Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 aardvark (hap1 2026)
GCA_054668785.1
n/a n/a 18,288
(0.81 %)
20,681
(0.76 %)
n/a 40.40
(100.00 %)
0
(0 %)
121
(0.00 %)
354
(100.00 %)
10,530,628
(70.06 %)
890,633
(3.80 %)
19,549,882
(59.96 %)
0
(0 %)
2,125,530
(3.76 %)
36,422
(1.04 %)
41,547
(0.56 %)
2 aardvark (hap2 2026)
GCA_054668755.1
n/a n/a 17,455
(0.85 %)
18,974
(0.77 %)
n/a 40.25
(100.00 %)
0
(0 %)
89
(0.00 %)
269
(100.00 %)
9,589,258
(69.56 %)
812,088
(2.92 %)
18,264,020
(58.96 %)
1
(0.00 %)
n/a 31,668
(0.72 %)
30,612
(0.48 %)
3 aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad)
GCF_000298275.1
25,594
(1.08 %)
n/a 18,351
(1.06 %)
20,358
(0.98 %)
n/a 40.07
(76.89 %)
411,144
(23.15 %)
411,144
(23.15 %)
433,653
(76.85 %)
n/a 536,700
(0.74 %)
18,176,790
(39.08 %)
3,595
(0.03 %)
723,185
(1.16 %)
26,235
(0.40 %)
24,645
(0.35 %)
4 African grass rat (maternal 2020)
GCA_011750645.1
n/a n/a 20,916
(2.01 %)
19,513
(1.43 %)
n/a 41.37
(98.89 %)
0
(0 %)
1,526
(1.11 %)
1,610
(100.00 %)
4,928,847
(37.45 %)
1,652,295
(5.20 %)
13,507,965
(32.27 %)
0
(0 %)
1,023,525
(1.96 %)
17,712
(0.51 %)
16,897
(0.46 %)
5 African grass rat (paternal 2020)
GCA_011762545.1
n/a n/a 20,796
(2.00 %)
19,611
(1.43 %)
n/a 41.42
(97.70 %)
0
(0 %)
1,563
(2.30 %)
1,740
(100.00 %)
4,904,243
(37.25 %)
1,672,608
(5.37 %)
13,465,246
(32.19 %)
1
(0.00 %)
1,034,950
(2.07 %)
17,677
(0.50 %)
16,772
(0.46 %)
6 African grass rat (v1 paternal X 2020 refseq)
GCF_011762505.1
45,963
(2.46 %)
n/a 20,878
(1.99 %)
19,613
(1.43 %)
37,929
(2.32 %)
41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,595
(100.00 %)
4,939,557
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,429
(32.71 %)
2
(0.00 %)
1,065,249
(2.09 %)
17,767
(0.51 %)
16,852
(0.46 %)
7 African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank)
GCA_011762505.2
n/a n/a 19,637
(1.95 %)
19,610
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
5,399,465
(42.90 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
2
(0.00 %)
979,697
(2.05 %)
17,767
(0.51 %)
15,566
(0.42 %)
8 African grass rat (v2 paternal X 2025 refseq)
GCF_011762505.2
70,837
(3.51 %)
n/a 19,640
(1.95 %)
19,607
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,595
(100.00 %)
5,625,390
(42.96 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,612,806
(32.71 %)
2
(0.00 %)
855,406
(1.69 %)
17,767
(0.51 %)
15,567
(0.42 %)
9 African grass rat (v3 paternal hap 2024)
GCA_011762505.3
n/a n/a 20,986
(2.01 %)
19,611
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,532,782
(33.95 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,612,916
(32.71 %)
2
(0.00 %)
1,064,933
(2.09 %)
17,767
(0.51 %)
16,931
(0.46 %)
10 African hunting dog
GCA_001887905.1
n/a n/a 18,956
(1.75 %)
17,562
(1.41 %)
n/a 40.98
(92.89 %)
0
(0 %)
1,415,298
(7.28 %)
803
(100.00 %)
4,458,183
(39.99 %)
658,637
(1.13 %)
13,671,493
(28.24 %)
854
(0.01 %)
288,980
(0.71 %)
47,644
(1.64 %)
45,393
(1.41 %)
11 African hunting dog (LycPic1hap1 2024)
GCA_040955645.1
n/a n/a 18,688
(1.61 %)
19,670
(1.44 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
1
(0.00 %)
82
(0.00 %)
86
(100.00 %)
4,281,139
(31.62 %)
959,378
(2.78 %)
12,859,760
(32.95 %)
1
(0.00 %)
632,917
(1.70 %)
49,122
(2.32 %)
45,729
(1.55 %)
12 African hunting dog (LycPic1hap2 2024)
GCA_040955705.1
n/a n/a 19,463
(1.58 %)
20,378
(1.42 %)
n/a 41.30
(100.00 %)
1
(0.00 %)
91
(0.00 %)
77
(100.00 %)
4,513,580
(32.16 %)
1,008,611
(2.91 %)
13,570,452
(33.71 %)
2
(0.00 %)
686,092
(1.77 %)
50,954
(2.21 %)
46,966
(1.51 %)
13 African savanna elephant (2009 refseq)
GCF_000001905.1
46,043
(2.30 %)
n/a 19,169
(1.26 %)
19,664
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,363,315
(57.54 %)
365,797
(0.88 %)
16,073,053
(44.89 %)
11
(0.00 %)
417,291
(1.06 %)
33,513
(0.68 %)
24,503
(0.51 %)
14 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1
n/a n/a 18,845
(1.07 %)
22,426
(1.10 %)
n/a 41.34
(99.85 %)
169
(0.15 %)
169
(0.15 %)
1,253
(99.85 %)
4,406,744
(29.55 %)
925,868
(4.71 %)
15,966,881
(50.49 %)
0
(0 %)
1,248,627
(2.71 %)
68,531
(1.61 %)
23,142
(0.47 %)
15 African savanna elephant (hap2 2023 genbank)
GCA_030014295.1
n/a n/a 18,981
(1.10 %)
22,759
(1.12 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
0
(0 %)
231
(0.10 %)
880
(100.00 %)
4,426,756
(29.95 %)
832,908
(4.08 %)
16,118,910
(49.47 %)
1
(0.00 %)
1,082,958
(2.38 %)
62,315
(1.49 %)
23,783
(0.48 %)
16 African savanna elephant (hap2 2023 refseq)
GCF_030014295.1
64,034
(3.35 %)
n/a 18,980
(1.10 %)
21,593
(1.06 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
0
(0 %)
231
(0.10 %)
879
(100.00 %)
4,426,749
(29.95 %)
832,904
(4.08 %)
16,118,888
(49.47 %)
1
(0.00 %)
1,082,957
(2.38 %)
62,314
(1.49 %)
23,783
(0.48 %)
17 African soft-furred rat (Lowveld savanna grassland N552 2022)
GCA_021653895.1
n/a n/a 20,232
(2.08 %)
18,517
(1.32 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,311
(100.00 %)
5,083,017
(39.13 %)
1,337,200
(3.02 %)
13,402,561
(30.35 %)
0
(0 %)
432,162
(1.35 %)
17,841
(0.51 %)
15,654
(0.45 %)
18 African soft-furred rat (MVZ Mamm 221054 2021)
GCA_019843795.1
n/a n/a 26,123
(1.59 %)
49,154
(1.23 %)
n/a 41.38
(99.06 %)
92,030
(0.93 %)
92,030
(0.93 %)
412,491
(99.07 %)
5,251,146
(37.28 %)
1,541,020
(3.13 %)
13,613,713
(32.35 %)
7,441
(0.10 %)
n/a 21,054
(0.58 %)
19,246
(0.53 %)
19 agile gracile mouse opossum
GCF_016433145.1
30,697
(1.32 %)
n/a 17,361
(0.78 %)
17,596
(0.81 %)
n/a 37.86
(91.75 %)
0
(0 %)
85,142
(8.25 %)
60,714
(100.00 %)
7,917,577
(49.04 %)
1,054,566
(1.57 %)
22,701,659
(37.69 %)
3,920
(0.14 %)
434,964
(1.27 %)
27,301
(0.49 %)
25,777
(0.43 %)
20 Allen's wood mouse (MVZ Mamm 196246 2021)
GCA_019843855.1
n/a n/a 22,687
(1.16 %)
46,299
(0.94 %)
n/a 41.37
(99.72 %)
75,967
(0.24 %)
75,967
(0.24 %)
659,537
(99.76 %)
6,139,432
(45.57 %)
1,339,550
(3.13 %)
12,293,115
(32.34 %)
6,671
(0.10 %)
n/a 16,575
(0.44 %)
15,096
(0.40 %)
21 alpaca (2025)
GCF_048564905.1
80,233
(3.11 %)
n/a 18,667
(1.53 %)
23,043
(1.52 %)
n/a 41.92
(99.91 %)
0
(0 %)
681
(0.09 %)
519
(100.00 %)
3,387,094
(33.34 %)
395,581
(10.22 %)
11,510,740
(36.96 %)
5
(0.00 %)
727,944
(2.17 %)
72,497
(1.98 %)
52,064
(1.17 %)
22 alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.4
54,987
(3.56 %)
n/a 18,439
(1.93 %)
18,426
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
0
(0 %)
166,272
(4.17 %)
77,389
(100.00 %)
3,004,413
(33.17 %)
315,092
(1.36 %)
12,458,272
(24.89 %)
1,213
(0.03 %)
207,593
(1.22 %)
54,502
(1.38 %)
49,907
(1.20 %)
23 Alpine marmot (2019)
GCF_001458135.2
69,587
(3.43 %)
n/a 19,047
(1.54 %)
17,768
(1.39 %)
n/a 39.80
(96.13 %)
0
(0 %)
88,858
(3.88 %)
14,031
(100.00 %)
3,726,252
(26.48 %)
746,953
(1.83 %)
14,066,368
(30.30 %)
494
(0.01 %)
202,554
(0.77 %)
30,191
(0.63 %)
24,232
(0.48 %)
24 Alston's brown mouse (SKS-2025a 2025)
GCA_049901635.1
n/a 38,437
(1.69 %)
19,201
(1.73 %)
20,397
(1.45 %)
n/a 41.54
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,689
(100.00 %)
6,399,518
(45.04 %)
1,172,526
(4.32 %)
13,154,869
(32.85 %)
0
(0 %)
801,643
(2.07 %)
17,916
(0.51 %)
16,290
(0.45 %)
25 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1
n/a n/a 19,086
(1.55 %)
22,040
(1.52 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,182
(0.01 %)
1,182
(0.01 %)
1,369
(99.99 %)
3,846,728
(31.78 %)
639,852
(2.90 %)
11,937,936
(38.98 %)
24
(0.00 %)
819,376
(2.67 %)
75,377
(2.21 %)
66,761
(1.68 %)
26 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1
n/a n/a 18,980
(1.50 %)
22,394
(1.50 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
326
(100.00 %)
3,896,863
(31.56 %)
659,711
(4.74 %)
11,945,162
(40.81 %)
3
(0.00 %)
979,504
(2.79 %)
76,769
(2.57 %)
66,591
(1.63 %)
27 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1
n/a n/a 19,066
(1.48 %)
22,356
(1.48 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
287
(100.00 %)
3,908,607
(31.48 %)
664,931
(5.23 %)
11,892,191
(41.08 %)
1
(0.00 %)
994,645
(2.87 %)
76,453
(2.43 %)
66,568
(1.61 %)
28 Amazon manatee (hap1 2025)
GCA_046562985.1
n/a n/a 17,917
(1.26 %)
20,499
(1.11 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
0
(0 %)
377
(0.00 %)
550
(100.00 %)
5,812,915
(56.93 %)
431,488
(2.57 %)
14,336,638
(47.98 %)
1
(0.00 %)
593,346
(1.52 %)
33,775
(0.84 %)
28,206
(0.66 %)
29 Amazon manatee (hap2 2025)
GCA_046562895.1
n/a 48,414
(2.36 %)
18,949
(1.23 %)
21,655
(1.08 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
294
(0.00 %)
401
(100.00 %)
6,218,266
(57.31 %)
470,437
(3.04 %)
15,241,157
(48.91 %)
1
(0.00 %)
714,873
(1.68 %)
37,124
(0.86 %)
30,784
(0.66 %)
30 American beaver (hap1 2025)
GCA_047511655.1
n/a n/a 19,828
(1.45 %)
20,376
(1.31 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
1
(0.00 %)
181
(0.00 %)
503
(100.00 %)
4,030,880
(35.35 %)
566,770
(2.63 %)
14,198,970
(35.24 %)
9
(0.00 %)
640,099
(2.12 %)
24,454
(0.96 %)
23,257
(0.88 %)
31 American beaver (hap1v2 2025)
GCA_047511655.2
n/a n/a 19,759
(1.46 %)
19,656
(1.23 %)
n/a 39.67
(100.00 %)
0
(0 %)
181
(0.00 %)
182
(100.00 %)
4,077,829
(35.51 %)
563,159
(2.55 %)
14,502,350
(35.45 %)
9
(0.00 %)
635,015
(2.11 %)
23,983
(0.89 %)
22,786
(0.80 %)
32 American beaver (hap2 2025)
GCA_047511605.1
n/a n/a 19,144
(1.44 %)
18,959
(1.23 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
1
(0.00 %)
194
(0.00 %)
229
(100.00 %)
3,981,637
(35.85 %)
561,691
(2.26 %)
14,374,940
(35.03 %)
6
(0.00 %)
576,331
(1.99 %)
23,386
(0.80 %)
22,058
(0.72 %)
33 American beaver (hap2v2 2025)
GCA_047511605.2
n/a n/a 19,115
(1.44 %)
18,756
(1.21 %)
n/a 39.53
(100.00 %)
1
(0.00 %)
194
(0.00 %)
154
(100.00 %)
4,032,632
(35.91 %)
560,508
(2.24 %)
14,349,713
(35.01 %)
6
(0.00 %)
574,426
(1.98 %)
23,225
(0.77 %)
21,898
(0.70 %)
34 American beaver (mCasCan1.hap1v2 2025)
GCF_047511655.1
79,343
(3.55 %)
n/a 19,759
(1.46 %)
19,920
(1.23 %)
n/a 39.67
(100.00 %)
0
(0 %)
181
(0.00 %)
181
(100.00 %)
4,023,733
(35.50 %)
563,158
(2.55 %)
14,502,226
(35.45 %)
9
(0.00 %)
635,015
(2.11 %)
23,983
(0.89 %)
22,786
(0.80 %)
35 American beaver (Ward 2017 refseq)
GCF_001984765.1
40,013
(2.15 %)
n/a 20,867
(1.53 %)
24,201
(1.33 %)
n/a 39.72
(99.99 %)
0
(0 %)
3,321
(0.01 %)
21,157
(100.00 %)
4,526,430
(33.75 %)
486,353
(1.30 %)
14,347,145
(31.96 %)
19
(0.00 %)
463,382
(1.20 %)
23,046
(0.72 %)
22,461
(0.67 %)
36 American bison (2014 refseq)
GCF_000754665.1
38,699
(2.34 %)
n/a 19,782
(1.47 %)
20,444
(1.25 %)
n/a 41.82
(93.12 %)
341,984
(6.92 %)
341,984
(6.92 %)
470,415
(93.08 %)
n/a 419,596
(0.95 %)
13,519,877
(37.66 %)
8,184
(0.08 %)
n/a 60,388
(1.03 %)
36,362
(0.64 %)
37 American black bear (L20-20 2025 refseq)
GCF_024610735.1
62,897
(3.86 %)
n/a 18,085
(1.59 %)
21,360
(1.46 %)
n/a n/a 0
(0 %)
41
(0.00 %)
297
(100.00 %)
4,678,918
(45.94 %)
642,273
(5.89 %)
13,210,460
(35.54 %)
0
(0 %)
996,230
(3.22 %)
68,975
(3.00 %)
52,798
(1.40 %)
38 American black bear (L20-20 alternate hap 2022)
GCA_024610745.1
n/a n/a 22,502
(1.17 %)
43,431
(1.28 %)
n/a 43.14
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 77,311
(100.00 %)
4,587,986
(32.30 %)
773,829
(6.39 %)
14,594,034
(35.67 %)
0
(0 %)
1,078,790
(3.25 %)
78,849
(3.32 %)
57,618
(1.17 %)
39 American black bear (v1 L20-20 primary hap 2022 genbank)
GCA_024610735.1
n/a n/a 18,458
(1.52 %)
21,049
(1.43 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
0
(0 %)
22
(0.00 %)
317
(100.00 %)
4,000,508
(32.69 %)
641,903
(5.91 %)
13,210,530
(35.54 %)
0
(0 %)
996,585
(3.22 %)
68,981
(3.00 %)
52,140
(1.23 %)
40 American black bear (v2 L20-20 2025 genbank)
GCA_024610735.2
n/a n/a 18,082
(1.59 %)
20,977
(1.43 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
0
(0 %)
41
(0.00 %)
298
(100.00 %)
4,773,058
(45.96 %)
641,956
(5.91 %)
13,210,521
(35.54 %)
0
(0 %)
996,230
(3.22 %)
68,976
(3.00 %)
52,798
(1.40 %)
41 American black bear (UA15103 2021)
GCF_020975775.1
53,916
(3.11 %)
n/a 18,840
(1.73 %)
20,969
(1.50 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,213
(100.00 %)
3,936,528
(34.53 %)
594,864
(2.90 %)
13,725,005
(32.35 %)
0
(0 %)
629,590
(1.78 %)
62,580
(1.91 %)
56,387
(1.69 %)
42 American mink (2018)
GCA_900108605.1
n/a n/a 18,686
(1.70 %)
20,016
(1.50 %)
36,997
(1.74 %)
41.60
(92.95 %)
154,172
(7.07 %)
154,172
(7.07 %)
161,347
(92.93 %)
4,350,343
(38.70 %)
606,128
(1.17 %)
13,605,797
(28.74 %)
2,225
(0.02 %)
334,330
(1.15 %)
54,199
(1.98 %)
53,125
(1.77 %)
43 American mink (hap1 2024)
GCA_964106545.1
n/a n/a 19,203
(1.43 %)
22,174
(1.33 %)
n/a 42.39
(99.98 %)
0
(0 %)
2,957
(0.02 %)
435
(100.00 %)
4,188,829
(30.04 %)
802,295
(5.81 %)
14,041,290
(37.98 %)
19
(0.00 %)
1,190,442
(3.02 %)
65,430
(2.64 %)
54,362
(1.78 %)
44 American mink (hap2 2024)
GCA_964106205.1
n/a n/a 18,890
(1.43 %)
21,684
(1.33 %)
n/a 42.35
(99.98 %)
2,849
(0.02 %)
2,849
(0.02 %)
3,200
(99.98 %)
4,158,563
(30.22 %)
786,430
(5.25 %)
13,845,377
(37.58 %)
10
(0.00 %)
1,137,591
(2.93 %)
64,307
(2.75 %)
53,505
(1.79 %)
45 American mink (M4711 2021 Dalhousie U)
GCF_020171115.1
50,253
(2.26 %)
n/a 18,949
(1.49 %)
20,914
(1.29 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 183
(100.00 %)
4,705,680
(39.15 %)
795,684
(5.50 %)
14,085,357
(37.99 %)
0
(0 %)
1,135,030
(2.90 %)
63,307
(2.38 %)
63,004
(2.19 %)
46 American mink (M4711 2021)
GCA_020171115.1
n/a n/a 18,487
(1.48 %)
20,915
(1.29 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 182
(100.00 %)
5,389,046
(47.85 %)
795,680
(5.50 %)
14,085,303
(37.99 %)
0
(0 %)
1,135,044
(2.90 %)
63,306
(2.38 %)
52,680
(1.84 %)
47 American pika (hap1 2023 genbank)
GCA_030435755.1
n/a n/a 17,835
(1.28 %)
23,188
(1.49 %)
n/a n/a 0
(0 %)
432
(0.00 %)
5,865
(100.00 %)
3,094,189
(27.70 %)
629,412
(15.71 %)
11,100,896
(42.69 %)
18
(0.00 %)
1,888,432
(5.34 %)
60,350
(1.67 %)
29,283
(0.97 %)
48 American pika (hap1 2023 refseq)
GCF_030435755.1
45,008
(1.93 %)
n/a 17,997
(1.35 %)
23,185
(1.49 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
0
(0 %)
432
(0.00 %)
5,864
(100.00 %)
4,126,248
(43.60 %)
628,344
(15.71 %)
11,100,962
(42.69 %)
18
(0.00 %)
1,888,430
(5.34 %)
60,350
(1.67 %)
30,970
(1.18 %)
49 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1
n/a n/a 16,911
(1.23 %)
21,107
(1.43 %)
n/a 44.43
(100.00 %)
6
(0.00 %)
375
(0.00 %)
6,123
(100.00 %)
1,808,768
(10.42 %)
561,106
(21.05 %)
10,283,513
(45.97 %)
16
(0.00 %)
2,348,969
(6.68 %)
54,919
(1.33 %)
26,689
(0.79 %)
50 American pika 3.0 (2012 Broad refseq)
GCF_000292845.1
26,240
(1.93 %)
n/a 17,576
(1.61 %)
20,076
(1.70 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
122,542
(12.82 %)
132,962
(87.18 %)
2,761,257
(29.47 %)
414,896
(1.07 %)
10,968,698
(26.71 %)
1,958
(0.04 %)
269,478
(1.11 %)
44,652
(1.14 %)
26,757
(0.80 %)
51 American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020)
GCF_014633375.1
31,887
(1.92 %)
n/a 17,532
(1.60 %)
19,609
(1.65 %)
n/a 43.35
(87.14 %)
0
(0 %)
124,941
(12.88 %)
9,351
(100.00 %)
2,827,662
(29.77 %)
414,980
(1.07 %)
10,969,165
(26.69 %)
1,976
(0.04 %)
271,948
(1.12 %)
44,743
(1.13 %)
26,798
(0.80 %)
52 American red squirrel (v2 hap1 2026)
GCA_057930835.1
n/a n/a 20,538
(0.79 %)
28,853
(0.92 %)
n/a 39.25
(100.00 %)
0
(0 %)
426
(0.00 %)
489
(100.00 %)
9,215,331
(50.80 %)
1,317,907
(3.34 %)
26,748,417
(47.09 %)
1
(0.00 %)
1,374,869
(1.91 %)
55,960
(0.71 %)
48,366
(0.60 %)
53 American red squirrel (v2 hap2 2026)
GCA_057931055.1
n/a n/a 19,151
(0.81 %)
26,172
(0.93 %)
n/a 39.26
(100.00 %)
0
(0 %)
468
(0.00 %)
426
(100.00 %)
8,342,035
(49.80 %)
1,194,845
(3.33 %)
24,234,438
(46.10 %)
0
(0 %)
1,037,244
(1.61 %)
49,136
(0.69 %)
42,145
(0.57 %)
54 American red squirrel (v3 hap1 2026)
GCA_057657825.1
n/a n/a 22,076
(0.75 %)
28,760
(0.85 %)
n/a 39.63
(100.00 %)
0
(0 %)
191
(0.00 %)
141
(100.00 %)
9,677,339
(48.50 %)
1,456,018
(3.67 %)
23,033,952
(52.86 %)
3
(0.00 %)
1,206,915
(1.62 %)
60,291
(0.74 %)
53,034
(0.58 %)
55 American red squirrel (v3 hap2 2026)
GCA_057657875.1
n/a n/a 20,617
(0.79 %)
28,522
(0.91 %)
n/a 39.48
(100.00 %)
0
(0 %)
194
(0.00 %)
96
(100.00 %)
9,339,714
(48.88 %)
1,335,432
(3.43 %)
25,390,192
(47.00 %)
3
(0.00 %)
1,101,163
(1.57 %)
59,575
(0.75 %)
52,408
(0.65 %)
56 American wolverine (FN33715 2022)
GCA_024509225.1
n/a 9,758
(0.77 %)
18,360
(1.57 %)
20,615
(1.47 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
53
(0.00 %)
53
(0.00 %)
758
(100.00 %)
4,038,995
(32.25 %)
664,825
(1.25 %)
13,625,080
(33.05 %)
0
(0 %)
485,617
(1.31 %)
56,595
(2.13 %)
52,911
(1.70 %)
57 Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq)
GCF_000464555.1
33,681
(2.23 %)
n/a 17,929
(1.49 %)
15,090
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
155,553
(2.44 %)
157,032
(97.56 %)
n/a 831,136
(1.67 %)
13,654,437
(31.78 %)
59
(0.00 %)
289,892
(0.97 %)
65,229
(1.60 %)
56,194
(1.22 %)
58 Angolan free-tailed bat
GCA_043748645.2
n/a n/a 18,321
(1.73 %)
23,033
(1.67 %)
n/a 42.90
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
34
(100.00 %)
4,324,378
(43.44 %)
558,565
(2.08 %)
11,330,414
(35.72 %)
0
(0 %)
670,463
(2.01 %)
103,798
(3.90 %)
94,418
(3.14 %)
59 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024)
GCA_043748645.1
n/a n/a 18,528
(1.65 %)
22,359
(1.64 %)
n/a 42.89
(100.00 %)
6
(0.00 %)
88
(0.00 %)
44
(100.00 %)
3,531,044
(35.70 %)
555,304
(2.07 %)
11,439,853
(36.03 %)
0
(0 %)
663,932
(1.99 %)
102,112
(3.75 %)
92,727
(2.81 %)
60 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa alternate hap 2024)
GCA_043748605.1
n/a n/a 17,996
(1.77 %)
23,084
(1.76 %)
n/a 43.12
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,670
(100.00 %)
4,087,571
(42.52 %)
525,056
(2.00 %)
10,779,134
(34.81 %)
0
(0 %)
577,573
(1.82 %)
100,610
(3.93 %)
91,755
(3.14 %)
61 Angus cow (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2
n/a n/a 19,096
(1.59 %)
20,674
(1.34 %)
n/a 41.99
(99.75 %)
0
(0 %)
277
(0.25 %)
1,435
(100.00 %)
5,290,422
(47.51 %)
478,946
(1.94 %)
12,568,313
(41.15 %)
0
(0 %)
1,196,258
(3.44 %)
45,850
(1.37 %)
36,573
(1.00 %)
62 Antarctic minke whale
GCA_000978805.1
n/a n/a 23,312
(1.49 %)
45,535
(1.26 %)
n/a 40.73
(99.37 %)
299,456
(0.64 %)
299,456
(0.64 %)
720,900
(99.36 %)
4,011,313
(41.13 %)
504,837
(1.04 %)
13,553,641
(30.96 %)
200
(0.00 %)
66,191
(0.20 %)
56,223
(1.31 %)
44,709
(1.10 %)
63 Antillean ghost-faced bat
GCA_004026545.1
n/a n/a 20,088
(1.74 %)
31,558
(1.63 %)
n/a 41.74
(99.97 %)
1,835
(0.01 %)
1,835
(0.01 %)
207,094
(99.99 %)
3,025,044
(30.67 %)
332,606
(0.70 %)
12,504,556
(28.79 %)
7
(0.00 %)
n/a 65,503
(2.30 %)
62,089
(2.01 %)
64 aoudad
GCA_002201775.1
n/a n/a 19,905
(1.62 %)
27,488
(1.60 %)
n/a 42.01
(95.96 %)
186,672
(4.05 %)
186,672
(4.05 %)
263,992
(95.95 %)
5,418,013
(45.05 %)
471,426
(1.19 %)
13,396,252
(36.94 %)
4,983
(0.03 %)
648,031
(1.83 %)
48,844
(1.32 %)
44,082
(1.20 %)
65 Arabian camel (Drom800 2019 refseq)
GCF_000803125.2
64,532
(3.85 %)
n/a 18,483
(1.89 %)
20,554
(1.62 %)
n/a 41.51
(99.22 %)
0
(0 %)
47,342
(0.79 %)
21,070
(100.00 %)
3,233,022
(34.07 %)
345,049
(1.55 %)
13,383,050
(26.19 %)
87
(0.01 %)
348,169
(1.51 %)
58,872
(1.79 %)
54,784
(1.59 %)
66 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1
n/a n/a 17,085
(1.73 %)
19,317
(1.59 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
0
(0 %)
210
(0.00 %)
173
(100.00 %)
2,818,446
(29.44 %)
316,646
(8.90 %)
11,192,133
(31.47 %)
1
(0.00 %)
1,151,809
(3.75 %)
52,135
(1.67 %)
44,943
(1.23 %)
67 Arabian camel (paternal hap 2024 genbank)
GCA_036321535.1
n/a n/a 18,080
(1.66 %)
20,345
(1.52 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
0
(0 %)
195
(0.00 %)
172
(100.00 %)
3,040,473
(29.22 %)
343,482
(10.93 %)
11,797,012
(33.50 %)
2
(0.00 %)
1,611,842
(4.73 %)
55,428
(1.61 %)
47,478
(1.18 %)
68 Arabian camel (paternal hap 2024 refseq)
GCF_036321535.1
62,940
(3.46 %)
n/a 18,078
(1.66 %)
21,071
(1.56 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
0
(0 %)
195
(0.00 %)
171
(100.00 %)
3,040,467
(29.22 %)
343,480
(10.93 %)
11,796,955
(33.50 %)
2
(0.00 %)
1,611,842
(4.73 %)
55,427
(1.61 %)
47,478
(1.18 %)
69 Arctic fox (Blue_001 2021 refseq)
GCF_018345385.1
60,759
(3.11 %)
n/a 19,942
(1.72 %)
19,529
(1.38 %)
n/a 41.27
(100.00 %)
0
(0 %)
529
(0.00 %)
929
(100.00 %)
4,821,229
(41.22 %)
1,006,124
(2.31 %)
13,556,149
(32.92 %)
1
(0.00 %)
686,539
(2.19 %)
49,997
(2.23 %)
50,342
(1.99 %)
70 Arctic ground squirrel (AGS 11-09-20 2018)
GCF_003426925.1
39,569
(2.25 %)
n/a 18,954
(1.74 %)
19,372
(1.45 %)
n/a 39.95
(89.51 %)
0
(0 %)
2,429,461
(10.59 %)
15,883
(100.00 %)
4,400,304
(32.67 %)
672,831
(1.50 %)
13,913,477
(26.41 %)
1,383
(0.11 %)
167,257
(0.60 %)
27,575
(0.72 %)
26,295
(0.67 %)
71 Arctic ground squirrel (hap1 2024)
GCA_045843805.1
n/a n/a 20,255
(1.35 %)
21,401
(1.44 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
0
(0 %)
694
(0.00 %)
2,530
(100.00 %)
4,287,108
(25.85 %)
895,123
(5.96 %)
15,722,314
(36.45 %)
3
(0.00 %)
1,383,542
(4.24 %)
34,781
(0.82 %)
29,107
(0.60 %)
72 Arctic ground squirrel (hap2 2024)
GCA_045843765.1
n/a n/a 18,385
(1.31 %)
19,099
(1.34 %)
n/a 39.97
(100.00 %)
0
(0 %)
590
(0.00 %)
2,307
(100.00 %)
4,314,945
(35.63 %)
820,736
(6.65 %)
14,490,422
(35.95 %)
2
(0.00 %)
1,426,241
(3.70 %)
31,201
(0.78 %)
25,818
(0.56 %)
73 Arctic ground squirrel (mUroPar1hap1 2024)
GCF_045843805.1
45,939
(2.00 %)
n/a 19,773
(1.41 %)
20,880
(1.28 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
0
(0 %)
694
(0.00 %)
2,529
(100.00 %)
5,291,989
(39.61 %)
895,123
(5.96 %)
15,722,212
(36.45 %)
3
(0.00 %)
1,383,542
(4.24 %)
34,781
(0.82 %)
30,632
(0.69 %)
74 Argentine brown bat (hap1 2026)
GCA_054644455.1
n/a n/a 18,052
(1.73 %)
21,405
(1.63 %)
n/a 43.75
(100.00 %)
0
(0 %)
182
(0.00 %)
128
(100.00 %)
5,245,679
(48.66 %)
977,198
(7.30 %)
10,493,417
(40.05 %)
1
(0.00 %)
1,033,812
(3.27 %)
79,568
(3.84 %)
59,300
(2.91 %)
75 Argentine brown bat (hap2 2026)
GCA_054644445.1
n/a n/a 18,052
(1.75 %)
21,190
(1.62 %)
n/a 43.67
(100.00 %)
0
(0 %)
180
(0.00 %)
86
(100.00 %)
5,220,241
(48.57 %)
944,596
(6.38 %)
10,596,184
(39.27 %)
2
(0.00 %)
906,982
(2.90 %)
79,656
(3.86 %)
59,568
(2.86 %)
76 Asian palm civet
GCA_004024585.1
n/a n/a 22,124
(1.43 %)
43,710
(1.39 %)
n/a 42.52
(99.95 %)
4,533
(0.02 %)
4,533
(0.02 %)
442,658
(99.98 %)
4,877,367
(40.32 %)
754,440
(1.35 %)
14,557,779
(32.29 %)
38
(0.00 %)
163,468
(0.41 %)
148,246
(5.67 %)
137,633
(4.25 %)
77 Asiatic brush-tailed porcupine (POm2014 2021)
GCA_016801275.1
n/a n/a 18,688
(1.73 %)
22,642
(1.64 %)
n/a 41.26
(97.24 %)
152,126
(2.77 %)
152,126
(2.77 %)
303,244
(97.23 %)
3,431,580
(28.56 %)
667,375
(2.21 %)
13,572,972
(26.90 %)
218
(0.02 %)
n/a 42,853
(1.30 %)
40,880
(1.19 %)
78 Asiatic elephant (hap1 2025)
GCA_051911825.1
n/a n/a 18,110
(1.16 %)
21,254
(1.07 %)
n/a 41.12
(100.00 %)
2
(0.00 %)
83
(0.00 %)
106
(100.00 %)
8,688,198
(60.75 %)
617,944
(3.48 %)
16,342,943
(48.24 %)
1
(0.00 %)
762,977
(1.75 %)
54,726
(1.19 %)
24,374
(0.57 %)
79 Asiatic elephant (hap2 2025)
GCA_051911805.1
n/a n/a 17,315
(1.21 %)
20,345
(1.11 %)
n/a 41.03
(99.98 %)
0
(0 %)
51
(0.02 %)
88
(100.00 %)
8,066,849
(59.94 %)
495,013
(2.47 %)
15,276,267
(46.85 %)
2
(0.00 %)
563,371
(1.40 %)
44,484
(1.08 %)
22,697
(0.59 %)
80 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1
n/a n/a 17,906
(1.18 %)
21,966
(1.14 %)
n/a 41.14
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,361
(100.00 %)
3,818,524
(29.72 %)
533,426
(3.22 %)
14,381,781
(47.30 %)
0
(0 %)
613,432
(1.61 %)
50,264
(1.15 %)
21,331
(0.51 %)
81 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1
61,202
(2.60 %)
n/a 18,887
(1.13 %)
21,194
(1.06 %)
n/a 41.14
(99.90 %)
0
(0 %)
126
(0.10 %)
64
(100.00 %)
4,358,470
(31.27 %)
663,094
(4.56 %)
16,261,778
(48.66 %)
1
(0.00 %)
851,540
(1.93 %)
69,120
(1.32 %)
23,319
(0.49 %)
82 Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020)
GCA_014523465.1
n/a n/a 19,569
(1.59 %)
21,293
(1.35 %)
n/a 41.97
(99.68 %)
0
(0 %)
257
(0.32 %)
128
(100.00 %)
5,390,761
(47.15 %)
451,837
(1.15 %)
13,157,608
(40.67 %)
0
(0 %)
983,804
(2.72 %)
44,158
(1.19 %)
39,278
(1.06 %)
83 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1
n/a n/a 18,969
(1.75 %)
20,207
(1.36 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
3
(0.00 %)
79
(0.00 %)
262
(100.00 %)
3,650,963
(38.06 %)
355,322
(2.63 %)
14,837,952
(31.37 %)
1
(0.00 %)
267,829
(0.92 %)
37,174
(1.87 %)
37,977
(1.58 %)
84 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1
n/a n/a 18,931
(1.76 %)
19,988
(1.37 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
0
(0 %)
92
(0.00 %)
193
(100.00 %)
3,632,286
(38.21 %)
350,074
(2.22 %)
14,785,531
(30.90 %)
1
(0.00 %)
254,432
(0.91 %)
36,699
(1.70 %)
36,659
(1.49 %)
85 ass (donkey Dezhou 2021)
GCF_016077325.2
84,046
(4.01 %)
n/a 18,838
(1.75 %)
20,239
(1.42 %)
69,689
(3.29 %)
41.42
(99.86 %)
0
(0 %)
1,922
(0.15 %)
50
(100.00 %)
3,840,509
(41.57 %)
319,943
(0.81 %)
14,889,114
(29.46 %)
1
(0.00 %)
180,097
(0.75 %)
41,082
(1.37 %)
38,212
(1.20 %)
86 ass (donkey Dezhou DZ240498 2026)
GCA_054375355.1
n/a n/a 18,466
(1.53 %)
21,452
(1.35 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 32
(100.00 %)
4,884,564
(46.47 %)
681,289
(5.26 %)
14,410,624
(36.71 %)
0
(0 %)
438,956
(1.37 %)
42,583
(2.97 %)
38,264
(1.11 %)
87 ass (donkey D_3611 2024)
GCF_041296235.1
92,510
(3.84 %)
n/a 18,566
(1.54 %)
21,504
(1.32 %)
n/a 42.37
(99.94 %)
0
(0 %)
7
(0.06 %)
849
(100.00 %)
3,555,052
(38.38 %)
658,645
(5.79 %)
14,242,715
(36.79 %)
1
(0.01 %)
489,643
(1.48 %)
43,875
(3.45 %)
39,831
(2.77 %)
88 ass (donkey Maral har 2015 refseq)
GCF_001305755.1
48,976
(3.12 %)
n/a 18,838
(1.78 %)
19,295
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
0
(0 %)
69,593
(1.38 %)
2,167
(100.00 %)
3,731,432
(40.84 %)
289,737
(0.96 %)
14,695,308
(28.58 %)
5,680
(0.23 %)
136,343
(0.85 %)
40,025
(1.06 %)
36,660
(0.92 %)
89 Atlantic white-sided dolphin (hap1.1 2024)
GCF_964270905.1
34,820
(1.84 %)
n/a 18,692
(1.56 %)
21,070
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,034
(0.01 %)
1,034
(0.01 %)
1,932
(99.99 %)
4,918,851
(54.26 %)
1,054,000
(10.27 %)
12,280,671
(41.92 %)
6
(0.00 %)
2,009,438
(5.51 %)
79,762
(4.08 %)
41,302
(1.17 %)
90 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024)
GCA_964270905.1
n/a n/a 18,773
(1.50 %)
21,069
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1
(0.00 %)
1,034
(0.01 %)
900
(100.00 %)
3,975,427
(35.64 %)
1,054,000
(10.27 %)
12,281,095
(41.92 %)
6
(0.00 %)
2,009,438
(5.51 %)
79,762
(4.08 %)
42,028
(1.04 %)
91 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024)
GCA_964270935.1
n/a n/a 17,961
(1.59 %)
20,087
(1.36 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
917
(0.01 %)
917
(0.01 %)
1,796
(99.99 %)
3,626,392
(35.51 %)
824,778
(7.32 %)
11,499,904
(39.18 %)
3
(0.00 %)
1,314,679
(4.17 %)
74,348
(3.46 %)
40,100
(1.09 %)
92 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1
n/a n/a 13,505
(1.03 %)
18,978
(1.47 %)
n/a 45.32
(99.98 %)
0
(0 %)
26
(0.02 %)
3,482
(100.00 %)
6,880,857
(41.88 %)
1,099,932
(7.47 %)
8,156,735
(56.68 %)
0
(0 %)
4,129,545
(10.90 %)
70,515
(2.88 %)
41,464
(1.12 %)
93 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
n/a 14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
0
(0 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
1
(0.00 %)
4,597,115
(10.42 %)
78,364
(2.73 %)
45,620
(1.05 %)
94 Australian echidna (primary hap 2020)
GCA_015852505.1
n/a n/a 14,558
(1.03 %)
19,716
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
0
(0 %)
524
(1.39 %)
311
(100.00 %)
11,576,251
(65.36 %)
1,219,765
(6.93 %)
9,488,197
(55.68 %)
1
(0.00 %)
4,597,255
(10.42 %)
78,365
(2.74 %)
53,424
(1.53 %)
95 Bactrian camel (Alxa 2014 refseq)
GCF_000767855.1
52,191
(3.64 %)
n/a 18,303
(1.98 %)
17,097
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
31,980
(0.69 %)
67,435
(99.31 %)
2,966,704
(34.06 %)
306,997
(0.95 %)
12,209,949
(25.43 %)
58
(0.01 %)
73,573
(0.41 %)
49,790
(1.25 %)
45,376
(1.09 %)
96 Bactrian camel YW-2024 2025
GCF_048773025.1
76,927
(4.47 %)
n/a 18,239
(1.57 %)
22,111
(1.51 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
0
(0 %)
127
(0.00 %)
158
(100.00 %)
3,258,307
(30.21 %)
377,352
(13.70 %)
11,533,205
(36.22 %)
1
(0.00 %)
1,968,776
(5.41 %)
65,887
(1.95 %)
48,815
(1.13 %)
97 banded mongoose
GCA_004023785.1
n/a n/a 21,568
(1.57 %)
30,427
(1.43 %)
n/a 42.00
(99.96 %)
4,510
(0.02 %)
4,510
(0.02 %)
316,874
(99.98 %)
4,768,524
(40.51 %)
684,187
(1.30 %)
13,713,756
(33.42 %)
6
(0.00 %)
227,084
(0.54 %)
78,648
(2.80 %)
76,038
(2.38 %)
98 bank vole
GCF_902806735.1
56,423
(2.99 %)
n/a 18,977
(1.71 %)
18,408
(1.50 %)
n/a 41.86
(98.62 %)
53,506
(1.39 %)
53,506
(1.39 %)
54,142
(98.61 %)
3,222,366
(21.59 %)
933,697
(2.20 %)
12,831,232
(31.50 %)
4,497
(0.04 %)
287,292
(0.90 %)
18,784
(0.42 %)
16,451
(0.36 %)
99 bank vole (2345 2026)
GCF_055000105.1
61,430
(3.61 %)
n/a 18,641
(1.83 %)
18,703
(1.51 %)
n/a 41.82
(99.31 %)
0
(0 %)
169,690
(0.72 %)
29
(100.00 %)
4,407,241
(38.94 %)
862,256
(2.01 %)
13,050,067
(29.53 %)
1,562
(0.02 %)
242,912
(0.72 %)
17,023
(0.50 %)
16,286
(0.47 %)
100 bank vole (alternate hap 2026)
GCA_982192455.1
n/a n/a 19,256
(1.62 %)
21,366
(1.49 %)
n/a 41.90
(99.96 %)
11,276
(0.04 %)
11,276
(0.04 %)
13,377
(99.96 %)
4,826,217
(40.86 %)
1,054,486
(5.70 %)
13,388,267
(35.53 %)
430
(0.02 %)
921,030
(6.35 %)
21,460
(0.81 %)
19,744
(0.62 %)
101 Bank vole (primary hap 2026 genbank)
GCA_982192425.1
n/a n/a 19,486
(1.64 %)
20,748
(1.44 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
0
(0 %)
282
(0.00 %)
189
(100.00 %)
4,753,576
(39.91 %)
1,023,408
(7.51 %)
13,554,153
(36.18 %)
6
(0.00 %)
997,654
(2.81 %)
20,512
(0.55 %)
18,705
(0.48 %)
102 bank vole (primary hap 2026 refseq)
GCF_982192425.1
65,946
(3.22 %)
n/a 19,403
(1.63 %)
20,825
(1.44 %)
n/a n/a 282
(0.00 %)
282
(0.00 %)
470
(100.00 %)
5,296,968
(43.54 %)
1,023,918
(7.50 %)
13,554,104
(36.18 %)
6
(0.00 %)
997,654
(2.81 %)
20,512
(0.55 %)
18,531
(0.47 %)
103 banner-tailed kangaroo rat
GCF_019054845.1
43,753
(1.82 %)
n/a 18,397
(1.18 %)
24,180
(1.39 %)
n/a 40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,026
(100.00 %)
5,587,719
(30.97 %)
1,363,513
(3.95 %)
12,128,920
(48.74 %)
0
(0 %)
1,518,982
(3.07 %)
36,371
(1.27 %)
31,849
(0.74 %)
104 banteng 2023
GCF_032452875.1
71,974
(3.56 %)
n/a 19,305
(1.36 %)
21,174
(1.20 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
1,518
(100.00 %)
3,344,481
(20.63 %)
1,039,571
(11.74 %)
13,031,356
(47.36 %)
1
(0.00 %)
2,790,223
(5.90 %)
73,031
(1.72 %)
36,726
(0.78 %)
105 bat A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1
n/a n/a 17,124
(1.63 %)
18,342
(1.54 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
56
(0.00 %)
187
(100.00 %)
2,597,378
(26.81 %)
332,733
(4.43 %)
10,957,327
(33.52 %)
2
(0.00 %)
406,013
(1.59 %)
63,688
(2.22 %)
49,331
(1.50 %)
106 bat C.sowelli (hap1 2025)
GCA_051307085.1
n/a n/a 18,014
(1.42 %)
20,809
(1.93 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
68
(0.00 %)
509
(100.00 %)
3,004,656
(32.84 %)
845,572
(16.12 %)
11,658,155
(41.10 %)
0
(0 %)
1,743,333
(4.38 %)
66,315
(3.59 %)
61,977
(2.14 %)
107 bat C.sowelli (hap2 2025)
GCA_051307135.1
n/a n/a 17,963
(1.56 %)
20,587
(1.76 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
0
(0 %)
58
(0.00 %)
272
(100.00 %)
2,925,013
(29.51 %)
669,006
(8.09 %)
11,656,071
(35.51 %)
0
(0 %)
753,150
(2.30 %)
66,056
(3.20 %)
62,169
(2.33 %)
108 bat G.keenani (hap1 2025)
GCA_050655435.1
n/a n/a 17,710
(1.68 %)
20,322
(1.57 %)
n/a 42.06
(100.00 %)
0
(0 %)
103
(0.00 %)
188
(100.00 %)
3,982,570
(44.25 %)
413,159
(3.00 %)
12,157,326
(33.66 %)
2
(0.00 %)
306,689
(1.15 %)
69,493
(3.54 %)
64,857
(3.47 %)
109 bat G.keenani (hap2 2025)
GCA_050655445.1
n/a n/a 17,129
(1.75 %)
19,351
(1.61 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
57
(0.00 %)
83
(100.00 %)
3,507,996
(42.55 %)
382,739
(1.78 %)
11,541,032
(32.12 %)
2
(0.00 %)
226,699
(0.91 %)
67,214
(3.68 %)
63,019
(3.69 %)
110 bat H.larvatus (alternate hap 2023)
GCA_031878685.1
n/a n/a 19,431
(1.77 %)
23,767
(1.57 %)
n/a 41.38
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
7,531
(100.00 %)
4,390,631
(44.16 %)
678,913
(4.61 %)
11,883,673
(33.41 %)
0
(0 %)
776,574
(2.63 %)
41,004
(1.20 %)
30,308
(0.96 %)
111 bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024)
GCA_043727955.1
n/a n/a 19,354
(1.74 %)
21,367
(1.51 %)
n/a 41.48
(100.00 %)
15
(0.00 %)
190
(0.00 %)
265
(100.00 %)
3,860,506
(38.95 %)
722,335
(7.13 %)
11,994,816
(35.77 %)
1
(0.00 %)
1,149,103
(3.65 %)
44,562
(1.21 %)
35,219
(1.01 %)
112 bat M.microtis (hap1 2025)
GCA_051107205.1
n/a n/a 18,403
(1.68 %)
20,606
(1.62 %)
n/a 42.65
(100.00 %)
0
(0 %)
68
(0.00 %)
190
(100.00 %)
3,101,865
(28.94 %)
356,434
(1.13 %)
11,717,214
(32.98 %)
0
(0 %)
342,547
(1.24 %)
78,560
(2.78 %)
59,662
(1.89 %)
113 bat M.microtis (hap2 2025)
GCA_051107335.1
n/a n/a 17,634
(1.72 %)
19,795
(1.66 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
0
(0 %)
64
(0.00 %)
158
(100.00 %)
2,904,392
(28.42 %)
330,754
(1.09 %)
11,070,209
(31.88 %)
0
(0 %)
283,709
(1.10 %)
74,480
(2.76 %)
57,743
(1.93 %)
114 beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020)
GCA_009917745.1
n/a n/a 19,239
(1.79 %)
22,513
(1.43 %)
35,878
(1.82 %)
41.25
(97.57 %)
26,969
(2.43 %)
27,070
(2.43 %)
52,780
(97.57 %)
4,021,599
(43.53 %)
544,323
(1.08 %)
12,738,162
(33.47 %)
1,426
(0.06 %)
346,086
(1.08 %)
59,710
(1.51 %)
43,139
(1.22 %)
115 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019)
GCF_002288925.2
59,413
(3.09 %)
n/a 18,667
(1.79 %)
20,314
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.49 %)
23,539
(1.52 %)
24,414
(1.52 %)
29,444
(98.48 %)
4,001,248
(43.73 %)
543,276
(1.11 %)
12,802,735
(34.18 %)
583
(0.02 %)
388,902
(1.70 %)
59,307
(1.53 %)
42,900
(1.24 %)
116 big brown bat (BU_THK_EF1 2012)
GCF_000308155.1
59,162
(3.17 %)
n/a 18,334
(1.94 %)
20,121
(1.78 %)
n/a 42.93
(89.41 %)
160,269
(10.62 %)
160,269
(10.62 %)
167,057
(89.38 %)
2,842,065
(25.82 %)
614,712
(1.89 %)
10,407,733
(28.90 %)
1,641
(0.04 %)
222,087
(1.20 %)
66,720
(2.99 %)
60,637
(2.11 %)
117 big brown bat (TK198812 2023 genbank)
GCA_027574615.1
n/a n/a 18,420
(1.89 %)
21,275
(1.72 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
49
(100.00 %)
4,895,568
(45.28 %)
904,082
(3.80 %)
10,530,742
(37.05 %)
0
(0 %)
647,994
(2.05 %)
77,606
(3.68 %)
60,841
(2.88 %)
118 big brown bat (TK198812 2023 refseq)
GCF_027574615.1
46,266
(2.61 %)
n/a 18,620
(1.80 %)
21,271
(1.72 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
48
(100.00 %)
3,041,145
(25.08 %)
904,075
(3.80 %)
10,530,666
(37.05 %)
0
(0 %)
647,994
(2.05 %)
77,605
(3.68 %)
62,105
(2.31 %)
119 bighorn sheep (Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCA_042477335.2
n/a n/a 19,021
(1.39 %)
21,154
(1.33 %)
n/a 43.91
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
41
(100.00 %)
5,490,141
(54.04 %)
826,352
(11.67 %)
12,918,667
(46.86 %)
0
(0 %)
1,582,127
(3.98 %)
52,254
(10.67 %)
39,426
(1.80 %)
120 bighorn sheep (BS48 2019)
GCA_004026945.1
n/a n/a 23,059
(1.34 %)
36,486
(1.19 %)
n/a 43.20
(99.90 %)
9,412
(0.03 %)
9,412
(0.03 %)
1,057,548
(99.97 %)
6,321,577
(50.75 %)
716,846
(1.66 %)
13,904,326
(44.98 %)
63
(0.00 %)
n/a 95,564
(1.72 %)
50,916
(1.03 %)
121 bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.2
78,636
(2.63 %)
n/a 19,459
(1.36 %)
21,150
(1.33 %)
n/a 43.91
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
42
(100.00 %)
3,963,383
(22.89 %)
826,353
(11.67 %)
12,918,743
(46.86 %)
0
(0 %)
2,225,863
(5.63 %)
52,254
(10.67 %)
39,631
(0.85 %)
122 bilby (mMagLag1 2024 genbank)
GCA_037893015.1
n/a n/a 18,686
(0.72 %)
17,238
(0.81 %)
n/a 37.35
(99.66 %)
0
(0 %)
4,431
(0.34 %)
609
(100.00 %)
6,263,094
(27.34 %)
2,223,995
(5.89 %)
23,994,844
(43.69 %)
70
(0.01 %)
1,521,039
(3.02 %)
51,039
(3.47 %)
15,234
(0.24 %)
123 bilby (mMagLag1 2024 refseq)
GCF_037893015.1
60,460
(3.10 %)
n/a 18,687
(0.72 %)
17,229
(0.81 %)
n/a 37.35
(99.66 %)
0
(0 %)
4,431
(0.34 %)
608
(100.00 %)
6,299,949
(27.49 %)
2,223,987
(5.89 %)
23,992,536
(43.69 %)
70
(0.01 %)
1,330,409
(2.60 %)
51,039
(3.47 %)
15,234
(0.24 %)
124 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024)
GCA_043290085.1
n/a n/a 20,713
(0.64 %)
21,469
(0.64 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
1
(0.00 %)
770
(0.00 %)
470
(100.00 %)
3,860,121
(14.52 %)
1,230,113
(2.81 %)
21,600,460
(65.53 %)
7
(0.00 %)
n/a 49,878
(0.73 %)
48,556
(0.69 %)
125 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024)
GCA_043290065.1
n/a n/a 19,814
(0.63 %)
20,140
(0.63 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
1
(0.00 %)
723
(0.00 %)
315
(100.00 %)
3,657,357
(14.24 %)
1,158,716
(2.84 %)
22,924,986
(64.53 %)
6
(0.00 %)
n/a 46,774
(0.90 %)
21,729
(0.30 %)
126 black flying fox
GCF_000325575.1
46,991
(3.15 %)
n/a 18,089
(2.00 %)
20,668
(1.75 %)
n/a 39.74
(97.93 %)
104,566
(2.08 %)
104,566
(2.08 %)
170,164
(97.92 %)
2,975,186
(34.05 %)
481,859
(1.45 %)
12,582,349
(26.52 %)
97
(0.01 %)
114,693
(0.91 %)
62,483
(3.88 %)
64,215
(2.93 %)
127 black rat
GCF_011064425.1
39,601
(2.37 %)
n/a 20,793
(1.98 %)
17,944
(1.37 %)
n/a 42.14
(99.98 %)
0
(0 %)
6,158
(0.02 %)
2,173
(100.00 %)
4,715,157
(41.57 %)
1,432,294
(3.45 %)
13,275,550
(32.36 %)
20
(0.00 %)
625,923
(1.66 %)
18,055
(0.48 %)
16,181
(0.43 %)
128 black rhinoceros (alternate hap 2021)
GCA_020826835.1
n/a n/a 19,000
(1.37 %)
22,547
(1.26 %)
n/a 41.56
(99.97 %)
0
(0 %)
178
(0.03 %)
1,199
(100.00 %)
4,340,245
(37.22 %)
564,468
(8.07 %)
14,384,523
(40.40 %)
0
(0 %)
941,914
(2.51 %)
44,971
(1.16 %)
34,023
(0.74 %)
129 black rhinoceros (BS38 2019 Broad)
GCA_004027315.1
n/a n/a 21,713
(1.32 %)
32,731
(1.18 %)
n/a 41.22
(99.85 %)
7,256
(0.02 %)
7,256
(0.02 %)
2,029,914
(99.98 %)
4,618,655
(36.76 %)
618,834
(2.21 %)
16,248,532
(40.32 %)
32
(0.00 %)
n/a 44,113
(0.97 %)
35,130
(0.72 %)
130 black rhinoceros (primary hap 2021 refseq)
GCF_020826845.1
56,268
(2.28 %)
n/a 18,774
(1.38 %)
22,348
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
0
(0 %)
215
(0.05 %)
1,076
(100.00 %)
4,200,390
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,693
(40.14 %)
2
(0.00 %)
984,722
(2.61 %)
43,525
(1.14 %)
33,963
(0.76 %)
131 black-footed cat
GCA_004023925.1
n/a n/a 22,895
(1.14 %)
51,789
(1.13 %)
n/a 41.92
(99.90 %)
13,476
(0.06 %)
13,476
(0.06 %)
603,600
(99.94 %)
5,261,265
(44.11 %)
943,514
(1.77 %)
13,681,435
(34.77 %)
43
(0.00 %)
262,081
(0.70 %)
86,892
(2.23 %)
62,055
(1.65 %)
132 black-footed ferret (SB6536 2022)
GCF_022355385.1
56,415
(2.78 %)
n/a 18,681
(1.55 %)
20,685
(1.40 %)
n/a 41.55
(96.71 %)
0
(0 %)
33,042
(3.30 %)
20,575
(100.00 %)
4,087,717
(30.94 %)
695,805
(1.18 %)
13,880,116
(32.08 %)
890
(0.03 %)
471,613
(1.24 %)
54,060
(2.11 %)
51,472
(1.69 %)
133 Black-footed pygmy rice rat (hap1 2026)
GCA_057876635.1
n/a n/a 18,406
(1.50 %)
19,794
(1.40 %)
n/a 40.25
(100.00 %)
0
(0 %)
310
(0.00 %)
130
(100.00 %)
3,808,746
(29.86 %)
1,161,779
(5.60 %)
13,927,799
(34.51 %)
6
(0.00 %)
1,019,146
(2.65 %)
20,238
(0.63 %)
15,778
(0.37 %)
134 Black-footed pygmy rice rat (hap2 2026)
GCA_057876665.1
n/a n/a 18,294
(1.57 %)
19,184
(1.44 %)
n/a 40.44
(100.00 %)
0
(0 %)
279
(0.00 %)
95
(100.00 %)
3,674,443
(30.08 %)
1,059,812
(5.20 %)
14,027,360
(32.36 %)
4
(0.00 %)
873,114
(2.35 %)
18,895
(0.59 %)
15,501
(0.39 %)
135 black-lipped pika
GCF_017591425.1
46,297
(2.64 %)
n/a 18,529
(1.63 %)
23,458
(1.83 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
0
(0 %)
54
(0.00 %)
2,214
(100.00 %)
1,843,705
(12.62 %)
471,798
(2.76 %)
11,394,992
(31.27 %)
0
(0 %)
530,175
(1.74 %)
63,124
(1.85 %)
31,410
(1.04 %)
136 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1
n/a n/a 17,838
(1.54 %)
21,389
(1.35 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,198
(100.00 %)
3,542,727
(35.35 %)
650,369
(8.86 %)
10,971,320
(41.15 %)
0
(0 %)
1,286,122
(4.20 %)
62,389
(1.68 %)
34,595
(0.95 %)
137 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1
47,553
(2.07 %)
n/a 19,041
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
0
(0 %)
97
(0.03 %)
74
(100.00 %)
3,964,038
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,229
(41.78 %)
1
(0.00 %)
1,795,618
(5.01 %)
70,851
(1.80 %)
37,949
(0.93 %)
138 Blasius's horseshoe bat (hap1 2026)
GCA_057428245.1
n/a n/a 18,361
(1.90 %)
20,645
(1.66 %)
n/a 40.57
(100.00 %)
0
(0 %)
106
(0.00 %)
197
(100.00 %)
3,589,565
(40.46 %)
551,655
(1.43 %)
12,136,235
(30.17 %)
1
(0.00 %)
232,541
(1.09 %)
34,854
(1.10 %)
30,020
(0.97 %)
139 Blasius's horseshoe bat (hap2 2026)
GCA_057428315.1
n/a n/a 17,508
(1.97 %)
19,717
(1.71 %)
n/a n/a 0
(0 %)
82
(0.00 %)
150
(100.00 %)
3,296,778
(39.22 %)
511,295
(1.37 %)
11,469,148
(28.59 %)
0
(0 %)
145,401
(0.64 %)
30,364
(1.09 %)
27,425
(0.98 %)
140 blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019)
GCA_008658375.1
n/a n/a 17,285
(1.80 %)
21,295
(1.43 %)
n/a 41.22
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 12,574
(100.00 %)
3,196,354
(43.47 %)
467,194
(1.26 %)
10,176,588
(33.66 %)
0
(0 %)
306,308
(1.20 %)
56,916
(1.85 %)
39,871
(1.51 %)
141 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 primary hap 2020)
GCA_009873245.3
n/a n/a 19,151
(1.81 %)
20,574
(1.41 %)
n/a 40.88
(98.91 %)
0
(0 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,871
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,081
(34.60 %)
4
(0.00 %)
422,171
(1.33 %)
67,032
(1.73 %)
46,602
(1.41 %)
142 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2
n/a n/a 16,997
(1.82 %)
20,609
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
10,999
(100.00 %)
3,126,800
(43.49 %)
454,452
(1.23 %)
9,916,868
(33.63 %)
0
(0 %)
296,938
(1.19 %)
55,436
(1.85 %)
38,786
(1.50 %)
143 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2
58,737
(2.71 %)
n/a 19,162
(1.80 %)
20,576
(1.41 %)
36,291
(1.99 %)
40.88
(98.91 %)
0
(0 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,870
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,384
(34.60 %)
4
(0.00 %)
422,171
(1.33 %)
67,032
(1.73 %)
46,602
(1.41 %)
144 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022)
GCA_022079275.1
n/a n/a 24,877
(1.23 %)
48,382
(1.39 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
4,716
(0.01 %)
4,716
(0.01 %)
72,827
(99.99 %)
6,403,412
(33.31 %)
1,269,531
(1.94 %)
17,771,689
(33.82 %)
79
(0.00 %)
706,367
(3.07 %)
100,915
(3.00 %)
90,223
(2.05 %)
145 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022)
GCF_022079265.1
45,417
(2.39 %)
n/a 18,576
(1.65 %)
20,510
(1.41 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
0
(0 %)
24
(0.00 %)
75
(100.00 %)
4,970,082
(43.28 %)
894,002
(1.80 %)
13,648,384
(34.21 %)
0
(0 %)
602,631
(1.69 %)
69,211
(2.68 %)
63,384
(2.18 %)
146 boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023)
GCA_019903745.2
n/a n/a 20,135
(1.60 %)
22,598
(1.47 %)
n/a 41.46
(96.98 %)
0
(0 %)
34,682
(3.03 %)
12,266
(100.00 %)
3,134,107
(24.41 %)
394,920
(0.92 %)
13,154,929
(36.43 %)
3,241
(0.04 %)
471,129
(1.38 %)
48,826
(1.07 %)
42,368
(0.88 %)
147 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022)
GCA_024803775.1
n/a n/a 18,647
(0.96 %)
23,998
(1.13 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
0
(0 %)
124
(0.00 %)
3,340
(100.00 %)
3,775,862
(22.40 %)
1,257,803
(21.71 %)
9,347,543
(61.85 %)
0
(0 %)
9,701,648
(16.46 %)
33,757
(1.35 %)
24,065
(0.48 %)
148 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1
n/a n/a 17,791
(1.12 %)
22,667
(1.29 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
106
(0.00 %)
106
(0.00 %)
2,898
(100.00 %)
6,293,452
(41.30 %)
1,076,688
(17.94 %)
8,553,272
(57.13 %)
1
(0.00 %)
6,983,927
(14.02 %)
31,102
(1.31 %)
23,419
(0.57 %)
149 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1
n/a n/a 18,247
(1.61 %)
22,673
(1.83 %)
n/a 41.12
(99.99 %)
205
(0.00 %)
775
(0.01 %)
835
(100.00 %)
2,918,285
(18.64 %)
868,090
(5.77 %)
9,427,604
(40.78 %)
2
(0.00 %)
1,601,923
(4.79 %)
27,049
(1.25 %)
22,545
(0.76 %)
150 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1
n/a n/a 17,612
(1.68 %)
22,099
(1.91 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
25
(0.00 %)
541
(0.01 %)
365
(100.00 %)
2,748,918
(17.16 %)
827,542
(4.51 %)
8,832,809
(39.20 %)
2
(0.00 %)
1,074,853
(3.77 %)
26,416
(1.35 %)
22,242
(0.81 %)
151 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1
n/a n/a 18,667
(1.46 %)
20,817
(1.26 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
284
(0.00 %)
903
(100.00 %)
4,004,895
(35.23 %)
925,158
(12.15 %)
11,999,784
(42.65 %)
3
(0.00 %)
1,841,091
(5.04 %)
63,428
(1.55 %)
38,329
(0.93 %)
152 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1
n/a n/a 17,954
(1.51 %)
19,994
(1.30 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
0
(0 %)
240
(0.00 %)
800
(100.00 %)
3,723,164
(34.96 %)
809,880
(11.02 %)
11,359,211
(41.42 %)
2
(0.00 %)
1,554,419
(4.60 %)
60,067
(1.55 %)
36,564
(0.95 %)
153 Brahman cow (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1
63,234
(2.88 %)
n/a 19,601
(1.57 %)
21,699
(1.34 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
0
(0 %)
302
(0.06 %)
1,250
(100.00 %)
5,524,454
(47.57 %)
459,928
(1.40 %)
13,208,799
(41.21 %)
0
(0 %)
1,222,662
(3.37 %)
41,359
(1.10 %)
37,367
(0.98 %)
154 Brandt's bat
GCF_000412655.1
46,912
(2.84 %)
n/a 19,267
(1.75 %)
18,495
(1.62 %)
n/a 42.59
(94.06 %)
155,664
(5.95 %)
155,664
(5.95 %)
325,414
(94.05 %)
2,897,662
(25.08 %)
634,208
(3.20 %)
11,323,618
(31.06 %)
356
(0.04 %)
n/a 66,749
(1.59 %)
51,826
(1.12 %)
155 Brazilian free-tailed bat (alternate hap 2023)
GCA_030848815.1
n/a n/a 18,921
(1.72 %)
22,946
(1.65 %)
n/a 42.50
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,728
(100.00 %)
4,021,020
(40.28 %)
637,136
(3.60 %)
11,382,826
(36.28 %)
0
(0 %)
630,202
(2.22 %)
70,547
(2.64 %)
65,739
(2.10 %)
156 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1
n/a n/a 19,039
(1.66 %)
21,660
(1.59 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
20
(0.00 %)
148
(100.00 %)
3,805,818
(31.80 %)
640,446
(2.50 %)
11,793,353
(36.15 %)
1
(0.00 %)
609,574
(1.94 %)
68,896
(2.40 %)
57,812
(1.49 %)
157 Brazilian guinea pig
GCA_000688575.1
n/a n/a 16,531
(1.49 %)
11,177
(1.44 %)
n/a 39.81
(64.76 %)
0
(0 %)
2,565,595
(35.61 %)
3,131
(100.00 %)
2,529,479
(25.87 %)
342,907
(0.66 %)
10,719,517
(21.05 %)
551
(0.01 %)
218,010
(0.72 %)
19,508
(0.31 %)
9,721
(0.14 %)
158 Brazilian tapir
GCA_004025025.1
n/a n/a 21,581
(1.61 %)
30,818
(1.32 %)
n/a 41.12
(99.93 %)
2,273
(0.01 %)
2,273
(0.01 %)
805,779
(99.99 %)
3,877,938
(38.36 %)
344,032
(0.79 %)
15,601,710
(32.81 %)
14
(0.00 %)
n/a 43,382
(1.17 %)
39,596
(1.04 %)
159 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018)
GCF_003584765.2
50,229
(2.92 %)
n/a 18,811
(1.77 %)
21,073
(1.52 %)
n/a 41.84
(99.31 %)
15,552
(0.70 %)
17,380
(0.70 %)
21,813
(99.30 %)
4,201,043
(40.86 %)
567,586
(1.23 %)
13,807,211
(30.86 %)
760
(0.01 %)
325,785
(0.96 %)
62,125
(1.80 %)
56,227
(1.57 %)
160 brown bear (v2.0 North America Adak 2023)
GCF_023065955.2
66,371
(4.20 %)
n/a 18,615
(1.68 %)
21,434
(1.53 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
250
(0.00 %)
362
(100.00 %)
4,030,019
(33.22 %)
630,008
(4.17 %)
13,240,060
(32.92 %)
1
(0.00 %)
668,459
(2.28 %)
64,814
(2.05 %)
58,450
(1.77 %)
161 brown big-eared bat (alternate hap 2023)
GCA_963455325.1
n/a n/a 18,932
(1.77 %)
23,324
(1.64 %)
n/a 43.04
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,570
(100.00 %)
4,970,484
(48.00 %)
928,854
(4.06 %)
10,332,383
(39.35 %)
0
(0 %)
794,551
(2.62 %)
59,133
(2.45 %)
49,887
(1.93 %)
162 brown big-eared bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_963455305.1
n/a n/a 19,138
(1.72 %)
20,370
(1.54 %)
n/a 43.08
(99.99 %)
0
(0 %)
1,237
(0.01 %)
65
(100.00 %)
3,201,470
(26.24 %)
957,903
(4.27 %)
10,687,995
(39.65 %)
8
(0.00 %)
881,577
(2.81 %)
60,671
(2.39 %)
52,889
(1.71 %)
163 brown big-eared bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963455305.1
51,465
(2.81 %)
n/a 18,957
(1.79 %)
20,368
(1.54 %)
n/a 43.08
(99.99 %)
0
(0 %)
1,237
(0.01 %)
64
(100.00 %)
5,119,261
(48.27 %)
957,900
(4.27 %)
10,687,449
(39.65 %)
8
(0.00 %)
881,575
(2.81 %)
60,670
(2.39 %)
51,182
(1.93 %)
164 brown-throated sloth
GCA_004027775.1
n/a n/a 17,043
(1.21 %)
37,090
(1.36 %)
n/a 42.76
(99.76 %)
462
(0.00 %)
462
(0.00 %)
1,772,267
(100.00 %)
2,487,215
(36.18 %)
316,812
(1.60 %)
7,948,666
(37.96 %)
5
(0.00 %)
n/a 62,325
(2.36 %)
46,228
(1.74 %)
165 bush duiker (CMD-5126 2019)
GCA_006408735.1
n/a n/a 21,234
(1.49 %)
24,405
(1.37 %)
n/a 42.55
(81.82 %)
787,889
(18.24 %)
787,889
(18.24 %)
810,213
(81.76 %)
5,743,783
(45.60 %)
588,471
(5.37 %)
13,114,146
(31.74 %)
101,748
(1.69 %)
1,339,519
(11.29 %)
52,826
(1.05 %)
46,468
(0.91 %)
166 cactus mouse (2023)
GCF_949786415.1
47,537
(2.02 %)
n/a 18,894
(1.46 %)
20,159
(1.22 %)
n/a 42.40
(99.98 %)
0
(0 %)
2,603
(0.02 %)
4,297
(100.00 %)
7,181,232
(52.75 %)
1,247,378
(18.35 %)
13,329,318
(43.03 %)
32
(0.00 %)
4,621,934
(9.77 %)
19,540
(0.49 %)
17,819
(0.43 %)
167 California mouse (IS 2022)
GCF_007827085.1
62,273
(3.80 %)
n/a 18,959
(1.75 %)
19,378
(1.41 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
0
(0 %)
547
(0.00 %)
237
(100.00 %)
5,970,582
(45.08 %)
1,165,743
(3.67 %)
13,734,349
(33.67 %)
4
(0.00 %)
738,622
(2.20 %)
19,529
(0.58 %)
17,949
(0.52 %)
168 California sea lion (alternate hap 2019)
GCA_009762295.1
n/a n/a 18,348
(1.81 %)
18,692
(1.47 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,093
(100.00 %)
3,722,619
(42.89 %)
488,086
(1.26 %)
10,893,132
(33.14 %)
0
(0 %)
393,471
(1.40 %)
44,449
(1.57 %)
41,300
(1.38 %)
169 California sea lion (LMU 2018 refseq)
GCF_900631625.1
69,240
(2.99 %)
n/a 20,741
(1.78 %)
20,298
(1.40 %)
n/a 41.38
(99.81 %)
0
(0 %)
47,716
(0.20 %)
10,423
(100.00 %)
4,530,259
(43.28 %)
573,086
(1.12 %)
13,442,336
(33.58 %)
9,701
(0.17 %)
414,311
(1.26 %)
50,583
(1.46 %)
46,836
(1.28 %)
170 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2
n/a n/a 18,319
(1.81 %)
18,772
(1.48 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,096
(100.00 %)
3,724,021
(42.91 %)
488,356
(1.26 %)
10,891,276
(33.15 %)
0
(0 %)
395,508
(1.40 %)
44,467
(1.57 %)
41,289
(1.38 %)
171 California sea lion (primary hap 2020)
GCA_009762305.2
n/a n/a 20,939
(1.78 %)
20,184
(1.40 %)
n/a 41.40
(99.23 %)
0
(0 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,530,531
(43.69 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,573
(33.76 %)
2
(0.00 %)
495,451
(1.44 %)
51,899
(1.50 %)
48,196
(1.32 %)
172 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2
70,801
(3.05 %)
n/a 20,915
(1.77 %)
20,179
(1.40 %)
44,926
(2.10 %)
41.40
(99.23 %)
0
(0 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,525,652
(43.65 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,648
(33.76 %)
2
(0.00 %)
495,451
(1.44 %)
51,899
(1.50 %)
48,201
(1.32 %)
173 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023)
GCA_028537755.1
n/a n/a 19,409
(1.86 %)
20,578
(1.69 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
310
(100.00 %)
3,161,054
(22.60 %)
891,453
(5.62 %)
11,087,206
(33.12 %)
0
(0 %)
957,188
(2.77 %)
19,104
(0.65 %)
16,548
(0.48 %)
174 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023)
GCA_028537955.1
n/a n/a 19,681
(1.86 %)
21,257
(1.62 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
51
(0.00 %)
350
(100.00 %)
4,957,057
(42.33 %)
943,226
(5.63 %)
11,695,871
(33.83 %)
0
(0 %)
1,058,642
(2.90 %)
20,062
(0.64 %)
18,632
(0.53 %)
175 Canada lynx (alternate hap LIC74 2019)
GCA_007474575.1
n/a n/a 12,029
(1.42 %)
15,171
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
15,036
(100.00 %)
2,937,491
(43.50 %)
544,410
(1.76 %)
7,641,565
(32.72 %)
0
(0 %)
294,221
(1.43 %)
39,082
(2.44 %)
34,616
(1.88 %)
176 Canada lynx (LIC74 primary hap 2020)
GCA_007474595.2
n/a n/a 18,286
(1.66 %)
19,266
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
0
(0 %)
842
(0.12 %)
55
(100.00 %)
5,014,416
(43.75 %)
904,528
(1.75 %)
13,467,329
(34.19 %)
0
(0 %)
572,383
(1.64 %)
66,805
(2.53 %)
60,477
(2.02 %)
177 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2
n/a n/a 12,041
(1.42 %)
15,226
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
15,046
(100.00 %)
2,939,291
(43.50 %)
544,849
(1.76 %)
7,650,345
(32.74 %)
0
(0 %)
294,817
(1.43 %)
39,099
(2.44 %)
34,631
(1.88 %)
178 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2
50,142
(2.69 %)
n/a 18,273
(1.65 %)
19,264
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
0
(0 %)
842
(0.12 %)
54
(100.00 %)
5,011,165
(43.72 %)
904,525
(1.75 %)
13,467,551
(34.19 %)
0
(0 %)
572,384
(1.64 %)
66,799
(2.48 %)
60,482
(2.02 %)
179 Cantor's roundleaf bat
GCA_004027415.1
n/a n/a 23,788
(1.42 %)
45,328
(1.68 %)
38,254
(1.57 %)
41.36
(99.91 %)
6,366
(0.03 %)
6,366
(0.03 %)
846,566
(99.97 %)
3,997,370
(31.48 %)
775,742
(1.42 %)
12,770,948
(33.45 %)
57
(0.00 %)
n/a 41,527
(1.41 %)
30,440
(1.13 %)
180 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1
25,406
(1.08 %)
n/a 23,258
(1.07 %)
24,266
(1.16 %)
n/a 40.30
(86.29 %)
279,394
(13.74 %)
279,394
(13.74 %)
288,162
(86.26 %)
3,765,232
(16.90 %)
604,351
(0.89 %)
20,072,078
(42.36 %)
1,643
(0.02 %)
356,320
(0.77 %)
25,977
(0.42 %)
23,327
(0.35 %)
181 Cape golden mole (2012 Broad)
GCF_000296735.1
25,323
(1.07 %)
n/a 20,961
(1.07 %)
21,723
(1.04 %)
n/a 40.01
(79.93 %)
370,844
(20.11 %)
370,844
(20.11 %)
391,344
(79.89 %)
4,924,640
(21.03 %)
500,830
(1.95 %)
18,946,663
(41.18 %)
3,416
(0.03 %)
805,638
(1.24 %)
21,186
(0.33 %)
18,126
(0.27 %)
182 Cape hairy bat (hap1 2026)
GCA_054824995.1
n/a n/a 18,941
(1.79 %)
22,450
(1.66 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
0
(0 %)
127
(0.00 %)
189
(100.00 %)
5,144,376
(47.81 %)
778,035
(6.45 %)
10,243,708
(39.07 %)
4
(0.00 %)
1,134,718
(3.60 %)
58,204
(2.36 %)
49,558
(1.99 %)
183 Cape hairy bat (hap2 2026)
GCA_054825045.1
n/a n/a 17,887
(1.90 %)
20,599
(1.71 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
0
(0 %)
113
(0.00 %)
118
(100.00 %)
4,691,733
(46.04 %)
682,924
(4.53 %)
9,907,631
(36.70 %)
2
(0.00 %)
687,675
(2.52 %)
54,230
(2.37 %)
47,473
(2.00 %)
184 Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014)
GCA_000152225.2
n/a n/a 18,455
(1.10 %)
22,103
(1.12 %)
n/a 41.00
(88.89 %)
259,874
(11.14 %)
259,879
(11.14 %)
325,568
(88.86 %)
6,210,235
(51.92 %)
381,915
(1.06 %)
20,080,212
(36.28 %)
7,944
(0.20 %)
267,970
(1.80 %)
29,690
(0.50 %)
26,217
(0.43 %)
185 Cape rock hyrax (US060 2019 Broad)
GCA_004026925.1
n/a n/a 21,401
(0.85 %)
45,353
(1.14 %)
n/a 41.08
(99.93 %)
4,203
(0.01 %)
4,203
(0.01 %)
1,048,940
(99.99 %)
7,222,494
(54.48 %)
430,286
(0.85 %)
21,775,991
(44.61 %)
44
(0.00 %)
n/a 37,158
(0.70 %)
31,196
(0.61 %)
186 capybara
GCA_004027455.1
n/a n/a 20,152
(1.22 %)
28,931
(1.29 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
5,747
(0.02 %)
5,747
(0.02 %)
661,089
(99.98 %)
4,220,878
(29.16 %)
777,357
(2.04 %)
15,214,944
(35.16 %)
23
(0.00 %)
n/a 34,558
(0.85 %)
32,123
(0.72 %)
187 carabao (swamp buffalo K-KA32 2023)
GCF_029407905.1
77,279
(2.89 %)
n/a 19,433
(1.40 %)
21,166
(1.23 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
115
(100.00 %)
3,479,445
(21.92 %)
547,054
(6.39 %)
12,840,677
(45.22 %)
0
(0 %)
2,206,180
(5.44 %)
99,752
(3.73 %)
36,683
(0.81 %)
188 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA)
GCF_002263795.3
77,808
(4.11 %)
n/a 19,428
(1.48 %)
22,236
(1.33 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
0
(0 %)
386
(0.00 %)
1,958
(100.00 %)
3,449,588
(22.63 %)
596,092
(3.13 %)
12,785,607
(42.11 %)
1
(0.00 %)
1,626,342
(4.17 %)
46,864
(1.37 %)
37,742
(0.86 %)
189 cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014)
GCF_000003055.6
57,977
(2.74 %)
n/a 19,583
(1.56 %)
20,581
(1.31 %)
n/a 41.82
(99.23 %)
72,454
(0.78 %)
74,464
(0.78 %)
75,598
(99.22 %)
5,607,556
(49.02 %)
440,521
(1.25 %)
13,167,657
(40.78 %)
789
(0.04 %)
1,243,109
(3.73 %)
42,869
(1.24 %)
37,223
(0.90 %)
190 Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad)
GCA_004024745.2
n/a n/a 18,603
(1.52 %)
22,330
(1.36 %)
n/a 42.35
(98.12 %)
57,013
(1.80 %)
57,013
(1.80 %)
1,240,743
(98.20 %)
5,255,211
(43.27 %)
2,502,373
(4.37 %)
12,968,788
(40.96 %)
10,788
(0.55 %)
n/a 172,178
(3.66 %)
153,143
(3.23 %)
191 cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022)
GCF_027475565.1
80,997
(4.53 %)
n/a 18,420
(1.70 %)
19,561
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
0
(0 %)
22
(0.00 %)
195
(100.00 %)
4,611,842
(35.10 %)
837,685
(1.68 %)
13,649,125
(33.06 %)
0
(0 %)
327,107
(0.89 %)
60,367
(2.22 %)
56,975
(1.91 %)
192 cheetah (Rico 2018)
GCF_003709585.1
72,154
(3.33 %)
n/a 18,472
(1.70 %)
20,443
(1.42 %)
n/a 41.55
(99.55 %)
0
(0 %)
24,173
(0.45 %)
3,220
(100.00 %)
4,853,945
(42.85 %)
831,106
(1.53 %)
13,663,571
(32.84 %)
1,699
(0.02 %)
283,401
(0.75 %)
60,744
(2.17 %)
55,562
(1.77 %)
193 Chinese forest musk deer (Sichuan 2022)
GCF_022376915.1
51,625
(2.80 %)
n/a 19,565
(1.43 %)
22,280
(1.29 %)
n/a 42.30
(99.97 %)
0
(0 %)
1,781
(0.03 %)
2,446
(100.00 %)
3,257,347
(21.65 %)
399,120
(3.81 %)
12,906,274
(43.79 %)
0
(0 %)
2,278,433
(5.31 %)
46,689
(1.12 %)
38,849
(0.85 %)
194 Chinese hamster (17A/GY CHO 2020)
GCF_003668045.3
55,440
(2.79 %)
n/a 20,030
(1.84 %)
18,721
(1.41 %)
67,900
(3.41 %)
41.51
(99.90 %)
0
(0 %)
4,164
(0.10 %)
647
(100.00 %)
8,121,057
(33.74 %)
1,095,058
(2.91 %)
12,923,274
(32.25 %)
17
(0.00 %)
566,700
(1.72 %)
19,341
(0.58 %)
18,196
(0.52 %)
195 Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI)
GCF_000223135.1
46,006
(2.59 %)
n/a 20,602
(1.78 %)
17,467
(1.35 %)
n/a 41.37
(96.61 %)
156,635
(3.40 %)
156,635
(3.40 %)
265,787
(96.60 %)
4,541,936
(33.03 %)
1,072,129
(2.66 %)
13,150,189
(30.04 %)
213
(0.02 %)
n/a 12,522
(0.25 %)
11,560
(0.23 %)
196 Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd)
GCA_900186095.1
n/a n/a 19,874
(1.85 %)
19,298
(1.44 %)
n/a 41.45
(98.56 %)
63,334
(1.45 %)
63,334
(1.45 %)
71,598
(98.55 %)
4,521,726
(33.66 %)
1,060,619
(2.55 %)
12,867,288
(31.26 %)
9,581
(0.18 %)
445,818
(1.43 %)
17,960
(0.54 %)
17,137
(0.50 %)
197 Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022)
GCA_026545065.1
n/a n/a 20,293
(1.81 %)
18,881
(1.42 %)
n/a 41.62
(71.16 %)
924,541
(28.93 %)
924,541
(28.93 %)
1,236,122
(71.07 %)
4,330,728
(30.92 %)
987,319
(3.70 %)
13,374,062
(21.92 %)
817
(0.01 %)
n/a 18,838
(0.40 %)
17,349
(0.35 %)
198 Chinese pangolin (2020 Yunnan U)
GCF_014570555.1
69,694
(3.21 %)
n/a 18,206
(1.70 %)
20,508
(1.48 %)
n/a 40.79
(95.54 %)
0
(0 %)
34,903
(4.47 %)
4,694
(100.00 %)
2,927,176
(35.60 %)
269,964
(0.67 %)
12,610,535
(29.10 %)
647
(0.02 %)
253,501
(1.85 %)
35,278
(1.05 %)
33,613
(0.98 %)
199 Chinese pangolin (hap1 2023 genbank)
GCA_030020395.1
n/a n/a 18,675
(1.41 %)
21,838
(1.29 %)
n/a 41.07
(99.77 %)
0
(0 %)
383
(0.23 %)
662
(100.00 %)
3,516,380
(43.45 %)
618,194
(3.68 %)
12,009,657
(39.02 %)
8
(0.00 %)
1,132,161
(3.87 %)
47,708
(1.22 %)
42,611
(1.05 %)
200 Chinese pangolin (hap1 2023 refseq)
GCF_030020395.1
71,445
(2.98 %)
n/a 18,379
(1.34 %)
21,837
(1.29 %)
n/a 41.07
(99.77 %)
0
(0 %)
383
(0.23 %)
661
(100.00 %)
3,318,871
(34.65 %)
618,193
(3.68 %)
12,009,669
(39.02 %)
8
(0.00 %)
1,132,160
(3.87 %)
47,708
(1.22 %)
34,214
(0.79 %)
201 Chinese pangolin (hap2 2023)
GCA_030020945.1
n/a n/a 18,538
(1.34 %)
21,724
(1.27 %)
n/a 41.09
(99.48 %)
0
(0 %)
190
(0.52 %)
700
(100.00 %)
3,362,899
(34.48 %)
678,384
(4.11 %)
12,024,241
(39.52 %)
7
(0.00 %)
1,198,886
(3.98 %)
48,960
(1.19 %)
34,434
(0.79 %)
202 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1
n/a n/a 18,749
(1.63 %)
22,506
(1.40 %)
n/a 40.93
(90.69 %)
138,158
(9.33 %)
257,424
(9.33 %)
230,927
(90.67 %)
2,691,116
(34.48 %)
316,518
(1.96 %)
11,538,086
(25.40 %)
37,129
(1.10 %)
304,419
(2.99 %)
30,693
(0.58 %)
28,150
(0.52 %)
203 Chinese rufous horseshoe bat
GCA_001888835.1
n/a n/a 26,871
(2.34 %)
25,467
(1.89 %)
n/a 40.52
(97.22 %)
0
(0 %)
212,601
(2.80 %)
63,439
(100.00 %)
3,219,611
(33.86 %)
495,126
(1.20 %)
12,476,551
(27.16 %)
60
(0.00 %)
103,290
(0.35 %)
32,993
(0.98 %)
31,139
(0.91 %)
204 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024 genbank)
GCA_036562045.1
n/a n/a 17,893
(1.95 %)
19,249
(1.60 %)
n/a 40.47
(100.00 %)
0
(0 %)
286
(0.00 %)
454
(100.00 %)
3,055,304
(33.11 %)
531,106
(1.34 %)
11,858,144
(29.52 %)
0
(0 %)
158,830
(0.76 %)
30,884
(1.08 %)
29,146
(0.97 %)
205 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024 refseq)
GCF_036562045.2
67,162
(3.87 %)
n/a 17,890
(1.94 %)
19,248
(1.60 %)
n/a 40.47
(100.00 %)
0
(0 %)
286
(0.00 %)
454
(100.00 %)
3,325,750
(39.02 %)
531,106
(1.34 %)
11,858,028
(29.52 %)
0
(0 %)
218,904
(1.04 %)
30,884
(1.08 %)
26,927
(0.94 %)
206 Chinese tree shrew (2013 BGI)
GCF_000334495.1
47,005
(2.07 %)
n/a 21,375
(1.39 %)
19,231
(1.28 %)
n/a 41.73
(95.10 %)
191,695
(4.92 %)
191,695
(4.92 %)
242,445
(95.08 %)
5,060,321
(23.05 %)
1,046,388
(4.15 %)
14,978,259
(38.04 %)
914
(0.08 %)
803,568
(6.04 %)
88,806
(1.44 %)
55,240
(1.01 %)
207 Chinese tree shrew (KIZ-2021 2023)
GCA_033439345.1
n/a n/a 22,218
(1.55 %)
22,364
(1.36 %)
n/a 41.78
(99.99 %)
0
(0 %)
1,697
(0.01 %)
1,645
(100.00 %)
6,126,341
(42.08 %)
1,035,957
(2.47 %)
14,328,193
(41.14 %)
1
(0.00 %)
840,196
(1.95 %)
90,914
(1.82 %)
54,999
(1.38 %)
208 Chiriquinan serotine (hap1 2025)
GCA_054100705.1
n/a n/a 17,992
(1.72 %)
21,541
(1.60 %)
n/a 43.57
(100.00 %)
0
(0 %)
319
(0.00 %)
133
(100.00 %)
5,339,985
(49.93 %)
956,399
(6.53 %)
10,659,420
(39.61 %)
3
(0.00 %)
888,139
(2.85 %)
80,046
(3.68 %)
60,884
(2.54 %)
209 Chiriquinan serotine (hap2 2025)
GCA_054099605.1
n/a n/a 17,252
(1.79 %)
20,347
(1.66 %)
n/a 43.70
(100.00 %)
0
(0 %)
267
(0.00 %)
112
(100.00 %)
4,920,908
(48.27 %)
859,047
(6.45 %)
9,871,329
(38.13 %)
2
(0.00 %)
767,280
(2.65 %)
75,180
(3.74 %)
58,564
(2.67 %)
210 chiru
GCA_000400835.1
n/a n/a 20,320
(1.60 %)
42,654
(2.51 %)
n/a 42.01
(93.04 %)
283,069
(7.00 %)
283,069
(7.00 %)
298,127
(93.00 %)
5,342,241
(43.54 %)
425,329
(1.25 %)
13,714,420
(34.66 %)
321
(0.03 %)
521,516
(1.73 %)
43,135
(1.89 %)
39,020
(1.80 %)
211 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1
n/a n/a 16,430
(1.52 %)
21,057
(1.44 %)
n/a 41.79
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 10,377
(100.00 %)
3,845,437
(33.39 %)
794,587
(2.14 %)
10,765,695
(33.40 %)
0
(0 %)
461,307
(1.56 %)
56,375
(2.45 %)
47,473
(1.74 %)
212 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1
81,219
(3.62 %)
n/a 18,300
(1.65 %)
20,361
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
0
(0 %)
181
(0.06 %)
33
(100.00 %)
4,224,269
(34.84 %)
992,668
(2.08 %)
13,618,866
(34.42 %)
3
(0.00 %)
647,739
(1.89 %)
67,830
(2.45 %)
58,781
(1.98 %)
213 common bottlenose dolphin (maternal 2020)
GCA_011762535.1
n/a n/a 18,837
(1.77 %)
20,857
(1.43 %)
n/a 41.43
(99.73 %)
0
(0 %)
649
(0.27 %)
985
(100.00 %)
4,073,893
(46.15 %)
630,039
(2.15 %)
12,628,219
(35.41 %)
1
(0.00 %)
705,496
(1.85 %)
65,379
(1.89 %)
42,994
(1.34 %)
214 common bottlenose dolphin (maternal hap 2024)
GCA_011762595.2
n/a n/a 18,777
(1.77 %)
20,526
(1.42 %)
n/a 41.44
(99.74 %)
0
(0 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,064,487
(44.85 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,633
(35.29 %)
1
(0.00 %)
623,127
(1.85 %)
65,551
(1.90 %)
43,440
(1.36 %)
215 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1
67,220
(3.31 %)
n/a 18,766
(1.77 %)
20,528
(1.42 %)
35,852
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
0
(0 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,069,115
(46.17 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,891
(35.29 %)
1
(0.00 %)
629,903
(1.85 %)
65,551
(1.90 %)
43,136
(1.35 %)
216 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq)
GCF_001922835.1
45,975
(2.99 %)
n/a 17,255
(1.69 %)
17,058
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
0
(0 %)
114,003
(0.57 %)
2,648
(100.00 %)
3,845,938
(43.89 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,098
(32.18 %)
466
(0.01 %)
284,934
(0.89 %)
48,030
(1.35 %)
31,891
(1.03 %)
217 common bottlenose dolphin (mTurTru1 2024)
GCF_011762595.2
80,385
(4.33 %)
n/a 18,770
(1.77 %)
20,525
(1.42 %)
n/a 41.44
(99.74 %)
0
(0 %)
674
(0.26 %)
361
(100.00 %)
3,981,744
(44.78 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,558
(35.29 %)
1
(0.00 %)
556,315
(1.61 %)
65,551
(1.90 %)
43,444
(1.36 %)
218 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1
n/a n/a 18,537
(1.77 %)
20,619
(1.44 %)
n/a 41.42
(98.08 %)
0
(0 %)
868
(1.92 %)
1,166
(100.00 %)
3,997,801
(45.93 %)
609,838
(1.85 %)
12,400,272
(34.53 %)
1
(0.00 %)
649,569
(1.73 %)
64,630
(1.84 %)
42,623
(1.32 %)
219 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1
n/a n/a 14,863
(0.75 %)
15,426
(0.89 %)
n/a 39.41
(100.00 %)
313
(0.00 %)
313
(0.00 %)
12,446
(100.00 %)
5,846,769
(38.56 %)
987,917
(1.99 %)
16,764,356
(40.14 %)
0
(0 %)
345,940
(1.13 %)
13,303
(0.35 %)
10,338
(0.23 %)
220 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1
37,661
(1.80 %)
n/a 18,653
(0.80 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,116
(38.90 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,306
(40.56 %)
0
(0 %)
455,717
(1.17 %)
17,762
(0.38 %)
13,986
(0.24 %)
221 common dormouse
GCF_963383645.1
31,384
(1.35 %)
n/a 18,619
(1.42 %)
22,414
(1.38 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
1,805
(0.01 %)
1,805
(0.01 %)
2,017
(99.99 %)
6,589,540
(42.09 %)
1,593,656
(4.46 %)
12,228,695
(43.98 %)
8
(0.00 %)
1,313,148
(3.16 %)
71,058
(1.88 %)
45,398
(0.93 %)
222 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1
n/a n/a 17,216
(1.82 %)
19,202
(1.79 %)
n/a 42.55
(99.97 %)
0
(0 %)
1,546
(0.03 %)
323
(100.00 %)
2,953,532
(23.94 %)
805,142
(2.83 %)
9,964,846
(34.69 %)
0
(0 %)
446,836
(1.61 %)
57,295
(2.83 %)
54,882
(1.90 %)
223 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1
n/a n/a 15,974
(1.72 %)
20,563
(1.66 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
10,459
(100.00 %)
2,634,333
(23.76 %)
703,674
(2.65 %)
8,909,525
(33.95 %)
0
(0 %)
343,235
(1.37 %)
50,430
(2.54 %)
45,982
(1.75 %)
224 common pipistrelle (Broad 2019)
GCA_004026625.1
n/a n/a 21,938
(1.35 %)
53,915
(1.60 %)
n/a 42.88
(99.88 %)
10,870
(0.05 %)
10,870
(0.05 %)
736,974
(99.95 %)
3,499,501
(22.91 %)
1,046,301
(2.96 %)
11,759,516
(37.96 %)
17
(0.00 %)
n/a 92,062
(3.23 %)
75,629
(2.04 %)
225 common pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_965203405.1
n/a n/a 18,233
(1.77 %)
21,445
(1.80 %)
n/a 42.93
(99.98 %)
0
(0 %)
1,650
(0.02 %)
575
(100.00 %)
3,324,262
(26.83 %)
869,167
(7.44 %)
10,218,519
(37.91 %)
6
(0.00 %)
778,854
(2.75 %)
76,006
(3.29 %)
60,694
(1.98 %)
226 common pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_965203405.2
n/a n/a 18,176
(1.76 %)
21,285
(1.78 %)
n/a 42.95
(100.00 %)
12
(0.00 %)
370
(0.00 %)
254
(100.00 %)
3,357,975
(26.71 %)
873,676
(8.26 %)
10,088,614
(38.25 %)
3
(0.00 %)
835,307
(2.96 %)
78,890
(3.25 %)
60,761
(1.97 %)
227 common pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_965204225.1
n/a n/a 18,115
(1.81 %)
21,233
(1.83 %)
n/a 42.89
(99.98 %)
1,602
(0.02 %)
1,602
(0.02 %)
1,971
(99.98 %)
3,303,323
(27.28 %)
852,756
(5.65 %)
10,047,424
(36.41 %)
13
(0.00 %)
655,173
(2.34 %)
69,105
(3.25 %)
60,657
(2.04 %)
228 common pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_965204225.2
n/a n/a 18,092
(1.83 %)
21,286
(1.85 %)
n/a 42.90
(100.00 %)
358
(0.00 %)
358
(0.00 %)
656
(100.00 %)
3,325,603
(27.55 %)
851,200
(4.82 %)
10,152,156
(36.08 %)
2
(0.00 %)
605,388
(2.14 %)
66,359
(3.22 %)
60,960
(2.07 %)
229 common thicket rat (MVZ Mamm 221001 2021)
GCA_019843835.1
n/a n/a 25,148
(1.36 %)
49,594
(1.08 %)
n/a 41.11
(99.52 %)
63,300
(0.44 %)
63,300
(0.44 %)
572,372
(99.56 %)
3,806,717
(32.04 %)
1,181,694
(2.86 %)
12,272,340
(28.58 %)
6,281
(0.11 %)
n/a 16,373
(0.48 %)
14,787
(0.43 %)
230 common vampire bat (v2 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.2
n/a n/a 17,485
(1.76 %)
18,907
(1.66 %)
n/a 42.87
(99.99 %)
0
(0 %)
576
(0.01 %)
429
(100.00 %)
2,592,246
(28.20 %)
352,985
(2.87 %)
10,737,944
(31.11 %)
25
(0.00 %)
264,293
(1.29 %)
61,125
(2.28 %)
42,729
(1.28 %)
231 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.2
58,786
(3.38 %)
n/a 18,507
(1.82 %)
19,451
(1.59 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
0
(0 %)
615
(0.01 %)
574
(100.00 %)
2,960,602
(36.90 %)
431,577
(3.90 %)
11,286,753
(32.62 %)
37
(0.00 %)
367,677
(1.66 %)
71,507
(2.50 %)
83,078
(2.13 %)
232 common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018)
GCF_002940915.2
51,044
(3.24 %)
n/a 18,503
(1.88 %)
18,071
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,246
(2.23 %)
54,246
(2.23 %)
83,364
(97.77 %)
2,799,509
(29.62 %)
275,242
(1.03 %)
11,796,826
(28.19 %)
237
(0.03 %)
174,535
(2.84 %)
51,634
(1.37 %)
47,271
(1.22 %)
233 common warthog (WHEZ1 2021)
GCF_016906955.1
55,156
(2.64 %)
n/a 18,264
(1.56 %)
19,251
(1.34 %)
54,816
(2.83 %)
41.95
(99.61 %)
0
(0 %)
523
(0.39 %)
194
(100.00 %)
3,898,243
(30.33 %)
588,742
(1.17 %)
12,955,929
(36.44 %)
1
(0.00 %)
519,262
(1.56 %)
75,592
(1.86 %)
45,338
(1.21 %)
234 common wombat
GCF_900497805.2
46,365
(1.78 %)
n/a 19,437
(0.86 %)
18,947
(0.96 %)
n/a 38.86
(99.68 %)
0
(0 %)
67,461
(0.33 %)
14,183
(100.00 %)
8,645,969
(41.99 %)
1,203,246
(1.61 %)
23,878,215
(39.11 %)
3,092
(0.01 %)
284,840
(0.59 %)
18,752
(0.37 %)
17,700
(0.31 %)
235 Corsac fox (zsh2022 2023)
GCA_030463245.1
n/a n/a 19,527
(1.61 %)
18,923
(1.35 %)
n/a 41.24
(100.00 %)
0
(0 %)
107
(0.00 %)
202
(100.00 %)
4,435,406
(32.05 %)
981,019
(1.98 %)
13,673,245
(32.65 %)
0
(0 %)
644,894
(1.63 %)
49,252
(2.20 %)
46,666
(1.57 %)
236 cotton mouse (hap1 2026)
GCA_057877385.1
n/a n/a 19,246
(1.53 %)
21,031
(1.33 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
109
(0.00 %)
464
(100.00 %)
7,290,342
(52.57 %)
1,324,779
(10.83 %)
13,875,877
(39.90 %)
3
(0.00 %)
1,375,954
(3.61 %)
24,010
(0.68 %)
19,731
(0.49 %)
237 cotton mouse (hap2 2026)
GCA_057877455.1
n/a n/a 18,393
(1.64 %)
19,527
(1.40 %)
n/a 42.37
(100.00 %)
0
(0 %)
78
(0.00 %)
197
(100.00 %)
6,785,800
(49.24 %)
1,222,530
(8.19 %)
13,058,217
(36.83 %)
0
(0 %)
1,085,301
(3.16 %)
22,704
(0.69 %)
18,988
(0.53 %)
238 coyote (coyote_06102 2023)
GCA_034620425.1
n/a n/a 19,251
(1.60 %)
19,585
(1.40 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
0
(0 %)
93
(0.00 %)
120
(100.00 %)
4,493,000
(32.28 %)
982,814
(2.01 %)
13,803,318
(33.09 %)
0
(0 %)
634,473
(1.64 %)
50,777
(2.23 %)
47,871
(1.58 %)
239 creeping vole
GCF_018167655.1
54,941
(2.31 %)
n/a 23,033
(1.55 %)
25,427
(1.53 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,147
(100.00 %)
4,549,519
(25.66 %)
1,153,429
(13.60 %)
13,568,297
(40.65 %)
0
(0 %)
3,223,361
(6.77 %)
23,141
(0.54 %)
19,563
(0.42 %)
240 crested porcupine
GCA_004026905.1
n/a n/a 21,005
(1.32 %)
35,975
(1.39 %)
n/a 41.51
(99.89 %)
4,351
(0.02 %)
4,351
(0.02 %)
1,140,949
(99.98 %)
4,303,147
(30.69 %)
600,488
(1.19 %)
14,049,490
(33.80 %)
35
(0.00 %)
n/a 57,196
(1.33 %)
41,516
(0.95 %)
241 crested rat (2021)
GCA_907164525.1
n/a n/a 18,829
(1.57 %)
20,084
(1.23 %)
n/a 40.89
(92.16 %)
116,236
(7.85 %)
116,236
(7.85 %)
153,441
(92.15 %)
6,937,911
(48.56 %)
1,051,397
(2.16 %)
13,178,644
(37.15 %)
8,286
(0.10 %)
761,138
(1.87 %)
22,912
(0.47 %)
20,486
(0.42 %)
242 Crete spiny mouse (2024)
GCA_964271855.1
n/a n/a 19,467
(1.76 %)
18,734
(1.43 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
113
(100.00 %)
4,718,848
(32.83 %)
1,327,449
(6.80 %)
12,893,458
(34.03 %)
0
(0 %)
1,009,136
(2.74 %)
21,236
(0.61 %)
17,412
(0.44 %)
243 Crete spiny mouse (2025 genbank)
GCA_964271855.5
n/a n/a 19,050
(1.82 %)
18,719
(1.43 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
112
(100.00 %)
5,710,100
(41.99 %)
1,327,449
(6.80 %)
12,893,310
(34.03 %)
0
(0 %)
1,009,081
(2.74 %)
21,236
(0.61 %)
19,155
(0.54 %)
244 Crete spiny mouse (2025 refseq)
GCF_964271855.1
66,570
(3.41 %)
n/a 19,050
(1.82 %)
18,721
(1.43 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
112
(100.00 %)
5,710,100
(41.99 %)
1,327,449
(6.80 %)
12,893,309
(34.03 %)
0
(0 %)
1,009,081
(2.74 %)
21,236
(0.61 %)
19,155
(0.54 %)
245 Cucacao Myotis (hap1 2026)
GCA_054855985.1
n/a n/a 18,818
(1.71 %)
22,379
(1.61 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
0
(0 %)
173
(0.00 %)
193
(100.00 %)
5,262,057
(49.88 %)
855,921
(7.52 %)
10,259,960
(40.77 %)
1
(0.00 %)
1,148,232
(3.75 %)
65,544
(2.34 %)
50,749
(1.71 %)
246 Cucacao Myotis (hap2 2026)
GCA_054855975.1
n/a n/a 17,661
(1.79 %)
20,358
(1.64 %)
n/a 42.80
(100.00 %)
0
(0 %)
174
(0.00 %)
150
(100.00 %)
4,786,224
(48.01 %)
751,852
(6.76 %)
9,699,043
(38.95 %)
1
(0.00 %)
823,672
(2.98 %)
57,353
(2.24 %)
44,175
(1.64 %)
247 Cuvier's beaked whale
GCA_004364475.1
n/a n/a 23,700
(0.90 %)
51,715
(0.86 %)
n/a 42.01
(99.76 %)
3,229
(0.01 %)
3,229
(0.01 %)
3,761,505
(99.99 %)
6,544,424
(43.61 %)
1,417,186
(3.11 %)
16,127,873
(42.25 %)
43
(0.00 %)
n/a 68,668
(1.15 %)
53,793
(0.96 %)
248 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa alternate hap 2024)
GCA_043880225.1
n/a n/a 18,335
(1.64 %)
20,207
(1.46 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,440
(100.00 %)
4,675,929
(43.51 %)
742,038
(2.58 %)
11,746,853
(36.11 %)
0
(0 %)
1,280,177
(3.44 %)
47,949
(1.04 %)
23,817
(0.70 %)
249 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024)
GCA_043880285.1
n/a n/a 18,610
(1.67 %)
19,098
(1.39 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
7
(0.00 %)
334
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,077,286
(41.85 %)
754,689
(2.64 %)
11,873,386
(36.16 %)
1
(0.00 %)
1,326,571
(3.53 %)
48,137
(1.04 %)
24,623
(0.71 %)
250 Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI)
GCF_000743615.1
52,373
(2.57 %)
n/a 17,983
(1.45 %)
17,063
(1.43 %)
n/a 40.34
(97.96 %)
87,815
(2.05 %)
87,815
(2.05 %)
162,545
(97.95 %)
4,053,433
(30.86 %)
545,281
(1.74 %)
13,406,483
(30.65 %)
793
(0.06 %)
243,492
(1.42 %)
37,008
(0.74 %)
33,397
(0.64 %)
251 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo)
GCF_012274545.1
58,091
(2.74 %)
n/a 17,780
(1.44 %)
16,515
(1.42 %)
n/a 40.34
(97.94 %)
0
(0 %)
88,899
(2.07 %)
73,970
(100.00 %)
4,035,140
(30.95 %)
544,772
(1.73 %)
13,390,872
(30.61 %)
838
(0.06 %)
245,667
(1.44 %)
37,008
(0.74 %)
33,408
(0.64 %)
252 Darling's horseshoe bat (hap1 2026)
GCA_057427945.1
n/a n/a 18,798
(1.86 %)
20,919
(1.64 %)
n/a 40.67
(100.00 %)
0
(0 %)
59
(0.00 %)
223
(100.00 %)
3,581,848
(41.00 %)
560,680
(2.97 %)
12,112,526
(30.87 %)
0
(0 %)
715,307
(2.12 %)
34,026
(1.18 %)
30,448
(0.99 %)
253 Darling's horseshoe bat (hap2 2026)
GCA_057428265.1
n/a n/a 17,853
(1.82 %)
19,924
(1.60 %)
n/a 41.00
(100.00 %)
0
(0 %)
104
(0.00 %)
822
(100.00 %)
3,352,243
(43.10 %)
530,397
(7.87 %)
11,337,379
(33.03 %)
0
(0 %)
1,767,391
(4.34 %)
32,081
(1.08 %)
28,476
(0.93 %)
254 dassie-rat
GCA_004026965.1
n/a n/a 20,479
(1.16 %)
42,937
(1.41 %)
n/a 41.86
(99.89 %)
9,645
(0.04 %)
9,645
(0.04 %)
920,324
(99.96 %)
4,563,054
(28.83 %)
660,623
(1.92 %)
12,899,807
(34.48 %)
14
(0.00 %)
n/a 46,569
(1.25 %)
40,791
(1.01 %)
255 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1
n/a n/a 18,895
(1.78 %)
24,235
(1.81 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,930
(100.00 %)
2,813,870
(23.75 %)
718,406
(5.18 %)
9,977,320
(37.24 %)
0
(0 %)
609,378
(2.37 %)
62,910
(2.66 %)
55,962
(1.97 %)
256 Daubenton's bat (hap1.2 2025)
GCA_963259705.2
n/a n/a 19,016
(1.77 %)
22,392
(1.66 %)
n/a 43.17
(100.00 %)
0
(0 %)
219
(0.00 %)
176
(100.00 %)
5,102,002
(45.10 %)
815,584
(6.94 %)
10,416,086
(39.34 %)
6
(0.00 %)
829,407
(2.99 %)
66,271
(2.56 %)
56,702
(2.15 %)
257 Daubenton's bat (hap2.2 2025)
GCA_963242275.2
n/a n/a 18,127
(1.87 %)
21,346
(1.75 %)
n/a 43.37
(100.00 %)
0
(0 %)
136
(0.00 %)
208
(100.00 %)
4,712,850
(43.86 %)
726,883
(5.33 %)
9,942,977
(37.29 %)
1
(0.00 %)
631,553
(2.48 %)
62,442
(2.66 %)
54,783
(2.31 %)
258 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1
64,558
(3.32 %)
n/a 19,141
(1.72 %)
22,133
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
0
(0 %)
1,099
(0.01 %)
121
(100.00 %)
3,040,232
(24.03 %)
796,911
(6.38 %)
10,478,180
(38.84 %)
9
(0.00 %)
756,429
(2.76 %)
64,920
(2.51 %)
57,806
(1.88 %)
259 Daurian ground squirrel
GCA_002406435.1
n/a n/a 20,990
(1.31 %)
17,575
(1.17 %)
n/a 39.77
(96.15 %)
141,850
(3.84 %)
141,850
(3.84 %)
502,654
(96.16 %)
5,783,538
(34.36 %)
924,038
(3.73 %)
17,533,301
(30.85 %)
318
(0.01 %)
1,230,179
(17.33 %)
27,955
(0.39 %)
26,034
(0.36 %)
260 David's myotis bat
GCF_000327345.1
37,645
(2.70 %)
n/a 18,744
(1.78 %)
17,565
(1.62 %)
n/a 42.69
(91.23 %)
223,511
(8.80 %)
223,511
(8.80 %)
325,280
(91.20 %)
2,680,166
(23.79 %)
532,273
(1.90 %)
11,016,028
(29.55 %)
303
(0.05 %)
n/a 59,615
(1.59 %)
49,977
(1.17 %)
261 Davis's round-eared bat (hap1 2025)
GCA_051307075.1
n/a n/a 17,736
(1.53 %)
21,703
(1.45 %)
n/a 42.03
(100.00 %)
0
(0 %)
153
(0.00 %)
311
(100.00 %)
4,450,174
(45.25 %)
390,322
(7.86 %)
12,108,244
(37.90 %)
0
(0 %)
542,413
(1.83 %)
76,695
(4.57 %)
65,855
(4.12 %)
262 Davis's round-eared bat (hap2 2025)
GCA_051307065.1
n/a n/a 16,878
(1.65 %)
20,512
(1.56 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
113
(0.00 %)
148
(100.00 %)
3,720,522
(43.45 %)
352,035
(4.96 %)
11,326,247
(34.44 %)
0
(0 %)
432,006
(1.68 %)
72,242
(4.65 %)
62,245
(4.14 %)
263 degu (3935 2012 refseq)
GCF_000260255.1
48,165
(2.13 %)
n/a 22,242
(1.41 %)
22,101
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,770
(15.68 %)
252,772
(15.68 %)
259,904
(84.32 %)
4,901,673
(27.74 %)
898,945
(1.50 %)
14,282,003
(29.30 %)
2,582
(0.03 %)
313,028
(1.02 %)
40,135
(0.82 %)
36,410
(0.69 %)
264 desert hamster (2022)
GCF_943737965.1
37,291
(2.11 %)
n/a 19,744
(1.74 %)
20,215
(1.50 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,079
(100.00 %)
4,038,079
(31.01 %)
1,132,871
(2.71 %)
11,946,112
(32.62 %)
0
(0 %)
618,568
(1.94 %)
17,053
(0.51 %)
15,416
(0.41 %)
265 Desmarest's hutia
GCA_004027915.1
n/a n/a 23,535
(0.78 %)
50,796
(0.95 %)
n/a 42.03
(99.83 %)
3,492
(0.01 %)
3,492
(0.01 %)
2,355,850
(99.99 %)
5,790,506
(26.72 %)
1,062,134
(1.71 %)
16,977,224
(35.29 %)
16
(0.00 %)
n/a 54,479
(1.01 %)
46,753
(0.82 %)
266 dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW)
GCF_012295265.1
102,060
(4.04 %)
n/a 19,777
(1.69 %)
20,341
(1.41 %)
n/a 41.29
(99.69 %)
0
(0 %)
325
(0.31 %)
477
(100.00 %)
4,950,808
(42.83 %)
1,033,921
(2.36 %)
13,745,703
(33.32 %)
0
(0 %)
820,425
(2.05 %)
51,835
(2.25 %)
47,504
(1.92 %)
267 dingo (Sandy 2020 James Cook U)
GCF_003254725.2
104,332
(4.50 %)
n/a 19,710
(1.72 %)
19,857
(1.42 %)
n/a 41.24
(100.00 %)
0
(0 %)
69
(0.00 %)
159
(100.00 %)
4,547,906
(33.32 %)
993,474
(2.19 %)
13,701,060
(33.18 %)
0
(0 %)
716,455
(1.82 %)
51,216
(2.28 %)
51,748
(2.14 %)
268 dog (Basenji MU ID 185726 2019)
GCA_004886185.2
n/a n/a 19,889
(1.67 %)
20,501
(1.39 %)
n/a 41.36
(99.99 %)
1,387
(0.01 %)
1,388
(0.01 %)
3,630
(99.99 %)
4,950,227
(43.32 %)
1,059,639
(2.97 %)
13,694,849
(33.70 %)
3
(0.00 %)
1,006,008
(2.40 %)
51,443
(2.16 %)
47,254
(1.90 %)
269 dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021)
GCA_013276365.2
n/a n/a 19,310
(1.60 %)
19,947
(1.42 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
631
(100.00 %)
4,452,916
(32.14 %)
960,590
(2.23 %)
13,685,353
(33.01 %)
0
(0 %)
644,106
(1.68 %)
50,715
(2.22 %)
47,698
(1.58 %)
270 dog (Bernese Mountain Dog BD 2023)
GCA_031010765.1
n/a n/a 19,211
(1.60 %)
20,327
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
0
(0 %)
641
(0.00 %)
175
(100.00 %)
4,471,016
(32.18 %)
984,776
(2.03 %)
13,719,474
(32.88 %)
0
(0 %)
644,486
(1.60 %)
51,050
(2.25 %)
47,721
(1.59 %)
271 dog (Bernese Mountain Dog OD 2023)
GCA_031010635.1
n/a n/a 19,279
(1.60 %)
20,348
(1.44 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
0
(0 %)
1,015
(0.00 %)
159
(100.00 %)
4,491,081
(32.21 %)
996,142
(2.01 %)
13,761,195
(32.97 %)
0
(0 %)
645,724
(1.69 %)
51,490
(2.25 %)
48,166
(1.60 %)
272 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3
82,536
(3.63 %)
n/a 19,772
(1.66 %)
19,565
(1.39 %)
n/a 41.31
(99.25 %)
23,876
(0.76 %)
23,876
(0.76 %)
27,106
(99.24 %)
4,918,098
(43.29 %)
991,835
(2.81 %)
13,644,959
(33.60 %)
34
(0.00 %)
971,687
(2.39 %)
53,269
(2.07 %)
48,154
(1.73 %)
273 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5
93,761
(3.84 %)
n/a 19,392
(1.71 %)
19,572
(1.42 %)
52,141
(3.27 %)
41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
1,028
(0.00 %)
147
(100.00 %)
23,927,903
(42.42 %)
972,851
(2.05 %)
13,611,845
(33.11 %)
0
(0 %)
657,594
(1.69 %)
50,679
(2.26 %)
46,402
(1.93 %)
274 dog (Cairn Terrier CA611 2023)
GCA_031010295.1
n/a n/a 19,255
(1.61 %)
20,479
(1.45 %)
n/a 41.19
(100.00 %)
0
(0 %)
262
(0.00 %)
141
(100.00 %)
4,490,019
(32.25 %)
989,383
(1.99 %)
13,710,808
(32.97 %)
0
(0 %)
634,521
(1.63 %)
50,883
(2.22 %)
47,572
(1.58 %)
275 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1
96,734
(3.71 %)
n/a 20,135
(1.64 %)
20,871
(1.38 %)
56,772
(3.19 %)
41.50
(100.00 %)
585
(0.00 %)
585
(0.00 %)
2,782
(100.00 %)
20,264,827
(43.87 %)
1,152,879
(3.22 %)
13,784,690
(34.30 %)
9
(0.00 %)
1,226,639
(2.84 %)
53,518
(2.23 %)
49,021
(1.97 %)
276 dog (German Shepherd Nala 2020)
GCA_008641055.3
n/a n/a 19,757
(1.69 %)
20,201
(1.41 %)
n/a 41.32
(99.74 %)
0
(0 %)
458
(0.26 %)
410
(100.00 %)
4,974,233
(43.03 %)
1,048,366
(2.46 %)
13,881,889
(33.61 %)
0
(0 %)
887,952
(2.14 %)
51,900
(2.21 %)
47,682
(1.96 %)
277 dog (Labrador retriever 2023)
GCA_031165255.1
n/a n/a 19,256
(1.61 %)
20,247
(1.44 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
0
(0 %)
516
(0.00 %)
675
(100.00 %)
4,456,220
(32.19 %)
960,584
(1.96 %)
13,688,006
(32.82 %)
0
(0 %)
620,296
(1.57 %)
50,670
(2.21 %)
47,790
(1.59 %)
278 dog (labrador SID07034 2020)
GCF_014441545.1
99,420
(3.87 %)
n/a 19,870
(1.70 %)
20,252
(1.41 %)
54,322
(3.23 %)
41.19
(99.47 %)
0
(0 %)
575
(0.53 %)
376
(100.00 %)
4,981,985
(42.28 %)
1,019,772
(1.97 %)
13,959,750
(32.77 %)
2
(0.01 %)
648,526
(1.66 %)
52,469
(2.25 %)
48,334
(1.95 %)
279 dog (poodle 2003)
GCA_000181415.1
n/a n/a 12,852
(0.53 %)
24,666
(0.57 %)
n/a 41.09
(99.86 %)
0
(0 %)
n/a 1,089,636
(100.00 %)
3,212,912
(39.08 %)
549,098
(1.63 %)
8,833,799
(29.80 %)
0
(0 %)
n/a 41,068
(1.31 %)
35,977
(1.11 %)
280 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU)
GCF_000181335.3
72,076
(3.30 %)
n/a 18,662
(1.64 %)
20,897
(1.37 %)
n/a 41.73
(98.20 %)
403
(1.80 %)
436
(1.80 %)
5,079
(98.20 %)
5,086,462
(43.51 %)
964,126
(2.68 %)
13,947,871
(33.33 %)
0
(0 %)
785,059
(2.13 %)
69,701
(2.41 %)
61,568
(1.95 %)
281 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU)
GCA_000181335.5
n/a n/a 18,378
(1.53 %)
21,242
(1.40 %)
n/a 41.73
(98.21 %)
350
(1.69 %)
422
(1.79 %)
5,010
(98.31 %)
4,683,703
(33.33 %)
964,129
(2.68 %)
13,948,305
(33.33 %)
0
(0 %)
784,749
(2.13 %)
69,725
(2.42 %)
63,619
(1.83 %)
282 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021)
GCA_000181335.6
n/a n/a 18,357
(1.55 %)
20,085
(1.38 %)
n/a 41.76
(98.18 %)
350
(1.72 %)
422
(1.82 %)
1,254
(98.28 %)
4,661,997
(33.78 %)
947,221
(2.58 %)
13,867,949
(33.67 %)
0
(0 %)
696,984
(2.13 %)
68,011
(2.41 %)
62,123
(1.82 %)
283 domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U)
GCF_018350175.1
99,222
(4.40 %)
n/a 18,456
(1.66 %)
19,833
(1.39 %)
94,133
(5.63 %)
41.81
(100.00 %)
31
(0.00 %)
39
(0.00 %)
102
(100.00 %)
4,965,571
(43.65 %)
932,424
(1.95 %)
13,596,808
(33.85 %)
0
(0 %)
555,637
(1.52 %)
67,329
(2.48 %)
60,307
(2.00 %)
284 domestic cattle (Mongolian 80415 2024)
GCA_043882115.1
n/a n/a 19,213
(1.34 %)
21,950
(1.20 %)
n/a 43.41
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
46
(100.00 %)
6,723,585
(53.11 %)
1,123,913
(13.40 %)
12,798,664
(48.31 %)
0
(0 %)
2,143,284
(5.09 %)
85,793
(6.20 %)
41,005
(4.56 %)
285 domestic cattle (Tuli MAZUNGA 2024)
GCA_040285425.1
n/a n/a 19,454
(1.36 %)
22,081
(1.21 %)
n/a 44.04
(99.98 %)
0
(0 %)
31
(0.02 %)
878
(100.00 %)
6,506,177
(50.93 %)
1,038,848
(13.71 %)
11,547,434
(49.22 %)
0
(0 %)
2,025,362
(5.06 %)
84,199
(8.81 %)
51,490
(6.94 %)
286 domestic cattle (Wagyu 3DWFS0412 2024)
GCA_040286185.1
n/a n/a 19,252
(1.32 %)
22,269
(1.20 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
5
(0.01 %)
17
(0.04 %)
407
(99.99 %)
6,783,665
(51.29 %)
1,072,289
(13.17 %)
12,697,022
(49.18 %)
1
(0.00 %)
2,150,279
(5.22 %)
89,666
(8.32 %)
49,463
(7.02 %)
287 domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020)
GCF_011764305.1
68,868
(3.09 %)
n/a 19,019
(1.55 %)
21,812
(1.42 %)
n/a 41.90
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,224
(100.00 %)
4,650,028
(39.49 %)
745,115
(2.02 %)
13,758,447
(36.14 %)
0
(0 %)
1,196,360
(3.06 %)
58,684
(2.16 %)
59,034
(1.99 %)
288 domestic ferret (Sable 2011 Broad)
GCA_000239315.1
n/a n/a 18,778
(1.67 %)
19,571
(1.47 %)
n/a 41.48
(96.89 %)
72,670
(3.12 %)
72,670
(3.12 %)
76,914
(96.88 %)
4,491,876
(40.13 %)
618,556
(1.07 %)
13,721,938
(31.04 %)
1,362
(0.02 %)
377,830
(1.02 %)
54,600
(1.94 %)
53,359
(1.69 %)
289 domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023)
GCF_034190915.1
79,333
(3.55 %)
n/a 17,999
(1.09 %)
21,509
(1.20 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
84
(0.00 %)
84
(0.00 %)
672
(100.00 %)
5,037,431
(41.68 %)
886,785
(13.97 %)
14,620,284
(42.71 %)
1
(0.00 %)
2,850,832
(6.00 %)
39,682
(0.89 %)
26,858
(0.57 %)
290 domestic guinea pig (2N 2008 refseq)
GCF_000151735.1
44,762
(2.31 %)
n/a 18,301
(1.33 %)
20,111
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
58,460
(2.20 %)
61,604
(97.80 %)
4,257,852
(38.85 %)
658,533
(1.25 %)
14,547,726
(34.19 %)
3
(0.00 %)
423,409
(1.39 %)
37,093
(0.85 %)
27,300
(0.63 %)
291 domestic yak (maiwa yakHY00 2019)
GCA_005887515.3
n/a n/a 18,672
(1.39 %)
19,408
(1.24 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
0
(0 %)
646
(0.00 %)
343
(100.00 %)
3,570,978
(23.00 %)
583,762
(8.57 %)
14,055,227
(40.52 %)
0
(0 %)
2,774,518
(21.40 %)
43,883
(1.17 %)
40,029
(0.94 %)
292 domestic yak (Pamir PY7600 2026)
GCF_055505025.1
139,812
(4.26 %)
n/a 19,009
(1.56 %)
21,215
(1.34 %)
n/a 41.90
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
31
(100.00 %)
6,364,775
(50.31 %)
452,332
(1.58 %)
12,984,103
(41.16 %)
0
(0 %)
1,211,736
(3.33 %)
41,459
(1.23 %)
37,045
(1.01 %)
293 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1
n/a n/a 18,354
(1.22 %)
20,434
(1.08 %)
n/a 40.65
(100.00 %)
0
(0 %)
96
(0.00 %)
198
(100.00 %)
4,458,084
(33.00 %)
444,499
(1.79 %)
15,031,940
(47.42 %)
0
(0 %)
508,936
(1.29 %)
29,863
(0.83 %)
24,007
(0.54 %)
294 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1
n/a n/a 18,538
(1.23 %)
20,775
(1.09 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
0
(0 %)
89
(0.00 %)
167
(100.00 %)
4,455,227
(33.01 %)
444,021
(1.73 %)
14,946,847
(47.37 %)
1
(0.00 %)
504,439
(1.27 %)
29,828
(0.79 %)
24,008
(0.54 %)
295 dwarf bonneted bat (hap1 2026)
GCA_058972175.1
n/a n/a 19,701
(1.66 %)
22,894
(1.55 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
91
(0.00 %)
159
(100.00 %)
4,868,188
(46.76 %)
814,580
(2.65 %)
11,250,323
(40.87 %)
3
(0.00 %)
1,229,968
(3.85 %)
94,798
(3.08 %)
78,015
(2.28 %)
296 dwarf bonneted bat (hap2 2026)
GCA_058971805.1
n/a n/a 19,646
(1.68 %)
22,856
(1.56 %)
n/a 42.89
(100.00 %)
0
(0 %)
112
(0.00 %)
114
(100.00 %)
4,830,940
(46.92 %)
798,083
(2.59 %)
11,230,678
(40.34 %)
2
(0.00 %)
1,205,198
(3.81 %)
94,036
(3.05 %)
77,444
(2.27 %)
297 dwarf fruit-eating bat (hap1 2025)
GCA_051107565.1
n/a n/a 17,834
(1.67 %)
19,738
(1.55 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
77
(0.00 %)
106
(100.00 %)
3,731,962
(43.43 %)
377,985
(3.87 %)
11,915,741
(34.43 %)
1
(0.00 %)
527,224
(2.07 %)
72,159
(2.56 %)
55,565
(2.04 %)
298 dwarf fruit-eating bat (hap2 2025)
GCA_051107595.1
n/a n/a 16,790
(1.71 %)
18,246
(1.55 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
102
(100.00 %)
3,412,455
(42.90 %)
339,875
(3.98 %)
10,947,746
(33.73 %)
2
(0.00 %)
468,703
(1.96 %)
65,083
(2.56 %)
50,711
(2.13 %)
299 dwarf mongoose
GCA_004023845.1
n/a n/a 21,478
(1.57 %)
32,174
(1.43 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
10,815
(0.05 %)
10,815
(0.05 %)
200,185
(99.95 %)
4,574,991
(40.34 %)
595,520
(1.11 %)
13,720,585
(32.94 %)
42
(0.00 %)
180,761
(0.49 %)
70,689
(2.42 %)
67,427
(2.05 %)
300 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1
n/a n/a 18,522
(1.26 %)
22,314
(1.28 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
0
(0 %)
316
(0.00 %)
99
(100.00 %)
3,699,683
(20.55 %)
935,350
(11.22 %)
13,112,318
(44.07 %)
1
(0.00 %)
n/a 99,224
(2.27 %)
68,695
(1.75 %)
301 eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022)
GCA_921998335.2
n/a n/a 21,903
(2.13 %)
19,801
(1.40 %)
108,675
(4.42 %)
41.79
(99.89 %)
3
(0.00 %)
207
(0.11 %)
211
(100.00 %)
4,630,645
(40.56 %)
1,531,506
(3.70 %)
13,011,312
(35.48 %)
2
(0.00 %)
816,051
(2.46 %)
22,270
(0.54 %)
15,877
(0.42 %)
302 eastern mole
GCA_004024925.1
n/a n/a 19,631
(1.57 %)
32,414
(1.63 %)
n/a 42.02
(99.91 %)
7,239
(0.03 %)
7,239
(0.03 %)
647,535
(99.97 %)
3,145,725
(29.42 %)
554,620
(1.75 %)
10,663,504
(32.88 %)
18
(0.00 %)
n/a 55,063
(3.69 %)
48,440
(3.22 %)
303 eastern quoll
GCA_020854095.1
n/a n/a 15,715
(0.80 %)
16,750
(0.93 %)
n/a 36.19
(100.00 %)
0
(0 %)
431
(0.00 %)
76
(100.00 %)
5,256,999
(24.81 %)
1,280,160
(3.39 %)
21,362,866
(41.74 %)
2
(0.00 %)
642,432
(1.62 %)
24,508
(0.70 %)
24,041
(0.54 %)
304 eastern spiny mouse (2021)
GCA_907164435.1
n/a n/a 20,397
(1.93 %)
20,515
(1.44 %)
n/a 42.68
(98.12 %)
3,526
(0.10 %)
109,220
(1.90 %)
19,837
(99.90 %)
4,701,702
(33.98 %)
1,304,933
(2.91 %)
13,145,044
(31.05 %)
6,458
(0.04 %)
453,997
(1.14 %)
19,636
(0.56 %)
18,226
(0.51 %)
305 eastern woodrat (hap1 2025)
GCA_050000055.1
n/a n/a 19,460
(1.37 %)
22,249
(1.25 %)
n/a 40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
154
(0.00 %)
1,382
(100.00 %)
7,741,791
(54.00 %)
2,194,305
(10.09 %)
13,803,906
(42.49 %)
2
(0.00 %)
3,045,177
(5.33 %)
22,114
(0.48 %)
18,925
(0.39 %)
306 eastern woodrat (hap2 2025)
GCA_050000045.1
n/a n/a 18,460
(1.50 %)
21,237
(1.36 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
0
(0 %)
154
(0.00 %)
942
(100.00 %)
6,975,151
(51.59 %)
1,843,248
(8.41 %)
12,873,831
(39.03 %)
1
(0.00 %)
2,293,923
(4.56 %)
20,366
(0.52 %)
17,751
(0.43 %)
307 Egyptian rousette (1219 2016 Boston U)
GCF_001466805.2
54,791
(4.93 %)
n/a 18,221
(2.05 %)
24,192
(1.88 %)
46,601
(2.22 %)
40.02
(99.97 %)
0
(0 %)
638
(0.03 %)
2,490
(100.00 %)
2,815,693
(32.23 %)
440,119
(1.01 %)
12,346,041
(26.86 %)
0
(0 %)
74,090
(0.43 %)
56,244
(6.54 %)
61,126
(5.16 %)
308 Egyptian rousette (primary hap 2025)
GCA_014176215.2
n/a n/a 17,319
(2.06 %)
22,433
(1.85 %)
n/a 40.05
(98.63 %)
0
(0 %)
250
(1.37 %)
27
(100.00 %)
3,010,528
(35.56 %)
434,429
(1.02 %)
12,031,135
(26.53 %)
0
(0 %)
65,582
(0.33 %)
53,517
(6.74 %)
57,229
(5.18 %)
309 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1
65,163
(4.76 %)
n/a 17,642
(2.07 %)
22,317
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
0
(0 %)
242
(1.41 %)
29
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,414
(1.02 %)
12,031,597
(26.52 %)
0
(0 %)
65,562
(0.33 %)
53,573
(4.84 %)
57,281
(4.47 %)
310 Egyptian spiny mouse (US019 2019)
GCA_004027535.1
n/a n/a 23,498
(1.69 %)
36,970
(1.40 %)
30,076
(1.58 %)
42.71
(99.88 %)
20,469
(0.09 %)
20,469
(0.09 %)
391,811
(99.91 %)
4,983,574
(35.17 %)
1,342,514
(3.45 %)
13,029,270
(32.79 %)
32
(0.00 %)
n/a 19,944
(0.55 %)
18,844
(0.51 %)
311 Eld's deer (hap1 2026)
GCA_054824865.1
n/a n/a 20,240
(1.16 %)
22,436
(1.05 %)
n/a n/a 0
(0 %)
952
(0.01 %)
3,422
(100.00 %)
5,941,523
(62.49 %)
634,128
(29.99 %)
13,002,287
(56.20 %)
33
(0.00 %)
3,227,053
(6.67 %)
69,829
(2.06 %)
47,408
(1.13 %)
312 Eld's deer (hap2 2026)
GCA_054824845.1
n/a n/a 19,521
(1.50 %)
22,180
(1.33 %)
n/a 42.69
(100.00 %)
0
(0 %)
397
(0.00 %)
902
(100.00 %)
5,867,476
(52.38 %)
497,079
(9.42 %)
13,109,210
(43.24 %)
10
(0.00 %)
1,218,313
(3.33 %)
54,156
(1.66 %)
43,734
(1.18 %)
313 elk (wapiti)
GCF_019320065.1
66,846
(3.00 %)
n/a 20,090
(1.67 %)
21,999
(1.44 %)
n/a 41.62
(99.93 %)
0
(0 %)
6,643
(0.08 %)
185
(100.00 %)
4,884,711
(43.14 %)
429,925
(1.65 %)
13,135,255
(37.85 %)
78
(0.00 %)
802,680
(2.76 %)
47,099
(1.31 %)
44,586
(1.19 %)
314 ermine (2020)
GCF_009829155.1
74,345
(3.19 %)
n/a 18,855
(1.65 %)
20,667
(1.43 %)
44,584
(2.07 %)
41.56
(99.12 %)
0
(0 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,647,934
(41.44 %)
714,174
(1.30 %)
13,845,904
(33.42 %)
3
(0.01 %)
452,963
(1.26 %)
56,065
(2.25 %)
56,447
(2.07 %)
315 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1
n/a n/a 13,583
(1.65 %)
15,403
(1.46 %)
n/a 41.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,327
(100.00 %)
3,139,035
(40.57 %)
480,111
(1.29 %)
9,106,061
(31.93 %)
0
(0 %)
342,175
(1.40 %)
39,139
(2.25 %)
38,863
(2.02 %)
316 ermine (hap1.1 2025)
GCA_965636865.1
n/a n/a 18,538
(1.35 %)
23,646
(1.36 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
212
(0.00 %)
1,036
(100.00 %)
6,455,322
(46.66 %)
881,285
(5.47 %)
13,096,768
(42.14 %)
4
(0.00 %)
1,333,576
(3.60 %)
93,973
(3.17 %)
56,856
(1.86 %)
317 ermine (hap2.1 2025)
GCA_965636855.1
n/a n/a 17,654
(1.42 %)
22,483
(1.40 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
139
(0.00 %)
139
(0.00 %)
1,083
(100.00 %)
5,945,296
(44.94 %)
800,358
(4.39 %)
12,526,091
(40.11 %)
3
(0.00 %)
1,020,366
(2.96 %)
85,220
(2.90 %)
53,568
(1.87 %)
318 ermine (primary hap 2020)
GCA_009829155.1
n/a n/a 18,855
(1.65 %)
20,668
(1.43 %)
n/a 41.56
(99.12 %)
0
(0 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,647,997
(41.44 %)
714,178
(1.30 %)
13,845,820
(33.42 %)
3
(0.01 %)
530,336
(1.47 %)
56,065
(2.25 %)
56,448
(2.07 %)
319 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1
n/a n/a 19,332
(1.42 %)
22,424
(1.40 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
0
(0 %)
27
(0.00 %)
726
(100.00 %)
4,362,536
(31.74 %)
801,232
(4.02 %)
13,893,672
(37.73 %)
1
(0.00 %)
1,089,255
(2.94 %)
65,806
(4.13 %)
53,831
(1.83 %)
320 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2
n/a n/a 19,268
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
41,043
(1.93 %)
42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,417,203
(31.72 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,720
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,257
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
54,563
(1.83 %)
321 Eurasian beaver (alternate hap 2025)
GCA_977035955.1
n/a n/a 14,184
(1.28 %)
14,518
(1.21 %)
n/a 40.16
(99.94 %)
12,413
(0.06 %)
12,413
(0.06 %)
17,640
(99.94 %)
2,894,516
(33.23 %)
469,512
(3.63 %)
8,909,825
(39.95 %)
354
(0.02 %)
873,169
(9.81 %)
18,772
(1.65 %)
14,598
(0.48 %)
322 Eurasian beaver (primary hap 2025)
GCA_977036005.1
n/a n/a 20,316
(1.47 %)
20,429
(1.25 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
0
(0 %)
237
(0.00 %)
228
(100.00 %)
4,115,552
(36.09 %)
562,383
(2.69 %)
14,321,638
(36.02 %)
3
(0.00 %)
763,351
(2.48 %)
24,219
(0.75 %)
24,015
(0.66 %)
323 Eurasian field mouse (2024)
GCA_964023405.1
n/a n/a 20,487
(1.88 %)
19,707
(1.34 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
0
(0 %)
182
(0.00 %)
61
(100.00 %)
5,115,510
(39.18 %)
1,868,284
(4.29 %)
13,503,826
(37.29 %)
2
(0.00 %)
1,262,006
(3.13 %)
26,414
(0.61 %)
24,636
(0.56 %)
324 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1
n/a n/a 12,437
(1.51 %)
12,702
(1.22 %)
n/a 40.06
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
10,657
(100.00 %)
2,303,176
(35.38 %)
353,996
(1.49 %)
7,218,556
(31.67 %)
0
(0 %)
194,541
(1.24 %)
24,268
(1.07 %)
22,754
(0.97 %)
325 Eurasian red squirrel (primary hap 2019)
GCF_902686455.1
65,975
(3.30 %)
n/a 20,156
(1.54 %)
21,025
(1.36 %)
n/a 40.08
(94.33 %)
1,177
(5.67 %)
1,177
(5.67 %)
1,815
(94.33 %)
5,315,833
(42.85 %)
704,218
(1.42 %)
14,991,523
(31.49 %)
5
(0.00 %)
419,661
(1.29 %)
48,159
(1.04 %)
38,984
(0.85 %)
326 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2
n/a n/a 21,309
(1.58 %)
21,026
(1.36 %)
33,465
(1.53 %)
40.08
(94.33 %)
0
(0 %)
1,177
(5.67 %)
639
(100.00 %)
4,677,412
(35.73 %)
704,218
(1.42 %)
14,992,063
(31.49 %)
5
(0.00 %)
419,661
(1.29 %)
48,159
(1.04 %)
45,470
(0.95 %)
327 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1
67,269
(2.96 %)
n/a 18,842
(1.54 %)
20,178
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
0
(0 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,259,294
(33.39 %)
713,721
(1.36 %)
13,626,048
(34.37 %)
1
(0.00 %)
695,796
(1.86 %)
57,073
(1.82 %)
47,446
(1.36 %)
328 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1
n/a n/a 9,910
(1.59 %)
11,315
(1.31 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,506
(100.00 %)
2,052,338
(42.25 %)
316,084
(1.64 %)
6,222,460
(33.12 %)
0
(0 %)
291,189
(1.91 %)
27,057
(1.96 %)
26,047
(1.75 %)
329 Eurasian river otter (primary hap 2020)
GCA_902655055.2
n/a n/a 19,133
(1.66 %)
20,177
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
0
(0 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,736,483
(42.28 %)
713,721
(1.36 %)
13,625,976
(34.37 %)
1
(0.00 %)
695,796
(1.86 %)
57,073
(1.82 %)
54,770
(1.64 %)
330 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1
n/a n/a 16,761
(1.66 %)
19,715
(1.37 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
105
(0.00 %)
105
(0.00 %)
16,473
(100.00 %)
3,118,266
(26.44 %)
829,463
(2.82 %)
9,700,482
(31.37 %)
0
(0 %)
353,652
(1.44 %)
14,146
(0.57 %)
12,571
(0.45 %)
331 Eurasian water vole (primary hap 2021)
GCA_903992535.2
n/a n/a 19,126
(1.84 %)
19,054
(1.47 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
5,439,454
(42.21 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,486
(32.42 %)
5
(0.00 %)
518,665
(1.69 %)
19,000
(0.58 %)
17,235
(0.51 %)
332 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
n/a 19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
36,935
(2.27 %)
42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
5
(0.00 %)
518,667
(1.69 %)
19,000
(0.58 %)
16,851
(0.46 %)
333 European badger
GCF_922984935.2
57,137
(2.48 %)
n/a 18,649
(1.45 %)
22,117
(1.36 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
537
(100.00 %)
6,255,467
(47.25 %)
821,660
(4.02 %)
13,814,631
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,257
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
59,502
(2.13 %)
334 European free-tailed bat (hap1.1 2025)
GCA_976988885.1
n/a n/a 19,367
(1.49 %)
21,955
(1.44 %)
n/a 42.35
(100.00 %)
0
(0 %)
174
(0.00 %)
641
(100.00 %)
4,439,364
(40.01 %)
680,470
(8.16 %)
11,487,613
(43.09 %)
1
(0.00 %)
1,686,945
(5.56 %)
73,991
(1.99 %)
48,950
(1.14 %)
335 European free-tailed bat (hap2.1 2025)
GCA_976988855.1
n/a n/a 19,630
(1.68 %)
21,945
(1.52 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
121
(0.00 %)
370
(100.00 %)
4,242,872
(41.74 %)
637,498
(4.18 %)
11,360,772
(39.15 %)
0
(0 %)
1,095,513
(3.93 %)
69,324
(2.22 %)
54,969
(1.59 %)
336 European ground squirrel (alternate hap 2024)
GCA_964194095.1
n/a n/a 15,410
(1.11 %)
21,126
(1.11 %)
n/a 39.96
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28,045
(100.00 %)
3,186,054
(30.28 %)
656,568
(16.12 %)
9,975,571
(43.35 %)
0
(0 %)
1,969,114
(6.28 %)
28,808
(1.24 %)
18,867
(0.50 %)
337 European ground squirrel (primary hap 2024)
GCF_964194105.1
58,589
(2.31 %)
n/a 20,075
(1.28 %)
20,268
(1.19 %)
n/a 39.90
(99.99 %)
1,436
(0.01 %)
1,436
(0.01 %)
1,933
(99.99 %)
4,479,230
(31.86 %)
882,536
(12.27 %)
14,881,793
(41.66 %)
9
(0.00 %)
1,303,088
(3.18 %)
39,275
(0.88 %)
27,165
(0.54 %)
338 European hare (LE1 primary hap 2023)
GCF_033115175.1
46,528
(2.09 %)
n/a 19,392
(1.25 %)
23,070
(1.29 %)
n/a 44.03
(100.00 %)
0
(0 %)
418
(0.00 %)
651
(100.00 %)
4,011,592
(19.81 %)
1,000,204
(8.44 %)
13,414,251
(44.25 %)
2
(0.00 %)
2,116,577
(4.63 %)
98,831
(2.33 %)
72,807
(1.75 %)
339 European harvest mouse
GCF_963924665.1
35,455
(1.84 %)
n/a 20,235
(1.71 %)
19,365
(1.32 %)
n/a 40.05
(99.99 %)
0
(0 %)
2,020
(0.02 %)
893
(100.00 %)
5,424,328
(37.31 %)
1,223,387
(18.26 %)
11,906,806
(42.51 %)
10
(0.00 %)
4,662,981
(9.87 %)
17,423
(0.62 %)
15,264
(0.35 %)
340 European harvest mouse (alternate hap 2024)
GCA_963924645.1
n/a n/a 3,404
(1.16 %)
2,956
(0.83 %)
n/a 39.56
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,020
(100.00 %)
741,789
(44.38 %)
265,801
(43.28 %)
1,048,943
(61.65 %)
0
(0 %)
2,121,819
(24.22 %)
3,244
(3.57 %)
1,742
(0.22 %)
341 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1
n/a n/a 20,236
(1.71 %)
19,368
(1.32 %)
n/a 40.05
(99.99 %)
0
(0 %)
2,020
(0.02 %)
894
(100.00 %)
4,892,811
(36.49 %)
1,223,387
(18.26 %)
11,907,631
(42.51 %)
10
(0.00 %)
4,679,739
(9.91 %)
17,423
(0.62 %)
15,264
(0.35 %)
342 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1
n/a n/a 15,419
(1.50 %)
21,175
(1.51 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 12,043
(100.00 %)
2,952,218
(30.62 %)
538,508
(2.18 %)
9,303,303
(34.20 %)
0
(0 %)
511,888
(2.10 %)
47,810
(2.50 %)
39,732
(1.82 %)
343 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1
69,556
(3.13 %)
n/a 18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
25
(100.00 %)
4,237,791
(30.90 %)
792,897
(2.69 %)
13,417,195
(36.59 %)
0
(0 %)
894,272
(2.55 %)
67,132
(2.54 %)
51,333
(1.62 %)
344 European mole (hap1 2024)
GCA_964194135.1
n/a n/a 18,085
(1.69 %)
19,509
(1.58 %)
n/a 42.08
(99.99 %)
0
(0 %)
1,056
(0.01 %)
464
(100.00 %)
2,569,380
(23.32 %)
565,465
(2.18 %)
10,506,666
(33.68 %)
42
(0.00 %)
704,393
(2.62 %)
46,367
(3.09 %)
42,313
(2.40 %)
345 European mole (hap2 2024)
GCA_964194205.1
n/a n/a 18,064
(1.69 %)
19,764
(1.59 %)
n/a 42.07
(99.99 %)
1,040
(0.01 %)
1,040
(0.01 %)
1,396
(99.99 %)
2,567,492
(23.34 %)
570,250
(2.16 %)
10,485,959
(33.56 %)
30
(0.00 %)
702,644
(2.60 %)
46,213
(3.27 %)
42,349
(2.41 %)
346 European mole (hap1.1 2024)
GCF_964194135.1
32,332
(1.69 %)
n/a 17,635
(1.77 %)
19,511
(1.58 %)
n/a 42.08
(99.99 %)
1,056
(0.01 %)
1,056
(0.01 %)
1,519
(99.99 %)
4,036,401
(41.00 %)
565,464
(2.18 %)
10,506,260
(33.68 %)
42
(0.00 %)
704,393
(2.62 %)
46,366
(3.09 %)
37,444
(3.02 %)
347 European pine marten (primary hap 2023)
GCF_963455335.1
39,266
(2.23 %)
n/a 17,953
(1.59 %)
20,814
(1.41 %)
n/a 42.38
(99.98 %)
0
(0 %)
2,250
(0.02 %)
476
(100.00 %)
5,504,277
(42.55 %)
707,333
(3.28 %)
13,714,536
(34.73 %)
10
(0.00 %)
600,686
(1.77 %)
61,480
(4.29 %)
56,832
(3.43 %)
348 European pine marten (alternate hap 2023)
GCA_963455355.1
n/a n/a 11,162
(1.58 %)
15,150
(1.47 %)
n/a n/a 0
(0 %)
n/a 10,046
(100.00 %)
2,781,622
(41.73 %)
366,014
(3.55 %)
7,394,702
(32.79 %)
0
(0 %)
306,099
(1.74 %)
35,991
(5.06 %)
34,428
(4.01 %)
349 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1
n/a n/a 18,336
(1.50 %)
20,807
(1.41 %)
n/a 42.38
(99.98 %)
0
(0 %)
2,250
(0.02 %)
477
(100.00 %)
4,096,160
(31.55 %)
707,337
(3.28 %)
13,715,382
(34.73 %)
10
(0.00 %)
626,861
(1.84 %)
61,481
(4.29 %)
56,462
(1.94 %)
350 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1
n/a n/a 17,506
(1.26 %)
25,527
(1.52 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,699
(100.00 %)
2,400,784
(15.19 %)
1,062,793
(3.20 %)
13,284,496
(41.93 %)
0
(0 %)
768,770
(2.06 %)
77,009
(2.86 %)
75,481
(2.15 %)
351 European shrew (GB8-d 2012)
GCF_000181275.1
23,525
(1.54 %)
n/a 17,290
(1.33 %)
22,005
(1.50 %)
n/a 42.90
(90.49 %)
188,953
(9.54 %)
188,953
(9.54 %)
201,798
(90.46 %)
4,400,127
(33.22 %)
946,629
(2.03 %)
13,377,581
(35.30 %)
3,389
(0.06 %)
410,333
(1.21 %)
77,851
(2.58 %)
76,553
(1.98 %)
352 European shrew (primary hap 2023 genbank)
GCA_027595985.1
n/a n/a 17,481
(1.26 %)
22,511
(1.43 %)
n/a 43.24
(99.46 %)
0
(0 %)
1,427
(0.54 %)
66
(100.00 %)
2,474,589
(15.18 %)
1,107,886
(3.28 %)
13,638,525
(41.72 %)
10
(0.00 %)
n/a 79,786
(2.86 %)
77,901
(2.13 %)
353 European shrew (primary hap 2023 refseq)
GCF_027595985.1
44,643
(2.60 %)
n/a 17,479
(1.26 %)
21,293
(1.37 %)
n/a 43.24
(99.46 %)
0
(0 %)
1,427
(0.54 %)
65
(100.00 %)
2,474,584
(15.18 %)
1,107,884
(3.28 %)
13,638,467
(41.72 %)
10
(0.00 %)
822,159
(2.15 %)
79,785
(2.86 %)
77,901
(2.13 %)
354 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1
n/a n/a 18,364
(1.79 %)
20,379
(1.63 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,256
(100.00 %)
3,049,618
(22.22 %)
852,708
(4.50 %)
10,501,392
(33.34 %)
0
(0 %)
706,136
(2.67 %)
17,629
(0.60 %)
15,048
(0.47 %)
355 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1
47,025
(2.69 %)
n/a 19,592
(1.78 %)
21,173
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
197
(0.00 %)
160
(100.00 %)
5,048,186
(44.12 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,053
(34.97 %)
4
(0.00 %)
954,164
(3.20 %)
20,725
(0.63 %)
18,727
(0.52 %)
356 European suslik (primary hap 2024)
GCA_964194105.1
n/a n/a 20,075
(1.28 %)
20,274
(1.19 %)
n/a 39.90
(99.99 %)
4
(0.00 %)
1,436
(0.01 %)
502
(100.00 %)
4,357,247
(31.78 %)
882,536
(12.27 %)
14,882,486
(41.66 %)
9
(0.00 %)
1,833,125
(4.49 %)
39,275
(0.88 %)
27,165
(0.54 %)
357 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1
54,113
(2.24 %)
n/a 19,959
(1.65 %)
19,953
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
0
(0 %)
1,129
(0.01 %)
497
(100.00 %)
4,863,650
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,732
(40.58 %)
17
(0.00 %)
2,516,593
(5.37 %)
23,961
(0.53 %)
17,318
(0.36 %)
358 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1
n/a n/a 18,692
(1.72 %)
22,021
(1.36 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
10,863
(100.00 %)
4,055,957
(36.08 %)
1,513,576
(9.53 %)
11,306,811
(39.67 %)
0
(0 %)
1,995,176
(5.07 %)
20,865
(0.55 %)
15,533
(0.39 %)
359 fallow deer (Ldn47 2023)
GCF_033118175.1
57,013
(2.35 %)
n/a 20,187
(1.33 %)
23,290
(1.33 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
44
(0.00 %)
284
(100.00 %)
3,308,241
(20.72 %)
513,748
(18.20 %)
12,996,819
(48.19 %)
0
(0 %)
5,629,434
(11.23 %)
214,480
(2.98 %)
41,647
(0.85 %)
360 fallow deer (maternal hap SK-2024 2025)
GCA_048126745.1
n/a n/a 20,072
(1.51 %)
22,668
(1.37 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
65
(0.00 %)
147
(0.00 %)
1,369
(100.00 %)
4,623,335
(34.75 %)
475,143
(7.51 %)
13,000,703
(41.56 %)
1
(0.00 %)
2,295,952
(5.37 %)
112,581
(2.00 %)
41,372
(0.95 %)
361 fallow deer (paternal hap SK-2024 2025)
GCA_048127045.1
n/a n/a 18,238
(1.57 %)
20,307
(1.42 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
78
(0.00 %)
242
(0.00 %)
388
(100.00 %)
4,244,450
(35.89 %)
405,446
(2.83 %)
12,211,643
(38.55 %)
0
(0 %)
937,470
(2.69 %)
52,418
(1.36 %)
34,784
(0.91 %)
362 false killer whale (hap1 2024 genbank)
GCA_039906515.1
n/a n/a 18,718
(1.50 %)
20,929
(1.32 %)
n/a 42.08
(99.90 %)
0
(0 %)
123
(0.10 %)
439
(100.00 %)
3,958,932
(35.76 %)
1,002,329
(11.61 %)
12,193,131
(41.85 %)
3
(0.00 %)
1,441,777
(4.23 %)
79,158
(3.74 %)
41,701
(1.03 %)
363 false killer whale (hap1 2024 refseq)
GCF_039906515.1
75,958
(3.31 %)
n/a 18,718
(1.50 %)
20,982
(1.32 %)
n/a 42.08
(99.90 %)
0
(0 %)
123
(0.10 %)
438
(100.00 %)
3,958,926
(35.76 %)
1,002,329
(11.61 %)
12,193,061
(41.85 %)
3
(0.00 %)
1,441,777
(4.23 %)
79,158
(3.74 %)
41,701
(1.03 %)
364 false killer whale (hap2 2024)
GCA_039906525.1
n/a n/a 17,866
(1.45 %)
21,079
(1.46 %)
n/a 42.37
(99.08 %)
0
(0 %)
133
(0.92 %)
416
(100.00 %)
3,852,502
(34.98 %)
1,112,185
(16.42 %)
11,435,533
(44.17 %)
1
(0.00 %)
1,686,603
(5.16 %)
75,215
(4.36 %)
39,963
(0.98 %)
365 fat dormouse (hap1.1 2026)
GCA_986694645.1
n/a n/a 19,297
(1.66 %)
22,170
(1.44 %)
n/a n/a 0
(0 %)
142
(0.00 %)
81
(100.00 %)
8,399,708
(44.86 %)
1,574,754
(4.50 %)
12,366,897
(39.95 %)
4
(0.00 %)
2,180,528
(4.40 %)
69,837
(1.83 %)
38,271
(1.36 %)
366 fat dormouse (US078 2019)
GCA_004027185.1
n/a n/a 23,122
(1.24 %)
48,677
(1.27 %)
n/a 42.33
(99.92 %)
10,685
(0.04 %)
10,685
(0.04 %)
444,115
(99.96 %)
6,783,404
(37.03 %)
1,642,515
(3.72 %)
12,706,289
(39.97 %)
58
(0.00 %)
n/a 65,521
(1.47 %)
33,794
(0.75 %)
367 fat sand rat (mPsaObe1 2021)
GCF_907164565.1
43,224
(2.50 %)
n/a 18,543
(1.78 %)
20,094
(1.42 %)
n/a 41.95
(99.11 %)
0
(0 %)
50,482
(0.90 %)
11,389
(100.00 %)
4,686,377
(43.10 %)
920,563
(1.85 %)
12,813,848
(35.08 %)
2,665
(0.03 %)
294,151
(0.96 %)
22,480
(0.71 %)
20,772
(0.63 %)
368 fat sand rat (Psa_ob012049795 2017)
GCA_002215935.1
n/a n/a 21,644
(1.71 %)
31,665
(1.41 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 96,427
(100.00 %)
4,646,110
(38.87 %)
946,664
(2.24 %)
13,134,526
(33.94 %)
0
(0 %)
232,939
(1.07 %)
26,411
(0.73 %)
24,961
(0.66 %)
369 fat-tailed dunnart (SCR6 2025)
GCF_048593235.1
60,212
(2.43 %)
n/a 15,763
(0.77 %)
16,031
(0.89 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
0
(0 %)
1,908
(0.01 %)
8
(100.00 %)
5,302,378
(24.47 %)
1,450,227
(3.79 %)
20,870,714
(44.26 %)
5
(0.00 %)
628,150
(1.54 %)
24,586
(0.65 %)
24,216
(0.53 %)
370 fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025)
GCA_048593235.1
n/a n/a 15,762
(0.77 %)
16,035
(0.89 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
1,908
(0.01 %)
1,908
(0.01 %)
1,915
(99.99 %)
5,302,372
(24.47 %)
1,450,220
(3.79 %)
20,870,654
(44.26 %)
5
(0.00 %)
1,034,421
(2.56 %)
24,585
(0.65 %)
24,216
(0.53 %)
371 fat-tailed dunnart (SCR6 hap2 2025)
GCA_048593295.1
n/a n/a 16,012
(0.77 %)
16,430
(0.90 %)
n/a 36.18
(99.99 %)
1,730
(0.01 %)
1,730
(0.01 %)
1,737
(99.99 %)
5,361,847
(24.48 %)
1,474,744
(3.79 %)
21,021,671
(44.20 %)
6
(0.00 %)
1,053,897
(2.55 %)
25,669
(0.69 %)
25,354
(0.55 %)
372 fin whale (hap1.1 2025)
GCA_965194825.1
n/a n/a 19,491
(1.21 %)
22,538
(1.06 %)
n/a 42.19
(99.99 %)
0
(0 %)
1,516
(0.01 %)
2,612
(100.00 %)
4,598,236
(35.34 %)
1,716,315
(24.14 %)
12,260,919
(52.40 %)
7
(0.00 %)
3,173,278
(8.14 %)
82,683
(1.47 %)
44,824
(0.87 %)
373 fin whale (hap2.1 2025)
GCA_965194765.1
n/a n/a 18,684
(1.40 %)
21,322
(1.20 %)
n/a 41.87
(99.99 %)
1,258
(0.01 %)
1,258
(0.01 %)
3,706
(99.99 %)
4,103,716
(36.69 %)
1,030,821
(16.12 %)
11,633,934
(45.82 %)
11
(0.00 %)
1,843,351
(5.96 %)
74,782
(1.60 %)
42,885
(1.00 %)
374 finback whale
GCF_965194825.1
88,327
(5.86 %)
n/a 19,923
(1.28 %)
22,534
(1.06 %)
n/a 42.19
(99.99 %)
0
(0 %)
1,516
(0.01 %)
2,611
(100.00 %)
4,839,138
(57.33 %)
1,716,315
(24.14 %)
12,260,862
(52.40 %)
7
(0.00 %)
3,173,278
(8.14 %)
82,683
(1.47 %)
46,784
(1.09 %)
375 fishing cat (Anna 2022 U Missouri)
GCF_022837055.1
68,085
(2.86 %)
n/a 18,432
(1.63 %)
19,912
(1.37 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
0
(0 %)
63
(0.00 %)
192
(100.00 %)
4,777,906
(34.85 %)
937,432
(2.30 %)
13,438,032
(34.55 %)
0
(0 %)
654,267
(1.76 %)
70,402
(2.61 %)
68,720
(2.25 %)
376 Florida manatee (CSIC 2023)
GCA_030013775.1
n/a n/a 19,432
(1.24 %)
24,035
(1.14 %)
n/a 40.66
(100.00 %)
33
(0.00 %)
33
(0.00 %)
15,641
(100.00 %)
4,400,331
(33.07 %)
439,615
(1.04 %)
14,884,753
(46.98 %)
2
(0.00 %)
413,231
(1.00 %)
32,563
(0.80 %)
26,358
(0.59 %)
377 Florida manatee (Lorelei 2012 refseq)
GCF_000243295.1
39,664
(2.08 %)
n/a 18,308
(1.37 %)
20,588
(1.23 %)
32,868
(1.38 %)
40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
160,167
(10.78 %)
166,490
(89.22 %)
n/a 389,315
(0.74 %)
14,633,038
(38.46 %)
5,748
(0.06 %)
244,060
(0.64 %)
27,462
(0.64 %)
25,464
(0.54 %)
378 fossa
GCA_004023885.1
n/a n/a 21,156
(1.56 %)
29,809
(1.38 %)
n/a 41.51
(99.94 %)
6,335
(0.03 %)
6,335
(0.03 %)
470,371
(99.97 %)
4,962,168
(42.36 %)
814,639
(1.52 %)
13,708,904
(34.14 %)
29
(0.00 %)
263,077
(0.54 %)
78,033
(2.52 %)
74,289
(2.13 %)
379 Gambian giant pouched rat
GCA_004027575.1
n/a n/a 21,189
(1.59 %)
32,806
(1.43 %)
n/a 42.11
(99.88 %)
7,473
(0.03 %)
7,473
(0.03 %)
1,110,425
(99.97 %)
4,137,605
(24.57 %)
1,071,627
(2.76 %)
12,905,250
(32.78 %)
51
(0.00 %)
n/a 32,359
(0.80 %)
21,577
(0.55 %)
380 gaur (Gaur_Henry_Doorly_Zoo_5443 2020)
GCA_014182915.2
n/a n/a 19,130
(1.53 %)
21,239
(1.30 %)
n/a 41.83
(99.99 %)
0
(0 %)
2,194
(0.01 %)
635
(100.00 %)
6,520,228
(50.46 %)
466,916
(1.41 %)
13,425,286
(41.25 %)
0
(0 %)
1,230,155
(3.35 %)
41,833
(1.15 %)
36,947
(0.95 %)
381 gayal (CVASU_BF_001 2021)
GCA_017311355.1
n/a n/a 24,549
(1.09 %)
55,194
(1.15 %)
n/a 42.05
(99.91 %)
0
(0 %)
n/a 1,262,134
(100.00 %)
3,691,398
(22.78 %)
677,397
(2.00 %)
14,380,670
(42.36 %)
0
(0 %)
n/a 75,114
(1.33 %)
44,401
(0.88 %)
382 gayal (Nagaland 2019)
GCA_007844835.1
n/a n/a 22,715
(1.55 %)
23,635
(1.33 %)
n/a 41.67
(96.51 %)
301,761
(3.52 %)
301,761
(3.52 %)
306,776
(96.48 %)
6,243,468
(45.69 %)
518,664
(1.99 %)
15,147,647
(37.64 %)
5,199
(0.13 %)
1,060,226
(3.23 %)
45,586
(0.89 %)
40,275
(0.78 %)
383 Geoffroy's bat (hap1.1 2025)
GCA_965115925.1
n/a n/a 19,320
(1.74 %)
21,940
(1.65 %)
n/a 42.55
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,540
(0.01 %)
404
(100.00 %)
3,707,500
(37.60 %)
733,107
(7.78 %)
10,515,474
(39.35 %)
11
(0.00 %)
903,956
(3.14 %)
60,200
(2.41 %)
51,657
(1.64 %)
384 Geoffroy's bat (hap1.2 2025)
GCA_965115925.2
n/a n/a 18,831
(1.81 %)
22,032
(1.67 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
226
(0.00 %)
306
(100.00 %)
4,958,159
(48.46 %)
733,004
(7.77 %)
10,528,813
(39.34 %)
1
(0.00 %)
838,165
(2.87 %)
59,971
(2.41 %)
50,901
(1.98 %)
385 Geoffroy's bat (hap2.1 2025)
GCA_965115945.1
n/a n/a 18,718
(1.71 %)
20,961
(1.62 %)
n/a 42.29
(99.98 %)
1,597
(0.02 %)
1,597
(0.02 %)
2,101
(99.98 %)
3,662,405
(37.72 %)
717,069
(7.80 %)
10,298,372
(39.22 %)
11
(0.00 %)
842,144
(3.02 %)
56,300
(2.26 %)
45,967
(1.45 %)
386 Geoffroy's bat (hap2.2 2025)
GCA_965115945.2
n/a n/a 18,471
(1.79 %)
21,274
(1.64 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
264
(0.00 %)
418
(100.00 %)
4,911,358
(48.79 %)
719,004
(7.65 %)
10,340,272
(39.15 %)
5
(0.00 %)
657,146
(2.35 %)
56,616
(2.24 %)
46,407
(1.75 %)
387 Geoffroy's cat
GCF_018350155.1
85,344
(3.53 %)
n/a 18,469
(1.66 %)
19,516
(1.36 %)
93,795
(4.83 %)
41.75
(100.00 %)
35
(0.00 %)
45
(0.00 %)
82
(100.00 %)
5,021,854
(43.23 %)
930,175
(1.84 %)
13,757,469
(34.29 %)
0
(0 %)
627,614
(1.76 %)
65,918
(2.36 %)
58,825
(1.96 %)
388 Geoffroy's horseshoe bat (hap1 2026)
GCA_054645015.1
n/a n/a 18,745
(1.80 %)
21,820
(1.62 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
0
(0 %)
36
(0.00 %)
271
(100.00 %)
3,730,344
(39.95 %)
1,346,563
(3.86 %)
11,511,257
(32.29 %)
0
(0 %)
473,448
(1.73 %)
36,004
(1.17 %)
31,586
(0.98 %)
389 Geoffroy's horseshoe bat (hap2 2026)
GCA_054645025.1
n/a n/a 17,882
(1.88 %)
20,855
(1.70 %)
n/a 40.07
(100.00 %)
0
(0 %)
30
(0.00 %)
219
(100.00 %)
3,459,687
(38.78 %)
1,115,210
(3.49 %)
10,640,816
(29.99 %)
0
(0 %)
341,797
(1.40 %)
32,817
(1.14 %)
29,357
(0.98 %)
390 giant anteater
GCA_004026745.1
n/a n/a 24,383
(0.91 %)
44,315
(0.93 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
8,283
(0.02 %)
8,283
(0.02 %)
1,629,691
(99.98 %)
5,333,757
(35.57 %)
575,140
(0.91 %)
21,181,213
(39.97 %)
116
(0.00 %)
n/a 57,558
(0.94 %)
45,184
(0.73 %)
391 giant otter
GCA_004024605.1
n/a n/a 21,199
(1.46 %)
30,565
(1.34 %)
n/a 41.71
(99.93 %)
7,431
(0.03 %)
7,431
(0.03 %)
652,159
(99.97 %)
5,113,769
(41.55 %)
788,677
(1.46 %)
14,385,279
(35.77 %)
57
(0.00 %)
420,852
(0.84 %)
82,376
(2.05 %)
79,949
(1.87 %)
392 giant panda (Jingjing v3 2020)
GCF_002007445.2
65,481
(3.27 %)
n/a 19,077
(1.67 %)
20,176
(1.39 %)
n/a 41.68
(98.09 %)
0
(0 %)
189,277
(1.92 %)
73,514
(100.00 %)
4,012,144
(34.40 %)
617,803
(1.99 %)
14,216,587
(30.41 %)
9,430
(0.13 %)
581,226
(4.37 %)
59,449
(1.50 %)
54,779
(1.33 %)
393 goat (v2 San Clemente 2016 USDA)
GCF_001704415.2
47,172
(2.31 %)
n/a 19,342
(1.38 %)
22,346
(1.24 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
790
(0.00 %)
29,886
(100.00 %)
3,502,527
(22.45 %)
760,831
(7.07 %)
13,024,178
(44.85 %)
0
(0 %)
2,571,330
(5.65 %)
125,662
(4.00 %)
40,923
(0.89 %)
394 Gobi jerboa
GCA_004027895.1
n/a n/a 22,410
(0.91 %)
45,268
(1.02 %)
n/a 41.94
(99.88 %)
10,987
(0.04 %)
10,987
(0.04 %)
1,295,369
(99.96 %)
8,828,417
(40.19 %)
1,979,806
(6.43 %)
14,759,732
(47.73 %)
96
(0.00 %)
n/a 24,314
(0.52 %)
19,787
(0.39 %)
395 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1
67,831
(3.37 %)
n/a 19,354
(1.71 %)
19,863
(1.47 %)
69,903
(4.39 %)
42.04
(96.99 %)
711
(3.01 %)
711
(3.01 %)
7,058
(96.99 %)
3,981,818
(27.65 %)
976,456
(3.46 %)
12,580,903
(32.87 %)
25
(0.00 %)
766,407
(1.98 %)
21,268
(0.61 %)
18,135
(0.47 %)
396 golden hamster (Broad 2013 refseq)
GCF_000349665.1
42,636
(2.91 %)
37,986
(2.21 %)
18,976
(1.82 %)
19,149
(1.51 %)
29,936
(1.96 %)
42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
216,216
(17.12 %)
237,700
(82.88 %)
3,599,795
(26.09 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,956
(24.29 %)
3,589
(0.05 %)
254,929
(0.76 %)
18,591
(0.51 %)
17,093
(0.42 %)
397 golden jackal (CA01 2025)
GCF_053574225.1
115,457
(4.37 %)
n/a 19,332
(1.58 %)
21,009
(1.39 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
59
(0.00 %)
306
(100.00 %)
6,089,485
(46.31 %)
1,184,044
(5.44 %)
13,574,928
(35.96 %)
0
(0 %)
1,273,197
(3.07 %)
54,314
(2.19 %)
48,434
(1.90 %)
398 golden spiny mouse (2020 genbank)
GCA_903995435.1
n/a n/a 20,001
(1.90 %)
19,127
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
0
(0 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,976,496
(36.34 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,957,738
(32.33 %)
0
(0 %)
684,879
(1.84 %)
20,760
(0.59 %)
18,533
(0.52 %)
399 golden spiny mouse (2020 refseq)
GCF_903995435.1
36,997
(1.96 %)
n/a 20,006
(1.91 %)
19,132
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
0
(0 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,785,907
(32.61 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,958,061
(32.33 %)
0
(0 %)
684,879
(1.84 %)
20,760
(0.59 %)
18,457
(0.52 %)
400 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 genbank)
GCA_048772815.1
n/a n/a 20,967
(0.89 %)
24,137
(0.94 %)
n/a 39.52
(99.99 %)
0
(0 %)
1,448
(0.01 %)
8,087
(100.00 %)
5,547,018
(29.30 %)
1,312,047
(10.07 %)
15,174,898
(52.73 %)
10
(0.00 %)
5,076,603
(7.43 %)
40,182
(0.59 %)
29,493
(0.39 %)
401 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 refseq)
GCF_048772815.1
49,173
(1.30 %)
n/a 19,845
(0.90 %)
24,244
(0.94 %)
n/a 39.52
(99.99 %)
0
(0 %)
1,448
(0.01 %)
8,088
(100.00 %)
8,197,827
(62.01 %)
1,312,047
(10.07 %)
15,174,958
(52.73 %)
10
(0.00 %)
5,076,603
(7.43 %)
40,182
(0.59 %)
29,417
(0.42 %)
402 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 genbank)
GCA_048772825.1
n/a n/a 19,719
(1.16 %)
22,611
(1.21 %)
n/a 39.48
(100.00 %)
0
(0 %)
643
(0.00 %)
2,820
(100.00 %)
4,725,546
(31.70 %)
997,950
(3.53 %)
14,753,550
(39.53 %)
6
(0.00 %)
1,428,961
(3.10 %)
33,465
(0.69 %)
26,996
(0.48 %)
403 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 refseq)
GCF_048772825.1
46,395
(1.71 %)
n/a 18,853
(1.19 %)
22,613
(1.21 %)
n/a 39.48
(100.00 %)
0
(0 %)
643
(0.00 %)
2,821
(100.00 %)
6,984,115
(50.68 %)
997,950
(3.53 %)
14,753,604
(39.53 %)
6
(0.00 %)
1,428,961
(3.10 %)
33,465
(0.69 %)
26,805
(0.53 %)
404 gracile shrew mole
GCA_004024945.1
n/a n/a 19,165
(1.25 %)
43,816
(1.48 %)
n/a 41.08
(99.89 %)
8,248
(0.04 %)
8,248
(0.04 %)
732,083
(99.96 %)
2,957,465
(23.76 %)
783,289
(2.60 %)
11,503,344
(31.38 %)
23
(0.00 %)
n/a 92,729
(3.60 %)
75,685
(2.89 %)
405 gray fox (Vermont ataVT051 2023)
GCA_032313775.1
n/a n/a 19,352
(1.42 %)
20,724
(1.33 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
26
(0.00 %)
898
(100.00 %)
4,418,039
(36.90 %)
1,050,244
(11.63 %)
13,240,305
(39.50 %)
0
(0 %)
3,860,162
(6.83 %)
89,246
(2.69 %)
49,263
(1.43 %)
406 gray seal (241Hg 2020)
GCF_012393455.1
79,009
(3.73 %)
n/a 19,882
(1.73 %)
22,416
(1.46 %)
n/a 41.44
(100.00 %)
0
(0 %)
117
(0.00 %)
6,880
(100.00 %)
4,448,588
(43.28 %)
557,710
(1.32 %)
13,340,576
(33.41 %)
0
(0 %)
506,266
(1.47 %)
55,637
(1.78 %)
52,209
(1.58 %)
407 gray seal (hap1.1 2025)
GCA_964656455.1
n/a n/a 19,291
(1.73 %)
20,301
(1.41 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
0
(0 %)
1,130
(0.01 %)
171
(100.00 %)
4,245,582
(34.81 %)
600,624
(2.16 %)
13,240,803
(34.28 %)
4
(0.00 %)
615,950
(1.85 %)
56,932
(1.78 %)
54,064
(1.60 %)
408 gray seal (hap2.1 2025)
GCA_964656465.1
n/a n/a 19,222
(1.73 %)
20,205
(1.41 %)
n/a 41.54
(99.99 %)
1,110
(0.01 %)
1,110
(0.01 %)
1,233
(99.99 %)
4,236,942
(34.95 %)
601,409
(1.99 %)
13,226,667
(34.03 %)
5
(0.00 %)
598,973
(1.85 %)
57,067
(1.82 %)
54,058
(1.64 %)
409 gray seal (mHalGry1.hap1.1 2025)
GCF_964656455.1
70,736
(3.27 %)
n/a 18,889
(1.71 %)
20,343
(1.40 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
1,130
(0.01 %)
1,130
(0.01 %)
1,300
(99.99 %)
5,332,627
(44.68 %)
600,622
(2.16 %)
13,240,769
(34.28 %)
4
(0.00 %)
615,940
(1.85 %)
56,931
(1.78 %)
46,951
(1.45 %)
410 gray short-tailed opossum
GCA_027887165.2
n/a n/a 16,583
(0.75 %)
16,408
(0.86 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
0
(0 %)
2,255
(0.89 %)
14
(100.00 %)
9,126,134
(61.38 %)
1,096,062
(2.60 %)
22,321,931
(43.37 %)
13
(0.00 %)
641,868
(1.47 %)
28,894
(0.57 %)
23,383
(0.46 %)
411 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1
n/a n/a 12,662
(0.70 %)
15,124
(0.89 %)
n/a 37.74
(100.00 %)
24
(0.00 %)
24
(0.00 %)
8,086
(100.00 %)
4,098,004
(25.33 %)
806,470
(2.98 %)
16,244,072
(43.39 %)
0
(0 %)
n/a 24,879
(0.67 %)
15,867
(0.39 %)
412 gray short-tailed opossum (MonDom5 2007)
GCF_000002295.2
68,388
(2.34 %)
n/a 16,663
(0.75 %)
16,162
(0.84 %)
n/a 37.82
(97.26 %)
67,660
(2.75 %)
67,660
(2.75 %)
72,674
(97.25 %)
7,753,175
(55.85 %)
1,051,473
(2.34 %)
22,274,001
(42.23 %)
6
(0.00 %)
680,995
(1.61 %)
30,883
(0.53 %)
22,339
(0.40 %)
413 gray short-tailed opossum (v1 mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1
73,383
(3.04 %)
n/a 16,637
(0.72 %)
16,036
(0.85 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
0
(0 %)
2,255
(0.89 %)
13
(100.00 %)
5,562,359
(25.40 %)
1,096,620
(2.60 %)
22,322,748
(43.37 %)
13
(0.00 %)
793,648
(1.81 %)
28,894
(0.57 %)
22,987
(0.42 %)
414 gray short-tailed opossum (v2 mMonDom1 primary hap 2026 refseq)
GCF_027887165.2
73,367
(2.55 %)
n/a 16,583
(0.75 %)
16,407
(0.86 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
0
(0 %)
2,255
(0.89 %)
13
(100.00 %)
9,126,125
(61.38 %)
1,096,057
(2.60 %)
22,321,881
(43.37 %)
13
(0.00 %)
791,861
(1.81 %)
28,894
(0.57 %)
23,383
(0.46 %)
415 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1
59,073
(2.48 %)
n/a 20,752
(1.49 %)
21,107
(1.31 %)
32,732
(1.45 %)
40.06
(99.98 %)
0
(0 %)
1,824
(0.02 %)
752
(100.00 %)
4,605,578
(34.50 %)
728,192
(1.65 %)
15,467,412
(33.91 %)
2
(0.00 %)
504,786
(1.54 %)
51,878
(1.11 %)
49,715
(1.03 %)
416 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1
n/a n/a 17,156
(1.53 %)
18,190
(1.33 %)
n/a 40.25
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
9,510
(100.00 %)
3,455,580
(34.94 %)
530,053
(1.56 %)
10,927,458
(32.64 %)
0
(0 %)
323,766
(1.34 %)
38,976
(1.13 %)
37,317
(1.05 %)
417 gray squirrel (primary hap 2020)
GCA_902686445.2
n/a n/a 20,739
(1.50 %)
21,110
(1.31 %)
n/a 40.06
(99.98 %)
0
(0 %)
1,824
(0.02 %)
753
(100.00 %)
4,732,857
(35.28 %)
728,193
(1.65 %)
15,466,750
(33.91 %)
2
(0.00 %)
504,785
(1.54 %)
51,878
(1.11 %)
49,562
(1.03 %)
418 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2
n/a n/a 19,474
(1.55 %)
20,394
(1.40 %)
72,806
(4.12 %)
41.49
(100.00 %)
0
(0 %)
166
(0.00 %)
82
(100.00 %)
4,550,524
(31.76 %)
1,063,944
(3.96 %)
13,588,117
(34.74 %)
23
(0.00 %)
1,048,956
(2.49 %)
51,996
(2.15 %)
47,971
(1.53 %)
419 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1
n/a n/a 12,760
(1.57 %)
14,423
(1.42 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,537
(100.00 %)
2,725,227
(31.66 %)
616,862
(3.40 %)
8,041,744
(32.68 %)
0
(0 %)
465,446
(1.97 %)
32,293
(2.35 %)
29,871
(1.57 %)
420 Great evening bat (hap2 2026)
GCA_054824975.1
n/a n/a 17,446
(1.71 %)
20,330
(1.57 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
0
(0 %)
360
(0.00 %)
196
(100.00 %)
4,933,307
(51.60 %)
914,468
(10.92 %)
9,849,063
(41.54 %)
3
(0.00 %)
926,343
(3.13 %)
64,133
(2.42 %)
48,631
(1.85 %)
421 great fruit-eating bat (hap1 2025)
GCA_038363095.4
n/a n/a 18,198
(1.65 %)
19,926
(1.51 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
0
(0 %)
44
(0.00 %)
487
(100.00 %)
3,105,608
(36.84 %)
379,427
(5.52 %)
11,651,533
(35.11 %)
0
(0 %)
570,792
(2.01 %)
72,337
(2.76 %)
54,692
(2.40 %)
422 great fruit-eating bat (v2 hap2 2024)
GCA_038363175.2
n/a n/a 16,978
(1.61 %)
18,544
(1.54 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
0
(0 %)
54
(0.00 %)
312
(100.00 %)
2,601,985
(26.67 %)
331,187
(4.87 %)
10,884,729
(33.93 %)
1
(0.00 %)
458,782
(1.76 %)
63,610
(2.71 %)
49,165
(1.49 %)
423 great fruit-eating bat (v2 hap1 2024)
GCA_038363095.2
n/a n/a 18,051
(1.56 %)
19,955
(1.51 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
0
(0 %)
45
(0.00 %)
487
(100.00 %)
2,841,143
(26.67 %)
379,430
(5.52 %)
11,651,542
(35.11 %)
0
(0 %)
569,322
(2.01 %)
72,337
(2.76 %)
54,165
(1.48 %)
424 great fruit-eating bat (v3 hap2 2025)
GCA_038363175.3
n/a n/a 17,189
(1.70 %)
18,544
(1.54 %)
n/a n/a 0
(0 %)
54
(0.00 %)
312
(100.00 %)
2,838,138
(36.48 %)
339,722
(5.05 %)
10,884,721
(33.93 %)
1
(0.00 %)
458,782
(1.76 %)
63,610
(2.71 %)
49,457
(2.35 %)
425 great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016)
GCF_001890085.2
50,908
(3.26 %)
n/a 18,993
(2.01 %)
19,633
(1.65 %)
41,769
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
0
(0 %)
172,750
(12.60 %)
7,387
(100.00 %)
2,946,981
(30.72 %)
495,272
(1.05 %)
11,587,728
(25.43 %)
2,116
(0.03 %)
193,018
(1.10 %)
32,949
(0.96 %)
30,173
(0.87 %)
426 greater bulldog bat
GCA_004026585.1
n/a n/a 20,774
(1.62 %)
28,140
(1.63 %)
n/a 40.92
(99.94 %)
6,171
(0.03 %)
6,171
(0.03 %)
304,393
(99.97 %)
3,288,598
(29.60 %)
478,424
(1.16 %)
11,427,553
(35.29 %)
6
(0.00 %)
n/a 44,124
(1.99 %)
42,024
(1.78 %)
427 Greater cane rat
GCA_004025085.1
n/a n/a 20,383
(0.98 %)
47,456
(1.25 %)
n/a 42.85
(99.83 %)
8,825
(0.03 %)
8,825
(0.03 %)
1,898,466
(99.97 %)
5,569,185
(30.19 %)
946,696
(3.12 %)
13,144,109
(41.83 %)
28
(0.00 %)
n/a 97,686
(2.61 %)
84,205
(2.21 %)
428 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1
n/a n/a 14,896
(1.85 %)
18,939
(1.59 %)
n/a 40.69
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
13,426
(100.00 %)
2,426,330
(34.43 %)
418,341
(1.36 %)
8,763,234
(27.86 %)
0
(0 %)
108,521
(0.55 %)
24,370
(1.08 %)
22,940
(1.00 %)
429 greater horseshoe bat (MPI-CBG mRhiFer1 2019)
GCA_004115265.3
n/a n/a 18,510
(1.96 %)
20,357
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,547,476
(40.33 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,002
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
28,931
(0.94 %)
430 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2
53,353
(3.13 %)
n/a 18,641
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,218,744
(34.52 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,641
(0.98 %)
431 greater Indian rhinoceros (Sample0755 2023)
GCA_028646465.1
n/a n/a 19,533
(1.67 %)
23,705
(1.37 %)
n/a 41.10
(101.83 %)
1,557
(0.01 %)
33,235
(0.47 %)
275,222
(99.99 %)
5,364,142
(46.33 %)
487,256
(1.17 %)
16,182,706
(30.52 %)
1,990
(0.06 %)
n/a 42,131
(1.13 %)
35,814
(0.98 %)
432 greater mouse-eared bat
GCA_014108235.2
n/a n/a 18,686
(1.94 %)
21,567
(1.74 %)
n/a 43.11
(98.56 %)
0
(0 %)
600
(1.44 %)
51
(100.00 %)
4,876,518
(44.95 %)
752,949
(2.84 %)
10,383,290
(35.84 %)
0
(0 %)
500,004
(1.88 %)
60,936
(2.45 %)
52,833
(2.12 %)
433 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
n/a 19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
0
(0 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
0
(0 %)
499,733
(1.88 %)
61,023
(2.69 %)
54,015
(1.81 %)
434 Greater mouse-tailed bat (20210906_DDa alternate hap 2024)
GCA_043880455.1
n/a n/a 16,611
(1.60 %)
22,294
(1.43 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,359
(100.00 %)
4,914,747
(44.93 %)
593,619
(4.20 %)
10,708,461
(39.52 %)
0
(0 %)
1,103,529
(3.39 %)
222,795
(3.47 %)
55,095
(1.35 %)
435 greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024)
GCA_043880545.1
n/a n/a 18,582
(1.55 %)
20,954
(1.35 %)
n/a 42.46
(100.00 %)
0
(0 %)
152
(0.00 %)
106
(100.00 %)
4,158,629
(40.30 %)
696,150
(4.67 %)
12,702,667
(41.11 %)
1
(0.00 %)
1,418,508
(3.67 %)
257,446
(3.38 %)
44,752
(1.05 %)
436 greater sac-winged bat (alternate hap 2024)
GCA_036850925.1
n/a n/a 17,838
(1.44 %)
21,425
(1.45 %)
n/a 41.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,167
(100.00 %)
6,139,040
(42.07 %)
974,353
(2.52 %)
11,694,399
(43.03 %)
0
(0 %)
1,008,898
(2.85 %)
96,465
(2.06 %)
42,893
(1.08 %)
437 greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850765.1
55,259
(2.53 %)
n/a 18,321
(1.40 %)
21,048
(1.35 %)
n/a 41.71
(98.73 %)
0
(0 %)
468
(1.27 %)
256
(100.00 %)
4,247,145
(29.53 %)
1,031,385
(2.50 %)
12,465,157
(43.30 %)
3
(0.00 %)
1,113,639
(2.95 %)
101,620
(2.01 %)
44,590
(1.04 %)
438 greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U)
GCF_019186645.2
50,563
(2.96 %)
n/a 18,224
(1.70 %)
20,689
(1.67 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
0
(0 %)
55
(0.00 %)
534
(100.00 %)
2,961,591
(0.00 %)
387,908
(0.97 %)
12,179,612
(30.91 %)
1
(0.00 %)
167,034
(0.66 %)
62,189
(5.35 %)
65,269
(4.61 %)
439 Grevy's zebra (hap1 2026)
GCA_057876975.1
n/a n/a 18,036
(1.58 %)
20,487
(1.33 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
0
(0 %)
123
(0.00 %)
767
(100.00 %)
4,643,638
(47.12 %)
545,325
(5.89 %)
14,404,726
(34.24 %)
2
(0.00 %)
642,428
(1.93 %)
42,105
(3.78 %)
38,195
(1.16 %)
440 Grevy's zebra (hap2 2026)
GCA_057877195.1
n/a n/a 17,709
(1.64 %)
19,935
(1.36 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
0
(0 %)
145
(0.00 %)
274
(100.00 %)
4,483,471
(45.66 %)
430,395
(2.96 %)
14,426,365
(31.58 %)
5
(0.00 %)
321,172
(1.08 %)
39,398
(2.28 %)
35,686
(1.14 %)
441 grey whale
GCA_004363415.1
n/a n/a 21,827
(1.52 %)
32,191
(1.24 %)
n/a 41.22
(99.88 %)
10,622
(0.04 %)
10,622
(0.04 %)
1,046,770
(99.96 %)
4,841,166
(45.56 %)
780,015
(1.83 %)
13,559,563
(39.86 %)
79
(0.00 %)
n/a 72,343
(1.59 %)
48,741
(1.27 %)
442 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1
n/a n/a 19,129
(1.37 %)
24,628
(1.24 %)
n/a 41.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 14,442
(100.00 %)
3,892,130
(35.74 %)
874,864
(15.70 %)
11,484,916
(45.69 %)
0
(0 %)
2,048,708
(5.99 %)
73,507
(1.72 %)
41,124
(0.98 %)
443 grey whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_028021215.1
n/a n/a 19,288
(1.38 %)
21,791
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
0
(0 %)
279
(0.00 %)
704
(100.00 %)
4,116,900
(35.85 %)
966,065
(16.74 %)
12,154,173
(46.39 %)
3
(0.00 %)
2,154,240
(5.67 %)
77,011
(1.59 %)
42,884
(0.96 %)
444 grey whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_028021215.1
49,276
(1.90 %)
n/a 19,295
(1.38 %)
21,790
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
0
(0 %)
279
(0.00 %)
703
(100.00 %)
4,116,894
(35.85 %)
966,064
(16.74 %)
12,154,101
(46.39 %)
3
(0.00 %)
2,154,240
(5.67 %)
77,011
(1.59 %)
42,884
(0.96 %)
445 hairy big-eared bat (US037 2019 Broad)
GCA_004026765.1
n/a n/a 21,360
(1.44 %)
37,376
(1.52 %)
n/a 42.38
(99.94 %)
3,218
(0.01 %)
3,218
(0.01 %)
553,308
(99.99 %)
3,519,246
(30.77 %)
393,318
(0.85 %)
12,525,258
(34.42 %)
12
(0.00 %)
n/a 84,875
(2.37 %)
63,057
(1.80 %)
446 Hanaki's dwarf bat (v1 2024)
GCA_964339955.1
n/a n/a 17,856
(1.76 %)
20,604
(1.75 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
306
(0.00 %)
141
(100.00 %)
3,697,250
(33.21 %)
842,827
(8.27 %)
10,094,062
(38.40 %)
2
(0.00 %)
752,759
(2.71 %)
61,715
(2.96 %)
59,765
(1.96 %)
447 Hanaki's dwarf bat (v5 2025 genbank)
GCA_964339955.5
n/a n/a 17,654
(1.85 %)
20,599
(1.75 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
306
(0.00 %)
141
(100.00 %)
4,660,276
(45.88 %)
842,822
(8.27 %)
10,093,872
(38.40 %)
2
(0.00 %)
752,744
(2.70 %)
61,715
(2.96 %)
58,095
(2.84 %)
448 Hanaki's dwarf bat (v5 2025 refseq)
GCF_964339955.1
51,103
(3.48 %)
n/a 17,654
(1.85 %)
20,598
(1.75 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
306
(0.00 %)
141
(100.00 %)
4,660,276
(45.88 %)
842,822
(8.27 %)
10,093,872
(38.40 %)
2
(0.00 %)
752,744
(2.70 %)
61,715
(2.96 %)
58,095
(2.84 %)
449 harbor porpoise (alternate hap 2024)
GCA_963924725.1
n/a n/a 19,112
(1.54 %)
22,516
(1.29 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,636
(100.00 %)
4,295,938
(43.35 %)
1,111,088
(11.90 %)
12,254,452
(42.18 %)
0
(0 %)
2,259,281
(5.55 %)
77,325
(3.31 %)
52,852
(1.62 %)
450 harbor porpoise (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924675.1
n/a n/a 18,529
(1.58 %)
20,583
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
2
(0.00 %)
966
(0.01 %)
442
(100.00 %)
3,760,716
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,240
(39.04 %)
4
(0.00 %)
1,410,168
(3.71 %)
71,530
(2.69 %)
40,160
(1.06 %)
451 harbor porpoise (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924675.1
33,578
(1.54 %)
n/a 18,528
(1.58 %)
20,582
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
966
(0.01 %)
966
(0.01 %)
1,405
(99.99 %)
3,760,713
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,181
(39.04 %)
4
(0.00 %)
1,410,168
(3.71 %)
71,530
(2.69 %)
40,160
(1.06 %)
452 harbor seal
GCF_004348235.1
50,657
(2.98 %)
n/a 19,484
(1.76 %)
20,771
(1.44 %)
33,296
(1.58 %)
41.38
(99.09 %)
16,031
(0.91 %)
16,480
(0.91 %)
21,161
(99.09 %)
4,526,182
(43.28 %)
576,921
(1.11 %)
13,421,780
(33.06 %)
945
(0.02 %)
459,159
(1.28 %)
54,592
(1.70 %)
51,200
(1.50 %)
453 Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.2
37,605
(1.99 %)
n/a 19,483
(1.73 %)
19,767
(1.35 %)
n/a 41.41
(98.23 %)
0
(0 %)
25,763
(1.77 %)
7,487
(100.00 %)
4,575,217
(43.59 %)
583,394
(1.11 %)
13,374,131
(33.69 %)
2,318
(0.04 %)
611,862
(1.63 %)
52,067
(1.50 %)
48,495
(1.32 %)
454 hazel dormouse
GCA_004027005.1
n/a n/a 21,556
(1.24 %)
40,971
(1.33 %)
n/a 41.60
(99.91 %)
15,076
(0.06 %)
15,076
(0.06 %)
481,881
(99.94 %)
6,679,641
(33.98 %)
1,653,419
(3.72 %)
12,685,676
(43.98 %)
42
(0.00 %)
n/a 71,478
(1.57 %)
45,897
(0.92 %)
455 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1
n/a n/a 11,130
(1.23 %)
22,071
(1.36 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 31,856
(100.00 %)
2,958,239
(41.25 %)
788,242
(4.52 %)
6,056,268
(41.88 %)
0
(0 %)
532,149
(2.74 %)
36,143
(1.96 %)
23,949
(1.02 %)
456 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1
n/a n/a 18,620
(1.42 %)
22,403
(1.38 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
1
(0.00 %)
1,805
(0.01 %)
214
(100.00 %)
6,063,911
(41.66 %)
1,593,657
(4.46 %)
12,229,281
(43.98 %)
8
(0.00 %)
1,313,148
(3.16 %)
71,058
(1.88 %)
45,398
(0.93 %)
457 Heller's broad-nosed bat (hap1 2025)
GCA_051107505.1
n/a n/a 17,977
(1.62 %)
19,578
(1.49 %)
n/a n/a 0
(0 %)
94
(0.00 %)
365
(100.00 %)
3,844,689
(40.85 %)
495,667
(5.71 %)
11,659,980
(35.39 %)
1
(0.00 %)
752,092
(2.57 %)
51,652
(2.95 %)
46,364
(2.48 %)
458 hippopotamus (BS01 2019 Broad)
GCA_004027065.1
n/a n/a 24,267
(1.55 %)
34,820
(1.30 %)
n/a 41.43
(99.91 %)
4,730
(0.02 %)
4,730
(0.02 %)
972,599
(99.98 %)
4,579,311
(41.26 %)
606,731
(1.02 %)
14,514,493
(36.58 %)
17
(0.00 %)
n/a 54,753
(1.59 %)
52,362
(1.50 %)
459 hippopotamus (HIP001 2018)
GCA_002995585.1
n/a n/a 22,343
(1.70 %)
31,687
(1.45 %)
n/a 40.96
(94.63 %)
153,125
(5.38 %)
153,125
(5.38 %)
281,897
(94.62 %)
3,952,905
(38.55 %)
476,243
(1.97 %)
14,216,817
(27.43 %)
6,026
(0.29 %)
n/a 48,380
(1.43 %)
46,263
(1.31 %)
460 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1
n/a n/a 20,391
(1.63 %)
20,668
(1.37 %)
n/a 41.62
(100.00 %)
0
(0 %)
83
(0.00 %)
545
(100.00 %)
3,778,764
(35.17 %)
563,345
(3.63 %)
13,524,869
(35.56 %)
0
(0 %)
369,754
(1.46 %)
48,164
(1.90 %)
44,065
(1.33 %)
461 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1
64,153
(2.73 %)
n/a 20,331
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
0
(0 %)
226
(0.00 %)
357
(100.00 %)
3,783,440
(35.17 %)
567,797
(3.38 %)
13,462,531
(35.48 %)
2
(0.00 %)
396,368
(1.55 %)
48,365
(1.91 %)
44,048
(1.34 %)
462 hirola (BS46 2019 Broad)
GCA_004027495.1
n/a n/a 22,264
(1.40 %)
36,984
(1.26 %)
n/a 42.31
(99.93 %)
9,287
(0.03 %)
9,287
(0.03 %)
545,176
(99.97 %)
5,809,405
(48.62 %)
465,001
(1.08 %)
13,326,245
(42.35 %)
43
(0.00 %)
n/a 48,312
(1.15 %)
38,948
(0.98 %)
463 Hispaniolan solenodon
GCA_004363575.1
n/a n/a 18,805
(1.55 %)
27,454
(1.64 %)
n/a 39.98
(99.96 %)
5,186
(0.02 %)
5,186
(0.02 %)
181,804
(99.98 %)
2,669,787
(26.78 %)
431,610
(1.04 %)
13,429,711
(27.35 %)
24
(0.00 %)
86,983
(0.25 %)
53,444
(2.30 %)
52,300
(2.09 %)
464 hispid cotton rat
GCA_004025045.1
n/a n/a 25,324
(1.49 %)
31,681
(1.31 %)
39,953
(1.43 %)
39.77
(99.89 %)
13,744
(0.05 %)
13,744
(0.05 %)
897,290
(99.95 %)
4,384,099
(28.17 %)
1,132,313
(3.34 %)
14,729,737
(38.08 %)
28
(0.00 %)
n/a 17,558
(0.40 %)
15,148
(0.33 %)
465 hoary bat (Cryan_1219 primary hap 2025)
GCA_011751065.5
n/a n/a 18,411
(1.72 %)
20,852
(1.49 %)
n/a 41.93
(97.36 %)
35,513
(2.65 %)
35,513
(2.65 %)
37,763
(97.35 %)
4,953,747
(48.32 %)
773,513
(2.08 %)
11,116,507
(38.56 %)
2,708
(0.04 %)
439,534
(1.50 %)
61,320
(2.76 %)
54,582
(2.12 %)
466 Hoffmann's two-fingered sloth
GCA_000164785.2
n/a n/a 24,546
(1.30 %)
30,273
(1.15 %)
n/a 39.80
(98.09 %)
100,957
(1.91 %)
101,085
(1.91 %)
370,035
(98.09 %)
5,145,551
(52.20 %)
614,819
(1.62 %)
17,932,269
(39.26 %)
280
(0.01 %)
469,834
(1.28 %)
55,943
(1.04 %)
45,466
(0.86 %)
467 Hog deer (hap2 2026)
GCA_054883225.1
n/a n/a 18,236
(1.44 %)
21,068
(1.32 %)
n/a 43.42
(99.99 %)
0
(0 %)
1,362
(0.01 %)
1,968
(100.00 %)
5,210,730
(50.70 %)
450,467
(12.73 %)
12,050,600
(44.70 %)
15
(0.00 %)
3,020,170
(7.34 %)
98,724
(4.11 %)
43,357
(3.37 %)
468 hog-nosed bat
GCA_004027555.1
n/a n/a 20,591
(1.30 %)
39,589
(1.39 %)
n/a 40.99
(99.88 %)
6,224
(0.03 %)
6,224
(0.03 %)
1,230,480
(99.97 %)
4,081,924
(31.12 %)
1,008,077
(2.20 %)
12,068,828
(39.98 %)
17
(0.00 %)
n/a 55,567
(2.02 %)
43,665
(1.48 %)
469 Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.3
49,071
(2.78 %)
n/a 17,588
(1.64 %)
19,357
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
0
(0 %)
38,648
(0.21 %)
25,848
(100.00 %)
2,708,400
(27.89 %)
366,870
(1.48 %)
11,795,308
(31.27 %)
99
(0.00 %)
330,126
(1.83 %)
59,066
(1.72 %)
48,113
(1.34 %)
470 Honduran yellow-shouldered bat (v3 Veracruz 20B 2022)
GCF_014824575.4
49,074
(2.78 %)
n/a 17,270
(1.72 %)
19,383
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.80 %)
38,653
(0.21 %)
38,653
(0.21 %)
64,534
(99.79 %)
3,759,212
(41.79 %)
366,883
(1.48 %)
11,795,401
(31.27 %)
99
(0.00 %)
330,139
(1.83 %)
59,077
(1.72 %)
46,795
(1.39 %)
471 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1
n/a n/a 16,789
(1.65 %)
18,017
(1.36 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
210
(0.00 %)
821
(100.00 %)
3,146,381
(34.68 %)
430,664
(5.91 %)
13,246,059
(32.62 %)
0
(0 %)
714,785
(2.15 %)
37,293
(2.80 %)
35,249
(2.66 %)
472 horse (paternal hap 2024)
GCA_036426135.1
n/a n/a 19,073
(1.67 %)
20,636
(1.38 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
114
(0.00 %)
602
(100.00 %)
3,521,953
(35.39 %)
461,571
(5.26 %)
14,833,688
(32.77 %)
2
(0.00 %)
728,239
(2.01 %)
43,527
(2.54 %)
41,129
(2.38 %)
473 horse (thoroughbred H_3958 2024)
GCF_041296265.1
124,629
(3.91 %)
n/a 18,742
(1.47 %)
21,901
(1.39 %)
n/a 42.90
(99.96 %)
0
(0 %)
5
(0.04 %)
625
(100.00 %)
3,600,073
(33.96 %)
709,759
(8.89 %)
14,396,691
(35.72 %)
0
(0 %)
872,612
(2.26 %)
48,802
(5.67 %)
38,553
(0.92 %)
474 horse (Twilight 2018)
GCF_002863925.1
76,388
(4.03 %)
n/a 18,997
(1.73 %)
20,914
(1.42 %)
113,346
(6.08 %)
41.50
(99.62 %)
0
(0 %)
6,294
(0.38 %)
4,701
(100.00 %)
4,080,319
(44.85 %)
395,037
(1.44 %)
15,169,517
(29.93 %)
41
(0.00 %)
354,039
(1.05 %)
44,825
(1.77 %)
37,394
(1.12 %)
475 Hottentot golden mole (hap1 2026)
GCA_054824725.1
n/a n/a 23,545
(0.65 %)
25,587
(0.69 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
397
(0.00 %)
397
(0.00 %)
2,994
(100.00 %)
15,378,633
(76.69 %)
1,709,398
(27.18 %)
17,909,037
(71.38 %)
2
(0.00 %)
12,487,327
(12.60 %)
48,162
(0.41 %)
21,486
(0.24 %)
476 Hottentot golden mole (hap2 2026)
GCA_054824785.1
n/a n/a 22,773
(0.75 %)
23,199
(0.76 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
334
(0.00 %)
334
(0.00 %)
1,448
(100.00 %)
10,749,854
(56.06 %)
1,271,895
(18.31 %)
19,407,780
(65.71 %)
1
(0.00 %)
7,293,977
(9.34 %)
40,984
(0.45 %)
20,114
(0.26 %)
477 house mouse (129S1_SvImJv1 2016)
GCA_001624185.1
n/a n/a 21,289
(2.22 %)
18,626
(1.42 %)
102,148
(4.16 %)
41.77
(85.00 %)
54,773
(4.85 %)
366,945
(15.05 %)
62,882
(95.15 %)
5,075,137
(40.38 %)
1,400,072
(2.80 %)
13,497,076
(26.20 %)
20,479
(1.14 %)
431,052
(1.88 %)
16,957
(0.40 %)
16,083
(0.37 %)
478 house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022)
GCA_921998555.2
n/a n/a 21,780
(2.13 %)
19,436
(1.37 %)
110,376
(4.47 %)
41.79
(99.60 %)
8
(0.00 %)
1,557
(0.40 %)
188
(100.00 %)
4,653,663
(40.74 %)
1,550,342
(3.54 %)
12,930,784
(35.48 %)
22
(0.00 %)
820,282
(2.63 %)
23,211
(0.57 %)
15,822
(0.42 %)
479 house mouse (AKR_J v3 2022)
GCA_922000895.2
n/a n/a 21,721
(2.13 %)
19,324
(1.37 %)
110,654
(4.48 %)
41.80
(99.85 %)
6
(0.00 %)
2,714
(0.15 %)
201
(100.00 %)
4,645,513
(40.70 %)
1,547,237
(3.56 %)
13,016,932
(35.69 %)
31
(0.00 %)
816,257
(2.70 %)
23,309
(0.57 %)
15,840
(0.42 %)
480 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1
n/a n/a 661
(0.88 %)
720
(0.54 %)
n/a 38.59
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,806
(100.00 %)
97,279
(72.21 %)
40,071
(55.89 %)
208,928
(64.94 %)
0
(0 %)
239,612
(15.41 %)
506
(0.31 %)
327
(0.20 %)
481 house mouse (A_J v3 2022)
GCA_921998355.2
n/a n/a 21,869
(2.13 %)
19,400
(1.37 %)
110,389
(4.48 %)
41.80
(99.39 %)
5
(0.00 %)
608
(0.61 %)
163
(100.00 %)
4,668,553
(40.80 %)
1,556,835
(3.58 %)
12,995,938
(35.53 %)
4
(0.00 %)
832,187
(2.55 %)
23,203
(0.56 %)
15,809
(0.42 %)
482 house mouse (BALB_cJ v3 2022)
GCA_921997145.2
n/a n/a 21,891
(2.13 %)
19,499
(1.37 %)
110,461
(4.47 %)
41.79
(99.80 %)
7
(0.00 %)
274
(0.20 %)
217
(100.00 %)
4,673,990
(40.79 %)
1,560,327
(3.63 %)
13,018,071
(35.70 %)
1
(0.00 %)
836,824
(2.52 %)
23,196
(0.56 %)
15,865
(0.42 %)
483 house mouse (C3H_HeJ v3 2022)
GCA_921997125.2
n/a n/a 21,793
(2.13 %)
19,516
(1.38 %)
110,049
(4.46 %)
41.79
(99.05 %)
3
(0.00 %)
844
(0.95 %)
174
(100.00 %)
4,657,005
(40.76 %)
1,551,107
(3.53 %)
12,949,100
(35.32 %)
12
(0.00 %)
825,975
(2.56 %)
23,262
(0.56 %)
15,821
(0.42 %)
484 house mouse (C57BL/6J 2012)
GCA_000185105.2
n/a n/a 21,313
(2.28 %)
19,336
(1.53 %)
n/a 41.71
(91.01 %)
189,267
(9.02 %)
189,267
(9.02 %)
191,581
(90.98 %)
4,937,032
(40.05 %)
1,409,489
(2.64 %)
13,090,524
(27.69 %)
5,529
(0.08 %)
357,127
(1.10 %)
16,523
(0.40 %)
15,591
(0.37 %)
485 house mouse (C57BL_6J T2T 2024)
GCA_964188535.1
n/a n/a 21,496
(1.92 %)
19,278
(1.25 %)
n/a 41.31
(99.85 %)
108
(0.15 %)
108
(0.15 %)
345
(99.85 %)
4,519,975
(46.81 %)
1,564,206
(14.33 %)
12,267,542
(42.16 %)
0
(0 %)
1,961,197
(5.36 %)
23,119
(0.55 %)
15,974
(0.40 %)
486 house mouse (CBA_J v3 2022)
GCA_921998905.2
n/a n/a 21,829
(2.13 %)
19,841
(1.39 %)
110,858
(4.48 %)
41.79
(99.52 %)
2
(0.00 %)
658
(0.48 %)
145
(100.00 %)
4,658,032
(40.77 %)
1,552,298
(3.59 %)
12,948,038
(35.52 %)
2
(0.00 %)
829,314
(2.57 %)
23,232
(0.56 %)
15,810
(0.42 %)
487 house mouse (DBA_2J v3 2022)
GCA_921998315.2
n/a n/a 22,302
(2.08 %)
19,749
(1.35 %)
113,269
(4.42 %)
41.72
(100.00 %)
9
(0.00 %)
153
(0.00 %)
361
(100.00 %)
4,785,676
(41.69 %)
1,597,598
(4.56 %)
13,190,158
(36.58 %)
0
(0 %)
968,205
(2.82 %)
24,140
(0.59 %)
16,383
(0.43 %)
488 house mouse (FVB_NJ v3 2022)
GCA_921998635.2
n/a n/a 21,633
(2.15 %)
19,565
(1.40 %)
110,246
(4.50 %)
41.82
(98.35 %)
8
(0.00 %)
6,244
(1.65 %)
384
(100.00 %)
4,621,601
(40.42 %)
1,537,622
(3.48 %)
12,818,729
(34.77 %)
54
(0.00 %)
781,344
(2.48 %)
22,696
(0.55 %)
15,795
(0.42 %)
489 house mouse (LP_J v3 2022)
GCA_947599735.1
n/a n/a 22,452
(1.91 %)
19,841
(1.23 %)
110,073
(3.98 %)
41.29
(99.99 %)
87
(0.00 %)
386
(0.01 %)
515
(100.00 %)
4,839,574
(46.33 %)
1,645,163
(11.88 %)
12,936,515
(41.49 %)
63
(0.00 %)
1,839,684
(4.85 %)
24,374
(0.54 %)
16,515
(0.39 %)
490 house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022)
GCA_921998325.2
n/a n/a 21,797
(2.13 %)
19,521
(1.38 %)
109,890
(4.48 %)
41.80
(99.50 %)
2
(0.00 %)
1,462
(0.50 %)
170
(100.00 %)
4,650,016
(40.74 %)
1,547,220
(3.54 %)
12,918,125
(35.45 %)
24
(0.00 %)
826,087
(2.65 %)
23,253
(0.56 %)
15,815
(0.42 %)
491 house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022)
GCA_947593165.1
n/a n/a 22,481
(1.93 %)
19,932
(1.26 %)
109,670
(4.03 %)
41.34
(100.00 %)
58
(0.00 %)
234
(0.00 %)
441
(100.00 %)
4,822,230
(45.92 %)
1,637,027
(11.19 %)
13,082,730
(41.04 %)
19
(0.00 %)
1,756,117
(4.67 %)
24,187
(0.54 %)
16,389
(0.39 %)
492 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1
n/a n/a 22,351
(1.96 %)
19,629
(1.26 %)
n/a 41.38
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
179
(100.00 %)
4,774,018
(45.31 %)
1,620,102
(10.50 %)
13,181,250
(40.47 %)
0
(0 %)
1,650,132
(4.47 %)
23,955
(0.54 %)
16,164
(0.39 %)
493 house mouse C57BL/6J 2020 GRC
GCF_000001635.27
136,224
(4.84 %)
n/a 22,409
(2.02 %)
19,480
(1.31 %)
140,725
(4.83 %)
41.67
(97.30 %)
324
(2.70 %)
334
(2.70 %)
22,273
(97.30 %)
5,361,085
(45.51 %)
1,641,063
(3.41 %)
12,722,791
(36.04 %)
1
(0.00 %)
858,983
(2.44 %)
23,794
(0.53 %)
15,980
(0.39 %)
494 house mouse C57BL_6NJ (2016)
GCA_001632555.1
n/a n/a 21,177
(2.23 %)
18,495
(1.42 %)
103,002
(4.20 %)
41.76
(82.53 %)
45,300
(3.63 %)
410,660
(17.53 %)
49,821
(96.37 %)
5,081,049
(40.22 %)
1,392,942
(2.58 %)
13,476,268
(25.21 %)
24,698
(0.96 %)
429,021
(1.56 %)
16,877
(0.39 %)
16,035
(0.36 %)
495 house mouse C57BL_6NJ (2022)
GCA_921999865.2
n/a n/a 21,817
(2.13 %)
19,349
(1.37 %)
n/a 41.79
(99.76 %)
7
(0.00 %)
1,127
(0.24 %)
214
(100.00 %)
4,661,104
(40.76 %)
1,552,079
(3.56 %)
12,953,662
(35.57 %)
8
(0.00 %)
825,187
(2.60 %)
23,204
(0.56 %)
15,812
(0.42 %)
496 humpback whale (KW2013002 2024)
GCA_041834305.1
n/a n/a 19,463
(1.32 %)
22,424
(1.19 %)
n/a 42.05
(100.00 %)
0
(0 %)
88
(0.00 %)
1,355
(100.00 %)
4,164,459
(34.02 %)
1,281,751
(18.33 %)
12,412,281
(48.28 %)
0
(0 %)
2,009,593
(5.80 %)
82,412
(1.67 %)
44,791
(0.96 %)
497 Iberian mole (v2.1 TD23 2020)
GCF_014898055.3
56,986
(3.41 %)
n/a 18,431
(1.69 %)
20,317
(1.59 %)
n/a 41.89
(99.89 %)
0
(0 %)
3,575
(0.11 %)
3,202
(100.00 %)
2,635,974
(23.38 %)
496,514
(1.29 %)
10,969,546
(32.61 %)
2
(0.00 %)
637,831
(2.54 %)
47,466
(2.89 %)
43,066
(2.46 %)
498 Incan shrew opossum (hap1 2026)
GCA_054644205.1
n/a n/a 18,571
(0.65 %)
18,069
(0.75 %)
n/a 37.91
(100.00 %)
0
(0 %)
1,075
(0.00 %)
188
(100.00 %)
12,536,015
(55.82 %)
1,210,154
(3.86 %)
24,488,548
(48.61 %)
16
(0.00 %)
1,205,947
(2.25 %)
20,671
(0.41 %)
19,897
(0.36 %)
499 Incan shrew opossum (hap2 2026)
GCA_054644215.1
n/a n/a 18,021
(0.67 %)
17,310
(0.75 %)
n/a 37.79
(100.00 %)
0
(0 %)
994
(0.00 %)
98
(100.00 %)
12,176,230
(56.47 %)
1,165,452
(2.75 %)
23,829,102
(48.11 %)
9
(0.00 %)
737,131
(1.48 %)
19,139
(0.39 %)
18,320
(0.35 %)
500 Indian false vampire
GCA_004026885.1
n/a n/a 20,067
(1.37 %)
36,544
(1.53 %)
32,548
(1.37 %)
40.84
(99.83 %)
6,266
(0.02 %)
6,266
(0.02 %)
1,909,067
(99.98 %)
4,096,409
(31.50 %)
699,311
(1.81 %)
12,307,198
(39.96 %)
15
(0.00 %)
n/a 92,830
(3.12 %)
82,461
(2.65 %)
501 Indian flying fox
GCF_902729225.1
64,763
(3.85 %)
n/a 18,222
(2.01 %)
23,187
(1.82 %)
45,389
(2.18 %)
39.83
(99.10 %)
0
(0 %)
17,500
(0.90 %)
16,113
(100.00 %)
2,972,300
(34.11 %)
487,157
(1.49 %)
12,486,528
(27.37 %)
384
(0.01 %)
202,174
(1.56 %)
57,869
(3.73 %)
61,442
(3.09 %)
502 Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023)
GCA_030015415.1
n/a n/a 17,560
(2.04 %)
21,687
(1.83 %)
n/a 39.77
(100.00 %)
0
(0 %)
26
(0.00 %)
181
(100.00 %)
2,598,385
(30.48 %)
486,921
(1.41 %)
11,828,726
(27.28 %)
0
(0 %)
175,274
(0.71 %)
37,476
(5.58 %)
39,290
(5.02 %)
503 Indiana bat (hap1 2026)
GCA_057945255.1
n/a n/a 18,747
(1.84 %)
22,021
(1.70 %)
n/a 42.83
(100.00 %)
0
(0 %)
70
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,983,941
(48.10 %)
727,252
(6.15 %)
10,651,549
(38.18 %)
9
(0.00 %)
773,202
(2.69 %)
64,219
(2.52 %)
52,342
(2.02 %)
504 Indiana bat (hap2 2026)
GCA_057945245.1
n/a n/a 18,074
(1.89 %)
21,376
(1.78 %)
n/a 42.96
(100.00 %)
0
(0 %)
50
(0.00 %)
43
(100.00 %)
4,650,326
(46.91 %)
666,495
(5.97 %)
9,978,341
(37.20 %)
8
(0.00 %)
687,120
(2.60 %)
61,322
(2.61 %)
50,791
(2.10 %)
505 Indochinese shrew (US011 2019 Broad)
GCA_004027635.1
n/a n/a 18,870
(0.51 %)
55,636
(0.81 %)
n/a 39.81
(99.83 %)
5,267
(0.02 %)
5,267
(0.02 %)
2,420,679
(99.98 %)
4,130,068
(16.60 %)
1,663,335
(3.30 %)
18,728,711
(46.19 %)
45
(0.00 %)
n/a 31,453
(0.55 %)
25,923
(0.42 %)
506 Indus River dolphin
GCA_004363435.1
n/a n/a 24,321
(1.30 %)
47,065
(1.14 %)
n/a 41.72
(99.88 %)
11,702
(0.04 %)
11,702
(0.04 %)
1,110,492
(99.96 %)
5,093,308
(45.60 %)
845,860
(1.72 %)
13,162,111
(41.37 %)
34
(0.00 %)
n/a 68,257
(1.40 %)
49,070
(1.11 %)
507 Inner Mongolia cashmere goat (2024)
GCA_041735815.1
n/a n/a 19,123
(1.40 %)
21,508
(1.26 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 31
(100.00 %)
3,982,368
(23.76 %)
650,129
(7.44 %)
12,858,872
(44.33 %)
0
(0 %)
2,309,715
(5.29 %)
99,144
(2.87 %)
39,833
(0.88 %)
508 intermediate fruit-eating bat (hap1 2024)
GCA_038363145.1
n/a n/a 18,022
(1.56 %)
19,824
(1.51 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
419
(100.00 %)
2,827,417
(26.82 %)
371,479
(4.97 %)
11,603,093
(34.64 %)
1
(0.00 %)
522,672
(1.87 %)
71,574
(2.28 %)
54,020
(1.50 %)
509 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa alternate hap 2024)
GCA_043727925.1
n/a n/a 17,564
(1.87 %)
20,064
(1.66 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,194
(100.00 %)
3,406,902
(41.38 %)
537,189
(4.88 %)
11,454,141
(30.99 %)
0
(0 %)
817,381
(2.10 %)
32,338
(1.09 %)
27,698
(0.96 %)
510 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024)
GCA_043728065.1
n/a n/a 18,239
(1.76 %)
20,378
(1.53 %)
n/a 41.40
(100.00 %)
1
(0.00 %)
37
(0.00 %)
2,195
(100.00 %)
3,438,644
(42.82 %)
584,006
(9.54 %)
12,207,998
(35.49 %)
0
(0 %)
1,679,263
(3.77 %)
34,491
(1.02 %)
29,817
(0.90 %)
511 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1
n/a n/a 19,064
(1.67 %)
20,800
(1.49 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
0
(0 %)
119
(0.00 %)
69
(100.00 %)
3,393,548
(30.92 %)
723,545
(6.58 %)
12,073,117
(35.40 %)
0
(0 %)
1,106,960
(3.54 %)
43,736
(1.20 %)
30,847
(0.87 %)
512 jaguar
GCF_046562875.1
75,496
(3.58 %)
n/a 18,871
(1.64 %)
21,072
(1.41 %)
n/a 41.76
(100.00 %)
0
(0 %)
200
(0.00 %)
86
(100.00 %)
5,097,978
(41.83 %)
982,066
(2.10 %)
13,365,317
(34.16 %)
3
(0.00 %)
459,797
(1.37 %)
66,000
(2.75 %)
59,508
(2.25 %)
513 jaguar (BS21 2019)
GCA_004023805.1
n/a n/a 21,431
(1.51 %)
32,835
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.89 %)
21,329
(0.09 %)
21,329
(0.09 %)
460,121
(99.91 %)
5,420,861
(43.75 %)
1,049,353
(1.93 %)
13,848,545
(34.90 %)
43
(0.00 %)
425,795
(0.77 %)
71,066
(2.37 %)
62,901
(1.89 %)
514 jaguar (hap1 2025 genbank)
GCA_046562885.1
n/a n/a 17,882
(1.68 %)
19,103
(1.41 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
0
(0 %)
140
(0.00 %)
115
(100.00 %)
4,622,385
(41.25 %)
893,297
(1.89 %)
12,851,116
(33.53 %)
1
(0.00 %)
402,314
(1.33 %)
61,319
(2.55 %)
55,085
(2.08 %)
515 jaguar (hap1 2025 refseq)
GCF_046562885.1
72,531
(3.71 %)
n/a 17,886
(1.68 %)
19,296
(1.42 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
0
(0 %)
140
(0.00 %)
116
(100.00 %)
4,733,281
(41.33 %)
893,299
(1.89 %)
12,851,153
(33.54 %)
1
(0.00 %)
402,317
(1.33 %)
61,319
(2.55 %)
55,064
(2.08 %)
516 jaguar (hap1 2025)
GCA_046562885.2
n/a n/a 17,884
(1.68 %)
19,104
(1.41 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
0
(0 %)
140
(0.00 %)
115
(100.00 %)
4,733,274
(41.33 %)
893,297
(1.89 %)
12,851,116
(33.53 %)
1
(0.00 %)
402,314
(1.33 %)
61,319
(2.55 %)
55,064
(2.08 %)
517 jaguar (Sample0147 2023)
GCF_028533385.1
71,578
(4.12 %)
n/a 19,122
(1.67 %)
21,950
(1.36 %)
n/a 41.58
(99.31 %)
0
(0 %)
56,371
(0.70 %)
36,243
(100.00 %)
4,552,854
(33.37 %)
897,371
(1.63 %)
13,732,912
(32.89 %)
2,743
(0.10 %)
314,574
(0.82 %)
63,777
(2.41 %)
60,478
(2.01 %)
518 jaguar (v1 hap2 2025)
GCA_046562875.1
n/a n/a 18,867
(1.64 %)
20,784
(1.40 %)
n/a 41.76
(100.00 %)
0
(0 %)
200
(0.00 %)
85
(100.00 %)
4,977,843
(41.75 %)
982,064
(2.10 %)
13,365,332
(34.16 %)
3
(0.00 %)
459,794
(1.37 %)
66,000
(2.75 %)
59,529
(2.25 %)
519 jaguar (v2 hap2 2025)
GCA_046562875.2
n/a n/a 18,869
(1.64 %)
20,781
(1.40 %)
n/a 41.76
(100.00 %)
0
(0 %)
200
(0.00 %)
85
(100.00 %)
5,097,971
(41.83 %)
982,064
(2.10 %)
13,365,332
(34.16 %)
3
(0.00 %)
459,794
(1.37 %)
66,000
(2.75 %)
59,508
(2.25 %)
520 jaguarundi
GCF_014898765.1
72,564
(3.15 %)
n/a 18,602
(1.64 %)
20,510
(1.39 %)
n/a 41.75
(97.85 %)
0
(0 %)
42,499
(2.16 %)
10,948
(100.00 %)
5,035,745
(43.29 %)
907,329
(1.61 %)
13,590,905
(33.57 %)
2,609
(0.04 %)
574,230
(1.55 %)
69,090
(2.29 %)
60,356
(1.80 %)
521 Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U)
GCF_014825515.1
48,692
(2.72 %)
n/a 19,921
(1.66 %)
23,614
(1.68 %)
39,384
(2.12 %)
41.95
(98.87 %)
0
(0 %)
110,840
(1.13 %)
56,740
(100.00 %)
2,972,388
(28.79 %)
405,474
(2.15 %)
12,458,880
(30.65 %)
8,380
(0.26 %)
388,646
(3.79 %)
61,973
(1.87 %)
54,441
(1.58 %)
522 Jamaican fruit-eating bat (2021)
GCF_021234435.1
55,114
(3.18 %)
n/a 17,875
(1.68 %)
19,958
(1.66 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
868
(100.00 %)
2,697,287
(28.17 %)
318,700
(0.84 %)
11,750,329
(31.61 %)
0
(0 %)
245,042
(0.98 %)
61,951
(1.93 %)
52,462
(1.61 %)
523 Japanese wild mouse (2022)
GCA_921999095.2
n/a n/a 23,292
(2.05 %)
20,114
(1.31 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
51
(0.00 %)
397
(0.00 %)
1,449
(100.00 %)
4,952,306
(42.53 %)
1,635,456
(4.60 %)
12,838,321
(38.56 %)
8
(0.00 %)
1,050,247
(2.88 %)
24,168
(0.56 %)
16,545
(0.42 %)
524 Java mouse-deer (US108 2019 Broad)
GCA_004024965.1
n/a n/a 23,081
(1.38 %)
38,181
(1.41 %)
n/a 42.73
(99.91 %)
2,829
(0.01 %)
2,829
(0.01 %)
1,159,819
(99.99 %)
4,791,310
(34.97 %)
448,498
(1.92 %)
13,175,375
(39.89 %)
11
(0.00 %)
n/a 68,778
(2.92 %)
61,444
(2.39 %)
525 kiang (wild_1 2025)
GCA_052150635.1
n/a n/a 18,140
(1.70 %)
20,652
(1.44 %)
n/a n/a 0
(0 %)
n/a 27
(100.00 %)
4,377,664
(45.26 %)
349,813
(2.17 %)
14,698,895
(30.82 %)
0
(0 %)
445,927
(1.23 %)
41,765
(2.48 %)
39,983
(1.32 %)
526 killer whale (2022)
GCF_937001465.1
78,479
(3.76 %)
n/a 18,710
(1.51 %)
21,101
(1.30 %)
34,448
(1.49 %)
41.91
(100.00 %)
0
(0 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
3,955,401
(36.81 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,568
(41.63 %)
2
(0.00 %)
1,982,992
(5.71 %)
77,307
(3.08 %)
40,935
(1.02 %)
527 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1
n/a n/a 14,982
(1.50 %)
19,185
(1.30 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 12,410
(100.00 %)
2,752,892
(35.61 %)
589,217
(10.15 %)
8,371,032
(41.11 %)
0
(0 %)
1,464,220
(5.92 %)
57,347
(3.41 %)
30,003
(1.05 %)
528 killer whale (Morgan 2013)
GCF_000331955.2
70,972
(3.55 %)
n/a 18,736
(1.86 %)
20,365
(1.48 %)
n/a 41.35
(94.82 %)
78,432
(5.20 %)
78,441
(5.20 %)
80,100
(94.80 %)
3,978,339
(43.98 %)
555,737
(1.13 %)
12,773,973
(31.51 %)
2,677
(0.03 %)
355,274
(1.15 %)
61,145
(1.59 %)
40,101
(1.20 %)
529 killer whale (primary hap 2022)
GCA_937001465.1
n/a n/a 18,847
(1.59 %)
21,099
(1.30 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
0
(0 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
4,361,647
(43.69 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,548
(41.63 %)
2
(0.00 %)
1,982,992
(5.71 %)
77,307
(3.08 %)
55,911
(2.03 %)
530 klipspringer (KSP-560 2019)
GCA_006410675.1
n/a n/a 22,317
(1.37 %)
27,606
(1.31 %)
n/a 42.04
(89.74 %)
371,212
(10.28 %)
371,212
(10.28 %)
396,104
(89.72 %)
6,379,883
(45.04 %)
726,514
(5.64 %)
15,472,957
(34.77 %)
110,495
(1.31 %)
1,435,553
(13.13 %)
50,579
(1.00 %)
44,503
(0.87 %)
531 koala (Bilbo 61053 2022 genbank)
GCA_003287225.2
n/a n/a 17,087
(0.81 %)
14,711
(0.86 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
0
(0 %)
669
(0.00 %)
1,246
(100.00 %)
6,280,029
(29.77 %)
1,123,294
(2.02 %)
21,796,316
(39.24 %)
2
(0.00 %)
412,593
(0.92 %)
15,957
(0.35 %)
13,996
(0.24 %)
532 koala (Bilbo 61053 2022 refseq)
GCF_003287225.1
50,393
(2.58 %)
n/a 17,125
(0.85 %)
14,711
(0.86 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
0
(0 %)
669
(0.00 %)
1,246
(100.00 %)
10,370,789
(60.23 %)
1,123,294
(2.02 %)
21,796,035
(39.24 %)
2
(0.00 %)
362,271
(0.81 %)
15,957
(0.35 %)
14,970
(0.30 %)
533 koala (Bilbo 61053 2025)
GCA_003287225.3
n/a n/a 17,123
(0.85 %)
14,700
(0.86 %)
n/a 39.06
(100.00 %)
4
(0.00 %)
664
(0.00 %)
1,239
(100.00 %)
10,358,875
(60.22 %)
1,121,543
(2.02 %)
21,754,367
(39.21 %)
2
(0.00 %)
411,358
(0.92 %)
15,940
(0.35 %)
14,953
(0.30 %)
534 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1
65,654
(3.37 %)
n/a 17,918
(1.89 %)
20,819
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
0
(0 %)
394
(0.69 %)
202
(100.00 %)
2,897,422
(23.58 %)
797,420
(2.76 %)
10,057,100
(34.56 %)
2
(0.00 %)
425,636
(1.52 %)
55,965
(2.99 %)
57,667
(2.01 %)
535 Kuhl's pipistrelle (primary hap 2025)
GCA_014108245.2
n/a n/a 17,770
(2.01 %)
20,646
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
0
(0 %)
522
(0.69 %)
82
(100.00 %)
4,542,064
(41.94 %)
797,434
(2.76 %)
10,057,037
(34.56 %)
2
(0.00 %)
426,465
(1.53 %)
55,766
(2.87 %)
56,160
(2.88 %)
536 large flying fox
GCF_000151845.1
52,243
(3.10 %)
n/a 18,454
(1.91 %)
23,631
(1.73 %)
n/a 39.82
(91.80 %)
189,339
(8.24 %)
189,340
(8.24 %)
225,433
(91.76 %)
3,117,045
(36.49 %)
504,277
(3.03 %)
13,025,556
(25.00 %)
22,188
(0.92 %)
358,468
(6.48 %)
78,404
(3.24 %)
74,747
(2.62 %)
537 large Japanese field mouse (IB14-021 2017)
GCA_002335545.1
n/a n/a 22,630
(1.74 %)
33,810
(1.26 %)
n/a 42.04
(57.78 %)
4,289,924
(42.35 %)
4,289,924
(42.35 %)
4,626,044
(57.65 %)
3,638,537
(31.76 %)
1,048,253
(1.87 %)
12,039,926
(16.61 %)
10,107
(0.44 %)
n/a 19,817
(0.34 %)
18,415
(0.32 %)
538 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1
n/a n/a 21,678
(1.34 %)
22,317
(1.25 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
1,188
(0.00 %)
1,198
(100.00 %)
5,530,547
(22.20 %)
1,357,640
(10.13 %)
14,334,312
(46.09 %)
5
(0.00 %)
2,400,830
(5.08 %)
123,453
(2.17 %)
59,337
(1.38 %)
539 large tree shrew (BS70 2025)
GCA_026018925.2
n/a n/a 21,760
(1.34 %)
22,479
(1.26 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
1,263
(0.00 %)
1,209
(100.00 %)
6,876,878
(36.82 %)
1,357,671
(10.13 %)
14,333,971
(46.09 %)
5
(0.00 %)
2,401,446
(5.08 %)
123,449
(2.17 %)
59,326
(1.38 %)
540 least weasel (hap1 2026)
GCA_057128415.1
n/a n/a 18,939
(1.27 %)
22,764
(1.19 %)
n/a 42.71
(99.36 %)
0
(0 %)
600
(0.64 %)
4,178
(100.00 %)
6,149,771
(53.28 %)
869,596
(6.56 %)
13,236,177
(44.78 %)
4
(0.00 %)
2,809,459
(7.20 %)
66,312
(2.12 %)
54,158
(1.60 %)
541 least weasel (hap1.1 2025 genbank)
GCA_964662115.1
n/a n/a 19,085
(1.11 %)
23,074
(1.09 %)
n/a 43.54
(99.98 %)
9
(0.00 %)
2,938
(0.02 %)
3,189
(100.00 %)
4,687,333
(25.05 %)
908,610
(10.98 %)
12,922,050
(49.64 %)
17
(0.00 %)
4,143,372
(9.39 %)
68,749
(2.22 %)
53,921
(1.35 %)
542 least weasel (hap1.1 2025 refseq)
GCF_964662115.1
87,413
(2.56 %)
n/a 19,035
(1.16 %)
23,079
(1.09 %)
n/a 43.54
(99.98 %)
2,938
(0.02 %)
2,938
(0.02 %)
6,117
(99.98 %)
6,208,263
(57.37 %)
908,609
(10.98 %)
12,922,009
(49.64 %)
17
(0.00 %)
4,140,971
(9.38 %)
68,748
(2.22 %)
54,532
(1.50 %)
543 least weasel (hap2 2026)
GCA_057128425.1
n/a n/a 18,078
(1.29 %)
21,580
(1.20 %)
n/a 42.81
(99.66 %)
0
(0 %)
460
(0.34 %)
4,263
(100.00 %)
5,771,273
(52.83 %)
811,406
(6.89 %)
12,416,602
(44.69 %)
4
(0.00 %)
2,771,111
(7.55 %)
62,699
(2.08 %)
51,434
(1.58 %)
544 least weasel (hap2.1 2025)
GCA_964662095.1
n/a n/a 18,255
(1.29 %)
22,201
(1.27 %)
n/a 42.68
(99.98 %)
2,709
(0.02 %)
2,709
(0.02 %)
4,948
(99.98 %)
4,268,233
(27.47 %)
787,850
(6.40 %)
12,592,088
(42.54 %)
17
(0.00 %)
2,083,429
(5.88 %)
62,416
(2.34 %)
51,317
(1.55 %)
545 leopard (Hobbes primary hap 2022)
GCF_024362965.1
70,501
(3.29 %)
n/a 18,472
(1.56 %)
20,388
(1.41 %)
n/a 41.75
(99.99 %)
0
(0 %)
335
(0.01 %)
382
(100.00 %)
4,634,038
(33.80 %)
932,991
(2.25 %)
13,686,652
(34.03 %)
1
(0.00 %)
451,937
(1.32 %)
65,793
(2.64 %)
60,846
(1.89 %)
546 leopard (Maewha 2016 refseq)
GCF_001857705.1
73,279
(3.20 %)
n/a 18,881
(1.63 %)
21,010
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
214,953
(3.85 %)
265,330
(96.15 %)
5,247,029
(42.87 %)
1,059,446
(5.13 %)
14,265,573
(32.20 %)
28,667
(1.17 %)
525,712
(5.63 %)
77,001
(2.45 %)
66,922
(1.91 %)
547 leopard cat
GCF_016509475.1
59,965
(3.05 %)
n/a 18,472
(1.65 %)
19,934
(1.38 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
39
(0.00 %)
56
(0.00 %)
123
(100.00 %)
4,978,115
(43.28 %)
901,754
(1.84 %)
13,596,535
(34.23 %)
0
(0 %)
586,248
(1.62 %)
67,390
(2.50 %)
62,344
(2.02 %)
548 Leschenault's rousette (2020)
GCA_015472975.1
n/a n/a 17,815
(2.05 %)
23,917
(1.90 %)
n/a 40.13
(99.14 %)
100,669
(0.88 %)
100,669
(0.88 %)
108,810
(99.12 %)
2,688,705
(31.20 %)
428,968
(1.19 %)
12,245,385
(26.51 %)
13
(0.00 %)
121,479
(0.56 %)
58,118
(6.81 %)
61,535
(5.42 %)
549 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1
51,730
(1.99 %)
n/a 20,129
(1.24 %)
22,089
(1.24 %)
40,414
(1.76 %)
42.00
(99.52 %)
0
(0 %)
561
(0.48 %)
160
(100.00 %)
7,346,291
(41.25 %)
1,187,587
(2.92 %)
14,222,177
(44.13 %)
1
(0.00 %)
1,219,048
(2.53 %)
34,688
(0.86 %)
25,175
(0.54 %)
550 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1
n/a n/a 17,777
(1.27 %)
19,232
(1.28 %)
n/a 42.13
(92.75 %)
0
(0 %)
2,875
(7.25 %)
508
(100.00 %)
6,476,967
(33.93 %)
999,133
(2.78 %)
11,809,834
(40.52 %)
1
(0.00 %)
1,062,479
(2.36 %)
29,872
(0.82 %)
21,704
(0.51 %)
551 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq)
GCF_000280705.1
25,978
(1.44 %)
n/a 19,408
(1.38 %)
20,312
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
326,464
(12.87 %)
337,360
(87.13 %)
6,125,934
(38.31 %)
832,825
(1.53 %)
13,661,612
(33.98 %)
2,666
(0.03 %)
430,190
(1.14 %)
26,669
(0.59 %)
23,227
(0.47 %)
552 lesser Egyptian jerboa (primary hap 2021)
GCA_020740685.1
n/a n/a 20,129
(1.24 %)
22,086
(1.24 %)
n/a 42.00
(99.52 %)
0
(0 %)
561
(0.48 %)
159
(100.00 %)
6,288,871
(38.51 %)
1,187,585
(2.92 %)
14,221,962
(44.13 %)
1
(0.00 %)
1,219,063
(2.53 %)
34,688
(0.86 %)
25,175
(0.54 %)
553 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb alternate hap 2024)
GCA_043880535.1
n/a n/a 1,572
(0.57 %)
3,175
(1.45 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,678
(100.00 %)
286,260
(35.16 %)
107,917
(13.71 %)
1,232,326
(51.86 %)
0
(0 %)
518,360
(11.82 %)
5,144
(2.91 %)
5,111
(1.69 %)
554 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024)
GCA_043880595.1
n/a n/a 18,484
(1.87 %)
24,356
(1.84 %)
n/a 41.88
(97.91 %)
198
(0.32 %)
866
(2.09 %)
617
(99.68 %)
3,419,622
(36.65 %)
663,182
(2.53 %)
11,508,574
(30.58 %)
15
(0.00 %)
639,747
(2.02 %)
84,174
(4.85 %)
81,198
(4.01 %)
555 lesser horseshoe bat (hap1 2024)
GCA_964194185.1
n/a n/a 19,031
(1.88 %)
21,003
(1.63 %)
n/a 40.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,627
(0.01 %)
723
(100.00 %)
3,133,745
(33.46 %)
660,064
(3.79 %)
11,720,176
(32.32 %)
8
(0.00 %)
718,567
(2.35 %)
35,414
(1.75 %)
34,111
(1.64 %)
556 lesser horseshoe bat (hap2 2024)
GCA_964194215.1
n/a n/a 18,875
(1.72 %)
21,166
(1.58 %)
n/a 41.18
(99.99 %)
1,648
(0.01 %)
1,648
(0.01 %)
2,727
(99.99 %)
3,160,659
(34.00 %)
696,130
(6.23 %)
11,662,645
(34.26 %)
8
(0.00 %)
1,288,588
(3.71 %)
36,176
(1.80 %)
28,160
(0.89 %)
557 lesser horseshoe bat (hap2.2 2025)
GCA_964194215.2
n/a n/a 18,974
(1.81 %)
21,191
(1.58 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
56
(0.00 %)
56
(0.00 %)
1,036
(100.00 %)
3,652,081
(41.23 %)
696,117
(6.18 %)
11,690,617
(34.28 %)
1
(0.00 %)
1,274,034
(3.65 %)
36,376
(1.84 %)
31,832
(1.67 %)
558 lesser horseshoe bat (mRhiHip2.hap1.1 2024)
GCF_964194185.1
59,989
(3.28 %)
n/a 18,874
(1.86 %)
21,002
(1.63 %)
n/a 40.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,627
(0.01 %)
723
(100.00 %)
3,621,058
(40.92 %)
660,064
(3.79 %)
11,719,468
(32.32 %)
8
(0.00 %)
718,567
(2.35 %)
35,414
(1.75 %)
30,800
(1.57 %)
559 lesser noctule (v2 hap1 2025)
GCA_964264875.2
n/a n/a 18,342
(1.54 %)
22,974
(1.62 %)
n/a 43.04
(100.00 %)
3
(0.00 %)
302
(0.00 %)
588
(100.00 %)
4,258,096
(37.31 %)
1,289,911
(11.51 %)
9,694,758
(42.52 %)
2
(0.00 %)
1,992,418
(5.41 %)
65,974
(2.80 %)
61,273
(1.84 %)
560 lesser noctule (v2 hap2 2025)
GCA_964264895.2
n/a n/a 17,492
(1.62 %)
22,188
(1.72 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
247
(0.00 %)
247
(0.00 %)
920
(100.00 %)
3,886,341
(36.52 %)
1,139,308
(10.89 %)
9,356,457
(40.65 %)
2
(0.00 %)
1,617,080
(4.89 %)
62,254
(3.00 %)
59,522
(1.92 %)
561 lesser panda (RP43 2017)
GCA_002007465.1
n/a n/a 19,120
(1.69 %)
20,591
(1.50 %)
n/a 41.60
(98.56 %)
137,333
(1.45 %)
137,333
(1.45 %)
148,922
(98.55 %)
4,513,888
(40.87 %)
692,778
(1.62 %)
13,691,859
(31.36 %)
3,438
(0.05 %)
680,690
(2.32 %)
64,369
(2.52 %)
63,356
(2.19 %)
562 lesser sac-winged bat (alternate hap 2024)
GCA_036851165.1
n/a n/a 18,593
(1.42 %)
23,334
(1.46 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,715
(100.00 %)
6,471,175
(42.04 %)
1,030,472
(2.62 %)
12,509,696
(42.43 %)
0
(0 %)
1,069,868
(2.82 %)
96,414
(2.05 %)
47,984
(1.15 %)
563 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850995.1
53,210
(2.49 %)
n/a 18,323
(1.42 %)
21,350
(1.39 %)
n/a 41.84
(99.24 %)
0
(0 %)
573
(0.76 %)
168
(100.00 %)
4,224,344
(28.69 %)
1,030,576
(2.60 %)
12,591,989
(42.30 %)
1
(0.00 %)
1,128,543
(2.95 %)
98,189
(2.06 %)
48,427
(1.15 %)
564 lion
GCF_018350215.1
67,745
(2.86 %)
n/a 17,956
(1.69 %)
19,033
(1.40 %)
61,242
(3.04 %)
41.71
(100.00 %)
45
(0.00 %)
55
(0.00 %)
99
(100.00 %)
4,666,951
(42.23 %)
889,987
(1.87 %)
13,151,686
(33.40 %)
1
(0.00 %)
394,792
(1.11 %)
62,675
(2.56 %)
59,062
(2.11 %)
565 little brown bat
GCF_000147115.1
50,660
(2.76 %)
n/a 19,314
(1.86 %)
22,683
(1.70 %)
n/a 42.50
(96.66 %)
61,131
(3.35 %)
61,131
(3.35 %)
72,785
(96.65 %)
3,682,263
(37.05 %)
634,854
(2.15 %)
10,841,759
(33.45 %)
7
(0.00 %)
404,463
(1.53 %)
57,630
(1.79 %)
51,011
(1.50 %)
566 little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022)
GCA_024363435.1
n/a n/a 19,150
(1.52 %)
23,435
(1.64 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
229
(0.00 %)
718
(100.00 %)
n/a 1,051,300
(12.43 %)
9,858,628
(43.20 %)
3
(0.00 %)
1,828,018
(5.83 %)
48,101
(2.62 %)
48,908
(1.62 %)
567 little pocket mouse (longimembris primary hap 2022)
GCA_024363575.1
n/a n/a 19,760
(1.50 %)
24,317
(1.63 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
215
(0.00 %)
1,135
(100.00 %)
3,913,744
(28.43 %)
1,095,577
(12.70 %)
10,273,833
(43.74 %)
2
(0.00 %)
1,919,880
(5.85 %)
49,636
(2.61 %)
49,755
(1.59 %)
568 little tube-nosed bat
GCA_004026665.1
n/a n/a 22,009
(1.26 %)
45,725
(1.35 %)
n/a 43.80
(99.90 %)
6,795
(0.03 %)
6,795
(0.03 %)
886,972
(99.97 %)
3,372,804
(23.57 %)
1,014,476
(3.00 %)
11,948,592
(41.18 %)
29
(0.00 %)
n/a 71,530
(2.05 %)
53,483
(1.43 %)
569 little yellow-shouldered Mesoamerican bat (hap1 2026)
GCA_054855685.1
n/a n/a 18,026
(1.60 %)
20,157
(1.49 %)
n/a 42.76
(100.00 %)
0
(0 %)
107
(0.00 %)
948
(100.00 %)
4,010,797
(44.26 %)
492,856
(4.68 %)
11,967,529
(35.61 %)
3
(0.00 %)
464,417
(2.07 %)
67,991
(1.87 %)
53,031
(1.50 %)
570 little yellow-shouldered Mesoamerican bat (hap2 2026)
GCA_054855695.1
n/a n/a 16,884
(1.64 %)
18,316
(1.50 %)
n/a 42.71
(100.00 %)
0
(0 %)
83
(0.00 %)
703
(100.00 %)
3,651,686
(43.73 %)
427,096
(4.49 %)
11,079,759
(34.79 %)
4
(0.00 %)
387,725
(1.86 %)
61,324
(1.78 %)
47,154
(1.47 %)
571 long-finned pilot whale (alternate hap 2024)
GCA_963455345.2
n/a n/a 17,552
(1.56 %)
25,954
(1.35 %)
n/a 42.12
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28,097
(100.00 %)
3,815,058
(48.74 %)
789,873
(8.23 %)
9,845,230
(38.66 %)
0
(0 %)
774,006
(3.18 %)
58,137
(3.47 %)
38,440
(1.66 %)
572 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_963455315.2
61,447
(2.80 %)
n/a 18,725
(1.51 %)
20,946
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
1,084
(0.01 %)
1,084
(0.01 %)
2,076
(99.99 %)
4,125,452
(35.62 %)
1,577,896
(12.03 %)
12,347,170
(42.01 %)
10
(0.00 %)
1,284,155
(3.89 %)
71,822
(5.51 %)
41,663
(1.04 %)
573 long-finned pilot whale (X-22926-18 2019)
GCF_006547405.1
66,117
(3.28 %)
n/a 18,772
(1.80 %)
21,031
(1.46 %)
33,672
(1.78 %)
41.29
(99.58 %)
14,583
(0.42 %)
14,859
(0.42 %)
20,999
(99.58 %)
3,962,125
(45.58 %)
557,247
(1.11 %)
12,616,535
(34.70 %)
643
(0.01 %)
404,788
(1.24 %)
62,905
(1.69 %)
41,085
(1.25 %)
574 long-footed potoroo (2021)
GCA_904812075.1
n/a n/a 278
(19.06 %)
223
(16.20 %)
n/a 51.14
(99.50 %)
0
(0 %)
n/a 1,479
(100.00 %)
194
(1.83 %)
54
(0.32 %)
2,088
(5.90 %)
0
(0 %)
9
(0.15 %)
51
(2.47 %)
46
(2.25 %)
575 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1
54,854
(2.98 %)
n/a 18,096
(1.59 %)
19,514
(1.52 %)
n/a 41.06
(95.56 %)
78,817
(4.46 %)
78,817
(4.46 %)
81,656
(95.54 %)
4,018,866
(30.94 %)
607,082
(1.15 %)
13,528,234
(28.15 %)
1,183
(0.02 %)
162,447
(0.63 %)
46,931
(1.25 %)
45,334
(1.13 %)
576 long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad)
GCA_004027375.1
n/a n/a 19,208
(1.99 %)
31,180
(1.92 %)
n/a 39.56
(99.97 %)
2,056
(0.01 %)
2,056
(0.01 %)
174,041
(99.99 %)
2,893,453
(32.61 %)
597,516
(1.76 %)
12,093,608
(28.14 %)
6
(0.00 %)
n/a 63,015
(4.70 %)
62,530
(4.18 %)
577 Lowland paca
GCA_004365215.1
n/a n/a 21,953
(0.62 %)
56,356
(0.80 %)
n/a 40.83
(99.78 %)
3,060
(0.01 %)
3,060
(0.01 %)
3,771,510
(99.99 %)
5,892,507
(29.20 %)
802,811
(1.38 %)
18,630,883
(38.61 %)
101
(0.00 %)
n/a 61,715
(0.94 %)
53,212
(0.77 %)
578 Madagascan rousette (hap1 2026)
GCA_059802055.1
n/a n/a 17,416
(1.97 %)
23,244
(1.81 %)
n/a 40.37
(100.00 %)
0
(0 %)
50
(0.00 %)
78
(100.00 %)
3,077,702
(36.99 %)
514,081
(2.88 %)
12,173,492
(28.58 %)
3
(0.00 %)
176,741
(0.82 %)
63,249
(7.20 %)
63,191
(5.35 %)
579 Madagascan rousette (hap2 2026)
GCA_059802175.1
n/a n/a 16,694
(2.02 %)
21,640
(1.82 %)
n/a 40.41
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
65
(100.00 %)
2,881,737
(36.08 %)
472,529
(2.90 %)
11,388,923
(27.61 %)
0
(0 %)
141,212
(0.69 %)
58,575
(7.09 %)
58,859
(5.20 %)
580 Malagasy straw-colored fruit bat (hap1 2026)
GCA_059749095.1
n/a n/a 17,913
(1.98 %)
21,869
(1.77 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
103
(0.00 %)
81
(100.00 %)
2,947,096
(34.06 %)
499,471
(2.74 %)
12,180,358
(28.48 %)
1
(0.00 %)
218,681
(0.90 %)
53,093
(4.84 %)
56,785
(4.10 %)
581 Malagasy straw-colored fruit bat (hap2 2026)
GCA_059749105.1
n/a n/a 17,938
(1.99 %)
21,961
(1.77 %)
n/a 39.68
(100.00 %)
0
(0 %)
91
(0.00 %)
54
(100.00 %)
2,950,196
(34.03 %)
496,069
(2.49 %)
12,277,483
(28.35 %)
2
(0.00 %)
194,722
(0.82 %)
52,990
(4.61 %)
56,569
(3.94 %)
582 Malayan pangolin (MJ-LG 2024)
GCF_040802235.1
87,404
(4.24 %)
n/a 18,382
(1.54 %)
19,802
(1.30 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
0
(0 %)
90
(0.00 %)
63
(100.00 %)
3,146,889
(38.39 %)
384,539
(2.15 %)
12,642,995
(34.68 %)
1
(0.00 %)
568,487
(1.95 %)
48,454
(1.30 %)
44,955
(1.18 %)
583 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq)
GCF_001685135.1
48,591
(2.76 %)
n/a 19,458
(1.57 %)
24,783
(1.38 %)
41,272
(1.95 %)
40.78
(92.27 %)
0
(0 %)
984,658
(7.81 %)
80,670
(100.00 %)
3,064,599
(35.21 %)
866,309
(3.08 %)
13,310,859
(28.76 %)
389,500
(1.56 %)
884,203
(3.10 %)
35,558
(0.84 %)
33,754
(0.78 %)
584 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1
68,043
(3.50 %)
n/a 18,167
(1.72 %)
20,453
(1.54 %)
n/a 40.83
(91.78 %)
0
(0 %)
57,746
(8.23 %)
17,969
(100.00 %)
2,864,567
(34.23 %)
277,996
(1.69 %)
12,659,207
(25.72 %)
610
(0.01 %)
258,572
(5.38 %)
33,486
(1.00 %)
32,201
(0.94 %)
585 marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025)
GCA_048126345.1
n/a n/a 25,281
(0.80 %)
18,740
(0.87 %)
n/a 37.80
(99.99 %)
196
(0.01 %)
196
(0.01 %)
889
(99.99 %)
6,538,990
(26.08 %)
1,450,668
(2.40 %)
21,374,371
(47.19 %)
1
(0.00 %)
1,242,479
(2.55 %)
17,923
(0.30 %)
14,429
(0.21 %)
586 Masai giraffe (alternate hap 2026)
GCA_054371575.1
n/a n/a 17,968
(1.65 %)
19,375
(1.35 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
15
(100.00 %)
5,097,065
(47.28 %)
419,165
(2.46 %)
11,795,337
(39.58 %)
0
(0 %)
800,744
(2.64 %)
41,621
(1.98 %)
35,565
(1.70 %)
587 Masai giraffe (MA1 2016 Penn St)
GCA_001651235.1
n/a n/a 20,950
(1.52 %)
28,854
(1.33 %)
n/a 41.39
(96.50 %)
257,672
(3.48 %)
257,672
(3.48 %)
770,838
(96.52 %)
5,502,479
(43.94 %)
531,418
(2.64 %)
13,936,018
(36.18 %)
31,941
(0.52 %)
748,633
(4.02 %)
40,504
(1.02 %)
38,345
(0.94 %)
588 Masai giraffe (primary hap 2026 genbank)
GCA_054371585.1
n/a n/a 18,881
(1.61 %)
20,786
(1.36 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 17
(100.00 %)
5,464,683
(47.98 %)
447,812
(2.90 %)
12,442,051
(40.00 %)
0
(0 %)
937,701
(2.76 %)
44,333
(2.00 %)
37,621
(1.61 %)
589 Masai giraffe (primary hap 2026 refseq)
GCF_054371585.1
146,626
(4.30 %)
n/a 18,883
(1.61 %)
20,802
(1.36 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 16
(100.00 %)
5,464,676
(47.98 %)
447,812
(2.90 %)
12,441,991
(40.00 %)
0
(0 %)
937,701
(2.76 %)
44,333
(2.00 %)
37,621
(1.61 %)
590 meadow jumping mouse
GCA_004024765.1
n/a n/a 22,236
(1.08 %)
44,719
(1.21 %)
n/a 42.31
(99.88 %)
7,610
(0.03 %)
7,610
(0.03 %)
1,165,710
(99.97 %)
6,135,446
(33.31 %)
1,525,146
(3.34 %)
13,854,475
(39.91 %)
38
(0.00 %)
n/a 26,633
(0.68 %)
21,059
(0.49 %)
591 meadow vole (hap1 2024 genbank)
GCA_037038515.1
n/a n/a 19,134
(1.78 %)
20,672
(1.55 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
181
(100.00 %)
4,818,689
(41.90 %)
962,362
(4.16 %)
12,161,222
(34.42 %)
0
(0 %)
1,559,409
(4.65 %)
23,781
(0.74 %)
19,793
(0.55 %)
592 meadow vole (hap1 2024 refseq)
GCF_037038515.1
56,969
(2.88 %)
n/a 19,974
(1.74 %)
20,672
(1.55 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
180
(100.00 %)
4,116,239
(33.62 %)
962,362
(4.16 %)
12,161,153
(34.42 %)
0
(0 %)
1,559,409
(4.65 %)
23,781
(0.74 %)
17,740
(0.46 %)
593 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1
n/a n/a 19,001
(1.82 %)
20,271
(1.68 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
143
(100.00 %)
3,141,368
(21.37 %)
898,900
(4.24 %)
11,475,531
(32.14 %)
0
(0 %)
862,918
(2.64 %)
22,186
(0.75 %)
16,985
(0.48 %)
594 meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq)
GCF_006229205.1
58,806
(2.67 %)
n/a 19,009
(1.64 %)
19,088
(1.36 %)
n/a 41.68
(99.72 %)
0
(0 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,564,931
(40.13 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
5,134
(0.09 %)
236,044
(0.75 %)
64,858
(2.22 %)
63,010
(1.87 %)
595 melon-headed whale (hap1 2025)
GCA_051427945.1
n/a n/a 18,643
(1.64 %)
20,840
(1.43 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
204
(100.00 %)
5,100,394
(52.00 %)
1,312,199
(7.54 %)
12,322,262
(38.99 %)
2
(0.00 %)
1,107,114
(3.27 %)
69,873
(4.58 %)
40,873
(1.19 %)
596 melon-headed whale (hap2 2025)
GCA_051427955.1
n/a n/a 17,790
(1.73 %)
19,805
(1.50 %)
n/a 41.92
(100.00 %)
0
(0 %)
65
(0.00 %)
167
(100.00 %)
4,595,309
(50.05 %)
975,539
(5.44 %)
11,730,402
(37.10 %)
1
(0.00 %)
636,344
(2.05 %)
65,883
(3.79 %)
38,998
(1.23 %)
597 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022)
GCA_024711525.1
n/a n/a 18,555
(1.22 %)
24,508
(1.35 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
0
(0 %)
181
(0.00 %)
3,482
(100.00 %)
6,419,007
(53.84 %)
1,384,128
(15.63 %)
11,486,822
(50.51 %)
2
(0.00 %)
4,107,493
(7.03 %)
38,521
(1.60 %)
33,680
(1.03 %)
598 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022 genbank)
GCA_024711535.1
n/a n/a 21,281
(1.16 %)
28,592
(1.34 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
0
(0 %)
182
(0.00 %)
4,354
(100.00 %)
4,378,955
(29.66 %)
1,568,842
(17.75 %)
12,889,786
(51.96 %)
1
(0.00 %)
5,252,588
(7.78 %)
46,167
(1.71 %)
38,895
(0.74 %)
599 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022 refseq)
GCF_024711535.1
68,331
(2.37 %)
n/a 21,280
(1.16 %)
28,582
(1.34 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
182
(0.00 %)
182
(0.00 %)
4,535
(100.00 %)
4,378,949
(29.66 %)
1,568,842
(17.75 %)
12,889,725
(51.96 %)
1
(0.00 %)
5,252,586
(7.78 %)
46,167
(1.71 %)
38,895
(0.74 %)
600 Merriam's long-tongued bat (hap1 2024)
GCA_039655065.1
n/a n/a 18,172
(1.67 %)
20,736
(1.60 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
0
(0 %)
47
(0.00 %)
82
(100.00 %)
2,998,913
(29.48 %)
418,833
(1.07 %)
11,783,716
(32.96 %)
1
(0.00 %)
317,774
(1.27 %)
65,956
(4.38 %)
57,781
(3.83 %)
601 Merriam's long-tongued bat (hap2 2024)
GCA_039656995.1
n/a n/a 18,105
(1.68 %)
20,751
(1.60 %)
n/a 42.18
(100.00 %)
0
(0 %)
45
(0.00 %)
71
(100.00 %)
2,994,788
(29.48 %)
415,375
(1.07 %)
11,752,432
(32.88 %)
3
(0.00 %)
316,278
(1.25 %)
65,597
(4.38 %)
57,841
(3.85 %)
602 mesic four-striped grass rat (FMNH 192475 2021)
GCA_019844195.1
n/a n/a 18,926
(2.00 %)
20,713
(1.46 %)
n/a 41.06
(99.08 %)
121,340
(0.94 %)
121,340
(0.94 %)
152,293
(99.06 %)
6,081,188
(43.08 %)
1,497,646
(3.55 %)
13,086,584
(30.02 %)
5,768
(0.04 %)
350,470
(0.92 %)
15,700
(0.46 %)
14,500
(0.42 %)
603 Mesoamerican common mustached bat (primary hap 2026)
GCA_056363955.1
n/a n/a 18,206
(1.82 %)
21,154
(1.65 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
27
(100.00 %)
2,457,342
(32.26 %)
349,146
(1.10 %)
12,607,430
(31.43 %)
1
(0.00 %)
152,791
(0.69 %)
54,759
(4.86 %)
55,182
(4.11 %)
604 Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq)
GCF_048164855.1
112,768
(4.40 %)
n/a 19,582
(1.52 %)
20,911
(1.39 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
0
(0 %)
167
(0.00 %)
249
(100.00 %)
4,598,813
(31.70 %)
1,102,136
(4.40 %)
13,591,364
(35.18 %)
1
(0.00 %)
1,132,845
(2.70 %)
53,470
(2.24 %)
48,664
(1.52 %)
605 Mexican gray wolf (hap2 2025)
GCA_048164845.1
n/a n/a 18,738
(1.56 %)
19,759
(1.41 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
124
(0.00 %)
155
(100.00 %)
4,265,479
(32.40 %)
1,030,876
(4.11 %)
12,818,772
(34.22 %)
0
(0 %)
1,040,160
(2.59 %)
50,269
(2.22 %)
46,611
(1.56 %)
606 minke whale (2013 refseq)
GCF_000493695.1
42,553
(2.38 %)
n/a 19,159
(1.73 %)
18,656
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
173,296
(5.96 %)
184,072
(94.04 %)
n/a 573,951
(1.48 %)
13,504,347
(30.96 %)
211
(0.02 %)
317,691
(1.50 %)
65,448
(1.38 %)
43,887
(1.02 %)
607 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1
n/a n/a 20,412
(1.46 %)
27,421
(1.34 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
21,272
(100.00 %)
3,811,435
(36.24 %)
959,712
(10.27 %)
12,159,896
(41.30 %)
0
(0 %)
1,298,777
(4.12 %)
69,852
(1.62 %)
42,454
(1.09 %)
608 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1
61,711
(2.51 %)
n/a 19,550
(1.49 %)
21,499
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
0
(0 %)
1,177
(0.01 %)
1,374
(100.00 %)
4,006,927
(35.92 %)
1,058,105
(12.08 %)
12,708,103
(42.66 %)
4
(0.00 %)
1,500,515
(4.32 %)
72,756
(1.59 %)
44,094
(1.06 %)
609 Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.)
GCF_002204375.1
40,359
(2.29 %)
n/a 21,215
(1.83 %)
24,305
(1.47 %)
n/a 42.09
(95.23 %)
0
(0 %)
91,601
(4.78 %)
68,793
(100.00 %)
4,821,343
(37.74 %)
940,776
(1.82 %)
13,848,274
(31.31 %)
11,561
(0.34 %)
205,312
(0.64 %)
24,154
(0.74 %)
22,829
(0.67 %)
610 Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI)
GCA_008131255.1
n/a n/a 19,952
(1.59 %)
23,462
(1.36 %)
n/a 41.98
(99.01 %)
103,843
(0.97 %)
103,843
(0.97 %)
412,933
(99.03 %)
5,009,454
(0.00 %)
1,042,929
(2.52 %)
14,121,194
(34.63 %)
5,269
(0.12 %)
n/a 26,044
(0.71 %)
23,140
(0.56 %)
611 Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023)
GCF_030254825.1
65,502
(2.97 %)
n/a 19,045
(1.53 %)
20,203
(1.29 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
193
(100.00 %)
4,477,607
(37.21 %)
1,124,432
(5.22 %)
13,244,320
(39.20 %)
0
(0 %)
1,187,344
(2.95 %)
25,300
(0.76 %)
21,781
(0.54 %)
612 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1
n/a n/a 16,419
(0.77 %)
17,219
(0.89 %)
n/a 39.03
(100.00 %)
33
(0.00 %)
33
(0.00 %)
9,959
(100.00 %)
6,332,360
(29.69 %)
1,065,454
(2.09 %)
17,908,986
(42.25 %)
0
(0 %)
1,232,672
(2.38 %)
13,856
(0.35 %)
11,596
(0.23 %)
613 monito del monte (primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1
47,034
(2.02 %)
n/a 18,399
(0.80 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
0
(0 %)
260
(0.09 %)
17
(100.00 %)
9,107,968
(41.08 %)
1,249,635
(2.12 %)
21,135,324
(42.80 %)
0
(0 %)
1,546,314
(2.55 %)
16,598
(0.36 %)
13,911
(0.23 %)
614 Montane guinea pig
GCA_004027695.1
n/a n/a 20,064
(1.06 %)
31,321
(1.18 %)
39,905
(1.42 %)
40.09
(99.88 %)
11,321
(0.04 %)
11,321
(0.04 %)
1,379,500
(99.96 %)
4,730,634
(30.02 %)
1,583,664
(6.57 %)
15,806,339
(40.40 %)
31
(0.00 %)
n/a 37,371
(0.76 %)
27,339
(0.57 %)
615 moose/elk (2024)
GCA_964270355.1
n/a n/a 19,816
(1.60 %)
22,341
(1.44 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
1,737
(100.00 %)
3,099,775
(24.20 %)
406,796
(2.52 %)
13,117,056
(38.34 %)
0
(0 %)
916,612
(2.40 %)
50,644
(1.33 %)
42,520
(1.04 %)
616 moose/elk (AALL_1980 2023)
GCA_015832495.2
n/a n/a 19,116
(1.66 %)
21,184
(1.45 %)
n/a 41.55
(95.50 %)
71,769
(4.51 %)
71,769
(4.51 %)
77,708
(95.49 %)
3,026,678
(23.77 %)
373,266
(0.91 %)
13,167,376
(34.08 %)
1,299
(0.05 %)
343,983
(1.04 %)
44,302
(1.21 %)
41,306
(1.01 %)
617 moose/elk (MIG12-28694850 2019)
GCA_007570765.1
n/a n/a 21,375
(1.65 %)
26,769
(1.42 %)
n/a 41.64
(92.66 %)
83,533
(7.35 %)
83,831
(7.35 %)
131,373
(92.65 %)
5,022,053
(43.27 %)
384,658
(1.22 %)
13,422,381
(34.52 %)
2,907
(0.05 %)
424,593
(1.20 %)
49,216
(1.18 %)
45,847
(1.08 %)
618 Mount Data shrew rat (FMNH 198792 2021)
GCA_019843965.1
n/a n/a 18,266
(2.07 %)
18,451
(1.45 %)
n/a 41.51
(99.45 %)
47,796
(0.55 %)
47,796
(0.55 %)
61,989
(99.45 %)
5,656,524
(42.94 %)
1,120,762
(2.44 %)
12,212,163
(29.98 %)
6,957
(0.06 %)
313,446
(0.95 %)
15,204
(0.46 %)
14,180
(0.42 %)
619 mountain beaver
GCA_004027875.1
n/a n/a 22,428
(1.10 %)
38,670
(1.12 %)
n/a 40.58
(99.89 %)
7,253
(0.02 %)
7,253
(0.02 %)
1,286,779
(99.98 %)
5,859,004
(32.29 %)
914,052
(2.37 %)
16,249,666
(38.21 %)
103
(0.00 %)
n/a 39,133
(0.76 %)
26,371
(0.54 %)
620 mountain bongo (Barney_WCC 2024)
GCA_040438115.1
n/a n/a 19,857
(1.47 %)
21,826
(1.20 %)
n/a 41.99
(96.15 %)
0
(0 %)
62,885
(3.86 %)
34,537
(100.00 %)
6,342,707
(52.09 %)
474,043
(1.33 %)
13,361,157
(42.94 %)
3,843
(0.05 %)
1,843,489
(4.38 %)
42,078
(0.91 %)
34,738
(0.78 %)
621 muskrat
GCA_004026605.1
n/a n/a 22,540
(1.52 %)
32,136
(1.35 %)
n/a 41.59
(99.93 %)
6,243
(0.02 %)
6,243
(0.02 %)
571,599
(99.98 %)
4,437,736
(28.49 %)
922,826
(2.38 %)
13,945,732
(35.23 %)
31
(0.00 %)
n/a 19,876
(0.50 %)
16,936
(0.41 %)
622 naked mole-rat (2022)
GCA_944319725.1
n/a n/a 20,755
(1.51 %)
20,024
(1.35 %)
n/a 39.98
(99.96 %)
0
(0 %)
2,332
(0.04 %)
264
(100.00 %)
3,593,261
(30.76 %)
529,045
(1.14 %)
13,294,831
(36.07 %)
19
(0.00 %)
314,025
(1.11 %)
32,235
(0.93 %)
30,323
(0.79 %)
623 naked mole-rat (maternal 2024)
GCA_964261345.1
n/a n/a 19,980
(1.56 %)
19,365
(1.33 %)
n/a 39.96
(99.93 %)
191
(0.00 %)
2,238
(0.07 %)
263
(100.00 %)
5,099,610
(44.65 %)
523,459
(1.13 %)
13,036,461
(35.91 %)
17
(0.00 %)
306,657
(1.09 %)
31,614
(0.92 %)
29,594
(0.84 %)
624 naked mole-rat (MEF-2018 2020)
GCA_014060925.1
n/a n/a 22,011
(1.30 %)
21,392
(1.22 %)
n/a 40.13
(95.11 %)
139,535
(4.91 %)
139,535
(4.91 %)
148,797
(95.09 %)
4,885,102
(35.91 %)
654,418
(1.90 %)
16,401,315
(34.21 %)
228
(0.03 %)
1,754,699
(7.39 %)
40,717
(0.98 %)
38,057
(0.81 %)
625 naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq)
GCF_000247695.1
74,587
(3.56 %)
n/a 21,332
(1.74 %)
20,861
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
110,424
(11.59 %)
114,653
(88.41 %)
4,179,991
(32.69 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,561
(27.63 %)
595
(0.01 %)
103,053
(0.44 %)
31,950
(0.88 %)
31,055
(0.81 %)
626 naked mole-rat (pHap 2024)
GCA_964261355.1
n/a n/a 19,953
(1.57 %)
19,579
(1.35 %)
n/a 39.98
(99.91 %)
189
(0.00 %)
2,381
(0.09 %)
264
(100.00 %)
5,097,978
(44.61 %)
523,861
(1.13 %)
13,168,788
(36.09 %)
19
(0.00 %)
308,689
(1.11 %)
31,789
(0.93 %)
29,704
(0.84 %)
627 narwhal
GCA_005190385.4
n/a 55,319
(3.47 %)
18,678
(1.79 %)
19,820
(1.40 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
323
(0.00 %)
91
(100.00 %)
4,018,392
(43.94 %)
611,903
(1.52 %)
12,641,524
(35.02 %)
0
(0 %)
536,287
(1.64 %)
60,518
(1.78 %)
39,651
(1.18 %)
628 narwhal (Baffin Bay 2019)
GCF_005190385.1
51,639
(2.71 %)
n/a 18,741
(1.78 %)
20,365
(1.40 %)
33,148
(1.79 %)
41.22
(99.52 %)
0
(0 %)
18,323
(0.49 %)
6,972
(100.00 %)
4,011,742
(43.97 %)
565,367
(1.22 %)
12,720,018
(34.85 %)
1,797
(0.02 %)
430,336
(1.30 %)
60,492
(1.58 %)
43,582
(1.25 %)
629 narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022)
GCA_005190385.3
n/a n/a 18,681
(1.79 %)
19,816
(1.40 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
313
(0.00 %)
101
(100.00 %)
3,618,235
(37.24 %)
612,229
(1.52 %)
12,641,632
(35.02 %)
0
(0 %)
550,897
(1.69 %)
60,518
(1.78 %)
57,655
(1.47 %)
630 Natal long-fingered bat (2016)
GCF_001595765.1
32,050
(3.03 %)
n/a 18,015
(2.17 %)
18,293
(1.87 %)
n/a 42.07
(96.24 %)
0
(0 %)
204,616
(3.79 %)
1,269
(100.00 %)
2,565,457
(28.95 %)
376,532
(1.91 %)
10,427,823
(26.35 %)
3,320
(0.15 %)
203,691
(1.83 %)
63,261
(2.07 %)
59,010
(1.80 %)
631 Natal long-fingered bat (hap1 2026 genbank)
GCA_054644295.1
n/a n/a 17,698
(2.09 %)
21,893
(1.88 %)
n/a 42.54
(100.00 %)
0
(0 %)
113
(0.00 %)
136
(100.00 %)
3,272,492
(39.30 %)
405,440
(5.61 %)
10,243,363
(30.84 %)
2
(0.00 %)
523,758
(1.89 %)
59,199
(2.79 %)
53,557
(2.26 %)
632 Natal long-fingered bat (hap1 2026 refseq)
GCF_054644295.1
36,349
(3.04 %)
n/a 17,696
(2.09 %)
21,235
(1.88 %)
n/a n/a 0
(0 %)
113
(0.00 %)
135
(100.00 %)
3,232,325
(39.29 %)
405,970
(5.62 %)
10,243,311
(30.84 %)
2
(0.00 %)
523,758
(1.89 %)
59,198
(2.79 %)
53,560
(2.26 %)
633 Natal long-fingered bat (hap2 2026)
GCA_054644305.1
n/a n/a 17,715
(2.11 %)
22,079
(1.91 %)
n/a 42.49
(100.00 %)
0
(0 %)
121
(0.00 %)
99
(100.00 %)
3,263,689
(38.58 %)
393,153
(4.56 %)
10,248,496
(30.06 %)
1
(0.00 %)
448,180
(1.62 %)
59,330
(2.85 %)
53,664
(2.29 %)
634 Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_964656225.1
n/a n/a 18,001
(1.75 %)
21,219
(1.77 %)
n/a 42.26
(99.98 %)
0
(0 %)
1,836
(0.02 %)
1,062
(100.00 %)
3,664,854
(32.90 %)
906,692
(8.55 %)
10,164,440
(37.98 %)
12
(0.00 %)
783,617
(2.68 %)
56,705
(2.75 %)
55,975
(1.86 %)
635 Nathusius's pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_964656225.2
n/a n/a 17,671
(1.80 %)
21,057
(1.71 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
13
(0.00 %)
307
(0.00 %)
410
(100.00 %)
4,579,266
(45.39 %)
943,644
(11.48 %)
9,925,875
(39.77 %)
2
(0.00 %)
931,343
(3.13 %)
56,485
(2.63 %)
54,464
(2.50 %)
636 Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_964656075.1
n/a n/a 17,899
(1.71 %)
20,808
(1.69 %)
n/a 42.15
(99.98 %)
1,832
(0.02 %)
1,832
(0.02 %)
2,485
(99.98 %)
3,637,576
(31.92 %)
930,013
(11.25 %)
9,967,930
(39.61 %)
9
(0.00 %)
910,240
(3.07 %)
56,237
(2.62 %)
55,739
(1.82 %)
637 Nathusius's pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_964656075.2
n/a n/a 17,650
(1.86 %)
21,005
(1.78 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
306
(0.00 %)
306
(0.00 %)
759
(100.00 %)
4,580,609
(44.28 %)
888,097
(8.14 %)
10,070,978
(37.75 %)
2
(0.00 %)
747,635
(2.57 %)
56,514
(2.79 %)
54,801
(2.58 %)
638 Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024)
GCA_963693515.1
n/a 19,038
(1.68 %)
17,944
(1.86 %)
20,545
(1.83 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
1
(0.00 %)
263
(0.00 %)
154
(100.00 %)
3,628,328
(34.57 %)
838,723
(4.04 %)
10,155,601
(35.22 %)
1
(0.00 %)
545,765
(1.88 %)
56,332
(2.92 %)
56,107
(1.97 %)
639 Natterer's bat
GCF_964212035.1
36,662
(2.62 %)
n/a 18,650
(1.78 %)
22,423
(1.68 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
0
(0 %)
225
(0.00 %)
212
(100.00 %)
5,075,897
(48.88 %)
801,041
(5.78 %)
10,278,311
(38.66 %)
2
(0.00 %)
750,791
(2.61 %)
64,639
(2.57 %)
55,681
(2.11 %)
640 Natterer's bat (hap1.2 2025)
GCA_964212035.2
n/a n/a 19,475
(1.82 %)
22,424
(1.68 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
0
(0 %)
225
(0.00 %)
212
(100.00 %)
3,841,654
(38.99 %)
801,041
(5.78 %)
10,278,311
(38.66 %)
2
(0.00 %)
750,791
(2.61 %)
64,639
(2.57 %)
58,753
(2.26 %)
641 Natterer's bat (hap2.2 2025)
GCA_964212025.2
n/a n/a 18,368
(1.91 %)
21,701
(1.80 %)
n/a 43.27
(100.00 %)
136
(0.00 %)
136
(0.00 %)
309
(100.00 %)
3,509,151
(38.16 %)
704,537
(5.21 %)
9,806,703
(36.74 %)
8
(0.00 %)
600,350
(2.27 %)
61,004
(2.65 %)
56,443
(2.40 %)
642 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2
49,109
(2.78 %)
n/a 17,703
(1.63 %)
19,389
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
0
(0 %)
38,675
(0.21 %)
26,068
(100.00 %)
2,862,405
(29.31 %)
366,960
(1.48 %)
11,796,203
(31.27 %)
105
(0.00 %)
330,211
(1.83 %)
59,091
(1.70 %)
48,137
(1.34 %)
643 New Mexican meadow jumping mouse (hap1 2026)
GCA_057945945.1
n/a n/a 19,141
(1.41 %)
22,877
(1.82 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
0
(0 %)
466
(0.00 %)
309
(100.00 %)
5,003,584
(35.98 %)
1,325,881
(5.09 %)
12,286,670
(39.67 %)
3
(0.00 %)
1,190,322
(3.22 %)
26,988
(1.58 %)
18,923
(0.53 %)
644 New Mexican meadow jumping mouse (hap2 2026)
GCA_057945955.1
n/a n/a 19,093
(1.41 %)
22,903
(1.71 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
0
(0 %)
462
(0.00 %)
262
(100.00 %)
5,039,618
(35.97 %)
1,310,844
(5.10 %)
12,276,585
(39.57 %)
6
(0.00 %)
1,219,807
(3.28 %)
26,703
(1.33 %)
18,788
(0.52 %)
645 Nilgiri tahr
GCA_004026825.1
n/a n/a 22,735
(1.44 %)
34,961
(1.27 %)
n/a 42.37
(99.93 %)
10,387
(0.04 %)
10,387
(0.04 %)
479,550
(99.96 %)
5,793,761
(48.50 %)
535,297
(1.34 %)
13,378,352
(42.46 %)
61
(0.00 %)
n/a 57,653
(1.29 %)
42,256
(1.01 %)
646 nine-banded armadillo (hap2 2023)
GCA_030445035.2
n/a n/a 21,049
(1.11 %)
24,419
(1.07 %)
n/a 41.00
(99.67 %)
0
(0 %)
793
(0.33 %)
546
(100.00 %)
5,507,356
(53.38 %)
738,321
(2.02 %)
19,755,425
(43.69 %)
4
(0.00 %)
652,231
(1.43 %)
142,597
(2.85 %)
85,773
(2.07 %)
647 nine-banded armadillo (v2 hap1 2023)
GCA_030445055.2
n/a n/a 19,350
(1.07 %)
22,207
(1.07 %)
n/a 40.97
(99.27 %)
0
(0 %)
823
(0.73 %)
588
(100.00 %)
4,330,716
(32.85 %)
661,966
(1.52 %)
18,302,021
(42.22 %)
5
(0.00 %)
542,125
(1.36 %)
130,245
(2.79 %)
70,861
(1.76 %)
648 nine-banded armadillo (v2 hap2 2023)
GCF_030445035.2
72,174
(2.47 %)
n/a 21,051
(1.11 %)
24,418
(1.07 %)
n/a 41.00
(99.67 %)
0
(0 %)
793
(0.33 %)
546
(100.00 %)
5,412,063
(53.31 %)
738,320
(2.02 %)
19,755,423
(43.69 %)
4
(0.00 %)
736,184
(1.61 %)
142,597
(2.85 %)
85,791
(2.07 %)
649 nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor)
GCF_000208655.3
46,110
(1.87 %)
n/a 20,820
(1.08 %)
25,226
(1.08 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,408
(9.13 %)
268,437
(9.13 %)
314,788
(90.87 %)
4,552,770
(34.01 %)
651,225
(1.26 %)
19,266,969
(38.27 %)
239
(0.00 %)
482,237
(1.17 %)
139,490
(2.47 %)
79,407
(1.60 %)
650 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022)
GCA_026167925.1
n/a n/a 19,342
(1.57 %)
20,947
(1.48 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
0
(0 %)
229
(0.00 %)
1,006
(100.00 %)
4,161,568
(23.13 %)
1,278,205
(8.22 %)
13,148,019
(37.60 %)
1
(0.00 %)
1,208,815
(3.32 %)
23,523
(0.71 %)
19,170
(0.46 %)
651 North American deer mouse (v1 MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1
n/a n/a 19,700
(1.54 %)
22,354
(1.46 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
244
(0.00 %)
244
(0.00 %)
2,082
(100.00 %)
6,089,884
(47.99 %)
1,358,786
(9.39 %)
13,799,349
(39.08 %)
3
(0.00 %)
1,511,691
(3.84 %)
24,733
(0.70 %)
22,588
(0.58 %)
652 North American deer mouse (v2 MVZ:Mamm:240117 primary hap 2026)
GCA_026229955.2
n/a 76,907
(41.22 %)
19,460
(1.53 %)
21,066
(1.38 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
0
(0 %)
477
(0.00 %)
1,632
(100.00 %)
7,214,715
(49.58 %)
1,352,727
(9.20 %)
13,819,592
(38.94 %)
5
(0.00 %)
1,476,108
(3.76 %)
24,484
(0.70 %)
20,642
(0.52 %)
653 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1
n/a n/a 15,210
(1.55 %)
18,316
(1.43 %)
n/a 41.06
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,051
(100.00 %)
3,911,633
(40.55 %)
565,546
(1.54 %)
10,853,726
(32.61 %)
0
(0 %)
378,575
(1.36 %)
40,925
(1.35 %)
26,837
(0.96 %)
654 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1
n/a n/a 18,102
(1.58 %)
20,073
(1.40 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
0
(0 %)
277
(0.00 %)
116
(100.00 %)
4,958,089
(41.64 %)
719,163
(1.59 %)
13,867,662
(33.89 %)
7
(0.00 %)
506,727
(1.48 %)
51,299
(1.36 %)
33,440
(0.96 %)
655 North Atlantic bottlenose whale
GCF_949752795.1
33,287
(1.31 %)
n/a 19,106
(1.50 %)
20,818
(1.21 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,098
(0.01 %)
756
(100.00 %)
5,163,512
(53.86 %)
769,275
(14.94 %)
12,133,394
(44.83 %)
6
(0.00 %)
3,171,972
(7.30 %)
67,258
(2.00 %)
39,081
(1.51 %)
656 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1
49,646
(1.86 %)
n/a 19,562
(1.46 %)
21,631
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
367
(0.17 %)
789
(100.00 %)
1,368,536
(2.24 %)
841,303
(13.08 %)
12,527,582
(43.92 %)
11
(0.00 %)
1,404,448
(3.90 %)
94,259
(1.92 %)
41,005
(0.96 %)
657 North Atlantic right whale (hap2._XY 2023)
GCA_028564815.2
n/a n/a 19,476
(1.53 %)
21,630
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
367
(0.17 %)
788
(100.00 %)
4,812,242
(53.57 %)
841,302
(13.08 %)
12,527,493
(43.92 %)
11
(0.00 %)
1,404,448
(3.90 %)
94,259
(1.92 %)
42,410
(1.06 %)
658 North Atlantic right whale (v1 hap1 2023)
GCA_028571275.1
n/a n/a 18,699
(1.61 %)
20,354
(1.28 %)
n/a 41.64
(99.84 %)
0
(0 %)
385
(0.16 %)
947
(100.00 %)
3,815,900
(43.46 %)
718,935
(11.38 %)
11,928,210
(42.25 %)
2
(0.00 %)
1,117,252
(3.44 %)
85,881
(1.90 %)
41,289
(1.19 %)
659 North Atlantic right whale (v2 hap1 2023)
GCA_028571275.2
n/a n/a 18,673
(1.52 %)
20,481
(1.29 %)
n/a 41.64
(99.84 %)
0
(0 %)
381
(0.16 %)
938
(100.00 %)
1,270,626
(2.25 %)
714,265
(11.41 %)
11,856,103
(42.12 %)
2
(0.00 %)
1,108,370
(3.43 %)
85,484
(1.90 %)
38,920
(0.99 %)
660 North Pacific right whale
GCA_004363455.1
n/a n/a 23,145
(1.43 %)
38,161
(1.21 %)
n/a 41.15
(99.88 %)
7,094
(0.03 %)
7,094
(0.03 %)
1,361,057
(99.97 %)
5,039,622
(45.69 %)
694,986
(1.31 %)
14,063,101
(40.51 %)
73
(0.00 %)
n/a 74,800
(1.52 %)
49,455
(1.20 %)
661 North Sulawesi babirusa (hap1 2026)
GCA_057927545.1
n/a n/a 17,837
(1.53 %)
19,846
(1.30 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
531
(0.00 %)
2,202
(100.00 %)
6,623,055
(49.70 %)
672,980
(3.45 %)
13,111,305
(38.79 %)
16
(0.00 %)
656,543
(2.22 %)
61,896
(2.07 %)
44,778
(1.75 %)
662 North Sulawesi babirusa (hap2 2026)
GCA_057877285.1
n/a n/a 15,642
(1.54 %)
17,116
(1.32 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
0
(0 %)
578
(0.00 %)
1,389
(100.00 %)
5,920,679
(48.33 %)
593,514
(2.37 %)
11,705,732
(36.85 %)
24
(0.00 %)
445,117
(1.71 %)
48,967
(1.68 %)
35,325
(1.40 %)
663 northern American river otter
GCF_010015895.1
53,945
(2.18 %)
n/a 18,974
(1.68 %)
21,247
(1.45 %)
n/a 41.41
(99.58 %)
6,928
(0.42 %)
7,620
(0.42 %)
13,541
(99.58 %)
4,538,847
(41.18 %)
685,281
(1.20 %)
13,840,953
(32.61 %)
360
(0.01 %)
364,620
(0.96 %)
53,559
(1.88 %)
52,003
(1.68 %)
664 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1
n/a n/a 18,343
(1.80 %)
23,253
(1.77 %)
n/a 43.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
4,899
(100.00 %)
1,174,241
(2.96 %)
825,170
(5.11 %)
9,889,579
(36.12 %)
0
(0 %)
598,356
(2.10 %)
76,164
(3.52 %)
59,778
(2.27 %)
665 northern bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_951640355.1
n/a n/a 18,636
(1.75 %)
21,446
(1.68 %)
n/a 43.32
(99.99 %)
0
(0 %)
1,423
(0.01 %)
207
(100.00 %)
1,259,729
(2.95 %)
905,676
(6.25 %)
10,554,535
(38.21 %)
3
(0.00 %)
780,081
(2.54 %)
77,656
(3.27 %)
60,964
(2.14 %)
666 northern bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_951640355.1
44,040
(3.33 %)
n/a 17,979
(1.82 %)
21,447
(1.68 %)
n/a n/a 0
(0 %)
1,423
(0.01 %)
206
(100.00 %)
5,798,530
(48.90 %)
906,181
(6.23 %)
10,553,943
(38.21 %)
3
(0.00 %)
780,076
(2.54 %)
77,655
(3.27 %)
58,050
(2.54 %)
667 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1
n/a n/a 18,924
(1.53 %)
22,934
(1.58 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
199
(0.00 %)
146
(100.00 %)
3,850,624
(31.21 %)
648,359
(3.76 %)
11,788,702
(39.25 %)
2
(0.00 %)
811,589
(2.31 %)
85,908
(2.60 %)
73,781
(1.91 %)
668 northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024)
GCA_039880945.1
n/a n/a 18,933
(1.44 %)
23,629
(1.50 %)
n/a 42.60
(100.00 %)
0
(0 %)
113
(0.00 %)
366
(100.00 %)
4,027,155
(30.73 %)
712,278
(5.22 %)
12,003,034
(41.58 %)
3
(0.00 %)
975,691
(2.71 %)
96,116
(3.02 %)
75,017
(1.84 %)
669 northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024)
GCA_039880925.1
n/a n/a 18,305
(1.49 %)
22,534
(1.56 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
282
(100.00 %)
3,783,543
(30.10 %)
656,592
(4.68 %)
11,353,707
(40.26 %)
0
(0 %)
877,118
(2.58 %)
92,041
(3.01 %)
72,323
(1.87 %)
670 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1
n/a n/a 19,537
(1.44 %)
27,826
(1.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 23,401
(100.00 %)
3,634,923
(35.56 %)
672,860
(11.00 %)
11,175,398
(41.72 %)
0
(0 %)
1,941,411
(5.36 %)
62,007
(1.94 %)
36,247
(0.95 %)
671 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1
n/a n/a 19,073
(1.44 %)
20,821
(1.21 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,098
(0.01 %)
757
(100.00 %)
3,997,911
(34.76 %)
769,275
(14.94 %)
12,133,820
(44.83 %)
6
(0.00 %)
3,171,972
(7.30 %)
67,258
(2.00 %)
38,513
(0.89 %)
672 northern elephant seal (BS05 2019 Broad)
GCA_004023865.1
n/a n/a 22,834
(1.54 %)
36,083
(1.32 %)
n/a 41.52
(99.94 %)
9,483
(0.04 %)
9,483
(0.04 %)
330,739
(99.96 %)
4,849,944
(43.83 %)
600,306
(1.16 %)
13,420,049
(34.43 %)
55
(0.00 %)
452,384
(1.15 %)
57,236
(1.62 %)
53,204
(1.43 %)
673 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank)
GCA_029215605.1
n/a n/a 19,278
(1.60 %)
19,908
(1.39 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
98
(0.00 %)
98
(0.00 %)
596
(100.00 %)
4,348,333
(34.40 %)
621,985
(2.21 %)
13,251,768
(35.32 %)
0
(0 %)
811,715
(2.28 %)
69,898
(2.38 %)
44,044
(1.16 %)
674 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq)
GCF_029215605.1
74,106
(3.88 %)
n/a 19,277
(1.60 %)
20,000
(1.36 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
98
(0.00 %)
98
(0.00 %)
595
(100.00 %)
4,348,327
(34.40 %)
621,980
(2.21 %)
13,251,706
(35.32 %)
0
(0 %)
811,710
(2.28 %)
69,897
(2.38 %)
44,044
(1.16 %)
675 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023)
GCA_029215635.1
n/a n/a 19,340
(1.59 %)
19,732
(1.37 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
60
(0.00 %)
60
(0.00 %)
482
(100.00 %)
4,365,070
(34.26 %)
627,639
(2.43 %)
13,174,494
(35.47 %)
2
(0.00 %)
866,044
(2.39 %)
74,314
(2.49 %)
44,405
(1.17 %)
676 northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022)
GCF_021288785.2
53,819
(3.32 %)
n/a 20,099
(1.75 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
0
(0 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,368,400
(33.93 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
2,726
(0.09 %)
n/a 52,064
(1.59 %)
49,271
(1.43 %)
677 northern fur seal
GCF_003265705.1
54,953
(2.43 %)
n/a 23,408
(1.78 %)
23,666
(1.43 %)
52,089
(2.17 %)
41.48
(98.01 %)
38,666
(1.99 %)
38,666
(1.99 %)
52,469
(98.01 %)
5,047,032
(43.38 %)
638,130
(1.06 %)
14,922,442
(33.12 %)
2,675
(0.04 %)
444,034
(1.22 %)
57,281
(1.44 %)
53,162
(1.27 %)
678 northern fur seal (GAN/ISIS: 27379988/994484 2025)
GCF_003265705.2
71,169
(3.14 %)
n/a 21,276
(1.78 %)
21,276
(1.42 %)
n/a 41.44
(98.05 %)
29,679
(1.95 %)
30,369
(1.95 %)
43,734
(98.05 %)
4,118,994
(34.95 %)
578,801
(1.07 %)
13,530,999
(33.27 %)
1,105
(0.03 %)
400,358
(1.22 %)
51,258
(1.43 %)
48,682
(1.30 %)
679 northern gundi (hap1 2025)
GCA_048771875.1
n/a n/a 16,996
(1.51 %)
21,787
(1.66 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
117
(0.00 %)
535
(100.00 %)
3,293,772
(27.51 %)
602,403
(3.02 %)
11,827,700
(30.64 %)
2
(0.00 %)
353,736
(1.31 %)
44,220
(1.55 %)
38,845
(1.17 %)
680 northern gundi (hap2 2025)
GCA_048771865.1
n/a n/a 17,037
(1.43 %)
21,690
(1.55 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
0
(0 %)
115
(0.00 %)
1,031
(100.00 %)
3,527,940
(26.81 %)
646,620
(6.32 %)
11,343,462
(34.09 %)
0
(0 %)
754,284
(2.54 %)
47,125
(1.51 %)
39,404
(1.11 %)
681 northern gundi (US049 2019)
GCA_004027205.1
n/a n/a 18,035
(1.39 %)
27,379
(1.57 %)
n/a 42.68
(99.91 %)
5,037
(0.02 %)
5,037
(0.02 %)
865,110
(99.98 %)
4,149,883
(27.83 %)
654,063
(1.64 %)
12,342,565
(33.72 %)
12
(0.00 %)
n/a 47,533
(1.43 %)
40,352
(1.09 %)
682 Northern hairy-legged myotis (hap1 2026)
GCA_057888715.1
n/a n/a 18,686
(1.84 %)
21,585
(1.68 %)
n/a 42.92
(100.00 %)
0
(0 %)
86
(0.00 %)
115
(100.00 %)
5,056,672
(47.84 %)
720,091
(4.09 %)
10,496,975
(37.76 %)
9
(0.00 %)
743,593
(2.59 %)
58,979
(2.35 %)
49,429
(1.81 %)
683 Northern hairy-legged myotis (hap2 2026)
GCA_057888765.1
n/a n/a 18,721
(1.84 %)
21,762
(1.69 %)
n/a 42.92
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
94
(100.00 %)
5,050,793
(47.87 %)
719,858
(4.19 %)
10,485,939
(37.74 %)
9
(0.00 %)
669,260
(2.27 %)
58,950
(2.33 %)
49,629
(1.83 %)
684 northern mole vole
GCA_001685095.1
n/a n/a 23,252
(1.39 %)
44,209
(1.25 %)
n/a 41.68
(99.04 %)
371,627
(0.98 %)
371,627
(0.98 %)
722,087
(99.02 %)
3,923,814
(25.79 %)
898,453
(2.47 %)
13,708,986
(29.04 %)
96,051
(0.87 %)
280,901
(1.10 %)
16,583
(0.36 %)
15,193
(0.32 %)
685 northern three-toed jerboa (halli NM19106 2024)
GCA_036346955.1
n/a n/a 19,574
(1.25 %)
21,306
(1.23 %)
n/a 42.16
(99.93 %)
0
(0 %)
954
(0.07 %)
487
(100.00 %)
6,447,286
(38.11 %)
1,321,523
(3.44 %)
13,986,035
(43.83 %)
0
(0 %)
1,353,424
(3.71 %)
30,337
(0.84 %)
23,455
(0.53 %)
686 northern white rhinoceros
GCA_004027795.1
n/a n/a 25,328
(1.34 %)
61,003
(1.95 %)
n/a 41.32
(99.90 %)
7,054
(0.03 %)
7,054
(0.03 %)
949,480
(99.97 %)
4,330,882
(38.89 %)
484,754
(1.12 %)
15,544,248
(33.11 %)
44
(0.00 %)
n/a 43,689
(2.08 %)
40,625
(1.98 %)
687 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc alternate hap 2024)
GCA_043748905.1
n/a n/a 17,474
(1.85 %)
19,891
(1.65 %)
n/a 40.73
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,329
(100.00 %)
3,473,169
(40.23 %)
618,364
(2.01 %)
11,013,083
(30.75 %)
0
(0 %)
417,595
(1.73 %)
32,427
(1.26 %)
25,855
(1.05 %)
688 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024)
GCA_043748575.1
n/a n/a 18,475
(1.82 %)
19,990
(1.56 %)
n/a 40.72
(100.00 %)
2
(0.00 %)
63
(0.00 %)
68
(100.00 %)
3,507,612
(39.92 %)
711,081
(2.15 %)
11,788,205
(32.17 %)
0
(0 %)
524,992
(2.03 %)
35,670
(1.25 %)
28,616
(1.05 %)
689 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank)
GCA_036323735.1
114,725
(42.69 %)
n/a 21,917
(1.75 %)
19,476
(1.26 %)
n/a 41.82
(99.86 %)
0
(0 %)
220
(0.14 %)
77
(100.00 %)
4,700,726
(39.99 %)
1,603,005
(5.45 %)
13,451,813
(38.68 %)
21
(0.00 %)
1,553,966
(4.21 %)
20,118
(0.44 %)
17,465
(0.38 %)
690 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq)
GCF_036323735.1
114,725
(5.38 %)
n/a 21,870
(1.74 %)
19,989
(1.27 %)
n/a 41.82
(99.86 %)
0
(0 %)
220
(0.14 %)
76
(100.00 %)
5,294,185
(42.75 %)
1,603,005
(5.45 %)
13,451,760
(38.68 %)
21
(0.00 %)
1,553,966
(4.21 %)
20,118
(0.44 %)
17,703
(0.38 %)
691 Norway rat (F344/Stm 2024)
GCA_041222355.1
n/a n/a 21,764
(1.78 %)
20,141
(1.30 %)
n/a 41.87
(99.96 %)
0
(0 %)
234
(0.04 %)
120
(100.00 %)
4,636,987
(39.98 %)
1,579,595
(5.22 %)
13,544,768
(38.06 %)
4
(0.00 %)
1,510,531
(4.17 %)
20,127
(0.46 %)
17,493
(0.40 %)
692 Norway rat (LE/Stm RGD_629485 2026)
GCA_058775275.1
n/a n/a 22,033
(1.74 %)
20,312
(1.28 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
0
(0 %)
255
(0.00 %)
1,330
(100.00 %)
4,747,037
(40.17 %)
1,613,740
(6.08 %)
13,369,040
(38.80 %)
8
(0.00 %)
1,672,013
(4.57 %)
20,630
(0.51 %)
19,157
(0.45 %)
693 Norway rat (v1 SHRSP/BppUtx 2022)
GCA_021556685.1
n/a n/a 22,366
(1.71 %)
20,531
(1.26 %)
57,580
(2.44 %)
41.86
(99.94 %)
0
(0 %)
1,610
(0.06 %)
2,734
(100.00 %)
5,238,574
(46.36 %)
1,638,412
(5.87 %)
13,769,141
(38.49 %)
12
(0.00 %)
1,712,824
(4.62 %)
21,006
(0.49 %)
17,310
(0.40 %)
694 Norway rat (v2 T2T SHRSP/BbbUtx 2026)
GCA_021556685.2
n/a n/a 21,935
(1.75 %)
20,183
(1.28 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
0
(0 %)
7
(0.00 %)
192
(100.00 %)
4,752,792
(40.32 %)
1,617,613
(5.77 %)
13,383,610
(38.76 %)
0
(0 %)
1,664,480
(4.51 %)
20,532
(0.56 %)
19,133
(0.46 %)
695 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1
n/a n/a 3,096
(1.64 %)
2,450
(1.02 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
3,156
(100.00 %)
517,347
(50.76 %)
157,701
(3.90 %)
1,502,752
(34.14 %)
0
(0 %)
157,923
(4.57 %)
1,806
(0.40 %)
1,380
(0.31 %)
696 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
97,432
(4.08 %)
n/a 21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
4
(0.00 %)
1,172,090
(3.51 %)
19,244
(0.46 %)
16,098
(0.39 %)
697 Norway rat celera
GCF_000002265.2
39,745
(2.91 %)
n/a 21,492
(1.95 %)
19,112
(1.38 %)
n/a 41.98
(95.28 %)
111,393
(4.74 %)
111,391
(4.74 %)
118,423
(95.26 %)
9,721,869
(43.57 %)
1,387,703
(3.05 %)
13,224,921
(32.45 %)
11
(0.00 %)
813,629
(2.20 %)
18,944
(0.42 %)
16,117
(0.37 %)
698 Norway rat Dahl SR JrHsd (RGD_1582184 2024)
GCA_045688005.1
n/a n/a 21,901
(1.75 %)
20,001
(1.28 %)
n/a 41.84
(99.81 %)
4
(0.00 %)
299
(0.19 %)
141
(100.00 %)
4,717,442
(40.25 %)
1,598,987
(5.75 %)
13,553,199
(38.60 %)
12
(0.00 %)
1,610,558
(4.37 %)
20,297
(0.46 %)
18,817
(0.41 %)
699 Norway rat Lyon Hypertensive(RGD_10755352 2024)
GCA_045687965.1
n/a n/a 21,971
(1.75 %)
20,095
(1.28 %)
n/a 41.85
(99.93 %)
0
(0 %)
269
(0.07 %)
133
(100.00 %)
4,719,614
(40.23 %)
1,601,400
(5.83 %)
13,552,374
(38.67 %)
7
(0.00 %)
1,617,311
(4.39 %)
20,429
(0.47 %)
18,920
(0.42 %)
700 Norway rat Lyon Normot (RGD_10755354 2024)
GCA_045687995.1
n/a n/a 21,928
(1.75 %)
20,321
(1.29 %)
n/a 41.85
(99.84 %)
5
(0.00 %)
302
(0.16 %)
154
(100.00 %)
4,723,406
(40.27 %)
1,602,417
(5.79 %)
13,563,546
(38.65 %)
12
(0.00 %)
1,622,336
(4.39 %)
20,456
(0.47 %)
18,945
(0.41 %)
701 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5
69,456
(3.34 %)
n/a 22,369
(1.83 %)
20,269
(1.32 %)
n/a 41.93
(95.13 %)
70,664
(4.84 %)
145,731
(4.89 %)
76,195
(95.16 %)
5,329,187
(44.14 %)
1,620,304
(3.72 %)
14,520,050
(33.09 %)
719
(0.06 %)
916,050
(3.68 %)
22,600
(0.47 %)
18,401
(0.40 %)
702 Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022
GCA_023515785.1
n/a n/a 21,116
(1.68 %)
20,103
(1.27 %)
57,027
(2.45 %)
41.85
(99.82 %)
0
(0 %)
1,256
(0.18 %)
2,151
(100.00 %)
4,704,388
(38.22 %)
1,611,144
(5.76 %)
13,524,575
(38.35 %)
24
(0.00 %)
1,665,234
(4.47 %)
20,720
(0.48 %)
16,247
(0.34 %)
703 Norway rat WKY/Bbb 2022
GCA_023515805.1
n/a n/a 21,607
(1.68 %)
21,244
(1.28 %)
58,136
(2.47 %)
41.92
(99.80 %)
0
(0 %)
1,456
(0.20 %)
3,553
(100.00 %)
4,811,412
(38.21 %)
1,650,950
(5.41 %)
13,740,644
(38.24 %)
16
(0.00 %)
1,626,115
(4.31 %)
21,449
(0.51 %)
16,486
(0.34 %)
704 Nubian ibex (hap1 2026)
GCA_054855995.1
n/a n/a 18,692
(1.49 %)
21,269
(1.31 %)
n/a 42.65
(100.00 %)
0
(0 %)
83
(0.00 %)
227
(100.00 %)
6,520,577
(52.69 %)
553,105
(4.22 %)
12,816,690
(42.59 %)
1
(0.00 %)
1,624,740
(4.00 %)
65,657
(1.95 %)
39,503
(1.05 %)
705 Nubian ibex (hap2 2026)
GCA_054856215.1
n/a n/a 18,088
(1.44 %)
20,620
(1.27 %)
n/a 43.70
(100.00 %)
0
(0 %)
58
(0.00 %)
554
(100.00 %)
6,123,561
(54.71 %)
611,034
(8.85 %)
11,972,217
(45.26 %)
0
(0 %)
2,206,264
(5.15 %)
91,790
(2.58 %)
37,394
(0.97 %)
706 nutria
GCA_004027025.1
n/a n/a 24,707
(1.00 %)
47,533
(1.18 %)
n/a 41.70
(99.84 %)
15,249
(0.05 %)
15,249
(0.05 %)
1,684,916
(99.95 %)
6,961,690
(30.09 %)
1,698,977
(3.31 %)
15,207,563
(42.57 %)
44
(0.00 %)
n/a 59,854
(1.00 %)
31,029
(0.63 %)
707 okapi
GCA_001660835.1
n/a n/a 21,483
(1.43 %)
31,061
(1.26 %)
n/a 41.48
(95.11 %)
376,008
(4.86 %)
376,008
(4.86 %)
1,213,177
(95.14 %)
5,808,036
(42.90 %)
619,044
(4.22 %)
14,940,153
(35.17 %)
41,083
(0.65 %)
843,551
(6.96 %)
47,417
(1.12 %)
45,138
(1.04 %)
708 Okinawa island spiny rat (P-3 2024)
GCA_047150545.1
n/a n/a 20,516
(1.33 %)
20,222
(0.99 %)
n/a 40.89
(100.00 %)
19
(0.00 %)
19
(0.00 %)
53
(100.00 %)
9,452,355
(48.57 %)
2,252,101
(4.71 %)
12,808,891
(51.48 %)
0
(0 %)
1,055,430
(2.16 %)
20,770
(0.36 %)
16,586
(0.28 %)
709 Okinawa island spiny rat (P-3 primary hap 2023)
GCA_036184385.1
n/a n/a 18,829
(1.78 %)
19,061
(1.29 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
250
(0.00 %)
250
(0.00 %)
1,778
(100.00 %)
6,918,941
(46.48 %)
1,550,409
(4.06 %)
12,787,294
(38.04 %)
4
(0.00 %)
788,811
(2.05 %)
19,458
(0.47 %)
17,594
(0.42 %)
710 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1
30,625
(2.21 %)
n/a 17,959
(1.54 %)
19,318
(1.54 %)
n/a 42.06
(92.36 %)
83,033
(7.65 %)
83,035
(7.65 %)
148,226
(92.35 %)
4,337,455
(33.76 %)
1,140,316
(7.60 %)
10,422,685
(36.59 %)
3,290
(0.06 %)
1,520,292
(3.90 %)
61,921
(3.56 %)
30,924
(0.78 %)
711 pacarana
GCA_004027595.1
n/a n/a 20,748
(1.20 %)
33,195
(1.31 %)
n/a 41.81
(99.90 %)
6,392
(0.02 %)
6,392
(0.02 %)
1,164,830
(99.98 %)
4,374,443
(30.16 %)
660,811
(1.38 %)
14,062,133
(35.99 %)
8
(0.00 %)
n/a 59,382
(1.23 %)
28,291
(0.70 %)
712 Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad)
GCA_004363475.1
n/a n/a 21,575
(1.07 %)
47,478
(1.31 %)
n/a 41.87
(99.76 %)
18,801
(0.07 %)
18,801
(0.07 %)
2,428,619
(99.93 %)
4,881,232
(20.80 %)
1,352,971
(4.11 %)
12,583,960
(48.42 %)
36
(0.00 %)
n/a 74,961
(2.33 %)
61,745
(1.54 %)
713 Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo)
GCF_023159225.1
46,202
(2.48 %)
n/a 18,752
(1.50 %)
22,526
(1.60 %)
n/a 41.98
(99.96 %)
0
(0 %)
1,807
(0.04 %)
6,180
(100.00 %)
3,313,319
(16.79 %)
1,066,382
(10.88 %)
9,981,468
(42.63 %)
8
(0.00 %)
1,996,445
(6.17 %)
49,134
(2.83 %)
50,049
(1.70 %)
714 Pacific walrus
GCF_000321225.1
27,163
(1.89 %)
n/a 20,293
(1.71 %)
20,982
(1.48 %)
n/a 41.36
(95.85 %)
66,763
(4.16 %)
66,766
(4.16 %)
70,656
(95.84 %)
4,372,578
(41.12 %)
511,500
(1.05 %)
13,507,582
(30.43 %)
2,581
(0.03 %)
386,274
(1.21 %)
45,142
(1.29 %)
37,732
(0.95 %)
715 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1
65,970
(3.26 %)
n/a 18,743
(1.79 %)
20,862
(1.45 %)
31,917
(1.69 %)
41.28
(99.56 %)
16,337
(0.44 %)
16,699
(0.44 %)
21,350
(99.56 %)
3,971,820
(45.64 %)
574,056
(1.14 %)
12,602,965
(34.83 %)
610
(0.02 %)
419,325
(1.28 %)
62,275
(1.67 %)
40,749
(1.23 %)
716 pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019)
GCA_004115245.1
n/a n/a 18,118
(1.63 %)
23,536
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
38
(0.00 %)
10,873
(100.00 %)
3,001,130
(29.46 %)
375,042
(0.79 %)
11,813,971
(29.64 %)
0
(0 %)
140,066
(0.57 %)
67,712
(4.23 %)
70,108
(3.94 %)
717 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP mPhyDis1 primary hap 2020)
GCA_004126475.3
n/a n/a 18,167
(1.70 %)
20,017
(1.62 %)
n/a 42.38
(99.28 %)
0
(0 %)
884
(0.72 %)
78
(100.00 %)
3,071,886
(30.03 %)
385,665
(0.81 %)
12,049,923
(30.57 %)
1
(0.00 %)
174,292
(0.75 %)
63,918
(4.33 %)
66,774
(4.08 %)
718 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2
n/a n/a 18,116
(1.63 %)
23,608
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
38
(0.00 %)
10,895
(100.00 %)
3,002,448
(29.46 %)
375,226
(0.79 %)
11,824,034
(29.65 %)
0
(0 %)
140,328
(0.57 %)
67,718
(4.23 %)
70,109
(3.93 %)
719 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2
54,932
(3.31 %)
n/a 18,171
(1.69 %)
20,025
(1.62 %)
42,786
(3.39 %)
42.38
(99.28 %)
0
(0 %)
884
(0.72 %)
77
(100.00 %)
3,069,141
(30.00 %)
385,664
(0.81 %)
12,050,232
(30.57 %)
1
(0.00 %)
174,292
(0.75 %)
63,905
(3.75 %)
66,744
(3.26 %)
720 Pallas's mastiff bat (2020 refseq)
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
n/a 18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
0
(0 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
1
(0.00 %)
714,726
(2.00 %)
79,984
(2.45 %)
71,436
(1.91 %)
721 Pallas's mastiff bat (2026 genbank)
GCA_014108415.2
n/a n/a 18,473
(1.70 %)
21,847
(1.58 %)
n/a 42.35
(97.96 %)
0
(0 %)
373
(2.04 %)
45
(100.00 %)
4,907,773
(46.09 %)
624,938
(1.88 %)
11,572,201
(37.09 %)
1
(0.00 %)
714,729
(2.00 %)
79,987
(2.48 %)
69,824
(2.00 %)
722 pallid bat
GCA_027563665.2
n/a 45,801
(2.74 %)
19,038
(1.74 %)
21,934
(1.63 %)
n/a 43.04
(99.72 %)
19
(0.01 %)
234
(0.28 %)
108
(99.99 %)
5,341,178
(49.43 %)
937,994
(3.72 %)
11,240,393
(39.42 %)
0
(0 %)
666,854
(1.92 %)
70,270
(2.89 %)
59,856
(2.38 %)
723 pallid bat (TK200870 alternate hap 2023)
GCA_027595915.1
n/a n/a 19,085
(1.74 %)
22,770
(1.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,839
(100.00 %)
5,323,924
(49.33 %)
928,982
(3.65 %)
11,123,530
(39.36 %)
0
(0 %)
673,744
(1.95 %)
70,095
(2.89 %)
59,471
(2.37 %)
724 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1
n/a n/a 19,688
(1.69 %)
21,998
(1.64 %)
n/a 43.04
(99.72 %)
19
(0.01 %)
234
(0.28 %)
112
(99.99 %)
2,794,986
(22.60 %)
938,016
(3.72 %)
11,241,518
(39.41 %)
0
(0 %)
704,408
(2.03 %)
70,272
(2.89 %)
61,250
(1.98 %)
725 Parnell's mustached bat (2013)
GCA_000465405.1
n/a n/a 21,436
(1.40 %)
57,232
(2.18 %)
n/a 40.82
(99.34 %)
265,720
(0.70 %)
265,720
(0.70 %)
443,121
(99.30 %)
2,780,805
(29.26 %)
290,520
(0.63 %)
12,354,814
(27.13 %)
3
(0.00 %)
21,621
(0.07 %)
69,806
(1.89 %)
63,572
(1.69 %)
726 Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021)
GCF_021234165.1
37,033
(2.48 %)
n/a 18,339
(1.76 %)
21,630
(1.69 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
333
(100.00 %)
2,828,339
(30.56 %)
333,670
(0.75 %)
12,444,271
(30.90 %)
0
(0 %)
111,571
(0.50 %)
53,180
(4.61 %)
54,187
(3.93 %)
727 particolored bat (hap1.2 2025)
GCA_963924515.2
n/a n/a 17,612
(1.78 %)
20,793
(1.69 %)
n/a 43.57
(100.00 %)
5
(0.00 %)
189
(0.00 %)
273
(100.00 %)
5,418,781
(46.24 %)
903,727
(5.36 %)
10,321,898
(38.41 %)
3
(0.00 %)
807,561
(2.69 %)
78,516
(4.52 %)
79,927
(3.87 %)
728 particolored bat (hap2.2 2025)
GCA_963924695.2
n/a n/a 16,887
(1.81 %)
20,042
(1.72 %)
n/a 43.67
(100.00 %)
128
(0.00 %)
128
(0.00 %)
395
(100.00 %)
5,048,325
(44.60 %)
836,727
(4.41 %)
9,638,999
(37.87 %)
2
(0.00 %)
652,916
(2.36 %)
76,656
(4.63 %)
78,378
(4.04 %)
729 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1
n/a n/a 17,913
(1.72 %)
20,720
(1.72 %)
n/a 43.54
(99.99 %)
7
(0.00 %)
980
(0.01 %)
185
(100.00 %)
2,932,869
(21.94 %)
874,665
(4.83 %)
10,263,103
(37.46 %)
2
(0.00 %)
742,499
(2.50 %)
77,397
(4.55 %)
76,849
(2.51 %)
730 Patagonian cavy
GCA_004027295.1
n/a n/a 21,143
(0.94 %)
40,887
(1.10 %)
n/a 39.86
(99.87 %)
6,223
(0.02 %)
6,223
(0.02 %)
1,911,987
(99.98 %)
5,194,890
(30.95 %)
892,551
(2.11 %)
17,052,577
(40.22 %)
47
(0.00 %)
n/a 45,730
(0.84 %)
40,047
(0.71 %)
731 Pere David's deer
GCA_002443075.1
n/a n/a 20,723
(1.65 %)
23,551
(1.43 %)
n/a 41.58
(97.49 %)
144,642
(2.51 %)
144,642
(2.51 %)
339,454
(97.49 %)
5,171,293
(43.30 %)
427,987
(1.20 %)
13,665,133
(35.97 %)
3,724
(0.06 %)
460,451
(1.49 %)
48,374
(1.14 %)
45,141
(1.04 %)
732 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1
n/a n/a 18,794
(1.72 %)
21,421
(1.40 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,750
(100.00 %)
4,001,442
(39.37 %)
547,894
(2.75 %)
13,870,563
(34.33 %)
0
(0 %)
585,313
(2.32 %)
40,162
(1.31 %)
39,090
(1.18 %)
733 Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409185.1
n/a n/a 20,384
(1.64 %)
22,124
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
116
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,492,423
(39.31 %)
627,842
(4.79 %)
15,561,515
(36.57 %)
2
(0.00 %)
n/a 45,336
(1.27 %)
44,264
(1.15 %)
734 Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1
44,950
(1.91 %)
n/a 20,385
(1.64 %)
22,123
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
116
(0.00 %)
130
(100.00 %)
4,492,417
(39.31 %)
627,841
(4.79 %)
15,561,458
(36.57 %)
2
(0.00 %)
862,813
(2.91 %)
45,336
(1.27 %)
44,264
(1.15 %)
735 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1
n/a n/a 18,472
(1.44 %)
19,911
(1.28 %)
n/a 42.63
(99.98 %)
0
(0 %)
878
(0.02 %)
379
(100.00 %)
3,996,827
(27.97 %)
2,094,728
(7.23 %)
12,677,118
(40.57 %)
4
(0.00 %)
1,289,995
(3.44 %)
81,791
(2.82 %)
46,045
(1.12 %)
736 pig (Bamei 2025)
GCA_030704935.2
n/a n/a 17,940
(1.49 %)
20,133
(1.29 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 21
(100.00 %)
6,650,808
(50.63 %)
1,731,111
(5.80 %)
12,817,015
(40.05 %)
0
(0 %)
1,087,455
(2.96 %)
81,487
(2.80 %)
46,164
(1.99 %)
737 pig (Duroc 2017)
GCF_000003025.6
77,695
(4.05 %)
n/a 18,980
(1.64 %)
19,453
(1.32 %)
59,876
(4.84 %)
41.87
(98.81 %)
328
(1.19 %)
544
(1.19 %)
1,313
(98.81 %)
5,021,184
(45.67 %)
710,994
(1.32 %)
13,243,289
(36.33 %)
2
(0.00 %)
554,834
(1.64 %)
79,132
(1.82 %)
46,116
(1.30 %)
738 pig (Norwegian landrace 2024)
GCA_963921485.1
n/a n/a 18,500
(1.46 %)
19,718
(1.29 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 54
(100.00 %)
4,068,783
(28.54 %)
1,511,605
(5.52 %)
12,867,101
(39.59 %)
0
(0 %)
1,099,633
(2.98 %)
82,002
(2.44 %)
46,611
(1.15 %)
739 pig (SSC_HxYL_T2T_F1_AM1 2026)
GCF_054392235.1
157,635
(4.99 %)
n/a 17,898
(1.49 %)
21,216
(1.31 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
37
(100.00 %)
6,695,257
(50.66 %)
1,516,907
(5.52 %)
12,754,415
(39.86 %)
0
(0 %)
1,117,848
(2.98 %)
82,330
(3.08 %)
47,172
(1.96 %)
740 pig (USMARCv1 2017)
GCA_002844635.1
n/a n/a 19,458
(1.54 %)
21,487
(1.27 %)
58,655
(2.58 %)
42.49
(95.20 %)
0
(0 %)
661
(4.80 %)
14,157
(100.00 %)
5,159,244
(47.53 %)
902,079
(3.63 %)
13,145,120
(36.86 %)
1
(0.00 %)
1,358,423
(3.46 %)
82,442
(2.62 %)
47,468
(1.28 %)
741 pig (Wuzhishan WZS1 2025)
GCA_048338725.1
n/a n/a 18,525
(1.46 %)
19,792
(1.29 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 20
(100.00 %)
4,084,482
(28.40 %)
1,424,314
(5.35 %)
12,927,595
(39.56 %)
0
(0 %)
1,032,116
(2.85 %)
81,967
(2.96 %)
46,624
(1.14 %)
742 plains viscacha rat (AO245 2017)
GCA_002564285.1
n/a n/a 23,367
(0.78 %)
50,706
(0.93 %)
n/a 41.26
(99.73 %)
124,165
(0.16 %)
124,165
(0.16 %)
1,682,965
(99.84 %)
5,295,703
(27.32 %)
1,024,529
(1.81 %)
16,181,193
(35.22 %)
10,385
(0.05 %)
n/a 46,628
(0.97 %)
40,536
(0.81 %)
743 plains zebra (Etosha38 2022 UCLA)
GCF_021613505.1
55,794
(2.87 %)
n/a 19,529
(1.76 %)
21,214
(1.39 %)
n/a 41.38
(99.04 %)
0
(0 %)
14,595
(0.96 %)
11,098
(100.00 %)
3,683,862
(38.74 %)
314,723
(0.68 %)
15,217,328
(29.38 %)
2,057
(0.02 %)
119,672
(0.38 %)
41,391
(1.27 %)
38,911
(1.12 %)
744 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2
n/a n/a 13,244
(1.26 %)
19,241
(1.68 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
25
(0.00 %)
25
(0.00 %)
5,868
(100.00 %)
4,420,884
(51.59 %)
513,006
(3.13 %)
7,749,797
(49.18 %)
0
(0 %)
994,720
(3.65 %)
81,538
(8.24 %)
68,267
(3.13 %)
745 platypus (Pmale09 primary hap 2020)
GCA_004115215.4
n/a n/a 14,555
(1.24 %)
18,891
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
0
(0 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
7,731,079
(57.03 %)
578,617
(2.89 %)
9,113,668
(48.93 %)
0
(0 %)
1,130,252
(3.59 %)
87,861
(7.92 %)
71,875
(2.71 %)
746 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2
51,379
(3.07 %)
n/a 14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
0
(0 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
0
(0 %)
1,130,252
(3.59 %)
87,796
(6.47 %)
74,209
(2.87 %)
747 polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq)
GCF_000687225.1
35,751
(2.39 %)
n/a 18,466
(1.69 %)
15,384
(1.38 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
110,343
(1.67 %)
134,162
(98.33 %)
4,123,540
(40.16 %)
553,196
(1.29 %)
13,765,581
(29.91 %)
205
(0.03 %)
311,409
(1.04 %)
54,907
(1.17 %)
47,736
(0.98 %)
748 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1
52,175
(2.92 %)
n/a 18,588
(1.75 %)
20,731
(1.54 %)
n/a 41.88
(99.60 %)
0
(0 %)
45,532
(0.41 %)
3,900
(100.00 %)
4,204,162
(40.75 %)
572,129
(1.75 %)
13,926,894
(30.79 %)
587
(0.02 %)
437,254
(2.43 %)
63,315
(1.93 %)
57,593
(1.70 %)
749 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1
50,187
(2.51 %)
n/a 20,427
(1.69 %)
20,874
(1.45 %)
n/a 42.34
(94.06 %)
182,041
(5.97 %)
182,263
(5.97 %)
212,962
(94.03 %)
n/a 1,229,123
(2.83 %)
14,447,916
(30.09 %)
7,908
(0.12 %)
806,105
(3.40 %)
23,246
(0.56 %)
19,518
(0.43 %)
750 prairie deer mouse (BWxNUB_F1_BW_parent 2025)
GCF_049852395.1
84,704
(3.63 %)
n/a 19,312
(1.68 %)
20,354
(1.41 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
106
(0.00 %)
25
(100.00 %)
6,577,724
(45.25 %)
1,288,198
(5.24 %)
13,978,540
(35.31 %)
1
(0.00 %)
964,471
(2.66 %)
23,724
(0.69 %)
20,765
(0.57 %)
751 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1
69,779
(3.28 %)
n/a 19,755
(1.73 %)
19,194
(1.43 %)
n/a 42.28
(95.07 %)
147,442
(4.96 %)
147,442
(4.96 %)
155,966
(95.04 %)
4,751,621
(29.04 %)
1,172,212
(2.66 %)
13,934,672
(29.87 %)
6,396
(0.08 %)
477,575
(1.54 %)
22,444
(0.57 %)
19,164
(0.44 %)
752 prairie vole (2012)
GCF_000317375.1
40,484
(2.72 %)
n/a 19,648
(1.91 %)
19,489
(1.62 %)
n/a 42.25
(92.03 %)
180,677
(8.00 %)
180,677
(8.00 %)
187,012
(92.00 %)
3,779,126
(25.51 %)
879,192
(2.11 %)
12,360,347
(27.34 %)
6,788
(0.11 %)
335,553
(1.15 %)
18,233
(0.52 %)
16,466
(0.44 %)
753 prairie vole (hap1 2026)
GCA_984569965.1
n/a n/a 21,146
(1.74 %)
20,796
(1.49 %)
n/a n/a 138
(0.07 %)
138
(0.07 %)
235
(99.93 %)
4,876,492
(38.85 %)
1,243,697
(5.13 %)
12,444,882
(37.53 %)
3
(0.00 %)
1,381,261
(3.84 %)
22,449
(0.71 %)
21,171
(0.53 %)
754 Preble's meadow jumping mouse (hap1 2026)
GCA_057945845.1
n/a n/a 19,379
(1.41 %)
23,135
(1.60 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
243
(0.00 %)
263
(100.00 %)
5,161,690
(36.34 %)
1,280,534
(4.59 %)
12,486,697
(39.33 %)
0
(0 %)
1,127,889
(2.99 %)
27,286
(0.98 %)
19,584
(0.53 %)
755 Preble's meadow jumping mouse (hap2 2026)
GCA_057945655.1
n/a n/a 17,778
(1.50 %)
21,028
(1.59 %)
n/a 42.49
(100.00 %)
0
(0 %)
176
(0.00 %)
163
(100.00 %)
4,493,139
(34.60 %)
1,067,139
(3.68 %)
11,131,637
(37.03 %)
2
(0.00 %)
798,823
(2.44 %)
21,835
(0.87 %)
17,571
(0.55 %)
756 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1
n/a n/a 17,919
(1.46 %)
19,330
(1.31 %)
n/a 40.78
(100.00 %)
0
(0 %)
68
(0.00 %)
41
(100.00 %)
3,707,234
(28.28 %)
643,817
(2.22 %)
12,106,384
(41.48 %)
5
(0.00 %)
871,436
(2.63 %)
54,438
(1.38 %)
34,899
(0.85 %)
757 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1
n/a n/a 17,253
(1.51 %)
18,507
(1.35 %)
n/a 40.91
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
38
(100.00 %)
3,466,835
(27.96 %)
585,261
(1.91 %)
11,364,898
(40.65 %)
2
(0.00 %)
726,868
(2.39 %)
50,527
(1.37 %)
32,436
(0.84 %)
758 pronghorn (PH2016 2021)
GCA_021018645.1
n/a n/a 21,848
(1.58 %)
27,614
(1.56 %)
n/a 41.70
(96.83 %)
74,027
(3.17 %)
74,027
(3.17 %)
140,480
(96.83 %)
3,335,744
(24.40 %)
405,435
(4.11 %)
13,855,606
(34.67 %)
3,445
(0.16 %)
489,014
(7.21 %)
48,670
(1.19 %)
43,625
(0.95 %)
759 Przewalski's gazelle (PLG-pushi 2019)
GCA_006410515.1
n/a n/a 19,722
(1.52 %)
21,663
(1.29 %)
n/a 42.49
(95.93 %)
557,686
(4.13 %)
557,686
(4.13 %)
831,816
(95.87 %)
5,438,181
(47.21 %)
408,156
(1.63 %)
13,068,837
(39.30 %)
1,440
(0.01 %)
n/a 67,544
(1.31 %)
41,220
(0.85 %)
760 Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq)
GCF_000696695.1
45,089
(2.76 %)
n/a 19,546
(1.69 %)
22,107
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
80,963
(0.88 %)
134,060
(99.12 %)
3,787,533
(40.54 %)
435,607
(1.73 %)
14,738,418
(28.36 %)
39
(0.00 %)
276,230
(1.12 %)
40,752
(0.94 %)
36,104
(0.79 %)
761 Przewalski's horse (Varuska primary hap 2024)
GCF_037783145.1
117,131
(4.09 %)
n/a 18,569
(1.70 %)
20,018
(1.38 %)
n/a 42.23
(100.00 %)
0
(0 %)
310
(0.00 %)
2,146
(100.00 %)
3,768,149
(39.86 %)
632,308
(5.35 %)
14,449,518
(32.71 %)
0
(0 %)
956,665
(2.51 %)
42,166
(4.46 %)
39,294
(4.31 %)
762 puma (L17-30 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028749965.1
n/a n/a 18,380
(1.53 %)
20,701
(1.40 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
96
(0.00 %)
96
(0.00 %)
304
(100.00 %)
4,881,674
(33.96 %)
978,817
(2.17 %)
13,422,986
(35.08 %)
0
(0 %)
741,350
(2.01 %)
69,437
(2.62 %)
59,105
(1.71 %)
763 puma (L17-30 alternate hap 2023 refseq)
GCF_028749965.1
74,801
(3.83 %)
n/a 17,892
(1.65 %)
19,079
(1.37 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
208
(100.00 %)
4,919,626
(40.47 %)
914,522
(2.10 %)
12,893,715
(34.74 %)
1
(0.00 %)
681,761
(1.92 %)
66,387
(2.67 %)
60,312
(2.23 %)
764 puma (L17-30 primary hap 2023)
GCA_028749985.1
n/a n/a 17,553
(1.53 %)
19,299
(1.39 %)
n/a 41.89
(100.00 %)
134
(0.00 %)
134
(0.00 %)
390
(100.00 %)
4,629,539
(33.53 %)
919,008
(2.02 %)
12,766,157
(34.70 %)
0
(0 %)
673,940
(1.93 %)
65,437
(2.53 %)
55,660
(1.67 %)
765 puma (SC36_Marlon 2018 refseq)
GCF_003327715.1
25,588
(1.44 %)
n/a 17,664
(1.57 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
0
(0 %)
178,992
(4.69 %)
2,175
(100.00 %)
4,885,335
(42.70 %)
833,138
(1.76 %)
13,705,778
(31.28 %)
2,166
(0.06 %)
494,981
(1.78 %)
58,912
(1.65 %)
50,360
(1.31 %)
766 punctate agouti
GCA_004363535.1
n/a n/a 22,612
(1.05 %)
45,433
(1.19 %)
n/a 40.79
(99.92 %)
6,459
(0.02 %)
6,459
(0.02 %)
993,123
(99.98 %)
5,671,738
(32.53 %)
945,722
(1.69 %)
17,003,309
(36.58 %)
32
(0.00 %)
n/a 85,696
(1.65 %)
65,973
(1.32 %)
767 Punta de Vaca leaf-eared mouse (GD2095 2023)
GCA_033318265.1
n/a n/a 18,332
(1.50 %)
18,296
(1.29 %)
n/a 40.01
(100.00 %)
133
(0.00 %)
133
(0.00 %)
437
(100.00 %)
3,825,722
(28.38 %)
915,865
(11.98 %)
13,456,122
(37.89 %)
2
(0.00 %)
1,095,352
(3.10 %)
18,577
(0.50 %)
14,656
(0.36 %)
768 pygmy sperm whale
GCA_004363705.1
n/a n/a 22,661
(1.30 %)
42,546
(1.15 %)
n/a 41.89
(99.89 %)
6,053
(0.02 %)
6,053
(0.02 %)
1,258,125
(99.98 %)
5,185,912
(43.65 %)
836,752
(1.88 %)
14,150,125
(39.88 %)
43
(0.00 %)
n/a 95,344
(2.15 %)
68,248
(1.67 %)
769 pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq)
GCF_026419965.1
73,518
(2.67 %)
n/a 18,496
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
0
(0 %)
143
(0.19 %)
581
(100.00 %)
3,817,659
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,998
(39.96 %)
0
(0 %)
1,197,809
(3.53 %)
101,353
(2.90 %)
50,216
(1.47 %)
770 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1
n/a n/a 18,550
(1.51 %)
20,491
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
0
(0 %)
138
(0.01 %)
391
(100.00 %)
3,860,112
(33.83 %)
820,375
(9.58 %)
12,159,196
(41.59 %)
2
(0.00 %)
1,346,279
(3.87 %)
106,168
(2.78 %)
50,294
(1.44 %)
771 Pyrenean desman (IBE-C5619 2021)
GCA_019455555.1
n/a 20,936
(1.95 %)
17,527
(1.87 %)
20,474
(1.83 %)
n/a 41.67
(98.52 %)
63,679
(1.49 %)
63,679
(1.49 %)
75,985
(98.51 %)
2,147,379
(23.41 %)
327,740
(0.98 %)
10,539,226
(28.05 %)
1,165
(0.02 %)
291,271
(1.07 %)
44,487
(4.39 %)
47,205
(4.01 %)
772 rabbit (A946 2020)
GCA_013371645.1
n/a n/a 19,881
(1.40 %)
22,566
(1.32 %)
n/a 44.09
(99.92 %)
4,066
(0.07 %)
4,254
(0.08 %)
5,157
(99.93 %)
5,202,709
(44.78 %)
1,059,544
(2.39 %)
13,897,372
(40.69 %)
4
(0.00 %)
1,532,783
(5.00 %)
119,691
(2.74 %)
75,409
(2.53 %)
773 rabbit (alternate hap 2024)
GCA_964237575.1
n/a n/a 12,274
(1.39 %)
16,482
(1.38 %)
n/a 44.19
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 10,111
(100.00 %)
3,613,446
(49.48 %)
579,915
(3.18 %)
7,084,192
(39.81 %)
0
(0 %)
741,382
(3.30 %)
65,573
(2.79 %)
40,362
(2.38 %)
774 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq)
GCF_009806435.1
83,033
(4.16 %)
n/a 19,486
(1.31 %)
23,267
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
0
(0 %)
18,178
(2.32 %)
3,160
(100.00 %)
4,072,524
(21.41 %)
976,273
(2.33 %)
13,766,413
(39.76 %)
85
(0.00 %)
1,275,666
(3.04 %)
113,371
(2.46 %)
70,869
(1.75 %)
775 rabbit (primary hap 2024 refseq)
GCF_964237555.1
95,289
(4.22 %)
n/a 19,385
(1.31 %)
22,631
(1.31 %)
n/a 44.02
(99.98 %)
0
(0 %)
2,276
(0.02 %)
221
(100.00 %)
4,099,586
(21.20 %)
1,062,900
(3.78 %)
13,416,814
(41.72 %)
5
(0.00 %)
1,560,076
(3.77 %)
116,523
(2.66 %)
74,863
(1.94 %)
776 rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq)
GCF_000003625.3
43,642
(2.34 %)
n/a 18,665
(1.39 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,890,480
(44.71 %)
883,939
(1.73 %)
13,254,520
(38.27 %)
12
(0.00 %)
1,022,784
(2.54 %)
110,337
(2.33 %)
68,468
(1.73 %)
777 raccoon dog (2021)
GCF_905146905.1
52,577
(2.89 %)
n/a 19,628
(1.60 %)
20,274
(1.43 %)
n/a 41.28
(99.98 %)
0
(0 %)
70
(0.02 %)
811
(100.00 %)
4,499,368
(31.98 %)
1,005,212
(2.04 %)
13,884,201
(32.95 %)
2
(0.00 %)
702,009
(1.75 %)
52,450
(2.27 %)
46,478
(1.53 %)
778 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1
50,083
(2.48 %)
46,295
(2.32 %)
19,992
(1.47 %)
22,506
(1.31 %)
41,290
(1.46 %)
41.91
(99.99 %)
4,845
(0.01 %)
4,847
(0.01 %)
7,486
(99.99 %)
5,764,757
(47.38 %)
507,629
(1.55 %)
14,138,601
(41.27 %)
7
(0.00 %)
1,279,574
(3.49 %)
51,748
(1.29 %)
40,690
(1.04 %)
779 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1
70,461
(3.21 %)
n/a 19,413
(1.59 %)
21,222
(1.35 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
142
(100.00 %)
5,300,958
(46.83 %)
455,553
(1.24 %)
13,023,443
(40.62 %)
0
(0 %)
979,102
(2.67 %)
43,959
(1.30 %)
38,834
(1.07 %)
780 ratel
GCA_004024625.1
n/a n/a 22,196
(1.21 %)
35,937
(1.18 %)
n/a 42.00
(99.85 %)
6,511
(0.02 %)
6,511
(0.02 %)
2,074,823
(99.98 %)
6,171,383
(41.93 %)
877,669
(1.49 %)
15,269,908
(41.22 %)
36
(0.00 %)
465,016
(0.89 %)
95,094
(1.91 %)
92,023
(1.73 %)
781 red bat
GCA_004026805.1
n/a n/a 27,510
(1.22 %)
65,467
(1.48 %)
n/a 42.69
(99.94 %)
6,380
(0.02 %)
6,380
(0.02 %)
525,280
(99.98 %)
4,644,227
(28.24 %)
1,170,868
(2.68 %)
15,628,238
(39.97 %)
16
(0.00 %)
n/a 125,564
(3.55 %)
108,686
(2.27 %)
782 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1
n/a n/a 18,817
(1.29 %)
21,916
(1.20 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
0
(0 %)
22
(0.00 %)
4,021
(100.00 %)
3,279,005
(20.48 %)
472,706
(21.87 %)
11,466,609
(50.26 %)
0
(0 %)
3,624,599
(9.05 %)
128,858
(2.07 %)
39,577
(0.84 %)
783 red deer (hap1.2 2026)
GCA_910594005.2
n/a n/a 20,226
(1.25 %)
23,009
(1.19 %)
n/a 44.31
(100.00 %)
0
(0 %)
110
(0.00 %)
965
(100.00 %)
6,158,139
(37.49 %)
572,918
(22.39 %)
12,897,105
(51.16 %)
2
(0.00 %)
3,778,446
(8.30 %)
136,992
(2.02 %)
42,961
(0.80 %)
784 red deer (hap2.2 2026)
GCA_910593805.2
n/a n/a 20,412
(1.37 %)
22,827
(1.25 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
0
(0 %)
102
(0.00 %)
500
(100.00 %)
5,927,428
(40.11 %)
501,561
(16.00 %)
12,984,298
(46.91 %)
3
(0.00 %)
2,848,169
(6.96 %)
108,724
(1.86 %)
42,763
(0.88 %)
785 red deer (primary hap 2021)
GCF_910594005.1
68,992
(2.68 %)
n/a 20,470
(1.48 %)
22,563
(1.32 %)
n/a 42.98
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
144
(100.00 %)
5,501,063
(44.60 %)
503,301
(12.23 %)
13,102,622
(44.55 %)
1
(0.00 %)
2,197,198
(5.57 %)
88,756
(1.66 %)
46,960
(1.12 %)
786 red fox (BD-2025 2025)
GCF_048418805.1
84,632
(3.45 %)
n/a 19,565
(1.57 %)
19,909
(1.38 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
0
(0 %)
104
(0.00 %)
289
(100.00 %)
4,480,315
(31.76 %)
1,010,887
(2.70 %)
13,766,344
(33.12 %)
1
(0.00 %)
718,295
(1.89 %)
50,763
(2.22 %)
47,197
(1.53 %)
787 red fox (hap1 2024)
GCA_964106825.2
n/a n/a 19,622
(1.57 %)
20,371
(1.38 %)
n/a 41.34
(99.98 %)
0
(0 %)
1,845
(0.02 %)
461
(100.00 %)
4,519,485
(31.91 %)
1,018,114
(2.59 %)
13,810,284
(32.99 %)
9
(0.00 %)
712,146
(1.92 %)
52,053
(2.31 %)
47,294
(1.54 %)
788 red fox (hap2 2024)
GCA_964106925.2
n/a n/a 19,517
(1.57 %)
20,105
(1.37 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
0
(0 %)
1,819
(0.02 %)
350
(100.00 %)
4,487,839
(31.79 %)
1,010,106
(2.64 %)
13,838,711
(33.07 %)
17
(0.00 %)
695,908
(1.88 %)
51,373
(2.26 %)
46,876
(1.53 %)
789 red fox (tameXaggressive cross 2018)
GCF_003160815.1
43,508
(2.67 %)
n/a 19,826
(1.69 %)
18,893
(1.40 %)
n/a 41.08
(97.06 %)
0
(0 %)
246,167
(2.96 %)
82,424
(100.00 %)
4,919,102
(40.79 %)
954,461
(2.46 %)
14,190,625
(30.86 %)
739
(0.02 %)
634,373
(2.40 %)
53,204
(1.88 %)
51,541
(1.62 %)
790 reed vole (MF-2015 2020)
GCF_014885135.2
55,722
(3.60 %)
n/a 19,808
(1.93 %)
20,787
(1.69 %)
n/a 42.36
(95.60 %)
0
(0 %)
67,118
(4.40 %)
10,460
(100.00 %)
3,130,955
(20.09 %)
831,969
(2.09 %)
11,985,657
(28.48 %)
1,977
(0.20 %)
258,905
(1.26 %)
18,764
(0.58 %)
16,940
(0.48 %)
791 Reeves' muntjac
GCA_963930625.2
n/a n/a 19,215
(1.54 %)
22,411
(1.38 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
37
(0.00 %)
242
(100.00 %)
5,985,581
(48.42 %)
555,815
(2.95 %)
13,147,360
(40.36 %)
0
(0 %)
1,261,604
(3.13 %)
59,987
(1.80 %)
46,135
(1.23 %)
792 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1
n/a n/a 18,947
(1.29 %)
24,114
(1.28 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,892
(100.00 %)
3,375,476
(23.21 %)
654,539
(6.64 %)
11,132,469
(48.29 %)
0
(0 %)
3,008,562
(7.07 %)
79,357
(2.66 %)
41,548
(0.93 %)
793 Reeves' muntjac (alternate hap 2026)
GCA_963930665.2
n/a n/a 17,920
(1.33 %)
21,346
(1.19 %)
n/a 42.73
(99.99 %)
1,900
(0.01 %)
1,900
(0.01 %)
8,017
(99.99 %)
5,791,847
(51.71 %)
627,169
(6.70 %)
11,205,813
(47.89 %)
26
(0.00 %)
2,896,763
(7.36 %)
76,839
(2.77 %)
45,635
(1.16 %)
794 Reeves' muntjac (primary hap 2024)
GCF_963930625.1
52,442
(2.57 %)
n/a 19,577
(1.52 %)
22,283
(1.38 %)
n/a 41.89
(99.99 %)
0
(0 %)
682
(0.01 %)
267
(100.00 %)
3,294,672
(23.89 %)
527,436
(2.98 %)
13,137,581
(39.89 %)
1
(0.00 %)
1,222,379
(3.05 %)
57,436
(1.81 %)
44,949
(1.09 %)
795 reindeer (2023)
GCA_963422255.1
n/a n/a 21,329
(1.58 %)
25,201
(1.59 %)
n/a 41.46
(98.35 %)
131,886
(1.65 %)
131,886
(1.65 %)
259,765
(98.35 %)
3,254,173
(23.49 %)
440,431
(2.00 %)
14,258,607
(36.17 %)
3,361
(0.18 %)
n/a 48,931
(1.20 %)
43,592
(0.99 %)
796 reindeer (US061 2019)
GCA_004026565.1
n/a n/a 24,150
(1.39 %)
39,911
(1.41 %)
n/a 42.08
(99.89 %)
4,769
(0.02 %)
4,769
(0.02 %)
1,365,508
(99.98 %)
6,083,178
(46.10 %)
546,470
(1.23 %)
14,434,855
(43.16 %)
13
(0.00 %)
n/a 55,319
(1.23 %)
51,245
(1.12 %)
797 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1
n/a n/a 19,396
(1.48 %)
21,693
(1.26 %)
n/a 41.62
(97.80 %)
0
(0 %)
131
(2.20 %)
1,039
(100.00 %)
3,973,936
(35.55 %)
987,571
(11.66 %)
12,473,459
(42.11 %)
1
(0.00 %)
1,271,959
(3.79 %)
74,971
(1.64 %)
44,274
(1.06 %)
798 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1
59,888
(2.34 %)
n/a 19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
0
(0 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
4
(0.00 %)
1,071,329
(3.37 %)
73,126
(1.69 %)
43,865
(1.11 %)
799 Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024)
GCA_036010255.1
n/a n/a 18,982
(1.81 %)
22,002
(1.76 %)
n/a 43.12
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 105
(100.00 %)
2,909,847
(24.53 %)
757,964
(3.03 %)
10,561,925
(36.25 %)
0
(0 %)
534,987
(1.92 %)
57,318
(2.32 %)
52,282
(1.76 %)
800 Risso's dolphin
GCF_964374135.1
37,640
(1.92 %)
n/a 18,598
(1.56 %)
20,984
(1.29 %)
n/a 42.25
(99.99 %)
1,138
(0.01 %)
1,138
(0.01 %)
2,283
(99.99 %)
5,101,286
(54.29 %)
1,342,544
(11.28 %)
12,274,011
(41.76 %)
9
(0.00 %)
1,663,930
(5.05 %)
76,936
(4.65 %)
40,785
(1.12 %)
801 Risso's dolphin (hap1.1 2024)
GCA_964374135.1
n/a n/a 18,825
(1.58 %)
20,986
(1.29 %)
n/a 42.25
(99.99 %)
4
(0.00 %)
1,138
(0.01 %)
1,150
(100.00 %)
4,405,513
(43.51 %)
1,342,544
(11.28 %)
12,274,096
(41.76 %)
9
(0.00 %)
1,663,930
(5.05 %)
76,936
(4.65 %)
55,192
(2.62 %)
802 Risso's dolphin (hap2.1 2024)
GCA_964374185.1
n/a n/a 18,061
(1.68 %)
20,080
(1.36 %)
n/a 41.97
(99.99 %)
1,073
(0.01 %)
1,073
(0.01 %)
2,135
(99.99 %)
3,948,427
(43.52 %)
848,222
(8.00 %)
11,527,950
(38.76 %)
3
(0.00 %)
1,133,241
(3.81 %)
70,117
(3.31 %)
50,095
(2.07 %)
803 rodents (hap1 2026)
GCA_058744715.1
n/a n/a 19,325
(1.61 %)
21,068
(1.34 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
0
(0 %)
73
(0.00 %)
224
(100.00 %)
4,943,430
(39.29 %)
980,338
(9.21 %)
13,005,095
(37.12 %)
0
(0 %)
1,761,425
(3.96 %)
51,129
(1.40 %)
48,434
(1.25 %)
804 rodents (hap2 2026)
GCA_058744725.1
n/a n/a 19,322
(1.66 %)
21,110
(1.37 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
0
(0 %)
91
(0.00 %)
223
(100.00 %)
4,873,730
(39.22 %)
928,422
(7.03 %)
13,088,495
(35.57 %)
1
(0.00 %)
1,348,499
(3.12 %)
47,812
(1.36 %)
45,153
(1.22 %)
805 root vole (2023)
GCA_963919705.1
n/a n/a 19,293
(1.92 %)
20,635
(1.67 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
268
(100.00 %)
4,396,130
(38.90 %)
891,534
(2.66 %)
12,119,692
(31.39 %)
0
(0 %)
469,049
(1.48 %)
19,542
(0.63 %)
17,677
(0.55 %)
806 Ryukyu mouse (2026)
GCF_978045245.1
58,951
(2.50 %)
n/a 22,322
(1.90 %)
19,296
(1.22 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
0
(0 %)
1,393
(0.00 %)
1,195
(100.00 %)
5,665,093
(45.11 %)
1,943,248
(10.22 %)
12,791,355
(41.32 %)
14
(0.00 %)
2,136,081
(4.82 %)
20,072
(0.50 %)
16,577
(0.42 %)
807 Ryukyu mouse (v2 2017)
GCF_900094665.2
53,792
(2.85 %)
n/a 21,351
(2.29 %)
18,073
(1.39 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
27,758
(7.30 %)
306,599
(10.98 %)
30,835
(92.70 %)
4,479,912
(35.83 %)
1,351,677
(2.59 %)
12,964,608
(27.49 %)
6,570
(0.06 %)
398,054
(1.12 %)
15,963
(0.43 %)
15,425
(0.40 %)
808 Saanen dairy goat
GCA_015443085.1
n/a n/a 19,257
(1.54 %)
21,221
(1.32 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
0
(0 %)
170
(0.00 %)
1,362
(100.00 %)
5,336,862
(47.58 %)
515,161
(2.87 %)
13,144,895
(41.67 %)
3
(0.00 %)
1,309,461
(3.33 %)
58,623
(2.22 %)
39,483
(1.04 %)
809 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1
n/a n/a 18,509
(1.54 %)
22,514
(1.36 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,427
(100.00 %)
3,675,922
(35.75 %)
950,374
(10.49 %)
11,670,399
(40.31 %)
0
(0 %)
1,395,810
(4.32 %)
63,587
(3.15 %)
40,331
(1.09 %)
810 saddleback dolphin (alternate hap 2024)
GCA_949987525.2
n/a n/a 18,426
(1.62 %)
22,420
(1.35 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,427
(100.00 %)
4,448,346
(50.40 %)
950,374
(10.49 %)
11,670,399
(40.31 %)
0
(0 %)
1,395,813
(4.32 %)
63,587
(3.15 %)
40,063
(1.33 %)
811 saddleback dolphin (primary hap 2024)
GCA_949987515.2
n/a n/a 18,542
(1.57 %)
20,620
(1.32 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
0
(0 %)
968
(0.01 %)
631
(100.00 %)
4,890,277
(52.33 %)
1,258,165
(13.09 %)
12,359,469
(42.64 %)
0
(0 %)
1,787,080
(5.07 %)
66,188
(3.91 %)
41,202
(1.38 %)
812 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1
46,746
(2.39 %)
n/a 18,624
(1.49 %)
20,662
(1.31 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
0
(0 %)
968
(0.01 %)
630
(100.00 %)
4,020,676
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,748
(42.64 %)
0
(0 %)
1,785,427
(5.07 %)
66,179
(3.91 %)
41,466
(1.03 %)
813 saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_949987515.2
46,014
(2.36 %)
n/a 18,616
(1.49 %)
20,618
(1.32 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
968
(0.01 %)
1,598
(99.99 %)
4,020,525
(35.99 %)
1,258,165
(13.09 %)
12,359,758
(42.64 %)
0
(0 %)
1,475,119
(4.19 %)
66,188
(3.91 %)
41,466
(1.03 %)
814 saiga antelope
GCA_004024985.1
n/a n/a 23,736
(0.84 %)
55,133
(0.88 %)
n/a 42.52
(99.87 %)
2,867
(0.01 %)
2,867
(0.01 %)
1,775,066
(99.99 %)
6,485,113
(49.43 %)
447,097
(0.88 %)
13,972,753
(44.46 %)
57
(0.00 %)
n/a 46,883
(0.82 %)
38,101
(0.69 %)
815 Schreibers' long-fingered ba
GCF_964146895.1
50,853
(3.35 %)
n/a 18,113
(2.10 %)
21,266
(1.89 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
0
(0 %)
140
(0.00 %)
186
(100.00 %)
2,843,364
(34.45 %)
457,565
(5.58 %)
10,220,082
(31.02 %)
0
(0 %)
662,735
(2.58 %)
59,522
(2.81 %)
54,302
(2.29 %)
816 Schreibers' long-fingered bat (US075 2019)
GCA_004026525.1
n/a n/a 20,147
(2.06 %)
31,271
(1.82 %)
n/a 42.27
(99.94 %)
6,918
(0.04 %)
6,918
(0.04 %)
184,538
(99.96 %)
2,772,932
(29.66 %)
366,782
(1.13 %)
10,477,531
(28.60 %)
19
(0.00 %)
n/a 62,520
(2.73 %)
58,978
(2.39 %)
817 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025)
GCA_964146895.2
n/a n/a 18,109
(2.10 %)
21,263
(1.89 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
0
(0 %)
140
(0.00 %)
186
(100.00 %)
2,812,261
(34.39 %)
457,565
(5.58 %)
10,220,083
(31.02 %)
0
(0 %)
662,735
(2.58 %)
59,522
(2.81 %)
54,315
(2.29 %)
818 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap2 2025)
GCA_964145185.2
n/a n/a 17,286
(2.19 %)
20,474
(1.95 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
86
(0.00 %)
86
(0.00 %)
254
(100.00 %)
2,610,773
(33.65 %)
389,844
(4.42 %)
9,728,138
(29.49 %)
0
(0 %)
460,730
(1.78 %)
56,508
(2.97 %)
51,969
(2.42 %)
819 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2
51,527
(2.72 %)
n/a 19,713
(1.57 %)
21,928
(1.32 %)
n/a 41.74
(99.30 %)
0
(0 %)
16,241
(0.70 %)
9,089
(100.00 %)
5,435,109
(46.76 %)
414,279
(0.98 %)
13,490,956
(40.45 %)
2,509
(0.03 %)
982,620
(2.65 %)
42,961
(1.10 %)
38,033
(0.97 %)
820 Screaming hairy armadillo
GCA_004027955.1
n/a n/a 24,532
(0.39 %)
56,725
(0.46 %)
n/a 39.68
(99.70 %)
2,747
(0.01 %)
2,747
(0.01 %)
7,680,080
(99.99 %)
8,978,735
(36.02 %)
1,516,551
(1.58 %)
32,918,217
(47.67 %)
32
(0.00 %)
n/a 234,762
(1.56 %)
66,537
(0.64 %)
821 sea otter (GAN:26980312 2017 refseq)
GCF_002288905.1
38,140
(2.17 %)
n/a 18,578
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
34,179
(1.77 %)
41.56
(98.79 %)
22,821
(1.21 %)
23,134
(1.21 %)
29,589
(98.79 %)
4,703,044
(41.42 %)
721,750
(1.39 %)
14,065,653
(32.89 %)
1,203
(0.02 %)
504,215
(2.00 %)
55,388
(1.87 %)
53,465
(1.67 %)
822 Seba's short-tailed bat
GCA_004027735.1
n/a n/a 21,878
(0.94 %)
55,858
(1.10 %)
n/a 42.70
(99.84 %)
3,864
(0.01 %)
3,864
(0.01 %)
1,929,203
(99.99 %)
3,802,235
(28.35 %)
606,320
(1.03 %)
15,171,250
(31.99 %)
69
(0.00 %)
n/a 118,227
(2.28 %)
103,103
(1.92 %)
823 sei whale
GCF_965194805.1
89,176
(6.49 %)
n/a 19,289
(1.32 %)
21,865
(1.14 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
0
(0 %)
1,179
(0.01 %)
2,571
(100.00 %)
4,862,311
(59.97 %)
1,097,215
(21.14 %)
12,203,838
(50.47 %)
12
(0.00 %)
2,217,448
(6.14 %)
80,128
(1.58 %)
45,477
(1.01 %)
824 sei whale (hap1.1 2025)
GCA_965194805.1
n/a n/a 19,292
(1.27 %)
21,865
(1.14 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
0
(0 %)
1,179
(0.01 %)
2,572
(100.00 %)
4,525,289
(42.25 %)
1,097,216
(21.14 %)
12,203,884
(50.47 %)
12
(0.00 %)
2,217,448
(6.14 %)
80,128
(1.58 %)
44,102
(0.91 %)
825 sei whale (hap2.1 2025)
GCA_965194725.1
n/a n/a 19,313
(1.37 %)
21,662
(1.17 %)
n/a 41.68
(99.99 %)
1,066
(0.01 %)
1,066
(0.01 %)
2,917
(99.99 %)
4,418,625
(42.98 %)
875,114
(15.81 %)
12,360,254
(46.52 %)
0
(0 %)
1,705,441
(5.02 %)
78,537
(1.66 %)
44,115
(0.98 %)
826 sheep (hu hu3095 2024)
GCA_040805955.1
n/a 21,525
(1.22 %)
19,388
(1.42 %)
21,612
(1.28 %)
n/a 43.17
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28
(100.00 %)
5,311,536
(44.06 %)
653,238
(7.29 %)
12,937,231
(44.10 %)
0
(0 %)
1,552,087
(3.95 %)
63,230
(6.03 %)
40,222
(0.90 %)
827 sheep (OAR_USU_Benz2616 2023)
GCF_016772045.2
89,680
(5.44 %)
n/a 19,308
(1.52 %)
21,506
(1.35 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
143
(100.00 %)
3,275,767
(22.85 %)
464,346
(1.26 %)
12,987,607
(40.61 %)
0
(0 %)
992,253
(2.68 %)
44,477
(1.28 %)
39,609
(0.96 %)
828 sheep (Texel 2015)
GCA_000298735.2
n/a n/a 19,179
(1.56 %)
19,001
(1.26 %)
48,105
(1.85 %)
41.90
(98.94 %)
43,016
(1.07 %)
44,566
(1.07 %)
48,481
(98.93 %)
5,429,824
(46.13 %)
540,267
(1.64 %)
13,509,668
(38.83 %)
123
(0.01 %)
863,621
(2.69 %)
43,911
(1.13 %)
39,178
(0.99 %)
829 short-tailed field vole (hap1.1 2026)
GCA_987114375.1
n/a n/a 20,597
(1.43 %)
22,792
(1.32 %)
n/a n/a 0
(0 %)
349
(0.00 %)
1,296
(100.00 %)
7,143,482
(56.52 %)
1,606,680
(8.13 %)
12,067,439
(46.41 %)
99
(0.00 %)
2,783,840
(6.80 %)
22,002
(0.55 %)
19,107
(0.42 %)
830 short-tailed shrew (CBP01580 primary hap 2026)
GCA_051295465.2
n/a n/a 16,479
(1.36 %)
21,313
(1.48 %)
n/a 42.66
(99.98 %)
2,066
(0.02 %)
2,066
(0.02 %)
2,486
(99.98 %)
6,370,533
(45.64 %)
1,336,462
(5.34 %)
11,780,354
(42.31 %)
23
(0.00 %)
1,308,083
(3.61 %)
51,740
(1.94 %)
43,140
(1.64 %)
831 shrew mouse
GCF_900095145.1
46,279
(2.64 %)
43,645
(2.34 %)
20,549
(2.23 %)
18,979
(1.49 %)
94,079
(3.98 %)
41.89
(90.53 %)
15,298
(6.27 %)
269,643
(9.50 %)
17,879
(93.73 %)
4,788,498
(38.32 %)
1,499,714
(3.03 %)
13,021,757
(27.83 %)
6,442
(0.07 %)
442,006
(1.19 %)
16,787
(0.47 %)
15,907
(0.43 %)
832 Siberian hamster (SSSS 2022)
GCA_023856395.1
n/a n/a 18,375
(1.83 %)
17,066
(1.44 %)
n/a 41.27
(99.64 %)
0
(0 %)
88,601
(0.37 %)
7,756
(100.00 %)
3,152,242
(21.63 %)
1,087,009
(2.64 %)
12,055,167
(29.20 %)
1,976
(0.02 %)
260,068
(0.73 %)
15,455
(0.48 %)
14,212
(0.40 %)
833 Siberian musk deer (BS20 2019 Broad)
GCA_004024705.1
n/a n/a 23,440
(1.32 %)
37,497
(1.19 %)
n/a 42.32
(99.86 %)
19,764
(0.07 %)
19,764
(0.07 %)
1,195,467
(99.93 %)
6,726,950
(49.79 %)
437,480
(1.57 %)
14,155,240
(46.22 %)
13
(0.00 %)
n/a 49,177
(1.05 %)
43,489
(0.94 %)
834 sika deer (Changchun, China MLH-2022 2023)
GCA_034195675.1
n/a n/a 20,087
(1.59 %)
23,556
(1.46 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
0
(0 %)
1,724
(0.03 %)
1,889
(100.00 %)
3,925,148
(27.17 %)
419,490
(1.24 %)
13,364,988
(37.79 %)
0
(0 %)
653,312
(1.92 %)
47,630
(1.31 %)
42,485
(1.04 %)
835 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2
37,090
(1.93 %)
n/a 18,969
(1.19 %)
19,298
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.43 %)
0
(0 %)
270,406
(11.60 %)
7,490
(100.00 %)
3,789,337
(28.89 %)
429,226
(0.87 %)
16,951,112
(32.23 %)
3,875
(0.06 %)
191,573
(0.64 %)
39,993
(0.70 %)
32,202
(0.55 %)
836 smoky shrew (2023)
GCF_029834395.1
37,165
(1.66 %)
n/a 17,572
(1.06 %)
24,146
(1.29 %)
n/a 43.43
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 497
(100.00 %)
2,593,080
(14.11 %)
1,194,567
(7.25 %)
14,051,522
(48.20 %)
0
(0 %)
1,447,378
(3.75 %)
107,473
(2.80 %)
53,859
(1.19 %)
837 snow leopard (11264 2022)
GCF_023721935.1
53,569
(3.37 %)
n/a 18,780
(1.67 %)
21,038
(1.40 %)
n/a 41.60
(99.30 %)
0
(0 %)
23,786
(0.70 %)
2,636
(100.00 %)
4,714,429
(34.93 %)
919,518
(1.59 %)
13,711,504
(33.24 %)
1,871
(0.02 %)
357,999
(0.95 %)
64,690
(2.41 %)
61,670
(2.00 %)
838 snowshoe hare
GCA_004026855.1
n/a n/a 23,263
(0.88 %)
55,811
(1.01 %)
n/a 44.12
(99.87 %)
10,153
(0.03 %)
10,153
(0.03 %)
1,602,982
(99.97 %)
4,767,120
(21.29 %)
1,040,992
(2.22 %)
15,680,144
(43.23 %)
86
(0.00 %)
n/a 126,152
(2.28 %)
87,841
(1.66 %)
839 social tuco-tuco
GCA_004027165.1
n/a n/a 25,166
(1.12 %)
41,316
(1.26 %)
n/a 40.71
(99.89 %)
16,191
(0.06 %)
16,191
(0.06 %)
823,762
(99.94 %)
5,390,906
(28.28 %)
1,027,922
(2.15 %)
15,241,308
(38.39 %)
45
(0.00 %)
n/a 31,883
(0.72 %)
27,410
(0.58 %)
840 Soft-furred tree mouse (WYS1704033 2022)
GCA_023101885.1
n/a n/a 20,505
(1.36 %)
25,606
(1.53 %)
n/a 42.21
(99.64 %)
0
(0 %)
3,794
(0.36 %)
1,243
(100.00 %)
5,973,279
(45.08 %)
1,551,851
(4.63 %)
13,570,249
(38.60 %)
34
(0.00 %)
1,376,656
(3.63 %)
73,762
(1.53 %)
41,027
(1.00 %)
841 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1
n/a n/a 17,590
(1.81 %)
21,597
(1.85 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,717
(100.00 %)
2,734,555
(21.46 %)
795,752
(6.56 %)
9,601,735
(36.35 %)
0
(0 %)
660,443
(2.50 %)
62,524
(3.25 %)
60,391
(2.11 %)
842 soprano pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_949987585.2
n/a n/a 17,999
(1.88 %)
21,396
(1.80 %)
n/a 42.74
(100.00 %)
2
(0.00 %)
122
(0.00 %)
330
(100.00 %)
4,426,108
(44.40 %)
866,819
(7.44 %)
10,132,985
(37.65 %)
2
(0.00 %)
810,871
(2.84 %)
64,680
(3.15 %)
60,272
(2.96 %)
843 soprano pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_949987765.2
n/a n/a 17,269
(1.90 %)
20,534
(1.83 %)
n/a 42.89
(100.00 %)
87
(0.00 %)
87
(0.00 %)
369
(100.00 %)
4,151,522
(43.86 %)
809,312
(8.01 %)
9,615,104
(37.56 %)
1
(0.00 %)
780,383
(2.91 %)
63,890
(3.24 %)
59,199
(3.09 %)
844 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1
n/a n/a 18,056
(1.78 %)
21,158
(1.79 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
6
(0.00 %)
161
(0.00 %)
249
(100.00 %)
2,899,535
(21.64 %)
853,717
(7.80 %)
10,162,216
(37.72 %)
1
(0.00 %)
802,761
(2.85 %)
63,256
(3.06 %)
61,642
(2.03 %)
845 South African ground squirrel
GCA_004024805.1
n/a n/a 22,802
(1.44 %)
33,892
(1.27 %)
n/a 39.97
(99.92 %)
9,745
(0.04 %)
9,745
(0.04 %)
587,115
(99.96 %)
5,256,998
(34.93 %)
594,122
(1.27 %)
14,462,947
(33.96 %)
36
(0.00 %)
n/a 34,141
(0.80 %)
32,509
(0.74 %)
846 Southeastern Asian house mouse (2016)
GCA_001624445.1
n/a n/a 21,103
(2.24 %)
18,682
(1.45 %)
102,099
(4.16 %)
41.83
(86.23 %)
48,311
(2.15 %)
424,005
(13.83 %)
52,352
(97.85 %)
4,990,851
(39.88 %)
1,356,202
(2.67 %)
13,469,640
(26.15 %)
14,714
(0.76 %)
396,098
(1.49 %)
16,724
(0.41 %)
15,971
(0.39 %)
847 Southeastern Asian house mouse (2022)
GCA_921999005.2
n/a n/a 21,799
(2.13 %)
19,729
(1.40 %)
110,356
(4.43 %)
41.78
(99.19 %)
4
(0.00 %)
278
(0.81 %)
151
(100.00 %)
4,663,228
(40.41 %)
1,549,985
(3.70 %)
13,012,600
(34.99 %)
8
(0.01 %)
788,439
(2.30 %)
21,349
(0.52 %)
15,914
(0.42 %)
848 Southeastern Asian house mouse (T2T 2024)
GCA_964188545.1
n/a n/a 22,529
(1.85 %)
20,409
(1.22 %)
n/a 41.10
(99.90 %)
78
(0.10 %)
78
(0.10 %)
416
(99.90 %)
4,880,101
(47.77 %)
1,689,287
(15.13 %)
12,822,147
(42.92 %)
1
(0.00 %)
2,529,336
(6.14 %)
22,642
(0.54 %)
16,895
(0.41 %)
849 Southern African pygmy mouse (2020)
GCA_902729485.2
n/a n/a 21,253
(2.02 %)
24,053
(1.41 %)
n/a 41.62
(85.36 %)
26,006
(14.65 %)
63,317
(14.65 %)
92,356
(85.35 %)
5,677,434
(41.24 %)
1,683,338
(3.20 %)
13,320,768
(28.29 %)
7,916
(0.40 %)
718,161
(1.80 %)
21,132
(0.44 %)
15,972
(0.37 %)
850 southern elephant seal
GCF_011800145.1
53,210
(2.86 %)
n/a 19,520
(1.73 %)
20,727
(1.41 %)
39,634
(1.86 %)
41.45
(99.36 %)
0
(0 %)
22,850
(0.64 %)
1,115
(100.00 %)
4,728,105
(43.75 %)
585,443
(1.13 %)
13,463,979
(33.65 %)
2,467
(0.03 %)
627,414
(1.65 %)
53,182
(1.62 %)
49,837
(1.42 %)
851 southern flying squirrel (Volans SFS_CC1 2021)
GCA_020662805.1
n/a n/a 19,813
(1.54 %)
25,643
(1.37 %)
n/a 40.48
(98.33 %)
53,082
(1.67 %)
53,082
(1.67 %)
114,190
(98.33 %)
5,649,834
(41.22 %)
689,166
(1.55 %)
14,561,421
(30.61 %)
2,798
(0.03 %)
320,860
(0.99 %)
37,158
(0.90 %)
34,914
(0.82 %)
852 southern grasshopper mouse (2020 genbank)
GCA_903995425.1
n/a n/a 19,395
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
0
(0 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,480
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,539,823
(32.73 %)
0
(0 %)
547,538
(1.62 %)
18,046
(0.54 %)
16,132
(0.42 %)
853 southern grasshopper mouse (2020 refseq)
GCF_903995425.1
47,152
(2.39 %)
n/a 19,356
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
0
(0 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,460
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,540,762
(32.73 %)
0
(0 %)
547,538
(1.62 %)
18,046
(0.54 %)
16,132
(0.42 %)
854 Southern marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2026)
GCA_048126345.2
n/a n/a 24,714
(0.82 %)
18,971
(0.87 %)
n/a 37.80
(99.99 %)
0
(0 %)
211
(0.01 %)
688
(100.00 %)
13,545,658
(58.39 %)
1,450,475
(2.40 %)
21,374,274
(47.19 %)
1
(0.00 %)
1,154,226
(2.37 %)
17,923
(0.30 %)
16,104
(0.25 %)
855 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1
69,058
(3.04 %)
n/a 20,313
(2.11 %)
17,745
(1.38 %)
n/a 41.39
(91.90 %)
0
(0 %)
146,713
(8.12 %)
28
(100.00 %)
4,875,400
(38.43 %)
1,454,350
(2.93 %)
13,104,717
(28.82 %)
2,045
(0.04 %)
494,819
(1.13 %)
16,715
(0.45 %)
15,641
(0.42 %)
856 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1
n/a n/a 20,179
(1.21 %)
24,249
(1.19 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
7,866
(100.00 %)
3,953,031
(35.88 %)
531,111
(1.14 %)
16,354,874
(39.96 %)
0
(0 %)
425,622
(1.30 %)
59,907
(1.35 %)
35,916
(0.80 %)
857 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023851605.1
n/a n/a 20,058
(1.26 %)
22,196
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
961
(0.56 %)
201
(100.00 %)
4,037,291
(46.02 %)
593,019
(1.17 %)
18,033,833
(40.56 %)
9
(0.00 %)
500,101
(1.40 %)
65,039
(1.33 %)
38,121
(0.86 %)
858 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023851605.1
84,279
(3.04 %)
n/a 20,960
(1.28 %)
22,188
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
961
(0.56 %)
200
(100.00 %)
4,793,649
(47.24 %)
593,018
(1.17 %)
18,033,318
(40.56 %)
9
(0.00 %)
500,100
(1.40 %)
65,039
(1.33 %)
57,260
(1.12 %)
859 southern three-banded armadillo
GCA_004025125.1
n/a n/a 29,138
(0.73 %)
56,522
(0.75 %)
n/a 39.20
(99.82 %)
15,801
(0.04 %)
15,801
(0.04 %)
2,941,308
(99.96 %)
6,990,740
(38.88 %)
839,452
(1.23 %)
24,805,397
(43.95 %)
220
(0.00 %)
n/a 71,951
(0.98 %)
63,325
(0.84 %)
860 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1
n/a n/a 22,897
(1.23 %)
27,007
(1.18 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
70
(0.00 %)
70
(0.00 %)
12,050
(100.00 %)
4,502,020
(38.27 %)
576,759
(1.02 %)
17,143,050
(40.65 %)
0
(0 %)
450,196
(1.59 %)
51,339
(1.15 %)
40,459
(0.82 %)
861 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1
63,054
(2.39 %)
n/a 21,998
(1.29 %)
23,177
(1.18 %)
45,345
(1.69 %)
39.89
(97.48 %)
0
(0 %)
1,243
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,559,690
(39.66 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,630
(40.50 %)
4
(0.00 %)
492,026
(1.69 %)
51,430
(1.14 %)
40,148
(0.81 %)
862 southern two-toed sloth (primary hap 2020)
GCA_015220235.1
n/a n/a 22,250
(1.38 %)
23,180
(1.18 %)
n/a 39.89
(97.48 %)
0
(0 %)
1,240
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,830,544
(50.68 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,148
(40.49 %)
4
(0.00 %)
492,033
(1.69 %)
51,430
(1.14 %)
47,818
(1.03 %)
863 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq)
GCF_000283155.1
37,037
(2.11 %)
n/a 18,398
(1.71 %)
19,753
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
54,737
(3.96 %)
57,824
(96.04 %)
3,685,898
(38.31 %)
421,694
(0.97 %)
14,765,529
(28.93 %)
1,818
(0.02 %)
184,274
(0.57 %)
36,281
(1.02 %)
32,113
(0.82 %)
864 Southern yellow bat (hap1 2026)
GCA_058971415.1
n/a n/a 18,554
(1.45 %)
20,850
(1.37 %)
n/a 42.36
(100.00 %)
0
(0 %)
387
(0.00 %)
835
(100.00 %)
4,105,444
(42.92 %)
958,849
(9.83 %)
11,113,701
(45.96 %)
3
(0.00 %)
1,911,582
(5.59 %)
72,495
(5.06 %)
62,371
(1.86 %)
865 Southern yellow bat (hap2 2026)
GCA_058972195.1
n/a n/a 17,721
(1.51 %)
19,825
(1.41 %)
n/a 42.46
(100.00 %)
0
(0 %)
319
(0.00 %)
591
(100.00 %)
3,812,032
(41.99 %)
848,611
(8.64 %)
10,398,244
(44.23 %)
3
(0.00 %)
1,669,918
(5.28 %)
68,141
(4.77 %)
60,659
(1.95 %)
866 Sowerby's beaked whale
GCF_964165515.1
50,568
(2.18 %)
n/a 19,470
(1.39 %)
22,885
(1.24 %)
n/a 42.04
(99.99 %)
1,095
(0.01 %)
1,095
(0.01 %)
2,696
(99.99 %)
4,774,485
(38.32 %)
825,474
(10.97 %)
11,375,525
(45.31 %)
11
(0.00 %)
3,517,431
(7.94 %)
76,527
(3.10 %)
39,378
(0.86 %)
867 Sowerby's beaked whale (hap1 2024)
GCA_964165515.1
n/a n/a 19,471
(1.39 %)
22,951
(1.24 %)
n/a 42.04
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,095
(0.01 %)
1,604
(100.00 %)
4,307,839
(34.31 %)
825,475
(10.97 %)
11,375,945
(45.31 %)
11
(0.00 %)
3,517,431
(7.94 %)
76,527
(3.10 %)
39,378
(0.86 %)
868 Sowerby's beaked whale (hap2 2024)
GCA_964148845.1
n/a n/a 18,591
(1.46 %)
21,588
(1.27 %)
n/a 42.00
(99.99 %)
974
(0.01 %)
974
(0.01 %)
2,126
(99.99 %)
3,961,403
(34.20 %)
742,897
(9.73 %)
10,832,739
(43.68 %)
2
(0.00 %)
2,951,041
(7.25 %)
70,803
(2.85 %)
37,380
(0.90 %)
869 Sowerby's beaked whale (US080 2019)
GCA_004027085.1
n/a n/a 22,800
(1.32 %)
38,247
(1.17 %)
n/a 41.68
(99.84 %)
8,597
(0.03 %)
8,597
(0.03 %)
1,810,317
(99.97 %)
5,520,986
(45.05 %)
1,081,962
(2.69 %)
13,480,261
(43.01 %)
62
(0.00 %)
n/a 69,001
(1.39 %)
52,160
(1.13 %)
870 sperm whale (hap1.1 2026)
GCA_978012005.1
n/a n/a 19,211
(1.53 %)
21,574
(1.27 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
0
(0 %)
357
(0.00 %)
783
(100.00 %)
4,849,649
(50.53 %)
873,547
(8.11 %)
11,855,809
(42.39 %)
5
(0.00 %)
1,513,205
(4.72 %)
103,167
(3.00 %)
56,555
(2.16 %)
871 sperm whale (SW-GA 2023)
GCF_002837175.3
62,616
(2.83 %)
n/a 19,485
(1.75 %)
22,707
(1.41 %)
n/a 41.33
(95.82 %)
121,387
(4.20 %)
121,387
(4.20 %)
133,555
(95.80 %)
3,906,439
(36.43 %)
691,647
(2.39 %)
13,489,368
(32.95 %)
1,869
(0.17 %)
517,424
(4.47 %)
86,751
(2.23 %)
82,633
(2.04 %)
872 spotted hyena (KB4526 2019)
GCF_008692635.1
44,813
(2.42 %)
n/a 17,929
(1.62 %)
18,444
(1.40 %)
n/a 41.48
(99.10 %)
259,266
(0.92 %)
259,266
(0.92 %)
283,944
(99.08 %)
5,744,848
(42.15 %)
646,532
(1.63 %)
13,599,442
(32.09 %)
2,962
(0.12 %)
367,159
(2.13 %)
61,299
(2.04 %)
57,732
(1.70 %)
873 spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025)
GCA_048593285.1
n/a n/a 15,188
(0.80 %)
15,406
(0.90 %)
n/a 36.07
(99.97 %)
151
(0.03 %)
151
(0.03 %)
157
(99.97 %)
4,933,924
(23.65 %)
1,239,006
(2.76 %)
20,612,787
(41.98 %)
1
(0.00 %)
575,621
(1.68 %)
21,700
(0.64 %)
21,289
(0.49 %)
874 spotted-tailed quoll (Chaos hap2 2025)
GCA_048593245.1
n/a n/a 15,441
(0.80 %)
15,791
(0.92 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
118
(0.01 %)
118
(0.01 %)
124
(99.99 %)
4,962,547
(23.62 %)
1,257,253
(2.87 %)
20,652,321
(42.01 %)
2
(0.00 %)
597,604
(1.75 %)
22,718
(0.69 %)
22,508
(0.51 %)
875 star-nosed mole
GCF_000260355.1
30,444
(2.86 %)
n/a 16,116
(1.82 %)
17,403
(1.78 %)
n/a 41.55
(95.10 %)
82,557
(4.92 %)
82,557
(4.92 %)
84,595
(95.08 %)
1,855,039
(18.90 %)
308,473
(0.86 %)
9,571,561
(26.02 %)
1,110
(0.03 %)
253,120
(1.17 %)
48,079
(2.76 %)
50,592
(2.47 %)
876 Steller sea lion
GCF_004028035.1
46,044
(2.38 %)
n/a 21,171
(1.78 %)
21,626
(1.43 %)
36,701
(1.75 %)
41.38
(99.41 %)
17,263
(0.59 %)
18,994
(0.59 %)
24,485
(99.41 %)
4,556,415
(43.53 %)
577,797
(1.09 %)
13,545,012
(33.71 %)
733
(0.02 %)
410,405
(1.19 %)
51,355
(1.45 %)
47,732
(1.28 %)
877 Stephens's kangaroo rat
GCA_004024685.1
n/a n/a 20,638
(1.19 %)
43,541
(1.37 %)
n/a 41.90
(99.85 %)
8,882
(0.04 %)
8,882
(0.04 %)
1,278,525
(99.96 %)
4,886,095
(30.36 %)
1,229,832
(5.30 %)
11,334,494
(44.33 %)
37
(0.00 %)
n/a 38,450
(1.17 %)
29,741
(0.76 %)
878 steppe mouse (ZRU 2018)
GCA_003336285.1
n/a n/a 22,032
(2.17 %)
20,891
(1.41 %)
n/a 41.70
(95.78 %)
123,681
(4.24 %)
123,681
(4.24 %)
161,217
(95.76 %)
4,964,415
(42.35 %)
1,414,584
(2.75 %)
12,989,925
(31.80 %)
1,690
(0.04 %)
440,790
(1.25 %)
17,544
(0.44 %)
15,542
(0.39 %)
879 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA alternate hap 2024)
GCA_043727795.1
n/a n/a 18,498
(1.82 %)
20,345
(1.58 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
2,228
(100.00 %)
4,403,018
(41.05 %)
809,880
(2.56 %)
11,206,839
(32.61 %)
0
(0 %)
589,463
(2.07 %)
38,354
(1.36 %)
31,765
(1.13 %)
880 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024)
GCA_043727835.1
n/a n/a 19,605
(1.80 %)
20,075
(1.48 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
5
(0.00 %)
87
(0.00 %)
80
(100.00 %)
4,110,913
(40.46 %)
838,212
(2.48 %)
11,938,168
(33.52 %)
2
(0.00 %)
646,825
(2.22 %)
40,424
(1.32 %)
35,299
(1.15 %)
881 straw-colored fruit bat
GCA_000465285.1
n/a n/a 20,161
(1.66 %)
40,283
(1.50 %)
n/a 39.24
(99.62 %)
154,908
(0.40 %)
154,908
(0.40 %)
288,446
(99.60 %)
2,814,732
(32.92 %)
372,539
(1.01 %)
12,351,823
(25.93 %)
27
(0.00 %)
33,439
(0.13 %)
67,245
(2.34 %)
61,933
(1.94 %)
882 stripe-headed round-eared bat
GCA_004024845.1
n/a n/a 20,248
(1.62 %)
29,173
(1.61 %)
n/a 42.04
(99.96 %)
2,860
(0.01 %)
2,860
(0.01 %)
252,670
(99.99 %)
3,018,746
(29.48 %)
333,243
(0.74 %)
12,128,116
(30.51 %)
14
(0.00 %)
n/a 59,513
(1.87 %)
52,210
(1.57 %)
883 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1
n/a n/a 18,204
(1.54 %)
21,036
(1.34 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,464
(100.00 %)
3,767,720
(35.65 %)
1,102,723
(10.92 %)
11,794,617
(40.96 %)
0
(0 %)
1,492,009
(4.69 %)
67,537
(3.57 %)
41,008
(1.09 %)
884 striped dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_951394435.1
n/a n/a 18,595
(1.48 %)
20,637
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1
(0.00 %)
993
(0.01 %)
639
(100.00 %)
4,097,623
(35.88 %)
1,442,973
(13.60 %)
12,327,244
(43.08 %)
1
(0.00 %)
1,896,129
(5.45 %)
68,498
(4.29 %)
42,011
(1.04 %)
885 striped dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_951394435.1
55,298
(2.72 %)
n/a 18,760
(1.55 %)
20,645
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
993
(0.01 %)
993
(0.01 %)
1,630
(99.99 %)
5,991,283
(52.35 %)
1,442,973
(13.60 %)
12,326,846
(43.08 %)
1
(0.00 %)
1,896,129
(5.45 %)
68,498
(4.29 %)
50,190
(1.37 %)
886 striped hyena (BS54 2019 Broad)
GCA_004023945.1
n/a n/a 22,373
(1.45 %)
39,382
(1.45 %)
n/a 41.66
(99.93 %)
11,849
(0.05 %)
11,849
(0.05 %)
362,072
(99.95 %)
5,048,667
(42.42 %)
712,073
(1.24 %)
13,879,012
(34.58 %)
54
(0.00 %)
302,752
(0.79 %)
69,835
(2.20 %)
65,774
(1.90 %)
887 striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U)
GCF_003009895.1
48,870
(2.41 %)
n/a 18,793
(1.67 %)
20,950
(1.44 %)
n/a 41.56
(99.29 %)
0
(0 %)
23,058
(0.71 %)
5,761
(100.00 %)
4,782,500
(41.88 %)
701,157
(1.32 %)
13,436,624
(33.05 %)
2,049
(0.04 %)
413,871
(1.33 %)
58,977
(2.20 %)
57,500
(1.94 %)
888 sugar glider (PSGF00001 2023 genbank)
GCA_028583685.1
n/a n/a 19,326
(0.81 %)
17,560
(0.95 %)
n/a 38.95
(98.12 %)
0
(0 %)
85,933
(1.89 %)
1,895
(100.00 %)
6,382,198
(27.07 %)
1,058,207
(1.74 %)
22,508,040
(39.84 %)
4,157
(0.04 %)
398,213
(0.87 %)
16,224
(0.33 %)
14,028
(0.23 %)
889 sugar glider (PSGF00001 2023 refseq)
GCF_028583685.1
55,990
(2.41 %)
n/a 19,328
(0.81 %)
17,559
(0.95 %)
n/a 38.95
(98.12 %)
0
(0 %)
85,933
(1.89 %)
1,896
(100.00 %)
6,382,203
(27.07 %)
1,058,208
(1.74 %)
22,508,106
(39.84 %)
4,157
(0.04 %)
398,217
(0.87 %)
16,224
(0.33 %)
14,028
(0.23 %)
890 Sumatran rhinoceros (hap1 2026)
GCA_060039915.1
n/a n/a 18,591
(1.58 %)
22,216
(1.40 %)
n/a 41.01
(100.00 %)
0
(0 %)
246
(0.00 %)
404
(100.00 %)
5,002,790
(48.58 %)
498,846
(1.86 %)
15,182,511
(34.12 %)
6
(0.00 %)
515,632
(1.57 %)
43,768
(1.30 %)
34,410
(0.98 %)
891 Sumatran rhinoceros (hap2 2026)
GCA_060039925.1
n/a n/a 17,652
(1.59 %)
20,770
(1.39 %)
n/a 41.19
(100.00 %)
0
(0 %)
221
(0.00 %)
888
(100.00 %)
4,702,969
(48.73 %)
501,843
(3.62 %)
13,805,271
(34.22 %)
0
(0 %)
515,144
(1.55 %)
41,269
(1.27 %)
32,112
(0.96 %)
892 Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017)
GCA_002844835.1
n/a n/a 20,368
(1.53 %)
24,204
(1.23 %)
n/a 41.05
(95.54 %)
50,874
(4.40 %)
50,876
(4.40 %)
1,112,463
(95.60 %)
4,516,240
(39.90 %)
561,540
(1.56 %)
15,821,451
(34.68 %)
11,238
(0.78 %)
n/a 45,201
(1.03 %)
42,111
(0.93 %)
893 Sumatran serow (serow.1 2024)
GCF_032405125.1
36,400
(1.65 %)
n/a 19,192
(1.42 %)
22,014
(1.41 %)
n/a 43.08
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
159
(100.00 %)
3,242,768
(21.18 %)
612,565
(8.05 %)
12,812,990
(44.37 %)
1
(0.00 %)
1,821,554
(4.84 %)
75,177
(5.86 %)
39,082
(0.88 %)
894 Sunda flying lemur (2014 WashU)
GCF_000696425.1
34,734
(1.83 %)
n/a 21,356
(1.55 %)
25,832
(1.21 %)
n/a 40.21
(87.96 %)
332,364
(12.07 %)
412,608
(12.07 %)
511,878
(87.93 %)
4,961,153
(38.35 %)
854,441
(3.33 %)
17,562,576
(28.82 %)
58,964
(1.13 %)
n/a 82,988
(1.05 %)
76,682
(0.95 %)
895 Sunda flying lemur (US047 2019 Broad)
GCA_004027255.1
n/a n/a 24,882
(1.29 %)
43,546
(1.12 %)
n/a 40.46
(99.88 %)
5,895
(0.02 %)
5,895
(0.02 %)
1,655,642
(99.98 %)
5,807,241
(38.62 %)
953,765
(2.48 %)
18,836,777
(37.68 %)
23
(0.00 %)
n/a 114,955
(1.43 %)
106,305
(1.30 %)
896 tailed tailless bat
GCA_004027475.1
n/a n/a 19,920
(1.58 %)
28,017
(1.58 %)
n/a 41.76
(99.95 %)
4,640
(0.02 %)
4,640
(0.02 %)
341,895
(99.98 %)
3,139,817
(30.43 %)
381,536
(0.81 %)
12,069,229
(32.73 %)
25
(0.00 %)
n/a 54,528
(2.15 %)
52,231
(1.90 %)
897 tailess tenrec (hap1 2025 genbank)
GCA_050624435.1
n/a n/a 21,323
(0.86 %)
25,222
(1.02 %)
n/a 44.80
(100.00 %)
0
(0 %)
175
(0.00 %)
2,180
(100.00 %)
5,682,996
(38.93 %)
1,001,072
(14.26 %)
17,866,411
(50.04 %)
0
(0 %)
5,912,988
(9.31 %)
53,320
(1.01 %)
38,205
(0.58 %)
898 tailess tenrec (hap1 2025 refseq)
GCF_050624435.1
45,770
(1.60 %)
n/a 21,323
(0.86 %)
25,223
(1.02 %)
n/a 44.80
(100.00 %)
0
(0 %)
175
(0.00 %)
2,180
(100.00 %)
5,633,466
(38.91 %)
1,001,072
(14.26 %)
17,866,411
(50.04 %)
0
(0 %)
5,333,247
(8.40 %)
53,320
(1.01 %)
38,205
(0.58 %)
899 tailess tenrec (hap2 2025)
GCA_050624465.1
n/a n/a 20,180
(0.96 %)
23,467
(1.13 %)
n/a 44.21
(100.00 %)
0
(0 %)
160
(0.00 %)
1,233
(100.00 %)
5,074,733
(40.88 %)
791,473
(8.15 %)
16,742,233
(44.91 %)
0
(0 %)
2,945,083
(5.65 %)
47,409
(1.01 %)
35,296
(0.63 %)
900 takin (Tak-1 2022)
GCF_023091745.1
31,927
(1.65 %)
n/a 19,290
(1.42 %)
21,656
(1.27 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
0
(0 %)
152
(0.00 %)
1,363
(100.00 %)
3,256,033
(21.01 %)
714,375
(8.32 %)
13,010,154
(44.58 %)
4
(0.00 %)
1,681,924
(4.50 %)
49,134
(7.43 %)
39,324
(0.88 %)
901 Talazac's shrew tenrec
GCA_004026705.1
n/a n/a 22,605
(0.81 %)
50,725
(1.09 %)
n/a 43.03
(99.93 %)
6,619
(0.02 %)
6,619
(0.02 %)
795,514
(99.98 %)
3,493,378
(14.58 %)
705,274
(1.31 %)
20,975,335
(36.85 %)
51
(0.00 %)
n/a 70,793
(1.26 %)
54,287
(0.89 %)
902 tammar wallaby (alternate hap 2023)
GCA_028389975.1
n/a n/a 11,133
(0.77 %)
13,869
(0.98 %)
n/a 38.63
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
14,285
(100.00 %)
3,114,522
(26.10 %)
661,874
(3.02 %)
11,667,649
(38.41 %)
0
(0 %)
320,252
(1.29 %)
12,393
(0.46 %)
7,824
(0.29 %)
903 tammar wallaby (Barry hap1 2025)
GCA_048593335.1
n/a n/a 17,491
(0.79 %)
15,701
(0.88 %)
n/a 38.69
(100.00 %)
32
(0.00 %)
32
(0.00 %)
40
(100.00 %)
5,762,317
(26.52 %)
1,078,692
(1.83 %)
22,476,051
(38.99 %)
0
(0 %)
359,624
(0.79 %)
22,756
(0.48 %)
14,728
(0.29 %)
904 tammar wallaby (Barry hap2 2025)
GCA_048593345.1
n/a n/a 17,037
(0.79 %)
15,066
(0.87 %)
n/a 38.62
(100.00 %)
16
(0.00 %)
16
(0.00 %)
24
(100.00 %)
5,608,153
(26.57 %)
1,050,173
(1.77 %)
21,856,273
(38.96 %)
0
(0 %)
329,638
(0.74 %)
21,811
(0.47 %)
14,145
(0.29 %)
905 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq)
GCF_028372415.1
73,219
(3.07 %)
n/a 17,615
(0.77 %)
15,415
(0.86 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
0
(0 %)
515
(0.19 %)
272
(100.00 %)
5,866,314
(26.30 %)
1,193,604
(2.72 %)
22,677,480
(39.53 %)
4
(0.00 %)
565,991
(1.21 %)
23,590
(0.47 %)
14,746
(0.29 %)
906 Tasmanian devil (McLovin hap1 2025)
GCA_048593225.1
n/a n/a 15,725
(0.77 %)
16,721
(0.92 %)
n/a 36.17
(99.49 %)
1,514
(0.51 %)
1,514
(0.51 %)
1,521
(99.49 %)
5,222,976
(23.42 %)
1,357,438
(3.95 %)
21,705,122
(42.26 %)
2
(0.00 %)
779,205
(1.97 %)
24,443
(0.70 %)
24,411
(0.52 %)
907 Tasmanian devil (McLovin hap2 2025)
GCA_048593325.1
n/a n/a 15,165
(0.76 %)
15,663
(0.91 %)
n/a 36.00
(99.11 %)
2,578
(0.89 %)
2,578
(0.89 %)
2,584
(99.11 %)
5,039,957
(23.64 %)
1,257,168
(2.97 %)
20,893,744
(41.44 %)
4
(0.00 %)
610,743
(1.64 %)
22,574
(0.67 %)
22,546
(0.51 %)
908 Tasmanian devil (primary hap 2019)
GCF_902635505.1
52,070
(2.36 %)
n/a 15,918
(0.85 %)
16,111
(0.91 %)
n/a 36.16
(100.00 %)
0
(0 %)
354
(0.00 %)
106
(100.00 %)
6,789,158
(44.28 %)
1,246,027
(2.19 %)
21,434,803
(41.20 %)
1
(0.00 %)
454,463
(1.20 %)
23,609
(0.65 %)
23,356
(0.61 %)
909 Tasmanian wolf (PY-MV-C5757 2022)
GCA_007646695.3
n/a n/a 15,896
(0.81 %)
37,523
(1.30 %)
n/a 36.26
(90.01 %)
0
(0 %)
295,304
(10.01 %)
149,109
(100.00 %)
9,159,284
(56.14 %)
1,604,085
(2.22 %)
21,839,162
(35.42 %)
17,762
(0.42 %)
n/a 46,604
(0.74 %)
43,696
(0.67 %)
910 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1
69,352
(3.50 %)
n/a 18,934
(1.68 %)
16,775
(1.37 %)
n/a 39.91
(93.25 %)
0
(0 %)
146,412
(6.77 %)
7,132
(100.00 %)
4,262,890
(35.64 %)
640,624
(1.64 %)
14,118,452
(27.90 %)
3,000
(0.05 %)
226,596
(0.80 %)
28,317
(0.64 %)
26,522
(0.58 %)
911 thirteen-lined ground squirrel (hap1 2025)
GCA_052094955.1
n/a n/a 19,425
(1.31 %)
21,287
(1.27 %)
n/a 40.31
(99.99 %)
0
(0 %)
1,444
(0.01 %)
5,280
(100.00 %)
6,062,160
(43.45 %)
940,716
(10.02 %)
16,322,133
(37.64 %)
11
(0.00 %)
2,274,560
(4.34 %)
34,544
(0.73 %)
31,733
(0.65 %)
912 thirteen-lined ground squirrel (hap2 2025)
GCA_052094965.1
n/a n/a 17,228
(1.41 %)
17,999
(1.30 %)
n/a 39.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,000
(0.01 %)
1,438
(100.00 %)
5,253,166
(38.98 %)
750,953
(4.01 %)
14,542,518
(32.77 %)
6
(0.00 %)
833,303
(2.05 %)
27,458
(0.71 %)
25,216
(0.64 %)
913 thirteen-lined ground squirrel (mIctTri1hap1 2025)
GCF_052094955.1
91,025
(3.74 %)
n/a 19,425
(1.31 %)
20,977
(1.20 %)
n/a 40.31
(99.99 %)
0
(0 %)
1,444
(0.01 %)
5,279
(100.00 %)
6,062,154
(43.45 %)
940,716
(10.02 %)
16,322,064
(37.64 %)
11
(0.00 %)
2,274,560
(4.34 %)
34,544
(0.73 %)
31,733
(0.65 %)
914 Tibetan sand fox (lyu1992 2022)
GCA_024500485.1
n/a n/a 19,552
(1.59 %)
19,307
(1.35 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
0
(0 %)
145
(0.00 %)
234
(100.00 %)
4,500,832
(32.18 %)
999,068
(2.01 %)
13,646,015
(32.98 %)
0
(0 %)
668,288
(1.70 %)
49,402
(2.19 %)
47,111
(1.57 %)
915 tiger
GCF_018350195.1
71,226
(2.84 %)
n/a 18,513
(1.68 %)
19,919
(1.39 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
56
(0.00 %)
65
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,878,003
(42.77 %)
912,595
(1.82 %)
13,804,650
(33.76 %)
1
(0.00 %)
408,593
(1.10 %)
64,312
(2.55 %)
60,048
(2.06 %)
916 Townsend's big-eared bat (COTO_CA2020_CCGPhap1 2025)
GCA_026230055.2
n/a n/a 18,747
(1.81 %)
21,398
(1.62 %)
n/a 42.82
(100.00 %)
0
(0 %)
256
(0.00 %)
381
(100.00 %)
5,017,312
(48.85 %)
779,839
(3.26 %)
10,740,034
(37.51 %)
2
(0.00 %)
511,098
(1.76 %)
49,071
(2.44 %)
50,053
(2.00 %)
917 Townsend's big-eared bat (COTO_CA2020_CCGPhap2 2025)
GCA_026230045.2
n/a n/a 17,913
(1.88 %)
19,986
(1.66 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
0
(0 %)
239
(0.00 %)
165
(100.00 %)
4,617,916
(47.27 %)
707,796
(3.14 %)
9,951,985
(36.27 %)
1
(0.00 %)
451,447
(1.67 %)
46,302
(2.55 %)
47,929
(2.10 %)
918 Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230055.1
n/a n/a 19,370
(1.77 %)
21,062
(1.61 %)
n/a 42.81
(100.00 %)
219
(0.00 %)
219
(0.00 %)
610
(100.00 %)
2,923,694
(25.49 %)
772,382
(3.25 %)
10,654,074
(37.41 %)
2
(0.00 %)
500,435
(1.74 %)
48,226
(2.42 %)
50,955
(1.88 %)
919 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1
n/a n/a 18,627
(1.82 %)
20,108
(1.67 %)
n/a 42.95
(100.00 %)
0
(0 %)
217
(0.00 %)
182
(100.00 %)
2,733,927
(24.79 %)
715,258
(3.17 %)
10,099,456
(36.35 %)
1
(0.00 %)
459,634
(1.69 %)
47,139
(2.58 %)
49,626
(1.96 %)
920 Transcaucasian mole vole
GCA_001685075.1
n/a n/a 20,173
(1.62 %)
18,627
(1.30 %)
n/a 41.51
(96.09 %)
440,846
(3.96 %)
440,846
(3.96 %)
499,269
(96.04 %)
3,827,136
(25.51 %)
810,597
(2.65 %)
13,634,524
(27.54 %)
26,487
(0.57 %)
259,635
(1.42 %)
9,596
(0.16 %)
8,622
(0.14 %)
921 Trefoil horseshoe bat (Malaysia alternate hap 2024)
GCA_043728055.1
n/a n/a 17,828
(1.84 %)
20,454
(1.63 %)
n/a 40.66
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,403
(100.00 %)
3,519,024
(41.02 %)
627,372
(2.04 %)
11,034,851
(31.87 %)
0
(0 %)
484,384
(2.04 %)
33,992
(1.29 %)
26,331
(1.02 %)
922 trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024)
GCA_043728145.1
n/a n/a 18,871
(1.79 %)
20,351
(1.55 %)
n/a 40.66
(99.99 %)
10
(0.00 %)
397
(0.01 %)
136
(100.00 %)
3,580,957
(40.75 %)
683,947
(2.19 %)
11,464,418
(33.39 %)
23
(0.00 %)
658,821
(2.63 %)
37,175
(1.31 %)
29,161
(1.04 %)
923 True's beaked whale
GCF_964341445.1
51,240
(1.91 %)
n/a 19,491
(1.24 %)
24,573
(1.13 %)
n/a 42.48
(99.99 %)
0
(0 %)
1,240
(0.01 %)
2,756
(100.00 %)
5,445,244
(60.47 %)
949,926
(20.01 %)
10,981,870
(51.51 %)
11
(0.00 %)
5,232,828
(10.31 %)
91,880
(2.74 %)
41,626
(0.88 %)
924 True's beaked whale (hap1.1 2024)
GCA_964341445.1
n/a n/a 19,530
(1.21 %)
24,576
(1.13 %)
n/a 42.48
(99.99 %)
0
(0 %)
1,240
(0.01 %)
2,757
(100.00 %)
4,847,855
(34.88 %)
949,927
(20.01 %)
10,981,914
(51.51 %)
11
(0.00 %)
5,641,807
(11.20 %)
91,880
(2.74 %)
39,724
(0.76 %)
925 True's beaked whale (hap1.2 2026)
GCA_964341445.2
n/a n/a 19,446
(1.25 %)
23,872
(1.13 %)
n/a 42.50
(99.99 %)
0
(0 %)
1,215
(0.01 %)
2,365
(100.00 %)
5,438,551
(60.72 %)
947,935
(20.05 %)
10,903,184
(51.60 %)
11
(0.00 %)
5,632,572
(11.22 %)
91,540
(2.75 %)
41,298
(0.88 %)
926 True's beaked whale (hap2.1 2024)
GCA_964341485.1
n/a n/a 19,313
(1.40 %)
22,642
(1.25 %)
n/a 42.03
(99.99 %)
1,073
(0.01 %)
1,073
(0.01 %)
2,457
(99.99 %)
4,540,507
(37.61 %)
826,104
(12.82 %)
11,296,445
(45.25 %)
8
(0.00 %)
3,246,098
(7.56 %)
80,840
(2.24 %)
38,974
(0.87 %)
927 True's beaked whale (hap2.2 2026)
GCA_964341485.2
n/a n/a 19,335
(1.44 %)
23,239
(1.28 %)
n/a 42.03
(99.99 %)
1,073
(0.01 %)
1,073
(0.01 %)
2,453
(99.99 %)
5,186,124
(55.45 %)
826,101
(12.82 %)
11,296,189
(45.25 %)
8
(0.00 %)
3,245,999
(7.56 %)
80,840
(2.24 %)
41,569
(1.03 %)
928 Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq)
GCF_000622305.1
54,680
(2.07 %)
n/a 19,704
(1.26 %)
21,262
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
201,121
(4.83 %)
356,097
(95.17 %)
6,165,645
(34.95 %)
1,197,750
(2.77 %)
16,282,383
(36.21 %)
730
(0.04 %)
n/a 22,905
(0.49 %)
18,563
(0.39 %)
929 Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019)
GCA_005458795.1
n/a n/a 19,867
(1.62 %)
15,893
(1.33 %)
n/a 39.77
(94.43 %)
291,728
(5.60 %)
296,819
(5.60 %)
315,631
(94.40 %)
4,452,628
(33.94 %)
751,210
(1.84 %)
13,917,879
(30.08 %)
10,755
(0.11 %)
190,776
(0.77 %)
26,541
(0.58 %)
25,046
(0.53 %)
930 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1
n/a n/a 9,367
(1.66 %)
11,297
(1.30 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,470
(100.00 %)
1,708,360
(43.81 %)
267,584
(1.67 %)
5,373,410
(33.52 %)
0
(0 %)
245,754
(1.84 %)
29,783
(1.94 %)
21,396
(1.51 %)
931 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1
60,106
(3.00 %)
n/a 18,611
(1.76 %)
20,103
(1.39 %)
35,176
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
0
(0 %)
212
(0.34 %)
64
(100.00 %)
4,067,454
(44.25 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,582
(35.55 %)
3
(0.00 %)
550,113
(1.71 %)
66,806
(1.79 %)
48,624
(1.46 %)
932 vaquita (primary hap 2019)
GCA_008692025.1
n/a n/a 18,599
(1.75 %)
20,104
(1.39 %)
35,398
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
0
(0 %)
212
(0.34 %)
65
(100.00 %)
4,067,518
(44.25 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,653
(35.55 %)
3
(0.00 %)
549,962
(1.71 %)
66,806
(1.79 %)
48,623
(1.46 %)
933 water buffalo (Mediterranean 2018)
GCF_003121395.1
69,771
(3.14 %)
62,816
(2.76 %)
19,465
(1.58 %)
21,849
(1.37 %)
46,051
(1.86 %)
41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
410
(0.01 %)
509
(100.00 %)
5,407,697
(47.11 %)
473,976
(1.54 %)
13,015,899
(41.23 %)
0
(0 %)
1,256,741
(3.44 %)
43,120
(1.15 %)
37,204
(0.96 %)
934 water buffalo (Murrah 2021)
GCF_019923935.1
80,565
(3.26 %)
n/a 19,402
(1.59 %)
20,375
(1.31 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
0
(0 %)
659
(0.00 %)
26
(100.00 %)
5,358,548
(47.11 %)
447,338
(1.14 %)
13,034,537
(41.28 %)
1
(0.00 %)
1,149,595
(3.22 %)
40,189
(1.07 %)
36,130
(0.95 %)
935 water vole (JQ59JK4JDI 2023)
GCA_019206885.2
n/a n/a 18,401
(2.03 %)
18,085
(1.65 %)
n/a 42.19
(89.99 %)
0
(0 %)
161,581
(10.04 %)
2,585
(100.00 %)
4,771,963
(38.17 %)
705,400
(1.96 %)
11,410,837
(25.00 %)
14,627
(0.18 %)
239,938
(0.72 %)
16,195
(0.52 %)
15,532
(0.49 %)
936 Weddell seal (Sample4059 2025)
GCF_054177405.1
64,922
(3.92 %)
n/a 20,961
(1.71 %)
22,100
(1.30 %)
n/a 41.56
(101.48 %)
0
(0 %)
51,965
(0.82 %)
396,181
(100.00 %)
4,778,614
(41.37 %)
576,425
(1.10 %)
14,014,212
(32.58 %)
2,227
(0.08 %)
n/a 53,779
(1.51 %)
47,102
(1.30 %)
937 Weddell seal (WS11-02 2013 refseq)
GCF_000349705.1
48,264
(2.73 %)
n/a 21,063
(1.73 %)
22,333
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
152,836
(29.58 %)
169,547
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,256
(0.66 %)
13,410,237
(22.09 %)
2,022
(0.05 %)
348,917
(1.08 %)
48,738
(1.01 %)
44,867
(0.88 %)
938 western European hedgehog (2012 refseq)
GCF_000296755.1
29,923
(1.67 %)
n/a 18,067
(1.33 %)
19,777
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
219,764
(14.09 %)
225,567
(85.91 %)
6,594,783
(45.66 %)
1,271,533
(2.29 %)
12,374,161
(42.02 %)
3,596
(0.06 %)
861,216
(2.39 %)
28,528
(0.71 %)
23,900
(0.52 %)
939 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1
n/a n/a 14,370
(1.06 %)
24,297
(1.27 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
26,601
(100.00 %)
3,360,923
(19.59 %)
1,043,098
(3.92 %)
8,511,380
(53.68 %)
0
(0 %)
1,216,984
(4.33 %)
23,321
(0.97 %)
17,608
(0.60 %)
940 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1
61,103
(2.36 %)
n/a 18,125
(1.16 %)
20,689
(1.21 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
0
(0 %)
3,760
(0.03 %)
1,174
(100.00 %)
4,891,329
(19.68 %)
1,507,929
(3.81 %)
12,571,105
(54.50 %)
7
(0.00 %)
1,975,693
(4.67 %)
32,667
(0.90 %)
24,067
(0.56 %)
941 western European house mouse (C57BL/6 2026)
GCA_056825265.1
n/a n/a 22,725
(1.91 %)
20,127
(1.25 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 22
(100.00 %)
5,054,625
(45.46 %)
1,712,800
(10.08 %)
12,627,747
(41.14 %)
0
(0 %)
1,329,590
(3.48 %)
24,439
(0.56 %)
16,499
(0.40 %)
942 western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022)
GCA_921998345.2
n/a n/a 21,722
(2.14 %)
19,586
(1.39 %)
108,856
(4.46 %)
41.81
(98.87 %)
1
(0.00 %)
1,233
(1.13 %)
233
(100.00 %)
4,634,551
(40.61 %)
1,541,826
(3.49 %)
13,030,566
(35.21 %)
1
(0.00 %)
789,553
(2.49 %)
22,985
(0.56 %)
15,853
(0.42 %)
943 western roe deer (2023)
GCA_951849835.1
n/a n/a 20,291
(1.29 %)
23,555
(1.23 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 212
(100.00 %)
4,204,612
(25.49 %)
848,463
(7.79 %)
12,687,776
(48.28 %)
0
(0 %)
3,910,662
(7.70 %)
57,315
(1.25 %)
43,092
(0.85 %)
944 western spotted skunk
GCA_004023965.1
n/a n/a 21,665
(1.46 %)
34,370
(1.32 %)
n/a 41.61
(99.92 %)
11,822
(0.05 %)
11,822
(0.05 %)
433,831
(99.95 %)
4,889,781
(40.77 %)
901,906
(2.30 %)
13,931,764
(34.80 %)
69
(0.00 %)
550,674
(1.31 %)
54,394
(1.54 %)
50,665
(1.39 %)
945 western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022)
GCA_921997135.2
n/a n/a 21,699
(2.10 %)
18,837
(1.32 %)
n/a 41.69
(99.51 %)
4
(0.00 %)
1,576
(0.49 %)
143
(100.00 %)
4,507,329
(41.24 %)
1,517,241
(3.77 %)
12,832,499
(36.17 %)
35
(0.00 %)
908,992
(2.83 %)
22,568
(0.53 %)
15,701
(0.41 %)
946 whiskered bat (hap1 2024)
GCA_964094495.2
n/a n/a 19,504
(1.78 %)
22,272
(1.73 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
7
(0.00 %)
1,566
(0.02 %)
533
(100.00 %)
3,046,246
(25.06 %)
753,151
(4.86 %)
10,596,418
(37.62 %)
7
(0.00 %)
729,123
(2.57 %)
66,785
(2.55 %)
53,825
(1.76 %)
947 whiskered bat (hap1.2 2025)
GCA_964094495.3
n/a n/a 19,023
(1.85 %)
22,199
(1.73 %)
n/a 43.02
(100.00 %)
0
(0 %)
267
(0.00 %)
241
(100.00 %)
5,005,820
(47.73 %)
756,354
(4.85 %)
10,602,346
(37.72 %)
2
(0.00 %)
711,178
(2.47 %)
67,615
(2.61 %)
52,556
(2.03 %)
948 whiskered bat (hap2 2024)
GCA_964195625.1
n/a n/a 18,681
(1.83 %)
21,523
(1.79 %)
n/a 43.13
(99.99 %)
1,414
(0.01 %)
1,414
(0.01 %)
1,741
(99.99 %)
2,849,223
(24.50 %)
688,594
(4.80 %)
9,968,980
(36.80 %)
9
(0.00 %)
650,767
(2.46 %)
64,365
(2.68 %)
52,706
(1.84 %)
949 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1
n/a n/a 17,639
(1.50 %)
25,684
(1.35 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 25,619
(100.00 %)
3,039,324
(36.05 %)
637,912
(8.02 %)
9,746,398
(38.98 %)
0
(0 %)
811,711
(3.51 %)
56,325
(3.33 %)
35,586
(1.15 %)
950 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1
59,995
(2.43 %)
n/a 18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
0
(0 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
2
(0.00 %)
1,117,804
(3.60 %)
68,551
(3.58 %)
41,698
(1.09 %)
951 white-footed mouse (LL stock 2020)
GCF_004664715.2
54,479
(2.82 %)
n/a 19,971
(1.69 %)
20,132
(1.42 %)
n/a 42.23
(99.95 %)
0
(0 %)
2,299
(0.05 %)
1,857
(100.00 %)
5,060,487
(30.71 %)
1,258,073
(2.85 %)
14,007,098
(32.99 %)
1
(0.00 %)
568,416
(1.60 %)
23,456
(0.67 %)
19,779
(0.50 %)
952 white-tailed deer (Illinois 20LAN1187 2024)
GCF_023699985.2
68,660
(3.60 %)
n/a 19,951
(1.73 %)
21,804
(1.48 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
237
(0.00 %)
294
(0.00 %)
718
(100.00 %)
4,512,173
(43.10 %)
402,481
(1.14 %)
12,813,223
(37.56 %)
0
(0 %)
544,080
(1.60 %)
45,863
(1.30 %)
41,250
(1.17 %)
953 white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq)
GCF_002102435.1
57,787
(2.93 %)
n/a 20,661
(1.75 %)
23,085
(1.50 %)
40,987
(1.94 %)
41.55
(99.10 %)
31,627
(0.90 %)
107,058
(0.91 %)
48,653
(99.10 %)
4,800,704
(41.29 %)
413,129
(2.59 %)
13,296,779
(34.22 %)
7,681
(0.08 %)
439,019
(2.88 %)
44,165
(1.19 %)
41,200
(1.10 %)
954 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1
n/a n/a 12,198
(1.10 %)
18,494
(1.29 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
26
(0.00 %)
26
(0.00 %)
14,841
(100.00 %)
1,725,021
(17.81 %)
802,415
(4.26 %)
8,321,474
(45.72 %)
0
(0 %)
653,092
(2.79 %)
15,669
(0.79 %)
13,175
(0.55 %)
955 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1
40,430
(1.81 %)
n/a 17,575
(1.21 %)
21,880
(1.35 %)
47,496
(1.55 %)
39.81
(99.57 %)
0
(0 %)
1,010
(0.43 %)
147
(100.00 %)
2,846,063
(18.57 %)
1,252,362
(3.89 %)
13,776,063
(46.50 %)
14
(0.00 %)
1,059,317
(2.87 %)
24,589
(0.78 %)
20,877
(0.55 %)
956 white-toothed pygmy shrew (primary hap 2022)
GCA_024139225.1
n/a n/a 17,350
(1.25 %)
21,890
(1.35 %)
n/a 39.81
(99.57 %)
0
(0 %)
1,010
(0.43 %)
148
(100.00 %)
6,924,771
(50.26 %)
1,252,365
(3.89 %)
13,775,765
(46.50 %)
14
(0.00 %)
1,059,318
(2.87 %)
24,589
(0.78 %)
21,240
(0.65 %)
957 wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020)
GCF_009834535.1
70,235
(4.11 %)
n/a 18,202
(1.93 %)
20,199
(1.66 %)
42,728
(2.35 %)
41.66
(99.99 %)
0
(0 %)
2,345
(0.01 %)
2,043
(100.00 %)
3,091,018
(33.31 %)
332,720
(5.33 %)
12,161,286
(28.79 %)
5
(0.00 %)
978,328
(2.98 %)
55,524
(1.75 %)
51,693
(1.56 %)
958 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq)
GCF_000311805.1
34,726
(2.40 %)
n/a 18,746
(1.96 %)
17,104
(1.61 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
55,538
(1.18 %)
60,971
(1.18 %)
68,872
(98.82 %)
2,991,821
(33.93 %)
353,632
(1.23 %)
12,349,615
(25.12 %)
11
(0.00 %)
101,845
(0.63 %)
45,437
(1.02 %)
41,010
(0.88 %)
959 wild goat
GCA_000978405.1
n/a n/a 19,104
(1.48 %)
16,198
(1.21 %)
n/a 41.91
(91.72 %)
279,195
(8.31 %)
279,195
(8.31 %)
368,693
(91.69 %)
5,563,294
(45.39 %)
452,402
(1.99 %)
13,802,376
(35.47 %)
3,626
(0.18 %)
791,539
(4.01 %)
41,935
(0.63 %)
35,405
(0.52 %)
960 wild yak (GX-2022 2023)
GCF_027580195.1
52,505
(2.90 %)
n/a 19,278
(1.60 %)
20,813
(1.31 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
0
(0 %)
196
(0.00 %)
2,040
(100.00 %)
5,706,841
(46.71 %)
464,013
(1.82 %)
12,973,198
(41.46 %)
0
(0 %)
1,346,892
(3.70 %)
42,508
(1.32 %)
39,621
(1.15 %)
961 wild yak (yakQH1 2013)
GCF_000298355.1
29,789
(1.92 %)
n/a 19,936
(1.62 %)
19,914
(1.32 %)
n/a 41.71
(95.48 %)
192,006
(4.54 %)
192,006
(4.54 %)
233,198
(95.46 %)
5,348,663
(46.08 %)
449,880
(1.38 %)
13,572,902
(36.62 %)
139
(0.01 %)
753,906
(2.31 %)
41,147
(0.82 %)
37,405
(0.73 %)
962 winter white dwarf (Siberian hamster Psun_Stras_1 2023)
GCA_030556225.1
n/a n/a 18,177
(1.88 %)
18,942
(1.54 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
742
(100.00 %)
5,398,126
(39.36 %)
1,168,723
(3.56 %)
12,272,233
(30.38 %)
0
(0 %)
500,811
(1.32 %)
18,332
(0.60 %)
16,608
(0.53 %)
963 woodchuck (v1.1 L192 2022)
GCF_021218885.2
68,030
(3.47 %)
n/a 19,116
(1.55 %)
21,017
(1.38 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
47
(0.00 %)
47
(0.00 %)
3,380
(100.00 %)
5,285,788
(43.20 %)
912,552
(2.73 %)
14,538,866
(35.15 %)
0
(0 %)
413,178
(1.33 %)
36,914
(1.02 %)
26,813
(0.66 %)
964 woodland dormouse
GCA_004027655.1
n/a n/a 23,556
(1.09 %)
55,517
(1.33 %)
n/a 41.52
(99.86 %)
15,691
(0.06 %)
15,691
(0.06 %)
1,283,630
(99.94 %)
7,674,195
(34.99 %)
1,698,258
(3.76 %)
13,705,886
(42.23 %)
20
(0.00 %)
n/a 68,562
(1.41 %)
46,064
(0.97 %)
965 woodland thicket rat
GCF_004785775.1
43,129
(2.40 %)
n/a 22,710
(2.13 %)
21,042
(1.49 %)
n/a 41.17
(98.57 %)
0
(0 %)
76,623
(1.44 %)
23,656
(100.00 %)
4,732,544
(38.04 %)
1,424,025
(3.23 %)
13,549,399
(30.42 %)
5,008
(0.04 %)
449,709
(1.17 %)
18,232
(0.48 %)
16,831
(0.43 %)
966 woolly hare (The Qinghai-Tibet Plateau SH-2023 2024)
GCA_036325905.1
n/a n/a 19,363
(1.28 %)
22,239
(1.28 %)
n/a 44.08
(100.00 %)
0
(0 %)
240
(0.00 %)
112
(100.00 %)
4,432,114
(42.23 %)
966,165
(7.11 %)
13,263,822
(43.77 %)
1
(0.00 %)
1,913,575
(4.39 %)
96,755
(2.28 %)
70,154
(1.73 %)
967 wrinkle-faced bat (hap1 2026)
GCA_058972505.1
n/a n/a 17,620
(1.53 %)
20,718
(1.49 %)
n/a 42.82
(100.00 %)
0
(0 %)
85
(0.00 %)
812
(100.00 %)
3,933,017
(42.96 %)
461,927
(10.60 %)
10,236,179
(38.95 %)
0
(0 %)
1,186,176
(3.08 %)
68,442
(2.55 %)
61,202
(3.09 %)
968 wrinkle-faced bat (hap2 2026)
GCA_058972435.1
n/a n/a 17,530
(1.57 %)
20,692
(1.50 %)
n/a 42.70
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
654
(100.00 %)
3,876,611
(42.49 %)
425,909
(9.29 %)
10,283,412
(37.60 %)
0
(0 %)
1,136,871
(3.33 %)
68,200
(2.41 %)
60,353
(2.62 %)
969 Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq)
GCF_003031525.2
43,310
(2.49 %)
n/a 18,747
(1.81 %)
19,638
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
52,647
(0.72 %)
66,343
(99.28 %)
3,547,466
(35.83 %)
540,760
(1.65 %)
12,691,756
(32.88 %)
427
(0.03 %)
363,612
(1.97 %)
59,050
(1.48 %)
55,323
(1.35 %)
970 Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.2
26,128
(1.61 %)
n/a 18,978
(1.74 %)
20,661
(1.39 %)
n/a 41.24
(98.69 %)
123,788
(1.33 %)
123,788
(1.33 %)
148,598
(98.67 %)
3,788,303
(37.04 %)
690,288
(1.96 %)
12,841,906
(35.04 %)
292
(0.02 %)
514,620
(2.01 %)
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(1.54 %)
59,005
(1.41 %)
971 yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq)
GCF_047511675.1
55,299
(2.52 %)
n/a 19,502
(1.44 %)
20,297
(1.34 %)
n/a 39.90
(100.00 %)
0
(0 %)
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(0.00 %)
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(100.00 %)
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(29.07 %)
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(3.28 %)
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(34.97 %)
4
(0.00 %)
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(1.44 %)
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(1.05 %)
27,659
(0.61 %)
972 yellow-bellied marmot (hap2 2025)
GCA_047512175.1
n/a n/a 18,677
(1.51 %)
19,370
(1.40 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
0
(0 %)
307
(0.00 %)
329
(100.00 %)
3,694,109
(28.05 %)
793,102
(2.43 %)
13,585,913
(33.39 %)
4
(0.00 %)
351,043
(1.26 %)
33,990
(1.02 %)
26,212
(0.65 %)
973 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019)
GCF_003676075.3
42,667
(2.16 %)
n/a 19,547
(1.52 %)
21,406
(1.40 %)
n/a 39.89
(97.96 %)
34,682
(2.04 %)
35,509
(2.04 %)
66,442
(97.96 %)
3,814,223
(27.39 %)
800,865
(1.96 %)
14,323,977
(32.63 %)
1,266
(0.04 %)
210,361
(0.69 %)
34,122
(0.91 %)
26,843
(0.62 %)
974 yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCF_016432865.1
47,618
(2.51 %)
n/a 15,703
(0.78 %)
16,155
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
0
(0 %)
620
(0.01 %)
486
(100.00 %)
5,191,383
(23.81 %)
1,269,772
(2.59 %)
21,430,585
(42.69 %)
2
(0.00 %)
714,623
(2.20 %)
28,118
(0.66 %)
28,157
(0.56 %)
975 yellow-spotted hyrax
GCA_004026845.1
n/a n/a 20,424
(0.86 %)
43,984
(1.27 %)
n/a 40.93
(99.94 %)
3,815
(0.01 %)
3,815
(0.01 %)
971,748
(99.99 %)
5,365,974
(31.41 %)
435,699
(1.22 %)
21,229,266
(45.17 %)
42
(0.00 %)
n/a 38,521
(0.68 %)
31,852
(0.55 %)
976 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1
n/a n/a 17,610
(1.00 %)
20,322
(1.04 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
276
(0.00 %)
62
(100.00 %)
3,295,935
(23.58 %)
389,907
(6.37 %)
19,525,382
(45.90 %)
0
(0 %)
1,020,287
(2.23 %)
31,831
(0.63 %)
26,588
(0.47 %)
977 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1
n/a n/a 16,320
(1.03 %)
20,318
(1.13 %)
n/a 40.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,169
(100.00 %)
2,911,332
(23.50 %)
347,110
(4.57 %)
17,256,419
(44.04 %)
0
(0 %)
683,195
(1.71 %)
28,674
(0.68 %)
24,228
(0.50 %)
978 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd alternate hap 2024)
GCA_043880365.1
n/a n/a 18,844
(1.70 %)
23,805
(1.54 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,862
(100.00 %)
3,638,702
(42.22 %)
847,774
(6.68 %)
11,654,541
(34.78 %)
0
(0 %)
1,444,870
(4.06 %)
34,055
(3.45 %)
25,436
(0.96 %)
979 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024)
GCA_043880425.1
n/a n/a 18,352
(1.71 %)
20,233
(1.46 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
44
(0.00 %)
196
(0.00 %)
1,530
(100.00 %)
3,466,695
(41.95 %)
934,524
(8.81 %)
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(36.30 %)
0
(0 %)
1,908,821
(5.07 %)
35,257
(5.20 %)
27,363
(0.98 %)
980 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023)
GCA_028536395.1
n/a n/a 19,188
(1.79 %)
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(1.72 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
0
(0 %)
215
(0.00 %)
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(100.00 %)
3,043,589
(24.76 %)
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(4.49 %)
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(37.26 %)
2
(0.00 %)
684,501
(2.39 %)
61,910
(2.52 %)
51,884
(1.68 %)
981 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 refseq)
GCF_028538775.1
48,707
(3.25 %)
n/a 18,807
(1.93 %)
21,046
(1.76 %)
n/a 43.22
(100.00 %)
209
(0.00 %)
209
(0.00 %)
684
(100.00 %)
3,552,235
(38.46 %)
719,552
(4.26 %)
10,089,365
(36.35 %)
0
(0 %)
648,904
(2.37 %)
60,974
(2.61 %)
54,521
(2.25 %)
982 zebra duiker (hap1 2025)
GCA_054099735.1
n/a n/a 19,411
(1.04 %)
23,174
(0.98 %)
n/a 46.14
(100.00 %)
0
(0 %)
185
(0.00 %)
598
(100.00 %)
6,742,800
(39.85 %)
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(26.55 %)
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(58.45 %)
3
(0.00 %)
6,242,957
(11.61 %)
605,557
(5.20 %)
46,593
(0.81 %)
983 zebra duiker (hap2 2025)
GCA_054099755.1
n/a n/a 19,383
(1.06 %)
23,042
(0.98 %)
n/a 46.07
(100.00 %)
0
(0 %)
162
(0.00 %)
677
(100.00 %)
6,681,000
(40.47 %)
636,475
(26.14 %)
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(57.66 %)
1
(0.00 %)
7,301,330
(13.79 %)
583,195
(5.17 %)
46,667
(0.82 %)
984 zebu cattle (Hainan HN024 2024)
GCA_039881165.1
n/a n/a 19,162
(1.53 %)
20,991
(1.34 %)
n/a 41.77
(99.99 %)
0
(0 %)
350
(0.01 %)
292
(100.00 %)
3,296,209
(23.14 %)
440,574
(1.28 %)
12,824,144
(40.98 %)
0
(0 %)
1,191,569
(3.42 %)
39,400
(1.07 %)
35,669
(0.87 %)
985 zebu cattle (Nelore 2014 refseq)
GCF_000247795.1
39,830
(2.52 %)
n/a 18,603
(1.59 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
253,738
(7.41 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,770
(92.59 %)
5,119,428
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,672
(36.60 %)
476
(0.01 %)
998,817
(3.00 %)
35,241
(0.84 %)
32,220
(0.75 %)
986 zebu cattle (Sahiwal x Tharparkar maternal NIAB-ARS_2022 2023)
GCF_029378745.1
70,745
(4.27 %)
n/a 19,546
(1.58 %)
21,187
(1.33 %)
n/a 41.86
(100.00 %)
0
(0 %)
283
(0.00 %)
67
(100.00 %)
5,530,890
(46.61 %)
459,827
(1.43 %)
13,190,355
(41.36 %)
0
(0 %)
1,188,902
(3.30 %)
42,544
(1.21 %)
38,882
(1.11 %)
TOTALS:total assembly count 986

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 627 assemblies assembly stats track stats
Mammals 986 assemblies assembly stats track stats
Birds 631 assemblies assembly stats track stats
Fishes 874 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 519 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1999 assemblies assembly stats track stats
Plants 466 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4136 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15117 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2977 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 23960 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 691 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5522 assemblies assembly stats track stats