Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base AGP
gap		 all
gaps		 assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 gap
Overlap		 tandem
Dups		 cpg
unmasked		 cpg
island
1 aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad)
GCF_000298275.1		 25,607
(1.08 %)		 n/a 18,351
(1.06 %)		 20,358
(0.98 %)		 n/a 40.07
(76.89 %)		 411,144
(23.15 %)		 411,144
(23.15 %)		 433,653
(76.85 %)		 n/a 536,700
(0.74 %)		 18,176,790
(39.08 %)		 3,595
(0.03 %)		 723,185
(1.16 %)		 26,235
(0.40 %)		 24,645
(0.35 %)
2 African grass rat (maternal 2020)
GCA_011750645.1		 n/a n/a 20,916
(2.01 %)		 19,513
(1.43 %)		 n/a 41.37
(98.89 %)		 0
(0 %)		 1,526
(1.11 %)		 1,610
(100.00 %)		 4,928,847
(37.45 %)		 1,652,295
(5.20 %)		 13,507,965
(32.27 %)		 0
(0 %)		 1,023,525
(1.96 %)		 17,712
(0.51 %)		 16,897
(0.46 %)
3 African grass rat (paternal 2020)
GCA_011762545.1		 n/a n/a 20,796
(2.00 %)		 19,611
(1.43 %)		 n/a 41.42
(97.70 %)		 0
(0 %)		 1,563
(2.30 %)		 1,740
(100.00 %)		 4,904,243
(37.25 %)		 1,672,608
(5.37 %)		 13,465,246
(32.19 %)		 1
(0.00 %)		 1,034,950
(2.07 %)		 17,677
(0.50 %)		 16,772
(0.46 %)
4 African grass rat (paternal X 2020)
GCF_011762505.1		 45,963
(2.46 %)		 n/a 20,878
(1.99 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 0
(0 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,595
(100.00 %)		 4,939,557
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,429
(32.71 %)		 2
(0.00 %)		 1,065,249
(2.09 %)		 17,767
(0.51 %)		 16,852
(0.46 %)
5 African hunting dog
GCA_001887905.1		 n/a n/a 18,956
(1.75 %)		 17,562
(1.41 %)		 n/a 40.98
(92.89 %)		 0
(0 %)		 1,415,298
(7.28 %)		 803
(100.00 %)		 4,458,183
(39.99 %)		 658,637
(1.13 %)		 13,671,493
(28.24 %)		 854
(0.01 %)		 288,980
(0.71 %)		 47,644
(1.64 %)		 45,393
(1.41 %)
6 African hunting dog (LycPic1hap1 2024)
GCA_040955645.1		 n/a n/a 18,688
(1.61 %)		 19,670
(1.44 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 82
(0.00 %)		 86
(100.00 %)		 4,281,139
(31.62 %)		 959,378
(2.78 %)		 12,859,760
(32.95 %)		 1
(0.00 %)		 632,917
(1.70 %)		 49,122
(2.32 %)		 45,729
(1.55 %)
7 African hunting dog (LycPic1hap2 2024)
GCA_040955705.1		 n/a n/a 19,463
(1.58 %)		 20,378
(1.42 %)		 n/a 41.30
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 91
(0.00 %)		 77
(100.00 %)		 4,513,580
(32.16 %)		 1,008,611
(2.91 %)		 13,570,452
(33.71 %)		 2
(0.00 %)		 686,092
(1.77 %)		 50,954
(2.21 %)		 46,966
(1.51 %)
8 African savanna elephant (2009 refseq)
GCF_000001905.1		 46,043
(2.30 %)		 n/a 19,169
(1.26 %)		 19,664
(1.10 %)		 n/a 40.76
(97.57 %)		 93,514
(2.45 %)		 93,514
(2.45 %)		 95,866
(97.55 %)		 6,363,315
(57.54 %)		 365,797
(0.88 %)		 16,073,053
(44.89 %)		 11
(0.00 %)		 417,291
(1.06 %)		 33,513
(0.68 %)		 24,503
(0.51 %)
9 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1		 n/a n/a 18,845
(1.07 %)		 22,426
(1.10 %)		 n/a 41.34
(99.85 %)		 169
(0.15 %)		 169
(0.15 %)		 1,253
(99.85 %)		 4,406,744
(29.55 %)		 925,868
(4.71 %)		 15,966,881
(50.49 %)		 0
(0 %)		 1,248,627
(2.71 %)		 68,531
(1.61 %)		 23,142
(0.47 %)
10 African savanna elephant (hap2 2023)
GCF_030014295.1		 64,034
(3.35 %)		 n/a 18,980
(1.10 %)		 21,593
(1.06 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 0
(0 %)		 231
(0.10 %)		 879
(100.00 %)		 4,426,749
(29.95 %)		 832,904
(4.08 %)		 16,118,888
(49.47 %)		 1
(0.00 %)		 1,082,957
(2.38 %)		 62,314
(1.49 %)		 23,783
(0.48 %)
11 African savanna elephant (hap2 mLoxAfr1 2023)
GCA_030014295.1		 n/a n/a 18,981
(1.10 %)		 22,759
(1.12 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 0
(0 %)		 231
(0.10 %)		 880
(100.00 %)		 4,426,756
(29.95 %)		 832,908
(4.08 %)		 16,118,910
(49.47 %)		 1
(0.00 %)		 1,082,958
(2.38 %)		 62,315
(1.49 %)		 23,783
(0.48 %)
12 agile gracile mouse opossum
GCF_016433145.1		 30,697
(1.32 %)		 n/a 17,361
(0.78 %)		 17,596
(0.81 %)		 n/a 37.86
(91.75 %)		 0
(0 %)		 85,142
(8.25 %)		 60,714
(100.00 %)		 7,917,577
(49.04 %)		 1,054,566
(1.57 %)		 22,701,659
(37.69 %)		 3,920
(0.14 %)		 434,964
(1.27 %)		 27,301
(0.49 %)		 25,777
(0.43 %)
13 alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.4		 54,987
(3.56 %)		 n/a 18,439
(1.93 %)		 18,426
(1.63 %)		 n/a 41.40
(95.85 %)		 0
(0 %)		 166,272
(4.17 %)		 77,389
(100.00 %)		 3,004,413
(33.17 %)		 315,092
(1.36 %)		 12,458,272
(24.89 %)		 1,213
(0.03 %)		 207,593
(1.22 %)		 54,502
(1.38 %)		 49,907
(1.20 %)
14 Alpine marmot (2019)
GCF_001458135.2		 69,587
(3.43 %)		 n/a 19,047
(1.54 %)		 17,768
(1.39 %)		 n/a 39.80
(96.13 %)		 0
(0 %)		 88,858
(3.88 %)		 14,031
(100.00 %)		 3,726,252
(26.48 %)		 746,953
(1.83 %)		 14,066,368
(30.30 %)		 494
(0.01 %)		 202,554
(0.77 %)		 30,191
(0.63 %)		 24,232
(0.48 %)
15 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1		 n/a n/a 19,086
(1.55 %)		 22,040
(1.52 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 1,182
(0.01 %)		 1,182
(0.01 %)		 1,369
(99.99 %)		 3,846,728
(31.78 %)		 639,852
(2.90 %)		 11,937,936
(38.98 %)		 24
(0.00 %)		 819,376
(2.67 %)		 75,377
(2.21 %)		 66,761
(1.68 %)
16 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1		 n/a n/a 18,980
(1.50 %)		 22,394
(1.50 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 0
(0 %)		 80
(0.00 %)		 326
(100.00 %)		 3,896,863
(31.56 %)		 659,711
(4.74 %)		 11,945,162
(40.81 %)		 3
(0.00 %)		 979,504
(2.79 %)		 76,769
(2.57 %)		 66,591
(1.63 %)
17 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1		 n/a n/a 19,066
(1.48 %)		 22,356
(1.48 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 0
(0 %)		 75
(0.00 %)		 287
(100.00 %)		 3,908,607
(31.48 %)		 664,931
(5.23 %)		 11,892,191
(41.08 %)		 1
(0.00 %)		 994,645
(2.87 %)		 76,453
(2.43 %)		 66,568
(1.61 %)
18 American beaver (Ward 2017 refseq)
GCF_001984765.1		 40,013
(2.15 %)		 n/a 20,867
(1.53 %)		 24,201
(1.33 %)		 n/a 39.72
(99.99 %)		 0
(0 %)		 3,321
(0.01 %)		 21,157
(100.00 %)		 4,526,430
(33.75 %)		 486,353
(1.30 %)		 14,347,145
(31.96 %)		 19
(0.00 %)		 463,382
(1.20 %)		 23,046
(0.72 %)		 22,461
(0.67 %)
19 American bison (2014 refseq)
GCF_000754665.1		 38,686
(2.34 %)		 n/a 19,782
(1.47 %)		 20,444
(1.25 %)		 n/a 41.82
(93.12 %)		 341,984
(6.92 %)		 341,984
(6.92 %)		 470,415
(93.08 %)		 n/a 419,596
(0.95 %)		 13,519,877
(37.66 %)		 8,184
(0.08 %)		 n/a 60,388
(1.03 %)		 36,362
(0.64 %)
20 American black bear (L20-20 alternate hap 2022)
GCA_024610745.1		 n/a n/a 22,502
(1.17 %)		 43,431
(1.28 %)		 n/a 43.14
(99.99 %)		 0
(0 %)		 n/a 77,311
(100.00 %)		 4,587,986
(32.30 %)		 773,829
(6.39 %)		 14,594,034
(35.67 %)		 0
(0 %)		 1,078,790
(3.25 %)		 78,849
(3.32 %)		 57,618
(1.17 %)
21 American black bear (L20-20 primary hap 2022)
GCA_024610735.1		 n/a n/a 18,458
(1.52 %)		 21,049
(1.43 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 0
(0 %)		 22
(0.00 %)		 317
(100.00 %)		 4,000,508
(32.69 %)		 641,903
(5.91 %)		 13,210,530
(35.54 %)		 0
(0 %)		 996,585
(3.22 %)		 68,981
(3.00 %)		 52,140
(1.23 %)
22 American black bear (UA15103 2021)
GCF_020975775.1		 53,916
(3.11 %)		 n/a 18,840
(1.73 %)		 20,969
(1.50 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 2,213
(100.00 %)		 3,936,528
(34.53 %)		 594,864
(2.90 %)		 13,725,005
(32.35 %)		 0
(0 %)		 629,590
(1.78 %)		 62,580
(1.91 %)		 56,387
(1.69 %)
23 American mink (2018)
GCA_900108605.1		 n/a n/a 18,686
(1.70 %)		 20,016
(1.50 %)		 36,997
(1.74 %)		 41.60
(92.95 %)		 154,172
(7.07 %)		 154,172
(7.07 %)		 161,347
(92.93 %)		 4,350,343
(38.70 %)		 606,128
(1.17 %)		 13,605,797
(28.74 %)		 2,225
(0.02 %)		 334,330
(1.15 %)		 54,199
(1.98 %)		 53,125
(1.77 %)
24 American mink (hap1 2024)
GCA_964106545.1		 n/a n/a 19,203
(1.43 %)		 22,174
(1.33 %)		 n/a 42.39
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,957
(0.02 %)		 435
(100.00 %)		 4,188,829
(30.04 %)		 802,295
(5.81 %)		 14,041,290
(37.98 %)		 19
(0.00 %)		 1,190,442
(3.02 %)		 65,430
(2.64 %)		 54,362
(1.78 %)
25 American mink (hap2 2024)
GCA_964106205.1		 n/a n/a 18,890
(1.43 %)		 21,684
(1.33 %)		 n/a 42.35
(99.98 %)		 2,849
(0.02 %)		 2,849
(0.02 %)		 3,200
(99.98 %)		 4,158,563
(30.22 %)		 786,430
(5.25 %)		 13,845,377
(37.58 %)		 10
(0.00 %)		 1,137,591
(2.93 %)		 64,307
(2.75 %)		 53,505
(1.79 %)
26 American mink (M4711 2021 Dalhousie U)
GCF_020171115.1		 50,253
(2.26 %)		 n/a 18,949
(1.49 %)		 20,914
(1.29 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 183
(100.00 %)		 4,705,680
(39.15 %)		 795,684
(5.50 %)		 14,085,357
(37.99 %)		 0
(0 %)		 1,135,030
(2.90 %)		 63,307
(2.38 %)		 63,004
(2.19 %)
27 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1		 45,008
(1.93 %)		 n/a 17,997
(1.35 %)		 23,185
(1.49 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 0
(0 %)		 432
(0.00 %)		 5,864
(100.00 %)		 4,126,248
(43.60 %)		 628,344
(15.71 %)		 11,100,962
(42.69 %)		 18
(0.00 %)		 1,888,430
(5.34 %)		 60,350
(1.67 %)		 30,970
(1.18 %)
28 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1		 n/a n/a 16,911
(1.23 %)		 21,107
(1.43 %)		 n/a 44.43
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 375
(0.00 %)		 6,123
(100.00 %)		 1,808,768
(10.42 %)		 561,106
(21.05 %)		 10,283,513
(45.97 %)		 16
(0.00 %)		 2,348,969
(6.68 %)		 54,919
(1.33 %)		 26,689
(0.79 %)
29 American pika 3.0 (2012 Broad refseq)
GCF_000292845.1		 26,253
(1.93 %)		 n/a 17,576
(1.61 %)		 20,076
(1.70 %)		 n/a 43.35
(87.20 %)		 122,542
(12.82 %)		 122,542
(12.82 %)		 132,962
(87.18 %)		 2,761,257
(29.47 %)		 414,896
(1.07 %)		 10,968,698
(26.71 %)		 1,958
(0.04 %)		 269,478
(1.11 %)		 44,652
(1.14 %)		 26,757
(0.80 %)
30 American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020)
GCF_014633375.1		 31,887
(1.92 %)		 n/a 17,532
(1.60 %)		 19,609
(1.65 %)		 n/a 43.35
(87.14 %)		 0
(0 %)		 124,941
(12.88 %)		 9,351
(100.00 %)		 2,827,662
(29.77 %)		 414,980
(1.07 %)		 10,969,165
(26.69 %)		 1,976
(0.04 %)		 271,948
(1.12 %)		 44,743
(1.13 %)		 26,798
(0.80 %)
31 Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq)
GCF_000464555.1		 33,681
(2.23 %)		 n/a 17,929
(1.49 %)		 15,090
(1.29 %)		 n/a 41.40
(97.59 %)		 155,553
(2.44 %)		 155,553
(2.44 %)		 157,032
(97.56 %)		 n/a 831,136
(1.67 %)		 13,654,437
(31.78 %)		 59
(0.00 %)		 289,892
(0.97 %)		 65,229
(1.60 %)		 56,194
(1.22 %)
32 Antarctic minke whale
GCA_000978805.1		 n/a n/a 23,312
(1.49 %)		 45,535
(1.26 %)		 n/a 40.73
(99.37 %)		 299,456
(0.64 %)		 299,456
(0.64 %)		 720,900
(99.36 %)		 4,011,313
(41.13 %)		 504,837
(1.04 %)		 13,553,641
(30.96 %)		 200
(0.00 %)		 66,191
(0.20 %)		 56,223
(1.31 %)		 44,709
(1.10 %)
33 Antillean ghost-faced bat
GCA_004026545.1		 n/a n/a 20,088
(1.74 %)		 31,558
(1.63 %)		 n/a 41.74
(99.97 %)		 1,835
(0.01 %)		 1,835
(0.01 %)		 207,094
(99.99 %)		 3,025,044
(30.67 %)		 332,606
(0.70 %)		 12,504,556
(28.79 %)		 7
(0.00 %)		 n/a 65,503
(2.30 %)		 62,089
(2.01 %)
34 aoudad
GCA_002201775.1		 n/a n/a 19,905
(1.62 %)		 27,488
(1.60 %)		 n/a 42.01
(95.96 %)		 186,672
(4.05 %)		 186,672
(4.05 %)		 263,992
(95.95 %)		 5,418,013
(45.05 %)		 471,426
(1.19 %)		 13,396,252
(36.94 %)		 4,983
(0.03 %)		 648,031
(1.83 %)		 48,844
(1.32 %)		 44,082
(1.20 %)
35 Arabian camel (Drom800 2019 refseq)
GCF_000803125.2		 64,519
(3.85 %)		 n/a 18,483
(1.89 %)		 20,554
(1.62 %)		 n/a 41.51
(99.22 %)		 0
(0 %)		 47,342
(0.79 %)		 21,070
(100.00 %)		 3,233,022
(34.07 %)		 345,049
(1.55 %)		 13,383,050
(26.19 %)		 87
(0.01 %)		 348,169
(1.51 %)		 58,872
(1.79 %)		 54,784
(1.59 %)
36 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1		 n/a n/a 17,085
(1.73 %)		 19,317
(1.59 %)		 n/a 41.75
(100.00 %)		 0
(0 %)		 210
(0.00 %)		 173
(100.00 %)		 2,818,446
(29.44 %)		 316,646
(8.90 %)		 11,192,133
(31.47 %)		 1
(0.00 %)		 1,151,809
(3.75 %)		 52,135
(1.67 %)		 44,943
(1.23 %)
37 Arabian camel (mCamDro1 2024)
GCF_036321535.1		 62,940
(3.46 %)		 n/a 18,078
(1.66 %)		 21,071
(1.56 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 0
(0 %)		 195
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 3,040,467
(29.22 %)		 343,480
(10.93 %)		 11,796,955
(33.50 %)		 2
(0.00 %)		 1,611,842
(4.73 %)		 55,427
(1.61 %)		 47,478
(1.18 %)
38 Arabian camel (paternal 2024)
GCA_036321535.1		 n/a n/a 18,080
(1.66 %)		 20,345
(1.52 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 0
(0 %)		 195
(0.00 %)		 172
(100.00 %)		 3,040,473
(29.22 %)		 343,482
(10.93 %)		 11,797,012
(33.50 %)		 2
(0.00 %)		 1,611,842
(4.73 %)		 55,428
(1.61 %)		 47,478
(1.18 %)
39 Arctic fox (Blue_001 2021 refseq)
GCF_018345385.1		 60,759
(3.11 %)		 n/a 19,942
(1.72 %)		 19,529
(1.38 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 529
(0.00 %)		 929
(100.00 %)		 4,821,229
(41.22 %)		 1,006,124
(2.31 %)		 13,556,149
(32.92 %)		 1
(0.00 %)		 686,539
(2.19 %)		 49,997
(2.23 %)		 50,342
(1.99 %)
40 Arctic ground squirrel
GCF_003426925.1		 39,569
(2.25 %)		 n/a 18,954
(1.74 %)		 19,372
(1.45 %)		 n/a 39.95
(89.51 %)		 0
(0 %)		 2,429,461
(10.59 %)		 15,883
(100.00 %)		 4,400,304
(32.67 %)		 672,831
(1.50 %)		 13,913,477
(26.41 %)		 1,383
(0.11 %)		 167,257
(0.60 %)		 27,575
(0.72 %)		 26,295
(0.67 %)
41 Asian palm civet
GCA_004024585.1		 n/a n/a 22,124
(1.43 %)		 43,710
(1.39 %)		 n/a 42.52
(99.95 %)		 4,533
(0.02 %)		 4,533
(0.02 %)		 442,658
(99.98 %)		 4,877,367
(40.32 %)		 754,440
(1.35 %)		 14,557,779
(32.29 %)		 38
(0.00 %)		 163,468
(0.41 %)		 148,246
(5.67 %)		 137,633
(4.25 %)
42 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1		 n/a n/a 17,906
(1.18 %)		 21,966
(1.14 %)		 n/a 41.14
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 6,361
(100.00 %)		 3,818,524
(29.72 %)		 533,426
(3.22 %)		 14,381,781
(47.30 %)		 0
(0 %)		 613,432
(1.61 %)		 50,264
(1.15 %)		 21,331
(0.51 %)
43 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1		 61,202
(2.60 %)		 n/a 18,887
(1.13 %)		 21,194
(1.06 %)		 n/a 41.14
(99.90 %)		 0
(0 %)		 126
(0.10 %)		 64
(100.00 %)		 4,358,470
(31.27 %)		 663,094
(4.56 %)		 16,261,778
(48.66 %)		 1
(0.00 %)		 851,540
(1.93 %)		 69,120
(1.32 %)		 23,319
(0.49 %)
44 Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020)
GCA_014523465.1		 n/a n/a 19,569
(1.59 %)		 21,293
(1.35 %)		 n/a 41.97
(99.68 %)		 0
(0 %)		 257
(0.32 %)		 128
(100.00 %)		 5,390,761
(47.15 %)		 451,837
(1.15 %)		 13,157,608
(40.67 %)		 0
(0 %)		 983,804
(2.72 %)		 44,158
(1.19 %)		 39,278
(1.06 %)
45 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1		 n/a n/a 18,969
(1.75 %)		 20,207
(1.36 %)		 n/a 41.25
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 79
(0.00 %)		 262
(100.00 %)		 3,650,963
(38.06 %)		 355,322
(2.63 %)		 14,837,952
(31.37 %)		 1
(0.00 %)		 267,829
(0.92 %)		 37,174
(1.87 %)		 37,977
(1.58 %)
46 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1		 n/a n/a 18,931
(1.76 %)		 19,988
(1.37 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 0
(0 %)		 92
(0.00 %)		 193
(100.00 %)		 3,632,286
(38.21 %)		 350,074
(2.22 %)		 14,785,531
(30.90 %)		 1
(0.00 %)		 254,432
(0.91 %)		 36,699
(1.70 %)		 36,659
(1.49 %)
47 ass (Dezhou 2021)
GCF_016077325.2		 84,046
(4.01 %)		 n/a 18,838
(1.75 %)		 20,239
(1.42 %)		 69,689
(3.29 %)		 41.42
(99.86 %)		 0
(0 %)		 1,922
(0.15 %)		 50
(100.00 %)		 3,840,509
(41.57 %)		 319,943
(0.81 %)		 14,889,114
(29.46 %)		 1
(0.00 %)		 180,097
(0.75 %)		 41,082
(1.37 %)		 38,212
(1.20 %)
48 ass (Maral har 2015 refseq)
GCF_001305755.1		 48,989
(3.12 %)		 n/a 18,838
(1.78 %)		 19,295
(1.44 %)		 n/a 41.28
(98.63 %)		 0
(0 %)		 69,593
(1.38 %)		 2,167
(100.00 %)		 3,731,432
(40.84 %)		 289,737
(0.96 %)		 14,695,308
(28.58 %)		 5,680
(0.23 %)		 136,343
(0.85 %)		 40,025
(1.06 %)		 36,660
(0.92 %)
49 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024)
GCA_964270905.1		 n/a n/a 18,773
(1.50 %)		 21,069
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 1
(0.00 %)		 1,034
(0.01 %)		 900
(100.00 %)		 3,975,427
(35.64 %)		 1,054,000
(10.27 %)		 12,281,095
(41.92 %)		 6
(0.00 %)		 2,009,438
(5.51 %)		 79,762
(4.08 %)		 42,028
(1.04 %)
50 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024)
GCA_964270935.1		 n/a n/a 17,961
(1.59 %)		 20,087
(1.36 %)		 n/a 42.05
(99.99 %)		 917
(0.01 %)		 917
(0.01 %)		 1,796
(99.99 %)		 3,626,392
(35.51 %)		 824,778
(7.32 %)		 11,499,904
(39.18 %)		 3
(0.00 %)		 1,314,679
(4.17 %)		 74,348
(3.46 %)		 40,100
(1.09 %)
51 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1		 n/a n/a 13,505
(1.03 %)		 18,978
(1.47 %)		 n/a 45.32
(99.98 %)		 0
(0 %)		 26
(0.02 %)		 3,482
(100.00 %)		 6,880,857
(41.88 %)		 1,099,932
(7.47 %)		 8,156,735
(56.68 %)		 0
(0 %)		 4,129,545
(10.90 %)		 70,515
(2.88 %)		 41,464
(1.12 %)
52 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1		 42,938
(2.28 %)		 n/a 14,891
(1.01 %)		 19,714
(1.45 %)		 n/a 45.30
(98.61 %)		 0
(0 %)		 524
(1.39 %)		 310
(100.00 %)		 7,814,876
(42.89 %)		 1,219,764
(6.93 %)		 9,488,325
(55.68 %)		 1
(0.00 %)		 4,597,115
(10.42 %)		 78,364
(2.73 %)		 45,620
(1.05 %)
53 Bactrian camel (Alxa 2014 refseq)
GCF_000767855.1		 52,178
(3.64 %)		 n/a 18,303
(1.98 %)		 17,097
(1.64 %)		 n/a 41.32
(99.32 %)		 31,980
(0.69 %)		 31,980
(0.69 %)		 67,435
(99.31 %)		 2,966,704
(34.06 %)		 306,997
(0.95 %)		 12,209,949
(25.43 %)		 58
(0.01 %)		 73,573
(0.41 %)		 49,790
(1.25 %)		 45,376
(1.09 %)
54 banded mongoose
GCA_004023785.1		 n/a n/a 21,568
(1.57 %)		 30,427
(1.43 %)		 n/a 42.00
(99.96 %)		 4,510
(0.02 %)		 4,510
(0.02 %)		 316,874
(99.98 %)		 4,768,524
(40.51 %)		 684,187
(1.30 %)		 13,713,756
(33.42 %)		 6
(0.00 %)		 227,084
(0.54 %)		 78,648
(2.80 %)		 76,038
(2.38 %)
55 bank vole
GCF_902806735.1		 56,410
(2.99 %)		 n/a 18,977
(1.71 %)		 18,408
(1.50 %)		 n/a 41.86
(98.62 %)		 53,506
(1.39 %)		 53,506
(1.39 %)		 54,142
(98.61 %)		 3,222,366
(21.59 %)		 933,697
(2.20 %)		 12,831,232
(31.50 %)		 4,497
(0.04 %)		 287,292
(0.90 %)		 18,784
(0.42 %)		 16,451
(0.36 %)
56 banner-tailed kangaroo rat
GCF_019054845.1		 43,753
(1.82 %)		 n/a 18,397
(1.18 %)		 24,180
(1.39 %)		 n/a 40.83
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 2,026
(100.00 %)		 5,587,719
(30.97 %)		 1,363,513
(3.95 %)		 12,128,920
(48.74 %)		 0
(0 %)		 1,518,982
(3.07 %)		 36,371
(1.27 %)		 31,849
(0.74 %)
57 banteng 2023
GCF_032452875.1		 71,974
(3.56 %)		 n/a 19,305
(1.36 %)		 21,174
(1.20 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 0
(0 %)		 84
(0.00 %)		 1,518
(100.00 %)		 3,344,481
(20.63 %)		 1,039,571
(11.74 %)		 13,031,356
(47.36 %)		 1
(0.00 %)		 2,790,223
(5.90 %)		 73,031
(1.72 %)		 36,726
(0.78 %)
58 bats A.intermedius (hap1 2024)
GCA_038363145.1		 n/a n/a 18,022
(1.56 %)		 19,824
(1.51 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 0
(0 %)		 81
(0.00 %)		 419
(100.00 %)		 2,827,417
(26.82 %)		 371,479
(4.97 %)		 11,603,093
(34.64 %)		 1
(0.00 %)		 522,672
(1.87 %)		 71,574
(2.28 %)		 54,020
(1.50 %)
59 bats A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1		 n/a n/a 17,124
(1.63 %)		 18,342
(1.54 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 0
(0 %)		 56
(0.00 %)		 187
(100.00 %)		 2,597,378
(26.81 %)		 332,733
(4.43 %)		 10,957,327
(33.52 %)		 2
(0.00 %)		 406,013
(1.59 %)		 63,688
(2.22 %)		 49,331
(1.50 %)
60 beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020)
GCA_009917745.1		 n/a n/a 19,239
(1.79 %)		 22,513
(1.43 %)		 35,878
(1.82 %)		 41.25
(97.57 %)		 26,969
(2.43 %)		 27,070
(2.43 %)		 52,780
(97.57 %)		 4,021,599
(43.53 %)		 544,323
(1.08 %)		 12,738,162
(33.47 %)		 1,426
(0.06 %)		 346,086
(1.08 %)		 59,710
(1.51 %)		 43,139
(1.22 %)
61 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019)
GCF_002288925.2		 59,400
(3.08 %)		 n/a 18,667
(1.79 %)		 20,314
(1.43 %)		 n/a 41.24
(98.49 %)		 23,539
(1.52 %)		 24,414
(1.52 %)		 29,444
(98.48 %)		 4,001,248
(43.73 %)		 543,276
(1.11 %)		 12,802,735
(34.18 %)		 583
(0.02 %)		 388,902
(1.70 %)		 59,307
(1.53 %)		 42,900
(1.24 %)
62 big brown bat (BU_THK_EF1 2012)
GCF_000308155.1		 59,162
(3.17 %)		 n/a 18,334
(1.94 %)		 20,121
(1.78 %)		 n/a 42.93
(89.41 %)		 160,269
(10.62 %)		 160,269
(10.62 %)		 167,057
(89.38 %)		 2,842,065
(25.82 %)		 614,712
(1.89 %)		 10,407,733
(28.90 %)		 1,641
(0.04 %)		 222,087
(1.20 %)		 66,720
(2.99 %)		 60,637
(2.11 %)
63 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1		 46,266
(2.61 %)		 n/a 18,620
(1.80 %)		 21,271
(1.72 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 0
(0 %)		 75
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 3,041,145
(25.08 %)		 904,075
(3.80 %)		 10,530,666
(37.05 %)		 0
(0 %)		 647,994
(2.05 %)		 77,605
(3.68 %)		 62,105
(2.31 %)
64 bighorn sheep (Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.1		 75,387
(2.66 %)		 n/a 18,667
(1.37 %)		 20,248
(1.35 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 3
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 3,081,260
(20.10 %)		 796,298
(12.14 %)		 12,235,764
(46.75 %)		 0
(0 %)		 703,302
(1.83 %)		 50,538
(11.18 %)		 38,494
(0.86 %)
65 bighorn sheep (BS48 2019)
GCA_004026945.1		 n/a n/a 23,059
(1.34 %)		 36,486
(1.19 %)		 n/a 43.20
(99.90 %)		 9,412
(0.03 %)		 9,412
(0.03 %)		 1,057,548
(99.97 %)		 6,321,577
(50.75 %)		 716,846
(1.66 %)		 13,904,326
(44.98 %)		 63
(0.00 %)		 n/a 95,564
(1.72 %)		 50,916
(1.03 %)
66 bilby (mMagLag1 2024)
GCA_037893015.1		 n/a n/a 18,686
(0.72 %)		 17,238
(0.81 %)		 n/a 37.35
(99.66 %)		 0
(0 %)		 4,431
(0.34 %)		 609
(100.00 %)		 6,263,094
(27.34 %)		 2,223,995
(5.89 %)		 23,994,844
(43.69 %)		 70
(0.01 %)		 1,521,039
(3.02 %)		 51,039
(3.47 %)		 15,234
(0.24 %)
67 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024)
GCA_043290085.1		 n/a n/a 20,713
(0.64 %)		 21,469
(0.64 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 770
(0.00 %)		 470
(100.00 %)		 3,860,121
(14.52 %)		 1,230,113
(2.81 %)		 1,239
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 n/a 49,878
(0.73 %)		 48,556
(0.69 %)
68 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024)
GCA_043290065.1		 n/a n/a 19,814
(0.63 %)		 20,140
(0.63 %)		 n/a 41.82
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 723
(0.00 %)		 315
(100.00 %)		 3,657,357
(14.24 %)		 1,158,716
(2.84 %)		 22,924,986
(64.53 %)		 6
(0.00 %)		 n/a 46,774
(0.90 %)		 21,729
(0.30 %)
69 black flying fox
GCF_000325575.1		 46,978
(3.15 %)		 n/a 18,089
(2.00 %)		 20,668
(1.75 %)		 n/a 39.74
(97.93 %)		 104,566
(2.08 %)		 104,566
(2.08 %)		 170,164
(97.92 %)		 2,975,186
(34.05 %)		 481,859
(1.45 %)		 12,582,349
(26.52 %)		 97
(0.01 %)		 114,693
(0.91 %)		 62,483
(3.88 %)		 64,215
(2.93 %)
70 black rat
GCF_011064425.1		 39,601
(2.37 %)		 n/a 20,793
(1.98 %)		 17,944
(1.37 %)		 n/a 42.14
(99.98 %)		 0
(0 %)		 6,158
(0.02 %)		 2,173
(100.00 %)		 4,715,157
(41.57 %)		 1,432,294
(3.45 %)		 13,275,550
(32.36 %)		 20
(0.00 %)		 625,923
(1.66 %)		 18,055
(0.48 %)		 16,181
(0.43 %)
71 black rhinoceros (BS38 2019 Broad)
GCA_004027315.1		 n/a n/a 21,713
(1.32 %)		 32,731
(1.18 %)		 n/a 41.22
(99.85 %)		 7,256
(0.02 %)		 7,256
(0.02 %)		 2,029,914
(99.98 %)		 4,618,655
(36.76 %)		 618,834
(2.21 %)		 16,248,532
(40.32 %)		 32
(0.00 %)		 n/a 44,113
(0.97 %)		 35,130
(0.72 %)
72 black rhinoceros (mBicDic1 alternate hap 2021)
GCA_020826835.1		 n/a n/a 19,000
(1.37 %)		 22,547
(1.26 %)		 n/a 41.56
(99.97 %)		 0
(0 %)		 178
(0.03 %)		 1,199
(100.00 %)		 4,340,245
(37.22 %)		 564,468
(8.07 %)		 14,384,523
(40.40 %)		 0
(0 %)		 941,914
(2.51 %)		 44,971
(1.16 %)		 34,023
(0.74 %)
73 black rhinoceros (mBicDic1 primary hap 2021)
GCF_020826845.1		 56,255
(2.28 %)		 n/a 18,774
(1.38 %)		 22,348
(1.26 %)		 n/a 41.59
(99.95 %)		 0
(0 %)		 215
(0.05 %)		 1,076
(100.00 %)		 4,200,390
(36.22 %)		 548,030
(8.34 %)		 14,347,693
(40.14 %)		 2
(0.00 %)		 984,722
(2.61 %)		 43,525
(1.14 %)		 33,963
(0.76 %)
74 black-footed cat
GCA_004023925.1		 n/a n/a 22,895
(1.14 %)		 51,789
(1.13 %)		 n/a 41.92
(99.90 %)		 13,476
(0.06 %)		 13,476
(0.06 %)		 603,600
(99.94 %)		 5,261,265
(44.11 %)		 943,514
(1.77 %)		 13,681,435
(34.77 %)		 43
(0.00 %)		 262,081
(0.70 %)		 86,892
(2.23 %)		 62,055
(1.65 %)
75 black-footed ferret (SB6536 2022)
GCF_022355385.1		 56,402
(2.78 %)		 n/a 18,681
(1.55 %)		 20,685
(1.40 %)		 n/a 41.55
(96.71 %)		 0
(0 %)		 33,042
(3.30 %)		 20,575
(100.00 %)		 4,087,717
(30.94 %)		 695,805
(1.18 %)		 13,880,116
(32.08 %)		 890
(0.03 %)		 471,613
(1.24 %)		 54,060
(2.11 %)		 51,472
(1.69 %)
76 black-lipped pika
GCF_017591425.1		 46,297
(2.64 %)		 n/a 18,529
(1.63 %)		 23,458
(1.83 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 0
(0 %)		 54
(0.00 %)		 2,214
(100.00 %)		 1,843,705
(12.62 %)		 471,798
(2.76 %)		 11,394,992
(31.27 %)		 0
(0 %)		 530,175
(1.74 %)		 63,124
(1.85 %)		 31,410
(1.04 %)
77 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1		 n/a n/a 17,838
(1.54 %)		 21,389
(1.35 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,198
(100.00 %)		 3,542,727
(35.35 %)		 650,369
(8.86 %)		 10,971,320
(41.15 %)		 0
(0 %)		 1,286,122
(4.20 %)		 62,389
(1.68 %)		 34,595
(0.95 %)
78 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1		 47,540
(2.07 %)		 n/a 19,041
(1.52 %)		 20,766
(1.27 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 0
(0 %)		 97
(0.03 %)		 74
(100.00 %)		 3,964,038
(35.29 %)		 765,957
(8.74 %)		 12,128,229
(41.78 %)		 1
(0.00 %)		 1,795,618
(5.01 %)		 70,851
(1.80 %)		 37,949
(0.93 %)
79 blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019)
GCA_008658375.1		 n/a n/a 17,285
(1.80 %)		 21,295
(1.43 %)		 n/a 41.22
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 12,574
(100.00 %)		 3,196,354
(43.47 %)		 467,194
(1.26 %)		 10,176,588
(33.66 %)		 0
(0 %)		 306,308
(1.20 %)		 56,916
(1.85 %)		 39,871
(1.51 %)
80 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2		 n/a n/a 16,997
(1.82 %)		 20,609
(1.44 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(0.00 %)		 10,999
(100.00 %)		 3,126,800
(43.49 %)		 454,452
(1.23 %)		 9,916,868
(33.63 %)		 0
(0 %)		 296,938
(1.19 %)		 55,436
(1.85 %)		 38,786
(1.50 %)
81 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2		 58,750
(2.71 %)		 n/a 19,162
(1.80 %)		 20,576
(1.41 %)		 36,291
(1.99 %)		 40.88
(98.91 %)		 0
(0 %)		 886
(1.09 %)		 106
(100.00 %)		 3,986,870
(44.21 %)		 579,629
(1.22 %)		 12,858,384
(34.60 %)		 4
(0.00 %)		 422,171
(1.33 %)		 67,032
(1.73 %)		 46,602
(1.41 %)
82 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022)
GCA_022079275.1		 n/a n/a 24,877
(1.23 %)		 48,382
(1.39 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 4,716
(0.01 %)		 4,716
(0.01 %)		 72,827
(99.99 %)		 6,403,412
(33.31 %)		 1,269,531
(1.94 %)		 17,771,689
(33.82 %)		 79
(0.00 %)		 706,367
(3.07 %)		 100,915
(3.00 %)		 90,223
(2.05 %)
83 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022)
GCF_022079265.1		 45,362
(2.39 %)		 n/a 18,576
(1.65 %)		 20,510
(1.41 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 0
(0 %)		 24
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 4,970,082
(43.28 %)		 894,002
(1.80 %)		 13,648,384
(34.21 %)		 0
(0 %)		 602,631
(1.69 %)		 69,211
(2.68 %)		 63,384
(2.18 %)
84 boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023)
GCA_019903745.2		 n/a n/a 20,135
(1.60 %)		 22,598
(1.47 %)		 n/a 41.46
(96.98 %)		 0
(0 %)		 34,682
(3.03 %)		 12,266
(100.00 %)		 3,134,107
(24.41 %)		 394,920
(0.92 %)		 13,154,929
(36.43 %)		 3,241
(0.04 %)		 471,129
(1.38 %)		 48,826
(1.07 %)		 42,368
(0.88 %)
85 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022)
GCA_024803775.1		 n/a n/a 18,647
(0.96 %)		 23,998
(1.13 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 0
(0 %)		 124
(0.00 %)		 3,340
(100.00 %)		 3,775,862
(22.40 %)		 1,257,803
(21.71 %)		 9,347,543
(61.85 %)		 0
(0 %)		 9,701,648
(16.46 %)		 33,757
(1.35 %)		 24,065
(0.48 %)
86 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1		 n/a n/a 17,791
(1.12 %)		 22,667
(1.29 %)		 n/a 41.66
(100.00 %)		 106
(0.00 %)		 106
(0.00 %)		 2,898
(100.00 %)		 6,293,452
(41.30 %)		 1,076,688
(17.94 %)		 8,553,272
(57.13 %)		 1
(0.00 %)		 6,983,927
(14.02 %)		 31,102
(1.31 %)		 23,419
(0.57 %)
87 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1		 n/a n/a 18,247
(1.61 %)		 22,673
(1.83 %)		 n/a 41.12
(99.99 %)		 205
(0.00 %)		 775
(0.01 %)		 835
(100.00 %)		 2,918,285
(18.64 %)		 868,090
(5.77 %)		 9,427,604
(40.78 %)		 2
(0.00 %)		 1,601,923
(4.79 %)		 27,049
(1.25 %)		 22,545
(0.76 %)
88 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1		 n/a n/a 17,612
(1.68 %)		 22,099
(1.91 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 25
(0.00 %)		 541
(0.01 %)		 365
(100.00 %)		 2,748,918
(17.16 %)		 827,542
(4.51 %)		 8,832,809
(39.20 %)		 2
(0.00 %)		 1,074,853
(3.77 %)		 26,416
(1.35 %)		 22,242
(0.81 %)
89 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1		 n/a n/a 18,667
(1.46 %)		 20,817
(1.26 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 284
(0.00 %)		 903
(100.00 %)		 4,004,895
(35.23 %)		 925,158
(12.15 %)		 11,999,784
(42.65 %)		 3
(0.00 %)		 1,841,091
(5.04 %)		 63,428
(1.55 %)		 38,329
(0.93 %)
90 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1		 n/a n/a 17,954
(1.51 %)		 19,994
(1.30 %)		 n/a 42.02
(100.00 %)		 0
(0 %)		 240
(0.00 %)		 800
(100.00 %)		 3,723,164
(34.96 %)		 809,880
(11.02 %)		 11,359,211
(41.42 %)		 2
(0.00 %)		 1,554,419
(4.60 %)		 60,067
(1.55 %)		 36,564
(0.95 %)
91 Brandt's bat
GCF_000412655.1		 46,912
(2.84 %)		 n/a 19,267
(1.75 %)		 18,495
(1.62 %)		 n/a 42.59
(94.06 %)		 155,664
(5.95 %)		 155,664
(5.95 %)		 325,414
(94.05 %)		 2,897,662
(25.08 %)		 634,208
(3.20 %)		 11,323,618
(31.06 %)		 356
(0.04 %)		 n/a 66,749
(1.59 %)		 51,826
(1.12 %)
92 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1		 n/a n/a 19,039
(1.66 %)		 21,660
(1.59 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 0
(0 %)		 20
(0.00 %)		 148
(100.00 %)		 3,805,818
(31.80 %)		 640,446
(2.50 %)		 11,793,353
(36.15 %)		 1
(0.00 %)		 609,574
(1.94 %)		 68,896
(2.40 %)		 57,812
(1.49 %)
93 Brazilian guinea pig
GCA_000688575.1		 n/a n/a 16,531
(1.49 %)		 11,177
(1.44 %)		 n/a 39.81
(64.76 %)		 0
(0 %)		 2,565,595
(35.61 %)		 3,131
(100.00 %)		 2,529,479
(25.87 %)		 342,907
(0.66 %)		 10,719,517
(21.05 %)		 551
(0.01 %)		 218,010
(0.72 %)		 19,508
(0.31 %)		 9,721
(0.14 %)
94 Brazilian tapir
GCA_004025025.1		 n/a n/a 21,581
(1.61 %)		 30,818
(1.32 %)		 n/a 41.12
(99.93 %)		 2,273
(0.01 %)		 2,273
(0.01 %)		 805,779
(99.99 %)		 3,877,938
(38.36 %)		 344,032
(0.79 %)		 15,601,710
(32.81 %)		 14
(0.00 %)		 n/a 43,382
(1.17 %)		 39,596
(1.04 %)
95 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018)
GCF_003584765.2		 50,242
(2.92 %)		 n/a 18,811
(1.77 %)		 21,073
(1.52 %)		 n/a 41.84
(99.31 %)		 15,552
(0.70 %)		 17,380
(0.70 %)		 21,813
(99.30 %)		 4,201,043
(40.86 %)		 567,586
(1.23 %)		 13,807,211
(30.86 %)		 760
(0.01 %)		 325,785
(0.96 %)		 62,125
(1.80 %)		 56,227
(1.57 %)
96 brown bear (v2.0 North America Adak 2023)
GCF_023065955.2		 66,371
(4.20 %)		 n/a 18,615
(1.68 %)		 21,434
(1.53 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 0
(0 %)		 250
(0.00 %)		 362
(100.00 %)		 4,030,019
(33.22 %)		 630,008
(4.17 %)		 13,240,060
(32.92 %)		 1
(0.00 %)		 668,459
(2.28 %)		 64,814
(2.05 %)		 58,450
(1.77 %)
97 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1		 n/a n/a 19,138
(1.72 %)		 20,370
(1.54 %)		 n/a 43.08
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,237
(0.01 %)		 65
(100.00 %)		 3,201,470
(26.24 %)		 957,903
(4.27 %)		 10,687,995
(39.65 %)		 8
(0.00 %)		 881,577
(2.81 %)		 60,671
(2.39 %)		 52,889
(1.71 %)
98 brown-throated sloth
GCA_004027775.1		 n/a n/a 17,043
(1.21 %)		 37,090
(1.36 %)		 n/a 42.76
(99.76 %)		 462
(0.00 %)		 462
(0.00 %)		 1,772,267
(100.00 %)		 2,487,215
(36.18 %)		 316,812
(1.60 %)		 7,948,666
(37.96 %)		 5
(0.00 %)		 n/a 62,325
(2.36 %)		 46,228
(1.74 %)
99 cactus mouse (2023)
GCF_949786415.1		 47,524
(2.02 %)		 n/a 18,894
(1.46 %)		 20,159
(1.22 %)		 n/a 42.40
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,603
(0.02 %)		 4,297
(100.00 %)		 7,181,232
(52.75 %)		 1,247,378
(18.35 %)		 13,329,318
(43.03 %)		 32
(0.00 %)		 4,621,934
(9.77 %)		 19,540
(0.49 %)		 17,819
(0.43 %)
100 California mouse (IS 2022)
GCF_007827085.1		 62,274
(3.80 %)		 n/a 18,959
(1.75 %)		 19,378
(1.41 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 0
(0 %)		 547
(0.00 %)		 237
(100.00 %)		 5,970,582
(45.08 %)		 1,165,743
(3.67 %)		 13,734,349
(33.67 %)		 4
(0.00 %)		 738,622
(2.20 %)		 19,529
(0.58 %)		 17,949
(0.52 %)
101 California sea lion (alternate hap 2019)
GCA_009762295.1		 n/a n/a 18,348
(1.81 %)		 18,692
(1.47 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,093
(100.00 %)		 3,722,619
(42.89 %)		 488,086
(1.26 %)		 10,893,132
(33.14 %)		 0
(0 %)		 393,471
(1.40 %)		 44,449
(1.57 %)		 41,300
(1.38 %)
102 California sea lion (LMU 2018 refseq)
GCF_900631625.1		 69,240
(2.99 %)		 n/a 20,741
(1.78 %)		 20,298
(1.40 %)		 n/a 41.38
(99.81 %)		 0
(0 %)		 47,716
(0.20 %)		 10,423
(100.00 %)		 4,530,259
(43.28 %)		 573,086
(1.12 %)		 13,442,336
(33.58 %)		 9,701
(0.17 %)		 414,311
(1.26 %)		 50,583
(1.46 %)		 46,836
(1.28 %)
103 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2		 n/a n/a 18,319
(1.81 %)		 18,772
(1.48 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,096
(100.00 %)		 3,724,021
(42.91 %)		 488,356
(1.26 %)		 10,891,276
(33.15 %)		 0
(0 %)		 395,508
(1.40 %)		 44,467
(1.57 %)		 41,289
(1.38 %)
104 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2		 70,801
(3.05 %)		 n/a 20,915
(1.77 %)		 20,179
(1.40 %)		 44,926
(2.10 %)		 41.40
(99.23 %)		 0
(0 %)		 185
(0.77 %)		 47
(100.00 %)		 4,525,652
(43.65 %)		 590,246
(1.24 %)		 13,263,648
(33.76 %)		 2
(0.00 %)		 495,451
(1.44 %)		 51,899
(1.50 %)		 48,201
(1.32 %)
105 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023)
GCA_028537755.1		 n/a n/a 19,409
(1.86 %)		 20,578
(1.69 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 0
(0 %)		 43
(0.00 %)		 310
(100.00 %)		 3,161,054
(22.60 %)		 891,453
(5.62 %)		 11,087,206
(33.12 %)		 0
(0 %)		 957,188
(2.77 %)		 19,104
(0.65 %)		 16,548
(0.48 %)
106 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023)
GCA_028537955.1		 n/a n/a 19,681
(1.86 %)		 21,257
(1.62 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 0
(0 %)		 51
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 4,957,057
(42.33 %)		 943,226
(5.63 %)		 11,695,871
(33.83 %)		 0
(0 %)		 1,058,642
(2.90 %)		 20,062
(0.64 %)		 18,632
(0.53 %)
107 Canada lynx (alternate hap LIC74 2019)
GCA_007474575.1		 n/a n/a 12,029
(1.42 %)		 15,171
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(0.00 %)		 15,036
(100.00 %)		 2,937,491
(43.50 %)		 544,410
(1.76 %)		 7,641,565
(32.72 %)		 0
(0 %)		 294,221
(1.43 %)		 39,082
(2.44 %)		 34,616
(1.88 %)
108 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2		 n/a n/a 12,041
(1.42 %)		 15,226
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 5
(0.00 %)		 15,046
(100.00 %)		 2,939,291
(43.50 %)		 544,849
(1.76 %)		 7,650,345
(32.74 %)		 0
(0 %)		 294,817
(1.43 %)		 39,099
(2.44 %)		 34,631
(1.88 %)
109 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2		 50,142
(2.69 %)		 n/a 18,273
(1.65 %)		 19,264
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.88 %)		 0
(0 %)		 842
(0.12 %)		 54
(100.00 %)		 5,011,165
(43.72 %)		 904,525
(1.75 %)		 13,467,551
(34.19 %)		 0
(0 %)		 572,384
(1.64 %)		 66,799
(2.48 %)		 60,482
(2.02 %)
110 Cantor's roundleaf bat
GCA_004027415.1		 n/a n/a 23,788
(1.42 %)		 45,328
(1.68 %)		 38,254
(1.57 %)		 41.36
(99.91 %)		 6,366
(0.03 %)		 6,366
(0.03 %)		 846,566
(99.97 %)		 3,997,370
(31.48 %)		 775,742
(1.42 %)		 12,770,948
(33.45 %)		 57
(0.00 %)		 n/a 41,527
(1.41 %)		 30,440
(1.13 %)
111 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1		 25,406
(1.08 %)		 n/a 23,258
(1.07 %)		 24,266
(1.16 %)		 n/a 40.30
(86.29 %)		 279,394
(13.74 %)		 279,394
(13.74 %)		 288,162
(86.26 %)		 3,765,232
(16.90 %)		 604,351
(0.89 %)		 20,072,078
(42.36 %)		 1,643
(0.02 %)		 356,320
(0.77 %)		 25,977
(0.42 %)		 23,327
(0.35 %)
112 Cape golden mole (2012 Broad)
GCF_000296735.1		 25,323
(1.07 %)		 n/a 20,961
(1.07 %)		 21,723
(1.04 %)		 n/a 40.01
(79.93 %)		 370,844
(20.11 %)		 370,844
(20.11 %)		 391,344
(79.89 %)		 4,924,640
(21.03 %)		 500,830
(1.95 %)		 18,946,663
(41.18 %)		 3,416
(0.03 %)		 805,638
(1.24 %)		 21,186
(0.33 %)		 18,126
(0.27 %)
113 Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014)
GCA_000152225.2		 n/a n/a 18,455
(1.10 %)		 22,103
(1.12 %)		 n/a 41.00
(88.89 %)		 259,874
(11.14 %)		 259,879
(11.14 %)		 325,568
(88.86 %)		 6,210,235
(51.92 %)		 381,915
(1.06 %)		 20,080,212
(36.28 %)		 7,944
(0.20 %)		 267,970
(1.80 %)		 29,690
(0.50 %)		 26,217
(0.43 %)
114 Cape rock hyrax (US060 2019 Broad)
GCA_004026925.1		 n/a n/a 21,401
(0.85 %)		 45,353
(1.14 %)		 n/a 41.08
(99.93 %)		 4,203
(0.01 %)		 4,203
(0.01 %)		 1,048,940
(99.99 %)		 7,222,494
(54.48 %)		 430,286
(0.85 %)		 21,775,991
(44.61 %)		 44
(0.00 %)		 n/a 37,158
(0.70 %)		 31,196
(0.61 %)
115 capybara
GCA_004027455.1		 n/a n/a 20,152
(1.22 %)		 28,931
(1.29 %)		 n/a 39.76
(99.93 %)		 5,747
(0.02 %)		 5,747
(0.02 %)		 661,089
(99.98 %)		 4,220,878
(29.16 %)		 777,357
(2.04 %)		 15,214,944
(35.16 %)		 23
(0.00 %)		 n/a 34,558
(0.85 %)		 32,123
(0.72 %)
116 carabao (swamp buffalo K-KA32 2023)
GCF_029407905.1		 77,279
(2.89 %)		 n/a 19,433
(1.40 %)		 21,166
(1.23 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 0
(0 %)		 21
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 3,479,445
(21.92 %)		 547,054
(6.39 %)		 12,840,677
(45.22 %)		 0
(0 %)		 2,206,180
(5.44 %)		 99,752
(3.73 %)		 36,683
(0.81 %)
117 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA)
GCF_002263795.3		 77,927
(4.11 %)		 n/a 19,428
(1.48 %)		 22,236
(1.33 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 0
(0 %)		 386
(0.00 %)		 1,958
(100.00 %)		 3,449,588
(22.63 %)		 596,092
(3.13 %)		 12,785,607
(42.11 %)		 1
(0.00 %)		 1,626,342
(4.17 %)		 46,864
(1.37 %)		 37,742
(0.86 %)
118 cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014)
GCF_000003055.6		 57,977
(2.74 %)		 n/a 19,583
(1.56 %)		 20,581
(1.31 %)		 n/a 41.82
(99.23 %)		 72,454
(0.78 %)		 74,464
(0.78 %)		 75,598
(99.22 %)		 5,607,556
(49.02 %)		 440,521
(1.25 %)		 13,167,657
(40.78 %)		 789
(0.04 %)		 1,243,109
(3.73 %)		 42,869
(1.24 %)		 37,223
(0.90 %)
119 Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad)
GCA_004024745.2		 n/a n/a 18,603
(1.52 %)		 22,330
(1.36 %)		 n/a 42.35
(98.12 %)		 57,013
(1.80 %)		 57,013
(1.80 %)		 1,240,743
(98.20 %)		 5,255,211
(43.27 %)		 2,502,373
(4.37 %)		 12,968,788
(40.96 %)		 10,788
(0.55 %)		 n/a 172,178
(3.66 %)		 153,143
(3.23 %)
120 cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022)
GCF_027475565.1		 80,997
(4.53 %)		 n/a 18,420
(1.70 %)		 19,561
(1.40 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 0
(0 %)		 22
(0.00 %)		 195
(100.00 %)		 4,611,842
(35.10 %)		 837,685
(1.68 %)		 13,649,125
(33.06 %)		 0
(0 %)		 327,107
(0.89 %)		 60,367
(2.22 %)		 56,975
(1.91 %)
121 cheetah (Rico 2018)
GCF_003709585.1		 72,154
(3.33 %)		 n/a 18,472
(1.70 %)		 20,443
(1.42 %)		 n/a 41.55
(99.55 %)		 0
(0 %)		 24,173
(0.45 %)		 3,220
(100.00 %)		 4,853,945
(42.85 %)		 831,106
(1.53 %)		 13,663,571
(32.84 %)		 1,699
(0.02 %)		 283,401
(0.75 %)		 60,744
(2.17 %)		 55,562
(1.77 %)
122 Chinese forest musk deer (Sichuan 2022)
GCF_022376915.1		 51,612
(2.80 %)		 n/a 19,565
(1.43 %)		 22,280
(1.29 %)		 n/a 42.30
(99.97 %)		 0
(0 %)		 1,781
(0.03 %)		 2,446
(100.00 %)		 3,257,347
(21.65 %)		 399,120
(3.81 %)		 12,906,274
(43.79 %)		 0
(0 %)		 2,278,433
(5.31 %)		 46,689
(1.12 %)		 38,849
(0.85 %)
123 Chinese hamster (17A/GY CHO 2020)
GCF_003668045.3		 55,440
(2.79 %)		 n/a 20,030
(1.84 %)		 18,721
(1.41 %)		 67,900
(3.41 %)		 41.51
(99.90 %)		 0
(0 %)		 4,164
(0.10 %)		 647
(100.00 %)		 8,121,057
(33.74 %)		 1,095,058
(2.91 %)		 12,923,274
(32.25 %)		 17
(0.00 %)		 566,700
(1.72 %)		 19,341
(0.58 %)		 18,196
(0.52 %)
124 Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI)
GCF_000223135.1		 45,993
(2.59 %)		 n/a 20,602
(1.78 %)		 17,467
(1.35 %)		 n/a 41.37
(96.61 %)		 156,635
(3.40 %)		 156,635
(3.40 %)		 265,787
(96.60 %)		 4,541,936
(33.03 %)		 1,072,129
(2.66 %)		 13,150,189
(30.04 %)		 213
(0.02 %)		 n/a 12,522
(0.25 %)		 11,560
(0.23 %)
125 Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd)
GCA_900186095.1		 n/a n/a 19,874
(1.85 %)		 19,298
(1.44 %)		 n/a 41.45
(98.56 %)		 63,334
(1.45 %)		 63,334
(1.45 %)		 71,598
(98.55 %)		 4,521,726
(33.66 %)		 1,060,619
(2.55 %)		 12,867,288
(31.26 %)		 9,581
(0.18 %)		 445,818
(1.43 %)		 17,960
(0.54 %)		 17,137
(0.50 %)
126 Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022)
GCA_026545065.1		 n/a n/a 20,293
(1.81 %)		 18,881
(1.42 %)		 n/a 41.62
(71.16 %)		 924,541
(28.93 %)		 924,541
(28.93 %)		 1,236,122
(71.07 %)		 4,330,728
(30.92 %)		 987,319
(3.70 %)		 13,374,062
(21.92 %)		 817
(0.01 %)		 n/a 18,838
(0.40 %)		 17,349
(0.35 %)
127 Chinese pangolin (2020 Yunnan U)
GCF_014570555.1		 69,694
(3.21 %)		 n/a 18,206
(1.70 %)		 20,508
(1.48 %)		 n/a 40.79
(95.54 %)		 0
(0 %)		 34,903
(4.47 %)		 4,694
(100.00 %)		 2,927,176
(35.60 %)		 269,964
(0.67 %)		 12,610,535
(29.10 %)		 647
(0.02 %)		 253,501
(1.85 %)		 35,278
(1.05 %)		 33,613
(0.98 %)
128 Chinese pangolin (hap1 mManPen7 2023)
GCF_030020395.1		 71,445
(2.98 %)		 n/a 18,379
(1.34 %)		 21,837
(1.29 %)		 n/a 41.07
(99.77 %)		 0
(0 %)		 383
(0.23 %)		 661
(100.00 %)		 3,318,871
(34.65 %)		 618,193
(3.68 %)		 12,009,669
(39.02 %)		 8
(0.00 %)		 1,132,160
(3.87 %)		 47,708
(1.22 %)		 34,214
(0.79 %)
129 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1		 n/a n/a 18,538
(1.34 %)		 21,724
(1.27 %)		 n/a 41.09
(99.48 %)		 0
(0 %)		 190
(0.52 %)		 700
(100.00 %)		 3,362,899
(34.48 %)		 678,384
(4.11 %)		 12,024,241
(39.52 %)		 7
(0.00 %)		 1,198,886
(3.98 %)		 48,960
(1.19 %)		 34,434
(0.79 %)
130 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1		 n/a n/a 18,749
(1.63 %)		 22,506
(1.40 %)		 n/a 40.93
(90.69 %)		 138,158
(9.33 %)		 257,424
(9.33 %)		 230,927
(90.67 %)		 2,691,116
(34.48 %)		 316,518
(1.96 %)		 11,538,086
(25.40 %)		 37,129
(1.10 %)		 304,419
(2.99 %)		 30,693
(0.58 %)		 28,150
(0.52 %)
131 Chinese rufous horseshoe bat
GCA_001888835.1		 n/a n/a 26,871
(2.34 %)		 25,467
(1.89 %)		 n/a 40.52
(97.22 %)		 0
(0 %)		 212,601
(2.80 %)		 63,439
(100.00 %)		 3,219,611
(33.86 %)		 495,126
(1.20 %)		 12,476,551
(27.16 %)		 60
(0.00 %)		 103,290
(0.35 %)		 32,993
(0.98 %)		 31,139
(0.91 %)
132 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024)
GCA_036562045.1		 n/a n/a 17,893
(1.95 %)		 19,249
(1.60 %)		 n/a 40.47
(100.00 %)		 0
(0 %)		 286
(0.00 %)		 454
(100.00 %)		 3,055,304
(33.11 %)		 531,106
(1.34 %)		 11,858,144
(29.52 %)		 0
(0 %)		 158,830
(0.76 %)		 30,884
(1.08 %)		 29,146
(0.97 %)
133 Chinese tree shrew
GCF_000334495.1		 47,005
(2.07 %)		 n/a 21,375
(1.39 %)		 19,231
(1.28 %)		 n/a 41.73
(95.10 %)		 191,695
(4.92 %)		 191,695
(4.92 %)		 242,445
(95.08 %)		 5,060,321
(23.05 %)		 1,046,388
(4.15 %)		 14,978,259
(38.04 %)		 914
(0.08 %)		 803,568
(6.04 %)		 88,806
(1.44 %)		 55,240
(1.01 %)
134 chiru
GCA_000400835.1		 n/a n/a 20,320
(1.60 %)		 42,654
(2.51 %)		 n/a 42.01
(93.04 %)		 283,069
(7.00 %)		 283,069
(7.00 %)		 298,127
(93.00 %)		 5,342,241
(43.54 %)		 425,329
(1.25 %)		 13,714,420
(34.66 %)		 321
(0.03 %)		 521,516
(1.73 %)		 43,135
(1.89 %)		 39,020
(1.80 %)
135 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1		 n/a n/a 16,430
(1.52 %)		 21,057
(1.44 %)		 n/a 41.79
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 10,377
(100.00 %)		 3,845,437
(33.39 %)		 794,587
(2.14 %)		 10,765,695
(33.40 %)		 0
(0 %)		 461,307
(1.56 %)		 56,375
(2.45 %)		 47,473
(1.74 %)
136 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1		 81,219
(3.62 %)		 n/a 18,300
(1.65 %)		 20,361
(1.39 %)		 n/a 41.79
(99.94 %)		 0
(0 %)		 181
(0.06 %)		 33
(100.00 %)		 4,224,269
(34.84 %)		 992,668
(2.08 %)		 13,618,866
(34.42 %)		 3
(0.00 %)		 647,739
(1.89 %)		 67,830
(2.45 %)		 58,781
(1.98 %)
137 common bottlenose dolphin (maternal 2020)
GCA_011762535.1		 n/a n/a 18,837
(1.77 %)		 20,857
(1.43 %)		 n/a 41.43
(99.73 %)		 0
(0 %)		 649
(0.27 %)		 985
(100.00 %)		 4,073,893
(46.15 %)		 630,039
(2.15 %)		 12,628,219
(35.41 %)		 1
(0.00 %)		 705,496
(1.85 %)		 65,379
(1.89 %)		 42,994
(1.34 %)
138 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1		 67,207
(3.31 %)		 n/a 18,766
(1.77 %)		 20,528
(1.42 %)		 35,852
(1.58 %)		 41.44
(99.74 %)		 0
(0 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,069,115
(46.17 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,891
(35.29 %)		 1
(0.00 %)		 629,903
(1.85 %)		 65,551
(1.90 %)		 43,136
(1.35 %)
139 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq)
GCF_001922835.1		 45,975
(2.99 %)		 n/a 17,255
(1.69 %)		 17,058
(1.34 %)		 n/a 40.85
(99.45 %)		 0
(0 %)		 114,003
(0.57 %)		 2,648
(100.00 %)		 3,845,938
(43.89 %)		 514,631
(1.06 %)		 12,317,098
(32.18 %)		 466
(0.01 %)		 284,934
(0.89 %)		 48,030
(1.35 %)		 31,891
(1.03 %)
140 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1		 n/a n/a 18,537
(1.77 %)		 20,619
(1.44 %)		 n/a 41.42
(98.08 %)		 0
(0 %)		 868
(1.92 %)		 1,166
(100.00 %)		 3,997,801
(45.93 %)		 609,838
(1.85 %)		 12,400,272
(34.53 %)		 1
(0.00 %)		 649,569
(1.73 %)		 64,630
(1.84 %)		 42,623
(1.32 %)
141 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1		 n/a n/a 14,863
(0.75 %)		 15,426
(0.89 %)		 n/a 39.41
(100.00 %)		 313
(0.00 %)		 313
(0.00 %)		 12,446
(100.00 %)		 5,846,769
(38.56 %)		 987,917
(1.99 %)		 16,764,356
(40.14 %)		 0
(0 %)		 345,940
(1.13 %)		 13,303
(0.35 %)		 10,338
(0.23 %)
142 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1		 37,674
(1.80 %)		 n/a 18,653
(0.80 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 0
(0 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,116
(38.90 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,306
(40.56 %)		 0
(0 %)		 455,717
(1.17 %)		 17,762
(0.38 %)		 13,986
(0.24 %)
143 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1		 n/a n/a 17,216
(1.82 %)		 19,202
(1.79 %)		 n/a 42.55
(99.97 %)		 0
(0 %)		 1,546
(0.03 %)		 323
(100.00 %)		 2,953,532
(23.94 %)		 805,142
(2.83 %)		 9,964,846
(34.69 %)		 0
(0 %)		 446,836
(1.61 %)		 57,295
(2.83 %)		 54,882
(1.90 %)
144 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1		 n/a n/a 15,974
(1.72 %)		 20,563
(1.66 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 12
(0.00 %)		 10,459
(100.00 %)		 2,634,333
(23.76 %)		 703,674
(2.65 %)		 8,909,525
(33.95 %)		 0
(0 %)		 343,235
(1.37 %)		 50,430
(2.54 %)		 45,982
(1.75 %)
145 common pipistrelle (Broad 2019)
GCA_004026625.1		 n/a n/a 21,938
(1.35 %)		 53,915
(1.60 %)		 n/a 42.88
(99.88 %)		 10,870
(0.05 %)		 10,870
(0.05 %)		 736,974
(99.95 %)		 3,499,501
(22.91 %)		 1,046,301
(2.96 %)		 11,759,516
(37.96 %)		 17
(0.00 %)		 n/a 92,062
(3.23 %)		 75,629
(2.04 %)
146 common vampire bat (HL8 alternate hap 2022)
GCA_022682395.1		 n/a n/a 17,520
(1.75 %)		 18,995
(1.67 %)		 n/a 42.89
(99.99 %)		 0
(0 %)		 580
(0.01 %)		 430
(100.00 %)		 2,597,497
(28.17 %)		 356,620
(2.88 %)		 10,797,225
(31.23 %)		 25
(0.00 %)		 271,481
(1.34 %)		 61,931
(2.30 %)		 43,396
(1.30 %)
147 common vampire bat (HL8 alternate hap 2022)
GCA_022682395.2		 n/a n/a 17,485
(1.76 %)		 18,907
(1.66 %)		 n/a 42.87
(99.99 %)		 0
(0 %)		 576
(0.01 %)		 429
(100.00 %)		 2,592,246
(28.20 %)		 352,985
(2.87 %)		 10,737,944
(31.11 %)		 25
(0.00 %)		 264,293
(1.29 %)		 61,125
(2.28 %)		 42,729
(1.28 %)
148 common vampire bat (HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.1		 58,054
(3.40 %)		 n/a 18,280
(1.71 %)		 19,515
(1.59 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 0
(0 %)		 611
(0.01 %)		 573
(100.00 %)		 2,761,826
(28.38 %)		 427,942
(3.89 %)		 11,250,529
(32.57 %)		 37
(0.00 %)		 360,489
(1.62 %)		 70,701
(2.48 %)		 44,289
(1.24 %)
149 common vampire bat (HL8 primary hap 2022)
GCA_022682495.2		 n/a n/a 18,311
(1.71 %)		 19,456
(1.59 %)		 n/a 42.99
(99.99 %)		 0
(0 %)		 615
(0.01 %)		 573
(100.00 %)		 2,767,071
(28.35 %)		 431,575
(3.90 %)		 11,286,853
(32.63 %)		 37
(0.00 %)		 330,061
(1.50 %)		 71,506
(2.50 %)		 45,001
(1.26 %)
150 common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018)
GCF_002940915.2		 51,031
(3.24 %)		 n/a 18,503
(1.88 %)		 18,071
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,246
(2.23 %)		 54,246
(2.23 %)		 83,364
(97.77 %)		 2,799,509
(29.62 %)		 275,242
(1.03 %)		 11,796,826
(28.19 %)		 237
(0.03 %)		 174,535
(2.84 %)		 51,634
(1.37 %)		 47,271
(1.22 %)
151 common warthog (WHEZ1 2021)
GCF_016906955.1		 55,088
(2.64 %)		 n/a 18,264
(1.56 %)		 19,251
(1.34 %)		 54,816
(2.83 %)		 41.95
(99.61 %)		 0
(0 %)		 523
(0.39 %)		 194
(100.00 %)		 3,898,243
(30.33 %)		 588,742
(1.17 %)		 12,955,929
(36.44 %)		 1
(0.00 %)		 519,262
(1.56 %)		 75,592
(1.86 %)		 45,338
(1.21 %)
152 common wombat
GCF_900497805.2		 46,365
(1.78 %)		 n/a 19,437
(0.86 %)		 18,947
(0.96 %)		 n/a 38.86
(99.68 %)		 0
(0 %)		 67,461
(0.33 %)		 14,183
(100.00 %)		 8,645,969
(41.99 %)		 1,203,246
(1.61 %)		 23,878,215
(39.11 %)		 3,092
(0.01 %)		 284,840
(0.59 %)		 18,752
(0.37 %)		 17,700
(0.31 %)
153 Corsac fox (zsh2022 2023)
GCA_030463245.1		 n/a n/a 19,527
(1.61 %)		 18,923
(1.35 %)		 n/a 41.24
(100.00 %)		 0
(0 %)		 107
(0.00 %)		 202
(100.00 %)		 4,435,406
(32.05 %)		 981,019
(1.98 %)		 13,673,245
(32.65 %)		 0
(0 %)		 644,894
(1.63 %)		 49,252
(2.20 %)		 46,666
(1.57 %)
154 coyote (coyote_06102 2023)
GCA_034620425.1		 n/a n/a 19,251
(1.60 %)		 19,585
(1.40 %)		 n/a 41.18
(100.00 %)		 0
(0 %)		 93
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 4,493,000
(32.28 %)		 982,814
(2.01 %)		 13,803,318
(33.09 %)		 0
(0 %)		 634,473
(1.64 %)		 50,777
(2.23 %)		 47,871
(1.58 %)
155 creeping vole
GCF_018167655.1		 54,941
(2.31 %)		 n/a 23,033
(1.55 %)		 25,427
(1.53 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 2,147
(100.00 %)		 4,549,519
(25.66 %)		 1,153,429
(13.60 %)		 13,568,297
(40.65 %)		 0
(0 %)		 3,223,361
(6.77 %)		 23,141
(0.54 %)		 19,563
(0.42 %)
156 crested porcupine
GCA_004026905.1		 n/a n/a 21,005
(1.32 %)		 35,975
(1.39 %)		 n/a 41.51
(99.89 %)		 4,351
(0.02 %)		 4,351
(0.02 %)		 1,140,949
(99.98 %)		 4,303,147
(30.69 %)		 600,488
(1.19 %)		 14,049,490
(33.80 %)		 35
(0.00 %)		 n/a 57,196
(1.33 %)		 41,516
(0.95 %)
157 Cuvier's beaked whale
GCA_004364475.1		 n/a n/a 23,700
(0.90 %)		 51,715
(0.86 %)		 n/a 42.01
(99.76 %)		 3,229
(0.01 %)		 3,229
(0.01 %)		 3,761,505
(99.99 %)		 6,544,424
(43.61 %)		 1,417,186
(3.11 %)		 16,127,873
(42.25 %)		 43
(0.00 %)		 n/a 68,668
(1.15 %)		 53,793
(0.96 %)
158 Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI)
GCF_000743615.1		 52,373
(2.57 %)		 n/a 17,983
(1.45 %)		 17,063
(1.43 %)		 n/a 40.34
(97.96 %)		 87,815
(2.05 %)		 87,815
(2.05 %)		 162,545
(97.95 %)		 4,053,433
(30.86 %)		 545,281
(1.74 %)		 13,406,483
(30.65 %)		 793
(0.06 %)		 243,492
(1.42 %)		 37,008
(0.74 %)		 33,397
(0.64 %)
159 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo)
GCF_012274545.1		 58,091
(2.74 %)		 n/a 17,780
(1.44 %)		 16,515
(1.42 %)		 n/a 40.34
(97.94 %)		 0
(0 %)		 88,899
(2.07 %)		 73,970
(100.00 %)		 4,035,140
(30.95 %)		 544,772
(1.73 %)		 13,390,872
(30.61 %)		 838
(0.06 %)		 245,667
(1.44 %)		 37,008
(0.74 %)		 33,408
(0.64 %)
160 dassie-rat
GCA_004026965.1		 n/a n/a 20,479
(1.16 %)		 42,937
(1.41 %)		 n/a 41.86
(99.89 %)		 9,645
(0.04 %)		 9,645
(0.04 %)		 920,324
(99.96 %)		 4,563,054
(28.83 %)		 660,623
(1.92 %)		 12,899,807
(34.48 %)		 14
(0.00 %)		 n/a 46,569
(1.25 %)		 40,791
(1.01 %)
161 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1		 n/a n/a 18,895
(1.78 %)		 24,235
(1.81 %)		 n/a 43.39
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 4,930
(100.00 %)		 2,813,870
(23.75 %)		 718,406
(5.18 %)		 9,977,320
(37.24 %)		 0
(0 %)		 609,378
(2.37 %)		 62,910
(2.66 %)		 55,962
(1.97 %)
162 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1		 64,558
(3.32 %)		 n/a 19,141
(1.72 %)		 22,133
(1.66 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,099
(0.01 %)		 121
(100.00 %)		 3,040,232
(24.03 %)		 796,911
(6.38 %)		 10,478,180
(38.84 %)		 9
(0.00 %)		 756,429
(2.76 %)		 64,920
(2.51 %)		 57,806
(1.88 %)
163 Daurian ground squirrel
GCA_002406435.1		 n/a n/a 20,990
(1.31 %)		 17,575
(1.17 %)		 n/a 39.77
(96.15 %)		 141,850
(3.84 %)		 141,850
(3.84 %)		 502,654
(96.16 %)		 5,783,538
(34.36 %)		 924,038
(3.73 %)		 17,533,301
(30.85 %)		 318
(0.01 %)		 1,230,179
(17.33 %)		 27,955
(0.39 %)		 26,034
(0.36 %)
164 David's myotis bat
GCF_000327345.1		 37,645
(2.70 %)		 n/a 18,744
(1.78 %)		 17,565
(1.62 %)		 n/a 42.69
(91.23 %)		 223,511
(8.80 %)		 223,511
(8.80 %)		 325,280
(91.20 %)		 2,680,166
(23.79 %)		 532,273
(1.90 %)		 11,016,028
(29.55 %)		 303
(0.05 %)		 n/a 59,615
(1.59 %)		 49,977
(1.17 %)
165 degu (3935 2012 refseq)
GCF_000260255.1		 48,152
(2.13 %)		 n/a 22,242
(1.41 %)		 22,101
(1.46 %)		 n/a 41.38
(84.36 %)		 252,770
(15.68 %)		 252,772
(15.68 %)		 259,904
(84.32 %)		 4,901,673
(27.74 %)		 898,945
(1.50 %)		 14,282,003
(29.30 %)		 2,582
(0.03 %)		 313,028
(1.02 %)		 40,135
(0.82 %)		 36,410
(0.69 %)
166 desert hamster (2022)
GCF_943737965.1		 37,279
(2.11 %)		 n/a 19,744
(1.74 %)		 20,215
(1.50 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 2,079
(100.00 %)		 4,038,079
(31.01 %)		 1,132,871
(2.71 %)		 11,946,112
(32.62 %)		 0
(0 %)		 618,568
(1.94 %)		 17,053
(0.51 %)		 15,416
(0.41 %)
167 Desmarest's hutia
GCA_004027915.1		 n/a n/a 23,535
(0.78 %)		 50,796
(0.95 %)		 n/a 42.03
(99.83 %)		 3,492
(0.01 %)		 3,492
(0.01 %)		 2,355,850
(99.99 %)		 5,790,506
(26.72 %)		 1,062,134
(1.71 %)		 16,977,224
(35.29 %)		 16
(0.00 %)		 n/a 54,479
(1.01 %)		 46,753
(0.82 %)
168 dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW)
GCF_012295265.1		 102,060
(4.04 %)		 n/a 19,777
(1.69 %)		 20,341
(1.41 %)		 n/a 41.29
(99.69 %)		 0
(0 %)		 325
(0.31 %)		 477
(100.00 %)		 4,950,808
(42.83 %)		 1,033,921
(2.36 %)		 13,745,703
(33.32 %)		 0
(0 %)		 820,425
(2.05 %)		 51,835
(2.25 %)		 47,504
(1.92 %)
169 dingo (Sandy 2020 James Cook U)
GCF_003254725.2		 104,332
(4.50 %)		 n/a 19,710
(1.72 %)		 19,857
(1.42 %)		 n/a 41.24
(100.00 %)		 0
(0 %)		 69
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 4,547,906
(33.32 %)		 993,474
(2.19 %)		 13,701,060
(33.18 %)		 0
(0 %)		 716,455
(1.82 %)		 51,216
(2.28 %)		 51,748
(2.14 %)
170 dog (Basenji MU ID 185726 2019)
GCA_004886185.2		 n/a n/a 19,889
(1.67 %)		 20,501
(1.39 %)		 n/a 41.36
(99.99 %)		 1,387
(0.01 %)		 1,388
(0.01 %)		 3,630
(99.99 %)		 4,950,227
(43.32 %)		 1,059,639
(2.97 %)		 13,694,849
(33.70 %)		 3
(0.00 %)		 1,006,008
(2.40 %)		 51,443
(2.16 %)		 47,254
(1.90 %)
171 dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021)
GCA_013276365.2		 n/a n/a 19,310
(1.60 %)		 19,947
(1.42 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 0
(0 %)		 149
(0.00 %)		 631
(100.00 %)		 4,452,916
(32.14 %)		 960,590
(2.23 %)		 13,685,353
(33.01 %)		 0
(0 %)		 644,106
(1.68 %)		 50,715
(2.22 %)		 47,698
(1.58 %)
172 dog (Bernese Mountain Dog BD 2023)
GCA_031010765.1		 n/a n/a 19,211
(1.60 %)		 20,327
(1.44 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 0
(0 %)		 641
(0.00 %)		 175
(100.00 %)		 4,471,016
(32.18 %)		 984,776
(2.03 %)		 13,719,474
(32.88 %)		 0
(0 %)		 644,486
(1.60 %)		 51,050
(2.25 %)		 47,721
(1.59 %)
173 dog (Bernese Mountain Dog OD 2023)
GCA_031010635.1		 n/a n/a 19,279
(1.60 %)		 20,348
(1.44 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 0
(0 %)		 1,015
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 4,491,081
(32.21 %)		 996,142
(2.01 %)		 13,761,195
(32.97 %)		 0
(0 %)		 645,724
(1.69 %)		 51,490
(2.25 %)		 48,166
(1.60 %)
174 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3		 82,549
(3.63 %)		 n/a 19,772
(1.66 %)		 19,565
(1.39 %)		 n/a 41.31
(99.25 %)		 23,876
(0.76 %)		 23,876
(0.76 %)		 27,106
(99.24 %)		 4,918,098
(43.29 %)		 991,835
(2.81 %)		 13,644,959
(33.60 %)		 34
(0.00 %)		 971,687
(2.39 %)		 53,269
(2.07 %)		 48,154
(1.73 %)
175 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5		 93,774
(3.84 %)		 n/a 19,392
(1.71 %)		 19,572
(1.42 %)		 52,141
(3.27 %)		 41.26
(100.00 %)		 0
(0 %)		 1,028
(0.00 %)		 147
(100.00 %)		 23,927,903
(42.42 %)		 972,851
(2.05 %)		 13,611,845
(33.11 %)		 0
(0 %)		 657,594
(1.69 %)		 50,679
(2.26 %)		 46,402
(1.93 %)
176 dog (Cairn Terrier CA611 2023)
GCA_031010295.1		 n/a n/a 19,255
(1.61 %)		 20,479
(1.45 %)		 n/a 41.19
(100.00 %)		 0
(0 %)		 262
(0.00 %)		 141
(100.00 %)		 4,490,019
(32.25 %)		 989,383
(1.99 %)		 13,710,808
(32.97 %)		 0
(0 %)		 634,521
(1.63 %)		 50,883
(2.22 %)		 47,572
(1.58 %)
177 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1		 96,734
(3.71 %)		 n/a 20,135
(1.64 %)		 20,871
(1.38 %)		 56,772
(3.19 %)		 41.50
(100.00 %)		 585
(0.00 %)		 585
(0.00 %)		 2,782
(100.00 %)		 20,264,827
(43.87 %)		 1,152,879
(3.22 %)		 13,784,690
(34.30 %)		 9
(0.00 %)		 1,226,639
(2.84 %)		 53,518
(2.23 %)		 49,021
(1.97 %)
178 dog (German Shepherd Nala 2020)
GCA_008641055.3		 n/a n/a 19,757
(1.69 %)		 20,201
(1.41 %)		 n/a 41.32
(99.74 %)		 0
(0 %)		 458
(0.26 %)		 410
(100.00 %)		 4,974,233
(43.03 %)		 1,048,366
(2.46 %)		 13,881,889
(33.61 %)		 0
(0 %)		 887,952
(2.14 %)		 51,900
(2.21 %)		 47,682
(1.96 %)
179 dog (Labrador retriever 2023)
GCA_031165255.1		 n/a n/a 19,256
(1.61 %)		 20,247
(1.44 %)		 n/a 41.18
(100.00 %)		 0
(0 %)		 516
(0.00 %)		 675
(100.00 %)		 4,456,220
(32.19 %)		 960,584
(1.96 %)		 13,688,006
(32.82 %)		 0
(0 %)		 620,296
(1.57 %)		 50,670
(2.21 %)		 47,790
(1.59 %)
180 dog (labrador SID07034 2020)
GCF_014441545.1		 99,420
(3.87 %)		 n/a 19,870
(1.70 %)		 20,252
(1.41 %)		 54,322
(3.23 %)		 41.19
(99.47 %)		 0
(0 %)		 575
(0.53 %)		 376
(100.00 %)		 4,981,985
(42.28 %)		 1,019,772
(1.97 %)		 13,959,750
(32.77 %)		 2
(0.01 %)		 648,526
(1.66 %)		 52,469
(2.25 %)		 48,334
(1.95 %)
181 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU)
GCF_000181335.3		 72,089
(3.30 %)		 n/a 18,662
(1.64 %)		 20,897
(1.37 %)		 n/a 41.73
(98.20 %)		 403
(1.80 %)		 436
(1.80 %)		 5,079
(98.20 %)		 5,086,462
(43.51 %)		 964,126
(2.68 %)		 13,947,871
(33.33 %)		 0
(0 %)		 785,059
(2.13 %)		 69,701
(2.41 %)		 61,568
(1.95 %)
182 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU)
GCA_000181335.5		 n/a n/a 18,378
(1.53 %)		 21,242
(1.40 %)		 n/a 41.73
(98.21 %)		 350
(1.69 %)		 422
(1.79 %)		 5,010
(98.31 %)		 4,683,703
(33.33 %)		 964,129
(2.68 %)		 13,948,305
(33.33 %)		 0
(0 %)		 784,749
(2.13 %)		 69,725
(2.42 %)		 63,619
(1.83 %)
183 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021)
GCA_000181335.6		 n/a n/a 18,357
(1.55 %)		 20,085
(1.38 %)		 n/a 41.76
(98.18 %)		 350
(1.72 %)		 422
(1.82 %)		 1,254
(98.28 %)		 4,661,997
(33.78 %)		 947,221
(2.58 %)		 13,867,949
(33.67 %)		 0
(0 %)		 696,984
(2.13 %)		 68,011
(2.41 %)		 62,123
(1.82 %)
184 domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U)
GCF_018350175.1		 99,222
(4.40 %)		 n/a 18,456
(1.66 %)		 19,833
(1.39 %)		 94,133
(5.63 %)		 41.81
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 39
(0.00 %)		 102
(100.00 %)		 4,965,571
(43.65 %)		 932,424
(1.95 %)		 13,596,808
(33.85 %)		 0
(0 %)		 555,637
(1.52 %)		 67,329
(2.48 %)		 60,307
(2.00 %)
185 domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020)
GCF_011764305.1		 68,855
(3.09 %)		 n/a 19,019
(1.55 %)		 21,812
(1.42 %)		 n/a 41.90
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,224
(100.00 %)		 4,650,028
(39.49 %)		 745,115
(2.02 %)		 13,758,447
(36.14 %)		 0
(0 %)		 1,196,360
(3.06 %)		 58,684
(2.16 %)		 59,034
(1.99 %)
186 domestic ferret (Sable 2011 Broad)
GCA_000239315.1		 n/a n/a 18,778
(1.67 %)		 19,571
(1.47 %)		 n/a 41.48
(96.89 %)		 72,670
(3.12 %)		 72,670
(3.12 %)		 76,914
(96.88 %)		 4,491,876
(40.13 %)		 618,556
(1.07 %)		 13,721,938
(31.04 %)		 1,362
(0.02 %)		 377,830
(1.02 %)		 54,600
(1.94 %)		 53,359
(1.69 %)
187 domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023)
GCF_034190915.1		 79,333
(3.55 %)		 n/a 17,999
(1.09 %)		 21,509
(1.20 %)		 n/a 40.64
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 84
(0.00 %)		 672
(100.00 %)		 5,037,431
(41.68 %)		 886,785
(13.97 %)		 14,620,284
(42.71 %)		 1
(0.00 %)		 2,850,832
(6.00 %)		 39,682
(0.89 %)		 26,858
(0.57 %)
188 domestic guinea pig (2N 2008 refseq)
GCF_000151735.1		 44,762
(2.31 %)		 n/a 18,301
(1.33 %)		 20,111
(1.34 %)		 n/a 39.95
(97.81 %)		 58,460
(2.20 %)		 58,460
(2.20 %)		 61,604
(97.80 %)		 4,257,852
(38.85 %)		 658,533
(1.25 %)		 14,547,726
(34.19 %)		 3
(0.00 %)		 423,409
(1.39 %)		 37,093
(0.85 %)		 27,300
(0.63 %)
189 domestic yak (maiwa yakHY00 2019)
GCA_005887515.3		 n/a n/a 18,672
(1.39 %)		 19,408
(1.24 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 0
(0 %)		 646
(0.00 %)		 343
(100.00 %)		 3,570,978
(23.00 %)		 583,762
(8.57 %)		 14,055,227
(40.52 %)		 0
(0 %)		 2,774,518
(21.40 %)		 43,883
(1.17 %)		 40,029
(0.94 %)
190 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1		 n/a n/a 18,354
(1.22 %)		 20,434
(1.08 %)		 n/a 40.65
(100.00 %)		 0
(0 %)		 96
(0.00 %)		 198
(100.00 %)		 4,458,084
(33.00 %)		 444,499
(1.79 %)		 15,031,940
(47.42 %)		 0
(0 %)		 508,936
(1.29 %)		 29,863
(0.83 %)		 24,007
(0.54 %)
191 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1		 n/a n/a 18,538
(1.23 %)		 20,775
(1.09 %)		 n/a 40.64
(100.00 %)		 0
(0 %)		 89
(0.00 %)		 167
(100.00 %)		 4,455,227
(33.01 %)		 444,021
(1.73 %)		 14,946,847
(47.37 %)		 1
(0.00 %)		 504,439
(1.27 %)		 29,828
(0.79 %)		 24,008
(0.54 %)
192 dwarf mongoose
GCA_004023845.1		 n/a n/a 21,478
(1.57 %)		 32,174
(1.43 %)		 n/a 41.83
(99.94 %)		 10,815
(0.05 %)		 10,815
(0.05 %)		 200,185
(99.95 %)		 4,574,991
(40.34 %)		 595,520
(1.11 %)		 13,720,585
(32.94 %)		 42
(0.00 %)		 180,761
(0.49 %)		 70,689
(2.42 %)		 67,427
(2.05 %)
193 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1		 n/a n/a 18,522
(1.26 %)		 22,314
(1.28 %)		 n/a 43.69
(100.00 %)		 0
(0 %)		 316
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 3,699,683
(20.55 %)		 935,350
(11.22 %)		 13,112,318
(44.07 %)		 1
(0.00 %)		 n/a 99,224
(2.27 %)		 68,695
(1.75 %)
194 eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022)
GCA_921998335.2		 n/a n/a 21,903
(2.13 %)		 19,801
(1.40 %)		 108,675
(4.42 %)		 41.79
(99.89 %)		 3
(0.00 %)		 207
(0.11 %)		 211
(100.00 %)		 4,630,645
(40.56 %)		 1,531,506
(3.70 %)		 13,011,312
(35.48 %)		 2
(0.00 %)		 816,051
(2.46 %)		 22,270
(0.54 %)		 15,877
(0.42 %)
195 eastern mole
GCA_004024925.1		 n/a n/a 19,631
(1.57 %)		 32,414
(1.63 %)		 n/a 42.02
(99.91 %)		 7,239
(0.03 %)		 7,239
(0.03 %)		 647,535
(99.97 %)		 3,145,725
(29.42 %)		 554,620
(1.75 %)		 10,663,504
(32.88 %)		 18
(0.00 %)		 n/a 55,063
(3.69 %)		 48,440
(3.22 %)
196 eastern quoll
GCA_020854095.1		 n/a n/a 15,715
(0.80 %)		 16,750
(0.93 %)		 n/a 36.19
(100.00 %)		 0
(0 %)		 431
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 5,256,999
(24.81 %)		 1,280,160
(3.39 %)		 21,362,866
(41.74 %)		 2
(0.00 %)		 642,432
(1.62 %)		 24,508
(0.70 %)		 24,041
(0.54 %)
197 Egyptian rousette (1219 2016 Boston U)
GCF_001466805.2		 54,791
(4.93 %)		 n/a 18,221
(2.05 %)		 24,192
(1.88 %)		 46,601
(2.22 %)		 40.02
(99.97 %)		 0
(0 %)		 638
(0.03 %)		 2,490
(100.00 %)		 2,815,693
(32.23 %)		 440,119
(1.01 %)		 12,346,041
(26.86 %)		 0
(0 %)		 74,090
(0.43 %)		 56,244
(6.54 %)		 61,126
(5.16 %)
198 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1		 65,163
(4.76 %)		 n/a 17,642
(2.07 %)		 22,317
(1.84 %)		 n/a 40.05
(98.59 %)		 0
(0 %)		 242
(1.41 %)		 29
(100.00 %)		 2,821,248
(33.05 %)		 434,414
(1.02 %)		 12,031,597
(26.52 %)		 0
(0 %)		 65,562
(0.33 %)		 53,573
(4.84 %)		 57,281
(4.47 %)
199 Egyptian spiny mouse
GCA_004027535.1		 n/a n/a 23,498
(1.69 %)		 36,970
(1.40 %)		 30,076
(1.58 %)		 42.71
(99.88 %)		 20,469
(0.09 %)		 20,469
(0.09 %)		 391,811
(99.91 %)		 4,983,574
(35.17 %)		 1,342,514
(3.45 %)		 13,029,270
(32.79 %)		 32
(0.00 %)		 n/a 19,944
(0.55 %)		 18,844
(0.51 %)
200 elk (wapiti)
GCF_019320065.1		 66,846
(3.00 %)		 n/a 20,090
(1.67 %)		 21,999
(1.44 %)		 n/a 41.62
(99.93 %)		 0
(0 %)		 6,643
(0.08 %)		 185
(100.00 %)		 4,884,711
(43.14 %)		 429,925
(1.65 %)		 13,135,255
(37.85 %)		 78
(0.00 %)		 802,680
(2.76 %)		 47,099
(1.31 %)		 44,586
(1.19 %)
201 ermine (2020)
GCF_009829155.1		 74,332
(3.19 %)		 n/a 18,855
(1.65 %)		 20,667
(1.43 %)		 44,584
(2.07 %)		 41.56
(99.12 %)		 0
(0 %)		 199
(0.88 %)		 94
(100.00 %)		 4,647,934
(41.44 %)		 714,174
(1.30 %)		 13,845,904
(33.42 %)		 3
(0.01 %)		 452,963
(1.26 %)		 56,065
(2.25 %)		 56,447
(2.07 %)
202 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1		 n/a n/a 13,583
(1.65 %)		 15,403
(1.46 %)		 n/a 41.72
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,327
(100.00 %)		 3,139,035
(40.57 %)		 480,111
(1.29 %)		 9,106,061
(31.93 %)		 0
(0 %)		 342,175
(1.40 %)		 39,139
(2.25 %)		 38,863
(2.02 %)
203 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1		 n/a n/a 19,332
(1.42 %)		 22,424
(1.40 %)		 n/a 42.47
(100.00 %)		 0
(0 %)		 27
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 4,362,536
(31.74 %)		 801,232
(4.02 %)		 13,893,672
(37.73 %)		 1
(0.00 %)		 1,089,255
(2.94 %)		 65,806
(4.13 %)		 53,831
(1.83 %)
204 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2		 n/a n/a 19,268
(1.40 %)		 22,121
(1.36 %)		 41,043
(1.93 %)		 42.48
(100.00 %)		 0
(0 %)		 101
(0.00 %)		 538
(100.00 %)		 4,417,203
(31.72 %)		 821,664
(4.02 %)		 13,814,720
(38.08 %)		 1
(0.00 %)		 1,177,257
(3.11 %)		 66,524
(3.95 %)		 54,563
(1.83 %)
205 Eurasian field mouse (2024)
GCA_964023405.1		 n/a n/a 20,487
(1.88 %)		 19,707
(1.34 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 0
(0 %)		 182
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 5,115,510
(39.18 %)		 1,868,284
(4.29 %)		 13,503,826
(37.29 %)		 2
(0.00 %)		 1,262,006
(3.13 %)		 26,414
(0.61 %)		 24,636
(0.56 %)
206 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1		 n/a n/a 12,437
(1.51 %)		 12,702
(1.22 %)		 n/a 40.06
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 10,657
(100.00 %)		 2,303,176
(35.38 %)		 353,996
(1.49 %)		 7,218,556
(31.67 %)		 0
(0 %)		 194,541
(1.24 %)		 24,268
(1.07 %)		 22,754
(0.97 %)
207 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2		 n/a n/a 21,309
(1.58 %)		 21,026
(1.36 %)		 33,465
(1.53 %)		 40.08
(94.33 %)		 0
(0 %)		 1,177
(5.67 %)		 639
(100.00 %)		 4,677,412
(35.73 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,992,063
(31.49 %)		 5
(0.00 %)		 419,661
(1.29 %)		 48,159
(1.04 %)		 45,470
(0.95 %)
208 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1		 67,145
(2.95 %)		 n/a 18,842
(1.54 %)		 20,178
(1.40 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 0
(0 %)		 185
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 4,259,294
(33.39 %)		 713,721
(1.36 %)		 13,626,048
(34.37 %)		 1
(0.00 %)		 695,796
(1.86 %)		 57,073
(1.82 %)		 47,446
(1.36 %)
209 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1		 n/a n/a 9,910
(1.59 %)		 11,315
(1.31 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 8,506
(100.00 %)		 2,052,338
(42.25 %)		 316,084
(1.64 %)		 6,222,460
(33.12 %)		 0
(0 %)		 291,189
(1.91 %)		 27,057
(1.96 %)		 26,047
(1.75 %)
210 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1		 n/a n/a 16,761
(1.66 %)		 19,715
(1.37 %)		 n/a 42.13
(100.00 %)		 105
(0.00 %)		 105
(0.00 %)		 16,473
(100.00 %)		 3,118,266
(26.44 %)		 829,463
(2.82 %)		 9,700,482
(31.37 %)		 0
(0 %)		 353,652
(1.44 %)		 14,146
(0.57 %)		 12,571
(0.45 %)
211 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2		 45,544
(2.51 %)		 n/a 19,733
(1.78 %)		 19,053
(1.47 %)		 36,935
(2.27 %)		 42.15
(99.74 %)		 0
(0 %)		 873
(0.26 %)		 215
(100.00 %)		 3,993,912
(25.74 %)		 1,088,163
(2.91 %)		 12,853,770
(32.42 %)		 5
(0.00 %)		 518,667
(1.69 %)		 19,000
(0.58 %)		 16,851
(0.46 %)
212 European hare (LE1 primary hap 2023)
GCF_033115175.1		 46,528
(2.09 %)		 n/a 19,392
(1.25 %)		 23,070
(1.29 %)		 n/a 44.03
(100.00 %)		 0
(0 %)		 418
(0.00 %)		 651
(100.00 %)		 4,011,592
(19.81 %)		 1,000,204
(8.44 %)		 13,414,251
(44.25 %)		 2
(0.00 %)		 2,116,577
(4.63 %)		 98,831
(2.33 %)		 72,807
(1.75 %)
213 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1		 n/a n/a 20,236
(1.71 %)		 19,368
(1.32 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,020
(0.02 %)		 894
(100.00 %)		 4,892,811
(36.49 %)		 1,223,387
(18.26 %)		 11,907,631
(42.51 %)		 10
(0.00 %)		 4,679,739
(9.91 %)		 17,423
(0.62 %)		 15,264
(0.35 %)
214 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1		 n/a n/a 15,419
(1.50 %)		 21,175
(1.51 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 12,043
(100.00 %)		 2,952,218
(30.62 %)		 538,508
(2.18 %)		 9,303,303
(34.20 %)		 0
(0 %)		 511,888
(2.10 %)		 47,810
(2.50 %)		 39,732
(1.82 %)
215 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1		 69,556
(3.13 %)		 n/a 18,706
(1.46 %)		 21,193
(1.37 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 0
(0 %)		 39
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 4,237,791
(30.90 %)		 792,897
(2.69 %)		 13,417,195
(36.59 %)		 0
(0 %)		 894,272
(2.55 %)		 67,132
(2.54 %)		 51,333
(1.62 %)
216 European mole (hap1 2024)
GCA_964194135.1		 n/a n/a 18,085
(1.69 %)		 19,509
(1.58 %)		 n/a 42.08
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,056
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 2,569,380
(23.32 %)		 565,465
(2.18 %)		 10,506,666
(33.68 %)		 42
(0.00 %)		 704,393
(2.62 %)		 46,367
(3.09 %)		 42,313
(2.40 %)
217 European mole (hap2 2024)
GCA_964194205.1		 n/a n/a 18,064
(1.69 %)		 19,764
(1.59 %)		 n/a 42.07
(99.99 %)		 1,040
(0.01 %)		 1,040
(0.01 %)		 1,396
(99.99 %)		 2,567,492
(23.34 %)		 570,250
(2.16 %)		 10,485,959
(33.56 %)		 30
(0.00 %)		 702,644
(2.60 %)		 46,213
(3.27 %)		 42,349
(2.41 %)
218 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1		 n/a n/a 18,336
(1.50 %)		 20,807
(1.41 %)		 n/a 42.38
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,250
(0.02 %)		 477
(100.00 %)		 4,096,160
(31.55 %)		 707,337
(3.28 %)		 13,715,382
(34.73 %)		 10
(0.00 %)		 626,861
(1.84 %)		 61,481
(4.29 %)		 56,462
(1.94 %)
219 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1		 n/a n/a 17,506
(1.26 %)		 25,527
(1.52 %)		 n/a 43.20
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 5,699
(100.00 %)		 2,400,784
(15.19 %)		 1,062,793
(3.20 %)		 13,284,496
(41.93 %)		 0
(0 %)		 768,770
(2.06 %)		 77,009
(2.86 %)		 75,481
(2.15 %)
220 European shrew (GB8-d 2012)
GCF_000181275.1		 23,525
(1.54 %)		 n/a 17,290
(1.33 %)		 22,005
(1.50 %)		 n/a 42.90
(90.49 %)		 188,953
(9.54 %)		 188,953
(9.54 %)		 201,798
(90.46 %)		 4,400,127
(33.22 %)		 946,629
(2.03 %)		 13,377,581
(35.30 %)		 3,389
(0.06 %)		 410,333
(1.21 %)		 77,851
(2.58 %)		 76,553
(1.98 %)
221 European shrew (primary hap 2023)
GCF_027595985.1		 44,643
(2.60 %)		 n/a 17,479
(1.26 %)		 21,293
(1.37 %)		 n/a 43.24
(99.46 %)		 0
(0 %)		 1,427
(0.54 %)		 65
(100.00 %)		 2,474,584
(15.18 %)		 1,107,884
(3.28 %)		 13,638,467
(41.72 %)		 10
(0.00 %)		 822,159
(2.15 %)		 79,785
(2.86 %)		 77,901
(2.13 %)
222 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1		 n/a n/a 18,364
(1.79 %)		 20,379
(1.63 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,256
(100.00 %)		 3,049,618
(22.22 %)		 852,708
(4.50 %)		 10,501,392
(33.34 %)		 0
(0 %)		 706,136
(2.67 %)		 17,629
(0.60 %)		 15,048
(0.47 %)
223 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1		 47,025
(2.69 %)		 n/a 19,592
(1.78 %)		 21,173
(1.56 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 0
(0 %)		 197
(0.00 %)		 160
(100.00 %)		 5,048,186
(44.12 %)		 998,537
(5.14 %)		 12,204,053
(34.97 %)		 4
(0.00 %)		 954,164
(3.20 %)		 20,725
(0.63 %)		 18,727
(0.52 %)
224 European suslik (primary hap 2024)
GCA_964194105.1		 n/a n/a 20,075
(1.28 %)		 20,274
(1.19 %)		 n/a 39.90
(99.99 %)		 4
(0.00 %)		 1,436
(0.01 %)		 502
(100.00 %)		 4,357,247
(31.78 %)		 882,536
(12.27 %)		 14,882,486
(41.66 %)		 9
(0.00 %)		 1,833,125
(4.49 %)		 39,275
(0.88 %)		 27,165
(0.54 %)
225 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1		 54,114
(2.24 %)		 n/a 19,959
(1.65 %)		 19,953
(1.25 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,129
(0.01 %)		 497
(100.00 %)		 4,863,650
(37.41 %)		 1,795,997
(8.95 %)		 13,681,732
(40.58 %)		 17
(0.00 %)		 2,516,593
(5.37 %)		 23,961
(0.53 %)		 17,318
(0.36 %)
226 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1		 n/a n/a 18,692
(1.72 %)		 22,021
(1.36 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 10,863
(100.00 %)		 4,055,957
(36.08 %)		 1,513,576
(9.53 %)		 11,306,811
(39.67 %)		 0
(0 %)		 1,995,176
(5.07 %)		 20,865
(0.55 %)		 15,533
(0.39 %)
227 fallow deer (Ldn47 2023)
GCF_033118175.1		 57,013
(2.35 %)		 n/a 20,187
(1.33 %)		 23,290
(1.33 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 0
(0 %)		 44
(0.00 %)		 284
(100.00 %)		 3,308,241
(20.72 %)		 513,748
(18.20 %)		 12,996,819
(48.19 %)		 0
(0 %)		 5,629,434
(11.23 %)		 214,480
(2.98 %)		 41,647
(0.85 %)
228 false killer whale (hap1 2024)
GCA_039906515.1		 n/a n/a 18,718
(1.50 %)		 20,929
(1.32 %)		 n/a 42.08
(99.90 %)		 0
(0 %)		 123
(0.10 %)		 439
(100.00 %)		 3,958,932
(35.76 %)		 1,002,329
(11.61 %)		 12,193,131
(41.85 %)		 3
(0.00 %)		 1,441,777
(4.23 %)		 79,158
(3.74 %)		 41,701
(1.03 %)
229 false killer whale (hap2 2024)
GCA_039906525.1		 n/a n/a 17,866
(1.45 %)		 21,079
(1.46 %)		 n/a 42.37
(99.08 %)		 0
(0 %)		 133
(0.92 %)		 416
(100.00 %)		 3,852,502
(34.98 %)		 1,112,185
(16.42 %)		 11,435,533
(44.17 %)		 1
(0.00 %)		 1,686,603
(5.16 %)		 75,215
(4.36 %)		 39,963
(0.98 %)
230 false killer whale (mPseCra1hap1 2024)
GCF_039906515.1		 75,958
(3.31 %)		 n/a 18,718
(1.50 %)		 20,982
(1.32 %)		 n/a 42.08
(99.90 %)		 0
(0 %)		 123
(0.10 %)		 438
(100.00 %)		 3,958,926
(35.76 %)		 1,002,329
(11.61 %)		 12,193,061
(41.85 %)		 3
(0.00 %)		 1,441,777
(4.23 %)		 79,158
(3.74 %)		 41,701
(1.03 %)
231 fat dormouse (US078 2019)
GCA_004027185.1		 n/a n/a 23,122
(1.24 %)		 48,677
(1.27 %)		 n/a 42.33
(99.92 %)		 10,685
(0.04 %)		 10,685
(0.04 %)		 444,115
(99.96 %)		 6,783,404
(37.03 %)		 1,642,515
(3.72 %)		 12,706,289
(39.97 %)		 58
(0.00 %)		 n/a 65,521
(1.47 %)		 33,794
(0.75 %)
232 fat sand rat (mPsaObe1 2021)
GCF_907164565.1		 43,211
(2.50 %)		 n/a 18,543
(1.78 %)		 20,094
(1.42 %)		 n/a 41.95
(99.11 %)		 0
(0 %)		 50,482
(0.90 %)		 11,389
(100.00 %)		 4,686,377
(43.10 %)		 920,563
(1.85 %)		 12,813,848
(35.08 %)		 2,665
(0.03 %)		 294,151
(0.96 %)		 22,480
(0.71 %)		 20,772
(0.63 %)
233 fat sand rat (Psa_ob012049795 2017)
GCA_002215935.1		 n/a n/a 21,644
(1.71 %)		 31,665
(1.41 %)		 n/a 41.99
(99.99 %)		 0
(0 %)		 n/a 96,427
(100.00 %)		 4,646,110
(38.87 %)		 946,664
(2.24 %)		 13,134,526
(33.94 %)		 0
(0 %)		 232,939
(1.07 %)		 26,411
(0.73 %)		 24,961
(0.66 %)
234 fishing cat (Anna 2022 U Missouri)
GCF_022837055.1		 68,015
(2.86 %)		 n/a 18,432
(1.63 %)		 19,912
(1.37 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 0
(0 %)		 63
(0.00 %)		 192
(100.00 %)		 4,777,906
(34.85 %)		 937,432
(2.30 %)		 13,438,032
(34.55 %)		 0
(0 %)		 654,267
(1.76 %)		 70,402
(2.61 %)		 68,720
(2.25 %)
235 Florida manatee (CSIC 2023)
GCA_030013775.1		 n/a n/a 19,432
(1.24 %)		 24,035
(1.14 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 33
(0.00 %)		 15,641
(100.00 %)		 4,400,331
(33.07 %)		 439,615
(1.04 %)		 14,884,753
(46.98 %)		 2
(0.00 %)		 413,231
(1.00 %)		 32,563
(0.80 %)		 26,358
(0.59 %)
236 Florida manatee (Lorelei 2012 refseq)
GCF_000243295.1		 39,645
(2.08 %)		 n/a 18,308
(1.37 %)		 20,588
(1.23 %)		 32,868
(1.38 %)		 40.73
(89.24 %)		 160,167
(10.78 %)		 160,167
(10.78 %)		 166,490
(89.22 %)		 n/a 389,315
(0.74 %)		 14,633,038
(38.46 %)		 5,748
(0.06 %)		 244,060
(0.64 %)		 27,462
(0.64 %)		 25,464
(0.54 %)
237 fossa
GCA_004023885.1		 n/a n/a 21,156
(1.56 %)		 29,809
(1.38 %)		 n/a 41.51
(99.94 %)		 6,335
(0.03 %)		 6,335
(0.03 %)		 470,371
(99.97 %)		 4,962,168
(42.36 %)		 814,639
(1.52 %)		 13,708,904
(34.14 %)		 29
(0.00 %)		 263,077
(0.54 %)		 78,033
(2.52 %)		 74,289
(2.13 %)
238 Gambian giant pouched rat
GCA_004027575.1		 n/a n/a 21,189
(1.59 %)		 32,806
(1.43 %)		 n/a 42.11
(99.88 %)		 7,473
(0.03 %)		 7,473
(0.03 %)		 1,110,425
(99.97 %)		 4,137,605
(24.57 %)		 1,071,627
(2.76 %)		 12,905,250
(32.78 %)		 51
(0.00 %)		 n/a 32,359
(0.80 %)		 21,577
(0.55 %)
239 gayal (CVASU_BF_001 2021)
GCA_017311355.1		 n/a n/a 24,549
(1.09 %)		 55,194
(1.15 %)		 n/a 42.05
(99.91 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,262,134
(100.00 %)		 3,691,398
(22.78 %)		 677,397
(2.00 %)		 14,380,670
(42.36 %)		 0
(0 %)		 n/a 75,114
(1.33 %)		 44,401
(0.88 %)
240 gayal (Nagaland 2019)
GCA_007844835.1		 n/a n/a 22,715
(1.55 %)		 23,635
(1.33 %)		 n/a 41.67
(96.51 %)		 301,761
(3.52 %)		 301,761
(3.52 %)		 306,776
(96.48 %)		 6,243,468
(45.69 %)		 518,664
(1.99 %)		 15,147,647
(37.64 %)		 5,199
(0.13 %)		 1,060,226
(3.23 %)		 45,586
(0.89 %)		 40,275
(0.78 %)
241 Geoffroy's cat
GCF_018350155.1		 85,331
(3.53 %)		 n/a 18,469
(1.66 %)		 19,516
(1.36 %)		 93,795
(4.83 %)		 41.75
(100.00 %)		 35
(0.00 %)		 45
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 5,021,854
(43.23 %)		 930,175
(1.84 %)		 13,757,469
(34.29 %)		 0
(0 %)		 627,614
(1.76 %)		 65,918
(2.36 %)		 58,825
(1.96 %)
242 giant anteater
GCA_004026745.1		 n/a n/a 24,383
(0.91 %)		 44,315
(0.93 %)		 n/a 39.53
(99.88 %)		 8,283
(0.02 %)		 8,283
(0.02 %)		 1,629,691
(99.98 %)		 5,333,757
(35.57 %)		 575,140
(0.91 %)		 21,181,213
(39.97 %)		 116
(0.00 %)		 n/a 57,558
(0.94 %)		 45,184
(0.73 %)
243 giant otter
GCA_004024605.1		 n/a n/a 21,199
(1.46 %)		 30,565
(1.34 %)		 n/a 41.71
(99.93 %)		 7,431
(0.03 %)		 7,431
(0.03 %)		 652,159
(99.97 %)		 5,113,769
(41.55 %)		 788,677
(1.46 %)		 14,385,279
(35.77 %)		 57
(0.00 %)		 420,852
(0.84 %)		 82,376
(2.05 %)		 79,949
(1.87 %)
244 giant panda (Jingjing v3 2020)
GCF_002007445.2		 65,468
(3.27 %)		 n/a 19,077
(1.67 %)		 20,176
(1.39 %)		 n/a 41.68
(98.09 %)		 0
(0 %)		 189,277
(1.92 %)		 73,514
(100.00 %)		 4,012,144
(34.40 %)		 617,803
(1.99 %)		 14,216,587
(30.41 %)		 9,430
(0.13 %)		 581,226
(4.37 %)		 59,449
(1.50 %)		 54,779
(1.33 %)
245 goat (v2 San Clemente 2016 USDA)
GCF_001704415.2		 47,159
(2.31 %)		 n/a 19,342
(1.38 %)		 22,346
(1.24 %)		 n/a 43.16
(100.00 %)		 0
(0 %)		 790
(0.00 %)		 29,886
(100.00 %)		 3,502,527
(22.45 %)		 760,831
(7.07 %)		 13,024,178
(44.85 %)		 0
(0 %)		 2,571,330
(5.65 %)		 125,662
(4.00 %)		 40,923
(0.89 %)
246 Gobi jerboa
GCA_004027895.1		 n/a n/a 22,410
(0.91 %)		 45,268
(1.02 %)		 n/a 41.94
(99.88 %)		 10,987
(0.04 %)		 10,987
(0.04 %)		 1,295,369
(99.96 %)		 8,828,417
(40.19 %)		 1,979,806
(6.43 %)		 14,759,732
(47.73 %)		 96
(0.00 %)		 n/a 24,314
(0.52 %)		 19,787
(0.39 %)
247 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1		 67,831
(3.37 %)		 n/a 19,354
(1.71 %)		 19,863
(1.47 %)		 69,903
(4.39 %)		 42.04
(96.99 %)		 711
(3.01 %)		 711
(3.01 %)		 7,058
(96.99 %)		 3,981,818
(27.65 %)		 976,456
(3.46 %)		 12,580,903
(32.87 %)		 25
(0.00 %)		 766,407
(1.98 %)		 21,268
(0.61 %)		 18,135
(0.47 %)
248 golden hamster (Broad 2013 refseq)
GCF_000349665.1		 42,636
(2.91 %)		 37,986
(2.21 %)		 18,976
(1.82 %)		 19,149
(1.51 %)		 29,936
(1.96 %)		 42.01
(82.92 %)		 216,216
(17.12 %)		 216,216
(17.12 %)		 237,700
(82.88 %)		 3,599,795
(26.09 %)		 790,256
(1.69 %)		 12,003,956
(24.29 %)		 3,589
(0.05 %)		 254,929
(0.76 %)		 18,591
(0.51 %)		 17,093
(0.42 %)
249 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1		 36,997
(1.96 %)		 n/a 20,006
(1.91 %)		 19,132
(1.50 %)		 n/a 42.51
(99.65 %)		 0
(0 %)		 880
(0.35 %)		 623
(100.00 %)		 4,785,907
(32.61 %)		 1,305,613
(3.34 %)		 12,958,061
(32.33 %)		 0
(0 %)		 684,879
(1.84 %)		 20,760
(0.59 %)		 18,457
(0.52 %)
250 gracile shrew mole
GCA_004024945.1		 n/a n/a 19,165
(1.25 %)		 43,816
(1.48 %)		 n/a 41.08
(99.89 %)		 8,248
(0.04 %)		 8,248
(0.04 %)		 732,083
(99.96 %)		 2,957,465
(23.76 %)		 783,289
(2.60 %)		 11,503,344
(31.38 %)		 23
(0.00 %)		 n/a 92,729
(3.60 %)		 75,685
(2.89 %)
251 gray fox (Vermont ataVT051 2023)
GCA_032313775.1		 n/a n/a 19,352
(1.42 %)		 20,724
(1.33 %)		 n/a 42.10
(100.00 %)		 0
(0 %)		 26
(0.00 %)		 898
(100.00 %)		 4,418,039
(36.90 %)		 1,050,244
(11.63 %)		 13,240,305
(39.50 %)		 0
(0 %)		 3,860,162
(6.83 %)		 89,246
(2.69 %)		 49,263
(1.43 %)
252 gray seal
GCF_012393455.1		 79,009
(3.73 %)		 n/a 19,882
(1.73 %)		 22,416
(1.46 %)		 n/a 41.44
(100.00 %)		 0
(0 %)		 117
(0.00 %)		 6,880
(100.00 %)		 4,448,588
(43.28 %)		 557,710
(1.32 %)		 13,340,576
(33.41 %)		 0
(0 %)		 506,266
(1.47 %)		 55,637
(1.78 %)		 52,209
(1.58 %)
253 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1		 n/a n/a 12,662
(0.70 %)		 15,124
(0.89 %)		 n/a 37.74
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 24
(0.00 %)		 8,086
(100.00 %)		 4,098,004
(25.33 %)		 806,470
(2.98 %)		 16,244,072
(43.39 %)		 0
(0 %)		 n/a 24,879
(0.67 %)		 15,867
(0.39 %)
254 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1		 73,383
(3.04 %)		 n/a 16,637
(0.72 %)		 16,036
(0.85 %)		 n/a 37.92
(99.11 %)		 0
(0 %)		 2,255
(0.89 %)		 13
(100.00 %)		 5,562,359
(25.40 %)		 1,096,620
(2.60 %)		 22,322,748
(43.37 %)		 13
(0.00 %)		 793,648
(1.81 %)		 28,894
(0.57 %)		 22,987
(0.42 %)
255 gray short-tailed opossum (MonDom5 2007)
GCF_000002295.2		 68,375
(2.34 %)		 n/a 16,663
(0.75 %)		 16,162
(0.84 %)		 n/a 37.82
(97.26 %)		 67,660
(2.75 %)		 67,660
(2.75 %)		 72,674
(97.25 %)		 7,753,175
(55.85 %)		 1,051,473
(2.34 %)		 22,274,001
(42.23 %)		 6
(0.00 %)		 680,995
(1.61 %)		 30,883
(0.53 %)		 22,339
(0.40 %)
256 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1		 58,884
(2.46 %)		 n/a 20,752
(1.49 %)		 21,107
(1.31 %)		 32,732
(1.45 %)		 40.06
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,824
(0.02 %)		 752
(100.00 %)		 4,605,578
(34.50 %)		 728,192
(1.65 %)		 15,467,412
(33.91 %)		 2
(0.00 %)		 504,786
(1.54 %)		 51,878
(1.11 %)		 49,715
(1.03 %)
257 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1		 n/a n/a 17,156
(1.53 %)		 18,190
(1.33 %)		 n/a 40.25
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 9,510
(100.00 %)		 3,455,580
(34.94 %)		 530,053
(1.56 %)		 10,927,458
(32.64 %)		 0
(0 %)		 323,766
(1.34 %)		 38,976
(1.13 %)		 37,317
(1.05 %)
258 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2		 n/a n/a 19,474
(1.55 %)		 20,394
(1.40 %)		 72,806
(4.12 %)		 41.49
(100.00 %)		 0
(0 %)		 166
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 4,550,524
(31.76 %)		 1,063,944
(3.96 %)		 13,588,117
(34.74 %)		 23
(0.00 %)		 1,048,956
(2.49 %)		 51,996
(2.15 %)		 47,971
(1.53 %)
259 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1		 n/a n/a 12,760
(1.57 %)		 14,423
(1.42 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,537
(100.00 %)		 2,725,227
(31.66 %)		 616,862
(3.40 %)		 8,041,744
(32.68 %)		 0
(0 %)		 465,446
(1.97 %)		 32,293
(2.35 %)		 29,871
(1.57 %)
260 great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024)
GCA_038363175.2		 n/a n/a 16,978
(1.61 %)		 18,544
(1.54 %)		 n/a 42.42
(100.00 %)		 0
(0 %)		 54
(0.00 %)		 312
(100.00 %)		 2,601,985
(26.67 %)		 331,187
(4.87 %)		 10,884,729
(33.93 %)		 1
(0.00 %)		 458,782
(1.76 %)		 63,610
(2.71 %)		 49,165
(1.49 %)
261 great fruit-eating bat (v2 hap1 2024)
GCA_038363095.2		 n/a n/a 18,051
(1.56 %)		 19,955
(1.51 %)		 n/a 42.45
(100.00 %)		 0
(0 %)		 45
(0.00 %)		 487
(100.00 %)		 2,841,143
(26.67 %)		 379,430
(5.52 %)		 11,651,542
(35.11 %)		 0
(0 %)		 569,322
(2.01 %)		 72,337
(2.76 %)		 54,165
(1.48 %)
262 great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016)
GCF_001890085.2		 50,895
(3.26 %)		 n/a 18,993
(2.01 %)		 19,633
(1.65 %)		 41,769
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 0
(0 %)		 172,750
(12.60 %)		 7,387
(100.00 %)		 2,946,981
(30.72 %)		 495,272
(1.05 %)		 11,587,728
(25.43 %)		 2,116
(0.03 %)		 193,018
(1.10 %)		 32,949
(0.96 %)		 30,173
(0.87 %)
263 greater bulldog bat
GCA_004026585.1		 n/a n/a 20,774
(1.62 %)		 28,140
(1.63 %)		 n/a 40.92
(99.94 %)		 6,171
(0.03 %)		 6,171
(0.03 %)		 304,393
(99.97 %)		 3,288,598
(29.60 %)		 478,424
(1.16 %)		 11,427,553
(35.29 %)		 6
(0.00 %)		 n/a 44,124
(1.99 %)		 42,024
(1.78 %)
264 Greater cane rat
GCA_004025085.1		 n/a n/a 20,383
(0.98 %)		 47,456
(1.25 %)		 n/a 42.85
(99.83 %)		 8,825
(0.03 %)		 8,825
(0.03 %)		 1,898,466
(99.97 %)		 5,569,185
(30.19 %)		 946,696
(3.12 %)		 13,144,109
(41.83 %)		 28
(0.00 %)		 n/a 97,686
(2.61 %)		 84,205
(2.21 %)
265 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1		 n/a n/a 14,896
(1.85 %)		 18,939
(1.59 %)		 n/a 40.69
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 13,426
(100.00 %)		 2,426,330
(34.43 %)		 418,341
(1.36 %)		 8,763,234
(27.86 %)		 0
(0 %)		 108,521
(0.55 %)		 24,370
(1.08 %)		 22,940
(1.00 %)
266 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2		 53,353
(3.13 %)		 n/a 18,641
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 0
(0 %)		 158
(0.36 %)		 134
(100.00 %)		 3,218,744
(34.52 %)		 564,789
(1.35 %)		 12,217,020
(29.39 %)		 0
(0 %)		 171,202
(0.67 %)		 32,445
(1.06 %)		 30,641
(0.98 %)
267 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1		 70,930
(3.43 %)		 n/a 19,052
(1.84 %)		 21,498
(1.73 %)		 n/a 43.11
(98.55 %)		 0
(0 %)		 538
(1.45 %)		 93
(100.00 %)		 3,088,083
(26.27 %)		 753,124
(2.84 %)		 10,383,466
(35.84 %)		 0
(0 %)		 499,733
(1.88 %)		 61,023
(2.69 %)		 54,015
(1.81 %)
268 greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850765.1		 55,259
(2.53 %)		 n/a 18,321
(1.40 %)		 21,048
(1.35 %)		 n/a 41.71
(98.73 %)		 0
(0 %)		 468
(1.27 %)		 256
(100.00 %)		 4,247,145
(29.53 %)		 1,031,385
(2.50 %)		 12,465,157
(43.30 %)		 3
(0.00 %)		 1,113,639
(2.95 %)		 101,620
(2.01 %)		 44,590
(1.04 %)
269 greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U)
GCF_019186645.2		 50,563
(2.96 %)		 n/a 18,224
(1.70 %)		 20,689
(1.67 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 55
(0.00 %)		 534
(100.00 %)		 2,961,591
(0.00 %)		 387,908
(0.97 %)		 12,179,612
(30.91 %)		 1
(0.00 %)		 167,034
(0.66 %)		 62,189
(5.35 %)		 65,269
(4.61 %)
270 grey whale
GCA_004363415.1		 n/a n/a 21,827
(1.52 %)		 32,191
(1.24 %)		 n/a 41.22
(99.88 %)		 10,622
(0.04 %)		 10,622
(0.04 %)		 1,046,770
(99.96 %)		 4,841,166
(45.56 %)		 780,015
(1.83 %)		 13,559,563
(39.86 %)		 79
(0.00 %)		 n/a 72,343
(1.59 %)		 48,741
(1.27 %)
271 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1		 n/a n/a 19,129
(1.37 %)		 24,628
(1.24 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 14,442
(100.00 %)		 3,892,130
(35.74 %)		 874,864
(15.70 %)		 11,484,916
(45.69 %)		 0
(0 %)		 2,048,708
(5.99 %)		 73,507
(1.72 %)		 41,124
(0.98 %)
272 grey whale (mEscRob2 primary hap 2023)
GCA_028021215.1		 n/a n/a 19,288
(1.38 %)		 21,791
(1.21 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 0
(0 %)		 279
(0.00 %)		 704
(100.00 %)		 4,116,900
(35.85 %)		 966,065
(16.74 %)		 12,154,173
(46.39 %)		 3
(0.00 %)		 2,154,240
(5.67 %)		 77,011
(1.59 %)		 42,884
(0.96 %)
273 grey whale (mEscRob2 primary hap 2023)
GCF_028021215.1		 49,276
(1.90 %)		 n/a 19,295
(1.38 %)		 21,790
(1.21 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 0
(0 %)		 279
(0.00 %)		 703
(100.00 %)		 4,116,894
(35.85 %)		 966,064
(16.74 %)		 12,154,101
(46.39 %)		 3
(0.00 %)		 2,154,240
(5.67 %)		 77,011
(1.59 %)		 42,884
(0.96 %)
274 hairy big-eared bat (US037 2019 Broad)
GCA_004026765.1		 n/a n/a 21,360
(1.44 %)		 37,376
(1.52 %)		 n/a 42.38
(99.94 %)		 3,218
(0.01 %)		 3,218
(0.01 %)		 553,308
(99.99 %)		 3,519,246
(30.77 %)		 393,318
(0.85 %)		 12,525,258
(34.42 %)		 12
(0.00 %)		 n/a 84,875
(2.37 %)		 63,057
(1.80 %)
275 harbor porpoise (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924675.1		 n/a n/a 18,529
(1.58 %)		 20,583
(1.34 %)		 n/a 41.72
(99.99 %)		 2
(0.00 %)		 966
(0.01 %)		 442
(100.00 %)		 3,760,716
(36.18 %)		 888,368
(7.18 %)		 12,379,240
(39.04 %)		 4
(0.00 %)		 1,410,168
(3.71 %)		 71,530
(2.69 %)		 40,160
(1.06 %)
276 harbor porpoise (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924675.1		 33,578
(1.54 %)		 n/a 18,528
(1.58 %)		 20,582
(1.34 %)		 n/a 41.72
(99.99 %)		 966
(0.01 %)		 966
(0.01 %)		 1,405
(99.99 %)		 3,760,713
(36.18 %)		 888,368
(7.18 %)		 12,379,181
(39.04 %)		 4
(0.00 %)		 1,410,168
(3.71 %)		 71,530
(2.69 %)		 40,160
(1.06 %)
277 harbor seal
GCF_004348235.1		 50,670
(2.98 %)		 n/a 19,484
(1.76 %)		 20,771
(1.44 %)		 33,296
(1.58 %)		 41.38
(99.09 %)		 16,031
(0.91 %)		 16,480
(0.91 %)		 21,161
(99.09 %)		 4,526,182
(43.28 %)		 576,921
(1.11 %)		 13,421,780
(33.06 %)		 945
(0.02 %)		 459,159
(1.28 %)		 54,592
(1.70 %)		 51,200
(1.50 %)
278 Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.2		 37,605
(1.99 %)		 n/a 19,483
(1.73 %)		 19,767
(1.35 %)		 n/a 41.41
(98.23 %)		 0
(0 %)		 25,763
(1.77 %)		 7,487
(100.00 %)		 4,575,217
(43.59 %)		 583,394
(1.11 %)		 13,374,131
(33.69 %)		 2,318
(0.04 %)		 611,862
(1.63 %)		 52,067
(1.50 %)		 48,495
(1.32 %)
279 hazel dormouse
GCA_004027005.1		 n/a n/a 21,556
(1.24 %)		 40,971
(1.33 %)		 n/a 41.60
(99.91 %)		 15,076
(0.06 %)		 15,076
(0.06 %)		 481,881
(99.94 %)		 6,679,641
(33.98 %)		 1,653,419
(3.72 %)		 12,685,676
(43.98 %)		 42
(0.00 %)		 n/a 71,478
(1.57 %)		 45,897
(0.92 %)
280 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1		 n/a n/a 11,130
(1.23 %)		 22,071
(1.36 %)		 n/a 42.15
(99.99 %)		 0
(0 %)		 n/a 31,856
(100.00 %)		 2,958,239
(41.25 %)		 788,242
(4.52 %)		 6,056,268
(41.88 %)		 0
(0 %)		 532,149
(2.74 %)		 36,143
(1.96 %)		 23,949
(1.02 %)
281 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1		 n/a n/a 18,620
(1.42 %)		 22,403
(1.38 %)		 n/a 41.73
(99.99 %)		 1
(0.00 %)		 1,805
(0.01 %)		 214
(100.00 %)		 6,063,911
(41.66 %)		 1,593,657
(4.46 %)		 12,229,281
(43.98 %)		 8
(0.00 %)		 1,313,148
(3.16 %)		 71,058
(1.88 %)		 45,398
(0.93 %)
282 hippopotamus (BS01 2019 Broad)
GCA_004027065.1		 n/a n/a 24,267
(1.55 %)		 34,820
(1.30 %)		 n/a 41.43
(99.91 %)		 4,730
(0.02 %)		 4,730
(0.02 %)		 972,599
(99.98 %)		 4,579,311
(41.26 %)		 606,731
(1.02 %)		 14,514,493
(36.58 %)		 17
(0.00 %)		 n/a 54,753
(1.59 %)		 52,362
(1.50 %)
283 hippopotamus (HIP001 2018)
GCA_002995585.1		 n/a n/a 22,343
(1.70 %)		 31,687
(1.45 %)		 n/a 40.96
(94.63 %)		 153,125
(5.38 %)		 153,125
(5.38 %)		 281,897
(94.62 %)		 3,952,905
(38.55 %)		 476,243
(1.97 %)		 14,216,817
(27.43 %)		 6,026
(0.29 %)		 n/a 48,380
(1.43 %)		 46,263
(1.31 %)
284 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1		 n/a n/a 20,391
(1.63 %)		 20,668
(1.37 %)		 n/a 41.62
(100.00 %)		 0
(0 %)		 83
(0.00 %)		 545
(100.00 %)		 3,778,764
(35.17 %)		 563,345
(3.63 %)		 13,524,869
(35.56 %)		 0
(0 %)		 369,754
(1.46 %)		 48,164
(1.90 %)		 44,065
(1.33 %)
285 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1		 64,153
(2.73 %)		 n/a 20,331
(1.62 %)		 20,633
(1.37 %)		 n/a 41.60
(100.00 %)		 0
(0 %)		 226
(0.00 %)		 357
(100.00 %)		 3,783,440
(35.17 %)		 567,797
(3.38 %)		 13,462,531
(35.48 %)		 2
(0.00 %)		 396,368
(1.55 %)		 48,365
(1.91 %)		 44,048
(1.34 %)
286 hirola (BS46 2019 Broad)
GCA_004027495.1		 n/a n/a 22,264
(1.40 %)		 36,984
(1.26 %)		 n/a 42.31
(99.93 %)		 9,287
(0.03 %)		 9,287
(0.03 %)		 545,176
(99.97 %)		 5,809,405
(48.62 %)		 465,001
(1.08 %)		 13,326,245
(42.35 %)		 43
(0.00 %)		 n/a 48,312
(1.15 %)		 38,948
(0.98 %)
287 Hispaniolan solenodon
GCA_004363575.1		 n/a n/a 18,805
(1.55 %)		 27,454
(1.64 %)		 n/a 39.98
(99.96 %)		 5,186
(0.02 %)		 5,186
(0.02 %)		 181,804
(99.98 %)		 2,669,787
(26.78 %)		 431,610
(1.04 %)		 13,429,711
(27.35 %)		 24
(0.00 %)		 86,983
(0.25 %)		 53,444
(2.30 %)		 52,300
(2.09 %)
288 hispid cotton rat
GCA_004025045.1		 n/a n/a 25,324
(1.49 %)		 31,681
(1.31 %)		 39,953
(1.43 %)		 39.77
(99.89 %)		 13,744
(0.05 %)		 13,744
(0.05 %)		 897,290
(99.95 %)		 4,384,099
(28.17 %)		 1,132,313
(3.34 %)		 14,729,737
(38.08 %)		 28
(0.00 %)		 n/a 17,558
(0.40 %)		 15,148
(0.33 %)
289 Hoffmann's two-fingered sloth
GCA_000164785.2		 n/a n/a 24,546
(1.30 %)		 30,273
(1.15 %)		 n/a 39.80
(98.09 %)		 100,957
(1.91 %)		 101,085
(1.91 %)		 370,035
(98.09 %)		 5,145,551
(52.20 %)		 614,819
(1.62 %)		 17,932,269
(39.26 %)		 280
(0.01 %)		 469,834
(1.28 %)		 55,943
(1.04 %)		 45,466
(0.86 %)
290 hog-nosed bat
GCA_004027555.1		 n/a n/a 20,591
(1.30 %)		 39,589
(1.39 %)		 n/a 40.99
(99.88 %)		 6,224
(0.03 %)		 6,224
(0.03 %)		 1,230,480
(99.97 %)		 4,081,924
(31.12 %)		 1,008,077
(2.20 %)		 12,068,828
(39.98 %)		 17
(0.00 %)		 n/a 55,567
(2.02 %)		 43,665
(1.48 %)
291 Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.3		 49,071
(2.78 %)		 n/a 17,588
(1.64 %)		 19,357
(1.60 %)		 n/a 42.32
(99.79 %)		 0
(0 %)		 38,648
(0.21 %)		 25,848
(100.00 %)		 2,708,400
(27.89 %)		 366,870
(1.48 %)		 11,795,308
(31.27 %)		 99
(0.00 %)		 330,126
(1.83 %)		 59,066
(1.72 %)		 48,113
(1.34 %)
292 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1		 n/a n/a 16,789
(1.65 %)		 18,017
(1.36 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 210
(0.00 %)		 821
(100.00 %)		 3,146,381
(34.68 %)		 430,664
(5.91 %)		 13,246,059
(32.62 %)		 0
(0 %)		 714,785
(2.15 %)		 37,293
(2.80 %)		 35,249
(2.66 %)
293 horse (paternal 2024)
GCA_036426135.1		 n/a n/a 19,073
(1.67 %)		 20,636
(1.38 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 0
(0 %)		 114
(0.00 %)		 602
(100.00 %)		 3,521,953
(35.39 %)		 461,571
(5.26 %)		 14,833,688
(32.77 %)		 2
(0.00 %)		 728,239
(2.01 %)		 43,527
(2.54 %)		 41,129
(2.38 %)
294 horse (Twilight 2018)
GCF_002863925.1		 76,567
(4.06 %)		 n/a 18,997
(1.73 %)		 20,914
(1.42 %)		 113,346
(6.08 %)		 41.50
(99.62 %)		 0
(0 %)		 6,294
(0.38 %)		 4,701
(100.00 %)		 4,080,319
(44.85 %)		 395,037
(1.44 %)		 15,169,517
(29.93 %)		 41
(0.00 %)		 354,039
(1.05 %)		 44,825
(1.77 %)		 37,394
(1.12 %)
295 house mouse (129S1_SvImJv1 2016)
GCA_001624185.1		 n/a n/a 21,289
(2.22 %)		 18,626
(1.42 %)		 102,148
(4.16 %)		 41.77
(85.00 %)		 54,773
(4.85 %)		 366,945
(15.05 %)		 62,882
(95.15 %)		 5,075,137
(40.38 %)		 1,400,072
(2.80 %)		 13,497,076
(26.20 %)		 20,479
(1.14 %)		 431,052
(1.88 %)		 16,957
(0.40 %)		 16,083
(0.37 %)
296 house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022)
GCA_921998555.2		 n/a n/a 21,780
(2.13 %)		 19,436
(1.37 %)		 110,376
(4.47 %)		 41.79
(99.60 %)		 8
(0.00 %)		 1,557
(0.40 %)		 188
(100.00 %)		 4,653,663
(40.74 %)		 1,550,342
(3.54 %)		 12,930,784
(35.48 %)		 22
(0.00 %)		 820,282
(2.63 %)		 23,211
(0.57 %)		 15,822
(0.42 %)
297 house mouse (AKR_J v3 2022)
GCA_922000895.2		 n/a n/a 21,721
(2.13 %)		 19,324
(1.37 %)		 110,654
(4.48 %)		 41.80
(99.85 %)		 6
(0.00 %)		 2,714
(0.15 %)		 201
(100.00 %)		 4,645,513
(40.70 %)		 1,547,237
(3.56 %)		 13,016,932
(35.69 %)		 31
(0.00 %)		 816,257
(2.70 %)		 23,309
(0.57 %)		 15,840
(0.42 %)
298 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1		 n/a n/a 661
(0.88 %)		 720
(0.54 %)		 n/a 38.59
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,806
(100.00 %)		 97,279
(72.21 %)		 40,071
(55.89 %)		 208,928
(64.94 %)		 0
(0 %)		 239,612
(15.41 %)		 506
(0.31 %)		 327
(0.20 %)
299 house mouse (A_J v3 2022)
GCA_921998355.2		 n/a n/a 21,869
(2.13 %)		 19,400
(1.37 %)		 110,389
(4.48 %)		 41.80
(99.39 %)		 5
(0.00 %)		 608
(0.61 %)		 163
(100.00 %)		 4,668,553
(40.80 %)		 1,556,835
(3.58 %)		 12,995,938
(35.53 %)		 4
(0.00 %)		 832,187
(2.55 %)		 23,203
(0.56 %)		 15,809
(0.42 %)
300 house mouse (BALB_cJ v3 2022)
GCA_921997145.2		 n/a n/a 21,891
(2.13 %)		 19,499
(1.37 %)		 110,461
(4.47 %)		 41.79
(99.80 %)		 7
(0.00 %)		 274
(0.20 %)		 217
(100.00 %)		 4,673,990
(40.79 %)		 1,560,327
(3.63 %)		 13,018,071
(35.70 %)		 1
(0.00 %)		 836,824
(2.52 %)		 23,196
(0.56 %)		 15,865
(0.42 %)
301 house mouse (C3H_HeJ v3 2022)
GCA_921997125.2		 n/a n/a 21,793
(2.13 %)		 19,516
(1.38 %)		 110,049
(4.46 %)		 41.79
(99.05 %)		 3
(0.00 %)		 844
(0.95 %)		 174
(100.00 %)		 4,657,005
(40.76 %)		 1,551,107
(3.53 %)		 12,949,100
(35.32 %)		 12
(0.00 %)		 825,975
(2.56 %)		 23,262
(0.56 %)		 15,821
(0.42 %)
302 house mouse (C57BL_6J T2T 2024)
GCA_964188535.1		 n/a n/a 21,496
(1.92 %)		 19,278
(1.25 %)		 n/a 41.31
(99.85 %)		 108
(0.15 %)		 108
(0.15 %)		 345
(99.85 %)		 4,519,975
(46.81 %)		 1,564,206
(14.33 %)		 12,267,542
(42.16 %)		 0
(0 %)		 1,961,197
(5.36 %)		 23,119
(0.55 %)		 15,974
(0.40 %)
303 house mouse (CBA_J v3 2022)
GCA_921998905.2		 n/a n/a 21,829
(2.13 %)		 19,841
(1.39 %)		 110,858
(4.48 %)		 41.79
(99.52 %)		 2
(0.00 %)		 658
(0.48 %)		 145
(100.00 %)		 4,658,032
(40.77 %)		 1,552,298
(3.59 %)		 12,948,038
(35.52 %)		 2
(0.00 %)		 829,314
(2.57 %)		 23,232
(0.56 %)		 15,810
(0.42 %)
304 house mouse (DBA_2J v3 2022)
GCA_921998315.2		 n/a n/a 22,302
(2.08 %)		 19,749
(1.35 %)		 113,269
(4.42 %)		 41.72
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 153
(0.00 %)		 361
(100.00 %)		 4,785,676
(41.69 %)		 1,597,598
(4.56 %)		 13,190,158
(36.58 %)		 0
(0 %)		 968,205
(2.82 %)		 24,140
(0.59 %)		 16,383
(0.43 %)
305 house mouse (FVB_NJ v3 2022)
GCA_921998635.2		 n/a n/a 21,633
(2.15 %)		 19,565
(1.40 %)		 110,246
(4.50 %)		 41.82
(98.35 %)		 8
(0.00 %)		 6,244
(1.65 %)		 384
(100.00 %)		 4,621,601
(40.42 %)		 1,537,622
(3.48 %)		 12,818,729
(34.77 %)		 54
(0.00 %)		 781,344
(2.48 %)		 22,696
(0.55 %)		 15,795
(0.42 %)
306 house mouse (LP_J v3 2022)
GCA_947599735.1		 n/a n/a 22,452
(1.91 %)		 19,841
(1.23 %)		 110,073
(3.98 %)		 41.29
(99.99 %)		 87
(0.00 %)		 386
(0.01 %)		 515
(100.00 %)		 4,839,574
(46.33 %)		 1,645,163
(11.88 %)		 12,936,515
(41.49 %)		 63
(0.00 %)		 1,839,684
(4.85 %)		 24,374
(0.54 %)		 16,515
(0.39 %)
307 house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022)
GCA_921998325.2		 n/a n/a 21,797
(2.13 %)		 19,521
(1.38 %)		 109,890
(4.48 %)		 41.80
(99.50 %)		 2
(0.00 %)		 1,462
(0.50 %)		 170
(100.00 %)		 4,650,016
(40.74 %)		 1,547,220
(3.54 %)		 12,918,125
(35.45 %)		 24
(0.00 %)		 826,087
(2.65 %)		 23,253
(0.56 %)		 15,815
(0.42 %)
308 house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022)
GCA_947593165.1		 n/a n/a 22,481
(1.93 %)		 19,932
(1.26 %)		 109,670
(4.03 %)		 41.34
(100.00 %)		 58
(0.00 %)		 234
(0.00 %)		 441
(100.00 %)		 4,822,230
(45.92 %)		 1,637,027
(11.19 %)		 13,082,730
(41.04 %)		 19
(0.00 %)		 1,756,117
(4.67 %)		 24,187
(0.54 %)		 16,389
(0.39 %)
309 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1		 n/a n/a 22,351
(1.96 %)		 19,629
(1.26 %)		 n/a 41.38
(100.00 %)		 0
(0 %)		 101
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 4,774,018
(45.31 %)		 1,620,102
(10.50 %)		 13,181,250
(40.47 %)		 0
(0 %)		 1,650,132
(4.47 %)		 23,955
(0.54 %)		 16,164
(0.39 %)
310 house mouse C57BL/6J 2020 GRC
GCF_000001635.27		 130,343
(4.85 %)		 n/a 22,409
(2.02 %)		 19,480
(1.31 %)		 140,725
(4.83 %)		 41.67
(97.30 %)		 324
(2.70 %)		 334
(2.70 %)		 22,273
(97.30 %)		 5,361,085
(45.51 %)		 1,641,063
(3.41 %)		 12,722,791
(36.04 %)		 1
(0.00 %)		 858,983
(2.44 %)		 23,794
(0.53 %)		 15,980
(0.39 %)
311 house mouse C57BL_6NJ (2016)
GCA_001632555.1		 n/a n/a 21,177
(2.23 %)		 18,495
(1.42 %)		 103,002
(4.20 %)		 41.76
(82.53 %)		 45,300
(3.63 %)		 410,660
(17.53 %)		 49,821
(96.37 %)		 5,081,049
(40.22 %)		 1,392,942
(2.58 %)		 13,476,268
(25.21 %)		 24,698
(0.96 %)		 429,021
(1.56 %)		 16,877
(0.39 %)		 16,035
(0.36 %)
312 house mouse C57BL_6NJ (2022)
GCA_921999865.2		 n/a n/a 21,817
(2.13 %)		 19,349
(1.37 %)		 n/a 41.79
(99.76 %)		 7
(0.00 %)		 1,127
(0.24 %)		 214
(100.00 %)		 4,661,104
(40.76 %)		 1,552,079
(3.56 %)		 12,953,662
(35.57 %)		 8
(0.00 %)		 825,187
(2.60 %)		 23,204
(0.56 %)		 15,812
(0.42 %)
313 humpback whale (KW2013002 2024)
GCA_041834305.1		 n/a n/a 19,463
(1.32 %)		 22,424
(1.19 %)		 n/a 42.05
(100.00 %)		 0
(0 %)		 88
(0.00 %)		 1,355
(100.00 %)		 4,164,459
(34.02 %)		 1,281,751
(18.33 %)		 12,412,281
(48.28 %)		 0
(0 %)		 2,009,593
(5.80 %)		 82,412
(1.67 %)		 44,791
(0.96 %)
314 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2		 n/a n/a 19,096
(1.59 %)		 20,674
(1.34 %)		 n/a 41.99
(99.75 %)		 0
(0 %)		 277
(0.25 %)		 1,435
(100.00 %)		 5,290,422
(47.51 %)		 478,946
(1.94 %)		 12,568,313
(41.15 %)		 0
(0 %)		 1,196,258
(3.44 %)		 45,850
(1.37 %)		 36,573
(1.00 %)
315 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1		 63,234
(2.88 %)		 n/a 19,601
(1.57 %)		 21,699
(1.34 %)		 n/a 41.83
(99.94 %)		 0
(0 %)		 302
(0.06 %)		 1,250
(100.00 %)		 5,524,454
(47.57 %)		 459,928
(1.40 %)		 13,208,799
(41.21 %)		 0
(0 %)		 1,222,662
(3.37 %)		 41,359
(1.10 %)		 37,367
(0.98 %)
316 Iberian mole (v2.1 TD23 2020)
GCF_014898055.3		 56,973
(3.41 %)		 n/a 18,431
(1.69 %)		 20,317
(1.59 %)		 n/a 41.89
(99.89 %)		 0
(0 %)		 3,575
(0.11 %)		 3,202
(100.00 %)		 2,635,974
(23.38 %)		 496,514
(1.29 %)		 10,969,546
(32.61 %)		 2
(0.00 %)		 637,831
(2.54 %)		 47,466
(2.89 %)		 43,066
(2.46 %)
317 Indian false vampire
GCA_004026885.1		 n/a n/a 20,067
(1.37 %)		 36,544
(1.53 %)		 32,548
(1.37 %)		 40.84
(99.83 %)		 6,266
(0.02 %)		 6,266
(0.02 %)		 1,909,067
(99.98 %)		 4,096,409
(31.50 %)		 699,311
(1.81 %)		 12,307,198
(39.96 %)		 15
(0.00 %)		 n/a 92,830
(3.12 %)		 82,461
(2.65 %)
318 Indian flying fox
GCF_902729225.1		 64,763
(3.85 %)		 n/a 18,222
(2.01 %)		 23,187
(1.82 %)		 45,389
(2.18 %)		 39.83
(99.10 %)		 0
(0 %)		 17,500
(0.90 %)		 16,113
(100.00 %)		 2,972,300
(34.11 %)		 487,157
(1.49 %)		 12,486,528
(27.37 %)		 384
(0.01 %)		 202,174
(1.56 %)		 57,869
(3.73 %)		 61,442
(3.09 %)
319 Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023)
GCA_030015415.1		 n/a n/a 17,560
(2.04 %)		 21,687
(1.83 %)		 n/a 39.77
(100.00 %)		 0
(0 %)		 26
(0.00 %)		 181
(100.00 %)		 2,598,385
(30.48 %)		 486,921
(1.41 %)		 11,828,726
(27.28 %)		 0
(0 %)		 175,274
(0.71 %)		 37,476
(5.58 %)		 39,290
(5.02 %)
320 Indochinese shrew (US011 2019 Broad)
GCA_004027635.1		 n/a n/a 18,870
(0.51 %)		 55,636
(0.81 %)		 n/a 39.81
(99.83 %)		 5,267
(0.02 %)		 5,267
(0.02 %)		 2,420,679
(99.98 %)		 4,130,068
(16.60 %)		 1,663,335
(3.30 %)		 18,728,711
(46.19 %)		 45
(0.00 %)		 n/a 31,453
(0.55 %)		 25,923
(0.42 %)
321 Indus River dolphin
GCA_004363435.1		 n/a n/a 24,321
(1.30 %)		 47,065
(1.14 %)		 n/a 41.72
(99.88 %)		 11,702
(0.04 %)		 11,702
(0.04 %)		 1,110,492
(99.96 %)		 5,093,308
(45.60 %)		 845,860
(1.72 %)		 13,162,111
(41.37 %)		 34
(0.00 %)		 n/a 68,257
(1.40 %)		 49,070
(1.11 %)
322 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1		 n/a n/a 19,064
(1.67 %)		 20,800
(1.49 %)		 n/a 41.55
(100.00 %)		 0
(0 %)		 119
(0.00 %)		 69
(100.00 %)		 3,393,548
(30.92 %)		 723,545
(6.58 %)		 12,073,117
(35.40 %)		 0
(0 %)		 1,106,960
(3.54 %)		 43,736
(1.20 %)		 30,847
(0.87 %)
323 jaguar (BS21 2019)
GCA_004023805.1		 n/a n/a 21,431
(1.51 %)		 32,835
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.89 %)		 21,329
(0.09 %)		 21,329
(0.09 %)		 460,121
(99.91 %)		 5,420,861
(43.75 %)		 1,049,353
(1.93 %)		 13,848,545
(34.90 %)		 43
(0.00 %)		 425,795
(0.77 %)		 71,066
(2.37 %)		 62,901
(1.89 %)
324 jaguar (Sample0147 2023)
GCF_028533385.1		 71,565
(4.12 %)		 n/a 19,122
(1.67 %)		 21,950
(1.36 %)		 n/a 41.58
(99.31 %)		 0
(0 %)		 56,371
(0.70 %)		 36,243
(100.00 %)		 4,552,854
(33.37 %)		 897,371
(1.63 %)		 13,732,912
(32.89 %)		 2,743
(0.10 %)		 314,574
(0.82 %)		 63,777
(2.41 %)		 60,478
(2.01 %)
325 jaguarundi
GCF_014898765.1		 72,564
(3.15 %)		 n/a 18,602
(1.64 %)		 20,510
(1.39 %)		 n/a 41.75
(97.85 %)		 0
(0 %)		 42,499
(2.16 %)		 10,948
(100.00 %)		 5,035,745
(43.29 %)		 907,329
(1.61 %)		 13,590,905
(33.57 %)		 2,609
(0.04 %)		 574,230
(1.55 %)		 69,090
(2.29 %)		 60,356
(1.80 %)
326 Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U)
GCF_014825515.1		 48,705
(2.72 %)		 n/a 19,921
(1.66 %)		 23,614
(1.68 %)		 39,384
(2.12 %)		 41.95
(98.87 %)		 0
(0 %)		 110,840
(1.13 %)		 56,740
(100.00 %)		 2,972,388
(28.79 %)		 405,474
(2.15 %)		 12,458,880
(30.65 %)		 8,380
(0.26 %)		 388,646
(3.79 %)		 61,973
(1.87 %)		 54,441
(1.58 %)
327 Jamaican fruit-eating bat (2021)
GCF_021234435.1		 55,114
(3.18 %)		 n/a 17,875
(1.68 %)		 19,958
(1.66 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 0
(0 %)		 3
(0.00 %)		 868
(100.00 %)		 2,697,287
(28.17 %)		 318,700
(0.84 %)		 11,750,329
(31.61 %)		 0
(0 %)		 245,042
(0.98 %)		 61,951
(1.93 %)		 52,462
(1.61 %)
328 Japanese wild mouse (2022)
GCA_921999095.2		 n/a n/a 23,292
(2.05 %)		 20,114
(1.31 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 397
(0.00 %)		 1,449
(100.00 %)		 4,952,306
(42.53 %)		 1,635,456
(4.60 %)		 12,838,321
(38.56 %)		 8
(0.00 %)		 1,050,247
(2.88 %)		 24,168
(0.56 %)		 16,545
(0.42 %)
329 Java mouse-deer (US108 2019 Broad)
GCA_004024965.1		 n/a n/a 23,081
(1.38 %)		 38,181
(1.41 %)		 n/a 42.73
(99.91 %)		 2,829
(0.01 %)		 2,829
(0.01 %)		 1,159,819
(99.99 %)		 4,791,310
(34.97 %)		 448,498
(1.92 %)		 13,175,375
(39.89 %)		 11
(0.00 %)		 n/a 68,778
(2.92 %)		 61,444
(2.39 %)
330 killer whale (2022)
GCF_937001465.1		 78,470
(3.76 %)		 n/a 18,710
(1.51 %)		 21,101
(1.30 %)		 34,448
(1.49 %)		 41.91
(100.00 %)		 0
(0 %)		 123
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 3,955,401
(36.81 %)		 844,672
(9.94 %)		 12,233,568
(41.63 %)		 2
(0.00 %)		 1,982,992
(5.71 %)		 77,307
(3.08 %)		 40,935
(1.02 %)
331 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1		 n/a n/a 14,982
(1.50 %)		 19,185
(1.30 %)		 n/a 42.13
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 12,410
(100.00 %)		 2,752,892
(35.61 %)		 589,217
(10.15 %)		 8,371,032
(41.11 %)		 0
(0 %)		 1,464,220
(5.92 %)		 57,347
(3.41 %)		 30,003
(1.05 %)
332 killer whale (Morgan 2013)
GCF_000331955.2		 70,972
(3.55 %)		 n/a 18,736
(1.86 %)		 20,365
(1.48 %)		 n/a 41.35
(94.82 %)		 78,432
(5.20 %)		 78,441
(5.20 %)		 80,100
(94.80 %)		 3,978,339
(43.98 %)		 555,737
(1.13 %)		 12,773,973
(31.51 %)		 2,677
(0.03 %)		 355,274
(1.15 %)		 61,145
(1.59 %)		 40,101
(1.20 %)
333 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2		 n/a n/a 17,087
(0.81 %)		 14,711
(0.86 %)		 n/a 39.05
(100.00 %)		 0
(0 %)		 669
(0.00 %)		 1,246
(100.00 %)		 6,280,029
(29.77 %)		 1,123,294
(2.02 %)		 21,796,316
(39.24 %)		 2
(0.00 %)		 412,593
(0.92 %)		 15,957
(0.35 %)		 13,996
(0.24 %)
334 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1		 63,293
(2.96 %)		 n/a 17,918
(1.89 %)		 20,819
(1.86 %)		 n/a 42.57
(99.31 %)		 0
(0 %)		 394
(0.69 %)		 202
(100.00 %)		 2,897,422
(23.58 %)		 797,420
(2.76 %)		 10,057,100
(34.56 %)		 2
(0.00 %)		 425,636
(1.52 %)		 55,965
(2.99 %)		 57,667
(2.01 %)
335 large flying fox
GCF_000151845.1		 52,243
(3.10 %)		 n/a 18,454
(1.91 %)		 23,631
(1.73 %)		 n/a 39.82
(91.80 %)		 189,339
(8.24 %)		 189,340
(8.24 %)		 225,433
(91.76 %)		 3,117,045
(36.49 %)		 504,277
(3.03 %)		 13,025,556
(25.00 %)		 22,188
(0.92 %)		 358,468
(6.48 %)		 78,404
(3.24 %)		 74,747
(2.62 %)
336 large Japanese field mouse (IB14-021 2017)
GCA_002335545.1		 n/a n/a 22,630
(1.74 %)		 33,810
(1.26 %)		 n/a 42.04
(57.78 %)		 4,289,924
(42.35 %)		 4,289,924
(42.35 %)		 4,626,044
(57.65 %)		 3,638,537
(31.76 %)		 1,048,253
(1.87 %)		 12,039,926
(16.61 %)		 10,107
(0.44 %)		 n/a 19,817
(0.34 %)		 18,415
(0.32 %)
337 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1		 n/a n/a 21,678
(1.34 %)		 22,317
(1.25 %)		 n/a 42.17
(100.00 %)		 0
(0 %)		 1,188
(0.00 %)		 1,198
(100.00 %)		 5,530,547
(22.20 %)		 1,357,640
(10.13 %)		 14,334,312
(46.09 %)		 5
(0.00 %)		 2,400,830
(5.08 %)		 123,453
(2.17 %)		 59,337
(1.38 %)
338 leopard (Hobbes primary hap 2022)
GCF_024362965.1		 70,488
(3.29 %)		 n/a 18,472
(1.56 %)		 20,388
(1.41 %)		 n/a 41.75
(99.99 %)		 0
(0 %)		 335
(0.01 %)		 382
(100.00 %)		 4,634,038
(33.80 %)		 932,991
(2.25 %)		 13,686,652
(34.03 %)		 1
(0.00 %)		 451,937
(1.32 %)		 65,793
(2.64 %)		 60,846
(1.89 %)
339 leopard (Maewha 2016 refseq)
GCF_001857705.1		 73,266
(3.20 %)		 n/a 18,881
(1.63 %)		 21,010
(1.44 %)		 n/a 41.71
(96.17 %)		 214,953
(3.85 %)		 214,953
(3.85 %)		 265,330
(96.15 %)		 5,247,029
(42.87 %)		 1,059,446
(5.13 %)		 14,265,573
(32.20 %)		 28,667
(1.17 %)		 525,712
(5.63 %)		 77,001
(2.45 %)		 66,922
(1.91 %)
340 leopard cat
GCF_016509475.1		 59,965
(3.05 %)		 n/a 18,472
(1.65 %)		 19,934
(1.38 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 56
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 4,978,115
(43.28 %)		 901,754
(1.84 %)		 13,596,535
(34.23 %)		 0
(0 %)		 586,248
(1.62 %)		 67,390
(2.50 %)		 62,344
(2.02 %)
341 Leschenault's rousette (2020)
GCA_015472975.1		 n/a n/a 17,815
(2.05 %)		 23,917
(1.90 %)		 n/a 40.13
(99.14 %)		 100,669
(0.88 %)		 100,669
(0.88 %)		 108,810
(99.12 %)		 2,688,705
(31.20 %)		 428,968
(1.19 %)		 12,245,385
(26.51 %)		 13
(0.00 %)		 121,479
(0.56 %)		 58,118
(6.81 %)		 61,535
(5.42 %)
342 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1		 51,730
(1.99 %)		 n/a 20,129
(1.24 %)		 22,089
(1.24 %)		 40,414
(1.76 %)		 42.00
(99.52 %)		 0
(0 %)		 561
(0.48 %)		 160
(100.00 %)		 7,346,291
(41.25 %)		 1,187,587
(2.92 %)		 14,222,177
(44.13 %)		 1
(0.00 %)		 1,219,048
(2.53 %)		 34,688
(0.86 %)		 25,175
(0.54 %)
343 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1		 n/a n/a 17,777
(1.27 %)		 19,232
(1.28 %)		 n/a 42.13
(92.75 %)		 0
(0 %)		 2,875
(7.25 %)		 508
(100.00 %)		 6,476,967
(33.93 %)		 999,133
(2.78 %)		 11,809,834
(40.52 %)		 1
(0.00 %)		 1,062,479
(2.36 %)		 29,872
(0.82 %)		 21,704
(0.51 %)
344 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq)
GCF_000280705.1		 25,991
(1.44 %)		 n/a 19,408
(1.38 %)		 20,312
(1.35 %)		 n/a 41.87
(87.17 %)		 326,464
(12.87 %)		 326,464
(12.87 %)		 337,360
(87.13 %)		 6,125,934
(38.31 %)		 832,825
(1.53 %)		 13,661,612
(33.98 %)		 2,666
(0.03 %)		 430,190
(1.14 %)		 26,669
(0.59 %)		 23,227
(0.47 %)
345 lesser horseshoe bat (hap1 2024)
GCA_964194185.1		 n/a n/a 19,031
(1.88 %)		 21,003
(1.63 %)		 n/a 40.81
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,627
(0.01 %)		 723
(100.00 %)		 3,133,745
(33.46 %)		 660,064
(3.79 %)		 11,720,176
(32.32 %)		 8
(0.00 %)		 718,567
(2.35 %)		 35,414
(1.75 %)		 34,111
(1.64 %)
346 lesser horseshoe bat (hap2 2024)
GCA_964194215.1		 n/a n/a 18,875
(1.72 %)		 21,166
(1.58 %)		 n/a 41.18
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,727
(99.99 %)		 3,160,659
(34.00 %)		 696,130
(6.23 %)		 11,662,645
(34.26 %)		 8
(0.00 %)		 1,288,588
(3.71 %)		 36,176
(1.80 %)		 28,160
(0.89 %)
347 lesser noctule (mNycLei1.hap1.1 2024)
GCA_964264875.1		 n/a n/a 18,260
(1.53 %)		 23,046
(1.60 %)		 n/a 43.05
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,662
(0.01 %)		 1,281
(100.00 %)		 3,246,021
(21.13 %)		 1,298,965
(12.06 %)		 9,752,193
(42.90 %)		 10
(0.00 %)		 2,023,792
(5.54 %)		 66,137
(2.85 %)		 61,169
(1.82 %)
348 lesser noctule (mNycLei1.hap2.1 2024)
GCA_964264895.1		 n/a n/a 17,557
(1.64 %)		 22,484
(1.74 %)		 n/a 43.06
(99.98 %)		 1,563
(0.02 %)		 1,563
(0.02 %)		 2,898
(99.98 %)		 2,999,553
(21.19 %)		 1,122,371
(10.04 %)		 9,331,392
(40.02 %)		 7
(0.00 %)		 1,542,388
(4.66 %)		 61,834
(2.95 %)		 59,536
(1.92 %)
349 lesser panda (RP43 2017)
GCA_002007465.1		 n/a n/a 19,120
(1.69 %)		 20,591
(1.50 %)		 n/a 41.60
(98.56 %)		 137,333
(1.45 %)		 137,333
(1.45 %)		 148,922
(98.55 %)		 4,513,888
(40.87 %)		 692,778
(1.62 %)		 13,691,859
(31.36 %)		 3,438
(0.05 %)		 680,690
(2.32 %)		 64,369
(2.52 %)		 63,356
(2.19 %)
350 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850995.1		 53,210
(2.49 %)		 n/a 18,323
(1.42 %)		 21,350
(1.39 %)		 n/a 41.84
(99.24 %)		 0
(0 %)		 573
(0.76 %)		 168
(100.00 %)		 4,224,344
(28.69 %)		 1,030,576
(2.60 %)		 12,591,989
(42.30 %)		 1
(0.00 %)		 1,128,543
(2.95 %)		 98,189
(2.06 %)		 48,427
(1.15 %)
351 lion
GCF_018350215.1		 67,745
(2.86 %)		 n/a 17,956
(1.69 %)		 19,033
(1.40 %)		 61,242
(3.04 %)		 41.71
(100.00 %)		 45
(0.00 %)		 55
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 4,666,951
(42.23 %)		 889,987
(1.87 %)		 13,151,686
(33.40 %)		 1
(0.00 %)		 394,792
(1.11 %)		 62,675
(2.56 %)		 59,062
(2.11 %)
352 little brown bat
GCF_000147115.1		 50,660
(2.76 %)		 n/a 19,314
(1.86 %)		 22,683
(1.70 %)		 n/a 42.50
(96.66 %)		 61,131
(3.35 %)		 61,131
(3.35 %)		 72,785
(96.65 %)		 3,682,263
(37.05 %)		 634,854
(2.15 %)		 10,841,759
(33.45 %)		 7
(0.00 %)		 404,463
(1.53 %)		 57,630
(1.79 %)		 51,011
(1.50 %)
353 little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022)
GCA_024363435.1		 n/a n/a 19,150
(1.52 %)		 23,435
(1.64 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 0
(0 %)		 229
(0.00 %)		 718
(100.00 %)		 n/a 1,051,300
(12.43 %)		 9,858,628
(43.20 %)		 3
(0.00 %)		 1,828,018
(5.83 %)		 48,101
(2.62 %)		 48,908
(1.62 %)
354 little pocket mouse (longimembris primary hap 2022)
GCA_024363575.1		 n/a n/a 19,760
(1.50 %)		 24,317
(1.63 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 0
(0 %)		 215
(0.00 %)		 1,135
(100.00 %)		 3,913,744
(28.43 %)		 1,095,577
(12.70 %)		 10,273,833
(43.74 %)		 2
(0.00 %)		 1,919,880
(5.85 %)		 49,636
(2.61 %)		 49,755
(1.59 %)
355 little tube-nosed bat
GCA_004026665.1		 n/a n/a 22,009
(1.26 %)		 45,725
(1.35 %)		 n/a 43.80
(99.90 %)		 6,795
(0.03 %)		 6,795
(0.03 %)		 886,972
(99.97 %)		 3,372,804
(23.57 %)		 1,014,476
(3.00 %)		 11,948,592
(41.18 %)		 29
(0.00 %)		 n/a 71,530
(2.05 %)		 53,483
(1.43 %)
356 long-finned pilot whale (primary hap 2023)
GCF_963455315.1		 61,797
(2.84 %)		 n/a 18,712
(1.51 %)		 20,920
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,084
(0.01 %)		 993
(100.00 %)		 4,125,420
(35.62 %)		 1,577,899
(12.03 %)		 12,347,226
(42.01 %)		 10
(0.00 %)		 1,284,155
(3.89 %)		 71,821
(5.51 %)		 41,663
(1.04 %)
357 long-finned pilot whale (primary hap 2024)
GCA_963455315.2		 n/a n/a 18,726
(1.51 %)		 20,948
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 2
(0.00 %)		 1,084
(0.01 %)		 995
(100.00 %)		 4,125,459
(35.62 %)		 1,577,896
(12.03 %)		 12,347,226
(42.01 %)		 10
(0.00 %)		 1,284,155
(3.89 %)		 71,822
(5.51 %)		 41,663
(1.04 %)
358 long-finned pilot whale (primary hap 2024)
GCF_963455315.2		 61,447
(2.80 %)		 n/a 18,725
(1.51 %)		 20,946
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 1,084
(0.01 %)		 1,084
(0.01 %)		 2,076
(99.99 %)		 4,125,452
(35.62 %)		 1,577,896
(12.03 %)		 12,347,170
(42.01 %)		 10
(0.00 %)		 1,284,155
(3.89 %)		 71,822
(5.51 %)		 41,663
(1.04 %)
359 long-finned pilot whale (X-22926-18 2019)
GCF_006547405.1		 66,104
(3.28 %)		 n/a 18,772
(1.80 %)		 21,031
(1.46 %)		 33,672
(1.78 %)		 41.29
(99.58 %)		 14,583
(0.42 %)		 14,859
(0.42 %)		 20,999
(99.58 %)		 3,962,125
(45.58 %)		 557,247
(1.11 %)		 12,616,535
(34.70 %)		 643
(0.01 %)		 404,788
(1.24 %)		 62,905
(1.69 %)		 41,085
(1.25 %)
360 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1		 54,841
(2.98 %)		 n/a 18,096
(1.59 %)		 19,514
(1.52 %)		 n/a 41.06
(95.56 %)		 78,817
(4.46 %)		 78,817
(4.46 %)		 81,656
(95.54 %)		 4,018,866
(30.94 %)		 607,082
(1.15 %)		 13,528,234
(28.15 %)		 1,183
(0.02 %)		 162,447
(0.63 %)		 46,931
(1.25 %)		 45,334
(1.13 %)
361 long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad)
GCA_004027375.1		 n/a n/a 19,208
(1.99 %)		 31,180
(1.92 %)		 n/a 39.56
(99.97 %)		 2,056
(0.01 %)		 2,056
(0.01 %)		 174,041
(99.99 %)		 2,893,453
(32.61 %)		 597,516
(1.76 %)		 12,093,608
(28.14 %)		 6
(0.00 %)		 n/a 63,015
(4.70 %)		 62,530
(4.18 %)
362 Lowland paca
GCA_004365215.1		 n/a n/a 21,953
(0.62 %)		 56,356
(0.80 %)		 n/a 40.83
(99.78 %)		 3,060
(0.01 %)		 3,060
(0.01 %)		 3,771,510
(99.99 %)		 5,892,507
(29.20 %)		 802,811
(1.38 %)		 18,630,883
(38.61 %)		 101
(0.00 %)		 n/a 61,715
(0.94 %)		 53,212
(0.77 %)
363 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq)
GCF_001685135.1		 48,591
(2.76 %)		 n/a 19,458
(1.57 %)		 24,783
(1.38 %)		 41,272
(1.95 %)		 40.78
(92.27 %)		 0
(0 %)		 984,658
(7.81 %)		 80,670
(100.00 %)		 3,064,599
(35.21 %)		 866,309
(3.08 %)		 13,310,859
(28.76 %)		 389,500
(1.56 %)		 884,203
(3.10 %)		 35,558
(0.84 %)		 33,754
(0.78 %)
364 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1		 68,043
(3.50 %)		 n/a 18,167
(1.72 %)		 20,453
(1.54 %)		 n/a 40.83
(91.78 %)		 0
(0 %)		 57,746
(8.23 %)		 17,969
(100.00 %)		 2,864,567
(34.23 %)		 277,996
(1.69 %)		 12,659,207
(25.72 %)		 610
(0.01 %)		 258,572
(5.38 %)		 33,486
(1.00 %)		 32,201
(0.94 %)
365 Masai giraffe (MA1 2016 Penn St)
GCA_001651235.1		 n/a n/a 20,950
(1.52 %)		 28,854
(1.33 %)		 n/a 41.39
(96.50 %)		 257,672
(3.48 %)		 257,672
(3.48 %)		 770,838
(96.52 %)		 5,502,479
(43.94 %)		 531,418
(2.64 %)		 13,936,018
(36.18 %)		 31,941
(0.52 %)		 748,633
(4.02 %)		 40,504
(1.02 %)		 38,345
(0.94 %)
366 meadow jumping mouse
GCA_004024765.1		 n/a n/a 22,236
(1.08 %)		 44,719
(1.21 %)		 n/a 42.31
(99.88 %)		 7,610
(0.03 %)		 7,610
(0.03 %)		 1,165,710
(99.97 %)		 6,135,446
(33.31 %)		 1,525,146
(3.34 %)		 13,854,475
(39.91 %)		 38
(0.00 %)		 n/a 26,633
(0.68 %)		 21,059
(0.49 %)
367 meadow vole (hap1 2024)
GCA_037038515.1		 n/a n/a 19,134
(1.78 %)		 20,672
(1.55 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 0
(0 %)		 60
(0.00 %)		 181
(100.00 %)		 4,818,689
(41.90 %)		 962,362
(4.16 %)		 12,161,222
(34.42 %)		 0
(0 %)		 1,559,409
(4.65 %)		 23,781
(0.74 %)		 19,793
(0.55 %)
368 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1		 n/a n/a 19,001
(1.82 %)		 20,271
(1.68 %)		 n/a 42.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 53
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 3,141,368
(21.37 %)		 898,900
(4.24 %)		 11,475,531
(32.14 %)		 0
(0 %)		 862,918
(2.64 %)		 22,186
(0.75 %)		 16,985
(0.48 %)
369 meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq)
GCF_006229205.1		 58,806
(2.67 %)		 n/a 19,009
(1.64 %)		 19,088
(1.36 %)		 n/a 41.68
(99.72 %)		 0
(0 %)		 65,245
(0.28 %)		 63,791
(100.00 %)		 4,564,931
(40.13 %)		 634,179
(1.21 %)		 13,631,635
(32.17 %)		 5,134
(0.09 %)		 236,044
(0.75 %)		 64,858
(2.22 %)		 63,010
(1.87 %)
370 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022)
GCA_024711525.1		 n/a n/a 18,555
(1.22 %)		 24,508
(1.35 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 0
(0 %)		 181
(0.00 %)		 3,482
(100.00 %)		 6,419,007
(53.84 %)		 1,384,128
(15.63 %)		 11,486,822
(50.51 %)		 2
(0.00 %)		 4,107,493
(7.03 %)		 38,521
(1.60 %)		 33,680
(1.03 %)
371 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCA_024711535.1		 n/a n/a 21,281
(1.16 %)		 28,592
(1.34 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 182
(0.00 %)		 4,354
(100.00 %)		 4,378,955
(29.66 %)		 1,568,842
(17.75 %)		 12,889,786
(51.96 %)		 1
(0.00 %)		 5,252,588
(7.78 %)		 46,167
(1.71 %)		 38,895
(0.74 %)
372 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCF_024711535.1		 68,331
(2.37 %)		 n/a 21,280
(1.16 %)		 28,582
(1.34 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 182
(0.00 %)		 4,535
(100.00 %)		 4,378,949
(29.66 %)		 1,568,842
(17.75 %)		 12,889,725
(51.96 %)		 1
(0.00 %)		 5,252,586
(7.78 %)		 46,167
(1.71 %)		 38,895
(0.74 %)
373 Merriam's long-tongued bat (hap1 2024)
GCA_039655065.1		 n/a n/a 18,172
(1.67 %)		 20,736
(1.60 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 0
(0 %)		 47
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 2,998,913
(29.48 %)		 418,833
(1.07 %)		 11,783,716
(32.96 %)		 1
(0.00 %)		 317,774
(1.27 %)		 65,956
(4.38 %)		 57,781
(3.83 %)
374 Merriam's long-tongued bat (hap2 2024)
GCA_039656995.1		 n/a n/a 18,105
(1.68 %)		 20,751
(1.60 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 0
(0 %)		 45
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 2,994,788
(29.48 %)		 415,375
(1.07 %)		 11,752,432
(32.88 %)		 3
(0.00 %)		 316,278
(1.25 %)		 65,597
(4.38 %)		 57,841
(3.85 %)
375 minke whale (2013 refseq)
GCF_000493695.1		 42,553
(2.38 %)		 n/a 19,159
(1.73 %)		 18,656
(1.42 %)		 n/a 40.94
(94.06 %)		 173,296
(5.96 %)		 173,296
(5.96 %)		 184,072
(94.04 %)		 n/a 573,951
(1.48 %)		 13,504,347
(30.96 %)		 211
(0.02 %)		 317,691
(1.50 %)		 65,448
(1.38 %)		 43,887
(1.02 %)
376 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1		 n/a n/a 20,412
(1.46 %)		 27,421
(1.34 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 21,272
(100.00 %)		 3,811,435
(36.24 %)		 959,712
(10.27 %)		 12,159,896
(41.30 %)		 0
(0 %)		 1,298,777
(4.12 %)		 69,852
(1.62 %)		 42,454
(1.09 %)
377 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1		 61,711
(2.51 %)		 n/a 19,550
(1.49 %)		 21,499
(1.26 %)		 n/a 41.55
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,177
(0.01 %)		 1,374
(100.00 %)		 4,006,927
(35.92 %)		 1,058,105
(12.08 %)		 12,708,103
(42.66 %)		 4
(0.00 %)		 1,500,515
(4.32 %)		 72,756
(1.59 %)		 44,094
(1.06 %)
378 Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.)
GCF_002204375.1		 40,346
(2.29 %)		 n/a 21,215
(1.83 %)		 24,305
(1.47 %)		 n/a 42.09
(95.23 %)		 0
(0 %)		 91,601
(4.78 %)		 68,793
(100.00 %)		 4,821,343
(37.74 %)		 940,776
(1.82 %)		 13,848,274
(31.31 %)		 11,561
(0.34 %)		 205,312
(0.64 %)		 24,154
(0.74 %)		 22,829
(0.67 %)
379 Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI)
GCA_008131255.1		 n/a n/a 19,952
(1.59 %)		 23,462
(1.36 %)		 n/a 41.98
(99.01 %)		 103,843
(0.97 %)		 103,843
(0.97 %)		 412,933
(99.03 %)		 5,009,454
(0.00 %)		 1,042,929
(2.52 %)		 14,121,194
(34.63 %)		 5,269
(0.12 %)		 n/a 26,044
(0.71 %)		 23,140
(0.56 %)
380 Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023)
GCF_030254825.1		 65,502
(2.97 %)		 n/a 19,045
(1.53 %)		 20,203
(1.29 %)		 n/a 41.87
(100.00 %)		 0
(0 %)		 53
(0.00 %)		 193
(100.00 %)		 4,477,607
(37.21 %)		 1,124,432
(5.22 %)		 13,244,320
(39.20 %)		 0
(0 %)		 1,187,344
(2.95 %)		 25,300
(0.76 %)		 21,781
(0.54 %)
381 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1		 n/a n/a 16,419
(0.77 %)		 17,219
(0.89 %)		 n/a 39.03
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 33
(0.00 %)		 9,959
(100.00 %)		 6,332,360
(29.69 %)		 1,065,454
(2.09 %)		 17,908,986
(42.25 %)		 0
(0 %)		 1,232,672
(2.38 %)		 13,856
(0.35 %)		 11,596
(0.23 %)
382 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1		 47,034
(2.02 %)		 n/a 18,399
(0.80 %)		 15,519
(0.85 %)		 n/a 39.11
(99.91 %)		 0
(0 %)		 260
(0.09 %)		 17
(100.00 %)		 9,107,968
(41.08 %)		 1,249,635
(2.12 %)		 21,135,324
(42.80 %)		 0
(0 %)		 1,546,314
(2.55 %)		 16,598
(0.36 %)		 13,911
(0.23 %)
383 Montane guinea pig
GCA_004027695.1		 n/a n/a 20,064
(1.06 %)		 31,321
(1.18 %)		 39,905
(1.42 %)		 40.09
(99.88 %)		 11,321
(0.04 %)		 11,321
(0.04 %)		 1,379,500
(99.96 %)		 4,730,634
(30.02 %)		 1,583,664
(6.57 %)		 15,806,339
(40.40 %)		 31
(0.00 %)		 n/a 37,371
(0.76 %)		 27,339
(0.57 %)
384 mountain beaver
GCA_004027875.1		 n/a n/a 22,428
(1.10 %)		 38,670
(1.12 %)		 n/a 40.58
(99.89 %)		 7,253
(0.02 %)		 7,253
(0.02 %)		 1,286,779
(99.98 %)		 5,859,004
(32.29 %)		 914,052
(2.37 %)		 16,249,666
(38.21 %)		 103
(0.00 %)		 n/a 39,133
(0.76 %)		 26,371
(0.54 %)
385 muskrat
GCA_004026605.1		 n/a n/a 22,540
(1.52 %)		 32,136
(1.35 %)		 n/a 41.59
(99.93 %)		 6,243
(0.02 %)		 6,243
(0.02 %)		 571,599
(99.98 %)		 4,437,736
(28.49 %)		 922,826
(2.38 %)		 13,945,732
(35.23 %)		 31
(0.00 %)		 n/a 19,876
(0.50 %)		 16,936
(0.41 %)
386 naked mole-rat (MEF-2018 2020)
GCA_014060925.1		 n/a n/a 22,011
(1.30 %)		 21,392
(1.22 %)		 n/a 40.13
(95.11 %)		 139,535
(4.91 %)		 139,535
(4.91 %)		 148,797
(95.09 %)		 4,885,102
(35.91 %)		 654,418
(1.90 %)		 16,401,315
(34.21 %)		 228
(0.03 %)		 1,754,699
(7.39 %)		 40,717
(0.98 %)		 38,057
(0.81 %)
387 naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq)
GCF_000247695.1		 74,574
(3.56 %)		 n/a 21,332
(1.74 %)		 20,861
(1.51 %)		 n/a 40.21
(88.43 %)		 110,424
(11.59 %)		 110,424
(11.59 %)		 114,653
(88.41 %)		 4,179,991
(32.69 %)		 484,933
(0.92 %)		 13,672,561
(27.63 %)		 595
(0.01 %)		 103,053
(0.44 %)		 31,950
(0.88 %)		 31,055
(0.81 %)
388 narwhal (Baffin Bay 2019)
GCF_005190385.1		 51,639
(2.71 %)		 n/a 18,741
(1.78 %)		 20,365
(1.40 %)		 33,148
(1.79 %)		 41.22
(99.52 %)		 0
(0 %)		 18,323
(0.49 %)		 6,972
(100.00 %)		 4,011,742
(43.97 %)		 565,367
(1.22 %)		 12,720,018
(34.85 %)		 1,797
(0.02 %)		 430,336
(1.30 %)		 60,492
(1.58 %)		 43,582
(1.25 %)
389 narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022)
GCA_005190385.3		 n/a n/a 18,681
(1.79 %)		 19,816
(1.40 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 0
(0 %)		 313
(0.00 %)		 101
(100.00 %)		 3,618,235
(37.24 %)		 612,229
(1.52 %)		 12,641,632
(35.02 %)		 0
(0 %)		 550,897
(1.69 %)		 60,518
(1.78 %)		 57,655
(1.47 %)
390 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1		 32,050
(3.03 %)		 n/a 18,015
(2.17 %)		 18,293
(1.87 %)		 n/a 42.07
(96.24 %)		 0
(0 %)		 204,616
(3.79 %)		 1,269
(100.00 %)		 2,565,457
(28.95 %)		 376,532
(1.91 %)		 10,427,823
(26.35 %)		 3,320
(0.15 %)		 203,691
(1.83 %)		 63,261
(2.07 %)		 59,010
(1.80 %)
391 Natterer's bat (mMyoNat1.hap1.1 2024)
GCA_964212035.1		 n/a n/a 19,180
(1.72 %)		 22,635
(1.71 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,620
(0.02 %)		 343
(100.00 %)		 3,081,500
(24.27 %)		 797,071
(5.37 %)		 10,372,159
(38.30 %)		 18
(0.00 %)		 729,559
(2.57 %)		 64,460
(2.57 %)		 57,628
(1.87 %)
392 Natterer's bat (mMyoNat1.hap2.1 2024)
GCA_964212025.1		 n/a n/a 18,275
(1.81 %)		 21,799
(1.80 %)		 n/a 43.28
(99.99 %)		 1,387
(0.01 %)		 1,387
(0.01 %)		 1,706
(99.99 %)		 2,833,193
(23.73 %)		 705,278
(5.10 %)		 9,802,564
(36.67 %)		 5
(0.00 %)		 596,875
(2.28 %)		 61,024
(2.68 %)		 55,279
(1.95 %)
393 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2		 49,109
(2.78 %)		 n/a 17,703
(1.63 %)		 19,389
(1.60 %)		 n/a 42.32
(99.79 %)		 0
(0 %)		 38,675
(0.21 %)		 26,068
(100.00 %)		 2,862,405
(29.31 %)		 366,960
(1.48 %)		 11,796,203
(31.27 %)		 105
(0.00 %)		 330,211
(1.83 %)		 59,091
(1.70 %)		 48,137
(1.34 %)
394 Nile rat (mArvNil1 2024)
GCA_011762505.2		 n/a n/a 19,637
(1.95 %)		 19,610
(1.43 %)		 n/a 41.39
(99.19 %)		 0
(0 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 5,399,465
(42.90 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,540
(32.71 %)		 2
(0.00 %)		 979,697
(2.05 %)		 17,767
(0.51 %)		 15,566
(0.42 %)
395 Nilgiri tahr
GCA_004026825.1		 n/a n/a 22,735
(1.44 %)		 34,961
(1.27 %)		 n/a 42.37
(99.93 %)		 10,387
(0.04 %)		 10,387
(0.04 %)		 479,550
(99.96 %)		 5,793,761
(48.50 %)		 535,297
(1.34 %)		 13,378,352
(42.46 %)		 61
(0.00 %)		 n/a 57,653
(1.29 %)		 42,256
(1.01 %)
396 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023)
GCA_030445055.1		 n/a n/a 19,429
(1.06 %)		 22,396
(1.07 %)		 n/a 40.96
(99.27 %)		 0
(0 %)		 845
(0.73 %)		 594
(100.00 %)		 4,369,568
(32.83 %)		 673,707
(1.55 %)		 18,586,102
(42.41 %)		 5
(0.00 %)		 558,255
(1.38 %)		 131,852
(2.78 %)		 71,325
(1.75 %)
397 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023)
GCA_030445055.2		 n/a n/a 19,350
(1.07 %)		 22,207
(1.07 %)		 n/a 40.97
(99.27 %)		 0
(0 %)		 823
(0.73 %)		 588
(100.00 %)		 4,330,716
(32.85 %)		 661,966
(1.52 %)		 18,302,021
(42.22 %)		 5
(0.00 %)		 542,125
(1.36 %)		 130,245
(2.79 %)		 70,861
(1.76 %)
398 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap2 2023)
GCF_030445035.1		 69,043
(2.70 %)		 n/a 20,516
(1.05 %)		 n/a n/a 41.00
(99.68 %)		 0
(0 %)		 771
(0.32 %)		 539
(100.00 %)		 4,656,325
(32.86 %)		 726,574
(1.99 %)		 19,585,522
(43.65 %)		 4
(0.00 %)		 720,053
(1.59 %)		 140,990
(2.86 %)		 76,550
(1.81 %)
399 nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor)
GCF_000208655.3		 46,110
(1.87 %)		 n/a 20,820
(1.08 %)		 25,226
(1.08 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,408
(9.13 %)		 268,437
(9.13 %)		 314,788
(90.87 %)		 4,552,770
(34.01 %)		 651,225
(1.26 %)		 19,266,969
(38.27 %)		 239
(0.00 %)		 482,237
(1.17 %)		 139,490
(2.47 %)		 79,407
(1.60 %)
400 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022)
GCA_026167925.1		 n/a n/a 19,342
(1.57 %)		 20,947
(1.48 %)		 n/a 42.40
(100.00 %)		 0
(0 %)		 229
(0.00 %)		 1,006
(100.00 %)		 4,161,568
(23.13 %)		 1,278,205
(8.22 %)		 13,148,019
(37.60 %)		 1
(0.00 %)		 1,208,815
(3.32 %)		 23,523
(0.71 %)		 19,170
(0.46 %)
401 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1		 n/a n/a 19,700
(1.54 %)		 22,354
(1.46 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 244
(0.00 %)		 244
(0.00 %)		 2,082
(100.00 %)		 6,089,884
(47.99 %)		 1,358,786
(9.39 %)		 13,799,349
(39.08 %)		 3
(0.00 %)		 1,511,691
(3.84 %)		 24,733
(0.70 %)		 22,588
(0.58 %)
402 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1		 n/a n/a 15,210
(1.55 %)		 18,316
(1.43 %)		 n/a 41.06
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,051
(100.00 %)		 3,911,633
(40.55 %)		 565,546
(1.54 %)		 10,853,726
(32.61 %)		 0
(0 %)		 378,575
(1.36 %)		 40,925
(1.35 %)		 26,837
(0.96 %)
403 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1		 n/a n/a 18,102
(1.58 %)		 20,073
(1.40 %)		 n/a 41.03
(100.00 %)		 0
(0 %)		 277
(0.00 %)		 116
(100.00 %)		 4,958,089
(41.64 %)		 719,163
(1.59 %)		 13,867,662
(33.89 %)		 7
(0.00 %)		 506,727
(1.48 %)		 51,299
(1.36 %)		 33,440
(0.96 %)
404 North Atlantic right whale (hap1 2023)
GCA_028571275.1		 n/a n/a 18,699
(1.61 %)		 20,354
(1.28 %)		 n/a 41.64
(99.84 %)		 0
(0 %)		 385
(0.16 %)		 947
(100.00 %)		 3,815,900
(43.46 %)		 718,935
(11.38 %)		 11,928,210
(42.25 %)		 2
(0.00 %)		 1,117,252
(3.44 %)		 85,881
(1.90 %)		 41,289
(1.19 %)
405 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1		 49,646
(1.86 %)		 n/a 19,562
(1.46 %)		 21,631
(1.25 %)		 n/a 41.69
(99.83 %)		 0
(0 %)		 367
(0.17 %)		 789
(100.00 %)		 1,368,536
(2.24 %)		 841,303
(13.08 %)		 12,527,582
(43.92 %)		 11
(0.00 %)		 1,404,448
(3.90 %)		 94,259
(1.92 %)		 41,005
(0.96 %)
406 North Pacific right whale
GCA_004363455.1		 n/a n/a 23,145
(1.43 %)		 38,161
(1.21 %)		 n/a 41.15
(99.88 %)		 7,094
(0.03 %)		 7,094
(0.03 %)		 1,361,057
(99.97 %)		 5,039,622
(45.69 %)		 694,986
(1.31 %)		 14,063,101
(40.51 %)		 73
(0.00 %)		 n/a 74,800
(1.52 %)		 49,455
(1.20 %)
407 northern American river otter
GCF_010015895.1		 53,945
(2.18 %)		 n/a 18,974
(1.68 %)		 21,247
(1.45 %)		 n/a 41.41
(99.58 %)		 6,928
(0.42 %)		 7,620
(0.42 %)		 13,541
(99.58 %)		 4,538,847
(41.18 %)		 685,281
(1.20 %)		 13,840,953
(32.61 %)		 360
(0.01 %)		 364,620
(0.96 %)		 53,559
(1.88 %)		 52,003
(1.68 %)
408 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1		 n/a n/a 18,343
(1.80 %)		 23,253
(1.77 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(0.00 %)		 4,899
(100.00 %)		 1,174,241
(2.96 %)		 825,170
(5.11 %)		 9,889,579
(36.12 %)		 0
(0 %)		 598,356
(2.10 %)		 76,164
(3.52 %)		 59,778
(2.27 %)
409 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1		 n/a n/a 18,636
(1.75 %)		 21,446
(1.68 %)		 n/a 43.32
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,423
(0.01 %)		 207
(100.00 %)		 1,259,729
(2.95 %)		 905,676
(6.25 %)		 10,554,535
(38.21 %)		 3
(0.00 %)		 780,081
(2.54 %)		 77,656
(3.27 %)		 60,964
(2.14 %)
410 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1		 n/a n/a 18,924
(1.53 %)		 22,934
(1.58 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 0
(0 %)		 199
(0.00 %)		 146
(100.00 %)		 3,850,624
(31.21 %)		 648,359
(3.76 %)		 11,788,702
(39.25 %)		 2
(0.00 %)		 811,589
(2.31 %)		 85,908
(2.60 %)		 73,781
(1.91 %)
411 northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024)
GCA_039880945.1		 n/a n/a 18,933
(1.44 %)		 23,629
(1.50 %)		 n/a 42.60
(100.00 %)		 0
(0 %)		 113
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 4,027,155
(30.73 %)		 712,278
(5.22 %)		 12,003,034
(41.58 %)		 3
(0.00 %)		 975,691
(2.71 %)		 96,116
(3.02 %)		 75,017
(1.84 %)
412 northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024)
GCA_039880925.1		 n/a n/a 18,305
(1.49 %)		 22,534
(1.56 %)		 n/a 42.75
(100.00 %)		 0
(0 %)		 80
(0.00 %)		 282
(100.00 %)		 3,783,543
(30.10 %)		 656,592
(4.68 %)		 11,353,707
(40.26 %)		 0
(0 %)		 877,118
(2.58 %)		 92,041
(3.01 %)		 72,323
(1.87 %)
413 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1		 n/a n/a 19,537
(1.44 %)		 27,826
(1.30 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 23,401
(100.00 %)		 3,634,923
(35.56 %)		 672,860
(11.00 %)		 11,175,398
(41.72 %)		 0
(0 %)		 1,941,411
(5.36 %)		 62,007
(1.94 %)		 36,247
(0.95 %)
414 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1		 n/a n/a 19,073
(1.44 %)		 20,821
(1.21 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,098
(0.01 %)		 757
(100.00 %)		 3,997,911
(34.76 %)		 769,275
(14.94 %)		 12,133,820
(44.83 %)		 6
(0.00 %)		 3,171,972
(7.30 %)		 67,258
(2.00 %)		 38,513
(0.89 %)
415 northern elephant seal (BS05 2019 Broad)
GCA_004023865.1		 n/a n/a 22,834
(1.54 %)		 36,083
(1.32 %)		 n/a 41.52
(99.94 %)		 9,483
(0.04 %)		 9,483
(0.04 %)		 330,739
(99.96 %)		 4,849,944
(43.83 %)		 600,306
(1.16 %)		 13,420,049
(34.43 %)		 55
(0.00 %)		 452,384
(1.15 %)		 57,236
(1.62 %)		 53,204
(1.43 %)
416 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank)
GCA_029215605.1		 n/a n/a 19,278
(1.60 %)		 19,908
(1.39 %)		 n/a 41.84
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 98
(0.00 %)		 596
(100.00 %)		 4,348,333
(34.40 %)		 621,985
(2.21 %)		 13,251,768
(35.32 %)		 0
(0 %)		 811,715
(2.28 %)		 69,898
(2.38 %)		 44,044
(1.16 %)
417 Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq)
GCF_029215605.1		 74,106
(3.88 %)		 n/a 19,277
(1.60 %)		 20,000
(1.36 %)		 n/a 41.84
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 98
(0.00 %)		 595
(100.00 %)		 4,348,327
(34.40 %)		 621,980
(2.21 %)		 13,251,706
(35.32 %)		 0
(0 %)		 811,710
(2.28 %)		 69,897
(2.38 %)		 44,044
(1.16 %)
418 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023)
GCA_029215635.1		 n/a n/a 19,340
(1.59 %)		 19,732
(1.37 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 60
(0.00 %)		 482
(100.00 %)		 4,365,070
(34.26 %)		 627,639
(2.43 %)		 13,174,494
(35.47 %)		 2
(0.00 %)		 866,044
(2.39 %)		 74,314
(2.49 %)		 44,405
(1.17 %)
419 northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022)
GCF_021288785.2		 53,819
(3.32 %)		 n/a 20,099
(1.75 %)		 20,957
(1.35 %)		 n/a 41.51
(99.35 %)		 0
(0 %)		 39,936
(0.65 %)		 142,455
(100.00 %)		 4,368,400
(33.93 %)		 588,877
(1.19 %)		 13,745,426
(32.96 %)		 2,726
(0.09 %)		 n/a 52,064
(1.59 %)		 49,271
(1.43 %)
420 northern fur seal
GCF_003265705.1		 54,940
(2.43 %)		 n/a 23,408
(1.78 %)		 23,666
(1.43 %)		 52,089
(2.17 %)		 41.48
(98.01 %)		 38,666
(1.99 %)		 38,666
(1.99 %)		 52,469
(98.01 %)		 5,047,032
(43.38 %)		 638,130
(1.06 %)		 14,922,442
(33.12 %)		 2,675
(0.04 %)		 444,034
(1.22 %)		 57,281
(1.44 %)		 53,162
(1.27 %)
421 northern gundi
GCA_004027205.1		 n/a n/a 18,035
(1.39 %)		 27,379
(1.57 %)		 n/a 42.68
(99.91 %)		 5,037
(0.02 %)		 5,037
(0.02 %)		 865,110
(99.98 %)		 4,149,883
(27.83 %)		 654,063
(1.64 %)		 12,342,565
(33.72 %)		 12
(0.00 %)		 n/a 47,533
(1.43 %)		 40,352
(1.09 %)
422 northern mole vole
GCA_001685095.1		 n/a n/a 23,252
(1.39 %)		 44,209
(1.25 %)		 n/a 41.68
(99.04 %)		 371,627
(0.98 %)		 371,627
(0.98 %)		 722,087
(99.02 %)		 3,923,814
(25.79 %)		 898,453
(2.47 %)		 13,708,986
(29.04 %)		 96,051
(0.87 %)		 280,901
(1.10 %)		 16,583
(0.36 %)		 15,193
(0.32 %)
423 northern white rhinoceros
GCA_004027795.1		 n/a n/a 25,328
(1.34 %)		 61,003
(1.95 %)		 n/a 41.32
(99.90 %)		 7,054
(0.03 %)		 7,054
(0.03 %)		 949,480
(99.97 %)		 4,330,882
(38.89 %)		 484,754
(1.12 %)		 15,544,248
(33.11 %)		 44
(0.00 %)		 n/a 43,689
(2.08 %)		 40,625
(1.98 %)
424 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank)
GCA_036323735.1		 114,725
(42.69 %)		 n/a 21,917
(1.75 %)		 19,476
(1.26 %)		 n/a 41.82
(99.86 %)		 0
(0 %)		 220
(0.14 %)		 77
(100.00 %)		 4,700,726
(39.99 %)		 1,603,005
(5.45 %)		 13,451,813
(38.68 %)		 21
(0.00 %)		 1,553,966
(4.21 %)		 20,118
(0.44 %)		 17,465
(0.38 %)
425 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq)
GCF_036323735.1		 114,725
(5.38 %)		 n/a 21,870
(1.74 %)		 19,989
(1.27 %)		 n/a 41.82
(99.86 %)		 0
(0 %)		 220
(0.14 %)		 76
(100.00 %)		 5,294,185
(42.75 %)		 1,603,005
(5.45 %)		 13,451,760
(38.68 %)		 21
(0.00 %)		 1,553,966
(4.21 %)		 20,118
(0.44 %)		 17,703
(0.38 %)
426 Norway rat (F344/Stm 2024)
GCA_041222355.1		 n/a n/a 21,764
(1.78 %)		 20,141
(1.30 %)		 n/a 41.87
(99.96 %)		 0
(0 %)		 234
(0.04 %)		 120
(100.00 %)		 4,636,987
(39.98 %)		 1,579,595
(5.22 %)		 13,544,768
(38.06 %)		 4
(0.00 %)		 1,510,531
(4.17 %)		 20,127
(0.46 %)		 17,493
(0.40 %)
427 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1		 n/a n/a 3,096
(1.64 %)		 2,450
(1.02 %)		 n/a 41.23
(100.00 %)		 0
(0 %)		 6
(0.00 %)		 3,156
(100.00 %)		 517,347
(50.76 %)		 157,701
(3.90 %)		 1,502,752
(34.14 %)		 0
(0 %)		 157,923
(4.57 %)		 1,806
(0.40 %)		 1,380
(0.31 %)
428 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2		 99,139
(4.10 %)		 n/a 21,526
(1.86 %)		 19,266
(1.33 %)		 54,530
(2.79 %)		 41.99
(99.19 %)		 581
(0.81 %)		 581
(0.81 %)		 757
(99.19 %)		 5,029,005
(45.44 %)		 1,514,974
(3.57 %)		 13,450,428
(35.83 %)		 4
(0.00 %)		 1,172,090
(3.51 %)		 19,244
(0.46 %)		 16,098
(0.39 %)
429 Norway rat celera
GCF_000002265.2		 39,745
(2.91 %)		 n/a 21,492
(1.95 %)		 19,112
(1.38 %)		 n/a 41.98
(95.28 %)		 111,393
(4.74 %)		 111,391
(4.74 %)		 118,423
(95.26 %)		 9,721,869
(43.57 %)		 1,387,703
(3.05 %)		 13,224,921
(32.45 %)		 11
(0.00 %)		 813,629
(2.20 %)		 18,944
(0.42 %)		 16,117
(0.37 %)
430 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5		 69,456
(3.34 %)		 n/a 22,369
(1.83 %)		 20,269
(1.32 %)		 n/a 41.93
(95.13 %)		 70,664
(4.84 %)		 145,731
(4.89 %)		 76,195
(95.16 %)		 5,329,187
(44.14 %)		 1,620,304
(3.72 %)		 14,520,050
(33.09 %)		 719
(0.06 %)		 916,050
(3.68 %)		 22,600
(0.47 %)		 18,401
(0.40 %)
431 Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022
GCA_023515785.1		 n/a n/a 21,116
(1.68 %)		 20,103
(1.27 %)		 57,027
(2.45 %)		 41.85
(99.82 %)		 0
(0 %)		 1,256
(0.18 %)		 2,151
(100.00 %)		 4,704,388
(38.22 %)		 1,611,144
(5.76 %)		 13,524,575
(38.35 %)		 24
(0.00 %)		 1,665,234
(4.47 %)		 20,720
(0.48 %)		 16,247
(0.34 %)
432 Norway rat SHRSP/BppUtx 2022
GCA_021556685.1		 n/a n/a 22,366
(1.71 %)		 20,531
(1.26 %)		 57,580
(2.44 %)		 41.86
(99.94 %)		 0
(0 %)		 1,610
(0.06 %)		 2,734
(100.00 %)		 5,238,574
(46.36 %)		 1,638,412
(5.87 %)		 13,769,141
(38.49 %)		 12
(0.00 %)		 1,712,824
(4.62 %)		 21,006
(0.49 %)		 17,310
(0.40 %)
433 Norway rat WKY/Bbb 2022
GCA_023515805.1		 n/a n/a 21,607
(1.68 %)		 21,244
(1.28 %)		 58,136
(2.47 %)		 41.92
(99.80 %)		 0
(0 %)		 1,456
(0.20 %)		 3,553
(100.00 %)		 4,811,412
(38.21 %)		 1,650,950
(5.41 %)		 13,740,644
(38.24 %)		 16
(0.00 %)		 1,626,115
(4.31 %)		 21,449
(0.51 %)		 16,486
(0.34 %)
434 nutria
GCA_004027025.1		 n/a n/a 24,707
(1.00 %)		 47,533
(1.18 %)		 n/a 41.70
(99.84 %)		 15,249
(0.05 %)		 15,249
(0.05 %)		 1,684,916
(99.95 %)		 6,961,690
(30.09 %)		 1,698,977
(3.31 %)		 15,207,563
(42.57 %)		 44
(0.00 %)		 n/a 59,854
(1.00 %)		 31,029
(0.63 %)
435 okapi
GCA_001660835.1		 n/a n/a 21,483
(1.43 %)		 31,061
(1.26 %)		 n/a 41.48
(95.11 %)		 376,008
(4.86 %)		 376,008
(4.86 %)		 1,213,177
(95.14 %)		 5,808,036
(42.90 %)		 619,044
(4.22 %)		 14,940,153
(35.17 %)		 41,083
(0.65 %)		 843,551
(6.96 %)		 47,417
(1.12 %)		 45,138
(1.04 %)
436 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1		 30,625
(2.21 %)		 n/a 17,959
(1.54 %)		 19,318
(1.54 %)		 n/a 42.06
(92.36 %)		 83,033
(7.65 %)		 83,035
(7.65 %)		 148,226
(92.35 %)		 4,337,455
(33.76 %)		 1,140,316
(7.60 %)		 10,422,685
(36.59 %)		 3,290
(0.06 %)		 1,520,292
(3.90 %)		 61,921
(3.56 %)		 30,924
(0.78 %)
437 pacarana
GCA_004027595.1		 n/a n/a 20,748
(1.20 %)		 33,195
(1.31 %)		 n/a 41.81
(99.90 %)		 6,392
(0.02 %)		 6,392
(0.02 %)		 1,164,830
(99.98 %)		 4,374,443
(30.16 %)		 660,811
(1.38 %)		 14,062,133
(35.99 %)		 8
(0.00 %)		 n/a 59,382
(1.23 %)		 28,291
(0.70 %)
438 Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad)
GCA_004363475.1		 n/a n/a 21,575
(1.07 %)		 47,478
(1.31 %)		 n/a 41.87
(99.76 %)		 18,801
(0.07 %)		 18,801
(0.07 %)		 2,428,619
(99.93 %)		 4,881,232
(20.80 %)		 1,352,971
(4.11 %)		 12,583,960
(48.42 %)		 36
(0.00 %)		 n/a 74,961
(2.33 %)		 61,745
(1.54 %)
439 Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo)
GCF_023159225.1		 46,202
(2.48 %)		 n/a 18,752
(1.50 %)		 22,526
(1.60 %)		 n/a 41.98
(99.96 %)		 0
(0 %)		 1,807
(0.04 %)		 6,180
(100.00 %)		 3,313,319
(16.79 %)		 1,066,382
(10.88 %)		 9,981,468
(42.63 %)		 8
(0.00 %)		 1,996,445
(6.17 %)		 49,134
(2.83 %)		 50,049
(1.70 %)
440 Pacific walrus
GCF_000321225.1		 27,163
(1.89 %)		 n/a 20,293
(1.71 %)		 20,982
(1.48 %)		 n/a 41.36
(95.85 %)		 66,763
(4.16 %)		 66,766
(4.16 %)		 70,656
(95.84 %)		 4,372,578
(41.12 %)		 511,500
(1.05 %)		 13,507,582
(30.43 %)		 2,581
(0.03 %)		 386,274
(1.21 %)		 45,142
(1.29 %)		 37,732
(0.95 %)
441 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1		 65,947
(3.26 %)		 n/a 18,743
(1.79 %)		 20,862
(1.45 %)		 31,917
(1.69 %)		 41.28
(99.56 %)		 16,337
(0.44 %)		 16,699
(0.44 %)		 21,350
(99.56 %)		 3,971,820
(45.64 %)		 574,056
(1.14 %)		 12,602,965
(34.83 %)		 610
(0.02 %)		 419,325
(1.28 %)		 62,275
(1.67 %)		 40,749
(1.23 %)
442 pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019)
GCA_004115245.1		 n/a n/a 18,118
(1.63 %)		 23,536
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,873
(100.00 %)		 3,001,130
(29.46 %)		 375,042
(0.79 %)		 11,813,971
(29.64 %)		 0
(0 %)		 140,066
(0.57 %)		 67,712
(4.23 %)		 70,108
(3.94 %)
443 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2		 n/a n/a 18,116
(1.63 %)		 23,608
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,895
(100.00 %)		 3,002,448
(29.46 %)		 375,226
(0.79 %)		 11,824,034
(29.65 %)		 0
(0 %)		 140,328
(0.57 %)		 67,718
(4.23 %)		 70,109
(3.93 %)
444 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2		 54,932
(3.31 %)		 n/a 18,171
(1.69 %)		 20,025
(1.62 %)		 42,786
(3.39 %)		 42.38
(99.28 %)		 0
(0 %)		 884
(0.72 %)		 77
(100.00 %)		 3,069,141
(30.00 %)		 385,664
(0.81 %)		 12,050,232
(30.57 %)		 1
(0.00 %)		 174,292
(0.75 %)		 63,905
(3.75 %)		 66,744
(3.26 %)
445 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1		 48,421
(2.20 %)		 n/a 18,667
(1.61 %)		 21,915
(1.59 %)		 n/a 42.35
(97.95 %)		 0
(0 %)		 349
(2.05 %)		 60
(100.00 %)		 3,863,217
(32.76 %)		 624,933
(1.88 %)		 11,572,319
(37.09 %)		 1
(0.00 %)		 714,726
(2.00 %)		 79,984
(2.45 %)		 71,436
(1.91 %)
446 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1		 n/a n/a 19,688
(1.69 %)		 21,998
(1.64 %)		 n/a 43.04
(99.72 %)		 19
(0.01 %)		 234
(0.28 %)		 112
(99.99 %)		 2,794,986
(22.60 %)		 938,016
(3.72 %)		 11,241,518
(39.41 %)		 0
(0 %)		 704,408
(2.03 %)		 70,272
(2.89 %)		 61,250
(1.98 %)
447 Parnell's mustached bat (2013)
GCA_000465405.1		 n/a n/a 21,436
(1.40 %)		 57,232
(2.18 %)		 n/a 40.82
(99.34 %)		 265,720
(0.70 %)		 265,720
(0.70 %)		 443,121
(99.30 %)		 2,780,805
(29.26 %)		 290,520
(0.63 %)		 12,354,814
(27.13 %)		 3
(0.00 %)		 21,621
(0.07 %)		 69,806
(1.89 %)		 63,572
(1.69 %)
448 Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021)
GCF_021234165.1		 37,033
(2.48 %)		 n/a 18,339
(1.76 %)		 21,630
(1.69 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 0
(0 %)		 12
(0.00 %)		 333
(100.00 %)		 2,828,339
(30.56 %)		 333,670
(0.75 %)		 12,444,271
(30.90 %)		 0
(0 %)		 111,571
(0.50 %)		 53,180
(4.61 %)		 54,187
(3.93 %)
449 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1		 n/a n/a 17,913
(1.72 %)		 20,720
(1.72 %)		 n/a 43.54
(99.99 %)		 7
(0.00 %)		 980
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 2,932,869
(21.94 %)		 874,665
(4.83 %)		 10,263,103
(37.46 %)		 2
(0.00 %)		 742,499
(2.50 %)		 77,397
(4.55 %)		 76,849
(2.51 %)
450 Patagonian cavy
GCA_004027295.1		 n/a n/a 21,143
(0.94 %)		 40,887
(1.10 %)		 n/a 39.86
(99.87 %)		 6,223
(0.02 %)		 6,223
(0.02 %)		 1,911,987
(99.98 %)		 5,194,890
(30.95 %)		 892,551
(2.11 %)		 17,052,577
(40.22 %)		 47
(0.00 %)		 n/a 45,730
(0.84 %)		 40,047
(0.71 %)
451 Pere David's deer
GCA_002443075.1		 n/a n/a 20,723
(1.65 %)		 23,551
(1.43 %)		 n/a 41.58
(97.49 %)		 144,642
(2.51 %)		 144,642
(2.51 %)		 339,454
(97.49 %)		 5,171,293
(43.30 %)		 427,987
(1.20 %)		 13,665,133
(35.97 %)		 3,724
(0.06 %)		 460,451
(1.49 %)		 48,374
(1.14 %)		 45,141
(1.04 %)
452 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1		 n/a n/a 18,794
(1.72 %)		 21,421
(1.40 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 1,750
(100.00 %)		 4,001,442
(39.37 %)		 547,894
(2.75 %)		 13,870,563
(34.33 %)		 0
(0 %)		 585,313
(2.32 %)		 40,162
(1.31 %)		 39,090
(1.18 %)
453 Philippine flying lemur (mCynVol1 primary hap 2022 genbank)
GCA_027409185.1		 n/a n/a 20,384
(1.64 %)		 22,124
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 0
(0 %)		 116
(0.00 %)		 131
(100.00 %)		 4,492,423
(39.31 %)		 627,842
(4.79 %)		 15,561,515
(36.57 %)		 2
(0.00 %)		 n/a 45,336
(1.27 %)		 44,264
(1.15 %)
454 Philippine flying lemur (mCynVol1 primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1		 44,950
(1.91 %)		 n/a 20,385
(1.64 %)		 22,123
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 0
(0 %)		 116
(0.00 %)		 130
(100.00 %)		 4,492,417
(39.31 %)		 627,841
(4.79 %)		 15,561,458
(36.57 %)		 2
(0.00 %)		 862,813
(2.91 %)		 45,336
(1.27 %)		 44,264
(1.15 %)
455 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1		 n/a n/a 18,472
(1.44 %)		 19,911
(1.28 %)		 n/a 42.63
(99.98 %)		 0
(0 %)		 878
(0.02 %)		 379
(100.00 %)		 3,996,827
(27.97 %)		 2,094,728
(7.23 %)		 12,677,118
(40.57 %)		 4
(0.00 %)		 1,289,995
(3.44 %)		 81,791
(2.82 %)		 46,045
(1.12 %)
456 pig (Duroc 2017)
GCF_000003025.6		 77,695
(4.05 %)		 n/a 18,980
(1.64 %)		 19,453
(1.32 %)		 59,876
(4.84 %)		 41.87
(98.81 %)		 328
(1.19 %)		 544
(1.19 %)		 1,313
(98.81 %)		 5,021,184
(45.67 %)		 710,994
(1.32 %)		 13,243,289
(36.33 %)		 2
(0.00 %)		 554,834
(1.64 %)		 79,132
(1.82 %)		 46,116
(1.30 %)
457 pig (USMARCv1 2017)
GCA_002844635.1		 n/a n/a 19,458
(1.54 %)		 21,487
(1.27 %)		 58,655
(2.58 %)		 42.49
(95.20 %)		 0
(0 %)		 661
(4.80 %)		 14,157
(100.00 %)		 5,159,244
(47.53 %)		 902,079
(3.63 %)		 13,145,120
(36.86 %)		 1
(0.00 %)		 1,358,423
(3.46 %)		 82,442
(2.62 %)		 47,468
(1.28 %)
458 plains zebra (Etosha38 2022 UCLA)
GCF_021613505.1		 55,779
(2.87 %)		 n/a 19,529
(1.76 %)		 21,214
(1.39 %)		 n/a 41.38
(99.04 %)		 0
(0 %)		 14,595
(0.96 %)		 11,098
(100.00 %)		 3,683,862
(38.74 %)		 314,723
(0.68 %)		 15,217,328
(29.38 %)		 2,057
(0.02 %)		 119,672
(0.38 %)		 41,391
(1.27 %)		 38,911
(1.12 %)
459 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2		 n/a n/a 13,244
(1.26 %)		 19,241
(1.68 %)		 n/a 46.27
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 25
(0.00 %)		 5,868
(100.00 %)		 4,420,884
(51.59 %)		 513,006
(3.13 %)		 7,749,797
(49.18 %)		 0
(0 %)		 994,720
(3.65 %)		 81,538
(8.24 %)		 68,267
(3.13 %)
460 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2		 51,392
(3.07 %)		 n/a 14,778
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 0
(0 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,071,089
(51.34 %)		 578,614
(2.89 %)		 9,113,848
(48.93 %)		 0
(0 %)		 1,130,252
(3.59 %)		 87,796
(6.47 %)		 74,209
(2.87 %)
461 polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq)
GCF_000687225.1		 35,764
(2.39 %)		 n/a 18,466
(1.69 %)		 15,384
(1.38 %)		 n/a 41.65
(98.35 %)		 110,343
(1.67 %)		 110,343
(1.67 %)		 134,162
(98.33 %)		 4,123,540
(40.16 %)		 553,196
(1.29 %)		 13,765,581
(29.91 %)		 205
(0.03 %)		 311,409
(1.04 %)		 54,907
(1.17 %)		 47,736
(0.98 %)
462 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1		 52,188
(2.92 %)		 n/a 18,588
(1.75 %)		 20,731
(1.54 %)		 n/a 41.88
(99.60 %)		 0
(0 %)		 45,532
(0.41 %)		 3,900
(100.00 %)		 4,204,162
(40.75 %)		 572,129
(1.75 %)		 13,926,894
(30.79 %)		 587
(0.02 %)		 437,254
(2.43 %)		 63,315
(1.93 %)		 57,593
(1.70 %)
463 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1		 50,187
(2.51 %)		 n/a 20,427
(1.69 %)		 20,874
(1.45 %)		 n/a 42.34
(94.06 %)		 182,041
(5.97 %)		 182,263
(5.97 %)		 212,962
(94.03 %)		 n/a 1,229,123
(2.83 %)		 14,447,916
(30.09 %)		 7,908
(0.12 %)		 806,105
(3.40 %)		 23,246
(0.56 %)		 19,518
(0.43 %)
464 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1		 69,779
(3.28 %)		 n/a 19,755
(1.73 %)		 19,194
(1.43 %)		 n/a 42.28
(95.07 %)		 147,442
(4.96 %)		 147,442
(4.96 %)		 155,966
(95.04 %)		 4,751,621
(29.04 %)		 1,172,212
(2.66 %)		 13,934,672
(29.87 %)		 6,396
(0.08 %)		 477,575
(1.54 %)		 22,444
(0.57 %)		 19,164
(0.44 %)
465 prairie vole
GCF_000317375.1		 40,484
(2.72 %)		 n/a 19,648
(1.91 %)		 19,489
(1.62 %)		 n/a 42.25
(92.03 %)		 180,677
(8.00 %)		 180,677
(8.00 %)		 187,012
(92.00 %)		 3,779,126
(25.51 %)		 879,192
(2.11 %)		 12,360,347
(27.34 %)		 6,788
(0.11 %)		 335,553
(1.15 %)		 18,233
(0.52 %)		 16,466
(0.44 %)
466 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1		 n/a n/a 17,919
(1.46 %)		 19,330
(1.31 %)		 n/a 40.78
(100.00 %)		 0
(0 %)		 68
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 3,707,234
(28.28 %)		 643,817
(2.22 %)		 12,106,384
(41.48 %)		 5
(0.00 %)		 871,436
(2.63 %)		 54,438
(1.38 %)		 34,899
(0.85 %)
467 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1		 n/a n/a 17,253
(1.51 %)		 18,507
(1.35 %)		 n/a 40.91
(100.00 %)		 0
(0 %)		 39
(0.00 %)		 38
(100.00 %)		 3,466,835
(27.96 %)		 585,261
(1.91 %)		 11,364,898
(40.65 %)		 2
(0.00 %)		 726,868
(2.39 %)		 50,527
(1.37 %)		 32,436
(0.84 %)
468 pronghorn (PH2016 2021)
GCA_021018645.1		 n/a n/a 21,848
(1.58 %)		 27,614
(1.56 %)		 n/a 41.70
(96.83 %)		 74,027
(3.17 %)		 74,027
(3.17 %)		 140,480
(96.83 %)		 3,335,744
(24.40 %)		 405,435
(4.11 %)		 13,855,606
(34.67 %)		 3,445
(0.16 %)		 489,014
(7.21 %)		 48,670
(1.19 %)		 43,625
(0.95 %)
469 Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq)
GCF_000696695.1		 45,076
(2.76 %)		 n/a 19,546
(1.69 %)		 22,107
(1.36 %)		 n/a 41.27
(99.13 %)		 80,963
(0.88 %)		 80,963
(0.88 %)		 134,060
(99.12 %)		 3,787,533
(40.54 %)		 435,607
(1.73 %)		 14,738,418
(28.36 %)		 39
(0.00 %)		 276,230
(1.12 %)		 40,752
(0.94 %)		 36,104
(0.79 %)
470 puma (L17-30 alternate hap 2023)
GCA_028749965.1		 n/a n/a 18,380
(1.53 %)		 20,701
(1.40 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 96
(0.00 %)		 304
(100.00 %)		 4,881,674
(33.96 %)		 978,817
(2.17 %)		 13,422,986
(35.08 %)		 0
(0 %)		 741,350
(2.01 %)		 69,437
(2.62 %)		 59,105
(1.71 %)
471 puma (L17-30 primary hap 2023)
GCA_028749985.1		 n/a n/a 17,553
(1.53 %)		 19,299
(1.39 %)		 n/a 41.89
(100.00 %)		 134
(0.00 %)		 134
(0.00 %)		 390
(100.00 %)		 4,629,539
(33.53 %)		 919,008
(2.02 %)		 12,766,157
(34.70 %)		 0
(0 %)		 673,940
(1.93 %)		 65,437
(2.53 %)		 55,660
(1.67 %)
472 puma (SC36_Marlon 2018 refseq)
GCF_003327715.1		 25,575
(1.43 %)		 n/a 17,664
(1.57 %)		 16,565
(1.29 %)		 n/a 41.36
(95.34 %)		 0
(0 %)		 178,992
(4.69 %)		 2,175
(100.00 %)		 4,885,335
(42.70 %)		 833,138
(1.76 %)		 13,705,778
(31.28 %)		 2,166
(0.06 %)		 494,981
(1.78 %)		 58,912
(1.65 %)		 50,360
(1.31 %)
473 punctate agouti
GCA_004363535.1		 n/a n/a 22,612
(1.05 %)		 45,433
(1.19 %)		 n/a 40.79
(99.92 %)		 6,459
(0.02 %)		 6,459
(0.02 %)		 993,123
(99.98 %)		 5,671,738
(32.53 %)		 945,722
(1.69 %)		 17,003,309
(36.58 %)		 32
(0.00 %)		 n/a 85,696
(1.65 %)		 65,973
(1.32 %)
474 pygmy sperm whale
GCA_004363705.1		 n/a n/a 22,661
(1.30 %)		 42,546
(1.15 %)		 n/a 41.89
(99.89 %)		 6,053
(0.02 %)		 6,053
(0.02 %)		 1,258,125
(99.98 %)		 5,185,912
(43.65 %)		 836,752
(1.88 %)		 14,150,125
(39.88 %)		 43
(0.00 %)		 n/a 95,344
(2.15 %)		 68,248
(1.67 %)
475 pygmy sperm whale (mKogBre1 2022 refseq)
GCF_026419965.1		 56,261
(2.22 %)		 n/a 18,496
(1.55 %)		 20,718
(1.32 %)		 n/a 42.05
(99.81 %)		 0
(0 %)		 143
(0.19 %)		 581
(100.00 %)		 3,817,659
(34.51 %)		 758,297
(7.42 %)		 12,196,998
(39.96 %)		 0
(0 %)		 1,197,809
(3.53 %)		 101,353
(2.90 %)		 50,216
(1.47 %)
476 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1		 n/a n/a 18,550
(1.51 %)		 20,491
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 0
(0 %)		 138
(0.01 %)		 391
(100.00 %)		 3,860,112
(33.83 %)		 820,375
(9.58 %)		 12,159,196
(41.59 %)		 2
(0.00 %)		 1,346,279
(3.87 %)		 106,168
(2.78 %)		 50,294
(1.44 %)
477 Pyrenean desman (IBE-C5619 2021)
GCA_019455555.1		 n/a 20,936
(1.95 %)		 17,527
(1.87 %)		 20,474
(1.83 %)		 n/a 41.67
(98.52 %)		 63,679
(1.49 %)		 63,679
(1.49 %)		 75,985
(98.51 %)		 2,147,379
(23.41 %)		 327,740
(0.98 %)		 10,539,226
(28.05 %)		 1,165
(0.02 %)		 291,271
(1.07 %)		 44,487
(4.39 %)		 47,205
(4.01 %)
478 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq)
GCF_009806435.1		 83,045
(4.16 %)		 n/a 19,486
(1.31 %)		 23,267
(1.31 %)		 n/a 43.83
(97.68 %)		 0
(0 %)		 18,178
(2.32 %)		 3,160
(100.00 %)		 4,072,524
(21.41 %)		 976,273
(2.33 %)		 13,766,413
(39.76 %)		 85
(0.00 %)		 1,275,666
(3.04 %)		 113,371
(2.46 %)		 70,869
(1.75 %)
479 rabbit (primary hap 2024)
GCA_964237555.1		 n/a n/a 19,386
(1.31 %)		 22,863
(1.35 %)		 n/a 44.02
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,276
(0.02 %)		 222
(100.00 %)		 4,099,590
(21.20 %)		 1,062,902
(3.78 %)		 13,416,878
(41.72 %)		 5
(0.00 %)		 1,560,079
(3.77 %)		 116,524
(2.66 %)		 74,863
(1.94 %)
480 rabbit (primary hap 2024)
GCF_964237555.1		 95,289
(4.22 %)		 n/a 19,385
(1.31 %)		 22,631
(1.31 %)		 n/a 44.02
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,276
(0.02 %)		 221
(100.00 %)		 4,099,586
(21.20 %)		 1,062,900
(3.78 %)		 13,416,814
(41.72 %)		 5
(0.00 %)		 1,560,076
(3.77 %)		 116,523
(2.66 %)		 74,863
(1.94 %)
481 rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq)
GCF_000003625.3		 43,655
(2.34 %)		 n/a 18,665
(1.39 %)		 20,095
(1.24 %)		 n/a 43.75
(95.14 %)		 80,789
(4.88 %)		 80,789
(4.88 %)		 84,024
(95.12 %)		 4,890,480
(44.71 %)		 883,939
(1.73 %)		 13,254,520
(38.27 %)		 12
(0.00 %)		 1,022,784
(2.54 %)		 110,337
(2.33 %)		 68,468
(1.73 %)
482 raccoon dog (2021)
GCF_905146905.1		 52,564
(2.89 %)		 n/a 19,628
(1.60 %)		 20,274
(1.43 %)		 n/a 41.28
(99.98 %)		 0
(0 %)		 70
(0.02 %)		 811
(100.00 %)		 4,499,368
(31.98 %)		 1,005,212
(2.04 %)		 13,884,201
(32.95 %)		 2
(0.00 %)		 702,009
(1.75 %)		 52,450
(2.27 %)		 46,478
(1.53 %)
483 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1		 50,096
(2.48 %)		 46,295
(2.32 %)		 19,992
(1.47 %)		 22,506
(1.31 %)		 41,290
(1.46 %)		 41.91
(99.99 %)		 4,845
(0.01 %)		 4,847
(0.01 %)		 7,486
(99.99 %)		 5,764,757
(47.38 %)		 507,629
(1.55 %)		 14,138,601
(41.27 %)		 7
(0.00 %)		 1,279,574
(3.49 %)		 51,748
(1.29 %)		 40,690
(1.04 %)
484 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1		 70,474
(3.21 %)		 n/a 19,413
(1.59 %)		 21,222
(1.35 %)		 n/a 41.99
(100.00 %)		 0
(0 %)		 84
(0.00 %)		 142
(100.00 %)		 5,300,958
(46.83 %)		 455,553
(1.24 %)		 13,023,443
(40.62 %)		 0
(0 %)		 979,102
(2.67 %)		 43,959
(1.30 %)		 38,834
(1.07 %)
485 ratel
GCA_004024625.1		 n/a n/a 22,196
(1.21 %)		 35,937
(1.18 %)		 n/a 42.00
(99.85 %)		 6,511
(0.02 %)		 6,511
(0.02 %)		 2,074,823
(99.98 %)		 6,171,383
(41.93 %)		 877,669
(1.49 %)		 15,269,908
(41.22 %)		 36
(0.00 %)		 465,016
(0.89 %)		 95,094
(1.91 %)		 92,023
(1.73 %)
486 red bat
GCA_004026805.1		 n/a n/a 27,510
(1.22 %)		 65,467
(1.48 %)		 n/a 42.69
(99.94 %)		 6,380
(0.02 %)		 6,380
(0.02 %)		 525,280
(99.98 %)		 4,644,227
(28.24 %)		 1,170,868
(2.68 %)		 15,628,238
(39.97 %)		 16
(0.00 %)		 n/a 125,564
(3.55 %)		 108,686
(2.27 %)
487 red deer (2021)
GCF_910594005.1		 68,992
(2.68 %)		 n/a 20,470
(1.48 %)		 22,563
(1.32 %)		 n/a 42.98
(100.00 %)		 0
(0 %)		 40
(0.00 %)		 144
(100.00 %)		 5,501,063
(44.60 %)		 503,301
(12.23 %)		 13,102,622
(44.55 %)		 1
(0.00 %)		 2,197,198
(5.57 %)		 88,756
(1.66 %)		 46,960
(1.12 %)
488 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1		 n/a n/a 18,817
(1.29 %)		 21,916
(1.20 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 0
(0 %)		 22
(0.00 %)		 4,021
(100.00 %)		 3,279,005
(20.48 %)		 472,706
(21.87 %)		 11,466,609
(50.26 %)		 0
(0 %)		 3,624,599
(9.05 %)		 128,858
(2.07 %)		 39,577
(0.84 %)
489 red fox (hap1 2024)
GCA_964106825.2		 n/a n/a 19,622
(1.57 %)		 20,371
(1.38 %)		 n/a 41.34
(99.98 %)		 0
(0 %)		 1,845
(0.02 %)		 461
(100.00 %)		 4,519,485
(31.91 %)		 1,018,114
(2.59 %)		 13,810,284
(32.99 %)		 9
(0.00 %)		 712,146
(1.92 %)		 52,053
(2.31 %)		 47,294
(1.54 %)
490 red fox (hap2 2024)
GCA_964106925.2		 n/a n/a 19,517
(1.57 %)		 20,105
(1.37 %)		 n/a 41.31
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,819
(0.02 %)		 350
(100.00 %)		 4,487,839
(31.79 %)		 1,010,106
(2.64 %)		 13,838,711
(33.07 %)		 17
(0.00 %)		 695,908
(1.88 %)		 51,373
(2.26 %)		 46,876
(1.53 %)
491 red fox (tameXaggressive cross 2018)
GCF_003160815.1		 43,495
(2.67 %)		 n/a 19,826
(1.69 %)		 18,893
(1.40 %)		 n/a 41.08
(97.06 %)		 0
(0 %)		 246,167
(2.96 %)		 82,424
(100.00 %)		 4,919,102
(40.79 %)		 954,461
(2.46 %)		 14,190,625
(30.86 %)		 739
(0.02 %)		 634,373
(2.40 %)		 53,204
(1.88 %)		 51,541
(1.62 %)
492 reed vole (MF-2015 2020)
GCF_014885135.2		 55,722
(3.60 %)		 n/a 19,808
(1.93 %)		 20,787
(1.69 %)		 n/a 42.36
(95.60 %)		 0
(0 %)		 67,118
(4.40 %)		 10,460
(100.00 %)		 3,130,955
(20.09 %)		 831,969
(2.09 %)		 11,985,657
(28.48 %)		 1,977
(0.20 %)		 258,905
(1.26 %)		 18,764
(0.58 %)		 16,940
(0.48 %)
493 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1		 n/a n/a 18,947
(1.29 %)		 24,114
(1.28 %)		 n/a 42.75
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 8,892
(100.00 %)		 3,375,476
(23.21 %)		 654,539
(6.64 %)		 11,132,469
(48.29 %)		 0
(0 %)		 3,008,562
(7.07 %)		 79,357
(2.66 %)		 41,548
(0.93 %)
494 Reeves' muntjac (primary hap 2024)
GCF_963930625.1		 52,442
(2.57 %)		 n/a 19,577
(1.52 %)		 22,283
(1.38 %)		 n/a 41.89
(99.99 %)		 0
(0 %)		 682
(0.01 %)		 267
(100.00 %)		 3,294,672
(23.89 %)		 527,436
(2.98 %)		 13,137,581
(39.89 %)		 1
(0.00 %)		 1,222,379
(3.05 %)		 57,436
(1.81 %)		 44,949
(1.09 %)
495 reindeer (2023)
GCA_963422255.1		 n/a n/a 21,329
(1.58 %)		 25,201
(1.59 %)		 n/a 41.46
(98.35 %)		 131,886
(1.65 %)		 131,886
(1.65 %)		 259,765
(98.35 %)		 3,254,173
(23.49 %)		 440,431
(2.00 %)		 14,258,607
(36.17 %)		 3,361
(0.18 %)		 n/a 48,931
(1.20 %)		 43,592
(0.99 %)
496 reindeer (US061 2019)
GCA_004026565.1		 n/a n/a 24,150
(1.39 %)		 39,911
(1.41 %)		 n/a 42.08
(99.89 %)		 4,769
(0.02 %)		 4,769
(0.02 %)		 1,365,508
(99.98 %)		 6,083,178
(46.10 %)		 546,470
(1.23 %)		 14,434,855
(43.16 %)		 13
(0.00 %)		 n/a 55,319
(1.23 %)		 51,245
(1.12 %)
497 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1		 n/a n/a 19,396
(1.48 %)		 21,693
(1.26 %)		 n/a 41.62
(97.80 %)		 0
(0 %)		 131
(2.20 %)		 1,039
(100.00 %)		 3,973,936
(35.55 %)		 987,571
(11.66 %)		 12,473,459
(42.11 %)		 1
(0.00 %)		 1,271,959
(3.79 %)		 74,971
(1.64 %)		 44,274
(1.06 %)
498 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1		 59,888
(2.34 %)		 n/a 19,291
(1.53 %)		 21,195
(1.30 %)		 n/a 41.44
(99.90 %)		 0
(0 %)		 334
(0.10 %)		 774
(100.00 %)		 3,917,923
(36.26 %)		 828,521
(9.28 %)		 12,518,796
(41.08 %)		 4
(0.00 %)		 1,071,329
(3.37 %)		 73,126
(1.69 %)		 43,865
(1.11 %)
499 Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024)
GCA_036010255.1		 n/a n/a 18,982
(1.81 %)		 22,002
(1.76 %)		 n/a 43.12
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 105
(100.00 %)		 2,909,847
(24.53 %)		 757,964
(3.03 %)		 10,561,925
(36.25 %)		 0
(0 %)		 534,987
(1.92 %)		 57,318
(2.32 %)		 52,282
(1.76 %)
500 Ryukyu mouse (v2 2017)
GCF_900094665.2		 53,779
(2.85 %)		 n/a 21,351
(2.29 %)		 18,073
(1.39 %)		 n/a 41.70
(89.05 %)		 27,758
(7.30 %)		 306,599
(10.98 %)		 30,835
(92.70 %)		 4,479,912
(35.83 %)		 1,351,677
(2.59 %)		 12,964,608
(27.49 %)		 6,570
(0.06 %)		 398,054
(1.12 %)		 15,963
(0.43 %)		 15,425
(0.40 %)
501 Saanen dairy goat
GCA_015443085.1		 n/a n/a 19,257
(1.54 %)		 21,221
(1.32 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 0
(0 %)		 170
(0.00 %)		 1,362
(100.00 %)		 5,336,862
(47.58 %)		 515,161
(2.87 %)		 13,144,895
(41.67 %)		 3
(0.00 %)		 1,309,461
(3.33 %)		 58,623
(2.22 %)		 39,483
(1.04 %)
502 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1		 n/a n/a 18,509
(1.54 %)		 22,514
(1.36 %)		 n/a 41.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,427
(100.00 %)		 3,675,922
(35.75 %)		 950,374
(10.49 %)		 11,670,399
(40.31 %)		 0
(0 %)		 1,395,810
(4.32 %)		 63,587
(3.15 %)		 40,331
(1.09 %)
503 saddleback dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1		 46,746
(2.39 %)		 n/a 18,624
(1.49 %)		 20,662
(1.31 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 0
(0 %)		 968
(0.01 %)		 630
(100.00 %)		 4,020,676
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,748
(42.64 %)		 0
(0 %)		 1,785,427
(5.07 %)		 66,179
(3.91 %)		 41,466
(1.03 %)
504 saddleback dolphin (primary hap 2024)
GCF_949987515.2		 46,014
(2.36 %)		 n/a 18,616
(1.49 %)		 20,618
(1.32 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 968
(0.01 %)		 1,598
(99.99 %)		 4,020,525
(35.99 %)		 1,258,165
(13.09 %)		 12,359,758
(42.64 %)		 0
(0 %)		 1,475,119
(4.19 %)		 66,188
(3.91 %)		 41,466
(1.03 %)
505 saiga antelope
GCA_004024985.1		 n/a n/a 23,736
(0.84 %)		 55,133
(0.88 %)		 n/a 42.52
(99.87 %)		 2,867
(0.01 %)		 2,867
(0.01 %)		 1,775,066
(99.99 %)		 6,485,113
(49.43 %)		 447,097
(0.88 %)		 13,972,753
(44.46 %)		 57
(0.00 %)		 n/a 46,883
(0.82 %)		 38,101
(0.69 %)
506 Schreibers' long-fingered bat (hap1 2024)
GCA_964146895.1		 n/a n/a 17,882
(1.96 %)		 21,291
(1.88 %)		 n/a 42.53
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,322
(0.01 %)		 265
(100.00 %)		 2,639,522
(28.12 %)		 453,024
(5.66 %)		 10,206,715
(31.11 %)		 6
(0.00 %)		 673,573
(2.67 %)		 59,363
(2.86 %)		 53,151
(1.93 %)
507 Schreibers' long-fingered bat (hap2 2024)
GCA_964145185.1		 n/a n/a 17,115
(2.05 %)		 19,972
(1.93 %)		 n/a 42.62
(99.99 %)		 1,137
(0.01 %)		 1,137
(0.01 %)		 1,305
(99.99 %)		 2,445,695
(27.61 %)		 386,295
(4.40 %)		 9,657,997
(29.32 %)		 2
(0.00 %)		 458,566
(1.76 %)		 56,451
(2.93 %)		 50,746
(2.02 %)
508 Schreibers' long-fingered bat (US075 2019)
GCA_004026525.1		 n/a n/a 20,147
(2.06 %)		 31,271
(1.82 %)		 n/a 42.27
(99.94 %)		 6,918
(0.04 %)		 6,918
(0.04 %)		 184,538
(99.96 %)		 2,772,932
(29.66 %)		 366,782
(1.13 %)		 10,477,531
(28.60 %)		 19
(0.00 %)		 n/a 62,520
(2.73 %)		 58,978
(2.39 %)
509 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2		 51,527
(2.72 %)		 n/a 19,713
(1.57 %)		 21,928
(1.32 %)		 n/a 41.74
(99.30 %)		 0
(0 %)		 16,241
(0.70 %)		 9,089
(100.00 %)		 5,435,109
(46.76 %)		 414,279
(0.98 %)		 13,490,956
(40.45 %)		 2,509
(0.03 %)		 982,620
(2.65 %)		 42,961
(1.10 %)		 38,033
(0.97 %)
510 Screaming hairy armadillo
GCA_004027955.1		 n/a n/a 24,532
(0.39 %)		 56,725
(0.46 %)		 n/a 39.68
(99.70 %)		 2,747
(0.01 %)		 2,747
(0.01 %)		 7,680,080
(99.99 %)		 8,978,735
(36.02 %)		 1,516,551
(1.58 %)		 32,918,217
(47.67 %)		 32
(0.00 %)		 n/a 234,762
(1.56 %)		 66,537
(0.64 %)
511 sea otter (GAN:26980312 2017 refseq)
GCF_002288905.1		 38,127
(2.16 %)		 n/a 18,578
(1.64 %)		 20,913
(1.44 %)		 34,179
(1.77 %)		 41.56
(98.79 %)		 22,821
(1.21 %)		 23,134
(1.21 %)		 29,589
(98.79 %)		 4,703,044
(41.42 %)		 721,750
(1.39 %)		 14,065,653
(32.89 %)		 1,203
(0.02 %)		 504,215
(2.00 %)		 55,388
(1.87 %)		 53,465
(1.67 %)
512 Seba's short-tailed bat
GCA_004027735.1		 n/a n/a 21,878
(0.94 %)		 55,858
(1.10 %)		 n/a 42.70
(99.84 %)		 3,864
(0.01 %)		 3,864
(0.01 %)		 1,929,203
(99.99 %)		 3,802,235
(28.35 %)		 606,320
(1.03 %)		 15,171,250
(31.99 %)		 69
(0.00 %)		 n/a 118,227
(2.28 %)		 103,103
(1.92 %)
513 sheep (OAR_USU_Benz2616 2023)
GCF_016772045.2		 89,680
(5.44 %)		 n/a 19,308
(1.52 %)		 21,506
(1.35 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 0
(0 %)		 84
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 3,275,767
(22.85 %)		 464,346
(1.26 %)		 12,987,607
(40.61 %)		 0
(0 %)		 992,253
(2.68 %)		 44,477
(1.28 %)		 39,609
(0.96 %)
514 sheep (Texel 2015)
GCA_000298735.2		 n/a n/a 19,179
(1.56 %)		 19,001
(1.26 %)		 48,105
(1.85 %)		 41.90
(98.94 %)		 43,016
(1.07 %)		 44,566
(1.07 %)		 48,481
(98.93 %)		 5,429,824
(46.13 %)		 540,267
(1.64 %)		 13,509,668
(38.83 %)		 123
(0.01 %)		 863,621
(2.69 %)		 43,911
(1.13 %)		 39,178
(0.99 %)
515 shrew mouse
GCF_900095145.1		 46,279
(2.64 %)		 43,645
(2.34 %)		 20,549
(2.23 %)		 18,979
(1.49 %)		 94,079
(3.98 %)		 41.89
(90.53 %)		 15,298
(6.27 %)		 269,643
(9.50 %)		 17,879
(93.73 %)		 4,788,498
(38.32 %)		 1,499,714
(3.03 %)		 13,021,757
(27.83 %)		 6,442
(0.07 %)		 442,006
(1.19 %)		 16,787
(0.47 %)		 15,907
(0.43 %)
516 Siberian hamster (SSSS 2022)
GCA_023856395.1		 n/a n/a 18,375
(1.83 %)		 17,066
(1.44 %)		 n/a 41.27
(99.64 %)		 0
(0 %)		 88,601
(0.37 %)		 7,756
(100.00 %)		 3,152,242
(21.63 %)		 1,087,009
(2.64 %)		 12,055,167
(29.20 %)		 1,976
(0.02 %)		 260,068
(0.73 %)		 15,455
(0.48 %)		 14,212
(0.40 %)
517 Siberian musk deer (BS20 2019 Broad)
GCA_004024705.1		 n/a n/a 23,440
(1.32 %)		 37,497
(1.19 %)		 n/a 42.32
(99.86 %)		 19,764
(0.07 %)		 19,764
(0.07 %)		 1,195,467
(99.93 %)		 6,726,950
(49.79 %)		 437,480
(1.57 %)		 14,155,240
(46.22 %)		 13
(0.00 %)		 n/a 49,177
(1.05 %)		 43,489
(0.94 %)
518 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2		 37,090
(1.93 %)		 n/a 18,969
(1.19 %)		 19,298
(1.31 %)		 n/a 43.01
(88.43 %)		 0
(0 %)		 270,406
(11.60 %)		 7,490
(100.00 %)		 3,789,337
(28.89 %)		 429,226
(0.87 %)		 16,951,112
(32.23 %)		 3,875
(0.06 %)		 191,573
(0.64 %)		 39,993
(0.70 %)		 32,202
(0.55 %)
519 smoky shrew (2023)
GCF_029834395.1		 37,165
(1.66 %)		 n/a 17,572
(1.06 %)		 24,146
(1.29 %)		 n/a 43.43
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 497
(100.00 %)		 2,593,080
(14.11 %)		 1,194,567
(7.25 %)		 14,051,522
(48.20 %)		 0
(0 %)		 1,447,378
(3.75 %)		 107,473
(2.80 %)		 53,859
(1.19 %)
520 snow leopard (11264 2022)
GCF_023721935.1		 53,556
(3.37 %)		 n/a 18,780
(1.67 %)		 21,038
(1.40 %)		 n/a 41.60
(99.30 %)		 0
(0 %)		 23,786
(0.70 %)		 2,636
(100.00 %)		 4,714,429
(34.93 %)		 919,518
(1.59 %)		 13,711,504
(33.24 %)		 1,871
(0.02 %)		 357,999
(0.95 %)		 64,690
(2.41 %)		 61,670
(2.00 %)
521 snowshoe hare
GCA_004026855.1		 n/a n/a 23,263
(0.88 %)		 55,811
(1.01 %)		 n/a 44.12
(99.87 %)		 10,153
(0.03 %)		 10,153
(0.03 %)		 1,602,982
(99.97 %)		 4,767,120
(21.29 %)		 1,040,992
(2.22 %)		 15,680,144
(43.23 %)		 86
(0.00 %)		 n/a 126,152
(2.28 %)		 87,841
(1.66 %)
522 social tuco-tuco
GCA_004027165.1		 n/a n/a 25,166
(1.12 %)		 41,316
(1.26 %)		 n/a 40.71
(99.89 %)		 16,191
(0.06 %)		 16,191
(0.06 %)		 823,762
(99.94 %)		 5,390,906
(28.28 %)		 1,027,922
(2.15 %)		 15,241,308
(38.39 %)		 45
(0.00 %)		 n/a 31,883
(0.72 %)		 27,410
(0.58 %)
523 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1		 n/a n/a 17,590
(1.81 %)		 21,597
(1.85 %)		 n/a 42.88
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,717
(100.00 %)		 2,734,555
(21.46 %)		 795,752
(6.56 %)		 9,601,735
(36.35 %)		 0
(0 %)		 660,443
(2.50 %)		 62,524
(3.25 %)		 60,391
(2.11 %)
524 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1		 n/a n/a 18,056
(1.78 %)		 21,158
(1.79 %)		 n/a 42.67
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 161
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 2,899,535
(21.64 %)		 853,717
(7.80 %)		 10,162,216
(37.72 %)		 1
(0.00 %)		 802,761
(2.85 %)		 63,256
(3.06 %)		 61,642
(2.03 %)
525 South African ground squirrel
GCA_004024805.1		 n/a n/a 22,802
(1.44 %)		 33,892
(1.27 %)		 n/a 39.97
(99.92 %)		 9,745
(0.04 %)		 9,745
(0.04 %)		 587,115
(99.96 %)		 5,256,998
(34.93 %)		 594,122
(1.27 %)		 14,462,947
(33.96 %)		 36
(0.00 %)		 n/a 34,141
(0.80 %)		 32,509
(0.74 %)
526 Southeastern Asian house mouse (2016)
GCA_001624445.1		 n/a n/a 21,103
(2.24 %)		 18,682
(1.45 %)		 102,099
(4.16 %)		 41.83
(86.23 %)		 48,311
(2.15 %)		 424,005
(13.83 %)		 52,352
(97.85 %)		 4,990,851
(39.88 %)		 1,356,202
(2.67 %)		 13,469,640
(26.15 %)		 14,714
(0.76 %)		 396,098
(1.49 %)		 16,724
(0.41 %)		 15,971
(0.39 %)
527 Southeastern Asian house mouse (2022)
GCA_921999005.2		 n/a n/a 21,799
(2.13 %)		 19,729
(1.40 %)		 110,356
(4.43 %)		 41.78
(99.19 %)		 4
(0.00 %)		 278
(0.81 %)		 151
(100.00 %)		 4,663,228
(40.41 %)		 1,549,985
(3.70 %)		 13,012,600
(34.99 %)		 8
(0.01 %)		 788,439
(2.30 %)		 21,349
(0.52 %)		 15,914
(0.42 %)
528 Southeastern Asian house mouse (T2T 2024)
GCA_964188545.1		 n/a n/a 22,529
(1.85 %)		 20,409
(1.22 %)		 n/a 41.10
(99.90 %)		 78
(0.10 %)		 78
(0.10 %)		 416
(99.90 %)		 4,880,101
(47.77 %)		 1,689,287
(15.13 %)		 12,822,147
(42.92 %)		 1
(0.00 %)		 2,529,336
(6.14 %)		 22,642
(0.54 %)		 16,895
(0.41 %)
529 southern elephant seal
GCF_011800145.1		 53,210
(2.86 %)		 n/a 19,520
(1.73 %)		 20,727
(1.41 %)		 39,634
(1.86 %)		 41.45
(99.36 %)		 0
(0 %)		 22,850
(0.64 %)		 1,115
(100.00 %)		 4,728,105
(43.75 %)		 585,443
(1.13 %)		 13,463,979
(33.65 %)		 2,467
(0.03 %)		 627,414
(1.65 %)		 53,182
(1.62 %)		 49,837
(1.42 %)
530 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1		 47,152
(2.39 %)		 n/a 19,356
(1.68 %)		 18,821
(1.36 %)		 n/a 41.81
(98.94 %)		 0
(0 %)		 2,143
(1.06 %)		 2,949
(100.00 %)		 4,850,460
(28.64 %)		 1,195,836
(2.72 %)		 13,540,762
(32.73 %)		 0
(0 %)		 547,538
(1.62 %)		 18,046
(0.54 %)		 16,132
(0.42 %)
531 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1		 69,045
(3.04 %)		 n/a 20,313
(2.11 %)		 17,745
(1.38 %)		 n/a 41.39
(91.90 %)		 0
(0 %)		 146,713
(8.12 %)		 28
(100.00 %)		 4,875,400
(38.43 %)		 1,454,350
(2.93 %)		 13,104,717
(28.82 %)		 2,045
(0.04 %)		 494,819
(1.13 %)		 16,715
(0.45 %)		 15,641
(0.42 %)
532 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1		 n/a n/a 20,179
(1.21 %)		 24,249
(1.19 %)		 n/a 39.54
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 4
(0.00 %)		 7,866
(100.00 %)		 3,953,031
(35.88 %)		 531,111
(1.14 %)		 16,354,874
(39.96 %)		 0
(0 %)		 425,622
(1.30 %)		 59,907
(1.35 %)		 35,916
(0.80 %)
533 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1		 n/a n/a 20,058
(1.26 %)		 22,196
(1.13 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 0
(0 %)		 961
(0.56 %)		 201
(100.00 %)		 4,037,291
(46.02 %)		 593,019
(1.17 %)		 18,033,833
(40.56 %)		 9
(0.00 %)		 500,101
(1.40 %)		 65,039
(1.33 %)		 38,121
(0.86 %)
534 southern three-banded armadillo
GCA_004025125.1		 n/a n/a 29,138
(0.73 %)		 56,522
(0.75 %)		 n/a 39.20
(99.82 %)		 15,801
(0.04 %)		 15,801
(0.04 %)		 2,941,308
(99.96 %)		 6,990,740
(38.88 %)		 839,452
(1.23 %)		 24,805,397
(43.95 %)		 220
(0.00 %)		 n/a 71,951
(0.98 %)		 63,325
(0.84 %)
535 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1		 n/a n/a 22,897
(1.23 %)		 27,007
(1.18 %)		 n/a 39.87
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 70
(0.00 %)		 12,050
(100.00 %)		 4,502,020
(38.27 %)		 576,759
(1.02 %)		 17,143,050
(40.65 %)		 0
(0 %)		 450,196
(1.59 %)		 51,339
(1.15 %)		 40,459
(0.82 %)
536 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1		 63,054
(2.39 %)		 n/a 21,998
(1.29 %)		 23,177
(1.18 %)		 45,345
(1.69 %)		 39.89
(97.48 %)		 0
(0 %)		 1,243
(2.52 %)		 146
(100.00 %)		 4,559,690
(39.66 %)		 577,607
(1.02 %)		 16,594,630
(40.50 %)		 4
(0.00 %)		 492,026
(1.69 %)		 51,430
(1.14 %)		 40,148
(0.81 %)
537 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq)
GCF_000283155.1		 37,037
(2.11 %)		 n/a 18,398
(1.71 %)		 19,753
(1.44 %)		 n/a 40.90
(96.05 %)		 54,737
(3.96 %)		 54,737
(3.96 %)		 57,824
(96.04 %)		 3,685,898
(38.31 %)		 421,694
(0.97 %)		 14,765,529
(28.93 %)		 1,818
(0.02 %)		 184,274
(0.57 %)		 36,281
(1.02 %)		 32,113
(0.82 %)
538 Sowerby's beaked whale (hap1 2024)
GCA_964165515.1		 n/a n/a 19,471
(1.39 %)		 22,951
(1.24 %)		 n/a 42.04
(99.99 %)		 2
(0.00 %)		 1,095
(0.01 %)		 1,604
(100.00 %)		 4,307,839
(34.31 %)		 825,475
(10.97 %)		 11,375,945
(45.31 %)		 11
(0.00 %)		 3,517,431
(7.94 %)		 76,527
(3.10 %)		 39,378
(0.86 %)
539 Sowerby's beaked whale (hap2 2024)
GCA_964148845.1		 n/a n/a 18,591
(1.46 %)		 21,588
(1.27 %)		 n/a 42.00
(99.99 %)		 974
(0.01 %)		 974
(0.01 %)		 2,126
(99.99 %)		 3,961,403
(34.20 %)		 742,897
(9.73 %)		 10,832,739
(43.68 %)		 2
(0.00 %)		 2,951,041
(7.25 %)		 70,803
(2.85 %)		 37,380
(0.90 %)
540 Sowerby's beaked whale (US080 2019)
GCA_004027085.1		 n/a n/a 22,800
(1.32 %)		 38,247
(1.17 %)		 n/a 41.68
(99.84 %)		 8,597
(0.03 %)		 8,597
(0.03 %)		 1,810,317
(99.97 %)		 5,520,986
(45.05 %)		 1,081,962
(2.69 %)		 13,480,261
(43.01 %)		 62
(0.00 %)		 n/a 69,001
(1.39 %)		 52,160
(1.13 %)
541 sperm whale (SW-GA 2023)
GCF_002837175.3		 62,615
(2.83 %)		 n/a 19,485
(1.75 %)		 22,707
(1.41 %)		 n/a 41.33
(95.82 %)		 121,387
(4.20 %)		 121,387
(4.20 %)		 133,555
(95.80 %)		 3,906,439
(36.43 %)		 691,647
(2.39 %)		 13,489,368
(32.95 %)		 1,869
(0.17 %)		 517,424
(4.47 %)		 86,751
(2.23 %)		 82,633
(2.04 %)
542 star-nosed mole
GCF_000260355.1		 30,444
(2.86 %)		 n/a 16,116
(1.82 %)		 17,403
(1.78 %)		 n/a 41.55
(95.10 %)		 82,557
(4.92 %)		 82,557
(4.92 %)		 84,595
(95.08 %)		 1,855,039
(18.90 %)		 308,473
(0.86 %)		 9,571,561
(26.02 %)		 1,110
(0.03 %)		 253,120
(1.17 %)		 48,079
(2.76 %)		 50,592
(2.47 %)
543 Steller sea lion
GCF_004028035.1		 46,044
(2.38 %)		 n/a 21,171
(1.78 %)		 21,626
(1.43 %)		 36,701
(1.75 %)		 41.38
(99.41 %)		 17,263
(0.59 %)		 18,994
(0.59 %)		 24,485
(99.41 %)		 4,556,415
(43.53 %)		 577,797
(1.09 %)		 13,545,012
(33.71 %)		 733
(0.02 %)		 410,405
(1.19 %)		 51,355
(1.45 %)		 47,732
(1.28 %)
544 Stephens's kangaroo rat
GCA_004024685.1		 n/a n/a 20,638
(1.19 %)		 43,541
(1.37 %)		 n/a 41.90
(99.85 %)		 8,882
(0.04 %)		 8,882
(0.04 %)		 1,278,525
(99.96 %)		 4,886,095
(30.36 %)		 1,229,832
(5.30 %)		 11,334,494
(44.33 %)		 37
(0.00 %)		 n/a 38,450
(1.17 %)		 29,741
(0.76 %)
545 steppe mouse (ZRU 2018)
GCA_003336285.1		 n/a n/a 22,032
(2.17 %)		 20,891
(1.41 %)		 n/a 41.70
(95.78 %)		 123,681
(4.24 %)		 123,681
(4.24 %)		 161,217
(95.76 %)		 4,964,415
(42.35 %)		 1,414,584
(2.75 %)		 12,989,925
(31.80 %)		 1,690
(0.04 %)		 440,790
(1.25 %)		 17,544
(0.44 %)		 15,542
(0.39 %)
546 straw-colored fruit bat
GCA_000465285.1		 n/a n/a 20,161
(1.66 %)		 40,283
(1.50 %)		 n/a 39.24
(99.62 %)		 154,908
(0.40 %)		 154,908
(0.40 %)		 288,446
(99.60 %)		 2,814,732
(32.92 %)		 372,539
(1.01 %)		 12,351,823
(25.93 %)		 27
(0.00 %)		 33,439
(0.13 %)		 67,245
(2.34 %)		 61,933
(1.94 %)
547 stripe-headed round-eared bat
GCA_004024845.1		 n/a n/a 20,248
(1.62 %)		 29,173
(1.61 %)		 n/a 42.04
(99.96 %)		 2,860
(0.01 %)		 2,860
(0.01 %)		 252,670
(99.99 %)		 3,018,746
(29.48 %)		 333,243
(0.74 %)		 12,128,116
(30.51 %)		 14
(0.00 %)		 n/a 59,513
(1.87 %)		 52,210
(1.57 %)
548 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1		 n/a n/a 18,204
(1.54 %)		 21,036
(1.34 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,464
(100.00 %)		 3,767,720
(35.65 %)		 1,102,723
(10.92 %)		 11,794,617
(40.96 %)		 0
(0 %)		 1,492,009
(4.69 %)		 67,537
(3.57 %)		 41,008
(1.09 %)
549 striped dolphin (primary hap 2023)
GCA_951394435.1		 n/a n/a 18,595
(1.48 %)		 20,637
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 1
(0.00 %)		 993
(0.01 %)		 639
(100.00 %)		 4,097,623
(35.88 %)		 1,442,973
(13.60 %)		 12,327,244
(43.08 %)		 1
(0.00 %)		 1,896,129
(5.45 %)		 68,498
(4.29 %)		 42,011
(1.04 %)
550 striped hyena (BS54 2019 Broad)
GCA_004023945.1		 n/a n/a 22,373
(1.45 %)		 39,382
(1.45 %)		 n/a 41.66
(99.93 %)		 11,849
(0.05 %)		 11,849
(0.05 %)		 362,072
(99.95 %)		 5,048,667
(42.42 %)		 712,073
(1.24 %)		 13,879,012
(34.58 %)		 54
(0.00 %)		 302,752
(0.79 %)		 69,835
(2.20 %)		 65,774
(1.90 %)
551 striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U)
GCF_003009895.1		 48,870
(2.41 %)		 n/a 18,793
(1.67 %)		 20,950
(1.44 %)		 n/a 41.56
(99.29 %)		 0
(0 %)		 23,058
(0.71 %)		 5,761
(100.00 %)		 4,782,500
(41.88 %)		 701,157
(1.32 %)		 13,436,624
(33.05 %)		 2,049
(0.04 %)		 413,871
(1.33 %)		 58,977
(2.20 %)		 57,500
(1.94 %)
552 sugar glider (PSGF00001 2023)
GCA_028583685.1		 n/a n/a 19,326
(0.81 %)		 17,560
(0.95 %)		 n/a 38.95
(98.12 %)		 0
(0 %)		 85,933
(1.89 %)		 1,895
(100.00 %)		 6,382,198
(27.07 %)		 1,058,207
(1.74 %)		 22,508,040
(39.84 %)		 4,157
(0.04 %)		 398,213
(0.87 %)		 16,224
(0.33 %)		 14,028
(0.23 %)
553 sugar glider (PSGF00001 2023)
GCF_028583685.1		 55,990
(2.41 %)		 n/a 19,328
(0.81 %)		 17,559
(0.95 %)		 n/a 38.95
(98.12 %)		 0
(0 %)		 85,933
(1.89 %)		 1,896
(100.00 %)		 6,382,203
(27.07 %)		 1,058,208
(1.74 %)		 22,508,106
(39.84 %)		 4,157
(0.04 %)		 398,217
(0.87 %)		 16,224
(0.33 %)		 14,028
(0.23 %)
554 Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017)
GCA_002844835.1		 n/a n/a 20,368
(1.53 %)		 24,204
(1.23 %)		 n/a 41.05
(95.54 %)		 50,874
(4.40 %)		 50,876
(4.40 %)		 1,112,463
(95.60 %)		 4,516,240
(39.90 %)		 561,540
(1.56 %)		 15,821,451
(34.68 %)		 11,238
(0.78 %)		 n/a 45,201
(1.03 %)		 42,111
(0.93 %)
555 Sumatran serow (serow.1 2024)
GCF_032405125.1		 36,400
(1.65 %)		 n/a 19,192
(1.42 %)		 22,014
(1.41 %)		 n/a 43.08
(100.00 %)		 0
(0 %)		 6
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 3,242,768
(21.18 %)		 612,565
(8.05 %)		 12,812,990
(44.37 %)		 1
(0.00 %)		 1,821,554
(4.84 %)		 75,177
(5.86 %)		 39,082
(0.88 %)
556 Sunda flying lemur (2014 WashU)
GCF_000696425.1		 34,734
(1.83 %)		 n/a 21,356
(1.55 %)		 25,832
(1.21 %)		 n/a 40.21
(87.96 %)		 332,364
(12.07 %)		 412,608
(12.07 %)		 511,878
(87.93 %)		 4,961,153
(38.35 %)		 854,441
(3.33 %)		 17,562,576
(28.82 %)		 58,964
(1.13 %)		 n/a 82,988
(1.05 %)		 76,682
(0.95 %)
557 Sunda flying lemur (US047 2019 Broad)
GCA_004027255.1		 n/a n/a 24,882
(1.29 %)		 43,546
(1.12 %)		 n/a 40.46
(99.88 %)		 5,895
(0.02 %)		 5,895
(0.02 %)		 1,655,642
(99.98 %)		 5,807,241
(38.62 %)		 953,765
(2.48 %)		 18,836,777
(37.68 %)		 23
(0.00 %)		 n/a 114,955
(1.43 %)		 106,305
(1.30 %)
558 tailed tailless bat
GCA_004027475.1		 n/a n/a 19,920
(1.58 %)		 28,017
(1.58 %)		 n/a 41.76
(99.95 %)		 4,640
(0.02 %)		 4,640
(0.02 %)		 341,895
(99.98 %)		 3,139,817
(30.43 %)		 381,536
(0.81 %)		 12,069,229
(32.73 %)		 25
(0.00 %)		 n/a 54,528
(2.15 %)		 52,231
(1.90 %)
559 takin (Tak-1 2022)
GCF_023091745.1		 31,914
(1.65 %)		 n/a 19,290
(1.42 %)		 21,656
(1.27 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 0
(0 %)		 152
(0.00 %)		 1,363
(100.00 %)		 3,256,033
(21.01 %)		 714,375
(8.32 %)		 13,010,154
(44.58 %)		 4
(0.00 %)		 1,681,924
(4.50 %)		 49,134
(7.43 %)		 39,324
(0.88 %)
560 Talazac's shrew tenrec
GCA_004026705.1		 n/a n/a 22,605
(0.81 %)		 50,725
(1.09 %)		 n/a 43.03
(99.93 %)		 6,619
(0.02 %)		 6,619
(0.02 %)		 795,514
(99.98 %)		 3,493,378
(14.58 %)		 705,274
(1.31 %)		 20,975,335
(36.85 %)		 51
(0.00 %)		 n/a 70,793
(1.26 %)		 54,287
(0.89 %)
561 tammar wallaby (mMacEug1 alternate hap 2023)
GCA_028389975.1		 n/a n/a 11,133
(0.77 %)		 13,869
(0.98 %)		 n/a 38.63
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2
(0.00 %)		 14,285
(100.00 %)		 3,114,522
(26.10 %)		 661,874
(3.02 %)		 11,667,649
(38.41 %)		 0
(0 %)		 320,252
(1.29 %)		 12,393
(0.46 %)		 7,824
(0.29 %)
562 tammar wallaby (mMacEug1 primary hap 2023)
GCA_028372415.1		 n/a n/a 17,652
(0.77 %)		 15,774
(0.88 %)		 n/a 38.73
(99.81 %)		 0
(0 %)		 515
(0.19 %)		 315
(100.00 %)		 5,836,160
(26.14 %)		 1,193,709
(2.72 %)		 22,682,658
(39.52 %)		 4
(0.00 %)		 566,172
(1.21 %)		 23,629
(0.48 %)		 14,785
(0.29 %)
563 Tasmanian devil
GCF_902635505.1		 52,057
(2.36 %)		 n/a 15,918
(0.85 %)		 16,111
(0.91 %)		 n/a 36.16
(100.00 %)		 0
(0 %)		 354
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 6,789,158
(44.28 %)		 1,246,027
(2.19 %)		 21,434,803
(41.20 %)		 1
(0.00 %)		 454,463
(1.20 %)		 23,609
(0.65 %)		 23,356
(0.61 %)
564 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1		 69,352
(3.50 %)		 n/a 18,934
(1.68 %)		 16,775
(1.37 %)		 n/a 39.91
(93.25 %)		 0
(0 %)		 146,412
(6.77 %)		 7,132
(100.00 %)		 4,262,890
(35.64 %)		 640,624
(1.64 %)		 14,118,452
(27.90 %)		 3,000
(0.05 %)		 226,596
(0.80 %)		 28,317
(0.64 %)		 26,522
(0.58 %)
565 Tibetan sand fox (lyu1992 2022)
GCA_024500485.1		 n/a n/a 19,552
(1.59 %)		 19,307
(1.35 %)		 n/a 41.25
(100.00 %)		 0
(0 %)		 145
(0.00 %)		 234
(100.00 %)		 4,500,832
(32.18 %)		 999,068
(2.01 %)		 13,646,015
(32.98 %)		 0
(0 %)		 668,288
(1.70 %)		 49,402
(2.19 %)		 47,111
(1.57 %)
566 tiger
GCF_018350195.1		 71,226
(2.84 %)		 n/a 18,513
(1.68 %)		 19,919
(1.39 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 56
(0.00 %)		 65
(0.00 %)		 131
(100.00 %)		 4,878,003
(42.77 %)		 912,595
(1.82 %)		 13,804,650
(33.76 %)		 1
(0.00 %)		 408,593
(1.10 %)		 64,312
(2.55 %)		 60,048
(2.06 %)
567 Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230055.1		 n/a n/a 19,370
(1.77 %)		 21,062
(1.61 %)		 n/a 42.81
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 219
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 2,923,694
(25.49 %)		 772,382
(3.25 %)		 10,654,074
(37.41 %)		 2
(0.00 %)		 500,435
(1.74 %)		 48,226
(2.42 %)		 50,955
(1.88 %)
568 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1		 n/a n/a 18,627
(1.82 %)		 20,108
(1.67 %)		 n/a 42.95
(100.00 %)		 0
(0 %)		 217
(0.00 %)		 182
(100.00 %)		 2,733,927
(24.79 %)		 715,258
(3.17 %)		 10,099,456
(36.35 %)		 1
(0.00 %)		 459,634
(1.69 %)		 47,139
(2.58 %)		 49,626
(1.96 %)
569 Transcaucasian mole vole
GCA_001685075.1		 n/a n/a 20,173
(1.62 %)		 18,627
(1.30 %)		 n/a 41.51
(96.09 %)		 440,846
(3.96 %)		 440,846
(3.96 %)		 499,269
(96.04 %)		 3,827,136
(25.51 %)		 810,597
(2.65 %)		 13,634,524
(27.54 %)		 26,487
(0.57 %)		 259,635
(1.42 %)		 9,596
(0.16 %)		 8,622
(0.14 %)
570 Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq)
GCF_000622305.1		 54,667
(2.07 %)		 n/a 19,704
(1.26 %)		 21,262
(1.20 %)		 n/a 41.26
(95.18 %)		 201,121
(4.83 %)		 201,121
(4.83 %)		 356,097
(95.17 %)		 6,165,645
(34.95 %)		 1,197,750
(2.77 %)		 16,282,383
(36.21 %)		 730
(0.04 %)		 n/a 22,905
(0.49 %)		 18,563
(0.39 %)
571 Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019)
GCA_005458795.1		 n/a n/a 19,867
(1.62 %)		 15,893
(1.33 %)		 n/a 39.77
(94.43 %)		 291,728
(5.60 %)		 296,819
(5.60 %)		 315,631
(94.40 %)		 4,452,628
(33.94 %)		 751,210
(1.84 %)		 13,917,879
(30.08 %)		 10,755
(0.11 %)		 190,776
(0.77 %)		 26,541
(0.58 %)		 25,046
(0.53 %)
572 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1		 n/a n/a 9,367
(1.66 %)		 11,297
(1.30 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,470
(100.00 %)		 1,708,360
(43.81 %)		 267,584
(1.67 %)		 5,373,410
(33.52 %)		 0
(0 %)		 245,754
(1.84 %)		 29,783
(1.94 %)		 21,396
(1.51 %)
573 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1		 60,106
(3.00 %)		 n/a 18,611
(1.76 %)		 20,103
(1.39 %)		 35,176
(2.22 %)		 41.36
(99.66 %)		 0
(0 %)		 212
(0.34 %)		 64
(100.00 %)		 4,067,454
(44.25 %)		 602,407
(1.34 %)		 12,468,582
(35.55 %)		 3
(0.00 %)		 550,113
(1.71 %)		 66,806
(1.79 %)		 48,624
(1.46 %)
574 water buffalo (Mediterranean 2018)
GCF_003121395.1		 69,771
(3.14 %)		 62,816
(2.76 %)		 19,465
(1.58 %)		 21,849
(1.37 %)		 46,051
(1.86 %)		 41.81
(99.99 %)		 0
(0 %)		 410
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 5,407,697
(47.11 %)		 473,976
(1.54 %)		 13,015,899
(41.23 %)		 0
(0 %)		 1,256,741
(3.44 %)		 43,120
(1.15 %)		 37,204
(0.96 %)
575 water buffalo (Murrah 2021)
GCF_019923935.1		 80,552
(3.26 %)		 n/a 19,402
(1.59 %)		 20,375
(1.31 %)		 n/a 41.75
(100.00 %)		 0
(0 %)		 659
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 5,358,548
(47.11 %)		 447,338
(1.14 %)		 13,034,537
(41.28 %)		 1
(0.00 %)		 1,149,595
(3.22 %)		 40,189
(1.07 %)		 36,130
(0.95 %)
576 Weddell seal (WS11-02 2013 refseq)
GCF_000349705.1		 48,251
(2.73 %)		 n/a 21,063
(1.73 %)		 22,333
(1.43 %)		 n/a 41.39
(70.44 %)		 152,836
(29.58 %)		 152,836
(29.58 %)		 169,547
(70.42 %)		 4,420,479
(41.72 %)		 471,256
(0.66 %)		 13,410,237
(22.09 %)		 2,022
(0.05 %)		 348,917
(1.08 %)		 48,738
(1.01 %)		 44,867
(0.88 %)
577 western European hedgehog (2012 refseq)
GCF_000296755.1		 29,923
(1.67 %)		 n/a 18,067
(1.33 %)		 19,777
(1.35 %)		 n/a 41.54
(85.94 %)		 219,764
(14.09 %)		 219,764
(14.09 %)		 225,567
(85.91 %)		 6,594,783
(45.66 %)		 1,271,533
(2.29 %)		 12,374,161
(42.02 %)		 3,596
(0.06 %)		 861,216
(2.39 %)		 28,528
(0.71 %)		 23,900
(0.52 %)
578 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1		 n/a n/a 14,370
(1.06 %)		 24,297
(1.27 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 26,601
(100.00 %)		 3,360,923
(19.59 %)		 1,043,098
(3.92 %)		 8,511,380
(53.68 %)		 0
(0 %)		 1,216,984
(4.33 %)		 23,321
(0.97 %)		 17,608
(0.60 %)
579 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1		 61,103
(2.36 %)		 n/a 18,125
(1.16 %)		 20,689
(1.21 %)		 n/a 42.00
(99.97 %)		 0
(0 %)		 3,760
(0.03 %)		 1,174
(100.00 %)		 4,891,329
(19.68 %)		 1,507,929
(3.81 %)		 12,571,105
(54.50 %)		 7
(0.00 %)		 1,975,693
(4.67 %)		 32,667
(0.90 %)		 24,067
(0.56 %)
580 western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022)
GCA_921998345.2		 n/a n/a 21,722
(2.14 %)		 19,586
(1.39 %)		 108,856
(4.46 %)		 41.81
(98.87 %)		 1
(0.00 %)		 1,233
(1.13 %)		 233
(100.00 %)		 4,634,551
(40.61 %)		 1,541,826
(3.49 %)		 13,030,566
(35.21 %)		 1
(0.00 %)		 789,553
(2.49 %)		 22,985
(0.56 %)		 15,853
(0.42 %)
581 western spotted skunk
GCA_004023965.1		 n/a n/a 21,665
(1.46 %)		 34,370
(1.32 %)		 n/a 41.61
(99.92 %)		 11,822
(0.05 %)		 11,822
(0.05 %)		 433,831
(99.95 %)		 4,889,781
(40.77 %)		 901,906
(2.30 %)		 13,931,764
(34.80 %)		 69
(0.00 %)		 550,674
(1.31 %)		 54,394
(1.54 %)		 50,665
(1.39 %)
582 western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022)
GCA_921997135.2		 n/a n/a 21,699
(2.10 %)		 18,837
(1.32 %)		 n/a 41.69
(99.51 %)		 4
(0.00 %)		 1,576
(0.49 %)		 143
(100.00 %)		 4,507,329
(41.24 %)		 1,517,241
(3.77 %)		 12,832,499
(36.17 %)		 35
(0.00 %)		 908,992
(2.83 %)		 22,568
(0.53 %)		 15,701
(0.41 %)
583 whiskered bat (hap1 2024)
GCA_964094495.2		 n/a n/a 19,504
(1.78 %)		 22,272
(1.73 %)		 n/a 42.99
(99.99 %)		 7
(0.00 %)		 1,566
(0.02 %)		 533
(100.00 %)		 3,046,246
(25.06 %)		 753,151
(4.86 %)		 10,596,418
(37.62 %)		 7
(0.00 %)		 729,123
(2.57 %)		 66,785
(2.55 %)		 53,825
(1.76 %)
584 whiskered bat (hap2 2024)
GCA_964195625.1		 n/a n/a 18,681
(1.83 %)		 21,523
(1.79 %)		 n/a 43.13
(99.99 %)		 1,414
(0.01 %)		 1,414
(0.01 %)		 1,741
(99.99 %)		 2,849,223
(24.50 %)		 688,594
(4.80 %)		 9,968,980
(36.80 %)		 9
(0.00 %)		 650,767
(2.46 %)		 64,365
(2.68 %)		 52,706
(1.84 %)
585 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1		 n/a n/a 17,639
(1.50 %)		 25,684
(1.35 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 25,619
(100.00 %)		 3,039,324
(36.05 %)		 637,912
(8.02 %)		 9,746,398
(38.98 %)		 0
(0 %)		 811,711
(3.51 %)		 56,325
(3.33 %)		 35,586
(1.15 %)
586 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1		 59,982
(2.43 %)		 n/a 18,737
(1.57 %)		 20,767
(1.34 %)		 n/a 41.91
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,070
(0.01 %)		 410
(100.00 %)		 3,820,566
(36.21 %)		 922,103
(8.43 %)		 12,304,360
(39.74 %)		 2
(0.00 %)		 1,117,804
(3.60 %)		 68,551
(3.58 %)		 41,698
(1.09 %)
587 white-footed mouse
GCF_004664715.2		 54,479
(2.82 %)		 n/a 19,971
(1.69 %)		 20,132
(1.42 %)		 n/a 42.23
(99.95 %)		 0
(0 %)		 2,299
(0.05 %)		 1,857
(100.00 %)		 5,060,487
(30.71 %)		 1,258,073
(2.85 %)		 14,007,098
(32.99 %)		 1
(0.00 %)		 568,416
(1.60 %)		 23,456
(0.67 %)		 19,779
(0.50 %)
588 white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq)
GCF_002102435.1		 57,774
(2.93 %)		 n/a 20,661
(1.75 %)		 23,085
(1.50 %)		 40,987
(1.94 %)		 41.55
(99.10 %)		 31,627
(0.90 %)		 107,058
(0.91 %)		 48,653
(99.10 %)		 4,800,704
(41.29 %)		 413,129
(2.59 %)		 13,296,779
(34.22 %)		 7,681
(0.08 %)		 439,019
(2.88 %)		 44,165
(1.19 %)		 41,200
(1.10 %)
589 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1		 n/a n/a 12,198
(1.10 %)		 18,494
(1.29 %)		 n/a 39.87
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 26
(0.00 %)		 14,841
(100.00 %)		 1,725,021
(17.81 %)		 802,415
(4.26 %)		 8,321,474
(45.72 %)		 0
(0 %)		 653,092
(2.79 %)		 15,669
(0.79 %)		 13,175
(0.55 %)
590 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1		 40,430
(1.81 %)		 n/a 17,575
(1.21 %)		 21,880
(1.35 %)		 47,496
(1.55 %)		 39.81
(99.57 %)		 0
(0 %)		 1,010
(0.43 %)		 147
(100.00 %)		 2,846,063
(18.57 %)		 1,252,362
(3.89 %)		 13,776,063
(46.50 %)		 14
(0.00 %)		 1,059,317
(2.87 %)		 24,589
(0.78 %)		 20,877
(0.55 %)
591 wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020)
GCF_009834535.1		 70,235
(4.11 %)		 n/a 18,202
(1.93 %)		 20,199
(1.66 %)		 42,728
(2.35 %)		 41.66
(99.99 %)		 0
(0 %)		 2,345
(0.01 %)		 2,043
(100.00 %)		 3,091,018
(33.31 %)		 332,720
(5.33 %)		 12,161,286
(28.79 %)		 5
(0.00 %)		 978,328
(2.98 %)		 55,524
(1.75 %)		 51,693
(1.56 %)
592 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq)
GCF_000311805.1		 34,726
(2.40 %)		 n/a 18,746
(1.96 %)		 17,104
(1.61 %)		 n/a 41.28
(98.83 %)		 55,538
(1.18 %)		 60,971
(1.18 %)		 68,872
(98.82 %)		 2,991,821
(33.93 %)		 353,632
(1.23 %)		 12,349,615
(25.12 %)		 11
(0.00 %)		 101,845
(0.63 %)		 45,437
(1.02 %)		 41,010
(0.88 %)
593 wild goat
GCA_000978405.1		 n/a n/a 19,104
(1.48 %)		 16,198
(1.21 %)		 n/a 41.91
(91.72 %)		 279,195
(8.31 %)		 279,195
(8.31 %)		 368,693
(91.69 %)		 5,563,294
(45.39 %)		 452,402
(1.99 %)		 13,802,376
(35.47 %)		 3,626
(0.18 %)		 791,539
(4.01 %)		 41,935
(0.63 %)		 35,405
(0.52 %)
594 wild yak
GCF_000298355.1		 29,776
(1.92 %)		 n/a 19,936
(1.62 %)		 19,914
(1.32 %)		 n/a 41.71
(95.48 %)		 192,006
(4.54 %)		 192,006
(4.54 %)		 233,198
(95.46 %)		 5,348,663
(46.08 %)		 449,880
(1.38 %)		 13,572,902
(36.62 %)		 139
(0.01 %)		 753,906
(2.31 %)		 41,147
(0.82 %)		 37,405
(0.73 %)
595 woodchuck (v1.1 L192 2022)
GCF_021218885.2		 68,030
(3.47 %)		 n/a 19,116
(1.55 %)		 21,017
(1.38 %)		 n/a 39.92
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 47
(0.00 %)		 3,380
(100.00 %)		 5,285,788
(43.20 %)		 912,552
(2.73 %)		 14,538,866
(35.15 %)		 0
(0 %)		 413,178
(1.33 %)		 36,914
(1.02 %)		 26,813
(0.66 %)
596 woodland dormouse
GCA_004027655.1		 n/a n/a 23,556
(1.09 %)		 55,517
(1.33 %)		 n/a 41.52
(99.86 %)		 15,691
(0.06 %)		 15,691
(0.06 %)		 1,283,630
(99.94 %)		 7,674,195
(34.99 %)		 1,698,258
(3.76 %)		 13,705,886
(42.23 %)		 20
(0.00 %)		 n/a 68,562
(1.41 %)		 46,064
(0.97 %)
597 woodland thicket rat
GCF_004785775.1		 43,129
(2.40 %)		 n/a 22,710
(2.13 %)		 21,042
(1.49 %)		 n/a 41.17
(98.57 %)		 0
(0 %)		 76,623
(1.44 %)		 23,656
(100.00 %)		 4,732,544
(38.04 %)		 1,424,025
(3.23 %)		 13,549,399
(30.42 %)		 5,008
(0.04 %)		 449,709
(1.17 %)		 18,232
(0.48 %)		 16,831
(0.43 %)
598 Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq)
GCF_003031525.2		 43,297
(2.49 %)		 n/a 18,747
(1.81 %)		 19,638
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,343
(99.28 %)		 3,547,466
(35.83 %)		 540,760
(1.65 %)		 12,691,756
(32.88 %)		 427
(0.03 %)		 363,612
(1.97 %)		 59,050
(1.48 %)		 55,323
(1.35 %)
599 Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.2		 26,115
(1.61 %)		 n/a 18,978
(1.74 %)		 20,661
(1.39 %)		 n/a 41.24
(98.69 %)		 123,788
(1.33 %)		 123,788
(1.33 %)		 148,598
(98.67 %)		 3,788,303
(37.04 %)		 690,288
(1.96 %)		 12,841,906
(35.04 %)		 292
(0.02 %)		 514,620
(2.01 %)		 62,458
(1.54 %)		 59,005
(1.41 %)
600 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019)
GCF_003676075.3		 42,654
(2.16 %)		 n/a 19,547
(1.52 %)		 21,406
(1.40 %)		 n/a 39.89
(97.96 %)		 34,682
(2.04 %)		 35,509
(2.04 %)		 66,442
(97.96 %)		 3,814,223
(27.39 %)		 800,865
(1.96 %)		 14,323,977
(32.63 %)		 1,266
(0.04 %)		 210,361
(0.69 %)		 34,122
(0.91 %)		 26,843
(0.62 %)
601 yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCF_016432865.1		 47,606
(2.50 %)		 n/a 15,703
(0.78 %)		 16,155
(0.90 %)		 n/a 36.21
(99.99 %)		 0
(0 %)		 620
(0.01 %)		 486
(100.00 %)		 5,191,383
(23.81 %)		 1,269,772
(2.59 %)		 21,430,585
(42.69 %)		 2
(0.00 %)		 714,623
(2.20 %)		 28,118
(0.66 %)		 28,157
(0.56 %)
602 yellow-spotted hyrax
GCA_004026845.1		 n/a n/a 20,424
(0.86 %)		 43,984
(1.27 %)		 n/a 40.93
(99.94 %)		 3,815
(0.01 %)		 3,815
(0.01 %)		 971,748
(99.99 %)		 5,365,974
(31.41 %)		 435,699
(1.22 %)		 21,229,266
(45.17 %)		 42
(0.00 %)		 n/a 38,521
(0.68 %)		 31,852
(0.55 %)
603 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1		 n/a n/a 17,610
(1.00 %)		 20,322
(1.04 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 0
(0 %)		 276
(0.00 %)		 62
(100.00 %)		 3,295,935
(23.58 %)		 389,907
(6.37 %)		 19,525,382
(45.90 %)		 0
(0 %)		 1,020,287
(2.23 %)		 31,831
(0.63 %)		 26,588
(0.47 %)
604 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1		 n/a n/a 16,320
(1.03 %)		 20,318
(1.13 %)		 n/a 40.93
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,169
(100.00 %)		 2,911,332
(23.50 %)		 347,110
(4.57 %)		 17,256,419
(44.04 %)		 0
(0 %)		 683,195
(1.71 %)		 28,674
(0.68 %)		 24,228
(0.50 %)
605 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023)
GCA_028536395.1		 n/a n/a 19,188
(1.79 %)		 21,673
(1.72 %)		 n/a 43.03
(100.00 %)		 0
(0 %)		 215
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 3,043,589
(24.76 %)		 773,853
(4.49 %)		 10,648,494
(37.26 %)		 2
(0.00 %)		 684,501
(2.39 %)		 61,910
(2.52 %)		 51,884
(1.68 %)
606 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023)
GCA_028538775.1		 n/a n/a 18,587
(1.82 %)		 21,049
(1.76 %)		 n/a 43.22
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 209
(0.00 %)		 685
(100.00 %)		 2,890,086
(24.28 %)		 719,555
(4.26 %)		 10,089,514
(36.35 %)		 0
(0 %)		 649,001
(2.37 %)		 60,975
(2.61 %)		 51,711
(1.75 %)
607 zebu cattle (Hainan HN024 2024)
GCA_039881165.1		 n/a n/a 19,162
(1.53 %)		 20,991
(1.34 %)		 n/a 41.77
(99.99 %)		 0
(0 %)		 350
(0.01 %)		 292
(100.00 %)		 3,296,209
(23.14 %)		 440,574
(1.28 %)		 12,824,144
(40.98 %)		 0
(0 %)		 1,191,569
(3.42 %)		 39,400
(1.07 %)		 35,669
(0.87 %)
608 zebu cattle (Nelore 2014 refseq)
GCF_000247795.1		 39,817
(2.52 %)		 n/a 18,603
(1.59 %)		 18,779
(1.29 %)		 n/a 41.75
(92.62 %)		 253,738
(7.41 %)		 6,941,272
(7.66 %)		 253,770
(92.59 %)		 5,119,428
(46.84 %)		 358,908
(0.88 %)		 13,431,672
(36.60 %)		 476
(0.01 %)		 998,817
(3.00 %)		 35,241
(0.84 %)		 32,220
(0.75 %)
TOTALS:total assembly count 608

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 221 assemblies assembly stats track stats
Mammals 608 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1060 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 775 assemblies assembly stats track stats