Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

Data resource links

NOTE: Click on the column headers to sort the table by that column
The link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)

count	common name link to genome browser	ncbiRefSeq	ncbiGene	xenoRefGene	augustus genes	Ensembl genes	gc5 base	AGP gap	all gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	gap Overlap	tandem Dups	cpg unmasked	cpg island
1	aardvark (BS58 2019 Broad) GCA_004365145.1	n/a	n/a	22,095 (0.63 %)	44,942 (0.68 %)	n/a	40.25 (99.86 %)	15,429 (0.03 %)	15,429 (0.03 %)	2,690,873 (99.97 %)	8,755,250 (34.47 %)	869,360 (1.26 %)	22,002,517 (59.65 %)	146 (0.00 %)	n/a	39,239 (0.49 %)	27,849 (0.37 %)
2	Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank) GCA_027172205.1	57,514 (54.61 %)	n/a	14,340 (1.37 %)	20,053 (2.31 %)	n/a	43.81 (100.00 %)	0 (0 %)	30 (0.00 %)	27 (100.00 %)	832,937 (4.17 %)	474,203 (4.04 %)	7,020,288 (38.29 %)	2 (0.00 %)	631,733 (3.50 %)	94,745 (2.70 %)	19,879 (0.76 %)
3	African clawed frog (2016) GCF_001663975.1	61,172 (3.82 %)	n/a	23,424 (1.78 %)	27,990 (2.23 %)	n/a	38.98 (88.63 %)	216,028 (11.39 %)	216,028 (11.39 %)	324,061 (88.61 %)	1,726,079 (12.81 %)	680,428 (2.28 %)	13,887,586 (35.94 %)	2,660 (0.08 %)	n/a	85,680 (0.94 %)	12,234 (0.16 %)
4	African grass rat (v1 paternal X 2020 genbank) GCA_011762505.1	45,963 (36.56 %)	n/a	20,933 (2.00 %)	19,613 (1.43 %)	37,929 (2.32 %)	41.39 (99.19 %)	0 (0 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	4,940,083 (37.33 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,540 (32.71 %)	2 (0.00 %)	1,027,357 (2.09 %)	17,767 (0.51 %)	16,848 (0.46 %)
5	African malaria mosquito (PEST 2006) GCA_000005575.1	n/a	14,608 (8.95 %)	5,478 (2.34 %)	30,482 (13.88 %)	n/a	44.27 (95.26 %)	55 (0.21 %)	8,735 (4.75 %)	8,115 (99.79 %)	241,805 (14.48 %)	72,702 (2.39 %)	1,434,880 (21.28 %)	6 (0.01 %)	77,560 (3.59 %)	25,507 (8.25 %)	24,151 (5.88 %)
6	African savanna elephant (2009 genbank) GCA_000001905.1	46,043 (34.84 %)	n/a	19,181 (1.25 %)	19,665 (1.10 %)	n/a	40.76 (97.57 %)	93,514 (2.45 %)	93,514 (2.45 %)	95,866 (97.55 %)	6,337,637 (57.82 %)	365,796 (0.88 %)	16,073,052 (44.89 %)	11 (0.00 %)	417,291 (1.06 %)	33,513 (0.68 %)	24,486 (0.51 %)
7	alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018) GCF_003710045.1	27,736 (10.71 %)	n/a	4,020 (1.34 %)	42,185 (10.12 %)	n/a	40.41 (94.37 %)	0 (0 %)	14,031 (5.59 %)	95,883 (100.00 %)	112,828 (2.21 %)	95,886 (3.63 %)	2,006,114 (27.47 %)	1 (0.00 %)	49,074 (1.16 %)	23,832 (3.81 %)	20,331 (3.23 %)
8	alpaca (2015 BGI) GCA_000767525.1	n/a	n/a	18,513 (1.97 %)	19,112 (1.70 %)	31,905 (1.94 %)	41.46 (99.38 %)	23,458 (0.62 %)	23,458 (0.62 %)	75,733 (99.38 %)	3,095,742 (36.41 %)	314,508 (1.07 %)	12,365,152 (25.46 %)	83 (0.00 %)	120,145 (0.60 %)	53,956 (1.50 %)	49,211 (1.30 %)
9	alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U) GCF_000164845.3	55,014 (3.56 %)	n/a	18,437 (1.94 %)	18,446 (1.63 %)	n/a	41.40 (95.85 %)	0 (0 %)	166,280 (4.17 %)	77,390 (100.00 %)	3,150,224 (36.21 %)	315,108 (1.36 %)	12,461,739 (24.88 %)	1,213 (0.03 %)	207,655 (1.22 %)	54,502 (1.38 %)	49,324 (1.18 %)
10	Alpine marmot (2015) GCF_001458135.1	35,350 (2.23 %)	n/a	20,139 (1.58 %)	18,286 (1.41 %)	n/a	39.80 (96.07 %)	0 (0 %)	89,362 (3.94 %)	14,543 (100.00 %)	n/a	747,129 (1.83 %)	14,077,162 (30.27 %)	494 (0.01 %)	202,989 (0.77 %)	30,224 (0.63 %)	24,261 (0.48 %)
11	American alligator (2023 genbank) GCA_030867065.1	n/a	n/a	14,487 (0.97 %)	20,444 (1.61 %)	n/a	45.04 (99.81 %)	136 (0.19 %)	136 (0.19 %)	806 (99.81 %)	3,380,365 (43.12 %)	560,127 (2.00 %)	12,524,244 (32.47 %)	1 (0.00 %)	370,300 (1.41 %)	50,852 (2.67 %)	30,117 (1.71 %)
12	American alligator (chrom assembly 2023 genbank) GCA_030867095.1	60,799 (51.66 %)	n/a	14,382 (0.98 %)	18,601 (1.45 %)	n/a	45.01 (99.30 %)	0 (0 %)	161 (0.70 %)	194 (100.00 %)	3,322,619 (43.19 %)	478,206 (1.77 %)	12,316,391 (32.01 %)	0 (0 %)	334,854 (1.31 %)	49,792 (2.45 %)	29,504 (1.51 %)
13	American beaver (US014 2019 Broad) GCA_004027675.1	n/a	n/a	22,515 (1.25 %)	34,527 (1.17 %)	n/a	39.58 (99.92 %)	5,769 (0.02 %)	5,769 (0.02 %)	837,916 (99.98 %)	5,101,904 (34.46 %)	552,100 (1.02 %)	15,150,706 (34.57 %)	36 (0.00 %)	n/a	24,558 (0.63 %)	21,525 (0.51 %)
14	American bison (2014 genbank) GCA_000754665.1	38,686 (33.79 %)	n/a	20,215 (1.44 %)	20,845 (1.20 %)	n/a	41.99 (93.39 %)	341,984 (6.63 %)	341,984 (6.63 %)	792,165 (93.37 %)	6,006,931 (47.67 %)	495,106 (1.11 %)	13,902,115 (39.01 %)	8,184 (0.08 %)	978,698 (2.61 %)	90,767 (1.29 %)	43,651 (0.72 %)
15	American pika 3.0 (2012 Broad genbank) GCA_000292845.1	26,240 (36.96 %)	n/a	17,569 (1.60 %)	20,092 (1.69 %)	n/a	43.35 (87.20 %)	122,542 (12.82 %)	122,542 (12.82 %)	132,961 (87.18 %)	2,829,934 (29.80 %)	414,895 (1.07 %)	10,968,663 (26.71 %)	1,958 (0.04 %)	269,478 (1.11 %)	44,651 (1.14 %)	26,757 (0.80 %)
16	amphioxus (hap2 2024 genbank) GCA_035083965.1	n/a	n/a	5,217 (0.97 %)	41,736 (12.73 %)	n/a	41.61 (100.00 %)	0 (0 %)	103 (0.00 %)	34 (100.00 %)	128,505 (1.65 %)	182,123 (8.03 %)	2,157,899 (27.45 %)	0 (0 %)	274,077 (4.65 %)	44,261 (5.21 %)	29,041 (2.94 %)
17	amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016) GCF_000764305.1	24,008 (8.48 %)	n/a	3,331 (0.47 %)	38,201 (8.97 %)	24,453 (8.50 %)	38.47 (99.52 %)	5,426 (0.48 %)	23,726 (0.48 %)	23,426 (99.52 %)	161,274 (1.72 %)	432,436 (8.89 %)	3,517,080 (28.92 %)	149 (0.01 %)	409,772 (5.41 %)	50,987 (4.44 %)	35,313 (2.58 %)
18	Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank) GCA_000464555.1	33,668 (37.51 %)	n/a	18,213 (1.58 %)	15,093 (1.29 %)	n/a	41.40 (97.59 %)	155,553 (2.44 %)	155,553 (2.44 %)	157,031 (97.56 %)	4,832,679 (42.49 %)	831,134 (1.67 %)	13,654,373 (31.78 %)	59 (0.00 %)	289,887 (0.97 %)	65,229 (1.60 %)	55,104 (1.18 %)
19	Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank) GCA_003957555.2	n/a	n/a	12,258 (1.95 %)	20,580 (2.26 %)	n/a	41.49 (98.48 %)	0 (0 %)	429 (1.52 %)	160 (100.00 %)	535,315 (7.95 %)	262,056 (1.51 %)	6,092,351 (20.84 %)	0 (0 %)	152,105 (1.27 %)	17,130 (1.48 %)	15,125 (1.04 %)
20	ant C.costatus (v1 MS0001 2016) GCF_001594065.1	16,082 (8.44 %)	n/a	4,038 (1.42 %)	32,856 (9.80 %)	n/a	34.73 (95.75 %)	10,626 (4.26 %)	10,626 (4.26 %)	26,005 (95.74 %)	203,498 (3.41 %)	100,483 (2.15 %)	2,221,362 (35.19 %)	127 (0.11 %)	43,690 (1.77 %)	18,108 (3.49 %)	18,662 (3.08 %)
21	ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019) GCF_005281655.1	28,261 (10.34 %)	n/a	4,915 (1.27 %)	40,257 (10.17 %)	n/a	35.18 (99.51 %)	0 (0 %)	1,076 (0.49 %)	2,869 (100.00 %)	322,753 (4.92 %)	245,412 (6.65 %)	1,952,946 (43.11 %)	0 (0 %)	252,395 (6.75 %)	17,048 (6.08 %)	17,349 (3.45 %)
22	ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI) GCF_001594075.1	22,023 (8.25 %)	n/a	4,211 (1.25 %)	37,113 (9.30 %)	n/a	35.01 (91.82 %)	40,822 (8.21 %)	40,822 (8.21 %)	60,583 (91.79 %)	218,162 (3.24 %)	139,385 (2.26 %)	2,347,922 (34.62 %)	136 (0.08 %)	54,250 (1.47 %)	23,814 (3.66 %)	21,810 (2.96 %)
23	apicomplexans C.sp. chipmunk genotype I (37763 2021 genbank) GCA_004936735.2	n/a	3,783 (76.65 %)	426 (3.03 %)	203 (12.39 %)	n/a	32.03 (100.00 %)	0 (0 %)	10 (0.00 %)	50 (100.00 %)	3,358 (1.88 %)	1,257 (0.81 %)	67,711 (20.74 %)	1 (0.00 %)	458 (0.29 %)	4 (0.02 %)	3 (0.01 %)
24	apicomplexans E.tenella (Houghton 2013) GCA_000499545.1	n/a	38,608 (25.51 %)	326 (0.37 %)	1,632 (4.94 %)	n/a	51.33 (98.72 %)	8,063 (1.32 %)	8,063 (1.32 %)	12,727 (98.68 %)	127,265 (17.42 %)	148,397 (16.77 %)	326,694 (37.33 %)	20 (0.03 %)	37,723 (6.57 %)	12,417 (22.22 %)	4,790 (5.71 %)
25	apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank) GCA_002114115.1	n/a	n/a	22,542 (3.52 %)	67,060 (16.20 %)	n/a	38.04 (88.95 %)	0 (0 %)	7,175 (11.05 %)	806 (100.00 %)	692,611 (50.80 %)	322,540 (4.42 %)	3,033,193 (35.58 %)	2 (0.00 %)	451,430 (6.86 %)	25,871 (1.75 %)	13,877 (0.88 %)
26	Arabian camel (2014 genbank) GCA_000767585.1	n/a	n/a	18,452 (1.96 %)	16,975 (1.61 %)	n/a	41.29 (98.88 %)	72,775 (1.13 %)	72,775 (1.13 %)	105,347 (98.87 %)	3,079,920 (34.79 %)	319,928 (0.96 %)	12,281,845 (25.28 %)	43 (0.00 %)	88,463 (0.39 %)	48,638 (1.17 %)	44,009 (1.01 %)
27	Arctic fox (US066 2019 Broad) GCA_004023825.1	n/a	n/a	22,910 (1.42 %)	31,985 (1.20 %)	35,342 (1.47 %)	41.93 (99.87 %)	9,604 (0.04 %)	9,604 (0.04 %)	1,272,949 (99.96 %)	6,096,013 (44.89 %)	1,265,350 (2.67 %)	14,617,986 (39.29 %)	19 (0.00 %)	594,304 (1.21 %)	64,716 (1.93 %)	61,195 (1.72 %)
28	ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006) GCF_000149645.2	10,390 (48.16 %)	n/a	1,538 (3.76 %)	6,155 (25.19 %)	n/a	49.56 (99.97 %)	90 (0.03 %)	90 (0.03 %)	466 (99.97 %)	5,026 (0.77 %)	2,256 (0.38 %)	68,790 (5.94 %)	0 (0 %)	710 (0.23 %)	2,846 (42.44 %)	3,973 (22.95 %)
29	ascomycetes A.nidulans (FGSC A4 2012 genbank) GCA_000149205.2	n/a	35,369 (50.73 %)	1,524 (3.90 %)	5,275 (23.90 %)	n/a	50.30 (99.43 %)	158 (0.58 %)	158 (0.58 %)	249 (99.42 %)	5,218 (3.22 %)	2,452 (0.41 %)	51,693 (4.64 %)	1 (0.00 %)	625 (0.60 %)	1,128 (90.37 %)	1,810 (9.92 %)
30	ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007) GCF_000002855.3	10,608 (51.05 %)	n/a	1,481 (3.36 %)	5,692 (22.11 %)	n/a	50.35 (99.87 %)	449 (0.13 %)	662 (0.13 %)	469 (99.87 %)	9,986 (1.32 %)	2,619 (0.36 %)	106,480 (7.71 %)	1 (0.00 %)	262 (0.07 %)	5,568 (53.86 %)	6,938 (24.44 %)
31	ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019) GCF_004011695.1	11,257 (41.02 %)	n/a	1,596 (2.91 %)	8,283 (26.43 %)	n/a	49.20 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	34 (100.00 %)	14,775 (2.01 %)	16,031 (2.34 %)	103,256 (17.19 %)	0 (0 %)	7,380 (1.61 %)	805 (44.28 %)	832 (32.41 %)
32	ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank) GCA_000003525.2	n/a	11,865 (30.24 %)	1,516 (1.76 %)	5,714 (11.07 %)	n/a	37.07 (99.50 %)	566 (0.51 %)	566 (0.51 %)	593 (99.49 %)	38,696 (2.74 %)	27,571 (2.05 %)	270,617 (48.64 %)	2 (0.00 %)	31,958 (3.92 %)	8,002 (10.69 %)	7,438 (8.47 %)
33	ascomycetes B.gilchristii (SLH14081 2009 genbank) GCA_000003855.2	n/a	11,799 (26.55 %)	1,518 (1.57 %)	5,702 (9.73 %)	n/a	35.75 (98.67 %)	1,691 (1.34 %)	1,691 (1.34 %)	1,794 (98.66 %)	42,930 (2.67 %)	27,826 (1.78 %)	328,698 (50.87 %)	0 (0 %)	32,248 (3.50 %)	7,943 (9.35 %)	7,488 (7.50 %)
34	ascomycetes C.posadasii (C735 delta SOWgp 2009 genban) GCA_000151335.1	n/a	7,255 (49.92 %)	1,479 (4.26 %)	5,283 (25.22 %)	n/a	46.59 (100.00 %)	33 (0.00 %)	33 (0.00 %)	88 (100.00 %)	10,463 (5.97 %)	5,206 (0.91 %)	74,027 (11.89 %)	0 (0 %)	3,254 (0.84 %)	4,784 (34.49 %)	4,865 (16.04 %)
35	ascomycetes F.oxysporum (NRRL 32931 2014 genbank) GCA_000271745.2	n/a	24,097 (64.91 %)	1,503 (2.37 %)	11,741 (30.20 %)	n/a	47.63 (98.55 %)	377 (1.46 %)	377 (1.46 %)	545 (98.54 %)	8,453 (2.23 %)	3,560 (0.37 %)	129,150 (7.65 %)	11 (0.00 %)	1,096 (0.18 %)	14,398 (29.11 %)	11,860 (16.53 %)
36	ascomycetes P.destructans (20631-21 2010 genbank) GCA_000184105.1	n/a	9,303 (55.05 %)	1,446 (3.95 %)	5,635 (25.84 %)	n/a	50.12 (92.42 %)	1,732 (7.59 %)	2,066 (7.59 %)	3,579 (92.41 %)	11,499 (5.71 %)	11,754 (2.10 %)	87,648 (13.51 %)	22 (0.03 %)	2,836 (0.73 %)	4,483 (54.70 %)	4,759 (18.94 %)
37	ascomycetes P.digitatum (Pd1 2012 genbank) GCA_000315645.2	n/a	8,963 (49.28 %)	1,461 (4.51 %)	5,599 (29.85 %)	n/a	48.91 (95.53 %)	508 (4.48 %)	516 (4.48 %)	562 (95.52 %)	3,575 (0.59 %)	2,210 (0.38 %)	66,810 (6.03 %)	8 (0.02 %)	344 (0.13 %)	7,344 (38.10 %)	6,767 (25.05 %)
38	ascomycetes P.pennisetigena (Br36 2019 genbank) GCA_004337985.1	n/a	11,430 (33.47 %)	1,482 (2.32 %)	7,302 (20.85 %)	n/a	47.48 (99.41 %)	0 (0 %)	1,281 (0.60 %)	108 (100.00 %)	24,268 (1.88 %)	11,049 (1.23 %)	163,225 (20.20 %)	5 (0.01 %)	7,142 (1.57 %)	764 (17.56 %)	1,559 (15.28 %)
39	ascomycetes P.rubens (Wisconsin 54-1255 2008 genbank) GCA_000226395.1	n/a	13,922 (56.71 %)	1,550 (3.72 %)	7,756 (30.06 %)	n/a	48.96 (99.94 %)	0 (0 %)	775 (0.06 %)	49 (100.00 %)	5,678 (0.78 %)	4,560 (0.81 %)	73,645 (5.86 %)	1 (0.01 %)	1,650 (0.43 %)	7,807 (50.55 %)	7,905 (32.71 %)
40	ascomycetes R.enersibuu (CBS 393.64 2015 genbank) GCA_000968595.1	n/a	9,843 (50.65 %)	1,499 (4.04 %)	3,608 (17.47 %)	n/a	50.55 (99.99 %)	76 (0.00 %)	76 (0.00 %)	938 (100.00 %)	12,877 (1.80 %)	4,459 (0.56 %)	116,737 (10.53 %)	0 (0 %)	117 (0.03 %)	2,561 (81.62 %)	2,992 (17.71 %)
41	ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012) GCF_000182805.2	9,903 (39.44 %)	n/a	1,311 (2.58 %)	4,612 (17.66 %)	n/a	52.11 (99.64 %)	0 (0 %)	978 (0.36 %)	1,583 (100.00 %)	16,540 (1.85 %)	7,316 (0.76 %)	171,684 (11.10 %)	0 (0 %)	371 (0.08 %)	1,770 (49.40 %)	6,766 (16.80 %)
42	ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank) GCA_000961545.1	10,279 (51.22 %)	10,434 (48.46 %)	1,134 (2.55 %)	2,026 (10.60 %)	n/a	54.96 (100.00 %)	57 (0.00 %)	57 (0.00 %)	73 (100.00 %)	15,846 (2.28 %)	8,000 (0.94 %)	169,678 (13.75 %)	0 (0 %)	339 (0.06 %)	22 (99.61 %)	22 (0.11 %)
43	ascomycetes T.marneffei (ATCC 18224 2008 genbank) GCA_000001985.1	n/a	10,749 (60.97 %)	1,532 (4.18 %)	7,679 (34.14 %)	n/a	46.67 (99.38 %)	137 (0.62 %)	137 (0.62 %)	589 (99.38 %)	6,404 (1.04 %)	2,594 (0.58 %)	61,594 (6.70 %)	0 (0 %)	951 (0.36 %)	5,746 (15.84 %)	5,169 (10.66 %)
44	ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank) GCA_000219625.1	10,941 (44.32 %)	10,965 (38.50 %)	1,451 (2.81 %)	6,906 (25.36 %)	n/a	52.14 (99.98 %)	3 (0.02 %)	3 (0.02 %)	24 (99.98 %)	8,941 (1.69 %)	8,367 (1.51 %)	99,818 (11.14 %)	0 (0 %)	6,612 (1.57 %)	27 (96.31 %)	89 (4.28 %)
45	Asian corn borer (v1 ACB-3 2019) GCF_004193835.1	25,279 (7.94 %)	n/a	4,931 (1.05 %)	28,608 (7.16 %)	n/a	37.50 (100.00 %)	0 (0 %)	34,722 (0.01 %)	7,722 (100.00 %)	146,974 (1.35 %)	89,987 (2.68 %)	2,666,250 (38.74 %)	899 (0.07 %)	268,435 (6.89 %)	39,696 (5.22 %)	19,418 (2.22 %)
46	Asian corn borer (v2 ACB-3 2019) GCF_004193835.2	25,169 (7.95 %)	n/a	4,867 (1.05 %)	28,255 (7.08 %)	n/a	37.49 (100.00 %)	0 (0 %)	34,702 (0.01 %)	6,269 (100.00 %)	150,783 (1.53 %)	89,885 (2.69 %)	2,627,296 (38.56 %)	899 (0.07 %)	268,390 (6.92 %)	39,511 (5.22 %)	19,307 (2.21 %)
47	Asian swallowtail (v1 2015) GCF_000836235.1	22,417 (13.18 %)	n/a	5,290 (2.15 %)	13,925 (7.00 %)	n/a	33.81 (97.56 %)	5,205 (2.44 %)	5,205 (2.44 %)	10,777 (97.56 %)	122,491 (2.29 %)	27,169 (0.71 %)	2,130,840 (38.92 %)	27 (0.01 %)	39,978 (1.31 %)	11,899 (2.85 %)	8,383 (1.82 %)
48	Asian tiger mosquito (C6/36 2017 genbank) GCA_001876365.2	n/a	n/a	10,893 (0.53 %)	128,502 (8.33 %)	n/a	40.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,434 (100.00 %)	605,350 (2.88 %)	921,761 (7.40 %)	11,169,474 (57.07 %)	0 (0 %)	1,146,944 (4.60 %)	220,674 (10.38 %)	117,106 (3.58 %)
49	Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 genbank GCA_006496715.1	n/a	n/a	10,347 (0.43 %)	138,311 (7.69 %)	n/a	40.40 (99.93 %)	0 (0 %)	3,359 (0.07 %)	2,196 (100.00 %)	691,302 (2.69 %)	1,084,185 (7.47 %)	12,619,495 (57.66 %)	0 (0 %)	1,197,283 (4.46 %)	250,421 (10.15 %)	127,434 (3.51 %)
50	Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 refseq) GCF_006496715.1	49,254 (2.57 %)	n/a	10,500 (0.44 %)	138,307 (7.69 %)	n/a	40.40 (99.93 %)	0 (0 %)	3,359 (0.07 %)	2,197 (100.00 %)	6,821,491 (69.74 %)	1,084,205 (7.47 %)	12,619,646 (57.66 %)	0 (0 %)	1,197,291 (4.46 %)	250,420 (10.13 %)	139,292 (3.15 %)
51	Asiatic tapir (BS100 BIUU 2019) GCA_004024905.1	n/a	n/a	20,854 (1.73 %)	28,046 (1.39 %)	n/a	40.91 (99.96 %)	4,333 (0.02 %)	4,333 (0.02 %)	284,468 (99.98 %)	3,802,671 (39.88 %)	335,521 (0.73 %)	15,053,564 (30.25 %)	11 (0.00 %)	n/a	39,691 (1.17 %)	36,849 (1.05 %)
52	ass (Maral har 2015 genbank) GCA_001305755.1	48,976 (40.12 %)	n/a	18,884 (1.76 %)	19,296 (1.44 %)	n/a	41.28 (98.63 %)	0 (0 %)	69,593 (1.38 %)	2,166 (100.00 %)	3,855,699 (41.69 %)	289,735 (0.96 %)	14,695,257 (28.58 %)	5,680 (0.23 %)	136,343 (0.85 %)	40,025 (1.06 %)	36,402 (0.92 %)
53	Atlantic halibut (primary hap 2019 genbank) GCA_009819705.1	52,117 (66.34 %)	n/a	14,960 (3.20 %)	45,365 (7.48 %)	69,625 (10.94 %)	42.21 (99.43 %)	0 (0 %)	290 (0.57 %)	57 (100.00 %)	428,421 (4.16 %)	256,153 (3.73 %)	3,725,979 (24.13 %)	0 (0 %)	240,110 (3.16 %)	31,325 (2.25 %)	20,749 (1.34 %)
54	Atlantic herring (v1) GCF_900700415.1	46,216 (9.88 %)	n/a	15,249 (2.65 %)	25,664 (6.68 %)	n/a	44.24 (99.88 %)	1,963 (0.12 %)	1,963 (0.12 %)	1,990 (99.88 %)	1,175,759 (12.03 %)	1,231,613 (13.39 %)	3,511,276 (32.20 %)	2 (0.00 %)	1,037,723 (8.32 %)	33,465 (1.97 %)	20,325 (1.10 %)
55	Atlantic salmon (genbank 2021) GCA_905237065.2	n/a	n/a	28,077 (1.40 %)	120,383 (3.99 %)	183,727 (7.26 %)	43.42 (100.00 %)	211 (0.00 %)	211 (0.00 %)	4,222 (100.00 %)	4,501,521 (48.00 %)	2,247,891 (25.01 %)	10,731,814 (59.31 %)	0 (0 %)	4,866,269 (10.20 %)	77,089 (1.86 %)	20,127 (0.31 %)
56	Atlantic stingray (hap1 2023 genbank) GCA_030144855.1	60,922 (45.62 %)	n/a	12,545 (0.38 %)	29,428 (1.34 %)	n/a	43.35 (99.99 %)	0 (0 %)	1,648 (0.01 %)	2,990 (100.00 %)	8,579,105 (49.81 %)	831,224 (15.75 %)	21,718,213 (51.79 %)	9 (0.00 %)	4,445,293 (7.00 %)	105,821 (2.42 %)	35,197 (0.42 %)
57	B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis) GCF_000002995.3	11,472 (14.88 %)	n/a	2,843 (2.29 %)	3,797 (4.95 %)	n/a	30.21 (92.98 %)	2,303 (6.97 %)	58,744 (7.04 %)	26,881 (93.03 %)	147,614 (11.55 %)	54,885 (7.91 %)	647,155 (33.62 %)	55 (0.02 %)	69,072 (5.04 %)	509 (0.15 %)	126 (0.04 %)
58	Bactrian camel (Alxa 2014 genbank) GCA_000767855.1	52,178 (47.52 %)	n/a	18,330 (1.96 %)	17,094 (1.64 %)	n/a	41.32 (99.32 %)	31,980 (0.69 %)	31,980 (0.69 %)	67,434 (99.31 %)	3,072,373 (34.88 %)	306,996 (0.95 %)	12,209,895 (25.43 %)	58 (0.01 %)	73,572 (0.41 %)	49,789 (1.25 %)	45,112 (1.08 %)
59	banded archerfish (primary hap 2021 genbank) GCA_017976425.1	42,399 (57.52 %)	n/a	15,312 (3.18 %)	41,147 (7.01 %)	62,990 (9.37 %)	41.11 (99.82 %)	0 (0 %)	98 (0.18 %)	96 (100.00 %)	811,892 (18.19 %)	271,913 (9.55 %)	3,355,326 (28.08 %)	1 (0.00 %)	297,728 (3.49 %)	15,089 (0.96 %)	9,304 (0.55 %)
60	barn owl (2020) GCF_902150015.1	37,361 (4.54 %)	n/a	12,958 (1.72 %)	22,922 (1.99 %)	26,976 (3.04 %)	41.55 (99.23 %)	0 (0 %)	177,340 (0.79 %)	21,504 (100.00 %)	585,627 (5.48 %)	367,764 (2.44 %)	7,399,161 (19.58 %)	6,614 (0.13 %)	188,767 (2.21 %)	47,061 (3.25 %)	41,356 (2.24 %)
61	barn owl BGI_N341 (2014) GCF_000687205.1	15,006 (2.07 %)	n/a	11,133 (1.44 %)	21,138 (1.69 %)	n/a	40.21 (99.24 %)	109,223 (0.79 %)	109,223 (0.79 %)	171,345 (99.21 %)	413,761 (3.90 %)	181,353 (0.91 %)	6,776,326 (18.43 %)	2 (0.00 %)	15,140 (0.13 %)	10,575 (0.29 %)	9,101 (0.25 %)
62	barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021) GCA_015227805.2	n/a	n/a	12,385 (1.88 %)	23,302 (2.31 %)	n/a	42.54 (97.69 %)	0 (0 %)	1,102 (2.31 %)	617 (100.00 %)	579,928 (6.20 %)	364,636 (2.27 %)	6,198,840 (21.01 %)	0 (0 %)	237,664 (1.56 %)	36,546 (2.82 %)	29,760 (1.66 %)
63	barn swallow (v2 primary hap 2021 refseq) GCF_015227805.1	43,374 (5.14 %)	n/a	12,385 (1.88 %)	23,302 (2.31 %)	n/a	42.54 (97.69 %)	0 (0 %)	1,102 (2.31 %)	617 (100.00 %)	579,928 (6.20 %)	364,636 (2.27 %)	6,198,840 (21.01 %)	0 (0 %)	237,664 (1.56 %)	36,546 (2.82 %)	29,760 (1.66 %)
64	barn swallow (v3 primary hap 2021 genbank) GCA_015227805.3	n/a	n/a	12,395 (1.89 %)	23,302 (2.31 %)	n/a	42.54 (97.69 %)	0 (0 %)	1,102 (2.31 %)	617 (100.00 %)	664,757 (13.92 %)	364,636 (2.27 %)	6,198,840 (21.01 %)	0 (0 %)	237,664 (1.56 %)	36,548 (2.85 %)	29,760 (1.66 %)
65	barramundi perch (ASB-BC8 2016) GCF_001640805.1	50,205 (13.10 %)	n/a	16,166 (3.05 %)	25,084 (6.20 %)	n/a	40.75 (100.00 %)	0 (0 %)	110 (0.00 %)	3,808 (100.00 %)	465,997 (3.11 %)	237,955 (4.36 %)	4,027,027 (23.91 %)	0 (0 %)	248,089 (3.21 %)	16,276 (1.04 %)	9,104 (0.52 %)
66	basidiomycetes A.bisporus (H97 2012) GCF_000300575.1	10,448 (49.20 %)	n/a	1,066 (2.53 %)	5,238 (16.95 %)	n/a	46.48 (99.32 %)	225 (0.68 %)	225 (0.68 %)	254 (99.32 %)	4,921 (0.90 %)	2,352 (0.47 %)	62,603 (9.90 %)	0 (0 %)	7,487 (2.92 %)	5,244 (15.19 %)	4,407 (9.08 %)
67	basidiomycetes C.cinerea (okayama7#130 2010 genbank) GCA_000182895.1	n/a	13,661 (52.73 %)	1,050 (2.04 %)	3,917 (10.89 %)	n/a	51.64 (100.00 %)	0 (0 %)	33 (0.00 %)	68 (100.00 %)	n/a	3,805 (0.81 %)	107,373 (7.81 %)	0 (0 %)	2,879 (1.50 %)	81 (99.54 %)	135 (0.47 %)
68	basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7841 2024 genbank) GCA_001720195.2	n/a	6,409 (59.64 %)	921 (4.16 %)	4,119 (24.79 %)	n/a	44.80 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	2,424 (0.66 %)	1,011 (0.30 %)	56,356 (7.99 %)	0 (0 %)	901 (0.80 %)	1,869 (7.30 %)	1,482 (5.65 %)
69	basidiomycetes C.neoformans (JEC21 2005 genbank) GCA_000091045.1	n/a	6,999 (68.28 %)	957 (3.66 %)	3,784 (19.12 %)	n/a	48.54 (99.99 %)	85 (0.01 %)	85 (0.01 %)	99 (99.99 %)	4,944 (5.25 %)	1,808 (0.52 %)	68,717 (8.41 %)	2 (0.00 %)	1,433 (1.21 %)	5,128 (28.73 %)	3,532 (11.09 %)
70	basidiomycetes K.bestiolae (CBS 10118 2024 genbank) GCA_000512585.3	n/a	9,175 (54.34 %)	918 (2.66 %)	4,907 (18.38 %)	n/a	47.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	7,245 (1.32 %)	2,141 (0.47 %)	97,927 (9.78 %)	0 (0 %)	863 (0.56 %)	4,995 (11.17 %)	3,011 (4.94 %)
71	basidiomycetes K.bestiolae (v1 CBS 10118 2016) GCF_000512585.1	9,187 (54.88 %)	n/a	867 (2.56 %)	4,441 (17.03 %)	n/a	47.25 (99.94 %)	30 (0.06 %)	30 (0.06 %)	42 (99.94 %)	7,231 (1.31 %)	1,919 (0.32 %)	110,288 (10.48 %)	3 (0.00 %)	63 (0.02 %)	4,972 (10.95 %)	2,807 (4.52 %)
72	basidiomycetes K.dejecticola (CBS 10117 2024 genbank) GCA_000512565.3	n/a	8,696 (55.58 %)	910 (2.69 %)	4,861 (19.78 %)	n/a	48.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	7,778 (1.42 %)	2,452 (0.43 %)	86,630 (7.97 %)	0 (0 %)	812 (0.23 %)	3,644 (14.24 %)	3,514 (7.22 %)
73	basidiomycetes K.dejecticola (v1 CBS 10117 2016) GCF_000512565.1	8,645 (55.47 %)	n/a	908 (2.72 %)	4,862 (19.87 %)	n/a	48.38 (99.98 %)	56 (0.02 %)	56 (0.02 %)	69 (99.98 %)	7,816 (1.43 %)	2,425 (0.42 %)	85,868 (7.91 %)	14 (0.01 %)	48 (0.02 %)	3,698 (15.12 %)	3,518 (7.28 %)
74	basidiomycetes K.mangroviensis (v1 CBS 8507 2016 refseq) GCF_000507465.1	8,472 (55.96 %)	n/a	884 (2.79 %)	5,418 (21.48 %)	n/a	44.88 (99.73 %)	43 (0.27 %)	43 (0.27 %)	105 (99.73 %)	6,509 (1.21 %)	1,529 (0.25 %)	101,733 (9.98 %)	2 (0.00 %)	24 (0.01 %)	2,326 (4.59 %)	1,405 (2.26 %)
75	basidiomycetes K.mangroviensis (v2 CBS 8507 2024 genbank) GCA_000507465.4	n/a	8,582 (55.68 %)	886 (2.74 %)	5,392 (21.25 %)	n/a	44.92 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4 (100.00 %)	6,585 (1.21 %)	1,546 (0.27 %)	104,495 (10.38 %)	0 (0 %)	1,321 (0.50 %)	2,335 (5.10 %)	1,396 (2.19 %)
76	basidiomycetes K.shandongensis (v1 CBS 12478 2019) GCF_008629635.1	7,454 (55.86 %)	n/a	893 (2.94 %)	3,348 (15.13 %)	n/a	49.82 (99.99 %)	0 (0 %)	11 (0.01 %)	132 (100.00 %)	5,510 (1.13 %)	1,598 (0.33 %)	81,983 (9.00 %)	2 (0.00 %)	105 (0.05 %)	512 (39.06 %)	1,900 (4.96 %)
77	basidiomycetes M.globosa (v1 CBS 7966 2007) GCF_000181695.1	4,286 (69.39 %)	n/a	1,060 (8.79 %)	2,585 (44.95 %)	n/a	52.06 (100.00 %)	22 (0.00 %)	22 (0.00 %)	89 (100.00 %)	1,777 (0.93 %)	720 (0.48 %)	22,182 (4.73 %)	0 (0 %)	252 (0.26 %)	124 (60.74 %)	105 (31.95 %)
78	basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010) GCF_000143185.1	13,192 (49.72 %)	n/a	894 (1.60 %)	973 (2.80 %)	n/a	57.50 (98.57 %)	316 (1.43 %)	316 (1.43 %)	352 (98.57 %)	7,478 (4.11 %)	7,640 (1.13 %)	176,404 (11.51 %)	1 (0.00 %)	5,378 (1.90 %)	38 (40.33 %)	55 (0.23 %)
79	bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016) GCF_001652005.1	25,020 (17.94 %)	n/a	4,205 (2.34 %)	27,352 (12.83 %)	n/a	41.09 (91.93 %)	0 (0 %)	19,248 (8.05 %)	50,565 (100.00 %)	57,833 (1.39 %)	27,440 (2.49 %)	1,173,760 (18.39 %)	416 (0.39 %)	14,577 (3.60 %)	10,942 (2.61 %)	10,587 (2.22 %)
80	bee E.mexicana (v1 0111107269 2016) GCF_001483705.1	16,406 (4.01 %)	n/a	4,087 (0.75 %)	46,846 (6.53 %)	16,764 (4.04 %)	40.92 (95.72 %)	25,039 (4.23 %)	25,039 (4.23 %)	212,650 (95.77 %)	641,987 (7.51 %)	360,406 (11.43 %)	3,411,951 (46.01 %)	306 (0.12 %)	259,979 (5.86 %)	40,540 (3.99 %)	18,218 (1.75 %)
81	beet (2015) GCF_000511025.2	37,939 (8.78 %)	n/a	12,044 (2.14 %)	63,283 (17.52 %)	n/a	36.14 (91.40 %)	30,962 (8.61 %)	30,962 (8.61 %)	71,208 (91.39 %)	288,084 (4.25 %)	299,650 (4.72 %)	3,021,571 (30.10 %)	1,360 (0.22 %)	218,658 (4.15 %)	32,547 (2.39 %)	20,111 (1.55 %)
82	beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017) GCA_002288925.2	n/a	n/a	18,686 (1.78 %)	20,378 (1.43 %)	n/a	41.24 (98.66 %)	28,398 (1.35 %)	28,398 (1.35 %)	35,369 (98.65 %)	4,001,688 (43.72 %)	542,326 (1.10 %)	12,806,249 (34.24 %)	954 (0.02 %)	386,729 (1.71 %)	59,279 (1.53 %)	42,903 (1.24 %)
83	Betapolyomavirus macacae (2000) GCA_000837645.1	n/a	18 (99.29 %)	n/a	n/a	n/a	40.76 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (4.54 %)	15 (4.33 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
84	black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018) GCF_000002775.4	59,637 (15.47 %)	n/a	20,361 (4.67 %)	44,177 (15.83 %)	n/a	33.75 (97.43 %)	6,871 (2.58 %)	6,871 (2.58 %)	8,318 (97.42 %)	402,600 (27.63 %)	177,746 (4.65 %)	2,639,214 (36.04 %)	34 (0.01 %)	246,517 (5.54 %)	4,559 (0.56 %)	1,801 (0.17 %)
85	black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 genbank) GCA_022577435.1	n/a	n/a	14,991 (3.02 %)	47,106 (6.98 %)	n/a	41.61 (100.00 %)	0 (0 %)	234 (0.00 %)	230 (100.00 %)	1,017,149 (18.99 %)	360,899 (8.75 %)	3,761,526 (28.91 %)	0 (0 %)	469,043 (4.64 %)	48,360 (4.43 %)	30,659 (2.05 %)
86	black rhinoceros (primary hap 2021 genbank) GCA_020826845.1	56,255 (36.51 %)	n/a	18,774 (1.38 %)	22,346 (1.26 %)	n/a	41.59 (99.95 %)	0 (0 %)	215 (0.05 %)	1,075 (100.00 %)	4,200,385 (36.22 %)	548,030 (8.34 %)	14,347,639 (40.14 %)	2 (0.00 %)	984,722 (2.61 %)	43,525 (1.14 %)	33,963 (0.76 %)
87	black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016) GCA_001698545.1	59,197 (39.21 %)	n/a	21,244 (1.88 %)	23,681 (1.25 %)	n/a	40.94 (94.13 %)	0 (0 %)	149,843 (5.88 %)	105,030 (100.00 %)	5,600,915 (50.57 %)	991,762 (2.45 %)	16,353,992 (34.26 %)	4,262 (0.14 %)	867,902 (3.08 %)	81,205 (1.19 %)	29,129 (0.68 %)
88	black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016) GCF_001698545.1	59,210 (2.48 %)	n/a	21,256 (1.89 %)	23,679 (1.25 %)	n/a	40.94 (94.13 %)	0 (0 %)	149,843 (5.88 %)	105,031 (100.00 %)	5,602,009 (50.58 %)	991,745 (2.45 %)	16,354,078 (34.26 %)	4,262 (0.14 %)	n/a	81,205 (1.19 %)	29,123 (0.68 %)
89	black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020) GCF_013377495.1	41,255 (4.77 %)	n/a	12,955 (1.98 %)	22,656 (2.28 %)	31,476 (5.07 %)	41.95 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	396 (100.00 %)	680,976 (7.66 %)	296,152 (1.44 %)	6,797,141 (21.40 %)	0 (0 %)	86,777 (0.79 %)	31,750 (3.32 %)	30,007 (2.00 %)
90	black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020) GCF_015228065.1	35,923 (2.41 %)	n/a	3,903 (0.15 %)	39,667 (2.27 %)	40,959 (2.59 %)	36.64 (83.75 %)	0 (0 %)	1,158,725 (16.44 %)	26,876 (100.00 %)	5,488,723 (29.98 %)	7,028,944 (21.91 %)	10,445,796 (49.62 %)	239 (0.01 %)	4,167,031 (8.98 %)	178,205 (3.43 %)	77,006 (1.37 %)
91	black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank) GCA_028500815.1	51,115 (48.16 %)	n/a	13,211 (1.67 %)	24,108 (1.99 %)	n/a	44.40 (99.94 %)	0 (0 %)	283 (0.06 %)	716 (100.00 %)	521,275 (5.36 %)	236,727 (8.62 %)	5,684,588 (26.70 %)	8 (0.00 %)	651,836 (3.67 %)	45,318 (4.71 %)	36,668 (1.67 %)
92	black-legged tick (U.Maryland v1 2021) GCF_016920785.1	41,018 (2.61 %)	n/a	4,064 (0.14 %)	135,587 (7.67 %)	n/a	46.27 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,977 (100.00 %)	1,153,773 (4.93 %)	754,711 (7.52 %)	10,964,182 (43.13 %)	0 (0 %)	805,883 (3.13 %)	138,831 (8.38 %)	232,611 (7.21 %)
93	black-legged tick (Wikel colony 2008 genbank) GCA_000208615.1	n/a	24,903 (1.43 %)	3,432 (0.19 %)	108,471 (5.13 %)	n/a	45.22 (78.65 %)	201,145 (21.35 %)	201,145 (21.35 %)	570,637 (78.65 %)	656,957 (3.38 %)	365,918 (1.61 %)	8,574,437 (27.02 %)	124 (0.01 %)	n/a	345,141 (14.15 %)	189,691 (5.45 %)
94	blackcap (primary hap 2019 genbank) GCA_009819655.1	n/a	n/a	12,378 (1.92 %)	22,970 (2.37 %)	n/a	42.00 (98.88 %)	0 (0 %)	413 (1.12 %)	189 (100.00 %)	506,242 (6.14 %)	330,354 (2.12 %)	6,410,567 (19.76 %)	0 (0 %)	190,210 (1.30 %)	26,838 (2.34 %)	22,667 (1.33 %)
95	Blainville's beaked whale (primary hap 2022 genbank) GCA_025265405.1	47,540 (38.02 %)	n/a	19,042 (1.52 %)	20,766 (1.27 %)	n/a	41.70 (99.97 %)	0 (0 %)	97 (0.03 %)	73 (100.00 %)	3,964,035 (35.29 %)	765,957 (8.74 %)	12,128,162 (41.78 %)	1 (0.00 %)	1,795,618 (5.01 %)	70,851 (1.80 %)	37,949 (0.93 %)
96	bloodfluke planorb (v1 BB02 2013 refseq) GCF_000457365.1	42,229 (5.95 %)	n/a	3,558 (0.29 %)	24,115 (2.96 %)	n/a	35.99 (98.05 %)	76,921 (1.91 %)	76,921 (1.91 %)	408,322 (98.09 %)	629,362 (4.20 %)	749,383 (9.40 %)	6,932,184 (43.02 %)	435 (0.03 %)	800,142 (5.40 %)	16,970 (0.64 %)	6,405 (0.27 %)
97	bloodfluke planorb (v2 BB02 2013 genbank) GCA_000457365.2	n/a	n/a	3,378 (0.29 %)	23,684 (2.94 %)	n/a	35.99 (98.05 %)	76,903 (1.91 %)	76,903 (1.91 %)	406,924 (98.09 %)	587,583 (3.57 %)	749,212 (9.41 %)	6,921,847 (43.04 %)	434 (0.03 %)	n/a	16,561 (0.63 %)	6,013 (0.25 %)
98	blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020) GCA_009873245.2	n/a	n/a	19,164 (1.81 %)	20,546 (1.41 %)	34,210 (1.86 %)	40.88 (98.91 %)	0 (0 %)	936 (1.09 %)	130 (100.00 %)	3,999,202 (44.22 %)	581,540 (1.22 %)	12,900,977 (34.62 %)	2 (0.00 %)	424,951 (1.36 %)	67,189 (1.73 %)	46,700 (1.41 %)
99	blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank) GCA_900634775.1	47,312 (59.52 %)	n/a	14,496 (1.97 %)	28,873 (5.58 %)	60,981 (6.13 %)	38.27 (98.47 %)	0 (0 %)	1,160 (1.53 %)	441 (100.00 %)	731,730 (4.21 %)	471,620 (4.92 %)	5,974,002 (42.88 %)	0 (0 %)	455,135 (4.01 %)	29,050 (1.48 %)	14,672 (0.63 %)
100	blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq) GCF_900634775.1	47,312 (7.12 %)	n/a	14,496 (1.97 %)	28,873 (5.58 %)	60,981 (6.13 %)	38.27 (98.47 %)	0 (0 %)	1,160 (1.53 %)	441 (100.00 %)	731,730 (4.21 %)	471,620 (4.92 %)	5,974,002 (42.88 %)	0 (0 %)	455,135 (4.01 %)	29,050 (1.48 %)	14,672 (0.63 %)
101	Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021) GCF_016699345.1	53,030 (2.41 %)	n/a	20,599 (1.98 %)	21,182 (1.34 %)	46,441 (1.87 %)	40.95 (99.56 %)	1,074 (0.44 %)	1,074 (0.44 %)	2,790 (99.56 %)	5,098,799 (47.87 %)	946,231 (3.04 %)	14,608,771 (36.99 %)	14 (0.00 %)	1,335,352 (2.84 %)	37,273 (1.03 %)	32,351 (0.89 %)
102	Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011) GCF_000235385.1	39,820 (2.33 %)	n/a	20,222 (2.04 %)	18,404 (1.34 %)	49,071 (2.26 %)	40.77 (94.98 %)	148,728 (5.04 %)	148,728 (5.04 %)	151,414 (94.96 %)	4,710,420 (46.30 %)	767,602 (1.48 %)	14,489,703 (32.96 %)	1,541 (0.02 %)	526,235 (1.31 %)	32,474 (0.75 %)	29,285 (0.67 %)
103	Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023 genbank) GCA_028885525.1	n/a	n/a	19,820 (1.76 %)	20,399 (1.15 %)	n/a	40.98 (99.88 %)	36 (0.12 %)	36 (0.12 %)	251 (99.88 %)	5,232,617 (54.01 %)	1,003,539 (10.19 %)	14,858,575 (42.10 %)	0 (0 %)	2,511,941 (4.39 %)	42,467 (1.24 %)	29,563 (0.80 %)
104	Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023 refseq) GCF_028885625.1	81,966 (2.93 %)	n/a	20,794 (1.72 %)	21,307 (1.13 %)	n/a	41.13 (99.86 %)	39 (0.14 %)	39 (0.14 %)	1,593 (99.86 %)	5,651,267 (54.21 %)	1,155,151 (9.33 %)	16,242,823 (42.82 %)	0 (0 %)	2,513,241 (4.25 %)	52,294 (2.02 %)	36,160 (1.02 %)
105	boutu (BS63 2019) GCA_004363515.1	n/a	n/a	21,835 (1.38 %)	35,087 (1.18 %)	n/a	42.09 (99.89 %)	5,072 (0.02 %)	5,072 (0.02 %)	1,218,682 (99.98 %)	5,098,108 (45.85 %)	856,878 (2.32 %)	13,046,921 (40.74 %)	29 (0.00 %)	n/a	63,992 (1.47 %)	47,092 (1.19 %)
106	Brazilian free-tailed bat (US034 2019) GCA_004025005.1	n/a	n/a	23,562 (1.20 %)	51,200 (1.27 %)	n/a	42.40 (99.91 %)	4,243 (0.02 %)	4,243 (0.02 %)	1,071,858 (99.98 %)	4,884,584 (32.93 %)	777,032 (1.49 %)	14,195,446 (36.38 %)	31 (0.00 %)	n/a	89,940 (1.88 %)	76,243 (1.50 %)
107	brown anole (Geneva1000 2022 genbank) GCA_025583915.1	38,099 (52.40 %)	n/a	14,028 (1.05 %)	19,927 (1.81 %)	n/a	41.14 (98.37 %)	0 (0 %)	114,440 (1.64 %)	3,738 (100.00 %)	1,376,455 (6.78 %)	1,094,843 (5.18 %)	9,127,396 (44.98 %)	261 (0.01 %)	1,132,418 (4.31 %)	46,291 (1.18 %)	17,324 (0.40 %)
108	brown argus (genbank 2021) GCA_905147365.1	23,611 (63.03 %)	n/a	4,734 (1.03 %)	24,267 (6.80 %)	24,237 (6.16 %)	36.86 (100.00 %)	0 (0 %)	4 (0.00 %)	26 (100.00 %)	264,378 (2.90 %)	144,255 (3.35 %)	2,651,028 (48.44 %)	0 (0 %)	205,174 (4.19 %)	35,431 (4.56 %)	15,409 (1.89 %)
109	brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018) GCF_003584765.1	54,006 (3.19 %)	n/a	18,811 (1.78 %)	21,058 (1.52 %)	39,408 (1.98 %)	41.84 (99.31 %)	15,552 (0.70 %)	17,380 (0.70 %)	21,814 (99.30 %)	4,283,780 (41.29 %)	567,588 (1.23 %)	13,807,277 (30.86 %)	760 (0.01 %)	325,786 (0.96 %)	62,126 (1.80 %)	56,003 (1.56 %)
110	brown bear (v1.0 2022 WashU) GCF_023065955.1	60,162 (4.01 %)	n/a	18,920 (1.66 %)	21,641 (1.49 %)	n/a	42.51 (100.00 %)	0 (0 %)	215 (0.00 %)	902 (100.00 %)	4,166,472 (34.00 %)	659,124 (5.14 %)	13,282,996 (33.88 %)	0 (0 %)	788,951 (2.62 %)	68,113 (2.27 %)	61,162 (1.99 %)
111	brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020) GCF_013339695.1	39,619 (2.36 %)	n/a	3,965 (0.13 %)	116,426 (5.96 %)	45,849 (2.46 %)	46.86 (99.96 %)	0 (0 %)	10,359 (0.04 %)	2,329 (100.00 %)	1,064,424 (3.53 %)	716,579 (3.47 %)	10,608,171 (42.78 %)	1 (0.00 %)	n/a	13,204 (0.97 %)	233,049 (6.32 %)
112	brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020) GCF_012460135.1	31,379 (5.19 %)	n/a	12,572 (1.89 %)	24,442 (2.44 %)	26,137 (3.13 %)	42.40 (99.99 %)	278 (0.01 %)	278 (0.01 %)	691 (99.99 %)	504,872 (6.53 %)	420,620 (3.73 %)	6,496,619 (21.26 %)	0 (0 %)	353,680 (2.15 %)	28,576 (2.39 %)	22,561 (1.23 %)
113	brown planthopper (v1 BPH 2020 genbank) GCA_014356525.1	36,936 (60.13 %)	n/a	4,416 (0.37 %)	22,354 (3.57 %)	37,534 (4.91 %)	34.69 (99.96 %)	0 (0 %)	4,529 (0.04 %)	7,093 (100.00 %)	597,351 (3.69 %)	564,076 (6.64 %)	6,601,703 (47.48 %)	11 (0.00 %)	905,418 (9.48 %)	39,697 (1.55 %)	15,292 (0.62 %)
114	brown planthopper (v1 BPH 2020 refseq) GCF_014356525.1	36,949 (4.89 %)	n/a	4,427 (0.37 %)	22,417 (3.57 %)	37,573 (4.91 %)	34.69 (99.96 %)	0 (0 %)	4,529 (0.04 %)	7,094 (100.00 %)	597,178 (3.69 %)	564,092 (6.64 %)	6,601,918 (47.49 %)	11 (0.00 %)	905,421 (9.48 %)	39,697 (1.55 %)	15,292 (0.62 %)
115	budding yeast C.auris (6684 2015 genbank) GCA_001189475.1	n/a	7,564 (65.02 %)	1,948 (12.61 %)	4,664 (59.90 %)	n/a	45.12 (98.69 %)	0 (0 %)	689 (1.33 %)	99 (100.00 %)	3,478 (1.23 %)	2,281 (0.83 %)	48,703 (8.19 %)	27 (0.12 %)	258 (0.23 %)	1,579 (6.36 %)	1,147 (4.11 %)
116	budding yeast C.auris (B11221 2017 genbank) GCA_002775015.1	n/a	5,715 (64.44 %)	2,030 (12.92 %)	4,702 (58.30 %)	n/a	45.32 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	20 (100.00 %)	3,464 (2.27 %)	2,436 (0.80 %)	28,524 (6.96 %)	0 (0 %)	1,194 (1.58 %)	1,757 (7.37 %)	1,331 (4.92 %)
117	budding yeast C.lusitaniae (ATCC 42720 2009 genbank) GCA_000003835.1	n/a	6,153 (65.84 %)	1,956 (12.86 %)	4,335 (54.85 %)	n/a	44.50 (99.71 %)	79 (0.29 %)	79 (0.29 %)	88 (99.71 %)	2,272 (1.18 %)	4,036 (1.77 %)	48,188 (8.66 %)	0 (0 %)	697 (0.55 %)	1,474 (15.82 %)	1,218 (9.79 %)
118	budding yeast C.oxycetoniae (v1 CBS 10844 2022) GCF_023343755.1	4,892 (62.35 %)	n/a	1,845 (11.42 %)	4,476 (56.70 %)	n/a	37.84 (99.95 %)	0 (0 %)	167 (0.05 %)	148 (100.00 %)	14,118 (4.93 %)	19,713 (8.99 %)	82,014 (21.64 %)	3 (0.01 %)	4,249 (2.09 %)	201 (0.52 %)	34 (0.08 %)
119	budding yeast K.marxianus (DMKU3-1042 2014 genbank) GCA_001417885.1	n/a	5,342 (68.28 %)	3,349 (28.79 %)	4,665 (66.28 %)	n/a	40.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	7,406 (3.43 %)	3,781 (1.46 %)	51,732 (11.80 %)	0 (0 %)	614 (0.85 %)	742 (4.91 %)	562 (2.75 %)
120	budding yeast L.elongisporus (NRRL YB-4239 2007 genbank) GCA_000149685.1	n/a	5,905 (57.07 %)	1,905 (9.82 %)	5,004 (52.37 %)	n/a	36.94 (99.45 %)	117 (0.56 %)	117 (0.56 %)	145 (99.44 %)	30,880 (10.91 %)	18,155 (4.10 %)	100,210 (23.18 %)	0 (0 %)	1,604 (1.36 %)	22 (0.04 %)	19 (0.04 %)
121	budding yeast N.glabratus (CBS 138 2008 genbank) GCA_000002545.2	n/a	5,552 (64.50 %)	3,553 (27.93 %)	4,799 (61.37 %)	n/a	38.65 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	16 (100.00 %)	3,047 (1.32 %)	2,546 (1.58 %)	59,567 (11.20 %)	0 (0 %)	804 (0.77 %)	635 (3.11 %)	567 (2.52 %)
122	budding yeast Y.lipolytica (CLIB122 2004 genbank) GCA_000002525.1	n/a	8,157 (46.30 %)	1,755 (6.59 %)	4,802 (37.76 %)	n/a	49.05 (99.99 %)	28 (0.01 %)	28 (0.01 %)	34 (99.99 %)	7,553 (2.98 %)	9,578 (2.12 %)	81,595 (9.59 %)	0 (0 %)	960 (0.42 %)	6,216 (33.42 %)	5,390 (18.49 %)
123	budgerigar (maternal Z 2020 genbank) GCA_012275295.1	32,026 (47.01 %)	n/a	13,250 (1.87 %)	23,063 (2.25 %)	26,324 (3.11 %)	41.80 (99.72 %)	0 (0 %)	284 (0.28 %)	865 (100.00 %)	539,059 (10.20 %)	279,511 (3.12 %)	5,874,608 (22.08 %)	1 (0.00 %)	324,823 (2.05 %)	21,155 (1.61 %)	17,590 (1.10 %)
124	butterfly L.sinapis (2021 genbank) GCA_905404315.1	25,882 (55.17 %)	n/a	4,722 (0.65 %)	16,896 (3.62 %)	47,660 (8.03 %)	35.73 (100.00 %)	0 (0 %)	13 (0.00 %)	50 (100.00 %)	272,738 (1.92 %)	98,053 (6.01 %)	4,662,765 (51.79 %)	0 (0 %)	376,611 (5.06 %)	43,150 (4.96 %)	13,298 (1.08 %)
125	butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021) GCA_905475465.1	n/a	n/a	4,588 (1.37 %)	11,218 (5.90 %)	42,925 (13.84 %)	33.95 (100.00 %)	0 (0 %)	41 (0.00 %)	43 (100.00 %)	143,323 (2.19 %)	45,473 (3.23 %)	2,501,939 (42.55 %)	0 (0 %)	106,106 (3.41 %)	11,070 (2.07 %)	6,650 (1.23 %)
126	cabbage white (genbank 2021) GCA_905147795.1	21,844 (65.09 %)	n/a	4,557 (1.68 %)	9,253 (6.32 %)	30,285 (15.57 %)	33.23 (100.00 %)	0 (0 %)	4 (0.00 %)	40 (100.00 %)	116,781 (2.12 %)	30,577 (1.24 %)	2,300,336 (39.04 %)	0 (0 %)	40,164 (2.03 %)	6,783 (2.24 %)	5,041 (1.33 %)
127	California condor (v1 813 2021 genbank) GCA_018139145.1	n/a	n/a	12,650 (1.75 %)	21,946 (1.95 %)	n/a	42.16 (99.97 %)	0 (0 %)	632 (0.03 %)	542 (100.00 %)	518,393 (6.41 %)	177,329 (0.88 %)	7,168,675 (20.31 %)	6 (0.00 %)	116,410 (1.11 %)	34,926 (2.94 %)	32,355 (1.72 %)
128	California sea lion (BS06 2019 Broad) GCA_004024565.1	n/a	n/a	23,668 (1.61 %)	29,709 (1.32 %)	n/a	41.56 (99.92 %)	10,276 (0.04 %)	10,276 (0.04 %)	582,272 (99.96 %)	4,952,087 (44.00 %)	651,744 (1.26 %)	13,644,805 (35.79 %)	27 (0.00 %)	376,234 (0.87 %)	62,245 (1.50 %)	57,048 (1.32 %)
129	California sea lion (v1 2019) GCA_009762305.1	n/a	n/a	21,020 (1.79 %)	20,045 (1.39 %)	45,176 (2.15 %)	41.40 (99.28 %)	0 (0 %)	122 (0.72 %)	43 (100.00 %)	4,529,949 (43.67 %)	589,962 (1.24 %)	13,266,465 (33.77 %)	0 (0 %)	491,959 (1.43 %)	51,989 (1.50 %)	48,284 (1.32 %)
130	California two-spot octopus (v1 UCB-OBI-ISO-001 male 2015) GCF_001194135.1	26,135 (1.83 %)	n/a	3,125 (0.12 %)	17,875 (1.29 %)	27,144 (1.85 %)	36.03 (84.95 %)	548,450 (15.13 %)	548,450 (15.13 %)	700,124 (84.87 %)	3,498,348 (13.19 %)	3,005,729 (6.50 %)	13,687,022 (41.09 %)	20,815 (0.26 %)	912,571 (2.22 %)	22,984 (0.34 %)	4,782 (0.07 %)
131	Canada lynx (LIC74 v1 2019) GCF_007474595.1	50,094 (2.69 %)	n/a	18,283 (1.66 %)	19,326 (1.35 %)	38,985 (1.96 %)	41.70 (99.88 %)	0 (0 %)	848 (0.12 %)	66 (100.00 %)	5,016,399 (43.75 %)	904,986 (1.75 %)	13,476,288 (34.20 %)	0 (0 %)	572,992 (1.64 %)	66,822 (2.52 %)	60,494 (2.02 %)
132	Cape golden mole (BS56 2019 Broad) GCA_004027935.1	n/a	n/a	25,543 (0.55 %)	52,506 (0.63 %)	n/a	40.04 (99.84 %)	4,876 (0.01 %)	4,876 (0.01 %)	3,432,954 (99.99 %)	7,363,240 (21.82 %)	876,677 (2.53 %)	25,446,677 (58.18 %)	62 (0.00 %)	n/a	25,319 (0.31 %)	19,908 (0.25 %)
133	capsicum (Zunla-1 2015 genbank) GCA_000710875.1	n/a	n/a	16,133 (0.56 %)	62,445 (2.92 %)	n/a	34.93 (96.78 %)	107,172 (3.23 %)	107,172 (3.23 %)	108,797 (96.77 %)	1,171,727 (3.54 %)	948,641 (4.39 %)	21,533,236 (46.16 %)	331 (0.03 %)	1,512,400 (5.05 %)	16,621 (0.21 %)	4,972 (0.06 %)
134	Caribbean electric ray (hap1 2024 genbank) GCA_036971445.1	n/a	n/a	11,967 (0.44 %)	20,851 (1.23 %)	n/a	43.35 (99.99 %)	0 (0 %)	1,443 (0.01 %)	596 (100.00 %)	4,902,656 (34.96 %)	1,040,893 (17.82 %)	16,403,253 (54.79 %)	2 (0.00 %)	3,888,884 (8.11 %)	113,936 (1.69 %)	22,323 (0.31 %)
135	carmine bee-eater (2014 BGI) GCF_000691845.1	15,520 (2.12 %)	n/a	11,303 (1.45 %)	24,758 (1.84 %)	n/a	41.67 (99.59 %)	50,632 (0.42 %)	50,632 (0.42 %)	104,131 (99.58 %)	405,042 (5.66 %)	161,525 (1.05 %)	6,445,961 (19.27 %)	2 (0.00 %)	37,279 (0.40 %)	11,477 (0.36 %)	9,158 (0.28 %)
136	cassava (v6 AM560-2 2016 DOE) GCF_001659605.1	48,199 (10.95 %)	n/a	18,537 (3.62 %)	45,536 (13.17 %)	n/a	35.94 (85.14 %)	37,896 (14.88 %)	37,896 (14.88 %)	39,916 (85.12 %)	295,656 (2.88 %)	266,527 (3.40 %)	2,434,269 (42.34 %)	26 (0.02 %)	352,557 (6.54 %)	30,963 (1.41 %)	4,126 (0.23 %)
137	cattle (Hereford 2015) GCA_000003205.6	n/a	n/a	19,803 (1.54 %)	21,001 (1.30 %)	n/a	41.83 (99.57 %)	39,124 (0.44 %)	41,517 (0.44 %)	42,578 (99.56 %)	5,725,274 (49.24 %)	459,535 (1.33 %)	12,905,109 (41.11 %)	628 (0.03 %)	1,325,981 (3.97 %)	43,324 (1.28 %)	37,641 (0.94 %)
138	cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA) GCF_002263795.1	76,369 (2.97 %)	n/a	19,669 (1.56 %)	21,999 (1.33 %)	n/a	41.93 (100.00 %)	0 (0 %)	386 (0.00 %)	2,211 (100.00 %)	5,643,592 (49.67 %)	545,256 (2.90 %)	13,085,601 (41.79 %)	1 (0.00 %)	1,556,737 (4.07 %)	44,357 (1.24 %)	37,714 (0.98 %)
139	cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA) GCF_002263795.2	76,293 (2.98 %)	n/a	19,325 (1.49 %)	21,665 (1.32 %)	n/a	41.94 (100.00 %)	0 (0 %)	386 (0.00 %)	1,957 (100.00 %)	3,550,686 (24.18 %)	544,595 (2.90 %)	13,050,221 (41.81 %)	1 (0.00 %)	1,554,173 (4.07 %)	44,208 (1.24 %)	37,290 (0.87 %)
140	Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad) GCA_004024745.1	n/a	n/a	21,372 (1.41 %)	34,453 (1.31 %)	n/a	42.35 (99.87 %)	10,534 (0.04 %)	10,534 (0.04 %)	1,240,696 (99.96 %)	5,244,572 (43.13 %)	2,503,015 (4.45 %)	12,961,004 (41.69 %)	59 (0.00 %)	n/a	173,264 (3.70 %)	153,887 (3.31 %)
141	channel bull blenny (2019 genbank) GCA_900634415.1	40,788 (61.50 %)	n/a	14,472 (3.02 %)	24,012 (6.59 %)	60,720 (10.43 %)	40.96 (99.58 %)	0 (0 %)	445 (0.42 %)	322 (100.00 %)	420,697 (5.49 %)	320,518 (6.91 %)	3,394,846 (28.67 %)	0 (0 %)	452,303 (4.62 %)	20,453 (1.39 %)	10,802 (0.65 %)
142	channel catfish (USDA103 v1 2016) GCF_001660625.1	53,933 (9.58 %)	n/a	15,712 (2.71 %)	25,639 (5.25 %)	n/a	39.70 (98.56 %)	25,203 (1.45 %)	25,203 (1.45 %)	34,544 (98.55 %)	871,222 (5.75 %)	585,250 (4.19 %)	5,150,651 (33.94 %)	63 (0.01 %)	258,935 (2.61 %)	31,438 (1.87 %)	20,402 (1.03 %)
143	channel catfish (USDA103 v1.2 2019) GCF_001660625.2	57,087 (10.27 %)	n/a	16,253 (2.68 %)	44,936 (5.15 %)	n/a	39.70 (98.57 %)	25,203 (1.39 %)	25,285 (1.44 %)	34,545 (98.61 %)	900,327 (5.55 %)	614,695 (4.28 %)	5,348,266 (33.81 %)	63 (0.01 %)	281,774 (2.67 %)	32,840 (1.87 %)	21,251 (1.03 %)
144	cheetah (AJU 981 2015) GCA_001443585.1	n/a	n/a	18,264 (1.57 %)	14,665 (1.26 %)	n/a	41.30 (98.26 %)	0 (0 %)	183,260 (1.77 %)	14,382 (100.00 %)	4,777,041 (42.51 %)	784,368 (1.53 %)	13,503,827 (31.65 %)	42 (0.00 %)	261,774 (0.78 %)	57,657 (1.31 %)	48,632 (1.00 %)
145	chimney swift (M959 v1.0 2014) GCF_000747805.1	15,979 (2.53 %)	n/a	12,065 (1.82 %)	10,050 (2.07 %)	n/a	41.40 (95.99 %)	65,523 (4.03 %)	65,523 (4.03 %)	84,595 (95.97 %)	453,775 (7.30 %)	194,988 (2.21 %)	6,363,949 (19.70 %)	135 (0.03 %)	104,994 (2.61 %)	12,486 (0.42 %)	8,538 (0.26 %)
146	chimpanzee (Clint C0471 2018 genbank) GCA_002880755.3	n/a	162,869 (3.61 %)	20,378 (1.83 %)	21,427 (1.19 %)	n/a	40.71 (98.98 %)	693 (1.02 %)	693 (1.02 %)	5,037 (98.98 %)	5,409,980 (53.76 %)	984,231 (7.31 %)	15,896,744 (39.56 %)	4 (0.00 %)	2,559,246 (4.40 %)	45,870 (0.97 %)	28,273 (0.73 %)
147	chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023 genbank) GCA_028858805.1	n/a	n/a	20,001 (1.79 %)	21,230 (1.19 %)	n/a	40.62 (99.78 %)	22 (0.22 %)	22 (0.22 %)	141 (99.78 %)	5,092,768 (48.83 %)	946,933 (11.75 %)	14,844,947 (42.39 %)	0 (0 %)	3,140,392 (5.61 %)	47,662 (1.21 %)	29,340 (0.82 %)
148	chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023 refseq) GCF_028858775.1	111,282 (4.36 %)	n/a	20,990 (1.75 %)	21,705 (1.15 %)	n/a	40.94 (99.90 %)	29 (0.10 %)	29 (0.10 %)	1,500 (99.90 %)	5,581,205 (50.06 %)	1,158,792 (10.59 %)	15,972,274 (43.09 %)	0 (0 %)	3,093,549 (5.27 %)	61,901 (2.29 %)	38,043 (1.17 %)
149	China rose (Old Blush v1 2018) GCF_002994745.1	60,293 (11.65 %)	n/a	15,433 (2.84 %)	67,310 (21.70 %)	n/a	38.83 (100.00 %)	0 (0 %)	33 (0.00 %)	45 (100.00 %)	273,992 (2.25 %)	228,466 (3.97 %)	2,261,888 (35.14 %)	0 (0 %)	273,738 (7.11 %)	37,317 (4.18 %)	22,576 (1.74 %)
150	Chinese hamster (17A/GY CHO 2018) GCF_003668045.1	55,529 (3.00 %)	n/a	19,755 (1.76 %)	20,017 (1.50 %)	n/a	41.51 (99.88 %)	0 (0 %)	4,356 (0.12 %)	1,830 (100.00 %)	4,544,603 (29.89 %)	1,095,407 (2.92 %)	12,942,232 (32.27 %)	20 (0.00 %)	553,246 (1.59 %)	19,343 (0.58 %)	15,755 (0.43 %)
151	Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank) GCA_018296145.1	92,370 (51.48 %)	n/a	27,141 (1.63 %)	113,328 (4.52 %)	157,545 (6.65 %)	43.55 (99.99 %)	2,313 (0.01 %)	2,333 (0.01 %)	9,977 (99.99 %)	4,892,399 (55.31 %)	2,306,695 (23.48 %)	10,038,870 (54.55 %)	10 (0.00 %)	5,031,323 (11.16 %)	62,726 (1.40 %)	18,444 (0.39 %)
152	chub mackerel (primary hap 2022 genbank) GCA_027409825.1	34,390 (49.60 %)	n/a	15,350 (2.35 %)	46,858 (6.07 %)	n/a	40.01 (99.92 %)	0 (0 %)	1,572 (0.08 %)	361 (100.00 %)	1,669,327 (28.44 %)	638,340 (11.55 %)	4,613,422 (32.38 %)	3 (0.00 %)	927,880 (7.23 %)	16,290 (0.85 %)	8,913 (0.42 %)
153	chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014) GCF_000700745.1	17,196 (2.21 %)	n/a	12,140 (1.50 %)	25,641 (1.91 %)	n/a	40.76 (99.61 %)	56,667 (0.39 %)	56,667 (0.39 %)	126,789 (99.61 %)	560,317 (7.62 %)	203,204 (1.12 %)	6,593,712 (20.47 %)	4 (0.00 %)	63,810 (0.48 %)	8,105 (0.24 %)	6,684 (0.19 %)
154	chytrid fungus B.dendrobatidis (v1 JAM81 2011) GCF_000203795.1	8,677 (50.60 %)	n/a	1,251 (4.00 %)	7,681 (34.45 %)	n/a	39.25 (99.25 %)	383 (0.76 %)	383 (0.76 %)	510 (99.24 %)	2,585 (1.13 %)	3,424 (1.20 %)	81,225 (12.02 %)	0 (0 %)	5,784 (3.45 %)	161 (0.21 %)	141 (0.19 %)
155	ciliates Oxytricha trifallax (v1 JRB310 2012) GCA_000295675.1	n/a	24,578 (70.50 %)	1,065 (1.03 %)	1,781 (1.87 %)	n/a	31.32 (99.93 %)	1,347 (0.00 %)	1,347 (0.00 %)	23,709 (100.00 %)	29,228 (1.96 %)	22,291 (1.48 %)	550,667 (25.14 %)	6 (0.00 %)	1,285 (0.43 %)	20 (0.01 %)	20 (0.01 %)
156	climbing perch (v1.1 2018 refseq) GCF_900324465.1	42,930 (13.31 %)	n/a	15,237 (3.47 %)	22,710 (7.34 %)	37,043 (11.25 %)	40.40 (98.65 %)	0 (0 %)	292 (1.35 %)	70 (100.00 %)	329,586 (2.67 %)	133,519 (1.94 %)	3,418,470 (21.84 %)	0 (0 %)	182,187 (2.87 %)	10,698 (0.86 %)	7,641 (0.56 %)
157	climbing perch (v1.2 2018 genbank) GCA_900324465.2	42,746 (63.74 %)	n/a	15,239 (3.53 %)	39,067 (7.54 %)	63,908 (10.45 %)	40.40 (99.35 %)	0 (0 %)	266 (0.65 %)	50 (100.00 %)	324,479 (2.66 %)	130,248 (1.89 %)	3,324,960 (21.31 %)	0 (0 %)	169,785 (2.72 %)	10,500 (0.87 %)	7,574 (0.57 %)
158	climbing perch (v1.2 2018 refseq) GCF_900324465.2	42,746 (13.53 %)	n/a	15,241 (3.53 %)	39,067 (7.54 %)	63,908 (10.45 %)	40.40 (99.35 %)	0 (0 %)	266 (0.65 %)	51 (100.00 %)	324,324 (2.66 %)	130,249 (1.89 %)	3,325,009 (21.31 %)	0 (0 %)	169,785 (2.72 %)	10,500 (0.87 %)	7,574 (0.57 %)
159	clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank) GCA_028018385.1	81,219 (51.66 %)	n/a	18,516 (1.55 %)	20,363 (1.39 %)	n/a	41.79 (99.94 %)	0 (0 %)	181 (0.06 %)	34 (100.00 %)	4,798,634 (33.91 %)	992,669 (2.08 %)	13,618,933 (34.42 %)	3 (0.00 %)	647,740 (1.89 %)	67,831 (2.45 %)	58,578 (1.71 %)
160	clouded yellow (genbank 2021) GCA_905220415.1	23,070 (64.23 %)	n/a	4,767 (1.38 %)	15,869 (7.12 %)	34,699 (13.48 %)	33.59 (100.00 %)	0 (0 %)	9 (0.00 %)	33 (100.00 %)	161,872 (2.42 %)	73,892 (2.86 %)	2,544,844 (42.14 %)	0 (0 %)	134,497 (3.68 %)	15,663 (2.98 %)	9,943 (1.81 %)
161	coho salmon (150728-3 2017) GCF_002021735.1	64,032 (4.29 %)	n/a	24,727 (1.43 %)	46,926 (3.38 %)	n/a	43.33 (95.39 %)	1,566 (0.01 %)	265,291 (4.63 %)	22,810 (99.99 %)	1,185,308 (5.22 %)	2,455,045 (15.99 %)	11,710,855 (46.53 %)	9,333 (0.29 %)	4,110,586 (10.80 %)	72,061 (1.46 %)	24,530 (0.46 %)
162	common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020) GCA_011762595.1	67,207 (45.84 %)	n/a	18,772 (1.77 %)	20,527 (1.42 %)	35,815 (1.58 %)	41.44 (99.74 %)	0 (0 %)	674 (0.26 %)	362 (100.00 %)	4,067,521 (46.14 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,896 (35.29 %)	1 (0.00 %)	597,652 (1.78 %)	65,551 (1.90 %)	43,161 (1.35 %)
163	common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank) GCA_001922835.1	45,962 (43.27 %)	n/a	17,254 (1.68 %)	17,112 (1.34 %)	n/a	40.85 (99.45 %)	0 (0 %)	114,003 (0.57 %)	2,647 (100.00 %)	3,845,214 (43.88 %)	514,631 (1.06 %)	12,317,013 (32.18 %)	466 (0.01 %)	284,934 (0.89 %)	48,030 (1.35 %)	31,891 (1.03 %)
164	common brushtail (genbank 2020) GCA_011100635.1	37,661 (35.20 %)	n/a	18,681 (0.81 %)	15,375 (0.86 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	0 (0 %)	1,796 (0.56 %)	212 (100.00 %)	7,598,697 (38.92 %)	1,259,434 (1.97 %)	22,071,301 (40.56 %)	0 (0 %)	455,834 (1.17 %)	17,762 (0.38 %)	13,986 (0.24 %)
165	common carp (2014) GCF_000951615.1	75,427 (5.81 %)	n/a	27,632 (2.17 %)	59,950 (5.28 %)	n/a	37.00 (97.48 %)	0 (0 %)	57,940 (2.53 %)	9,378 (100.00 %)	1,460,282 (5.17 %)	987,356 (7.88 %)	9,900,821 (37.41 %)	8 (0.00 %)	1,320,956 (12.02 %)	48,702 (1.38 %)	28,063 (0.71 %)
166	common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank) GCA_017976375.1	50,206 (57.28 %)	n/a	13,179 (1.84 %)	25,859 (2.41 %)	n/a	42.18 (99.58 %)	0 (0 %)	296 (0.42 %)	151 (100.00 %)	521,043 (9.61 %)	310,469 (2.36 %)	6,712,849 (21.76 %)	0 (0 %)	326,521 (1.83 %)	25,267 (1.71 %)	20,672 (1.05 %)
167	common cuckoo (BGI 2014) GCF_000709325.1	16,827 (2.53 %)	n/a	12,599 (1.80 %)	12,623 (2.28 %)	n/a	41.52 (97.64 %)	56,977 (2.38 %)	56,977 (2.38 %)	71,907 (97.62 %)	418,870 (8.06 %)	192,437 (2.08 %)	6,576,259 (19.85 %)	113 (0.02 %)	126,008 (2.66 %)	18,002 (0.74 %)	15,128 (0.57 %)
168	common house spider (v2 Geottingen 2017) GCF_000365465.2	30,064 (3.79 %)	n/a	3,347 (0.23 %)	7,571 (1.48 %)	n/a	29.46 (81.63 %)	247,375 (18.44 %)	247,378 (18.44 %)	263,908 (81.56 %)	587,943 (2.23 %)	464,643 (2.90 %)	10,795,253 (40.31 %)	12,788 (0.38 %)	474,681 (4.16 %)	10,480 (0.23 %)	1,791 (0.05 %)
169	common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank) GCA_000365465.3	37,121 (48.05 %)	n/a	3,276 (0.22 %)	9,098 (1.38 %)	38,273 (4.24 %)	29.40 (98.45 %)	24,382 (1.54 %)	124,228 (1.55 %)	84,235 (98.46 %)	637,694 (2.45 %)	527,781 (4.43 %)	11,553,196 (51.16 %)	299 (0.01 %)	477,709 (3.61 %)	11,998 (0.33 %)	2,762 (0.10 %)
170	common limpet (v1 primary hap 2022) GCF_932274485.1	41,888 (9.21 %)	n/a	3,611 (0.43 %)	13,244 (4.58 %)	44,721 (6.30 %)	36.11 (100.00 %)	0 (0 %)	75 (0.00 %)	13 (100.00 %)	239,042 (1.40 %)	359,961 (7.89 %)	4,399,053 (45.69 %)	5 (0.00 %)	629,372 (7.98 %)	33,411 (1.94 %)	2,344 (0.13 %)
171	common sole (primary hap 2023 genbank) GCA_958295425.1	55,359 (63.58 %)	n/a	14,846 (2.94 %)	42,832 (6.93 %)	n/a	40.87 (99.99 %)	0 (0 %)	373 (0.01 %)	243 (100.00 %)	1,149,249 (19.12 %)	342,239 (9.71 %)	3,906,839 (32.84 %)	2 (0.00 %)	440,509 (5.18 %)	27,772 (2.71 %)	15,561 (0.92 %)
172	common swift (bApuApu2 2021 genbank) GCA_020740795.1	39,986 (53.94 %)	n/a	12,277 (1.88 %)	20,379 (2.16 %)	n/a	41.95 (99.84 %)	0 (0 %)	256 (0.16 %)	109 (100.00 %)	533,758 (8.66 %)	199,748 (1.12 %)	6,353,957 (21.19 %)	1 (0.00 %)	113,872 (0.91 %)	20,393 (1.74 %)	16,313 (0.88 %)
173	common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 genbank) GCA_022682495.1	58,054 (45.51 %)	n/a	18,280 (1.71 %)	19,514 (1.59 %)	n/a	42.98 (99.99 %)	0 (0 %)	611 (0.01 %)	572 (100.00 %)	2,761,820 (28.38 %)	427,940 (3.89 %)	11,250,492 (32.57 %)	37 (0.00 %)	360,489 (1.62 %)	70,700 (2.48 %)	44,288 (1.24 %)
174	common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank) GCA_002940915.2	n/a	n/a	18,511 (1.87 %)	18,170 (1.68 %)	n/a	42.15 (97.78 %)	54,308 (2.23 %)	54,308 (2.23 %)	84,108 (97.77 %)	2,860,991 (29.93 %)	275,245 (1.03 %)	11,798,152 (28.19 %)	237 (0.03 %)	174,536 (2.84 %)	51,833 (1.38 %)	47,411 (1.21 %)
175	common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq) GCF_002940915.1	51,034 (3.23 %)	n/a	18,506 (1.88 %)	18,166 (1.68 %)	n/a	42.15 (97.78 %)	54,308 (2.23 %)	54,308 (2.23 %)	84,109 (97.77 %)	2,861,697 (29.93 %)	275,247 (1.03 %)	11,798,198 (28.19 %)	237 (0.03 %)	174,536 (2.84 %)	51,834 (1.38 %)	47,410 (1.21 %)
176	Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank) GCA_000956105.1	29,369 (33.72 %)	n/a	19,335 (2.10 %)	21,769 (1.63 %)	n/a	41.24 (74.51 %)	276,531 (25.53 %)	276,544 (25.53 %)	299,069 (74.47 %)	3,513,698 (39.82 %)	304,033 (0.59 %)	13,333,842 (21.06 %)	1,491 (0.03 %)	288,329 (2.06 %)	56,694 (1.59 %)	52,345 (1.34 %)
177	cork oak (v1 HL8 2018) GCF_002906115.1	65,969 (8.84 %)	n/a	20,226 (1.95 %)	89,703 (16.66 %)	n/a	36.19 (97.99 %)	0 (0 %)	26,139 (2.01 %)	23,344 (100.00 %)	865,884 (3.63 %)	491,126 (5.95 %)	6,119,503 (36.10 %)	267 (0.02 %)	690,224 (9.50 %)	21,505 (3.50 %)	10,784 (2.71 %)
178	corroboree frog (hap2 2023 genbank) GCA_028390025.1	n/a	n/a	n/a	54,346 (1.07 %)	n/a	45.66 (99.76 %)	0 (0 %)	2,699 (0.24 %)	3,127 (100.00 %)	18,782,633 (75.22 %)	5,902,115 (18.63 %)	5,826 (99.76 %)	23 (0.00 %)	n/a	990,274 (4.84 %)	90,184 (0.51 %)
179	cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank) GCA_002156985.1	21,972 (59.55 %)	17,082 (10.65 %)	4,839 (1.54 %)	21,045 (8.01 %)	n/a	36.13 (89.02 %)	23,558 (11.01 %)	26,910 (11.01 %)	24,551 (88.99 %)	115,046 (2.97 %)	31,900 (0.85 %)	2,230,382 (25.45 %)	1,738 (0.70 %)	33,991 (1.55 %)	15,851 (2.18 %)	9,912 (1.25 %)
180	cowpea (IT97K-499-35 v1 2019) GCF_004118075.1	48,679 (10.56 %)	n/a	16,927 (3.30 %)	44,814 (13.06 %)	54,348 (11.30 %)	32.98 (99.48 %)	0 (0 %)	68 (0.52 %)	682 (100.00 %)	352,238 (4.22 %)	283,949 (8.14 %)	3,092,021 (41.64 %)	1 (0.00 %)	420,724 (7.56 %)	24,513 (2.40 %)	11,823 (1.16 %)
181	crab-eating macaque WashU 2013 genbank GCA_000364345.1	76,183 (45.03 %)	n/a	20,283 (1.90 %)	20,544 (1.22 %)	n/a	40.90 (95.16 %)	80,163 (4.85 %)	80,474 (4.85 %)	87,763 (95.15 %)	5,351,207 (51.35 %)	941,514 (3.24 %)	15,778,449 (35.74 %)	1,138 (0.05 %)	1,213,705 (2.53 %)	76,963 (1.14 %)	28,050 (0.65 %)
182	crab-eating macaque WashU 2013 refseq GCF_000364345.1	76,196 (3.30 %)	n/a	20,209 (1.91 %)	51,427 (6.84 %)	n/a	40.90 (95.16 %)	80,163 (4.85 %)	80,474 (4.85 %)	87,764 (95.15 %)	5,251,819 (50.85 %)	941,514 (3.24 %)	15,778,510 (35.74 %)	1,138 (0.05 %)	1,213,705 (2.53 %)	76,963 (1.14 %)	27,520 (0.64 %)
183	crucian carp (primary hap 2023 genbank) GCA_963082965.1	90,094 (55.93 %)	n/a	29,389 (2.81 %)	88,291 (5.37 %)	n/a	38.31 (99.99 %)	0 (0 %)	832 (0.01 %)	278 (100.00 %)	3,481,389 (45.81 %)	802,775 (6.54 %)	8,190,816 (44.41 %)	1 (0.00 %)	1,003,533 (5.09 %)	83,696 (3.82 %)	26,039 (0.81 %)
184	crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022) GCF_022539665.1	22,902 (28.68 %)	n/a	3,621 (2.94 %)	11,430 (17.96 %)	n/a	40.34 (99.47 %)	0 (0 %)	2 (0.53 %)	227 (100.00 %)	81,008 (2.67 %)	29,625 (4.98 %)	609,395 (25.66 %)	0 (0 %)	39,313 (3.92 %)	6,559 (5.05 %)	5,546 (3.62 %)
185	crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank) GCA_003990815.1	n/a	n/a	3,519 (2.64 %)	12,174 (17.22 %)	n/a	40.54 (93.29 %)	0 (0 %)	13,228 (6.75 %)	4,192 (100.00 %)	63,254 (2.07 %)	22,325 (1.44 %)	728,942 (20.81 %)	35 (0.03 %)	32,114 (3.20 %)	8,375 (4.98 %)	6,466 (3.39 %)
186	crustacean P.pollicipes (v2 AB1234 2020) GCF_011947565.2	30,025 (5.21 %)	n/a	3,968 (0.39 %)	56,084 (8.02 %)	32,834 (5.48 %)	52.34 (98.93 %)	0 (0 %)	10,786 (1.08 %)	1,254 (100.00 %)	361,409 (3.23 %)	533,046 (8.92 %)	3,456,307 (19.29 %)	27 (0.01 %)	627,943 (7.18 %)	6,722 (54.88 %)	103,043 (9.72 %)
187	dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank) GCA_021462225.2	n/a	n/a	15,131 (1.68 %)	50,084 (4.18 %)	n/a	40.18 (99.46 %)	0 (0 %)	409 (0.54 %)	73 (100.00 %)	2,175,293 (47.80 %)	176,956 (1.87 %)	6,142,692 (38.35 %)	4 (0.00 %)	383,249 (3.60 %)	32,973 (1.28 %)	10,198 (0.33 %)
188	Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank) GCA_963259705.1	64,558 (45.64 %)	n/a	19,142 (1.72 %)	22,139 (1.66 %)	n/a	43.18 (99.99 %)	0 (0 %)	1,099 (0.01 %)	122 (100.00 %)	3,040,239 (24.03 %)	796,913 (6.38 %)	10,478,261 (38.84 %)	9 (0.00 %)	756,430 (2.76 %)	64,921 (2.50 %)	57,806 (1.88 %)
189	degu (3935 2012 genbank) GCA_000260255.1	48,152 (35.39 %)	n/a	22,240 (1.40 %)	22,108 (1.46 %)	n/a	41.38 (84.36 %)	252,770 (15.68 %)	252,770 (15.68 %)	259,903 (84.32 %)	4,890,270 (27.82 %)	898,943 (1.50 %)	14,281,942 (29.30 %)	2,582 (0.03 %)	313,025 (1.02 %)	40,135 (0.82 %)	36,410 (0.69 %)
190	denticle herring (v1 2019) GCF_900700375.1	59,645 (12.74 %)	n/a	16,556 (3.78 %)	37,861 (8.42 %)	72,719 (10.66 %)	43.69 (99.18 %)	0 (0 %)	464 (0.82 %)	460 (100.00 %)	403,512 (3.23 %)	224,282 (4.61 %)	2,948,671 (28.79 %)	0 (0 %)	306,165 (4.31 %)	64,661 (9.49 %)	52,867 (4.93 %)
191	diamondback terrapin (hap1 2023 genbank) GCA_027887155.1	50,318 (52.07 %)	n/a	15,109 (1.08 %)	19,281 (1.62 %)	n/a	44.46 (99.92 %)	0 (0 %)	141 (0.08 %)	76 (100.00 %)	4,088,064 (46.33 %)	403,943 (1.72 %)	11,014,504 (33.74 %)	0 (0 %)	407,696 (1.71 %)	110,838 (2.71 %)	30,093 (0.82 %)
192	diplomonads (v1 WB C6 WB C6 2008) GCF_000002435.1	6,502 (71.82 %)	n/a	251 (1.29 %)	2,079 (62.62 %)	n/a	49.25 (99.82 %)	214 (0.19 %)	242 (0.19 %)	306 (99.81 %)	697 (1.34 %)	335 (0.65 %)	20,634 (5.24 %)	19 (0.14 %)	859 (1.76 %)	2,275 (23.86 %)	2,064 (18.94 %)
193	dog (BS72 2019 Broad) GCA_004027395.1	n/a	n/a	22,343 (1.53 %)	28,525 (1.27 %)	n/a	41.66 (99.91 %)	10,428 (0.04 %)	10,428 (0.04 %)	667,170 (99.96 %)	5,598,608 (45.38 %)	1,220,686 (2.58 %)	14,079,363 (36.37 %)	28 (0.00 %)	n/a	62,881 (2.13 %)	53,176 (1.80 %)
194	domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011) GCF_000215625.1	55,980 (3.39 %)	n/a	18,440 (1.59 %)	19,474 (1.48 %)	n/a	41.47 (94.51 %)	109,700 (5.51 %)	109,700 (5.51 %)	117,442 (94.49 %)	n/a	606,818 (1.04 %)	13,503,550 (29.63 %)	1,009 (0.02 %)	309,552 (0.86 %)	53,376 (1.90 %)	51,864 (1.65 %)
195	domestic guinea pig (2N 2008 genbank) GCA_000151735.1	44,762 (33.07 %)	n/a	18,297 (1.33 %)	20,107 (1.34 %)	n/a	39.95 (97.81 %)	58,460 (2.20 %)	58,460 (2.20 %)	61,603 (97.80 %)	4,257,412 (38.85 %)	658,532 (1.25 %)	14,547,631 (34.19 %)	3 (0.00 %)	423,409 (1.39 %)	37,092 (0.85 %)	27,299 (0.63 %)
196	domestic silkworm (genbank 2020) GCA_014905235.2	n/a	n/a	5,227 (1.28 %)	18,795 (5.67 %)	n/a	38.55 (99.90 %)	0 (0 %)	30 (0.10 %)	696 (100.00 %)	615,428 (29.26 %)	86,179 (1.65 %)	2,607,325 (47.66 %)	0 (0 %)	297,922 (5.59 %)	44,022 (10.06 %)	15,414 (1.64 %)
197	domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank) GCA_904849725.1	63,294 (3.74 %)	n/a	18,050 (0.43 %)	260,902 (9.04 %)	n/a	44.46 (99.97 %)	0 (0 %)	162 (0.03 %)	290 (100.00 %)	1,274,894 (2.42 %)	1,726,303 (5.40 %)	14,010,542 (72.58 %)	0 (0 %)	5,823,193 (14.08 %)	732,828 (17.24 %)	271,779 (4.92 %)
198	downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020) GCA_014839835.1	25,483 (48.39 %)	n/a	12,405 (1.70 %)	23,073 (2.18 %)	n/a	45.31 (99.66 %)	0 (0 %)	187 (0.34 %)	181 (100.00 %)	1,008,118 (21.51 %)	378,537 (3.38 %)	5,846,717 (32.04 %)	0 (0 %)	791,076 (4.25 %)	26,005 (1.75 %)	19,919 (1.16 %)
199	downy woodpecker (BGI 2014) GCF_000699005.1	15,850 (2.33 %)	n/a	11,864 (1.67 %)	11,795 (1.99 %)	n/a	44.51 (96.31 %)	96,471 (3.72 %)	96,471 (3.72 %)	127,725 (96.28 %)	842,281 (18.63 %)	310,018 (2.09 %)	5,822,687 (27.83 %)	59 (0.01 %)	397,798 (2.49 %)	17,379 (0.69 %)	13,913 (0.52 %)
200	E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank) GCA_000750555.1	n/a	4,501 (88.85 %)	n/a	n/a	n/a	50.78 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	90 (0.38 %)	19,508 (7.44 %)	0 (0 %)	189 (0.40 %)	1 (99.99 %)	0 (0.00 %)
201	East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019) GCF_008831285.1	39,088 (10.61 %)	n/a	11,569 (2.49 %)	38,114 (15.67 %)	n/a	38.59 (99.98 %)	625 (0.02 %)	627 (0.02 %)	1,425 (99.98 %)	230,165 (2.88 %)	153,929 (4.02 %)	2,160,647 (26.81 %)	1 (0.00 %)	233,651 (6.36 %)	24,567 (4.41 %)	18,177 (2.46 %)
202	eastern European house mouse (PWK_PhJ v1 2016) GCA_001624775.1	n/a	n/a	21,013 (2.21 %)	18,237 (1.40 %)	101,394 (4.09 %)	41.76 (90.89 %)	26,578 (1.66 %)	904,107 (9.24 %)	30,233 (98.34 %)	5,250,349 (40.55 %)	1,508,787 (2.97 %)	13,823,341 (28.09 %)	246,352 (1.73 %)	681,079 (2.29 %)	16,695 (0.43 %)	15,885 (0.40 %)
203	eastern happy (v2 2018) GCF_900246225.1	57,615 (9.59 %)	n/a	15,348 (2.22 %)	28,518 (6.29 %)	42,170 (8.31 %)	41.07 (99.87 %)	115 (0.00 %)	490 (0.13 %)	364 (100.00 %)	527,486 (5.98 %)	217,915 (1.89 %)	4,547,443 (30.78 %)	2 (0.00 %)	212,425 (2.79 %)	33,005 (1.88 %)	16,748 (0.95 %)
204	Egyptian rousette (US006 2019 Broad) GCA_004024865.1	n/a	n/a	20,133 (1.87 %)	36,361 (1.80 %)	n/a	40.23 (99.96 %)	4,332 (0.02 %)	4,332 (0.02 %)	226,086 (99.98 %)	2,985,622 (32.66 %)	475,311 (1.11 %)	12,612,081 (27.34 %)	15 (0.00 %)	n/a	81,930 (5.75 %)	81,575 (4.78 %)
205	Egyptian rousette (v1 2020 genbank) GCA_014176215.1	65,163 (51.34 %)	61,105 (4.04 %)	17,637 (2.08 %)	22,318 (1.84 %)	n/a	40.05 (98.59 %)	0 (0 %)	242 (1.41 %)	30 (100.00 %)	2,821,248 (33.05 %)	434,415 (1.02 %)	12,031,652 (26.52 %)	0 (0 %)	65,562 (0.33 %)	53,604 (6.69 %)	57,305 (5.33 %)
206	elephant shark (2013) GCF_000165045.1	30,695 (4.95 %)	n/a	11,306 (1.54 %)	18,189 (3.03 %)	n/a	42.34 (96.16 %)	46,217 (3.85 %)	46,232 (3.85 %)	67,421 (96.15 %)	1,405,480 (27.29 %)	330,698 (2.60 %)	5,549,534 (36.65 %)	31 (0.01 %)	365,912 (2.44 %)	35,561 (2.16 %)	11,961 (0.52 %)
207	emu (v1 ZJU1.0 2020) GCA_016128335.1	n/a	n/a	13,181 (1.74 %)	24,708 (2.10 %)	33,433 (3.99 %)	42.41 (100.00 %)	0 (0 %)	512 (0.00 %)	802 (100.00 %)	504,527 (4.38 %)	259,276 (2.59 %)	7,105,965 (19.15 %)	8 (0.00 %)	316,149 (1.79 %)	41,784 (5.52 %)	41,105 (3.30 %)
208	epaulette shark (2021 genbank) GCA_020745735.1	43,156 (39.58 %)	n/a	12,439 (0.39 %)	19,520 (1.06 %)	n/a	42.76 (98.05 %)	0 (0 %)	3,716 (1.95 %)	1,963 (100.00 %)	9,211,963 (69.93 %)	935,037 (6.51 %)	20,660,613 (43.88 %)	0 (0 %)	2,903,274 (4.44 %)	41,682 (1.08 %)	13,048 (0.16 %)
209	eudicots lettuce (Salinas v7 2020) GCF_002870075.2	65,115 (2.96 %)	n/a	16,271 (0.65 %)	102,071 (6.37 %)	n/a	37.79 (92.44 %)	3,138 (0.29 %)	353,389 (7.60 %)	11,454 (99.71 %)	1,109,875 (4.83 %)	983,866 (3.64 %)	12,335,790 (52.95 %)	2,249 (0.09 %)	1,828,920 (9.42 %)	117,743 (2.02 %)	19,959 (0.28 %)
210	Euphrates poplar (v1 2014) GCF_000495115.1	56,539 (12.93 %)	n/a	20,844 (4.28 %)	41,664 (12.47 %)	n/a	32.08 (95.31 %)	23,174 (4.71 %)	23,174 (4.71 %)	32,789 (95.29 %)	332,532 (5.23 %)	246,766 (4.06 %)	2,679,673 (43.30 %)	21 (0.01 %)	283,121 (6.41 %)	2,781 (0.47 %)	1,761 (0.21 %)
211	Eurasian badger (v3.1 2021) GCF_922984935.1	57,138 (2.48 %)	n/a	19,265 (1.40 %)	22,121 (1.36 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	0 (0 %)	101 (0.00 %)	538 (100.00 %)	4,487,951 (32.73 %)	821,664 (4.02 %)	13,814,723 (38.08 %)	1 (0.00 %)	1,177,258 (3.11 %)	66,524 (3.95 %)	54,563 (1.83 %)
212	Eurasian red squirrel (v1.1 2019) GCA_902686455.1	n/a	n/a	21,298 (1.58 %)	21,024 (1.36 %)	36,645 (1.54 %)	40.08 (94.33 %)	0 (0 %)	1,177 (5.67 %)	638 (100.00 %)	4,680,964 (35.76 %)	704,218 (1.42 %)	14,991,981 (31.49 %)	5 (0.00 %)	419,662 (1.29 %)	48,159 (1.04 %)	45,455 (0.95 %)
213	Eurasian water vole (v1 2020) GCF_903992535.1	45,658 (2.52 %)	n/a	19,724 (1.77 %)	19,069 (1.47 %)	34,561 (2.01 %)	42.15 (99.74 %)	0 (0 %)	872 (0.26 %)	216 (100.00 %)	4,098,151 (26.75 %)	1,088,237 (2.91 %)	12,853,776 (32.42 %)	5 (0.00 %)	518,686 (1.69 %)	19,000 (0.58 %)	16,851 (0.46 %)
214	European conger (primary hap 2023 genbank) GCA_963514075.1	54,631 (54.17 %)	n/a	17,073 (1.89 %)	34,794 (5.07 %)	n/a	43.89 (99.98 %)	13 (0.00 %)	1,009 (0.02 %)	394 (100.00 %)	761,527 (5.99 %)	913,328 (13.25 %)	5,768,003 (35.48 %)	3 (0.00 %)	1,603,442 (8.94 %)	120,990 (6.12 %)	81,342 (2.93 %)
215	European eel (primary hap 2020 genbank) GCA_013347855.1	n/a	n/a	17,048 (2.22 %)	34,271 (5.56 %)	n/a	43.64 (99.61 %)	0 (0 %)	640 (0.40 %)	53 (100.00 %)	831,037 (5.48 %)	786,520 (8.15 %)	5,700,818 (27.40 %)	2 (0.00 %)	774,914 (5.14 %)	130,345 (8.19 %)	94,445 (4.12 %)
216	European mink (primary hap 2023 genbank) GCA_030435805.1	69,556 (45.15 %)	n/a	18,706 (1.46 %)	21,193 (1.37 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	0 (0 %)	39 (0.00 %)	26 (100.00 %)	4,237,797 (30.90 %)	792,898 (2.69 %)	13,417,248 (36.59 %)	0 (0 %)	894,273 (2.55 %)	67,133 (2.54 %)	51,333 (1.62 %)
217	European peacock (2021 genbank) GCA_905147045.1	22,557 (62.12 %)	n/a	4,716 (1.16 %)	12,599 (4.34 %)	26,251 (7.81 %)	33.70 (100.00 %)	0 (0 %)	10 (0.00 %)	42 (100.00 %)	212,528 (2.58 %)	60,682 (1.18 %)	3,127,157 (46.89 %)	0 (0 %)	154,469 (3.96 %)	24,620 (4.88 %)	7,312 (0.89 %)
218	European plaice (primary hap 2022 genbank) GCA_947347685.1	46,467 (52.27 %)	n/a	14,820 (2.71 %)	51,453 (7.41 %)	n/a	42.51 (99.97 %)	0 (0 %)	1,072 (0.03 %)	356 (100.00 %)	476,317 (3.63 %)	520,730 (13.27 %)	3,283,400 (33.55 %)	2 (0.00 %)	525,277 (6.36 %)	47,051 (4.45 %)	21,879 (1.29 %)
219	European snow vole (primary hap 2023 genbank) GCA_950005125.1	47,025 (39.90 %)	n/a	20,576 (1.75 %)	21,171 (1.56 %)	n/a	41.98 (100.00 %)	0 (0 %)	197 (0.00 %)	161 (100.00 %)	3,580,811 (22.71 %)	998,537 (5.14 %)	12,204,125 (34.97 %)	4 (0.00 %)	954,164 (3.20 %)	20,725 (0.63 %)	17,303 (0.45 %)
220	European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019) GCA_901699165.1	n/a	n/a	11,276 (1.79 %)	21,238 (2.15 %)	n/a	41.73 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,333 (100.00 %)	466,567 (7.08 %)	182,345 (0.97 %)	6,037,183 (20.24 %)	0 (0 %)	110,549 (1.11 %)	29,648 (2.35 %)	26,084 (1.59 %)
221	European turtle dove (v1.1 primary hap 2019) GCA_901699155.1	n/a	n/a	12,415 (1.77 %)	23,484 (2.17 %)	n/a	41.84 (99.67 %)	0 (0 %)	894 (0.33 %)	357 (100.00 %)	539,737 (7.60 %)	227,500 (1.16 %)	6,768,805 (21.05 %)	4 (0.00 %)	181,333 (1.65 %)	34,729 (2.65 %)	30,692 (1.70 %)
222	European woodmouse (2022 genbank) GCA_947179515.1	54,113 (34.13 %)	n/a	19,960 (1.65 %)	19,954 (1.25 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	0 (0 %)	1,129 (0.01 %)	498 (100.00 %)	4,863,656 (37.41 %)	1,795,997 (8.95 %)	13,681,786 (40.58 %)	17 (0.00 %)	2,516,599 (5.37 %)	23,961 (0.53 %)	17,318 (0.36 %)
223	fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank) GCA_011064685.1	32,738 (63.63 %)	n/a	5,744 (1.12 %)	26,631 (7.08 %)	n/a	36.43 (99.99 %)	0 (0 %)	525 (0.01 %)	91 (100.00 %)	168,479 (1.60 %)	72,876 (1.70 %)	3,384,083 (37.35 %)	0 (0 %)	128,947 (2.55 %)	30,753 (4.27 %)	12,571 (1.35 %)
224	fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020) GCF_011064685.1	32,751 (9.65 %)	n/a	5,744 (1.12 %)	26,632 (7.08 %)	n/a	36.43 (99.99 %)	0 (0 %)	525 (0.01 %)	92 (100.00 %)	169,122 (1.61 %)	72,892 (1.70 %)	3,384,365 (37.36 %)	0 (0 %)	128,947 (2.55 %)	30,753 (4.27 %)	12,571 (1.35 %)
225	fire-bellied toad (primary hap 2023 genbank) GCA_027579735.1	n/a	n/a	15,456 (0.21 %)	47,501 (0.88 %)	n/a	38.98 (98.02 %)	0 (0 %)	7,009 (1.99 %)	2,468 (100.00 %)	20,643,710 (70.75 %)	7,150,262 (12.27 %)	9,477 (98.01 %)	3 (0.00 %)	n/a	365,066 (1.20 %)	29,706 (0.10 %)
226	fission yeast (v1 972h- 2007 refseq) GCF_000002945.1	6,744 (82.69 %)	n/a	5,085 (73.29 %)	3,403 (39.29 %)	n/a	36.05 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	4 (100.00 %)	3,336 (2.63 %)	1,034 (0.58 %)	80,458 (16.22 %)	1 (0.01 %)	411 (0.72 %)	105 (0.31 %)	95 (0.28 %)
227	fission yeast (v2 972h- 2019 genbank) GCA_000002945.3	n/a	17,791 (77.29 %)	5,084 (73.46 %)	3,394 (39.28 %)	n/a	36.06 (100.00 %)	6 (0.00 %)	6 (0.00 %)	9 (100.00 %)	3,053 (1.03 %)	1,034 (0.58 %)	79,714 (16.06 %)	1 (0.01 %)	411 (0.72 %)	105 (0.31 %)	95 (0.28 %)
228	flatworm S.haematobium (v2 2020) GCF_000699445.2	8,934 (5.16 %)	n/a	1,548 (0.29 %)	4,070 (2.36 %)	8,934 (5.16 %)	34.53 (99.76 %)	0 (0 %)	15,128 (0.26 %)	666 (100.00 %)	124,259 (1.58 %)	35,312 (1.17 %)	2,638,150 (34.10 %)	31 (0.01 %)	69,190 (3.97 %)	3,957 (0.38 %)	906 (0.11 %)
229	flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank) GCA_007364275.2	n/a	n/a	15,436 (2.15 %)	26,448 (5.90 %)	64,657 (6.60 %)	41.23 (98.19 %)	0 (0 %)	744 (1.81 %)	189 (100.00 %)	1,014,141 (16.95 %)	287,037 (2.21 %)	5,305,987 (30.67 %)	0 (0 %)	227,443 (2.84 %)	24,130 (1.26 %)	11,082 (0.48 %)
230	Florida manatee (Lorelei 2012 genbank) GCA_000243295.1	39,651 (35.92 %)	n/a	18,302 (1.36 %)	20,592 (1.23 %)	32,831 (1.38 %)	40.73 (89.24 %)	160,167 (10.78 %)	160,167 (10.78 %)	166,489 (89.22 %)	5,109,822 (37.03 %)	389,314 (0.74 %)	14,633,007 (38.46 %)	5,748 (0.06 %)	244,060 (0.64 %)	27,461 (0.64 %)	25,464 (0.54 %)
231	fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019) GCF_009650485.1	24,196 (18.66 %)	n/a	10,065 (8.48 %)	14,473 (13.61 %)	n/a	38.15 (100.00 %)	0 (0 %)	7 (0.00 %)	11 (100.00 %)	298,709 (14.86 %)	80,048 (3.56 %)	1,317,733 (33.56 %)	0 (0 %)	69,521 (4.49 %)	18,849 (8.62 %)	11,752 (5.15 %)
232	fly D.santomea (v1.0 2021) GCF_016746245.1	25,550 (21.64 %)	n/a	13,354 (17.52 %)	20,540 (17.87 %)	n/a	42.61 (100.00 %)	0 (0 %)	14 (0.00 %)	104 (100.00 %)	169,365 (23.08 %)	64,316 (3.47 %)	791,743 (23.14 %)	0 (0 %)	69,581 (6.26 %)	27,794 (16.15 %)	20,742 (10.27 %)
233	fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine) GCF_004382195.1	26,658 (22.06 %)	n/a	13,461 (17.65 %)	21,781 (17.83 %)	n/a	42.26 (100.00 %)	0 (0 %)	38 (0.00 %)	402 (100.00 %)	145,818 (25.16 %)	34,869 (4.31 %)	719,811 (25.74 %)	0 (0 %)	87,076 (8.91 %)	30,130 (16.11 %)	22,906 (10.22 %)
234	fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017) GCF_002093755.1	21,759 (15.21 %)	n/a	12,488 (9.92 %)	21,269 (14.06 %)	n/a	39.11 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,356 (100.00 %)	314,594 (25.90 %)	82,446 (12.33 %)	1,113,448 (37.00 %)	0 (0 %)	199,881 (8.53 %)	27,493 (12.03 %)	20,330 (8.62 %)
235	fly D.simulans (w501 v3.0 2021) GCF_016746395.1	28,595 (26.45 %)	n/a	13,448 (20.44 %)	18,989 (18.34 %)	n/a	42.47 (100.00 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	96 (100.00 %)	126,424 (16.72 %)	32,595 (4.31 %)	759,296 (23.70 %)	0 (0 %)	46,993 (4.17 %)	27,530 (17.02 %)	20,622 (10.65 %)
236	fly D.yakuba (2018) GCF_000005975.2	5,444 (4.10 %)	n/a	13,713 (15.95 %)	22,613 (16.71 %)	n/a	42.28 (98.12 %)	5,317 (1.88 %)	5,400 (1.88 %)	13,440 (98.12 %)	180,908 (22.48 %)	68,911 (3.75 %)	897,353 (23.94 %)	85 (0.04 %)	85,136 (6.91 %)	31,387 (14.91 %)	22,960 (9.55 %)
237	fly D.yakuba (v1 2021) GCF_016746365.1	27,938 (24.60 %)	n/a	13,343 (17.86 %)	20,029 (17.64 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	54 (100.00 %)	169,559 (23.47 %)	60,591 (3.64 %)	837,616 (23.40 %)	0 (0 %)	64,895 (6.52 %)	28,204 (16.22 %)	22,365 (10.80 %)
238	Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank) GCA_902459505.1	54,713 (61.19 %)	n/a	14,267 (0.51 %)	29,026 (1.40 %)	n/a	43.24 (99.85 %)	0 (0 %)	433 (0.15 %)	163 (100.00 %)	1,311,113 (1.64 %)	1,364,596 (3.83 %)	19,589,738 (52.85 %)	3 (0.00 %)	1,182,977 (2.68 %)	270,923 (4.52 %)	38,622 (0.50 %)
239	Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq) GCF_902459505.1	54,713 (1.72 %)	n/a	14,269 (0.51 %)	29,026 (1.40 %)	n/a	43.24 (99.85 %)	0 (0 %)	433 (0.15 %)	164 (100.00 %)	1,310,970 (1.64 %)	1,364,597 (3.83 %)	19,589,802 (52.85 %)	3 (0.00 %)	1,182,977 (2.68 %)	270,923 (4.52 %)	38,622 (0.50 %)
240	giant panda (2009 BGI) GCF_000004335.2	40,432 (2.55 %)	n/a	18,884 (1.76 %)	18,919 (1.46 %)	n/a	41.60 (97.66 %)	119,126 (2.36 %)	119,126 (2.36 %)	200,593 (97.64 %)	4,236,423 (40.48 %)	503,179 (1.10 %)	13,781,487 (28.85 %)	48 (0.00 %)	252,804 (0.90 %)	53,465 (1.34 %)	45,835 (1.12 %)
241	giant panda (Jingjing v1 2017) GCA_002007445.1	n/a	n/a	20,110 (1.71 %)	22,288 (1.49 %)	n/a	41.69 (98.08 %)	186,846 (1.93 %)	186,846 (1.93 %)	244,258 (98.07 %)	4,464,041 (41.66 %)	614,896 (2.00 %)	14,294,774 (30.62 %)	9,506 (0.14 %)	580,134 (4.39 %)	59,340 (1.50 %)	49,319 (1.23 %)
242	giant panda (Jingjing v2 genbank 2020) GCA_002007445.2	n/a	n/a	20,381 (1.71 %)	21,979 (1.44 %)	43,086 (2.00 %)	41.69 (98.09 %)	0 (0 %)	190,364 (1.92 %)	77,287 (100.00 %)	4,484,597 (41.53 %)	618,595 (2.00 %)	14,236,406 (30.39 %)	9,762 (0.14 %)	583,295 (4.39 %)	59,945 (1.50 %)	49,872 (1.23 %)
243	giant panda (Jingjing v2 refseq 2020) GCF_002007445.1	67,162 (3.32 %)	n/a	20,374 (1.71 %)	21,965 (1.44 %)	43,086 (2.00 %)	41.69 (98.09 %)	0 (0 %)	190,364 (1.92 %)	77,288 (100.00 %)	4,476,689 (41.47 %)	618,596 (2.00 %)	14,236,463 (30.39 %)	9,762 (0.14 %)	583,300 (4.39 %)	59,946 (1.50 %)	49,916 (1.23 %)
244	gilthead seabream (v1 2019) GCF_900880675.1	59,027 (10.96 %)	n/a	15,412 (2.36 %)	31,802 (6.47 %)	73,197 (7.97 %)	41.94 (99.96 %)	0 (0 %)	1,050 (0.04 %)	176 (100.00 %)	531,360 (3.04 %)	305,809 (3.03 %)	4,701,694 (25.69 %)	0 (0 %)	355,475 (3.53 %)	47,327 (2.41 %)	23,697 (1.07 %)
245	Glanville fritillary (genbank 2021) GCA_905220565.1	17,520 (43.15 %)	n/a	4,738 (0.89 %)	16,197 (5.05 %)	35,235 (7.97 %)	34.09 (100.00 %)	0 (0 %)	80 (0.01 %)	32 (100.00 %)	343,193 (3.25 %)	144,286 (3.46 %)	3,683,956 (48.60 %)	0 (0 %)	198,815 (3.74 %)	30,200 (4.54 %)	11,245 (1.52 %)
246	globe artichoke (v1 2C 2018) GCF_001531365.1	42,119 (6.72 %)	n/a	15,804 (2.23 %)	49,721 (11.10 %)	n/a	35.35 (90.31 %)	5,305 (0.07 %)	310,473 (9.77 %)	13,588 (99.93 %)	394,687 (2.79 %)	364,361 (3.37 %)	4,191,676 (39.48 %)	3,050 (0.15 %)	283,546 (3.56 %)	12,198 (0.64 %)	7,326 (0.39 %)
247	goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank) GCA_001704415.1	n/a	n/a	19,842 (1.43 %)	22,426 (1.24 %)	52,608 (1.64 %)	43.16 (100.00 %)	0 (0 %)	790 (0.00 %)	29,906 (100.00 %)	5,669,868 (50.59 %)	760,836 (7.07 %)	13,024,386 (44.85 %)	0 (0 %)	2,571,292 (5.65 %)	125,682 (4.01 %)	44,489 (1.09 %)
248	goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq) GCF_001704415.1	47,206 (2.31 %)	46,486 (2.23 %)	19,857 (1.43 %)	22,880 (1.27 %)	52,608 (1.64 %)	43.16 (100.00 %)	0 (0 %)	790 (0.00 %)	29,907 (100.00 %)	5,578,287 (50.22 %)	760,837 (7.07 %)	13,024,440 (44.85 %)	0 (0 %)	2,571,292 (5.65 %)	125,682 (4.02 %)	44,510 (1.09 %)
249	golden eagle (v1.2 2019) GCF_900496995.1	55,164 (5.86 %)	n/a	13,226 (1.87 %)	23,033 (2.15 %)	25,921 (3.22 %)	42.11 (99.61 %)	0 (0 %)	191 (0.39 %)	142 (100.00 %)	519,341 (5.86 %)	180,990 (0.79 %)	7,005,531 (19.25 %)	1 (0.00 %)	53,053 (0.51 %)	37,343 (3.12 %)	34,701 (1.97 %)
250	golden eagle (v1.2 alternate hap 2019) GCA_902153765.1	n/a	n/a	9,334 (1.82 %)	17,594 (2.12 %)	n/a	42.53 (99.93 %)	0 (0 %)	39 (0.07 %)	3,860 (100.00 %)	356,284 (6.03 %)	123,430 (0.80 %)	4,417,887 (19.25 %)	0 (0 %)	53,254 (0.85 %)	28,919 (3.52 %)	25,970 (2.20 %)
251	golden hamster (Baylor 2013 genbank) GCA_000349665.1	n/a	n/a	18,965 (1.82 %)	19,339 (1.52 %)	n/a	42.01 (82.92 %)	216,216 (17.12 %)	216,216 (17.12 %)	237,699 (82.88 %)	3,724,142 (27.19 %)	790,256 (1.69 %)	12,003,866 (24.29 %)	3,589 (0.05 %)	254,929 (0.76 %)	18,591 (0.51 %)	17,093 (0.42 %)
252	golden snub-nosed monkey (2014 Novogene) GCA_000769185.1	n/a	n/a	21,341 (1.86 %)	22,492 (1.24 %)	n/a	40.87 (98.50 %)	61,291 (1.50 %)	61,291 (1.50 %)	196,804 (98.50 %)	5,673,299 (51.36 %)	1,080,627 (3.06 %)	16,205,827 (36.77 %)	187 (0.01 %)	1,068,178 (2.78 %)	79,387 (1.14 %)	27,171 (0.63 %)
253	grape phylloxera (Bord-2020 2022 genbank) GCA_025091365.1	n/a	n/a	2,982 (0.90 %)	5,710 (2.77 %)	n/a	27.24 (97.73 %)	0 (0 %)	41,970 (2.29 %)	8,544 (100.00 %)	195,538 (3.32 %)	65,664 (2.79 %)	2,529,566 (54.06 %)	4,954 (0.23 %)	100,935 (4.52 %)	4,357 (1.18 %)	3,416 (0.91 %)
254	gray mouse lemur genbank GCA_000165445.3	n/a	n/a	20,031 (1.89 %)	22,619 (1.50 %)	n/a	40.98 (95.94 %)	43,305 (4.06 %)	43,363 (4.06 %)	50,982 (95.94 %)	4,082,873 (41.60 %)	582,430 (1.47 %)	14,808,558 (30.05 %)	325 (0.02 %)	1,168,690 (4.77 %)	74,772 (2.61 %)	69,260 (2.12 %)
255	gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank) GCA_027887165.1	73,383 (42.66 %)	n/a	16,638 (0.72 %)	16,171 (0.86 %)	n/a	37.92 (99.11 %)	0 (0 %)	2,255 (0.89 %)	14 (100.00 %)	5,562,366 (25.40 %)	1,096,625 (2.60 %)	22,322,798 (43.37 %)	13 (0.00 %)	n/a	28,894 (0.57 %)	22,987 (0.42 %)
256	great fruit-eating bat (v1 hap1 2024) GCA_038363095.1	n/a	n/a	18,022 (1.56 %)	20,018 (1.52 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	0 (0 %)	81 (0.00 %)	419 (100.00 %)	2,827,417 (26.82 %)	371,479 (4.97 %)	11,603,093 (34.64 %)	1 (0.00 %)	522,672 (1.87 %)	71,574 (2.28 %)	54,020 (1.50 %)
257	great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank) GCA_001890085.1	50,937 (43.78 %)	n/a	19,011 (2.00 %)	19,882 (1.66 %)	41,741 (2.41 %)	41.11 (87.42 %)	0 (0 %)	172,751 (12.60 %)	7,570 (100.00 %)	3,078,210 (32.07 %)	495,290 (1.05 %)	11,588,202 (25.43 %)	2,116 (0.03 %)	193,024 (1.10 %)	33,101 (0.97 %)	30,240 (0.87 %)
258	great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq) GCF_001890085.1	50,937 (3.26 %)	n/a	18,992 (2.00 %)	19,880 (1.66 %)	41,778 (2.41 %)	41.11 (87.42 %)	0 (0 %)	172,751 (12.60 %)	7,571 (100.00 %)	3,285,971 (33.14 %)	495,292 (1.05 %)	11,588,248 (25.43 %)	2,116 (0.03 %)	193,024 (1.10 %)	33,101 (0.97 %)	29,553 (0.86 %)
259	greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020) GCA_014108255.1	n/a	41,563 (2.11 %)	18,531 (1.97 %)	20,309 (1.67 %)	n/a	40.52 (99.19 %)	0 (0 %)	292 (0.81 %)	50 (100.00 %)	3,284,473 (35.00 %)	559,653 (1.29 %)	12,043,562 (29.15 %)	0 (0 %)	155,142 (0.71 %)	32,047 (1.05 %)	30,235 (0.96 %)
260	greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank) GCA_004115265.2	53,353 (46.77 %)	n/a	18,647 (1.97 %)	20,359 (1.68 %)	n/a	40.54 (99.64 %)	0 (0 %)	158 (0.36 %)	135 (100.00 %)	3,301,020 (34.99 %)	564,790 (1.35 %)	12,217,069 (29.39 %)	0 (0 %)	171,202 (0.67 %)	32,445 (1.06 %)	30,625 (0.98 %)
261	greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq) GCF_004115265.1	53,352 (3.13 %)	n/a	18,647 (1.97 %)	20,359 (1.68 %)	n/a	40.54 (99.64 %)	0 (0 %)	158 (0.36 %)	134 (100.00 %)	3,300,836 (34.99 %)	564,789 (1.35 %)	12,217,020 (29.39 %)	0 (0 %)	171,202 (0.67 %)	32,445 (1.06 %)	30,627 (0.98 %)
262	greater mouse-eared bat (2019 Broad) GCA_004026985.1	n/a	n/a	23,153 (1.31 %)	51,642 (1.43 %)	n/a	43.16 (99.88 %)	8,133 (0.04 %)	8,133 (0.04 %)	1,053,330 (99.96 %)	3,675,075 (25.48 %)	938,700 (2.73 %)	12,027,923 (39.01 %)	44 (0.00 %)	n/a	80,955 (2.31 %)	64,379 (1.67 %)
263	greater pipefish (v1.1 2019) GCA_901709675.1	n/a	n/a	13,467 (5.26 %)	42,380 (12.01 %)	n/a	43.46 (100.00 %)	0 (0 %)	43 (0.00 %)	87 (100.00 %)	193,442 (3.05 %)	125,716 (4.25 %)	1,676,004 (25.93 %)	0 (0 %)	112,918 (3.25 %)	46,340 (13.40 %)	32,897 (5.93 %)
264	greater sac-winged bat (primary hap 2024 genbank) GCA_036850765.1	n/a	n/a	18,322 (1.40 %)	21,049 (1.35 %)	n/a	41.71 (98.73 %)	102 (0.41 %)	468 (1.27 %)	359 (99.59 %)	4,247,148 (29.53 %)	1,031,385 (2.50 %)	12,465,194 (43.30 %)	3 (0.00 %)	1,113,639 (2.95 %)	101,620 (2.01 %)	44,590 (1.04 %)
265	greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank) GCA_003640425.2	20,814 (51.89 %)	n/a	4,346 (0.99 %)	12,930 (3.50 %)	21,226 (7.60 %)	33.06 (99.10 %)	0 (0 %)	27,314 (0.92 %)	13,303 (100.00 %)	270,925 (3.18 %)	86,050 (1.20 %)	3,416,162 (48.29 %)	102 (0.01 %)	135,364 (1.95 %)	11,043 (1.07 %)	7,092 (0.63 %)
266	green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007) GCF_000002595.1	14,484 (22.24 %)	n/a	987 (0.55 %)	11,299 (59.37 %)	n/a	63.87 (87.58 %)	9,827 (12.45 %)	10,425 (12.45 %)	11,385 (87.55 %)	167,652 (16.23 %)	100,391 (4.60 %)	734,057 (30.38 %)	3 (0.00 %)	37,459 (3.99 %)	3,154 (63.45 %)	17,305 (12.08 %)
267	green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank) GCA_000002595.3	n/a	19,528 (53.99 %)	988 (0.56 %)	9,689 (59.71 %)	n/a	64.08 (96.36 %)	1,459 (3.65 %)	1,459 (3.65 %)	1,512 (96.35 %)	171,684 (17.03 %)	110,553 (6.12 %)	748,240 (34.06 %)	26 (0.03 %)	48,564 (5.08 %)	106 (99.48 %)	15,883 (12.21 %)
268	green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank) GCA_000147415.1	9,780 (62.01 %)	9,780 (32.79 %)	743 (1.01 %)	4,520 (67.55 %)	n/a	67.14 (91.48 %)	3,396 (8.55 %)	3,543 (8.55 %)	3,810 (91.45 %)	65,787 (8.35 %)	28,736 (2.86 %)	416,740 (37.15 %)	0 (0 %)	6,856 (2.06 %)	776 (95.90 %)	9,593 (9.00 %)
269	green monkey 1994-021 (2014 genbank) GCA_000409795.2	76,037 (46.89 %)	n/a	20,079 (1.94 %)	20,246 (1.25 %)	n/a	40.81 (98.67 %)	160,731 (1.35 %)	178,925 (1.35 %)	163,017 (98.65 %)	5,382,039 (50.20 %)	980,479 (2.63 %)	16,076,172 (35.62 %)	23,631 (0.16 %)	934,122 (2.70 %)	50,033 (1.04 %)	27,104 (0.75 %)
270	green sea turtle (BGI 2013) GCF_000344595.1	31,786 (2.57 %)	n/a	14,548 (1.02 %)	15,297 (1.46 %)	n/a	43.49 (95.57 %)	134,344 (4.44 %)	134,344 (4.44 %)	274,367 (95.56 %)	1,615,553 (13.87 %)	317,600 (2.08 %)	11,732,990 (28.32 %)	129 (0.02 %)	n/a	36,782 (0.70 %)	21,797 (0.42 %)
271	green sea turtle (v1 2020) GCF_015237465.1	56,917 (3.63 %)	n/a	14,729 (1.06 %)	17,439 (1.56 %)	n/a	44.01 (99.44 %)	0 (0 %)	294 (0.56 %)	99 (100.00 %)	1,641,730 (15.08 %)	304,356 (1.25 %)	11,136,918 (31.96 %)	0 (0 %)	429,794 (1.68 %)	49,035 (1.44 %)	26,943 (0.68 %)
272	harbor porpoise (BS71 2019) GCA_004363495.1	n/a	n/a	21,044 (1.46 %)	30,072 (1.23 %)	n/a	41.83 (99.88 %)	7,114 (0.03 %)	7,114 (0.03 %)	1,338,272 (99.97 %)	5,359,537 (46.83 %)	772,736 (1.54 %)	13,705,428 (42.29 %)	44 (0.00 %)	n/a	80,965 (1.65 %)	55,941 (1.28 %)
273	Harpy eagle (primary hap 2022 genbank) GCA_026419915.1	51,641 (50.37 %)	n/a	13,412 (1.70 %)	24,002 (2.05 %)	n/a	43.39 (99.80 %)	0 (0 %)	342 (0.20 %)	322 (100.00 %)	456,476 (3.62 %)	260,495 (7.70 %)	5,658,773 (24.81 %)	1 (0.00 %)	480,042 (2.70 %)	60,606 (5.66 %)	30,636 (1.52 %)
274	Hawaiian crow (2021 genbank) GCA_020740725.1	51,593 (54.67 %)	n/a	12,737 (1.83 %)	23,664 (2.30 %)	n/a	43.30 (99.84 %)	0 (0 %)	294 (0.16 %)	187 (100.00 %)	502,844 (6.10 %)	304,680 (5.73 %)	5,953,316 (23.59 %)	3 (0.00 %)	336,844 (2.41 %)	46,108 (3.49 %)	24,228 (1.26 %)
275	Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank) GCA_002201575.1	n/a	n/a	19,385 (1.74 %)	20,265 (1.41 %)	33,375 (1.66 %)	41.41 (97.77 %)	0 (0 %)	38,833 (2.24 %)	7,871 (100.00 %)	4,629,031 (43.70 %)	573,328 (1.09 %)	13,374,887 (33.10 %)	882 (0.03 %)	587,399 (1.58 %)	50,379 (1.45 %)	46,745 (1.27 %)
276	Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq) GCF_002201575.1	29,897 (1.95 %)	29,595 (1.94 %)	19,404 (1.74 %)	20,264 (1.41 %)	33,412 (1.67 %)	41.41 (97.77 %)	0 (0 %)	38,833 (2.24 %)	7,872 (100.00 %)	4,547,865 (43.29 %)	573,335 (1.09 %)	13,374,928 (33.10 %)	882 (0.03 %)	587,410 (1.58 %)	50,380 (1.45 %)	46,841 (1.28 %)
277	hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank) GCA_030028045.1	64,153 (41.00 %)	n/a	20,337 (1.62 %)	20,633 (1.37 %)	n/a	41.60 (100.00 %)	0 (0 %)	226 (0.00 %)	356 (100.00 %)	3,783,435 (35.17 %)	567,796 (3.38 %)	13,462,481 (35.48 %)	2 (0.00 %)	396,368 (1.55 %)	48,365 (1.91 %)	44,048 (1.34 %)
278	Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020) GCF_014824575.1	49,894 (2.81 %)	n/a	18,317 (1.66 %)	19,991 (1.63 %)	n/a	42.33 (99.79 %)	0 (0 %)	38,823 (0.21 %)	27,486 (100.00 %)	2,844,834 (29.10 %)	367,443 (1.49 %)	11,805,151 (31.26 %)	151 (0.00 %)	330,522 (1.83 %)	59,262 (1.70 %)	48,287 (1.35 %)
279	honeybee mite (v1 2017) GCF_002443255.1	35,654 (12.86 %)	n/a	2,741 (0.61 %)	28,868 (8.05 %)	n/a	40.92 (99.93 %)	0 (0 %)	3,073 (0.07 %)	1,426 (100.00 %)	117,879 (1.26 %)	43,685 (1.30 %)	1,858,762 (15.09 %)	11 (0.00 %)	32,482 (0.75 %)	31,400 (5.04 %)	28,693 (3.46 %)
280	hooded crow (v2 S_Up_H32 2017) GCF_000738735.2	35,874 (6.47 %)	n/a	11,298 (1.84 %)	17,627 (2.12 %)	n/a	41.48 (97.07 %)	0 (0 %)	27,795 (2.94 %)	113 (100.00 %)	392,199 (5.95 %)	139,126 (0.76 %)	6,141,002 (18.21 %)	16 (0.00 %)	38,866 (0.37 %)	12,943 (0.48 %)	10,321 (0.36 %)
281	hooded crow (v5 S_Up_H32 2021) GCF_000738735.5	42,799 (57.51 %)	n/a	11,845 (1.92 %)	20,738 (2.23 %)	n/a	42.10 (99.68 %)	0 (0 %)	425 (0.32 %)	47 (100.00 %)	421,463 (6.12 %)	164,830 (0.93 %)	6,148,741 (19.00 %)	0 (0 %)	77,475 (0.63 %)	25,266 (2.09 %)	20,747 (1.24 %)
282	horse (Twilight 2007 genbank) GCA_000002305.1	n/a	n/a	18,575 (1.67 %)	17,121 (1.34 %)	n/a	41.50 (98.14 %)	45,680 (1.86 %)	45,680 (1.86 %)	55,316 (98.14 %)	3,941,878 (45.17 %)	381,229 (1.99 %)	14,674,265 (29.80 %)	3 (0.00 %)	384,525 (1.12 %)	45,521 (1.52 %)	36,682 (0.85 %)
283	hourglass treefrog (paternal 2023 genbank) GCA_027789765.1	n/a	n/a	14,058 (0.89 %)	31,050 (2.69 %)	n/a	43.97 (99.70 %)	0 (0 %)	804 (0.30 %)	2,200 (100.00 %)	906,816 (2.43 %)	1,710,859 (17.48 %)	10,069,798 (51.41 %)	3 (0.00 %)	3,539,111 (9.05 %)	235,277 (5.56 %)	28,414 (0.63 %)
284	house finch (primary hap 2022 genbank) GCA_027477595.1	43,228 (49.63 %)	n/a	12,700 (1.83 %)	24,567 (2.38 %)	n/a	42.91 (99.02 %)	0 (0 %)	295 (0.98 %)	183 (100.00 %)	440,379 (3.17 %)	463,164 (6.37 %)	6,300,100 (23.47 %)	1 (0.00 %)	573,829 (3.39 %)	30,897 (2.53 %)	22,852 (1.24 %)
285	house fly (aabys 2013 genbank) GCA_000371365.1	n/a	n/a	7,825 (1.36 %)	12,819 (3.07 %)	n/a	35.11 (92.22 %)	83,567 (7.82 %)	102,610 (7.82 %)	104,053 (92.18 %)	415,874 (2.30 %)	376,409 (8.80 %)	4,931,104 (52.61 %)	1,284 (0.11 %)	575,203 (6.40 %)	7,139 (0.35 %)	3,214 (0.17 %)
286	house mouse (AKR_J v1 2016) GCA_001624295.1	n/a	n/a	21,299 (2.19 %)	18,730 (1.41 %)	102,168 (4.09 %)	41.70 (86.82 %)	34,083 (4.00 %)	314,064 (13.22 %)	40,550 (96.00 %)	5,186,721 (40.97 %)	1,485,719 (3.05 %)	13,610,761 (27.42 %)	18,106 (1.03 %)	469,625 (2.17 %)	16,745 (0.41 %)	15,817 (0.38 %)
287	house mouse (A_J v1 2016) GCA_001624215.1	n/a	n/a	21,171 (2.20 %)	18,776 (1.40 %)	102,254 (4.12 %)	41.70 (89.34 %)	28,597 (3.99 %)	365,877 (10.71 %)	33,692 (96.01 %)	5,186,523 (40.90 %)	1,483,826 (3.06 %)	13,614,266 (28.13 %)	38,843 (1.02 %)	487,933 (2.04 %)	16,590 (0.42 %)	15,701 (0.39 %)
288	house mouse (BALB_cJ v1 2016) GCA_001632525.1	n/a	n/a	21,337 (2.21 %)	18,682 (1.41 %)	102,138 (4.14 %)	41.74 (88.91 %)	32,984 (4.16 %)	361,689 (11.14 %)	37,453 (95.84 %)	5,096,953 (40.72 %)	1,407,754 (2.90 %)	13,416,041 (27.66 %)	15,793 (0.80 %)	453,227 (1.90 %)	16,788 (0.42 %)	15,890 (0.39 %)
289	house mouse (C3H_HeJ v1 2016) GCA_001632575.1	n/a	n/a	21,177 (2.22 %)	18,550 (1.42 %)	101,710 (4.15 %)	41.74 (85.90 %)	32,785 (4.09 %)	369,499 (14.15 %)	37,497 (95.91 %)	5,089,496 (40.41 %)	1,399,438 (2.72 %)	13,485,480 (26.52 %)	19,436 (0.94 %)	427,663 (1.66 %)	16,675 (0.41 %)	15,897 (0.38 %)
290	house mouse (CBA_J v1 2016) GCA_001624475.1	n/a	n/a	21,259 (2.23 %)	18,593 (1.42 %)	101,632 (4.14 %)	41.78 (79.43 %)	36,013 (3.86 %)	410,639 (20.63 %)	42,242 (96.14 %)	5,081,543 (40.40 %)	1,393,763 (2.54 %)	13,472,532 (24.46 %)	24,180 (1.46 %)	418,702 (1.72 %)	16,809 (0.38 %)	15,953 (0.35 %)
291	house mouse (DBA_2J v1 2016) GCA_001624505.1	n/a	n/a	21,156 (2.23 %)	18,610 (1.43 %)	101,908 (4.18 %)	41.80 (88.67 %)	37,461 (4.86 %)	409,306 (11.39 %)	42,324 (95.14 %)	5,028,217 (40.37 %)	1,364,702 (2.73 %)	13,540,805 (27.33 %)	13,245 (0.55 %)	420,635 (1.47 %)	16,544 (0.42 %)	15,786 (0.39 %)
292	house mouse (FVB_NJ v1 2016) GCA_001624535.1	n/a	n/a	21,195 (2.22 %)	18,615 (1.42 %)	101,520 (4.15 %)	41.75 (89.39 %)	61,976 (6.27 %)	380,840 (10.66 %)	67,805 (93.73 %)	5,037,447 (40.28 %)	1,381,859 (2.89 %)	13,440,164 (27.32 %)	14,811 (0.71 %)	426,149 (1.81 %)	16,625 (0.42 %)	15,829 (0.39 %)
293	house mouse (GRCm38.p6 2017) GCF_000001635.26	123,667 (4.49 %)	n/a	24,134 (2.09 %)	22,855 (1.67 %)	n/a	41.73 (97.18 %)	676 (2.82 %)	904 (2.82 %)	21,179 (97.18 %)	5,554,281 (45.50 %)	1,695,255 (3.40 %)	13,041,229 (35.91 %)	3 (0.00 %)	889,196 (2.45 %)	25,014 (0.54 %)	16,961 (0.40 %)
294	house mouse (LP_J v1 2016) GCA_001632615.1	n/a	n/a	21,012 (2.23 %)	18,555 (1.43 %)	101,892 (4.18 %)	41.78 (84.14 %)	34,444 (4.11 %)	402,247 (15.91 %)	38,542 (95.89 %)	5,032,748 (40.03 %)	1,373,374 (2.60 %)	13,411,126 (25.61 %)	18,175 (0.88 %)	405,473 (1.47 %)	16,668 (0.40 %)	15,888 (0.37 %)
295	house mouse (NOD_ShiLtJ v1 2016) GCA_001624675.1	n/a	n/a	21,291 (2.24 %)	19,697 (1.47 %)	101,562 (4.18 %)	42.00 (77.13 %)	60,087 (4.21 %)	595,433 (22.95 %)	66,154 (95.79 %)	5,059,815 (40.57 %)	1,370,443 (2.51 %)	13,251,532 (23.62 %)	36,838 (1.54 %)	452,044 (2.17 %)	18,188 (0.42 %)	17,273 (0.39 %)
296	house mouse (NZO_HlLtJ v1 2016) GCA_001624745.1	n/a	n/a	21,233 (2.22 %)	18,805 (1.43 %)	103,134 (4.18 %)	41.74 (86.47 %)	49,204 (4.63 %)	337,909 (13.58 %)	57,439 (95.37 %)	5,112,301 (40.60 %)	1,418,629 (2.92 %)	13,588,055 (27.01 %)	21,209 (1.18 %)	440,820 (2.04 %)	16,857 (0.41 %)	15,946 (0.38 %)
297	human (GRCh38.p13 2019) GCF_000001405.39	172,809 (4.43 %)	n/a	23,121 (1.97 %)	27,697 (1.78 %)	n/a	41.04 (95.07 %)	827 (4.93 %)	1,268 (4.93 %)	46,029 (95.07 %)	5,859,855 (52.78 %)	1,037,733 (4.60 %)	16,933,424 (36.88 %)	12 (0.00 %)	1,408,888 (2.55 %)	56,646 (1.06 %)	31,442 (0.75 %)
298	human (GRCh38.p14 2022) GCF_000001405.40	188,352 (5.12 %)	n/a	23,474 (1.98 %)	28,557 (1.86 %)	n/a	41.05 (95.10 %)	829 (4.90 %)	1,270 (4.90 %)	46,502 (95.10 %)	5,910,293 (52.77 %)	1,047,827 (4.59 %)	17,068,934 (36.82 %)	12 (0.00 %)	1,423,169 (2.56 %)	57,427 (1.07 %)	31,985 (0.75 %)
299	human (NA24385.mat 2021) GCA_018852615.1	n/a	n/a	20,744 (1.84 %)	21,968 (1.22 %)	233,779 (4.92 %)	40.85 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	445 (100.00 %)	5,435,410 (53.40 %)	1,086,871 (8.27 %)	15,970,867 (40.97 %)	0 (0 %)	1,819,917 (3.54 %)	53,581 (1.32 %)	29,359 (0.79 %)
300	human (NA24385.mat 2022) GCA_021951015.1	n/a	n/a	20,809 (1.82 %)	21,369 (1.18 %)	234,089 (4.92 %)	40.85 (99.95 %)	0 (0 %)	109 (0.05 %)	355 (100.00 %)	5,489,855 (53.93 %)	1,085,681 (8.26 %)	15,968,830 (40.95 %)	0 (0 %)	1,817,110 (3.54 %)	53,511 (1.32 %)	30,302 (0.84 %)
301	human (NA24385.pat 2021) GCA_018852605.1	n/a	n/a	19,919 (1.83 %)	21,582 (1.22 %)	227,333 (4.91 %)	40.87 (100.00 %)	0 (0 %)	5 (0.00 %)	610 (100.00 %)	5,215,774 (53.54 %)	1,094,036 (9.09 %)	15,125,069 (41.29 %)	0 (0 %)	1,903,592 (3.87 %)	52,653 (1.34 %)	28,881 (0.81 %)
302	human (NA24385.pat 2022) GCA_021950905.1	n/a	n/a	20,014 (1.81 %)	20,716 (1.19 %)	227,278 (4.91 %)	40.87 (99.97 %)	0 (0 %)	117 (0.03 %)	514 (100.00 %)	5,293,356 (54.01 %)	1,100,786 (9.09 %)	15,122,569 (41.27 %)	2 (0.00 %)	1,900,161 (3.87 %)	52,546 (1.35 %)	29,891 (0.86 %)
303	human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank) GCA_000845685.2	n/a	115 (79.56 %)	n/a	n/a	n/a	42.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	33 (1.67 %)	36 (4.27 %)	603 (9.83 %)	0 (0 %)	52 (1.87 %)	3 (13.72 %)	2 (13.38 %)
304	human T2T CHM13 v2.0 GCA_009914755.4	108,944 (51.73 %)	n/a	20,844 (1.79 %)	21,287 (1.16 %)	n/a	40.75 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25 (100.00 %)	5,591,082 (54.45 %)	1,155,353 (8.89 %)	16,163,340 (41.63 %)	0 (0 %)	2,006,129 (3.86 %)	52,408 (1.38 %)	30,616 (0.83 %)
305	Iberian mole (v1 TD23 2020) GCF_014898055.1	46,872 (2.59 %)	n/a	18,566 (1.67 %)	20,793 (1.59 %)	n/a	41.91 (99.98 %)	0 (0 %)	3,640 (0.02 %)	4,425 (100.00 %)	3,269,038 (31.47 %)	501,677 (1.32 %)	11,176,747 (32.61 %)	2 (0.00 %)	644,819 (2.55 %)	48,076 (2.80 %)	43,577 (2.14 %)
306	Iberian mole (v2 TD23 2020) GCF_014898055.2	46,746 (2.60 %)	n/a	18,453 (1.69 %)	20,410 (1.59 %)	n/a	41.90 (99.98 %)	0 (0 %)	3,639 (0.02 %)	3,202 (100.00 %)	2,637,156 (23.36 %)	497,087 (1.30 %)	10,984,260 (32.64 %)	2 (0.00 %)	638,388 (2.54 %)	47,552 (2.89 %)	43,140 (2.46 %)
307	Indian glassy fish (v1 2019) GCF_900634625.1	44,096 (12.32 %)	n/a	15,337 (3.60 %)	23,988 (7.92 %)	60,224 (10.41 %)	42.38 (98.08 %)	0 (0 %)	1,523 (1.92 %)	156 (100.00 %)	346,406 (3.02 %)	163,522 (3.00 %)	2,755,229 (25.07 %)	0 (0 %)	235,504 (4.25 %)	17,930 (1.47 %)	9,748 (0.74 %)
308	Indian medaka GCF_002922805.1	47,300 (9.26 %)	n/a	14,561 (2.50 %)	31,867 (6.43 %)	n/a	39.04 (94.73 %)	0 (0 %)	51,440 (5.29 %)	8,603 (100.00 %)	319,637 (2.20 %)	208,749 (2.67 %)	5,412,794 (33.26 %)	180 (0.02 %)	209,615 (2.14 %)	40,721 (2.36 %)	28,619 (1.60 %)
309	Indianmeal moth (v1 USDA-ARS_2022_Savannah primary hap 2023) GCF_027563975.1	28,377 (14.36 %)	n/a	4,799 (1.56 %)	15,737 (7.20 %)	n/a	35.38 (100.00 %)	0 (0 %)	26 (0.00 %)	46 (100.00 %)	136,242 (3.33 %)	48,275 (1.61 %)	2,518,372 (36.69 %)	0 (0 %)	71,420 (2.05 %)	14,106 (2.86 %)	9,147 (1.55 %)
310	Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad) GCA_004027435.1	n/a	n/a	21,188 (1.26 %)	41,550 (1.34 %)	35,477 (1.51 %)	42.19 (99.92 %)	4,324 (0.02 %)	4,324 (0.02 %)	798,700 (99.98 %)	3,297,388 (28.66 %)	476,792 (1.23 %)	13,144,912 (34.13 %)	14 (0.00 %)	n/a	81,685 (1.86 %)	59,284 (1.43 %)
311	Japanese quail GCF_001577835.1	47,008 (7.38 %)	n/a	12,864 (2.55 %)	36,126 (11.03 %)	n/a	41.28 (98.88 %)	7,630 (1.12 %)	11,601 (1.12 %)	9,642 (98.88 %)	466,141 (6.58 %)	321,128 (2.22 %)	5,497,911 (19.81 %)	628 (0.03 %)	160,342 (1.32 %)	17,977 (1.86 %)	15,897 (1.26 %)
312	Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018) GCF_003227715.1	29,097 (10.82 %)	n/a	4,337 (1.33 %)	43,907 (11.32 %)	n/a	44.75 (99.72 %)	0 (0 %)	499 (0.28 %)	857 (100.00 %)	439,110 (17.67 %)	262,539 (5.69 %)	1,834,301 (29.28 %)	3 (0.00 %)	159,215 (3.71 %)	6,204 (9.08 %)	5,973 (2.13 %)
313	kakapo (Jane v1 2019) GCF_004027225.1	49,444 (5.77 %)	n/a	13,114 (1.92 %)	17,732 (2.50 %)	29,004 (4.44 %)	41.97 (97.63 %)	0 (0 %)	362 (2.37 %)	99 (100.00 %)	548,758 (10.76 %)	208,171 (1.07 %)	6,258,082 (20.20 %)	0 (0 %)	165,436 (1.31 %)	22,279 (1.75 %)	19,230 (1.19 %)
314	kakapo (Jane v2 2020 genbank) GCA_004027225.2	49,757 (54.33 %)	n/a	13,112 (1.92 %)	17,637 (2.48 %)	n/a	41.97 (99.08 %)	0 (0 %)	373 (0.92 %)	90 (100.00 %)	507,072 (7.85 %)	208,180 (1.08 %)	6,258,178 (20.50 %)	0 (0 %)	165,532 (1.34 %)	22,278 (1.77 %)	19,230 (1.21 %)
315	koala (Bilbo 61053 2017) GCF_002099425.1	55,723 (2.15 %)	n/a	17,500 (0.86 %)	16,193 (0.94 %)	n/a	39.05 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	1,907 (100.00 %)	7,814,631 (41.58 %)	1,123,545 (2.03 %)	21,796,057 (39.25 %)	0 (0 %)	405,744 (0.85 %)	15,957 (0.35 %)	15,019 (0.30 %)
316	Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank) GCA_009829125.1	29,504 (53.56 %)	n/a	14,221 (2.37 %)	44,144 (5.80 %)	41,384 (6.20 %)	40.22 (99.05 %)	0 (0 %)	700 (0.95 %)	124 (100.00 %)	423,338 (4.48 %)	551,472 (7.22 %)	4,887,148 (38.97 %)	5 (0.00 %)	523,224 (4.75 %)	37,287 (2.58 %)	18,380 (0.95 %)
317	Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq) GCF_009829125.1	29,517 (6.48 %)	n/a	14,243 (2.37 %)	44,144 (5.80 %)	41,421 (6.20 %)	40.22 (99.05 %)	0 (0 %)	700 (0.95 %)	124 (100.00 %)	423,274 (4.48 %)	551,472 (7.22 %)	4,887,142 (38.97 %)	5 (0.00 %)	523,224 (4.75 %)	37,287 (2.58 %)	18,380 (0.95 %)
318	lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank) GCA_023638135.1	48,561 (51.20 %)	n/a	12,862 (1.69 %)	21,562 (1.92 %)	n/a	43.03 (99.83 %)	0 (0 %)	158 (0.17 %)	397 (100.00 %)	439,975 (3.77 %)	203,640 (6.96 %)	6,921,438 (23.57 %)	2 (0.00 %)	479,269 (2.67 %)	32,398 (2.65 %)	19,870 (0.89 %)
319	large cabbage white (genbank 2021) GCA_905147105.1	24,631 (60.59 %)	n/a	4,550 (1.47 %)	9,197 (5.18 %)	30,394 (12.69 %)	34.13 (100.00 %)	0 (0 %)	29 (0.00 %)	402 (100.00 %)	123,352 (2.30 %)	36,616 (6.05 %)	2,431,238 (41.04 %)	2 (0.00 %)	86,654 (3.36 %)	8,442 (2.49 %)	4,829 (1.03 %)
320	large tree shrew (BS70 2019 Broad) GCA_004365275.1	n/a	n/a	26,266 (0.71 %)	59,868 (0.81 %)	n/a	42.00 (99.77 %)	6,466 (0.02 %)	6,466 (0.02 %)	3,890,086 (99.98 %)	7,163,973 (22.64 %)	1,629,329 (2.64 %)	18,970,992 (42.82 %)	38 (0.00 %)	n/a	138,732 (1.75 %)	77,459 (1.17 %)
321	leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K) GCA_009764565.1	n/a	n/a	14,572 (1.03 %)	16,165 (1.42 %)	n/a	43.36 (99.74 %)	0 (0 %)	558 (0.26 %)	55 (100.00 %)	1,631,923 (15.09 %)	303,440 (1.14 %)	11,122,938 (34.12 %)	1 (0.00 %)	664,235 (2.49 %)	35,505 (1.37 %)	19,641 (0.51 %)
322	leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019) GCA_009762595.1	n/a	n/a	10,857 (1.01 %)	15,585 (1.46 %)	n/a	43.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8,982 (100.00 %)	1,090,219 (15.03 %)	206,192 (1.19 %)	7,154,939 (33.03 %)	0 (0 %)	432,559 (2.40 %)	25,155 (1.42 %)	14,585 (0.57 %)
323	leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K) GCF_009764565.2	62,576 (3.50 %)	n/a	14,610 (1.03 %)	16,359 (1.45 %)	n/a	43.35 (99.74 %)	0 (0 %)	667 (0.26 %)	40 (100.00 %)	1,637,236 (15.13 %)	304,730 (1.14 %)	11,121,967 (34.21 %)	3 (0.00 %)	670,755 (2.51 %)	35,485 (1.36 %)	19,615 (0.51 %)
324	Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank) GCA_000002875.2	n/a	8,389 (48.67 %)	591 (1.09 %)	4,193 (46.51 %)	n/a	59.58 (99.94 %)	0 (0 %)	454 (0.06 %)	76 (100.00 %)	24,390 (4.61 %)	4,228 (1.93 %)	243,087 (20.97 %)	1 (0.00 %)	5,939 (3.84 %)	92 (99.40 %)	72 (0.21 %)
325	Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank) GCA_000002725.2	n/a	8,731 (48.79 %)	626 (1.15 %)	4,290 (46.53 %)	n/a	59.72 (100.00 %)	7 (0.00 %)	7 (0.00 %)	43 (100.00 %)	33,021 (5.20 %)	8,477 (2.43 %)	238,932 (20.91 %)	0 (0 %)	6,726 (4.51 %)	41 (99.80 %)	27 (0.06 %)
326	Leishmania martiniquensis (LSCM1 2021 genbank) GCA_017916325.1	n/a	7,967 (45.66 %)	619 (1.14 %)	3,882 (44.58 %)	n/a	59.85 (100.00 %)	0 (0 %)	5 (0.00 %)	42 (100.00 %)	20,726 (2.91 %)	2,267 (2.64 %)	232,973 (20.45 %)	0 (0 %)	6,246 (4.12 %)	44 (99.29 %)	43 (0.15 %)
327	Leishmania orientalis (LSCM4 2021 genbank) GCA_017916335.1	n/a	8,158 (45.05 %)	643 (1.12 %)	4,666 (45.26 %)	n/a	59.72 (99.99 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	98 (100.00 %)	22,632 (2.47 %)	4,241 (2.74 %)	231,120 (20.18 %)	1 (0.00 %)	10,584 (6.63 %)	100 (99.82 %)	164 (0.40 %)
328	leopard (Maewha 2016 genbank) GCA_001857705.1	73,266 (49.50 %)	n/a	18,874 (1.62 %)	21,014 (1.44 %)	n/a	41.71 (96.17 %)	214,953 (3.85 %)	214,953 (3.85 %)	265,329 (96.15 %)	5,246,283 (42.87 %)	1,059,443 (5.13 %)	14,265,514 (32.20 %)	28,667 (1.17 %)	525,709 (5.63 %)	77,000 (2.45 %)	66,922 (1.91 %)
329	lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank) GCA_000280705.1	25,978 (33.60 %)	n/a	19,393 (1.38 %)	20,311 (1.35 %)	n/a	41.87 (87.17 %)	326,464 (12.87 %)	326,464 (12.87 %)	337,359 (87.13 %)	6,205,858 (38.76 %)	832,823 (1.53 %)	13,661,563 (33.98 %)	2,666 (0.03 %)	430,190 (1.14 %)	26,669 (0.59 %)	23,227 (0.47 %)
330	lesser kestrel (v1 2021) GCF_017639655.1	47,420 (5.64 %)	n/a	13,097 (1.80 %)	22,203 (2.07 %)	n/a	42.30 (99.66 %)	0 (0 %)	298 (0.34 %)	291 (100.00 %)	516,498 (5.58 %)	210,236 (1.26 %)	7,133,927 (19.19 %)	1 (0.00 %)	132,959 (0.79 %)	27,558 (2.21 %)	21,862 (1.03 %)
331	lesser rhea (primary hap 2023 genbank) GCA_028389875.1	39,024 (47.65 %)	n/a	13,358 (1.72 %)	23,870 (2.13 %)	n/a	42.45 (99.89 %)	0 (0 %)	128 (0.11 %)	179 (100.00 %)	674,141 (6.73 %)	329,122 (5.34 %)	6,820,211 (22.78 %)	1 (0.00 %)	266,226 (1.85 %)	45,073 (5.83 %)	38,575 (2.59 %)
332	lesser sac-winged bat (primary hap 2024 genbank) GCA_036850995.1	n/a	n/a	18,322 (1.42 %)	21,350 (1.39 %)	n/a	41.84 (99.24 %)	178 (0.49 %)	573 (0.76 %)	345 (99.51 %)	4,224,340 (28.69 %)	1,030,574 (2.60 %)	12,591,928 (42.30 %)	1 (0.00 %)	1,128,543 (2.95 %)	98,189 (2.06 %)	48,427 (1.15 %)
333	lesser salmon catfish (primary hap 2023 genbank) GCA_027579695.1	53,323 (53.05 %)	n/a	15,841 (0.90 %)	85,700 (3.30 %)	n/a	42.44 (99.43 %)	0 (0 %)	334 (0.57 %)	38 (100.00 %)	5,905,868 (49.76 %)	1,126,468 (6.51 %)	7,609,180 (62.74 %)	11 (0.00 %)	2,750,473 (9.00 %)	166,630 (4.38 %)	15,646 (0.27 %)
334	lettuce (Salinas v7 2018) GCF_002870075.1	60,760 (2.83 %)	n/a	16,272 (0.65 %)	109,234 (6.86 %)	n/a	37.79 (92.71 %)	0 (0 %)	350,251 (7.33 %)	11,453 (100.00 %)	946,986 (1.96 %)	983,572 (3.65 %)	12,334,735 (53.11 %)	2,244 (0.09 %)	1,823,579 (9.42 %)	117,678 (2.02 %)	19,900 (0.28 %)
335	lettuce (Salinas v8 2020) GCF_002870075.3	64,708 (2.94 %)	n/a	16,252 (0.65 %)	101,828 (6.36 %)	n/a	37.79 (92.44 %)	3,138 (0.29 %)	351,533 (7.59 %)	9,960 (99.71 %)	945,052 (1.95 %)	983,641 (3.64 %)	12,325,371 (53.00 %)	2,249 (0.09 %)	n/a	117,703 (2.02 %)	19,916 (0.28 %)
336	live sharksucker (v1 2019) GCF_900963305.1	40,255 (11.91 %)	n/a	14,975 (3.53 %)	22,304 (7.09 %)	56,266 (9.51 %)	41.43 (99.89 %)	0 (0 %)	140 (0.11 %)	38 (100.00 %)	448,828 (3.61 %)	146,353 (1.65 %)	3,204,476 (21.79 %)	0 (0 %)	109,664 (1.83 %)	16,807 (1.33 %)	12,095 (0.89 %)
337	lumpfish (primary hap 2019 genbank) GCA_009769545.1	41,612 (58.17 %)	n/a	14,748 (3.32 %)	49,223 (8.10 %)	52,721 (8.34 %)	42.83 (98.22 %)	0 (0 %)	347 (1.78 %)	49 (100.00 %)	478,416 (6.02 %)	421,634 (11.07 %)	2,928,668 (27.98 %)	1 (0.00 %)	655,785 (6.31 %)	53,323 (5.09 %)	32,724 (2.40 %)
338	Ma's night monkey genbank GCA_000952055.2	55,061 (41.68 %)	n/a	21,084 (1.92 %)	22,287 (1.31 %)	n/a	40.74 (94.86 %)	83,929 (5.15 %)	83,929 (5.15 %)	112,850 (94.85 %)	5,109,404 (47.71 %)	734,754 (2.02 %)	15,854,134 (33.62 %)	2,334 (0.15 %)	767,102 (3.42 %)	36,070 (0.90 %)	31,862 (0.80 %)
339	malaria parasite P. falciparum (3D7 2016 genbank) GCA_000002765.3	n/a	14,866 (53.86 %)	n/a	n/a	n/a	19.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16 (100.00 %)	79,857 (19.18 %)	78,154 (15.50 %)	186,960 (66.90 %)	0 (0 %)	31,278 (6.16 %)	22 (0.04 %)	14 (0.02 %)
340	Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank) GCA_001685135.1	48,578 (30.31 %)	n/a	19,449 (1.56 %)	24,645 (1.37 %)	41,235 (1.95 %)	40.78 (92.27 %)	0 (0 %)	984,656 (7.81 %)	80,669 (100.00 %)	3,063,619 (35.20 %)	866,306 (3.08 %)	13,310,826 (28.76 %)	389,500 (1.56 %)	884,201 (3.10 %)	35,558 (0.84 %)	33,754 (0.78 %)
341	malo sina (v1 2012) GCF_000231095.1	29,549 (16.44 %)	n/a	15,120 (6.45 %)	49,515 (30.69 %)	n/a	40.48 (93.32 %)	20,693 (6.71 %)	20,693 (6.71 %)	23,184 (93.29 %)	115,049 (2.29 %)	51,516 (1.90 %)	1,488,940 (24.12 %)	25 (0.03 %)	35,840 (1.56 %)	42,077 (12.05 %)	32,193 (7.48 %)
342	mangrove rivulus GCF_001649575.1	45,306 (11.02 %)	n/a	14,510 (2.84 %)	29,750 (6.81 %)	n/a	40.03 (94.35 %)	0 (0 %)	29,388 (5.66 %)	3,073 (100.00 %)	345,930 (2.32 %)	146,268 (1.33 %)	4,717,260 (27.31 %)	231 (0.09 %)	62,480 (1.04 %)	39,557 (2.69 %)	29,549 (1.76 %)
343	meadow brown (genbank 2021) GCA_905333055.1	29,488 (69.09 %)	n/a	4,863 (1.16 %)	19,812 (6.60 %)	27,763 (8.31 %)	36.96 (100.00 %)	0 (0 %)	21 (0.00 %)	32 (100.00 %)	227,482 (2.41 %)	107,773 (3.02 %)	2,456,144 (43.97 %)	0 (0 %)	297,573 (6.20 %)	24,873 (3.15 %)	12,170 (1.54 %)
344	meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank) GCA_006229205.1	n/a	n/a	19,020 (1.63 %)	19,812 (1.43 %)	42,441 (2.08 %)	41.68 (99.72 %)	0 (0 %)	65,245 (0.28 %)	63,791 (100.00 %)	4,552,310 (40.02 %)	634,179 (1.21 %)	13,631,635 (32.17 %)	5,134 (0.09 %)	236,044 (0.75 %)	64,849 (2.13 %)	63,058 (1.88 %)
345	meerkat (BS45 2019 Broad) GCA_004023905.1	n/a	n/a	21,726 (1.54 %)	31,908 (1.39 %)	n/a	41.89 (99.96 %)	4,153 (0.02 %)	4,153 (0.02 %)	354,021 (99.98 %)	4,835,157 (40.73 %)	693,037 (1.32 %)	13,779,279 (33.49 %)	21 (0.00 %)	224,239 (0.53 %)	76,740 (2.37 %)	72,844 (2.03 %)
346	melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014) GCF_000806345.1	26,008 (10.49 %)	n/a	7,743 (3.09 %)	12,206 (6.18 %)	n/a	35.15 (84.42 %)	37,430 (15.62 %)	37,430 (15.62 %)	43,002 (84.38 %)	237,943 (3.36 %)	74,977 (1.26 %)	2,410,203 (31.96 %)	376 (0.08 %)	35,789 (1.03 %)	15,259 (2.01 %)	8,482 (1.01 %)
347	microsporidians E.bieneusi (H348 2009 genbank) GCA_000209485.1	n/a	3,804 (69.39 %)	238 (3.03 %)	394 (8.09 %)	n/a	33.70 (99.89 %)	10 (0.03 %)	437 (0.04 %)	1,743 (99.97 %)	1,511 (2.99 %)	268 (0.36 %)	31,900 (26.59 %)	0 (0 %)	57 (0.18 %)	373 (7.62 %)	360 (7.39 %)
348	microsporidians E.cuniculi (v1 GB-M1 2002) GCF_000091225.1	1,996 (85.79 %)	n/a	1,569 (68.26 %)	596 (33.73 %)	n/a	47.31 (99.97 %)	4 (0.03 %)	4 (0.03 %)	15 (99.97 %)	257 (0.70 %)	199 (0.40 %)	10,819 (8.68 %)	0 (0 %)	168 (0.67 %)	126 (3.52 %)	105 (3.03 %)
349	microsporidians N.ceranae (BRL01 2009 genbank) GCA_000182985.1	n/a	2,678 (29.97 %)	348 (2.68 %)	284 (3.31 %)	n/a	25.26 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	5,465 (100.00 %)	3,179 (1.99 %)	1,572 (1.39 %)	85,189 (41.34 %)	0 (0 %)	432 (0.38 %)	4 (0.02 %)	4 (0.02 %)
350	minke whale (2013 genbank) GCA_000493695.1	42,553 (41.45 %)	n/a	19,298 (1.81 %)	18,661 (1.42 %)	n/a	40.94 (94.06 %)	173,296 (5.96 %)	173,296 (5.96 %)	184,071 (94.04 %)	4,041,828 (42.24 %)	573,950 (1.48 %)	13,504,295 (30.96 %)	211 (0.02 %)	317,691 (1.50 %)	65,448 (1.38 %)	46,041 (1.09 %)
351	minke whale (primary hap 2023 genbank) GCA_949987535.1	61,711 (41.50 %)	n/a	19,544 (1.49 %)	21,502 (1.26 %)	n/a	41.55 (99.99 %)	0 (0 %)	1,177 (0.01 %)	1,375 (100.00 %)	4,006,932 (35.92 %)	1,058,106 (12.08 %)	12,708,154 (42.66 %)	4 (0.00 %)	1,500,515 (4.32 %)	72,756 (1.59 %)	44,094 (1.06 %)
352	mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017) GCF_002532875.1	35,332 (12.83 %)	n/a	2,750 (0.61 %)	29,731 (8.07 %)	n/a	40.94 (99.89 %)	3,360 (0.11 %)	3,360 (0.11 %)	8,241 (99.89 %)	115,140 (1.18 %)	39,880 (0.71 %)	1,832,298 (14.55 %)	37 (0.00 %)	12,922 (0.23 %)	31,479 (5.12 %)	28,744 (3.52 %)
353	Mongolian gerbil (US013 2019 Broad) GCA_004026785.1	n/a	n/a	21,302 (1.57 %)	27,162 (1.27 %)	40,982 (1.78 %)	41.88 (99.90 %)	11,139 (0.04 %)	11,139 (0.04 %)	796,326 (99.96 %)	5,253,752 (39.29 %)	1,211,658 (3.13 %)	13,894,596 (38.35 %)	15 (0.00 %)	n/a	24,829 (0.69 %)	23,158 (0.63 %)
354	monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank) GCA_019393635.1	47,034 (41.56 %)	n/a	18,428 (0.81 %)	15,519 (0.85 %)	n/a	39.11 (99.91 %)	0 (0 %)	260 (0.09 %)	18 (100.00 %)	7,426,369 (29.77 %)	1,249,638 (2.12 %)	21,135,395 (42.80 %)	0 (0 %)	1,546,316 (2.55 %)	16,598 (0.36 %)	13,911 (0.23 %)
355	moth C.splendana (v1 2021 genbank) GCA_910591565.1	n/a	n/a	4,930 (0.75 %)	38,413 (8.53 %)	35,924 (4.55 %)	38.08 (99.99 %)	0 (0 %)	150 (0.01 %)	112 (100.00 %)	261,421 (1.99 %)	175,466 (5.62 %)	3,107,482 (46.30 %)	2 (0.00 %)	358,346 (5.72 %)	58,547 (5.75 %)	28,884 (2.78 %)
356	moth S.litura (Ishihara v1 2017) GCF_002706865.1	25,114 (8.87 %)	n/a	5,088 (1.13 %)	22,625 (7.19 %)	n/a	36.56 (97.52 %)	10,662 (2.49 %)	10,662 (2.49 %)	13,637 (97.51 %)	154,017 (1.49 %)	50,642 (0.97 %)	2,919,487 (37.00 %)	96 (0.06 %)	122,138 (2.50 %)	34,396 (3.66 %)	10,482 (1.09 %)
357	mung bean (VC1973A 2015 genbank) GCA_000741045.2	n/a	n/a	16,645 (3.88 %)	43,866 (14.64 %)	n/a	33.16 (92.79 %)	0 (0 %)	96,870 (7.25 %)	2,463 (100.00 %)	265,072 (3.32 %)	198,918 (3.34 %)	2,840,410 (34.89 %)	1,607 (0.24 %)	171,012 (3.42 %)	13,926 (1.48 %)	11,027 (1.18 %)
358	mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019) GCA_009769485.1	n/a	n/a	10,083 (1.97 %)	18,350 (2.23 %)	n/a	42.22 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	5,616 (100.00 %)	485,827 (7.06 %)	212,892 (1.28 %)	4,756,962 (19.95 %)	0 (0 %)	53,808 (0.72 %)	25,670 (3.87 %)	24,319 (2.23 %)
359	mute swan (v1 primary hap 2019) GCA_009769625.1	n/a	n/a	12,973 (1.97 %)	22,300 (2.18 %)	n/a	41.92 (99.06 %)	0 (0 %)	446 (0.94 %)	181 (100.00 %)	688,720 (7.65 %)	301,358 (1.34 %)	6,775,217 (21.21 %)	1 (0.00 %)	78,646 (0.75 %)	31,271 (3.60 %)	29,996 (2.02 %)
360	naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank) GCA_000247695.1	74,574 (44.06 %)	n/a	21,317 (1.73 %)	20,856 (1.51 %)	n/a	40.21 (88.43 %)	110,424 (11.59 %)	110,424 (11.59 %)	114,652 (88.41 %)	4,162,977 (32.77 %)	484,933 (0.92 %)	13,672,503 (27.63 %)	595 (0.01 %)	103,053 (0.44 %)	31,950 (0.88 %)	31,054 (0.81 %)
361	narwhal (BS41 2019 Broad) GCA_004026685.1	n/a	n/a	21,418 (1.52 %)	34,189 (1.28 %)	n/a	41.35 (99.92 %)	8,600 (0.03 %)	8,600 (0.03 %)	653,473 (99.97 %)	4,512,168 (44.82 %)	592,047 (1.17 %)	13,009,453 (37.18 %)	92 (0.00 %)	n/a	63,033 (1.47 %)	45,747 (1.19 %)
362	Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank) GCA_027579445.1	31,033 (46.15 %)	n/a	12,385 (1.72 %)	24,339 (2.24 %)	n/a	43.01 (99.57 %)	0 (0 %)	215 (0.43 %)	77 (100.00 %)	479,994 (3.33 %)	443,098 (9.18 %)	6,350,593 (25.82 %)	5 (0.00 %)	478,923 (3.35 %)	31,693 (3.88 %)	22,817 (1.16 %)
363	nematode C.briggsae (AF16 v1 2008) GCF_000004555.1	19,404 (22.65 %)	n/a	12,088 (12.63 %)	7,533 (12.85 %)	n/a	37.35 (97.22 %)	595 (0.05 %)	6,713 (2.80 %)	607 (99.95 %)	116,909 (19.60 %)	45,475 (4.23 %)	820,686 (35.42 %)	82 (0.06 %)	36,018 (3.86 %)	4,887 (1.65 %)	2,967 (0.93 %)
364	New South Wales waratah (AGSP 2013) GCF_000471905.2	36,251 (5.66 %)	n/a	10,150 (1.34 %)	42,117 (8.90 %)	n/a	37.47 (94.63 %)	39,556 (5.39 %)	39,556 (5.39 %)	45,302 (94.61 %)	396,916 (3.25 %)	506,716 (6.41 %)	4,768,175 (36.07 %)	384 (0.04 %)	264,746 (2.83 %)	17,009 (0.90 %)	8,756 (0.45 %)
365	nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank) GCA_000208655.2	n/a	n/a	21,293 (1.15 %)	25,302 (1.09 %)	n/a	40.77 (90.89 %)	268,413 (9.13 %)	268,442 (9.13 %)	314,971 (90.87 %)	5,327,246 (49.09 %)	651,311 (1.26 %)	19,267,381 (38.27 %)	239 (0.00 %)	482,244 (1.17 %)	139,552 (2.47 %)	82,520 (1.71 %)
366	nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq) GCF_000208655.1	46,144 (1.87 %)	n/a	21,316 (1.15 %)	25,308 (1.09 %)	n/a	40.77 (90.89 %)	268,413 (9.13 %)	268,442 (9.13 %)	314,972 (90.87 %)	5,328,146 (49.10 %)	651,316 (1.26 %)	19,267,438 (38.27 %)	239 (0.00 %)	482,246 (1.17 %)	139,552 (2.47 %)	82,520 (1.71 %)
367	North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank) GCA_028564815.1	n/a	n/a	19,541 (1.47 %)	21,516 (1.25 %)	n/a	41.69 (99.83 %)	0 (0 %)	363 (0.17 %)	779 (100.00 %)	1,361,117 (2.23 %)	836,632 (13.12 %)	12,597,969 (44.00 %)	11 (0.00 %)	1,395,565 (3.89 %)	93,862 (1.92 %)	40,806 (0.95 %)
368	northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021) GCF_021288785.1	49,934 (2.73 %)	n/a	20,106 (1.74 %)	20,957 (1.35 %)	n/a	41.51 (99.35 %)	0 (0 %)	39,936 (0.65 %)	142,455 (100.00 %)	4,434,732 (35.01 %)	588,877 (1.19 %)	13,745,426 (32.96 %)	2,726 (0.09 %)	n/a	52,064 (1.59 %)	49,212 (1.43 %)
369	northern house mosquito (v1 TS 2021) GCF_016801865.1	28,512 (7.14 %)	n/a	5,830 (1.09 %)	39,806 (8.27 %)	n/a	36.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,714 (100.00 %)	222,294 (5.58 %)	187,561 (9.87 %)	3,009,613 (56.49 %)	0 (0 %)	397,617 (5.35 %)	63,009 (9.78 %)	42,868 (6.50 %)
370	northern pike (primary hap 2020 genbank) GCA_011004845.1	63,720 (60.35 %)	n/a	16,616 (2.41 %)	55,784 (5.64 %)	82,918 (8.82 %)	42.22 (99.89 %)	0 (0 %)	112 (0.11 %)	53 (100.00 %)	1,039,521 (30.93 %)	524,708 (7.32 %)	4,691,094 (32.91 %)	1 (0.00 %)	602,569 (4.43 %)	42,910 (2.52 %)	22,099 (1.02 %)
371	northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC) GCA_000146795.3	n/a	n/a	20,134 (1.89 %)	18,568 (1.14 %)	n/a	40.76 (93.09 %)	180,468 (6.94 %)	180,468 (6.94 %)	197,908 (93.06 %)	5,169,984 (51.90 %)	831,865 (4.16 %)	15,243,657 (35.77 %)	861 (0.05 %)	1,641,885 (4.15 %)	65,761 (1.00 %)	25,432 (0.56 %)
372	Norway rat BN7 genbank GCA_015227675.2	n/a	37 (0.00 %)	21,523 (1.86 %)	19,627 (1.36 %)	54,530 (2.79 %)	41.99 (99.19 %)	581 (0.81 %)	581 (0.81 %)	757 (99.19 %)	4,895,563 (44.53 %)	1,514,974 (3.57 %)	13,450,428 (35.83 %)	4 (0.00 %)	1,172,090 (3.51 %)	19,244 (0.46 %)	16,092 (0.39 %)
373	olive baboon (2017 HGSC genbank) GCA_000264685.2	n/a	n/a	20,319 (1.82 %)	21,542 (1.19 %)	n/a	40.99 (99.25 %)	55,576 (0.76 %)	58,981 (0.76 %)	118,810 (99.24 %)	5,524,514 (52.78 %)	1,068,912 (5.55 %)	16,068,031 (38.71 %)	368 (0.01 %)	1,968,093 (4.25 %)	95,595 (1.41 %)	30,263 (0.74 %)
374	olive baboon (2017 HGSC RefSeq) GCF_000264685.3	84,433 (3.85 %)	n/a	20,317 (1.83 %)	21,239 (1.18 %)	n/a	40.99 (99.25 %)	55,576 (0.76 %)	58,981 (0.76 %)	118,811 (99.24 %)	5,525,293 (52.79 %)	1,068,912 (5.55 %)	16,068,088 (38.71 %)	368 (0.01 %)	1,968,092 (4.25 %)	95,595 (1.41 %)	30,263 (0.74 %)
375	oriental river prawn (v1 FS-2020 2020 genbank) GCA_015104395.1	n/a	n/a	1,945 (0.08 %)	23,579 (1.88 %)	n/a	36.81 (99.60 %)	16,132 (0.41 %)	16,132 (0.41 %)	16,156 (99.59 %)	2,706,474 (10.11 %)	2,525,264 (12.75 %)	9,704,257 (48.31 %)	44 (0.00 %)	2,589,746 (7.83 %)	77,313 (3.01 %)	18,031 (0.34 %)
376	painted lady (genbank 2021) GCA_905220365.1	20,948 (56.23 %)	n/a	4,705 (1.06 %)	15,277 (5.00 %)	29,018 (10.11 %)	33.42 (99.99 %)	0 (0 %)	91 (0.01 %)	37 (100.00 %)	209,233 (2.16 %)	56,676 (1.12 %)	3,372,591 (44.40 %)	3 (0.00 %)	131,267 (3.01 %)	13,547 (2.72 %)	8,615 (1.04 %)
377	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019) GCF_004126475.1	35,529 (2.39 %)	n/a	18,185 (1.70 %)	20,184 (1.64 %)	41,094 (3.29 %)	42.38 (98.92 %)	0 (0 %)	831 (1.08 %)	141 (100.00 %)	3,072,951 (30.02 %)	385,608 (0.80 %)	12,060,365 (30.47 %)	1 (0.00 %)	173,548 (0.73 %)	64,081 (4.30 %)	66,821 (4.05 %)
378	pea aphid (AL4f v1 2019) GCF_005508785.1	31,681 (7.81 %)	n/a	4,257 (0.79 %)	16,323 (3.39 %)	n/a	29.76 (92.38 %)	0 (0 %)	46,297 (7.65 %)	21,920 (100.00 %)	768,383 (18.87 %)	135,468 (2.11 %)	4,536,093 (48.39 %)	93 (0.01 %)	158,249 (4.28 %)	16,332 (2.13 %)	13,468 (1.54 %)
379	peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank) GCA_023634155.1	49,100 (50.44 %)	n/a	13,025 (1.67 %)	24,167 (2.02 %)	n/a	42.65 (99.69 %)	0 (0 %)	232 (0.31 %)	124 (100.00 %)	586,316 (11.83 %)	335,214 (8.05 %)	7,038,700 (24.65 %)	0 (0 %)	405,444 (2.46 %)	26,085 (2.25 %)	20,023 (0.87 %)
380	pigeon pea (v1 2016 BGI) GCF_000340665.1	46,646 (9.41 %)	n/a	17,409 (3.12 %)	51,529 (12.74 %)	48,654 (8.33 %)	32.79 (94.21 %)	36,387 (5.81 %)	36,387 (5.81 %)	72,923 (94.19 %)	400,327 (3.60 %)	306,656 (4.69 %)	3,754,630 (39.24 %)	431 (0.18 %)	219,000 (6.77 %)	26,578 (2.89 %)	13,839 (1.14 %)
381	pike-perch GCF_008315115.1	56,221 (8.23 %)	n/a	15,677 (2.23 %)	29,967 (5.65 %)	62,989 (6.22 %)	40.92 (100.00 %)	0 (0 %)	94 (0.00 %)	1,313 (100.00 %)	591,660 (5.05 %)	569,876 (7.39 %)	4,713,605 (36.32 %)	0 (0 %)	788,001 (5.34 %)	39,545 (1.93 %)	12,857 (0.60 %)
382	platypus (Pmale09 2018 BGI) GCA_002966995.1	n/a	n/a	15,042 (1.17 %)	19,939 (1.55 %)	n/a	46.64 (100.00 %)	0 (0 %)	476 (0.00 %)	4,568 (100.00 %)	5,326,862 (52.88 %)	879,598 (5.00 %)	9,545,961 (50.95 %)	3 (0.00 %)	1,781,446 (5.23 %)	94,468 (9.28 %)	81,476 (3.15 %)
383	platypus (Pmale09 v1 2019) GCF_004115215.1	56,708 (3.09 %)	n/a	14,805 (1.26 %)	18,918 (1.63 %)	42,516 (2.60 %)	46.13 (99.18 %)	0 (0 %)	522 (0.82 %)	305 (100.00 %)	5,099,803 (51.62 %)	577,434 (2.88 %)	9,110,403 (48.91 %)	0 (0 %)	1,127,318 (3.58 %)	87,829 (7.91 %)	74,084 (2.86 %)
384	platypus (Pmale09 v3 2020) GCA_004115215.3	n/a	n/a	14,805 (1.26 %)	18,888 (1.63 %)	n/a	46.14 (99.18 %)	0 (0 %)	515 (0.82 %)	322 (100.00 %)	5,101,303 (51.62 %)	578,617 (2.89 %)	9,113,847 (48.93 %)	0 (0 %)	1,130,252 (3.59 %)	87,861 (7.92 %)	74,107 (2.86 %)
385	polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank) GCA_000687225.1	35,751 (39.94 %)	n/a	18,495 (1.67 %)	15,243 (1.37 %)	n/a	41.65 (98.35 %)	110,343 (1.67 %)	110,343 (1.67 %)	134,161 (98.33 %)	4,221,025 (40.96 %)	553,193 (1.29 %)	13,765,526 (29.91 %)	205 (0.03 %)	311,409 (1.04 %)	54,906 (1.17 %)	47,465 (0.98 %)
386	prehistoric monster fish (2019 genbank) GCA_902500255.1	45,404 (55.83 %)	n/a	14,654 (0.76 %)	72,609 (2.41 %)	57,391 (2.04 %)	41.99 (99.49 %)	0 (0 %)	2,554 (0.51 %)	464 (100.00 %)	1,311,131 (2.79 %)	786,401 (3.65 %)	9,901,286 (59.90 %)	3 (0.00 %)	1,623,656 (7.33 %)	172,199 (5.45 %)	18,080 (0.31 %)
387	pronghorn (BS35 2019 Broad) GCA_004027515.1	n/a	n/a	24,094 (1.34 %)	35,119 (1.27 %)	n/a	41.97 (99.87 %)	6,569 (0.02 %)	6,569 (0.02 %)	1,649,700 (99.98 %)	5,613,563 (41.47 %)	652,408 (1.55 %)	13,943,055 (43.64 %)	21 (0.00 %)	n/a	61,057 (1.17 %)	39,599 (0.79 %)
388	Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank) GCA_000696695.1	45,076 (35.88 %)	n/a	19,564 (1.68 %)	22,124 (1.36 %)	n/a	41.27 (99.13 %)	80,963 (0.88 %)	80,963 (0.88 %)	134,059 (99.12 %)	3,917,534 (41.44 %)	435,606 (1.73 %)	14,738,354 (28.36 %)	39 (0.00 %)	276,230 (1.12 %)	40,752 (0.94 %)	35,911 (0.79 %)
389	puma (SC36_Marlon 2018 genbank) GCA_003327715.1	25,575 (34.74 %)	n/a	17,665 (1.56 %)	16,565 (1.29 %)	n/a	41.36 (95.34 %)	0 (0 %)	178,992 (4.69 %)	2,174 (100.00 %)	4,884,619 (42.70 %)	833,136 (1.76 %)	13,705,706 (31.28 %)	2,166 (0.06 %)	494,972 (1.78 %)	58,912 (1.65 %)	50,363 (1.31 %)
390	pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015) GCA_000258655.2	59,332 (37.06 %)	26 (0.00 %)	19,951 (1.94 %)	19,039 (1.18 %)	n/a	40.74 (82.95 %)	111,087 (17.06 %)	156,797 (17.06 %)	121,337 (82.94 %)	5,136,492 (50.91 %)	775,493 (1.63 %)	15,570,612 (30.28 %)	70 (0.03 %)	729,770 (1.34 %)	43,049 (0.71 %)	26,732 (0.52 %)
391	pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023) GCF_029289425.1	84,858 (3.73 %)	n/a	20,765 (1.73 %)	22,666 (1.18 %)	n/a	40.49 (99.96 %)	0 (0 %)	8 (0.04 %)	443 (100.00 %)	5,487,575 (50.65 %)	1,054,555 (12.79 %)	15,952,698 (43.80 %)	0 (0 %)	3,830,835 (6.42 %)	53,329 (1.37 %)	27,996 (0.60 %)
392	pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank) GCA_026419965.1	56,261 (41.31 %)	n/a	18,495 (1.55 %)	20,718 (1.32 %)	n/a	42.05 (99.81 %)	0 (0 %)	143 (0.19 %)	580 (100.00 %)	3,817,653 (34.51 %)	758,297 (7.42 %)	12,196,926 (39.96 %)	0 (0 %)	1,197,918 (3.53 %)	101,353 (2.90 %)	50,216 (1.47 %)
393	rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank) GCA_009806435.2	n/a	n/a	19,480 (1.31 %)	23,335 (1.31 %)	n/a	43.83 (97.68 %)	0 (0 %)	18,178 (2.32 %)	3,159 (100.00 %)	4,179,975 (0.00 %)	976,271 (2.33 %)	13,766,353 (39.76 %)	85 (0.00 %)	1,275,666 (3.04 %)	113,370 (2.46 %)	70,869 (1.75 %)
394	rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank) GCA_000003625.1	n/a	n/a	18,676 (1.38 %)	20,095 (1.24 %)	n/a	43.75 (95.14 %)	80,789 (4.88 %)	80,789 (4.88 %)	84,024 (95.12 %)	4,884,561 (44.65 %)	883,943 (1.73 %)	13,254,559 (38.27 %)	12 (0.00 %)	1,022,805 (2.55 %)	110,338 (2.33 %)	68,466 (1.73 %)
395	radish (v1 WS10039 2015) GCF_000801105.1	69,943 (20.66 %)	n/a	33,762 (10.20 %)	70,765 (28.80 %)	n/a	35.29 (87.22 %)	0 (0 %)	28,041 (12.80 %)	10,676 (100.00 %)	196,483 (2.53 %)	150,132 (3.32 %)	2,256,858 (26.65 %)	148 (0.08 %)	181,090 (8.85 %)	23,381 (2.80 %)	18,811 (2.08 %)
396	red admiral (genbank 2021) GCA_905147765.2	n/a	n/a	4,641 (1.20 %)	13,258 (4.79 %)	32,725 (10.42 %)	32.84 (100.00 %)	0 (0 %)	18 (0.00 %)	142 (100.00 %)	184,094 (2.52 %)	41,639 (1.23 %)	3,193,736 (41.82 %)	0 (0 %)	59,270 (1.97 %)	10,747 (2.25 %)	7,305 (0.97 %)
397	red mason bee (LIB18336 2019) GCF_004153925.1	26,926 (16.13 %)	n/a	4,185 (2.08 %)	24,859 (11.07 %)	n/a	39.77 (99.98 %)	0 (0 %)	2,089 (0.02 %)	10,222 (100.00 %)	88,278 (1.96 %)	74,016 (3.78 %)	1,305,254 (28.61 %)	137 (0.02 %)	68,133 (2.01 %)	10,712 (6.90 %)	7,940 (2.34 %)
398	red-crested turaco (2014 BGI) GCF_000709365.1	16,151 (2.15 %)	n/a	12,046 (1.50 %)	25,077 (1.98 %)	n/a	41.63 (99.43 %)	75,085 (0.59 %)	75,085 (0.59 %)	134,672 (99.41 %)	401,465 (6.41 %)	153,694 (0.86 %)	6,705,299 (20.45 %)	1 (0.00 %)	58,294 (0.41 %)	30,183 (1.07 %)	25,549 (0.87 %)
399	red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI) GCF_000690535.1	16,238 (2.21 %)	n/a	12,016 (1.53 %)	23,985 (1.93 %)	n/a	41.20 (99.63 %)	59,230 (0.38 %)	59,230 (0.38 %)	112,704 (99.62 %)	322,026 (4.02 %)	121,725 (0.68 %)	6,797,850 (18.25 %)	4 (0.00 %)	20,461 (0.20 %)	18,873 (0.62 %)	16,327 (0.52 %)
400	red-throated loon (hap2 2023 genbank) GCA_030936135.1	25,173 (40.74 %)	n/a	13,218 (1.71 %)	28,120 (2.39 %)	n/a	43.11 (100.00 %)	9 (0.00 %)	249 (0.00 %)	1,195 (100.00 %)	544,427 (8.81 %)	223,674 (5.77 %)	6,669,469 (23.63 %)	3 (0.00 %)	398,605 (2.64 %)	38,306 (3.37 %)	35,069 (1.78 %)
401	reedfish (2019) GCF_900747795.1	40,545 (1.73 %)	n/a	13,154 (0.46 %)	24,028 (1.29 %)	34,856 (1.34 %)	39.44 (93.75 %)	0 (0 %)	5,614 (6.25 %)	1,885 (100.00 %)	1,834,613 (2.79 %)	1,018,031 (2.36 %)	20,081,632 (44.56 %)	4 (0.00 %)	1,039,686 (2.44 %)	88,254 (1.06 %)	22,510 (0.28 %)
402	Rhesus monkey (2015 Baylor) GCA_000772875.3	n/a	n/a	20,558 (1.71 %)	22,141 (1.12 %)	n/a	40.95 (97.08 %)	63,767 (2.91 %)	64,538 (2.91 %)	348,579 (97.09 %)	5,846,699 (54.61 %)	1,429,378 (9.24 %)	16,512,587 (40.26 %)	80 (0.01 %)	2,975,593 (6.12 %)	98,572 (1.29 %)	30,558 (0.68 %)
403	Rice's whale (hap2 2023 genbank) GCA_028023285.1	59,888 (43.60 %)	n/a	19,291 (1.53 %)	21,195 (1.30 %)	n/a	41.44 (99.90 %)	0 (0 %)	334 (0.10 %)	774 (100.00 %)	3,917,923 (36.26 %)	828,521 (9.28 %)	12,518,796 (41.08 %)	4 (0.00 %)	1,071,329 (3.37 %)	73,126 (1.69 %)	43,865 (1.11 %)
404	rifleman (BGI 2014) GCF_000695815.1	16,166 (2.37 %)	n/a	12,054 (1.65 %)	23,851 (2.04 %)	n/a	41.63 (99.55 %)	66,437 (0.46 %)	66,437 (0.46 %)	120,312 (99.54 %)	392,481 (7.69 %)	217,040 (2.27 %)	5,855,355 (18.33 %)	5 (0.00 %)	69,222 (0.63 %)	7,602 (0.24 %)	5,949 (0.18 %)
405	ring-tailed lemur BS26 Broad 2019 GCA_004024665.1	n/a	n/a	21,125 (1.90 %)	29,864 (1.51 %)	65,909 (1.91 %)	41.13 (99.93 %)	4,599 (0.02 %)	4,599 (0.02 %)	580,026 (99.98 %)	3,840,645 (39.25 %)	675,921 (1.83 %)	13,841,750 (31.45 %)	17 (0.00 %)	304,327 (0.71 %)	59,440 (1.72 %)	54,385 (1.53 %)
406	Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020) GCF_014905685.1	25,353 (3.88 %)	n/a	14,334 (1.56 %)	58,475 (4.46 %)	n/a	41.06 (92.01 %)	0 (0 %)	100,521 (8.02 %)	18,998 (100.00 %)	642,988 (3.38 %)	444,158 (3.06 %)	6,203,124 (42.81 %)	7,501 (0.17 %)	424,697 (2.96 %)	52,308 (2.11 %)	22,130 (0.71 %)
407	river trout (v1 2019) GCF_901001165.1	102,772 (6.02 %)	n/a	27,413 (1.62 %)	51,424 (4.17 %)	121,979 (5.28 %)	43.36 (96.90 %)	0 (0 %)	3,941 (3.10 %)	1,441 (100.00 %)	1,438,988 (5.72 %)	1,789,507 (15.87 %)	9,819,761 (52.37 %)	2 (0.00 %)	3,428,195 (8.64 %)	70,821 (1.77 %)	18,627 (0.33 %)
408	rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank) GCA_023343835.1	51,619 (61.28 %)	n/a	12,831 (2.31 %)	n/a	n/a	41.57 (99.99 %)	0 (0 %)	210 (0.01 %)	164 (100.00 %)	667,924 (11.59 %)	268,431 (2.63 %)	5,885,274 (21.73 %)	0 (0 %)	216,565 (1.89 %)	21,346 (2.37 %)	19,067 (1.48 %)
409	rose-grain aphid (CAU 2021 genbank) GCA_019925205.1	n/a	n/a	4,332 (0.82 %)	15,532 (3.91 %)	n/a	30.24 (99.98 %)	0 (0 %)	240 (0.02 %)	67 (100.00 %)	481,097 (4.72 %)	135,266 (7.01 %)	4,093,473 (52.65 %)	2 (0.00 %)	194,054 (4.51 %)	12,709 (2.68 %)	10,994 (1.68 %)
410	Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank) GCA_900094665.2	53,779 (39.43 %)	n/a	21,304 (2.26 %)	18,211 (1.40 %)	n/a	41.70 (89.05 %)	27,758 (7.29 %)	306,650 (10.98 %)	30,919 (92.71 %)	4,878,260 (40.08 %)	1,351,707 (2.59 %)	12,965,226 (27.49 %)	6,570 (0.06 %)	398,071 (1.12 %)	16,050 (0.44 %)	15,502 (0.41 %)
411	Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq) GCF_900094665.1	53,855 (2.85 %)	49,148 (2.43 %)	21,291 (2.26 %)	19,256 (1.49 %)	96,713 (4.05 %)	41.70 (89.05 %)	27,758 (7.29 %)	306,650 (10.98 %)	30,920 (92.71 %)	4,749,528 (39.06 %)	1,351,707 (2.59 %)	12,965,297 (27.49 %)	6,570 (0.06 %)	398,071 (1.12 %)	16,050 (0.44 %)	15,491 (0.41 %)
412	saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 genbank) GCA_949987515.1	46,746 (40.70 %)	n/a	18,625 (1.49 %)	20,451 (1.28 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	0 (0 %)	968 (0.01 %)	631 (100.00 %)	4,020,682 (35.99 %)	1,259,549 (13.09 %)	12,359,818 (42.64 %)	0 (0 %)	1,785,427 (5.07 %)	66,179 (3.91 %)	41,466 (1.03 %)
413	Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank) GCA_023634085.1	50,290 (50.75 %)	n/a	12,971 (1.67 %)	23,351 (2.02 %)	n/a	43.15 (99.70 %)	0 (0 %)	258 (0.30 %)	282 (100.00 %)	548,087 (7.21 %)	201,482 (8.55 %)	7,030,761 (24.94 %)	0 (0 %)	469,777 (2.60 %)	31,791 (2.57 %)	20,215 (0.89 %)
414	salmon louse (v1.1 2020) GCF_016086655.2	27,164 (5.26 %)	n/a	3,465 (0.45 %)	3,673 (1.75 %)	n/a	30.90 (99.99 %)	603 (0.01 %)	608 (0.01 %)	10,436 (99.99 %)	1,394,872 (53.53 %)	76,419 (1.13 %)	6,311,228 (43.85 %)	0 (0 %)	80,432 (1.10 %)	647 (0.04 %)	374 (0.03 %)
415	saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank) GCA_027887145.1	27,528 (42.80 %)	n/a	12,832 (1.69 %)	25,514 (2.23 %)	n/a	43.50 (99.76 %)	0 (0 %)	363 (0.24 %)	282 (100.00 %)	541,958 (3.43 %)	566,692 (13.38 %)	6,205,274 (28.98 %)	1 (0.00 %)	651,029 (4.07 %)	35,549 (5.05 %)	23,802 (1.15 %)
416	Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank) GCA_029499605.1	108,406 (45.40 %)	n/a	13,961 (0.46 %)	36,603 (1.55 %)	n/a	43.90 (99.99 %)	0 (0 %)	2,297 (0.01 %)	3,475 (100.00 %)	1,903,658 (2.85 %)	2,970,695 (16.56 %)	15,354,615 (64.31 %)	20 (0.00 %)	n/a	652,708 (8.36 %)	43,665 (0.45 %)
417	SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19) GCF_009858895.2	n/a	13 (97.85 %)	n/a	n/a	n/a	37.98 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.24 %)	1 (0.11 %)	33 (1.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (0.73 %)	1 (0.73 %)
418	sea anemones (CC7 2015 genbank) GCA_001417965.1	29,778 (59.32 %)	26,042 (31.72 %)	3,020 (1.06 %)	13,146 (12.99 %)	30,497 (24.04 %)	36.33 (82.34 %)	0 (0 %)	637,478 (17.95 %)	4,312 (100.00 %)	74,671 (1.98 %)	63,328 (2.24 %)	1,417,036 (20.33 %)	493 (0.38 %)	82,695 (5.22 %)	2,099 (0.38 %)	1,309 (0.28 %)
419	sea lamprey (kPetMar1 primary hap 2020) GCA_010993605.1	n/a	n/a	8,130 (0.73 %)	36,343 (4.06 %)	n/a	48.31 (98.62 %)	0 (0 %)	930 (1.38 %)	1,433 (100.00 %)	3,309,659 (59.73 %)	1,194,161 (21.47 %)	5,320,564 (50.50 %)	4 (0.00 %)	768,508 (3.64 %)	178,590 (35.88 %)	150,079 (6.78 %)
420	sea otter (GAN:26980312 2017 genbank) GCA_002288905.2	n/a	n/a	18,591 (1.64 %)	20,913 (1.44 %)	34,142 (1.77 %)	41.56 (98.79 %)	22,821 (1.21 %)	23,134 (1.21 %)	29,588 (98.79 %)	4,702,292 (41.42 %)	721,749 (1.39 %)	14,065,592 (32.89 %)	1,203 (0.02 %)	504,215 (2.00 %)	55,388 (1.87 %)	53,466 (1.67 %)
421	segmented worms (v1 2012) GCF_000326865.1	23,426 (13.46 %)	n/a	2,741 (0.95 %)	3,156 (4.19 %)	n/a	32.82 (91.54 %)	10,301 (8.47 %)	11,185 (8.47 %)	12,292 (91.53 %)	572,062 (30.90 %)	474,390 (10.49 %)	1,741,644 (44.75 %)	9 (0.01 %)	91,780 (2.82 %)	3,489 (0.51 %)	1,342 (0.18 %)
422	siamang (v1 Jambi primary hap 2023) GCF_028878055.1	79,118 (2.62 %)	n/a	20,139 (1.70 %)	21,232 (1.14 %)	n/a	40.62 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	606 (100.00 %)	5,278,880 (55.89 %)	946,219 (14.68 %)	14,395,605 (46.26 %)	0 (0 %)	2,376,584 (4.99 %)	95,573 (1.75 %)	30,053 (0.74 %)
423	siamang (v2 Jambi primary hap 2024 genbank) GCA_028878055.2	105,360 (44.53 %)	n/a	20,433 (1.69 %)	21,357 (1.12 %)	n/a	40.42 (99.97 %)	0 (0 %)	1 (0.03 %)	26 (100.00 %)	5,354,441 (55.80 %)	935,620 (14.70 %)	14,917,483 (46.01 %)	0 (0 %)	2,398,386 (4.90 %)	92,243 (1.42 %)	27,998 (0.68 %)
424	siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq) GCF_028878055.2	105,373 (3.05 %)	n/a	20,434 (1.69 %)	21,357 (1.12 %)	n/a	40.42 (99.97 %)	0 (0 %)	2 (0.03 %)	27 (100.00 %)	5,354,446 (55.80 %)	935,620 (14.70 %)	14,917,515 (46.01 %)	0 (0 %)	2,398,386 (4.90 %)	92,243 (1.42 %)	27,998 (0.68 %)
425	Siamese fighting fish (v2 primary hap 2019) GCF_900634795.2	54,389 (16.95 %)	n/a	14,745 (4.21 %)	34,348 (10.09 %)	62,673 (13.02 %)	45.30 (99.99 %)	0 (0 %)	328 (0.01 %)	70 (100.00 %)	252,955 (3.51 %)	184,269 (4.62 %)	2,010,934 (23.88 %)	0 (0 %)	232,426 (4.41 %)	72,126 (13.08 %)	55,959 (7.25 %)
426	Siamese fighting fish (v3 primary hap 2020) GCF_900634795.3	54,864 (17.78 %)	n/a	14,745 (4.20 %)	56,808 (10.87 %)	69,466 (16.34 %)	45.30 (99.99 %)	0 (0 %)	328 (0.01 %)	70 (100.00 %)	255,550 (3.51 %)	184,269 (4.62 %)	2,010,934 (23.88 %)	0 (0 %)	232,435 (4.41 %)	72,126 (13.08 %)	55,959 (7.25 %)
427	silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz) GCF_009828535.1	54,238 (2.74 %)	n/a	17,887 (2.00 %)	18,517 (1.25 %)	n/a	41.17 (98.20 %)	0 (0 %)	18,567 (1.80 %)	18,392 (100.00 %)	4,399,357 (50.55 %)	711,948 (2.37 %)	12,623,705 (36.55 %)	554 (0.02 %)	851,081 (2.16 %)	67,835 (1.30 %)	23,062 (0.73 %)
428	silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz) GCF_009828535.2	63,475 (2.65 %)	n/a	20,581 (1.94 %)	21,181 (1.20 %)	41,252 (1.46 %)	41.02 (97.81 %)	0 (0 %)	25,106 (2.19 %)	18,395 (100.00 %)	5,332,131 (51.09 %)	857,562 (2.26 %)	15,565,289 (36.84 %)	736 (0.02 %)	997,772 (2.11 %)	80,124 (1.26 %)	26,690 (0.70 %)
429	slow loris (BS32 2019) GCA_004027815.1	n/a	n/a	26,771 (1.11 %)	44,247 (1.00 %)	n/a	40.68 (99.86 %)	9,648 (0.03 %)	9,648 (0.03 %)	1,946,791 (99.97 %)	6,230,312 (41.68 %)	688,924 (1.23 %)	16,892,392 (43.00 %)	103 (0.00 %)	n/a	39,326 (0.65 %)	24,515 (0.47 %)
430	slow loris (primary hap 2022 genbank) GCA_027406575.1	67,213 (41.75 %)	n/a	22,195 (1.49 %)	21,341 (1.28 %)	n/a	40.82 (99.86 %)	0 (0 %)	218 (0.14 %)	85 (100.00 %)	4,625,875 (39.88 %)	579,984 (1.59 %)	14,405,402 (40.78 %)	2 (0.00 %)	991,314 (2.40 %)	38,257 (0.77 %)	22,955 (0.54 %)
431	small Madagascar hedgehog GCA_000313985.1	n/a	n/a	19,066 (1.18 %)	19,334 (1.31 %)	n/a	43.01 (88.44 %)	269,444 (11.60 %)	269,444 (11.60 %)	277,845 (88.40 %)	3,789,866 (28.89 %)	429,318 (0.87 %)	16,950,647 (32.23 %)	3,871 (0.06 %)	189,446 (0.64 %)	39,994 (0.70 %)	32,202 (0.55 %)
432	smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq) GCF_902713615.1	55,762 (1.62 %)	n/a	12,597 (0.36 %)	23,987 (1.08 %)	n/a	47.65 (98.48 %)	0 (0 %)	7,146 (1.52 %)	646 (100.00 %)	1,185,832 (1.72 %)	1,448,620 (6.25 %)	20,884,767 (51.41 %)	10 (0.00 %)	3,334,926 (4.99 %)	456,658 (8.18 %)	31,096 (0.32 %)
433	smalleye Pacific opah (hap2 2023 genbank) GCA_029633865.1	n/a	n/a	13,617 (1.10 %)	74,639 (4.12 %)	n/a	44.94 (99.96 %)	0 (0 %)	3,115 (0.04 %)	544 (100.00 %)	4,603,649 (53.23 %)	1,009,241 (18.00 %)	5,236,063 (51.65 %)	17 (0.00 %)	n/a	143,632 (7.43 %)	65,914 (2.15 %)
434	smalltooth sawfish (v2 primary hap 2019 genbank) GCA_009764475.1	n/a	n/a	11,828 (0.66 %)	18,627 (1.55 %)	n/a	42.38 (99.09 %)	0 (0 %)	698 (0.91 %)	173 (100.00 %)	405,021 (1.14 %)	391,531 (1.52 %)	11,282,302 (38.19 %)	0 (0 %)	471,290 (1.50 %)	45,398 (1.34 %)	18,572 (0.38 %)
435	snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016) GCF_001687245.1	37,836 (4.45 %)	n/a	10,526 (1.07 %)	59,331 (6.34 %)	n/a	36.53 (93.84 %)	52,913 (6.17 %)	227,684 (6.18 %)	139,583 (93.83 %)	653,914 (2.87 %)	386,956 (5.71 %)	7,364,314 (43.00 %)	22,478 (0.98 %)	443,424 (7.26 %)	60,636 (4.05 %)	36,565 (2.36 %)
436	sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019) GCF_006149115.1	76,167 (6.12 %)	n/a	24,114 (1.71 %)	51,371 (4.08 %)	102,891 (5.24 %)	43.39 (96.16 %)	1,903 (0.01 %)	25,659 (3.84 %)	38,027 (99.99 %)	1,300,179 (8.96 %)	1,465,690 (10.81 %)	8,849,714 (48.44 %)	872 (0.04 %)	1,716,006 (5.17 %)	64,215 (1.55 %)	18,038 (0.45 %)
437	southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank) GCA_910596095.1	58,416 (66.24 %)	n/a	15,695 (2.61 %)	42,730 (5.74 %)	n/a	39.73 (100.00 %)	0 (0 %)	95 (0.00 %)	58 (100.00 %)	1,591,314 (33.50 %)	247,764 (2.94 %)	5,176,850 (26.85 %)	0 (0 %)	326,259 (3.37 %)	14,097 (0.88 %)	9,797 (0.48 %)
438	southern cattle tick (Rmic-2018 2020 genbank) GCA_013339725.1	n/a	29,870 (1.19 %)	3,698 (0.12 %)	117,910 (5.00 %)	35,315 (1.88 %)	45.79 (99.99 %)	0 (0 %)	1,576 (0.01 %)	7,048 (100.00 %)	770,997 (2.03 %)	680,149 (3.55 %)	10,994,272 (39.37 %)	0 (0 %)	979,976 (3.85 %)	304,620 (17.03 %)	234,809 (5.42 %)
439	southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad) GCA_004026725.1	n/a	n/a	24,302 (1.12 %)	43,055 (0.98 %)	n/a	41.63 (99.82 %)	10,550 (0.03 %)	10,550 (0.03 %)	2,272,285 (99.97 %)	5,668,964 (24.75 %)	1,628,683 (5.38 %)	15,658,806 (41.85 %)	67 (0.00 %)	n/a	21,801 (0.44 %)	18,380 (0.34 %)
440	southern house mosquito (JHB 2007 genbank) GCA_000209185.1	n/a	22,629 (4.75 %)	5,905 (1.14 %)	41,195 (8.84 %)	n/a	37.42 (93.28 %)	45,500 (6.75 %)	45,500 (6.75 %)	48,671 (93.25 %)	738,398 (35.22 %)	171,041 (5.71 %)	3,037,349 (50.41 %)	88 (0.02 %)	323,404 (5.87 %)	65,784 (9.49 %)	44,205 (6.42 %)
441	southern tamandua (Broad 2019) GCA_004025105.1	n/a	n/a	25,638 (0.82 %)	49,782 (0.86 %)	n/a	39.53 (99.88 %)	5,819 (0.02 %)	5,819 (0.02 %)	2,150,023 (99.98 %)	6,033,640 (37.10 %)	708,890 (0.99 %)	22,371,532 (41.88 %)	62 (0.00 %)	n/a	80,897 (1.09 %)	48,136 (0.70 %)
442	southern two-toed sloth (US054 2019 Broad) GCA_004027855.1	n/a	n/a	25,877 (0.78 %)	56,071 (0.82 %)	n/a	39.82 (99.84 %)	5,099 (0.02 %)	5,099 (0.02 %)	2,537,432 (99.98 %)	5,384,587 (37.86 %)	724,925 (2.20 %)	19,492,096 (41.12 %)	63 (0.00 %)	n/a	55,674 (0.90 %)	46,833 (0.74 %)
443	southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank) GCA_000283155.1	37,037 (37.57 %)	n/a	18,551 (1.79 %)	19,747 (1.44 %)	n/a	40.90 (96.05 %)	54,737 (3.96 %)	54,737 (3.96 %)	57,823 (96.04 %)	3,824,807 (39.33 %)	421,693 (0.97 %)	14,765,476 (28.93 %)	1,818 (0.02 %)	184,274 (0.57 %)	36,281 (1.02 %)	34,129 (0.92 %)
444	soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010) GCF_000004515.4	82,440 (9.65 %)	n/a	27,682 (3.07 %)	77,218 (11.84 %)	n/a	34.77 (97.65 %)	15,955 (2.35 %)	15,955 (2.35 %)	17,146 (97.65 %)	834,646 (37.35 %)	436,219 (5.65 %)	5,341,660 (45.30 %)	54 (0.01 %)	659,519 (6.22 %)	35,897 (1.56 %)	13,140 (0.58 %)
445	soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018) GCF_000004515.5	85,123 (9.72 %)	n/a	27,647 (3.06 %)	77,190 (11.83 %)	n/a	34.77 (97.65 %)	15,995 (2.36 %)	15,995 (2.36 %)	17,187 (97.64 %)	834,651 (37.35 %)	436,225 (5.65 %)	5,341,721 (45.30 %)	55 (0.01 %)	659,428 (6.22 %)	35,897 (1.47 %)	13,140 (0.58 %)
446	speckled wood butterfly (genbank 2021) GCA_905163445.1	21,720 (55.73 %)	n/a	4,713 (0.87 %)	17,002 (4.33 %)	29,238 (7.81 %)	35.99 (100.00 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	71 (100.00 %)	304,077 (2.97 %)	110,835 (4.09 %)	3,704,355 (44.42 %)	1 (0.00 %)	144,758 (2.93 %)	28,108 (2.75 %)	11,566 (0.96 %)
447	sperm whale (SW-GA 2019) GCF_002837175.2	60,921 (2.59 %)	n/a	19,527 (1.73 %)	25,114 (1.51 %)	n/a	41.39 (95.90 %)	128,928 (4.12 %)	128,928 (4.12 %)	143,605 (95.88 %)	4,365,057 (42.78 %)	694,673 (2.40 %)	13,518,590 (32.76 %)	1,887 (0.17 %)	521,351 (4.50 %)	94,152 (2.52 %)	63,303 (1.97 %)
448	sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF) GCF_000090795.1	31,248 (25.26 %)	n/a	2,167 (1.08 %)	6,648 (9.22 %)	n/a	35.83 (86.92 %)	14,574 (13.10 %)	14,944 (13.10 %)	27,972 (86.90 %)	108,973 (4.04 %)	70,563 (4.66 %)	881,116 (24.58 %)	109 (0.03 %)	120,772 (5.83 %)	668 (0.62 %)	519 (0.56 %)
449	stable fly (8C7A2A5H3J4 2015 genbank) GCA_001015335.1	n/a	n/a	7,737 (1.16 %)	11,972 (2.65 %)	n/a	38.85 (84.55 %)	113,660 (15.50 %)	129,113 (15.50 %)	125,702 (84.50 %)	310,342 (1.75 %)	391,619 (8.42 %)	5,616,633 (48.71 %)	6,705 (0.32 %)	483,703 (3.74 %)	38,246 (1.55 %)	4,353 (0.18 %)
450	sterlet (maternal hap 2022 genbank) GCA_902713425.2	n/a	n/a	25,364 (1.76 %)	40,452 (4.10 %)	n/a	40.11 (100.00 %)	0 (0 %)	433 (0.00 %)	1,731 (100.00 %)	4,055,215 (43.14 %)	1,124,096 (10.13 %)	9,426,172 (41.81 %)	10 (0.00 %)	1,593,749 (6.87 %)	64,522 (2.85 %)	21,984 (0.89 %)
451	sterlet (v1 Gen_M01 2020) GCF_010645085.1	73,251 (5.76 %)	n/a	24,411 (1.72 %)	39,637 (3.96 %)	n/a	39.76 (99.93 %)	0 (0 %)	6,283 (0.07 %)	3,404 (100.00 %)	1,269,345 (3.50 %)	1,095,665 (6.81 %)	10,007,602 (39.30 %)	5 (0.00 %)	1,356,511 (6.13 %)	60,475 (1.95 %)	17,954 (0.41 %)
452	stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017) GCF_002571385.1	36,135 (16.45 %)	n/a	3,324 (0.70 %)	20,909 (10.93 %)	38,198 (17.00 %)	38.54 (89.50 %)	0 (0 %)	49,077 (10.54 %)	5,688 (100.00 %)	111,077 (1.70 %)	108,732 (2.95 %)	2,009,396 (21.40 %)	206 (0.10 %)	118,773 (3.74 %)	6,012 (0.58 %)	3,703 (0.31 %)
453	striped catfish (primary hap 2022 genbank) GCA_027358585.1	53,859 (65.52 %)	n/a	16,035 (2.86 %)	41,619 (5.48 %)	n/a	38.99 (99.49 %)	0 (0 %)	236 (0.51 %)	59 (100.00 %)	1,870,238 (37.80 %)	605,571 (6.82 %)	5,059,499 (32.43 %)	2 (0.00 %)	531,388 (4.26 %)	17,919 (1.29 %)	12,796 (0.75 %)
454	Sumatran orangutan (Susie 2018 genbank) GCA_002880775.3	n/a	160,726 (3.42 %)	20,174 (1.79 %)	20,994 (1.15 %)	47,806 (1.68 %)	40.80 (99.29 %)	553 (0.70 %)	553 (0.70 %)	5,813 (99.30 %)	5,497,148 (54.41 %)	1,048,361 (8.01 %)	15,948,575 (40.68 %)	0 (0 %)	2,413,946 (4.00 %)	39,481 (0.87 %)	26,385 (0.67 %)
455	Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023) GCF_028885655.1	98,046 (3.46 %)	n/a	21,162 (1.68 %)	21,714 (1.13 %)	n/a	41.13 (99.79 %)	59 (0.21 %)	59 (0.21 %)	2,670 (99.79 %)	5,730,768 (55.05 %)	1,175,314 (11.19 %)	16,323,507 (44.05 %)	0 (0 %)	2,553,363 (4.41 %)	55,799 (2.08 %)	39,159 (1.10 %)
456	Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019) GCA_009819505.1	n/a	n/a	13,403 (1.85 %)	27,456 (2.48 %)	n/a	42.86 (100.00 %)	0 (0 %)	13 (0.00 %)	3,601 (100.00 %)	497,374 (5.78 %)	649,859 (4.89 %)	6,740,713 (22.65 %)	0 (0 %)	505,741 (2.66 %)	49,076 (3.54 %)	23,486 (1.21 %)
457	Swainson's thrush (v1 primary hap 2019) GCF_009819885.1	40,128 (5.45 %)	n/a	13,016 (1.88 %)	24,787 (2.41 %)	30,064 (2.94 %)	42.48 (98.86 %)	0 (0 %)	428 (1.14 %)	161 (100.00 %)	483,978 (5.85 %)	589,859 (4.32 %)	6,708,638 (22.44 %)	1 (0.00 %)	449,585 (2.41 %)	49,404 (3.53 %)	22,206 (1.16 %)
458	swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank) GCA_028018845.1	29,544 (46.92 %)	n/a	12,375 (1.75 %)	24,577 (2.31 %)	n/a	43.08 (99.89 %)	0 (0 %)	236 (0.11 %)	40 (100.00 %)	419,473 (3.09 %)	439,909 (7.61 %)	6,077,743 (24.47 %)	1 (0.00 %)	578,723 (3.93 %)	32,064 (3.27 %)	22,996 (1.19 %)
459	Tasmanian devil GCF_000189315.1	32,527 (1.79 %)	n/a	16,112 (0.84 %)	16,152 (0.94 %)	n/a	36.05 (92.36 %)	201,317 (7.66 %)	201,403 (7.66 %)	237,291 (92.34 %)	6,766,259 (42.85 %)	1,240,681 (2.07 %)	20,998,733 (36.61 %)	17,494 (0.40 %)	351,216 (1.07 %)	23,155 (0.38 %)	21,337 (0.32 %)
460	thale cress (tair10 Columbia 2011) GCF_000001735.3	54,010 (40.19 %)	n/a	26,552 (34.12 %)	25,867 (35.78 %)	n/a	36.06 (99.85 %)	0 (0 %)	357 (0.16 %)	7 (100.00 %)	67,353 (16.32 %)	27,063 (2.77 %)	749,020 (22.64 %)	1 (0.00 %)	42,547 (3.36 %)	4,599 (1.63 %)	3,518 (1.15 %)
461	thirteen-lined ground squirrel (2011) GCF_000236235.1	41,886 (2.61 %)	n/a	19,165 (1.70 %)	18,102 (1.44 %)	n/a	39.91 (93.27 %)	141,005 (6.75 %)	141,005 (6.75 %)	153,488 (93.25 %)	4,378,557 (36.61 %)	640,337 (1.64 %)	14,116,066 (27.91 %)	2,964 (0.05 %)	213,421 (0.74 %)	28,321 (0.64 %)	26,464 (0.58 %)
462	thorny skate (v1 CabotCenter1 v1 2020 refseq) GCF_010909765.1	45,969 (2.40 %)	n/a	11,433 (0.60 %)	26,341 (1.72 %)	32,017 (1.87 %)	44.30 (92.54 %)	0 (0 %)	3,753 (7.46 %)	957 (100.00 %)	865,711 (2.57 %)	1,176,348 (3.79 %)	9,964,038 (52.25 %)	26 (0.00 %)	1,634,657 (4.98 %)	242,676 (4.73 %)	31,030 (0.57 %)
463	thorny skate (v1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank) GCA_010909765.1	45,969 (46.35 %)	n/a	11,434 (0.60 %)	26,342 (1.72 %)	32,017 (1.87 %)	44.30 (92.54 %)	0 (0 %)	3,753 (7.46 %)	958 (100.00 %)	866,598 (2.58 %)	1,176,350 (3.79 %)	9,964,083 (52.25 %)	26 (0.00 %)	1,634,657 (4.98 %)	242,676 (4.73 %)	31,030 (0.57 %)
464	tick D.silvarum (v1 2020) GCF_013339745.1	36,084 (1.94 %)	n/a	4,032 (0.13 %)	128,567 (5.82 %)	43,960 (2.05 %)	46.91 (99.95 %)	0 (0 %)	13,519 (0.05 %)	1,665 (100.00 %)	1,116,542 (2.95 %)	642,860 (3.16 %)	10,429,455 (39.18 %)	6 (0.00 %)	n/a	37,849 (2.30 %)	244,151 (6.39 %)
465	tidepool copepod (San Diego 2019 genbank) GCA_007210705.1	23,429 (54.20 %)	15,577 (15.83 %)	3,517 (1.61 %)	18,910 (15.71 %)	n/a	42.18 (97.94 %)	0 (0 %)	14,007 (2.09 %)	459 (100.00 %)	52,042 (1.17 %)	27,065 (1.23 %)	928,666 (18.11 %)	1,035 (0.11 %)	46,898 (3.89 %)	15,823 (5.51 %)	13,041 (4.23 %)
466	tiger tail seahorse (QL1 v1 2016) GCF_001891065.1	47,041 (13.29 %)	n/a	13,817 (3.76 %)	32,943 (8.81 %)	n/a	43.30 (93.04 %)	23,101 (6.97 %)	23,101 (6.97 %)	60,478 (93.03 %)	359,724 (3.91 %)	155,380 (3.35 %)	2,811,700 (24.51 %)	111 (0.08 %)	112,479 (5.30 %)	61,685 (7.72 %)	45,970 (4.19 %)
467	tomato (v3.0 Heinz 1706 2018) GCF_000188115.4	46,015 (6.94 %)	n/a	15,396 (2.15 %)	38,462 (7.56 %)	n/a	34.12 (90.18 %)	0 (0 %)	19,634 (9.83 %)	3,150 (100.00 %)	417,162 (18.21 %)	229,803 (3.18 %)	5,370,478 (35.28 %)	224 (0.02 %)	412,060 (4.40 %)	25,279 (1.28 %)	2,409 (0.12 %)
468	trahira (v1 hap1 2023) GCA_029633855.1	n/a	n/a	16,039 (2.06 %)	44,287 (4.38 %)	n/a	40.99 (92.91 %)	0 (0 %)	867 (7.09 %)	597 (100.00 %)	2,228,831 (30.95 %)	687,495 (13.85 %)	5,309,097 (36.70 %)	2 (0.01 %)	1,157,952 (7.09 %)	27,070 (2.09 %)	12,077 (0.44 %)
469	Trypanosoma equiperdum (OVI 2016 genbank) GCA_001457755.2	n/a	10,902 (50.13 %)	576 (1.36 %)	2,999 (35.93 %)	n/a	45.94 (99.65 %)	0 (0 %)	6,447 (0.44 %)	2,026 (100.00 %)	16,807 (2.60 %)	3,925 (0.79 %)	141,656 (16.64 %)	0 (0 %)	1,684 (0.54 %)	4,877 (34.82 %)	4,352 (15.04 %)
470	Trypanosoma melophagium (St. Kilda St. Kilda 2022 genbank) GCA_022059095.1	n/a	10,057 (64.23 %)	742 (1.83 %)	848 (40.20 %)	n/a	41.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	64 (100.00 %)	39,141 (7.68 %)	14,366 (6.71 %)	131,898 (25.19 %)	0 (0 %)	9,068 (6.92 %)	4,119 (14.82 %)	3,546 (9.39 %)
471	tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020) GCF_014805625.1	24,334 (8.13 %)	n/a	7,223 (2.32 %)	6,632 (3.62 %)	n/a	33.80 (97.46 %)	0 (0 %)	9,688 (2.55 %)	7,986 (100.00 %)	418,532 (4.76 %)	185,734 (2.26 %)	3,090,742 (35.34 %)	677 (0.08 %)	40,269 (0.93 %)	3,487 (0.58 %)	1,907 (0.28 %)
472	two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq) GCF_901001135.1	56,617 (1.50 %)	n/a	14,448 (0.38 %)	40,572 (1.31 %)	n/a	44.40 (99.36 %)	0 (0 %)	3,573 (0.64 %)	1,330 (100.00 %)	2,263,606 (1.94 %)	2,036,108 (4.34 %)	29,400,958 (44.09 %)	9 (0.01 %)	2,193,249 (3.24 %)	602,912 (6.66 %)	94,935 (0.82 %)
473	Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017) GCA_002776525.1	n/a	n/a	21,053 (1.88 %)	23,024 (1.24 %)	n/a	40.68 (96.59 %)	0 (0 %)	77,615 (3.42 %)	47,644 (100.00 %)	5,478,730 (51.13 %)	969,126 (2.63 %)	16,127,854 (36.40 %)	1,906 (0.05 %)	947,012 (1.94 %)	63,965 (1.04 %)	25,907 (0.65 %)
474	Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018) GCF_002776525.2	66,965 (2.69 %)	n/a	21,958 (1.85 %)	24,388 (1.22 %)	55,722 (1.95 %)	40.60 (97.10 %)	0 (0 %)	63,620 (2.91 %)	47,449 (100.00 %)	5,699,639 (51.61 %)	1,066,606 (2.87 %)	16,603,622 (37.49 %)	6,170 (0.10 %)	1,075,458 (2.10 %)	71,084 (1.08 %)	26,726 (0.65 %)
475	Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019) GCF_002776525.3	68,173 (2.68 %)	n/a	21,804 (1.85 %)	23,385 (1.18 %)	n/a	40.60 (97.10 %)	0 (0 %)	64,415 (2.91 %)	46,654 (100.00 %)	5,700,226 (51.61 %)	1,066,759 (2.88 %)	16,603,818 (37.49 %)	6,208 (0.10 %)	1,080,318 (2.10 %)	71,078 (1.08 %)	26,732 (0.65 %)
476	Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019) GCF_002776525.4	63,704 (2.55 %)	n/a	21,347 (1.86 %)	23,056 (1.19 %)	n/a	40.84 (97.07 %)	0 (0 %)	57,757 (2.93 %)	34,372 (100.00 %)	5,504,117 (51.70 %)	961,351 (2.75 %)	16,208,033 (37.10 %)	4,987 (0.09 %)	1,064,626 (2.10 %)	71,046 (1.10 %)	29,347 (0.68 %)
477	Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank) GCA_000622305.1	54,667 (35.81 %)	n/a	19,685 (1.25 %)	21,268 (1.20 %)	n/a	41.26 (95.18 %)	201,121 (4.83 %)	201,121 (4.83 %)	356,096 (95.17 %)	6,165,270 (34.95 %)	1,197,778 (2.77 %)	16,282,333 (36.21 %)	730 (0.04 %)	592,599 (1.56 %)	22,905 (0.49 %)	18,563 (0.39 %)
478	valley oak (v3.0 2019) GCF_001633185.1	63,555 (8.16 %)	n/a	16,886 (1.90 %)	72,876 (14.48 %)	n/a	35.38 (99.77 %)	0 (0 %)	1,674 (0.23 %)	2,010 (100.00 %)	800,389 (3.72 %)	460,244 (7.41 %)	5,439,256 (37.83 %)	3 (0.00 %)	746,332 (7.48 %)	19,635 (1.10 %)	9,142 (0.41 %)
479	vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017) GCF_002806865.1	48,870 (21.91 %)	n/a	19,421 (7.41 %)	36,314 (20.76 %)	n/a	36.49 (94.25 %)	0 (0 %)	49,649 (5.76 %)	25,263 (100.00 %)	182,696 (3.35 %)	143,269 (7.40 %)	1,620,517 (29.12 %)	3,454 (0.84 %)	135,503 (7.90 %)	13,323 (2.49 %)	9,786 (1.57 %)
480	velvet spider S.dumicola (v1 Namibia, Etosha 2020) GCF_010614865.1	34,675 (2.01 %)	n/a	3,329 (0.10 %)	24,015 (1.20 %)	n/a	33.26 (100.00 %)	0 (0 %)	7 (0.00 %)	16,531 (100.00 %)	1,258,301 (2.08 %)	828,332 (2.42 %)	17,994,342 (48.98 %)	0 (0 %)	650,236 (2.42 %)	63,015 (0.95 %)	8,586 (0.12 %)
481	wasp C.solmsi marchali (v1 2013) GCF_000503995.1	13,201 (7.14 %)	n/a	3,474 (1.25 %)	15,142 (4.89 %)	n/a	30.36 (99.55 %)	7,471 (0.46 %)	7,471 (0.46 %)	9,928 (99.54 %)	340,841 (7.52 %)	251,386 (3.99 %)	2,448,273 (49.27 %)	11 (0.00 %)	43,154 (0.99 %)	16,346 (4.08 %)	14,983 (2.78 %)
482	water buffalo (Mediterranean 2013) GCA_000471725.1	n/a	n/a	20,245 (1.49 %)	24,230 (1.29 %)	n/a	42.11 (97.39 %)	263,385 (2.62 %)	263,385 (2.62 %)	630,367 (97.38 %)	5,997,926 (47.35 %)	466,019 (1.02 %)	13,822,739 (40.29 %)	2,383 (0.04 %)	975,519 (2.73 %)	93,080 (1.71 %)	42,806 (0.88 %)
483	Weddell seal (WS11-02 2013 genbank) GCA_000349705.1	48,251 (30.18 %)	n/a	21,044 (1.72 %)	22,320 (1.43 %)	n/a	41.39 (70.44 %)	152,836 (29.58 %)	152,836 (29.58 %)	169,546 (70.42 %)	4,420,479 (41.72 %)	471,250 (0.66 %)	13,410,191 (22.09 %)	2,022 (0.05 %)	348,918 (1.08 %)	48,738 (1.01 %)	44,867 (0.88 %)
484	western European hedgehog (2012 genbank) GCA_000296755.1	29,923 (35.25 %)	n/a	18,034 (1.33 %)	19,779 (1.35 %)	n/a	41.54 (85.94 %)	219,764 (14.09 %)	219,764 (14.09 %)	225,566 (85.91 %)	6,527,125 (45.87 %)	1,271,531 (2.29 %)	12,374,069 (42.02 %)	3,596 (0.06 %)	861,216 (2.39 %)	28,528 (0.71 %)	23,900 (0.52 %)
485	western European hedgehog (primary hap 2023 genbank) GCA_950295315.1	61,103 (44.10 %)	n/a	18,126 (1.16 %)	21,345 (1.28 %)	n/a	42.00 (99.97 %)	0 (0 %)	3,760 (0.03 %)	1,175 (100.00 %)	4,891,344 (19.68 %)	1,507,933 (3.81 %)	12,571,193 (54.50 %)	7 (0.00 %)	1,975,693 (4.67 %)	32,667 (0.90 %)	24,067 (0.56 %)
486	western European house mouse (WSB_EiJ v1 2016) GCA_001624835.1	n/a	n/a	20,870 (2.26 %)	18,535 (1.45 %)	100,622 (4.22 %)	41.80 (84.36 %)	68,691 (5.19 %)	399,976 (15.70 %)	72,315 (94.81 %)	4,961,700 (39.53 %)	1,345,987 (2.51 %)	13,324,808 (25.23 %)	11,455 (0.66 %)	369,064 (1.23 %)	16,556 (0.40 %)	15,878 (0.38 %)
487	western flower thrips (v2 FOCC.00 2017) GCF_000697945.2	24,277 (14.78 %)	n/a	4,066 (1.46 %)	26,743 (11.40 %)	n/a	51.10 (94.72 %)	15,747 (5.29 %)	60,375 (5.31 %)	34,226 (94.71 %)	275,482 (4.88 %)	167,812 (3.67 %)	1,832,537 (24.44 %)	729 (0.04 %)	58,278 (2.14 %)	26,406 (36.85 %)	31,568 (5.58 %)
488	western lowland gorilla (Susie 2016) GCA_900006655.3	n/a	n/a	20,323 (1.77 %)	22,069 (1.15 %)	n/a	40.71 (99.64 %)	768 (0.36 %)	768 (0.36 %)	16,065 (99.64 %)	5,373,630 (50.30 %)	1,025,389 (10.17 %)	15,954,613 (41.78 %)	0 (0 %)	3,581,997 (5.69 %)	53,557 (1.01 %)	27,578 (0.69 %)
489	western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023) GCF_029281585.1	101,242 (3.18 %)	n/a	20,994 (1.57 %)	41,945 (1.53 %)	n/a	40.59 (99.85 %)	0 (0 %)	38 (0.15 %)	637 (100.00 %)	5,526,927 (51.16 %)	1,080,693 (20.38 %)	15,929,020 (48.46 %)	0 (0 %)	5,690,867 (9.25 %)	76,432 (1.35 %)	30,764 (0.70 %)
490	western lowland gorilla (v2 KB3781 2024 genbank) GCA_029281585.2	98,415 (41.67 %)	n/a	21,010 (1.59 %)	50,696 (1.83 %)	n/a	40.49 (99.94 %)	0 (0 %)	2 (0.06 %)	25 (100.00 %)	5,456,267 (50.77 %)	1,060,267 (19.55 %)	15,870,191 (47.77 %)	0 (0 %)	n/a	69,745 (1.19 %)	30,644 (0.70 %)
491	western painted turtle (v303 2014) GCF_000241765.3	51,681 (3.25 %)	n/a	15,203 (1.04 %)	22,272 (1.67 %)	46,230 (2.32 %)	44.19 (91.88 %)	183,751 (8.14 %)	183,744 (8.14 %)	262,326 (91.86 %)	2,767,141 (30.92 %)	316,971 (0.98 %)	11,856,824 (28.95 %)	6,315 (0.16 %)	313,471 (1.46 %)	104,231 (1.84 %)	32,424 (0.69 %)
492	western painted turtle (v304 RCT428 2020) GCF_000241765.4	64,798 (3.75 %)	n/a	15,669 (1.09 %)	21,663 (1.64 %)	n/a	44.19 (87.54 %)	184,311 (12.48 %)	184,311 (12.48 %)	260,698 (87.52 %)	3,780,252 (41.81 %)	316,422 (0.93 %)	11,852,305 (27.59 %)	6,323 (0.15 %)	313,495 (1.39 %)	103,899 (1.75 %)	33,034 (0.70 %)
493	western predatory mite (v1.0 2012) GCF_000255335.1	12,199 (13.86 %)	n/a	2,842 (1.49 %)	27,198 (19.18 %)	n/a	51.58 (99.74 %)	1,782 (0.26 %)	1,901 (0.26 %)	3,993 (99.74 %)	33,136 (1.10 %)	13,115 (0.57 %)	612,854 (9.73 %)	4 (0.00 %)	11,929 (0.89 %)	2,003 (54.71 %)	1,569 (0.97 %)
494	western wild mouse (SPRET_EiJ v1 2016) GCA_001624865.1	n/a	n/a	21,211 (2.19 %)	17,797 (1.36 %)	100,839 (4.01 %)	41.65 (89.10 %)	23,451 (1.23 %)	334,091 (10.95 %)	29,259 (98.77 %)	5,087,807 (40.60 %)	1,402,357 (3.14 %)	13,522,663 (27.99 %)	17,567 (1.08 %)	457,523 (2.25 %)	16,888 (0.42 %)	15,748 (0.39 %)
495	wheat stem sawfly (v1 2014) GCF_000341935.1	37,175 (25.01 %)	n/a	4,407 (2.81 %)	15,504 (11.96 %)	n/a	40.34 (98.12 %)	8,731 (1.89 %)	8,733 (1.89 %)	10,707 (98.11 %)	87,084 (2.38 %)	44,673 (2.55 %)	1,001,343 (22.18 %)	41 (0.03 %)	19,750 (1.66 %)	7,519 (2.78 %)	7,623 (2.13 %)
496	white leghorn X broiler chicken (v1 leghorn haplotype v1 2021) GCF_016700215.1	55,865 (8.86 %)	n/a	12,310 (2.41 %)	22,056 (2.57 %)	n/a	42.20 (99.65 %)	254 (0.35 %)	254 (0.35 %)	509 (99.65 %)	604,452 (10.76 %)	232,416 (2.03 %)	5,541,059 (20.23 %)	2 (0.00 %)	203,559 (1.88 %)	22,185 (2.62 %)	19,239 (1.58 %)
497	white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank) GCA_949774975.1	59,982 (41.87 %)	n/a	18,737 (1.57 %)	20,767 (1.34 %)	n/a	41.91 (99.99 %)	0 (0 %)	1,070 (0.01 %)	410 (100.00 %)	3,820,566 (36.21 %)	922,103 (8.43 %)	12,304,360 (39.74 %)	2 (0.00 %)	1,117,804 (3.60 %)	68,551 (3.58 %)	41,698 (1.09 %)
498	white-footed mouse GCF_004664715.1	46,167 (2.56 %)	n/a	20,406 (1.72 %)	20,857 (1.46 %)	39,081 (1.88 %)	42.23 (100.00 %)	0 (0 %)	79 (0.00 %)	1,763 (100.00 %)	5,064,597 (30.73 %)	1,258,088 (2.85 %)	14,005,845 (33.01 %)	0 (0 %)	551,791 (1.47 %)	23,475 (0.69 %)	19,781 (0.50 %)
499	white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank) GCA_002102435.1	57,774 (39.81 %)	n/a	20,653 (1.75 %)	23,083 (1.50 %)	40,950 (1.94 %)	41.55 (99.10 %)	31,627 (0.90 %)	107,030 (0.91 %)	48,652 (99.10 %)	4,799,958 (41.28 %)	413,128 (2.59 %)	13,296,686 (34.22 %)	7,681 (0.08 %)	439,019 (2.88 %)	44,165 (1.19 %)	41,200 (1.10 %)
500	white-tailed eagle (primary hap 2022 genbank) GCA_947461875.1	n/a	n/a	13,735 (1.76 %)	28,993 (2.53 %)	n/a	43.15 (99.99 %)	0 (0 %)	424 (0.01 %)	188 (100.00 %)	585,276 (12.89 %)	291,289 (6.10 %)	6,474,027 (23.66 %)	0 (0 %)	312,204 (2.16 %)	54,851 (4.05 %)	31,757 (1.50 %)
501	white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U) GCF_000004665.1	58,109 (2.92 %)	n/a	21,699 (1.91 %)	20,910 (1.24 %)	n/a	40.85 (94.45 %)	187,214 (5.57 %)	187,214 (5.57 %)	201,523 (94.43 %)	5,120,629 (48.95 %)	768,432 (2.30 %)	15,303,718 (34.75 %)	1,516 (0.02 %)	933,431 (2.31 %)	35,805 (0.79 %)	27,299 (0.64 %)
502	white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017) GCA_002754865.1	n/a	n/a	21,754 (1.86 %)	21,668 (1.22 %)	n/a	40.77 (99.67 %)	48,495 (0.33 %)	48,495 (0.33 %)	88,439 (99.67 %)	5,195,965 (48.83 %)	825,714 (3.60 %)	15,372,168 (38.05 %)	5,083 (0.10 %)	1,223,766 (2.72 %)	34,994 (0.85 %)	26,156 (0.69 %)
503	white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank) GCA_009663435.1	n/a	n/a	21,729 (1.89 %)	21,502 (1.30 %)	n/a	40.85 (98.70 %)	370 (1.30 %)	370 (1.30 %)	1,360 (98.70 %)	5,122,418 (49.40 %)	818,502 (3.68 %)	15,232,829 (38.20 %)	0 (0 %)	1,395,363 (2.77 %)	36,656 (0.90 %)	26,567 (0.71 %)
504	white-tufted-ear marmoset (v1 paternal hap 2020) GCA_011100535.1	n/a	n/a	20,939 (1.94 %)	20,416 (1.31 %)	n/a	41.04 (99.58 %)	0 (0 %)	788 (0.42 %)	336 (100.00 %)	4,869,007 (49.39 %)	746,577 (2.68 %)	14,347,286 (37.59 %)	0 (0 %)	1,026,338 (2.34 %)	35,222 (0.94 %)	25,795 (0.75 %)
505	white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank) GCA_011100555.2	n/a	n/a	21,801 (1.88 %)	21,501 (1.28 %)	n/a	40.92 (99.52 %)	0 (0 %)	1,165 (0.48 %)	1,234 (100.00 %)	5,036,594 (47.71 %)	842,846 (3.25 %)	15,161,577 (38.08 %)	2 (0.00 %)	1,256,016 (2.62 %)	37,603 (0.93 %)	34,471 (0.83 %)
506	whooping crane (maternal hap 2023 genbank) GCA_028858705.1	55,408 (53.40 %)	n/a	13,572 (1.81 %)	24,739 (2.19 %)	n/a	43.07 (99.63 %)	0 (0 %)	262 (0.37 %)	929 (100.00 %)	616,295 (10.57 %)	211,557 (2.90 %)	6,785,134 (22.11 %)	0 (0 %)	n/a	42,795 (4.66 %)	39,036 (2.34 %)
507	wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank) GCA_000311805.2	n/a	20,251 (1.34 %)	18,785 (1.94 %)	17,252 (1.62 %)	n/a	41.28 (98.83 %)	55,538 (1.18 %)	60,971 (1.18 %)	68,871 (98.82 %)	3,098,525 (34.75 %)	353,630 (1.23 %)	12,349,553 (25.12 %)	11 (0.00 %)	101,843 (0.63 %)	45,436 (1.02 %)	40,638 (0.87 %)
508	wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019) GCF_002162155.1	131,302 (1.34 %)	n/a	33,079 (0.33 %)	567,762 (8.14 %)	n/a	45.99 (96.70 %)	0 (0 %)	344,768 (3.31 %)	148,396 (100.00 %)	2,762,705 (2.81 %)	2,991,142 (3.37 %)	493,164 (96.69 %)	210 (0.02 %)	12,513,149 (13.71 %)	2,220,897 (25.33 %)	2,138,478 (24.00 %)
509	wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017) GCF_000817695.2	69,091 (6.81 %)	n/a	16,823 (1.67 %)	75,740 (11.45 %)	n/a	35.81 (86.74 %)	1,682 (1.55 %)	133,967 (13.30 %)	3,189 (98.45 %)	588,761 (3.39 %)	493,855 (3.35 %)	5,206,772 (45.36 %)	66 (0.02 %)	710,693 (6.46 %)	48,008 (1.88 %)	21,883 (0.84 %)
510	wild strawberry (2011 genbank) GCA_000184155.1	n/a	n/a	14,001 (6.64 %)	34,562 (26.90 %)	n/a	38.40 (94.26 %)	13,412 (5.76 %)	16,253 (5.76 %)	16,459 (94.24 %)	152,427 (20.00 %)	74,539 (2.79 %)	1,032,592 (21.43 %)	25 (0.01 %)	71,241 (3.11 %)	14,802 (3.20 %)	9,026 (1.93 %)
511	wire-tailed manakin (2018) GCF_003945595.1	50,529 (5.75 %)	n/a	12,950 (1.89 %)	19,252 (2.57 %)	24,522 (2.44 %)	42.30 (100.00 %)	0 (0 %)	102 (0.00 %)	3,744 (100.00 %)	500,823 (7.17 %)	300,638 (2.31 %)	6,414,267 (20.54 %)	0 (0 %)	235,724 (1.54 %)	28,268 (2.21 %)	22,544 (1.15 %)
512	woodchuck (CNAG 2019) GCA_901343595.1	n/a	424,165 (27.27 %)	20,813 (1.60 %)	23,199 (1.43 %)	45,153 (1.99 %)	40.00 (97.18 %)	57,045 (2.82 %)	57,045 (2.82 %)	105,556 (97.18 %)	4,756,333 (33.73 %)	836,503 (2.41 %)	14,755,960 (31.13 %)	505 (0.04 %)	358,587 (3.15 %)	34,151 (0.87 %)	32,950 (0.82 %)
513	woodchuck (v1.0 LI92 2021) GCF_021218885.1	62,044 (2.80 %)	n/a	19,783 (1.48 %)	21,060 (1.38 %)	n/a	39.92 (100.00 %)	46 (0.00 %)	46 (0.00 %)	3,381 (100.00 %)	3,884,968 (28.12 %)	912,591 (2.73 %)	14,538,767 (35.15 %)	0 (0 %)	413,043 (1.33 %)	36,919 (1.02 %)	26,677 (0.60 %)
514	wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 genbank) GCA_029207755.1	n/a	n/a	13,052 (1.78 %)	24,950 (2.30 %)	n/a	43.93 (100.00 %)	353 (0.00 %)	353 (0.00 %)	1,695 (100.00 %)	444,866 (3.08 %)	473,471 (7.97 %)	5,336,498 (25.82 %)	4 (0.00 %)	847,256 (5.29 %)	37,210 (3.14 %)	26,585 (1.31 %)
515	Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq) GCF_003031525.1	43,312 (2.49 %)	n/a	18,639 (1.72 %)	19,645 (1.46 %)	n/a	41.28 (99.29 %)	52,647 (0.72 %)	52,647 (0.72 %)	66,346 (99.28 %)	n/a	540,765 (1.65 %)	12,691,760 (32.87 %)	427 (0.03 %)	363,613 (1.97 %)	59,052 (1.48 %)	39,130 (1.07 %)
516	Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank) GCA_003031525.1	43,299 (41.33 %)	n/a	18,726 (1.80 %)	19,644 (1.46 %)	n/a	41.28 (99.29 %)	52,647 (0.72 %)	52,647 (0.72 %)	66,345 (99.28 %)	3,990,044 (42.54 %)	540,765 (1.65 %)	12,691,683 (32.88 %)	427 (0.03 %)	363,612 (1.97 %)	59,052 (1.48 %)	42,519 (1.18 %)
517	Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank) GCA_000442215.1	27,063 (35.76 %)	n/a	19,219 (1.73 %)	27,456 (1.66 %)	n/a	41.30 (98.69 %)	124,797 (1.33 %)	124,797 (1.33 %)	155,509 (98.67 %)	4,277,556 (44.10 %)	690,534 (1.95 %)	13,025,034 (35.19 %)	292 (0.02 %)	514,863 (2.00 %)	67,035 (1.82 %)	48,666 (1.49 %)
518	Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq) GCF_000442215.1	27,063 (1.65 %)	n/a	19,227 (1.75 %)	27,468 (1.66 %)	n/a	41.30 (98.69 %)	124,797 (1.33 %)	124,797 (1.33 %)	155,510 (98.67 %)	4,193,317 (43.38 %)	690,534 (1.95 %)	13,025,097 (35.19 %)	292 (0.02 %)	514,863 (2.00 %)	67,035 (1.82 %)	49,158 (1.49 %)
519	yellow fever mosquito (LVP_AGWG 2017 genbank) GCA_002204515.1	n/a	38 (0.00 %)	8,814 (0.51 %)	152,909 (17.36 %)	n/a	38.16 (100.00 %)	0 (0 %)	229 (0.00 %)	6,534 (100.00 %)	2,912,289 (46.74 %)	533,475 (4.34 %)	10,210,670 (53.65 %)	0 (0 %)	641,478 (3.84 %)	132,732 (6.12 %)	69,844 (2.30 %)
520	yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019) GCF_003676075.2	42,715 (2.16 %)	n/a	19,894 (1.62 %)	21,366 (1.40 %)	43,878 (1.99 %)	39.89 (97.96 %)	34,765 (2.04 %)	35,595 (2.04 %)	66,624 (97.96 %)	4,646,957 (34.05 %)	800,897 (1.96 %)	14,340,028 (32.63 %)	1,270 (0.04 %)	210,697 (0.69 %)	34,125 (0.91 %)	32,958 (0.85 %)
521	yellow-bellied marmot (v1 2018) GCF_003676075.1	41,573 (2.14 %)	n/a	19,845 (1.63 %)	21,262 (1.39 %)	n/a	39.88 (97.82 %)	38,354 (2.18 %)	38,354 (2.18 %)	69,503 (97.82 %)	4,683,625 (34.38 %)	799,659 (1.95 %)	14,322,765 (32.58 %)	2,342 (0.05 %)	209,445 (0.69 %)	34,127 (0.91 %)	32,957 (0.85 %)
522	yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021) GCA_016432865.1	n/a	n/a	15,703 (0.78 %)	16,184 (0.90 %)	n/a	36.21 (99.99 %)	0 (0 %)	620 (0.01 %)	487 (100.00 %)	5,424,579 (25.40 %)	1,269,774 (2.59 %)	21,430,550 (42.69 %)	2 (0.00 %)	714,621 (2.20 %)	28,121 (0.66 %)	28,159 (0.56 %)
523	yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI) GCF_000699245.1	15,990 (2.25 %)	n/a	11,775 (1.55 %)	23,935 (1.90 %)	n/a	41.36 (99.67 %)	48,553 (0.34 %)	48,553 (0.34 %)	107,160 (99.66 %)	384,032 (4.45 %)	182,309 (1.03 %)	6,529,534 (19.24 %)	1 (0.00 %)	41,594 (0.34 %)	15,660 (0.55 %)	12,721 (0.42 %)
524	yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017) GCF_002814215.1	41,168 (9.96 %)	n/a	15,861 (2.76 %)	30,671 (6.00 %)	n/a	40.75 (97.79 %)	0 (0 %)	33,664 (2.20 %)	99,598 (100.00 %)	614,513 (4.16 %)	522,349 (4.83 %)	4,650,538 (24.98 %)	309 (0.03 %)	357,703 (3.09 %)	18,054 (0.96 %)	12,855 (0.67 %)
525	zebra finch (v1 Black17 2019 refseq) GCF_003957565.1	51,472 (7.16 %)	n/a	13,211 (2.02 %)	17,812 (2.70 %)	38,655 (7.10 %)	42.04 (99.78 %)	0 (0 %)	312 (0.22 %)	135 (100.00 %)	535,521 (8.50 %)	550,118 (4.01 %)	6,519,872 (21.47 %)	1 (0.00 %)	381,676 (2.04 %)	30,053 (2.58 %)	22,898 (1.24 %)
526	zebra finch (v1 Black17 male 2019 genbank) GCA_003957565.2	n/a	n/a	13,212 (2.02 %)	25,117 (2.57 %)	38,655 (7.10 %)	42.04 (99.78 %)	0 (0 %)	312 (0.22 %)	135 (100.00 %)	535,521 (8.50 %)	550,118 (4.01 %)	6,519,872 (21.47 %)	1 (0.00 %)	381,676 (2.04 %)	30,053 (2.58 %)	22,898 (1.24 %)
527	zebra shark (hap1 2023 genbank) GCA_030684315.1	n/a	n/a	12,291 (0.48 %)	16,769 (1.14 %)	n/a	43.41 (99.47 %)	0 (0 %)	1,159 (0.53 %)	835 (100.00 %)	8,087,543 (64.92 %)	798,373 (9.17 %)	14,838,773 (42.39 %)	4 (0.00 %)	2,946,268 (5.37 %)	45,284 (1.67 %)	14,105 (0.37 %)
528	zebu cattle (Nelore 2014 genbank) GCA_000247795.2	n/a	n/a	18,599 (1.58 %)	18,779 (1.29 %)	n/a	41.75 (92.62 %)	253,738 (7.41 %)	6,941,272 (7.66 %)	253,769 (92.59 %)	5,118,783 (46.84 %)	358,908 (0.88 %)	13,431,620 (36.60 %)	476 (0.01 %)	998,817 (3.00 %)	35,241 (0.84 %)	32,220 (0.75 %)
529	zig-zag eel (v1.1 2018) GCF_900324485.1	44,813 (12.05 %)	n/a	15,028 (3.35 %)	21,782 (6.89 %)	36,982 (11.22 %)	40.66 (97.63 %)	0 (0 %)	235 (2.37 %)	126 (100.00 %)	348,517 (2.87 %)	157,776 (2.00 %)	3,182,742 (23.42 %)	0 (0 %)	175,932 (3.08 %)	12,824 (1.08 %)	8,713 (0.67 %)
TOTALS:	total assembly count 529

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	221 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	610 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	399 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	426 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	280 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	1114 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	306 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	918 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	289 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	111 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	528 assemblies	assembly stats	track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project	1067 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	96 assemblies	assembly stats	track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center	778 assemblies	assembly stats	track stats

Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

See also: hub access, assembly statistics

Data resource links