Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1
n/a n/a 22,095
(0.63 %)
44,942
(0.68 %)
n/a 40.25
(99.86 %)
15,429
(0.03 %)
15,429
(0.03 %)
2,690,873
(99.97 %)
8,755,250
(34.47 %)
869,360
(1.26 %)
22,002,517
(59.65 %)
146
(0.00 %)
n/a 39,239
(0.49 %)
27,849
(0.37 %)
2 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank)
GCA_027172205.1
57,514
(54.61 %)
n/a 14,340
(1.37 %)
20,053
(2.31 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
0
(0 %)
30
(0.00 %)
27
(100.00 %)
832,937
(4.17 %)
474,203
(4.04 %)
7,020,288
(38.29 %)
2
(0.00 %)
631,733
(3.50 %)
94,745
(2.70 %)
19,879
(0.76 %)
3 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1
61,172
(3.82 %)
n/a 23,424
(1.78 %)
27,990
(2.23 %)
n/a 38.98
(88.63 %)
216,028
(11.39 %)
216,028
(11.39 %)
324,061
(88.61 %)
1,726,079
(12.81 %)
680,428
(2.28 %)
13,887,586
(35.94 %)
2,660
(0.08 %)
n/a 85,680
(0.94 %)
12,234
(0.16 %)
4 African grass rat (paternal X 2020)
GCA_011762505.1
45,963
(36.56 %)
n/a 20,933
(2.00 %)
19,613
(1.43 %)
37,929
(2.32 %)
41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,940,083
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
2
(0.00 %)
1,027,357
(2.09 %)
17,767
(0.51 %)
16,848
(0.46 %)
5 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1
46,043
(34.84 %)
n/a 19,181
(1.25 %)
19,665
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,337,637
(57.82 %)
365,796
(0.88 %)
16,073,052
(44.89 %)
11
(0.00 %)
417,291
(1.06 %)
33,513
(0.68 %)
24,486
(0.51 %)
6 alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018)
GCF_003710045.1
27,736
(10.71 %)
n/a 4,020
(1.34 %)
42,185
(10.12 %)
n/a 40.41
(94.37 %)
0
(0 %)
14,031
(5.59 %)
95,883
(100.00 %)
112,828
(2.21 %)
95,886
(3.63 %)
2,006,114
(27.47 %)
1
(0.00 %)
49,074
(1.16 %)
23,832
(3.81 %)
20,331
(3.23 %)
7 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1
n/a n/a 18,513
(1.97 %)
19,112
(1.70 %)
31,905
(1.94 %)
41.46
(99.38 %)
23,458
(0.62 %)
23,458
(0.62 %)
75,733
(99.38 %)
3,095,742
(36.41 %)
314,508
(1.07 %)
12,365,152
(25.46 %)
83
(0.00 %)
120,145
(0.60 %)
53,956
(1.50 %)
49,211
(1.30 %)
8 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3
55,014
(3.56 %)
n/a 18,437
(1.94 %)
18,446
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
0
(0 %)
166,280
(4.17 %)
77,390
(100.00 %)
3,150,224
(36.21 %)
315,108
(1.36 %)
12,461,739
(24.88 %)
1,213
(0.03 %)
207,655
(1.22 %)
54,502
(1.38 %)
49,324
(1.18 %)
9 Alpine marmot (2015)
GCF_001458135.1
35,350
(2.23 %)
n/a 20,139
(1.58 %)
18,286
(1.41 %)
n/a 39.80
(96.07 %)
0
(0 %)
89,362
(3.94 %)
14,543
(100.00 %)
n/a 747,129
(1.83 %)
14,077,162
(30.27 %)
494
(0.01 %)
202,989
(0.77 %)
30,224
(0.63 %)
24,261
(0.48 %)
10 American alligator (scaffold assembly 2023 genbank)
GCA_030867065.1
n/a n/a 14,487
(0.97 %)
20,444
(1.61 %)
n/a 45.04
(99.81 %)
136
(0.19 %)
136
(0.19 %)
806
(99.81 %)
3,380,365
(43.12 %)
560,127
(2.00 %)
12,524,244
(32.47 %)
1
(0.00 %)
370,300
(1.41 %)
50,852
(2.67 %)
30,117
(1.71 %)
11 American alligator (chrom assembly 2023 genbank)
GCA_030867095.1
60,799
(51.66 %)
n/a 14,382
(0.98 %)
18,601
(1.45 %)
n/a 45.01
(99.30 %)
0
(0 %)
161
(0.70 %)
194
(100.00 %)
3,322,619
(43.19 %)
478,206
(1.77 %)
12,316,391
(32.01 %)
0
(0 %)
334,854
(1.31 %)
49,792
(2.45 %)
29,504
(1.51 %)
12 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1
n/a n/a 22,515
(1.25 %)
34,527
(1.17 %)
n/a 39.58
(99.92 %)
5,769
(0.02 %)
5,769
(0.02 %)
837,916
(99.98 %)
5,101,904
(34.46 %)
552,100
(1.02 %)
15,150,706
(34.57 %)
36
(0.00 %)
n/a 24,558
(0.63 %)
21,525
(0.51 %)
13 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1
38,686
(33.79 %)
n/a 20,215
(1.44 %)
20,845
(1.20 %)
n/a 41.99
(93.39 %)
341,984
(6.63 %)
341,984
(6.63 %)
792,165
(93.37 %)
6,006,931
(47.67 %)
495,106
(1.11 %)
13,902,115
(39.01 %)
8,184
(0.08 %)
978,698
(2.61 %)
90,767
(1.29 %)
43,651
(0.72 %)
14 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1
26,240
(36.96 %)
n/a 17,569
(1.60 %)
20,092
(1.69 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
122,542
(12.82 %)
132,961
(87.18 %)
2,829,934
(29.80 %)
414,895
(1.07 %)
10,968,663
(26.71 %)
1,958
(0.04 %)
269,478
(1.11 %)
44,651
(1.14 %)
26,757
(0.80 %)
15 amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016)
GCF_000764305.1
24,008
(8.48 %)
n/a 3,331
(0.47 %)
38,201
(8.97 %)
24,453
(8.50 %)
38.47
(99.52 %)
5,426
(0.48 %)
23,726
(0.48 %)
23,426
(99.52 %)
161,274
(1.72 %)
432,436
(8.89 %)
3,517,080
(28.92 %)
149
(0.01 %)
409,772
(5.41 %)
50,987
(4.44 %)
35,313
(2.58 %)
16 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1
33,668
(37.51 %)
n/a 18,213
(1.58 %)
15,093
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
155,553
(2.44 %)
157,031
(97.56 %)
4,832,679
(42.49 %)
831,134
(1.67 %)
13,654,373
(31.78 %)
59
(0.00 %)
289,887
(0.97 %)
65,229
(1.60 %)
55,104
(1.18 %)
17 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2
n/a n/a 12,258
(1.95 %)
20,580
(2.26 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
0
(0 %)
429
(1.52 %)
160
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,056
(1.51 %)
6,092,351
(20.84 %)
0
(0 %)
152,105
(1.27 %)
17,130
(1.48 %)
15,125
(1.04 %)
18 ant C.costatus (v1 MS0001 2016)
GCF_001594065.1
16,082
(8.44 %)
n/a 4,038
(1.42 %)
32,856
(9.80 %)
n/a 34.73
(95.75 %)
10,626
(4.26 %)
10,626
(4.26 %)
26,005
(95.74 %)
203,498
(3.41 %)
100,483
(2.15 %)
2,221,362
(35.19 %)
127
(0.11 %)
43,690
(1.77 %)
18,108
(3.49 %)
18,662
(3.08 %)
19 ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019)
GCF_005281655.1
28,261
(10.34 %)
n/a 4,915
(1.27 %)
40,257
(10.17 %)
n/a 35.18
(99.51 %)
0
(0 %)
1,076
(0.49 %)
2,869
(100.00 %)
322,753
(4.92 %)
245,412
(6.65 %)
1,952,946
(43.11 %)
0
(0 %)
252,395
(6.75 %)
17,048
(6.08 %)
17,349
(3.45 %)
20 ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI)
GCF_001594075.1
22,023
(8.25 %)
n/a 4,211
(1.25 %)
37,113
(9.30 %)
n/a 35.01
(91.82 %)
40,822
(8.21 %)
40,822
(8.21 %)
60,583
(91.79 %)
218,162
(3.24 %)
139,385
(2.26 %)
2,347,922
(34.62 %)
136
(0.08 %)
54,250
(1.47 %)
23,814
(3.66 %)
21,810
(2.96 %)
21 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank)
GCA_002114115.1
n/a n/a 22,542
(3.52 %)
67,060
(16.20 %)
n/a 38.04
(88.95 %)
0
(0 %)
7,175
(11.05 %)
806
(100.00 %)
692,611
(50.80 %)
322,540
(4.42 %)
3,033,193
(35.58 %)
2
(0.00 %)
451,430
(6.86 %)
25,871
(1.75 %)
13,877
(0.88 %)
22 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1
n/a n/a 18,452
(1.96 %)
16,975
(1.61 %)
n/a 41.29
(98.88 %)
72,775
(1.13 %)
72,775
(1.13 %)
105,347
(98.87 %)
3,079,920
(34.79 %)
319,928
(0.96 %)
12,281,845
(25.28 %)
43
(0.00 %)
88,463
(0.39 %)
48,638
(1.17 %)
44,009
(1.01 %)
23 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1
n/a n/a 22,910
(1.42 %)
31,985
(1.20 %)
35,342
(1.47 %)
41.93
(99.87 %)
9,604
(0.04 %)
9,604
(0.04 %)
1,272,949
(99.96 %)
6,096,013
(44.89 %)
1,265,350
(2.67 %)
14,617,986
(39.29 %)
19
(0.00 %)
594,304
(1.21 %)
64,716
(1.93 %)
61,195
(1.72 %)
24 Asian corn borer (v1 ACB-3 2019)
GCF_004193835.1
25,279
(7.94 %)
n/a 4,931
(1.05 %)
28,608
(7.16 %)
n/a 37.50
(100.00 %)
0
(0 %)
34,722
(0.01 %)
7,722
(100.00 %)
146,974
(1.35 %)
89,987
(2.68 %)
2,666,250
(38.74 %)
899
(0.07 %)
268,435
(6.89 %)
39,696
(5.22 %)
19,418
(2.22 %)
25 Asian corn borer (v2 ACB-3 2019)
GCF_004193835.2
25,169
(7.95 %)
n/a 4,867
(1.05 %)
28,255
(7.08 %)
n/a 37.49
(100.00 %)
0
(0 %)
34,702
(0.01 %)
6,269
(100.00 %)
150,783
(1.53 %)
89,885
(2.69 %)
2,627,296
(38.56 %)
899
(0.07 %)
268,390
(6.92 %)
39,511
(5.22 %)
19,307
(2.21 %)
26 Asiatic tapir (BS100 BIUU 2019)
GCA_004024905.1
n/a n/a 20,854
(1.73 %)
28,046
(1.39 %)
n/a 40.91
(99.96 %)
4,333
(0.02 %)
4,333
(0.02 %)
284,468
(99.98 %)
3,802,671
(39.88 %)
335,521
(0.73 %)
15,053,564
(30.25 %)
11
(0.00 %)
n/a 39,691
(1.17 %)
36,849
(1.05 %)
27 ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006)
GCF_000149645.2
10,390
(48.16 %)
n/a 1,538
(3.76 %)
6,155
(25.19 %)
n/a 49.56
(99.97 %)
90
(0.03 %)
90
(0.03 %)
466
(99.97 %)
5,026
(0.77 %)
2,256
(0.38 %)
68,790
(5.94 %)
0
(0 %)
710
(0.23 %)
2,846
(42.44 %)
3,973
(22.95 %)
28 ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007)
GCF_000002855.3
10,608
(51.05 %)
n/a 1,481
(3.36 %)
5,692
(22.11 %)
n/a 50.35
(99.87 %)
449
(0.13 %)
662
(0.13 %)
469
(99.87 %)
9,986
(1.32 %)
2,619
(0.36 %)
106,480
(7.71 %)
1
(0.00 %)
262
(0.07 %)
5,568
(53.86 %)
6,938
(24.44 %)
29 ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019)
GCF_004011695.1
11,257
(41.02 %)
n/a 1,596
(2.91 %)
8,283
(26.43 %)
n/a 49.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 34
(100.00 %)
14,775
(2.01 %)
16,031
(2.34 %)
103,256
(17.19 %)
0
(0 %)
7,380
(1.61 %)
805
(44.28 %)
832
(32.41 %)
30 ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank)
GCA_000003525.2
n/a 11,865
(30.24 %)
1,516
(1.76 %)
5,714
(11.07 %)
n/a 37.07
(99.50 %)
566
(0.51 %)
566
(0.51 %)
593
(99.49 %)
38,696
(2.74 %)
27,571
(2.05 %)
270,617
(48.64 %)
2
(0.00 %)
31,958
(3.92 %)
8,002
(10.69 %)
7,438
(8.47 %)
31 ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012)
GCF_000182805.2
9,903
(39.44 %)
n/a 1,311
(2.58 %)
4,612
(17.66 %)
n/a 52.11
(99.64 %)
0
(0 %)
978
(0.36 %)
1,583
(100.00 %)
16,540
(1.85 %)
7,316
(0.76 %)
171,684
(11.10 %)
0
(0 %)
371
(0.08 %)
1,770
(49.40 %)
6,766
(16.80 %)
32 ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank)
GCA_000961545.1
10,279
(51.22 %)
10,434
(48.46 %)
1,134
(2.55 %)
2,026
(10.60 %)
n/a 54.96
(100.00 %)
57
(0.00 %)
57
(0.00 %)
73
(100.00 %)
15,846
(2.28 %)
8,000
(0.94 %)
169,678
(13.75 %)
0
(0 %)
339
(0.06 %)
22
(99.61 %)
22
(0.11 %)
33 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1
48,976
(40.12 %)
n/a 18,884
(1.76 %)
19,296
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
0
(0 %)
69,593
(1.38 %)
2,166
(100.00 %)
3,855,699
(41.69 %)
289,735
(0.96 %)
14,695,257
(28.58 %)
5,680
(0.23 %)
136,343
(0.85 %)
40,025
(1.06 %)
36,402
(0.92 %)
34 Atlantic halibut (2019 genbank)
GCA_009819705.1
52,117
(66.34 %)
n/a 14,960
(3.20 %)
45,365
(7.48 %)
69,625
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
0
(0 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,421
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,979
(24.13 %)
0
(0 %)
240,110
(3.16 %)
31,325
(2.25 %)
20,749
(1.34 %)
35 Atlantic herring (v1)
GCF_900700415.1
46,216
(9.88 %)
n/a 15,249
(2.65 %)
25,664
(6.68 %)
n/a 44.24
(99.88 %)
1,963
(0.12 %)
1,963
(0.12 %)
1,990
(99.88 %)
1,175,759
(12.03 %)
1,231,613
(13.39 %)
3,511,276
(32.20 %)
2
(0.00 %)
1,037,723
(8.32 %)
33,465
(1.97 %)
20,325
(1.10 %)
36 Atlantic salmon (genbank 2021)
GCA_905237065.2
n/a n/a 28,077
(1.40 %)
120,383
(3.99 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
4,501,521
(48.00 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
0
(0 %)
4,866,269
(10.20 %)
77,089
(1.86 %)
20,127
(0.31 %)
37 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1
60,922
(45.62 %)
n/a 12,545
(0.38 %)
29,428
(1.34 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,648
(0.01 %)
2,990
(100.00 %)
8,579,105
(49.81 %)
831,224
(15.75 %)
21,718,213
(51.79 %)
9
(0.00 %)
4,445,293
(7.00 %)
105,821
(2.42 %)
35,197
(0.42 %)
38 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3
11,472
(14.88 %)
n/a 2,843
(2.29 %)
3,797
(4.95 %)
n/a 30.21
(92.98 %)
2,303
(6.97 %)
58,744
(7.04 %)
26,881
(93.03 %)
147,614
(11.55 %)
54,885
(7.91 %)
647,155
(33.62 %)
55
(0.02 %)
69,072
(5.04 %)
509
(0.15 %)
126
(0.04 %)
39 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1
52,178
(47.52 %)
n/a 18,330
(1.96 %)
17,094
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
31,980
(0.69 %)
67,434
(99.31 %)
3,072,373
(34.88 %)
306,996
(0.95 %)
12,209,895
(25.43 %)
58
(0.01 %)
73,572
(0.41 %)
49,789
(1.25 %)
45,112
(1.08 %)
40 banded archerfish (primary hap 2021 genbank)
GCA_017976425.1
42,399
(57.52 %)
n/a 15,312
(3.18 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
0
(0 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
811,892
(18.19 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
1
(0.00 %)
297,728
(3.49 %)
15,089
(0.96 %)
9,304
(0.55 %)
41 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1
15,006
(2.07 %)
n/a 11,133
(1.44 %)
21,138
(1.69 %)
n/a 40.21
(99.24 %)
109,223
(0.79 %)
109,223
(0.79 %)
171,345
(99.21 %)
413,761
(3.90 %)
181,353
(0.91 %)
6,776,326
(18.43 %)
2
(0.00 %)
15,140
(0.13 %)
10,575
(0.29 %)
9,101
(0.25 %)
42 barn owl (2020)
GCF_902150015.1
37,361
(4.54 %)
n/a 12,958
(1.72 %)
22,922
(1.99 %)
26,976
(3.04 %)
41.55
(99.23 %)
0
(0 %)
177,340
(0.79 %)
21,504
(100.00 %)
585,627
(5.48 %)
367,764
(2.44 %)
7,399,161
(19.58 %)
6,614
(0.13 %)
188,767
(2.21 %)
47,061
(3.25 %)
41,356
(2.24 %)
43 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021)
GCA_015227805.2
n/a n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,546
(2.82 %)
29,760
(1.66 %)
44 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap refseq 2021)
GCF_015227805.1
43,374
(5.14 %)
n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,546
(2.82 %)
29,760
(1.66 %)
45 Barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021 genbank)
GCA_015227805.3
n/a n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,548
(2.85 %)
29,760
(1.66 %)
46 basidiomycetes A.bisporus (H97 2012)
GCF_000300575.1
10,448
(49.20 %)
n/a 1,066
(2.53 %)
5,238
(16.95 %)
n/a 46.48
(99.32 %)
225
(0.68 %)
225
(0.68 %)
254
(99.32 %)
4,921
(0.90 %)
2,352
(0.47 %)
62,603
(9.90 %)
0
(0 %)
7,487
(2.92 %)
5,244
(15.19 %)
4,407
(9.08 %)
47 basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010)
GCF_000143185.1
13,192
(49.72 %)
n/a 894
(1.60 %)
973
(2.80 %)
n/a 57.50
(98.57 %)
316
(1.43 %)
316
(1.43 %)
352
(98.57 %)
7,478
(4.11 %)
7,640
(1.13 %)
176,404
(11.51 %)
1
(0.00 %)
5,378
(1.90 %)
38
(40.33 %)
55
(0.23 %)
48 ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank)
GCA_000219625.1
10,941
(44.32 %)
10,965
(38.50 %)
1,451
(2.81 %)
6,906
(25.36 %)
n/a 52.14
(99.98 %)
3
(0.02 %)
3
(0.02 %)
24
(99.98 %)
8,941
(1.69 %)
8,367
(1.51 %)
99,818
(11.14 %)
0
(0 %)
6,612
(1.57 %)
27
(96.31 %)
89
(4.28 %)
49 barramundi perch (ASB-BC8 2016)
GCF_001640805.1
50,205
(13.10 %)
n/a 16,166
(3.05 %)
25,084
(6.20 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
110
(0.00 %)
3,808
(100.00 %)
465,997
(3.11 %)
237,955
(4.36 %)
4,027,027
(23.91 %)
0
(0 %)
248,089
(3.21 %)
16,276
(1.04 %)
9,104
(0.52 %)
50 bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016)
GCF_001652005.1
25,020
(17.94 %)
n/a 4,205
(2.34 %)
27,352
(12.83 %)
n/a 41.09
(91.93 %)
0
(0 %)
19,248
(8.05 %)
50,565
(100.00 %)
57,833
(1.39 %)
27,440
(2.49 %)
1,173,760
(18.39 %)
416
(0.39 %)
14,577
(3.60 %)
10,942
(2.61 %)
10,587
(2.22 %)
51 bee E.mexicana (v1 0111107269 2016)
GCF_001483705.1
16,406
(4.01 %)
n/a 4,087
(0.75 %)
46,846
(6.53 %)
16,764
(4.04 %)
40.92
(95.72 %)
25,039
(4.23 %)
25,039
(4.23 %)
212,650
(95.77 %)
641,987
(7.51 %)
360,406
(11.43 %)
3,411,951
(46.01 %)
306
(0.12 %)
259,979
(5.86 %)
40,540
(3.99 %)
18,218
(1.75 %)
52 beet (2015)
GCF_000511025.2
37,939
(8.78 %)
n/a 12,044
(2.14 %)
63,283
(17.52 %)
n/a 36.14
(91.40 %)
30,962
(8.61 %)
30,962
(8.61 %)
71,208
(91.39 %)
288,084
(4.25 %)
299,650
(4.72 %)
3,021,571
(30.10 %)
1,360
(0.22 %)
218,658
(4.15 %)
32,547
(2.39 %)
20,111
(1.55 %)
53 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017)
GCA_002288925.2
n/a n/a 18,686
(1.78 %)
20,378
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.66 %)
28,398
(1.35 %)
28,398
(1.35 %)
35,369
(98.65 %)
4,001,688
(43.72 %)
542,326
(1.10 %)
12,806,249
(34.24 %)
954
(0.02 %)
386,729
(1.71 %)
59,279
(1.53 %)
42,903
(1.24 %)
54 black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018)
GCF_000002775.4
59,637
(15.47 %)
n/a 20,361
(4.67 %)
44,177
(15.83 %)
n/a 33.75
(97.43 %)
6,871
(2.58 %)
6,871
(2.58 %)
8,318
(97.42 %)
402,600
(27.63 %)
177,746
(4.65 %)
2,639,214
(36.04 %)
34
(0.01 %)
246,517
(5.54 %)
4,559
(0.56 %)
1,801
(0.17 %)
55 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1
51,115
(48.16 %)
n/a 13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
0
(0 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
8
(0.00 %)
651,836
(3.67 %)
45,318
(4.71 %)
36,668
(1.67 %)
56 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1
41,018
(2.61 %)
n/a 4,064
(0.14 %)
135,587
(7.67 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,977
(100.00 %)
1,153,773
(4.93 %)
754,711
(7.52 %)
10,964,182
(43.13 %)
0
(0 %)
805,883
(3.13 %)
138,831
(8.38 %)
232,611
(7.21 %)
57 black rhinoceros (mBicDic1 primary hap genbank 2021)
GCA_020826845.1
56,255
(36.51 %)
n/a 18,774
(1.38 %)
22,346
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
0
(0 %)
215
(0.05 %)
1,075
(100.00 %)
4,200,385
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,639
(40.14 %)
2
(0.00 %)
984,722
(2.61 %)
43,525
(1.14 %)
33,963
(0.76 %)
58 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016)
GCF_001698545.1
59,210
(2.48 %)
n/a 21,256
(1.89 %)
23,679
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
0
(0 %)
149,843
(5.88 %)
105,031
(100.00 %)
5,602,009
(50.58 %)
991,745
(2.45 %)
16,354,078
(34.26 %)
4,262
(0.14 %)
n/a 81,205
(1.19 %)
29,123
(0.68 %)
59 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016)
GCA_001698545.1
59,197
(39.21 %)
n/a 21,244
(1.88 %)
23,681
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
0
(0 %)
149,843
(5.88 %)
105,030
(100.00 %)
5,600,915
(50.57 %)
991,762
(2.45 %)
16,353,992
(34.26 %)
4,262
(0.14 %)
867,902
(3.08 %)
81,205
(1.19 %)
29,129
(0.68 %)
60 black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020)
GCF_013377495.1
41,255
(4.77 %)
n/a 12,955
(1.98 %)
22,656
(2.28 %)
31,476
(5.07 %)
41.95
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 396
(100.00 %)
680,976
(7.66 %)
296,152
(1.44 %)
6,797,141
(21.40 %)
0
(0 %)
86,777
(0.79 %)
31,750
(3.32 %)
30,007
(2.00 %)
61 black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020)
GCF_015228065.1
35,923
(2.41 %)
n/a 3,903
(0.15 %)
39,667
(2.27 %)
40,959
(2.59 %)
36.64
(83.75 %)
0
(0 %)
1,158,725
(16.44 %)
26,876
(100.00 %)
5,488,723
(29.98 %)
7,028,944
(21.91 %)
10,445,796
(49.62 %)
239
(0.01 %)
4,167,031
(8.98 %)
178,205
(3.43 %)
77,006
(1.37 %)
62 Blainville's beaked whale (mMesDen1 primary hap 2022 genbank)
GCA_025265405.1
47,540
(38.02 %)
n/a 19,042
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
0
(0 %)
97
(0.03 %)
73
(100.00 %)
3,964,035
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,162
(41.78 %)
1
(0.00 %)
1,795,618
(5.01 %)
70,851
(1.80 %)
37,949
(0.93 %)
63 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2
n/a n/a 19,164
(1.81 %)
20,546
(1.41 %)
34,210
(1.86 %)
40.88
(98.91 %)
0
(0 %)
936
(1.09 %)
130
(100.00 %)
3,999,202
(44.22 %)
581,540
(1.22 %)
12,900,977
(34.62 %)
2
(0.00 %)
424,951
(1.36 %)
67,189
(1.73 %)
46,700
(1.41 %)
64 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1
47,312
(59.52 %)
n/a 14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
0
(0 %)
455,135
(4.01 %)
29,050
(1.48 %)
14,672
(0.63 %)
65 blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq)
GCF_900634775.1
47,312
(7.12 %)
n/a 14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
0
(0 %)
455,135
(4.01 %)
29,050
(1.48 %)
14,672
(0.63 %)
66 Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011)
GCF_000235385.1
39,820
(2.33 %)
n/a 20,222
(2.04 %)
18,404
(1.34 %)
49,071
(2.26 %)
40.77
(94.98 %)
148,728
(5.04 %)
148,728
(5.04 %)
151,414
(94.96 %)
4,710,420
(46.30 %)
767,602
(1.48 %)
14,489,703
(32.96 %)
1,541
(0.02 %)
526,235
(1.31 %)
32,474
(0.75 %)
29,285
(0.67 %)
67 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021)
GCF_016699345.1
53,030
(2.41 %)
n/a 20,599
(1.98 %)
21,182
(1.34 %)
46,441
(1.87 %)
40.95
(99.56 %)
1,074
(0.44 %)
1,074
(0.44 %)
2,790
(99.56 %)
5,098,799
(47.87 %)
946,231
(3.04 %)
14,608,771
(36.99 %)
14
(0.00 %)
1,335,352
(2.84 %)
37,273
(1.03 %)
32,351
(0.89 %)
68 Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023)
GCA_028885525.1
n/a n/a 19,820
(1.76 %)
20,399
(1.15 %)
n/a 40.98
(99.88 %)
36
(0.12 %)
36
(0.12 %)
251
(99.88 %)
5,232,617
(54.01 %)
1,003,539
(10.19 %)
14,858,575
(42.10 %)
0
(0 %)
2,511,941
(4.39 %)
42,467
(1.24 %)
29,563
(0.80 %)
69 Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023)
GCF_028885625.1
81,966
(2.93 %)
n/a 20,794
(1.72 %)
21,307
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.86 %)
39
(0.14 %)
39
(0.14 %)
1,593
(99.86 %)
5,651,267
(54.21 %)
1,155,151
(9.33 %)
16,242,823
(42.82 %)
0
(0 %)
2,513,241
(4.25 %)
52,294
(2.02 %)
36,160
(1.02 %)
70 boutu (BS63 2019)
GCA_004363515.1
n/a n/a 21,835
(1.38 %)
35,087
(1.18 %)
n/a 42.09
(99.89 %)
5,072
(0.02 %)
5,072
(0.02 %)
1,218,682
(99.98 %)
5,098,108
(45.85 %)
856,878
(2.32 %)
13,046,921
(40.74 %)
29
(0.00 %)
n/a 63,992
(1.47 %)
47,092
(1.19 %)
71 Brazilian free-tailed bat (US034 2019)
GCA_004025005.1
n/a n/a 23,562
(1.20 %)
51,200
(1.27 %)
n/a 42.40
(99.91 %)
4,243
(0.02 %)
4,243
(0.02 %)
1,071,858
(99.98 %)
4,884,584
(32.93 %)
777,032
(1.49 %)
14,195,446
(36.38 %)
31
(0.00 %)
n/a 89,940
(1.88 %)
76,243
(1.50 %)
72 brown anole (Geneva1000 2022 genbank)
GCA_025583915.1
38,099
(52.40 %)
n/a 14,028
(1.05 %)
19,927
(1.81 %)
n/a 41.14
(98.37 %)
0
(0 %)
114,440
(1.64 %)
3,738
(100.00 %)
1,376,455
(6.78 %)
1,094,843
(5.18 %)
9,127,396
(44.98 %)
261
(0.01 %)
1,132,418
(4.31 %)
46,291
(1.18 %)
17,324
(0.40 %)
73 brown argus (genbank 2021)
GCA_905147365.1
23,611
(63.03 %)
n/a 4,734
(1.03 %)
24,267
(6.80 %)
24,237
(6.16 %)
36.86
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
26
(100.00 %)
264,378
(2.90 %)
144,255
(3.35 %)
2,651,028
(48.44 %)
0
(0 %)
205,174
(4.19 %)
35,431
(4.56 %)
15,409
(1.89 %)
74 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1
54,006
(3.19 %)
n/a 18,811
(1.78 %)
21,058
(1.52 %)
39,408
(1.98 %)
41.84
(99.31 %)
15,552
(0.70 %)
17,380
(0.70 %)
21,814
(99.30 %)
4,283,780
(41.29 %)
567,588
(1.23 %)
13,807,277
(30.86 %)
760
(0.01 %)
325,786
(0.96 %)
62,126
(1.80 %)
56,003
(1.56 %)
75 brown bear (v1.0 2022 WashU)
GCF_023065955.1
60,162
(4.01 %)
n/a 18,920
(1.66 %)
21,641
(1.49 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
0
(0 %)
215
(0.00 %)
902
(100.00 %)
4,166,472
(34.00 %)
659,124
(5.14 %)
13,282,996
(33.88 %)
0
(0 %)
788,951
(2.62 %)
68,113
(2.27 %)
61,162
(1.99 %)
76 brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020)
GCF_013339695.1
39,619
(2.36 %)
n/a 3,965
(0.13 %)
116,426
(5.96 %)
45,849
(2.46 %)
46.86
(99.96 %)
0
(0 %)
10,359
(0.04 %)
2,329
(100.00 %)
1,064,424
(3.53 %)
716,579
(3.47 %)
10,608,171
(42.78 %)
1
(0.00 %)
n/a 13,204
(0.97 %)
233,049
(6.32 %)
77 brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020)
GCF_012460135.1
31,379
(5.19 %)
n/a 12,572
(1.89 %)
24,442
(2.44 %)
26,137
(3.13 %)
42.40
(99.99 %)
278
(0.01 %)
278
(0.01 %)
691
(99.99 %)
504,872
(6.53 %)
420,620
(3.73 %)
6,496,619
(21.26 %)
0
(0 %)
353,680
(2.15 %)
28,576
(2.39 %)
22,561
(1.23 %)
78 brown planthopper (BPH 2020 genbank)
GCA_014356525.1
36,936
(60.13 %)
n/a 4,416
(0.37 %)
22,354
(3.57 %)
37,534
(4.91 %)
34.69
(99.96 %)
0
(0 %)
4,529
(0.04 %)
7,093
(100.00 %)
597,351
(3.69 %)
564,076
(6.64 %)
6,601,703
(47.48 %)
11
(0.00 %)
905,418
(9.48 %)
39,697
(1.55 %)
15,292
(0.62 %)
79 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1
32,026
(47.01 %)
n/a 13,250
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
26,324
(3.11 %)
41.80
(99.72 %)
0
(0 %)
284
(0.28 %)
865
(100.00 %)
539,059
(10.20 %)
279,511
(3.12 %)
5,874,608
(22.08 %)
1
(0.00 %)
324,823
(2.05 %)
21,155
(1.61 %)
17,590
(1.10 %)
80 butterfly L.sinapis (2021 genbank)
GCA_905404315.1
25,882
(55.17 %)
n/a 4,722
(0.65 %)
16,896
(3.62 %)
47,660
(8.03 %)
35.73
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
50
(100.00 %)
272,738
(1.92 %)
98,053
(6.01 %)
4,662,765
(51.79 %)
0
(0 %)
376,611
(5.06 %)
43,150
(4.96 %)
13,298
(1.08 %)
81 butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021)
GCA_905475465.1
n/a n/a 4,588
(1.37 %)
11,218
(5.90 %)
42,925
(13.84 %)
33.95
(100.00 %)
0
(0 %)
41
(0.00 %)
43
(100.00 %)
143,323
(2.19 %)
45,473
(3.23 %)
2,501,939
(42.55 %)
0
(0 %)
106,106
(3.41 %)
11,070
(2.07 %)
6,650
(1.23 %)
82 cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147795.1
21,844
(65.09 %)
n/a 4,557
(1.68 %)
9,253
(6.32 %)
30,285
(15.57 %)
33.23
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
40
(100.00 %)
116,781
(2.12 %)
30,577
(1.24 %)
2,300,336
(39.04 %)
0
(0 %)
40,164
(2.03 %)
6,783
(2.24 %)
5,041
(1.33 %)
83 California condor (v1 813 2021 genbank)
GCA_018139145.1
n/a n/a 12,650
(1.75 %)
21,946
(1.95 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
0
(0 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
518,393
(6.41 %)
177,329
(0.88 %)
7,168,675
(20.31 %)
6
(0.00 %)
116,410
(1.11 %)
34,926
(2.94 %)
32,355
(1.72 %)
84 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1
n/a n/a 23,668
(1.61 %)
29,709
(1.32 %)
n/a 41.56
(99.92 %)
10,276
(0.04 %)
10,276
(0.04 %)
582,272
(99.96 %)
4,952,087
(44.00 %)
651,744
(1.26 %)
13,644,805
(35.79 %)
27
(0.00 %)
376,234
(0.87 %)
62,245
(1.50 %)
57,048
(1.32 %)
85 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1
n/a n/a 21,020
(1.79 %)
20,045
(1.39 %)
45,176
(2.15 %)
41.40
(99.28 %)
0
(0 %)
122
(0.72 %)
43
(100.00 %)
4,529,949
(43.67 %)
589,962
(1.24 %)
13,266,465
(33.77 %)
0
(0 %)
491,959
(1.43 %)
51,989
(1.50 %)
48,284
(1.32 %)
86 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1
50,094
(2.69 %)
n/a 18,283
(1.66 %)
19,326
(1.35 %)
38,985
(1.96 %)
41.70
(99.88 %)
0
(0 %)
848
(0.12 %)
66
(100.00 %)
5,016,399
(43.75 %)
904,986
(1.75 %)
13,476,288
(34.20 %)
0
(0 %)
572,992
(1.64 %)
66,822
(2.52 %)
60,494
(2.02 %)
87 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1
n/a n/a 25,543
(0.55 %)
52,506
(0.63 %)
n/a 40.04
(99.84 %)
4,876
(0.01 %)
4,876
(0.01 %)
3,432,954
(99.99 %)
7,363,240
(21.82 %)
876,677
(2.53 %)
25,446,677
(58.18 %)
62
(0.00 %)
n/a 25,319
(0.31 %)
19,908
(0.25 %)
88 capsicum (Zunla-1 2015 genbank)
GCA_000710875.1
n/a n/a 16,133
(0.56 %)
62,445
(2.92 %)
n/a 34.93
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
107,172
(3.23 %)
108,797
(96.77 %)
1,171,727
(3.54 %)
948,641
(4.39 %)
21,533,236
(46.16 %)
331
(0.03 %)
1,512,400
(5.05 %)
16,621
(0.21 %)
4,972
(0.06 %)
89 carmine bee-eater (2014 BGI)
GCF_000691845.1
15,520
(2.12 %)
n/a 11,303
(1.45 %)
24,758
(1.84 %)
n/a 41.67
(99.59 %)
50,632
(0.42 %)
50,632
(0.42 %)
104,131
(99.58 %)
405,042
(5.66 %)
161,525
(1.05 %)
6,445,961
(19.27 %)
2
(0.00 %)
37,279
(0.40 %)
11,477
(0.36 %)
9,158
(0.28 %)
90 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1
48,199
(10.95 %)
n/a 18,537
(3.62 %)
45,536
(13.17 %)
n/a 35.94
(85.14 %)
37,896
(14.88 %)
37,896
(14.88 %)
39,916
(85.12 %)
295,656
(2.88 %)
266,527
(3.40 %)
2,434,269
(42.34 %)
26
(0.02 %)
352,557
(6.54 %)
30,963
(1.41 %)
4,126
(0.23 %)
91 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6
n/a n/a 19,803
(1.54 %)
21,001
(1.30 %)
n/a 41.83
(99.57 %)
39,124
(0.44 %)
41,517
(0.44 %)
42,578
(99.56 %)
5,725,274
(49.24 %)
459,535
(1.33 %)
12,905,109
(41.11 %)
628
(0.03 %)
1,325,981
(3.97 %)
43,324
(1.28 %)
37,641
(0.94 %)
92 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA)
GCF_002263795.1
76,369
(2.97 %)
n/a 19,669
(1.56 %)
21,999
(1.33 %)
n/a 41.93
(100.00 %)
0
(0 %)
386
(0.00 %)
2,211
(100.00 %)
5,643,592
(49.67 %)
545,256
(2.90 %)
13,085,601
(41.79 %)
1
(0.00 %)
1,556,737
(4.07 %)
44,357
(1.24 %)
37,714
(0.98 %)
93 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA)
GCF_002263795.2
76,293
(2.98 %)
n/a 19,325
(1.49 %)
21,665
(1.32 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
386
(0.00 %)
1,957
(100.00 %)
3,550,686
(24.18 %)
544,595
(2.90 %)
13,050,221
(41.81 %)
1
(0.00 %)
1,554,173
(4.07 %)
44,208
(1.24 %)
37,290
(0.87 %)
94 Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad)
GCA_004024745.1
n/a n/a 21,372
(1.41 %)
34,453
(1.31 %)
n/a 42.35
(99.87 %)
10,534
(0.04 %)
10,534
(0.04 %)
1,240,696
(99.96 %)
5,244,572
(43.13 %)
2,503,015
(4.45 %)
12,961,004
(41.69 %)
59
(0.00 %)
n/a 173,264
(3.70 %)
153,887
(3.31 %)
95 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1
40,788
(61.50 %)
n/a 14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
0
(0 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
0
(0 %)
452,303
(4.62 %)
20,453
(1.39 %)
10,802
(0.65 %)
96 channel catfish (USDA103 v1 2016)
GCF_001660625.1
53,933
(9.58 %)
n/a 15,712
(2.71 %)
25,639
(5.25 %)
n/a 39.70
(98.56 %)
25,203
(1.45 %)
25,203
(1.45 %)
34,544
(98.55 %)
871,222
(5.75 %)
585,250
(4.19 %)
5,150,651
(33.94 %)
63
(0.01 %)
258,935
(2.61 %)
31,438
(1.87 %)
20,402
(1.03 %)
97 channel catfish (USDA103 v1.2 2019)
GCF_001660625.2
57,087
(10.27 %)
n/a 16,253
(2.68 %)
44,936
(5.15 %)
n/a 39.70
(98.57 %)
25,203
(1.39 %)
25,285
(1.44 %)
34,545
(98.61 %)
900,327
(5.55 %)
614,695
(4.28 %)
5,348,266
(33.81 %)
63
(0.01 %)
281,774
(2.67 %)
32,840
(1.87 %)
21,251
(1.03 %)
98 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1
n/a n/a 18,264
(1.57 %)
14,665
(1.26 %)
n/a 41.30
(98.26 %)
0
(0 %)
183,260
(1.77 %)
14,382
(100.00 %)
4,777,041
(42.51 %)
784,368
(1.53 %)
13,503,827
(31.65 %)
42
(0.00 %)
261,774
(0.78 %)
57,657
(1.31 %)
48,632
(1.00 %)
99 chimney swift (M959 v1.0 2014)
GCF_000747805.1
15,979
(2.53 %)
n/a 12,065
(1.82 %)
10,050
(2.07 %)
n/a 41.40
(95.99 %)
65,523
(4.03 %)
65,523
(4.03 %)
84,595
(95.97 %)
453,775
(7.30 %)
194,988
(2.21 %)
6,363,949
(19.70 %)
135
(0.03 %)
104,994
(2.61 %)
12,486
(0.42 %)
8,538
(0.26 %)
100 chimpanzee (Clint C0471 2018 genbank)
GCA_002880755.3
n/a 162,869
(3.61 %)
20,378
(1.83 %)
21,427
(1.19 %)
n/a 40.71
(98.98 %)
693
(1.02 %)
693
(1.02 %)
5,037
(98.98 %)
5,409,980
(53.76 %)
984,231
(7.31 %)
15,896,744
(39.56 %)
4
(0.00 %)
2,559,246
(4.40 %)
45,870
(0.97 %)
28,273
(0.73 %)
101 chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023)
GCA_028858805.1
n/a n/a 20,001
(1.79 %)
21,230
(1.19 %)
n/a 40.62
(99.78 %)
22
(0.22 %)
22
(0.22 %)
141
(99.78 %)
5,092,768
(48.83 %)
946,933
(11.75 %)
14,844,947
(42.39 %)
0
(0 %)
3,140,392
(5.61 %)
47,662
(1.21 %)
29,340
(0.82 %)
102 chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023)
GCF_028858775.1
111,282
(4.36 %)
n/a 20,990
(1.75 %)
21,705
(1.15 %)
n/a 40.94
(99.90 %)
29
(0.10 %)
29
(0.10 %)
1,500
(99.90 %)
5,581,205
(50.06 %)
1,158,792
(10.59 %)
15,972,274
(43.09 %)
0
(0 %)
3,093,549
(5.27 %)
61,901
(2.29 %)
38,043
(1.17 %)
103 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1
60,293
(11.65 %)
n/a 15,433
(2.84 %)
67,310
(21.70 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
45
(100.00 %)
273,992
(2.25 %)
228,466
(3.97 %)
2,261,888
(35.14 %)
0
(0 %)
273,738
(7.11 %)
37,317
(4.18 %)
22,576
(1.74 %)
104 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1
55,529
(3.00 %)
n/a 19,755
(1.76 %)
20,017
(1.50 %)
n/a 41.51
(99.88 %)
0
(0 %)
4,356
(0.12 %)
1,830
(100.00 %)
4,544,603
(29.89 %)
1,095,407
(2.92 %)
12,942,232
(32.27 %)
20
(0.00 %)
553,246
(1.59 %)
19,343
(0.58 %)
15,755
(0.43 %)
105 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank)
GCA_018296145.1
92,370
(51.48 %)
n/a 27,141
(1.63 %)
113,328
(4.52 %)
157,545
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,313
(0.01 %)
2,333
(0.01 %)
9,977
(99.99 %)
4,892,399
(55.31 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,870
(54.55 %)
10
(0.00 %)
5,031,323
(11.16 %)
62,726
(1.40 %)
18,444
(0.39 %)
106 chub mackerel (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409825.1
34,390
(49.60 %)
n/a 15,350
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
0
(0 %)
1,572
(0.08 %)
361
(100.00 %)
1,669,327
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,422
(32.38 %)
3
(0.00 %)
927,880
(7.23 %)
16,290
(0.85 %)
8,913
(0.42 %)
107 chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014)
GCF_000700745.1
17,196
(2.21 %)
n/a 12,140
(1.50 %)
25,641
(1.91 %)
n/a 40.76
(99.61 %)
56,667
(0.39 %)
56,667
(0.39 %)
126,789
(99.61 %)
560,317
(7.62 %)
203,204
(1.12 %)
6,593,712
(20.47 %)
4
(0.00 %)
63,810
(0.48 %)
8,105
(0.24 %)
6,684
(0.19 %)
108 climbing perch (v1.1 2018 refseq)
GCF_900324465.1
42,930
(13.31 %)
n/a 15,237
(3.47 %)
22,710
(7.34 %)
37,043
(11.25 %)
40.40
(98.65 %)
0
(0 %)
292
(1.35 %)
70
(100.00 %)
329,586
(2.67 %)
133,519
(1.94 %)
3,418,470
(21.84 %)
0
(0 %)
182,187
(2.87 %)
10,698
(0.86 %)
7,641
(0.56 %)
109 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2
42,746
(63.74 %)
n/a 15,239
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
50
(100.00 %)
324,479
(2.66 %)
130,248
(1.89 %)
3,324,960
(21.31 %)
0
(0 %)
169,785
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
110 climbing perch (v1.2 2018 refseq)
GCF_900324465.2
42,746
(13.53 %)
n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
324,324
(2.66 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,009
(21.31 %)
0
(0 %)
169,785
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
111 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018385.1
81,219
(51.66 %)
n/a 18,516
(1.55 %)
20,363
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
0
(0 %)
181
(0.06 %)
34
(100.00 %)
4,798,634
(33.91 %)
992,669
(2.08 %)
13,618,933
(34.42 %)
3
(0.00 %)
647,740
(1.89 %)
67,831
(2.45 %)
58,578
(1.71 %)
112 clouded yellow (genbank 2021)
GCA_905220415.1
23,070
(64.23 %)
n/a 4,767
(1.38 %)
15,869
(7.12 %)
34,699
(13.48 %)
33.59
(100.00 %)
0
(0 %)
9
(0.00 %)
33
(100.00 %)
161,872
(2.42 %)
73,892
(2.86 %)
2,544,844
(42.14 %)
0
(0 %)
134,497
(3.68 %)
15,663
(2.98 %)
9,943
(1.81 %)
113 coho salmon (150728-3 2017)
GCF_002021735.1
64,032
(4.29 %)
n/a 24,727
(1.43 %)
46,926
(3.38 %)
n/a 43.33
(95.39 %)
1,566
(0.01 %)
265,291
(4.63 %)
22,810
(99.99 %)
1,185,308
(5.22 %)
2,455,045
(15.99 %)
11,710,855
(46.53 %)
9,333
(0.29 %)
4,110,586
(10.80 %)
72,061
(1.46 %)
24,530
(0.46 %)
114 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1
67,207
(45.84 %)
n/a 18,772
(1.77 %)
20,527
(1.42 %)
35,815
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
0
(0 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,067,521
(46.14 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,896
(35.29 %)
1
(0.00 %)
597,652
(1.78 %)
65,551
(1.90 %)
43,161
(1.35 %)
115 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1
45,962
(43.27 %)
n/a 17,254
(1.68 %)
17,112
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
0
(0 %)
114,003
(0.57 %)
2,647
(100.00 %)
3,845,214
(43.88 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,013
(32.18 %)
466
(0.01 %)
284,934
(0.89 %)
48,030
(1.35 %)
31,891
(1.03 %)
116 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1
37,661
(35.20 %)
n/a 18,681
(0.81 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,697
(38.92 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,301
(40.56 %)
0
(0 %)
455,834
(1.17 %)
17,762
(0.38 %)
13,986
(0.24 %)
117 common carp (2014)
GCF_000951615.1
75,427
(5.81 %)
n/a 27,632
(2.17 %)
59,950
(5.28 %)
n/a 37.00
(97.48 %)
0
(0 %)
57,940
(2.53 %)
9,378
(100.00 %)
1,460,282
(5.17 %)
987,356
(7.88 %)
9,900,821
(37.41 %)
8
(0.00 %)
1,320,956
(12.02 %)
48,702
(1.38 %)
28,063
(0.71 %)
118 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1
50,206
(57.28 %)
n/a 13,179
(1.84 %)
25,859
(2.41 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
0
(0 %)
296
(0.42 %)
151
(100.00 %)
521,043
(9.61 %)
310,469
(2.36 %)
6,712,849
(21.76 %)
0
(0 %)
326,521
(1.83 %)
25,267
(1.71 %)
20,672
(1.05 %)
119 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1
16,827
(2.53 %)
n/a 12,599
(1.80 %)
12,623
(2.28 %)
n/a 41.52
(97.64 %)
56,977
(2.38 %)
56,977
(2.38 %)
71,907
(97.62 %)
418,870
(8.06 %)
192,437
(2.08 %)
6,576,259
(19.85 %)
113
(0.02 %)
126,008
(2.66 %)
18,002
(0.74 %)
15,128
(0.57 %)
120 common house spider (v2 Geottingen 2017)
GCF_000365465.2
30,064
(3.79 %)
n/a 3,347
(0.23 %)
7,571
(1.48 %)
n/a 29.46
(81.63 %)
247,375
(18.44 %)
247,378
(18.44 %)
263,908
(81.56 %)
587,943
(2.23 %)
464,643
(2.90 %)
10,795,253
(40.31 %)
12,788
(0.38 %)
474,681
(4.16 %)
10,480
(0.23 %)
1,791
(0.05 %)
121 common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank)
GCA_000365465.3
37,121
(48.05 %)
n/a 3,276
(0.22 %)
9,098
(1.38 %)
38,273
(4.24 %)
29.40
(98.45 %)
24,382
(1.54 %)
124,228
(1.55 %)
84,235
(98.46 %)
637,694
(2.45 %)
527,781
(4.43 %)
11,553,196
(51.16 %)
299
(0.01 %)
477,709
(3.61 %)
11,998
(0.33 %)
2,762
(0.10 %)
122 common limpet (v1 primary hap 2022)
GCF_932274485.1
41,888
(9.21 %)
n/a 3,611
(0.43 %)
13,244
(4.58 %)
44,721
(6.30 %)
36.11
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
13
(100.00 %)
239,042
(1.40 %)
359,961
(7.89 %)
4,399,053
(45.69 %)
5
(0.00 %)
629,372
(7.98 %)
33,411
(1.94 %)
2,344
(0.13 %)
123 common sole (primary hap 2023 genbank)
GCA_958295425.1
55,359
(63.58 %)
n/a 14,846
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
243
(100.00 %)
1,149,249
(19.12 %)
342,239
(9.71 %)
3,906,839
(32.84 %)
2
(0.00 %)
440,509
(5.18 %)
27,772
(2.71 %)
15,561
(0.92 %)
124 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1
39,986
(53.94 %)
n/a 12,277
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
0
(0 %)
256
(0.16 %)
109
(100.00 %)
533,758
(8.66 %)
199,748
(1.12 %)
6,353,957
(21.19 %)
1
(0.00 %)
113,872
(0.91 %)
20,393
(1.74 %)
16,313
(0.88 %)
125 common vampire bat (HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1
58,054
(45.51 %)
n/a 18,280
(1.71 %)
19,514
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
611
(0.01 %)
572
(100.00 %)
2,761,820
(28.38 %)
427,940
(3.89 %)
11,250,492
(32.57 %)
37
(0.00 %)
360,489
(1.62 %)
70,700
(2.48 %)
44,288
(1.24 %)
126 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2
n/a n/a 18,511
(1.87 %)
18,170
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
54,308
(2.23 %)
84,108
(97.77 %)
2,860,991
(29.93 %)
275,245
(1.03 %)
11,798,152
(28.19 %)
237
(0.03 %)
174,536
(2.84 %)
51,833
(1.38 %)
47,411
(1.21 %)
127 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1
51,034
(3.23 %)
n/a 18,506
(1.88 %)
18,166
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
54,308
(2.23 %)
84,109
(97.77 %)
2,861,697
(29.93 %)
275,247
(1.03 %)
11,798,198
(28.19 %)
237
(0.03 %)
174,536
(2.84 %)
51,834
(1.38 %)
47,410
(1.21 %)
128 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1
29,369
(33.72 %)
n/a 19,335
(2.10 %)
21,769
(1.63 %)
n/a 41.24
(74.51 %)
276,531
(25.53 %)
276,544
(25.53 %)
299,069
(74.47 %)
3,513,698
(39.82 %)
304,033
(0.59 %)
13,333,842
(21.06 %)
1,491
(0.03 %)
288,329
(2.06 %)
56,694
(1.59 %)
52,345
(1.34 %)
129 cork oak (v1 HL8 2018)
GCF_002906115.1
65,969
(8.84 %)
n/a 20,226
(1.95 %)
89,703
(16.66 %)
n/a 36.19
(97.99 %)
0
(0 %)
26,139
(2.01 %)
23,344
(100.00 %)
865,884
(3.63 %)
491,126
(5.95 %)
6,119,503
(36.10 %)
267
(0.02 %)
690,224
(9.50 %)
21,505
(3.50 %)
10,784
(2.71 %)
130 corroboree frog (hap2 2023 genbank)
GCA_028390025.1
n/a n/a n/a 54,346
(1.07 %)
n/a 45.66
(99.76 %)
0
(0 %)
2,699
(0.24 %)
3,127
(100.00 %)
18,782,633
(75.22 %)
5,902,115
(18.63 %)
5,826
(99.76 %)
23
(0.00 %)
n/a 990,274
(4.84 %)
90,184
(0.51 %)
131 cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank)
GCA_002156985.1
21,972
(59.55 %)
17,082
(10.65 %)
4,839
(1.54 %)
21,045
(8.01 %)
n/a 36.13
(89.02 %)
23,558
(11.01 %)
26,910
(11.01 %)
24,551
(88.99 %)
115,046
(2.97 %)
31,900
(0.85 %)
2,230,382
(25.45 %)
1,738
(0.70 %)
33,991
(1.55 %)
15,851
(2.18 %)
9,912
(1.25 %)
132 cowpea (IT97K-499-35 v1 2019)
GCF_004118075.1
48,679
(10.56 %)
n/a 16,927
(3.30 %)
44,814
(13.06 %)
54,348
(11.30 %)
32.98
(99.48 %)
0
(0 %)
68
(0.52 %)
682
(100.00 %)
352,238
(4.22 %)
283,949
(8.14 %)
3,092,021
(41.64 %)
1
(0.00 %)
420,724
(7.56 %)
24,513
(2.40 %)
11,823
(1.16 %)
133 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1
76,183
(45.03 %)
n/a 20,283
(1.90 %)
20,544
(1.22 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,163
(4.85 %)
80,474
(4.85 %)
87,763
(95.15 %)
5,351,207
(51.35 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,449
(35.74 %)
1,138
(0.05 %)
1,213,705
(2.53 %)
76,963
(1.14 %)
28,050
(0.65 %)
134 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1
76,196
(3.30 %)
n/a 20,209
(1.91 %)
51,427
(6.84 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,163
(4.85 %)
80,474
(4.85 %)
87,764
(95.15 %)
5,251,819
(50.85 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,510
(35.74 %)
1,138
(0.05 %)
1,213,705
(2.53 %)
76,963
(1.14 %)
27,520
(0.64 %)
135 crucian carp (primary hap 2023 genbank)
GCA_963082965.1
90,094
(55.93 %)
n/a 29,389
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
0
(0 %)
832
(0.01 %)
278
(100.00 %)
3,481,389
(45.81 %)
802,775
(6.54 %)
8,190,816
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,003,533
(5.09 %)
83,696
(3.82 %)
26,039
(0.81 %)
136 crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022)
GCF_022539665.1
22,902
(28.68 %)
n/a 3,621
(2.94 %)
11,430
(17.96 %)
n/a 40.34
(99.47 %)
0
(0 %)
2
(0.53 %)
227
(100.00 %)
81,008
(2.67 %)
29,625
(4.98 %)
609,395
(25.66 %)
0
(0 %)
39,313
(3.92 %)
6,559
(5.05 %)
5,546
(3.62 %)
137 crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank)
GCA_003990815.1
n/a n/a 3,519
(2.64 %)
12,174
(17.22 %)
n/a 40.54
(93.29 %)
0
(0 %)
13,228
(6.75 %)
4,192
(100.00 %)
63,254
(2.07 %)
22,325
(1.44 %)
728,942
(20.81 %)
35
(0.03 %)
32,114
(3.20 %)
8,375
(4.98 %)
6,466
(3.39 %)
138 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank)
GCA_021462225.2
n/a n/a 15,131
(1.68 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
0
(0 %)
409
(0.54 %)
73
(100.00 %)
2,175,293
(47.80 %)
176,956
(1.87 %)
6,142,692
(38.35 %)
4
(0.00 %)
383,249
(3.60 %)
32,973
(1.28 %)
10,198
(0.33 %)
139 Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_963259705.1
64,558
(45.64 %)
n/a 19,142
(1.72 %)
22,139
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
0
(0 %)
1,099
(0.01 %)
122
(100.00 %)
3,040,239
(24.03 %)
796,913
(6.38 %)
10,478,261
(38.84 %)
9
(0.00 %)
756,430
(2.76 %)
64,921
(2.50 %)
57,806
(1.88 %)
140 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1
48,152
(35.39 %)
n/a 22,240
(1.40 %)
22,108
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,770
(15.68 %)
252,770
(15.68 %)
259,903
(84.32 %)
4,890,270
(27.82 %)
898,943
(1.50 %)
14,281,942
(29.30 %)
2,582
(0.03 %)
313,025
(1.02 %)
40,135
(0.82 %)
36,410
(0.69 %)
141 denticle herring (v1 2019)
GCF_900700375.1
59,645
(12.74 %)
n/a 16,556
(3.78 %)
37,861
(8.42 %)
72,719
(10.66 %)
43.69
(99.18 %)
0
(0 %)
464
(0.82 %)
460
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,282
(4.61 %)
2,948,671
(28.79 %)
0
(0 %)
306,165
(4.31 %)
64,661
(9.49 %)
52,867
(4.93 %)
142 diamondback terrapin (hap1 2023 genbank)
GCA_027887155.1
50,318
(52.07 %)
n/a 15,109
(1.08 %)
19,281
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.92 %)
0
(0 %)
141
(0.08 %)
76
(100.00 %)
4,088,064
(46.33 %)
403,943
(1.72 %)
11,014,504
(33.74 %)
0
(0 %)
407,696
(1.71 %)
110,838
(2.71 %)
30,093
(0.82 %)
143 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1
n/a n/a 22,343
(1.53 %)
28,525
(1.27 %)
n/a 41.66
(99.91 %)
10,428
(0.04 %)
10,428
(0.04 %)
667,170
(99.96 %)
5,598,608
(45.38 %)
1,220,686
(2.58 %)
14,079,363
(36.37 %)
28
(0.00 %)
n/a 62,881
(2.13 %)
53,176
(1.80 %)
144 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1
55,980
(3.39 %)
n/a 18,440
(1.59 %)
19,474
(1.48 %)
n/a 41.47
(94.51 %)
109,700
(5.51 %)
109,700
(5.51 %)
117,442
(94.49 %)
n/a 606,818
(1.04 %)
13,503,550
(29.63 %)
1,009
(0.02 %)
309,552
(0.86 %)
53,376
(1.90 %)
51,864
(1.65 %)
145 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1
44,762
(33.07 %)
n/a 18,297
(1.33 %)
20,107
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
58,460
(2.20 %)
61,603
(97.80 %)
4,257,412
(38.85 %)
658,532
(1.25 %)
14,547,631
(34.19 %)
3
(0.00 %)
423,409
(1.39 %)
37,092
(0.85 %)
27,299
(0.63 %)
146 domestic silkworm (genbank 2020)
GCA_014905235.2
n/a n/a 5,227
(1.28 %)
18,795
(5.67 %)
n/a 38.55
(99.90 %)
0
(0 %)
30
(0.10 %)
696
(100.00 %)
615,428
(29.26 %)
86,179
(1.65 %)
2,607,325
(47.66 %)
0
(0 %)
297,922
(5.59 %)
44,022
(10.06 %)
15,414
(1.64 %)
147 domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank)
GCA_904849725.1
63,294
(3.74 %)
n/a 18,050
(0.43 %)
260,902
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
0
(0 %)
162
(0.03 %)
290
(100.00 %)
1,274,894
(2.42 %)
1,726,303
(5.40 %)
14,010,542
(72.58 %)
0
(0 %)
5,823,193
(14.08 %)
732,828
(17.24 %)
271,779
(4.92 %)
148 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1
15,850
(2.33 %)
n/a 11,864
(1.67 %)
11,795
(1.99 %)
n/a 44.51
(96.31 %)
96,471
(3.72 %)
96,471
(3.72 %)
127,725
(96.28 %)
842,281
(18.63 %)
310,018
(2.09 %)
5,822,687
(27.83 %)
59
(0.01 %)
397,798
(2.49 %)
17,379
(0.69 %)
13,913
(0.52 %)
149 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1
25,483
(48.39 %)
n/a 12,405
(1.70 %)
23,073
(2.18 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
0
(0 %)
187
(0.34 %)
181
(100.00 %)
1,008,118
(21.51 %)
378,537
(3.38 %)
5,846,717
(32.04 %)
0
(0 %)
791,076
(4.25 %)
26,005
(1.75 %)
19,919
(1.16 %)
150 E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank)
GCA_000750555.1
n/a 4,501
(88.85 %)
n/a n/a n/a 50.78
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 90
(0.38 %)
19,508
(7.44 %)
0
(0 %)
189
(0.40 %)
1
(99.99 %)
0
(0.00 %)
151 East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019)
GCF_008831285.1
39,088
(10.61 %)
n/a 11,569
(2.49 %)
38,114
(15.67 %)
n/a 38.59
(99.98 %)
625
(0.02 %)
627
(0.02 %)
1,425
(99.98 %)
230,165
(2.88 %)
153,929
(4.02 %)
2,160,647
(26.81 %)
1
(0.00 %)
233,651
(6.36 %)
24,567
(4.41 %)
18,177
(2.46 %)
152 eastern European house mouse (PWK_PhJ v1 2016)
GCA_001624775.1
n/a n/a 21,013
(2.21 %)
18,237
(1.40 %)
101,394
(4.09 %)
41.76
(90.89 %)
26,578
(1.66 %)
904,107
(9.24 %)
30,233
(98.34 %)
5,250,349
(40.55 %)
1,508,787
(2.97 %)
13,823,341
(28.09 %)
246,352
(1.73 %)
681,079
(2.29 %)
16,695
(0.43 %)
15,885
(0.40 %)
153 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1
57,615
(9.59 %)
n/a 15,348
(2.22 %)
28,518
(6.29 %)
42,170
(8.31 %)
41.07
(99.87 %)
115
(0.00 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
527,486
(5.98 %)
217,915
(1.89 %)
4,547,443
(30.78 %)
2
(0.00 %)
212,425
(2.79 %)
33,005
(1.88 %)
16,748
(0.95 %)
154 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1
n/a n/a 20,133
(1.87 %)
36,361
(1.80 %)
n/a 40.23
(99.96 %)
4,332
(0.02 %)
4,332
(0.02 %)
226,086
(99.98 %)
2,985,622
(32.66 %)
475,311
(1.11 %)
12,612,081
(27.34 %)
15
(0.00 %)
n/a 81,930
(5.75 %)
81,575
(4.78 %)
155 Egyptian rousette (v1 2020 genbank)
GCA_014176215.1
65,163
(51.34 %)
61,105
(4.04 %)
17,637
(2.08 %)
22,318
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
0
(0 %)
242
(1.41 %)
30
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,415
(1.02 %)
12,031,652
(26.52 %)
0
(0 %)
65,562
(0.33 %)
53,604
(6.69 %)
57,305
(5.33 %)
156 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1
30,695
(4.95 %)
n/a 11,306
(1.54 %)
18,189
(3.03 %)
n/a 42.34
(96.16 %)
46,217
(3.85 %)
46,232
(3.85 %)
67,421
(96.15 %)
1,405,480
(27.29 %)
330,698
(2.60 %)
5,549,534
(36.65 %)
31
(0.01 %)
365,912
(2.44 %)
35,561
(2.16 %)
11,961
(0.52 %)
157 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1
n/a n/a 13,181
(1.74 %)
24,708
(2.10 %)
33,433
(3.99 %)
42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
512
(0.00 %)
802
(100.00 %)
504,527
(4.38 %)
259,276
(2.59 %)
7,105,965
(19.15 %)
8
(0.00 %)
316,149
(1.79 %)
41,784
(5.52 %)
41,105
(3.30 %)
158 epaulette shark (2021 genbank)
GCA_020745735.1
43,156
(39.58 %)
n/a 12,439
(0.39 %)
19,520
(1.06 %)
n/a 42.76
(98.05 %)
0
(0 %)
3,716
(1.95 %)
1,963
(100.00 %)
9,211,963
(69.93 %)
935,037
(6.51 %)
20,660,613
(43.88 %)
0
(0 %)
2,903,274
(4.44 %)
41,682
(1.08 %)
13,048
(0.16 %)
159 eudicots lettuce (Salinas v7 2020)
GCF_002870075.2
65,115
(2.96 %)
n/a 16,271
(0.65 %)
102,071
(6.37 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
3,138
(0.29 %)
353,389
(7.60 %)
11,454
(99.71 %)
1,109,875
(4.83 %)
983,866
(3.64 %)
12,335,790
(52.95 %)
2,249
(0.09 %)
1,828,920
(9.42 %)
117,743
(2.02 %)
19,959
(0.28 %)
160 Euphrates poplar (v1 2014)
GCF_000495115.1
56,539
(12.93 %)
n/a 20,844
(4.28 %)
41,664
(12.47 %)
n/a 32.08
(95.31 %)
23,174
(4.71 %)
23,174
(4.71 %)
32,789
(95.29 %)
332,532
(5.23 %)
246,766
(4.06 %)
2,679,673
(43.30 %)
21
(0.01 %)
283,121
(6.41 %)
2,781
(0.47 %)
1,761
(0.21 %)
161 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1
57,138
(2.48 %)
n/a 19,265
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,487,951
(32.73 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,723
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,258
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
54,563
(1.83 %)
162 Eurasian red squirrel (v1.1 2019)
GCA_902686455.1
n/a n/a 21,298
(1.58 %)
21,024
(1.36 %)
36,645
(1.54 %)
40.08
(94.33 %)
0
(0 %)
1,177
(5.67 %)
638
(100.00 %)
4,680,964
(35.76 %)
704,218
(1.42 %)
14,991,981
(31.49 %)
5
(0.00 %)
419,662
(1.29 %)
48,159
(1.04 %)
45,455
(0.95 %)
163 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1
45,658
(2.52 %)
n/a 19,724
(1.77 %)
19,069
(1.47 %)
34,561
(2.01 %)
42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
872
(0.26 %)
216
(100.00 %)
4,098,151
(26.75 %)
1,088,237
(2.91 %)
12,853,776
(32.42 %)
5
(0.00 %)
518,686
(1.69 %)
19,000
(0.58 %)
16,851
(0.46 %)
164 European conger (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514075.1
54,631
(54.17 %)
n/a 17,073
(1.89 %)
34,794
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
13
(0.00 %)
1,009
(0.02 %)
394
(100.00 %)
761,527
(5.99 %)
913,328
(13.25 %)
5,768,003
(35.48 %)
3
(0.00 %)
1,603,442
(8.94 %)
120,990
(6.12 %)
81,342
(2.93 %)
165 European eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013347855.1
n/a n/a 17,048
(2.22 %)
34,271
(5.56 %)
n/a 43.64
(99.61 %)
0
(0 %)
640
(0.40 %)
53
(100.00 %)
831,037
(5.48 %)
786,520
(8.15 %)
5,700,818
(27.40 %)
2
(0.00 %)
774,914
(5.14 %)
130,345
(8.19 %)
94,445
(4.12 %)
166 European mink (primary hap 2023 genbank)
GCA_030435805.1
69,556
(45.15 %)
n/a 18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
26
(100.00 %)
4,237,797
(30.90 %)
792,898
(2.69 %)
13,417,248
(36.59 %)
0
(0 %)
894,273
(2.55 %)
67,133
(2.54 %)
51,333
(1.62 %)
167 European peacock (2021 genbank)
GCA_905147045.1
22,557
(62.12 %)
n/a 4,716
(1.16 %)
12,599
(4.34 %)
26,251
(7.81 %)
33.70
(100.00 %)
0
(0 %)
10
(0.00 %)
42
(100.00 %)
212,528
(2.58 %)
60,682
(1.18 %)
3,127,157
(46.89 %)
0
(0 %)
154,469
(3.96 %)
24,620
(4.88 %)
7,312
(0.89 %)
168 European plaice (primary hap 2022 genbank)
GCA_947347685.1
46,467
(52.27 %)
n/a 14,820
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
0
(0 %)
1,072
(0.03 %)
356
(100.00 %)
476,317
(3.63 %)
520,730
(13.27 %)
3,283,400
(33.55 %)
2
(0.00 %)
525,277
(6.36 %)
47,051
(4.45 %)
21,879
(1.29 %)
169 European snow vole (primary hap 2023 genbank)
GCA_950005125.1
47,025
(39.90 %)
n/a 20,576
(1.75 %)
21,171
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
197
(0.00 %)
161
(100.00 %)
3,580,811
(22.71 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,125
(34.97 %)
4
(0.00 %)
954,164
(3.20 %)
20,725
(0.63 %)
17,303
(0.45 %)
170 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1
n/a n/a 11,276
(1.79 %)
21,238
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,333
(100.00 %)
466,567
(7.08 %)
182,345
(0.97 %)
6,037,183
(20.24 %)
0
(0 %)
110,549
(1.11 %)
29,648
(2.35 %)
26,084
(1.59 %)
171 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1
n/a n/a 12,415
(1.77 %)
23,484
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
0
(0 %)
894
(0.33 %)
357
(100.00 %)
539,737
(7.60 %)
227,500
(1.16 %)
6,768,805
(21.05 %)
4
(0.00 %)
181,333
(1.65 %)
34,729
(2.65 %)
30,692
(1.70 %)
172 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1
54,113
(34.13 %)
n/a 19,960
(1.65 %)
19,954
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
0
(0 %)
1,129
(0.01 %)
498
(100.00 %)
4,863,656
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,786
(40.58 %)
17
(0.00 %)
2,516,599
(5.37 %)
23,961
(0.53 %)
17,318
(0.36 %)
173 fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank)
GCA_011064685.1
32,738
(63.63 %)
n/a 5,744
(1.12 %)
26,631
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
0
(0 %)
525
(0.01 %)
91
(100.00 %)
168,479
(1.60 %)
72,876
(1.70 %)
3,384,083
(37.35 %)
0
(0 %)
128,947
(2.55 %)
30,753
(4.27 %)
12,571
(1.35 %)
174 fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020)
GCF_011064685.1
32,751
(9.65 %)
n/a 5,744
(1.12 %)
26,632
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
0
(0 %)
525
(0.01 %)
92
(100.00 %)
169,122
(1.61 %)
72,892
(1.70 %)
3,384,365
(37.36 %)
0
(0 %)
128,947
(2.55 %)
30,753
(4.27 %)
12,571
(1.35 %)
175 fire-bellied toad (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579735.1
n/a n/a 15,456
(0.21 %)
47,501
(0.88 %)
n/a 38.98
(98.02 %)
0
(0 %)
7,009
(1.99 %)
2,468
(100.00 %)
20,643,710
(70.75 %)
7,150,262
(12.27 %)
9,477
(98.01 %)
3
(0.00 %)
n/a 365,066
(1.20 %)
29,706
(0.10 %)
176 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2
n/a n/a 15,436
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
0
(0 %)
744
(1.81 %)
189
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,037
(2.21 %)
5,305,987
(30.67 %)
0
(0 %)
227,443
(2.84 %)
24,130
(1.26 %)
11,082
(0.48 %)
177 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1
39,651
(35.92 %)
n/a 18,302
(1.36 %)
20,592
(1.23 %)
32,831
(1.38 %)
40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
160,167
(10.78 %)
166,489
(89.22 %)
5,109,822
(37.03 %)
389,314
(0.74 %)
14,633,007
(38.46 %)
5,748
(0.06 %)
244,060
(0.64 %)
27,461
(0.64 %)
25,464
(0.54 %)
178 fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019)
GCF_009650485.1
24,196
(18.66 %)
n/a 10,065
(8.48 %)
14,473
(13.61 %)
n/a 38.15
(100.00 %)
0
(0 %)
7
(0.00 %)
11
(100.00 %)
298,709
(14.86 %)
80,048
(3.56 %)
1,317,733
(33.56 %)
0
(0 %)
69,521
(4.49 %)
18,849
(8.62 %)
11,752
(5.15 %)
179 fly D.santomea (v1.0 2021)
GCF_016746245.1
25,550
(21.64 %)
n/a 13,354
(17.52 %)
20,540
(17.87 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
104
(100.00 %)
169,365
(23.08 %)
64,316
(3.47 %)
791,743
(23.14 %)
0
(0 %)
69,581
(6.26 %)
27,794
(16.15 %)
20,742
(10.27 %)
180 fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine)
GCF_004382195.1
26,658
(22.06 %)
n/a 13,461
(17.65 %)
21,781
(17.83 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
38
(0.00 %)
402
(100.00 %)
145,818
(25.16 %)
34,869
(4.31 %)
719,811
(25.74 %)
0
(0 %)
87,076
(8.91 %)
30,130
(16.11 %)
22,906
(10.22 %)
181 fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017)
GCF_002093755.1
21,759
(15.21 %)
n/a 12,488
(9.92 %)
21,269
(14.06 %)
n/a 39.11
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,356
(100.00 %)
314,594
(25.90 %)
82,446
(12.33 %)
1,113,448
(37.00 %)
0
(0 %)
199,881
(8.53 %)
27,493
(12.03 %)
20,330
(8.62 %)
182 fly D.simulans (w501 v3.0 2021)
GCF_016746395.1
28,595
(26.45 %)
n/a 13,448
(20.44 %)
18,989
(18.34 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
96
(100.00 %)
126,424
(16.72 %)
32,595
(4.31 %)
759,296
(23.70 %)
0
(0 %)
46,993
(4.17 %)
27,530
(17.02 %)
20,622
(10.65 %)
183 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2
5,444
(4.10 %)
n/a 13,713
(15.95 %)
22,613
(16.71 %)
n/a 42.28
(98.12 %)
5,317
(1.88 %)
5,400
(1.88 %)
13,440
(98.12 %)
180,908
(22.48 %)
68,911
(3.75 %)
897,353
(23.94 %)
85
(0.04 %)
85,136
(6.91 %)
31,387
(14.91 %)
22,960
(9.55 %)
184 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1
27,938
(24.60 %)
n/a 13,343
(17.86 %)
20,029
(17.64 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
54
(100.00 %)
169,559
(23.47 %)
60,591
(3.64 %)
837,616
(23.40 %)
0
(0 %)
64,895
(6.52 %)
28,204
(16.22 %)
22,365
(10.80 %)
185 Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank)
GCA_902459505.1
54,713
(61.19 %)
n/a 14,267
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
163
(100.00 %)
1,311,113
(1.64 %)
1,364,596
(3.83 %)
19,589,738
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,977
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
186 Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_902459505.1
54,713
(1.72 %)
n/a 14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,310,970
(1.64 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,802
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,977
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
187 giant panda (2009 BGI)
GCF_000004335.2
40,432
(2.55 %)
n/a 18,884
(1.76 %)
18,919
(1.46 %)
n/a 41.60
(97.66 %)
119,126
(2.36 %)
119,126
(2.36 %)
200,593
(97.64 %)
4,236,423
(40.48 %)
503,179
(1.10 %)
13,781,487
(28.85 %)
48
(0.00 %)
252,804
(0.90 %)
53,465
(1.34 %)
45,835
(1.12 %)
188 giant panda (Jingjing v1 2017)
GCA_002007445.1
n/a n/a 20,110
(1.71 %)
22,288
(1.49 %)
n/a 41.69
(98.08 %)
186,846
(1.93 %)
186,846
(1.93 %)
244,258
(98.07 %)
4,464,041
(41.66 %)
614,896
(2.00 %)
14,294,774
(30.62 %)
9,506
(0.14 %)
580,134
(4.39 %)
59,340
(1.50 %)
49,319
(1.23 %)
189 giant panda (Jingjing v2 refseq 2020)
GCF_002007445.1
67,162
(3.32 %)
n/a 20,374
(1.71 %)
21,965
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
0
(0 %)
190,364
(1.92 %)
77,288
(100.00 %)
4,476,689
(41.47 %)
618,596
(2.00 %)
14,236,463
(30.39 %)
9,762
(0.14 %)
583,300
(4.39 %)
59,946
(1.50 %)
49,916
(1.23 %)
190 giant panda (Jingjing v2 genbank 2020)
GCA_002007445.2
n/a n/a 20,381
(1.71 %)
21,979
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
0
(0 %)
190,364
(1.92 %)
77,287
(100.00 %)
4,484,597
(41.53 %)
618,595
(2.00 %)
14,236,406
(30.39 %)
9,762
(0.14 %)
583,295
(4.39 %)
59,945
(1.50 %)
49,872
(1.23 %)
191 gilthead seabream (v1 2019)
GCF_900880675.1
59,027
(10.96 %)
n/a 15,412
(2.36 %)
31,802
(6.47 %)
73,197
(7.97 %)
41.94
(99.96 %)
0
(0 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
531,360
(3.04 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,694
(25.69 %)
0
(0 %)
355,475
(3.53 %)
47,327
(2.41 %)
23,697
(1.07 %)
192 Glanville fritillary (genbank 2021)
GCA_905220565.1
17,520
(43.15 %)
n/a 4,738
(0.89 %)
16,197
(5.05 %)
35,235
(7.97 %)
34.09
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.01 %)
32
(100.00 %)
343,193
(3.25 %)
144,286
(3.46 %)
3,683,956
(48.60 %)
0
(0 %)
198,815
(3.74 %)
30,200
(4.54 %)
11,245
(1.52 %)
193 globe artichoke (v1 2C 2018)
GCF_001531365.1
42,119
(6.72 %)
n/a 15,804
(2.23 %)
49,721
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
5,305
(0.07 %)
310,473
(9.77 %)
13,588
(99.93 %)
394,687
(2.79 %)
364,361
(3.37 %)
4,191,676
(39.48 %)
3,050
(0.15 %)
283,546
(3.56 %)
12,198
(0.64 %)
7,326
(0.39 %)
194 goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1
n/a n/a 19,842
(1.43 %)
22,426
(1.24 %)
52,608
(1.64 %)
43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
790
(0.00 %)
29,906
(100.00 %)
5,669,868
(50.59 %)
760,836
(7.07 %)
13,024,386
(44.85 %)
0
(0 %)
2,571,292
(5.65 %)
125,682
(4.01 %)
44,489
(1.09 %)
195 goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1
47,206
(2.31 %)
46,486
(2.23 %)
19,857
(1.43 %)
22,880
(1.27 %)
52,608
(1.64 %)
43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
790
(0.00 %)
29,907
(100.00 %)
5,578,287
(50.22 %)
760,837
(7.07 %)
13,024,440
(44.85 %)
0
(0 %)
2,571,292
(5.65 %)
125,682
(4.02 %)
44,510
(1.09 %)
196 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1
n/a n/a 9,334
(1.82 %)
17,594
(2.12 %)
n/a 42.53
(99.93 %)
0
(0 %)
39
(0.07 %)
3,860
(100.00 %)
356,284
(6.03 %)
123,430
(0.80 %)
4,417,887
(19.25 %)
0
(0 %)
53,254
(0.85 %)
28,919
(3.52 %)
25,970
(2.20 %)
197 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1
55,164
(5.86 %)
n/a 13,226
(1.87 %)
23,033
(2.15 %)
25,921
(3.22 %)
42.11
(99.61 %)
0
(0 %)
191
(0.39 %)
142
(100.00 %)
519,341
(5.86 %)
180,990
(0.79 %)
7,005,531
(19.25 %)
1
(0.00 %)
53,053
(0.51 %)
37,343
(3.12 %)
34,701
(1.97 %)
198 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1
n/a n/a 18,965
(1.82 %)
19,339
(1.52 %)
n/a 42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
216,216
(17.12 %)
237,699
(82.88 %)
3,724,142
(27.19 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,866
(24.29 %)
3,589
(0.05 %)
254,929
(0.76 %)
18,591
(0.51 %)
17,093
(0.42 %)
199 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1
n/a n/a 21,341
(1.86 %)
22,492
(1.24 %)
n/a 40.87
(98.50 %)
61,291
(1.50 %)
61,291
(1.50 %)
196,804
(98.50 %)
5,673,299
(51.36 %)
1,080,627
(3.06 %)
16,205,827
(36.77 %)
187
(0.01 %)
1,068,178
(2.78 %)
79,387
(1.14 %)
27,171
(0.63 %)
200 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3
n/a n/a 20,031
(1.89 %)
22,619
(1.50 %)
n/a 40.98
(95.94 %)
43,305
(4.06 %)
43,363
(4.06 %)
50,982
(95.94 %)
4,082,873
(41.60 %)
582,430
(1.47 %)
14,808,558
(30.05 %)
325
(0.02 %)
1,168,690
(4.77 %)
74,772
(2.61 %)
69,260
(2.12 %)
201 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887165.1
73,383
(42.66 %)
n/a 16,638
(0.72 %)
16,171
(0.86 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
0
(0 %)
2,255
(0.89 %)
14
(100.00 %)
5,562,366
(25.40 %)
1,096,625
(2.60 %)
22,322,798
(43.37 %)
13
(0.00 %)
n/a 28,894
(0.57 %)
22,987
(0.42 %)
202 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1
50,937
(43.78 %)
n/a 19,011
(2.00 %)
19,882
(1.66 %)
41,741
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
0
(0 %)
172,751
(12.60 %)
7,570
(100.00 %)
3,078,210
(32.07 %)
495,290
(1.05 %)
11,588,202
(25.43 %)
2,116
(0.03 %)
193,024
(1.10 %)
33,101
(0.97 %)
30,240
(0.87 %)
203 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1
50,937
(3.26 %)
n/a 18,992
(2.00 %)
19,880
(1.66 %)
41,778
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
0
(0 %)
172,751
(12.60 %)
7,571
(100.00 %)
3,285,971
(33.14 %)
495,292
(1.05 %)
11,588,248
(25.43 %)
2,116
(0.03 %)
193,024
(1.10 %)
33,101
(0.97 %)
29,553
(0.86 %)
204 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1
n/a 41,563
(2.11 %)
18,531
(1.97 %)
20,309
(1.67 %)
n/a 40.52
(99.19 %)
0
(0 %)
292
(0.81 %)
50
(100.00 %)
3,284,473
(35.00 %)
559,653
(1.29 %)
12,043,562
(29.15 %)
0
(0 %)
155,142
(0.71 %)
32,047
(1.05 %)
30,235
(0.96 %)
205 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2
53,353
(46.77 %)
n/a 18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,301,020
(34.99 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,069
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,625
(0.98 %)
206 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1
53,352
(3.13 %)
n/a 18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,300,836
(34.99 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,627
(0.98 %)
207 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1
n/a n/a 23,153
(1.31 %)
51,642
(1.43 %)
n/a 43.16
(99.88 %)
8,133
(0.04 %)
8,133
(0.04 %)
1,053,330
(99.96 %)
3,675,075
(25.48 %)
938,700
(2.73 %)
12,027,923
(39.01 %)
44
(0.00 %)
n/a 80,955
(2.31 %)
64,379
(1.67 %)
208 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1
n/a n/a 13,467
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,442
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
0
(0 %)
112,918
(3.25 %)
46,340
(13.40 %)
32,897
(5.93 %)
209 greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank)
GCA_003640425.2
20,814
(51.89 %)
n/a 4,346
(0.99 %)
12,930
(3.50 %)
21,226
(7.60 %)
33.06
(99.10 %)
0
(0 %)
27,314
(0.92 %)
13,303
(100.00 %)
270,925
(3.18 %)
86,050
(1.20 %)
3,416,162
(48.29 %)
102
(0.01 %)
135,364
(1.95 %)
11,043
(1.07 %)
7,092
(0.63 %)
210 green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007)
GCF_000002595.1
14,484
(22.24 %)
n/a 987
(0.55 %)
11,299
(59.37 %)
n/a 63.87
(87.58 %)
9,827
(12.45 %)
10,425
(12.45 %)
11,385
(87.55 %)
167,652
(16.23 %)
100,391
(4.60 %)
734,057
(30.38 %)
3
(0.00 %)
37,459
(3.99 %)
3,154
(63.45 %)
17,305
(12.08 %)
211 green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank)
GCA_000147415.1
9,780
(62.01 %)
9,780
(32.79 %)
743
(1.01 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,396
(8.55 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
65,787
(8.35 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
0
(0 %)
6,856
(2.06 %)
776
(95.90 %)
9,593
(9.00 %)
212 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank)
GCA_000002595.3
n/a 19,528
(53.99 %)
988
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
171,684
(17.03 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
26
(0.03 %)
48,564
(5.08 %)
106
(99.48 %)
15,883
(12.21 %)
213 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2
76,037
(46.89 %)
n/a 20,079
(1.94 %)
20,246
(1.25 %)
n/a 40.81
(98.67 %)
160,731
(1.35 %)
178,925
(1.35 %)
163,017
(98.65 %)
5,382,039
(50.20 %)
980,479
(2.63 %)
16,076,172
(35.62 %)
23,631
(0.16 %)
934,122
(2.70 %)
50,033
(1.04 %)
27,104
(0.75 %)
214 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1
31,786
(2.57 %)
n/a 14,548
(1.02 %)
15,297
(1.46 %)
n/a 43.49
(95.57 %)
134,344
(4.44 %)
134,344
(4.44 %)
274,367
(95.56 %)
1,615,553
(13.87 %)
317,600
(2.08 %)
11,732,990
(28.32 %)
129
(0.02 %)
n/a 36,782
(0.70 %)
21,797
(0.42 %)
215 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1
56,917
(3.63 %)
n/a 14,729
(1.06 %)
17,439
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
0
(0 %)
294
(0.56 %)
99
(100.00 %)
1,641,730
(15.08 %)
304,356
(1.25 %)
11,136,918
(31.96 %)
0
(0 %)
429,794
(1.68 %)
49,035
(1.44 %)
26,943
(0.68 %)
216 harbor porpoise (BS71 2019)
GCA_004363495.1
n/a n/a 21,044
(1.46 %)
30,072
(1.23 %)
n/a 41.83
(99.88 %)
7,114
(0.03 %)
7,114
(0.03 %)
1,338,272
(99.97 %)
5,359,537
(46.83 %)
772,736
(1.54 %)
13,705,428
(42.29 %)
44
(0.00 %)
n/a 80,965
(1.65 %)
55,941
(1.28 %)
217 Harpy eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_026419915.1
51,641
(50.37 %)
n/a 13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
0
(0 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
1
(0.00 %)
480,042
(2.70 %)
60,606
(5.66 %)
30,636
(1.52 %)
218 Hawaiian crow (2021 genbank)
GCA_020740725.1
51,593
(54.67 %)
n/a 12,737
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
0
(0 %)
294
(0.16 %)
187
(100.00 %)
502,844
(6.10 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,316
(23.59 %)
3
(0.00 %)
336,844
(2.41 %)
46,108
(3.49 %)
24,228
(1.26 %)
219 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq)
GCF_002201575.1
29,897
(1.95 %)
29,595
(1.94 %)
19,404
(1.74 %)
20,264
(1.41 %)
33,412
(1.67 %)
41.41
(97.77 %)
0
(0 %)
38,833
(2.24 %)
7,872
(100.00 %)
4,547,865
(43.29 %)
573,335
(1.09 %)
13,374,928
(33.10 %)
882
(0.03 %)
587,410
(1.58 %)
50,380
(1.45 %)
46,841
(1.28 %)
220 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank)
GCA_002201575.1
n/a n/a 19,385
(1.74 %)
20,265
(1.41 %)
33,375
(1.66 %)
41.41
(97.77 %)
0
(0 %)
38,833
(2.24 %)
7,871
(100.00 %)
4,629,031
(43.70 %)
573,328
(1.09 %)
13,374,887
(33.10 %)
882
(0.03 %)
587,399
(1.58 %)
50,379
(1.45 %)
46,745
(1.27 %)
221 hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank)
GCA_030028045.1
64,153
(41.00 %)
n/a 20,337
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
0
(0 %)
226
(0.00 %)
356
(100.00 %)
3,783,435
(35.17 %)
567,796
(3.38 %)
13,462,481
(35.48 %)
2
(0.00 %)
396,368
(1.55 %)
48,365
(1.91 %)
44,048
(1.34 %)
222 Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.1
49,894
(2.81 %)
n/a 18,317
(1.66 %)
19,991
(1.63 %)
n/a 42.33
(99.79 %)
0
(0 %)
38,823
(0.21 %)
27,486
(100.00 %)
2,844,834
(29.10 %)
367,443
(1.49 %)
11,805,151
(31.26 %)
151
(0.00 %)
330,522
(1.83 %)
59,262
(1.70 %)
48,287
(1.35 %)
223 hooded crow (v2 S_Up_H32 2017)
GCF_000738735.2
35,874
(6.47 %)
n/a 11,298
(1.84 %)
17,627
(2.12 %)
n/a 41.48
(97.07 %)
0
(0 %)
27,795
(2.94 %)
113
(100.00 %)
392,199
(5.95 %)
139,126
(0.76 %)
6,141,002
(18.21 %)
16
(0.00 %)
38,866
(0.37 %)
12,943
(0.48 %)
10,321
(0.36 %)
224 hooded crow (v5 S_Up_H32 2021)
GCF_000738735.5
42,799
(57.51 %)
n/a 11,845
(1.92 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
0
(0 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
421,463
(6.12 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
0
(0 %)
77,475
(0.63 %)
25,266
(2.09 %)
20,747
(1.24 %)
225 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1
n/a n/a 18,575
(1.67 %)
17,121
(1.34 %)
n/a 41.50
(98.14 %)
45,680
(1.86 %)
45,680
(1.86 %)
55,316
(98.14 %)
3,941,878
(45.17 %)
381,229
(1.99 %)
14,674,265
(29.80 %)
3
(0.00 %)
384,525
(1.12 %)
45,521
(1.52 %)
36,682
(0.85 %)
226 house finch (bHaeMex1 primary hap 2022 genbank)
GCA_027477595.1
43,228
(49.63 %)
n/a 12,700
(1.83 %)
24,567
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
0
(0 %)
295
(0.98 %)
183
(100.00 %)
440,379
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,100
(23.47 %)
1
(0.00 %)
573,829
(3.39 %)
30,897
(2.53 %)
22,852
(1.24 %)
227 house mouse (A_J v1 2016)
GCA_001624215.1
n/a n/a 21,171
(2.20 %)
18,776
(1.40 %)
102,254
(4.12 %)
41.70
(89.34 %)
28,597
(3.99 %)
365,877
(10.71 %)
33,692
(96.01 %)
5,186,523
(40.90 %)
1,483,826
(3.06 %)
13,614,266
(28.13 %)
38,843
(1.02 %)
487,933
(2.04 %)
16,590
(0.42 %)
15,701
(0.39 %)
228 house mouse (AKR_J v1 2016)
GCA_001624295.1
n/a n/a 21,299
(2.19 %)
18,730
(1.41 %)
102,168
(4.09 %)
41.70
(86.82 %)
34,083
(4.00 %)
314,064
(13.22 %)
40,550
(96.00 %)
5,186,721
(40.97 %)
1,485,719
(3.05 %)
13,610,761
(27.42 %)
18,106
(1.03 %)
469,625
(2.17 %)
16,745
(0.41 %)
15,817
(0.38 %)
229 house mouse (BALB_cJ v1 2016)
GCA_001632525.1
n/a n/a 21,337
(2.21 %)
18,682
(1.41 %)
102,138
(4.14 %)
41.74
(88.91 %)
32,984
(4.16 %)
361,689
(11.14 %)
37,453
(95.84 %)
5,096,953
(40.72 %)
1,407,754
(2.90 %)
13,416,041
(27.66 %)
15,793
(0.80 %)
453,227
(1.90 %)
16,788
(0.42 %)
15,890
(0.39 %)
230 house mouse (CBA_J v1 2016)
GCA_001624475.1
n/a n/a 21,259
(2.23 %)
18,593
(1.42 %)
101,632
(4.14 %)
41.78
(79.43 %)
36,013
(3.86 %)
410,639
(20.63 %)
42,242
(96.14 %)
5,081,543
(40.40 %)
1,393,763
(2.54 %)
13,472,532
(24.46 %)
24,180
(1.46 %)
418,702
(1.72 %)
16,809
(0.38 %)
15,953
(0.35 %)
231 house mouse (DBA_2J v1 2016)
GCA_001624505.1
n/a n/a 21,156
(2.23 %)
18,610
(1.43 %)
101,908
(4.18 %)
41.80
(88.67 %)
37,461
(4.86 %)
409,306
(11.39 %)
42,324
(95.14 %)
5,028,217
(40.37 %)
1,364,702
(2.73 %)
13,540,805
(27.33 %)
13,245
(0.55 %)
420,635
(1.47 %)
16,544
(0.42 %)
15,786
(0.39 %)
232 house mouse (C3H_HeJ v1 2016)
GCA_001632575.1
n/a n/a 21,177
(2.22 %)
18,550
(1.42 %)
101,710
(4.15 %)
41.74
(85.90 %)
32,785
(4.09 %)
369,499
(14.15 %)
37,497
(95.91 %)
5,089,496
(40.41 %)
1,399,438
(2.72 %)
13,485,480
(26.52 %)
19,436
(0.94 %)
427,663
(1.66 %)
16,675
(0.41 %)
15,897
(0.38 %)
233 house mouse (FVB_NJ v1 2016)
GCA_001624535.1
n/a n/a 21,195
(2.22 %)
18,615
(1.42 %)
101,520
(4.15 %)
41.75
(89.39 %)
61,976
(6.27 %)
380,840
(10.66 %)
67,805
(93.73 %)
5,037,447
(40.28 %)
1,381,859
(2.89 %)
13,440,164
(27.32 %)
14,811
(0.71 %)
426,149
(1.81 %)
16,625
(0.42 %)
15,829
(0.39 %)
234 house mouse (GRCm38.p6 2017)
GCF_000001635.26
123,667
(4.49 %)
n/a 24,134
(2.09 %)
22,855
(1.67 %)
n/a 41.73
(97.18 %)
676
(2.82 %)
904
(2.82 %)
21,179
(97.18 %)
5,554,281
(45.50 %)
1,695,255
(3.40 %)
13,041,229
(35.91 %)
3
(0.00 %)
889,196
(2.45 %)
25,014
(0.54 %)
16,961
(0.40 %)
235 house mouse (LP_J v1 2016)
GCA_001632615.1
n/a n/a 21,012
(2.23 %)
18,555
(1.43 %)
101,892
(4.18 %)
41.78
(84.14 %)
34,444
(4.11 %)
402,247
(15.91 %)
38,542
(95.89 %)
5,032,748
(40.03 %)
1,373,374
(2.60 %)
13,411,126
(25.61 %)
18,175
(0.88 %)
405,473
(1.47 %)
16,668
(0.40 %)
15,888
(0.37 %)
236 house mouse (NOD_ShiLtJ v1 2016)
GCA_001624675.1
n/a n/a 21,291
(2.24 %)
19,697
(1.47 %)
101,562
(4.18 %)
42.00
(77.13 %)
60,087
(4.21 %)
595,433
(22.95 %)
66,154
(95.79 %)
5,059,815
(40.57 %)
1,370,443
(2.51 %)
13,251,532
(23.62 %)
36,838
(1.54 %)
452,044
(2.17 %)
18,188
(0.42 %)
17,273
(0.39 %)
237 house mouse (NZO_HlLtJ v1 2016)
GCA_001624745.1
n/a n/a 21,233
(2.22 %)
18,805
(1.43 %)
103,134
(4.18 %)
41.74
(86.47 %)
49,204
(4.63 %)
337,909
(13.58 %)
57,439
(95.37 %)
5,112,301
(40.60 %)
1,418,629
(2.92 %)
13,588,055
(27.01 %)
21,209
(1.18 %)
440,820
(2.04 %)
16,857
(0.41 %)
15,946
(0.38 %)
238 human (GRCh38.p13 2019)
GCF_000001405.39
172,809
(4.43 %)
n/a 23,121
(1.97 %)
27,697
(1.78 %)
n/a 41.04
(95.07 %)
827
(4.93 %)
1,268
(4.93 %)
46,029
(95.07 %)
5,859,855
(52.78 %)
1,037,733
(4.60 %)
16,933,424
(36.88 %)
12
(0.00 %)
1,408,888
(2.55 %)
56,646
(1.06 %)
31,442
(0.75 %)
239 human (GRCh38.p14 2022)
GCF_000001405.40
188,352
(5.12 %)
n/a 23,474
(1.98 %)
28,557
(1.86 %)
n/a 41.05
(95.10 %)
829
(4.90 %)
1,270
(4.90 %)
46,502
(95.10 %)
5,910,293
(52.77 %)
1,047,827
(4.59 %)
17,068,934
(36.82 %)
12
(0.00 %)
1,423,169
(2.56 %)
57,427
(1.07 %)
31,985
(0.75 %)
240 human (NA24385.mat 2022)
GCA_021951015.1
n/a n/a 20,809
(1.82 %)
21,369
(1.18 %)
234,089
(4.92 %)
40.85
(99.95 %)
0
(0 %)
109
(0.05 %)
355
(100.00 %)
5,489,855
(53.93 %)
1,085,681
(8.26 %)
15,968,830
(40.95 %)
0
(0 %)
1,817,110
(3.54 %)
53,511
(1.32 %)
30,302
(0.84 %)
241 human (NA24385.pat 2022)
GCA_021950905.1
n/a n/a 20,014
(1.81 %)
20,716
(1.19 %)
227,278
(4.91 %)
40.87
(99.97 %)
0
(0 %)
117
(0.03 %)
514
(100.00 %)
5,293,356
(54.01 %)
1,100,786
(9.09 %)
15,122,569
(41.27 %)
2
(0.00 %)
1,900,161
(3.87 %)
52,546
(1.35 %)
29,891
(0.86 %)
242 human (NA24385.mat 2021)
GCA_018852615.1
n/a n/a 20,744
(1.84 %)
21,968
(1.22 %)
233,779
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
445
(100.00 %)
5,435,410
(53.40 %)
1,086,871
(8.27 %)
15,970,867
(40.97 %)
0
(0 %)
1,819,917
(3.54 %)
53,581
(1.32 %)
29,359
(0.79 %)
243 human (NA24385.pat 2021)
GCA_018852605.1
n/a n/a 19,919
(1.83 %)
21,582
(1.22 %)
227,333
(4.91 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
610
(100.00 %)
5,215,774
(53.54 %)
1,094,036
(9.09 %)
15,125,069
(41.29 %)
0
(0 %)
1,903,592
(3.87 %)
52,653
(1.34 %)
28,881
(0.81 %)
244 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank)
GCA_000845685.2
n/a 115
(79.56 %)
n/a n/a n/a 42.44
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
33
(1.67 %)
36
(4.27 %)
603
(9.83 %)
0
(0 %)
52
(1.87 %)
3
(13.72 %)
2
(13.38 %)
245 human T2T CHM13 v2.0
GCA_009914755.4
108,944
(51.73 %)
n/a 20,844
(1.79 %)
21,287
(1.16 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 25
(100.00 %)
5,591,082
(54.45 %)
1,155,353
(8.89 %)
16,163,340
(41.63 %)
0
(0 %)
2,006,129
(3.86 %)
52,408
(1.38 %)
30,616
(0.83 %)
246 Iberian mole (v1 TD23 2020)
GCF_014898055.1
46,872
(2.59 %)
n/a 18,566
(1.67 %)
20,793
(1.59 %)
n/a 41.91
(99.98 %)
0
(0 %)
3,640
(0.02 %)
4,425
(100.00 %)
3,269,038
(31.47 %)
501,677
(1.32 %)
11,176,747
(32.61 %)
2
(0.00 %)
644,819
(2.55 %)
48,076
(2.80 %)
43,577
(2.14 %)
247 Iberian mole (v2 TD23 2020)
GCF_014898055.2
46,746
(2.60 %)
n/a 18,453
(1.69 %)
20,410
(1.59 %)
n/a 41.90
(99.98 %)
0
(0 %)
3,639
(0.02 %)
3,202
(100.00 %)
2,637,156
(23.36 %)
497,087
(1.30 %)
10,984,260
(32.64 %)
2
(0.00 %)
638,388
(2.54 %)
47,552
(2.89 %)
43,140
(2.46 %)
248 Indian glassy fish (v1 2019)
GCF_900634625.1
44,096
(12.32 %)
n/a 15,337
(3.60 %)
23,988
(7.92 %)
60,224
(10.41 %)
42.38
(98.08 %)
0
(0 %)
1,523
(1.92 %)
156
(100.00 %)
346,406
(3.02 %)
163,522
(3.00 %)
2,755,229
(25.07 %)
0
(0 %)
235,504
(4.25 %)
17,930
(1.47 %)
9,748
(0.74 %)
249 Indian medaka
GCF_002922805.1
47,300
(9.26 %)
n/a 14,561
(2.50 %)
31,867
(6.43 %)
n/a 39.04
(94.73 %)
0
(0 %)
51,440
(5.29 %)
8,603
(100.00 %)
319,637
(2.20 %)
208,749
(2.67 %)
5,412,794
(33.26 %)
180
(0.02 %)
209,615
(2.14 %)
40,721
(2.36 %)
28,619
(1.60 %)
250 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1
n/a n/a 21,188
(1.26 %)
41,550
(1.34 %)
35,477
(1.51 %)
42.19
(99.92 %)
4,324
(0.02 %)
4,324
(0.02 %)
798,700
(99.98 %)
3,297,388
(28.66 %)
476,792
(1.23 %)
13,144,912
(34.13 %)
14
(0.00 %)
n/a 81,685
(1.86 %)
59,284
(1.43 %)
251 Japanese quail
GCF_001577835.1
47,008
(7.38 %)
n/a 12,864
(2.55 %)
36,126
(11.03 %)
n/a 41.28
(98.88 %)
7,630
(1.12 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
466,141
(6.58 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
628
(0.03 %)
160,342
(1.32 %)
17,977
(1.86 %)
15,897
(1.26 %)
252 Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018)
GCF_003227715.1
29,097
(10.82 %)
n/a 4,337
(1.33 %)
43,907
(11.32 %)
n/a 44.75
(99.72 %)
0
(0 %)
499
(0.28 %)
857
(100.00 %)
439,110
(17.67 %)
262,539
(5.69 %)
1,834,301
(29.28 %)
3
(0.00 %)
159,215
(3.71 %)
6,204
(9.08 %)
5,973
(2.13 %)
253 kakapo (Jane v1 2019)
GCF_004027225.1
49,444
(5.77 %)
n/a 13,114
(1.92 %)
17,732
(2.50 %)
29,004
(4.44 %)
41.97
(97.63 %)
0
(0 %)
362
(2.37 %)
99
(100.00 %)
548,758
(10.76 %)
208,171
(1.07 %)
6,258,082
(20.20 %)
0
(0 %)
165,436
(1.31 %)
22,279
(1.75 %)
19,230
(1.19 %)
254 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2
49,757
(54.33 %)
n/a 13,112
(1.92 %)
17,637
(2.48 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
0
(0 %)
373
(0.92 %)
90
(100.00 %)
507,072
(7.85 %)
208,180
(1.08 %)
6,258,178
(20.50 %)
0
(0 %)
165,532
(1.34 %)
22,278
(1.77 %)
19,230
(1.21 %)
255 koala (Bilbo 61053 2017)
GCF_002099425.1
55,723
(2.15 %)
n/a 17,500
(0.86 %)
16,193
(0.94 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
1,907
(100.00 %)
7,814,631
(41.58 %)
1,123,545
(2.03 %)
21,796,057
(39.25 %)
0
(0 %)
405,744
(0.85 %)
15,957
(0.35 %)
15,019
(0.30 %)
256 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1
29,504
(53.56 %)
n/a 14,221
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
41,384
(6.20 %)
40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,338
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,148
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,224
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
18,380
(0.95 %)
257 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1
29,517
(6.48 %)
n/a 14,243
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
41,421
(6.20 %)
40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,274
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,142
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,224
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
18,380
(0.95 %)
258 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023638135.1
48,561
(51.20 %)
n/a 12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
0
(0 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
2
(0.00 %)
479,269
(2.67 %)
32,398
(2.65 %)
19,870
(0.89 %)
259 large cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147105.1
24,631
(60.59 %)
n/a 4,550
(1.47 %)
9,197
(5.18 %)
30,394
(12.69 %)
34.13
(100.00 %)
0
(0 %)
29
(0.00 %)
402
(100.00 %)
123,352
(2.30 %)
36,616
(6.05 %)
2,431,238
(41.04 %)
2
(0.00 %)
86,654
(3.36 %)
8,442
(2.49 %)
4,829
(1.03 %)
260 large tree shrew (BS70 2019 Broad)
GCA_004365275.1
n/a n/a 26,266
(0.71 %)
59,868
(0.81 %)
n/a 42.00
(99.77 %)
6,466
(0.02 %)
6,466
(0.02 %)
3,890,086
(99.98 %)
7,163,973
(22.64 %)
1,629,329
(2.64 %)
18,970,992
(42.82 %)
38
(0.00 %)
n/a 138,732
(1.75 %)
77,459
(1.17 %)
261 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2
62,576
(3.50 %)
n/a 14,610
(1.03 %)
16,359
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
0
(0 %)
667
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,637,236
(15.13 %)
304,730
(1.14 %)
11,121,967
(34.21 %)
3
(0.00 %)
670,755
(2.51 %)
35,485
(1.36 %)
19,615
(0.51 %)
262 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1
n/a n/a 14,572
(1.03 %)
16,165
(1.42 %)
n/a 43.36
(99.74 %)
0
(0 %)
558
(0.26 %)
55
(100.00 %)
1,631,923
(15.09 %)
303,440
(1.14 %)
11,122,938
(34.12 %)
1
(0.00 %)
664,235
(2.49 %)
35,505
(1.37 %)
19,641
(0.51 %)
263 leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019)
GCA_009762595.1
n/a n/a 10,857
(1.01 %)
15,585
(1.46 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,982
(100.00 %)
1,090,219
(15.03 %)
206,192
(1.19 %)
7,154,939
(33.03 %)
0
(0 %)
432,559
(2.40 %)
25,155
(1.42 %)
14,585
(0.57 %)
264 Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002875.2
n/a 8,389
(48.67 %)
591
(1.09 %)
4,193
(46.51 %)
n/a 59.58
(99.94 %)
0
(0 %)
454
(0.06 %)
76
(100.00 %)
24,390
(4.61 %)
4,228
(1.93 %)
243,087
(20.97 %)
1
(0.00 %)
5,939
(3.84 %)
92
(99.40 %)
72
(0.21 %)
265 Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002725.2
n/a 8,731
(48.79 %)
626
(1.15 %)
4,290
(46.53 %)
n/a 59.72
(100.00 %)
7
(0.00 %)
7
(0.00 %)
43
(100.00 %)
33,021
(5.20 %)
8,477
(2.43 %)
238,932
(20.91 %)
0
(0 %)
6,726
(4.51 %)
41
(99.80 %)
27
(0.06 %)
266 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1
73,266
(49.50 %)
n/a 18,874
(1.62 %)
21,014
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
214,953
(3.85 %)
265,329
(96.15 %)
5,246,283
(42.87 %)
1,059,443
(5.13 %)
14,265,514
(32.20 %)
28,667
(1.17 %)
525,709
(5.63 %)
77,000
(2.45 %)
66,922
(1.91 %)
267 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1
25,978
(33.60 %)
n/a 19,393
(1.38 %)
20,311
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
326,464
(12.87 %)
337,359
(87.13 %)
6,205,858
(38.76 %)
832,823
(1.53 %)
13,661,563
(33.98 %)
2,666
(0.03 %)
430,190
(1.14 %)
26,669
(0.59 %)
23,227
(0.47 %)
268 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1
47,420
(5.64 %)
n/a 13,097
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
0
(0 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,498
(5.58 %)
210,236
(1.26 %)
7,133,927
(19.19 %)
1
(0.00 %)
132,959
(0.79 %)
27,558
(2.21 %)
21,862
(1.03 %)
269 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028389875.1
39,024
(47.65 %)
n/a 13,358
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
0
(0 %)
128
(0.11 %)
179
(100.00 %)
674,141
(6.73 %)
329,122
(5.34 %)
6,820,211
(22.78 %)
1
(0.00 %)
266,226
(1.85 %)
45,073
(5.83 %)
38,575
(2.59 %)
270 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579695.1
53,323
(53.05 %)
n/a 15,841
(0.90 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
5,905,868
(49.76 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
15,646
(0.27 %)
271 lettuce (Salinas v7 2018)
GCF_002870075.1
60,760
(2.83 %)
n/a 16,272
(0.65 %)
109,234
(6.86 %)
n/a 37.79
(92.71 %)
0
(0 %)
350,251
(7.33 %)
11,453
(100.00 %)
946,986
(1.96 %)
983,572
(3.65 %)
12,334,735
(53.11 %)
2,244
(0.09 %)
1,823,579
(9.42 %)
117,678
(2.02 %)
19,900
(0.28 %)
272 lettuce (Salinas v8 2020)
GCF_002870075.3
64,708
(2.94 %)
n/a 16,252
(0.65 %)
101,828
(6.36 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
3,138
(0.29 %)
351,533
(7.59 %)
9,960
(99.71 %)
945,052
(1.95 %)
983,641
(3.64 %)
12,325,371
(53.00 %)
2,249
(0.09 %)
n/a 117,703
(2.02 %)
19,916
(0.28 %)
273 live sharksucker (v1 2019)
GCF_900963305.1
40,255
(11.91 %)
n/a 14,975
(3.53 %)
22,304
(7.09 %)
56,266
(9.51 %)
41.43
(99.89 %)
0
(0 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
448,828
(3.61 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,476
(21.79 %)
0
(0 %)
109,664
(1.83 %)
16,807
(1.33 %)
12,095
(0.89 %)
274 lumpfish (2019 genbank)
GCA_009769545.1
41,612
(58.17 %)
n/a 14,748
(3.32 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
0
(0 %)
347
(1.78 %)
49
(100.00 %)
478,416
(6.02 %)
421,634
(11.07 %)
2,928,668
(27.98 %)
1
(0.00 %)
655,785
(6.31 %)
53,323
(5.09 %)
32,724
(2.40 %)
275 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2
55,061
(41.68 %)
n/a 21,084
(1.92 %)
22,287
(1.31 %)
n/a 40.74
(94.86 %)
83,929
(5.15 %)
83,929
(5.15 %)
112,850
(94.85 %)
5,109,404
(47.71 %)
734,754
(2.02 %)
15,854,134
(33.62 %)
2,334
(0.15 %)
767,102
(3.42 %)
36,070
(0.90 %)
31,862
(0.80 %)
276 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1
48,578
(30.31 %)
n/a 19,449
(1.56 %)
24,645
(1.37 %)
41,235
(1.95 %)
40.78
(92.27 %)
0
(0 %)
984,656
(7.81 %)
80,669
(100.00 %)
3,063,619
(35.20 %)
866,306
(3.08 %)
13,310,826
(28.76 %)
389,500
(1.56 %)
884,201
(3.10 %)
35,558
(0.84 %)
33,754
(0.78 %)
277 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1
29,549
(16.44 %)
n/a 15,120
(6.45 %)
49,515
(30.69 %)
n/a 40.48
(93.32 %)
20,693
(6.71 %)
20,693
(6.71 %)
23,184
(93.29 %)
115,049
(2.29 %)
51,516
(1.90 %)
1,488,940
(24.12 %)
25
(0.03 %)
35,840
(1.56 %)
42,077
(12.05 %)
32,193
(7.48 %)
278 mangrove rivulus
GCF_001649575.1
45,306
(11.02 %)
n/a 14,510
(2.84 %)
29,750
(6.81 %)
n/a 40.03
(94.35 %)
0
(0 %)
29,388
(5.66 %)
3,073
(100.00 %)
345,930
(2.32 %)
146,268
(1.33 %)
4,717,260
(27.31 %)
231
(0.09 %)
62,480
(1.04 %)
39,557
(2.69 %)
29,549
(1.76 %)
279 meadow brown (genbank 2021)
GCA_905333055.1
29,488
(69.09 %)
n/a 4,863
(1.16 %)
19,812
(6.60 %)
27,763
(8.31 %)
36.96
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
32
(100.00 %)
227,482
(2.41 %)
107,773
(3.02 %)
2,456,144
(43.97 %)
0
(0 %)
297,573
(6.20 %)
24,873
(3.15 %)
12,170
(1.54 %)
280 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1
n/a n/a 21,726
(1.54 %)
31,908
(1.39 %)
n/a 41.89
(99.96 %)
4,153
(0.02 %)
4,153
(0.02 %)
354,021
(99.98 %)
4,835,157
(40.73 %)
693,037
(1.32 %)
13,779,279
(33.49 %)
21
(0.00 %)
224,239
(0.53 %)
76,740
(2.37 %)
72,844
(2.03 %)
281 meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank)
GCA_006229205.1
n/a n/a 19,020
(1.63 %)
19,812
(1.43 %)
42,441
(2.08 %)
41.68
(99.72 %)
0
(0 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,552,310
(40.02 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
5,134
(0.09 %)
236,044
(0.75 %)
64,849
(2.13 %)
63,058
(1.88 %)
282 melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014)
GCF_000806345.1
26,008
(10.49 %)
n/a 7,743
(3.09 %)
12,206
(6.18 %)
n/a 35.15
(84.42 %)
37,430
(15.62 %)
37,430
(15.62 %)
43,002
(84.38 %)
237,943
(3.36 %)
74,977
(1.26 %)
2,410,203
(31.96 %)
376
(0.08 %)
35,789
(1.03 %)
15,259
(2.01 %)
8,482
(1.01 %)
283 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1
42,553
(41.45 %)
n/a 19,298
(1.81 %)
18,661
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
173,296
(5.96 %)
184,071
(94.04 %)
4,041,828
(42.24 %)
573,950
(1.48 %)
13,504,295
(30.96 %)
211
(0.02 %)
317,691
(1.50 %)
65,448
(1.38 %)
46,041
(1.09 %)
284 minke whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987535.1
61,711
(41.50 %)
n/a 19,544
(1.49 %)
21,502
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
0
(0 %)
1,177
(0.01 %)
1,375
(100.00 %)
4,006,932
(35.92 %)
1,058,106
(12.08 %)
12,708,154
(42.66 %)
4
(0.00 %)
1,500,515
(4.32 %)
72,756
(1.59 %)
44,094
(1.06 %)
285 mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017)
GCF_002532875.1
35,332
(12.83 %)
n/a 2,750
(0.61 %)
29,731
(8.07 %)
n/a 40.94
(99.89 %)
3,360
(0.11 %)
3,360
(0.11 %)
8,241
(99.89 %)
115,140
(1.18 %)
39,880
(0.71 %)
1,832,298
(14.55 %)
37
(0.00 %)
12,922
(0.23 %)
31,479
(5.12 %)
28,744
(3.52 %)
286 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1
n/a n/a 21,302
(1.57 %)
27,162
(1.27 %)
40,982
(1.78 %)
41.88
(99.90 %)
11,139
(0.04 %)
11,139
(0.04 %)
796,326
(99.96 %)
5,253,752
(39.29 %)
1,211,658
(3.13 %)
13,894,596
(38.35 %)
15
(0.00 %)
n/a 24,829
(0.69 %)
23,158
(0.63 %)
287 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank)
GCA_019393635.1
47,034
(41.56 %)
n/a 18,428
(0.81 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
0
(0 %)
260
(0.09 %)
18
(100.00 %)
7,426,369
(29.77 %)
1,249,638
(2.12 %)
21,135,395
(42.80 %)
0
(0 %)
1,546,316
(2.55 %)
16,598
(0.36 %)
13,911
(0.23 %)
288 moth S.litura (Ishihara v1 2017)
GCF_002706865.1
25,114
(8.87 %)
n/a 5,088
(1.13 %)
22,625
(7.19 %)
n/a 36.56
(97.52 %)
10,662
(2.49 %)
10,662
(2.49 %)
13,637
(97.51 %)
154,017
(1.49 %)
50,642
(0.97 %)
2,919,487
(37.00 %)
96
(0.06 %)
122,138
(2.50 %)
34,396
(3.66 %)
10,482
(1.09 %)
289 mung bean (VC1973A 2015 genbank)
GCA_000741045.2
n/a n/a 16,645
(3.88 %)
43,866
(14.64 %)
n/a 33.16
(92.79 %)
0
(0 %)
96,870
(7.25 %)
2,463
(100.00 %)
265,072
(3.32 %)
198,918
(3.34 %)
2,840,410
(34.89 %)
1,607
(0.24 %)
171,012
(3.42 %)
13,926
(1.48 %)
11,027
(1.18 %)
290 mute swan (bCygOlo1 v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1
n/a n/a 12,973
(1.97 %)
22,300
(2.18 %)
n/a 41.92
(99.06 %)
0
(0 %)
446
(0.94 %)
181
(100.00 %)
688,720
(7.65 %)
301,358
(1.34 %)
6,775,217
(21.21 %)
1
(0.00 %)
78,646
(0.75 %)
31,271
(3.60 %)
29,996
(2.02 %)
291 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1
n/a n/a 10,083
(1.97 %)
18,350
(2.23 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
5,616
(100.00 %)
485,827
(7.06 %)
212,892
(1.28 %)
4,756,962
(19.95 %)
0
(0 %)
53,808
(0.72 %)
25,670
(3.87 %)
24,319
(2.23 %)
292 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1
74,574
(44.06 %)
n/a 21,317
(1.73 %)
20,856
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
110,424
(11.59 %)
114,652
(88.41 %)
4,162,977
(32.77 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,503
(27.63 %)
595
(0.01 %)
103,053
(0.44 %)
31,950
(0.88 %)
31,054
(0.81 %)
293 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1
n/a n/a 21,418
(1.52 %)
34,189
(1.28 %)
n/a 41.35
(99.92 %)
8,600
(0.03 %)
8,600
(0.03 %)
653,473
(99.97 %)
4,512,168
(44.82 %)
592,047
(1.17 %)
13,009,453
(37.18 %)
92
(0.00 %)
n/a 63,033
(1.47 %)
45,747
(1.19 %)
294 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579445.1
31,033
(46.15 %)
n/a 12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
0
(0 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
5
(0.00 %)
478,923
(3.35 %)
31,693
(3.88 %)
22,817
(1.16 %)
295 nematode C.briggsae (AF16 v1 2008)
GCF_000004555.1
19,404
(22.65 %)
n/a 12,088
(12.63 %)
7,533
(12.85 %)
n/a 37.35
(97.22 %)
595
(0.05 %)
6,713
(2.80 %)
607
(99.95 %)
116,909
(19.60 %)
45,475
(4.23 %)
820,686
(35.42 %)
82
(0.06 %)
36,018
(3.86 %)
4,887
(1.65 %)
2,967
(0.93 %)
296 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2
36,251
(5.66 %)
n/a 10,150
(1.34 %)
42,117
(8.90 %)
n/a 37.47
(94.63 %)
39,556
(5.39 %)
39,556
(5.39 %)
45,302
(94.61 %)
396,916
(3.25 %)
506,716
(6.41 %)
4,768,175
(36.07 %)
384
(0.04 %)
264,746
(2.83 %)
17,009
(0.90 %)
8,756
(0.45 %)
297 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2
n/a n/a 21,293
(1.15 %)
25,302
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,413
(9.13 %)
268,442
(9.13 %)
314,971
(90.87 %)
5,327,246
(49.09 %)
651,311
(1.26 %)
19,267,381
(38.27 %)
239
(0.00 %)
482,244
(1.17 %)
139,552
(2.47 %)
82,520
(1.71 %)
298 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1
46,144
(1.87 %)
n/a 21,316
(1.15 %)
25,308
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,413
(9.13 %)
268,442
(9.13 %)
314,972
(90.87 %)
5,328,146
(49.10 %)
651,316
(1.26 %)
19,267,438
(38.27 %)
239
(0.00 %)
482,246
(1.17 %)
139,552
(2.47 %)
82,520
(1.71 %)
299 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1
n/a n/a 19,541
(1.47 %)
21,516
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
363
(0.17 %)
779
(100.00 %)
1,361,117
(2.23 %)
836,632
(13.12 %)
12,597,969
(44.00 %)
11
(0.00 %)
1,395,565
(3.89 %)
93,862
(1.92 %)
40,806
(0.95 %)
300 northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021)
GCF_021288785.1
49,934
(2.73 %)
n/a 20,106
(1.74 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
0
(0 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,434,732
(35.01 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
2,726
(0.09 %)
n/a 52,064
(1.59 %)
49,212
(1.43 %)
301 northern house mosquito (v1 TS 2021)
GCF_016801865.1
28,512
(7.14 %)
n/a 5,830
(1.09 %)
39,806
(8.27 %)
n/a 36.76
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,714
(100.00 %)
222,294
(5.58 %)
187,561
(9.87 %)
3,009,613
(56.49 %)
0
(0 %)
397,617
(5.35 %)
63,009
(9.78 %)
42,868
(6.50 %)
302 northern pike (2020 genbank)
GCA_011004845.1
63,720
(60.35 %)
n/a 16,616
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,918
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
0
(0 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
1,039,521
(30.93 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,094
(32.91 %)
1
(0.00 %)
602,569
(4.43 %)
42,910
(2.52 %)
22,099
(1.02 %)
303 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3
n/a n/a 20,134
(1.89 %)
18,568
(1.14 %)
n/a 40.76
(93.09 %)
180,468
(6.94 %)
180,468
(6.94 %)
197,908
(93.06 %)
5,169,984
(51.90 %)
831,865
(4.16 %)
15,243,657
(35.77 %)
861
(0.05 %)
1,641,885
(4.15 %)
65,761
(1.00 %)
25,432
(0.56 %)
304 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2
n/a 37
(0.00 %)
21,523
(1.86 %)
19,627
(1.36 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
4,895,563
(44.53 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
4
(0.00 %)
1,172,090
(3.51 %)
19,244
(0.46 %)
16,092
(0.39 %)
305 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3
84,433
(3.85 %)
n/a 20,317
(1.83 %)
21,239
(1.18 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
55,576
(0.76 %)
58,981
(0.76 %)
118,811
(99.24 %)
5,525,293
(52.79 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,088
(38.71 %)
368
(0.01 %)
1,968,092
(4.25 %)
95,595
(1.41 %)
30,263
(0.74 %)
306 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2
n/a n/a 20,319
(1.82 %)
21,542
(1.19 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
55,576
(0.76 %)
58,981
(0.76 %)
118,810
(99.24 %)
5,524,514
(52.78 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,031
(38.71 %)
368
(0.01 %)
1,968,093
(4.25 %)
95,595
(1.41 %)
30,263
(0.74 %)
307 painted lady (genbank 2021)
GCA_905220365.1
20,948
(56.23 %)
n/a 4,705
(1.06 %)
15,277
(5.00 %)
29,018
(10.11 %)
33.42
(99.99 %)
0
(0 %)
91
(0.01 %)
37
(100.00 %)
209,233
(2.16 %)
56,676
(1.12 %)
3,372,591
(44.40 %)
3
(0.00 %)
131,267
(3.01 %)
13,547
(2.72 %)
8,615
(1.04 %)
308 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1
35,529
(2.39 %)
n/a 18,185
(1.70 %)
20,184
(1.64 %)
41,094
(3.29 %)
42.38
(98.92 %)
0
(0 %)
831
(1.08 %)
141
(100.00 %)
3,072,951
(30.02 %)
385,608
(0.80 %)
12,060,365
(30.47 %)
1
(0.00 %)
173,548
(0.73 %)
64,081
(4.30 %)
66,821
(4.05 %)
309 pea aphid (AL4f v1 2019)
GCF_005508785.1
31,681
(7.81 %)
n/a 4,257
(0.79 %)
16,323
(3.39 %)
n/a 29.76
(92.38 %)
0
(0 %)
46,297
(7.65 %)
21,920
(100.00 %)
768,383
(18.87 %)
135,468
(2.11 %)
4,536,093
(48.39 %)
93
(0.01 %)
158,249
(4.28 %)
16,332
(2.13 %)
13,468
(1.54 %)
310 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1
49,100
(50.44 %)
n/a 13,025
(1.67 %)
24,167
(2.02 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
0
(0 %)
232
(0.31 %)
124
(100.00 %)
586,316
(11.83 %)
335,214
(8.05 %)
7,038,700
(24.65 %)
0
(0 %)
405,444
(2.46 %)
26,085
(2.25 %)
20,023
(0.87 %)
311 pigeon pea (v1 2016 BGI)
GCF_000340665.1
46,646
(9.41 %)
n/a 17,409
(3.12 %)
51,529
(12.74 %)
48,654
(8.33 %)
32.79
(94.21 %)
36,387
(5.81 %)
36,387
(5.81 %)
72,923
(94.19 %)
400,327
(3.60 %)
306,656
(4.69 %)
3,754,630
(39.24 %)
431
(0.18 %)
219,000
(6.77 %)
26,578
(2.89 %)
13,839
(1.14 %)
312 pike-perch
GCF_008315115.1
56,221
(8.23 %)
n/a 15,677
(2.23 %)
29,967
(5.65 %)
62,989
(6.22 %)
40.92
(100.00 %)
0
(0 %)
94
(0.00 %)
1,313
(100.00 %)
591,660
(5.05 %)
569,876
(7.39 %)
4,713,605
(36.32 %)
0
(0 %)
788,001
(5.34 %)
39,545
(1.93 %)
12,857
(0.60 %)
313 platypus (Pmale09 2018 BGI)
GCA_002966995.1
n/a n/a 15,042
(1.17 %)
19,939
(1.55 %)
n/a 46.64
(100.00 %)
0
(0 %)
476
(0.00 %)
4,568
(100.00 %)
5,326,862
(52.88 %)
879,598
(5.00 %)
9,545,961
(50.95 %)
3
(0.00 %)
1,781,446
(5.23 %)
94,468
(9.28 %)
81,476
(3.15 %)
314 platypus (Pmale09 v1 2019)
GCF_004115215.1
56,708
(3.09 %)
n/a 14,805
(1.26 %)
18,918
(1.63 %)
42,516
(2.60 %)
46.13
(99.18 %)
0
(0 %)
522
(0.82 %)
305
(100.00 %)
5,099,803
(51.62 %)
577,434
(2.88 %)
9,110,403
(48.91 %)
0
(0 %)
1,127,318
(3.58 %)
87,829
(7.91 %)
74,084
(2.86 %)
315 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3
n/a n/a 14,805
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
0
(0 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,101,303
(51.62 %)
578,617
(2.89 %)
9,113,847
(48.93 %)
0
(0 %)
1,130,252
(3.59 %)
87,861
(7.92 %)
74,107
(2.86 %)
316 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1
35,751
(39.94 %)
n/a 18,495
(1.67 %)
15,243
(1.37 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
110,343
(1.67 %)
134,161
(98.33 %)
4,221,025
(40.96 %)
553,193
(1.29 %)
13,765,526
(29.91 %)
205
(0.03 %)
311,409
(1.04 %)
54,906
(1.17 %)
47,465
(0.98 %)
317 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1
45,404
(55.83 %)
n/a 14,654
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
0
(0 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,311,131
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
3
(0.00 %)
1,623,656
(7.33 %)
172,199
(5.45 %)
18,080
(0.31 %)
318 pronghorn (BS35 2019 Broad)
GCA_004027515.1
n/a n/a 24,094
(1.34 %)
35,119
(1.27 %)
n/a 41.97
(99.87 %)
6,569
(0.02 %)
6,569
(0.02 %)
1,649,700
(99.98 %)
5,613,563
(41.47 %)
652,408
(1.55 %)
13,943,055
(43.64 %)
21
(0.00 %)
n/a 61,057
(1.17 %)
39,599
(0.79 %)
319 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1
45,076
(35.88 %)
n/a 19,564
(1.68 %)
22,124
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
80,963
(0.88 %)
134,059
(99.12 %)
3,917,534
(41.44 %)
435,606
(1.73 %)
14,738,354
(28.36 %)
39
(0.00 %)
276,230
(1.12 %)
40,752
(0.94 %)
35,911
(0.79 %)
320 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1
25,575
(34.74 %)
n/a 17,665
(1.56 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
0
(0 %)
178,992
(4.69 %)
2,174
(100.00 %)
4,884,619
(42.70 %)
833,136
(1.76 %)
13,705,706
(31.28 %)
2,166
(0.06 %)
494,972
(1.78 %)
58,912
(1.65 %)
50,363
(1.31 %)
321 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2
59,332
(37.06 %)
26
(0.00 %)
19,951
(1.94 %)
19,039
(1.18 %)
n/a 40.74
(82.95 %)
111,087
(17.06 %)
156,797
(17.06 %)
121,337
(82.94 %)
5,136,492
(50.91 %)
775,493
(1.63 %)
15,570,612
(30.28 %)
70
(0.03 %)
729,770
(1.34 %)
43,049
(0.71 %)
26,732
(0.52 %)
322 pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023)
GCF_029289425.1
84,858
(3.73 %)
n/a 20,765
(1.73 %)
22,666
(1.18 %)
n/a 40.49
(99.96 %)
0
(0 %)
8
(0.04 %)
443
(100.00 %)
5,487,575
(50.65 %)
1,054,555
(12.79 %)
15,952,698
(43.80 %)
0
(0 %)
3,830,835
(6.42 %)
53,329
(1.37 %)
27,996
(0.60 %)
323 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank)
GCA_026419965.1
56,261
(41.31 %)
n/a 18,495
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
0
(0 %)
143
(0.19 %)
580
(100.00 %)
3,817,653
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,926
(39.96 %)
0
(0 %)
1,197,918
(3.53 %)
101,353
(2.90 %)
50,216
(1.47 %)
324 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank)
GCA_009806435.2
n/a n/a 19,480
(1.31 %)
23,335
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
0
(0 %)
18,178
(2.32 %)
3,159
(100.00 %)
4,179,975
(0.00 %)
976,271
(2.33 %)
13,766,353
(39.76 %)
85
(0.00 %)
1,275,666
(3.04 %)
113,370
(2.46 %)
70,869
(1.75 %)
325 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1
n/a n/a 18,676
(1.38 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,884,561
(44.65 %)
883,943
(1.73 %)
13,254,559
(38.27 %)
12
(0.00 %)
1,022,805
(2.55 %)
110,338
(2.33 %)
68,466
(1.73 %)
326 radish (v1 WS10039 2015)
GCF_000801105.1
69,943
(20.66 %)
n/a 33,762
(10.20 %)
70,765
(28.80 %)
n/a 35.29
(87.22 %)
0
(0 %)
28,041
(12.80 %)
10,676
(100.00 %)
196,483
(2.53 %)
150,132
(3.32 %)
2,256,858
(26.65 %)
148
(0.08 %)
181,090
(8.85 %)
23,381
(2.80 %)
18,811
(2.08 %)
327 red admiral (genbank 2021)
GCA_905147765.2
n/a n/a 4,641
(1.20 %)
13,258
(4.79 %)
32,725
(10.42 %)
32.84
(100.00 %)
0
(0 %)
18
(0.00 %)
142
(100.00 %)
184,094
(2.52 %)
41,639
(1.23 %)
3,193,736
(41.82 %)
0
(0 %)
59,270
(1.97 %)
10,747
(2.25 %)
7,305
(0.97 %)
328 red-crested turaco (2014 BGI)
GCF_000709365.1
16,151
(2.15 %)
n/a 12,046
(1.50 %)
25,077
(1.98 %)
n/a 41.63
(99.43 %)
75,085
(0.59 %)
75,085
(0.59 %)
134,672
(99.41 %)
401,465
(6.41 %)
153,694
(0.86 %)
6,705,299
(20.45 %)
1
(0.00 %)
58,294
(0.41 %)
30,183
(1.07 %)
25,549
(0.87 %)
329 red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI)
GCF_000690535.1
16,238
(2.21 %)
n/a 12,016
(1.53 %)
23,985
(1.93 %)
n/a 41.20
(99.63 %)
59,230
(0.38 %)
59,230
(0.38 %)
112,704
(99.62 %)
322,026
(4.02 %)
121,725
(0.68 %)
6,797,850
(18.25 %)
4
(0.00 %)
20,461
(0.20 %)
18,873
(0.62 %)
16,327
(0.52 %)
330 red mason bee (LIB18336 2019)
GCF_004153925.1
26,926
(16.13 %)
n/a 4,185
(2.08 %)
24,859
(11.07 %)
n/a 39.77
(99.98 %)
0
(0 %)
2,089
(0.02 %)
10,222
(100.00 %)
88,278
(1.96 %)
74,016
(3.78 %)
1,305,254
(28.61 %)
137
(0.02 %)
68,133
(2.01 %)
10,712
(6.90 %)
7,940
(2.34 %)
331 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1
25,173
(40.74 %)
n/a 13,218
(1.71 %)
28,120
(2.39 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
9
(0.00 %)
249
(0.00 %)
1,195
(100.00 %)
544,427
(8.81 %)
223,674
(5.77 %)
6,669,469
(23.63 %)
3
(0.00 %)
398,605
(2.64 %)
38,306
(3.37 %)
35,069
(1.78 %)
332 reedfish (2019)
GCF_900747795.1
40,545
(1.73 %)
n/a 13,154
(0.46 %)
24,028
(1.29 %)
34,856
(1.34 %)
39.44
(93.75 %)
0
(0 %)
5,614
(6.25 %)
1,885
(100.00 %)
1,834,613
(2.79 %)
1,018,031
(2.36 %)
20,081,632
(44.56 %)
4
(0.00 %)
1,039,686
(2.44 %)
88,254
(1.06 %)
22,510
(0.28 %)
333 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3
n/a n/a 20,558
(1.71 %)
22,141
(1.12 %)
n/a 40.95
(97.08 %)
63,767
(2.91 %)
64,538
(2.91 %)
348,579
(97.09 %)
5,846,699
(54.61 %)
1,429,378
(9.24 %)
16,512,587
(40.26 %)
80
(0.01 %)
2,975,593
(6.12 %)
98,572
(1.29 %)
30,558
(0.68 %)
334 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1
59,888
(43.60 %)
n/a 19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
0
(0 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
4
(0.00 %)
1,071,329
(3.37 %)
73,126
(1.69 %)
43,865
(1.11 %)
335 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1
16,166
(2.37 %)
n/a 12,054
(1.65 %)
23,851
(2.04 %)
n/a 41.63
(99.55 %)
66,437
(0.46 %)
66,437
(0.46 %)
120,312
(99.54 %)
392,481
(7.69 %)
217,040
(2.27 %)
5,855,355
(18.33 %)
5
(0.00 %)
69,222
(0.63 %)
7,602
(0.24 %)
5,949
(0.18 %)
336 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1
n/a n/a 21,125
(1.90 %)
29,864
(1.51 %)
65,909
(1.91 %)
41.13
(99.93 %)
4,599
(0.02 %)
4,599
(0.02 %)
580,026
(99.98 %)
3,840,645
(39.25 %)
675,921
(1.83 %)
13,841,750
(31.45 %)
17
(0.00 %)
304,327
(0.71 %)
59,440
(1.72 %)
54,385
(1.53 %)
337 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1
25,353
(3.88 %)
n/a 14,334
(1.56 %)
58,475
(4.46 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
0
(0 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
642,988
(3.38 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
7,501
(0.17 %)
424,697
(2.96 %)
52,308
(2.11 %)
22,130
(0.71 %)
338 river trout (v1 2019)
GCF_901001165.1
102,772
(6.02 %)
n/a 27,413
(1.62 %)
51,424
(4.17 %)
121,979
(5.28 %)
43.36
(96.90 %)
0
(0 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
1,438,988
(5.72 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,761
(52.37 %)
2
(0.00 %)
3,428,195
(8.64 %)
70,821
(1.77 %)
18,627
(0.33 %)
339 rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank)
GCA_023343835.1
51,619
(61.28 %)
n/a 12,831
(2.31 %)
n/a n/a 41.57
(99.99 %)
0
(0 %)
210
(0.01 %)
164
(100.00 %)
667,924
(11.59 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,274
(21.73 %)
0
(0 %)
216,565
(1.89 %)
21,346
(2.37 %)
19,067
(1.48 %)
340 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2
53,779
(39.43 %)
n/a 21,304
(2.26 %)
18,211
(1.40 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
27,758
(7.29 %)
306,650
(10.98 %)
30,919
(92.71 %)
4,878,260
(40.08 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,226
(27.49 %)
6,570
(0.06 %)
398,071
(1.12 %)
16,050
(0.44 %)
15,502
(0.41 %)
341 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1
53,855
(2.85 %)
49,148
(2.43 %)
21,291
(2.26 %)
19,256
(1.49 %)
96,713
(4.05 %)
41.70
(89.05 %)
27,758
(7.29 %)
306,650
(10.98 %)
30,920
(92.71 %)
4,749,528
(39.06 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,297
(27.49 %)
6,570
(0.06 %)
398,071
(1.12 %)
16,050
(0.44 %)
15,491
(0.41 %)
342 saddleback dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1
46,746
(40.70 %)
n/a 18,625
(1.49 %)
20,451
(1.28 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
0
(0 %)
968
(0.01 %)
631
(100.00 %)
4,020,682
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,818
(42.64 %)
0
(0 %)
1,785,427
(5.07 %)
66,179
(3.91 %)
41,466
(1.03 %)
343 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1
50,290
(50.75 %)
n/a 12,971
(1.67 %)
23,351
(2.02 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
0
(0 %)
258
(0.30 %)
282
(100.00 %)
548,087
(7.21 %)
201,482
(8.55 %)
7,030,761
(24.94 %)
0
(0 %)
469,777
(2.60 %)
31,791
(2.57 %)
20,215
(0.89 %)
344 salmon louse (v1.1 2020)
GCF_016086655.2
27,164
(5.26 %)
n/a 3,465
(0.45 %)
3,673
(1.75 %)
n/a 30.90
(99.99 %)
603
(0.01 %)
608
(0.01 %)
10,436
(99.99 %)
1,394,872
(53.53 %)
76,419
(1.13 %)
6,311,228
(43.85 %)
0
(0 %)
80,432
(1.10 %)
647
(0.04 %)
374
(0.03 %)
345 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887145.1
27,528
(42.80 %)
n/a 12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
0
(0 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
1
(0.00 %)
651,029
(4.07 %)
35,549
(5.05 %)
23,802
(1.15 %)
346 Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank)
GCA_029499605.1
108,406
(45.40 %)
n/a 13,961
(0.46 %)
36,603
(1.55 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
0
(0 %)
2,297
(0.01 %)
3,475
(100.00 %)
1,903,658
(2.85 %)
2,970,695
(16.56 %)
15,354,615
(64.31 %)
20
(0.00 %)
n/a 652,708
(8.36 %)
43,665
(0.45 %)
347 SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19)
GCF_009858895.2
n/a 13
(97.85 %)
n/a n/a n/a 37.98
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.24 %)
1
(0.11 %)
33
(1.38 %)
0
(0 %)
0
(0.00 %)
1
(0.73 %)
1
(0.73 %)
348 sea anemones (CC7 2015 genbank)
GCA_001417965.1
29,778
(59.32 %)
26,042
(31.72 %)
3,020
(1.06 %)
13,146
(12.99 %)
30,497
(24.04 %)
36.33
(82.34 %)
0
(0 %)
637,478
(17.95 %)
4,312
(100.00 %)
74,671
(1.98 %)
63,328
(2.24 %)
1,417,036
(20.33 %)
493
(0.38 %)
82,695
(5.22 %)
2,099
(0.38 %)
1,309
(0.28 %)
349 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2
n/a n/a 18,591
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
34,142
(1.77 %)
41.56
(98.79 %)
22,821
(1.21 %)
23,134
(1.21 %)
29,588
(98.79 %)
4,702,292
(41.42 %)
721,749
(1.39 %)
14,065,592
(32.89 %)
1,203
(0.02 %)
504,215
(2.00 %)
55,388
(1.87 %)
53,466
(1.67 %)
350 segmented worms (v1 2012)
GCF_000326865.1
23,426
(13.46 %)
n/a 2,741
(0.95 %)
3,156
(4.19 %)
n/a 32.82
(91.54 %)
10,301
(8.47 %)
11,185
(8.47 %)
12,292
(91.53 %)
572,062
(30.90 %)
474,390
(10.49 %)
1,741,644
(44.75 %)
9
(0.01 %)
91,780
(2.82 %)
3,489
(0.51 %)
1,342
(0.18 %)
351 siamang (v1 Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1
79,118
(2.62 %)
n/a 20,139
(1.70 %)
21,232
(1.14 %)
n/a 40.62
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
606
(100.00 %)
5,278,880
(55.89 %)
946,219
(14.68 %)
14,395,605
(46.26 %)
0
(0 %)
2,376,584
(4.99 %)
95,573
(1.75 %)
30,053
(0.74 %)
352 Siamese fighting fish (v2 2019)
GCF_900634795.2
54,389
(16.95 %)
n/a 14,745
(4.21 %)
34,348
(10.09 %)
62,673
(13.02 %)
45.30
(99.99 %)
0
(0 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
252,955
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
0
(0 %)
232,426
(4.41 %)
72,126
(13.08 %)
55,959
(7.25 %)
353 Siamese fighting fish (v3 2020)
GCF_900634795.3
54,864
(17.78 %)
n/a 14,745
(4.20 %)
56,808
(10.87 %)
69,466
(16.34 %)
45.30
(99.99 %)
0
(0 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
255,550
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
0
(0 %)
232,435
(4.41 %)
72,126
(13.08 %)
55,959
(7.25 %)
354 silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.1
54,238
(2.74 %)
n/a 17,887
(2.00 %)
18,517
(1.25 %)
n/a 41.17
(98.20 %)
0
(0 %)
18,567
(1.80 %)
18,392
(100.00 %)
4,399,357
(50.55 %)
711,948
(2.37 %)
12,623,705
(36.55 %)
554
(0.02 %)
851,081
(2.16 %)
67,835
(1.30 %)
23,062
(0.73 %)
355 silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.2
63,475
(2.65 %)
n/a 20,581
(1.94 %)
21,181
(1.20 %)
41,252
(1.46 %)
41.02
(97.81 %)
0
(0 %)
25,106
(2.19 %)
18,395
(100.00 %)
5,332,131
(51.09 %)
857,562
(2.26 %)
15,565,289
(36.84 %)
736
(0.02 %)
997,772
(2.11 %)
80,124
(1.26 %)
26,690
(0.70 %)
356 slow loris (BS32 2019)
GCA_004027815.1
n/a n/a 26,771
(1.11 %)
44,247
(1.00 %)
n/a 40.68
(99.86 %)
9,648
(0.03 %)
9,648
(0.03 %)
1,946,791
(99.97 %)
6,230,312
(41.68 %)
688,924
(1.23 %)
16,892,392
(43.00 %)
103
(0.00 %)
n/a 39,326
(0.65 %)
24,515
(0.47 %)
357 slow loris (primary hap 2022 genbank)
GCA_027406575.1
67,213
(41.75 %)
n/a 22,195
(1.49 %)
21,341
(1.28 %)
n/a 40.82
(99.86 %)
0
(0 %)
218
(0.14 %)
85
(100.00 %)
4,625,875
(39.88 %)
579,984
(1.59 %)
14,405,402
(40.78 %)
2
(0.00 %)
991,314
(2.40 %)
38,257
(0.77 %)
22,955
(0.54 %)
358 small Madagascar hedgehog
GCA_000313985.1
n/a n/a 19,066
(1.18 %)
19,334
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.44 %)
269,444
(11.60 %)
269,444
(11.60 %)
277,845
(88.40 %)
3,789,866
(28.89 %)
429,318
(0.87 %)
16,950,647
(32.23 %)
3,871
(0.06 %)
189,446
(0.64 %)
39,994
(0.70 %)
32,202
(0.55 %)
359 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1
55,762
(1.62 %)
n/a 12,597
(0.36 %)
23,987
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
0
(0 %)
7,146
(1.52 %)
646
(100.00 %)
1,185,832
(1.72 %)
1,448,620
(6.25 %)
20,884,767
(51.41 %)
10
(0.00 %)
3,334,926
(4.99 %)
456,658
(8.18 %)
31,096
(0.32 %)
360 smalleye Pacific opah (hap2 2023 genbank)
GCA_029633865.1
n/a n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
0
(0 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
17
(0.00 %)
n/a 143,632
(7.43 %)
65,914
(2.15 %)
361 smalltooth sawfish (2019 genbank)
GCA_009764475.1
n/a n/a 11,828
(0.66 %)
18,627
(1.55 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
0
(0 %)
698
(0.91 %)
173
(100.00 %)
405,021
(1.14 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,302
(38.19 %)
0
(0 %)
471,290
(1.50 %)
45,398
(1.34 %)
18,572
(0.38 %)
362 snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016)
GCF_001687245.1
37,836
(4.45 %)
n/a 10,526
(1.07 %)
59,331
(6.34 %)
n/a 36.53
(93.84 %)
52,913
(6.17 %)
227,684
(6.18 %)
139,583
(93.83 %)
653,914
(2.87 %)
386,956
(5.71 %)
7,364,314
(43.00 %)
22,478
(0.98 %)
443,424
(7.26 %)
60,636
(4.05 %)
36,565
(2.36 %)
363 sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019)
GCF_006149115.1
76,167
(6.12 %)
n/a 24,114
(1.71 %)
51,371
(4.08 %)
102,891
(5.24 %)
43.39
(96.16 %)
1,903
(0.01 %)
25,659
(3.84 %)
38,027
(99.99 %)
1,300,179
(8.96 %)
1,465,690
(10.81 %)
8,849,714
(48.44 %)
872
(0.04 %)
1,716,006
(5.17 %)
64,215
(1.55 %)
18,038
(0.45 %)
364 southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank)
GCA_910596095.1
58,416
(66.24 %)
n/a 15,695
(2.61 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
95
(0.00 %)
58
(100.00 %)
1,591,314
(33.50 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,850
(26.85 %)
0
(0 %)
326,259
(3.37 %)
14,097
(0.88 %)
9,797
(0.48 %)
365 southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad)
GCA_004026725.1
n/a n/a 24,302
(1.12 %)
43,055
(0.98 %)
n/a 41.63
(99.82 %)
10,550
(0.03 %)
10,550
(0.03 %)
2,272,285
(99.97 %)
5,668,964
(24.75 %)
1,628,683
(5.38 %)
15,658,806
(41.85 %)
67
(0.00 %)
n/a 21,801
(0.44 %)
18,380
(0.34 %)
366 southern tamandua (Broad 2019)
GCA_004025105.1
n/a n/a 25,638
(0.82 %)
49,782
(0.86 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
5,819
(0.02 %)
5,819
(0.02 %)
2,150,023
(99.98 %)
6,033,640
(37.10 %)
708,890
(0.99 %)
22,371,532
(41.88 %)
62
(0.00 %)
n/a 80,897
(1.09 %)
48,136
(0.70 %)
367 southern two-toed sloth (US054 2019 Broad)
GCA_004027855.1
n/a n/a 25,877
(0.78 %)
56,071
(0.82 %)
n/a 39.82
(99.84 %)
5,099
(0.02 %)
5,099
(0.02 %)
2,537,432
(99.98 %)
5,384,587
(37.86 %)
724,925
(2.20 %)
19,492,096
(41.12 %)
63
(0.00 %)
n/a 55,674
(0.90 %)
46,833
(0.74 %)
368 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1
37,037
(37.57 %)
n/a 18,551
(1.79 %)
19,747
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
54,737
(3.96 %)
57,823
(96.04 %)
3,824,807
(39.33 %)
421,693
(0.97 %)
14,765,476
(28.93 %)
1,818
(0.02 %)
184,274
(0.57 %)
36,281
(1.02 %)
34,129
(0.92 %)
369 soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010)
GCF_000004515.4
82,440
(9.65 %)
n/a 27,682
(3.07 %)
77,218
(11.84 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,955
(2.35 %)
15,955
(2.35 %)
17,146
(97.65 %)
834,646
(37.35 %)
436,219
(5.65 %)
5,341,660
(45.30 %)
54
(0.01 %)
659,519
(6.22 %)
35,897
(1.56 %)
13,140
(0.58 %)
370 soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018)
GCF_000004515.5
85,123
(9.72 %)
n/a 27,647
(3.06 %)
77,190
(11.83 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,995
(2.36 %)
15,995
(2.36 %)
17,187
(97.64 %)
834,651
(37.35 %)
436,225
(5.65 %)
5,341,721
(45.30 %)
55
(0.01 %)
659,428
(6.22 %)
35,897
(1.47 %)
13,140
(0.58 %)
371 speckled wood butterfly (genbank 2021)
GCA_905163445.1
21,720
(55.73 %)
n/a 4,713
(0.87 %)
17,002
(4.33 %)
29,238
(7.81 %)
35.99
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
71
(100.00 %)
304,077
(2.97 %)
110,835
(4.09 %)
3,704,355
(44.42 %)
1
(0.00 %)
144,758
(2.93 %)
28,108
(2.75 %)
11,566
(0.96 %)
372 sperm whale (SW-GA 2019)
GCF_002837175.2
60,921
(2.59 %)
n/a 19,527
(1.73 %)
25,114
(1.51 %)
n/a 41.39
(95.90 %)
128,928
(4.12 %)
128,928
(4.12 %)
143,605
(95.88 %)
4,365,057
(42.78 %)
694,673
(2.40 %)
13,518,590
(32.76 %)
1,887
(0.17 %)
521,351
(4.50 %)
94,152
(2.52 %)
63,303
(1.97 %)
373 sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF)
GCF_000090795.1
31,248
(25.26 %)
n/a 2,167
(1.08 %)
6,648
(9.22 %)
n/a 35.83
(86.92 %)
14,574
(13.10 %)
14,944
(13.10 %)
27,972
(86.90 %)
108,973
(4.04 %)
70,563
(4.66 %)
881,116
(24.58 %)
109
(0.03 %)
120,772
(5.83 %)
668
(0.62 %)
519
(0.56 %)
374 sterlet (v1 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.1
73,251
(5.76 %)
n/a 24,411
(1.72 %)
39,637
(3.96 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
0
(0 %)
6,283
(0.07 %)
3,404
(100.00 %)
1,269,345
(3.50 %)
1,095,665
(6.81 %)
10,007,602
(39.30 %)
5
(0.00 %)
1,356,511
(6.13 %)
60,475
(1.95 %)
17,954
(0.41 %)
375 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.2
n/a n/a 25,364
(1.76 %)
40,452
(4.10 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
0
(0 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
10
(0.00 %)
1,593,749
(6.87 %)
64,522
(2.85 %)
21,984
(0.89 %)
376 stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017)
GCF_002571385.1
36,135
(16.45 %)
n/a 3,324
(0.70 %)
20,909
(10.93 %)
38,198
(17.00 %)
38.54
(89.50 %)
0
(0 %)
49,077
(10.54 %)
5,688
(100.00 %)
111,077
(1.70 %)
108,732
(2.95 %)
2,009,396
(21.40 %)
206
(0.10 %)
118,773
(3.74 %)
6,012
(0.58 %)
3,703
(0.31 %)
377 striped catfish (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358585.1
53,859
(65.52 %)
n/a 16,035
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
0
(0 %)
236
(0.51 %)
59
(100.00 %)
1,870,238
(37.80 %)
605,571
(6.82 %)
5,059,499
(32.43 %)
2
(0.00 %)
531,388
(4.26 %)
17,919
(1.29 %)
12,796
(0.75 %)
378 Sumatran orangutan (Susie 2018 genbank)
GCA_002880775.3
n/a 160,726
(3.42 %)
20,174
(1.79 %)
20,994
(1.15 %)
47,806
(1.68 %)
40.80
(99.29 %)
553
(0.70 %)
553
(0.70 %)
5,813
(99.30 %)
5,497,148
(54.41 %)
1,048,361
(8.01 %)
15,948,575
(40.68 %)
0
(0 %)
2,413,946
(4.00 %)
39,481
(0.87 %)
26,385
(0.67 %)
379 Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1
98,046
(3.46 %)
n/a 21,162
(1.68 %)
21,714
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.79 %)
59
(0.21 %)
59
(0.21 %)
2,670
(99.79 %)
5,730,768
(55.05 %)
1,175,314
(11.19 %)
16,323,507
(44.05 %)
0
(0 %)
2,553,363
(4.41 %)
55,799
(2.08 %)
39,159
(1.10 %)
380 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1
40,128
(5.45 %)
n/a 13,016
(1.88 %)
24,787
(2.41 %)
30,064
(2.94 %)
42.48
(98.86 %)
0
(0 %)
428
(1.14 %)
161
(100.00 %)
483,978
(5.85 %)
589,859
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
1
(0.00 %)
449,585
(2.41 %)
49,404
(3.53 %)
22,206
(1.16 %)
381 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1
n/a n/a 13,403
(1.85 %)
27,456
(2.48 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
497,374
(5.78 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
0
(0 %)
505,741
(2.66 %)
49,076
(3.54 %)
23,486
(1.21 %)
382 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018845.1
29,544
(46.92 %)
n/a 12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
0
(0 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
1
(0.00 %)
578,723
(3.93 %)
32,064
(3.27 %)
22,996
(1.19 %)
383 Tasmanian devil
GCF_000189315.1
32,527
(1.79 %)
n/a 16,112
(0.84 %)
16,152
(0.94 %)
n/a 36.05
(92.36 %)
201,317
(7.66 %)
201,403
(7.66 %)
237,291
(92.34 %)
6,766,259
(42.85 %)
1,240,681
(2.07 %)
20,998,733
(36.61 %)
17,494
(0.40 %)
351,216
(1.07 %)
23,155
(0.38 %)
21,337
(0.32 %)
384 thale cress (tair10 Columbia 2011)
GCF_000001735.3
54,010
(40.19 %)
n/a 26,552
(34.12 %)
25,867
(35.78 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
0
(0 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
67,353
(16.32 %)
27,063
(2.77 %)
749,020
(22.64 %)
1
(0.00 %)
42,547
(3.36 %)
4,599
(1.63 %)
3,518
(1.15 %)
385 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1
41,886
(2.61 %)
n/a 19,165
(1.70 %)
18,102
(1.44 %)
n/a 39.91
(93.27 %)
141,005
(6.75 %)
141,005
(6.75 %)
153,488
(93.25 %)
4,378,557
(36.61 %)
640,337
(1.64 %)
14,116,066
(27.91 %)
2,964
(0.05 %)
213,421
(0.74 %)
28,321
(0.64 %)
26,464
(0.58 %)
386 thorny skate (CabotCenter1 v1 2020 genbank)
GCA_010909765.1
45,969
(46.35 %)
n/a 11,434
(0.60 %)
26,342
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
0
(0 %)
3,753
(7.46 %)
958
(100.00 %)
866,598
(2.58 %)
1,176,350
(3.79 %)
9,964,083
(52.25 %)
26
(0.00 %)
1,634,657
(4.98 %)
242,676
(4.73 %)
31,030
(0.57 %)
387 thorny skate (CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1
45,969
(2.40 %)
n/a 11,433
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
0
(0 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
865,711
(2.57 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
26
(0.00 %)
1,634,657
(4.98 %)
242,676
(4.73 %)
31,030
(0.57 %)
388 tidepool copepod (San Diego 2019 genbank)
GCA_007210705.1
23,429
(54.20 %)
15,577
(15.83 %)
3,517
(1.61 %)
18,910
(15.71 %)
n/a 42.18
(97.94 %)
0
(0 %)
14,007
(2.09 %)
459
(100.00 %)
52,042
(1.17 %)
27,065
(1.23 %)
928,666
(18.11 %)
1,035
(0.11 %)
46,898
(3.89 %)
15,823
(5.51 %)
13,041
(4.23 %)
389 tiger tail seahorse (QL1 v1 2016)
GCF_001891065.1
47,041
(13.29 %)
n/a 13,817
(3.76 %)
32,943
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.04 %)
23,101
(6.97 %)
23,101
(6.97 %)
60,478
(93.03 %)
359,724
(3.91 %)
155,380
(3.35 %)
2,811,700
(24.51 %)
111
(0.08 %)
112,479
(5.30 %)
61,685
(7.72 %)
45,970
(4.19 %)
390 tomato (v3.0 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.4
46,015
(6.94 %)
n/a 15,396
(2.15 %)
38,462
(7.56 %)
n/a 34.12
(90.18 %)
0
(0 %)
19,634
(9.83 %)
3,150
(100.00 %)
417,162
(18.21 %)
229,803
(3.18 %)
5,370,478
(35.28 %)
224
(0.02 %)
412,060
(4.40 %)
25,279
(1.28 %)
2,409
(0.12 %)
391 tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020)
GCF_014805625.1
24,334
(8.13 %)
n/a 7,223
(2.32 %)
6,632
(3.62 %)
n/a 33.80
(97.46 %)
0
(0 %)
9,688
(2.55 %)
7,986
(100.00 %)
418,532
(4.76 %)
185,734
(2.26 %)
3,090,742
(35.34 %)
677
(0.08 %)
40,269
(0.93 %)
3,487
(0.58 %)
1,907
(0.28 %)
392 two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_901001135.1
56,617
(1.50 %)
n/a 14,448
(0.38 %)
40,572
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
0
(0 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,263,606
(1.94 %)
2,036,108
(4.34 %)
29,400,958
(44.09 %)
9
(0.01 %)
2,193,249
(3.24 %)
602,912
(6.66 %)
94,935
(0.82 %)
393 Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017)
GCA_002776525.1
n/a n/a 21,053
(1.88 %)
23,024
(1.24 %)
n/a 40.68
(96.59 %)
0
(0 %)
77,615
(3.42 %)
47,644
(100.00 %)
5,478,730
(51.13 %)
969,126
(2.63 %)
16,127,854
(36.40 %)
1,906
(0.05 %)
947,012
(1.94 %)
63,965
(1.04 %)
25,907
(0.65 %)
394 Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018)
GCF_002776525.2
66,965
(2.69 %)
n/a 21,958
(1.85 %)
24,388
(1.22 %)
55,722
(1.95 %)
40.60
(97.10 %)
0
(0 %)
63,620
(2.91 %)
47,449
(100.00 %)
5,699,639
(51.61 %)
1,066,606
(2.87 %)
16,603,622
(37.49 %)
6,170
(0.10 %)
1,075,458
(2.10 %)
71,084
(1.08 %)
26,726
(0.65 %)
395 Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019)
GCF_002776525.3
68,173
(2.68 %)
n/a 21,804
(1.85 %)
23,385
(1.18 %)
n/a 40.60
(97.10 %)
0
(0 %)
64,415
(2.91 %)
46,654
(100.00 %)
5,700,226
(51.61 %)
1,066,759
(2.88 %)
16,603,818
(37.49 %)
6,208
(0.10 %)
1,080,318
(2.10 %)
71,078
(1.08 %)
26,732
(0.65 %)
396 Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019)
GCF_002776525.4
63,704
(2.55 %)
n/a 21,347
(1.86 %)
23,056
(1.19 %)
n/a 40.84
(97.07 %)
0
(0 %)
57,757
(2.93 %)
34,372
(100.00 %)
5,504,117
(51.70 %)
961,351
(2.75 %)
16,208,033
(37.10 %)
4,987
(0.09 %)
1,064,626
(2.10 %)
71,046
(1.10 %)
29,347
(0.68 %)
397 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1
54,667
(35.81 %)
n/a 19,685
(1.25 %)
21,268
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
201,121
(4.83 %)
356,096
(95.17 %)
6,165,270
(34.95 %)
1,197,778
(2.77 %)
16,282,333
(36.21 %)
730
(0.04 %)
592,599
(1.56 %)
22,905
(0.49 %)
18,563
(0.39 %)
398 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1
63,555
(8.16 %)
n/a 16,886
(1.90 %)
72,876
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
0
(0 %)
1,674
(0.23 %)
2,010
(100.00 %)
800,389
(3.72 %)
460,244
(7.41 %)
5,439,256
(37.83 %)
3
(0.00 %)
746,332
(7.48 %)
19,635
(1.10 %)
9,142
(0.41 %)
399 vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.1
48,870
(21.91 %)
n/a 19,421
(7.41 %)
36,314
(20.76 %)
n/a 36.49
(94.25 %)
0
(0 %)
49,649
(5.76 %)
25,263
(100.00 %)
182,696
(3.35 %)
143,269
(7.40 %)
1,620,517
(29.12 %)
3,454
(0.84 %)
135,503
(7.90 %)
13,323
(2.49 %)
9,786
(1.57 %)
400 wasp C.solmsi marchali (v1 2013)
GCF_000503995.1
13,201
(7.14 %)
n/a 3,474
(1.25 %)
15,142
(4.89 %)
n/a 30.36
(99.55 %)
7,471
(0.46 %)
7,471
(0.46 %)
9,928
(99.54 %)
340,841
(7.52 %)
251,386
(3.99 %)
2,448,273
(49.27 %)
11
(0.00 %)
43,154
(0.99 %)
16,346
(4.08 %)
14,983
(2.78 %)
401 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1
n/a n/a 20,245
(1.49 %)
24,230
(1.29 %)
n/a 42.11
(97.39 %)
263,385
(2.62 %)
263,385
(2.62 %)
630,367
(97.38 %)
5,997,926
(47.35 %)
466,019
(1.02 %)
13,822,739
(40.29 %)
2,383
(0.04 %)
975,519
(2.73 %)
93,080
(1.71 %)
42,806
(0.88 %)
402 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1
48,251
(30.18 %)
n/a 21,044
(1.72 %)
22,320
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
152,836
(29.58 %)
169,546
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,250
(0.66 %)
13,410,191
(22.09 %)
2,022
(0.05 %)
348,918
(1.08 %)
48,738
(1.01 %)
44,867
(0.88 %)
403 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1
29,923
(35.25 %)
n/a 18,034
(1.33 %)
19,779
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
219,764
(14.09 %)
225,566
(85.91 %)
6,527,125
(45.87 %)
1,271,531
(2.29 %)
12,374,069
(42.02 %)
3,596
(0.06 %)
861,216
(2.39 %)
28,528
(0.71 %)
23,900
(0.52 %)
404 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1
61,103
(44.10 %)
n/a 18,126
(1.16 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
0
(0 %)
3,760
(0.03 %)
1,175
(100.00 %)
4,891,344
(19.68 %)
1,507,933
(3.81 %)
12,571,193
(54.50 %)
7
(0.00 %)
1,975,693
(4.67 %)
32,667
(0.90 %)
24,067
(0.56 %)
405 western European house mouse (WSB_EiJ v1 2016)
GCA_001624835.1
n/a n/a 20,870
(2.26 %)
18,535
(1.45 %)
100,622
(4.22 %)
41.80
(84.36 %)
68,691
(5.19 %)
399,976
(15.70 %)
72,315
(94.81 %)
4,961,700
(39.53 %)
1,345,987
(2.51 %)
13,324,808
(25.23 %)
11,455
(0.66 %)
369,064
(1.23 %)
16,556
(0.40 %)
15,878
(0.38 %)
406 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3
n/a n/a 20,323
(1.77 %)
22,069
(1.15 %)
n/a 40.71
(99.64 %)
768
(0.36 %)
768
(0.36 %)
16,065
(99.64 %)
5,373,630
(50.30 %)
1,025,389
(10.17 %)
15,954,613
(41.78 %)
0
(0 %)
3,581,997
(5.69 %)
53,557
(1.01 %)
27,578
(0.69 %)
407 western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023)
GCF_029281585.1
101,242
(3.18 %)
n/a 20,994
(1.57 %)
41,945
(1.53 %)
n/a 40.59
(99.85 %)
0
(0 %)
38
(0.15 %)
637
(100.00 %)
5,526,927
(51.16 %)
1,080,693
(20.38 %)
15,929,020
(48.46 %)
0
(0 %)
5,690,867
(9.25 %)
76,432
(1.35 %)
30,764
(0.70 %)
408 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3
51,681
(3.25 %)
n/a 15,203
(1.04 %)
22,272
(1.67 %)
46,230
(2.32 %)
44.19
(91.88 %)
183,751
(8.14 %)
183,744
(8.14 %)
262,326
(91.86 %)
2,767,141
(30.92 %)
316,971
(0.98 %)
11,856,824
(28.95 %)
6,315
(0.16 %)
313,471
(1.46 %)
104,231
(1.84 %)
32,424
(0.69 %)
409 western painted turtle (v304 RCT428 2020)
GCF_000241765.4
64,798
(3.75 %)
n/a 15,669
(1.09 %)
21,663
(1.64 %)
n/a 44.19
(87.54 %)
184,311
(12.48 %)
184,311
(12.48 %)
260,698
(87.52 %)
3,780,252
(41.81 %)
316,422
(0.93 %)
11,852,305
(27.59 %)
6,323
(0.15 %)
313,495
(1.39 %)
103,899
(1.75 %)
33,034
(0.70 %)
410 western predatory mite (v1.0 2012)
GCF_000255335.1
12,199
(13.86 %)
n/a 2,842
(1.49 %)
27,198
(19.18 %)
n/a 51.58
(99.74 %)
1,782
(0.26 %)
1,901
(0.26 %)
3,993
(99.74 %)
33,136
(1.10 %)
13,115
(0.57 %)
612,854
(9.73 %)
4
(0.00 %)
11,929
(0.89 %)
2,003
(54.71 %)
1,569
(0.97 %)
411 western wild mouse (SPRET_EiJ v1 2016)
GCA_001624865.1
n/a n/a 21,211
(2.19 %)
17,797
(1.36 %)
100,839
(4.01 %)
41.65
(89.10 %)
23,451
(1.23 %)
334,091
(10.95 %)
29,259
(98.77 %)
5,087,807
(40.60 %)
1,402,357
(3.14 %)
13,522,663
(27.99 %)
17,567
(1.08 %)
457,523
(2.25 %)
16,888
(0.42 %)
15,748
(0.39 %)
412 wheat stem sawfly (v1 2014)
GCF_000341935.1
37,175
(25.01 %)
n/a 4,407
(2.81 %)
15,504
(11.96 %)
n/a 40.34
(98.12 %)
8,731
(1.89 %)
8,733
(1.89 %)
10,707
(98.11 %)
87,084
(2.38 %)
44,673
(2.55 %)
1,001,343
(22.18 %)
41
(0.03 %)
19,750
(1.66 %)
7,519
(2.78 %)
7,623
(2.13 %)
413 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1
59,982
(41.87 %)
n/a 18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
0
(0 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
2
(0.00 %)
1,117,804
(3.60 %)
68,551
(3.58 %)
41,698
(1.09 %)
414 white-footed mouse
GCF_004664715.1
46,167
(2.56 %)
n/a 20,406
(1.72 %)
20,857
(1.46 %)
39,081
(1.88 %)
42.23
(100.00 %)
0
(0 %)
79
(0.00 %)
1,763
(100.00 %)
5,064,597
(30.73 %)
1,258,088
(2.85 %)
14,005,845
(33.01 %)
0
(0 %)
551,791
(1.47 %)
23,475
(0.69 %)
19,781
(0.50 %)
415 white leghorn X broiler chicken (leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1
55,865
(8.86 %)
n/a 12,310
(2.41 %)
22,056
(2.57 %)
n/a 42.20
(99.65 %)
254
(0.35 %)
254
(0.35 %)
509
(99.65 %)
604,452
(10.76 %)
232,416
(2.03 %)
5,541,059
(20.23 %)
2
(0.00 %)
203,559
(1.88 %)
22,185
(2.62 %)
19,239
(1.58 %)
416 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1
57,774
(39.81 %)
n/a 20,653
(1.75 %)
23,083
(1.50 %)
40,950
(1.94 %)
41.55
(99.10 %)
31,627
(0.90 %)
107,030
(0.91 %)
48,652
(99.10 %)
4,799,958
(41.28 %)
413,128
(2.59 %)
13,296,686
(34.22 %)
7,681
(0.08 %)
439,019
(2.88 %)
44,165
(1.19 %)
41,200
(1.10 %)
417 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1
n/a n/a 21,754
(1.86 %)
21,668
(1.22 %)
n/a 40.77
(99.67 %)
48,495
(0.33 %)
48,495
(0.33 %)
88,439
(99.67 %)
5,195,965
(48.83 %)
825,714
(3.60 %)
15,372,168
(38.05 %)
5,083
(0.10 %)
1,223,766
(2.72 %)
34,994
(0.85 %)
26,156
(0.69 %)
418 white-tufted-ear marmoset (v1.0 paternal 2020)
GCA_011100535.1
n/a n/a 20,939
(1.94 %)
20,416
(1.31 %)
n/a 41.04
(99.58 %)
0
(0 %)
788
(0.42 %)
336
(100.00 %)
4,869,007
(49.39 %)
746,577
(2.68 %)
14,347,286
(37.59 %)
0
(0 %)
1,026,338
(2.34 %)
35,222
(0.94 %)
25,795
(0.75 %)
419 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank)
GCA_011100555.2
n/a n/a 21,801
(1.88 %)
21,501
(1.28 %)
n/a 40.92
(99.52 %)
0
(0 %)
1,165
(0.48 %)
1,234
(100.00 %)
5,036,594
(47.71 %)
842,846
(3.25 %)
15,161,577
(38.08 %)
2
(0.00 %)
1,256,016
(2.62 %)
37,603
(0.93 %)
34,471
(0.83 %)
420 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1
58,109
(2.92 %)
n/a 21,699
(1.91 %)
20,910
(1.24 %)
n/a 40.85
(94.45 %)
187,214
(5.57 %)
187,214
(5.57 %)
201,523
(94.43 %)
5,120,629
(48.95 %)
768,432
(2.30 %)
15,303,718
(34.75 %)
1,516
(0.02 %)
933,431
(2.31 %)
35,805
(0.79 %)
27,299
(0.64 %)
421 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1
n/a n/a 21,729
(1.89 %)
21,502
(1.30 %)
n/a 40.85
(98.70 %)
370
(1.30 %)
370
(1.30 %)
1,360
(98.70 %)
5,122,418
(49.40 %)
818,502
(3.68 %)
15,232,829
(38.20 %)
0
(0 %)
1,395,363
(2.77 %)
36,656
(0.90 %)
26,567
(0.71 %)
422 whooping crane (maternal hap 2023 genbank)
GCA_028858705.1
55,408
(53.40 %)
n/a 13,572
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
0
(0 %)
262
(0.37 %)
929
(100.00 %)
616,295
(10.57 %)
211,557
(2.90 %)
6,785,134
(22.11 %)
0
(0 %)
n/a 42,795
(4.66 %)
39,036
(2.34 %)
423 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2
n/a 20,251
(1.34 %)
18,785
(1.94 %)
17,252
(1.62 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
55,538
(1.18 %)
60,971
(1.18 %)
68,871
(98.82 %)
3,098,525
(34.75 %)
353,630
(1.23 %)
12,349,553
(25.12 %)
11
(0.00 %)
101,843
(0.63 %)
45,436
(1.02 %)
40,638
(0.87 %)
424 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019)
GCF_002162155.1
131,302
(1.34 %)
n/a 33,079
(0.33 %)
567,762
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
0
(0 %)
344,768
(3.31 %)
148,396
(100.00 %)
2,762,705
(2.81 %)
2,991,142
(3.37 %)
493,164
(96.69 %)
210
(0.02 %)
12,513,149
(13.71 %)
2,220,897
(25.33 %)
2,138,478
(24.00 %)
425 wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017)
GCF_000817695.2
69,091
(6.81 %)
n/a 16,823
(1.67 %)
75,740
(11.45 %)
n/a 35.81
(86.74 %)
1,682
(1.55 %)
133,967
(13.30 %)
3,189
(98.45 %)
588,761
(3.39 %)
493,855
(3.35 %)
5,206,772
(45.36 %)
66
(0.02 %)
710,693
(6.46 %)
48,008
(1.88 %)
21,883
(0.84 %)
426 wild strawberry (2011 genbank)
GCA_000184155.1
n/a n/a 14,001
(6.64 %)
34,562
(26.90 %)
n/a 38.40
(94.26 %)
13,412
(5.76 %)
16,253
(5.76 %)
16,459
(94.24 %)
152,427
(20.00 %)
74,539
(2.79 %)
1,032,592
(21.43 %)
25
(0.01 %)
71,241
(3.11 %)
14,802
(3.20 %)
9,026
(1.93 %)
427 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1
50,529
(5.75 %)
n/a 12,950
(1.89 %)
19,252
(2.57 %)
24,522
(2.44 %)
42.30
(100.00 %)
0
(0 %)
102
(0.00 %)
3,744
(100.00 %)
500,823
(7.17 %)
300,638
(2.31 %)
6,414,267
(20.54 %)
0
(0 %)
235,724
(1.54 %)
28,268
(2.21 %)
22,544
(1.15 %)
428 woodchuck (CNAG 2019)
GCA_901343595.1
n/a 424,165
(27.27 %)
20,813
(1.60 %)
23,199
(1.43 %)
45,153
(1.99 %)
40.00
(97.18 %)
57,045
(2.82 %)
57,045
(2.82 %)
105,556
(97.18 %)
4,756,333
(33.73 %)
836,503
(2.41 %)
14,755,960
(31.13 %)
505
(0.04 %)
358,587
(3.15 %)
34,151
(0.87 %)
32,950
(0.82 %)
429 woodchuck (v1.0 LI92 2021)
GCF_021218885.1
62,044
(2.80 %)
n/a 19,783
(1.48 %)
21,060
(1.38 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
46
(0.00 %)
46
(0.00 %)
3,381
(100.00 %)
3,884,968
(28.12 %)
912,591
(2.73 %)
14,538,767
(35.15 %)
0
(0 %)
413,043
(1.33 %)
36,919
(1.02 %)
26,677
(0.60 %)
430 Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq)
GCF_003031525.1
43,312
(2.49 %)
n/a 18,639
(1.72 %)
19,645
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
52,647
(0.72 %)
66,346
(99.28 %)
n/a 540,765
(1.65 %)
12,691,760
(32.87 %)
427
(0.03 %)
363,613
(1.97 %)
59,052
(1.48 %)
39,130
(1.07 %)
431 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1
27,063
(35.76 %)
n/a 19,219
(1.73 %)
27,456
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
124,797
(1.33 %)
155,509
(98.67 %)
4,277,556
(44.10 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,034
(35.19 %)
292
(0.02 %)
514,863
(2.00 %)
67,035
(1.82 %)
48,666
(1.49 %)
432 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1
27,063
(1.65 %)
n/a 19,227
(1.75 %)
27,468
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
124,797
(1.33 %)
155,510
(98.67 %)
4,193,317
(43.38 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,097
(35.19 %)
292
(0.02 %)
514,863
(2.00 %)
67,035
(1.82 %)
49,158
(1.49 %)
433 Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank)
GCA_003031525.1
43,299
(41.33 %)
n/a 18,726
(1.80 %)
19,644
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
52,647
(0.72 %)
66,345
(99.28 %)
3,990,044
(42.54 %)
540,765
(1.65 %)
12,691,683
(32.88 %)
427
(0.03 %)
363,612
(1.97 %)
59,052
(1.48 %)
42,519
(1.18 %)
434 yellow-bellied marmot (v1 2018)
GCF_003676075.1
41,573
(2.14 %)
n/a 19,845
(1.63 %)
21,262
(1.39 %)
n/a 39.88
(97.82 %)
38,354
(2.18 %)
38,354
(2.18 %)
69,503
(97.82 %)
4,683,625
(34.38 %)
799,659
(1.95 %)
14,322,765
(32.58 %)
2,342
(0.05 %)
209,445
(0.69 %)
34,127
(0.91 %)
32,957
(0.85 %)
435 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019)
GCF_003676075.2
42,715
(2.16 %)
n/a 19,894
(1.62 %)
21,366
(1.40 %)
43,878
(1.99 %)
39.89
(97.96 %)
34,765
(2.04 %)
35,595
(2.04 %)
66,624
(97.96 %)
4,646,957
(34.05 %)
800,897
(1.96 %)
14,340,028
(32.63 %)
1,270
(0.04 %)
210,697
(0.69 %)
34,125
(0.91 %)
32,958
(0.85 %)
436 yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCA_016432865.1
n/a n/a 15,703
(0.78 %)
16,184
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
0
(0 %)
620
(0.01 %)
487
(100.00 %)
5,424,579
(25.40 %)
1,269,774
(2.59 %)
21,430,550
(42.69 %)
2
(0.00 %)
714,621
(2.20 %)
28,121
(0.66 %)
28,159
(0.56 %)
437 yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI)
GCF_000699245.1
15,990
(2.25 %)
n/a 11,775
(1.55 %)
23,935
(1.90 %)
n/a 41.36
(99.67 %)
48,553
(0.34 %)
48,553
(0.34 %)
107,160
(99.66 %)
384,032
(4.45 %)
182,309
(1.03 %)
6,529,534
(19.24 %)
1
(0.00 %)
41,594
(0.34 %)
15,660
(0.55 %)
12,721
(0.42 %)
438 yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.1
41,168
(9.96 %)
n/a 15,861
(2.76 %)
30,671
(6.00 %)
n/a 40.75
(97.79 %)
0
(0 %)
33,664
(2.20 %)
99,598
(100.00 %)
614,513
(4.16 %)
522,349
(4.83 %)
4,650,538
(24.98 %)
309
(0.03 %)
357,703
(3.09 %)
18,054
(0.96 %)
12,855
(0.67 %)
439 zebra finch (Black17 v1 2019 genbank)
GCA_003957565.2
n/a n/a 13,212
(2.02 %)
25,117
(2.57 %)
38,655
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
0
(0 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
1
(0.00 %)
381,676
(2.04 %)
30,053
(2.58 %)
22,898
(1.24 %)
440 zebra finch (Black17 v1 2019 refseq)
GCF_003957565.1
51,472
(7.16 %)
n/a 13,211
(2.02 %)
17,812
(2.70 %)
38,655
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
0
(0 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
1
(0.00 %)
381,676
(2.04 %)
30,053
(2.58 %)
22,898
(1.24 %)
441 zebra shark (hap1 2023 genbank)
GCA_030684315.1
n/a n/a 12,291
(0.48 %)
16,769
(1.14 %)
n/a 43.41
(99.47 %)
0
(0 %)
1,159
(0.53 %)
835
(100.00 %)
8,087,543
(64.92 %)
798,373
(9.17 %)
14,838,773
(42.39 %)
4
(0.00 %)
2,946,268
(5.37 %)
45,284
(1.67 %)
14,105
(0.37 %)
442 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2
n/a n/a 18,599
(1.58 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
253,738
(7.41 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,769
(92.59 %)
5,118,783
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,620
(36.60 %)
476
(0.01 %)
998,817
(3.00 %)
35,241
(0.84 %)
32,220
(0.75 %)
443 zig-zag eel (v1.1 2018)
GCF_900324485.1
44,813
(12.05 %)
n/a 15,028
(3.35 %)
21,782
(6.89 %)
36,982
(11.22 %)
40.66
(97.63 %)
0
(0 %)
235
(2.37 %)
126
(100.00 %)
348,517
(2.87 %)
157,776
(2.00 %)
3,182,742
(23.42 %)
0
(0 %)
175,932
(3.08 %)
12,824
(1.08 %)
8,713
(0.67 %)
TOTALS:total assembly count 443

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 215 assemblies assembly stats track stats
Mammals 538 assemblies assembly stats track stats
Birds 356 assemblies assembly stats track stats
Fishes 391 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 222 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 717 assemblies assembly stats track stats
Plants 299 assemblies assembly stats track stats
Fungi 662 assemblies assembly stats track stats
Viruses 281 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 103 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 442 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 882 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats