Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

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count	common name link to genome browser	ncbiRefSeq	ncbiGene	xenoRefGene	augustus genes	Ensembl genes	gc5 base	AGP gap	all gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	gap Overlap	tandem Dups	cpg unmasked	cpg island
1	aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad) GCF_000298275.1	25,594 (1.08 %)	n/a	18,351 (1.06 %)	20,358 (0.98 %)	n/a	40.07 (76.89 %)	411,144 (23.15 %)	411,144 (23.15 %)	433,653 (76.85 %)	n/a	536,700 (0.74 %)	18,176,790 (39.08 %)	3,595 (0.03 %)	723,185 (1.16 %)	26,235 (0.40 %)	24,645 (0.35 %)
2	African grass rat (maternal 2020) GCA_011750645.1	n/a	n/a	20,916 (2.01 %)	19,513 (1.43 %)	n/a	41.37 (98.89 %)	0 (0 %)	1,526 (1.11 %)	1,610 (100.00 %)	4,928,847 (37.45 %)	1,652,295 (5.20 %)	13,507,965 (32.27 %)	0 (0 %)	1,023,525 (1.96 %)	17,712 (0.51 %)	16,897 (0.46 %)
3	African grass rat (paternal 2020) GCA_011762545.1	n/a	n/a	20,796 (2.00 %)	19,611 (1.43 %)	n/a	41.42 (97.70 %)	0 (0 %)	1,563 (2.30 %)	1,740 (100.00 %)	4,904,243 (37.25 %)	1,672,608 (5.37 %)	13,465,246 (32.19 %)	1 (0.00 %)	1,034,950 (2.07 %)	17,677 (0.50 %)	16,772 (0.46 %)
4	African grass rat (v1 paternal X 2020 refseq) GCF_011762505.1	45,963 (2.46 %)	n/a	20,878 (1.99 %)	19,613 (1.43 %)	37,929 (2.32 %)	41.39 (99.19 %)	0 (0 %)	1,624 (0.81 %)	1,595 (100.00 %)	4,939,557 (37.33 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,429 (32.71 %)	2 (0.00 %)	1,065,249 (2.09 %)	17,767 (0.51 %)	16,852 (0.46 %)
5	African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank) GCA_011762505.2	n/a	n/a	19,637 (1.95 %)	19,610 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	0 (0 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	5,399,465 (42.90 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,540 (32.71 %)	2 (0.00 %)	979,697 (2.05 %)	17,767 (0.51 %)	15,566 (0.42 %)
6	African grass rat (v2 paternal X 2025 refseq) GCF_011762505.2	70,837 (3.51 %)	n/a	19,640 (1.95 %)	19,607 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	0 (0 %)	1,624 (0.81 %)	1,595 (100.00 %)	5,625,390 (42.96 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,612,806 (32.71 %)	2 (0.00 %)	855,406 (1.69 %)	17,767 (0.51 %)	15,567 (0.42 %)
7	African grass rat (v3 paternal hap 2024) GCA_011762505.3	n/a	n/a	20,986 (2.01 %)	19,611 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	0 (0 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	4,532,782 (33.95 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,612,916 (32.71 %)	2 (0.00 %)	1,064,933 (2.09 %)	17,767 (0.51 %)	16,931 (0.46 %)
8	African hunting dog GCA_001887905.1	n/a	n/a	18,956 (1.75 %)	17,562 (1.41 %)	n/a	40.98 (92.89 %)	0 (0 %)	1,415,298 (7.28 %)	803 (100.00 %)	4,458,183 (39.99 %)	658,637 (1.13 %)	13,671,493 (28.24 %)	854 (0.01 %)	288,980 (0.71 %)	47,644 (1.64 %)	45,393 (1.41 %)
9	African hunting dog (LycPic1hap1 2024) GCA_040955645.1	n/a	n/a	18,688 (1.61 %)	19,670 (1.44 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	1 (0.00 %)	82 (0.00 %)	86 (100.00 %)	4,281,139 (31.62 %)	959,378 (2.78 %)	12,859,760 (32.95 %)	1 (0.00 %)	632,917 (1.70 %)	49,122 (2.32 %)	45,729 (1.55 %)
10	African hunting dog (LycPic1hap2 2024) GCA_040955705.1	n/a	n/a	19,463 (1.58 %)	20,378 (1.42 %)	n/a	41.30 (100.00 %)	1 (0.00 %)	91 (0.00 %)	77 (100.00 %)	4,513,580 (32.16 %)	1,008,611 (2.91 %)	13,570,452 (33.71 %)	2 (0.00 %)	686,092 (1.77 %)	50,954 (2.21 %)	46,966 (1.51 %)
11	African savanna elephant (2009 refseq) GCF_000001905.1	46,043 (2.30 %)	n/a	19,169 (1.26 %)	19,664 (1.10 %)	n/a	40.76 (97.57 %)	93,514 (2.45 %)	93,514 (2.45 %)	95,866 (97.55 %)	6,363,315 (57.54 %)	365,797 (0.88 %)	16,073,053 (44.89 %)	11 (0.00 %)	417,291 (1.06 %)	33,513 (0.68 %)	24,503 (0.51 %)
12	African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023) GCA_030020305.1	n/a	n/a	18,845 (1.07 %)	22,426 (1.10 %)	n/a	41.34 (99.85 %)	169 (0.15 %)	169 (0.15 %)	1,253 (99.85 %)	4,406,744 (29.55 %)	925,868 (4.71 %)	15,966,881 (50.49 %)	0 (0 %)	1,248,627 (2.71 %)	68,531 (1.61 %)	23,142 (0.47 %)
13	African savanna elephant (hap2 2023 genbank) GCA_030014295.1	n/a	n/a	18,981 (1.10 %)	22,759 (1.12 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	0 (0 %)	231 (0.10 %)	880 (100.00 %)	4,426,756 (29.95 %)	832,908 (4.08 %)	16,118,910 (49.47 %)	1 (0.00 %)	1,082,958 (2.38 %)	62,315 (1.49 %)	23,783 (0.48 %)
14	African savanna elephant (hap2 2023 refseq) GCF_030014295.1	64,034 (3.35 %)	n/a	18,980 (1.10 %)	21,593 (1.06 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	0 (0 %)	231 (0.10 %)	879 (100.00 %)	4,426,749 (29.95 %)	832,904 (4.08 %)	16,118,888 (49.47 %)	1 (0.00 %)	1,082,957 (2.38 %)	62,314 (1.49 %)	23,783 (0.48 %)
15	African soft-furred rat (Lowveld savanna grassland N552 2022) GCA_021653895.1	n/a	n/a	20,232 (2.08 %)	18,517 (1.32 %)	n/a	41.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7,311 (100.00 %)	5,083,017 (39.13 %)	1,337,200 (3.02 %)	13,402,561 (30.35 %)	0 (0 %)	432,162 (1.35 %)	17,841 (0.51 %)	15,654 (0.45 %)
16	African soft-furred rat (MVZ Mamm 221054 2021) GCA_019843795.1	n/a	n/a	26,123 (1.59 %)	49,154 (1.23 %)	n/a	41.38 (99.06 %)	92,030 (0.93 %)	92,030 (0.93 %)	412,491 (99.07 %)	5,251,146 (37.28 %)	1,541,020 (3.13 %)	13,613,713 (32.35 %)	7,441 (0.10 %)	n/a	21,054 (0.58 %)	19,246 (0.53 %)
17	agile gracile mouse opossum GCF_016433145.1	30,697 (1.32 %)	n/a	17,361 (0.78 %)	17,596 (0.81 %)	n/a	37.86 (91.75 %)	0 (0 %)	85,142 (8.25 %)	60,714 (100.00 %)	7,917,577 (49.04 %)	1,054,566 (1.57 %)	22,701,659 (37.69 %)	3,920 (0.14 %)	434,964 (1.27 %)	27,301 (0.49 %)	25,777 (0.43 %)
18	Allen's wood mouse (MVZ Mamm 196246 2021) GCA_019843855.1	n/a	n/a	22,687 (1.16 %)	46,299 (0.94 %)	n/a	41.37 (99.72 %)	75,967 (0.24 %)	75,967 (0.24 %)	659,537 (99.76 %)	6,139,432 (45.57 %)	1,339,550 (3.13 %)	12,293,115 (32.34 %)	6,671 (0.10 %)	n/a	16,575 (0.44 %)	15,096 (0.40 %)
19	alpaca (2025) GCF_048564905.1	80,233 (3.11 %)	n/a	18,667 (1.53 %)	23,043 (1.52 %)	n/a	41.92 (99.91 %)	0 (0 %)	681 (0.09 %)	519 (100.00 %)	3,387,094 (33.34 %)	395,581 (10.22 %)	11,510,740 (36.96 %)	5 (0.00 %)	727,944 (2.17 %)	72,497 (1.98 %)	52,064 (1.17 %)
20	alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U) GCF_000164845.4	54,987 (3.56 %)	n/a	18,439 (1.93 %)	18,426 (1.63 %)	n/a	41.40 (95.85 %)	0 (0 %)	166,272 (4.17 %)	77,389 (100.00 %)	3,004,413 (33.17 %)	315,092 (1.36 %)	12,458,272 (24.89 %)	1,213 (0.03 %)	207,593 (1.22 %)	54,502 (1.38 %)	49,907 (1.20 %)
21	Alpine marmot (2019) GCF_001458135.2	69,587 (3.43 %)	n/a	19,047 (1.54 %)	17,768 (1.39 %)	n/a	39.80 (96.13 %)	0 (0 %)	88,858 (3.88 %)	14,031 (100.00 %)	3,726,252 (26.48 %)	746,953 (1.83 %)	14,066,368 (30.30 %)	494 (0.01 %)	202,554 (0.77 %)	30,191 (0.63 %)	24,232 (0.48 %)
22	Alvarez's mastiff bat (A012 2023) GCA_031001765.1	n/a	n/a	19,086 (1.55 %)	22,040 (1.52 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1,182 (0.01 %)	1,182 (0.01 %)	1,369 (99.99 %)	3,846,728 (31.78 %)	639,852 (2.90 %)	11,937,936 (38.98 %)	24 (0.00 %)	819,376 (2.67 %)	75,377 (2.21 %)	66,761 (1.68 %)
23	Alvarez's mastiff bat (hap1 2024) GCA_037157525.1	n/a	n/a	18,980 (1.50 %)	22,394 (1.50 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	0 (0 %)	80 (0.00 %)	326 (100.00 %)	3,896,863 (31.56 %)	659,711 (4.74 %)	11,945,162 (40.81 %)	3 (0.00 %)	979,504 (2.79 %)	76,769 (2.57 %)	66,591 (1.63 %)
24	Alvarez's mastiff bat (hap2 2024) GCA_037176705.1	n/a	n/a	19,066 (1.48 %)	22,356 (1.48 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	0 (0 %)	75 (0.00 %)	287 (100.00 %)	3,908,607 (31.48 %)	664,931 (5.23 %)	11,892,191 (41.08 %)	1 (0.00 %)	994,645 (2.87 %)	76,453 (2.43 %)	66,568 (1.61 %)
25	Amazon manatee (hap1 2025) GCA_046562985.1	n/a	n/a	17,917 (1.26 %)	20,499 (1.11 %)	n/a	40.77 (100.00 %)	0 (0 %)	377 (0.00 %)	550 (100.00 %)	5,812,915 (56.93 %)	431,488 (2.57 %)	14,336,638 (47.98 %)	1 (0.00 %)	593,346 (1.52 %)	33,775 (0.84 %)	28,206 (0.66 %)
26	Amazon manatee (hap2 2025) GCA_046562895.1	n/a	n/a	18,949 (1.23 %)	21,655 (1.08 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	0 (0 %)	294 (0.00 %)	401 (100.00 %)	6,218,266 (57.31 %)	470,437 (3.04 %)	15,241,157 (48.91 %)	1 (0.00 %)	714,873 (1.68 %)	37,124 (0.86 %)	30,784 (0.66 %)
27	American beaver (hap1 2025) GCA_047511655.1	n/a	n/a	19,828 (1.45 %)	20,376 (1.31 %)	n/a	39.72 (100.00 %)	1 (0.00 %)	181 (0.00 %)	503 (100.00 %)	4,030,880 (35.35 %)	566,770 (2.63 %)	14,198,970 (35.24 %)	9 (0.00 %)	640,099 (2.12 %)	24,454 (0.96 %)	23,257 (0.88 %)
28	American beaver (hap2 2025) GCA_047511605.1	n/a	n/a	19,144 (1.44 %)	18,959 (1.23 %)	n/a	39.54 (100.00 %)	1 (0.00 %)	194 (0.00 %)	229 (100.00 %)	3,981,637 (35.85 %)	561,691 (2.26 %)	14,374,940 (35.03 %)	6 (0.00 %)	576,331 (1.99 %)	23,386 (0.80 %)	22,058 (0.72 %)
29	American beaver (mCasCan1.hap1v2 2025) GCF_047511655.1	79,343 (3.55 %)	n/a	19,759 (1.46 %)	19,920 (1.23 %)	n/a	39.67 (100.00 %)	0 (0 %)	181 (0.00 %)	181 (100.00 %)	4,023,733 (35.50 %)	563,158 (2.55 %)	14,502,226 (35.45 %)	9 (0.00 %)	635,015 (2.11 %)	23,983 (0.89 %)	22,786 (0.80 %)
30	American beaver (Ward 2017 refseq) GCF_001984765.1	40,013 (2.15 %)	n/a	20,867 (1.53 %)	24,201 (1.33 %)	n/a	39.72 (99.99 %)	0 (0 %)	3,321 (0.01 %)	21,157 (100.00 %)	4,526,430 (33.75 %)	486,353 (1.30 %)	14,347,145 (31.96 %)	19 (0.00 %)	463,382 (1.20 %)	23,046 (0.72 %)	22,461 (0.67 %)
31	American bison (2014 refseq) GCF_000754665.1	38,699 (2.34 %)	n/a	19,782 (1.47 %)	20,444 (1.25 %)	n/a	41.82 (93.12 %)	341,984 (6.92 %)	341,984 (6.92 %)	470,415 (93.08 %)	n/a	419,596 (0.95 %)	13,519,877 (37.66 %)	8,184 (0.08 %)	n/a	60,388 (1.03 %)	36,362 (0.64 %)
32	American black bear (L20-20 alternate hap 2022) GCA_024610745.1	n/a	n/a	22,502 (1.17 %)	43,431 (1.28 %)	n/a	43.14 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	77,311 (100.00 %)	4,587,986 (32.30 %)	773,829 (6.39 %)	14,594,034 (35.67 %)	0 (0 %)	1,078,790 (3.25 %)	78,849 (3.32 %)	57,618 (1.17 %)
33	American black bear (L20-20 primary hap 2022) GCA_024610735.1	n/a	n/a	18,458 (1.52 %)	21,049 (1.43 %)	n/a	42.93 (100.00 %)	0 (0 %)	22 (0.00 %)	317 (100.00 %)	4,000,508 (32.69 %)	641,903 (5.91 %)	13,210,530 (35.54 %)	0 (0 %)	996,585 (3.22 %)	68,981 (3.00 %)	52,140 (1.23 %)
34	American black bear (UA15103 2021) GCF_020975775.1	53,916 (3.11 %)	n/a	18,840 (1.73 %)	20,969 (1.50 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,213 (100.00 %)	3,936,528 (34.53 %)	594,864 (2.90 %)	13,725,005 (32.35 %)	0 (0 %)	629,590 (1.78 %)	62,580 (1.91 %)	56,387 (1.69 %)
35	American mink (2018) GCA_900108605.1	n/a	n/a	18,686 (1.70 %)	20,016 (1.50 %)	36,997 (1.74 %)	41.60 (92.95 %)	154,172 (7.07 %)	154,172 (7.07 %)	161,347 (92.93 %)	4,350,343 (38.70 %)	606,128 (1.17 %)	13,605,797 (28.74 %)	2,225 (0.02 %)	334,330 (1.15 %)	54,199 (1.98 %)	53,125 (1.77 %)
36	American mink (hap1 2024) GCA_964106545.1	n/a	n/a	19,203 (1.43 %)	22,174 (1.33 %)	n/a	42.39 (99.98 %)	0 (0 %)	2,957 (0.02 %)	435 (100.00 %)	4,188,829 (30.04 %)	802,295 (5.81 %)	14,041,290 (37.98 %)	19 (0.00 %)	1,190,442 (3.02 %)	65,430 (2.64 %)	54,362 (1.78 %)
37	American mink (hap2 2024) GCA_964106205.1	n/a	n/a	18,890 (1.43 %)	21,684 (1.33 %)	n/a	42.35 (99.98 %)	2,849 (0.02 %)	2,849 (0.02 %)	3,200 (99.98 %)	4,158,563 (30.22 %)	786,430 (5.25 %)	13,845,377 (37.58 %)	10 (0.00 %)	1,137,591 (2.93 %)	64,307 (2.75 %)	53,505 (1.79 %)
38	American mink (M4711 2021 Dalhousie U) GCF_020171115.1	50,253 (2.26 %)	n/a	18,949 (1.49 %)	20,914 (1.29 %)	n/a	42.26 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	183 (100.00 %)	4,705,680 (39.15 %)	795,684 (5.50 %)	14,085,357 (37.99 %)	0 (0 %)	1,135,030 (2.90 %)	63,307 (2.38 %)	63,004 (2.19 %)
39	American pika (hap1 2023) GCF_030435755.1	45,008 (1.93 %)	n/a	17,997 (1.35 %)	23,185 (1.49 %)	n/a	44.16 (100.00 %)	0 (0 %)	432 (0.00 %)	5,864 (100.00 %)	4,126,248 (43.60 %)	628,344 (15.71 %)	11,100,962 (42.69 %)	18 (0.00 %)	1,888,430 (5.34 %)	60,350 (1.67 %)	30,970 (1.18 %)
40	American pika (hap2 2023) GCA_030435715.1	n/a	n/a	16,911 (1.23 %)	21,107 (1.43 %)	n/a	44.43 (100.00 %)	6 (0.00 %)	375 (0.00 %)	6,123 (100.00 %)	1,808,768 (10.42 %)	561,106 (21.05 %)	10,283,513 (45.97 %)	16 (0.00 %)	2,348,969 (6.68 %)	54,919 (1.33 %)	26,689 (0.79 %)
41	American pika 3.0 (2012 Broad refseq) GCF_000292845.1	26,240 (1.93 %)	n/a	17,576 (1.61 %)	20,076 (1.70 %)	n/a	43.35 (87.20 %)	122,542 (12.82 %)	122,542 (12.82 %)	132,962 (87.18 %)	2,761,257 (29.47 %)	414,896 (1.07 %)	10,968,698 (26.71 %)	1,958 (0.04 %)	269,478 (1.11 %)	44,652 (1.14 %)	26,757 (0.80 %)
42	American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020) GCF_014633375.1	31,887 (1.92 %)	n/a	17,532 (1.60 %)	19,609 (1.65 %)	n/a	43.35 (87.14 %)	0 (0 %)	124,941 (12.88 %)	9,351 (100.00 %)	2,827,662 (29.77 %)	414,980 (1.07 %)	10,969,165 (26.69 %)	1,976 (0.04 %)	271,948 (1.12 %)	44,743 (1.13 %)	26,798 (0.80 %)
43	American wolverine (FN33715 2022) GCA_024509225.1	n/a	9,758 (0.77 %)	18,360 (1.57 %)	20,615 (1.47 %)	n/a	41.70 (100.00 %)	53 (0.00 %)	53 (0.00 %)	758 (100.00 %)	4,038,995 (32.25 %)	664,825 (1.25 %)	13,625,080 (33.05 %)	0 (0 %)	485,617 (1.31 %)	56,595 (2.13 %)	52,911 (1.70 %)
44	Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq) GCF_000464555.1	33,681 (2.23 %)	n/a	17,929 (1.49 %)	15,090 (1.29 %)	n/a	41.40 (97.59 %)	155,553 (2.44 %)	155,553 (2.44 %)	157,032 (97.56 %)	n/a	831,136 (1.67 %)	13,654,437 (31.78 %)	59 (0.00 %)	289,892 (0.97 %)	65,229 (1.60 %)	56,194 (1.22 %)
45	Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024) GCA_043748645.1	n/a	n/a	18,528 (1.65 %)	22,359 (1.64 %)	n/a	42.89 (100.00 %)	6 (0.00 %)	88 (0.00 %)	44 (100.00 %)	3,531,044 (35.70 %)	555,304 (2.07 %)	11,439,853 (36.03 %)	0 (0 %)	663,932 (1.99 %)	102,112 (3.75 %)	92,727 (2.81 %)
46	Angus cow (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018) GCA_003369685.2	n/a	n/a	19,096 (1.59 %)	20,674 (1.34 %)	n/a	41.99 (99.75 %)	0 (0 %)	277 (0.25 %)	1,435 (100.00 %)	5,290,422 (47.51 %)	478,946 (1.94 %)	12,568,313 (41.15 %)	0 (0 %)	1,196,258 (3.44 %)	45,850 (1.37 %)	36,573 (1.00 %)
47	Antarctic minke whale GCA_000978805.1	n/a	n/a	23,312 (1.49 %)	45,535 (1.26 %)	n/a	40.73 (99.37 %)	299,456 (0.64 %)	299,456 (0.64 %)	720,900 (99.36 %)	4,011,313 (41.13 %)	504,837 (1.04 %)	13,553,641 (30.96 %)	200 (0.00 %)	66,191 (0.20 %)	56,223 (1.31 %)	44,709 (1.10 %)
48	Antillean ghost-faced bat GCA_004026545.1	n/a	n/a	20,088 (1.74 %)	31,558 (1.63 %)	n/a	41.74 (99.97 %)	1,835 (0.01 %)	1,835 (0.01 %)	207,094 (99.99 %)	3,025,044 (30.67 %)	332,606 (0.70 %)	12,504,556 (28.79 %)	7 (0.00 %)	n/a	65,503 (2.30 %)	62,089 (2.01 %)
49	aoudad GCA_002201775.1	n/a	n/a	19,905 (1.62 %)	27,488 (1.60 %)	n/a	42.01 (95.96 %)	186,672 (4.05 %)	186,672 (4.05 %)	263,992 (95.95 %)	5,418,013 (45.05 %)	471,426 (1.19 %)	13,396,252 (36.94 %)	4,983 (0.03 %)	648,031 (1.83 %)	48,844 (1.32 %)	44,082 (1.20 %)
50	Arabian camel (Drom800 2019 refseq) GCF_000803125.2	64,532 (3.85 %)	n/a	18,483 (1.89 %)	20,554 (1.62 %)	n/a	41.51 (99.22 %)	0 (0 %)	47,342 (0.79 %)	21,070 (100.00 %)	3,233,022 (34.07 %)	345,049 (1.55 %)	13,383,050 (26.19 %)	87 (0.01 %)	348,169 (1.51 %)	58,872 (1.79 %)	54,784 (1.59 %)
51	Arabian camel (hap2 2024) GCA_036321565.1	n/a	n/a	17,085 (1.73 %)	19,317 (1.59 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	0 (0 %)	210 (0.00 %)	173 (100.00 %)	2,818,446 (29.44 %)	316,646 (8.90 %)	11,192,133 (31.47 %)	1 (0.00 %)	1,151,809 (3.75 %)	52,135 (1.67 %)	44,943 (1.23 %)
52	Arabian camel (paternal hap 2024 genbank) GCA_036321535.1	n/a	n/a	18,080 (1.66 %)	20,345 (1.52 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	0 (0 %)	195 (0.00 %)	172 (100.00 %)	3,040,473 (29.22 %)	343,482 (10.93 %)	11,797,012 (33.50 %)	2 (0.00 %)	1,611,842 (4.73 %)	55,428 (1.61 %)	47,478 (1.18 %)
53	Arabian camel (paternal hap 2024 refseq) GCF_036321535.1	62,940 (3.46 %)	n/a	18,078 (1.66 %)	21,071 (1.56 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	0 (0 %)	195 (0.00 %)	171 (100.00 %)	3,040,467 (29.22 %)	343,480 (10.93 %)	11,796,955 (33.50 %)	2 (0.00 %)	1,611,842 (4.73 %)	55,427 (1.61 %)	47,478 (1.18 %)
54	Arctic fox (Blue_001 2021 refseq) GCF_018345385.1	60,759 (3.11 %)	n/a	19,942 (1.72 %)	19,529 (1.38 %)	n/a	41.27 (100.00 %)	0 (0 %)	529 (0.00 %)	929 (100.00 %)	4,821,229 (41.22 %)	1,006,124 (2.31 %)	13,556,149 (32.92 %)	1 (0.00 %)	686,539 (2.19 %)	49,997 (2.23 %)	50,342 (1.99 %)
55	Arctic ground squirrel (AGS 11-09-20 2018) GCF_003426925.1	39,569 (2.25 %)	n/a	18,954 (1.74 %)	19,372 (1.45 %)	n/a	39.95 (89.51 %)	0 (0 %)	2,429,461 (10.59 %)	15,883 (100.00 %)	4,400,304 (32.67 %)	672,831 (1.50 %)	13,913,477 (26.41 %)	1,383 (0.11 %)	167,257 (0.60 %)	27,575 (0.72 %)	26,295 (0.67 %)
56	Arctic ground squirrel (hap1 2024) GCA_045843805.1	n/a	n/a	20,255 (1.35 %)	21,401 (1.44 %)	n/a	40.08 (100.00 %)	0 (0 %)	694 (0.00 %)	2,530 (100.00 %)	4,287,108 (25.85 %)	895,123 (5.96 %)	15,722,314 (36.45 %)	3 (0.00 %)	1,383,542 (4.24 %)	34,781 (0.82 %)	29,107 (0.60 %)
57	Arctic ground squirrel (hap2 2024) GCA_045843765.1	n/a	n/a	18,385 (1.31 %)	19,099 (1.34 %)	n/a	39.97 (100.00 %)	0 (0 %)	590 (0.00 %)	2,307 (100.00 %)	4,314,945 (35.63 %)	820,736 (6.65 %)	14,490,422 (35.95 %)	2 (0.00 %)	1,426,241 (3.70 %)	31,201 (0.78 %)	25,818 (0.56 %)
58	Arctic ground squirrel (mUroPar1hap1 2024) GCF_045843805.1	45,939 (2.00 %)	n/a	19,773 (1.41 %)	20,880 (1.28 %)	n/a	40.08 (100.00 %)	0 (0 %)	694 (0.00 %)	2,529 (100.00 %)	5,291,989 (39.61 %)	895,123 (5.96 %)	15,722,212 (36.45 %)	3 (0.00 %)	1,383,542 (4.24 %)	34,781 (0.82 %)	30,632 (0.69 %)
59	Asian palm civet GCA_004024585.1	n/a	n/a	22,124 (1.43 %)	43,710 (1.39 %)	n/a	42.52 (99.95 %)	4,533 (0.02 %)	4,533 (0.02 %)	442,658 (99.98 %)	4,877,367 (40.32 %)	754,440 (1.35 %)	14,557,779 (32.29 %)	38 (0.00 %)	163,468 (0.41 %)	148,246 (5.67 %)	137,633 (4.25 %)
60	Asiatic brush-tailed porcupine (POm2014 2021) GCA_016801275.1	n/a	n/a	18,688 (1.73 %)	22,642 (1.64 %)	n/a	41.26 (97.24 %)	152,126 (2.77 %)	152,126 (2.77 %)	303,244 (97.23 %)	3,431,580 (28.56 %)	667,375 (2.21 %)	13,572,972 (26.90 %)	218 (0.02 %)	n/a	42,853 (1.30 %)	40,880 (1.19 %)
61	Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022) GCA_024166345.1	n/a	n/a	17,906 (1.18 %)	21,966 (1.14 %)	n/a	41.14 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	6,361 (100.00 %)	3,818,524 (29.72 %)	533,426 (3.22 %)	14,381,781 (47.30 %)	0 (0 %)	613,432 (1.61 %)	50,264 (1.15 %)	21,331 (0.51 %)
62	Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022) GCF_024166365.1	61,202 (2.60 %)	n/a	18,887 (1.13 %)	21,194 (1.06 %)	n/a	41.14 (99.90 %)	0 (0 %)	126 (0.10 %)	64 (100.00 %)	4,358,470 (31.27 %)	663,094 (4.56 %)	16,261,778 (48.66 %)	1 (0.00 %)	851,540 (1.93 %)	69,120 (1.32 %)	23,319 (0.49 %)
63	Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020) GCA_014523465.1	n/a	n/a	19,569 (1.59 %)	21,293 (1.35 %)	n/a	41.97 (99.68 %)	0 (0 %)	257 (0.32 %)	128 (100.00 %)	5,390,761 (47.15 %)	451,837 (1.15 %)	13,157,608 (40.67 %)	0 (0 %)	983,804 (2.72 %)	44,158 (1.19 %)	39,278 (1.06 %)
64	Asiatic tapir (hap1 2023) GCA_031878655.1	n/a	n/a	18,969 (1.75 %)	20,207 (1.36 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	3 (0.00 %)	79 (0.00 %)	262 (100.00 %)	3,650,963 (38.06 %)	355,322 (2.63 %)	14,837,952 (31.37 %)	1 (0.00 %)	267,829 (0.92 %)	37,174 (1.87 %)	37,977 (1.58 %)
65	Asiatic tapir (hap2 2023) GCA_031878705.1	n/a	n/a	18,931 (1.76 %)	19,988 (1.37 %)	n/a	41.16 (100.00 %)	0 (0 %)	92 (0.00 %)	193 (100.00 %)	3,632,286 (38.21 %)	350,074 (2.22 %)	14,785,531 (30.90 %)	1 (0.00 %)	254,432 (0.91 %)	36,699 (1.70 %)	36,659 (1.49 %)
66	ass (Dezhou 2021) GCF_016077325.2	84,046 (4.01 %)	n/a	18,838 (1.75 %)	20,239 (1.42 %)	69,689 (3.29 %)	41.42 (99.86 %)	0 (0 %)	1,922 (0.15 %)	50 (100.00 %)	3,840,509 (41.57 %)	319,943 (0.81 %)	14,889,114 (29.46 %)	1 (0.00 %)	180,097 (0.75 %)	41,082 (1.37 %)	38,212 (1.20 %)
67	ass (Donkey D_3611 2024) GCF_041296235.1	92,510 (3.84 %)	n/a	18,566 (1.54 %)	21,504 (1.32 %)	n/a	42.37 (99.94 %)	0 (0 %)	7 (0.06 %)	849 (100.00 %)	3,555,052 (38.38 %)	658,645 (5.79 %)	14,242,715 (36.79 %)	1 (0.01 %)	489,643 (1.48 %)	43,875 (3.45 %)	39,831 (2.77 %)
68	ass (Maral har 2015 refseq) GCF_001305755.1	48,976 (3.12 %)	n/a	18,838 (1.78 %)	19,295 (1.44 %)	n/a	41.28 (98.63 %)	0 (0 %)	69,593 (1.38 %)	2,167 (100.00 %)	3,731,432 (40.84 %)	289,737 (0.96 %)	14,695,308 (28.58 %)	5,680 (0.23 %)	136,343 (0.85 %)	40,025 (1.06 %)	36,660 (0.92 %)
69	Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024) GCA_964270905.1	n/a	n/a	18,773 (1.50 %)	21,069 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1 (0.00 %)	1,034 (0.01 %)	900 (100.00 %)	3,975,427 (35.64 %)	1,054,000 (10.27 %)	12,281,095 (41.92 %)	6 (0.00 %)	2,009,438 (5.51 %)	79,762 (4.08 %)	42,028 (1.04 %)
70	Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024) GCA_964270935.1	n/a	n/a	17,961 (1.59 %)	20,087 (1.36 %)	n/a	42.05 (99.99 %)	917 (0.01 %)	917 (0.01 %)	1,796 (99.99 %)	3,626,392 (35.51 %)	824,778 (7.32 %)	11,499,904 (39.18 %)	3 (0.00 %)	1,314,679 (4.17 %)	74,348 (3.46 %)	40,100 (1.09 %)
71	Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020) GCA_015852515.1	n/a	n/a	13,505 (1.03 %)	18,978 (1.47 %)	n/a	45.32 (99.98 %)	0 (0 %)	26 (0.02 %)	3,482 (100.00 %)	6,880,857 (41.88 %)	1,099,932 (7.47 %)	8,156,735 (56.68 %)	0 (0 %)	4,129,545 (10.90 %)	70,515 (2.88 %)	41,464 (1.12 %)
72	Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020) GCF_015852505.1	42,938 (2.28 %)	n/a	14,891 (1.01 %)	19,714 (1.45 %)	n/a	45.30 (98.61 %)	0 (0 %)	524 (1.39 %)	310 (100.00 %)	7,814,876 (42.89 %)	1,219,764 (6.93 %)	9,488,325 (55.68 %)	1 (0.00 %)	4,597,115 (10.42 %)	78,364 (2.73 %)	45,620 (1.05 %)
73	Bactrian camel (Alxa 2014 refseq) GCF_000767855.1	52,191 (3.64 %)	n/a	18,303 (1.98 %)	17,097 (1.64 %)	n/a	41.32 (99.32 %)	31,980 (0.69 %)	31,980 (0.69 %)	67,435 (99.31 %)	2,966,704 (34.06 %)	306,997 (0.95 %)	12,209,949 (25.43 %)	58 (0.01 %)	73,573 (0.41 %)	49,790 (1.25 %)	45,376 (1.09 %)
74	Bactrian camel YW-2024 2025 GCF_048773025.1	76,927 (4.47 %)	n/a	18,239 (1.57 %)	22,111 (1.51 %)	n/a	41.95 (100.00 %)	0 (0 %)	127 (0.00 %)	158 (100.00 %)	3,258,307 (30.21 %)	377,352 (13.70 %)	11,533,205 (36.22 %)	1 (0.00 %)	1,968,776 (5.41 %)	65,887 (1.95 %)	48,815 (1.13 %)
75	banded mongoose GCA_004023785.1	n/a	n/a	21,568 (1.57 %)	30,427 (1.43 %)	n/a	42.00 (99.96 %)	4,510 (0.02 %)	4,510 (0.02 %)	316,874 (99.98 %)	4,768,524 (40.51 %)	684,187 (1.30 %)	13,713,756 (33.42 %)	6 (0.00 %)	227,084 (0.54 %)	78,648 (2.80 %)	76,038 (2.38 %)
76	bank vole GCF_902806735.1	56,423 (2.99 %)	n/a	18,977 (1.71 %)	18,408 (1.50 %)	n/a	41.86 (98.62 %)	53,506 (1.39 %)	53,506 (1.39 %)	54,142 (98.61 %)	3,222,366 (21.59 %)	933,697 (2.20 %)	12,831,232 (31.50 %)	4,497 (0.04 %)	287,292 (0.90 %)	18,784 (0.42 %)	16,451 (0.36 %)
77	banner-tailed kangaroo rat GCF_019054845.1	43,753 (1.82 %)	n/a	18,397 (1.18 %)	24,180 (1.39 %)	n/a	40.83 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,026 (100.00 %)	5,587,719 (30.97 %)	1,363,513 (3.95 %)	12,128,920 (48.74 %)	0 (0 %)	1,518,982 (3.07 %)	36,371 (1.27 %)	31,849 (0.74 %)
78	banteng 2023 GCF_032452875.1	71,974 (3.56 %)	n/a	19,305 (1.36 %)	21,174 (1.20 %)	n/a	42.79 (100.00 %)	0 (0 %)	84 (0.00 %)	1,518 (100.00 %)	3,344,481 (20.63 %)	1,039,571 (11.74 %)	13,031,356 (47.36 %)	1 (0.00 %)	2,790,223 (5.90 %)	73,031 (1.72 %)	36,726 (0.78 %)
79	bat A.intermedius (hap2 2024) GCA_038363225.1	n/a	n/a	17,124 (1.63 %)	18,342 (1.54 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	0 (0 %)	56 (0.00 %)	187 (100.00 %)	2,597,378 (26.81 %)	332,733 (4.43 %)	10,957,327 (33.52 %)	2 (0.00 %)	406,013 (1.59 %)	63,688 (2.22 %)	49,331 (1.50 %)
80	bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024) GCA_043727955.1	n/a	n/a	19,354 (1.74 %)	21,367 (1.51 %)	n/a	41.48 (100.00 %)	15 (0.00 %)	190 (0.00 %)	265 (100.00 %)	3,860,506 (38.95 %)	722,335 (7.13 %)	11,994,816 (35.77 %)	1 (0.00 %)	1,149,103 (3.65 %)	44,562 (1.21 %)	35,219 (1.01 %)
81	beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020) GCA_009917745.1	n/a	n/a	19,239 (1.79 %)	22,513 (1.43 %)	35,878 (1.82 %)	41.25 (97.57 %)	26,969 (2.43 %)	27,070 (2.43 %)	52,780 (97.57 %)	4,021,599 (43.53 %)	544,323 (1.08 %)	12,738,162 (33.47 %)	1,426 (0.06 %)	346,086 (1.08 %)	59,710 (1.51 %)	43,139 (1.22 %)
82	beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019) GCF_002288925.2	59,413 (3.09 %)	n/a	18,667 (1.79 %)	20,314 (1.43 %)	n/a	41.24 (98.49 %)	23,539 (1.52 %)	24,414 (1.52 %)	29,444 (98.48 %)	4,001,248 (43.73 %)	543,276 (1.11 %)	12,802,735 (34.18 %)	583 (0.02 %)	388,902 (1.70 %)	59,307 (1.53 %)	42,900 (1.24 %)
83	big brown bat (BU_THK_EF1 2012) GCF_000308155.1	59,162 (3.17 %)	n/a	18,334 (1.94 %)	20,121 (1.78 %)	n/a	42.93 (89.41 %)	160,269 (10.62 %)	160,269 (10.62 %)	167,057 (89.38 %)	2,842,065 (25.82 %)	614,712 (1.89 %)	10,407,733 (28.90 %)	1,641 (0.04 %)	222,087 (1.20 %)	66,720 (2.99 %)	60,637 (2.11 %)
84	big brown bat (TK198812 2023) GCF_027574615.1	46,266 (2.61 %)	n/a	18,620 (1.80 %)	21,271 (1.72 %)	n/a	43.51 (100.00 %)	0 (0 %)	75 (0.00 %)	48 (100.00 %)	3,041,145 (25.08 %)	904,075 (3.80 %)	10,530,666 (37.05 %)	0 (0 %)	647,994 (2.05 %)	77,605 (3.68 %)	62,105 (2.31 %)
85	bighorn sheep (BS48 2019) GCA_004026945.1	n/a	n/a	23,059 (1.34 %)	36,486 (1.19 %)	n/a	43.20 (99.90 %)	9,412 (0.03 %)	9,412 (0.03 %)	1,057,548 (99.97 %)	6,321,577 (50.75 %)	716,846 (1.66 %)	13,904,326 (44.98 %)	63 (0.00 %)	n/a	95,564 (1.72 %)	50,916 (1.03 %)
86	bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024) GCF_042477335.2	78,636 (2.63 %)	n/a	19,459 (1.36 %)	21,150 (1.33 %)	n/a	43.91 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	42 (100.00 %)	3,963,383 (22.89 %)	826,353 (11.67 %)	12,918,743 (46.86 %)	0 (0 %)	2,225,863 (5.63 %)	52,254 (10.67 %)	39,631 (0.85 %)
87	bilby (mMagLag1 2024) GCA_037893015.1	n/a	n/a	18,686 (0.72 %)	17,238 (0.81 %)	n/a	37.35 (99.66 %)	0 (0 %)	4,431 (0.34 %)	609 (100.00 %)	6,263,094 (27.34 %)	2,223,995 (5.89 %)	23,994,844 (43.69 %)	70 (0.01 %)	1,521,039 (3.02 %)	51,039 (3.47 %)	15,234 (0.24 %)
88	bilby (mMagLag1 2024) GCF_037893015.1	60,460 (3.10 %)	n/a	18,687 (0.72 %)	17,229 (0.81 %)	n/a	37.35 (99.66 %)	0 (0 %)	4,431 (0.34 %)	608 (100.00 %)	6,299,949 (27.49 %)	2,223,987 (5.89 %)	23,992,536 (43.69 %)	70 (0.01 %)	1,330,409 (2.60 %)	51,039 (3.47 %)	15,234 (0.24 %)
89	black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024) GCA_043290085.1	n/a	n/a	20,713 (0.64 %)	21,469 (0.64 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	1 (0.00 %)	770 (0.00 %)	470 (100.00 %)	3,860,121 (14.52 %)	1,230,113 (2.81 %)	21,600,460 (65.53 %)	7 (0.00 %)	n/a	49,878 (0.73 %)	48,556 (0.69 %)
90	black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024) GCA_043290065.1	n/a	n/a	19,814 (0.63 %)	20,140 (0.63 %)	n/a	41.82 (100.00 %)	1 (0.00 %)	723 (0.00 %)	315 (100.00 %)	3,657,357 (14.24 %)	1,158,716 (2.84 %)	22,924,986 (64.53 %)	6 (0.00 %)	n/a	46,774 (0.90 %)	21,729 (0.30 %)
91	black flying fox GCF_000325575.1	46,991 (3.15 %)	n/a	18,089 (2.00 %)	20,668 (1.75 %)	n/a	39.74 (97.93 %)	104,566 (2.08 %)	104,566 (2.08 %)	170,164 (97.92 %)	2,975,186 (34.05 %)	481,859 (1.45 %)	12,582,349 (26.52 %)	97 (0.01 %)	114,693 (0.91 %)	62,483 (3.88 %)	64,215 (2.93 %)
92	black rat GCF_011064425.1	39,601 (2.37 %)	n/a	20,793 (1.98 %)	17,944 (1.37 %)	n/a	42.14 (99.98 %)	0 (0 %)	6,158 (0.02 %)	2,173 (100.00 %)	4,715,157 (41.57 %)	1,432,294 (3.45 %)	13,275,550 (32.36 %)	20 (0.00 %)	625,923 (1.66 %)	18,055 (0.48 %)	16,181 (0.43 %)
93	black rhinoceros (alternate hap 2021) GCA_020826835.1	n/a	n/a	19,000 (1.37 %)	22,547 (1.26 %)	n/a	41.56 (99.97 %)	0 (0 %)	178 (0.03 %)	1,199 (100.00 %)	4,340,245 (37.22 %)	564,468 (8.07 %)	14,384,523 (40.40 %)	0 (0 %)	941,914 (2.51 %)	44,971 (1.16 %)	34,023 (0.74 %)
94	black rhinoceros (BS38 2019 Broad) GCA_004027315.1	n/a	n/a	21,713 (1.32 %)	32,731 (1.18 %)	n/a	41.22 (99.85 %)	7,256 (0.02 %)	7,256 (0.02 %)	2,029,914 (99.98 %)	4,618,655 (36.76 %)	618,834 (2.21 %)	16,248,532 (40.32 %)	32 (0.00 %)	n/a	44,113 (0.97 %)	35,130 (0.72 %)
95	black rhinoceros (primary hap 2021 refseq) GCF_020826845.1	56,268 (2.28 %)	n/a	18,774 (1.38 %)	22,348 (1.26 %)	n/a	41.59 (99.95 %)	0 (0 %)	215 (0.05 %)	1,076 (100.00 %)	4,200,390 (36.22 %)	548,030 (8.34 %)	14,347,693 (40.14 %)	2 (0.00 %)	984,722 (2.61 %)	43,525 (1.14 %)	33,963 (0.76 %)
96	black-footed cat GCA_004023925.1	n/a	n/a	22,895 (1.14 %)	51,789 (1.13 %)	n/a	41.92 (99.90 %)	13,476 (0.06 %)	13,476 (0.06 %)	603,600 (99.94 %)	5,261,265 (44.11 %)	943,514 (1.77 %)	13,681,435 (34.77 %)	43 (0.00 %)	262,081 (0.70 %)	86,892 (2.23 %)	62,055 (1.65 %)
97	black-footed ferret (SB6536 2022) GCF_022355385.1	56,415 (2.78 %)	n/a	18,681 (1.55 %)	20,685 (1.40 %)	n/a	41.55 (96.71 %)	0 (0 %)	33,042 (3.30 %)	20,575 (100.00 %)	4,087,717 (30.94 %)	695,805 (1.18 %)	13,880,116 (32.08 %)	890 (0.03 %)	471,613 (1.24 %)	54,060 (2.11 %)	51,472 (1.69 %)
98	black-lipped pika GCF_017591425.1	46,297 (2.64 %)	n/a	18,529 (1.63 %)	23,458 (1.83 %)	n/a	43.71 (100.00 %)	0 (0 %)	54 (0.00 %)	2,214 (100.00 %)	1,843,705 (12.62 %)	471,798 (2.76 %)	11,394,992 (31.27 %)	0 (0 %)	530,175 (1.74 %)	63,124 (1.85 %)	31,410 (1.04 %)
99	Blainville's beaked whale (alternate hap 2022) GCA_025094165.1	n/a	n/a	17,838 (1.54 %)	21,389 (1.35 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	5,198 (100.00 %)	3,542,727 (35.35 %)	650,369 (8.86 %)	10,971,320 (41.15 %)	0 (0 %)	1,286,122 (4.20 %)	62,389 (1.68 %)	34,595 (0.95 %)
100	Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq) GCF_025265405.1	47,553 (2.07 %)	n/a	19,041 (1.52 %)	20,766 (1.27 %)	n/a	41.70 (99.97 %)	0 (0 %)	97 (0.03 %)	74 (100.00 %)	3,964,038 (35.29 %)	765,957 (8.74 %)	12,128,229 (41.78 %)	1 (0.00 %)	1,795,618 (5.01 %)	70,851 (1.80 %)	37,949 (0.93 %)
101	blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019) GCA_008658375.1	n/a	n/a	17,285 (1.80 %)	21,295 (1.43 %)	n/a	41.22 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12,574 (100.00 %)	3,196,354 (43.47 %)	467,194 (1.26 %)	10,176,588 (33.66 %)	0 (0 %)	306,308 (1.20 %)	56,916 (1.85 %)	39,871 (1.51 %)
102	Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020) GCA_008658375.2	n/a	n/a	16,997 (1.82 %)	20,609 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	10,999 (100.00 %)	3,126,800 (43.49 %)	454,452 (1.23 %)	9,916,868 (33.63 %)	0 (0 %)	296,938 (1.19 %)	55,436 (1.85 %)	38,786 (1.50 %)
103	blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020) GCF_009873245.2	58,737 (2.71 %)	n/a	19,162 (1.80 %)	20,576 (1.41 %)	36,291 (1.99 %)	40.88 (98.91 %)	0 (0 %)	886 (1.09 %)	106 (100.00 %)	3,986,870 (44.21 %)	579,629 (1.22 %)	12,858,384 (34.60 %)	4 (0.00 %)	422,171 (1.33 %)	67,032 (1.73 %)	46,602 (1.41 %)
104	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022) GCA_022079275.1	n/a	n/a	24,877 (1.23 %)	48,382 (1.39 %)	n/a	42.05 (99.98 %)	4,716 (0.01 %)	4,716 (0.01 %)	72,827 (99.99 %)	6,403,412 (33.31 %)	1,269,531 (1.94 %)	17,771,689 (33.82 %)	79 (0.00 %)	706,367 (3.07 %)	100,915 (3.00 %)	90,223 (2.05 %)
105	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022) GCF_022079265.1	45,417 (2.39 %)	n/a	18,576 (1.65 %)	20,510 (1.41 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	0 (0 %)	24 (0.00 %)	75 (100.00 %)	4,970,082 (43.28 %)	894,002 (1.80 %)	13,648,384 (34.21 %)	0 (0 %)	602,631 (1.69 %)	69,211 (2.68 %)	63,384 (2.18 %)
106	boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023) GCA_019903745.2	n/a	n/a	20,135 (1.60 %)	22,598 (1.47 %)	n/a	41.46 (96.98 %)	0 (0 %)	34,682 (3.03 %)	12,266 (100.00 %)	3,134,107 (24.41 %)	394,920 (0.92 %)	13,154,929 (36.43 %)	3,241 (0.04 %)	471,129 (1.38 %)	48,826 (1.07 %)	42,368 (0.88 %)
107	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022) GCA_024803775.1	n/a	n/a	18,647 (0.96 %)	23,998 (1.13 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	0 (0 %)	124 (0.00 %)	3,340 (100.00 %)	3,775,862 (22.40 %)	1,257,803 (21.71 %)	9,347,543 (61.85 %)	0 (0 %)	9,701,648 (16.46 %)	33,757 (1.35 %)	24,065 (0.48 %)
108	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022) GCA_024803745.1	n/a	n/a	17,791 (1.12 %)	22,667 (1.29 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	106 (0.00 %)	106 (0.00 %)	2,898 (100.00 %)	6,293,452 (41.30 %)	1,076,688 (17.94 %)	8,553,272 (57.13 %)	1 (0.00 %)	6,983,927 (14.02 %)	31,102 (1.31 %)	23,419 (0.57 %)
109	Botta's pocket gopher (hap1 2023) GCA_031878675.1	n/a	n/a	18,247 (1.61 %)	22,673 (1.83 %)	n/a	41.12 (99.99 %)	205 (0.00 %)	775 (0.01 %)	835 (100.00 %)	2,918,285 (18.64 %)	868,090 (5.77 %)	9,427,604 (40.78 %)	2 (0.00 %)	1,601,923 (4.79 %)	27,049 (1.25 %)	22,545 (0.76 %)
110	Botta's pocket gopher (hap2 2023) GCA_031878665.1	n/a	n/a	17,612 (1.68 %)	22,099 (1.91 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	25 (0.00 %)	541 (0.01 %)	365 (100.00 %)	2,748,918 (17.16 %)	827,542 (4.51 %)	8,832,809 (39.20 %)	2 (0.00 %)	1,074,853 (3.77 %)	26,416 (1.35 %)	22,242 (0.81 %)
111	boutu (hap1 2024) GCA_036417435.1	n/a	n/a	18,667 (1.46 %)	20,817 (1.26 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	0 (0 %)	284 (0.00 %)	903 (100.00 %)	4,004,895 (35.23 %)	925,158 (12.15 %)	11,999,784 (42.65 %)	3 (0.00 %)	1,841,091 (5.04 %)	63,428 (1.55 %)	38,329 (0.93 %)
112	boutu (hap2 2024) GCA_036417475.1	n/a	n/a	17,954 (1.51 %)	19,994 (1.30 %)	n/a	42.02 (100.00 %)	0 (0 %)	240 (0.00 %)	800 (100.00 %)	3,723,164 (34.96 %)	809,880 (11.02 %)	11,359,211 (41.42 %)	2 (0.00 %)	1,554,419 (4.60 %)	60,067 (1.55 %)	36,564 (0.95 %)
113	Brahman cow (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018) GCF_003369695.1	63,234 (2.88 %)	n/a	19,601 (1.57 %)	21,699 (1.34 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	0 (0 %)	302 (0.06 %)	1,250 (100.00 %)	5,524,454 (47.57 %)	459,928 (1.40 %)	13,208,799 (41.21 %)	0 (0 %)	1,222,662 (3.37 %)	41,359 (1.10 %)	37,367 (0.98 %)
114	Brandt's bat GCF_000412655.1	46,912 (2.84 %)	n/a	19,267 (1.75 %)	18,495 (1.62 %)	n/a	42.59 (94.06 %)	155,664 (5.95 %)	155,664 (5.95 %)	325,414 (94.05 %)	2,897,662 (25.08 %)	634,208 (3.20 %)	11,323,618 (31.06 %)	356 (0.04 %)	n/a	66,749 (1.59 %)	51,826 (1.12 %)
115	Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023) GCA_030848825.1	n/a	n/a	19,039 (1.66 %)	21,660 (1.59 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	0 (0 %)	20 (0.00 %)	148 (100.00 %)	3,805,818 (31.80 %)	640,446 (2.50 %)	11,793,353 (36.15 %)	1 (0.00 %)	609,574 (1.94 %)	68,896 (2.40 %)	57,812 (1.49 %)
116	Brazilian guinea pig GCA_000688575.1	n/a	n/a	16,531 (1.49 %)	11,177 (1.44 %)	n/a	39.81 (64.76 %)	0 (0 %)	2,565,595 (35.61 %)	3,131 (100.00 %)	2,529,479 (25.87 %)	342,907 (0.66 %)	10,719,517 (21.05 %)	551 (0.01 %)	218,010 (0.72 %)	19,508 (0.31 %)	9,721 (0.14 %)
117	Brazilian tapir GCA_004025025.1	n/a	n/a	21,581 (1.61 %)	30,818 (1.32 %)	n/a	41.12 (99.93 %)	2,273 (0.01 %)	2,273 (0.01 %)	805,779 (99.99 %)	3,877,938 (38.36 %)	344,032 (0.79 %)	15,601,710 (32.81 %)	14 (0.00 %)	n/a	43,382 (1.17 %)	39,596 (1.04 %)
118	brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018) GCF_003584765.2	50,229 (2.92 %)	n/a	18,811 (1.77 %)	21,073 (1.52 %)	n/a	41.84 (99.31 %)	15,552 (0.70 %)	17,380 (0.70 %)	21,813 (99.30 %)	4,201,043 (40.86 %)	567,586 (1.23 %)	13,807,211 (30.86 %)	760 (0.01 %)	325,785 (0.96 %)	62,125 (1.80 %)	56,227 (1.57 %)
119	brown bear (v2.0 North America Adak 2023) GCF_023065955.2	66,371 (4.20 %)	n/a	18,615 (1.68 %)	21,434 (1.53 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	0 (0 %)	250 (0.00 %)	362 (100.00 %)	4,030,019 (33.22 %)	630,008 (4.17 %)	13,240,060 (32.92 %)	1 (0.00 %)	668,459 (2.28 %)	64,814 (2.05 %)	58,450 (1.77 %)
120	brown big-eared bat (primary hap 2023) GCA_963455305.1	n/a	n/a	19,138 (1.72 %)	20,370 (1.54 %)	n/a	43.08 (99.99 %)	0 (0 %)	1,237 (0.01 %)	65 (100.00 %)	3,201,470 (26.24 %)	957,903 (4.27 %)	10,687,995 (39.65 %)	8 (0.00 %)	881,577 (2.81 %)	60,671 (2.39 %)	52,889 (1.71 %)
121	brown-throated sloth GCA_004027775.1	n/a	n/a	17,043 (1.21 %)	37,090 (1.36 %)	n/a	42.76 (99.76 %)	462 (0.00 %)	462 (0.00 %)	1,772,267 (100.00 %)	2,487,215 (36.18 %)	316,812 (1.60 %)	7,948,666 (37.96 %)	5 (0.00 %)	n/a	62,325 (2.36 %)	46,228 (1.74 %)
122	cactus mouse (2023) GCF_949786415.1	47,537 (2.02 %)	n/a	18,894 (1.46 %)	20,159 (1.22 %)	n/a	42.40 (99.98 %)	0 (0 %)	2,603 (0.02 %)	4,297 (100.00 %)	7,181,232 (52.75 %)	1,247,378 (18.35 %)	13,329,318 (43.03 %)	32 (0.00 %)	4,621,934 (9.77 %)	19,540 (0.49 %)	17,819 (0.43 %)
123	California mouse (IS 2022) GCF_007827085.1	62,273 (3.80 %)	n/a	18,959 (1.75 %)	19,378 (1.41 %)	n/a	42.21 (100.00 %)	0 (0 %)	547 (0.00 %)	237 (100.00 %)	5,970,582 (45.08 %)	1,165,743 (3.67 %)	13,734,349 (33.67 %)	4 (0.00 %)	738,622 (2.20 %)	19,529 (0.58 %)	17,949 (0.52 %)
124	California sea lion (alternate hap 2019) GCA_009762295.1	n/a	n/a	18,348 (1.81 %)	18,692 (1.47 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,093 (100.00 %)	3,722,619 (42.89 %)	488,086 (1.26 %)	10,893,132 (33.14 %)	0 (0 %)	393,471 (1.40 %)	44,449 (1.57 %)	41,300 (1.38 %)
125	California sea lion (LMU 2018 refseq) GCF_900631625.1	69,240 (2.99 %)	n/a	20,741 (1.78 %)	20,298 (1.40 %)	n/a	41.38 (99.81 %)	0 (0 %)	47,716 (0.20 %)	10,423 (100.00 %)	4,530,259 (43.28 %)	573,086 (1.12 %)	13,442,336 (33.58 %)	9,701 (0.17 %)	414,311 (1.26 %)	50,583 (1.46 %)	46,836 (1.28 %)
126	California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020) GCA_009762295.2	n/a	n/a	18,319 (1.81 %)	18,772 (1.48 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,096 (100.00 %)	3,724,021 (42.91 %)	488,356 (1.26 %)	10,891,276 (33.15 %)	0 (0 %)	395,508 (1.40 %)	44,467 (1.57 %)	41,289 (1.38 %)
127	California sea lion (v2 primary hap 2020) GCF_009762305.2	70,801 (3.05 %)	n/a	20,915 (1.77 %)	20,179 (1.40 %)	44,926 (2.10 %)	41.40 (99.23 %)	0 (0 %)	185 (0.77 %)	47 (100.00 %)	4,525,652 (43.65 %)	590,246 (1.24 %)	13,263,648 (33.76 %)	2 (0.00 %)	495,451 (1.44 %)	51,899 (1.50 %)	48,201 (1.32 %)
128	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023) GCA_028537755.1	n/a	n/a	19,409 (1.86 %)	20,578 (1.69 %)	n/a	42.43 (100.00 %)	0 (0 %)	43 (0.00 %)	310 (100.00 %)	3,161,054 (22.60 %)	891,453 (5.62 %)	11,087,206 (33.12 %)	0 (0 %)	957,188 (2.77 %)	19,104 (0.65 %)	16,548 (0.48 %)
129	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023) GCA_028537955.1	n/a	n/a	19,681 (1.86 %)	21,257 (1.62 %)	n/a	42.24 (100.00 %)	0 (0 %)	51 (0.00 %)	350 (100.00 %)	4,957,057 (42.33 %)	943,226 (5.63 %)	11,695,871 (33.83 %)	0 (0 %)	1,058,642 (2.90 %)	20,062 (0.64 %)	18,632 (0.53 %)
130	Canada lynx (alternate hap LIC74 2019) GCA_007474575.1	n/a	n/a	12,029 (1.42 %)	15,171 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	15,036 (100.00 %)	2,937,491 (43.50 %)	544,410 (1.76 %)	7,641,565 (32.72 %)	0 (0 %)	294,221 (1.43 %)	39,082 (2.44 %)	34,616 (1.88 %)
131	Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020) GCA_007474575.2	n/a	n/a	12,041 (1.42 %)	15,226 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	5 (0.00 %)	5 (0.00 %)	15,046 (100.00 %)	2,939,291 (43.50 %)	544,849 (1.76 %)	7,650,345 (32.74 %)	0 (0 %)	294,817 (1.43 %)	39,099 (2.44 %)	34,631 (1.88 %)
132	Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020) GCF_007474595.2	50,142 (2.69 %)	n/a	18,273 (1.65 %)	19,264 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.88 %)	0 (0 %)	842 (0.12 %)	54 (100.00 %)	5,011,165 (43.72 %)	904,525 (1.75 %)	13,467,551 (34.19 %)	0 (0 %)	572,384 (1.64 %)	66,799 (2.48 %)	60,482 (2.02 %)
133	Cantor's roundleaf bat GCA_004027415.1	n/a	n/a	23,788 (1.42 %)	45,328 (1.68 %)	38,254 (1.57 %)	41.36 (99.91 %)	6,366 (0.03 %)	6,366 (0.03 %)	846,566 (99.97 %)	3,997,370 (31.48 %)	775,742 (1.42 %)	12,770,948 (33.45 %)	57 (0.00 %)	n/a	41,527 (1.41 %)	30,440 (1.13 %)
134	Cape elephant shrew GCF_000299155.1	25,406 (1.08 %)	n/a	23,258 (1.07 %)	24,266 (1.16 %)	n/a	40.30 (86.29 %)	279,394 (13.74 %)	279,394 (13.74 %)	288,162 (86.26 %)	3,765,232 (16.90 %)	604,351 (0.89 %)	20,072,078 (42.36 %)	1,643 (0.02 %)	356,320 (0.77 %)	25,977 (0.42 %)	23,327 (0.35 %)
135	Cape golden mole (2012 Broad) GCF_000296735.1	25,323 (1.07 %)	n/a	20,961 (1.07 %)	21,723 (1.04 %)	n/a	40.01 (79.93 %)	370,844 (20.11 %)	370,844 (20.11 %)	391,344 (79.89 %)	4,924,640 (21.03 %)	500,830 (1.95 %)	18,946,663 (41.18 %)	3,416 (0.03 %)	805,638 (1.24 %)	21,186 (0.33 %)	18,126 (0.27 %)
136	Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014) GCA_000152225.2	n/a	n/a	18,455 (1.10 %)	22,103 (1.12 %)	n/a	41.00 (88.89 %)	259,874 (11.14 %)	259,879 (11.14 %)	325,568 (88.86 %)	6,210,235 (51.92 %)	381,915 (1.06 %)	20,080,212 (36.28 %)	7,944 (0.20 %)	267,970 (1.80 %)	29,690 (0.50 %)	26,217 (0.43 %)
137	Cape rock hyrax (US060 2019 Broad) GCA_004026925.1	n/a	n/a	21,401 (0.85 %)	45,353 (1.14 %)	n/a	41.08 (99.93 %)	4,203 (0.01 %)	4,203 (0.01 %)	1,048,940 (99.99 %)	7,222,494 (54.48 %)	430,286 (0.85 %)	21,775,991 (44.61 %)	44 (0.00 %)	n/a	37,158 (0.70 %)	31,196 (0.61 %)
138	capybara GCA_004027455.1	n/a	n/a	20,152 (1.22 %)	28,931 (1.29 %)	n/a	39.76 (99.93 %)	5,747 (0.02 %)	5,747 (0.02 %)	661,089 (99.98 %)	4,220,878 (29.16 %)	777,357 (2.04 %)	15,214,944 (35.16 %)	23 (0.00 %)	n/a	34,558 (0.85 %)	32,123 (0.72 %)
139	carabao (swamp buffalo K-KA32 2023) GCF_029407905.1	77,279 (2.89 %)	n/a	19,433 (1.40 %)	21,166 (1.23 %)	n/a	42.77 (100.00 %)	0 (0 %)	21 (0.00 %)	115 (100.00 %)	3,479,445 (21.92 %)	547,054 (6.39 %)	12,840,677 (45.22 %)	0 (0 %)	2,206,180 (5.44 %)	99,752 (3.73 %)	36,683 (0.81 %)
140	cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA) GCF_002263795.3	77,808 (4.11 %)	n/a	19,428 (1.48 %)	22,236 (1.33 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	0 (0 %)	386 (0.00 %)	1,958 (100.00 %)	3,449,588 (22.63 %)	596,092 (3.13 %)	12,785,607 (42.11 %)	1 (0.00 %)	1,626,342 (4.17 %)	46,864 (1.37 %)	37,742 (0.86 %)
141	cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014) GCF_000003055.6	57,977 (2.74 %)	n/a	19,583 (1.56 %)	20,581 (1.31 %)	n/a	41.82 (99.23 %)	72,454 (0.78 %)	74,464 (0.78 %)	75,598 (99.22 %)	5,607,556 (49.02 %)	440,521 (1.25 %)	13,167,657 (40.78 %)	789 (0.04 %)	1,243,109 (3.73 %)	42,869 (1.24 %)	37,223 (0.90 %)
142	Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad) GCA_004024745.2	n/a	n/a	18,603 (1.52 %)	22,330 (1.36 %)	n/a	42.35 (98.12 %)	57,013 (1.80 %)	57,013 (1.80 %)	1,240,743 (98.20 %)	5,255,211 (43.27 %)	2,502,373 (4.37 %)	12,968,788 (40.96 %)	10,788 (0.55 %)	n/a	172,178 (3.66 %)	153,143 (3.23 %)
143	cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022) GCF_027475565.1	80,997 (4.53 %)	n/a	18,420 (1.70 %)	19,561 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	0 (0 %)	22 (0.00 %)	195 (100.00 %)	4,611,842 (35.10 %)	837,685 (1.68 %)	13,649,125 (33.06 %)	0 (0 %)	327,107 (0.89 %)	60,367 (2.22 %)	56,975 (1.91 %)
144	cheetah (Rico 2018) GCF_003709585.1	72,154 (3.33 %)	n/a	18,472 (1.70 %)	20,443 (1.42 %)	n/a	41.55 (99.55 %)	0 (0 %)	24,173 (0.45 %)	3,220 (100.00 %)	4,853,945 (42.85 %)	831,106 (1.53 %)	13,663,571 (32.84 %)	1,699 (0.02 %)	283,401 (0.75 %)	60,744 (2.17 %)	55,562 (1.77 %)
145	Chinese forest musk deer (Sichuan 2022) GCF_022376915.1	51,625 (2.80 %)	n/a	19,565 (1.43 %)	22,280 (1.29 %)	n/a	42.30 (99.97 %)	0 (0 %)	1,781 (0.03 %)	2,446 (100.00 %)	3,257,347 (21.65 %)	399,120 (3.81 %)	12,906,274 (43.79 %)	0 (0 %)	2,278,433 (5.31 %)	46,689 (1.12 %)	38,849 (0.85 %)
146	Chinese hamster (17A/GY CHO 2020) GCF_003668045.3	55,440 (2.79 %)	n/a	20,030 (1.84 %)	18,721 (1.41 %)	67,900 (3.41 %)	41.51 (99.90 %)	0 (0 %)	4,164 (0.10 %)	647 (100.00 %)	8,121,057 (33.74 %)	1,095,058 (2.91 %)	12,923,274 (32.25 %)	17 (0.00 %)	566,700 (1.72 %)	19,341 (0.58 %)	18,196 (0.52 %)
147	Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI) GCF_000223135.1	46,006 (2.59 %)	n/a	20,602 (1.78 %)	17,467 (1.35 %)	n/a	41.37 (96.61 %)	156,635 (3.40 %)	156,635 (3.40 %)	265,787 (96.60 %)	4,541,936 (33.03 %)	1,072,129 (2.66 %)	13,150,189 (30.04 %)	213 (0.02 %)	n/a	12,522 (0.25 %)	11,560 (0.23 %)
148	Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd) GCA_900186095.1	n/a	n/a	19,874 (1.85 %)	19,298 (1.44 %)	n/a	41.45 (98.56 %)	63,334 (1.45 %)	63,334 (1.45 %)	71,598 (98.55 %)	4,521,726 (33.66 %)	1,060,619 (2.55 %)	12,867,288 (31.26 %)	9,581 (0.18 %)	445,818 (1.43 %)	17,960 (0.54 %)	17,137 (0.50 %)
149	Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022) GCA_026545065.1	n/a	n/a	20,293 (1.81 %)	18,881 (1.42 %)	n/a	41.62 (71.16 %)	924,541 (28.93 %)	924,541 (28.93 %)	1,236,122 (71.07 %)	4,330,728 (30.92 %)	987,319 (3.70 %)	13,374,062 (21.92 %)	817 (0.01 %)	n/a	18,838 (0.40 %)	17,349 (0.35 %)
150	Chinese pangolin (2020 Yunnan U) GCF_014570555.1	69,694 (3.21 %)	n/a	18,206 (1.70 %)	20,508 (1.48 %)	n/a	40.79 (95.54 %)	0 (0 %)	34,903 (4.47 %)	4,694 (100.00 %)	2,927,176 (35.60 %)	269,964 (0.67 %)	12,610,535 (29.10 %)	647 (0.02 %)	253,501 (1.85 %)	35,278 (1.05 %)	33,613 (0.98 %)
151	Chinese pangolin (hap1 2023) GCF_030020395.1	71,445 (2.98 %)	n/a	18,379 (1.34 %)	21,837 (1.29 %)	n/a	41.07 (99.77 %)	0 (0 %)	383 (0.23 %)	661 (100.00 %)	3,318,871 (34.65 %)	618,193 (3.68 %)	12,009,669 (39.02 %)	8 (0.00 %)	1,132,160 (3.87 %)	47,708 (1.22 %)	34,214 (0.79 %)
152	Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023) GCA_030020945.1	n/a	n/a	18,538 (1.34 %)	21,724 (1.27 %)	n/a	41.09 (99.48 %)	0 (0 %)	190 (0.52 %)	700 (100.00 %)	3,362,899 (34.48 %)	678,384 (4.11 %)	12,024,241 (39.52 %)	7 (0.00 %)	1,198,886 (3.98 %)	48,960 (1.19 %)	34,434 (0.79 %)
153	Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU) GCA_000738955.1	n/a	n/a	18,749 (1.63 %)	22,506 (1.40 %)	n/a	40.93 (90.69 %)	138,158 (9.33 %)	257,424 (9.33 %)	230,927 (90.67 %)	2,691,116 (34.48 %)	316,518 (1.96 %)	11,538,086 (25.40 %)	37,129 (1.10 %)	304,419 (2.99 %)	30,693 (0.58 %)	28,150 (0.52 %)
154	Chinese rufous horseshoe bat GCA_001888835.1	n/a	n/a	26,871 (2.34 %)	25,467 (1.89 %)	n/a	40.52 (97.22 %)	0 (0 %)	212,601 (2.80 %)	63,439 (100.00 %)	3,219,611 (33.86 %)	495,126 (1.20 %)	12,476,551 (27.16 %)	60 (0.00 %)	103,290 (0.35 %)	32,993 (0.98 %)	31,139 (0.91 %)
155	Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024) GCA_036562045.1	n/a	n/a	17,893 (1.95 %)	19,249 (1.60 %)	n/a	40.47 (100.00 %)	0 (0 %)	286 (0.00 %)	454 (100.00 %)	3,055,304 (33.11 %)	531,106 (1.34 %)	11,858,144 (29.52 %)	0 (0 %)	158,830 (0.76 %)	30,884 (1.08 %)	29,146 (0.97 %)
156	Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024) GCF_036562045.2	67,162 (3.87 %)	n/a	17,890 (1.94 %)	19,248 (1.60 %)	n/a	40.47 (100.00 %)	0 (0 %)	286 (0.00 %)	454 (100.00 %)	3,325,750 (39.02 %)	531,106 (1.34 %)	11,858,028 (29.52 %)	0 (0 %)	218,904 (1.04 %)	30,884 (1.08 %)	26,927 (0.94 %)
157	Chinese tree shrew (2013 BGI) GCF_000334495.1	47,005 (2.07 %)	n/a	21,375 (1.39 %)	19,231 (1.28 %)	n/a	41.73 (95.10 %)	191,695 (4.92 %)	191,695 (4.92 %)	242,445 (95.08 %)	5,060,321 (23.05 %)	1,046,388 (4.15 %)	14,978,259 (38.04 %)	914 (0.08 %)	803,568 (6.04 %)	88,806 (1.44 %)	55,240 (1.01 %)
158	Chinese tree shrew (KIZ-2021 2023) GCA_033439345.1	n/a	n/a	22,218 (1.55 %)	22,364 (1.36 %)	n/a	41.78 (99.99 %)	0 (0 %)	1,697 (0.01 %)	1,645 (100.00 %)	6,126,341 (42.08 %)	1,035,957 (2.47 %)	14,328,193 (41.14 %)	1 (0.00 %)	840,196 (1.95 %)	90,914 (1.82 %)	54,999 (1.38 %)
159	chiru GCA_000400835.1	n/a	n/a	20,320 (1.60 %)	42,654 (2.51 %)	n/a	42.01 (93.04 %)	283,069 (7.00 %)	283,069 (7.00 %)	298,127 (93.00 %)	5,342,241 (43.54 %)	425,329 (1.25 %)	13,714,420 (34.66 %)	321 (0.03 %)	521,516 (1.73 %)	43,135 (1.89 %)	39,020 (1.80 %)
160	clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023) GCA_028018655.1	n/a	n/a	16,430 (1.52 %)	21,057 (1.44 %)	n/a	41.79 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	10,377 (100.00 %)	3,845,437 (33.39 %)	794,587 (2.14 %)	10,765,695 (33.40 %)	0 (0 %)	461,307 (1.56 %)	56,375 (2.45 %)	47,473 (1.74 %)
161	clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq) GCF_028018385.1	81,219 (3.62 %)	n/a	18,300 (1.65 %)	20,361 (1.39 %)	n/a	41.79 (99.94 %)	0 (0 %)	181 (0.06 %)	33 (100.00 %)	4,224,269 (34.84 %)	992,668 (2.08 %)	13,618,866 (34.42 %)	3 (0.00 %)	647,739 (1.89 %)	67,830 (2.45 %)	58,781 (1.98 %)
162	common bottlenose dolphin (maternal 2020) GCA_011762535.1	n/a	n/a	18,837 (1.77 %)	20,857 (1.43 %)	n/a	41.43 (99.73 %)	0 (0 %)	649 (0.27 %)	985 (100.00 %)	4,073,893 (46.15 %)	630,039 (2.15 %)	12,628,219 (35.41 %)	1 (0.00 %)	705,496 (1.85 %)	65,379 (1.89 %)	42,994 (1.34 %)
163	common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020) GCF_011762595.1	67,220 (3.31 %)	n/a	18,766 (1.77 %)	20,528 (1.42 %)	35,852 (1.58 %)	41.44 (99.74 %)	0 (0 %)	674 (0.26 %)	362 (100.00 %)	4,069,115 (46.17 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,891 (35.29 %)	1 (0.00 %)	629,903 (1.85 %)	65,551 (1.90 %)	43,136 (1.35 %)
164	common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq) GCF_001922835.1	45,975 (2.99 %)	n/a	17,255 (1.69 %)	17,058 (1.34 %)	n/a	40.85 (99.45 %)	0 (0 %)	114,003 (0.57 %)	2,648 (100.00 %)	3,845,938 (43.89 %)	514,631 (1.06 %)	12,317,098 (32.18 %)	466 (0.01 %)	284,934 (0.89 %)	48,030 (1.35 %)	31,891 (1.03 %)
165	common bottlenose dolphin (mTurTru1 2024) GCF_011762595.2	80,385 (4.33 %)	n/a	18,770 (1.77 %)	20,525 (1.42 %)	n/a	41.44 (99.74 %)	0 (0 %)	674 (0.26 %)	361 (100.00 %)	3,981,744 (44.78 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,558 (35.29 %)	1 (0.00 %)	556,315 (1.61 %)	65,551 (1.90 %)	43,444 (1.36 %)
166	common bottlenose dolphin (paternal 2020) GCA_011762515.1	n/a	n/a	18,537 (1.77 %)	20,619 (1.44 %)	n/a	41.42 (98.08 %)	0 (0 %)	868 (1.92 %)	1,166 (100.00 %)	3,997,801 (45.93 %)	609,838 (1.85 %)	12,400,272 (34.53 %)	1 (0.00 %)	649,569 (1.73 %)	64,630 (1.84 %)	42,623 (1.32 %)
167	common brushtail (alternate hap 2020) GCA_011100645.1	n/a	n/a	14,863 (0.75 %)	15,426 (0.89 %)	n/a	39.41 (100.00 %)	313 (0.00 %)	313 (0.00 %)	12,446 (100.00 %)	5,846,769 (38.56 %)	987,917 (1.99 %)	16,764,356 (40.14 %)	0 (0 %)	345,940 (1.13 %)	13,303 (0.35 %)	10,338 (0.23 %)
168	common brushtail (refseq 2020) GCF_011100635.1	37,661 (1.80 %)	n/a	18,653 (0.80 %)	15,375 (0.86 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	0 (0 %)	1,796 (0.56 %)	212 (100.00 %)	7,598,116 (38.90 %)	1,259,434 (1.97 %)	22,071,306 (40.56 %)	0 (0 %)	455,717 (1.17 %)	17,762 (0.38 %)	13,986 (0.24 %)
169	common pipistrelle (2020) GCA_903992545.1	n/a	n/a	17,216 (1.82 %)	19,202 (1.79 %)	n/a	42.55 (99.97 %)	0 (0 %)	1,546 (0.03 %)	323 (100.00 %)	2,953,532 (23.94 %)	805,142 (2.83 %)	9,964,846 (34.69 %)	0 (0 %)	446,836 (1.61 %)	57,295 (2.83 %)	54,882 (1.90 %)
170	common pipistrelle (alternate hap 2020) GCA_903992515.1	n/a	n/a	15,974 (1.72 %)	20,563 (1.66 %)	n/a	42.41 (100.00 %)	12 (0.00 %)	12 (0.00 %)	10,459 (100.00 %)	2,634,333 (23.76 %)	703,674 (2.65 %)	8,909,525 (33.95 %)	0 (0 %)	343,235 (1.37 %)	50,430 (2.54 %)	45,982 (1.75 %)
171	common pipistrelle (Broad 2019) GCA_004026625.1	n/a	n/a	21,938 (1.35 %)	53,915 (1.60 %)	n/a	42.88 (99.88 %)	10,870 (0.05 %)	10,870 (0.05 %)	736,974 (99.95 %)	3,499,501 (22.91 %)	1,046,301 (2.96 %)	11,759,516 (37.96 %)	17 (0.00 %)	n/a	92,062 (3.23 %)	75,629 (2.04 %)
172	common pipistrelle (hap1.1 2025) GCA_965203405.1	n/a	n/a	18,233 (1.77 %)	21,445 (1.80 %)	n/a	42.93 (99.98 %)	0 (0 %)	1,650 (0.02 %)	575 (100.00 %)	3,324,262 (26.83 %)	869,167 (7.44 %)	10,218,519 (37.91 %)	6 (0.00 %)	778,854 (2.75 %)	76,006 (3.29 %)	60,694 (1.98 %)
173	common pipistrelle (hap2.1 2025) GCA_965204225.1	n/a	n/a	18,115 (1.81 %)	21,233 (1.83 %)	n/a	42.89 (99.98 %)	1,602 (0.02 %)	1,602 (0.02 %)	1,971 (99.98 %)	3,303,323 (27.28 %)	852,756 (5.65 %)	10,047,424 (36.41 %)	13 (0.00 %)	655,173 (2.34 %)	69,105 (3.25 %)	60,657 (2.04 %)
174	common thicket rat (MVZ Mamm 221001 2021) GCA_019843835.1	n/a	n/a	25,148 (1.36 %)	49,594 (1.08 %)	n/a	41.11 (99.52 %)	63,300 (0.44 %)	63,300 (0.44 %)	572,372 (99.56 %)	3,806,717 (32.04 %)	1,181,694 (2.86 %)	12,272,340 (28.58 %)	6,281 (0.11 %)	n/a	16,373 (0.48 %)	14,787 (0.43 %)
175	common vampire bat (v2 HL8 alternate hap 2022 genbank) GCA_022682395.2	n/a	n/a	17,485 (1.76 %)	18,907 (1.66 %)	n/a	42.87 (99.99 %)	0 (0 %)	576 (0.01 %)	429 (100.00 %)	2,592,246 (28.20 %)	352,985 (2.87 %)	10,737,944 (31.11 %)	25 (0.00 %)	264,293 (1.29 %)	61,125 (2.28 %)	42,729 (1.28 %)
176	common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 refseq) GCF_022682495.2	58,786 (3.38 %)	n/a	18,507 (1.82 %)	19,451 (1.59 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	0 (0 %)	615 (0.01 %)	574 (100.00 %)	2,960,602 (36.90 %)	431,577 (3.90 %)	11,286,753 (32.62 %)	37 (0.00 %)	367,677 (1.66 %)	71,507 (2.50 %)	83,078 (2.13 %)
177	common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018) GCF_002940915.2	51,044 (3.24 %)	n/a	18,503 (1.88 %)	18,071 (1.68 %)	n/a	42.15 (97.78 %)	54,246 (2.23 %)	54,246 (2.23 %)	83,364 (97.77 %)	2,799,509 (29.62 %)	275,242 (1.03 %)	11,796,826 (28.19 %)	237 (0.03 %)	174,535 (2.84 %)	51,634 (1.37 %)	47,271 (1.22 %)
178	common warthog (WHEZ1 2021) GCF_016906955.1	55,156 (2.64 %)	n/a	18,264 (1.56 %)	19,251 (1.34 %)	54,816 (2.83 %)	41.95 (99.61 %)	0 (0 %)	523 (0.39 %)	194 (100.00 %)	3,898,243 (30.33 %)	588,742 (1.17 %)	12,955,929 (36.44 %)	1 (0.00 %)	519,262 (1.56 %)	75,592 (1.86 %)	45,338 (1.21 %)
179	common wombat GCF_900497805.2	46,365 (1.78 %)	n/a	19,437 (0.86 %)	18,947 (0.96 %)	n/a	38.86 (99.68 %)	0 (0 %)	67,461 (0.33 %)	14,183 (100.00 %)	8,645,969 (41.99 %)	1,203,246 (1.61 %)	23,878,215 (39.11 %)	3,092 (0.01 %)	284,840 (0.59 %)	18,752 (0.37 %)	17,700 (0.31 %)
180	Corsac fox (zsh2022 2023) GCA_030463245.1	n/a	n/a	19,527 (1.61 %)	18,923 (1.35 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	0 (0 %)	107 (0.00 %)	202 (100.00 %)	4,435,406 (32.05 %)	981,019 (1.98 %)	13,673,245 (32.65 %)	0 (0 %)	644,894 (1.63 %)	49,252 (2.20 %)	46,666 (1.57 %)
181	coyote (coyote_06102 2023) GCA_034620425.1	n/a	n/a	19,251 (1.60 %)	19,585 (1.40 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	0 (0 %)	93 (0.00 %)	120 (100.00 %)	4,493,000 (32.28 %)	982,814 (2.01 %)	13,803,318 (33.09 %)	0 (0 %)	634,473 (1.64 %)	50,777 (2.23 %)	47,871 (1.58 %)
182	creeping vole GCF_018167655.1	54,941 (2.31 %)	n/a	23,033 (1.55 %)	25,427 (1.53 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,147 (100.00 %)	4,549,519 (25.66 %)	1,153,429 (13.60 %)	13,568,297 (40.65 %)	0 (0 %)	3,223,361 (6.77 %)	23,141 (0.54 %)	19,563 (0.42 %)
183	crested porcupine GCA_004026905.1	n/a	n/a	21,005 (1.32 %)	35,975 (1.39 %)	n/a	41.51 (99.89 %)	4,351 (0.02 %)	4,351 (0.02 %)	1,140,949 (99.98 %)	4,303,147 (30.69 %)	600,488 (1.19 %)	14,049,490 (33.80 %)	35 (0.00 %)	n/a	57,196 (1.33 %)	41,516 (0.95 %)
184	crested rat (2021) GCA_907164525.1	n/a	n/a	18,829 (1.57 %)	20,084 (1.23 %)	n/a	40.89 (92.16 %)	116,236 (7.85 %)	116,236 (7.85 %)	153,441 (92.15 %)	6,937,911 (48.56 %)	1,051,397 (2.16 %)	13,178,644 (37.15 %)	8,286 (0.10 %)	761,138 (1.87 %)	22,912 (0.47 %)	20,486 (0.42 %)
185	Crete spiny mouse (2024) GCA_964271855.1	n/a	n/a	19,467 (1.76 %)	18,734 (1.43 %)	n/a	42.87 (100.00 %)	0 (0 %)	184 (0.00 %)	113 (100.00 %)	4,718,848 (32.83 %)	1,327,449 (6.80 %)	12,893,458 (34.03 %)	0 (0 %)	1,009,136 (2.74 %)	21,236 (0.61 %)	17,412 (0.44 %)
186	Cuvier's beaked whale GCA_004364475.1	n/a	n/a	23,700 (0.90 %)	51,715 (0.86 %)	n/a	42.01 (99.76 %)	3,229 (0.01 %)	3,229 (0.01 %)	3,761,505 (99.99 %)	6,544,424 (43.61 %)	1,417,186 (3.11 %)	16,127,873 (42.25 %)	43 (0.00 %)	n/a	68,668 (1.15 %)	53,793 (0.96 %)
187	cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024) GCA_043880285.1	n/a	n/a	18,610 (1.67 %)	19,098 (1.39 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	7 (0.00 %)	334 (0.01 %)	73 (100.00 %)	4,077,286 (41.85 %)	754,689 (2.64 %)	11,873,386 (36.16 %)	1 (0.00 %)	1,326,571 (3.53 %)	48,137 (1.04 %)	24,623 (0.71 %)
188	Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI) GCF_000743615.1	52,373 (2.57 %)	n/a	17,983 (1.45 %)	17,063 (1.43 %)	n/a	40.34 (97.96 %)	87,815 (2.05 %)	87,815 (2.05 %)	162,545 (97.95 %)	4,053,433 (30.86 %)	545,281 (1.74 %)	13,406,483 (30.65 %)	793 (0.06 %)	243,492 (1.42 %)	37,008 (0.74 %)	33,397 (0.64 %)
189	Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo) GCF_012274545.1	58,091 (2.74 %)	n/a	17,780 (1.44 %)	16,515 (1.42 %)	n/a	40.34 (97.94 %)	0 (0 %)	88,899 (2.07 %)	73,970 (100.00 %)	4,035,140 (30.95 %)	544,772 (1.73 %)	13,390,872 (30.61 %)	838 (0.06 %)	245,667 (1.44 %)	37,008 (0.74 %)	33,408 (0.64 %)
190	dassie-rat GCA_004026965.1	n/a	n/a	20,479 (1.16 %)	42,937 (1.41 %)	n/a	41.86 (99.89 %)	9,645 (0.04 %)	9,645 (0.04 %)	920,324 (99.96 %)	4,563,054 (28.83 %)	660,623 (1.92 %)	12,899,807 (34.48 %)	14 (0.00 %)	n/a	46,569 (1.25 %)	40,791 (1.01 %)
191	Daubenton's bat (alternate hap 2023) GCA_963242275.1	n/a	n/a	18,895 (1.78 %)	24,235 (1.81 %)	n/a	43.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4,930 (100.00 %)	2,813,870 (23.75 %)	718,406 (5.18 %)	9,977,320 (37.24 %)	0 (0 %)	609,378 (2.37 %)	62,910 (2.66 %)	55,962 (1.97 %)
192	Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq) GCF_963259705.1	64,558 (3.32 %)	n/a	19,141 (1.72 %)	22,133 (1.66 %)	n/a	43.18 (99.99 %)	0 (0 %)	1,099 (0.01 %)	121 (100.00 %)	3,040,232 (24.03 %)	796,911 (6.38 %)	10,478,180 (38.84 %)	9 (0.00 %)	756,429 (2.76 %)	64,920 (2.51 %)	57,806 (1.88 %)
193	Daurian ground squirrel GCA_002406435.1	n/a	n/a	20,990 (1.31 %)	17,575 (1.17 %)	n/a	39.77 (96.15 %)	141,850 (3.84 %)	141,850 (3.84 %)	502,654 (96.16 %)	5,783,538 (34.36 %)	924,038 (3.73 %)	17,533,301 (30.85 %)	318 (0.01 %)	1,230,179 (17.33 %)	27,955 (0.39 %)	26,034 (0.36 %)
194	David's myotis bat GCF_000327345.1	37,645 (2.70 %)	n/a	18,744 (1.78 %)	17,565 (1.62 %)	n/a	42.69 (91.23 %)	223,511 (8.80 %)	223,511 (8.80 %)	325,280 (91.20 %)	2,680,166 (23.79 %)	532,273 (1.90 %)	11,016,028 (29.55 %)	303 (0.05 %)	n/a	59,615 (1.59 %)	49,977 (1.17 %)
195	degu (3935 2012 refseq) GCF_000260255.1	48,165 (2.13 %)	n/a	22,242 (1.41 %)	22,101 (1.46 %)	n/a	41.38 (84.36 %)	252,770 (15.68 %)	252,772 (15.68 %)	259,904 (84.32 %)	4,901,673 (27.74 %)	898,945 (1.50 %)	14,282,003 (29.30 %)	2,582 (0.03 %)	313,028 (1.02 %)	40,135 (0.82 %)	36,410 (0.69 %)
196	desert hamster (2022) GCF_943737965.1	37,291 (2.11 %)	n/a	19,744 (1.74 %)	20,215 (1.50 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,079 (100.00 %)	4,038,079 (31.01 %)	1,132,871 (2.71 %)	11,946,112 (32.62 %)	0 (0 %)	618,568 (1.94 %)	17,053 (0.51 %)	15,416 (0.41 %)
197	Desmarest's hutia GCA_004027915.1	n/a	n/a	23,535 (0.78 %)	50,796 (0.95 %)	n/a	42.03 (99.83 %)	3,492 (0.01 %)	3,492 (0.01 %)	2,355,850 (99.99 %)	5,790,506 (26.72 %)	1,062,134 (1.71 %)	16,977,224 (35.29 %)	16 (0.00 %)	n/a	54,479 (1.01 %)	46,753 (0.82 %)
198	dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW) GCF_012295265.1	102,060 (4.04 %)	n/a	19,777 (1.69 %)	20,341 (1.41 %)	n/a	41.29 (99.69 %)	0 (0 %)	325 (0.31 %)	477 (100.00 %)	4,950,808 (42.83 %)	1,033,921 (2.36 %)	13,745,703 (33.32 %)	0 (0 %)	820,425 (2.05 %)	51,835 (2.25 %)	47,504 (1.92 %)
199	dingo (Sandy 2020 James Cook U) GCF_003254725.2	104,332 (4.50 %)	n/a	19,710 (1.72 %)	19,857 (1.42 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	0 (0 %)	69 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,547,906 (33.32 %)	993,474 (2.19 %)	13,701,060 (33.18 %)	0 (0 %)	716,455 (1.82 %)	51,216 (2.28 %)	51,748 (2.14 %)
200	dog (Basenji MU ID 185726 2019) GCA_004886185.2	n/a	n/a	19,889 (1.67 %)	20,501 (1.39 %)	n/a	41.36 (99.99 %)	1,387 (0.01 %)	1,388 (0.01 %)	3,630 (99.99 %)	4,950,227 (43.32 %)	1,059,639 (2.97 %)	13,694,849 (33.70 %)	3 (0.00 %)	1,006,008 (2.40 %)	51,443 (2.16 %)	47,254 (1.90 %)
201	dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021) GCA_013276365.2	n/a	n/a	19,310 (1.60 %)	19,947 (1.42 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	0 (0 %)	149 (0.00 %)	631 (100.00 %)	4,452,916 (32.14 %)	960,590 (2.23 %)	13,685,353 (33.01 %)	0 (0 %)	644,106 (1.68 %)	50,715 (2.22 %)	47,698 (1.58 %)
202	dog (Bernese Mountain Dog BD 2023) GCA_031010765.1	n/a	n/a	19,211 (1.60 %)	20,327 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	0 (0 %)	641 (0.00 %)	175 (100.00 %)	4,471,016 (32.18 %)	984,776 (2.03 %)	13,719,474 (32.88 %)	0 (0 %)	644,486 (1.60 %)	51,050 (2.25 %)	47,721 (1.59 %)
203	dog (Bernese Mountain Dog OD 2023) GCA_031010635.1	n/a	n/a	19,279 (1.60 %)	20,348 (1.44 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	0 (0 %)	1,015 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,491,081 (32.21 %)	996,142 (2.01 %)	13,761,195 (32.97 %)	0 (0 %)	645,724 (1.69 %)	51,490 (2.25 %)	48,166 (1.60 %)
204	dog (boxer Tasha 2011) GCF_000002285.3	82,536 (3.63 %)	n/a	19,772 (1.66 %)	19,565 (1.39 %)	n/a	41.31 (99.25 %)	23,876 (0.76 %)	23,876 (0.76 %)	27,106 (99.24 %)	4,918,098 (43.29 %)	991,835 (2.81 %)	13,644,959 (33.60 %)	34 (0.00 %)	971,687 (2.39 %)	53,269 (2.07 %)	48,154 (1.73 %)
205	dog (boxer Tasha 2020) GCF_000002285.5	93,761 (3.84 %)	n/a	19,392 (1.71 %)	19,572 (1.42 %)	52,141 (3.27 %)	41.26 (100.00 %)	0 (0 %)	1,028 (0.00 %)	147 (100.00 %)	23,927,903 (42.42 %)	972,851 (2.05 %)	13,611,845 (33.11 %)	0 (0 %)	657,594 (1.69 %)	50,679 (2.26 %)	46,402 (1.93 %)
206	dog (Cairn Terrier CA611 2023) GCA_031010295.1	n/a	n/a	19,255 (1.61 %)	20,479 (1.45 %)	n/a	41.19 (100.00 %)	0 (0 %)	262 (0.00 %)	141 (100.00 %)	4,490,019 (32.25 %)	989,383 (1.99 %)	13,710,808 (32.97 %)	0 (0 %)	634,521 (1.63 %)	50,883 (2.22 %)	47,572 (1.58 %)
207	dog (German shepard Mischka 2020) GCF_011100685.1	96,734 (3.71 %)	n/a	20,135 (1.64 %)	20,871 (1.38 %)	56,772 (3.19 %)	41.50 (100.00 %)	585 (0.00 %)	585 (0.00 %)	2,782 (100.00 %)	20,264,827 (43.87 %)	1,152,879 (3.22 %)	13,784,690 (34.30 %)	9 (0.00 %)	1,226,639 (2.84 %)	53,518 (2.23 %)	49,021 (1.97 %)
208	dog (German Shepherd Nala 2020) GCA_008641055.3	n/a	n/a	19,757 (1.69 %)	20,201 (1.41 %)	n/a	41.32 (99.74 %)	0 (0 %)	458 (0.26 %)	410 (100.00 %)	4,974,233 (43.03 %)	1,048,366 (2.46 %)	13,881,889 (33.61 %)	0 (0 %)	887,952 (2.14 %)	51,900 (2.21 %)	47,682 (1.96 %)
209	dog (Labrador retriever 2023) GCA_031165255.1	n/a	n/a	19,256 (1.61 %)	20,247 (1.44 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	0 (0 %)	516 (0.00 %)	675 (100.00 %)	4,456,220 (32.19 %)	960,584 (1.96 %)	13,688,006 (32.82 %)	0 (0 %)	620,296 (1.57 %)	50,670 (2.21 %)	47,790 (1.59 %)
210	dog (labrador SID07034 2020) GCF_014441545.1	99,420 (3.87 %)	n/a	19,870 (1.70 %)	20,252 (1.41 %)	54,322 (3.23 %)	41.19 (99.47 %)	0 (0 %)	575 (0.53 %)	376 (100.00 %)	4,981,985 (42.28 %)	1,019,772 (1.97 %)	13,959,750 (32.77 %)	2 (0.01 %)	648,526 (1.66 %)	52,469 (2.25 %)	48,334 (1.95 %)
211	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU) GCF_000181335.3	72,076 (3.30 %)	n/a	18,662 (1.64 %)	20,897 (1.37 %)	n/a	41.73 (98.20 %)	403 (1.80 %)	436 (1.80 %)	5,079 (98.20 %)	5,086,462 (43.51 %)	964,126 (2.68 %)	13,947,871 (33.33 %)	0 (0 %)	785,059 (2.13 %)	69,701 (2.41 %)	61,568 (1.95 %)
212	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU) GCA_000181335.5	n/a	n/a	18,378 (1.53 %)	21,242 (1.40 %)	n/a	41.73 (98.21 %)	350 (1.69 %)	422 (1.79 %)	5,010 (98.31 %)	4,683,703 (33.33 %)	964,129 (2.68 %)	13,948,305 (33.33 %)	0 (0 %)	784,749 (2.13 %)	69,725 (2.42 %)	63,619 (1.83 %)
213	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021) GCA_000181335.6	n/a	n/a	18,357 (1.55 %)	20,085 (1.38 %)	n/a	41.76 (98.18 %)	350 (1.72 %)	422 (1.82 %)	1,254 (98.28 %)	4,661,997 (33.78 %)	947,221 (2.58 %)	13,867,949 (33.67 %)	0 (0 %)	696,984 (2.13 %)	68,011 (2.41 %)	62,123 (1.82 %)
214	domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U) GCF_018350175.1	99,222 (4.40 %)	n/a	18,456 (1.66 %)	19,833 (1.39 %)	94,133 (5.63 %)	41.81 (100.00 %)	31 (0.00 %)	39 (0.00 %)	102 (100.00 %)	4,965,571 (43.65 %)	932,424 (1.95 %)	13,596,808 (33.85 %)	0 (0 %)	555,637 (1.52 %)	67,329 (2.48 %)	60,307 (2.00 %)
215	domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020) GCF_011764305.1	68,868 (3.09 %)	n/a	19,019 (1.55 %)	21,812 (1.42 %)	n/a	41.90 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,224 (100.00 %)	4,650,028 (39.49 %)	745,115 (2.02 %)	13,758,447 (36.14 %)	0 (0 %)	1,196,360 (3.06 %)	58,684 (2.16 %)	59,034 (1.99 %)
216	domestic ferret (Sable 2011 Broad) GCA_000239315.1	n/a	n/a	18,778 (1.67 %)	19,571 (1.47 %)	n/a	41.48 (96.89 %)	72,670 (3.12 %)	72,670 (3.12 %)	76,914 (96.88 %)	4,491,876 (40.13 %)	618,556 (1.07 %)	13,721,938 (31.04 %)	1,362 (0.02 %)	377,830 (1.02 %)	54,600 (1.94 %)	53,359 (1.69 %)
217	domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023) GCF_034190915.1	79,333 (3.55 %)	n/a	17,999 (1.09 %)	21,509 (1.20 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	84 (0.00 %)	84 (0.00 %)	672 (100.00 %)	5,037,431 (41.68 %)	886,785 (13.97 %)	14,620,284 (42.71 %)	1 (0.00 %)	2,850,832 (6.00 %)	39,682 (0.89 %)	26,858 (0.57 %)
218	domestic guinea pig (2N 2008 refseq) GCF_000151735.1	44,762 (2.31 %)	n/a	18,301 (1.33 %)	20,111 (1.34 %)	n/a	39.95 (97.81 %)	58,460 (2.20 %)	58,460 (2.20 %)	61,604 (97.80 %)	4,257,852 (38.85 %)	658,533 (1.25 %)	14,547,726 (34.19 %)	3 (0.00 %)	423,409 (1.39 %)	37,093 (0.85 %)	27,300 (0.63 %)
219	domestic yak (maiwa yakHY00 2019) GCA_005887515.3	n/a	n/a	18,672 (1.39 %)	19,408 (1.24 %)	n/a	41.97 (100.00 %)	0 (0 %)	646 (0.00 %)	343 (100.00 %)	3,570,978 (23.00 %)	583,762 (8.57 %)	14,055,227 (40.52 %)	0 (0 %)	2,774,518 (21.40 %)	43,883 (1.17 %)	40,029 (0.94 %)
220	dugong (hap1 mDugDug1 2023) GCA_030035585.1	n/a	n/a	18,354 (1.22 %)	20,434 (1.08 %)	n/a	40.65 (100.00 %)	0 (0 %)	96 (0.00 %)	198 (100.00 %)	4,458,084 (33.00 %)	444,499 (1.79 %)	15,031,940 (47.42 %)	0 (0 %)	508,936 (1.29 %)	29,863 (0.83 %)	24,007 (0.54 %)
221	dugong (hap2 mDugDug1 2023) GCA_030020955.1	n/a	n/a	18,538 (1.23 %)	20,775 (1.09 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	0 (0 %)	89 (0.00 %)	167 (100.00 %)	4,455,227 (33.01 %)	444,021 (1.73 %)	14,946,847 (47.37 %)	1 (0.00 %)	504,439 (1.27 %)	29,828 (0.79 %)	24,008 (0.54 %)
222	dwarf mongoose GCA_004023845.1	n/a	n/a	21,478 (1.57 %)	32,174 (1.43 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	10,815 (0.05 %)	10,815 (0.05 %)	200,185 (99.95 %)	4,574,991 (40.34 %)	595,520 (1.11 %)	13,720,585 (32.94 %)	42 (0.00 %)	180,761 (0.49 %)	70,689 (2.42 %)	67,427 (2.05 %)
223	eastern cottontail (primary hap 2023) GCA_949820135.1	n/a	n/a	18,522 (1.26 %)	22,314 (1.28 %)	n/a	43.69 (100.00 %)	0 (0 %)	316 (0.00 %)	99 (100.00 %)	3,699,683 (20.55 %)	935,350 (11.22 %)	13,112,318 (44.07 %)	1 (0.00 %)	n/a	99,224 (2.27 %)	68,695 (1.75 %)
224	eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022) GCA_921998335.2	n/a	n/a	21,903 (2.13 %)	19,801 (1.40 %)	108,675 (4.42 %)	41.79 (99.89 %)	3 (0.00 %)	207 (0.11 %)	211 (100.00 %)	4,630,645 (40.56 %)	1,531,506 (3.70 %)	13,011,312 (35.48 %)	2 (0.00 %)	816,051 (2.46 %)	22,270 (0.54 %)	15,877 (0.42 %)
225	eastern mole GCA_004024925.1	n/a	n/a	19,631 (1.57 %)	32,414 (1.63 %)	n/a	42.02 (99.91 %)	7,239 (0.03 %)	7,239 (0.03 %)	647,535 (99.97 %)	3,145,725 (29.42 %)	554,620 (1.75 %)	10,663,504 (32.88 %)	18 (0.00 %)	n/a	55,063 (3.69 %)	48,440 (3.22 %)
226	eastern quoll GCA_020854095.1	n/a	n/a	15,715 (0.80 %)	16,750 (0.93 %)	n/a	36.19 (100.00 %)	0 (0 %)	431 (0.00 %)	76 (100.00 %)	5,256,999 (24.81 %)	1,280,160 (3.39 %)	21,362,866 (41.74 %)	2 (0.00 %)	642,432 (1.62 %)	24,508 (0.70 %)	24,041 (0.54 %)
227	eastern spiny mouse (2021) GCA_907164435.1	n/a	n/a	20,397 (1.93 %)	20,515 (1.44 %)	n/a	42.68 (98.12 %)	3,526 (0.10 %)	109,220 (1.90 %)	19,837 (99.90 %)	4,701,702 (33.98 %)	1,304,933 (2.91 %)	13,145,044 (31.05 %)	6,458 (0.04 %)	453,997 (1.14 %)	19,636 (0.56 %)	18,226 (0.51 %)
228	Egyptian rousette (1219 2016 Boston U) GCF_001466805.2	54,791 (4.93 %)	n/a	18,221 (2.05 %)	24,192 (1.88 %)	46,601 (2.22 %)	40.02 (99.97 %)	0 (0 %)	638 (0.03 %)	2,490 (100.00 %)	2,815,693 (32.23 %)	440,119 (1.01 %)	12,346,041 (26.86 %)	0 (0 %)	74,090 (0.43 %)	56,244 (6.54 %)	61,126 (5.16 %)
229	Egyptian rousette (v1 2020 refseq) GCF_014176215.1	65,163 (4.76 %)	n/a	17,642 (2.07 %)	22,317 (1.84 %)	n/a	40.05 (98.59 %)	0 (0 %)	242 (1.41 %)	29 (100.00 %)	2,821,248 (33.05 %)	434,414 (1.02 %)	12,031,597 (26.52 %)	0 (0 %)	65,562 (0.33 %)	53,573 (4.84 %)	57,281 (4.47 %)
230	Egyptian spiny mouse (US019 2019) GCA_004027535.1	n/a	n/a	23,498 (1.69 %)	36,970 (1.40 %)	30,076 (1.58 %)	42.71 (99.88 %)	20,469 (0.09 %)	20,469 (0.09 %)	391,811 (99.91 %)	4,983,574 (35.17 %)	1,342,514 (3.45 %)	13,029,270 (32.79 %)	32 (0.00 %)	n/a	19,944 (0.55 %)	18,844 (0.51 %)
231	elk (wapiti) GCF_019320065.1	66,846 (3.00 %)	n/a	20,090 (1.67 %)	21,999 (1.44 %)	n/a	41.62 (99.93 %)	0 (0 %)	6,643 (0.08 %)	185 (100.00 %)	4,884,711 (43.14 %)	429,925 (1.65 %)	13,135,255 (37.85 %)	78 (0.00 %)	802,680 (2.76 %)	47,099 (1.31 %)	44,586 (1.19 %)
232	ermine (2020) GCF_009829155.1	74,345 (3.19 %)	n/a	18,855 (1.65 %)	20,667 (1.43 %)	44,584 (2.07 %)	41.56 (99.12 %)	0 (0 %)	199 (0.88 %)	94 (100.00 %)	4,647,934 (41.44 %)	714,174 (1.30 %)	13,845,904 (33.42 %)	3 (0.01 %)	452,963 (1.26 %)	56,065 (2.25 %)	56,447 (2.07 %)
233	ermine (alternate hap 2020) GCA_009829165.1	n/a	n/a	13,583 (1.65 %)	15,403 (1.46 %)	n/a	41.72 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,327 (100.00 %)	3,139,035 (40.57 %)	480,111 (1.29 %)	9,106,061 (31.93 %)	0 (0 %)	342,175 (1.40 %)	39,139 (2.25 %)	38,863 (2.02 %)
234	Eurasian badger (2021) GCA_922990625.1	n/a	n/a	19,332 (1.42 %)	22,424 (1.40 %)	n/a	42.47 (100.00 %)	0 (0 %)	27 (0.00 %)	726 (100.00 %)	4,362,536 (31.74 %)	801,232 (4.02 %)	13,893,672 (37.73 %)	1 (0.00 %)	1,089,255 (2.94 %)	65,806 (4.13 %)	53,831 (1.83 %)
235	Eurasian badger (v3.2 2022) GCA_922984935.2	n/a	n/a	19,268 (1.40 %)	22,121 (1.36 %)	41,043 (1.93 %)	42.48 (100.00 %)	0 (0 %)	101 (0.00 %)	538 (100.00 %)	4,417,203 (31.72 %)	821,664 (4.02 %)	13,814,720 (38.08 %)	1 (0.00 %)	1,177,257 (3.11 %)	66,524 (3.95 %)	54,563 (1.83 %)
236	Eurasian field mouse (2024) GCA_964023405.1	n/a	n/a	20,487 (1.88 %)	19,707 (1.34 %)	n/a	42.15 (100.00 %)	0 (0 %)	182 (0.00 %)	61 (100.00 %)	5,115,510 (39.18 %)	1,868,284 (4.29 %)	13,503,826 (37.29 %)	2 (0.00 %)	1,262,006 (3.13 %)	26,414 (0.61 %)	24,636 (0.56 %)
237	Eurasian red squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685485.1	n/a	n/a	12,437 (1.51 %)	12,702 (1.22 %)	n/a	40.06 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	10,657 (100.00 %)	2,303,176 (35.38 %)	353,996 (1.49 %)	7,218,556 (31.67 %)	0 (0 %)	194,541 (1.24 %)	24,268 (1.07 %)	22,754 (0.97 %)
238	Eurasian red squirrel (v1.2 2020) GCA_902686455.2	n/a	n/a	21,309 (1.58 %)	21,026 (1.36 %)	33,465 (1.53 %)	40.08 (94.33 %)	0 (0 %)	1,177 (5.67 %)	639 (100.00 %)	4,677,412 (35.73 %)	704,218 (1.42 %)	14,992,063 (31.49 %)	5 (0.00 %)	419,661 (1.29 %)	48,159 (1.04 %)	45,470 (0.95 %)
239	Eurasian river otter (2020) GCF_902655055.1	67,269 (2.96 %)	n/a	18,842 (1.54 %)	20,178 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	0 (0 %)	185 (0.00 %)	44 (100.00 %)	4,259,294 (33.39 %)	713,721 (1.36 %)	13,626,048 (34.37 %)	1 (0.00 %)	695,796 (1.86 %)	57,073 (1.82 %)	47,446 (1.36 %)
240	Eurasian river otter (alternate hap 2019) GCA_902653095.1	n/a	n/a	9,910 (1.59 %)	11,315 (1.31 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8,506 (100.00 %)	2,052,338 (42.25 %)	316,084 (1.64 %)	6,222,460 (33.12 %)	0 (0 %)	291,189 (1.91 %)	27,057 (1.96 %)	26,047 (1.75 %)
241	Eurasian water vole (alternate hap 2020) GCA_903992525.1	n/a	n/a	16,761 (1.66 %)	19,715 (1.37 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	105 (0.00 %)	105 (0.00 %)	16,473 (100.00 %)	3,118,266 (26.44 %)	829,463 (2.82 %)	9,700,482 (31.37 %)	0 (0 %)	353,652 (1.44 %)	14,146 (0.57 %)	12,571 (0.45 %)
242	Eurasian water vole (v2 2021) GCF_903992535.2	45,544 (2.51 %)	n/a	19,733 (1.78 %)	19,053 (1.47 %)	36,935 (2.27 %)	42.15 (99.74 %)	0 (0 %)	873 (0.26 %)	215 (100.00 %)	3,993,912 (25.74 %)	1,088,163 (2.91 %)	12,853,770 (32.42 %)	5 (0.00 %)	518,667 (1.69 %)	19,000 (0.58 %)	16,851 (0.46 %)
243	European hare (LE1 primary hap 2023) GCF_033115175.1	46,528 (2.09 %)	n/a	19,392 (1.25 %)	23,070 (1.29 %)	n/a	44.03 (100.00 %)	0 (0 %)	418 (0.00 %)	651 (100.00 %)	4,011,592 (19.81 %)	1,000,204 (8.44 %)	13,414,251 (44.25 %)	2 (0.00 %)	2,116,577 (4.63 %)	98,831 (2.33 %)	72,807 (1.75 %)
244	European harvest mouse (primary hap 2024) GCA_963924665.1	n/a	n/a	20,236 (1.71 %)	19,368 (1.32 %)	n/a	40.05 (99.99 %)	0 (0 %)	2,020 (0.02 %)	894 (100.00 %)	4,892,811 (36.49 %)	1,223,387 (18.26 %)	11,907,631 (42.51 %)	10 (0.00 %)	4,679,739 (9.91 %)	17,423 (0.62 %)	15,264 (0.35 %)
245	European mink (alternate hap 2023) GCA_030435785.1	n/a	n/a	15,419 (1.50 %)	21,175 (1.51 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12,043 (100.00 %)	2,952,218 (30.62 %)	538,508 (2.18 %)	9,303,303 (34.20 %)	0 (0 %)	511,888 (2.10 %)	47,810 (2.50 %)	39,732 (1.82 %)
246	European mink (primary hap 2023 refseq) GCF_030435805.1	69,556 (3.13 %)	n/a	18,706 (1.46 %)	21,193 (1.37 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	0 (0 %)	39 (0.00 %)	25 (100.00 %)	4,237,791 (30.90 %)	792,897 (2.69 %)	13,417,195 (36.59 %)	0 (0 %)	894,272 (2.55 %)	67,132 (2.54 %)	51,333 (1.62 %)
247	European mole (hap1 2024) GCA_964194135.1	n/a	n/a	18,085 (1.69 %)	19,509 (1.58 %)	n/a	42.08 (99.99 %)	0 (0 %)	1,056 (0.01 %)	464 (100.00 %)	2,569,380 (23.32 %)	565,465 (2.18 %)	10,506,666 (33.68 %)	42 (0.00 %)	704,393 (2.62 %)	46,367 (3.09 %)	42,313 (2.40 %)
248	European mole (hap2 2024) GCA_964194205.1	n/a	n/a	18,064 (1.69 %)	19,764 (1.59 %)	n/a	42.07 (99.99 %)	1,040 (0.01 %)	1,040 (0.01 %)	1,396 (99.99 %)	2,567,492 (23.34 %)	570,250 (2.16 %)	10,485,959 (33.56 %)	30 (0.00 %)	702,644 (2.60 %)	46,213 (3.27 %)	42,349 (2.41 %)
249	European pine marten (primary hap 2023) GCA_963455335.1	n/a	n/a	18,336 (1.50 %)	20,807 (1.41 %)	n/a	42.38 (99.98 %)	0 (0 %)	2,250 (0.02 %)	477 (100.00 %)	4,096,160 (31.55 %)	707,337 (3.28 %)	13,715,382 (34.73 %)	10 (0.00 %)	626,861 (1.84 %)	61,481 (4.29 %)	56,462 (1.94 %)
250	European shrew (alternate hap 2023) GCA_027595995.1	n/a	n/a	17,506 (1.26 %)	25,527 (1.52 %)	n/a	43.20 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	5,699 (100.00 %)	2,400,784 (15.19 %)	1,062,793 (3.20 %)	13,284,496 (41.93 %)	0 (0 %)	768,770 (2.06 %)	77,009 (2.86 %)	75,481 (2.15 %)
251	European shrew (GB8-d 2012) GCF_000181275.1	23,525 (1.54 %)	n/a	17,290 (1.33 %)	22,005 (1.50 %)	n/a	42.90 (90.49 %)	188,953 (9.54 %)	188,953 (9.54 %)	201,798 (90.46 %)	4,400,127 (33.22 %)	946,629 (2.03 %)	13,377,581 (35.30 %)	3,389 (0.06 %)	410,333 (1.21 %)	77,851 (2.58 %)	76,553 (1.98 %)
252	European shrew (primary hap 2023) GCF_027595985.1	44,643 (2.60 %)	n/a	17,479 (1.26 %)	21,293 (1.37 %)	n/a	43.24 (99.46 %)	0 (0 %)	1,427 (0.54 %)	65 (100.00 %)	2,474,584 (15.18 %)	1,107,884 (3.28 %)	13,638,467 (41.72 %)	10 (0.00 %)	822,159 (2.15 %)	79,785 (2.86 %)	77,901 (2.13 %)
253	European snow vole (alternate hap 2023) GCA_950005115.1	n/a	n/a	18,364 (1.79 %)	20,379 (1.63 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	4,256 (100.00 %)	3,049,618 (22.22 %)	852,708 (4.50 %)	10,501,392 (33.34 %)	0 (0 %)	706,136 (2.67 %)	17,629 (0.60 %)	15,048 (0.47 %)
254	European snow vole (primary hap 2023 refseq) GCF_950005125.1	47,025 (2.69 %)	n/a	19,592 (1.78 %)	21,173 (1.56 %)	n/a	41.98 (100.00 %)	0 (0 %)	197 (0.00 %)	160 (100.00 %)	5,048,186 (44.12 %)	998,537 (5.14 %)	12,204,053 (34.97 %)	4 (0.00 %)	954,164 (3.20 %)	20,725 (0.63 %)	18,727 (0.52 %)
255	European suslik (primary hap 2024) GCA_964194105.1	n/a	n/a	20,075 (1.28 %)	20,274 (1.19 %)	n/a	39.90 (99.99 %)	4 (0.00 %)	1,436 (0.01 %)	502 (100.00 %)	4,357,247 (31.78 %)	882,536 (12.27 %)	14,882,486 (41.66 %)	9 (0.00 %)	1,833,125 (4.49 %)	39,275 (0.88 %)	27,165 (0.54 %)
256	European woodmouse (2022 refseq) GCF_947179515.1	54,113 (2.24 %)	n/a	19,959 (1.65 %)	19,953 (1.25 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	0 (0 %)	1,129 (0.01 %)	497 (100.00 %)	4,863,650 (37.41 %)	1,795,997 (8.95 %)	13,681,732 (40.58 %)	17 (0.00 %)	2,516,593 (5.37 %)	23,961 (0.53 %)	17,318 (0.36 %)
257	European woodmouse (alternate hap 2022) GCA_947179525.1	n/a	n/a	18,692 (1.72 %)	22,021 (1.36 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	10,863 (100.00 %)	4,055,957 (36.08 %)	1,513,576 (9.53 %)	11,306,811 (39.67 %)	0 (0 %)	1,995,176 (5.07 %)	20,865 (0.55 %)	15,533 (0.39 %)
258	fallow deer (Ldn47 2023) GCF_033118175.1	57,013 (2.35 %)	n/a	20,187 (1.33 %)	23,290 (1.33 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	0 (0 %)	44 (0.00 %)	284 (100.00 %)	3,308,241 (20.72 %)	513,748 (18.20 %)	12,996,819 (48.19 %)	0 (0 %)	5,629,434 (11.23 %)	214,480 (2.98 %)	41,647 (0.85 %)
259	fallow deer (maternal hap SK-2024 2025) GCA_048126745.1	n/a	n/a	20,072 (1.51 %)	22,668 (1.37 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	65 (0.00 %)	147 (0.00 %)	1,369 (100.00 %)	4,623,335 (34.75 %)	475,143 (7.51 %)	13,000,703 (41.56 %)	1 (0.00 %)	2,295,952 (5.37 %)	112,581 (2.00 %)	41,372 (0.95 %)
260	fallow deer (paternal hap SK-2024 2025) GCA_048127045.1	n/a	n/a	18,238 (1.57 %)	20,307 (1.42 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	78 (0.00 %)	242 (0.00 %)	388 (100.00 %)	4,244,450 (35.89 %)	405,446 (2.83 %)	12,211,643 (38.55 %)	0 (0 %)	937,470 (2.69 %)	52,418 (1.36 %)	34,784 (0.91 %)
261	false killer whale (hap1 2024 genbank) GCA_039906515.1	n/a	n/a	18,718 (1.50 %)	20,929 (1.32 %)	n/a	42.08 (99.90 %)	0 (0 %)	123 (0.10 %)	439 (100.00 %)	3,958,932 (35.76 %)	1,002,329 (11.61 %)	12,193,131 (41.85 %)	3 (0.00 %)	1,441,777 (4.23 %)	79,158 (3.74 %)	41,701 (1.03 %)
262	false killer whale (hap1 2024 refseq) GCF_039906515.1	75,958 (3.31 %)	n/a	18,718 (1.50 %)	20,982 (1.32 %)	n/a	42.08 (99.90 %)	0 (0 %)	123 (0.10 %)	438 (100.00 %)	3,958,926 (35.76 %)	1,002,329 (11.61 %)	12,193,061 (41.85 %)	3 (0.00 %)	1,441,777 (4.23 %)	79,158 (3.74 %)	41,701 (1.03 %)
263	false killer whale (hap2 2024) GCA_039906525.1	n/a	n/a	17,866 (1.45 %)	21,079 (1.46 %)	n/a	42.37 (99.08 %)	0 (0 %)	133 (0.92 %)	416 (100.00 %)	3,852,502 (34.98 %)	1,112,185 (16.42 %)	11,435,533 (44.17 %)	1 (0.00 %)	1,686,603 (5.16 %)	75,215 (4.36 %)	39,963 (0.98 %)
264	fat dormouse (US078 2019) GCA_004027185.1	n/a	n/a	23,122 (1.24 %)	48,677 (1.27 %)	n/a	42.33 (99.92 %)	10,685 (0.04 %)	10,685 (0.04 %)	444,115 (99.96 %)	6,783,404 (37.03 %)	1,642,515 (3.72 %)	12,706,289 (39.97 %)	58 (0.00 %)	n/a	65,521 (1.47 %)	33,794 (0.75 %)
265	fat sand rat (mPsaObe1 2021) GCF_907164565.1	43,224 (2.50 %)	n/a	18,543 (1.78 %)	20,094 (1.42 %)	n/a	41.95 (99.11 %)	0 (0 %)	50,482 (0.90 %)	11,389 (100.00 %)	4,686,377 (43.10 %)	920,563 (1.85 %)	12,813,848 (35.08 %)	2,665 (0.03 %)	294,151 (0.96 %)	22,480 (0.71 %)	20,772 (0.63 %)
266	fat sand rat (Psa_ob012049795 2017) GCA_002215935.1	n/a	n/a	21,644 (1.71 %)	31,665 (1.41 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	96,427 (100.00 %)	4,646,110 (38.87 %)	946,664 (2.24 %)	13,134,526 (33.94 %)	0 (0 %)	232,939 (1.07 %)	26,411 (0.73 %)	24,961 (0.66 %)
267	fat-tailed dunnart (SCR6 2025) GCF_048593235.1	60,212 (2.43 %)	n/a	15,763 (0.77 %)	16,031 (0.89 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	0 (0 %)	1,908 (0.01 %)	8 (100.00 %)	5,302,378 (24.47 %)	1,450,227 (3.79 %)	20,870,714 (44.26 %)	5 (0.00 %)	628,150 (1.54 %)	24,586 (0.65 %)	24,216 (0.53 %)
268	fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025) GCA_048593235.1	n/a	n/a	15,762 (0.77 %)	16,035 (0.89 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	1,908 (0.01 %)	1,908 (0.01 %)	1,915 (99.99 %)	5,302,372 (24.47 %)	1,450,220 (3.79 %)	20,870,654 (44.26 %)	5 (0.00 %)	1,034,421 (2.56 %)	24,585 (0.65 %)	24,216 (0.53 %)
269	fat-tailed dunnart (SCR6 hap2 2025) GCA_048593295.1	n/a	n/a	16,012 (0.77 %)	16,430 (0.90 %)	n/a	36.18 (99.99 %)	1,730 (0.01 %)	1,730 (0.01 %)	1,737 (99.99 %)	5,361,847 (24.48 %)	1,474,744 (3.79 %)	21,021,671 (44.20 %)	6 (0.00 %)	1,053,897 (2.55 %)	25,669 (0.69 %)	25,354 (0.55 %)
270	fin whale (hap1.1 2025) GCA_965194825.1	n/a	n/a	19,491 (1.21 %)	22,538 (1.06 %)	n/a	42.19 (99.99 %)	0 (0 %)	1,516 (0.01 %)	2,612 (100.00 %)	4,598,236 (35.34 %)	1,716,315 (24.14 %)	12,260,919 (52.40 %)	7 (0.00 %)	3,173,278 (8.14 %)	82,683 (1.47 %)	44,824 (0.87 %)
271	fin whale (hap2.1 2025) GCA_965194765.1	n/a	n/a	18,684 (1.40 %)	21,322 (1.20 %)	n/a	41.87 (99.99 %)	1,258 (0.01 %)	1,258 (0.01 %)	3,706 (99.99 %)	4,103,716 (36.69 %)	1,030,821 (16.12 %)	11,633,934 (45.82 %)	11 (0.00 %)	1,843,351 (5.96 %)	74,782 (1.60 %)	42,885 (1.00 %)
272	fishing cat (Anna 2022 U Missouri) GCF_022837055.1	68,085 (2.86 %)	n/a	18,432 (1.63 %)	19,912 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	0 (0 %)	63 (0.00 %)	192 (100.00 %)	4,777,906 (34.85 %)	937,432 (2.30 %)	13,438,032 (34.55 %)	0 (0 %)	654,267 (1.76 %)	70,402 (2.61 %)	68,720 (2.25 %)
273	Florida manatee (CSIC 2023) GCA_030013775.1	n/a	n/a	19,432 (1.24 %)	24,035 (1.14 %)	n/a	40.66 (100.00 %)	33 (0.00 %)	33 (0.00 %)	15,641 (100.00 %)	4,400,331 (33.07 %)	439,615 (1.04 %)	14,884,753 (46.98 %)	2 (0.00 %)	413,231 (1.00 %)	32,563 (0.80 %)	26,358 (0.59 %)
274	Florida manatee (Lorelei 2012 refseq) GCF_000243295.1	39,664 (2.08 %)	n/a	18,308 (1.37 %)	20,588 (1.23 %)	32,868 (1.38 %)	40.73 (89.24 %)	160,167 (10.78 %)	160,167 (10.78 %)	166,490 (89.22 %)	n/a	389,315 (0.74 %)	14,633,038 (38.46 %)	5,748 (0.06 %)	244,060 (0.64 %)	27,462 (0.64 %)	25,464 (0.54 %)
275	fossa GCA_004023885.1	n/a	n/a	21,156 (1.56 %)	29,809 (1.38 %)	n/a	41.51 (99.94 %)	6,335 (0.03 %)	6,335 (0.03 %)	470,371 (99.97 %)	4,962,168 (42.36 %)	814,639 (1.52 %)	13,708,904 (34.14 %)	29 (0.00 %)	263,077 (0.54 %)	78,033 (2.52 %)	74,289 (2.13 %)
276	Gambian giant pouched rat GCA_004027575.1	n/a	n/a	21,189 (1.59 %)	32,806 (1.43 %)	n/a	42.11 (99.88 %)	7,473 (0.03 %)	7,473 (0.03 %)	1,110,425 (99.97 %)	4,137,605 (24.57 %)	1,071,627 (2.76 %)	12,905,250 (32.78 %)	51 (0.00 %)	n/a	32,359 (0.80 %)	21,577 (0.55 %)
277	gaur (Gaur_Henry_Doorly_Zoo_5443 2020) GCA_014182915.2	n/a	n/a	19,130 (1.53 %)	21,239 (1.30 %)	n/a	41.83 (99.99 %)	0 (0 %)	2,194 (0.01 %)	635 (100.00 %)	6,520,228 (50.46 %)	466,916 (1.41 %)	13,425,286 (41.25 %)	0 (0 %)	1,230,155 (3.35 %)	41,833 (1.15 %)	36,947 (0.95 %)
278	gayal (CVASU_BF_001 2021) GCA_017311355.1	n/a	n/a	24,549 (1.09 %)	55,194 (1.15 %)	n/a	42.05 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1,262,134 (100.00 %)	3,691,398 (22.78 %)	677,397 (2.00 %)	14,380,670 (42.36 %)	0 (0 %)	n/a	75,114 (1.33 %)	44,401 (0.88 %)
279	gayal (Nagaland 2019) GCA_007844835.1	n/a	n/a	22,715 (1.55 %)	23,635 (1.33 %)	n/a	41.67 (96.51 %)	301,761 (3.52 %)	301,761 (3.52 %)	306,776 (96.48 %)	6,243,468 (45.69 %)	518,664 (1.99 %)	15,147,647 (37.64 %)	5,199 (0.13 %)	1,060,226 (3.23 %)	45,586 (0.89 %)	40,275 (0.78 %)
280	Geoffroy's bat (hap1.1 2025) GCA_965115925.1	n/a	n/a	19,320 (1.74 %)	21,940 (1.65 %)	n/a	42.55 (99.99 %)	2 (0.00 %)	1,540 (0.01 %)	404 (100.00 %)	3,707,500 (37.60 %)	733,107 (7.78 %)	10,515,474 (39.35 %)	11 (0.00 %)	903,956 (3.14 %)	60,200 (2.41 %)	51,657 (1.64 %)
281	Geoffroy's bat (hap2.1 2025) GCA_965115945.1	n/a	n/a	18,718 (1.71 %)	20,961 (1.62 %)	n/a	42.29 (99.98 %)	1,597 (0.02 %)	1,597 (0.02 %)	2,101 (99.98 %)	3,662,405 (37.72 %)	717,069 (7.80 %)	10,298,372 (39.22 %)	11 (0.00 %)	842,144 (3.02 %)	56,300 (2.26 %)	45,967 (1.45 %)
282	Geoffroy's cat GCF_018350155.1	85,344 (3.53 %)	n/a	18,469 (1.66 %)	19,516 (1.36 %)	93,795 (4.83 %)	41.75 (100.00 %)	35 (0.00 %)	45 (0.00 %)	82 (100.00 %)	5,021,854 (43.23 %)	930,175 (1.84 %)	13,757,469 (34.29 %)	0 (0 %)	627,614 (1.76 %)	65,918 (2.36 %)	58,825 (1.96 %)
283	giant anteater GCA_004026745.1	n/a	n/a	24,383 (0.91 %)	44,315 (0.93 %)	n/a	39.53 (99.88 %)	8,283 (0.02 %)	8,283 (0.02 %)	1,629,691 (99.98 %)	5,333,757 (35.57 %)	575,140 (0.91 %)	21,181,213 (39.97 %)	116 (0.00 %)	n/a	57,558 (0.94 %)	45,184 (0.73 %)
284	giant otter GCA_004024605.1	n/a	n/a	21,199 (1.46 %)	30,565 (1.34 %)	n/a	41.71 (99.93 %)	7,431 (0.03 %)	7,431 (0.03 %)	652,159 (99.97 %)	5,113,769 (41.55 %)	788,677 (1.46 %)	14,385,279 (35.77 %)	57 (0.00 %)	420,852 (0.84 %)	82,376 (2.05 %)	79,949 (1.87 %)
285	giant panda (Jingjing v3 2020) GCF_002007445.2	65,481 (3.27 %)	n/a	19,077 (1.67 %)	20,176 (1.39 %)	n/a	41.68 (98.09 %)	0 (0 %)	189,277 (1.92 %)	73,514 (100.00 %)	4,012,144 (34.40 %)	617,803 (1.99 %)	14,216,587 (30.41 %)	9,430 (0.13 %)	581,226 (4.37 %)	59,449 (1.50 %)	54,779 (1.33 %)
286	goat (v2 San Clemente 2016 USDA) GCF_001704415.2	47,172 (2.31 %)	n/a	19,342 (1.38 %)	22,346 (1.24 %)	n/a	43.16 (100.00 %)	0 (0 %)	790 (0.00 %)	29,886 (100.00 %)	3,502,527 (22.45 %)	760,831 (7.07 %)	13,024,178 (44.85 %)	0 (0 %)	2,571,330 (5.65 %)	125,662 (4.00 %)	40,923 (0.89 %)
287	Gobi jerboa GCA_004027895.1	n/a	n/a	22,410 (0.91 %)	45,268 (1.02 %)	n/a	41.94 (99.88 %)	10,987 (0.04 %)	10,987 (0.04 %)	1,295,369 (99.96 %)	8,828,417 (40.19 %)	1,979,806 (6.43 %)	14,759,732 (47.73 %)	96 (0.00 %)	n/a	24,314 (0.52 %)	19,787 (0.39 %)
288	golden hamster (Baylor 2021) GCF_017639785.1	67,831 (3.37 %)	n/a	19,354 (1.71 %)	19,863 (1.47 %)	69,903 (4.39 %)	42.04 (96.99 %)	711 (3.01 %)	711 (3.01 %)	7,058 (96.99 %)	3,981,818 (27.65 %)	976,456 (3.46 %)	12,580,903 (32.87 %)	25 (0.00 %)	766,407 (1.98 %)	21,268 (0.61 %)	18,135 (0.47 %)
289	golden hamster (Broad 2013 refseq) GCF_000349665.1	42,636 (2.91 %)	37,986 (2.21 %)	18,976 (1.82 %)	19,149 (1.51 %)	29,936 (1.96 %)	42.01 (82.92 %)	216,216 (17.12 %)	216,216 (17.12 %)	237,700 (82.88 %)	3,599,795 (26.09 %)	790,256 (1.69 %)	12,003,956 (24.29 %)	3,589 (0.05 %)	254,929 (0.76 %)	18,591 (0.51 %)	17,093 (0.42 %)
290	golden jackal (CA01 2025) GCF_053574225.1	115,457 (4.37 %)	n/a	19,332 (1.58 %)	21,009 (1.39 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	0 (0 %)	59 (0.00 %)	306 (100.00 %)	6,089,485 (46.31 %)	1,184,044 (5.44 %)	13,574,928 (35.96 %)	0 (0 %)	1,273,197 (3.07 %)	54,314 (2.19 %)	48,434 (1.90 %)
291	golden spiny mouse (2020) GCF_903995435.1	36,997 (1.96 %)	n/a	20,006 (1.91 %)	19,132 (1.50 %)	n/a	42.51 (99.65 %)	0 (0 %)	880 (0.35 %)	623 (100.00 %)	4,785,907 (32.61 %)	1,305,613 (3.34 %)	12,958,061 (32.33 %)	0 (0 %)	684,879 (1.84 %)	20,760 (0.59 %)	18,457 (0.52 %)
292	golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 genbank) GCA_048772815.1	n/a	n/a	20,967 (0.89 %)	24,137 (0.94 %)	n/a	39.52 (99.99 %)	0 (0 %)	1,448 (0.01 %)	8,087 (100.00 %)	5,547,018 (29.30 %)	1,312,047 (10.07 %)	15,174,898 (52.73 %)	10 (0.00 %)	5,076,603 (7.43 %)	40,182 (0.59 %)	29,493 (0.39 %)
293	golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 refseq) GCF_048772815.1	49,173 (1.30 %)	n/a	19,845 (0.90 %)	24,244 (0.94 %)	n/a	39.52 (99.99 %)	0 (0 %)	1,448 (0.01 %)	8,088 (100.00 %)	8,197,827 (62.01 %)	1,312,047 (10.07 %)	15,174,958 (52.73 %)	10 (0.00 %)	5,076,603 (7.43 %)	40,182 (0.59 %)	29,417 (0.42 %)
294	golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 genbank) GCA_048772825.1	n/a	n/a	19,719 (1.16 %)	22,611 (1.21 %)	n/a	39.48 (100.00 %)	0 (0 %)	643 (0.00 %)	2,820 (100.00 %)	4,725,546 (31.70 %)	997,950 (3.53 %)	14,753,550 (39.53 %)	6 (0.00 %)	1,428,961 (3.10 %)	33,465 (0.69 %)	26,996 (0.48 %)
295	golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 refseq) GCF_048772825.1	46,395 (1.71 %)	n/a	18,853 (1.19 %)	22,613 (1.21 %)	n/a	39.48 (100.00 %)	0 (0 %)	643 (0.00 %)	2,821 (100.00 %)	6,984,115 (50.68 %)	997,950 (3.53 %)	14,753,604 (39.53 %)	6 (0.00 %)	1,428,961 (3.10 %)	33,465 (0.69 %)	26,805 (0.53 %)
296	gracile shrew mole GCA_004024945.1	n/a	n/a	19,165 (1.25 %)	43,816 (1.48 %)	n/a	41.08 (99.89 %)	8,248 (0.04 %)	8,248 (0.04 %)	732,083 (99.96 %)	2,957,465 (23.76 %)	783,289 (2.60 %)	11,503,344 (31.38 %)	23 (0.00 %)	n/a	92,729 (3.60 %)	75,685 (2.89 %)
297	gray fox (Vermont ataVT051 2023) GCA_032313775.1	n/a	n/a	19,352 (1.42 %)	20,724 (1.33 %)	n/a	42.10 (100.00 %)	0 (0 %)	26 (0.00 %)	898 (100.00 %)	4,418,039 (36.90 %)	1,050,244 (11.63 %)	13,240,305 (39.50 %)	0 (0 %)	3,860,162 (6.83 %)	89,246 (2.69 %)	49,263 (1.43 %)
298	gray seal (241Hg 2020) GCF_012393455.1	79,009 (3.73 %)	n/a	19,882 (1.73 %)	22,416 (1.46 %)	n/a	41.44 (100.00 %)	0 (0 %)	117 (0.00 %)	6,880 (100.00 %)	4,448,588 (43.28 %)	557,710 (1.32 %)	13,340,576 (33.41 %)	0 (0 %)	506,266 (1.47 %)	55,637 (1.78 %)	52,209 (1.58 %)
299	gray seal (hap1.1 2025) GCA_964656455.1	n/a	n/a	19,291 (1.73 %)	20,301 (1.41 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	0 (0 %)	1,130 (0.01 %)	171 (100.00 %)	4,245,582 (34.81 %)	600,624 (2.16 %)	13,240,803 (34.28 %)	4 (0.00 %)	615,950 (1.85 %)	56,932 (1.78 %)	54,064 (1.60 %)
300	gray seal (hap2.1 2025) GCA_964656465.1	n/a	n/a	19,222 (1.73 %)	20,205 (1.41 %)	n/a	41.54 (99.99 %)	1,110 (0.01 %)	1,110 (0.01 %)	1,233 (99.99 %)	4,236,942 (34.95 %)	601,409 (1.99 %)	13,226,667 (34.03 %)	5 (0.00 %)	598,973 (1.85 %)	57,067 (1.82 %)	54,058 (1.64 %)
301	gray seal (mHalGry1.hap1.1 2025) GCF_964656455.1	70,736 (3.27 %)	n/a	18,889 (1.71 %)	20,343 (1.40 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	1,130 (0.01 %)	1,130 (0.01 %)	1,300 (99.99 %)	5,332,627 (44.68 %)	600,622 (2.16 %)	13,240,769 (34.28 %)	4 (0.00 %)	615,940 (1.85 %)	56,931 (1.78 %)	46,951 (1.45 %)
302	gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023) GCA_027917375.1	n/a	n/a	12,662 (0.70 %)	15,124 (0.89 %)	n/a	37.74 (100.00 %)	24 (0.00 %)	24 (0.00 %)	8,086 (100.00 %)	4,098,004 (25.33 %)	806,470 (2.98 %)	16,244,072 (43.39 %)	0 (0 %)	n/a	24,879 (0.67 %)	15,867 (0.39 %)
303	gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq) GCF_027887165.1	73,383 (3.04 %)	n/a	16,637 (0.72 %)	16,036 (0.85 %)	n/a	37.92 (99.11 %)	0 (0 %)	2,255 (0.89 %)	13 (100.00 %)	5,562,359 (25.40 %)	1,096,620 (2.60 %)	22,322,748 (43.37 %)	13 (0.00 %)	793,648 (1.81 %)	28,894 (0.57 %)	22,987 (0.42 %)
304	gray short-tailed opossum (MonDom5 2007) GCF_000002295.2	68,388 (2.34 %)	n/a	16,663 (0.75 %)	16,162 (0.84 %)	n/a	37.82 (97.26 %)	67,660 (2.75 %)	67,660 (2.75 %)	72,674 (97.25 %)	7,753,175 (55.85 %)	1,051,473 (2.34 %)	22,274,001 (42.23 %)	6 (0.00 %)	680,995 (1.61 %)	30,883 (0.53 %)	22,339 (0.40 %)
305	gray squirrel (2020) GCF_902686445.1	59,073 (2.48 %)	n/a	20,752 (1.49 %)	21,107 (1.31 %)	32,732 (1.45 %)	40.06 (99.98 %)	0 (0 %)	1,824 (0.02 %)	752 (100.00 %)	4,605,578 (34.50 %)	728,192 (1.65 %)	15,467,412 (33.91 %)	2 (0.00 %)	504,786 (1.54 %)	51,878 (1.11 %)	49,715 (1.03 %)
306	gray squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685475.1	n/a	n/a	17,156 (1.53 %)	18,190 (1.33 %)	n/a	40.25 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	9,510 (100.00 %)	3,455,580 (34.94 %)	530,053 (1.56 %)	10,927,458 (32.64 %)	0 (0 %)	323,766 (1.34 %)	38,976 (1.13 %)	37,317 (1.05 %)
307	gray wolf (2021) GCA_905319855.2	n/a	n/a	19,474 (1.55 %)	20,394 (1.40 %)	72,806 (4.12 %)	41.49 (100.00 %)	0 (0 %)	166 (0.00 %)	82 (100.00 %)	4,550,524 (31.76 %)	1,063,944 (3.96 %)	13,588,117 (34.74 %)	23 (0.00 %)	1,048,956 (2.49 %)	51,996 (2.15 %)	47,971 (1.53 %)
308	gray wolf (alternate hap 2021) GCA_905319845.1	n/a	n/a	12,760 (1.57 %)	14,423 (1.42 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	5,537 (100.00 %)	2,725,227 (31.66 %)	616,862 (3.40 %)	8,041,744 (32.68 %)	0 (0 %)	465,446 (1.97 %)	32,293 (2.35 %)	29,871 (1.57 %)
309	great fruit-eating bat (hap1 2024) GCA_038363145.1	n/a	n/a	18,022 (1.56 %)	19,824 (1.51 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	0 (0 %)	81 (0.00 %)	419 (100.00 %)	2,827,417 (26.82 %)	371,479 (4.97 %)	11,603,093 (34.64 %)	1 (0.00 %)	522,672 (1.87 %)	71,574 (2.28 %)	54,020 (1.50 %)
310	great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024) GCA_038363175.2	n/a	n/a	16,978 (1.61 %)	18,544 (1.54 %)	n/a	42.42 (100.00 %)	0 (0 %)	54 (0.00 %)	312 (100.00 %)	2,601,985 (26.67 %)	331,187 (4.87 %)	10,884,729 (33.93 %)	1 (0.00 %)	458,782 (1.76 %)	63,610 (2.71 %)	49,165 (1.49 %)
311	great fruit-eating bat (v2 hap1 2024) GCA_038363095.2	n/a	n/a	18,051 (1.56 %)	19,955 (1.51 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	0 (0 %)	45 (0.00 %)	487 (100.00 %)	2,841,143 (26.67 %)	379,430 (5.52 %)	11,651,542 (35.11 %)	0 (0 %)	569,322 (2.01 %)	72,337 (2.76 %)	54,165 (1.48 %)
312	great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016) GCF_001890085.2	50,908 (3.26 %)	n/a	18,993 (2.01 %)	19,633 (1.65 %)	41,769 (2.41 %)	41.11 (87.42 %)	0 (0 %)	172,750 (12.60 %)	7,387 (100.00 %)	2,946,981 (30.72 %)	495,272 (1.05 %)	11,587,728 (25.43 %)	2,116 (0.03 %)	193,018 (1.10 %)	32,949 (0.96 %)	30,173 (0.87 %)
313	greater bulldog bat GCA_004026585.1	n/a	n/a	20,774 (1.62 %)	28,140 (1.63 %)	n/a	40.92 (99.94 %)	6,171 (0.03 %)	6,171 (0.03 %)	304,393 (99.97 %)	3,288,598 (29.60 %)	478,424 (1.16 %)	11,427,553 (35.29 %)	6 (0.00 %)	n/a	44,124 (1.99 %)	42,024 (1.78 %)
314	Greater cane rat GCA_004025085.1	n/a	n/a	20,383 (0.98 %)	47,456 (1.25 %)	n/a	42.85 (99.83 %)	8,825 (0.03 %)	8,825 (0.03 %)	1,898,466 (99.97 %)	5,569,185 (30.19 %)	946,696 (3.12 %)	13,144,109 (41.83 %)	28 (0.00 %)	n/a	97,686 (2.61 %)	84,205 (2.21 %)
315	greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019) GCA_004115295.1	n/a	n/a	14,896 (1.85 %)	18,939 (1.59 %)	n/a	40.69 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	13,426 (100.00 %)	2,426,330 (34.43 %)	418,341 (1.36 %)	8,763,234 (27.86 %)	0 (0 %)	108,521 (0.55 %)	24,370 (1.08 %)	22,940 (1.00 %)
316	greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019) GCF_004115265.2	53,353 (3.13 %)	n/a	18,641 (1.97 %)	20,359 (1.68 %)	n/a	40.54 (99.64 %)	0 (0 %)	158 (0.36 %)	134 (100.00 %)	3,218,744 (34.52 %)	564,789 (1.35 %)	12,217,020 (29.39 %)	0 (0 %)	171,202 (0.67 %)	32,445 (1.06 %)	30,641 (0.98 %)
317	greater mouse-eared bat (2020 Bat1K) GCF_014108235.1	70,930 (3.43 %)	n/a	19,052 (1.84 %)	21,498 (1.73 %)	n/a	43.11 (98.55 %)	0 (0 %)	538 (1.45 %)	93 (100.00 %)	3,088,083 (26.27 %)	753,124 (2.84 %)	10,383,466 (35.84 %)	0 (0 %)	499,733 (1.88 %)	61,023 (2.69 %)	54,015 (1.81 %)
318	greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024) GCA_043880545.1	n/a	n/a	18,582 (1.55 %)	20,954 (1.35 %)	n/a	42.46 (100.00 %)	0 (0 %)	152 (0.00 %)	106 (100.00 %)	4,158,629 (40.30 %)	696,150 (4.67 %)	12,702,667 (41.11 %)	1 (0.00 %)	1,418,508 (3.67 %)	257,446 (3.38 %)	44,752 (1.05 %)
319	greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq) GCF_036850765.1	55,259 (2.53 %)	n/a	18,321 (1.40 %)	21,048 (1.35 %)	n/a	41.71 (98.73 %)	0 (0 %)	468 (1.27 %)	256 (100.00 %)	4,247,145 (29.53 %)	1,031,385 (2.50 %)	12,465,157 (43.30 %)	3 (0.00 %)	1,113,639 (2.95 %)	101,620 (2.01 %)	44,590 (1.04 %)
320	greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U) GCF_019186645.2	50,563 (2.96 %)	n/a	18,224 (1.70 %)	20,689 (1.67 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	0 (0 %)	55 (0.00 %)	534 (100.00 %)	2,961,591 (0.00 %)	387,908 (0.97 %)	12,179,612 (30.91 %)	1 (0.00 %)	167,034 (0.66 %)	62,189 (5.35 %)	65,269 (4.61 %)
321	grey whale GCA_004363415.1	n/a	n/a	21,827 (1.52 %)	32,191 (1.24 %)	n/a	41.22 (99.88 %)	10,622 (0.04 %)	10,622 (0.04 %)	1,046,770 (99.96 %)	4,841,166 (45.56 %)	780,015 (1.83 %)	13,559,563 (39.86 %)	79 (0.00 %)	n/a	72,343 (1.59 %)	48,741 (1.27 %)
322	grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023) GCA_028021475.1	n/a	n/a	19,129 (1.37 %)	24,628 (1.24 %)	n/a	41.83 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14,442 (100.00 %)	3,892,130 (35.74 %)	874,864 (15.70 %)	11,484,916 (45.69 %)	0 (0 %)	2,048,708 (5.99 %)	73,507 (1.72 %)	41,124 (0.98 %)
323	grey whale (primary hap 2023 genbank) GCA_028021215.1	n/a	n/a	19,288 (1.38 %)	21,791 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	0 (0 %)	279 (0.00 %)	704 (100.00 %)	4,116,900 (35.85 %)	966,065 (16.74 %)	12,154,173 (46.39 %)	3 (0.00 %)	2,154,240 (5.67 %)	77,011 (1.59 %)	42,884 (0.96 %)
324	grey whale (primary hap 2023 refseq) GCF_028021215.1	49,276 (1.90 %)	n/a	19,295 (1.38 %)	21,790 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	0 (0 %)	279 (0.00 %)	703 (100.00 %)	4,116,894 (35.85 %)	966,064 (16.74 %)	12,154,101 (46.39 %)	3 (0.00 %)	2,154,240 (5.67 %)	77,011 (1.59 %)	42,884 (0.96 %)
325	hairy big-eared bat (US037 2019 Broad) GCA_004026765.1	n/a	n/a	21,360 (1.44 %)	37,376 (1.52 %)	n/a	42.38 (99.94 %)	3,218 (0.01 %)	3,218 (0.01 %)	553,308 (99.99 %)	3,519,246 (30.77 %)	393,318 (0.85 %)	12,525,258 (34.42 %)	12 (0.00 %)	n/a	84,875 (2.37 %)	63,057 (1.80 %)
326	Hanaki's dwarf bat (2024) GCA_964339955.1	n/a	n/a	17,856 (1.76 %)	20,604 (1.75 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	0 (0 %)	306 (0.00 %)	141 (100.00 %)	3,697,250 (33.21 %)	842,827 (8.27 %)	10,094,062 (38.40 %)	2 (0.00 %)	752,759 (2.71 %)	61,715 (2.96 %)	59,765 (1.96 %)
327	harbor porpoise (primary hap 2024 genbank) GCA_963924675.1	n/a	n/a	18,529 (1.58 %)	20,583 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	2 (0.00 %)	966 (0.01 %)	442 (100.00 %)	3,760,716 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,240 (39.04 %)	4 (0.00 %)	1,410,168 (3.71 %)	71,530 (2.69 %)	40,160 (1.06 %)
328	harbor porpoise (primary hap 2024 refseq) GCF_963924675.1	33,578 (1.54 %)	n/a	18,528 (1.58 %)	20,582 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	966 (0.01 %)	966 (0.01 %)	1,405 (99.99 %)	3,760,713 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,181 (39.04 %)	4 (0.00 %)	1,410,168 (3.71 %)	71,530 (2.69 %)	40,160 (1.06 %)
329	harbor seal GCF_004348235.1	50,657 (2.98 %)	n/a	19,484 (1.76 %)	20,771 (1.44 %)	33,296 (1.58 %)	41.38 (99.09 %)	16,031 (0.91 %)	16,480 (0.91 %)	21,161 (99.09 %)	4,526,182 (43.28 %)	576,921 (1.11 %)	13,421,780 (33.06 %)	945 (0.02 %)	459,159 (1.28 %)	54,592 (1.70 %)	51,200 (1.50 %)
330	Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U) GCF_002201575.2	37,605 (1.99 %)	n/a	19,483 (1.73 %)	19,767 (1.35 %)	n/a	41.41 (98.23 %)	0 (0 %)	25,763 (1.77 %)	7,487 (100.00 %)	4,575,217 (43.59 %)	583,394 (1.11 %)	13,374,131 (33.69 %)	2,318 (0.04 %)	611,862 (1.63 %)	52,067 (1.50 %)	48,495 (1.32 %)
331	hazel dormouse GCA_004027005.1	n/a	n/a	21,556 (1.24 %)	40,971 (1.33 %)	n/a	41.60 (99.91 %)	15,076 (0.06 %)	15,076 (0.06 %)	481,881 (99.94 %)	6,679,641 (33.98 %)	1,653,419 (3.72 %)	12,685,676 (43.98 %)	42 (0.00 %)	n/a	71,478 (1.57 %)	45,897 (0.92 %)
332	hazel dormouse (alternate hap 2023) GCA_963383665.1	n/a	n/a	11,130 (1.23 %)	22,071 (1.36 %)	n/a	42.15 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	31,856 (100.00 %)	2,958,239 (41.25 %)	788,242 (4.52 %)	6,056,268 (41.88 %)	0 (0 %)	532,149 (2.74 %)	36,143 (1.96 %)	23,949 (1.02 %)
333	hazel dormouse (primary hap 2023) GCA_963383645.1	n/a	n/a	18,620 (1.42 %)	22,403 (1.38 %)	n/a	41.73 (99.99 %)	1 (0.00 %)	1,805 (0.01 %)	214 (100.00 %)	6,063,911 (41.66 %)	1,593,657 (4.46 %)	12,229,281 (43.98 %)	8 (0.00 %)	1,313,148 (3.16 %)	71,058 (1.88 %)	45,398 (0.93 %)
334	hippopotamus (BS01 2019 Broad) GCA_004027065.1	n/a	n/a	24,267 (1.55 %)	34,820 (1.30 %)	n/a	41.43 (99.91 %)	4,730 (0.02 %)	4,730 (0.02 %)	972,599 (99.98 %)	4,579,311 (41.26 %)	606,731 (1.02 %)	14,514,493 (36.58 %)	17 (0.00 %)	n/a	54,753 (1.59 %)	52,362 (1.50 %)
335	hippopotamus (HIP001 2018) GCA_002995585.1	n/a	n/a	22,343 (1.70 %)	31,687 (1.45 %)	n/a	40.96 (94.63 %)	153,125 (5.38 %)	153,125 (5.38 %)	281,897 (94.62 %)	3,952,905 (38.55 %)	476,243 (1.97 %)	14,216,817 (27.43 %)	6,026 (0.29 %)	n/a	48,380 (1.43 %)	46,263 (1.31 %)
336	hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023) GCA_030028035.1	n/a	n/a	20,391 (1.63 %)	20,668 (1.37 %)	n/a	41.62 (100.00 %)	0 (0 %)	83 (0.00 %)	545 (100.00 %)	3,778,764 (35.17 %)	563,345 (3.63 %)	13,524,869 (35.56 %)	0 (0 %)	369,754 (1.46 %)	48,164 (1.90 %)	44,065 (1.33 %)
337	hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq) GCF_030028045.1	64,153 (2.73 %)	n/a	20,331 (1.62 %)	20,633 (1.37 %)	n/a	41.60 (100.00 %)	0 (0 %)	226 (0.00 %)	357 (100.00 %)	3,783,440 (35.17 %)	567,797 (3.38 %)	13,462,531 (35.48 %)	2 (0.00 %)	396,368 (1.55 %)	48,365 (1.91 %)	44,048 (1.34 %)
338	hirola (BS46 2019 Broad) GCA_004027495.1	n/a	n/a	22,264 (1.40 %)	36,984 (1.26 %)	n/a	42.31 (99.93 %)	9,287 (0.03 %)	9,287 (0.03 %)	545,176 (99.97 %)	5,809,405 (48.62 %)	465,001 (1.08 %)	13,326,245 (42.35 %)	43 (0.00 %)	n/a	48,312 (1.15 %)	38,948 (0.98 %)
339	Hispaniolan solenodon GCA_004363575.1	n/a	n/a	18,805 (1.55 %)	27,454 (1.64 %)	n/a	39.98 (99.96 %)	5,186 (0.02 %)	5,186 (0.02 %)	181,804 (99.98 %)	2,669,787 (26.78 %)	431,610 (1.04 %)	13,429,711 (27.35 %)	24 (0.00 %)	86,983 (0.25 %)	53,444 (2.30 %)	52,300 (2.09 %)
340	hispid cotton rat GCA_004025045.1	n/a	n/a	25,324 (1.49 %)	31,681 (1.31 %)	39,953 (1.43 %)	39.77 (99.89 %)	13,744 (0.05 %)	13,744 (0.05 %)	897,290 (99.95 %)	4,384,099 (28.17 %)	1,132,313 (3.34 %)	14,729,737 (38.08 %)	28 (0.00 %)	n/a	17,558 (0.40 %)	15,148 (0.33 %)
341	Hoffmann's two-fingered sloth GCA_000164785.2	n/a	n/a	24,546 (1.30 %)	30,273 (1.15 %)	n/a	39.80 (98.09 %)	100,957 (1.91 %)	101,085 (1.91 %)	370,035 (98.09 %)	5,145,551 (52.20 %)	614,819 (1.62 %)	17,932,269 (39.26 %)	280 (0.01 %)	469,834 (1.28 %)	55,943 (1.04 %)	45,466 (0.86 %)
342	hog-nosed bat GCA_004027555.1	n/a	n/a	20,591 (1.30 %)	39,589 (1.39 %)	n/a	40.99 (99.88 %)	6,224 (0.03 %)	6,224 (0.03 %)	1,230,480 (99.97 %)	4,081,924 (31.12 %)	1,008,077 (2.20 %)	12,068,828 (39.98 %)	17 (0.00 %)	n/a	55,567 (2.02 %)	43,665 (1.48 %)
343	Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020) GCF_014824575.3	49,071 (2.78 %)	n/a	17,588 (1.64 %)	19,357 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	0 (0 %)	38,648 (0.21 %)	25,848 (100.00 %)	2,708,400 (27.89 %)	366,870 (1.48 %)	11,795,308 (31.27 %)	99 (0.00 %)	330,126 (1.83 %)	59,066 (1.72 %)	48,113 (1.34 %)
344	horse (maternal 2024) GCA_036418255.1	n/a	n/a	16,789 (1.65 %)	18,017 (1.36 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	0 (0 %)	210 (0.00 %)	821 (100.00 %)	3,146,381 (34.68 %)	430,664 (5.91 %)	13,246,059 (32.62 %)	0 (0 %)	714,785 (2.15 %)	37,293 (2.80 %)	35,249 (2.66 %)
345	horse (paternal hap 2024) GCA_036426135.1	n/a	n/a	19,073 (1.67 %)	20,636 (1.38 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	0 (0 %)	114 (0.00 %)	602 (100.00 %)	3,521,953 (35.39 %)	461,571 (5.26 %)	14,833,688 (32.77 %)	2 (0.00 %)	728,239 (2.01 %)	43,527 (2.54 %)	41,129 (2.38 %)
346	horse (thoroughbred H_3958 2024) GCF_041296265.1	124,629 (3.91 %)	n/a	18,742 (1.47 %)	21,901 (1.39 %)	n/a	42.90 (99.96 %)	0 (0 %)	5 (0.04 %)	625 (100.00 %)	3,600,073 (33.96 %)	709,759 (8.89 %)	14,396,691 (35.72 %)	0 (0 %)	872,612 (2.26 %)	48,802 (5.67 %)	38,553 (0.92 %)
347	horse (Twilight 2018) GCF_002863925.1	76,388 (4.03 %)	n/a	18,997 (1.73 %)	20,914 (1.42 %)	113,346 (6.08 %)	41.50 (99.62 %)	0 (0 %)	6,294 (0.38 %)	4,701 (100.00 %)	4,080,319 (44.85 %)	395,037 (1.44 %)	15,169,517 (29.93 %)	41 (0.00 %)	354,039 (1.05 %)	44,825 (1.77 %)	37,394 (1.12 %)
348	house mouse (129S1_SvImJv1 2016) GCA_001624185.1	n/a	n/a	21,289 (2.22 %)	18,626 (1.42 %)	102,148 (4.16 %)	41.77 (85.00 %)	54,773 (4.85 %)	366,945 (15.05 %)	62,882 (95.15 %)	5,075,137 (40.38 %)	1,400,072 (2.80 %)	13,497,076 (26.20 %)	20,479 (1.14 %)	431,052 (1.88 %)	16,957 (0.40 %)	16,083 (0.37 %)
349	house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022) GCA_921998555.2	n/a	n/a	21,780 (2.13 %)	19,436 (1.37 %)	110,376 (4.47 %)	41.79 (99.60 %)	8 (0.00 %)	1,557 (0.40 %)	188 (100.00 %)	4,653,663 (40.74 %)	1,550,342 (3.54 %)	12,930,784 (35.48 %)	22 (0.00 %)	820,282 (2.63 %)	23,211 (0.57 %)	15,822 (0.42 %)
350	house mouse (AKR_J v3 2022) GCA_922000895.2	n/a	n/a	21,721 (2.13 %)	19,324 (1.37 %)	110,654 (4.48 %)	41.80 (99.85 %)	6 (0.00 %)	2,714 (0.15 %)	201 (100.00 %)	4,645,513 (40.70 %)	1,547,237 (3.56 %)	13,016,932 (35.69 %)	31 (0.00 %)	816,257 (2.70 %)	23,309 (0.57 %)	15,840 (0.42 %)
351	house mouse (alternate hap 2023) GCA_949316305.1	n/a	n/a	661 (0.88 %)	720 (0.54 %)	n/a	38.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,806 (100.00 %)	97,279 (72.21 %)	40,071 (55.89 %)	208,928 (64.94 %)	0 (0 %)	239,612 (15.41 %)	506 (0.31 %)	327 (0.20 %)
352	house mouse (A_J v3 2022) GCA_921998355.2	n/a	n/a	21,869 (2.13 %)	19,400 (1.37 %)	110,389 (4.48 %)	41.80 (99.39 %)	5 (0.00 %)	608 (0.61 %)	163 (100.00 %)	4,668,553 (40.80 %)	1,556,835 (3.58 %)	12,995,938 (35.53 %)	4 (0.00 %)	832,187 (2.55 %)	23,203 (0.56 %)	15,809 (0.42 %)
353	house mouse (BALB_cJ v3 2022) GCA_921997145.2	n/a	n/a	21,891 (2.13 %)	19,499 (1.37 %)	110,461 (4.47 %)	41.79 (99.80 %)	7 (0.00 %)	274 (0.20 %)	217 (100.00 %)	4,673,990 (40.79 %)	1,560,327 (3.63 %)	13,018,071 (35.70 %)	1 (0.00 %)	836,824 (2.52 %)	23,196 (0.56 %)	15,865 (0.42 %)
354	house mouse (C3H_HeJ v3 2022) GCA_921997125.2	n/a	n/a	21,793 (2.13 %)	19,516 (1.38 %)	110,049 (4.46 %)	41.79 (99.05 %)	3 (0.00 %)	844 (0.95 %)	174 (100.00 %)	4,657,005 (40.76 %)	1,551,107 (3.53 %)	12,949,100 (35.32 %)	12 (0.00 %)	825,975 (2.56 %)	23,262 (0.56 %)	15,821 (0.42 %)
355	house mouse (C57BL/6J 2012) GCA_000185105.2	n/a	n/a	21,313 (2.28 %)	19,336 (1.53 %)	n/a	41.71 (91.01 %)	189,267 (9.02 %)	189,267 (9.02 %)	191,581 (90.98 %)	4,937,032 (40.05 %)	1,409,489 (2.64 %)	13,090,524 (27.69 %)	5,529 (0.08 %)	357,127 (1.10 %)	16,523 (0.40 %)	15,591 (0.37 %)
356	house mouse (C57BL_6J T2T 2024) GCA_964188535.1	n/a	n/a	21,496 (1.92 %)	19,278 (1.25 %)	n/a	41.31 (99.85 %)	108 (0.15 %)	108 (0.15 %)	345 (99.85 %)	4,519,975 (46.81 %)	1,564,206 (14.33 %)	12,267,542 (42.16 %)	0 (0 %)	1,961,197 (5.36 %)	23,119 (0.55 %)	15,974 (0.40 %)
357	house mouse (CBA_J v3 2022) GCA_921998905.2	n/a	n/a	21,829 (2.13 %)	19,841 (1.39 %)	110,858 (4.48 %)	41.79 (99.52 %)	2 (0.00 %)	658 (0.48 %)	145 (100.00 %)	4,658,032 (40.77 %)	1,552,298 (3.59 %)	12,948,038 (35.52 %)	2 (0.00 %)	829,314 (2.57 %)	23,232 (0.56 %)	15,810 (0.42 %)
358	house mouse (DBA_2J v3 2022) GCA_921998315.2	n/a	n/a	22,302 (2.08 %)	19,749 (1.35 %)	113,269 (4.42 %)	41.72 (100.00 %)	9 (0.00 %)	153 (0.00 %)	361 (100.00 %)	4,785,676 (41.69 %)	1,597,598 (4.56 %)	13,190,158 (36.58 %)	0 (0 %)	968,205 (2.82 %)	24,140 (0.59 %)	16,383 (0.43 %)
359	house mouse (FVB_NJ v3 2022) GCA_921998635.2	n/a	n/a	21,633 (2.15 %)	19,565 (1.40 %)	110,246 (4.50 %)	41.82 (98.35 %)	8 (0.00 %)	6,244 (1.65 %)	384 (100.00 %)	4,621,601 (40.42 %)	1,537,622 (3.48 %)	12,818,729 (34.77 %)	54 (0.00 %)	781,344 (2.48 %)	22,696 (0.55 %)	15,795 (0.42 %)
360	house mouse (LP_J v3 2022) GCA_947599735.1	n/a	n/a	22,452 (1.91 %)	19,841 (1.23 %)	110,073 (3.98 %)	41.29 (99.99 %)	87 (0.00 %)	386 (0.01 %)	515 (100.00 %)	4,839,574 (46.33 %)	1,645,163 (11.88 %)	12,936,515 (41.49 %)	63 (0.00 %)	1,839,684 (4.85 %)	24,374 (0.54 %)	16,515 (0.39 %)
361	house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022) GCA_921998325.2	n/a	n/a	21,797 (2.13 %)	19,521 (1.38 %)	109,890 (4.48 %)	41.80 (99.50 %)	2 (0.00 %)	1,462 (0.50 %)	170 (100.00 %)	4,650,016 (40.74 %)	1,547,220 (3.54 %)	12,918,125 (35.45 %)	24 (0.00 %)	826,087 (2.65 %)	23,253 (0.56 %)	15,815 (0.42 %)
362	house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022) GCA_947593165.1	n/a	n/a	22,481 (1.93 %)	19,932 (1.26 %)	109,670 (4.03 %)	41.34 (100.00 %)	58 (0.00 %)	234 (0.00 %)	441 (100.00 %)	4,822,230 (45.92 %)	1,637,027 (11.19 %)	13,082,730 (41.04 %)	19 (0.00 %)	1,756,117 (4.67 %)	24,187 (0.54 %)	16,389 (0.39 %)
363	house mouse (primary hap 2023) GCA_949316315.1	n/a	n/a	22,351 (1.96 %)	19,629 (1.26 %)	n/a	41.38 (100.00 %)	0 (0 %)	101 (0.00 %)	179 (100.00 %)	4,774,018 (45.31 %)	1,620,102 (10.50 %)	13,181,250 (40.47 %)	0 (0 %)	1,650,132 (4.47 %)	23,955 (0.54 %)	16,164 (0.39 %)
364	house mouse C57BL/6J 2020 GRC GCF_000001635.27	136,224 (4.84 %)	n/a	22,409 (2.02 %)	19,480 (1.31 %)	140,725 (4.83 %)	41.67 (97.30 %)	324 (2.70 %)	334 (2.70 %)	22,273 (97.30 %)	5,361,085 (45.51 %)	1,641,063 (3.41 %)	12,722,791 (36.04 %)	1 (0.00 %)	858,983 (2.44 %)	23,794 (0.53 %)	15,980 (0.39 %)
365	house mouse C57BL_6NJ (2016) GCA_001632555.1	n/a	n/a	21,177 (2.23 %)	18,495 (1.42 %)	103,002 (4.20 %)	41.76 (82.53 %)	45,300 (3.63 %)	410,660 (17.53 %)	49,821 (96.37 %)	5,081,049 (40.22 %)	1,392,942 (2.58 %)	13,476,268 (25.21 %)	24,698 (0.96 %)	429,021 (1.56 %)	16,877 (0.39 %)	16,035 (0.36 %)
366	house mouse C57BL_6NJ (2022) GCA_921999865.2	n/a	n/a	21,817 (2.13 %)	19,349 (1.37 %)	n/a	41.79 (99.76 %)	7 (0.00 %)	1,127 (0.24 %)	214 (100.00 %)	4,661,104 (40.76 %)	1,552,079 (3.56 %)	12,953,662 (35.57 %)	8 (0.00 %)	825,187 (2.60 %)	23,204 (0.56 %)	15,812 (0.42 %)
367	humpback whale (KW2013002 2024) GCA_041834305.1	n/a	n/a	19,463 (1.32 %)	22,424 (1.19 %)	n/a	42.05 (100.00 %)	0 (0 %)	88 (0.00 %)	1,355 (100.00 %)	4,164,459 (34.02 %)	1,281,751 (18.33 %)	12,412,281 (48.28 %)	0 (0 %)	2,009,593 (5.80 %)	82,412 (1.67 %)	44,791 (0.96 %)
368	Iberian mole (v2.1 TD23 2020) GCF_014898055.3	56,986 (3.41 %)	n/a	18,431 (1.69 %)	20,317 (1.59 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	0 (0 %)	3,575 (0.11 %)	3,202 (100.00 %)	2,635,974 (23.38 %)	496,514 (1.29 %)	10,969,546 (32.61 %)	2 (0.00 %)	637,831 (2.54 %)	47,466 (2.89 %)	43,066 (2.46 %)
369	Indian false vampire GCA_004026885.1	n/a	n/a	20,067 (1.37 %)	36,544 (1.53 %)	32,548 (1.37 %)	40.84 (99.83 %)	6,266 (0.02 %)	6,266 (0.02 %)	1,909,067 (99.98 %)	4,096,409 (31.50 %)	699,311 (1.81 %)	12,307,198 (39.96 %)	15 (0.00 %)	n/a	92,830 (3.12 %)	82,461 (2.65 %)
370	Indian flying fox GCF_902729225.1	64,763 (3.85 %)	n/a	18,222 (2.01 %)	23,187 (1.82 %)	45,389 (2.18 %)	39.83 (99.10 %)	0 (0 %)	17,500 (0.90 %)	16,113 (100.00 %)	2,972,300 (34.11 %)	487,157 (1.49 %)	12,486,528 (27.37 %)	384 (0.01 %)	202,174 (1.56 %)	57,869 (3.73 %)	61,442 (3.09 %)
371	Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023) GCA_030015415.1	n/a	n/a	17,560 (2.04 %)	21,687 (1.83 %)	n/a	39.77 (100.00 %)	0 (0 %)	26 (0.00 %)	181 (100.00 %)	2,598,385 (30.48 %)	486,921 (1.41 %)	11,828,726 (27.28 %)	0 (0 %)	175,274 (0.71 %)	37,476 (5.58 %)	39,290 (5.02 %)
372	Indochinese shrew (US011 2019 Broad) GCA_004027635.1	n/a	n/a	18,870 (0.51 %)	55,636 (0.81 %)	n/a	39.81 (99.83 %)	5,267 (0.02 %)	5,267 (0.02 %)	2,420,679 (99.98 %)	4,130,068 (16.60 %)	1,663,335 (3.30 %)	18,728,711 (46.19 %)	45 (0.00 %)	n/a	31,453 (0.55 %)	25,923 (0.42 %)
373	Indus River dolphin GCA_004363435.1	n/a	n/a	24,321 (1.30 %)	47,065 (1.14 %)	n/a	41.72 (99.88 %)	11,702 (0.04 %)	11,702 (0.04 %)	1,110,492 (99.96 %)	5,093,308 (45.60 %)	845,860 (1.72 %)	13,162,111 (41.37 %)	34 (0.00 %)	n/a	68,257 (1.40 %)	49,070 (1.11 %)
374	Inner Mongolia cashmere goat (2024) GCA_041735815.1	n/a	n/a	19,123 (1.40 %)	21,508 (1.26 %)	n/a	43.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	31 (100.00 %)	3,982,368 (23.76 %)	650,129 (7.44 %)	12,858,872 (44.33 %)	0 (0 %)	2,309,715 (5.29 %)	99,144 (2.87 %)	39,833 (0.88 %)
375	intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024) GCA_043728065.1	n/a	n/a	18,239 (1.76 %)	20,378 (1.53 %)	n/a	41.40 (100.00 %)	1 (0.00 %)	37 (0.00 %)	2,195 (100.00 %)	3,438,644 (42.82 %)	584,006 (9.54 %)	12,207,998 (35.49 %)	0 (0 %)	1,679,263 (3.77 %)	34,491 (1.02 %)	29,817 (0.90 %)
376	intermediate roundleaf bat (primary hap 2023) GCA_031876335.1	n/a	n/a	19,064 (1.67 %)	20,800 (1.49 %)	n/a	41.55 (100.00 %)	0 (0 %)	119 (0.00 %)	69 (100.00 %)	3,393,548 (30.92 %)	723,545 (6.58 %)	12,073,117 (35.40 %)	0 (0 %)	1,106,960 (3.54 %)	43,736 (1.20 %)	30,847 (0.87 %)
377	jaguar (BS21 2019) GCA_004023805.1	n/a	n/a	21,431 (1.51 %)	32,835 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.89 %)	21,329 (0.09 %)	21,329 (0.09 %)	460,121 (99.91 %)	5,420,861 (43.75 %)	1,049,353 (1.93 %)	13,848,545 (34.90 %)	43 (0.00 %)	425,795 (0.77 %)	71,066 (2.37 %)	62,901 (1.89 %)
378	jaguar (hap1 2025) GCA_046562885.1	n/a	n/a	17,882 (1.68 %)	19,103 (1.41 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	0 (0 %)	140 (0.00 %)	115 (100.00 %)	4,622,385 (41.25 %)	893,297 (1.89 %)	12,851,116 (33.53 %)	1 (0.00 %)	402,314 (1.33 %)	61,319 (2.55 %)	55,085 (2.08 %)
379	jaguar (hap2 2025) GCA_046562875.1	n/a	n/a	18,867 (1.64 %)	20,784 (1.40 %)	n/a	41.76 (100.00 %)	0 (0 %)	200 (0.00 %)	85 (100.00 %)	4,977,843 (41.75 %)	982,064 (2.10 %)	13,365,332 (34.16 %)	3 (0.00 %)	459,794 (1.37 %)	66,000 (2.75 %)	59,529 (2.25 %)
380	jaguar (Sample0147 2023) GCF_028533385.1	71,578 (4.12 %)	n/a	19,122 (1.67 %)	21,950 (1.36 %)	n/a	41.58 (99.31 %)	0 (0 %)	56,371 (0.70 %)	36,243 (100.00 %)	4,552,854 (33.37 %)	897,371 (1.63 %)	13,732,912 (32.89 %)	2,743 (0.10 %)	314,574 (0.82 %)	63,777 (2.41 %)	60,478 (2.01 %)
381	jaguarundi GCF_014898765.1	72,564 (3.15 %)	n/a	18,602 (1.64 %)	20,510 (1.39 %)	n/a	41.75 (97.85 %)	0 (0 %)	42,499 (2.16 %)	10,948 (100.00 %)	5,035,745 (43.29 %)	907,329 (1.61 %)	13,590,905 (33.57 %)	2,609 (0.04 %)	574,230 (1.55 %)	69,090 (2.29 %)	60,356 (1.80 %)
382	Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U) GCF_014825515.1	48,692 (2.72 %)	n/a	19,921 (1.66 %)	23,614 (1.68 %)	39,384 (2.12 %)	41.95 (98.87 %)	0 (0 %)	110,840 (1.13 %)	56,740 (100.00 %)	2,972,388 (28.79 %)	405,474 (2.15 %)	12,458,880 (30.65 %)	8,380 (0.26 %)	388,646 (3.79 %)	61,973 (1.87 %)	54,441 (1.58 %)
383	Jamaican fruit-eating bat (2021) GCF_021234435.1	55,114 (3.18 %)	n/a	17,875 (1.68 %)	19,958 (1.66 %)	n/a	42.00 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	868 (100.00 %)	2,697,287 (28.17 %)	318,700 (0.84 %)	11,750,329 (31.61 %)	0 (0 %)	245,042 (0.98 %)	61,951 (1.93 %)	52,462 (1.61 %)
384	Japanese wild mouse (2022) GCA_921999095.2	n/a	n/a	23,292 (2.05 %)	20,114 (1.31 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	51 (0.00 %)	397 (0.00 %)	1,449 (100.00 %)	4,952,306 (42.53 %)	1,635,456 (4.60 %)	12,838,321 (38.56 %)	8 (0.00 %)	1,050,247 (2.88 %)	24,168 (0.56 %)	16,545 (0.42 %)
385	Java mouse-deer (US108 2019 Broad) GCA_004024965.1	n/a	n/a	23,081 (1.38 %)	38,181 (1.41 %)	n/a	42.73 (99.91 %)	2,829 (0.01 %)	2,829 (0.01 %)	1,159,819 (99.99 %)	4,791,310 (34.97 %)	448,498 (1.92 %)	13,175,375 (39.89 %)	11 (0.00 %)	n/a	68,778 (2.92 %)	61,444 (2.39 %)
386	killer whale (2022) GCF_937001465.1	78,479 (3.76 %)	n/a	18,710 (1.51 %)	21,101 (1.30 %)	34,448 (1.49 %)	41.91 (100.00 %)	0 (0 %)	123 (0.00 %)	448 (100.00 %)	3,955,401 (36.81 %)	844,672 (9.94 %)	12,233,568 (41.63 %)	2 (0.00 %)	1,982,992 (5.71 %)	77,307 (3.08 %)	40,935 (1.02 %)
387	killer whale (alternate hap 2022) GCA_937001455.1	n/a	n/a	14,982 (1.50 %)	19,185 (1.30 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12,410 (100.00 %)	2,752,892 (35.61 %)	589,217 (10.15 %)	8,371,032 (41.11 %)	0 (0 %)	1,464,220 (5.92 %)	57,347 (3.41 %)	30,003 (1.05 %)
388	killer whale (Morgan 2013) GCF_000331955.2	70,972 (3.55 %)	n/a	18,736 (1.86 %)	20,365 (1.48 %)	n/a	41.35 (94.82 %)	78,432 (5.20 %)	78,441 (5.20 %)	80,100 (94.80 %)	3,978,339 (43.98 %)	555,737 (1.13 %)	12,773,973 (31.51 %)	2,677 (0.03 %)	355,274 (1.15 %)	61,145 (1.59 %)	40,101 (1.20 %)
389	koala (Bilbo 61053 2022) GCA_003287225.2	n/a	n/a	17,087 (0.81 %)	14,711 (0.86 %)	n/a	39.05 (100.00 %)	0 (0 %)	669 (0.00 %)	1,246 (100.00 %)	6,280,029 (29.77 %)	1,123,294 (2.02 %)	21,796,316 (39.24 %)	2 (0.00 %)	412,593 (0.92 %)	15,957 (0.35 %)	13,996 (0.24 %)
390	koala (Bilbo 61053 2022) GCF_003287225.1	50,393 (2.58 %)	n/a	17,125 (0.85 %)	14,711 (0.86 %)	n/a	39.05 (100.00 %)	0 (0 %)	669 (0.00 %)	1,246 (100.00 %)	10,370,789 (60.23 %)	1,123,294 (2.02 %)	21,796,035 (39.24 %)	2 (0.00 %)	362,271 (0.81 %)	15,957 (0.35 %)	14,970 (0.30 %)
391	Kuhl's pipistrelle (2020) GCF_014108245.1	65,654 (3.37 %)	n/a	17,918 (1.89 %)	20,819 (1.86 %)	n/a	42.57 (99.31 %)	0 (0 %)	394 (0.69 %)	202 (100.00 %)	2,897,422 (23.58 %)	797,420 (2.76 %)	10,057,100 (34.56 %)	2 (0.00 %)	425,636 (1.52 %)	55,965 (2.99 %)	57,667 (2.01 %)
392	large flying fox GCF_000151845.1	52,243 (3.10 %)	n/a	18,454 (1.91 %)	23,631 (1.73 %)	n/a	39.82 (91.80 %)	189,339 (8.24 %)	189,340 (8.24 %)	225,433 (91.76 %)	3,117,045 (36.49 %)	504,277 (3.03 %)	13,025,556 (25.00 %)	22,188 (0.92 %)	358,468 (6.48 %)	78,404 (3.24 %)	74,747 (2.62 %)
393	large Japanese field mouse (IB14-021 2017) GCA_002335545.1	n/a	n/a	22,630 (1.74 %)	33,810 (1.26 %)	n/a	42.04 (57.78 %)	4,289,924 (42.35 %)	4,289,924 (42.35 %)	4,626,044 (57.65 %)	3,638,537 (31.76 %)	1,048,253 (1.87 %)	12,039,926 (16.61 %)	10,107 (0.44 %)	n/a	19,817 (0.34 %)	18,415 (0.32 %)
394	large tree shrew (BS70 2022) GCA_026018925.1	n/a	n/a	21,678 (1.34 %)	22,317 (1.25 %)	n/a	42.17 (100.00 %)	0 (0 %)	1,188 (0.00 %)	1,198 (100.00 %)	5,530,547 (22.20 %)	1,357,640 (10.13 %)	14,334,312 (46.09 %)	5 (0.00 %)	2,400,830 (5.08 %)	123,453 (2.17 %)	59,337 (1.38 %)
395	least weasel (hap1.1 2025) GCA_964662115.1	n/a	n/a	19,085 (1.11 %)	23,074 (1.09 %)	n/a	43.54 (99.98 %)	9 (0.00 %)	2,938 (0.02 %)	3,189 (100.00 %)	4,687,333 (25.05 %)	908,610 (10.98 %)	12,922,050 (49.64 %)	17 (0.00 %)	4,143,372 (9.39 %)	68,749 (2.22 %)	53,921 (1.35 %)
396	least weasel (hap2.1 2025) GCA_964662095.1	n/a	n/a	18,255 (1.29 %)	22,201 (1.27 %)	n/a	42.68 (99.98 %)	2,709 (0.02 %)	2,709 (0.02 %)	4,948 (99.98 %)	4,268,233 (27.47 %)	787,850 (6.40 %)	12,592,088 (42.54 %)	17 (0.00 %)	2,083,429 (5.88 %)	62,416 (2.34 %)	51,317 (1.55 %)
397	leopard (Hobbes primary hap 2022) GCF_024362965.1	70,501 (3.29 %)	n/a	18,472 (1.56 %)	20,388 (1.41 %)	n/a	41.75 (99.99 %)	0 (0 %)	335 (0.01 %)	382 (100.00 %)	4,634,038 (33.80 %)	932,991 (2.25 %)	13,686,652 (34.03 %)	1 (0.00 %)	451,937 (1.32 %)	65,793 (2.64 %)	60,846 (1.89 %)
398	leopard (Maewha 2016 refseq) GCF_001857705.1	73,279 (3.20 %)	n/a	18,881 (1.63 %)	21,010 (1.44 %)	n/a	41.71 (96.17 %)	214,953 (3.85 %)	214,953 (3.85 %)	265,330 (96.15 %)	5,247,029 (42.87 %)	1,059,446 (5.13 %)	14,265,573 (32.20 %)	28,667 (1.17 %)	525,712 (5.63 %)	77,001 (2.45 %)	66,922 (1.91 %)
399	leopard cat GCF_016509475.1	59,965 (3.05 %)	n/a	18,472 (1.65 %)	19,934 (1.38 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	39 (0.00 %)	56 (0.00 %)	123 (100.00 %)	4,978,115 (43.28 %)	901,754 (1.84 %)	13,596,535 (34.23 %)	0 (0 %)	586,248 (1.62 %)	67,390 (2.50 %)	62,344 (2.02 %)
400	Leschenault's rousette (2020) GCA_015472975.1	n/a	n/a	17,815 (2.05 %)	23,917 (1.90 %)	n/a	40.13 (99.14 %)	100,669 (0.88 %)	100,669 (0.88 %)	108,810 (99.12 %)	2,688,705 (31.20 %)	428,968 (1.19 %)	12,245,385 (26.51 %)	13 (0.00 %)	121,479 (0.56 %)	58,118 (6.81 %)	61,535 (5.42 %)
401	lesser Egyptian jerboa (2021) GCF_020740685.1	51,730 (1.99 %)	n/a	20,129 (1.24 %)	22,089 (1.24 %)	40,414 (1.76 %)	42.00 (99.52 %)	0 (0 %)	561 (0.48 %)	160 (100.00 %)	7,346,291 (41.25 %)	1,187,587 (2.92 %)	14,222,177 (44.13 %)	1 (0.00 %)	1,219,048 (2.53 %)	34,688 (0.86 %)	25,175 (0.54 %)
402	lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021) GCA_020740715.1	n/a	n/a	17,777 (1.27 %)	19,232 (1.28 %)	n/a	42.13 (92.75 %)	0 (0 %)	2,875 (7.25 %)	508 (100.00 %)	6,476,967 (33.93 %)	999,133 (2.78 %)	11,809,834 (40.52 %)	1 (0.00 %)	1,062,479 (2.36 %)	29,872 (0.82 %)	21,704 (0.51 %)
403	lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq) GCF_000280705.1	25,978 (1.44 %)	n/a	19,408 (1.38 %)	20,312 (1.35 %)	n/a	41.87 (87.17 %)	326,464 (12.87 %)	326,464 (12.87 %)	337,360 (87.13 %)	6,125,934 (38.31 %)	832,825 (1.53 %)	13,661,612 (33.98 %)	2,666 (0.03 %)	430,190 (1.14 %)	26,669 (0.59 %)	23,227 (0.47 %)
404	lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024) GCA_043880595.1	n/a	n/a	18,484 (1.87 %)	24,356 (1.84 %)	n/a	41.88 (97.91 %)	198 (0.32 %)	866 (2.09 %)	617 (99.68 %)	3,419,622 (36.65 %)	663,182 (2.53 %)	11,508,574 (30.58 %)	15 (0.00 %)	639,747 (2.02 %)	84,174 (4.85 %)	81,198 (4.01 %)
405	lesser horseshoe bat (hap1 2024) GCA_964194185.1	n/a	n/a	19,031 (1.88 %)	21,003 (1.63 %)	n/a	40.81 (99.99 %)	0 (0 %)	1,627 (0.01 %)	723 (100.00 %)	3,133,745 (33.46 %)	660,064 (3.79 %)	11,720,176 (32.32 %)	8 (0.00 %)	718,567 (2.35 %)	35,414 (1.75 %)	34,111 (1.64 %)
406	lesser horseshoe bat (hap2 2024) GCA_964194215.1	n/a	n/a	18,875 (1.72 %)	21,166 (1.58 %)	n/a	41.18 (99.99 %)	1,648 (0.01 %)	1,648 (0.01 %)	2,727 (99.99 %)	3,160,659 (34.00 %)	696,130 (6.23 %)	11,662,645 (34.26 %)	8 (0.00 %)	1,288,588 (3.71 %)	36,176 (1.80 %)	28,160 (0.89 %)
407	lesser noctule (v2 hap1 2025) GCA_964264875.2	n/a	n/a	18,342 (1.54 %)	22,974 (1.62 %)	n/a	43.04 (100.00 %)	3 (0.00 %)	302 (0.00 %)	588 (100.00 %)	4,258,096 (37.31 %)	1,289,911 (11.51 %)	9,694,758 (42.52 %)	2 (0.00 %)	1,992,418 (5.41 %)	65,974 (2.80 %)	61,273 (1.84 %)
408	lesser noctule (v2 hap2 2025) GCA_964264895.2	n/a	n/a	17,492 (1.62 %)	22,188 (1.72 %)	n/a	43.10 (100.00 %)	247 (0.00 %)	247 (0.00 %)	920 (100.00 %)	3,886,341 (36.52 %)	1,139,308 (10.89 %)	9,356,457 (40.65 %)	2 (0.00 %)	1,617,080 (4.89 %)	62,254 (3.00 %)	59,522 (1.92 %)
409	lesser panda (RP43 2017) GCA_002007465.1	n/a	n/a	19,120 (1.69 %)	20,591 (1.50 %)	n/a	41.60 (98.56 %)	137,333 (1.45 %)	137,333 (1.45 %)	148,922 (98.55 %)	4,513,888 (40.87 %)	692,778 (1.62 %)	13,691,859 (31.36 %)	3,438 (0.05 %)	680,690 (2.32 %)	64,369 (2.52 %)	63,356 (2.19 %)
410	lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq) GCF_036850995.1	53,210 (2.49 %)	n/a	18,323 (1.42 %)	21,350 (1.39 %)	n/a	41.84 (99.24 %)	0 (0 %)	573 (0.76 %)	168 (100.00 %)	4,224,344 (28.69 %)	1,030,576 (2.60 %)	12,591,989 (42.30 %)	1 (0.00 %)	1,128,543 (2.95 %)	98,189 (2.06 %)	48,427 (1.15 %)
411	lion GCF_018350215.1	67,745 (2.86 %)	n/a	17,956 (1.69 %)	19,033 (1.40 %)	61,242 (3.04 %)	41.71 (100.00 %)	45 (0.00 %)	55 (0.00 %)	99 (100.00 %)	4,666,951 (42.23 %)	889,987 (1.87 %)	13,151,686 (33.40 %)	1 (0.00 %)	394,792 (1.11 %)	62,675 (2.56 %)	59,062 (2.11 %)
412	little brown bat GCF_000147115.1	50,660 (2.76 %)	n/a	19,314 (1.86 %)	22,683 (1.70 %)	n/a	42.50 (96.66 %)	61,131 (3.35 %)	61,131 (3.35 %)	72,785 (96.65 %)	3,682,263 (37.05 %)	634,854 (2.15 %)	10,841,759 (33.45 %)	7 (0.00 %)	404,463 (1.53 %)	57,630 (1.79 %)	51,011 (1.50 %)
413	little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022) GCA_024363435.1	n/a	n/a	19,150 (1.52 %)	23,435 (1.64 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	0 (0 %)	229 (0.00 %)	718 (100.00 %)	n/a	1,051,300 (12.43 %)	9,858,628 (43.20 %)	3 (0.00 %)	1,828,018 (5.83 %)	48,101 (2.62 %)	48,908 (1.62 %)
414	little pocket mouse (longimembris primary hap 2022) GCA_024363575.1	n/a	n/a	19,760 (1.50 %)	24,317 (1.63 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	0 (0 %)	215 (0.00 %)	1,135 (100.00 %)	3,913,744 (28.43 %)	1,095,577 (12.70 %)	10,273,833 (43.74 %)	2 (0.00 %)	1,919,880 (5.85 %)	49,636 (2.61 %)	49,755 (1.59 %)
415	little tube-nosed bat GCA_004026665.1	n/a	n/a	22,009 (1.26 %)	45,725 (1.35 %)	n/a	43.80 (99.90 %)	6,795 (0.03 %)	6,795 (0.03 %)	886,972 (99.97 %)	3,372,804 (23.57 %)	1,014,476 (3.00 %)	11,948,592 (41.18 %)	29 (0.00 %)	n/a	71,530 (2.05 %)	53,483 (1.43 %)
416	long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq) GCF_963455315.2	61,447 (2.80 %)	n/a	18,725 (1.51 %)	20,946 (1.39 %)	n/a	42.38 (99.99 %)	1,084 (0.01 %)	1,084 (0.01 %)	2,076 (99.99 %)	4,125,452 (35.62 %)	1,577,896 (12.03 %)	12,347,170 (42.01 %)	10 (0.00 %)	1,284,155 (3.89 %)	71,822 (5.51 %)	41,663 (1.04 %)
417	long-finned pilot whale (X-22926-18 2019) GCF_006547405.1	66,117 (3.28 %)	n/a	18,772 (1.80 %)	21,031 (1.46 %)	33,672 (1.78 %)	41.29 (99.58 %)	14,583 (0.42 %)	14,859 (0.42 %)	20,999 (99.58 %)	3,962,125 (45.58 %)	557,247 (1.11 %)	12,616,535 (34.70 %)	643 (0.01 %)	404,788 (1.24 %)	62,905 (1.69 %)	41,085 (1.25 %)
418	long-footed potoroo (2021) GCA_904812075.1	n/a	n/a	278 (19.06 %)	223 (16.20 %)	n/a	51.14 (99.50 %)	0 (0 %)	n/a	1,479 (100.00 %)	194 (1.83 %)	54 (0.32 %)	2,088 (5.90 %)	0 (0 %)	9 (0.15 %)	51 (2.47 %)	46 (2.25 %)
419	long-tailed chinchilla GCF_000276665.1	54,854 (2.98 %)	n/a	18,096 (1.59 %)	19,514 (1.52 %)	n/a	41.06 (95.56 %)	78,817 (4.46 %)	78,817 (4.46 %)	81,656 (95.54 %)	4,018,866 (30.94 %)	607,082 (1.15 %)	13,528,234 (28.15 %)	1,183 (0.02 %)	162,447 (0.63 %)	46,931 (1.25 %)	45,334 (1.13 %)
420	long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad) GCA_004027375.1	n/a	n/a	19,208 (1.99 %)	31,180 (1.92 %)	n/a	39.56 (99.97 %)	2,056 (0.01 %)	2,056 (0.01 %)	174,041 (99.99 %)	2,893,453 (32.61 %)	597,516 (1.76 %)	12,093,608 (28.14 %)	6 (0.00 %)	n/a	63,015 (4.70 %)	62,530 (4.18 %)
421	Lowland paca GCA_004365215.1	n/a	n/a	21,953 (0.62 %)	56,356 (0.80 %)	n/a	40.83 (99.78 %)	3,060 (0.01 %)	3,060 (0.01 %)	3,771,510 (99.99 %)	5,892,507 (29.20 %)	802,811 (1.38 %)	18,630,883 (38.61 %)	101 (0.00 %)	n/a	61,715 (0.94 %)	53,212 (0.77 %)
422	Malayan pangolin (MJ-LG 2024) GCF_040802235.1	87,404 (4.24 %)	n/a	18,382 (1.54 %)	19,802 (1.30 %)	n/a	41.03 (100.00 %)	0 (0 %)	90 (0.00 %)	63 (100.00 %)	3,146,889 (38.39 %)	384,539 (2.15 %)	12,642,995 (34.68 %)	1 (0.00 %)	568,487 (1.95 %)	48,454 (1.30 %)	44,955 (1.18 %)
423	Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq) GCF_001685135.1	48,591 (2.76 %)	n/a	19,458 (1.57 %)	24,783 (1.38 %)	41,272 (1.95 %)	40.78 (92.27 %)	0 (0 %)	984,658 (7.81 %)	80,670 (100.00 %)	3,064,599 (35.21 %)	866,309 (3.08 %)	13,310,859 (28.76 %)	389,500 (1.56 %)	884,203 (3.10 %)	35,558 (0.84 %)	33,754 (0.78 %)
424	Malayan pangolin YNU ManJav 2.0 GCF_014570535.1	68,043 (3.50 %)	n/a	18,167 (1.72 %)	20,453 (1.54 %)	n/a	40.83 (91.78 %)	0 (0 %)	57,746 (8.23 %)	17,969 (100.00 %)	2,864,567 (34.23 %)	277,996 (1.69 %)	12,659,207 (25.72 %)	610 (0.01 %)	258,572 (5.38 %)	33,486 (1.00 %)	32,201 (0.94 %)
425	marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025) GCA_048126345.1	n/a	n/a	25,281 (0.80 %)	18,740 (0.87 %)	n/a	37.80 (99.99 %)	196 (0.01 %)	196 (0.01 %)	889 (99.99 %)	6,538,990 (26.08 %)	1,450,668 (2.40 %)	21,374,371 (47.19 %)	1 (0.00 %)	1,242,479 (2.55 %)	17,923 (0.30 %)	14,429 (0.21 %)
426	Masai giraffe (MA1 2016 Penn St) GCA_001651235.1	n/a	n/a	20,950 (1.52 %)	28,854 (1.33 %)	n/a	41.39 (96.50 %)	257,672 (3.48 %)	257,672 (3.48 %)	770,838 (96.52 %)	5,502,479 (43.94 %)	531,418 (2.64 %)	13,936,018 (36.18 %)	31,941 (0.52 %)	748,633 (4.02 %)	40,504 (1.02 %)	38,345 (0.94 %)
427	meadow jumping mouse GCA_004024765.1	n/a	n/a	22,236 (1.08 %)	44,719 (1.21 %)	n/a	42.31 (99.88 %)	7,610 (0.03 %)	7,610 (0.03 %)	1,165,710 (99.97 %)	6,135,446 (33.31 %)	1,525,146 (3.34 %)	13,854,475 (39.91 %)	38 (0.00 %)	n/a	26,633 (0.68 %)	21,059 (0.49 %)
428	meadow vole (hap1 2024 genbank) GCA_037038515.1	n/a	n/a	19,134 (1.78 %)	20,672 (1.55 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	0 (0 %)	60 (0.00 %)	181 (100.00 %)	4,818,689 (41.90 %)	962,362 (4.16 %)	12,161,222 (34.42 %)	0 (0 %)	1,559,409 (4.65 %)	23,781 (0.74 %)	19,793 (0.55 %)
429	meadow vole (hap1 2024 refseq) GCF_037038515.1	56,969 (2.88 %)	n/a	19,974 (1.74 %)	20,672 (1.55 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	0 (0 %)	60 (0.00 %)	180 (100.00 %)	4,116,239 (33.62 %)	962,362 (4.16 %)	12,161,153 (34.42 %)	0 (0 %)	1,559,409 (4.65 %)	23,781 (0.74 %)	17,740 (0.46 %)
430	meadow vole (hap2 2024) GCA_037039175.1	n/a	n/a	19,001 (1.82 %)	20,271 (1.68 %)	n/a	42.58 (100.00 %)	0 (0 %)	53 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,141,368 (21.37 %)	898,900 (4.24 %)	11,475,531 (32.14 %)	0 (0 %)	862,918 (2.64 %)	22,186 (0.75 %)	16,985 (0.48 %)
431	meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq) GCF_006229205.1	58,806 (2.67 %)	n/a	19,009 (1.64 %)	19,088 (1.36 %)	n/a	41.68 (99.72 %)	0 (0 %)	65,245 (0.28 %)	63,791 (100.00 %)	4,564,931 (40.13 %)	634,179 (1.21 %)	13,631,635 (32.17 %)	5,134 (0.09 %)	236,044 (0.75 %)	64,858 (2.22 %)	63,010 (1.87 %)
432	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022) GCA_024711525.1	n/a	n/a	18,555 (1.22 %)	24,508 (1.35 %)	n/a	42.04 (100.00 %)	0 (0 %)	181 (0.00 %)	3,482 (100.00 %)	6,419,007 (53.84 %)	1,384,128 (15.63 %)	11,486,822 (50.51 %)	2 (0.00 %)	4,107,493 (7.03 %)	38,521 (1.60 %)	33,680 (1.03 %)
433	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022) GCA_024711535.1	n/a	n/a	21,281 (1.16 %)	28,592 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	0 (0 %)	182 (0.00 %)	4,354 (100.00 %)	4,378,955 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,786 (51.96 %)	1 (0.00 %)	5,252,588 (7.78 %)	46,167 (1.71 %)	38,895 (0.74 %)
434	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022) GCF_024711535.1	68,331 (2.37 %)	n/a	21,280 (1.16 %)	28,582 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	182 (0.00 %)	182 (0.00 %)	4,535 (100.00 %)	4,378,949 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,725 (51.96 %)	1 (0.00 %)	5,252,586 (7.78 %)	46,167 (1.71 %)	38,895 (0.74 %)
435	Merriam's long-tongued bat (hap1 2024) GCA_039655065.1	n/a	n/a	18,172 (1.67 %)	20,736 (1.60 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	0 (0 %)	47 (0.00 %)	82 (100.00 %)	2,998,913 (29.48 %)	418,833 (1.07 %)	11,783,716 (32.96 %)	1 (0.00 %)	317,774 (1.27 %)	65,956 (4.38 %)	57,781 (3.83 %)
436	Merriam's long-tongued bat (hap2 2024) GCA_039656995.1	n/a	n/a	18,105 (1.68 %)	20,751 (1.60 %)	n/a	42.18 (100.00 %)	0 (0 %)	45 (0.00 %)	71 (100.00 %)	2,994,788 (29.48 %)	415,375 (1.07 %)	11,752,432 (32.88 %)	3 (0.00 %)	316,278 (1.25 %)	65,597 (4.38 %)	57,841 (3.85 %)
437	mesic four-striped grass rat (FMNH 192475 2021) GCA_019844195.1	n/a	n/a	18,926 (2.00 %)	20,713 (1.46 %)	n/a	41.06 (99.08 %)	121,340 (0.94 %)	121,340 (0.94 %)	152,293 (99.06 %)	6,081,188 (43.08 %)	1,497,646 (3.55 %)	13,086,584 (30.02 %)	5,768 (0.04 %)	350,470 (0.92 %)	15,700 (0.46 %)	14,500 (0.42 %)
438	Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq) GCF_048164855.1	112,768 (4.40 %)	n/a	19,582 (1.52 %)	20,911 (1.39 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	0 (0 %)	167 (0.00 %)	249 (100.00 %)	4,598,813 (31.70 %)	1,102,136 (4.40 %)	13,591,364 (35.18 %)	1 (0.00 %)	1,132,845 (2.70 %)	53,470 (2.24 %)	48,664 (1.52 %)
439	Mexican gray wolf (hap2 2025) GCA_048164845.1	n/a	n/a	18,738 (1.56 %)	19,759 (1.41 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	0 (0 %)	124 (0.00 %)	155 (100.00 %)	4,265,479 (32.40 %)	1,030,876 (4.11 %)	12,818,772 (34.22 %)	0 (0 %)	1,040,160 (2.59 %)	50,269 (2.22 %)	46,611 (1.56 %)
440	minke whale (2013 refseq) GCF_000493695.1	42,553 (2.38 %)	n/a	19,159 (1.73 %)	18,656 (1.42 %)	n/a	40.94 (94.06 %)	173,296 (5.96 %)	173,296 (5.96 %)	184,072 (94.04 %)	n/a	573,951 (1.48 %)	13,504,347 (30.96 %)	211 (0.02 %)	317,691 (1.50 %)	65,448 (1.38 %)	43,887 (1.02 %)
441	minke whale (alternate hap 2023) GCA_950005055.1	n/a	n/a	20,412 (1.46 %)	27,421 (1.34 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	21,272 (100.00 %)	3,811,435 (36.24 %)	959,712 (10.27 %)	12,159,896 (41.30 %)	0 (0 %)	1,298,777 (4.12 %)	69,852 (1.62 %)	42,454 (1.09 %)
442	minke whale (primary hap 2023 refseq) GCF_949987535.1	61,711 (2.51 %)	n/a	19,550 (1.49 %)	21,499 (1.26 %)	n/a	41.55 (99.99 %)	0 (0 %)	1,177 (0.01 %)	1,374 (100.00 %)	4,006,927 (35.92 %)	1,058,105 (12.08 %)	12,708,103 (42.66 %)	4 (0.00 %)	1,500,515 (4.32 %)	72,756 (1.59 %)	44,094 (1.06 %)
443	Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.) GCF_002204375.1	40,359 (2.29 %)	n/a	21,215 (1.83 %)	24,305 (1.47 %)	n/a	42.09 (95.23 %)	0 (0 %)	91,601 (4.78 %)	68,793 (100.00 %)	4,821,343 (37.74 %)	940,776 (1.82 %)	13,848,274 (31.31 %)	11,561 (0.34 %)	205,312 (0.64 %)	24,154 (0.74 %)	22,829 (0.67 %)
444	Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI) GCA_008131255.1	n/a	n/a	19,952 (1.59 %)	23,462 (1.36 %)	n/a	41.98 (99.01 %)	103,843 (0.97 %)	103,843 (0.97 %)	412,933 (99.03 %)	5,009,454 (0.00 %)	1,042,929 (2.52 %)	14,121,194 (34.63 %)	5,269 (0.12 %)	n/a	26,044 (0.71 %)	23,140 (0.56 %)
445	Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023) GCF_030254825.1	65,502 (2.97 %)	n/a	19,045 (1.53 %)	20,203 (1.29 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	0 (0 %)	53 (0.00 %)	193 (100.00 %)	4,477,607 (37.21 %)	1,124,432 (5.22 %)	13,244,320 (39.20 %)	0 (0 %)	1,187,344 (2.95 %)	25,300 (0.76 %)	21,781 (0.54 %)
446	monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021) GCA_019395325.1	n/a	n/a	16,419 (0.77 %)	17,219 (0.89 %)	n/a	39.03 (100.00 %)	33 (0.00 %)	33 (0.00 %)	9,959 (100.00 %)	6,332,360 (29.69 %)	1,065,454 (2.09 %)	17,908,986 (42.25 %)	0 (0 %)	1,232,672 (2.38 %)	13,856 (0.35 %)	11,596 (0.23 %)
447	monito del monte (primary hap 2021 refseq) GCF_019393635.1	47,034 (2.02 %)	n/a	18,399 (0.80 %)	15,519 (0.85 %)	n/a	39.11 (99.91 %)	0 (0 %)	260 (0.09 %)	17 (100.00 %)	9,107,968 (41.08 %)	1,249,635 (2.12 %)	21,135,324 (42.80 %)	0 (0 %)	1,546,314 (2.55 %)	16,598 (0.36 %)	13,911 (0.23 %)
448	Montane guinea pig GCA_004027695.1	n/a	n/a	20,064 (1.06 %)	31,321 (1.18 %)	39,905 (1.42 %)	40.09 (99.88 %)	11,321 (0.04 %)	11,321 (0.04 %)	1,379,500 (99.96 %)	4,730,634 (30.02 %)	1,583,664 (6.57 %)	15,806,339 (40.40 %)	31 (0.00 %)	n/a	37,371 (0.76 %)	27,339 (0.57 %)
449	moose/elk (2024) GCA_964270355.1	n/a	n/a	19,816 (1.60 %)	22,341 (1.44 %)	n/a	41.70 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	1,737 (100.00 %)	3,099,775 (24.20 %)	406,796 (2.52 %)	13,117,056 (38.34 %)	0 (0 %)	916,612 (2.40 %)	50,644 (1.33 %)	42,520 (1.04 %)
450	moose/elk (AALL_1980 2023) GCA_015832495.2	n/a	n/a	19,116 (1.66 %)	21,184 (1.45 %)	n/a	41.55 (95.50 %)	71,769 (4.51 %)	71,769 (4.51 %)	77,708 (95.49 %)	3,026,678 (23.77 %)	373,266 (0.91 %)	13,167,376 (34.08 %)	1,299 (0.05 %)	343,983 (1.04 %)	44,302 (1.21 %)	41,306 (1.01 %)
451	moose/elk (MIG12-28694850 2019) GCA_007570765.1	n/a	n/a	21,375 (1.65 %)	26,769 (1.42 %)	n/a	41.64 (92.66 %)	83,533 (7.35 %)	83,831 (7.35 %)	131,373 (92.65 %)	5,022,053 (43.27 %)	384,658 (1.22 %)	13,422,381 (34.52 %)	2,907 (0.05 %)	424,593 (1.20 %)	49,216 (1.18 %)	45,847 (1.08 %)
452	Mount Data shrew rat (FMNH 198792 2021) GCA_019843965.1	n/a	n/a	18,266 (2.07 %)	18,451 (1.45 %)	n/a	41.51 (99.45 %)	47,796 (0.55 %)	47,796 (0.55 %)	61,989 (99.45 %)	5,656,524 (42.94 %)	1,120,762 (2.44 %)	12,212,163 (29.98 %)	6,957 (0.06 %)	313,446 (0.95 %)	15,204 (0.46 %)	14,180 (0.42 %)
453	mountain beaver GCA_004027875.1	n/a	n/a	22,428 (1.10 %)	38,670 (1.12 %)	n/a	40.58 (99.89 %)	7,253 (0.02 %)	7,253 (0.02 %)	1,286,779 (99.98 %)	5,859,004 (32.29 %)	914,052 (2.37 %)	16,249,666 (38.21 %)	103 (0.00 %)	n/a	39,133 (0.76 %)	26,371 (0.54 %)
454	muskrat GCA_004026605.1	n/a	n/a	22,540 (1.52 %)	32,136 (1.35 %)	n/a	41.59 (99.93 %)	6,243 (0.02 %)	6,243 (0.02 %)	571,599 (99.98 %)	4,437,736 (28.49 %)	922,826 (2.38 %)	13,945,732 (35.23 %)	31 (0.00 %)	n/a	19,876 (0.50 %)	16,936 (0.41 %)
455	naked mole-rat (2022) GCA_944319725.1	n/a	n/a	20,755 (1.51 %)	20,024 (1.35 %)	n/a	39.98 (99.96 %)	0 (0 %)	2,332 (0.04 %)	264 (100.00 %)	3,593,261 (30.76 %)	529,045 (1.14 %)	13,294,831 (36.07 %)	19 (0.00 %)	314,025 (1.11 %)	32,235 (0.93 %)	30,323 (0.79 %)
456	naked mole-rat (mHap 2024) GCA_964261345.1	n/a	n/a	19,980 (1.56 %)	19,365 (1.33 %)	n/a	39.96 (99.93 %)	191 (0.00 %)	2,238 (0.07 %)	263 (100.00 %)	5,099,610 (44.65 %)	523,459 (1.13 %)	13,036,461 (35.91 %)	17 (0.00 %)	306,657 (1.09 %)	31,614 (0.92 %)	29,594 (0.84 %)
457	naked mole-rat (pHap 2024) GCA_964261355.1	n/a	n/a	19,953 (1.57 %)	19,579 (1.35 %)	n/a	39.98 (99.91 %)	189 (0.00 %)	2,381 (0.09 %)	264 (100.00 %)	5,097,978 (44.61 %)	523,861 (1.13 %)	13,168,788 (36.09 %)	19 (0.00 %)	308,689 (1.11 %)	31,789 (0.93 %)	29,704 (0.84 %)
458	naked mole-rat (MEF-2018 2020) GCA_014060925.1	n/a	n/a	22,011 (1.30 %)	21,392 (1.22 %)	n/a	40.13 (95.11 %)	139,535 (4.91 %)	139,535 (4.91 %)	148,797 (95.09 %)	4,885,102 (35.91 %)	654,418 (1.90 %)	16,401,315 (34.21 %)	228 (0.03 %)	1,754,699 (7.39 %)	40,717 (0.98 %)	38,057 (0.81 %)
459	naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq) GCF_000247695.1	74,587 (3.56 %)	n/a	21,332 (1.74 %)	20,861 (1.51 %)	n/a	40.21 (88.43 %)	110,424 (11.59 %)	110,424 (11.59 %)	114,653 (88.41 %)	4,179,991 (32.69 %)	484,933 (0.92 %)	13,672,561 (27.63 %)	595 (0.01 %)	103,053 (0.44 %)	31,950 (0.88 %)	31,055 (0.81 %)
460	narwhal (Baffin Bay 2019) GCF_005190385.1	51,639 (2.71 %)	n/a	18,741 (1.78 %)	20,365 (1.40 %)	33,148 (1.79 %)	41.22 (99.52 %)	0 (0 %)	18,323 (0.49 %)	6,972 (100.00 %)	4,011,742 (43.97 %)	565,367 (1.22 %)	12,720,018 (34.85 %)	1,797 (0.02 %)	430,336 (1.30 %)	60,492 (1.58 %)	43,582 (1.25 %)
461	narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022) GCA_005190385.3	n/a	n/a	18,681 (1.79 %)	19,816 (1.40 %)	n/a	41.26 (100.00 %)	0 (0 %)	313 (0.00 %)	101 (100.00 %)	3,618,235 (37.24 %)	612,229 (1.52 %)	12,641,632 (35.02 %)	0 (0 %)	550,897 (1.69 %)	60,518 (1.78 %)	57,655 (1.47 %)
462	Natal long-fingered bat GCF_001595765.1	32,050 (3.03 %)	n/a	18,015 (2.17 %)	18,293 (1.87 %)	n/a	42.07 (96.24 %)	0 (0 %)	204,616 (3.79 %)	1,269 (100.00 %)	2,565,457 (28.95 %)	376,532 (1.91 %)	10,427,823 (26.35 %)	3,320 (0.15 %)	203,691 (1.83 %)	63,261 (2.07 %)	59,010 (1.80 %)
463	Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025) GCA_964656225.1	n/a	n/a	18,001 (1.75 %)	21,219 (1.77 %)	n/a	42.26 (99.98 %)	0 (0 %)	1,836 (0.02 %)	1,062 (100.00 %)	3,664,854 (32.90 %)	906,692 (8.55 %)	10,164,440 (37.98 %)	12 (0.00 %)	783,617 (2.68 %)	56,705 (2.75 %)	55,975 (1.86 %)
464	Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025) GCA_964656075.1	n/a	n/a	17,899 (1.71 %)	20,808 (1.69 %)	n/a	42.15 (99.98 %)	1,832 (0.02 %)	1,832 (0.02 %)	2,485 (99.98 %)	3,637,576 (31.92 %)	930,013 (11.25 %)	9,967,930 (39.61 %)	9 (0.00 %)	910,240 (3.07 %)	56,237 (2.62 %)	55,739 (1.82 %)
465	Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024) GCA_963693515.1	n/a	19,038 (1.68 %)	17,944 (1.86 %)	20,545 (1.83 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	1 (0.00 %)	263 (0.00 %)	154 (100.00 %)	3,628,328 (34.57 %)	838,723 (4.04 %)	10,155,601 (35.22 %)	1 (0.00 %)	545,765 (1.88 %)	56,332 (2.92 %)	56,107 (1.97 %)
466	Natterer's bat (hap1.2 2025) GCA_964212035.2	n/a	n/a	19,475 (1.82 %)	22,424 (1.68 %)	n/a	43.15 (100.00 %)	0 (0 %)	225 (0.00 %)	212 (100.00 %)	3,841,654 (38.99 %)	801,041 (5.78 %)	10,278,311 (38.66 %)	2 (0.00 %)	750,791 (2.61 %)	64,639 (2.57 %)	58,753 (2.26 %)
467	Natterer's bat (hap2.2 2025) GCA_964212025.2	n/a	n/a	18,368 (1.91 %)	21,701 (1.80 %)	n/a	43.27 (100.00 %)	136 (0.00 %)	136 (0.00 %)	309 (100.00 %)	3,509,151 (38.16 %)	704,537 (5.21 %)	9,806,703 (36.74 %)	8 (0.00 %)	600,350 (2.27 %)	61,004 (2.65 %)	56,443 (2.40 %)
468	neotropical fruit bat GCF_014824575.2	49,109 (2.78 %)	n/a	17,703 (1.63 %)	19,389 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	0 (0 %)	38,675 (0.21 %)	26,068 (100.00 %)	2,862,405 (29.31 %)	366,960 (1.48 %)	11,796,203 (31.27 %)	105 (0.00 %)	330,211 (1.83 %)	59,091 (1.70 %)	48,137 (1.34 %)
469	Nilgiri tahr GCA_004026825.1	n/a	n/a	22,735 (1.44 %)	34,961 (1.27 %)	n/a	42.37 (99.93 %)	10,387 (0.04 %)	10,387 (0.04 %)	479,550 (99.96 %)	5,793,761 (48.50 %)	535,297 (1.34 %)	13,378,352 (42.46 %)	61 (0.00 %)	n/a	57,653 (1.29 %)	42,256 (1.01 %)
470	nine-banded armadillo (v2 hap1 2023) GCA_030445055.2	n/a	n/a	19,350 (1.07 %)	22,207 (1.07 %)	n/a	40.97 (99.27 %)	0 (0 %)	823 (0.73 %)	588 (100.00 %)	4,330,716 (32.85 %)	661,966 (1.52 %)	18,302,021 (42.22 %)	5 (0.00 %)	542,125 (1.36 %)	130,245 (2.79 %)	70,861 (1.76 %)
471	nine-banded armadillo (v2 hap2 2023) GCF_030445035.2	72,174 (2.47 %)	n/a	21,051 (1.11 %)	24,418 (1.07 %)	n/a	41.00 (99.67 %)	0 (0 %)	793 (0.33 %)	546 (100.00 %)	5,412,063 (53.31 %)	738,320 (2.02 %)	19,755,423 (43.69 %)	4 (0.00 %)	736,184 (1.61 %)	142,597 (2.85 %)	85,791 (2.07 %)
472	nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor) GCF_000208655.3	46,110 (1.87 %)	n/a	20,820 (1.08 %)	25,226 (1.08 %)	n/a	40.77 (90.89 %)	268,408 (9.13 %)	268,437 (9.13 %)	314,788 (90.87 %)	4,552,770 (34.01 %)	651,225 (1.26 %)	19,266,969 (38.27 %)	239 (0.00 %)	482,237 (1.17 %)	139,490 (2.47 %)	79,407 (1.60 %)
473	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022) GCA_026167925.1	n/a	n/a	19,342 (1.57 %)	20,947 (1.48 %)	n/a	42.40 (100.00 %)	0 (0 %)	229 (0.00 %)	1,006 (100.00 %)	4,161,568 (23.13 %)	1,278,205 (8.22 %)	13,148,019 (37.60 %)	1 (0.00 %)	1,208,815 (3.32 %)	23,523 (0.71 %)	19,170 (0.46 %)
474	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022) GCA_026229955.1	n/a	n/a	19,700 (1.54 %)	22,354 (1.46 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	244 (0.00 %)	244 (0.00 %)	2,082 (100.00 %)	6,089,884 (47.99 %)	1,358,786 (9.39 %)	13,799,349 (39.08 %)	3 (0.00 %)	1,511,691 (3.84 %)	24,733 (0.70 %)	22,588 (0.58 %)
475	North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023) GCA_028500835.1	n/a	n/a	15,210 (1.55 %)	18,316 (1.43 %)	n/a	41.06 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	5,051 (100.00 %)	3,911,633 (40.55 %)	565,546 (1.54 %)	10,853,726 (32.61 %)	0 (0 %)	378,575 (1.36 %)	40,925 (1.35 %)	26,837 (0.96 %)
476	North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023) GCA_028451465.1	n/a	n/a	18,102 (1.58 %)	20,073 (1.40 %)	n/a	41.03 (100.00 %)	0 (0 %)	277 (0.00 %)	116 (100.00 %)	4,958,089 (41.64 %)	719,163 (1.59 %)	13,867,662 (33.89 %)	7 (0.00 %)	506,727 (1.48 %)	51,299 (1.36 %)	33,440 (0.96 %)
477	North Atlantic right whale (hap1 2023) GCA_028571275.1	n/a	n/a	18,699 (1.61 %)	20,354 (1.28 %)	n/a	41.64 (99.84 %)	0 (0 %)	385 (0.16 %)	947 (100.00 %)	3,815,900 (43.46 %)	718,935 (11.38 %)	11,928,210 (42.25 %)	2 (0.00 %)	1,117,252 (3.44 %)	85,881 (1.90 %)	41,289 (1.19 %)
478	North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq) GCF_028564815.1	49,646 (1.86 %)	n/a	19,562 (1.46 %)	21,631 (1.25 %)	n/a	41.69 (99.83 %)	0 (0 %)	367 (0.17 %)	789 (100.00 %)	1,368,536 (2.24 %)	841,303 (13.08 %)	12,527,582 (43.92 %)	11 (0.00 %)	1,404,448 (3.90 %)	94,259 (1.92 %)	41,005 (0.96 %)
479	North Pacific right whale GCA_004363455.1	n/a	n/a	23,145 (1.43 %)	38,161 (1.21 %)	n/a	41.15 (99.88 %)	7,094 (0.03 %)	7,094 (0.03 %)	1,361,057 (99.97 %)	5,039,622 (45.69 %)	694,986 (1.31 %)	14,063,101 (40.51 %)	73 (0.00 %)	n/a	74,800 (1.52 %)	49,455 (1.20 %)
480	northern American river otter GCF_010015895.1	53,945 (2.18 %)	n/a	18,974 (1.68 %)	21,247 (1.45 %)	n/a	41.41 (99.58 %)	6,928 (0.42 %)	7,620 (0.42 %)	13,541 (99.58 %)	4,538,847 (41.18 %)	685,281 (1.20 %)	13,840,953 (32.61 %)	360 (0.01 %)	364,620 (0.96 %)	53,559 (1.88 %)	52,003 (1.68 %)
481	northern bat (alternate hap 2023) GCA_951640545.1	n/a	n/a	18,343 (1.80 %)	23,253 (1.77 %)	n/a	43.55 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	4,899 (100.00 %)	1,174,241 (2.96 %)	825,170 (5.11 %)	9,889,579 (36.12 %)	0 (0 %)	598,356 (2.10 %)	76,164 (3.52 %)	59,778 (2.27 %)
482	northern bat (primary hap 2023) GCA_951640355.1	n/a	n/a	18,636 (1.75 %)	21,446 (1.68 %)	n/a	43.32 (99.99 %)	0 (0 %)	1,423 (0.01 %)	207 (100.00 %)	1,259,729 (2.95 %)	905,676 (6.25 %)	10,554,535 (38.21 %)	3 (0.00 %)	780,081 (2.54 %)	77,656 (3.27 %)	60,964 (2.14 %)
483	northern black mastiff bat (mMolNig1 2022) GCA_026936385.1	n/a	n/a	18,924 (1.53 %)	22,934 (1.58 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	0 (0 %)	199 (0.00 %)	146 (100.00 %)	3,850,624 (31.21 %)	648,359 (3.76 %)	11,788,702 (39.25 %)	2 (0.00 %)	811,589 (2.31 %)	85,908 (2.60 %)	73,781 (1.91 %)
484	northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024) GCA_039880945.1	n/a	n/a	18,933 (1.44 %)	23,629 (1.50 %)	n/a	42.60 (100.00 %)	0 (0 %)	113 (0.00 %)	366 (100.00 %)	4,027,155 (30.73 %)	712,278 (5.22 %)	12,003,034 (41.58 %)	3 (0.00 %)	975,691 (2.71 %)	96,116 (3.02 %)	75,017 (1.84 %)
485	northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024) GCA_039880925.1	n/a	n/a	18,305 (1.49 %)	22,534 (1.56 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	0 (0 %)	80 (0.00 %)	282 (100.00 %)	3,783,543 (30.10 %)	656,592 (4.68 %)	11,353,707 (40.26 %)	0 (0 %)	877,118 (2.58 %)	92,041 (3.01 %)	72,323 (1.87 %)
486	northern bottlenose whale (alternate hap 2023) GCA_949752845.1	n/a	n/a	19,537 (1.44 %)	27,826 (1.30 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	23,401 (100.00 %)	3,634,923 (35.56 %)	672,860 (11.00 %)	11,175,398 (41.72 %)	0 (0 %)	1,941,411 (5.36 %)	62,007 (1.94 %)	36,247 (0.95 %)
487	northern bottlenose whale (primary hap 2023) GCA_949752795.1	n/a	n/a	19,073 (1.44 %)	20,821 (1.21 %)	n/a	41.81 (99.99 %)	0 (0 %)	1,098 (0.01 %)	757 (100.00 %)	3,997,911 (34.76 %)	769,275 (14.94 %)	12,133,820 (44.83 %)	6 (0.00 %)	3,171,972 (7.30 %)	67,258 (2.00 %)	38,513 (0.89 %)
488	northern elephant seal (BS05 2019 Broad) GCA_004023865.1	n/a	n/a	22,834 (1.54 %)	36,083 (1.32 %)	n/a	41.52 (99.94 %)	9,483 (0.04 %)	9,483 (0.04 %)	330,739 (99.96 %)	4,849,944 (43.83 %)	600,306 (1.16 %)	13,420,049 (34.43 %)	55 (0.00 %)	452,384 (1.15 %)	57,236 (1.62 %)	53,204 (1.43 %)
489	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank) GCA_029215605.1	n/a	n/a	19,278 (1.60 %)	19,908 (1.39 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	98 (0.00 %)	596 (100.00 %)	4,348,333 (34.40 %)	621,985 (2.21 %)	13,251,768 (35.32 %)	0 (0 %)	811,715 (2.28 %)	69,898 (2.38 %)	44,044 (1.16 %)
490	Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq) GCF_029215605.1	74,106 (3.88 %)	n/a	19,277 (1.60 %)	20,000 (1.36 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	98 (0.00 %)	595 (100.00 %)	4,348,327 (34.40 %)	621,980 (2.21 %)	13,251,706 (35.32 %)	0 (0 %)	811,710 (2.28 %)	69,897 (2.38 %)	44,044 (1.16 %)
491	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023) GCA_029215635.1	n/a	n/a	19,340 (1.59 %)	19,732 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	60 (0.00 %)	60 (0.00 %)	482 (100.00 %)	4,365,070 (34.26 %)	627,639 (2.43 %)	13,174,494 (35.47 %)	2 (0.00 %)	866,044 (2.39 %)	74,314 (2.49 %)	44,405 (1.17 %)
492	northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022) GCF_021288785.2	53,819 (3.32 %)	n/a	20,099 (1.75 %)	20,957 (1.35 %)	n/a	41.51 (99.35 %)	0 (0 %)	39,936 (0.65 %)	142,455 (100.00 %)	4,368,400 (33.93 %)	588,877 (1.19 %)	13,745,426 (32.96 %)	2,726 (0.09 %)	n/a	52,064 (1.59 %)	49,271 (1.43 %)
493	northern fur seal GCF_003265705.1	54,953 (2.43 %)	n/a	23,408 (1.78 %)	23,666 (1.43 %)	52,089 (2.17 %)	41.48 (98.01 %)	38,666 (1.99 %)	38,666 (1.99 %)	52,469 (98.01 %)	5,047,032 (43.38 %)	638,130 (1.06 %)	14,922,442 (33.12 %)	2,675 (0.04 %)	444,034 (1.22 %)	57,281 (1.44 %)	53,162 (1.27 %)
494	northern fur seal (GAN/ISIS: 27379988/994484 2025) GCF_003265705.2	71,169 (3.14 %)	n/a	21,276 (1.78 %)	21,276 (1.42 %)	n/a	41.44 (98.05 %)	29,679 (1.95 %)	30,369 (1.95 %)	43,734 (98.05 %)	4,118,994 (34.95 %)	578,801 (1.07 %)	13,530,999 (33.27 %)	1,105 (0.03 %)	400,358 (1.22 %)	51,258 (1.43 %)	48,682 (1.30 %)
495	northern gundi (hap1 2025) GCA_048771875.1	n/a	n/a	16,996 (1.51 %)	21,787 (1.66 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	0 (0 %)	117 (0.00 %)	535 (100.00 %)	3,293,772 (27.51 %)	602,403 (3.02 %)	11,827,700 (30.64 %)	2 (0.00 %)	353,736 (1.31 %)	44,220 (1.55 %)	38,845 (1.17 %)
496	northern gundi (hap2 2025) GCA_048771865.1	n/a	n/a	17,037 (1.43 %)	21,690 (1.55 %)	n/a	42.88 (100.00 %)	0 (0 %)	115 (0.00 %)	1,031 (100.00 %)	3,527,940 (26.81 %)	646,620 (6.32 %)	11,343,462 (34.09 %)	0 (0 %)	754,284 (2.54 %)	47,125 (1.51 %)	39,404 (1.11 %)
497	northern gundi (US049 2019) GCA_004027205.1	n/a	n/a	18,035 (1.39 %)	27,379 (1.57 %)	n/a	42.68 (99.91 %)	5,037 (0.02 %)	5,037 (0.02 %)	865,110 (99.98 %)	4,149,883 (27.83 %)	654,063 (1.64 %)	12,342,565 (33.72 %)	12 (0.00 %)	n/a	47,533 (1.43 %)	40,352 (1.09 %)
498	northern mole vole GCA_001685095.1	n/a	n/a	23,252 (1.39 %)	44,209 (1.25 %)	n/a	41.68 (99.04 %)	371,627 (0.98 %)	371,627 (0.98 %)	722,087 (99.02 %)	3,923,814 (25.79 %)	898,453 (2.47 %)	13,708,986 (29.04 %)	96,051 (0.87 %)	280,901 (1.10 %)	16,583 (0.36 %)	15,193 (0.32 %)
499	northern three-toed jerboa (halli NM19106 2024) GCA_036346955.1	n/a	n/a	19,574 (1.25 %)	21,306 (1.23 %)	n/a	42.16 (99.93 %)	0 (0 %)	954 (0.07 %)	487 (100.00 %)	6,447,286 (38.11 %)	1,321,523 (3.44 %)	13,986,035 (43.83 %)	0 (0 %)	1,353,424 (3.71 %)	30,337 (0.84 %)	23,455 (0.53 %)
500	northern white rhinoceros GCA_004027795.1	n/a	n/a	25,328 (1.34 %)	61,003 (1.95 %)	n/a	41.32 (99.90 %)	7,054 (0.03 %)	7,054 (0.03 %)	949,480 (99.97 %)	4,330,882 (38.89 %)	484,754 (1.12 %)	15,544,248 (33.11 %)	44 (0.00 %)	n/a	43,689 (2.08 %)	40,625 (1.98 %)
501	northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024) GCA_043748575.1	n/a	n/a	18,475 (1.82 %)	19,990 (1.56 %)	n/a	40.72 (100.00 %)	2 (0.00 %)	63 (0.00 %)	68 (100.00 %)	3,507,612 (39.92 %)	711,081 (2.15 %)	11,788,205 (32.17 %)	0 (0 %)	524,992 (2.03 %)	35,670 (1.25 %)	28,616 (1.05 %)
502	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank) GCA_036323735.1	114,725 (42.69 %)	n/a	21,917 (1.75 %)	19,476 (1.26 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	0 (0 %)	220 (0.14 %)	77 (100.00 %)	4,700,726 (39.99 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,813 (38.68 %)	21 (0.00 %)	1,553,966 (4.21 %)	20,118 (0.44 %)	17,465 (0.38 %)
503	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq) GCF_036323735.1	114,725 (5.38 %)	n/a	21,870 (1.74 %)	19,989 (1.27 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	0 (0 %)	220 (0.14 %)	76 (100.00 %)	5,294,185 (42.75 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,760 (38.68 %)	21 (0.00 %)	1,553,966 (4.21 %)	20,118 (0.44 %)	17,703 (0.38 %)
504	Norway rat (F344/Stm 2024) GCA_041222355.1	n/a	n/a	21,764 (1.78 %)	20,141 (1.30 %)	n/a	41.87 (99.96 %)	0 (0 %)	234 (0.04 %)	120 (100.00 %)	4,636,987 (39.98 %)	1,579,595 (5.22 %)	13,544,768 (38.06 %)	4 (0.00 %)	1,510,531 (4.17 %)	20,127 (0.46 %)	17,493 (0.40 %)
505	Norway rat BN7 haplotype GCA_015244455.1	n/a	n/a	3,096 (1.64 %)	2,450 (1.02 %)	n/a	41.23 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	3,156 (100.00 %)	517,347 (50.76 %)	157,701 (3.90 %)	1,502,752 (34.14 %)	0 (0 %)	157,923 (4.57 %)	1,806 (0.40 %)	1,380 (0.31 %)
506	Norway rat BN7.2 GCF_015227675.2	97,432 (4.08 %)	n/a	21,526 (1.86 %)	19,266 (1.33 %)	54,530 (2.79 %)	41.99 (99.19 %)	581 (0.81 %)	581 (0.81 %)	757 (99.19 %)	5,029,005 (45.44 %)	1,514,974 (3.57 %)	13,450,428 (35.83 %)	4 (0.00 %)	1,172,090 (3.51 %)	19,244 (0.46 %)	16,098 (0.39 %)
507	Norway rat celera GCF_000002265.2	39,745 (2.91 %)	n/a	21,492 (1.95 %)	19,112 (1.38 %)	n/a	41.98 (95.28 %)	111,393 (4.74 %)	111,391 (4.74 %)	118,423 (95.26 %)	9,721,869 (43.57 %)	1,387,703 (3.05 %)	13,224,921 (32.45 %)	11 (0.00 %)	813,629 (2.20 %)	18,944 (0.42 %)	16,117 (0.37 %)
508	Norway rat Rnor6.0 GCF_000001895.5	69,456 (3.34 %)	n/a	22,369 (1.83 %)	20,269 (1.32 %)	n/a	41.93 (95.13 %)	70,664 (4.84 %)	145,731 (4.89 %)	76,195 (95.16 %)	5,329,187 (44.14 %)	1,620,304 (3.72 %)	14,520,050 (33.09 %)	719 (0.06 %)	916,050 (3.68 %)	22,600 (0.47 %)	18,401 (0.40 %)
509	Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022 GCA_023515785.1	n/a	n/a	21,116 (1.68 %)	20,103 (1.27 %)	57,027 (2.45 %)	41.85 (99.82 %)	0 (0 %)	1,256 (0.18 %)	2,151 (100.00 %)	4,704,388 (38.22 %)	1,611,144 (5.76 %)	13,524,575 (38.35 %)	24 (0.00 %)	1,665,234 (4.47 %)	20,720 (0.48 %)	16,247 (0.34 %)
510	Norway rat SHRSP/BppUtx 2022 GCA_021556685.1	n/a	n/a	22,366 (1.71 %)	20,531 (1.26 %)	57,580 (2.44 %)	41.86 (99.94 %)	0 (0 %)	1,610 (0.06 %)	2,734 (100.00 %)	5,238,574 (46.36 %)	1,638,412 (5.87 %)	13,769,141 (38.49 %)	12 (0.00 %)	1,712,824 (4.62 %)	21,006 (0.49 %)	17,310 (0.40 %)
511	Norway rat WKY/Bbb 2022 GCA_023515805.1	n/a	n/a	21,607 (1.68 %)	21,244 (1.28 %)	58,136 (2.47 %)	41.92 (99.80 %)	0 (0 %)	1,456 (0.20 %)	3,553 (100.00 %)	4,811,412 (38.21 %)	1,650,950 (5.41 %)	13,740,644 (38.24 %)	16 (0.00 %)	1,626,115 (4.31 %)	21,449 (0.51 %)	16,486 (0.34 %)
512	nutria GCA_004027025.1	n/a	n/a	24,707 (1.00 %)	47,533 (1.18 %)	n/a	41.70 (99.84 %)	15,249 (0.05 %)	15,249 (0.05 %)	1,684,916 (99.95 %)	6,961,690 (30.09 %)	1,698,977 (3.31 %)	15,207,563 (42.57 %)	44 (0.00 %)	n/a	59,854 (1.00 %)	31,029 (0.63 %)
513	okapi GCA_001660835.1	n/a	n/a	21,483 (1.43 %)	31,061 (1.26 %)	n/a	41.48 (95.11 %)	376,008 (4.86 %)	376,008 (4.86 %)	1,213,177 (95.14 %)	5,808,036 (42.90 %)	619,044 (4.22 %)	14,940,153 (35.17 %)	41,083 (0.65 %)	843,551 (6.96 %)	47,417 (1.12 %)	45,138 (1.04 %)
514	Okinawa island spiny rat (P-3 2024) GCA_047150545.1	n/a	n/a	20,516 (1.33 %)	20,222 (0.99 %)	n/a	40.89 (100.00 %)	19 (0.00 %)	19 (0.00 %)	53 (100.00 %)	9,452,355 (48.57 %)	2,252,101 (4.71 %)	12,808,891 (51.48 %)	0 (0 %)	1,055,430 (2.16 %)	20,770 (0.36 %)	16,586 (0.28 %)
515	Okinawa island spiny rat (P-3 primary hap 2023) GCA_036184385.1	n/a	n/a	18,829 (1.78 %)	19,061 (1.29 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	250 (0.00 %)	250 (0.00 %)	1,778 (100.00 %)	6,918,941 (46.48 %)	1,550,409 (4.06 %)	12,787,294 (38.04 %)	4 (0.00 %)	788,811 (2.05 %)	19,458 (0.47 %)	17,594 (0.42 %)
516	Ord's kangaroo rat GCF_000151885.1	30,625 (2.21 %)	n/a	17,959 (1.54 %)	19,318 (1.54 %)	n/a	42.06 (92.36 %)	83,033 (7.65 %)	83,035 (7.65 %)	148,226 (92.35 %)	4,337,455 (33.76 %)	1,140,316 (7.60 %)	10,422,685 (36.59 %)	3,290 (0.06 %)	1,520,292 (3.90 %)	61,921 (3.56 %)	30,924 (0.78 %)
517	pacarana GCA_004027595.1	n/a	n/a	20,748 (1.20 %)	33,195 (1.31 %)	n/a	41.81 (99.90 %)	6,392 (0.02 %)	6,392 (0.02 %)	1,164,830 (99.98 %)	4,374,443 (30.16 %)	660,811 (1.38 %)	14,062,133 (35.99 %)	8 (0.00 %)	n/a	59,382 (1.23 %)	28,291 (0.70 %)
518	Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad) GCA_004363475.1	n/a	n/a	21,575 (1.07 %)	47,478 (1.31 %)	n/a	41.87 (99.76 %)	18,801 (0.07 %)	18,801 (0.07 %)	2,428,619 (99.93 %)	4,881,232 (20.80 %)	1,352,971 (4.11 %)	12,583,960 (48.42 %)	36 (0.00 %)	n/a	74,961 (2.33 %)	61,745 (1.54 %)
519	Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo) GCF_023159225.1	46,202 (2.48 %)	n/a	18,752 (1.50 %)	22,526 (1.60 %)	n/a	41.98 (99.96 %)	0 (0 %)	1,807 (0.04 %)	6,180 (100.00 %)	3,313,319 (16.79 %)	1,066,382 (10.88 %)	9,981,468 (42.63 %)	8 (0.00 %)	1,996,445 (6.17 %)	49,134 (2.83 %)	50,049 (1.70 %)
520	Pacific walrus GCF_000321225.1	27,163 (1.89 %)	n/a	20,293 (1.71 %)	20,982 (1.48 %)	n/a	41.36 (95.85 %)	66,763 (4.16 %)	66,766 (4.16 %)	70,656 (95.84 %)	4,372,578 (41.12 %)	511,500 (1.05 %)	13,507,582 (30.43 %)	2,581 (0.03 %)	386,274 (1.21 %)	45,142 (1.29 %)	37,732 (0.95 %)
521	Pacific white-sided dolphin GCF_003676395.1	65,970 (3.26 %)	n/a	18,743 (1.79 %)	20,862 (1.45 %)	31,917 (1.69 %)	41.28 (99.56 %)	16,337 (0.44 %)	16,699 (0.44 %)	21,350 (99.56 %)	3,971,820 (45.64 %)	574,056 (1.14 %)	12,602,965 (34.83 %)	610 (0.02 %)	419,325 (1.28 %)	62,275 (1.67 %)	40,749 (1.23 %)
522	pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019) GCA_004115245.1	n/a	n/a	18,118 (1.63 %)	23,536 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	38 (0.00 %)	10,873 (100.00 %)	3,001,130 (29.46 %)	375,042 (0.79 %)	11,813,971 (29.64 %)	0 (0 %)	140,066 (0.57 %)	67,712 (4.23 %)	70,108 (3.94 %)
523	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020) GCA_004115245.2	n/a	n/a	18,116 (1.63 %)	23,608 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	38 (0.00 %)	10,895 (100.00 %)	3,002,448 (29.46 %)	375,226 (0.79 %)	11,824,034 (29.65 %)	0 (0 %)	140,328 (0.57 %)	67,718 (4.23 %)	70,109 (3.93 %)
524	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020) GCF_004126475.2	54,932 (3.31 %)	n/a	18,171 (1.69 %)	20,025 (1.62 %)	42,786 (3.39 %)	42.38 (99.28 %)	0 (0 %)	884 (0.72 %)	77 (100.00 %)	3,069,141 (30.00 %)	385,664 (0.81 %)	12,050,232 (30.57 %)	1 (0.00 %)	174,292 (0.75 %)	63,905 (3.75 %)	66,744 (3.26 %)
525	Pallas's mastiff bat GCF_014108415.1	48,421 (2.20 %)	n/a	18,667 (1.61 %)	21,915 (1.59 %)	n/a	42.35 (97.95 %)	0 (0 %)	349 (2.05 %)	60 (100.00 %)	3,863,217 (32.76 %)	624,933 (1.88 %)	11,572,319 (37.09 %)	1 (0.00 %)	714,726 (2.00 %)	79,984 (2.45 %)	71,436 (1.91 %)
526	pallid bat (TK200870 primary hap 2023) GCA_027563665.1	n/a	n/a	19,688 (1.69 %)	21,998 (1.64 %)	n/a	43.04 (99.72 %)	19 (0.01 %)	234 (0.28 %)	112 (99.99 %)	2,794,986 (22.60 %)	938,016 (3.72 %)	11,241,518 (39.41 %)	0 (0 %)	704,408 (2.03 %)	70,272 (2.89 %)	61,250 (1.98 %)
527	Parnell's mustached bat (2013) GCA_000465405.1	n/a	n/a	21,436 (1.40 %)	57,232 (2.18 %)	n/a	40.82 (99.34 %)	265,720 (0.70 %)	265,720 (0.70 %)	443,121 (99.30 %)	2,780,805 (29.26 %)	290,520 (0.63 %)	12,354,814 (27.13 %)	3 (0.00 %)	21,621 (0.07 %)	69,806 (1.89 %)	63,572 (1.69 %)
528	Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021) GCF_021234165.1	37,033 (2.48 %)	n/a	18,339 (1.76 %)	21,630 (1.69 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	0 (0 %)	12 (0.00 %)	333 (100.00 %)	2,828,339 (30.56 %)	333,670 (0.75 %)	12,444,271 (30.90 %)	0 (0 %)	111,571 (0.50 %)	53,180 (4.61 %)	54,187 (3.93 %)
529	particolored bat (primary hap 2024) GCA_963924515.1	n/a	n/a	17,913 (1.72 %)	20,720 (1.72 %)	n/a	43.54 (99.99 %)	7 (0.00 %)	980 (0.01 %)	185 (100.00 %)	2,932,869 (21.94 %)	874,665 (4.83 %)	10,263,103 (37.46 %)	2 (0.00 %)	742,499 (2.50 %)	77,397 (4.55 %)	76,849 (2.51 %)
530	Patagonian cavy GCA_004027295.1	n/a	n/a	21,143 (0.94 %)	40,887 (1.10 %)	n/a	39.86 (99.87 %)	6,223 (0.02 %)	6,223 (0.02 %)	1,911,987 (99.98 %)	5,194,890 (30.95 %)	892,551 (2.11 %)	17,052,577 (40.22 %)	47 (0.00 %)	n/a	45,730 (0.84 %)	40,047 (0.71 %)
531	Pere David's deer GCA_002443075.1	n/a	n/a	20,723 (1.65 %)	23,551 (1.43 %)	n/a	41.58 (97.49 %)	144,642 (2.51 %)	144,642 (2.51 %)	339,454 (97.49 %)	5,171,293 (43.30 %)	427,987 (1.20 %)	13,665,133 (35.97 %)	3,724 (0.06 %)	460,451 (1.49 %)	48,374 (1.14 %)	45,141 (1.04 %)
532	Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022) GCA_027409165.1	n/a	n/a	18,794 (1.72 %)	21,421 (1.40 %)	n/a	40.18 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,750 (100.00 %)	4,001,442 (39.37 %)	547,894 (2.75 %)	13,870,563 (34.33 %)	0 (0 %)	585,313 (2.32 %)	40,162 (1.31 %)	39,090 (1.18 %)
533	Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank) GCA_027409185.1	n/a	n/a	20,384 (1.64 %)	22,124 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	0 (0 %)	116 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,492,423 (39.31 %)	627,842 (4.79 %)	15,561,515 (36.57 %)	2 (0.00 %)	n/a	45,336 (1.27 %)	44,264 (1.15 %)
534	Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq) GCF_027409185.1	44,950 (1.91 %)	n/a	20,385 (1.64 %)	22,123 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	0 (0 %)	116 (0.00 %)	130 (100.00 %)	4,492,417 (39.31 %)	627,841 (4.79 %)	15,561,458 (36.57 %)	2 (0.00 %)	862,813 (2.91 %)	45,336 (1.27 %)	44,264 (1.15 %)
535	pig (Bamei 2023) GCA_030704935.1	n/a	n/a	18,472 (1.44 %)	19,911 (1.28 %)	n/a	42.63 (99.98 %)	0 (0 %)	878 (0.02 %)	379 (100.00 %)	3,996,827 (27.97 %)	2,094,728 (7.23 %)	12,677,118 (40.57 %)	4 (0.00 %)	1,289,995 (3.44 %)	81,791 (2.82 %)	46,045 (1.12 %)
536	pig (Duroc 2017) GCF_000003025.6	77,695 (4.05 %)	n/a	18,980 (1.64 %)	19,453 (1.32 %)	59,876 (4.84 %)	41.87 (98.81 %)	328 (1.19 %)	544 (1.19 %)	1,313 (98.81 %)	5,021,184 (45.67 %)	710,994 (1.32 %)	13,243,289 (36.33 %)	2 (0.00 %)	554,834 (1.64 %)	79,132 (1.82 %)	46,116 (1.30 %)
537	pig (Norwegian landrace 2024) GCA_963921485.1	n/a	n/a	18,500 (1.46 %)	19,718 (1.29 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	54 (100.00 %)	4,068,783 (28.54 %)	1,511,605 (5.52 %)	12,867,101 (39.59 %)	0 (0 %)	1,099,633 (2.98 %)	82,002 (2.44 %)	46,611 (1.15 %)
538	pig (USMARCv1 2017) GCA_002844635.1	n/a	n/a	19,458 (1.54 %)	21,487 (1.27 %)	58,655 (2.58 %)	42.49 (95.20 %)	0 (0 %)	661 (4.80 %)	14,157 (100.00 %)	5,159,244 (47.53 %)	902,079 (3.63 %)	13,145,120 (36.86 %)	1 (0.00 %)	1,358,423 (3.46 %)	82,442 (2.62 %)	47,468 (1.28 %)
539	pig (Wuzhishan WZS1 2025) GCA_048338725.1	n/a	n/a	18,525 (1.46 %)	19,792 (1.29 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	20 (100.00 %)	4,084,482 (28.40 %)	1,424,314 (5.35 %)	12,927,595 (39.56 %)	0 (0 %)	1,032,116 (2.85 %)	81,967 (2.96 %)	46,624 (1.14 %)
540	plains viscacha rat (AO245 2017) GCA_002564285.1	n/a	n/a	23,367 (0.78 %)	50,706 (0.93 %)	n/a	41.26 (99.73 %)	124,165 (0.16 %)	124,165 (0.16 %)	1,682,965 (99.84 %)	5,295,703 (27.32 %)	1,024,529 (1.81 %)	16,181,193 (35.22 %)	10,385 (0.05 %)	n/a	46,628 (0.97 %)	40,536 (0.81 %)
541	plains zebra (Etosha38 2022 UCLA) GCF_021613505.1	55,794 (2.87 %)	n/a	19,529 (1.76 %)	21,214 (1.39 %)	n/a	41.38 (99.04 %)	0 (0 %)	14,595 (0.96 %)	11,098 (100.00 %)	3,683,862 (38.74 %)	314,723 (0.68 %)	15,217,328 (29.38 %)	2,057 (0.02 %)	119,672 (0.38 %)	41,391 (1.27 %)	38,911 (1.12 %)
542	platypus (alternate hap Pmale09 2020) GCA_004115175.2	n/a	n/a	13,244 (1.26 %)	19,241 (1.68 %)	n/a	46.27 (100.00 %)	25 (0.00 %)	25 (0.00 %)	5,868 (100.00 %)	4,420,884 (51.59 %)	513,006 (3.13 %)	7,749,797 (49.18 %)	0 (0 %)	994,720 (3.65 %)	81,538 (8.24 %)	68,267 (3.13 %)
543	platypus (Pmale09 v4 2020) GCF_004115215.2	51,379 (3.07 %)	n/a	14,778 (1.26 %)	18,888 (1.63 %)	n/a	46.14 (99.18 %)	0 (0 %)	515 (0.82 %)	322 (100.00 %)	5,071,089 (51.34 %)	578,614 (2.89 %)	9,113,848 (48.93 %)	0 (0 %)	1,130,252 (3.59 %)	87,796 (6.47 %)	74,209 (2.87 %)
544	polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq) GCF_000687225.1	35,751 (2.39 %)	n/a	18,466 (1.69 %)	15,384 (1.38 %)	n/a	41.65 (98.35 %)	110,343 (1.67 %)	110,343 (1.67 %)	134,162 (98.33 %)	4,123,540 (40.16 %)	553,196 (1.29 %)	13,765,581 (29.91 %)	205 (0.03 %)	311,409 (1.04 %)	54,907 (1.17 %)	47,736 (0.98 %)
545	polar bear (UCSC 2021) GCF_017311325.1	52,175 (2.92 %)	n/a	18,588 (1.75 %)	20,731 (1.54 %)	n/a	41.88 (99.60 %)	0 (0 %)	45,532 (0.41 %)	3,900 (100.00 %)	4,204,162 (40.75 %)	572,129 (1.75 %)	13,926,894 (30.79 %)	587 (0.02 %)	437,254 (2.43 %)	63,315 (1.93 %)	57,593 (1.70 %)
546	prairie deer mouse (Baylor 2013) GCF_000500345.1	50,187 (2.51 %)	n/a	20,427 (1.69 %)	20,874 (1.45 %)	n/a	42.34 (94.06 %)	182,041 (5.97 %)	182,263 (5.97 %)	212,962 (94.03 %)	n/a	1,229,123 (2.83 %)	14,447,916 (30.09 %)	7,908 (0.12 %)	806,105 (3.40 %)	23,246 (0.56 %)	19,518 (0.43 %)
547	prairie deer mouse (BWxNUB_F1_BW_parent 2025) GCF_049852395.1	84,704 (3.63 %)	n/a	19,312 (1.68 %)	20,354 (1.41 %)	n/a	42.31 (100.00 %)	0 (0 %)	106 (0.00 %)	25 (100.00 %)	6,577,724 (45.25 %)	1,288,198 (5.24 %)	13,978,540 (35.31 %)	1 (0.00 %)	964,471 (2.66 %)	23,724 (0.69 %)	20,765 (0.57 %)
548	prairie deer mouse (Harvard 2020) GCF_003704035.1	69,779 (3.28 %)	n/a	19,755 (1.73 %)	19,194 (1.43 %)	n/a	42.28 (95.07 %)	147,442 (4.96 %)	147,442 (4.96 %)	155,966 (95.04 %)	4,751,621 (29.04 %)	1,172,212 (2.66 %)	13,934,672 (29.87 %)	6,396 (0.08 %)	477,575 (1.54 %)	22,444 (0.57 %)	19,164 (0.44 %)
549	prairie vole GCF_000317375.1	40,484 (2.72 %)	n/a	19,648 (1.91 %)	19,489 (1.62 %)	n/a	42.25 (92.03 %)	180,677 (8.00 %)	180,677 (8.00 %)	187,012 (92.00 %)	3,779,126 (25.51 %)	879,192 (2.11 %)	12,360,347 (27.34 %)	6,788 (0.11 %)	335,553 (1.15 %)	18,233 (0.52 %)	16,466 (0.44 %)
550	proboscis bat (hap1 2024) GCA_037038545.1	n/a	n/a	17,919 (1.46 %)	19,330 (1.31 %)	n/a	40.78 (100.00 %)	0 (0 %)	68 (0.00 %)	41 (100.00 %)	3,707,234 (28.28 %)	643,817 (2.22 %)	12,106,384 (41.48 %)	5 (0.00 %)	871,436 (2.63 %)	54,438 (1.38 %)	34,899 (0.85 %)
551	proboscis bat (hap2 2024) GCA_037038555.1	n/a	n/a	17,253 (1.51 %)	18,507 (1.35 %)	n/a	40.91 (100.00 %)	0 (0 %)	39 (0.00 %)	38 (100.00 %)	3,466,835 (27.96 %)	585,261 (1.91 %)	11,364,898 (40.65 %)	2 (0.00 %)	726,868 (2.39 %)	50,527 (1.37 %)	32,436 (0.84 %)
552	pronghorn (PH2016 2021) GCA_021018645.1	n/a	n/a	21,848 (1.58 %)	27,614 (1.56 %)	n/a	41.70 (96.83 %)	74,027 (3.17 %)	74,027 (3.17 %)	140,480 (96.83 %)	3,335,744 (24.40 %)	405,435 (4.11 %)	13,855,606 (34.67 %)	3,445 (0.16 %)	489,014 (7.21 %)	48,670 (1.19 %)	43,625 (0.95 %)
553	Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq) GCF_000696695.1	45,089 (2.76 %)	n/a	19,546 (1.69 %)	22,107 (1.36 %)	n/a	41.27 (99.13 %)	80,963 (0.88 %)	80,963 (0.88 %)	134,060 (99.12 %)	3,787,533 (40.54 %)	435,607 (1.73 %)	14,738,418 (28.36 %)	39 (0.00 %)	276,230 (1.12 %)	40,752 (0.94 %)	36,104 (0.79 %)
554	Przewalski's horse (Varuska primary hap 2024) GCF_037783145.1	117,131 (4.09 %)	n/a	18,569 (1.70 %)	20,018 (1.38 %)	n/a	42.23 (100.00 %)	0 (0 %)	310 (0.00 %)	2,146 (100.00 %)	3,768,149 (39.86 %)	632,308 (5.35 %)	14,449,518 (32.71 %)	0 (0 %)	956,665 (2.51 %)	42,166 (4.46 %)	39,294 (4.31 %)
555	puma (L17-30 alternate hap 2023) GCA_028749965.1	n/a	n/a	18,380 (1.53 %)	20,701 (1.40 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	96 (0.00 %)	96 (0.00 %)	304 (100.00 %)	4,881,674 (33.96 %)	978,817 (2.17 %)	13,422,986 (35.08 %)	0 (0 %)	741,350 (2.01 %)	69,437 (2.62 %)	59,105 (1.71 %)
556	puma (L17-30 primary hap 2023) GCA_028749985.1	n/a	n/a	17,553 (1.53 %)	19,299 (1.39 %)	n/a	41.89 (100.00 %)	134 (0.00 %)	134 (0.00 %)	390 (100.00 %)	4,629,539 (33.53 %)	919,008 (2.02 %)	12,766,157 (34.70 %)	0 (0 %)	673,940 (1.93 %)	65,437 (2.53 %)	55,660 (1.67 %)
557	puma (SC36_Marlon 2018 refseq) GCF_003327715.1	25,588 (1.44 %)	n/a	17,664 (1.57 %)	16,565 (1.29 %)	n/a	41.36 (95.34 %)	0 (0 %)	178,992 (4.69 %)	2,175 (100.00 %)	4,885,335 (42.70 %)	833,138 (1.76 %)	13,705,778 (31.28 %)	2,166 (0.06 %)	494,981 (1.78 %)	58,912 (1.65 %)	50,360 (1.31 %)
558	punctate agouti GCA_004363535.1	n/a	n/a	22,612 (1.05 %)	45,433 (1.19 %)	n/a	40.79 (99.92 %)	6,459 (0.02 %)	6,459 (0.02 %)	993,123 (99.98 %)	5,671,738 (32.53 %)	945,722 (1.69 %)	17,003,309 (36.58 %)	32 (0.00 %)	n/a	85,696 (1.65 %)	65,973 (1.32 %)
559	Punta de Vaca leaf-eared mouse (GD2095 2023) GCA_033318265.1	n/a	n/a	18,332 (1.50 %)	18,296 (1.29 %)	n/a	40.01 (100.00 %)	133 (0.00 %)	133 (0.00 %)	437 (100.00 %)	3,825,722 (28.38 %)	915,865 (11.98 %)	13,456,122 (37.89 %)	2 (0.00 %)	1,095,352 (3.10 %)	18,577 (0.50 %)	14,656 (0.36 %)
560	pygmy sperm whale GCA_004363705.1	n/a	n/a	22,661 (1.30 %)	42,546 (1.15 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	6,053 (0.02 %)	6,053 (0.02 %)	1,258,125 (99.98 %)	5,185,912 (43.65 %)	836,752 (1.88 %)	14,150,125 (39.88 %)	43 (0.00 %)	n/a	95,344 (2.15 %)	68,248 (1.67 %)
561	pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq) GCF_026419965.1	73,518 (2.67 %)	n/a	18,496 (1.55 %)	20,718 (1.32 %)	n/a	42.05 (99.81 %)	0 (0 %)	143 (0.19 %)	581 (100.00 %)	3,817,659 (34.51 %)	758,297 (7.42 %)	12,196,998 (39.96 %)	0 (0 %)	1,197,809 (3.53 %)	101,353 (2.90 %)	50,216 (1.47 %)
562	pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022) GCA_026419985.1	n/a	n/a	18,550 (1.51 %)	20,491 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	0 (0 %)	138 (0.01 %)	391 (100.00 %)	3,860,112 (33.83 %)	820,375 (9.58 %)	12,159,196 (41.59 %)	2 (0.00 %)	1,346,279 (3.87 %)	106,168 (2.78 %)	50,294 (1.44 %)
563	Pyrenean desman (IBE-C5619 2021) GCA_019455555.1	n/a	20,936 (1.95 %)	17,527 (1.87 %)	20,474 (1.83 %)	n/a	41.67 (98.52 %)	63,679 (1.49 %)	63,679 (1.49 %)	75,985 (98.51 %)	2,147,379 (23.41 %)	327,740 (0.98 %)	10,539,226 (28.05 %)	1,165 (0.02 %)	291,271 (1.07 %)	44,487 (4.39 %)	47,205 (4.01 %)
564	rabbit (A946 2020) GCA_013371645.1	n/a	n/a	19,881 (1.40 %)	22,566 (1.32 %)	n/a	44.09 (99.92 %)	4,066 (0.07 %)	4,254 (0.08 %)	5,157 (99.93 %)	5,202,709 (44.78 %)	1,059,544 (2.39 %)	13,897,372 (40.69 %)	4 (0.00 %)	1,532,783 (5.00 %)	119,691 (2.74 %)	75,409 (2.53 %)
565	rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq) GCF_009806435.1	83,033 (4.16 %)	n/a	19,486 (1.31 %)	23,267 (1.31 %)	n/a	43.83 (97.68 %)	0 (0 %)	18,178 (2.32 %)	3,160 (100.00 %)	4,072,524 (21.41 %)	976,273 (2.33 %)	13,766,413 (39.76 %)	85 (0.00 %)	1,275,666 (3.04 %)	113,371 (2.46 %)	70,869 (1.75 %)
566	rabbit (primary hap 2024 refseq) GCF_964237555.1	95,289 (4.22 %)	n/a	19,385 (1.31 %)	22,631 (1.31 %)	n/a	44.02 (99.98 %)	0 (0 %)	2,276 (0.02 %)	221 (100.00 %)	4,099,586 (21.20 %)	1,062,900 (3.78 %)	13,416,814 (41.72 %)	5 (0.00 %)	1,560,076 (3.77 %)	116,523 (2.66 %)	74,863 (1.94 %)
567	rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq) GCF_000003625.3	43,642 (2.34 %)	n/a	18,665 (1.39 %)	20,095 (1.24 %)	n/a	43.75 (95.14 %)	80,789 (4.88 %)	80,789 (4.88 %)	84,024 (95.12 %)	4,890,480 (44.71 %)	883,939 (1.73 %)	13,254,520 (38.27 %)	12 (0.00 %)	1,022,784 (2.54 %)	110,337 (2.33 %)	68,468 (1.73 %)
568	raccoon dog (2021) GCF_905146905.1	52,577 (2.89 %)	n/a	19,628 (1.60 %)	20,274 (1.43 %)	n/a	41.28 (99.98 %)	0 (0 %)	70 (0.02 %)	811 (100.00 %)	4,499,368 (31.98 %)	1,005,212 (2.04 %)	13,884,201 (32.95 %)	2 (0.00 %)	702,009 (1.75 %)	52,450 (2.27 %)	46,478 (1.53 %)
569	Rambouillet sheep (Baylor 2017) GCF_002742125.1	50,083 (2.48 %)	46,295 (2.32 %)	19,992 (1.47 %)	22,506 (1.31 %)	41,290 (1.46 %)	41.91 (99.99 %)	4,845 (0.01 %)	4,847 (0.01 %)	7,486 (99.99 %)	5,764,757 (47.38 %)	507,629 (1.55 %)	14,138,601 (41.27 %)	7 (0.00 %)	1,279,574 (3.49 %)	51,748 (1.29 %)	40,690 (1.04 %)
570	Rambouillet sheep (U.Idaho 2021) GCF_016772045.1	70,461 (3.21 %)	n/a	19,413 (1.59 %)	21,222 (1.35 %)	n/a	41.99 (100.00 %)	0 (0 %)	84 (0.00 %)	142 (100.00 %)	5,300,958 (46.83 %)	455,553 (1.24 %)	13,023,443 (40.62 %)	0 (0 %)	979,102 (2.67 %)	43,959 (1.30 %)	38,834 (1.07 %)
571	ratel GCA_004024625.1	n/a	n/a	22,196 (1.21 %)	35,937 (1.18 %)	n/a	42.00 (99.85 %)	6,511 (0.02 %)	6,511 (0.02 %)	2,074,823 (99.98 %)	6,171,383 (41.93 %)	877,669 (1.49 %)	15,269,908 (41.22 %)	36 (0.00 %)	465,016 (0.89 %)	95,094 (1.91 %)	92,023 (1.73 %)
572	red bat GCA_004026805.1	n/a	n/a	27,510 (1.22 %)	65,467 (1.48 %)	n/a	42.69 (99.94 %)	6,380 (0.02 %)	6,380 (0.02 %)	525,280 (99.98 %)	4,644,227 (28.24 %)	1,170,868 (2.68 %)	15,628,238 (39.97 %)	16 (0.00 %)	n/a	125,564 (3.55 %)	108,686 (2.27 %)
573	red deer (2021) GCF_910594005.1	68,992 (2.68 %)	n/a	20,470 (1.48 %)	22,563 (1.32 %)	n/a	42.98 (100.00 %)	0 (0 %)	40 (0.00 %)	144 (100.00 %)	5,501,063 (44.60 %)	503,301 (12.23 %)	13,102,622 (44.55 %)	1 (0.00 %)	2,197,198 (5.57 %)	88,756 (1.66 %)	46,960 (1.12 %)
574	red deer (alternate hap 2021) GCA_910593805.1	n/a	n/a	18,817 (1.29 %)	21,916 (1.20 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	0 (0 %)	22 (0.00 %)	4,021 (100.00 %)	3,279,005 (20.48 %)	472,706 (21.87 %)	11,466,609 (50.26 %)	0 (0 %)	3,624,599 (9.05 %)	128,858 (2.07 %)	39,577 (0.84 %)
575	red fox (BD-2025 2025) GCF_048418805.1	84,632 (3.45 %)	n/a	19,565 (1.57 %)	19,909 (1.38 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	0 (0 %)	104 (0.00 %)	289 (100.00 %)	4,480,315 (31.76 %)	1,010,887 (2.70 %)	13,766,344 (33.12 %)	1 (0.00 %)	718,295 (1.89 %)	50,763 (2.22 %)	47,197 (1.53 %)
576	red fox (hap1 2024) GCA_964106825.2	n/a	n/a	19,622 (1.57 %)	20,371 (1.38 %)	n/a	41.34 (99.98 %)	0 (0 %)	1,845 (0.02 %)	461 (100.00 %)	4,519,485 (31.91 %)	1,018,114 (2.59 %)	13,810,284 (32.99 %)	9 (0.00 %)	712,146 (1.92 %)	52,053 (2.31 %)	47,294 (1.54 %)
577	red fox (hap2 2024) GCA_964106925.2	n/a	n/a	19,517 (1.57 %)	20,105 (1.37 %)	n/a	41.31 (99.99 %)	0 (0 %)	1,819 (0.02 %)	350 (100.00 %)	4,487,839 (31.79 %)	1,010,106 (2.64 %)	13,838,711 (33.07 %)	17 (0.00 %)	695,908 (1.88 %)	51,373 (2.26 %)	46,876 (1.53 %)
578	red fox (tameXaggressive cross 2018) GCF_003160815.1	43,508 (2.67 %)	n/a	19,826 (1.69 %)	18,893 (1.40 %)	n/a	41.08 (97.06 %)	0 (0 %)	246,167 (2.96 %)	82,424 (100.00 %)	4,919,102 (40.79 %)	954,461 (2.46 %)	14,190,625 (30.86 %)	739 (0.02 %)	634,373 (2.40 %)	53,204 (1.88 %)	51,541 (1.62 %)
579	reed vole (MF-2015 2020) GCF_014885135.2	55,722 (3.60 %)	n/a	19,808 (1.93 %)	20,787 (1.69 %)	n/a	42.36 (95.60 %)	0 (0 %)	67,118 (4.40 %)	10,460 (100.00 %)	3,130,955 (20.09 %)	831,969 (2.09 %)	11,985,657 (28.48 %)	1,977 (0.20 %)	258,905 (1.26 %)	18,764 (0.58 %)	16,940 (0.48 %)
580	Reeves' muntjac (alternate hap 2024) GCA_963930665.1	n/a	n/a	18,947 (1.29 %)	24,114 (1.28 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8,892 (100.00 %)	3,375,476 (23.21 %)	654,539 (6.64 %)	11,132,469 (48.29 %)	0 (0 %)	3,008,562 (7.07 %)	79,357 (2.66 %)	41,548 (0.93 %)
581	Reeves' muntjac (primary hap 2024) GCF_963930625.1	52,442 (2.57 %)	n/a	19,577 (1.52 %)	22,283 (1.38 %)	n/a	41.89 (99.99 %)	0 (0 %)	682 (0.01 %)	267 (100.00 %)	3,294,672 (23.89 %)	527,436 (2.98 %)	13,137,581 (39.89 %)	1 (0.00 %)	1,222,379 (3.05 %)	57,436 (1.81 %)	44,949 (1.09 %)
582	reindeer (2023) GCA_963422255.1	n/a	n/a	21,329 (1.58 %)	25,201 (1.59 %)	n/a	41.46 (98.35 %)	131,886 (1.65 %)	131,886 (1.65 %)	259,765 (98.35 %)	3,254,173 (23.49 %)	440,431 (2.00 %)	14,258,607 (36.17 %)	3,361 (0.18 %)	n/a	48,931 (1.20 %)	43,592 (0.99 %)
583	reindeer (US061 2019) GCA_004026565.1	n/a	n/a	24,150 (1.39 %)	39,911 (1.41 %)	n/a	42.08 (99.89 %)	4,769 (0.02 %)	4,769 (0.02 %)	1,365,508 (99.98 %)	6,083,178 (46.10 %)	546,470 (1.23 %)	14,434,855 (43.16 %)	13 (0.00 %)	n/a	55,319 (1.23 %)	51,245 (1.12 %)
584	Rice's whale (hap1 2023) GCA_028017805.1	n/a	n/a	19,396 (1.48 %)	21,693 (1.26 %)	n/a	41.62 (97.80 %)	0 (0 %)	131 (2.20 %)	1,039 (100.00 %)	3,973,936 (35.55 %)	987,571 (11.66 %)	12,473,459 (42.11 %)	1 (0.00 %)	1,271,959 (3.79 %)	74,971 (1.64 %)	44,274 (1.06 %)
585	Rice's whale (hap2 2023 refseq) GCF_028023285.1	59,888 (2.34 %)	n/a	19,291 (1.53 %)	21,195 (1.30 %)	n/a	41.44 (99.90 %)	0 (0 %)	334 (0.10 %)	774 (100.00 %)	3,917,923 (36.26 %)	828,521 (9.28 %)	12,518,796 (41.08 %)	4 (0.00 %)	1,071,329 (3.37 %)	73,126 (1.69 %)	43,865 (1.11 %)
586	Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024) GCA_036010255.1	n/a	n/a	18,982 (1.81 %)	22,002 (1.76 %)	n/a	43.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	105 (100.00 %)	2,909,847 (24.53 %)	757,964 (3.03 %)	10,561,925 (36.25 %)	0 (0 %)	534,987 (1.92 %)	57,318 (2.32 %)	52,282 (1.76 %)
587	Risso's dolphin (hap1.1 2024) GCA_964374135.1	n/a	n/a	18,825 (1.58 %)	20,986 (1.29 %)	n/a	42.25 (99.99 %)	4 (0.00 %)	1,138 (0.01 %)	1,150 (100.00 %)	4,405,513 (43.51 %)	1,342,544 (11.28 %)	12,274,096 (41.76 %)	9 (0.00 %)	1,663,930 (5.05 %)	76,936 (4.65 %)	55,192 (2.62 %)
588	Risso's dolphin (hap2.1 2024) GCA_964374185.1	n/a	n/a	18,061 (1.68 %)	20,080 (1.36 %)	n/a	41.97 (99.99 %)	1,073 (0.01 %)	1,073 (0.01 %)	2,135 (99.99 %)	3,948,427 (43.52 %)	848,222 (8.00 %)	11,527,950 (38.76 %)	3 (0.00 %)	1,133,241 (3.81 %)	70,117 (3.31 %)	50,095 (2.07 %)
589	root vole (2023) GCA_963919705.1	n/a	n/a	19,293 (1.92 %)	20,635 (1.67 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	268 (100.00 %)	4,396,130 (38.90 %)	891,534 (2.66 %)	12,119,692 (31.39 %)	0 (0 %)	469,049 (1.48 %)	19,542 (0.63 %)	17,677 (0.55 %)
590	Ryukyu mouse (v2 2017) GCF_900094665.2	53,792 (2.85 %)	n/a	21,351 (2.29 %)	18,073 (1.39 %)	n/a	41.70 (89.05 %)	27,758 (7.30 %)	306,599 (10.98 %)	30,835 (92.70 %)	4,479,912 (35.83 %)	1,351,677 (2.59 %)	12,964,608 (27.49 %)	6,570 (0.06 %)	398,054 (1.12 %)	15,963 (0.43 %)	15,425 (0.40 %)
591	Saanen dairy goat GCA_015443085.1	n/a	n/a	19,257 (1.54 %)	21,221 (1.32 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	0 (0 %)	170 (0.00 %)	1,362 (100.00 %)	5,336,862 (47.58 %)	515,161 (2.87 %)	13,144,895 (41.67 %)	3 (0.00 %)	1,309,461 (3.33 %)	58,623 (2.22 %)	39,483 (1.04 %)
592	saddleback dolphin (alternate hap 2023) GCA_949987525.1	n/a	n/a	18,509 (1.54 %)	22,514 (1.36 %)	n/a	41.95 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	7,427 (100.00 %)	3,675,922 (35.75 %)	950,374 (10.49 %)	11,670,399 (40.31 %)	0 (0 %)	1,395,810 (4.32 %)	63,587 (3.15 %)	40,331 (1.09 %)
593	saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq) GCF_949987515.1	46,746 (2.39 %)	n/a	18,624 (1.49 %)	20,662 (1.31 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	0 (0 %)	968 (0.01 %)	630 (100.00 %)	4,020,676 (35.99 %)	1,259,549 (13.09 %)	12,359,748 (42.64 %)	0 (0 %)	1,785,427 (5.07 %)	66,179 (3.91 %)	41,466 (1.03 %)
594	saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq) GCF_949987515.2	46,014 (2.36 %)	n/a	18,616 (1.49 %)	20,618 (1.32 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	968 (0.01 %)	968 (0.01 %)	1,598 (99.99 %)	4,020,525 (35.99 %)	1,258,165 (13.09 %)	12,359,758 (42.64 %)	0 (0 %)	1,475,119 (4.19 %)	66,188 (3.91 %)	41,466 (1.03 %)
595	saiga antelope GCA_004024985.1	n/a	n/a	23,736 (0.84 %)	55,133 (0.88 %)	n/a	42.52 (99.87 %)	2,867 (0.01 %)	2,867 (0.01 %)	1,775,066 (99.99 %)	6,485,113 (49.43 %)	447,097 (0.88 %)	13,972,753 (44.46 %)	57 (0.00 %)	n/a	46,883 (0.82 %)	38,101 (0.69 %)
596	Schreibers' long-fingered bat (US075 2019) GCA_004026525.1	n/a	n/a	20,147 (2.06 %)	31,271 (1.82 %)	n/a	42.27 (99.94 %)	6,918 (0.04 %)	6,918 (0.04 %)	184,538 (99.96 %)	2,772,932 (29.66 %)	366,782 (1.13 %)	10,477,531 (28.60 %)	19 (0.00 %)	n/a	62,520 (2.73 %)	58,978 (2.39 %)
597	Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025) GCA_964146895.2	n/a	n/a	18,109 (2.10 %)	21,263 (1.89 %)	n/a	42.51 (100.00 %)	0 (0 %)	140 (0.00 %)	186 (100.00 %)	2,812,261 (34.39 %)	457,565 (5.58 %)	10,220,083 (31.02 %)	0 (0 %)	662,735 (2.58 %)	59,522 (2.81 %)	54,315 (2.29 %)
598	Schreibers' long-fingered bat (v2 hap2 2025) GCA_964145185.2	n/a	n/a	17,286 (2.19 %)	20,474 (1.95 %)	n/a	42.64 (100.00 %)	86 (0.00 %)	86 (0.00 %)	254 (100.00 %)	2,610,773 (33.65 %)	389,844 (4.42 %)	9,728,138 (29.49 %)	0 (0 %)	460,730 (1.78 %)	56,508 (2.97 %)	51,969 (2.42 %)
599	scimitar-horned oryx GCF_014754425.2	51,527 (2.72 %)	n/a	19,713 (1.57 %)	21,928 (1.32 %)	n/a	41.74 (99.30 %)	0 (0 %)	16,241 (0.70 %)	9,089 (100.00 %)	5,435,109 (46.76 %)	414,279 (0.98 %)	13,490,956 (40.45 %)	2,509 (0.03 %)	982,620 (2.65 %)	42,961 (1.10 %)	38,033 (0.97 %)
600	Screaming hairy armadillo GCA_004027955.1	n/a	n/a	24,532 (0.39 %)	56,725 (0.46 %)	n/a	39.68 (99.70 %)	2,747 (0.01 %)	2,747 (0.01 %)	7,680,080 (99.99 %)	8,978,735 (36.02 %)	1,516,551 (1.58 %)	32,918,217 (47.67 %)	32 (0.00 %)	n/a	234,762 (1.56 %)	66,537 (0.64 %)
601	sea otter (GAN:26980312 2017 refseq) GCF_002288905.1	38,140 (2.17 %)	n/a	18,578 (1.64 %)	20,913 (1.44 %)	34,179 (1.77 %)	41.56 (98.79 %)	22,821 (1.21 %)	23,134 (1.21 %)	29,589 (98.79 %)	4,703,044 (41.42 %)	721,750 (1.39 %)	14,065,653 (32.89 %)	1,203 (0.02 %)	504,215 (2.00 %)	55,388 (1.87 %)	53,465 (1.67 %)
602	Seba's short-tailed bat GCA_004027735.1	n/a	n/a	21,878 (0.94 %)	55,858 (1.10 %)	n/a	42.70 (99.84 %)	3,864 (0.01 %)	3,864 (0.01 %)	1,929,203 (99.99 %)	3,802,235 (28.35 %)	606,320 (1.03 %)	15,171,250 (31.99 %)	69 (0.00 %)	n/a	118,227 (2.28 %)	103,103 (1.92 %)
603	sei whale (hap1.1 2025) GCA_965194805.1	n/a	n/a	19,292 (1.27 %)	21,865 (1.14 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	0 (0 %)	1,179 (0.01 %)	2,572 (100.00 %)	4,525,289 (42.25 %)	1,097,216 (21.14 %)	12,203,884 (50.47 %)	12 (0.00 %)	2,217,448 (6.14 %)	80,128 (1.58 %)	44,102 (0.91 %)
604	sei whale (hap2.1 2025) GCA_965194725.1	n/a	n/a	19,313 (1.37 %)	21,662 (1.17 %)	n/a	41.68 (99.99 %)	1,066 (0.01 %)	1,066 (0.01 %)	2,917 (99.99 %)	4,418,625 (42.98 %)	875,114 (15.81 %)	12,360,254 (46.52 %)	0 (0 %)	1,705,441 (5.02 %)	78,537 (1.66 %)	44,115 (0.98 %)
605	sheep (hu hu3095 2024) GCA_040805955.1	n/a	21,525 (1.22 %)	19,388 (1.42 %)	21,612 (1.28 %)	n/a	43.17 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	28 (100.00 %)	5,311,536 (44.06 %)	653,238 (7.29 %)	12,937,231 (44.10 %)	0 (0 %)	1,552,087 (3.95 %)	63,230 (6.03 %)	40,222 (0.90 %)
606	sheep (OAR_USU_Benz2616 2023) GCF_016772045.2	89,680 (5.44 %)	n/a	19,308 (1.52 %)	21,506 (1.35 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	0 (0 %)	84 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,275,767 (22.85 %)	464,346 (1.26 %)	12,987,607 (40.61 %)	0 (0 %)	992,253 (2.68 %)	44,477 (1.28 %)	39,609 (0.96 %)
607	sheep (Texel 2015) GCA_000298735.2	n/a	n/a	19,179 (1.56 %)	19,001 (1.26 %)	48,105 (1.85 %)	41.90 (98.94 %)	43,016 (1.07 %)	44,566 (1.07 %)	48,481 (98.93 %)	5,429,824 (46.13 %)	540,267 (1.64 %)	13,509,668 (38.83 %)	123 (0.01 %)	863,621 (2.69 %)	43,911 (1.13 %)	39,178 (0.99 %)
608	shrew mouse GCF_900095145.1	46,279 (2.64 %)	43,645 (2.34 %)	20,549 (2.23 %)	18,979 (1.49 %)	94,079 (3.98 %)	41.89 (90.53 %)	15,298 (6.27 %)	269,643 (9.50 %)	17,879 (93.73 %)	4,788,498 (38.32 %)	1,499,714 (3.03 %)	13,021,757 (27.83 %)	6,442 (0.07 %)	442,006 (1.19 %)	16,787 (0.47 %)	15,907 (0.43 %)
609	Siberian hamster (SSSS 2022) GCA_023856395.1	n/a	n/a	18,375 (1.83 %)	17,066 (1.44 %)	n/a	41.27 (99.64 %)	0 (0 %)	88,601 (0.37 %)	7,756 (100.00 %)	3,152,242 (21.63 %)	1,087,009 (2.64 %)	12,055,167 (29.20 %)	1,976 (0.02 %)	260,068 (0.73 %)	15,455 (0.48 %)	14,212 (0.40 %)
610	Siberian musk deer (BS20 2019 Broad) GCA_004024705.1	n/a	n/a	23,440 (1.32 %)	37,497 (1.19 %)	n/a	42.32 (99.86 %)	19,764 (0.07 %)	19,764 (0.07 %)	1,195,467 (99.93 %)	6,726,950 (49.79 %)	437,480 (1.57 %)	14,155,240 (46.22 %)	13 (0.00 %)	n/a	49,177 (1.05 %)	43,489 (0.94 %)
611	sika deer (Changchun, China MLH-2022 2023) GCA_034195675.1	n/a	n/a	20,087 (1.59 %)	23,556 (1.46 %)	n/a	41.66 (99.97 %)	0 (0 %)	1,724 (0.03 %)	1,889 (100.00 %)	3,925,148 (27.17 %)	419,490 (1.24 %)	13,364,988 (37.79 %)	0 (0 %)	653,312 (1.92 %)	47,630 (1.31 %)	42,485 (1.04 %)
612	small Madagascar hedgehog GCF_000313985.2	37,090 (1.93 %)	n/a	18,969 (1.19 %)	19,298 (1.31 %)	n/a	43.01 (88.43 %)	0 (0 %)	270,406 (11.60 %)	7,490 (100.00 %)	3,789,337 (28.89 %)	429,226 (0.87 %)	16,951,112 (32.23 %)	3,875 (0.06 %)	191,573 (0.64 %)	39,993 (0.70 %)	32,202 (0.55 %)
613	smoky shrew (2023) GCF_029834395.1	37,165 (1.66 %)	n/a	17,572 (1.06 %)	24,146 (1.29 %)	n/a	43.43 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	497 (100.00 %)	2,593,080 (14.11 %)	1,194,567 (7.25 %)	14,051,522 (48.20 %)	0 (0 %)	1,447,378 (3.75 %)	107,473 (2.80 %)	53,859 (1.19 %)
614	snow leopard (11264 2022) GCF_023721935.1	53,569 (3.37 %)	n/a	18,780 (1.67 %)	21,038 (1.40 %)	n/a	41.60 (99.30 %)	0 (0 %)	23,786 (0.70 %)	2,636 (100.00 %)	4,714,429 (34.93 %)	919,518 (1.59 %)	13,711,504 (33.24 %)	1,871 (0.02 %)	357,999 (0.95 %)	64,690 (2.41 %)	61,670 (2.00 %)
615	snowshoe hare GCA_004026855.1	n/a	n/a	23,263 (0.88 %)	55,811 (1.01 %)	n/a	44.12 (99.87 %)	10,153 (0.03 %)	10,153 (0.03 %)	1,602,982 (99.97 %)	4,767,120 (21.29 %)	1,040,992 (2.22 %)	15,680,144 (43.23 %)	86 (0.00 %)	n/a	126,152 (2.28 %)	87,841 (1.66 %)
616	social tuco-tuco GCA_004027165.1	n/a	n/a	25,166 (1.12 %)	41,316 (1.26 %)	n/a	40.71 (99.89 %)	16,191 (0.06 %)	16,191 (0.06 %)	823,762 (99.94 %)	5,390,906 (28.28 %)	1,027,922 (2.15 %)	15,241,308 (38.39 %)	45 (0.00 %)	n/a	31,883 (0.72 %)	27,410 (0.58 %)
617	Soft-furred tree mouse (WYS1704033 2022) GCA_023101885.1	n/a	n/a	20,505 (1.36 %)	25,606 (1.53 %)	n/a	42.21 (99.64 %)	0 (0 %)	3,794 (0.36 %)	1,243 (100.00 %)	5,973,279 (45.08 %)	1,551,851 (4.63 %)	13,570,249 (38.60 %)	34 (0.00 %)	1,376,656 (3.63 %)	73,762 (1.53 %)	41,027 (1.00 %)
618	soprano pipistrelle (alternate hap 2023) GCA_949987765.1	n/a	n/a	17,590 (1.81 %)	21,597 (1.85 %)	n/a	42.88 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	2,717 (100.00 %)	2,734,555 (21.46 %)	795,752 (6.56 %)	9,601,735 (36.35 %)	0 (0 %)	660,443 (2.50 %)	62,524 (3.25 %)	60,391 (2.11 %)
619	soprano pipistrelle (primary hap 2023) GCA_949987585.1	n/a	n/a	18,056 (1.78 %)	21,158 (1.79 %)	n/a	42.67 (100.00 %)	6 (0.00 %)	161 (0.00 %)	249 (100.00 %)	2,899,535 (21.64 %)	853,717 (7.80 %)	10,162,216 (37.72 %)	1 (0.00 %)	802,761 (2.85 %)	63,256 (3.06 %)	61,642 (2.03 %)
620	South African ground squirrel GCA_004024805.1	n/a	n/a	22,802 (1.44 %)	33,892 (1.27 %)	n/a	39.97 (99.92 %)	9,745 (0.04 %)	9,745 (0.04 %)	587,115 (99.96 %)	5,256,998 (34.93 %)	594,122 (1.27 %)	14,462,947 (33.96 %)	36 (0.00 %)	n/a	34,141 (0.80 %)	32,509 (0.74 %)
621	Southeastern Asian house mouse (2016) GCA_001624445.1	n/a	n/a	21,103 (2.24 %)	18,682 (1.45 %)	102,099 (4.16 %)	41.83 (86.23 %)	48,311 (2.15 %)	424,005 (13.83 %)	52,352 (97.85 %)	4,990,851 (39.88 %)	1,356,202 (2.67 %)	13,469,640 (26.15 %)	14,714 (0.76 %)	396,098 (1.49 %)	16,724 (0.41 %)	15,971 (0.39 %)
622	Southeastern Asian house mouse (2022) GCA_921999005.2	n/a	n/a	21,799 (2.13 %)	19,729 (1.40 %)	110,356 (4.43 %)	41.78 (99.19 %)	4 (0.00 %)	278 (0.81 %)	151 (100.00 %)	4,663,228 (40.41 %)	1,549,985 (3.70 %)	13,012,600 (34.99 %)	8 (0.01 %)	788,439 (2.30 %)	21,349 (0.52 %)	15,914 (0.42 %)
623	Southeastern Asian house mouse (T2T 2024) GCA_964188545.1	n/a	n/a	22,529 (1.85 %)	20,409 (1.22 %)	n/a	41.10 (99.90 %)	78 (0.10 %)	78 (0.10 %)	416 (99.90 %)	4,880,101 (47.77 %)	1,689,287 (15.13 %)	12,822,147 (42.92 %)	1 (0.00 %)	2,529,336 (6.14 %)	22,642 (0.54 %)	16,895 (0.41 %)
624	southern elephant seal GCF_011800145.1	53,210 (2.86 %)	n/a	19,520 (1.73 %)	20,727 (1.41 %)	39,634 (1.86 %)	41.45 (99.36 %)	0 (0 %)	22,850 (0.64 %)	1,115 (100.00 %)	4,728,105 (43.75 %)	585,443 (1.13 %)	13,463,979 (33.65 %)	2,467 (0.03 %)	627,414 (1.65 %)	53,182 (1.62 %)	49,837 (1.42 %)
625	southern grasshopper mouse (2020) GCF_903995425.1	47,152 (2.39 %)	n/a	19,356 (1.68 %)	18,821 (1.36 %)	n/a	41.81 (98.94 %)	0 (0 %)	2,143 (1.06 %)	2,949 (100.00 %)	4,850,460 (28.64 %)	1,195,836 (2.72 %)	13,540,762 (32.73 %)	0 (0 %)	547,538 (1.62 %)	18,046 (0.54 %)	16,132 (0.42 %)
626	southern multimammate mouse GCF_008632895.1	69,058 (3.04 %)	n/a	20,313 (2.11 %)	17,745 (1.38 %)	n/a	41.39 (91.90 %)	0 (0 %)	146,713 (8.12 %)	28 (100.00 %)	4,875,400 (38.43 %)	1,454,350 (2.93 %)	13,104,717 (28.82 %)	2,045 (0.04 %)	494,819 (1.13 %)	16,715 (0.45 %)	15,641 (0.42 %)
627	southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022) GCA_023853755.1	n/a	n/a	20,179 (1.21 %)	24,249 (1.19 %)	n/a	39.54 (100.00 %)	4 (0.00 %)	4 (0.00 %)	7,866 (100.00 %)	3,953,031 (35.88 %)	531,111 (1.14 %)	16,354,874 (39.96 %)	0 (0 %)	425,622 (1.30 %)	59,907 (1.35 %)	35,916 (0.80 %)
628	southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022) GCA_023851605.1	n/a	n/a	20,058 (1.26 %)	22,196 (1.13 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	0 (0 %)	961 (0.56 %)	201 (100.00 %)	4,037,291 (46.02 %)	593,019 (1.17 %)	18,033,833 (40.56 %)	9 (0.00 %)	500,101 (1.40 %)	65,039 (1.33 %)	38,121 (0.86 %)
629	southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022) GCF_023851605.1	84,279 (3.04 %)	n/a	20,960 (1.28 %)	22,188 (1.13 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	0 (0 %)	961 (0.56 %)	200 (100.00 %)	4,793,649 (47.24 %)	593,018 (1.17 %)	18,033,318 (40.56 %)	9 (0.00 %)	500,100 (1.40 %)	65,039 (1.33 %)	57,260 (1.12 %)
630	southern three-banded armadillo GCA_004025125.1	n/a	n/a	29,138 (0.73 %)	56,522 (0.75 %)	n/a	39.20 (99.82 %)	15,801 (0.04 %)	15,801 (0.04 %)	2,941,308 (99.96 %)	6,990,740 (38.88 %)	839,452 (1.23 %)	24,805,397 (43.95 %)	220 (0.00 %)	n/a	71,951 (0.98 %)	63,325 (0.84 %)
631	southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020) GCA_015220265.1	n/a	n/a	22,897 (1.23 %)	27,007 (1.18 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	70 (0.00 %)	70 (0.00 %)	12,050 (100.00 %)	4,502,020 (38.27 %)	576,759 (1.02 %)	17,143,050 (40.65 %)	0 (0 %)	450,196 (1.59 %)	51,339 (1.15 %)	40,459 (0.82 %)
632	southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020) GCF_015220235.1	63,054 (2.39 %)	n/a	21,998 (1.29 %)	23,177 (1.18 %)	45,345 (1.69 %)	39.89 (97.48 %)	0 (0 %)	1,243 (2.52 %)	146 (100.00 %)	4,559,690 (39.66 %)	577,607 (1.02 %)	16,594,630 (40.50 %)	4 (0.00 %)	492,026 (1.69 %)	51,430 (1.14 %)	40,148 (0.81 %)
633	southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq) GCF_000283155.1	37,037 (2.11 %)	n/a	18,398 (1.71 %)	19,753 (1.44 %)	n/a	40.90 (96.05 %)	54,737 (3.96 %)	54,737 (3.96 %)	57,824 (96.04 %)	3,685,898 (38.31 %)	421,694 (0.97 %)	14,765,529 (28.93 %)	1,818 (0.02 %)	184,274 (0.57 %)	36,281 (1.02 %)	32,113 (0.82 %)
634	Sowerby's beaked whale (hap1 2024) GCA_964165515.1	n/a	n/a	19,471 (1.39 %)	22,951 (1.24 %)	n/a	42.04 (99.99 %)	2 (0.00 %)	1,095 (0.01 %)	1,604 (100.00 %)	4,307,839 (34.31 %)	825,475 (10.97 %)	11,375,945 (45.31 %)	11 (0.00 %)	3,517,431 (7.94 %)	76,527 (3.10 %)	39,378 (0.86 %)
635	Sowerby's beaked whale (hap2 2024) GCA_964148845.1	n/a	n/a	18,591 (1.46 %)	21,588 (1.27 %)	n/a	42.00 (99.99 %)	974 (0.01 %)	974 (0.01 %)	2,126 (99.99 %)	3,961,403 (34.20 %)	742,897 (9.73 %)	10,832,739 (43.68 %)	2 (0.00 %)	2,951,041 (7.25 %)	70,803 (2.85 %)	37,380 (0.90 %)
636	Sowerby's beaked whale (US080 2019) GCA_004027085.1	n/a	n/a	22,800 (1.32 %)	38,247 (1.17 %)	n/a	41.68 (99.84 %)	8,597 (0.03 %)	8,597 (0.03 %)	1,810,317 (99.97 %)	5,520,986 (45.05 %)	1,081,962 (2.69 %)	13,480,261 (43.01 %)	62 (0.00 %)	n/a	69,001 (1.39 %)	52,160 (1.13 %)
637	sperm whale (SW-GA 2023) GCF_002837175.3	62,616 (2.83 %)	n/a	19,485 (1.75 %)	22,707 (1.41 %)	n/a	41.33 (95.82 %)	121,387 (4.20 %)	121,387 (4.20 %)	133,555 (95.80 %)	3,906,439 (36.43 %)	691,647 (2.39 %)	13,489,368 (32.95 %)	1,869 (0.17 %)	517,424 (4.47 %)	86,751 (2.23 %)	82,633 (2.04 %)
638	spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025) GCA_048593285.1	n/a	n/a	15,188 (0.80 %)	15,406 (0.90 %)	n/a	36.07 (99.97 %)	151 (0.03 %)	151 (0.03 %)	157 (99.97 %)	4,933,924 (23.65 %)	1,239,006 (2.76 %)	20,612,787 (41.98 %)	1 (0.00 %)	575,621 (1.68 %)	21,700 (0.64 %)	21,289 (0.49 %)
639	spotted-tailed quoll (Chaos hap2 2025) GCA_048593245.1	n/a	n/a	15,441 (0.80 %)	15,791 (0.92 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	118 (0.01 %)	118 (0.01 %)	124 (99.99 %)	4,962,547 (23.62 %)	1,257,253 (2.87 %)	20,652,321 (42.01 %)	2 (0.00 %)	597,604 (1.75 %)	22,718 (0.69 %)	22,508 (0.51 %)
640	star-nosed mole GCF_000260355.1	30,444 (2.86 %)	n/a	16,116 (1.82 %)	17,403 (1.78 %)	n/a	41.55 (95.10 %)	82,557 (4.92 %)	82,557 (4.92 %)	84,595 (95.08 %)	1,855,039 (18.90 %)	308,473 (0.86 %)	9,571,561 (26.02 %)	1,110 (0.03 %)	253,120 (1.17 %)	48,079 (2.76 %)	50,592 (2.47 %)
641	Steller sea lion GCF_004028035.1	46,044 (2.38 %)	n/a	21,171 (1.78 %)	21,626 (1.43 %)	36,701 (1.75 %)	41.38 (99.41 %)	17,263 (0.59 %)	18,994 (0.59 %)	24,485 (99.41 %)	4,556,415 (43.53 %)	577,797 (1.09 %)	13,545,012 (33.71 %)	733 (0.02 %)	410,405 (1.19 %)	51,355 (1.45 %)	47,732 (1.28 %)
642	Stephens's kangaroo rat GCA_004024685.1	n/a	n/a	20,638 (1.19 %)	43,541 (1.37 %)	n/a	41.90 (99.85 %)	8,882 (0.04 %)	8,882 (0.04 %)	1,278,525 (99.96 %)	4,886,095 (30.36 %)	1,229,832 (5.30 %)	11,334,494 (44.33 %)	37 (0.00 %)	n/a	38,450 (1.17 %)	29,741 (0.76 %)
643	steppe mouse (ZRU 2018) GCA_003336285.1	n/a	n/a	22,032 (2.17 %)	20,891 (1.41 %)	n/a	41.70 (95.78 %)	123,681 (4.24 %)	123,681 (4.24 %)	161,217 (95.76 %)	4,964,415 (42.35 %)	1,414,584 (2.75 %)	12,989,925 (31.80 %)	1,690 (0.04 %)	440,790 (1.25 %)	17,544 (0.44 %)	15,542 (0.39 %)
644	Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024) GCA_043727835.1	n/a	n/a	19,605 (1.80 %)	20,075 (1.48 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	5 (0.00 %)	87 (0.00 %)	80 (100.00 %)	4,110,913 (40.46 %)	838,212 (2.48 %)	11,938,168 (33.52 %)	2 (0.00 %)	646,825 (2.22 %)	40,424 (1.32 %)	35,299 (1.15 %)
645	straw-colored fruit bat GCA_000465285.1	n/a	n/a	20,161 (1.66 %)	40,283 (1.50 %)	n/a	39.24 (99.62 %)	154,908 (0.40 %)	154,908 (0.40 %)	288,446 (99.60 %)	2,814,732 (32.92 %)	372,539 (1.01 %)	12,351,823 (25.93 %)	27 (0.00 %)	33,439 (0.13 %)	67,245 (2.34 %)	61,933 (1.94 %)
646	stripe-headed round-eared bat GCA_004024845.1	n/a	n/a	20,248 (1.62 %)	29,173 (1.61 %)	n/a	42.04 (99.96 %)	2,860 (0.01 %)	2,860 (0.01 %)	252,670 (99.99 %)	3,018,746 (29.48 %)	333,243 (0.74 %)	12,128,116 (30.51 %)	14 (0.00 %)	n/a	59,513 (1.87 %)	52,210 (1.57 %)
647	striped dolphin (alternate hap 2023) GCA_951394445.1	n/a	n/a	18,204 (1.54 %)	21,036 (1.34 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,464 (100.00 %)	3,767,720 (35.65 %)	1,102,723 (10.92 %)	11,794,617 (40.96 %)	0 (0 %)	1,492,009 (4.69 %)	67,537 (3.57 %)	41,008 (1.09 %)
648	striped dolphin (primary hap 2023) GCA_951394435.1	n/a	n/a	18,595 (1.48 %)	20,637 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1 (0.00 %)	993 (0.01 %)	639 (100.00 %)	4,097,623 (35.88 %)	1,442,973 (13.60 %)	12,327,244 (43.08 %)	1 (0.00 %)	1,896,129 (5.45 %)	68,498 (4.29 %)	42,011 (1.04 %)
649	striped hyena (BS54 2019 Broad) GCA_004023945.1	n/a	n/a	22,373 (1.45 %)	39,382 (1.45 %)	n/a	41.66 (99.93 %)	11,849 (0.05 %)	11,849 (0.05 %)	362,072 (99.95 %)	5,048,667 (42.42 %)	712,073 (1.24 %)	13,879,012 (34.58 %)	54 (0.00 %)	302,752 (0.79 %)	69,835 (2.20 %)	65,774 (1.90 %)
650	striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U) GCF_003009895.1	48,870 (2.41 %)	n/a	18,793 (1.67 %)	20,950 (1.44 %)	n/a	41.56 (99.29 %)	0 (0 %)	23,058 (0.71 %)	5,761 (100.00 %)	4,782,500 (41.88 %)	701,157 (1.32 %)	13,436,624 (33.05 %)	2,049 (0.04 %)	413,871 (1.33 %)	58,977 (2.20 %)	57,500 (1.94 %)
651	sugar glider (PSGF00001 2023) GCA_028583685.1	n/a	n/a	19,326 (0.81 %)	17,560 (0.95 %)	n/a	38.95 (98.12 %)	0 (0 %)	85,933 (1.89 %)	1,895 (100.00 %)	6,382,198 (27.07 %)	1,058,207 (1.74 %)	22,508,040 (39.84 %)	4,157 (0.04 %)	398,213 (0.87 %)	16,224 (0.33 %)	14,028 (0.23 %)
652	sugar glider (PSGF00001 2023) GCF_028583685.1	55,990 (2.41 %)	n/a	19,328 (0.81 %)	17,559 (0.95 %)	n/a	38.95 (98.12 %)	0 (0 %)	85,933 (1.89 %)	1,896 (100.00 %)	6,382,203 (27.07 %)	1,058,208 (1.74 %)	22,508,106 (39.84 %)	4,157 (0.04 %)	398,217 (0.87 %)	16,224 (0.33 %)	14,028 (0.23 %)
653	Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017) GCA_002844835.1	n/a	n/a	20,368 (1.53 %)	24,204 (1.23 %)	n/a	41.05 (95.54 %)	50,874 (4.40 %)	50,876 (4.40 %)	1,112,463 (95.60 %)	4,516,240 (39.90 %)	561,540 (1.56 %)	15,821,451 (34.68 %)	11,238 (0.78 %)	n/a	45,201 (1.03 %)	42,111 (0.93 %)
654	Sumatran serow (serow.1 2024) GCF_032405125.1	36,400 (1.65 %)	n/a	19,192 (1.42 %)	22,014 (1.41 %)	n/a	43.08 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	159 (100.00 %)	3,242,768 (21.18 %)	612,565 (8.05 %)	12,812,990 (44.37 %)	1 (0.00 %)	1,821,554 (4.84 %)	75,177 (5.86 %)	39,082 (0.88 %)
655	Sunda flying lemur (2014 WashU) GCF_000696425.1	34,734 (1.83 %)	n/a	21,356 (1.55 %)	25,832 (1.21 %)	n/a	40.21 (87.96 %)	332,364 (12.07 %)	412,608 (12.07 %)	511,878 (87.93 %)	4,961,153 (38.35 %)	854,441 (3.33 %)	17,562,576 (28.82 %)	58,964 (1.13 %)	n/a	82,988 (1.05 %)	76,682 (0.95 %)
656	Sunda flying lemur (US047 2019 Broad) GCA_004027255.1	n/a	n/a	24,882 (1.29 %)	43,546 (1.12 %)	n/a	40.46 (99.88 %)	5,895 (0.02 %)	5,895 (0.02 %)	1,655,642 (99.98 %)	5,807,241 (38.62 %)	953,765 (2.48 %)	18,836,777 (37.68 %)	23 (0.00 %)	n/a	114,955 (1.43 %)	106,305 (1.30 %)
657	tailed tailless bat GCA_004027475.1	n/a	n/a	19,920 (1.58 %)	28,017 (1.58 %)	n/a	41.76 (99.95 %)	4,640 (0.02 %)	4,640 (0.02 %)	341,895 (99.98 %)	3,139,817 (30.43 %)	381,536 (0.81 %)	12,069,229 (32.73 %)	25 (0.00 %)	n/a	54,528 (2.15 %)	52,231 (1.90 %)
658	tailess tenrec (hap1 2025) GCF_050624435.1	45,770 (1.60 %)	n/a	21,323 (0.86 %)	25,223 (1.02 %)	n/a	44.80 (100.00 %)	0 (0 %)	175 (0.00 %)	2,180 (100.00 %)	5,633,466 (38.91 %)	1,001,072 (14.26 %)	17,866,411 (50.04 %)	0 (0 %)	5,333,247 (8.40 %)	53,320 (1.01 %)	38,205 (0.58 %)
659	takin (Tak-1 2022) GCF_023091745.1	31,927 (1.65 %)	n/a	19,290 (1.42 %)	21,656 (1.27 %)	n/a	43.32 (100.00 %)	0 (0 %)	152 (0.00 %)	1,363 (100.00 %)	3,256,033 (21.01 %)	714,375 (8.32 %)	13,010,154 (44.58 %)	4 (0.00 %)	1,681,924 (4.50 %)	49,134 (7.43 %)	39,324 (0.88 %)
660	Talazac's shrew tenrec GCA_004026705.1	n/a	n/a	22,605 (0.81 %)	50,725 (1.09 %)	n/a	43.03 (99.93 %)	6,619 (0.02 %)	6,619 (0.02 %)	795,514 (99.98 %)	3,493,378 (14.58 %)	705,274 (1.31 %)	20,975,335 (36.85 %)	51 (0.00 %)	n/a	70,793 (1.26 %)	54,287 (0.89 %)
661	tammar wallaby (alternate hap 2023) GCA_028389975.1	n/a	n/a	11,133 (0.77 %)	13,869 (0.98 %)	n/a	38.63 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	14,285 (100.00 %)	3,114,522 (26.10 %)	661,874 (3.02 %)	11,667,649 (38.41 %)	0 (0 %)	320,252 (1.29 %)	12,393 (0.46 %)	7,824 (0.29 %)
662	tammar wallaby (Barry hap1 2025) GCA_048593335.1	n/a	n/a	17,491 (0.79 %)	15,701 (0.88 %)	n/a	38.69 (100.00 %)	32 (0.00 %)	32 (0.00 %)	40 (100.00 %)	5,762,317 (26.52 %)	1,078,692 (1.83 %)	22,476,051 (38.99 %)	0 (0 %)	359,624 (0.79 %)	22,756 (0.48 %)	14,728 (0.29 %)
663	tammar wallaby (Barry hap2 2025) GCA_048593345.1	n/a	n/a	17,037 (0.79 %)	15,066 (0.87 %)	n/a	38.62 (100.00 %)	16 (0.00 %)	16 (0.00 %)	24 (100.00 %)	5,608,153 (26.57 %)	1,050,173 (1.77 %)	21,856,273 (38.96 %)	0 (0 %)	329,638 (0.74 %)	21,811 (0.47 %)	14,145 (0.29 %)
664	tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq) GCF_028372415.1	73,219 (3.07 %)	n/a	17,615 (0.77 %)	15,415 (0.86 %)	n/a	38.73 (99.81 %)	0 (0 %)	515 (0.19 %)	272 (100.00 %)	5,866,314 (26.30 %)	1,193,604 (2.72 %)	22,677,480 (39.53 %)	4 (0.00 %)	565,991 (1.21 %)	23,590 (0.47 %)	14,746 (0.29 %)
665	Tasmanian devil (McLovin hap1 2025) GCA_048593225.1	n/a	n/a	15,725 (0.77 %)	16,721 (0.92 %)	n/a	36.17 (99.49 %)	1,514 (0.51 %)	1,514 (0.51 %)	1,521 (99.49 %)	5,222,976 (23.42 %)	1,357,438 (3.95 %)	21,705,122 (42.26 %)	2 (0.00 %)	779,205 (1.97 %)	24,443 (0.70 %)	24,411 (0.52 %)
666	Tasmanian devil (McLovin hap2 2025) GCA_048593325.1	n/a	n/a	15,165 (0.76 %)	15,663 (0.91 %)	n/a	36.00 (99.11 %)	2,578 (0.89 %)	2,578 (0.89 %)	2,584 (99.11 %)	5,039,957 (23.64 %)	1,257,168 (2.97 %)	20,893,744 (41.44 %)	4 (0.00 %)	610,743 (1.64 %)	22,574 (0.67 %)	22,546 (0.51 %)
667	Tasmanian devil (primary hap 2019) GCF_902635505.1	52,070 (2.36 %)	n/a	15,918 (0.85 %)	16,111 (0.91 %)	n/a	36.16 (100.00 %)	0 (0 %)	354 (0.00 %)	106 (100.00 %)	6,789,158 (44.28 %)	1,246,027 (2.19 %)	21,434,803 (41.20 %)	1 (0.00 %)	454,463 (1.20 %)	23,609 (0.65 %)	23,356 (0.61 %)
668	thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC) GCF_016881025.1	69,352 (3.50 %)	n/a	18,934 (1.68 %)	16,775 (1.37 %)	n/a	39.91 (93.25 %)	0 (0 %)	146,412 (6.77 %)	7,132 (100.00 %)	4,262,890 (35.64 %)	640,624 (1.64 %)	14,118,452 (27.90 %)	3,000 (0.05 %)	226,596 (0.80 %)	28,317 (0.64 %)	26,522 (0.58 %)
669	thirteen-lined ground squirrel (mIctTri1hap1 2025) GCF_052094955.1	91,025 (3.74 %)	n/a	19,425 (1.31 %)	20,977 (1.20 %)	n/a	40.31 (99.99 %)	0 (0 %)	1,444 (0.01 %)	5,279 (100.00 %)	6,062,154 (43.45 %)	940,716 (10.02 %)	16,322,064 (37.64 %)	11 (0.00 %)	2,274,560 (4.34 %)	34,544 (0.73 %)	31,733 (0.65 %)
670	Tibetan sand fox (lyu1992 2022) GCA_024500485.1	n/a	n/a	19,552 (1.59 %)	19,307 (1.35 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	0 (0 %)	145 (0.00 %)	234 (100.00 %)	4,500,832 (32.18 %)	999,068 (2.01 %)	13,646,015 (32.98 %)	0 (0 %)	668,288 (1.70 %)	49,402 (2.19 %)	47,111 (1.57 %)
671	tiger GCF_018350195.1	71,226 (2.84 %)	n/a	18,513 (1.68 %)	19,919 (1.39 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	56 (0.00 %)	65 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,878,003 (42.77 %)	912,595 (1.82 %)	13,804,650 (33.76 %)	1 (0.00 %)	408,593 (1.10 %)	64,312 (2.55 %)	60,048 (2.06 %)
672	Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230055.1	n/a	n/a	19,370 (1.77 %)	21,062 (1.61 %)	n/a	42.81 (100.00 %)	219 (0.00 %)	219 (0.00 %)	610 (100.00 %)	2,923,694 (25.49 %)	772,382 (3.25 %)	10,654,074 (37.41 %)	2 (0.00 %)	500,435 (1.74 %)	48,226 (2.42 %)	50,955 (1.88 %)
673	Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230045.1	n/a	n/a	18,627 (1.82 %)	20,108 (1.67 %)	n/a	42.95 (100.00 %)	0 (0 %)	217 (0.00 %)	182 (100.00 %)	2,733,927 (24.79 %)	715,258 (3.17 %)	10,099,456 (36.35 %)	1 (0.00 %)	459,634 (1.69 %)	47,139 (2.58 %)	49,626 (1.96 %)
674	Transcaucasian mole vole GCA_001685075.1	n/a	n/a	20,173 (1.62 %)	18,627 (1.30 %)	n/a	41.51 (96.09 %)	440,846 (3.96 %)	440,846 (3.96 %)	499,269 (96.04 %)	3,827,136 (25.51 %)	810,597 (2.65 %)	13,634,524 (27.54 %)	26,487 (0.57 %)	259,635 (1.42 %)	9,596 (0.16 %)	8,622 (0.14 %)
675	trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024) GCA_043728145.1	n/a	n/a	18,871 (1.79 %)	20,351 (1.55 %)	n/a	40.66 (99.99 %)	10 (0.00 %)	397 (0.01 %)	136 (100.00 %)	3,580,957 (40.75 %)	683,947 (2.19 %)	11,464,418 (33.39 %)	23 (0.00 %)	658,821 (2.63 %)	37,175 (1.31 %)	29,161 (1.04 %)
676	True's beaked whale (hap1.1 2024) GCA_964341445.1	n/a	n/a	19,530 (1.21 %)	24,576 (1.13 %)	n/a	42.48 (99.99 %)	0 (0 %)	1,240 (0.01 %)	2,757 (100.00 %)	4,847,855 (34.88 %)	949,927 (20.01 %)	10,981,914 (51.51 %)	11 (0.00 %)	5,641,807 (11.20 %)	91,880 (2.74 %)	39,724 (0.76 %)
677	True's beaked whale (hap2.1 2024) GCA_964341485.1	n/a	n/a	19,313 (1.40 %)	22,642 (1.25 %)	n/a	42.03 (99.99 %)	1,073 (0.01 %)	1,073 (0.01 %)	2,457 (99.99 %)	4,540,507 (37.61 %)	826,104 (12.82 %)	11,296,445 (45.25 %)	8 (0.00 %)	3,246,098 (7.56 %)	80,840 (2.24 %)	38,974 (0.87 %)
678	Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq) GCF_000622305.1	54,680 (2.07 %)	n/a	19,704 (1.26 %)	21,262 (1.20 %)	n/a	41.26 (95.18 %)	201,121 (4.83 %)	201,121 (4.83 %)	356,097 (95.17 %)	6,165,645 (34.95 %)	1,197,750 (2.77 %)	16,282,383 (36.21 %)	730 (0.04 %)	n/a	22,905 (0.49 %)	18,563 (0.39 %)
679	Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019) GCA_005458795.1	n/a	n/a	19,867 (1.62 %)	15,893 (1.33 %)	n/a	39.77 (94.43 %)	291,728 (5.60 %)	296,819 (5.60 %)	315,631 (94.40 %)	4,452,628 (33.94 %)	751,210 (1.84 %)	13,917,879 (30.08 %)	10,755 (0.11 %)	190,776 (0.77 %)	26,541 (0.58 %)	25,046 (0.53 %)
680	vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019) GCA_008692045.1	n/a	n/a	9,367 (1.66 %)	11,297 (1.30 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	9,470 (100.00 %)	1,708,360 (43.81 %)	267,584 (1.67 %)	5,373,410 (33.52 %)	0 (0 %)	245,754 (1.84 %)	29,783 (1.94 %)	21,396 (1.51 %)
681	vaquita (mPhoSin1 2019) GCF_008692025.1	60,106 (3.00 %)	n/a	18,611 (1.76 %)	20,103 (1.39 %)	35,176 (2.22 %)	41.36 (99.66 %)	0 (0 %)	212 (0.34 %)	64 (100.00 %)	4,067,454 (44.25 %)	602,407 (1.34 %)	12,468,582 (35.55 %)	3 (0.00 %)	550,113 (1.71 %)	66,806 (1.79 %)	48,624 (1.46 %)
682	water buffalo (Mediterranean 2018) GCF_003121395.1	69,771 (3.14 %)	62,816 (2.76 %)	19,465 (1.58 %)	21,849 (1.37 %)	46,051 (1.86 %)	41.81 (99.99 %)	0 (0 %)	410 (0.01 %)	509 (100.00 %)	5,407,697 (47.11 %)	473,976 (1.54 %)	13,015,899 (41.23 %)	0 (0 %)	1,256,741 (3.44 %)	43,120 (1.15 %)	37,204 (0.96 %)
683	water buffalo (Murrah 2021) GCF_019923935.1	80,565 (3.26 %)	n/a	19,402 (1.59 %)	20,375 (1.31 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	0 (0 %)	659 (0.00 %)	26 (100.00 %)	5,358,548 (47.11 %)	447,338 (1.14 %)	13,034,537 (41.28 %)	1 (0.00 %)	1,149,595 (3.22 %)	40,189 (1.07 %)	36,130 (0.95 %)
684	water vole (JQ59JK4JDI 2023) GCA_019206885.2	n/a	n/a	18,401 (2.03 %)	18,085 (1.65 %)	n/a	42.19 (89.99 %)	0 (0 %)	161,581 (10.04 %)	2,585 (100.00 %)	4,771,963 (38.17 %)	705,400 (1.96 %)	11,410,837 (25.00 %)	14,627 (0.18 %)	239,938 (0.72 %)	16,195 (0.52 %)	15,532 (0.49 %)
685	Weddell seal (WS11-02 2013 refseq) GCF_000349705.1	48,264 (2.73 %)	n/a	21,063 (1.73 %)	22,333 (1.43 %)	n/a	41.39 (70.44 %)	152,836 (29.58 %)	152,836 (29.58 %)	169,547 (70.42 %)	4,420,479 (41.72 %)	471,256 (0.66 %)	13,410,237 (22.09 %)	2,022 (0.05 %)	348,917 (1.08 %)	48,738 (1.01 %)	44,867 (0.88 %)
686	western European hedgehog (2012 refseq) GCF_000296755.1	29,923 (1.67 %)	n/a	18,067 (1.33 %)	19,777 (1.35 %)	n/a	41.54 (85.94 %)	219,764 (14.09 %)	219,764 (14.09 %)	225,567 (85.91 %)	6,594,783 (45.66 %)	1,271,533 (2.29 %)	12,374,161 (42.02 %)	3,596 (0.06 %)	861,216 (2.39 %)	28,528 (0.71 %)	23,900 (0.52 %)
687	western European hedgehog (alternate hap 2023) GCA_950295305.1	n/a	n/a	14,370 (1.06 %)	24,297 (1.27 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	26,601 (100.00 %)	3,360,923 (19.59 %)	1,043,098 (3.92 %)	8,511,380 (53.68 %)	0 (0 %)	1,216,984 (4.33 %)	23,321 (0.97 %)	17,608 (0.60 %)
688	western European hedgehog (primary hap 2023 refseq) GCF_950295315.1	61,103 (2.36 %)	n/a	18,125 (1.16 %)	20,689 (1.21 %)	n/a	42.00 (99.97 %)	0 (0 %)	3,760 (0.03 %)	1,174 (100.00 %)	4,891,329 (19.68 %)	1,507,929 (3.81 %)	12,571,105 (54.50 %)	7 (0.00 %)	1,975,693 (4.67 %)	32,667 (0.90 %)	24,067 (0.56 %)
689	western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022) GCA_921998345.2	n/a	n/a	21,722 (2.14 %)	19,586 (1.39 %)	108,856 (4.46 %)	41.81 (98.87 %)	1 (0.00 %)	1,233 (1.13 %)	233 (100.00 %)	4,634,551 (40.61 %)	1,541,826 (3.49 %)	13,030,566 (35.21 %)	1 (0.00 %)	789,553 (2.49 %)	22,985 (0.56 %)	15,853 (0.42 %)
690	western roe deer (2023) GCA_951849835.1	n/a	n/a	20,291 (1.29 %)	23,555 (1.23 %)	n/a	42.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	212 (100.00 %)	4,204,612 (25.49 %)	848,463 (7.79 %)	12,687,776 (48.28 %)	0 (0 %)	3,910,662 (7.70 %)	57,315 (1.25 %)	43,092 (0.85 %)
691	western spotted skunk GCA_004023965.1	n/a	n/a	21,665 (1.46 %)	34,370 (1.32 %)	n/a	41.61 (99.92 %)	11,822 (0.05 %)	11,822 (0.05 %)	433,831 (99.95 %)	4,889,781 (40.77 %)	901,906 (2.30 %)	13,931,764 (34.80 %)	69 (0.00 %)	550,674 (1.31 %)	54,394 (1.54 %)	50,665 (1.39 %)
692	western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022) GCA_921997135.2	n/a	n/a	21,699 (2.10 %)	18,837 (1.32 %)	n/a	41.69 (99.51 %)	4 (0.00 %)	1,576 (0.49 %)	143 (100.00 %)	4,507,329 (41.24 %)	1,517,241 (3.77 %)	12,832,499 (36.17 %)	35 (0.00 %)	908,992 (2.83 %)	22,568 (0.53 %)	15,701 (0.41 %)
693	whiskered bat (hap1 2024) GCA_964094495.2	n/a	n/a	19,504 (1.78 %)	22,272 (1.73 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	7 (0.00 %)	1,566 (0.02 %)	533 (100.00 %)	3,046,246 (25.06 %)	753,151 (4.86 %)	10,596,418 (37.62 %)	7 (0.00 %)	729,123 (2.57 %)	66,785 (2.55 %)	53,825 (1.76 %)
694	whiskered bat (hap2 2024) GCA_964195625.1	n/a	n/a	18,681 (1.83 %)	21,523 (1.79 %)	n/a	43.13 (99.99 %)	1,414 (0.01 %)	1,414 (0.01 %)	1,741 (99.99 %)	2,849,223 (24.50 %)	688,594 (4.80 %)	9,968,980 (36.80 %)	9 (0.00 %)	650,767 (2.46 %)	64,365 (2.68 %)	52,706 (1.84 %)
695	white-beaked dolphin (alternate hap 2023) GCA_949774935.1	n/a	n/a	17,639 (1.50 %)	25,684 (1.35 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25,619 (100.00 %)	3,039,324 (36.05 %)	637,912 (8.02 %)	9,746,398 (38.98 %)	0 (0 %)	811,711 (3.51 %)	56,325 (3.33 %)	35,586 (1.15 %)
696	white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq) GCF_949774975.1	59,995 (2.43 %)	n/a	18,737 (1.57 %)	20,767 (1.34 %)	n/a	41.91 (99.99 %)	0 (0 %)	1,070 (0.01 %)	410 (100.00 %)	3,820,566 (36.21 %)	922,103 (8.43 %)	12,304,360 (39.74 %)	2 (0.00 %)	1,117,804 (3.60 %)	68,551 (3.58 %)	41,698 (1.09 %)
697	white-footed mouse (LL stock 2020) GCF_004664715.2	54,479 (2.82 %)	n/a	19,971 (1.69 %)	20,132 (1.42 %)	n/a	42.23 (99.95 %)	0 (0 %)	2,299 (0.05 %)	1,857 (100.00 %)	5,060,487 (30.71 %)	1,258,073 (2.85 %)	14,007,098 (32.99 %)	1 (0.00 %)	568,416 (1.60 %)	23,456 (0.67 %)	19,779 (0.50 %)
698	white-tailed deer (Illinois 20LAN1187 2024) GCF_023699985.2	68,660 (3.60 %)	n/a	19,951 (1.73 %)	21,804 (1.48 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	237 (0.00 %)	294 (0.00 %)	718 (100.00 %)	4,512,173 (43.10 %)	402,481 (1.14 %)	12,813,223 (37.56 %)	0 (0 %)	544,080 (1.60 %)	45,863 (1.30 %)	41,250 (1.17 %)
699	white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq) GCF_002102435.1	57,787 (2.93 %)	n/a	20,661 (1.75 %)	23,085 (1.50 %)	40,987 (1.94 %)	41.55 (99.10 %)	31,627 (0.90 %)	107,058 (0.91 %)	48,653 (99.10 %)	4,800,704 (41.29 %)	413,129 (2.59 %)	13,296,779 (34.22 %)	7,681 (0.08 %)	439,019 (2.88 %)	44,165 (1.19 %)	41,200 (1.10 %)
700	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022) GCA_024140225.1	n/a	n/a	12,198 (1.10 %)	18,494 (1.29 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	26 (0.00 %)	26 (0.00 %)	14,841 (100.00 %)	1,725,021 (17.81 %)	802,415 (4.26 %)	8,321,474 (45.72 %)	0 (0 %)	653,092 (2.79 %)	15,669 (0.79 %)	13,175 (0.55 %)
701	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022) GCF_024139225.1	40,430 (1.81 %)	n/a	17,575 (1.21 %)	21,880 (1.35 %)	47,496 (1.55 %)	39.81 (99.57 %)	0 (0 %)	1,010 (0.43 %)	147 (100.00 %)	2,846,063 (18.57 %)	1,252,362 (3.89 %)	13,776,063 (46.50 %)	14 (0.00 %)	1,059,317 (2.87 %)	24,589 (0.78 %)	20,877 (0.55 %)
702	wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020) GCF_009834535.1	70,235 (4.11 %)	n/a	18,202 (1.93 %)	20,199 (1.66 %)	42,728 (2.35 %)	41.66 (99.99 %)	0 (0 %)	2,345 (0.01 %)	2,043 (100.00 %)	3,091,018 (33.31 %)	332,720 (5.33 %)	12,161,286 (28.79 %)	5 (0.00 %)	978,328 (2.98 %)	55,524 (1.75 %)	51,693 (1.56 %)
703	wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq) GCF_000311805.1	34,726 (2.40 %)	n/a	18,746 (1.96 %)	17,104 (1.61 %)	n/a	41.28 (98.83 %)	55,538 (1.18 %)	60,971 (1.18 %)	68,872 (98.82 %)	2,991,821 (33.93 %)	353,632 (1.23 %)	12,349,615 (25.12 %)	11 (0.00 %)	101,845 (0.63 %)	45,437 (1.02 %)	41,010 (0.88 %)
704	wild goat GCA_000978405.1	n/a	n/a	19,104 (1.48 %)	16,198 (1.21 %)	n/a	41.91 (91.72 %)	279,195 (8.31 %)	279,195 (8.31 %)	368,693 (91.69 %)	5,563,294 (45.39 %)	452,402 (1.99 %)	13,802,376 (35.47 %)	3,626 (0.18 %)	791,539 (4.01 %)	41,935 (0.63 %)	35,405 (0.52 %)
705	wild yak (GX-2022 2023) GCF_027580195.1	52,505 (2.90 %)	n/a	19,278 (1.60 %)	20,813 (1.31 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	0 (0 %)	196 (0.00 %)	2,040 (100.00 %)	5,706,841 (46.71 %)	464,013 (1.82 %)	12,973,198 (41.46 %)	0 (0 %)	1,346,892 (3.70 %)	42,508 (1.32 %)	39,621 (1.15 %)
706	wild yak (yakQH1 2013) GCF_000298355.1	29,789 (1.92 %)	n/a	19,936 (1.62 %)	19,914 (1.32 %)	n/a	41.71 (95.48 %)	192,006 (4.54 %)	192,006 (4.54 %)	233,198 (95.46 %)	5,348,663 (46.08 %)	449,880 (1.38 %)	13,572,902 (36.62 %)	139 (0.01 %)	753,906 (2.31 %)	41,147 (0.82 %)	37,405 (0.73 %)
707	winter white dwarf (Siberian hamster Psun_Stras_1 2023) GCA_030556225.1	n/a	n/a	18,177 (1.88 %)	18,942 (1.54 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	742 (100.00 %)	5,398,126 (39.36 %)	1,168,723 (3.56 %)	12,272,233 (30.38 %)	0 (0 %)	500,811 (1.32 %)	18,332 (0.60 %)	16,608 (0.53 %)
708	woodchuck (v1.1 L192 2022) GCF_021218885.2	68,030 (3.47 %)	n/a	19,116 (1.55 %)	21,017 (1.38 %)	n/a	39.92 (100.00 %)	47 (0.00 %)	47 (0.00 %)	3,380 (100.00 %)	5,285,788 (43.20 %)	912,552 (2.73 %)	14,538,866 (35.15 %)	0 (0 %)	413,178 (1.33 %)	36,914 (1.02 %)	26,813 (0.66 %)
709	woodland dormouse GCA_004027655.1	n/a	n/a	23,556 (1.09 %)	55,517 (1.33 %)	n/a	41.52 (99.86 %)	15,691 (0.06 %)	15,691 (0.06 %)	1,283,630 (99.94 %)	7,674,195 (34.99 %)	1,698,258 (3.76 %)	13,705,886 (42.23 %)	20 (0.00 %)	n/a	68,562 (1.41 %)	46,064 (0.97 %)
710	woodland thicket rat GCF_004785775.1	43,129 (2.40 %)	n/a	22,710 (2.13 %)	21,042 (1.49 %)	n/a	41.17 (98.57 %)	0 (0 %)	76,623 (1.44 %)	23,656 (100.00 %)	4,732,544 (38.04 %)	1,424,025 (3.23 %)	13,549,399 (30.42 %)	5,008 (0.04 %)	449,709 (1.17 %)	18,232 (0.48 %)	16,831 (0.43 %)
711	woolly hare (The Qinghai-Tibet Plateau SH-2023 2024) GCA_036325905.1	n/a	n/a	19,363 (1.28 %)	22,239 (1.28 %)	n/a	44.08 (100.00 %)	0 (0 %)	240 (0.00 %)	112 (100.00 %)	4,432,114 (42.23 %)	966,165 (7.11 %)	13,263,822 (43.77 %)	1 (0.00 %)	1,913,575 (4.39 %)	96,755 (2.28 %)	70,154 (1.73 %)
712	Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq) GCF_003031525.2	43,310 (2.49 %)	n/a	18,747 (1.81 %)	19,638 (1.46 %)	n/a	41.28 (99.29 %)	52,647 (0.72 %)	52,647 (0.72 %)	66,343 (99.28 %)	3,547,466 (35.83 %)	540,760 (1.65 %)	12,691,756 (32.88 %)	427 (0.03 %)	363,612 (1.97 %)	59,050 (1.48 %)	55,323 (1.35 %)
713	Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq) GCF_000442215.2	26,128 (1.61 %)	n/a	18,978 (1.74 %)	20,661 (1.39 %)	n/a	41.24 (98.69 %)	123,788 (1.33 %)	123,788 (1.33 %)	148,598 (98.67 %)	3,788,303 (37.04 %)	690,288 (1.96 %)	12,841,906 (35.04 %)	292 (0.02 %)	514,620 (2.01 %)	62,458 (1.54 %)	59,005 (1.41 %)
714	yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq) GCF_047511675.1	55,299 (2.52 %)	n/a	19,502 (1.44 %)	20,297 (1.34 %)	n/a	39.90 (100.00 %)	0 (0 %)	330 (0.00 %)	813 (100.00 %)	4,038,893 (29.07 %)	978,915 (3.28 %)	14,404,633 (34.97 %)	4 (0.00 %)	446,138 (1.44 %)	36,674 (1.05 %)	27,659 (0.61 %)
715	yellow-bellied marmot (hap2 2025) GCA_047512175.1	n/a	n/a	18,677 (1.51 %)	19,370 (1.40 %)	n/a	40.03 (100.00 %)	0 (0 %)	307 (0.00 %)	329 (100.00 %)	3,694,109 (28.05 %)	793,102 (2.43 %)	13,585,913 (33.39 %)	4 (0.00 %)	351,043 (1.26 %)	33,990 (1.02 %)	26,212 (0.65 %)
716	yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019) GCF_003676075.3	42,667 (2.16 %)	n/a	19,547 (1.52 %)	21,406 (1.40 %)	n/a	39.89 (97.96 %)	34,682 (2.04 %)	35,509 (2.04 %)	66,442 (97.96 %)	3,814,223 (27.39 %)	800,865 (1.96 %)	14,323,977 (32.63 %)	1,266 (0.04 %)	210,361 (0.69 %)	34,122 (0.91 %)	26,843 (0.62 %)
717	yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021) GCF_016432865.1	47,618 (2.51 %)	n/a	15,703 (0.78 %)	16,155 (0.90 %)	n/a	36.21 (99.99 %)	0 (0 %)	620 (0.01 %)	486 (100.00 %)	5,191,383 (23.81 %)	1,269,772 (2.59 %)	21,430,585 (42.69 %)	2 (0.00 %)	714,623 (2.20 %)	28,118 (0.66 %)	28,157 (0.56 %)
718	yellow-spotted hyrax GCA_004026845.1	n/a	n/a	20,424 (0.86 %)	43,984 (1.27 %)	n/a	40.93 (99.94 %)	3,815 (0.01 %)	3,815 (0.01 %)	971,748 (99.99 %)	5,365,974 (31.41 %)	435,699 (1.22 %)	21,229,266 (45.17 %)	42 (0.00 %)	n/a	38,521 (0.68 %)	31,852 (0.55 %)
719	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023) GCA_028571685.1	n/a	n/a	17,610 (1.00 %)	20,322 (1.04 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	0 (0 %)	276 (0.00 %)	62 (100.00 %)	3,295,935 (23.58 %)	389,907 (6.37 %)	19,525,382 (45.90 %)	0 (0 %)	1,020,287 (2.23 %)	31,831 (0.63 %)	26,588 (0.47 %)
720	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023) GCA_028571665.1	n/a	n/a	16,320 (1.03 %)	20,318 (1.13 %)	n/a	40.93 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	4,169 (100.00 %)	2,911,332 (23.50 %)	347,110 (4.57 %)	17,256,419 (44.04 %)	0 (0 %)	683,195 (1.71 %)	28,674 (0.68 %)	24,228 (0.50 %)
721	Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024) GCA_043880425.1	n/a	n/a	18,352 (1.71 %)	20,233 (1.46 %)	n/a	41.73 (100.00 %)	44 (0.00 %)	196 (0.00 %)	1,530 (100.00 %)	3,466,695 (41.95 %)	934,524 (8.81 %)	11,690,112 (36.30 %)	0 (0 %)	1,908,821 (5.07 %)	35,257 (5.20 %)	27,363 (0.98 %)
722	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023) GCA_028536395.1	n/a	n/a	19,188 (1.79 %)	21,673 (1.72 %)	n/a	43.03 (100.00 %)	0 (0 %)	215 (0.00 %)	250 (100.00 %)	3,043,589 (24.76 %)	773,853 (4.49 %)	10,648,494 (37.26 %)	2 (0.00 %)	684,501 (2.39 %)	61,910 (2.52 %)	51,884 (1.68 %)
723	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 refseq) GCF_028538775.1	48,707 (3.25 %)	n/a	18,807 (1.93 %)	21,046 (1.76 %)	n/a	43.22 (100.00 %)	209 (0.00 %)	209 (0.00 %)	684 (100.00 %)	3,552,235 (38.46 %)	719,552 (4.26 %)	10,089,365 (36.35 %)	0 (0 %)	648,904 (2.37 %)	60,974 (2.61 %)	54,521 (2.25 %)
724	zebu cattle (Hainan HN024 2024) GCA_039881165.1	n/a	n/a	19,162 (1.53 %)	20,991 (1.34 %)	n/a	41.77 (99.99 %)	0 (0 %)	350 (0.01 %)	292 (100.00 %)	3,296,209 (23.14 %)	440,574 (1.28 %)	12,824,144 (40.98 %)	0 (0 %)	1,191,569 (3.42 %)	39,400 (1.07 %)	35,669 (0.87 %)
725	zebu cattle (Nelore 2014 refseq) GCF_000247795.1	39,830 (2.52 %)	n/a	18,603 (1.59 %)	18,779 (1.29 %)	n/a	41.75 (92.62 %)	253,738 (7.41 %)	6,941,272 (7.66 %)	253,770 (92.59 %)	5,119,428 (46.84 %)	358,908 (0.88 %)	13,431,672 (36.60 %)	476 (0.01 %)	998,817 (3.00 %)	35,241 (0.84 %)	32,220 (0.75 %)
726	zebu cattle (Sahiwal x Tharparkar maternal NIAB-ARS_2022 2023) GCF_029378745.1	70,745 (4.27 %)	n/a	19,546 (1.58 %)	21,187 (1.33 %)	n/a	41.86 (100.00 %)	0 (0 %)	283 (0.00 %)	67 (100.00 %)	5,530,890 (46.61 %)	459,827 (1.43 %)	13,190,355 (41.36 %)	0 (0 %)	1,188,902 (3.30 %)	42,544 (1.21 %)	38,882 (1.11 %)
TOTALS:	total assembly count 726

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Primates	605 assemblies	assembly stats	track stats
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