Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

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count	common name link to genome browser	ncbiRefSeq	ncbiGene	xenoRefGene	augustus genes	Ensembl genes	gc5 base	AGP gap	all gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	gap Overlap	tandem Dups	cpg unmasked	cpg island
1	aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad) GCF_000298275.1	25,594 (1.08 %)	n/a	18,351 (1.06 %)	20,358 (0.98 %)	n/a	40.07 (76.89 %)	411,144 (23.15 %)	411,144 (23.15 %)	433,653 (76.85 %)	n/a	536,700 (0.74 %)	18,176,790 (39.08 %)	3,595 (0.03 %)	723,185 (1.16 %)	26,235 (0.40 %)	24,645 (0.35 %)
2	African grass rat (maternal 2020) GCA_011750645.1	n/a	n/a	20,916 (2.01 %)	19,513 (1.43 %)	n/a	41.37 (98.89 %)	0 (0 %)	1,526 (1.11 %)	1,610 (100.00 %)	4,928,847 (37.45 %)	1,652,295 (5.20 %)	13,507,965 (32.27 %)	0 (0 %)	1,023,525 (1.96 %)	17,712 (0.51 %)	16,897 (0.46 %)
3	African grass rat (paternal 2020) GCA_011762545.1	n/a	n/a	20,796 (2.00 %)	19,611 (1.43 %)	n/a	41.42 (97.70 %)	0 (0 %)	1,563 (2.30 %)	1,740 (100.00 %)	4,904,243 (37.25 %)	1,672,608 (5.37 %)	13,465,246 (32.19 %)	1 (0.00 %)	1,034,950 (2.07 %)	17,677 (0.50 %)	16,772 (0.46 %)
4	African grass rat (v1 paternal X 2020 refseq) GCF_011762505.1	45,963 (2.46 %)	n/a	20,878 (1.99 %)	19,613 (1.43 %)	37,929 (2.32 %)	41.39 (99.19 %)	0 (0 %)	1,624 (0.81 %)	1,595 (100.00 %)	4,939,557 (37.33 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,429 (32.71 %)	2 (0.00 %)	1,065,249 (2.09 %)	17,767 (0.51 %)	16,852 (0.46 %)
5	African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank) GCA_011762505.2	n/a	n/a	19,637 (1.95 %)	19,610 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	0 (0 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	5,399,465 (42.90 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,540 (32.71 %)	2 (0.00 %)	979,697 (2.05 %)	17,767 (0.51 %)	15,566 (0.42 %)
6	African grass rat (v2 paternal X 2025 refseq) GCF_011762505.2	70,837 (3.51 %)	n/a	19,640 (1.95 %)	19,607 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	0 (0 %)	1,624 (0.81 %)	1,595 (100.00 %)	5,625,390 (42.96 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,612,806 (32.71 %)	2 (0.00 %)	855,406 (1.69 %)	17,767 (0.51 %)	15,567 (0.42 %)
7	African grass rat (v3 paternal hap 2024) GCA_011762505.3	n/a	n/a	20,986 (2.01 %)	19,611 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	0 (0 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	4,532,782 (33.95 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,612,916 (32.71 %)	2 (0.00 %)	1,064,933 (2.09 %)	17,767 (0.51 %)	16,931 (0.46 %)
8	African hunting dog GCA_001887905.1	n/a	n/a	18,956 (1.75 %)	17,562 (1.41 %)	n/a	40.98 (92.89 %)	0 (0 %)	1,415,298 (7.28 %)	803 (100.00 %)	4,458,183 (39.99 %)	658,637 (1.13 %)	13,671,493 (28.24 %)	854 (0.01 %)	288,980 (0.71 %)	47,644 (1.64 %)	45,393 (1.41 %)
9	African hunting dog (LycPic1hap1 2024) GCA_040955645.1	n/a	n/a	18,688 (1.61 %)	19,670 (1.44 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	1 (0.00 %)	82 (0.00 %)	86 (100.00 %)	4,281,139 (31.62 %)	959,378 (2.78 %)	12,859,760 (32.95 %)	1 (0.00 %)	632,917 (1.70 %)	49,122 (2.32 %)	45,729 (1.55 %)
10	African hunting dog (LycPic1hap2 2024) GCA_040955705.1	n/a	n/a	19,463 (1.58 %)	20,378 (1.42 %)	n/a	41.30 (100.00 %)	1 (0.00 %)	91 (0.00 %)	77 (100.00 %)	4,513,580 (32.16 %)	1,008,611 (2.91 %)	13,570,452 (33.71 %)	2 (0.00 %)	686,092 (1.77 %)	50,954 (2.21 %)	46,966 (1.51 %)
11	African savanna elephant (2009 refseq) GCF_000001905.1	46,043 (2.30 %)	n/a	19,169 (1.26 %)	19,664 (1.10 %)	n/a	40.76 (97.57 %)	93,514 (2.45 %)	93,514 (2.45 %)	95,866 (97.55 %)	6,363,315 (57.54 %)	365,797 (0.88 %)	16,073,053 (44.89 %)	11 (0.00 %)	417,291 (1.06 %)	33,513 (0.68 %)	24,503 (0.51 %)
12	African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023) GCA_030020305.1	n/a	n/a	18,845 (1.07 %)	22,426 (1.10 %)	n/a	41.34 (99.85 %)	169 (0.15 %)	169 (0.15 %)	1,253 (99.85 %)	4,406,744 (29.55 %)	925,868 (4.71 %)	15,966,881 (50.49 %)	0 (0 %)	1,248,627 (2.71 %)	68,531 (1.61 %)	23,142 (0.47 %)
13	African savanna elephant (hap2 2023 genbank) GCA_030014295.1	n/a	n/a	18,981 (1.10 %)	22,759 (1.12 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	0 (0 %)	231 (0.10 %)	880 (100.00 %)	4,426,756 (29.95 %)	832,908 (4.08 %)	16,118,910 (49.47 %)	1 (0.00 %)	1,082,958 (2.38 %)	62,315 (1.49 %)	23,783 (0.48 %)
14	African savanna elephant (hap2 2023 refseq) GCF_030014295.1	64,034 (3.35 %)	n/a	18,980 (1.10 %)	21,593 (1.06 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	0 (0 %)	231 (0.10 %)	879 (100.00 %)	4,426,749 (29.95 %)	832,904 (4.08 %)	16,118,888 (49.47 %)	1 (0.00 %)	1,082,957 (2.38 %)	62,314 (1.49 %)	23,783 (0.48 %)
15	agile gracile mouse opossum GCF_016433145.1	30,697 (1.32 %)	n/a	17,361 (0.78 %)	17,596 (0.81 %)	n/a	37.86 (91.75 %)	0 (0 %)	85,142 (8.25 %)	60,714 (100.00 %)	7,917,577 (49.04 %)	1,054,566 (1.57 %)	22,701,659 (37.69 %)	3,920 (0.14 %)	434,964 (1.27 %)	27,301 (0.49 %)	25,777 (0.43 %)
16	Allen's wood mouse (MVZ Mamm 196246 2021) GCA_019843855.1	n/a	n/a	22,687 (1.16 %)	46,299 (0.94 %)	n/a	41.37 (99.72 %)	75,967 (0.24 %)	75,967 (0.24 %)	659,537 (99.76 %)	6,139,432 (45.57 %)	1,339,550 (3.13 %)	12,293,115 (32.34 %)	6,671 (0.10 %)	n/a	16,575 (0.44 %)	15,096 (0.40 %)
17	alpaca (2025) GCF_048564905.1	80,233 (3.11 %)	n/a	18,667 (1.53 %)	23,043 (1.52 %)	n/a	41.92 (99.91 %)	0 (0 %)	681 (0.09 %)	519 (100.00 %)	3,387,094 (33.34 %)	395,581 (10.22 %)	11,510,740 (36.96 %)	5 (0.00 %)	727,944 (2.17 %)	72,497 (1.98 %)	52,064 (1.17 %)
18	alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U) GCF_000164845.4	54,987 (3.56 %)	n/a	18,439 (1.93 %)	18,426 (1.63 %)	n/a	41.40 (95.85 %)	0 (0 %)	166,272 (4.17 %)	77,389 (100.00 %)	3,004,413 (33.17 %)	315,092 (1.36 %)	12,458,272 (24.89 %)	1,213 (0.03 %)	207,593 (1.22 %)	54,502 (1.38 %)	49,907 (1.20 %)
19	Alpine marmot (2019) GCF_001458135.2	69,587 (3.43 %)	n/a	19,047 (1.54 %)	17,768 (1.39 %)	n/a	39.80 (96.13 %)	0 (0 %)	88,858 (3.88 %)	14,031 (100.00 %)	3,726,252 (26.48 %)	746,953 (1.83 %)	14,066,368 (30.30 %)	494 (0.01 %)	202,554 (0.77 %)	30,191 (0.63 %)	24,232 (0.48 %)
20	Alvarez's mastiff bat (A012 2023) GCA_031001765.1	n/a	n/a	19,086 (1.55 %)	22,040 (1.52 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1,182 (0.01 %)	1,182 (0.01 %)	1,369 (99.99 %)	3,846,728 (31.78 %)	639,852 (2.90 %)	11,937,936 (38.98 %)	24 (0.00 %)	819,376 (2.67 %)	75,377 (2.21 %)	66,761 (1.68 %)
21	Alvarez's mastiff bat (hap1 2024) GCA_037157525.1	n/a	n/a	18,980 (1.50 %)	22,394 (1.50 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	0 (0 %)	80 (0.00 %)	326 (100.00 %)	3,896,863 (31.56 %)	659,711 (4.74 %)	11,945,162 (40.81 %)	3 (0.00 %)	979,504 (2.79 %)	76,769 (2.57 %)	66,591 (1.63 %)
22	Alvarez's mastiff bat (hap2 2024) GCA_037176705.1	n/a	n/a	19,066 (1.48 %)	22,356 (1.48 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	0 (0 %)	75 (0.00 %)	287 (100.00 %)	3,908,607 (31.48 %)	664,931 (5.23 %)	11,892,191 (41.08 %)	1 (0.00 %)	994,645 (2.87 %)	76,453 (2.43 %)	66,568 (1.61 %)
23	Amazon manatee (hap1 2025) GCA_046562985.1	n/a	n/a	17,917 (1.26 %)	20,499 (1.11 %)	n/a	40.77 (100.00 %)	0 (0 %)	377 (0.00 %)	550 (100.00 %)	5,812,915 (56.93 %)	431,488 (2.57 %)	14,336,638 (47.98 %)	1 (0.00 %)	593,346 (1.52 %)	33,775 (0.84 %)	28,206 (0.66 %)
24	Amazon manatee (hap2 2025) GCA_046562895.1	n/a	n/a	18,949 (1.23 %)	21,655 (1.08 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	0 (0 %)	294 (0.00 %)	401 (100.00 %)	6,218,266 (57.31 %)	470,437 (3.04 %)	15,241,157 (48.91 %)	1 (0.00 %)	714,873 (1.68 %)	37,124 (0.86 %)	30,784 (0.66 %)
25	American beaver (hap1 2025) GCA_047511655.1	n/a	n/a	19,828 (1.45 %)	20,376 (1.31 %)	n/a	39.72 (100.00 %)	1 (0.00 %)	181 (0.00 %)	503 (100.00 %)	4,030,880 (35.35 %)	566,770 (2.63 %)	14,198,970 (35.24 %)	9 (0.00 %)	640,099 (2.12 %)	24,454 (0.96 %)	23,257 (0.88 %)
26	American beaver (hap2 2025) GCA_047511605.1	n/a	n/a	19,144 (1.44 %)	18,959 (1.23 %)	n/a	39.54 (100.00 %)	1 (0.00 %)	194 (0.00 %)	229 (100.00 %)	3,981,637 (35.85 %)	561,691 (2.26 %)	14,374,940 (35.03 %)	6 (0.00 %)	576,331 (1.99 %)	23,386 (0.80 %)	22,058 (0.72 %)
27	American beaver (mCasCan1.hap1v2 2025) GCF_047511655.1	79,343 (3.55 %)	n/a	19,759 (1.46 %)	19,920 (1.23 %)	n/a	39.67 (100.00 %)	0 (0 %)	181 (0.00 %)	181 (100.00 %)	4,023,733 (35.50 %)	563,158 (2.55 %)	14,502,226 (35.45 %)	9 (0.00 %)	635,015 (2.11 %)	23,983 (0.89 %)	22,786 (0.80 %)
28	American beaver (Ward 2017 refseq) GCF_001984765.1	40,013 (2.15 %)	n/a	20,867 (1.53 %)	24,201 (1.33 %)	n/a	39.72 (99.99 %)	0 (0 %)	3,321 (0.01 %)	21,157 (100.00 %)	4,526,430 (33.75 %)	486,353 (1.30 %)	14,347,145 (31.96 %)	19 (0.00 %)	463,382 (1.20 %)	23,046 (0.72 %)	22,461 (0.67 %)
29	American bison (2014 refseq) GCF_000754665.1	38,699 (2.34 %)	n/a	19,782 (1.47 %)	20,444 (1.25 %)	n/a	41.82 (93.12 %)	341,984 (6.92 %)	341,984 (6.92 %)	470,415 (93.08 %)	n/a	419,596 (0.95 %)	13,519,877 (37.66 %)	8,184 (0.08 %)	n/a	60,388 (1.03 %)	36,362 (0.64 %)
30	American black bear (L20-20 alternate hap 2022) GCA_024610745.1	n/a	n/a	22,502 (1.17 %)	43,431 (1.28 %)	n/a	43.14 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	77,311 (100.00 %)	4,587,986 (32.30 %)	773,829 (6.39 %)	14,594,034 (35.67 %)	0 (0 %)	1,078,790 (3.25 %)	78,849 (3.32 %)	57,618 (1.17 %)
31	American black bear (L20-20 primary hap 2022) GCA_024610735.1	n/a	n/a	18,458 (1.52 %)	21,049 (1.43 %)	n/a	42.93 (100.00 %)	0 (0 %)	22 (0.00 %)	317 (100.00 %)	4,000,508 (32.69 %)	641,903 (5.91 %)	13,210,530 (35.54 %)	0 (0 %)	996,585 (3.22 %)	68,981 (3.00 %)	52,140 (1.23 %)
32	American black bear (UA15103 2021) GCF_020975775.1	53,916 (3.11 %)	n/a	18,840 (1.73 %)	20,969 (1.50 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,213 (100.00 %)	3,936,528 (34.53 %)	594,864 (2.90 %)	13,725,005 (32.35 %)	0 (0 %)	629,590 (1.78 %)	62,580 (1.91 %)	56,387 (1.69 %)
33	American mink (2018) GCA_900108605.1	n/a	n/a	18,686 (1.70 %)	20,016 (1.50 %)	36,997 (1.74 %)	41.60 (92.95 %)	154,172 (7.07 %)	154,172 (7.07 %)	161,347 (92.93 %)	4,350,343 (38.70 %)	606,128 (1.17 %)	13,605,797 (28.74 %)	2,225 (0.02 %)	334,330 (1.15 %)	54,199 (1.98 %)	53,125 (1.77 %)
34	American mink (hap1 2024) GCA_964106545.1	n/a	n/a	19,203 (1.43 %)	22,174 (1.33 %)	n/a	42.39 (99.98 %)	0 (0 %)	2,957 (0.02 %)	435 (100.00 %)	4,188,829 (30.04 %)	802,295 (5.81 %)	14,041,290 (37.98 %)	19 (0.00 %)	1,190,442 (3.02 %)	65,430 (2.64 %)	54,362 (1.78 %)
35	American mink (hap2 2024) GCA_964106205.1	n/a	n/a	18,890 (1.43 %)	21,684 (1.33 %)	n/a	42.35 (99.98 %)	2,849 (0.02 %)	2,849 (0.02 %)	3,200 (99.98 %)	4,158,563 (30.22 %)	786,430 (5.25 %)	13,845,377 (37.58 %)	10 (0.00 %)	1,137,591 (2.93 %)	64,307 (2.75 %)	53,505 (1.79 %)
36	American mink (M4711 2021 Dalhousie U) GCF_020171115.1	50,253 (2.26 %)	n/a	18,949 (1.49 %)	20,914 (1.29 %)	n/a	42.26 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	183 (100.00 %)	4,705,680 (39.15 %)	795,684 (5.50 %)	14,085,357 (37.99 %)	0 (0 %)	1,135,030 (2.90 %)	63,307 (2.38 %)	63,004 (2.19 %)
37	American pika (hap1 2023) GCF_030435755.1	45,008 (1.93 %)	n/a	17,997 (1.35 %)	23,185 (1.49 %)	n/a	44.16 (100.00 %)	0 (0 %)	432 (0.00 %)	5,864 (100.00 %)	4,126,248 (43.60 %)	628,344 (15.71 %)	11,100,962 (42.69 %)	18 (0.00 %)	1,888,430 (5.34 %)	60,350 (1.67 %)	30,970 (1.18 %)
38	American pika (hap2 2023) GCA_030435715.1	n/a	n/a	16,911 (1.23 %)	21,107 (1.43 %)	n/a	44.43 (100.00 %)	6 (0.00 %)	375 (0.00 %)	6,123 (100.00 %)	1,808,768 (10.42 %)	561,106 (21.05 %)	10,283,513 (45.97 %)	16 (0.00 %)	2,348,969 (6.68 %)	54,919 (1.33 %)	26,689 (0.79 %)
39	American pika 3.0 (2012 Broad refseq) GCF_000292845.1	26,240 (1.93 %)	n/a	17,576 (1.61 %)	20,076 (1.70 %)	n/a	43.35 (87.20 %)	122,542 (12.82 %)	122,542 (12.82 %)	132,962 (87.18 %)	2,761,257 (29.47 %)	414,896 (1.07 %)	10,968,698 (26.71 %)	1,958 (0.04 %)	269,478 (1.11 %)	44,652 (1.14 %)	26,757 (0.80 %)
40	American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020) GCF_014633375.1	31,887 (1.92 %)	n/a	17,532 (1.60 %)	19,609 (1.65 %)	n/a	43.35 (87.14 %)	0 (0 %)	124,941 (12.88 %)	9,351 (100.00 %)	2,827,662 (29.77 %)	414,980 (1.07 %)	10,969,165 (26.69 %)	1,976 (0.04 %)	271,948 (1.12 %)	44,743 (1.13 %)	26,798 (0.80 %)
41	American wolverine (FN33715 2022) GCA_024509225.1	n/a	9,758 (0.77 %)	18,360 (1.57 %)	20,615 (1.47 %)	n/a	41.70 (100.00 %)	53 (0.00 %)	53 (0.00 %)	758 (100.00 %)	4,038,995 (32.25 %)	664,825 (1.25 %)	13,625,080 (33.05 %)	0 (0 %)	485,617 (1.31 %)	56,595 (2.13 %)	52,911 (1.70 %)
42	Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq) GCF_000464555.1	33,681 (2.23 %)	n/a	17,929 (1.49 %)	15,090 (1.29 %)	n/a	41.40 (97.59 %)	155,553 (2.44 %)	155,553 (2.44 %)	157,032 (97.56 %)	n/a	831,136 (1.67 %)	13,654,437 (31.78 %)	59 (0.00 %)	289,892 (0.97 %)	65,229 (1.60 %)	56,194 (1.22 %)
43	Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024) GCA_043748645.1	n/a	n/a	18,528 (1.65 %)	22,359 (1.64 %)	n/a	42.89 (100.00 %)	6 (0.00 %)	88 (0.00 %)	44 (100.00 %)	3,531,044 (35.70 %)	555,304 (2.07 %)	11,439,853 (36.03 %)	0 (0 %)	663,932 (1.99 %)	102,112 (3.75 %)	92,727 (2.81 %)
44	Angus cow (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018) GCA_003369685.2	n/a	n/a	19,096 (1.59 %)	20,674 (1.34 %)	n/a	41.99 (99.75 %)	0 (0 %)	277 (0.25 %)	1,435 (100.00 %)	5,290,422 (47.51 %)	478,946 (1.94 %)	12,568,313 (41.15 %)	0 (0 %)	1,196,258 (3.44 %)	45,850 (1.37 %)	36,573 (1.00 %)
45	Antarctic minke whale GCA_000978805.1	n/a	n/a	23,312 (1.49 %)	45,535 (1.26 %)	n/a	40.73 (99.37 %)	299,456 (0.64 %)	299,456 (0.64 %)	720,900 (99.36 %)	4,011,313 (41.13 %)	504,837 (1.04 %)	13,553,641 (30.96 %)	200 (0.00 %)	66,191 (0.20 %)	56,223 (1.31 %)	44,709 (1.10 %)
46	Antillean ghost-faced bat GCA_004026545.1	n/a	n/a	20,088 (1.74 %)	31,558 (1.63 %)	n/a	41.74 (99.97 %)	1,835 (0.01 %)	1,835 (0.01 %)	207,094 (99.99 %)	3,025,044 (30.67 %)	332,606 (0.70 %)	12,504,556 (28.79 %)	7 (0.00 %)	n/a	65,503 (2.30 %)	62,089 (2.01 %)
47	aoudad GCA_002201775.1	n/a	n/a	19,905 (1.62 %)	27,488 (1.60 %)	n/a	42.01 (95.96 %)	186,672 (4.05 %)	186,672 (4.05 %)	263,992 (95.95 %)	5,418,013 (45.05 %)	471,426 (1.19 %)	13,396,252 (36.94 %)	4,983 (0.03 %)	648,031 (1.83 %)	48,844 (1.32 %)	44,082 (1.20 %)
48	Arabian camel (Drom800 2019 refseq) GCF_000803125.2	64,532 (3.85 %)	n/a	18,483 (1.89 %)	20,554 (1.62 %)	n/a	41.51 (99.22 %)	0 (0 %)	47,342 (0.79 %)	21,070 (100.00 %)	3,233,022 (34.07 %)	345,049 (1.55 %)	13,383,050 (26.19 %)	87 (0.01 %)	348,169 (1.51 %)	58,872 (1.79 %)	54,784 (1.59 %)
49	Arabian camel (hap2 2024) GCA_036321565.1	n/a	n/a	17,085 (1.73 %)	19,317 (1.59 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	0 (0 %)	210 (0.00 %)	173 (100.00 %)	2,818,446 (29.44 %)	316,646 (8.90 %)	11,192,133 (31.47 %)	1 (0.00 %)	1,151,809 (3.75 %)	52,135 (1.67 %)	44,943 (1.23 %)
50	Arabian camel (paternal hap 2024 genbank) GCA_036321535.1	n/a	n/a	18,080 (1.66 %)	20,345 (1.52 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	0 (0 %)	195 (0.00 %)	172 (100.00 %)	3,040,473 (29.22 %)	343,482 (10.93 %)	11,797,012 (33.50 %)	2 (0.00 %)	1,611,842 (4.73 %)	55,428 (1.61 %)	47,478 (1.18 %)
51	Arabian camel (paternal hap 2024 refseq) GCF_036321535.1	62,940 (3.46 %)	n/a	18,078 (1.66 %)	21,071 (1.56 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	0 (0 %)	195 (0.00 %)	171 (100.00 %)	3,040,467 (29.22 %)	343,480 (10.93 %)	11,796,955 (33.50 %)	2 (0.00 %)	1,611,842 (4.73 %)	55,427 (1.61 %)	47,478 (1.18 %)
52	Arctic fox (Blue_001 2021 refseq) GCF_018345385.1	60,759 (3.11 %)	n/a	19,942 (1.72 %)	19,529 (1.38 %)	n/a	41.27 (100.00 %)	0 (0 %)	529 (0.00 %)	929 (100.00 %)	4,821,229 (41.22 %)	1,006,124 (2.31 %)	13,556,149 (32.92 %)	1 (0.00 %)	686,539 (2.19 %)	49,997 (2.23 %)	50,342 (1.99 %)
53	Arctic ground squirrel (AGS 11-09-20 2018) GCF_003426925.1	39,569 (2.25 %)	n/a	18,954 (1.74 %)	19,372 (1.45 %)	n/a	39.95 (89.51 %)	0 (0 %)	2,429,461 (10.59 %)	15,883 (100.00 %)	4,400,304 (32.67 %)	672,831 (1.50 %)	13,913,477 (26.41 %)	1,383 (0.11 %)	167,257 (0.60 %)	27,575 (0.72 %)	26,295 (0.67 %)
54	Arctic ground squirrel (hap1 2024) GCA_045843805.1	n/a	n/a	20,255 (1.35 %)	21,401 (1.44 %)	n/a	40.08 (100.00 %)	0 (0 %)	694 (0.00 %)	2,530 (100.00 %)	4,287,108 (25.85 %)	895,123 (5.96 %)	15,722,314 (36.45 %)	3 (0.00 %)	1,383,542 (4.24 %)	34,781 (0.82 %)	29,107 (0.60 %)
55	Arctic ground squirrel (hap2 2024) GCA_045843765.1	n/a	n/a	18,385 (1.31 %)	19,099 (1.34 %)	n/a	39.97 (100.00 %)	0 (0 %)	590 (0.00 %)	2,307 (100.00 %)	4,314,945 (35.63 %)	820,736 (6.65 %)	14,490,422 (35.95 %)	2 (0.00 %)	1,426,241 (3.70 %)	31,201 (0.78 %)	25,818 (0.56 %)
56	Asian palm civet GCA_004024585.1	n/a	n/a	22,124 (1.43 %)	43,710 (1.39 %)	n/a	42.52 (99.95 %)	4,533 (0.02 %)	4,533 (0.02 %)	442,658 (99.98 %)	4,877,367 (40.32 %)	754,440 (1.35 %)	14,557,779 (32.29 %)	38 (0.00 %)	163,468 (0.41 %)	148,246 (5.67 %)	137,633 (4.25 %)
57	Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022) GCA_024166345.1	n/a	n/a	17,906 (1.18 %)	21,966 (1.14 %)	n/a	41.14 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	6,361 (100.00 %)	3,818,524 (29.72 %)	533,426 (3.22 %)	14,381,781 (47.30 %)	0 (0 %)	613,432 (1.61 %)	50,264 (1.15 %)	21,331 (0.51 %)
58	Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022) GCF_024166365.1	61,202 (2.60 %)	n/a	18,887 (1.13 %)	21,194 (1.06 %)	n/a	41.14 (99.90 %)	0 (0 %)	126 (0.10 %)	64 (100.00 %)	4,358,470 (31.27 %)	663,094 (4.56 %)	16,261,778 (48.66 %)	1 (0.00 %)	851,540 (1.93 %)	69,120 (1.32 %)	23,319 (0.49 %)
59	Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020) GCA_014523465.1	n/a	n/a	19,569 (1.59 %)	21,293 (1.35 %)	n/a	41.97 (99.68 %)	0 (0 %)	257 (0.32 %)	128 (100.00 %)	5,390,761 (47.15 %)	451,837 (1.15 %)	13,157,608 (40.67 %)	0 (0 %)	983,804 (2.72 %)	44,158 (1.19 %)	39,278 (1.06 %)
60	Asiatic tapir (hap1 2023) GCA_031878655.1	n/a	n/a	18,969 (1.75 %)	20,207 (1.36 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	3 (0.00 %)	79 (0.00 %)	262 (100.00 %)	3,650,963 (38.06 %)	355,322 (2.63 %)	14,837,952 (31.37 %)	1 (0.00 %)	267,829 (0.92 %)	37,174 (1.87 %)	37,977 (1.58 %)
61	Asiatic tapir (hap2 2023) GCA_031878705.1	n/a	n/a	18,931 (1.76 %)	19,988 (1.37 %)	n/a	41.16 (100.00 %)	0 (0 %)	92 (0.00 %)	193 (100.00 %)	3,632,286 (38.21 %)	350,074 (2.22 %)	14,785,531 (30.90 %)	1 (0.00 %)	254,432 (0.91 %)	36,699 (1.70 %)	36,659 (1.49 %)
62	ass (Dezhou 2021) GCF_016077325.2	84,046 (4.01 %)	n/a	18,838 (1.75 %)	20,239 (1.42 %)	69,689 (3.29 %)	41.42 (99.86 %)	0 (0 %)	1,922 (0.15 %)	50 (100.00 %)	3,840,509 (41.57 %)	319,943 (0.81 %)	14,889,114 (29.46 %)	1 (0.00 %)	180,097 (0.75 %)	41,082 (1.37 %)	38,212 (1.20 %)
63	ass (Donkey D_3611 2024) GCF_041296235.1	92,510 (3.84 %)	n/a	18,566 (1.54 %)	21,504 (1.32 %)	n/a	42.37 (99.94 %)	0 (0 %)	7 (0.06 %)	849 (100.00 %)	3,555,052 (38.38 %)	658,645 (5.79 %)	14,242,715 (36.79 %)	1 (0.01 %)	489,643 (1.48 %)	43,875 (3.45 %)	39,831 (2.77 %)
64	ass (Maral har 2015 refseq) GCF_001305755.1	48,976 (3.12 %)	n/a	18,838 (1.78 %)	19,295 (1.44 %)	n/a	41.28 (98.63 %)	0 (0 %)	69,593 (1.38 %)	2,167 (100.00 %)	3,731,432 (40.84 %)	289,737 (0.96 %)	14,695,308 (28.58 %)	5,680 (0.23 %)	136,343 (0.85 %)	40,025 (1.06 %)	36,660 (0.92 %)
65	Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024) GCA_964270905.1	n/a	n/a	18,773 (1.50 %)	21,069 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1 (0.00 %)	1,034 (0.01 %)	900 (100.00 %)	3,975,427 (35.64 %)	1,054,000 (10.27 %)	12,281,095 (41.92 %)	6 (0.00 %)	2,009,438 (5.51 %)	79,762 (4.08 %)	42,028 (1.04 %)
66	Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024) GCA_964270935.1	n/a	n/a	17,961 (1.59 %)	20,087 (1.36 %)	n/a	42.05 (99.99 %)	917 (0.01 %)	917 (0.01 %)	1,796 (99.99 %)	3,626,392 (35.51 %)	824,778 (7.32 %)	11,499,904 (39.18 %)	3 (0.00 %)	1,314,679 (4.17 %)	74,348 (3.46 %)	40,100 (1.09 %)
67	Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020) GCA_015852515.1	n/a	n/a	13,505 (1.03 %)	18,978 (1.47 %)	n/a	45.32 (99.98 %)	0 (0 %)	26 (0.02 %)	3,482 (100.00 %)	6,880,857 (41.88 %)	1,099,932 (7.47 %)	8,156,735 (56.68 %)	0 (0 %)	4,129,545 (10.90 %)	70,515 (2.88 %)	41,464 (1.12 %)
68	Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020) GCF_015852505.1	42,938 (2.28 %)	n/a	14,891 (1.01 %)	19,714 (1.45 %)	n/a	45.30 (98.61 %)	0 (0 %)	524 (1.39 %)	310 (100.00 %)	7,814,876 (42.89 %)	1,219,764 (6.93 %)	9,488,325 (55.68 %)	1 (0.00 %)	4,597,115 (10.42 %)	78,364 (2.73 %)	45,620 (1.05 %)
69	Bactrian camel (Alxa 2014 refseq) GCF_000767855.1	52,191 (3.64 %)	n/a	18,303 (1.98 %)	17,097 (1.64 %)	n/a	41.32 (99.32 %)	31,980 (0.69 %)	31,980 (0.69 %)	67,435 (99.31 %)	2,966,704 (34.06 %)	306,997 (0.95 %)	12,209,949 (25.43 %)	58 (0.01 %)	73,573 (0.41 %)	49,790 (1.25 %)	45,376 (1.09 %)
70	Bactrian camel YW-2024 2025 GCF_048773025.1	76,927 (4.47 %)	n/a	18,239 (1.57 %)	22,111 (1.51 %)	n/a	41.95 (100.00 %)	0 (0 %)	127 (0.00 %)	158 (100.00 %)	3,258,307 (30.21 %)	377,352 (13.70 %)	11,533,205 (36.22 %)	1 (0.00 %)	1,968,776 (5.41 %)	65,887 (1.95 %)	48,815 (1.13 %)
71	banded mongoose GCA_004023785.1	n/a	n/a	21,568 (1.57 %)	30,427 (1.43 %)	n/a	42.00 (99.96 %)	4,510 (0.02 %)	4,510 (0.02 %)	316,874 (99.98 %)	4,768,524 (40.51 %)	684,187 (1.30 %)	13,713,756 (33.42 %)	6 (0.00 %)	227,084 (0.54 %)	78,648 (2.80 %)	76,038 (2.38 %)
72	bank vole GCF_902806735.1	56,423 (2.99 %)	n/a	18,977 (1.71 %)	18,408 (1.50 %)	n/a	41.86 (98.62 %)	53,506 (1.39 %)	53,506 (1.39 %)	54,142 (98.61 %)	3,222,366 (21.59 %)	933,697 (2.20 %)	12,831,232 (31.50 %)	4,497 (0.04 %)	287,292 (0.90 %)	18,784 (0.42 %)	16,451 (0.36 %)
73	banner-tailed kangaroo rat GCF_019054845.1	43,753 (1.82 %)	n/a	18,397 (1.18 %)	24,180 (1.39 %)	n/a	40.83 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,026 (100.00 %)	5,587,719 (30.97 %)	1,363,513 (3.95 %)	12,128,920 (48.74 %)	0 (0 %)	1,518,982 (3.07 %)	36,371 (1.27 %)	31,849 (0.74 %)
74	banteng 2023 GCF_032452875.1	71,974 (3.56 %)	n/a	19,305 (1.36 %)	21,174 (1.20 %)	n/a	42.79 (100.00 %)	0 (0 %)	84 (0.00 %)	1,518 (100.00 %)	3,344,481 (20.63 %)	1,039,571 (11.74 %)	13,031,356 (47.36 %)	1 (0.00 %)	2,790,223 (5.90 %)	73,031 (1.72 %)	36,726 (0.78 %)
75	bat A.intermedius (hap2 2024) GCA_038363225.1	n/a	n/a	17,124 (1.63 %)	18,342 (1.54 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	0 (0 %)	56 (0.00 %)	187 (100.00 %)	2,597,378 (26.81 %)	332,733 (4.43 %)	10,957,327 (33.52 %)	2 (0.00 %)	406,013 (1.59 %)	63,688 (2.22 %)	49,331 (1.50 %)
76	bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024) GCA_043727955.1	n/a	n/a	19,354 (1.74 %)	21,367 (1.51 %)	n/a	41.48 (100.00 %)	15 (0.00 %)	190 (0.00 %)	265 (100.00 %)	3,860,506 (38.95 %)	722,335 (7.13 %)	11,994,816 (35.77 %)	1 (0.00 %)	1,149,103 (3.65 %)	44,562 (1.21 %)	35,219 (1.01 %)
77	beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020) GCA_009917745.1	n/a	n/a	19,239 (1.79 %)	22,513 (1.43 %)	35,878 (1.82 %)	41.25 (97.57 %)	26,969 (2.43 %)	27,070 (2.43 %)	52,780 (97.57 %)	4,021,599 (43.53 %)	544,323 (1.08 %)	12,738,162 (33.47 %)	1,426 (0.06 %)	346,086 (1.08 %)	59,710 (1.51 %)	43,139 (1.22 %)
78	beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019) GCF_002288925.2	59,413 (3.09 %)	n/a	18,667 (1.79 %)	20,314 (1.43 %)	n/a	41.24 (98.49 %)	23,539 (1.52 %)	24,414 (1.52 %)	29,444 (98.48 %)	4,001,248 (43.73 %)	543,276 (1.11 %)	12,802,735 (34.18 %)	583 (0.02 %)	388,902 (1.70 %)	59,307 (1.53 %)	42,900 (1.24 %)
79	big brown bat (BU_THK_EF1 2012) GCF_000308155.1	59,162 (3.17 %)	n/a	18,334 (1.94 %)	20,121 (1.78 %)	n/a	42.93 (89.41 %)	160,269 (10.62 %)	160,269 (10.62 %)	167,057 (89.38 %)	2,842,065 (25.82 %)	614,712 (1.89 %)	10,407,733 (28.90 %)	1,641 (0.04 %)	222,087 (1.20 %)	66,720 (2.99 %)	60,637 (2.11 %)
80	big brown bat (TK198812 2023) GCF_027574615.1	46,266 (2.61 %)	n/a	18,620 (1.80 %)	21,271 (1.72 %)	n/a	43.51 (100.00 %)	0 (0 %)	75 (0.00 %)	48 (100.00 %)	3,041,145 (25.08 %)	904,075 (3.80 %)	10,530,666 (37.05 %)	0 (0 %)	647,994 (2.05 %)	77,605 (3.68 %)	62,105 (2.31 %)
81	bighorn sheep (BS48 2019) GCA_004026945.1	n/a	n/a	23,059 (1.34 %)	36,486 (1.19 %)	n/a	43.20 (99.90 %)	9,412 (0.03 %)	9,412 (0.03 %)	1,057,548 (99.97 %)	6,321,577 (50.75 %)	716,846 (1.66 %)	13,904,326 (44.98 %)	63 (0.00 %)	n/a	95,564 (1.72 %)	50,916 (1.03 %)
82	bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024) GCF_042477335.2	78,636 (2.63 %)	n/a	19,459 (1.36 %)	21,150 (1.33 %)	n/a	43.91 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	42 (100.00 %)	3,963,383 (22.89 %)	826,353 (11.67 %)	12,918,743 (46.86 %)	0 (0 %)	2,225,863 (5.63 %)	52,254 (10.67 %)	39,631 (0.85 %)
83	bilby (mMagLag1 2024) GCA_037893015.1	n/a	n/a	18,686 (0.72 %)	17,238 (0.81 %)	n/a	37.35 (99.66 %)	0 (0 %)	4,431 (0.34 %)	609 (100.00 %)	6,263,094 (27.34 %)	2,223,995 (5.89 %)	23,994,844 (43.69 %)	70 (0.01 %)	1,521,039 (3.02 %)	51,039 (3.47 %)	15,234 (0.24 %)
84	bilby (mMagLag1 2024) GCF_037893015.1	60,460 (3.10 %)	n/a	18,687 (0.72 %)	17,229 (0.81 %)	n/a	37.35 (99.66 %)	0 (0 %)	4,431 (0.34 %)	608 (100.00 %)	6,299,949 (27.49 %)	2,223,987 (5.89 %)	23,992,536 (43.69 %)	70 (0.01 %)	1,330,409 (2.60 %)	51,039 (3.47 %)	15,234 (0.24 %)
85	black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024) GCA_043290085.1	n/a	n/a	20,713 (0.64 %)	21,469 (0.64 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	1 (0.00 %)	770 (0.00 %)	470 (100.00 %)	3,860,121 (14.52 %)	1,230,113 (2.81 %)	21,600,460 (65.53 %)	7 (0.00 %)	n/a	49,878 (0.73 %)	48,556 (0.69 %)
86	black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024) GCA_043290065.1	n/a	n/a	19,814 (0.63 %)	20,140 (0.63 %)	n/a	41.82 (100.00 %)	1 (0.00 %)	723 (0.00 %)	315 (100.00 %)	3,657,357 (14.24 %)	1,158,716 (2.84 %)	22,924,986 (64.53 %)	6 (0.00 %)	n/a	46,774 (0.90 %)	21,729 (0.30 %)
87	black flying fox GCF_000325575.1	46,991 (3.15 %)	n/a	18,089 (2.00 %)	20,668 (1.75 %)	n/a	39.74 (97.93 %)	104,566 (2.08 %)	104,566 (2.08 %)	170,164 (97.92 %)	2,975,186 (34.05 %)	481,859 (1.45 %)	12,582,349 (26.52 %)	97 (0.01 %)	114,693 (0.91 %)	62,483 (3.88 %)	64,215 (2.93 %)
88	black rat GCF_011064425.1	39,601 (2.37 %)	n/a	20,793 (1.98 %)	17,944 (1.37 %)	n/a	42.14 (99.98 %)	0 (0 %)	6,158 (0.02 %)	2,173 (100.00 %)	4,715,157 (41.57 %)	1,432,294 (3.45 %)	13,275,550 (32.36 %)	20 (0.00 %)	625,923 (1.66 %)	18,055 (0.48 %)	16,181 (0.43 %)
89	black rhinoceros (alternate hap 2021) GCA_020826835.1	n/a	n/a	19,000 (1.37 %)	22,547 (1.26 %)	n/a	41.56 (99.97 %)	0 (0 %)	178 (0.03 %)	1,199 (100.00 %)	4,340,245 (37.22 %)	564,468 (8.07 %)	14,384,523 (40.40 %)	0 (0 %)	941,914 (2.51 %)	44,971 (1.16 %)	34,023 (0.74 %)
90	black rhinoceros (BS38 2019 Broad) GCA_004027315.1	n/a	n/a	21,713 (1.32 %)	32,731 (1.18 %)	n/a	41.22 (99.85 %)	7,256 (0.02 %)	7,256 (0.02 %)	2,029,914 (99.98 %)	4,618,655 (36.76 %)	618,834 (2.21 %)	16,248,532 (40.32 %)	32 (0.00 %)	n/a	44,113 (0.97 %)	35,130 (0.72 %)
91	black rhinoceros (primary hap 2021 refseq) GCF_020826845.1	56,268 (2.28 %)	n/a	18,774 (1.38 %)	22,348 (1.26 %)	n/a	41.59 (99.95 %)	0 (0 %)	215 (0.05 %)	1,076 (100.00 %)	4,200,390 (36.22 %)	548,030 (8.34 %)	14,347,693 (40.14 %)	2 (0.00 %)	984,722 (2.61 %)	43,525 (1.14 %)	33,963 (0.76 %)
92	black-footed cat GCA_004023925.1	n/a	n/a	22,895 (1.14 %)	51,789 (1.13 %)	n/a	41.92 (99.90 %)	13,476 (0.06 %)	13,476 (0.06 %)	603,600 (99.94 %)	5,261,265 (44.11 %)	943,514 (1.77 %)	13,681,435 (34.77 %)	43 (0.00 %)	262,081 (0.70 %)	86,892 (2.23 %)	62,055 (1.65 %)
93	black-footed ferret (SB6536 2022) GCF_022355385.1	56,415 (2.78 %)	n/a	18,681 (1.55 %)	20,685 (1.40 %)	n/a	41.55 (96.71 %)	0 (0 %)	33,042 (3.30 %)	20,575 (100.00 %)	4,087,717 (30.94 %)	695,805 (1.18 %)	13,880,116 (32.08 %)	890 (0.03 %)	471,613 (1.24 %)	54,060 (2.11 %)	51,472 (1.69 %)
94	black-lipped pika GCF_017591425.1	46,297 (2.64 %)	n/a	18,529 (1.63 %)	23,458 (1.83 %)	n/a	43.71 (100.00 %)	0 (0 %)	54 (0.00 %)	2,214 (100.00 %)	1,843,705 (12.62 %)	471,798 (2.76 %)	11,394,992 (31.27 %)	0 (0 %)	530,175 (1.74 %)	63,124 (1.85 %)	31,410 (1.04 %)
95	Blainville's beaked whale (alternate hap 2022) GCA_025094165.1	n/a	n/a	17,838 (1.54 %)	21,389 (1.35 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	5,198 (100.00 %)	3,542,727 (35.35 %)	650,369 (8.86 %)	10,971,320 (41.15 %)	0 (0 %)	1,286,122 (4.20 %)	62,389 (1.68 %)	34,595 (0.95 %)
96	Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq) GCF_025265405.1	47,553 (2.07 %)	n/a	19,041 (1.52 %)	20,766 (1.27 %)	n/a	41.70 (99.97 %)	0 (0 %)	97 (0.03 %)	74 (100.00 %)	3,964,038 (35.29 %)	765,957 (8.74 %)	12,128,229 (41.78 %)	1 (0.00 %)	1,795,618 (5.01 %)	70,851 (1.80 %)	37,949 (0.93 %)
97	blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019) GCA_008658375.1	n/a	n/a	17,285 (1.80 %)	21,295 (1.43 %)	n/a	41.22 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12,574 (100.00 %)	3,196,354 (43.47 %)	467,194 (1.26 %)	10,176,588 (33.66 %)	0 (0 %)	306,308 (1.20 %)	56,916 (1.85 %)	39,871 (1.51 %)
98	Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020) GCA_008658375.2	n/a	n/a	16,997 (1.82 %)	20,609 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	10,999 (100.00 %)	3,126,800 (43.49 %)	454,452 (1.23 %)	9,916,868 (33.63 %)	0 (0 %)	296,938 (1.19 %)	55,436 (1.85 %)	38,786 (1.50 %)
99	blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020) GCF_009873245.2	58,737 (2.71 %)	n/a	19,162 (1.80 %)	20,576 (1.41 %)	36,291 (1.99 %)	40.88 (98.91 %)	0 (0 %)	886 (1.09 %)	106 (100.00 %)	3,986,870 (44.21 %)	579,629 (1.22 %)	12,858,384 (34.60 %)	4 (0.00 %)	422,171 (1.33 %)	67,032 (1.73 %)	46,602 (1.41 %)
100	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022) GCA_022079275.1	n/a	n/a	24,877 (1.23 %)	48,382 (1.39 %)	n/a	42.05 (99.98 %)	4,716 (0.01 %)	4,716 (0.01 %)	72,827 (99.99 %)	6,403,412 (33.31 %)	1,269,531 (1.94 %)	17,771,689 (33.82 %)	79 (0.00 %)	706,367 (3.07 %)	100,915 (3.00 %)	90,223 (2.05 %)
101	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022) GCF_022079265.1	45,417 (2.39 %)	n/a	18,576 (1.65 %)	20,510 (1.41 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	0 (0 %)	24 (0.00 %)	75 (100.00 %)	4,970,082 (43.28 %)	894,002 (1.80 %)	13,648,384 (34.21 %)	0 (0 %)	602,631 (1.69 %)	69,211 (2.68 %)	63,384 (2.18 %)
102	boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023) GCA_019903745.2	n/a	n/a	20,135 (1.60 %)	22,598 (1.47 %)	n/a	41.46 (96.98 %)	0 (0 %)	34,682 (3.03 %)	12,266 (100.00 %)	3,134,107 (24.41 %)	394,920 (0.92 %)	13,154,929 (36.43 %)	3,241 (0.04 %)	471,129 (1.38 %)	48,826 (1.07 %)	42,368 (0.88 %)
103	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022) GCA_024803775.1	n/a	n/a	18,647 (0.96 %)	23,998 (1.13 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	0 (0 %)	124 (0.00 %)	3,340 (100.00 %)	3,775,862 (22.40 %)	1,257,803 (21.71 %)	9,347,543 (61.85 %)	0 (0 %)	9,701,648 (16.46 %)	33,757 (1.35 %)	24,065 (0.48 %)
104	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022) GCA_024803745.1	n/a	n/a	17,791 (1.12 %)	22,667 (1.29 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	106 (0.00 %)	106 (0.00 %)	2,898 (100.00 %)	6,293,452 (41.30 %)	1,076,688 (17.94 %)	8,553,272 (57.13 %)	1 (0.00 %)	6,983,927 (14.02 %)	31,102 (1.31 %)	23,419 (0.57 %)
105	Botta's pocket gopher (hap1 2023) GCA_031878675.1	n/a	n/a	18,247 (1.61 %)	22,673 (1.83 %)	n/a	41.12 (99.99 %)	205 (0.00 %)	775 (0.01 %)	835 (100.00 %)	2,918,285 (18.64 %)	868,090 (5.77 %)	9,427,604 (40.78 %)	2 (0.00 %)	1,601,923 (4.79 %)	27,049 (1.25 %)	22,545 (0.76 %)
106	Botta's pocket gopher (hap2 2023) GCA_031878665.1	n/a	n/a	17,612 (1.68 %)	22,099 (1.91 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	25 (0.00 %)	541 (0.01 %)	365 (100.00 %)	2,748,918 (17.16 %)	827,542 (4.51 %)	8,832,809 (39.20 %)	2 (0.00 %)	1,074,853 (3.77 %)	26,416 (1.35 %)	22,242 (0.81 %)
107	boutu (hap1 2024) GCA_036417435.1	n/a	n/a	18,667 (1.46 %)	20,817 (1.26 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	0 (0 %)	284 (0.00 %)	903 (100.00 %)	4,004,895 (35.23 %)	925,158 (12.15 %)	11,999,784 (42.65 %)	3 (0.00 %)	1,841,091 (5.04 %)	63,428 (1.55 %)	38,329 (0.93 %)
108	boutu (hap2 2024) GCA_036417475.1	n/a	n/a	17,954 (1.51 %)	19,994 (1.30 %)	n/a	42.02 (100.00 %)	0 (0 %)	240 (0.00 %)	800 (100.00 %)	3,723,164 (34.96 %)	809,880 (11.02 %)	11,359,211 (41.42 %)	2 (0.00 %)	1,554,419 (4.60 %)	60,067 (1.55 %)	36,564 (0.95 %)
109	Brahman cow (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018) GCF_003369695.1	63,234 (2.88 %)	n/a	19,601 (1.57 %)	21,699 (1.34 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	0 (0 %)	302 (0.06 %)	1,250 (100.00 %)	5,524,454 (47.57 %)	459,928 (1.40 %)	13,208,799 (41.21 %)	0 (0 %)	1,222,662 (3.37 %)	41,359 (1.10 %)	37,367 (0.98 %)
110	Brandt's bat GCF_000412655.1	46,912 (2.84 %)	n/a	19,267 (1.75 %)	18,495 (1.62 %)	n/a	42.59 (94.06 %)	155,664 (5.95 %)	155,664 (5.95 %)	325,414 (94.05 %)	2,897,662 (25.08 %)	634,208 (3.20 %)	11,323,618 (31.06 %)	356 (0.04 %)	n/a	66,749 (1.59 %)	51,826 (1.12 %)
111	Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023) GCA_030848825.1	n/a	n/a	19,039 (1.66 %)	21,660 (1.59 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	0 (0 %)	20 (0.00 %)	148 (100.00 %)	3,805,818 (31.80 %)	640,446 (2.50 %)	11,793,353 (36.15 %)	1 (0.00 %)	609,574 (1.94 %)	68,896 (2.40 %)	57,812 (1.49 %)
112	Brazilian guinea pig GCA_000688575.1	n/a	n/a	16,531 (1.49 %)	11,177 (1.44 %)	n/a	39.81 (64.76 %)	0 (0 %)	2,565,595 (35.61 %)	3,131 (100.00 %)	2,529,479 (25.87 %)	342,907 (0.66 %)	10,719,517 (21.05 %)	551 (0.01 %)	218,010 (0.72 %)	19,508 (0.31 %)	9,721 (0.14 %)
113	Brazilian tapir GCA_004025025.1	n/a	n/a	21,581 (1.61 %)	30,818 (1.32 %)	n/a	41.12 (99.93 %)	2,273 (0.01 %)	2,273 (0.01 %)	805,779 (99.99 %)	3,877,938 (38.36 %)	344,032 (0.79 %)	15,601,710 (32.81 %)	14 (0.00 %)	n/a	43,382 (1.17 %)	39,596 (1.04 %)
114	brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018) GCF_003584765.2	50,229 (2.92 %)	n/a	18,811 (1.77 %)	21,073 (1.52 %)	n/a	41.84 (99.31 %)	15,552 (0.70 %)	17,380 (0.70 %)	21,813 (99.30 %)	4,201,043 (40.86 %)	567,586 (1.23 %)	13,807,211 (30.86 %)	760 (0.01 %)	325,785 (0.96 %)	62,125 (1.80 %)	56,227 (1.57 %)
115	brown bear (v2.0 North America Adak 2023) GCF_023065955.2	66,371 (4.20 %)	n/a	18,615 (1.68 %)	21,434 (1.53 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	0 (0 %)	250 (0.00 %)	362 (100.00 %)	4,030,019 (33.22 %)	630,008 (4.17 %)	13,240,060 (32.92 %)	1 (0.00 %)	668,459 (2.28 %)	64,814 (2.05 %)	58,450 (1.77 %)
116	brown big-eared bat (primary hap 2023) GCA_963455305.1	n/a	n/a	19,138 (1.72 %)	20,370 (1.54 %)	n/a	43.08 (99.99 %)	0 (0 %)	1,237 (0.01 %)	65 (100.00 %)	3,201,470 (26.24 %)	957,903 (4.27 %)	10,687,995 (39.65 %)	8 (0.00 %)	881,577 (2.81 %)	60,671 (2.39 %)	52,889 (1.71 %)
117	brown-throated sloth GCA_004027775.1	n/a	n/a	17,043 (1.21 %)	37,090 (1.36 %)	n/a	42.76 (99.76 %)	462 (0.00 %)	462 (0.00 %)	1,772,267 (100.00 %)	2,487,215 (36.18 %)	316,812 (1.60 %)	7,948,666 (37.96 %)	5 (0.00 %)	n/a	62,325 (2.36 %)	46,228 (1.74 %)
118	cactus mouse (2023) GCF_949786415.1	47,537 (2.02 %)	n/a	18,894 (1.46 %)	20,159 (1.22 %)	n/a	42.40 (99.98 %)	0 (0 %)	2,603 (0.02 %)	4,297 (100.00 %)	7,181,232 (52.75 %)	1,247,378 (18.35 %)	13,329,318 (43.03 %)	32 (0.00 %)	4,621,934 (9.77 %)	19,540 (0.49 %)	17,819 (0.43 %)
119	California mouse (IS 2022) GCF_007827085.1	62,273 (3.80 %)	n/a	18,959 (1.75 %)	19,378 (1.41 %)	n/a	42.21 (100.00 %)	0 (0 %)	547 (0.00 %)	237 (100.00 %)	5,970,582 (45.08 %)	1,165,743 (3.67 %)	13,734,349 (33.67 %)	4 (0.00 %)	738,622 (2.20 %)	19,529 (0.58 %)	17,949 (0.52 %)
120	California sea lion (alternate hap 2019) GCA_009762295.1	n/a	n/a	18,348 (1.81 %)	18,692 (1.47 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,093 (100.00 %)	3,722,619 (42.89 %)	488,086 (1.26 %)	10,893,132 (33.14 %)	0 (0 %)	393,471 (1.40 %)	44,449 (1.57 %)	41,300 (1.38 %)
121	California sea lion (LMU 2018 refseq) GCF_900631625.1	69,240 (2.99 %)	n/a	20,741 (1.78 %)	20,298 (1.40 %)	n/a	41.38 (99.81 %)	0 (0 %)	47,716 (0.20 %)	10,423 (100.00 %)	4,530,259 (43.28 %)	573,086 (1.12 %)	13,442,336 (33.58 %)	9,701 (0.17 %)	414,311 (1.26 %)	50,583 (1.46 %)	46,836 (1.28 %)
122	California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020) GCA_009762295.2	n/a	n/a	18,319 (1.81 %)	18,772 (1.48 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,096 (100.00 %)	3,724,021 (42.91 %)	488,356 (1.26 %)	10,891,276 (33.15 %)	0 (0 %)	395,508 (1.40 %)	44,467 (1.57 %)	41,289 (1.38 %)
123	California sea lion (v2 primary hap 2020) GCF_009762305.2	70,801 (3.05 %)	n/a	20,915 (1.77 %)	20,179 (1.40 %)	44,926 (2.10 %)	41.40 (99.23 %)	0 (0 %)	185 (0.77 %)	47 (100.00 %)	4,525,652 (43.65 %)	590,246 (1.24 %)	13,263,648 (33.76 %)	2 (0.00 %)	495,451 (1.44 %)	51,899 (1.50 %)	48,201 (1.32 %)
124	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023) GCA_028537755.1	n/a	n/a	19,409 (1.86 %)	20,578 (1.69 %)	n/a	42.43 (100.00 %)	0 (0 %)	43 (0.00 %)	310 (100.00 %)	3,161,054 (22.60 %)	891,453 (5.62 %)	11,087,206 (33.12 %)	0 (0 %)	957,188 (2.77 %)	19,104 (0.65 %)	16,548 (0.48 %)
125	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023) GCA_028537955.1	n/a	n/a	19,681 (1.86 %)	21,257 (1.62 %)	n/a	42.24 (100.00 %)	0 (0 %)	51 (0.00 %)	350 (100.00 %)	4,957,057 (42.33 %)	943,226 (5.63 %)	11,695,871 (33.83 %)	0 (0 %)	1,058,642 (2.90 %)	20,062 (0.64 %)	18,632 (0.53 %)
126	Canada lynx (alternate hap LIC74 2019) GCA_007474575.1	n/a	n/a	12,029 (1.42 %)	15,171 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	15,036 (100.00 %)	2,937,491 (43.50 %)	544,410 (1.76 %)	7,641,565 (32.72 %)	0 (0 %)	294,221 (1.43 %)	39,082 (2.44 %)	34,616 (1.88 %)
127	Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020) GCA_007474575.2	n/a	n/a	12,041 (1.42 %)	15,226 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	5 (0.00 %)	5 (0.00 %)	15,046 (100.00 %)	2,939,291 (43.50 %)	544,849 (1.76 %)	7,650,345 (32.74 %)	0 (0 %)	294,817 (1.43 %)	39,099 (2.44 %)	34,631 (1.88 %)
128	Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020) GCF_007474595.2	50,142 (2.69 %)	n/a	18,273 (1.65 %)	19,264 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.88 %)	0 (0 %)	842 (0.12 %)	54 (100.00 %)	5,011,165 (43.72 %)	904,525 (1.75 %)	13,467,551 (34.19 %)	0 (0 %)	572,384 (1.64 %)	66,799 (2.48 %)	60,482 (2.02 %)
129	Cantor's roundleaf bat GCA_004027415.1	n/a	n/a	23,788 (1.42 %)	45,328 (1.68 %)	38,254 (1.57 %)	41.36 (99.91 %)	6,366 (0.03 %)	6,366 (0.03 %)	846,566 (99.97 %)	3,997,370 (31.48 %)	775,742 (1.42 %)	12,770,948 (33.45 %)	57 (0.00 %)	n/a	41,527 (1.41 %)	30,440 (1.13 %)
130	Cape elephant shrew GCF_000299155.1	25,406 (1.08 %)	n/a	23,258 (1.07 %)	24,266 (1.16 %)	n/a	40.30 (86.29 %)	279,394 (13.74 %)	279,394 (13.74 %)	288,162 (86.26 %)	3,765,232 (16.90 %)	604,351 (0.89 %)	20,072,078 (42.36 %)	1,643 (0.02 %)	356,320 (0.77 %)	25,977 (0.42 %)	23,327 (0.35 %)
131	Cape golden mole (2012 Broad) GCF_000296735.1	25,323 (1.07 %)	n/a	20,961 (1.07 %)	21,723 (1.04 %)	n/a	40.01 (79.93 %)	370,844 (20.11 %)	370,844 (20.11 %)	391,344 (79.89 %)	4,924,640 (21.03 %)	500,830 (1.95 %)	18,946,663 (41.18 %)	3,416 (0.03 %)	805,638 (1.24 %)	21,186 (0.33 %)	18,126 (0.27 %)
132	Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014) GCA_000152225.2	n/a	n/a	18,455 (1.10 %)	22,103 (1.12 %)	n/a	41.00 (88.89 %)	259,874 (11.14 %)	259,879 (11.14 %)	325,568 (88.86 %)	6,210,235 (51.92 %)	381,915 (1.06 %)	20,080,212 (36.28 %)	7,944 (0.20 %)	267,970 (1.80 %)	29,690 (0.50 %)	26,217 (0.43 %)
133	Cape rock hyrax (US060 2019 Broad) GCA_004026925.1	n/a	n/a	21,401 (0.85 %)	45,353 (1.14 %)	n/a	41.08 (99.93 %)	4,203 (0.01 %)	4,203 (0.01 %)	1,048,940 (99.99 %)	7,222,494 (54.48 %)	430,286 (0.85 %)	21,775,991 (44.61 %)	44 (0.00 %)	n/a	37,158 (0.70 %)	31,196 (0.61 %)
134	capybara GCA_004027455.1	n/a	n/a	20,152 (1.22 %)	28,931 (1.29 %)	n/a	39.76 (99.93 %)	5,747 (0.02 %)	5,747 (0.02 %)	661,089 (99.98 %)	4,220,878 (29.16 %)	777,357 (2.04 %)	15,214,944 (35.16 %)	23 (0.00 %)	n/a	34,558 (0.85 %)	32,123 (0.72 %)
135	carabao (swamp buffalo K-KA32 2023) GCF_029407905.1	77,279 (2.89 %)	n/a	19,433 (1.40 %)	21,166 (1.23 %)	n/a	42.77 (100.00 %)	0 (0 %)	21 (0.00 %)	115 (100.00 %)	3,479,445 (21.92 %)	547,054 (6.39 %)	12,840,677 (45.22 %)	0 (0 %)	2,206,180 (5.44 %)	99,752 (3.73 %)	36,683 (0.81 %)
136	cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA) GCF_002263795.3	77,808 (4.11 %)	n/a	19,428 (1.48 %)	22,236 (1.33 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	0 (0 %)	386 (0.00 %)	1,958 (100.00 %)	3,449,588 (22.63 %)	596,092 (3.13 %)	12,785,607 (42.11 %)	1 (0.00 %)	1,626,342 (4.17 %)	46,864 (1.37 %)	37,742 (0.86 %)
137	cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014) GCF_000003055.6	57,977 (2.74 %)	n/a	19,583 (1.56 %)	20,581 (1.31 %)	n/a	41.82 (99.23 %)	72,454 (0.78 %)	74,464 (0.78 %)	75,598 (99.22 %)	5,607,556 (49.02 %)	440,521 (1.25 %)	13,167,657 (40.78 %)	789 (0.04 %)	1,243,109 (3.73 %)	42,869 (1.24 %)	37,223 (0.90 %)
138	Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad) GCA_004024745.2	n/a	n/a	18,603 (1.52 %)	22,330 (1.36 %)	n/a	42.35 (98.12 %)	57,013 (1.80 %)	57,013 (1.80 %)	1,240,743 (98.20 %)	5,255,211 (43.27 %)	2,502,373 (4.37 %)	12,968,788 (40.96 %)	10,788 (0.55 %)	n/a	172,178 (3.66 %)	153,143 (3.23 %)
139	cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022) GCF_027475565.1	80,997 (4.53 %)	n/a	18,420 (1.70 %)	19,561 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	0 (0 %)	22 (0.00 %)	195 (100.00 %)	4,611,842 (35.10 %)	837,685 (1.68 %)	13,649,125 (33.06 %)	0 (0 %)	327,107 (0.89 %)	60,367 (2.22 %)	56,975 (1.91 %)
140	cheetah (Rico 2018) GCF_003709585.1	72,154 (3.33 %)	n/a	18,472 (1.70 %)	20,443 (1.42 %)	n/a	41.55 (99.55 %)	0 (0 %)	24,173 (0.45 %)	3,220 (100.00 %)	4,853,945 (42.85 %)	831,106 (1.53 %)	13,663,571 (32.84 %)	1,699 (0.02 %)	283,401 (0.75 %)	60,744 (2.17 %)	55,562 (1.77 %)
141	Chinese forest musk deer (Sichuan 2022) GCF_022376915.1	51,625 (2.80 %)	n/a	19,565 (1.43 %)	22,280 (1.29 %)	n/a	42.30 (99.97 %)	0 (0 %)	1,781 (0.03 %)	2,446 (100.00 %)	3,257,347 (21.65 %)	399,120 (3.81 %)	12,906,274 (43.79 %)	0 (0 %)	2,278,433 (5.31 %)	46,689 (1.12 %)	38,849 (0.85 %)
142	Chinese hamster (17A/GY CHO 2020) GCF_003668045.3	55,440 (2.79 %)	n/a	20,030 (1.84 %)	18,721 (1.41 %)	67,900 (3.41 %)	41.51 (99.90 %)	0 (0 %)	4,164 (0.10 %)	647 (100.00 %)	8,121,057 (33.74 %)	1,095,058 (2.91 %)	12,923,274 (32.25 %)	17 (0.00 %)	566,700 (1.72 %)	19,341 (0.58 %)	18,196 (0.52 %)
143	Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI) GCF_000223135.1	46,006 (2.59 %)	n/a	20,602 (1.78 %)	17,467 (1.35 %)	n/a	41.37 (96.61 %)	156,635 (3.40 %)	156,635 (3.40 %)	265,787 (96.60 %)	4,541,936 (33.03 %)	1,072,129 (2.66 %)	13,150,189 (30.04 %)	213 (0.02 %)	n/a	12,522 (0.25 %)	11,560 (0.23 %)
144	Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd) GCA_900186095.1	n/a	n/a	19,874 (1.85 %)	19,298 (1.44 %)	n/a	41.45 (98.56 %)	63,334 (1.45 %)	63,334 (1.45 %)	71,598 (98.55 %)	4,521,726 (33.66 %)	1,060,619 (2.55 %)	12,867,288 (31.26 %)	9,581 (0.18 %)	445,818 (1.43 %)	17,960 (0.54 %)	17,137 (0.50 %)
145	Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022) GCA_026545065.1	n/a	n/a	20,293 (1.81 %)	18,881 (1.42 %)	n/a	41.62 (71.16 %)	924,541 (28.93 %)	924,541 (28.93 %)	1,236,122 (71.07 %)	4,330,728 (30.92 %)	987,319 (3.70 %)	13,374,062 (21.92 %)	817 (0.01 %)	n/a	18,838 (0.40 %)	17,349 (0.35 %)
146	Chinese pangolin (2020 Yunnan U) GCF_014570555.1	69,694 (3.21 %)	n/a	18,206 (1.70 %)	20,508 (1.48 %)	n/a	40.79 (95.54 %)	0 (0 %)	34,903 (4.47 %)	4,694 (100.00 %)	2,927,176 (35.60 %)	269,964 (0.67 %)	12,610,535 (29.10 %)	647 (0.02 %)	253,501 (1.85 %)	35,278 (1.05 %)	33,613 (0.98 %)
147	Chinese pangolin (hap1 2023) GCF_030020395.1	71,445 (2.98 %)	n/a	18,379 (1.34 %)	21,837 (1.29 %)	n/a	41.07 (99.77 %)	0 (0 %)	383 (0.23 %)	661 (100.00 %)	3,318,871 (34.65 %)	618,193 (3.68 %)	12,009,669 (39.02 %)	8 (0.00 %)	1,132,160 (3.87 %)	47,708 (1.22 %)	34,214 (0.79 %)
148	Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023) GCA_030020945.1	n/a	n/a	18,538 (1.34 %)	21,724 (1.27 %)	n/a	41.09 (99.48 %)	0 (0 %)	190 (0.52 %)	700 (100.00 %)	3,362,899 (34.48 %)	678,384 (4.11 %)	12,024,241 (39.52 %)	7 (0.00 %)	1,198,886 (3.98 %)	48,960 (1.19 %)	34,434 (0.79 %)
149	Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU) GCA_000738955.1	n/a	n/a	18,749 (1.63 %)	22,506 (1.40 %)	n/a	40.93 (90.69 %)	138,158 (9.33 %)	257,424 (9.33 %)	230,927 (90.67 %)	2,691,116 (34.48 %)	316,518 (1.96 %)	11,538,086 (25.40 %)	37,129 (1.10 %)	304,419 (2.99 %)	30,693 (0.58 %)	28,150 (0.52 %)
150	Chinese rufous horseshoe bat GCA_001888835.1	n/a	n/a	26,871 (2.34 %)	25,467 (1.89 %)	n/a	40.52 (97.22 %)	0 (0 %)	212,601 (2.80 %)	63,439 (100.00 %)	3,219,611 (33.86 %)	495,126 (1.20 %)	12,476,551 (27.16 %)	60 (0.00 %)	103,290 (0.35 %)	32,993 (0.98 %)	31,139 (0.91 %)
151	Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024) GCA_036562045.1	n/a	n/a	17,893 (1.95 %)	19,249 (1.60 %)	n/a	40.47 (100.00 %)	0 (0 %)	286 (0.00 %)	454 (100.00 %)	3,055,304 (33.11 %)	531,106 (1.34 %)	11,858,144 (29.52 %)	0 (0 %)	158,830 (0.76 %)	30,884 (1.08 %)	29,146 (0.97 %)
152	Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024) GCF_036562045.2	67,162 (3.87 %)	n/a	17,890 (1.94 %)	19,248 (1.60 %)	n/a	40.47 (100.00 %)	0 (0 %)	286 (0.00 %)	454 (100.00 %)	3,325,750 (39.02 %)	531,106 (1.34 %)	11,858,028 (29.52 %)	0 (0 %)	218,904 (1.04 %)	30,884 (1.08 %)	26,927 (0.94 %)
153	Chinese tree shrew (2013 BGI) GCF_000334495.1	47,005 (2.07 %)	n/a	21,375 (1.39 %)	19,231 (1.28 %)	n/a	41.73 (95.10 %)	191,695 (4.92 %)	191,695 (4.92 %)	242,445 (95.08 %)	5,060,321 (23.05 %)	1,046,388 (4.15 %)	14,978,259 (38.04 %)	914 (0.08 %)	803,568 (6.04 %)	88,806 (1.44 %)	55,240 (1.01 %)
154	Chinese tree shrew (KIZ-2021 2023) GCA_033439345.1	n/a	n/a	22,218 (1.55 %)	22,364 (1.36 %)	n/a	41.78 (99.99 %)	0 (0 %)	1,697 (0.01 %)	1,645 (100.00 %)	6,126,341 (42.08 %)	1,035,957 (2.47 %)	14,328,193 (41.14 %)	1 (0.00 %)	840,196 (1.95 %)	90,914 (1.82 %)	54,999 (1.38 %)
155	chiru GCA_000400835.1	n/a	n/a	20,320 (1.60 %)	42,654 (2.51 %)	n/a	42.01 (93.04 %)	283,069 (7.00 %)	283,069 (7.00 %)	298,127 (93.00 %)	5,342,241 (43.54 %)	425,329 (1.25 %)	13,714,420 (34.66 %)	321 (0.03 %)	521,516 (1.73 %)	43,135 (1.89 %)	39,020 (1.80 %)
156	clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023) GCA_028018655.1	n/a	n/a	16,430 (1.52 %)	21,057 (1.44 %)	n/a	41.79 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	10,377 (100.00 %)	3,845,437 (33.39 %)	794,587 (2.14 %)	10,765,695 (33.40 %)	0 (0 %)	461,307 (1.56 %)	56,375 (2.45 %)	47,473 (1.74 %)
157	clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq) GCF_028018385.1	81,219 (3.62 %)	n/a	18,300 (1.65 %)	20,361 (1.39 %)	n/a	41.79 (99.94 %)	0 (0 %)	181 (0.06 %)	33 (100.00 %)	4,224,269 (34.84 %)	992,668 (2.08 %)	13,618,866 (34.42 %)	3 (0.00 %)	647,739 (1.89 %)	67,830 (2.45 %)	58,781 (1.98 %)
158	common bottlenose dolphin (maternal 2020) GCA_011762535.1	n/a	n/a	18,837 (1.77 %)	20,857 (1.43 %)	n/a	41.43 (99.73 %)	0 (0 %)	649 (0.27 %)	985 (100.00 %)	4,073,893 (46.15 %)	630,039 (2.15 %)	12,628,219 (35.41 %)	1 (0.00 %)	705,496 (1.85 %)	65,379 (1.89 %)	42,994 (1.34 %)
159	common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020) GCF_011762595.1	67,220 (3.31 %)	n/a	18,766 (1.77 %)	20,528 (1.42 %)	35,852 (1.58 %)	41.44 (99.74 %)	0 (0 %)	674 (0.26 %)	362 (100.00 %)	4,069,115 (46.17 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,891 (35.29 %)	1 (0.00 %)	629,903 (1.85 %)	65,551 (1.90 %)	43,136 (1.35 %)
160	common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq) GCF_001922835.1	45,975 (2.99 %)	n/a	17,255 (1.69 %)	17,058 (1.34 %)	n/a	40.85 (99.45 %)	0 (0 %)	114,003 (0.57 %)	2,648 (100.00 %)	3,845,938 (43.89 %)	514,631 (1.06 %)	12,317,098 (32.18 %)	466 (0.01 %)	284,934 (0.89 %)	48,030 (1.35 %)	31,891 (1.03 %)
161	common bottlenose dolphin (mTurTru1 2024) GCF_011762595.2	80,385 (4.33 %)	n/a	18,770 (1.77 %)	20,525 (1.42 %)	n/a	41.44 (99.74 %)	0 (0 %)	674 (0.26 %)	361 (100.00 %)	3,981,744 (44.78 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,558 (35.29 %)	1 (0.00 %)	556,315 (1.61 %)	65,551 (1.90 %)	43,444 (1.36 %)
162	common bottlenose dolphin (paternal 2020) GCA_011762515.1	n/a	n/a	18,537 (1.77 %)	20,619 (1.44 %)	n/a	41.42 (98.08 %)	0 (0 %)	868 (1.92 %)	1,166 (100.00 %)	3,997,801 (45.93 %)	609,838 (1.85 %)	12,400,272 (34.53 %)	1 (0.00 %)	649,569 (1.73 %)	64,630 (1.84 %)	42,623 (1.32 %)
163	common brushtail (alternate hap 2020) GCA_011100645.1	n/a	n/a	14,863 (0.75 %)	15,426 (0.89 %)	n/a	39.41 (100.00 %)	313 (0.00 %)	313 (0.00 %)	12,446 (100.00 %)	5,846,769 (38.56 %)	987,917 (1.99 %)	16,764,356 (40.14 %)	0 (0 %)	345,940 (1.13 %)	13,303 (0.35 %)	10,338 (0.23 %)
164	common brushtail (refseq 2020) GCF_011100635.1	37,661 (1.80 %)	n/a	18,653 (0.80 %)	15,375 (0.86 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	0 (0 %)	1,796 (0.56 %)	212 (100.00 %)	7,598,116 (38.90 %)	1,259,434 (1.97 %)	22,071,306 (40.56 %)	0 (0 %)	455,717 (1.17 %)	17,762 (0.38 %)	13,986 (0.24 %)
165	common pipistrelle (2020) GCA_903992545.1	n/a	n/a	17,216 (1.82 %)	19,202 (1.79 %)	n/a	42.55 (99.97 %)	0 (0 %)	1,546 (0.03 %)	323 (100.00 %)	2,953,532 (23.94 %)	805,142 (2.83 %)	9,964,846 (34.69 %)	0 (0 %)	446,836 (1.61 %)	57,295 (2.83 %)	54,882 (1.90 %)
166	common pipistrelle (alternate hap 2020) GCA_903992515.1	n/a	n/a	15,974 (1.72 %)	20,563 (1.66 %)	n/a	42.41 (100.00 %)	12 (0.00 %)	12 (0.00 %)	10,459 (100.00 %)	2,634,333 (23.76 %)	703,674 (2.65 %)	8,909,525 (33.95 %)	0 (0 %)	343,235 (1.37 %)	50,430 (2.54 %)	45,982 (1.75 %)
167	common pipistrelle (Broad 2019) GCA_004026625.1	n/a	n/a	21,938 (1.35 %)	53,915 (1.60 %)	n/a	42.88 (99.88 %)	10,870 (0.05 %)	10,870 (0.05 %)	736,974 (99.95 %)	3,499,501 (22.91 %)	1,046,301 (2.96 %)	11,759,516 (37.96 %)	17 (0.00 %)	n/a	92,062 (3.23 %)	75,629 (2.04 %)
168	common pipistrelle (hap1.1 2025) GCA_965203405.1	n/a	n/a	18,233 (1.77 %)	21,445 (1.80 %)	n/a	42.93 (99.98 %)	0 (0 %)	1,650 (0.02 %)	575 (100.00 %)	3,324,262 (26.83 %)	869,167 (7.44 %)	10,218,519 (37.91 %)	6 (0.00 %)	778,854 (2.75 %)	76,006 (3.29 %)	60,694 (1.98 %)
169	common pipistrelle (hap2.1 2025) GCA_965204225.1	n/a	n/a	18,115 (1.81 %)	21,233 (1.83 %)	n/a	42.89 (99.98 %)	1,602 (0.02 %)	1,602 (0.02 %)	1,971 (99.98 %)	3,303,323 (27.28 %)	852,756 (5.65 %)	10,047,424 (36.41 %)	13 (0.00 %)	655,173 (2.34 %)	69,105 (3.25 %)	60,657 (2.04 %)
170	common vampire bat (v2 HL8 alternate hap 2022 genbank) GCA_022682395.2	n/a	n/a	17,485 (1.76 %)	18,907 (1.66 %)	n/a	42.87 (99.99 %)	0 (0 %)	576 (0.01 %)	429 (100.00 %)	2,592,246 (28.20 %)	352,985 (2.87 %)	10,737,944 (31.11 %)	25 (0.00 %)	264,293 (1.29 %)	61,125 (2.28 %)	42,729 (1.28 %)
171	common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 refseq) GCF_022682495.2	58,786 (3.38 %)	n/a	18,507 (1.82 %)	19,451 (1.59 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	0 (0 %)	615 (0.01 %)	574 (100.00 %)	2,960,602 (36.90 %)	431,577 (3.90 %)	11,286,753 (32.62 %)	37 (0.00 %)	367,677 (1.66 %)	71,507 (2.50 %)	83,078 (2.13 %)
172	common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018) GCF_002940915.2	51,044 (3.24 %)	n/a	18,503 (1.88 %)	18,071 (1.68 %)	n/a	42.15 (97.78 %)	54,246 (2.23 %)	54,246 (2.23 %)	83,364 (97.77 %)	2,799,509 (29.62 %)	275,242 (1.03 %)	11,796,826 (28.19 %)	237 (0.03 %)	174,535 (2.84 %)	51,634 (1.37 %)	47,271 (1.22 %)
173	common warthog (WHEZ1 2021) GCF_016906955.1	55,156 (2.64 %)	n/a	18,264 (1.56 %)	19,251 (1.34 %)	54,816 (2.83 %)	41.95 (99.61 %)	0 (0 %)	523 (0.39 %)	194 (100.00 %)	3,898,243 (30.33 %)	588,742 (1.17 %)	12,955,929 (36.44 %)	1 (0.00 %)	519,262 (1.56 %)	75,592 (1.86 %)	45,338 (1.21 %)
174	common wombat GCF_900497805.2	46,365 (1.78 %)	n/a	19,437 (0.86 %)	18,947 (0.96 %)	n/a	38.86 (99.68 %)	0 (0 %)	67,461 (0.33 %)	14,183 (100.00 %)	8,645,969 (41.99 %)	1,203,246 (1.61 %)	23,878,215 (39.11 %)	3,092 (0.01 %)	284,840 (0.59 %)	18,752 (0.37 %)	17,700 (0.31 %)
175	Corsac fox (zsh2022 2023) GCA_030463245.1	n/a	n/a	19,527 (1.61 %)	18,923 (1.35 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	0 (0 %)	107 (0.00 %)	202 (100.00 %)	4,435,406 (32.05 %)	981,019 (1.98 %)	13,673,245 (32.65 %)	0 (0 %)	644,894 (1.63 %)	49,252 (2.20 %)	46,666 (1.57 %)
176	coyote (coyote_06102 2023) GCA_034620425.1	n/a	n/a	19,251 (1.60 %)	19,585 (1.40 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	0 (0 %)	93 (0.00 %)	120 (100.00 %)	4,493,000 (32.28 %)	982,814 (2.01 %)	13,803,318 (33.09 %)	0 (0 %)	634,473 (1.64 %)	50,777 (2.23 %)	47,871 (1.58 %)
177	creeping vole GCF_018167655.1	54,941 (2.31 %)	n/a	23,033 (1.55 %)	25,427 (1.53 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,147 (100.00 %)	4,549,519 (25.66 %)	1,153,429 (13.60 %)	13,568,297 (40.65 %)	0 (0 %)	3,223,361 (6.77 %)	23,141 (0.54 %)	19,563 (0.42 %)
178	crested porcupine GCA_004026905.1	n/a	n/a	21,005 (1.32 %)	35,975 (1.39 %)	n/a	41.51 (99.89 %)	4,351 (0.02 %)	4,351 (0.02 %)	1,140,949 (99.98 %)	4,303,147 (30.69 %)	600,488 (1.19 %)	14,049,490 (33.80 %)	35 (0.00 %)	n/a	57,196 (1.33 %)	41,516 (0.95 %)
179	Crete spiny mouse (2024) GCA_964271855.1	n/a	n/a	19,467 (1.76 %)	18,734 (1.43 %)	n/a	42.87 (100.00 %)	0 (0 %)	184 (0.00 %)	113 (100.00 %)	4,718,848 (32.83 %)	1,327,449 (6.80 %)	12,893,458 (34.03 %)	0 (0 %)	1,009,136 (2.74 %)	21,236 (0.61 %)	17,412 (0.44 %)
180	Cuvier's beaked whale GCA_004364475.1	n/a	n/a	23,700 (0.90 %)	51,715 (0.86 %)	n/a	42.01 (99.76 %)	3,229 (0.01 %)	3,229 (0.01 %)	3,761,505 (99.99 %)	6,544,424 (43.61 %)	1,417,186 (3.11 %)	16,127,873 (42.25 %)	43 (0.00 %)	n/a	68,668 (1.15 %)	53,793 (0.96 %)
181	cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024) GCA_043880285.1	n/a	n/a	18,610 (1.67 %)	19,098 (1.39 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	7 (0.00 %)	334 (0.01 %)	73 (100.00 %)	4,077,286 (41.85 %)	754,689 (2.64 %)	11,873,386 (36.16 %)	1 (0.00 %)	1,326,571 (3.53 %)	48,137 (1.04 %)	24,623 (0.71 %)
182	Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI) GCF_000743615.1	52,373 (2.57 %)	n/a	17,983 (1.45 %)	17,063 (1.43 %)	n/a	40.34 (97.96 %)	87,815 (2.05 %)	87,815 (2.05 %)	162,545 (97.95 %)	4,053,433 (30.86 %)	545,281 (1.74 %)	13,406,483 (30.65 %)	793 (0.06 %)	243,492 (1.42 %)	37,008 (0.74 %)	33,397 (0.64 %)
183	Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo) GCF_012274545.1	58,091 (2.74 %)	n/a	17,780 (1.44 %)	16,515 (1.42 %)	n/a	40.34 (97.94 %)	0 (0 %)	88,899 (2.07 %)	73,970 (100.00 %)	4,035,140 (30.95 %)	544,772 (1.73 %)	13,390,872 (30.61 %)	838 (0.06 %)	245,667 (1.44 %)	37,008 (0.74 %)	33,408 (0.64 %)
184	dassie-rat GCA_004026965.1	n/a	n/a	20,479 (1.16 %)	42,937 (1.41 %)	n/a	41.86 (99.89 %)	9,645 (0.04 %)	9,645 (0.04 %)	920,324 (99.96 %)	4,563,054 (28.83 %)	660,623 (1.92 %)	12,899,807 (34.48 %)	14 (0.00 %)	n/a	46,569 (1.25 %)	40,791 (1.01 %)
185	Daubenton's bat (alternate hap 2023) GCA_963242275.1	n/a	n/a	18,895 (1.78 %)	24,235 (1.81 %)	n/a	43.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4,930 (100.00 %)	2,813,870 (23.75 %)	718,406 (5.18 %)	9,977,320 (37.24 %)	0 (0 %)	609,378 (2.37 %)	62,910 (2.66 %)	55,962 (1.97 %)
186	Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq) GCF_963259705.1	64,558 (3.32 %)	n/a	19,141 (1.72 %)	22,133 (1.66 %)	n/a	43.18 (99.99 %)	0 (0 %)	1,099 (0.01 %)	121 (100.00 %)	3,040,232 (24.03 %)	796,911 (6.38 %)	10,478,180 (38.84 %)	9 (0.00 %)	756,429 (2.76 %)	64,920 (2.51 %)	57,806 (1.88 %)
187	Daurian ground squirrel GCA_002406435.1	n/a	n/a	20,990 (1.31 %)	17,575 (1.17 %)	n/a	39.77 (96.15 %)	141,850 (3.84 %)	141,850 (3.84 %)	502,654 (96.16 %)	5,783,538 (34.36 %)	924,038 (3.73 %)	17,533,301 (30.85 %)	318 (0.01 %)	1,230,179 (17.33 %)	27,955 (0.39 %)	26,034 (0.36 %)
188	David's myotis bat GCF_000327345.1	37,645 (2.70 %)	n/a	18,744 (1.78 %)	17,565 (1.62 %)	n/a	42.69 (91.23 %)	223,511 (8.80 %)	223,511 (8.80 %)	325,280 (91.20 %)	2,680,166 (23.79 %)	532,273 (1.90 %)	11,016,028 (29.55 %)	303 (0.05 %)	n/a	59,615 (1.59 %)	49,977 (1.17 %)
189	degu (3935 2012 refseq) GCF_000260255.1	48,165 (2.13 %)	n/a	22,242 (1.41 %)	22,101 (1.46 %)	n/a	41.38 (84.36 %)	252,770 (15.68 %)	252,772 (15.68 %)	259,904 (84.32 %)	4,901,673 (27.74 %)	898,945 (1.50 %)	14,282,003 (29.30 %)	2,582 (0.03 %)	313,028 (1.02 %)	40,135 (0.82 %)	36,410 (0.69 %)
190	desert hamster (2022) GCF_943737965.1	37,291 (2.11 %)	n/a	19,744 (1.74 %)	20,215 (1.50 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,079 (100.00 %)	4,038,079 (31.01 %)	1,132,871 (2.71 %)	11,946,112 (32.62 %)	0 (0 %)	618,568 (1.94 %)	17,053 (0.51 %)	15,416 (0.41 %)
191	Desmarest's hutia GCA_004027915.1	n/a	n/a	23,535 (0.78 %)	50,796 (0.95 %)	n/a	42.03 (99.83 %)	3,492 (0.01 %)	3,492 (0.01 %)	2,355,850 (99.99 %)	5,790,506 (26.72 %)	1,062,134 (1.71 %)	16,977,224 (35.29 %)	16 (0.00 %)	n/a	54,479 (1.01 %)	46,753 (0.82 %)
192	dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW) GCF_012295265.1	102,060 (4.04 %)	n/a	19,777 (1.69 %)	20,341 (1.41 %)	n/a	41.29 (99.69 %)	0 (0 %)	325 (0.31 %)	477 (100.00 %)	4,950,808 (42.83 %)	1,033,921 (2.36 %)	13,745,703 (33.32 %)	0 (0 %)	820,425 (2.05 %)	51,835 (2.25 %)	47,504 (1.92 %)
193	dingo (Sandy 2020 James Cook U) GCF_003254725.2	104,332 (4.50 %)	n/a	19,710 (1.72 %)	19,857 (1.42 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	0 (0 %)	69 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,547,906 (33.32 %)	993,474 (2.19 %)	13,701,060 (33.18 %)	0 (0 %)	716,455 (1.82 %)	51,216 (2.28 %)	51,748 (2.14 %)
194	dog (Basenji MU ID 185726 2019) GCA_004886185.2	n/a	n/a	19,889 (1.67 %)	20,501 (1.39 %)	n/a	41.36 (99.99 %)	1,387 (0.01 %)	1,388 (0.01 %)	3,630 (99.99 %)	4,950,227 (43.32 %)	1,059,639 (2.97 %)	13,694,849 (33.70 %)	3 (0.00 %)	1,006,008 (2.40 %)	51,443 (2.16 %)	47,254 (1.90 %)
195	dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021) GCA_013276365.2	n/a	n/a	19,310 (1.60 %)	19,947 (1.42 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	0 (0 %)	149 (0.00 %)	631 (100.00 %)	4,452,916 (32.14 %)	960,590 (2.23 %)	13,685,353 (33.01 %)	0 (0 %)	644,106 (1.68 %)	50,715 (2.22 %)	47,698 (1.58 %)
196	dog (Bernese Mountain Dog BD 2023) GCA_031010765.1	n/a	n/a	19,211 (1.60 %)	20,327 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	0 (0 %)	641 (0.00 %)	175 (100.00 %)	4,471,016 (32.18 %)	984,776 (2.03 %)	13,719,474 (32.88 %)	0 (0 %)	644,486 (1.60 %)	51,050 (2.25 %)	47,721 (1.59 %)
197	dog (Bernese Mountain Dog OD 2023) GCA_031010635.1	n/a	n/a	19,279 (1.60 %)	20,348 (1.44 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	0 (0 %)	1,015 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,491,081 (32.21 %)	996,142 (2.01 %)	13,761,195 (32.97 %)	0 (0 %)	645,724 (1.69 %)	51,490 (2.25 %)	48,166 (1.60 %)
198	dog (boxer Tasha 2011) GCF_000002285.3	82,536 (3.63 %)	n/a	19,772 (1.66 %)	19,565 (1.39 %)	n/a	41.31 (99.25 %)	23,876 (0.76 %)	23,876 (0.76 %)	27,106 (99.24 %)	4,918,098 (43.29 %)	991,835 (2.81 %)	13,644,959 (33.60 %)	34 (0.00 %)	971,687 (2.39 %)	53,269 (2.07 %)	48,154 (1.73 %)
199	dog (boxer Tasha 2020) GCF_000002285.5	93,761 (3.84 %)	n/a	19,392 (1.71 %)	19,572 (1.42 %)	52,141 (3.27 %)	41.26 (100.00 %)	0 (0 %)	1,028 (0.00 %)	147 (100.00 %)	23,927,903 (42.42 %)	972,851 (2.05 %)	13,611,845 (33.11 %)	0 (0 %)	657,594 (1.69 %)	50,679 (2.26 %)	46,402 (1.93 %)
200	dog (Cairn Terrier CA611 2023) GCA_031010295.1	n/a	n/a	19,255 (1.61 %)	20,479 (1.45 %)	n/a	41.19 (100.00 %)	0 (0 %)	262 (0.00 %)	141 (100.00 %)	4,490,019 (32.25 %)	989,383 (1.99 %)	13,710,808 (32.97 %)	0 (0 %)	634,521 (1.63 %)	50,883 (2.22 %)	47,572 (1.58 %)
201	dog (German shepard Mischka 2020) GCF_011100685.1	96,734 (3.71 %)	n/a	20,135 (1.64 %)	20,871 (1.38 %)	56,772 (3.19 %)	41.50 (100.00 %)	585 (0.00 %)	585 (0.00 %)	2,782 (100.00 %)	20,264,827 (43.87 %)	1,152,879 (3.22 %)	13,784,690 (34.30 %)	9 (0.00 %)	1,226,639 (2.84 %)	53,518 (2.23 %)	49,021 (1.97 %)
202	dog (German Shepherd Nala 2020) GCA_008641055.3	n/a	n/a	19,757 (1.69 %)	20,201 (1.41 %)	n/a	41.32 (99.74 %)	0 (0 %)	458 (0.26 %)	410 (100.00 %)	4,974,233 (43.03 %)	1,048,366 (2.46 %)	13,881,889 (33.61 %)	0 (0 %)	887,952 (2.14 %)	51,900 (2.21 %)	47,682 (1.96 %)
203	dog (Labrador retriever 2023) GCA_031165255.1	n/a	n/a	19,256 (1.61 %)	20,247 (1.44 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	0 (0 %)	516 (0.00 %)	675 (100.00 %)	4,456,220 (32.19 %)	960,584 (1.96 %)	13,688,006 (32.82 %)	0 (0 %)	620,296 (1.57 %)	50,670 (2.21 %)	47,790 (1.59 %)
204	dog (labrador SID07034 2020) GCF_014441545.1	99,420 (3.87 %)	n/a	19,870 (1.70 %)	20,252 (1.41 %)	54,322 (3.23 %)	41.19 (99.47 %)	0 (0 %)	575 (0.53 %)	376 (100.00 %)	4,981,985 (42.28 %)	1,019,772 (1.97 %)	13,959,750 (32.77 %)	2 (0.01 %)	648,526 (1.66 %)	52,469 (2.25 %)	48,334 (1.95 %)
205	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU) GCF_000181335.3	72,076 (3.30 %)	n/a	18,662 (1.64 %)	20,897 (1.37 %)	n/a	41.73 (98.20 %)	403 (1.80 %)	436 (1.80 %)	5,079 (98.20 %)	5,086,462 (43.51 %)	964,126 (2.68 %)	13,947,871 (33.33 %)	0 (0 %)	785,059 (2.13 %)	69,701 (2.41 %)	61,568 (1.95 %)
206	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU) GCA_000181335.5	n/a	n/a	18,378 (1.53 %)	21,242 (1.40 %)	n/a	41.73 (98.21 %)	350 (1.69 %)	422 (1.79 %)	5,010 (98.31 %)	4,683,703 (33.33 %)	964,129 (2.68 %)	13,948,305 (33.33 %)	0 (0 %)	784,749 (2.13 %)	69,725 (2.42 %)	63,619 (1.83 %)
207	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021) GCA_000181335.6	n/a	n/a	18,357 (1.55 %)	20,085 (1.38 %)	n/a	41.76 (98.18 %)	350 (1.72 %)	422 (1.82 %)	1,254 (98.28 %)	4,661,997 (33.78 %)	947,221 (2.58 %)	13,867,949 (33.67 %)	0 (0 %)	696,984 (2.13 %)	68,011 (2.41 %)	62,123 (1.82 %)
208	domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U) GCF_018350175.1	99,222 (4.40 %)	n/a	18,456 (1.66 %)	19,833 (1.39 %)	94,133 (5.63 %)	41.81 (100.00 %)	31 (0.00 %)	39 (0.00 %)	102 (100.00 %)	4,965,571 (43.65 %)	932,424 (1.95 %)	13,596,808 (33.85 %)	0 (0 %)	555,637 (1.52 %)	67,329 (2.48 %)	60,307 (2.00 %)
209	domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020) GCF_011764305.1	68,868 (3.09 %)	n/a	19,019 (1.55 %)	21,812 (1.42 %)	n/a	41.90 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,224 (100.00 %)	4,650,028 (39.49 %)	745,115 (2.02 %)	13,758,447 (36.14 %)	0 (0 %)	1,196,360 (3.06 %)	58,684 (2.16 %)	59,034 (1.99 %)
210	domestic ferret (Sable 2011 Broad) GCA_000239315.1	n/a	n/a	18,778 (1.67 %)	19,571 (1.47 %)	n/a	41.48 (96.89 %)	72,670 (3.12 %)	72,670 (3.12 %)	76,914 (96.88 %)	4,491,876 (40.13 %)	618,556 (1.07 %)	13,721,938 (31.04 %)	1,362 (0.02 %)	377,830 (1.02 %)	54,600 (1.94 %)	53,359 (1.69 %)
211	domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023) GCF_034190915.1	79,333 (3.55 %)	n/a	17,999 (1.09 %)	21,509 (1.20 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	84 (0.00 %)	84 (0.00 %)	672 (100.00 %)	5,037,431 (41.68 %)	886,785 (13.97 %)	14,620,284 (42.71 %)	1 (0.00 %)	2,850,832 (6.00 %)	39,682 (0.89 %)	26,858 (0.57 %)
212	domestic guinea pig (2N 2008 refseq) GCF_000151735.1	44,762 (2.31 %)	n/a	18,301 (1.33 %)	20,111 (1.34 %)	n/a	39.95 (97.81 %)	58,460 (2.20 %)	58,460 (2.20 %)	61,604 (97.80 %)	4,257,852 (38.85 %)	658,533 (1.25 %)	14,547,726 (34.19 %)	3 (0.00 %)	423,409 (1.39 %)	37,093 (0.85 %)	27,300 (0.63 %)
213	domestic yak (maiwa yakHY00 2019) GCA_005887515.3	n/a	n/a	18,672 (1.39 %)	19,408 (1.24 %)	n/a	41.97 (100.00 %)	0 (0 %)	646 (0.00 %)	343 (100.00 %)	3,570,978 (23.00 %)	583,762 (8.57 %)	14,055,227 (40.52 %)	0 (0 %)	2,774,518 (21.40 %)	43,883 (1.17 %)	40,029 (0.94 %)
214	dugong (hap1 mDugDug1 2023) GCA_030035585.1	n/a	n/a	18,354 (1.22 %)	20,434 (1.08 %)	n/a	40.65 (100.00 %)	0 (0 %)	96 (0.00 %)	198 (100.00 %)	4,458,084 (33.00 %)	444,499 (1.79 %)	15,031,940 (47.42 %)	0 (0 %)	508,936 (1.29 %)	29,863 (0.83 %)	24,007 (0.54 %)
215	dugong (hap2 mDugDug1 2023) GCA_030020955.1	n/a	n/a	18,538 (1.23 %)	20,775 (1.09 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	0 (0 %)	89 (0.00 %)	167 (100.00 %)	4,455,227 (33.01 %)	444,021 (1.73 %)	14,946,847 (47.37 %)	1 (0.00 %)	504,439 (1.27 %)	29,828 (0.79 %)	24,008 (0.54 %)
216	dwarf mongoose GCA_004023845.1	n/a	n/a	21,478 (1.57 %)	32,174 (1.43 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	10,815 (0.05 %)	10,815 (0.05 %)	200,185 (99.95 %)	4,574,991 (40.34 %)	595,520 (1.11 %)	13,720,585 (32.94 %)	42 (0.00 %)	180,761 (0.49 %)	70,689 (2.42 %)	67,427 (2.05 %)
217	eastern cottontail (primary hap 2023) GCA_949820135.1	n/a	n/a	18,522 (1.26 %)	22,314 (1.28 %)	n/a	43.69 (100.00 %)	0 (0 %)	316 (0.00 %)	99 (100.00 %)	3,699,683 (20.55 %)	935,350 (11.22 %)	13,112,318 (44.07 %)	1 (0.00 %)	n/a	99,224 (2.27 %)	68,695 (1.75 %)
218	eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022) GCA_921998335.2	n/a	n/a	21,903 (2.13 %)	19,801 (1.40 %)	108,675 (4.42 %)	41.79 (99.89 %)	3 (0.00 %)	207 (0.11 %)	211 (100.00 %)	4,630,645 (40.56 %)	1,531,506 (3.70 %)	13,011,312 (35.48 %)	2 (0.00 %)	816,051 (2.46 %)	22,270 (0.54 %)	15,877 (0.42 %)
219	eastern mole GCA_004024925.1	n/a	n/a	19,631 (1.57 %)	32,414 (1.63 %)	n/a	42.02 (99.91 %)	7,239 (0.03 %)	7,239 (0.03 %)	647,535 (99.97 %)	3,145,725 (29.42 %)	554,620 (1.75 %)	10,663,504 (32.88 %)	18 (0.00 %)	n/a	55,063 (3.69 %)	48,440 (3.22 %)
220	eastern quoll GCA_020854095.1	n/a	n/a	15,715 (0.80 %)	16,750 (0.93 %)	n/a	36.19 (100.00 %)	0 (0 %)	431 (0.00 %)	76 (100.00 %)	5,256,999 (24.81 %)	1,280,160 (3.39 %)	21,362,866 (41.74 %)	2 (0.00 %)	642,432 (1.62 %)	24,508 (0.70 %)	24,041 (0.54 %)
221	eastern spiny mouse (2021) GCA_907164435.1	n/a	n/a	20,397 (1.93 %)	20,515 (1.44 %)	n/a	42.68 (98.12 %)	3,526 (0.10 %)	109,220 (1.90 %)	19,837 (99.90 %)	4,701,702 (33.98 %)	1,304,933 (2.91 %)	13,145,044 (31.05 %)	6,458 (0.04 %)	453,997 (1.14 %)	19,636 (0.56 %)	18,226 (0.51 %)
222	Egyptian rousette (1219 2016 Boston U) GCF_001466805.2	54,791 (4.93 %)	n/a	18,221 (2.05 %)	24,192 (1.88 %)	46,601 (2.22 %)	40.02 (99.97 %)	0 (0 %)	638 (0.03 %)	2,490 (100.00 %)	2,815,693 (32.23 %)	440,119 (1.01 %)	12,346,041 (26.86 %)	0 (0 %)	74,090 (0.43 %)	56,244 (6.54 %)	61,126 (5.16 %)
223	Egyptian rousette (v1 2020 refseq) GCF_014176215.1	65,163 (4.76 %)	n/a	17,642 (2.07 %)	22,317 (1.84 %)	n/a	40.05 (98.59 %)	0 (0 %)	242 (1.41 %)	29 (100.00 %)	2,821,248 (33.05 %)	434,414 (1.02 %)	12,031,597 (26.52 %)	0 (0 %)	65,562 (0.33 %)	53,573 (4.84 %)	57,281 (4.47 %)
224	Egyptian spiny mouse (US019 2019) GCA_004027535.1	n/a	n/a	23,498 (1.69 %)	36,970 (1.40 %)	30,076 (1.58 %)	42.71 (99.88 %)	20,469 (0.09 %)	20,469 (0.09 %)	391,811 (99.91 %)	4,983,574 (35.17 %)	1,342,514 (3.45 %)	13,029,270 (32.79 %)	32 (0.00 %)	n/a	19,944 (0.55 %)	18,844 (0.51 %)
225	elk (wapiti) GCF_019320065.1	66,846 (3.00 %)	n/a	20,090 (1.67 %)	21,999 (1.44 %)	n/a	41.62 (99.93 %)	0 (0 %)	6,643 (0.08 %)	185 (100.00 %)	4,884,711 (43.14 %)	429,925 (1.65 %)	13,135,255 (37.85 %)	78 (0.00 %)	802,680 (2.76 %)	47,099 (1.31 %)	44,586 (1.19 %)
226	ermine (2020) GCF_009829155.1	74,345 (3.19 %)	n/a	18,855 (1.65 %)	20,667 (1.43 %)	44,584 (2.07 %)	41.56 (99.12 %)	0 (0 %)	199 (0.88 %)	94 (100.00 %)	4,647,934 (41.44 %)	714,174 (1.30 %)	13,845,904 (33.42 %)	3 (0.01 %)	452,963 (1.26 %)	56,065 (2.25 %)	56,447 (2.07 %)
227	ermine (alternate hap 2020) GCA_009829165.1	n/a	n/a	13,583 (1.65 %)	15,403 (1.46 %)	n/a	41.72 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,327 (100.00 %)	3,139,035 (40.57 %)	480,111 (1.29 %)	9,106,061 (31.93 %)	0 (0 %)	342,175 (1.40 %)	39,139 (2.25 %)	38,863 (2.02 %)
228	Eurasian badger (2021) GCA_922990625.1	n/a	n/a	19,332 (1.42 %)	22,424 (1.40 %)	n/a	42.47 (100.00 %)	0 (0 %)	27 (0.00 %)	726 (100.00 %)	4,362,536 (31.74 %)	801,232 (4.02 %)	13,893,672 (37.73 %)	1 (0.00 %)	1,089,255 (2.94 %)	65,806 (4.13 %)	53,831 (1.83 %)
229	Eurasian badger (v3.2 2022) GCA_922984935.2	n/a	n/a	19,268 (1.40 %)	22,121 (1.36 %)	41,043 (1.93 %)	42.48 (100.00 %)	0 (0 %)	101 (0.00 %)	538 (100.00 %)	4,417,203 (31.72 %)	821,664 (4.02 %)	13,814,720 (38.08 %)	1 (0.00 %)	1,177,257 (3.11 %)	66,524 (3.95 %)	54,563 (1.83 %)
230	Eurasian field mouse (2024) GCA_964023405.1	n/a	n/a	20,487 (1.88 %)	19,707 (1.34 %)	n/a	42.15 (100.00 %)	0 (0 %)	182 (0.00 %)	61 (100.00 %)	5,115,510 (39.18 %)	1,868,284 (4.29 %)	13,503,826 (37.29 %)	2 (0.00 %)	1,262,006 (3.13 %)	26,414 (0.61 %)	24,636 (0.56 %)
231	Eurasian red squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685485.1	n/a	n/a	12,437 (1.51 %)	12,702 (1.22 %)	n/a	40.06 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	10,657 (100.00 %)	2,303,176 (35.38 %)	353,996 (1.49 %)	7,218,556 (31.67 %)	0 (0 %)	194,541 (1.24 %)	24,268 (1.07 %)	22,754 (0.97 %)
232	Eurasian red squirrel (v1.2 2020) GCA_902686455.2	n/a	n/a	21,309 (1.58 %)	21,026 (1.36 %)	33,465 (1.53 %)	40.08 (94.33 %)	0 (0 %)	1,177 (5.67 %)	639 (100.00 %)	4,677,412 (35.73 %)	704,218 (1.42 %)	14,992,063 (31.49 %)	5 (0.00 %)	419,661 (1.29 %)	48,159 (1.04 %)	45,470 (0.95 %)
233	Eurasian river otter (2020) GCF_902655055.1	67,269 (2.96 %)	n/a	18,842 (1.54 %)	20,178 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	0 (0 %)	185 (0.00 %)	44 (100.00 %)	4,259,294 (33.39 %)	713,721 (1.36 %)	13,626,048 (34.37 %)	1 (0.00 %)	695,796 (1.86 %)	57,073 (1.82 %)	47,446 (1.36 %)
234	Eurasian river otter (alternate hap 2019) GCA_902653095.1	n/a	n/a	9,910 (1.59 %)	11,315 (1.31 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8,506 (100.00 %)	2,052,338 (42.25 %)	316,084 (1.64 %)	6,222,460 (33.12 %)	0 (0 %)	291,189 (1.91 %)	27,057 (1.96 %)	26,047 (1.75 %)
235	Eurasian water vole (alternate hap 2020) GCA_903992525.1	n/a	n/a	16,761 (1.66 %)	19,715 (1.37 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	105 (0.00 %)	105 (0.00 %)	16,473 (100.00 %)	3,118,266 (26.44 %)	829,463 (2.82 %)	9,700,482 (31.37 %)	0 (0 %)	353,652 (1.44 %)	14,146 (0.57 %)	12,571 (0.45 %)
236	Eurasian water vole (v2 2021) GCF_903992535.2	45,544 (2.51 %)	n/a	19,733 (1.78 %)	19,053 (1.47 %)	36,935 (2.27 %)	42.15 (99.74 %)	0 (0 %)	873 (0.26 %)	215 (100.00 %)	3,993,912 (25.74 %)	1,088,163 (2.91 %)	12,853,770 (32.42 %)	5 (0.00 %)	518,667 (1.69 %)	19,000 (0.58 %)	16,851 (0.46 %)
237	European hare (LE1 primary hap 2023) GCF_033115175.1	46,528 (2.09 %)	n/a	19,392 (1.25 %)	23,070 (1.29 %)	n/a	44.03 (100.00 %)	0 (0 %)	418 (0.00 %)	651 (100.00 %)	4,011,592 (19.81 %)	1,000,204 (8.44 %)	13,414,251 (44.25 %)	2 (0.00 %)	2,116,577 (4.63 %)	98,831 (2.33 %)	72,807 (1.75 %)
238	European harvest mouse (primary hap 2024) GCA_963924665.1	n/a	n/a	20,236 (1.71 %)	19,368 (1.32 %)	n/a	40.05 (99.99 %)	0 (0 %)	2,020 (0.02 %)	894 (100.00 %)	4,892,811 (36.49 %)	1,223,387 (18.26 %)	11,907,631 (42.51 %)	10 (0.00 %)	4,679,739 (9.91 %)	17,423 (0.62 %)	15,264 (0.35 %)
239	European mink (alternate hap 2023) GCA_030435785.1	n/a	n/a	15,419 (1.50 %)	21,175 (1.51 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12,043 (100.00 %)	2,952,218 (30.62 %)	538,508 (2.18 %)	9,303,303 (34.20 %)	0 (0 %)	511,888 (2.10 %)	47,810 (2.50 %)	39,732 (1.82 %)
240	European mink (primary hap 2023 refseq) GCF_030435805.1	69,556 (3.13 %)	n/a	18,706 (1.46 %)	21,193 (1.37 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	0 (0 %)	39 (0.00 %)	25 (100.00 %)	4,237,791 (30.90 %)	792,897 (2.69 %)	13,417,195 (36.59 %)	0 (0 %)	894,272 (2.55 %)	67,132 (2.54 %)	51,333 (1.62 %)
241	European mole (hap1 2024) GCA_964194135.1	n/a	n/a	18,085 (1.69 %)	19,509 (1.58 %)	n/a	42.08 (99.99 %)	0 (0 %)	1,056 (0.01 %)	464 (100.00 %)	2,569,380 (23.32 %)	565,465 (2.18 %)	10,506,666 (33.68 %)	42 (0.00 %)	704,393 (2.62 %)	46,367 (3.09 %)	42,313 (2.40 %)
242	European mole (hap2 2024) GCA_964194205.1	n/a	n/a	18,064 (1.69 %)	19,764 (1.59 %)	n/a	42.07 (99.99 %)	1,040 (0.01 %)	1,040 (0.01 %)	1,396 (99.99 %)	2,567,492 (23.34 %)	570,250 (2.16 %)	10,485,959 (33.56 %)	30 (0.00 %)	702,644 (2.60 %)	46,213 (3.27 %)	42,349 (2.41 %)
243	European pine marten (primary hap 2023) GCA_963455335.1	n/a	n/a	18,336 (1.50 %)	20,807 (1.41 %)	n/a	42.38 (99.98 %)	0 (0 %)	2,250 (0.02 %)	477 (100.00 %)	4,096,160 (31.55 %)	707,337 (3.28 %)	13,715,382 (34.73 %)	10 (0.00 %)	626,861 (1.84 %)	61,481 (4.29 %)	56,462 (1.94 %)
244	European shrew (alternate hap 2023) GCA_027595995.1	n/a	n/a	17,506 (1.26 %)	25,527 (1.52 %)	n/a	43.20 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	5,699 (100.00 %)	2,400,784 (15.19 %)	1,062,793 (3.20 %)	13,284,496 (41.93 %)	0 (0 %)	768,770 (2.06 %)	77,009 (2.86 %)	75,481 (2.15 %)
245	European shrew (GB8-d 2012) GCF_000181275.1	23,525 (1.54 %)	n/a	17,290 (1.33 %)	22,005 (1.50 %)	n/a	42.90 (90.49 %)	188,953 (9.54 %)	188,953 (9.54 %)	201,798 (90.46 %)	4,400,127 (33.22 %)	946,629 (2.03 %)	13,377,581 (35.30 %)	3,389 (0.06 %)	410,333 (1.21 %)	77,851 (2.58 %)	76,553 (1.98 %)
246	European shrew (primary hap 2023) GCF_027595985.1	44,643 (2.60 %)	n/a	17,479 (1.26 %)	21,293 (1.37 %)	n/a	43.24 (99.46 %)	0 (0 %)	1,427 (0.54 %)	65 (100.00 %)	2,474,584 (15.18 %)	1,107,884 (3.28 %)	13,638,467 (41.72 %)	10 (0.00 %)	822,159 (2.15 %)	79,785 (2.86 %)	77,901 (2.13 %)
247	European snow vole (alternate hap 2023) GCA_950005115.1	n/a	n/a	18,364 (1.79 %)	20,379 (1.63 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	4,256 (100.00 %)	3,049,618 (22.22 %)	852,708 (4.50 %)	10,501,392 (33.34 %)	0 (0 %)	706,136 (2.67 %)	17,629 (0.60 %)	15,048 (0.47 %)
248	European snow vole (primary hap 2023 refseq) GCF_950005125.1	47,025 (2.69 %)	n/a	19,592 (1.78 %)	21,173 (1.56 %)	n/a	41.98 (100.00 %)	0 (0 %)	197 (0.00 %)	160 (100.00 %)	5,048,186 (44.12 %)	998,537 (5.14 %)	12,204,053 (34.97 %)	4 (0.00 %)	954,164 (3.20 %)	20,725 (0.63 %)	18,727 (0.52 %)
249	European suslik (primary hap 2024) GCA_964194105.1	n/a	n/a	20,075 (1.28 %)	20,274 (1.19 %)	n/a	39.90 (99.99 %)	4 (0.00 %)	1,436 (0.01 %)	502 (100.00 %)	4,357,247 (31.78 %)	882,536 (12.27 %)	14,882,486 (41.66 %)	9 (0.00 %)	1,833,125 (4.49 %)	39,275 (0.88 %)	27,165 (0.54 %)
250	European woodmouse (2022 refseq) GCF_947179515.1	54,113 (2.24 %)	n/a	19,959 (1.65 %)	19,953 (1.25 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	0 (0 %)	1,129 (0.01 %)	497 (100.00 %)	4,863,650 (37.41 %)	1,795,997 (8.95 %)	13,681,732 (40.58 %)	17 (0.00 %)	2,516,593 (5.37 %)	23,961 (0.53 %)	17,318 (0.36 %)
251	European woodmouse (alternate hap 2022) GCA_947179525.1	n/a	n/a	18,692 (1.72 %)	22,021 (1.36 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	10,863 (100.00 %)	4,055,957 (36.08 %)	1,513,576 (9.53 %)	11,306,811 (39.67 %)	0 (0 %)	1,995,176 (5.07 %)	20,865 (0.55 %)	15,533 (0.39 %)
252	fallow deer (Ldn47 2023) GCF_033118175.1	57,013 (2.35 %)	n/a	20,187 (1.33 %)	23,290 (1.33 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	0 (0 %)	44 (0.00 %)	284 (100.00 %)	3,308,241 (20.72 %)	513,748 (18.20 %)	12,996,819 (48.19 %)	0 (0 %)	5,629,434 (11.23 %)	214,480 (2.98 %)	41,647 (0.85 %)
253	fallow deer (maternal hap SK-2024 2025) GCA_048126745.1	n/a	n/a	20,072 (1.51 %)	22,668 (1.37 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	65 (0.00 %)	147 (0.00 %)	1,369 (100.00 %)	4,623,335 (34.75 %)	475,143 (7.51 %)	13,000,703 (41.56 %)	1 (0.00 %)	2,295,952 (5.37 %)	112,581 (2.00 %)	41,372 (0.95 %)
254	fallow deer (paternal hap SK-2024 2025) GCA_048127045.1	n/a	n/a	18,238 (1.57 %)	20,307 (1.42 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	78 (0.00 %)	242 (0.00 %)	388 (100.00 %)	4,244,450 (35.89 %)	405,446 (2.83 %)	12,211,643 (38.55 %)	0 (0 %)	937,470 (2.69 %)	52,418 (1.36 %)	34,784 (0.91 %)
255	false killer whale (hap1 2024 genbank) GCA_039906515.1	n/a	n/a	18,718 (1.50 %)	20,929 (1.32 %)	n/a	42.08 (99.90 %)	0 (0 %)	123 (0.10 %)	439 (100.00 %)	3,958,932 (35.76 %)	1,002,329 (11.61 %)	12,193,131 (41.85 %)	3 (0.00 %)	1,441,777 (4.23 %)	79,158 (3.74 %)	41,701 (1.03 %)
256	false killer whale (hap1 2024 refseq) GCF_039906515.1	75,958 (3.31 %)	n/a	18,718 (1.50 %)	20,982 (1.32 %)	n/a	42.08 (99.90 %)	0 (0 %)	123 (0.10 %)	438 (100.00 %)	3,958,926 (35.76 %)	1,002,329 (11.61 %)	12,193,061 (41.85 %)	3 (0.00 %)	1,441,777 (4.23 %)	79,158 (3.74 %)	41,701 (1.03 %)
257	false killer whale (hap2 2024) GCA_039906525.1	n/a	n/a	17,866 (1.45 %)	21,079 (1.46 %)	n/a	42.37 (99.08 %)	0 (0 %)	133 (0.92 %)	416 (100.00 %)	3,852,502 (34.98 %)	1,112,185 (16.42 %)	11,435,533 (44.17 %)	1 (0.00 %)	1,686,603 (5.16 %)	75,215 (4.36 %)	39,963 (0.98 %)
258	fat dormouse (US078 2019) GCA_004027185.1	n/a	n/a	23,122 (1.24 %)	48,677 (1.27 %)	n/a	42.33 (99.92 %)	10,685 (0.04 %)	10,685 (0.04 %)	444,115 (99.96 %)	6,783,404 (37.03 %)	1,642,515 (3.72 %)	12,706,289 (39.97 %)	58 (0.00 %)	n/a	65,521 (1.47 %)	33,794 (0.75 %)
259	fat sand rat (mPsaObe1 2021) GCF_907164565.1	43,224 (2.50 %)	n/a	18,543 (1.78 %)	20,094 (1.42 %)	n/a	41.95 (99.11 %)	0 (0 %)	50,482 (0.90 %)	11,389 (100.00 %)	4,686,377 (43.10 %)	920,563 (1.85 %)	12,813,848 (35.08 %)	2,665 (0.03 %)	294,151 (0.96 %)	22,480 (0.71 %)	20,772 (0.63 %)
260	fat sand rat (Psa_ob012049795 2017) GCA_002215935.1	n/a	n/a	21,644 (1.71 %)	31,665 (1.41 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	96,427 (100.00 %)	4,646,110 (38.87 %)	946,664 (2.24 %)	13,134,526 (33.94 %)	0 (0 %)	232,939 (1.07 %)	26,411 (0.73 %)	24,961 (0.66 %)
261	fat-tailed dunnart (SCR6 2025) GCF_048593235.1	60,212 (2.43 %)	n/a	15,763 (0.77 %)	16,031 (0.89 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	0 (0 %)	1,908 (0.01 %)	8 (100.00 %)	5,302,378 (24.47 %)	1,450,227 (3.79 %)	20,870,714 (44.26 %)	5 (0.00 %)	628,150 (1.54 %)	24,586 (0.65 %)	24,216 (0.53 %)
262	fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025) GCA_048593235.1	n/a	n/a	15,762 (0.77 %)	16,035 (0.89 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	1,908 (0.01 %)	1,908 (0.01 %)	1,915 (99.99 %)	5,302,372 (24.47 %)	1,450,220 (3.79 %)	20,870,654 (44.26 %)	5 (0.00 %)	1,034,421 (2.56 %)	24,585 (0.65 %)	24,216 (0.53 %)
263	fat-tailed dunnart (SCR6 hap2 2025) GCA_048593295.1	n/a	n/a	16,012 (0.77 %)	16,430 (0.90 %)	n/a	36.18 (99.99 %)	1,730 (0.01 %)	1,730 (0.01 %)	1,737 (99.99 %)	5,361,847 (24.48 %)	1,474,744 (3.79 %)	21,021,671 (44.20 %)	6 (0.00 %)	1,053,897 (2.55 %)	25,669 (0.69 %)	25,354 (0.55 %)
264	fin whale (hap1.1 2025) GCA_965194825.1	n/a	n/a	19,491 (1.21 %)	22,538 (1.06 %)	n/a	42.19 (99.99 %)	0 (0 %)	1,516 (0.01 %)	2,612 (100.00 %)	4,598,236 (35.34 %)	1,716,315 (24.14 %)	12,260,919 (52.40 %)	7 (0.00 %)	3,173,278 (8.14 %)	82,683 (1.47 %)	44,824 (0.87 %)
265	fin whale (hap2.1 2025) GCA_965194765.1	n/a	n/a	18,684 (1.40 %)	21,322 (1.20 %)	n/a	41.87 (99.99 %)	1,258 (0.01 %)	1,258 (0.01 %)	3,706 (99.99 %)	4,103,716 (36.69 %)	1,030,821 (16.12 %)	11,633,934 (45.82 %)	11 (0.00 %)	1,843,351 (5.96 %)	74,782 (1.60 %)	42,885 (1.00 %)
266	fishing cat (Anna 2022 U Missouri) GCF_022837055.1	68,085 (2.86 %)	n/a	18,432 (1.63 %)	19,912 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	0 (0 %)	63 (0.00 %)	192 (100.00 %)	4,777,906 (34.85 %)	937,432 (2.30 %)	13,438,032 (34.55 %)	0 (0 %)	654,267 (1.76 %)	70,402 (2.61 %)	68,720 (2.25 %)
267	Florida manatee (CSIC 2023) GCA_030013775.1	n/a	n/a	19,432 (1.24 %)	24,035 (1.14 %)	n/a	40.66 (100.00 %)	33 (0.00 %)	33 (0.00 %)	15,641 (100.00 %)	4,400,331 (33.07 %)	439,615 (1.04 %)	14,884,753 (46.98 %)	2 (0.00 %)	413,231 (1.00 %)	32,563 (0.80 %)	26,358 (0.59 %)
268	Florida manatee (Lorelei 2012 refseq) GCF_000243295.1	39,664 (2.08 %)	n/a	18,308 (1.37 %)	20,588 (1.23 %)	32,868 (1.38 %)	40.73 (89.24 %)	160,167 (10.78 %)	160,167 (10.78 %)	166,490 (89.22 %)	n/a	389,315 (0.74 %)	14,633,038 (38.46 %)	5,748 (0.06 %)	244,060 (0.64 %)	27,462 (0.64 %)	25,464 (0.54 %)
269	fossa GCA_004023885.1	n/a	n/a	21,156 (1.56 %)	29,809 (1.38 %)	n/a	41.51 (99.94 %)	6,335 (0.03 %)	6,335 (0.03 %)	470,371 (99.97 %)	4,962,168 (42.36 %)	814,639 (1.52 %)	13,708,904 (34.14 %)	29 (0.00 %)	263,077 (0.54 %)	78,033 (2.52 %)	74,289 (2.13 %)
270	Gambian giant pouched rat GCA_004027575.1	n/a	n/a	21,189 (1.59 %)	32,806 (1.43 %)	n/a	42.11 (99.88 %)	7,473 (0.03 %)	7,473 (0.03 %)	1,110,425 (99.97 %)	4,137,605 (24.57 %)	1,071,627 (2.76 %)	12,905,250 (32.78 %)	51 (0.00 %)	n/a	32,359 (0.80 %)	21,577 (0.55 %)
271	gayal (CVASU_BF_001 2021) GCA_017311355.1	n/a	n/a	24,549 (1.09 %)	55,194 (1.15 %)	n/a	42.05 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1,262,134 (100.00 %)	3,691,398 (22.78 %)	677,397 (2.00 %)	14,380,670 (42.36 %)	0 (0 %)	n/a	75,114 (1.33 %)	44,401 (0.88 %)
272	gayal (Nagaland 2019) GCA_007844835.1	n/a	n/a	22,715 (1.55 %)	23,635 (1.33 %)	n/a	41.67 (96.51 %)	301,761 (3.52 %)	301,761 (3.52 %)	306,776 (96.48 %)	6,243,468 (45.69 %)	518,664 (1.99 %)	15,147,647 (37.64 %)	5,199 (0.13 %)	1,060,226 (3.23 %)	45,586 (0.89 %)	40,275 (0.78 %)
273	Geoffroy's bat (hap1.1 2025) GCA_965115925.1	n/a	n/a	19,320 (1.74 %)	21,940 (1.65 %)	n/a	42.55 (99.99 %)	2 (0.00 %)	1,540 (0.01 %)	404 (100.00 %)	3,707,500 (37.60 %)	733,107 (7.78 %)	10,515,474 (39.35 %)	11 (0.00 %)	903,956 (3.14 %)	60,200 (2.41 %)	51,657 (1.64 %)
274	Geoffroy's bat (hap2.1 2025) GCA_965115945.1	n/a	n/a	18,718 (1.71 %)	20,961 (1.62 %)	n/a	42.29 (99.98 %)	1,597 (0.02 %)	1,597 (0.02 %)	2,101 (99.98 %)	3,662,405 (37.72 %)	717,069 (7.80 %)	10,298,372 (39.22 %)	11 (0.00 %)	842,144 (3.02 %)	56,300 (2.26 %)	45,967 (1.45 %)
275	Geoffroy's cat GCF_018350155.1	85,344 (3.53 %)	n/a	18,469 (1.66 %)	19,516 (1.36 %)	93,795 (4.83 %)	41.75 (100.00 %)	35 (0.00 %)	45 (0.00 %)	82 (100.00 %)	5,021,854 (43.23 %)	930,175 (1.84 %)	13,757,469 (34.29 %)	0 (0 %)	627,614 (1.76 %)	65,918 (2.36 %)	58,825 (1.96 %)
276	giant anteater GCA_004026745.1	n/a	n/a	24,383 (0.91 %)	44,315 (0.93 %)	n/a	39.53 (99.88 %)	8,283 (0.02 %)	8,283 (0.02 %)	1,629,691 (99.98 %)	5,333,757 (35.57 %)	575,140 (0.91 %)	21,181,213 (39.97 %)	116 (0.00 %)	n/a	57,558 (0.94 %)	45,184 (0.73 %)
277	giant otter GCA_004024605.1	n/a	n/a	21,199 (1.46 %)	30,565 (1.34 %)	n/a	41.71 (99.93 %)	7,431 (0.03 %)	7,431 (0.03 %)	652,159 (99.97 %)	5,113,769 (41.55 %)	788,677 (1.46 %)	14,385,279 (35.77 %)	57 (0.00 %)	420,852 (0.84 %)	82,376 (2.05 %)	79,949 (1.87 %)
278	giant panda (Jingjing v3 2020) GCF_002007445.2	65,481 (3.27 %)	n/a	19,077 (1.67 %)	20,176 (1.39 %)	n/a	41.68 (98.09 %)	0 (0 %)	189,277 (1.92 %)	73,514 (100.00 %)	4,012,144 (34.40 %)	617,803 (1.99 %)	14,216,587 (30.41 %)	9,430 (0.13 %)	581,226 (4.37 %)	59,449 (1.50 %)	54,779 (1.33 %)
279	goat (v2 San Clemente 2016 USDA) GCF_001704415.2	47,172 (2.31 %)	n/a	19,342 (1.38 %)	22,346 (1.24 %)	n/a	43.16 (100.00 %)	0 (0 %)	790 (0.00 %)	29,886 (100.00 %)	3,502,527 (22.45 %)	760,831 (7.07 %)	13,024,178 (44.85 %)	0 (0 %)	2,571,330 (5.65 %)	125,662 (4.00 %)	40,923 (0.89 %)
280	Gobi jerboa GCA_004027895.1	n/a	n/a	22,410 (0.91 %)	45,268 (1.02 %)	n/a	41.94 (99.88 %)	10,987 (0.04 %)	10,987 (0.04 %)	1,295,369 (99.96 %)	8,828,417 (40.19 %)	1,979,806 (6.43 %)	14,759,732 (47.73 %)	96 (0.00 %)	n/a	24,314 (0.52 %)	19,787 (0.39 %)
281	golden hamster (Baylor 2021) GCF_017639785.1	67,831 (3.37 %)	n/a	19,354 (1.71 %)	19,863 (1.47 %)	69,903 (4.39 %)	42.04 (96.99 %)	711 (3.01 %)	711 (3.01 %)	7,058 (96.99 %)	3,981,818 (27.65 %)	976,456 (3.46 %)	12,580,903 (32.87 %)	25 (0.00 %)	766,407 (1.98 %)	21,268 (0.61 %)	18,135 (0.47 %)
282	golden hamster (Broad 2013 refseq) GCF_000349665.1	42,636 (2.91 %)	37,986 (2.21 %)	18,976 (1.82 %)	19,149 (1.51 %)	29,936 (1.96 %)	42.01 (82.92 %)	216,216 (17.12 %)	216,216 (17.12 %)	237,700 (82.88 %)	3,599,795 (26.09 %)	790,256 (1.69 %)	12,003,956 (24.29 %)	3,589 (0.05 %)	254,929 (0.76 %)	18,591 (0.51 %)	17,093 (0.42 %)
283	golden spiny mouse (2020) GCF_903995435.1	36,997 (1.96 %)	n/a	20,006 (1.91 %)	19,132 (1.50 %)	n/a	42.51 (99.65 %)	0 (0 %)	880 (0.35 %)	623 (100.00 %)	4,785,907 (32.61 %)	1,305,613 (3.34 %)	12,958,061 (32.33 %)	0 (0 %)	684,879 (1.84 %)	20,760 (0.59 %)	18,457 (0.52 %)
284	golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 genbank) GCA_048772815.1	n/a	n/a	20,967 (0.89 %)	24,137 (0.94 %)	n/a	39.52 (99.99 %)	0 (0 %)	1,448 (0.01 %)	8,087 (100.00 %)	5,547,018 (29.30 %)	1,312,047 (10.07 %)	15,174,898 (52.73 %)	10 (0.00 %)	5,076,603 (7.43 %)	40,182 (0.59 %)	29,493 (0.39 %)
285	golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 refseq) GCF_048772815.1	49,173 (1.30 %)	n/a	19,845 (0.90 %)	24,244 (0.94 %)	n/a	39.52 (99.99 %)	0 (0 %)	1,448 (0.01 %)	8,088 (100.00 %)	8,197,827 (62.01 %)	1,312,047 (10.07 %)	15,174,958 (52.73 %)	10 (0.00 %)	5,076,603 (7.43 %)	40,182 (0.59 %)	29,417 (0.42 %)
286	golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 genbank) GCA_048772825.1	n/a	n/a	19,719 (1.16 %)	22,611 (1.21 %)	n/a	39.48 (100.00 %)	0 (0 %)	643 (0.00 %)	2,820 (100.00 %)	4,725,546 (31.70 %)	997,950 (3.53 %)	14,753,550 (39.53 %)	6 (0.00 %)	1,428,961 (3.10 %)	33,465 (0.69 %)	26,996 (0.48 %)
287	golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 refseq) GCF_048772825.1	46,395 (1.71 %)	n/a	18,853 (1.19 %)	22,613 (1.21 %)	n/a	39.48 (100.00 %)	0 (0 %)	643 (0.00 %)	2,821 (100.00 %)	6,984,115 (50.68 %)	997,950 (3.53 %)	14,753,604 (39.53 %)	6 (0.00 %)	1,428,961 (3.10 %)	33,465 (0.69 %)	26,805 (0.53 %)
288	gracile shrew mole GCA_004024945.1	n/a	n/a	19,165 (1.25 %)	43,816 (1.48 %)	n/a	41.08 (99.89 %)	8,248 (0.04 %)	8,248 (0.04 %)	732,083 (99.96 %)	2,957,465 (23.76 %)	783,289 (2.60 %)	11,503,344 (31.38 %)	23 (0.00 %)	n/a	92,729 (3.60 %)	75,685 (2.89 %)
289	gray fox (Vermont ataVT051 2023) GCA_032313775.1	n/a	n/a	19,352 (1.42 %)	20,724 (1.33 %)	n/a	42.10 (100.00 %)	0 (0 %)	26 (0.00 %)	898 (100.00 %)	4,418,039 (36.90 %)	1,050,244 (11.63 %)	13,240,305 (39.50 %)	0 (0 %)	3,860,162 (6.83 %)	89,246 (2.69 %)	49,263 (1.43 %)
290	gray seal (241Hg 2020) GCF_012393455.1	79,009 (3.73 %)	n/a	19,882 (1.73 %)	22,416 (1.46 %)	n/a	41.44 (100.00 %)	0 (0 %)	117 (0.00 %)	6,880 (100.00 %)	4,448,588 (43.28 %)	557,710 (1.32 %)	13,340,576 (33.41 %)	0 (0 %)	506,266 (1.47 %)	55,637 (1.78 %)	52,209 (1.58 %)
291	gray seal (hap1.1 2025) GCA_964656455.1	n/a	n/a	19,291 (1.73 %)	20,301 (1.41 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	0 (0 %)	1,130 (0.01 %)	171 (100.00 %)	4,245,582 (34.81 %)	600,624 (2.16 %)	13,240,803 (34.28 %)	4 (0.00 %)	615,950 (1.85 %)	56,932 (1.78 %)	54,064 (1.60 %)
292	gray seal (hap2.1 2025) GCA_964656465.1	n/a	n/a	19,222 (1.73 %)	20,205 (1.41 %)	n/a	41.54 (99.99 %)	1,110 (0.01 %)	1,110 (0.01 %)	1,233 (99.99 %)	4,236,942 (34.95 %)	601,409 (1.99 %)	13,226,667 (34.03 %)	5 (0.00 %)	598,973 (1.85 %)	57,067 (1.82 %)	54,058 (1.64 %)
293	gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023) GCA_027917375.1	n/a	n/a	12,662 (0.70 %)	15,124 (0.89 %)	n/a	37.74 (100.00 %)	24 (0.00 %)	24 (0.00 %)	8,086 (100.00 %)	4,098,004 (25.33 %)	806,470 (2.98 %)	16,244,072 (43.39 %)	0 (0 %)	n/a	24,879 (0.67 %)	15,867 (0.39 %)
294	gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq) GCF_027887165.1	73,383 (3.04 %)	n/a	16,637 (0.72 %)	16,036 (0.85 %)	n/a	37.92 (99.11 %)	0 (0 %)	2,255 (0.89 %)	13 (100.00 %)	5,562,359 (25.40 %)	1,096,620 (2.60 %)	22,322,748 (43.37 %)	13 (0.00 %)	793,648 (1.81 %)	28,894 (0.57 %)	22,987 (0.42 %)
295	gray short-tailed opossum (MonDom5 2007) GCF_000002295.2	68,388 (2.34 %)	n/a	16,663 (0.75 %)	16,162 (0.84 %)	n/a	37.82 (97.26 %)	67,660 (2.75 %)	67,660 (2.75 %)	72,674 (97.25 %)	7,753,175 (55.85 %)	1,051,473 (2.34 %)	22,274,001 (42.23 %)	6 (0.00 %)	680,995 (1.61 %)	30,883 (0.53 %)	22,339 (0.40 %)
296	gray squirrel (2020) GCF_902686445.1	59,073 (2.48 %)	n/a	20,752 (1.49 %)	21,107 (1.31 %)	32,732 (1.45 %)	40.06 (99.98 %)	0 (0 %)	1,824 (0.02 %)	752 (100.00 %)	4,605,578 (34.50 %)	728,192 (1.65 %)	15,467,412 (33.91 %)	2 (0.00 %)	504,786 (1.54 %)	51,878 (1.11 %)	49,715 (1.03 %)
297	gray squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685475.1	n/a	n/a	17,156 (1.53 %)	18,190 (1.33 %)	n/a	40.25 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	9,510 (100.00 %)	3,455,580 (34.94 %)	530,053 (1.56 %)	10,927,458 (32.64 %)	0 (0 %)	323,766 (1.34 %)	38,976 (1.13 %)	37,317 (1.05 %)
298	gray wolf (2021) GCA_905319855.2	n/a	n/a	19,474 (1.55 %)	20,394 (1.40 %)	72,806 (4.12 %)	41.49 (100.00 %)	0 (0 %)	166 (0.00 %)	82 (100.00 %)	4,550,524 (31.76 %)	1,063,944 (3.96 %)	13,588,117 (34.74 %)	23 (0.00 %)	1,048,956 (2.49 %)	51,996 (2.15 %)	47,971 (1.53 %)
299	gray wolf (alternate hap 2021) GCA_905319845.1	n/a	n/a	12,760 (1.57 %)	14,423 (1.42 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	5,537 (100.00 %)	2,725,227 (31.66 %)	616,862 (3.40 %)	8,041,744 (32.68 %)	0 (0 %)	465,446 (1.97 %)	32,293 (2.35 %)	29,871 (1.57 %)
300	great fruit-eating bat (hap1 2024) GCA_038363145.1	n/a	n/a	18,022 (1.56 %)	19,824 (1.51 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	0 (0 %)	81 (0.00 %)	419 (100.00 %)	2,827,417 (26.82 %)	371,479 (4.97 %)	11,603,093 (34.64 %)	1 (0.00 %)	522,672 (1.87 %)	71,574 (2.28 %)	54,020 (1.50 %)
301	great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024) GCA_038363175.2	n/a	n/a	16,978 (1.61 %)	18,544 (1.54 %)	n/a	42.42 (100.00 %)	0 (0 %)	54 (0.00 %)	312 (100.00 %)	2,601,985 (26.67 %)	331,187 (4.87 %)	10,884,729 (33.93 %)	1 (0.00 %)	458,782 (1.76 %)	63,610 (2.71 %)	49,165 (1.49 %)
302	great fruit-eating bat (v2 hap1 2024) GCA_038363095.2	n/a	n/a	18,051 (1.56 %)	19,955 (1.51 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	0 (0 %)	45 (0.00 %)	487 (100.00 %)	2,841,143 (26.67 %)	379,430 (5.52 %)	11,651,542 (35.11 %)	0 (0 %)	569,322 (2.01 %)	72,337 (2.76 %)	54,165 (1.48 %)
303	great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016) GCF_001890085.2	50,908 (3.26 %)	n/a	18,993 (2.01 %)	19,633 (1.65 %)	41,769 (2.41 %)	41.11 (87.42 %)	0 (0 %)	172,750 (12.60 %)	7,387 (100.00 %)	2,946,981 (30.72 %)	495,272 (1.05 %)	11,587,728 (25.43 %)	2,116 (0.03 %)	193,018 (1.10 %)	32,949 (0.96 %)	30,173 (0.87 %)
304	greater bulldog bat GCA_004026585.1	n/a	n/a	20,774 (1.62 %)	28,140 (1.63 %)	n/a	40.92 (99.94 %)	6,171 (0.03 %)	6,171 (0.03 %)	304,393 (99.97 %)	3,288,598 (29.60 %)	478,424 (1.16 %)	11,427,553 (35.29 %)	6 (0.00 %)	n/a	44,124 (1.99 %)	42,024 (1.78 %)
305	Greater cane rat GCA_004025085.1	n/a	n/a	20,383 (0.98 %)	47,456 (1.25 %)	n/a	42.85 (99.83 %)	8,825 (0.03 %)	8,825 (0.03 %)	1,898,466 (99.97 %)	5,569,185 (30.19 %)	946,696 (3.12 %)	13,144,109 (41.83 %)	28 (0.00 %)	n/a	97,686 (2.61 %)	84,205 (2.21 %)
306	greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019) GCA_004115295.1	n/a	n/a	14,896 (1.85 %)	18,939 (1.59 %)	n/a	40.69 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	13,426 (100.00 %)	2,426,330 (34.43 %)	418,341 (1.36 %)	8,763,234 (27.86 %)	0 (0 %)	108,521 (0.55 %)	24,370 (1.08 %)	22,940 (1.00 %)
307	greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019) GCF_004115265.2	53,353 (3.13 %)	n/a	18,641 (1.97 %)	20,359 (1.68 %)	n/a	40.54 (99.64 %)	0 (0 %)	158 (0.36 %)	134 (100.00 %)	3,218,744 (34.52 %)	564,789 (1.35 %)	12,217,020 (29.39 %)	0 (0 %)	171,202 (0.67 %)	32,445 (1.06 %)	30,641 (0.98 %)
308	greater mouse-eared bat (2020 Bat1K) GCF_014108235.1	70,930 (3.43 %)	n/a	19,052 (1.84 %)	21,498 (1.73 %)	n/a	43.11 (98.55 %)	0 (0 %)	538 (1.45 %)	93 (100.00 %)	3,088,083 (26.27 %)	753,124 (2.84 %)	10,383,466 (35.84 %)	0 (0 %)	499,733 (1.88 %)	61,023 (2.69 %)	54,015 (1.81 %)
309	greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024) GCA_043880545.1	n/a	n/a	18,582 (1.55 %)	20,954 (1.35 %)	n/a	42.46 (100.00 %)	0 (0 %)	152 (0.00 %)	106 (100.00 %)	4,158,629 (40.30 %)	696,150 (4.67 %)	12,702,667 (41.11 %)	1 (0.00 %)	1,418,508 (3.67 %)	257,446 (3.38 %)	44,752 (1.05 %)
310	greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq) GCF_036850765.1	55,259 (2.53 %)	n/a	18,321 (1.40 %)	21,048 (1.35 %)	n/a	41.71 (98.73 %)	0 (0 %)	468 (1.27 %)	256 (100.00 %)	4,247,145 (29.53 %)	1,031,385 (2.50 %)	12,465,157 (43.30 %)	3 (0.00 %)	1,113,639 (2.95 %)	101,620 (2.01 %)	44,590 (1.04 %)
311	greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U) GCF_019186645.2	50,563 (2.96 %)	n/a	18,224 (1.70 %)	20,689 (1.67 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	0 (0 %)	55 (0.00 %)	534 (100.00 %)	2,961,591 (0.00 %)	387,908 (0.97 %)	12,179,612 (30.91 %)	1 (0.00 %)	167,034 (0.66 %)	62,189 (5.35 %)	65,269 (4.61 %)
312	grey whale GCA_004363415.1	n/a	n/a	21,827 (1.52 %)	32,191 (1.24 %)	n/a	41.22 (99.88 %)	10,622 (0.04 %)	10,622 (0.04 %)	1,046,770 (99.96 %)	4,841,166 (45.56 %)	780,015 (1.83 %)	13,559,563 (39.86 %)	79 (0.00 %)	n/a	72,343 (1.59 %)	48,741 (1.27 %)
313	grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023) GCA_028021475.1	n/a	n/a	19,129 (1.37 %)	24,628 (1.24 %)	n/a	41.83 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14,442 (100.00 %)	3,892,130 (35.74 %)	874,864 (15.70 %)	11,484,916 (45.69 %)	0 (0 %)	2,048,708 (5.99 %)	73,507 (1.72 %)	41,124 (0.98 %)
314	grey whale (primary hap 2023 genbank) GCA_028021215.1	n/a	n/a	19,288 (1.38 %)	21,791 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	0 (0 %)	279 (0.00 %)	704 (100.00 %)	4,116,900 (35.85 %)	966,065 (16.74 %)	12,154,173 (46.39 %)	3 (0.00 %)	2,154,240 (5.67 %)	77,011 (1.59 %)	42,884 (0.96 %)
315	grey whale (primary hap 2023 refseq) GCF_028021215.1	49,276 (1.90 %)	n/a	19,295 (1.38 %)	21,790 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	0 (0 %)	279 (0.00 %)	703 (100.00 %)	4,116,894 (35.85 %)	966,064 (16.74 %)	12,154,101 (46.39 %)	3 (0.00 %)	2,154,240 (5.67 %)	77,011 (1.59 %)	42,884 (0.96 %)
316	hairy big-eared bat (US037 2019 Broad) GCA_004026765.1	n/a	n/a	21,360 (1.44 %)	37,376 (1.52 %)	n/a	42.38 (99.94 %)	3,218 (0.01 %)	3,218 (0.01 %)	553,308 (99.99 %)	3,519,246 (30.77 %)	393,318 (0.85 %)	12,525,258 (34.42 %)	12 (0.00 %)	n/a	84,875 (2.37 %)	63,057 (1.80 %)
317	Hanaki's dwarf bat (2024) GCA_964339955.1	n/a	n/a	17,856 (1.76 %)	20,604 (1.75 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	0 (0 %)	306 (0.00 %)	141 (100.00 %)	3,697,250 (33.21 %)	842,827 (8.27 %)	10,094,062 (38.40 %)	2 (0.00 %)	752,759 (2.71 %)	61,715 (2.96 %)	59,765 (1.96 %)
318	harbor porpoise (primary hap 2024 genbank) GCA_963924675.1	n/a	n/a	18,529 (1.58 %)	20,583 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	2 (0.00 %)	966 (0.01 %)	442 (100.00 %)	3,760,716 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,240 (39.04 %)	4 (0.00 %)	1,410,168 (3.71 %)	71,530 (2.69 %)	40,160 (1.06 %)
319	harbor porpoise (primary hap 2024 refseq) GCF_963924675.1	33,578 (1.54 %)	n/a	18,528 (1.58 %)	20,582 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	966 (0.01 %)	966 (0.01 %)	1,405 (99.99 %)	3,760,713 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,181 (39.04 %)	4 (0.00 %)	1,410,168 (3.71 %)	71,530 (2.69 %)	40,160 (1.06 %)
320	harbor seal GCF_004348235.1	50,657 (2.98 %)	n/a	19,484 (1.76 %)	20,771 (1.44 %)	33,296 (1.58 %)	41.38 (99.09 %)	16,031 (0.91 %)	16,480 (0.91 %)	21,161 (99.09 %)	4,526,182 (43.28 %)	576,921 (1.11 %)	13,421,780 (33.06 %)	945 (0.02 %)	459,159 (1.28 %)	54,592 (1.70 %)	51,200 (1.50 %)
321	Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U) GCF_002201575.2	37,605 (1.99 %)	n/a	19,483 (1.73 %)	19,767 (1.35 %)	n/a	41.41 (98.23 %)	0 (0 %)	25,763 (1.77 %)	7,487 (100.00 %)	4,575,217 (43.59 %)	583,394 (1.11 %)	13,374,131 (33.69 %)	2,318 (0.04 %)	611,862 (1.63 %)	52,067 (1.50 %)	48,495 (1.32 %)
322	hazel dormouse GCA_004027005.1	n/a	n/a	21,556 (1.24 %)	40,971 (1.33 %)	n/a	41.60 (99.91 %)	15,076 (0.06 %)	15,076 (0.06 %)	481,881 (99.94 %)	6,679,641 (33.98 %)	1,653,419 (3.72 %)	12,685,676 (43.98 %)	42 (0.00 %)	n/a	71,478 (1.57 %)	45,897 (0.92 %)
323	hazel dormouse (alternate hap 2023) GCA_963383665.1	n/a	n/a	11,130 (1.23 %)	22,071 (1.36 %)	n/a	42.15 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	31,856 (100.00 %)	2,958,239 (41.25 %)	788,242 (4.52 %)	6,056,268 (41.88 %)	0 (0 %)	532,149 (2.74 %)	36,143 (1.96 %)	23,949 (1.02 %)
324	hazel dormouse (primary hap 2023) GCA_963383645.1	n/a	n/a	18,620 (1.42 %)	22,403 (1.38 %)	n/a	41.73 (99.99 %)	1 (0.00 %)	1,805 (0.01 %)	214 (100.00 %)	6,063,911 (41.66 %)	1,593,657 (4.46 %)	12,229,281 (43.98 %)	8 (0.00 %)	1,313,148 (3.16 %)	71,058 (1.88 %)	45,398 (0.93 %)
325	hippopotamus (BS01 2019 Broad) GCA_004027065.1	n/a	n/a	24,267 (1.55 %)	34,820 (1.30 %)	n/a	41.43 (99.91 %)	4,730 (0.02 %)	4,730 (0.02 %)	972,599 (99.98 %)	4,579,311 (41.26 %)	606,731 (1.02 %)	14,514,493 (36.58 %)	17 (0.00 %)	n/a	54,753 (1.59 %)	52,362 (1.50 %)
326	hippopotamus (HIP001 2018) GCA_002995585.1	n/a	n/a	22,343 (1.70 %)	31,687 (1.45 %)	n/a	40.96 (94.63 %)	153,125 (5.38 %)	153,125 (5.38 %)	281,897 (94.62 %)	3,952,905 (38.55 %)	476,243 (1.97 %)	14,216,817 (27.43 %)	6,026 (0.29 %)	n/a	48,380 (1.43 %)	46,263 (1.31 %)
327	hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023) GCA_030028035.1	n/a	n/a	20,391 (1.63 %)	20,668 (1.37 %)	n/a	41.62 (100.00 %)	0 (0 %)	83 (0.00 %)	545 (100.00 %)	3,778,764 (35.17 %)	563,345 (3.63 %)	13,524,869 (35.56 %)	0 (0 %)	369,754 (1.46 %)	48,164 (1.90 %)	44,065 (1.33 %)
328	hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq) GCF_030028045.1	64,153 (2.73 %)	n/a	20,331 (1.62 %)	20,633 (1.37 %)	n/a	41.60 (100.00 %)	0 (0 %)	226 (0.00 %)	357 (100.00 %)	3,783,440 (35.17 %)	567,797 (3.38 %)	13,462,531 (35.48 %)	2 (0.00 %)	396,368 (1.55 %)	48,365 (1.91 %)	44,048 (1.34 %)
329	hirola (BS46 2019 Broad) GCA_004027495.1	n/a	n/a	22,264 (1.40 %)	36,984 (1.26 %)	n/a	42.31 (99.93 %)	9,287 (0.03 %)	9,287 (0.03 %)	545,176 (99.97 %)	5,809,405 (48.62 %)	465,001 (1.08 %)	13,326,245 (42.35 %)	43 (0.00 %)	n/a	48,312 (1.15 %)	38,948 (0.98 %)
330	Hispaniolan solenodon GCA_004363575.1	n/a	n/a	18,805 (1.55 %)	27,454 (1.64 %)	n/a	39.98 (99.96 %)	5,186 (0.02 %)	5,186 (0.02 %)	181,804 (99.98 %)	2,669,787 (26.78 %)	431,610 (1.04 %)	13,429,711 (27.35 %)	24 (0.00 %)	86,983 (0.25 %)	53,444 (2.30 %)	52,300 (2.09 %)
331	hispid cotton rat GCA_004025045.1	n/a	n/a	25,324 (1.49 %)	31,681 (1.31 %)	39,953 (1.43 %)	39.77 (99.89 %)	13,744 (0.05 %)	13,744 (0.05 %)	897,290 (99.95 %)	4,384,099 (28.17 %)	1,132,313 (3.34 %)	14,729,737 (38.08 %)	28 (0.00 %)	n/a	17,558 (0.40 %)	15,148 (0.33 %)
332	Hoffmann's two-fingered sloth GCA_000164785.2	n/a	n/a	24,546 (1.30 %)	30,273 (1.15 %)	n/a	39.80 (98.09 %)	100,957 (1.91 %)	101,085 (1.91 %)	370,035 (98.09 %)	5,145,551 (52.20 %)	614,819 (1.62 %)	17,932,269 (39.26 %)	280 (0.01 %)	469,834 (1.28 %)	55,943 (1.04 %)	45,466 (0.86 %)
333	hog-nosed bat GCA_004027555.1	n/a	n/a	20,591 (1.30 %)	39,589 (1.39 %)	n/a	40.99 (99.88 %)	6,224 (0.03 %)	6,224 (0.03 %)	1,230,480 (99.97 %)	4,081,924 (31.12 %)	1,008,077 (2.20 %)	12,068,828 (39.98 %)	17 (0.00 %)	n/a	55,567 (2.02 %)	43,665 (1.48 %)
334	Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020) GCF_014824575.3	49,071 (2.78 %)	n/a	17,588 (1.64 %)	19,357 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	0 (0 %)	38,648 (0.21 %)	25,848 (100.00 %)	2,708,400 (27.89 %)	366,870 (1.48 %)	11,795,308 (31.27 %)	99 (0.00 %)	330,126 (1.83 %)	59,066 (1.72 %)	48,113 (1.34 %)
335	horse (maternal 2024) GCA_036418255.1	n/a	n/a	16,789 (1.65 %)	18,017 (1.36 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	0 (0 %)	210 (0.00 %)	821 (100.00 %)	3,146,381 (34.68 %)	430,664 (5.91 %)	13,246,059 (32.62 %)	0 (0 %)	714,785 (2.15 %)	37,293 (2.80 %)	35,249 (2.66 %)
336	horse (paternal hap 2024) GCA_036426135.1	n/a	n/a	19,073 (1.67 %)	20,636 (1.38 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	0 (0 %)	114 (0.00 %)	602 (100.00 %)	3,521,953 (35.39 %)	461,571 (5.26 %)	14,833,688 (32.77 %)	2 (0.00 %)	728,239 (2.01 %)	43,527 (2.54 %)	41,129 (2.38 %)
337	horse (thoroughbred H_3958 2024) GCF_041296265.1	124,629 (3.91 %)	n/a	18,742 (1.47 %)	21,901 (1.39 %)	n/a	42.90 (99.96 %)	0 (0 %)	5 (0.04 %)	625 (100.00 %)	3,600,073 (33.96 %)	709,759 (8.89 %)	14,396,691 (35.72 %)	0 (0 %)	872,612 (2.26 %)	48,802 (5.67 %)	38,553 (0.92 %)
338	horse (Twilight 2018) GCF_002863925.1	76,388 (4.03 %)	n/a	18,997 (1.73 %)	20,914 (1.42 %)	113,346 (6.08 %)	41.50 (99.62 %)	0 (0 %)	6,294 (0.38 %)	4,701 (100.00 %)	4,080,319 (44.85 %)	395,037 (1.44 %)	15,169,517 (29.93 %)	41 (0.00 %)	354,039 (1.05 %)	44,825 (1.77 %)	37,394 (1.12 %)
339	house mouse (129S1_SvImJv1 2016) GCA_001624185.1	n/a	n/a	21,289 (2.22 %)	18,626 (1.42 %)	102,148 (4.16 %)	41.77 (85.00 %)	54,773 (4.85 %)	366,945 (15.05 %)	62,882 (95.15 %)	5,075,137 (40.38 %)	1,400,072 (2.80 %)	13,497,076 (26.20 %)	20,479 (1.14 %)	431,052 (1.88 %)	16,957 (0.40 %)	16,083 (0.37 %)
340	house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022) GCA_921998555.2	n/a	n/a	21,780 (2.13 %)	19,436 (1.37 %)	110,376 (4.47 %)	41.79 (99.60 %)	8 (0.00 %)	1,557 (0.40 %)	188 (100.00 %)	4,653,663 (40.74 %)	1,550,342 (3.54 %)	12,930,784 (35.48 %)	22 (0.00 %)	820,282 (2.63 %)	23,211 (0.57 %)	15,822 (0.42 %)
341	house mouse (AKR_J v3 2022) GCA_922000895.2	n/a	n/a	21,721 (2.13 %)	19,324 (1.37 %)	110,654 (4.48 %)	41.80 (99.85 %)	6 (0.00 %)	2,714 (0.15 %)	201 (100.00 %)	4,645,513 (40.70 %)	1,547,237 (3.56 %)	13,016,932 (35.69 %)	31 (0.00 %)	816,257 (2.70 %)	23,309 (0.57 %)	15,840 (0.42 %)
342	house mouse (alternate hap 2023) GCA_949316305.1	n/a	n/a	661 (0.88 %)	720 (0.54 %)	n/a	38.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,806 (100.00 %)	97,279 (72.21 %)	40,071 (55.89 %)	208,928 (64.94 %)	0 (0 %)	239,612 (15.41 %)	506 (0.31 %)	327 (0.20 %)
343	house mouse (A_J v3 2022) GCA_921998355.2	n/a	n/a	21,869 (2.13 %)	19,400 (1.37 %)	110,389 (4.48 %)	41.80 (99.39 %)	5 (0.00 %)	608 (0.61 %)	163 (100.00 %)	4,668,553 (40.80 %)	1,556,835 (3.58 %)	12,995,938 (35.53 %)	4 (0.00 %)	832,187 (2.55 %)	23,203 (0.56 %)	15,809 (0.42 %)
344	house mouse (BALB_cJ v3 2022) GCA_921997145.2	n/a	n/a	21,891 (2.13 %)	19,499 (1.37 %)	110,461 (4.47 %)	41.79 (99.80 %)	7 (0.00 %)	274 (0.20 %)	217 (100.00 %)	4,673,990 (40.79 %)	1,560,327 (3.63 %)	13,018,071 (35.70 %)	1 (0.00 %)	836,824 (2.52 %)	23,196 (0.56 %)	15,865 (0.42 %)
345	house mouse (C3H_HeJ v3 2022) GCA_921997125.2	n/a	n/a	21,793 (2.13 %)	19,516 (1.38 %)	110,049 (4.46 %)	41.79 (99.05 %)	3 (0.00 %)	844 (0.95 %)	174 (100.00 %)	4,657,005 (40.76 %)	1,551,107 (3.53 %)	12,949,100 (35.32 %)	12 (0.00 %)	825,975 (2.56 %)	23,262 (0.56 %)	15,821 (0.42 %)
346	house mouse (C57BL_6J T2T 2024) GCA_964188535.1	n/a	n/a	21,496 (1.92 %)	19,278 (1.25 %)	n/a	41.31 (99.85 %)	108 (0.15 %)	108 (0.15 %)	345 (99.85 %)	4,519,975 (46.81 %)	1,564,206 (14.33 %)	12,267,542 (42.16 %)	0 (0 %)	1,961,197 (5.36 %)	23,119 (0.55 %)	15,974 (0.40 %)
347	house mouse (CBA_J v3 2022) GCA_921998905.2	n/a	n/a	21,829 (2.13 %)	19,841 (1.39 %)	110,858 (4.48 %)	41.79 (99.52 %)	2 (0.00 %)	658 (0.48 %)	145 (100.00 %)	4,658,032 (40.77 %)	1,552,298 (3.59 %)	12,948,038 (35.52 %)	2 (0.00 %)	829,314 (2.57 %)	23,232 (0.56 %)	15,810 (0.42 %)
348	house mouse (DBA_2J v3 2022) GCA_921998315.2	n/a	n/a	22,302 (2.08 %)	19,749 (1.35 %)	113,269 (4.42 %)	41.72 (100.00 %)	9 (0.00 %)	153 (0.00 %)	361 (100.00 %)	4,785,676 (41.69 %)	1,597,598 (4.56 %)	13,190,158 (36.58 %)	0 (0 %)	968,205 (2.82 %)	24,140 (0.59 %)	16,383 (0.43 %)
349	house mouse (FVB_NJ v3 2022) GCA_921998635.2	n/a	n/a	21,633 (2.15 %)	19,565 (1.40 %)	110,246 (4.50 %)	41.82 (98.35 %)	8 (0.00 %)	6,244 (1.65 %)	384 (100.00 %)	4,621,601 (40.42 %)	1,537,622 (3.48 %)	12,818,729 (34.77 %)	54 (0.00 %)	781,344 (2.48 %)	22,696 (0.55 %)	15,795 (0.42 %)
350	house mouse (LP_J v3 2022) GCA_947599735.1	n/a	n/a	22,452 (1.91 %)	19,841 (1.23 %)	110,073 (3.98 %)	41.29 (99.99 %)	87 (0.00 %)	386 (0.01 %)	515 (100.00 %)	4,839,574 (46.33 %)	1,645,163 (11.88 %)	12,936,515 (41.49 %)	63 (0.00 %)	1,839,684 (4.85 %)	24,374 (0.54 %)	16,515 (0.39 %)
351	house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022) GCA_921998325.2	n/a	n/a	21,797 (2.13 %)	19,521 (1.38 %)	109,890 (4.48 %)	41.80 (99.50 %)	2 (0.00 %)	1,462 (0.50 %)	170 (100.00 %)	4,650,016 (40.74 %)	1,547,220 (3.54 %)	12,918,125 (35.45 %)	24 (0.00 %)	826,087 (2.65 %)	23,253 (0.56 %)	15,815 (0.42 %)
352	house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022) GCA_947593165.1	n/a	n/a	22,481 (1.93 %)	19,932 (1.26 %)	109,670 (4.03 %)	41.34 (100.00 %)	58 (0.00 %)	234 (0.00 %)	441 (100.00 %)	4,822,230 (45.92 %)	1,637,027 (11.19 %)	13,082,730 (41.04 %)	19 (0.00 %)	1,756,117 (4.67 %)	24,187 (0.54 %)	16,389 (0.39 %)
353	house mouse (primary hap 2023) GCA_949316315.1	n/a	n/a	22,351 (1.96 %)	19,629 (1.26 %)	n/a	41.38 (100.00 %)	0 (0 %)	101 (0.00 %)	179 (100.00 %)	4,774,018 (45.31 %)	1,620,102 (10.50 %)	13,181,250 (40.47 %)	0 (0 %)	1,650,132 (4.47 %)	23,955 (0.54 %)	16,164 (0.39 %)
354	house mouse C57BL/6J 2020 GRC GCF_000001635.27	136,224 (4.84 %)	n/a	22,409 (2.02 %)	19,480 (1.31 %)	140,725 (4.83 %)	41.67 (97.30 %)	324 (2.70 %)	334 (2.70 %)	22,273 (97.30 %)	5,361,085 (45.51 %)	1,641,063 (3.41 %)	12,722,791 (36.04 %)	1 (0.00 %)	858,983 (2.44 %)	23,794 (0.53 %)	15,980 (0.39 %)
355	house mouse C57BL_6NJ (2016) GCA_001632555.1	n/a	n/a	21,177 (2.23 %)	18,495 (1.42 %)	103,002 (4.20 %)	41.76 (82.53 %)	45,300 (3.63 %)	410,660 (17.53 %)	49,821 (96.37 %)	5,081,049 (40.22 %)	1,392,942 (2.58 %)	13,476,268 (25.21 %)	24,698 (0.96 %)	429,021 (1.56 %)	16,877 (0.39 %)	16,035 (0.36 %)
356	house mouse C57BL_6NJ (2022) GCA_921999865.2	n/a	n/a	21,817 (2.13 %)	19,349 (1.37 %)	n/a	41.79 (99.76 %)	7 (0.00 %)	1,127 (0.24 %)	214 (100.00 %)	4,661,104 (40.76 %)	1,552,079 (3.56 %)	12,953,662 (35.57 %)	8 (0.00 %)	825,187 (2.60 %)	23,204 (0.56 %)	15,812 (0.42 %)
357	humpback whale (KW2013002 2024) GCA_041834305.1	n/a	n/a	19,463 (1.32 %)	22,424 (1.19 %)	n/a	42.05 (100.00 %)	0 (0 %)	88 (0.00 %)	1,355 (100.00 %)	4,164,459 (34.02 %)	1,281,751 (18.33 %)	12,412,281 (48.28 %)	0 (0 %)	2,009,593 (5.80 %)	82,412 (1.67 %)	44,791 (0.96 %)
358	Iberian mole (v2.1 TD23 2020) GCF_014898055.3	56,986 (3.41 %)	n/a	18,431 (1.69 %)	20,317 (1.59 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	0 (0 %)	3,575 (0.11 %)	3,202 (100.00 %)	2,635,974 (23.38 %)	496,514 (1.29 %)	10,969,546 (32.61 %)	2 (0.00 %)	637,831 (2.54 %)	47,466 (2.89 %)	43,066 (2.46 %)
359	Indian false vampire GCA_004026885.1	n/a	n/a	20,067 (1.37 %)	36,544 (1.53 %)	32,548 (1.37 %)	40.84 (99.83 %)	6,266 (0.02 %)	6,266 (0.02 %)	1,909,067 (99.98 %)	4,096,409 (31.50 %)	699,311 (1.81 %)	12,307,198 (39.96 %)	15 (0.00 %)	n/a	92,830 (3.12 %)	82,461 (2.65 %)
360	Indian flying fox GCF_902729225.1	64,763 (3.85 %)	n/a	18,222 (2.01 %)	23,187 (1.82 %)	45,389 (2.18 %)	39.83 (99.10 %)	0 (0 %)	17,500 (0.90 %)	16,113 (100.00 %)	2,972,300 (34.11 %)	487,157 (1.49 %)	12,486,528 (27.37 %)	384 (0.01 %)	202,174 (1.56 %)	57,869 (3.73 %)	61,442 (3.09 %)
361	Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023) GCA_030015415.1	n/a	n/a	17,560 (2.04 %)	21,687 (1.83 %)	n/a	39.77 (100.00 %)	0 (0 %)	26 (0.00 %)	181 (100.00 %)	2,598,385 (30.48 %)	486,921 (1.41 %)	11,828,726 (27.28 %)	0 (0 %)	175,274 (0.71 %)	37,476 (5.58 %)	39,290 (5.02 %)
362	Indochinese shrew (US011 2019 Broad) GCA_004027635.1	n/a	n/a	18,870 (0.51 %)	55,636 (0.81 %)	n/a	39.81 (99.83 %)	5,267 (0.02 %)	5,267 (0.02 %)	2,420,679 (99.98 %)	4,130,068 (16.60 %)	1,663,335 (3.30 %)	18,728,711 (46.19 %)	45 (0.00 %)	n/a	31,453 (0.55 %)	25,923 (0.42 %)
363	Indus River dolphin GCA_004363435.1	n/a	n/a	24,321 (1.30 %)	47,065 (1.14 %)	n/a	41.72 (99.88 %)	11,702 (0.04 %)	11,702 (0.04 %)	1,110,492 (99.96 %)	5,093,308 (45.60 %)	845,860 (1.72 %)	13,162,111 (41.37 %)	34 (0.00 %)	n/a	68,257 (1.40 %)	49,070 (1.11 %)
364	Inner Mongolia cashmere goat (2024) GCA_041735815.1	n/a	n/a	19,123 (1.40 %)	21,508 (1.26 %)	n/a	43.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	31 (100.00 %)	3,982,368 (23.76 %)	650,129 (7.44 %)	12,858,872 (44.33 %)	0 (0 %)	2,309,715 (5.29 %)	99,144 (2.87 %)	39,833 (0.88 %)
365	intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024) GCA_043728065.1	n/a	n/a	18,239 (1.76 %)	20,378 (1.53 %)	n/a	41.40 (100.00 %)	1 (0.00 %)	37 (0.00 %)	2,195 (100.00 %)	3,438,644 (42.82 %)	584,006 (9.54 %)	12,207,998 (35.49 %)	0 (0 %)	1,679,263 (3.77 %)	34,491 (1.02 %)	29,817 (0.90 %)
366	intermediate roundleaf bat (primary hap 2023) GCA_031876335.1	n/a	n/a	19,064 (1.67 %)	20,800 (1.49 %)	n/a	41.55 (100.00 %)	0 (0 %)	119 (0.00 %)	69 (100.00 %)	3,393,548 (30.92 %)	723,545 (6.58 %)	12,073,117 (35.40 %)	0 (0 %)	1,106,960 (3.54 %)	43,736 (1.20 %)	30,847 (0.87 %)
367	jaguar (BS21 2019) GCA_004023805.1	n/a	n/a	21,431 (1.51 %)	32,835 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.89 %)	21,329 (0.09 %)	21,329 (0.09 %)	460,121 (99.91 %)	5,420,861 (43.75 %)	1,049,353 (1.93 %)	13,848,545 (34.90 %)	43 (0.00 %)	425,795 (0.77 %)	71,066 (2.37 %)	62,901 (1.89 %)
368	jaguar (hap1 2025) GCA_046562885.1	n/a	n/a	17,882 (1.68 %)	19,103 (1.41 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	0 (0 %)	140 (0.00 %)	115 (100.00 %)	4,622,385 (41.25 %)	893,297 (1.89 %)	12,851,116 (33.53 %)	1 (0.00 %)	402,314 (1.33 %)	61,319 (2.55 %)	55,085 (2.08 %)
369	jaguar (hap2 2025) GCA_046562875.1	n/a	n/a	18,867 (1.64 %)	20,784 (1.40 %)	n/a	41.76 (100.00 %)	0 (0 %)	200 (0.00 %)	85 (100.00 %)	4,977,843 (41.75 %)	982,064 (2.10 %)	13,365,332 (34.16 %)	3 (0.00 %)	459,794 (1.37 %)	66,000 (2.75 %)	59,529 (2.25 %)
370	jaguar (Sample0147 2023) GCF_028533385.1	71,578 (4.12 %)	n/a	19,122 (1.67 %)	21,950 (1.36 %)	n/a	41.58 (99.31 %)	0 (0 %)	56,371 (0.70 %)	36,243 (100.00 %)	4,552,854 (33.37 %)	897,371 (1.63 %)	13,732,912 (32.89 %)	2,743 (0.10 %)	314,574 (0.82 %)	63,777 (2.41 %)	60,478 (2.01 %)
371	jaguarundi GCF_014898765.1	72,564 (3.15 %)	n/a	18,602 (1.64 %)	20,510 (1.39 %)	n/a	41.75 (97.85 %)	0 (0 %)	42,499 (2.16 %)	10,948 (100.00 %)	5,035,745 (43.29 %)	907,329 (1.61 %)	13,590,905 (33.57 %)	2,609 (0.04 %)	574,230 (1.55 %)	69,090 (2.29 %)	60,356 (1.80 %)
372	Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U) GCF_014825515.1	48,692 (2.72 %)	n/a	19,921 (1.66 %)	23,614 (1.68 %)	39,384 (2.12 %)	41.95 (98.87 %)	0 (0 %)	110,840 (1.13 %)	56,740 (100.00 %)	2,972,388 (28.79 %)	405,474 (2.15 %)	12,458,880 (30.65 %)	8,380 (0.26 %)	388,646 (3.79 %)	61,973 (1.87 %)	54,441 (1.58 %)
373	Jamaican fruit-eating bat (2021) GCF_021234435.1	55,114 (3.18 %)	n/a	17,875 (1.68 %)	19,958 (1.66 %)	n/a	42.00 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	868 (100.00 %)	2,697,287 (28.17 %)	318,700 (0.84 %)	11,750,329 (31.61 %)	0 (0 %)	245,042 (0.98 %)	61,951 (1.93 %)	52,462 (1.61 %)
374	Japanese wild mouse (2022) GCA_921999095.2	n/a	n/a	23,292 (2.05 %)	20,114 (1.31 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	51 (0.00 %)	397 (0.00 %)	1,449 (100.00 %)	4,952,306 (42.53 %)	1,635,456 (4.60 %)	12,838,321 (38.56 %)	8 (0.00 %)	1,050,247 (2.88 %)	24,168 (0.56 %)	16,545 (0.42 %)
375	Java mouse-deer (US108 2019 Broad) GCA_004024965.1	n/a	n/a	23,081 (1.38 %)	38,181 (1.41 %)	n/a	42.73 (99.91 %)	2,829 (0.01 %)	2,829 (0.01 %)	1,159,819 (99.99 %)	4,791,310 (34.97 %)	448,498 (1.92 %)	13,175,375 (39.89 %)	11 (0.00 %)	n/a	68,778 (2.92 %)	61,444 (2.39 %)
376	killer whale (2022) GCF_937001465.1	78,479 (3.76 %)	n/a	18,710 (1.51 %)	21,101 (1.30 %)	34,448 (1.49 %)	41.91 (100.00 %)	0 (0 %)	123 (0.00 %)	448 (100.00 %)	3,955,401 (36.81 %)	844,672 (9.94 %)	12,233,568 (41.63 %)	2 (0.00 %)	1,982,992 (5.71 %)	77,307 (3.08 %)	40,935 (1.02 %)
377	killer whale (alternate hap 2022) GCA_937001455.1	n/a	n/a	14,982 (1.50 %)	19,185 (1.30 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12,410 (100.00 %)	2,752,892 (35.61 %)	589,217 (10.15 %)	8,371,032 (41.11 %)	0 (0 %)	1,464,220 (5.92 %)	57,347 (3.41 %)	30,003 (1.05 %)
378	killer whale (Morgan 2013) GCF_000331955.2	70,972 (3.55 %)	n/a	18,736 (1.86 %)	20,365 (1.48 %)	n/a	41.35 (94.82 %)	78,432 (5.20 %)	78,441 (5.20 %)	80,100 (94.80 %)	3,978,339 (43.98 %)	555,737 (1.13 %)	12,773,973 (31.51 %)	2,677 (0.03 %)	355,274 (1.15 %)	61,145 (1.59 %)	40,101 (1.20 %)
379	koala (Bilbo 61053 2022) GCA_003287225.2	n/a	n/a	17,087 (0.81 %)	14,711 (0.86 %)	n/a	39.05 (100.00 %)	0 (0 %)	669 (0.00 %)	1,246 (100.00 %)	6,280,029 (29.77 %)	1,123,294 (2.02 %)	21,796,316 (39.24 %)	2 (0.00 %)	412,593 (0.92 %)	15,957 (0.35 %)	13,996 (0.24 %)
380	Kuhl's pipistrelle (2020) GCF_014108245.1	65,654 (3.37 %)	n/a	17,918 (1.89 %)	20,819 (1.86 %)	n/a	42.57 (99.31 %)	0 (0 %)	394 (0.69 %)	202 (100.00 %)	2,897,422 (23.58 %)	797,420 (2.76 %)	10,057,100 (34.56 %)	2 (0.00 %)	425,636 (1.52 %)	55,965 (2.99 %)	57,667 (2.01 %)
381	large flying fox GCF_000151845.1	52,243 (3.10 %)	n/a	18,454 (1.91 %)	23,631 (1.73 %)	n/a	39.82 (91.80 %)	189,339 (8.24 %)	189,340 (8.24 %)	225,433 (91.76 %)	3,117,045 (36.49 %)	504,277 (3.03 %)	13,025,556 (25.00 %)	22,188 (0.92 %)	358,468 (6.48 %)	78,404 (3.24 %)	74,747 (2.62 %)
382	large Japanese field mouse (IB14-021 2017) GCA_002335545.1	n/a	n/a	22,630 (1.74 %)	33,810 (1.26 %)	n/a	42.04 (57.78 %)	4,289,924 (42.35 %)	4,289,924 (42.35 %)	4,626,044 (57.65 %)	3,638,537 (31.76 %)	1,048,253 (1.87 %)	12,039,926 (16.61 %)	10,107 (0.44 %)	n/a	19,817 (0.34 %)	18,415 (0.32 %)
383	large tree shrew (BS70 2022) GCA_026018925.1	n/a	n/a	21,678 (1.34 %)	22,317 (1.25 %)	n/a	42.17 (100.00 %)	0 (0 %)	1,188 (0.00 %)	1,198 (100.00 %)	5,530,547 (22.20 %)	1,357,640 (10.13 %)	14,334,312 (46.09 %)	5 (0.00 %)	2,400,830 (5.08 %)	123,453 (2.17 %)	59,337 (1.38 %)
384	least weasel (hap1.1 2025) GCA_964662115.1	n/a	n/a	19,085 (1.11 %)	23,074 (1.09 %)	n/a	43.54 (99.98 %)	9 (0.00 %)	2,938 (0.02 %)	3,189 (100.00 %)	4,687,333 (25.05 %)	908,610 (10.98 %)	12,922,050 (49.64 %)	17 (0.00 %)	4,143,372 (9.39 %)	68,749 (2.22 %)	53,921 (1.35 %)
385	least weasel (hap2.1 2025) GCA_964662095.1	n/a	n/a	18,255 (1.29 %)	22,201 (1.27 %)	n/a	42.68 (99.98 %)	2,709 (0.02 %)	2,709 (0.02 %)	4,948 (99.98 %)	4,268,233 (27.47 %)	787,850 (6.40 %)	12,592,088 (42.54 %)	17 (0.00 %)	2,083,429 (5.88 %)	62,416 (2.34 %)	51,317 (1.55 %)
386	leopard (Hobbes primary hap 2022) GCF_024362965.1	70,501 (3.29 %)	n/a	18,472 (1.56 %)	20,388 (1.41 %)	n/a	41.75 (99.99 %)	0 (0 %)	335 (0.01 %)	382 (100.00 %)	4,634,038 (33.80 %)	932,991 (2.25 %)	13,686,652 (34.03 %)	1 (0.00 %)	451,937 (1.32 %)	65,793 (2.64 %)	60,846 (1.89 %)
387	leopard (Maewha 2016 refseq) GCF_001857705.1	73,279 (3.20 %)	n/a	18,881 (1.63 %)	21,010 (1.44 %)	n/a	41.71 (96.17 %)	214,953 (3.85 %)	214,953 (3.85 %)	265,330 (96.15 %)	5,247,029 (42.87 %)	1,059,446 (5.13 %)	14,265,573 (32.20 %)	28,667 (1.17 %)	525,712 (5.63 %)	77,001 (2.45 %)	66,922 (1.91 %)
388	leopard cat GCF_016509475.1	59,965 (3.05 %)	n/a	18,472 (1.65 %)	19,934 (1.38 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	39 (0.00 %)	56 (0.00 %)	123 (100.00 %)	4,978,115 (43.28 %)	901,754 (1.84 %)	13,596,535 (34.23 %)	0 (0 %)	586,248 (1.62 %)	67,390 (2.50 %)	62,344 (2.02 %)
389	Leschenault's rousette (2020) GCA_015472975.1	n/a	n/a	17,815 (2.05 %)	23,917 (1.90 %)	n/a	40.13 (99.14 %)	100,669 (0.88 %)	100,669 (0.88 %)	108,810 (99.12 %)	2,688,705 (31.20 %)	428,968 (1.19 %)	12,245,385 (26.51 %)	13 (0.00 %)	121,479 (0.56 %)	58,118 (6.81 %)	61,535 (5.42 %)
390	lesser Egyptian jerboa (2021) GCF_020740685.1	51,730 (1.99 %)	n/a	20,129 (1.24 %)	22,089 (1.24 %)	40,414 (1.76 %)	42.00 (99.52 %)	0 (0 %)	561 (0.48 %)	160 (100.00 %)	7,346,291 (41.25 %)	1,187,587 (2.92 %)	14,222,177 (44.13 %)	1 (0.00 %)	1,219,048 (2.53 %)	34,688 (0.86 %)	25,175 (0.54 %)
391	lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021) GCA_020740715.1	n/a	n/a	17,777 (1.27 %)	19,232 (1.28 %)	n/a	42.13 (92.75 %)	0 (0 %)	2,875 (7.25 %)	508 (100.00 %)	6,476,967 (33.93 %)	999,133 (2.78 %)	11,809,834 (40.52 %)	1 (0.00 %)	1,062,479 (2.36 %)	29,872 (0.82 %)	21,704 (0.51 %)
392	lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq) GCF_000280705.1	25,978 (1.44 %)	n/a	19,408 (1.38 %)	20,312 (1.35 %)	n/a	41.87 (87.17 %)	326,464 (12.87 %)	326,464 (12.87 %)	337,360 (87.13 %)	6,125,934 (38.31 %)	832,825 (1.53 %)	13,661,612 (33.98 %)	2,666 (0.03 %)	430,190 (1.14 %)	26,669 (0.59 %)	23,227 (0.47 %)
393	lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024) GCA_043880595.1	n/a	n/a	18,484 (1.87 %)	24,356 (1.84 %)	n/a	41.88 (97.91 %)	198 (0.32 %)	866 (2.09 %)	617 (99.68 %)	3,419,622 (36.65 %)	663,182 (2.53 %)	11,508,574 (30.58 %)	15 (0.00 %)	639,747 (2.02 %)	84,174 (4.85 %)	81,198 (4.01 %)
394	lesser horseshoe bat (hap1 2024) GCA_964194185.1	n/a	n/a	19,031 (1.88 %)	21,003 (1.63 %)	n/a	40.81 (99.99 %)	0 (0 %)	1,627 (0.01 %)	723 (100.00 %)	3,133,745 (33.46 %)	660,064 (3.79 %)	11,720,176 (32.32 %)	8 (0.00 %)	718,567 (2.35 %)	35,414 (1.75 %)	34,111 (1.64 %)
395	lesser horseshoe bat (hap2 2024) GCA_964194215.1	n/a	n/a	18,875 (1.72 %)	21,166 (1.58 %)	n/a	41.18 (99.99 %)	1,648 (0.01 %)	1,648 (0.01 %)	2,727 (99.99 %)	3,160,659 (34.00 %)	696,130 (6.23 %)	11,662,645 (34.26 %)	8 (0.00 %)	1,288,588 (3.71 %)	36,176 (1.80 %)	28,160 (0.89 %)
396	lesser noctule (v2 hap1 2025) GCA_964264875.2	n/a	n/a	18,342 (1.54 %)	22,974 (1.62 %)	n/a	43.04 (100.00 %)	3 (0.00 %)	302 (0.00 %)	588 (100.00 %)	4,258,096 (37.31 %)	1,289,911 (11.51 %)	9,694,758 (42.52 %)	2 (0.00 %)	1,992,418 (5.41 %)	65,974 (2.80 %)	61,273 (1.84 %)
397	lesser noctule (v2 hap2 2025) GCA_964264895.2	n/a	n/a	17,492 (1.62 %)	22,188 (1.72 %)	n/a	43.10 (100.00 %)	247 (0.00 %)	247 (0.00 %)	920 (100.00 %)	3,886,341 (36.52 %)	1,139,308 (10.89 %)	9,356,457 (40.65 %)	2 (0.00 %)	1,617,080 (4.89 %)	62,254 (3.00 %)	59,522 (1.92 %)
398	lesser panda (RP43 2017) GCA_002007465.1	n/a	n/a	19,120 (1.69 %)	20,591 (1.50 %)	n/a	41.60 (98.56 %)	137,333 (1.45 %)	137,333 (1.45 %)	148,922 (98.55 %)	4,513,888 (40.87 %)	692,778 (1.62 %)	13,691,859 (31.36 %)	3,438 (0.05 %)	680,690 (2.32 %)	64,369 (2.52 %)	63,356 (2.19 %)
399	lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq) GCF_036850995.1	53,210 (2.49 %)	n/a	18,323 (1.42 %)	21,350 (1.39 %)	n/a	41.84 (99.24 %)	0 (0 %)	573 (0.76 %)	168 (100.00 %)	4,224,344 (28.69 %)	1,030,576 (2.60 %)	12,591,989 (42.30 %)	1 (0.00 %)	1,128,543 (2.95 %)	98,189 (2.06 %)	48,427 (1.15 %)
400	lion GCF_018350215.1	67,745 (2.86 %)	n/a	17,956 (1.69 %)	19,033 (1.40 %)	61,242 (3.04 %)	41.71 (100.00 %)	45 (0.00 %)	55 (0.00 %)	99 (100.00 %)	4,666,951 (42.23 %)	889,987 (1.87 %)	13,151,686 (33.40 %)	1 (0.00 %)	394,792 (1.11 %)	62,675 (2.56 %)	59,062 (2.11 %)
401	little brown bat GCF_000147115.1	50,660 (2.76 %)	n/a	19,314 (1.86 %)	22,683 (1.70 %)	n/a	42.50 (96.66 %)	61,131 (3.35 %)	61,131 (3.35 %)	72,785 (96.65 %)	3,682,263 (37.05 %)	634,854 (2.15 %)	10,841,759 (33.45 %)	7 (0.00 %)	404,463 (1.53 %)	57,630 (1.79 %)	51,011 (1.50 %)
402	little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022) GCA_024363435.1	n/a	n/a	19,150 (1.52 %)	23,435 (1.64 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	0 (0 %)	229 (0.00 %)	718 (100.00 %)	n/a	1,051,300 (12.43 %)	9,858,628 (43.20 %)	3 (0.00 %)	1,828,018 (5.83 %)	48,101 (2.62 %)	48,908 (1.62 %)
403	little pocket mouse (longimembris primary hap 2022) GCA_024363575.1	n/a	n/a	19,760 (1.50 %)	24,317 (1.63 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	0 (0 %)	215 (0.00 %)	1,135 (100.00 %)	3,913,744 (28.43 %)	1,095,577 (12.70 %)	10,273,833 (43.74 %)	2 (0.00 %)	1,919,880 (5.85 %)	49,636 (2.61 %)	49,755 (1.59 %)
404	little tube-nosed bat GCA_004026665.1	n/a	n/a	22,009 (1.26 %)	45,725 (1.35 %)	n/a	43.80 (99.90 %)	6,795 (0.03 %)	6,795 (0.03 %)	886,972 (99.97 %)	3,372,804 (23.57 %)	1,014,476 (3.00 %)	11,948,592 (41.18 %)	29 (0.00 %)	n/a	71,530 (2.05 %)	53,483 (1.43 %)
405	long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq) GCF_963455315.2	61,447 (2.80 %)	n/a	18,725 (1.51 %)	20,946 (1.39 %)	n/a	42.38 (99.99 %)	1,084 (0.01 %)	1,084 (0.01 %)	2,076 (99.99 %)	4,125,452 (35.62 %)	1,577,896 (12.03 %)	12,347,170 (42.01 %)	10 (0.00 %)	1,284,155 (3.89 %)	71,822 (5.51 %)	41,663 (1.04 %)
406	long-finned pilot whale (X-22926-18 2019) GCF_006547405.1	66,117 (3.28 %)	n/a	18,772 (1.80 %)	21,031 (1.46 %)	33,672 (1.78 %)	41.29 (99.58 %)	14,583 (0.42 %)	14,859 (0.42 %)	20,999 (99.58 %)	3,962,125 (45.58 %)	557,247 (1.11 %)	12,616,535 (34.70 %)	643 (0.01 %)	404,788 (1.24 %)	62,905 (1.69 %)	41,085 (1.25 %)
407	long-tailed chinchilla GCF_000276665.1	54,854 (2.98 %)	n/a	18,096 (1.59 %)	19,514 (1.52 %)	n/a	41.06 (95.56 %)	78,817 (4.46 %)	78,817 (4.46 %)	81,656 (95.54 %)	4,018,866 (30.94 %)	607,082 (1.15 %)	13,528,234 (28.15 %)	1,183 (0.02 %)	162,447 (0.63 %)	46,931 (1.25 %)	45,334 (1.13 %)
408	long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad) GCA_004027375.1	n/a	n/a	19,208 (1.99 %)	31,180 (1.92 %)	n/a	39.56 (99.97 %)	2,056 (0.01 %)	2,056 (0.01 %)	174,041 (99.99 %)	2,893,453 (32.61 %)	597,516 (1.76 %)	12,093,608 (28.14 %)	6 (0.00 %)	n/a	63,015 (4.70 %)	62,530 (4.18 %)
409	Lowland paca GCA_004365215.1	n/a	n/a	21,953 (0.62 %)	56,356 (0.80 %)	n/a	40.83 (99.78 %)	3,060 (0.01 %)	3,060 (0.01 %)	3,771,510 (99.99 %)	5,892,507 (29.20 %)	802,811 (1.38 %)	18,630,883 (38.61 %)	101 (0.00 %)	n/a	61,715 (0.94 %)	53,212 (0.77 %)
410	Malayan pangolin (MJ-LG 2024) GCF_040802235.1	87,404 (4.24 %)	n/a	18,382 (1.54 %)	19,802 (1.30 %)	n/a	41.03 (100.00 %)	0 (0 %)	90 (0.00 %)	63 (100.00 %)	3,146,889 (38.39 %)	384,539 (2.15 %)	12,642,995 (34.68 %)	1 (0.00 %)	568,487 (1.95 %)	48,454 (1.30 %)	44,955 (1.18 %)
411	Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq) GCF_001685135.1	48,591 (2.76 %)	n/a	19,458 (1.57 %)	24,783 (1.38 %)	41,272 (1.95 %)	40.78 (92.27 %)	0 (0 %)	984,658 (7.81 %)	80,670 (100.00 %)	3,064,599 (35.21 %)	866,309 (3.08 %)	13,310,859 (28.76 %)	389,500 (1.56 %)	884,203 (3.10 %)	35,558 (0.84 %)	33,754 (0.78 %)
412	Malayan pangolin YNU ManJav 2.0 GCF_014570535.1	68,043 (3.50 %)	n/a	18,167 (1.72 %)	20,453 (1.54 %)	n/a	40.83 (91.78 %)	0 (0 %)	57,746 (8.23 %)	17,969 (100.00 %)	2,864,567 (34.23 %)	277,996 (1.69 %)	12,659,207 (25.72 %)	610 (0.01 %)	258,572 (5.38 %)	33,486 (1.00 %)	32,201 (0.94 %)
413	marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025) GCA_048126345.1	n/a	n/a	25,281 (0.80 %)	18,740 (0.87 %)	n/a	37.80 (99.99 %)	196 (0.01 %)	196 (0.01 %)	889 (99.99 %)	6,538,990 (26.08 %)	1,450,668 (2.40 %)	21,374,371 (47.19 %)	1 (0.00 %)	1,242,479 (2.55 %)	17,923 (0.30 %)	14,429 (0.21 %)
414	Masai giraffe (MA1 2016 Penn St) GCA_001651235.1	n/a	n/a	20,950 (1.52 %)	28,854 (1.33 %)	n/a	41.39 (96.50 %)	257,672 (3.48 %)	257,672 (3.48 %)	770,838 (96.52 %)	5,502,479 (43.94 %)	531,418 (2.64 %)	13,936,018 (36.18 %)	31,941 (0.52 %)	748,633 (4.02 %)	40,504 (1.02 %)	38,345 (0.94 %)
415	meadow jumping mouse GCA_004024765.1	n/a	n/a	22,236 (1.08 %)	44,719 (1.21 %)	n/a	42.31 (99.88 %)	7,610 (0.03 %)	7,610 (0.03 %)	1,165,710 (99.97 %)	6,135,446 (33.31 %)	1,525,146 (3.34 %)	13,854,475 (39.91 %)	38 (0.00 %)	n/a	26,633 (0.68 %)	21,059 (0.49 %)
416	meadow vole (hap1 2024 genbank) GCA_037038515.1	n/a	n/a	19,134 (1.78 %)	20,672 (1.55 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	0 (0 %)	60 (0.00 %)	181 (100.00 %)	4,818,689 (41.90 %)	962,362 (4.16 %)	12,161,222 (34.42 %)	0 (0 %)	1,559,409 (4.65 %)	23,781 (0.74 %)	19,793 (0.55 %)
417	meadow vole (hap1 2024 refseq) GCF_037038515.1	56,969 (2.88 %)	n/a	19,974 (1.74 %)	20,672 (1.55 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	0 (0 %)	60 (0.00 %)	180 (100.00 %)	4,116,239 (33.62 %)	962,362 (4.16 %)	12,161,153 (34.42 %)	0 (0 %)	1,559,409 (4.65 %)	23,781 (0.74 %)	17,740 (0.46 %)
418	meadow vole (hap2 2024) GCA_037039175.1	n/a	n/a	19,001 (1.82 %)	20,271 (1.68 %)	n/a	42.58 (100.00 %)	0 (0 %)	53 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,141,368 (21.37 %)	898,900 (4.24 %)	11,475,531 (32.14 %)	0 (0 %)	862,918 (2.64 %)	22,186 (0.75 %)	16,985 (0.48 %)
419	meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq) GCF_006229205.1	58,806 (2.67 %)	n/a	19,009 (1.64 %)	19,088 (1.36 %)	n/a	41.68 (99.72 %)	0 (0 %)	65,245 (0.28 %)	63,791 (100.00 %)	4,564,931 (40.13 %)	634,179 (1.21 %)	13,631,635 (32.17 %)	5,134 (0.09 %)	236,044 (0.75 %)	64,858 (2.22 %)	63,010 (1.87 %)
420	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022) GCA_024711525.1	n/a	n/a	18,555 (1.22 %)	24,508 (1.35 %)	n/a	42.04 (100.00 %)	0 (0 %)	181 (0.00 %)	3,482 (100.00 %)	6,419,007 (53.84 %)	1,384,128 (15.63 %)	11,486,822 (50.51 %)	2 (0.00 %)	4,107,493 (7.03 %)	38,521 (1.60 %)	33,680 (1.03 %)
421	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022) GCA_024711535.1	n/a	n/a	21,281 (1.16 %)	28,592 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	0 (0 %)	182 (0.00 %)	4,354 (100.00 %)	4,378,955 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,786 (51.96 %)	1 (0.00 %)	5,252,588 (7.78 %)	46,167 (1.71 %)	38,895 (0.74 %)
422	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022) GCF_024711535.1	68,331 (2.37 %)	n/a	21,280 (1.16 %)	28,582 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	182 (0.00 %)	182 (0.00 %)	4,535 (100.00 %)	4,378,949 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,725 (51.96 %)	1 (0.00 %)	5,252,586 (7.78 %)	46,167 (1.71 %)	38,895 (0.74 %)
423	Merriam's long-tongued bat (hap1 2024) GCA_039655065.1	n/a	n/a	18,172 (1.67 %)	20,736 (1.60 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	0 (0 %)	47 (0.00 %)	82 (100.00 %)	2,998,913 (29.48 %)	418,833 (1.07 %)	11,783,716 (32.96 %)	1 (0.00 %)	317,774 (1.27 %)	65,956 (4.38 %)	57,781 (3.83 %)
424	Merriam's long-tongued bat (hap2 2024) GCA_039656995.1	n/a	n/a	18,105 (1.68 %)	20,751 (1.60 %)	n/a	42.18 (100.00 %)	0 (0 %)	45 (0.00 %)	71 (100.00 %)	2,994,788 (29.48 %)	415,375 (1.07 %)	11,752,432 (32.88 %)	3 (0.00 %)	316,278 (1.25 %)	65,597 (4.38 %)	57,841 (3.85 %)
425	Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq) GCF_048164855.1	112,768 (4.40 %)	n/a	19,582 (1.52 %)	20,911 (1.39 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	0 (0 %)	167 (0.00 %)	249 (100.00 %)	4,598,813 (31.70 %)	1,102,136 (4.40 %)	13,591,364 (35.18 %)	1 (0.00 %)	1,132,845 (2.70 %)	53,470 (2.24 %)	48,664 (1.52 %)
426	Mexican gray wolf (hap2 2025) GCA_048164845.1	n/a	n/a	18,738 (1.56 %)	19,759 (1.41 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	0 (0 %)	124 (0.00 %)	155 (100.00 %)	4,265,479 (32.40 %)	1,030,876 (4.11 %)	12,818,772 (34.22 %)	0 (0 %)	1,040,160 (2.59 %)	50,269 (2.22 %)	46,611 (1.56 %)
427	minke whale (2013 refseq) GCF_000493695.1	42,553 (2.38 %)	n/a	19,159 (1.73 %)	18,656 (1.42 %)	n/a	40.94 (94.06 %)	173,296 (5.96 %)	173,296 (5.96 %)	184,072 (94.04 %)	n/a	573,951 (1.48 %)	13,504,347 (30.96 %)	211 (0.02 %)	317,691 (1.50 %)	65,448 (1.38 %)	43,887 (1.02 %)
428	minke whale (alternate hap 2023) GCA_950005055.1	n/a	n/a	20,412 (1.46 %)	27,421 (1.34 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	21,272 (100.00 %)	3,811,435 (36.24 %)	959,712 (10.27 %)	12,159,896 (41.30 %)	0 (0 %)	1,298,777 (4.12 %)	69,852 (1.62 %)	42,454 (1.09 %)
429	minke whale (primary hap 2023 refseq) GCF_949987535.1	61,711 (2.51 %)	n/a	19,550 (1.49 %)	21,499 (1.26 %)	n/a	41.55 (99.99 %)	0 (0 %)	1,177 (0.01 %)	1,374 (100.00 %)	4,006,927 (35.92 %)	1,058,105 (12.08 %)	12,708,103 (42.66 %)	4 (0.00 %)	1,500,515 (4.32 %)	72,756 (1.59 %)	44,094 (1.06 %)
430	Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.) GCF_002204375.1	40,359 (2.29 %)	n/a	21,215 (1.83 %)	24,305 (1.47 %)	n/a	42.09 (95.23 %)	0 (0 %)	91,601 (4.78 %)	68,793 (100.00 %)	4,821,343 (37.74 %)	940,776 (1.82 %)	13,848,274 (31.31 %)	11,561 (0.34 %)	205,312 (0.64 %)	24,154 (0.74 %)	22,829 (0.67 %)
431	Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI) GCA_008131255.1	n/a	n/a	19,952 (1.59 %)	23,462 (1.36 %)	n/a	41.98 (99.01 %)	103,843 (0.97 %)	103,843 (0.97 %)	412,933 (99.03 %)	5,009,454 (0.00 %)	1,042,929 (2.52 %)	14,121,194 (34.63 %)	5,269 (0.12 %)	n/a	26,044 (0.71 %)	23,140 (0.56 %)
432	Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023) GCF_030254825.1	65,502 (2.97 %)	n/a	19,045 (1.53 %)	20,203 (1.29 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	0 (0 %)	53 (0.00 %)	193 (100.00 %)	4,477,607 (37.21 %)	1,124,432 (5.22 %)	13,244,320 (39.20 %)	0 (0 %)	1,187,344 (2.95 %)	25,300 (0.76 %)	21,781 (0.54 %)
433	monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021) GCA_019395325.1	n/a	n/a	16,419 (0.77 %)	17,219 (0.89 %)	n/a	39.03 (100.00 %)	33 (0.00 %)	33 (0.00 %)	9,959 (100.00 %)	6,332,360 (29.69 %)	1,065,454 (2.09 %)	17,908,986 (42.25 %)	0 (0 %)	1,232,672 (2.38 %)	13,856 (0.35 %)	11,596 (0.23 %)
434	monito del monte (primary hap 2021 refseq) GCF_019393635.1	47,034 (2.02 %)	n/a	18,399 (0.80 %)	15,519 (0.85 %)	n/a	39.11 (99.91 %)	0 (0 %)	260 (0.09 %)	17 (100.00 %)	9,107,968 (41.08 %)	1,249,635 (2.12 %)	21,135,324 (42.80 %)	0 (0 %)	1,546,314 (2.55 %)	16,598 (0.36 %)	13,911 (0.23 %)
435	Montane guinea pig GCA_004027695.1	n/a	n/a	20,064 (1.06 %)	31,321 (1.18 %)	39,905 (1.42 %)	40.09 (99.88 %)	11,321 (0.04 %)	11,321 (0.04 %)	1,379,500 (99.96 %)	4,730,634 (30.02 %)	1,583,664 (6.57 %)	15,806,339 (40.40 %)	31 (0.00 %)	n/a	37,371 (0.76 %)	27,339 (0.57 %)
436	moose/elk (2024) GCA_964270355.1	n/a	n/a	19,816 (1.60 %)	22,341 (1.44 %)	n/a	41.70 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	1,737 (100.00 %)	3,099,775 (24.20 %)	406,796 (2.52 %)	13,117,056 (38.34 %)	0 (0 %)	916,612 (2.40 %)	50,644 (1.33 %)	42,520 (1.04 %)
437	moose/elk (AALL_1980 2023) GCA_015832495.2	n/a	n/a	19,116 (1.66 %)	21,184 (1.45 %)	n/a	41.55 (95.50 %)	71,769 (4.51 %)	71,769 (4.51 %)	77,708 (95.49 %)	3,026,678 (23.77 %)	373,266 (0.91 %)	13,167,376 (34.08 %)	1,299 (0.05 %)	343,983 (1.04 %)	44,302 (1.21 %)	41,306 (1.01 %)
438	moose/elk (MIG12-28694850 2019) GCA_007570765.1	n/a	n/a	21,375 (1.65 %)	26,769 (1.42 %)	n/a	41.64 (92.66 %)	83,533 (7.35 %)	83,831 (7.35 %)	131,373 (92.65 %)	5,022,053 (43.27 %)	384,658 (1.22 %)	13,422,381 (34.52 %)	2,907 (0.05 %)	424,593 (1.20 %)	49,216 (1.18 %)	45,847 (1.08 %)
439	mountain beaver GCA_004027875.1	n/a	n/a	22,428 (1.10 %)	38,670 (1.12 %)	n/a	40.58 (99.89 %)	7,253 (0.02 %)	7,253 (0.02 %)	1,286,779 (99.98 %)	5,859,004 (32.29 %)	914,052 (2.37 %)	16,249,666 (38.21 %)	103 (0.00 %)	n/a	39,133 (0.76 %)	26,371 (0.54 %)
440	muskrat GCA_004026605.1	n/a	n/a	22,540 (1.52 %)	32,136 (1.35 %)	n/a	41.59 (99.93 %)	6,243 (0.02 %)	6,243 (0.02 %)	571,599 (99.98 %)	4,437,736 (28.49 %)	922,826 (2.38 %)	13,945,732 (35.23 %)	31 (0.00 %)	n/a	19,876 (0.50 %)	16,936 (0.41 %)
441	naked mole-rat (2022) GCA_944319725.1	n/a	n/a	20,755 (1.51 %)	20,024 (1.35 %)	n/a	39.98 (99.96 %)	0 (0 %)	2,332 (0.04 %)	264 (100.00 %)	3,593,261 (30.76 %)	529,045 (1.14 %)	13,294,831 (36.07 %)	19 (0.00 %)	314,025 (1.11 %)	32,235 (0.93 %)	30,323 (0.79 %)
442	naked mole-rat (MEF-2018 2020) GCA_014060925.1	n/a	n/a	22,011 (1.30 %)	21,392 (1.22 %)	n/a	40.13 (95.11 %)	139,535 (4.91 %)	139,535 (4.91 %)	148,797 (95.09 %)	4,885,102 (35.91 %)	654,418 (1.90 %)	16,401,315 (34.21 %)	228 (0.03 %)	1,754,699 (7.39 %)	40,717 (0.98 %)	38,057 (0.81 %)
443	naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq) GCF_000247695.1	74,587 (3.56 %)	n/a	21,332 (1.74 %)	20,861 (1.51 %)	n/a	40.21 (88.43 %)	110,424 (11.59 %)	110,424 (11.59 %)	114,653 (88.41 %)	4,179,991 (32.69 %)	484,933 (0.92 %)	13,672,561 (27.63 %)	595 (0.01 %)	103,053 (0.44 %)	31,950 (0.88 %)	31,055 (0.81 %)
444	narwhal (Baffin Bay 2019) GCF_005190385.1	51,639 (2.71 %)	n/a	18,741 (1.78 %)	20,365 (1.40 %)	33,148 (1.79 %)	41.22 (99.52 %)	0 (0 %)	18,323 (0.49 %)	6,972 (100.00 %)	4,011,742 (43.97 %)	565,367 (1.22 %)	12,720,018 (34.85 %)	1,797 (0.02 %)	430,336 (1.30 %)	60,492 (1.58 %)	43,582 (1.25 %)
445	narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022) GCA_005190385.3	n/a	n/a	18,681 (1.79 %)	19,816 (1.40 %)	n/a	41.26 (100.00 %)	0 (0 %)	313 (0.00 %)	101 (100.00 %)	3,618,235 (37.24 %)	612,229 (1.52 %)	12,641,632 (35.02 %)	0 (0 %)	550,897 (1.69 %)	60,518 (1.78 %)	57,655 (1.47 %)
446	Natal long-fingered bat GCF_001595765.1	32,050 (3.03 %)	n/a	18,015 (2.17 %)	18,293 (1.87 %)	n/a	42.07 (96.24 %)	0 (0 %)	204,616 (3.79 %)	1,269 (100.00 %)	2,565,457 (28.95 %)	376,532 (1.91 %)	10,427,823 (26.35 %)	3,320 (0.15 %)	203,691 (1.83 %)	63,261 (2.07 %)	59,010 (1.80 %)
447	Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025) GCA_964656225.1	n/a	n/a	18,001 (1.75 %)	21,219 (1.77 %)	n/a	42.26 (99.98 %)	0 (0 %)	1,836 (0.02 %)	1,062 (100.00 %)	3,664,854 (32.90 %)	906,692 (8.55 %)	10,164,440 (37.98 %)	12 (0.00 %)	783,617 (2.68 %)	56,705 (2.75 %)	55,975 (1.86 %)
448	Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025) GCA_964656075.1	n/a	n/a	17,899 (1.71 %)	20,808 (1.69 %)	n/a	42.15 (99.98 %)	1,832 (0.02 %)	1,832 (0.02 %)	2,485 (99.98 %)	3,637,576 (31.92 %)	930,013 (11.25 %)	9,967,930 (39.61 %)	9 (0.00 %)	910,240 (3.07 %)	56,237 (2.62 %)	55,739 (1.82 %)
449	Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024) GCA_963693515.1	n/a	19,038 (1.68 %)	17,944 (1.86 %)	20,545 (1.83 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	1 (0.00 %)	263 (0.00 %)	154 (100.00 %)	3,628,328 (34.57 %)	838,723 (4.04 %)	10,155,601 (35.22 %)	1 (0.00 %)	545,765 (1.88 %)	56,332 (2.92 %)	56,107 (1.97 %)
450	Natterer's bat (hap1.2 2025) GCA_964212035.2	n/a	n/a	19,475 (1.82 %)	22,424 (1.68 %)	n/a	43.15 (100.00 %)	0 (0 %)	225 (0.00 %)	212 (100.00 %)	3,841,654 (38.99 %)	801,041 (5.78 %)	10,278,311 (38.66 %)	2 (0.00 %)	750,791 (2.61 %)	64,639 (2.57 %)	58,753 (2.26 %)
451	Natterer's bat (hap2.2 2025) GCA_964212025.2	n/a	n/a	18,368 (1.91 %)	21,701 (1.80 %)	n/a	43.27 (100.00 %)	136 (0.00 %)	136 (0.00 %)	309 (100.00 %)	3,509,151 (38.16 %)	704,537 (5.21 %)	9,806,703 (36.74 %)	8 (0.00 %)	600,350 (2.27 %)	61,004 (2.65 %)	56,443 (2.40 %)
452	neotropical fruit bat GCF_014824575.2	49,109 (2.78 %)	n/a	17,703 (1.63 %)	19,389 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	0 (0 %)	38,675 (0.21 %)	26,068 (100.00 %)	2,862,405 (29.31 %)	366,960 (1.48 %)	11,796,203 (31.27 %)	105 (0.00 %)	330,211 (1.83 %)	59,091 (1.70 %)	48,137 (1.34 %)
453	Nilgiri tahr GCA_004026825.1	n/a	n/a	22,735 (1.44 %)	34,961 (1.27 %)	n/a	42.37 (99.93 %)	10,387 (0.04 %)	10,387 (0.04 %)	479,550 (99.96 %)	5,793,761 (48.50 %)	535,297 (1.34 %)	13,378,352 (42.46 %)	61 (0.00 %)	n/a	57,653 (1.29 %)	42,256 (1.01 %)
454	nine-banded armadillo (v2 hap1 2023) GCA_030445055.2	n/a	n/a	19,350 (1.07 %)	22,207 (1.07 %)	n/a	40.97 (99.27 %)	0 (0 %)	823 (0.73 %)	588 (100.00 %)	4,330,716 (32.85 %)	661,966 (1.52 %)	18,302,021 (42.22 %)	5 (0.00 %)	542,125 (1.36 %)	130,245 (2.79 %)	70,861 (1.76 %)
455	nine-banded armadillo (v2 hap2 2023) GCF_030445035.2	72,174 (2.47 %)	n/a	21,051 (1.11 %)	24,418 (1.07 %)	n/a	41.00 (99.67 %)	0 (0 %)	793 (0.33 %)	546 (100.00 %)	5,412,063 (53.31 %)	738,320 (2.02 %)	19,755,423 (43.69 %)	4 (0.00 %)	736,184 (1.61 %)	142,597 (2.85 %)	85,791 (2.07 %)
456	nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor) GCF_000208655.3	46,110 (1.87 %)	n/a	20,820 (1.08 %)	25,226 (1.08 %)	n/a	40.77 (90.89 %)	268,408 (9.13 %)	268,437 (9.13 %)	314,788 (90.87 %)	4,552,770 (34.01 %)	651,225 (1.26 %)	19,266,969 (38.27 %)	239 (0.00 %)	482,237 (1.17 %)	139,490 (2.47 %)	79,407 (1.60 %)
457	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022) GCA_026167925.1	n/a	n/a	19,342 (1.57 %)	20,947 (1.48 %)	n/a	42.40 (100.00 %)	0 (0 %)	229 (0.00 %)	1,006 (100.00 %)	4,161,568 (23.13 %)	1,278,205 (8.22 %)	13,148,019 (37.60 %)	1 (0.00 %)	1,208,815 (3.32 %)	23,523 (0.71 %)	19,170 (0.46 %)
458	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022) GCA_026229955.1	n/a	n/a	19,700 (1.54 %)	22,354 (1.46 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	244 (0.00 %)	244 (0.00 %)	2,082 (100.00 %)	6,089,884 (47.99 %)	1,358,786 (9.39 %)	13,799,349 (39.08 %)	3 (0.00 %)	1,511,691 (3.84 %)	24,733 (0.70 %)	22,588 (0.58 %)
459	North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023) GCA_028500835.1	n/a	n/a	15,210 (1.55 %)	18,316 (1.43 %)	n/a	41.06 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	5,051 (100.00 %)	3,911,633 (40.55 %)	565,546 (1.54 %)	10,853,726 (32.61 %)	0 (0 %)	378,575 (1.36 %)	40,925 (1.35 %)	26,837 (0.96 %)
460	North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023) GCA_028451465.1	n/a	n/a	18,102 (1.58 %)	20,073 (1.40 %)	n/a	41.03 (100.00 %)	0 (0 %)	277 (0.00 %)	116 (100.00 %)	4,958,089 (41.64 %)	719,163 (1.59 %)	13,867,662 (33.89 %)	7 (0.00 %)	506,727 (1.48 %)	51,299 (1.36 %)	33,440 (0.96 %)
461	North Atlantic right whale (hap1 2023) GCA_028571275.1	n/a	n/a	18,699 (1.61 %)	20,354 (1.28 %)	n/a	41.64 (99.84 %)	0 (0 %)	385 (0.16 %)	947 (100.00 %)	3,815,900 (43.46 %)	718,935 (11.38 %)	11,928,210 (42.25 %)	2 (0.00 %)	1,117,252 (3.44 %)	85,881 (1.90 %)	41,289 (1.19 %)
462	North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq) GCF_028564815.1	49,646 (1.86 %)	n/a	19,562 (1.46 %)	21,631 (1.25 %)	n/a	41.69 (99.83 %)	0 (0 %)	367 (0.17 %)	789 (100.00 %)	1,368,536 (2.24 %)	841,303 (13.08 %)	12,527,582 (43.92 %)	11 (0.00 %)	1,404,448 (3.90 %)	94,259 (1.92 %)	41,005 (0.96 %)
463	North Pacific right whale GCA_004363455.1	n/a	n/a	23,145 (1.43 %)	38,161 (1.21 %)	n/a	41.15 (99.88 %)	7,094 (0.03 %)	7,094 (0.03 %)	1,361,057 (99.97 %)	5,039,622 (45.69 %)	694,986 (1.31 %)	14,063,101 (40.51 %)	73 (0.00 %)	n/a	74,800 (1.52 %)	49,455 (1.20 %)
464	northern American river otter GCF_010015895.1	53,945 (2.18 %)	n/a	18,974 (1.68 %)	21,247 (1.45 %)	n/a	41.41 (99.58 %)	6,928 (0.42 %)	7,620 (0.42 %)	13,541 (99.58 %)	4,538,847 (41.18 %)	685,281 (1.20 %)	13,840,953 (32.61 %)	360 (0.01 %)	364,620 (0.96 %)	53,559 (1.88 %)	52,003 (1.68 %)
465	northern bat (alternate hap 2023) GCA_951640545.1	n/a	n/a	18,343 (1.80 %)	23,253 (1.77 %)	n/a	43.55 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	4,899 (100.00 %)	1,174,241 (2.96 %)	825,170 (5.11 %)	9,889,579 (36.12 %)	0 (0 %)	598,356 (2.10 %)	76,164 (3.52 %)	59,778 (2.27 %)
466	northern bat (primary hap 2023) GCA_951640355.1	n/a	n/a	18,636 (1.75 %)	21,446 (1.68 %)	n/a	43.32 (99.99 %)	0 (0 %)	1,423 (0.01 %)	207 (100.00 %)	1,259,729 (2.95 %)	905,676 (6.25 %)	10,554,535 (38.21 %)	3 (0.00 %)	780,081 (2.54 %)	77,656 (3.27 %)	60,964 (2.14 %)
467	northern black mastiff bat (mMolNig1 2022) GCA_026936385.1	n/a	n/a	18,924 (1.53 %)	22,934 (1.58 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	0 (0 %)	199 (0.00 %)	146 (100.00 %)	3,850,624 (31.21 %)	648,359 (3.76 %)	11,788,702 (39.25 %)	2 (0.00 %)	811,589 (2.31 %)	85,908 (2.60 %)	73,781 (1.91 %)
468	northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024) GCA_039880945.1	n/a	n/a	18,933 (1.44 %)	23,629 (1.50 %)	n/a	42.60 (100.00 %)	0 (0 %)	113 (0.00 %)	366 (100.00 %)	4,027,155 (30.73 %)	712,278 (5.22 %)	12,003,034 (41.58 %)	3 (0.00 %)	975,691 (2.71 %)	96,116 (3.02 %)	75,017 (1.84 %)
469	northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024) GCA_039880925.1	n/a	n/a	18,305 (1.49 %)	22,534 (1.56 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	0 (0 %)	80 (0.00 %)	282 (100.00 %)	3,783,543 (30.10 %)	656,592 (4.68 %)	11,353,707 (40.26 %)	0 (0 %)	877,118 (2.58 %)	92,041 (3.01 %)	72,323 (1.87 %)
470	northern bottlenose whale (alternate hap 2023) GCA_949752845.1	n/a	n/a	19,537 (1.44 %)	27,826 (1.30 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	23,401 (100.00 %)	3,634,923 (35.56 %)	672,860 (11.00 %)	11,175,398 (41.72 %)	0 (0 %)	1,941,411 (5.36 %)	62,007 (1.94 %)	36,247 (0.95 %)
471	northern bottlenose whale (primary hap 2023) GCA_949752795.1	n/a	n/a	19,073 (1.44 %)	20,821 (1.21 %)	n/a	41.81 (99.99 %)	0 (0 %)	1,098 (0.01 %)	757 (100.00 %)	3,997,911 (34.76 %)	769,275 (14.94 %)	12,133,820 (44.83 %)	6 (0.00 %)	3,171,972 (7.30 %)	67,258 (2.00 %)	38,513 (0.89 %)
472	northern elephant seal (BS05 2019 Broad) GCA_004023865.1	n/a	n/a	22,834 (1.54 %)	36,083 (1.32 %)	n/a	41.52 (99.94 %)	9,483 (0.04 %)	9,483 (0.04 %)	330,739 (99.96 %)	4,849,944 (43.83 %)	600,306 (1.16 %)	13,420,049 (34.43 %)	55 (0.00 %)	452,384 (1.15 %)	57,236 (1.62 %)	53,204 (1.43 %)
473	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank) GCA_029215605.1	n/a	n/a	19,278 (1.60 %)	19,908 (1.39 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	98 (0.00 %)	596 (100.00 %)	4,348,333 (34.40 %)	621,985 (2.21 %)	13,251,768 (35.32 %)	0 (0 %)	811,715 (2.28 %)	69,898 (2.38 %)	44,044 (1.16 %)
474	Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq) GCF_029215605.1	74,106 (3.88 %)	n/a	19,277 (1.60 %)	20,000 (1.36 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	98 (0.00 %)	595 (100.00 %)	4,348,327 (34.40 %)	621,980 (2.21 %)	13,251,706 (35.32 %)	0 (0 %)	811,710 (2.28 %)	69,897 (2.38 %)	44,044 (1.16 %)
475	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023) GCA_029215635.1	n/a	n/a	19,340 (1.59 %)	19,732 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	60 (0.00 %)	60 (0.00 %)	482 (100.00 %)	4,365,070 (34.26 %)	627,639 (2.43 %)	13,174,494 (35.47 %)	2 (0.00 %)	866,044 (2.39 %)	74,314 (2.49 %)	44,405 (1.17 %)
476	northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022) GCF_021288785.2	53,819 (3.32 %)	n/a	20,099 (1.75 %)	20,957 (1.35 %)	n/a	41.51 (99.35 %)	0 (0 %)	39,936 (0.65 %)	142,455 (100.00 %)	4,368,400 (33.93 %)	588,877 (1.19 %)	13,745,426 (32.96 %)	2,726 (0.09 %)	n/a	52,064 (1.59 %)	49,271 (1.43 %)
477	northern fur seal GCF_003265705.1	54,953 (2.43 %)	n/a	23,408 (1.78 %)	23,666 (1.43 %)	52,089 (2.17 %)	41.48 (98.01 %)	38,666 (1.99 %)	38,666 (1.99 %)	52,469 (98.01 %)	5,047,032 (43.38 %)	638,130 (1.06 %)	14,922,442 (33.12 %)	2,675 (0.04 %)	444,034 (1.22 %)	57,281 (1.44 %)	53,162 (1.27 %)
478	northern fur seal (GAN/ISIS: 27379988/994484 2025) GCF_003265705.2	71,169 (3.14 %)	n/a	21,276 (1.78 %)	21,276 (1.42 %)	n/a	41.44 (98.05 %)	29,679 (1.95 %)	30,369 (1.95 %)	43,734 (98.05 %)	4,118,994 (34.95 %)	578,801 (1.07 %)	13,530,999 (33.27 %)	1,105 (0.03 %)	400,358 (1.22 %)	51,258 (1.43 %)	48,682 (1.30 %)
479	northern gundi (hap1 2025) GCA_048771875.1	n/a	n/a	16,996 (1.51 %)	21,787 (1.66 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	0 (0 %)	117 (0.00 %)	535 (100.00 %)	3,293,772 (27.51 %)	602,403 (3.02 %)	11,827,700 (30.64 %)	2 (0.00 %)	353,736 (1.31 %)	44,220 (1.55 %)	38,845 (1.17 %)
480	northern gundi (hap2 2025) GCA_048771865.1	n/a	n/a	17,037 (1.43 %)	21,690 (1.55 %)	n/a	42.88 (100.00 %)	0 (0 %)	115 (0.00 %)	1,031 (100.00 %)	3,527,940 (26.81 %)	646,620 (6.32 %)	11,343,462 (34.09 %)	0 (0 %)	754,284 (2.54 %)	47,125 (1.51 %)	39,404 (1.11 %)
481	northern gundi (US049 2019) GCA_004027205.1	n/a	n/a	18,035 (1.39 %)	27,379 (1.57 %)	n/a	42.68 (99.91 %)	5,037 (0.02 %)	5,037 (0.02 %)	865,110 (99.98 %)	4,149,883 (27.83 %)	654,063 (1.64 %)	12,342,565 (33.72 %)	12 (0.00 %)	n/a	47,533 (1.43 %)	40,352 (1.09 %)
482	northern mole vole GCA_001685095.1	n/a	n/a	23,252 (1.39 %)	44,209 (1.25 %)	n/a	41.68 (99.04 %)	371,627 (0.98 %)	371,627 (0.98 %)	722,087 (99.02 %)	3,923,814 (25.79 %)	898,453 (2.47 %)	13,708,986 (29.04 %)	96,051 (0.87 %)	280,901 (1.10 %)	16,583 (0.36 %)	15,193 (0.32 %)
483	northern white rhinoceros GCA_004027795.1	n/a	n/a	25,328 (1.34 %)	61,003 (1.95 %)	n/a	41.32 (99.90 %)	7,054 (0.03 %)	7,054 (0.03 %)	949,480 (99.97 %)	4,330,882 (38.89 %)	484,754 (1.12 %)	15,544,248 (33.11 %)	44 (0.00 %)	n/a	43,689 (2.08 %)	40,625 (1.98 %)
484	northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024) GCA_043748575.1	n/a	n/a	18,475 (1.82 %)	19,990 (1.56 %)	n/a	40.72 (100.00 %)	2 (0.00 %)	63 (0.00 %)	68 (100.00 %)	3,507,612 (39.92 %)	711,081 (2.15 %)	11,788,205 (32.17 %)	0 (0 %)	524,992 (2.03 %)	35,670 (1.25 %)	28,616 (1.05 %)
485	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank) GCA_036323735.1	114,725 (42.69 %)	n/a	21,917 (1.75 %)	19,476 (1.26 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	0 (0 %)	220 (0.14 %)	77 (100.00 %)	4,700,726 (39.99 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,813 (38.68 %)	21 (0.00 %)	1,553,966 (4.21 %)	20,118 (0.44 %)	17,465 (0.38 %)
486	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq) GCF_036323735.1	114,725 (5.38 %)	n/a	21,870 (1.74 %)	19,989 (1.27 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	0 (0 %)	220 (0.14 %)	76 (100.00 %)	5,294,185 (42.75 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,760 (38.68 %)	21 (0.00 %)	1,553,966 (4.21 %)	20,118 (0.44 %)	17,703 (0.38 %)
487	Norway rat (F344/Stm 2024) GCA_041222355.1	n/a	n/a	21,764 (1.78 %)	20,141 (1.30 %)	n/a	41.87 (99.96 %)	0 (0 %)	234 (0.04 %)	120 (100.00 %)	4,636,987 (39.98 %)	1,579,595 (5.22 %)	13,544,768 (38.06 %)	4 (0.00 %)	1,510,531 (4.17 %)	20,127 (0.46 %)	17,493 (0.40 %)
488	Norway rat BN7 haplotype GCA_015244455.1	n/a	n/a	3,096 (1.64 %)	2,450 (1.02 %)	n/a	41.23 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	3,156 (100.00 %)	517,347 (50.76 %)	157,701 (3.90 %)	1,502,752 (34.14 %)	0 (0 %)	157,923 (4.57 %)	1,806 (0.40 %)	1,380 (0.31 %)
489	Norway rat BN7.2 GCF_015227675.2	97,432 (4.08 %)	n/a	21,526 (1.86 %)	19,266 (1.33 %)	54,530 (2.79 %)	41.99 (99.19 %)	581 (0.81 %)	581 (0.81 %)	757 (99.19 %)	5,029,005 (45.44 %)	1,514,974 (3.57 %)	13,450,428 (35.83 %)	4 (0.00 %)	1,172,090 (3.51 %)	19,244 (0.46 %)	16,098 (0.39 %)
490	Norway rat celera GCF_000002265.2	39,745 (2.91 %)	n/a	21,492 (1.95 %)	19,112 (1.38 %)	n/a	41.98 (95.28 %)	111,393 (4.74 %)	111,391 (4.74 %)	118,423 (95.26 %)	9,721,869 (43.57 %)	1,387,703 (3.05 %)	13,224,921 (32.45 %)	11 (0.00 %)	813,629 (2.20 %)	18,944 (0.42 %)	16,117 (0.37 %)
491	Norway rat Rnor6.0 GCF_000001895.5	69,456 (3.34 %)	n/a	22,369 (1.83 %)	20,269 (1.32 %)	n/a	41.93 (95.13 %)	70,664 (4.84 %)	145,731 (4.89 %)	76,195 (95.16 %)	5,329,187 (44.14 %)	1,620,304 (3.72 %)	14,520,050 (33.09 %)	719 (0.06 %)	916,050 (3.68 %)	22,600 (0.47 %)	18,401 (0.40 %)
492	Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022 GCA_023515785.1	n/a	n/a	21,116 (1.68 %)	20,103 (1.27 %)	57,027 (2.45 %)	41.85 (99.82 %)	0 (0 %)	1,256 (0.18 %)	2,151 (100.00 %)	4,704,388 (38.22 %)	1,611,144 (5.76 %)	13,524,575 (38.35 %)	24 (0.00 %)	1,665,234 (4.47 %)	20,720 (0.48 %)	16,247 (0.34 %)
493	Norway rat SHRSP/BppUtx 2022 GCA_021556685.1	n/a	n/a	22,366 (1.71 %)	20,531 (1.26 %)	57,580 (2.44 %)	41.86 (99.94 %)	0 (0 %)	1,610 (0.06 %)	2,734 (100.00 %)	5,238,574 (46.36 %)	1,638,412 (5.87 %)	13,769,141 (38.49 %)	12 (0.00 %)	1,712,824 (4.62 %)	21,006 (0.49 %)	17,310 (0.40 %)
494	Norway rat WKY/Bbb 2022 GCA_023515805.1	n/a	n/a	21,607 (1.68 %)	21,244 (1.28 %)	58,136 (2.47 %)	41.92 (99.80 %)	0 (0 %)	1,456 (0.20 %)	3,553 (100.00 %)	4,811,412 (38.21 %)	1,650,950 (5.41 %)	13,740,644 (38.24 %)	16 (0.00 %)	1,626,115 (4.31 %)	21,449 (0.51 %)	16,486 (0.34 %)
495	nutria GCA_004027025.1	n/a	n/a	24,707 (1.00 %)	47,533 (1.18 %)	n/a	41.70 (99.84 %)	15,249 (0.05 %)	15,249 (0.05 %)	1,684,916 (99.95 %)	6,961,690 (30.09 %)	1,698,977 (3.31 %)	15,207,563 (42.57 %)	44 (0.00 %)	n/a	59,854 (1.00 %)	31,029 (0.63 %)
496	okapi GCA_001660835.1	n/a	n/a	21,483 (1.43 %)	31,061 (1.26 %)	n/a	41.48 (95.11 %)	376,008 (4.86 %)	376,008 (4.86 %)	1,213,177 (95.14 %)	5,808,036 (42.90 %)	619,044 (4.22 %)	14,940,153 (35.17 %)	41,083 (0.65 %)	843,551 (6.96 %)	47,417 (1.12 %)	45,138 (1.04 %)
497	Ord's kangaroo rat GCF_000151885.1	30,625 (2.21 %)	n/a	17,959 (1.54 %)	19,318 (1.54 %)	n/a	42.06 (92.36 %)	83,033 (7.65 %)	83,035 (7.65 %)	148,226 (92.35 %)	4,337,455 (33.76 %)	1,140,316 (7.60 %)	10,422,685 (36.59 %)	3,290 (0.06 %)	1,520,292 (3.90 %)	61,921 (3.56 %)	30,924 (0.78 %)
498	pacarana GCA_004027595.1	n/a	n/a	20,748 (1.20 %)	33,195 (1.31 %)	n/a	41.81 (99.90 %)	6,392 (0.02 %)	6,392 (0.02 %)	1,164,830 (99.98 %)	4,374,443 (30.16 %)	660,811 (1.38 %)	14,062,133 (35.99 %)	8 (0.00 %)	n/a	59,382 (1.23 %)	28,291 (0.70 %)
499	Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad) GCA_004363475.1	n/a	n/a	21,575 (1.07 %)	47,478 (1.31 %)	n/a	41.87 (99.76 %)	18,801 (0.07 %)	18,801 (0.07 %)	2,428,619 (99.93 %)	4,881,232 (20.80 %)	1,352,971 (4.11 %)	12,583,960 (48.42 %)	36 (0.00 %)	n/a	74,961 (2.33 %)	61,745 (1.54 %)
500	Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo) GCF_023159225.1	46,202 (2.48 %)	n/a	18,752 (1.50 %)	22,526 (1.60 %)	n/a	41.98 (99.96 %)	0 (0 %)	1,807 (0.04 %)	6,180 (100.00 %)	3,313,319 (16.79 %)	1,066,382 (10.88 %)	9,981,468 (42.63 %)	8 (0.00 %)	1,996,445 (6.17 %)	49,134 (2.83 %)	50,049 (1.70 %)
501	Pacific walrus GCF_000321225.1	27,163 (1.89 %)	n/a	20,293 (1.71 %)	20,982 (1.48 %)	n/a	41.36 (95.85 %)	66,763 (4.16 %)	66,766 (4.16 %)	70,656 (95.84 %)	4,372,578 (41.12 %)	511,500 (1.05 %)	13,507,582 (30.43 %)	2,581 (0.03 %)	386,274 (1.21 %)	45,142 (1.29 %)	37,732 (0.95 %)
502	Pacific white-sided dolphin GCF_003676395.1	65,970 (3.26 %)	n/a	18,743 (1.79 %)	20,862 (1.45 %)	31,917 (1.69 %)	41.28 (99.56 %)	16,337 (0.44 %)	16,699 (0.44 %)	21,350 (99.56 %)	3,971,820 (45.64 %)	574,056 (1.14 %)	12,602,965 (34.83 %)	610 (0.02 %)	419,325 (1.28 %)	62,275 (1.67 %)	40,749 (1.23 %)
503	pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019) GCA_004115245.1	n/a	n/a	18,118 (1.63 %)	23,536 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	38 (0.00 %)	10,873 (100.00 %)	3,001,130 (29.46 %)	375,042 (0.79 %)	11,813,971 (29.64 %)	0 (0 %)	140,066 (0.57 %)	67,712 (4.23 %)	70,108 (3.94 %)
504	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020) GCA_004115245.2	n/a	n/a	18,116 (1.63 %)	23,608 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	38 (0.00 %)	10,895 (100.00 %)	3,002,448 (29.46 %)	375,226 (0.79 %)	11,824,034 (29.65 %)	0 (0 %)	140,328 (0.57 %)	67,718 (4.23 %)	70,109 (3.93 %)
505	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020) GCF_004126475.2	54,932 (3.31 %)	n/a	18,171 (1.69 %)	20,025 (1.62 %)	42,786 (3.39 %)	42.38 (99.28 %)	0 (0 %)	884 (0.72 %)	77 (100.00 %)	3,069,141 (30.00 %)	385,664 (0.81 %)	12,050,232 (30.57 %)	1 (0.00 %)	174,292 (0.75 %)	63,905 (3.75 %)	66,744 (3.26 %)
506	Pallas's mastiff bat GCF_014108415.1	48,421 (2.20 %)	n/a	18,667 (1.61 %)	21,915 (1.59 %)	n/a	42.35 (97.95 %)	0 (0 %)	349 (2.05 %)	60 (100.00 %)	3,863,217 (32.76 %)	624,933 (1.88 %)	11,572,319 (37.09 %)	1 (0.00 %)	714,726 (2.00 %)	79,984 (2.45 %)	71,436 (1.91 %)
507	pallid bat (TK200870 primary hap 2023) GCA_027563665.1	n/a	n/a	19,688 (1.69 %)	21,998 (1.64 %)	n/a	43.04 (99.72 %)	19 (0.01 %)	234 (0.28 %)	112 (99.99 %)	2,794,986 (22.60 %)	938,016 (3.72 %)	11,241,518 (39.41 %)	0 (0 %)	704,408 (2.03 %)	70,272 (2.89 %)	61,250 (1.98 %)
508	Parnell's mustached bat (2013) GCA_000465405.1	n/a	n/a	21,436 (1.40 %)	57,232 (2.18 %)	n/a	40.82 (99.34 %)	265,720 (0.70 %)	265,720 (0.70 %)	443,121 (99.30 %)	2,780,805 (29.26 %)	290,520 (0.63 %)	12,354,814 (27.13 %)	3 (0.00 %)	21,621 (0.07 %)	69,806 (1.89 %)	63,572 (1.69 %)
509	Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021) GCF_021234165.1	37,033 (2.48 %)	n/a	18,339 (1.76 %)	21,630 (1.69 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	0 (0 %)	12 (0.00 %)	333 (100.00 %)	2,828,339 (30.56 %)	333,670 (0.75 %)	12,444,271 (30.90 %)	0 (0 %)	111,571 (0.50 %)	53,180 (4.61 %)	54,187 (3.93 %)
510	particolored bat (primary hap 2024) GCA_963924515.1	n/a	n/a	17,913 (1.72 %)	20,720 (1.72 %)	n/a	43.54 (99.99 %)	7 (0.00 %)	980 (0.01 %)	185 (100.00 %)	2,932,869 (21.94 %)	874,665 (4.83 %)	10,263,103 (37.46 %)	2 (0.00 %)	742,499 (2.50 %)	77,397 (4.55 %)	76,849 (2.51 %)
511	Patagonian cavy GCA_004027295.1	n/a	n/a	21,143 (0.94 %)	40,887 (1.10 %)	n/a	39.86 (99.87 %)	6,223 (0.02 %)	6,223 (0.02 %)	1,911,987 (99.98 %)	5,194,890 (30.95 %)	892,551 (2.11 %)	17,052,577 (40.22 %)	47 (0.00 %)	n/a	45,730 (0.84 %)	40,047 (0.71 %)
512	Pere David's deer GCA_002443075.1	n/a	n/a	20,723 (1.65 %)	23,551 (1.43 %)	n/a	41.58 (97.49 %)	144,642 (2.51 %)	144,642 (2.51 %)	339,454 (97.49 %)	5,171,293 (43.30 %)	427,987 (1.20 %)	13,665,133 (35.97 %)	3,724 (0.06 %)	460,451 (1.49 %)	48,374 (1.14 %)	45,141 (1.04 %)
513	Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022) GCA_027409165.1	n/a	n/a	18,794 (1.72 %)	21,421 (1.40 %)	n/a	40.18 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,750 (100.00 %)	4,001,442 (39.37 %)	547,894 (2.75 %)	13,870,563 (34.33 %)	0 (0 %)	585,313 (2.32 %)	40,162 (1.31 %)	39,090 (1.18 %)
514	Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank) GCA_027409185.1	n/a	n/a	20,384 (1.64 %)	22,124 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	0 (0 %)	116 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,492,423 (39.31 %)	627,842 (4.79 %)	15,561,515 (36.57 %)	2 (0.00 %)	n/a	45,336 (1.27 %)	44,264 (1.15 %)
515	Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq) GCF_027409185.1	44,950 (1.91 %)	n/a	20,385 (1.64 %)	22,123 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	0 (0 %)	116 (0.00 %)	130 (100.00 %)	4,492,417 (39.31 %)	627,841 (4.79 %)	15,561,458 (36.57 %)	2 (0.00 %)	862,813 (2.91 %)	45,336 (1.27 %)	44,264 (1.15 %)
516	pig (Bamei 2023) GCA_030704935.1	n/a	n/a	18,472 (1.44 %)	19,911 (1.28 %)	n/a	42.63 (99.98 %)	0 (0 %)	878 (0.02 %)	379 (100.00 %)	3,996,827 (27.97 %)	2,094,728 (7.23 %)	12,677,118 (40.57 %)	4 (0.00 %)	1,289,995 (3.44 %)	81,791 (2.82 %)	46,045 (1.12 %)
517	pig (Duroc 2017) GCF_000003025.6	77,695 (4.05 %)	n/a	18,980 (1.64 %)	19,453 (1.32 %)	59,876 (4.84 %)	41.87 (98.81 %)	328 (1.19 %)	544 (1.19 %)	1,313 (98.81 %)	5,021,184 (45.67 %)	710,994 (1.32 %)	13,243,289 (36.33 %)	2 (0.00 %)	554,834 (1.64 %)	79,132 (1.82 %)	46,116 (1.30 %)
518	pig (Norwegian landrace 2024) GCA_963921485.1	n/a	n/a	18,500 (1.46 %)	19,718 (1.29 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	54 (100.00 %)	4,068,783 (28.54 %)	1,511,605 (5.52 %)	12,867,101 (39.59 %)	0 (0 %)	1,099,633 (2.98 %)	82,002 (2.44 %)	46,611 (1.15 %)
519	pig (USMARCv1 2017) GCA_002844635.1	n/a	n/a	19,458 (1.54 %)	21,487 (1.27 %)	58,655 (2.58 %)	42.49 (95.20 %)	0 (0 %)	661 (4.80 %)	14,157 (100.00 %)	5,159,244 (47.53 %)	902,079 (3.63 %)	13,145,120 (36.86 %)	1 (0.00 %)	1,358,423 (3.46 %)	82,442 (2.62 %)	47,468 (1.28 %)
520	pig (Wuzhishan WZS1 2025) GCA_048338725.1	n/a	n/a	18,525 (1.46 %)	19,792 (1.29 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	20 (100.00 %)	4,084,482 (28.40 %)	1,424,314 (5.35 %)	12,927,595 (39.56 %)	0 (0 %)	1,032,116 (2.85 %)	81,967 (2.96 %)	46,624 (1.14 %)
521	plains zebra (Etosha38 2022 UCLA) GCF_021613505.1	55,794 (2.87 %)	n/a	19,529 (1.76 %)	21,214 (1.39 %)	n/a	41.38 (99.04 %)	0 (0 %)	14,595 (0.96 %)	11,098 (100.00 %)	3,683,862 (38.74 %)	314,723 (0.68 %)	15,217,328 (29.38 %)	2,057 (0.02 %)	119,672 (0.38 %)	41,391 (1.27 %)	38,911 (1.12 %)
522	platypus (alternate hap Pmale09 2020) GCA_004115175.2	n/a	n/a	13,244 (1.26 %)	19,241 (1.68 %)	n/a	46.27 (100.00 %)	25 (0.00 %)	25 (0.00 %)	5,868 (100.00 %)	4,420,884 (51.59 %)	513,006 (3.13 %)	7,749,797 (49.18 %)	0 (0 %)	994,720 (3.65 %)	81,538 (8.24 %)	68,267 (3.13 %)
523	platypus (Pmale09 v4 2020) GCF_004115215.2	51,379 (3.07 %)	n/a	14,778 (1.26 %)	18,888 (1.63 %)	n/a	46.14 (99.18 %)	0 (0 %)	515 (0.82 %)	322 (100.00 %)	5,071,089 (51.34 %)	578,614 (2.89 %)	9,113,848 (48.93 %)	0 (0 %)	1,130,252 (3.59 %)	87,796 (6.47 %)	74,209 (2.87 %)
524	polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq) GCF_000687225.1	35,751 (2.39 %)	n/a	18,466 (1.69 %)	15,384 (1.38 %)	n/a	41.65 (98.35 %)	110,343 (1.67 %)	110,343 (1.67 %)	134,162 (98.33 %)	4,123,540 (40.16 %)	553,196 (1.29 %)	13,765,581 (29.91 %)	205 (0.03 %)	311,409 (1.04 %)	54,907 (1.17 %)	47,736 (0.98 %)
525	polar bear (UCSC 2021) GCF_017311325.1	52,175 (2.92 %)	n/a	18,588 (1.75 %)	20,731 (1.54 %)	n/a	41.88 (99.60 %)	0 (0 %)	45,532 (0.41 %)	3,900 (100.00 %)	4,204,162 (40.75 %)	572,129 (1.75 %)	13,926,894 (30.79 %)	587 (0.02 %)	437,254 (2.43 %)	63,315 (1.93 %)	57,593 (1.70 %)
526	prairie deer mouse (Baylor 2013) GCF_000500345.1	50,187 (2.51 %)	n/a	20,427 (1.69 %)	20,874 (1.45 %)	n/a	42.34 (94.06 %)	182,041 (5.97 %)	182,263 (5.97 %)	212,962 (94.03 %)	n/a	1,229,123 (2.83 %)	14,447,916 (30.09 %)	7,908 (0.12 %)	806,105 (3.40 %)	23,246 (0.56 %)	19,518 (0.43 %)
527	prairie deer mouse (BWxNUB_F1_BW_parent 2025) GCF_049852395.1	84,704 (3.63 %)	n/a	19,312 (1.68 %)	20,354 (1.41 %)	n/a	42.31 (100.00 %)	0 (0 %)	106 (0.00 %)	25 (100.00 %)	6,577,724 (45.25 %)	1,288,198 (5.24 %)	13,978,540 (35.31 %)	1 (0.00 %)	964,471 (2.66 %)	23,724 (0.69 %)	20,765 (0.57 %)
528	prairie deer mouse (Harvard 2020) GCF_003704035.1	69,779 (3.28 %)	n/a	19,755 (1.73 %)	19,194 (1.43 %)	n/a	42.28 (95.07 %)	147,442 (4.96 %)	147,442 (4.96 %)	155,966 (95.04 %)	4,751,621 (29.04 %)	1,172,212 (2.66 %)	13,934,672 (29.87 %)	6,396 (0.08 %)	477,575 (1.54 %)	22,444 (0.57 %)	19,164 (0.44 %)
529	prairie vole GCF_000317375.1	40,484 (2.72 %)	n/a	19,648 (1.91 %)	19,489 (1.62 %)	n/a	42.25 (92.03 %)	180,677 (8.00 %)	180,677 (8.00 %)	187,012 (92.00 %)	3,779,126 (25.51 %)	879,192 (2.11 %)	12,360,347 (27.34 %)	6,788 (0.11 %)	335,553 (1.15 %)	18,233 (0.52 %)	16,466 (0.44 %)
530	proboscis bat (hap1 2024) GCA_037038545.1	n/a	n/a	17,919 (1.46 %)	19,330 (1.31 %)	n/a	40.78 (100.00 %)	0 (0 %)	68 (0.00 %)	41 (100.00 %)	3,707,234 (28.28 %)	643,817 (2.22 %)	12,106,384 (41.48 %)	5 (0.00 %)	871,436 (2.63 %)	54,438 (1.38 %)	34,899 (0.85 %)
531	proboscis bat (hap2 2024) GCA_037038555.1	n/a	n/a	17,253 (1.51 %)	18,507 (1.35 %)	n/a	40.91 (100.00 %)	0 (0 %)	39 (0.00 %)	38 (100.00 %)	3,466,835 (27.96 %)	585,261 (1.91 %)	11,364,898 (40.65 %)	2 (0.00 %)	726,868 (2.39 %)	50,527 (1.37 %)	32,436 (0.84 %)
532	pronghorn (PH2016 2021) GCA_021018645.1	n/a	n/a	21,848 (1.58 %)	27,614 (1.56 %)	n/a	41.70 (96.83 %)	74,027 (3.17 %)	74,027 (3.17 %)	140,480 (96.83 %)	3,335,744 (24.40 %)	405,435 (4.11 %)	13,855,606 (34.67 %)	3,445 (0.16 %)	489,014 (7.21 %)	48,670 (1.19 %)	43,625 (0.95 %)
533	Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq) GCF_000696695.1	45,089 (2.76 %)	n/a	19,546 (1.69 %)	22,107 (1.36 %)	n/a	41.27 (99.13 %)	80,963 (0.88 %)	80,963 (0.88 %)	134,060 (99.12 %)	3,787,533 (40.54 %)	435,607 (1.73 %)	14,738,418 (28.36 %)	39 (0.00 %)	276,230 (1.12 %)	40,752 (0.94 %)	36,104 (0.79 %)
534	Przewalski's horse (Varuska primary hap 2024) GCF_037783145.1	117,131 (4.09 %)	n/a	18,569 (1.70 %)	20,018 (1.38 %)	n/a	42.23 (100.00 %)	0 (0 %)	310 (0.00 %)	2,146 (100.00 %)	3,768,149 (39.86 %)	632,308 (5.35 %)	14,449,518 (32.71 %)	0 (0 %)	956,665 (2.51 %)	42,166 (4.46 %)	39,294 (4.31 %)
535	puma (L17-30 alternate hap 2023) GCA_028749965.1	n/a	n/a	18,380 (1.53 %)	20,701 (1.40 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	96 (0.00 %)	96 (0.00 %)	304 (100.00 %)	4,881,674 (33.96 %)	978,817 (2.17 %)	13,422,986 (35.08 %)	0 (0 %)	741,350 (2.01 %)	69,437 (2.62 %)	59,105 (1.71 %)
536	puma (L17-30 primary hap 2023) GCA_028749985.1	n/a	n/a	17,553 (1.53 %)	19,299 (1.39 %)	n/a	41.89 (100.00 %)	134 (0.00 %)	134 (0.00 %)	390 (100.00 %)	4,629,539 (33.53 %)	919,008 (2.02 %)	12,766,157 (34.70 %)	0 (0 %)	673,940 (1.93 %)	65,437 (2.53 %)	55,660 (1.67 %)
537	puma (SC36_Marlon 2018 refseq) GCF_003327715.1	25,588 (1.44 %)	n/a	17,664 (1.57 %)	16,565 (1.29 %)	n/a	41.36 (95.34 %)	0 (0 %)	178,992 (4.69 %)	2,175 (100.00 %)	4,885,335 (42.70 %)	833,138 (1.76 %)	13,705,778 (31.28 %)	2,166 (0.06 %)	494,981 (1.78 %)	58,912 (1.65 %)	50,360 (1.31 %)
538	punctate agouti GCA_004363535.1	n/a	n/a	22,612 (1.05 %)	45,433 (1.19 %)	n/a	40.79 (99.92 %)	6,459 (0.02 %)	6,459 (0.02 %)	993,123 (99.98 %)	5,671,738 (32.53 %)	945,722 (1.69 %)	17,003,309 (36.58 %)	32 (0.00 %)	n/a	85,696 (1.65 %)	65,973 (1.32 %)
539	pygmy sperm whale GCA_004363705.1	n/a	n/a	22,661 (1.30 %)	42,546 (1.15 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	6,053 (0.02 %)	6,053 (0.02 %)	1,258,125 (99.98 %)	5,185,912 (43.65 %)	836,752 (1.88 %)	14,150,125 (39.88 %)	43 (0.00 %)	n/a	95,344 (2.15 %)	68,248 (1.67 %)
540	pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq) GCF_026419965.1	73,518 (2.67 %)	n/a	18,496 (1.55 %)	20,718 (1.32 %)	n/a	42.05 (99.81 %)	0 (0 %)	143 (0.19 %)	581 (100.00 %)	3,817,659 (34.51 %)	758,297 (7.42 %)	12,196,998 (39.96 %)	0 (0 %)	1,197,809 (3.53 %)	101,353 (2.90 %)	50,216 (1.47 %)
541	pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022) GCA_026419985.1	n/a	n/a	18,550 (1.51 %)	20,491 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	0 (0 %)	138 (0.01 %)	391 (100.00 %)	3,860,112 (33.83 %)	820,375 (9.58 %)	12,159,196 (41.59 %)	2 (0.00 %)	1,346,279 (3.87 %)	106,168 (2.78 %)	50,294 (1.44 %)
542	Pyrenean desman (IBE-C5619 2021) GCA_019455555.1	n/a	20,936 (1.95 %)	17,527 (1.87 %)	20,474 (1.83 %)	n/a	41.67 (98.52 %)	63,679 (1.49 %)	63,679 (1.49 %)	75,985 (98.51 %)	2,147,379 (23.41 %)	327,740 (0.98 %)	10,539,226 (28.05 %)	1,165 (0.02 %)	291,271 (1.07 %)	44,487 (4.39 %)	47,205 (4.01 %)
543	rabbit (A946 2020) GCA_013371645.1	n/a	n/a	19,881 (1.40 %)	22,566 (1.32 %)	n/a	44.09 (99.92 %)	4,066 (0.07 %)	4,254 (0.08 %)	5,157 (99.93 %)	5,202,709 (44.78 %)	1,059,544 (2.39 %)	13,897,372 (40.69 %)	4 (0.00 %)	1,532,783 (5.00 %)	119,691 (2.74 %)	75,409 (2.53 %)
544	rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq) GCF_009806435.1	83,033 (4.16 %)	n/a	19,486 (1.31 %)	23,267 (1.31 %)	n/a	43.83 (97.68 %)	0 (0 %)	18,178 (2.32 %)	3,160 (100.00 %)	4,072,524 (21.41 %)	976,273 (2.33 %)	13,766,413 (39.76 %)	85 (0.00 %)	1,275,666 (3.04 %)	113,371 (2.46 %)	70,869 (1.75 %)
545	rabbit (primary hap 2024 refseq) GCF_964237555.1	95,289 (4.22 %)	n/a	19,385 (1.31 %)	22,631 (1.31 %)	n/a	44.02 (99.98 %)	0 (0 %)	2,276 (0.02 %)	221 (100.00 %)	4,099,586 (21.20 %)	1,062,900 (3.78 %)	13,416,814 (41.72 %)	5 (0.00 %)	1,560,076 (3.77 %)	116,523 (2.66 %)	74,863 (1.94 %)
546	rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq) GCF_000003625.3	43,642 (2.34 %)	n/a	18,665 (1.39 %)	20,095 (1.24 %)	n/a	43.75 (95.14 %)	80,789 (4.88 %)	80,789 (4.88 %)	84,024 (95.12 %)	4,890,480 (44.71 %)	883,939 (1.73 %)	13,254,520 (38.27 %)	12 (0.00 %)	1,022,784 (2.54 %)	110,337 (2.33 %)	68,468 (1.73 %)
547	raccoon dog (2021) GCF_905146905.1	52,577 (2.89 %)	n/a	19,628 (1.60 %)	20,274 (1.43 %)	n/a	41.28 (99.98 %)	0 (0 %)	70 (0.02 %)	811 (100.00 %)	4,499,368 (31.98 %)	1,005,212 (2.04 %)	13,884,201 (32.95 %)	2 (0.00 %)	702,009 (1.75 %)	52,450 (2.27 %)	46,478 (1.53 %)
548	Rambouillet sheep (Baylor 2017) GCF_002742125.1	50,083 (2.48 %)	46,295 (2.32 %)	19,992 (1.47 %)	22,506 (1.31 %)	41,290 (1.46 %)	41.91 (99.99 %)	4,845 (0.01 %)	4,847 (0.01 %)	7,486 (99.99 %)	5,764,757 (47.38 %)	507,629 (1.55 %)	14,138,601 (41.27 %)	7 (0.00 %)	1,279,574 (3.49 %)	51,748 (1.29 %)	40,690 (1.04 %)
549	Rambouillet sheep (U.Idaho 2021) GCF_016772045.1	70,461 (3.21 %)	n/a	19,413 (1.59 %)	21,222 (1.35 %)	n/a	41.99 (100.00 %)	0 (0 %)	84 (0.00 %)	142 (100.00 %)	5,300,958 (46.83 %)	455,553 (1.24 %)	13,023,443 (40.62 %)	0 (0 %)	979,102 (2.67 %)	43,959 (1.30 %)	38,834 (1.07 %)
550	ratel GCA_004024625.1	n/a	n/a	22,196 (1.21 %)	35,937 (1.18 %)	n/a	42.00 (99.85 %)	6,511 (0.02 %)	6,511 (0.02 %)	2,074,823 (99.98 %)	6,171,383 (41.93 %)	877,669 (1.49 %)	15,269,908 (41.22 %)	36 (0.00 %)	465,016 (0.89 %)	95,094 (1.91 %)	92,023 (1.73 %)
551	red bat GCA_004026805.1	n/a	n/a	27,510 (1.22 %)	65,467 (1.48 %)	n/a	42.69 (99.94 %)	6,380 (0.02 %)	6,380 (0.02 %)	525,280 (99.98 %)	4,644,227 (28.24 %)	1,170,868 (2.68 %)	15,628,238 (39.97 %)	16 (0.00 %)	n/a	125,564 (3.55 %)	108,686 (2.27 %)
552	red deer (2021) GCF_910594005.1	68,992 (2.68 %)	n/a	20,470 (1.48 %)	22,563 (1.32 %)	n/a	42.98 (100.00 %)	0 (0 %)	40 (0.00 %)	144 (100.00 %)	5,501,063 (44.60 %)	503,301 (12.23 %)	13,102,622 (44.55 %)	1 (0.00 %)	2,197,198 (5.57 %)	88,756 (1.66 %)	46,960 (1.12 %)
553	red deer (alternate hap 2021) GCA_910593805.1	n/a	n/a	18,817 (1.29 %)	21,916 (1.20 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	0 (0 %)	22 (0.00 %)	4,021 (100.00 %)	3,279,005 (20.48 %)	472,706 (21.87 %)	11,466,609 (50.26 %)	0 (0 %)	3,624,599 (9.05 %)	128,858 (2.07 %)	39,577 (0.84 %)
554	red fox (BD-2025 2025) GCF_048418805.1	84,632 (3.45 %)	n/a	19,565 (1.57 %)	19,909 (1.38 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	0 (0 %)	104 (0.00 %)	289 (100.00 %)	4,480,315 (31.76 %)	1,010,887 (2.70 %)	13,766,344 (33.12 %)	1 (0.00 %)	718,295 (1.89 %)	50,763 (2.22 %)	47,197 (1.53 %)
555	red fox (hap1 2024) GCA_964106825.2	n/a	n/a	19,622 (1.57 %)	20,371 (1.38 %)	n/a	41.34 (99.98 %)	0 (0 %)	1,845 (0.02 %)	461 (100.00 %)	4,519,485 (31.91 %)	1,018,114 (2.59 %)	13,810,284 (32.99 %)	9 (0.00 %)	712,146 (1.92 %)	52,053 (2.31 %)	47,294 (1.54 %)
556	red fox (hap2 2024) GCA_964106925.2	n/a	n/a	19,517 (1.57 %)	20,105 (1.37 %)	n/a	41.31 (99.99 %)	0 (0 %)	1,819 (0.02 %)	350 (100.00 %)	4,487,839 (31.79 %)	1,010,106 (2.64 %)	13,838,711 (33.07 %)	17 (0.00 %)	695,908 (1.88 %)	51,373 (2.26 %)	46,876 (1.53 %)
557	red fox (tameXaggressive cross 2018) GCF_003160815.1	43,508 (2.67 %)	n/a	19,826 (1.69 %)	18,893 (1.40 %)	n/a	41.08 (97.06 %)	0 (0 %)	246,167 (2.96 %)	82,424 (100.00 %)	4,919,102 (40.79 %)	954,461 (2.46 %)	14,190,625 (30.86 %)	739 (0.02 %)	634,373 (2.40 %)	53,204 (1.88 %)	51,541 (1.62 %)
558	reed vole (MF-2015 2020) GCF_014885135.2	55,722 (3.60 %)	n/a	19,808 (1.93 %)	20,787 (1.69 %)	n/a	42.36 (95.60 %)	0 (0 %)	67,118 (4.40 %)	10,460 (100.00 %)	3,130,955 (20.09 %)	831,969 (2.09 %)	11,985,657 (28.48 %)	1,977 (0.20 %)	258,905 (1.26 %)	18,764 (0.58 %)	16,940 (0.48 %)
559	Reeves' muntjac (alternate hap 2024) GCA_963930665.1	n/a	n/a	18,947 (1.29 %)	24,114 (1.28 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8,892 (100.00 %)	3,375,476 (23.21 %)	654,539 (6.64 %)	11,132,469 (48.29 %)	0 (0 %)	3,008,562 (7.07 %)	79,357 (2.66 %)	41,548 (0.93 %)
560	Reeves' muntjac (primary hap 2024) GCF_963930625.1	52,442 (2.57 %)	n/a	19,577 (1.52 %)	22,283 (1.38 %)	n/a	41.89 (99.99 %)	0 (0 %)	682 (0.01 %)	267 (100.00 %)	3,294,672 (23.89 %)	527,436 (2.98 %)	13,137,581 (39.89 %)	1 (0.00 %)	1,222,379 (3.05 %)	57,436 (1.81 %)	44,949 (1.09 %)
561	reindeer (2023) GCA_963422255.1	n/a	n/a	21,329 (1.58 %)	25,201 (1.59 %)	n/a	41.46 (98.35 %)	131,886 (1.65 %)	131,886 (1.65 %)	259,765 (98.35 %)	3,254,173 (23.49 %)	440,431 (2.00 %)	14,258,607 (36.17 %)	3,361 (0.18 %)	n/a	48,931 (1.20 %)	43,592 (0.99 %)
562	reindeer (US061 2019) GCA_004026565.1	n/a	n/a	24,150 (1.39 %)	39,911 (1.41 %)	n/a	42.08 (99.89 %)	4,769 (0.02 %)	4,769 (0.02 %)	1,365,508 (99.98 %)	6,083,178 (46.10 %)	546,470 (1.23 %)	14,434,855 (43.16 %)	13 (0.00 %)	n/a	55,319 (1.23 %)	51,245 (1.12 %)
563	Rice's whale (hap1 2023) GCA_028017805.1	n/a	n/a	19,396 (1.48 %)	21,693 (1.26 %)	n/a	41.62 (97.80 %)	0 (0 %)	131 (2.20 %)	1,039 (100.00 %)	3,973,936 (35.55 %)	987,571 (11.66 %)	12,473,459 (42.11 %)	1 (0.00 %)	1,271,959 (3.79 %)	74,971 (1.64 %)	44,274 (1.06 %)
564	Rice's whale (hap2 2023 refseq) GCF_028023285.1	59,888 (2.34 %)	n/a	19,291 (1.53 %)	21,195 (1.30 %)	n/a	41.44 (99.90 %)	0 (0 %)	334 (0.10 %)	774 (100.00 %)	3,917,923 (36.26 %)	828,521 (9.28 %)	12,518,796 (41.08 %)	4 (0.00 %)	1,071,329 (3.37 %)	73,126 (1.69 %)	43,865 (1.11 %)
565	Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024) GCA_036010255.1	n/a	n/a	18,982 (1.81 %)	22,002 (1.76 %)	n/a	43.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	105 (100.00 %)	2,909,847 (24.53 %)	757,964 (3.03 %)	10,561,925 (36.25 %)	0 (0 %)	534,987 (1.92 %)	57,318 (2.32 %)	52,282 (1.76 %)
566	Risso's dolphin (hap1.1 2024) GCA_964374135.1	n/a	n/a	18,825 (1.58 %)	20,986 (1.29 %)	n/a	42.25 (99.99 %)	4 (0.00 %)	1,138 (0.01 %)	1,150 (100.00 %)	4,405,513 (43.51 %)	1,342,544 (11.28 %)	12,274,096 (41.76 %)	9 (0.00 %)	1,663,930 (5.05 %)	76,936 (4.65 %)	55,192 (2.62 %)
567	Risso's dolphin (hap2.1 2024) GCA_964374185.1	n/a	n/a	18,061 (1.68 %)	20,080 (1.36 %)	n/a	41.97 (99.99 %)	1,073 (0.01 %)	1,073 (0.01 %)	2,135 (99.99 %)	3,948,427 (43.52 %)	848,222 (8.00 %)	11,527,950 (38.76 %)	3 (0.00 %)	1,133,241 (3.81 %)	70,117 (3.31 %)	50,095 (2.07 %)
568	Ryukyu mouse (v2 2017) GCF_900094665.2	53,792 (2.85 %)	n/a	21,351 (2.29 %)	18,073 (1.39 %)	n/a	41.70 (89.05 %)	27,758 (7.30 %)	306,599 (10.98 %)	30,835 (92.70 %)	4,479,912 (35.83 %)	1,351,677 (2.59 %)	12,964,608 (27.49 %)	6,570 (0.06 %)	398,054 (1.12 %)	15,963 (0.43 %)	15,425 (0.40 %)
569	Saanen dairy goat GCA_015443085.1	n/a	n/a	19,257 (1.54 %)	21,221 (1.32 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	0 (0 %)	170 (0.00 %)	1,362 (100.00 %)	5,336,862 (47.58 %)	515,161 (2.87 %)	13,144,895 (41.67 %)	3 (0.00 %)	1,309,461 (3.33 %)	58,623 (2.22 %)	39,483 (1.04 %)
570	saddleback dolphin (alternate hap 2023) GCA_949987525.1	n/a	n/a	18,509 (1.54 %)	22,514 (1.36 %)	n/a	41.95 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	7,427 (100.00 %)	3,675,922 (35.75 %)	950,374 (10.49 %)	11,670,399 (40.31 %)	0 (0 %)	1,395,810 (4.32 %)	63,587 (3.15 %)	40,331 (1.09 %)
571	saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq) GCF_949987515.1	46,746 (2.39 %)	n/a	18,624 (1.49 %)	20,662 (1.31 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	0 (0 %)	968 (0.01 %)	630 (100.00 %)	4,020,676 (35.99 %)	1,259,549 (13.09 %)	12,359,748 (42.64 %)	0 (0 %)	1,785,427 (5.07 %)	66,179 (3.91 %)	41,466 (1.03 %)
572	saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq) GCF_949987515.2	46,014 (2.36 %)	n/a	18,616 (1.49 %)	20,618 (1.32 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	968 (0.01 %)	968 (0.01 %)	1,598 (99.99 %)	4,020,525 (35.99 %)	1,258,165 (13.09 %)	12,359,758 (42.64 %)	0 (0 %)	1,475,119 (4.19 %)	66,188 (3.91 %)	41,466 (1.03 %)
573	saiga antelope GCA_004024985.1	n/a	n/a	23,736 (0.84 %)	55,133 (0.88 %)	n/a	42.52 (99.87 %)	2,867 (0.01 %)	2,867 (0.01 %)	1,775,066 (99.99 %)	6,485,113 (49.43 %)	447,097 (0.88 %)	13,972,753 (44.46 %)	57 (0.00 %)	n/a	46,883 (0.82 %)	38,101 (0.69 %)
574	Schreibers' long-fingered bat (US075 2019) GCA_004026525.1	n/a	n/a	20,147 (2.06 %)	31,271 (1.82 %)	n/a	42.27 (99.94 %)	6,918 (0.04 %)	6,918 (0.04 %)	184,538 (99.96 %)	2,772,932 (29.66 %)	366,782 (1.13 %)	10,477,531 (28.60 %)	19 (0.00 %)	n/a	62,520 (2.73 %)	58,978 (2.39 %)
575	Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025) GCA_964146895.2	n/a	n/a	18,109 (2.10 %)	21,263 (1.89 %)	n/a	42.51 (100.00 %)	0 (0 %)	140 (0.00 %)	186 (100.00 %)	2,812,261 (34.39 %)	457,565 (5.58 %)	10,220,083 (31.02 %)	0 (0 %)	662,735 (2.58 %)	59,522 (2.81 %)	54,315 (2.29 %)
576	Schreibers' long-fingered bat (v2 hap2 2025) GCA_964145185.2	n/a	n/a	17,286 (2.19 %)	20,474 (1.95 %)	n/a	42.64 (100.00 %)	86 (0.00 %)	86 (0.00 %)	254 (100.00 %)	2,610,773 (33.65 %)	389,844 (4.42 %)	9,728,138 (29.49 %)	0 (0 %)	460,730 (1.78 %)	56,508 (2.97 %)	51,969 (2.42 %)
577	scimitar-horned oryx GCF_014754425.2	51,527 (2.72 %)	n/a	19,713 (1.57 %)	21,928 (1.32 %)	n/a	41.74 (99.30 %)	0 (0 %)	16,241 (0.70 %)	9,089 (100.00 %)	5,435,109 (46.76 %)	414,279 (0.98 %)	13,490,956 (40.45 %)	2,509 (0.03 %)	982,620 (2.65 %)	42,961 (1.10 %)	38,033 (0.97 %)
578	Screaming hairy armadillo GCA_004027955.1	n/a	n/a	24,532 (0.39 %)	56,725 (0.46 %)	n/a	39.68 (99.70 %)	2,747 (0.01 %)	2,747 (0.01 %)	7,680,080 (99.99 %)	8,978,735 (36.02 %)	1,516,551 (1.58 %)	32,918,217 (47.67 %)	32 (0.00 %)	n/a	234,762 (1.56 %)	66,537 (0.64 %)
579	sea otter (GAN:26980312 2017 refseq) GCF_002288905.1	38,140 (2.17 %)	n/a	18,578 (1.64 %)	20,913 (1.44 %)	34,179 (1.77 %)	41.56 (98.79 %)	22,821 (1.21 %)	23,134 (1.21 %)	29,589 (98.79 %)	4,703,044 (41.42 %)	721,750 (1.39 %)	14,065,653 (32.89 %)	1,203 (0.02 %)	504,215 (2.00 %)	55,388 (1.87 %)	53,465 (1.67 %)
580	Seba's short-tailed bat GCA_004027735.1	n/a	n/a	21,878 (0.94 %)	55,858 (1.10 %)	n/a	42.70 (99.84 %)	3,864 (0.01 %)	3,864 (0.01 %)	1,929,203 (99.99 %)	3,802,235 (28.35 %)	606,320 (1.03 %)	15,171,250 (31.99 %)	69 (0.00 %)	n/a	118,227 (2.28 %)	103,103 (1.92 %)
581	sei whale (hap1.1 2025) GCA_965194805.1	n/a	n/a	19,292 (1.27 %)	21,865 (1.14 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	0 (0 %)	1,179 (0.01 %)	2,572 (100.00 %)	4,525,289 (42.25 %)	1,097,216 (21.14 %)	12,203,884 (50.47 %)	12 (0.00 %)	2,217,448 (6.14 %)	80,128 (1.58 %)	44,102 (0.91 %)
582	sei whale (hap2.1 2025) GCA_965194725.1	n/a	n/a	19,313 (1.37 %)	21,662 (1.17 %)	n/a	41.68 (99.99 %)	1,066 (0.01 %)	1,066 (0.01 %)	2,917 (99.99 %)	4,418,625 (42.98 %)	875,114 (15.81 %)	12,360,254 (46.52 %)	0 (0 %)	1,705,441 (5.02 %)	78,537 (1.66 %)	44,115 (0.98 %)
583	sheep (hu hu3095 2024) GCA_040805955.1	n/a	21,525 (1.22 %)	19,388 (1.42 %)	21,612 (1.28 %)	n/a	43.17 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	28 (100.00 %)	5,311,536 (44.06 %)	653,238 (7.29 %)	12,937,231 (44.10 %)	0 (0 %)	1,552,087 (3.95 %)	63,230 (6.03 %)	40,222 (0.90 %)
584	sheep (OAR_USU_Benz2616 2023) GCF_016772045.2	89,680 (5.44 %)	n/a	19,308 (1.52 %)	21,506 (1.35 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	0 (0 %)	84 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,275,767 (22.85 %)	464,346 (1.26 %)	12,987,607 (40.61 %)	0 (0 %)	992,253 (2.68 %)	44,477 (1.28 %)	39,609 (0.96 %)
585	sheep (Texel 2015) GCA_000298735.2	n/a	n/a	19,179 (1.56 %)	19,001 (1.26 %)	48,105 (1.85 %)	41.90 (98.94 %)	43,016 (1.07 %)	44,566 (1.07 %)	48,481 (98.93 %)	5,429,824 (46.13 %)	540,267 (1.64 %)	13,509,668 (38.83 %)	123 (0.01 %)	863,621 (2.69 %)	43,911 (1.13 %)	39,178 (0.99 %)
586	shrew mouse GCF_900095145.1	46,279 (2.64 %)	43,645 (2.34 %)	20,549 (2.23 %)	18,979 (1.49 %)	94,079 (3.98 %)	41.89 (90.53 %)	15,298 (6.27 %)	269,643 (9.50 %)	17,879 (93.73 %)	4,788,498 (38.32 %)	1,499,714 (3.03 %)	13,021,757 (27.83 %)	6,442 (0.07 %)	442,006 (1.19 %)	16,787 (0.47 %)	15,907 (0.43 %)
587	Siberian hamster (SSSS 2022) GCA_023856395.1	n/a	n/a	18,375 (1.83 %)	17,066 (1.44 %)	n/a	41.27 (99.64 %)	0 (0 %)	88,601 (0.37 %)	7,756 (100.00 %)	3,152,242 (21.63 %)	1,087,009 (2.64 %)	12,055,167 (29.20 %)	1,976 (0.02 %)	260,068 (0.73 %)	15,455 (0.48 %)	14,212 (0.40 %)
588	Siberian musk deer (BS20 2019 Broad) GCA_004024705.1	n/a	n/a	23,440 (1.32 %)	37,497 (1.19 %)	n/a	42.32 (99.86 %)	19,764 (0.07 %)	19,764 (0.07 %)	1,195,467 (99.93 %)	6,726,950 (49.79 %)	437,480 (1.57 %)	14,155,240 (46.22 %)	13 (0.00 %)	n/a	49,177 (1.05 %)	43,489 (0.94 %)
589	sika deer (Changchun, China MLH-2022 2023) GCA_034195675.1	n/a	n/a	20,087 (1.59 %)	23,556 (1.46 %)	n/a	41.66 (99.97 %)	0 (0 %)	1,724 (0.03 %)	1,889 (100.00 %)	3,925,148 (27.17 %)	419,490 (1.24 %)	13,364,988 (37.79 %)	0 (0 %)	653,312 (1.92 %)	47,630 (1.31 %)	42,485 (1.04 %)
590	small Madagascar hedgehog GCF_000313985.2	37,090 (1.93 %)	n/a	18,969 (1.19 %)	19,298 (1.31 %)	n/a	43.01 (88.43 %)	0 (0 %)	270,406 (11.60 %)	7,490 (100.00 %)	3,789,337 (28.89 %)	429,226 (0.87 %)	16,951,112 (32.23 %)	3,875 (0.06 %)	191,573 (0.64 %)	39,993 (0.70 %)	32,202 (0.55 %)
591	smoky shrew (2023) GCF_029834395.1	37,165 (1.66 %)	n/a	17,572 (1.06 %)	24,146 (1.29 %)	n/a	43.43 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	497 (100.00 %)	2,593,080 (14.11 %)	1,194,567 (7.25 %)	14,051,522 (48.20 %)	0 (0 %)	1,447,378 (3.75 %)	107,473 (2.80 %)	53,859 (1.19 %)
592	snow leopard (11264 2022) GCF_023721935.1	53,569 (3.37 %)	n/a	18,780 (1.67 %)	21,038 (1.40 %)	n/a	41.60 (99.30 %)	0 (0 %)	23,786 (0.70 %)	2,636 (100.00 %)	4,714,429 (34.93 %)	919,518 (1.59 %)	13,711,504 (33.24 %)	1,871 (0.02 %)	357,999 (0.95 %)	64,690 (2.41 %)	61,670 (2.00 %)
593	snowshoe hare GCA_004026855.1	n/a	n/a	23,263 (0.88 %)	55,811 (1.01 %)	n/a	44.12 (99.87 %)	10,153 (0.03 %)	10,153 (0.03 %)	1,602,982 (99.97 %)	4,767,120 (21.29 %)	1,040,992 (2.22 %)	15,680,144 (43.23 %)	86 (0.00 %)	n/a	126,152 (2.28 %)	87,841 (1.66 %)
594	social tuco-tuco GCA_004027165.1	n/a	n/a	25,166 (1.12 %)	41,316 (1.26 %)	n/a	40.71 (99.89 %)	16,191 (0.06 %)	16,191 (0.06 %)	823,762 (99.94 %)	5,390,906 (28.28 %)	1,027,922 (2.15 %)	15,241,308 (38.39 %)	45 (0.00 %)	n/a	31,883 (0.72 %)	27,410 (0.58 %)
595	soprano pipistrelle (alternate hap 2023) GCA_949987765.1	n/a	n/a	17,590 (1.81 %)	21,597 (1.85 %)	n/a	42.88 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	2,717 (100.00 %)	2,734,555 (21.46 %)	795,752 (6.56 %)	9,601,735 (36.35 %)	0 (0 %)	660,443 (2.50 %)	62,524 (3.25 %)	60,391 (2.11 %)
596	soprano pipistrelle (primary hap 2023) GCA_949987585.1	n/a	n/a	18,056 (1.78 %)	21,158 (1.79 %)	n/a	42.67 (100.00 %)	6 (0.00 %)	161 (0.00 %)	249 (100.00 %)	2,899,535 (21.64 %)	853,717 (7.80 %)	10,162,216 (37.72 %)	1 (0.00 %)	802,761 (2.85 %)	63,256 (3.06 %)	61,642 (2.03 %)
597	South African ground squirrel GCA_004024805.1	n/a	n/a	22,802 (1.44 %)	33,892 (1.27 %)	n/a	39.97 (99.92 %)	9,745 (0.04 %)	9,745 (0.04 %)	587,115 (99.96 %)	5,256,998 (34.93 %)	594,122 (1.27 %)	14,462,947 (33.96 %)	36 (0.00 %)	n/a	34,141 (0.80 %)	32,509 (0.74 %)
598	Southeastern Asian house mouse (2016) GCA_001624445.1	n/a	n/a	21,103 (2.24 %)	18,682 (1.45 %)	102,099 (4.16 %)	41.83 (86.23 %)	48,311 (2.15 %)	424,005 (13.83 %)	52,352 (97.85 %)	4,990,851 (39.88 %)	1,356,202 (2.67 %)	13,469,640 (26.15 %)	14,714 (0.76 %)	396,098 (1.49 %)	16,724 (0.41 %)	15,971 (0.39 %)
599	Southeastern Asian house mouse (2022) GCA_921999005.2	n/a	n/a	21,799 (2.13 %)	19,729 (1.40 %)	110,356 (4.43 %)	41.78 (99.19 %)	4 (0.00 %)	278 (0.81 %)	151 (100.00 %)	4,663,228 (40.41 %)	1,549,985 (3.70 %)	13,012,600 (34.99 %)	8 (0.01 %)	788,439 (2.30 %)	21,349 (0.52 %)	15,914 (0.42 %)
600	Southeastern Asian house mouse (T2T 2024) GCA_964188545.1	n/a	n/a	22,529 (1.85 %)	20,409 (1.22 %)	n/a	41.10 (99.90 %)	78 (0.10 %)	78 (0.10 %)	416 (99.90 %)	4,880,101 (47.77 %)	1,689,287 (15.13 %)	12,822,147 (42.92 %)	1 (0.00 %)	2,529,336 (6.14 %)	22,642 (0.54 %)	16,895 (0.41 %)
601	southern elephant seal GCF_011800145.1	53,210 (2.86 %)	n/a	19,520 (1.73 %)	20,727 (1.41 %)	39,634 (1.86 %)	41.45 (99.36 %)	0 (0 %)	22,850 (0.64 %)	1,115 (100.00 %)	4,728,105 (43.75 %)	585,443 (1.13 %)	13,463,979 (33.65 %)	2,467 (0.03 %)	627,414 (1.65 %)	53,182 (1.62 %)	49,837 (1.42 %)
602	southern grasshopper mouse (2020) GCF_903995425.1	47,152 (2.39 %)	n/a	19,356 (1.68 %)	18,821 (1.36 %)	n/a	41.81 (98.94 %)	0 (0 %)	2,143 (1.06 %)	2,949 (100.00 %)	4,850,460 (28.64 %)	1,195,836 (2.72 %)	13,540,762 (32.73 %)	0 (0 %)	547,538 (1.62 %)	18,046 (0.54 %)	16,132 (0.42 %)
603	southern multimammate mouse GCF_008632895.1	69,058 (3.04 %)	n/a	20,313 (2.11 %)	17,745 (1.38 %)	n/a	41.39 (91.90 %)	0 (0 %)	146,713 (8.12 %)	28 (100.00 %)	4,875,400 (38.43 %)	1,454,350 (2.93 %)	13,104,717 (28.82 %)	2,045 (0.04 %)	494,819 (1.13 %)	16,715 (0.45 %)	15,641 (0.42 %)
604	southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022) GCA_023853755.1	n/a	n/a	20,179 (1.21 %)	24,249 (1.19 %)	n/a	39.54 (100.00 %)	4 (0.00 %)	4 (0.00 %)	7,866 (100.00 %)	3,953,031 (35.88 %)	531,111 (1.14 %)	16,354,874 (39.96 %)	0 (0 %)	425,622 (1.30 %)	59,907 (1.35 %)	35,916 (0.80 %)
605	southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022) GCA_023851605.1	n/a	n/a	20,058 (1.26 %)	22,196 (1.13 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	0 (0 %)	961 (0.56 %)	201 (100.00 %)	4,037,291 (46.02 %)	593,019 (1.17 %)	18,033,833 (40.56 %)	9 (0.00 %)	500,101 (1.40 %)	65,039 (1.33 %)	38,121 (0.86 %)
606	southern three-banded armadillo GCA_004025125.1	n/a	n/a	29,138 (0.73 %)	56,522 (0.75 %)	n/a	39.20 (99.82 %)	15,801 (0.04 %)	15,801 (0.04 %)	2,941,308 (99.96 %)	6,990,740 (38.88 %)	839,452 (1.23 %)	24,805,397 (43.95 %)	220 (0.00 %)	n/a	71,951 (0.98 %)	63,325 (0.84 %)
607	southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020) GCA_015220265.1	n/a	n/a	22,897 (1.23 %)	27,007 (1.18 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	70 (0.00 %)	70 (0.00 %)	12,050 (100.00 %)	4,502,020 (38.27 %)	576,759 (1.02 %)	17,143,050 (40.65 %)	0 (0 %)	450,196 (1.59 %)	51,339 (1.15 %)	40,459 (0.82 %)
608	southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020) GCF_015220235.1	63,054 (2.39 %)	n/a	21,998 (1.29 %)	23,177 (1.18 %)	45,345 (1.69 %)	39.89 (97.48 %)	0 (0 %)	1,243 (2.52 %)	146 (100.00 %)	4,559,690 (39.66 %)	577,607 (1.02 %)	16,594,630 (40.50 %)	4 (0.00 %)	492,026 (1.69 %)	51,430 (1.14 %)	40,148 (0.81 %)
609	southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq) GCF_000283155.1	37,037 (2.11 %)	n/a	18,398 (1.71 %)	19,753 (1.44 %)	n/a	40.90 (96.05 %)	54,737 (3.96 %)	54,737 (3.96 %)	57,824 (96.04 %)	3,685,898 (38.31 %)	421,694 (0.97 %)	14,765,529 (28.93 %)	1,818 (0.02 %)	184,274 (0.57 %)	36,281 (1.02 %)	32,113 (0.82 %)
610	Sowerby's beaked whale (hap1 2024) GCA_964165515.1	n/a	n/a	19,471 (1.39 %)	22,951 (1.24 %)	n/a	42.04 (99.99 %)	2 (0.00 %)	1,095 (0.01 %)	1,604 (100.00 %)	4,307,839 (34.31 %)	825,475 (10.97 %)	11,375,945 (45.31 %)	11 (0.00 %)	3,517,431 (7.94 %)	76,527 (3.10 %)	39,378 (0.86 %)
611	Sowerby's beaked whale (hap2 2024) GCA_964148845.1	n/a	n/a	18,591 (1.46 %)	21,588 (1.27 %)	n/a	42.00 (99.99 %)	974 (0.01 %)	974 (0.01 %)	2,126 (99.99 %)	3,961,403 (34.20 %)	742,897 (9.73 %)	10,832,739 (43.68 %)	2 (0.00 %)	2,951,041 (7.25 %)	70,803 (2.85 %)	37,380 (0.90 %)
612	Sowerby's beaked whale (US080 2019) GCA_004027085.1	n/a	n/a	22,800 (1.32 %)	38,247 (1.17 %)	n/a	41.68 (99.84 %)	8,597 (0.03 %)	8,597 (0.03 %)	1,810,317 (99.97 %)	5,520,986 (45.05 %)	1,081,962 (2.69 %)	13,480,261 (43.01 %)	62 (0.00 %)	n/a	69,001 (1.39 %)	52,160 (1.13 %)
613	sperm whale (SW-GA 2023) GCF_002837175.3	62,616 (2.83 %)	n/a	19,485 (1.75 %)	22,707 (1.41 %)	n/a	41.33 (95.82 %)	121,387 (4.20 %)	121,387 (4.20 %)	133,555 (95.80 %)	3,906,439 (36.43 %)	691,647 (2.39 %)	13,489,368 (32.95 %)	1,869 (0.17 %)	517,424 (4.47 %)	86,751 (2.23 %)	82,633 (2.04 %)
614	spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025) GCA_048593285.1	n/a	n/a	15,188 (0.80 %)	15,406 (0.90 %)	n/a	36.07 (99.97 %)	151 (0.03 %)	151 (0.03 %)	157 (99.97 %)	4,933,924 (23.65 %)	1,239,006 (2.76 %)	20,612,787 (41.98 %)	1 (0.00 %)	575,621 (1.68 %)	21,700 (0.64 %)	21,289 (0.49 %)
615	spotted-tailed quoll (Chaos hap2 2025) GCA_048593245.1	n/a	n/a	15,441 (0.80 %)	15,791 (0.92 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	118 (0.01 %)	118 (0.01 %)	124 (99.99 %)	4,962,547 (23.62 %)	1,257,253 (2.87 %)	20,652,321 (42.01 %)	2 (0.00 %)	597,604 (1.75 %)	22,718 (0.69 %)	22,508 (0.51 %)
616	star-nosed mole GCF_000260355.1	30,444 (2.86 %)	n/a	16,116 (1.82 %)	17,403 (1.78 %)	n/a	41.55 (95.10 %)	82,557 (4.92 %)	82,557 (4.92 %)	84,595 (95.08 %)	1,855,039 (18.90 %)	308,473 (0.86 %)	9,571,561 (26.02 %)	1,110 (0.03 %)	253,120 (1.17 %)	48,079 (2.76 %)	50,592 (2.47 %)
617	Steller sea lion GCF_004028035.1	46,044 (2.38 %)	n/a	21,171 (1.78 %)	21,626 (1.43 %)	36,701 (1.75 %)	41.38 (99.41 %)	17,263 (0.59 %)	18,994 (0.59 %)	24,485 (99.41 %)	4,556,415 (43.53 %)	577,797 (1.09 %)	13,545,012 (33.71 %)	733 (0.02 %)	410,405 (1.19 %)	51,355 (1.45 %)	47,732 (1.28 %)
618	Stephens's kangaroo rat GCA_004024685.1	n/a	n/a	20,638 (1.19 %)	43,541 (1.37 %)	n/a	41.90 (99.85 %)	8,882 (0.04 %)	8,882 (0.04 %)	1,278,525 (99.96 %)	4,886,095 (30.36 %)	1,229,832 (5.30 %)	11,334,494 (44.33 %)	37 (0.00 %)	n/a	38,450 (1.17 %)	29,741 (0.76 %)
619	steppe mouse (ZRU 2018) GCA_003336285.1	n/a	n/a	22,032 (2.17 %)	20,891 (1.41 %)	n/a	41.70 (95.78 %)	123,681 (4.24 %)	123,681 (4.24 %)	161,217 (95.76 %)	4,964,415 (42.35 %)	1,414,584 (2.75 %)	12,989,925 (31.80 %)	1,690 (0.04 %)	440,790 (1.25 %)	17,544 (0.44 %)	15,542 (0.39 %)
620	Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024) GCA_043727835.1	n/a	n/a	19,605 (1.80 %)	20,075 (1.48 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	5 (0.00 %)	87 (0.00 %)	80 (100.00 %)	4,110,913 (40.46 %)	838,212 (2.48 %)	11,938,168 (33.52 %)	2 (0.00 %)	646,825 (2.22 %)	40,424 (1.32 %)	35,299 (1.15 %)
621	straw-colored fruit bat GCA_000465285.1	n/a	n/a	20,161 (1.66 %)	40,283 (1.50 %)	n/a	39.24 (99.62 %)	154,908 (0.40 %)	154,908 (0.40 %)	288,446 (99.60 %)	2,814,732 (32.92 %)	372,539 (1.01 %)	12,351,823 (25.93 %)	27 (0.00 %)	33,439 (0.13 %)	67,245 (2.34 %)	61,933 (1.94 %)
622	stripe-headed round-eared bat GCA_004024845.1	n/a	n/a	20,248 (1.62 %)	29,173 (1.61 %)	n/a	42.04 (99.96 %)	2,860 (0.01 %)	2,860 (0.01 %)	252,670 (99.99 %)	3,018,746 (29.48 %)	333,243 (0.74 %)	12,128,116 (30.51 %)	14 (0.00 %)	n/a	59,513 (1.87 %)	52,210 (1.57 %)
623	striped dolphin (alternate hap 2023) GCA_951394445.1	n/a	n/a	18,204 (1.54 %)	21,036 (1.34 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,464 (100.00 %)	3,767,720 (35.65 %)	1,102,723 (10.92 %)	11,794,617 (40.96 %)	0 (0 %)	1,492,009 (4.69 %)	67,537 (3.57 %)	41,008 (1.09 %)
624	striped dolphin (primary hap 2023) GCA_951394435.1	n/a	n/a	18,595 (1.48 %)	20,637 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1 (0.00 %)	993 (0.01 %)	639 (100.00 %)	4,097,623 (35.88 %)	1,442,973 (13.60 %)	12,327,244 (43.08 %)	1 (0.00 %)	1,896,129 (5.45 %)	68,498 (4.29 %)	42,011 (1.04 %)
625	striped hyena (BS54 2019 Broad) GCA_004023945.1	n/a	n/a	22,373 (1.45 %)	39,382 (1.45 %)	n/a	41.66 (99.93 %)	11,849 (0.05 %)	11,849 (0.05 %)	362,072 (99.95 %)	5,048,667 (42.42 %)	712,073 (1.24 %)	13,879,012 (34.58 %)	54 (0.00 %)	302,752 (0.79 %)	69,835 (2.20 %)	65,774 (1.90 %)
626	striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U) GCF_003009895.1	48,870 (2.41 %)	n/a	18,793 (1.67 %)	20,950 (1.44 %)	n/a	41.56 (99.29 %)	0 (0 %)	23,058 (0.71 %)	5,761 (100.00 %)	4,782,500 (41.88 %)	701,157 (1.32 %)	13,436,624 (33.05 %)	2,049 (0.04 %)	413,871 (1.33 %)	58,977 (2.20 %)	57,500 (1.94 %)
627	sugar glider (PSGF00001 2023) GCA_028583685.1	n/a	n/a	19,326 (0.81 %)	17,560 (0.95 %)	n/a	38.95 (98.12 %)	0 (0 %)	85,933 (1.89 %)	1,895 (100.00 %)	6,382,198 (27.07 %)	1,058,207 (1.74 %)	22,508,040 (39.84 %)	4,157 (0.04 %)	398,213 (0.87 %)	16,224 (0.33 %)	14,028 (0.23 %)
628	sugar glider (PSGF00001 2023) GCF_028583685.1	55,990 (2.41 %)	n/a	19,328 (0.81 %)	17,559 (0.95 %)	n/a	38.95 (98.12 %)	0 (0 %)	85,933 (1.89 %)	1,896 (100.00 %)	6,382,203 (27.07 %)	1,058,208 (1.74 %)	22,508,106 (39.84 %)	4,157 (0.04 %)	398,217 (0.87 %)	16,224 (0.33 %)	14,028 (0.23 %)
629	Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017) GCA_002844835.1	n/a	n/a	20,368 (1.53 %)	24,204 (1.23 %)	n/a	41.05 (95.54 %)	50,874 (4.40 %)	50,876 (4.40 %)	1,112,463 (95.60 %)	4,516,240 (39.90 %)	561,540 (1.56 %)	15,821,451 (34.68 %)	11,238 (0.78 %)	n/a	45,201 (1.03 %)	42,111 (0.93 %)
630	Sumatran serow (serow.1 2024) GCF_032405125.1	36,400 (1.65 %)	n/a	19,192 (1.42 %)	22,014 (1.41 %)	n/a	43.08 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	159 (100.00 %)	3,242,768 (21.18 %)	612,565 (8.05 %)	12,812,990 (44.37 %)	1 (0.00 %)	1,821,554 (4.84 %)	75,177 (5.86 %)	39,082 (0.88 %)
631	Sunda flying lemur (2014 WashU) GCF_000696425.1	34,734 (1.83 %)	n/a	21,356 (1.55 %)	25,832 (1.21 %)	n/a	40.21 (87.96 %)	332,364 (12.07 %)	412,608 (12.07 %)	511,878 (87.93 %)	4,961,153 (38.35 %)	854,441 (3.33 %)	17,562,576 (28.82 %)	58,964 (1.13 %)	n/a	82,988 (1.05 %)	76,682 (0.95 %)
632	Sunda flying lemur (US047 2019 Broad) GCA_004027255.1	n/a	n/a	24,882 (1.29 %)	43,546 (1.12 %)	n/a	40.46 (99.88 %)	5,895 (0.02 %)	5,895 (0.02 %)	1,655,642 (99.98 %)	5,807,241 (38.62 %)	953,765 (2.48 %)	18,836,777 (37.68 %)	23 (0.00 %)	n/a	114,955 (1.43 %)	106,305 (1.30 %)
633	tailed tailless bat GCA_004027475.1	n/a	n/a	19,920 (1.58 %)	28,017 (1.58 %)	n/a	41.76 (99.95 %)	4,640 (0.02 %)	4,640 (0.02 %)	341,895 (99.98 %)	3,139,817 (30.43 %)	381,536 (0.81 %)	12,069,229 (32.73 %)	25 (0.00 %)	n/a	54,528 (2.15 %)	52,231 (1.90 %)
634	tailess tenrec (hap1 2025) GCF_050624435.1	45,770 (1.60 %)	n/a	21,323 (0.86 %)	25,223 (1.02 %)	n/a	44.80 (100.00 %)	0 (0 %)	175 (0.00 %)	2,180 (100.00 %)	5,633,466 (38.91 %)	1,001,072 (14.26 %)	17,866,411 (50.04 %)	0 (0 %)	5,333,247 (8.40 %)	53,320 (1.01 %)	38,205 (0.58 %)
635	takin (Tak-1 2022) GCF_023091745.1	31,927 (1.65 %)	n/a	19,290 (1.42 %)	21,656 (1.27 %)	n/a	43.32 (100.00 %)	0 (0 %)	152 (0.00 %)	1,363 (100.00 %)	3,256,033 (21.01 %)	714,375 (8.32 %)	13,010,154 (44.58 %)	4 (0.00 %)	1,681,924 (4.50 %)	49,134 (7.43 %)	39,324 (0.88 %)
636	Talazac's shrew tenrec GCA_004026705.1	n/a	n/a	22,605 (0.81 %)	50,725 (1.09 %)	n/a	43.03 (99.93 %)	6,619 (0.02 %)	6,619 (0.02 %)	795,514 (99.98 %)	3,493,378 (14.58 %)	705,274 (1.31 %)	20,975,335 (36.85 %)	51 (0.00 %)	n/a	70,793 (1.26 %)	54,287 (0.89 %)
637	tammar wallaby (alternate hap 2023) GCA_028389975.1	n/a	n/a	11,133 (0.77 %)	13,869 (0.98 %)	n/a	38.63 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	14,285 (100.00 %)	3,114,522 (26.10 %)	661,874 (3.02 %)	11,667,649 (38.41 %)	0 (0 %)	320,252 (1.29 %)	12,393 (0.46 %)	7,824 (0.29 %)
638	tammar wallaby (Barry hap1 2025) GCA_048593335.1	n/a	n/a	17,491 (0.79 %)	15,701 (0.88 %)	n/a	38.69 (100.00 %)	32 (0.00 %)	32 (0.00 %)	40 (100.00 %)	5,762,317 (26.52 %)	1,078,692 (1.83 %)	22,476,051 (38.99 %)	0 (0 %)	359,624 (0.79 %)	22,756 (0.48 %)	14,728 (0.29 %)
639	tammar wallaby (Barry hap2 2025) GCA_048593345.1	n/a	n/a	17,037 (0.79 %)	15,066 (0.87 %)	n/a	38.62 (100.00 %)	16 (0.00 %)	16 (0.00 %)	24 (100.00 %)	5,608,153 (26.57 %)	1,050,173 (1.77 %)	21,856,273 (38.96 %)	0 (0 %)	329,638 (0.74 %)	21,811 (0.47 %)	14,145 (0.29 %)
640	tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq) GCF_028372415.1	73,219 (3.07 %)	n/a	17,615 (0.77 %)	15,415 (0.86 %)	n/a	38.73 (99.81 %)	0 (0 %)	515 (0.19 %)	272 (100.00 %)	5,866,314 (26.30 %)	1,193,604 (2.72 %)	22,677,480 (39.53 %)	4 (0.00 %)	565,991 (1.21 %)	23,590 (0.47 %)	14,746 (0.29 %)
641	Tasmanian devil (McLovin hap1 2025) GCA_048593225.1	n/a	n/a	15,725 (0.77 %)	16,721 (0.92 %)	n/a	36.17 (99.49 %)	1,514 (0.51 %)	1,514 (0.51 %)	1,521 (99.49 %)	5,222,976 (23.42 %)	1,357,438 (3.95 %)	21,705,122 (42.26 %)	2 (0.00 %)	779,205 (1.97 %)	24,443 (0.70 %)	24,411 (0.52 %)
642	Tasmanian devil (McLovin hap2 2025) GCA_048593325.1	n/a	n/a	15,165 (0.76 %)	15,663 (0.91 %)	n/a	36.00 (99.11 %)	2,578 (0.89 %)	2,578 (0.89 %)	2,584 (99.11 %)	5,039,957 (23.64 %)	1,257,168 (2.97 %)	20,893,744 (41.44 %)	4 (0.00 %)	610,743 (1.64 %)	22,574 (0.67 %)	22,546 (0.51 %)
643	Tasmanian devil (primary hap 2019) GCF_902635505.1	52,070 (2.36 %)	n/a	15,918 (0.85 %)	16,111 (0.91 %)	n/a	36.16 (100.00 %)	0 (0 %)	354 (0.00 %)	106 (100.00 %)	6,789,158 (44.28 %)	1,246,027 (2.19 %)	21,434,803 (41.20 %)	1 (0.00 %)	454,463 (1.20 %)	23,609 (0.65 %)	23,356 (0.61 %)
644	thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC) GCF_016881025.1	69,352 (3.50 %)	n/a	18,934 (1.68 %)	16,775 (1.37 %)	n/a	39.91 (93.25 %)	0 (0 %)	146,412 (6.77 %)	7,132 (100.00 %)	4,262,890 (35.64 %)	640,624 (1.64 %)	14,118,452 (27.90 %)	3,000 (0.05 %)	226,596 (0.80 %)	28,317 (0.64 %)	26,522 (0.58 %)
645	Tibetan sand fox (lyu1992 2022) GCA_024500485.1	n/a	n/a	19,552 (1.59 %)	19,307 (1.35 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	0 (0 %)	145 (0.00 %)	234 (100.00 %)	4,500,832 (32.18 %)	999,068 (2.01 %)	13,646,015 (32.98 %)	0 (0 %)	668,288 (1.70 %)	49,402 (2.19 %)	47,111 (1.57 %)
646	tiger GCF_018350195.1	71,226 (2.84 %)	n/a	18,513 (1.68 %)	19,919 (1.39 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	56 (0.00 %)	65 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,878,003 (42.77 %)	912,595 (1.82 %)	13,804,650 (33.76 %)	1 (0.00 %)	408,593 (1.10 %)	64,312 (2.55 %)	60,048 (2.06 %)
647	Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230055.1	n/a	n/a	19,370 (1.77 %)	21,062 (1.61 %)	n/a	42.81 (100.00 %)	219 (0.00 %)	219 (0.00 %)	610 (100.00 %)	2,923,694 (25.49 %)	772,382 (3.25 %)	10,654,074 (37.41 %)	2 (0.00 %)	500,435 (1.74 %)	48,226 (2.42 %)	50,955 (1.88 %)
648	Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230045.1	n/a	n/a	18,627 (1.82 %)	20,108 (1.67 %)	n/a	42.95 (100.00 %)	0 (0 %)	217 (0.00 %)	182 (100.00 %)	2,733,927 (24.79 %)	715,258 (3.17 %)	10,099,456 (36.35 %)	1 (0.00 %)	459,634 (1.69 %)	47,139 (2.58 %)	49,626 (1.96 %)
649	Transcaucasian mole vole GCA_001685075.1	n/a	n/a	20,173 (1.62 %)	18,627 (1.30 %)	n/a	41.51 (96.09 %)	440,846 (3.96 %)	440,846 (3.96 %)	499,269 (96.04 %)	3,827,136 (25.51 %)	810,597 (2.65 %)	13,634,524 (27.54 %)	26,487 (0.57 %)	259,635 (1.42 %)	9,596 (0.16 %)	8,622 (0.14 %)
650	trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024) GCA_043728145.1	n/a	n/a	18,871 (1.79 %)	20,351 (1.55 %)	n/a	40.66 (99.99 %)	10 (0.00 %)	397 (0.01 %)	136 (100.00 %)	3,580,957 (40.75 %)	683,947 (2.19 %)	11,464,418 (33.39 %)	23 (0.00 %)	658,821 (2.63 %)	37,175 (1.31 %)	29,161 (1.04 %)
651	True's beaked whale (hap1.1 2024) GCA_964341445.1	n/a	n/a	19,530 (1.21 %)	24,576 (1.13 %)	n/a	42.48 (99.99 %)	0 (0 %)	1,240 (0.01 %)	2,757 (100.00 %)	4,847,855 (34.88 %)	949,927 (20.01 %)	10,981,914 (51.51 %)	11 (0.00 %)	5,641,807 (11.20 %)	91,880 (2.74 %)	39,724 (0.76 %)
652	True's beaked whale (hap2.1 2024) GCA_964341485.1	n/a	n/a	19,313 (1.40 %)	22,642 (1.25 %)	n/a	42.03 (99.99 %)	1,073 (0.01 %)	1,073 (0.01 %)	2,457 (99.99 %)	4,540,507 (37.61 %)	826,104 (12.82 %)	11,296,445 (45.25 %)	8 (0.00 %)	3,246,098 (7.56 %)	80,840 (2.24 %)	38,974 (0.87 %)
653	Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq) GCF_000622305.1	54,680 (2.07 %)	n/a	19,704 (1.26 %)	21,262 (1.20 %)	n/a	41.26 (95.18 %)	201,121 (4.83 %)	201,121 (4.83 %)	356,097 (95.17 %)	6,165,645 (34.95 %)	1,197,750 (2.77 %)	16,282,383 (36.21 %)	730 (0.04 %)	n/a	22,905 (0.49 %)	18,563 (0.39 %)
654	Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019) GCA_005458795.1	n/a	n/a	19,867 (1.62 %)	15,893 (1.33 %)	n/a	39.77 (94.43 %)	291,728 (5.60 %)	296,819 (5.60 %)	315,631 (94.40 %)	4,452,628 (33.94 %)	751,210 (1.84 %)	13,917,879 (30.08 %)	10,755 (0.11 %)	190,776 (0.77 %)	26,541 (0.58 %)	25,046 (0.53 %)
655	vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019) GCA_008692045.1	n/a	n/a	9,367 (1.66 %)	11,297 (1.30 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	9,470 (100.00 %)	1,708,360 (43.81 %)	267,584 (1.67 %)	5,373,410 (33.52 %)	0 (0 %)	245,754 (1.84 %)	29,783 (1.94 %)	21,396 (1.51 %)
656	vaquita (mPhoSin1 2019) GCF_008692025.1	60,106 (3.00 %)	n/a	18,611 (1.76 %)	20,103 (1.39 %)	35,176 (2.22 %)	41.36 (99.66 %)	0 (0 %)	212 (0.34 %)	64 (100.00 %)	4,067,454 (44.25 %)	602,407 (1.34 %)	12,468,582 (35.55 %)	3 (0.00 %)	550,113 (1.71 %)	66,806 (1.79 %)	48,624 (1.46 %)
657	water buffalo (Mediterranean 2018) GCF_003121395.1	69,771 (3.14 %)	62,816 (2.76 %)	19,465 (1.58 %)	21,849 (1.37 %)	46,051 (1.86 %)	41.81 (99.99 %)	0 (0 %)	410 (0.01 %)	509 (100.00 %)	5,407,697 (47.11 %)	473,976 (1.54 %)	13,015,899 (41.23 %)	0 (0 %)	1,256,741 (3.44 %)	43,120 (1.15 %)	37,204 (0.96 %)
658	water buffalo (Murrah 2021) GCF_019923935.1	80,565 (3.26 %)	n/a	19,402 (1.59 %)	20,375 (1.31 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	0 (0 %)	659 (0.00 %)	26 (100.00 %)	5,358,548 (47.11 %)	447,338 (1.14 %)	13,034,537 (41.28 %)	1 (0.00 %)	1,149,595 (3.22 %)	40,189 (1.07 %)	36,130 (0.95 %)
659	Weddell seal (WS11-02 2013 refseq) GCF_000349705.1	48,264 (2.73 %)	n/a	21,063 (1.73 %)	22,333 (1.43 %)	n/a	41.39 (70.44 %)	152,836 (29.58 %)	152,836 (29.58 %)	169,547 (70.42 %)	4,420,479 (41.72 %)	471,256 (0.66 %)	13,410,237 (22.09 %)	2,022 (0.05 %)	348,917 (1.08 %)	48,738 (1.01 %)	44,867 (0.88 %)
660	western European hedgehog (2012 refseq) GCF_000296755.1	29,923 (1.67 %)	n/a	18,067 (1.33 %)	19,777 (1.35 %)	n/a	41.54 (85.94 %)	219,764 (14.09 %)	219,764 (14.09 %)	225,567 (85.91 %)	6,594,783 (45.66 %)	1,271,533 (2.29 %)	12,374,161 (42.02 %)	3,596 (0.06 %)	861,216 (2.39 %)	28,528 (0.71 %)	23,900 (0.52 %)
661	western European hedgehog (alternate hap 2023) GCA_950295305.1	n/a	n/a	14,370 (1.06 %)	24,297 (1.27 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	26,601 (100.00 %)	3,360,923 (19.59 %)	1,043,098 (3.92 %)	8,511,380 (53.68 %)	0 (0 %)	1,216,984 (4.33 %)	23,321 (0.97 %)	17,608 (0.60 %)
662	western European hedgehog (primary hap 2023 refseq) GCF_950295315.1	61,103 (2.36 %)	n/a	18,125 (1.16 %)	20,689 (1.21 %)	n/a	42.00 (99.97 %)	0 (0 %)	3,760 (0.03 %)	1,174 (100.00 %)	4,891,329 (19.68 %)	1,507,929 (3.81 %)	12,571,105 (54.50 %)	7 (0.00 %)	1,975,693 (4.67 %)	32,667 (0.90 %)	24,067 (0.56 %)
663	western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022) GCA_921998345.2	n/a	n/a	21,722 (2.14 %)	19,586 (1.39 %)	108,856 (4.46 %)	41.81 (98.87 %)	1 (0.00 %)	1,233 (1.13 %)	233 (100.00 %)	4,634,551 (40.61 %)	1,541,826 (3.49 %)	13,030,566 (35.21 %)	1 (0.00 %)	789,553 (2.49 %)	22,985 (0.56 %)	15,853 (0.42 %)
664	western roe deer (2023) GCA_951849835.1	n/a	n/a	20,291 (1.29 %)	23,555 (1.23 %)	n/a	42.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	212 (100.00 %)	4,204,612 (25.49 %)	848,463 (7.79 %)	12,687,776 (48.28 %)	0 (0 %)	3,910,662 (7.70 %)	57,315 (1.25 %)	43,092 (0.85 %)
665	western spotted skunk GCA_004023965.1	n/a	n/a	21,665 (1.46 %)	34,370 (1.32 %)	n/a	41.61 (99.92 %)	11,822 (0.05 %)	11,822 (0.05 %)	433,831 (99.95 %)	4,889,781 (40.77 %)	901,906 (2.30 %)	13,931,764 (34.80 %)	69 (0.00 %)	550,674 (1.31 %)	54,394 (1.54 %)	50,665 (1.39 %)
666	western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022) GCA_921997135.2	n/a	n/a	21,699 (2.10 %)	18,837 (1.32 %)	n/a	41.69 (99.51 %)	4 (0.00 %)	1,576 (0.49 %)	143 (100.00 %)	4,507,329 (41.24 %)	1,517,241 (3.77 %)	12,832,499 (36.17 %)	35 (0.00 %)	908,992 (2.83 %)	22,568 (0.53 %)	15,701 (0.41 %)
667	whiskered bat (hap1 2024) GCA_964094495.2	n/a	n/a	19,504 (1.78 %)	22,272 (1.73 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	7 (0.00 %)	1,566 (0.02 %)	533 (100.00 %)	3,046,246 (25.06 %)	753,151 (4.86 %)	10,596,418 (37.62 %)	7 (0.00 %)	729,123 (2.57 %)	66,785 (2.55 %)	53,825 (1.76 %)
668	whiskered bat (hap2 2024) GCA_964195625.1	n/a	n/a	18,681 (1.83 %)	21,523 (1.79 %)	n/a	43.13 (99.99 %)	1,414 (0.01 %)	1,414 (0.01 %)	1,741 (99.99 %)	2,849,223 (24.50 %)	688,594 (4.80 %)	9,968,980 (36.80 %)	9 (0.00 %)	650,767 (2.46 %)	64,365 (2.68 %)	52,706 (1.84 %)
669	white-beaked dolphin (alternate hap 2023) GCA_949774935.1	n/a	n/a	17,639 (1.50 %)	25,684 (1.35 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25,619 (100.00 %)	3,039,324 (36.05 %)	637,912 (8.02 %)	9,746,398 (38.98 %)	0 (0 %)	811,711 (3.51 %)	56,325 (3.33 %)	35,586 (1.15 %)
670	white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq) GCF_949774975.1	59,995 (2.43 %)	n/a	18,737 (1.57 %)	20,767 (1.34 %)	n/a	41.91 (99.99 %)	0 (0 %)	1,070 (0.01 %)	410 (100.00 %)	3,820,566 (36.21 %)	922,103 (8.43 %)	12,304,360 (39.74 %)	2 (0.00 %)	1,117,804 (3.60 %)	68,551 (3.58 %)	41,698 (1.09 %)
671	white-footed mouse (LL stock 2020) GCF_004664715.2	54,479 (2.82 %)	n/a	19,971 (1.69 %)	20,132 (1.42 %)	n/a	42.23 (99.95 %)	0 (0 %)	2,299 (0.05 %)	1,857 (100.00 %)	5,060,487 (30.71 %)	1,258,073 (2.85 %)	14,007,098 (32.99 %)	1 (0.00 %)	568,416 (1.60 %)	23,456 (0.67 %)	19,779 (0.50 %)
672	white-tailed deer (Illinois 20LAN1187 2024) GCF_023699985.2	68,660 (3.60 %)	n/a	19,951 (1.73 %)	21,804 (1.48 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	237 (0.00 %)	294 (0.00 %)	718 (100.00 %)	4,512,173 (43.10 %)	402,481 (1.14 %)	12,813,223 (37.56 %)	0 (0 %)	544,080 (1.60 %)	45,863 (1.30 %)	41,250 (1.17 %)
673	white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq) GCF_002102435.1	57,787 (2.93 %)	n/a	20,661 (1.75 %)	23,085 (1.50 %)	40,987 (1.94 %)	41.55 (99.10 %)	31,627 (0.90 %)	107,058 (0.91 %)	48,653 (99.10 %)	4,800,704 (41.29 %)	413,129 (2.59 %)	13,296,779 (34.22 %)	7,681 (0.08 %)	439,019 (2.88 %)	44,165 (1.19 %)	41,200 (1.10 %)
674	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022) GCA_024140225.1	n/a	n/a	12,198 (1.10 %)	18,494 (1.29 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	26 (0.00 %)	26 (0.00 %)	14,841 (100.00 %)	1,725,021 (17.81 %)	802,415 (4.26 %)	8,321,474 (45.72 %)	0 (0 %)	653,092 (2.79 %)	15,669 (0.79 %)	13,175 (0.55 %)
675	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022) GCF_024139225.1	40,430 (1.81 %)	n/a	17,575 (1.21 %)	21,880 (1.35 %)	47,496 (1.55 %)	39.81 (99.57 %)	0 (0 %)	1,010 (0.43 %)	147 (100.00 %)	2,846,063 (18.57 %)	1,252,362 (3.89 %)	13,776,063 (46.50 %)	14 (0.00 %)	1,059,317 (2.87 %)	24,589 (0.78 %)	20,877 (0.55 %)
676	wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020) GCF_009834535.1	70,235 (4.11 %)	n/a	18,202 (1.93 %)	20,199 (1.66 %)	42,728 (2.35 %)	41.66 (99.99 %)	0 (0 %)	2,345 (0.01 %)	2,043 (100.00 %)	3,091,018 (33.31 %)	332,720 (5.33 %)	12,161,286 (28.79 %)	5 (0.00 %)	978,328 (2.98 %)	55,524 (1.75 %)	51,693 (1.56 %)
677	wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq) GCF_000311805.1	34,726 (2.40 %)	n/a	18,746 (1.96 %)	17,104 (1.61 %)	n/a	41.28 (98.83 %)	55,538 (1.18 %)	60,971 (1.18 %)	68,872 (98.82 %)	2,991,821 (33.93 %)	353,632 (1.23 %)	12,349,615 (25.12 %)	11 (0.00 %)	101,845 (0.63 %)	45,437 (1.02 %)	41,010 (0.88 %)
678	wild goat GCA_000978405.1	n/a	n/a	19,104 (1.48 %)	16,198 (1.21 %)	n/a	41.91 (91.72 %)	279,195 (8.31 %)	279,195 (8.31 %)	368,693 (91.69 %)	5,563,294 (45.39 %)	452,402 (1.99 %)	13,802,376 (35.47 %)	3,626 (0.18 %)	791,539 (4.01 %)	41,935 (0.63 %)	35,405 (0.52 %)
679	wild yak (GX-2022 2023) GCF_027580195.1	52,505 (2.90 %)	n/a	19,278 (1.60 %)	20,813 (1.31 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	0 (0 %)	196 (0.00 %)	2,040 (100.00 %)	5,706,841 (46.71 %)	464,013 (1.82 %)	12,973,198 (41.46 %)	0 (0 %)	1,346,892 (3.70 %)	42,508 (1.32 %)	39,621 (1.15 %)
680	wild yak (yakQH1 2013) GCF_000298355.1	29,789 (1.92 %)	n/a	19,936 (1.62 %)	19,914 (1.32 %)	n/a	41.71 (95.48 %)	192,006 (4.54 %)	192,006 (4.54 %)	233,198 (95.46 %)	5,348,663 (46.08 %)	449,880 (1.38 %)	13,572,902 (36.62 %)	139 (0.01 %)	753,906 (2.31 %)	41,147 (0.82 %)	37,405 (0.73 %)
681	woodchuck (v1.1 L192 2022) GCF_021218885.2	68,030 (3.47 %)	n/a	19,116 (1.55 %)	21,017 (1.38 %)	n/a	39.92 (100.00 %)	47 (0.00 %)	47 (0.00 %)	3,380 (100.00 %)	5,285,788 (43.20 %)	912,552 (2.73 %)	14,538,866 (35.15 %)	0 (0 %)	413,178 (1.33 %)	36,914 (1.02 %)	26,813 (0.66 %)
682	woodland dormouse GCA_004027655.1	n/a	n/a	23,556 (1.09 %)	55,517 (1.33 %)	n/a	41.52 (99.86 %)	15,691 (0.06 %)	15,691 (0.06 %)	1,283,630 (99.94 %)	7,674,195 (34.99 %)	1,698,258 (3.76 %)	13,705,886 (42.23 %)	20 (0.00 %)	n/a	68,562 (1.41 %)	46,064 (0.97 %)
683	woodland thicket rat GCF_004785775.1	43,129 (2.40 %)	n/a	22,710 (2.13 %)	21,042 (1.49 %)	n/a	41.17 (98.57 %)	0 (0 %)	76,623 (1.44 %)	23,656 (100.00 %)	4,732,544 (38.04 %)	1,424,025 (3.23 %)	13,549,399 (30.42 %)	5,008 (0.04 %)	449,709 (1.17 %)	18,232 (0.48 %)	16,831 (0.43 %)
684	woolly hare (The Qinghai-Tibet Plateau SH-2023 2024) GCA_036325905.1	n/a	n/a	19,363 (1.28 %)	22,239 (1.28 %)	n/a	44.08 (100.00 %)	0 (0 %)	240 (0.00 %)	112 (100.00 %)	4,432,114 (42.23 %)	966,165 (7.11 %)	13,263,822 (43.77 %)	1 (0.00 %)	1,913,575 (4.39 %)	96,755 (2.28 %)	70,154 (1.73 %)
685	Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq) GCF_003031525.2	43,310 (2.49 %)	n/a	18,747 (1.81 %)	19,638 (1.46 %)	n/a	41.28 (99.29 %)	52,647 (0.72 %)	52,647 (0.72 %)	66,343 (99.28 %)	3,547,466 (35.83 %)	540,760 (1.65 %)	12,691,756 (32.88 %)	427 (0.03 %)	363,612 (1.97 %)	59,050 (1.48 %)	55,323 (1.35 %)
686	Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq) GCF_000442215.2	26,128 (1.61 %)	n/a	18,978 (1.74 %)	20,661 (1.39 %)	n/a	41.24 (98.69 %)	123,788 (1.33 %)	123,788 (1.33 %)	148,598 (98.67 %)	3,788,303 (37.04 %)	690,288 (1.96 %)	12,841,906 (35.04 %)	292 (0.02 %)	514,620 (2.01 %)	62,458 (1.54 %)	59,005 (1.41 %)
687	yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq) GCF_047511675.1	55,299 (2.52 %)	n/a	19,502 (1.44 %)	20,297 (1.34 %)	n/a	39.90 (100.00 %)	0 (0 %)	330 (0.00 %)	813 (100.00 %)	4,038,893 (29.07 %)	978,915 (3.28 %)	14,404,633 (34.97 %)	4 (0.00 %)	446,138 (1.44 %)	36,674 (1.05 %)	27,659 (0.61 %)
688	yellow-bellied marmot (hap2 2025) GCA_047512175.1	n/a	n/a	18,677 (1.51 %)	19,370 (1.40 %)	n/a	40.03 (100.00 %)	0 (0 %)	307 (0.00 %)	329 (100.00 %)	3,694,109 (28.05 %)	793,102 (2.43 %)	13,585,913 (33.39 %)	4 (0.00 %)	351,043 (1.26 %)	33,990 (1.02 %)	26,212 (0.65 %)
689	yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019) GCF_003676075.3	42,667 (2.16 %)	n/a	19,547 (1.52 %)	21,406 (1.40 %)	n/a	39.89 (97.96 %)	34,682 (2.04 %)	35,509 (2.04 %)	66,442 (97.96 %)	3,814,223 (27.39 %)	800,865 (1.96 %)	14,323,977 (32.63 %)	1,266 (0.04 %)	210,361 (0.69 %)	34,122 (0.91 %)	26,843 (0.62 %)
690	yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021) GCF_016432865.1	47,618 (2.51 %)	n/a	15,703 (0.78 %)	16,155 (0.90 %)	n/a	36.21 (99.99 %)	0 (0 %)	620 (0.01 %)	486 (100.00 %)	5,191,383 (23.81 %)	1,269,772 (2.59 %)	21,430,585 (42.69 %)	2 (0.00 %)	714,623 (2.20 %)	28,118 (0.66 %)	28,157 (0.56 %)
691	yellow-spotted hyrax GCA_004026845.1	n/a	n/a	20,424 (0.86 %)	43,984 (1.27 %)	n/a	40.93 (99.94 %)	3,815 (0.01 %)	3,815 (0.01 %)	971,748 (99.99 %)	5,365,974 (31.41 %)	435,699 (1.22 %)	21,229,266 (45.17 %)	42 (0.00 %)	n/a	38,521 (0.68 %)	31,852 (0.55 %)
692	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023) GCA_028571685.1	n/a	n/a	17,610 (1.00 %)	20,322 (1.04 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	0 (0 %)	276 (0.00 %)	62 (100.00 %)	3,295,935 (23.58 %)	389,907 (6.37 %)	19,525,382 (45.90 %)	0 (0 %)	1,020,287 (2.23 %)	31,831 (0.63 %)	26,588 (0.47 %)
693	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023) GCA_028571665.1	n/a	n/a	16,320 (1.03 %)	20,318 (1.13 %)	n/a	40.93 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	4,169 (100.00 %)	2,911,332 (23.50 %)	347,110 (4.57 %)	17,256,419 (44.04 %)	0 (0 %)	683,195 (1.71 %)	28,674 (0.68 %)	24,228 (0.50 %)
694	Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024) GCA_043880425.1	n/a	n/a	18,352 (1.71 %)	20,233 (1.46 %)	n/a	41.73 (100.00 %)	44 (0.00 %)	196 (0.00 %)	1,530 (100.00 %)	3,466,695 (41.95 %)	934,524 (8.81 %)	11,690,112 (36.30 %)	0 (0 %)	1,908,821 (5.07 %)	35,257 (5.20 %)	27,363 (0.98 %)
695	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023) GCA_028536395.1	n/a	n/a	19,188 (1.79 %)	21,673 (1.72 %)	n/a	43.03 (100.00 %)	0 (0 %)	215 (0.00 %)	250 (100.00 %)	3,043,589 (24.76 %)	773,853 (4.49 %)	10,648,494 (37.26 %)	2 (0.00 %)	684,501 (2.39 %)	61,910 (2.52 %)	51,884 (1.68 %)
696	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 refseq) GCF_028538775.1	48,707 (3.25 %)	n/a	18,807 (1.93 %)	21,046 (1.76 %)	n/a	43.22 (100.00 %)	209 (0.00 %)	209 (0.00 %)	684 (100.00 %)	3,552,235 (38.46 %)	719,552 (4.26 %)	10,089,365 (36.35 %)	0 (0 %)	648,904 (2.37 %)	60,974 (2.61 %)	54,521 (2.25 %)
697	zebu cattle (Hainan HN024 2024) GCA_039881165.1	n/a	n/a	19,162 (1.53 %)	20,991 (1.34 %)	n/a	41.77 (99.99 %)	0 (0 %)	350 (0.01 %)	292 (100.00 %)	3,296,209 (23.14 %)	440,574 (1.28 %)	12,824,144 (40.98 %)	0 (0 %)	1,191,569 (3.42 %)	39,400 (1.07 %)	35,669 (0.87 %)
698	zebu cattle (Nelore 2014 refseq) GCF_000247795.1	39,830 (2.52 %)	n/a	18,603 (1.59 %)	18,779 (1.29 %)	n/a	41.75 (92.62 %)	253,738 (7.41 %)	6,941,272 (7.66 %)	253,770 (92.59 %)	5,119,428 (46.84 %)	358,908 (0.88 %)	13,431,672 (36.60 %)	476 (0.01 %)	998,817 (3.00 %)	35,241 (0.84 %)	32,220 (0.75 %)
699	zebu cattle (Sahiwal x Tharparkar maternal NIAB-ARS_2022 2023) GCF_029378745.1	70,745 (4.27 %)	n/a	19,546 (1.58 %)	21,187 (1.33 %)	n/a	41.86 (100.00 %)	0 (0 %)	283 (0.00 %)	67 (100.00 %)	5,530,890 (46.61 %)	459,827 (1.43 %)	13,190,355 (41.36 %)	0 (0 %)	1,188,902 (3.30 %)	42,544 (1.21 %)	38,882 (1.11 %)
TOTALS:	total assembly count 699

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	602 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	699 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	453 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	509 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	343 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	1476 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	353 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	3961 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	14995 assemblies	assembly stats	track stats
Archaea	2663 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	21659 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	687 assemblies	assembly stats	track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project	1303 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	464 assemblies	assembly stats	track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center	5058 assemblies	assembly stats	track stats

Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

See also: hub access, assembly statistics

Data resource links