorn haplotype v1 2021) GCF_016700215.1	55,865 (8.86 %)	n/a	12,310 (2.41 %)	22,056 (2.57 %)	n/a	42.20 (99.65 %)	254 (0.35 %)	254 (0.35 %)	509 (99.65 %)	604,452 (10.76 %)	232,416 (2.03 %)	5,541,059 (20.23 %)	2 (0.00 %)	203,559 (1.88 %)	22,185 (2.62 %)	19,239 (1.58 %)
523	white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank) GCA_949774975.1	59,982 (41.87 %)	n/a	18,737 (1.57 %)	20,767 (1.34 %)	n/a	41.91 (99.99 %)	0 (0 %)	1,070 (0.01 %)	410 (100.00 %)	3,820,566 (36.21 %)	922,103 (8.43 %)	12,304,360 (39.74 %)	2 (0.00 %)	1,117,804 (3.60 %)	68,551 (3.58 %)	41,698 (1.09 %)
524	white-footed mouse GCF_004664715.1	46,167 (2.56 %)	n/a	20,406 (1.72 %)	20,857 (1.46 %)	39,081 (1.88 %)	42.23 (100.00 %)	0 (0 %)	79 (0.00 %)	1,763 (100.00 %)	5,064,597 (30.73 %)	1,258,088 (2.85 %)	14,005,845 (33.01 %)	0 (0 %)	551,791 (1.47 %)	23,475 (0.69 %)	19,781 (0.50 %)
525	white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank) GCA_002102435.1	57,774 (39.81 %)	n/a	20,653 (1.75 %)	23,083 (1.50 %)	40,950 (1.94 %)	41.55 (99.10 %)	31,627 (0.90 %)	107,030 (0.91 %)	48,652 (99.10 %)	4,799,958 (41.28 %)	413,128 (2.59 %)	13,296,686 (34.22 %)	7,681 (0.08 %)	439,019 (2.88 %)	44,165 (1.19 %)	41,200 (1.10 %)
526	white-tailed eagle (primary hap 2022 genbank) GCA_947461875.1	n/a	n/a	13,735 (1.76 %)	28,993 (2.53 %)	n/a	43.15 (99.99 %)	0 (0 %)	424 (0.01 %)	188 (100.00 %)	585,276 (12.89 %)	291,289 (6.10 %)	6,474,027 (23.66 %)	0 (0 %)	312,204 (2.16 %)	54,851 (4.05 %)	31,757 (1.50 %)
527	white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U) GCF_000004665.1	58,109 (2.92 %)	n/a	21,699 (1.91 %)	20,910 (1.24 %)	n/a	40.85 (94.45 %)	187,214 (5.57 %)	187,214 (5.57 %)	201,523 (94.43 %)	5,120,629 (48.95 %)	768,432 (2.30 %)	15,303,718 (34.75 %)	1,516 (0.02 %)	933,431 (2.31 %)	35,805 (0.79 %)	27,299 (0.64 %)
528	white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017) GCA_002754865.1	n/a	n/a	21,754 (1.86 %)	21,668 (1.22 %)	n/a	40.77 (99.67 %)	48,495 (0.33 %)	48,495 (0.33 %)	88,439 (99.67 %)	5,195,965 (48.83 %)	825,714 (3.60 %)	15,372,168 (38.05 %)	5,083 (0.10 %)	1,223,766 (2.72 %)	34,994 (0.85 %)	26,156 (0.69 %)
529	white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank) GCA_009663435.1	n/a	n/a	21,729 (1.89 %)	21,502 (1.30 %)	n/a	40.85 (98.70 %)	370 (1.30 %)	370 (1.30 %)	1,360 (98.70 %)	5,122,418 (49.40 %)	818,502 (3.68 %)	15,232,829 (38.20 %)	0 (0 %)	1,395,363 (2.77 %)	36,656 (0.90 %)	26,567 (0.71 %)
530	white-tufted-ear marmoset (v1 paternal hap 2020) GCA_011100535.1	n/a	n/a	20,939 (1.94 %)	20,416 (1.31 %)	n/a	41.04 (99.58 %)	0 (0 %)	788 (0.42 %)	336 (100.00 %)	4,869,007 (49.39 %)	746,577 (2.68 %)	14,347,286 (37.59 %)	0 (0 %)	1,026,338 (2.34 %)	35,222 (0.94 %)	25,795 (0.75 %)
531	white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank) GCA_011100555.2	n/a	n/a	21,801 (1.88 %)	21,501 (1.28 %)	n/a	40.92 (99.52 %)	0 (0 %)	1,165 (0.48 %)	1,234 (100.00 %)	5,036,594 (47.71 %)	842,846 (3.25 %)	15,161,577 (38.08 %)	2 (0.00 %)	1,256,016 (2.62 %)	37,603 (0.93 %)	34,471 (0.83 %)
532	whooping crane (maternal hap 2023 genbank) GCA_028858705.1	55,408 (53.40 %)	n/a	13,572 (1.81 %)	24,739 (2.19 %)	n/a	43.07 (99.63 %)	0 (0 %)	262 (0.37 %)	929 (100.00 %)	616,295 (10.57 %)	211,557 (2.90 %)	6,785,134 (22.11 %)	0 (0 %)	n/a	42,795 (4.66 %)	39,036 (2.34 %)
533	wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank) GCA_000311805.2	n/a	20,251 (1.34 %)	18,785 (1.94 %)	17,252 (1.62 %)	n/a	41.28 (98.83 %)	55,538 (1.18 %)	60,971 (1.18 %)	68,871 (98.82 %)	3,098,525 (34.75 %)	353,630 (1.23 %)	12,349,553 (25.12 %)	11 (0.00 %)	101,843 (0.63 %)	45,436 (1.02 %)	40,638 (0.87 %)
534	wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019) GCF_002162155.1	131,302 (1.34 %)	n/a	33,079 (0.33 %)	567,762 (8.14 %)	n/a	45.99 (96.70 %)	0 (0 %)	344,768 (3.31 %)	148,396 (100.00 %)	2,762,705 (2.81 %)	2,991,142 (3.37 %)	493,164 (96.69 %)	210 (0.02 %)	12,513,149 (13.71 %)	2,220,897 (25.33 %)	2,138,478 (24.00 %)
535	wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017) GCF_000817695.2	69,091 (6.81 %)	n/a	16,823 (1.67 %)	75,740 (11.45 %)	n/a	35.81 (86.74 %)	1,682 (1.55 %)	133,967 (13.30 %)	3,189 (98.45 %)	588,761 (3.39 %)	493,855 (3.35 %)	5,206,772 (45.36 %)	66 (0.02 %)	710,693 (6.46 %)	48,008 (1.88 %)	21,883 (0.84 %)
536	wild strawberry (2011 genbank) GCA_000184155.1	n/a	n/a	14,001 (6.64 %)	34,562 (26.90 %)	n/a	38.40 (94.26 %)	13,412 (5.76 %)	16,253 (5.76 %)	16,459 (94.24 %)	152,427 (20.00 %)	74,539 (2.79 %)	1,032,592 (21.43 %)	25 (0.01 %)	71,241 (3.11 %)	14,802 (3.20 %)	9,026 (1.93 %)
537	wire-tailed manakin (2018) GCF_003945595.1	50,529 (5.75 %)	n/a	12,950 (1.89 %)	19,252 (2.57 %)	24,522 (2.44 %)	42.30 (100.00 %)	0 (0 %)	102 (0.00 %)	3,744 (100.00 %)	500,823 (7.17 %)	300,638 (2.31 %)	6,414,267 (20.54 %)	0 (0 %)	235,724 (1.54 %)	28,268 (2.21 %)	22,544 (1.15 %)
538	woodchuck (CNAG 2019) GCA_901343595.1	n/a	424,165 (27.27 %)	20,813 (1.60 %)	23,199 (1.43 %)	45,153 (1.99 %)	40.00 (97.18 %)	57,045 (2.82 %)	57,045 (2.82 %)	105,556 (97.18 %)	4,756,333 (33.73 %)	836,503 (2.41 %)	14,755,960 (31.13 %)	505 (0.04 %)	358,587 (3.15 %)	34,151 (0.87 %)	32,950 (0.82 %)
539	woodchuck (v1.0 LI92 2021) GCF_021218885.1	62,044 (2.80 %)	n/a	19,783 (1.48 %)	21,060 (1.38 %)	n/a	39.92 (100.00 %)	46 (0.00 %)	46 (0.00 %)	3,381 (100.00 %)	3,884,968 (28.12 %)	912,591 (2.73 %)	14,538,767 (35.15 %)	0 (0 %)	413,043 (1.33 %)	36,919 (1.02 %)	26,677 (0.60 %)
540	wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 genbank) GCA_029207755.1	n/a	n/a	13,052 (1.78 %)	24,950 (2.30 %)	n/a	43.93 (100.00 %)	353 (0.00 %)	353 (0.00 %)	1,695 (100.00 %)	444,866 (3.08 %)	473,471 (7.97 %)	5,336,498 (25.82 %)	4 (0.00 %)	847,256 (5.29 %)	37,210 (3.14 %)	26,585 (1.31 %)
541	Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq) GCF_003031525.1	43,312 (2.49 %)	n/a	18,639 (1.72 %)	19,645 (1.46 %)	n/a	41.28 (99.29 %)	52,647 (0.72 %)	52,647 (0.72 %)	66,346 (99.28 %)	n/a	540,765 (1.65 %)	12,691,760 (32.87 %)	427 (0.03 %)	363,613 (1.97 %)	59,052 (1.48 %)	39,130 (1.07 %)
542	Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank) GCA_003031525.1	43,299 (41.33 %)	n/a	18,726 (1.80 %)	19,644 (1.46 %)	n/a	41.28 (99.29 %)	52,647 (0.72 %)	52,647 (0.72 %)	66,345 (99.28 %)	3,990,044 (42.54 %)	540,765 (1.65 %)	12,691,683 (32.88 %)	427 (0.03 %)	363,612 (1.97 %)	59,052 (1.48 %)	42,519 (1.18 %)
543	Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank) GCA_000442215.1	27,063 (35.76 %)	n/a	19,219 (1.73 %)	27,456 (1.66 %)	n/a	41.30 (98.69 %)	124,797 (1.33 %)	124,797 (1.33 %)	155,509 (98.67 %)	4,277,556 (44.10 %)	690,534 (1.95 %)	13,025,034 (35.19 %)	292 (0.02 %)	514,863 (2.00 %)	67,035 (1.82 %)	48,666 (1.49 %)
544	Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq) GCF_000442215.1	27,063 (1.65 %)	n/a	19,227 (1.75 %)	27,468 (1.66 %)	n/a	41.30 (98.69 %)	124,797 (1.33 %)	124,797 (1.33 %)	155,510 (98.67 %)	4,193,317 (43.38 %)	690,534 (1.95 %)	13,025,097 (35.19 %)	292 (0.02 %)	514,863 (2.00 %)	67,035 (1.82 %)	49,158 (1.49 %)
545	yellow fever mosquito (LVP_AGWG 2017 genbank) GCA_002204515.1	n/a	38 (0.00 %)	8,814 (0.51 %)	152,909 (17.36 %)	n/a	38.16 (100.00 %)	0 (0 %)	229 (0.00 %)	6,534 (100.00 %)	2,912,289 (46.74 %)	533,475 (4.34 %)	10,210,670 (53.65 %)	0 (0 %)	641,478 (3.84 %)	132,732 (6.12 %)	69,844 (2.30 %)
546	yellow-bellied marmot (hap1 2025 genbank) GCA_047511675.1	n/a	n/a	19,503 (1.44 %)	20,301 (1.35 %)	n/a	39.90 (100.00 %)	0 (0 %)	330 (0.00 %)	814 (100.00 %)	4,038,897 (29.07 %)	978,915 (3.28 %)	14,404,740 (34.97 %)	4 (0.00 %)	446,138 (1.44 %)	36,674 (1.05 %)	27,659 (0.61 %)
547	yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019) GCF_003676075.2	42,715 (2.16 %)	n/a	19,894 (1.62 %)	21,366 (1.40 %)	43,878 (1.99 %)	39.89 (97.96 %)	34,765 (2.04 %)	35,595 (2.04 %)	66,624 (97.96 %)	4,646,957 (34.05 %)	800,897 (1.96 %)	14,340,028 (32.63 %)	1,270 (0.04 %)	210,697 (0.69 %)	34,125 (0.91 %)	32,958 (0.85 %)
548	yellow-bellied marmot (v1 2018) GCF_003676075.1	41,573 (2.14 %)	n/a	19,845 (1.63 %)	21,262 (1.39 %)	n/a	39.88 (97.82 %)	38,354 (2.18 %)	38,354 (2.18 %)	69,503 (97.82 %)	4,683,625 (34.38 %)	799,659 (1.95 %)	14,322,765 (32.58 %)	2,342 (0.05 %)	209,445 (0.69 %)	34,127 (0.91 %)	32,957 (0.85 %)
549	yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021) GCA_016432865.1	n/a	n/a	15,703 (0.78 %)	16,184 (0.90 %)	n/a	36.21 (99.99 %)	0 (0 %)	620 (0.01 %)	487 (100.00 %)	5,424,579 (25.40 %)	1,269,774 (2.59 %)	21,430,550 (42.69 %)	2 (0.00 %)	714,621 (2.20 %)	28,121 (0.66 %)	28,159 (0.56 %)
550	yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI) GCF_000699245.1	15,990 (2.25 %)	n/a	11,775 (1.55 %)	23,935 (1.90 %)	n/a	41.36 (99.67 %)	48,553 (0.34 %)	48,553 (0.34 %)	107,160 (99.66 %)	384,032 (4.45 %)	182,309 (1.03 %)	6,529,534 (19.24 %)	1 (0.00 %)	41,594 (0.34 %)	15,660 (0.55 %)	12,721 (0.42 %)
551	yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017) GCF_002814215.1	41,168 (9.96 %)	n/a	15,861 (2.76 %)	30,671 (6.00 %)	n/a	40.75 (97.79 %)	0 (0 %)	33,664 (2.20 %)	99,598 (100.00 %)	614,513 (4.16 %)	522,349 (4.83 %)	4,650,538 (24.98 %)	309 (0.03 %)	357,703 (3.09 %)	18,054 (0.96 %)	12,855 (0.67 %)
552	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 genbank) GCA_028538775.1	n/a	n/a	18,587 (1.82 %)	21,049 (1.76 %)	n/a	43.22 (100.00 %)	209 (0.00 %)	209 (0.00 %)	685 (100.00 %)	2,890,086 (24.28 %)	719,555 (4.26 %)	10,089,514 (36.35 %)	0 (0 %)	649,001 (2.37 %)	60,975 (2.61 %)	51,711 (1.75 %)
553	zebra finch (v1 Black17 2019 refseq) GCF_003957565.1	51,472 (7.16 %)	n/a	13,211 (2.02 %)	17,812 (2.70 %)	38,655 (7.10 %)	42.04 (99.78 %)	0 (0 %)	312 (0.22 %)	135 (100.00 %)	535,521 (8.50 %)	550,118 (4.01 %)	6,519,872 (21.47 %)	1 (0.00 %)	381,676 (2.04 %)	30,053 (2.58 %)	22,898 (1.24 %)
554	zebra finch (v1 Black17 male 2019 genbank) GCA_003957565.2	n/a	n/a	13,212 (2.02 %)	25,117 (2.57 %)	38,655 (7.10 %)	42.04 (99.78 %)	0 (0 %)	312 (0.22 %)	135 (100.00 %)	535,521 (8.50 %)	550,118 (4.01 %)	6,519,872 (21.47 %)	1 (0.00 %)	381,676 (2.04 %)	30,053 (2.58 %)	22,898 (1.24 %)
555	zebra finch (v1.4 Blue55 primary hap 2021 genbank) GCA_003957565.4	n/a	n/a	12,755 (1.97 %)	24,009 (2.47 %)	n/a	41.86 (99.66 %)	0 (0 %)	352 (0.34 %)	199 (100.00 %)	389,146 (3.10 %)	458,903 (3.33 %)	6,338,599 (20.92 %)	3 (0.00 %)	312,137 (1.80 %)	29,203 (2.49 %)	22,084 (1.22 %)
556	zebra shark (hap1 2023 genbank) GCA_030684315.1	n/a	n/a	12,291 (0.48 %)	16,769 (1.14 %)	n/a	43.41 (99.47 %)	0 (0 %)	1,159 (0.53 %)	835 (100.00 %)	8,087,543 (64.92 %)	798,373 (9.17 %)	14,838,773 (42.39 %)	4 (0.00 %)	2,946,268 (5.37 %)	45,284 (1.67 %)	14,105 (0.37 %)
557	zebu cattle (Nelore 2014 genbank) GCA_000247795.2	n/a	n/a	18,599 (1.58 %)	18,779 (1.29 %)	n/a	41.75 (92.62 %)	253,738 (7.41 %)	6,941,272 (7.66 %)	253,769 (92.59 %)	5,118,783 (46.84 %)	358,908 (0.88 %)	13,431,620 (36.60 %)	476 (0.01 %)	998,817 (3.00 %)	35,241 (0.84 %)	32,220 (0.75 %)
558	zig-zag eel (v1.1 2018) GCF_900324485.1	44,813 (12.05 %)	n/a	15,028 (3.35 %)	21,782 (6.89 %)	36,982 (11.22 %)	40.66 (97.63 %)	0 (0 %)	235 (2.37 %)	126 (100.00 %)	348,517 (2.87 %)	157,776 (2.00 %)	3,182,742 (23.42 %)	0 (0 %)	175,932 (3.08 %)	12,824 (1.08 %)	8,713 (0.67 %)
TOTALS:	total assembly count 558

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	223 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	674 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	428 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	471 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	310 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	1155 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	311 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	921 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	291 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	120 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	557 assemblies	assembly stats	track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project	1186 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	96 assemblies	assembly stats	track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center	778 assemblies	assembly stats	track stats

Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

See also: hub access, assembly statistics

Data resource links