Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1
n/a n/a 22,095
(0.63 %)
44,942
(0.68 %)
n/a 40.25
(99.86 %)
15,429
(0.03 %)
15,429
(0.03 %)
2,690,873
(99.97 %)
8,755,250
(34.47 %)
869,360
(1.26 %)
22,002,517
(59.65 %)
146
(0.00 %)
n/a 39,239
(0.49 %)
27,849
(0.37 %)
2 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024 genbank)
GCA_043250625.1
n/a n/a 15,735
(2.44 %)
50,184
(6.16 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
0
(0 %)
471
(0.01 %)
203
(100.00 %)
1,781,283
(37.65 %)
444,047
(7.93 %)
4,765,080
(37.01 %)
6
(0.00 %)
706,869
(5.97 %)
39,918
(2.01 %)
18,319
(0.92 %)
3 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank)
GCA_027172205.1
57,514
(54.61 %)
n/a 14,340
(1.37 %)
20,053
(2.31 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
0
(0 %)
30
(0.00 %)
27
(100.00 %)
832,937
(4.17 %)
474,203
(4.04 %)
7,020,288
(38.29 %)
2
(0.00 %)
631,733
(3.50 %)
94,745
(2.70 %)
19,879
(0.76 %)
4 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1
61,159
(3.82 %)
n/a 23,424
(1.78 %)
27,990
(2.23 %)
n/a 38.98
(88.63 %)
216,028
(11.39 %)
216,028
(11.39 %)
324,061
(88.61 %)
1,726,079
(12.81 %)
680,428
(2.28 %)
13,887,586
(35.94 %)
2,660
(0.08 %)
n/a 85,680
(0.94 %)
12,234
(0.16 %)
5 African grass rat (v1 paternal X 2020 genbank)
GCA_011762505.1
45,963
(36.56 %)
n/a 20,933
(2.00 %)
19,613
(1.43 %)
37,929
(2.32 %)
41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,940,083
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
2
(0.00 %)
1,027,357
(2.09 %)
17,767
(0.51 %)
16,848
(0.46 %)
6 African malaria mosquito (PEST 2006)
GCA_000005575.1
n/a 14,608
(8.95 %)
5,478
(2.34 %)
30,482
(13.88 %)
n/a 44.27
(95.26 %)
55
(0.21 %)
8,735
(4.75 %)
8,115
(99.79 %)
241,805
(14.48 %)
72,702
(2.39 %)
1,434,880
(21.28 %)
6
(0.01 %)
77,560
(3.59 %)
25,507
(8.25 %)
24,151
(5.88 %)
7 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1
46,043
(34.84 %)
n/a 19,181
(1.25 %)
19,665
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,337,637
(57.82 %)
365,796
(0.88 %)
16,073,052
(44.89 %)
11
(0.00 %)
417,291
(1.06 %)
33,513
(0.68 %)
24,486
(0.51 %)
8 alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018)
GCF_003710045.1
27,736
(10.71 %)
n/a 4,020
(1.34 %)
42,185
(10.12 %)
n/a 40.41
(94.37 %)
0
(0 %)
14,031
(5.59 %)
95,883
(100.00 %)
112,828
(2.21 %)
95,886
(3.63 %)
2,006,114
(27.47 %)
1
(0.00 %)
49,074
(1.16 %)
23,832
(3.81 %)
20,331
(3.23 %)
9 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1
n/a n/a 18,513
(1.97 %)
19,112
(1.70 %)
31,905
(1.94 %)
41.46
(99.38 %)
23,458
(0.62 %)
23,458
(0.62 %)
75,733
(99.38 %)
3,095,742
(36.41 %)
314,508
(1.07 %)
12,365,152
(25.46 %)
83
(0.00 %)
120,145
(0.60 %)
53,956
(1.50 %)
49,211
(1.30 %)
10 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3
55,001
(3.56 %)
n/a 18,437
(1.94 %)
18,446
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
0
(0 %)
166,280
(4.17 %)
77,390
(100.00 %)
3,150,224
(36.21 %)
315,108
(1.36 %)
12,461,739
(24.88 %)
1,213
(0.03 %)
207,655
(1.22 %)
54,502
(1.38 %)
49,324
(1.18 %)
11 Alpine marmot (2015)
GCF_001458135.1
35,350
(2.23 %)
n/a 20,139
(1.58 %)
18,286
(1.41 %)
n/a 39.80
(96.07 %)
0
(0 %)
89,362
(3.94 %)
14,543
(100.00 %)
n/a 747,129
(1.83 %)
14,077,162
(30.27 %)
494
(0.01 %)
202,989
(0.77 %)
30,224
(0.63 %)
24,261
(0.48 %)
12 American alligator (2023 genbank)
GCA_030867065.1
n/a n/a 14,487
(0.97 %)
20,444
(1.61 %)
n/a 45.04
(99.81 %)
136
(0.19 %)
136
(0.19 %)
806
(99.81 %)
3,380,365
(43.12 %)
560,127
(2.00 %)
12,524,244
(32.47 %)
1
(0.00 %)
370,300
(1.41 %)
50,852
(2.67 %)
30,117
(1.71 %)
13 American alligator (chrom assembly 2023 genbank)
GCA_030867095.1
60,799
(51.66 %)
n/a 14,382
(0.98 %)
18,601
(1.45 %)
n/a 45.01
(99.30 %)
0
(0 %)
161
(0.70 %)
194
(100.00 %)
3,322,619
(43.19 %)
478,206
(1.77 %)
12,316,391
(32.01 %)
0
(0 %)
334,854
(1.31 %)
49,792
(2.45 %)
29,504
(1.51 %)
14 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1
n/a n/a 22,515
(1.25 %)
34,527
(1.17 %)
n/a 39.58
(99.92 %)
5,769
(0.02 %)
5,769
(0.02 %)
837,916
(99.98 %)
5,101,904
(34.46 %)
552,100
(1.02 %)
15,150,706
(34.57 %)
36
(0.00 %)
n/a 24,558
(0.63 %)
21,525
(0.51 %)
15 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1
38,686
(33.79 %)
n/a 20,215
(1.44 %)
20,845
(1.20 %)
n/a 41.99
(93.39 %)
341,984
(6.63 %)
341,984
(6.63 %)
792,165
(93.37 %)
6,006,931
(47.67 %)
495,106
(1.11 %)
13,902,115
(39.01 %)
8,184
(0.08 %)
978,698
(2.61 %)
90,767
(1.29 %)
43,651
(0.72 %)
16 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1
26,240
(36.96 %)
n/a 17,569
(1.60 %)
20,092
(1.69 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
122,542
(12.82 %)
132,961
(87.18 %)
2,829,934
(29.80 %)
414,895
(1.07 %)
10,968,663
(26.71 %)
1,958
(0.04 %)
269,478
(1.11 %)
44,651
(1.14 %)
26,757
(0.80 %)
17 amphioxus (hap2 2024 genbank)
GCA_035083965.1
n/a n/a 5,217
(0.97 %)
41,736
(12.73 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
0
(0 %)
103
(0.00 %)
34
(100.00 %)
128,505
(1.65 %)
182,123
(8.03 %)
2,157,899
(27.45 %)
0
(0 %)
274,077
(4.65 %)
44,261
(5.21 %)
29,041
(2.94 %)
18 amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016)
GCF_000764305.1
24,008
(8.48 %)
n/a 3,331
(0.47 %)
38,201
(8.97 %)
24,453
(8.50 %)
38.47
(99.52 %)
5,426
(0.48 %)
23,726
(0.48 %)
23,426
(99.52 %)
161,274
(1.72 %)
432,436
(8.89 %)
3,517,080
(28.92 %)
149
(0.01 %)
409,772
(5.41 %)
50,987
(4.44 %)
35,313
(2.58 %)
19 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1
33,668
(37.51 %)
n/a 18,213
(1.58 %)
15,093
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
155,553
(2.44 %)
157,031
(97.56 %)
4,832,679
(42.49 %)
831,134
(1.67 %)
13,654,373
(31.78 %)
59
(0.00 %)
289,887
(0.97 %)
65,229
(1.60 %)
55,104
(1.18 %)
20 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2
n/a n/a 12,258
(1.95 %)
20,580
(2.26 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
0
(0 %)
429
(1.52 %)
160
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,056
(1.51 %)
6,092,351
(20.84 %)
0
(0 %)
152,105
(1.27 %)
17,130
(1.48 %)
15,125
(1.04 %)
21 ant C.costatus (v1 MS0001 2016)
GCF_001594065.1
16,082
(8.44 %)
n/a 4,038
(1.42 %)
32,856
(9.80 %)
n/a 34.73
(95.75 %)
10,626
(4.26 %)
10,626
(4.26 %)
26,005
(95.74 %)
203,498
(3.41 %)
100,483
(2.15 %)
2,221,362
(35.19 %)
127
(0.11 %)
43,690
(1.77 %)
18,108
(3.49 %)
18,662
(3.08 %)
22 ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019)
GCF_005281655.1
28,261
(10.34 %)
n/a 4,915
(1.27 %)
40,257
(10.17 %)
n/a 35.18
(99.51 %)
0
(0 %)
1,076
(0.49 %)
2,869
(100.00 %)
322,753
(4.92 %)
245,412
(6.65 %)
1,952,946
(43.11 %)
0
(0 %)
252,395
(6.75 %)
17,048
(6.08 %)
17,349
(3.45 %)
23 ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI)
GCF_001594075.1
22,023
(8.25 %)
n/a 4,211
(1.25 %)
37,113
(9.30 %)
n/a 35.01
(91.82 %)
40,822
(8.21 %)
40,822
(8.21 %)
60,583
(91.79 %)
218,162
(3.24 %)
139,385
(2.26 %)
2,347,922
(34.62 %)
136
(0.08 %)
54,250
(1.47 %)
23,814
(3.66 %)
21,810
(2.96 %)
24 apicomplexans C.sp. chipmunk genotype I (37763 2021 genbank)
GCA_004936735.2
n/a 3,783
(76.65 %)
426
(3.03 %)
203
(12.39 %)
n/a 32.03
(100.00 %)
0
(0 %)
10
(0.00 %)
50
(100.00 %)
3,358
(1.88 %)
1,257
(0.81 %)
67,711
(20.74 %)
1
(0.00 %)
458
(0.29 %)
4
(0.02 %)
3
(0.01 %)
25 apicomplexans E.tenella (Houghton 2013)
GCA_000499545.1
n/a 38,608
(25.51 %)
326
(0.37 %)
1,632
(4.94 %)
n/a 51.33
(98.72 %)
8,063
(1.32 %)
8,063
(1.32 %)
12,727
(98.68 %)
127,265
(17.42 %)
148,397
(16.77 %)
326,694
(37.33 %)
20
(0.03 %)
37,723
(6.57 %)
12,417
(22.22 %)
4,790
(5.71 %)
26 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank)
GCA_002114115.1
n/a n/a 22,542
(3.52 %)
67,060
(16.20 %)
n/a 38.04
(88.95 %)
0
(0 %)
7,175
(11.05 %)
806
(100.00 %)
692,611
(50.80 %)
322,540
(4.42 %)
3,033,193
(35.58 %)
2
(0.00 %)
451,430
(6.86 %)
25,871
(1.75 %)
13,877
(0.88 %)
27 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1
n/a n/a 18,452
(1.96 %)
16,975
(1.61 %)
n/a 41.29
(98.88 %)
72,775
(1.13 %)
72,775
(1.13 %)
105,347
(98.87 %)
3,079,920
(34.79 %)
319,928
(0.96 %)
12,281,845
(25.28 %)
43
(0.00 %)
88,463
(0.39 %)
48,638
(1.17 %)
44,009
(1.01 %)
28 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1
n/a n/a 22,910
(1.42 %)
31,985
(1.20 %)
35,342
(1.47 %)
41.93
(99.87 %)
9,604
(0.04 %)
9,604
(0.04 %)
1,272,949
(99.96 %)
6,096,013
(44.89 %)
1,265,350
(2.67 %)
14,617,986
(39.29 %)
19
(0.00 %)
594,304
(1.21 %)
64,716
(1.93 %)
61,195
(1.72 %)
29 ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006)
GCF_000149645.2
10,388
(48.16 %)
n/a 1,538
(3.76 %)
6,155
(25.19 %)
n/a 49.56
(99.97 %)
90
(0.03 %)
90
(0.03 %)
466
(99.97 %)
5,026
(0.77 %)
2,256
(0.38 %)
68,790
(5.94 %)
0
(0 %)
710
(0.23 %)
2,846
(42.44 %)
3,973
(22.95 %)
30 ascomycetes A.nidulans (FGSC A4 2012 genbank)
GCA_000149205.2
n/a 35,369
(50.73 %)
1,524
(3.90 %)
5,275
(23.90 %)
n/a 50.30
(99.43 %)
158
(0.58 %)
158
(0.58 %)
249
(99.42 %)
5,218
(3.22 %)
2,452
(0.41 %)
51,693
(4.64 %)
1
(0.00 %)
625
(0.60 %)
1,128
(90.37 %)
1,810
(9.92 %)
31 ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007)
GCF_000002855.3
10,609
(51.05 %)
n/a 1,481
(3.36 %)
5,692
(22.11 %)
n/a 50.35
(99.87 %)
449
(0.13 %)
662
(0.13 %)
469
(99.87 %)
9,986
(1.32 %)
2,619
(0.36 %)
106,480
(7.71 %)
1
(0.00 %)
262
(0.07 %)
5,568
(53.86 %)
6,938
(24.44 %)
32 ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019)
GCF_004011695.1
11,257
(41.02 %)
n/a 1,596
(2.91 %)
8,283
(26.43 %)
n/a 49.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 34
(100.00 %)
14,775
(2.01 %)
16,031
(2.34 %)
103,256
(17.19 %)
0
(0 %)
7,380
(1.61 %)
805
(44.28 %)
832
(32.41 %)
33 ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank)
GCA_000003525.2
n/a 11,865
(30.24 %)
1,516
(1.76 %)
5,714
(11.07 %)
n/a 37.07
(99.50 %)
566
(0.51 %)
566
(0.51 %)
593
(99.49 %)
38,696
(2.74 %)
27,571
(2.05 %)
270,617
(48.64 %)
2
(0.00 %)
31,958
(3.92 %)
8,002
(10.69 %)
7,438
(8.47 %)
34 ascomycetes B.gilchristii (SLH14081 2009 genbank)
GCA_000003855.2
n/a 11,799
(26.55 %)
1,518
(1.57 %)
5,702
(9.73 %)
n/a 35.75
(98.67 %)
1,691
(1.34 %)
1,691
(1.34 %)
1,794
(98.66 %)
42,930
(2.67 %)
27,826
(1.78 %)
328,698
(50.87 %)
0
(0 %)
32,248
(3.50 %)
7,943
(9.35 %)
7,488
(7.50 %)
35 ascomycetes C.posadasii (C735 delta SOWgp 2009 genban)
GCA_000151335.1
n/a 7,255
(49.92 %)
1,479
(4.26 %)
5,283
(25.22 %)
n/a 46.59
(100.00 %)
33
(0.00 %)
33
(0.00 %)
88
(100.00 %)
10,463
(5.97 %)
5,206
(0.91 %)
74,027
(11.89 %)
0
(0 %)
3,254
(0.84 %)
4,784
(34.49 %)
4,865
(16.04 %)
36 ascomycetes F.oxysporum (NRRL 32931 2014 genbank)
GCA_000271745.2
n/a 24,097
(64.91 %)
1,503
(2.37 %)
11,741
(30.20 %)
n/a 47.63
(98.55 %)
377
(1.46 %)
377
(1.46 %)
545
(98.54 %)
8,453
(2.23 %)
3,560
(0.37 %)
129,150
(7.65 %)
11
(0.00 %)
1,096
(0.18 %)
14,398
(29.11 %)
11,860
(16.53 %)
37 ascomycetes P.destructans (20631-21 2010 genbank)
GCA_000184105.1
n/a 9,303
(55.05 %)
1,446
(3.95 %)
5,635
(25.84 %)
n/a 50.12
(92.42 %)
1,732
(7.59 %)
2,066
(7.59 %)
3,579
(92.41 %)
11,499
(5.71 %)
11,754
(2.10 %)
87,648
(13.51 %)
22
(0.03 %)
2,836
(0.73 %)
4,483
(54.70 %)
4,759
(18.94 %)
38 ascomycetes P.digitatum (Pd1 2012 genbank)
GCA_000315645.2
n/a 8,963
(49.28 %)
1,461
(4.51 %)
5,599
(29.85 %)
n/a 48.91
(95.53 %)
508
(4.48 %)
516
(4.48 %)
562
(95.52 %)
3,575
(0.59 %)
2,210
(0.38 %)
66,810
(6.03 %)
8
(0.02 %)
344
(0.13 %)
7,344
(38.10 %)
6,767
(25.05 %)
39 ascomycetes P.pennisetigena (Br36 2019 genbank)
GCA_004337985.1
n/a 11,430
(33.47 %)
1,482
(2.32 %)
7,302
(20.85 %)
n/a 47.48
(99.41 %)
0
(0 %)
1,281
(0.60 %)
108
(100.00 %)
24,268
(1.88 %)
11,049
(1.23 %)
163,225
(20.20 %)
5
(0.01 %)
7,142
(1.57 %)
764
(17.56 %)
1,559
(15.28 %)
40 ascomycetes P.rubens (Wisconsin 54-1255 2008 genbank)
GCA_000226395.1
n/a 13,922
(56.71 %)
1,550
(3.72 %)
7,756
(30.06 %)
n/a 48.96
(99.94 %)
0
(0 %)
775
(0.06 %)
49
(100.00 %)
5,678
(0.78 %)
4,560
(0.81 %)
73,645
(5.86 %)
1
(0.01 %)
1,650
(0.43 %)
7,807
(50.55 %)
7,905
(32.71 %)
41 ascomycetes R.enersibuu (CBS 393.64 2015 genbank)
GCA_000968595.1
n/a 9,843
(50.65 %)
1,499
(4.04 %)
3,608
(17.47 %)
n/a 50.55
(99.99 %)
76
(0.00 %)
76
(0.00 %)
938
(100.00 %)
12,877
(1.80 %)
4,459
(0.56 %)
116,737
(10.53 %)
0
(0 %)
117
(0.03 %)
2,561
(81.62 %)
2,992
(17.71 %)
42 ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012)
GCF_000182805.2
9,903
(39.44 %)
n/a 1,311
(2.58 %)
4,612
(17.66 %)
n/a 52.11
(99.64 %)
0
(0 %)
978
(0.36 %)
1,583
(100.00 %)
16,540
(1.85 %)
7,316
(0.76 %)
171,684
(11.10 %)
0
(0 %)
371
(0.08 %)
1,770
(49.40 %)
6,766
(16.80 %)
43 ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank)
GCA_000961545.1
10,279
(51.22 %)
10,434
(48.46 %)
1,134
(2.55 %)
2,026
(10.60 %)
n/a 54.96
(100.00 %)
57
(0.00 %)
57
(0.00 %)
73
(100.00 %)
15,846
(2.28 %)
8,000
(0.94 %)
169,678
(13.75 %)
0
(0 %)
339
(0.06 %)
22
(99.61 %)
22
(0.11 %)
44 ascomycetes T.marneffei (ATCC 18224 2008 genbank)
GCA_000001985.1
n/a 10,749
(60.97 %)
1,532
(4.18 %)
7,679
(34.14 %)
n/a 46.67
(99.38 %)
137
(0.62 %)
137
(0.62 %)
589
(99.38 %)
6,404
(1.04 %)
2,594
(0.58 %)
61,594
(6.70 %)
0
(0 %)
951
(0.36 %)
5,746
(15.84 %)
5,169
(10.66 %)
45 ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank)
GCA_000219625.1
10,941
(44.32 %)
10,965
(38.50 %)
1,451
(2.81 %)
6,906
(25.36 %)
n/a 52.14
(99.98 %)
3
(0.02 %)
3
(0.02 %)
24
(99.98 %)
8,941
(1.69 %)
8,367
(1.51 %)
99,818
(11.14 %)
0
(0 %)
6,612
(1.57 %)
27
(96.31 %)
89
(4.28 %)
46 Asian corn borer (v1 ACB-3 2019)
GCF_004193835.1
25,266
(7.93 %)
n/a 4,931
(1.05 %)
28,608
(7.16 %)
n/a 37.50
(100.00 %)
0
(0 %)
34,722
(0.01 %)
7,722
(100.00 %)
146,974
(1.35 %)
89,987
(2.68 %)
2,666,250
(38.74 %)
899
(0.07 %)
268,435
(6.89 %)
39,696
(5.22 %)
19,418
(2.22 %)
47 Asian corn borer (v2 ACB-3 2019)
GCF_004193835.2
25,169
(7.95 %)
n/a 4,867
(1.05 %)
28,255
(7.08 %)
n/a 37.49
(100.00 %)
0
(0 %)
34,702
(0.01 %)
6,269
(100.00 %)
150,783
(1.53 %)
89,885
(2.69 %)
2,627,296
(38.56 %)
899
(0.07 %)
268,390
(6.92 %)
39,511
(5.22 %)
19,307
(2.21 %)
48 Asian swallowtail (v1 2015)
GCF_000836235.1
22,417
(13.18 %)
n/a 5,290
(2.15 %)
13,925
(7.00 %)
n/a 33.81
(97.56 %)
5,205
(2.44 %)
5,205
(2.44 %)
10,777
(97.56 %)
122,491
(2.29 %)
27,169
(0.71 %)
2,130,840
(38.92 %)
27
(0.01 %)
39,978
(1.31 %)
11,899
(2.85 %)
8,383
(1.82 %)
49 Asian tiger mosquito (C6/36 2017 genbank)
GCA_001876365.2
n/a n/a 10,893
(0.53 %)
128,502
(8.33 %)
n/a 40.42
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,434
(100.00 %)
605,350
(2.88 %)
921,761
(7.40 %)
11,169,474
(57.07 %)
0
(0 %)
1,146,944
(4.60 %)
220,674
(10.38 %)
117,106
(3.58 %)
50 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 genbank
GCA_006496715.1
n/a n/a 10,347
(0.43 %)
138,311
(7.69 %)
n/a 40.40
(99.93 %)
0
(0 %)
3,359
(0.07 %)
2,196
(100.00 %)
691,302
(2.69 %)
1,084,185
(7.47 %)
12,619,495
(57.66 %)
0
(0 %)
1,197,283
(4.46 %)
250,421
(10.15 %)
127,434
(3.51 %)
51 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 refseq)
GCF_006496715.1
49,254
(2.57 %)
n/a 10,500
(0.44 %)
138,307
(7.69 %)
n/a 40.40
(99.93 %)
0
(0 %)
3,359
(0.07 %)
2,197
(100.00 %)
6,821,491
(69.74 %)
1,084,205
(7.47 %)
12,619,646
(57.66 %)
0
(0 %)
1,197,291
(4.46 %)
250,420
(10.13 %)
139,292
(3.15 %)
52 Asiatic tapir (BS100 BIUU 2019)
GCA_004024905.1
n/a n/a 20,854
(1.73 %)
28,046
(1.39 %)
n/a 40.91
(99.96 %)
4,333
(0.02 %)
4,333
(0.02 %)
284,468
(99.98 %)
3,802,671
(39.88 %)
335,521
(0.73 %)
15,053,564
(30.25 %)
11
(0.00 %)
n/a 39,691
(1.17 %)
36,849
(1.05 %)
53 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1
48,976
(40.12 %)
n/a 18,884
(1.76 %)
19,296
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
0
(0 %)
69,593
(1.38 %)
2,166
(100.00 %)
3,855,699
(41.69 %)
289,735
(0.96 %)
14,695,257
(28.58 %)
5,680
(0.23 %)
136,343
(0.85 %)
40,025
(1.06 %)
36,402
(0.92 %)
54 Atlantic halibut (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819705.1
52,117
(66.34 %)
n/a 14,960
(3.20 %)
45,365
(7.48 %)
69,625
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
0
(0 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,421
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,979
(24.13 %)
0
(0 %)
240,110
(3.16 %)
31,325
(2.25 %)
20,749
(1.34 %)
55 Atlantic herring (v1)
GCF_900700415.1
46,216
(9.88 %)
n/a 15,249
(2.65 %)
25,664
(6.68 %)
n/a 44.24
(99.88 %)
1,963
(0.12 %)
1,963
(0.12 %)
1,990
(99.88 %)
1,175,759
(12.03 %)
1,231,613
(13.39 %)
3,511,276
(32.20 %)
2
(0.00 %)
1,037,723
(8.32 %)
33,465
(1.97 %)
20,325
(1.10 %)
56 Atlantic ridley (rLepKem1 hap2 2025 genbank)
GCA_965140265.1
n/a 25,966
(1.91 %)
14,601
(1.02 %)
17,367
(1.50 %)
n/a 44.08
(100.00 %)
245
(0.00 %)
245
(0.00 %)
332
(100.00 %)
1,335,525
(12.58 %)
314,640
(2.13 %)
10,517,469
(34.27 %)
2
(0.00 %)
609,926
(2.40 %)
45,940
(1.37 %)
24,119
(0.60 %)
57 Atlantic salmon (genbank 2021)
GCA_905237065.2
n/a n/a 28,077
(1.40 %)
120,383
(3.99 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
4,501,521
(48.00 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
0
(0 %)
4,866,269
(10.20 %)
77,089
(1.86 %)
20,127
(0.31 %)
58 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1
60,922
(45.62 %)
n/a 12,545
(0.38 %)
29,428
(1.34 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,648
(0.01 %)
2,990
(100.00 %)
8,579,105
(49.81 %)
831,224
(15.75 %)
21,718,213
(51.79 %)
9
(0.00 %)
4,445,293
(7.00 %)
105,821
(2.42 %)
35,197
(0.42 %)
59 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3
11,460
(14.87 %)
n/a 2,843
(2.29 %)
3,797
(4.95 %)
n/a 30.21
(92.98 %)
2,303
(6.97 %)
58,744
(7.04 %)
26,881
(93.03 %)
147,614
(11.55 %)
54,885
(7.91 %)
647,155
(33.62 %)
55
(0.02 %)
69,072
(5.04 %)
509
(0.15 %)
126
(0.04 %)
60 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1
52,178
(47.52 %)
n/a 18,330
(1.96 %)
17,094
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
31,980
(0.69 %)
67,434
(99.31 %)
3,072,373
(34.88 %)
306,996
(0.95 %)
12,209,895
(25.43 %)
58
(0.01 %)
73,572
(0.41 %)
49,789
(1.25 %)
45,112
(1.08 %)
61 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 genbank)
GCA_036971685.1
n/a n/a 13,319
(1.60 %)
25,993
(2.05 %)
n/a 43.83
(99.41 %)
0
(0 %)
219
(0.59 %)
453
(100.00 %)
700,173
(13.18 %)
457,546
(13.85 %)
4,523,003
(31.73 %)
2
(0.00 %)
1,089,353
(5.57 %)
42,686
(7.00 %)
31,415
(1.62 %)
62 banded archerfish (primary hap 2021 genbank)
GCA_017976425.1
42,399
(57.52 %)
n/a 15,312
(3.18 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
0
(0 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
811,892
(18.19 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
1
(0.00 %)
297,728
(3.49 %)
15,089
(0.96 %)
9,304
(0.55 %)
63 barn owl (2020)
GCF_902150015.1
37,361
(4.54 %)
n/a 12,958
(1.72 %)
22,922
(1.99 %)
26,976
(3.04 %)
41.55
(99.23 %)
0
(0 %)
177,340
(0.79 %)
21,504
(100.00 %)
585,627
(5.48 %)
367,764
(2.44 %)
7,399,161
(19.58 %)
6,614
(0.13 %)
188,767
(2.21 %)
47,061
(3.25 %)
41,356
(2.24 %)
64 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1
15,006
(2.07 %)
n/a 11,133
(1.44 %)
21,138
(1.69 %)
n/a 40.21
(99.24 %)
109,223
(0.79 %)
109,223
(0.79 %)
171,345
(99.21 %)
413,761
(3.90 %)
181,353
(0.91 %)
6,776,326
(18.43 %)
2
(0.00 %)
15,140
(0.13 %)
10,575
(0.29 %)
9,101
(0.25 %)
65 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021)
GCA_015227805.2
n/a n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,546
(2.82 %)
29,760
(1.66 %)
66 barn swallow (v2 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.1
43,374
(5.14 %)
n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,546
(2.82 %)
29,760
(1.66 %)
67 barn swallow (v3 primary hap 2021 genbank)
GCA_015227805.3
n/a n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,548
(2.85 %)
29,760
(1.66 %)
68 barramundi perch (ASB-BC8 2016)
GCF_001640805.1
50,205
(13.10 %)
n/a 16,166
(3.05 %)
25,084
(6.20 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
110
(0.00 %)
3,808
(100.00 %)
465,997
(3.11 %)
237,955
(4.36 %)
4,027,027
(23.91 %)
0
(0 %)
248,089
(3.21 %)
16,276
(1.04 %)
9,104
(0.52 %)
69 basidiomycetes A.bisporus (H97 2012)
GCF_000300575.1
10,448
(49.20 %)
n/a 1,066
(2.53 %)
5,238
(16.95 %)
n/a 46.48
(99.32 %)
225
(0.68 %)
225
(0.68 %)
254
(99.32 %)
4,921
(0.90 %)
2,352
(0.47 %)
62,603
(9.90 %)
0
(0 %)
7,487
(2.92 %)
5,244
(15.19 %)
4,407
(9.08 %)
70 basidiomycetes C.cinerea (okayama7#130 2010 genbank)
GCA_000182895.1
n/a 13,661
(52.73 %)
1,050
(2.04 %)
3,917
(10.89 %)
n/a 51.64
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
68
(100.00 %)
n/a 3,805
(0.81 %)
107,373
(7.81 %)
0
(0 %)
2,879
(1.50 %)
81
(99.54 %)
135
(0.47 %)
71 basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7841 2024 genbank)
GCA_001720195.2
n/a 6,409
(59.64 %)
921
(4.16 %)
4,119
(24.79 %)
n/a 44.80
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8
(100.00 %)
2,424
(0.66 %)
1,011
(0.30 %)
56,356
(7.99 %)
0
(0 %)
901
(0.80 %)
1,869
(7.30 %)
1,482
(5.65 %)
72 basidiomycetes C.neoformans (JEC21 2005 genbank)
GCA_000091045.1
n/a 6,999
(68.28 %)
957
(3.66 %)
3,784
(19.12 %)
n/a 48.54
(99.99 %)
85
(0.01 %)
85
(0.01 %)
99
(99.99 %)
4,944
(5.25 %)
1,808
(0.52 %)
68,717
(8.41 %)
2
(0.00 %)
1,433
(1.21 %)
5,128
(28.73 %)
3,532
(11.09 %)
73 basidiomycetes K.bestiolae (CBS 10118 2024 genbank)
GCA_000512585.3
n/a 9,175
(54.34 %)
918
(2.66 %)
4,907
(18.38 %)
n/a 47.29
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8
(100.00 %)
7,245
(1.32 %)
2,141
(0.47 %)
97,927
(9.78 %)
0
(0 %)
863
(0.56 %)
4,995
(11.17 %)
3,011
(4.94 %)
74 basidiomycetes K.bestiolae (v1 CBS 10118 2016)
GCF_000512585.1
9,187
(54.88 %)
n/a 867
(2.56 %)
4,441
(17.03 %)
n/a 47.25
(99.94 %)
30
(0.06 %)
30
(0.06 %)
42
(99.94 %)
7,231
(1.31 %)
1,919
(0.32 %)
110,288
(10.48 %)
3
(0.00 %)
63
(0.02 %)
4,972
(10.95 %)
2,807
(4.52 %)
75 basidiomycetes K.dejecticola (CBS 10117 2024 genbank)
GCA_000512565.3
n/a 8,696
(55.58 %)
910
(2.69 %)
4,861
(19.78 %)
n/a 48.39
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11
(100.00 %)
7,778
(1.42 %)
2,452
(0.43 %)
86,630
(7.97 %)
0
(0 %)
812
(0.23 %)
3,644
(14.24 %)
3,514
(7.22 %)
76 basidiomycetes K.dejecticola (v1 CBS 10117 2016)
GCF_000512565.1
8,645
(55.47 %)
n/a 908
(2.72 %)
4,862
(19.87 %)
n/a 48.38
(99.98 %)
56
(0.02 %)
56
(0.02 %)
69
(99.98 %)
7,816
(1.43 %)
2,425
(0.42 %)
85,868
(7.91 %)
14
(0.01 %)
48
(0.02 %)
3,698
(15.12 %)
3,518
(7.28 %)
77 basidiomycetes K.mangroviensis (v1 CBS 8507 2016 refseq)
GCF_000507465.1
8,471
(55.95 %)
n/a 884
(2.79 %)
5,418
(21.48 %)
n/a 44.88
(99.73 %)
43
(0.27 %)
43
(0.27 %)
105
(99.73 %)
6,509
(1.21 %)
1,529
(0.25 %)
101,733
(9.98 %)
2
(0.00 %)
24
(0.01 %)
2,326
(4.59 %)
1,405
(2.26 %)
78 basidiomycetes K.mangroviensis (v2 CBS 8507 2024 genbank)
GCA_000507465.4
n/a 8,582
(55.68 %)
886
(2.74 %)
5,392
(21.25 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4
(100.00 %)
6,585
(1.21 %)
1,546
(0.27 %)
104,495
(10.38 %)
0
(0 %)
1,321
(0.50 %)
2,335
(5.10 %)
1,396
(2.19 %)
79 basidiomycetes K.pini (v1 CBS 10737 2016)
GCF_000512605.1
7,854
(58.26 %)
n/a 816
(2.92 %)
5,392
(23.35 %)
n/a 40.23
(99.94 %)
24
(0.06 %)
24
(0.06 %)
42
(99.94 %)
6,502
(1.34 %)
1,847
(0.36 %)
99,393
(12.25 %)
3
(0.00 %)
46
(0.02 %)
1,191
(2.91 %)
956
(2.10 %)
80 basidiomycetes K.shandongensis (v1 CBS 12478 2019)
GCF_008629635.1
7,454
(55.86 %)
n/a 893
(2.94 %)
3,348
(15.13 %)
n/a 49.82
(99.99 %)
0
(0 %)
11
(0.01 %)
132
(100.00 %)
5,510
(1.13 %)
1,598
(0.33 %)
81,983
(9.00 %)
2
(0.00 %)
105
(0.05 %)
512
(39.06 %)
1,900
(4.96 %)
81 basidiomycetes M.globosa (v1 CBS 7966 2007)
GCF_000181695.1
4,286
(69.39 %)
n/a 1,060
(8.79 %)
2,585
(44.95 %)
n/a 52.06
(100.00 %)
22
(0.00 %)
22
(0.00 %)
89
(100.00 %)
1,777
(0.93 %)
720
(0.48 %)
22,182
(4.73 %)
0
(0 %)
252
(0.26 %)
124
(60.74 %)
105
(31.95 %)
82 basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010)
GCF_000143185.1
13,192
(49.72 %)
n/a 894
(1.60 %)
973
(2.80 %)
n/a 57.50
(98.57 %)
316
(1.43 %)
316
(1.43 %)
352
(98.57 %)
7,478
(4.11 %)
7,640
(1.13 %)
176,404
(11.51 %)
1
(0.00 %)
5,378
(1.90 %)
38
(40.33 %)
55
(0.23 %)
83 bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016)
GCF_001652005.1
25,020
(17.94 %)
n/a 4,205
(2.34 %)
27,352
(12.83 %)
n/a 41.09
(91.93 %)
0
(0 %)
19,248
(8.05 %)
50,565
(100.00 %)
57,833
(1.39 %)
27,440
(2.49 %)
1,173,760
(18.39 %)
416
(0.39 %)
14,577
(3.60 %)
10,942
(2.61 %)
10,587
(2.22 %)
84 bee E.mexicana (v1 0111107269 2016)
GCF_001483705.1
16,406
(4.01 %)
n/a 4,087
(0.75 %)
46,846
(6.53 %)
16,764
(4.04 %)
40.92
(95.72 %)
25,039
(4.23 %)
25,039
(4.23 %)
212,650
(95.77 %)
641,987
(7.51 %)
360,406
(11.43 %)
3,411,951
(46.01 %)
306
(0.12 %)
259,979
(5.86 %)
40,540
(3.99 %)
18,218
(1.75 %)
85 beet (2015)
GCF_000511025.2
37,803
(8.76 %)
n/a 12,044
(2.14 %)
63,283
(17.52 %)
n/a 36.14
(91.40 %)
30,962
(8.61 %)
30,962
(8.61 %)
71,208
(91.39 %)
288,084
(4.25 %)
299,650
(4.72 %)
3,021,571
(30.10 %)
1,360
(0.22 %)
218,658
(4.15 %)
32,547
(2.39 %)
20,111
(1.55 %)
86 Bellinger river turtle (v1 BRST_UC0152H_USYD 2024)
GCA_040894355.1
n/a n/a 14,732
(1.14 %)
18,988
(1.77 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
0
(0 %)
57
(0.00 %)
129
(100.00 %)
1,130,950
(11.22 %)
213,212
(1.80 %)
11,049,280
(26.48 %)
1
(0.00 %)
312,478
(1.26 %)
53,923
(2.09 %)
34,762
(1.11 %)
87 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017)
GCA_002288925.2
n/a n/a 18,686
(1.78 %)
20,378
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.66 %)
28,398
(1.35 %)
28,398
(1.35 %)
35,369
(98.65 %)
4,001,688
(43.72 %)
542,326
(1.10 %)
12,806,249
(34.24 %)
954
(0.02 %)
386,729
(1.71 %)
59,279
(1.53 %)
42,903
(1.24 %)
88 Betapolyomavirus macacae (2000)
GCA_000837645.1
n/a 18
(99.29 %)
n/a n/a n/a 40.76
(99.94 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(4.54 %)
15
(4.33 %)
0
(0 %)
0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
89 bighorn sheep (v1 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.1
75,387
(2.66 %)
n/a 18,667
(1.37 %)
20,248
(1.35 %)
n/a 44.07
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
41
(100.00 %)
3,081,260
(20.10 %)
796,298
(12.14 %)
12,235,764
(46.75 %)
0
(0 %)
703,302
(1.83 %)
50,538
(11.18 %)
38,494
(0.86 %)
90 black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018)
GCF_000002775.4
59,636
(15.47 %)
n/a 20,361
(4.67 %)
44,177
(15.83 %)
n/a 33.75
(97.43 %)
6,871
(2.58 %)
6,871
(2.58 %)
8,318
(97.42 %)
402,600
(27.63 %)
177,746
(4.65 %)
2,639,214
(36.04 %)
34
(0.01 %)
246,517
(5.54 %)
4,559
(0.56 %)
1,801
(0.17 %)
91 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 genbank)
GCA_022577435.1
n/a n/a 14,991
(3.02 %)
47,106
(6.98 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
0
(0 %)
234
(0.00 %)
230
(100.00 %)
1,017,149
(18.99 %)
360,899
(8.75 %)
3,761,526
(28.91 %)
0
(0 %)
469,043
(4.64 %)
48,360
(4.43 %)
30,659
(2.05 %)
92 black rhinoceros (primary hap 2021 genbank)
GCA_020826845.1
56,255
(36.51 %)
n/a 18,774
(1.38 %)
22,346
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
0
(0 %)
215
(0.05 %)
1,075
(100.00 %)
4,200,385
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,639
(40.14 %)
2
(0.00 %)
984,722
(2.61 %)
43,525
(1.14 %)
33,963
(0.76 %)
93 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016)
GCA_001698545.1
59,197
(39.21 %)
n/a 21,244
(1.88 %)
23,681
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
0
(0 %)
149,843
(5.88 %)
105,030
(100.00 %)
5,600,915
(50.57 %)
991,762
(2.45 %)
16,353,992
(34.26 %)
4,262
(0.14 %)
867,902
(3.08 %)
81,205
(1.19 %)
29,129
(0.68 %)
94 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016)
GCF_001698545.1
59,210
(2.48 %)
n/a 21,256
(1.89 %)
23,679
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
0
(0 %)
149,843
(5.88 %)
105,031
(100.00 %)
5,602,009
(50.58 %)
991,745
(2.45 %)
16,354,078
(34.26 %)
4,262
(0.14 %)
n/a 81,205
(1.19 %)
29,123
(0.68 %)
95 black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020)
GCF_013377495.1
41,255
(4.77 %)
n/a 12,955
(1.98 %)
22,656
(2.28 %)
31,476
(5.07 %)
41.95
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 396
(100.00 %)
680,976
(7.66 %)
296,152
(1.44 %)
6,797,141
(21.40 %)
0
(0 %)
86,777
(0.79 %)
31,750
(3.32 %)
30,007
(2.00 %)
96 black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020)
GCF_015228065.1
35,910
(2.41 %)
n/a 3,903
(0.15 %)
39,667
(2.27 %)
40,959
(2.59 %)
36.64
(83.75 %)
0
(0 %)
1,158,725
(16.44 %)
26,876
(100.00 %)
5,488,723
(29.98 %)
7,028,944
(21.91 %)
10,445,796
(49.62 %)
239
(0.01 %)
4,167,031
(8.98 %)
178,205
(3.43 %)
77,006
(1.37 %)
97 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1
51,115
(48.16 %)
n/a 13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
0
(0 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
8
(0.00 %)
651,836
(3.67 %)
45,318
(4.71 %)
36,668
(1.67 %)
98 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1
41,018
(2.61 %)
n/a 4,064
(0.14 %)
135,587
(7.67 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,977
(100.00 %)
1,153,773
(4.93 %)
754,711
(7.52 %)
10,964,182
(43.13 %)
0
(0 %)
805,883
(3.13 %)
138,831
(8.38 %)
232,611
(7.21 %)
99 black-legged tick (Wikel colony 2008 genbank)
GCA_000208615.1
n/a 24,903
(1.43 %)
3,432
(0.19 %)
108,471
(5.13 %)
n/a 45.22
(78.65 %)
201,145
(21.35 %)
201,145
(21.35 %)
570,637
(78.65 %)
656,957
(3.38 %)
365,918
(1.61 %)
8,574,437
(27.02 %)
124
(0.01 %)
n/a 345,141
(14.15 %)
189,691
(5.45 %)
100 blackcap (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819655.1
n/a n/a 12,378
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
0
(0 %)
413
(1.12 %)
189
(100.00 %)
506,242
(6.14 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,567
(19.76 %)
0
(0 %)
190,210
(1.30 %)
26,838
(2.34 %)
22,667
(1.33 %)
101 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 genbank)
GCA_025265405.1
47,540
(38.02 %)
n/a 19,042
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
0
(0 %)
97
(0.03 %)
73
(100.00 %)
3,964,035
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,162
(41.78 %)
1
(0.00 %)
1,795,618
(5.01 %)
70,851
(1.80 %)
37,949
(0.93 %)
102 bloodfluke planorb (v1 BB02 2013 refseq)
GCF_000457365.1
42,216
(5.95 %)
n/a 3,558
(0.29 %)
24,115
(2.96 %)
n/a 35.99
(98.05 %)
76,921
(1.91 %)
76,921
(1.91 %)
408,322
(98.09 %)
629,362
(4.20 %)
749,383
(9.40 %)
6,932,184
(43.02 %)
435
(0.03 %)
800,142
(5.40 %)
16,970
(0.64 %)
6,405
(0.27 %)
103 bloodfluke planorb (v2 BB02 2013 genbank)
GCA_000457365.2
n/a n/a 3,378
(0.29 %)
23,684
(2.94 %)
n/a 35.99
(98.05 %)
76,903
(1.91 %)
76,903
(1.91 %)
406,924
(98.09 %)
587,583
(3.57 %)
749,212
(9.41 %)
6,921,847
(43.04 %)
434
(0.03 %)
n/a 16,561
(0.63 %)
6,013
(0.25 %)
104 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2
n/a n/a 19,164
(1.81 %)
20,546
(1.41 %)
34,210
(1.86 %)
40.88
(98.91 %)
0
(0 %)
936
(1.09 %)
130
(100.00 %)
3,999,202
(44.22 %)
581,540
(1.22 %)
12,900,977
(34.62 %)
2
(0.00 %)
424,951
(1.36 %)
67,189
(1.73 %)
46,700
(1.41 %)
105 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1
47,312
(59.52 %)
n/a 14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
0
(0 %)
455,135
(4.01 %)
29,050
(1.48 %)
14,672
(0.63 %)
106 blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq)
GCF_900634775.1
47,312
(7.12 %)
n/a 14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
0
(0 %)
455,135
(4.01 %)
29,050
(1.48 %)
14,672
(0.63 %)
107 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021)
GCF_016699345.1
53,030
(2.41 %)
n/a 20,599
(1.98 %)
21,182
(1.34 %)
46,441
(1.87 %)
40.95
(99.56 %)
1,074
(0.44 %)
1,074
(0.44 %)
2,790
(99.56 %)
5,098,799
(47.87 %)
946,231
(3.04 %)
14,608,771
(36.99 %)
14
(0.00 %)
1,335,352
(2.84 %)
37,273
(1.03 %)
32,351
(0.89 %)
108 Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011)
GCF_000235385.1
39,820
(2.33 %)
n/a 20,222
(2.04 %)
18,404
(1.34 %)
49,071
(2.26 %)
40.77
(94.98 %)
148,728
(5.04 %)
148,728
(5.04 %)
151,414
(94.96 %)
4,710,420
(46.30 %)
767,602
(1.48 %)
14,489,703
(32.96 %)
1,541
(0.02 %)
526,235
(1.31 %)
32,474
(0.75 %)
29,285
(0.67 %)
109 Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028885525.1
n/a n/a 19,820
(1.76 %)
20,399
(1.15 %)
n/a 40.98
(99.88 %)
36
(0.12 %)
36
(0.12 %)
251
(99.88 %)
5,232,617
(54.01 %)
1,003,539
(10.19 %)
14,858,575
(42.10 %)
0
(0 %)
2,511,941
(4.39 %)
42,467
(1.24 %)
29,563
(0.80 %)
110 Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023 refseq)
GCF_028885625.1
81,966
(2.93 %)
n/a 20,794
(1.72 %)
21,307
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.86 %)
39
(0.14 %)
39
(0.14 %)
1,593
(99.86 %)
5,651,267
(54.21 %)
1,155,151
(9.33 %)
16,242,823
(42.82 %)
0
(0 %)
2,513,241
(4.25 %)
52,294
(2.02 %)
36,160
(1.02 %)
111 boutu (BS63 2019)
GCA_004363515.1
n/a n/a 21,835
(1.38 %)
35,087
(1.18 %)
n/a 42.09
(99.89 %)
5,072
(0.02 %)
5,072
(0.02 %)
1,218,682
(99.98 %)
5,098,108
(45.85 %)
856,878
(2.32 %)
13,046,921
(40.74 %)
29
(0.00 %)
n/a 63,992
(1.47 %)
47,092
(1.19 %)
112 bowfin (hap1 2024 genbank)
GCA_036373705.1
n/a n/a 13,851
(1.83 %)
27,058
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
97
(0.00 %)
390
(100.00 %)
953,497
(13.69 %)
387,700
(7.91 %)
4,552,410
(37.72 %)
4
(0.00 %)
613,799
(6.38 %)
46,301
(2.99 %)
26,437
(1.15 %)
113 Brazilian free-tailed bat (US034 2019)
GCA_004025005.1
n/a n/a 23,562
(1.20 %)
51,200
(1.27 %)
n/a 42.40
(99.91 %)
4,243
(0.02 %)
4,243
(0.02 %)
1,071,858
(99.98 %)
4,884,584
(32.93 %)
777,032
(1.49 %)
14,195,446
(36.38 %)
31
(0.00 %)
n/a 89,940
(1.88 %)
76,243
(1.50 %)
114 brown anole (Geneva1000 2022 genbank)
GCA_025583915.1
38,099
(52.40 %)
n/a 14,028
(1.05 %)
19,927
(1.81 %)
n/a 41.14
(98.37 %)
0
(0 %)
114,440
(1.64 %)
3,738
(100.00 %)
1,376,455
(6.78 %)
1,094,843
(5.18 %)
9,127,396
(44.98 %)
261
(0.01 %)
1,132,418
(4.31 %)
46,291
(1.18 %)
17,324
(0.40 %)
115 brown argus (genbank 2021)
GCA_905147365.1
23,611
(63.03 %)
n/a 4,734
(1.03 %)
24,267
(6.80 %)
24,237
(6.16 %)
36.86
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
26
(100.00 %)
264,378
(2.90 %)
144,255
(3.35 %)
2,651,028
(48.44 %)
0
(0 %)
205,174
(4.19 %)
35,431
(4.56 %)
15,409
(1.89 %)
116 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1
53,993
(3.19 %)
n/a 18,811
(1.78 %)
21,058
(1.52 %)
39,408
(1.98 %)
41.84
(99.31 %)
15,552
(0.70 %)
17,380
(0.70 %)
21,814
(99.30 %)
4,283,780
(41.29 %)
567,588
(1.23 %)
13,807,277
(30.86 %)
760
(0.01 %)
325,786
(0.96 %)
62,126
(1.80 %)
56,003
(1.56 %)
117 brown bear (v1.0 2022 WashU)
GCF_023065955.1
60,162
(4.01 %)
n/a 18,920
(1.66 %)
21,641
(1.49 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
0
(0 %)
215
(0.00 %)
902
(100.00 %)
4,166,472
(34.00 %)
659,124
(5.14 %)
13,282,996
(33.88 %)
0
(0 %)
788,951
(2.62 %)
68,113
(2.27 %)
61,162
(1.99 %)
118 brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020)
GCF_013339695.1
39,606
(2.36 %)
n/a 3,965
(0.13 %)
116,426
(5.96 %)
45,849
(2.46 %)
46.86
(99.96 %)
0
(0 %)
10,359
(0.04 %)
2,329
(100.00 %)
1,064,424
(3.53 %)
716,579
(3.47 %)
10,608,171
(42.78 %)
1
(0.00 %)
n/a 13,204
(0.97 %)
233,049
(6.32 %)
119 brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020)
GCF_012460135.1
31,379
(5.19 %)
n/a 12,572
(1.89 %)
24,442
(2.44 %)
26,137
(3.13 %)
42.40
(99.99 %)
278
(0.01 %)
278
(0.01 %)
691
(99.99 %)
504,872
(6.53 %)
420,620
(3.73 %)
6,496,619
(21.26 %)
0
(0 %)
353,680
(2.15 %)
28,576
(2.39 %)
22,561
(1.23 %)
120 brown planthopper (v1 BPH 2020 genbank)
GCA_014356525.1
36,936
(60.13 %)
n/a 4,416
(0.37 %)
22,354
(3.57 %)
37,534
(4.91 %)
34.69
(99.96 %)
0
(0 %)
4,529
(0.04 %)
7,093
(100.00 %)
597,351
(3.69 %)
564,076
(6.64 %)
6,601,703
(47.48 %)
11
(0.00 %)
905,418
(9.48 %)
39,697
(1.55 %)
15,292
(0.62 %)
121 brown planthopper (v1 BPH 2020 refseq)
GCF_014356525.1
36,949
(4.89 %)
n/a 4,427
(0.37 %)
22,417
(3.57 %)
37,573
(4.91 %)
34.69
(99.96 %)
0
(0 %)
4,529
(0.04 %)
7,094
(100.00 %)
597,178
(3.69 %)
564,092
(6.64 %)
6,601,918
(47.49 %)
11
(0.00 %)
905,421
(9.48 %)
39,697
(1.55 %)
15,292
(0.62 %)
122 budding yeast C.auris (6684 2015 genbank)
GCA_001189475.1
n/a 7,564
(65.02 %)
1,948
(12.61 %)
4,664
(59.90 %)
n/a 45.12
(98.69 %)
0
(0 %)
689
(1.33 %)
99
(100.00 %)
3,478
(1.23 %)
2,281
(0.83 %)
48,703
(8.19 %)
27
(0.12 %)
258
(0.23 %)
1,579
(6.36 %)
1,147
(4.11 %)
123 budding yeast C.auris (B11221 2017 genbank)
GCA_002775015.1
n/a 5,715
(64.44 %)
2,030
(12.92 %)
4,702
(58.30 %)
n/a 45.32
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
20
(100.00 %)
3,464
(2.27 %)
2,436
(0.80 %)
28,524
(6.96 %)
0
(0 %)
1,194
(1.58 %)
1,757
(7.37 %)
1,331
(4.92 %)
124 budding yeast C.lusitaniae (ATCC 42720 2009 genbank)
GCA_000003835.1
n/a 6,153
(65.84 %)
1,956
(12.86 %)
4,335
(54.85 %)
n/a 44.50
(99.71 %)
79
(0.29 %)
79
(0.29 %)
88
(99.71 %)
2,272
(1.18 %)
4,036
(1.77 %)
48,188
(8.66 %)
0
(0 %)
697
(0.55 %)
1,474
(15.82 %)
1,218
(9.79 %)
125 budding yeast C.oxycetoniae (v1 CBS 10844 2022)
GCF_023343755.1
4,917
(62.59 %)
n/a 1,845
(11.42 %)
4,476
(56.70 %)
n/a 37.84
(99.95 %)
0
(0 %)
167
(0.05 %)
148
(100.00 %)
14,118
(4.93 %)
19,713
(8.99 %)
82,014
(21.64 %)
3
(0.01 %)
4,249
(2.09 %)
201
(0.52 %)
34
(0.08 %)
126 budding yeast K.marxianus (DMKU3-1042 2014 genbank)
GCA_001417885.1
n/a 5,342
(68.28 %)
3,349
(28.79 %)
4,665
(66.28 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 9
(100.00 %)
7,406
(3.43 %)
3,781
(1.46 %)
51,732
(11.80 %)
0
(0 %)
614
(0.85 %)
742
(4.91 %)
562
(2.75 %)
127 budding yeast L.elongisporus (NRRL YB-4239 2007 genbank)
GCA_000149685.1
n/a 5,905
(57.07 %)
1,905
(9.82 %)
5,004
(52.37 %)
n/a 36.94
(99.45 %)
117
(0.56 %)
117
(0.56 %)
145
(99.44 %)
30,880
(10.91 %)
18,155
(4.10 %)
100,210
(23.18 %)
0
(0 %)
1,604
(1.36 %)
22
(0.04 %)
19
(0.04 %)
128 budding yeast N.glabratus (CBS 138 2008 genbank)
GCA_000002545.2
n/a 5,552
(64.50 %)
3,553
(27.93 %)
4,799
(61.37 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
16
(100.00 %)
3,047
(1.32 %)
2,546
(1.58 %)
59,567
(11.20 %)
0
(0 %)
804
(0.77 %)
635
(3.11 %)
567
(2.52 %)
129 budding yeast Y.lipolytica (CLIB122 2004 genbank)
GCA_000002525.1
n/a 8,157
(46.30 %)
1,755
(6.59 %)
4,802
(37.76 %)
n/a 49.05
(99.99 %)
28
(0.01 %)
28
(0.01 %)
34
(99.99 %)
7,553
(2.98 %)
9,578
(2.12 %)
81,595
(9.59 %)
0
(0 %)
960
(0.42 %)
6,216
(33.42 %)
5,390
(18.49 %)
130 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1
32,026
(47.01 %)
n/a 13,250
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
26,324
(3.11 %)
41.80
(99.72 %)
0
(0 %)
284
(0.28 %)
865
(100.00 %)
539,059
(10.20 %)
279,511
(3.12 %)
5,874,608
(22.08 %)
1
(0.00 %)
324,823
(2.05 %)
21,155
(1.61 %)
17,590
(1.10 %)
131 butterfly L.sinapis (2021 genbank)
GCA_905404315.1
25,882
(55.17 %)
n/a 4,722
(0.65 %)
16,896
(3.62 %)
47,660
(8.03 %)
35.73
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
50
(100.00 %)
272,738
(1.92 %)
98,053
(6.01 %)
4,662,765
(51.79 %)
0
(0 %)
376,611
(5.06 %)
43,150
(4.96 %)
13,298
(1.08 %)
132 butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021)
GCA_905475465.1
n/a n/a 4,588
(1.37 %)
11,218
(5.90 %)
42,925
(13.84 %)
33.95
(100.00 %)
0
(0 %)
41
(0.00 %)
43
(100.00 %)
143,323
(2.19 %)
45,473
(3.23 %)
2,501,939
(42.55 %)
0
(0 %)
106,106
(3.41 %)
11,070
(2.07 %)
6,650
(1.23 %)
133 cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147795.1
21,844
(65.09 %)
n/a 4,557
(1.68 %)
9,253
(6.32 %)
30,285
(15.57 %)
33.23
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
40
(100.00 %)
116,781
(2.12 %)
30,577
(1.24 %)
2,300,336
(39.04 %)
0
(0 %)
40,164
(2.03 %)
6,783
(2.24 %)
5,041
(1.33 %)
134 California condor (v1 813 2021 genbank)
GCA_018139145.1
n/a n/a 12,650
(1.75 %)
21,946
(1.95 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
0
(0 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
518,393
(6.41 %)
177,329
(0.88 %)
7,168,675
(20.31 %)
6
(0.00 %)
116,410
(1.11 %)
34,926
(2.94 %)
32,355
(1.72 %)
135 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1
n/a n/a 23,668
(1.61 %)
29,709
(1.32 %)
n/a 41.56
(99.92 %)
10,276
(0.04 %)
10,276
(0.04 %)
582,272
(99.96 %)
4,952,087
(44.00 %)
651,744
(1.26 %)
13,644,805
(35.79 %)
27
(0.00 %)
376,234
(0.87 %)
62,245
(1.50 %)
57,048
(1.32 %)
136 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1
n/a n/a 21,020
(1.79 %)
20,045
(1.39 %)
45,176
(2.15 %)
41.40
(99.28 %)
0
(0 %)
122
(0.72 %)
43
(100.00 %)
4,529,949
(43.67 %)
589,962
(1.24 %)
13,266,465
(33.77 %)
0
(0 %)
491,959
(1.43 %)
51,989
(1.50 %)
48,284
(1.32 %)
137 California two-spot octopus (v1 UCB-OBI-ISO-001 male 2015)
GCF_001194135.1
26,135
(1.83 %)
n/a 3,125
(0.12 %)
17,875
(1.29 %)
27,144
(1.85 %)
36.03
(84.95 %)
548,450
(15.13 %)
548,450
(15.13 %)
700,124
(84.87 %)
3,498,348
(13.19 %)
3,005,729
(6.50 %)
13,687,022
(41.09 %)
20,815
(0.26 %)
912,571
(2.22 %)
22,984
(0.34 %)
4,782
(0.07 %)
138 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1
50,094
(2.69 %)
n/a 18,283
(1.66 %)
19,326
(1.35 %)
38,985
(1.96 %)
41.70
(99.88 %)
0
(0 %)
848
(0.12 %)
66
(100.00 %)
5,016,399
(43.75 %)
904,986
(1.75 %)
13,476,288
(34.20 %)
0
(0 %)
572,992
(1.64 %)
66,822
(2.52 %)
60,494
(2.02 %)
139 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1
n/a n/a 25,543
(0.55 %)
52,506
(0.63 %)
n/a 40.04
(99.84 %)
4,876
(0.01 %)
4,876
(0.01 %)
3,432,954
(99.99 %)
7,363,240
(21.82 %)
876,677
(2.53 %)
25,446,677
(58.18 %)
62
(0.00 %)
n/a 25,319
(0.31 %)
19,908
(0.25 %)
140 capsicum (Zunla-1 2015 genbank)
GCA_000710875.1
n/a n/a 16,133
(0.56 %)
62,445
(2.92 %)
n/a 34.93
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
107,172
(3.23 %)
108,797
(96.77 %)
1,171,727
(3.54 %)
948,641
(4.39 %)
21,533,236
(46.16 %)
331
(0.03 %)
1,512,400
(5.05 %)
16,621
(0.21 %)
4,972
(0.06 %)
141 Caribbean electric ray (hap1 2024 genbank)
GCA_036971445.1
n/a n/a 11,967
(0.44 %)
20,851
(1.23 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,443
(0.01 %)
596
(100.00 %)
4,902,656
(34.96 %)
1,040,893
(17.82 %)
16,403,253
(54.79 %)
2
(0.00 %)
3,888,884
(8.11 %)
113,936
(1.69 %)
22,323
(0.31 %)
142 carmine bee-eater (2014 BGI)
GCF_000691845.1
15,520
(2.12 %)
n/a 11,303
(1.45 %)
24,758
(1.84 %)
n/a 41.67
(99.59 %)
50,632
(0.42 %)
50,632
(0.42 %)
104,131
(99.58 %)
405,042
(5.66 %)
161,525
(1.05 %)
6,445,961
(19.27 %)
2
(0.00 %)
37,279
(0.40 %)
11,477
(0.36 %)
9,158
(0.28 %)
143 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1
48,199
(10.95 %)
n/a 18,537
(3.62 %)
45,536
(13.17 %)
n/a 35.94
(85.14 %)
37,896
(14.88 %)
37,896
(14.88 %)
39,916
(85.12 %)
295,656
(2.88 %)
266,527
(3.40 %)
2,434,269
(42.34 %)
26
(0.02 %)
352,557
(6.54 %)
30,963
(1.41 %)
4,126
(0.23 %)
144 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6
n/a n/a 19,803
(1.54 %)
21,001
(1.30 %)
n/a 41.83
(99.57 %)
39,124
(0.44 %)
41,517
(0.44 %)
42,578
(99.56 %)
5,725,274
(49.24 %)
459,535
(1.33 %)
12,905,109
(41.11 %)
628
(0.03 %)
1,325,981
(3.97 %)
43,324
(1.28 %)
37,641
(0.94 %)
145 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA)
GCF_002263795.1
76,369
(2.97 %)
n/a 19,669
(1.56 %)
21,999
(1.33 %)
n/a 41.93
(100.00 %)
0
(0 %)
386
(0.00 %)
2,211
(100.00 %)
5,643,592
(49.67 %)
545,256
(2.90 %)
13,085,601
(41.79 %)
1
(0.00 %)
1,556,737
(4.07 %)
44,357
(1.24 %)
37,714
(0.98 %)
146 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA)
GCF_002263795.2
76,306
(2.98 %)
n/a 19,325
(1.49 %)
21,665
(1.32 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
386
(0.00 %)
1,957
(100.00 %)
3,550,686
(24.18 %)
544,595
(2.90 %)
13,050,221
(41.81 %)
1
(0.00 %)
1,554,173
(4.07 %)
44,208
(1.24 %)
37,290
(0.87 %)
147 Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad)
GCA_004024745.1
n/a n/a 21,372
(1.41 %)
34,453
(1.31 %)
n/a 42.35
(99.87 %)
10,534
(0.04 %)
10,534
(0.04 %)
1,240,696
(99.96 %)
5,244,572
(43.13 %)
2,503,015
(4.45 %)
12,961,004
(41.69 %)
59
(0.00 %)
n/a 173,264
(3.70 %)
153,887
(3.31 %)
148 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1
40,788
(61.50 %)
n/a 14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
0
(0 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
0
(0 %)
452,303
(4.62 %)
20,453
(1.39 %)
10,802
(0.65 %)
149 channel catfish (USDA103 v1 2016)
GCF_001660625.1
53,920
(9.58 %)
n/a 15,712
(2.71 %)
25,639
(5.25 %)
n/a 39.70
(98.56 %)
25,203
(1.45 %)
25,203
(1.45 %)
34,544
(98.55 %)
871,222
(5.75 %)
585,250
(4.19 %)
5,150,651
(33.94 %)
63
(0.01 %)
258,935
(2.61 %)
31,438
(1.87 %)
20,402
(1.03 %)
150 channel catfish (USDA103 v1.2 2019)
GCF_001660625.2
57,087
(10.27 %)
n/a 16,253
(2.68 %)
44,936
(5.15 %)
n/a 39.70
(98.57 %)
25,203
(1.39 %)
25,285
(1.44 %)
34,545
(98.61 %)
900,327
(5.55 %)
614,695
(4.28 %)
5,348,266
(33.81 %)
63
(0.01 %)
281,774
(2.67 %)
32,840
(1.87 %)
21,251
(1.03 %)
151 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1
n/a n/a 18,264
(1.57 %)
14,665
(1.26 %)
n/a 41.30
(98.26 %)
0
(0 %)
183,260
(1.77 %)
14,382
(100.00 %)
4,777,041
(42.51 %)
784,368
(1.53 %)
13,503,827
(31.65 %)
42
(0.00 %)
261,774
(0.78 %)
57,657
(1.31 %)
48,632
(1.00 %)
152 chevron butterflyfish (hap1 2024 genbank)
GCA_039877785.1
n/a n/a 15,255
(2.94 %)
48,037
(7.05 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
0
(0 %)
49
(0.00 %)
37
(100.00 %)
465,710
(3.82 %)
254,015
(3.62 %)
3,657,999
(23.28 %)
1
(0.00 %)
186,571
(2.20 %)
30,971
(2.02 %)
18,241
(1.05 %)
153 chimney swift (M959 v1.0 2014)
GCF_000747805.1
15,979
(2.53 %)
n/a 12,065
(1.82 %)
10,050
(2.07 %)
n/a 41.40
(95.99 %)
65,523
(4.03 %)
65,523
(4.03 %)
84,595
(95.97 %)
453,775
(7.30 %)
194,988
(2.21 %)
6,363,949
(19.70 %)
135
(0.03 %)
104,994
(2.61 %)
12,486
(0.42 %)
8,538
(0.26 %)
154 chimpanzee (Clint C0471 2018 genbank)
GCA_002880755.3
n/a 162,869
(3.61 %)
20,378
(1.83 %)
21,427
(1.19 %)
n/a 40.71
(98.98 %)
693
(1.02 %)
693
(1.02 %)
5,037
(98.98 %)
5,409,980
(53.76 %)
984,231
(7.31 %)
15,896,744
(39.56 %)
4
(0.00 %)
2,559,246
(4.40 %)
45,870
(0.97 %)
28,273
(0.73 %)
155 chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028858805.1
n/a n/a 20,001
(1.79 %)
21,230
(1.19 %)
n/a 40.62
(99.78 %)
22
(0.22 %)
22
(0.22 %)
141
(99.78 %)
5,092,768
(48.83 %)
946,933
(11.75 %)
14,844,947
(42.39 %)
0
(0 %)
3,140,392
(5.61 %)
47,662
(1.21 %)
29,340
(0.82 %)
156 chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023 refseq)
GCF_028858775.1
111,282
(4.36 %)
n/a 20,990
(1.75 %)
21,705
(1.15 %)
n/a 40.94
(99.90 %)
29
(0.10 %)
29
(0.10 %)
1,500
(99.90 %)
5,581,205
(50.06 %)
1,158,792
(10.59 %)
15,972,274
(43.09 %)
0
(0 %)
3,093,549
(5.27 %)
61,901
(2.29 %)
38,043
(1.17 %)
157 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1
60,293
(11.65 %)
n/a 15,433
(2.84 %)
67,310
(21.70 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
45
(100.00 %)
273,992
(2.25 %)
228,466
(3.97 %)
2,261,888
(35.14 %)
0
(0 %)
273,738
(7.11 %)
37,317
(4.18 %)
22,576
(1.74 %)
158 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1
55,529
(3.00 %)
n/a 19,755
(1.76 %)
20,017
(1.50 %)
n/a 41.51
(99.88 %)
0
(0 %)
4,356
(0.12 %)
1,830
(100.00 %)
4,544,603
(29.89 %)
1,095,407
(2.92 %)
12,942,232
(32.27 %)
20
(0.00 %)
553,246
(1.59 %)
19,343
(0.58 %)
15,755
(0.43 %)
159 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank)
GCA_018296145.1
92,370
(51.48 %)
n/a 27,141
(1.63 %)
113,328
(4.52 %)
157,545
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,313
(0.01 %)
2,333
(0.01 %)
9,977
(99.99 %)
4,892,399
(55.31 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,870
(54.55 %)
10
(0.00 %)
5,031,323
(11.16 %)
62,726
(1.40 %)
18,444
(0.39 %)
160 chub mackerel (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409825.1
34,390
(49.60 %)
n/a 15,350
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
0
(0 %)
1,572
(0.08 %)
361
(100.00 %)
1,669,327
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,422
(32.38 %)
3
(0.00 %)
927,880
(7.23 %)
16,290
(0.85 %)
8,913
(0.42 %)
161 chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014)
GCF_000700745.1
17,196
(2.21 %)
n/a 12,140
(1.50 %)
25,641
(1.91 %)
n/a 40.76
(99.61 %)
56,667
(0.39 %)
56,667
(0.39 %)
126,789
(99.61 %)
560,317
(7.62 %)
203,204
(1.12 %)
6,593,712
(20.47 %)
4
(0.00 %)
63,810
(0.48 %)
8,105
(0.24 %)
6,684
(0.19 %)
162 chytrid fungus B.dendrobatidis (v1 JAM81 2011)
GCF_000203795.1
8,677
(50.60 %)
n/a 1,251
(4.00 %)
7,681
(34.45 %)
n/a 39.25
(99.25 %)
383
(0.76 %)
383
(0.76 %)
510
(99.24 %)
2,585
(1.13 %)
3,424
(1.20 %)
81,225
(12.02 %)
0
(0 %)
5,784
(3.45 %)
161
(0.21 %)
141
(0.19 %)
163 ciliates Oxytricha trifallax (v1 JRB310 2012)
GCA_000295675.1
n/a 24,578
(70.50 %)
1,065
(1.03 %)
1,781
(1.87 %)
n/a 31.32
(99.93 %)
1,347
(0.00 %)
1,347
(0.00 %)
23,709
(100.00 %)
29,228
(1.96 %)
22,291
(1.48 %)
550,667
(25.14 %)
6
(0.00 %)
1,285
(0.43 %)
20
(0.01 %)
20
(0.01 %)
164 climbing perch (v1.1 2018 refseq)
GCF_900324465.1
42,930
(13.31 %)
n/a 15,237
(3.47 %)
22,710
(7.34 %)
37,043
(11.25 %)
40.40
(98.65 %)
0
(0 %)
292
(1.35 %)
70
(100.00 %)
329,586
(2.67 %)
133,519
(1.94 %)
3,418,470
(21.84 %)
0
(0 %)
182,187
(2.87 %)
10,698
(0.86 %)
7,641
(0.56 %)
165 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2
42,746
(63.74 %)
n/a 15,239
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
50
(100.00 %)
324,479
(2.66 %)
130,248
(1.89 %)
3,324,960
(21.31 %)
0
(0 %)
169,785
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
166 climbing perch (v1.2 2018 refseq)
GCF_900324465.2
42,759
(13.53 %)
n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
324,324
(2.66 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,009
(21.31 %)
0
(0 %)
169,785
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
167 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018385.1
81,219
(51.66 %)
n/a 18,516
(1.55 %)
20,363
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
0
(0 %)
181
(0.06 %)
34
(100.00 %)
4,798,634
(33.91 %)
992,669
(2.08 %)
13,618,933
(34.42 %)
3
(0.00 %)
647,740
(1.89 %)
67,831
(2.45 %)
58,578
(1.71 %)
168 clouded yellow (genbank 2021)
GCA_905220415.1
23,070
(64.23 %)
n/a 4,767
(1.38 %)
15,869
(7.12 %)
34,699
(13.48 %)
33.59
(100.00 %)
0
(0 %)
9
(0.00 %)
33
(100.00 %)
161,872
(2.42 %)
73,892
(2.86 %)
2,544,844
(42.14 %)
0
(0 %)
134,497
(3.68 %)
15,663
(2.98 %)
9,943
(1.81 %)
169 coho salmon (150728-3 2017)
GCF_002021735.1
64,032
(4.29 %)
n/a 24,727
(1.43 %)
46,926
(3.38 %)
n/a 43.33
(95.39 %)
1,566
(0.01 %)
265,291
(4.63 %)
22,810
(99.99 %)
1,185,308
(5.22 %)
2,455,045
(15.99 %)
11,710,855
(46.53 %)
9,333
(0.29 %)
4,110,586
(10.80 %)
72,061
(1.46 %)
24,530
(0.46 %)
170 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1
67,207
(45.84 %)
n/a 18,772
(1.77 %)
20,527
(1.42 %)
35,815
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
0
(0 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,067,521
(46.14 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,896
(35.29 %)
1
(0.00 %)
597,652
(1.78 %)
65,551
(1.90 %)
43,161
(1.35 %)
171 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1
45,962
(43.27 %)
n/a 17,254
(1.68 %)
17,112
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
0
(0 %)
114,003
(0.57 %)
2,647
(100.00 %)
3,845,214
(43.88 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,013
(32.18 %)
466
(0.01 %)
284,934
(0.89 %)
48,030
(1.35 %)
31,891
(1.03 %)
172 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1
37,661
(35.20 %)
n/a 18,681
(0.81 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,697
(38.92 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,301
(40.56 %)
0
(0 %)
455,834
(1.17 %)
17,762
(0.38 %)
13,986
(0.24 %)
173 common carp (2014)
GCF_000951615.1
75,414
(5.81 %)
n/a 27,632
(2.17 %)
59,950
(5.28 %)
n/a 37.00
(97.48 %)
0
(0 %)
57,940
(2.53 %)
9,378
(100.00 %)
1,460,282
(5.17 %)
987,356
(7.88 %)
9,900,821
(37.41 %)
8
(0.00 %)
1,320,956
(12.02 %)
48,702
(1.38 %)
28,063
(0.71 %)
174 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1
50,206
(57.28 %)
n/a 13,179
(1.84 %)
25,859
(2.41 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
0
(0 %)
296
(0.42 %)
151
(100.00 %)
521,043
(9.61 %)
310,469
(2.36 %)
6,712,849
(21.76 %)
0
(0 %)
326,521
(1.83 %)
25,267
(1.71 %)
20,672
(1.05 %)
175 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1
16,827
(2.53 %)
n/a 12,599
(1.80 %)
12,623
(2.28 %)
n/a 41.52
(97.64 %)
56,977
(2.38 %)
56,977
(2.38 %)
71,907
(97.62 %)
418,870
(8.06 %)
192,437
(2.08 %)
6,576,259
(19.85 %)
113
(0.02 %)
126,008
(2.66 %)
18,002
(0.74 %)
15,128
(0.57 %)
176 common house spider (v2 Geottingen 2017)
GCF_000365465.2
30,064
(3.79 %)
n/a 3,347
(0.23 %)
7,571
(1.48 %)
n/a 29.46
(81.63 %)
247,375
(18.44 %)
247,378
(18.44 %)
263,908
(81.56 %)
587,943
(2.23 %)
464,643
(2.90 %)
10,795,253
(40.31 %)
12,788
(0.38 %)
474,681
(4.16 %)
10,480
(0.23 %)
1,791
(0.05 %)
177 common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank)
GCA_000365465.3
37,121
(48.05 %)
n/a 3,276
(0.22 %)
9,098
(1.38 %)
38,273
(4.24 %)
29.40
(98.45 %)
24,382
(1.54 %)
124,228
(1.55 %)
84,235
(98.46 %)
637,694
(2.45 %)
527,781
(4.43 %)
11,553,196
(51.16 %)
299
(0.01 %)
477,709
(3.61 %)
11,998
(0.33 %)
2,762
(0.10 %)
178 common limpet (v1 primary hap 2022)
GCF_932274485.1
41,888
(9.21 %)
n/a 3,611
(0.43 %)
13,244
(4.58 %)
44,721
(6.30 %)
36.11
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
13
(100.00 %)
239,042
(1.40 %)
359,961
(7.89 %)
4,399,053
(45.69 %)
5
(0.00 %)
629,372
(7.98 %)
33,411
(1.94 %)
2,344
(0.13 %)
179 common sole (primary hap 2023 genbank)
GCA_958295425.1
55,359
(63.58 %)
n/a 14,846
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
243
(100.00 %)
1,149,249
(19.12 %)
342,239
(9.71 %)
3,906,839
(32.84 %)
2
(0.00 %)
440,509
(5.18 %)
27,772
(2.71 %)
15,561
(0.92 %)
180 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1
39,986
(53.94 %)
n/a 12,277
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
0
(0 %)
256
(0.16 %)
109
(100.00 %)
533,758
(8.66 %)
199,748
(1.12 %)
6,353,957
(21.19 %)
1
(0.00 %)
113,872
(0.91 %)
20,393
(1.74 %)
16,313
(0.88 %)
181 common vampire bat (v1 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.1
n/a n/a 17,520
(1.75 %)
18,995
(1.67 %)
n/a 42.89
(99.99 %)
0
(0 %)
580
(0.01 %)
430
(100.00 %)
2,597,497
(28.17 %)
356,620
(2.88 %)
10,797,225
(31.23 %)
25
(0.00 %)
271,481
(1.34 %)
61,931
(2.30 %)
43,396
(1.30 %)
182 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1
58,054
(45.51 %)
n/a 18,280
(1.71 %)
19,514
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
611
(0.01 %)
572
(100.00 %)
2,761,820
(28.38 %)
427,940
(3.89 %)
11,250,492
(32.57 %)
37
(0.00 %)
360,489
(1.62 %)
70,700
(2.48 %)
44,288
(1.24 %)
183 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.1
58,067
(3.40 %)
n/a 18,280
(1.71 %)
19,515
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
611
(0.01 %)
573
(100.00 %)
2,761,826
(28.38 %)
427,942
(3.89 %)
11,250,529
(32.57 %)
37
(0.00 %)
360,489
(1.62 %)
70,701
(2.48 %)
44,289
(1.24 %)
184 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2
n/a n/a 18,511
(1.87 %)
18,170
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
54,308
(2.23 %)
84,108
(97.77 %)
2,860,991
(29.93 %)
275,245
(1.03 %)
11,798,152
(28.19 %)
237
(0.03 %)
174,536
(2.84 %)
51,833
(1.38 %)
47,411
(1.21 %)
185 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1
51,047
(3.24 %)
n/a 18,506
(1.88 %)
18,166
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
54,308
(2.23 %)
84,109
(97.77 %)
2,861,697
(29.93 %)
275,247
(1.03 %)
11,798,198
(28.19 %)
237
(0.03 %)
174,536
(2.84 %)
51,834
(1.38 %)
47,410
(1.21 %)
186 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.2
n/a n/a 18,311
(1.71 %)
19,456
(1.59 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
0
(0 %)
615
(0.01 %)
573
(100.00 %)
2,767,071
(28.35 %)
431,575
(3.90 %)
11,286,853
(32.63 %)
37
(0.00 %)
330,061
(1.50 %)
71,506
(2.50 %)
45,001
(1.26 %)
187 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1
29,369
(33.72 %)
n/a 19,335
(2.10 %)
21,769
(1.63 %)
n/a 41.24
(74.51 %)
276,531
(25.53 %)
276,544
(25.53 %)
299,069
(74.47 %)
3,513,698
(39.82 %)
304,033
(0.59 %)
13,333,842
(21.06 %)
1,491
(0.03 %)
288,329
(2.06 %)
56,694
(1.59 %)
52,345
(1.34 %)
188 cork oak (v1 HL8 2018)
GCF_002906115.1
65,969
(8.84 %)
n/a 20,226
(1.95 %)
89,703
(16.66 %)
n/a 36.19
(97.99 %)
0
(0 %)
26,139
(2.01 %)
23,344
(100.00 %)
865,884
(3.63 %)
491,126
(5.95 %)
6,119,503
(36.10 %)
267
(0.02 %)
690,224
(9.50 %)
21,505
(3.50 %)
10,784
(2.71 %)
189 corroboree frog (hap2 2023 genbank)
GCA_028390025.1
n/a n/a n/a 54,346
(1.07 %)
n/a 45.66
(99.76 %)
0
(0 %)
2,699
(0.24 %)
3,127
(100.00 %)
18,782,633
(75.22 %)
5,902,115
(18.63 %)
5,826
(99.76 %)
23
(0.00 %)
n/a 990,274
(4.84 %)
90,184
(0.51 %)
190 Cory's shearwater (hap1.1 2024)
GCA_964195595.1
n/a n/a 13,703
(1.71 %)
26,310
(2.10 %)
n/a 43.29
(99.99 %)
59
(0.00 %)
525
(0.01 %)
414
(100.00 %)
479,045
(5.03 %)
336,466
(4.95 %)
5,910,298
(24.89 %)
4
(0.00 %)
487,078
(3.38 %)
48,046
(4.19 %)
40,252
(2.00 %)
191 Cory's shearwater (hap2.1 2024)
GCA_964196065.1
n/a n/a 12,750
(1.85 %)
23,191
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.99 %)
477
(0.01 %)
477
(0.01 %)
726
(99.99 %)
403,846
(4.59 %)
252,125
(3.30 %)
6,206,493
(22.07 %)
2
(0.00 %)
286,848
(2.45 %)
41,821
(4.50 %)
38,197
(2.23 %)
192 cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank)
GCA_002156985.1
21,972
(59.55 %)
17,082
(10.65 %)
4,839
(1.54 %)
21,045
(8.01 %)
n/a 36.13
(89.02 %)
23,558
(11.01 %)
26,910
(11.01 %)
24,551
(88.99 %)
115,046
(2.97 %)
31,900
(0.85 %)
2,230,382
(25.45 %)
1,738
(0.70 %)
33,991
(1.55 %)
15,851
(2.18 %)
9,912
(1.25 %)
193 cowpea (IT97K-499-35 v1 2019)
GCF_004118075.1
48,678
(10.56 %)
n/a 16,927
(3.30 %)
44,814
(13.06 %)
54,348
(11.30 %)
32.98
(99.48 %)
0
(0 %)
68
(0.52 %)
682
(100.00 %)
352,238
(4.22 %)
283,949
(8.14 %)
3,092,021
(41.64 %)
1
(0.00 %)
420,724
(7.56 %)
24,513
(2.40 %)
11,823
(1.16 %)
194 crab-eating macaque (v1 582-1 2024)
GCF_037993035.1
100,896
(3.93 %)
n/a 20,528
(1.79 %)
21,741
(1.19 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 21
(100.00 %)
5,357,498
(52.90 %)
1,017,190
(8.58 %)
15,617,344
(40.74 %)
0
(0 %)
2,146,978
(4.41 %)
94,759
(1.56 %)
30,541
(0.76 %)
195 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1
76,183
(45.03 %)
n/a 20,283
(1.90 %)
20,544
(1.22 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,163
(4.85 %)
80,474
(4.85 %)
87,763
(95.15 %)
5,351,207
(51.35 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,449
(35.74 %)
1,138
(0.05 %)
1,213,705
(2.53 %)
76,963
(1.14 %)
28,050
(0.65 %)
196 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1
76,196
(3.30 %)
n/a 20,209
(1.91 %)
51,427
(6.84 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,163
(4.85 %)
80,474
(4.85 %)
87,764
(95.15 %)
5,251,819
(50.85 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,510
(35.74 %)
1,138
(0.05 %)
1,213,705
(2.53 %)
76,963
(1.14 %)
27,520
(0.64 %)
197 crucian carp (primary hap 2023 genbank)
GCA_963082965.1
90,094
(55.93 %)
n/a 29,389
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
0
(0 %)
832
(0.01 %)
278
(100.00 %)
3,481,389
(45.81 %)
802,775
(6.54 %)
8,190,816
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,003,533
(5.09 %)
83,696
(3.82 %)
26,039
(0.81 %)
198 crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022)
GCF_022539665.1
22,915
(28.69 %)
n/a 3,621
(2.94 %)
11,430
(17.96 %)
n/a 40.34
(99.47 %)
0
(0 %)
2
(0.53 %)
227
(100.00 %)
81,008
(2.67 %)
29,625
(4.98 %)
609,395
(25.66 %)
0
(0 %)
39,313
(3.92 %)
6,559
(5.05 %)
5,546
(3.62 %)
199 crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank)
GCA_003990815.1
n/a n/a 3,519
(2.64 %)
12,174
(17.22 %)
n/a 40.54
(93.29 %)
0
(0 %)
13,228
(6.75 %)
4,192
(100.00 %)
63,254
(2.07 %)
22,325
(1.44 %)
728,942
(20.81 %)
35
(0.03 %)
32,114
(3.20 %)
8,375
(4.98 %)
6,466
(3.39 %)
200 crustacean P.pollicipes (v2 AB1234 2020)
GCF_011947565.2
30,025
(5.21 %)
n/a 3,968
(0.39 %)
56,084
(8.02 %)
32,834
(5.48 %)
52.34
(98.93 %)
0
(0 %)
10,786
(1.08 %)
1,254
(100.00 %)
361,409
(3.23 %)
533,046
(8.92 %)
3,456,307
(19.29 %)
27
(0.01 %)
627,943
(7.18 %)
6,722
(54.88 %)
103,043
(9.72 %)
201 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank)
GCA_021462225.2
n/a n/a 15,131
(1.68 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
0
(0 %)
409
(0.54 %)
73
(100.00 %)
2,175,293
(47.80 %)
176,956
(1.87 %)
6,142,692
(38.35 %)
4
(0.00 %)
383,249
(3.60 %)
32,973
(1.28 %)
10,198
(0.33 %)
202 Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_963259705.1
64,558
(45.64 %)
n/a 19,142
(1.72 %)
22,139
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
0
(0 %)
1,099
(0.01 %)
122
(100.00 %)
3,040,239
(24.03 %)
796,913
(6.38 %)
10,478,261
(38.84 %)
9
(0.00 %)
756,430
(2.76 %)
64,921
(2.50 %)
57,806
(1.88 %)
203 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1
48,152
(35.39 %)
n/a 22,240
(1.40 %)
22,108
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,770
(15.68 %)
252,770
(15.68 %)
259,903
(84.32 %)
4,890,270
(27.82 %)
898,943
(1.50 %)
14,281,942
(29.30 %)
2,582
(0.03 %)
313,025
(1.02 %)
40,135
(0.82 %)
36,410
(0.69 %)
204 denticle herring (v1 2019)
GCF_900700375.1
59,645
(12.74 %)
n/a 16,556
(3.78 %)
37,861
(8.42 %)
72,719
(10.66 %)
43.69
(99.18 %)
0
(0 %)
464
(0.82 %)
460
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,282
(4.61 %)
2,948,671
(28.79 %)
0
(0 %)
306,165
(4.31 %)
64,661
(9.49 %)
52,867
(4.93 %)
205 diamondback terrapin (hap1 2023 genbank)
GCA_027887155.1
50,318
(52.07 %)
n/a 15,109
(1.08 %)
19,281
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.92 %)
0
(0 %)
141
(0.08 %)
76
(100.00 %)
4,088,064
(46.33 %)
403,943
(1.72 %)
11,014,504
(33.74 %)
0
(0 %)
407,696
(1.71 %)
110,838
(2.71 %)
30,093
(0.82 %)
206 diplomonads (v1 WB C6 WB C6 2008)
GCF_000002435.1
6,502
(71.82 %)
n/a 251
(1.29 %)
2,079
(62.62 %)
n/a 49.25
(99.82 %)
214
(0.19 %)
242
(0.19 %)
306
(99.81 %)
697
(1.34 %)
335
(0.65 %)
20,634
(5.24 %)
19
(0.14 %)
859
(1.76 %)
2,275
(23.86 %)
2,064
(18.94 %)
207 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1
n/a n/a 22,343
(1.53 %)
28,525
(1.27 %)
n/a 41.66
(99.91 %)
10,428
(0.04 %)
10,428
(0.04 %)
667,170
(99.96 %)
5,598,608
(45.38 %)
1,220,686
(2.58 %)
14,079,363
(36.37 %)
28
(0.00 %)
n/a 62,881
(2.13 %)
53,176
(1.80 %)
208 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1
55,980
(3.39 %)
n/a 18,440
(1.59 %)
19,474
(1.48 %)
n/a 41.47
(94.51 %)
109,700
(5.51 %)
109,700
(5.51 %)
117,442
(94.49 %)
n/a 606,818
(1.04 %)
13,503,550
(29.63 %)
1,009
(0.02 %)
309,552
(0.86 %)
53,376
(1.90 %)
51,864
(1.65 %)
209 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1
44,762
(33.07 %)
n/a 18,297
(1.33 %)
20,107
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
58,460
(2.20 %)
61,603
(97.80 %)
4,257,412
(38.85 %)
658,532
(1.25 %)
14,547,631
(34.19 %)
3
(0.00 %)
423,409
(1.39 %)
37,092
(0.85 %)
27,299
(0.63 %)
210 domestic silkworm (genbank 2020)
GCA_014905235.2
n/a n/a 5,227
(1.28 %)
18,795
(5.67 %)
n/a 38.55
(99.90 %)
0
(0 %)
30
(0.10 %)
696
(100.00 %)
615,428
(29.26 %)
86,179
(1.65 %)
2,607,325
(47.66 %)
0
(0 %)
297,922
(5.59 %)
44,022
(10.06 %)
15,414
(1.64 %)
211 domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank)
GCA_904849725.1
63,294
(3.74 %)
n/a 18,050
(0.43 %)
260,902
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
0
(0 %)
162
(0.03 %)
290
(100.00 %)
1,274,894
(2.42 %)
1,726,303
(5.40 %)
14,010,542
(72.58 %)
0
(0 %)
5,823,193
(14.08 %)
732,828
(17.24 %)
271,779
(4.92 %)
212 dorado (hap2 2023 genbank)
GCA_030463535.1
n/a n/a 16,799
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
0
(0 %)
726
(0.85 %)
104
(100.00 %)
2,693,928
(34.60 %)
805,807
(14.65 %)
5,615,731
(36.69 %)
2
(0.00 %)
1,425,798
(8.96 %)
30,083
(1.31 %)
21,157
(0.81 %)
213 downy mildews (GKB4 2021 genbank)
GCA_018691715.1
n/a 21,334
(23.20 %)
1,641
(1.07 %)
33,976
(44.50 %)
n/a 54.16
(99.69 %)
0
(0 %)
80
(0.31 %)
133
(100.00 %)
18,997
(0.80 %)
16,094
(2.84 %)
200,994
(27.68 %)
0
(0 %)
68,037
(10.52 %)
232
(99.71 %)
2,904
(21.16 %)
214 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1
25,483
(48.39 %)
n/a 12,405
(1.70 %)
23,073
(2.18 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
0
(0 %)
187
(0.34 %)
181
(100.00 %)
1,008,118
(21.51 %)
378,537
(3.38 %)
5,846,717
(32.04 %)
0
(0 %)
791,076
(4.25 %)
26,005
(1.75 %)
19,919
(1.16 %)
215 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1
15,850
(2.33 %)
n/a 11,864
(1.67 %)
11,795
(1.99 %)
n/a 44.51
(96.31 %)
96,471
(3.72 %)
96,471
(3.72 %)
127,725
(96.28 %)
842,281
(18.63 %)
310,018
(2.09 %)
5,822,687
(27.83 %)
59
(0.01 %)
397,798
(2.49 %)
17,379
(0.69 %)
13,913
(0.52 %)
216 E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank)
GCA_000750555.1
n/a 4,501
(88.85 %)
n/a n/a n/a 50.78
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 90
(0.38 %)
19,508
(7.44 %)
0
(0 %)
189
(0.40 %)
1
(99.99 %)
0
(0.00 %)
217 East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019)
GCF_008831285.1
39,088
(10.61 %)
n/a 11,569
(2.49 %)
38,114
(15.67 %)
n/a 38.59
(99.98 %)
625
(0.02 %)
627
(0.02 %)
1,425
(99.98 %)
230,165
(2.88 %)
153,929
(4.02 %)
2,160,647
(26.81 %)
1
(0.00 %)
233,651
(6.36 %)
24,567
(4.41 %)
18,177
(2.46 %)
218 eastern European house mouse (PWK_PhJ v1 2016)
GCA_001624775.1
n/a n/a 21,013
(2.21 %)
18,237
(1.40 %)
101,394
(4.09 %)
41.76
(90.89 %)
26,578
(1.66 %)
904,107
(9.24 %)
30,233
(98.34 %)
5,250,349
(40.55 %)
1,508,787
(2.97 %)
13,823,341
(28.09 %)
246,352
(1.73 %)
681,079
(2.29 %)
16,695
(0.43 %)
15,885
(0.40 %)
219 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1
57,628
(9.59 %)
n/a 15,348
(2.22 %)
28,518
(6.29 %)
42,170
(8.31 %)
41.07
(99.87 %)
115
(0.00 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
527,486
(5.98 %)
217,915
(1.89 %)
4,547,443
(30.78 %)
2
(0.00 %)
212,425
(2.79 %)
33,005
(1.88 %)
16,748
(0.95 %)
220 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1
n/a n/a 20,133
(1.87 %)
36,361
(1.80 %)
n/a 40.23
(99.96 %)
4,332
(0.02 %)
4,332
(0.02 %)
226,086
(99.98 %)
2,985,622
(32.66 %)
475,311
(1.11 %)
12,612,081
(27.34 %)
15
(0.00 %)
n/a 81,930
(5.75 %)
81,575
(4.78 %)
221 Egyptian rousette (v1 2020 genbank)
GCA_014176215.1
65,163
(51.34 %)
61,105
(4.04 %)
17,637
(2.08 %)
22,318
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
0
(0 %)
242
(1.41 %)
30
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,415
(1.02 %)
12,031,652
(26.52 %)
0
(0 %)
65,562
(0.33 %)
53,604
(6.69 %)
57,305
(5.33 %)
222 electric eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013358815.1
n/a n/a 15,954
(3.67 %)
48,976
(7.25 %)
n/a 42.49
(98.20 %)
0
(0 %)
227
(1.80 %)
90
(100.00 %)
567,621
(7.41 %)
564,288
(10.86 %)
2,935,361
(24.79 %)
1
(0.00 %)
630,046
(5.96 %)
44,501
(3.93 %)
34,390
(2.63 %)
223 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1
30,695
(4.95 %)
n/a 11,306
(1.54 %)
18,189
(3.03 %)
n/a 42.34
(96.16 %)
46,217
(3.85 %)
46,232
(3.85 %)
67,421
(96.15 %)
1,405,480
(27.29 %)
330,698
(2.60 %)
5,549,534
(36.65 %)
31
(0.01 %)
365,912
(2.44 %)
35,561
(2.16 %)
11,961
(0.52 %)
224 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1
n/a n/a 13,181
(1.74 %)
24,708
(2.10 %)
33,433
(3.99 %)
42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
512
(0.00 %)
802
(100.00 %)
504,527
(4.38 %)
259,276
(2.59 %)
7,105,965
(19.15 %)
8
(0.00 %)
316,149
(1.79 %)
41,784
(5.52 %)
41,105
(3.30 %)
225 epaulette shark (2021 genbank)
GCA_020745735.1
43,156
(39.58 %)
n/a 12,439
(0.39 %)
19,520
(1.06 %)
n/a 42.76
(98.05 %)
0
(0 %)
3,716
(1.95 %)
1,963
(100.00 %)
9,211,963
(69.93 %)
935,037
(6.51 %)
20,660,613
(43.88 %)
0
(0 %)
2,903,274
(4.44 %)
41,682
(1.08 %)
13,048
(0.16 %)
226 eudicots lettuce (Salinas v7 2020)
GCF_002870075.2
65,115
(2.96 %)
n/a 16,271
(0.65 %)
102,071
(6.37 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
3,138
(0.29 %)
353,389
(7.60 %)
11,454
(99.71 %)
1,109,875
(4.83 %)
983,866
(3.64 %)
12,335,790
(52.95 %)
2,249
(0.09 %)
1,828,920
(9.42 %)
117,743
(2.02 %)
19,959
(0.28 %)
227 Euphrates poplar (v1 2014)
GCF_000495115.1
56,539
(12.93 %)
n/a 20,844
(4.28 %)
41,664
(12.47 %)
n/a 32.08
(95.31 %)
23,174
(4.71 %)
23,174
(4.71 %)
32,789
(95.29 %)
332,532
(5.23 %)
246,766
(4.06 %)
2,679,673
(43.30 %)
21
(0.01 %)
283,121
(6.41 %)
2,781
(0.47 %)
1,761
(0.21 %)
228 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1
57,151
(2.48 %)
n/a 19,265
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,487,951
(32.73 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,723
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,258
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
54,563
(1.83 %)
229 Eurasian red squirrel (v1.1 2019)
GCA_902686455.1
n/a n/a 21,298
(1.58 %)
21,024
(1.36 %)
36,645
(1.54 %)
40.08
(94.33 %)
0
(0 %)
1,177
(5.67 %)
638
(100.00 %)
4,680,964
(35.76 %)
704,218
(1.42 %)
14,991,981
(31.49 %)
5
(0.00 %)
419,662
(1.29 %)
48,159
(1.04 %)
45,455
(0.95 %)
230 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1
45,658
(2.52 %)
n/a 19,724
(1.77 %)
19,069
(1.47 %)
34,561
(2.01 %)
42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
872
(0.26 %)
216
(100.00 %)
4,098,151
(26.75 %)
1,088,237
(2.91 %)
12,853,776
(32.42 %)
5
(0.00 %)
518,686
(1.69 %)
19,000
(0.58 %)
16,851
(0.46 %)
231 European conger (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514075.1
54,631
(54.17 %)
n/a 17,073
(1.89 %)
34,794
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
13
(0.00 %)
1,009
(0.02 %)
394
(100.00 %)
761,527
(5.99 %)
913,328
(13.25 %)
5,768,003
(35.48 %)
3
(0.00 %)
1,603,442
(8.94 %)
120,990
(6.12 %)
81,342
(2.93 %)
232 European eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013347855.1
n/a n/a 17,048
(2.22 %)
34,271
(5.56 %)
n/a 43.64
(99.61 %)
0
(0 %)
640
(0.40 %)
53
(100.00 %)
831,037
(5.48 %)
786,520
(8.15 %)
5,700,818
(27.40 %)
2
(0.00 %)
774,914
(5.14 %)
130,345
(8.19 %)
94,445
(4.12 %)
233 European mink (primary hap 2023 genbank)
GCA_030435805.1
69,556
(45.15 %)
n/a 18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
26
(100.00 %)
4,237,797
(30.90 %)
792,898
(2.69 %)
13,417,248
(36.59 %)
0
(0 %)
894,273
(2.55 %)
67,133
(2.54 %)
51,333
(1.62 %)
234 European peacock (2021 genbank)
GCA_905147045.1
22,557
(62.12 %)
n/a 4,716
(1.16 %)
12,599
(4.34 %)
26,251
(7.81 %)
33.70
(100.00 %)
0
(0 %)
10
(0.00 %)
42
(100.00 %)
212,528
(2.58 %)
60,682
(1.18 %)
3,127,157
(46.89 %)
0
(0 %)
154,469
(3.96 %)
24,620
(4.88 %)
7,312
(0.89 %)
235 European plaice (primary hap 2022 genbank)
GCA_947347685.1
46,467
(52.27 %)
n/a 14,820
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
0
(0 %)
1,072
(0.03 %)
356
(100.00 %)
476,317
(3.63 %)
520,730
(13.27 %)
3,283,400
(33.55 %)
2
(0.00 %)
525,277
(6.36 %)
47,051
(4.45 %)
21,879
(1.29 %)
236 European snow vole (primary hap 2023 genbank)
GCA_950005125.1
47,025
(39.90 %)
n/a 20,576
(1.75 %)
21,171
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
197
(0.00 %)
161
(100.00 %)
3,580,811
(22.71 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,125
(34.97 %)
4
(0.00 %)
954,164
(3.20 %)
20,725
(0.63 %)
17,303
(0.45 %)
237 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1
n/a n/a 11,276
(1.79 %)
21,238
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,333
(100.00 %)
466,567
(7.08 %)
182,345
(0.97 %)
6,037,183
(20.24 %)
0
(0 %)
110,549
(1.11 %)
29,648
(2.35 %)
26,084
(1.59 %)
238 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1
n/a n/a 12,415
(1.77 %)
23,484
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
0
(0 %)
894
(0.33 %)
357
(100.00 %)
539,737
(7.60 %)
227,500
(1.16 %)
6,768,805
(21.05 %)
4
(0.00 %)
181,333
(1.65 %)
34,729
(2.65 %)
30,692
(1.70 %)
239 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1
54,113
(34.13 %)
n/a 19,960
(1.65 %)
19,954
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
0
(0 %)
1,129
(0.01 %)
498
(100.00 %)
4,863,656
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,786
(40.58 %)
17
(0.00 %)
2,516,599
(5.37 %)
23,961
(0.53 %)
17,318
(0.36 %)
240 fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank)
GCA_011064685.1
32,738
(63.63 %)
n/a 5,744
(1.12 %)
26,631
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
0
(0 %)
525
(0.01 %)
91
(100.00 %)
168,479
(1.60 %)
72,876
(1.70 %)
3,384,083
(37.35 %)
0
(0 %)
128,947
(2.55 %)
30,753
(4.27 %)
12,571
(1.35 %)
241 fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020)
GCF_011064685.1
32,751
(9.65 %)
n/a 5,744
(1.12 %)
26,632
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
0
(0 %)
525
(0.01 %)
92
(100.00 %)
169,122
(1.61 %)
72,892
(1.70 %)
3,384,365
(37.36 %)
0
(0 %)
128,947
(2.55 %)
30,753
(4.27 %)
12,571
(1.35 %)
242 fire-bellied toad (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579735.1
n/a n/a 15,456
(0.21 %)
47,501
(0.88 %)
n/a 38.98
(98.02 %)
0
(0 %)
7,009
(1.99 %)
2,468
(100.00 %)
20,643,710
(70.75 %)
7,150,262
(12.27 %)
9,477
(98.01 %)
3
(0.00 %)
n/a 365,066
(1.20 %)
29,706
(0.10 %)
243 fission yeast (v1 972h- 2007 refseq)
GCF_000002945.1
12,393
(87.51 %)
n/a 5,085
(73.29 %)
3,403
(39.29 %)
n/a 36.05
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
4
(100.00 %)
3,336
(2.63 %)
1,034
(0.58 %)
80,458
(16.22 %)
1
(0.01 %)
411
(0.72 %)
105
(0.31 %)
95
(0.28 %)
244 fission yeast (v2 972h- 2019 genbank)
GCA_000002945.3
n/a 17,791
(77.29 %)
5,084
(73.46 %)
3,394
(39.28 %)
n/a 36.06
(100.00 %)
6
(0.00 %)
6
(0.00 %)
9
(100.00 %)
3,053
(1.03 %)
1,034
(0.58 %)
79,714
(16.06 %)
1
(0.01 %)
411
(0.72 %)
105
(0.31 %)
95
(0.28 %)
245 flatworm S.haematobium (v2 2020)
GCF_000699445.2
8,934
(5.16 %)
n/a 1,548
(0.29 %)
4,070
(2.36 %)
8,934
(5.16 %)
34.53
(99.76 %)
0
(0 %)
15,128
(0.26 %)
666
(100.00 %)
124,259
(1.58 %)
35,312
(1.17 %)
2,638,150
(34.10 %)
31
(0.01 %)
69,190
(3.97 %)
3,957
(0.38 %)
906
(0.11 %)
246 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2
n/a n/a 15,436
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
0
(0 %)
744
(1.81 %)
189
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,037
(2.21 %)
5,305,987
(30.67 %)
0
(0 %)
227,443
(2.84 %)
24,130
(1.26 %)
11,082
(0.48 %)
247 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1
39,651
(35.92 %)
n/a 18,302
(1.36 %)
20,592
(1.23 %)
32,831
(1.38 %)
40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
160,167
(10.78 %)
166,489
(89.22 %)
5,109,822
(37.03 %)
389,314
(0.74 %)
14,633,007
(38.46 %)
5,748
(0.06 %)
244,060
(0.64 %)
27,461
(0.64 %)
25,464
(0.54 %)
248 fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019)
GCF_009650485.1
24,196
(18.66 %)
n/a 10,065
(8.48 %)
14,473
(13.61 %)
n/a 38.15
(100.00 %)
0
(0 %)
7
(0.00 %)
11
(100.00 %)
298,709
(14.86 %)
80,048
(3.56 %)
1,317,733
(33.56 %)
0
(0 %)
69,521
(4.49 %)
18,849
(8.62 %)
11,752
(5.15 %)
249 fly D.santomea (v1.0 2021)
GCF_016746245.1
25,550
(21.64 %)
n/a 13,354
(17.52 %)
20,540
(17.87 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
104
(100.00 %)
169,365
(23.08 %)
64,316
(3.47 %)
791,743
(23.14 %)
0
(0 %)
69,581
(6.26 %)
27,794
(16.15 %)
20,742
(10.27 %)
250 fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine)
GCF_004382195.1
26,658
(22.06 %)
n/a 13,461
(17.65 %)
21,781
(17.83 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
38
(0.00 %)
402
(100.00 %)
145,818
(25.16 %)
34,869
(4.31 %)
719,811
(25.74 %)
0
(0 %)
87,076
(8.91 %)
30,130
(16.11 %)
22,906
(10.22 %)
251 fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017)
GCF_002093755.1
21,759
(15.21 %)
n/a 12,488
(9.92 %)
21,269
(14.06 %)
n/a 39.11
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,356
(100.00 %)
314,594
(25.90 %)
82,446
(12.33 %)
1,113,448
(37.00 %)
0
(0 %)
199,881
(8.53 %)
27,493
(12.03 %)
20,330
(8.62 %)
252 fly D.simulans (w501 v3.0 2021)
GCF_016746395.1
28,582
(26.45 %)
n/a 13,448
(20.44 %)
18,989
(18.34 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
96
(100.00 %)
126,424
(16.72 %)
32,595
(4.31 %)
759,296
(23.70 %)
0
(0 %)
46,993
(4.17 %)
27,530
(17.02 %)
20,622
(10.65 %)
253 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2
5,431
(4.09 %)
n/a 13,713
(15.95 %)
22,613
(16.71 %)
n/a 42.28
(98.12 %)
5,317
(1.88 %)
5,400
(1.88 %)
13,440
(98.12 %)
180,908
(22.48 %)
68,911
(3.75 %)
897,353
(23.94 %)
85
(0.04 %)
85,136
(6.91 %)
31,387
(14.91 %)
22,960
(9.55 %)
254 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1
27,925
(24.59 %)
n/a 13,343
(17.86 %)
20,029
(17.64 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
54
(100.00 %)
169,559
(23.47 %)
60,591
(3.64 %)
837,616
(23.40 %)
0
(0 %)
64,895
(6.52 %)
28,204
(16.22 %)
22,365
(10.80 %)
255 Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank)
GCA_902459505.1
54,713
(61.19 %)
n/a 14,267
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
163
(100.00 %)
1,311,113
(1.64 %)
1,364,596
(3.83 %)
19,589,738
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,977
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
256 Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_902459505.1
54,726
(1.72 %)
n/a 14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,310,970
(1.64 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,802
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,977
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
257 giant manta (hap1 2023 genbank)
GCA_030028105.1
n/a n/a 12,432
(0.38 %)
24,821
(1.16 %)
n/a 43.26
(99.23 %)
0
(0 %)
1,810
(0.77 %)
4,715
(100.00 %)
7,913,208
(49.68 %)
969,352
(14.22 %)
20,235,210
(54.42 %)
17
(0.00 %)
4,636,724
(7.12 %)
110,678
(1.74 %)
30,504
(0.36 %)
258 giant panda (2009 BGI)
GCF_000004335.2
40,432
(2.55 %)
n/a 18,884
(1.76 %)
18,919
(1.46 %)
n/a 41.60
(97.66 %)
119,126
(2.36 %)
119,126
(2.36 %)
200,593
(97.64 %)
4,236,423
(40.48 %)
503,179
(1.10 %)
13,781,487
(28.85 %)
48
(0.00 %)
252,804
(0.90 %)
53,465
(1.34 %)
45,835
(1.12 %)
259 giant panda (Jingjing v1 2017)
GCA_002007445.1
n/a n/a 20,110
(1.71 %)
22,288
(1.49 %)
n/a 41.69
(98.08 %)
186,846
(1.93 %)
186,846
(1.93 %)
244,258
(98.07 %)
4,464,041
(41.66 %)
614,896
(2.00 %)
14,294,774
(30.62 %)
9,506
(0.14 %)
580,134
(4.39 %)
59,340
(1.50 %)
49,319
(1.23 %)
260 giant panda (Jingjing v2 genbank 2020)
GCA_002007445.2
n/a n/a 20,381
(1.71 %)
21,979
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
0
(0 %)
190,364
(1.92 %)
77,287
(100.00 %)
4,484,597
(41.53 %)
618,595
(2.00 %)
14,236,406
(30.39 %)
9,762
(0.14 %)
583,295
(4.39 %)
59,945
(1.50 %)
49,872
(1.23 %)
261 giant panda (Jingjing v2 refseq 2020)
GCF_002007445.1
67,162
(3.32 %)
n/a 20,374
(1.71 %)
21,965
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
0
(0 %)
190,364
(1.92 %)
77,288
(100.00 %)
4,476,689
(41.47 %)
618,596
(2.00 %)
14,236,463
(30.39 %)
9,762
(0.14 %)
583,300
(4.39 %)
59,946
(1.50 %)
49,916
(1.23 %)
262 gilthead seabream (v1 2019)
GCF_900880675.1
59,040
(10.97 %)
n/a 15,412
(2.36 %)
31,802
(6.47 %)
73,197
(7.97 %)
41.94
(99.96 %)
0
(0 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
531,360
(3.04 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,694
(25.69 %)
0
(0 %)
355,475
(3.53 %)
47,327
(2.41 %)
23,697
(1.07 %)
263 Glanville fritillary (genbank 2021)
GCA_905220565.1
17,520
(43.15 %)
n/a 4,738
(0.89 %)
16,197
(5.05 %)
35,235
(7.97 %)
34.09
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.01 %)
32
(100.00 %)
343,193
(3.25 %)
144,286
(3.46 %)
3,683,956
(48.60 %)
0
(0 %)
198,815
(3.74 %)
30,200
(4.54 %)
11,245
(1.52 %)
264 globe artichoke (v1 2C 2018)
GCF_001531365.1
42,119
(6.72 %)
n/a 15,804
(2.23 %)
49,721
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
5,305
(0.07 %)
310,473
(9.77 %)
13,588
(99.93 %)
394,687
(2.79 %)
364,361
(3.37 %)
4,191,676
(39.48 %)
3,050
(0.15 %)
283,546
(3.56 %)
12,198
(0.64 %)
7,326
(0.39 %)
265 goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1
0
(0.00 %)
n/a 19,842
(1.43 %)
22,426
(1.24 %)
52,608
(1.64 %)
43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
790
(0.00 %)
29,906
(100.00 %)
5,669,868
(50.59 %)
760,836
(7.07 %)
13,024,386
(44.85 %)
0
(0 %)
2,571,292
(5.65 %)
125,682
(4.01 %)
44,489
(1.09 %)
266 goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1
47,206
(2.31 %)
n/a 19,859
(1.44 %)
22,429
(1.24 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
790
(0.00 %)
29,907
(100.00 %)
5,670,600
(50.59 %)
760,837
(7.07 %)
13,024,197
(44.85 %)
0
(0 %)
2,571,343
(5.65 %)
125,682
(4.01 %)
44,489
(1.09 %)
267 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1
55,164
(5.86 %)
n/a 13,226
(1.87 %)
23,033
(2.15 %)
25,921
(3.22 %)
42.11
(99.61 %)
0
(0 %)
191
(0.39 %)
142
(100.00 %)
519,341
(5.86 %)
180,990
(0.79 %)
7,005,531
(19.25 %)
1
(0.00 %)
53,053
(0.51 %)
37,343
(3.12 %)
34,701
(1.97 %)
268 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1
n/a n/a 9,334
(1.82 %)
17,594
(2.12 %)
n/a 42.53
(99.93 %)
0
(0 %)
39
(0.07 %)
3,860
(100.00 %)
356,284
(6.03 %)
123,430
(0.80 %)
4,417,887
(19.25 %)
0
(0 %)
53,254
(0.85 %)
28,919
(3.52 %)
25,970
(2.20 %)
269 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1
0
(0.00 %)
n/a 18,965
(1.82 %)
19,339
(1.52 %)
n/a 42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
216,216
(17.12 %)
237,699
(82.88 %)
3,724,142
(27.19 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,866
(24.29 %)
3,589
(0.05 %)
254,929
(0.76 %)
18,591
(0.51 %)
17,093
(0.42 %)
270 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1
n/a n/a 21,341
(1.86 %)
22,492
(1.24 %)
n/a 40.87
(98.50 %)
61,291
(1.50 %)
61,291
(1.50 %)
196,804
(98.50 %)
5,673,299
(51.36 %)
1,080,627
(3.06 %)
16,205,827
(36.77 %)
187
(0.01 %)
1,068,178
(2.78 %)
79,387
(1.14 %)
27,171
(0.63 %)
271 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 genbank)
GCA_029215685.1
n/a n/a 12,291
(1.06 %)
19,125
(2.02 %)
n/a 40.55
(100.00 %)
584
(0.00 %)
584
(0.00 %)
1,233
(100.00 %)
1,259,781
(7.92 %)
925,571
(7.56 %)
7,739,320
(45.92 %)
3
(0.00 %)
840,495
(4.04 %)
73,681
(2.81 %)
26,366
(0.92 %)
272 grape phylloxera (Bord-2020 2022 genbank)
GCA_025091365.1
n/a n/a 2,982
(0.90 %)
5,710
(2.77 %)
n/a 27.24
(97.73 %)
0
(0 %)
41,970
(2.29 %)
8,544
(100.00 %)
195,538
(3.32 %)
65,664
(2.79 %)
2,529,566
(54.06 %)
4,954
(0.23 %)
100,935
(4.52 %)
4,357
(1.18 %)
3,416
(0.91 %)
273 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3
n/a n/a 20,031
(1.89 %)
22,619
(1.50 %)
n/a 40.98
(95.94 %)
43,305
(4.06 %)
43,363
(4.06 %)
50,982
(95.94 %)
4,082,873
(41.60 %)
582,430
(1.47 %)
14,808,558
(30.05 %)
325
(0.02 %)
1,168,690
(4.77 %)
74,772
(2.61 %)
69,260
(2.12 %)
274 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887165.1
73,383
(42.66 %)
n/a 16,638
(0.72 %)
16,171
(0.86 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
0
(0 %)
2,255
(0.89 %)
14
(100.00 %)
5,562,366
(25.40 %)
1,096,625
(2.60 %)
22,322,798
(43.37 %)
13
(0.00 %)
n/a 28,894
(0.57 %)
22,987
(0.42 %)
275 great fruit-eating bat (v1 hap1 2024)
GCA_038363095.1
n/a n/a 18,022
(1.56 %)
20,018
(1.52 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
419
(100.00 %)
2,827,417
(26.82 %)
371,479
(4.97 %)
11,603,093
(34.64 %)
1
(0.00 %)
522,672
(1.87 %)
71,574
(2.28 %)
54,020
(1.50 %)
276 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1
50,937
(43.78 %)
n/a 19,011
(2.00 %)
19,882
(1.66 %)
41,741
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
0
(0 %)
172,751
(12.60 %)
7,570
(100.00 %)
3,078,210
(32.07 %)
495,290
(1.05 %)
11,588,202
(25.43 %)
2,116
(0.03 %)
193,024
(1.10 %)
33,101
(0.97 %)
30,240
(0.87 %)
277 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1
50,950
(3.26 %)
n/a 18,992
(2.00 %)
19,880
(1.66 %)
41,778
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
0
(0 %)
172,751
(12.60 %)
7,571
(100.00 %)
3,285,971
(33.14 %)
495,292
(1.05 %)
11,588,248
(25.43 %)
2,116
(0.03 %)
193,024
(1.10 %)
33,101
(0.97 %)
29,553
(0.86 %)
278 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1
n/a 41,563
(2.11 %)
18,531
(1.97 %)
20,309
(1.67 %)
n/a 40.52
(99.19 %)
0
(0 %)
292
(0.81 %)
50
(100.00 %)
3,284,473
(35.00 %)
559,653
(1.29 %)
12,043,562
(29.15 %)
0
(0 %)
155,142
(0.71 %)
32,047
(1.05 %)
30,235
(0.96 %)
279 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2
53,353
(46.77 %)
n/a 18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,301,020
(34.99 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,069
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,625
(0.98 %)
280 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1
53,352
(3.13 %)
n/a 18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,300,836
(34.99 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,627
(0.98 %)
281 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1
n/a n/a 23,153
(1.31 %)
51,642
(1.43 %)
n/a 43.16
(99.88 %)
8,133
(0.04 %)
8,133
(0.04 %)
1,053,330
(99.96 %)
3,675,075
(25.48 %)
938,700
(2.73 %)
12,027,923
(39.01 %)
44
(0.00 %)
n/a 80,955
(2.31 %)
64,379
(1.67 %)
282 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1
n/a n/a 13,467
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,442
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
0
(0 %)
112,918
(3.25 %)
46,340
(13.40 %)
32,897
(5.93 %)
283 greater sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850765.1
n/a n/a 18,322
(1.40 %)
21,049
(1.35 %)
n/a 41.71
(98.73 %)
102
(0.41 %)
468
(1.27 %)
359
(99.59 %)
4,247,148
(29.53 %)
1,031,385
(2.50 %)
12,465,194
(43.30 %)
3
(0.00 %)
1,113,639
(2.95 %)
101,620
(2.01 %)
44,590
(1.04 %)
284 greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank)
GCA_003640425.2
20,814
(51.89 %)
n/a 4,346
(0.99 %)
12,930
(3.50 %)
21,226
(7.60 %)
33.06
(99.10 %)
0
(0 %)
27,314
(0.92 %)
13,303
(100.00 %)
270,925
(3.18 %)
86,050
(1.20 %)
3,416,162
(48.29 %)
102
(0.01 %)
135,364
(1.95 %)
11,043
(1.07 %)
7,092
(0.63 %)
285 green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007)
GCF_000002595.1
14,410
(22.17 %)
n/a 987
(0.55 %)
11,299
(59.37 %)
n/a 63.87
(87.58 %)
9,827
(12.45 %)
10,425
(12.45 %)
11,385
(87.55 %)
167,652
(16.23 %)
100,391
(4.60 %)
734,057
(30.38 %)
3
(0.00 %)
37,459
(3.99 %)
3,154
(63.45 %)
17,305
(12.08 %)
286 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank)
GCA_000002595.3
n/a 19,528
(53.99 %)
988
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
171,684
(17.03 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
26
(0.03 %)
48,564
(5.08 %)
106
(99.48 %)
15,883
(12.21 %)
287 green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank)
GCA_000147415.1
9,780
(62.01 %)
9,780
(32.79 %)
743
(1.01 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,396
(8.55 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
65,787
(8.35 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
0
(0 %)
6,856
(2.06 %)
776
(95.90 %)
9,593
(9.00 %)
288 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2
76,037
(46.89 %)
n/a 20,079
(1.94 %)
20,246
(1.25 %)
n/a 40.81
(98.67 %)
160,731
(1.35 %)
178,925
(1.35 %)
163,017
(98.65 %)
5,382,039
(50.20 %)
980,479
(2.63 %)
16,076,172
(35.62 %)
23,631
(0.16 %)
934,122
(2.70 %)
50,033
(1.04 %)
27,104
(0.75 %)
289 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1
31,773
(2.57 %)
n/a 14,548
(1.02 %)
15,297
(1.46 %)
n/a 43.49
(95.57 %)
134,344
(4.44 %)
134,344
(4.44 %)
274,367
(95.56 %)
1,615,553
(13.87 %)
317,600
(2.08 %)
11,732,990
(28.32 %)
129
(0.02 %)
n/a 36,782
(0.70 %)
21,797
(0.42 %)
290 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1
56,904
(3.63 %)
n/a 14,729
(1.06 %)
17,439
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
0
(0 %)
294
(0.56 %)
99
(100.00 %)
1,641,730
(15.08 %)
304,356
(1.25 %)
11,136,918
(31.96 %)
0
(0 %)
429,794
(1.68 %)
49,035
(1.44 %)
26,943
(0.68 %)
291 harbor porpoise (BS71 2019)
GCA_004363495.1
n/a n/a 21,044
(1.46 %)
30,072
(1.23 %)
n/a 41.83
(99.88 %)
7,114
(0.03 %)
7,114
(0.03 %)
1,338,272
(99.97 %)
5,359,537
(46.83 %)
772,736
(1.54 %)
13,705,428
(42.29 %)
44
(0.00 %)
n/a 80,965
(1.65 %)
55,941
(1.28 %)
292 Harpy eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_026419915.1
51,641
(50.37 %)
n/a 13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
0
(0 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
1
(0.00 %)
480,042
(2.70 %)
60,606
(5.66 %)
30,636
(1.52 %)
293 Hawaiian crow (2021 genbank)
GCA_020740725.1
51,593
(54.67 %)
n/a 12,737
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
0
(0 %)
294
(0.16 %)
187
(100.00 %)
502,844
(6.10 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,316
(23.59 %)
3
(0.00 %)
336,844
(2.41 %)
46,108
(3.49 %)
24,228
(1.26 %)
294 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank)
GCA_002201575.1
0
(0.00 %)
n/a 19,385
(1.74 %)
20,265
(1.41 %)
33,375
(1.66 %)
41.41
(97.77 %)
0
(0 %)
38,833
(2.24 %)
7,871
(100.00 %)
4,629,031
(43.70 %)
573,328
(1.09 %)
13,374,887
(33.10 %)
882
(0.03 %)
587,399
(1.58 %)
50,379
(1.45 %)
46,745
(1.27 %)
295 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq)
GCF_002201575.1
29,897
(1.95 %)
n/a 19,380
(1.75 %)
20,272
(1.41 %)
n/a 41.41
(97.77 %)
0
(0 %)
38,833
(2.24 %)
7,872
(100.00 %)
4,629,766
(43.70 %)
573,335
(1.09 %)
13,369,616
(33.10 %)
882
(0.03 %)
587,410
(1.58 %)
50,380
(1.45 %)
46,744
(1.27 %)
296 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v1 hap1 2024)
GCA_040954625.1
n/a n/a 4,944
(1.30 %)
35,031
(15.53 %)
n/a 39.72
(99.96 %)
0
(0 %)
254
(0.04 %)
77
(100.00 %)
87,841
(1.67 %)
119,697
(13.20 %)
1,309,907
(29.40 %)
5
(0.00 %)
336,770
(8.96 %)
21,623
(4.17 %)
15,834
(2.51 %)
297 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v1 hap2 2024)
GCA_040954595.1
n/a n/a 4,919
(1.33 %)
34,873
(16.02 %)
n/a 39.72
(99.96 %)
0
(0 %)
254
(0.04 %)
56
(100.00 %)
84,495
(1.58 %)
118,073
(13.23 %)
1,301,514
(28.77 %)
3
(0.00 %)
317,532
(8.60 %)
20,511
(4.03 %)
15,567
(2.64 %)
298 hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank)
GCA_030028045.1
64,153
(41.00 %)
n/a 20,337
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
0
(0 %)
226
(0.00 %)
356
(100.00 %)
3,783,435
(35.17 %)
567,796
(3.38 %)
13,462,481
(35.48 %)
2
(0.00 %)
396,368
(1.55 %)
48,365
(1.91 %)
44,048
(1.34 %)
299 Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.1
49,894
(2.81 %)
n/a 18,317
(1.66 %)
19,991
(1.63 %)
n/a 42.33
(99.79 %)
0
(0 %)
38,823
(0.21 %)
27,486
(100.00 %)
2,844,834
(29.10 %)
367,443
(1.49 %)
11,805,151
(31.26 %)
151
(0.00 %)
330,522
(1.83 %)
59,262
(1.70 %)
48,287
(1.35 %)
300 honeybee mite (v1 2017)
GCF_002443255.1
35,641
(12.86 %)
n/a 2,741
(0.61 %)
28,868
(8.05 %)
n/a 40.92
(99.93 %)
0
(0 %)
3,073
(0.07 %)
1,426
(100.00 %)
117,879
(1.26 %)
43,685
(1.30 %)
1,858,762
(15.09 %)
11
(0.00 %)
32,482
(0.75 %)
31,400
(5.04 %)
28,693
(3.46 %)
301 hooded crow (v2 S_Up_H32 2017)
GCF_000738735.2
35,874
(6.47 %)
n/a 11,298
(1.84 %)
17,627
(2.12 %)
n/a 41.48
(97.07 %)
0
(0 %)
27,795
(2.94 %)
113
(100.00 %)
392,199
(5.95 %)
139,126
(0.76 %)
6,141,002
(18.21 %)
16
(0.00 %)
38,866
(0.37 %)
12,943
(0.48 %)
10,321
(0.36 %)
302 hooded crow (v5 S_Up_H32 2021)
GCF_000738735.5
42,799
(6.57 %)
n/a 11,845
(1.92 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
0
(0 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
421,463
(6.12 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
0
(0 %)
77,475
(0.63 %)
25,266
(2.09 %)
20,747
(1.24 %)
303 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1
n/a n/a 18,575
(1.67 %)
17,121
(1.34 %)
n/a 41.50
(98.14 %)
45,680
(1.86 %)
45,680
(1.86 %)
55,316
(98.14 %)
3,941,878
(45.17 %)
381,229
(1.99 %)
14,674,265
(29.80 %)
3
(0.00 %)
384,525
(1.12 %)
45,521
(1.52 %)
36,682
(0.85 %)
304 hourglass treefrog (paternal 2023 genbank)
GCA_027789765.1
n/a n/a 14,058
(0.89 %)
31,050
(2.69 %)
n/a 43.97
(99.70 %)
0
(0 %)
804
(0.30 %)
2,200
(100.00 %)
906,816
(2.43 %)
1,710,859
(17.48 %)
10,069,798
(51.41 %)
3
(0.00 %)
3,539,111
(9.05 %)
235,277
(5.56 %)
28,414
(0.63 %)
305 house finch (primary hap 2022 genbank)
GCA_027477595.1
43,228
(49.63 %)
n/a 12,700
(1.83 %)
24,567
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
0
(0 %)
295
(0.98 %)
183
(100.00 %)
440,379
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,100
(23.47 %)
1
(0.00 %)
573,829
(3.39 %)
30,897
(2.53 %)
22,852
(1.24 %)
306 house fly (aabys 2013 genbank)
GCA_000371365.1
n/a n/a 7,825
(1.36 %)
12,819
(3.07 %)
n/a 35.11
(92.22 %)
83,567
(7.82 %)
102,610
(7.82 %)
104,053
(92.18 %)
415,874
(2.30 %)
376,409
(8.80 %)
4,931,104
(52.61 %)
1,284
(0.11 %)
575,203
(6.40 %)
7,139
(0.35 %)
3,214
(0.17 %)
307 house mouse (AKR_J v1 2016)
GCA_001624295.1
n/a n/a 21,299
(2.19 %)
18,730
(1.41 %)
102,168
(4.09 %)
41.70
(86.82 %)
34,083
(4.00 %)
314,064
(13.22 %)
40,550
(96.00 %)
5,186,721
(40.97 %)
1,485,719
(3.05 %)
13,610,761
(27.42 %)
18,106
(1.03 %)
469,625
(2.17 %)
16,745
(0.41 %)
15,817
(0.38 %)
308 house mouse (A_J v1 2016)
GCA_001624215.1
n/a n/a 21,171
(2.20 %)
18,776
(1.40 %)
102,254
(4.12 %)
41.70
(89.34 %)
28,597
(3.99 %)
365,877
(10.71 %)
33,692
(96.01 %)
5,186,523
(40.90 %)
1,483,826
(3.06 %)
13,614,266
(28.13 %)
38,843
(1.02 %)
487,933
(2.04 %)
16,590
(0.42 %)
15,701
(0.39 %)
309 house mouse (BALB_cJ v1 2016)
GCA_001632525.1
n/a n/a 21,337
(2.21 %)
18,682
(1.41 %)
102,138
(4.14 %)
41.74
(88.91 %)
32,984
(4.16 %)
361,689
(11.14 %)
37,453
(95.84 %)
5,096,953
(40.72 %)
1,407,754
(2.90 %)
13,416,041
(27.66 %)
15,793
(0.80 %)
453,227
(1.90 %)
16,788
(0.42 %)
15,890
(0.39 %)
310 house mouse (C3H_HeJ v1 2016)
GCA_001632575.1
n/a n/a 21,177
(2.22 %)
18,550
(1.42 %)
101,710
(4.15 %)
41.74
(85.90 %)
32,785
(4.09 %)
369,499
(14.15 %)
37,497
(95.91 %)
5,089,496
(40.41 %)
1,399,438
(2.72 %)
13,485,480
(26.52 %)
19,436
(0.94 %)
427,663
(1.66 %)
16,675
(0.41 %)
15,897
(0.38 %)
311 house mouse (CBA_J v1 2016)
GCA_001624475.1
n/a n/a 21,259
(2.23 %)
18,593
(1.42 %)
101,632
(4.14 %)
41.78
(79.43 %)
36,013
(3.86 %)
410,639
(20.63 %)
42,242
(96.14 %)
5,081,543
(40.40 %)
1,393,763
(2.54 %)
13,472,532
(24.46 %)
24,180
(1.46 %)
418,702
(1.72 %)
16,809
(0.38 %)
15,953
(0.35 %)
312 house mouse (DBA_2J v1 2016)
GCA_001624505.1
n/a n/a 21,156
(2.23 %)
18,610
(1.43 %)
101,908
(4.18 %)
41.80
(88.67 %)
37,461
(4.86 %)
409,306
(11.39 %)
42,324
(95.14 %)
5,028,217
(40.37 %)
1,364,702
(2.73 %)
13,540,805
(27.33 %)
13,245
(0.55 %)
420,635
(1.47 %)
16,544
(0.42 %)
15,786
(0.39 %)
313 house mouse (FVB_NJ v1 2016)
GCA_001624535.1
n/a n/a 21,195
(2.22 %)
18,615
(1.42 %)
101,520
(4.15 %)
41.75
(89.39 %)
61,976
(6.27 %)
380,840
(10.66 %)
67,805
(93.73 %)
5,037,447
(40.28 %)
1,381,859
(2.89 %)
13,440,164
(27.32 %)
14,811
(0.71 %)
426,149
(1.81 %)
16,625
(0.42 %)
15,829
(0.39 %)
314 house mouse (GRCm38.p6 2017)
GCF_000001635.26
123,654
(4.49 %)
n/a 24,134
(2.09 %)
22,855
(1.67 %)
n/a 41.73
(97.18 %)
676
(2.82 %)
904
(2.82 %)
21,179
(97.18 %)
5,554,281
(45.50 %)
1,695,255
(3.40 %)
13,041,229
(35.91 %)
3
(0.00 %)
889,196
(2.45 %)
25,014
(0.54 %)
16,961
(0.40 %)
315 house mouse (LP_J v1 2016)
GCA_001632615.1
n/a n/a 21,012
(2.23 %)
18,555
(1.43 %)
101,892
(4.18 %)
41.78
(84.14 %)
34,444
(4.11 %)
402,247
(15.91 %)
38,542
(95.89 %)
5,032,748
(40.03 %)
1,373,374
(2.60 %)
13,411,126
(25.61 %)
18,175
(0.88 %)
405,473
(1.47 %)
16,668
(0.40 %)
15,888
(0.37 %)
316 house mouse (NOD_ShiLtJ v1 2016)
GCA_001624675.1
n/a n/a 21,291
(2.24 %)
19,697
(1.47 %)
101,562
(4.18 %)
42.00
(77.13 %)
60,087
(4.21 %)
595,433
(22.95 %)
66,154
(95.79 %)
5,059,815
(40.57 %)
1,370,443
(2.51 %)
13,251,532
(23.62 %)
36,838
(1.54 %)
452,044
(2.17 %)
18,188
(0.42 %)
17,273
(0.39 %)
317 house mouse (NZO_HlLtJ v1 2016)
GCA_001624745.1
n/a n/a 21,233
(2.22 %)
18,805
(1.43 %)
103,134
(4.18 %)
41.74
(86.47 %)
49,204
(4.63 %)
337,909
(13.58 %)
57,439
(95.37 %)
5,112,301
(40.60 %)
1,418,629
(2.92 %)
13,588,055
(27.01 %)
21,209
(1.18 %)
440,820
(2.04 %)
16,857
(0.41 %)
15,946
(0.38 %)
318 human (HG00438.mat 2021)
GCA_018471515.1
n/a n/a 20,788
(1.85 %)
22,424
(1.25 %)
233,427
(57.20 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 258
(100.00 %)
5,426,471
(53.12 %)
1,085,458
(7.66 %)
16,023,596
(40.44 %)
0
(0 %)
1,660,644
(3.30 %)
52,702
(1.17 %)
28,454
(0.75 %)
319 human (HG00438.pat 2021)
GCA_018472595.1
n/a n/a 20,627
(1.85 %)
22,176
(1.24 %)
233,698
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
276
(100.00 %)
5,419,334
(52.97 %)
1,071,302
(7.38 %)
15,894,505
(40.10 %)
0
(0 %)
1,681,408
(3.32 %)
52,377
(1.20 %)
28,532
(0.76 %)
320 human (HG00621.mat 2021)
GCA_018472605.1
n/a n/a 20,611
(1.85 %)
22,275
(1.25 %)
233,258
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 253
(100.00 %)
5,392,161
(53.03 %)
1,048,372
(7.50 %)
15,960,374
(40.31 %)
0
(0 %)
1,701,207
(3.32 %)
52,502
(1.20 %)
28,554
(0.77 %)
321 human (HG00621.pat 2021)
GCA_018472575.1
n/a n/a 19,907
(1.86 %)
21,558
(1.26 %)
227,172
(5.00 %)
40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 287
(100.00 %)
5,174,496
(52.83 %)
1,030,071
(7.85 %)
15,147,153
(40.18 %)
0
(0 %)
1,671,972
(3.41 %)
50,988
(1.20 %)
27,845
(0.76 %)
322 human (HG00673.mat 2021)
GCA_018472565.1
n/a n/a 20,805
(1.84 %)
22,193
(1.24 %)
233,975
(4.93 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 348
(100.00 %)
5,408,639
(53.33 %)
1,056,398
(8.05 %)
16,117,475
(40.76 %)
0
(0 %)
1,829,654
(3.54 %)
52,411
(1.14 %)
28,185
(0.74 %)
323 human (HG00673.pat 2021)
GCA_018472585.1
n/a n/a 19,963
(1.85 %)
21,514
(1.25 %)
227,480
(4.97 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
420
(100.00 %)
5,185,516
(53.08 %)
1,065,657
(8.25 %)
15,183,778
(40.61 %)
0
(0 %)
1,749,434
(3.59 %)
50,883
(1.20 %)
27,934
(0.76 %)
324 human (HG00733 mat 2021)
GCA_018506975.1
n/a n/a 20,626
(1.85 %)
22,511
(1.25 %)
233,295
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
609
(100.00 %)
5,412,701
(52.97 %)
1,052,600
(7.34 %)
15,895,725
(40.14 %)
0
(0 %)
1,726,181
(3.39 %)
53,216
(1.22 %)
28,848
(0.77 %)
325 human (HG00733 pat 2021)
GCA_018506955.1
n/a n/a 20,749
(1.85 %)
22,251
(1.24 %)
233,792
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
695
(100.00 %)
5,420,299
(53.15 %)
1,076,604
(7.72 %)
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(40.46 %)
0
(0 %)
1,774,653
(3.49 %)
53,315
(1.19 %)
28,785
(0.76 %)
326 human (HG00735.mat 2021)
GCA_018472765.1
n/a n/a 20,674
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(100.00 %)
0
(0 %)
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(0.00 %)
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0
(0 %)
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(3.39 %)
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(1.14 %)
28,228
(0.74 %)
327 human (HG00735.pat 2021)
GCA_018472715.1
n/a n/a 20,688
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(0.00 %)
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(0 %)
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(3.44 %)
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(1.14 %)
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(0.74 %)
328 human (HG00741.mat 2021)
GCA_018471095.1
n/a n/a 20,654
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(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 297
(100.00 %)
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(0 %)
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(3.47 %)
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(1.14 %)
28,292
(0.75 %)
329 human (HG00741.pat 2021)
GCA_018471105.1
n/a n/a 20,657
(1.85 %)
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(0.00 %)
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(0.75 %)
330 human (HG01071.mat 2021)
GCA_018472685.1
n/a n/a 20,742
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(100.00 %)
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n/a 236
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(3.18 %)
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(0.74 %)
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GCA_018472725.1
n/a n/a 20,694
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(3.60 %)
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(0.75 %)
332 human (HG01106.mat 2021)
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n/a n/a 20,635
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(100.00 %)
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(0 %)
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(3.52 %)
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(0.76 %)
333 human (HG01106.pat 2021)
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n/a n/a 19,939
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(100.00 %)
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(3.55 %)
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(1.19 %)
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(0.76 %)
334 human (HG01109.mat 2021)
GCA_018504365.1
n/a n/a 20,638
(1.84 %)
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(1.25 %)
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(4.94 %)
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(100.00 %)
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(0.00 %)
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(100.00 %)
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(1.22 %)
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(0.77 %)
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GCA_018504645.1
n/a n/a 19,870
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(0.77 %)
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n/a n/a 20,643
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(0.00 %)
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0
(0 %)
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(1.15 %)
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(0.76 %)
337 human (HG01123.pat 2021)
GCA_018469695.1
n/a n/a 20,631
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(1.24 %)
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(4.97 %)
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(100.00 %)
0
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(0.00 %)
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(100.00 %)
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(0 %)
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(0.76 %)
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n/a n/a 20,587
(1.84 %)
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(1.24 %)
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(4.93 %)
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(100.00 %)
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(0.00 %)
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(100.00 %)
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(3.46 %)
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(1.14 %)
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(0.74 %)
339 human (HG01175.pat 2021)
GCA_018471065.1
n/a n/a 20,651
(1.85 %)
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(1.25 %)
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(4.94 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
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(100.00 %)
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(53.10 %)
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(40.44 %)
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(0 %)
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(3.35 %)
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(1.16 %)
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(0.75 %)
340 human (HG01243.mat 2021)
GCA_018504375.1
n/a n/a 20,701
(1.85 %)
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(1.24 %)
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(4.94 %)
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(100.00 %)
0
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n/a 345
(100.00 %)
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(7.61 %)
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(3.37 %)
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(1.16 %)
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(0.75 %)
341 human (HG01243.pat 2021)
GCA_018504045.1
n/a n/a 19,886
(1.86 %)
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(1.26 %)
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(100.00 %)
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1
(0.00 %)
436
(100.00 %)
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(52.80 %)
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(7.85 %)
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0
(0 %)
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(3.44 %)
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(1.26 %)
28,132
(0.77 %)
342 human (HG01258.mat 2021)
GCA_018469405.1
n/a n/a 20,652
(1.85 %)
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(1.25 %)
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(4.95 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
346
(100.00 %)
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(53.06 %)
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(7.57 %)
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(40.29 %)
0
(0 %)
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(3.35 %)
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(1.24 %)
28,873
(0.78 %)
343 human (HG01258.pat 2021)
GCA_018469675.1
n/a n/a 19,899
(1.85 %)
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(1.25 %)
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(4.98 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
324
(100.00 %)
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(52.93 %)
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(8.01 %)
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(40.34 %)
0
(0 %)
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(3.50 %)
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(1.15 %)
27,621
(0.75 %)
344 human (HG01358.mat 2021)
GCA_018469865.1
n/a n/a 20,620
(1.85 %)
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(1.24 %)
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(57.14 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
334
(100.00 %)
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(53.13 %)
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(7.68 %)
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(40.42 %)
0
(0 %)
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(3.46 %)
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(1.15 %)
28,292
(0.75 %)
345 human (HG01358.pat 2021)
GCA_018469965.1
n/a n/a 19,983
(1.85 %)
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(1.25 %)
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(4.96 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
441
(100.00 %)
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(53.10 %)
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(8.29 %)
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(40.47 %)
0
(0 %)
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(3.57 %)
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(1.21 %)
28,121
(0.77 %)
346 human (HG01361.mat 2021)
GCA_018469685.1
n/a n/a 20,709
(1.85 %)
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(1.24 %)
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(4.95 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 295
(100.00 %)
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(53.06 %)
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(7.57 %)
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(40.36 %)
0
(0 %)
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(3.41 %)
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(1.19 %)
28,479
(0.76 %)
347 human (HG01361.pat 2021)
GCA_018469705.1
n/a n/a 20,643
(1.86 %)
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(1.25 %)
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(4.98 %)
40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
288
(100.00 %)
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(52.82 %)
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(7.07 %)
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(40.01 %)
0
(0 %)
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(3.24 %)
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(1.17 %)
28,320
(0.75 %)
348 human (HG01891.mat 2021)
GCA_018467155.1
n/a n/a 20,644
(1.86 %)
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(1.24 %)
233,342
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
331
(100.00 %)
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(53.00 %)
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(7.41 %)
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(40.29 %)
0
(0 %)
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(3.35 %)
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(1.18 %)
28,443
(0.76 %)
349 human (HG01891.pat 2021)
GCA_018467165.1
n/a n/a 20,737
(1.84 %)
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(1.25 %)
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(4.94 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
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(100.00 %)
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(40.45 %)
0
(0 %)
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(3.60 %)
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(1.19 %)
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(0.76 %)
350 human (HG01928.mat 2021)
GCA_018472695.1
n/a n/a 20,608
(1.85 %)
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(1.24 %)
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(4.94 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 244
(100.00 %)
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(53.12 %)
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(7.67 %)
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(40.40 %)
0
(0 %)
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(3.46 %)
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(1.16 %)
28,097
(0.75 %)
351 human (HG01928.pat 2021)
GCA_018472705.1
n/a n/a 19,872
(1.85 %)
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(1.24 %)
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(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
317
(100.00 %)
5,191,849
(53.05 %)
1,052,422
(8.21 %)
15,216,610
(40.53 %)
0
(0 %)
1,685,112
(3.48 %)
50,940
(1.18 %)
27,635
(0.76 %)
352 human (HG01952.mat 2021)
GCA_018471545.1
n/a n/a 20,679
(1.86 %)
22,204
(1.25 %)
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(4.98 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 307
(100.00 %)
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(52.87 %)
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(7.18 %)
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(39.98 %)
0
(0 %)
1,656,772
(3.27 %)
52,866
(1.21 %)
28,673
(0.77 %)
353 human (HG01952.pat 2021)
GCA_018471555.1
n/a n/a 19,863
(1.85 %)
21,383
(1.24 %)
226,809
(4.97 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 378
(100.00 %)
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(52.95 %)
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(8.07 %)
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(40.47 %)
0
(0 %)
1,741,906
(3.59 %)
51,292
(1.24 %)
28,192
(0.78 %)
354 human (HG01978.mat 2021)
GCA_018472865.1
n/a n/a 20,711
(1.84 %)
22,195
(1.24 %)
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(4.92 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 247
(100.00 %)
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(53.41 %)
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(8.28 %)
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(40.83 %)
0
(0 %)
1,837,425
(3.56 %)
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(1.16 %)
28,504
(0.75 %)
355 human (HG01978.pat 2021)
GCA_018472845.1
n/a n/a 20,727
(1.84 %)
22,443
(1.25 %)
233,592
(4.92 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
286
(100.00 %)
5,424,250
(53.38 %)
1,090,520
(8.17 %)
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(40.68 %)
0
(0 %)
1,857,872
(3.63 %)
52,674
(1.19 %)
28,529
(0.75 %)
356 human (HG02055 mat 2021)
GCA_018506125.1
n/a n/a 20,668
(1.86 %)
22,497
(1.26 %)
233,148
(4.96 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
306
(100.00 %)
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(52.96 %)
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(7.31 %)
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(40.18 %)
0
(0 %)
1,711,779
(3.38 %)
52,182
(1.14 %)
28,129
(0.74 %)
357 human (HG02055 pat 2021)
GCA_018505855.1
n/a n/a 19,927
(1.83 %)
21,549
(1.23 %)
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(4.93 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 367
(100.00 %)
5,216,705
(53.37 %)
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(8.82 %)
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(40.89 %)
0
(0 %)
1,830,020
(3.73 %)
51,291
(1.20 %)
27,937
(0.76 %)
358 human (HG02080.mat 2021)
GCA_018504085.1
n/a n/a 20,633
(1.85 %)
22,288
(1.24 %)
233,237
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
422
(100.00 %)
5,403,587
(53.12 %)
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(7.68 %)
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(40.28 %)
0
(0 %)
1,751,713
(3.42 %)
52,572
(1.21 %)
28,530
(0.77 %)
359 human (HG02080.pat 2021)
GCA_018504055.1
n/a n/a 20,645
(1.85 %)
22,426
(1.26 %)
233,357
(4.96 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 485
(100.00 %)
5,400,305
(52.99 %)
1,056,100
(7.39 %)
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(40.12 %)
0
(0 %)
1,695,953
(3.33 %)
52,798
(1.20 %)
28,645
(0.77 %)
360 human (HG02109 mat 2021)
GCA_018505825.1
n/a n/a 20,672
(1.85 %)
22,359
(1.25 %)
233,217
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 445
(100.00 %)
5,404,232
(52.99 %)
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(7.38 %)
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(40.16 %)
0
(0 %)
1,773,533
(3.47 %)
52,821
(1.21 %)
28,671
(0.77 %)
361 human (HG02109 pat 2021)
GCA_018505865.1
n/a n/a 20,726
(1.85 %)
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(1.25 %)
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(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
481
(100.00 %)
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(53.08 %)
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(7.55 %)
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(40.27 %)
0
(0 %)
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(3.39 %)
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(1.18 %)
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(0.76 %)
362 human (HG02145 mat 2021)
GCA_018852585.1
n/a n/a 20,626
(1.85 %)
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(1.25 %)
233,065
(4.94 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
437
(100.00 %)
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(53.08 %)
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(7.58 %)
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(40.24 %)
0
(0 %)
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(3.36 %)
52,888
(1.19 %)
28,564
(0.75 %)
363 human (HG02145 pat 2021)
GCA_018852595.1
n/a n/a 19,971
(1.84 %)
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(1.40 %)
227,332
(4.94 %)
40.91
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
817
(100.00 %)
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(53.01 %)
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(8.52 %)
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(40.43 %)
0
(0 %)
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(3.61 %)
52,745
(1.32 %)
29,473
(0.88 %)
364 human (HG02148.mat 2021)
GCA_018471535.1
n/a n/a 20,622
(1.85 %)
22,230
(1.24 %)
233,267
(4.94 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 423
(100.00 %)
5,415,368
(53.22 %)
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(7.85 %)
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(40.54 %)
0
(0 %)
1,696,856
(3.35 %)
52,324
(1.14 %)
28,236
(0.74 %)
365 human (HG02148.pat 2021)
GCA_018471525.1
n/a n/a 20,675
(1.85 %)
22,449
(1.25 %)
233,621
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 487
(100.00 %)
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(53.04 %)
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(7.55 %)
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(40.19 %)
0
(0 %)
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(3.42 %)
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(1.23 %)
28,850
(0.77 %)
366 human (HG02257.mat 2021)
GCA_018466845.1
n/a n/a 20,636
(1.85 %)
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(1.24 %)
233,236
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
292
(100.00 %)
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(53.10 %)
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(7.60 %)
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(40.43 %)
0
(0 %)
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(3.44 %)
52,647
(1.16 %)
28,293
(0.75 %)
367 human (HG02257.pat 2021)
GCA_018466835.1
n/a n/a 20,659
(1.84 %)
22,252
(1.23 %)
233,332
(4.93 %)
40.78
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 306
(100.00 %)
5,414,841
(53.29 %)
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(7.99 %)
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(40.53 %)
0
(0 %)
1,858,343
(3.60 %)
52,638
(1.18 %)
28,403
(0.75 %)
368 human (HG02486.mat 2021)
GCA_018467015.1
n/a n/a 20,626
(1.85 %)
22,072
(1.24 %)
232,923
(4.95 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
283
(100.00 %)
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(53.15 %)
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(7.68 %)
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(40.44 %)
0
(0 %)
1,743,020
(3.45 %)
52,593
(1.16 %)
28,402
(0.76 %)
369 human (HG02486.pat 2021)
GCA_018467005.1
n/a n/a 20,047
(1.86 %)
21,511
(1.24 %)
227,472
(4.97 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
342
(100.00 %)
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(53.10 %)
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(8.26 %)
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(40.62 %)
0
(0 %)
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(3.57 %)
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(1.16 %)
27,863
(0.76 %)
370 human (HG02559.mat 2021)
GCA_018466985.1
n/a n/a 20,748
(1.85 %)
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(1.25 %)
233,661
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 329
(100.00 %)
5,409,998
(53.11 %)
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(7.64 %)
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(40.38 %)
0
(0 %)
1,799,081
(3.49 %)
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(1.22 %)
28,800
(0.77 %)
371 human (HG02559.pat 2021)
GCA_018466855.1
n/a n/a 20,684
(1.85 %)
22,457
(1.26 %)
233,500
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
260
(100.00 %)
5,394,499
(53.00 %)
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(7.39 %)
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(40.28 %)
0
(0 %)
1,772,200
(3.48 %)
52,834
(1.17 %)
28,486
(0.76 %)
372 human (HG02572.mat 2021)
GCA_018470445.1
n/a n/a 20,823
(1.84 %)
22,634
(1.24 %)
232,547
(4.89 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
632
(100.00 %)
5,435,641
(53.28 %)
1,076,981
(7.96 %)
15,851,923
(40.45 %)
0
(0 %)
1,808,343
(3.57 %)
53,410
(1.21 %)
28,781
(0.76 %)
373 human (HG02572.pat 2021)
GCA_018470435.1
n/a n/a 20,054
(1.85 %)
21,827
(1.25 %)
225,951
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
641
(100.00 %)
5,213,929
(53.30 %)
1,082,137
(8.76 %)
15,068,577
(40.69 %)
0
(0 %)
1,884,567
(3.86 %)
51,312
(1.19 %)
27,939
(0.75 %)
374 human (HG02622.mat 2021)
GCA_018469875.1
n/a n/a 20,669
(1.84 %)
22,455
(1.24 %)
233,354
(4.93 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 292
(100.00 %)
5,446,540
(53.17 %)
1,085,576
(7.76 %)
15,975,207
(40.52 %)
0
(0 %)
1,776,427
(3.47 %)
53,535
(1.26 %)
28,986
(0.77 %)
375 human (HG02622.pat 2021)
GCA_018469925.1
n/a n/a 20,698
(1.84 %)
22,536
(1.25 %)
233,733
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
270
(100.00 %)
5,421,378
(53.22 %)
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(7.81 %)
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(40.46 %)
0
(0 %)
1,803,645
(3.51 %)
52,975
(1.21 %)
28,639
(0.75 %)
376 human (HG02630.mat 2021)
GCA_018469955.1
n/a n/a 20,674
(1.84 %)
22,467
(1.25 %)
233,172
(4.93 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
497
(100.00 %)
5,432,857
(53.10 %)
1,072,648
(7.64 %)
15,990,876
(40.53 %)
0
(0 %)
1,722,501
(3.36 %)
54,101
(1.32 %)
29,504
(0.80 %)
377 human (HG02630.pat 2021)
GCA_018469945.1
n/a n/a 20,722
(1.83 %)
22,445
(1.24 %)
233,268
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
534
(100.00 %)
5,449,816
(53.34 %)
1,108,461
(8.05 %)
15,985,498
(40.79 %)
0
(0 %)
1,803,634
(3.57 %)
53,746
(1.28 %)
29,112
(0.77 %)
378 human (HG02717.mat 2021)
GCA_018469935.1
n/a n/a 20,621
(1.84 %)
22,396
(1.25 %)
233,096
(4.93 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
323
(100.00 %)
5,411,829
(53.22 %)
1,079,483
(7.87 %)
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(40.43 %)
0
(0 %)
1,785,077
(3.54 %)
53,155
(1.21 %)
28,854
(0.78 %)
379 human (HG02717.pat 2021)
GCA_018470425.1
n/a n/a 19,952
(1.84 %)
21,767
(1.25 %)
227,273
(4.93 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
399
(100.00 %)
5,216,997
(53.34 %)
1,089,537
(8.70 %)
15,132,132
(40.83 %)
0
(0 %)
1,819,884
(3.72 %)
51,815
(1.21 %)
28,146
(0.76 %)
380 human (HG02723.mat 2021)
GCA_018504065.1
n/a n/a 20,697
(1.85 %)
22,322
(1.25 %)
233,152
(4.95 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
429
(100.00 %)
5,403,282
(53.05 %)
1,062,881
(7.52 %)
15,861,495
(40.19 %)
0
(0 %)
1,727,512
(3.39 %)
52,733
(1.19 %)
28,558
(0.76 %)
381 human (HG02723.pat 2021)
GCA_018504075.1
n/a n/a 20,606
(1.84 %)
22,627
(1.25 %)
233,499
(4.92 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
529
(100.00 %)
5,419,888
(53.29 %)
1,079,052
(8.00 %)
15,778,626
(40.44 %)
0
(0 %)
1,828,728
(3.61 %)
53,133
(1.23 %)
28,789
(0.77 %)
382 human (HG02818.mat 2021)
GCA_018503585.1
n/a n/a 20,695
(1.85 %)
22,489
(1.25 %)
233,161
(4.93 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
620
(100.00 %)
5,406,404
(53.21 %)
1,061,348
(7.77 %)
15,879,759
(40.38 %)
0
(0 %)
1,755,044
(3.46 %)
52,992
(1.18 %)
28,591
(0.77 %)
383 human (HG02818.pat 2021)
GCA_018503575.1
n/a n/a 20,696
(1.86 %)
22,490
(1.27 %)
233,253
(4.97 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
566
(100.00 %)
5,397,389
(52.88 %)
1,044,887
(7.21 %)
16,011,018
(40.13 %)
0
(0 %)
1,663,167
(3.29 %)
52,793
(1.17 %)
28,656
(0.76 %)
384 human (HG02886.mat 2021)
GCA_018470455.1
n/a n/a 20,740
(1.84 %)
22,693
(1.25 %)
233,895
(4.94 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 461
(100.00 %)
5,448,421
(53.12 %)
1,077,973
(7.55 %)
15,956,661
(40.38 %)
0
(0 %)
1,776,179
(3.47 %)
53,701
(1.29 %)
29,198
(0.78 %)
385 human (HG02886.pat 2021)
GCA_018470465.1
n/a n/a 20,705
(1.84 %)
22,599
(1.26 %)
233,328
(4.93 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 503
(100.00 %)
5,438,367
(53.15 %)
1,090,141
(7.70 %)
16,016,158
(40.57 %)
0
(0 %)
1,803,515
(3.52 %)
53,652
(1.26 %)
29,087
(0.78 %)
386 human (HG03098 mat 2021)
GCA_018506165.1
n/a n/a 20,700
(1.83 %)
22,200
(1.24 %)
233,714
(4.91 %)
40.79
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 331
(100.00 %)
5,414,502
(53.46 %)
1,066,527
(8.36 %)
15,926,377
(40.78 %)
0
(0 %)
1,890,567
(3.67 %)
52,417
(1.18 %)
28,468
(0.76 %)
387 human (HG03098 pat 2021)
GCA_018506155.1
n/a n/a 19,900
(1.84 %)
21,567
(1.24 %)
226,998
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
445
(100.00 %)
5,201,143
(53.24 %)
1,083,861
(8.56 %)
15,069,721
(40.64 %)
0
(0 %)
1,817,407
(3.73 %)
51,389
(1.21 %)
28,025
(0.77 %)
388 human (HG03453.mat 2021)
GCA_018472855.1
n/a n/a 20,710
(1.84 %)
22,595
(1.25 %)
233,614
(4.93 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
439
(100.00 %)
5,436,784
(53.21 %)
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(7.82 %)
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(40.60 %)
0
(0 %)
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(3.50 %)
53,318
(1.27 %)
29,023
(0.78 %)
389 human (HG03453.pat 2021)
GCA_018473305.1
n/a n/a 20,661
(1.84 %)
22,407
(1.25 %)
233,945
(4.93 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 480
(100.00 %)
5,418,964
(53.30 %)
1,060,724
(7.98 %)
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(40.40 %)
0
(0 %)
1,768,342
(3.49 %)
53,149
(1.21 %)
28,793
(0.76 %)
390 human (HG03486 pat 2021)
GCA_018503245.1
n/a n/a 20,698
(1.84 %)
22,539
(1.24 %)
233,646
(4.92 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
519
(100.00 %)
5,426,413
(53.27 %)
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(7.93 %)
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(40.41 %)
0
(0 %)
1,763,702
(3.47 %)
53,143
(1.26 %)
28,964
(0.77 %)
391 human (HG03486.mat 2021)
GCA_018503525.1
n/a n/a 20,760
(1.85 %)
22,730
(1.26 %)
233,655
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
480
(100.00 %)
5,422,116
(53.02 %)
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(7.46 %)
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(40.27 %)
0
(0 %)
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(3.37 %)
53,338
(1.19 %)
28,836
(0.77 %)
392 human (HG03516.mat 2021)
GCA_018469425.1
n/a n/a 20,766
(1.85 %)
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(1.25 %)
233,619
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 320
(100.00 %)
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(52.96 %)
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(7.35 %)
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(40.30 %)
0
(0 %)
1,676,970
(3.29 %)
52,953
(1.18 %)
28,552
(0.75 %)
393 human (HG03516.pat 2021)
GCA_018469415.1
n/a n/a 20,820
(1.84 %)
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(1.25 %)
234,068
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
369
(100.00 %)
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(53.44 %)
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(8.28 %)
15,991,774
(40.84 %)
0
(0 %)
1,839,829
(3.59 %)
53,435
(1.18 %)
28,828
(0.76 %)
394 human (HG03540.mat 2021)
GCA_018473295.1
n/a n/a 20,665
(1.84 %)
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(1.26 %)
233,386
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
435
(100.00 %)
5,436,802
(53.34 %)
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(8.06 %)
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(40.72 %)
0
(0 %)
1,845,562
(3.57 %)
53,436
(1.26 %)
28,988
(0.77 %)
395 human (HG03540.pat 2021)
GCA_018473315.1
n/a n/a 20,724
(1.83 %)
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(1.25 %)
233,360
(4.91 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
512
(100.00 %)
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(53.39 %)
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(8.16 %)
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(40.79 %)
0
(0 %)
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(3.62 %)
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(1.30 %)
29,476
(0.80 %)
396 human (HG03579.mat 2021)
GCA_018472825.1
n/a n/a 20,702
(1.85 %)
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(1.25 %)
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(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
456
(100.00 %)
5,423,189
(53.07 %)
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(7.56 %)
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(40.31 %)
0
(0 %)
1,725,858
(3.40 %)
53,423
(1.24 %)
28,889
(0.78 %)
397 human (HG03579.pat 2021)
GCA_018472835.1
n/a n/a 19,942
(1.84 %)
21,710
(1.25 %)
227,313
(4.94 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 499
(100.00 %)
5,226,752
(53.28 %)
1,092,235
(8.58 %)
15,143,136
(40.79 %)
0
(0 %)
1,814,912
(3.72 %)
51,622
(1.24 %)
28,360
(0.77 %)
398 human (NA18906.mat 2021)
GCA_018503255.1
n/a n/a 20,739
(1.84 %)
22,340
(1.25 %)
233,812
(4.92 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 271
(100.00 %)
5,464,910
(53.26 %)
1,101,031
(7.88 %)
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(40.43 %)
0
(0 %)
1,765,214
(3.46 %)
53,290
(1.27 %)
29,035
(0.78 %)
399 human (NA18906.pat 2021)
GCA_018503285.1
n/a n/a 20,765
(1.85 %)
22,414
(1.25 %)
234,102
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 304
(100.00 %)
5,443,478
(53.06 %)
1,085,707
(7.53 %)
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(40.19 %)
0
(0 %)
1,786,732
(3.48 %)
53,328
(1.24 %)
28,936
(0.77 %)
400 human (NA19240.mat 2021)
GCA_018503275.1
n/a n/a 20,678
(1.85 %)
22,534
(1.26 %)
233,508
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
387
(100.00 %)
5,404,648
(52.98 %)
1,047,126
(7.31 %)
15,970,133
(40.15 %)
0
(0 %)
1,720,710
(3.38 %)
52,529
(1.17 %)
28,454
(0.75 %)
401 human (NA19240.pat 2021)
GCA_018503265.1
n/a n/a 20,772
(1.85 %)
22,461
(1.25 %)
233,684
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
453
(100.00 %)
5,424,224
(53.08 %)
1,063,925
(7.53 %)
15,954,132
(40.32 %)
0
(0 %)
1,771,797
(3.47 %)
53,106
(1.23 %)
28,804
(0.77 %)
402 human (NA20129 mat 2021)
GCA_018504635.1
n/a n/a 20,664
(1.84 %)
22,511
(1.24 %)
233,033
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
448
(100.00 %)
5,420,332
(53.24 %)
1,067,867
(7.86 %)
15,932,491
(40.50 %)
0
(0 %)
1,857,726
(3.61 %)
53,011
(1.20 %)
28,542
(0.76 %)
403 human (NA20129 pat 2021)
GCA_018504625.1
n/a n/a 20,706
(1.85 %)
22,365
(1.26 %)
233,543
(4.96 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 481
(100.00 %)
5,401,495
(53.02 %)
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(7.46 %)
16,041,778
(40.34 %)
0
(0 %)
1,700,248
(3.36 %)
52,911
(1.18 %)
28,488
(0.75 %)
404 human (NA21309 pat 2021)
GCA_018504665.1
n/a n/a 20,685
(1.85 %)
22,478
(1.25 %)
233,394
(4.95 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
608
(100.00 %)
5,399,150
(53.06 %)
1,053,638
(7.58 %)
15,999,929
(40.35 %)
0
(0 %)
1,741,217
(3.44 %)
52,798
(1.17 %)
28,498
(0.75 %)
405 human (NA21309.mat 2021)
GCA_018504655.1
n/a n/a 20,635
(1.84 %)
22,458
(1.25 %)
233,555
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
508
(100.00 %)
5,389,804
(53.21 %)
1,045,498
(7.82 %)
15,862,735
(40.38 %)
0
(0 %)
1,852,080
(3.61 %)
52,479
(1.17 %)
28,460
(0.75 %)
406 human (NA24385 HG002 alt pat 2023)
GCA_018852605.2
n/a n/a 19,962
(1.84 %)
20,471
(1.19 %)
n/a 40.79
(99.74 %)
4
(0.26 %)
4
(0.26 %)
27
(99.74 %)
5,196,926
(53.37 %)
1,083,984
(8.63 %)
15,221,567
(40.81 %)
0
(0 %)
1,762,077
(3.62 %)
50,569
(1.11 %)
27,432
(0.73 %)
407 human (NA24385 HG002 pri mat 2023)
GCA_018852615.2
n/a n/a 20,637
(1.85 %)
21,256
(1.20 %)
n/a 40.82
(99.23 %)
0
(0 %)
5
(0.77 %)
24
(100.00 %)
5,394,439
(53.04 %)
1,041,946
(7.44 %)
16,039,487
(40.04 %)
0
(0 %)
1,747,868
(3.36 %)
52,111
(1.11 %)
28,050
(0.73 %)
408 human (NA24385.mat 2021)
GCA_018852615.1
n/a n/a 20,744
(1.84 %)
21,968
(1.22 %)
233,779
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
445
(100.00 %)
5,435,410
(53.40 %)
1,086,871
(8.27 %)
15,970,867
(40.97 %)
0
(0 %)
1,819,917
(3.54 %)
53,581
(1.32 %)
29,359
(0.79 %)
409 human (NA24385.mat 2022)
GCA_021951015.1
n/a n/a 20,809
(1.82 %)
21,369
(1.18 %)
234,089
(4.92 %)
40.85
(99.95 %)
0
(0 %)
109
(0.05 %)
355
(100.00 %)
5,489,855
(53.93 %)
1,085,681
(8.26 %)
15,968,830
(40.95 %)
0
(0 %)
1,817,110
(3.54 %)
53,511
(1.32 %)
30,302
(0.84 %)
410 human (NA24385.pat 2021)
GCA_018852605.1
n/a n/a 19,919
(1.83 %)
21,582
(1.22 %)
227,333
(4.91 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
610
(100.00 %)
5,215,774
(53.54 %)
1,094,036
(9.09 %)
15,125,069
(41.29 %)
0
(0 %)
1,903,592
(3.87 %)
52,653
(1.34 %)
28,881
(0.81 %)
411 human (NA24385.pat 2022)
GCA_021950905.1
n/a n/a 20,014
(1.81 %)
20,716
(1.19 %)
227,278
(4.91 %)
40.87
(99.97 %)
0
(0 %)
117
(0.03 %)
514
(100.00 %)
5,293,356
(54.01 %)
1,100,786
(9.09 %)
15,122,569
(41.27 %)
2
(0.00 %)
1,900,161
(3.87 %)
52,546
(1.35 %)
29,891
(0.86 %)
412 human (NA24631 mat 2021)
GCA_018506965.1
n/a n/a 20,683
(1.85 %)
22,446
(1.25 %)
233,691
(4.96 %)
40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
503
(100.00 %)
5,423,411
(52.98 %)
1,075,094
(7.46 %)
15,897,770
(40.32 %)
0
(0 %)
1,659,982
(3.29 %)
53,731
(1.31 %)
29,377
(0.80 %)
413 human (NA24631 pat 2021)
GCA_018506945.1
n/a n/a 19,910
(1.84 %)
21,610
(1.24 %)
227,521
(4.95 %)
40.90
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
682
(100.00 %)
5,224,127
(53.12 %)
1,078,588
(8.33 %)
15,264,128
(40.95 %)
0
(0 %)
1,760,557
(3.59 %)
53,164
(1.35 %)
29,066
(0.82 %)
414 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank)
GCA_000845685.2
n/a 115
(79.56 %)
n/a n/a n/a 42.44
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
33
(1.67 %)
36
(4.27 %)
603
(9.83 %)
0
(0 %)
52
(1.87 %)
3
(13.72 %)
2
(13.38 %)
415 human T2T CHM13 v2.0
GCA_009914755.4
108,944
(51.73 %)
n/a 20,844
(1.79 %)
21,287
(1.16 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 25
(100.00 %)
5,591,082
(54.45 %)
1,155,353
(8.89 %)
16,163,340
(41.63 %)
0
(0 %)
2,006,129
(3.86 %)
52,408
(1.38 %)
30,616
(0.83 %)
416 Iberian mole (v1 TD23 2020)
GCF_014898055.1
46,872
(2.59 %)
n/a 18,566
(1.67 %)
20,793
(1.59 %)
n/a 41.91
(99.98 %)
0
(0 %)
3,640
(0.02 %)
4,425
(100.00 %)
3,269,038
(31.47 %)
501,677
(1.32 %)
11,176,747
(32.61 %)
2
(0.00 %)
644,819
(2.55 %)
48,076
(2.80 %)
43,577
(2.14 %)
417 Iberian mole (v2 TD23 2020)
GCF_014898055.2
46,759
(2.60 %)
n/a 18,453
(1.69 %)
20,410
(1.59 %)
n/a 41.90
(99.98 %)
0
(0 %)
3,639
(0.02 %)
3,202
(100.00 %)
2,637,156
(23.36 %)
497,087
(1.30 %)
10,984,260
(32.64 %)
2
(0.00 %)
638,388
(2.54 %)
47,552
(2.89 %)
43,140
(2.46 %)
418 Indian glassy fish (v1 2019)
GCF_900634625.1
44,096
(12.32 %)
n/a 15,337
(3.60 %)
23,988
(7.92 %)
60,224
(10.41 %)
42.38
(98.08 %)
0
(0 %)
1,523
(1.92 %)
156
(100.00 %)
346,406
(3.02 %)
163,522
(3.00 %)
2,755,229
(25.07 %)
0
(0 %)
235,504
(4.25 %)
17,930
(1.47 %)
9,748
(0.74 %)
419 Indian medaka
GCF_002922805.1
47,300
(9.26 %)
n/a 14,561
(2.50 %)
31,867
(6.43 %)
n/a 39.04
(94.73 %)
0
(0 %)
51,440
(5.29 %)
8,603
(100.00 %)
319,637
(2.20 %)
208,749
(2.67 %)
5,412,794
(33.26 %)
180
(0.02 %)
209,615
(2.14 %)
40,721
(2.36 %)
28,619
(1.60 %)
420 Indianmeal moth (v1 USDA-ARS_2022_Savannah primary hap 2023)
GCF_027563975.1
28,390
(14.36 %)
n/a 4,799
(1.56 %)
15,737
(7.20 %)
n/a 35.38
(100.00 %)
0
(0 %)
26
(0.00 %)
46
(100.00 %)
136,242
(3.33 %)
48,275
(1.61 %)
2,518,372
(36.69 %)
0
(0 %)
71,420
(2.05 %)
14,106
(2.86 %)
9,147
(1.55 %)
421 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1
n/a n/a 21,188
(1.26 %)
41,550
(1.34 %)
35,477
(1.51 %)
42.19
(99.92 %)
4,324
(0.02 %)
4,324
(0.02 %)
798,700
(99.98 %)
3,297,388
(28.66 %)
476,792
(1.23 %)
13,144,912
(34.13 %)
14
(0.00 %)
n/a 81,685
(1.86 %)
59,284
(1.43 %)
422 Japanese quail
GCF_001577835.1
46,995
(7.38 %)
n/a 12,864
(2.55 %)
36,126
(11.03 %)
n/a 41.28
(98.88 %)
7,630
(1.12 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
466,141
(6.58 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
628
(0.03 %)
160,342
(1.32 %)
17,977
(1.86 %)
15,897
(1.26 %)
423 Japanese sawshark (hap1 2024 genbank)
GCA_044704955.1
n/a n/a 14,672
(0.28 %)
30,181
(0.79 %)
n/a 47.02
(99.98 %)
0
(0 %)
5,985
(0.02 %)
4,317
(100.00 %)
1,167,498
(3.08 %)
2,399,496
(18.16 %)
10,302
(99.98 %)
38
(0.00 %)
5,044,826
(4.94 %)
503,637
(6.56 %)
489,893
(6.05 %)
424 Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018)
GCF_003227715.1
29,097
(10.82 %)
n/a 4,337
(1.33 %)
43,907
(11.32 %)
n/a 44.75
(99.72 %)
0
(0 %)
499
(0.28 %)
857
(100.00 %)
439,110
(17.67 %)
262,539
(5.69 %)
1,834,301
(29.28 %)
3
(0.00 %)
159,215
(3.71 %)
6,204
(9.08 %)
5,973
(2.13 %)
425 kakapo (Jane v1 2019)
GCF_004027225.1
49,444
(5.77 %)
n/a 13,114
(1.92 %)
17,732
(2.50 %)
29,004
(4.44 %)
41.97
(97.63 %)
0
(0 %)
362
(2.37 %)
99
(100.00 %)
548,758
(10.76 %)
208,171
(1.07 %)
6,258,082
(20.20 %)
0
(0 %)
165,436
(1.31 %)
22,279
(1.75 %)
19,230
(1.19 %)
426 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2
49,757
(54.33 %)
n/a 13,112
(1.92 %)
17,637
(2.48 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
0
(0 %)
373
(0.92 %)
90
(100.00 %)
507,072
(7.85 %)
208,180
(1.08 %)
6,258,178
(20.50 %)
0
(0 %)
165,532
(1.34 %)
22,278
(1.77 %)
19,230
(1.21 %)
427 koala (Bilbo 61053 2017)
GCF_002099425.1
55,736
(2.16 %)
n/a 17,500
(0.86 %)
16,193
(0.94 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
1,907
(100.00 %)
7,814,631
(41.58 %)
1,123,545
(2.03 %)
21,796,057
(39.25 %)
0
(0 %)
405,744
(0.85 %)
15,957
(0.35 %)
15,019
(0.30 %)
428 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1
29,504
(53.56 %)
n/a 14,221
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
41,384
(6.20 %)
40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,338
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,148
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,224
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
18,380
(0.95 %)
429 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1
29,517
(6.48 %)
n/a 14,243
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
41,421
(6.20 %)
40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,274
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,142
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,224
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
18,380
(0.95 %)
430 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023638135.1
48,561
(51.20 %)
n/a 12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
0
(0 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
2
(0.00 %)
479,269
(2.67 %)
32,398
(2.65 %)
19,870
(0.89 %)
431 large cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147105.1
24,631
(60.59 %)
n/a 4,550
(1.47 %)
9,197
(5.18 %)
30,394
(12.69 %)
34.13
(100.00 %)
0
(0 %)
29
(0.00 %)
402
(100.00 %)
123,352
(2.30 %)
36,616
(6.05 %)
2,431,238
(41.04 %)
2
(0.00 %)
86,654
(3.36 %)
8,442
(2.49 %)
4,829
(1.03 %)
432 large tree shrew (BS70 2019 Broad)
GCA_004365275.1
n/a n/a 26,266
(0.71 %)
59,868
(0.81 %)
n/a 42.00
(99.77 %)
6,466
(0.02 %)
6,466
(0.02 %)
3,890,086
(99.98 %)
7,163,973
(22.64 %)
1,629,329
(2.64 %)
18,970,992
(42.82 %)
38
(0.00 %)
n/a 138,732
(1.75 %)
77,459
(1.17 %)
433 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1
n/a n/a 14,572
(1.03 %)
16,165
(1.42 %)
n/a 43.36
(99.74 %)
0
(0 %)
558
(0.26 %)
55
(100.00 %)
1,631,923
(15.09 %)
303,440
(1.14 %)
11,122,938
(34.12 %)
1
(0.00 %)
664,235
(2.49 %)
35,505
(1.37 %)
19,641
(0.51 %)
434 leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019)
GCA_009762595.1
n/a n/a 10,857
(1.01 %)
15,585
(1.46 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,982
(100.00 %)
1,090,219
(15.03 %)
206,192
(1.19 %)
7,154,939
(33.03 %)
0
(0 %)
432,559
(2.40 %)
25,155
(1.42 %)
14,585
(0.57 %)
435 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2
62,576
(3.50 %)
n/a 14,610
(1.03 %)
16,359
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
0
(0 %)
667
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,637,236
(15.13 %)
304,730
(1.14 %)
11,121,967
(34.21 %)
3
(0.00 %)
670,755
(2.51 %)
35,485
(1.36 %)
19,615
(0.51 %)
436 Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002875.2
n/a 8,389
(48.67 %)
591
(1.09 %)
4,193
(46.51 %)
n/a 59.58
(99.94 %)
0
(0 %)
454
(0.06 %)
76
(100.00 %)
24,390
(4.61 %)
4,228
(1.93 %)
243,087
(20.97 %)
1
(0.00 %)
5,939
(3.84 %)
92
(99.40 %)
72
(0.21 %)
437 Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002725.2
n/a 8,731
(48.79 %)
626
(1.15 %)
4,290
(46.53 %)
n/a 59.72
(100.00 %)
7
(0.00 %)
7
(0.00 %)
43
(100.00 %)
33,021
(5.20 %)
8,477
(2.43 %)
238,932
(20.91 %)
0
(0 %)
6,726
(4.51 %)
41
(99.80 %)
27
(0.06 %)
438 Leishmania martiniquensis (LSCM1 2021 genbank)
GCA_017916325.1
n/a 7,967
(45.66 %)
619
(1.14 %)
3,882
(44.58 %)
n/a 59.85
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
42
(100.00 %)
20,726
(2.91 %)
2,267
(2.64 %)
232,973
(20.45 %)
0
(0 %)
6,246
(4.12 %)
44
(99.29 %)
43
(0.15 %)
439 Leishmania orientalis (LSCM4 2021 genbank)
GCA_017916335.1
n/a 8,158
(45.05 %)
643
(1.12 %)
4,666
(45.26 %)
n/a 59.72
(99.99 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
98
(100.00 %)
22,632
(2.47 %)
4,241
(2.74 %)
231,120
(20.18 %)
1
(0.00 %)
10,584
(6.63 %)
100
(99.82 %)
164
(0.40 %)
440 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1
73,266
(49.50 %)
n/a 18,874
(1.62 %)
21,014
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
214,953
(3.85 %)
265,329
(96.15 %)
5,246,283
(42.87 %)
1,059,443
(5.13 %)
14,265,514
(32.20 %)
28,667
(1.17 %)
525,709
(5.63 %)
77,000
(2.45 %)
66,922
(1.91 %)
441 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1
25,978
(33.60 %)
n/a 19,393
(1.38 %)
20,311
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
326,464
(12.87 %)
337,359
(87.13 %)
6,205,858
(38.76 %)
832,823
(1.53 %)
13,661,563
(33.98 %)
2,666
(0.03 %)
430,190
(1.14 %)
26,669
(0.59 %)
23,227
(0.47 %)
442 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1
47,420
(5.64 %)
n/a 13,097
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
0
(0 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,498
(5.58 %)
210,236
(1.26 %)
7,133,927
(19.19 %)
1
(0.00 %)
132,959
(0.79 %)
27,558
(2.21 %)
21,862
(1.03 %)
443 lesser noctule (v1 hap1 2024)
GCA_964264875.1
n/a n/a 18,260
(1.53 %)
23,046
(1.60 %)
n/a 43.05
(99.99 %)
0
(0 %)
1,662
(0.01 %)
1,281
(100.00 %)
3,246,021
(21.13 %)
1,298,965
(12.06 %)
9,752,193
(42.90 %)
10
(0.00 %)
2,023,792
(5.54 %)
66,137
(2.85 %)
61,169
(1.82 %)
444 lesser noctule (v1 hap2 2024)
GCA_964264895.1
n/a n/a 17,557
(1.64 %)
22,484
(1.74 %)
n/a 43.06
(99.98 %)
1,563
(0.02 %)
1,563
(0.02 %)
2,898
(99.98 %)
2,999,553
(21.19 %)
1,122,371
(10.04 %)
9,331,392
(40.02 %)
7
(0.00 %)
1,542,388
(4.66 %)
61,834
(2.95 %)
59,536
(1.92 %)
445 lesser rhea (primary hap 2023 genbank)
GCA_028389875.1
39,024
(47.65 %)
n/a 13,358
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
0
(0 %)
128
(0.11 %)
179
(100.00 %)
674,141
(6.73 %)
329,122
(5.34 %)
6,820,211
(22.78 %)
1
(0.00 %)
266,226
(1.85 %)
45,073
(5.83 %)
38,575
(2.59 %)
446 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850995.1
n/a n/a 18,322
(1.42 %)
21,350
(1.39 %)
n/a 41.84
(99.24 %)
178
(0.49 %)
573
(0.76 %)
345
(99.51 %)
4,224,340
(28.69 %)
1,030,574
(2.60 %)
12,591,928
(42.30 %)
1
(0.00 %)
1,128,543
(2.95 %)
98,189
(2.06 %)
48,427
(1.15 %)
447 lesser salmon catfish (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579695.1
53,323
(53.05 %)
n/a 15,841
(0.90 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
5,905,868
(49.76 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
15,646
(0.27 %)
448 lettuce (Salinas v7 2018)
GCF_002870075.1
60,760
(2.83 %)
n/a 16,272
(0.65 %)
109,234
(6.86 %)
n/a 37.79
(92.71 %)
0
(0 %)
350,251
(7.33 %)
11,453
(100.00 %)
946,986
(1.96 %)
983,572
(3.65 %)
12,334,735
(53.11 %)
2,244
(0.09 %)
1,823,579
(9.42 %)
117,678
(2.02 %)
19,900
(0.28 %)
449 lettuce (Salinas v8 2020)
GCF_002870075.3
64,818
(2.94 %)
n/a 16,252
(0.65 %)
101,828
(6.36 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
3,138
(0.29 %)
351,533
(7.59 %)
9,960
(99.71 %)
945,052
(1.95 %)
983,641
(3.64 %)
12,325,371
(53.00 %)
2,249
(0.09 %)
n/a 117,703
(2.02 %)
19,916
(0.28 %)
450 live sharksucker (v1 2019)
GCF_900963305.1
40,268
(11.91 %)
n/a 14,975
(3.53 %)
22,304
(7.09 %)
56,266
(9.51 %)
41.43
(99.89 %)
0
(0 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
448,828
(3.61 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,476
(21.79 %)
0
(0 %)
109,664
(1.83 %)
16,807
(1.33 %)
12,095
(0.89 %)
451 long-finned pilot whale (v1 primary hap 2023)
GCF_963455315.1
61,810
(2.84 %)
n/a 18,712
(1.51 %)
20,920
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
0
(0 %)
1,084
(0.01 %)
993
(100.00 %)
4,125,420
(35.62 %)
1,577,899
(12.03 %)
12,347,226
(42.01 %)
10
(0.00 %)
1,284,155
(3.89 %)
71,821
(5.51 %)
41,663
(1.04 %)
452 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 genbank)
GCA_963455315.2
n/a n/a 18,726
(1.51 %)
20,948
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,084
(0.01 %)
995
(100.00 %)
4,125,459
(35.62 %)
1,577,896
(12.03 %)
12,347,226
(42.01 %)
10
(0.00 %)
1,284,155
(3.89 %)
71,822
(5.51 %)
41,663
(1.04 %)
453 long-tailed hermit (v1 PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1
n/a n/a 12,328
(2.02 %)
20,312
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
141
(0.37 %)
141
(0.37 %)
211
(99.63 %)
497,506
(5.06 %)
265,815
(1.51 %)
6,045,702
(20.10 %)
0
(0 %)
100,035
(0.84 %)
15,922
(1.43 %)
13,768
(0.94 %)
454 lumpfish (primary hap 2019 genbank)
GCA_009769545.1
41,612
(58.17 %)
n/a 14,748
(3.32 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
0
(0 %)
347
(1.78 %)
49
(100.00 %)
478,416
(6.02 %)
421,634
(11.07 %)
2,928,668
(27.98 %)
1
(0.00 %)
655,785
(6.31 %)
53,323
(5.09 %)
32,724
(2.40 %)
455 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2
55,061
(41.68 %)
n/a 21,084
(1.92 %)
22,287
(1.31 %)
n/a 40.74
(94.86 %)
83,929
(5.15 %)
83,929
(5.15 %)
112,850
(94.85 %)
5,109,404
(47.71 %)
734,754
(2.02 %)
15,854,134
(33.62 %)
2,334
(0.15 %)
767,102
(3.42 %)
36,070
(0.90 %)
31,862
(0.80 %)
456 malaria parasite P. falciparum (3D7 2016 genbank)
GCA_000002765.3
n/a 14,866
(53.86 %)
n/a n/a n/a 19.34
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 16
(100.00 %)
79,857
(19.18 %)
78,154
(15.50 %)
186,960
(66.90 %)
0
(0 %)
31,278
(6.16 %)
22
(0.04 %)
14
(0.02 %)
457 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1
48,578
(30.31 %)
n/a 19,449
(1.56 %)
24,645
(1.37 %)
41,235
(1.95 %)
40.78
(92.27 %)
0
(0 %)
984,656
(7.81 %)
80,669
(100.00 %)
3,063,619
(35.20 %)
866,306
(3.08 %)
13,310,826
(28.76 %)
389,500
(1.56 %)
884,201
(3.10 %)
35,558
(0.84 %)
33,754
(0.78 %)
458 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1
29,549
(16.44 %)
n/a 15,120
(6.45 %)
49,515
(30.69 %)
n/a 40.48
(93.32 %)
20,693
(6.71 %)
20,693
(6.71 %)
23,184
(93.29 %)
115,049
(2.29 %)
51,516
(1.90 %)
1,488,940
(24.12 %)
25
(0.03 %)
35,840
(1.56 %)
42,077
(12.05 %)
32,193
(7.48 %)
459 mangrove rivulus
GCF_001649575.1
45,293
(11.01 %)
n/a 14,510
(2.84 %)
29,750
(6.81 %)
n/a 40.03
(94.35 %)
0
(0 %)
29,388
(5.66 %)
3,073
(100.00 %)
345,930
(2.32 %)
146,268
(1.33 %)
4,717,260
(27.31 %)
231
(0.09 %)
62,480
(1.04 %)
39,557
(2.69 %)
29,549
(1.76 %)
460 meadow brown (genbank 2021)
GCA_905333055.1
29,488
(69.09 %)
n/a 4,863
(1.16 %)
19,812
(6.60 %)
27,763
(8.31 %)
36.96
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
32
(100.00 %)
227,482
(2.41 %)
107,773
(3.02 %)
2,456,144
(43.97 %)
0
(0 %)
297,573
(6.20 %)
24,873
(3.15 %)
12,170
(1.54 %)
461 meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank)
GCA_006229205.1
n/a n/a 19,020
(1.63 %)
19,812
(1.43 %)
42,441
(2.08 %)
41.68
(99.72 %)
0
(0 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,552,310
(40.02 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
5,134
(0.09 %)
236,044
(0.75 %)
64,849
(2.13 %)
63,058
(1.88 %)
462 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1
n/a n/a 21,726
(1.54 %)
31,908
(1.39 %)
n/a 41.89
(99.96 %)
4,153
(0.02 %)
4,153
(0.02 %)
354,021
(99.98 %)
4,835,157
(40.73 %)
693,037
(1.32 %)
13,779,279
(33.49 %)
21
(0.00 %)
224,239
(0.53 %)
76,740
(2.37 %)
72,844
(2.03 %)
463 melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014)
GCF_000806345.1
26,008
(10.49 %)
n/a 7,743
(3.09 %)
12,206
(6.18 %)
n/a 35.15
(84.42 %)
37,430
(15.62 %)
37,430
(15.62 %)
43,002
(84.38 %)
237,943
(3.36 %)
74,977
(1.26 %)
2,410,203
(31.96 %)
376
(0.08 %)
35,789
(1.03 %)
15,259
(2.01 %)
8,482
(1.01 %)
464 Mexican gray wolf (hap1 2025 genbank)
GCA_048164855.1
n/a n/a 19,584
(1.52 %)
20,783
(1.39 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
0
(0 %)
167
(0.00 %)
250
(100.00 %)
4,643,072
(34.73 %)
1,102,137
(4.40 %)
13,591,414
(35.18 %)
1
(0.00 %)
1,132,849
(2.70 %)
53,471
(2.24 %)
48,664
(1.52 %)
465 microsporidians E.bieneusi (H348 2009 genbank)
GCA_000209485.1
n/a 3,804
(69.39 %)
238
(3.03 %)
394
(8.09 %)
n/a 33.70
(99.89 %)
10
(0.03 %)
437
(0.04 %)
1,743
(99.97 %)
1,511
(2.99 %)
268
(0.36 %)
31,900
(26.59 %)
0
(0 %)
57
(0.18 %)
373
(7.62 %)
360
(7.39 %)
466 microsporidians E.cuniculi (v1 GB-M1 2002)
GCF_000091225.1
1,996
(85.79 %)
n/a 1,569
(68.26 %)
596
(33.73 %)
n/a 47.31
(99.97 %)
4
(0.03 %)
4
(0.03 %)
15
(99.97 %)
257
(0.70 %)
199
(0.40 %)
10,819
(8.68 %)
0
(0 %)
168
(0.67 %)
126
(3.52 %)
105
(3.03 %)
467 microsporidians N.ceranae (BRL01 2009 genbank)
GCA_000182985.1
n/a 2,678
(29.97 %)
348
(2.68 %)
284
(3.31 %)
n/a 25.26
(99.86 %)
0
(0 %)
n/a 5,465
(100.00 %)
3,179
(1.99 %)
1,572
(1.39 %)
85,189
(41.34 %)
0
(0 %)
432
(0.38 %)
4
(0.02 %)
4
(0.02 %)
468 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1
42,553
(41.45 %)
n/a 19,298
(1.81 %)
18,661
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
173,296
(5.96 %)
184,071
(94.04 %)
4,041,828
(42.24 %)
573,950
(1.48 %)
13,504,295
(30.96 %)
211
(0.02 %)
317,691
(1.50 %)
65,448
(1.38 %)
46,041
(1.09 %)
469 minke whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987535.1
61,711
(41.50 %)
n/a 19,544
(1.49 %)
21,502
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
0
(0 %)
1,177
(0.01 %)
1,375
(100.00 %)
4,006,932
(35.92 %)
1,058,106
(12.08 %)
12,708,154
(42.66 %)
4
(0.00 %)
1,500,515
(4.32 %)
72,756
(1.59 %)
44,094
(1.06 %)
470 mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017)
GCF_002532875.1
35,332
(12.83 %)
n/a 2,750
(0.61 %)
29,731
(8.07 %)
n/a 40.94
(99.89 %)
3,360
(0.11 %)
3,360
(0.11 %)
8,241
(99.89 %)
115,140
(1.18 %)
39,880
(0.71 %)
1,832,298
(14.55 %)
37
(0.00 %)
12,922
(0.23 %)
31,479
(5.12 %)
28,744
(3.52 %)
471 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1
n/a n/a 21,302
(1.57 %)
27,162
(1.27 %)
40,982
(1.78 %)
41.88
(99.90 %)
11,139
(0.04 %)
11,139
(0.04 %)
796,326
(99.96 %)
5,253,752
(39.29 %)
1,211,658
(3.13 %)
13,894,596
(38.35 %)
15
(0.00 %)
n/a 24,829
(0.69 %)
23,158
(0.63 %)
472 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank)
GCA_019393635.1
47,034
(41.56 %)
n/a 18,428
(0.81 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
0
(0 %)
260
(0.09 %)
18
(100.00 %)
7,426,369
(29.77 %)
1,249,638
(2.12 %)
21,135,395
(42.80 %)
0
(0 %)
1,546,316
(2.55 %)
16,598
(0.36 %)
13,911
(0.23 %)
473 moth C.splendana (v1 2021 genbank)
GCA_910591565.1
n/a n/a 4,930
(0.75 %)
38,413
(8.53 %)
35,924
(4.55 %)
38.08
(99.99 %)
0
(0 %)
150
(0.01 %)
112
(100.00 %)
261,421
(1.99 %)
175,466
(5.62 %)
3,107,482
(46.30 %)
2
(0.00 %)
358,346
(5.72 %)
58,547
(5.75 %)
28,884
(2.78 %)
474 moth S.litura (Ishihara v1 2017)
GCF_002706865.1
25,114
(8.87 %)
n/a 5,088
(1.13 %)
22,625
(7.19 %)
n/a 36.56
(97.52 %)
10,662
(2.49 %)
10,662
(2.49 %)
13,637
(97.51 %)
154,017
(1.49 %)
50,642
(0.97 %)
2,919,487
(37.00 %)
96
(0.06 %)
122,138
(2.50 %)
34,396
(3.66 %)
10,482
(1.09 %)
475 mung bean (VC1973A 2015 genbank)
GCA_000741045.2
n/a n/a 16,645
(3.88 %)
43,866
(14.64 %)
n/a 33.16
(92.79 %)
0
(0 %)
96,870
(7.25 %)
2,463
(100.00 %)
265,072
(3.32 %)
198,918
(3.34 %)
2,840,410
(34.89 %)
1,607
(0.24 %)
171,012
(3.42 %)
13,926
(1.48 %)
11,027
(1.18 %)
476 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1
n/a n/a 10,083
(1.97 %)
18,350
(2.23 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
5,616
(100.00 %)
485,827
(7.06 %)
212,892
(1.28 %)
4,756,962
(19.95 %)
0
(0 %)
53,808
(0.72 %)
25,670
(3.87 %)
24,319
(2.23 %)
477 mute swan (v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1
n/a n/a 12,973
(1.97 %)
22,300
(2.18 %)
n/a 41.92
(99.06 %)
0
(0 %)
446
(0.94 %)
181
(100.00 %)
688,720
(7.65 %)
301,358
(1.34 %)
6,775,217
(21.21 %)
1
(0.00 %)
78,646
(0.75 %)
31,271
(3.60 %)
29,996
(2.02 %)
478 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1
74,574
(44.06 %)
n/a 21,317
(1.73 %)
20,856
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
110,424
(11.59 %)
114,652
(88.41 %)
4,162,977
(32.77 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,503
(27.63 %)
595
(0.01 %)
103,053
(0.44 %)
31,950
(0.88 %)
31,054
(0.81 %)
479 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1
n/a n/a 21,418
(1.52 %)
34,189
(1.28 %)
n/a 41.35
(99.92 %)
8,600
(0.03 %)
8,600
(0.03 %)
653,473
(99.97 %)
4,512,168
(44.82 %)
592,047
(1.17 %)
13,009,453
(37.18 %)
92
(0.00 %)
n/a 63,033
(1.47 %)
45,747
(1.19 %)
480 Natterer's bat (hap1.1 2024)
GCA_964212035.1
n/a n/a 19,180
(1.72 %)
22,635
(1.71 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
0
(0 %)
1,620
(0.02 %)
343
(100.00 %)
3,081,500
(24.27 %)
797,071
(5.37 %)
10,372,159
(38.30 %)
18
(0.00 %)
729,559
(2.57 %)
64,460
(2.57 %)
57,628
(1.87 %)
481 Natterer's bat (hap2.1 2024)
GCA_964212025.1
n/a n/a 18,275
(1.81 %)
21,799
(1.80 %)
n/a 43.28
(99.99 %)
1,387
(0.01 %)
1,387
(0.01 %)
1,706
(99.99 %)
2,833,193
(23.73 %)
705,278
(5.10 %)
9,802,564
(36.67 %)
5
(0.00 %)
596,875
(2.28 %)
61,024
(2.68 %)
55,279
(1.95 %)
482 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579445.1
31,033
(46.15 %)
n/a 12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
0
(0 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
5
(0.00 %)
478,923
(3.35 %)
31,693
(3.88 %)
22,817
(1.16 %)
483 nematode C.briggsae (AF16 v1 2008)
GCF_000004555.1
19,404
(22.65 %)
n/a 12,088
(12.63 %)
7,533
(12.85 %)
n/a 37.35
(97.22 %)
595
(0.05 %)
6,713
(2.80 %)
607
(99.95 %)
116,909
(19.60 %)
45,475
(4.23 %)
820,686
(35.42 %)
82
(0.06 %)
36,018
(3.86 %)
4,887
(1.65 %)
2,967
(0.93 %)
484 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2
36,181
(5.65 %)
n/a 10,150
(1.34 %)
42,117
(8.90 %)
n/a 37.47
(94.63 %)
39,556
(5.39 %)
39,556
(5.39 %)
45,302
(94.61 %)
396,916
(3.25 %)
506,716
(6.41 %)
4,768,175
(36.07 %)
384
(0.04 %)
264,746
(2.83 %)
17,009
(0.90 %)
8,756
(0.45 %)
485 nine-banded armadillo (v1 hap1 2023)
GCA_030445055.1
n/a n/a 19,429
(1.06 %)
22,396
(1.07 %)
n/a 40.96
(99.27 %)
0
(0 %)
845
(0.73 %)
594
(100.00 %)
4,369,568
(32.83 %)
673,707
(1.55 %)
18,586,102
(42.41 %)
5
(0.00 %)
558,255
(1.38 %)
131,852
(2.78 %)
71,325
(1.75 %)
486 nine-banded armadillo (v1 hap2 2023)
GCF_030445035.1
69,043
(2.70 %)
n/a 20,516
(1.05 %)
n/a n/a 41.00
(99.68 %)
0
(0 %)
771
(0.32 %)
539
(100.00 %)
4,656,325
(32.86 %)
726,574
(1.99 %)
19,585,522
(43.65 %)
4
(0.00 %)
720,053
(1.59 %)
140,990
(2.86 %)
76,550
(1.81 %)
487 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2
n/a n/a 21,293
(1.15 %)
25,302
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,413
(9.13 %)
268,442
(9.13 %)
314,971
(90.87 %)
5,327,246
(49.09 %)
651,311
(1.26 %)
19,267,381
(38.27 %)
239
(0.00 %)
482,244
(1.17 %)
139,552
(2.47 %)
82,520
(1.71 %)
488 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1
46,131
(1.87 %)
n/a 21,316
(1.15 %)
25,308
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,413
(9.13 %)
268,442
(9.13 %)
314,972
(90.87 %)
5,328,146
(49.10 %)
651,316
(1.26 %)
19,267,438
(38.27 %)
239
(0.00 %)
482,246
(1.17 %)
139,552
(2.47 %)
82,520
(1.71 %)
489 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1
n/a n/a 19,541
(1.47 %)
21,516
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
363
(0.17 %)
779
(100.00 %)
1,361,117
(2.23 %)
836,632
(13.12 %)
12,597,969
(44.00 %)
11
(0.00 %)
1,395,565
(3.89 %)
93,862
(1.92 %)
40,806
(0.95 %)
490 northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021)
GCF_021288785.1
49,934
(2.73 %)
n/a 20,106
(1.74 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
0
(0 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,434,732
(35.01 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
2,726
(0.09 %)
n/a 52,064
(1.59 %)
49,212
(1.43 %)
491 northern goshawk (v1 primary hap 2022 refseq)
GCF_929443795.1
50,662
(4.74 %)
n/a 13,528
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
183
(0.00 %)
454
(100.00 %)
521,768
(3.86 %)
325,987
(9.82 %)
5,542,269
(27.30 %)
4
(0.00 %)
458,030
(3.08 %)
43,070
(4.44 %)
32,753
(1.47 %)
492 northern house mosquito (v1 TS 2021)
GCF_016801865.1
28,512
(7.14 %)
n/a 5,830
(1.09 %)
39,806
(8.27 %)
n/a 36.76
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,714
(100.00 %)
222,294
(5.58 %)
187,561
(9.87 %)
3,009,613
(56.49 %)
0
(0 %)
397,617
(5.35 %)
63,009
(9.78 %)
42,868
(6.50 %)
493 northern pike (primary hap 2020 genbank)
GCA_011004845.1
63,720
(60.35 %)
n/a 16,616
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,918
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
0
(0 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
1,039,521
(30.93 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,094
(32.91 %)
1
(0.00 %)
602,569
(4.43 %)
42,910
(2.52 %)
22,099
(1.02 %)
494 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3
n/a n/a 20,134
(1.89 %)
18,568
(1.14 %)
n/a 40.76
(93.09 %)
180,468
(6.94 %)
180,468
(6.94 %)
197,908
(93.06 %)
5,169,984
(51.90 %)
831,865
(4.16 %)
15,243,657
(35.77 %)
861
(0.05 %)
1,641,885
(4.15 %)
65,761
(1.00 %)
25,432
(0.56 %)
495 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2
97,432
(43.01 %)
37
(0.00 %)
21,523
(1.86 %)
19,627
(1.36 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
4,895,563
(44.53 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
4
(0.00 %)
1,172,090
(3.51 %)
19,244
(0.46 %)
16,092
(0.39 %)
496 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2
n/a n/a 20,319
(1.82 %)
21,542
(1.19 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
55,576
(0.76 %)
58,981
(0.76 %)
118,810
(99.24 %)
5,524,514
(52.78 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,031
(38.71 %)
368
(0.01 %)
1,968,093
(4.25 %)
95,595
(1.41 %)
30,263
(0.74 %)
497 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3
84,433
(3.85 %)
n/a 20,317
(1.83 %)
21,239
(1.18 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
55,576
(0.76 %)
58,981
(0.76 %)
118,811
(99.24 %)
5,525,293
(52.79 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,088
(38.71 %)
368
(0.01 %)
1,968,092
(4.25 %)
95,595
(1.41 %)
30,263
(0.74 %)
498 oriental river prawn (v1 FS-2020 2020 genbank)
GCA_015104395.1
n/a n/a 1,945
(0.08 %)
23,579
(1.88 %)
n/a 36.81
(99.60 %)
16,132
(0.41 %)
16,132
(0.41 %)
16,156
(99.59 %)
2,706,474
(10.11 %)
2,525,264
(12.75 %)
9,704,257
(48.31 %)
44
(0.00 %)
2,589,746
(7.83 %)
77,313
(3.01 %)
18,031
(0.34 %)
499 painted lady (genbank 2021)
GCA_905220365.1
20,948
(56.23 %)
n/a 4,705
(1.06 %)
15,277
(5.00 %)
29,018
(10.11 %)
33.42
(99.99 %)
0
(0 %)
91
(0.01 %)
37
(100.00 %)
209,233
(2.16 %)
56,676
(1.12 %)
3,372,591
(44.40 %)
3
(0.00 %)
131,267
(3.01 %)
13,547
(2.72 %)
8,615
(1.04 %)
500 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1
35,529
(2.39 %)
n/a 18,185
(1.70 %)
20,184
(1.64 %)
41,094
(3.29 %)
42.38
(98.92 %)
0
(0 %)
831
(1.08 %)
141
(100.00 %)
3,072,951
(30.02 %)
385,608
(0.80 %)
12,060,365
(30.47 %)
1
(0.00 %)
173,548
(0.73 %)
64,081
(4.30 %)
66,821
(4.05 %)
501 pea aphid (AL4f v1 2019)
GCF_005508785.1
31,681
(7.81 %)
n/a 4,257
(0.79 %)
16,323
(3.39 %)
n/a 29.76
(92.38 %)
0
(0 %)
46,297
(7.65 %)
21,920
(100.00 %)
768,383
(18.87 %)
135,468
(2.11 %)
4,536,093
(48.39 %)
93
(0.01 %)
158,249
(4.28 %)
16,332
(2.13 %)
13,468
(1.54 %)
502 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1
49,100
(50.44 %)
n/a 13,025
(1.67 %)
24,167
(2.02 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
0
(0 %)
232
(0.31 %)
124
(100.00 %)
586,316
(11.83 %)
335,214
(8.05 %)
7,038,700
(24.65 %)
0
(0 %)
405,444
(2.46 %)
26,085
(2.25 %)
20,023
(0.87 %)
503 pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 genbank)
GCA_043159975.1
n/a n/a 20,768
(1.76 %)
21,550
(1.18 %)
n/a 41.04
(100.00 %)
0
(0 %)
260
(0.00 %)
362
(100.00 %)
5,387,919
(53.48 %)
1,027,640
(9.31 %)
15,407,988
(41.73 %)
1
(0.00 %)
1,792,632
(3.77 %)
99,854
(1.52 %)
30,686
(0.78 %)
504 pigeon pea (v1 2016 BGI)
GCF_000340665.1
46,646
(9.41 %)
n/a 17,409
(3.12 %)
51,529
(12.74 %)
48,654
(8.33 %)
32.79
(94.21 %)
36,387
(5.81 %)
36,387
(5.81 %)
72,923
(94.19 %)
400,327
(3.60 %)
306,656
(4.69 %)
3,754,630
(39.24 %)
431
(0.18 %)
219,000
(6.77 %)
26,578
(2.89 %)
13,839
(1.14 %)
505 pike-perch
GCF_008315115.1
56,221
(8.23 %)
n/a 15,677
(2.23 %)
29,967
(5.65 %)
62,989
(6.22 %)
40.92
(100.00 %)
0
(0 %)
94
(0.00 %)
1,313
(100.00 %)
591,660
(5.05 %)
569,876
(7.39 %)
4,713,605
(36.32 %)
0
(0 %)
788,001
(5.34 %)
39,545
(1.93 %)
12,857
(0.60 %)
506 platypus (Pmale09 2018 BGI)
GCA_002966995.1
n/a n/a 15,042
(1.17 %)
19,939
(1.55 %)
n/a 46.64
(100.00 %)
0
(0 %)
476
(0.00 %)
4,568
(100.00 %)
5,326,862
(52.88 %)
879,598
(5.00 %)
9,545,961
(50.95 %)
3
(0.00 %)
1,781,446
(5.23 %)
94,468
(9.28 %)
81,476
(3.15 %)
507 platypus (Pmale09 v1 2019)
GCF_004115215.1
56,695
(3.09 %)
n/a 14,805
(1.26 %)
18,918
(1.63 %)
42,516
(2.60 %)
46.13
(99.18 %)
0
(0 %)
522
(0.82 %)
305
(100.00 %)
5,099,803
(51.62 %)
577,434
(2.88 %)
9,110,403
(48.91 %)
0
(0 %)
1,127,318
(3.58 %)
87,829
(7.91 %)
74,084
(2.86 %)
508 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3
n/a n/a 14,805
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
0
(0 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,101,303
(51.62 %)
578,617
(2.89 %)
9,113,847
(48.93 %)
0
(0 %)
1,130,252
(3.59 %)
87,861
(7.92 %)
74,107
(2.86 %)
509 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1
35,751
(39.94 %)
n/a 18,495
(1.67 %)
15,243
(1.37 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
110,343
(1.67 %)
134,161
(98.33 %)
4,221,025
(40.96 %)
553,193
(1.29 %)
13,765,526
(29.91 %)
205
(0.03 %)
311,409
(1.04 %)
54,906
(1.17 %)
47,465
(0.98 %)
510 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1
45,404
(55.83 %)
n/a 14,654
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
0
(0 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,311,131
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
3
(0.00 %)
1,623,656
(7.33 %)
172,199
(5.45 %)
18,080
(0.31 %)
511 pronghorn (BS35 2019 Broad)
GCA_004027515.1
n/a n/a 24,094
(1.34 %)
35,119
(1.27 %)
n/a 41.97
(99.87 %)
6,569
(0.02 %)
6,569
(0.02 %)
1,649,700
(99.98 %)
5,613,563
(41.47 %)
652,408
(1.55 %)
13,943,055
(43.64 %)
21
(0.00 %)
n/a 61,057
(1.17 %)
39,599
(0.79 %)
512 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1
45,076
(35.88 %)
n/a 19,564
(1.68 %)
22,124
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
80,963
(0.88 %)
134,059
(99.12 %)
3,917,534
(41.44 %)
435,606
(1.73 %)
14,738,354
(28.36 %)
39
(0.00 %)
276,230
(1.12 %)
40,752
(0.94 %)
35,911
(0.79 %)
513 Puerto Rican coqui (hap1 2024 genbank)
GCA_035609145.1
n/a n/a 13,881
(0.57 %)
32,313
(1.67 %)
n/a 44.91
(100.00 %)
6
(0.00 %)
659
(0.00 %)
963
(100.00 %)
1,044,181
(1.98 %)
1,442,189
(16.51 %)
14,710,175
(54.00 %)
6
(0.00 %)
4,070,195
(8.73 %)
501,931
(8.81 %)
49,483
(0.82 %)
514 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1
25,575
(34.74 %)
n/a 17,665
(1.56 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
0
(0 %)
178,992
(4.69 %)
2,174
(100.00 %)
4,884,619
(42.70 %)
833,136
(1.76 %)
13,705,706
(31.28 %)
2,166
(0.06 %)
494,972
(1.78 %)
58,912
(1.65 %)
50,363
(1.31 %)
515 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2
59,332
(37.06 %)
26
(0.00 %)
19,951
(1.94 %)
19,039
(1.18 %)
n/a 40.74
(82.95 %)
111,087
(17.06 %)
156,797
(17.06 %)
121,337
(82.94 %)
5,136,492
(50.91 %)
775,493
(1.63 %)
15,570,612
(30.28 %)
70
(0.03 %)
729,770
(1.34 %)
43,049
(0.71 %)
26,732
(0.52 %)
516 pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023)
GCF_029289425.1
88,587
(3.87 %)
n/a 20,765
(1.73 %)
22,666
(1.18 %)
n/a 40.49
(99.96 %)
0
(0 %)
8
(0.04 %)
443
(100.00 %)
5,487,575
(50.65 %)
1,054,555
(12.79 %)
15,952,698
(43.80 %)
0
(0 %)
3,830,835
(6.42 %)
53,329
(1.37 %)
27,996
(0.60 %)
517 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank)
GCA_026419965.1
56,261
(41.31 %)
n/a 18,495
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
0
(0 %)
143
(0.19 %)
580
(100.00 %)
3,817,653
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,926
(39.96 %)
0
(0 %)
1,197,918
(3.53 %)
101,353
(2.90 %)
50,216
(1.47 %)
518 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank)
GCA_009806435.2
n/a n/a 19,480
(1.31 %)
23,335
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
0
(0 %)
18,178
(2.32 %)
3,159
(100.00 %)
4,179,975
(0.00 %)
976,271
(2.33 %)
13,766,353
(39.76 %)
85
(0.00 %)
1,275,666
(3.04 %)
113,370
(2.46 %)
70,869
(1.75 %)
519 rabbit (primary hap 2024 genbank)
GCA_964237555.1
n/a n/a 19,386
(1.31 %)
22,863
(1.35 %)
n/a 44.02
(99.98 %)
0
(0 %)
2,276
(0.02 %)
222
(100.00 %)
4,099,590
(21.20 %)
1,062,902
(3.78 %)
13,416,878
(41.72 %)
5
(0.00 %)
1,560,079
(3.77 %)
116,524
(2.66 %)
74,863
(1.94 %)
520 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1
n/a n/a 18,676
(1.38 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,884,561
(44.65 %)
883,943
(1.73 %)
13,254,559
(38.27 %)
12
(0.00 %)
1,022,805
(2.55 %)
110,338
(2.33 %)
68,466
(1.73 %)
521 radish (v1 WS10039 2015)
GCF_000801105.1
69,941
(20.66 %)
n/a 33,762
(10.20 %)
70,765
(28.80 %)
n/a 35.29
(87.22 %)
0
(0 %)
28,041
(12.80 %)
10,676
(100.00 %)
196,483
(2.53 %)
150,132
(3.32 %)
2,256,858
(26.65 %)
148
(0.08 %)
181,090
(8.85 %)
23,381
(2.80 %)
18,811
(2.08 %)
522 red admiral (genbank 2021)
GCA_905147765.2
n/a n/a 4,641
(1.20 %)
13,258
(4.79 %)
32,725
(10.42 %)
32.84
(100.00 %)
0
(0 %)
18
(0.00 %)
142
(100.00 %)
184,094
(2.52 %)
41,639
(1.23 %)
3,193,736
(41.82 %)
0
(0 %)
59,270
(1.97 %)
10,747
(2.25 %)
7,305
(0.97 %)
523 red mason bee (LIB18336 2019)
GCF_004153925.1
26,926
(16.13 %)
n/a 4,185
(2.08 %)
24,859
(11.07 %)
n/a 39.77
(99.98 %)
0
(0 %)
2,089
(0.02 %)
10,222
(100.00 %)
88,278
(1.96 %)
74,016
(3.78 %)
1,305,254
(28.61 %)
137
(0.02 %)
68,133
(2.01 %)
10,712
(6.90 %)
7,940
(2.34 %)
524 red-crested turaco (2014 BGI)
GCF_000709365.1
16,151
(2.15 %)
n/a 12,046
(1.50 %)
25,077
(1.98 %)
n/a 41.63
(99.43 %)
75,085
(0.59 %)
75,085
(0.59 %)
134,672
(99.41 %)
401,465
(6.41 %)
153,694
(0.86 %)
6,705,299
(20.45 %)
1
(0.00 %)
58,294
(0.41 %)
30,183
(1.07 %)
25,549
(0.87 %)
525 red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI)
GCF_000690535.1
16,238
(2.21 %)
n/a 12,016
(1.53 %)
23,985
(1.93 %)
n/a 41.20
(99.63 %)
59,230
(0.38 %)
59,230
(0.38 %)
112,704
(99.62 %)
322,026
(4.02 %)
121,725
(0.68 %)
6,797,850
(18.25 %)
4
(0.00 %)
20,461
(0.20 %)
18,873
(0.62 %)
16,327
(0.52 %)
526 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1
25,173
(40.74 %)
n/a 13,218
(1.71 %)
28,120
(2.39 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
9
(0.00 %)
249
(0.00 %)
1,195
(100.00 %)
544,427
(8.81 %)
223,674
(5.77 %)
6,669,469
(23.63 %)
3
(0.00 %)
398,605
(2.64 %)
38,306
(3.37 %)
35,069
(1.78 %)
527 reedfish (2019)
GCF_900747795.1
40,545
(1.73 %)
n/a 13,154
(0.46 %)
24,028
(1.29 %)
34,856
(1.34 %)
39.44
(93.75 %)
0
(0 %)
5,614
(6.25 %)
1,885
(100.00 %)
1,834,613
(2.79 %)
1,018,031
(2.36 %)
20,081,632
(44.56 %)
4
(0.00 %)
1,039,686
(2.44 %)
88,254
(1.06 %)
22,510
(0.28 %)
528 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3
n/a n/a 20,558
(1.71 %)
22,141
(1.12 %)
n/a 40.95
(97.08 %)
63,767
(2.91 %)
64,538
(2.91 %)
348,579
(97.09 %)
5,846,699
(54.61 %)
1,429,378
(9.24 %)
16,512,587
(40.26 %)
80
(0.01 %)
2,975,593
(6.12 %)
98,572
(1.29 %)
30,558
(0.68 %)
529 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1
59,888
(43.60 %)
n/a 19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
0
(0 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
4
(0.00 %)
1,071,329
(3.37 %)
73,126
(1.69 %)
43,865
(1.11 %)
530 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1
16,166
(2.37 %)
n/a 12,054
(1.65 %)
23,851
(2.04 %)
n/a 41.63
(99.55 %)
66,437
(0.46 %)
66,437
(0.46 %)
120,312
(99.54 %)
392,481
(7.69 %)
217,040
(2.27 %)
5,855,355
(18.33 %)
5
(0.00 %)
69,222
(0.63 %)
7,602
(0.24 %)
5,949
(0.18 %)
531 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1
n/a n/a 21,125
(1.90 %)
29,864
(1.51 %)
65,909
(1.91 %)
41.13
(99.93 %)
4,599
(0.02 %)
4,599
(0.02 %)
580,026
(99.98 %)
3,840,645
(39.25 %)
675,921
(1.83 %)
13,841,750
(31.45 %)
17
(0.00 %)
304,327
(0.71 %)
59,440
(1.72 %)
54,385
(1.53 %)
532 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1
25,353
(3.88 %)
n/a 14,334
(1.56 %)
58,475
(4.46 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
0
(0 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
642,988
(3.38 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
7,501
(0.17 %)
424,697
(2.96 %)
52,308
(2.11 %)
22,130
(0.71 %)
533 river trout (v1 2019)
GCF_901001165.1
102,785
(6.02 %)
n/a 27,413
(1.62 %)
51,424
(4.17 %)
121,979
(5.28 %)
43.36
(96.90 %)
0
(0 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
1,438,988
(5.72 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,761
(52.37 %)
2
(0.00 %)
3,428,195
(8.64 %)
70,821
(1.77 %)
18,627
(0.33 %)
534 rock pigeon (v1 racing homer maternal hap 2024)
GCA_036010775.1
n/a n/a 12,450
(1.75 %)
25,274
(2.35 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
23
(0.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
2
(0.00 %)
1,046,190
(5.37 %)
33,479
(3.29 %)
29,158
(1.73 %)
535 rock pigeon (v1 racing homer paternal W 2024)
GCA_036013475.1
n/a n/a 13,145
(1.66 %)
28,883
(2.53 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
248
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,923
(11.76 %)
412,678
(12.92 %)
6,047,578
(29.90 %)
0
(0 %)
1,266,126
(5.89 %)
36,847
(3.12 %)
31,114
(1.65 %)
536 rock pigeon (v2 racing homer 2024 genbank)
GCA_036013475.2
n/a n/a 13,146
(1.66 %)
25,463
(2.12 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,969
(11.76 %)
412,670
(12.92 %)
6,047,584
(29.90 %)
0
(0 %)
1,266,456
(5.89 %)
36,847
(3.12 %)
31,115
(1.65 %)
537 rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank)
GCA_023343835.1
51,619
(61.28 %)
n/a 12,831
(2.31 %)
n/a n/a 41.57
(99.99 %)
0
(0 %)
210
(0.01 %)
164
(100.00 %)
667,924
(11.59 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,274
(21.73 %)
0
(0 %)
216,565
(1.89 %)
21,346
(2.37 %)
19,067
(1.48 %)
538 rose-grain aphid (CAU 2021 genbank)
GCA_019925205.1
n/a n/a 4,332
(0.82 %)
15,532
(3.91 %)
n/a 30.24
(99.98 %)
0
(0 %)
240
(0.02 %)
67
(100.00 %)
481,097
(4.72 %)
135,266
(7.01 %)
4,093,473
(52.65 %)
2
(0.00 %)
194,054
(4.51 %)
12,709
(2.68 %)
10,994
(1.68 %)
539 rough bullseye (RE-2024b hap1 2024 genbank)
GCA_042242105.1
n/a n/a 14,592
(2.84 %)
44,299
(6.93 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
87
(0.00 %)
442
(100.00 %)
1,764,545
(30.13 %)
271,391
(5.93 %)
3,651,092
(24.53 %)
2
(0.00 %)
299,227
(3.11 %)
19,771
(1.39 %)
14,337
(0.85 %)
540 royal ground snake (hap1 2023 genbank)
GCA_031021105.1
n/a n/a 13,327
(0.96 %)
20,347
(1.68 %)
n/a 41.25
(99.99 %)
0
(0 %)
1,391
(0.01 %)
400
(100.00 %)
1,983,903
(10.40 %)
1,698,731
(7.29 %)
9,084,707
(53.44 %)
11
(0.00 %)
1,523,664
(5.77 %)
130,852
(4.47 %)
27,815
(0.70 %)
541 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2
53,779
(39.43 %)
n/a 21,304
(2.26 %)
18,211
(1.40 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
27,758
(7.29 %)
306,650
(10.98 %)
30,919
(92.71 %)
4,878,260
(40.08 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,226
(27.49 %)
6,570
(0.06 %)
398,071
(1.12 %)
16,050
(0.44 %)
15,502
(0.41 %)
542 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1
53,855
(2.85 %)
49,148
(2.43 %)
21,291
(2.26 %)
19,256
(1.49 %)
96,713
(4.05 %)
41.70
(89.05 %)
27,758
(7.29 %)
306,650
(10.98 %)
30,920
(92.71 %)
4,749,528
(39.06 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,297
(27.49 %)
6,570
(0.06 %)
398,071
(1.12 %)
16,050
(0.44 %)
15,491
(0.41 %)
543 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1
46,746
(40.70 %)
n/a 18,625
(1.49 %)
20,451
(1.28 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
0
(0 %)
968
(0.01 %)
631
(100.00 %)
4,020,682
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,818
(42.64 %)
0
(0 %)
1,785,427
(5.07 %)
66,179
(3.91 %)
41,466
(1.03 %)
544 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1
50,290
(50.75 %)
n/a 12,971
(1.67 %)
23,351
(2.02 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
0
(0 %)
258
(0.30 %)
282
(100.00 %)
548,087
(7.21 %)
201,482
(8.55 %)
7,030,761
(24.94 %)
0
(0 %)
469,777
(2.60 %)
31,791
(2.57 %)
20,215
(0.89 %)
545 salmon louse (v1.1 2020)
GCF_016086655.2
27,164
(5.26 %)
n/a 3,465
(0.45 %)
3,673
(1.75 %)
n/a 30.90
(99.99 %)
603
(0.01 %)
608
(0.01 %)
10,436
(99.99 %)
1,394,872
(53.53 %)
76,419
(1.13 %)
6,311,228
(43.85 %)
0
(0 %)
80,432
(1.10 %)
647
(0.04 %)
374
(0.03 %)
546 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887145.1
27,528
(42.80 %)
n/a 12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
0
(0 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
1
(0.00 %)
651,029
(4.07 %)
35,549
(5.05 %)
23,802
(1.15 %)
547 San Diegan tiger whiptail (v1.0 HBS 135688 primary hap 2022)
GCA_023333525.1
n/a n/a 10,727
(1.18 %)
14,669
(1.99 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
39
(0.00 %)
39
(0.00 %)
113
(100.00 %)
741,937
(6.29 %)
448,194
(5.60 %)
7,227,870
(36.97 %)
0
(0 %)
769,111
(3.76 %)
42,621
(2.15 %)
17,889
(0.90 %)
548 Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank)
GCA_029499605.1
108,406
(45.40 %)
n/a 13,961
(0.46 %)
36,603
(1.55 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
0
(0 %)
2,297
(0.01 %)
3,475
(100.00 %)
1,903,658
(2.85 %)
2,970,695
(16.56 %)
15,354,615
(64.31 %)
20
(0.00 %)
n/a 652,708
(8.36 %)
43,665
(0.45 %)
549 SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19)
GCF_009858895.2
n/a 13
(97.85 %)
n/a n/a n/a 37.98
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.24 %)
1
(0.11 %)
33
(1.38 %)
0
(0 %)
0
(0.00 %)
1
(0.73 %)
1
(0.73 %)
550 Schreibers' long-fingered bat (v1 hap1 2024)
GCA_964146895.1
n/a n/a 17,882
(1.96 %)
21,291
(1.88 %)
n/a 42.53
(99.99 %)
0
(0 %)
1,322
(0.01 %)
265
(100.00 %)
2,639,522
(28.12 %)
453,024
(5.66 %)
10,206,715
(31.11 %)
6
(0.00 %)
673,573
(2.67 %)
59,363
(2.86 %)
53,151
(1.93 %)
551 Schreibers' long-fingered bat (v1 hap2 2024)
GCA_964145185.1
n/a n/a 17,115
(2.05 %)
19,972
(1.93 %)
n/a 42.62
(99.99 %)
1,137
(0.01 %)
1,137
(0.01 %)
1,305
(99.99 %)
2,445,695
(27.61 %)
386,295
(4.40 %)
9,657,997
(29.32 %)
2
(0.00 %)
458,566
(1.76 %)
56,451
(2.93 %)
50,746
(2.02 %)
552 sea anemones (CC7 2015 genbank)
GCA_001417965.1
29,778
(59.32 %)
26,042
(31.72 %)
3,020
(1.06 %)
13,146
(12.99 %)
30,497
(24.04 %)
36.33
(82.34 %)
0
(0 %)
637,478
(17.95 %)
4,312
(100.00 %)
74,671
(1.98 %)
63,328
(2.24 %)
1,417,036
(20.33 %)
493
(0.38 %)
82,695
(5.22 %)
2,099
(0.38 %)
1,309
(0.28 %)
553 sea lamprey (kPetMar1 primary hap 2020)
GCA_010993605.1
n/a n/a 8,130
(0.73 %)
36,343
(4.06 %)
n/a 48.31
(98.62 %)
0
(0 %)
930
(1.38 %)
1,433
(100.00 %)
3,309,659
(59.73 %)
1,194,161
(21.47 %)
5,320,564
(50.50 %)
4
(0.00 %)
768,508
(3.64 %)
178,590
(35.88 %)
150,079
(6.78 %)
554 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2
n/a n/a 18,591
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
34,142
(1.77 %)
41.56
(98.79 %)
22,821
(1.21 %)
23,134
(1.21 %)
29,588
(98.79 %)
4,702,292
(41.42 %)
721,749
(1.39 %)
14,065,592
(32.89 %)
1,203
(0.02 %)
504,215
(2.00 %)
55,388
(1.87 %)
53,466
(1.67 %)
555 segmented worms (v1 2012)
GCF_000326865.1
23,426
(13.46 %)
n/a 2,741
(0.95 %)
3,156
(4.19 %)
n/a 32.82
(91.54 %)
10,301
(8.47 %)
11,185
(8.47 %)
12,292
(91.53 %)
572,062
(30.90 %)
474,390
(10.49 %)
1,741,644
(44.75 %)
9
(0.01 %)
91,780
(2.82 %)
3,489
(0.51 %)
1,342
(0.18 %)
556 siamang (v1 Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1
79,118
(2.62 %)
n/a 20,139
(1.70 %)
21,232
(1.14 %)
n/a 40.62
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
606
(100.00 %)
5,278,880
(55.89 %)
946,219
(14.68 %)
14,395,605
(46.26 %)
0
(0 %)
2,376,584
(4.99 %)
95,573
(1.75 %)
30,053
(0.74 %)
557 siamang (v2 Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.2
n/a n/a 19,572
(1.70 %)
20,107
(1.11 %)
n/a 40.45
(99.93 %)
0
(0 %)
3
(0.07 %)
40
(100.00 %)
5,057,491
(55.54 %)
869,279
(15.07 %)
14,090,400
(46.04 %)
0
(0 %)
2,292,373
(4.98 %)
87,907
(1.41 %)
26,874
(0.68 %)
558 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 genbank)
GCA_028878055.2
105,360
(44.53 %)
n/a 20,433
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
0
(0 %)
1
(0.03 %)
26
(100.00 %)
5,354,441
(55.80 %)
935,620
(14.70 %)
14,917,483
(46.01 %)
0
(0 %)
2,398,386
(4.90 %)
92,243
(1.42 %)
27,998
(0.68 %)
559 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.2
105,373
(3.05 %)
n/a 20,434
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
0
(0 %)
2
(0.03 %)
27
(100.00 %)
5,354,446
(55.80 %)
935,620
(14.70 %)
14,917,515
(46.01 %)
0
(0 %)
2,398,386
(4.90 %)
92,243
(1.42 %)
27,998
(0.68 %)
560 Siamese fighting fish (v2 primary hap 2019)
GCF_900634795.2
54,389
(16.95 %)
n/a 14,745
(4.21 %)
34,348
(10.09 %)
62,673
(13.02 %)
45.30
(99.99 %)
0
(0 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
252,955
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
0
(0 %)
232,426
(4.41 %)
72,126
(13.08 %)
55,959
(7.25 %)
561 Siamese fighting fish (v3 primary hap 2020)
GCF_900634795.3
54,864
(17.78 %)
n/a 14,745
(4.20 %)
56,808
(10.87 %)
69,466
(16.34 %)
45.30
(99.99 %)
0
(0 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
255,550
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
0
(0 %)
232,435
(4.41 %)
72,126
(13.08 %)
55,959
(7.25 %)
562 silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.1
54,238
(2.74 %)
n/a 17,887
(2.00 %)
18,517
(1.25 %)
n/a 41.17
(98.20 %)
0
(0 %)
18,567
(1.80 %)
18,392
(100.00 %)
4,399,357
(50.55 %)
711,948
(2.37 %)
12,623,705
(36.55 %)
554
(0.02 %)
851,081
(2.16 %)
67,835
(1.30 %)
23,062
(0.73 %)
563 silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.2
63,475
(2.65 %)
n/a 20,581
(1.94 %)
21,181
(1.20 %)
41,252
(1.46 %)
41.02
(97.81 %)
0
(0 %)
25,106
(2.19 %)
18,395
(100.00 %)
5,332,131
(51.09 %)
857,562
(2.26 %)
15,565,289
(36.84 %)
736
(0.02 %)
997,772
(2.11 %)
80,124
(1.26 %)
26,690
(0.70 %)
564 slow loris (BS32 2019)
GCA_004027815.1
n/a n/a 26,771
(1.11 %)
44,247
(1.00 %)
n/a 40.68
(99.86 %)
9,648
(0.03 %)
9,648
(0.03 %)
1,946,791
(99.97 %)
6,230,312
(41.68 %)
688,924
(1.23 %)
16,892,392
(43.00 %)
103
(0.00 %)
n/a 39,326
(0.65 %)
24,515
(0.47 %)
565 slow loris (primary hap 2022 genbank)
GCA_027406575.1
67,213
(41.75 %)
n/a 22,195
(1.49 %)
21,341
(1.28 %)
n/a 40.82
(99.86 %)
0
(0 %)
218
(0.14 %)
85
(100.00 %)
4,625,875
(39.88 %)
579,984
(1.59 %)
14,405,402
(40.78 %)
2
(0.00 %)
991,314
(2.40 %)
38,257
(0.77 %)
22,955
(0.54 %)
566 small Madagascar hedgehog
GCA_000313985.1
n/a n/a 19,066
(1.18 %)
19,334
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.44 %)
269,444
(11.60 %)
269,444
(11.60 %)
277,845
(88.40 %)
3,789,866
(28.89 %)
429,318
(0.87 %)
16,950,647
(32.23 %)
3,871
(0.06 %)
189,446
(0.64 %)
39,994
(0.70 %)
32,202
(0.55 %)
567 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1
55,749
(1.62 %)
n/a 12,597
(0.36 %)
23,987
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
0
(0 %)
7,146
(1.52 %)
646
(100.00 %)
1,185,832
(1.72 %)
1,448,620
(6.25 %)
20,884,767
(51.41 %)
10
(0.00 %)
3,334,926
(4.99 %)
456,658
(8.18 %)
31,096
(0.32 %)
568 smalleye Pacific opah (hap2 2023 genbank)
GCA_029633865.1
n/a n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
0
(0 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
17
(0.00 %)
n/a 143,632
(7.43 %)
65,914
(2.15 %)
569 smalltooth sawfish (v2 primary hap 2019 genbank)
GCA_009764475.1
n/a n/a 11,828
(0.66 %)
18,627
(1.55 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
0
(0 %)
698
(0.91 %)
173
(100.00 %)
405,021
(1.14 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,302
(38.19 %)
0
(0 %)
471,290
(1.50 %)
45,398
(1.34 %)
18,572
(0.38 %)
570 snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016)
GCF_001687245.1
37,836
(4.45 %)
n/a 10,526
(1.07 %)
59,331
(6.34 %)
n/a 36.53
(93.84 %)
52,913
(6.17 %)
227,684
(6.18 %)
139,583
(93.83 %)
653,914
(2.87 %)
386,956
(5.71 %)
7,364,314
(43.00 %)
22,478
(0.98 %)
443,424
(7.26 %)
60,636
(4.05 %)
36,565
(2.36 %)
571 sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019)
GCF_006149115.1
76,167
(6.12 %)
n/a 24,114
(1.71 %)
51,371
(4.08 %)
102,891
(5.24 %)
43.39
(96.16 %)
1,903
(0.01 %)
25,659
(3.84 %)
38,027
(99.99 %)
1,300,179
(8.96 %)
1,465,690
(10.81 %)
8,849,714
(48.44 %)
872
(0.04 %)
1,716,006
(5.17 %)
64,215
(1.55 %)
18,038
(0.45 %)
572 South Georgia icefish (v1 primary hap 2020)
GCF_902827115.1
41,307
(6.47 %)
n/a 14,776
(1.79 %)
68,734
(6.16 %)
61,643
(5.52 %)
42.07
(99.94 %)
0
(0 %)
2,461
(0.06 %)
1,563
(100.00 %)
498,451
(3.42 %)
474,032
(7.20 %)
3,613,731
(45.83 %)
19
(0.00 %)
763,187
(8.62 %)
88,984
(4.31 %)
17,905
(0.76 %)
573 southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank)
GCA_910596095.1
58,416
(66.24 %)
n/a 15,695
(2.61 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
95
(0.00 %)
58
(100.00 %)
1,591,314
(33.50 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,850
(26.85 %)
0
(0 %)
326,259
(3.37 %)
14,097
(0.88 %)
9,797
(0.48 %)
574 southern cattle tick (Rmic-2018 2020 genbank)
GCA_013339725.1
n/a 29,870
(1.19 %)
3,698
(0.12 %)
117,910
(5.00 %)
35,315
(1.88 %)
45.79
(99.99 %)
0
(0 %)
1,576
(0.01 %)
7,048
(100.00 %)
770,997
(2.03 %)
680,149
(3.55 %)
10,994,272
(39.37 %)
0
(0 %)
979,976
(3.85 %)
304,620
(17.03 %)
234,809
(5.42 %)
575 southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad)
GCA_004026725.1
n/a n/a 24,302
(1.12 %)
43,055
(0.98 %)
n/a 41.63
(99.82 %)
10,550
(0.03 %)
10,550
(0.03 %)
2,272,285
(99.97 %)
5,668,964
(24.75 %)
1,628,683
(5.38 %)
15,658,806
(41.85 %)
67
(0.00 %)
n/a 21,801
(0.44 %)
18,380
(0.34 %)
576 southern house mosquito (JHB 2007 genbank)
GCA_000209185.1
n/a 22,629
(4.75 %)
5,905
(1.14 %)
41,195
(8.84 %)
n/a 37.42
(93.28 %)
45,500
(6.75 %)
45,500
(6.75 %)
48,671
(93.25 %)
738,398
(35.22 %)
171,041
(5.71 %)
3,037,349
(50.41 %)
88
(0.02 %)
323,404
(5.87 %)
65,784
(9.49 %)
44,205
(6.42 %)
577 southern tamandua (Broad 2019)
GCA_004025105.1
n/a n/a 25,638
(0.82 %)
49,782
(0.86 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
5,819
(0.02 %)
5,819
(0.02 %)
2,150,023
(99.98 %)
6,033,640
(37.10 %)
708,890
(0.99 %)
22,371,532
(41.88 %)
62
(0.00 %)
n/a 80,897
(1.09 %)
48,136
(0.70 %)
578 southern two-toed sloth (US054 2019 Broad)
GCA_004027855.1
n/a n/a 25,877
(0.78 %)
56,071
(0.82 %)
n/a 39.82
(99.84 %)
5,099
(0.02 %)
5,099
(0.02 %)
2,537,432
(99.98 %)
5,384,587
(37.86 %)
724,925
(2.20 %)
19,492,096
(41.12 %)
63
(0.00 %)
n/a 55,674
(0.90 %)
46,833
(0.74 %)
579 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1
37,037
(37.57 %)
n/a 18,551
(1.79 %)
19,747
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
54,737
(3.96 %)
57,823
(96.04 %)
3,824,807
(39.33 %)
421,693
(0.97 %)
14,765,476
(28.93 %)
1,818
(0.02 %)
184,274
(0.57 %)
36,281
(1.02 %)
34,129
(0.92 %)
580 soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010)
GCF_000004515.4
82,440
(9.65 %)
n/a 27,682
(3.07 %)
77,218
(11.84 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,955
(2.35 %)
15,955
(2.35 %)
17,146
(97.65 %)
834,646
(37.35 %)
436,219
(5.65 %)
5,341,660
(45.30 %)
54
(0.01 %)
659,519
(6.22 %)
35,897
(1.56 %)
13,140
(0.58 %)
581 soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018)
GCF_000004515.5
85,123
(9.72 %)
n/a 27,647
(3.06 %)
77,190
(11.83 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,995
(2.36 %)
15,995
(2.36 %)
17,187
(97.64 %)
834,651
(37.35 %)
436,225
(5.65 %)
5,341,721
(45.30 %)
55
(0.01 %)
659,428
(6.22 %)
35,897
(1.47 %)
13,140
(0.58 %)
582 speckled mousebird (hap1 2023 genbank)
GCA_028858725.1
n/a n/a 11,956
(1.78 %)
25,177
(2.60 %)
n/a 42.38
(99.48 %)
0
(0 %)
143
(0.52 %)
189
(100.00 %)
523,056
(12.47 %)
243,547
(3.72 %)
5,408,003
(23.43 %)
1
(0.00 %)
397,635
(2.78 %)
25,552
(2.34 %)
19,232
(1.18 %)
583 speckled mousebird (v1 hap2 2023)
GCA_028858625.1
n/a n/a 13,169
(1.74 %)
26,896
(2.47 %)
n/a 42.62
(99.56 %)
0
(0 %)
151
(0.44 %)
243
(100.00 %)
570,907
(11.75 %)
317,226
(6.96 %)
5,854,600
(25.51 %)
0
(0 %)
605,114
(3.54 %)
28,905
(2.31 %)
21,335
(1.22 %)
584 speckled wood butterfly (genbank 2021)
GCA_905163445.1
21,720
(55.73 %)
n/a 4,713
(0.87 %)
17,002
(4.33 %)
29,238
(7.81 %)
35.99
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
71
(100.00 %)
304,077
(2.97 %)
110,835
(4.09 %)
3,704,355
(44.42 %)
1
(0.00 %)
144,758
(2.93 %)
28,108
(2.75 %)
11,566
(0.96 %)
585 sperm whale (SW-GA 2019)
GCF_002837175.2
60,921
(2.59 %)
n/a 19,527
(1.73 %)
25,114
(1.51 %)
n/a 41.39
(95.90 %)
128,928
(4.12 %)
128,928
(4.12 %)
143,605
(95.88 %)
4,365,057
(42.78 %)
694,673
(2.40 %)
13,518,590
(32.76 %)
1,887
(0.17 %)
521,351
(4.50 %)
94,152
(2.52 %)
63,303
(1.97 %)
586 sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF)
GCF_000090795.1
31,248
(25.26 %)
n/a 2,167
(1.08 %)
6,648
(9.22 %)
n/a 35.83
(86.92 %)
14,574
(13.10 %)
14,944
(13.10 %)
27,972
(86.90 %)
108,973
(4.04 %)
70,563
(4.66 %)
881,116
(24.58 %)
109
(0.03 %)
120,772
(5.83 %)
668
(0.62 %)
519
(0.56 %)
587 stable fly (8C7A2A5H3J4 2015 genbank)
GCA_001015335.1
n/a n/a 7,737
(1.16 %)
11,972
(2.65 %)
n/a 38.85
(84.55 %)
113,660
(15.50 %)
129,113
(15.50 %)
125,702
(84.50 %)
310,342
(1.75 %)
391,619
(8.42 %)
5,616,633
(48.71 %)
6,705
(0.32 %)
483,703
(3.74 %)
38,246
(1.55 %)
4,353
(0.18 %)
588 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.1
n/a n/a 22,306
(1.80 %)
33,366
(4.09 %)
n/a 39.56
(99.99 %)
0
(0 %)
402
(0.01 %)
245
(100.00 %)
1,126,738
(3.36 %)
889,853
(6.73 %)
8,766,715
(39.22 %)
4
(0.00 %)
1,059,859
(5.24 %)
51,356
(1.84 %)
13,633
(0.35 %)
589 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.2
n/a n/a 25,364
(1.76 %)
40,452
(4.10 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
0
(0 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
10
(0.00 %)
1,593,749
(6.87 %)
64,522
(2.85 %)
21,984
(0.89 %)
590 sterlet (v1 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.1
73,251
(5.76 %)
n/a 24,411
(1.72 %)
39,637
(3.96 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
0
(0 %)
6,283
(0.07 %)
3,404
(100.00 %)
1,269,345
(3.50 %)
1,095,665
(6.81 %)
10,007,602
(39.30 %)
5
(0.00 %)
1,356,511
(6.13 %)
60,475
(1.95 %)
17,954
(0.41 %)
591 sterlet (v1 paternal hap 2020)
GCA_902713435.1
n/a n/a 22,718
(1.81 %)
34,093
(4.15 %)
57,768
(4.88 %)
39.60
(100.00 %)
0
(0 %)
422
(0.01 %)
224
(100.00 %)
1,145,503
(3.39 %)
912,936
(6.84 %)
8,839,174
(39.17 %)
4
(0.00 %)
1,099,124
(5.35 %)
52,560
(1.82 %)
14,166
(0.36 %)
592 stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017)
GCF_002571385.1
36,135
(16.45 %)
n/a 3,324
(0.70 %)
20,909
(10.93 %)
38,198
(17.00 %)
38.54
(89.50 %)
0
(0 %)
49,077
(10.54 %)
5,688
(100.00 %)
111,077
(1.70 %)
108,732
(2.95 %)
2,009,396
(21.40 %)
206
(0.10 %)
118,773
(3.74 %)
6,012
(0.58 %)
3,703
(0.31 %)
593 striped catfish (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358585.1
53,859
(65.52 %)
n/a 16,035
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
0
(0 %)
236
(0.51 %)
59
(100.00 %)
1,870,238
(37.80 %)
605,571
(6.82 %)
5,059,499
(32.43 %)
2
(0.00 %)
531,388
(4.26 %)
17,919
(1.29 %)
12,796
(0.75 %)
594 sudden oak death agent (Pr-102 primary hap 2021 genbank)
GCA_020800215.1
n/a 15,507
(39.68 %)
1,461
(1.76 %)
22,413
(61.13 %)
n/a 54.37
(99.66 %)
0
(0 %)
50
(0.34 %)
28
(100.00 %)
8,935
(0.72 %)
9,528
(3.65 %)
117,380
(14.16 %)
0
(0 %)
17,976
(7.40 %)
34
(99.96 %)
156
(7.43 %)
595 Sumatran orangutan (Susie 2018 genbank)
GCA_002880775.3
n/a 160,726
(3.42 %)
20,174
(1.79 %)
20,994
(1.15 %)
47,806
(1.68 %)
40.80
(99.29 %)
553
(0.70 %)
553
(0.70 %)
5,813
(99.30 %)
5,497,148
(54.41 %)
1,048,361
(8.01 %)
15,948,575
(40.68 %)
0
(0 %)
2,413,946
(4.00 %)
39,481
(0.87 %)
26,385
(0.67 %)
596 Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1
98,046
(3.46 %)
n/a 21,162
(1.68 %)
21,714
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.79 %)
59
(0.21 %)
59
(0.21 %)
2,670
(99.79 %)
5,730,768
(55.05 %)
1,175,314
(11.19 %)
16,323,507
(44.05 %)
0
(0 %)
2,553,363
(4.41 %)
55,799
(2.08 %)
39,159
(1.10 %)
597 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1
n/a n/a 13,403
(1.85 %)
27,456
(2.48 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
497,374
(5.78 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
0
(0 %)
505,741
(2.66 %)
49,076
(3.54 %)
23,486
(1.21 %)
598 Swainson's thrush (v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1
40,128
(5.45 %)
n/a 13,016
(1.88 %)
24,787
(2.41 %)
30,064
(2.94 %)
42.48
(98.86 %)
0
(0 %)
428
(1.14 %)
161
(100.00 %)
483,978
(5.85 %)
589,859
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
1
(0.00 %)
449,585
(2.41 %)
49,404
(3.53 %)
22,206
(1.16 %)
599 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018845.1
29,544
(46.92 %)
n/a 12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
0
(0 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
1
(0.00 %)
578,723
(3.93 %)
32,064
(3.27 %)
22,996
(1.19 %)
600 tammar wallaby (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028372415.1
n/a n/a 17,652
(0.77 %)
15,774
(0.88 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
0
(0 %)
515
(0.19 %)
315
(100.00 %)
5,836,160
(26.14 %)
1,193,709
(2.72 %)
22,682,658
(39.52 %)
4
(0.00 %)
566,172
(1.21 %)
23,629
(0.48 %)
14,785
(0.29 %)
601 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 genbank)
GCA_028372415.2
n/a n/a 17,617
(0.77 %)
15,414
(0.86 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
0
(0 %)
515
(0.19 %)
273
(100.00 %)
5,866,321
(26.30 %)
1,193,604
(2.72 %)
22,677,517
(39.53 %)
4
(0.00 %)
565,991
(1.21 %)
23,590
(0.47 %)
14,746
(0.29 %)
602 Tasmanian devil
GCF_000189315.1
32,527
(1.79 %)
n/a 16,112
(0.84 %)
16,152
(0.94 %)
n/a 36.05
(92.36 %)
201,317
(7.66 %)
201,403
(7.66 %)
237,291
(92.34 %)
6,766,259
(42.85 %)
1,240,681
(2.07 %)
20,998,733
(36.61 %)
17,494
(0.40 %)
351,216
(1.07 %)
23,155
(0.38 %)
21,337
(0.32 %)
603 thale cress (tair10 Columbia 2011)
GCF_000001735.3
53,828
(40.09 %)
n/a 26,552
(34.12 %)
25,867
(35.78 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
0
(0 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
67,353
(16.32 %)
27,063
(2.77 %)
749,020
(22.64 %)
1
(0.00 %)
42,547
(3.36 %)
4,599
(1.63 %)
3,518
(1.15 %)
604 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1
41,886
(2.61 %)
n/a 19,165
(1.70 %)
18,102
(1.44 %)
n/a 39.91
(93.27 %)
141,005
(6.75 %)
141,005
(6.75 %)
153,488
(93.25 %)
4,378,557
(36.61 %)
640,337
(1.64 %)
14,116,066
(27.91 %)
2,964
(0.05 %)
213,421
(0.74 %)
28,321
(0.64 %)
26,464
(0.58 %)
605 thorny skate (v1 CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1
45,969
(2.40 %)
n/a 11,433
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
0
(0 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
865,711
(2.57 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
26
(0.00 %)
1,634,657
(4.98 %)
242,676
(4.73 %)
31,030
(0.57 %)
606 thorny skate (v1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank)
GCA_010909765.1
45,969
(46.35 %)
n/a 11,434
(0.60 %)
26,342
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
0
(0 %)
3,753
(7.46 %)
958
(100.00 %)
866,598
(2.58 %)
1,176,350
(3.79 %)
9,964,083
(52.25 %)
26
(0.00 %)
1,634,657
(4.98 %)
242,676
(4.73 %)
31,030
(0.57 %)
607 tick D.silvarum (v1 2020)
GCF_013339745.1
36,084
(1.94 %)
n/a 4,032
(0.13 %)
128,567
(5.82 %)
43,960
(2.05 %)
46.91
(99.95 %)
0
(0 %)
13,519
(0.05 %)
1,665
(100.00 %)
1,116,542
(2.95 %)
642,860
(3.16 %)
10,429,455
(39.18 %)
6
(0.00 %)
n/a 37,849
(2.30 %)
244,151
(6.39 %)
608 tidepool copepod (San Diego 2019 genbank)
GCA_007210705.1
23,429
(54.20 %)
15,577
(15.83 %)
3,517
(1.61 %)
18,910
(15.71 %)
n/a 42.18
(97.94 %)
0
(0 %)
14,007
(2.09 %)
459
(100.00 %)
52,042
(1.17 %)
27,065
(1.23 %)
928,666
(18.11 %)
1,035
(0.11 %)
46,898
(3.89 %)
15,823
(5.51 %)
13,041
(4.23 %)
609 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022 genbank)
GCA_026437365.1
n/a n/a 14,276
(1.78 %)
66,576
(6.32 %)
n/a 42.96
(99.99 %)
0
(0 %)
794
(0.01 %)
820
(100.00 %)
2,127,818
(38.86 %)
708,255
(30.28 %)
3,809,452
(49.66 %)
2
(0.00 %)
2,111,836
(12.18 %)
101,682
(8.04 %)
46,739
(2.13 %)
610 tiger tail seahorse (QL1 v1 2016)
GCF_001891065.1
47,041
(13.29 %)
n/a 13,817
(3.76 %)
32,943
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.04 %)
23,101
(6.97 %)
23,101
(6.97 %)
60,478
(93.03 %)
359,724
(3.91 %)
155,380
(3.35 %)
2,811,700
(24.51 %)
111
(0.08 %)
112,479
(5.30 %)
61,685
(7.72 %)
45,970
(4.19 %)
611 tiny Cayenne caecilian (v1 2019)
GCF_901765095.1
41,346
(1.27 %)
n/a 14,569
(0.43 %)
30,499
(1.16 %)
n/a 44.01
(98.99 %)
0
(0 %)
2,452
(1.01 %)
1,081
(100.00 %)
1,835,191
(1.59 %)
1,670,443
(3.30 %)
22,207,145
(52.43 %)
5
(0.00 %)
1,513,727
(3.00 %)
414,828
(3.91 %)
47,796
(0.38 %)
612 tomato (v3.0 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.4
46,014
(6.94 %)
n/a 15,396
(2.15 %)
38,462
(7.56 %)
n/a 34.12
(90.18 %)
0
(0 %)
19,634
(9.83 %)
3,150
(100.00 %)
417,162
(18.21 %)
229,803
(3.18 %)
5,370,478
(35.28 %)
224
(0.02 %)
412,060
(4.40 %)
25,279
(1.28 %)
2,409
(0.12 %)
613 tourmaline sunangel (hap1 2024 genbank)
GCA_036169615.1
n/a n/a 12,509
(1.97 %)
21,020
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.99 %)
0
(0 %)
437
(0.01 %)
131
(100.00 %)
532,267
(5.46 %)
332,284
(2.69 %)
6,084,978
(21.20 %)
0
(0 %)
215,264
(1.71 %)
19,080
(1.72 %)
15,764
(1.09 %)
614 trahira (v1 hap1 2023)
GCA_029633855.1
n/a n/a 16,039
(2.06 %)
44,287
(4.38 %)
n/a 40.99
(92.91 %)
0
(0 %)
867
(7.09 %)
597
(100.00 %)
2,228,831
(30.95 %)
687,495
(13.85 %)
5,309,097
(36.70 %)
2
(0.01 %)
1,157,952
(7.09 %)
27,070
(2.09 %)
12,077
(0.44 %)
615 trahira (v1 hap2 2023)
GCA_029633875.1
n/a n/a 16,216
(2.00 %)
45,209
(4.32 %)
n/a 41.03
(96.02 %)
0
(0 %)
907
(3.98 %)
452
(100.00 %)
2,280,303
(30.80 %)
708,327
(15.59 %)
5,394,248
(39.01 %)
7
(0.00 %)
1,246,906
(7.61 %)
28,386
(2.18 %)
12,439
(0.46 %)
616 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022 genbank)
GCA_023055355.1
n/a n/a 12,867
(1.81 %)
26,393
(2.48 %)
n/a 42.85
(100.00 %)
97
(0.00 %)
97
(0.00 %)
311
(100.00 %)
429,011
(3.16 %)
564,849
(5.52 %)
6,336,716
(23.32 %)
0
(0 %)
439,278
(2.62 %)
33,378
(2.70 %)
23,687
(1.26 %)
617 Trypanosoma equiperdum (OVI 2016 genbank)
GCA_001457755.2
n/a 10,902
(50.13 %)
576
(1.36 %)
2,999
(35.93 %)
n/a 45.94
(99.65 %)
0
(0 %)
6,447
(0.44 %)
2,026
(100.00 %)
16,807
(2.60 %)
3,925
(0.79 %)
141,656
(16.64 %)
0
(0 %)
1,684
(0.54 %)
4,877
(34.82 %)
4,352
(15.04 %)
618 Trypanosoma melophagium (St. Kilda St. Kilda 2022 genbank)
GCA_022059095.1
n/a 10,057
(64.23 %)
742
(1.83 %)
848
(40.20 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 64
(100.00 %)
39,141
(7.68 %)
14,366
(6.71 %)
131,898
(25.19 %)
0
(0 %)
9,068
(6.92 %)
4,119
(14.82 %)
3,546
(9.39 %)
619 tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020)
GCF_014805625.1
24,334
(8.13 %)
n/a 7,223
(2.32 %)
6,632
(3.62 %)
n/a 33.80
(97.46 %)
0
(0 %)
9,688
(2.55 %)
7,986
(100.00 %)
418,532
(4.76 %)
185,734
(2.26 %)
3,090,742
(35.34 %)
677
(0.08 %)
40,269
(0.93 %)
3,487
(0.58 %)
1,907
(0.28 %)
620 Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 genbank)
GCA_040894005.1
n/a n/a 13,678
(0.88 %)
29,720
(2.41 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
25
(0.00 %)
436
(0.00 %)
961
(100.00 %)
734,036
(2.54 %)
1,217,326
(21.42 %)
8,925,883
(52.53 %)
6
(0.00 %)
691,991
(2.19 %)
211,590
(5.08 %)
23,983
(0.47 %)
621 two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_901001135.1
56,630
(1.50 %)
n/a 14,448
(0.38 %)
40,572
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
0
(0 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,263,606
(1.94 %)
2,036,108
(4.34 %)
29,400,958
(44.09 %)
9
(0.01 %)
2,193,249
(3.24 %)
602,912
(6.66 %)
94,935
(0.82 %)
622 Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017)
GCA_002776525.1
n/a n/a 21,053
(1.88 %)
23,024
(1.24 %)
n/a 40.68
(96.59 %)
0
(0 %)
77,615
(3.42 %)
47,644
(100.00 %)
5,478,730
(51.13 %)
969,126
(2.63 %)
16,127,854
(36.40 %)
1,906
(0.05 %)
947,012
(1.94 %)
63,965
(1.04 %)
25,907
(0.65 %)
623 Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018)
GCF_002776525.2
66,965
(2.69 %)
n/a 21,958
(1.85 %)
24,388
(1.22 %)
55,722
(1.95 %)
40.60
(97.10 %)
0
(0 %)
63,620
(2.91 %)
47,449
(100.00 %)
5,699,639
(51.61 %)
1,066,606
(2.87 %)
16,603,622
(37.49 %)
6,170
(0.10 %)
1,075,458
(2.10 %)
71,084
(1.08 %)
26,726
(0.65 %)
624 Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019)
GCF_002776525.3
68,173
(2.68 %)
n/a 21,804
(1.85 %)
23,385
(1.18 %)
n/a 40.60
(97.10 %)
0
(0 %)
64,415
(2.91 %)
46,654
(100.00 %)
5,700,226
(51.61 %)
1,066,759
(2.88 %)
16,603,818
(37.49 %)
6,208
(0.10 %)
1,080,318
(2.10 %)
71,078
(1.08 %)
26,732
(0.65 %)
625 Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019)
GCF_002776525.4
63,704
(2.55 %)
n/a 21,347
(1.86 %)
23,056
(1.19 %)
n/a 40.84
(97.07 %)
0
(0 %)
57,757
(2.93 %)
34,372
(100.00 %)
5,504,117
(51.70 %)
961,351
(2.75 %)
16,208,033
(37.10 %)
4,987
(0.09 %)
1,064,626
(2.10 %)
71,046
(1.10 %)
29,347
(0.68 %)
626 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1
54,667
(35.81 %)
n/a 19,685
(1.25 %)
21,268
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
201,121
(4.83 %)
356,096
(95.17 %)
6,165,270
(34.95 %)
1,197,778
(2.77 %)
16,282,333
(36.21 %)
730
(0.04 %)
592,599
(1.56 %)
22,905
(0.49 %)
18,563
(0.39 %)
627 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1
63,555
(8.16 %)
n/a 16,886
(1.90 %)
72,876
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
0
(0 %)
1,674
(0.23 %)
2,010
(100.00 %)
800,389
(3.72 %)
460,244
(7.41 %)
5,439,256
(37.83 %)
3
(0.00 %)
746,332
(7.48 %)
19,635
(1.10 %)
9,142
(0.41 %)
628 vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.1
48,870
(21.91 %)
n/a 19,421
(7.41 %)
36,314
(20.76 %)
n/a 36.49
(94.25 %)
0
(0 %)
49,649
(5.76 %)
25,263
(100.00 %)
182,696
(3.35 %)
143,269
(7.40 %)
1,620,517
(29.12 %)
3,454
(0.84 %)
135,503
(7.90 %)
13,323
(2.49 %)
9,786
(1.57 %)
629 velvet spider S.dumicola (v1 Namibia, Etosha 2020)
GCF_010614865.1
34,675
(2.01 %)
n/a 3,329
(0.10 %)
24,015
(1.20 %)
n/a 33.26
(100.00 %)
0
(0 %)
7
(0.00 %)
16,531
(100.00 %)
1,258,301
(2.08 %)
828,332
(2.42 %)
17,994,342
(48.98 %)
0
(0 %)
650,236
(2.42 %)
63,015
(0.95 %)
8,586
(0.12 %)
630 wasp C.solmsi marchali (v1 2013)
GCF_000503995.1
13,201
(7.14 %)
n/a 3,474
(1.25 %)
15,142
(4.89 %)
n/a 30.36
(99.55 %)
7,471
(0.46 %)
7,471
(0.46 %)
9,928
(99.54 %)
340,841
(7.52 %)
251,386
(3.99 %)
2,448,273
(49.27 %)
11
(0.00 %)
43,154
(0.99 %)
16,346
(4.08 %)
14,983
(2.78 %)
631 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1
n/a n/a 20,245
(1.49 %)
24,230
(1.29 %)
n/a 42.11
(97.39 %)
263,385
(2.62 %)
263,385
(2.62 %)
630,367
(97.38 %)
5,997,926
(47.35 %)
466,019
(1.02 %)
13,822,739
(40.29 %)
2,383
(0.04 %)
975,519
(2.73 %)
93,080
(1.71 %)
42,806
(0.88 %)
632 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1
48,251
(30.18 %)
n/a 21,044
(1.72 %)
22,320
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
152,836
(29.58 %)
169,546
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,250
(0.66 %)
13,410,191
(22.09 %)
2,022
(0.05 %)
348,918
(1.08 %)
48,738
(1.01 %)
44,867
(0.88 %)
633 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1
29,923
(35.25 %)
n/a 18,034
(1.33 %)
19,779
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
219,764
(14.09 %)
225,566
(85.91 %)
6,527,125
(45.87 %)
1,271,531
(2.29 %)
12,374,069
(42.02 %)
3,596
(0.06 %)
861,216
(2.39 %)
28,528
(0.71 %)
23,900
(0.52 %)
634 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1
61,103
(44.10 %)
n/a 18,126
(1.16 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
0
(0 %)
3,760
(0.03 %)
1,175
(100.00 %)
4,891,344
(19.68 %)
1,507,933
(3.81 %)
12,571,193
(54.50 %)
7
(0.00 %)
1,975,693
(4.67 %)
32,667
(0.90 %)
24,067
(0.56 %)
635 western European house mouse (WSB_EiJ v1 2016)
GCA_001624835.1
n/a n/a 20,870
(2.26 %)
18,535
(1.45 %)
100,622
(4.22 %)
41.80
(84.36 %)
68,691
(5.19 %)
399,976
(15.70 %)
72,315
(94.81 %)
4,961,700
(39.53 %)
1,345,987
(2.51 %)
13,324,808
(25.23 %)
11,455
(0.66 %)
369,064
(1.23 %)
16,556
(0.40 %)
15,878
(0.38 %)
636 western flower thrips (v2 FOCC.00 2017)
GCF_000697945.2
24,277
(14.78 %)
n/a 4,066
(1.46 %)
26,743
(11.40 %)
n/a 51.10
(94.72 %)
15,747
(5.29 %)
60,375
(5.31 %)
34,226
(94.71 %)
275,482
(4.88 %)
167,812
(3.67 %)
1,832,537
(24.44 %)
729
(0.04 %)
58,278
(2.14 %)
26,406
(36.85 %)
31,568
(5.58 %)
637 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3
n/a n/a 20,323
(1.77 %)
22,069
(1.15 %)
n/a 40.71
(99.64 %)
768
(0.36 %)
768
(0.36 %)
16,065
(99.64 %)
5,373,630
(50.30 %)
1,025,389
(10.17 %)
15,954,613
(41.78 %)
0
(0 %)
3,581,997
(5.69 %)
53,557
(1.01 %)
27,578
(0.69 %)
638 western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023)
GCF_029281585.1
101,242
(3.18 %)
n/a 20,994
(1.57 %)
41,945
(1.53 %)
n/a 40.59
(99.85 %)
0
(0 %)
38
(0.15 %)
637
(100.00 %)
5,526,927
(51.16 %)
1,080,693
(20.38 %)
15,929,020
(48.46 %)
0
(0 %)
5,690,867
(9.25 %)
76,432
(1.35 %)
30,764
(0.70 %)
639 western lowland gorilla (v2.0 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.2
98,415
(41.67 %)
n/a 21,010
(1.59 %)
50,696
(1.83 %)
n/a 40.49
(99.94 %)
0
(0 %)
2
(0.06 %)
25
(100.00 %)
5,456,267
(50.77 %)
1,060,267
(19.55 %)
15,870,191
(47.77 %)
0
(0 %)
n/a 69,745
(1.19 %)
30,644
(0.70 %)
640 western lowland gorilla (v2.1 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.3
n/a n/a 21,010
(1.59 %)
50,695
(1.83 %)
n/a 40.49
(99.94 %)
0
(0 %)
2
(0.06 %)
26
(100.00 %)
5,456,271
(50.77 %)
1,060,267
(19.55 %)
15,870,225
(47.77 %)
0
(0 %)
1,391,066
(2.32 %)
69,745
(1.19 %)
30,644
(0.70 %)
641 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3
51,681
(3.25 %)
n/a 15,203
(1.04 %)
22,272
(1.67 %)
46,230
(2.32 %)
44.19
(91.88 %)
183,751
(8.14 %)
183,744
(8.14 %)
262,326
(91.86 %)
2,767,141
(30.92 %)
316,971
(0.98 %)
11,856,824
(28.95 %)
6,315
(0.16 %)
313,471
(1.46 %)
104,231
(1.84 %)
32,424
(0.69 %)
642 western painted turtle (v304 RCT428 2020)
GCF_000241765.4
64,798
(3.75 %)
n/a 15,669
(1.09 %)
21,663
(1.64 %)
n/a 44.19
(87.54 %)
184,311
(12.48 %)
184,311
(12.48 %)
260,698
(87.52 %)
3,780,252
(41.81 %)
316,422
(0.93 %)
11,852,305
(27.59 %)
6,323
(0.15 %)
313,495
(1.39 %)
103,899
(1.75 %)
33,034
(0.70 %)
643 western predatory mite (v1.0 2012)
GCF_000255335.1
12,199
(13.86 %)
n/a 2,842
(1.49 %)
27,198
(19.18 %)
n/a 51.58
(99.74 %)
1,782
(0.26 %)
1,901
(0.26 %)
3,993
(99.74 %)
33,136
(1.10 %)
13,115
(0.57 %)
612,854
(9.73 %)
4
(0.00 %)
11,929
(0.89 %)
2,003
(54.71 %)
1,569
(0.97 %)
644 western wild mouse (SPRET_EiJ v1 2016)
GCA_001624865.1
n/a n/a 21,211
(2.19 %)
17,797
(1.36 %)
100,839
(4.01 %)
41.65
(89.10 %)
23,451
(1.23 %)
334,091
(10.95 %)
29,259
(98.77 %)
5,087,807
(40.60 %)
1,402,357
(3.14 %)
13,522,663
(27.99 %)
17,567
(1.08 %)
457,523
(2.25 %)
16,888
(0.42 %)
15,748
(0.39 %)
645 wheat stem sawfly (v1 2014)
GCF_000341935.1
37,175
(25.01 %)
n/a 4,407
(2.81 %)
15,504
(11.96 %)
n/a 40.34
(98.12 %)
8,731
(1.89 %)
8,733
(1.89 %)
10,707
(98.11 %)
87,084
(2.38 %)
44,673
(2.55 %)
1,001,343
(22.18 %)
41
(0.03 %)
19,750
(1.66 %)
7,519
(2.78 %)
7,623
(2.13 %)
646 white leghorn X broiler chicken (v1 leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1
55,865
(8.86 %)
n/a 12,310
(2.41 %)
22,056
(2.57 %)
n/a 42.20
(99.65 %)
254
(0.35 %)
254
(0.35 %)
509
(99.65 %)
604,452
(10.76 %)
232,416
(2.03 %)
5,541,059
(20.23 %)
2
(0.00 %)
203,559
(1.88 %)
22,185
(2.62 %)
19,239
(1.58 %)
647 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1
59,982
(41.87 %)
n/a 18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
0
(0 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
2
(0.00 %)
1,117,804
(3.60 %)
68,551
(3.58 %)
41,698
(1.09 %)
648 white-footed mouse
GCF_004664715.1
46,167
(2.56 %)
n/a 20,406
(1.72 %)
20,857
(1.46 %)
39,081
(1.88 %)
42.23
(100.00 %)
0
(0 %)
79
(0.00 %)
1,763
(100.00 %)
5,064,597
(30.73 %)
1,258,088
(2.85 %)
14,005,845
(33.01 %)
0
(0 %)
551,791
(1.47 %)
23,475
(0.69 %)
19,781
(0.50 %)
649 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1
57,774
(39.81 %)
n/a 20,653
(1.75 %)
23,083
(1.50 %)
40,950
(1.94 %)
41.55
(99.10 %)
31,627
(0.90 %)
107,030
(0.91 %)
48,652
(99.10 %)
4,799,958
(41.28 %)
413,128
(2.59 %)
13,296,686
(34.22 %)
7,681
(0.08 %)
439,019
(2.88 %)
44,165
(1.19 %)
41,200
(1.10 %)
650 white-tailed eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_947461875.1
n/a n/a 13,735
(1.76 %)
28,993
(2.53 %)
n/a 43.15
(99.99 %)
0
(0 %)
424
(0.01 %)
188
(100.00 %)
585,276
(12.89 %)
291,289
(6.10 %)
6,474,027
(23.66 %)
0
(0 %)
312,204
(2.16 %)
54,851
(4.05 %)
31,757
(1.50 %)
651 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1
58,109
(2.92 %)
n/a 21,699
(1.91 %)
20,910
(1.24 %)
n/a 40.85
(94.45 %)
187,214
(5.57 %)
187,214
(5.57 %)
201,523
(94.43 %)
5,120,629
(48.95 %)
768,432
(2.30 %)
15,303,718
(34.75 %)
1,516
(0.02 %)
933,431
(2.31 %)
35,805
(0.79 %)
27,299
(0.64 %)
652 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1
n/a n/a 21,754
(1.86 %)
21,668
(1.22 %)
n/a 40.77
(99.67 %)
48,495
(0.33 %)
48,495
(0.33 %)
88,439
(99.67 %)
5,195,965
(48.83 %)
825,714
(3.60 %)
15,372,168
(38.05 %)
5,083
(0.10 %)
1,223,766
(2.72 %)
34,994
(0.85 %)
26,156
(0.69 %)
653 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1
n/a n/a 21,729
(1.89 %)
21,502
(1.30 %)
n/a 40.85
(98.70 %)
370
(1.30 %)
370
(1.30 %)
1,360
(98.70 %)
5,122,418
(49.40 %)
818,502
(3.68 %)
15,232,829
(38.20 %)
0
(0 %)
1,395,363
(2.77 %)
36,656
(0.90 %)
26,567
(0.71 %)
654 white-tufted-ear marmoset (v1 paternal hap 2020)
GCA_011100535.1
n/a n/a 20,939
(1.94 %)
20,416
(1.31 %)
n/a 41.04
(99.58 %)
0
(0 %)
788
(0.42 %)
336
(100.00 %)
4,869,007
(49.39 %)
746,577
(2.68 %)
14,347,286
(37.59 %)
0
(0 %)
1,026,338
(2.34 %)
35,222
(0.94 %)
25,795
(0.75 %)
655 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank)
GCA_011100555.2
n/a n/a 21,801
(1.88 %)
21,501
(1.28 %)
n/a 40.92
(99.52 %)
0
(0 %)
1,165
(0.48 %)
1,234
(100.00 %)
5,036,594
(47.71 %)
842,846
(3.25 %)
15,161,577
(38.08 %)
2
(0.00 %)
1,256,016
(2.62 %)
37,603
(0.93 %)
34,471
(0.83 %)
656 whooping crane (maternal hap 2023 genbank)
GCA_028858705.1
55,408
(53.40 %)
n/a 13,572
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
0
(0 %)
262
(0.37 %)
929
(100.00 %)
616,295
(10.57 %)
211,557
(2.90 %)
6,785,134
(22.11 %)
0
(0 %)
n/a 42,795
(4.66 %)
39,036
(2.34 %)
657 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2
n/a 20,251
(1.34 %)
18,785
(1.94 %)
17,252
(1.62 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
55,538
(1.18 %)
60,971
(1.18 %)
68,871
(98.82 %)
3,098,525
(34.75 %)
353,630
(1.23 %)
12,349,553
(25.12 %)
11
(0.00 %)
101,843
(0.63 %)
45,436
(1.02 %)
40,638
(0.87 %)
658 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019)
GCF_002162155.1
131,302
(1.34 %)
n/a 33,079
(0.33 %)
567,762
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
0
(0 %)
344,768
(3.31 %)
148,396
(100.00 %)
2,762,705
(2.81 %)
2,991,142
(3.37 %)
493,164
(96.69 %)
210
(0.02 %)
12,513,149
(13.71 %)
2,220,897
(25.33 %)
2,138,478
(24.00 %)
659 wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017)
GCF_000817695.2
69,091
(6.81 %)
n/a 16,823
(1.67 %)
75,740
(11.45 %)
n/a 35.81
(86.74 %)
1,682
(1.55 %)
133,967
(13.30 %)
3,189
(98.45 %)
588,761
(3.39 %)
493,855
(3.35 %)
5,206,772
(45.36 %)
66
(0.02 %)
710,693
(6.46 %)
48,008
(1.88 %)
21,883
(0.84 %)
660 wild strawberry (2011 genbank)
GCA_000184155.1
n/a n/a 14,001
(6.64 %)
34,562
(26.90 %)
n/a 38.40
(94.26 %)
13,412
(5.76 %)
16,253
(5.76 %)
16,459
(94.24 %)
152,427
(20.00 %)
74,539
(2.79 %)
1,032,592
(21.43 %)
25
(0.01 %)
71,241
(3.11 %)
14,802
(3.20 %)
9,026
(1.93 %)
661 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1
50,529
(5.75 %)
n/a 12,950
(1.89 %)
19,252
(2.57 %)
24,522
(2.44 %)
42.30
(100.00 %)
0
(0 %)
102
(0.00 %)
3,744
(100.00 %)
500,823
(7.17 %)
300,638
(2.31 %)
6,414,267
(20.54 %)
0
(0 %)
235,724
(1.54 %)
28,268
(2.21 %)
22,544
(1.15 %)
662 woodchuck (CNAG 2019)
GCA_901343595.1
n/a 424,165
(27.27 %)
20,813
(1.60 %)
23,199
(1.43 %)
45,153
(1.99 %)
40.00
(97.18 %)
57,045
(2.82 %)
57,045
(2.82 %)
105,556
(97.18 %)
4,756,333
(33.73 %)
836,503
(2.41 %)
14,755,960
(31.13 %)
505
(0.04 %)
358,587
(3.15 %)
34,151
(0.87 %)
32,950
(0.82 %)
663 woodchuck (v1.0 LI92 2021)
GCF_021218885.1
62,044
(2.80 %)
n/a 19,783
(1.48 %)
21,060
(1.38 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
46
(0.00 %)
46
(0.00 %)
3,381
(100.00 %)
3,884,968
(28.12 %)
912,591
(2.73 %)
14,538,767
(35.15 %)
0
(0 %)
413,043
(1.33 %)
36,919
(1.02 %)
26,677
(0.60 %)
664 worm pipefish (v1 RoL_2023-P1 2023)
GCF_033978685.1
73,681
(3.43 %)
n/a 25,892
(1.02 %)
114,154
(3.30 %)
n/a 39.45
(100.00 %)
0
(0 %)
146
(0.00 %)
630
(100.00 %)
4,795,312
(24.37 %)
2,093,730
(16.74 %)
13,132,465
(67.32 %)
0
(0 %)
5,394,148
(11.91 %)
248,526
(4.59 %)
79,895
(1.28 %)
665 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 genbank)
GCA_029207755.1
n/a n/a 13,052
(1.78 %)
24,950
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
353
(0.00 %)
353
(0.00 %)
1,695
(100.00 %)
444,866
(3.08 %)
473,471
(7.97 %)
5,336,498
(25.82 %)
4
(0.00 %)
847,256
(5.29 %)
37,210
(3.14 %)
26,585
(1.31 %)
666 Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq)
GCF_003031525.1
43,312
(2.49 %)
n/a 18,639
(1.72 %)
19,645
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
52,647
(0.72 %)
66,346
(99.28 %)
n/a 540,765
(1.65 %)
12,691,760
(32.87 %)
427
(0.03 %)
363,613
(1.97 %)
59,052
(1.48 %)
39,130
(1.07 %)
667 Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank)
GCA_003031525.1
43,299
(41.33 %)
n/a 18,726
(1.80 %)
19,644
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
52,647
(0.72 %)
66,345
(99.28 %)
3,990,044
(42.54 %)
540,765
(1.65 %)
12,691,683
(32.88 %)
427
(0.03 %)
363,612
(1.97 %)
59,052
(1.48 %)
42,519
(1.18 %)
668 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1
27,063
(35.76 %)
n/a 19,219
(1.73 %)
27,456
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
124,797
(1.33 %)
155,509
(98.67 %)
4,277,556
(44.10 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,034
(35.19 %)
292
(0.02 %)
514,863
(2.00 %)
67,035
(1.82 %)
48,666
(1.49 %)
669 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1
27,076
(1.65 %)
n/a 19,227
(1.75 %)
27,468
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
124,797
(1.33 %)
155,510
(98.67 %)
4,193,317
(43.38 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,097
(35.19 %)
292
(0.02 %)
514,863
(2.00 %)
67,035
(1.82 %)
49,158
(1.49 %)
670 yellow fever mosquito (LVP_AGWG 2017 genbank)
GCA_002204515.1
n/a 38
(0.00 %)
8,814
(0.51 %)
152,909
(17.36 %)
n/a 38.16
(100.00 %)
0
(0 %)
229
(0.00 %)
6,534
(100.00 %)
2,912,289
(46.74 %)
533,475
(4.34 %)
10,210,670
(53.65 %)
0
(0 %)
641,478
(3.84 %)
132,732
(6.12 %)
69,844
(2.30 %)
671 yellow-bellied marmot (hap1 2025 genbank)
GCA_047511675.1
n/a n/a 19,503
(1.44 %)
20,301
(1.35 %)
n/a 39.90
(100.00 %)
0
(0 %)
330
(0.00 %)
814
(100.00 %)
4,038,897
(29.07 %)
978,915
(3.28 %)
14,404,740
(34.97 %)
4
(0.00 %)
446,138
(1.44 %)
36,674
(1.05 %)
27,659
(0.61 %)
672 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019)
GCF_003676075.2
42,715
(2.16 %)
n/a 19,894
(1.62 %)
21,366
(1.40 %)
43,878
(1.99 %)
39.89
(97.96 %)
34,765
(2.04 %)
35,595
(2.04 %)
66,624
(97.96 %)
4,646,957
(34.05 %)
800,897
(1.96 %)
14,340,028
(32.63 %)
1,270
(0.04 %)
210,697
(0.69 %)
34,125
(0.91 %)
32,958
(0.85 %)
673 yellow-bellied marmot (v1 2018)
GCF_003676075.1
41,573
(2.14 %)
n/a 19,845
(1.63 %)
21,262
(1.39 %)
n/a 39.88
(97.82 %)
38,354
(2.18 %)
38,354
(2.18 %)
69,503
(97.82 %)
4,683,625
(34.38 %)
799,659
(1.95 %)
14,322,765
(32.58 %)
2,342
(0.05 %)
209,445
(0.69 %)
34,127
(0.91 %)
32,957
(0.85 %)
674 yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCA_016432865.1
n/a n/a 15,703
(0.78 %)
16,184
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
0
(0 %)
620
(0.01 %)
487
(100.00 %)
5,424,579
(25.40 %)
1,269,774
(2.59 %)
21,430,550
(42.69 %)
2
(0.00 %)
714,621
(2.20 %)
28,121
(0.66 %)
28,159
(0.56 %)
675 yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI)
GCF_000699245.1
15,990
(2.25 %)
n/a 11,775
(1.55 %)
23,935
(1.90 %)
n/a 41.36
(99.67 %)
48,553
(0.34 %)
48,553
(0.34 %)
107,160
(99.66 %)
384,032
(4.45 %)
182,309
(1.03 %)
6,529,534
(19.24 %)
1
(0.00 %)
41,594
(0.34 %)
15,660
(0.55 %)
12,721
(0.42 %)
676 yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.1
41,181
(9.96 %)
n/a 15,861
(2.76 %)
30,671
(6.00 %)
n/a 40.75
(97.79 %)
0
(0 %)
33,664
(2.20 %)
99,598
(100.00 %)
614,513
(4.16 %)
522,349
(4.83 %)
4,650,538
(24.98 %)
309
(0.03 %)
357,703
(3.09 %)
18,054
(0.96 %)
12,855
(0.67 %)
677 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 genbank)
GCA_028538775.1
n/a n/a 18,587
(1.82 %)
21,049
(1.76 %)
n/a 43.22
(100.00 %)
209
(0.00 %)
209
(0.00 %)
685
(100.00 %)
2,890,086
(24.28 %)
719,555
(4.26 %)
10,089,514
(36.35 %)
0
(0 %)
649,001
(2.37 %)
60,975
(2.61 %)
51,711
(1.75 %)
678 zebra finch (v1 Black17 2019 refseq)
GCF_003957565.1
51,472
(7.16 %)
n/a 13,211
(2.02 %)
17,812
(2.70 %)
38,655
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
0
(0 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
1
(0.00 %)
381,676
(2.04 %)
30,053
(2.58 %)
22,898
(1.24 %)
679 zebra finch (v1 Black17 male 2019 genbank)
GCA_003957565.2
n/a n/a 13,212
(2.02 %)
25,117
(2.57 %)
38,655
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
0
(0 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
1
(0.00 %)
381,676
(2.04 %)
30,053
(2.58 %)
22,898
(1.24 %)
680 zebra finch (v1.4 Blue55 primary hap 2021 genbank)
GCA_003957565.4
n/a n/a 12,755
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
0
(0 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
389,146
(3.10 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,599
(20.92 %)
3
(0.00 %)
312,137
(1.80 %)
29,203
(2.49 %)
22,084
(1.22 %)
681 zebra shark (hap1 2023 genbank)
GCA_030684315.1
n/a n/a 12,291
(0.48 %)
16,769
(1.14 %)
n/a 43.41
(99.47 %)
0
(0 %)
1,159
(0.53 %)
835
(100.00 %)
8,087,543
(64.92 %)
798,373
(9.17 %)
14,838,773
(42.39 %)
4
(0.00 %)
2,946,268
(5.37 %)
45,284
(1.67 %)
14,105
(0.37 %)
682 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2
n/a n/a 18,599
(1.58 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
253,738
(7.41 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,769
(92.59 %)
5,118,783
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,620
(36.60 %)
476
(0.01 %)
998,817
(3.00 %)
35,241
(0.84 %)
32,220
(0.75 %)
683 zig-zag eel (v1.1 2018)
GCF_900324485.1
44,813
(12.05 %)
n/a 15,028
(3.35 %)
21,782
(6.89 %)
36,982
(11.22 %)
40.66
(97.63 %)
0
(0 %)
235
(2.37 %)
126
(100.00 %)
348,517
(2.87 %)
157,776
(2.00 %)
3,182,742
(23.42 %)
0
(0 %)
175,932
(3.08 %)
12,824
(1.08 %)
8,713
(0.67 %)
TOTALS:total assembly count 683

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 600 assemblies assembly stats track stats
Mammals 689 assemblies assembly stats track stats
Birds 441 assemblies assembly stats track stats
Fishes 500 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 320 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1194 assemblies assembly stats track stats
Plants 338 assemblies assembly stats track stats
Fungi 932 assemblies assembly stats track stats
Viruses 707 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 322 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 682 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 1633 assemblies assembly stats track stats