Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub access, assembly statistics

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count	common name link to genome browser	ncbiRefSeq	ncbiGene	xenoRefGene	augustus genes	Ensembl genes	gc5 base	AGP gap	all gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	gap Overlap	tandem Dups	cpg unmasked	cpg island
1	aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad) GCF_000298275.1	25,607 (1.08 %)	n/a	18,351 (1.06 %)	20,358 (0.98 %)	n/a	40.07 (76.89 %)	411,144 (23.15 %)	411,144 (23.15 %)	433,653 (76.85 %)	n/a	536,700 (0.74 %)	18,176,790 (39.08 %)	3,595 (0.03 %)	723,185 (1.16 %)	26,235 (0.40 %)	24,645 (0.35 %)
2	African grass rat (maternal 2020) GCA_011750645.1	n/a	n/a	20,916 (2.01 %)	19,513 (1.43 %)	n/a	41.37 (98.89 %)	0 (0 %)	1,526 (1.11 %)	1,610 (100.00 %)	4,928,847 (37.45 %)	1,652,295 (5.20 %)	13,507,965 (32.27 %)	0 (0 %)	1,023,525 (1.96 %)	17,712 (0.51 %)	16,897 (0.46 %)
3	African grass rat (paternal 2020) GCA_011762545.1	n/a	n/a	20,796 (2.00 %)	19,611 (1.43 %)	n/a	41.42 (97.70 %)	0 (0 %)	1,563 (2.30 %)	1,740 (100.00 %)	4,904,243 (37.25 %)	1,672,608 (5.37 %)	13,465,246 (32.19 %)	1 (0.00 %)	1,034,950 (2.07 %)	17,677 (0.50 %)	16,772 (0.46 %)
4	African grass rat (paternal X 2020) GCF_011762505.1	45,963 (2.46 %)	n/a	20,878 (1.99 %)	19,613 (1.43 %)	37,929 (2.32 %)	41.39 (99.19 %)	0 (0 %)	1,624 (0.81 %)	1,595 (100.00 %)	4,939,557 (37.33 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,429 (32.71 %)	2 (0.00 %)	1,065,249 (2.09 %)	17,767 (0.51 %)	16,852 (0.46 %)
5	African hunting dog GCA_001887905.1	n/a	n/a	18,956 (1.75 %)	17,562 (1.41 %)	n/a	40.98 (92.89 %)	0 (0 %)	1,415,298 (7.28 %)	803 (100.00 %)	4,458,183 (39.99 %)	658,637 (1.13 %)	13,671,493 (28.24 %)	854 (0.01 %)	288,980 (0.71 %)	47,644 (1.64 %)	45,393 (1.41 %)
6	African savanna elephant (2009 refseq) GCF_000001905.1	46,043 (2.30 %)	n/a	19,169 (1.26 %)	19,664 (1.10 %)	n/a	40.76 (97.57 %)	93,514 (2.45 %)	93,514 (2.45 %)	95,866 (97.55 %)	6,363,315 (57.54 %)	365,797 (0.88 %)	16,073,053 (44.89 %)	11 (0.00 %)	417,291 (1.06 %)	33,513 (0.68 %)	24,503 (0.51 %)
7	African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023) GCA_030020305.1	n/a	n/a	18,845 (1.07 %)	22,426 (1.10 %)	n/a	41.34 (99.85 %)	169 (0.15 %)	169 (0.15 %)	1,253 (99.85 %)	4,406,744 (29.55 %)	925,868 (4.71 %)	15,966,881 (50.49 %)	0 (0 %)	1,248,627 (2.71 %)	68,531 (1.61 %)	23,142 (0.47 %)
8	African savanna elephant (hap2 2023) GCF_030014295.1	64,034 (3.35 %)	n/a	18,980 (1.10 %)	21,593 (1.06 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	0 (0 %)	231 (0.10 %)	879 (100.00 %)	4,426,749 (29.95 %)	832,904 (4.08 %)	16,118,888 (49.47 %)	1 (0.00 %)	1,082,957 (2.38 %)	62,314 (1.49 %)	23,783 (0.48 %)
9	African savanna elephant (hap2 mLoxAfr1 2023) GCA_030014295.1	n/a	n/a	18,981 (1.10 %)	22,759 (1.12 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	0 (0 %)	231 (0.10 %)	880 (100.00 %)	4,426,756 (29.95 %)	832,908 (4.08 %)	16,118,910 (49.47 %)	1 (0.00 %)	1,082,958 (2.38 %)	62,315 (1.49 %)	23,783 (0.48 %)
10	agile gracile mouse opossum GCF_016433145.1	30,697 (1.32 %)	n/a	17,361 (0.78 %)	17,596 (0.81 %)	n/a	37.86 (91.75 %)	0 (0 %)	85,142 (8.25 %)	60,714 (100.00 %)	7,917,577 (49.04 %)	1,054,566 (1.57 %)	22,701,659 (37.69 %)	3,920 (0.14 %)	434,964 (1.27 %)	27,301 (0.49 %)	25,777 (0.43 %)
11	alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U) GCF_000164845.4	54,987 (3.56 %)	n/a	18,439 (1.93 %)	18,426 (1.63 %)	n/a	41.40 (95.85 %)	0 (0 %)	166,272 (4.17 %)	77,389 (100.00 %)	3,004,413 (33.17 %)	315,092 (1.36 %)	12,458,272 (24.89 %)	1,213 (0.03 %)	207,593 (1.22 %)	54,502 (1.38 %)	49,907 (1.20 %)
12	Alpine marmot (2019) GCF_001458135.2	69,587 (3.43 %)	n/a	19,047 (1.54 %)	17,768 (1.39 %)	n/a	39.80 (96.13 %)	0 (0 %)	88,858 (3.88 %)	14,031 (100.00 %)	3,726,252 (26.48 %)	746,953 (1.83 %)	14,066,368 (30.30 %)	494 (0.01 %)	202,554 (0.77 %)	30,191 (0.63 %)	24,232 (0.48 %)
13	Alvarez's mastiff bat (A012 2023) GCA_031001765.1	n/a	n/a	19,086 (1.55 %)	22,040 (1.52 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1,182 (0.01 %)	1,182 (0.01 %)	1,369 (99.99 %)	3,846,728 (31.78 %)	639,852 (2.90 %)	11,937,936 (38.98 %)	24 (0.00 %)	819,376 (2.67 %)	75,377 (2.21 %)	66,761 (1.68 %)
14	Alvarez's mastiff bat (hap1 2024) GCA_037157525.1	n/a	n/a	18,980 (1.50 %)	22,394 (1.50 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	0 (0 %)	80 (0.00 %)	326 (100.00 %)	3,896,863 (31.56 %)	659,711 (4.74 %)	11,945,162 (40.81 %)	3 (0.00 %)	979,504 (2.79 %)	76,769 (2.57 %)	66,591 (1.63 %)
15	Alvarez's mastiff bat (hap2 2024) GCA_037176705.1	n/a	n/a	19,066 (1.48 %)	22,356 (1.48 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	0 (0 %)	75 (0.00 %)	287 (100.00 %)	3,908,607 (31.48 %)	664,931 (5.23 %)	11,892,191 (41.08 %)	1 (0.00 %)	994,645 (2.87 %)	76,453 (2.43 %)	66,568 (1.61 %)
16	American beaver (Ward 2017 refseq) GCF_001984765.1	40,013 (2.15 %)	n/a	20,867 (1.53 %)	24,201 (1.33 %)	n/a	39.72 (99.99 %)	0 (0 %)	3,321 (0.01 %)	21,157 (100.00 %)	4,526,430 (33.75 %)	486,353 (1.30 %)	14,347,145 (31.96 %)	19 (0.00 %)	463,382 (1.20 %)	23,046 (0.72 %)	22,461 (0.67 %)
17	American bison (2014 refseq) GCF_000754665.1	38,686 (2.34 %)	n/a	19,782 (1.47 %)	20,444 (1.25 %)	n/a	41.82 (93.12 %)	341,984 (6.92 %)	341,984 (6.92 %)	470,415 (93.08 %)	n/a	419,596 (0.95 %)	13,519,877 (37.66 %)	8,184 (0.08 %)	n/a	60,388 (1.03 %)	36,362 (0.64 %)
18	American black bear (L20-20 alternate hap 2022) GCA_024610745.1	n/a	n/a	22,502 (1.17 %)	43,431 (1.28 %)	n/a	43.14 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	77,311 (100.00 %)	4,587,986 (32.30 %)	773,829 (6.39 %)	14,594,034 (35.67 %)	0 (0 %)	1,078,790 (3.25 %)	78,849 (3.32 %)	57,618 (1.17 %)
19	American black bear (L20-20 primary hap 2022) GCA_024610735.1	n/a	n/a	18,458 (1.52 %)	21,049 (1.43 %)	n/a	42.93 (100.00 %)	0 (0 %)	22 (0.00 %)	317 (100.00 %)	4,000,508 (32.69 %)	641,903 (5.91 %)	13,210,530 (35.54 %)	0 (0 %)	996,585 (3.22 %)	68,981 (3.00 %)	52,140 (1.23 %)
20	American black bear (UA15103 2021) GCF_020975775.1	53,916 (3.11 %)	n/a	18,840 (1.73 %)	20,969 (1.50 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,213 (100.00 %)	3,936,528 (34.53 %)	594,864 (2.90 %)	13,725,005 (32.35 %)	0 (0 %)	629,590 (1.78 %)	62,580 (1.91 %)	56,387 (1.69 %)
21	American mink (2018) GCA_900108605.1	n/a	n/a	18,686 (1.70 %)	20,016 (1.50 %)	36,997 (1.74 %)	41.60 (92.95 %)	154,172 (7.07 %)	154,172 (7.07 %)	161,347 (92.93 %)	4,350,343 (38.70 %)	606,128 (1.17 %)	13,605,797 (28.74 %)	2,225 (0.02 %)	334,330 (1.15 %)	54,199 (1.98 %)	53,125 (1.77 %)
22	American mink (M4711 2021 Dalhousie U) GCF_020171115.1	50,253 (2.26 %)	n/a	18,949 (1.49 %)	20,914 (1.29 %)	n/a	42.26 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	183 (100.00 %)	4,705,680 (39.15 %)	795,684 (5.50 %)	14,085,357 (37.99 %)	0 (0 %)	1,135,030 (2.90 %)	63,307 (2.38 %)	63,004 (2.19 %)
23	American pika (hap1 2023) GCF_030435755.1	45,008 (1.93 %)	n/a	17,997 (1.35 %)	23,185 (1.49 %)	n/a	44.16 (100.00 %)	0 (0 %)	432 (0.00 %)	5,864 (100.00 %)	4,126,248 (43.60 %)	628,344 (15.71 %)	11,100,962 (42.69 %)	18 (0.00 %)	1,888,430 (5.34 %)	60,350 (1.67 %)	30,970 (1.18 %)
24	American pika (hap2 2023) GCA_030435715.1	n/a	n/a	16,911 (1.23 %)	21,107 (1.43 %)	n/a	44.43 (100.00 %)	6 (0.00 %)	375 (0.00 %)	6,123 (100.00 %)	1,808,768 (10.42 %)	561,106 (21.05 %)	10,283,513 (45.97 %)	16 (0.00 %)	2,348,969 (6.68 %)	54,919 (1.33 %)	26,689 (0.79 %)
25	American pika 3.0 (2012 Broad refseq) GCF_000292845.1	26,253 (1.93 %)	n/a	17,576 (1.61 %)	20,076 (1.70 %)	n/a	43.35 (87.20 %)	122,542 (12.82 %)	122,542 (12.82 %)	132,962 (87.18 %)	2,761,257 (29.47 %)	414,896 (1.07 %)	10,968,698 (26.71 %)	1,958 (0.04 %)	269,478 (1.11 %)	44,652 (1.14 %)	26,757 (0.80 %)
26	American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020) GCF_014633375.1	31,887 (1.92 %)	n/a	17,532 (1.60 %)	19,609 (1.65 %)	n/a	43.35 (87.14 %)	0 (0 %)	124,941 (12.88 %)	9,351 (100.00 %)	2,827,662 (29.77 %)	414,980 (1.07 %)	10,969,165 (26.69 %)	1,976 (0.04 %)	271,948 (1.12 %)	44,743 (1.13 %)	26,798 (0.80 %)
27	Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq) GCF_000464555.1	33,681 (2.23 %)	n/a	17,929 (1.49 %)	15,090 (1.29 %)	n/a	41.40 (97.59 %)	155,553 (2.44 %)	155,553 (2.44 %)	157,032 (97.56 %)	n/a	831,136 (1.67 %)	13,654,437 (31.78 %)	59 (0.00 %)	289,892 (0.97 %)	65,229 (1.60 %)	56,194 (1.22 %)
28	Antarctic minke whale GCA_000978805.1	n/a	n/a	23,312 (1.49 %)	45,535 (1.26 %)	n/a	40.73 (99.37 %)	299,456 (0.64 %)	299,456 (0.64 %)	720,900 (99.36 %)	4,011,313 (41.13 %)	504,837 (1.04 %)	13,553,641 (30.96 %)	200 (0.00 %)	66,191 (0.20 %)	56,223 (1.31 %)	44,709 (1.10 %)
29	Antillean ghost-faced bat GCA_004026545.1	n/a	n/a	20,088 (1.74 %)	31,558 (1.63 %)	n/a	41.74 (99.97 %)	1,835 (0.01 %)	1,835 (0.01 %)	207,094 (99.99 %)	3,025,044 (30.67 %)	332,606 (0.70 %)	12,504,556 (28.79 %)	7 (0.00 %)	n/a	65,503 (2.30 %)	62,089 (2.01 %)
30	aoudad GCA_002201775.1	n/a	n/a	19,905 (1.62 %)	27,488 (1.60 %)	n/a	42.01 (95.96 %)	186,672 (4.05 %)	186,672 (4.05 %)	263,992 (95.95 %)	5,418,013 (45.05 %)	471,426 (1.19 %)	13,396,252 (36.94 %)	4,983 (0.03 %)	648,031 (1.83 %)	48,844 (1.32 %)	44,082 (1.20 %)
31	Arabian camel (Drom800 2019 refseq) GCF_000803125.2	64,519 (3.85 %)	n/a	18,483 (1.89 %)	20,554 (1.62 %)	n/a	41.51 (99.22 %)	0 (0 %)	47,342 (0.79 %)	21,070 (100.00 %)	3,233,022 (34.07 %)	345,049 (1.55 %)	13,383,050 (26.19 %)	87 (0.01 %)	348,169 (1.51 %)	58,872 (1.79 %)	54,784 (1.59 %)
32	Arabian camel (hap2 2024) GCA_036321565.1	n/a	n/a	17,085 (1.73 %)	19,317 (1.59 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	0 (0 %)	210 (0.00 %)	173 (100.00 %)	2,818,446 (29.44 %)	316,646 (8.90 %)	11,192,133 (31.47 %)	1 (0.00 %)	1,151,809 (3.75 %)	52,135 (1.67 %)	44,943 (1.23 %)
33	Arabian camel (mCamDro1 2024) GCF_036321535.1	62,940 (3.46 %)	n/a	18,078 (1.66 %)	21,071 (1.56 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	0 (0 %)	195 (0.00 %)	171 (100.00 %)	3,040,467 (29.22 %)	343,480 (10.93 %)	11,796,955 (33.50 %)	2 (0.00 %)	1,611,842 (4.73 %)	55,427 (1.61 %)	47,478 (1.18 %)
34	Arabian camel (paternal 2024) GCA_036321535.1	n/a	n/a	18,080 (1.66 %)	20,345 (1.52 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	0 (0 %)	195 (0.00 %)	172 (100.00 %)	3,040,473 (29.22 %)	343,482 (10.93 %)	11,797,012 (33.50 %)	2 (0.00 %)	1,611,842 (4.73 %)	55,428 (1.61 %)	47,478 (1.18 %)
35	Arctic fox (Blue_001 2021 refseq) GCF_018345385.1	60,759 (3.11 %)	n/a	19,942 (1.72 %)	19,529 (1.38 %)	n/a	41.27 (100.00 %)	0 (0 %)	529 (0.00 %)	929 (100.00 %)	4,821,229 (41.22 %)	1,006,124 (2.31 %)	13,556,149 (32.92 %)	1 (0.00 %)	686,539 (2.19 %)	49,997 (2.23 %)	50,342 (1.99 %)
36	Arctic ground squirrel GCF_003426925.1	39,569 (2.25 %)	n/a	18,954 (1.74 %)	19,372 (1.45 %)	n/a	39.95 (89.51 %)	0 (0 %)	2,429,461 (10.59 %)	15,883 (100.00 %)	4,400,304 (32.67 %)	672,831 (1.50 %)	13,913,477 (26.41 %)	1,383 (0.11 %)	167,257 (0.60 %)	27,575 (0.72 %)	26,295 (0.67 %)
37	Asian palm civet GCA_004024585.1	n/a	n/a	22,124 (1.43 %)	43,710 (1.39 %)	n/a	42.52 (99.95 %)	4,533 (0.02 %)	4,533 (0.02 %)	442,658 (99.98 %)	4,877,367 (40.32 %)	754,440 (1.35 %)	14,557,779 (32.29 %)	38 (0.00 %)	163,468 (0.41 %)	148,246 (5.67 %)	137,633 (4.25 %)
38	Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022) GCA_024166345.1	n/a	n/a	17,906 (1.18 %)	21,966 (1.14 %)	n/a	41.14 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	6,361 (100.00 %)	3,818,524 (29.72 %)	533,426 (3.22 %)	14,381,781 (47.30 %)	0 (0 %)	613,432 (1.61 %)	50,264 (1.15 %)	21,331 (0.51 %)
39	Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022) GCF_024166365.1	61,202 (2.60 %)	n/a	18,887 (1.13 %)	21,194 (1.06 %)	n/a	41.14 (99.90 %)	0 (0 %)	126 (0.10 %)	64 (100.00 %)	4,358,470 (31.27 %)	663,094 (4.56 %)	16,261,778 (48.66 %)	1 (0.00 %)	851,540 (1.93 %)	69,120 (1.32 %)	23,319 (0.49 %)
40	Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020) GCA_014523465.1	n/a	n/a	19,569 (1.59 %)	21,293 (1.35 %)	n/a	41.97 (99.68 %)	0 (0 %)	257 (0.32 %)	128 (100.00 %)	5,390,761 (47.15 %)	451,837 (1.15 %)	13,157,608 (40.67 %)	0 (0 %)	983,804 (2.72 %)	44,158 (1.19 %)	39,278 (1.06 %)
41	Asiatic tapir (hap1 2023) GCA_031878655.1	n/a	n/a	18,969 (1.75 %)	20,207 (1.36 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	3 (0.00 %)	79 (0.00 %)	262 (100.00 %)	3,650,963 (38.06 %)	355,322 (2.63 %)	14,837,952 (31.37 %)	1 (0.00 %)	267,829 (0.92 %)	37,174 (1.87 %)	37,977 (1.58 %)
42	Asiatic tapir (hap2 2023) GCA_031878705.1	n/a	n/a	18,931 (1.76 %)	19,988 (1.37 %)	n/a	41.16 (100.00 %)	0 (0 %)	92 (0.00 %)	193 (100.00 %)	3,632,286 (38.21 %)	350,074 (2.22 %)	14,785,531 (30.90 %)	1 (0.00 %)	254,432 (0.91 %)	36,699 (1.70 %)	36,659 (1.49 %)
43	ass (Dezhou 2021) GCF_016077325.2	84,046 (4.01 %)	n/a	18,838 (1.75 %)	20,239 (1.42 %)	69,689 (3.29 %)	41.42 (99.86 %)	0 (0 %)	1,922 (0.15 %)	50 (100.00 %)	3,840,509 (41.57 %)	319,943 (0.81 %)	14,889,114 (29.46 %)	1 (0.00 %)	180,097 (0.75 %)	41,082 (1.37 %)	38,212 (1.20 %)
44	ass (Maral har 2015 refseq) GCF_001305755.1	48,989 (3.12 %)	n/a	18,838 (1.78 %)	19,295 (1.44 %)	n/a	41.28 (98.63 %)	0 (0 %)	69,593 (1.38 %)	2,167 (100.00 %)	3,731,432 (40.84 %)	289,737 (0.96 %)	14,695,308 (28.58 %)	5,680 (0.23 %)	136,343 (0.85 %)	40,025 (1.06 %)	36,660 (0.92 %)
45	Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020) GCA_015852515.1	n/a	n/a	13,505 (1.03 %)	18,978 (1.47 %)	n/a	45.32 (99.98 %)	0 (0 %)	26 (0.02 %)	3,482 (100.00 %)	6,880,857 (41.88 %)	1,099,932 (7.47 %)	8,156,735 (56.68 %)	0 (0 %)	4,129,545 (10.90 %)	70,515 (2.88 %)	41,464 (1.12 %)
46	Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020) GCF_015852505.1	42,938 (2.28 %)	n/a	14,891 (1.01 %)	19,714 (1.45 %)	n/a	45.30 (98.61 %)	0 (0 %)	524 (1.39 %)	310 (100.00 %)	7,814,876 (42.89 %)	1,219,764 (6.93 %)	9,488,325 (55.68 %)	1 (0.00 %)	4,597,115 (10.42 %)	78,364 (2.73 %)	45,620 (1.05 %)
47	Bactrian camel (Alxa 2014 refseq) GCF_000767855.1	52,178 (3.64 %)	n/a	18,303 (1.98 %)	17,097 (1.64 %)	n/a	41.32 (99.32 %)	31,980 (0.69 %)	31,980 (0.69 %)	67,435 (99.31 %)	2,966,704 (34.06 %)	306,997 (0.95 %)	12,209,949 (25.43 %)	58 (0.01 %)	73,573 (0.41 %)	49,790 (1.25 %)	45,376 (1.09 %)
48	banded mongoose GCA_004023785.1	n/a	n/a	21,568 (1.57 %)	30,427 (1.43 %)	n/a	42.00 (99.96 %)	4,510 (0.02 %)	4,510 (0.02 %)	316,874 (99.98 %)	4,768,524 (40.51 %)	684,187 (1.30 %)	13,713,756 (33.42 %)	6 (0.00 %)	227,084 (0.54 %)	78,648 (2.80 %)	76,038 (2.38 %)
49	bank vole GCF_902806735.1	56,410 (2.99 %)	n/a	18,977 (1.71 %)	18,408 (1.50 %)	n/a	41.86 (98.62 %)	53,506 (1.39 %)	53,506 (1.39 %)	54,142 (98.61 %)	3,222,366 (21.59 %)	933,697 (2.20 %)	12,831,232 (31.50 %)	4,497 (0.04 %)	287,292 (0.90 %)	18,784 (0.42 %)	16,451 (0.36 %)
50	banner-tailed kangaroo rat GCF_019054845.1	43,753 (1.82 %)	n/a	18,397 (1.18 %)	24,180 (1.39 %)	n/a	40.83 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,026 (100.00 %)	5,587,719 (30.97 %)	1,363,513 (3.95 %)	12,128,920 (48.74 %)	0 (0 %)	1,518,982 (3.07 %)	36,371 (1.27 %)	31,849 (0.74 %)
51	banteng 2023 GCF_032452875.1	71,974 (3.56 %)	n/a	19,305 (1.36 %)	21,174 (1.20 %)	n/a	42.79 (100.00 %)	0 (0 %)	84 (0.00 %)	1,518 (100.00 %)	3,344,481 (20.63 %)	1,039,571 (11.74 %)	13,031,356 (47.36 %)	1 (0.00 %)	2,790,223 (5.90 %)	73,031 (1.72 %)	36,726 (0.78 %)
52	bats A.intermedius (hap1 2024) GCA_038363145.1	n/a	n/a	18,022 (1.56 %)	19,824 (1.51 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	0 (0 %)	81 (0.00 %)	419 (100.00 %)	2,827,417 (26.82 %)	371,479 (4.97 %)	11,603,093 (34.64 %)	1 (0.00 %)	522,672 (1.87 %)	71,574 (2.28 %)	54,020 (1.50 %)
53	bats A.intermedius (hap2 2024) GCA_038363225.1	n/a	n/a	17,124 (1.63 %)	18,342 (1.54 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	0 (0 %)	56 (0.00 %)	187 (100.00 %)	2,597,378 (26.81 %)	332,733 (4.43 %)	10,957,327 (33.52 %)	2 (0.00 %)	406,013 (1.59 %)	63,688 (2.22 %)	49,331 (1.50 %)
54	beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020) GCA_009917745.1	n/a	n/a	19,239 (1.79 %)	22,513 (1.43 %)	35,878 (1.82 %)	41.25 (97.57 %)	26,969 (2.43 %)	27,070 (2.43 %)	52,780 (97.57 %)	4,021,599 (43.53 %)	544,323 (1.08 %)	12,738,162 (33.47 %)	1,426 (0.06 %)	346,086 (1.08 %)	59,710 (1.51 %)	43,139 (1.22 %)
55	beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019) GCF_002288925.2	59,400 (3.08 %)	n/a	18,667 (1.79 %)	20,314 (1.43 %)	n/a	41.24 (98.49 %)	23,539 (1.52 %)	24,414 (1.52 %)	29,444 (98.48 %)	4,001,248 (43.73 %)	543,276 (1.11 %)	12,802,735 (34.18 %)	583 (0.02 %)	388,902 (1.70 %)	59,307 (1.53 %)	42,900 (1.24 %)
56	big brown bat (BU_THK_EF1 2012) GCF_000308155.1	59,162 (3.17 %)	n/a	18,334 (1.94 %)	20,121 (1.78 %)	n/a	42.93 (89.41 %)	160,269 (10.62 %)	160,269 (10.62 %)	167,057 (89.38 %)	2,842,065 (25.82 %)	614,712 (1.89 %)	10,407,733 (28.90 %)	1,641 (0.04 %)	222,087 (1.20 %)	66,720 (2.99 %)	60,637 (2.11 %)
57	big brown bat (TK198812 2023) GCF_027574615.1	46,266 (2.61 %)	n/a	18,620 (1.80 %)	21,271 (1.72 %)	n/a	43.51 (100.00 %)	0 (0 %)	75 (0.00 %)	48 (100.00 %)	3,041,145 (25.08 %)	904,075 (3.80 %)	10,530,666 (37.05 %)	0 (0 %)	647,994 (2.05 %)	77,605 (3.68 %)	62,105 (2.31 %)
58	bighorn sheep GCA_004026945.1	n/a	n/a	23,059 (1.34 %)	36,486 (1.19 %)	n/a	43.20 (99.90 %)	9,412 (0.03 %)	9,412 (0.03 %)	1,057,548 (99.97 %)	6,321,577 (50.75 %)	716,846 (1.66 %)	13,904,326 (44.98 %)	63 (0.00 %)	n/a	95,564 (1.72 %)	50,916 (1.03 %)
59	black flying fox GCF_000325575.1	46,978 (3.15 %)	n/a	18,089 (2.00 %)	20,668 (1.75 %)	n/a	39.74 (97.93 %)	104,566 (2.08 %)	104,566 (2.08 %)	170,164 (97.92 %)	2,975,186 (34.05 %)	481,859 (1.45 %)	12,582,349 (26.52 %)	97 (0.01 %)	114,693 (0.91 %)	62,483 (3.88 %)	64,215 (2.93 %)
60	black rat GCF_011064425.1	39,601 (2.37 %)	n/a	20,793 (1.98 %)	17,944 (1.37 %)	n/a	42.14 (99.98 %)	0 (0 %)	6,158 (0.02 %)	2,173 (100.00 %)	4,715,157 (41.57 %)	1,432,294 (3.45 %)	13,275,550 (32.36 %)	20 (0.00 %)	625,923 (1.66 %)	18,055 (0.48 %)	16,181 (0.43 %)
61	black rhinoceros (BS38 2019 Broad) GCA_004027315.1	n/a	n/a	21,713 (1.32 %)	32,731 (1.18 %)	n/a	41.22 (99.85 %)	7,256 (0.02 %)	7,256 (0.02 %)	2,029,914 (99.98 %)	4,618,655 (36.76 %)	618,834 (2.21 %)	16,248,532 (40.32 %)	32 (0.00 %)	n/a	44,113 (0.97 %)	35,130 (0.72 %)
62	black rhinoceros (mBicDic1 alternate hap 2021) GCA_020826835.1	n/a	n/a	19,000 (1.37 %)	22,547 (1.26 %)	n/a	41.56 (99.97 %)	0 (0 %)	178 (0.03 %)	1,199 (100.00 %)	4,340,245 (37.22 %)	564,468 (8.07 %)	14,384,523 (40.40 %)	0 (0 %)	941,914 (2.51 %)	44,971 (1.16 %)	34,023 (0.74 %)
63	black rhinoceros (mBicDic1 primary hap 2021) GCF_020826845.1	56,255 (2.28 %)	n/a	18,774 (1.38 %)	22,348 (1.26 %)	n/a	41.59 (99.95 %)	0 (0 %)	215 (0.05 %)	1,076 (100.00 %)	4,200,390 (36.22 %)	548,030 (8.34 %)	14,347,693 (40.14 %)	2 (0.00 %)	984,722 (2.61 %)	43,525 (1.14 %)	33,963 (0.76 %)
64	black-footed cat GCA_004023925.1	n/a	n/a	22,895 (1.14 %)	51,789 (1.13 %)	n/a	41.92 (99.90 %)	13,476 (0.06 %)	13,476 (0.06 %)	603,600 (99.94 %)	5,261,265 (44.11 %)	943,514 (1.77 %)	13,681,435 (34.77 %)	43 (0.00 %)	262,081 (0.70 %)	86,892 (2.23 %)	62,055 (1.65 %)
65	black-footed ferret (SB6536 2022) GCF_022355385.1	56,402 (2.78 %)	n/a	18,681 (1.55 %)	20,685 (1.40 %)	n/a	41.55 (96.71 %)	0 (0 %)	33,042 (3.30 %)	20,575 (100.00 %)	4,087,717 (30.94 %)	695,805 (1.18 %)	13,880,116 (32.08 %)	890 (0.03 %)	471,613 (1.24 %)	54,060 (2.11 %)	51,472 (1.69 %)
66	black-lipped pika GCF_017591425.1	46,297 (2.64 %)	n/a	18,529 (1.63 %)	23,458 (1.83 %)	n/a	43.71 (100.00 %)	0 (0 %)	54 (0.00 %)	2,214 (100.00 %)	1,843,705 (12.62 %)	471,798 (2.76 %)	11,394,992 (31.27 %)	0 (0 %)	530,175 (1.74 %)	63,124 (1.85 %)	31,410 (1.04 %)
67	Blainville's beaked whale (alternate hap 2022) GCA_025094165.1	n/a	n/a	17,838 (1.54 %)	21,389 (1.35 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	5,198 (100.00 %)	3,542,727 (35.35 %)	650,369 (8.86 %)	10,971,320 (41.15 %)	0 (0 %)	1,286,122 (4.20 %)	62,389 (1.68 %)	34,595 (0.95 %)
68	Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq) GCF_025265405.1	47,540 (2.07 %)	n/a	19,041 (1.52 %)	20,766 (1.27 %)	n/a	41.70 (99.97 %)	0 (0 %)	97 (0.03 %)	74 (100.00 %)	3,964,038 (35.29 %)	765,957 (8.74 %)	12,128,229 (41.78 %)	1 (0.00 %)	1,795,618 (5.01 %)	70,851 (1.80 %)	37,949 (0.93 %)
69	blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019) GCA_008658375.1	n/a	n/a	17,285 (1.80 %)	21,295 (1.43 %)	n/a	41.22 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12,574 (100.00 %)	3,196,354 (43.47 %)	467,194 (1.26 %)	10,176,588 (33.66 %)	0 (0 %)	306,308 (1.20 %)	56,916 (1.85 %)	39,871 (1.51 %)
70	Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020) GCA_008658375.2	n/a	n/a	16,997 (1.82 %)	20,609 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	10,999 (100.00 %)	3,126,800 (43.49 %)	454,452 (1.23 %)	9,916,868 (33.63 %)	0 (0 %)	296,938 (1.19 %)	55,436 (1.85 %)	38,786 (1.50 %)
71	blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020) GCF_009873245.2	58,750 (2.71 %)	n/a	19,162 (1.80 %)	20,576 (1.41 %)	36,291 (1.99 %)	40.88 (98.91 %)	0 (0 %)	886 (1.09 %)	106 (100.00 %)	3,986,870 (44.21 %)	579,629 (1.22 %)	12,858,384 (34.60 %)	4 (0.00 %)	422,171 (1.33 %)	67,032 (1.73 %)	46,602 (1.41 %)
72	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022) GCA_022079275.1	n/a	n/a	24,877 (1.23 %)	48,382 (1.39 %)	n/a	42.05 (99.98 %)	4,716 (0.01 %)	4,716 (0.01 %)	72,827 (99.99 %)	6,403,412 (33.31 %)	1,269,531 (1.94 %)	17,771,689 (33.82 %)	79 (0.00 %)	706,367 (3.07 %)	100,915 (3.00 %)	90,223 (2.05 %)
73	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022) GCF_022079265.1	45,362 (2.39 %)	n/a	18,576 (1.65 %)	20,510 (1.41 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	0 (0 %)	24 (0.00 %)	75 (100.00 %)	4,970,082 (43.28 %)	894,002 (1.80 %)	13,648,384 (34.21 %)	0 (0 %)	602,631 (1.69 %)	69,211 (2.68 %)	63,384 (2.18 %)
74	boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023) GCA_019903745.2	n/a	n/a	20,135 (1.60 %)	22,598 (1.47 %)	n/a	41.46 (96.98 %)	0 (0 %)	34,682 (3.03 %)	12,266 (100.00 %)	3,134,107 (24.41 %)	394,920 (0.92 %)	13,154,929 (36.43 %)	3,241 (0.04 %)	471,129 (1.38 %)	48,826 (1.07 %)	42,368 (0.88 %)
75	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022) GCA_024803775.1	n/a	n/a	18,647 (0.96 %)	23,998 (1.13 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	0 (0 %)	124 (0.00 %)	3,340 (100.00 %)	3,775,862 (22.40 %)	1,257,803 (21.71 %)	9,347,543 (61.85 %)	0 (0 %)	9,701,648 (16.46 %)	33,757 (1.35 %)	24,065 (0.48 %)
76	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022) GCA_024803745.1	n/a	n/a	17,791 (1.12 %)	22,667 (1.29 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	106 (0.00 %)	106 (0.00 %)	2,898 (100.00 %)	6,293,452 (41.30 %)	1,076,688 (17.94 %)	8,553,272 (57.13 %)	1 (0.00 %)	6,983,927 (14.02 %)	31,102 (1.31 %)	23,419 (0.57 %)
77	Botta's pocket gopher (hap1 2023) GCA_031878675.1	n/a	n/a	18,247 (1.61 %)	22,673 (1.83 %)	n/a	41.12 (99.99 %)	205 (0.00 %)	775 (0.01 %)	835 (100.00 %)	2,918,285 (18.64 %)	868,090 (5.77 %)	9,427,604 (40.78 %)	2 (0.00 %)	1,601,923 (4.79 %)	27,049 (1.25 %)	22,545 (0.76 %)
78	Botta's pocket gopher (hap2 2023) GCA_031878665.1	n/a	n/a	17,612 (1.68 %)	22,099 (1.91 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	25 (0.00 %)	541 (0.01 %)	365 (100.00 %)	2,748,918 (17.16 %)	827,542 (4.51 %)	8,832,809 (39.20 %)	2 (0.00 %)	1,074,853 (3.77 %)	26,416 (1.35 %)	22,242 (0.81 %)
79	boutu (hap1 2024) GCA_036417435.1	n/a	n/a	18,667 (1.46 %)	20,817 (1.26 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	0 (0 %)	284 (0.00 %)	903 (100.00 %)	4,004,895 (35.23 %)	925,158 (12.15 %)	11,999,784 (42.65 %)	3 (0.00 %)	1,841,091 (5.04 %)	63,428 (1.55 %)	38,329 (0.93 %)
80	boutu (hap2 2024) GCA_036417475.1	n/a	n/a	17,954 (1.51 %)	19,994 (1.30 %)	n/a	42.02 (100.00 %)	0 (0 %)	240 (0.00 %)	800 (100.00 %)	3,723,164 (34.96 %)	809,880 (11.02 %)	11,359,211 (41.42 %)	2 (0.00 %)	1,554,419 (4.60 %)	60,067 (1.55 %)	36,564 (0.95 %)
81	Brandt's bat GCF_000412655.1	46,912 (2.84 %)	n/a	19,267 (1.75 %)	18,495 (1.62 %)	n/a	42.59 (94.06 %)	155,664 (5.95 %)	155,664 (5.95 %)	325,414 (94.05 %)	2,897,662 (25.08 %)	634,208 (3.20 %)	11,323,618 (31.06 %)	356 (0.04 %)	n/a	66,749 (1.59 %)	51,826 (1.12 %)
82	Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023) GCA_030848825.1	n/a	n/a	19,039 (1.66 %)	21,660 (1.59 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	0 (0 %)	20 (0.00 %)	148 (100.00 %)	3,805,818 (31.80 %)	640,446 (2.50 %)	11,793,353 (36.15 %)	1 (0.00 %)	609,574 (1.94 %)	68,896 (2.40 %)	57,812 (1.49 %)
83	Brazilian guinea pig GCA_000688575.1	n/a	n/a	16,531 (1.49 %)	11,177 (1.44 %)	n/a	39.81 (64.76 %)	0 (0 %)	2,565,595 (35.61 %)	3,131 (100.00 %)	2,529,479 (25.87 %)	342,907 (0.66 %)	10,719,517 (21.05 %)	551 (0.01 %)	218,010 (0.72 %)	19,508 (0.31 %)	9,721 (0.14 %)
84	Brazilian tapir GCA_004025025.1	n/a	n/a	21,581 (1.61 %)	30,818 (1.32 %)	n/a	41.12 (99.93 %)	2,273 (0.01 %)	2,273 (0.01 %)	805,779 (99.99 %)	3,877,938 (38.36 %)	344,032 (0.79 %)	15,601,710 (32.81 %)	14 (0.00 %)	n/a	43,382 (1.17 %)	39,596 (1.04 %)
85	brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018) GCF_003584765.2	50,242 (2.92 %)	n/a	18,811 (1.77 %)	21,073 (1.52 %)	n/a	41.84 (99.31 %)	15,552 (0.70 %)	17,380 (0.70 %)	21,813 (99.30 %)	4,201,043 (40.86 %)	567,586 (1.23 %)	13,807,211 (30.86 %)	760 (0.01 %)	325,785 (0.96 %)	62,125 (1.80 %)	56,227 (1.57 %)
86	brown bear (v2.0 North America Adak 2023) GCF_023065955.2	66,371 (4.20 %)	n/a	18,615 (1.68 %)	21,434 (1.53 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	0 (0 %)	250 (0.00 %)	362 (100.00 %)	4,030,019 (33.22 %)	630,008 (4.17 %)	13,240,060 (32.92 %)	1 (0.00 %)	668,459 (2.28 %)	64,814 (2.05 %)	58,450 (1.77 %)
87	brown big-eared bat (primary hap 2023) GCA_963455305.1	n/a	n/a	19,138 (1.72 %)	20,370 (1.54 %)	n/a	43.08 (99.99 %)	0 (0 %)	1,237 (0.01 %)	65 (100.00 %)	3,201,470 (26.24 %)	957,903 (4.27 %)	10,687,995 (39.65 %)	8 (0.00 %)	881,577 (2.81 %)	60,671 (2.39 %)	52,889 (1.71 %)
88	brown-throated sloth GCA_004027775.1	n/a	n/a	17,043 (1.21 %)	37,090 (1.36 %)	n/a	42.76 (99.76 %)	462 (0.00 %)	462 (0.00 %)	1,772,267 (100.00 %)	2,487,215 (36.18 %)	316,812 (1.60 %)	7,948,666 (37.96 %)	5 (0.00 %)	n/a	62,325 (2.36 %)	46,228 (1.74 %)
89	cactus mouse (2023) GCF_949786415.1	47,524 (2.02 %)	n/a	18,894 (1.46 %)	20,159 (1.22 %)	n/a	42.40 (99.98 %)	0 (0 %)	2,603 (0.02 %)	4,297 (100.00 %)	7,181,232 (52.75 %)	1,247,378 (18.35 %)	13,329,318 (43.03 %)	32 (0.00 %)	4,621,934 (9.77 %)	19,540 (0.49 %)	17,819 (0.43 %)
90	California mouse (IS 2022) GCF_007827085.1	62,274 (3.80 %)	n/a	18,959 (1.75 %)	19,378 (1.41 %)	n/a	42.21 (100.00 %)	0 (0 %)	547 (0.00 %)	237 (100.00 %)	5,970,582 (45.08 %)	1,165,743 (3.67 %)	13,734,349 (33.67 %)	4 (0.00 %)	738,622 (2.20 %)	19,529 (0.58 %)	17,949 (0.52 %)
91	California sea lion (alternate hap 2019) GCA_009762295.1	n/a	n/a	18,348 (1.81 %)	18,692 (1.47 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,093 (100.00 %)	3,722,619 (42.89 %)	488,086 (1.26 %)	10,893,132 (33.14 %)	0 (0 %)	393,471 (1.40 %)	44,449 (1.57 %)	41,300 (1.38 %)
92	California sea lion (LMU 2018 refseq) GCF_900631625.1	69,240 (2.99 %)	n/a	20,741 (1.78 %)	20,298 (1.40 %)	n/a	41.38 (99.81 %)	0 (0 %)	47,716 (0.20 %)	10,423 (100.00 %)	4,530,259 (43.28 %)	573,086 (1.12 %)	13,442,336 (33.58 %)	9,701 (0.17 %)	414,311 (1.26 %)	50,583 (1.46 %)	46,836 (1.28 %)
93	California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020) GCA_009762295.2	n/a	n/a	18,319 (1.81 %)	18,772 (1.48 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,096 (100.00 %)	3,724,021 (42.91 %)	488,356 (1.26 %)	10,891,276 (33.15 %)	0 (0 %)	395,508 (1.40 %)	44,467 (1.57 %)	41,289 (1.38 %)
94	California sea lion (v2 primary hap 2020) GCF_009762305.2	70,801 (3.05 %)	n/a	20,915 (1.77 %)	20,179 (1.40 %)	44,926 (2.10 %)	41.40 (99.23 %)	0 (0 %)	185 (0.77 %)	47 (100.00 %)	4,525,652 (43.65 %)	590,246 (1.24 %)	13,263,648 (33.76 %)	2 (0.00 %)	495,451 (1.44 %)	51,899 (1.50 %)	48,201 (1.32 %)
95	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023) GCA_028537755.1	n/a	n/a	19,409 (1.86 %)	20,578 (1.69 %)	n/a	42.43 (100.00 %)	0 (0 %)	43 (0.00 %)	310 (100.00 %)	3,161,054 (22.60 %)	891,453 (5.62 %)	11,087,206 (33.12 %)	0 (0 %)	957,188 (2.77 %)	19,104 (0.65 %)	16,548 (0.48 %)
96	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023) GCA_028537955.1	n/a	n/a	19,681 (1.86 %)	21,257 (1.62 %)	n/a	42.24 (100.00 %)	0 (0 %)	51 (0.00 %)	350 (100.00 %)	4,957,057 (42.33 %)	943,226 (5.63 %)	11,695,871 (33.83 %)	0 (0 %)	1,058,642 (2.90 %)	20,062 (0.64 %)	18,632 (0.53 %)
97	Canada lynx (alternate hap LIC74 2019) GCA_007474575.1	n/a	n/a	12,029 (1.42 %)	15,171 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	15,036 (100.00 %)	2,937,491 (43.50 %)	544,410 (1.76 %)	7,641,565 (32.72 %)	0 (0 %)	294,221 (1.43 %)	39,082 (2.44 %)	34,616 (1.88 %)
98	Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020) GCA_007474575.2	n/a	n/a	12,041 (1.42 %)	15,226 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	5 (0.00 %)	5 (0.00 %)	15,046 (100.00 %)	2,939,291 (43.50 %)	544,849 (1.76 %)	7,650,345 (32.74 %)	0 (0 %)	294,817 (1.43 %)	39,099 (2.44 %)	34,631 (1.88 %)
99	Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020) GCF_007474595.2	50,142 (2.69 %)	n/a	18,273 (1.65 %)	19,264 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.88 %)	0 (0 %)	842 (0.12 %)	54 (100.00 %)	5,011,165 (43.72 %)	904,525 (1.75 %)	13,467,551 (34.19 %)	0 (0 %)	572,384 (1.64 %)	66,799 (2.48 %)	60,482 (2.02 %)
100	Cantor's roundleaf bat GCA_004027415.1	n/a	n/a	23,788 (1.42 %)	45,328 (1.68 %)	38,254 (1.57 %)	41.36 (99.91 %)	6,366 (0.03 %)	6,366 (0.03 %)	846,566 (99.97 %)	3,997,370 (31.48 %)	775,742 (1.42 %)	12,770,948 (33.45 %)	57 (0.00 %)	n/a	41,527 (1.41 %)	30,440 (1.13 %)
101	Cape elephant shrew GCF_000299155.1	25,406 (1.08 %)	n/a	23,258 (1.07 %)	24,266 (1.16 %)	n/a	40.30 (86.29 %)	279,394 (13.74 %)	279,394 (13.74 %)	288,162 (86.26 %)	3,765,232 (16.90 %)	604,351 (0.89 %)	20,072,078 (42.36 %)	1,643 (0.02 %)	356,320 (0.77 %)	25,977 (0.42 %)	23,327 (0.35 %)
102	Cape golden mole (2012 Broad) GCF_000296735.1	25,323 (1.07 %)	n/a	20,961 (1.07 %)	21,723 (1.04 %)	n/a	40.01 (79.93 %)	370,844 (20.11 %)	370,844 (20.11 %)	391,344 (79.89 %)	4,924,640 (21.03 %)	500,830 (1.95 %)	18,946,663 (41.18 %)	3,416 (0.03 %)	805,638 (1.24 %)	21,186 (0.33 %)	18,126 (0.27 %)
103	Cape rock hyrax (US060 2019 Broad) GCA_004026925.1	n/a	n/a	21,401 (0.85 %)	45,353 (1.14 %)	n/a	41.08 (99.93 %)	4,203 (0.01 %)	4,203 (0.01 %)	1,048,940 (99.99 %)	7,222,494 (54.48 %)	430,286 (0.85 %)	21,775,991 (44.61 %)	44 (0.00 %)	n/a	37,158 (0.70 %)	31,196 (0.61 %)
104	capybara GCA_004027455.1	n/a	n/a	20,152 (1.22 %)	28,931 (1.29 %)	n/a	39.76 (99.93 %)	5,747 (0.02 %)	5,747 (0.02 %)	661,089 (99.98 %)	4,220,878 (29.16 %)	777,357 (2.04 %)	15,214,944 (35.16 %)	23 (0.00 %)	n/a	34,558 (0.85 %)	32,123 (0.72 %)
105	carabao (swamp buffalo K-KA32 2023) GCF_029407905.1	77,279 (2.89 %)	n/a	19,433 (1.40 %)	21,166 (1.23 %)	n/a	42.77 (100.00 %)	0 (0 %)	21 (0.00 %)	115 (100.00 %)	3,479,445 (21.92 %)	547,054 (6.39 %)	12,840,677 (45.22 %)	0 (0 %)	2,206,180 (5.44 %)	99,752 (3.73 %)	36,683 (0.81 %)
106	cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA) GCF_002263795.3	77,927 (4.11 %)	n/a	19,428 (1.48 %)	22,236 (1.33 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	0 (0 %)	386 (0.00 %)	1,958 (100.00 %)	3,449,588 (22.63 %)	596,092 (3.13 %)	12,785,607 (42.11 %)	1 (0.00 %)	1,626,342 (4.17 %)	46,864 (1.37 %)	37,742 (0.86 %)
107	cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014) GCF_000003055.6	57,977 (2.74 %)	n/a	19,583 (1.56 %)	20,581 (1.31 %)	n/a	41.82 (99.23 %)	72,454 (0.78 %)	74,464 (0.78 %)	75,598 (99.22 %)	5,607,556 (49.02 %)	440,521 (1.25 %)	13,167,657 (40.78 %)	789 (0.04 %)	1,243,109 (3.73 %)	42,869 (1.24 %)	37,223 (0.90 %)
108	Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad) GCA_004024745.2	n/a	n/a	18,603 (1.52 %)	22,330 (1.36 %)	n/a	42.35 (98.12 %)	57,013 (1.80 %)	57,013 (1.80 %)	1,240,743 (98.20 %)	5,255,211 (43.27 %)	2,502,373 (4.37 %)	12,968,788 (40.96 %)	10,788 (0.55 %)	n/a	172,178 (3.66 %)	153,143 (3.23 %)
109	cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022) GCF_027475565.1	80,997 (4.53 %)	n/a	18,420 (1.70 %)	19,561 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	0 (0 %)	22 (0.00 %)	195 (100.00 %)	4,611,842 (35.10 %)	837,685 (1.68 %)	13,649,125 (33.06 %)	0 (0 %)	327,107 (0.89 %)	60,367 (2.22 %)	56,975 (1.91 %)
110	cheetah (Rico 2018) GCF_003709585.1	72,154 (3.33 %)	n/a	18,472 (1.70 %)	20,443 (1.42 %)	n/a	41.55 (99.55 %)	0 (0 %)	24,173 (0.45 %)	3,220 (100.00 %)	4,853,945 (42.85 %)	831,106 (1.53 %)	13,663,571 (32.84 %)	1,699 (0.02 %)	283,401 (0.75 %)	60,744 (2.17 %)	55,562 (1.77 %)
111	Chinese forest musk deer (Sichuan 2022) GCF_022376915.1	51,612 (2.80 %)	n/a	19,565 (1.43 %)	22,280 (1.29 %)	n/a	42.30 (99.97 %)	0 (0 %)	1,781 (0.03 %)	2,446 (100.00 %)	3,257,347 (21.65 %)	399,120 (3.81 %)	12,906,274 (43.79 %)	0 (0 %)	2,278,433 (5.31 %)	46,689 (1.12 %)	38,849 (0.85 %)
112	Chinese hamster (17A/GY CHO 2020) GCF_003668045.3	55,440 (2.79 %)	n/a	20,030 (1.84 %)	18,721 (1.41 %)	67,900 (3.41 %)	41.51 (99.90 %)	0 (0 %)	4,164 (0.10 %)	647 (100.00 %)	8,121,057 (33.74 %)	1,095,058 (2.91 %)	12,923,274 (32.25 %)	17 (0.00 %)	566,700 (1.72 %)	19,341 (0.58 %)	18,196 (0.52 %)
113	Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI) GCF_000223135.1	45,993 (2.59 %)	n/a	20,602 (1.78 %)	17,467 (1.35 %)	n/a	41.37 (96.61 %)	156,635 (3.40 %)	156,635 (3.40 %)	265,787 (96.60 %)	4,541,936 (33.03 %)	1,072,129 (2.66 %)	13,150,189 (30.04 %)	213 (0.02 %)	n/a	12,522 (0.25 %)	11,560 (0.23 %)
114	Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd) GCA_900186095.1	n/a	n/a	19,874 (1.85 %)	19,298 (1.44 %)	n/a	41.45 (98.56 %)	63,334 (1.45 %)	63,334 (1.45 %)	71,598 (98.55 %)	4,521,726 (33.66 %)	1,060,619 (2.55 %)	12,867,288 (31.26 %)	9,581 (0.18 %)	445,818 (1.43 %)	17,960 (0.54 %)	17,137 (0.50 %)
115	Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022) GCA_026545065.1	n/a	n/a	20,293 (1.81 %)	18,881 (1.42 %)	n/a	41.62 (71.16 %)	924,541 (28.93 %)	924,541 (28.93 %)	1,236,122 (71.07 %)	4,330,728 (30.92 %)	987,319 (3.70 %)	13,374,062 (21.92 %)	817 (0.01 %)	n/a	18,838 (0.40 %)	17,349 (0.35 %)
116	Chinese pangolin (2020 Yunnan U) GCF_014570555.1	69,694 (3.21 %)	n/a	18,206 (1.70 %)	20,508 (1.48 %)	n/a	40.79 (95.54 %)	0 (0 %)	34,903 (4.47 %)	4,694 (100.00 %)	2,927,176 (35.60 %)	269,964 (0.67 %)	12,610,535 (29.10 %)	647 (0.02 %)	253,501 (1.85 %)	35,278 (1.05 %)	33,613 (0.98 %)
117	Chinese pangolin (hap1 mManPen7 2023) GCF_030020395.1	71,445 (2.98 %)	n/a	18,379 (1.34 %)	21,837 (1.29 %)	n/a	41.07 (99.77 %)	0 (0 %)	383 (0.23 %)	661 (100.00 %)	3,318,871 (34.65 %)	618,193 (3.68 %)	12,009,669 (39.02 %)	8 (0.00 %)	1,132,160 (3.87 %)	47,708 (1.22 %)	34,214 (0.79 %)
118	Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023) GCA_030020945.1	n/a	n/a	18,538 (1.34 %)	21,724 (1.27 %)	n/a	41.09 (99.48 %)	0 (0 %)	190 (0.52 %)	700 (100.00 %)	3,362,899 (34.48 %)	678,384 (4.11 %)	12,024,241 (39.52 %)	7 (0.00 %)	1,198,886 (3.98 %)	48,960 (1.19 %)	34,434 (0.79 %)
119	Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU) GCA_000738955.1	n/a	n/a	18,749 (1.63 %)	22,506 (1.40 %)	n/a	40.93 (90.69 %)	138,158 (9.33 %)	257,424 (9.33 %)	230,927 (90.67 %)	2,691,116 (34.48 %)	316,518 (1.96 %)	11,538,086 (25.40 %)	37,129 (1.10 %)	304,419 (2.99 %)	30,693 (0.58 %)	28,150 (0.52 %)
120	Chinese rufous horseshoe bat GCA_001888835.1	n/a	n/a	26,871 (2.34 %)	25,467 (1.89 %)	n/a	40.52 (97.22 %)	0 (0 %)	212,601 (2.80 %)	63,439 (100.00 %)	3,219,611 (33.86 %)	495,126 (1.20 %)	12,476,551 (27.16 %)	60 (0.00 %)	103,290 (0.35 %)	32,993 (0.98 %)	31,139 (0.91 %)
121	Chinese tree shrew GCF_000334495.1	47,005 (2.07 %)	n/a	21,375 (1.39 %)	19,231 (1.28 %)	n/a	41.73 (95.10 %)	191,695 (4.92 %)	191,695 (4.92 %)	242,445 (95.08 %)	5,060,321 (23.05 %)	1,046,388 (4.15 %)	14,978,259 (38.04 %)	914 (0.08 %)	803,568 (6.04 %)	88,806 (1.44 %)	55,240 (1.01 %)
122	chiru GCA_000400835.1	n/a	n/a	20,320 (1.60 %)	42,654 (2.51 %)	n/a	42.01 (93.04 %)	283,069 (7.00 %)	283,069 (7.00 %)	298,127 (93.00 %)	5,342,241 (43.54 %)	425,329 (1.25 %)	13,714,420 (34.66 %)	321 (0.03 %)	521,516 (1.73 %)	43,135 (1.89 %)	39,020 (1.80 %)
123	clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023) GCA_028018655.1	n/a	n/a	16,430 (1.52 %)	21,057 (1.44 %)	n/a	41.79 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	10,377 (100.00 %)	3,845,437 (33.39 %)	794,587 (2.14 %)	10,765,695 (33.40 %)	0 (0 %)	461,307 (1.56 %)	56,375 (2.45 %)	47,473 (1.74 %)
124	clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq) GCF_028018385.1	81,219 (3.62 %)	n/a	18,300 (1.65 %)	20,361 (1.39 %)	n/a	41.79 (99.94 %)	0 (0 %)	181 (0.06 %)	33 (100.00 %)	4,224,269 (34.84 %)	992,668 (2.08 %)	13,618,866 (34.42 %)	3 (0.00 %)	647,739 (1.89 %)	67,830 (2.45 %)	58,781 (1.98 %)
125	common bottlenose dolphin (maternal 2020) GCA_011762535.1	n/a	n/a	18,837 (1.77 %)	20,857 (1.43 %)	n/a	41.43 (99.73 %)	0 (0 %)	649 (0.27 %)	985 (100.00 %)	4,073,893 (46.15 %)	630,039 (2.15 %)	12,628,219 (35.41 %)	1 (0.00 %)	705,496 (1.85 %)	65,379 (1.89 %)	42,994 (1.34 %)
126	common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020) GCF_011762595.1	67,207 (3.31 %)	n/a	18,766 (1.77 %)	20,528 (1.42 %)	35,852 (1.58 %)	41.44 (99.74 %)	0 (0 %)	674 (0.26 %)	362 (100.00 %)	4,069,115 (46.17 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,891 (35.29 %)	1 (0.00 %)	629,903 (1.85 %)	65,551 (1.90 %)	43,136 (1.35 %)
127	common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq) GCF_001922835.1	45,975 (2.99 %)	n/a	17,255 (1.69 %)	17,058 (1.34 %)	n/a	40.85 (99.45 %)	0 (0 %)	114,003 (0.57 %)	2,648 (100.00 %)	3,845,938 (43.89 %)	514,631 (1.06 %)	12,317,098 (32.18 %)	466 (0.01 %)	284,934 (0.89 %)	48,030 (1.35 %)	31,891 (1.03 %)
128	common bottlenose dolphin (paternal 2020) GCA_011762515.1	n/a	n/a	18,537 (1.77 %)	20,619 (1.44 %)	n/a	41.42 (98.08 %)	0 (0 %)	868 (1.92 %)	1,166 (100.00 %)	3,997,801 (45.93 %)	609,838 (1.85 %)	12,400,272 (34.53 %)	1 (0.00 %)	649,569 (1.73 %)	64,630 (1.84 %)	42,623 (1.32 %)
129	common brushtail (alternate hap 2020) GCA_011100645.1	n/a	n/a	14,863 (0.75 %)	15,426 (0.89 %)	n/a	39.41 (100.00 %)	313 (0.00 %)	313 (0.00 %)	12,446 (100.00 %)	5,846,769 (38.56 %)	987,917 (1.99 %)	16,764,356 (40.14 %)	0 (0 %)	345,940 (1.13 %)	13,303 (0.35 %)	10,338 (0.23 %)
130	common brushtail (refseq 2020) GCF_011100635.1	37,674 (1.80 %)	n/a	18,653 (0.80 %)	15,375 (0.86 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	0 (0 %)	1,796 (0.56 %)	212 (100.00 %)	7,598,116 (38.90 %)	1,259,434 (1.97 %)	22,071,306 (40.56 %)	0 (0 %)	455,717 (1.17 %)	17,762 (0.38 %)	13,986 (0.24 %)
131	common pipistrelle (2020) GCA_903992545.1	n/a	n/a	17,216 (1.82 %)	19,202 (1.79 %)	n/a	42.55 (99.97 %)	0 (0 %)	1,546 (0.03 %)	323 (100.00 %)	2,953,532 (23.94 %)	805,142 (2.83 %)	9,964,846 (34.69 %)	0 (0 %)	446,836 (1.61 %)	57,295 (2.83 %)	54,882 (1.90 %)
132	common pipistrelle (alternate hap 2020) GCA_903992515.1	n/a	n/a	15,974 (1.72 %)	20,563 (1.66 %)	n/a	42.41 (100.00 %)	12 (0.00 %)	12 (0.00 %)	10,459 (100.00 %)	2,634,333 (23.76 %)	703,674 (2.65 %)	8,909,525 (33.95 %)	0 (0 %)	343,235 (1.37 %)	50,430 (2.54 %)	45,982 (1.75 %)
133	common pipistrelle (Broad 2019) GCA_004026625.1	n/a	n/a	21,938 (1.35 %)	53,915 (1.60 %)	n/a	42.88 (99.88 %)	10,870 (0.05 %)	10,870 (0.05 %)	736,974 (99.95 %)	3,499,501 (22.91 %)	1,046,301 (2.96 %)	11,759,516 (37.96 %)	17 (0.00 %)	n/a	92,062 (3.23 %)	75,629 (2.04 %)
134	common vampire bat (HL8 alternate hap 2022) GCA_022682395.1	n/a	n/a	17,520 (1.75 %)	18,995 (1.67 %)	n/a	42.89 (99.99 %)	0 (0 %)	580 (0.01 %)	430 (100.00 %)	2,597,497 (28.17 %)	356,620 (2.88 %)	10,797,225 (31.23 %)	25 (0.00 %)	271,481 (1.34 %)	61,931 (2.30 %)	43,396 (1.30 %)
135	common vampire bat (HL8 primary hap 2022 refseq) GCF_022682495.1	58,054 (3.40 %)	n/a	18,280 (1.71 %)	19,515 (1.59 %)	n/a	42.98 (99.99 %)	0 (0 %)	611 (0.01 %)	573 (100.00 %)	2,761,826 (28.38 %)	427,942 (3.89 %)	11,250,529 (32.57 %)	37 (0.00 %)	360,489 (1.62 %)	70,701 (2.48 %)	44,289 (1.24 %)
136	common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018) GCF_002940915.2	51,031 (3.24 %)	n/a	18,503 (1.88 %)	18,071 (1.68 %)	n/a	42.15 (97.78 %)	54,246 (2.23 %)	54,246 (2.23 %)	83,364 (97.77 %)	2,799,509 (29.62 %)	275,242 (1.03 %)	11,796,826 (28.19 %)	237 (0.03 %)	174,535 (2.84 %)	51,634 (1.37 %)	47,271 (1.22 %)
137	common warthog (WHEZ1 2021) GCF_016906955.1	55,088 (2.64 %)	n/a	18,264 (1.56 %)	19,251 (1.34 %)	54,816 (2.83 %)	41.95 (99.61 %)	0 (0 %)	523 (0.39 %)	194 (100.00 %)	3,898,243 (30.33 %)	588,742 (1.17 %)	12,955,929 (36.44 %)	1 (0.00 %)	519,262 (1.56 %)	75,592 (1.86 %)	45,338 (1.21 %)
138	common wombat GCF_900497805.2	46,365 (1.78 %)	n/a	19,437 (0.86 %)	18,947 (0.96 %)	n/a	38.86 (99.68 %)	0 (0 %)	67,461 (0.33 %)	14,183 (100.00 %)	8,645,969 (41.99 %)	1,203,246 (1.61 %)	23,878,215 (39.11 %)	3,092 (0.01 %)	284,840 (0.59 %)	18,752 (0.37 %)	17,700 (0.31 %)
139	creeping vole GCF_018167655.1	54,941 (2.31 %)	n/a	23,033 (1.55 %)	25,427 (1.53 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,147 (100.00 %)	4,549,519 (25.66 %)	1,153,429 (13.60 %)	13,568,297 (40.65 %)	0 (0 %)	3,223,361 (6.77 %)	23,141 (0.54 %)	19,563 (0.42 %)
140	crested porcupine GCA_004026905.1	n/a	n/a	21,005 (1.32 %)	35,975 (1.39 %)	n/a	41.51 (99.89 %)	4,351 (0.02 %)	4,351 (0.02 %)	1,140,949 (99.98 %)	4,303,147 (30.69 %)	600,488 (1.19 %)	14,049,490 (33.80 %)	35 (0.00 %)	n/a	57,196 (1.33 %)	41,516 (0.95 %)
141	Cuvier's beaked whale GCA_004364475.1	n/a	n/a	23,700 (0.90 %)	51,715 (0.86 %)	n/a	42.01 (99.76 %)	3,229 (0.01 %)	3,229 (0.01 %)	3,761,505 (99.99 %)	6,544,424 (43.61 %)	1,417,186 (3.11 %)	16,127,873 (42.25 %)	43 (0.00 %)	n/a	68,668 (1.15 %)	53,793 (0.96 %)
142	Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI) GCF_000743615.1	52,373 (2.57 %)	n/a	17,983 (1.45 %)	17,063 (1.43 %)	n/a	40.34 (97.96 %)	87,815 (2.05 %)	87,815 (2.05 %)	162,545 (97.95 %)	4,053,433 (30.86 %)	545,281 (1.74 %)	13,406,483 (30.65 %)	793 (0.06 %)	243,492 (1.42 %)	37,008 (0.74 %)	33,397 (0.64 %)
143	Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo) GCF_012274545.1	58,091 (2.74 %)	n/a	17,780 (1.44 %)	16,515 (1.42 %)	n/a	40.34 (97.94 %)	0 (0 %)	88,899 (2.07 %)	73,970 (100.00 %)	4,035,140 (30.95 %)	544,772 (1.73 %)	13,390,872 (30.61 %)	838 (0.06 %)	245,667 (1.44 %)	37,008 (0.74 %)	33,408 (0.64 %)
144	dassie-rat GCA_004026965.1	n/a	n/a	20,479 (1.16 %)	42,937 (1.41 %)	n/a	41.86 (99.89 %)	9,645 (0.04 %)	9,645 (0.04 %)	920,324 (99.96 %)	4,563,054 (28.83 %)	660,623 (1.92 %)	12,899,807 (34.48 %)	14 (0.00 %)	n/a	46,569 (1.25 %)	40,791 (1.01 %)
145	Daubenton's bat (alternate hap 2023) GCA_963242275.1	n/a	n/a	18,895 (1.78 %)	24,235 (1.81 %)	n/a	43.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4,930 (100.00 %)	2,813,870 (23.75 %)	718,406 (5.18 %)	9,977,320 (37.24 %)	0 (0 %)	609,378 (2.37 %)	62,910 (2.66 %)	55,962 (1.97 %)
146	Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq) GCF_963259705.1	64,558 (3.32 %)	n/a	19,141 (1.72 %)	22,133 (1.66 %)	n/a	43.18 (99.99 %)	0 (0 %)	1,099 (0.01 %)	121 (100.00 %)	3,040,232 (24.03 %)	796,911 (6.38 %)	10,478,180 (38.84 %)	9 (0.00 %)	756,429 (2.76 %)	64,920 (2.51 %)	57,806 (1.88 %)
147	Daurian ground squirrel GCA_002406435.1	n/a	n/a	20,990 (1.31 %)	17,575 (1.17 %)	n/a	39.77 (96.15 %)	141,850 (3.84 %)	141,850 (3.84 %)	502,654 (96.16 %)	5,783,538 (34.36 %)	924,038 (3.73 %)	17,533,301 (30.85 %)	318 (0.01 %)	1,230,179 (17.33 %)	27,955 (0.39 %)	26,034 (0.36 %)
148	David's myotis bat GCF_000327345.1	37,645 (2.70 %)	n/a	18,744 (1.78 %)	17,565 (1.62 %)	n/a	42.69 (91.23 %)	223,511 (8.80 %)	223,511 (8.80 %)	325,280 (91.20 %)	2,680,166 (23.79 %)	532,273 (1.90 %)	11,016,028 (29.55 %)	303 (0.05 %)	n/a	59,615 (1.59 %)	49,977 (1.17 %)
149	degu (3935 2012 refseq) GCF_000260255.1	48,152 (2.13 %)	n/a	22,242 (1.41 %)	22,101 (1.46 %)	n/a	41.38 (84.36 %)	252,770 (15.68 %)	252,772 (15.68 %)	259,904 (84.32 %)	4,901,673 (27.74 %)	898,945 (1.50 %)	14,282,003 (29.30 %)	2,582 (0.03 %)	313,028 (1.02 %)	40,135 (0.82 %)	36,410 (0.69 %)
150	desert hamster (2022) GCF_943737965.1	37,279 (2.11 %)	n/a	19,744 (1.74 %)	20,215 (1.50 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,079 (100.00 %)	4,038,079 (31.01 %)	1,132,871 (2.71 %)	11,946,112 (32.62 %)	0 (0 %)	618,568 (1.94 %)	17,053 (0.51 %)	15,416 (0.41 %)
151	Desmarest's hutia GCA_004027915.1	n/a	n/a	23,535 (0.78 %)	50,796 (0.95 %)	n/a	42.03 (99.83 %)	3,492 (0.01 %)	3,492 (0.01 %)	2,355,850 (99.99 %)	5,790,506 (26.72 %)	1,062,134 (1.71 %)	16,977,224 (35.29 %)	16 (0.00 %)	n/a	54,479 (1.01 %)	46,753 (0.82 %)
152	dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW) GCF_012295265.1	102,060 (4.04 %)	n/a	19,777 (1.69 %)	20,341 (1.41 %)	n/a	41.29 (99.69 %)	0 (0 %)	325 (0.31 %)	477 (100.00 %)	4,950,808 (42.83 %)	1,033,921 (2.36 %)	13,745,703 (33.32 %)	0 (0 %)	820,425 (2.05 %)	51,835 (2.25 %)	47,504 (1.92 %)
153	dingo (Sandy 2020 James Cook U) GCF_003254725.2	104,332 (4.50 %)	n/a	19,710 (1.72 %)	19,857 (1.42 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	0 (0 %)	69 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,547,906 (33.32 %)	993,474 (2.19 %)	13,701,060 (33.18 %)	0 (0 %)	716,455 (1.82 %)	51,216 (2.28 %)	51,748 (2.14 %)
154	dog (boxer Tasha 2011) GCF_000002285.3	82,549 (3.63 %)	n/a	19,772 (1.66 %)	19,565 (1.39 %)	n/a	41.31 (99.25 %)	23,876 (0.76 %)	23,876 (0.76 %)	27,106 (99.24 %)	4,918,098 (43.29 %)	991,835 (2.81 %)	13,644,959 (33.60 %)	34 (0.00 %)	971,687 (2.39 %)	53,269 (2.07 %)	48,154 (1.73 %)
155	dog (boxer Tasha 2020) GCF_000002285.5	93,774 (3.84 %)	n/a	19,392 (1.71 %)	19,572 (1.42 %)	52,141 (3.27 %)	41.26 (100.00 %)	0 (0 %)	1,028 (0.00 %)	147 (100.00 %)	23,927,903 (42.42 %)	972,851 (2.05 %)	13,611,845 (33.11 %)	0 (0 %)	657,594 (1.69 %)	50,679 (2.26 %)	46,402 (1.93 %)
156	dog (German shepard Mischka 2020) GCF_011100685.1	96,734 (3.71 %)	n/a	20,135 (1.64 %)	20,871 (1.38 %)	56,772 (3.19 %)	41.50 (100.00 %)	585 (0.00 %)	585 (0.00 %)	2,782 (100.00 %)	20,264,827 (43.87 %)	1,152,879 (3.22 %)	13,784,690 (34.30 %)	9 (0.00 %)	1,226,639 (2.84 %)	53,518 (2.23 %)	49,021 (1.97 %)
157	dog (labrador SID07034 2020) GCF_014441545.1	99,420 (3.87 %)	n/a	19,870 (1.70 %)	20,252 (1.41 %)	54,322 (3.23 %)	41.19 (99.47 %)	0 (0 %)	575 (0.53 %)	376 (100.00 %)	4,981,985 (42.28 %)	1,019,772 (1.97 %)	13,959,750 (32.77 %)	2 (0.01 %)	648,526 (1.66 %)	52,469 (2.25 %)	48,334 (1.95 %)
158	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU) GCF_000181335.3	72,089 (3.30 %)	n/a	18,662 (1.64 %)	20,897 (1.37 %)	n/a	41.73 (98.20 %)	403 (1.80 %)	436 (1.80 %)	5,079 (98.20 %)	5,086,462 (43.51 %)	964,126 (2.68 %)	13,947,871 (33.33 %)	0 (0 %)	785,059 (2.13 %)	69,701 (2.41 %)	61,568 (1.95 %)
159	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU) GCA_000181335.5	n/a	n/a	18,378 (1.53 %)	21,242 (1.40 %)	n/a	41.73 (98.21 %)	350 (1.69 %)	422 (1.79 %)	5,010 (98.31 %)	4,683,703 (33.33 %)	964,129 (2.68 %)	13,948,305 (33.33 %)	0 (0 %)	784,749 (2.13 %)	69,725 (2.42 %)	63,619 (1.83 %)
160	domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U) GCF_018350175.1	99,222 (4.40 %)	n/a	18,456 (1.66 %)	19,833 (1.39 %)	94,133 (5.63 %)	41.81 (100.00 %)	31 (0.00 %)	39 (0.00 %)	102 (100.00 %)	4,965,571 (43.65 %)	932,424 (1.95 %)	13,596,808 (33.85 %)	0 (0 %)	555,637 (1.52 %)	67,329 (2.48 %)	60,307 (2.00 %)
161	domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020) GCF_011764305.1	68,855 (3.09 %)	n/a	19,019 (1.55 %)	21,812 (1.42 %)	n/a	41.90 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,224 (100.00 %)	4,650,028 (39.49 %)	745,115 (2.02 %)	13,758,447 (36.14 %)	0 (0 %)	1,196,360 (3.06 %)	58,684 (2.16 %)	59,034 (1.99 %)
162	domestic ferret (Sable 2011 Broad) GCA_000239315.1	n/a	n/a	18,778 (1.67 %)	19,571 (1.47 %)	n/a	41.48 (96.89 %)	72,670 (3.12 %)	72,670 (3.12 %)	76,914 (96.88 %)	4,491,876 (40.13 %)	618,556 (1.07 %)	13,721,938 (31.04 %)	1,362 (0.02 %)	377,830 (1.02 %)	54,600 (1.94 %)	53,359 (1.69 %)
163	domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023) GCF_034190915.1	79,333 (3.55 %)	n/a	17,999 (1.09 %)	21,509 (1.20 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	84 (0.00 %)	84 (0.00 %)	672 (100.00 %)	5,037,431 (41.68 %)	886,785 (13.97 %)	14,620,284 (42.71 %)	1 (0.00 %)	2,850,832 (6.00 %)	39,682 (0.89 %)	26,858 (0.57 %)
164	domestic guinea pig (2N 2008 refseq) GCF_000151735.1	44,762 (2.31 %)	n/a	18,301 (1.33 %)	20,111 (1.34 %)	n/a	39.95 (97.81 %)	58,460 (2.20 %)	58,460 (2.20 %)	61,604 (97.80 %)	4,257,852 (38.85 %)	658,533 (1.25 %)	14,547,726 (34.19 %)	3 (0.00 %)	423,409 (1.39 %)	37,093 (0.85 %)	27,300 (0.63 %)
165	dugong (hap1 mDugDug1 2023) GCA_030035585.1	n/a	n/a	18,354 (1.22 %)	20,434 (1.08 %)	n/a	40.65 (100.00 %)	0 (0 %)	96 (0.00 %)	198 (100.00 %)	4,458,084 (33.00 %)	444,499 (1.79 %)	15,031,940 (47.42 %)	0 (0 %)	508,936 (1.29 %)	29,863 (0.83 %)	24,007 (0.54 %)
166	dugong (hap2 mDugDug1 2023) GCA_030020955.1	n/a	n/a	18,538 (1.23 %)	20,775 (1.09 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	0 (0 %)	89 (0.00 %)	167 (100.00 %)	4,455,227 (33.01 %)	444,021 (1.73 %)	14,946,847 (47.37 %)	1 (0.00 %)	504,439 (1.27 %)	29,828 (0.79 %)	24,008 (0.54 %)
167	dwarf mongoose GCA_004023845.1	n/a	n/a	21,478 (1.57 %)	32,174 (1.43 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	10,815 (0.05 %)	10,815 (0.05 %)	200,185 (99.95 %)	4,574,991 (40.34 %)	595,520 (1.11 %)	13,720,585 (32.94 %)	42 (0.00 %)	180,761 (0.49 %)	70,689 (2.42 %)	67,427 (2.05 %)
168	eastern cottontail (primary hap 2023) GCA_949820135.1	n/a	n/a	18,522 (1.26 %)	22,314 (1.28 %)	n/a	43.69 (100.00 %)	0 (0 %)	316 (0.00 %)	99 (100.00 %)	3,699,683 (20.55 %)	935,350 (11.22 %)	13,112,318 (44.07 %)	1 (0.00 %)	n/a	99,224 (2.27 %)	68,695 (1.75 %)
169	eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022) GCA_921998335.2	n/a	n/a	21,903 (2.13 %)	19,801 (1.40 %)	108,675 (4.42 %)	41.79 (99.89 %)	3 (0.00 %)	207 (0.11 %)	211 (100.00 %)	4,630,645 (40.56 %)	1,531,506 (3.70 %)	13,011,312 (35.48 %)	2 (0.00 %)	816,051 (2.46 %)	22,270 (0.54 %)	15,877 (0.42 %)
170	eastern mole GCA_004024925.1	n/a	n/a	19,631 (1.57 %)	32,414 (1.63 %)	n/a	42.02 (99.91 %)	7,239 (0.03 %)	7,239 (0.03 %)	647,535 (99.97 %)	3,145,725 (29.42 %)	554,620 (1.75 %)	10,663,504 (32.88 %)	18 (0.00 %)	n/a	55,063 (3.69 %)	48,440 (3.22 %)
171	eastern quoll GCA_020854095.1	n/a	n/a	15,715 (0.80 %)	16,750 (0.93 %)	n/a	36.19 (100.00 %)	0 (0 %)	431 (0.00 %)	76 (100.00 %)	5,256,999 (24.81 %)	1,280,160 (3.39 %)	21,362,866 (41.74 %)	2 (0.00 %)	642,432 (1.62 %)	24,508 (0.70 %)	24,041 (0.54 %)
172	Egyptian rousette (1219 2016 Boston U) GCF_001466805.2	54,791 (4.93 %)	n/a	18,221 (2.05 %)	24,192 (1.88 %)	46,601 (2.22 %)	40.02 (99.97 %)	0 (0 %)	638 (0.03 %)	2,490 (100.00 %)	2,815,693 (32.23 %)	440,119 (1.01 %)	12,346,041 (26.86 %)	0 (0 %)	74,090 (0.43 %)	56,244 (6.54 %)	61,126 (5.16 %)
173	Egyptian rousette (v1 2020 refseq) GCF_014176215.1	65,163 (4.76 %)	n/a	17,642 (2.07 %)	22,317 (1.84 %)	n/a	40.05 (98.59 %)	0 (0 %)	242 (1.41 %)	29 (100.00 %)	2,821,248 (33.05 %)	434,414 (1.02 %)	12,031,597 (26.52 %)	0 (0 %)	65,562 (0.33 %)	53,573 (4.84 %)	57,281 (4.47 %)
174	Egyptian spiny mouse GCA_004027535.1	n/a	n/a	23,498 (1.69 %)	36,970 (1.40 %)	30,076 (1.58 %)	42.71 (99.88 %)	20,469 (0.09 %)	20,469 (0.09 %)	391,811 (99.91 %)	4,983,574 (35.17 %)	1,342,514 (3.45 %)	13,029,270 (32.79 %)	32 (0.00 %)	n/a	19,944 (0.55 %)	18,844 (0.51 %)
175	elk (wapiti) GCF_019320065.1	66,846 (3.00 %)	n/a	20,090 (1.67 %)	21,999 (1.44 %)	n/a	41.62 (99.93 %)	0 (0 %)	6,643 (0.08 %)	185 (100.00 %)	4,884,711 (43.14 %)	429,925 (1.65 %)	13,135,255 (37.85 %)	78 (0.00 %)	802,680 (2.76 %)	47,099 (1.31 %)	44,586 (1.19 %)
176	ermine (2020) GCF_009829155.1	74,332 (3.19 %)	n/a	18,855 (1.65 %)	20,667 (1.43 %)	44,584 (2.07 %)	41.56 (99.12 %)	0 (0 %)	199 (0.88 %)	94 (100.00 %)	4,647,934 (41.44 %)	714,174 (1.30 %)	13,845,904 (33.42 %)	3 (0.01 %)	452,963 (1.26 %)	56,065 (2.25 %)	56,447 (2.07 %)
177	ermine (alternate hap 2020) GCA_009829165.1	n/a	n/a	13,583 (1.65 %)	15,403 (1.46 %)	n/a	41.72 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,327 (100.00 %)	3,139,035 (40.57 %)	480,111 (1.29 %)	9,106,061 (31.93 %)	0 (0 %)	342,175 (1.40 %)	39,139 (2.25 %)	38,863 (2.02 %)
178	Eurasian badger (2021) GCA_922990625.1	n/a	n/a	19,332 (1.42 %)	22,424 (1.40 %)	n/a	42.47 (100.00 %)	0 (0 %)	27 (0.00 %)	726 (100.00 %)	4,362,536 (31.74 %)	801,232 (4.02 %)	13,893,672 (37.73 %)	1 (0.00 %)	1,089,255 (2.94 %)	65,806 (4.13 %)	53,831 (1.83 %)
179	Eurasian badger (v3.2 2022) GCA_922984935.2	n/a	n/a	19,268 (1.40 %)	22,121 (1.36 %)	41,043 (1.93 %)	42.48 (100.00 %)	0 (0 %)	101 (0.00 %)	538 (100.00 %)	4,417,203 (31.72 %)	821,664 (4.02 %)	13,814,720 (38.08 %)	1 (0.00 %)	1,177,257 (3.11 %)	66,524 (3.95 %)	54,563 (1.83 %)
180	Eurasian field mouse (2024) GCA_964023405.1	n/a	n/a	20,487 (1.88 %)	19,707 (1.34 %)	n/a	42.15 (100.00 %)	0 (0 %)	182 (0.00 %)	61 (100.00 %)	5,115,510 (39.18 %)	1,868,284 (4.29 %)	13,503,826 (37.29 %)	2 (0.00 %)	1,262,006 (3.13 %)	26,414 (0.61 %)	24,636 (0.56 %)
181	Eurasian red squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685485.1	n/a	n/a	12,437 (1.51 %)	12,702 (1.22 %)	n/a	40.06 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	10,657 (100.00 %)	2,303,176 (35.38 %)	353,996 (1.49 %)	7,218,556 (31.67 %)	0 (0 %)	194,541 (1.24 %)	24,268 (1.07 %)	22,754 (0.97 %)
182	Eurasian red squirrel (v1.2 2020) GCA_902686455.2	n/a	n/a	21,309 (1.58 %)	21,026 (1.36 %)	33,465 (1.53 %)	40.08 (94.33 %)	0 (0 %)	1,177 (5.67 %)	639 (100.00 %)	4,677,412 (35.73 %)	704,218 (1.42 %)	14,992,063 (31.49 %)	5 (0.00 %)	419,661 (1.29 %)	48,159 (1.04 %)	45,470 (0.95 %)
183	Eurasian river otter (2020) GCF_902655055.1	67,145 (2.95 %)	n/a	18,842 (1.54 %)	20,178 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	0 (0 %)	185 (0.00 %)	44 (100.00 %)	4,259,294 (33.39 %)	713,721 (1.36 %)	13,626,048 (34.37 %)	1 (0.00 %)	695,796 (1.86 %)	57,073 (1.82 %)	47,446 (1.36 %)
184	Eurasian river otter (alternate hap 2019) GCA_902653095.1	n/a	n/a	9,910 (1.59 %)	11,315 (1.31 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8,506 (100.00 %)	2,052,338 (42.25 %)	316,084 (1.64 %)	6,222,460 (33.12 %)	0 (0 %)	291,189 (1.91 %)	27,057 (1.96 %)	26,047 (1.75 %)
185	Eurasian water vole (alternate hap 2020) GCA_903992525.1	n/a	n/a	16,761 (1.66 %)	19,715 (1.37 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	105 (0.00 %)	105 (0.00 %)	16,473 (100.00 %)	3,118,266 (26.44 %)	829,463 (2.82 %)	9,700,482 (31.37 %)	0 (0 %)	353,652 (1.44 %)	14,146 (0.57 %)	12,571 (0.45 %)
186	Eurasian water vole (v2 2021) GCF_903992535.2	45,544 (2.51 %)	n/a	19,733 (1.78 %)	19,053 (1.47 %)	36,935 (2.27 %)	42.15 (99.74 %)	0 (0 %)	873 (0.26 %)	215 (100.00 %)	3,993,912 (25.74 %)	1,088,163 (2.91 %)	12,853,770 (32.42 %)	5 (0.00 %)	518,667 (1.69 %)	19,000 (0.58 %)	16,851 (0.46 %)
187	European hare (LE1 primary hap 2023) GCF_033115175.1	46,528 (2.09 %)	n/a	19,392 (1.25 %)	23,070 (1.29 %)	n/a	44.03 (100.00 %)	0 (0 %)	418 (0.00 %)	651 (100.00 %)	4,011,592 (19.81 %)	1,000,204 (8.44 %)	13,414,251 (44.25 %)	2 (0.00 %)	2,116,577 (4.63 %)	98,831 (2.33 %)	72,807 (1.75 %)
188	European harvest mouse (primary hap 2024) GCA_963924665.1	n/a	n/a	20,236 (1.71 %)	19,368 (1.32 %)	n/a	40.05 (99.99 %)	0 (0 %)	2,020 (0.02 %)	894 (100.00 %)	4,892,811 (36.49 %)	1,223,387 (18.26 %)	11,907,631 (42.51 %)	10 (0.00 %)	4,679,739 (9.91 %)	17,423 (0.62 %)	15,264 (0.35 %)
189	European mink (alternate hap 2023) GCA_030435785.1	n/a	n/a	15,419 (1.50 %)	21,175 (1.51 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12,043 (100.00 %)	2,952,218 (30.62 %)	538,508 (2.18 %)	9,303,303 (34.20 %)	0 (0 %)	511,888 (2.10 %)	47,810 (2.50 %)	39,732 (1.82 %)
190	European mink (primary hap 2023 refseq) GCF_030435805.1	69,556 (3.13 %)	n/a	18,706 (1.46 %)	21,193 (1.37 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	0 (0 %)	39 (0.00 %)	25 (100.00 %)	4,237,791 (30.90 %)	792,897 (2.69 %)	13,417,195 (36.59 %)	0 (0 %)	894,272 (2.55 %)	67,132 (2.54 %)	51,333 (1.62 %)
191	European pine marten (primary hap 2023) GCA_963455335.1	n/a	n/a	18,336 (1.50 %)	20,807 (1.41 %)	n/a	42.38 (99.98 %)	0 (0 %)	2,250 (0.02 %)	477 (100.00 %)	4,096,160 (31.55 %)	707,337 (3.28 %)	13,715,382 (34.73 %)	10 (0.00 %)	626,861 (1.84 %)	61,481 (4.29 %)	56,462 (1.94 %)
192	European shrew (alternate hap 2023) GCA_027595995.1	n/a	n/a	17,506 (1.26 %)	25,527 (1.52 %)	n/a	43.20 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	5,699 (100.00 %)	2,400,784 (15.19 %)	1,062,793 (3.20 %)	13,284,496 (41.93 %)	0 (0 %)	768,770 (2.06 %)	77,009 (2.86 %)	75,481 (2.15 %)
193	European shrew (GB8-d 2012) GCF_000181275.1	23,525 (1.54 %)	n/a	17,290 (1.33 %)	22,005 (1.50 %)	n/a	42.90 (90.49 %)	188,953 (9.54 %)	188,953 (9.54 %)	201,798 (90.46 %)	4,400,127 (33.22 %)	946,629 (2.03 %)	13,377,581 (35.30 %)	3,389 (0.06 %)	410,333 (1.21 %)	77,851 (2.58 %)	76,553 (1.98 %)
194	European shrew (primary hap 2023) GCF_027595985.1	44,643 (2.60 %)	n/a	17,479 (1.26 %)	21,293 (1.37 %)	n/a	43.24 (99.46 %)	0 (0 %)	1,427 (0.54 %)	65 (100.00 %)	2,474,584 (15.18 %)	1,107,884 (3.28 %)	13,638,467 (41.72 %)	10 (0.00 %)	822,159 (2.15 %)	79,785 (2.86 %)	77,901 (2.13 %)
195	European snow vole (alternate hap 2023) GCA_950005115.1	n/a	n/a	18,364 (1.79 %)	20,379 (1.63 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	4,256 (100.00 %)	3,049,618 (22.22 %)	852,708 (4.50 %)	10,501,392 (33.34 %)	0 (0 %)	706,136 (2.67 %)	17,629 (0.60 %)	15,048 (0.47 %)
196	European snow vole (primary hap 2023 refseq) GCF_950005125.1	47,025 (2.69 %)	n/a	19,592 (1.78 %)	21,173 (1.56 %)	n/a	41.98 (100.00 %)	0 (0 %)	197 (0.00 %)	160 (100.00 %)	5,048,186 (44.12 %)	998,537 (5.14 %)	12,204,053 (34.97 %)	4 (0.00 %)	954,164 (3.20 %)	20,725 (0.63 %)	18,727 (0.52 %)
197	European woodmouse (2022 refseq) GCF_947179515.1	54,114 (2.24 %)	n/a	19,959 (1.65 %)	19,953 (1.25 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	0 (0 %)	1,129 (0.01 %)	497 (100.00 %)	4,863,650 (37.41 %)	1,795,997 (8.95 %)	13,681,732 (40.58 %)	17 (0.00 %)	2,516,593 (5.37 %)	23,961 (0.53 %)	17,318 (0.36 %)
198	European woodmouse (alternate hap 2022) GCA_947179525.1	n/a	n/a	18,692 (1.72 %)	22,021 (1.36 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	10,863 (100.00 %)	4,055,957 (36.08 %)	1,513,576 (9.53 %)	11,306,811 (39.67 %)	0 (0 %)	1,995,176 (5.07 %)	20,865 (0.55 %)	15,533 (0.39 %)
199	fallow deer (Ldn47 2023) GCF_033118175.1	57,013 (2.35 %)	n/a	20,187 (1.33 %)	23,290 (1.33 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	0 (0 %)	44 (0.00 %)	284 (100.00 %)	3,308,241 (20.72 %)	513,748 (18.20 %)	12,996,819 (48.19 %)	0 (0 %)	5,629,434 (11.23 %)	214,480 (2.98 %)	41,647 (0.85 %)
200	fat dormouse (US078 2019) GCA_004027185.1	n/a	n/a	23,122 (1.24 %)	48,677 (1.27 %)	n/a	42.33 (99.92 %)	10,685 (0.04 %)	10,685 (0.04 %)	444,115 (99.96 %)	6,783,404 (37.03 %)	1,642,515 (3.72 %)	12,706,289 (39.97 %)	58 (0.00 %)	n/a	65,521 (1.47 %)	33,794 (0.75 %)
201	fat sand rat (mPsaObe1 2021) GCF_907164565.1	43,211 (2.50 %)	n/a	18,543 (1.78 %)	20,094 (1.42 %)	n/a	41.95 (99.11 %)	0 (0 %)	50,482 (0.90 %)	11,389 (100.00 %)	4,686,377 (43.10 %)	920,563 (1.85 %)	12,813,848 (35.08 %)	2,665 (0.03 %)	294,151 (0.96 %)	22,480 (0.71 %)	20,772 (0.63 %)
202	fat sand rat (Psa_ob012049795 2017) GCA_002215935.1	n/a	n/a	21,644 (1.71 %)	31,665 (1.41 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	96,427 (100.00 %)	4,646,110 (38.87 %)	946,664 (2.24 %)	13,134,526 (33.94 %)	0 (0 %)	232,939 (1.07 %)	26,411 (0.73 %)	24,961 (0.66 %)
203	fishing cat (Anna 2022 U Missouri) GCF_022837055.1	68,015 (2.86 %)	n/a	18,432 (1.63 %)	19,912 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	0 (0 %)	63 (0.00 %)	192 (100.00 %)	4,777,906 (34.85 %)	937,432 (2.30 %)	13,438,032 (34.55 %)	0 (0 %)	654,267 (1.76 %)	70,402 (2.61 %)	68,720 (2.25 %)
204	Florida manatee (CSIC 2023) GCA_030013775.1	n/a	n/a	19,432 (1.24 %)	24,035 (1.14 %)	n/a	40.66 (100.00 %)	33 (0.00 %)	33 (0.00 %)	15,641 (100.00 %)	4,400,331 (33.07 %)	439,615 (1.04 %)	14,884,753 (46.98 %)	2 (0.00 %)	413,231 (1.00 %)	32,563 (0.80 %)	26,358 (0.59 %)
205	Florida manatee (Lorelei 2012 refseq) GCF_000243295.1	39,645 (2.08 %)	n/a	18,308 (1.37 %)	20,588 (1.23 %)	32,868 (1.38 %)	40.73 (89.24 %)	160,167 (10.78 %)	160,167 (10.78 %)	166,490 (89.22 %)	n/a	389,315 (0.74 %)	14,633,038 (38.46 %)	5,748 (0.06 %)	244,060 (0.64 %)	27,462 (0.64 %)	25,464 (0.54 %)
206	fossa GCA_004023885.1	n/a	n/a	21,156 (1.56 %)	29,809 (1.38 %)	n/a	41.51 (99.94 %)	6,335 (0.03 %)	6,335 (0.03 %)	470,371 (99.97 %)	4,962,168 (42.36 %)	814,639 (1.52 %)	13,708,904 (34.14 %)	29 (0.00 %)	263,077 (0.54 %)	78,033 (2.52 %)	74,289 (2.13 %)
207	Gambian giant pouched rat GCA_004027575.1	n/a	n/a	21,189 (1.59 %)	32,806 (1.43 %)	n/a	42.11 (99.88 %)	7,473 (0.03 %)	7,473 (0.03 %)	1,110,425 (99.97 %)	4,137,605 (24.57 %)	1,071,627 (2.76 %)	12,905,250 (32.78 %)	51 (0.00 %)	n/a	32,359 (0.80 %)	21,577 (0.55 %)
208	gayal (CVASU_BF_001 2021) GCA_017311355.1	n/a	n/a	24,549 (1.09 %)	55,194 (1.15 %)	n/a	42.05 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1,262,134 (100.00 %)	3,691,398 (22.78 %)	677,397 (2.00 %)	14,380,670 (42.36 %)	0 (0 %)	n/a	75,114 (1.33 %)	44,401 (0.88 %)
209	gayal (Nagaland 2019) GCA_007844835.1	n/a	n/a	22,715 (1.55 %)	23,635 (1.33 %)	n/a	41.67 (96.51 %)	301,761 (3.52 %)	301,761 (3.52 %)	306,776 (96.48 %)	6,243,468 (45.69 %)	518,664 (1.99 %)	15,147,647 (37.64 %)	5,199 (0.13 %)	1,060,226 (3.23 %)	45,586 (0.89 %)	40,275 (0.78 %)
210	Geoffroy's cat GCF_018350155.1	85,331 (3.53 %)	n/a	18,469 (1.66 %)	19,516 (1.36 %)	93,795 (4.83 %)	41.75 (100.00 %)	35 (0.00 %)	45 (0.00 %)	82 (100.00 %)	5,021,854 (43.23 %)	930,175 (1.84 %)	13,757,469 (34.29 %)	0 (0 %)	627,614 (1.76 %)	65,918 (2.36 %)	58,825 (1.96 %)
211	giant anteater GCA_004026745.1	n/a	n/a	24,383 (0.91 %)	44,315 (0.93 %)	n/a	39.53 (99.88 %)	8,283 (0.02 %)	8,283 (0.02 %)	1,629,691 (99.98 %)	5,333,757 (35.57 %)	575,140 (0.91 %)	21,181,213 (39.97 %)	116 (0.00 %)	n/a	57,558 (0.94 %)	45,184 (0.73 %)
212	giant otter GCA_004024605.1	n/a	n/a	21,199 (1.46 %)	30,565 (1.34 %)	n/a	41.71 (99.93 %)	7,431 (0.03 %)	7,431 (0.03 %)	652,159 (99.97 %)	5,113,769 (41.55 %)	788,677 (1.46 %)	14,385,279 (35.77 %)	57 (0.00 %)	420,852 (0.84 %)	82,376 (2.05 %)	79,949 (1.87 %)
213	giant panda (Jingjing v3 2020) GCF_002007445.2	65,468 (3.27 %)	n/a	19,077 (1.67 %)	20,176 (1.39 %)	n/a	41.68 (98.09 %)	0 (0 %)	189,277 (1.92 %)	73,514 (100.00 %)	4,012,144 (34.40 %)	617,803 (1.99 %)	14,216,587 (30.41 %)	9,430 (0.13 %)	581,226 (4.37 %)	59,449 (1.50 %)	54,779 (1.33 %)
214	goat (v2 San Clemente 2016 USDA) GCF_001704415.2	47,159 (2.31 %)	n/a	19,342 (1.38 %)	22,346 (1.24 %)	n/a	43.16 (100.00 %)	0 (0 %)	790 (0.00 %)	29,886 (100.00 %)	3,502,527 (22.45 %)	760,831 (7.07 %)	13,024,178 (44.85 %)	0 (0 %)	2,571,330 (5.65 %)	125,662 (4.00 %)	40,923 (0.89 %)
215	Gobi jerboa GCA_004027895.1	n/a	n/a	22,410 (0.91 %)	45,268 (1.02 %)	n/a	41.94 (99.88 %)	10,987 (0.04 %)	10,987 (0.04 %)	1,295,369 (99.96 %)	8,828,417 (40.19 %)	1,979,806 (6.43 %)	14,759,732 (47.73 %)	96 (0.00 %)	n/a	24,314 (0.52 %)	19,787 (0.39 %)
216	golden hamster (Baylor 2021) GCF_017639785.1	67,831 (3.37 %)	n/a	19,354 (1.71 %)	19,863 (1.47 %)	69,903 (4.39 %)	42.04 (96.99 %)	711 (3.01 %)	711 (3.01 %)	7,058 (96.99 %)	3,981,818 (27.65 %)	976,456 (3.46 %)	12,580,903 (32.87 %)	25 (0.00 %)	766,407 (1.98 %)	21,268 (0.61 %)	18,135 (0.47 %)
217	golden hamster (Broad 2013 refseq) GCF_000349665.1	42,636 (2.91 %)	37,986 (2.21 %)	18,976 (1.82 %)	19,149 (1.51 %)	29,936 (1.96 %)	42.01 (82.92 %)	216,216 (17.12 %)	216,216 (17.12 %)	237,700 (82.88 %)	3,599,795 (26.09 %)	790,256 (1.69 %)	12,003,956 (24.29 %)	3,589 (0.05 %)	254,929 (0.76 %)	18,591 (0.51 %)	17,093 (0.42 %)
218	golden spiny mouse (2020) GCF_903995435.1	36,997 (1.96 %)	n/a	20,006 (1.91 %)	19,132 (1.50 %)	n/a	42.51 (99.65 %)	0 (0 %)	880 (0.35 %)	623 (100.00 %)	4,785,907 (32.61 %)	1,305,613 (3.34 %)	12,958,061 (32.33 %)	0 (0 %)	684,879 (1.84 %)	20,760 (0.59 %)	18,457 (0.52 %)
219	gracile shrew mole GCA_004024945.1	n/a	n/a	19,165 (1.25 %)	43,816 (1.48 %)	n/a	41.08 (99.89 %)	8,248 (0.04 %)	8,248 (0.04 %)	732,083 (99.96 %)	2,957,465 (23.76 %)	783,289 (2.60 %)	11,503,344 (31.38 %)	23 (0.00 %)	n/a	92,729 (3.60 %)	75,685 (2.89 %)
220	gray seal GCF_012393455.1	79,009 (3.73 %)	n/a	19,882 (1.73 %)	22,416 (1.46 %)	n/a	41.44 (100.00 %)	0 (0 %)	117 (0.00 %)	6,880 (100.00 %)	4,448,588 (43.28 %)	557,710 (1.32 %)	13,340,576 (33.41 %)	0 (0 %)	506,266 (1.47 %)	55,637 (1.78 %)	52,209 (1.58 %)
221	gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023) GCA_027917375.1	n/a	n/a	12,662 (0.70 %)	15,124 (0.89 %)	n/a	37.74 (100.00 %)	24 (0.00 %)	24 (0.00 %)	8,086 (100.00 %)	4,098,004 (25.33 %)	806,470 (2.98 %)	16,244,072 (43.39 %)	0 (0 %)	n/a	24,879 (0.67 %)	15,867 (0.39 %)
222	gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq) GCF_027887165.1	73,383 (3.04 %)	n/a	16,637 (0.72 %)	16,036 (0.85 %)	n/a	37.92 (99.11 %)	0 (0 %)	2,255 (0.89 %)	13 (100.00 %)	5,562,359 (25.40 %)	1,096,620 (2.60 %)	22,322,748 (43.37 %)	13 (0.00 %)	793,648 (1.81 %)	28,894 (0.57 %)	22,987 (0.42 %)
223	gray short-tailed opossum (MonDom5 2007) GCF_000002295.2	68,375 (2.34 %)	n/a	16,663 (0.75 %)	16,162 (0.84 %)	n/a	37.82 (97.26 %)	67,660 (2.75 %)	67,660 (2.75 %)	72,674 (97.25 %)	7,753,175 (55.85 %)	1,051,473 (2.34 %)	22,274,001 (42.23 %)	6 (0.00 %)	680,995 (1.61 %)	30,883 (0.53 %)	22,339 (0.40 %)
224	gray squirrel (2020) GCF_902686445.1	58,884 (2.46 %)	n/a	20,752 (1.49 %)	21,107 (1.31 %)	32,732 (1.45 %)	40.06 (99.98 %)	0 (0 %)	1,824 (0.02 %)	752 (100.00 %)	4,605,578 (34.50 %)	728,192 (1.65 %)	15,467,412 (33.91 %)	2 (0.00 %)	504,786 (1.54 %)	51,878 (1.11 %)	49,715 (1.03 %)
225	gray squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685475.1	n/a	n/a	17,156 (1.53 %)	18,190 (1.33 %)	n/a	40.25 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	9,510 (100.00 %)	3,455,580 (34.94 %)	530,053 (1.56 %)	10,927,458 (32.64 %)	0 (0 %)	323,766 (1.34 %)	38,976 (1.13 %)	37,317 (1.05 %)
226	gray wolf (2021) GCA_905319855.2	n/a	n/a	19,474 (1.55 %)	20,394 (1.40 %)	72,806 (4.12 %)	41.49 (100.00 %)	0 (0 %)	166 (0.00 %)	82 (100.00 %)	4,550,524 (31.76 %)	1,063,944 (3.96 %)	13,588,117 (34.74 %)	23 (0.00 %)	1,048,956 (2.49 %)	51,996 (2.15 %)	47,971 (1.53 %)
227	gray wolf (alternate hap 2021) GCA_905319845.1	n/a	n/a	12,760 (1.57 %)	14,423 (1.42 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	5,537 (100.00 %)	2,725,227 (31.66 %)	616,862 (3.40 %)	8,041,744 (32.68 %)	0 (0 %)	465,446 (1.97 %)	32,293 (2.35 %)	29,871 (1.57 %)
228	great fruit-eating bat (mArtLit1 hap1 2024) GCA_038363095.1	n/a	n/a	18,022 (1.56 %)	20,018 (1.52 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	0 (0 %)	81 (0.00 %)	419 (100.00 %)	2,827,417 (26.82 %)	371,479 (4.97 %)	11,603,093 (34.64 %)	1 (0.00 %)	522,672 (1.87 %)	71,574 (2.28 %)	54,020 (1.50 %)
229	great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016) GCF_001890085.2	50,895 (3.26 %)	n/a	18,993 (2.01 %)	19,633 (1.65 %)	41,769 (2.41 %)	41.11 (87.42 %)	0 (0 %)	172,750 (12.60 %)	7,387 (100.00 %)	2,946,981 (30.72 %)	495,272 (1.05 %)	11,587,728 (25.43 %)	2,116 (0.03 %)	193,018 (1.10 %)	32,949 (0.96 %)	30,173 (0.87 %)
230	greater bulldog bat GCA_004026585.1	n/a	n/a	20,774 (1.62 %)	28,140 (1.63 %)	n/a	40.92 (99.94 %)	6,171 (0.03 %)	6,171 (0.03 %)	304,393 (99.97 %)	3,288,598 (29.60 %)	478,424 (1.16 %)	11,427,553 (35.29 %)	6 (0.00 %)	n/a	44,124 (1.99 %)	42,024 (1.78 %)
231	Greater cane rat GCA_004025085.1	n/a	n/a	20,383 (0.98 %)	47,456 (1.25 %)	n/a	42.85 (99.83 %)	8,825 (0.03 %)	8,825 (0.03 %)	1,898,466 (99.97 %)	5,569,185 (30.19 %)	946,696 (3.12 %)	13,144,109 (41.83 %)	28 (0.00 %)	n/a	97,686 (2.61 %)	84,205 (2.21 %)
232	greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019) GCA_004115295.1	n/a	n/a	14,896 (1.85 %)	18,939 (1.59 %)	n/a	40.69 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	13,426 (100.00 %)	2,426,330 (34.43 %)	418,341 (1.36 %)	8,763,234 (27.86 %)	0 (0 %)	108,521 (0.55 %)	24,370 (1.08 %)	22,940 (1.00 %)
233	greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019) GCF_004115265.2	53,353 (3.13 %)	n/a	18,641 (1.97 %)	20,359 (1.68 %)	n/a	40.54 (99.64 %)	0 (0 %)	158 (0.36 %)	134 (100.00 %)	3,218,744 (34.52 %)	564,789 (1.35 %)	12,217,020 (29.39 %)	0 (0 %)	171,202 (0.67 %)	32,445 (1.06 %)	30,641 (0.98 %)
234	greater mouse-eared bat (2020 Bat1K) GCF_014108235.1	70,930 (3.43 %)	n/a	19,052 (1.84 %)	21,498 (1.73 %)	n/a	43.11 (98.55 %)	0 (0 %)	538 (1.45 %)	93 (100.00 %)	3,088,083 (26.27 %)	753,124 (2.84 %)	10,383,466 (35.84 %)	0 (0 %)	499,733 (1.88 %)	61,023 (2.69 %)	54,015 (1.81 %)
235	greater sac-winged bat (mSacBil1 primary hap 2024) GCA_036850765.1	n/a	n/a	18,322 (1.40 %)	21,049 (1.35 %)	n/a	41.71 (98.73 %)	102 (0.41 %)	468 (1.27 %)	359 (99.59 %)	4,247,148 (29.53 %)	1,031,385 (2.50 %)	12,465,194 (43.30 %)	3 (0.00 %)	1,113,639 (2.95 %)	101,620 (2.01 %)	44,590 (1.04 %)
236	greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U) GCF_019186645.2	50,563 (2.96 %)	n/a	18,224 (1.70 %)	20,689 (1.67 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	0 (0 %)	55 (0.00 %)	534 (100.00 %)	2,961,591 (0.00 %)	387,908 (0.97 %)	12,179,612 (30.91 %)	1 (0.00 %)	167,034 (0.66 %)	62,189 (5.35 %)	65,269 (4.61 %)
237	grey whale GCA_004363415.1	n/a	n/a	21,827 (1.52 %)	32,191 (1.24 %)	n/a	41.22 (99.88 %)	10,622 (0.04 %)	10,622 (0.04 %)	1,046,770 (99.96 %)	4,841,166 (45.56 %)	780,015 (1.83 %)	13,559,563 (39.86 %)	79 (0.00 %)	n/a	72,343 (1.59 %)	48,741 (1.27 %)
238	grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023) GCA_028021475.1	n/a	n/a	19,129 (1.37 %)	24,628 (1.24 %)	n/a	41.83 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14,442 (100.00 %)	3,892,130 (35.74 %)	874,864 (15.70 %)	11,484,916 (45.69 %)	0 (0 %)	2,048,708 (5.99 %)	73,507 (1.72 %)	41,124 (0.98 %)
239	grey whale (mEscRob2 primary hap 2023) GCA_028021215.1	n/a	n/a	19,288 (1.38 %)	21,791 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	0 (0 %)	279 (0.00 %)	704 (100.00 %)	4,116,900 (35.85 %)	966,065 (16.74 %)	12,154,173 (46.39 %)	3 (0.00 %)	2,154,240 (5.67 %)	77,011 (1.59 %)	42,884 (0.96 %)
240	hairy big-eared bat (US037 2019 Broad) GCA_004026765.1	n/a	n/a	21,360 (1.44 %)	37,376 (1.52 %)	n/a	42.38 (99.94 %)	3,218 (0.01 %)	3,218 (0.01 %)	553,308 (99.99 %)	3,519,246 (30.77 %)	393,318 (0.85 %)	12,525,258 (34.42 %)	12 (0.00 %)	n/a	84,875 (2.37 %)	63,057 (1.80 %)
241	harbor porpoise (primary hap 2024 genbank) GCA_963924675.1	n/a	n/a	18,529 (1.58 %)	20,583 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	2 (0.00 %)	966 (0.01 %)	442 (100.00 %)	3,760,716 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,240 (39.04 %)	4 (0.00 %)	1,410,168 (3.71 %)	71,530 (2.69 %)	40,160 (1.06 %)
242	harbor porpoise (primary hap 2024 refseq) GCF_963924675.1	33,578 (1.54 %)	n/a	18,528 (1.58 %)	20,582 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	966 (0.01 %)	966 (0.01 %)	1,405 (99.99 %)	3,760,713 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,181 (39.04 %)	4 (0.00 %)	1,410,168 (3.71 %)	71,530 (2.69 %)	40,160 (1.06 %)
243	harbor seal GCF_004348235.1	50,670 (2.98 %)	n/a	19,484 (1.76 %)	20,771 (1.44 %)	33,296 (1.58 %)	41.38 (99.09 %)	16,031 (0.91 %)	16,480 (0.91 %)	21,161 (99.09 %)	4,526,182 (43.28 %)	576,921 (1.11 %)	13,421,780 (33.06 %)	945 (0.02 %)	459,159 (1.28 %)	54,592 (1.70 %)	51,200 (1.50 %)
244	Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U) GCF_002201575.2	37,605 (1.99 %)	n/a	19,483 (1.73 %)	19,767 (1.35 %)	n/a	41.41 (98.23 %)	0 (0 %)	25,763 (1.77 %)	7,487 (100.00 %)	4,575,217 (43.59 %)	583,394 (1.11 %)	13,374,131 (33.69 %)	2,318 (0.04 %)	611,862 (1.63 %)	52,067 (1.50 %)	48,495 (1.32 %)
245	hazel dormouse GCA_004027005.1	n/a	n/a	21,556 (1.24 %)	40,971 (1.33 %)	n/a	41.60 (99.91 %)	15,076 (0.06 %)	15,076 (0.06 %)	481,881 (99.94 %)	6,679,641 (33.98 %)	1,653,419 (3.72 %)	12,685,676 (43.98 %)	42 (0.00 %)	n/a	71,478 (1.57 %)	45,897 (0.92 %)
246	hazel dormouse (alternate hap 2023) GCA_963383665.1	n/a	n/a	11,130 (1.23 %)	22,071 (1.36 %)	n/a	42.15 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	31,856 (100.00 %)	2,958,239 (41.25 %)	788,242 (4.52 %)	6,056,268 (41.88 %)	0 (0 %)	532,149 (2.74 %)	36,143 (1.96 %)	23,949 (1.02 %)
247	hazel dormouse (primary hap 2023) GCA_963383645.1	n/a	n/a	18,620 (1.42 %)	22,403 (1.38 %)	n/a	41.73 (99.99 %)	1 (0.00 %)	1,805 (0.01 %)	214 (100.00 %)	6,063,911 (41.66 %)	1,593,657 (4.46 %)	12,229,281 (43.98 %)	8 (0.00 %)	1,313,148 (3.16 %)	71,058 (1.88 %)	45,398 (0.93 %)
248	hippopotamus (BS01 2019 Broad) GCA_004027065.1	n/a	n/a	24,267 (1.55 %)	34,820 (1.30 %)	n/a	41.43 (99.91 %)	4,730 (0.02 %)	4,730 (0.02 %)	972,599 (99.98 %)	4,579,311 (41.26 %)	606,731 (1.02 %)	14,514,493 (36.58 %)	17 (0.00 %)	n/a	54,753 (1.59 %)	52,362 (1.50 %)
249	hippopotamus (HIP001 2018) GCA_002995585.1	n/a	n/a	22,343 (1.70 %)	31,687 (1.45 %)	n/a	40.96 (94.63 %)	153,125 (5.38 %)	153,125 (5.38 %)	281,897 (94.62 %)	3,952,905 (38.55 %)	476,243 (1.97 %)	14,216,817 (27.43 %)	6,026 (0.29 %)	n/a	48,380 (1.43 %)	46,263 (1.31 %)
250	hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023) GCA_030028035.1	n/a	n/a	20,391 (1.63 %)	20,668 (1.37 %)	n/a	41.62 (100.00 %)	0 (0 %)	83 (0.00 %)	545 (100.00 %)	3,778,764 (35.17 %)	563,345 (3.63 %)	13,524,869 (35.56 %)	0 (0 %)	369,754 (1.46 %)	48,164 (1.90 %)	44,065 (1.33 %)
251	hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq) GCF_030028045.1	64,153 (2.73 %)	n/a	20,331 (1.62 %)	20,633 (1.37 %)	n/a	41.60 (100.00 %)	0 (0 %)	226 (0.00 %)	357 (100.00 %)	3,783,440 (35.17 %)	567,797 (3.38 %)	13,462,531 (35.48 %)	2 (0.00 %)	396,368 (1.55 %)	48,365 (1.91 %)	44,048 (1.34 %)
252	hirola (BS46 2019 Broad) GCA_004027495.1	n/a	n/a	22,264 (1.40 %)	36,984 (1.26 %)	n/a	42.31 (99.93 %)	9,287 (0.03 %)	9,287 (0.03 %)	545,176 (99.97 %)	5,809,405 (48.62 %)	465,001 (1.08 %)	13,326,245 (42.35 %)	43 (0.00 %)	n/a	48,312 (1.15 %)	38,948 (0.98 %)
253	Hispaniolan solenodon GCA_004363575.1	n/a	n/a	18,805 (1.55 %)	27,454 (1.64 %)	n/a	39.98 (99.96 %)	5,186 (0.02 %)	5,186 (0.02 %)	181,804 (99.98 %)	2,669,787 (26.78 %)	431,610 (1.04 %)	13,429,711 (27.35 %)	24 (0.00 %)	86,983 (0.25 %)	53,444 (2.30 %)	52,300 (2.09 %)
254	hispid cotton rat GCA_004025045.1	n/a	n/a	25,324 (1.49 %)	31,681 (1.31 %)	39,953 (1.43 %)	39.77 (99.89 %)	13,744 (0.05 %)	13,744 (0.05 %)	897,290 (99.95 %)	4,384,099 (28.17 %)	1,132,313 (3.34 %)	14,729,737 (38.08 %)	28 (0.00 %)	n/a	17,558 (0.40 %)	15,148 (0.33 %)
255	Hoffmann's two-fingered sloth GCA_000164785.2	n/a	n/a	24,546 (1.30 %)	30,273 (1.15 %)	n/a	39.80 (98.09 %)	100,957 (1.91 %)	101,085 (1.91 %)	370,035 (98.09 %)	5,145,551 (52.20 %)	614,819 (1.62 %)	17,932,269 (39.26 %)	280 (0.01 %)	469,834 (1.28 %)	55,943 (1.04 %)	45,466 (0.86 %)
256	hog-nosed bat GCA_004027555.1	n/a	n/a	20,591 (1.30 %)	39,589 (1.39 %)	n/a	40.99 (99.88 %)	6,224 (0.03 %)	6,224 (0.03 %)	1,230,480 (99.97 %)	4,081,924 (31.12 %)	1,008,077 (2.20 %)	12,068,828 (39.98 %)	17 (0.00 %)	n/a	55,567 (2.02 %)	43,665 (1.48 %)
257	Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020) GCF_014824575.3	49,071 (2.78 %)	n/a	17,588 (1.64 %)	19,357 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	0 (0 %)	38,648 (0.21 %)	25,848 (100.00 %)	2,708,400 (27.89 %)	366,870 (1.48 %)	11,795,308 (31.27 %)	99 (0.00 %)	330,126 (1.83 %)	59,066 (1.72 %)	48,113 (1.34 %)
258	horse (maternal 2024) GCA_036418255.1	n/a	n/a	16,789 (1.65 %)	18,017 (1.36 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	0 (0 %)	210 (0.00 %)	821 (100.00 %)	3,146,381 (34.68 %)	430,664 (5.91 %)	13,246,059 (32.62 %)	0 (0 %)	714,785 (2.15 %)	37,293 (2.80 %)	35,249 (2.66 %)
259	horse (paternal 2024) GCA_036426135.1	n/a	n/a	19,073 (1.67 %)	20,636 (1.38 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	0 (0 %)	114 (0.00 %)	602 (100.00 %)	3,521,953 (35.39 %)	461,571 (5.26 %)	14,833,688 (32.77 %)	2 (0.00 %)	728,239 (2.01 %)	43,527 (2.54 %)	41,129 (2.38 %)
260	horse (Twilight 2018) GCF_002863925.1	76,567 (4.06 %)	n/a	18,997 (1.73 %)	20,914 (1.42 %)	113,346 (6.08 %)	41.50 (99.62 %)	0 (0 %)	6,294 (0.38 %)	4,701 (100.00 %)	4,080,319 (44.85 %)	395,037 (1.44 %)	15,169,517 (29.93 %)	41 (0.00 %)	354,039 (1.05 %)	44,825 (1.77 %)	37,394 (1.12 %)
261	house mouse (129S1_SvImJv1 2016) GCA_001624185.1	n/a	n/a	21,289 (2.22 %)	18,626 (1.42 %)	102,148 (4.16 %)	41.77 (85.00 %)	54,773 (4.85 %)	366,945 (15.05 %)	62,882 (95.15 %)	5,075,137 (40.38 %)	1,400,072 (2.80 %)	13,497,076 (26.20 %)	20,479 (1.14 %)	431,052 (1.88 %)	16,957 (0.40 %)	16,083 (0.37 %)
262	house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022) GCA_921998555.2	n/a	n/a	21,780 (2.13 %)	19,436 (1.37 %)	110,376 (4.47 %)	41.79 (99.60 %)	8 (0.00 %)	1,557 (0.40 %)	188 (100.00 %)	4,653,663 (40.74 %)	1,550,342 (3.54 %)	12,930,784 (35.48 %)	22 (0.00 %)	820,282 (2.63 %)	23,211 (0.57 %)	15,822 (0.42 %)
263	house mouse (AKR_J v3 2022) GCA_922000895.2	n/a	n/a	21,721 (2.13 %)	19,324 (1.37 %)	110,654 (4.48 %)	41.80 (99.85 %)	6 (0.00 %)	2,714 (0.15 %)	201 (100.00 %)	4,645,513 (40.70 %)	1,547,237 (3.56 %)	13,016,932 (35.69 %)	31 (0.00 %)	816,257 (2.70 %)	23,309 (0.57 %)	15,840 (0.42 %)
264	house mouse (alternate hap 2023) GCA_949316305.1	n/a	n/a	661 (0.88 %)	720 (0.54 %)	n/a	38.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,806 (100.00 %)	97,279 (72.21 %)	40,071 (55.89 %)	208,928 (64.94 %)	0 (0 %)	239,612 (15.41 %)	506 (0.31 %)	327 (0.20 %)
265	house mouse (A_J v3 2022) GCA_921998355.2	n/a	n/a	21,869 (2.13 %)	19,400 (1.37 %)	110,389 (4.48 %)	41.80 (99.39 %)	5 (0.00 %)	608 (0.61 %)	163 (100.00 %)	4,668,553 (40.80 %)	1,556,835 (3.58 %)	12,995,938 (35.53 %)	4 (0.00 %)	832,187 (2.55 %)	23,203 (0.56 %)	15,809 (0.42 %)
266	house mouse (BALB_cJ v3 2022) GCA_921997145.2	n/a	n/a	21,891 (2.13 %)	19,499 (1.37 %)	110,461 (4.47 %)	41.79 (99.80 %)	7 (0.00 %)	274 (0.20 %)	217 (100.00 %)	4,673,990 (40.79 %)	1,560,327 (3.63 %)	13,018,071 (35.70 %)	1 (0.00 %)	836,824 (2.52 %)	23,196 (0.56 %)	15,865 (0.42 %)
267	house mouse (C3H_HeJ v3 2022) GCA_921997125.2	n/a	n/a	21,793 (2.13 %)	19,516 (1.38 %)	110,049 (4.46 %)	41.79 (99.05 %)	3 (0.00 %)	844 (0.95 %)	174 (100.00 %)	4,657,005 (40.76 %)	1,551,107 (3.53 %)	12,949,100 (35.32 %)	12 (0.00 %)	825,975 (2.56 %)	23,262 (0.56 %)	15,821 (0.42 %)
268	house mouse (C57BL_6J T2T 2024) GCA_964188535.1	n/a	n/a	21,496 (1.92 %)	19,278 (1.25 %)	n/a	41.31 (99.85 %)	108 (0.15 %)	108 (0.15 %)	345 (99.85 %)	4,519,975 (46.81 %)	1,564,206 (14.33 %)	12,267,542 (42.16 %)	0 (0 %)	1,961,197 (5.36 %)	23,119 (0.55 %)	15,974 (0.40 %)
269	house mouse (CBA_J v3 2022) GCA_921998905.2	n/a	n/a	21,829 (2.13 %)	19,841 (1.39 %)	110,858 (4.48 %)	41.79 (99.52 %)	2 (0.00 %)	658 (0.48 %)	145 (100.00 %)	4,658,032 (40.77 %)	1,552,298 (3.59 %)	12,948,038 (35.52 %)	2 (0.00 %)	829,314 (2.57 %)	23,232 (0.56 %)	15,810 (0.42 %)
270	house mouse (DBA_2J v3 2022) GCA_921998315.2	n/a	n/a	22,302 (2.08 %)	19,749 (1.35 %)	113,269 (4.42 %)	41.72 (100.00 %)	9 (0.00 %)	153 (0.00 %)	361 (100.00 %)	4,785,676 (41.69 %)	1,597,598 (4.56 %)	13,190,158 (36.58 %)	0 (0 %)	968,205 (2.82 %)	24,140 (0.59 %)	16,383 (0.43 %)
271	house mouse (FVB_NJ v3 2022) GCA_921998635.2	n/a	n/a	21,633 (2.15 %)	19,565 (1.40 %)	110,246 (4.50 %)	41.82 (98.35 %)	8 (0.00 %)	6,244 (1.65 %)	384 (100.00 %)	4,621,601 (40.42 %)	1,537,622 (3.48 %)	12,818,729 (34.77 %)	54 (0.00 %)	781,344 (2.48 %)	22,696 (0.55 %)	15,795 (0.42 %)
272	house mouse (LP_J v3 2022) GCA_947599735.1	n/a	n/a	22,452 (1.91 %)	19,841 (1.23 %)	110,073 (3.98 %)	41.29 (99.99 %)	87 (0.00 %)	386 (0.01 %)	515 (100.00 %)	4,839,574 (46.33 %)	1,645,163 (11.88 %)	12,936,515 (41.49 %)	63 (0.00 %)	1,839,684 (4.85 %)	24,374 (0.54 %)	16,515 (0.39 %)
273	house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022) GCA_921998325.2	n/a	n/a	21,797 (2.13 %)	19,521 (1.38 %)	109,890 (4.48 %)	41.80 (99.50 %)	2 (0.00 %)	1,462 (0.50 %)	170 (100.00 %)	4,650,016 (40.74 %)	1,547,220 (3.54 %)	12,918,125 (35.45 %)	24 (0.00 %)	826,087 (2.65 %)	23,253 (0.56 %)	15,815 (0.42 %)
274	house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022) GCA_947593165.1	n/a	n/a	22,481 (1.93 %)	19,932 (1.26 %)	109,670 (4.03 %)	41.34 (100.00 %)	58 (0.00 %)	234 (0.00 %)	441 (100.00 %)	4,822,230 (45.92 %)	1,637,027 (11.19 %)	13,082,730 (41.04 %)	19 (0.00 %)	1,756,117 (4.67 %)	24,187 (0.54 %)	16,389 (0.39 %)
275	house mouse (primary hap 2023) GCA_949316315.1	n/a	n/a	22,351 (1.96 %)	19,629 (1.26 %)	n/a	41.38 (100.00 %)	0 (0 %)	101 (0.00 %)	179 (100.00 %)	4,774,018 (45.31 %)	1,620,102 (10.50 %)	13,181,250 (40.47 %)	0 (0 %)	1,650,132 (4.47 %)	23,955 (0.54 %)	16,164 (0.39 %)
276	house mouse C57BL/6J 2020 GRC GCF_000001635.27	130,343 (4.85 %)	n/a	22,409 (2.02 %)	19,480 (1.31 %)	140,725 (4.83 %)	41.67 (97.30 %)	324 (2.70 %)	334 (2.70 %)	22,273 (97.30 %)	5,361,085 (45.51 %)	1,641,063 (3.41 %)	12,722,791 (36.04 %)	1 (0.00 %)	858,983 (2.44 %)	23,794 (0.53 %)	15,980 (0.39 %)
277	house mouse C57BL_6NJ (2016) GCA_001632555.1	n/a	n/a	21,177 (2.23 %)	18,495 (1.42 %)	103,002 (4.20 %)	41.76 (82.53 %)	45,300 (3.63 %)	410,660 (17.53 %)	49,821 (96.37 %)	5,081,049 (40.22 %)	1,392,942 (2.58 %)	13,476,268 (25.21 %)	24,698 (0.96 %)	429,021 (1.56 %)	16,877 (0.39 %)	16,035 (0.36 %)
278	house mouse C57BL_6NJ (2022) GCA_921999865.2	n/a	n/a	21,817 (2.13 %)	19,349 (1.37 %)	n/a	41.79 (99.76 %)	7 (0.00 %)	1,127 (0.24 %)	214 (100.00 %)	4,661,104 (40.76 %)	1,552,079 (3.56 %)	12,953,662 (35.57 %)	8 (0.00 %)	825,187 (2.60 %)	23,204 (0.56 %)	15,812 (0.42 %)
279	hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018) GCA_003369685.2	n/a	n/a	19,096 (1.59 %)	20,674 (1.34 %)	n/a	41.99 (99.75 %)	0 (0 %)	277 (0.25 %)	1,435 (100.00 %)	5,290,422 (47.51 %)	478,946 (1.94 %)	12,568,313 (41.15 %)	0 (0 %)	1,196,258 (3.44 %)	45,850 (1.37 %)	36,573 (1.00 %)
280	hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018) GCF_003369695.1	63,234 (2.88 %)	n/a	19,601 (1.57 %)	21,699 (1.34 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	0 (0 %)	302 (0.06 %)	1,250 (100.00 %)	5,524,454 (47.57 %)	459,928 (1.40 %)	13,208,799 (41.21 %)	0 (0 %)	1,222,662 (3.37 %)	41,359 (1.10 %)	37,367 (0.98 %)
281	Iberian mole (v2.1 TD23 2020) GCF_014898055.3	56,973 (3.41 %)	n/a	18,431 (1.69 %)	20,317 (1.59 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	0 (0 %)	3,575 (0.11 %)	3,202 (100.00 %)	2,635,974 (23.38 %)	496,514 (1.29 %)	10,969,546 (32.61 %)	2 (0.00 %)	637,831 (2.54 %)	47,466 (2.89 %)	43,066 (2.46 %)
282	Indian false vampire GCA_004026885.1	n/a	n/a	20,067 (1.37 %)	36,544 (1.53 %)	32,548 (1.37 %)	40.84 (99.83 %)	6,266 (0.02 %)	6,266 (0.02 %)	1,909,067 (99.98 %)	4,096,409 (31.50 %)	699,311 (1.81 %)	12,307,198 (39.96 %)	15 (0.00 %)	n/a	92,830 (3.12 %)	82,461 (2.65 %)
283	Indian flying fox GCF_902729225.1	64,763 (3.85 %)	n/a	18,222 (2.01 %)	23,187 (1.82 %)	45,389 (2.18 %)	39.83 (99.10 %)	0 (0 %)	17,500 (0.90 %)	16,113 (100.00 %)	2,972,300 (34.11 %)	487,157 (1.49 %)	12,486,528 (27.37 %)	384 (0.01 %)	202,174 (1.56 %)	57,869 (3.73 %)	61,442 (3.09 %)
284	Indochinese shrew (US011 2019 Broad) GCA_004027635.1	n/a	n/a	18,870 (0.51 %)	55,636 (0.81 %)	n/a	39.81 (99.83 %)	5,267 (0.02 %)	5,267 (0.02 %)	2,420,679 (99.98 %)	4,130,068 (16.60 %)	1,663,335 (3.30 %)	18,728,711 (46.19 %)	45 (0.00 %)	n/a	31,453 (0.55 %)	25,923 (0.42 %)
285	Indus River dolphin GCA_004363435.1	n/a	n/a	24,321 (1.30 %)	47,065 (1.14 %)	n/a	41.72 (99.88 %)	11,702 (0.04 %)	11,702 (0.04 %)	1,110,492 (99.96 %)	5,093,308 (45.60 %)	845,860 (1.72 %)	13,162,111 (41.37 %)	34 (0.00 %)	n/a	68,257 (1.40 %)	49,070 (1.11 %)
286	intermediate roundleaf bat (primary hap 2023) GCA_031876335.1	n/a	n/a	19,064 (1.67 %)	20,800 (1.49 %)	n/a	41.55 (100.00 %)	0 (0 %)	119 (0.00 %)	69 (100.00 %)	3,393,548 (30.92 %)	723,545 (6.58 %)	12,073,117 (35.40 %)	0 (0 %)	1,106,960 (3.54 %)	43,736 (1.20 %)	30,847 (0.87 %)
287	jaguar (BS21 2019) GCA_004023805.1	n/a	n/a	21,431 (1.51 %)	32,835 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.89 %)	21,329 (0.09 %)	21,329 (0.09 %)	460,121 (99.91 %)	5,420,861 (43.75 %)	1,049,353 (1.93 %)	13,848,545 (34.90 %)	43 (0.00 %)	425,795 (0.77 %)	71,066 (2.37 %)	62,901 (1.89 %)
288	jaguar (Sample0147 2023) GCF_028533385.1	71,565 (4.12 %)	n/a	19,122 (1.67 %)	21,950 (1.36 %)	n/a	41.58 (99.31 %)	0 (0 %)	56,371 (0.70 %)	36,243 (100.00 %)	4,552,854 (33.37 %)	897,371 (1.63 %)	13,732,912 (32.89 %)	2,743 (0.10 %)	314,574 (0.82 %)	63,777 (2.41 %)	60,478 (2.01 %)
289	jaguarundi GCF_014898765.1	72,564 (3.15 %)	n/a	18,602 (1.64 %)	20,510 (1.39 %)	n/a	41.75 (97.85 %)	0 (0 %)	42,499 (2.16 %)	10,948 (100.00 %)	5,035,745 (43.29 %)	907,329 (1.61 %)	13,590,905 (33.57 %)	2,609 (0.04 %)	574,230 (1.55 %)	69,090 (2.29 %)	60,356 (1.80 %)
290	Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U) GCF_014825515.1	48,705 (2.72 %)	n/a	19,921 (1.66 %)	23,614 (1.68 %)	39,384 (2.12 %)	41.95 (98.87 %)	0 (0 %)	110,840 (1.13 %)	56,740 (100.00 %)	2,972,388 (28.79 %)	405,474 (2.15 %)	12,458,880 (30.65 %)	8,380 (0.26 %)	388,646 (3.79 %)	61,973 (1.87 %)	54,441 (1.58 %)
291	Jamaican fruit-eating bat (2021) GCF_021234435.1	55,114 (3.18 %)	n/a	17,875 (1.68 %)	19,958 (1.66 %)	n/a	42.00 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	868 (100.00 %)	2,697,287 (28.17 %)	318,700 (0.84 %)	11,750,329 (31.61 %)	0 (0 %)	245,042 (0.98 %)	61,951 (1.93 %)	52,462 (1.61 %)
292	Japanese wild mouse (2022) GCA_921999095.2	n/a	n/a	23,292 (2.05 %)	20,114 (1.31 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	51 (0.00 %)	397 (0.00 %)	1,449 (100.00 %)	4,952,306 (42.53 %)	1,635,456 (4.60 %)	12,838,321 (38.56 %)	8 (0.00 %)	1,050,247 (2.88 %)	24,168 (0.56 %)	16,545 (0.42 %)
293	Java mouse-deer (US108 2019 Broad) GCA_004024965.1	n/a	n/a	23,081 (1.38 %)	38,181 (1.41 %)	n/a	42.73 (99.91 %)	2,829 (0.01 %)	2,829 (0.01 %)	1,159,819 (99.99 %)	4,791,310 (34.97 %)	448,498 (1.92 %)	13,175,375 (39.89 %)	11 (0.00 %)	n/a	68,778 (2.92 %)	61,444 (2.39 %)
294	killer whale (2022) GCF_937001465.1	78,470 (3.76 %)	n/a	18,710 (1.51 %)	21,101 (1.30 %)	34,448 (1.49 %)	41.91 (100.00 %)	0 (0 %)	123 (0.00 %)	448 (100.00 %)	3,955,401 (36.81 %)	844,672 (9.94 %)	12,233,568 (41.63 %)	2 (0.00 %)	1,982,992 (5.71 %)	77,307 (3.08 %)	40,935 (1.02 %)
295	killer whale (alternate hap 2022) GCA_937001455.1	n/a	n/a	14,982 (1.50 %)	19,185 (1.30 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12,410 (100.00 %)	2,752,892 (35.61 %)	589,217 (10.15 %)	8,371,032 (41.11 %)	0 (0 %)	1,464,220 (5.92 %)	57,347 (3.41 %)	30,003 (1.05 %)
296	killer whale (Morgan 2013) GCF_000331955.2	70,972 (3.55 %)	n/a	18,736 (1.86 %)	20,365 (1.48 %)	n/a	41.35 (94.82 %)	78,432 (5.20 %)	78,441 (5.20 %)	80,100 (94.80 %)	3,978,339 (43.98 %)	555,737 (1.13 %)	12,773,973 (31.51 %)	2,677 (0.03 %)	355,274 (1.15 %)	61,145 (1.59 %)	40,101 (1.20 %)
297	koala (Bilbo 61053 2022) GCA_003287225.2	n/a	n/a	17,087 (0.81 %)	14,711 (0.86 %)	n/a	39.05 (100.00 %)	0 (0 %)	669 (0.00 %)	1,246 (100.00 %)	6,280,029 (29.77 %)	1,123,294 (2.02 %)	21,796,316 (39.24 %)	2 (0.00 %)	412,593 (0.92 %)	15,957 (0.35 %)	13,996 (0.24 %)
298	Kuhl's pipistrelle (2020) GCF_014108245.1	63,293 (2.96 %)	n/a	17,918 (1.89 %)	20,819 (1.86 %)	n/a	42.57 (99.31 %)	0 (0 %)	394 (0.69 %)	202 (100.00 %)	2,897,422 (23.58 %)	797,420 (2.76 %)	10,057,100 (34.56 %)	2 (0.00 %)	425,636 (1.52 %)	55,965 (2.99 %)	57,667 (2.01 %)
299	large flying fox GCF_000151845.1	52,243 (3.10 %)	n/a	18,454 (1.91 %)	23,631 (1.73 %)	n/a	39.82 (91.80 %)	189,339 (8.24 %)	189,340 (8.24 %)	225,433 (91.76 %)	3,117,045 (36.49 %)	504,277 (3.03 %)	13,025,556 (25.00 %)	22,188 (0.92 %)	358,468 (6.48 %)	78,404 (3.24 %)	74,747 (2.62 %)
300	large Japanese field mouse (IB14-021 2017) GCA_002335545.1	n/a	n/a	22,630 (1.74 %)	33,810 (1.26 %)	n/a	42.04 (57.78 %)	4,289,924 (42.35 %)	4,289,924 (42.35 %)	4,626,044 (57.65 %)	3,638,537 (31.76 %)	1,048,253 (1.87 %)	12,039,926 (16.61 %)	10,107 (0.44 %)	n/a	19,817 (0.34 %)	18,415 (0.32 %)
301	large tree shrew (BS70 2022) GCA_026018925.1	n/a	n/a	21,678 (1.34 %)	22,317 (1.25 %)	n/a	42.17 (100.00 %)	0 (0 %)	1,188 (0.00 %)	1,198 (100.00 %)	5,530,547 (22.20 %)	1,357,640 (10.13 %)	14,334,312 (46.09 %)	5 (0.00 %)	2,400,830 (5.08 %)	123,453 (2.17 %)	59,337 (1.38 %)
302	leopard (Hobbes primary hap 2022) GCF_024362965.1	70,488 (3.29 %)	n/a	18,472 (1.56 %)	20,388 (1.41 %)	n/a	41.75 (99.99 %)	0 (0 %)	335 (0.01 %)	382 (100.00 %)	4,634,038 (33.80 %)	932,991 (2.25 %)	13,686,652 (34.03 %)	1 (0.00 %)	451,937 (1.32 %)	65,793 (2.64 %)	60,846 (1.89 %)
303	leopard (Maewha 2016 refseq) GCF_001857705.1	73,266 (3.20 %)	n/a	18,881 (1.63 %)	21,010 (1.44 %)	n/a	41.71 (96.17 %)	214,953 (3.85 %)	214,953 (3.85 %)	265,330 (96.15 %)	5,247,029 (42.87 %)	1,059,446 (5.13 %)	14,265,573 (32.20 %)	28,667 (1.17 %)	525,712 (5.63 %)	77,001 (2.45 %)	66,922 (1.91 %)
304	leopard cat GCF_016509475.1	59,965 (3.05 %)	n/a	18,472 (1.65 %)	19,934 (1.38 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	39 (0.00 %)	56 (0.00 %)	123 (100.00 %)	4,978,115 (43.28 %)	901,754 (1.84 %)	13,596,535 (34.23 %)	0 (0 %)	586,248 (1.62 %)	67,390 (2.50 %)	62,344 (2.02 %)
305	lesser Egyptian jerboa (2021) GCF_020740685.1	51,730 (1.99 %)	n/a	20,129 (1.24 %)	22,089 (1.24 %)	40,414 (1.76 %)	42.00 (99.52 %)	0 (0 %)	561 (0.48 %)	160 (100.00 %)	7,346,291 (41.25 %)	1,187,587 (2.92 %)	14,222,177 (44.13 %)	1 (0.00 %)	1,219,048 (2.53 %)	34,688 (0.86 %)	25,175 (0.54 %)
306	lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021) GCA_020740715.1	n/a	n/a	17,777 (1.27 %)	19,232 (1.28 %)	n/a	42.13 (92.75 %)	0 (0 %)	2,875 (7.25 %)	508 (100.00 %)	6,476,967 (33.93 %)	999,133 (2.78 %)	11,809,834 (40.52 %)	1 (0.00 %)	1,062,479 (2.36 %)	29,872 (0.82 %)	21,704 (0.51 %)
307	lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq) GCF_000280705.1	25,991 (1.44 %)	n/a	19,408 (1.38 %)	20,312 (1.35 %)	n/a	41.87 (87.17 %)	326,464 (12.87 %)	326,464 (12.87 %)	337,360 (87.13 %)	6,125,934 (38.31 %)	832,825 (1.53 %)	13,661,612 (33.98 %)	2,666 (0.03 %)	430,190 (1.14 %)	26,669 (0.59 %)	23,227 (0.47 %)
308	lesser panda GCA_002007465.1	n/a	n/a	19,120 (1.69 %)	20,591 (1.50 %)	n/a	41.60 (98.56 %)	137,333 (1.45 %)	137,333 (1.45 %)	148,922 (98.55 %)	4,513,888 (40.87 %)	692,778 (1.62 %)	13,691,859 (31.36 %)	3,438 (0.05 %)	680,690 (2.32 %)	64,369 (2.52 %)	63,356 (2.19 %)
309	lesser sac-winged bat (mSacLep1 primary hap 2024) GCA_036850995.1	n/a	n/a	18,322 (1.42 %)	21,350 (1.39 %)	n/a	41.84 (99.24 %)	178 (0.49 %)	573 (0.76 %)	345 (99.51 %)	4,224,340 (28.69 %)	1,030,574 (2.60 %)	12,591,928 (42.30 %)	1 (0.00 %)	1,128,543 (2.95 %)	98,189 (2.06 %)	48,427 (1.15 %)
310	lion GCF_018350215.1	67,745 (2.86 %)	n/a	17,956 (1.69 %)	19,033 (1.40 %)	61,242 (3.04 %)	41.71 (100.00 %)	45 (0.00 %)	55 (0.00 %)	99 (100.00 %)	4,666,951 (42.23 %)	889,987 (1.87 %)	13,151,686 (33.40 %)	1 (0.00 %)	394,792 (1.11 %)	62,675 (2.56 %)	59,062 (2.11 %)
311	little brown bat GCF_000147115.1	50,660 (2.76 %)	n/a	19,314 (1.86 %)	22,683 (1.70 %)	n/a	42.50 (96.66 %)	61,131 (3.35 %)	61,131 (3.35 %)	72,785 (96.65 %)	3,682,263 (37.05 %)	634,854 (2.15 %)	10,841,759 (33.45 %)	7 (0.00 %)	404,463 (1.53 %)	57,630 (1.79 %)	51,011 (1.50 %)
312	little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022) GCA_024363435.1	n/a	n/a	19,150 (1.52 %)	23,435 (1.64 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	0 (0 %)	229 (0.00 %)	718 (100.00 %)	n/a	1,051,300 (12.43 %)	9,858,628 (43.20 %)	3 (0.00 %)	1,828,018 (5.83 %)	48,101 (2.62 %)	48,908 (1.62 %)
313	little pocket mouse (longimembris primary hap 2022) GCA_024363575.1	n/a	n/a	19,760 (1.50 %)	24,317 (1.63 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	0 (0 %)	215 (0.00 %)	1,135 (100.00 %)	3,913,744 (28.43 %)	1,095,577 (12.70 %)	10,273,833 (43.74 %)	2 (0.00 %)	1,919,880 (5.85 %)	49,636 (2.61 %)	49,755 (1.59 %)
314	little tube-nosed bat GCA_004026665.1	n/a	n/a	22,009 (1.26 %)	45,725 (1.35 %)	n/a	43.80 (99.90 %)	6,795 (0.03 %)	6,795 (0.03 %)	886,972 (99.97 %)	3,372,804 (23.57 %)	1,014,476 (3.00 %)	11,948,592 (41.18 %)	29 (0.00 %)	n/a	71,530 (2.05 %)	53,483 (1.43 %)
315	long-finned pilot whale (primary hap 2023) GCF_963455315.1	61,797 (2.84 %)	n/a	18,712 (1.51 %)	20,920 (1.39 %)	n/a	42.38 (99.99 %)	0 (0 %)	1,084 (0.01 %)	993 (100.00 %)	4,125,420 (35.62 %)	1,577,899 (12.03 %)	12,347,226 (42.01 %)	10 (0.00 %)	1,284,155 (3.89 %)	71,821 (5.51 %)	41,663 (1.04 %)
316	long-finned pilot whale (X-22926-18 2019) GCF_006547405.1	66,104 (3.28 %)	n/a	18,772 (1.80 %)	21,031 (1.46 %)	33,672 (1.78 %)	41.29 (99.58 %)	14,583 (0.42 %)	14,859 (0.42 %)	20,999 (99.58 %)	3,962,125 (45.58 %)	557,247 (1.11 %)	12,616,535 (34.70 %)	643 (0.01 %)	404,788 (1.24 %)	62,905 (1.69 %)	41,085 (1.25 %)
317	long-tailed chinchilla GCF_000276665.1	54,841 (2.98 %)	n/a	18,096 (1.59 %)	19,514 (1.52 %)	n/a	41.06 (95.56 %)	78,817 (4.46 %)	78,817 (4.46 %)	81,656 (95.54 %)	4,018,866 (30.94 %)	607,082 (1.15 %)	13,528,234 (28.15 %)	1,183 (0.02 %)	162,447 (0.63 %)	46,931 (1.25 %)	45,334 (1.13 %)
318	long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad) GCA_004027375.1	n/a	n/a	19,208 (1.99 %)	31,180 (1.92 %)	n/a	39.56 (99.97 %)	2,056 (0.01 %)	2,056 (0.01 %)	174,041 (99.99 %)	2,893,453 (32.61 %)	597,516 (1.76 %)	12,093,608 (28.14 %)	6 (0.00 %)	n/a	63,015 (4.70 %)	62,530 (4.18 %)
319	Lowland paca GCA_004365215.1	n/a	n/a	21,953 (0.62 %)	56,356 (0.80 %)	n/a	40.83 (99.78 %)	3,060 (0.01 %)	3,060 (0.01 %)	3,771,510 (99.99 %)	5,892,507 (29.20 %)	802,811 (1.38 %)	18,630,883 (38.61 %)	101 (0.00 %)	n/a	61,715 (0.94 %)	53,212 (0.77 %)
320	Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq) GCF_001685135.1	48,591 (2.76 %)	n/a	19,458 (1.57 %)	24,783 (1.38 %)	41,272 (1.95 %)	40.78 (92.27 %)	0 (0 %)	984,658 (7.81 %)	80,670 (100.00 %)	3,064,599 (35.21 %)	866,309 (3.08 %)	13,310,859 (28.76 %)	389,500 (1.56 %)	884,203 (3.10 %)	35,558 (0.84 %)	33,754 (0.78 %)
321	Malayan pangolin YNU ManJav 2.0 GCF_014570535.1	68,043 (3.50 %)	n/a	18,167 (1.72 %)	20,453 (1.54 %)	n/a	40.83 (91.78 %)	0 (0 %)	57,746 (8.23 %)	17,969 (100.00 %)	2,864,567 (34.23 %)	277,996 (1.69 %)	12,659,207 (25.72 %)	610 (0.01 %)	258,572 (5.38 %)	33,486 (1.00 %)	32,201 (0.94 %)
322	Masai giraffe (MA1 2016 Penn St) GCA_001651235.1	n/a	n/a	20,950 (1.52 %)	28,854 (1.33 %)	n/a	41.39 (96.50 %)	257,672 (3.48 %)	257,672 (3.48 %)	770,838 (96.52 %)	5,502,479 (43.94 %)	531,418 (2.64 %)	13,936,018 (36.18 %)	31,941 (0.52 %)	748,633 (4.02 %)	40,504 (1.02 %)	38,345 (0.94 %)
323	meadow jumping mouse GCA_004024765.1	n/a	n/a	22,236 (1.08 %)	44,719 (1.21 %)	n/a	42.31 (99.88 %)	7,610 (0.03 %)	7,610 (0.03 %)	1,165,710 (99.97 %)	6,135,446 (33.31 %)	1,525,146 (3.34 %)	13,854,475 (39.91 %)	38 (0.00 %)	n/a	26,633 (0.68 %)	21,059 (0.49 %)
324	meadow vole (hap1 2024) GCA_037038515.1	n/a	n/a	19,134 (1.78 %)	20,672 (1.55 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	0 (0 %)	60 (0.00 %)	181 (100.00 %)	4,818,689 (41.90 %)	962,362 (4.16 %)	12,161,222 (34.42 %)	0 (0 %)	1,559,409 (4.65 %)	23,781 (0.74 %)	19,793 (0.55 %)
325	meadow vole (hap2 2024) GCA_037039175.1	n/a	n/a	19,001 (1.82 %)	20,271 (1.68 %)	n/a	42.58 (100.00 %)	0 (0 %)	53 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,141,368 (21.37 %)	898,900 (4.24 %)	11,475,531 (32.14 %)	0 (0 %)	862,918 (2.64 %)	22,186 (0.75 %)	16,985 (0.48 %)
326	meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq) GCF_006229205.1	58,806 (2.67 %)	n/a	19,009 (1.64 %)	19,088 (1.36 %)	n/a	41.68 (99.72 %)	0 (0 %)	65,245 (0.28 %)	63,791 (100.00 %)	4,564,931 (40.13 %)	634,179 (1.21 %)	13,631,635 (32.17 %)	5,134 (0.09 %)	236,044 (0.75 %)	64,858 (2.22 %)	63,010 (1.87 %)
327	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022) GCA_024711525.1	n/a	n/a	18,555 (1.22 %)	24,508 (1.35 %)	n/a	42.04 (100.00 %)	0 (0 %)	181 (0.00 %)	3,482 (100.00 %)	6,419,007 (53.84 %)	1,384,128 (15.63 %)	11,486,822 (50.51 %)	2 (0.00 %)	4,107,493 (7.03 %)	38,521 (1.60 %)	33,680 (1.03 %)
328	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022) GCA_024711535.1	n/a	n/a	21,281 (1.16 %)	28,592 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	0 (0 %)	182 (0.00 %)	4,354 (100.00 %)	4,378,955 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,786 (51.96 %)	1 (0.00 %)	5,252,588 (7.78 %)	46,167 (1.71 %)	38,895 (0.74 %)
329	minke whale (2013 refseq) GCF_000493695.1	42,553 (2.38 %)	n/a	19,159 (1.73 %)	18,656 (1.42 %)	n/a	40.94 (94.06 %)	173,296 (5.96 %)	173,296 (5.96 %)	184,072 (94.04 %)	n/a	573,951 (1.48 %)	13,504,347 (30.96 %)	211 (0.02 %)	317,691 (1.50 %)	65,448 (1.38 %)	43,887 (1.02 %)
330	minke whale (alternate hap 2023) GCA_950005055.1	n/a	n/a	20,412 (1.46 %)	27,421 (1.34 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	21,272 (100.00 %)	3,811,435 (36.24 %)	959,712 (10.27 %)	12,159,896 (41.30 %)	0 (0 %)	1,298,777 (4.12 %)	69,852 (1.62 %)	42,454 (1.09 %)
331	minke whale (primary hap 2023 refseq) GCF_949987535.1	61,711 (2.51 %)	n/a	19,550 (1.49 %)	21,499 (1.26 %)	n/a	41.55 (99.99 %)	0 (0 %)	1,177 (0.01 %)	1,374 (100.00 %)	4,006,927 (35.92 %)	1,058,105 (12.08 %)	12,708,103 (42.66 %)	4 (0.00 %)	1,500,515 (4.32 %)	72,756 (1.59 %)	44,094 (1.06 %)
332	Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.) GCF_002204375.1	40,346 (2.29 %)	n/a	21,215 (1.83 %)	24,305 (1.47 %)	n/a	42.09 (95.23 %)	0 (0 %)	91,601 (4.78 %)	68,793 (100.00 %)	4,821,343 (37.74 %)	940,776 (1.82 %)	13,848,274 (31.31 %)	11,561 (0.34 %)	205,312 (0.64 %)	24,154 (0.74 %)	22,829 (0.67 %)
333	Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI) GCA_008131255.1	n/a	n/a	19,952 (1.59 %)	23,462 (1.36 %)	n/a	41.98 (99.01 %)	103,843 (0.97 %)	103,843 (0.97 %)	412,933 (99.03 %)	5,009,454 (0.00 %)	1,042,929 (2.52 %)	14,121,194 (34.63 %)	5,269 (0.12 %)	n/a	26,044 (0.71 %)	23,140 (0.56 %)
334	Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023) GCF_030254825.1	65,502 (2.97 %)	n/a	19,045 (1.53 %)	20,203 (1.29 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	0 (0 %)	53 (0.00 %)	193 (100.00 %)	4,477,607 (37.21 %)	1,124,432 (5.22 %)	13,244,320 (39.20 %)	0 (0 %)	1,187,344 (2.95 %)	25,300 (0.76 %)	21,781 (0.54 %)
335	monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021) GCA_019395325.1	n/a	n/a	16,419 (0.77 %)	17,219 (0.89 %)	n/a	39.03 (100.00 %)	33 (0.00 %)	33 (0.00 %)	9,959 (100.00 %)	6,332,360 (29.69 %)	1,065,454 (2.09 %)	17,908,986 (42.25 %)	0 (0 %)	1,232,672 (2.38 %)	13,856 (0.35 %)	11,596 (0.23 %)
336	monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 refseq) GCF_019393635.1	47,034 (2.02 %)	n/a	18,399 (0.80 %)	15,519 (0.85 %)	n/a	39.11 (99.91 %)	0 (0 %)	260 (0.09 %)	17 (100.00 %)	9,107,968 (41.08 %)	1,249,635 (2.12 %)	21,135,324 (42.80 %)	0 (0 %)	1,546,314 (2.55 %)	16,598 (0.36 %)	13,911 (0.23 %)
337	Montane guinea pig GCA_004027695.1	n/a	n/a	20,064 (1.06 %)	31,321 (1.18 %)	39,905 (1.42 %)	40.09 (99.88 %)	11,321 (0.04 %)	11,321 (0.04 %)	1,379,500 (99.96 %)	4,730,634 (30.02 %)	1,583,664 (6.57 %)	15,806,339 (40.40 %)	31 (0.00 %)	n/a	37,371 (0.76 %)	27,339 (0.57 %)
338	mountain beaver GCA_004027875.1	n/a	n/a	22,428 (1.10 %)	38,670 (1.12 %)	n/a	40.58 (99.89 %)	7,253 (0.02 %)	7,253 (0.02 %)	1,286,779 (99.98 %)	5,859,004 (32.29 %)	914,052 (2.37 %)	16,249,666 (38.21 %)	103 (0.00 %)	n/a	39,133 (0.76 %)	26,371 (0.54 %)
339	muskrat GCA_004026605.1	n/a	n/a	22,540 (1.52 %)	32,136 (1.35 %)	n/a	41.59 (99.93 %)	6,243 (0.02 %)	6,243 (0.02 %)	571,599 (99.98 %)	4,437,736 (28.49 %)	922,826 (2.38 %)	13,945,732 (35.23 %)	31 (0.00 %)	n/a	19,876 (0.50 %)	16,936 (0.41 %)
340	naked mole-rat (MEF-2018 2020) GCA_014060925.1	n/a	n/a	22,011 (1.30 %)	21,392 (1.22 %)	n/a	40.13 (95.11 %)	139,535 (4.91 %)	139,535 (4.91 %)	148,797 (95.09 %)	4,885,102 (35.91 %)	654,418 (1.90 %)	16,401,315 (34.21 %)	228 (0.03 %)	1,754,699 (7.39 %)	40,717 (0.98 %)	38,057 (0.81 %)
341	naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq) GCF_000247695.1	74,574 (3.56 %)	n/a	21,332 (1.74 %)	20,861 (1.51 %)	n/a	40.21 (88.43 %)	110,424 (11.59 %)	110,424 (11.59 %)	114,653 (88.41 %)	4,179,991 (32.69 %)	484,933 (0.92 %)	13,672,561 (27.63 %)	595 (0.01 %)	103,053 (0.44 %)	31,950 (0.88 %)	31,055 (0.81 %)
342	narwhal (Baffin Bay 2019) GCF_005190385.1	51,639 (2.71 %)	n/a	18,741 (1.78 %)	20,365 (1.40 %)	33,148 (1.79 %)	41.22 (99.52 %)	0 (0 %)	18,323 (0.49 %)	6,972 (100.00 %)	4,011,742 (43.97 %)	565,367 (1.22 %)	12,720,018 (34.85 %)	1,797 (0.02 %)	430,336 (1.30 %)	60,492 (1.58 %)	43,582 (1.25 %)
343	Natal long-fingered bat GCF_001595765.1	32,050 (3.03 %)	n/a	18,015 (2.17 %)	18,293 (1.87 %)	n/a	42.07 (96.24 %)	0 (0 %)	204,616 (3.79 %)	1,269 (100.00 %)	2,565,457 (28.95 %)	376,532 (1.91 %)	10,427,823 (26.35 %)	3,320 (0.15 %)	203,691 (1.83 %)	63,261 (2.07 %)	59,010 (1.80 %)
344	neotropical fruit bat GCF_014824575.2	49,109 (2.78 %)	n/a	17,703 (1.63 %)	19,389 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	0 (0 %)	38,675 (0.21 %)	26,068 (100.00 %)	2,862,405 (29.31 %)	366,960 (1.48 %)	11,796,203 (31.27 %)	105 (0.00 %)	330,211 (1.83 %)	59,091 (1.70 %)	48,137 (1.34 %)
345	Nilgiri tahr GCA_004026825.1	n/a	n/a	22,735 (1.44 %)	34,961 (1.27 %)	n/a	42.37 (99.93 %)	10,387 (0.04 %)	10,387 (0.04 %)	479,550 (99.96 %)	5,793,761 (48.50 %)	535,297 (1.34 %)	13,378,352 (42.46 %)	61 (0.00 %)	n/a	57,653 (1.29 %)	42,256 (1.01 %)
346	nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023) GCA_030445055.1	n/a	n/a	19,429 (1.06 %)	22,396 (1.07 %)	n/a	40.96 (99.27 %)	0 (0 %)	845 (0.73 %)	594 (100.00 %)	4,369,568 (32.83 %)	673,707 (1.55 %)	18,586,102 (42.41 %)	5 (0.00 %)	558,255 (1.38 %)	131,852 (2.78 %)	71,325 (1.75 %)
347	nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023) GCA_030445055.2	n/a	n/a	19,350 (1.07 %)	22,207 (1.07 %)	n/a	40.97 (99.27 %)	0 (0 %)	823 (0.73 %)	588 (100.00 %)	4,330,716 (32.85 %)	661,966 (1.52 %)	18,302,021 (42.22 %)	5 (0.00 %)	542,125 (1.36 %)	130,245 (2.79 %)	70,861 (1.76 %)
348	nine-banded armadillo (mDasNov1 hap2 2023) GCF_030445035.1	69,043 (2.70 %)	n/a	20,516 (1.05 %)	n/a	n/a	41.00 (99.68 %)	0 (0 %)	771 (0.32 %)	539 (100.00 %)	4,656,325 (32.86 %)	726,574 (1.99 %)	19,585,522 (43.65 %)	4 (0.00 %)	720,053 (1.59 %)	140,990 (2.86 %)	76,550 (1.81 %)
349	nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor) GCF_000208655.3	46,110 (1.87 %)	n/a	20,820 (1.08 %)	25,226 (1.08 %)	n/a	40.77 (90.89 %)	268,408 (9.13 %)	268,437 (9.13 %)	314,788 (90.87 %)	4,552,770 (34.01 %)	651,225 (1.26 %)	19,266,969 (38.27 %)	239 (0.00 %)	482,237 (1.17 %)	139,490 (2.47 %)	79,407 (1.60 %)
350	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022) GCA_026167925.1	n/a	n/a	19,342 (1.57 %)	20,947 (1.48 %)	n/a	42.40 (100.00 %)	0 (0 %)	229 (0.00 %)	1,006 (100.00 %)	4,161,568 (23.13 %)	1,278,205 (8.22 %)	13,148,019 (37.60 %)	1 (0.00 %)	1,208,815 (3.32 %)	23,523 (0.71 %)	19,170 (0.46 %)
351	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022) GCA_026229955.1	n/a	n/a	19,700 (1.54 %)	22,354 (1.46 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	244 (0.00 %)	244 (0.00 %)	2,082 (100.00 %)	6,089,884 (47.99 %)	1,358,786 (9.39 %)	13,799,349 (39.08 %)	3 (0.00 %)	1,511,691 (3.84 %)	24,733 (0.70 %)	22,588 (0.58 %)
352	North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023) GCA_028500835.1	n/a	n/a	15,210 (1.55 %)	18,316 (1.43 %)	n/a	41.06 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	5,051 (100.00 %)	3,911,633 (40.55 %)	565,546 (1.54 %)	10,853,726 (32.61 %)	0 (0 %)	378,575 (1.36 %)	40,925 (1.35 %)	26,837 (0.96 %)
353	North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023) GCA_028451465.1	n/a	n/a	18,102 (1.58 %)	20,073 (1.40 %)	n/a	41.03 (100.00 %)	0 (0 %)	277 (0.00 %)	116 (100.00 %)	4,958,089 (41.64 %)	719,163 (1.59 %)	13,867,662 (33.89 %)	7 (0.00 %)	506,727 (1.48 %)	51,299 (1.36 %)	33,440 (0.96 %)
354	North Atlantic right whale (hap1 2023) GCA_028571275.1	n/a	n/a	18,699 (1.61 %)	20,354 (1.28 %)	n/a	41.64 (99.84 %)	0 (0 %)	385 (0.16 %)	947 (100.00 %)	3,815,900 (43.46 %)	718,935 (11.38 %)	11,928,210 (42.25 %)	2 (0.00 %)	1,117,252 (3.44 %)	85,881 (1.90 %)	41,289 (1.19 %)
355	North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq) GCF_028564815.1	49,646 (1.86 %)	n/a	19,562 (1.46 %)	21,631 (1.25 %)	n/a	41.69 (99.83 %)	0 (0 %)	367 (0.17 %)	789 (100.00 %)	1,368,536 (2.24 %)	841,303 (13.08 %)	12,527,582 (43.92 %)	11 (0.00 %)	1,404,448 (3.90 %)	94,259 (1.92 %)	41,005 (0.96 %)
356	North Pacific right whale GCA_004363455.1	n/a	n/a	23,145 (1.43 %)	38,161 (1.21 %)	n/a	41.15 (99.88 %)	7,094 (0.03 %)	7,094 (0.03 %)	1,361,057 (99.97 %)	5,039,622 (45.69 %)	694,986 (1.31 %)	14,063,101 (40.51 %)	73 (0.00 %)	n/a	74,800 (1.52 %)	49,455 (1.20 %)
357	northern American river otter GCF_010015895.1	53,945 (2.18 %)	n/a	18,974 (1.68 %)	21,247 (1.45 %)	n/a	41.41 (99.58 %)	6,928 (0.42 %)	7,620 (0.42 %)	13,541 (99.58 %)	4,538,847 (41.18 %)	685,281 (1.20 %)	13,840,953 (32.61 %)	360 (0.01 %)	364,620 (0.96 %)	53,559 (1.88 %)	52,003 (1.68 %)
358	northern bat (alternate hap 2023) GCA_951640545.1	n/a	n/a	18,343 (1.80 %)	23,253 (1.77 %)	n/a	43.55 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	4,899 (100.00 %)	1,174,241 (2.96 %)	825,170 (5.11 %)	9,889,579 (36.12 %)	0 (0 %)	598,356 (2.10 %)	76,164 (3.52 %)	59,778 (2.27 %)
359	northern bat (primary hap 2023) GCA_951640355.1	n/a	n/a	18,636 (1.75 %)	21,446 (1.68 %)	n/a	43.32 (99.99 %)	0 (0 %)	1,423 (0.01 %)	207 (100.00 %)	1,259,729 (2.95 %)	905,676 (6.25 %)	10,554,535 (38.21 %)	3 (0.00 %)	780,081 (2.54 %)	77,656 (3.27 %)	60,964 (2.14 %)
360	northern black mastiff bat (mMolNig1 2022) GCA_026936385.1	n/a	n/a	18,924 (1.53 %)	22,934 (1.58 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	0 (0 %)	199 (0.00 %)	146 (100.00 %)	3,850,624 (31.21 %)	648,359 (3.76 %)	11,788,702 (39.25 %)	2 (0.00 %)	811,589 (2.31 %)	85,908 (2.60 %)	73,781 (1.91 %)
361	northern bottlenose whale (alternate hap 2023) GCA_949752845.1	n/a	n/a	19,537 (1.44 %)	27,826 (1.30 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	23,401 (100.00 %)	3,634,923 (35.56 %)	672,860 (11.00 %)	11,175,398 (41.72 %)	0 (0 %)	1,941,411 (5.36 %)	62,007 (1.94 %)	36,247 (0.95 %)
362	northern bottlenose whale (primary hap 2023) GCA_949752795.1	n/a	n/a	19,073 (1.44 %)	20,821 (1.21 %)	n/a	41.81 (99.99 %)	0 (0 %)	1,098 (0.01 %)	757 (100.00 %)	3,997,911 (34.76 %)	769,275 (14.94 %)	12,133,820 (44.83 %)	6 (0.00 %)	3,171,972 (7.30 %)	67,258 (2.00 %)	38,513 (0.89 %)
363	northern elephant seal (BS05 2019 Broad) GCA_004023865.1	n/a	n/a	22,834 (1.54 %)	36,083 (1.32 %)	n/a	41.52 (99.94 %)	9,483 (0.04 %)	9,483 (0.04 %)	330,739 (99.96 %)	4,849,944 (43.83 %)	600,306 (1.16 %)	13,420,049 (34.43 %)	55 (0.00 %)	452,384 (1.15 %)	57,236 (1.62 %)	53,204 (1.43 %)
364	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank) GCA_029215605.1	n/a	n/a	19,278 (1.60 %)	19,908 (1.39 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	98 (0.00 %)	596 (100.00 %)	4,348,333 (34.40 %)	621,985 (2.21 %)	13,251,768 (35.32 %)	0 (0 %)	811,715 (2.28 %)	69,898 (2.38 %)	44,044 (1.16 %)
365	Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq) GCF_029215605.1	74,106 (3.88 %)	n/a	19,277 (1.60 %)	20,000 (1.36 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	98 (0.00 %)	595 (100.00 %)	4,348,327 (34.40 %)	621,980 (2.21 %)	13,251,706 (35.32 %)	0 (0 %)	811,710 (2.28 %)	69,897 (2.38 %)	44,044 (1.16 %)
366	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023) GCA_029215635.1	n/a	n/a	19,340 (1.59 %)	19,732 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	60 (0.00 %)	60 (0.00 %)	482 (100.00 %)	4,365,070 (34.26 %)	627,639 (2.43 %)	13,174,494 (35.47 %)	2 (0.00 %)	866,044 (2.39 %)	74,314 (2.49 %)	44,405 (1.17 %)
367	northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022) GCF_021288785.2	53,819 (3.32 %)	n/a	20,099 (1.75 %)	20,957 (1.35 %)	n/a	41.51 (99.35 %)	0 (0 %)	39,936 (0.65 %)	142,455 (100.00 %)	4,368,400 (33.93 %)	588,877 (1.19 %)	13,745,426 (32.96 %)	2,726 (0.09 %)	n/a	52,064 (1.59 %)	49,271 (1.43 %)
368	northern fur seal GCF_003265705.1	54,940 (2.43 %)	n/a	23,408 (1.78 %)	23,666 (1.43 %)	52,089 (2.17 %)	41.48 (98.01 %)	38,666 (1.99 %)	38,666 (1.99 %)	52,469 (98.01 %)	5,047,032 (43.38 %)	638,130 (1.06 %)	14,922,442 (33.12 %)	2,675 (0.04 %)	444,034 (1.22 %)	57,281 (1.44 %)	53,162 (1.27 %)
369	northern gundi GCA_004027205.1	n/a	n/a	18,035 (1.39 %)	27,379 (1.57 %)	n/a	42.68 (99.91 %)	5,037 (0.02 %)	5,037 (0.02 %)	865,110 (99.98 %)	4,149,883 (27.83 %)	654,063 (1.64 %)	12,342,565 (33.72 %)	12 (0.00 %)	n/a	47,533 (1.43 %)	40,352 (1.09 %)
370	northern mole vole GCA_001685095.1	n/a	n/a	23,252 (1.39 %)	44,209 (1.25 %)	n/a	41.68 (99.04 %)	371,627 (0.98 %)	371,627 (0.98 %)	722,087 (99.02 %)	3,923,814 (25.79 %)	898,453 (2.47 %)	13,708,986 (29.04 %)	96,051 (0.87 %)	280,901 (1.10 %)	16,583 (0.36 %)	15,193 (0.32 %)
371	northern white rhinoceros GCA_004027795.1	n/a	n/a	25,328 (1.34 %)	61,003 (1.95 %)	n/a	41.32 (99.90 %)	7,054 (0.03 %)	7,054 (0.03 %)	949,480 (99.97 %)	4,330,882 (38.89 %)	484,754 (1.12 %)	15,544,248 (33.11 %)	44 (0.00 %)	n/a	43,689 (2.08 %)	40,625 (1.98 %)
372	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank) GCA_036323735.1	114,725 (42.69 %)	n/a	21,917 (1.75 %)	19,476 (1.26 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	0 (0 %)	220 (0.14 %)	77 (100.00 %)	4,700,726 (39.99 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,813 (38.68 %)	21 (0.00 %)	1,553,966 (4.21 %)	20,118 (0.44 %)	17,465 (0.38 %)
373	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq) GCF_036323735.1	114,725 (5.38 %)	n/a	21,870 (1.74 %)	19,989 (1.27 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	0 (0 %)	220 (0.14 %)	76 (100.00 %)	5,294,185 (42.75 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,760 (38.68 %)	21 (0.00 %)	1,553,966 (4.21 %)	20,118 (0.44 %)	17,703 (0.38 %)
374	Norway rat BN7 haplotype GCA_015244455.1	n/a	n/a	3,096 (1.64 %)	2,450 (1.02 %)	n/a	41.23 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	3,156 (100.00 %)	517,347 (50.76 %)	157,701 (3.90 %)	1,502,752 (34.14 %)	0 (0 %)	157,923 (4.57 %)	1,806 (0.40 %)	1,380 (0.31 %)
375	Norway rat BN7.2 GCF_015227675.2	99,139 (4.10 %)	n/a	21,526 (1.86 %)	19,266 (1.33 %)	54,530 (2.79 %)	41.99 (99.19 %)	581 (0.81 %)	581 (0.81 %)	757 (99.19 %)	5,029,005 (45.44 %)	1,514,974 (3.57 %)	13,450,428 (35.83 %)	4 (0.00 %)	1,172,090 (3.51 %)	19,244 (0.46 %)	16,098 (0.39 %)
376	Norway rat celera GCF_000002265.2	39,745 (2.91 %)	n/a	21,492 (1.95 %)	19,112 (1.38 %)	n/a	41.98 (95.28 %)	111,393 (4.74 %)	111,391 (4.74 %)	118,423 (95.26 %)	9,721,869 (43.57 %)	1,387,703 (3.05 %)	13,224,921 (32.45 %)	11 (0.00 %)	813,629 (2.20 %)	18,944 (0.42 %)	16,117 (0.37 %)
377	Norway rat Rnor6.0 GCF_000001895.5	69,456 (3.34 %)	n/a	22,369 (1.83 %)	20,269 (1.32 %)	n/a	41.93 (95.13 %)	70,664 (4.84 %)	145,731 (4.89 %)	76,195 (95.16 %)	5,329,187 (44.14 %)	1,620,304 (3.72 %)	14,520,050 (33.09 %)	719 (0.06 %)	916,050 (3.68 %)	22,600 (0.47 %)	18,401 (0.40 %)
378	Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022 GCA_023515785.1	n/a	n/a	21,116 (1.68 %)	20,103 (1.27 %)	57,027 (2.45 %)	41.85 (99.82 %)	0 (0 %)	1,256 (0.18 %)	2,151 (100.00 %)	4,704,388 (38.22 %)	1,611,144 (5.76 %)	13,524,575 (38.35 %)	24 (0.00 %)	1,665,234 (4.47 %)	20,720 (0.48 %)	16,247 (0.34 %)
379	Norway rat SHRSP/BppUtx 2022 GCA_021556685.1	n/a	n/a	22,366 (1.71 %)	20,531 (1.26 %)	57,580 (2.44 %)	41.86 (99.94 %)	0 (0 %)	1,610 (0.06 %)	2,734 (100.00 %)	5,238,574 (46.36 %)	1,638,412 (5.87 %)	13,769,141 (38.49 %)	12 (0.00 %)	1,712,824 (4.62 %)	21,006 (0.49 %)	17,310 (0.40 %)
380	Norway rat WKY/Bbb 2022 GCA_023515805.1	n/a	n/a	21,607 (1.68 %)	21,244 (1.28 %)	58,136 (2.47 %)	41.92 (99.80 %)	0 (0 %)	1,456 (0.20 %)	3,553 (100.00 %)	4,811,412 (38.21 %)	1,650,950 (5.41 %)	13,740,644 (38.24 %)	16 (0.00 %)	1,626,115 (4.31 %)	21,449 (0.51 %)	16,486 (0.34 %)
381	nutria GCA_004027025.1	n/a	n/a	24,707 (1.00 %)	47,533 (1.18 %)	n/a	41.70 (99.84 %)	15,249 (0.05 %)	15,249 (0.05 %)	1,684,916 (99.95 %)	6,961,690 (30.09 %)	1,698,977 (3.31 %)	15,207,563 (42.57 %)	44 (0.00 %)	n/a	59,854 (1.00 %)	31,029 (0.63 %)
382	okapi GCA_001660835.1	n/a	n/a	21,483 (1.43 %)	31,061 (1.26 %)	n/a	41.48 (95.11 %)	376,008 (4.86 %)	376,008 (4.86 %)	1,213,177 (95.14 %)	5,808,036 (42.90 %)	619,044 (4.22 %)	14,940,153 (35.17 %)	41,083 (0.65 %)	843,551 (6.96 %)	47,417 (1.12 %)	45,138 (1.04 %)
383	Ord's kangaroo rat GCF_000151885.1	30,625 (2.21 %)	n/a	17,959 (1.54 %)	19,318 (1.54 %)	n/a	42.06 (92.36 %)	83,033 (7.65 %)	83,035 (7.65 %)	148,226 (92.35 %)	4,337,455 (33.76 %)	1,140,316 (7.60 %)	10,422,685 (36.59 %)	3,290 (0.06 %)	1,520,292 (3.90 %)	61,921 (3.56 %)	30,924 (0.78 %)
384	pacarana GCA_004027595.1	n/a	n/a	20,748 (1.20 %)	33,195 (1.31 %)	n/a	41.81 (99.90 %)	6,392 (0.02 %)	6,392 (0.02 %)	1,164,830 (99.98 %)	4,374,443 (30.16 %)	660,811 (1.38 %)	14,062,133 (35.99 %)	8 (0.00 %)	n/a	59,382 (1.23 %)	28,291 (0.70 %)
385	Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad) GCA_004363475.1	n/a	n/a	21,575 (1.07 %)	47,478 (1.31 %)	n/a	41.87 (99.76 %)	18,801 (0.07 %)	18,801 (0.07 %)	2,428,619 (99.93 %)	4,881,232 (20.80 %)	1,352,971 (4.11 %)	12,583,960 (48.42 %)	36 (0.00 %)	n/a	74,961 (2.33 %)	61,745 (1.54 %)
386	Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo) GCF_023159225.1	46,202 (2.48 %)	n/a	18,752 (1.50 %)	22,526 (1.60 %)	n/a	41.98 (99.96 %)	0 (0 %)	1,807 (0.04 %)	6,180 (100.00 %)	3,313,319 (16.79 %)	1,066,382 (10.88 %)	9,981,468 (42.63 %)	8 (0.00 %)	1,996,445 (6.17 %)	49,134 (2.83 %)	50,049 (1.70 %)
387	Pacific walrus GCF_000321225.1	27,163 (1.89 %)	n/a	20,293 (1.71 %)	20,982 (1.48 %)	n/a	41.36 (95.85 %)	66,763 (4.16 %)	66,766 (4.16 %)	70,656 (95.84 %)	4,372,578 (41.12 %)	511,500 (1.05 %)	13,507,582 (30.43 %)	2,581 (0.03 %)	386,274 (1.21 %)	45,142 (1.29 %)	37,732 (0.95 %)
388	Pacific white-sided dolphin GCF_003676395.1	65,947 (3.26 %)	n/a	18,743 (1.79 %)	20,862 (1.45 %)	31,917 (1.69 %)	41.28 (99.56 %)	16,337 (0.44 %)	16,699 (0.44 %)	21,350 (99.56 %)	3,971,820 (45.64 %)	574,056 (1.14 %)	12,602,965 (34.83 %)	610 (0.02 %)	419,325 (1.28 %)	62,275 (1.67 %)	40,749 (1.23 %)
389	pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019) GCA_004115245.1	n/a	n/a	18,118 (1.63 %)	23,536 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	38 (0.00 %)	10,873 (100.00 %)	3,001,130 (29.46 %)	375,042 (0.79 %)	11,813,971 (29.64 %)	0 (0 %)	140,066 (0.57 %)	67,712 (4.23 %)	70,108 (3.94 %)
390	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020) GCA_004115245.2	n/a	n/a	18,116 (1.63 %)	23,608 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	38 (0.00 %)	10,895 (100.00 %)	3,002,448 (29.46 %)	375,226 (0.79 %)	11,824,034 (29.65 %)	0 (0 %)	140,328 (0.57 %)	67,718 (4.23 %)	70,109 (3.93 %)
391	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020) GCF_004126475.2	54,932 (3.31 %)	n/a	18,171 (1.69 %)	20,025 (1.62 %)	42,786 (3.39 %)	42.38 (99.28 %)	0 (0 %)	884 (0.72 %)	77 (100.00 %)	3,069,141 (30.00 %)	385,664 (0.81 %)	12,050,232 (30.57 %)	1 (0.00 %)	174,292 (0.75 %)	63,905 (3.75 %)	66,744 (3.26 %)
392	Pallas's mastiff bat GCF_014108415.1	48,421 (2.20 %)	n/a	18,667 (1.61 %)	21,915 (1.59 %)	n/a	42.35 (97.95 %)	0 (0 %)	349 (2.05 %)	60 (100.00 %)	3,863,217 (32.76 %)	624,933 (1.88 %)	11,572,319 (37.09 %)	1 (0.00 %)	714,726 (2.00 %)	79,984 (2.45 %)	71,436 (1.91 %)
393	pallid bat (TK200870 primary hap 2023) GCA_027563665.1	n/a	n/a	19,688 (1.69 %)	21,998 (1.64 %)	n/a	43.04 (99.72 %)	19 (0.01 %)	234 (0.28 %)	112 (99.99 %)	2,794,986 (22.60 %)	938,016 (3.72 %)	11,241,518 (39.41 %)	0 (0 %)	704,408 (2.03 %)	70,272 (2.89 %)	61,250 (1.98 %)
394	Parnell's mustached bat (2013) GCA_000465405.1	n/a	n/a	21,436 (1.40 %)	57,232 (2.18 %)	n/a	40.82 (99.34 %)	265,720 (0.70 %)	265,720 (0.70 %)	443,121 (99.30 %)	2,780,805 (29.26 %)	290,520 (0.63 %)	12,354,814 (27.13 %)	3 (0.00 %)	21,621 (0.07 %)	69,806 (1.89 %)	63,572 (1.69 %)
395	Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021) GCF_021234165.1	37,033 (2.48 %)	n/a	18,339 (1.76 %)	21,630 (1.69 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	0 (0 %)	12 (0.00 %)	333 (100.00 %)	2,828,339 (30.56 %)	333,670 (0.75 %)	12,444,271 (30.90 %)	0 (0 %)	111,571 (0.50 %)	53,180 (4.61 %)	54,187 (3.93 %)
396	particolored bat (primary hap 2024) GCA_963924515.1	n/a	n/a	17,913 (1.72 %)	20,720 (1.72 %)	n/a	43.54 (99.99 %)	7 (0.00 %)	980 (0.01 %)	185 (100.00 %)	2,932,869 (21.94 %)	874,665 (4.83 %)	10,263,103 (37.46 %)	2 (0.00 %)	742,499 (2.50 %)	77,397 (4.55 %)	76,849 (2.51 %)
397	Patagonian cavy GCA_004027295.1	n/a	n/a	21,143 (0.94 %)	40,887 (1.10 %)	n/a	39.86 (99.87 %)	6,223 (0.02 %)	6,223 (0.02 %)	1,911,987 (99.98 %)	5,194,890 (30.95 %)	892,551 (2.11 %)	17,052,577 (40.22 %)	47 (0.00 %)	n/a	45,730 (0.84 %)	40,047 (0.71 %)
398	Pere David's deer GCA_002443075.1	n/a	n/a	20,723 (1.65 %)	23,551 (1.43 %)	n/a	41.58 (97.49 %)	144,642 (2.51 %)	144,642 (2.51 %)	339,454 (97.49 %)	5,171,293 (43.30 %)	427,987 (1.20 %)	13,665,133 (35.97 %)	3,724 (0.06 %)	460,451 (1.49 %)	48,374 (1.14 %)	45,141 (1.04 %)
399	Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022) GCA_027409165.1	n/a	n/a	18,794 (1.72 %)	21,421 (1.40 %)	n/a	40.18 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,750 (100.00 %)	4,001,442 (39.37 %)	547,894 (2.75 %)	13,870,563 (34.33 %)	0 (0 %)	585,313 (2.32 %)	40,162 (1.31 %)	39,090 (1.18 %)
400	Philippine flying lemur (mCynVol1 primary hap 2022 genbank) GCA_027409185.1	n/a	n/a	20,384 (1.64 %)	22,124 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	0 (0 %)	116 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,492,423 (39.31 %)	627,842 (4.79 %)	15,561,515 (36.57 %)	2 (0.00 %)	n/a	45,336 (1.27 %)	44,264 (1.15 %)
401	Philippine flying lemur (mCynVol1 primary hap 2022 refseq) GCF_027409185.1	44,950 (1.91 %)	n/a	20,385 (1.64 %)	22,123 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	0 (0 %)	116 (0.00 %)	130 (100.00 %)	4,492,417 (39.31 %)	627,841 (4.79 %)	15,561,458 (36.57 %)	2 (0.00 %)	862,813 (2.91 %)	45,336 (1.27 %)	44,264 (1.15 %)
402	pig (Bamei 2023) GCA_030704935.1	n/a	n/a	18,472 (1.44 %)	19,911 (1.28 %)	n/a	42.63 (99.98 %)	0 (0 %)	878 (0.02 %)	379 (100.00 %)	3,996,827 (27.97 %)	2,094,728 (7.23 %)	12,677,118 (40.57 %)	4 (0.00 %)	1,289,995 (3.44 %)	81,791 (2.82 %)	46,045 (1.12 %)
403	pig (Duroc 2017) GCF_000003025.6	77,695 (4.05 %)	n/a	18,980 (1.64 %)	19,453 (1.32 %)	59,876 (4.84 %)	41.87 (98.81 %)	328 (1.19 %)	544 (1.19 %)	1,313 (98.81 %)	5,021,184 (45.67 %)	710,994 (1.32 %)	13,243,289 (36.33 %)	2 (0.00 %)	554,834 (1.64 %)	79,132 (1.82 %)	46,116 (1.30 %)
404	pig (USMARCv1 2017) GCA_002844635.1	n/a	n/a	19,458 (1.54 %)	21,487 (1.27 %)	58,655 (2.58 %)	42.49 (95.20 %)	0 (0 %)	661 (4.80 %)	14,157 (100.00 %)	5,159,244 (47.53 %)	902,079 (3.63 %)	13,145,120 (36.86 %)	1 (0.00 %)	1,358,423 (3.46 %)	82,442 (2.62 %)	47,468 (1.28 %)
405	plains zebra (Etosha38 2022 UCLA) GCF_021613505.1	55,779 (2.87 %)	n/a	19,529 (1.76 %)	21,214 (1.39 %)	n/a	41.38 (99.04 %)	0 (0 %)	14,595 (0.96 %)	11,098 (100.00 %)	3,683,862 (38.74 %)	314,723 (0.68 %)	15,217,328 (29.38 %)	2,057 (0.02 %)	119,672 (0.38 %)	41,391 (1.27 %)	38,911 (1.12 %)
406	platypus (alternate hap Pmale09 2020) GCA_004115175.2	n/a	n/a	13,244 (1.26 %)	19,241 (1.68 %)	n/a	46.27 (100.00 %)	25 (0.00 %)	25 (0.00 %)	5,868 (100.00 %)	4,420,884 (51.59 %)	513,006 (3.13 %)	7,749,797 (49.18 %)	0 (0 %)	994,720 (3.65 %)	81,538 (8.24 %)	68,267 (3.13 %)
407	platypus (Pmale09 v4 2020) GCF_004115215.2	51,392 (3.07 %)	n/a	14,778 (1.26 %)	18,888 (1.63 %)	n/a	46.14 (99.18 %)	0 (0 %)	515 (0.82 %)	322 (100.00 %)	5,071,089 (51.34 %)	578,614 (2.89 %)	9,113,848 (48.93 %)	0 (0 %)	1,130,252 (3.59 %)	87,796 (6.47 %)	74,209 (2.87 %)
408	polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq) GCF_000687225.1	35,764 (2.39 %)	n/a	18,466 (1.69 %)	15,384 (1.38 %)	n/a	41.65 (98.35 %)	110,343 (1.67 %)	110,343 (1.67 %)	134,162 (98.33 %)	4,123,540 (40.16 %)	553,196 (1.29 %)	13,765,581 (29.91 %)	205 (0.03 %)	311,409 (1.04 %)	54,907 (1.17 %)	47,736 (0.98 %)
409	polar bear (UCSC 2021) GCF_017311325.1	52,188 (2.92 %)	n/a	18,588 (1.75 %)	20,731 (1.54 %)	n/a	41.88 (99.60 %)	0 (0 %)	45,532 (0.41 %)	3,900 (100.00 %)	4,204,162 (40.75 %)	572,129 (1.75 %)	13,926,894 (30.79 %)	587 (0.02 %)	437,254 (2.43 %)	63,315 (1.93 %)	57,593 (1.70 %)
410	prairie deer mouse (Baylor 2013) GCF_000500345.1	50,187 (2.51 %)	n/a	20,427 (1.69 %)	20,874 (1.45 %)	n/a	42.34 (94.06 %)	182,041 (5.97 %)	182,263 (5.97 %)	212,962 (94.03 %)	n/a	1,229,123 (2.83 %)	14,447,916 (30.09 %)	7,908 (0.12 %)	806,105 (3.40 %)	23,246 (0.56 %)	19,518 (0.43 %)
411	prairie deer mouse (Harvard 2020) GCF_003704035.1	69,779 (3.28 %)	n/a	19,755 (1.73 %)	19,194 (1.43 %)	n/a	42.28 (95.07 %)	147,442 (4.96 %)	147,442 (4.96 %)	155,966 (95.04 %)	4,751,621 (29.04 %)	1,172,212 (2.66 %)	13,934,672 (29.87 %)	6,396 (0.08 %)	477,575 (1.54 %)	22,444 (0.57 %)	19,164 (0.44 %)
412	prairie vole GCF_000317375.1	40,484 (2.72 %)	n/a	19,648 (1.91 %)	19,489 (1.62 %)	n/a	42.25 (92.03 %)	180,677 (8.00 %)	180,677 (8.00 %)	187,012 (92.00 %)	3,779,126 (25.51 %)	879,192 (2.11 %)	12,360,347 (27.34 %)	6,788 (0.11 %)	335,553 (1.15 %)	18,233 (0.52 %)	16,466 (0.44 %)
413	proboscis bat (hap1 2024) GCA_037038545.1	n/a	n/a	17,919 (1.46 %)	19,330 (1.31 %)	n/a	40.78 (100.00 %)	0 (0 %)	68 (0.00 %)	41 (100.00 %)	3,707,234 (28.28 %)	643,817 (2.22 %)	12,106,384 (41.48 %)	5 (0.00 %)	871,436 (2.63 %)	54,438 (1.38 %)	34,899 (0.85 %)
414	proboscis bat (hap2 2024) GCA_037038555.1	n/a	n/a	17,253 (1.51 %)	18,507 (1.35 %)	n/a	40.91 (100.00 %)	0 (0 %)	39 (0.00 %)	38 (100.00 %)	3,466,835 (27.96 %)	585,261 (1.91 %)	11,364,898 (40.65 %)	2 (0.00 %)	726,868 (2.39 %)	50,527 (1.37 %)	32,436 (0.84 %)
415	pronghorn (PH2016 2021) GCA_021018645.1	n/a	n/a	21,848 (1.58 %)	27,614 (1.56 %)	n/a	41.70 (96.83 %)	74,027 (3.17 %)	74,027 (3.17 %)	140,480 (96.83 %)	3,335,744 (24.40 %)	405,435 (4.11 %)	13,855,606 (34.67 %)	3,445 (0.16 %)	489,014 (7.21 %)	48,670 (1.19 %)	43,625 (0.95 %)
416	Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq) GCF_000696695.1	45,076 (2.76 %)	n/a	19,546 (1.69 %)	22,107 (1.36 %)	n/a	41.27 (99.13 %)	80,963 (0.88 %)	80,963 (0.88 %)	134,060 (99.12 %)	3,787,533 (40.54 %)	435,607 (1.73 %)	14,738,418 (28.36 %)	39 (0.00 %)	276,230 (1.12 %)	40,752 (0.94 %)	36,104 (0.79 %)
417	puma (L17-30 alternate hap 2023) GCA_028749965.1	n/a	n/a	18,380 (1.53 %)	20,701 (1.40 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	96 (0.00 %)	96 (0.00 %)	304 (100.00 %)	4,881,674 (33.96 %)	978,817 (2.17 %)	13,422,986 (35.08 %)	0 (0 %)	741,350 (2.01 %)	69,437 (2.62 %)	59,105 (1.71 %)
418	puma (L17-30 primary hap 2023) GCA_028749985.1	n/a	n/a	17,553 (1.53 %)	19,299 (1.39 %)	n/a	41.89 (100.00 %)	134 (0.00 %)	134 (0.00 %)	390 (100.00 %)	4,629,539 (33.53 %)	919,008 (2.02 %)	12,766,157 (34.70 %)	0 (0 %)	673,940 (1.93 %)	65,437 (2.53 %)	55,660 (1.67 %)
419	puma (SC36_Marlon 2018 refseq) GCF_003327715.1	25,575 (1.43 %)	n/a	17,664 (1.57 %)	16,565 (1.29 %)	n/a	41.36 (95.34 %)	0 (0 %)	178,992 (4.69 %)	2,175 (100.00 %)	4,885,335 (42.70 %)	833,138 (1.76 %)	13,705,778 (31.28 %)	2,166 (0.06 %)	494,981 (1.78 %)	58,912 (1.65 %)	50,360 (1.31 %)
420	punctate agouti GCA_004363535.1	n/a	n/a	22,612 (1.05 %)	45,433 (1.19 %)	n/a	40.79 (99.92 %)	6,459 (0.02 %)	6,459 (0.02 %)	993,123 (99.98 %)	5,671,738 (32.53 %)	945,722 (1.69 %)	17,003,309 (36.58 %)	32 (0.00 %)	n/a	85,696 (1.65 %)	65,973 (1.32 %)
421	pygmy sperm whale GCA_004363705.1	n/a	n/a	22,661 (1.30 %)	42,546 (1.15 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	6,053 (0.02 %)	6,053 (0.02 %)	1,258,125 (99.98 %)	5,185,912 (43.65 %)	836,752 (1.88 %)	14,150,125 (39.88 %)	43 (0.00 %)	n/a	95,344 (2.15 %)	68,248 (1.67 %)
422	pygmy sperm whale (mKogBre1 2022 refseq) GCF_026419965.1	56,261 (2.22 %)	n/a	18,496 (1.55 %)	20,718 (1.32 %)	n/a	42.05 (99.81 %)	0 (0 %)	143 (0.19 %)	581 (100.00 %)	3,817,659 (34.51 %)	758,297 (7.42 %)	12,196,998 (39.96 %)	0 (0 %)	1,197,809 (3.53 %)	101,353 (2.90 %)	50,216 (1.47 %)
423	pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022) GCA_026419985.1	n/a	n/a	18,550 (1.51 %)	20,491 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	0 (0 %)	138 (0.01 %)	391 (100.00 %)	3,860,112 (33.83 %)	820,375 (9.58 %)	12,159,196 (41.59 %)	2 (0.00 %)	1,346,279 (3.87 %)	106,168 (2.78 %)	50,294 (1.44 %)
424	rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq) GCF_009806435.1	83,045 (4.16 %)	n/a	19,486 (1.31 %)	23,267 (1.31 %)	n/a	43.83 (97.68 %)	0 (0 %)	18,178 (2.32 %)	3,160 (100.00 %)	4,072,524 (21.41 %)	976,273 (2.33 %)	13,766,413 (39.76 %)	85 (0.00 %)	1,275,666 (3.04 %)	113,371 (2.46 %)	70,869 (1.75 %)
425	rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq) GCF_000003625.3	43,655 (2.34 %)	n/a	18,665 (1.39 %)	20,095 (1.24 %)	n/a	43.75 (95.14 %)	80,789 (4.88 %)	80,789 (4.88 %)	84,024 (95.12 %)	4,890,480 (44.71 %)	883,939 (1.73 %)	13,254,520 (38.27 %)	12 (0.00 %)	1,022,784 (2.54 %)	110,337 (2.33 %)	68,468 (1.73 %)
426	raccoon dog (2021) GCF_905146905.1	52,564 (2.89 %)	n/a	19,628 (1.60 %)	20,274 (1.43 %)	n/a	41.28 (99.98 %)	0 (0 %)	70 (0.02 %)	811 (100.00 %)	4,499,368 (31.98 %)	1,005,212 (2.04 %)	13,884,201 (32.95 %)	2 (0.00 %)	702,009 (1.75 %)	52,450 (2.27 %)	46,478 (1.53 %)
427	Rambouillet sheep (Baylor 2017) GCF_002742125.1	50,096 (2.48 %)	46,295 (2.32 %)	19,992 (1.47 %)	22,506 (1.31 %)	41,290 (1.46 %)	41.91 (99.99 %)	4,845 (0.01 %)	4,847 (0.01 %)	7,486 (99.99 %)	5,764,757 (47.38 %)	507,629 (1.55 %)	14,138,601 (41.27 %)	7 (0.00 %)	1,279,574 (3.49 %)	51,748 (1.29 %)	40,690 (1.04 %)
428	Rambouillet sheep (U.Idaho 2021) GCF_016772045.1	70,474 (3.21 %)	n/a	19,413 (1.59 %)	21,222 (1.35 %)	n/a	41.99 (100.00 %)	0 (0 %)	84 (0.00 %)	142 (100.00 %)	5,300,958 (46.83 %)	455,553 (1.24 %)	13,023,443 (40.62 %)	0 (0 %)	979,102 (2.67 %)	43,959 (1.30 %)	38,834 (1.07 %)
429	ratel GCA_004024625.1	n/a	n/a	22,196 (1.21 %)	35,937 (1.18 %)	n/a	42.00 (99.85 %)	6,511 (0.02 %)	6,511 (0.02 %)	2,074,823 (99.98 %)	6,171,383 (41.93 %)	877,669 (1.49 %)	15,269,908 (41.22 %)	36 (0.00 %)	465,016 (0.89 %)	95,094 (1.91 %)	92,023 (1.73 %)
430	red bat GCA_004026805.1	n/a	n/a	27,510 (1.22 %)	65,467 (1.48 %)	n/a	42.69 (99.94 %)	6,380 (0.02 %)	6,380 (0.02 %)	525,280 (99.98 %)	4,644,227 (28.24 %)	1,170,868 (2.68 %)	15,628,238 (39.97 %)	16 (0.00 %)	n/a	125,564 (3.55 %)	108,686 (2.27 %)
431	red deer (2021) GCF_910594005.1	68,992 (2.68 %)	n/a	20,470 (1.48 %)	22,563 (1.32 %)	n/a	42.98 (100.00 %)	0 (0 %)	40 (0.00 %)	144 (100.00 %)	5,501,063 (44.60 %)	503,301 (12.23 %)	13,102,622 (44.55 %)	1 (0.00 %)	2,197,198 (5.57 %)	88,756 (1.66 %)	46,960 (1.12 %)
432	red deer (alternate hap 2021) GCA_910593805.1	n/a	n/a	18,817 (1.29 %)	21,916 (1.20 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	0 (0 %)	22 (0.00 %)	4,021 (100.00 %)	3,279,005 (20.48 %)	472,706 (21.87 %)	11,466,609 (50.26 %)	0 (0 %)	3,624,599 (9.05 %)	128,858 (2.07 %)	39,577 (0.84 %)
433	red fox GCF_003160815.1	43,495 (2.67 %)	n/a	19,826 (1.69 %)	18,893 (1.40 %)	n/a	41.08 (97.06 %)	0 (0 %)	246,167 (2.96 %)	82,424 (100.00 %)	4,919,102 (40.79 %)	954,461 (2.46 %)	14,190,625 (30.86 %)	739 (0.02 %)	634,373 (2.40 %)	53,204 (1.88 %)	51,541 (1.62 %)
434	reed vole (MF-2015 2020) GCF_014885135.2	55,722 (3.60 %)	n/a	19,808 (1.93 %)	20,787 (1.69 %)	n/a	42.36 (95.60 %)	0 (0 %)	67,118 (4.40 %)	10,460 (100.00 %)	3,130,955 (20.09 %)	831,969 (2.09 %)	11,985,657 (28.48 %)	1,977 (0.20 %)	258,905 (1.26 %)	18,764 (0.58 %)	16,940 (0.48 %)
435	Reeves' muntjac (alternate hap 2024) GCA_963930665.1	n/a	n/a	18,947 (1.29 %)	24,114 (1.28 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8,892 (100.00 %)	3,375,476 (23.21 %)	654,539 (6.64 %)	11,132,469 (48.29 %)	0 (0 %)	3,008,562 (7.07 %)	79,357 (2.66 %)	41,548 (0.93 %)
436	Reeves' muntjac (primary hap 2024) GCF_963930625.1	52,442 (2.57 %)	n/a	19,577 (1.52 %)	22,283 (1.38 %)	n/a	41.89 (99.99 %)	0 (0 %)	682 (0.01 %)	267 (100.00 %)	3,294,672 (23.89 %)	527,436 (2.98 %)	13,137,581 (39.89 %)	1 (0.00 %)	1,222,379 (3.05 %)	57,436 (1.81 %)	44,949 (1.09 %)
437	reindeer (2023) GCA_963422255.1	n/a	n/a	21,329 (1.58 %)	25,201 (1.59 %)	n/a	41.46 (98.35 %)	131,886 (1.65 %)	131,886 (1.65 %)	259,765 (98.35 %)	3,254,173 (23.49 %)	440,431 (2.00 %)	14,258,607 (36.17 %)	3,361 (0.18 %)	n/a	48,931 (1.20 %)	43,592 (0.99 %)
438	reindeer (US061 2019) GCA_004026565.1	n/a	n/a	24,150 (1.39 %)	39,911 (1.41 %)	n/a	42.08 (99.89 %)	4,769 (0.02 %)	4,769 (0.02 %)	1,365,508 (99.98 %)	6,083,178 (46.10 %)	546,470 (1.23 %)	14,434,855 (43.16 %)	13 (0.00 %)	n/a	55,319 (1.23 %)	51,245 (1.12 %)
439	Rice's whale (hap1 2023) GCA_028017805.1	n/a	n/a	19,396 (1.48 %)	21,693 (1.26 %)	n/a	41.62 (97.80 %)	0 (0 %)	131 (2.20 %)	1,039 (100.00 %)	3,973,936 (35.55 %)	987,571 (11.66 %)	12,473,459 (42.11 %)	1 (0.00 %)	1,271,959 (3.79 %)	74,971 (1.64 %)	44,274 (1.06 %)
440	Rice's whale (hap2 2023 refseq) GCF_028023285.1	59,888 (2.34 %)	n/a	19,291 (1.53 %)	21,195 (1.30 %)	n/a	41.44 (99.90 %)	0 (0 %)	334 (0.10 %)	774 (100.00 %)	3,917,923 (36.26 %)	828,521 (9.28 %)	12,518,796 (41.08 %)	4 (0.00 %)	1,071,329 (3.37 %)	73,126 (1.69 %)	43,865 (1.11 %)
441	Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024) GCA_036010255.1	n/a	n/a	18,982 (1.81 %)	22,002 (1.76 %)	n/a	43.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	105 (100.00 %)	2,909,847 (24.53 %)	757,964 (3.03 %)	10,561,925 (36.25 %)	0 (0 %)	534,987 (1.92 %)	57,318 (2.32 %)	52,282 (1.76 %)
442	Ryukyu mouse (v2 2017) GCF_900094665.2	53,779 (2.85 %)	n/a	21,351 (2.29 %)	18,073 (1.39 %)	n/a	41.70 (89.05 %)	27,758 (7.30 %)	306,599 (10.98 %)	30,835 (92.70 %)	4,479,912 (35.83 %)	1,351,677 (2.59 %)	12,964,608 (27.49 %)	6,570 (0.06 %)	398,054 (1.12 %)	15,963 (0.43 %)	15,425 (0.40 %)
443	Saanen dairy goat GCA_015443085.1	n/a	n/a	19,257 (1.54 %)	21,221 (1.32 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	0 (0 %)	170 (0.00 %)	1,362 (100.00 %)	5,336,862 (47.58 %)	515,161 (2.87 %)	13,144,895 (41.67 %)	3 (0.00 %)	1,309,461 (3.33 %)	58,623 (2.22 %)	39,483 (1.04 %)
444	saddleback dolphin (alternate hap 2023) GCA_949987525.1	n/a	n/a	18,509 (1.54 %)	22,514 (1.36 %)	n/a	41.95 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	7,427 (100.00 %)	3,675,922 (35.75 %)	950,374 (10.49 %)	11,670,399 (40.31 %)	0 (0 %)	1,395,810 (4.32 %)	63,587 (3.15 %)	40,331 (1.09 %)
445	saddleback dolphin (primary hap 2023 refseq) GCF_949987515.1	46,746 (2.39 %)	n/a	18,624 (1.49 %)	20,662 (1.31 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	0 (0 %)	968 (0.01 %)	630 (100.00 %)	4,020,676 (35.99 %)	1,259,549 (13.09 %)	12,359,748 (42.64 %)	0 (0 %)	1,785,427 (5.07 %)	66,179 (3.91 %)	41,466 (1.03 %)
446	saiga antelope GCA_004024985.1	n/a	n/a	23,736 (0.84 %)	55,133 (0.88 %)	n/a	42.52 (99.87 %)	2,867 (0.01 %)	2,867 (0.01 %)	1,775,066 (99.99 %)	6,485,113 (49.43 %)	447,097 (0.88 %)	13,972,753 (44.46 %)	57 (0.00 %)	n/a	46,883 (0.82 %)	38,101 (0.69 %)
447	Schreibers' long-fingered bat GCA_004026525.1	n/a	n/a	20,147 (2.06 %)	31,271 (1.82 %)	n/a	42.27 (99.94 %)	6,918 (0.04 %)	6,918 (0.04 %)	184,538 (99.96 %)	2,772,932 (29.66 %)	366,782 (1.13 %)	10,477,531 (28.60 %)	19 (0.00 %)	n/a	62,520 (2.73 %)	58,978 (2.39 %)
448	scimitar-horned oryx GCF_014754425.2	51,527 (2.72 %)	n/a	19,713 (1.57 %)	21,928 (1.32 %)	n/a	41.74 (99.30 %)	0 (0 %)	16,241 (0.70 %)	9,089 (100.00 %)	5,435,109 (46.76 %)	414,279 (0.98 %)	13,490,956 (40.45 %)	2,509 (0.03 %)	982,620 (2.65 %)	42,961 (1.10 %)	38,033 (0.97 %)
449	Screaming hairy armadillo GCA_004027955.1	n/a	n/a	24,532 (0.39 %)	56,725 (0.46 %)	n/a	39.68 (99.70 %)	2,747 (0.01 %)	2,747 (0.01 %)	7,680,080 (99.99 %)	8,978,735 (36.02 %)	1,516,551 (1.58 %)	32,918,217 (47.67 %)	32 (0.00 %)	n/a	234,762 (1.56 %)	66,537 (0.64 %)
450	sea otter (GAN:26980312 2017 refseq) GCF_002288905.1	38,127 (2.16 %)	n/a	18,578 (1.64 %)	20,913 (1.44 %)	34,179 (1.77 %)	41.56 (98.79 %)	22,821 (1.21 %)	23,134 (1.21 %)	29,589 (98.79 %)	4,703,044 (41.42 %)	721,750 (1.39 %)	14,065,653 (32.89 %)	1,203 (0.02 %)	504,215 (2.00 %)	55,388 (1.87 %)	53,465 (1.67 %)
451	Seba's short-tailed bat GCA_004027735.1	n/a	n/a	21,878 (0.94 %)	55,858 (1.10 %)	n/a	42.70 (99.84 %)	3,864 (0.01 %)	3,864 (0.01 %)	1,929,203 (99.99 %)	3,802,235 (28.35 %)	606,320 (1.03 %)	15,171,250 (31.99 %)	69 (0.00 %)	n/a	118,227 (2.28 %)	103,103 (1.92 %)
452	sheep (OAR_USU_Benz2616 2023) GCF_016772045.2	89,680 (5.44 %)	n/a	19,308 (1.52 %)	21,506 (1.35 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	0 (0 %)	84 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,275,767 (22.85 %)	464,346 (1.26 %)	12,987,607 (40.61 %)	0 (0 %)	992,253 (2.68 %)	44,477 (1.28 %)	39,609 (0.96 %)
453	sheep (Texel 2015) GCA_000298735.2	n/a	n/a	19,179 (1.56 %)	19,001 (1.26 %)	48,105 (1.85 %)	41.90 (98.94 %)	43,016 (1.07 %)	44,566 (1.07 %)	48,481 (98.93 %)	5,429,824 (46.13 %)	540,267 (1.64 %)	13,509,668 (38.83 %)	123 (0.01 %)	863,621 (2.69 %)	43,911 (1.13 %)	39,178 (0.99 %)
454	shrew mouse GCF_900095145.1	46,279 (2.64 %)	43,645 (2.34 %)	20,549 (2.23 %)	18,979 (1.49 %)	94,079 (3.98 %)	41.89 (90.53 %)	15,298 (6.27 %)	269,643 (9.50 %)	17,879 (93.73 %)	4,788,498 (38.32 %)	1,499,714 (3.03 %)	13,021,757 (27.83 %)	6,442 (0.07 %)	442,006 (1.19 %)	16,787 (0.47 %)	15,907 (0.43 %)
455	Siberian hamster (SSSS 2022) GCA_023856395.1	n/a	n/a	18,375 (1.83 %)	17,066 (1.44 %)	n/a	41.27 (99.64 %)	0 (0 %)	88,601 (0.37 %)	7,756 (100.00 %)	3,152,242 (21.63 %)	1,087,009 (2.64 %)	12,055,167 (29.20 %)	1,976 (0.02 %)	260,068 (0.73 %)	15,455 (0.48 %)	14,212 (0.40 %)
456	Siberian musk deer (BS20 2019 Broad) GCA_004024705.1	n/a	n/a	23,440 (1.32 %)	37,497 (1.19 %)	n/a	42.32 (99.86 %)	19,764 (0.07 %)	19,764 (0.07 %)	1,195,467 (99.93 %)	6,726,950 (49.79 %)	437,480 (1.57 %)	14,155,240 (46.22 %)	13 (0.00 %)	n/a	49,177 (1.05 %)	43,489 (0.94 %)
457	small Madagascar hedgehog GCF_000313985.2	37,090 (1.93 %)	n/a	18,969 (1.19 %)	19,298 (1.31 %)	n/a	43.01 (88.43 %)	0 (0 %)	270,406 (11.60 %)	7,490 (100.00 %)	3,789,337 (28.89 %)	429,226 (0.87 %)	16,951,112 (32.23 %)	3,875 (0.06 %)	191,573 (0.64 %)	39,993 (0.70 %)	32,202 (0.55 %)
458	smoky shrew (2023) GCF_029834395.1	37,165 (1.66 %)	n/a	17,572 (1.06 %)	24,146 (1.29 %)	n/a	43.43 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	497 (100.00 %)	2,593,080 (14.11 %)	1,194,567 (7.25 %)	14,051,522 (48.20 %)	0 (0 %)	1,447,378 (3.75 %)	107,473 (2.80 %)	53,859 (1.19 %)
459	snow leopard (11264 2022) GCF_023721935.1	53,556 (3.37 %)	n/a	18,780 (1.67 %)	21,038 (1.40 %)	n/a	41.60 (99.30 %)	0 (0 %)	23,786 (0.70 %)	2,636 (100.00 %)	4,714,429 (34.93 %)	919,518 (1.59 %)	13,711,504 (33.24 %)	1,871 (0.02 %)	357,999 (0.95 %)	64,690 (2.41 %)	61,670 (2.00 %)
460	snowshoe hare GCA_004026855.1	n/a	n/a	23,263 (0.88 %)	55,811 (1.01 %)	n/a	44.12 (99.87 %)	10,153 (0.03 %)	10,153 (0.03 %)	1,602,982 (99.97 %)	4,767,120 (21.29 %)	1,040,992 (2.22 %)	15,680,144 (43.23 %)	86 (0.00 %)	n/a	126,152 (2.28 %)	87,841 (1.66 %)
461	social tuco-tuco GCA_004027165.1	n/a	n/a	25,166 (1.12 %)	41,316 (1.26 %)	n/a	40.71 (99.89 %)	16,191 (0.06 %)	16,191 (0.06 %)	823,762 (99.94 %)	5,390,906 (28.28 %)	1,027,922 (2.15 %)	15,241,308 (38.39 %)	45 (0.00 %)	n/a	31,883 (0.72 %)	27,410 (0.58 %)
462	soprano pipistrelle (alternate hap 2023) GCA_949987765.1	n/a	n/a	17,590 (1.81 %)	21,597 (1.85 %)	n/a	42.88 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	2,717 (100.00 %)	2,734,555 (21.46 %)	795,752 (6.56 %)	9,601,735 (36.35 %)	0 (0 %)	660,443 (2.50 %)	62,524 (3.25 %)	60,391 (2.11 %)
463	soprano pipistrelle (primary hap 2023) GCA_949987585.1	n/a	n/a	18,056 (1.78 %)	21,158 (1.79 %)	n/a	42.67 (100.00 %)	6 (0.00 %)	161 (0.00 %)	249 (100.00 %)	2,899,535 (21.64 %)	853,717 (7.80 %)	10,162,216 (37.72 %)	1 (0.00 %)	802,761 (2.85 %)	63,256 (3.06 %)	61,642 (2.03 %)
464	South African ground squirrel GCA_004024805.1	n/a	n/a	22,802 (1.44 %)	33,892 (1.27 %)	n/a	39.97 (99.92 %)	9,745 (0.04 %)	9,745 (0.04 %)	587,115 (99.96 %)	5,256,998 (34.93 %)	594,122 (1.27 %)	14,462,947 (33.96 %)	36 (0.00 %)	n/a	34,141 (0.80 %)	32,509 (0.74 %)
465	Southeastern Asian house mouse (2016) GCA_001624445.1	n/a	n/a	21,103 (2.24 %)	18,682 (1.45 %)	102,099 (4.16 %)	41.83 (86.23 %)	48,311 (2.15 %)	424,005 (13.83 %)	52,352 (97.85 %)	4,990,851 (39.88 %)	1,356,202 (2.67 %)	13,469,640 (26.15 %)	14,714 (0.76 %)	396,098 (1.49 %)	16,724 (0.41 %)	15,971 (0.39 %)
466	Southeastern Asian house mouse (2022) GCA_921999005.2	n/a	n/a	21,799 (2.13 %)	19,729 (1.40 %)	110,356 (4.43 %)	41.78 (99.19 %)	4 (0.00 %)	278 (0.81 %)	151 (100.00 %)	4,663,228 (40.41 %)	1,549,985 (3.70 %)	13,012,600 (34.99 %)	8 (0.01 %)	788,439 (2.30 %)	21,349 (0.52 %)	15,914 (0.42 %)
467	Southeastern Asian house mouse (T2T 2024) GCA_964188545.1	n/a	n/a	22,529 (1.85 %)	20,409 (1.22 %)	n/a	41.10 (99.90 %)	78 (0.10 %)	78 (0.10 %)	416 (99.90 %)	4,880,101 (47.77 %)	1,689,287 (15.13 %)	12,822,147 (42.92 %)	1 (0.00 %)	2,529,336 (6.14 %)	22,642 (0.54 %)	16,895 (0.41 %)
468	southern elephant seal GCF_011800145.1	53,210 (2.86 %)	n/a	19,520 (1.73 %)	20,727 (1.41 %)	39,634 (1.86 %)	41.45 (99.36 %)	0 (0 %)	22,850 (0.64 %)	1,115 (100.00 %)	4,728,105 (43.75 %)	585,443 (1.13 %)	13,463,979 (33.65 %)	2,467 (0.03 %)	627,414 (1.65 %)	53,182 (1.62 %)	49,837 (1.42 %)
469	southern grasshopper mouse (2020) GCF_903995425.1	47,152 (2.39 %)	n/a	19,356 (1.68 %)	18,821 (1.36 %)	n/a	41.81 (98.94 %)	0 (0 %)	2,143 (1.06 %)	2,949 (100.00 %)	4,850,460 (28.64 %)	1,195,836 (2.72 %)	13,540,762 (32.73 %)	0 (0 %)	547,538 (1.62 %)	18,046 (0.54 %)	16,132 (0.42 %)
470	southern multimammate mouse GCF_008632895.1	69,045 (3.04 %)	n/a	20,313 (2.11 %)	17,745 (1.38 %)	n/a	41.39 (91.90 %)	0 (0 %)	146,713 (8.12 %)	28 (100.00 %)	4,875,400 (38.43 %)	1,454,350 (2.93 %)	13,104,717 (28.82 %)	2,045 (0.04 %)	494,819 (1.13 %)	16,715 (0.45 %)	15,641 (0.42 %)
471	southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022) GCA_023853755.1	n/a	n/a	20,179 (1.21 %)	24,249 (1.19 %)	n/a	39.54 (100.00 %)	4 (0.00 %)	4 (0.00 %)	7,866 (100.00 %)	3,953,031 (35.88 %)	531,111 (1.14 %)	16,354,874 (39.96 %)	0 (0 %)	425,622 (1.30 %)	59,907 (1.35 %)	35,916 (0.80 %)
472	southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022) GCA_023851605.1	n/a	n/a	20,058 (1.26 %)	22,196 (1.13 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	0 (0 %)	961 (0.56 %)	201 (100.00 %)	4,037,291 (46.02 %)	593,019 (1.17 %)	18,033,833 (40.56 %)	9 (0.00 %)	500,101 (1.40 %)	65,039 (1.33 %)	38,121 (0.86 %)
473	southern three-banded armadillo GCA_004025125.1	n/a	n/a	29,138 (0.73 %)	56,522 (0.75 %)	n/a	39.20 (99.82 %)	15,801 (0.04 %)	15,801 (0.04 %)	2,941,308 (99.96 %)	6,990,740 (38.88 %)	839,452 (1.23 %)	24,805,397 (43.95 %)	220 (0.00 %)	n/a	71,951 (0.98 %)	63,325 (0.84 %)
474	southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020) GCA_015220265.1	n/a	n/a	22,897 (1.23 %)	27,007 (1.18 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	70 (0.00 %)	70 (0.00 %)	12,050 (100.00 %)	4,502,020 (38.27 %)	576,759 (1.02 %)	17,143,050 (40.65 %)	0 (0 %)	450,196 (1.59 %)	51,339 (1.15 %)	40,459 (0.82 %)
475	southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020) GCF_015220235.1	63,054 (2.39 %)	n/a	21,998 (1.29 %)	23,177 (1.18 %)	45,345 (1.69 %)	39.89 (97.48 %)	0 (0 %)	1,243 (2.52 %)	146 (100.00 %)	4,559,690 (39.66 %)	577,607 (1.02 %)	16,594,630 (40.50 %)	4 (0.00 %)	492,026 (1.69 %)	51,430 (1.14 %)	40,148 (0.81 %)
476	southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq) GCF_000283155.1	37,037 (2.11 %)	n/a	18,398 (1.71 %)	19,753 (1.44 %)	n/a	40.90 (96.05 %)	54,737 (3.96 %)	54,737 (3.96 %)	57,824 (96.04 %)	3,685,898 (38.31 %)	421,694 (0.97 %)	14,765,529 (28.93 %)	1,818 (0.02 %)	184,274 (0.57 %)	36,281 (1.02 %)	32,113 (0.82 %)
477	Sowerby's beaked whale GCA_004027085.1	n/a	n/a	22,800 (1.32 %)	38,247 (1.17 %)	n/a	41.68 (99.84 %)	8,597 (0.03 %)	8,597 (0.03 %)	1,810,317 (99.97 %)	5,520,986 (45.05 %)	1,081,962 (2.69 %)	13,480,261 (43.01 %)	62 (0.00 %)	n/a	69,001 (1.39 %)	52,160 (1.13 %)
478	sperm whale (SW-GA 2023) GCF_002837175.3	62,615 (2.83 %)	n/a	19,485 (1.75 %)	22,707 (1.41 %)	n/a	41.33 (95.82 %)	121,387 (4.20 %)	121,387 (4.20 %)	133,555 (95.80 %)	3,906,439 (36.43 %)	691,647 (2.39 %)	13,489,368 (32.95 %)	1,869 (0.17 %)	517,424 (4.47 %)	86,751 (2.23 %)	82,633 (2.04 %)
479	star-nosed mole GCF_000260355.1	30,444 (2.86 %)	n/a	16,116 (1.82 %)	17,403 (1.78 %)	n/a	41.55 (95.10 %)	82,557 (4.92 %)	82,557 (4.92 %)	84,595 (95.08 %)	1,855,039 (18.90 %)	308,473 (0.86 %)	9,571,561 (26.02 %)	1,110 (0.03 %)	253,120 (1.17 %)	48,079 (2.76 %)	50,592 (2.47 %)
480	Steller sea lion GCF_004028035.1	46,044 (2.38 %)	n/a	21,171 (1.78 %)	21,626 (1.43 %)	36,701 (1.75 %)	41.38 (99.41 %)	17,263 (0.59 %)	18,994 (0.59 %)	24,485 (99.41 %)	4,556,415 (43.53 %)	577,797 (1.09 %)	13,545,012 (33.71 %)	733 (0.02 %)	410,405 (1.19 %)	51,355 (1.45 %)	47,732 (1.28 %)
481	Stephens's kangaroo rat GCA_004024685.1	n/a	n/a	20,638 (1.19 %)	43,541 (1.37 %)	n/a	41.90 (99.85 %)	8,882 (0.04 %)	8,882 (0.04 %)	1,278,525 (99.96 %)	4,886,095 (30.36 %)	1,229,832 (5.30 %)	11,334,494 (44.33 %)	37 (0.00 %)	n/a	38,450 (1.17 %)	29,741 (0.76 %)
482	steppe mouse (ZRU 2018) GCA_003336285.1	n/a	n/a	22,032 (2.17 %)	20,891 (1.41 %)	n/a	41.70 (95.78 %)	123,681 (4.24 %)	123,681 (4.24 %)	161,217 (95.76 %)	4,964,415 (42.35 %)	1,414,584 (2.75 %)	12,989,925 (31.80 %)	1,690 (0.04 %)	440,790 (1.25 %)	17,544 (0.44 %)	15,542 (0.39 %)
483	straw-colored fruit bat GCA_000465285.1	n/a	n/a	20,161 (1.66 %)	40,283 (1.50 %)	n/a	39.24 (99.62 %)	154,908 (0.40 %)	154,908 (0.40 %)	288,446 (99.60 %)	2,814,732 (32.92 %)	372,539 (1.01 %)	12,351,823 (25.93 %)	27 (0.00 %)	33,439 (0.13 %)	67,245 (2.34 %)	61,933 (1.94 %)
484	stripe-headed round-eared bat GCA_004024845.1	n/a	n/a	20,248 (1.62 %)	29,173 (1.61 %)	n/a	42.04 (99.96 %)	2,860 (0.01 %)	2,860 (0.01 %)	252,670 (99.99 %)	3,018,746 (29.48 %)	333,243 (0.74 %)	12,128,116 (30.51 %)	14 (0.00 %)	n/a	59,513 (1.87 %)	52,210 (1.57 %)
485	striped dolphin (alternate hap 2023) GCA_951394445.1	n/a	n/a	18,204 (1.54 %)	21,036 (1.34 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,464 (100.00 %)	3,767,720 (35.65 %)	1,102,723 (10.92 %)	11,794,617 (40.96 %)	0 (0 %)	1,492,009 (4.69 %)	67,537 (3.57 %)	41,008 (1.09 %)
486	striped dolphin (primary hap 2023) GCA_951394435.1	n/a	n/a	18,595 (1.48 %)	20,637 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1 (0.00 %)	993 (0.01 %)	639 (100.00 %)	4,097,623 (35.88 %)	1,442,973 (13.60 %)	12,327,244 (43.08 %)	1 (0.00 %)	1,896,129 (5.45 %)	68,498 (4.29 %)	42,011 (1.04 %)
487	striped hyena (BS54 2019 Broad) GCA_004023945.1	n/a	n/a	22,373 (1.45 %)	39,382 (1.45 %)	n/a	41.66 (99.93 %)	11,849 (0.05 %)	11,849 (0.05 %)	362,072 (99.95 %)	5,048,667 (42.42 %)	712,073 (1.24 %)	13,879,012 (34.58 %)	54 (0.00 %)	302,752 (0.79 %)	69,835 (2.20 %)	65,774 (1.90 %)
488	striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U) GCF_003009895.1	48,870 (2.41 %)	n/a	18,793 (1.67 %)	20,950 (1.44 %)	n/a	41.56 (99.29 %)	0 (0 %)	23,058 (0.71 %)	5,761 (100.00 %)	4,782,500 (41.88 %)	701,157 (1.32 %)	13,436,624 (33.05 %)	2,049 (0.04 %)	413,871 (1.33 %)	58,977 (2.20 %)	57,500 (1.94 %)
489	Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017) GCA_002844835.1	n/a	n/a	20,368 (1.53 %)	24,204 (1.23 %)	n/a	41.05 (95.54 %)	50,874 (4.40 %)	50,876 (4.40 %)	1,112,463 (95.60 %)	4,516,240 (39.90 %)	561,540 (1.56 %)	15,821,451 (34.68 %)	11,238 (0.78 %)	n/a	45,201 (1.03 %)	42,111 (0.93 %)
490	Sunda flying lemur (2014 WashU) GCF_000696425.1	34,734 (1.83 %)	n/a	21,356 (1.55 %)	25,832 (1.21 %)	n/a	40.21 (87.96 %)	332,364 (12.07 %)	412,608 (12.07 %)	511,878 (87.93 %)	4,961,153 (38.35 %)	854,441 (3.33 %)	17,562,576 (28.82 %)	58,964 (1.13 %)	n/a	82,988 (1.05 %)	76,682 (0.95 %)
491	Sunda flying lemur (US047 2019 Broad) GCA_004027255.1	n/a	n/a	24,882 (1.29 %)	43,546 (1.12 %)	n/a	40.46 (99.88 %)	5,895 (0.02 %)	5,895 (0.02 %)	1,655,642 (99.98 %)	5,807,241 (38.62 %)	953,765 (2.48 %)	18,836,777 (37.68 %)	23 (0.00 %)	n/a	114,955 (1.43 %)	106,305 (1.30 %)
492	tailed tailless bat GCA_004027475.1	n/a	n/a	19,920 (1.58 %)	28,017 (1.58 %)	n/a	41.76 (99.95 %)	4,640 (0.02 %)	4,640 (0.02 %)	341,895 (99.98 %)	3,139,817 (30.43 %)	381,536 (0.81 %)	12,069,229 (32.73 %)	25 (0.00 %)	n/a	54,528 (2.15 %)	52,231 (1.90 %)
493	takin (Tak-1 2022) GCF_023091745.1	31,914 (1.65 %)	n/a	19,290 (1.42 %)	21,656 (1.27 %)	n/a	43.32 (100.00 %)	0 (0 %)	152 (0.00 %)	1,363 (100.00 %)	3,256,033 (21.01 %)	714,375 (8.32 %)	13,010,154 (44.58 %)	4 (0.00 %)	1,681,924 (4.50 %)	49,134 (7.43 %)	39,324 (0.88 %)
494	Talazac's shrew tenrec GCA_004026705.1	n/a	n/a	22,605 (0.81 %)	50,725 (1.09 %)	n/a	43.03 (99.93 %)	6,619 (0.02 %)	6,619 (0.02 %)	795,514 (99.98 %)	3,493,378 (14.58 %)	705,274 (1.31 %)	20,975,335 (36.85 %)	51 (0.00 %)	n/a	70,793 (1.26 %)	54,287 (0.89 %)
495	tammar wallaby (mMacEug1 alternate hap 2023) GCA_028389975.1	n/a	n/a	11,133 (0.77 %)	13,869 (0.98 %)	n/a	38.63 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	14,285 (100.00 %)	3,114,522 (26.10 %)	661,874 (3.02 %)	11,667,649 (38.41 %)	0 (0 %)	320,252 (1.29 %)	12,393 (0.46 %)	7,824 (0.29 %)
496	tammar wallaby (mMacEug1 primary hap 2023) GCA_028372415.1	n/a	n/a	17,652 (0.77 %)	15,774 (0.88 %)	n/a	38.73 (99.81 %)	0 (0 %)	515 (0.19 %)	315 (100.00 %)	5,836,160 (26.14 %)	1,193,709 (2.72 %)	22,682,658 (39.52 %)	4 (0.00 %)	566,172 (1.21 %)	23,629 (0.48 %)	14,785 (0.29 %)
497	Tasmanian devil GCF_902635505.1	52,057 (2.36 %)	n/a	15,918 (0.85 %)	16,111 (0.91 %)	n/a	36.16 (100.00 %)	0 (0 %)	354 (0.00 %)	106 (100.00 %)	6,789,158 (44.28 %)	1,246,027 (2.19 %)	21,434,803 (41.20 %)	1 (0.00 %)	454,463 (1.20 %)	23,609 (0.65 %)	23,356 (0.61 %)
498	thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC) GCF_016881025.1	69,352 (3.50 %)	n/a	18,934 (1.68 %)	16,775 (1.37 %)	n/a	39.91 (93.25 %)	0 (0 %)	146,412 (6.77 %)	7,132 (100.00 %)	4,262,890 (35.64 %)	640,624 (1.64 %)	14,118,452 (27.90 %)	3,000 (0.05 %)	226,596 (0.80 %)	28,317 (0.64 %)	26,522 (0.58 %)
499	tiger GCF_018350195.1	71,226 (2.84 %)	n/a	18,513 (1.68 %)	19,919 (1.39 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	56 (0.00 %)	65 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,878,003 (42.77 %)	912,595 (1.82 %)	13,804,650 (33.76 %)	1 (0.00 %)	408,593 (1.10 %)	64,312 (2.55 %)	60,048 (2.06 %)
500	Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230055.1	n/a	n/a	19,370 (1.77 %)	21,062 (1.61 %)	n/a	42.81 (100.00 %)	219 (0.00 %)	219 (0.00 %)	610 (100.00 %)	2,923,694 (25.49 %)	772,382 (3.25 %)	10,654,074 (37.41 %)	2 (0.00 %)	500,435 (1.74 %)	48,226 (2.42 %)	50,955 (1.88 %)
501	Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230045.1	n/a	n/a	18,627 (1.82 %)	20,108 (1.67 %)	n/a	42.95 (100.00 %)	0 (0 %)	217 (0.00 %)	182 (100.00 %)	2,733,927 (24.79 %)	715,258 (3.17 %)	10,099,456 (36.35 %)	1 (0.00 %)	459,634 (1.69 %)	47,139 (2.58 %)	49,626 (1.96 %)
502	Transcaucasian mole vole GCA_001685075.1	n/a	n/a	20,173 (1.62 %)	18,627 (1.30 %)	n/a	41.51 (96.09 %)	440,846 (3.96 %)	440,846 (3.96 %)	499,269 (96.04 %)	3,827,136 (25.51 %)	810,597 (2.65 %)	13,634,524 (27.54 %)	26,487 (0.57 %)	259,635 (1.42 %)	9,596 (0.16 %)	8,622 (0.14 %)
503	Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq) GCF_000622305.1	54,667 (2.07 %)	n/a	19,704 (1.26 %)	21,262 (1.20 %)	n/a	41.26 (95.18 %)	201,121 (4.83 %)	201,121 (4.83 %)	356,097 (95.17 %)	6,165,645 (34.95 %)	1,197,750 (2.77 %)	16,282,383 (36.21 %)	730 (0.04 %)	n/a	22,905 (0.49 %)	18,563 (0.39 %)
504	Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019) GCA_005458795.1	n/a	n/a	19,867 (1.62 %)	15,893 (1.33 %)	n/a	39.77 (94.43 %)	291,728 (5.60 %)	296,819 (5.60 %)	315,631 (94.40 %)	4,452,628 (33.94 %)	751,210 (1.84 %)	13,917,879 (30.08 %)	10,755 (0.11 %)	190,776 (0.77 %)	26,541 (0.58 %)	25,046 (0.53 %)
505	vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019) GCA_008692045.1	n/a	n/a	9,367 (1.66 %)	11,297 (1.30 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	9,470 (100.00 %)	1,708,360 (43.81 %)	267,584 (1.67 %)	5,373,410 (33.52 %)	0 (0 %)	245,754 (1.84 %)	29,783 (1.94 %)	21,396 (1.51 %)
506	vaquita (mPhoSin1 2019) GCF_008692025.1	60,106 (3.00 %)	n/a	18,611 (1.76 %)	20,103 (1.39 %)	35,176 (2.22 %)	41.36 (99.66 %)	0 (0 %)	212 (0.34 %)	64 (100.00 %)	4,067,454 (44.25 %)	602,407 (1.34 %)	12,468,582 (35.55 %)	3 (0.00 %)	550,113 (1.71 %)	66,806 (1.79 %)	48,624 (1.46 %)
507	water buffalo (Mediterranean 2018) GCF_003121395.1	69,771 (3.14 %)	62,816 (2.76 %)	19,465 (1.58 %)	21,849 (1.37 %)	46,051 (1.86 %)	41.81 (99.99 %)	0 (0 %)	410 (0.01 %)	509 (100.00 %)	5,407,697 (47.11 %)	473,976 (1.54 %)	13,015,899 (41.23 %)	0 (0 %)	1,256,741 (3.44 %)	43,120 (1.15 %)	37,204 (0.96 %)
508	water buffalo (Murrah 2021) GCF_019923935.1	80,552 (3.26 %)	n/a	19,402 (1.59 %)	20,375 (1.31 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	0 (0 %)	659 (0.00 %)	26 (100.00 %)	5,358,548 (47.11 %)	447,338 (1.14 %)	13,034,537 (41.28 %)	1 (0.00 %)	1,149,595 (3.22 %)	40,189 (1.07 %)	36,130 (0.95 %)
509	Weddell seal (WS11-02 2013 refseq) GCF_000349705.1	48,251 (2.73 %)	n/a	21,063 (1.73 %)	22,333 (1.43 %)	n/a	41.39 (70.44 %)	152,836 (29.58 %)	152,836 (29.58 %)	169,547 (70.42 %)	4,420,479 (41.72 %)	471,256 (0.66 %)	13,410,237 (22.09 %)	2,022 (0.05 %)	348,917 (1.08 %)	48,738 (1.01 %)	44,867 (0.88 %)
510	western European hedgehog (2012 refseq) GCF_000296755.1	29,923 (1.67 %)	n/a	18,067 (1.33 %)	19,777 (1.35 %)	n/a	41.54 (85.94 %)	219,764 (14.09 %)	219,764 (14.09 %)	225,567 (85.91 %)	6,594,783 (45.66 %)	1,271,533 (2.29 %)	12,374,161 (42.02 %)	3,596 (0.06 %)	861,216 (2.39 %)	28,528 (0.71 %)	23,900 (0.52 %)
511	western European hedgehog (alternate hap 2023) GCA_950295305.1	n/a	n/a	14,370 (1.06 %)	24,297 (1.27 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	26,601 (100.00 %)	3,360,923 (19.59 %)	1,043,098 (3.92 %)	8,511,380 (53.68 %)	0 (0 %)	1,216,984 (4.33 %)	23,321 (0.97 %)	17,608 (0.60 %)
512	western European hedgehog (primary hap 2023 refseq) GCF_950295315.1	61,103 (2.36 %)	n/a	18,125 (1.16 %)	20,689 (1.21 %)	n/a	42.00 (99.97 %)	0 (0 %)	3,760 (0.03 %)	1,174 (100.00 %)	4,891,329 (19.68 %)	1,507,929 (3.81 %)	12,571,105 (54.50 %)	7 (0.00 %)	1,975,693 (4.67 %)	32,667 (0.90 %)	24,067 (0.56 %)
513	western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022) GCA_921998345.2	n/a	n/a	21,722 (2.14 %)	19,586 (1.39 %)	108,856 (4.46 %)	41.81 (98.87 %)	1 (0.00 %)	1,233 (1.13 %)	233 (100.00 %)	4,634,551 (40.61 %)	1,541,826 (3.49 %)	13,030,566 (35.21 %)	1 (0.00 %)	789,553 (2.49 %)	22,985 (0.56 %)	15,853 (0.42 %)
514	western spotted skunk GCA_004023965.1	n/a	n/a	21,665 (1.46 %)	34,370 (1.32 %)	n/a	41.61 (99.92 %)	11,822 (0.05 %)	11,822 (0.05 %)	433,831 (99.95 %)	4,889,781 (40.77 %)	901,906 (2.30 %)	13,931,764 (34.80 %)	69 (0.00 %)	550,674 (1.31 %)	54,394 (1.54 %)	50,665 (1.39 %)
515	western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022) GCA_921997135.2	n/a	n/a	21,699 (2.10 %)	18,837 (1.32 %)	n/a	41.69 (99.51 %)	4 (0.00 %)	1,576 (0.49 %)	143 (100.00 %)	4,507,329 (41.24 %)	1,517,241 (3.77 %)	12,832,499 (36.17 %)	35 (0.00 %)	908,992 (2.83 %)	22,568 (0.53 %)	15,701 (0.41 %)
516	white-beaked dolphin (alternate hap 2023) GCA_949774935.1	n/a	n/a	17,639 (1.50 %)	25,684 (1.35 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25,619 (100.00 %)	3,039,324 (36.05 %)	637,912 (8.02 %)	9,746,398 (38.98 %)	0 (0 %)	811,711 (3.51 %)	56,325 (3.33 %)	35,586 (1.15 %)
517	white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq) GCF_949774975.1	59,982 (2.43 %)	n/a	18,737 (1.57 %)	20,767 (1.34 %)	n/a	41.91 (99.99 %)	0 (0 %)	1,070 (0.01 %)	410 (100.00 %)	3,820,566 (36.21 %)	922,103 (8.43 %)	12,304,360 (39.74 %)	2 (0.00 %)	1,117,804 (3.60 %)	68,551 (3.58 %)	41,698 (1.09 %)
518	white-footed mouse GCF_004664715.2	54,479 (2.82 %)	n/a	19,971 (1.69 %)	20,132 (1.42 %)	n/a	42.23 (99.95 %)	0 (0 %)	2,299 (0.05 %)	1,857 (100.00 %)	5,060,487 (30.71 %)	1,258,073 (2.85 %)	14,007,098 (32.99 %)	1 (0.00 %)	568,416 (1.60 %)	23,456 (0.67 %)	19,779 (0.50 %)
519	white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq) GCF_002102435.1	57,774 (2.93 %)	n/a	20,661 (1.75 %)	23,085 (1.50 %)	40,987 (1.94 %)	41.55 (99.10 %)	31,627 (0.90 %)	107,058 (0.91 %)	48,653 (99.10 %)	4,800,704 (41.29 %)	413,129 (2.59 %)	13,296,779 (34.22 %)	7,681 (0.08 %)	439,019 (2.88 %)	44,165 (1.19 %)	41,200 (1.10 %)
520	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022) GCA_024140225.1	n/a	n/a	12,198 (1.10 %)	18,494 (1.29 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	26 (0.00 %)	26 (0.00 %)	14,841 (100.00 %)	1,725,021 (17.81 %)	802,415 (4.26 %)	8,321,474 (45.72 %)	0 (0 %)	653,092 (2.79 %)	15,669 (0.79 %)	13,175 (0.55 %)
521	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022) GCF_024139225.1	40,430 (1.81 %)	n/a	17,575 (1.21 %)	21,880 (1.35 %)	47,496 (1.55 %)	39.81 (99.57 %)	0 (0 %)	1,010 (0.43 %)	147 (100.00 %)	2,846,063 (18.57 %)	1,252,362 (3.89 %)	13,776,063 (46.50 %)	14 (0.00 %)	1,059,317 (2.87 %)	24,589 (0.78 %)	20,877 (0.55 %)
522	wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020) GCF_009834535.1	70,235 (4.11 %)	n/a	18,202 (1.93 %)	20,199 (1.66 %)	42,728 (2.35 %)	41.66 (99.99 %)	0 (0 %)	2,345 (0.01 %)	2,043 (100.00 %)	3,091,018 (33.31 %)	332,720 (5.33 %)	12,161,286 (28.79 %)	5 (0.00 %)	978,328 (2.98 %)	55,524 (1.75 %)	51,693 (1.56 %)
523	wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq) GCF_000311805.1	34,726 (2.40 %)	n/a	18,746 (1.96 %)	17,104 (1.61 %)	n/a	41.28 (98.83 %)	55,538 (1.18 %)	60,971 (1.18 %)	68,872 (98.82 %)	2,991,821 (33.93 %)	353,632 (1.23 %)	12,349,615 (25.12 %)	11 (0.00 %)	101,845 (0.63 %)	45,437 (1.02 %)	41,010 (0.88 %)
524	wild goat GCA_000978405.1	n/a	n/a	19,104 (1.48 %)	16,198 (1.21 %)	n/a	41.91 (91.72 %)	279,195 (8.31 %)	279,195 (8.31 %)	368,693 (91.69 %)	5,563,294 (45.39 %)	452,402 (1.99 %)	13,802,376 (35.47 %)	3,626 (0.18 %)	791,539 (4.01 %)	41,935 (0.63 %)	35,405 (0.52 %)
525	wild yak GCF_000298355.1	29,776 (1.92 %)	n/a	19,936 (1.62 %)	19,914 (1.32 %)	n/a	41.71 (95.48 %)	192,006 (4.54 %)	192,006 (4.54 %)	233,198 (95.46 %)	5,348,663 (46.08 %)	449,880 (1.38 %)	13,572,902 (36.62 %)	139 (0.01 %)	753,906 (2.31 %)	41,147 (0.82 %)	37,405 (0.73 %)
526	woodchuck (v1.1 L192 2022) GCF_021218885.2	68,030 (3.47 %)	n/a	19,116 (1.55 %)	21,017 (1.38 %)	n/a	39.92 (100.00 %)	47 (0.00 %)	47 (0.00 %)	3,380 (100.00 %)	5,285,788 (43.20 %)	912,552 (2.73 %)	14,538,866 (35.15 %)	0 (0 %)	413,178 (1.33 %)	36,914 (1.02 %)	26,813 (0.66 %)
527	woodland dormouse GCA_004027655.1	n/a	n/a	23,556 (1.09 %)	55,517 (1.33 %)	n/a	41.52 (99.86 %)	15,691 (0.06 %)	15,691 (0.06 %)	1,283,630 (99.94 %)	7,674,195 (34.99 %)	1,698,258 (3.76 %)	13,705,886 (42.23 %)	20 (0.00 %)	n/a	68,562 (1.41 %)	46,064 (0.97 %)
528	woodland thicket rat GCF_004785775.1	43,129 (2.40 %)	n/a	22,710 (2.13 %)	21,042 (1.49 %)	n/a	41.17 (98.57 %)	0 (0 %)	76,623 (1.44 %)	23,656 (100.00 %)	4,732,544 (38.04 %)	1,424,025 (3.23 %)	13,549,399 (30.42 %)	5,008 (0.04 %)	449,709 (1.17 %)	18,232 (0.48 %)	16,831 (0.43 %)
529	Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq) GCF_003031525.2	43,297 (2.49 %)	n/a	18,747 (1.81 %)	19,638 (1.46 %)	n/a	41.28 (99.29 %)	52,647 (0.72 %)	52,647 (0.72 %)	66,343 (99.28 %)	3,547,466 (35.83 %)	540,760 (1.65 %)	12,691,756 (32.88 %)	427 (0.03 %)	363,612 (1.97 %)	59,050 (1.48 %)	55,323 (1.35 %)
530	Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq) GCF_000442215.2	26,115 (1.61 %)	n/a	18,978 (1.74 %)	20,661 (1.39 %)	n/a	41.24 (98.69 %)	123,788 (1.33 %)	123,788 (1.33 %)	148,598 (98.67 %)	3,788,303 (37.04 %)	690,288 (1.96 %)	12,841,906 (35.04 %)	292 (0.02 %)	514,620 (2.01 %)	62,458 (1.54 %)	59,005 (1.41 %)
531	yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019) GCF_003676075.3	42,654 (2.16 %)	n/a	19,547 (1.52 %)	21,406 (1.40 %)	n/a	39.89 (97.96 %)	34,682 (2.04 %)	35,509 (2.04 %)	66,442 (97.96 %)	3,814,223 (27.39 %)	800,865 (1.96 %)	14,323,977 (32.63 %)	1,266 (0.04 %)	210,361 (0.69 %)	34,122 (0.91 %)	26,843 (0.62 %)
532	yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021) GCF_016432865.1	47,606 (2.50 %)	n/a	15,703 (0.78 %)	16,155 (0.90 %)	n/a	36.21 (99.99 %)	0 (0 %)	620 (0.01 %)	486 (100.00 %)	5,191,383 (23.81 %)	1,269,772 (2.59 %)	21,430,585 (42.69 %)	2 (0.00 %)	714,623 (2.20 %)	28,118 (0.66 %)	28,157 (0.56 %)
533	yellow-spotted hyrax GCA_004026845.1	n/a	n/a	20,424 (0.86 %)	43,984 (1.27 %)	n/a	40.93 (99.94 %)	3,815 (0.01 %)	3,815 (0.01 %)	971,748 (99.99 %)	5,365,974 (31.41 %)	435,699 (1.22 %)	21,229,266 (45.17 %)	42 (0.00 %)	n/a	38,521 (0.68 %)	31,852 (0.55 %)
534	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023) GCA_028571685.1	n/a	n/a	17,610 (1.00 %)	20,322 (1.04 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	0 (0 %)	276 (0.00 %)	62 (100.00 %)	3,295,935 (23.58 %)	389,907 (6.37 %)	19,525,382 (45.90 %)	0 (0 %)	1,020,287 (2.23 %)	31,831 (0.63 %)	26,588 (0.47 %)
535	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023) GCA_028571665.1	n/a	n/a	16,320 (1.03 %)	20,318 (1.13 %)	n/a	40.93 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	4,169 (100.00 %)	2,911,332 (23.50 %)	347,110 (4.57 %)	17,256,419 (44.04 %)	0 (0 %)	683,195 (1.71 %)	28,674 (0.68 %)	24,228 (0.50 %)
536	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023) GCA_028536395.1	n/a	n/a	19,188 (1.79 %)	21,673 (1.72 %)	n/a	43.03 (100.00 %)	0 (0 %)	215 (0.00 %)	250 (100.00 %)	3,043,589 (24.76 %)	773,853 (4.49 %)	10,648,494 (37.26 %)	2 (0.00 %)	684,501 (2.39 %)	61,910 (2.52 %)	51,884 (1.68 %)
537	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023) GCA_028538775.1	n/a	n/a	18,587 (1.82 %)	21,049 (1.76 %)	n/a	43.22 (100.00 %)	209 (0.00 %)	209 (0.00 %)	685 (100.00 %)	2,890,086 (24.28 %)	719,555 (4.26 %)	10,089,514 (36.35 %)	0 (0 %)	649,001 (2.37 %)	60,975 (2.61 %)	51,711 (1.75 %)
538	zebu cattle (Nelore 2014 refseq) GCF_000247795.1	39,817 (2.52 %)	n/a	18,603 (1.59 %)	18,779 (1.29 %)	n/a	41.75 (92.62 %)	253,738 (7.41 %)	6,941,272 (7.66 %)	253,770 (92.59 %)	5,119,428 (46.84 %)	358,908 (0.88 %)	13,431,672 (36.60 %)	476 (0.01 %)	998,817 (3.00 %)	35,241 (0.84 %)	32,220 (0.75 %)
TOTALS:	total assembly count 538

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	215 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	538 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	356 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	391 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	222 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	717 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	299 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	662 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	281 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	103 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	442 assemblies	assembly stats	track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project	882 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	96 assemblies	assembly stats	track stats