Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 aardvark (hap1 2026)
GCA_054668785.1
n/a n/a 18,288
(0.81 %)
20,681
(0.76 %)
n/a 40.40
(100.00 %)
0
(0 %)
121
(0.00 %)
354
(100.00 %)
10,530,628
(70.06 %)
890,633
(3.80 %)
19,549,882
(59.96 %)
0
(0 %)
2,125,530
(3.76 %)
36,422
(1.04 %)
41,547
(0.56 %)
2 aardvark (hap2 2026)
GCA_054668755.1
n/a n/a 17,455
(0.85 %)
18,974
(0.77 %)
n/a 40.25
(100.00 %)
0
(0 %)
89
(0.00 %)
269
(100.00 %)
9,589,258
(69.56 %)
812,088
(2.92 %)
18,264,020
(58.96 %)
1
(0.00 %)
n/a 31,668
(0.72 %)
30,612
(0.48 %)
3 aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad)
GCF_000298275.1
25,594
(1.08 %)
n/a 18,351
(1.06 %)
20,358
(0.98 %)
n/a 40.07
(76.89 %)
411,144
(23.15 %)
411,144
(23.15 %)
433,653
(76.85 %)
n/a 536,700
(0.74 %)
18,176,790
(39.08 %)
3,595
(0.03 %)
723,185
(1.16 %)
26,235
(0.40 %)
24,645
(0.35 %)
4 African grass rat (maternal 2020)
GCA_011750645.1
n/a n/a 20,916
(2.01 %)
19,513
(1.43 %)
n/a 41.37
(98.89 %)
0
(0 %)
1,526
(1.11 %)
1,610
(100.00 %)
4,928,847
(37.45 %)
1,652,295
(5.20 %)
13,507,965
(32.27 %)
0
(0 %)
1,023,525
(1.96 %)
17,712
(0.51 %)
16,897
(0.46 %)
5 African grass rat (paternal 2020)
GCA_011762545.1
n/a n/a 20,796
(2.00 %)
19,611
(1.43 %)
n/a 41.42
(97.70 %)
0
(0 %)
1,563
(2.30 %)
1,740
(100.00 %)
4,904,243
(37.25 %)
1,672,608
(5.37 %)
13,465,246
(32.19 %)
1
(0.00 %)
1,034,950
(2.07 %)
17,677
(0.50 %)
16,772
(0.46 %)
6 African grass rat (v1 paternal X 2020 refseq)
GCF_011762505.1
45,963
(2.46 %)
n/a 20,878
(1.99 %)
19,613
(1.43 %)
37,929
(2.32 %)
41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,595
(100.00 %)
4,939,557
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,429
(32.71 %)
2
(0.00 %)
1,065,249
(2.09 %)
17,767
(0.51 %)
16,852
(0.46 %)
7 African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank)
GCA_011762505.2
n/a n/a 19,637
(1.95 %)
19,610
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
5,399,465
(42.90 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
2
(0.00 %)
979,697
(2.05 %)
17,767
(0.51 %)
15,566
(0.42 %)
8 African grass rat (v2 paternal X 2025 refseq)
GCF_011762505.2
70,837
(3.51 %)
n/a 19,640
(1.95 %)
19,607
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,595
(100.00 %)
5,625,390
(42.96 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,612,806
(32.71 %)
2
(0.00 %)
855,406
(1.69 %)
17,767
(0.51 %)
15,567
(0.42 %)
9 African grass rat (v3 paternal hap 2024)
GCA_011762505.3
n/a n/a 20,986
(2.01 %)
19,611
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,532,782
(33.95 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,612,916
(32.71 %)
2
(0.00 %)
1,064,933
(2.09 %)
17,767
(0.51 %)
16,931
(0.46 %)
10 African hunting dog
GCA_001887905.1
n/a n/a 18,956
(1.75 %)
17,562
(1.41 %)
n/a 40.98
(92.89 %)
0
(0 %)
1,415,298
(7.28 %)
803
(100.00 %)
4,458,183
(39.99 %)
658,637
(1.13 %)
13,671,493
(28.24 %)
854
(0.01 %)
288,980
(0.71 %)
47,644
(1.64 %)
45,393
(1.41 %)
11 African hunting dog (LycPic1hap1 2024)
GCA_040955645.1
n/a n/a 18,688
(1.61 %)
19,670
(1.44 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
1
(0.00 %)
82
(0.00 %)
86
(100.00 %)
4,281,139
(31.62 %)
959,378
(2.78 %)
12,859,760
(32.95 %)
1
(0.00 %)
632,917
(1.70 %)
49,122
(2.32 %)
45,729
(1.55 %)
12 African hunting dog (LycPic1hap2 2024)
GCA_040955705.1
n/a n/a 19,463
(1.58 %)
20,378
(1.42 %)
n/a 41.30
(100.00 %)
1
(0.00 %)
91
(0.00 %)
77
(100.00 %)
4,513,580
(32.16 %)
1,008,611
(2.91 %)
13,570,452
(33.71 %)
2
(0.00 %)
686,092
(1.77 %)
50,954
(2.21 %)
46,966
(1.51 %)
13 African savanna elephant (2009 refseq)
GCF_000001905.1
46,043
(2.30 %)
n/a 19,169
(1.26 %)
19,664
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,363,315
(57.54 %)
365,797
(0.88 %)
16,073,053
(44.89 %)
11
(0.00 %)
417,291
(1.06 %)
33,513
(0.68 %)
24,503
(0.51 %)
14 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1
n/a n/a 18,845
(1.07 %)
22,426
(1.10 %)
n/a 41.34
(99.85 %)
169
(0.15 %)
169
(0.15 %)
1,253
(99.85 %)
4,406,744
(29.55 %)
925,868
(4.71 %)
15,966,881
(50.49 %)
0
(0 %)
1,248,627
(2.71 %)
68,531
(1.61 %)
23,142
(0.47 %)
15 African savanna elephant (hap2 2023 genbank)
GCA_030014295.1
n/a n/a 18,981
(1.10 %)
22,759
(1.12 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
0
(0 %)
231
(0.10 %)
880
(100.00 %)
4,426,756
(29.95 %)
832,908
(4.08 %)
16,118,910
(49.47 %)
1
(0.00 %)
1,082,958
(2.38 %)
62,315
(1.49 %)
23,783
(0.48 %)
16 African savanna elephant (hap2 2023 refseq)
GCF_030014295.1
64,034
(3.35 %)
n/a 18,980
(1.10 %)
21,593
(1.06 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
0
(0 %)
231
(0.10 %)
879
(100.00 %)
4,426,749
(29.95 %)
832,904
(4.08 %)
16,118,888
(49.47 %)
1
(0.00 %)
1,082,957
(2.38 %)
62,314
(1.49 %)
23,783
(0.48 %)
17 African soft-furred rat (Lowveld savanna grassland N552 2022)
GCA_021653895.1
n/a n/a 20,232
(2.08 %)
18,517
(1.32 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,311
(100.00 %)
5,083,017
(39.13 %)
1,337,200
(3.02 %)
13,402,561
(30.35 %)
0
(0 %)
432,162
(1.35 %)
17,841
(0.51 %)
15,654
(0.45 %)
18 African soft-furred rat (MVZ Mamm 221054 2021)
GCA_019843795.1
n/a n/a 26,123
(1.59 %)
49,154
(1.23 %)
n/a 41.38
(99.06 %)
92,030
(0.93 %)
92,030
(0.93 %)
412,491
(99.07 %)
5,251,146
(37.28 %)
1,541,020
(3.13 %)
13,613,713
(32.35 %)
7,441
(0.10 %)
n/a 21,054
(0.58 %)
19,246
(0.53 %)
19 agile gracile mouse opossum
GCF_016433145.1
30,697
(1.32 %)
n/a 17,361
(0.78 %)
17,596
(0.81 %)
n/a 37.86
(91.75 %)
0
(0 %)
85,142
(8.25 %)
60,714
(100.00 %)
7,917,577
(49.04 %)
1,054,566
(1.57 %)
22,701,659
(37.69 %)
3,920
(0.14 %)
434,964
(1.27 %)
27,301
(0.49 %)
25,777
(0.43 %)
20 Allen's wood mouse (MVZ Mamm 196246 2021)
GCA_019843855.1
n/a n/a 22,687
(1.16 %)
46,299
(0.94 %)
n/a 41.37
(99.72 %)
75,967
(0.24 %)
75,967
(0.24 %)
659,537
(99.76 %)
6,139,432
(45.57 %)
1,339,550
(3.13 %)
12,293,115
(32.34 %)
6,671
(0.10 %)
n/a 16,575
(0.44 %)
15,096
(0.40 %)
21 alpaca (2025)
GCF_048564905.1
80,233
(3.11 %)
n/a 18,667
(1.53 %)
23,043
(1.52 %)
n/a 41.92
(99.91 %)
0
(0 %)
681
(0.09 %)
519
(100.00 %)
3,387,094
(33.34 %)
395,581
(10.22 %)
11,510,740
(36.96 %)
5
(0.00 %)
727,944
(2.17 %)
72,497
(1.98 %)
52,064
(1.17 %)
22 alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.4
54,987
(3.56 %)
n/a 18,439
(1.93 %)
18,426
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
0
(0 %)
166,272
(4.17 %)
77,389
(100.00 %)
3,004,413
(33.17 %)
315,092
(1.36 %)
12,458,272
(24.89 %)
1,213
(0.03 %)
207,593
(1.22 %)
54,502
(1.38 %)
49,907
(1.20 %)
23 Alpine marmot (2019)
GCF_001458135.2
69,587
(3.43 %)
n/a 19,047
(1.54 %)
17,768
(1.39 %)
n/a 39.80
(96.13 %)
0
(0 %)
88,858
(3.88 %)
14,031
(100.00 %)
3,726,252
(26.48 %)
746,953
(1.83 %)
14,066,368
(30.30 %)
494
(0.01 %)
202,554
(0.77 %)
30,191
(0.63 %)
24,232
(0.48 %)
24 Alston's brown mouse (SKS-2025a 2025)
GCA_049901635.1
n/a 38,437
(1.69 %)
19,201
(1.73 %)
20,397
(1.45 %)
n/a 41.54
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,689
(100.00 %)
6,399,518
(45.04 %)
1,172,526
(4.32 %)
13,154,869
(32.85 %)
0
(0 %)
801,643
(2.07 %)
17,916
(0.51 %)
16,290
(0.45 %)
25 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1
n/a n/a 19,086
(1.55 %)
22,040
(1.52 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,182
(0.01 %)
1,182
(0.01 %)
1,369
(99.99 %)
3,846,728
(31.78 %)
639,852
(2.90 %)
11,937,936
(38.98 %)
24
(0.00 %)
819,376
(2.67 %)
75,377
(2.21 %)
66,761
(1.68 %)
26 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1
n/a n/a 18,980
(1.50 %)
22,394
(1.50 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
326
(100.00 %)
3,896,863
(31.56 %)
659,711
(4.74 %)
11,945,162
(40.81 %)
3
(0.00 %)
979,504
(2.79 %)
76,769
(2.57 %)
66,591
(1.63 %)
27 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1
n/a n/a 19,066
(1.48 %)
22,356
(1.48 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
287
(100.00 %)
3,908,607
(31.48 %)
664,931
(5.23 %)
11,892,191
(41.08 %)
1
(0.00 %)
994,645
(2.87 %)
76,453
(2.43 %)
66,568
(1.61 %)
28 Amazon manatee (hap1 2025)
GCA_046562985.1
n/a n/a 17,917
(1.26 %)
20,499
(1.11 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
0
(0 %)
377
(0.00 %)
550
(100.00 %)
5,812,915
(56.93 %)
431,488
(2.57 %)
14,336,638
(47.98 %)
1
(0.00 %)
593,346
(1.52 %)
33,775
(0.84 %)
28,206
(0.66 %)
29 Amazon manatee (hap2 2025)
GCA_046562895.1
n/a 48,414
(2.36 %)
18,949
(1.23 %)
21,655
(1.08 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
294
(0.00 %)
401
(100.00 %)
6,218,266
(57.31 %)
470,437
(3.04 %)
15,241,157
(48.91 %)
1
(0.00 %)
714,873
(1.68 %)
37,124
(0.86 %)
30,784
(0.66 %)
30 American beaver (hap1 2025)
GCA_047511655.1
n/a n/a 19,828
(1.45 %)
20,376
(1.31 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
1
(0.00 %)
181
(0.00 %)
503
(100.00 %)
4,030,880
(35.35 %)
566,770
(2.63 %)
14,198,970
(35.24 %)
9
(0.00 %)
640,099
(2.12 %)
24,454
(0.96 %)
23,257
(0.88 %)
31 American beaver (hap1v2 2025)
GCA_047511655.2
n/a n/a 19,759
(1.46 %)
19,656
(1.23 %)
n/a 39.67
(100.00 %)
0
(0 %)
181
(0.00 %)
182
(100.00 %)
4,077,829
(35.51 %)
563,159
(2.55 %)
14,502,350
(35.45 %)
9
(0.00 %)
635,015
(2.11 %)
23,983
(0.89 %)
22,786
(0.80 %)
32 American beaver (hap2 2025)
GCA_047511605.1
n/a n/a 19,144
(1.44 %)
18,959
(1.23 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
1
(0.00 %)
194
(0.00 %)
229
(100.00 %)
3,981,637
(35.85 %)
561,691
(2.26 %)
14,374,940
(35.03 %)
6
(0.00 %)
576,331
(1.99 %)
23,386
(0.80 %)
22,058
(0.72 %)
33 American beaver (hap2v2 2025)
GCA_047511605.2
n/a n/a 19,115
(1.44 %)
18,756
(1.21 %)
n/a 39.53
(100.00 %)
1
(0.00 %)
194
(0.00 %)
154
(100.00 %)
4,032,632
(35.91 %)
560,508
(2.24 %)
14,349,713
(35.01 %)
6
(0.00 %)
574,426
(1.98 %)
23,225
(0.77 %)
21,898
(0.70 %)
34 American beaver (mCasCan1.hap1v2 2025)
GCF_047511655.1
79,343
(3.55 %)
n/a 19,759
(1.46 %)
19,920
(1.23 %)
n/a 39.67
(100.00 %)
0
(0 %)
181
(0.00 %)
181
(100.00 %)
4,023,733
(35.50 %)
563,158
(2.55 %)
14,502,226
(35.45 %)
9
(0.00 %)
635,015
(2.11 %)
23,983
(0.89 %)
22,786
(0.80 %)
35 American beaver (Ward 2017 refseq)
GCF_001984765.1
40,013
(2.15 %)
n/a 20,867
(1.53 %)
24,201
(1.33 %)
n/a 39.72
(99.99 %)
0
(0 %)
3,321
(0.01 %)
21,157
(100.00 %)
4,526,430
(33.75 %)
486,353
(1.30 %)
14,347,145
(31.96 %)
19
(0.00 %)
463,382
(1.20 %)
23,046
(0.72 %)
22,461
(0.67 %)
36 American bison (2014 refseq)
GCF_000754665.1
38,699
(2.34 %)
n/a 19,782
(1.47 %)
20,444
(1.25 %)
n/a 41.82
(93.12 %)
341,984
(6.92 %)
341,984
(6.92 %)
470,415
(93.08 %)
n/a 419,596
(0.95 %)
13,519,877
(37.66 %)
8,184
(0.08 %)
n/a 60,388
(1.03 %)
36,362
(0.64 %)
37 American black bear (L20-20 2025)
GCA_024610735.2
n/a n/a 18,082
(1.59 %)
20,977
(1.43 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
0
(0 %)
41
(0.00 %)
298
(100.00 %)
4,773,058
(45.96 %)
641,956
(5.91 %)
13,210,521
(35.54 %)
0
(0 %)
996,230
(3.22 %)
68,976
(3.00 %)
52,798
(1.40 %)
38 American black bear (L20-20 alternate hap 2022)
GCA_024610745.1
n/a n/a 22,502
(1.17 %)
43,431
(1.28 %)
n/a 43.14
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 77,311
(100.00 %)
4,587,986
(32.30 %)
773,829
(6.39 %)
14,594,034
(35.67 %)
0
(0 %)
1,078,790
(3.25 %)
78,849
(3.32 %)
57,618
(1.17 %)
39 American black bear (L20-20 primary hap 2022)
GCA_024610735.1
n/a n/a 18,458
(1.52 %)
21,049
(1.43 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
0
(0 %)
22
(0.00 %)
317
(100.00 %)
4,000,508
(32.69 %)
641,903
(5.91 %)
13,210,530
(35.54 %)
0
(0 %)
996,585
(3.22 %)
68,981
(3.00 %)
52,140
(1.23 %)
40 American black bear (UA15103 2021)
GCF_020975775.1
53,916
(3.11 %)
n/a 18,840
(1.73 %)
20,969
(1.50 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,213
(100.00 %)
3,936,528
(34.53 %)
594,864
(2.90 %)
13,725,005
(32.35 %)
0
(0 %)
629,590
(1.78 %)
62,580
(1.91 %)
56,387
(1.69 %)
41 American mink (2018)
GCA_900108605.1
n/a n/a 18,686
(1.70 %)
20,016
(1.50 %)
36,997
(1.74 %)
41.60
(92.95 %)
154,172
(7.07 %)
154,172
(7.07 %)
161,347
(92.93 %)
4,350,343
(38.70 %)
606,128
(1.17 %)
13,605,797
(28.74 %)
2,225
(0.02 %)
334,330
(1.15 %)
54,199
(1.98 %)
53,125
(1.77 %)
42 American mink (hap1 2024)
GCA_964106545.1
n/a n/a 19,203
(1.43 %)
22,174
(1.33 %)
n/a 42.39
(99.98 %)
0
(0 %)
2,957
(0.02 %)
435
(100.00 %)
4,188,829
(30.04 %)
802,295
(5.81 %)
14,041,290
(37.98 %)
19
(0.00 %)
1,190,442
(3.02 %)
65,430
(2.64 %)
54,362
(1.78 %)
43 American mink (hap2 2024)
GCA_964106205.1
n/a n/a 18,890
(1.43 %)
21,684
(1.33 %)
n/a 42.35
(99.98 %)
2,849
(0.02 %)
2,849
(0.02 %)
3,200
(99.98 %)
4,158,563
(30.22 %)
786,430
(5.25 %)
13,845,377
(37.58 %)
10
(0.00 %)
1,137,591
(2.93 %)
64,307
(2.75 %)
53,505
(1.79 %)
44 American mink (M4711 2021 Dalhousie U)
GCF_020171115.1
50,253
(2.26 %)
n/a 18,949
(1.49 %)
20,914
(1.29 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 183
(100.00 %)
4,705,680
(39.15 %)
795,684
(5.50 %)
14,085,357
(37.99 %)
0
(0 %)
1,135,030
(2.90 %)
63,307
(2.38 %)
63,004
(2.19 %)
45 American mink (M4711 2021)
GCA_020171115.1
n/a n/a 18,487
(1.48 %)
20,915
(1.29 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 182
(100.00 %)
5,389,046
(47.85 %)
795,680
(5.50 %)
14,085,303
(37.99 %)
0
(0 %)
1,135,044
(2.90 %)
63,306
(2.38 %)
52,680
(1.84 %)
46 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1
45,008
(1.93 %)
n/a 17,997
(1.35 %)
23,185
(1.49 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
0
(0 %)
432
(0.00 %)
5,864
(100.00 %)
4,126,248
(43.60 %)
628,344
(15.71 %)
11,100,962
(42.69 %)
18
(0.00 %)
1,888,430
(5.34 %)
60,350
(1.67 %)
30,970
(1.18 %)
47 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1
n/a n/a 16,911
(1.23 %)
21,107
(1.43 %)
n/a 44.43
(100.00 %)
6
(0.00 %)
375
(0.00 %)
6,123
(100.00 %)
1,808,768
(10.42 %)
561,106
(21.05 %)
10,283,513
(45.97 %)
16
(0.00 %)
2,348,969
(6.68 %)
54,919
(1.33 %)
26,689
(0.79 %)
48 American pika 3.0 (2012 Broad refseq)
GCF_000292845.1
26,240
(1.93 %)
n/a 17,576
(1.61 %)
20,076
(1.70 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
122,542
(12.82 %)
132,962
(87.18 %)
2,761,257
(29.47 %)
414,896
(1.07 %)
10,968,698
(26.71 %)
1,958
(0.04 %)
269,478
(1.11 %)
44,652
(1.14 %)
26,757
(0.80 %)
49 American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020)
GCF_014633375.1
31,887
(1.92 %)
n/a 17,532
(1.60 %)
19,609
(1.65 %)
n/a 43.35
(87.14 %)
0
(0 %)
124,941
(12.88 %)
9,351
(100.00 %)
2,827,662
(29.77 %)
414,980
(1.07 %)
10,969,165
(26.69 %)
1,976
(0.04 %)
271,948
(1.12 %)
44,743
(1.13 %)
26,798
(0.80 %)
50 American red squirrel (v2 hap1 2026)
GCA_057930835.1
n/a n/a 20,538
(0.79 %)
28,853
(0.92 %)
n/a 39.25
(100.00 %)
0
(0 %)
426
(0.00 %)
489
(100.00 %)
9,215,331
(50.80 %)
1,317,907
(3.34 %)
26,748,417
(47.09 %)
1
(0.00 %)
1,374,869
(1.91 %)
55,960
(0.71 %)
48,366
(0.60 %)
51 American red squirrel (v2 hap2 2026)
GCA_057931055.1
n/a n/a 19,151
(0.81 %)
26,172
(0.93 %)
n/a 39.26
(100.00 %)
0
(0 %)
468
(0.00 %)
426
(100.00 %)
8,342,035
(49.80 %)
1,194,845
(3.33 %)
24,234,438
(46.10 %)
0
(0 %)
1,037,244
(1.61 %)
49,136
(0.69 %)
42,145
(0.57 %)
52 American red squirrel (v3 hap1 2026)
GCA_057657825.1
n/a n/a 22,076
(0.75 %)
28,760
(0.85 %)
n/a 39.63
(100.00 %)
0
(0 %)
191
(0.00 %)
141
(100.00 %)
9,677,339
(48.50 %)
1,456,018
(3.67 %)
23,033,952
(52.86 %)
3
(0.00 %)
1,206,915
(1.62 %)
60,291
(0.74 %)
53,034
(0.58 %)
53 American red squirrel (v3 hap2 2026)
GCA_057657875.1
n/a n/a 20,617
(0.79 %)
28,522
(0.91 %)
n/a 39.48
(100.00 %)
0
(0 %)
194
(0.00 %)
96
(100.00 %)
9,339,714
(48.88 %)
1,335,432
(3.43 %)
25,390,192
(47.00 %)
3
(0.00 %)
1,101,163
(1.57 %)
59,575
(0.75 %)
52,408
(0.65 %)
54 American wolverine (FN33715 2022)
GCA_024509225.1
n/a 9,758
(0.77 %)
18,360
(1.57 %)
20,615
(1.47 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
53
(0.00 %)
53
(0.00 %)
758
(100.00 %)
4,038,995
(32.25 %)
664,825
(1.25 %)
13,625,080
(33.05 %)
0
(0 %)
485,617
(1.31 %)
56,595
(2.13 %)
52,911
(1.70 %)
55 Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq)
GCF_000464555.1
33,681
(2.23 %)
n/a 17,929
(1.49 %)
15,090
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
155,553
(2.44 %)
157,032
(97.56 %)
n/a 831,136
(1.67 %)
13,654,437
(31.78 %)
59
(0.00 %)
289,892
(0.97 %)
65,229
(1.60 %)
56,194
(1.22 %)
56 Angolan free-tailed bat
GCA_043748645.2
n/a n/a 18,321
(1.73 %)
23,033
(1.67 %)
n/a 42.90
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
34
(100.00 %)
4,324,378
(43.44 %)
558,565
(2.08 %)
11,330,414
(35.72 %)
0
(0 %)
670,463
(2.01 %)
103,798
(3.90 %)
94,418
(3.14 %)
57 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024)
GCA_043748645.1
n/a n/a 18,528
(1.65 %)
22,359
(1.64 %)
n/a 42.89
(100.00 %)
6
(0.00 %)
88
(0.00 %)
44
(100.00 %)
3,531,044
(35.70 %)
555,304
(2.07 %)
11,439,853
(36.03 %)
0
(0 %)
663,932
(1.99 %)
102,112
(3.75 %)
92,727
(2.81 %)
58 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa alternate hap 2024)
GCA_043748605.1
n/a n/a 17,996
(1.77 %)
23,084
(1.76 %)
n/a 43.12
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,670
(100.00 %)
4,087,571
(42.52 %)
525,056
(2.00 %)
10,779,134
(34.81 %)
0
(0 %)
577,573
(1.82 %)
100,610
(3.93 %)
91,755
(3.14 %)
59 Angus cow (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2
n/a n/a 19,096
(1.59 %)
20,674
(1.34 %)
n/a 41.99
(99.75 %)
0
(0 %)
277
(0.25 %)
1,435
(100.00 %)
5,290,422
(47.51 %)
478,946
(1.94 %)
12,568,313
(41.15 %)
0
(0 %)
1,196,258
(3.44 %)
45,850
(1.37 %)
36,573
(1.00 %)
60 Antarctic minke whale
GCA_000978805.1
n/a n/a 23,312
(1.49 %)
45,535
(1.26 %)
n/a 40.73
(99.37 %)
299,456
(0.64 %)
299,456
(0.64 %)
720,900
(99.36 %)
4,011,313
(41.13 %)
504,837
(1.04 %)
13,553,641
(30.96 %)
200
(0.00 %)
66,191
(0.20 %)
56,223
(1.31 %)
44,709
(1.10 %)
61 Antillean ghost-faced bat
GCA_004026545.1
n/a n/a 20,088
(1.74 %)
31,558
(1.63 %)
n/a 41.74
(99.97 %)
1,835
(0.01 %)
1,835
(0.01 %)
207,094
(99.99 %)
3,025,044
(30.67 %)
332,606
(0.70 %)
12,504,556
(28.79 %)
7
(0.00 %)
n/a 65,503
(2.30 %)
62,089
(2.01 %)
62 aoudad
GCA_002201775.1
n/a n/a 19,905
(1.62 %)
27,488
(1.60 %)
n/a 42.01
(95.96 %)
186,672
(4.05 %)
186,672
(4.05 %)
263,992
(95.95 %)
5,418,013
(45.05 %)
471,426
(1.19 %)
13,396,252
(36.94 %)
4,983
(0.03 %)
648,031
(1.83 %)
48,844
(1.32 %)
44,082
(1.20 %)
63 Arabian camel (Drom800 2019 refseq)
GCF_000803125.2
64,532
(3.85 %)
n/a 18,483
(1.89 %)
20,554
(1.62 %)
n/a 41.51
(99.22 %)
0
(0 %)
47,342
(0.79 %)
21,070
(100.00 %)
3,233,022
(34.07 %)
345,049
(1.55 %)
13,383,050
(26.19 %)
87
(0.01 %)
348,169
(1.51 %)
58,872
(1.79 %)
54,784
(1.59 %)
64 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1
n/a n/a 17,085
(1.73 %)
19,317
(1.59 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
0
(0 %)
210
(0.00 %)
173
(100.00 %)
2,818,446
(29.44 %)
316,646
(8.90 %)
11,192,133
(31.47 %)
1
(0.00 %)
1,151,809
(3.75 %)
52,135
(1.67 %)
44,943
(1.23 %)
65 Arabian camel (paternal hap 2024 genbank)
GCA_036321535.1
n/a n/a 18,080
(1.66 %)
20,345
(1.52 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
0
(0 %)
195
(0.00 %)
172
(100.00 %)
3,040,473
(29.22 %)
343,482
(10.93 %)
11,797,012
(33.50 %)
2
(0.00 %)
1,611,842
(4.73 %)
55,428
(1.61 %)
47,478
(1.18 %)
66 Arabian camel (paternal hap 2024 refseq)
GCF_036321535.1
62,940
(3.46 %)
n/a 18,078
(1.66 %)
21,071
(1.56 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
0
(0 %)
195
(0.00 %)
171
(100.00 %)
3,040,467
(29.22 %)
343,480
(10.93 %)
11,796,955
(33.50 %)
2
(0.00 %)
1,611,842
(4.73 %)
55,427
(1.61 %)
47,478
(1.18 %)
67 Arctic fox (Blue_001 2021 refseq)
GCF_018345385.1
60,759
(3.11 %)
n/a 19,942
(1.72 %)
19,529
(1.38 %)
n/a 41.27
(100.00 %)
0
(0 %)
529
(0.00 %)
929
(100.00 %)
4,821,229
(41.22 %)
1,006,124
(2.31 %)
13,556,149
(32.92 %)
1
(0.00 %)
686,539
(2.19 %)
49,997
(2.23 %)
50,342
(1.99 %)
68 Arctic ground squirrel (AGS 11-09-20 2018)
GCF_003426925.1
39,569
(2.25 %)
n/a 18,954
(1.74 %)
19,372
(1.45 %)
n/a 39.95
(89.51 %)
0
(0 %)
2,429,461
(10.59 %)
15,883
(100.00 %)
4,400,304
(32.67 %)
672,831
(1.50 %)
13,913,477
(26.41 %)
1,383
(0.11 %)
167,257
(0.60 %)
27,575
(0.72 %)
26,295
(0.67 %)
69 Arctic ground squirrel (hap1 2024)
GCA_045843805.1
n/a n/a 20,255
(1.35 %)
21,401
(1.44 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
0
(0 %)
694
(0.00 %)
2,530
(100.00 %)
4,287,108
(25.85 %)
895,123
(5.96 %)
15,722,314
(36.45 %)
3
(0.00 %)
1,383,542
(4.24 %)
34,781
(0.82 %)
29,107
(0.60 %)
70 Arctic ground squirrel (hap2 2024)
GCA_045843765.1
n/a n/a 18,385
(1.31 %)
19,099
(1.34 %)
n/a 39.97
(100.00 %)
0
(0 %)
590
(0.00 %)
2,307
(100.00 %)
4,314,945
(35.63 %)
820,736
(6.65 %)
14,490,422
(35.95 %)
2
(0.00 %)
1,426,241
(3.70 %)
31,201
(0.78 %)
25,818
(0.56 %)
71 Arctic ground squirrel (mUroPar1hap1 2024)
GCF_045843805.1
45,939
(2.00 %)
n/a 19,773
(1.41 %)
20,880
(1.28 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
0
(0 %)
694
(0.00 %)
2,529
(100.00 %)
5,291,989
(39.61 %)
895,123
(5.96 %)
15,722,212
(36.45 %)
3
(0.00 %)
1,383,542
(4.24 %)
34,781
(0.82 %)
30,632
(0.69 %)
72 Argentine brown bat (hap1 2026)
GCA_054644455.1
n/a n/a 18,052
(1.73 %)
21,405
(1.63 %)
n/a 43.75
(100.00 %)
0
(0 %)
182
(0.00 %)
128
(100.00 %)
5,245,679
(48.66 %)
977,198
(7.30 %)
10,493,417
(40.05 %)
1
(0.00 %)
1,033,812
(3.27 %)
79,568
(3.84 %)
59,300
(2.91 %)
73 Argentine brown bat (hap2 2026)
GCA_054644445.1
n/a n/a 18,052
(1.75 %)
21,190
(1.62 %)
n/a 43.67
(100.00 %)
0
(0 %)
180
(0.00 %)
86
(100.00 %)
5,220,241
(48.57 %)
944,596
(6.38 %)
10,596,184
(39.27 %)
2
(0.00 %)
906,982
(2.90 %)
79,656
(3.86 %)
59,568
(2.86 %)
74 Asian palm civet
GCA_004024585.1
n/a n/a 22,124
(1.43 %)
43,710
(1.39 %)
n/a 42.52
(99.95 %)
4,533
(0.02 %)
4,533
(0.02 %)
442,658
(99.98 %)
4,877,367
(40.32 %)
754,440
(1.35 %)
14,557,779
(32.29 %)
38
(0.00 %)
163,468
(0.41 %)
148,246
(5.67 %)
137,633
(4.25 %)
75 Asiatic brush-tailed porcupine (POm2014 2021)
GCA_016801275.1
n/a n/a 18,688
(1.73 %)
22,642
(1.64 %)
n/a 41.26
(97.24 %)
152,126
(2.77 %)
152,126
(2.77 %)
303,244
(97.23 %)
3,431,580
(28.56 %)
667,375
(2.21 %)
13,572,972
(26.90 %)
218
(0.02 %)
n/a 42,853
(1.30 %)
40,880
(1.19 %)
76 Asiatic elephant (hap1 2025)
GCA_051911825.1
n/a n/a 18,110
(1.16 %)
21,254
(1.07 %)
n/a 41.12
(100.00 %)
2
(0.00 %)
83
(0.00 %)
106
(100.00 %)
8,688,198
(60.75 %)
617,944
(3.48 %)
16,342,943
(48.24 %)
1
(0.00 %)
762,977
(1.75 %)
54,726
(1.19 %)
24,374
(0.57 %)
77 Asiatic elephant (hap2 2025)
GCA_051911805.1
n/a n/a 17,315
(1.21 %)
20,345
(1.11 %)
n/a 41.03
(99.98 %)
0
(0 %)
51
(0.02 %)
88
(100.00 %)
8,066,849
(59.94 %)
495,013
(2.47 %)
15,276,267
(46.85 %)
2
(0.00 %)
563,371
(1.40 %)
44,484
(1.08 %)
22,697
(0.59 %)
78 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1
n/a n/a 17,906
(1.18 %)
21,966
(1.14 %)
n/a 41.14
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,361
(100.00 %)
3,818,524
(29.72 %)
533,426
(3.22 %)
14,381,781
(47.30 %)
0
(0 %)
613,432
(1.61 %)
50,264
(1.15 %)
21,331
(0.51 %)
79 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1
61,202
(2.60 %)
n/a 18,887
(1.13 %)
21,194
(1.06 %)
n/a 41.14
(99.90 %)
0
(0 %)
126
(0.10 %)
64
(100.00 %)
4,358,470
(31.27 %)
663,094
(4.56 %)
16,261,778
(48.66 %)
1
(0.00 %)
851,540
(1.93 %)
69,120
(1.32 %)
23,319
(0.49 %)
80 Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020)
GCA_014523465.1
n/a n/a 19,569
(1.59 %)
21,293
(1.35 %)
n/a 41.97
(99.68 %)
0
(0 %)
257
(0.32 %)
128
(100.00 %)
5,390,761
(47.15 %)
451,837
(1.15 %)
13,157,608
(40.67 %)
0
(0 %)
983,804
(2.72 %)
44,158
(1.19 %)
39,278
(1.06 %)
81 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1
n/a n/a 18,969
(1.75 %)
20,207
(1.36 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
3
(0.00 %)
79
(0.00 %)
262
(100.00 %)
3,650,963
(38.06 %)
355,322
(2.63 %)
14,837,952
(31.37 %)
1
(0.00 %)
267,829
(0.92 %)
37,174
(1.87 %)
37,977
(1.58 %)
82 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1
n/a n/a 18,931
(1.76 %)
19,988
(1.37 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
0
(0 %)
92
(0.00 %)
193
(100.00 %)
3,632,286
(38.21 %)
350,074
(2.22 %)
14,785,531
(30.90 %)
1
(0.00 %)
254,432
(0.91 %)
36,699
(1.70 %)
36,659
(1.49 %)
83 ass (donkey Dezhou 2021)
GCF_016077325.2
84,046
(4.01 %)
n/a 18,838
(1.75 %)
20,239
(1.42 %)
69,689
(3.29 %)
41.42
(99.86 %)
0
(0 %)
1,922
(0.15 %)
50
(100.00 %)
3,840,509
(41.57 %)
319,943
(0.81 %)
14,889,114
(29.46 %)
1
(0.00 %)
180,097
(0.75 %)
41,082
(1.37 %)
38,212
(1.20 %)
84 ass (donkey Dezhou DZ240498 2026)
GCA_054375355.1
n/a n/a 18,466
(1.53 %)
21,452
(1.35 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 32
(100.00 %)
4,884,564
(46.47 %)
681,289
(5.26 %)
14,410,624
(36.71 %)
0
(0 %)
438,956
(1.37 %)
42,583
(2.97 %)
38,264
(1.11 %)
85 ass (donkey D_3611 2024)
GCF_041296235.1
92,510
(3.84 %)
n/a 18,566
(1.54 %)
21,504
(1.32 %)
n/a 42.37
(99.94 %)
0
(0 %)
7
(0.06 %)
849
(100.00 %)
3,555,052
(38.38 %)
658,645
(5.79 %)
14,242,715
(36.79 %)
1
(0.01 %)
489,643
(1.48 %)
43,875
(3.45 %)
39,831
(2.77 %)
86 ass (donkey Maral har 2015 refseq)
GCF_001305755.1
48,976
(3.12 %)
n/a 18,838
(1.78 %)
19,295
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
0
(0 %)
69,593
(1.38 %)
2,167
(100.00 %)
3,731,432
(40.84 %)
289,737
(0.96 %)
14,695,308
(28.58 %)
5,680
(0.23 %)
136,343
(0.85 %)
40,025
(1.06 %)
36,660
(0.92 %)
87 Atlantic white-sided dolphin (hap1.1 2024)
GCF_964270905.1
34,820
(1.84 %)
n/a 18,692
(1.56 %)
21,070
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,034
(0.01 %)
1,034
(0.01 %)
1,932
(99.99 %)
4,918,851
(54.26 %)
1,054,000
(10.27 %)
12,280,671
(41.92 %)
6
(0.00 %)
2,009,438
(5.51 %)
79,762
(4.08 %)
41,302
(1.17 %)
88 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024)
GCA_964270905.1
n/a n/a 18,773
(1.50 %)
21,069
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1
(0.00 %)
1,034
(0.01 %)
900
(100.00 %)
3,975,427
(35.64 %)
1,054,000
(10.27 %)
12,281,095
(41.92 %)
6
(0.00 %)
2,009,438
(5.51 %)
79,762
(4.08 %)
42,028
(1.04 %)
89 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024)
GCA_964270935.1
n/a n/a 17,961
(1.59 %)
20,087
(1.36 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
917
(0.01 %)
917
(0.01 %)
1,796
(99.99 %)
3,626,392
(35.51 %)
824,778
(7.32 %)
11,499,904
(39.18 %)
3
(0.00 %)
1,314,679
(4.17 %)
74,348
(3.46 %)
40,100
(1.09 %)
90 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1
n/a n/a 13,505
(1.03 %)
18,978
(1.47 %)
n/a 45.32
(99.98 %)
0
(0 %)
26
(0.02 %)
3,482
(100.00 %)
6,880,857
(41.88 %)
1,099,932
(7.47 %)
8,156,735
(56.68 %)
0
(0 %)
4,129,545
(10.90 %)
70,515
(2.88 %)
41,464
(1.12 %)
91 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
n/a 14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
0
(0 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
1
(0.00 %)
4,597,115
(10.42 %)
78,364
(2.73 %)
45,620
(1.05 %)
92 Australian echidna (primary hap 2020)
GCA_015852505.1
n/a n/a 14,558
(1.03 %)
19,716
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
0
(0 %)
524
(1.39 %)
311
(100.00 %)
11,576,251
(65.36 %)
1,219,765
(6.93 %)
9,488,197
(55.68 %)
1
(0.00 %)
4,597,255
(10.42 %)
78,365
(2.74 %)
53,424
(1.53 %)
93 Bactrian camel (Alxa 2014 refseq)
GCF_000767855.1
52,191
(3.64 %)
n/a 18,303
(1.98 %)
17,097
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
31,980
(0.69 %)
67,435
(99.31 %)
2,966,704
(34.06 %)
306,997
(0.95 %)
12,209,949
(25.43 %)
58
(0.01 %)
73,573
(0.41 %)
49,790
(1.25 %)
45,376
(1.09 %)
94 Bactrian camel YW-2024 2025
GCF_048773025.1
76,927
(4.47 %)
n/a 18,239
(1.57 %)
22,111
(1.51 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
0
(0 %)
127
(0.00 %)
158
(100.00 %)
3,258,307
(30.21 %)
377,352
(13.70 %)
11,533,205
(36.22 %)
1
(0.00 %)
1,968,776
(5.41 %)
65,887
(1.95 %)
48,815
(1.13 %)
95 banded mongoose
GCA_004023785.1
n/a n/a 21,568
(1.57 %)
30,427
(1.43 %)
n/a 42.00
(99.96 %)
4,510
(0.02 %)
4,510
(0.02 %)
316,874
(99.98 %)
4,768,524
(40.51 %)
684,187
(1.30 %)
13,713,756
(33.42 %)
6
(0.00 %)
227,084
(0.54 %)
78,648
(2.80 %)
76,038
(2.38 %)
96 bank vole
GCF_902806735.1
56,423
(2.99 %)
n/a 18,977
(1.71 %)
18,408
(1.50 %)
n/a 41.86
(98.62 %)
53,506
(1.39 %)
53,506
(1.39 %)
54,142
(98.61 %)
3,222,366
(21.59 %)
933,697
(2.20 %)
12,831,232
(31.50 %)
4,497
(0.04 %)
287,292
(0.90 %)
18,784
(0.42 %)
16,451
(0.36 %)
97 Bank vole (2345 2026)
GCF_055000105.1
61,430
(3.61 %)
n/a 18,641
(1.83 %)
18,703
(1.51 %)
n/a 41.82
(99.31 %)
0
(0 %)
169,690
(0.72 %)
29
(100.00 %)
4,407,241
(38.94 %)
862,256
(2.01 %)
13,050,067
(29.53 %)
1,562
(0.02 %)
242,912
(0.72 %)
17,023
(0.50 %)
16,286
(0.47 %)
98 Bank vole (alternate hap 2026)
GCA_982192455.1
n/a n/a 19,256
(1.62 %)
21,366
(1.49 %)
n/a 41.90
(99.96 %)
11,276
(0.04 %)
11,276
(0.04 %)
13,377
(99.96 %)
4,826,217
(40.86 %)
1,054,486
(5.70 %)
13,388,267
(35.53 %)
430
(0.02 %)
921,030
(6.35 %)
21,460
(0.81 %)
19,744
(0.62 %)
99 Bank vole (primary hap 2026)
GCA_982192425.1
n/a n/a 19,486
(1.64 %)
20,748
(1.44 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
0
(0 %)
282
(0.00 %)
189
(100.00 %)
4,753,576
(39.91 %)
1,023,408
(7.51 %)
13,554,153
(36.18 %)
6
(0.00 %)
997,654
(2.81 %)
20,512
(0.55 %)
18,705
(0.48 %)
100 banner-tailed kangaroo rat
GCF_019054845.1
43,753
(1.82 %)
n/a 18,397
(1.18 %)
24,180
(1.39 %)
n/a 40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,026
(100.00 %)
5,587,719
(30.97 %)
1,363,513
(3.95 %)
12,128,920
(48.74 %)
0
(0 %)
1,518,982
(3.07 %)
36,371
(1.27 %)
31,849
(0.74 %)
101 banteng 2023
GCF_032452875.1
71,974
(3.56 %)
n/a 19,305
(1.36 %)
21,174
(1.20 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
1,518
(100.00 %)
3,344,481
(20.63 %)
1,039,571
(11.74 %)
13,031,356
(47.36 %)
1
(0.00 %)
2,790,223
(5.90 %)
73,031
(1.72 %)
36,726
(0.78 %)
102 bat A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1
n/a n/a 17,124
(1.63 %)
18,342
(1.54 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
56
(0.00 %)
187
(100.00 %)
2,597,378
(26.81 %)
332,733
(4.43 %)
10,957,327
(33.52 %)
2
(0.00 %)
406,013
(1.59 %)
63,688
(2.22 %)
49,331
(1.50 %)
103 bat C.sowelli (hap1 2025)
GCA_051307085.1
n/a n/a 18,014
(1.42 %)
20,809
(1.93 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
68
(0.00 %)
509
(100.00 %)
3,004,656
(32.84 %)
845,572
(16.12 %)
11,658,155
(41.10 %)
0
(0 %)
1,743,333
(4.38 %)
66,315
(3.59 %)
61,977
(2.14 %)
104 bat C.sowelli (hap2 2025)
GCA_051307135.1
n/a n/a 17,963
(1.56 %)
20,587
(1.76 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
0
(0 %)
58
(0.00 %)
272
(100.00 %)
2,925,013
(29.51 %)
669,006
(8.09 %)
11,656,071
(35.51 %)
0
(0 %)
753,150
(2.30 %)
66,056
(3.20 %)
62,169
(2.33 %)
105 bat G.keenani (hap1 2025)
GCA_050655435.1
n/a n/a 17,710
(1.68 %)
20,322
(1.57 %)
n/a 42.06
(100.00 %)
0
(0 %)
103
(0.00 %)
188
(100.00 %)
3,982,570
(44.25 %)
413,159
(3.00 %)
12,157,326
(33.66 %)
2
(0.00 %)
306,689
(1.15 %)
69,493
(3.54 %)
64,857
(3.47 %)
106 bat G.keenani (hap2 2025)
GCA_050655445.1
n/a n/a 17,129
(1.75 %)
19,351
(1.61 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
57
(0.00 %)
83
(100.00 %)
3,507,996
(42.55 %)
382,739
(1.78 %)
11,541,032
(32.12 %)
2
(0.00 %)
226,699
(0.91 %)
67,214
(3.68 %)
63,019
(3.69 %)
107 bat H.larvatus (alternate hap 2023)
GCA_031878685.1
n/a n/a 19,431
(1.77 %)
23,767
(1.57 %)
n/a 41.38
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
7,531
(100.00 %)
4,390,631
(44.16 %)
678,913
(4.61 %)
11,883,673
(33.41 %)
0
(0 %)
776,574
(2.63 %)
41,004
(1.20 %)
30,308
(0.96 %)
108 bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024)
GCA_043727955.1
n/a n/a 19,354
(1.74 %)
21,367
(1.51 %)
n/a 41.48
(100.00 %)
15
(0.00 %)
190
(0.00 %)
265
(100.00 %)
3,860,506
(38.95 %)
722,335
(7.13 %)
11,994,816
(35.77 %)
1
(0.00 %)
1,149,103
(3.65 %)
44,562
(1.21 %)
35,219
(1.01 %)
109 bat M.microtis (hap1 2025)
GCA_051107205.1
n/a n/a 18,403
(1.68 %)
20,606
(1.62 %)
n/a 42.65
(100.00 %)
0
(0 %)
68
(0.00 %)
190
(100.00 %)
3,101,865
(28.94 %)
356,434
(1.13 %)
11,717,214
(32.98 %)
0
(0 %)
342,547
(1.24 %)
78,560
(2.78 %)
59,662
(1.89 %)
110 bat M.microtis (hap2 2025)
GCA_051107335.1
n/a n/a 17,634
(1.72 %)
19,795
(1.66 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
0
(0 %)
64
(0.00 %)
158
(100.00 %)
2,904,392
(28.42 %)
330,754
(1.09 %)
11,070,209
(31.88 %)
0
(0 %)
283,709
(1.10 %)
74,480
(2.76 %)
57,743
(1.93 %)
111 beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020)
GCA_009917745.1
n/a n/a 19,239
(1.79 %)
22,513
(1.43 %)
35,878
(1.82 %)
41.25
(97.57 %)
26,969
(2.43 %)
27,070
(2.43 %)
52,780
(97.57 %)
4,021,599
(43.53 %)
544,323
(1.08 %)
12,738,162
(33.47 %)
1,426
(0.06 %)
346,086
(1.08 %)
59,710
(1.51 %)
43,139
(1.22 %)
112 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019)
GCF_002288925.2
59,413
(3.09 %)
n/a 18,667
(1.79 %)
20,314
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.49 %)
23,539
(1.52 %)
24,414
(1.52 %)
29,444
(98.48 %)
4,001,248
(43.73 %)
543,276
(1.11 %)
12,802,735
(34.18 %)
583
(0.02 %)
388,902
(1.70 %)
59,307
(1.53 %)
42,900
(1.24 %)
113 big brown bat (BU_THK_EF1 2012)
GCF_000308155.1
59,162
(3.17 %)
n/a 18,334
(1.94 %)
20,121
(1.78 %)
n/a 42.93
(89.41 %)
160,269
(10.62 %)
160,269
(10.62 %)
167,057
(89.38 %)
2,842,065
(25.82 %)
614,712
(1.89 %)
10,407,733
(28.90 %)
1,641
(0.04 %)
222,087
(1.20 %)
66,720
(2.99 %)
60,637
(2.11 %)
114 big brown bat (TK198812 2023 genbank)
GCA_027574615.1
n/a n/a 18,420
(1.89 %)
21,275
(1.72 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
49
(100.00 %)
4,895,568
(45.28 %)
904,082
(3.80 %)
10,530,742
(37.05 %)
0
(0 %)
647,994
(2.05 %)
77,606
(3.68 %)
60,841
(2.88 %)
115 big brown bat (TK198812 2023 refseq)
GCF_027574615.1
46,266
(2.61 %)
n/a 18,620
(1.80 %)
21,271
(1.72 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
48
(100.00 %)
3,041,145
(25.08 %)
904,075
(3.80 %)
10,530,666
(37.05 %)
0
(0 %)
647,994
(2.05 %)
77,605
(3.68 %)
62,105
(2.31 %)
116 bighorn sheep (Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCA_042477335.2
n/a n/a 19,021
(1.39 %)
21,154
(1.33 %)
n/a 43.91
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
41
(100.00 %)
5,490,141
(54.04 %)
826,352
(11.67 %)
12,918,667
(46.86 %)
0
(0 %)
1,582,127
(3.98 %)
52,254
(10.67 %)
39,426
(1.80 %)
117 bighorn sheep (BS48 2019)
GCA_004026945.1
n/a n/a 23,059
(1.34 %)
36,486
(1.19 %)
n/a 43.20
(99.90 %)
9,412
(0.03 %)
9,412
(0.03 %)
1,057,548
(99.97 %)
6,321,577
(50.75 %)
716,846
(1.66 %)
13,904,326
(44.98 %)
63
(0.00 %)
n/a 95,564
(1.72 %)
50,916
(1.03 %)
118 bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.2
78,636
(2.63 %)
n/a 19,459
(1.36 %)
21,150
(1.33 %)
n/a 43.91
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
42
(100.00 %)
3,963,383
(22.89 %)
826,353
(11.67 %)
12,918,743
(46.86 %)
0
(0 %)
2,225,863
(5.63 %)
52,254
(10.67 %)
39,631
(0.85 %)
119 bilby (mMagLag1 2024 genbank)
GCA_037893015.1
n/a n/a 18,686
(0.72 %)
17,238
(0.81 %)
n/a 37.35
(99.66 %)
0
(0 %)
4,431
(0.34 %)
609
(100.00 %)
6,263,094
(27.34 %)
2,223,995
(5.89 %)
23,994,844
(43.69 %)
70
(0.01 %)
1,521,039
(3.02 %)
51,039
(3.47 %)
15,234
(0.24 %)
120 bilby (mMagLag1 2024 refseq)
GCF_037893015.1
60,460
(3.10 %)
n/a 18,687
(0.72 %)
17,229
(0.81 %)
n/a 37.35
(99.66 %)
0
(0 %)
4,431
(0.34 %)
608
(100.00 %)
6,299,949
(27.49 %)
2,223,987
(5.89 %)
23,992,536
(43.69 %)
70
(0.01 %)
1,330,409
(2.60 %)
51,039
(3.47 %)
15,234
(0.24 %)
121 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024)
GCA_043290085.1
n/a n/a 20,713
(0.64 %)
21,469
(0.64 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
1
(0.00 %)
770
(0.00 %)
470
(100.00 %)
3,860,121
(14.52 %)
1,230,113
(2.81 %)
21,600,460
(65.53 %)
7
(0.00 %)
n/a 49,878
(0.73 %)
48,556
(0.69 %)
122 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024)
GCA_043290065.1
n/a n/a 19,814
(0.63 %)
20,140
(0.63 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
1
(0.00 %)
723
(0.00 %)
315
(100.00 %)
3,657,357
(14.24 %)
1,158,716
(2.84 %)
22,924,986
(64.53 %)
6
(0.00 %)
n/a 46,774
(0.90 %)
21,729
(0.30 %)
123 black flying fox
GCF_000325575.1
46,991
(3.15 %)
n/a 18,089
(2.00 %)
20,668
(1.75 %)
n/a 39.74
(97.93 %)
104,566
(2.08 %)
104,566
(2.08 %)
170,164
(97.92 %)
2,975,186
(34.05 %)
481,859
(1.45 %)
12,582,349
(26.52 %)
97
(0.01 %)
114,693
(0.91 %)
62,483
(3.88 %)
64,215
(2.93 %)
124 black rat
GCF_011064425.1
39,601
(2.37 %)
n/a 20,793
(1.98 %)
17,944
(1.37 %)
n/a 42.14
(99.98 %)
0
(0 %)
6,158
(0.02 %)
2,173
(100.00 %)
4,715,157
(41.57 %)
1,432,294
(3.45 %)
13,275,550
(32.36 %)
20
(0.00 %)
625,923
(1.66 %)
18,055
(0.48 %)
16,181
(0.43 %)
125 black rhinoceros (alternate hap 2021)
GCA_020826835.1
n/a n/a 19,000
(1.37 %)
22,547
(1.26 %)
n/a 41.56
(99.97 %)
0
(0 %)
178
(0.03 %)
1,199
(100.00 %)
4,340,245
(37.22 %)
564,468
(8.07 %)
14,384,523
(40.40 %)
0
(0 %)
941,914
(2.51 %)
44,971
(1.16 %)
34,023
(0.74 %)
126 black rhinoceros (BS38 2019 Broad)
GCA_004027315.1
n/a n/a 21,713
(1.32 %)
32,731
(1.18 %)
n/a 41.22
(99.85 %)
7,256
(0.02 %)
7,256
(0.02 %)
2,029,914
(99.98 %)
4,618,655
(36.76 %)
618,834
(2.21 %)
16,248,532
(40.32 %)
32
(0.00 %)
n/a 44,113
(0.97 %)
35,130
(0.72 %)
127 black rhinoceros (primary hap 2021 refseq)
GCF_020826845.1
56,268
(2.28 %)
n/a 18,774
(1.38 %)
22,348
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
0
(0 %)
215
(0.05 %)
1,076
(100.00 %)
4,200,390
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,693
(40.14 %)
2
(0.00 %)
984,722
(2.61 %)
43,525
(1.14 %)
33,963
(0.76 %)
128 black-footed cat
GCA_004023925.1
n/a n/a 22,895
(1.14 %)
51,789
(1.13 %)
n/a 41.92
(99.90 %)
13,476
(0.06 %)
13,476
(0.06 %)
603,600
(99.94 %)
5,261,265
(44.11 %)
943,514
(1.77 %)
13,681,435
(34.77 %)
43
(0.00 %)
262,081
(0.70 %)
86,892
(2.23 %)
62,055
(1.65 %)
129 black-footed ferret (SB6536 2022)
GCF_022355385.1
56,415
(2.78 %)
n/a 18,681
(1.55 %)
20,685
(1.40 %)
n/a 41.55
(96.71 %)
0
(0 %)
33,042
(3.30 %)
20,575
(100.00 %)
4,087,717
(30.94 %)
695,805
(1.18 %)
13,880,116
(32.08 %)
890
(0.03 %)
471,613
(1.24 %)
54,060
(2.11 %)
51,472
(1.69 %)
130 Black-footed pygmy rice rat (hap1 2026)
GCA_057876635.1
n/a n/a 18,406
(1.50 %)
19,794
(1.40 %)
n/a 40.25
(100.00 %)
0
(0 %)
310
(0.00 %)
130
(100.00 %)
3,808,746
(29.86 %)
1,161,779
(5.60 %)
13,927,799
(34.51 %)
6
(0.00 %)
1,019,146
(2.65 %)
20,238
(0.63 %)
15,778
(0.37 %)
131 Black-footed pygmy rice rat (hap2 2026)
GCA_057876665.1
n/a n/a 18,294
(1.57 %)
19,184
(1.44 %)
n/a 40.44
(100.00 %)
0
(0 %)
279
(0.00 %)
95
(100.00 %)
3,674,443
(30.08 %)
1,059,812
(5.20 %)
14,027,360
(32.36 %)
4
(0.00 %)
873,114
(2.35 %)
18,895
(0.59 %)
15,501
(0.39 %)
132 black-lipped pika
GCF_017591425.1
46,297
(2.64 %)
n/a 18,529
(1.63 %)
23,458
(1.83 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
0
(0 %)
54
(0.00 %)
2,214
(100.00 %)
1,843,705
(12.62 %)
471,798
(2.76 %)
11,394,992
(31.27 %)
0
(0 %)
530,175
(1.74 %)
63,124
(1.85 %)
31,410
(1.04 %)
133 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1
n/a n/a 17,838
(1.54 %)
21,389
(1.35 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,198
(100.00 %)
3,542,727
(35.35 %)
650,369
(8.86 %)
10,971,320
(41.15 %)
0
(0 %)
1,286,122
(4.20 %)
62,389
(1.68 %)
34,595
(0.95 %)
134 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1
47,553
(2.07 %)
n/a 19,041
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
0
(0 %)
97
(0.03 %)
74
(100.00 %)
3,964,038
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,229
(41.78 %)
1
(0.00 %)
1,795,618
(5.01 %)
70,851
(1.80 %)
37,949
(0.93 %)
135 Blasius's horseshoe bat (hap1 2026)
GCA_057428245.1
n/a n/a 18,361
(1.90 %)
20,645
(1.66 %)
n/a 40.57
(100.00 %)
0
(0 %)
106
(0.00 %)
197
(100.00 %)
3,589,565
(40.46 %)
551,655
(1.43 %)
12,136,235
(30.17 %)
1
(0.00 %)
232,541
(1.09 %)
34,854
(1.10 %)
30,020
(0.97 %)
136 blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019)
GCA_008658375.1
n/a n/a 17,285
(1.80 %)
21,295
(1.43 %)
n/a 41.22
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 12,574
(100.00 %)
3,196,354
(43.47 %)
467,194
(1.26 %)
10,176,588
(33.66 %)
0
(0 %)
306,308
(1.20 %)
56,916
(1.85 %)
39,871
(1.51 %)
137 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 primary hap 2020)
GCA_009873245.3
n/a n/a 19,151
(1.81 %)
20,574
(1.41 %)
n/a 40.88
(98.91 %)
0
(0 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,871
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,081
(34.60 %)
4
(0.00 %)
422,171
(1.33 %)
67,032
(1.73 %)
46,602
(1.41 %)
138 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2
n/a n/a 16,997
(1.82 %)
20,609
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
10,999
(100.00 %)
3,126,800
(43.49 %)
454,452
(1.23 %)
9,916,868
(33.63 %)
0
(0 %)
296,938
(1.19 %)
55,436
(1.85 %)
38,786
(1.50 %)
139 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2
58,737
(2.71 %)
n/a 19,162
(1.80 %)
20,576
(1.41 %)
36,291
(1.99 %)
40.88
(98.91 %)
0
(0 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,870
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,384
(34.60 %)
4
(0.00 %)
422,171
(1.33 %)
67,032
(1.73 %)
46,602
(1.41 %)
140 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022)
GCA_022079275.1
n/a n/a 24,877
(1.23 %)
48,382
(1.39 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
4,716
(0.01 %)
4,716
(0.01 %)
72,827
(99.99 %)
6,403,412
(33.31 %)
1,269,531
(1.94 %)
17,771,689
(33.82 %)
79
(0.00 %)
706,367
(3.07 %)
100,915
(3.00 %)
90,223
(2.05 %)
141 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022)
GCF_022079265.1
45,417
(2.39 %)
n/a 18,576
(1.65 %)
20,510
(1.41 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
0
(0 %)
24
(0.00 %)
75
(100.00 %)
4,970,082
(43.28 %)
894,002
(1.80 %)
13,648,384
(34.21 %)
0
(0 %)
602,631
(1.69 %)
69,211
(2.68 %)
63,384
(2.18 %)
142 boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023)
GCA_019903745.2
n/a n/a 20,135
(1.60 %)
22,598
(1.47 %)
n/a 41.46
(96.98 %)
0
(0 %)
34,682
(3.03 %)
12,266
(100.00 %)
3,134,107
(24.41 %)
394,920
(0.92 %)
13,154,929
(36.43 %)
3,241
(0.04 %)
471,129
(1.38 %)
48,826
(1.07 %)
42,368
(0.88 %)
143 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022)
GCA_024803775.1
n/a n/a 18,647
(0.96 %)
23,998
(1.13 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
0
(0 %)
124
(0.00 %)
3,340
(100.00 %)
3,775,862
(22.40 %)
1,257,803
(21.71 %)
9,347,543
(61.85 %)
0
(0 %)
9,701,648
(16.46 %)
33,757
(1.35 %)
24,065
(0.48 %)
144 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1
n/a n/a 17,791
(1.12 %)
22,667
(1.29 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
106
(0.00 %)
106
(0.00 %)
2,898
(100.00 %)
6,293,452
(41.30 %)
1,076,688
(17.94 %)
8,553,272
(57.13 %)
1
(0.00 %)
6,983,927
(14.02 %)
31,102
(1.31 %)
23,419
(0.57 %)
145 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1
n/a n/a 18,247
(1.61 %)
22,673
(1.83 %)
n/a 41.12
(99.99 %)
205
(0.00 %)
775
(0.01 %)
835
(100.00 %)
2,918,285
(18.64 %)
868,090
(5.77 %)
9,427,604
(40.78 %)
2
(0.00 %)
1,601,923
(4.79 %)
27,049
(1.25 %)
22,545
(0.76 %)
146 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1
n/a n/a 17,612
(1.68 %)
22,099
(1.91 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
25
(0.00 %)
541
(0.01 %)
365
(100.00 %)
2,748,918
(17.16 %)
827,542
(4.51 %)
8,832,809
(39.20 %)
2
(0.00 %)
1,074,853
(3.77 %)
26,416
(1.35 %)
22,242
(0.81 %)
147 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1
n/a n/a 18,667
(1.46 %)
20,817
(1.26 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
284
(0.00 %)
903
(100.00 %)
4,004,895
(35.23 %)
925,158
(12.15 %)
11,999,784
(42.65 %)
3
(0.00 %)
1,841,091
(5.04 %)
63,428
(1.55 %)
38,329
(0.93 %)
148 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1
n/a n/a 17,954
(1.51 %)
19,994
(1.30 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
0
(0 %)
240
(0.00 %)
800
(100.00 %)
3,723,164
(34.96 %)
809,880
(11.02 %)
11,359,211
(41.42 %)
2
(0.00 %)
1,554,419
(4.60 %)
60,067
(1.55 %)
36,564
(0.95 %)
149 Brahman cow (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1
63,234
(2.88 %)
n/a 19,601
(1.57 %)
21,699
(1.34 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
0
(0 %)
302
(0.06 %)
1,250
(100.00 %)
5,524,454
(47.57 %)
459,928
(1.40 %)
13,208,799
(41.21 %)
0
(0 %)
1,222,662
(3.37 %)
41,359
(1.10 %)
37,367
(0.98 %)
150 Brandt's bat
GCF_000412655.1
46,912
(2.84 %)
n/a 19,267
(1.75 %)
18,495
(1.62 %)
n/a 42.59
(94.06 %)
155,664
(5.95 %)
155,664
(5.95 %)
325,414
(94.05 %)
2,897,662
(25.08 %)
634,208
(3.20 %)
11,323,618
(31.06 %)
356
(0.04 %)
n/a 66,749
(1.59 %)
51,826
(1.12 %)
151 Brazilian free-tailed bat (alternate hap 2023)
GCA_030848815.1
n/a n/a 18,921
(1.72 %)
22,946
(1.65 %)
n/a 42.50
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,728
(100.00 %)
4,021,020
(40.28 %)
637,136
(3.60 %)
11,382,826
(36.28 %)
0
(0 %)
630,202
(2.22 %)
70,547
(2.64 %)
65,739
(2.10 %)
152 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1
n/a n/a 19,039
(1.66 %)
21,660
(1.59 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
20
(0.00 %)
148
(100.00 %)
3,805,818
(31.80 %)
640,446
(2.50 %)
11,793,353
(36.15 %)
1
(0.00 %)
609,574
(1.94 %)
68,896
(2.40 %)
57,812
(1.49 %)
153 Brazilian guinea pig
GCA_000688575.1
n/a n/a 16,531
(1.49 %)
11,177
(1.44 %)
n/a 39.81
(64.76 %)
0
(0 %)
2,565,595
(35.61 %)
3,131
(100.00 %)
2,529,479
(25.87 %)
342,907
(0.66 %)
10,719,517
(21.05 %)
551
(0.01 %)
218,010
(0.72 %)
19,508
(0.31 %)
9,721
(0.14 %)
154 Brazilian tapir
GCA_004025025.1
n/a n/a 21,581
(1.61 %)
30,818
(1.32 %)
n/a 41.12
(99.93 %)
2,273
(0.01 %)
2,273
(0.01 %)
805,779
(99.99 %)
3,877,938
(38.36 %)
344,032
(0.79 %)
15,601,710
(32.81 %)
14
(0.00 %)
n/a 43,382
(1.17 %)
39,596
(1.04 %)
155 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018)
GCF_003584765.2
50,229
(2.92 %)
n/a 18,811
(1.77 %)
21,073
(1.52 %)
n/a 41.84
(99.31 %)
15,552
(0.70 %)
17,380
(0.70 %)
21,813
(99.30 %)
4,201,043
(40.86 %)
567,586
(1.23 %)
13,807,211
(30.86 %)
760
(0.01 %)
325,785
(0.96 %)
62,125
(1.80 %)
56,227
(1.57 %)
156 brown bear (v2.0 North America Adak 2023)
GCF_023065955.2
66,371
(4.20 %)
n/a 18,615
(1.68 %)
21,434
(1.53 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
250
(0.00 %)
362
(100.00 %)
4,030,019
(33.22 %)
630,008
(4.17 %)
13,240,060
(32.92 %)
1
(0.00 %)
668,459
(2.28 %)
64,814
(2.05 %)
58,450
(1.77 %)
157 brown big-eared bat (alternate hap 2023)
GCA_963455325.1
n/a n/a 18,932
(1.77 %)
23,324
(1.64 %)
n/a 43.04
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,570
(100.00 %)
4,970,484
(48.00 %)
928,854
(4.06 %)
10,332,383
(39.35 %)
0
(0 %)
794,551
(2.62 %)
59,133
(2.45 %)
49,887
(1.93 %)
158 brown big-eared bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_963455305.1
n/a n/a 19,138
(1.72 %)
20,370
(1.54 %)
n/a 43.08
(99.99 %)
0
(0 %)
1,237
(0.01 %)
65
(100.00 %)
3,201,470
(26.24 %)
957,903
(4.27 %)
10,687,995
(39.65 %)
8
(0.00 %)
881,577
(2.81 %)
60,671
(2.39 %)
52,889
(1.71 %)
159 brown big-eared bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963455305.1
51,465
(2.81 %)
n/a 18,957
(1.79 %)
20,368
(1.54 %)
n/a 43.08
(99.99 %)
0
(0 %)
1,237
(0.01 %)
64
(100.00 %)
5,119,261
(48.27 %)
957,900
(4.27 %)
10,687,449
(39.65 %)
8
(0.00 %)
881,575
(2.81 %)
60,670
(2.39 %)
51,182
(1.93 %)
160 brown-throated sloth
GCA_004027775.1
n/a n/a 17,043
(1.21 %)
37,090
(1.36 %)
n/a 42.76
(99.76 %)
462
(0.00 %)
462
(0.00 %)
1,772,267
(100.00 %)
2,487,215
(36.18 %)
316,812
(1.60 %)
7,948,666
(37.96 %)
5
(0.00 %)
n/a 62,325
(2.36 %)
46,228
(1.74 %)
161 bush duiker (CMD-5126 2019)
GCA_006408735.1
n/a n/a 21,234
(1.49 %)
24,405
(1.37 %)
n/a 42.55
(81.82 %)
787,889
(18.24 %)
787,889
(18.24 %)
810,213
(81.76 %)
5,743,783
(45.60 %)
588,471
(5.37 %)
13,114,146
(31.74 %)
101,748
(1.69 %)
1,339,519
(11.29 %)
52,826
(1.05 %)
46,468
(0.91 %)
162 cactus mouse (2023)
GCF_949786415.1
47,537
(2.02 %)
n/a 18,894
(1.46 %)
20,159
(1.22 %)
n/a 42.40
(99.98 %)
0
(0 %)
2,603
(0.02 %)
4,297
(100.00 %)
7,181,232
(52.75 %)
1,247,378
(18.35 %)
13,329,318
(43.03 %)
32
(0.00 %)
4,621,934
(9.77 %)
19,540
(0.49 %)
17,819
(0.43 %)
163 California mouse (IS 2022)
GCF_007827085.1
62,273
(3.80 %)
n/a 18,959
(1.75 %)
19,378
(1.41 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
0
(0 %)
547
(0.00 %)
237
(100.00 %)
5,970,582
(45.08 %)
1,165,743
(3.67 %)
13,734,349
(33.67 %)
4
(0.00 %)
738,622
(2.20 %)
19,529
(0.58 %)
17,949
(0.52 %)
164 California sea lion (alternate hap 2019)
GCA_009762295.1
n/a n/a 18,348
(1.81 %)
18,692
(1.47 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,093
(100.00 %)
3,722,619
(42.89 %)
488,086
(1.26 %)
10,893,132
(33.14 %)
0
(0 %)
393,471
(1.40 %)
44,449
(1.57 %)
41,300
(1.38 %)
165 California sea lion (LMU 2018 refseq)
GCF_900631625.1
69,240
(2.99 %)
n/a 20,741
(1.78 %)
20,298
(1.40 %)
n/a 41.38
(99.81 %)
0
(0 %)
47,716
(0.20 %)
10,423
(100.00 %)
4,530,259
(43.28 %)
573,086
(1.12 %)
13,442,336
(33.58 %)
9,701
(0.17 %)
414,311
(1.26 %)
50,583
(1.46 %)
46,836
(1.28 %)
166 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2
n/a n/a 18,319
(1.81 %)
18,772
(1.48 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,096
(100.00 %)
3,724,021
(42.91 %)
488,356
(1.26 %)
10,891,276
(33.15 %)
0
(0 %)
395,508
(1.40 %)
44,467
(1.57 %)
41,289
(1.38 %)
167 California sea lion (primary hap 2020)
GCA_009762305.2
n/a n/a 20,939
(1.78 %)
20,184
(1.40 %)
n/a 41.40
(99.23 %)
0
(0 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,530,531
(43.69 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,573
(33.76 %)
2
(0.00 %)
495,451
(1.44 %)
51,899
(1.50 %)
48,196
(1.32 %)
168 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2
70,801
(3.05 %)
n/a 20,915
(1.77 %)
20,179
(1.40 %)
44,926
(2.10 %)
41.40
(99.23 %)
0
(0 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,525,652
(43.65 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,648
(33.76 %)
2
(0.00 %)
495,451
(1.44 %)
51,899
(1.50 %)
48,201
(1.32 %)
169 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023)
GCA_028537755.1
n/a n/a 19,409
(1.86 %)
20,578
(1.69 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
310
(100.00 %)
3,161,054
(22.60 %)
891,453
(5.62 %)
11,087,206
(33.12 %)
0
(0 %)
957,188
(2.77 %)
19,104
(0.65 %)
16,548
(0.48 %)
170 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023)
GCA_028537955.1
n/a n/a 19,681
(1.86 %)
21,257
(1.62 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
51
(0.00 %)
350
(100.00 %)
4,957,057
(42.33 %)
943,226
(5.63 %)
11,695,871
(33.83 %)
0
(0 %)
1,058,642
(2.90 %)
20,062
(0.64 %)
18,632
(0.53 %)
171 Canada lynx (alternate hap LIC74 2019)
GCA_007474575.1
n/a n/a 12,029
(1.42 %)
15,171
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
15,036
(100.00 %)
2,937,491
(43.50 %)
544,410
(1.76 %)
7,641,565
(32.72 %)
0
(0 %)
294,221
(1.43 %)
39,082
(2.44 %)
34,616
(1.88 %)
172 Canada lynx (LIC74 primary hap 2020)
GCA_007474595.2
n/a n/a 18,286
(1.66 %)
19,266
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
0
(0 %)
842
(0.12 %)
55
(100.00 %)
5,014,416
(43.75 %)
904,528
(1.75 %)
13,467,329
(34.19 %)
0
(0 %)
572,383
(1.64 %)
66,805
(2.53 %)
60,477
(2.02 %)
173 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2
n/a n/a 12,041
(1.42 %)
15,226
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
15,046
(100.00 %)
2,939,291
(43.50 %)
544,849
(1.76 %)
7,650,345
(32.74 %)
0
(0 %)
294,817
(1.43 %)
39,099
(2.44 %)
34,631
(1.88 %)
174 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2
50,142
(2.69 %)
n/a 18,273
(1.65 %)
19,264
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
0
(0 %)
842
(0.12 %)
54
(100.00 %)
5,011,165
(43.72 %)
904,525
(1.75 %)
13,467,551
(34.19 %)
0
(0 %)
572,384
(1.64 %)
66,799
(2.48 %)
60,482
(2.02 %)
175 Cantor's roundleaf bat
GCA_004027415.1
n/a n/a 23,788
(1.42 %)
45,328
(1.68 %)
38,254
(1.57 %)
41.36
(99.91 %)
6,366
(0.03 %)
6,366
(0.03 %)
846,566
(99.97 %)
3,997,370
(31.48 %)
775,742
(1.42 %)
12,770,948
(33.45 %)
57
(0.00 %)
n/a 41,527
(1.41 %)
30,440
(1.13 %)
176 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1
25,406
(1.08 %)
n/a 23,258
(1.07 %)
24,266
(1.16 %)
n/a 40.30
(86.29 %)
279,394
(13.74 %)
279,394
(13.74 %)
288,162
(86.26 %)
3,765,232
(16.90 %)
604,351
(0.89 %)
20,072,078
(42.36 %)
1,643
(0.02 %)
356,320
(0.77 %)
25,977
(0.42 %)
23,327
(0.35 %)
177 Cape golden mole (2012 Broad)
GCF_000296735.1
25,323
(1.07 %)
n/a 20,961
(1.07 %)
21,723
(1.04 %)
n/a 40.01
(79.93 %)
370,844
(20.11 %)
370,844
(20.11 %)
391,344
(79.89 %)
4,924,640
(21.03 %)
500,830
(1.95 %)
18,946,663
(41.18 %)
3,416
(0.03 %)
805,638
(1.24 %)
21,186
(0.33 %)
18,126
(0.27 %)
178 Cape hairy bat (hap1 2026)
GCA_054824995.1
n/a n/a 18,941
(1.79 %)
22,450
(1.66 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
0
(0 %)
127
(0.00 %)
189
(100.00 %)
5,144,376
(47.81 %)
778,035
(6.45 %)
10,243,708
(39.07 %)
4
(0.00 %)
1,134,718
(3.60 %)
58,204
(2.36 %)
49,558
(1.99 %)
179 Cape hairy bat (hap2 2026)
GCA_054825045.1
n/a n/a 17,887
(1.90 %)
20,599
(1.71 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
0
(0 %)
113
(0.00 %)
118
(100.00 %)
4,691,733
(46.04 %)
682,924
(4.53 %)
9,907,631
(36.70 %)
2
(0.00 %)
687,675
(2.52 %)
54,230
(2.37 %)
47,473
(2.00 %)
180 Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014)
GCA_000152225.2
n/a n/a 18,455
(1.10 %)
22,103
(1.12 %)
n/a 41.00
(88.89 %)
259,874
(11.14 %)
259,879
(11.14 %)
325,568
(88.86 %)
6,210,235
(51.92 %)
381,915
(1.06 %)
20,080,212
(36.28 %)
7,944
(0.20 %)
267,970
(1.80 %)
29,690
(0.50 %)
26,217
(0.43 %)
181 Cape rock hyrax (US060 2019 Broad)
GCA_004026925.1
n/a n/a 21,401
(0.85 %)
45,353
(1.14 %)
n/a 41.08
(99.93 %)
4,203
(0.01 %)
4,203
(0.01 %)
1,048,940
(99.99 %)
7,222,494
(54.48 %)
430,286
(0.85 %)
21,775,991
(44.61 %)
44
(0.00 %)
n/a 37,158
(0.70 %)
31,196
(0.61 %)
182 capybara
GCA_004027455.1
n/a n/a 20,152
(1.22 %)
28,931
(1.29 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
5,747
(0.02 %)
5,747
(0.02 %)
661,089
(99.98 %)
4,220,878
(29.16 %)
777,357
(2.04 %)
15,214,944
(35.16 %)
23
(0.00 %)
n/a 34,558
(0.85 %)
32,123
(0.72 %)
183 carabao (swamp buffalo K-KA32 2023)
GCF_029407905.1
77,279
(2.89 %)
n/a 19,433
(1.40 %)
21,166
(1.23 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
115
(100.00 %)
3,479,445
(21.92 %)
547,054
(6.39 %)
12,840,677
(45.22 %)
0
(0 %)
2,206,180
(5.44 %)
99,752
(3.73 %)
36,683
(0.81 %)
184 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA)
GCF_002263795.3
77,808
(4.11 %)
n/a 19,428
(1.48 %)
22,236
(1.33 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
0
(0 %)
386
(0.00 %)
1,958
(100.00 %)
3,449,588
(22.63 %)
596,092
(3.13 %)
12,785,607
(42.11 %)
1
(0.00 %)
1,626,342
(4.17 %)
46,864
(1.37 %)
37,742
(0.86 %)
185 cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014)
GCF_000003055.6
57,977
(2.74 %)
n/a 19,583
(1.56 %)
20,581
(1.31 %)
n/a 41.82
(99.23 %)
72,454
(0.78 %)
74,464
(0.78 %)
75,598
(99.22 %)
5,607,556
(49.02 %)
440,521
(1.25 %)
13,167,657
(40.78 %)
789
(0.04 %)
1,243,109
(3.73 %)
42,869
(1.24 %)
37,223
(0.90 %)
186 Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad)
GCA_004024745.2
n/a n/a 18,603
(1.52 %)
22,330
(1.36 %)
n/a 42.35
(98.12 %)
57,013
(1.80 %)
57,013
(1.80 %)
1,240,743
(98.20 %)
5,255,211
(43.27 %)
2,502,373
(4.37 %)
12,968,788
(40.96 %)
10,788
(0.55 %)
n/a 172,178
(3.66 %)
153,143
(3.23 %)
187 cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022)
GCF_027475565.1
80,997
(4.53 %)
n/a 18,420
(1.70 %)
19,561
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
0
(0 %)
22
(0.00 %)
195
(100.00 %)
4,611,842
(35.10 %)
837,685
(1.68 %)
13,649,125
(33.06 %)
0
(0 %)
327,107
(0.89 %)
60,367
(2.22 %)
56,975
(1.91 %)
188 cheetah (Rico 2018)
GCF_003709585.1
72,154
(3.33 %)
n/a 18,472
(1.70 %)
20,443
(1.42 %)
n/a 41.55
(99.55 %)
0
(0 %)
24,173
(0.45 %)
3,220
(100.00 %)
4,853,945
(42.85 %)
831,106
(1.53 %)
13,663,571
(32.84 %)
1,699
(0.02 %)
283,401
(0.75 %)
60,744
(2.17 %)
55,562
(1.77 %)
189 Chinese forest musk deer (Sichuan 2022)
GCF_022376915.1
51,625
(2.80 %)
n/a 19,565
(1.43 %)
22,280
(1.29 %)
n/a 42.30
(99.97 %)
0
(0 %)
1,781
(0.03 %)
2,446
(100.00 %)
3,257,347
(21.65 %)
399,120
(3.81 %)
12,906,274
(43.79 %)
0
(0 %)
2,278,433
(5.31 %)
46,689
(1.12 %)
38,849
(0.85 %)
190 Chinese hamster (17A/GY CHO 2020)
GCF_003668045.3
55,440
(2.79 %)
n/a 20,030
(1.84 %)
18,721
(1.41 %)
67,900
(3.41 %)
41.51
(99.90 %)
0
(0 %)
4,164
(0.10 %)
647
(100.00 %)
8,121,057
(33.74 %)
1,095,058
(2.91 %)
12,923,274
(32.25 %)
17
(0.00 %)
566,700
(1.72 %)
19,341
(0.58 %)
18,196
(0.52 %)
191 Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI)
GCF_000223135.1
46,006
(2.59 %)
n/a 20,602
(1.78 %)
17,467
(1.35 %)
n/a 41.37
(96.61 %)
156,635
(3.40 %)
156,635
(3.40 %)
265,787
(96.60 %)
4,541,936
(33.03 %)
1,072,129
(2.66 %)
13,150,189
(30.04 %)
213
(0.02 %)
n/a 12,522
(0.25 %)
11,560
(0.23 %)
192 Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd)
GCA_900186095.1
n/a n/a 19,874
(1.85 %)
19,298
(1.44 %)
n/a 41.45
(98.56 %)
63,334
(1.45 %)
63,334
(1.45 %)
71,598
(98.55 %)
4,521,726
(33.66 %)
1,060,619
(2.55 %)
12,867,288
(31.26 %)
9,581
(0.18 %)
445,818
(1.43 %)
17,960
(0.54 %)
17,137
(0.50 %)
193 Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022)
GCA_026545065.1
n/a n/a 20,293
(1.81 %)
18,881
(1.42 %)
n/a 41.62
(71.16 %)
924,541
(28.93 %)
924,541
(28.93 %)
1,236,122
(71.07 %)
4,330,728
(30.92 %)
987,319
(3.70 %)
13,374,062
(21.92 %)
817
(0.01 %)
n/a 18,838
(0.40 %)
17,349
(0.35 %)
194 Chinese pangolin (2020 Yunnan U)
GCF_014570555.1
69,694
(3.21 %)
n/a 18,206
(1.70 %)
20,508
(1.48 %)
n/a 40.79
(95.54 %)
0
(0 %)
34,903
(4.47 %)
4,694
(100.00 %)
2,927,176
(35.60 %)
269,964
(0.67 %)
12,610,535
(29.10 %)
647
(0.02 %)
253,501
(1.85 %)
35,278
(1.05 %)
33,613
(0.98 %)
195 Chinese pangolin (hap1 2023 genbank)
GCA_030020395.1
n/a n/a 18,675
(1.41 %)
21,838
(1.29 %)
n/a 41.07
(99.77 %)
0
(0 %)
383
(0.23 %)
662
(100.00 %)
3,516,380
(43.45 %)
618,194
(3.68 %)
12,009,657
(39.02 %)
8
(0.00 %)
1,132,161
(3.87 %)
47,708
(1.22 %)
42,611
(1.05 %)
196 Chinese pangolin (hap1 2023 refseq)
GCF_030020395.1
71,445
(2.98 %)
n/a 18,379
(1.34 %)
21,837
(1.29 %)
n/a 41.07
(99.77 %)
0
(0 %)
383
(0.23 %)
661
(100.00 %)
3,318,871
(34.65 %)
618,193
(3.68 %)
12,009,669
(39.02 %)
8
(0.00 %)
1,132,160
(3.87 %)
47,708
(1.22 %)
34,214
(0.79 %)
197 Chinese pangolin (hap2 2023)
GCA_030020945.1
n/a n/a 18,538
(1.34 %)
21,724
(1.27 %)
n/a 41.09
(99.48 %)
0
(0 %)
190
(0.52 %)
700
(100.00 %)
3,362,899
(34.48 %)
678,384
(4.11 %)
12,024,241
(39.52 %)
7
(0.00 %)
1,198,886
(3.98 %)
48,960
(1.19 %)
34,434
(0.79 %)
198 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1
n/a n/a 18,749
(1.63 %)
22,506
(1.40 %)
n/a 40.93
(90.69 %)
138,158
(9.33 %)
257,424
(9.33 %)
230,927
(90.67 %)
2,691,116
(34.48 %)
316,518
(1.96 %)
11,538,086
(25.40 %)
37,129
(1.10 %)
304,419
(2.99 %)
30,693
(0.58 %)
28,150
(0.52 %)
199 Chinese rufous horseshoe bat
GCA_001888835.1
n/a n/a 26,871
(2.34 %)
25,467
(1.89 %)
n/a 40.52
(97.22 %)
0
(0 %)
212,601
(2.80 %)
63,439
(100.00 %)
3,219,611
(33.86 %)
495,126
(1.20 %)
12,476,551
(27.16 %)
60
(0.00 %)
103,290
(0.35 %)
32,993
(0.98 %)
31,139
(0.91 %)
200 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024 genbank)
GCA_036562045.1
n/a n/a 17,893
(1.95 %)
19,249
(1.60 %)
n/a 40.47
(100.00 %)
0
(0 %)
286
(0.00 %)
454
(100.00 %)
3,055,304
(33.11 %)
531,106
(1.34 %)
11,858,144
(29.52 %)
0
(0 %)
158,830
(0.76 %)
30,884
(1.08 %)
29,146
(0.97 %)
201 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024 refseq)
GCF_036562045.2
67,162
(3.87 %)
n/a 17,890
(1.94 %)
19,248
(1.60 %)
n/a 40.47
(100.00 %)
0
(0 %)
286
(0.00 %)
454
(100.00 %)
3,325,750
(39.02 %)
531,106
(1.34 %)
11,858,028
(29.52 %)
0
(0 %)
218,904
(1.04 %)
30,884
(1.08 %)
26,927
(0.94 %)
202 Chinese tree shrew (2013 BGI)
GCF_000334495.1
47,005
(2.07 %)
n/a 21,375
(1.39 %)
19,231
(1.28 %)
n/a 41.73
(95.10 %)
191,695
(4.92 %)
191,695
(4.92 %)
242,445
(95.08 %)
5,060,321
(23.05 %)
1,046,388
(4.15 %)
14,978,259
(38.04 %)
914
(0.08 %)
803,568
(6.04 %)
88,806
(1.44 %)
55,240
(1.01 %)
203 Chinese tree shrew (KIZ-2021 2023)
GCA_033439345.1
n/a n/a 22,218
(1.55 %)
22,364
(1.36 %)
n/a 41.78
(99.99 %)
0
(0 %)
1,697
(0.01 %)
1,645
(100.00 %)
6,126,341
(42.08 %)
1,035,957
(2.47 %)
14,328,193
(41.14 %)
1
(0.00 %)
840,196
(1.95 %)
90,914
(1.82 %)
54,999
(1.38 %)
204 Chiriquinan serotine (hap1 2025)
GCA_054100705.1
n/a n/a 17,992
(1.72 %)
21,541
(1.60 %)
n/a 43.57
(100.00 %)
0
(0 %)
319
(0.00 %)
133
(100.00 %)
5,339,985
(49.93 %)
956,399
(6.53 %)
10,659,420
(39.61 %)
3
(0.00 %)
888,139
(2.85 %)
80,046
(3.68 %)
60,884
(2.54 %)
205 Chiriquinan serotine (hap2 2025)
GCA_054099605.1
n/a n/a 17,252
(1.79 %)
20,347
(1.66 %)
n/a 43.70
(100.00 %)
0
(0 %)
267
(0.00 %)
112
(100.00 %)
4,920,908
(48.27 %)
859,047
(6.45 %)
9,871,329
(38.13 %)
2
(0.00 %)
767,280
(2.65 %)
75,180
(3.74 %)
58,564
(2.67 %)
206 chiru
GCA_000400835.1
n/a n/a 20,320
(1.60 %)
42,654
(2.51 %)
n/a 42.01
(93.04 %)
283,069
(7.00 %)
283,069
(7.00 %)
298,127
(93.00 %)
5,342,241
(43.54 %)
425,329
(1.25 %)
13,714,420
(34.66 %)
321
(0.03 %)
521,516
(1.73 %)
43,135
(1.89 %)
39,020
(1.80 %)
207 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1
n/a n/a 16,430
(1.52 %)
21,057
(1.44 %)
n/a 41.79
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 10,377
(100.00 %)
3,845,437
(33.39 %)
794,587
(2.14 %)
10,765,695
(33.40 %)
0
(0 %)
461,307
(1.56 %)
56,375
(2.45 %)
47,473
(1.74 %)
208 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1
81,219
(3.62 %)
n/a 18,300
(1.65 %)
20,361
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
0
(0 %)
181
(0.06 %)
33
(100.00 %)
4,224,269
(34.84 %)
992,668
(2.08 %)
13,618,866
(34.42 %)
3
(0.00 %)
647,739
(1.89 %)
67,830
(2.45 %)
58,781
(1.98 %)
209 common bottlenose dolphin (maternal 2020)
GCA_011762535.1
n/a n/a 18,837
(1.77 %)
20,857
(1.43 %)
n/a 41.43
(99.73 %)
0
(0 %)
649
(0.27 %)
985
(100.00 %)
4,073,893
(46.15 %)
630,039
(2.15 %)
12,628,219
(35.41 %)
1
(0.00 %)
705,496
(1.85 %)
65,379
(1.89 %)
42,994
(1.34 %)
210 common bottlenose dolphin (maternal hap 2024)
GCA_011762595.2
n/a n/a 18,777
(1.77 %)
20,526
(1.42 %)
n/a 41.44
(99.74 %)
0
(0 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,064,487
(44.85 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,633
(35.29 %)
1
(0.00 %)
623,127
(1.85 %)
65,551
(1.90 %)
43,440
(1.36 %)
211 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1
67,220
(3.31 %)
n/a 18,766
(1.77 %)
20,528
(1.42 %)
35,852
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
0
(0 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,069,115
(46.17 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,891
(35.29 %)
1
(0.00 %)
629,903
(1.85 %)
65,551
(1.90 %)
43,136
(1.35 %)
212 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq)
GCF_001922835.1
45,975
(2.99 %)
n/a 17,255
(1.69 %)
17,058
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
0
(0 %)
114,003
(0.57 %)
2,648
(100.00 %)
3,845,938
(43.89 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,098
(32.18 %)
466
(0.01 %)
284,934
(0.89 %)
48,030
(1.35 %)
31,891
(1.03 %)
213 common bottlenose dolphin (mTurTru1 2024)
GCF_011762595.2
80,385
(4.33 %)
n/a 18,770
(1.77 %)
20,525
(1.42 %)
n/a 41.44
(99.74 %)
0
(0 %)
674
(0.26 %)
361
(100.00 %)
3,981,744
(44.78 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,558
(35.29 %)
1
(0.00 %)
556,315
(1.61 %)
65,551
(1.90 %)
43,444
(1.36 %)
214 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1
n/a n/a 18,537
(1.77 %)
20,619
(1.44 %)
n/a 41.42
(98.08 %)
0
(0 %)
868
(1.92 %)
1,166
(100.00 %)
3,997,801
(45.93 %)
609,838
(1.85 %)
12,400,272
(34.53 %)
1
(0.00 %)
649,569
(1.73 %)
64,630
(1.84 %)
42,623
(1.32 %)
215 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1
n/a n/a 14,863
(0.75 %)
15,426
(0.89 %)
n/a 39.41
(100.00 %)
313
(0.00 %)
313
(0.00 %)
12,446
(100.00 %)
5,846,769
(38.56 %)
987,917
(1.99 %)
16,764,356
(40.14 %)
0
(0 %)
345,940
(1.13 %)
13,303
(0.35 %)
10,338
(0.23 %)
216 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1
37,661
(1.80 %)
n/a 18,653
(0.80 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,116
(38.90 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,306
(40.56 %)
0
(0 %)
455,717
(1.17 %)
17,762
(0.38 %)
13,986
(0.24 %)
217 common dormouse
GCF_963383645.1
31,384
(1.35 %)
n/a 18,619
(1.42 %)
22,414
(1.38 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
1,805
(0.01 %)
1,805
(0.01 %)
2,017
(99.99 %)
6,589,540
(42.09 %)
1,593,656
(4.46 %)
12,228,695
(43.98 %)
8
(0.00 %)
1,313,148
(3.16 %)
71,058
(1.88 %)
45,398
(0.93 %)
218 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1
n/a n/a 17,216
(1.82 %)
19,202
(1.79 %)
n/a 42.55
(99.97 %)
0
(0 %)
1,546
(0.03 %)
323
(100.00 %)
2,953,532
(23.94 %)
805,142
(2.83 %)
9,964,846
(34.69 %)
0
(0 %)
446,836
(1.61 %)
57,295
(2.83 %)
54,882
(1.90 %)
219 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1
n/a n/a 15,974
(1.72 %)
20,563
(1.66 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
10,459
(100.00 %)
2,634,333
(23.76 %)
703,674
(2.65 %)
8,909,525
(33.95 %)
0
(0 %)
343,235
(1.37 %)
50,430
(2.54 %)
45,982
(1.75 %)
220 common pipistrelle (Broad 2019)
GCA_004026625.1
n/a n/a 21,938
(1.35 %)
53,915
(1.60 %)
n/a 42.88
(99.88 %)
10,870
(0.05 %)
10,870
(0.05 %)
736,974
(99.95 %)
3,499,501
(22.91 %)
1,046,301
(2.96 %)
11,759,516
(37.96 %)
17
(0.00 %)
n/a 92,062
(3.23 %)
75,629
(2.04 %)
221 common pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_965203405.1
n/a n/a 18,233
(1.77 %)
21,445
(1.80 %)
n/a 42.93
(99.98 %)
0
(0 %)
1,650
(0.02 %)
575
(100.00 %)
3,324,262
(26.83 %)
869,167
(7.44 %)
10,218,519
(37.91 %)
6
(0.00 %)
778,854
(2.75 %)
76,006
(3.29 %)
60,694
(1.98 %)
222 common pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_965203405.2
n/a n/a 18,176
(1.76 %)
21,285
(1.78 %)
n/a 42.95
(100.00 %)
12
(0.00 %)
370
(0.00 %)
254
(100.00 %)
3,357,975
(26.71 %)
873,676
(8.26 %)
10,088,614
(38.25 %)
3
(0.00 %)
835,307
(2.96 %)
78,890
(3.25 %)
60,761
(1.97 %)
223 common pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_965204225.1
n/a n/a 18,115
(1.81 %)
21,233
(1.83 %)
n/a 42.89
(99.98 %)
1,602
(0.02 %)
1,602
(0.02 %)
1,971
(99.98 %)
3,303,323
(27.28 %)
852,756
(5.65 %)
10,047,424
(36.41 %)
13
(0.00 %)
655,173
(2.34 %)
69,105
(3.25 %)
60,657
(2.04 %)
224 common pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_965204225.2
n/a n/a 18,092
(1.83 %)
21,286
(1.85 %)
n/a 42.90
(100.00 %)
358
(0.00 %)
358
(0.00 %)
656
(100.00 %)
3,325,603
(27.55 %)
851,200
(4.82 %)
10,152,156
(36.08 %)
2
(0.00 %)
605,388
(2.14 %)
66,359
(3.22 %)
60,960
(2.07 %)
225 common thicket rat (MVZ Mamm 221001 2021)
GCA_019843835.1
n/a n/a 25,148
(1.36 %)
49,594
(1.08 %)
n/a 41.11
(99.52 %)
63,300
(0.44 %)
63,300
(0.44 %)
572,372
(99.56 %)
3,806,717
(32.04 %)
1,181,694
(2.86 %)
12,272,340
(28.58 %)
6,281
(0.11 %)
n/a 16,373
(0.48 %)
14,787
(0.43 %)
226 common vampire bat (v2 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.2
n/a n/a 17,485
(1.76 %)
18,907
(1.66 %)
n/a 42.87
(99.99 %)
0
(0 %)
576
(0.01 %)
429
(100.00 %)
2,592,246
(28.20 %)
352,985
(2.87 %)
10,737,944
(31.11 %)
25
(0.00 %)
264,293
(1.29 %)
61,125
(2.28 %)
42,729
(1.28 %)
227 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.2
58,786
(3.38 %)
n/a 18,507
(1.82 %)
19,451
(1.59 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
0
(0 %)
615
(0.01 %)
574
(100.00 %)
2,960,602
(36.90 %)
431,577
(3.90 %)
11,286,753
(32.62 %)
37
(0.00 %)
367,677
(1.66 %)
71,507
(2.50 %)
83,078
(2.13 %)
228 common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018)
GCF_002940915.2
51,044
(3.24 %)
n/a 18,503
(1.88 %)
18,071
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,246
(2.23 %)
54,246
(2.23 %)
83,364
(97.77 %)
2,799,509
(29.62 %)
275,242
(1.03 %)
11,796,826
(28.19 %)
237
(0.03 %)
174,535
(2.84 %)
51,634
(1.37 %)
47,271
(1.22 %)
229 common warthog (WHEZ1 2021)
GCF_016906955.1
55,156
(2.64 %)
n/a 18,264
(1.56 %)
19,251
(1.34 %)
54,816
(2.83 %)
41.95
(99.61 %)
0
(0 %)
523
(0.39 %)
194
(100.00 %)
3,898,243
(30.33 %)
588,742
(1.17 %)
12,955,929
(36.44 %)
1
(0.00 %)
519,262
(1.56 %)
75,592
(1.86 %)
45,338
(1.21 %)
230 common wombat
GCF_900497805.2
46,365
(1.78 %)
n/a 19,437
(0.86 %)
18,947
(0.96 %)
n/a 38.86
(99.68 %)
0
(0 %)
67,461
(0.33 %)
14,183
(100.00 %)
8,645,969
(41.99 %)
1,203,246
(1.61 %)
23,878,215
(39.11 %)
3,092
(0.01 %)
284,840
(0.59 %)
18,752
(0.37 %)
17,700
(0.31 %)
231 Corsac fox (zsh2022 2023)
GCA_030463245.1
n/a n/a 19,527
(1.61 %)
18,923
(1.35 %)
n/a 41.24
(100.00 %)
0
(0 %)
107
(0.00 %)
202
(100.00 %)
4,435,406
(32.05 %)
981,019
(1.98 %)
13,673,245
(32.65 %)
0
(0 %)
644,894
(1.63 %)
49,252
(2.20 %)
46,666
(1.57 %)
232 cotton mouse (hap1 2026)
GCA_057877385.1
n/a n/a 19,246
(1.53 %)
21,031
(1.33 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
109
(0.00 %)
464
(100.00 %)
7,290,342
(52.57 %)
1,324,779
(10.83 %)
13,875,877
(39.90 %)
3
(0.00 %)
1,375,954
(3.61 %)
24,010
(0.68 %)
19,731
(0.49 %)
233 cotton mouse (hap2 2026)
GCA_057877455.1
n/a n/a 18,393
(1.64 %)
19,527
(1.40 %)
n/a 42.37
(100.00 %)
0
(0 %)
78
(0.00 %)
197
(100.00 %)
6,785,800
(49.24 %)
1,222,530
(8.19 %)
13,058,217
(36.83 %)
0
(0 %)
1,085,301
(3.16 %)
22,704
(0.69 %)
18,988
(0.53 %)
234 coyote (coyote_06102 2023)
GCA_034620425.1
n/a n/a 19,251
(1.60 %)
19,585
(1.40 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
0
(0 %)
93
(0.00 %)
120
(100.00 %)
4,493,000
(32.28 %)
982,814
(2.01 %)
13,803,318
(33.09 %)
0
(0 %)
634,473
(1.64 %)
50,777
(2.23 %)
47,871
(1.58 %)
235 creeping vole
GCF_018167655.1
54,941
(2.31 %)
n/a 23,033
(1.55 %)
25,427
(1.53 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,147
(100.00 %)
4,549,519
(25.66 %)
1,153,429
(13.60 %)
13,568,297
(40.65 %)
0
(0 %)
3,223,361
(6.77 %)
23,141
(0.54 %)
19,563
(0.42 %)
236 crested porcupine
GCA_004026905.1
n/a n/a 21,005
(1.32 %)
35,975
(1.39 %)
n/a 41.51
(99.89 %)
4,351
(0.02 %)
4,351
(0.02 %)
1,140,949
(99.98 %)
4,303,147
(30.69 %)
600,488
(1.19 %)
14,049,490
(33.80 %)
35
(0.00 %)
n/a 57,196
(1.33 %)
41,516
(0.95 %)
237 crested rat (2021)
GCA_907164525.1
n/a n/a 18,829
(1.57 %)
20,084
(1.23 %)
n/a 40.89
(92.16 %)
116,236
(7.85 %)
116,236
(7.85 %)
153,441
(92.15 %)
6,937,911
(48.56 %)
1,051,397
(2.16 %)
13,178,644
(37.15 %)
8,286
(0.10 %)
761,138
(1.87 %)
22,912
(0.47 %)
20,486
(0.42 %)
238 Crete spiny mouse (2024)
GCA_964271855.1
n/a n/a 19,467
(1.76 %)
18,734
(1.43 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
113
(100.00 %)
4,718,848
(32.83 %)
1,327,449
(6.80 %)
12,893,458
(34.03 %)
0
(0 %)
1,009,136
(2.74 %)
21,236
(0.61 %)
17,412
(0.44 %)
239 Crete spiny mouse (2025 genbank)
GCA_964271855.5
n/a n/a 19,050
(1.82 %)
18,719
(1.43 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
112
(100.00 %)
5,710,100
(41.99 %)
1,327,449
(6.80 %)
12,893,310
(34.03 %)
0
(0 %)
1,009,081
(2.74 %)
21,236
(0.61 %)
19,155
(0.54 %)
240 Crete spiny mouse (2025 refseq)
GCF_964271855.1
66,570
(3.41 %)
n/a 19,050
(1.82 %)
18,721
(1.43 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
112
(100.00 %)
5,710,100
(41.99 %)
1,327,449
(6.80 %)
12,893,309
(34.03 %)
0
(0 %)
1,009,081
(2.74 %)
21,236
(0.61 %)
19,155
(0.54 %)
241 Cucacao Myotis (hap1 2026)
GCA_054855985.1
n/a n/a 18,818
(1.71 %)
22,379
(1.61 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
0
(0 %)
173
(0.00 %)
193
(100.00 %)
5,262,057
(49.88 %)
855,921
(7.52 %)
10,259,960
(40.77 %)
1
(0.00 %)
1,148,232
(3.75 %)
65,544
(2.34 %)
50,749
(1.71 %)
242 Cucacao Myotis (hap2 2026)
GCA_054855975.1
n/a n/a 17,661
(1.79 %)
20,358
(1.64 %)
n/a 42.80
(100.00 %)
0
(0 %)
174
(0.00 %)
150
(100.00 %)
4,786,224
(48.01 %)
751,852
(6.76 %)
9,699,043
(38.95 %)
1
(0.00 %)
823,672
(2.98 %)
57,353
(2.24 %)
44,175
(1.64 %)
243 Cuvier's beaked whale
GCA_004364475.1
n/a n/a 23,700
(0.90 %)
51,715
(0.86 %)
n/a 42.01
(99.76 %)
3,229
(0.01 %)
3,229
(0.01 %)
3,761,505
(99.99 %)
6,544,424
(43.61 %)
1,417,186
(3.11 %)
16,127,873
(42.25 %)
43
(0.00 %)
n/a 68,668
(1.15 %)
53,793
(0.96 %)
244 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa alternate hap 2024)
GCA_043880225.1
n/a n/a 18,335
(1.64 %)
20,207
(1.46 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,440
(100.00 %)
4,675,929
(43.51 %)
742,038
(2.58 %)
11,746,853
(36.11 %)
0
(0 %)
1,280,177
(3.44 %)
47,949
(1.04 %)
23,817
(0.70 %)
245 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024)
GCA_043880285.1
n/a n/a 18,610
(1.67 %)
19,098
(1.39 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
7
(0.00 %)
334
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,077,286
(41.85 %)
754,689
(2.64 %)
11,873,386
(36.16 %)
1
(0.00 %)
1,326,571
(3.53 %)
48,137
(1.04 %)
24,623
(0.71 %)
246 Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI)
GCF_000743615.1
52,373
(2.57 %)
n/a 17,983
(1.45 %)
17,063
(1.43 %)
n/a 40.34
(97.96 %)
87,815
(2.05 %)
87,815
(2.05 %)
162,545
(97.95 %)
4,053,433
(30.86 %)
545,281
(1.74 %)
13,406,483
(30.65 %)
793
(0.06 %)
243,492
(1.42 %)
37,008
(0.74 %)
33,397
(0.64 %)
247 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo)
GCF_012274545.1
58,091
(2.74 %)
n/a 17,780
(1.44 %)
16,515
(1.42 %)
n/a 40.34
(97.94 %)
0
(0 %)
88,899
(2.07 %)
73,970
(100.00 %)
4,035,140
(30.95 %)
544,772
(1.73 %)
13,390,872
(30.61 %)
838
(0.06 %)
245,667
(1.44 %)
37,008
(0.74 %)
33,408
(0.64 %)
248 Darling's horseshoe bat (hap1 2026)
GCA_057427945.1
n/a n/a 18,798
(1.86 %)
20,919
(1.64 %)
n/a 40.67
(100.00 %)
0
(0 %)
59
(0.00 %)
223
(100.00 %)
3,581,848
(41.00 %)
560,680
(2.97 %)
12,112,526
(30.87 %)
0
(0 %)
715,307
(2.12 %)
34,026
(1.18 %)
30,448
(0.99 %)
249 Darling's horseshoe bat (hap2 2026)
GCA_057428265.1
n/a n/a 17,853
(1.82 %)
19,924
(1.60 %)
n/a 41.00
(100.00 %)
0
(0 %)
104
(0.00 %)
822
(100.00 %)
3,352,243
(43.10 %)
530,397
(7.87 %)
11,337,379
(33.03 %)
0
(0 %)
1,767,391
(4.34 %)
32,081
(1.08 %)
28,476
(0.93 %)
250 dassie-rat
GCA_004026965.1
n/a n/a 20,479
(1.16 %)
42,937
(1.41 %)
n/a 41.86
(99.89 %)
9,645
(0.04 %)
9,645
(0.04 %)
920,324
(99.96 %)
4,563,054
(28.83 %)
660,623
(1.92 %)
12,899,807
(34.48 %)
14
(0.00 %)
n/a 46,569
(1.25 %)
40,791
(1.01 %)
251 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1
n/a n/a 18,895
(1.78 %)
24,235
(1.81 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,930
(100.00 %)
2,813,870
(23.75 %)
718,406
(5.18 %)
9,977,320
(37.24 %)
0
(0 %)
609,378
(2.37 %)
62,910
(2.66 %)
55,962
(1.97 %)
252 Daubenton's bat (hap1.2 2025)
GCA_963259705.2
n/a n/a 19,016
(1.77 %)
22,392
(1.66 %)
n/a 43.17
(100.00 %)
0
(0 %)
219
(0.00 %)
176
(100.00 %)
5,102,002
(45.10 %)
815,584
(6.94 %)
10,416,086
(39.34 %)
6
(0.00 %)
829,407
(2.99 %)
66,271
(2.56 %)
56,702
(2.15 %)
253 Daubenton's bat (hap2.2 2025)
GCA_963242275.2
n/a n/a 18,127
(1.87 %)
21,346
(1.75 %)
n/a 43.37
(100.00 %)
0
(0 %)
136
(0.00 %)
208
(100.00 %)
4,712,850
(43.86 %)
726,883
(5.33 %)
9,942,977
(37.29 %)
1
(0.00 %)
631,553
(2.48 %)
62,442
(2.66 %)
54,783
(2.31 %)
254 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1
64,558
(3.32 %)
n/a 19,141
(1.72 %)
22,133
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
0
(0 %)
1,099
(0.01 %)
121
(100.00 %)
3,040,232
(24.03 %)
796,911
(6.38 %)
10,478,180
(38.84 %)
9
(0.00 %)
756,429
(2.76 %)
64,920
(2.51 %)
57,806
(1.88 %)
255 Daurian ground squirrel
GCA_002406435.1
n/a n/a 20,990
(1.31 %)
17,575
(1.17 %)
n/a 39.77
(96.15 %)
141,850
(3.84 %)
141,850
(3.84 %)
502,654
(96.16 %)
5,783,538
(34.36 %)
924,038
(3.73 %)
17,533,301
(30.85 %)
318
(0.01 %)
1,230,179
(17.33 %)
27,955
(0.39 %)
26,034
(0.36 %)
256 David's myotis bat
GCF_000327345.1
37,645
(2.70 %)
n/a 18,744
(1.78 %)
17,565
(1.62 %)
n/a 42.69
(91.23 %)
223,511
(8.80 %)
223,511
(8.80 %)
325,280
(91.20 %)
2,680,166
(23.79 %)
532,273
(1.90 %)
11,016,028
(29.55 %)
303
(0.05 %)
n/a 59,615
(1.59 %)
49,977
(1.17 %)
257 Davis's round-eared bat (hap1 2025)
GCA_051307075.1
n/a n/a 17,736
(1.53 %)
21,703
(1.45 %)
n/a 42.03
(100.00 %)
0
(0 %)
153
(0.00 %)
311
(100.00 %)
4,450,174
(45.25 %)
390,322
(7.86 %)
12,108,244
(37.90 %)
0
(0 %)
542,413
(1.83 %)
76,695
(4.57 %)
65,855
(4.12 %)
258 Davis's round-eared bat (hap2 2025)
GCA_051307065.1
n/a n/a 16,878
(1.65 %)
20,512
(1.56 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
113
(0.00 %)
148
(100.00 %)
3,720,522
(43.45 %)
352,035
(4.96 %)
11,326,247
(34.44 %)
0
(0 %)
432,006
(1.68 %)
72,242
(4.65 %)
62,245
(4.14 %)
259 degu (3935 2012 refseq)
GCF_000260255.1
48,165
(2.13 %)
n/a 22,242
(1.41 %)
22,101
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,770
(15.68 %)
252,772
(15.68 %)
259,904
(84.32 %)
4,901,673
(27.74 %)
898,945
(1.50 %)
14,282,003
(29.30 %)
2,582
(0.03 %)
313,028
(1.02 %)
40,135
(0.82 %)
36,410
(0.69 %)
260 desert hamster (2022)
GCF_943737965.1
37,291
(2.11 %)
n/a 19,744
(1.74 %)
20,215
(1.50 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,079
(100.00 %)
4,038,079
(31.01 %)
1,132,871
(2.71 %)
11,946,112
(32.62 %)
0
(0 %)
618,568
(1.94 %)
17,053
(0.51 %)
15,416
(0.41 %)
261 Desmarest's hutia
GCA_004027915.1
n/a n/a 23,535
(0.78 %)
50,796
(0.95 %)
n/a 42.03
(99.83 %)
3,492
(0.01 %)
3,492
(0.01 %)
2,355,850
(99.99 %)
5,790,506
(26.72 %)
1,062,134
(1.71 %)
16,977,224
(35.29 %)
16
(0.00 %)
n/a 54,479
(1.01 %)
46,753
(0.82 %)
262 dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW)
GCF_012295265.1
102,060
(4.04 %)
n/a 19,777
(1.69 %)
20,341
(1.41 %)
n/a 41.29
(99.69 %)
0
(0 %)
325
(0.31 %)
477
(100.00 %)
4,950,808
(42.83 %)
1,033,921
(2.36 %)
13,745,703
(33.32 %)
0
(0 %)
820,425
(2.05 %)
51,835
(2.25 %)
47,504
(1.92 %)
263 dingo (Sandy 2020 James Cook U)
GCF_003254725.2
104,332
(4.50 %)
n/a 19,710
(1.72 %)
19,857
(1.42 %)
n/a 41.24
(100.00 %)
0
(0 %)
69
(0.00 %)
159
(100.00 %)
4,547,906
(33.32 %)
993,474
(2.19 %)
13,701,060
(33.18 %)
0
(0 %)
716,455
(1.82 %)
51,216
(2.28 %)
51,748
(2.14 %)
264 dog (Basenji MU ID 185726 2019)
GCA_004886185.2
n/a n/a 19,889
(1.67 %)
20,501
(1.39 %)
n/a 41.36
(99.99 %)
1,387
(0.01 %)
1,388
(0.01 %)
3,630
(99.99 %)
4,950,227
(43.32 %)
1,059,639
(2.97 %)
13,694,849
(33.70 %)
3
(0.00 %)
1,006,008
(2.40 %)
51,443
(2.16 %)
47,254
(1.90 %)
265 dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021)
GCA_013276365.2
n/a n/a 19,310
(1.60 %)
19,947
(1.42 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
631
(100.00 %)
4,452,916
(32.14 %)
960,590
(2.23 %)
13,685,353
(33.01 %)
0
(0 %)
644,106
(1.68 %)
50,715
(2.22 %)
47,698
(1.58 %)
266 dog (Bernese Mountain Dog BD 2023)
GCA_031010765.1
n/a n/a 19,211
(1.60 %)
20,327
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
0
(0 %)
641
(0.00 %)
175
(100.00 %)
4,471,016
(32.18 %)
984,776
(2.03 %)
13,719,474
(32.88 %)
0
(0 %)
644,486
(1.60 %)
51,050
(2.25 %)
47,721
(1.59 %)
267 dog (Bernese Mountain Dog OD 2023)
GCA_031010635.1
n/a n/a 19,279
(1.60 %)
20,348
(1.44 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
0
(0 %)
1,015
(0.00 %)
159
(100.00 %)
4,491,081
(32.21 %)
996,142
(2.01 %)
13,761,195
(32.97 %)
0
(0 %)
645,724
(1.69 %)
51,490
(2.25 %)
48,166
(1.60 %)
268 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3
82,536
(3.63 %)
n/a 19,772
(1.66 %)
19,565
(1.39 %)
n/a 41.31
(99.25 %)
23,876
(0.76 %)
23,876
(0.76 %)
27,106
(99.24 %)
4,918,098
(43.29 %)
991,835
(2.81 %)
13,644,959
(33.60 %)
34
(0.00 %)
971,687
(2.39 %)
53,269
(2.07 %)
48,154
(1.73 %)
269 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5
93,761
(3.84 %)
n/a 19,392
(1.71 %)
19,572
(1.42 %)
52,141
(3.27 %)
41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
1,028
(0.00 %)
147
(100.00 %)
23,927,903
(42.42 %)
972,851
(2.05 %)
13,611,845
(33.11 %)
0
(0 %)
657,594
(1.69 %)
50,679
(2.26 %)
46,402
(1.93 %)
270 dog (Cairn Terrier CA611 2023)
GCA_031010295.1
n/a n/a 19,255
(1.61 %)
20,479
(1.45 %)
n/a 41.19
(100.00 %)
0
(0 %)
262
(0.00 %)
141
(100.00 %)
4,490,019
(32.25 %)
989,383
(1.99 %)
13,710,808
(32.97 %)
0
(0 %)
634,521
(1.63 %)
50,883
(2.22 %)
47,572
(1.58 %)
271 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1
96,734
(3.71 %)
n/a 20,135
(1.64 %)
20,871
(1.38 %)
56,772
(3.19 %)
41.50
(100.00 %)
585
(0.00 %)
585
(0.00 %)
2,782
(100.00 %)
20,264,827
(43.87 %)
1,152,879
(3.22 %)
13,784,690
(34.30 %)
9
(0.00 %)
1,226,639
(2.84 %)
53,518
(2.23 %)
49,021
(1.97 %)
272 dog (German Shepherd Nala 2020)
GCA_008641055.3
n/a n/a 19,757
(1.69 %)
20,201
(1.41 %)
n/a 41.32
(99.74 %)
0
(0 %)
458
(0.26 %)
410
(100.00 %)
4,974,233
(43.03 %)
1,048,366
(2.46 %)
13,881,889
(33.61 %)
0
(0 %)
887,952
(2.14 %)
51,900
(2.21 %)
47,682
(1.96 %)
273 dog (Labrador retriever 2023)
GCA_031165255.1
n/a n/a 19,256
(1.61 %)
20,247
(1.44 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
0
(0 %)
516
(0.00 %)
675
(100.00 %)
4,456,220
(32.19 %)
960,584
(1.96 %)
13,688,006
(32.82 %)
0
(0 %)
620,296
(1.57 %)
50,670
(2.21 %)
47,790
(1.59 %)
274 dog (labrador SID07034 2020)
GCF_014441545.1
99,420
(3.87 %)
n/a 19,870
(1.70 %)
20,252
(1.41 %)
54,322
(3.23 %)
41.19
(99.47 %)
0
(0 %)
575
(0.53 %)
376
(100.00 %)
4,981,985
(42.28 %)
1,019,772
(1.97 %)
13,959,750
(32.77 %)
2
(0.01 %)
648,526
(1.66 %)
52,469
(2.25 %)
48,334
(1.95 %)
275 dog (poodle 2003)
GCA_000181415.1
n/a n/a 12,852
(0.53 %)
24,666
(0.57 %)
n/a 41.09
(99.86 %)
0
(0 %)
n/a 1,089,636
(100.00 %)
3,212,912
(39.08 %)
549,098
(1.63 %)
8,833,799
(29.80 %)
0
(0 %)
n/a 41,068
(1.31 %)
35,977
(1.11 %)
276 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU)
GCF_000181335.3
72,076
(3.30 %)
n/a 18,662
(1.64 %)
20,897
(1.37 %)
n/a 41.73
(98.20 %)
403
(1.80 %)
436
(1.80 %)
5,079
(98.20 %)
5,086,462
(43.51 %)
964,126
(2.68 %)
13,947,871
(33.33 %)
0
(0 %)
785,059
(2.13 %)
69,701
(2.41 %)
61,568
(1.95 %)
277 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU)
GCA_000181335.5
n/a n/a 18,378
(1.53 %)
21,242
(1.40 %)
n/a 41.73
(98.21 %)
350
(1.69 %)
422
(1.79 %)
5,010
(98.31 %)
4,683,703
(33.33 %)
964,129
(2.68 %)
13,948,305
(33.33 %)
0
(0 %)
784,749
(2.13 %)
69,725
(2.42 %)
63,619
(1.83 %)
278 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021)
GCA_000181335.6
n/a n/a 18,357
(1.55 %)
20,085
(1.38 %)
n/a 41.76
(98.18 %)
350
(1.72 %)
422
(1.82 %)
1,254
(98.28 %)
4,661,997
(33.78 %)
947,221
(2.58 %)
13,867,949
(33.67 %)
0
(0 %)
696,984
(2.13 %)
68,011
(2.41 %)
62,123
(1.82 %)
279 domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U)
GCF_018350175.1
99,222
(4.40 %)
n/a 18,456
(1.66 %)
19,833
(1.39 %)
94,133
(5.63 %)
41.81
(100.00 %)
31
(0.00 %)
39
(0.00 %)
102
(100.00 %)
4,965,571
(43.65 %)
932,424
(1.95 %)
13,596,808
(33.85 %)
0
(0 %)
555,637
(1.52 %)
67,329
(2.48 %)
60,307
(2.00 %)
280 domestic cattle (Mongolian 80415 2024)
GCA_043882115.1
n/a n/a 19,213
(1.34 %)
21,950
(1.20 %)
n/a 43.41
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
46
(100.00 %)
6,723,585
(53.11 %)
1,123,913
(13.40 %)
12,798,664
(48.31 %)
0
(0 %)
2,143,284
(5.09 %)
85,793
(6.20 %)
41,005
(4.56 %)
281 domestic cattle (Tuli MAZUNGA 2024)
GCA_040285425.1
n/a n/a 19,454
(1.36 %)
22,081
(1.21 %)
n/a 44.04
(99.98 %)
0
(0 %)
31
(0.02 %)
878
(100.00 %)
6,506,177
(50.93 %)
1,038,848
(13.71 %)
11,547,434
(49.22 %)
0
(0 %)
2,025,362
(5.06 %)
84,199
(8.81 %)
51,490
(6.94 %)
282 domestic cattle (Wagyu 3DWFS0412 2024)
GCA_040286185.1
n/a n/a 19,252
(1.32 %)
22,269
(1.20 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
5
(0.01 %)
17
(0.04 %)
407
(99.99 %)
6,783,665
(51.29 %)
1,072,289
(13.17 %)
12,697,022
(49.18 %)
1
(0.00 %)
2,150,279
(5.22 %)
89,666
(8.32 %)
49,463
(7.02 %)
283 domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020)
GCF_011764305.1
68,868
(3.09 %)
n/a 19,019
(1.55 %)
21,812
(1.42 %)
n/a 41.90
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,224
(100.00 %)
4,650,028
(39.49 %)
745,115
(2.02 %)
13,758,447
(36.14 %)
0
(0 %)
1,196,360
(3.06 %)
58,684
(2.16 %)
59,034
(1.99 %)
284 domestic ferret (Sable 2011 Broad)
GCA_000239315.1
n/a n/a 18,778
(1.67 %)
19,571
(1.47 %)
n/a 41.48
(96.89 %)
72,670
(3.12 %)
72,670
(3.12 %)
76,914
(96.88 %)
4,491,876
(40.13 %)
618,556
(1.07 %)
13,721,938
(31.04 %)
1,362
(0.02 %)
377,830
(1.02 %)
54,600
(1.94 %)
53,359
(1.69 %)
285 domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023)
GCF_034190915.1
79,333
(3.55 %)
n/a 17,999
(1.09 %)
21,509
(1.20 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
84
(0.00 %)
84
(0.00 %)
672
(100.00 %)
5,037,431
(41.68 %)
886,785
(13.97 %)
14,620,284
(42.71 %)
1
(0.00 %)
2,850,832
(6.00 %)
39,682
(0.89 %)
26,858
(0.57 %)
286 domestic guinea pig (2N 2008 refseq)
GCF_000151735.1
44,762
(2.31 %)
n/a 18,301
(1.33 %)
20,111
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
58,460
(2.20 %)
61,604
(97.80 %)
4,257,852
(38.85 %)
658,533
(1.25 %)
14,547,726
(34.19 %)
3
(0.00 %)
423,409
(1.39 %)
37,093
(0.85 %)
27,300
(0.63 %)
287 domestic yak (maiwa yakHY00 2019)
GCA_005887515.3
n/a n/a 18,672
(1.39 %)
19,408
(1.24 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
0
(0 %)
646
(0.00 %)
343
(100.00 %)
3,570,978
(23.00 %)
583,762
(8.57 %)
14,055,227
(40.52 %)
0
(0 %)
2,774,518
(21.40 %)
43,883
(1.17 %)
40,029
(0.94 %)
288 domestic yak (Pamir PY7600 2026)
GCF_055505025.1
139,812
(4.26 %)
n/a 19,009
(1.56 %)
21,215
(1.34 %)
n/a 41.90
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
31
(100.00 %)
6,364,775
(50.31 %)
452,332
(1.58 %)
12,984,103
(41.16 %)
0
(0 %)
1,211,736
(3.33 %)
41,459
(1.23 %)
37,045
(1.01 %)
289 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1
n/a n/a 18,354
(1.22 %)
20,434
(1.08 %)
n/a 40.65
(100.00 %)
0
(0 %)
96
(0.00 %)
198
(100.00 %)
4,458,084
(33.00 %)
444,499
(1.79 %)
15,031,940
(47.42 %)
0
(0 %)
508,936
(1.29 %)
29,863
(0.83 %)
24,007
(0.54 %)
290 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1
n/a n/a 18,538
(1.23 %)
20,775
(1.09 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
0
(0 %)
89
(0.00 %)
167
(100.00 %)
4,455,227
(33.01 %)
444,021
(1.73 %)
14,946,847
(47.37 %)
1
(0.00 %)
504,439
(1.27 %)
29,828
(0.79 %)
24,008
(0.54 %)
291 dwarf bonneted bat (hap1 2026)
GCA_058972175.1
n/a n/a 19,701
(1.66 %)
22,894
(1.55 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
91
(0.00 %)
159
(100.00 %)
4,868,188
(46.76 %)
814,580
(2.65 %)
11,250,323
(40.87 %)
3
(0.00 %)
1,229,968
(3.85 %)
94,798
(3.08 %)
78,015
(2.28 %)
292 dwarf bonneted bat (hap2 2026)
GCA_058971805.1
n/a n/a 19,646
(1.68 %)
22,856
(1.56 %)
n/a 42.89
(100.00 %)
0
(0 %)
112
(0.00 %)
114
(100.00 %)
4,830,940
(46.92 %)
798,083
(2.59 %)
11,230,678
(40.34 %)
2
(0.00 %)
1,205,198
(3.81 %)
94,036
(3.05 %)
77,444
(2.27 %)
293 dwarf fruit-eating bat (hap1 2025)
GCA_051107565.1
n/a n/a 17,834
(1.67 %)
19,738
(1.55 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
77
(0.00 %)
106
(100.00 %)
3,731,962
(43.43 %)
377,985
(3.87 %)
11,915,741
(34.43 %)
1
(0.00 %)
527,224
(2.07 %)
72,159
(2.56 %)
55,565
(2.04 %)
294 dwarf fruit-eating bat (hap2 2025)
GCA_051107595.1
n/a n/a 16,790
(1.71 %)
18,246
(1.55 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
102
(100.00 %)
3,412,455
(42.90 %)
339,875
(3.98 %)
10,947,746
(33.73 %)
2
(0.00 %)
468,703
(1.96 %)
65,083
(2.56 %)
50,711
(2.13 %)
295 dwarf mongoose
GCA_004023845.1
n/a n/a 21,478
(1.57 %)
32,174
(1.43 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
10,815
(0.05 %)
10,815
(0.05 %)
200,185
(99.95 %)
4,574,991
(40.34 %)
595,520
(1.11 %)
13,720,585
(32.94 %)
42
(0.00 %)
180,761
(0.49 %)
70,689
(2.42 %)
67,427
(2.05 %)
296 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1
n/a n/a 18,522
(1.26 %)
22,314
(1.28 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
0
(0 %)
316
(0.00 %)
99
(100.00 %)
3,699,683
(20.55 %)
935,350
(11.22 %)
13,112,318
(44.07 %)
1
(0.00 %)
n/a 99,224
(2.27 %)
68,695
(1.75 %)
297 eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022)
GCA_921998335.2
n/a n/a 21,903
(2.13 %)
19,801
(1.40 %)
108,675
(4.42 %)
41.79
(99.89 %)
3
(0.00 %)
207
(0.11 %)
211
(100.00 %)
4,630,645
(40.56 %)
1,531,506
(3.70 %)
13,011,312
(35.48 %)
2
(0.00 %)
816,051
(2.46 %)
22,270
(0.54 %)
15,877
(0.42 %)
298 eastern mole
GCA_004024925.1
n/a n/a 19,631
(1.57 %)
32,414
(1.63 %)
n/a 42.02
(99.91 %)
7,239
(0.03 %)
7,239
(0.03 %)
647,535
(99.97 %)
3,145,725
(29.42 %)
554,620
(1.75 %)
10,663,504
(32.88 %)
18
(0.00 %)
n/a 55,063
(3.69 %)
48,440
(3.22 %)
299 eastern quoll
GCA_020854095.1
n/a n/a 15,715
(0.80 %)
16,750
(0.93 %)
n/a 36.19
(100.00 %)
0
(0 %)
431
(0.00 %)
76
(100.00 %)
5,256,999
(24.81 %)
1,280,160
(3.39 %)
21,362,866
(41.74 %)
2
(0.00 %)
642,432
(1.62 %)
24,508
(0.70 %)
24,041
(0.54 %)
300 eastern spiny mouse (2021)
GCA_907164435.1
n/a n/a 20,397
(1.93 %)
20,515
(1.44 %)
n/a 42.68
(98.12 %)
3,526
(0.10 %)
109,220
(1.90 %)
19,837
(99.90 %)
4,701,702
(33.98 %)
1,304,933
(2.91 %)
13,145,044
(31.05 %)
6,458
(0.04 %)
453,997
(1.14 %)
19,636
(0.56 %)
18,226
(0.51 %)
301 eastern woodrat (hap1 2025)
GCA_050000055.1
n/a n/a 19,460
(1.37 %)
22,249
(1.25 %)
n/a 40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
154
(0.00 %)
1,382
(100.00 %)
7,741,791
(54.00 %)
2,194,305
(10.09 %)
13,803,906
(42.49 %)
2
(0.00 %)
3,045,177
(5.33 %)
22,114
(0.48 %)
18,925
(0.39 %)
302 eastern woodrat (hap2 2025)
GCA_050000045.1
n/a n/a 18,460
(1.50 %)
21,237
(1.36 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
0
(0 %)
154
(0.00 %)
942
(100.00 %)
6,975,151
(51.59 %)
1,843,248
(8.41 %)
12,873,831
(39.03 %)
1
(0.00 %)
2,293,923
(4.56 %)
20,366
(0.52 %)
17,751
(0.43 %)
303 Egyptian rousette (1219 2016 Boston U)
GCF_001466805.2
54,791
(4.93 %)
n/a 18,221
(2.05 %)
24,192
(1.88 %)
46,601
(2.22 %)
40.02
(99.97 %)
0
(0 %)
638
(0.03 %)
2,490
(100.00 %)
2,815,693
(32.23 %)
440,119
(1.01 %)
12,346,041
(26.86 %)
0
(0 %)
74,090
(0.43 %)
56,244
(6.54 %)
61,126
(5.16 %)
304 Egyptian rousette (primary hap 2025)
GCA_014176215.2
n/a n/a 17,319
(2.06 %)
22,433
(1.85 %)
n/a 40.05
(98.63 %)
0
(0 %)
250
(1.37 %)
27
(100.00 %)
3,010,528
(35.56 %)
434,429
(1.02 %)
12,031,135
(26.53 %)
0
(0 %)
65,582
(0.33 %)
53,517
(6.74 %)
57,229
(5.18 %)
305 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1
65,163
(4.76 %)
n/a 17,642
(2.07 %)
22,317
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
0
(0 %)
242
(1.41 %)
29
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,414
(1.02 %)
12,031,597
(26.52 %)
0
(0 %)
65,562
(0.33 %)
53,573
(4.84 %)
57,281
(4.47 %)
306 Egyptian spiny mouse (US019 2019)
GCA_004027535.1
n/a n/a 23,498
(1.69 %)
36,970
(1.40 %)
30,076
(1.58 %)
42.71
(99.88 %)
20,469
(0.09 %)
20,469
(0.09 %)
391,811
(99.91 %)
4,983,574
(35.17 %)
1,342,514
(3.45 %)
13,029,270
(32.79 %)
32
(0.00 %)
n/a 19,944
(0.55 %)
18,844
(0.51 %)
307 Eld's deer (hap2 2026)
GCA_054824845.1
n/a n/a 19,521
(1.50 %)
22,180
(1.33 %)
n/a 42.69
(100.00 %)
0
(0 %)
397
(0.00 %)
902
(100.00 %)
5,867,476
(52.38 %)
497,079
(9.42 %)
13,109,210
(43.24 %)
10
(0.00 %)
1,218,313
(3.33 %)
54,156
(1.66 %)
43,734
(1.18 %)
308 elk (wapiti)
GCF_019320065.1
66,846
(3.00 %)
n/a 20,090
(1.67 %)
21,999
(1.44 %)
n/a 41.62
(99.93 %)
0
(0 %)
6,643
(0.08 %)
185
(100.00 %)
4,884,711
(43.14 %)
429,925
(1.65 %)
13,135,255
(37.85 %)
78
(0.00 %)
802,680
(2.76 %)
47,099
(1.31 %)
44,586
(1.19 %)
309 ermine (2020)
GCF_009829155.1
74,345
(3.19 %)
n/a 18,855
(1.65 %)
20,667
(1.43 %)
44,584
(2.07 %)
41.56
(99.12 %)
0
(0 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,647,934
(41.44 %)
714,174
(1.30 %)
13,845,904
(33.42 %)
3
(0.01 %)
452,963
(1.26 %)
56,065
(2.25 %)
56,447
(2.07 %)
310 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1
n/a n/a 13,583
(1.65 %)
15,403
(1.46 %)
n/a 41.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,327
(100.00 %)
3,139,035
(40.57 %)
480,111
(1.29 %)
9,106,061
(31.93 %)
0
(0 %)
342,175
(1.40 %)
39,139
(2.25 %)
38,863
(2.02 %)
311 ermine (hap1.1 2025)
GCA_965636865.1
n/a n/a 18,538
(1.35 %)
23,646
(1.36 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
212
(0.00 %)
1,036
(100.00 %)
6,455,322
(46.66 %)
881,285
(5.47 %)
13,096,768
(42.14 %)
4
(0.00 %)
1,333,576
(3.60 %)
93,973
(3.17 %)
56,856
(1.86 %)
312 ermine (hap2.1 2025)
GCA_965636855.1
n/a n/a 17,654
(1.42 %)
22,483
(1.40 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
139
(0.00 %)
139
(0.00 %)
1,083
(100.00 %)
5,945,296
(44.94 %)
800,358
(4.39 %)
12,526,091
(40.11 %)
3
(0.00 %)
1,020,366
(2.96 %)
85,220
(2.90 %)
53,568
(1.87 %)
313 ermine (primary hap 2020)
GCA_009829155.1
n/a n/a 18,855
(1.65 %)
20,668
(1.43 %)
n/a 41.56
(99.12 %)
0
(0 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,647,997
(41.44 %)
714,178
(1.30 %)
13,845,820
(33.42 %)
3
(0.01 %)
530,336
(1.47 %)
56,065
(2.25 %)
56,448
(2.07 %)
314 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1
n/a n/a 19,332
(1.42 %)
22,424
(1.40 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
0
(0 %)
27
(0.00 %)
726
(100.00 %)
4,362,536
(31.74 %)
801,232
(4.02 %)
13,893,672
(37.73 %)
1
(0.00 %)
1,089,255
(2.94 %)
65,806
(4.13 %)
53,831
(1.83 %)
315 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2
n/a n/a 19,268
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
41,043
(1.93 %)
42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,417,203
(31.72 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,720
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,257
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
54,563
(1.83 %)
316 Eurasian beaver (alternate hap 2025)
GCA_977035955.1
n/a n/a 14,184
(1.28 %)
14,518
(1.21 %)
n/a 40.16
(99.94 %)
12,413
(0.06 %)
12,413
(0.06 %)
17,640
(99.94 %)
2,894,516
(33.23 %)
469,512
(3.63 %)
8,909,825
(39.95 %)
354
(0.02 %)
873,169
(9.81 %)
18,772
(1.65 %)
14,598
(0.48 %)
317 Eurasian beaver (primary hap 2025)
GCA_977036005.1
n/a n/a 20,316
(1.47 %)
20,429
(1.25 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
0
(0 %)
237
(0.00 %)
228
(100.00 %)
4,115,552
(36.09 %)
562,383
(2.69 %)
14,321,638
(36.02 %)
3
(0.00 %)
763,351
(2.48 %)
24,219
(0.75 %)
24,015
(0.66 %)
318 Eurasian field mouse (2024)
GCA_964023405.1
n/a n/a 20,487
(1.88 %)
19,707
(1.34 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
0
(0 %)
182
(0.00 %)
61
(100.00 %)
5,115,510
(39.18 %)
1,868,284
(4.29 %)
13,503,826
(37.29 %)
2
(0.00 %)
1,262,006
(3.13 %)
26,414
(0.61 %)
24,636
(0.56 %)
319 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1
n/a n/a 12,437
(1.51 %)
12,702
(1.22 %)
n/a 40.06
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
10,657
(100.00 %)
2,303,176
(35.38 %)
353,996
(1.49 %)
7,218,556
(31.67 %)
0
(0 %)
194,541
(1.24 %)
24,268
(1.07 %)
22,754
(0.97 %)
320 Eurasian red squirrel (primary hap 2019)
GCF_902686455.1
65,975
(3.30 %)
n/a 20,156
(1.54 %)
21,025
(1.36 %)
n/a 40.08
(94.33 %)
1,177
(5.67 %)
1,177
(5.67 %)
1,815
(94.33 %)
5,315,833
(42.85 %)
704,218
(1.42 %)
14,991,523
(31.49 %)
5
(0.00 %)
419,661
(1.29 %)
48,159
(1.04 %)
38,984
(0.85 %)
321 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2
n/a n/a 21,309
(1.58 %)
21,026
(1.36 %)
33,465
(1.53 %)
40.08
(94.33 %)
0
(0 %)
1,177
(5.67 %)
639
(100.00 %)
4,677,412
(35.73 %)
704,218
(1.42 %)
14,992,063
(31.49 %)
5
(0.00 %)
419,661
(1.29 %)
48,159
(1.04 %)
45,470
(0.95 %)
322 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1
67,269
(2.96 %)
n/a 18,842
(1.54 %)
20,178
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
0
(0 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,259,294
(33.39 %)
713,721
(1.36 %)
13,626,048
(34.37 %)
1
(0.00 %)
695,796
(1.86 %)
57,073
(1.82 %)
47,446
(1.36 %)
323 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1
n/a n/a 9,910
(1.59 %)
11,315
(1.31 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,506
(100.00 %)
2,052,338
(42.25 %)
316,084
(1.64 %)
6,222,460
(33.12 %)
0
(0 %)
291,189
(1.91 %)
27,057
(1.96 %)
26,047
(1.75 %)
324 Eurasian river otter (primary hap 2020)
GCA_902655055.2
n/a n/a 19,133
(1.66 %)
20,177
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
0
(0 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,736,483
(42.28 %)
713,721
(1.36 %)
13,625,976
(34.37 %)
1
(0.00 %)
695,796
(1.86 %)
57,073
(1.82 %)
54,770
(1.64 %)
325 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1
n/a n/a 16,761
(1.66 %)
19,715
(1.37 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
105
(0.00 %)
105
(0.00 %)
16,473
(100.00 %)
3,118,266
(26.44 %)
829,463
(2.82 %)
9,700,482
(31.37 %)
0
(0 %)
353,652
(1.44 %)
14,146
(0.57 %)
12,571
(0.45 %)
326 Eurasian water vole (primary hap 2021)
GCA_903992535.2
n/a n/a 19,126
(1.84 %)
19,054
(1.47 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
5,439,454
(42.21 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,486
(32.42 %)
5
(0.00 %)
518,665
(1.69 %)
19,000
(0.58 %)
17,235
(0.51 %)
327 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
n/a 19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
36,935
(2.27 %)
42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
5
(0.00 %)
518,667
(1.69 %)
19,000
(0.58 %)
16,851
(0.46 %)
328 European badger
GCF_922984935.2
57,137
(2.48 %)
n/a 18,649
(1.45 %)
22,117
(1.36 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
537
(100.00 %)
6,255,467
(47.25 %)
821,660
(4.02 %)
13,814,631
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,257
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
59,502
(2.13 %)
329 European free-tailed bat (hap1.1 2025)
GCA_976988885.1
n/a n/a 19,367
(1.49 %)
21,955
(1.44 %)
n/a 42.35
(100.00 %)
0
(0 %)
174
(0.00 %)
641
(100.00 %)
4,439,364
(40.01 %)
680,470
(8.16 %)
11,487,613
(43.09 %)
1
(0.00 %)
1,686,945
(5.56 %)
73,991
(1.99 %)
48,950
(1.14 %)
330 European free-tailed bat (hap2.1 2025)
GCA_976988855.1
n/a n/a 19,630
(1.68 %)
21,945
(1.52 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
121
(0.00 %)
370
(100.00 %)
4,242,872
(41.74 %)
637,498
(4.18 %)
11,360,772
(39.15 %)
0
(0 %)
1,095,513
(3.93 %)
69,324
(2.22 %)
54,969
(1.59 %)
331 European ground squirrel (alternate hap 2024)
GCA_964194095.1
n/a n/a 15,410
(1.11 %)
21,126
(1.11 %)
n/a 39.96
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28,045
(100.00 %)
3,186,054
(30.28 %)
656,568
(16.12 %)
9,975,571
(43.35 %)
0
(0 %)
1,969,114
(6.28 %)
28,808
(1.24 %)
18,867
(0.50 %)
332 European ground squirrel (primary hap 2024)
GCF_964194105.1
58,589
(2.31 %)
n/a 20,075
(1.28 %)
20,268
(1.19 %)
n/a 39.90
(99.99 %)
1,436
(0.01 %)
1,436
(0.01 %)
1,933
(99.99 %)
4,479,230
(31.86 %)
882,536
(12.27 %)
14,881,793
(41.66 %)
9
(0.00 %)
1,303,088
(3.18 %)
39,275
(0.88 %)
27,165
(0.54 %)
333 European hare (LE1 primary hap 2023)
GCF_033115175.1
46,528
(2.09 %)
n/a 19,392
(1.25 %)
23,070
(1.29 %)
n/a 44.03
(100.00 %)
0
(0 %)
418
(0.00 %)
651
(100.00 %)
4,011,592
(19.81 %)
1,000,204
(8.44 %)
13,414,251
(44.25 %)
2
(0.00 %)
2,116,577
(4.63 %)
98,831
(2.33 %)
72,807
(1.75 %)
334 European harvest mouse
GCF_963924665.1
35,455
(1.84 %)
n/a 20,235
(1.71 %)
19,365
(1.32 %)
n/a 40.05
(99.99 %)
0
(0 %)
2,020
(0.02 %)
893
(100.00 %)
5,424,328
(37.31 %)
1,223,387
(18.26 %)
11,906,806
(42.51 %)
10
(0.00 %)
4,662,981
(9.87 %)
17,423
(0.62 %)
15,264
(0.35 %)
335 European harvest mouse (alternate hap 2024)
GCA_963924645.1
n/a n/a 3,404
(1.16 %)
2,956
(0.83 %)
n/a 39.56
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,020
(100.00 %)
741,789
(44.38 %)
265,801
(43.28 %)
1,048,943
(61.65 %)
0
(0 %)
2,121,819
(24.22 %)
3,244
(3.57 %)
1,742
(0.22 %)
336 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1
n/a n/a 20,236
(1.71 %)
19,368
(1.32 %)
n/a 40.05
(99.99 %)
0
(0 %)
2,020
(0.02 %)
894
(100.00 %)
4,892,811
(36.49 %)
1,223,387
(18.26 %)
11,907,631
(42.51 %)
10
(0.00 %)
4,679,739
(9.91 %)
17,423
(0.62 %)
15,264
(0.35 %)
337 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1
n/a n/a 15,419
(1.50 %)
21,175
(1.51 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 12,043
(100.00 %)
2,952,218
(30.62 %)
538,508
(2.18 %)
9,303,303
(34.20 %)
0
(0 %)
511,888
(2.10 %)
47,810
(2.50 %)
39,732
(1.82 %)
338 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1
69,556
(3.13 %)
n/a 18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
25
(100.00 %)
4,237,791
(30.90 %)
792,897
(2.69 %)
13,417,195
(36.59 %)
0
(0 %)
894,272
(2.55 %)
67,132
(2.54 %)
51,333
(1.62 %)
339 European mole (hap1 2024)
GCA_964194135.1
n/a n/a 18,085
(1.69 %)
19,509
(1.58 %)
n/a 42.08
(99.99 %)
0
(0 %)
1,056
(0.01 %)
464
(100.00 %)
2,569,380
(23.32 %)
565,465
(2.18 %)
10,506,666
(33.68 %)
42
(0.00 %)
704,393
(2.62 %)
46,367
(3.09 %)
42,313
(2.40 %)
340 European mole (hap2 2024)
GCA_964194205.1
n/a n/a 18,064
(1.69 %)
19,764
(1.59 %)
n/a 42.07
(99.99 %)
1,040
(0.01 %)
1,040
(0.01 %)
1,396
(99.99 %)
2,567,492
(23.34 %)
570,250
(2.16 %)
10,485,959
(33.56 %)
30
(0.00 %)
702,644
(2.60 %)
46,213
(3.27 %)
42,349
(2.41 %)
341 European mole (mTalEur1.hap1.1 2024)
GCF_964194135.1
32,332
(1.69 %)
n/a 17,635
(1.77 %)
19,511
(1.58 %)
n/a 42.08
(99.99 %)
1,056
(0.01 %)
1,056
(0.01 %)
1,519
(99.99 %)
4,036,401
(41.00 %)
565,464
(2.18 %)
10,506,260
(33.68 %)
42
(0.00 %)
704,393
(2.62 %)
46,366
(3.09 %)
37,444
(3.02 %)
342 European pine marten
GCF_963455335.1
39,266
(2.23 %)
n/a 17,953
(1.59 %)
20,814
(1.41 %)
n/a 42.38
(99.98 %)
0
(0 %)
2,250
(0.02 %)
476
(100.00 %)
5,504,277
(42.55 %)
707,333
(3.28 %)
13,714,536
(34.73 %)
10
(0.00 %)
600,686
(1.77 %)
61,480
(4.29 %)
56,832
(3.43 %)
343 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1
n/a n/a 18,336
(1.50 %)
20,807
(1.41 %)
n/a 42.38
(99.98 %)
0
(0 %)
2,250
(0.02 %)
477
(100.00 %)
4,096,160
(31.55 %)
707,337
(3.28 %)
13,715,382
(34.73 %)
10
(0.00 %)
626,861
(1.84 %)
61,481
(4.29 %)
56,462
(1.94 %)
344 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1
n/a n/a 17,506
(1.26 %)
25,527
(1.52 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,699
(100.00 %)
2,400,784
(15.19 %)
1,062,793
(3.20 %)
13,284,496
(41.93 %)
0
(0 %)
768,770
(2.06 %)
77,009
(2.86 %)
75,481
(2.15 %)
345 European shrew (GB8-d 2012)
GCF_000181275.1
23,525
(1.54 %)
n/a 17,290
(1.33 %)
22,005
(1.50 %)
n/a 42.90
(90.49 %)
188,953
(9.54 %)
188,953
(9.54 %)
201,798
(90.46 %)
4,400,127
(33.22 %)
946,629
(2.03 %)
13,377,581
(35.30 %)
3,389
(0.06 %)
410,333
(1.21 %)
77,851
(2.58 %)
76,553
(1.98 %)
346 European shrew (primary hap 2023 genbank)
GCA_027595985.1
n/a n/a 17,481
(1.26 %)
22,511
(1.43 %)
n/a 43.24
(99.46 %)
0
(0 %)
1,427
(0.54 %)
66
(100.00 %)
2,474,589
(15.18 %)
1,107,886
(3.28 %)
13,638,525
(41.72 %)
10
(0.00 %)
n/a 79,786
(2.86 %)
77,901
(2.13 %)
347 European shrew (primary hap 2023 refseq)
GCF_027595985.1
44,643
(2.60 %)
n/a 17,479
(1.26 %)
21,293
(1.37 %)
n/a 43.24
(99.46 %)
0
(0 %)
1,427
(0.54 %)
65
(100.00 %)
2,474,584
(15.18 %)
1,107,884
(3.28 %)
13,638,467
(41.72 %)
10
(0.00 %)
822,159
(2.15 %)
79,785
(2.86 %)
77,901
(2.13 %)
348 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1
n/a n/a 18,364
(1.79 %)
20,379
(1.63 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,256
(100.00 %)
3,049,618
(22.22 %)
852,708
(4.50 %)
10,501,392
(33.34 %)
0
(0 %)
706,136
(2.67 %)
17,629
(0.60 %)
15,048
(0.47 %)
349 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1
47,025
(2.69 %)
n/a 19,592
(1.78 %)
21,173
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
197
(0.00 %)
160
(100.00 %)
5,048,186
(44.12 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,053
(34.97 %)
4
(0.00 %)
954,164
(3.20 %)
20,725
(0.63 %)
18,727
(0.52 %)
350 European suslik (primary hap 2024)
GCA_964194105.1
n/a n/a 20,075
(1.28 %)
20,274
(1.19 %)
n/a 39.90
(99.99 %)
4
(0.00 %)
1,436
(0.01 %)
502
(100.00 %)
4,357,247
(31.78 %)
882,536
(12.27 %)
14,882,486
(41.66 %)
9
(0.00 %)
1,833,125
(4.49 %)
39,275
(0.88 %)
27,165
(0.54 %)
351 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1
54,113
(2.24 %)
n/a 19,959
(1.65 %)
19,953
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
0
(0 %)
1,129
(0.01 %)
497
(100.00 %)
4,863,650
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,732
(40.58 %)
17
(0.00 %)
2,516,593
(5.37 %)
23,961
(0.53 %)
17,318
(0.36 %)
352 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1
n/a n/a 18,692
(1.72 %)
22,021
(1.36 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
10,863
(100.00 %)
4,055,957
(36.08 %)
1,513,576
(9.53 %)
11,306,811
(39.67 %)
0
(0 %)
1,995,176
(5.07 %)
20,865
(0.55 %)
15,533
(0.39 %)
353 fallow deer (Ldn47 2023)
GCF_033118175.1
57,013
(2.35 %)
n/a 20,187
(1.33 %)
23,290
(1.33 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
44
(0.00 %)
284
(100.00 %)
3,308,241
(20.72 %)
513,748
(18.20 %)
12,996,819
(48.19 %)
0
(0 %)
5,629,434
(11.23 %)
214,480
(2.98 %)
41,647
(0.85 %)
354 fallow deer (maternal hap SK-2024 2025)
GCA_048126745.1
n/a n/a 20,072
(1.51 %)
22,668
(1.37 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
65
(0.00 %)
147
(0.00 %)
1,369
(100.00 %)
4,623,335
(34.75 %)
475,143
(7.51 %)
13,000,703
(41.56 %)
1
(0.00 %)
2,295,952
(5.37 %)
112,581
(2.00 %)
41,372
(0.95 %)
355 fallow deer (paternal hap SK-2024 2025)
GCA_048127045.1
n/a n/a 18,238
(1.57 %)
20,307
(1.42 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
78
(0.00 %)
242
(0.00 %)
388
(100.00 %)
4,244,450
(35.89 %)
405,446
(2.83 %)
12,211,643
(38.55 %)
0
(0 %)
937,470
(2.69 %)
52,418
(1.36 %)
34,784
(0.91 %)
356 false killer whale (hap1 2024 genbank)
GCA_039906515.1
n/a n/a 18,718
(1.50 %)
20,929
(1.32 %)
n/a 42.08
(99.90 %)
0
(0 %)
123
(0.10 %)
439
(100.00 %)
3,958,932
(35.76 %)
1,002,329
(11.61 %)
12,193,131
(41.85 %)
3
(0.00 %)
1,441,777
(4.23 %)
79,158
(3.74 %)
41,701
(1.03 %)
357 false killer whale (hap1 2024 refseq)
GCF_039906515.1
75,958
(3.31 %)
n/a 18,718
(1.50 %)
20,982
(1.32 %)
n/a 42.08
(99.90 %)
0
(0 %)
123
(0.10 %)
438
(100.00 %)
3,958,926
(35.76 %)
1,002,329
(11.61 %)
12,193,061
(41.85 %)
3
(0.00 %)
1,441,777
(4.23 %)
79,158
(3.74 %)
41,701
(1.03 %)
358 false killer whale (hap2 2024)
GCA_039906525.1
n/a n/a 17,866
(1.45 %)
21,079
(1.46 %)
n/a 42.37
(99.08 %)
0
(0 %)
133
(0.92 %)
416
(100.00 %)
3,852,502
(34.98 %)
1,112,185
(16.42 %)
11,435,533
(44.17 %)
1
(0.00 %)
1,686,603
(5.16 %)
75,215
(4.36 %)
39,963
(0.98 %)
359 fat dormouse (US078 2019)
GCA_004027185.1
n/a n/a 23,122
(1.24 %)
48,677
(1.27 %)
n/a 42.33
(99.92 %)
10,685
(0.04 %)
10,685
(0.04 %)
444,115
(99.96 %)
6,783,404
(37.03 %)
1,642,515
(3.72 %)
12,706,289
(39.97 %)
58
(0.00 %)
n/a 65,521
(1.47 %)
33,794
(0.75 %)
360 fat sand rat (mPsaObe1 2021)
GCF_907164565.1
43,224
(2.50 %)
n/a 18,543
(1.78 %)
20,094
(1.42 %)
n/a 41.95
(99.11 %)
0
(0 %)
50,482
(0.90 %)
11,389
(100.00 %)
4,686,377
(43.10 %)
920,563
(1.85 %)
12,813,848
(35.08 %)
2,665
(0.03 %)
294,151
(0.96 %)
22,480
(0.71 %)
20,772
(0.63 %)
361 fat sand rat (Psa_ob012049795 2017)
GCA_002215935.1
n/a n/a 21,644
(1.71 %)
31,665
(1.41 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 96,427
(100.00 %)
4,646,110
(38.87 %)
946,664
(2.24 %)
13,134,526
(33.94 %)
0
(0 %)
232,939
(1.07 %)
26,411
(0.73 %)
24,961
(0.66 %)
362 fat-tailed dunnart (SCR6 2025)
GCF_048593235.1
60,212
(2.43 %)
n/a 15,763
(0.77 %)
16,031
(0.89 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
0
(0 %)
1,908
(0.01 %)
8
(100.00 %)
5,302,378
(24.47 %)
1,450,227
(3.79 %)
20,870,714
(44.26 %)
5
(0.00 %)
628,150
(1.54 %)
24,586
(0.65 %)
24,216
(0.53 %)
363 fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025)
GCA_048593235.1
n/a n/a 15,762
(0.77 %)
16,035
(0.89 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
1,908
(0.01 %)
1,908
(0.01 %)
1,915
(99.99 %)
5,302,372
(24.47 %)
1,450,220
(3.79 %)
20,870,654
(44.26 %)
5
(0.00 %)
1,034,421
(2.56 %)
24,585
(0.65 %)
24,216
(0.53 %)
364 fat-tailed dunnart (SCR6 hap2 2025)
GCA_048593295.1
n/a n/a 16,012
(0.77 %)
16,430
(0.90 %)
n/a 36.18
(99.99 %)
1,730
(0.01 %)
1,730
(0.01 %)
1,737
(99.99 %)
5,361,847
(24.48 %)
1,474,744
(3.79 %)
21,021,671
(44.20 %)
6
(0.00 %)
1,053,897
(2.55 %)
25,669
(0.69 %)
25,354
(0.55 %)
365 fin whale (hap1.1 2025)
GCA_965194825.1
n/a n/a 19,491
(1.21 %)
22,538
(1.06 %)
n/a 42.19
(99.99 %)
0
(0 %)
1,516
(0.01 %)
2,612
(100.00 %)
4,598,236
(35.34 %)
1,716,315
(24.14 %)
12,260,919
(52.40 %)
7
(0.00 %)
3,173,278
(8.14 %)
82,683
(1.47 %)
44,824
(0.87 %)
366 fin whale (hap2.1 2025)
GCA_965194765.1
n/a n/a 18,684
(1.40 %)
21,322
(1.20 %)
n/a 41.87
(99.99 %)
1,258
(0.01 %)
1,258
(0.01 %)
3,706
(99.99 %)
4,103,716
(36.69 %)
1,030,821
(16.12 %)
11,633,934
(45.82 %)
11
(0.00 %)
1,843,351
(5.96 %)
74,782
(1.60 %)
42,885
(1.00 %)
367 finback whale
GCF_965194825.1
88,327
(5.86 %)
n/a 19,923
(1.28 %)
22,534
(1.06 %)
n/a 42.19
(99.99 %)
0
(0 %)
1,516
(0.01 %)
2,611
(100.00 %)
4,839,138
(57.33 %)
1,716,315
(24.14 %)
12,260,862
(52.40 %)
7
(0.00 %)
3,173,278
(8.14 %)
82,683
(1.47 %)
46,784
(1.09 %)
368 fishing cat (Anna 2022 U Missouri)
GCF_022837055.1
68,085
(2.86 %)
n/a 18,432
(1.63 %)
19,912
(1.37 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
0
(0 %)
63
(0.00 %)
192
(100.00 %)
4,777,906
(34.85 %)
937,432
(2.30 %)
13,438,032
(34.55 %)
0
(0 %)
654,267
(1.76 %)
70,402
(2.61 %)
68,720
(2.25 %)
369 Florida manatee (CSIC 2023)
GCA_030013775.1
n/a n/a 19,432
(1.24 %)
24,035
(1.14 %)
n/a 40.66
(100.00 %)
33
(0.00 %)
33
(0.00 %)
15,641
(100.00 %)
4,400,331
(33.07 %)
439,615
(1.04 %)
14,884,753
(46.98 %)
2
(0.00 %)
413,231
(1.00 %)
32,563
(0.80 %)
26,358
(0.59 %)
370 Florida manatee (Lorelei 2012 refseq)
GCF_000243295.1
39,664
(2.08 %)
n/a 18,308
(1.37 %)
20,588
(1.23 %)
32,868
(1.38 %)
40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
160,167
(10.78 %)
166,490
(89.22 %)
n/a 389,315
(0.74 %)
14,633,038
(38.46 %)
5,748
(0.06 %)
244,060
(0.64 %)
27,462
(0.64 %)
25,464
(0.54 %)
371 fossa
GCA_004023885.1
n/a n/a 21,156
(1.56 %)
29,809
(1.38 %)
n/a 41.51
(99.94 %)
6,335
(0.03 %)
6,335
(0.03 %)
470,371
(99.97 %)
4,962,168
(42.36 %)
814,639
(1.52 %)
13,708,904
(34.14 %)
29
(0.00 %)
263,077
(0.54 %)
78,033
(2.52 %)
74,289
(2.13 %)
372 Gambian giant pouched rat
GCA_004027575.1
n/a n/a 21,189
(1.59 %)
32,806
(1.43 %)
n/a 42.11
(99.88 %)
7,473
(0.03 %)
7,473
(0.03 %)
1,110,425
(99.97 %)
4,137,605
(24.57 %)
1,071,627
(2.76 %)
12,905,250
(32.78 %)
51
(0.00 %)
n/a 32,359
(0.80 %)
21,577
(0.55 %)
373 gaur (Gaur_Henry_Doorly_Zoo_5443 2020)
GCA_014182915.2
n/a n/a 19,130
(1.53 %)
21,239
(1.30 %)
n/a 41.83
(99.99 %)
0
(0 %)
2,194
(0.01 %)
635
(100.00 %)
6,520,228
(50.46 %)
466,916
(1.41 %)
13,425,286
(41.25 %)
0
(0 %)
1,230,155
(3.35 %)
41,833
(1.15 %)
36,947
(0.95 %)
374 gayal (CVASU_BF_001 2021)
GCA_017311355.1
n/a n/a 24,549
(1.09 %)
55,194
(1.15 %)
n/a 42.05
(99.91 %)
0
(0 %)
n/a 1,262,134
(100.00 %)
3,691,398
(22.78 %)
677,397
(2.00 %)
14,380,670
(42.36 %)
0
(0 %)
n/a 75,114
(1.33 %)
44,401
(0.88 %)
375 gayal (Nagaland 2019)
GCA_007844835.1
n/a n/a 22,715
(1.55 %)
23,635
(1.33 %)
n/a 41.67
(96.51 %)
301,761
(3.52 %)
301,761
(3.52 %)
306,776
(96.48 %)
6,243,468
(45.69 %)
518,664
(1.99 %)
15,147,647
(37.64 %)
5,199
(0.13 %)
1,060,226
(3.23 %)
45,586
(0.89 %)
40,275
(0.78 %)
376 Geoffroy's bat (hap1.1 2025)
GCA_965115925.1
n/a n/a 19,320
(1.74 %)
21,940
(1.65 %)
n/a 42.55
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,540
(0.01 %)
404
(100.00 %)
3,707,500
(37.60 %)
733,107
(7.78 %)
10,515,474
(39.35 %)
11
(0.00 %)
903,956
(3.14 %)
60,200
(2.41 %)
51,657
(1.64 %)
377 Geoffroy's bat (hap1.2 2025)
GCA_965115925.2
n/a n/a 18,831
(1.81 %)
22,032
(1.67 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
226
(0.00 %)
306
(100.00 %)
4,958,159
(48.46 %)
733,004
(7.77 %)
10,528,813
(39.34 %)
1
(0.00 %)
838,165
(2.87 %)
59,971
(2.41 %)
50,901
(1.98 %)
378 Geoffroy's bat (hap2.1 2025)
GCA_965115945.1
n/a n/a 18,718
(1.71 %)
20,961
(1.62 %)
n/a 42.29
(99.98 %)
1,597
(0.02 %)
1,597
(0.02 %)
2,101
(99.98 %)
3,662,405
(37.72 %)
717,069
(7.80 %)
10,298,372
(39.22 %)
11
(0.00 %)
842,144
(3.02 %)
56,300
(2.26 %)
45,967
(1.45 %)
379 Geoffroy's bat (hap2.2 2025)
GCA_965115945.2
n/a n/a 18,471
(1.79 %)
21,274
(1.64 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
264
(0.00 %)
418
(100.00 %)
4,911,358
(48.79 %)
719,004
(7.65 %)
10,340,272
(39.15 %)
5
(0.00 %)
657,146
(2.35 %)
56,616
(2.24 %)
46,407
(1.75 %)
380 Geoffroy's cat
GCF_018350155.1
85,344
(3.53 %)
n/a 18,469
(1.66 %)
19,516
(1.36 %)
93,795
(4.83 %)
41.75
(100.00 %)
35
(0.00 %)
45
(0.00 %)
82
(100.00 %)
5,021,854
(43.23 %)
930,175
(1.84 %)
13,757,469
(34.29 %)
0
(0 %)
627,614
(1.76 %)
65,918
(2.36 %)
58,825
(1.96 %)
381 Geoffroy's horseshoe bat (hap1 2026)
GCA_054645015.1
n/a n/a 18,745
(1.80 %)
21,820
(1.62 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
0
(0 %)
36
(0.00 %)
271
(100.00 %)
3,730,344
(39.95 %)
1,346,563
(3.86 %)
11,511,257
(32.29 %)
0
(0 %)
473,448
(1.73 %)
36,004
(1.17 %)
31,586
(0.98 %)
382 Geoffroy's horseshoe bat (hap2 2026)
GCA_054645025.1
n/a n/a 17,882
(1.88 %)
20,855
(1.70 %)
n/a 40.07
(100.00 %)
0
(0 %)
30
(0.00 %)
219
(100.00 %)
3,459,687
(38.78 %)
1,115,210
(3.49 %)
10,640,816
(29.99 %)
0
(0 %)
341,797
(1.40 %)
32,817
(1.14 %)
29,357
(0.98 %)
383 giant anteater
GCA_004026745.1
n/a n/a 24,383
(0.91 %)
44,315
(0.93 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
8,283
(0.02 %)
8,283
(0.02 %)
1,629,691
(99.98 %)
5,333,757
(35.57 %)
575,140
(0.91 %)
21,181,213
(39.97 %)
116
(0.00 %)
n/a 57,558
(0.94 %)
45,184
(0.73 %)
384 giant otter
GCA_004024605.1
n/a n/a 21,199
(1.46 %)
30,565
(1.34 %)
n/a 41.71
(99.93 %)
7,431
(0.03 %)
7,431
(0.03 %)
652,159
(99.97 %)
5,113,769
(41.55 %)
788,677
(1.46 %)
14,385,279
(35.77 %)
57
(0.00 %)
420,852
(0.84 %)
82,376
(2.05 %)
79,949
(1.87 %)
385 giant panda (Jingjing v3 2020)
GCF_002007445.2
65,481
(3.27 %)
n/a 19,077
(1.67 %)
20,176
(1.39 %)
n/a 41.68
(98.09 %)
0
(0 %)
189,277
(1.92 %)
73,514
(100.00 %)
4,012,144
(34.40 %)
617,803
(1.99 %)
14,216,587
(30.41 %)
9,430
(0.13 %)
581,226
(4.37 %)
59,449
(1.50 %)
54,779
(1.33 %)
386 goat (v2 San Clemente 2016 USDA)
GCF_001704415.2
47,172
(2.31 %)
n/a 19,342
(1.38 %)
22,346
(1.24 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
790
(0.00 %)
29,886
(100.00 %)
3,502,527
(22.45 %)
760,831
(7.07 %)
13,024,178
(44.85 %)
0
(0 %)
2,571,330
(5.65 %)
125,662
(4.00 %)
40,923
(0.89 %)
387 Gobi jerboa
GCA_004027895.1
n/a n/a 22,410
(0.91 %)
45,268
(1.02 %)
n/a 41.94
(99.88 %)
10,987
(0.04 %)
10,987
(0.04 %)
1,295,369
(99.96 %)
8,828,417
(40.19 %)
1,979,806
(6.43 %)
14,759,732
(47.73 %)
96
(0.00 %)
n/a 24,314
(0.52 %)
19,787
(0.39 %)
388 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1
67,831
(3.37 %)
n/a 19,354
(1.71 %)
19,863
(1.47 %)
69,903
(4.39 %)
42.04
(96.99 %)
711
(3.01 %)
711
(3.01 %)
7,058
(96.99 %)
3,981,818
(27.65 %)
976,456
(3.46 %)
12,580,903
(32.87 %)
25
(0.00 %)
766,407
(1.98 %)
21,268
(0.61 %)
18,135
(0.47 %)
389 golden hamster (Broad 2013 refseq)
GCF_000349665.1
42,636
(2.91 %)
37,986
(2.21 %)
18,976
(1.82 %)
19,149
(1.51 %)
29,936
(1.96 %)
42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
216,216
(17.12 %)
237,700
(82.88 %)
3,599,795
(26.09 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,956
(24.29 %)
3,589
(0.05 %)
254,929
(0.76 %)
18,591
(0.51 %)
17,093
(0.42 %)
390 golden jackal (CA01 2025)
GCF_053574225.1
115,457
(4.37 %)
n/a 19,332
(1.58 %)
21,009
(1.39 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
59
(0.00 %)
306
(100.00 %)
6,089,485
(46.31 %)
1,184,044
(5.44 %)
13,574,928
(35.96 %)
0
(0 %)
1,273,197
(3.07 %)
54,314
(2.19 %)
48,434
(1.90 %)
391 golden spiny mouse (2020 genbank)
GCA_903995435.1
n/a n/a 20,001
(1.90 %)
19,127
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
0
(0 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,976,496
(36.34 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,957,738
(32.33 %)
0
(0 %)
684,879
(1.84 %)
20,760
(0.59 %)
18,533
(0.52 %)
392 golden spiny mouse (2020 refseq)
GCF_903995435.1
36,997
(1.96 %)
n/a 20,006
(1.91 %)
19,132
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
0
(0 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,785,907
(32.61 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,958,061
(32.33 %)
0
(0 %)
684,879
(1.84 %)
20,760
(0.59 %)
18,457
(0.52 %)
393 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 genbank)
GCA_048772815.1
n/a n/a 20,967
(0.89 %)
24,137
(0.94 %)
n/a 39.52
(99.99 %)
0
(0 %)
1,448
(0.01 %)
8,087
(100.00 %)
5,547,018
(29.30 %)
1,312,047
(10.07 %)
15,174,898
(52.73 %)
10
(0.00 %)
5,076,603
(7.43 %)
40,182
(0.59 %)
29,493
(0.39 %)
394 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 refseq)
GCF_048772815.1
49,173
(1.30 %)
n/a 19,845
(0.90 %)
24,244
(0.94 %)
n/a 39.52
(99.99 %)
0
(0 %)
1,448
(0.01 %)
8,088
(100.00 %)
8,197,827
(62.01 %)
1,312,047
(10.07 %)
15,174,958
(52.73 %)
10
(0.00 %)
5,076,603
(7.43 %)
40,182
(0.59 %)
29,417
(0.42 %)
395 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 genbank)
GCA_048772825.1
n/a n/a 19,719
(1.16 %)
22,611
(1.21 %)
n/a 39.48
(100.00 %)
0
(0 %)
643
(0.00 %)
2,820
(100.00 %)
4,725,546
(31.70 %)
997,950
(3.53 %)
14,753,550
(39.53 %)
6
(0.00 %)
1,428,961
(3.10 %)
33,465
(0.69 %)
26,996
(0.48 %)
396 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 refseq)
GCF_048772825.1
46,395
(1.71 %)
n/a 18,853
(1.19 %)
22,613
(1.21 %)
n/a 39.48
(100.00 %)
0
(0 %)
643
(0.00 %)
2,821
(100.00 %)
6,984,115
(50.68 %)
997,950
(3.53 %)
14,753,604
(39.53 %)
6
(0.00 %)
1,428,961
(3.10 %)
33,465
(0.69 %)
26,805
(0.53 %)
397 gracile shrew mole
GCA_004024945.1
n/a n/a 19,165
(1.25 %)
43,816
(1.48 %)
n/a 41.08
(99.89 %)
8,248
(0.04 %)
8,248
(0.04 %)
732,083
(99.96 %)
2,957,465
(23.76 %)
783,289
(2.60 %)
11,503,344
(31.38 %)
23
(0.00 %)
n/a 92,729
(3.60 %)
75,685
(2.89 %)
398 gray fox (Vermont ataVT051 2023)
GCA_032313775.1
n/a n/a 19,352
(1.42 %)
20,724
(1.33 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
26
(0.00 %)
898
(100.00 %)
4,418,039
(36.90 %)
1,050,244
(11.63 %)
13,240,305
(39.50 %)
0
(0 %)
3,860,162
(6.83 %)
89,246
(2.69 %)
49,263
(1.43 %)
399 gray seal (241Hg 2020)
GCF_012393455.1
79,009
(3.73 %)
n/a 19,882
(1.73 %)
22,416
(1.46 %)
n/a 41.44
(100.00 %)
0
(0 %)
117
(0.00 %)
6,880
(100.00 %)
4,448,588
(43.28 %)
557,710
(1.32 %)
13,340,576
(33.41 %)
0
(0 %)
506,266
(1.47 %)
55,637
(1.78 %)
52,209
(1.58 %)
400 gray seal (hap1.1 2025)
GCA_964656455.1
n/a n/a 19,291
(1.73 %)
20,301
(1.41 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
0
(0 %)
1,130
(0.01 %)
171
(100.00 %)
4,245,582
(34.81 %)
600,624
(2.16 %)
13,240,803
(34.28 %)
4
(0.00 %)
615,950
(1.85 %)
56,932
(1.78 %)
54,064
(1.60 %)
401 gray seal (hap2.1 2025)
GCA_964656465.1
n/a n/a 19,222
(1.73 %)
20,205
(1.41 %)
n/a 41.54
(99.99 %)
1,110
(0.01 %)
1,110
(0.01 %)
1,233
(99.99 %)
4,236,942
(34.95 %)
601,409
(1.99 %)
13,226,667
(34.03 %)
5
(0.00 %)
598,973
(1.85 %)
57,067
(1.82 %)
54,058
(1.64 %)
402 gray seal (mHalGry1.hap1.1 2025)
GCF_964656455.1
70,736
(3.27 %)
n/a 18,889
(1.71 %)
20,343
(1.40 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
1,130
(0.01 %)
1,130
(0.01 %)
1,300
(99.99 %)
5,332,627
(44.68 %)
600,622
(2.16 %)
13,240,769
(34.28 %)
4
(0.00 %)
615,940
(1.85 %)
56,931
(1.78 %)
46,951
(1.45 %)
403 gray short-tailed opossum
GCA_027887165.2
n/a n/a 16,583
(0.75 %)
16,408
(0.86 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
0
(0 %)
2,255
(0.89 %)
14
(100.00 %)
9,126,134
(61.38 %)
1,096,062
(2.60 %)
22,321,931
(43.37 %)
13
(0.00 %)
641,868
(1.47 %)
28,894
(0.57 %)
23,383
(0.46 %)
404 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1
n/a n/a 12,662
(0.70 %)
15,124
(0.89 %)
n/a 37.74
(100.00 %)
24
(0.00 %)
24
(0.00 %)
8,086
(100.00 %)
4,098,004
(25.33 %)
806,470
(2.98 %)
16,244,072
(43.39 %)
0
(0 %)
n/a 24,879
(0.67 %)
15,867
(0.39 %)
405 gray short-tailed opossum (MonDom5 2007)
GCF_000002295.2
68,388
(2.34 %)
n/a 16,663
(0.75 %)
16,162
(0.84 %)
n/a 37.82
(97.26 %)
67,660
(2.75 %)
67,660
(2.75 %)
72,674
(97.25 %)
7,753,175
(55.85 %)
1,051,473
(2.34 %)
22,274,001
(42.23 %)
6
(0.00 %)
680,995
(1.61 %)
30,883
(0.53 %)
22,339
(0.40 %)
406 gray short-tailed opossum (v1 mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1
73,383
(3.04 %)
n/a 16,637
(0.72 %)
16,036
(0.85 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
0
(0 %)
2,255
(0.89 %)
13
(100.00 %)
5,562,359
(25.40 %)
1,096,620
(2.60 %)
22,322,748
(43.37 %)
13
(0.00 %)
793,648
(1.81 %)
28,894
(0.57 %)
22,987
(0.42 %)
407 gray short-tailed opossum (v2 mMonDom1 primary hap 2026 refseq)
GCF_027887165.2
73,367
(2.55 %)
n/a 16,583
(0.75 %)
16,407
(0.86 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
0
(0 %)
2,255
(0.89 %)
13
(100.00 %)
9,126,125
(61.38 %)
1,096,057
(2.60 %)
22,321,881
(43.37 %)
13
(0.00 %)
791,861
(1.81 %)
28,894
(0.57 %)
23,383
(0.46 %)
408 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1
59,073
(2.48 %)
n/a 20,752
(1.49 %)
21,107
(1.31 %)
32,732
(1.45 %)
40.06
(99.98 %)
0
(0 %)
1,824
(0.02 %)
752
(100.00 %)
4,605,578
(34.50 %)
728,192
(1.65 %)
15,467,412
(33.91 %)
2
(0.00 %)
504,786
(1.54 %)
51,878
(1.11 %)
49,715
(1.03 %)
409 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1
n/a n/a 17,156
(1.53 %)
18,190
(1.33 %)
n/a 40.25
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
9,510
(100.00 %)
3,455,580
(34.94 %)
530,053
(1.56 %)
10,927,458
(32.64 %)
0
(0 %)
323,766
(1.34 %)
38,976
(1.13 %)
37,317
(1.05 %)
410 gray squirrel (primary hap 2020)
GCA_902686445.2
n/a n/a 20,739
(1.50 %)
21,110
(1.31 %)
n/a 40.06
(99.98 %)
0
(0 %)
1,824
(0.02 %)
753
(100.00 %)
4,732,857
(35.28 %)
728,193
(1.65 %)
15,466,750
(33.91 %)
2
(0.00 %)
504,785
(1.54 %)
51,878
(1.11 %)
49,562
(1.03 %)
411 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2
n/a n/a 19,474
(1.55 %)
20,394
(1.40 %)
72,806
(4.12 %)
41.49
(100.00 %)
0
(0 %)
166
(0.00 %)
82
(100.00 %)
4,550,524
(31.76 %)
1,063,944
(3.96 %)
13,588,117
(34.74 %)
23
(0.00 %)
1,048,956
(2.49 %)
51,996
(2.15 %)
47,971
(1.53 %)
412 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1
n/a n/a 12,760
(1.57 %)
14,423
(1.42 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,537
(100.00 %)
2,725,227
(31.66 %)
616,862
(3.40 %)
8,041,744
(32.68 %)
0
(0 %)
465,446
(1.97 %)
32,293
(2.35 %)
29,871
(1.57 %)
413 Great evening bat (hap2 2026)
GCA_054824975.1
n/a n/a 17,446
(1.71 %)
20,330
(1.57 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
0
(0 %)
360
(0.00 %)
196
(100.00 %)
4,933,307
(51.60 %)
914,468
(10.92 %)
9,849,063
(41.54 %)
3
(0.00 %)
926,343
(3.13 %)
64,133
(2.42 %)
48,631
(1.85 %)
414 great fruit-eating bat (hap1 2025)
GCA_038363095.4
n/a n/a 18,198
(1.65 %)
19,926
(1.51 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
0
(0 %)
44
(0.00 %)
487
(100.00 %)
3,105,608
(36.84 %)
379,427
(5.52 %)
11,651,533
(35.11 %)
0
(0 %)
570,792
(2.01 %)
72,337
(2.76 %)
54,692
(2.40 %)
415 great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024)
GCA_038363175.2
n/a n/a 16,978
(1.61 %)
18,544
(1.54 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
0
(0 %)
54
(0.00 %)
312
(100.00 %)
2,601,985
(26.67 %)
331,187
(4.87 %)
10,884,729
(33.93 %)
1
(0.00 %)
458,782
(1.76 %)
63,610
(2.71 %)
49,165
(1.49 %)
416 great fruit-eating bat (v2 hap1 2024)
GCA_038363095.2
n/a n/a 18,051
(1.56 %)
19,955
(1.51 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
0
(0 %)
45
(0.00 %)
487
(100.00 %)
2,841,143
(26.67 %)
379,430
(5.52 %)
11,651,542
(35.11 %)
0
(0 %)
569,322
(2.01 %)
72,337
(2.76 %)
54,165
(1.48 %)
417 great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016)
GCF_001890085.2
50,908
(3.26 %)
n/a 18,993
(2.01 %)
19,633
(1.65 %)
41,769
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
0
(0 %)
172,750
(12.60 %)
7,387
(100.00 %)
2,946,981
(30.72 %)
495,272
(1.05 %)
11,587,728
(25.43 %)
2,116
(0.03 %)
193,018
(1.10 %)
32,949
(0.96 %)
30,173
(0.87 %)
418 greater bulldog bat
GCA_004026585.1
n/a n/a 20,774
(1.62 %)
28,140
(1.63 %)
n/a 40.92
(99.94 %)
6,171
(0.03 %)
6,171
(0.03 %)
304,393
(99.97 %)
3,288,598
(29.60 %)
478,424
(1.16 %)
11,427,553
(35.29 %)
6
(0.00 %)
n/a 44,124
(1.99 %)
42,024
(1.78 %)
419 Greater cane rat
GCA_004025085.1
n/a n/a 20,383
(0.98 %)
47,456
(1.25 %)
n/a 42.85
(99.83 %)
8,825
(0.03 %)
8,825
(0.03 %)
1,898,466
(99.97 %)
5,569,185
(30.19 %)
946,696
(3.12 %)
13,144,109
(41.83 %)
28
(0.00 %)
n/a 97,686
(2.61 %)
84,205
(2.21 %)
420 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1
n/a n/a 14,896
(1.85 %)
18,939
(1.59 %)
n/a 40.69
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
13,426
(100.00 %)
2,426,330
(34.43 %)
418,341
(1.36 %)
8,763,234
(27.86 %)
0
(0 %)
108,521
(0.55 %)
24,370
(1.08 %)
22,940
(1.00 %)
421 greater horseshoe bat (MPI-CBG mRhiFer1 2019)
GCA_004115265.3
n/a n/a 18,510
(1.96 %)
20,357
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,547,476
(40.33 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,002
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
28,931
(0.94 %)
422 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2
53,353
(3.13 %)
n/a 18,641
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,218,744
(34.52 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,641
(0.98 %)
423 greater Indian rhinoceros (Sample0755 2023)
GCA_028646465.1
n/a n/a 19,533
(1.67 %)
23,705
(1.37 %)
n/a 41.10
(101.83 %)
1,557
(0.01 %)
33,235
(0.47 %)
275,222
(99.99 %)
5,364,142
(46.33 %)
487,256
(1.17 %)
16,182,706
(30.52 %)
1,990
(0.06 %)
n/a 42,131
(1.13 %)
35,814
(0.98 %)
424 greater mouse-eared bat
GCA_014108235.2
n/a n/a 18,686
(1.94 %)
21,567
(1.74 %)
n/a 43.11
(98.56 %)
0
(0 %)
600
(1.44 %)
51
(100.00 %)
4,876,518
(44.95 %)
752,949
(2.84 %)
10,383,290
(35.84 %)
0
(0 %)
500,004
(1.88 %)
60,936
(2.45 %)
52,833
(2.12 %)
425 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
n/a 19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
0
(0 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
0
(0 %)
499,733
(1.88 %)
61,023
(2.69 %)
54,015
(1.81 %)
426 Greater mouse-tailed bat (20210906_DDa alternate hap 2024)
GCA_043880455.1
n/a n/a 16,611
(1.60 %)
22,294
(1.43 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,359
(100.00 %)
4,914,747
(44.93 %)
593,619
(4.20 %)
10,708,461
(39.52 %)
0
(0 %)
1,103,529
(3.39 %)
222,795
(3.47 %)
55,095
(1.35 %)
427 greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024)
GCA_043880545.1
n/a n/a 18,582
(1.55 %)
20,954
(1.35 %)
n/a 42.46
(100.00 %)
0
(0 %)
152
(0.00 %)
106
(100.00 %)
4,158,629
(40.30 %)
696,150
(4.67 %)
12,702,667
(41.11 %)
1
(0.00 %)
1,418,508
(3.67 %)
257,446
(3.38 %)
44,752
(1.05 %)
428 greater sac-winged bat (alternate hap 2024)
GCA_036850925.1
n/a n/a 17,838
(1.44 %)
21,425
(1.45 %)
n/a 41.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,167
(100.00 %)
6,139,040
(42.07 %)
974,353
(2.52 %)
11,694,399
(43.03 %)
0
(0 %)
1,008,898
(2.85 %)
96,465
(2.06 %)
42,893
(1.08 %)
429 greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850765.1
55,259
(2.53 %)
n/a 18,321
(1.40 %)
21,048
(1.35 %)
n/a 41.71
(98.73 %)
0
(0 %)
468
(1.27 %)
256
(100.00 %)
4,247,145
(29.53 %)
1,031,385
(2.50 %)
12,465,157
(43.30 %)
3
(0.00 %)
1,113,639
(2.95 %)
101,620
(2.01 %)
44,590
(1.04 %)
430 greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U)
GCF_019186645.2
50,563
(2.96 %)
n/a 18,224
(1.70 %)
20,689
(1.67 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
0
(0 %)
55
(0.00 %)
534
(100.00 %)
2,961,591
(0.00 %)
387,908
(0.97 %)
12,179,612
(30.91 %)
1
(0.00 %)
167,034
(0.66 %)
62,189
(5.35 %)
65,269
(4.61 %)
431 Grevy's zebra (hap1 2026)
GCA_057876975.1
n/a n/a 18,036
(1.58 %)
20,487
(1.33 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
0
(0 %)
123
(0.00 %)
767
(100.00 %)
4,643,638
(47.12 %)
545,325
(5.89 %)
14,404,726
(34.24 %)
2
(0.00 %)
642,428
(1.93 %)
42,105
(3.78 %)
38,195
(1.16 %)
432 Grevy's zebra (hap2 2026)
GCA_057877195.1
n/a n/a 17,709
(1.64 %)
19,935
(1.36 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
0
(0 %)
145
(0.00 %)
274
(100.00 %)
4,483,471
(45.66 %)
430,395
(2.96 %)
14,426,365
(31.58 %)
5
(0.00 %)
321,172
(1.08 %)
39,398
(2.28 %)
35,686
(1.14 %)
433 grey whale
GCA_004363415.1
n/a n/a 21,827
(1.52 %)
32,191
(1.24 %)
n/a 41.22
(99.88 %)
10,622
(0.04 %)
10,622
(0.04 %)
1,046,770
(99.96 %)
4,841,166
(45.56 %)
780,015
(1.83 %)
13,559,563
(39.86 %)
79
(0.00 %)
n/a 72,343
(1.59 %)
48,741
(1.27 %)
434 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1
n/a n/a 19,129
(1.37 %)
24,628
(1.24 %)
n/a 41.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 14,442
(100.00 %)
3,892,130
(35.74 %)
874,864
(15.70 %)
11,484,916
(45.69 %)
0
(0 %)
2,048,708
(5.99 %)
73,507
(1.72 %)
41,124
(0.98 %)
435 grey whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_028021215.1
n/a n/a 19,288
(1.38 %)
21,791
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
0
(0 %)
279
(0.00 %)
704
(100.00 %)
4,116,900
(35.85 %)
966,065
(16.74 %)
12,154,173
(46.39 %)
3
(0.00 %)
2,154,240
(5.67 %)
77,011
(1.59 %)
42,884
(0.96 %)
436 grey whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_028021215.1
49,276
(1.90 %)
n/a 19,295
(1.38 %)
21,790
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
0
(0 %)
279
(0.00 %)
703
(100.00 %)
4,116,894
(35.85 %)
966,064
(16.74 %)
12,154,101
(46.39 %)
3
(0.00 %)
2,154,240
(5.67 %)
77,011
(1.59 %)
42,884
(0.96 %)
437 hairy big-eared bat (US037 2019 Broad)
GCA_004026765.1
n/a n/a 21,360
(1.44 %)
37,376
(1.52 %)
n/a 42.38
(99.94 %)
3,218
(0.01 %)
3,218
(0.01 %)
553,308
(99.99 %)
3,519,246
(30.77 %)
393,318
(0.85 %)
12,525,258
(34.42 %)
12
(0.00 %)
n/a 84,875
(2.37 %)
63,057
(1.80 %)
438 Hanaki's dwarf bat (v1 2024)
GCA_964339955.1
n/a n/a 17,856
(1.76 %)
20,604
(1.75 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
306
(0.00 %)
141
(100.00 %)
3,697,250
(33.21 %)
842,827
(8.27 %)
10,094,062
(38.40 %)
2
(0.00 %)
752,759
(2.71 %)
61,715
(2.96 %)
59,765
(1.96 %)
439 Hanaki's dwarf bat (v5 2025 genbank)
GCA_964339955.5
n/a n/a 17,654
(1.85 %)
20,599
(1.75 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
306
(0.00 %)
141
(100.00 %)
4,660,276
(45.88 %)
842,822
(8.27 %)
10,093,872
(38.40 %)
2
(0.00 %)
752,744
(2.70 %)
61,715
(2.96 %)
58,095
(2.84 %)
440 Hanaki's dwarf bat (v5 2025 refseq)
GCF_964339955.1
51,103
(3.48 %)
n/a 17,654
(1.85 %)
20,598
(1.75 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
306
(0.00 %)
141
(100.00 %)
4,660,276
(45.88 %)
842,822
(8.27 %)
10,093,872
(38.40 %)
2
(0.00 %)
752,744
(2.70 %)
61,715
(2.96 %)
58,095
(2.84 %)
441 harbor porpoise (alternate hap 2024)
GCA_963924725.1
n/a n/a 19,112
(1.54 %)
22,516
(1.29 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,636
(100.00 %)
4,295,938
(43.35 %)
1,111,088
(11.90 %)
12,254,452
(42.18 %)
0
(0 %)
2,259,281
(5.55 %)
77,325
(3.31 %)
52,852
(1.62 %)
442 harbor porpoise (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924675.1
n/a n/a 18,529
(1.58 %)
20,583
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
2
(0.00 %)
966
(0.01 %)
442
(100.00 %)
3,760,716
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,240
(39.04 %)
4
(0.00 %)
1,410,168
(3.71 %)
71,530
(2.69 %)
40,160
(1.06 %)
443 harbor porpoise (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924675.1
33,578
(1.54 %)
n/a 18,528
(1.58 %)
20,582
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
966
(0.01 %)
966
(0.01 %)
1,405
(99.99 %)
3,760,713
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,181
(39.04 %)
4
(0.00 %)
1,410,168
(3.71 %)
71,530
(2.69 %)
40,160
(1.06 %)
444 harbor seal
GCF_004348235.1
50,657
(2.98 %)
n/a 19,484
(1.76 %)
20,771
(1.44 %)
33,296
(1.58 %)
41.38
(99.09 %)
16,031
(0.91 %)
16,480
(0.91 %)
21,161
(99.09 %)
4,526,182
(43.28 %)
576,921
(1.11 %)
13,421,780
(33.06 %)
945
(0.02 %)
459,159
(1.28 %)
54,592
(1.70 %)
51,200
(1.50 %)
445 Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.2
37,605
(1.99 %)
n/a 19,483
(1.73 %)
19,767
(1.35 %)
n/a 41.41
(98.23 %)
0
(0 %)
25,763
(1.77 %)
7,487
(100.00 %)
4,575,217
(43.59 %)
583,394
(1.11 %)
13,374,131
(33.69 %)
2,318
(0.04 %)
611,862
(1.63 %)
52,067
(1.50 %)
48,495
(1.32 %)
446 hazel dormouse
GCA_004027005.1
n/a n/a 21,556
(1.24 %)
40,971
(1.33 %)
n/a 41.60
(99.91 %)
15,076
(0.06 %)
15,076
(0.06 %)
481,881
(99.94 %)
6,679,641
(33.98 %)
1,653,419
(3.72 %)
12,685,676
(43.98 %)
42
(0.00 %)
n/a 71,478
(1.57 %)
45,897
(0.92 %)
447 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1
n/a n/a 11,130
(1.23 %)
22,071
(1.36 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 31,856
(100.00 %)
2,958,239
(41.25 %)
788,242
(4.52 %)
6,056,268
(41.88 %)
0
(0 %)
532,149
(2.74 %)
36,143
(1.96 %)
23,949
(1.02 %)
448 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1
n/a n/a 18,620
(1.42 %)
22,403
(1.38 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
1
(0.00 %)
1,805
(0.01 %)
214
(100.00 %)
6,063,911
(41.66 %)
1,593,657
(4.46 %)
12,229,281
(43.98 %)
8
(0.00 %)
1,313,148
(3.16 %)
71,058
(1.88 %)
45,398
(0.93 %)
449 hippopotamus (BS01 2019 Broad)
GCA_004027065.1
n/a n/a 24,267
(1.55 %)
34,820
(1.30 %)
n/a 41.43
(99.91 %)
4,730
(0.02 %)
4,730
(0.02 %)
972,599
(99.98 %)
4,579,311
(41.26 %)
606,731
(1.02 %)
14,514,493
(36.58 %)
17
(0.00 %)
n/a 54,753
(1.59 %)
52,362
(1.50 %)
450 hippopotamus (HIP001 2018)
GCA_002995585.1
n/a n/a 22,343
(1.70 %)
31,687
(1.45 %)
n/a 40.96
(94.63 %)
153,125
(5.38 %)
153,125
(5.38 %)
281,897
(94.62 %)
3,952,905
(38.55 %)
476,243
(1.97 %)
14,216,817
(27.43 %)
6,026
(0.29 %)
n/a 48,380
(1.43 %)
46,263
(1.31 %)
451 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1
n/a n/a 20,391
(1.63 %)
20,668
(1.37 %)
n/a 41.62
(100.00 %)
0
(0 %)
83
(0.00 %)
545
(100.00 %)
3,778,764
(35.17 %)
563,345
(3.63 %)
13,524,869
(35.56 %)
0
(0 %)
369,754
(1.46 %)
48,164
(1.90 %)
44,065
(1.33 %)
452 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1
64,153
(2.73 %)
n/a 20,331
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
0
(0 %)
226
(0.00 %)
357
(100.00 %)
3,783,440
(35.17 %)
567,797
(3.38 %)
13,462,531
(35.48 %)
2
(0.00 %)
396,368
(1.55 %)
48,365
(1.91 %)
44,048
(1.34 %)
453 hirola (BS46 2019 Broad)
GCA_004027495.1
n/a n/a 22,264
(1.40 %)
36,984
(1.26 %)
n/a 42.31
(99.93 %)
9,287
(0.03 %)
9,287
(0.03 %)
545,176
(99.97 %)
5,809,405
(48.62 %)
465,001
(1.08 %)
13,326,245
(42.35 %)
43
(0.00 %)
n/a 48,312
(1.15 %)
38,948
(0.98 %)
454 Hispaniolan solenodon
GCA_004363575.1
n/a n/a 18,805
(1.55 %)
27,454
(1.64 %)
n/a 39.98
(99.96 %)
5,186
(0.02 %)
5,186
(0.02 %)
181,804
(99.98 %)
2,669,787
(26.78 %)
431,610
(1.04 %)
13,429,711
(27.35 %)
24
(0.00 %)
86,983
(0.25 %)
53,444
(2.30 %)
52,300
(2.09 %)
455 hispid cotton rat
GCA_004025045.1
n/a n/a 25,324
(1.49 %)
31,681
(1.31 %)
39,953
(1.43 %)
39.77
(99.89 %)
13,744
(0.05 %)
13,744
(0.05 %)
897,290
(99.95 %)
4,384,099
(28.17 %)
1,132,313
(3.34 %)
14,729,737
(38.08 %)
28
(0.00 %)
n/a 17,558
(0.40 %)
15,148
(0.33 %)
456 hoary bat (Cryan_1219 primary hap 2025)
GCA_011751065.5
n/a n/a 18,411
(1.72 %)
20,852
(1.49 %)
n/a 41.93
(97.36 %)
35,513
(2.65 %)
35,513
(2.65 %)
37,763
(97.35 %)
4,953,747
(48.32 %)
773,513
(2.08 %)
11,116,507
(38.56 %)
2,708
(0.04 %)
439,534
(1.50 %)
61,320
(2.76 %)
54,582
(2.12 %)
457 Hoffmann's two-fingered sloth
GCA_000164785.2
n/a n/a 24,546
(1.30 %)
30,273
(1.15 %)
n/a 39.80
(98.09 %)
100,957
(1.91 %)
101,085
(1.91 %)
370,035
(98.09 %)
5,145,551
(52.20 %)
614,819
(1.62 %)
17,932,269
(39.26 %)
280
(0.01 %)
469,834
(1.28 %)
55,943
(1.04 %)
45,466
(0.86 %)
458 Hog deer (hap2 2026)
GCA_054883225.1
n/a n/a 18,236
(1.44 %)
21,068
(1.32 %)
n/a 43.42
(99.99 %)
0
(0 %)
1,362
(0.01 %)
1,968
(100.00 %)
5,210,730
(50.70 %)
450,467
(12.73 %)
12,050,600
(44.70 %)
15
(0.00 %)
3,020,170
(7.34 %)
98,724
(4.11 %)
43,357
(3.37 %)
459 hog-nosed bat
GCA_004027555.1
n/a n/a 20,591
(1.30 %)
39,589
(1.39 %)
n/a 40.99
(99.88 %)
6,224
(0.03 %)
6,224
(0.03 %)
1,230,480
(99.97 %)
4,081,924
(31.12 %)
1,008,077
(2.20 %)
12,068,828
(39.98 %)
17
(0.00 %)
n/a 55,567
(2.02 %)
43,665
(1.48 %)
460 Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.3
49,071
(2.78 %)
n/a 17,588
(1.64 %)
19,357
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
0
(0 %)
38,648
(0.21 %)
25,848
(100.00 %)
2,708,400
(27.89 %)
366,870
(1.48 %)
11,795,308
(31.27 %)
99
(0.00 %)
330,126
(1.83 %)
59,066
(1.72 %)
48,113
(1.34 %)
461 Honduran yellow-shouldered bat (v3 Veracruz 20B 2022)
GCF_014824575.4
49,074
(2.78 %)
n/a 17,270
(1.72 %)
19,383
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.80 %)
38,653
(0.21 %)
38,653
(0.21 %)
64,534
(99.79 %)
3,759,212
(41.79 %)
366,883
(1.48 %)
11,795,401
(31.27 %)
99
(0.00 %)
330,139
(1.83 %)
59,077
(1.72 %)
46,795
(1.39 %)
462 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1
n/a n/a 16,789
(1.65 %)
18,017
(1.36 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
210
(0.00 %)
821
(100.00 %)
3,146,381
(34.68 %)
430,664
(5.91 %)
13,246,059
(32.62 %)
0
(0 %)
714,785
(2.15 %)
37,293
(2.80 %)
35,249
(2.66 %)
463 horse (paternal hap 2024)
GCA_036426135.1
n/a n/a 19,073
(1.67 %)
20,636
(1.38 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
114
(0.00 %)
602
(100.00 %)
3,521,953
(35.39 %)
461,571
(5.26 %)
14,833,688
(32.77 %)
2
(0.00 %)
728,239
(2.01 %)
43,527
(2.54 %)
41,129
(2.38 %)
464 horse (thoroughbred H_3958 2024)
GCF_041296265.1
124,629
(3.91 %)
n/a 18,742
(1.47 %)
21,901
(1.39 %)
n/a 42.90
(99.96 %)
0
(0 %)
5
(0.04 %)
625
(100.00 %)
3,600,073
(33.96 %)
709,759
(8.89 %)
14,396,691
(35.72 %)
0
(0 %)
872,612
(2.26 %)
48,802
(5.67 %)
38,553
(0.92 %)
465 horse (Twilight 2018)
GCF_002863925.1
76,388
(4.03 %)
n/a 18,997
(1.73 %)
20,914
(1.42 %)
113,346
(6.08 %)
41.50
(99.62 %)
0
(0 %)
6,294
(0.38 %)
4,701
(100.00 %)
4,080,319
(44.85 %)
395,037
(1.44 %)
15,169,517
(29.93 %)
41
(0.00 %)
354,039
(1.05 %)
44,825
(1.77 %)
37,394
(1.12 %)
466 Hottentot golden mole (hap1 2026)
GCA_054824725.1
n/a n/a 23,545
(0.65 %)
25,587
(0.69 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
397
(0.00 %)
397
(0.00 %)
2,994
(100.00 %)
15,378,633
(76.69 %)
1,709,398
(27.18 %)
17,909,037
(71.38 %)
2
(0.00 %)
12,487,327
(12.60 %)
48,162
(0.41 %)
21,486
(0.24 %)
467 Hottentot golden mole (hap2 2026)
GCA_054824785.1
n/a n/a 22,773
(0.75 %)
23,199
(0.76 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
334
(0.00 %)
334
(0.00 %)
1,448
(100.00 %)
10,749,854
(56.06 %)
1,271,895
(18.31 %)
19,407,780
(65.71 %)
1
(0.00 %)
7,293,977
(9.34 %)
40,984
(0.45 %)
20,114
(0.26 %)
468 house mouse (129S1_SvImJv1 2016)
GCA_001624185.1
n/a n/a 21,289
(2.22 %)
18,626
(1.42 %)
102,148
(4.16 %)
41.77
(85.00 %)
54,773
(4.85 %)
366,945
(15.05 %)
62,882
(95.15 %)
5,075,137
(40.38 %)
1,400,072
(2.80 %)
13,497,076
(26.20 %)
20,479
(1.14 %)
431,052
(1.88 %)
16,957
(0.40 %)
16,083
(0.37 %)
469 house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022)
GCA_921998555.2
n/a n/a 21,780
(2.13 %)
19,436
(1.37 %)
110,376
(4.47 %)
41.79
(99.60 %)
8
(0.00 %)
1,557
(0.40 %)
188
(100.00 %)
4,653,663
(40.74 %)
1,550,342
(3.54 %)
12,930,784
(35.48 %)
22
(0.00 %)
820,282
(2.63 %)
23,211
(0.57 %)
15,822
(0.42 %)
470 house mouse (AKR_J v3 2022)
GCA_922000895.2
n/a n/a 21,721
(2.13 %)
19,324
(1.37 %)
110,654
(4.48 %)
41.80
(99.85 %)
6
(0.00 %)
2,714
(0.15 %)
201
(100.00 %)
4,645,513
(40.70 %)
1,547,237
(3.56 %)
13,016,932
(35.69 %)
31
(0.00 %)
816,257
(2.70 %)
23,309
(0.57 %)
15,840
(0.42 %)
471 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1
n/a n/a 661
(0.88 %)
720
(0.54 %)
n/a 38.59
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,806
(100.00 %)
97,279
(72.21 %)
40,071
(55.89 %)
208,928
(64.94 %)
0
(0 %)
239,612
(15.41 %)
506
(0.31 %)
327
(0.20 %)
472 house mouse (A_J v3 2022)
GCA_921998355.2
n/a n/a 21,869
(2.13 %)
19,400
(1.37 %)
110,389
(4.48 %)
41.80
(99.39 %)
5
(0.00 %)
608
(0.61 %)
163
(100.00 %)
4,668,553
(40.80 %)
1,556,835
(3.58 %)
12,995,938
(35.53 %)
4
(0.00 %)
832,187
(2.55 %)
23,203
(0.56 %)
15,809
(0.42 %)
473 house mouse (BALB_cJ v3 2022)
GCA_921997145.2
n/a n/a 21,891
(2.13 %)
19,499
(1.37 %)
110,461
(4.47 %)
41.79
(99.80 %)
7
(0.00 %)
274
(0.20 %)
217
(100.00 %)
4,673,990
(40.79 %)
1,560,327
(3.63 %)
13,018,071
(35.70 %)
1
(0.00 %)
836,824
(2.52 %)
23,196
(0.56 %)
15,865
(0.42 %)
474 house mouse (C3H_HeJ v3 2022)
GCA_921997125.2
n/a n/a 21,793
(2.13 %)
19,516
(1.38 %)
110,049
(4.46 %)
41.79
(99.05 %)
3
(0.00 %)
844
(0.95 %)
174
(100.00 %)
4,657,005
(40.76 %)
1,551,107
(3.53 %)
12,949,100
(35.32 %)
12
(0.00 %)
825,975
(2.56 %)
23,262
(0.56 %)
15,821
(0.42 %)
475 house mouse (C57BL/6J 2012)
GCA_000185105.2
n/a n/a 21,313
(2.28 %)
19,336
(1.53 %)
n/a 41.71
(91.01 %)
189,267
(9.02 %)
189,267
(9.02 %)
191,581
(90.98 %)
4,937,032
(40.05 %)
1,409,489
(2.64 %)
13,090,524
(27.69 %)
5,529
(0.08 %)
357,127
(1.10 %)
16,523
(0.40 %)
15,591
(0.37 %)
476 house mouse (C57BL_6J T2T 2024)
GCA_964188535.1
n/a n/a 21,496
(1.92 %)
19,278
(1.25 %)
n/a 41.31
(99.85 %)
108
(0.15 %)
108
(0.15 %)
345
(99.85 %)
4,519,975
(46.81 %)
1,564,206
(14.33 %)
12,267,542
(42.16 %)
0
(0 %)
1,961,197
(5.36 %)
23,119
(0.55 %)
15,974
(0.40 %)
477 house mouse (CBA_J v3 2022)
GCA_921998905.2
n/a n/a 21,829
(2.13 %)
19,841
(1.39 %)
110,858
(4.48 %)
41.79
(99.52 %)
2
(0.00 %)
658
(0.48 %)
145
(100.00 %)
4,658,032
(40.77 %)
1,552,298
(3.59 %)
12,948,038
(35.52 %)
2
(0.00 %)
829,314
(2.57 %)
23,232
(0.56 %)
15,810
(0.42 %)
478 house mouse (DBA_2J v3 2022)
GCA_921998315.2
n/a n/a 22,302
(2.08 %)
19,749
(1.35 %)
113,269
(4.42 %)
41.72
(100.00 %)
9
(0.00 %)
153
(0.00 %)
361
(100.00 %)
4,785,676
(41.69 %)
1,597,598
(4.56 %)
13,190,158
(36.58 %)
0
(0 %)
968,205
(2.82 %)
24,140
(0.59 %)
16,383
(0.43 %)
479 house mouse (FVB_NJ v3 2022)
GCA_921998635.2
n/a n/a 21,633
(2.15 %)
19,565
(1.40 %)
110,246
(4.50 %)
41.82
(98.35 %)
8
(0.00 %)
6,244
(1.65 %)
384
(100.00 %)
4,621,601
(40.42 %)
1,537,622
(3.48 %)
12,818,729
(34.77 %)
54
(0.00 %)
781,344
(2.48 %)
22,696
(0.55 %)
15,795
(0.42 %)
480 house mouse (LP_J v3 2022)
GCA_947599735.1
n/a n/a 22,452
(1.91 %)
19,841
(1.23 %)
110,073
(3.98 %)
41.29
(99.99 %)
87
(0.00 %)
386
(0.01 %)
515
(100.00 %)
4,839,574
(46.33 %)
1,645,163
(11.88 %)
12,936,515
(41.49 %)
63
(0.00 %)
1,839,684
(4.85 %)
24,374
(0.54 %)
16,515
(0.39 %)
481 house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022)
GCA_921998325.2
n/a n/a 21,797
(2.13 %)
19,521
(1.38 %)
109,890
(4.48 %)
41.80
(99.50 %)
2
(0.00 %)
1,462
(0.50 %)
170
(100.00 %)
4,650,016
(40.74 %)
1,547,220
(3.54 %)
12,918,125
(35.45 %)
24
(0.00 %)
826,087
(2.65 %)
23,253
(0.56 %)
15,815
(0.42 %)
482 house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022)
GCA_947593165.1
n/a n/a 22,481
(1.93 %)
19,932
(1.26 %)
109,670
(4.03 %)
41.34
(100.00 %)
58
(0.00 %)
234
(0.00 %)
441
(100.00 %)
4,822,230
(45.92 %)
1,637,027
(11.19 %)
13,082,730
(41.04 %)
19
(0.00 %)
1,756,117
(4.67 %)
24,187
(0.54 %)
16,389
(0.39 %)
483 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1
n/a n/a 22,351
(1.96 %)
19,629
(1.26 %)
n/a 41.38
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
179
(100.00 %)
4,774,018
(45.31 %)
1,620,102
(10.50 %)
13,181,250
(40.47 %)
0
(0 %)
1,650,132
(4.47 %)
23,955
(0.54 %)
16,164
(0.39 %)
484 house mouse C57BL/6J 2020 GRC
GCF_000001635.27
136,224
(4.84 %)
n/a 22,409
(2.02 %)
19,480
(1.31 %)
140,725
(4.83 %)
41.67
(97.30 %)
324
(2.70 %)
334
(2.70 %)
22,273
(97.30 %)
5,361,085
(45.51 %)
1,641,063
(3.41 %)
12,722,791
(36.04 %)
1
(0.00 %)
858,983
(2.44 %)
23,794
(0.53 %)
15,980
(0.39 %)
485 house mouse C57BL_6NJ (2016)
GCA_001632555.1
n/a n/a 21,177
(2.23 %)
18,495
(1.42 %)
103,002
(4.20 %)
41.76
(82.53 %)
45,300
(3.63 %)
410,660
(17.53 %)
49,821
(96.37 %)
5,081,049
(40.22 %)
1,392,942
(2.58 %)
13,476,268
(25.21 %)
24,698
(0.96 %)
429,021
(1.56 %)
16,877
(0.39 %)
16,035
(0.36 %)
486 house mouse C57BL_6NJ (2022)
GCA_921999865.2
n/a n/a 21,817
(2.13 %)
19,349
(1.37 %)
n/a 41.79
(99.76 %)
7
(0.00 %)
1,127
(0.24 %)
214
(100.00 %)
4,661,104
(40.76 %)
1,552,079
(3.56 %)
12,953,662
(35.57 %)
8
(0.00 %)
825,187
(2.60 %)
23,204
(0.56 %)
15,812
(0.42 %)
487 humpback whale (KW2013002 2024)
GCA_041834305.1
n/a n/a 19,463
(1.32 %)
22,424
(1.19 %)
n/a 42.05
(100.00 %)
0
(0 %)
88
(0.00 %)
1,355
(100.00 %)
4,164,459
(34.02 %)
1,281,751
(18.33 %)
12,412,281
(48.28 %)
0
(0 %)
2,009,593
(5.80 %)
82,412
(1.67 %)
44,791
(0.96 %)
488 Iberian mole (v2.1 TD23 2020)
GCF_014898055.3
56,986
(3.41 %)
n/a 18,431
(1.69 %)
20,317
(1.59 %)
n/a 41.89
(99.89 %)
0
(0 %)
3,575
(0.11 %)
3,202
(100.00 %)
2,635,974
(23.38 %)
496,514
(1.29 %)
10,969,546
(32.61 %)
2
(0.00 %)
637,831
(2.54 %)
47,466
(2.89 %)
43,066
(2.46 %)
489 Incan shrew opossum (hap1 2026)
GCA_054644205.1
n/a n/a 18,571
(0.65 %)
18,069
(0.75 %)
n/a 37.91
(100.00 %)
0
(0 %)
1,075
(0.00 %)
188
(100.00 %)
12,536,015
(55.82 %)
1,210,154
(3.86 %)
24,488,548
(48.61 %)
16
(0.00 %)
1,205,947
(2.25 %)
20,671
(0.41 %)
19,897
(0.36 %)
490 Incan shrew opossum (hap2 2026)
GCA_054644215.1
n/a n/a 18,021
(0.67 %)
17,310
(0.75 %)
n/a 37.79
(100.00 %)
0
(0 %)
994
(0.00 %)
98
(100.00 %)
12,176,230
(56.47 %)
1,165,452
(2.75 %)
23,829,102
(48.11 %)
9
(0.00 %)
737,131
(1.48 %)
19,139
(0.39 %)
18,320
(0.35 %)
491 Indian false vampire
GCA_004026885.1
n/a n/a 20,067
(1.37 %)
36,544
(1.53 %)
32,548
(1.37 %)
40.84
(99.83 %)
6,266
(0.02 %)
6,266
(0.02 %)
1,909,067
(99.98 %)
4,096,409
(31.50 %)
699,311
(1.81 %)
12,307,198
(39.96 %)
15
(0.00 %)
n/a 92,830
(3.12 %)
82,461
(2.65 %)
492 Indian flying fox
GCF_902729225.1
64,763
(3.85 %)
n/a 18,222
(2.01 %)
23,187
(1.82 %)
45,389
(2.18 %)
39.83
(99.10 %)
0
(0 %)
17,500
(0.90 %)
16,113
(100.00 %)
2,972,300
(34.11 %)
487,157
(1.49 %)
12,486,528
(27.37 %)
384
(0.01 %)
202,174
(1.56 %)
57,869
(3.73 %)
61,442
(3.09 %)
493 Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023)
GCA_030015415.1
n/a n/a 17,560
(2.04 %)
21,687
(1.83 %)
n/a 39.77
(100.00 %)
0
(0 %)
26
(0.00 %)
181
(100.00 %)
2,598,385
(30.48 %)
486,921
(1.41 %)
11,828,726
(27.28 %)
0
(0 %)
175,274
(0.71 %)
37,476
(5.58 %)
39,290
(5.02 %)
494 Indiana bat (hap1 2026)
GCA_057945255.1
n/a n/a 18,747
(1.84 %)
22,021
(1.70 %)
n/a 42.83
(100.00 %)
0
(0 %)
70
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,983,941
(48.10 %)
727,252
(6.15 %)
10,651,549
(38.18 %)
9
(0.00 %)
773,202
(2.69 %)
64,219
(2.52 %)
52,342
(2.02 %)
495 Indiana bat (hap2 2026)
GCA_057945245.1
n/a n/a 18,074
(1.89 %)
21,376
(1.78 %)
n/a 42.96
(100.00 %)
0
(0 %)
50
(0.00 %)
43
(100.00 %)
4,650,326
(46.91 %)
666,495
(5.97 %)
9,978,341
(37.20 %)
8
(0.00 %)
687,120
(2.60 %)
61,322
(2.61 %)
50,791
(2.10 %)
496 Indochinese shrew (US011 2019 Broad)
GCA_004027635.1
n/a n/a 18,870
(0.51 %)
55,636
(0.81 %)
n/a 39.81
(99.83 %)
5,267
(0.02 %)
5,267
(0.02 %)
2,420,679
(99.98 %)
4,130,068
(16.60 %)
1,663,335
(3.30 %)
18,728,711
(46.19 %)
45
(0.00 %)
n/a 31,453
(0.55 %)
25,923
(0.42 %)
497 Indus River dolphin
GCA_004363435.1
n/a n/a 24,321
(1.30 %)
47,065
(1.14 %)
n/a 41.72
(99.88 %)
11,702
(0.04 %)
11,702
(0.04 %)
1,110,492
(99.96 %)
5,093,308
(45.60 %)
845,860
(1.72 %)
13,162,111
(41.37 %)
34
(0.00 %)
n/a 68,257
(1.40 %)
49,070
(1.11 %)
498 Inner Mongolia cashmere goat (2024)
GCA_041735815.1
n/a n/a 19,123
(1.40 %)
21,508
(1.26 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 31
(100.00 %)
3,982,368
(23.76 %)
650,129
(7.44 %)
12,858,872
(44.33 %)
0
(0 %)
2,309,715
(5.29 %)
99,144
(2.87 %)
39,833
(0.88 %)
499 intermediate fruit-eating bat (hap1 2024)
GCA_038363145.1
n/a n/a 18,022
(1.56 %)
19,824
(1.51 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
419
(100.00 %)
2,827,417
(26.82 %)
371,479
(4.97 %)
11,603,093
(34.64 %)
1
(0.00 %)
522,672
(1.87 %)
71,574
(2.28 %)
54,020
(1.50 %)
500 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa alternate hap 2024)
GCA_043727925.1
n/a n/a 17,564
(1.87 %)
20,064
(1.66 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,194
(100.00 %)
3,406,902
(41.38 %)
537,189
(4.88 %)
11,454,141
(30.99 %)
0
(0 %)
817,381
(2.10 %)
32,338
(1.09 %)
27,698
(0.96 %)
501 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024)
GCA_043728065.1
n/a n/a 18,239
(1.76 %)
20,378
(1.53 %)
n/a 41.40
(100.00 %)
1
(0.00 %)
37
(0.00 %)
2,195
(100.00 %)
3,438,644
(42.82 %)
584,006
(9.54 %)
12,207,998
(35.49 %)
0
(0 %)
1,679,263
(3.77 %)
34,491
(1.02 %)
29,817
(0.90 %)
502 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1
n/a n/a 19,064
(1.67 %)
20,800
(1.49 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
0
(0 %)
119
(0.00 %)
69
(100.00 %)
3,393,548
(30.92 %)
723,545
(6.58 %)
12,073,117
(35.40 %)
0
(0 %)
1,106,960
(3.54 %)
43,736
(1.20 %)
30,847
(0.87 %)
503 jaguar
GCF_046562875.1
75,496
(3.58 %)
n/a 18,871
(1.64 %)
21,072
(1.41 %)
n/a 41.76
(100.00 %)
0
(0 %)
200
(0.00 %)
86
(100.00 %)
5,097,978
(41.83 %)
982,066
(2.10 %)
13,365,317
(34.16 %)
3
(0.00 %)
459,797
(1.37 %)
66,000
(2.75 %)
59,508
(2.25 %)
504 jaguar (BS21 2019)
GCA_004023805.1
n/a n/a 21,431
(1.51 %)
32,835
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.89 %)
21,329
(0.09 %)
21,329
(0.09 %)
460,121
(99.91 %)
5,420,861
(43.75 %)
1,049,353
(1.93 %)
13,848,545
(34.90 %)
43
(0.00 %)
425,795
(0.77 %)
71,066
(2.37 %)
62,901
(1.89 %)
505 jaguar (hap1 2025 genbank)
GCA_046562885.1
n/a n/a 17,882
(1.68 %)
19,103
(1.41 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
0
(0 %)
140
(0.00 %)
115
(100.00 %)
4,622,385
(41.25 %)
893,297
(1.89 %)
12,851,116
(33.53 %)
1
(0.00 %)
402,314
(1.33 %)
61,319
(2.55 %)
55,085
(2.08 %)
506 jaguar (hap1 2025 refseq)
GCF_046562885.1
72,531
(3.71 %)
n/a 17,886
(1.68 %)
19,296
(1.42 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
0
(0 %)
140
(0.00 %)
116
(100.00 %)
4,733,281
(41.33 %)
893,299
(1.89 %)
12,851,153
(33.54 %)
1
(0.00 %)
402,317
(1.33 %)
61,319
(2.55 %)
55,064
(2.08 %)
507 jaguar (hap1 2025)
GCA_046562885.2
n/a n/a 17,884
(1.68 %)
19,104
(1.41 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
0
(0 %)
140
(0.00 %)
115
(100.00 %)
4,733,274
(41.33 %)
893,297
(1.89 %)
12,851,116
(33.53 %)
1
(0.00 %)
402,314
(1.33 %)
61,319
(2.55 %)
55,064
(2.08 %)
508 jaguar (Sample0147 2023)
GCF_028533385.1
71,578
(4.12 %)
n/a 19,122
(1.67 %)
21,950
(1.36 %)
n/a 41.58
(99.31 %)
0
(0 %)
56,371
(0.70 %)
36,243
(100.00 %)
4,552,854
(33.37 %)
897,371
(1.63 %)
13,732,912
(32.89 %)
2,743
(0.10 %)
314,574
(0.82 %)
63,777
(2.41 %)
60,478
(2.01 %)
509 jaguar (v1 hap2 2025)
GCA_046562875.1
n/a n/a 18,867
(1.64 %)
20,784
(1.40 %)
n/a 41.76
(100.00 %)
0
(0 %)
200
(0.00 %)
85
(100.00 %)
4,977,843
(41.75 %)
982,064
(2.10 %)
13,365,332
(34.16 %)
3
(0.00 %)
459,794
(1.37 %)
66,000
(2.75 %)
59,529
(2.25 %)
510 jaguar (v2 hap2 2025)
GCA_046562875.2
n/a n/a 18,869
(1.64 %)
20,781
(1.40 %)
n/a 41.76
(100.00 %)
0
(0 %)
200
(0.00 %)
85
(100.00 %)
5,097,971
(41.83 %)
982,064
(2.10 %)
13,365,332
(34.16 %)
3
(0.00 %)
459,794
(1.37 %)
66,000
(2.75 %)
59,508
(2.25 %)
511 jaguarundi
GCF_014898765.1
72,564
(3.15 %)
n/a 18,602
(1.64 %)
20,510
(1.39 %)
n/a 41.75
(97.85 %)
0
(0 %)
42,499
(2.16 %)
10,948
(100.00 %)
5,035,745
(43.29 %)
907,329
(1.61 %)
13,590,905
(33.57 %)
2,609
(0.04 %)
574,230
(1.55 %)
69,090
(2.29 %)
60,356
(1.80 %)
512 Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U)
GCF_014825515.1
48,692
(2.72 %)
n/a 19,921
(1.66 %)
23,614
(1.68 %)
39,384
(2.12 %)
41.95
(98.87 %)
0
(0 %)
110,840
(1.13 %)
56,740
(100.00 %)
2,972,388
(28.79 %)
405,474
(2.15 %)
12,458,880
(30.65 %)
8,380
(0.26 %)
388,646
(3.79 %)
61,973
(1.87 %)
54,441
(1.58 %)
513 Jamaican fruit-eating bat (2021)
GCF_021234435.1
55,114
(3.18 %)
n/a 17,875
(1.68 %)
19,958
(1.66 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
868
(100.00 %)
2,697,287
(28.17 %)
318,700
(0.84 %)
11,750,329
(31.61 %)
0
(0 %)
245,042
(0.98 %)
61,951
(1.93 %)
52,462
(1.61 %)
514 Japanese wild mouse (2022)
GCA_921999095.2
n/a n/a 23,292
(2.05 %)
20,114
(1.31 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
51
(0.00 %)
397
(0.00 %)
1,449
(100.00 %)
4,952,306
(42.53 %)
1,635,456
(4.60 %)
12,838,321
(38.56 %)
8
(0.00 %)
1,050,247
(2.88 %)
24,168
(0.56 %)
16,545
(0.42 %)
515 Java mouse-deer (US108 2019 Broad)
GCA_004024965.1
n/a n/a 23,081
(1.38 %)
38,181
(1.41 %)
n/a 42.73
(99.91 %)
2,829
(0.01 %)
2,829
(0.01 %)
1,159,819
(99.99 %)
4,791,310
(34.97 %)
448,498
(1.92 %)
13,175,375
(39.89 %)
11
(0.00 %)
n/a 68,778
(2.92 %)
61,444
(2.39 %)
516 killer whale (2022)
GCF_937001465.1
78,479
(3.76 %)
n/a 18,710
(1.51 %)
21,101
(1.30 %)
34,448
(1.49 %)
41.91
(100.00 %)
0
(0 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
3,955,401
(36.81 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,568
(41.63 %)
2
(0.00 %)
1,982,992
(5.71 %)
77,307
(3.08 %)
40,935
(1.02 %)
517 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1
n/a n/a 14,982
(1.50 %)
19,185
(1.30 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 12,410
(100.00 %)
2,752,892
(35.61 %)
589,217
(10.15 %)
8,371,032
(41.11 %)
0
(0 %)
1,464,220
(5.92 %)
57,347
(3.41 %)
30,003
(1.05 %)
518 killer whale (Morgan 2013)
GCF_000331955.2
70,972
(3.55 %)
n/a 18,736
(1.86 %)
20,365
(1.48 %)
n/a 41.35
(94.82 %)
78,432
(5.20 %)
78,441
(5.20 %)
80,100
(94.80 %)
3,978,339
(43.98 %)
555,737
(1.13 %)
12,773,973
(31.51 %)
2,677
(0.03 %)
355,274
(1.15 %)
61,145
(1.59 %)
40,101
(1.20 %)
519 killer whale (primary hap 2022)
GCA_937001465.1
n/a n/a 18,847
(1.59 %)
21,099
(1.30 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
0
(0 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
4,361,647
(43.69 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,548
(41.63 %)
2
(0.00 %)
1,982,992
(5.71 %)
77,307
(3.08 %)
55,911
(2.03 %)
520 klipspringer (KSP-560 2019)
GCA_006410675.1
n/a n/a 22,317
(1.37 %)
27,606
(1.31 %)
n/a 42.04
(89.74 %)
371,212
(10.28 %)
371,212
(10.28 %)
396,104
(89.72 %)
6,379,883
(45.04 %)
726,514
(5.64 %)
15,472,957
(34.77 %)
110,495
(1.31 %)
1,435,553
(13.13 %)
50,579
(1.00 %)
44,503
(0.87 %)
521 koala (Bilbo 61053 2022 genbank)
GCA_003287225.2
n/a n/a 17,087
(0.81 %)
14,711
(0.86 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
0
(0 %)
669
(0.00 %)
1,246
(100.00 %)
6,280,029
(29.77 %)
1,123,294
(2.02 %)
21,796,316
(39.24 %)
2
(0.00 %)
412,593
(0.92 %)
15,957
(0.35 %)
13,996
(0.24 %)
522 koala (Bilbo 61053 2022 refseq)
GCF_003287225.1
50,393
(2.58 %)
n/a 17,125
(0.85 %)
14,711
(0.86 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
0
(0 %)
669
(0.00 %)
1,246
(100.00 %)
10,370,789
(60.23 %)
1,123,294
(2.02 %)
21,796,035
(39.24 %)
2
(0.00 %)
362,271
(0.81 %)
15,957
(0.35 %)
14,970
(0.30 %)
523 koala (Bilbo 61053 2025)
GCA_003287225.3
n/a n/a 17,123
(0.85 %)
14,700
(0.86 %)
n/a 39.06
(100.00 %)
4
(0.00 %)
664
(0.00 %)
1,239
(100.00 %)
10,358,875
(60.22 %)
1,121,543
(2.02 %)
21,754,367
(39.21 %)
2
(0.00 %)
411,358
(0.92 %)
15,940
(0.35 %)
14,953
(0.30 %)
524 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1
65,654
(3.37 %)
n/a 17,918
(1.89 %)
20,819
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
0
(0 %)
394
(0.69 %)
202
(100.00 %)
2,897,422
(23.58 %)
797,420
(2.76 %)
10,057,100
(34.56 %)
2
(0.00 %)
425,636
(1.52 %)
55,965
(2.99 %)
57,667
(2.01 %)
525 Kuhl's pipistrelle (primary hap 2025)
GCA_014108245.2
n/a n/a 17,770
(2.01 %)
20,646
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
0
(0 %)
522
(0.69 %)
82
(100.00 %)
4,542,064
(41.94 %)
797,434
(2.76 %)
10,057,037
(34.56 %)
2
(0.00 %)
426,465
(1.53 %)
55,766
(2.87 %)
56,160
(2.88 %)
526 large flying fox
GCF_000151845.1
52,243
(3.10 %)
n/a 18,454
(1.91 %)
23,631
(1.73 %)
n/a 39.82
(91.80 %)
189,339
(8.24 %)
189,340
(8.24 %)
225,433
(91.76 %)
3,117,045
(36.49 %)
504,277
(3.03 %)
13,025,556
(25.00 %)
22,188
(0.92 %)
358,468
(6.48 %)
78,404
(3.24 %)
74,747
(2.62 %)
527 large Japanese field mouse (IB14-021 2017)
GCA_002335545.1
n/a n/a 22,630
(1.74 %)
33,810
(1.26 %)
n/a 42.04
(57.78 %)
4,289,924
(42.35 %)
4,289,924
(42.35 %)
4,626,044
(57.65 %)
3,638,537
(31.76 %)
1,048,253
(1.87 %)
12,039,926
(16.61 %)
10,107
(0.44 %)
n/a 19,817
(0.34 %)
18,415
(0.32 %)
528 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1
n/a n/a 21,678
(1.34 %)
22,317
(1.25 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
1,188
(0.00 %)
1,198
(100.00 %)
5,530,547
(22.20 %)
1,357,640
(10.13 %)
14,334,312
(46.09 %)
5
(0.00 %)
2,400,830
(5.08 %)
123,453
(2.17 %)
59,337
(1.38 %)
529 large tree shrew (BS70 2025)
GCA_026018925.2
n/a n/a 21,760
(1.34 %)
22,479
(1.26 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
1,263
(0.00 %)
1,209
(100.00 %)
6,876,878
(36.82 %)
1,357,671
(10.13 %)
14,333,971
(46.09 %)
5
(0.00 %)
2,401,446
(5.08 %)
123,449
(2.17 %)
59,326
(1.38 %)
530 least weasel (hap1 2026)
GCA_057128415.1
n/a n/a 18,939
(1.27 %)
22,764
(1.19 %)
n/a 42.71
(99.36 %)
0
(0 %)
600
(0.64 %)
4,178
(100.00 %)
6,149,771
(53.28 %)
869,596
(6.56 %)
13,236,177
(44.78 %)
4
(0.00 %)
2,809,459
(7.20 %)
66,312
(2.12 %)
54,158
(1.60 %)
531 least weasel (hap1.1 2025 genbank)
GCA_964662115.1
n/a n/a 19,085
(1.11 %)
23,074
(1.09 %)
n/a 43.54
(99.98 %)
9
(0.00 %)
2,938
(0.02 %)
3,189
(100.00 %)
4,687,333
(25.05 %)
908,610
(10.98 %)
12,922,050
(49.64 %)
17
(0.00 %)
4,143,372
(9.39 %)
68,749
(2.22 %)
53,921
(1.35 %)
532 least weasel (hap1.1 2025 refseq)
GCF_964662115.1
87,413
(2.56 %)
n/a 19,035
(1.16 %)
23,079
(1.09 %)
n/a 43.54
(99.98 %)
2,938
(0.02 %)
2,938
(0.02 %)
6,117
(99.98 %)
6,208,263
(57.37 %)
908,609
(10.98 %)
12,922,009
(49.64 %)
17
(0.00 %)
4,140,971
(9.38 %)
68,748
(2.22 %)
54,532
(1.50 %)
533 least weasel (hap2 2026)
GCA_057128425.1
n/a n/a 18,078
(1.29 %)
21,580
(1.20 %)
n/a 42.81
(99.66 %)
0
(0 %)
460
(0.34 %)
4,263
(100.00 %)
5,771,273
(52.83 %)
811,406
(6.89 %)
12,416,602
(44.69 %)
4
(0.00 %)
2,771,111
(7.55 %)
62,699
(2.08 %)
51,434
(1.58 %)
534 least weasel (hap2.1 2025)
GCA_964662095.1
n/a n/a 18,255
(1.29 %)
22,201
(1.27 %)
n/a 42.68
(99.98 %)
2,709
(0.02 %)
2,709
(0.02 %)
4,948
(99.98 %)
4,268,233
(27.47 %)
787,850
(6.40 %)
12,592,088
(42.54 %)
17
(0.00 %)
2,083,429
(5.88 %)
62,416
(2.34 %)
51,317
(1.55 %)
535 leopard (Hobbes primary hap 2022)
GCF_024362965.1
70,501
(3.29 %)
n/a 18,472
(1.56 %)
20,388
(1.41 %)
n/a 41.75
(99.99 %)
0
(0 %)
335
(0.01 %)
382
(100.00 %)
4,634,038
(33.80 %)
932,991
(2.25 %)
13,686,652
(34.03 %)
1
(0.00 %)
451,937
(1.32 %)
65,793
(2.64 %)
60,846
(1.89 %)
536 leopard (Maewha 2016 refseq)
GCF_001857705.1
73,279
(3.20 %)
n/a 18,881
(1.63 %)
21,010
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
214,953
(3.85 %)
265,330
(96.15 %)
5,247,029
(42.87 %)
1,059,446
(5.13 %)
14,265,573
(32.20 %)
28,667
(1.17 %)
525,712
(5.63 %)
77,001
(2.45 %)
66,922
(1.91 %)
537 leopard cat
GCF_016509475.1
59,965
(3.05 %)
n/a 18,472
(1.65 %)
19,934
(1.38 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
39
(0.00 %)
56
(0.00 %)
123
(100.00 %)
4,978,115
(43.28 %)
901,754
(1.84 %)
13,596,535
(34.23 %)
0
(0 %)
586,248
(1.62 %)
67,390
(2.50 %)
62,344
(2.02 %)
538 Leschenault's rousette (2020)
GCA_015472975.1
n/a n/a 17,815
(2.05 %)
23,917
(1.90 %)
n/a 40.13
(99.14 %)
100,669
(0.88 %)
100,669
(0.88 %)
108,810
(99.12 %)
2,688,705
(31.20 %)
428,968
(1.19 %)
12,245,385
(26.51 %)
13
(0.00 %)
121,479
(0.56 %)
58,118
(6.81 %)
61,535
(5.42 %)
539 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1
51,730
(1.99 %)
n/a 20,129
(1.24 %)
22,089
(1.24 %)
40,414
(1.76 %)
42.00
(99.52 %)
0
(0 %)
561
(0.48 %)
160
(100.00 %)
7,346,291
(41.25 %)
1,187,587
(2.92 %)
14,222,177
(44.13 %)
1
(0.00 %)
1,219,048
(2.53 %)
34,688
(0.86 %)
25,175
(0.54 %)
540 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1
n/a n/a 17,777
(1.27 %)
19,232
(1.28 %)
n/a 42.13
(92.75 %)
0
(0 %)
2,875
(7.25 %)
508
(100.00 %)
6,476,967
(33.93 %)
999,133
(2.78 %)
11,809,834
(40.52 %)
1
(0.00 %)
1,062,479
(2.36 %)
29,872
(0.82 %)
21,704
(0.51 %)
541 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq)
GCF_000280705.1
25,978
(1.44 %)
n/a 19,408
(1.38 %)
20,312
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
326,464
(12.87 %)
337,360
(87.13 %)
6,125,934
(38.31 %)
832,825
(1.53 %)
13,661,612
(33.98 %)
2,666
(0.03 %)
430,190
(1.14 %)
26,669
(0.59 %)
23,227
(0.47 %)
542 lesser Egyptian jerboa (primary hap 2021)
GCA_020740685.1
n/a n/a 20,129
(1.24 %)
22,086
(1.24 %)
n/a 42.00
(99.52 %)
0
(0 %)
561
(0.48 %)
159
(100.00 %)
6,288,871
(38.51 %)
1,187,585
(2.92 %)
14,221,962
(44.13 %)
1
(0.00 %)
1,219,063
(2.53 %)
34,688
(0.86 %)
25,175
(0.54 %)
543 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb alternate hap 2024)
GCA_043880535.1
n/a n/a 1,572
(0.57 %)
3,175
(1.45 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,678
(100.00 %)
286,260
(35.16 %)
107,917
(13.71 %)
1,232,326
(51.86 %)
0
(0 %)
518,360
(11.82 %)
5,144
(2.91 %)
5,111
(1.69 %)
544 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024)
GCA_043880595.1
n/a n/a 18,484
(1.87 %)
24,356
(1.84 %)
n/a 41.88
(97.91 %)
198
(0.32 %)
866
(2.09 %)
617
(99.68 %)
3,419,622
(36.65 %)
663,182
(2.53 %)
11,508,574
(30.58 %)
15
(0.00 %)
639,747
(2.02 %)
84,174
(4.85 %)
81,198
(4.01 %)
545 lesser horseshoe bat (hap1 2024)
GCA_964194185.1
n/a n/a 19,031
(1.88 %)
21,003
(1.63 %)
n/a 40.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,627
(0.01 %)
723
(100.00 %)
3,133,745
(33.46 %)
660,064
(3.79 %)
11,720,176
(32.32 %)
8
(0.00 %)
718,567
(2.35 %)
35,414
(1.75 %)
34,111
(1.64 %)
546 lesser horseshoe bat (hap2 2024)
GCA_964194215.1
n/a n/a 18,875
(1.72 %)
21,166
(1.58 %)
n/a 41.18
(99.99 %)
1,648
(0.01 %)
1,648
(0.01 %)
2,727
(99.99 %)
3,160,659
(34.00 %)
696,130
(6.23 %)
11,662,645
(34.26 %)
8
(0.00 %)
1,288,588
(3.71 %)
36,176
(1.80 %)
28,160
(0.89 %)
547 lesser horseshoe bat (hap2.2 2025)
GCA_964194215.2
n/a n/a 18,974
(1.81 %)
21,191
(1.58 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
56
(0.00 %)
56
(0.00 %)
1,036
(100.00 %)
3,652,081
(41.23 %)
696,117
(6.18 %)
11,690,617
(34.28 %)
1
(0.00 %)
1,274,034
(3.65 %)
36,376
(1.84 %)
31,832
(1.67 %)
548 lesser horseshoe bat (mRhiHip2.hap1.1 2024)
GCF_964194185.1
59,989
(3.28 %)
n/a 18,874
(1.86 %)
21,002
(1.63 %)
n/a 40.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,627
(0.01 %)
723
(100.00 %)
3,621,058
(40.92 %)
660,064
(3.79 %)
11,719,468
(32.32 %)
8
(0.00 %)
718,567
(2.35 %)
35,414
(1.75 %)
30,800
(1.57 %)
549 lesser noctule (v2 hap1 2025)
GCA_964264875.2
n/a n/a 18,342
(1.54 %)
22,974
(1.62 %)
n/a 43.04
(100.00 %)
3
(0.00 %)
302
(0.00 %)
588
(100.00 %)
4,258,096
(37.31 %)
1,289,911
(11.51 %)
9,694,758
(42.52 %)
2
(0.00 %)
1,992,418
(5.41 %)
65,974
(2.80 %)
61,273
(1.84 %)
550 lesser noctule (v2 hap2 2025)
GCA_964264895.2
n/a n/a 17,492
(1.62 %)
22,188
(1.72 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
247
(0.00 %)
247
(0.00 %)
920
(100.00 %)
3,886,341
(36.52 %)
1,139,308
(10.89 %)
9,356,457
(40.65 %)
2
(0.00 %)
1,617,080
(4.89 %)
62,254
(3.00 %)
59,522
(1.92 %)
551 lesser panda (RP43 2017)
GCA_002007465.1
n/a n/a 19,120
(1.69 %)
20,591
(1.50 %)
n/a 41.60
(98.56 %)
137,333
(1.45 %)
137,333
(1.45 %)
148,922
(98.55 %)
4,513,888
(40.87 %)
692,778
(1.62 %)
13,691,859
(31.36 %)
3,438
(0.05 %)
680,690
(2.32 %)
64,369
(2.52 %)
63,356
(2.19 %)
552 lesser sac-winged bat (alternate hap 2024)
GCA_036851165.1
n/a n/a 18,593
(1.42 %)
23,334
(1.46 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,715
(100.00 %)
6,471,175
(42.04 %)
1,030,472
(2.62 %)
12,509,696
(42.43 %)
0
(0 %)
1,069,868
(2.82 %)
96,414
(2.05 %)
47,984
(1.15 %)
553 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850995.1
53,210
(2.49 %)
n/a 18,323
(1.42 %)
21,350
(1.39 %)
n/a 41.84
(99.24 %)
0
(0 %)
573
(0.76 %)
168
(100.00 %)
4,224,344
(28.69 %)
1,030,576
(2.60 %)
12,591,989
(42.30 %)
1
(0.00 %)
1,128,543
(2.95 %)
98,189
(2.06 %)
48,427
(1.15 %)
554 lion
GCF_018350215.1
67,745
(2.86 %)
n/a 17,956
(1.69 %)
19,033
(1.40 %)
61,242
(3.04 %)
41.71
(100.00 %)
45
(0.00 %)
55
(0.00 %)
99
(100.00 %)
4,666,951
(42.23 %)
889,987
(1.87 %)
13,151,686
(33.40 %)
1
(0.00 %)
394,792
(1.11 %)
62,675
(2.56 %)
59,062
(2.11 %)
555 little brown bat
GCF_000147115.1
50,660
(2.76 %)
n/a 19,314
(1.86 %)
22,683
(1.70 %)
n/a 42.50
(96.66 %)
61,131
(3.35 %)
61,131
(3.35 %)
72,785
(96.65 %)
3,682,263
(37.05 %)
634,854
(2.15 %)
10,841,759
(33.45 %)
7
(0.00 %)
404,463
(1.53 %)
57,630
(1.79 %)
51,011
(1.50 %)
556 little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022)
GCA_024363435.1
n/a n/a 19,150
(1.52 %)
23,435
(1.64 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
229
(0.00 %)
718
(100.00 %)
n/a 1,051,300
(12.43 %)
9,858,628
(43.20 %)
3
(0.00 %)
1,828,018
(5.83 %)
48,101
(2.62 %)
48,908
(1.62 %)
557 little pocket mouse (longimembris primary hap 2022)
GCA_024363575.1
n/a n/a 19,760
(1.50 %)
24,317
(1.63 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
215
(0.00 %)
1,135
(100.00 %)
3,913,744
(28.43 %)
1,095,577
(12.70 %)
10,273,833
(43.74 %)
2
(0.00 %)
1,919,880
(5.85 %)
49,636
(2.61 %)
49,755
(1.59 %)
558 little tube-nosed bat
GCA_004026665.1
n/a n/a 22,009
(1.26 %)
45,725
(1.35 %)
n/a 43.80
(99.90 %)
6,795
(0.03 %)
6,795
(0.03 %)
886,972
(99.97 %)
3,372,804
(23.57 %)
1,014,476
(3.00 %)
11,948,592
(41.18 %)
29
(0.00 %)
n/a 71,530
(2.05 %)
53,483
(1.43 %)
559 little yellow-shouldered Mesoamerican bat (hap1 2026)
GCA_054855685.1
n/a n/a 18,026
(1.60 %)
20,157
(1.49 %)
n/a 42.76
(100.00 %)
0
(0 %)
107
(0.00 %)
948
(100.00 %)
4,010,797
(44.26 %)
492,856
(4.68 %)
11,967,529
(35.61 %)
3
(0.00 %)
464,417
(2.07 %)
67,991
(1.87 %)
53,031
(1.50 %)
560 little yellow-shouldered Mesoamerican bat (hap2 2026)
GCA_054855695.1
n/a n/a 16,884
(1.64 %)
18,316
(1.50 %)
n/a 42.71
(100.00 %)
0
(0 %)
83
(0.00 %)
703
(100.00 %)
3,651,686
(43.73 %)
427,096
(4.49 %)
11,079,759
(34.79 %)
4
(0.00 %)
387,725
(1.86 %)
61,324
(1.78 %)
47,154
(1.47 %)
561 long-finned pilot whale (alternate hap 2024)
GCA_963455345.2
n/a n/a 17,552
(1.56 %)
25,954
(1.35 %)
n/a 42.12
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28,097
(100.00 %)
3,815,058
(48.74 %)
789,873
(8.23 %)
9,845,230
(38.66 %)
0
(0 %)
774,006
(3.18 %)
58,137
(3.47 %)
38,440
(1.66 %)
562 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_963455315.2
61,447
(2.80 %)
n/a 18,725
(1.51 %)
20,946
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
1,084
(0.01 %)
1,084
(0.01 %)
2,076
(99.99 %)
4,125,452
(35.62 %)
1,577,896
(12.03 %)
12,347,170
(42.01 %)
10
(0.00 %)
1,284,155
(3.89 %)
71,822
(5.51 %)
41,663
(1.04 %)
563 long-finned pilot whale (X-22926-18 2019)
GCF_006547405.1
66,117
(3.28 %)
n/a 18,772
(1.80 %)
21,031
(1.46 %)
33,672
(1.78 %)
41.29
(99.58 %)
14,583
(0.42 %)
14,859
(0.42 %)
20,999
(99.58 %)
3,962,125
(45.58 %)
557,247
(1.11 %)
12,616,535
(34.70 %)
643
(0.01 %)
404,788
(1.24 %)
62,905
(1.69 %)
41,085
(1.25 %)
564 long-footed potoroo (2021)
GCA_904812075.1
n/a n/a 278
(19.06 %)
223
(16.20 %)
n/a 51.14
(99.50 %)
0
(0 %)
n/a 1,479
(100.00 %)
194
(1.83 %)
54
(0.32 %)
2,088
(5.90 %)
0
(0 %)
9
(0.15 %)
51
(2.47 %)
46
(2.25 %)
565 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1
54,854
(2.98 %)
n/a 18,096
(1.59 %)
19,514
(1.52 %)
n/a 41.06
(95.56 %)
78,817
(4.46 %)
78,817
(4.46 %)
81,656
(95.54 %)
4,018,866
(30.94 %)
607,082
(1.15 %)
13,528,234
(28.15 %)
1,183
(0.02 %)
162,447
(0.63 %)
46,931
(1.25 %)
45,334
(1.13 %)
566 long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad)
GCA_004027375.1
n/a n/a 19,208
(1.99 %)
31,180
(1.92 %)
n/a 39.56
(99.97 %)
2,056
(0.01 %)
2,056
(0.01 %)
174,041
(99.99 %)
2,893,453
(32.61 %)
597,516
(1.76 %)
12,093,608
(28.14 %)
6
(0.00 %)
n/a 63,015
(4.70 %)
62,530
(4.18 %)
567 Lowland paca
GCA_004365215.1
n/a n/a 21,953
(0.62 %)
56,356
(0.80 %)
n/a 40.83
(99.78 %)
3,060
(0.01 %)
3,060
(0.01 %)
3,771,510
(99.99 %)
5,892,507
(29.20 %)
802,811
(1.38 %)
18,630,883
(38.61 %)
101
(0.00 %)
n/a 61,715
(0.94 %)
53,212
(0.77 %)
568 Madagascan rousette (hap1 2026)
GCA_059802055.1
n/a n/a 17,416
(1.97 %)
23,244
(1.81 %)
n/a 40.37
(100.00 %)
0
(0 %)
50
(0.00 %)
78
(100.00 %)
3,077,702
(36.99 %)
514,081
(2.88 %)
12,173,492
(28.58 %)
3
(0.00 %)
176,741
(0.82 %)
63,249
(7.20 %)
63,191
(5.35 %)
569 Madagascan rousette (hap2 2026)
GCA_059802175.1
n/a n/a 16,694
(2.02 %)
21,640
(1.82 %)
n/a 40.41
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
65
(100.00 %)
2,881,737
(36.08 %)
472,529
(2.90 %)
11,388,923
(27.61 %)
0
(0 %)
141,212
(0.69 %)
58,575
(7.09 %)
58,859
(5.20 %)
570 Malagasy straw-colored fruit bat (hap1 2026)
GCA_059749095.1
n/a n/a 17,913
(1.98 %)
21,869
(1.77 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
103
(0.00 %)
81
(100.00 %)
2,947,096
(34.06 %)
499,471
(2.74 %)
12,180,358
(28.48 %)
1
(0.00 %)
218,681
(0.90 %)
53,093
(4.84 %)
56,785
(4.10 %)
571 Malagasy straw-colored fruit bat (hap2 2026)
GCA_059749105.1
n/a n/a 17,938
(1.99 %)
21,961
(1.77 %)
n/a 39.68
(100.00 %)
0
(0 %)
91
(0.00 %)
54
(100.00 %)
2,950,196
(34.03 %)
496,069
(2.49 %)
12,277,483
(28.35 %)
2
(0.00 %)
194,722
(0.82 %)
52,990
(4.61 %)
56,569
(3.94 %)
572 Malayan pangolin (MJ-LG 2024)
GCF_040802235.1
87,404
(4.24 %)
n/a 18,382
(1.54 %)
19,802
(1.30 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
0
(0 %)
90
(0.00 %)
63
(100.00 %)
3,146,889
(38.39 %)
384,539
(2.15 %)
12,642,995
(34.68 %)
1
(0.00 %)
568,487
(1.95 %)
48,454
(1.30 %)
44,955
(1.18 %)
573 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq)
GCF_001685135.1
48,591
(2.76 %)
n/a 19,458
(1.57 %)
24,783
(1.38 %)
41,272
(1.95 %)
40.78
(92.27 %)
0
(0 %)
984,658
(7.81 %)
80,670
(100.00 %)
3,064,599
(35.21 %)
866,309
(3.08 %)
13,310,859
(28.76 %)
389,500
(1.56 %)
884,203
(3.10 %)
35,558
(0.84 %)
33,754
(0.78 %)
574 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1
68,043
(3.50 %)
n/a 18,167
(1.72 %)
20,453
(1.54 %)
n/a 40.83
(91.78 %)
0
(0 %)
57,746
(8.23 %)
17,969
(100.00 %)
2,864,567
(34.23 %)
277,996
(1.69 %)
12,659,207
(25.72 %)
610
(0.01 %)
258,572
(5.38 %)
33,486
(1.00 %)
32,201
(0.94 %)
575 marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025)
GCA_048126345.1
n/a n/a 25,281
(0.80 %)
18,740
(0.87 %)
n/a 37.80
(99.99 %)
196
(0.01 %)
196
(0.01 %)
889
(99.99 %)
6,538,990
(26.08 %)
1,450,668
(2.40 %)
21,374,371
(47.19 %)
1
(0.00 %)
1,242,479
(2.55 %)
17,923
(0.30 %)
14,429
(0.21 %)
576 Masai giraffe (alternate hap 2026)
GCA_054371575.1
n/a n/a 17,968
(1.65 %)
19,375
(1.35 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
15
(100.00 %)
5,097,065
(47.28 %)
419,165
(2.46 %)
11,795,337
(39.58 %)
0
(0 %)
800,744
(2.64 %)
41,621
(1.98 %)
35,565
(1.70 %)
577 Masai giraffe (MA1 2016 Penn St)
GCA_001651235.1
n/a n/a 20,950
(1.52 %)
28,854
(1.33 %)
n/a 41.39
(96.50 %)
257,672
(3.48 %)
257,672
(3.48 %)
770,838
(96.52 %)
5,502,479
(43.94 %)
531,418
(2.64 %)
13,936,018
(36.18 %)
31,941
(0.52 %)
748,633
(4.02 %)
40,504
(1.02 %)
38,345
(0.94 %)
578 Masai giraffe (primary hap 2026 genbank)
GCA_054371585.1
n/a n/a 18,881
(1.61 %)
20,786
(1.36 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 17
(100.00 %)
5,464,683
(47.98 %)
447,812
(2.90 %)
12,442,051
(40.00 %)
0
(0 %)
937,701
(2.76 %)
44,333
(2.00 %)
37,621
(1.61 %)
579 Masai giraffe (primary hap 2026 refseq)
GCF_054371585.1
146,626
(4.30 %)
n/a 18,883
(1.61 %)
20,802
(1.36 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 16
(100.00 %)
5,464,676
(47.98 %)
447,812
(2.90 %)
12,441,991
(40.00 %)
0
(0 %)
937,701
(2.76 %)
44,333
(2.00 %)
37,621
(1.61 %)
580 meadow jumping mouse
GCA_004024765.1
n/a n/a 22,236
(1.08 %)
44,719
(1.21 %)
n/a 42.31
(99.88 %)
7,610
(0.03 %)
7,610
(0.03 %)
1,165,710
(99.97 %)
6,135,446
(33.31 %)
1,525,146
(3.34 %)
13,854,475
(39.91 %)
38
(0.00 %)
n/a 26,633
(0.68 %)
21,059
(0.49 %)
581 meadow vole (hap1 2024 genbank)
GCA_037038515.1
n/a n/a 19,134
(1.78 %)
20,672
(1.55 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
181
(100.00 %)
4,818,689
(41.90 %)
962,362
(4.16 %)
12,161,222
(34.42 %)
0
(0 %)
1,559,409
(4.65 %)
23,781
(0.74 %)
19,793
(0.55 %)
582 meadow vole (hap1 2024 refseq)
GCF_037038515.1
56,969
(2.88 %)
n/a 19,974
(1.74 %)
20,672
(1.55 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
180
(100.00 %)
4,116,239
(33.62 %)
962,362
(4.16 %)
12,161,153
(34.42 %)
0
(0 %)
1,559,409
(4.65 %)
23,781
(0.74 %)
17,740
(0.46 %)
583 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1
n/a n/a 19,001
(1.82 %)
20,271
(1.68 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
143
(100.00 %)
3,141,368
(21.37 %)
898,900
(4.24 %)
11,475,531
(32.14 %)
0
(0 %)
862,918
(2.64 %)
22,186
(0.75 %)
16,985
(0.48 %)
584 meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq)
GCF_006229205.1
58,806
(2.67 %)
n/a 19,009
(1.64 %)
19,088
(1.36 %)
n/a 41.68
(99.72 %)
0
(0 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,564,931
(40.13 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
5,134
(0.09 %)
236,044
(0.75 %)
64,858
(2.22 %)
63,010
(1.87 %)
585 melon-headed whale (hap1 2025)
GCA_051427945.1
n/a n/a 18,643
(1.64 %)
20,840
(1.43 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
204
(100.00 %)
5,100,394
(52.00 %)
1,312,199
(7.54 %)
12,322,262
(38.99 %)
2
(0.00 %)
1,107,114
(3.27 %)
69,873
(4.58 %)
40,873
(1.19 %)
586 melon-headed whale (hap2 2025)
GCA_051427955.1
n/a n/a 17,790
(1.73 %)
19,805
(1.50 %)
n/a 41.92
(100.00 %)
0
(0 %)
65
(0.00 %)
167
(100.00 %)
4,595,309
(50.05 %)
975,539
(5.44 %)
11,730,402
(37.10 %)
1
(0.00 %)
636,344
(2.05 %)
65,883
(3.79 %)
38,998
(1.23 %)
587 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022)
GCA_024711525.1
n/a n/a 18,555
(1.22 %)
24,508
(1.35 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
0
(0 %)
181
(0.00 %)
3,482
(100.00 %)
6,419,007
(53.84 %)
1,384,128
(15.63 %)
11,486,822
(50.51 %)
2
(0.00 %)
4,107,493
(7.03 %)
38,521
(1.60 %)
33,680
(1.03 %)
588 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022 genbank)
GCA_024711535.1
n/a n/a 21,281
(1.16 %)
28,592
(1.34 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
0
(0 %)
182
(0.00 %)
4,354
(100.00 %)
4,378,955
(29.66 %)
1,568,842
(17.75 %)
12,889,786
(51.96 %)
1
(0.00 %)
5,252,588
(7.78 %)
46,167
(1.71 %)
38,895
(0.74 %)
589 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022 refseq)
GCF_024711535.1
68,331
(2.37 %)
n/a 21,280
(1.16 %)
28,582
(1.34 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
182
(0.00 %)
182
(0.00 %)
4,535
(100.00 %)
4,378,949
(29.66 %)
1,568,842
(17.75 %)
12,889,725
(51.96 %)
1
(0.00 %)
5,252,586
(7.78 %)
46,167
(1.71 %)
38,895
(0.74 %)
590 Merriam's long-tongued bat (hap1 2024)
GCA_039655065.1
n/a n/a 18,172
(1.67 %)
20,736
(1.60 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
0
(0 %)
47
(0.00 %)
82
(100.00 %)
2,998,913
(29.48 %)
418,833
(1.07 %)
11,783,716
(32.96 %)
1
(0.00 %)
317,774
(1.27 %)
65,956
(4.38 %)
57,781
(3.83 %)
591 Merriam's long-tongued bat (hap2 2024)
GCA_039656995.1
n/a n/a 18,105
(1.68 %)
20,751
(1.60 %)
n/a 42.18
(100.00 %)
0
(0 %)
45
(0.00 %)
71
(100.00 %)
2,994,788
(29.48 %)
415,375
(1.07 %)
11,752,432
(32.88 %)
3
(0.00 %)
316,278
(1.25 %)
65,597
(4.38 %)
57,841
(3.85 %)
592 mesic four-striped grass rat (FMNH 192475 2021)
GCA_019844195.1
n/a n/a 18,926
(2.00 %)
20,713
(1.46 %)
n/a 41.06
(99.08 %)
121,340
(0.94 %)
121,340
(0.94 %)
152,293
(99.06 %)
6,081,188
(43.08 %)
1,497,646
(3.55 %)
13,086,584
(30.02 %)
5,768
(0.04 %)
350,470
(0.92 %)
15,700
(0.46 %)
14,500
(0.42 %)
593 Mesoamerican common mustached bat (primary hap 2026)
GCA_056363955.1
n/a n/a 18,206
(1.82 %)
21,154
(1.65 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
27
(100.00 %)
2,457,342
(32.26 %)
349,146
(1.10 %)
12,607,430
(31.43 %)
1
(0.00 %)
152,791
(0.69 %)
54,759
(4.86 %)
55,182
(4.11 %)
594 Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq)
GCF_048164855.1
112,768
(4.40 %)
n/a 19,582
(1.52 %)
20,911
(1.39 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
0
(0 %)
167
(0.00 %)
249
(100.00 %)
4,598,813
(31.70 %)
1,102,136
(4.40 %)
13,591,364
(35.18 %)
1
(0.00 %)
1,132,845
(2.70 %)
53,470
(2.24 %)
48,664
(1.52 %)
595 Mexican gray wolf (hap2 2025)
GCA_048164845.1
n/a n/a 18,738
(1.56 %)
19,759
(1.41 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
124
(0.00 %)
155
(100.00 %)
4,265,479
(32.40 %)
1,030,876
(4.11 %)
12,818,772
(34.22 %)
0
(0 %)
1,040,160
(2.59 %)
50,269
(2.22 %)
46,611
(1.56 %)
596 minke whale (2013 refseq)
GCF_000493695.1
42,553
(2.38 %)
n/a 19,159
(1.73 %)
18,656
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
173,296
(5.96 %)
184,072
(94.04 %)
n/a 573,951
(1.48 %)
13,504,347
(30.96 %)
211
(0.02 %)
317,691
(1.50 %)
65,448
(1.38 %)
43,887
(1.02 %)
597 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1
n/a n/a 20,412
(1.46 %)
27,421
(1.34 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
21,272
(100.00 %)
3,811,435
(36.24 %)
959,712
(10.27 %)
12,159,896
(41.30 %)
0
(0 %)
1,298,777
(4.12 %)
69,852
(1.62 %)
42,454
(1.09 %)
598 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1
61,711
(2.51 %)
n/a 19,550
(1.49 %)
21,499
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
0
(0 %)
1,177
(0.01 %)
1,374
(100.00 %)
4,006,927
(35.92 %)
1,058,105
(12.08 %)
12,708,103
(42.66 %)
4
(0.00 %)
1,500,515
(4.32 %)
72,756
(1.59 %)
44,094
(1.06 %)
599 Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.)
GCF_002204375.1
40,359
(2.29 %)
n/a 21,215
(1.83 %)
24,305
(1.47 %)
n/a 42.09
(95.23 %)
0
(0 %)
91,601
(4.78 %)
68,793
(100.00 %)
4,821,343
(37.74 %)
940,776
(1.82 %)
13,848,274
(31.31 %)
11,561
(0.34 %)
205,312
(0.64 %)
24,154
(0.74 %)
22,829
(0.67 %)
600 Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI)
GCA_008131255.1
n/a n/a 19,952
(1.59 %)
23,462
(1.36 %)
n/a 41.98
(99.01 %)
103,843
(0.97 %)
103,843
(0.97 %)
412,933
(99.03 %)
5,009,454
(0.00 %)
1,042,929
(2.52 %)
14,121,194
(34.63 %)
5,269
(0.12 %)
n/a 26,044
(0.71 %)
23,140
(0.56 %)
601 Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023)
GCF_030254825.1
65,502
(2.97 %)
n/a 19,045
(1.53 %)
20,203
(1.29 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
193
(100.00 %)
4,477,607
(37.21 %)
1,124,432
(5.22 %)
13,244,320
(39.20 %)
0
(0 %)
1,187,344
(2.95 %)
25,300
(0.76 %)
21,781
(0.54 %)
602 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1
n/a n/a 16,419
(0.77 %)
17,219
(0.89 %)
n/a 39.03
(100.00 %)
33
(0.00 %)
33
(0.00 %)
9,959
(100.00 %)
6,332,360
(29.69 %)
1,065,454
(2.09 %)
17,908,986
(42.25 %)
0
(0 %)
1,232,672
(2.38 %)
13,856
(0.35 %)
11,596
(0.23 %)
603 monito del monte (primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1
47,034
(2.02 %)
n/a 18,399
(0.80 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
0
(0 %)
260
(0.09 %)
17
(100.00 %)
9,107,968
(41.08 %)
1,249,635
(2.12 %)
21,135,324
(42.80 %)
0
(0 %)
1,546,314
(2.55 %)
16,598
(0.36 %)
13,911
(0.23 %)
604 Montane guinea pig
GCA_004027695.1
n/a n/a 20,064
(1.06 %)
31,321
(1.18 %)
39,905
(1.42 %)
40.09
(99.88 %)
11,321
(0.04 %)
11,321
(0.04 %)
1,379,500
(99.96 %)
4,730,634
(30.02 %)
1,583,664
(6.57 %)
15,806,339
(40.40 %)
31
(0.00 %)
n/a 37,371
(0.76 %)
27,339
(0.57 %)
605 moose/elk (2024)
GCA_964270355.1
n/a n/a 19,816
(1.60 %)
22,341
(1.44 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
1,737
(100.00 %)
3,099,775
(24.20 %)
406,796
(2.52 %)
13,117,056
(38.34 %)
0
(0 %)
916,612
(2.40 %)
50,644
(1.33 %)
42,520
(1.04 %)
606 moose/elk (AALL_1980 2023)
GCA_015832495.2
n/a n/a 19,116
(1.66 %)
21,184
(1.45 %)
n/a 41.55
(95.50 %)
71,769
(4.51 %)
71,769
(4.51 %)
77,708
(95.49 %)
3,026,678
(23.77 %)
373,266
(0.91 %)
13,167,376
(34.08 %)
1,299
(0.05 %)
343,983
(1.04 %)
44,302
(1.21 %)
41,306
(1.01 %)
607 moose/elk (MIG12-28694850 2019)
GCA_007570765.1
n/a n/a 21,375
(1.65 %)
26,769
(1.42 %)
n/a 41.64
(92.66 %)
83,533
(7.35 %)
83,831
(7.35 %)
131,373
(92.65 %)
5,022,053
(43.27 %)
384,658
(1.22 %)
13,422,381
(34.52 %)
2,907
(0.05 %)
424,593
(1.20 %)
49,216
(1.18 %)
45,847
(1.08 %)
608 Mount Data shrew rat (FMNH 198792 2021)
GCA_019843965.1
n/a n/a 18,266
(2.07 %)
18,451
(1.45 %)
n/a 41.51
(99.45 %)
47,796
(0.55 %)
47,796
(0.55 %)
61,989
(99.45 %)
5,656,524
(42.94 %)
1,120,762
(2.44 %)
12,212,163
(29.98 %)
6,957
(0.06 %)
313,446
(0.95 %)
15,204
(0.46 %)
14,180
(0.42 %)
609 mountain beaver
GCA_004027875.1
n/a n/a 22,428
(1.10 %)
38,670
(1.12 %)
n/a 40.58
(99.89 %)
7,253
(0.02 %)
7,253
(0.02 %)
1,286,779
(99.98 %)
5,859,004
(32.29 %)
914,052
(2.37 %)
16,249,666
(38.21 %)
103
(0.00 %)
n/a 39,133
(0.76 %)
26,371
(0.54 %)
610 mountain bongo (Barney_WCC 2024)
GCA_040438115.1
n/a n/a 19,857
(1.47 %)
21,826
(1.20 %)
n/a 41.99
(96.15 %)
0
(0 %)
62,885
(3.86 %)
34,537
(100.00 %)
6,342,707
(52.09 %)
474,043
(1.33 %)
13,361,157
(42.94 %)
3,843
(0.05 %)
1,843,489
(4.38 %)
42,078
(0.91 %)
34,738
(0.78 %)
611 muskrat
GCA_004026605.1
n/a n/a 22,540
(1.52 %)
32,136
(1.35 %)
n/a 41.59
(99.93 %)
6,243
(0.02 %)
6,243
(0.02 %)
571,599
(99.98 %)
4,437,736
(28.49 %)
922,826
(2.38 %)
13,945,732
(35.23 %)
31
(0.00 %)
n/a 19,876
(0.50 %)
16,936
(0.41 %)
612 naked mole-rat (2022)
GCA_944319725.1
n/a n/a 20,755
(1.51 %)
20,024
(1.35 %)
n/a 39.98
(99.96 %)
0
(0 %)
2,332
(0.04 %)
264
(100.00 %)
3,593,261
(30.76 %)
529,045
(1.14 %)
13,294,831
(36.07 %)
19
(0.00 %)
314,025
(1.11 %)
32,235
(0.93 %)
30,323
(0.79 %)
613 naked mole-rat (maternal 2024)
GCA_964261345.1
n/a n/a 19,980
(1.56 %)
19,365
(1.33 %)
n/a 39.96
(99.93 %)
191
(0.00 %)
2,238
(0.07 %)
263
(100.00 %)
5,099,610
(44.65 %)
523,459
(1.13 %)
13,036,461
(35.91 %)
17
(0.00 %)
306,657
(1.09 %)
31,614
(0.92 %)
29,594
(0.84 %)
614 naked mole-rat (MEF-2018 2020)
GCA_014060925.1
n/a n/a 22,011
(1.30 %)
21,392
(1.22 %)
n/a 40.13
(95.11 %)
139,535
(4.91 %)
139,535
(4.91 %)
148,797
(95.09 %)
4,885,102
(35.91 %)
654,418
(1.90 %)
16,401,315
(34.21 %)
228
(0.03 %)
1,754,699
(7.39 %)
40,717
(0.98 %)
38,057
(0.81 %)
615 naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq)
GCF_000247695.1
74,587
(3.56 %)
n/a 21,332
(1.74 %)
20,861
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
110,424
(11.59 %)
114,653
(88.41 %)
4,179,991
(32.69 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,561
(27.63 %)
595
(0.01 %)
103,053
(0.44 %)
31,950
(0.88 %)
31,055
(0.81 %)
616 naked mole-rat (pHap 2024)
GCA_964261355.1
n/a n/a 19,953
(1.57 %)
19,579
(1.35 %)
n/a 39.98
(99.91 %)
189
(0.00 %)
2,381
(0.09 %)
264
(100.00 %)
5,097,978
(44.61 %)
523,861
(1.13 %)
13,168,788
(36.09 %)
19
(0.00 %)
308,689
(1.11 %)
31,789
(0.93 %)
29,704
(0.84 %)
617 narwhal
GCA_005190385.4
n/a 55,319
(3.47 %)
18,678
(1.79 %)
19,820
(1.40 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
323
(0.00 %)
91
(100.00 %)
4,018,392
(43.94 %)
611,903
(1.52 %)
12,641,524
(35.02 %)
0
(0 %)
536,287
(1.64 %)
60,518
(1.78 %)
39,651
(1.18 %)
618 narwhal (Baffin Bay 2019)
GCF_005190385.1
51,639
(2.71 %)
n/a 18,741
(1.78 %)
20,365
(1.40 %)
33,148
(1.79 %)
41.22
(99.52 %)
0
(0 %)
18,323
(0.49 %)
6,972
(100.00 %)
4,011,742
(43.97 %)
565,367
(1.22 %)
12,720,018
(34.85 %)
1,797
(0.02 %)
430,336
(1.30 %)
60,492
(1.58 %)
43,582
(1.25 %)
619 narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022)
GCA_005190385.3
n/a n/a 18,681
(1.79 %)
19,816
(1.40 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
313
(0.00 %)
101
(100.00 %)
3,618,235
(37.24 %)
612,229
(1.52 %)
12,641,632
(35.02 %)
0
(0 %)
550,897
(1.69 %)
60,518
(1.78 %)
57,655
(1.47 %)
620 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1
32,050
(3.03 %)
n/a 18,015
(2.17 %)
18,293
(1.87 %)
n/a 42.07
(96.24 %)
0
(0 %)
204,616
(3.79 %)
1,269
(100.00 %)
2,565,457
(28.95 %)
376,532
(1.91 %)
10,427,823
(26.35 %)
3,320
(0.15 %)
203,691
(1.83 %)
63,261
(2.07 %)
59,010
(1.80 %)
621 Natal long-fingered bat (hap1 2026)
GCA_054644295.1
n/a n/a 17,698
(2.09 %)
21,893
(1.88 %)
n/a 42.54
(100.00 %)
0
(0 %)
113
(0.00 %)
136
(100.00 %)
3,272,492
(39.30 %)
405,440
(5.61 %)
10,243,363
(30.84 %)
2
(0.00 %)
523,758
(1.89 %)
59,199
(2.79 %)
53,557
(2.26 %)
622 Natal long-fingered bat (hap2 2026)
GCA_054644305.1
n/a n/a 17,715
(2.11 %)
22,079
(1.91 %)
n/a 42.49
(100.00 %)
0
(0 %)
121
(0.00 %)
99
(100.00 %)
3,263,689
(38.58 %)
393,153
(4.56 %)
10,248,496
(30.06 %)
1
(0.00 %)
448,180
(1.62 %)
59,330
(2.85 %)
53,664
(2.29 %)
623 Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_964656225.1
n/a n/a 18,001
(1.75 %)
21,219
(1.77 %)
n/a 42.26
(99.98 %)
0
(0 %)
1,836
(0.02 %)
1,062
(100.00 %)
3,664,854
(32.90 %)
906,692
(8.55 %)
10,164,440
(37.98 %)
12
(0.00 %)
783,617
(2.68 %)
56,705
(2.75 %)
55,975
(1.86 %)
624 Nathusius's pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_964656225.2
n/a n/a 17,671
(1.80 %)
21,057
(1.71 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
13
(0.00 %)
307
(0.00 %)
410
(100.00 %)
4,579,266
(45.39 %)
943,644
(11.48 %)
9,925,875
(39.77 %)
2
(0.00 %)
931,343
(3.13 %)
56,485
(2.63 %)
54,464
(2.50 %)
625 Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_964656075.1
n/a n/a 17,899
(1.71 %)
20,808
(1.69 %)
n/a 42.15
(99.98 %)
1,832
(0.02 %)
1,832
(0.02 %)
2,485
(99.98 %)
3,637,576
(31.92 %)
930,013
(11.25 %)
9,967,930
(39.61 %)
9
(0.00 %)
910,240
(3.07 %)
56,237
(2.62 %)
55,739
(1.82 %)
626 Nathusius's pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_964656075.2
n/a n/a 17,650
(1.86 %)
21,005
(1.78 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
306
(0.00 %)
306
(0.00 %)
759
(100.00 %)
4,580,609
(44.28 %)
888,097
(8.14 %)
10,070,978
(37.75 %)
2
(0.00 %)
747,635
(2.57 %)
56,514
(2.79 %)
54,801
(2.58 %)
627 Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024)
GCA_963693515.1
n/a 19,038
(1.68 %)
17,944
(1.86 %)
20,545
(1.83 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
1
(0.00 %)
263
(0.00 %)
154
(100.00 %)
3,628,328
(34.57 %)
838,723
(4.04 %)
10,155,601
(35.22 %)
1
(0.00 %)
545,765
(1.88 %)
56,332
(2.92 %)
56,107
(1.97 %)
628 Natterer's bat
GCF_964212035.1
36,662
(2.62 %)
n/a 18,650
(1.78 %)
22,423
(1.68 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
0
(0 %)
225
(0.00 %)
212
(100.00 %)
5,075,897
(48.88 %)
801,041
(5.78 %)
10,278,311
(38.66 %)
2
(0.00 %)
750,791
(2.61 %)
64,639
(2.57 %)
55,681
(2.11 %)
629 Natterer's bat (hap1.2 2025)
GCA_964212035.2
n/a n/a 19,475
(1.82 %)
22,424
(1.68 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
0
(0 %)
225
(0.00 %)
212
(100.00 %)
3,841,654
(38.99 %)
801,041
(5.78 %)
10,278,311
(38.66 %)
2
(0.00 %)
750,791
(2.61 %)
64,639
(2.57 %)
58,753
(2.26 %)
630 Natterer's bat (hap2.2 2025)
GCA_964212025.2
n/a n/a 18,368
(1.91 %)
21,701
(1.80 %)
n/a 43.27
(100.00 %)
136
(0.00 %)
136
(0.00 %)
309
(100.00 %)
3,509,151
(38.16 %)
704,537
(5.21 %)
9,806,703
(36.74 %)
8
(0.00 %)
600,350
(2.27 %)
61,004
(2.65 %)
56,443
(2.40 %)
631 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2
49,109
(2.78 %)
n/a 17,703
(1.63 %)
19,389
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
0
(0 %)
38,675
(0.21 %)
26,068
(100.00 %)
2,862,405
(29.31 %)
366,960
(1.48 %)
11,796,203
(31.27 %)
105
(0.00 %)
330,211
(1.83 %)
59,091
(1.70 %)
48,137
(1.34 %)
632 New Mexican meadow jumping mouse (hap1 2026)
GCA_057945945.1
n/a n/a 19,141
(1.41 %)
22,877
(1.82 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
0
(0 %)
466
(0.00 %)
309
(100.00 %)
5,003,584
(35.98 %)
1,325,881
(5.09 %)
12,286,670
(39.67 %)
3
(0.00 %)
1,190,322
(3.22 %)
26,988
(1.58 %)
18,923
(0.53 %)
633 New Mexican meadow jumping mouse (hap2 2026)
GCA_057945955.1
n/a n/a 19,093
(1.41 %)
22,903
(1.71 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
0
(0 %)
462
(0.00 %)
262
(100.00 %)
5,039,618
(35.97 %)
1,310,844
(5.10 %)
12,276,585
(39.57 %)
6
(0.00 %)
1,219,807
(3.28 %)
26,703
(1.33 %)
18,788
(0.52 %)
634 Nilgiri tahr
GCA_004026825.1
n/a n/a 22,735
(1.44 %)
34,961
(1.27 %)
n/a 42.37
(99.93 %)
10,387
(0.04 %)
10,387
(0.04 %)
479,550
(99.96 %)
5,793,761
(48.50 %)
535,297
(1.34 %)
13,378,352
(42.46 %)
61
(0.00 %)
n/a 57,653
(1.29 %)
42,256
(1.01 %)
635 nine-banded armadillo (hap2 2023)
GCA_030445035.2
n/a n/a 21,049
(1.11 %)
24,419
(1.07 %)
n/a 41.00
(99.67 %)
0
(0 %)
793
(0.33 %)
546
(100.00 %)
5,507,356
(53.38 %)
738,321
(2.02 %)
19,755,425
(43.69 %)
4
(0.00 %)
652,231
(1.43 %)
142,597
(2.85 %)
85,773
(2.07 %)
636 nine-banded armadillo (v2 hap1 2023)
GCA_030445055.2
n/a n/a 19,350
(1.07 %)
22,207
(1.07 %)
n/a 40.97
(99.27 %)
0
(0 %)
823
(0.73 %)
588
(100.00 %)
4,330,716
(32.85 %)
661,966
(1.52 %)
18,302,021
(42.22 %)
5
(0.00 %)
542,125
(1.36 %)
130,245
(2.79 %)
70,861
(1.76 %)
637 nine-banded armadillo (v2 hap2 2023)
GCF_030445035.2
72,174
(2.47 %)
n/a 21,051
(1.11 %)
24,418
(1.07 %)
n/a 41.00
(99.67 %)
0
(0 %)
793
(0.33 %)
546
(100.00 %)
5,412,063
(53.31 %)
738,320
(2.02 %)
19,755,423
(43.69 %)
4
(0.00 %)
736,184
(1.61 %)
142,597
(2.85 %)
85,791
(2.07 %)
638 nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor)
GCF_000208655.3
46,110
(1.87 %)
n/a 20,820
(1.08 %)
25,226
(1.08 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,408
(9.13 %)
268,437
(9.13 %)
314,788
(90.87 %)
4,552,770
(34.01 %)
651,225
(1.26 %)
19,266,969
(38.27 %)
239
(0.00 %)
482,237
(1.17 %)
139,490
(2.47 %)
79,407
(1.60 %)
639 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022)
GCA_026167925.1
n/a n/a 19,342
(1.57 %)
20,947
(1.48 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
0
(0 %)
229
(0.00 %)
1,006
(100.00 %)
4,161,568
(23.13 %)
1,278,205
(8.22 %)
13,148,019
(37.60 %)
1
(0.00 %)
1,208,815
(3.32 %)
23,523
(0.71 %)
19,170
(0.46 %)
640 North American deer mouse (v1 MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1
n/a n/a 19,700
(1.54 %)
22,354
(1.46 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
244
(0.00 %)
244
(0.00 %)
2,082
(100.00 %)
6,089,884
(47.99 %)
1,358,786
(9.39 %)
13,799,349
(39.08 %)
3
(0.00 %)
1,511,691
(3.84 %)
24,733
(0.70 %)
22,588
(0.58 %)
641 North American deer mouse (v2 MVZ:Mamm:240117 primary hap 2026)
GCA_026229955.2
n/a 76,907
(41.22 %)
19,460
(1.53 %)
21,066
(1.38 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
0
(0 %)
477
(0.00 %)
1,632
(100.00 %)
7,214,715
(49.58 %)
1,352,727
(9.20 %)
13,819,592
(38.94 %)
5
(0.00 %)
1,476,108
(3.76 %)
24,484
(0.70 %)
20,642
(0.52 %)
642 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1
n/a n/a 15,210
(1.55 %)
18,316
(1.43 %)
n/a 41.06
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,051
(100.00 %)
3,911,633
(40.55 %)
565,546
(1.54 %)
10,853,726
(32.61 %)
0
(0 %)
378,575
(1.36 %)
40,925
(1.35 %)
26,837
(0.96 %)
643 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1
n/a n/a 18,102
(1.58 %)
20,073
(1.40 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
0
(0 %)
277
(0.00 %)
116
(100.00 %)
4,958,089
(41.64 %)
719,163
(1.59 %)
13,867,662
(33.89 %)
7
(0.00 %)
506,727
(1.48 %)
51,299
(1.36 %)
33,440
(0.96 %)
644 North Atlantic bottlenose whale
GCF_949752795.1
33,287
(1.31 %)
n/a 19,106
(1.50 %)
20,818
(1.21 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,098
(0.01 %)
756
(100.00 %)
5,163,512
(53.86 %)
769,275
(14.94 %)
12,133,394
(44.83 %)
6
(0.00 %)
3,171,972
(7.30 %)
67,258
(2.00 %)
39,081
(1.51 %)
645 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1
49,646
(1.86 %)
n/a 19,562
(1.46 %)
21,631
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
367
(0.17 %)
789
(100.00 %)
1,368,536
(2.24 %)
841,303
(13.08 %)
12,527,582
(43.92 %)
11
(0.00 %)
1,404,448
(3.90 %)
94,259
(1.92 %)
41,005
(0.96 %)
646 North Atlantic right whale (hap2._XY 2023)
GCA_028564815.2
n/a n/a 19,476
(1.53 %)
21,630
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
367
(0.17 %)
788
(100.00 %)
4,812,242
(53.57 %)
841,302
(13.08 %)
12,527,493
(43.92 %)
11
(0.00 %)
1,404,448
(3.90 %)
94,259
(1.92 %)
42,410
(1.06 %)
647 North Atlantic right whale (v1 hap1 2023)
GCA_028571275.1
n/a n/a 18,699
(1.61 %)
20,354
(1.28 %)
n/a 41.64
(99.84 %)
0
(0 %)
385
(0.16 %)
947
(100.00 %)
3,815,900
(43.46 %)
718,935
(11.38 %)
11,928,210
(42.25 %)
2
(0.00 %)
1,117,252
(3.44 %)
85,881
(1.90 %)
41,289
(1.19 %)
648 North Atlantic right whale (v2 hap1 2023)
GCA_028571275.2
n/a n/a 18,673
(1.52 %)
20,481
(1.29 %)
n/a 41.64
(99.84 %)
0
(0 %)
381
(0.16 %)
938
(100.00 %)
1,270,626
(2.25 %)
714,265
(11.41 %)
11,856,103
(42.12 %)
2
(0.00 %)
1,108,370
(3.43 %)
85,484
(1.90 %)
38,920
(0.99 %)
649 North Pacific right whale
GCA_004363455.1
n/a n/a 23,145
(1.43 %)
38,161
(1.21 %)
n/a 41.15
(99.88 %)
7,094
(0.03 %)
7,094
(0.03 %)
1,361,057
(99.97 %)
5,039,622
(45.69 %)
694,986
(1.31 %)
14,063,101
(40.51 %)
73
(0.00 %)
n/a 74,800
(1.52 %)
49,455
(1.20 %)
650 North Sulawesi babirusa (hap1 2026)
GCA_057927545.1
n/a n/a 17,837
(1.53 %)
19,846
(1.30 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
531
(0.00 %)
2,202
(100.00 %)
6,623,055
(49.70 %)
672,980
(3.45 %)
13,111,305
(38.79 %)
16
(0.00 %)
656,543
(2.22 %)
61,896
(2.07 %)
44,778
(1.75 %)
651 North Sulawesi babirusa (hap2 2026)
GCA_057877285.1
n/a n/a 15,642
(1.54 %)
17,116
(1.32 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
0
(0 %)
578
(0.00 %)
1,389
(100.00 %)
5,920,679
(48.33 %)
593,514
(2.37 %)
11,705,732
(36.85 %)
24
(0.00 %)
445,117
(1.71 %)
48,967
(1.68 %)
35,325
(1.40 %)
652 northern American river otter
GCF_010015895.1
53,945
(2.18 %)
n/a 18,974
(1.68 %)
21,247
(1.45 %)
n/a 41.41
(99.58 %)
6,928
(0.42 %)
7,620
(0.42 %)
13,541
(99.58 %)
4,538,847
(41.18 %)
685,281
(1.20 %)
13,840,953
(32.61 %)
360
(0.01 %)
364,620
(0.96 %)
53,559
(1.88 %)
52,003
(1.68 %)
653 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1
n/a n/a 18,343
(1.80 %)
23,253
(1.77 %)
n/a 43.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
4,899
(100.00 %)
1,174,241
(2.96 %)
825,170
(5.11 %)
9,889,579
(36.12 %)
0
(0 %)
598,356
(2.10 %)
76,164
(3.52 %)
59,778
(2.27 %)
654 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1
n/a n/a 18,636
(1.75 %)
21,446
(1.68 %)
n/a 43.32
(99.99 %)
0
(0 %)
1,423
(0.01 %)
207
(100.00 %)
1,259,729
(2.95 %)
905,676
(6.25 %)
10,554,535
(38.21 %)
3
(0.00 %)
780,081
(2.54 %)
77,656
(3.27 %)
60,964
(2.14 %)
655 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1
n/a n/a 18,924
(1.53 %)
22,934
(1.58 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
199
(0.00 %)
146
(100.00 %)
3,850,624
(31.21 %)
648,359
(3.76 %)
11,788,702
(39.25 %)
2
(0.00 %)
811,589
(2.31 %)
85,908
(2.60 %)
73,781
(1.91 %)
656 northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024)
GCA_039880945.1
n/a n/a 18,933
(1.44 %)
23,629
(1.50 %)
n/a 42.60
(100.00 %)
0
(0 %)
113
(0.00 %)
366
(100.00 %)
4,027,155
(30.73 %)
712,278
(5.22 %)
12,003,034
(41.58 %)
3
(0.00 %)
975,691
(2.71 %)
96,116
(3.02 %)
75,017
(1.84 %)
657 northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024)
GCA_039880925.1
n/a n/a 18,305
(1.49 %)
22,534
(1.56 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
282
(100.00 %)
3,783,543
(30.10 %)
656,592
(4.68 %)
11,353,707
(40.26 %)
0
(0 %)
877,118
(2.58 %)
92,041
(3.01 %)
72,323
(1.87 %)
658 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1
n/a n/a 19,537
(1.44 %)
27,826
(1.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 23,401
(100.00 %)
3,634,923
(35.56 %)
672,860
(11.00 %)
11,175,398
(41.72 %)
0
(0 %)
1,941,411
(5.36 %)
62,007
(1.94 %)
36,247
(0.95 %)
659 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1
n/a n/a 19,073
(1.44 %)
20,821
(1.21 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,098
(0.01 %)
757
(100.00 %)
3,997,911
(34.76 %)
769,275
(14.94 %)
12,133,820
(44.83 %)
6
(0.00 %)
3,171,972
(7.30 %)
67,258
(2.00 %)
38,513
(0.89 %)
660 northern elephant seal (BS05 2019 Broad)
GCA_004023865.1
n/a n/a 22,834
(1.54 %)
36,083
(1.32 %)
n/a 41.52
(99.94 %)
9,483
(0.04 %)
9,483
(0.04 %)
330,739
(99.96 %)
4,849,944
(43.83 %)
600,306
(1.16 %)
13,420,049
(34.43 %)
55
(0.00 %)
452,384
(1.15 %)
57,236
(1.62 %)
53,204
(1.43 %)
661 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank)
GCA_029215605.1
n/a n/a 19,278
(1.60 %)
19,908
(1.39 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
98
(0.00 %)
98
(0.00 %)
596
(100.00 %)
4,348,333
(34.40 %)
621,985
(2.21 %)
13,251,768
(35.32 %)
0
(0 %)
811,715
(2.28 %)
69,898
(2.38 %)
44,044
(1.16 %)
662 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq)
GCF_029215605.1
74,106
(3.88 %)
n/a 19,277
(1.60 %)
20,000
(1.36 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
98
(0.00 %)
98
(0.00 %)
595
(100.00 %)
4,348,327
(34.40 %)
621,980
(2.21 %)
13,251,706
(35.32 %)
0
(0 %)
811,710
(2.28 %)
69,897
(2.38 %)
44,044
(1.16 %)
663 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023)
GCA_029215635.1
n/a n/a 19,340
(1.59 %)
19,732
(1.37 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
60
(0.00 %)
60
(0.00 %)
482
(100.00 %)
4,365,070
(34.26 %)
627,639
(2.43 %)
13,174,494
(35.47 %)
2
(0.00 %)
866,044
(2.39 %)
74,314
(2.49 %)
44,405
(1.17 %)
664 northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022)
GCF_021288785.2
53,819
(3.32 %)
n/a 20,099
(1.75 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
0
(0 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,368,400
(33.93 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
2,726
(0.09 %)
n/a 52,064
(1.59 %)
49,271
(1.43 %)
665 northern fur seal
GCF_003265705.1
54,953
(2.43 %)
n/a 23,408
(1.78 %)
23,666
(1.43 %)
52,089
(2.17 %)
41.48
(98.01 %)
38,666
(1.99 %)
38,666
(1.99 %)
52,469
(98.01 %)
5,047,032
(43.38 %)
638,130
(1.06 %)
14,922,442
(33.12 %)
2,675
(0.04 %)
444,034
(1.22 %)
57,281
(1.44 %)
53,162
(1.27 %)
666 northern fur seal (GAN/ISIS: 27379988/994484 2025)
GCF_003265705.2
71,169
(3.14 %)
n/a 21,276
(1.78 %)
21,276
(1.42 %)
n/a 41.44
(98.05 %)
29,679
(1.95 %)
30,369
(1.95 %)
43,734
(98.05 %)
4,118,994
(34.95 %)
578,801
(1.07 %)
13,530,999
(33.27 %)
1,105
(0.03 %)
400,358
(1.22 %)
51,258
(1.43 %)
48,682
(1.30 %)
667 northern gundi (hap1 2025)
GCA_048771875.1
n/a n/a 16,996
(1.51 %)
21,787
(1.66 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
117
(0.00 %)
535
(100.00 %)
3,293,772
(27.51 %)
602,403
(3.02 %)
11,827,700
(30.64 %)
2
(0.00 %)
353,736
(1.31 %)
44,220
(1.55 %)
38,845
(1.17 %)
668 northern gundi (hap2 2025)
GCA_048771865.1
n/a n/a 17,037
(1.43 %)
21,690
(1.55 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
0
(0 %)
115
(0.00 %)
1,031
(100.00 %)
3,527,940
(26.81 %)
646,620
(6.32 %)
11,343,462
(34.09 %)
0
(0 %)
754,284
(2.54 %)
47,125
(1.51 %)
39,404
(1.11 %)
669 northern gundi (US049 2019)
GCA_004027205.1
n/a n/a 18,035
(1.39 %)
27,379
(1.57 %)
n/a 42.68
(99.91 %)
5,037
(0.02 %)
5,037
(0.02 %)
865,110
(99.98 %)
4,149,883
(27.83 %)
654,063
(1.64 %)
12,342,565
(33.72 %)
12
(0.00 %)
n/a 47,533
(1.43 %)
40,352
(1.09 %)
670 Northern hairy-legged myotis (hap1 2026)
GCA_057888715.1
n/a n/a 18,686
(1.84 %)
21,585
(1.68 %)
n/a 42.92
(100.00 %)
0
(0 %)
86
(0.00 %)
115
(100.00 %)
5,056,672
(47.84 %)
720,091
(4.09 %)
10,496,975
(37.76 %)
9
(0.00 %)
743,593
(2.59 %)
58,979
(2.35 %)
49,429
(1.81 %)
671 Northern hairy-legged myotis (hap2 2026)
GCA_057888765.1
n/a n/a 18,721
(1.84 %)
21,762
(1.69 %)
n/a 42.92
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
94
(100.00 %)
5,050,793
(47.87 %)
719,858
(4.19 %)
10,485,939
(37.74 %)
9
(0.00 %)
669,260
(2.27 %)
58,950
(2.33 %)
49,629
(1.83 %)
672 northern mole vole
GCA_001685095.1
n/a n/a 23,252
(1.39 %)
44,209
(1.25 %)
n/a 41.68
(99.04 %)
371,627
(0.98 %)
371,627
(0.98 %)
722,087
(99.02 %)
3,923,814
(25.79 %)
898,453
(2.47 %)
13,708,986
(29.04 %)
96,051
(0.87 %)
280,901
(1.10 %)
16,583
(0.36 %)
15,193
(0.32 %)
673 northern three-toed jerboa (halli NM19106 2024)
GCA_036346955.1
n/a n/a 19,574
(1.25 %)
21,306
(1.23 %)
n/a 42.16
(99.93 %)
0
(0 %)
954
(0.07 %)
487
(100.00 %)
6,447,286
(38.11 %)
1,321,523
(3.44 %)
13,986,035
(43.83 %)
0
(0 %)
1,353,424
(3.71 %)
30,337
(0.84 %)
23,455
(0.53 %)
674 northern white rhinoceros
GCA_004027795.1
n/a n/a 25,328
(1.34 %)
61,003
(1.95 %)
n/a 41.32
(99.90 %)
7,054
(0.03 %)
7,054
(0.03 %)
949,480
(99.97 %)
4,330,882
(38.89 %)
484,754
(1.12 %)
15,544,248
(33.11 %)
44
(0.00 %)
n/a 43,689
(2.08 %)
40,625
(1.98 %)
675 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc alternate hap 2024)
GCA_043748905.1
n/a n/a 17,474
(1.85 %)
19,891
(1.65 %)
n/a 40.73
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,329
(100.00 %)
3,473,169
(40.23 %)
618,364
(2.01 %)
11,013,083
(30.75 %)
0
(0 %)
417,595
(1.73 %)
32,427
(1.26 %)
25,855
(1.05 %)
676 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024)
GCA_043748575.1
n/a n/a 18,475
(1.82 %)
19,990
(1.56 %)
n/a 40.72
(100.00 %)
2
(0.00 %)
63
(0.00 %)
68
(100.00 %)
3,507,612
(39.92 %)
711,081
(2.15 %)
11,788,205
(32.17 %)
0
(0 %)
524,992
(2.03 %)
35,670
(1.25 %)
28,616
(1.05 %)
677 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank)
GCA_036323735.1
114,725
(42.69 %)
n/a 21,917
(1.75 %)
19,476
(1.26 %)
n/a 41.82
(99.86 %)
0
(0 %)
220
(0.14 %)
77
(100.00 %)
4,700,726
(39.99 %)
1,603,005
(5.45 %)
13,451,813
(38.68 %)
21
(0.00 %)
1,553,966
(4.21 %)
20,118
(0.44 %)
17,465
(0.38 %)
678 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq)
GCF_036323735.1
114,725
(5.38 %)
n/a 21,870
(1.74 %)
19,989
(1.27 %)
n/a 41.82
(99.86 %)
0
(0 %)
220
(0.14 %)
76
(100.00 %)
5,294,185
(42.75 %)
1,603,005
(5.45 %)
13,451,760
(38.68 %)
21
(0.00 %)
1,553,966
(4.21 %)
20,118
(0.44 %)
17,703
(0.38 %)
679 Norway rat (F344/Stm 2024)
GCA_041222355.1
n/a n/a 21,764
(1.78 %)
20,141
(1.30 %)
n/a 41.87
(99.96 %)
0
(0 %)
234
(0.04 %)
120
(100.00 %)
4,636,987
(39.98 %)
1,579,595
(5.22 %)
13,544,768
(38.06 %)
4
(0.00 %)
1,510,531
(4.17 %)
20,127
(0.46 %)
17,493
(0.40 %)
680 Norway rat (LE/Stm RGD_629485 2026)
GCA_058775275.1
n/a n/a 22,033
(1.74 %)
20,312
(1.28 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
0
(0 %)
255
(0.00 %)
1,330
(100.00 %)
4,747,037
(40.17 %)
1,613,740
(6.08 %)
13,369,040
(38.80 %)
8
(0.00 %)
1,672,013
(4.57 %)
20,630
(0.51 %)
19,157
(0.45 %)
681 Norway rat (v1 SHRSP/BppUtx 2022)
GCA_021556685.1
n/a n/a 22,366
(1.71 %)
20,531
(1.26 %)
57,580
(2.44 %)
41.86
(99.94 %)
0
(0 %)
1,610
(0.06 %)
2,734
(100.00 %)
5,238,574
(46.36 %)
1,638,412
(5.87 %)
13,769,141
(38.49 %)
12
(0.00 %)
1,712,824
(4.62 %)
21,006
(0.49 %)
17,310
(0.40 %)
682 Norway rat (v2 T2T SHRSP/BbbUtx 2026)
GCA_021556685.2
n/a n/a 21,935
(1.75 %)
20,183
(1.28 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
0
(0 %)
7
(0.00 %)
192
(100.00 %)
4,752,792
(40.32 %)
1,617,613
(5.77 %)
13,383,610
(38.76 %)
0
(0 %)
1,664,480
(4.51 %)
20,532
(0.56 %)
19,133
(0.46 %)
683 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1
n/a n/a 3,096
(1.64 %)
2,450
(1.02 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
3,156
(100.00 %)
517,347
(50.76 %)
157,701
(3.90 %)
1,502,752
(34.14 %)
0
(0 %)
157,923
(4.57 %)
1,806
(0.40 %)
1,380
(0.31 %)
684 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
97,432
(4.08 %)
n/a 21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
4
(0.00 %)
1,172,090
(3.51 %)
19,244
(0.46 %)
16,098
(0.39 %)
685 Norway rat celera
GCF_000002265.2
39,745
(2.91 %)
n/a 21,492
(1.95 %)
19,112
(1.38 %)
n/a 41.98
(95.28 %)
111,393
(4.74 %)
111,391
(4.74 %)
118,423
(95.26 %)
9,721,869
(43.57 %)
1,387,703
(3.05 %)
13,224,921
(32.45 %)
11
(0.00 %)
813,629
(2.20 %)
18,944
(0.42 %)
16,117
(0.37 %)
686 Norway rat Dahl SR JrHsd (RGD_1582184 2024)
GCA_045688005.1
n/a n/a 21,901
(1.75 %)
20,001
(1.28 %)
n/a 41.84
(99.81 %)
4
(0.00 %)
299
(0.19 %)
141
(100.00 %)
4,717,442
(40.25 %)
1,598,987
(5.75 %)
13,553,199
(38.60 %)
12
(0.00 %)
1,610,558
(4.37 %)
20,297
(0.46 %)
18,817
(0.41 %)
687 Norway rat Lyon Hypertensive(RGD_10755352 2024)
GCA_045687965.1
n/a n/a 21,971
(1.75 %)
20,095
(1.28 %)
n/a 41.85
(99.93 %)
0
(0 %)
269
(0.07 %)
133
(100.00 %)
4,719,614
(40.23 %)
1,601,400
(5.83 %)
13,552,374
(38.67 %)
7
(0.00 %)
1,617,311
(4.39 %)
20,429
(0.47 %)
18,920
(0.42 %)
688 Norway rat Lyon Normot (RGD_10755354 2024)
GCA_045687995.1
n/a n/a 21,928
(1.75 %)
20,321
(1.29 %)
n/a 41.85
(99.84 %)
5
(0.00 %)
302
(0.16 %)
154
(100.00 %)
4,723,406
(40.27 %)
1,602,417
(5.79 %)
13,563,546
(38.65 %)
12
(0.00 %)
1,622,336
(4.39 %)
20,456
(0.47 %)
18,945
(0.41 %)
689 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5
69,456
(3.34 %)
n/a 22,369
(1.83 %)
20,269
(1.32 %)
n/a 41.93
(95.13 %)
70,664
(4.84 %)
145,731
(4.89 %)
76,195
(95.16 %)
5,329,187
(44.14 %)
1,620,304
(3.72 %)
14,520,050
(33.09 %)
719
(0.06 %)
916,050
(3.68 %)
22,600
(0.47 %)
18,401
(0.40 %)
690 Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022
GCA_023515785.1
n/a n/a 21,116
(1.68 %)
20,103
(1.27 %)
57,027
(2.45 %)
41.85
(99.82 %)
0
(0 %)
1,256
(0.18 %)
2,151
(100.00 %)
4,704,388
(38.22 %)
1,611,144
(5.76 %)
13,524,575
(38.35 %)
24
(0.00 %)
1,665,234
(4.47 %)
20,720
(0.48 %)
16,247
(0.34 %)
691 Norway rat WKY/Bbb 2022
GCA_023515805.1
n/a n/a 21,607
(1.68 %)
21,244
(1.28 %)
58,136
(2.47 %)
41.92
(99.80 %)
0
(0 %)
1,456
(0.20 %)
3,553
(100.00 %)
4,811,412
(38.21 %)
1,650,950
(5.41 %)
13,740,644
(38.24 %)
16
(0.00 %)
1,626,115
(4.31 %)
21,449
(0.51 %)
16,486
(0.34 %)
692 Nubian ibex (hap1 2026)
GCA_054855995.1
n/a n/a 18,692
(1.49 %)
21,269
(1.31 %)
n/a 42.65
(100.00 %)
0
(0 %)
83
(0.00 %)
227
(100.00 %)
6,520,577
(52.69 %)
553,105
(4.22 %)
12,816,690
(42.59 %)
1
(0.00 %)
1,624,740
(4.00 %)
65,657
(1.95 %)
39,503
(1.05 %)
693 Nubian ibex (hap2 2026)
GCA_054856215.1
n/a n/a 18,088
(1.44 %)
20,620
(1.27 %)
n/a 43.70
(100.00 %)
0
(0 %)
58
(0.00 %)
554
(100.00 %)
6,123,561
(54.71 %)
611,034
(8.85 %)
11,972,217
(45.26 %)
0
(0 %)
2,206,264
(5.15 %)
91,790
(2.58 %)
37,394
(0.97 %)
694 nutria
GCA_004027025.1
n/a n/a 24,707
(1.00 %)
47,533
(1.18 %)
n/a 41.70
(99.84 %)
15,249
(0.05 %)
15,249
(0.05 %)
1,684,916
(99.95 %)
6,961,690
(30.09 %)
1,698,977
(3.31 %)
15,207,563
(42.57 %)
44
(0.00 %)
n/a 59,854
(1.00 %)
31,029
(0.63 %)
695 okapi
GCA_001660835.1
n/a n/a 21,483
(1.43 %)
31,061
(1.26 %)
n/a 41.48
(95.11 %)
376,008
(4.86 %)
376,008
(4.86 %)
1,213,177
(95.14 %)
5,808,036
(42.90 %)
619,044
(4.22 %)
14,940,153
(35.17 %)
41,083
(0.65 %)
843,551
(6.96 %)
47,417
(1.12 %)
45,138
(1.04 %)
696 Okinawa island spiny rat (P-3 2024)
GCA_047150545.1
n/a n/a 20,516
(1.33 %)
20,222
(0.99 %)
n/a 40.89
(100.00 %)
19
(0.00 %)
19
(0.00 %)
53
(100.00 %)
9,452,355
(48.57 %)
2,252,101
(4.71 %)
12,808,891
(51.48 %)
0
(0 %)
1,055,430
(2.16 %)
20,770
(0.36 %)
16,586
(0.28 %)
697 Okinawa island spiny rat (P-3 primary hap 2023)
GCA_036184385.1
n/a n/a 18,829
(1.78 %)
19,061
(1.29 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
250
(0.00 %)
250
(0.00 %)
1,778
(100.00 %)
6,918,941
(46.48 %)
1,550,409
(4.06 %)
12,787,294
(38.04 %)
4
(0.00 %)
788,811
(2.05 %)
19,458
(0.47 %)
17,594
(0.42 %)
698 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1
30,625
(2.21 %)
n/a 17,959
(1.54 %)
19,318
(1.54 %)
n/a 42.06
(92.36 %)
83,033
(7.65 %)
83,035
(7.65 %)
148,226
(92.35 %)
4,337,455
(33.76 %)
1,140,316
(7.60 %)
10,422,685
(36.59 %)
3,290
(0.06 %)
1,520,292
(3.90 %)
61,921
(3.56 %)
30,924
(0.78 %)
699 pacarana
GCA_004027595.1
n/a n/a 20,748
(1.20 %)
33,195
(1.31 %)
n/a 41.81
(99.90 %)
6,392
(0.02 %)
6,392
(0.02 %)
1,164,830
(99.98 %)
4,374,443
(30.16 %)
660,811
(1.38 %)
14,062,133
(35.99 %)
8
(0.00 %)
n/a 59,382
(1.23 %)
28,291
(0.70 %)
700 Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad)
GCA_004363475.1
n/a n/a 21,575
(1.07 %)
47,478
(1.31 %)
n/a 41.87
(99.76 %)
18,801
(0.07 %)
18,801
(0.07 %)
2,428,619
(99.93 %)
4,881,232
(20.80 %)
1,352,971
(4.11 %)
12,583,960
(48.42 %)
36
(0.00 %)
n/a 74,961
(2.33 %)
61,745
(1.54 %)
701 Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo)
GCF_023159225.1
46,202
(2.48 %)
n/a 18,752
(1.50 %)
22,526
(1.60 %)
n/a 41.98
(99.96 %)
0
(0 %)
1,807
(0.04 %)
6,180
(100.00 %)
3,313,319
(16.79 %)
1,066,382
(10.88 %)
9,981,468
(42.63 %)
8
(0.00 %)
1,996,445
(6.17 %)
49,134
(2.83 %)
50,049
(1.70 %)
702 Pacific walrus
GCF_000321225.1
27,163
(1.89 %)
n/a 20,293
(1.71 %)
20,982
(1.48 %)
n/a 41.36
(95.85 %)
66,763
(4.16 %)
66,766
(4.16 %)
70,656
(95.84 %)
4,372,578
(41.12 %)
511,500
(1.05 %)
13,507,582
(30.43 %)
2,581
(0.03 %)
386,274
(1.21 %)
45,142
(1.29 %)
37,732
(0.95 %)
703 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1
65,970
(3.26 %)
n/a 18,743
(1.79 %)
20,862
(1.45 %)
31,917
(1.69 %)
41.28
(99.56 %)
16,337
(0.44 %)
16,699
(0.44 %)
21,350
(99.56 %)
3,971,820
(45.64 %)
574,056
(1.14 %)
12,602,965
(34.83 %)
610
(0.02 %)
419,325
(1.28 %)
62,275
(1.67 %)
40,749
(1.23 %)
704 pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019)
GCA_004115245.1
n/a n/a 18,118
(1.63 %)
23,536
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
38
(0.00 %)
10,873
(100.00 %)
3,001,130
(29.46 %)
375,042
(0.79 %)
11,813,971
(29.64 %)
0
(0 %)
140,066
(0.57 %)
67,712
(4.23 %)
70,108
(3.94 %)
705 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP mPhyDis1 primary hap 2020)
GCA_004126475.3
n/a n/a 18,167
(1.70 %)
20,017
(1.62 %)
n/a 42.38
(99.28 %)
0
(0 %)
884
(0.72 %)
78
(100.00 %)
3,071,886
(30.03 %)
385,665
(0.81 %)
12,049,923
(30.57 %)
1
(0.00 %)
174,292
(0.75 %)
63,918
(4.33 %)
66,774
(4.08 %)
706 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2
n/a n/a 18,116
(1.63 %)
23,608
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
38
(0.00 %)
10,895
(100.00 %)
3,002,448
(29.46 %)
375,226
(0.79 %)
11,824,034
(29.65 %)
0
(0 %)
140,328
(0.57 %)
67,718
(4.23 %)
70,109
(3.93 %)
707 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2
54,932
(3.31 %)
n/a 18,171
(1.69 %)
20,025
(1.62 %)
42,786
(3.39 %)
42.38
(99.28 %)
0
(0 %)
884
(0.72 %)
77
(100.00 %)
3,069,141
(30.00 %)
385,664
(0.81 %)
12,050,232
(30.57 %)
1
(0.00 %)
174,292
(0.75 %)
63,905
(3.75 %)
66,744
(3.26 %)
708 Pallas's mastiff bat (2020 refseq)
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
n/a 18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
0
(0 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
1
(0.00 %)
714,726
(2.00 %)
79,984
(2.45 %)
71,436
(1.91 %)
709 Pallas's mastiff bat (2026 genbank)
GCA_014108415.2
n/a n/a 18,473
(1.70 %)
21,847
(1.58 %)
n/a 42.35
(97.96 %)
0
(0 %)
373
(2.04 %)
45
(100.00 %)
4,907,773
(46.09 %)
624,938
(1.88 %)
11,572,201
(37.09 %)
1
(0.00 %)
714,729
(2.00 %)
79,987
(2.48 %)
69,824
(2.00 %)
710 pallid bat
GCA_027563665.2
n/a 45,801
(2.74 %)
19,038
(1.74 %)
21,934
(1.63 %)
n/a 43.04
(99.72 %)
19
(0.01 %)
234
(0.28 %)
108
(99.99 %)
5,341,178
(49.43 %)
937,994
(3.72 %)
11,240,393
(39.42 %)
0
(0 %)
666,854
(1.92 %)
70,270
(2.89 %)
59,856
(2.38 %)
711 pallid bat (TK200870 alternate hap 2023)
GCA_027595915.1
n/a n/a 19,085
(1.74 %)
22,770
(1.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,839
(100.00 %)
5,323,924
(49.33 %)
928,982
(3.65 %)
11,123,530
(39.36 %)
0
(0 %)
673,744
(1.95 %)
70,095
(2.89 %)
59,471
(2.37 %)
712 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1
n/a n/a 19,688
(1.69 %)
21,998
(1.64 %)
n/a 43.04
(99.72 %)
19
(0.01 %)
234
(0.28 %)
112
(99.99 %)
2,794,986
(22.60 %)
938,016
(3.72 %)
11,241,518
(39.41 %)
0
(0 %)
704,408
(2.03 %)
70,272
(2.89 %)
61,250
(1.98 %)
713 Parnell's mustached bat (2013)
GCA_000465405.1
n/a n/a 21,436
(1.40 %)
57,232
(2.18 %)
n/a 40.82
(99.34 %)
265,720
(0.70 %)
265,720
(0.70 %)
443,121
(99.30 %)
2,780,805
(29.26 %)
290,520
(0.63 %)
12,354,814
(27.13 %)
3
(0.00 %)
21,621
(0.07 %)
69,806
(1.89 %)
63,572
(1.69 %)
714 Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021)
GCF_021234165.1
37,033
(2.48 %)
n/a 18,339
(1.76 %)
21,630
(1.69 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
333
(100.00 %)
2,828,339
(30.56 %)
333,670
(0.75 %)
12,444,271
(30.90 %)
0
(0 %)
111,571
(0.50 %)
53,180
(4.61 %)
54,187
(3.93 %)
715 particolored bat (hap1.2 2025)
GCA_963924515.2
n/a n/a 17,612
(1.78 %)
20,793
(1.69 %)
n/a 43.57
(100.00 %)
5
(0.00 %)
189
(0.00 %)
273
(100.00 %)
5,418,781
(46.24 %)
903,727
(5.36 %)
10,321,898
(38.41 %)
3
(0.00 %)
807,561
(2.69 %)
78,516
(4.52 %)
79,927
(3.87 %)
716 particolored bat (hap2.2 2025)
GCA_963924695.2
n/a n/a 16,887
(1.81 %)
20,042
(1.72 %)
n/a 43.67
(100.00 %)
128
(0.00 %)
128
(0.00 %)
395
(100.00 %)
5,048,325
(44.60 %)
836,727
(4.41 %)
9,638,999
(37.87 %)
2
(0.00 %)
652,916
(2.36 %)
76,656
(4.63 %)
78,378
(4.04 %)
717 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1
n/a n/a 17,913
(1.72 %)
20,720
(1.72 %)
n/a 43.54
(99.99 %)
7
(0.00 %)
980
(0.01 %)
185
(100.00 %)
2,932,869
(21.94 %)
874,665
(4.83 %)
10,263,103
(37.46 %)
2
(0.00 %)
742,499
(2.50 %)
77,397
(4.55 %)
76,849
(2.51 %)
718 Patagonian cavy
GCA_004027295.1
n/a n/a 21,143
(0.94 %)
40,887
(1.10 %)
n/a 39.86
(99.87 %)
6,223
(0.02 %)
6,223
(0.02 %)
1,911,987
(99.98 %)
5,194,890
(30.95 %)
892,551
(2.11 %)
17,052,577
(40.22 %)
47
(0.00 %)
n/a 45,730
(0.84 %)
40,047
(0.71 %)
719 Pere David's deer
GCA_002443075.1
n/a n/a 20,723
(1.65 %)
23,551
(1.43 %)
n/a 41.58
(97.49 %)
144,642
(2.51 %)
144,642
(2.51 %)
339,454
(97.49 %)
5,171,293
(43.30 %)
427,987
(1.20 %)
13,665,133
(35.97 %)
3,724
(0.06 %)
460,451
(1.49 %)
48,374
(1.14 %)
45,141
(1.04 %)
720 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1
n/a n/a 18,794
(1.72 %)
21,421
(1.40 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,750
(100.00 %)
4,001,442
(39.37 %)
547,894
(2.75 %)
13,870,563
(34.33 %)
0
(0 %)
585,313
(2.32 %)
40,162
(1.31 %)
39,090
(1.18 %)
721 Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409185.1
n/a n/a 20,384
(1.64 %)
22,124
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
116
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,492,423
(39.31 %)
627,842
(4.79 %)
15,561,515
(36.57 %)
2
(0.00 %)
n/a 45,336
(1.27 %)
44,264
(1.15 %)
722 Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1
44,950
(1.91 %)
n/a 20,385
(1.64 %)
22,123
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
116
(0.00 %)
130
(100.00 %)
4,492,417
(39.31 %)
627,841
(4.79 %)
15,561,458
(36.57 %)
2
(0.00 %)
862,813
(2.91 %)
45,336
(1.27 %)
44,264
(1.15 %)
723 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1
n/a n/a 18,472
(1.44 %)
19,911
(1.28 %)
n/a 42.63
(99.98 %)
0
(0 %)
878
(0.02 %)
379
(100.00 %)
3,996,827
(27.97 %)
2,094,728
(7.23 %)
12,677,118
(40.57 %)
4
(0.00 %)
1,289,995
(3.44 %)
81,791
(2.82 %)
46,045
(1.12 %)
724 pig (Bamei 2025)
GCA_030704935.2
n/a n/a 17,940
(1.49 %)
20,133
(1.29 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 21
(100.00 %)
6,650,808
(50.63 %)
1,731,111
(5.80 %)
12,817,015
(40.05 %)
0
(0 %)
1,087,455
(2.96 %)
81,487
(2.80 %)
46,164
(1.99 %)
725 pig (Duroc 2017)
GCF_000003025.6
77,695
(4.05 %)
n/a 18,980
(1.64 %)
19,453
(1.32 %)
59,876
(4.84 %)
41.87
(98.81 %)
328
(1.19 %)
544
(1.19 %)
1,313
(98.81 %)
5,021,184
(45.67 %)
710,994
(1.32 %)
13,243,289
(36.33 %)
2
(0.00 %)
554,834
(1.64 %)
79,132
(1.82 %)
46,116
(1.30 %)
726 pig (Norwegian landrace 2024)
GCA_963921485.1
n/a n/a 18,500
(1.46 %)
19,718
(1.29 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 54
(100.00 %)
4,068,783
(28.54 %)
1,511,605
(5.52 %)
12,867,101
(39.59 %)
0
(0 %)
1,099,633
(2.98 %)
82,002
(2.44 %)
46,611
(1.15 %)
727 pig (SSC_HxYL_T2T_F1_AM1 2026)
GCF_054392235.1
157,635
(4.99 %)
n/a 17,898
(1.49 %)
21,216
(1.31 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
37
(100.00 %)
6,695,257
(50.66 %)
1,516,907
(5.52 %)
12,754,415
(39.86 %)
0
(0 %)
1,117,848
(2.98 %)
82,330
(3.08 %)
47,172
(1.96 %)
728 pig (USMARCv1 2017)
GCA_002844635.1
n/a n/a 19,458
(1.54 %)
21,487
(1.27 %)
58,655
(2.58 %)
42.49
(95.20 %)
0
(0 %)
661
(4.80 %)
14,157
(100.00 %)
5,159,244
(47.53 %)
902,079
(3.63 %)
13,145,120
(36.86 %)
1
(0.00 %)
1,358,423
(3.46 %)
82,442
(2.62 %)
47,468
(1.28 %)
729 pig (Wuzhishan WZS1 2025)
GCA_048338725.1
n/a n/a 18,525
(1.46 %)
19,792
(1.29 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 20
(100.00 %)
4,084,482
(28.40 %)
1,424,314
(5.35 %)
12,927,595
(39.56 %)
0
(0 %)
1,032,116
(2.85 %)
81,967
(2.96 %)
46,624
(1.14 %)
730 plains viscacha rat (AO245 2017)
GCA_002564285.1
n/a n/a 23,367
(0.78 %)
50,706
(0.93 %)
n/a 41.26
(99.73 %)
124,165
(0.16 %)
124,165
(0.16 %)
1,682,965
(99.84 %)
5,295,703
(27.32 %)
1,024,529
(1.81 %)
16,181,193
(35.22 %)
10,385
(0.05 %)
n/a 46,628
(0.97 %)
40,536
(0.81 %)
731 plains zebra (Etosha38 2022 UCLA)
GCF_021613505.1
55,794
(2.87 %)
n/a 19,529
(1.76 %)
21,214
(1.39 %)
n/a 41.38
(99.04 %)
0
(0 %)
14,595
(0.96 %)
11,098
(100.00 %)
3,683,862
(38.74 %)
314,723
(0.68 %)
15,217,328
(29.38 %)
2,057
(0.02 %)
119,672
(0.38 %)
41,391
(1.27 %)
38,911
(1.12 %)
732 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2
n/a n/a 13,244
(1.26 %)
19,241
(1.68 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
25
(0.00 %)
25
(0.00 %)
5,868
(100.00 %)
4,420,884
(51.59 %)
513,006
(3.13 %)
7,749,797
(49.18 %)
0
(0 %)
994,720
(3.65 %)
81,538
(8.24 %)
68,267
(3.13 %)
733 platypus (Pmale09 primary hap 2020)
GCA_004115215.4
n/a n/a 14,555
(1.24 %)
18,891
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
0
(0 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
7,731,079
(57.03 %)
578,617
(2.89 %)
9,113,668
(48.93 %)
0
(0 %)
1,130,252
(3.59 %)
87,861
(7.92 %)
71,875
(2.71 %)
734 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2
51,379
(3.07 %)
n/a 14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
0
(0 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
0
(0 %)
1,130,252
(3.59 %)
87,796
(6.47 %)
74,209
(2.87 %)
735 polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq)
GCF_000687225.1
35,751
(2.39 %)
n/a 18,466
(1.69 %)
15,384
(1.38 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
110,343
(1.67 %)
134,162
(98.33 %)
4,123,540
(40.16 %)
553,196
(1.29 %)
13,765,581
(29.91 %)
205
(0.03 %)
311,409
(1.04 %)
54,907
(1.17 %)
47,736
(0.98 %)
736 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1
52,175
(2.92 %)
n/a 18,588
(1.75 %)
20,731
(1.54 %)
n/a 41.88
(99.60 %)
0
(0 %)
45,532
(0.41 %)
3,900
(100.00 %)
4,204,162
(40.75 %)
572,129
(1.75 %)
13,926,894
(30.79 %)
587
(0.02 %)
437,254
(2.43 %)
63,315
(1.93 %)
57,593
(1.70 %)
737 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1
50,187
(2.51 %)
n/a 20,427
(1.69 %)
20,874
(1.45 %)
n/a 42.34
(94.06 %)
182,041
(5.97 %)
182,263
(5.97 %)
212,962
(94.03 %)
n/a 1,229,123
(2.83 %)
14,447,916
(30.09 %)
7,908
(0.12 %)
806,105
(3.40 %)
23,246
(0.56 %)
19,518
(0.43 %)
738 prairie deer mouse (BWxNUB_F1_BW_parent 2025)
GCF_049852395.1
84,704
(3.63 %)
n/a 19,312
(1.68 %)
20,354
(1.41 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
106
(0.00 %)
25
(100.00 %)
6,577,724
(45.25 %)
1,288,198
(5.24 %)
13,978,540
(35.31 %)
1
(0.00 %)
964,471
(2.66 %)
23,724
(0.69 %)
20,765
(0.57 %)
739 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1
69,779
(3.28 %)
n/a 19,755
(1.73 %)
19,194
(1.43 %)
n/a 42.28
(95.07 %)
147,442
(4.96 %)
147,442
(4.96 %)
155,966
(95.04 %)
4,751,621
(29.04 %)
1,172,212
(2.66 %)
13,934,672
(29.87 %)
6,396
(0.08 %)
477,575
(1.54 %)
22,444
(0.57 %)
19,164
(0.44 %)
740 prairie vole
GCF_000317375.1
40,484
(2.72 %)
n/a 19,648
(1.91 %)
19,489
(1.62 %)
n/a 42.25
(92.03 %)
180,677
(8.00 %)
180,677
(8.00 %)
187,012
(92.00 %)
3,779,126
(25.51 %)
879,192
(2.11 %)
12,360,347
(27.34 %)
6,788
(0.11 %)
335,553
(1.15 %)
18,233
(0.52 %)
16,466
(0.44 %)
741 Preble's meadow jumping mouse (hap1 2026)
GCA_057945845.1
n/a n/a 19,379
(1.41 %)
23,135
(1.60 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
243
(0.00 %)
263
(100.00 %)
5,161,690
(36.34 %)
1,280,534
(4.59 %)
12,486,697
(39.33 %)
0
(0 %)
1,127,889
(2.99 %)
27,286
(0.98 %)
19,584
(0.53 %)
742 Preble's meadow jumping mouse (hap2 2026)
GCA_057945655.1
n/a n/a 17,778
(1.50 %)
21,028
(1.59 %)
n/a 42.49
(100.00 %)
0
(0 %)
176
(0.00 %)
163
(100.00 %)
4,493,139
(34.60 %)
1,067,139
(3.68 %)
11,131,637
(37.03 %)
2
(0.00 %)
798,823
(2.44 %)
21,835
(0.87 %)
17,571
(0.55 %)
743 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1
n/a n/a 17,919
(1.46 %)
19,330
(1.31 %)
n/a 40.78
(100.00 %)
0
(0 %)
68
(0.00 %)
41
(100.00 %)
3,707,234
(28.28 %)
643,817
(2.22 %)
12,106,384
(41.48 %)
5
(0.00 %)
871,436
(2.63 %)
54,438
(1.38 %)
34,899
(0.85 %)
744 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1
n/a n/a 17,253
(1.51 %)
18,507
(1.35 %)
n/a 40.91
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
38
(100.00 %)
3,466,835
(27.96 %)
585,261
(1.91 %)
11,364,898
(40.65 %)
2
(0.00 %)
726,868
(2.39 %)
50,527
(1.37 %)
32,436
(0.84 %)
745 pronghorn (PH2016 2021)
GCA_021018645.1
n/a n/a 21,848
(1.58 %)
27,614
(1.56 %)
n/a 41.70
(96.83 %)
74,027
(3.17 %)
74,027
(3.17 %)
140,480
(96.83 %)
3,335,744
(24.40 %)
405,435
(4.11 %)
13,855,606
(34.67 %)
3,445
(0.16 %)
489,014
(7.21 %)
48,670
(1.19 %)
43,625
(0.95 %)
746 Przewalski's gazelle (PLG-pushi 2019)
GCA_006410515.1
n/a n/a 19,722
(1.52 %)
21,663
(1.29 %)
n/a 42.49
(95.93 %)
557,686
(4.13 %)
557,686
(4.13 %)
831,816
(95.87 %)
5,438,181
(47.21 %)
408,156
(1.63 %)
13,068,837
(39.30 %)
1,440
(0.01 %)
n/a 67,544
(1.31 %)
41,220
(0.85 %)
747 Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq)
GCF_000696695.1
45,089
(2.76 %)
n/a 19,546
(1.69 %)
22,107
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
80,963
(0.88 %)
134,060
(99.12 %)
3,787,533
(40.54 %)
435,607
(1.73 %)
14,738,418
(28.36 %)
39
(0.00 %)
276,230
(1.12 %)
40,752
(0.94 %)
36,104
(0.79 %)
748 Przewalski's horse (Varuska primary hap 2024)
GCF_037783145.1
117,131
(4.09 %)
n/a 18,569
(1.70 %)
20,018
(1.38 %)
n/a 42.23
(100.00 %)
0
(0 %)
310
(0.00 %)
2,146
(100.00 %)
3,768,149
(39.86 %)
632,308
(5.35 %)
14,449,518
(32.71 %)
0
(0 %)
956,665
(2.51 %)
42,166
(4.46 %)
39,294
(4.31 %)
749 puma (L17-30 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028749965.1
n/a n/a 18,380
(1.53 %)
20,701
(1.40 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
96
(0.00 %)
96
(0.00 %)
304
(100.00 %)
4,881,674
(33.96 %)
978,817
(2.17 %)
13,422,986
(35.08 %)
0
(0 %)
741,350
(2.01 %)
69,437
(2.62 %)
59,105
(1.71 %)
750 puma (L17-30 alternate hap 2023 refseq)
GCF_028749965.1
74,801
(3.83 %)
n/a 17,892
(1.65 %)
19,079
(1.37 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
208
(100.00 %)
4,919,626
(40.47 %)
914,522
(2.10 %)
12,893,715
(34.74 %)
1
(0.00 %)
681,761
(1.92 %)
66,387
(2.67 %)
60,312
(2.23 %)
751 puma (L17-30 primary hap 2023)
GCA_028749985.1
n/a n/a 17,553
(1.53 %)
19,299
(1.39 %)
n/a 41.89
(100.00 %)
134
(0.00 %)
134
(0.00 %)
390
(100.00 %)
4,629,539
(33.53 %)
919,008
(2.02 %)
12,766,157
(34.70 %)
0
(0 %)
673,940
(1.93 %)
65,437
(2.53 %)
55,660
(1.67 %)
752 puma (SC36_Marlon 2018 refseq)
GCF_003327715.1
25,588
(1.44 %)
n/a 17,664
(1.57 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
0
(0 %)
178,992
(4.69 %)
2,175
(100.00 %)
4,885,335
(42.70 %)
833,138
(1.76 %)
13,705,778
(31.28 %)
2,166
(0.06 %)
494,981
(1.78 %)
58,912
(1.65 %)
50,360
(1.31 %)
753 punctate agouti
GCA_004363535.1
n/a n/a 22,612
(1.05 %)
45,433
(1.19 %)
n/a 40.79
(99.92 %)
6,459
(0.02 %)
6,459
(0.02 %)
993,123
(99.98 %)
5,671,738
(32.53 %)
945,722
(1.69 %)
17,003,309
(36.58 %)
32
(0.00 %)
n/a 85,696
(1.65 %)
65,973
(1.32 %)
754 Punta de Vaca leaf-eared mouse (GD2095 2023)
GCA_033318265.1
n/a n/a 18,332
(1.50 %)
18,296
(1.29 %)
n/a 40.01
(100.00 %)
133
(0.00 %)
133
(0.00 %)
437
(100.00 %)
3,825,722
(28.38 %)
915,865
(11.98 %)
13,456,122
(37.89 %)
2
(0.00 %)
1,095,352
(3.10 %)
18,577
(0.50 %)
14,656
(0.36 %)
755 pygmy sperm whale
GCA_004363705.1
n/a n/a 22,661
(1.30 %)
42,546
(1.15 %)
n/a 41.89
(99.89 %)
6,053
(0.02 %)
6,053
(0.02 %)
1,258,125
(99.98 %)
5,185,912
(43.65 %)
836,752
(1.88 %)
14,150,125
(39.88 %)
43
(0.00 %)
n/a 95,344
(2.15 %)
68,248
(1.67 %)
756 pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq)
GCF_026419965.1
73,518
(2.67 %)
n/a 18,496
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
0
(0 %)
143
(0.19 %)
581
(100.00 %)
3,817,659
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,998
(39.96 %)
0
(0 %)
1,197,809
(3.53 %)
101,353
(2.90 %)
50,216
(1.47 %)
757 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1
n/a n/a 18,550
(1.51 %)
20,491
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
0
(0 %)
138
(0.01 %)
391
(100.00 %)
3,860,112
(33.83 %)
820,375
(9.58 %)
12,159,196
(41.59 %)
2
(0.00 %)
1,346,279
(3.87 %)
106,168
(2.78 %)
50,294
(1.44 %)
758 Pyrenean desman (IBE-C5619 2021)
GCA_019455555.1
n/a 20,936
(1.95 %)
17,527
(1.87 %)
20,474
(1.83 %)
n/a 41.67
(98.52 %)
63,679
(1.49 %)
63,679
(1.49 %)
75,985
(98.51 %)
2,147,379
(23.41 %)
327,740
(0.98 %)
10,539,226
(28.05 %)
1,165
(0.02 %)
291,271
(1.07 %)
44,487
(4.39 %)
47,205
(4.01 %)
759 rabbit (A946 2020)
GCA_013371645.1
n/a n/a 19,881
(1.40 %)
22,566
(1.32 %)
n/a 44.09
(99.92 %)
4,066
(0.07 %)
4,254
(0.08 %)
5,157
(99.93 %)
5,202,709
(44.78 %)
1,059,544
(2.39 %)
13,897,372
(40.69 %)
4
(0.00 %)
1,532,783
(5.00 %)
119,691
(2.74 %)
75,409
(2.53 %)
760 rabbit (alternate hap 2024)
GCA_964237575.1
n/a n/a 12,274
(1.39 %)
16,482
(1.38 %)
n/a 44.19
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 10,111
(100.00 %)
3,613,446
(49.48 %)
579,915
(3.18 %)
7,084,192
(39.81 %)
0
(0 %)
741,382
(3.30 %)
65,573
(2.79 %)
40,362
(2.38 %)
761 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq)
GCF_009806435.1
83,033
(4.16 %)
n/a 19,486
(1.31 %)
23,267
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
0
(0 %)
18,178
(2.32 %)
3,160
(100.00 %)
4,072,524
(21.41 %)
976,273
(2.33 %)
13,766,413
(39.76 %)
85
(0.00 %)
1,275,666
(3.04 %)
113,371
(2.46 %)
70,869
(1.75 %)
762 rabbit (primary hap 2024 refseq)
GCF_964237555.1
95,289
(4.22 %)
n/a 19,385
(1.31 %)
22,631
(1.31 %)
n/a 44.02
(99.98 %)
0
(0 %)
2,276
(0.02 %)
221
(100.00 %)
4,099,586
(21.20 %)
1,062,900
(3.78 %)
13,416,814
(41.72 %)
5
(0.00 %)
1,560,076
(3.77 %)
116,523
(2.66 %)
74,863
(1.94 %)
763 rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq)
GCF_000003625.3
43,642
(2.34 %)
n/a 18,665
(1.39 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,890,480
(44.71 %)
883,939
(1.73 %)
13,254,520
(38.27 %)
12
(0.00 %)
1,022,784
(2.54 %)
110,337
(2.33 %)
68,468
(1.73 %)
764 raccoon dog (2021)
GCF_905146905.1
52,577
(2.89 %)
n/a 19,628
(1.60 %)
20,274
(1.43 %)
n/a 41.28
(99.98 %)
0
(0 %)
70
(0.02 %)
811
(100.00 %)
4,499,368
(31.98 %)
1,005,212
(2.04 %)
13,884,201
(32.95 %)
2
(0.00 %)
702,009
(1.75 %)
52,450
(2.27 %)
46,478
(1.53 %)
765 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1
50,083
(2.48 %)
46,295
(2.32 %)
19,992
(1.47 %)
22,506
(1.31 %)
41,290
(1.46 %)
41.91
(99.99 %)
4,845
(0.01 %)
4,847
(0.01 %)
7,486
(99.99 %)
5,764,757
(47.38 %)
507,629
(1.55 %)
14,138,601
(41.27 %)
7
(0.00 %)
1,279,574
(3.49 %)
51,748
(1.29 %)
40,690
(1.04 %)
766 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1
70,461
(3.21 %)
n/a 19,413
(1.59 %)
21,222
(1.35 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
142
(100.00 %)
5,300,958
(46.83 %)
455,553
(1.24 %)
13,023,443
(40.62 %)
0
(0 %)
979,102
(2.67 %)
43,959
(1.30 %)
38,834
(1.07 %)
767 ratel
GCA_004024625.1
n/a n/a 22,196
(1.21 %)
35,937
(1.18 %)
n/a 42.00
(99.85 %)
6,511
(0.02 %)
6,511
(0.02 %)
2,074,823
(99.98 %)
6,171,383
(41.93 %)
877,669
(1.49 %)
15,269,908
(41.22 %)
36
(0.00 %)
465,016
(0.89 %)
95,094
(1.91 %)
92,023
(1.73 %)
768 red bat
GCA_004026805.1
n/a n/a 27,510
(1.22 %)
65,467
(1.48 %)
n/a 42.69
(99.94 %)
6,380
(0.02 %)
6,380
(0.02 %)
525,280
(99.98 %)
4,644,227
(28.24 %)
1,170,868
(2.68 %)
15,628,238
(39.97 %)
16
(0.00 %)
n/a 125,564
(3.55 %)
108,686
(2.27 %)
769 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1
n/a n/a 18,817
(1.29 %)
21,916
(1.20 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
0
(0 %)
22
(0.00 %)
4,021
(100.00 %)
3,279,005
(20.48 %)
472,706
(21.87 %)
11,466,609
(50.26 %)
0
(0 %)
3,624,599
(9.05 %)
128,858
(2.07 %)
39,577
(0.84 %)
770 red deer (hap1.2 2026)
GCA_910594005.2
n/a n/a 20,226
(1.25 %)
23,009
(1.19 %)
n/a 44.31
(100.00 %)
0
(0 %)
110
(0.00 %)
965
(100.00 %)
6,158,139
(37.49 %)
572,918
(22.39 %)
12,897,105
(51.16 %)
2
(0.00 %)
3,778,446
(8.30 %)
136,992
(2.02 %)
42,961
(0.80 %)
771 red deer (hap2.2 2026)
GCA_910593805.2
n/a n/a 20,412
(1.37 %)
22,827
(1.25 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
0
(0 %)
102
(0.00 %)
500
(100.00 %)
5,927,428
(40.11 %)
501,561
(16.00 %)
12,984,298
(46.91 %)
3
(0.00 %)
2,848,169
(6.96 %)
108,724
(1.86 %)
42,763
(0.88 %)
772 red deer (primary hap 2021)
GCF_910594005.1
68,992
(2.68 %)
n/a 20,470
(1.48 %)
22,563
(1.32 %)
n/a 42.98
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
144
(100.00 %)
5,501,063
(44.60 %)
503,301
(12.23 %)
13,102,622
(44.55 %)
1
(0.00 %)
2,197,198
(5.57 %)
88,756
(1.66 %)
46,960
(1.12 %)
773 red fox (BD-2025 2025)
GCF_048418805.1
84,632
(3.45 %)
n/a 19,565
(1.57 %)
19,909
(1.38 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
0
(0 %)
104
(0.00 %)
289
(100.00 %)
4,480,315
(31.76 %)
1,010,887
(2.70 %)
13,766,344
(33.12 %)
1
(0.00 %)
718,295
(1.89 %)
50,763
(2.22 %)
47,197
(1.53 %)
774 red fox (hap1 2024)
GCA_964106825.2
n/a n/a 19,622
(1.57 %)
20,371
(1.38 %)
n/a 41.34
(99.98 %)
0
(0 %)
1,845
(0.02 %)
461
(100.00 %)
4,519,485
(31.91 %)
1,018,114
(2.59 %)
13,810,284
(32.99 %)
9
(0.00 %)
712,146
(1.92 %)
52,053
(2.31 %)
47,294
(1.54 %)
775 red fox (hap2 2024)
GCA_964106925.2
n/a n/a 19,517
(1.57 %)
20,105
(1.37 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
0
(0 %)
1,819
(0.02 %)
350
(100.00 %)
4,487,839
(31.79 %)
1,010,106
(2.64 %)
13,838,711
(33.07 %)
17
(0.00 %)
695,908
(1.88 %)
51,373
(2.26 %)
46,876
(1.53 %)
776 red fox (tameXaggressive cross 2018)
GCF_003160815.1
43,508
(2.67 %)
n/a 19,826
(1.69 %)
18,893
(1.40 %)
n/a 41.08
(97.06 %)
0
(0 %)
246,167
(2.96 %)
82,424
(100.00 %)
4,919,102
(40.79 %)
954,461
(2.46 %)
14,190,625
(30.86 %)
739
(0.02 %)
634,373
(2.40 %)
53,204
(1.88 %)
51,541
(1.62 %)
777 reed vole (MF-2015 2020)
GCF_014885135.2
55,722
(3.60 %)
n/a 19,808
(1.93 %)
20,787
(1.69 %)
n/a 42.36
(95.60 %)
0
(0 %)
67,118
(4.40 %)
10,460
(100.00 %)
3,130,955
(20.09 %)
831,969
(2.09 %)
11,985,657
(28.48 %)
1,977
(0.20 %)
258,905
(1.26 %)
18,764
(0.58 %)
16,940
(0.48 %)
778 Reeves' muntjac
GCA_963930625.2
n/a n/a 19,215
(1.54 %)
22,411
(1.38 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
37
(0.00 %)
242
(100.00 %)
5,985,581
(48.42 %)
555,815
(2.95 %)
13,147,360
(40.36 %)
0
(0 %)
1,261,604
(3.13 %)
59,987
(1.80 %)
46,135
(1.23 %)
779 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1
n/a n/a 18,947
(1.29 %)
24,114
(1.28 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,892
(100.00 %)
3,375,476
(23.21 %)
654,539
(6.64 %)
11,132,469
(48.29 %)
0
(0 %)
3,008,562
(7.07 %)
79,357
(2.66 %)
41,548
(0.93 %)
780 Reeves' muntjac (alternate hap 2026)
GCA_963930665.2
n/a n/a 17,920
(1.33 %)
21,346
(1.19 %)
n/a 42.73
(99.99 %)
1,900
(0.01 %)
1,900
(0.01 %)
8,017
(99.99 %)
5,791,847
(51.71 %)
627,169
(6.70 %)
11,205,813
(47.89 %)
26
(0.00 %)
2,896,763
(7.36 %)
76,839
(2.77 %)
45,635
(1.16 %)
781 Reeves' muntjac (primary hap 2024)
GCF_963930625.1
52,442
(2.57 %)
n/a 19,577
(1.52 %)
22,283
(1.38 %)
n/a 41.89
(99.99 %)
0
(0 %)
682
(0.01 %)
267
(100.00 %)
3,294,672
(23.89 %)
527,436
(2.98 %)
13,137,581
(39.89 %)
1
(0.00 %)
1,222,379
(3.05 %)
57,436
(1.81 %)
44,949
(1.09 %)
782 reindeer (2023)
GCA_963422255.1
n/a n/a 21,329
(1.58 %)
25,201
(1.59 %)
n/a 41.46
(98.35 %)
131,886
(1.65 %)
131,886
(1.65 %)
259,765
(98.35 %)
3,254,173
(23.49 %)
440,431
(2.00 %)
14,258,607
(36.17 %)
3,361
(0.18 %)
n/a 48,931
(1.20 %)
43,592
(0.99 %)
783 reindeer (US061 2019)
GCA_004026565.1
n/a n/a 24,150
(1.39 %)
39,911
(1.41 %)
n/a 42.08
(99.89 %)
4,769
(0.02 %)
4,769
(0.02 %)
1,365,508
(99.98 %)
6,083,178
(46.10 %)
546,470
(1.23 %)
14,434,855
(43.16 %)
13
(0.00 %)
n/a 55,319
(1.23 %)
51,245
(1.12 %)
784 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1
n/a n/a 19,396
(1.48 %)
21,693
(1.26 %)
n/a 41.62
(97.80 %)
0
(0 %)
131
(2.20 %)
1,039
(100.00 %)
3,973,936
(35.55 %)
987,571
(11.66 %)
12,473,459
(42.11 %)
1
(0.00 %)
1,271,959
(3.79 %)
74,971
(1.64 %)
44,274
(1.06 %)
785 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1
59,888
(2.34 %)
n/a 19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
0
(0 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
4
(0.00 %)
1,071,329
(3.37 %)
73,126
(1.69 %)
43,865
(1.11 %)
786 Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024)
GCA_036010255.1
n/a n/a 18,982
(1.81 %)
22,002
(1.76 %)
n/a 43.12
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 105
(100.00 %)
2,909,847
(24.53 %)
757,964
(3.03 %)
10,561,925
(36.25 %)
0
(0 %)
534,987
(1.92 %)
57,318
(2.32 %)
52,282
(1.76 %)
787 Risso's dolphin
GCF_964374135.1
37,640
(1.92 %)
n/a 18,598
(1.56 %)
20,984
(1.29 %)
n/a 42.25
(99.99 %)
1,138
(0.01 %)
1,138
(0.01 %)
2,283
(99.99 %)
5,101,286
(54.29 %)
1,342,544
(11.28 %)
12,274,011
(41.76 %)
9
(0.00 %)
1,663,930
(5.05 %)
76,936
(4.65 %)
40,785
(1.12 %)
788 Risso's dolphin (hap1.1 2024)
GCA_964374135.1
n/a n/a 18,825
(1.58 %)
20,986
(1.29 %)
n/a 42.25
(99.99 %)
4
(0.00 %)
1,138
(0.01 %)
1,150
(100.00 %)
4,405,513
(43.51 %)
1,342,544
(11.28 %)
12,274,096
(41.76 %)
9
(0.00 %)
1,663,930
(5.05 %)
76,936
(4.65 %)
55,192
(2.62 %)
789 Risso's dolphin (hap2.1 2024)
GCA_964374185.1
n/a n/a 18,061
(1.68 %)
20,080
(1.36 %)
n/a 41.97
(99.99 %)
1,073
(0.01 %)
1,073
(0.01 %)
2,135
(99.99 %)
3,948,427
(43.52 %)
848,222
(8.00 %)
11,527,950
(38.76 %)
3
(0.00 %)
1,133,241
(3.81 %)
70,117
(3.31 %)
50,095
(2.07 %)
790 rodents (hap1 2026)
GCA_058744715.1
n/a n/a 19,325
(1.61 %)
21,068
(1.34 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
0
(0 %)
73
(0.00 %)
224
(100.00 %)
4,943,430
(39.29 %)
980,338
(9.21 %)
13,005,095
(37.12 %)
0
(0 %)
1,761,425
(3.96 %)
51,129
(1.40 %)
48,434
(1.25 %)
791 rodents (hap2 2026)
GCA_058744725.1
n/a n/a 19,322
(1.66 %)
21,110
(1.37 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
0
(0 %)
91
(0.00 %)
223
(100.00 %)
4,873,730
(39.22 %)
928,422
(7.03 %)
13,088,495
(35.57 %)
1
(0.00 %)
1,348,499
(3.12 %)
47,812
(1.36 %)
45,153
(1.22 %)
792 root vole (2023)
GCA_963919705.1
n/a n/a 19,293
(1.92 %)
20,635
(1.67 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
268
(100.00 %)
4,396,130
(38.90 %)
891,534
(2.66 %)
12,119,692
(31.39 %)
0
(0 %)
469,049
(1.48 %)
19,542
(0.63 %)
17,677
(0.55 %)
793 Ryukyu mouse (2026)
GCF_978045245.1
58,951
(2.50 %)
n/a 22,322
(1.90 %)
19,296
(1.22 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
0
(0 %)
1,393
(0.00 %)
1,195
(100.00 %)
5,665,093
(45.11 %)
1,943,248
(10.22 %)
12,791,355
(41.32 %)
14
(0.00 %)
2,136,081
(4.82 %)
20,072
(0.50 %)
16,577
(0.42 %)
794 Ryukyu mouse (v2 2017)
GCF_900094665.2
53,792
(2.85 %)
n/a 21,351
(2.29 %)
18,073
(1.39 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
27,758
(7.30 %)
306,599
(10.98 %)
30,835
(92.70 %)
4,479,912
(35.83 %)
1,351,677
(2.59 %)
12,964,608
(27.49 %)
6,570
(0.06 %)
398,054
(1.12 %)
15,963
(0.43 %)
15,425
(0.40 %)
795 Saanen dairy goat
GCA_015443085.1
n/a n/a 19,257
(1.54 %)
21,221
(1.32 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
0
(0 %)
170
(0.00 %)
1,362
(100.00 %)
5,336,862
(47.58 %)
515,161
(2.87 %)
13,144,895
(41.67 %)
3
(0.00 %)
1,309,461
(3.33 %)
58,623
(2.22 %)
39,483
(1.04 %)
796 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1
n/a n/a 18,509
(1.54 %)
22,514
(1.36 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,427
(100.00 %)
3,675,922
(35.75 %)
950,374
(10.49 %)
11,670,399
(40.31 %)
0
(0 %)
1,395,810
(4.32 %)
63,587
(3.15 %)
40,331
(1.09 %)
797 saddleback dolphin (alternate hap 2024)
GCA_949987525.2
n/a n/a 18,426
(1.62 %)
22,420
(1.35 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,427
(100.00 %)
4,448,346
(50.40 %)
950,374
(10.49 %)
11,670,399
(40.31 %)
0
(0 %)
1,395,813
(4.32 %)
63,587
(3.15 %)
40,063
(1.33 %)
798 saddleback dolphin (primary hap 2024)
GCA_949987515.2
n/a n/a 18,542
(1.57 %)
20,620
(1.32 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
0
(0 %)
968
(0.01 %)
631
(100.00 %)
4,890,277
(52.33 %)
1,258,165
(13.09 %)
12,359,469
(42.64 %)
0
(0 %)
1,787,080
(5.07 %)
66,188
(3.91 %)
41,202
(1.38 %)
799 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1
46,746
(2.39 %)
n/a 18,624
(1.49 %)
20,662
(1.31 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
0
(0 %)
968
(0.01 %)
630
(100.00 %)
4,020,676
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,748
(42.64 %)
0
(0 %)
1,785,427
(5.07 %)
66,179
(3.91 %)
41,466
(1.03 %)
800 saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_949987515.2
46,014
(2.36 %)
n/a 18,616
(1.49 %)
20,618
(1.32 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
968
(0.01 %)
1,598
(99.99 %)
4,020,525
(35.99 %)
1,258,165
(13.09 %)
12,359,758
(42.64 %)
0
(0 %)
1,475,119
(4.19 %)
66,188
(3.91 %)
41,466
(1.03 %)
801 saiga antelope
GCA_004024985.1
n/a n/a 23,736
(0.84 %)
55,133
(0.88 %)
n/a 42.52
(99.87 %)
2,867
(0.01 %)
2,867
(0.01 %)
1,775,066
(99.99 %)
6,485,113
(49.43 %)
447,097
(0.88 %)
13,972,753
(44.46 %)
57
(0.00 %)
n/a 46,883
(0.82 %)
38,101
(0.69 %)
802 Schreibers' long-fingered ba
GCF_964146895.1
50,853
(3.35 %)
n/a 18,113
(2.10 %)
21,266
(1.89 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
0
(0 %)
140
(0.00 %)
186
(100.00 %)
2,843,364
(34.45 %)
457,565
(5.58 %)
10,220,082
(31.02 %)
0
(0 %)
662,735
(2.58 %)
59,522
(2.81 %)
54,302
(2.29 %)
803 Schreibers' long-fingered bat (US075 2019)
GCA_004026525.1
n/a n/a 20,147
(2.06 %)
31,271
(1.82 %)
n/a 42.27
(99.94 %)
6,918
(0.04 %)
6,918
(0.04 %)
184,538
(99.96 %)
2,772,932
(29.66 %)
366,782
(1.13 %)
10,477,531
(28.60 %)
19
(0.00 %)
n/a 62,520
(2.73 %)
58,978
(2.39 %)
804 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025)
GCA_964146895.2
n/a n/a 18,109
(2.10 %)
21,263
(1.89 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
0
(0 %)
140
(0.00 %)
186
(100.00 %)
2,812,261
(34.39 %)
457,565
(5.58 %)
10,220,083
(31.02 %)
0
(0 %)
662,735
(2.58 %)
59,522
(2.81 %)
54,315
(2.29 %)
805 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap2 2025)
GCA_964145185.2
n/a n/a 17,286
(2.19 %)
20,474
(1.95 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
86
(0.00 %)
86
(0.00 %)
254
(100.00 %)
2,610,773
(33.65 %)
389,844
(4.42 %)
9,728,138
(29.49 %)
0
(0 %)
460,730
(1.78 %)
56,508
(2.97 %)
51,969
(2.42 %)
806 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2
51,527
(2.72 %)
n/a 19,713
(1.57 %)
21,928
(1.32 %)
n/a 41.74
(99.30 %)
0
(0 %)
16,241
(0.70 %)
9,089
(100.00 %)
5,435,109
(46.76 %)
414,279
(0.98 %)
13,490,956
(40.45 %)
2,509
(0.03 %)
982,620
(2.65 %)
42,961
(1.10 %)
38,033
(0.97 %)
807 Screaming hairy armadillo
GCA_004027955.1
n/a n/a 24,532
(0.39 %)
56,725
(0.46 %)
n/a 39.68
(99.70 %)
2,747
(0.01 %)
2,747
(0.01 %)
7,680,080
(99.99 %)
8,978,735
(36.02 %)
1,516,551
(1.58 %)
32,918,217
(47.67 %)
32
(0.00 %)
n/a 234,762
(1.56 %)
66,537
(0.64 %)
808 sea otter (GAN:26980312 2017 refseq)
GCF_002288905.1
38,140
(2.17 %)
n/a 18,578
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
34,179
(1.77 %)
41.56
(98.79 %)
22,821
(1.21 %)
23,134
(1.21 %)
29,589
(98.79 %)
4,703,044
(41.42 %)
721,750
(1.39 %)
14,065,653
(32.89 %)
1,203
(0.02 %)
504,215
(2.00 %)
55,388
(1.87 %)
53,465
(1.67 %)
809 Seba's short-tailed bat
GCA_004027735.1
n/a n/a 21,878
(0.94 %)
55,858
(1.10 %)
n/a 42.70
(99.84 %)
3,864
(0.01 %)
3,864
(0.01 %)
1,929,203
(99.99 %)
3,802,235
(28.35 %)
606,320
(1.03 %)
15,171,250
(31.99 %)
69
(0.00 %)
n/a 118,227
(2.28 %)
103,103
(1.92 %)
810 sei whale
GCF_965194805.1
89,176
(6.49 %)
n/a 19,289
(1.32 %)
21,865
(1.14 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
0
(0 %)
1,179
(0.01 %)
2,571
(100.00 %)
4,862,311
(59.97 %)
1,097,215
(21.14 %)
12,203,838
(50.47 %)
12
(0.00 %)
2,217,448
(6.14 %)
80,128
(1.58 %)
45,477
(1.01 %)
811 sei whale (hap1.1 2025)
GCA_965194805.1
n/a n/a 19,292
(1.27 %)
21,865
(1.14 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
0
(0 %)
1,179
(0.01 %)
2,572
(100.00 %)
4,525,289
(42.25 %)
1,097,216
(21.14 %)
12,203,884
(50.47 %)
12
(0.00 %)
2,217,448
(6.14 %)
80,128
(1.58 %)
44,102
(0.91 %)
812 sei whale (hap2.1 2025)
GCA_965194725.1
n/a n/a 19,313
(1.37 %)
21,662
(1.17 %)
n/a 41.68
(99.99 %)
1,066
(0.01 %)
1,066
(0.01 %)
2,917
(99.99 %)
4,418,625
(42.98 %)
875,114
(15.81 %)
12,360,254
(46.52 %)
0
(0 %)
1,705,441
(5.02 %)
78,537
(1.66 %)
44,115
(0.98 %)
813 sheep (hu hu3095 2024)
GCA_040805955.1
n/a 21,525
(1.22 %)
19,388
(1.42 %)
21,612
(1.28 %)
n/a 43.17
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28
(100.00 %)
5,311,536
(44.06 %)
653,238
(7.29 %)
12,937,231
(44.10 %)
0
(0 %)
1,552,087
(3.95 %)
63,230
(6.03 %)
40,222
(0.90 %)
814 sheep (OAR_USU_Benz2616 2023)
GCF_016772045.2
89,680
(5.44 %)
n/a 19,308
(1.52 %)
21,506
(1.35 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
143
(100.00 %)
3,275,767
(22.85 %)
464,346
(1.26 %)
12,987,607
(40.61 %)
0
(0 %)
992,253
(2.68 %)
44,477
(1.28 %)
39,609
(0.96 %)
815 sheep (Texel 2015)
GCA_000298735.2
n/a n/a 19,179
(1.56 %)
19,001
(1.26 %)
48,105
(1.85 %)
41.90
(98.94 %)
43,016
(1.07 %)
44,566
(1.07 %)
48,481
(98.93 %)
5,429,824
(46.13 %)
540,267
(1.64 %)
13,509,668
(38.83 %)
123
(0.01 %)
863,621
(2.69 %)
43,911
(1.13 %)
39,178
(0.99 %)
816 short-tailed shrew (CBP01580 primary hap 2026)
GCA_051295465.2
n/a n/a 16,479
(1.36 %)
21,313
(1.48 %)
n/a 42.66
(99.98 %)
2,066
(0.02 %)
2,066
(0.02 %)
2,486
(99.98 %)
6,370,533
(45.64 %)
1,336,462
(5.34 %)
11,780,354
(42.31 %)
23
(0.00 %)
1,308,083
(3.61 %)
51,740
(1.94 %)
43,140
(1.64 %)
817 shrew mouse
GCF_900095145.1
46,279
(2.64 %)
43,645
(2.34 %)
20,549
(2.23 %)
18,979
(1.49 %)
94,079
(3.98 %)
41.89
(90.53 %)
15,298
(6.27 %)
269,643
(9.50 %)
17,879
(93.73 %)
4,788,498
(38.32 %)
1,499,714
(3.03 %)
13,021,757
(27.83 %)
6,442
(0.07 %)
442,006
(1.19 %)
16,787
(0.47 %)
15,907
(0.43 %)
818 Siberian hamster (SSSS 2022)
GCA_023856395.1
n/a n/a 18,375
(1.83 %)
17,066
(1.44 %)
n/a 41.27
(99.64 %)
0
(0 %)
88,601
(0.37 %)
7,756
(100.00 %)
3,152,242
(21.63 %)
1,087,009
(2.64 %)
12,055,167
(29.20 %)
1,976
(0.02 %)
260,068
(0.73 %)
15,455
(0.48 %)
14,212
(0.40 %)
819 Siberian musk deer (BS20 2019 Broad)
GCA_004024705.1
n/a n/a 23,440
(1.32 %)
37,497
(1.19 %)
n/a 42.32
(99.86 %)
19,764
(0.07 %)
19,764
(0.07 %)
1,195,467
(99.93 %)
6,726,950
(49.79 %)
437,480
(1.57 %)
14,155,240
(46.22 %)
13
(0.00 %)
n/a 49,177
(1.05 %)
43,489
(0.94 %)
820 sika deer (Changchun, China MLH-2022 2023)
GCA_034195675.1
n/a n/a 20,087
(1.59 %)
23,556
(1.46 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
0
(0 %)
1,724
(0.03 %)
1,889
(100.00 %)
3,925,148
(27.17 %)
419,490
(1.24 %)
13,364,988
(37.79 %)
0
(0 %)
653,312
(1.92 %)
47,630
(1.31 %)
42,485
(1.04 %)
821 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2
37,090
(1.93 %)
n/a 18,969
(1.19 %)
19,298
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.43 %)
0
(0 %)
270,406
(11.60 %)
7,490
(100.00 %)
3,789,337
(28.89 %)
429,226
(0.87 %)
16,951,112
(32.23 %)
3,875
(0.06 %)
191,573
(0.64 %)
39,993
(0.70 %)
32,202
(0.55 %)
822 smoky shrew (2023)
GCF_029834395.1
37,165
(1.66 %)
n/a 17,572
(1.06 %)
24,146
(1.29 %)
n/a 43.43
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 497
(100.00 %)
2,593,080
(14.11 %)
1,194,567
(7.25 %)
14,051,522
(48.20 %)
0
(0 %)
1,447,378
(3.75 %)
107,473
(2.80 %)
53,859
(1.19 %)
823 snow leopard (11264 2022)
GCF_023721935.1
53,569
(3.37 %)
n/a 18,780
(1.67 %)
21,038
(1.40 %)
n/a 41.60
(99.30 %)
0
(0 %)
23,786
(0.70 %)
2,636
(100.00 %)
4,714,429
(34.93 %)
919,518
(1.59 %)
13,711,504
(33.24 %)
1,871
(0.02 %)
357,999
(0.95 %)
64,690
(2.41 %)
61,670
(2.00 %)
824 snowshoe hare
GCA_004026855.1
n/a n/a 23,263
(0.88 %)
55,811
(1.01 %)
n/a 44.12
(99.87 %)
10,153
(0.03 %)
10,153
(0.03 %)
1,602,982
(99.97 %)
4,767,120
(21.29 %)
1,040,992
(2.22 %)
15,680,144
(43.23 %)
86
(0.00 %)
n/a 126,152
(2.28 %)
87,841
(1.66 %)
825 social tuco-tuco
GCA_004027165.1
n/a n/a 25,166
(1.12 %)
41,316
(1.26 %)
n/a 40.71
(99.89 %)
16,191
(0.06 %)
16,191
(0.06 %)
823,762
(99.94 %)
5,390,906
(28.28 %)
1,027,922
(2.15 %)
15,241,308
(38.39 %)
45
(0.00 %)
n/a 31,883
(0.72 %)
27,410
(0.58 %)
826 Soft-furred tree mouse (WYS1704033 2022)
GCA_023101885.1
n/a n/a 20,505
(1.36 %)
25,606
(1.53 %)
n/a 42.21
(99.64 %)
0
(0 %)
3,794
(0.36 %)
1,243
(100.00 %)
5,973,279
(45.08 %)
1,551,851
(4.63 %)
13,570,249
(38.60 %)
34
(0.00 %)
1,376,656
(3.63 %)
73,762
(1.53 %)
41,027
(1.00 %)
827 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1
n/a n/a 17,590
(1.81 %)
21,597
(1.85 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,717
(100.00 %)
2,734,555
(21.46 %)
795,752
(6.56 %)
9,601,735
(36.35 %)
0
(0 %)
660,443
(2.50 %)
62,524
(3.25 %)
60,391
(2.11 %)
828 soprano pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_949987585.2
n/a n/a 17,999
(1.88 %)
21,396
(1.80 %)
n/a 42.74
(100.00 %)
2
(0.00 %)
122
(0.00 %)
330
(100.00 %)
4,426,108
(44.40 %)
866,819
(7.44 %)
10,132,985
(37.65 %)
2
(0.00 %)
810,871
(2.84 %)
64,680
(3.15 %)
60,272
(2.96 %)
829 soprano pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_949987765.2
n/a n/a 17,269
(1.90 %)
20,534
(1.83 %)
n/a 42.89
(100.00 %)
87
(0.00 %)
87
(0.00 %)
369
(100.00 %)
4,151,522
(43.86 %)
809,312
(8.01 %)
9,615,104
(37.56 %)
1
(0.00 %)
780,383
(2.91 %)
63,890
(3.24 %)
59,199
(3.09 %)
830 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1
n/a n/a 18,056
(1.78 %)
21,158
(1.79 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
6
(0.00 %)
161
(0.00 %)
249
(100.00 %)
2,899,535
(21.64 %)
853,717
(7.80 %)
10,162,216
(37.72 %)
1
(0.00 %)
802,761
(2.85 %)
63,256
(3.06 %)
61,642
(2.03 %)
831 South African ground squirrel
GCA_004024805.1
n/a n/a 22,802
(1.44 %)
33,892
(1.27 %)
n/a 39.97
(99.92 %)
9,745
(0.04 %)
9,745
(0.04 %)
587,115
(99.96 %)
5,256,998
(34.93 %)
594,122
(1.27 %)
14,462,947
(33.96 %)
36
(0.00 %)
n/a 34,141
(0.80 %)
32,509
(0.74 %)
832 Southeastern Asian house mouse (2016)
GCA_001624445.1
n/a n/a 21,103
(2.24 %)
18,682
(1.45 %)
102,099
(4.16 %)
41.83
(86.23 %)
48,311
(2.15 %)
424,005
(13.83 %)
52,352
(97.85 %)
4,990,851
(39.88 %)
1,356,202
(2.67 %)
13,469,640
(26.15 %)
14,714
(0.76 %)
396,098
(1.49 %)
16,724
(0.41 %)
15,971
(0.39 %)
833 Southeastern Asian house mouse (2022)
GCA_921999005.2
n/a n/a 21,799
(2.13 %)
19,729
(1.40 %)
110,356
(4.43 %)
41.78
(99.19 %)
4
(0.00 %)
278
(0.81 %)
151
(100.00 %)
4,663,228
(40.41 %)
1,549,985
(3.70 %)
13,012,600
(34.99 %)
8
(0.01 %)
788,439
(2.30 %)
21,349
(0.52 %)
15,914
(0.42 %)
834 Southeastern Asian house mouse (T2T 2024)
GCA_964188545.1
n/a n/a 22,529
(1.85 %)
20,409
(1.22 %)
n/a 41.10
(99.90 %)
78
(0.10 %)
78
(0.10 %)
416
(99.90 %)
4,880,101
(47.77 %)
1,689,287
(15.13 %)
12,822,147
(42.92 %)
1
(0.00 %)
2,529,336
(6.14 %)
22,642
(0.54 %)
16,895
(0.41 %)
835 Southern African pygmy mouse (2020)
GCA_902729485.2
n/a n/a 21,253
(2.02 %)
24,053
(1.41 %)
n/a 41.62
(85.36 %)
26,006
(14.65 %)
63,317
(14.65 %)
92,356
(85.35 %)
5,677,434
(41.24 %)
1,683,338
(3.20 %)
13,320,768
(28.29 %)
7,916
(0.40 %)
718,161
(1.80 %)
21,132
(0.44 %)
15,972
(0.37 %)
836 southern elephant seal
GCF_011800145.1
53,210
(2.86 %)
n/a 19,520
(1.73 %)
20,727
(1.41 %)
39,634
(1.86 %)
41.45
(99.36 %)
0
(0 %)
22,850
(0.64 %)
1,115
(100.00 %)
4,728,105
(43.75 %)
585,443
(1.13 %)
13,463,979
(33.65 %)
2,467
(0.03 %)
627,414
(1.65 %)
53,182
(1.62 %)
49,837
(1.42 %)
837 southern flying squirrel (Volans SFS_CC1 2021)
GCA_020662805.1
n/a n/a 19,813
(1.54 %)
25,643
(1.37 %)
n/a 40.48
(98.33 %)
53,082
(1.67 %)
53,082
(1.67 %)
114,190
(98.33 %)
5,649,834
(41.22 %)
689,166
(1.55 %)
14,561,421
(30.61 %)
2,798
(0.03 %)
320,860
(0.99 %)
37,158
(0.90 %)
34,914
(0.82 %)
838 southern grasshopper mouse (2020 genbank)
GCA_903995425.1
n/a n/a 19,395
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
0
(0 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,480
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,539,823
(32.73 %)
0
(0 %)
547,538
(1.62 %)
18,046
(0.54 %)
16,132
(0.42 %)
839 southern grasshopper mouse (2020 refseq)
GCF_903995425.1
47,152
(2.39 %)
n/a 19,356
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
0
(0 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,460
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,540,762
(32.73 %)
0
(0 %)
547,538
(1.62 %)
18,046
(0.54 %)
16,132
(0.42 %)
840 Southern marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2026)
GCA_048126345.2
n/a n/a 24,714
(0.82 %)
18,971
(0.87 %)
n/a 37.80
(99.99 %)
0
(0 %)
211
(0.01 %)
688
(100.00 %)
13,545,658
(58.39 %)
1,450,475
(2.40 %)
21,374,274
(47.19 %)
1
(0.00 %)
1,154,226
(2.37 %)
17,923
(0.30 %)
16,104
(0.25 %)
841 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1
69,058
(3.04 %)
n/a 20,313
(2.11 %)
17,745
(1.38 %)
n/a 41.39
(91.90 %)
0
(0 %)
146,713
(8.12 %)
28
(100.00 %)
4,875,400
(38.43 %)
1,454,350
(2.93 %)
13,104,717
(28.82 %)
2,045
(0.04 %)
494,819
(1.13 %)
16,715
(0.45 %)
15,641
(0.42 %)
842 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1
n/a n/a 20,179
(1.21 %)
24,249
(1.19 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
7,866
(100.00 %)
3,953,031
(35.88 %)
531,111
(1.14 %)
16,354,874
(39.96 %)
0
(0 %)
425,622
(1.30 %)
59,907
(1.35 %)
35,916
(0.80 %)
843 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023851605.1
n/a n/a 20,058
(1.26 %)
22,196
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
961
(0.56 %)
201
(100.00 %)
4,037,291
(46.02 %)
593,019
(1.17 %)
18,033,833
(40.56 %)
9
(0.00 %)
500,101
(1.40 %)
65,039
(1.33 %)
38,121
(0.86 %)
844 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023851605.1
84,279
(3.04 %)
n/a 20,960
(1.28 %)
22,188
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
961
(0.56 %)
200
(100.00 %)
4,793,649
(47.24 %)
593,018
(1.17 %)
18,033,318
(40.56 %)
9
(0.00 %)
500,100
(1.40 %)
65,039
(1.33 %)
57,260
(1.12 %)
845 southern three-banded armadillo
GCA_004025125.1
n/a n/a 29,138
(0.73 %)
56,522
(0.75 %)
n/a 39.20
(99.82 %)
15,801
(0.04 %)
15,801
(0.04 %)
2,941,308
(99.96 %)
6,990,740
(38.88 %)
839,452
(1.23 %)
24,805,397
(43.95 %)
220
(0.00 %)
n/a 71,951
(0.98 %)
63,325
(0.84 %)
846 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1
n/a n/a 22,897
(1.23 %)
27,007
(1.18 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
70
(0.00 %)
70
(0.00 %)
12,050
(100.00 %)
4,502,020
(38.27 %)
576,759
(1.02 %)
17,143,050
(40.65 %)
0
(0 %)
450,196
(1.59 %)
51,339
(1.15 %)
40,459
(0.82 %)
847 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1
63,054
(2.39 %)
n/a 21,998
(1.29 %)
23,177
(1.18 %)
45,345
(1.69 %)
39.89
(97.48 %)
0
(0 %)
1,243
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,559,690
(39.66 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,630
(40.50 %)
4
(0.00 %)
492,026
(1.69 %)
51,430
(1.14 %)
40,148
(0.81 %)
848 southern two-toed sloth (primary hap 2020)
GCA_015220235.1
n/a n/a 22,250
(1.38 %)
23,180
(1.18 %)
n/a 39.89
(97.48 %)
0
(0 %)
1,240
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,830,544
(50.68 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,148
(40.49 %)
4
(0.00 %)
492,033
(1.69 %)
51,430
(1.14 %)
47,818
(1.03 %)
849 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq)
GCF_000283155.1
37,037
(2.11 %)
n/a 18,398
(1.71 %)
19,753
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
54,737
(3.96 %)
57,824
(96.04 %)
3,685,898
(38.31 %)
421,694
(0.97 %)
14,765,529
(28.93 %)
1,818
(0.02 %)
184,274
(0.57 %)
36,281
(1.02 %)
32,113
(0.82 %)
850 Southern yellow bat (hap1 2026)
GCA_058971415.1
n/a n/a 18,554
(1.45 %)
20,850
(1.37 %)
n/a 42.36
(100.00 %)
0
(0 %)
387
(0.00 %)
835
(100.00 %)
4,105,444
(42.92 %)
958,849
(9.83 %)
11,113,701
(45.96 %)
3
(0.00 %)
1,911,582
(5.59 %)
72,495
(5.06 %)
62,371
(1.86 %)
851 Southern yellow bat (hap2 2026)
GCA_058972195.1
n/a n/a 17,721
(1.51 %)
19,825
(1.41 %)
n/a 42.46
(100.00 %)
0
(0 %)
319
(0.00 %)
591
(100.00 %)
3,812,032
(41.99 %)
848,611
(8.64 %)
10,398,244
(44.23 %)
3
(0.00 %)
1,669,918
(5.28 %)
68,141
(4.77 %)
60,659
(1.95 %)
852 Sowerby's beaked whale
GCF_964165515.1
50,568
(2.18 %)
n/a 19,470
(1.39 %)
22,885
(1.24 %)
n/a 42.04
(99.99 %)
1,095
(0.01 %)
1,095
(0.01 %)
2,696
(99.99 %)
4,774,485
(38.32 %)
825,474
(10.97 %)
11,375,525
(45.31 %)
11
(0.00 %)
3,517,431
(7.94 %)
76,527
(3.10 %)
39,378
(0.86 %)
853 Sowerby's beaked whale (hap1 2024)
GCA_964165515.1
n/a n/a 19,471
(1.39 %)
22,951
(1.24 %)
n/a 42.04
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,095
(0.01 %)
1,604
(100.00 %)
4,307,839
(34.31 %)
825,475
(10.97 %)
11,375,945
(45.31 %)
11
(0.00 %)
3,517,431
(7.94 %)
76,527
(3.10 %)
39,378
(0.86 %)
854 Sowerby's beaked whale (hap2 2024)
GCA_964148845.1
n/a n/a 18,591
(1.46 %)
21,588
(1.27 %)
n/a 42.00
(99.99 %)
974
(0.01 %)
974
(0.01 %)
2,126
(99.99 %)
3,961,403
(34.20 %)
742,897
(9.73 %)
10,832,739
(43.68 %)
2
(0.00 %)
2,951,041
(7.25 %)
70,803
(2.85 %)
37,380
(0.90 %)
855 Sowerby's beaked whale (US080 2019)
GCA_004027085.1
n/a n/a 22,800
(1.32 %)
38,247
(1.17 %)
n/a 41.68
(99.84 %)
8,597
(0.03 %)
8,597
(0.03 %)
1,810,317
(99.97 %)
5,520,986
(45.05 %)
1,081,962
(2.69 %)
13,480,261
(43.01 %)
62
(0.00 %)
n/a 69,001
(1.39 %)
52,160
(1.13 %)
856 sperm whale (hap1.1 2026)
GCA_978012005.1
n/a n/a 19,211
(1.53 %)
21,574
(1.27 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
0
(0 %)
357
(0.00 %)
783
(100.00 %)
4,849,649
(50.53 %)
873,547
(8.11 %)
11,855,809
(42.39 %)
5
(0.00 %)
1,513,205
(4.72 %)
103,167
(3.00 %)
56,555
(2.16 %)
857 sperm whale (SW-GA 2023)
GCF_002837175.3
62,616
(2.83 %)
n/a 19,485
(1.75 %)
22,707
(1.41 %)
n/a 41.33
(95.82 %)
121,387
(4.20 %)
121,387
(4.20 %)
133,555
(95.80 %)
3,906,439
(36.43 %)
691,647
(2.39 %)
13,489,368
(32.95 %)
1,869
(0.17 %)
517,424
(4.47 %)
86,751
(2.23 %)
82,633
(2.04 %)
858 spotted hyena (KB4526 2019)
GCF_008692635.1
44,813
(2.42 %)
n/a 17,929
(1.62 %)
18,444
(1.40 %)
n/a 41.48
(99.10 %)
259,266
(0.92 %)
259,266
(0.92 %)
283,944
(99.08 %)
5,744,848
(42.15 %)
646,532
(1.63 %)
13,599,442
(32.09 %)
2,962
(0.12 %)
367,159
(2.13 %)
61,299
(2.04 %)
57,732
(1.70 %)
859 spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025)
GCA_048593285.1
n/a n/a 15,188
(0.80 %)
15,406
(0.90 %)
n/a 36.07
(99.97 %)
151
(0.03 %)
151
(0.03 %)
157
(99.97 %)
4,933,924
(23.65 %)
1,239,006
(2.76 %)
20,612,787
(41.98 %)
1
(0.00 %)
575,621
(1.68 %)
21,700
(0.64 %)
21,289
(0.49 %)
860 spotted-tailed quoll (Chaos hap2 2025)
GCA_048593245.1
n/a n/a 15,441
(0.80 %)
15,791
(0.92 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
118
(0.01 %)
118
(0.01 %)
124
(99.99 %)
4,962,547
(23.62 %)
1,257,253
(2.87 %)
20,652,321
(42.01 %)
2
(0.00 %)
597,604
(1.75 %)
22,718
(0.69 %)
22,508
(0.51 %)
861 star-nosed mole
GCF_000260355.1
30,444
(2.86 %)
n/a 16,116
(1.82 %)
17,403
(1.78 %)
n/a 41.55
(95.10 %)
82,557
(4.92 %)
82,557
(4.92 %)
84,595
(95.08 %)
1,855,039
(18.90 %)
308,473
(0.86 %)
9,571,561
(26.02 %)
1,110
(0.03 %)
253,120
(1.17 %)
48,079
(2.76 %)
50,592
(2.47 %)
862 Steller sea lion
GCF_004028035.1
46,044
(2.38 %)
n/a 21,171
(1.78 %)
21,626
(1.43 %)
36,701
(1.75 %)
41.38
(99.41 %)
17,263
(0.59 %)
18,994
(0.59 %)
24,485
(99.41 %)
4,556,415
(43.53 %)
577,797
(1.09 %)
13,545,012
(33.71 %)
733
(0.02 %)
410,405
(1.19 %)
51,355
(1.45 %)
47,732
(1.28 %)
863 Stephens's kangaroo rat
GCA_004024685.1
n/a n/a 20,638
(1.19 %)
43,541
(1.37 %)
n/a 41.90
(99.85 %)
8,882
(0.04 %)
8,882
(0.04 %)
1,278,525
(99.96 %)
4,886,095
(30.36 %)
1,229,832
(5.30 %)
11,334,494
(44.33 %)
37
(0.00 %)
n/a 38,450
(1.17 %)
29,741
(0.76 %)
864 steppe mouse (ZRU 2018)
GCA_003336285.1
n/a n/a 22,032
(2.17 %)
20,891
(1.41 %)
n/a 41.70
(95.78 %)
123,681
(4.24 %)
123,681
(4.24 %)
161,217
(95.76 %)
4,964,415
(42.35 %)
1,414,584
(2.75 %)
12,989,925
(31.80 %)
1,690
(0.04 %)
440,790
(1.25 %)
17,544
(0.44 %)
15,542
(0.39 %)
865 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA alternate hap 2024)
GCA_043727795.1
n/a n/a 18,498
(1.82 %)
20,345
(1.58 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
2,228
(100.00 %)
4,403,018
(41.05 %)
809,880
(2.56 %)
11,206,839
(32.61 %)
0
(0 %)
589,463
(2.07 %)
38,354
(1.36 %)
31,765
(1.13 %)
866 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024)
GCA_043727835.1
n/a n/a 19,605
(1.80 %)
20,075
(1.48 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
5
(0.00 %)
87
(0.00 %)
80
(100.00 %)
4,110,913
(40.46 %)
838,212
(2.48 %)
11,938,168
(33.52 %)
2
(0.00 %)
646,825
(2.22 %)
40,424
(1.32 %)
35,299
(1.15 %)
867 straw-colored fruit bat
GCA_000465285.1
n/a n/a 20,161
(1.66 %)
40,283
(1.50 %)
n/a 39.24
(99.62 %)
154,908
(0.40 %)
154,908
(0.40 %)
288,446
(99.60 %)
2,814,732
(32.92 %)
372,539
(1.01 %)
12,351,823
(25.93 %)
27
(0.00 %)
33,439
(0.13 %)
67,245
(2.34 %)
61,933
(1.94 %)
868 stripe-headed round-eared bat
GCA_004024845.1
n/a n/a 20,248
(1.62 %)
29,173
(1.61 %)
n/a 42.04
(99.96 %)
2,860
(0.01 %)
2,860
(0.01 %)
252,670
(99.99 %)
3,018,746
(29.48 %)
333,243
(0.74 %)
12,128,116
(30.51 %)
14
(0.00 %)
n/a 59,513
(1.87 %)
52,210
(1.57 %)
869 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1
n/a n/a 18,204
(1.54 %)
21,036
(1.34 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,464
(100.00 %)
3,767,720
(35.65 %)
1,102,723
(10.92 %)
11,794,617
(40.96 %)
0
(0 %)
1,492,009
(4.69 %)
67,537
(3.57 %)
41,008
(1.09 %)
870 striped dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_951394435.1
n/a n/a 18,595
(1.48 %)
20,637
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1
(0.00 %)
993
(0.01 %)
639
(100.00 %)
4,097,623
(35.88 %)
1,442,973
(13.60 %)
12,327,244
(43.08 %)
1
(0.00 %)
1,896,129
(5.45 %)
68,498
(4.29 %)
42,011
(1.04 %)
871 striped dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_951394435.1
55,298
(2.72 %)
n/a 18,760
(1.55 %)
20,645
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
993
(0.01 %)
993
(0.01 %)
1,630
(99.99 %)
5,991,283
(52.35 %)
1,442,973
(13.60 %)
12,326,846
(43.08 %)
1
(0.00 %)
1,896,129
(5.45 %)
68,498
(4.29 %)
50,190
(1.37 %)
872 striped hyena (BS54 2019 Broad)
GCA_004023945.1
n/a n/a 22,373
(1.45 %)
39,382
(1.45 %)
n/a 41.66
(99.93 %)
11,849
(0.05 %)
11,849
(0.05 %)
362,072
(99.95 %)
5,048,667
(42.42 %)
712,073
(1.24 %)
13,879,012
(34.58 %)
54
(0.00 %)
302,752
(0.79 %)
69,835
(2.20 %)
65,774
(1.90 %)
873 striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U)
GCF_003009895.1
48,870
(2.41 %)
n/a 18,793
(1.67 %)
20,950
(1.44 %)
n/a 41.56
(99.29 %)
0
(0 %)
23,058
(0.71 %)
5,761
(100.00 %)
4,782,500
(41.88 %)
701,157
(1.32 %)
13,436,624
(33.05 %)
2,049
(0.04 %)
413,871
(1.33 %)
58,977
(2.20 %)
57,500
(1.94 %)
874 sugar glider (PSGF00001 2023 genbank)
GCA_028583685.1
n/a n/a 19,326
(0.81 %)
17,560
(0.95 %)
n/a 38.95
(98.12 %)
0
(0 %)
85,933
(1.89 %)
1,895
(100.00 %)
6,382,198
(27.07 %)
1,058,207
(1.74 %)
22,508,040
(39.84 %)
4,157
(0.04 %)
398,213
(0.87 %)
16,224
(0.33 %)
14,028
(0.23 %)
875 sugar glider (PSGF00001 2023 refseq)
GCF_028583685.1
55,990
(2.41 %)
n/a 19,328
(0.81 %)
17,559
(0.95 %)
n/a 38.95
(98.12 %)
0
(0 %)
85,933
(1.89 %)
1,896
(100.00 %)
6,382,203
(27.07 %)
1,058,208
(1.74 %)
22,508,106
(39.84 %)
4,157
(0.04 %)
398,217
(0.87 %)
16,224
(0.33 %)
14,028
(0.23 %)
876 Sumatran rhinoceros (hap1 2026)
GCA_060039915.1
n/a n/a 18,591
(1.58 %)
22,216
(1.40 %)
n/a 41.01
(100.00 %)
0
(0 %)
246
(0.00 %)
404
(100.00 %)
5,002,790
(48.58 %)
498,846
(1.86 %)
15,182,511
(34.12 %)
6
(0.00 %)
515,632
(1.57 %)
43,768
(1.30 %)
34,410
(0.98 %)
877 Sumatran rhinoceros (hap2 2026)
GCA_060039925.1
n/a n/a 17,652
(1.59 %)
20,770
(1.39 %)
n/a 41.19
(100.00 %)
0
(0 %)
221
(0.00 %)
888
(100.00 %)
4,702,969
(48.73 %)
501,843
(3.62 %)
13,805,271
(34.22 %)
0
(0 %)
515,144
(1.55 %)
41,269
(1.27 %)
32,112
(0.96 %)
878 Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017)
GCA_002844835.1
n/a n/a 20,368
(1.53 %)
24,204
(1.23 %)
n/a 41.05
(95.54 %)
50,874
(4.40 %)
50,876
(4.40 %)
1,112,463
(95.60 %)
4,516,240
(39.90 %)
561,540
(1.56 %)
15,821,451
(34.68 %)
11,238
(0.78 %)
n/a 45,201
(1.03 %)
42,111
(0.93 %)
879 Sumatran serow (serow.1 2024)
GCF_032405125.1
36,400
(1.65 %)
n/a 19,192
(1.42 %)
22,014
(1.41 %)
n/a 43.08
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
159
(100.00 %)
3,242,768
(21.18 %)
612,565
(8.05 %)
12,812,990
(44.37 %)
1
(0.00 %)
1,821,554
(4.84 %)
75,177
(5.86 %)
39,082
(0.88 %)
880 Sunda flying lemur (2014 WashU)
GCF_000696425.1
34,734
(1.83 %)
n/a 21,356
(1.55 %)
25,832
(1.21 %)
n/a 40.21
(87.96 %)
332,364
(12.07 %)
412,608
(12.07 %)
511,878
(87.93 %)
4,961,153
(38.35 %)
854,441
(3.33 %)
17,562,576
(28.82 %)
58,964
(1.13 %)
n/a 82,988
(1.05 %)
76,682
(0.95 %)
881 Sunda flying lemur (US047 2019 Broad)
GCA_004027255.1
n/a n/a 24,882
(1.29 %)
43,546
(1.12 %)
n/a 40.46
(99.88 %)
5,895
(0.02 %)
5,895
(0.02 %)
1,655,642
(99.98 %)
5,807,241
(38.62 %)
953,765
(2.48 %)
18,836,777
(37.68 %)
23
(0.00 %)
n/a 114,955
(1.43 %)
106,305
(1.30 %)
882 tailed tailless bat
GCA_004027475.1
n/a n/a 19,920
(1.58 %)
28,017
(1.58 %)
n/a 41.76
(99.95 %)
4,640
(0.02 %)
4,640
(0.02 %)
341,895
(99.98 %)
3,139,817
(30.43 %)
381,536
(0.81 %)
12,069,229
(32.73 %)
25
(0.00 %)
n/a 54,528
(2.15 %)
52,231
(1.90 %)
883 tailess tenrec (hap1 2025 genbank)
GCA_050624435.1
n/a n/a 21,323
(0.86 %)
25,222
(1.02 %)
n/a 44.80
(100.00 %)
0
(0 %)
175
(0.00 %)
2,180
(100.00 %)
5,682,996
(38.93 %)
1,001,072
(14.26 %)
17,866,411
(50.04 %)
0
(0 %)
5,912,988
(9.31 %)
53,320
(1.01 %)
38,205
(0.58 %)
884 tailess tenrec (hap1 2025 refseq)
GCF_050624435.1
45,770
(1.60 %)
n/a 21,323
(0.86 %)
25,223
(1.02 %)
n/a 44.80
(100.00 %)
0
(0 %)
175
(0.00 %)
2,180
(100.00 %)
5,633,466
(38.91 %)
1,001,072
(14.26 %)
17,866,411
(50.04 %)
0
(0 %)
5,333,247
(8.40 %)
53,320
(1.01 %)
38,205
(0.58 %)
885 tailess tenrec (hap2 2025)
GCA_050624465.1
n/a n/a 20,180
(0.96 %)
23,467
(1.13 %)
n/a 44.21
(100.00 %)
0
(0 %)
160
(0.00 %)
1,233
(100.00 %)
5,074,733
(40.88 %)
791,473
(8.15 %)
16,742,233
(44.91 %)
0
(0 %)
2,945,083
(5.65 %)
47,409
(1.01 %)
35,296
(0.63 %)
886 takin (Tak-1 2022)
GCF_023091745.1
31,927
(1.65 %)
n/a 19,290
(1.42 %)
21,656
(1.27 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
0
(0 %)
152
(0.00 %)
1,363
(100.00 %)
3,256,033
(21.01 %)
714,375
(8.32 %)
13,010,154
(44.58 %)
4
(0.00 %)
1,681,924
(4.50 %)
49,134
(7.43 %)
39,324
(0.88 %)
887 Talazac's shrew tenrec
GCA_004026705.1
n/a n/a 22,605
(0.81 %)
50,725
(1.09 %)
n/a 43.03
(99.93 %)
6,619
(0.02 %)
6,619
(0.02 %)
795,514
(99.98 %)
3,493,378
(14.58 %)
705,274
(1.31 %)
20,975,335
(36.85 %)
51
(0.00 %)
n/a 70,793
(1.26 %)
54,287
(0.89 %)
888 tammar wallaby (alternate hap 2023)
GCA_028389975.1
n/a n/a 11,133
(0.77 %)
13,869
(0.98 %)
n/a 38.63
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
14,285
(100.00 %)
3,114,522
(26.10 %)
661,874
(3.02 %)
11,667,649
(38.41 %)
0
(0 %)
320,252
(1.29 %)
12,393
(0.46 %)
7,824
(0.29 %)
889 tammar wallaby (Barry hap1 2025)
GCA_048593335.1
n/a n/a 17,491
(0.79 %)
15,701
(0.88 %)
n/a 38.69
(100.00 %)
32
(0.00 %)
32
(0.00 %)
40
(100.00 %)
5,762,317
(26.52 %)
1,078,692
(1.83 %)
22,476,051
(38.99 %)
0
(0 %)
359,624
(0.79 %)
22,756
(0.48 %)
14,728
(0.29 %)
890 tammar wallaby (Barry hap2 2025)
GCA_048593345.1
n/a n/a 17,037
(0.79 %)
15,066
(0.87 %)
n/a 38.62
(100.00 %)
16
(0.00 %)
16
(0.00 %)
24
(100.00 %)
5,608,153
(26.57 %)
1,050,173
(1.77 %)
21,856,273
(38.96 %)
0
(0 %)
329,638
(0.74 %)
21,811
(0.47 %)
14,145
(0.29 %)
891 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq)
GCF_028372415.1
73,219
(3.07 %)
n/a 17,615
(0.77 %)
15,415
(0.86 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
0
(0 %)
515
(0.19 %)
272
(100.00 %)
5,866,314
(26.30 %)
1,193,604
(2.72 %)
22,677,480
(39.53 %)
4
(0.00 %)
565,991
(1.21 %)
23,590
(0.47 %)
14,746
(0.29 %)
892 Tasmanian devil (McLovin hap1 2025)
GCA_048593225.1
n/a n/a 15,725
(0.77 %)
16,721
(0.92 %)
n/a 36.17
(99.49 %)
1,514
(0.51 %)
1,514
(0.51 %)
1,521
(99.49 %)
5,222,976
(23.42 %)
1,357,438
(3.95 %)
21,705,122
(42.26 %)
2
(0.00 %)
779,205
(1.97 %)
24,443
(0.70 %)
24,411
(0.52 %)
893 Tasmanian devil (McLovin hap2 2025)
GCA_048593325.1
n/a n/a 15,165
(0.76 %)
15,663
(0.91 %)
n/a 36.00
(99.11 %)
2,578
(0.89 %)
2,578
(0.89 %)
2,584
(99.11 %)
5,039,957
(23.64 %)
1,257,168
(2.97 %)
20,893,744
(41.44 %)
4
(0.00 %)
610,743
(1.64 %)
22,574
(0.67 %)
22,546
(0.51 %)
894 Tasmanian devil (primary hap 2019)
GCF_902635505.1
52,070
(2.36 %)
n/a 15,918
(0.85 %)
16,111
(0.91 %)
n/a 36.16
(100.00 %)
0
(0 %)
354
(0.00 %)
106
(100.00 %)
6,789,158
(44.28 %)
1,246,027
(2.19 %)
21,434,803
(41.20 %)
1
(0.00 %)
454,463
(1.20 %)
23,609
(0.65 %)
23,356
(0.61 %)
895 Tasmanian wolf (PY-MV-C5757 2022)
GCA_007646695.3
n/a n/a 15,896
(0.81 %)
37,523
(1.30 %)
n/a 36.26
(90.01 %)
0
(0 %)
295,304
(10.01 %)
149,109
(100.00 %)
9,159,284
(56.14 %)
1,604,085
(2.22 %)
21,839,162
(35.42 %)
17,762
(0.42 %)
n/a 46,604
(0.74 %)
43,696
(0.67 %)
896 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1
69,352
(3.50 %)
n/a 18,934
(1.68 %)
16,775
(1.37 %)
n/a 39.91
(93.25 %)
0
(0 %)
146,412
(6.77 %)
7,132
(100.00 %)
4,262,890
(35.64 %)
640,624
(1.64 %)
14,118,452
(27.90 %)
3,000
(0.05 %)
226,596
(0.80 %)
28,317
(0.64 %)
26,522
(0.58 %)
897 thirteen-lined ground squirrel (hap1 2025)
GCA_052094955.1
n/a n/a 19,425
(1.31 %)
21,287
(1.27 %)
n/a 40.31
(99.99 %)
0
(0 %)
1,444
(0.01 %)
5,280
(100.00 %)
6,062,160
(43.45 %)
940,716
(10.02 %)
16,322,133
(37.64 %)
11
(0.00 %)
2,274,560
(4.34 %)
34,544
(0.73 %)
31,733
(0.65 %)
898 thirteen-lined ground squirrel (hap2 2025)
GCA_052094965.1
n/a n/a 17,228
(1.41 %)
17,999
(1.30 %)
n/a 39.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,000
(0.01 %)
1,438
(100.00 %)
5,253,166
(38.98 %)
750,953
(4.01 %)
14,542,518
(32.77 %)
6
(0.00 %)
833,303
(2.05 %)
27,458
(0.71 %)
25,216
(0.64 %)
899 thirteen-lined ground squirrel (mIctTri1hap1 2025)
GCF_052094955.1
91,025
(3.74 %)
n/a 19,425
(1.31 %)
20,977
(1.20 %)
n/a 40.31
(99.99 %)
0
(0 %)
1,444
(0.01 %)
5,279
(100.00 %)
6,062,154
(43.45 %)
940,716
(10.02 %)
16,322,064
(37.64 %)
11
(0.00 %)
2,274,560
(4.34 %)
34,544
(0.73 %)
31,733
(0.65 %)
900 Tibetan sand fox (lyu1992 2022)
GCA_024500485.1
n/a n/a 19,552
(1.59 %)
19,307
(1.35 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
0
(0 %)
145
(0.00 %)
234
(100.00 %)
4,500,832
(32.18 %)
999,068
(2.01 %)
13,646,015
(32.98 %)
0
(0 %)
668,288
(1.70 %)
49,402
(2.19 %)
47,111
(1.57 %)
901 tiger
GCF_018350195.1
71,226
(2.84 %)
n/a 18,513
(1.68 %)
19,919
(1.39 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
56
(0.00 %)
65
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,878,003
(42.77 %)
912,595
(1.82 %)
13,804,650
(33.76 %)
1
(0.00 %)
408,593
(1.10 %)
64,312
(2.55 %)
60,048
(2.06 %)
902 Townsend's big-eared bat (COTO_CA2020_CCGPhap1 2025)
GCA_026230055.2
n/a n/a 18,747
(1.81 %)
21,398
(1.62 %)
n/a 42.82
(100.00 %)
0
(0 %)
256
(0.00 %)
381
(100.00 %)
5,017,312
(48.85 %)
779,839
(3.26 %)
10,740,034
(37.51 %)
2
(0.00 %)
511,098
(1.76 %)
49,071
(2.44 %)
50,053
(2.00 %)
903 Townsend's big-eared bat (COTO_CA2020_CCGPhap2 2025)
GCA_026230045.2
n/a n/a 17,913
(1.88 %)
19,986
(1.66 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
0
(0 %)
239
(0.00 %)
165
(100.00 %)
4,617,916
(47.27 %)
707,796
(3.14 %)
9,951,985
(36.27 %)
1
(0.00 %)
451,447
(1.67 %)
46,302
(2.55 %)
47,929
(2.10 %)
904 Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230055.1
n/a n/a 19,370
(1.77 %)
21,062
(1.61 %)
n/a 42.81
(100.00 %)
219
(0.00 %)
219
(0.00 %)
610
(100.00 %)
2,923,694
(25.49 %)
772,382
(3.25 %)
10,654,074
(37.41 %)
2
(0.00 %)
500,435
(1.74 %)
48,226
(2.42 %)
50,955
(1.88 %)
905 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1
n/a n/a 18,627
(1.82 %)
20,108
(1.67 %)
n/a 42.95
(100.00 %)
0
(0 %)
217
(0.00 %)
182
(100.00 %)
2,733,927
(24.79 %)
715,258
(3.17 %)
10,099,456
(36.35 %)
1
(0.00 %)
459,634
(1.69 %)
47,139
(2.58 %)
49,626
(1.96 %)
906 Transcaucasian mole vole
GCA_001685075.1
n/a n/a 20,173
(1.62 %)
18,627
(1.30 %)
n/a 41.51
(96.09 %)
440,846
(3.96 %)
440,846
(3.96 %)
499,269
(96.04 %)
3,827,136
(25.51 %)
810,597
(2.65 %)
13,634,524
(27.54 %)
26,487
(0.57 %)
259,635
(1.42 %)
9,596
(0.16 %)
8,622
(0.14 %)
907 Trefoil horseshoe bat (Malaysia alternate hap 2024)
GCA_043728055.1
n/a n/a 17,828
(1.84 %)
20,454
(1.63 %)
n/a 40.66
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,403
(100.00 %)
3,519,024
(41.02 %)
627,372
(2.04 %)
11,034,851
(31.87 %)
0
(0 %)
484,384
(2.04 %)
33,992
(1.29 %)
26,331
(1.02 %)
908 trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024)
GCA_043728145.1
n/a n/a 18,871
(1.79 %)
20,351
(1.55 %)
n/a 40.66
(99.99 %)
10
(0.00 %)
397
(0.01 %)
136
(100.00 %)
3,580,957
(40.75 %)
683,947
(2.19 %)
11,464,418
(33.39 %)
23
(0.00 %)
658,821
(2.63 %)
37,175
(1.31 %)
29,161
(1.04 %)
909 True's beaked whale
GCF_964341445.1
51,240
(1.91 %)
n/a 19,491
(1.24 %)
24,573
(1.13 %)
n/a 42.48
(99.99 %)
0
(0 %)
1,240
(0.01 %)
2,756
(100.00 %)
5,445,244
(60.47 %)
949,926
(20.01 %)
10,981,870
(51.51 %)
11
(0.00 %)
5,232,828
(10.31 %)
91,880
(2.74 %)
41,626
(0.88 %)
910 True's beaked whale (hap1.1 2024)
GCA_964341445.1
n/a n/a 19,530
(1.21 %)
24,576
(1.13 %)
n/a 42.48
(99.99 %)
0
(0 %)
1,240
(0.01 %)
2,757
(100.00 %)
4,847,855
(34.88 %)
949,927
(20.01 %)
10,981,914
(51.51 %)
11
(0.00 %)
5,641,807
(11.20 %)
91,880
(2.74 %)
39,724
(0.76 %)
911 True's beaked whale (hap1.2 2026)
GCA_964341445.2
n/a n/a 19,446
(1.25 %)
23,872
(1.13 %)
n/a 42.50
(99.99 %)
0
(0 %)
1,215
(0.01 %)
2,365
(100.00 %)
5,438,551
(60.72 %)
947,935
(20.05 %)
10,903,184
(51.60 %)
11
(0.00 %)
5,632,572
(11.22 %)
91,540
(2.75 %)
41,298
(0.88 %)
912 True's beaked whale (hap2.1 2024)
GCA_964341485.1
n/a n/a 19,313
(1.40 %)
22,642
(1.25 %)
n/a 42.03
(99.99 %)
1,073
(0.01 %)
1,073
(0.01 %)
2,457
(99.99 %)
4,540,507
(37.61 %)
826,104
(12.82 %)
11,296,445
(45.25 %)
8
(0.00 %)
3,246,098
(7.56 %)
80,840
(2.24 %)
38,974
(0.87 %)
913 True's beaked whale (hap2.2 2026)
GCA_964341485.2
n/a n/a 19,335
(1.44 %)
23,239
(1.28 %)
n/a 42.03
(99.99 %)
1,073
(0.01 %)
1,073
(0.01 %)
2,453
(99.99 %)
5,186,124
(55.45 %)
826,101
(12.82 %)
11,296,189
(45.25 %)
8
(0.00 %)
3,245,999
(7.56 %)
80,840
(2.24 %)
41,569
(1.03 %)
914 Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq)
GCF_000622305.1
54,680
(2.07 %)
n/a 19,704
(1.26 %)
21,262
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
201,121
(4.83 %)
356,097
(95.17 %)
6,165,645
(34.95 %)
1,197,750
(2.77 %)
16,282,383
(36.21 %)
730
(0.04 %)
n/a 22,905
(0.49 %)
18,563
(0.39 %)
915 Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019)
GCA_005458795.1
n/a n/a 19,867
(1.62 %)
15,893
(1.33 %)
n/a 39.77
(94.43 %)
291,728
(5.60 %)
296,819
(5.60 %)
315,631
(94.40 %)
4,452,628
(33.94 %)
751,210
(1.84 %)
13,917,879
(30.08 %)
10,755
(0.11 %)
190,776
(0.77 %)
26,541
(0.58 %)
25,046
(0.53 %)
916 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1
n/a n/a 9,367
(1.66 %)
11,297
(1.30 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,470
(100.00 %)
1,708,360
(43.81 %)
267,584
(1.67 %)
5,373,410
(33.52 %)
0
(0 %)
245,754
(1.84 %)
29,783
(1.94 %)
21,396
(1.51 %)
917 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1
60,106
(3.00 %)
n/a 18,611
(1.76 %)
20,103
(1.39 %)
35,176
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
0
(0 %)
212
(0.34 %)
64
(100.00 %)
4,067,454
(44.25 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,582
(35.55 %)
3
(0.00 %)
550,113
(1.71 %)
66,806
(1.79 %)
48,624
(1.46 %)
918 vaquita (primary hap 2019)
GCA_008692025.1
n/a n/a 18,599
(1.75 %)
20,104
(1.39 %)
35,398
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
0
(0 %)
212
(0.34 %)
65
(100.00 %)
4,067,518
(44.25 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,653
(35.55 %)
3
(0.00 %)
549,962
(1.71 %)
66,806
(1.79 %)
48,623
(1.46 %)
919 water buffalo (Mediterranean 2018)
GCF_003121395.1
69,771
(3.14 %)
62,816
(2.76 %)
19,465
(1.58 %)
21,849
(1.37 %)
46,051
(1.86 %)
41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
410
(0.01 %)
509
(100.00 %)
5,407,697
(47.11 %)
473,976
(1.54 %)
13,015,899
(41.23 %)
0
(0 %)
1,256,741
(3.44 %)
43,120
(1.15 %)
37,204
(0.96 %)
920 water buffalo (Murrah 2021)
GCF_019923935.1
80,565
(3.26 %)
n/a 19,402
(1.59 %)
20,375
(1.31 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
0
(0 %)
659
(0.00 %)
26
(100.00 %)
5,358,548
(47.11 %)
447,338
(1.14 %)
13,034,537
(41.28 %)
1
(0.00 %)
1,149,595
(3.22 %)
40,189
(1.07 %)
36,130
(0.95 %)
921 water vole (JQ59JK4JDI 2023)
GCA_019206885.2
n/a n/a 18,401
(2.03 %)
18,085
(1.65 %)
n/a 42.19
(89.99 %)
0
(0 %)
161,581
(10.04 %)
2,585
(100.00 %)
4,771,963
(38.17 %)
705,400
(1.96 %)
11,410,837
(25.00 %)
14,627
(0.18 %)
239,938
(0.72 %)
16,195
(0.52 %)
15,532
(0.49 %)
922 Weddell seal (Sample4059 2025)
GCF_054177405.1
64,922
(3.92 %)
n/a 20,961
(1.71 %)
22,100
(1.30 %)
n/a 41.56
(101.48 %)
0
(0 %)
51,965
(0.82 %)
396,181
(100.00 %)
4,778,614
(41.37 %)
576,425
(1.10 %)
14,014,212
(32.58 %)
2,227
(0.08 %)
n/a 53,779
(1.51 %)
47,102
(1.30 %)
923 Weddell seal (WS11-02 2013 refseq)
GCF_000349705.1
48,264
(2.73 %)
n/a 21,063
(1.73 %)
22,333
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
152,836
(29.58 %)
169,547
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,256
(0.66 %)
13,410,237
(22.09 %)
2,022
(0.05 %)
348,917
(1.08 %)
48,738
(1.01 %)
44,867
(0.88 %)
924 western European hedgehog (2012 refseq)
GCF_000296755.1
29,923
(1.67 %)
n/a 18,067
(1.33 %)
19,777
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
219,764
(14.09 %)
225,567
(85.91 %)
6,594,783
(45.66 %)
1,271,533
(2.29 %)
12,374,161
(42.02 %)
3,596
(0.06 %)
861,216
(2.39 %)
28,528
(0.71 %)
23,900
(0.52 %)
925 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1
n/a n/a 14,370
(1.06 %)
24,297
(1.27 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
26,601
(100.00 %)
3,360,923
(19.59 %)
1,043,098
(3.92 %)
8,511,380
(53.68 %)
0
(0 %)
1,216,984
(4.33 %)
23,321
(0.97 %)
17,608
(0.60 %)
926 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1
61,103
(2.36 %)
n/a 18,125
(1.16 %)
20,689
(1.21 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
0
(0 %)
3,760
(0.03 %)
1,174
(100.00 %)
4,891,329
(19.68 %)
1,507,929
(3.81 %)
12,571,105
(54.50 %)
7
(0.00 %)
1,975,693
(4.67 %)
32,667
(0.90 %)
24,067
(0.56 %)
927 western European house mouse (C57BL/6 2026)
GCA_056825265.1
n/a n/a 22,725
(1.91 %)
20,127
(1.25 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 22
(100.00 %)
5,054,625
(45.46 %)
1,712,800
(10.08 %)
12,627,747
(41.14 %)
0
(0 %)
1,329,590
(3.48 %)
24,439
(0.56 %)
16,499
(0.40 %)
928 western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022)
GCA_921998345.2
n/a n/a 21,722
(2.14 %)
19,586
(1.39 %)
108,856
(4.46 %)
41.81
(98.87 %)
1
(0.00 %)
1,233
(1.13 %)
233
(100.00 %)
4,634,551
(40.61 %)
1,541,826
(3.49 %)
13,030,566
(35.21 %)
1
(0.00 %)
789,553
(2.49 %)
22,985
(0.56 %)
15,853
(0.42 %)
929 western roe deer (2023)
GCA_951849835.1
n/a n/a 20,291
(1.29 %)
23,555
(1.23 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 212
(100.00 %)
4,204,612
(25.49 %)
848,463
(7.79 %)
12,687,776
(48.28 %)
0
(0 %)
3,910,662
(7.70 %)
57,315
(1.25 %)
43,092
(0.85 %)
930 western spotted skunk
GCA_004023965.1
n/a n/a 21,665
(1.46 %)
34,370
(1.32 %)
n/a 41.61
(99.92 %)
11,822
(0.05 %)
11,822
(0.05 %)
433,831
(99.95 %)
4,889,781
(40.77 %)
901,906
(2.30 %)
13,931,764
(34.80 %)
69
(0.00 %)
550,674
(1.31 %)
54,394
(1.54 %)
50,665
(1.39 %)
931 western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022)
GCA_921997135.2
n/a n/a 21,699
(2.10 %)
18,837
(1.32 %)
n/a 41.69
(99.51 %)
4
(0.00 %)
1,576
(0.49 %)
143
(100.00 %)
4,507,329
(41.24 %)
1,517,241
(3.77 %)
12,832,499
(36.17 %)
35
(0.00 %)
908,992
(2.83 %)
22,568
(0.53 %)
15,701
(0.41 %)
932 whiskered bat (hap1 2024)
GCA_964094495.2
n/a n/a 19,504
(1.78 %)
22,272
(1.73 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
7
(0.00 %)
1,566
(0.02 %)
533
(100.00 %)
3,046,246
(25.06 %)
753,151
(4.86 %)
10,596,418
(37.62 %)
7
(0.00 %)
729,123
(2.57 %)
66,785
(2.55 %)
53,825
(1.76 %)
933 whiskered bat (hap1.2 2025)
GCA_964094495.3
n/a n/a 19,023
(1.85 %)
22,199
(1.73 %)
n/a 43.02
(100.00 %)
0
(0 %)
267
(0.00 %)
241
(100.00 %)
5,005,820
(47.73 %)
756,354
(4.85 %)
10,602,346
(37.72 %)
2
(0.00 %)
711,178
(2.47 %)
67,615
(2.61 %)
52,556
(2.03 %)
934 whiskered bat (hap2 2024)
GCA_964195625.1
n/a n/a 18,681
(1.83 %)
21,523
(1.79 %)
n/a 43.13
(99.99 %)
1,414
(0.01 %)
1,414
(0.01 %)
1,741
(99.99 %)
2,849,223
(24.50 %)
688,594
(4.80 %)
9,968,980
(36.80 %)
9
(0.00 %)
650,767
(2.46 %)
64,365
(2.68 %)
52,706
(1.84 %)
935 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1
n/a n/a 17,639
(1.50 %)
25,684
(1.35 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 25,619
(100.00 %)
3,039,324
(36.05 %)
637,912
(8.02 %)
9,746,398
(38.98 %)
0
(0 %)
811,711
(3.51 %)
56,325
(3.33 %)
35,586
(1.15 %)
936 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1
59,995
(2.43 %)
n/a 18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
0
(0 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
2
(0.00 %)
1,117,804
(3.60 %)
68,551
(3.58 %)
41,698
(1.09 %)
937 white-footed mouse (LL stock 2020)
GCF_004664715.2
54,479
(2.82 %)
n/a 19,971
(1.69 %)
20,132
(1.42 %)
n/a 42.23
(99.95 %)
0
(0 %)
2,299
(0.05 %)
1,857
(100.00 %)
5,060,487
(30.71 %)
1,258,073
(2.85 %)
14,007,098
(32.99 %)
1
(0.00 %)
568,416
(1.60 %)
23,456
(0.67 %)
19,779
(0.50 %)
938 white-tailed deer (Illinois 20LAN1187 2024)
GCF_023699985.2
68,660
(3.60 %)
n/a 19,951
(1.73 %)
21,804
(1.48 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
237
(0.00 %)
294
(0.00 %)
718
(100.00 %)
4,512,173
(43.10 %)
402,481
(1.14 %)
12,813,223
(37.56 %)
0
(0 %)
544,080
(1.60 %)
45,863
(1.30 %)
41,250
(1.17 %)
939 white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq)
GCF_002102435.1
57,787
(2.93 %)
n/a 20,661
(1.75 %)
23,085
(1.50 %)
40,987
(1.94 %)
41.55
(99.10 %)
31,627
(0.90 %)
107,058
(0.91 %)
48,653
(99.10 %)
4,800,704
(41.29 %)
413,129
(2.59 %)
13,296,779
(34.22 %)
7,681
(0.08 %)
439,019
(2.88 %)
44,165
(1.19 %)
41,200
(1.10 %)
940 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1
n/a n/a 12,198
(1.10 %)
18,494
(1.29 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
26
(0.00 %)
26
(0.00 %)
14,841
(100.00 %)
1,725,021
(17.81 %)
802,415
(4.26 %)
8,321,474
(45.72 %)
0
(0 %)
653,092
(2.79 %)
15,669
(0.79 %)
13,175
(0.55 %)
941 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1
40,430
(1.81 %)
n/a 17,575
(1.21 %)
21,880
(1.35 %)
47,496
(1.55 %)
39.81
(99.57 %)
0
(0 %)
1,010
(0.43 %)
147
(100.00 %)
2,846,063
(18.57 %)
1,252,362
(3.89 %)
13,776,063
(46.50 %)
14
(0.00 %)
1,059,317
(2.87 %)
24,589
(0.78 %)
20,877
(0.55 %)
942 white-toothed pygmy shrew (primary hap 2022)
GCA_024139225.1
n/a n/a 17,350
(1.25 %)
21,890
(1.35 %)
n/a 39.81
(99.57 %)
0
(0 %)
1,010
(0.43 %)
148
(100.00 %)
6,924,771
(50.26 %)
1,252,365
(3.89 %)
13,775,765
(46.50 %)
14
(0.00 %)
1,059,318
(2.87 %)
24,589
(0.78 %)
21,240
(0.65 %)
943 wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020)
GCF_009834535.1
70,235
(4.11 %)
n/a 18,202
(1.93 %)
20,199
(1.66 %)
42,728
(2.35 %)
41.66
(99.99 %)
0
(0 %)
2,345
(0.01 %)
2,043
(100.00 %)
3,091,018
(33.31 %)
332,720
(5.33 %)
12,161,286
(28.79 %)
5
(0.00 %)
978,328
(2.98 %)
55,524
(1.75 %)
51,693
(1.56 %)
944 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq)
GCF_000311805.1
34,726
(2.40 %)
n/a 18,746
(1.96 %)
17,104
(1.61 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
55,538
(1.18 %)
60,971
(1.18 %)
68,872
(98.82 %)
2,991,821
(33.93 %)
353,632
(1.23 %)
12,349,615
(25.12 %)
11
(0.00 %)
101,845
(0.63 %)
45,437
(1.02 %)
41,010
(0.88 %)
945 wild goat
GCA_000978405.1
n/a n/a 19,104
(1.48 %)
16,198
(1.21 %)
n/a 41.91
(91.72 %)
279,195
(8.31 %)
279,195
(8.31 %)
368,693
(91.69 %)
5,563,294
(45.39 %)
452,402
(1.99 %)
13,802,376
(35.47 %)
3,626
(0.18 %)
791,539
(4.01 %)
41,935
(0.63 %)
35,405
(0.52 %)
946 wild yak (GX-2022 2023)
GCF_027580195.1
52,505
(2.90 %)
n/a 19,278
(1.60 %)
20,813
(1.31 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
0
(0 %)
196
(0.00 %)
2,040
(100.00 %)
5,706,841
(46.71 %)
464,013
(1.82 %)
12,973,198
(41.46 %)
0
(0 %)
1,346,892
(3.70 %)
42,508
(1.32 %)
39,621
(1.15 %)
947 wild yak (yakQH1 2013)
GCF_000298355.1
29,789
(1.92 %)
n/a 19,936
(1.62 %)
19,914
(1.32 %)
n/a 41.71
(95.48 %)
192,006
(4.54 %)
192,006
(4.54 %)
233,198
(95.46 %)
5,348,663
(46.08 %)
449,880
(1.38 %)
13,572,902
(36.62 %)
139
(0.01 %)
753,906
(2.31 %)
41,147
(0.82 %)
37,405
(0.73 %)
948 winter white dwarf (Siberian hamster Psun_Stras_1 2023)
GCA_030556225.1
n/a n/a 18,177
(1.88 %)
18,942
(1.54 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
742
(100.00 %)
5,398,126
(39.36 %)
1,168,723
(3.56 %)
12,272,233
(30.38 %)
0
(0 %)
500,811
(1.32 %)
18,332
(0.60 %)
16,608
(0.53 %)
949 woodchuck (v1.1 L192 2022)
GCF_021218885.2
68,030
(3.47 %)
n/a 19,116
(1.55 %)
21,017
(1.38 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
47
(0.00 %)
47
(0.00 %)
3,380
(100.00 %)
5,285,788
(43.20 %)
912,552
(2.73 %)
14,538,866
(35.15 %)
0
(0 %)
413,178
(1.33 %)
36,914
(1.02 %)
26,813
(0.66 %)
950 woodland dormouse
GCA_004027655.1
n/a n/a 23,556
(1.09 %)
55,517
(1.33 %)
n/a 41.52
(99.86 %)
15,691
(0.06 %)
15,691
(0.06 %)
1,283,630
(99.94 %)
7,674,195
(34.99 %)
1,698,258
(3.76 %)
13,705,886
(42.23 %)
20
(0.00 %)
n/a 68,562
(1.41 %)
46,064
(0.97 %)
951 woodland thicket rat
GCF_004785775.1
43,129
(2.40 %)
n/a 22,710
(2.13 %)
21,042
(1.49 %)
n/a 41.17
(98.57 %)
0
(0 %)
76,623
(1.44 %)
23,656
(100.00 %)
4,732,544
(38.04 %)
1,424,025
(3.23 %)
13,549,399
(30.42 %)
5,008
(0.04 %)
449,709
(1.17 %)
18,232
(0.48 %)
16,831
(0.43 %)
952 woolly hare (The Qinghai-Tibet Plateau SH-2023 2024)
GCA_036325905.1
n/a n/a 19,363
(1.28 %)
22,239
(1.28 %)
n/a 44.08
(100.00 %)
0
(0 %)
240
(0.00 %)
112
(100.00 %)
4,432,114
(42.23 %)
966,165
(7.11 %)
13,263,822
(43.77 %)
1
(0.00 %)
1,913,575
(4.39 %)
96,755
(2.28 %)
70,154
(1.73 %)
953 wrinkle-faced bat (hap1 2026)
GCA_058972505.1
n/a n/a 17,620
(1.53 %)
20,718
(1.49 %)
n/a 42.82
(100.00 %)
0
(0 %)
85
(0.00 %)
812
(100.00 %)
3,933,017
(42.96 %)
461,927
(10.60 %)
10,236,179
(38.95 %)
0
(0 %)
1,186,176
(3.08 %)
68,442
(2.55 %)
61,202
(3.09 %)
954 wrinkle-faced bat (hap2 2026)
GCA_058972435.1
n/a n/a 17,530
(1.57 %)
20,692
(1.50 %)
n/a 42.70
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
654
(100.00 %)
3,876,611
(42.49 %)
425,909
(9.29 %)
10,283,412
(37.60 %)
0
(0 %)
1,136,871
(3.33 %)
68,200
(2.41 %)
60,353
(2.62 %)
955 Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq)
GCF_003031525.2
43,310
(2.49 %)
n/a 18,747
(1.81 %)
19,638
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
52,647
(0.72 %)
66,343
(99.28 %)
3,547,466
(35.83 %)
540,760
(1.65 %)
12,691,756
(32.88 %)
427
(0.03 %)
363,612
(1.97 %)
59,050
(1.48 %)
55,323
(1.35 %)
956 Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.2
26,128
(1.61 %)
n/a 18,978
(1.74 %)
20,661
(1.39 %)
n/a 41.24
(98.69 %)
123,788
(1.33 %)
123,788
(1.33 %)
148,598
(98.67 %)
3,788,303
(37.04 %)
690,288
(1.96 %)
12,841,906
(35.04 %)
292
(0.02 %)
514,620
(2.01 %)
62,458
(1.54 %)
59,005
(1.41 %)
957 yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq)
GCF_047511675.1
55,299
(2.52 %)
n/a 19,502
(1.44 %)
20,297
(1.34 %)
n/a 39.90
(100.00 %)
0
(0 %)
330
(0.00 %)
813
(100.00 %)
4,038,893
(29.07 %)
978,915
(3.28 %)
14,404,633
(34.97 %)
4
(0.00 %)
446,138
(1.44 %)
36,674
(1.05 %)
27,659
(0.61 %)
958 yellow-bellied marmot (hap2 2025)
GCA_047512175.1
n/a n/a 18,677
(1.51 %)
19,370
(1.40 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
0
(0 %)
307
(0.00 %)
329
(100.00 %)
3,694,109
(28.05 %)
793,102
(2.43 %)
13,585,913
(33.39 %)
4
(0.00 %)
351,043
(1.26 %)
33,990
(1.02 %)
26,212
(0.65 %)
959 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019)
GCF_003676075.3
42,667
(2.16 %)
n/a 19,547
(1.52 %)
21,406
(1.40 %)
n/a 39.89
(97.96 %)
34,682
(2.04 %)
35,509
(2.04 %)
66,442
(97.96 %)
3,814,223
(27.39 %)
800,865
(1.96 %)
14,323,977
(32.63 %)
1,266
(0.04 %)
210,361
(0.69 %)
34,122
(0.91 %)
26,843
(0.62 %)
960 yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCF_016432865.1
47,618
(2.51 %)
n/a 15,703
(0.78 %)
16,155
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
0
(0 %)
620
(0.01 %)
486
(100.00 %)
5,191,383
(23.81 %)
1,269,772
(2.59 %)
21,430,585
(42.69 %)
2
(0.00 %)
714,623
(2.20 %)
28,118
(0.66 %)
28,157
(0.56 %)
961 yellow-spotted hyrax
GCA_004026845.1
n/a n/a 20,424
(0.86 %)
43,984
(1.27 %)
n/a 40.93
(99.94 %)
3,815
(0.01 %)
3,815
(0.01 %)
971,748
(99.99 %)
5,365,974
(31.41 %)
435,699
(1.22 %)
21,229,266
(45.17 %)
42
(0.00 %)
n/a 38,521
(0.68 %)
31,852
(0.55 %)
962 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1
n/a n/a 17,610
(1.00 %)
20,322
(1.04 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
276
(0.00 %)
62
(100.00 %)
3,295,935
(23.58 %)
389,907
(6.37 %)
19,525,382
(45.90 %)
0
(0 %)
1,020,287
(2.23 %)
31,831
(0.63 %)
26,588
(0.47 %)
963 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1
n/a n/a 16,320
(1.03 %)
20,318
(1.13 %)
n/a 40.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,169
(100.00 %)
2,911,332
(23.50 %)
347,110
(4.57 %)
17,256,419
(44.04 %)
0
(0 %)
683,195
(1.71 %)
28,674
(0.68 %)
24,228
(0.50 %)
964 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd alternate hap 2024)
GCA_043880365.1
n/a n/a 18,844
(1.70 %)
23,805
(1.54 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,862
(100.00 %)
3,638,702
(42.22 %)
847,774
(6.68 %)
11,654,541
(34.78 %)
0
(0 %)
1,444,870
(4.06 %)
34,055
(3.45 %)
25,436
(0.96 %)
965 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024)
GCA_043880425.1
n/a n/a 18,352
(1.71 %)
20,233
(1.46 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
44
(0.00 %)
196
(0.00 %)
1,530
(100.00 %)
3,466,695
(41.95 %)
934,524
(8.81 %)
11,690,112
(36.30 %)
0
(0 %)
1,908,821
(5.07 %)
35,257
(5.20 %)
27,363
(0.98 %)
966 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023)
GCA_028536395.1
n/a n/a 19,188
(1.79 %)
21,673
(1.72 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
0
(0 %)
215
(0.00 %)
250
(100.00 %)
3,043,589
(24.76 %)
773,853
(4.49 %)
10,648,494
(37.26 %)
2
(0.00 %)
684,501
(2.39 %)
61,910
(2.52 %)
51,884
(1.68 %)
967 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 refseq)
GCF_028538775.1
48,707
(3.25 %)
n/a 18,807
(1.93 %)
21,046
(1.76 %)
n/a 43.22
(100.00 %)
209
(0.00 %)
209
(0.00 %)
684
(100.00 %)
3,552,235
(38.46 %)
719,552
(4.26 %)
10,089,365
(36.35 %)
0
(0 %)
648,904
(2.37 %)
60,974
(2.61 %)
54,521
(2.25 %)
968 zebra duiker (hap1 2025)
GCA_054099735.1
n/a n/a 19,411
(1.04 %)
23,174
(0.98 %)
n/a 46.14
(100.00 %)
0
(0 %)
185
(0.00 %)
598
(100.00 %)
6,742,800
(39.85 %)
699,303
(26.55 %)
12,357,908
(58.45 %)
3
(0.00 %)
6,242,957
(11.61 %)
605,557
(5.20 %)
46,593
(0.81 %)
969 zebra duiker (hap2 2025)
GCA_054099755.1
n/a n/a 19,383
(1.06 %)
23,042
(0.98 %)
n/a 46.07
(100.00 %)
0
(0 %)
162
(0.00 %)
677
(100.00 %)
6,681,000
(40.47 %)
636,475
(26.14 %)
12,329,686
(57.66 %)
1
(0.00 %)
7,301,330
(13.79 %)
583,195
(5.17 %)
46,667
(0.82 %)
970 zebu cattle (Hainan HN024 2024)
GCA_039881165.1
n/a n/a 19,162
(1.53 %)
20,991
(1.34 %)
n/a 41.77
(99.99 %)
0
(0 %)
350
(0.01 %)
292
(100.00 %)
3,296,209
(23.14 %)
440,574
(1.28 %)
12,824,144
(40.98 %)
0
(0 %)
1,191,569
(3.42 %)
39,400
(1.07 %)
35,669
(0.87 %)
971 zebu cattle (Nelore 2014 refseq)
GCF_000247795.1
39,830
(2.52 %)
n/a 18,603
(1.59 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
253,738
(7.41 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,770
(92.59 %)
5,119,428
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,672
(36.60 %)
476
(0.01 %)
998,817
(3.00 %)
35,241
(0.84 %)
32,220
(0.75 %)
972 zebu cattle (Sahiwal x Tharparkar maternal NIAB-ARS_2022 2023)
GCF_029378745.1
70,745
(4.27 %)
n/a 19,546
(1.58 %)
21,187
(1.33 %)
n/a 41.86
(100.00 %)
0
(0 %)
283
(0.00 %)
67
(100.00 %)
5,530,890
(46.61 %)
459,827
(1.43 %)
13,190,355
(41.36 %)
0
(0 %)
1,188,902
(3.30 %)
42,544
(1.21 %)
38,882
(1.11 %)
TOTALS:total assembly count 972

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 627 assemblies assembly stats track stats
Mammals 972 assemblies assembly stats track stats
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Fishes 733 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 471 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1998 assemblies assembly stats track stats
Plants 465 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4136 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15117 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2977 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 23960 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 691 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5522 assemblies assembly stats track stats