Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1
n/a n/a 22,095
(0.63 %)
44,942
(0.68 %)
n/a 40.25
(99.86 %)
15,429
(0.03 %)
15,429
(0.03 %)
2,690,873
(99.97 %)
8,755,250
(34.47 %)
869,360
(1.26 %)
22,002,517
(59.65 %)
146
(0.00 %)
n/a 39,239
(0.49 %)
27,849
(0.37 %)
2 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank)
GCA_027172205.1
n/a n/a 14,340
(1.37 %)
20,053
(2.31 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
0
(0 %)
30
(0.00 %)
27
(100.00 %)
832,937
(4.17 %)
474,203
(4.04 %)
7,020,288
(38.29 %)
2
(0.00 %)
631,733
(3.50 %)
94,745
(2.70 %)
19,879
(0.76 %)
3 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1
61,172
(3.82 %)
n/a 23,424
(1.78 %)
27,990
(2.23 %)
n/a 38.98
(88.63 %)
216,028
(11.39 %)
216,028
(11.39 %)
324,061
(88.61 %)
1,726,079
(12.81 %)
680,428
(2.28 %)
13,887,586
(35.94 %)
2,660
(0.08 %)
n/a 85,680
(0.94 %)
12,234
(0.16 %)
4 African grass rat (paternal X 2020)
GCA_011762505.1
n/a n/a 20,933
(2.00 %)
19,613
(1.43 %)
37,929
(2.32 %)
41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,940,083
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
2
(0.00 %)
1,027,357
(2.09 %)
17,767
(0.51 %)
16,848
(0.46 %)
5 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1
n/a n/a 19,181
(1.25 %)
19,665
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,337,637
(57.82 %)
365,796
(0.88 %)
16,073,052
(44.89 %)
11
(0.00 %)
417,291
(1.06 %)
33,513
(0.68 %)
24,486
(0.51 %)
6 alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018)
GCF_003710045.1
27,736
(10.71 %)
n/a 4,020
(1.34 %)
42,185
(10.12 %)
n/a 40.41
(94.37 %)
0
(0 %)
14,031
(5.59 %)
95,883
(100.00 %)
112,828
(2.21 %)
95,886
(3.63 %)
2,006,114
(27.47 %)
1
(0.00 %)
49,074
(1.16 %)
23,832
(3.81 %)
20,331
(3.23 %)
7 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1
n/a n/a 18,513
(1.97 %)
19,112
(1.70 %)
31,905
(1.94 %)
41.46
(99.38 %)
23,458
(0.62 %)
23,458
(0.62 %)
75,733
(99.38 %)
3,095,742
(36.41 %)
314,508
(1.07 %)
12,365,152
(25.46 %)
83
(0.00 %)
120,145
(0.60 %)
53,956
(1.50 %)
49,211
(1.30 %)
8 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3
55,014
(3.56 %)
n/a 18,437
(1.94 %)
18,446
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
0
(0 %)
166,280
(4.17 %)
77,390
(100.00 %)
3,150,224
(36.21 %)
315,108
(1.36 %)
12,461,739
(24.88 %)
1,213
(0.03 %)
207,655
(1.22 %)
54,502
(1.38 %)
49,324
(1.18 %)
9 Alpine marmot (2015)
GCF_001458135.1
35,350
(2.23 %)
n/a 20,139
(1.58 %)
18,286
(1.41 %)
n/a 39.80
(96.07 %)
0
(0 %)
89,362
(3.94 %)
14,543
(100.00 %)
n/a 747,129
(1.83 %)
14,077,162
(30.27 %)
494
(0.01 %)
202,989
(0.77 %)
30,224
(0.63 %)
24,261
(0.48 %)
10 American alligator (scaffold assembly 2023 genbank)
GCA_030867065.1
n/a n/a 14,487
(0.97 %)
20,444
(1.61 %)
n/a 45.04
(99.81 %)
136
(0.19 %)
136
(0.19 %)
806
(99.81 %)
3,380,365
(43.12 %)
560,127
(2.00 %)
12,524,244
(32.47 %)
1
(0.00 %)
370,300
(1.41 %)
50,852
(2.67 %)
30,117
(1.71 %)
11 American alligator (chrom assembly 2023 genbank)
GCA_030867095.1
n/a n/a 14,382
(0.98 %)
18,601
(1.45 %)
n/a 45.01
(99.30 %)
0
(0 %)
161
(0.70 %)
194
(100.00 %)
3,322,619
(43.19 %)
478,206
(1.77 %)
12,316,391
(32.01 %)
0
(0 %)
334,854
(1.31 %)
49,792
(2.45 %)
29,504
(1.51 %)
12 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1
n/a n/a 22,515
(1.25 %)
34,527
(1.17 %)
n/a 39.58
(99.92 %)
5,769
(0.02 %)
5,769
(0.02 %)
837,916
(99.98 %)
5,101,904
(34.46 %)
552,100
(1.02 %)
15,150,706
(34.57 %)
36
(0.00 %)
n/a 24,558
(0.63 %)
21,525
(0.51 %)
13 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1
n/a n/a 20,215
(1.44 %)
20,845
(1.20 %)
n/a 41.99
(93.39 %)
341,984
(6.63 %)
341,984
(6.63 %)
792,165
(93.37 %)
6,006,931
(47.67 %)
495,106
(1.11 %)
13,902,115
(39.01 %)
8,184
(0.08 %)
978,698
(2.61 %)
90,767
(1.29 %)
43,651
(0.72 %)
14 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1
n/a n/a 17,569
(1.60 %)
20,092
(1.69 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
122,542
(12.82 %)
132,961
(87.18 %)
2,829,934
(29.80 %)
414,895
(1.07 %)
10,968,663
(26.71 %)
1,958
(0.04 %)
269,478
(1.11 %)
44,651
(1.14 %)
26,757
(0.80 %)
15 amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016)
GCF_000764305.1
24,008
(8.48 %)
n/a 3,331
(0.47 %)
38,201
(8.97 %)
24,453
(8.50 %)
38.47
(99.52 %)
5,426
(0.48 %)
23,726
(0.48 %)
23,426
(99.52 %)
161,274
(1.72 %)
432,436
(8.89 %)
3,517,080
(28.92 %)
149
(0.01 %)
409,772
(5.41 %)
50,987
(4.44 %)
35,313
(2.58 %)
16 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1
n/a n/a 18,213
(1.58 %)
15,093
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
155,553
(2.44 %)
157,031
(97.56 %)
4,832,679
(42.49 %)
831,134
(1.67 %)
13,654,373
(31.78 %)
59
(0.00 %)
289,887
(0.97 %)
65,229
(1.60 %)
55,104
(1.18 %)
17 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2
n/a n/a 12,258
(1.95 %)
20,580
(2.26 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
0
(0 %)
429
(1.52 %)
160
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,056
(1.51 %)
6,092,351
(20.84 %)
0
(0 %)
152,105
(1.27 %)
17,130
(1.48 %)
15,125
(1.04 %)
18 ant C.costatus (v1 MS0001 2016)
GCF_001594065.1
16,082
(8.44 %)
n/a 4,038
(1.42 %)
32,856
(9.80 %)
n/a 34.73
(95.75 %)
10,626
(4.26 %)
10,626
(4.26 %)
26,005
(95.74 %)
203,498
(3.41 %)
100,483
(2.15 %)
2,221,362
(35.19 %)
127
(0.11 %)
43,690
(1.77 %)
18,108
(3.49 %)
18,662
(3.08 %)
19 ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019)
GCF_005281655.1
28,261
(10.34 %)
n/a 4,915
(1.27 %)
40,257
(10.17 %)
n/a 35.18
(99.51 %)
0
(0 %)
1,076
(0.49 %)
2,869
(100.00 %)
322,753
(4.92 %)
245,412
(6.65 %)
1,952,946
(43.11 %)
0
(0 %)
252,395
(6.75 %)
17,048
(6.08 %)
17,349
(3.45 %)
20 ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI)
GCF_001594075.1
22,023
(8.25 %)
n/a 4,211
(1.25 %)
37,113
(9.30 %)
n/a 35.01
(91.82 %)
40,822
(8.21 %)
40,822
(8.21 %)
60,583
(91.79 %)
218,162
(3.24 %)
139,385
(2.26 %)
2,347,922
(34.62 %)
136
(0.08 %)
54,250
(1.47 %)
23,814
(3.66 %)
21,810
(2.96 %)
21 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank)
GCA_002114115.1
n/a n/a 22,542
(3.52 %)
67,060
(16.20 %)
n/a 38.04
(88.95 %)
0
(0 %)
7,175
(11.05 %)
806
(100.00 %)
692,611
(50.80 %)
322,540
(4.42 %)
3,033,193
(35.58 %)
2
(0.00 %)
451,430
(6.86 %)
25,871
(1.75 %)
13,877
(0.88 %)
22 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1
n/a n/a 18,452
(1.96 %)
16,975
(1.61 %)
n/a 41.29
(98.88 %)
72,775
(1.13 %)
72,775
(1.13 %)
105,347
(98.87 %)
3,079,920
(34.79 %)
319,928
(0.96 %)
12,281,845
(25.28 %)
43
(0.00 %)
88,463
(0.39 %)
48,638
(1.17 %)
44,009
(1.01 %)
23 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1
n/a n/a 22,910
(1.42 %)
31,985
(1.20 %)
35,342
(1.47 %)
41.93
(99.87 %)
9,604
(0.04 %)
9,604
(0.04 %)
1,272,949
(99.96 %)
6,096,013
(44.89 %)
1,265,350
(2.67 %)
14,617,986
(39.29 %)
19
(0.00 %)
594,304
(1.21 %)
64,716
(1.93 %)
61,195
(1.72 %)
24 Asian corn borer (v1 ACB-3 2019)
GCF_004193835.1
25,279
(7.94 %)
n/a 4,931
(1.05 %)
28,608
(7.16 %)
n/a 37.50
(100.00 %)
0
(0 %)
34,722
(0.01 %)
7,722
(100.00 %)
146,974
(1.35 %)
89,987
(2.68 %)
2,666,250
(38.74 %)
899
(0.07 %)
268,435
(6.89 %)
39,696
(5.22 %)
19,418
(2.22 %)
25 Asian corn borer (v2 ACB-3 2019)
GCF_004193835.2
25,169
(7.95 %)
n/a 4,867
(1.05 %)
28,255
(7.08 %)
n/a 37.49
(100.00 %)
0
(0 %)
34,702
(0.01 %)
6,269
(100.00 %)
150,783
(1.53 %)
89,885
(2.69 %)
2,627,296
(38.56 %)
899
(0.07 %)
268,390
(6.92 %)
39,511
(5.22 %)
19,307
(2.21 %)
26 Asiatic tapir (BS100 BIUU 2019)
GCA_004024905.1
n/a n/a 20,854
(1.73 %)
28,046
(1.39 %)
n/a 40.91
(99.96 %)
4,333
(0.02 %)
4,333
(0.02 %)
284,468
(99.98 %)
3,802,671
(39.88 %)
335,521
(0.73 %)
15,053,564
(30.25 %)
11
(0.00 %)
n/a 39,691
(1.17 %)
36,849
(1.05 %)
27 ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006)
GCF_000149645.2
10,390
(48.16 %)
n/a 1,538
(3.76 %)
6,155
(25.19 %)
n/a 49.56
(99.97 %)
90
(0.03 %)
90
(0.03 %)
466
(99.97 %)
5,026
(0.77 %)
2,256
(0.38 %)
68,790
(5.94 %)
0
(0 %)
710
(0.23 %)
2,846
(42.44 %)
3,973
(22.95 %)
28 ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007)
GCF_000002855.3
10,608
(51.05 %)
n/a 1,481
(3.36 %)
5,692
(22.11 %)
n/a 50.35
(99.87 %)
449
(0.13 %)
662
(0.13 %)
469
(99.87 %)
9,986
(1.32 %)
2,619
(0.36 %)
106,480
(7.71 %)
1
(0.00 %)
262
(0.07 %)
5,568
(53.86 %)
6,938
(24.44 %)
29 ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019)
GCF_004011695.1
11,257
(41.02 %)
n/a 1,596
(2.91 %)
8,283
(26.43 %)
n/a 49.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 34
(100.00 %)
14,775
(2.01 %)
16,031
(2.34 %)
103,256
(17.19 %)
0
(0 %)
7,380
(1.61 %)
805
(44.28 %)
832
(32.41 %)
30 ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank)
GCA_000003525.2
n/a 11,865
(30.24 %)
1,516
(1.76 %)
5,714
(11.07 %)
n/a 37.07
(99.50 %)
566
(0.51 %)
566
(0.51 %)
593
(99.49 %)
38,696
(2.74 %)
27,571
(2.05 %)
270,617
(48.64 %)
2
(0.00 %)
31,958
(3.92 %)
8,002
(10.69 %)
7,438
(8.47 %)
31 ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012)
GCF_000182805.2
9,903
(39.44 %)
n/a 1,311
(2.58 %)
4,612
(17.66 %)
n/a 52.11
(99.64 %)
0
(0 %)
978
(0.36 %)
1,583
(100.00 %)
16,540
(1.85 %)
7,316
(0.76 %)
171,684
(11.10 %)
0
(0 %)
371
(0.08 %)
1,770
(49.40 %)
6,766
(16.80 %)
32 ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank)
GCA_000961545.1
n/a 10,434
(48.46 %)
1,134
(2.55 %)
2,026
(10.60 %)
n/a 54.96
(100.00 %)
57
(0.00 %)
57
(0.00 %)
73
(100.00 %)
15,846
(2.28 %)
8,000
(0.94 %)
169,678
(13.75 %)
0
(0 %)
339
(0.06 %)
22
(99.61 %)
22
(0.11 %)
33 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1
n/a n/a 18,884
(1.76 %)
19,296
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
0
(0 %)
69,593
(1.38 %)
2,166
(100.00 %)
3,855,699
(41.69 %)
289,735
(0.96 %)
14,695,257
(28.58 %)
5,680
(0.23 %)
136,343
(0.85 %)
40,025
(1.06 %)
36,402
(0.92 %)
34 Atlantic halibut (2019 genbank)
GCA_009819705.1
n/a n/a 14,960
(3.20 %)
45,365
(7.48 %)
69,625
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
0
(0 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,421
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,979
(24.13 %)
0
(0 %)
240,110
(3.16 %)
31,325
(2.25 %)
20,749
(1.34 %)
35 Atlantic herring (v1)
GCF_900700415.1
46,216
(9.88 %)
n/a 15,249
(2.65 %)
25,664
(6.68 %)
n/a 44.24
(99.88 %)
1,963
(0.12 %)
1,963
(0.12 %)
1,990
(99.88 %)
1,175,759
(12.03 %)
1,231,613
(13.39 %)
3,511,276
(32.20 %)
2
(0.00 %)
1,037,723
(8.32 %)
33,465
(1.97 %)
20,325
(1.10 %)
36 Atlantic salmon (genbank 2021)
GCA_905237065.2
n/a n/a 28,077
(1.40 %)
120,383
(3.99 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
4,501,521
(48.00 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
0
(0 %)
4,866,269
(10.20 %)
77,089
(1.86 %)
20,127
(0.31 %)
37 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1
n/a n/a 12,545
(0.38 %)
29,428
(1.34 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,648
(0.01 %)
2,990
(100.00 %)
8,579,105
(49.81 %)
831,224
(15.75 %)
21,718,213
(51.79 %)
9
(0.00 %)
4,445,293
(7.00 %)
105,821
(2.42 %)
35,197
(0.42 %)
38 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3
11,472
(14.88 %)
n/a 2,843
(2.29 %)
3,797
(4.95 %)
n/a 30.21
(92.98 %)
2,303
(6.97 %)
58,744
(7.04 %)
26,881
(93.03 %)
147,614
(11.55 %)
54,885
(7.91 %)
647,155
(33.62 %)
55
(0.02 %)
69,072
(5.04 %)
509
(0.15 %)
126
(0.04 %)
39 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1
n/a n/a 18,330
(1.96 %)
17,094
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
31,980
(0.69 %)
67,434
(99.31 %)
3,072,373
(34.88 %)
306,996
(0.95 %)
12,209,895
(25.43 %)
58
(0.01 %)
73,572
(0.41 %)
49,789
(1.25 %)
45,112
(1.08 %)
40 banded archerfish (primary hap 2021 genbank)
GCA_017976425.1
n/a n/a 15,312
(3.18 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
0
(0 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
811,892
(18.19 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
1
(0.00 %)
297,728
(3.49 %)
15,089
(0.96 %)
9,304
(0.55 %)
41 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1
15,006
(2.07 %)
n/a 11,133
(1.44 %)
21,138
(1.69 %)
n/a 40.21
(99.24 %)
109,223
(0.79 %)
109,223
(0.79 %)
171,345
(99.21 %)
413,761
(3.90 %)
181,353
(0.91 %)
6,776,326
(18.43 %)
2
(0.00 %)
15,140
(0.13 %)
10,575
(0.29 %)
9,101
(0.25 %)
42 barn owl (2020)
GCF_902150015.1
37,361
(4.54 %)
n/a 12,958
(1.72 %)
22,922
(1.99 %)
26,976
(3.04 %)
41.55
(99.23 %)
0
(0 %)
177,340
(0.79 %)
21,504
(100.00 %)
585,627
(5.48 %)
367,764
(2.44 %)
7,399,161
(19.58 %)
6,614
(0.13 %)
188,767
(2.21 %)
47,061
(3.25 %)
41,356
(2.24 %)
43 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021)
GCA_015227805.2
n/a n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,546
(2.82 %)
29,760
(1.66 %)
44 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap refseq 2021)
GCF_015227805.1
43,374
(5.14 %)
n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,546
(2.82 %)
29,760
(1.66 %)
45 Barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021 genbank)
GCA_015227805.3
n/a n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,548
(2.85 %)
29,760
(1.66 %)
46 basidiomycetes A.bisporus (H97 2012)
GCF_000300575.1
10,448
(49.20 %)
n/a 1,066
(2.53 %)
5,238
(16.95 %)
n/a 46.48
(99.32 %)
225
(0.68 %)
225
(0.68 %)
254
(99.32 %)
4,921
(0.90 %)
2,352
(0.47 %)
62,603
(9.90 %)
0
(0 %)
7,487
(2.92 %)
5,244
(15.19 %)
4,407
(9.08 %)
47 basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010)
GCF_000143185.1
13,192
(49.72 %)
n/a 894
(1.60 %)
973
(2.80 %)
n/a 57.50
(98.57 %)
316
(1.43 %)
316
(1.43 %)
352
(98.57 %)
7,478
(4.11 %)
7,640
(1.13 %)
176,404
(11.51 %)
1
(0.00 %)
5,378
(1.90 %)
38
(40.33 %)
55
(0.23 %)
48 ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank)
GCA_000219625.1
n/a 10,965
(38.50 %)
1,451
(2.81 %)
6,906
(25.36 %)
n/a 52.14
(99.98 %)
3
(0.02 %)
3
(0.02 %)
24
(99.98 %)
8,941
(1.69 %)
8,367
(1.51 %)
99,818
(11.14 %)
0
(0 %)
6,612
(1.57 %)
27
(96.31 %)
89
(4.28 %)
49 barramundi perch (ASB-BC8 2016)
GCF_001640805.1
50,205
(13.10 %)
n/a 16,166
(3.05 %)
25,084
(6.20 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
110
(0.00 %)
3,808
(100.00 %)
465,997
(3.11 %)
237,955
(4.36 %)
4,027,027
(23.91 %)
0
(0 %)
248,089
(3.21 %)
16,276
(1.04 %)
9,104
(0.52 %)
50 bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016)
GCF_001652005.1
25,020
(17.94 %)
n/a 4,205
(2.34 %)
27,352
(12.83 %)
n/a 41.09
(91.93 %)
0
(0 %)
19,248
(8.05 %)
50,565
(100.00 %)
57,833
(1.39 %)
27,440
(2.49 %)
1,173,760
(18.39 %)
416
(0.39 %)
14,577
(3.60 %)
10,942
(2.61 %)
10,587
(2.22 %)
51 bee E.mexicana (v1 0111107269 2016)
GCF_001483705.1
16,406
(4.01 %)
n/a 4,087
(0.75 %)
46,846
(6.53 %)
16,764
(4.04 %)
40.92
(95.72 %)
25,039
(4.23 %)
25,039
(4.23 %)
212,650
(95.77 %)
641,987
(7.51 %)
360,406
(11.43 %)
3,411,951
(46.01 %)
306
(0.12 %)
259,979
(5.86 %)
40,540
(3.99 %)
18,218
(1.75 %)
52 beet (2015)
GCF_000511025.2
37,939
(8.78 %)
n/a 12,044
(2.14 %)
63,283
(17.52 %)
n/a 36.14
(91.40 %)
30,962
(8.61 %)
30,962
(8.61 %)
71,208
(91.39 %)
288,084
(4.25 %)
299,650
(4.72 %)
3,021,571
(30.10 %)
1,360
(0.22 %)
218,658
(4.15 %)
32,547
(2.39 %)
20,111
(1.55 %)
53 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017)
GCA_002288925.2
n/a n/a 18,686
(1.78 %)
20,378
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.66 %)
28,398
(1.35 %)
28,398
(1.35 %)
35,369
(98.65 %)
4,001,688
(43.72 %)
542,326
(1.10 %)
12,806,249
(34.24 %)
954
(0.02 %)
386,729
(1.71 %)
59,279
(1.53 %)
42,903
(1.24 %)
54 black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018)
GCF_000002775.4
59,637
(15.47 %)
n/a 20,361
(4.67 %)
44,177
(15.83 %)
n/a 33.75
(97.43 %)
6,871
(2.58 %)
6,871
(2.58 %)
8,318
(97.42 %)
402,600
(27.63 %)
177,746
(4.65 %)
2,639,214
(36.04 %)
34
(0.01 %)
246,517
(5.54 %)
4,559
(0.56 %)
1,801
(0.17 %)
55 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1
n/a n/a 13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
0
(0 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
8
(0.00 %)
651,836
(3.67 %)
45,318
(4.71 %)
36,668
(1.67 %)
56 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1
41,018
(2.61 %)
n/a 4,064
(0.14 %)
135,587
(7.67 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,977
(100.00 %)
1,153,773
(4.93 %)
754,711
(7.52 %)
10,964,182
(43.13 %)
0
(0 %)
805,883
(3.13 %)
138,831
(8.38 %)
232,611
(7.21 %)
57 black rhinoceros (mBicDic1 primary hap genbank 2021)
GCA_020826845.1
n/a n/a 18,774
(1.38 %)
22,346
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
0
(0 %)
215
(0.05 %)
1,075
(100.00 %)
4,200,385
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,639
(40.14 %)
2
(0.00 %)
984,722
(2.61 %)
43,525
(1.14 %)
33,963
(0.76 %)
58 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016)
GCF_001698545.1
59,210
(2.48 %)
n/a 21,256
(1.89 %)
23,679
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
0
(0 %)
149,843
(5.88 %)
105,031
(100.00 %)
5,602,009
(50.58 %)
991,745
(2.45 %)
16,354,078
(34.26 %)
4,262
(0.14 %)
n/a 81,205
(1.19 %)
29,123
(0.68 %)
59 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016)
GCA_001698545.1
n/a n/a 21,244
(1.88 %)
23,681
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
0
(0 %)
149,843
(5.88 %)
105,030
(100.00 %)
5,600,915
(50.57 %)
991,762
(2.45 %)
16,353,992
(34.26 %)
4,262
(0.14 %)
867,902
(3.08 %)
81,205
(1.19 %)
29,129
(0.68 %)
60 black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020)
GCF_013377495.1
41,255
(4.77 %)
n/a 12,955
(1.98 %)
22,656
(2.28 %)
31,476
(5.07 %)
41.95
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 396
(100.00 %)
680,976
(7.66 %)
296,152
(1.44 %)
6,797,141
(21.40 %)
0
(0 %)
86,777
(0.79 %)
31,750
(3.32 %)
30,007
(2.00 %)
61 black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020)
GCF_015228065.1
35,923
(2.41 %)
n/a 3,903
(0.15 %)
39,667
(2.27 %)
40,959
(2.59 %)
36.64
(83.75 %)
0
(0 %)
1,158,725
(16.44 %)
26,876
(100.00 %)
5,488,723
(29.98 %)
7,028,944
(21.91 %)
10,445,796
(49.62 %)
239
(0.01 %)
4,167,031
(8.98 %)
178,205
(3.43 %)
77,006
(1.37 %)
62 Blainville's beaked whale (mMesDen1 primary hap 2022 genbank)
GCA_025265405.1
n/a n/a 19,042
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
0
(0 %)
97
(0.03 %)
73
(100.00 %)
3,964,035
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,162
(41.78 %)
1
(0.00 %)
1,795,618
(5.01 %)
70,851
(1.80 %)
37,949
(0.93 %)
63 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2
n/a n/a 19,164
(1.81 %)
20,546
(1.41 %)
34,210
(1.86 %)
40.88
(98.91 %)
0
(0 %)
936
(1.09 %)
130
(100.00 %)
3,999,202
(44.22 %)
581,540
(1.22 %)
12,900,977
(34.62 %)
2
(0.00 %)
424,951
(1.36 %)
67,189
(1.73 %)
46,700
(1.41 %)
64 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1
n/a n/a 14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
0
(0 %)
455,135
(4.01 %)
29,050
(1.48 %)
14,672
(0.63 %)
65 blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq)
GCF_900634775.1
47,312
(7.12 %)
n/a 14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
0
(0 %)
455,135
(4.01 %)
29,050
(1.48 %)
14,672
(0.63 %)
66 Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011)
GCF_000235385.1
39,820
(2.33 %)
n/a 20,222
(2.04 %)
18,404
(1.34 %)
49,071
(2.26 %)
40.77
(94.98 %)
148,728
(5.04 %)
148,728
(5.04 %)
151,414
(94.96 %)
4,710,420
(46.30 %)
767,602
(1.48 %)
14,489,703
(32.96 %)
1,541
(0.02 %)
526,235
(1.31 %)
32,474
(0.75 %)
29,285
(0.67 %)
67 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021)
GCF_016699345.1
53,030
(2.41 %)
n/a 20,599
(1.98 %)
21,182
(1.34 %)
46,441
(1.87 %)
40.95
(99.56 %)
1,074
(0.44 %)
1,074
(0.44 %)
2,790
(99.56 %)
5,098,799
(47.87 %)
946,231
(3.04 %)
14,608,771
(36.99 %)
14
(0.00 %)
1,335,352
(2.84 %)
37,273
(1.03 %)
32,351
(0.89 %)
68 Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023)
GCA_028885525.1
n/a n/a 19,820
(1.76 %)
20,399
(1.15 %)
n/a 40.98
(99.88 %)
36
(0.12 %)
36
(0.12 %)
251
(99.88 %)
5,232,617
(54.01 %)
1,003,539
(10.19 %)
14,858,575
(42.10 %)
0
(0 %)
2,511,941
(4.39 %)
42,467
(1.24 %)
29,563
(0.80 %)
69 Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023)
GCF_028885625.1
81,966
(2.93 %)
n/a 20,794
(1.72 %)
21,307
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.86 %)
39
(0.14 %)
39
(0.14 %)
1,593
(99.86 %)
5,651,267
(54.21 %)
1,155,151
(9.33 %)
16,242,823
(42.82 %)
0
(0 %)
2,513,241
(4.25 %)
52,294
(2.02 %)
36,160
(1.02 %)
70 boutu (BS63 2019)
GCA_004363515.1
n/a n/a 21,835
(1.38 %)
35,087
(1.18 %)
n/a 42.09
(99.89 %)
5,072
(0.02 %)
5,072
(0.02 %)
1,218,682
(99.98 %)
5,098,108
(45.85 %)
856,878
(2.32 %)
13,046,921
(40.74 %)
29
(0.00 %)
n/a 63,992
(1.47 %)
47,092
(1.19 %)
71 Brazilian free-tailed bat (US034 2019)
GCA_004025005.1
n/a n/a 23,562
(1.20 %)
51,200
(1.27 %)
n/a 42.40
(99.91 %)
4,243
(0.02 %)
4,243
(0.02 %)
1,071,858
(99.98 %)
4,884,584
(32.93 %)
777,032
(1.49 %)
14,195,446
(36.38 %)
31
(0.00 %)
n/a 89,940
(1.88 %)
76,243
(1.50 %)
72 brown anole (Geneva1000 2022 genbank)
GCA_025583915.1
38,099
(52.40 %)
n/a 14,028
(1.05 %)
19,927
(1.81 %)
n/a 41.14
(98.37 %)
0
(0 %)
114,440
(1.64 %)
3,738
(100.00 %)
1,376,455
(6.78 %)
1,094,843
(5.18 %)
9,127,396
(44.98 %)
261
(0.01 %)
1,132,418
(4.31 %)
46,291
(1.18 %)
17,324
(0.40 %)
73 brown argus (genbank 2021)
GCA_905147365.1
n/a n/a 4,734
(1.03 %)
24,267
(6.80 %)
24,237
(6.16 %)
36.86
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
26
(100.00 %)
264,378
(2.90 %)
144,255
(3.35 %)
2,651,028
(48.44 %)
0
(0 %)
205,174
(4.19 %)
35,431
(4.56 %)
15,409
(1.89 %)
74 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1
54,006
(3.19 %)
n/a 18,811
(1.78 %)
21,058
(1.52 %)
39,408
(1.98 %)
41.84
(99.31 %)
15,552
(0.70 %)
17,380
(0.70 %)
21,814
(99.30 %)
4,283,780
(41.29 %)
567,588
(1.23 %)
13,807,277
(30.86 %)
760
(0.01 %)
325,786
(0.96 %)
62,126
(1.80 %)
56,003
(1.56 %)
75 brown bear (v1.0 2022 WashU)
GCF_023065955.1
60,162
(4.01 %)
n/a 18,920
(1.66 %)
21,641
(1.49 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
0
(0 %)
215
(0.00 %)
902
(100.00 %)
4,166,472
(34.00 %)
659,124
(5.14 %)
13,282,996
(33.88 %)
0
(0 %)
788,951
(2.62 %)
68,113
(2.27 %)
61,162
(1.99 %)
76 brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020)
GCF_013339695.1
39,619
(2.36 %)
n/a 3,965
(0.13 %)
116,426
(5.96 %)
45,849
(2.46 %)
46.86
(99.96 %)
0
(0 %)
10,359
(0.04 %)
2,329
(100.00 %)
1,064,424
(3.53 %)
716,579
(3.47 %)
10,608,171
(42.78 %)
1
(0.00 %)
n/a 13,204
(0.97 %)
233,049
(6.32 %)
77 brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020)
GCF_012460135.1
31,379
(5.19 %)
n/a 12,572
(1.89 %)
24,442
(2.44 %)
26,137
(3.13 %)
42.40
(99.99 %)
278
(0.01 %)
278
(0.01 %)
691
(99.99 %)
504,872
(6.53 %)
420,620
(3.73 %)
6,496,619
(21.26 %)
0
(0 %)
353,680
(2.15 %)
28,576
(2.39 %)
22,561
(1.23 %)
78 brown planthopper (BPH 2020 genbank)
GCA_014356525.1
n/a n/a 4,416
(0.37 %)
22,354
(3.57 %)
37,534
(4.91 %)
34.69
(99.96 %)
0
(0 %)
4,529
(0.04 %)
7,093
(100.00 %)
597,351
(3.69 %)
564,076
(6.64 %)
6,601,703
(47.48 %)
11
(0.00 %)
905,418
(9.48 %)
39,697
(1.55 %)
15,292
(0.62 %)
79 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1
n/a n/a 13,250
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
26,324
(3.11 %)
41.80
(99.72 %)
0
(0 %)
284
(0.28 %)
865
(100.00 %)
539,059
(10.20 %)
279,511
(3.12 %)
5,874,608
(22.08 %)
1
(0.00 %)
324,823
(2.05 %)
21,155
(1.61 %)
17,590
(1.10 %)
80 butterfly L.sinapis (2021 genbank)
GCA_905404315.1
n/a n/a 4,722
(0.65 %)
16,896
(3.62 %)
47,660
(8.03 %)
35.73
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
50
(100.00 %)
272,738
(1.92 %)
98,053
(6.01 %)
4,662,765
(51.79 %)
0
(0 %)
376,611
(5.06 %)
43,150
(4.96 %)
13,298
(1.08 %)
81 butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021)
GCA_905475465.1
n/a n/a 4,588
(1.37 %)
11,218
(5.90 %)
42,925
(13.84 %)
33.95
(100.00 %)
0
(0 %)
41
(0.00 %)
43
(100.00 %)
143,323
(2.19 %)
45,473
(3.23 %)
2,501,939
(42.55 %)
0
(0 %)
106,106
(3.41 %)
11,070
(2.07 %)
6,650
(1.23 %)
82 cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147795.1
n/a n/a 4,557
(1.68 %)
9,253
(6.32 %)
30,285
(15.57 %)
33.23
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
40
(100.00 %)
116,781
(2.12 %)
30,577
(1.24 %)
2,300,336
(39.04 %)
0
(0 %)
40,164
(2.03 %)
6,783
(2.24 %)
5,041
(1.33 %)
83 California condor (v1 813 2021 genbank)
GCA_018139145.1
n/a n/a 12,650
(1.75 %)
21,946
(1.95 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
0
(0 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
518,393
(6.41 %)
177,329
(0.88 %)
7,168,675
(20.31 %)
6
(0.00 %)
116,410
(1.11 %)
34,926
(2.94 %)
32,355
(1.72 %)
84 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1
n/a n/a 23,668
(1.61 %)
29,709
(1.32 %)
n/a 41.56
(99.92 %)
10,276
(0.04 %)
10,276
(0.04 %)
582,272
(99.96 %)
4,952,087
(44.00 %)
651,744
(1.26 %)
13,644,805
(35.79 %)
27
(0.00 %)
376,234
(0.87 %)
62,245
(1.50 %)
57,048
(1.32 %)
85 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1
n/a n/a 21,020
(1.79 %)
20,045
(1.39 %)
45,176
(2.15 %)
41.40
(99.28 %)
0
(0 %)
122
(0.72 %)
43
(100.00 %)
4,529,949
(43.67 %)
589,962
(1.24 %)
13,266,465
(33.77 %)
0
(0 %)
491,959
(1.43 %)
51,989
(1.50 %)
48,284
(1.32 %)
86 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1
50,094
(2.69 %)
n/a 18,283
(1.66 %)
19,326
(1.35 %)
38,985
(1.96 %)
41.70
(99.88 %)
0
(0 %)
848
(0.12 %)
66
(100.00 %)
5,016,399
(43.75 %)
904,986
(1.75 %)
13,476,288
(34.20 %)
0
(0 %)
572,992
(1.64 %)
66,822
(2.52 %)
60,494
(2.02 %)
87 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1
n/a n/a 25,543
(0.55 %)
52,506
(0.63 %)
n/a 40.04
(99.84 %)
4,876
(0.01 %)
4,876
(0.01 %)
3,432,954
(99.99 %)
7,363,240
(21.82 %)
876,677
(2.53 %)
25,446,677
(58.18 %)
62
(0.00 %)
n/a 25,319
(0.31 %)
19,908
(0.25 %)
88 capsicum (Zunla-1 2015 genbank)
GCA_000710875.1
n/a n/a 16,133
(0.56 %)
62,445
(2.92 %)
n/a 34.93
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
107,172
(3.23 %)
108,797
(96.77 %)
1,171,727
(3.54 %)
948,641
(4.39 %)
21,533,236
(46.16 %)
331
(0.03 %)
1,512,400
(5.05 %)
16,621
(0.21 %)
4,972
(0.06 %)
89 carmine bee-eater (2014 BGI)
GCF_000691845.1
15,520
(2.12 %)
n/a 11,303
(1.45 %)
24,758
(1.84 %)
n/a 41.67
(99.59 %)
50,632
(0.42 %)
50,632
(0.42 %)
104,131
(99.58 %)
405,042
(5.66 %)
161,525
(1.05 %)
6,445,961
(19.27 %)
2
(0.00 %)
37,279
(0.40 %)
11,477
(0.36 %)
9,158
(0.28 %)
90 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1
48,199
(10.95 %)
n/a 18,537
(3.62 %)
45,536
(13.17 %)
n/a 35.94
(85.14 %)
37,896
(14.88 %)
37,896
(14.88 %)
39,916
(85.12 %)
295,656
(2.88 %)
266,527
(3.40 %)
2,434,269
(42.34 %)
26
(0.02 %)
352,557
(6.54 %)
30,963
(1.41 %)
4,126
(0.23 %)
91 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6
n/a n/a 19,803
(1.54 %)
21,001
(1.30 %)
n/a 41.83
(99.57 %)
39,124
(0.44 %)
41,517
(0.44 %)
42,578
(99.56 %)
5,725,274
(49.24 %)
459,535
(1.33 %)
12,905,109
(41.11 %)
628
(0.03 %)
1,325,981
(3.97 %)
43,324
(1.28 %)
37,641
(0.94 %)
92 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA)
GCF_002263795.1
76,369
(2.97 %)
n/a 19,669
(1.56 %)
21,999
(1.33 %)
n/a 41.93
(100.00 %)
0
(0 %)
386
(0.00 %)
2,211
(100.00 %)
5,643,592
(49.67 %)
545,256
(2.90 %)
13,085,601
(41.79 %)
1
(0.00 %)
1,556,737
(4.07 %)
44,357
(1.24 %)
37,714
(0.98 %)
93 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA)
GCF_002263795.2
76,293
(2.98 %)
n/a 19,325
(1.49 %)
21,665
(1.32 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
386
(0.00 %)
1,957
(100.00 %)
3,550,686
(24.18 %)
544,595
(2.90 %)
13,050,221
(41.81 %)
1
(0.00 %)
1,554,173
(4.07 %)
44,208
(1.24 %)
37,290
(0.87 %)
94 Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad)
GCA_004024745.1
n/a n/a 21,372
(1.41 %)
34,453
(1.31 %)
n/a 42.35
(99.87 %)
10,534
(0.04 %)
10,534
(0.04 %)
1,240,696
(99.96 %)
5,244,572
(43.13 %)
2,503,015
(4.45 %)
12,961,004
(41.69 %)
59
(0.00 %)
n/a 173,264
(3.70 %)
153,887
(3.31 %)
95 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1
n/a n/a 14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
0
(0 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
0
(0 %)
452,303
(4.62 %)
20,453
(1.39 %)
10,802
(0.65 %)
96 channel catfish (USDA103 v1 2016)
GCF_001660625.1
53,933
(9.58 %)
n/a 15,712
(2.71 %)
25,639
(5.25 %)
n/a 39.70
(98.56 %)
25,203
(1.45 %)
25,203
(1.45 %)
34,544
(98.55 %)
871,222
(5.75 %)
585,250
(4.19 %)
5,150,651
(33.94 %)
63
(0.01 %)
258,935
(2.61 %)
31,438
(1.87 %)
20,402
(1.03 %)
97 channel catfish (USDA103 v1.2 2019)
GCF_001660625.2
57,087
(10.27 %)
n/a 16,253
(2.68 %)
44,936
(5.15 %)
n/a 39.70
(98.57 %)
25,203
(1.39 %)
25,285
(1.44 %)
34,545
(98.61 %)
900,327
(5.55 %)
614,695
(4.28 %)
5,348,266
(33.81 %)
63
(0.01 %)
281,774
(2.67 %)
32,840
(1.87 %)
21,251
(1.03 %)
98 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1
n/a n/a 18,264
(1.57 %)
14,665
(1.26 %)
n/a 41.30
(98.26 %)
0
(0 %)
183,260
(1.77 %)
14,382
(100.00 %)
4,777,041
(42.51 %)
784,368
(1.53 %)
13,503,827
(31.65 %)
42
(0.00 %)
261,774
(0.78 %)
57,657
(1.31 %)
48,632
(1.00 %)
99 chimney swift (M959 v1.0 2014)
GCF_000747805.1
15,979
(2.53 %)
n/a 12,065
(1.82 %)
10,050
(2.07 %)
n/a 41.40
(95.99 %)
65,523
(4.03 %)
65,523
(4.03 %)
84,595
(95.97 %)
453,775
(7.30 %)
194,988
(2.21 %)
6,363,949
(19.70 %)
135
(0.03 %)
104,994
(2.61 %)
12,486
(0.42 %)
8,538
(0.26 %)
100 chimpanzee (Clint C0471 2018 genbank)
GCA_002880755.3
n/a 162,869
(3.61 %)
20,378
(1.83 %)
21,427
(1.19 %)
n/a 40.71
(98.98 %)
693
(1.02 %)
693
(1.02 %)
5,037
(98.98 %)
5,409,980
(53.76 %)
984,231
(7.31 %)
15,896,744
(39.56 %)
4
(0.00 %)
2,559,246
(4.40 %)
45,870
(0.97 %)
28,273
(0.73 %)
101 chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023)
GCA_028858805.1
n/a n/a 20,001
(1.79 %)
21,230
(1.19 %)
n/a 40.62
(99.78 %)
22
(0.22 %)
22
(0.22 %)
141
(99.78 %)
5,092,768
(48.83 %)
946,933
(11.75 %)
14,844,947
(42.39 %)
0
(0 %)
3,140,392
(5.61 %)
47,662
(1.21 %)
29,340
(0.82 %)
102 chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023)
GCF_028858775.1
111,282
(4.36 %)
n/a 20,990
(1.75 %)
21,705
(1.15 %)
n/a 40.94
(99.90 %)
29
(0.10 %)
29
(0.10 %)
1,500
(99.90 %)
5,581,205
(50.06 %)
1,158,792
(10.59 %)
15,972,274
(43.09 %)
0
(0 %)
3,093,549
(5.27 %)
61,901
(2.29 %)
38,043
(1.17 %)
103 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1
60,293
(11.65 %)
n/a 15,433
(2.84 %)
67,310
(21.70 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
45
(100.00 %)
273,992
(2.25 %)
228,466
(3.97 %)
2,261,888
(35.14 %)
0
(0 %)
273,738
(7.11 %)
37,317
(4.18 %)
22,576
(1.74 %)
104 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1
55,529
(3.00 %)
n/a 19,755
(1.76 %)
20,017
(1.50 %)
n/a 41.51
(99.88 %)
0
(0 %)
4,356
(0.12 %)
1,830
(100.00 %)
4,544,603
(29.89 %)
1,095,407
(2.92 %)
12,942,232
(32.27 %)
20
(0.00 %)
553,246
(1.59 %)
19,343
(0.58 %)
15,755
(0.43 %)
105 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank)
GCA_018296145.1
n/a n/a 27,141
(1.63 %)
113,328
(4.52 %)
157,545
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,313
(0.01 %)
2,333
(0.01 %)
9,977
(99.99 %)
4,892,399
(55.31 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,870
(54.55 %)
10
(0.00 %)
5,031,323
(11.16 %)
62,726
(1.40 %)
18,444
(0.39 %)
106 chub mackerel (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409825.1
n/a n/a 15,350
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
0
(0 %)
1,572
(0.08 %)
361
(100.00 %)
1,669,327
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,422
(32.38 %)
3
(0.00 %)
927,880
(7.23 %)
16,290
(0.85 %)
8,913
(0.42 %)
107 chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014)
GCF_000700745.1
17,196
(2.21 %)
n/a 12,140
(1.50 %)
25,641
(1.91 %)
n/a 40.76
(99.61 %)
56,667
(0.39 %)
56,667
(0.39 %)
126,789
(99.61 %)
560,317
(7.62 %)
203,204
(1.12 %)
6,593,712
(20.47 %)
4
(0.00 %)
63,810
(0.48 %)
8,105
(0.24 %)
6,684
(0.19 %)
108 climbing perch (v1.1 2018 refseq)
GCF_900324465.1
42,930
(13.31 %)
n/a 15,237
(3.47 %)
22,710
(7.34 %)
37,043
(11.25 %)
40.40
(98.65 %)
0
(0 %)
292
(1.35 %)
70
(100.00 %)
329,586
(2.67 %)
133,519
(1.94 %)
3,418,470
(21.84 %)
0
(0 %)
182,187
(2.87 %)
10,698
(0.86 %)
7,641
(0.56 %)
109 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2
n/a n/a 15,239
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
50
(100.00 %)
324,479
(2.66 %)
130,248
(1.89 %)
3,324,960
(21.31 %)
0
(0 %)
169,785
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
110 climbing perch (v1.2 2018 refseq)
GCF_900324465.2
42,746
(13.53 %)
n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
324,324
(2.66 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,009
(21.31 %)
0
(0 %)
169,785
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
111 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018385.1
n/a n/a 18,516
(1.55 %)
20,363
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
0
(0 %)
181
(0.06 %)
34
(100.00 %)
4,798,634
(33.91 %)
992,669
(2.08 %)
13,618,933
(34.42 %)
3
(0.00 %)
647,740
(1.89 %)
67,831
(2.45 %)
58,578
(1.71 %)
112 clouded yellow (genbank 2021)
GCA_905220415.1
n/a n/a 4,767
(1.38 %)
15,869
(7.12 %)
34,699
(13.48 %)
33.59
(100.00 %)
0
(0 %)
9
(0.00 %)
33
(100.00 %)
161,872
(2.42 %)
73,892
(2.86 %)
2,544,844
(42.14 %)
0
(0 %)
134,497
(3.68 %)
15,663
(2.98 %)
9,943
(1.81 %)
113 coho salmon (150728-3 2017)
GCF_002021735.1
64,032
(4.29 %)
n/a 24,727
(1.43 %)
46,926
(3.38 %)
n/a 43.33
(95.39 %)
1,566
(0.01 %)
265,291
(4.63 %)
22,810
(99.99 %)
1,185,308
(5.22 %)
2,455,045
(15.99 %)
11,710,855
(46.53 %)
9,333
(0.29 %)
4,110,586
(10.80 %)
72,061
(1.46 %)
24,530
(0.46 %)
114 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1
n/a n/a 18,772
(1.77 %)
20,527
(1.42 %)
35,815
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
0
(0 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,067,521
(46.14 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,896
(35.29 %)
1
(0.00 %)
597,652
(1.78 %)
65,551
(1.90 %)
43,161
(1.35 %)
115 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1
n/a n/a 17,254
(1.68 %)
17,112
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
0
(0 %)
114,003
(0.57 %)
2,647
(100.00 %)
3,845,214
(43.88 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,013
(32.18 %)
466
(0.01 %)
284,934
(0.89 %)
48,030
(1.35 %)
31,891
(1.03 %)
116 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1
n/a n/a 18,681
(0.81 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,697
(38.92 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,301
(40.56 %)
0
(0 %)
455,834
(1.17 %)
17,762
(0.38 %)
13,986
(0.24 %)
117 common carp (2014)
GCF_000951615.1
75,427
(5.81 %)
n/a 27,632
(2.17 %)
59,950
(5.28 %)
n/a 37.00
(97.48 %)
0
(0 %)
57,940
(2.53 %)
9,378
(100.00 %)
1,460,282
(5.17 %)
987,356
(7.88 %)
9,900,821
(37.41 %)
8
(0.00 %)
1,320,956
(12.02 %)
48,702
(1.38 %)
28,063
(0.71 %)
118 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1
n/a n/a 13,179
(1.84 %)
25,859
(2.41 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
0
(0 %)
296
(0.42 %)
151
(100.00 %)
521,043
(9.61 %)
310,469
(2.36 %)
6,712,849
(21.76 %)
0
(0 %)
326,521
(1.83 %)
25,267
(1.71 %)
20,672
(1.05 %)
119 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1
16,827
(2.53 %)
n/a 12,599
(1.80 %)
12,623
(2.28 %)
n/a 41.52
(97.64 %)
56,977
(2.38 %)
56,977
(2.38 %)
71,907
(97.62 %)
418,870
(8.06 %)
192,437
(2.08 %)
6,576,259
(19.85 %)
113
(0.02 %)
126,008
(2.66 %)
18,002
(0.74 %)
15,128
(0.57 %)
120 common house spider (v2 Geottingen 2017)
GCF_000365465.2
30,064
(3.79 %)
n/a 3,347
(0.23 %)
7,571
(1.48 %)
n/a 29.46
(81.63 %)
247,375
(18.44 %)
247,378
(18.44 %)
263,908
(81.56 %)
587,943
(2.23 %)
464,643
(2.90 %)
10,795,253
(40.31 %)
12,788
(0.38 %)
474,681
(4.16 %)
10,480
(0.23 %)
1,791
(0.05 %)
121 common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank)
GCA_000365465.3
n/a n/a 3,276
(0.22 %)
9,098
(1.38 %)
38,273
(4.24 %)
29.40
(98.45 %)
24,382
(1.54 %)
124,228
(1.55 %)
84,235
(98.46 %)
637,694
(2.45 %)
527,781
(4.43 %)
11,553,196
(51.16 %)
299
(0.01 %)
477,709
(3.61 %)
11,998
(0.33 %)
2,762
(0.10 %)
122 common limpet (v1 primary hap 2022)
GCF_932274485.1
41,888
(9.21 %)
n/a 3,611
(0.43 %)
13,244
(4.58 %)
44,721
(6.30 %)
36.11
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
13
(100.00 %)
239,042
(1.40 %)
359,961
(7.89 %)
4,399,053
(45.69 %)
5
(0.00 %)
629,372
(7.98 %)
33,411
(1.94 %)
2,344
(0.13 %)
123 common sole (primary hap 2023 genbank)
GCA_958295425.1
n/a n/a 14,846
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
243
(100.00 %)
1,149,249
(19.12 %)
342,239
(9.71 %)
3,906,839
(32.84 %)
2
(0.00 %)
440,509
(5.18 %)
27,772
(2.71 %)
15,561
(0.92 %)
124 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1
n/a n/a 12,277
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
0
(0 %)
256
(0.16 %)
109
(100.00 %)
533,758
(8.66 %)
199,748
(1.12 %)
6,353,957
(21.19 %)
1
(0.00 %)
113,872
(0.91 %)
20,393
(1.74 %)
16,313
(0.88 %)
125 common vampire bat (HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1
n/a n/a 18,280
(1.71 %)
19,514
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
611
(0.01 %)
572
(100.00 %)
2,761,820
(28.38 %)
427,940
(3.89 %)
11,250,492
(32.57 %)
37
(0.00 %)
360,489
(1.62 %)
70,700
(2.48 %)
44,288
(1.24 %)
126 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2
n/a n/a 18,511
(1.87 %)
18,170
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
54,308
(2.23 %)
84,108
(97.77 %)
2,860,991
(29.93 %)
275,245
(1.03 %)
11,798,152
(28.19 %)
237
(0.03 %)
174,536
(2.84 %)
51,833
(1.38 %)
47,411
(1.21 %)
127 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1
51,034
(3.23 %)
n/a 18,506
(1.88 %)
18,166
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
54,308
(2.23 %)
84,109
(97.77 %)
2,861,697
(29.93 %)
275,247
(1.03 %)
11,798,198
(28.19 %)
237
(0.03 %)
174,536
(2.84 %)
51,834
(1.38 %)
47,410
(1.21 %)
128 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1
n/a n/a 19,335
(2.10 %)
21,769
(1.63 %)
n/a 41.24
(74.51 %)
276,531
(25.53 %)
276,544
(25.53 %)
299,069
(74.47 %)
3,513,698
(39.82 %)
304,033
(0.59 %)
13,333,842
(21.06 %)
1,491
(0.03 %)
288,329
(2.06 %)
56,694
(1.59 %)
52,345
(1.34 %)
129 cork oak (v1 HL8 2018)
GCF_002906115.1
65,969
(8.84 %)
n/a 20,226
(1.95 %)
89,703
(16.66 %)
n/a 36.19
(97.99 %)
0
(0 %)
26,139
(2.01 %)
23,344
(100.00 %)
865,884
(3.63 %)
491,126
(5.95 %)
6,119,503
(36.10 %)
267
(0.02 %)
690,224
(9.50 %)
21,505
(3.50 %)
10,784
(2.71 %)
130 cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank)
GCA_002156985.1
n/a 17,082
(10.65 %)
4,839
(1.54 %)
21,045
(8.01 %)
n/a 36.13
(89.02 %)
23,558
(11.01 %)
26,910
(11.01 %)
24,551
(88.99 %)
115,046
(2.97 %)
31,900
(0.85 %)
2,230,382
(25.45 %)
1,738
(0.70 %)
33,991
(1.55 %)
15,851
(2.18 %)
9,912
(1.25 %)
131 cowpea (IT97K-499-35 v1 2019)
GCF_004118075.1
48,679
(10.56 %)
n/a 16,927
(3.30 %)
44,814
(13.06 %)
54,348
(11.30 %)
32.98
(99.48 %)
0
(0 %)
68
(0.52 %)
682
(100.00 %)
352,238
(4.22 %)
283,949
(8.14 %)
3,092,021
(41.64 %)
1
(0.00 %)
420,724
(7.56 %)
24,513
(2.40 %)
11,823
(1.16 %)
132 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1
n/a n/a 20,283
(1.90 %)
20,544
(1.22 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,163
(4.85 %)
80,474
(4.85 %)
87,763
(95.15 %)
5,351,207
(51.35 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,449
(35.74 %)
1,138
(0.05 %)
1,213,705
(2.53 %)
76,963
(1.14 %)
28,050
(0.65 %)
133 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1
76,196
(3.30 %)
n/a 20,209
(1.91 %)
51,427
(6.84 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,163
(4.85 %)
80,474
(4.85 %)
87,764
(95.15 %)
5,251,819
(50.85 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,510
(35.74 %)
1,138
(0.05 %)
1,213,705
(2.53 %)
76,963
(1.14 %)
27,520
(0.64 %)
134 crucian carp (primary hap 2023 genbank)
GCA_963082965.1
n/a n/a 29,389
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
0
(0 %)
832
(0.01 %)
278
(100.00 %)
3,481,389
(45.81 %)
802,775
(6.54 %)
8,190,816
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,003,533
(5.09 %)
83,696
(3.82 %)
26,039
(0.81 %)
135 crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022)
GCF_022539665.1
22,902
(28.68 %)
n/a 3,621
(2.94 %)
11,430
(17.96 %)
n/a 40.34
(99.47 %)
0
(0 %)
2
(0.53 %)
227
(100.00 %)
81,008
(2.67 %)
29,625
(4.98 %)
609,395
(25.66 %)
0
(0 %)
39,313
(3.92 %)
6,559
(5.05 %)
5,546
(3.62 %)
136 crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank)
GCA_003990815.1
n/a n/a 3,519
(2.64 %)
12,174
(17.22 %)
n/a 40.54
(93.29 %)
0
(0 %)
13,228
(6.75 %)
4,192
(100.00 %)
63,254
(2.07 %)
22,325
(1.44 %)
728,942
(20.81 %)
35
(0.03 %)
32,114
(3.20 %)
8,375
(4.98 %)
6,466
(3.39 %)
137 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank)
GCA_021462225.2
n/a n/a 15,131
(1.68 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
0
(0 %)
409
(0.54 %)
73
(100.00 %)
2,175,293
(47.80 %)
176,956
(1.87 %)
6,142,692
(38.35 %)
4
(0.00 %)
383,249
(3.60 %)
32,973
(1.28 %)
10,198
(0.33 %)
138 Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_963259705.1
n/a n/a 19,142
(1.72 %)
22,139
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
0
(0 %)
1,099
(0.01 %)
122
(100.00 %)
3,040,239
(24.03 %)
796,913
(6.38 %)
10,478,261
(38.84 %)
9
(0.00 %)
756,430
(2.76 %)
64,921
(2.50 %)
57,806
(1.88 %)
139 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1
n/a n/a 22,240
(1.40 %)
22,108
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,770
(15.68 %)
252,770
(15.68 %)
259,903
(84.32 %)
4,890,270
(27.82 %)
898,943
(1.50 %)
14,281,942
(29.30 %)
2,582
(0.03 %)
313,025
(1.02 %)
40,135
(0.82 %)
36,410
(0.69 %)
140 denticle herring (v1 2019)
GCF_900700375.1
59,645
(12.74 %)
n/a 16,556
(3.78 %)
37,861
(8.42 %)
72,719
(10.66 %)
43.69
(99.18 %)
0
(0 %)
464
(0.82 %)
460
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,282
(4.61 %)
2,948,671
(28.79 %)
0
(0 %)
306,165
(4.31 %)
64,661
(9.49 %)
52,867
(4.93 %)
141 diamondback terrapin (hap1 2023 genbank)
GCA_027887155.1
n/a n/a 15,109
(1.08 %)
19,281
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.92 %)
0
(0 %)
141
(0.08 %)
76
(100.00 %)
4,088,064
(46.33 %)
403,943
(1.72 %)
11,014,504
(33.74 %)
0
(0 %)
407,696
(1.71 %)
110,838
(2.71 %)
30,093
(0.82 %)
142 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1
n/a n/a 22,343
(1.53 %)
28,525
(1.27 %)
n/a 41.66
(99.91 %)
10,428
(0.04 %)
10,428
(0.04 %)
667,170
(99.96 %)
5,598,608
(45.38 %)
1,220,686
(2.58 %)
14,079,363
(36.37 %)
28
(0.00 %)
n/a 62,881
(2.13 %)
53,176
(1.80 %)
143 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1
55,980
(3.39 %)
n/a 18,440
(1.59 %)
19,474
(1.48 %)
n/a 41.47
(94.51 %)
109,700
(5.51 %)
109,700
(5.51 %)
117,442
(94.49 %)
n/a 606,818
(1.04 %)
13,503,550
(29.63 %)
1,009
(0.02 %)
309,552
(0.86 %)
53,376
(1.90 %)
51,864
(1.65 %)
144 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1
n/a n/a 18,297
(1.33 %)
20,107
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
58,460
(2.20 %)
61,603
(97.80 %)
4,257,412
(38.85 %)
658,532
(1.25 %)
14,547,631
(34.19 %)
3
(0.00 %)
423,409
(1.39 %)
37,092
(0.85 %)
27,299
(0.63 %)
145 domestic silkworm (genbank 2020)
GCA_014905235.2
n/a n/a 5,227
(1.28 %)
18,795
(5.67 %)
n/a 38.55
(99.90 %)
0
(0 %)
30
(0.10 %)
696
(100.00 %)
615,428
(29.26 %)
86,179
(1.65 %)
2,607,325
(47.66 %)
0
(0 %)
297,922
(5.59 %)
44,022
(10.06 %)
15,414
(1.64 %)
146 domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank)
GCA_904849725.1
n/a n/a 18,050
(0.43 %)
260,902
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
0
(0 %)
162
(0.03 %)
290
(100.00 %)
1,274,894
(2.42 %)
1,726,303
(5.40 %)
14,010,542
(72.58 %)
0
(0 %)
5,823,193
(14.08 %)
732,828
(17.24 %)
271,779
(4.92 %)
147 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1
15,850
(2.33 %)
n/a 11,864
(1.67 %)
11,795
(1.99 %)
n/a 44.51
(96.31 %)
96,471
(3.72 %)
96,471
(3.72 %)
127,725
(96.28 %)
842,281
(18.63 %)
310,018
(2.09 %)
5,822,687
(27.83 %)
59
(0.01 %)
397,798
(2.49 %)
17,379
(0.69 %)
13,913
(0.52 %)
148 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1
n/a n/a 12,405
(1.70 %)
23,073
(2.18 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
0
(0 %)
187
(0.34 %)
181
(100.00 %)
1,008,118
(21.51 %)
378,537
(3.38 %)
5,846,717
(32.04 %)
0
(0 %)
791,076
(4.25 %)
26,005
(1.75 %)
19,919
(1.16 %)
149 E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank)
GCA_000750555.1
n/a 4,501
(88.85 %)
n/a n/a n/a 50.78
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 90
(0.38 %)
19,508
(7.44 %)
0
(0 %)
189
(0.40 %)
1
(99.99 %)
0
(0.00 %)
150 East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019)
GCF_008831285.1
39,088
(10.61 %)
n/a 11,569
(2.49 %)
38,114
(15.67 %)
n/a 38.59
(99.98 %)
625
(0.02 %)
627
(0.02 %)
1,425
(99.98 %)
230,165
(2.88 %)
153,929
(4.02 %)
2,160,647
(26.81 %)
1
(0.00 %)
233,651
(6.36 %)
24,567
(4.41 %)
18,177
(2.46 %)
151 eastern European house mouse (PWK_PhJ v1 2016)
GCA_001624775.1
n/a n/a 21,013
(2.21 %)
18,237
(1.40 %)
101,394
(4.09 %)
41.76
(90.89 %)
26,578
(1.66 %)
904,107
(9.24 %)
30,233
(98.34 %)
5,250,349
(40.55 %)
1,508,787
(2.97 %)
13,823,341
(28.09 %)
246,352
(1.73 %)
681,079
(2.29 %)
16,695
(0.43 %)
15,885
(0.40 %)
152 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1
57,615
(9.59 %)
n/a 15,348
(2.22 %)
28,518
(6.29 %)
42,170
(8.31 %)
41.07
(99.87 %)
115
(0.00 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
527,486
(5.98 %)
217,915
(1.89 %)
4,547,443
(30.78 %)
2
(0.00 %)
212,425
(2.79 %)
33,005
(1.88 %)
16,748
(0.95 %)
153 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1
n/a n/a 20,133
(1.87 %)
36,361
(1.80 %)
n/a 40.23
(99.96 %)
4,332
(0.02 %)
4,332
(0.02 %)
226,086
(99.98 %)
2,985,622
(32.66 %)
475,311
(1.11 %)
12,612,081
(27.34 %)
15
(0.00 %)
n/a 81,930
(5.75 %)
81,575
(4.78 %)
154 Egyptian rousette (v1 2020 genbank)
GCA_014176215.1
n/a 61,105
(4.04 %)
17,637
(2.08 %)
22,318
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
0
(0 %)
242
(1.41 %)
30
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,415
(1.02 %)
12,031,652
(26.52 %)
0
(0 %)
65,562
(0.33 %)
53,604
(6.69 %)
57,305
(5.33 %)
155 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1
30,695
(4.95 %)
n/a 11,306
(1.54 %)
18,189
(3.03 %)
n/a 42.34
(96.16 %)
46,217
(3.85 %)
46,232
(3.85 %)
67,421
(96.15 %)
1,405,480
(27.29 %)
330,698
(2.60 %)
5,549,534
(36.65 %)
31
(0.01 %)
365,912
(2.44 %)
35,561
(2.16 %)
11,961
(0.52 %)
156 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1
n/a n/a 13,181
(1.74 %)
24,708
(2.10 %)
33,433
(3.99 %)
42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
512
(0.00 %)
802
(100.00 %)
504,527
(4.38 %)
259,276
(2.59 %)
7,105,965
(19.15 %)
8
(0.00 %)
316,149
(1.79 %)
41,784
(5.52 %)
41,105
(3.30 %)
157 epaulette shark (2021 genbank)
GCA_020745735.1
n/a n/a 12,439
(0.39 %)
19,520
(1.06 %)
n/a 42.76
(98.05 %)
0
(0 %)
3,716
(1.95 %)
1,963
(100.00 %)
9,211,963
(69.93 %)
935,037
(6.51 %)
20,660,613
(43.88 %)
0
(0 %)
2,903,274
(4.44 %)
41,682
(1.08 %)
13,048
(0.16 %)
158 eudicots lettuce (Salinas v7 2020)
GCF_002870075.2
65,115
(2.96 %)
n/a 16,271
(0.65 %)
102,071
(6.37 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
3,138
(0.29 %)
353,389
(7.60 %)
11,454
(99.71 %)
1,109,875
(4.83 %)
983,866
(3.64 %)
12,335,790
(52.95 %)
2,249
(0.09 %)
1,828,920
(9.42 %)
117,743
(2.02 %)
19,959
(0.28 %)
159 Euphrates poplar (v1 2014)
GCF_000495115.1
56,539
(12.93 %)
n/a 20,844
(4.28 %)
41,664
(12.47 %)
n/a 32.08
(95.31 %)
23,174
(4.71 %)
23,174
(4.71 %)
32,789
(95.29 %)
332,532
(5.23 %)
246,766
(4.06 %)
2,679,673
(43.30 %)
21
(0.01 %)
283,121
(6.41 %)
2,781
(0.47 %)
1,761
(0.21 %)
160 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1
57,138
(2.48 %)
n/a 19,265
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,487,951
(32.73 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,723
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,258
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
54,563
(1.83 %)
161 Eurasian red squirrel (v1.1 2019)
GCA_902686455.1
n/a n/a 21,298
(1.58 %)
21,024
(1.36 %)
36,645
(1.54 %)
40.08
(94.33 %)
0
(0 %)
1,177
(5.67 %)
638
(100.00 %)
4,680,964
(35.76 %)
704,218
(1.42 %)
14,991,981
(31.49 %)
5
(0.00 %)
419,662
(1.29 %)
48,159
(1.04 %)
45,455
(0.95 %)
162 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1
45,658
(2.52 %)
n/a 19,724
(1.77 %)
19,069
(1.47 %)
34,561
(2.01 %)
42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
872
(0.26 %)
216
(100.00 %)
4,098,151
(26.75 %)
1,088,237
(2.91 %)
12,853,776
(32.42 %)
5
(0.00 %)
518,686
(1.69 %)
19,000
(0.58 %)
16,851
(0.46 %)
163 European conger (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514075.1
n/a n/a 17,073
(1.89 %)
34,794
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
13
(0.00 %)
1,009
(0.02 %)
394
(100.00 %)
761,527
(5.99 %)
913,328
(13.25 %)
5,768,003
(35.48 %)
3
(0.00 %)
1,603,442
(8.94 %)
120,990
(6.12 %)
81,342
(2.93 %)
164 European mink (primary hap 2023 genbank)
GCA_030435805.1
n/a n/a 18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
26
(100.00 %)
4,237,797
(30.90 %)
792,898
(2.69 %)
13,417,248
(36.59 %)
0
(0 %)
894,273
(2.55 %)
67,133
(2.54 %)
51,333
(1.62 %)
165 European peacock (2021 genbank)
GCA_905147045.1
n/a n/a 4,716
(1.16 %)
12,599
(4.34 %)
26,251
(7.81 %)
33.70
(100.00 %)
0
(0 %)
10
(0.00 %)
42
(100.00 %)
212,528
(2.58 %)
60,682
(1.18 %)
3,127,157
(46.89 %)
0
(0 %)
154,469
(3.96 %)
24,620
(4.88 %)
7,312
(0.89 %)
166 European plaice (primary hap 2022 genbank)
GCA_947347685.1
n/a n/a 14,820
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
0
(0 %)
1,072
(0.03 %)
356
(100.00 %)
476,317
(3.63 %)
520,730
(13.27 %)
3,283,400
(33.55 %)
2
(0.00 %)
525,277
(6.36 %)
47,051
(4.45 %)
21,879
(1.29 %)
167 European snow vole (primary hap 2023 genbank)
GCA_950005125.1
n/a n/a 20,576
(1.75 %)
21,171
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
197
(0.00 %)
161
(100.00 %)
3,580,811
(22.71 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,125
(34.97 %)
4
(0.00 %)
954,164
(3.20 %)
20,725
(0.63 %)
17,303
(0.45 %)
168 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1
n/a n/a 11,276
(1.79 %)
21,238
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,333
(100.00 %)
466,567
(7.08 %)
182,345
(0.97 %)
6,037,183
(20.24 %)
0
(0 %)
110,549
(1.11 %)
29,648
(2.35 %)
26,084
(1.59 %)
169 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1
n/a n/a 12,415
(1.77 %)
23,484
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
0
(0 %)
894
(0.33 %)
357
(100.00 %)
539,737
(7.60 %)
227,500
(1.16 %)
6,768,805
(21.05 %)
4
(0.00 %)
181,333
(1.65 %)
34,729
(2.65 %)
30,692
(1.70 %)
170 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1
n/a n/a 19,960
(1.65 %)
19,954
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
0
(0 %)
1,129
(0.01 %)
498
(100.00 %)
4,863,656
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,786
(40.58 %)
17
(0.00 %)
2,516,599
(5.37 %)
23,961
(0.53 %)
17,318
(0.36 %)
171 fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank)
GCA_011064685.1
n/a n/a 5,744
(1.12 %)
26,631
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
0
(0 %)
525
(0.01 %)
91
(100.00 %)
168,479
(1.60 %)
72,876
(1.70 %)
3,384,083
(37.35 %)
0
(0 %)
128,947
(2.55 %)
30,753
(4.27 %)
12,571
(1.35 %)
172 fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020)
GCF_011064685.1
32,751
(9.65 %)
n/a 5,744
(1.12 %)
26,632
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
0
(0 %)
525
(0.01 %)
92
(100.00 %)
169,122
(1.61 %)
72,892
(1.70 %)
3,384,365
(37.36 %)
0
(0 %)
128,947
(2.55 %)
30,753
(4.27 %)
12,571
(1.35 %)
173 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2
n/a n/a 15,436
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
0
(0 %)
744
(1.81 %)
189
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,037
(2.21 %)
5,305,987
(30.67 %)
0
(0 %)
227,443
(2.84 %)
24,130
(1.26 %)
11,082
(0.48 %)
174 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1
n/a n/a 18,302
(1.36 %)
20,592
(1.23 %)
32,831
(1.38 %)
40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
160,167
(10.78 %)
166,489
(89.22 %)
5,109,822
(37.03 %)
389,314
(0.74 %)
14,633,007
(38.46 %)
5,748
(0.06 %)
244,060
(0.64 %)
27,461
(0.64 %)
25,464
(0.54 %)
175 fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019)
GCF_009650485.1
24,196
(18.66 %)
n/a 10,065
(8.48 %)
14,473
(13.61 %)
n/a 38.15
(100.00 %)
0
(0 %)
7
(0.00 %)
11
(100.00 %)
298,709
(14.86 %)
80,048
(3.56 %)
1,317,733
(33.56 %)
0
(0 %)
69,521
(4.49 %)
18,849
(8.62 %)
11,752
(5.15 %)
176 fly D.santomea (v1.0 2021)
GCF_016746245.1
25,550
(21.64 %)
n/a 13,354
(17.52 %)
20,540
(17.87 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
104
(100.00 %)
169,365
(23.08 %)
64,316
(3.47 %)
791,743
(23.14 %)
0
(0 %)
69,581
(6.26 %)
27,794
(16.15 %)
20,742
(10.27 %)
177 fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine)
GCF_004382195.1
26,658
(22.06 %)
n/a 13,461
(17.65 %)
21,781
(17.83 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
38
(0.00 %)
402
(100.00 %)
145,818
(25.16 %)
34,869
(4.31 %)
719,811
(25.74 %)
0
(0 %)
87,076
(8.91 %)
30,130
(16.11 %)
22,906
(10.22 %)
178 fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017)
GCF_002093755.1
21,759
(15.21 %)
n/a 12,488
(9.92 %)
21,269
(14.06 %)
n/a 39.11
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,356
(100.00 %)
314,594
(25.90 %)
82,446
(12.33 %)
1,113,448
(37.00 %)
0
(0 %)
199,881
(8.53 %)
27,493
(12.03 %)
20,330
(8.62 %)
179 fly D.simulans (w501 v3.0 2021)
GCF_016746395.1
28,595
(26.45 %)
n/a 13,448
(20.44 %)
18,989
(18.34 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
96
(100.00 %)
126,424
(16.72 %)
32,595
(4.31 %)
759,296
(23.70 %)
0
(0 %)
46,993
(4.17 %)
27,530
(17.02 %)
20,622
(10.65 %)
180 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2
5,444
(4.10 %)
n/a 13,713
(15.95 %)
22,613
(16.71 %)
n/a 42.28
(98.12 %)
5,317
(1.88 %)
5,400
(1.88 %)
13,440
(98.12 %)
180,908
(22.48 %)
68,911
(3.75 %)
897,353
(23.94 %)
85
(0.04 %)
85,136
(6.91 %)
31,387
(14.91 %)
22,960
(9.55 %)
181 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1
27,938
(24.60 %)
n/a 13,343
(17.86 %)
20,029
(17.64 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
54
(100.00 %)
169,559
(23.47 %)
60,591
(3.64 %)
837,616
(23.40 %)
0
(0 %)
64,895
(6.52 %)
28,204
(16.22 %)
22,365
(10.80 %)
182 Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank)
GCA_902459505.1
n/a n/a 14,267
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
163
(100.00 %)
1,311,113
(1.64 %)
1,364,596
(3.83 %)
19,589,738
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,977
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
183 Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_902459505.1
54,713
(1.72 %)
n/a 14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,310,970
(1.64 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,802
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,977
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
184 giant panda (2009 BGI)
GCF_000004335.2
40,432
(2.55 %)
n/a 18,884
(1.76 %)
18,919
(1.46 %)
n/a 41.60
(97.66 %)
119,126
(2.36 %)
119,126
(2.36 %)
200,593
(97.64 %)
4,236,423
(40.48 %)
503,179
(1.10 %)
13,781,487
(28.85 %)
48
(0.00 %)
252,804
(0.90 %)
53,465
(1.34 %)
45,835
(1.12 %)
185 giant panda (Jingjing v1 2017)
GCA_002007445.1
n/a n/a 20,110
(1.71 %)
22,288
(1.49 %)
n/a 41.69
(98.08 %)
186,846
(1.93 %)
186,846
(1.93 %)
244,258
(98.07 %)
4,464,041
(41.66 %)
614,896
(2.00 %)
14,294,774
(30.62 %)
9,506
(0.14 %)
580,134
(4.39 %)
59,340
(1.50 %)
49,319
(1.23 %)
186 giant panda (Jingjing v2 refseq 2020)
GCF_002007445.1
67,162
(3.32 %)
n/a 20,374
(1.71 %)
21,965
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
0
(0 %)
190,364
(1.92 %)
77,288
(100.00 %)
4,476,689
(41.47 %)
618,596
(2.00 %)
14,236,463
(30.39 %)
9,762
(0.14 %)
583,300
(4.39 %)
59,946
(1.50 %)
49,916
(1.23 %)
187 giant panda (Jingjing v2 genbank 2020)
GCA_002007445.2
n/a n/a 20,381
(1.71 %)
21,979
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
0
(0 %)
190,364
(1.92 %)
77,287
(100.00 %)
4,484,597
(41.53 %)
618,595
(2.00 %)
14,236,406
(30.39 %)
9,762
(0.14 %)
583,295
(4.39 %)
59,945
(1.50 %)
49,872
(1.23 %)
188 gilthead seabream (v1 2019)
GCF_900880675.1
59,027
(10.96 %)
n/a 15,412
(2.36 %)
31,802
(6.47 %)
73,197
(7.97 %)
41.94
(99.96 %)
0
(0 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
531,360
(3.04 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,694
(25.69 %)
0
(0 %)
355,475
(3.53 %)
47,327
(2.41 %)
23,697
(1.07 %)
189 Glanville fritillary (genbank 2021)
GCA_905220565.1
n/a n/a 4,738
(0.89 %)
16,197
(5.05 %)
35,235
(7.97 %)
34.09
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.01 %)
32
(100.00 %)
343,193
(3.25 %)
144,286
(3.46 %)
3,683,956
(48.60 %)
0
(0 %)
198,815
(3.74 %)
30,200
(4.54 %)
11,245
(1.52 %)
190 globe artichoke (v1 2C 2018)
GCF_001531365.1
42,119
(6.72 %)
n/a 15,804
(2.23 %)
49,721
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
5,305
(0.07 %)
310,473
(9.77 %)
13,588
(99.93 %)
394,687
(2.79 %)
364,361
(3.37 %)
4,191,676
(39.48 %)
3,050
(0.15 %)
283,546
(3.56 %)
12,198
(0.64 %)
7,326
(0.39 %)
191 goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1
n/a n/a 19,842
(1.43 %)
22,426
(1.24 %)
52,608
(1.64 %)
43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
790
(0.00 %)
29,906
(100.00 %)
5,669,868
(50.59 %)
760,836
(7.07 %)
13,024,386
(44.85 %)
0
(0 %)
2,571,292
(5.65 %)
125,682
(4.01 %)
44,489
(1.09 %)
192 goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1
47,206
(2.31 %)
46,486
(2.23 %)
19,857
(1.43 %)
22,880
(1.27 %)
52,608
(1.64 %)
43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
790
(0.00 %)
29,907
(100.00 %)
5,578,287
(50.22 %)
760,837
(7.07 %)
13,024,440
(44.85 %)
0
(0 %)
2,571,292
(5.65 %)
125,682
(4.02 %)
44,510
(1.09 %)
193 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1
n/a n/a 9,334
(1.82 %)
17,594
(2.12 %)
n/a 42.53
(99.93 %)
0
(0 %)
39
(0.07 %)
3,860
(100.00 %)
356,284
(6.03 %)
123,430
(0.80 %)
4,417,887
(19.25 %)
0
(0 %)
53,254
(0.85 %)
28,919
(3.52 %)
25,970
(2.20 %)
194 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1
55,164
(5.86 %)
n/a 13,226
(1.87 %)
23,033
(2.15 %)
25,921
(3.22 %)
42.11
(99.61 %)
0
(0 %)
191
(0.39 %)
142
(100.00 %)
519,341
(5.86 %)
180,990
(0.79 %)
7,005,531
(19.25 %)
1
(0.00 %)
53,053
(0.51 %)
37,343
(3.12 %)
34,701
(1.97 %)
195 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1
n/a n/a 18,965
(1.82 %)
19,339
(1.52 %)
n/a 42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
216,216
(17.12 %)
237,699
(82.88 %)
3,724,142
(27.19 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,866
(24.29 %)
3,589
(0.05 %)
254,929
(0.76 %)
18,591
(0.51 %)
17,093
(0.42 %)
196 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1
n/a n/a 21,341
(1.86 %)
22,492
(1.24 %)
n/a 40.87
(98.50 %)
61,291
(1.50 %)
61,291
(1.50 %)
196,804
(98.50 %)
5,673,299
(51.36 %)
1,080,627
(3.06 %)
16,205,827
(36.77 %)
187
(0.01 %)
1,068,178
(2.78 %)
79,387
(1.14 %)
27,171
(0.63 %)
197 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3
n/a n/a 20,031
(1.89 %)
22,619
(1.50 %)
n/a 40.98
(95.94 %)
43,305
(4.06 %)
43,363
(4.06 %)
50,982
(95.94 %)
4,082,873
(41.60 %)
582,430
(1.47 %)
14,808,558
(30.05 %)
325
(0.02 %)
1,168,690
(4.77 %)
74,772
(2.61 %)
69,260
(2.12 %)
198 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887165.1
n/a n/a 16,638
(0.72 %)
16,171
(0.86 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
0
(0 %)
2,255
(0.89 %)
14
(100.00 %)
5,562,366
(25.40 %)
1,096,625
(2.60 %)
22,322,798
(43.37 %)
13
(0.00 %)
n/a 28,894
(0.57 %)
22,987
(0.42 %)
199 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1
n/a n/a 19,011
(2.00 %)
19,882
(1.66 %)
41,741
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
0
(0 %)
172,751
(12.60 %)
7,570
(100.00 %)
3,078,210
(32.07 %)
495,290
(1.05 %)
11,588,202
(25.43 %)
2,116
(0.03 %)
193,024
(1.10 %)
33,101
(0.97 %)
30,240
(0.87 %)
200 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1
50,937
(3.26 %)
n/a 18,992
(2.00 %)
19,880
(1.66 %)
41,778
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
0
(0 %)
172,751
(12.60 %)
7,571
(100.00 %)
3,285,971
(33.14 %)
495,292
(1.05 %)
11,588,248
(25.43 %)
2,116
(0.03 %)
193,024
(1.10 %)
33,101
(0.97 %)
29,553
(0.86 %)
201 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1
n/a 41,563
(2.11 %)
18,531
(1.97 %)
20,309
(1.67 %)
n/a 40.52
(99.19 %)
0
(0 %)
292
(0.81 %)
50
(100.00 %)
3,284,473
(35.00 %)
559,653
(1.29 %)
12,043,562
(29.15 %)
0
(0 %)
155,142
(0.71 %)
32,047
(1.05 %)
30,235
(0.96 %)
202 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2
n/a n/a 18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,301,020
(34.99 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,069
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,625
(0.98 %)
203 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1
53,352
(3.13 %)
n/a 18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,300,836
(34.99 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,627
(0.98 %)
204 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1
n/a n/a 23,153
(1.31 %)
51,642
(1.43 %)
n/a 43.16
(99.88 %)
8,133
(0.04 %)
8,133
(0.04 %)
1,053,330
(99.96 %)
3,675,075
(25.48 %)
938,700
(2.73 %)
12,027,923
(39.01 %)
44
(0.00 %)
n/a 80,955
(2.31 %)
64,379
(1.67 %)
205 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1
n/a n/a 13,467
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,442
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
0
(0 %)
112,918
(3.25 %)
46,340
(13.40 %)
32,897
(5.93 %)
206 greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank)
GCA_003640425.2
n/a n/a 4,346
(0.99 %)
12,930
(3.50 %)
21,226
(7.60 %)
33.06
(99.10 %)
0
(0 %)
27,314
(0.92 %)
13,303
(100.00 %)
270,925
(3.18 %)
86,050
(1.20 %)
3,416,162
(48.29 %)
102
(0.01 %)
135,364
(1.95 %)
11,043
(1.07 %)
7,092
(0.63 %)
207 green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007)
GCF_000002595.1
14,484
(22.24 %)
n/a 987
(0.55 %)
11,299
(59.37 %)
n/a 63.87
(87.58 %)
9,827
(12.45 %)
10,425
(12.45 %)
11,385
(87.55 %)
167,652
(16.23 %)
100,391
(4.60 %)
734,057
(30.38 %)
3
(0.00 %)
37,459
(3.99 %)
3,154
(63.45 %)
17,305
(12.08 %)
208 green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank)
GCA_000147415.1
n/a 9,780
(32.79 %)
743
(1.01 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,396
(8.55 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
65,787
(8.35 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
0
(0 %)
6,856
(2.06 %)
776
(95.90 %)
9,593
(9.00 %)
209 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank)
GCA_000002595.3
n/a 19,528
(53.99 %)
988
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
171,684
(17.03 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
26
(0.03 %)
48,564
(5.08 %)
106
(99.48 %)
15,883
(12.21 %)
210 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2
n/a n/a 20,079
(1.94 %)
20,246
(1.25 %)
n/a 40.81
(98.67 %)
160,731
(1.35 %)
178,925
(1.35 %)
163,017
(98.65 %)
5,382,039
(50.20 %)
980,479
(2.63 %)
16,076,172
(35.62 %)
23,631
(0.16 %)
934,122
(2.70 %)
50,033
(1.04 %)
27,104
(0.75 %)
211 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1
31,786
(2.57 %)
n/a 14,548
(1.02 %)
15,297
(1.46 %)
n/a 43.49
(95.57 %)
134,344
(4.44 %)
134,344
(4.44 %)
274,367
(95.56 %)
1,615,553
(13.87 %)
317,600
(2.08 %)
11,732,990
(28.32 %)
129
(0.02 %)
n/a 36,782
(0.70 %)
21,797
(0.42 %)
212 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1
56,917
(3.63 %)
n/a 14,729
(1.06 %)
17,439
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
0
(0 %)
294
(0.56 %)
99
(100.00 %)
1,641,730
(15.08 %)
304,356
(1.25 %)
11,136,918
(31.96 %)
0
(0 %)
429,794
(1.68 %)
49,035
(1.44 %)
26,943
(0.68 %)
213 harbor porpoise (BS71 2019)
GCA_004363495.1
n/a n/a 21,044
(1.46 %)
30,072
(1.23 %)
n/a 41.83
(99.88 %)
7,114
(0.03 %)
7,114
(0.03 %)
1,338,272
(99.97 %)
5,359,537
(46.83 %)
772,736
(1.54 %)
13,705,428
(42.29 %)
44
(0.00 %)
n/a 80,965
(1.65 %)
55,941
(1.28 %)
214 Harpy eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_026419915.1
n/a n/a 13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
0
(0 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
1
(0.00 %)
480,042
(2.70 %)
60,606
(5.66 %)
30,636
(1.52 %)
215 Hawaiian crow (2021 genbank)
GCA_020740725.1
n/a n/a 12,737
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
0
(0 %)
294
(0.16 %)
187
(100.00 %)
502,844
(6.10 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,316
(23.59 %)
3
(0.00 %)
336,844
(2.41 %)
46,108
(3.49 %)
24,228
(1.26 %)
216 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq)
GCF_002201575.1
29,897
(1.95 %)
29,595
(1.94 %)
19,404
(1.74 %)
20,264
(1.41 %)
33,412
(1.67 %)
41.41
(97.77 %)
0
(0 %)
38,833
(2.24 %)
7,872
(100.00 %)
4,547,865
(43.29 %)
573,335
(1.09 %)
13,374,928
(33.10 %)
882
(0.03 %)
587,410
(1.58 %)
50,380
(1.45 %)
46,841
(1.28 %)
217 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank)
GCA_002201575.1
n/a n/a 19,385
(1.74 %)
20,265
(1.41 %)
33,375
(1.66 %)
41.41
(97.77 %)
0
(0 %)
38,833
(2.24 %)
7,871
(100.00 %)
4,629,031
(43.70 %)
573,328
(1.09 %)
13,374,887
(33.10 %)
882
(0.03 %)
587,399
(1.58 %)
50,379
(1.45 %)
46,745
(1.27 %)
218 hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank)
GCA_030028045.1
n/a n/a 20,337
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
0
(0 %)
226
(0.00 %)
356
(100.00 %)
3,783,435
(35.17 %)
567,796
(3.38 %)
13,462,481
(35.48 %)
2
(0.00 %)
396,368
(1.55 %)
48,365
(1.91 %)
44,048
(1.34 %)
219 Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.1
49,894
(2.81 %)
n/a 18,317
(1.66 %)
19,991
(1.63 %)
n/a 42.33
(99.79 %)
0
(0 %)
38,823
(0.21 %)
27,486
(100.00 %)
2,844,834
(29.10 %)
367,443
(1.49 %)
11,805,151
(31.26 %)
151
(0.00 %)
330,522
(1.83 %)
59,262
(1.70 %)
48,287
(1.35 %)
220 hooded crow (v2 S_Up_H32 2017)
GCF_000738735.2
35,874
(6.47 %)
n/a 11,298
(1.84 %)
17,627
(2.12 %)
n/a 41.48
(97.07 %)
0
(0 %)
27,795
(2.94 %)
113
(100.00 %)
392,199
(5.95 %)
139,126
(0.76 %)
6,141,002
(18.21 %)
16
(0.00 %)
38,866
(0.37 %)
12,943
(0.48 %)
10,321
(0.36 %)
221 hooded crow (v5 S_Up_H32 2021)
GCF_000738735.5
42,799
(57.51 %)
n/a 11,845
(1.92 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
0
(0 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
421,463
(6.12 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
0
(0 %)
77,475
(0.63 %)
25,266
(2.09 %)
20,747
(1.24 %)
222 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1
n/a n/a 18,575
(1.67 %)
17,121
(1.34 %)
n/a 41.50
(98.14 %)
45,680
(1.86 %)
45,680
(1.86 %)
55,316
(98.14 %)
3,941,878
(45.17 %)
381,229
(1.99 %)
14,674,265
(29.80 %)
3
(0.00 %)
384,525
(1.12 %)
45,521
(1.52 %)
36,682
(0.85 %)
223 house finch (bHaeMex1 primary hap 2022 genbank)
GCA_027477595.1
n/a n/a 12,700
(1.83 %)
24,567
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
0
(0 %)
295
(0.98 %)
183
(100.00 %)
440,379
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,100
(23.47 %)
1
(0.00 %)
573,829
(3.39 %)
30,897
(2.53 %)
22,852
(1.24 %)
224 house mouse (A_J v1 2016)
GCA_001624215.1
n/a n/a 21,171
(2.20 %)
18,776
(1.40 %)
102,254
(4.12 %)
41.70
(89.34 %)
28,597
(3.99 %)
365,877
(10.71 %)
33,692
(96.01 %)
5,186,523
(40.90 %)
1,483,826
(3.06 %)
13,614,266
(28.13 %)
38,843
(1.02 %)
487,933
(2.04 %)
16,590
(0.42 %)
15,701
(0.39 %)
225 house mouse (AKR_J v1 2016)
GCA_001624295.1
n/a n/a 21,299
(2.19 %)
18,730
(1.41 %)
102,168
(4.09 %)
41.70
(86.82 %)
34,083
(4.00 %)
314,064
(13.22 %)
40,550
(96.00 %)
5,186,721
(40.97 %)
1,485,719
(3.05 %)
13,610,761
(27.42 %)
18,106
(1.03 %)
469,625
(2.17 %)
16,745
(0.41 %)
15,817
(0.38 %)
226 house mouse (BALB_cJ v1 2016)
GCA_001632525.1
n/a n/a 21,337
(2.21 %)
18,682
(1.41 %)
102,138
(4.14 %)
41.74
(88.91 %)
32,984
(4.16 %)
361,689
(11.14 %)
37,453
(95.84 %)
5,096,953
(40.72 %)
1,407,754
(2.90 %)
13,416,041
(27.66 %)
15,793
(0.80 %)
453,227
(1.90 %)
16,788
(0.42 %)
15,890
(0.39 %)
227 house mouse (CBA_J v1 2016)
GCA_001624475.1
n/a n/a 21,259
(2.23 %)
18,593
(1.42 %)
101,632
(4.14 %)
41.78
(79.43 %)
36,013
(3.86 %)
410,639
(20.63 %)
42,242
(96.14 %)
5,081,543
(40.40 %)
1,393,763
(2.54 %)
13,472,532
(24.46 %)
24,180
(1.46 %)
418,702
(1.72 %)
16,809
(0.38 %)
15,953
(0.35 %)
228 house mouse (DBA_2J v1 2016)
GCA_001624505.1
n/a n/a 21,156
(2.23 %)
18,610
(1.43 %)
101,908
(4.18 %)
41.80
(88.67 %)
37,461
(4.86 %)
409,306
(11.39 %)
42,324
(95.14 %)
5,028,217
(40.37 %)
1,364,702
(2.73 %)
13,540,805
(27.33 %)
13,245
(0.55 %)
420,635
(1.47 %)
16,544
(0.42 %)
15,786
(0.39 %)
229 house mouse (C3H_HeJ v1 2016)
GCA_001632575.1
n/a n/a 21,177
(2.22 %)
18,550
(1.42 %)
101,710
(4.15 %)
41.74
(85.90 %)
32,785
(4.09 %)
369,499
(14.15 %)
37,497
(95.91 %)
5,089,496
(40.41 %)
1,399,438
(2.72 %)
13,485,480
(26.52 %)
19,436
(0.94 %)
427,663
(1.66 %)
16,675
(0.41 %)
15,897
(0.38 %)
230 house mouse (FVB_NJ v1 2016)
GCA_001624535.1
n/a n/a 21,195
(2.22 %)
18,615
(1.42 %)
101,520
(4.15 %)
41.75
(89.39 %)
61,976
(6.27 %)
380,840
(10.66 %)
67,805
(93.73 %)
5,037,447
(40.28 %)
1,381,859
(2.89 %)
13,440,164
(27.32 %)
14,811
(0.71 %)
426,149
(1.81 %)
16,625
(0.42 %)
15,829
(0.39 %)
231 house mouse (GRCm38.p6 2017)
GCF_000001635.26
123,667
(4.49 %)
n/a 24,134
(2.09 %)
22,855
(1.67 %)
n/a 41.73
(97.18 %)
676
(2.82 %)
904
(2.82 %)
21,179
(97.18 %)
5,554,281
(45.50 %)
1,695,255
(3.40 %)
13,041,229
(35.91 %)
3
(0.00 %)
889,196
(2.45 %)
25,014
(0.54 %)
16,961
(0.40 %)
232 house mouse (LP_J v1 2016)
GCA_001632615.1
n/a n/a 21,012
(2.23 %)
18,555
(1.43 %)
101,892
(4.18 %)
41.78
(84.14 %)
34,444
(4.11 %)
402,247
(15.91 %)
38,542
(95.89 %)
5,032,748
(40.03 %)
1,373,374
(2.60 %)
13,411,126
(25.61 %)
18,175
(0.88 %)
405,473
(1.47 %)
16,668
(0.40 %)
15,888
(0.37 %)
233 house mouse (NOD_ShiLtJ v1 2016)
GCA_001624675.1
n/a n/a 21,291
(2.24 %)
19,697
(1.47 %)
101,562
(4.18 %)
42.00
(77.13 %)
60,087
(4.21 %)
595,433
(22.95 %)
66,154
(95.79 %)
5,059,815
(40.57 %)
1,370,443
(2.51 %)
13,251,532
(23.62 %)
36,838
(1.54 %)
452,044
(2.17 %)
18,188
(0.42 %)
17,273
(0.39 %)
234 house mouse (NZO_HlLtJ v1 2016)
GCA_001624745.1
n/a n/a 21,233
(2.22 %)
18,805
(1.43 %)
103,134
(4.18 %)
41.74
(86.47 %)
49,204
(4.63 %)
337,909
(13.58 %)
57,439
(95.37 %)
5,112,301
(40.60 %)
1,418,629
(2.92 %)
13,588,055
(27.01 %)
21,209
(1.18 %)
440,820
(2.04 %)
16,857
(0.41 %)
15,946
(0.38 %)
235 human (GRCh38.p13 2019)
GCF_000001405.39
172,809
(4.43 %)
n/a 23,121
(1.97 %)
27,697
(1.78 %)
n/a 41.04
(95.07 %)
827
(4.93 %)
1,268
(4.93 %)
46,029
(95.07 %)
5,859,855
(52.78 %)
1,037,733
(4.60 %)
16,933,424
(36.88 %)
12
(0.00 %)
1,408,888
(2.55 %)
56,646
(1.06 %)
31,442
(0.75 %)
236 human (GRCh38.p14 2022)
GCF_000001405.40
188,352
(5.12 %)
n/a 23,474
(1.98 %)
28,557
(1.86 %)
n/a 41.05
(95.10 %)
829
(4.90 %)
1,270
(4.90 %)
46,502
(95.10 %)
5,910,293
(52.77 %)
1,047,827
(4.59 %)
17,068,934
(36.82 %)
12
(0.00 %)
1,423,169
(2.56 %)
57,427
(1.07 %)
31,985
(0.75 %)
237 human (NA24385.mat 2022)
GCA_021951015.1
n/a n/a 20,809
(1.82 %)
21,369
(1.18 %)
234,089
(4.92 %)
40.85
(99.95 %)
0
(0 %)
109
(0.05 %)
355
(100.00 %)
5,489,855
(53.93 %)
1,085,681
(8.26 %)
15,968,830
(40.95 %)
0
(0 %)
1,817,110
(3.54 %)
53,511
(1.32 %)
30,302
(0.84 %)
238 human (NA24385.pat 2022)
GCA_021950905.1
n/a n/a 20,014
(1.81 %)
20,716
(1.19 %)
227,278
(4.91 %)
40.87
(99.97 %)
0
(0 %)
117
(0.03 %)
514
(100.00 %)
5,293,356
(54.01 %)
1,100,786
(9.09 %)
15,122,569
(41.27 %)
2
(0.00 %)
1,900,161
(3.87 %)
52,546
(1.35 %)
29,891
(0.86 %)
239 human (NA24385.mat 2021)
GCA_018852615.1
n/a n/a 20,744
(1.84 %)
21,968
(1.22 %)
233,779
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
445
(100.00 %)
5,435,410
(53.40 %)
1,086,871
(8.27 %)
15,970,867
(40.97 %)
0
(0 %)
1,819,917
(3.54 %)
53,581
(1.32 %)
29,359
(0.79 %)
240 human (NA24385.pat 2021)
GCA_018852605.1
n/a n/a 19,919
(1.83 %)
21,582
(1.22 %)
227,333
(4.91 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
610
(100.00 %)
5,215,774
(53.54 %)
1,094,036
(9.09 %)
15,125,069
(41.29 %)
0
(0 %)
1,903,592
(3.87 %)
52,653
(1.34 %)
28,881
(0.81 %)
241 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank)
GCA_000845685.2
n/a 115
(79.56 %)
n/a n/a n/a 42.44
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
33
(1.67 %)
36
(4.27 %)
603
(9.83 %)
0
(0 %)
52
(1.87 %)
3
(13.72 %)
2
(13.38 %)
242 human T2T CHM13 v2.0
GCA_009914755.4
108,944
(51.73 %)
n/a 20,844
(1.79 %)
21,287
(1.16 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 25
(100.00 %)
5,591,082
(54.45 %)
1,155,353
(8.89 %)
16,163,340
(41.63 %)
0
(0 %)
2,006,129
(3.86 %)
52,408
(1.38 %)
30,616
(0.83 %)
243 Iberian mole (v1 TD23 2020)
GCF_014898055.1
46,872
(2.59 %)
n/a 18,566
(1.67 %)
20,793
(1.59 %)
n/a 41.91
(99.98 %)
0
(0 %)
3,640
(0.02 %)
4,425
(100.00 %)
3,269,038
(31.47 %)
501,677
(1.32 %)
11,176,747
(32.61 %)
2
(0.00 %)
644,819
(2.55 %)
48,076
(2.80 %)
43,577
(2.14 %)
244 Iberian mole (v2 TD23 2020)
GCF_014898055.2
46,746
(2.60 %)
n/a 18,453
(1.69 %)
20,410
(1.59 %)
n/a 41.90
(99.98 %)
0
(0 %)
3,639
(0.02 %)
3,202
(100.00 %)
2,637,156
(23.36 %)
497,087
(1.30 %)
10,984,260
(32.64 %)
2
(0.00 %)
638,388
(2.54 %)
47,552
(2.89 %)
43,140
(2.46 %)
245 Indian glassy fish (v1 2019)
GCF_900634625.1
44,096
(12.32 %)
n/a 15,337
(3.60 %)
23,988
(7.92 %)
60,224
(10.41 %)
42.38
(98.08 %)
0
(0 %)
1,523
(1.92 %)
156
(100.00 %)
346,406
(3.02 %)
163,522
(3.00 %)
2,755,229
(25.07 %)
0
(0 %)
235,504
(4.25 %)
17,930
(1.47 %)
9,748
(0.74 %)
246 Indian medaka
GCF_002922805.1
47,300
(9.26 %)
n/a 14,561
(2.50 %)
31,867
(6.43 %)
n/a 39.04
(94.73 %)
0
(0 %)
51,440
(5.29 %)
8,603
(100.00 %)
319,637
(2.20 %)
208,749
(2.67 %)
5,412,794
(33.26 %)
180
(0.02 %)
209,615
(2.14 %)
40,721
(2.36 %)
28,619
(1.60 %)
247 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1
n/a n/a 21,188
(1.26 %)
41,550
(1.34 %)
35,477
(1.51 %)
42.19
(99.92 %)
4,324
(0.02 %)
4,324
(0.02 %)
798,700
(99.98 %)
3,297,388
(28.66 %)
476,792
(1.23 %)
13,144,912
(34.13 %)
14
(0.00 %)
n/a 81,685
(1.86 %)
59,284
(1.43 %)
248 Japanese quail
GCF_001577835.1
47,008
(7.38 %)
n/a 12,864
(2.55 %)
36,126
(11.03 %)
n/a 41.28
(98.88 %)
7,630
(1.12 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
466,141
(6.58 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
628
(0.03 %)
160,342
(1.32 %)
17,977
(1.86 %)
15,897
(1.26 %)
249 Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018)
GCF_003227715.1
29,097
(10.82 %)
n/a 4,337
(1.33 %)
43,907
(11.32 %)
n/a 44.75
(99.72 %)
0
(0 %)
499
(0.28 %)
857
(100.00 %)
439,110
(17.67 %)
262,539
(5.69 %)
1,834,301
(29.28 %)
3
(0.00 %)
159,215
(3.71 %)
6,204
(9.08 %)
5,973
(2.13 %)
250 kakapo (Jane v1 2019)
GCF_004027225.1
49,444
(5.77 %)
n/a 13,114
(1.92 %)
17,732
(2.50 %)
29,004
(4.44 %)
41.97
(97.63 %)
0
(0 %)
362
(2.37 %)
99
(100.00 %)
548,758
(10.76 %)
208,171
(1.07 %)
6,258,082
(20.20 %)
0
(0 %)
165,436
(1.31 %)
22,279
(1.75 %)
19,230
(1.19 %)
251 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2
n/a n/a 13,112
(1.92 %)
17,637
(2.48 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
0
(0 %)
373
(0.92 %)
90
(100.00 %)
507,072
(7.85 %)
208,180
(1.08 %)
6,258,178
(20.50 %)
0
(0 %)
165,532
(1.34 %)
22,278
(1.77 %)
19,230
(1.21 %)
252 koala (Bilbo 61053 2017)
GCF_002099425.1
55,723
(2.15 %)
n/a 17,500
(0.86 %)
16,193
(0.94 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
1,907
(100.00 %)
7,814,631
(41.58 %)
1,123,545
(2.03 %)
21,796,057
(39.25 %)
0
(0 %)
405,744
(0.85 %)
15,957
(0.35 %)
15,019
(0.30 %)
253 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1
n/a n/a 14,221
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
41,384
(6.20 %)
40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,338
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,148
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,224
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
18,380
(0.95 %)
254 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1
29,517
(6.48 %)
n/a 14,243
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
41,421
(6.20 %)
40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,274
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,142
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,224
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
18,380
(0.95 %)
255 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023638135.1
n/a n/a 12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
0
(0 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
2
(0.00 %)
479,269
(2.67 %)
32,398
(2.65 %)
19,870
(0.89 %)
256 large cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147105.1
n/a n/a 4,550
(1.47 %)
9,197
(5.18 %)
30,394
(12.69 %)
34.13
(100.00 %)
0
(0 %)
29
(0.00 %)
402
(100.00 %)
123,352
(2.30 %)
36,616
(6.05 %)
2,431,238
(41.04 %)
2
(0.00 %)
86,654
(3.36 %)
8,442
(2.49 %)
4,829
(1.03 %)
257 large tree shrew (BS70 2019 Broad)
GCA_004365275.1
n/a n/a 26,266
(0.71 %)
59,868
(0.81 %)
n/a 42.00
(99.77 %)
6,466
(0.02 %)
6,466
(0.02 %)
3,890,086
(99.98 %)
7,163,973
(22.64 %)
1,629,329
(2.64 %)
18,970,992
(42.82 %)
38
(0.00 %)
n/a 138,732
(1.75 %)
77,459
(1.17 %)
258 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2
62,576
(3.50 %)
n/a 14,610
(1.03 %)
16,359
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
0
(0 %)
667
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,637,236
(15.13 %)
304,730
(1.14 %)
11,121,967
(34.21 %)
3
(0.00 %)
670,755
(2.51 %)
35,485
(1.36 %)
19,615
(0.51 %)
259 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1
n/a n/a 14,572
(1.03 %)
16,165
(1.42 %)
n/a 43.36
(99.74 %)
0
(0 %)
558
(0.26 %)
55
(100.00 %)
1,631,923
(15.09 %)
303,440
(1.14 %)
11,122,938
(34.12 %)
1
(0.00 %)
664,235
(2.49 %)
35,505
(1.37 %)
19,641
(0.51 %)
260 leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019)
GCA_009762595.1
n/a n/a 10,857
(1.01 %)
15,585
(1.46 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,982
(100.00 %)
1,090,219
(15.03 %)
206,192
(1.19 %)
7,154,939
(33.03 %)
0
(0 %)
432,559
(2.40 %)
25,155
(1.42 %)
14,585
(0.57 %)
261 Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002875.2
n/a 8,389
(48.67 %)
591
(1.09 %)
4,193
(46.51 %)
n/a 59.58
(99.94 %)
0
(0 %)
454
(0.06 %)
76
(100.00 %)
24,390
(4.61 %)
4,228
(1.93 %)
243,087
(20.97 %)
1
(0.00 %)
5,939
(3.84 %)
92
(99.40 %)
72
(0.21 %)
262 Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002725.2
n/a 8,731
(48.79 %)
626
(1.15 %)
4,290
(46.53 %)
n/a 59.72
(100.00 %)
7
(0.00 %)
7
(0.00 %)
43
(100.00 %)
33,021
(5.20 %)
8,477
(2.43 %)
238,932
(20.91 %)
0
(0 %)
6,726
(4.51 %)
41
(99.80 %)
27
(0.06 %)
263 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1
n/a n/a 18,874
(1.62 %)
21,014
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
214,953
(3.85 %)
265,329
(96.15 %)
5,246,283
(42.87 %)
1,059,443
(5.13 %)
14,265,514
(32.20 %)
28,667
(1.17 %)
525,709
(5.63 %)
77,000
(2.45 %)
66,922
(1.91 %)
264 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1
n/a n/a 19,393
(1.38 %)
20,311
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
326,464
(12.87 %)
337,359
(87.13 %)
6,205,858
(38.76 %)
832,823
(1.53 %)
13,661,563
(33.98 %)
2,666
(0.03 %)
430,190
(1.14 %)
26,669
(0.59 %)
23,227
(0.47 %)
265 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1
47,420
(5.64 %)
n/a 13,097
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
0
(0 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,498
(5.58 %)
210,236
(1.26 %)
7,133,927
(19.19 %)
1
(0.00 %)
132,959
(0.79 %)
27,558
(2.21 %)
21,862
(1.03 %)
266 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028389875.1
n/a n/a 13,358
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
0
(0 %)
128
(0.11 %)
179
(100.00 %)
674,141
(6.73 %)
329,122
(5.34 %)
6,820,211
(22.78 %)
1
(0.00 %)
266,226
(1.85 %)
45,073
(5.83 %)
38,575
(2.59 %)
267 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579695.1
n/a n/a 15,841
(0.90 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
5,905,868
(49.76 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
15,646
(0.27 %)
268 lettuce (Salinas v7 2018)
GCF_002870075.1
60,760
(2.83 %)
n/a 16,272
(0.65 %)
109,234
(6.86 %)
n/a 37.79
(92.71 %)
0
(0 %)
350,251
(7.33 %)
11,453
(100.00 %)
946,986
(1.96 %)
983,572
(3.65 %)
12,334,735
(53.11 %)
2,244
(0.09 %)
1,823,579
(9.42 %)
117,678
(2.02 %)
19,900
(0.28 %)
269 lettuce (Salinas v8 2020)
GCF_002870075.3
64,708
(2.94 %)
n/a 16,252
(0.65 %)
101,828
(6.36 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
3,138
(0.29 %)
351,533
(7.59 %)
9,960
(99.71 %)
945,052
(1.95 %)
983,641
(3.64 %)
12,325,371
(53.00 %)
2,249
(0.09 %)
n/a 117,703
(2.02 %)
19,916
(0.28 %)
270 live sharksucker (v1 2019)
GCF_900963305.1
40,255
(11.91 %)
n/a 14,975
(3.53 %)
22,304
(7.09 %)
56,266
(9.51 %)
41.43
(99.89 %)
0
(0 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
448,828
(3.61 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,476
(21.79 %)
0
(0 %)
109,664
(1.83 %)
16,807
(1.33 %)
12,095
(0.89 %)
271 lumpfish (2019 genbank)
GCA_009769545.1
n/a n/a 14,748
(3.32 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
0
(0 %)
347
(1.78 %)
49
(100.00 %)
478,416
(6.02 %)
421,634
(11.07 %)
2,928,668
(27.98 %)
1
(0.00 %)
655,785
(6.31 %)
53,323
(5.09 %)
32,724
(2.40 %)
272 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2
n/a n/a 21,084
(1.92 %)
22,287
(1.31 %)
n/a 40.74
(94.86 %)
83,929
(5.15 %)
83,929
(5.15 %)
112,850
(94.85 %)
5,109,404
(47.71 %)
734,754
(2.02 %)
15,854,134
(33.62 %)
2,334
(0.15 %)
767,102
(3.42 %)
36,070
(0.90 %)
31,862
(0.80 %)
273 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1
n/a n/a 19,449
(1.56 %)
24,645
(1.37 %)
41,235
(1.95 %)
40.78
(92.27 %)
0
(0 %)
984,656
(7.81 %)
80,669
(100.00 %)
3,063,619
(35.20 %)
866,306
(3.08 %)
13,310,826
(28.76 %)
389,500
(1.56 %)
884,201
(3.10 %)
35,558
(0.84 %)
33,754
(0.78 %)
274 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1
29,549
(16.44 %)
n/a 15,120
(6.45 %)
49,515
(30.69 %)
n/a 40.48
(93.32 %)
20,693
(6.71 %)
20,693
(6.71 %)
23,184
(93.29 %)
115,049
(2.29 %)
51,516
(1.90 %)
1,488,940
(24.12 %)
25
(0.03 %)
35,840
(1.56 %)
42,077
(12.05 %)
32,193
(7.48 %)
275 mangrove rivulus
GCF_001649575.1
45,306
(11.02 %)
n/a 14,510
(2.84 %)
29,750
(6.81 %)
n/a 40.03
(94.35 %)
0
(0 %)
29,388
(5.66 %)
3,073
(100.00 %)
345,930
(2.32 %)
146,268
(1.33 %)
4,717,260
(27.31 %)
231
(0.09 %)
62,480
(1.04 %)
39,557
(2.69 %)
29,549
(1.76 %)
276 meadow brown (genbank 2021)
GCA_905333055.1
n/a n/a 4,863
(1.16 %)
19,812
(6.60 %)
27,763
(8.31 %)
36.96
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
32
(100.00 %)
227,482
(2.41 %)
107,773
(3.02 %)
2,456,144
(43.97 %)
0
(0 %)
297,573
(6.20 %)
24,873
(3.15 %)
12,170
(1.54 %)
277 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1
n/a n/a 21,726
(1.54 %)
31,908
(1.39 %)
n/a 41.89
(99.96 %)
4,153
(0.02 %)
4,153
(0.02 %)
354,021
(99.98 %)
4,835,157
(40.73 %)
693,037
(1.32 %)
13,779,279
(33.49 %)
21
(0.00 %)
224,239
(0.53 %)
76,740
(2.37 %)
72,844
(2.03 %)
278 meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank)
GCA_006229205.1
n/a n/a 19,020
(1.63 %)
19,812
(1.43 %)
42,441
(2.08 %)
41.68
(99.72 %)
0
(0 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,552,310
(40.02 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
5,134
(0.09 %)
236,044
(0.75 %)
64,849
(2.13 %)
63,058
(1.88 %)
279 melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014)
GCF_000806345.1
26,008
(10.49 %)
n/a 7,743
(3.09 %)
12,206
(6.18 %)
n/a 35.15
(84.42 %)
37,430
(15.62 %)
37,430
(15.62 %)
43,002
(84.38 %)
237,943
(3.36 %)
74,977
(1.26 %)
2,410,203
(31.96 %)
376
(0.08 %)
35,789
(1.03 %)
15,259
(2.01 %)
8,482
(1.01 %)
280 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1
n/a n/a 19,298
(1.81 %)
18,661
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
173,296
(5.96 %)
184,071
(94.04 %)
4,041,828
(42.24 %)
573,950
(1.48 %)
13,504,295
(30.96 %)
211
(0.02 %)
317,691
(1.50 %)
65,448
(1.38 %)
46,041
(1.09 %)
281 minke whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987535.1
n/a n/a 19,544
(1.49 %)
21,502
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
0
(0 %)
1,177
(0.01 %)
1,375
(100.00 %)
4,006,932
(35.92 %)
1,058,106
(12.08 %)
12,708,154
(42.66 %)
4
(0.00 %)
1,500,515
(4.32 %)
72,756
(1.59 %)
44,094
(1.06 %)
282 mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017)
GCF_002532875.1
35,332
(12.83 %)
n/a 2,750
(0.61 %)
29,731
(8.07 %)
n/a 40.94
(99.89 %)
3,360
(0.11 %)
3,360
(0.11 %)
8,241
(99.89 %)
115,140
(1.18 %)
39,880
(0.71 %)
1,832,298
(14.55 %)
37
(0.00 %)
12,922
(0.23 %)
31,479
(5.12 %)
28,744
(3.52 %)
283 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1
n/a n/a 21,302
(1.57 %)
27,162
(1.27 %)
40,982
(1.78 %)
41.88
(99.90 %)
11,139
(0.04 %)
11,139
(0.04 %)
796,326
(99.96 %)
5,253,752
(39.29 %)
1,211,658
(3.13 %)
13,894,596
(38.35 %)
15
(0.00 %)
n/a 24,829
(0.69 %)
23,158
(0.63 %)
284 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank)
GCA_019393635.1
n/a n/a 18,428
(0.81 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
0
(0 %)
260
(0.09 %)
18
(100.00 %)
7,426,369
(29.77 %)
1,249,638
(2.12 %)
21,135,395
(42.80 %)
0
(0 %)
1,546,316
(2.55 %)
16,598
(0.36 %)
13,911
(0.23 %)
285 moth S.litura (Ishihara v1 2017)
GCF_002706865.1
25,114
(8.87 %)
n/a 5,088
(1.13 %)
22,625
(7.19 %)
n/a 36.56
(97.52 %)
10,662
(2.49 %)
10,662
(2.49 %)
13,637
(97.51 %)
154,017
(1.49 %)
50,642
(0.97 %)
2,919,487
(37.00 %)
96
(0.06 %)
122,138
(2.50 %)
34,396
(3.66 %)
10,482
(1.09 %)
286 mung bean (VC1973A 2015 genbank)
GCA_000741045.2
n/a n/a 16,645
(3.88 %)
43,866
(14.64 %)
n/a 33.16
(92.79 %)
0
(0 %)
96,870
(7.25 %)
2,463
(100.00 %)
265,072
(3.32 %)
198,918
(3.34 %)
2,840,410
(34.89 %)
1,607
(0.24 %)
171,012
(3.42 %)
13,926
(1.48 %)
11,027
(1.18 %)
287 mute swan (bCygOlo1 v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1
n/a n/a 12,973
(1.97 %)
22,300
(2.18 %)
n/a 41.92
(99.06 %)
0
(0 %)
446
(0.94 %)
181
(100.00 %)
688,720
(7.65 %)
301,358
(1.34 %)
6,775,217
(21.21 %)
1
(0.00 %)
78,646
(0.75 %)
31,271
(3.60 %)
29,996
(2.02 %)
288 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1
n/a n/a 10,083
(1.97 %)
18,350
(2.23 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
5,616
(100.00 %)
485,827
(7.06 %)
212,892
(1.28 %)
4,756,962
(19.95 %)
0
(0 %)
53,808
(0.72 %)
25,670
(3.87 %)
24,319
(2.23 %)
289 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1
n/a n/a 21,317
(1.73 %)
20,856
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
110,424
(11.59 %)
114,652
(88.41 %)
4,162,977
(32.77 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,503
(27.63 %)
595
(0.01 %)
103,053
(0.44 %)
31,950
(0.88 %)
31,054
(0.81 %)
290 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1
n/a n/a 21,418
(1.52 %)
34,189
(1.28 %)
n/a 41.35
(99.92 %)
8,600
(0.03 %)
8,600
(0.03 %)
653,473
(99.97 %)
4,512,168
(44.82 %)
592,047
(1.17 %)
13,009,453
(37.18 %)
92
(0.00 %)
n/a 63,033
(1.47 %)
45,747
(1.19 %)
291 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579445.1
n/a n/a 12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
0
(0 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
5
(0.00 %)
478,923
(3.35 %)
31,693
(3.88 %)
22,817
(1.16 %)
292 nematode C.briggsae (AF16 v1 2008)
GCF_000004555.1
19,404
(22.65 %)
n/a 12,088
(12.63 %)
7,533
(12.85 %)
n/a 37.35
(97.22 %)
595
(0.05 %)
6,713
(2.80 %)
607
(99.95 %)
116,909
(19.60 %)
45,475
(4.23 %)
820,686
(35.42 %)
82
(0.06 %)
36,018
(3.86 %)
4,887
(1.65 %)
2,967
(0.93 %)
293 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2
36,251
(5.66 %)
n/a 10,150
(1.34 %)
42,117
(8.90 %)
n/a 37.47
(94.63 %)
39,556
(5.39 %)
39,556
(5.39 %)
45,302
(94.61 %)
396,916
(3.25 %)
506,716
(6.41 %)
4,768,175
(36.07 %)
384
(0.04 %)
264,746
(2.83 %)
17,009
(0.90 %)
8,756
(0.45 %)
294 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2
n/a n/a 21,293
(1.15 %)
25,302
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,413
(9.13 %)
268,442
(9.13 %)
314,971
(90.87 %)
5,327,246
(49.09 %)
651,311
(1.26 %)
19,267,381
(38.27 %)
239
(0.00 %)
482,244
(1.17 %)
139,552
(2.47 %)
82,520
(1.71 %)
295 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1
46,144
(1.87 %)
n/a 21,316
(1.15 %)
25,308
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,413
(9.13 %)
268,442
(9.13 %)
314,972
(90.87 %)
5,328,146
(49.10 %)
651,316
(1.26 %)
19,267,438
(38.27 %)
239
(0.00 %)
482,246
(1.17 %)
139,552
(2.47 %)
82,520
(1.71 %)
296 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1
n/a n/a 19,541
(1.47 %)
21,516
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
363
(0.17 %)
779
(100.00 %)
1,361,117
(2.23 %)
836,632
(13.12 %)
12,597,969
(44.00 %)
11
(0.00 %)
1,395,565
(3.89 %)
93,862
(1.92 %)
40,806
(0.95 %)
297 northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021)
GCF_021288785.1
49,934
(2.73 %)
n/a 20,106
(1.74 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
0
(0 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,434,732
(35.01 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
2,726
(0.09 %)
n/a 52,064
(1.59 %)
49,212
(1.43 %)
298 northern house mosquito (v1 TS 2021)
GCF_016801865.1
28,512
(7.14 %)
n/a 5,830
(1.09 %)
39,806
(8.27 %)
n/a 36.76
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,714
(100.00 %)
222,294
(5.58 %)
187,561
(9.87 %)
3,009,613
(56.49 %)
0
(0 %)
397,617
(5.35 %)
63,009
(9.78 %)
42,868
(6.50 %)
299 northern pike (2020 genbank)
GCA_011004845.1
n/a n/a 16,616
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,918
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
0
(0 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
1,039,521
(30.93 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,094
(32.91 %)
1
(0.00 %)
602,569
(4.43 %)
42,910
(2.52 %)
22,099
(1.02 %)
300 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3
n/a n/a 20,134
(1.89 %)
18,568
(1.14 %)
n/a 40.76
(93.09 %)
180,468
(6.94 %)
180,468
(6.94 %)
197,908
(93.06 %)
5,169,984
(51.90 %)
831,865
(4.16 %)
15,243,657
(35.77 %)
861
(0.05 %)
1,641,885
(4.15 %)
65,761
(1.00 %)
25,432
(0.56 %)
301 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2
n/a 37
(0.00 %)
21,523
(1.86 %)
19,627
(1.36 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
4,895,563
(44.53 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
4
(0.00 %)
1,172,090
(3.51 %)
19,244
(0.46 %)
16,092
(0.39 %)
302 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3
84,433
(3.85 %)
n/a 20,317
(1.83 %)
21,239
(1.18 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
55,576
(0.76 %)
58,981
(0.76 %)
118,811
(99.24 %)
5,525,293
(52.79 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,088
(38.71 %)
368
(0.01 %)
1,968,092
(4.25 %)
95,595
(1.41 %)
30,263
(0.74 %)
303 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2
n/a n/a 20,319
(1.82 %)
21,542
(1.19 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
55,576
(0.76 %)
58,981
(0.76 %)
118,810
(99.24 %)
5,524,514
(52.78 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,031
(38.71 %)
368
(0.01 %)
1,968,093
(4.25 %)
95,595
(1.41 %)
30,263
(0.74 %)
304 painted lady (genbank 2021)
GCA_905220365.1
n/a n/a 4,705
(1.06 %)
15,277
(5.00 %)
29,018
(10.11 %)
33.42
(99.99 %)
0
(0 %)
91
(0.01 %)
37
(100.00 %)
209,233
(2.16 %)
56,676
(1.12 %)
3,372,591
(44.40 %)
3
(0.00 %)
131,267
(3.01 %)
13,547
(2.72 %)
8,615
(1.04 %)
305 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1
35,529
(2.39 %)
n/a 18,185
(1.70 %)
20,184
(1.64 %)
41,094
(3.29 %)
42.38
(98.92 %)
0
(0 %)
831
(1.08 %)
141
(100.00 %)
3,072,951
(30.02 %)
385,608
(0.80 %)
12,060,365
(30.47 %)
1
(0.00 %)
173,548
(0.73 %)
64,081
(4.30 %)
66,821
(4.05 %)
306 pea aphid (AL4f v1 2019)
GCF_005508785.1
31,681
(7.81 %)
n/a 4,257
(0.79 %)
16,323
(3.39 %)
n/a 29.76
(92.38 %)
0
(0 %)
46,297
(7.65 %)
21,920
(100.00 %)
768,383
(18.87 %)
135,468
(2.11 %)
4,536,093
(48.39 %)
93
(0.01 %)
158,249
(4.28 %)
16,332
(2.13 %)
13,468
(1.54 %)
307 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1
n/a n/a 13,025
(1.67 %)
24,167
(2.02 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
0
(0 %)
232
(0.31 %)
124
(100.00 %)
586,316
(11.83 %)
335,214
(8.05 %)
7,038,700
(24.65 %)
0
(0 %)
405,444
(2.46 %)
26,085
(2.25 %)
20,023
(0.87 %)
308 pigeon pea (v1 2016 BGI)
GCF_000340665.1
46,646
(9.41 %)
n/a 17,409
(3.12 %)
51,529
(12.74 %)
48,654
(8.33 %)
32.79
(94.21 %)
36,387
(5.81 %)
36,387
(5.81 %)
72,923
(94.19 %)
400,327
(3.60 %)
306,656
(4.69 %)
3,754,630
(39.24 %)
431
(0.18 %)
219,000
(6.77 %)
26,578
(2.89 %)
13,839
(1.14 %)
309 pike-perch
GCF_008315115.1
56,221
(8.23 %)
n/a 15,677
(2.23 %)
29,967
(5.65 %)
62,989
(6.22 %)
40.92
(100.00 %)
0
(0 %)
94
(0.00 %)
1,313
(100.00 %)
591,660
(5.05 %)
569,876
(7.39 %)
4,713,605
(36.32 %)
0
(0 %)
788,001
(5.34 %)
39,545
(1.93 %)
12,857
(0.60 %)
310 platypus (Pmale09 2018 BGI)
GCA_002966995.1
n/a n/a 15,042
(1.17 %)
19,939
(1.55 %)
n/a 46.64
(100.00 %)
0
(0 %)
476
(0.00 %)
4,568
(100.00 %)
5,326,862
(52.88 %)
879,598
(5.00 %)
9,545,961
(50.95 %)
3
(0.00 %)
1,781,446
(5.23 %)
94,468
(9.28 %)
81,476
(3.15 %)
311 platypus (Pmale09 v1 2019)
GCF_004115215.1
56,708
(3.09 %)
n/a 14,805
(1.26 %)
18,918
(1.63 %)
42,516
(2.60 %)
46.13
(99.18 %)
0
(0 %)
522
(0.82 %)
305
(100.00 %)
5,099,803
(51.62 %)
577,434
(2.88 %)
9,110,403
(48.91 %)
0
(0 %)
1,127,318
(3.58 %)
87,829
(7.91 %)
74,084
(2.86 %)
312 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3
n/a n/a 14,805
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
0
(0 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,101,303
(51.62 %)
578,617
(2.89 %)
9,113,847
(48.93 %)
0
(0 %)
1,130,252
(3.59 %)
87,861
(7.92 %)
74,107
(2.86 %)
313 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1
n/a n/a 18,495
(1.67 %)
15,243
(1.37 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
110,343
(1.67 %)
134,161
(98.33 %)
4,221,025
(40.96 %)
553,193
(1.29 %)
13,765,526
(29.91 %)
205
(0.03 %)
311,409
(1.04 %)
54,906
(1.17 %)
47,465
(0.98 %)
314 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1
n/a n/a 14,654
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
0
(0 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,311,131
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
3
(0.00 %)
1,623,656
(7.33 %)
172,199
(5.45 %)
18,080
(0.31 %)
315 pronghorn (BS35 2019 Broad)
GCA_004027515.1
n/a n/a 24,094
(1.34 %)
35,119
(1.27 %)
n/a 41.97
(99.87 %)
6,569
(0.02 %)
6,569
(0.02 %)
1,649,700
(99.98 %)
5,613,563
(41.47 %)
652,408
(1.55 %)
13,943,055
(43.64 %)
21
(0.00 %)
n/a 61,057
(1.17 %)
39,599
(0.79 %)
316 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1
n/a n/a 19,564
(1.68 %)
22,124
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
80,963
(0.88 %)
134,059
(99.12 %)
3,917,534
(41.44 %)
435,606
(1.73 %)
14,738,354
(28.36 %)
39
(0.00 %)
276,230
(1.12 %)
40,752
(0.94 %)
35,911
(0.79 %)
317 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1
n/a n/a 17,665
(1.56 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
0
(0 %)
178,992
(4.69 %)
2,174
(100.00 %)
4,884,619
(42.70 %)
833,136
(1.76 %)
13,705,706
(31.28 %)
2,166
(0.06 %)
494,972
(1.78 %)
58,912
(1.65 %)
50,363
(1.31 %)
318 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2
n/a 26
(0.00 %)
19,951
(1.94 %)
19,039
(1.18 %)
n/a 40.74
(82.95 %)
111,087
(17.06 %)
156,797
(17.06 %)
121,337
(82.94 %)
5,136,492
(50.91 %)
775,493
(1.63 %)
15,570,612
(30.28 %)
70
(0.03 %)
729,770
(1.34 %)
43,049
(0.71 %)
26,732
(0.52 %)
319 pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023)
GCF_029289425.1
84,858
(3.73 %)
n/a 20,765
(1.73 %)
22,666
(1.18 %)
n/a 40.49
(99.96 %)
0
(0 %)
8
(0.04 %)
443
(100.00 %)
5,487,575
(50.65 %)
1,054,555
(12.79 %)
15,952,698
(43.80 %)
0
(0 %)
3,830,835
(6.42 %)
53,329
(1.37 %)
27,996
(0.60 %)
320 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank)
GCA_026419965.1
n/a n/a 18,495
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
0
(0 %)
143
(0.19 %)
580
(100.00 %)
3,817,653
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,926
(39.96 %)
0
(0 %)
1,197,918
(3.53 %)
101,353
(2.90 %)
50,216
(1.47 %)
321 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank)
GCA_009806435.2
n/a n/a 19,480
(1.31 %)
23,335
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
0
(0 %)
18,178
(2.32 %)
3,159
(100.00 %)
4,179,975
(0.00 %)
976,271
(2.33 %)
13,766,353
(39.76 %)
85
(0.00 %)
1,275,666
(3.04 %)
113,370
(2.46 %)
70,869
(1.75 %)
322 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1
n/a n/a 18,676
(1.38 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,884,561
(44.65 %)
883,943
(1.73 %)
13,254,559
(38.27 %)
12
(0.00 %)
1,022,805
(2.55 %)
110,338
(2.33 %)
68,466
(1.73 %)
323 radish (v1 WS10039 2015)
GCF_000801105.1
69,943
(20.66 %)
n/a 33,762
(10.20 %)
70,765
(28.80 %)
n/a 35.29
(87.22 %)
0
(0 %)
28,041
(12.80 %)
10,676
(100.00 %)
196,483
(2.53 %)
150,132
(3.32 %)
2,256,858
(26.65 %)
148
(0.08 %)
181,090
(8.85 %)
23,381
(2.80 %)
18,811
(2.08 %)
324 red admiral (genbank 2021)
GCA_905147765.2
n/a n/a 4,641
(1.20 %)
13,258
(4.79 %)
32,725
(10.42 %)
32.84
(100.00 %)
0
(0 %)
18
(0.00 %)
142
(100.00 %)
184,094
(2.52 %)
41,639
(1.23 %)
3,193,736
(41.82 %)
0
(0 %)
59,270
(1.97 %)
10,747
(2.25 %)
7,305
(0.97 %)
325 red-crested turaco (2014 BGI)
GCF_000709365.1
16,151
(2.15 %)
n/a 12,046
(1.50 %)
25,077
(1.98 %)
n/a 41.63
(99.43 %)
75,085
(0.59 %)
75,085
(0.59 %)
134,672
(99.41 %)
401,465
(6.41 %)
153,694
(0.86 %)
6,705,299
(20.45 %)
1
(0.00 %)
58,294
(0.41 %)
30,183
(1.07 %)
25,549
(0.87 %)
326 red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI)
GCF_000690535.1
16,238
(2.21 %)
n/a 12,016
(1.53 %)
23,985
(1.93 %)
n/a 41.20
(99.63 %)
59,230
(0.38 %)
59,230
(0.38 %)
112,704
(99.62 %)
322,026
(4.02 %)
121,725
(0.68 %)
6,797,850
(18.25 %)
4
(0.00 %)
20,461
(0.20 %)
18,873
(0.62 %)
16,327
(0.52 %)
327 red mason bee (LIB18336 2019)
GCF_004153925.1
26,926
(16.13 %)
n/a 4,185
(2.08 %)
24,859
(11.07 %)
n/a 39.77
(99.98 %)
0
(0 %)
2,089
(0.02 %)
10,222
(100.00 %)
88,278
(1.96 %)
74,016
(3.78 %)
1,305,254
(28.61 %)
137
(0.02 %)
68,133
(2.01 %)
10,712
(6.90 %)
7,940
(2.34 %)
328 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1
n/a n/a 13,218
(1.71 %)
28,120
(2.39 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
9
(0.00 %)
249
(0.00 %)
1,195
(100.00 %)
544,427
(8.81 %)
223,674
(5.77 %)
6,669,469
(23.63 %)
3
(0.00 %)
398,605
(2.64 %)
38,306
(3.37 %)
35,069
(1.78 %)
329 reedfish (2019)
GCF_900747795.1
40,545
(1.73 %)
n/a 13,154
(0.46 %)
24,028
(1.29 %)
34,856
(1.34 %)
39.44
(93.75 %)
0
(0 %)
5,614
(6.25 %)
1,885
(100.00 %)
1,834,613
(2.79 %)
1,018,031
(2.36 %)
20,081,632
(44.56 %)
4
(0.00 %)
1,039,686
(2.44 %)
88,254
(1.06 %)
22,510
(0.28 %)
330 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3
n/a n/a 20,558
(1.71 %)
22,141
(1.12 %)
n/a 40.95
(97.08 %)
63,767
(2.91 %)
64,538
(2.91 %)
348,579
(97.09 %)
5,846,699
(54.61 %)
1,429,378
(9.24 %)
16,512,587
(40.26 %)
80
(0.01 %)
2,975,593
(6.12 %)
98,572
(1.29 %)
30,558
(0.68 %)
331 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1
n/a n/a 19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
0
(0 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
4
(0.00 %)
1,071,329
(3.37 %)
73,126
(1.69 %)
43,865
(1.11 %)
332 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1
16,166
(2.37 %)
n/a 12,054
(1.65 %)
23,851
(2.04 %)
n/a 41.63
(99.55 %)
66,437
(0.46 %)
66,437
(0.46 %)
120,312
(99.54 %)
392,481
(7.69 %)
217,040
(2.27 %)
5,855,355
(18.33 %)
5
(0.00 %)
69,222
(0.63 %)
7,602
(0.24 %)
5,949
(0.18 %)
333 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1
n/a n/a 21,125
(1.90 %)
29,864
(1.51 %)
65,909
(1.91 %)
41.13
(99.93 %)
4,599
(0.02 %)
4,599
(0.02 %)
580,026
(99.98 %)
3,840,645
(39.25 %)
675,921
(1.83 %)
13,841,750
(31.45 %)
17
(0.00 %)
304,327
(0.71 %)
59,440
(1.72 %)
54,385
(1.53 %)
334 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1
25,353
(3.88 %)
n/a 14,334
(1.56 %)
58,475
(4.46 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
0
(0 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
642,988
(3.38 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
7,501
(0.17 %)
424,697
(2.96 %)
52,308
(2.11 %)
22,130
(0.71 %)
335 river trout (v1 2019)
GCF_901001165.1
102,772
(6.02 %)
n/a 27,413
(1.62 %)
51,424
(4.17 %)
121,979
(5.28 %)
43.36
(96.90 %)
0
(0 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
1,438,988
(5.72 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,761
(52.37 %)
2
(0.00 %)
3,428,195
(8.64 %)
70,821
(1.77 %)
18,627
(0.33 %)
336 rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank)
GCA_023343835.1
n/a n/a 12,831
(2.31 %)
n/a n/a 41.57
(99.99 %)
0
(0 %)
210
(0.01 %)
164
(100.00 %)
667,924
(11.59 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,274
(21.73 %)
0
(0 %)
216,565
(1.89 %)
21,346
(2.37 %)
19,067
(1.48 %)
337 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2
n/a n/a 21,304
(2.26 %)
18,211
(1.40 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
27,758
(7.29 %)
306,650
(10.98 %)
30,919
(92.71 %)
4,878,260
(40.08 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,226
(27.49 %)
6,570
(0.06 %)
398,071
(1.12 %)
16,050
(0.44 %)
15,502
(0.41 %)
338 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1
53,855
(2.85 %)
49,148
(2.43 %)
21,291
(2.26 %)
19,256
(1.49 %)
96,713
(4.05 %)
41.70
(89.05 %)
27,758
(7.29 %)
306,650
(10.98 %)
30,920
(92.71 %)
4,749,528
(39.06 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,297
(27.49 %)
6,570
(0.06 %)
398,071
(1.12 %)
16,050
(0.44 %)
15,491
(0.41 %)
339 saddleback dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1
n/a n/a 18,625
(1.49 %)
20,451
(1.28 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
0
(0 %)
968
(0.01 %)
631
(100.00 %)
4,020,682
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,818
(42.64 %)
0
(0 %)
1,785,427
(5.07 %)
66,179
(3.91 %)
41,466
(1.03 %)
340 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1
n/a n/a 12,971
(1.67 %)
23,351
(2.02 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
0
(0 %)
258
(0.30 %)
282
(100.00 %)
548,087
(7.21 %)
201,482
(8.55 %)
7,030,761
(24.94 %)
0
(0 %)
469,777
(2.60 %)
31,791
(2.57 %)
20,215
(0.89 %)
341 salmon louse (v1.1 2020)
GCF_016086655.2
27,164
(5.26 %)
n/a 3,465
(0.45 %)
3,673
(1.75 %)
n/a 30.90
(99.99 %)
603
(0.01 %)
608
(0.01 %)
10,436
(99.99 %)
1,394,872
(53.53 %)
76,419
(1.13 %)
6,311,228
(43.85 %)
0
(0 %)
80,432
(1.10 %)
647
(0.04 %)
374
(0.03 %)
342 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887145.1
n/a n/a 12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
0
(0 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
1
(0.00 %)
651,029
(4.07 %)
35,549
(5.05 %)
23,802
(1.15 %)
343 Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank)
GCA_029499605.1
n/a n/a 13,961
(0.46 %)
36,603
(1.55 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
0
(0 %)
2,297
(0.01 %)
3,475
(100.00 %)
1,903,658
(2.85 %)
2,970,695
(16.56 %)
15,354,615
(64.31 %)
20
(0.00 %)
n/a 652,708
(8.36 %)
43,665
(0.45 %)
344 SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19)
GCF_009858895.2
n/a 13
(97.85 %)
n/a n/a n/a 37.98
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.24 %)
1
(0.11 %)
33
(1.38 %)
0
(0 %)
0
(0.00 %)
1
(0.73 %)
1
(0.73 %)
345 sea anemones (CC7 2015 genbank)
GCA_001417965.1
n/a 26,042
(31.72 %)
3,020
(1.06 %)
13,146
(12.99 %)
30,497
(24.04 %)
36.33
(82.34 %)
0
(0 %)
637,478
(17.95 %)
4,312
(100.00 %)
74,671
(1.98 %)
63,328
(2.24 %)
1,417,036
(20.33 %)
493
(0.38 %)
82,695
(5.22 %)
2,099
(0.38 %)
1,309
(0.28 %)
346 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2
n/a n/a 18,591
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
34,142
(1.77 %)
41.56
(98.79 %)
22,821
(1.21 %)
23,134
(1.21 %)
29,588
(98.79 %)
4,702,292
(41.42 %)
721,749
(1.39 %)
14,065,592
(32.89 %)
1,203
(0.02 %)
504,215
(2.00 %)
55,388
(1.87 %)
53,466
(1.67 %)
347 segmented worms (v1 2012)
GCF_000326865.1
23,426
(13.46 %)
n/a 2,741
(0.95 %)
3,156
(4.19 %)
n/a 32.82
(91.54 %)
10,301
(8.47 %)
11,185
(8.47 %)
12,292
(91.53 %)
572,062
(30.90 %)
474,390
(10.49 %)
1,741,644
(44.75 %)
9
(0.01 %)
91,780
(2.82 %)
3,489
(0.51 %)
1,342
(0.18 %)
348 siamang (v1 Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1
79,118
(2.62 %)
n/a 20,139
(1.70 %)
21,232
(1.14 %)
n/a 40.62
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
606
(100.00 %)
5,278,880
(55.89 %)
946,219
(14.68 %)
14,395,605
(46.26 %)
0
(0 %)
2,376,584
(4.99 %)
95,573
(1.75 %)
30,053
(0.74 %)
349 Siamese fighting fish (v2 2019)
GCF_900634795.2
54,389
(16.95 %)
n/a 14,745
(4.21 %)
34,348
(10.09 %)
62,673
(13.02 %)
45.30
(99.99 %)
0
(0 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
252,955
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
0
(0 %)
232,426
(4.41 %)
72,126
(13.08 %)
55,959
(7.25 %)
350 Siamese fighting fish (v3 2020)
GCF_900634795.3
54,864
(17.78 %)
n/a 14,745
(4.20 %)
56,808
(10.87 %)
69,466
(16.34 %)
45.30
(99.99 %)
0
(0 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
255,550
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
0
(0 %)
232,435
(4.41 %)
72,126
(13.08 %)
55,959
(7.25 %)
351 silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.1
54,238
(2.74 %)
n/a 17,887
(2.00 %)
18,517
(1.25 %)
n/a 41.17
(98.20 %)
0
(0 %)
18,567
(1.80 %)
18,392
(100.00 %)
4,399,357
(50.55 %)
711,948
(2.37 %)
12,623,705
(36.55 %)
554
(0.02 %)
851,081
(2.16 %)
67,835
(1.30 %)
23,062
(0.73 %)
352 silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.2
63,475
(2.65 %)
n/a 20,581
(1.94 %)
21,181
(1.20 %)
41,252
(1.46 %)
41.02
(97.81 %)
0
(0 %)
25,106
(2.19 %)
18,395
(100.00 %)
5,332,131
(51.09 %)
857,562
(2.26 %)
15,565,289
(36.84 %)
736
(0.02 %)
997,772
(2.11 %)
80,124
(1.26 %)
26,690
(0.70 %)
353 slow loris (BS32 2019)
GCA_004027815.1
n/a n/a 26,771
(1.11 %)
44,247
(1.00 %)
n/a 40.68
(99.86 %)
9,648
(0.03 %)
9,648
(0.03 %)
1,946,791
(99.97 %)
6,230,312
(41.68 %)
688,924
(1.23 %)
16,892,392
(43.00 %)
103
(0.00 %)
n/a 39,326
(0.65 %)
24,515
(0.47 %)
354 slow loris (primary hap 2022 genbank)
GCA_027406575.1
n/a n/a 22,195
(1.49 %)
21,341
(1.28 %)
n/a 40.82
(99.86 %)
0
(0 %)
218
(0.14 %)
85
(100.00 %)
4,625,875
(39.88 %)
579,984
(1.59 %)
14,405,402
(40.78 %)
2
(0.00 %)
991,314
(2.40 %)
38,257
(0.77 %)
22,955
(0.54 %)
355 small Madagascar hedgehog
GCA_000313985.1
n/a n/a 19,066
(1.18 %)
19,334
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.44 %)
269,444
(11.60 %)
269,444
(11.60 %)
277,845
(88.40 %)
3,789,866
(28.89 %)
429,318
(0.87 %)
16,950,647
(32.23 %)
3,871
(0.06 %)
189,446
(0.64 %)
39,994
(0.70 %)
32,202
(0.55 %)
356 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1
55,762
(1.62 %)
n/a 12,597
(0.36 %)
23,987
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
0
(0 %)
7,146
(1.52 %)
646
(100.00 %)
1,185,832
(1.72 %)
1,448,620
(6.25 %)
20,884,767
(51.41 %)
10
(0.00 %)
3,334,926
(4.99 %)
456,658
(8.18 %)
31,096
(0.32 %)
357 smalltooth sawfish (2019 genbank)
GCA_009764475.1
n/a n/a 11,828
(0.66 %)
18,627
(1.55 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
0
(0 %)
698
(0.91 %)
173
(100.00 %)
405,021
(1.14 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,302
(38.19 %)
0
(0 %)
471,290
(1.50 %)
45,398
(1.34 %)
18,572
(0.38 %)
358 snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016)
GCF_001687245.1
37,836
(4.45 %)
n/a 10,526
(1.07 %)
59,331
(6.34 %)
n/a 36.53
(93.84 %)
52,913
(6.17 %)
227,684
(6.18 %)
139,583
(93.83 %)
653,914
(2.87 %)
386,956
(5.71 %)
7,364,314
(43.00 %)
22,478
(0.98 %)
443,424
(7.26 %)
60,636
(4.05 %)
36,565
(2.36 %)
359 sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019)
GCF_006149115.1
76,167
(6.12 %)
n/a 24,114
(1.71 %)
51,371
(4.08 %)
102,891
(5.24 %)
43.39
(96.16 %)
1,903
(0.01 %)
25,659
(3.84 %)
38,027
(99.99 %)
1,300,179
(8.96 %)
1,465,690
(10.81 %)
8,849,714
(48.44 %)
872
(0.04 %)
1,716,006
(5.17 %)
64,215
(1.55 %)
18,038
(0.45 %)
360 southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank)
GCA_910596095.1
n/a n/a 15,695
(2.61 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
95
(0.00 %)
58
(100.00 %)
1,591,314
(33.50 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,850
(26.85 %)
0
(0 %)
326,259
(3.37 %)
14,097
(0.88 %)
9,797
(0.48 %)
361 southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad)
GCA_004026725.1
n/a n/a 24,302
(1.12 %)
43,055
(0.98 %)
n/a 41.63
(99.82 %)
10,550
(0.03 %)
10,550
(0.03 %)
2,272,285
(99.97 %)
5,668,964
(24.75 %)
1,628,683
(5.38 %)
15,658,806
(41.85 %)
67
(0.00 %)
n/a 21,801
(0.44 %)
18,380
(0.34 %)
362 southern tamandua (Broad 2019)
GCA_004025105.1
n/a n/a 25,638
(0.82 %)
49,782
(0.86 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
5,819
(0.02 %)
5,819
(0.02 %)
2,150,023
(99.98 %)
6,033,640
(37.10 %)
708,890
(0.99 %)
22,371,532
(41.88 %)
62
(0.00 %)
n/a 80,897
(1.09 %)
48,136
(0.70 %)
363 southern two-toed sloth (US054 2019 Broad)
GCA_004027855.1
n/a n/a 25,877
(0.78 %)
56,071
(0.82 %)
n/a 39.82
(99.84 %)
5,099
(0.02 %)
5,099
(0.02 %)
2,537,432
(99.98 %)
5,384,587
(37.86 %)
724,925
(2.20 %)
19,492,096
(41.12 %)
63
(0.00 %)
n/a 55,674
(0.90 %)
46,833
(0.74 %)
364 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1
n/a n/a 18,551
(1.79 %)
19,747
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
54,737
(3.96 %)
57,823
(96.04 %)
3,824,807
(39.33 %)
421,693
(0.97 %)
14,765,476
(28.93 %)
1,818
(0.02 %)
184,274
(0.57 %)
36,281
(1.02 %)
34,129
(0.92 %)
365 soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010)
GCF_000004515.4
82,440
(9.65 %)
n/a 27,682
(3.07 %)
77,218
(11.84 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,955
(2.35 %)
15,955
(2.35 %)
17,146
(97.65 %)
834,646
(37.35 %)
436,219
(5.65 %)
5,341,660
(45.30 %)
54
(0.01 %)
659,519
(6.22 %)
35,897
(1.56 %)
13,140
(0.58 %)
366 soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018)
GCF_000004515.5
85,123
(9.72 %)
n/a 27,647
(3.06 %)
77,190
(11.83 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,995
(2.36 %)
15,995
(2.36 %)
17,187
(97.64 %)
834,651
(37.35 %)
436,225
(5.65 %)
5,341,721
(45.30 %)
55
(0.01 %)
659,428
(6.22 %)
35,897
(1.47 %)
13,140
(0.58 %)
367 speckled wood butterfly (genbank 2021)
GCA_905163445.1
n/a n/a 4,713
(0.87 %)
17,002
(4.33 %)
29,238
(7.81 %)
35.99
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
71
(100.00 %)
304,077
(2.97 %)
110,835
(4.09 %)
3,704,355
(44.42 %)
1
(0.00 %)
144,758
(2.93 %)
28,108
(2.75 %)
11,566
(0.96 %)
368 sperm whale (SW-GA 2019)
GCF_002837175.2
60,921
(2.59 %)
n/a 19,527
(1.73 %)
25,114
(1.51 %)
n/a 41.39
(95.90 %)
128,928
(4.12 %)
128,928
(4.12 %)
143,605
(95.88 %)
4,365,057
(42.78 %)
694,673
(2.40 %)
13,518,590
(32.76 %)
1,887
(0.17 %)
521,351
(4.50 %)
94,152
(2.52 %)
63,303
(1.97 %)
369 sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF)
GCF_000090795.1
31,248
(25.26 %)
n/a 2,167
(1.08 %)
6,648
(9.22 %)
n/a 35.83
(86.92 %)
14,574
(13.10 %)
14,944
(13.10 %)
27,972
(86.90 %)
108,973
(4.04 %)
70,563
(4.66 %)
881,116
(24.58 %)
109
(0.03 %)
120,772
(5.83 %)
668
(0.62 %)
519
(0.56 %)
370 sterlet (v1 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.1
73,251
(5.76 %)
n/a 24,411
(1.72 %)
39,637
(3.96 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
0
(0 %)
6,283
(0.07 %)
3,404
(100.00 %)
1,269,345
(3.50 %)
1,095,665
(6.81 %)
10,007,602
(39.30 %)
5
(0.00 %)
1,356,511
(6.13 %)
60,475
(1.95 %)
17,954
(0.41 %)
371 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.2
n/a n/a 25,364
(1.76 %)
40,452
(4.10 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
0
(0 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
10
(0.00 %)
1,593,749
(6.87 %)
64,522
(2.85 %)
21,984
(0.89 %)
372 stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017)
GCF_002571385.1
36,135
(16.45 %)
n/a 3,324
(0.70 %)
20,909
(10.93 %)
38,198
(17.00 %)
38.54
(89.50 %)
0
(0 %)
49,077
(10.54 %)
5,688
(100.00 %)
111,077
(1.70 %)
108,732
(2.95 %)
2,009,396
(21.40 %)
206
(0.10 %)
118,773
(3.74 %)
6,012
(0.58 %)
3,703
(0.31 %)
373 striped catfish (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358585.1
n/a n/a 16,035
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
0
(0 %)
236
(0.51 %)
59
(100.00 %)
1,870,238
(37.80 %)
605,571
(6.82 %)
5,059,499
(32.43 %)
2
(0.00 %)
531,388
(4.26 %)
17,919
(1.29 %)
12,796
(0.75 %)
374 Sumatran orangutan (Susie 2018 genbank)
GCA_002880775.3
n/a 160,726
(3.42 %)
20,174
(1.79 %)
20,994
(1.15 %)
47,806
(1.68 %)
40.80
(99.29 %)
553
(0.70 %)
553
(0.70 %)
5,813
(99.30 %)
5,497,148
(54.41 %)
1,048,361
(8.01 %)
15,948,575
(40.68 %)
0
(0 %)
2,413,946
(4.00 %)
39,481
(0.87 %)
26,385
(0.67 %)
375 Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1
98,046
(3.46 %)
n/a 21,162
(1.68 %)
21,714
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.79 %)
59
(0.21 %)
59
(0.21 %)
2,670
(99.79 %)
5,730,768
(55.05 %)
1,175,314
(11.19 %)
16,323,507
(44.05 %)
0
(0 %)
2,553,363
(4.41 %)
55,799
(2.08 %)
39,159
(1.10 %)
376 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1
40,128
(5.45 %)
n/a 13,016
(1.88 %)
24,787
(2.41 %)
30,064
(2.94 %)
42.48
(98.86 %)
0
(0 %)
428
(1.14 %)
161
(100.00 %)
483,978
(5.85 %)
589,859
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
1
(0.00 %)
449,585
(2.41 %)
49,404
(3.53 %)
22,206
(1.16 %)
377 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1
n/a n/a 13,403
(1.85 %)
27,456
(2.48 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
497,374
(5.78 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
0
(0 %)
505,741
(2.66 %)
49,076
(3.54 %)
23,486
(1.21 %)
378 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018845.1
n/a n/a 12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
0
(0 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
1
(0.00 %)
578,723
(3.93 %)
32,064
(3.27 %)
22,996
(1.19 %)
379 Tasmanian devil
GCF_000189315.1
32,527
(1.79 %)
n/a 16,112
(0.84 %)
16,152
(0.94 %)
n/a 36.05
(92.36 %)
201,317
(7.66 %)
201,403
(7.66 %)
237,291
(92.34 %)
6,766,259
(42.85 %)
1,240,681
(2.07 %)
20,998,733
(36.61 %)
17,494
(0.40 %)
351,216
(1.07 %)
23,155
(0.38 %)
21,337
(0.32 %)
380 thale cress (tair10 Columbia 2011)
GCF_000001735.3
54,010
(40.19 %)
n/a 26,552
(34.12 %)
25,867
(35.78 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
0
(0 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
67,353
(16.32 %)
27,063
(2.77 %)
749,020
(22.64 %)
1
(0.00 %)
42,547
(3.36 %)
4,599
(1.63 %)
3,518
(1.15 %)
381 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1
41,886
(2.61 %)
n/a 19,165
(1.70 %)
18,102
(1.44 %)
n/a 39.91
(93.27 %)
141,005
(6.75 %)
141,005
(6.75 %)
153,488
(93.25 %)
4,378,557
(36.61 %)
640,337
(1.64 %)
14,116,066
(27.91 %)
2,964
(0.05 %)
213,421
(0.74 %)
28,321
(0.64 %)
26,464
(0.58 %)
382 thorny skate (CabotCenter1 v1 2020 genbank)
GCA_010909765.1
n/a n/a 11,434
(0.60 %)
26,342
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
0
(0 %)
3,753
(7.46 %)
958
(100.00 %)
866,598
(2.58 %)
1,176,350
(3.79 %)
9,964,083
(52.25 %)
26
(0.00 %)
1,634,657
(4.98 %)
242,676
(4.73 %)
31,030
(0.57 %)
383 thorny skate (CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1
45,969
(2.40 %)
n/a 11,433
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
0
(0 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
865,711
(2.57 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
26
(0.00 %)
1,634,657
(4.98 %)
242,676
(4.73 %)
31,030
(0.57 %)
384 tidepool copepod (San Diego 2019 genbank)
GCA_007210705.1
n/a 15,577
(15.83 %)
3,517
(1.61 %)
18,910
(15.71 %)
n/a 42.18
(97.94 %)
0
(0 %)
14,007
(2.09 %)
459
(100.00 %)
52,042
(1.17 %)
27,065
(1.23 %)
928,666
(18.11 %)
1,035
(0.11 %)
46,898
(3.89 %)
15,823
(5.51 %)
13,041
(4.23 %)
385 tiger tail seahorse (QL1 v1 2016)
GCF_001891065.1
47,041
(13.29 %)
n/a 13,817
(3.76 %)
32,943
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.04 %)
23,101
(6.97 %)
23,101
(6.97 %)
60,478
(93.03 %)
359,724
(3.91 %)
155,380
(3.35 %)
2,811,700
(24.51 %)
111
(0.08 %)
112,479
(5.30 %)
61,685
(7.72 %)
45,970
(4.19 %)
386 tomato (v3.0 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.4
46,015
(6.94 %)
n/a 15,396
(2.15 %)
38,462
(7.56 %)
n/a 34.12
(90.18 %)
0
(0 %)
19,634
(9.83 %)
3,150
(100.00 %)
417,162
(18.21 %)
229,803
(3.18 %)
5,370,478
(35.28 %)
224
(0.02 %)
412,060
(4.40 %)
25,279
(1.28 %)
2,409
(0.12 %)
387 tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020)
GCF_014805625.1
24,334
(8.13 %)
n/a 7,223
(2.32 %)
6,632
(3.62 %)
n/a 33.80
(97.46 %)
0
(0 %)
9,688
(2.55 %)
7,986
(100.00 %)
418,532
(4.76 %)
185,734
(2.26 %)
3,090,742
(35.34 %)
677
(0.08 %)
40,269
(0.93 %)
3,487
(0.58 %)
1,907
(0.28 %)
388 two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_901001135.1
56,617
(1.50 %)
n/a 14,448
(0.38 %)
40,572
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
0
(0 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,263,606
(1.94 %)
2,036,108
(4.34 %)
29,400,958
(44.09 %)
9
(0.01 %)
2,193,249
(3.24 %)
602,912
(6.66 %)
94,935
(0.82 %)
389 Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017)
GCA_002776525.1
n/a n/a 21,053
(1.88 %)
23,024
(1.24 %)
n/a 40.68
(96.59 %)
0
(0 %)
77,615
(3.42 %)
47,644
(100.00 %)
5,478,730
(51.13 %)
969,126
(2.63 %)
16,127,854
(36.40 %)
1,906
(0.05 %)
947,012
(1.94 %)
63,965
(1.04 %)
25,907
(0.65 %)
390 Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018)
GCF_002776525.2
66,965
(2.69 %)
n/a 21,958
(1.85 %)
24,388
(1.22 %)
55,722
(1.95 %)
40.60
(97.10 %)
0
(0 %)
63,620
(2.91 %)
47,449
(100.00 %)
5,699,639
(51.61 %)
1,066,606
(2.87 %)
16,603,622
(37.49 %)
6,170
(0.10 %)
1,075,458
(2.10 %)
71,084
(1.08 %)
26,726
(0.65 %)
391 Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019)
GCF_002776525.3
68,173
(2.68 %)
n/a 21,804
(1.85 %)
23,385
(1.18 %)
n/a 40.60
(97.10 %)
0
(0 %)
64,415
(2.91 %)
46,654
(100.00 %)
5,700,226
(51.61 %)
1,066,759
(2.88 %)
16,603,818
(37.49 %)
6,208
(0.10 %)
1,080,318
(2.10 %)
71,078
(1.08 %)
26,732
(0.65 %)
392 Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019)
GCF_002776525.4
63,704
(2.55 %)
n/a 21,347
(1.86 %)
23,056
(1.19 %)
n/a 40.84
(97.07 %)
0
(0 %)
57,757
(2.93 %)
34,372
(100.00 %)
5,504,117
(51.70 %)
961,351
(2.75 %)
16,208,033
(37.10 %)
4,987
(0.09 %)
1,064,626
(2.10 %)
71,046
(1.10 %)
29,347
(0.68 %)
393 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1
n/a n/a 19,685
(1.25 %)
21,268
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
201,121
(4.83 %)
356,096
(95.17 %)
6,165,270
(34.95 %)
1,197,778
(2.77 %)
16,282,333
(36.21 %)
730
(0.04 %)
592,599
(1.56 %)
22,905
(0.49 %)
18,563
(0.39 %)
394 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1
63,555
(8.16 %)
n/a 16,886
(1.90 %)
72,876
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
0
(0 %)
1,674
(0.23 %)
2,010
(100.00 %)
800,389
(3.72 %)
460,244
(7.41 %)
5,439,256
(37.83 %)
3
(0.00 %)
746,332
(7.48 %)
19,635
(1.10 %)
9,142
(0.41 %)
395 vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.1
48,870
(21.91 %)
n/a 19,421
(7.41 %)
36,314
(20.76 %)
n/a 36.49
(94.25 %)
0
(0 %)
49,649
(5.76 %)
25,263
(100.00 %)
182,696
(3.35 %)
143,269
(7.40 %)
1,620,517
(29.12 %)
3,454
(0.84 %)
135,503
(7.90 %)
13,323
(2.49 %)
9,786
(1.57 %)
396 wasp C.solmsi marchali (v1 2013)
GCF_000503995.1
13,201
(7.14 %)
n/a 3,474
(1.25 %)
15,142
(4.89 %)
n/a 30.36
(99.55 %)
7,471
(0.46 %)
7,471
(0.46 %)
9,928
(99.54 %)
340,841
(7.52 %)
251,386
(3.99 %)
2,448,273
(49.27 %)
11
(0.00 %)
43,154
(0.99 %)
16,346
(4.08 %)
14,983
(2.78 %)
397 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1
n/a n/a 20,245
(1.49 %)
24,230
(1.29 %)
n/a 42.11
(97.39 %)
263,385
(2.62 %)
263,385
(2.62 %)
630,367
(97.38 %)
5,997,926
(47.35 %)
466,019
(1.02 %)
13,822,739
(40.29 %)
2,383
(0.04 %)
975,519
(2.73 %)
93,080
(1.71 %)
42,806
(0.88 %)
398 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1
n/a n/a 21,044
(1.72 %)
22,320
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
152,836
(29.58 %)
169,546
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,250
(0.66 %)
13,410,191
(22.09 %)
2,022
(0.05 %)
348,918
(1.08 %)
48,738
(1.01 %)
44,867
(0.88 %)
399 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1
n/a n/a 18,034
(1.33 %)
19,779
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
219,764
(14.09 %)
225,566
(85.91 %)
6,527,125
(45.87 %)
1,271,531
(2.29 %)
12,374,069
(42.02 %)
3,596
(0.06 %)
861,216
(2.39 %)
28,528
(0.71 %)
23,900
(0.52 %)
400 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1
n/a n/a 18,126
(1.16 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
0
(0 %)
3,760
(0.03 %)
1,175
(100.00 %)
4,891,344
(19.68 %)
1,507,933
(3.81 %)
12,571,193
(54.50 %)
7
(0.00 %)
1,975,693
(4.67 %)
32,667
(0.90 %)
24,067
(0.56 %)
401 western European house mouse (WSB_EiJ v1 2016)
GCA_001624835.1
n/a n/a 20,870
(2.26 %)
18,535
(1.45 %)
100,622
(4.22 %)
41.80
(84.36 %)
68,691
(5.19 %)
399,976
(15.70 %)
72,315
(94.81 %)
4,961,700
(39.53 %)
1,345,987
(2.51 %)
13,324,808
(25.23 %)
11,455
(0.66 %)
369,064
(1.23 %)
16,556
(0.40 %)
15,878
(0.38 %)
402 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3
n/a n/a 20,323
(1.77 %)
22,069
(1.15 %)
n/a 40.71
(99.64 %)
768
(0.36 %)
768
(0.36 %)
16,065
(99.64 %)
5,373,630
(50.30 %)
1,025,389
(10.17 %)
15,954,613
(41.78 %)
0
(0 %)
3,581,997
(5.69 %)
53,557
(1.01 %)
27,578
(0.69 %)
403 western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023)
GCF_029281585.1
101,242
(3.18 %)
n/a 20,994
(1.57 %)
41,945
(1.53 %)
n/a 40.59
(99.85 %)
0
(0 %)
38
(0.15 %)
637
(100.00 %)
5,526,927
(51.16 %)
1,080,693
(20.38 %)
15,929,020
(48.46 %)
0
(0 %)
5,690,867
(9.25 %)
76,432
(1.35 %)
30,764
(0.70 %)
404 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3
51,681
(3.25 %)
n/a 15,203
(1.04 %)
22,272
(1.67 %)
46,230
(2.32 %)
44.19
(91.88 %)
183,751
(8.14 %)
183,744
(8.14 %)
262,326
(91.86 %)
2,767,141
(30.92 %)
316,971
(0.98 %)
11,856,824
(28.95 %)
6,315
(0.16 %)
313,471
(1.46 %)
104,231
(1.84 %)
32,424
(0.69 %)
405 western painted turtle (v304 RCT428 2020)
GCF_000241765.4
64,798
(3.75 %)
n/a 15,669
(1.09 %)
21,663
(1.64 %)
n/a 44.19
(87.54 %)
184,311
(12.48 %)
184,311
(12.48 %)
260,698
(87.52 %)
3,780,252
(41.81 %)
316,422
(0.93 %)
11,852,305
(27.59 %)
6,323
(0.15 %)
313,495
(1.39 %)
103,899
(1.75 %)
33,034
(0.70 %)
406 western predatory mite (v1.0 2012)
GCF_000255335.1
12,199
(13.86 %)
n/a 2,842
(1.49 %)
27,198
(19.18 %)
n/a 51.58
(99.74 %)
1,782
(0.26 %)
1,901
(0.26 %)
3,993
(99.74 %)
33,136
(1.10 %)
13,115
(0.57 %)
612,854
(9.73 %)
4
(0.00 %)
11,929
(0.89 %)
2,003
(54.71 %)
1,569
(0.97 %)
407 western wild mouse (SPRET_EiJ v1 2016)
GCA_001624865.1
n/a n/a 21,211
(2.19 %)
17,797
(1.36 %)
100,839
(4.01 %)
41.65
(89.10 %)
23,451
(1.23 %)
334,091
(10.95 %)
29,259
(98.77 %)
5,087,807
(40.60 %)
1,402,357
(3.14 %)
13,522,663
(27.99 %)
17,567
(1.08 %)
457,523
(2.25 %)
16,888
(0.42 %)
15,748
(0.39 %)
408 wheat stem sawfly (v1 2014)
GCF_000341935.1
37,175
(25.01 %)
n/a 4,407
(2.81 %)
15,504
(11.96 %)
n/a 40.34
(98.12 %)
8,731
(1.89 %)
8,733
(1.89 %)
10,707
(98.11 %)
87,084
(2.38 %)
44,673
(2.55 %)
1,001,343
(22.18 %)
41
(0.03 %)
19,750
(1.66 %)
7,519
(2.78 %)
7,623
(2.13 %)
409 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1
n/a n/a 18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
0
(0 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
2
(0.00 %)
1,117,804
(3.60 %)
68,551
(3.58 %)
41,698
(1.09 %)
410 white-footed mouse
GCF_004664715.1
46,167
(2.56 %)
n/a 20,406
(1.72 %)
20,857
(1.46 %)
39,081
(1.88 %)
42.23
(100.00 %)
0
(0 %)
79
(0.00 %)
1,763
(100.00 %)
5,064,597
(30.73 %)
1,258,088
(2.85 %)
14,005,845
(33.01 %)
0
(0 %)
551,791
(1.47 %)
23,475
(0.69 %)
19,781
(0.50 %)
411 white leghorn X broiler chicken (leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1
55,865
(8.86 %)
n/a 12,310
(2.41 %)
22,056
(2.57 %)
n/a 42.20
(99.65 %)
254
(0.35 %)
254
(0.35 %)
509
(99.65 %)
604,452
(10.76 %)
232,416
(2.03 %)
5,541,059
(20.23 %)
2
(0.00 %)
203,559
(1.88 %)
22,185
(2.62 %)
19,239
(1.58 %)
412 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1
n/a n/a 20,653
(1.75 %)
23,083
(1.50 %)
40,950
(1.94 %)
41.55
(99.10 %)
31,627
(0.90 %)
107,030
(0.91 %)
48,652
(99.10 %)
4,799,958
(41.28 %)
413,128
(2.59 %)
13,296,686
(34.22 %)
7,681
(0.08 %)
439,019
(2.88 %)
44,165
(1.19 %)
41,200
(1.10 %)
413 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1
n/a n/a 21,754
(1.86 %)
21,668
(1.22 %)
n/a 40.77
(99.67 %)
48,495
(0.33 %)
48,495
(0.33 %)
88,439
(99.67 %)
5,195,965
(48.83 %)
825,714
(3.60 %)
15,372,168
(38.05 %)
5,083
(0.10 %)
1,223,766
(2.72 %)
34,994
(0.85 %)
26,156
(0.69 %)
414 white-tufted-ear marmoset (v1.0 paternal 2020)
GCA_011100535.1
n/a n/a 20,939
(1.94 %)
20,416
(1.31 %)
n/a 41.04
(99.58 %)
0
(0 %)
788
(0.42 %)
336
(100.00 %)
4,869,007
(49.39 %)
746,577
(2.68 %)
14,347,286
(37.59 %)
0
(0 %)
1,026,338
(2.34 %)
35,222
(0.94 %)
25,795
(0.75 %)
415 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank)
GCA_011100555.2
n/a n/a 21,801
(1.88 %)
21,501
(1.28 %)
n/a 40.92
(99.52 %)
0
(0 %)
1,165
(0.48 %)
1,234
(100.00 %)
5,036,594
(47.71 %)
842,846
(3.25 %)
15,161,577
(38.08 %)
2
(0.00 %)
1,256,016
(2.62 %)
37,603
(0.93 %)
34,471
(0.83 %)
416 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1
58,109
(2.92 %)
n/a 21,699
(1.91 %)
20,910
(1.24 %)
n/a 40.85
(94.45 %)
187,214
(5.57 %)
187,214
(5.57 %)
201,523
(94.43 %)
5,120,629
(48.95 %)
768,432
(2.30 %)
15,303,718
(34.75 %)
1,516
(0.02 %)
933,431
(2.31 %)
35,805
(0.79 %)
27,299
(0.64 %)
417 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1
n/a n/a 21,729
(1.89 %)
21,502
(1.30 %)
n/a 40.85
(98.70 %)
370
(1.30 %)
370
(1.30 %)
1,360
(98.70 %)
5,122,418
(49.40 %)
818,502
(3.68 %)
15,232,829
(38.20 %)
0
(0 %)
1,395,363
(2.77 %)
36,656
(0.90 %)
26,567
(0.71 %)
418 whooping crane (maternal hap 2023 genbank)
GCA_028858705.1
n/a n/a 13,572
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
0
(0 %)
262
(0.37 %)
929
(100.00 %)
616,295
(10.57 %)
211,557
(2.90 %)
6,785,134
(22.11 %)
0
(0 %)
n/a 42,795
(4.66 %)
39,036
(2.34 %)
419 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2
n/a 20,251
(1.34 %)
18,785
(1.94 %)
17,252
(1.62 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
55,538
(1.18 %)
60,971
(1.18 %)
68,871
(98.82 %)
3,098,525
(34.75 %)
353,630
(1.23 %)
12,349,553
(25.12 %)
11
(0.00 %)
101,843
(0.63 %)
45,436
(1.02 %)
40,638
(0.87 %)
420 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019)
GCF_002162155.1
131,302
(1.34 %)
n/a 33,079
(0.33 %)
567,762
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
0
(0 %)
344,768
(3.31 %)
148,396
(100.00 %)
2,762,705
(2.81 %)
2,991,142
(3.37 %)
493,164
(96.69 %)
210
(0.02 %)
12,513,149
(13.71 %)
2,220,897
(25.33 %)
2,138,478
(24.00 %)
421 wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017)
GCF_000817695.2
69,091
(6.81 %)
n/a 16,823
(1.67 %)
75,740
(11.45 %)
n/a 35.81
(86.74 %)
1,682
(1.55 %)
133,967
(13.30 %)
3,189
(98.45 %)
588,761
(3.39 %)
493,855
(3.35 %)
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(45.36 %)
66
(0.02 %)
710,693
(6.46 %)
48,008
(1.88 %)
21,883
(0.84 %)
422 wild strawberry (2011 genbank)
GCA_000184155.1
n/a n/a 14,001
(6.64 %)
34,562
(26.90 %)
n/a 38.40
(94.26 %)
13,412
(5.76 %)
16,253
(5.76 %)
16,459
(94.24 %)
152,427
(20.00 %)
74,539
(2.79 %)
1,032,592
(21.43 %)
25
(0.01 %)
71,241
(3.11 %)
14,802
(3.20 %)
9,026
(1.93 %)
423 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1
50,529
(5.75 %)
n/a 12,950
(1.89 %)
19,252
(2.57 %)
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(2.44 %)
42.30
(100.00 %)
0
(0 %)
102
(0.00 %)
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(100.00 %)
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(7.17 %)
300,638
(2.31 %)
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(20.54 %)
0
(0 %)
235,724
(1.54 %)
28,268
(2.21 %)
22,544
(1.15 %)
424 woodchuck (CNAG 2019)
GCA_901343595.1
n/a 424,165
(27.27 %)
20,813
(1.60 %)
23,199
(1.43 %)
45,153
(1.99 %)
40.00
(97.18 %)
57,045
(2.82 %)
57,045
(2.82 %)
105,556
(97.18 %)
4,756,333
(33.73 %)
836,503
(2.41 %)
14,755,960
(31.13 %)
505
(0.04 %)
358,587
(3.15 %)
34,151
(0.87 %)
32,950
(0.82 %)
425 woodchuck (v1.0 LI92 2021)
GCF_021218885.1
62,044
(2.80 %)
n/a 19,783
(1.48 %)
21,060
(1.38 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
46
(0.00 %)
46
(0.00 %)
3,381
(100.00 %)
3,884,968
(28.12 %)
912,591
(2.73 %)
14,538,767
(35.15 %)
0
(0 %)
413,043
(1.33 %)
36,919
(1.02 %)
26,677
(0.60 %)
426 Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq)
GCF_003031525.1
43,312
(2.49 %)
n/a 18,639
(1.72 %)
19,645
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
52,647
(0.72 %)
66,346
(99.28 %)
n/a 540,765
(1.65 %)
12,691,760
(32.87 %)
427
(0.03 %)
363,613
(1.97 %)
59,052
(1.48 %)
39,130
(1.07 %)
427 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1
n/a n/a 19,219
(1.73 %)
27,456
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
124,797
(1.33 %)
155,509
(98.67 %)
4,277,556
(44.10 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,034
(35.19 %)
292
(0.02 %)
514,863
(2.00 %)
67,035
(1.82 %)
48,666
(1.49 %)
428 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1
27,063
(1.65 %)
n/a 19,227
(1.75 %)
27,468
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
124,797
(1.33 %)
155,510
(98.67 %)
4,193,317
(43.38 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,097
(35.19 %)
292
(0.02 %)
514,863
(2.00 %)
67,035
(1.82 %)
49,158
(1.49 %)
429 Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank)
GCA_003031525.1
n/a n/a 18,726
(1.80 %)
19,644
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
52,647
(0.72 %)
66,345
(99.28 %)
3,990,044
(42.54 %)
540,765
(1.65 %)
12,691,683
(32.88 %)
427
(0.03 %)
363,612
(1.97 %)
59,052
(1.48 %)
42,519
(1.18 %)
430 yellow-bellied marmot (v1 2018)
GCF_003676075.1
41,573
(2.14 %)
n/a 19,845
(1.63 %)
21,262
(1.39 %)
n/a 39.88
(97.82 %)
38,354
(2.18 %)
38,354
(2.18 %)
69,503
(97.82 %)
4,683,625
(34.38 %)
799,659
(1.95 %)
14,322,765
(32.58 %)
2,342
(0.05 %)
209,445
(0.69 %)
34,127
(0.91 %)
32,957
(0.85 %)
431 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019)
GCF_003676075.2
42,715
(2.16 %)
n/a 19,894
(1.62 %)
21,366
(1.40 %)
43,878
(1.99 %)
39.89
(97.96 %)
34,765
(2.04 %)
35,595
(2.04 %)
66,624
(97.96 %)
4,646,957
(34.05 %)
800,897
(1.96 %)
14,340,028
(32.63 %)
1,270
(0.04 %)
210,697
(0.69 %)
34,125
(0.91 %)
32,958
(0.85 %)
432 yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCA_016432865.1
n/a n/a 15,703
(0.78 %)
16,184
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
0
(0 %)
620
(0.01 %)
487
(100.00 %)
5,424,579
(25.40 %)
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(2.59 %)
21,430,550
(42.69 %)
2
(0.00 %)
714,621
(2.20 %)
28,121
(0.66 %)
28,159
(0.56 %)
433 yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI)
GCF_000699245.1
15,990
(2.25 %)
n/a 11,775
(1.55 %)
23,935
(1.90 %)
n/a 41.36
(99.67 %)
48,553
(0.34 %)
48,553
(0.34 %)
107,160
(99.66 %)
384,032
(4.45 %)
182,309
(1.03 %)
6,529,534
(19.24 %)
1
(0.00 %)
41,594
(0.34 %)
15,660
(0.55 %)
12,721
(0.42 %)
434 yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.1
41,168
(9.96 %)
n/a 15,861
(2.76 %)
30,671
(6.00 %)
n/a 40.75
(97.79 %)
0
(0 %)
33,664
(2.20 %)
99,598
(100.00 %)
614,513
(4.16 %)
522,349
(4.83 %)
4,650,538
(24.98 %)
309
(0.03 %)
357,703
(3.09 %)
18,054
(0.96 %)
12,855
(0.67 %)
435 zebra finch (Black17 v1 2019 genbank)
GCA_003957565.2
n/a n/a 13,212
(2.02 %)
25,117
(2.57 %)
38,655
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
0
(0 %)
312
(0.22 %)
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(100.00 %)
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(0.00 %)
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(2.04 %)
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(1.24 %)
436 zebra finch (Black17 v1 2019 refseq)
GCF_003957565.1
51,472
(7.16 %)
n/a 13,211
(2.02 %)
17,812
(2.70 %)
38,655
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
0
(0 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
1
(0.00 %)
381,676
(2.04 %)
30,053
(2.58 %)
22,898
(1.24 %)
437 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2
n/a n/a 18,599
(1.58 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
253,738
(7.41 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,769
(92.59 %)
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(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,620
(36.60 %)
476
(0.01 %)
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(3.00 %)
35,241
(0.84 %)
32,220
(0.75 %)
438 zig-zag eel (v1.1 2018)
GCF_900324485.1
44,813
(12.05 %)
n/a 15,028
(3.35 %)
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(6.89 %)
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0
(0 %)
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(100.00 %)
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(23.42 %)
0
(0 %)
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Invertebrates 644 assemblies assembly stats track stats
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Fungi 612 assemblies assembly stats track stats
Viruses 265 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 74 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 437 assemblies assembly stats track stats
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CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats