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HPRC - Human Pangenome Reference Consortium assembly hubs, track statistics
This assembly hub contains assemblies released by the Human Pangenome Reference Consortium.
See also: hub access, assembly statistics
Data resource links
NOTE: Click on the column headers to sort the table by that columnThe link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
| count | common name link to genome browser |
ncbiRefSeq | ncbiGene | xenoRefGene | augustus genes |
Ensembl genes |
gc5 base | AGP gap |
all gaps |
assembly sequences |
Repeat Masker |
TRF simpleRepeat |
window Masker |
gap Overlap |
tandem Dups |
cpg unmasked |
cpg island |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | human (HG00438.mat 2021) GCA_018471515.1 |
n/a | n/a | 20,788 (1.85 %) |
22,424 (1.25 %) |
233,427 (57.20 %) |
40.83 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 258 (100.00 %) |
5,426,471 (53.12 %) |
1,085,458 (7.66 %) |
16,023,596 (40.44 %) |
0 (0 %) |
1,660,644 (3.30 %) |
52,702 (1.17 %) |
28,454 (0.75 %) |
| 2 | human (HG00438.pat 2021) GCA_018472595.1 |
n/a | n/a | 20,627 (1.85 %) |
22,176 (1.24 %) |
233,698 (4.96 %) |
40.82 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
276 (100.00 %) |
5,419,334 (52.97 %) |
1,071,302 (7.38 %) |
15,894,505 (40.10 %) |
0 (0 %) |
1,681,408 (3.32 %) |
52,377 (1.20 %) |
28,532 (0.76 %) |
| 3 | human (HG00621.mat 2021) GCA_018472605.1 |
n/a | n/a | 20,611 (1.85 %) |
22,275 (1.25 %) |
233,258 (4.96 %) |
40.86 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 253 (100.00 %) |
5,392,161 (53.03 %) |
1,048,372 (7.50 %) |
15,960,374 (40.31 %) |
0 (0 %) |
1,701,207 (3.32 %) |
52,502 (1.20 %) |
28,554 (0.77 %) |
| 4 | human (HG00621.pat 2021) GCA_018472575.1 |
n/a | n/a | 19,907 (1.86 %) |
21,558 (1.26 %) |
227,172 (5.00 %) |
40.88 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 287 (100.00 %) |
5,174,496 (52.83 %) |
1,030,071 (7.85 %) |
15,147,153 (40.18 %) |
0 (0 %) |
1,671,972 (3.41 %) |
50,988 (1.20 %) |
27,845 (0.76 %) |
| 5 | human (HG00673.mat 2021) GCA_018472565.1 |
n/a | n/a | 20,805 (1.84 %) |
22,193 (1.24 %) |
233,975 (4.93 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 348 (100.00 %) |
5,408,639 (53.33 %) |
1,056,398 (8.05 %) |
16,117,475 (40.76 %) |
0 (0 %) |
1,829,654 (3.54 %) |
52,411 (1.14 %) |
28,185 (0.74 %) |
| 6 | human (HG00673.pat 2021) GCA_018472585.1 |
n/a | n/a | 19,963 (1.85 %) |
21,514 (1.25 %) |
227,480 (4.97 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
2 (0.00 %) |
420 (100.00 %) |
5,185,516 (53.08 %) |
1,065,657 (8.25 %) |
15,183,778 (40.61 %) |
0 (0 %) |
1,749,434 (3.59 %) |
50,883 (1.20 %) |
27,934 (0.76 %) |
| 7 | human (HG00733.mat 2021) GCA_018506975.1 |
n/a | n/a | 20,626 (1.85 %) |
22,511 (1.25 %) |
233,295 (4.96 %) |
40.87 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
609 (100.00 %) |
5,412,701 (52.97 %) |
1,052,600 (7.34 %) |
15,895,725 (40.14 %) |
0 (0 %) |
1,726,181 (3.39 %) |
53,216 (1.22 %) |
28,848 (0.77 %) |
| 8 | human (HG00733.pat 2021) GCA_018506955.1 |
n/a | n/a | 20,749 (1.85 %) |
22,251 (1.24 %) |
233,792 (4.94 %) |
40.83 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
695 (100.00 %) |
5,420,299 (53.15 %) |
1,076,604 (7.72 %) |
15,964,663 (40.46 %) |
0 (0 %) |
1,774,653 (3.49 %) |
53,315 (1.19 %) |
28,785 (0.76 %) |
| 9 | human (HG00735.mat 2021) GCA_018472765.1 |
n/a | n/a | 20,674 (1.84 %) |
22,283 (1.25 %) |
233,363 (4.94 %) |
40.80 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
244 (100.00 %) |
5,406,821 (53.15 %) |
1,060,553 (7.74 %) |
16,051,646 (40.51 %) |
0 (0 %) |
1,735,619 (3.39 %) |
52,343 (1.14 %) |
28,228 (0.74 %) |
| 10 | human (HG00735.pat 2021) GCA_018472715.1 |
n/a | n/a | 20,688 (1.84 %) |
22,080 (1.23 %) |
233,237 (4.95 %) |
40.80 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
299 (100.00 %) |
5,391,900 (53.13 %) |
1,050,251 (7.66 %) |
16,052,188 (40.43 %) |
0 (0 %) |
1,770,137 (3.44 %) |
52,436 (1.14 %) |
28,192 (0.74 %) |
| 11 | human (HG00741.mat 2021) GCA_018471095.1 |
n/a | n/a | 20,654 (1.85 %) |
22,309 (1.25 %) |
233,294 (4.94 %) |
40.83 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 297 (100.00 %) |
5,410,814 (53.14 %) |
1,059,472 (7.72 %) |
16,043,406 (40.45 %) |
0 (0 %) |
1,792,676 (3.47 %) |
52,535 (1.14 %) |
28,292 (0.75 %) |
| 12 | human (HG00741.pat 2021) GCA_018471105.1 |
n/a | n/a | 20,657 (1.85 %) |
22,458 (1.25 %) |
233,356 (4.95 %) |
40.86 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
289 (100.00 %) |
5,397,570 (53.08 %) |
1,046,743 (7.55 %) |
16,021,887 (40.41 %) |
0 (0 %) |
1,730,728 (3.37 %) |
52,164 (1.20 %) |
28,347 (0.75 %) |
| 13 | human (HG01071.mat 2021) GCA_018472685.1 |
n/a | n/a | 20,742 (1.86 %) |
22,169 (1.25 %) |
233,386 (4.98 %) |
40.86 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 236 (100.00 %) |
5,380,815 (52.80 %) |
1,031,609 (7.04 %) |
16,008,178 (39.99 %) |
0 (0 %) |
1,619,715 (3.18 %) |
52,233 (1.13 %) |
28,193 (0.74 %) |
| 14 | human (HG01071.pat 2021) GCA_018472725.1 |
n/a | n/a | 20,694 (1.84 %) |
22,451 (1.25 %) |
232,969 (4.90 %) |
40.75 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
330 (100.00 %) |
5,420,540 (53.42 %) |
1,100,044 (8.26 %) |
15,926,032 (40.73 %) |
0 (0 %) |
1,834,663 (3.60 %) |
52,706 (1.14 %) |
28,522 (0.75 %) |
| 15 | human (HG01106.mat 2021) GCA_018471345.1 |
n/a | n/a | 20,635 (1.85 %) |
22,311 (1.24 %) |
233,162 (4.93 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
272 (100.00 %) |
5,394,949 (53.13 %) |
1,045,161 (7.68 %) |
15,896,292 (40.33 %) |
0 (0 %) |
1,825,502 (3.52 %) |
52,604 (1.18 %) |
28,412 (0.76 %) |
| 16 | human (HG01106.pat 2021) GCA_018471075.1 |
n/a | n/a | 19,939 (1.84 %) |
21,482 (1.25 %) |
227,418 (4.97 %) |
40.82 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 284 (100.00 %) |
5,199,262 (53.10 %) |
1,073,766 (8.08 %) |
15,085,301 (40.44 %) |
0 (0 %) |
1,716,731 (3.55 %) |
51,050 (1.19 %) |
27,890 (0.76 %) |
| 17 | human (HG01109.mat 2021) GCA_018504365.1 |
n/a | n/a | 20,638 (1.84 %) |
22,373 (1.25 %) |
233,201 (4.94 %) |
40.83 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
399 (100.00 %) |
5,405,239 (53.13 %) |
1,058,194 (7.69 %) |
15,910,496 (40.38 %) |
0 (0 %) |
1,751,509 (3.43 %) |
53,236 (1.22 %) |
28,762 (0.77 %) |
| 18 | human (HG01109.pat 2021) GCA_018504645.1 |
n/a | n/a | 19,870 (1.85 %) |
21,659 (1.26 %) |
227,481 (4.98 %) |
40.81 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
473 (100.00 %) |
5,197,395 (52.95 %) |
1,071,566 (7.99 %) |
15,109,996 (40.28 %) |
0 (0 %) |
1,724,212 (3.57 %) |
51,315 (1.20 %) |
28,020 (0.77 %) |
| 19 | human (HG01123.mat 2021) GCA_018469665.1 |
n/a | n/a | 20,643 (1.86 %) |
22,373 (1.25 %) |
233,154 (4.98 %) |
40.85 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
340 (100.00 %) |
5,382,379 (52.86 %) |
1,029,500 (7.16 %) |
15,979,100 (40.07 %) |
0 (0 %) |
1,647,554 (3.28 %) |
52,346 (1.15 %) |
28,326 (0.76 %) |
| 20 | human (HG01123.pat 2021) GCA_018469695.1 |
n/a | n/a | 20,631 (1.86 %) |
22,210 (1.24 %) |
233,273 (4.97 %) |
40.86 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
436 (100.00 %) |
5,391,322 (52.85 %) |
1,041,900 (7.14 %) |
15,985,878 (40.09 %) |
0 (0 %) |
1,624,959 (3.21 %) |
52,630 (1.16 %) |
28,418 (0.76 %) |
| 21 | human (HG01175.mat 2021) GCA_018471085.1 |
n/a | n/a | 20,587 (1.84 %) |
22,094 (1.24 %) |
232,602 (4.93 %) |
40.81 (100.00 %) |
0 (0 %) |
3 (0.00 %) |
315 (100.00 %) |
5,397,845 (53.20 %) |
1,069,444 (7.79 %) |
15,978,901 (40.45 %) |
0 (0 %) |
1,757,030 (3.46 %) |
51,968 (1.14 %) |
27,965 (0.74 %) |
| 22 | human (HG01175.pat 2021) GCA_018471065.1 |
n/a | n/a | 20,651 (1.85 %) |
22,302 (1.25 %) |
233,105 (4.94 %) |
40.83 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 365 (100.00 %) |
5,401,789 (53.10 %) |
1,061,956 (7.62 %) |
16,016,635 (40.44 %) |
0 (0 %) |
1,703,810 (3.35 %) |
52,440 (1.16 %) |
28,285 (0.75 %) |
| 23 | human (HG01243.mat 2021) GCA_018504375.1 |
n/a | n/a | 20,701 (1.85 %) |
22,327 (1.24 %) |
232,970 (4.94 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 345 (100.00 %) |
5,384,218 (53.11 %) |
1,029,835 (7.61 %) |
15,997,541 (40.37 %) |
0 (0 %) |
1,731,890 (3.37 %) |
52,287 (1.16 %) |
28,186 (0.75 %) |
| 24 | human (HG01243.pat 2021) GCA_018504045.1 |
n/a | n/a | 19,886 (1.86 %) |
21,597 (1.26 %) |
227,249 (5.00 %) |
40.90 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
436 (100.00 %) |
5,188,879 (52.80 %) |
1,041,178 (7.85 %) |
15,168,227 (40.25 %) |
0 (0 %) |
1,664,015 (3.44 %) |
51,387 (1.26 %) |
28,132 (0.77 %) |
| 25 | human (HG01258.mat 2021) GCA_018469405.1 |
n/a | n/a | 20,652 (1.85 %) |
22,270 (1.25 %) |
233,297 (4.95 %) |
40.86 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
346 (100.00 %) |
5,421,505 (53.06 %) |
1,070,796 (7.57 %) |
15,904,078 (40.29 %) |
0 (0 %) |
1,710,255 (3.35 %) |
52,952 (1.24 %) |
28,873 (0.78 %) |
| 26 | human (HG01258.pat 2021) GCA_018469675.1 |
n/a | n/a | 19,899 (1.85 %) |
21,663 (1.25 %) |
227,048 (4.98 %) |
40.83 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
324 (100.00 %) |
5,179,894 (52.93 %) |
1,053,273 (8.01 %) |
15,211,574 (40.34 %) |
0 (0 %) |
1,687,885 (3.50 %) |
50,868 (1.15 %) |
27,621 (0.75 %) |
| 27 | human (HG01358.mat 2021) GCA_018469865.1 |
n/a | n/a | 20,620 (1.85 %) |
22,173 (1.24 %) |
232,988 (57.14 %) |
40.83 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
334 (100.00 %) |
5,408,314 (53.13 %) |
1,082,369 (7.68 %) |
15,986,592 (40.42 %) |
0 (0 %) |
1,748,971 (3.46 %) |
52,497 (1.15 %) |
28,292 (0.75 %) |
| 28 | human (HG01358.pat 2021) GCA_018469965.1 |
n/a | n/a | 19,983 (1.85 %) |
21,787 (1.25 %) |
227,373 (4.96 %) |
40.85 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
441 (100.00 %) |
5,212,793 (53.10 %) |
1,073,348 (8.29 %) |
15,098,284 (40.47 %) |
0 (0 %) |
1,745,585 (3.57 %) |
51,706 (1.21 %) |
28,121 (0.77 %) |
| 29 | human (HG01361.mat 2021) GCA_018469685.1 |
n/a | n/a | 20,709 (1.85 %) |
22,220 (1.24 %) |
233,019 (4.95 %) |
40.82 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 295 (100.00 %) |
5,400,880 (53.06 %) |
1,072,673 (7.57 %) |
15,970,600 (40.36 %) |
0 (0 %) |
1,718,918 (3.41 %) |
52,279 (1.19 %) |
28,479 (0.76 %) |
| 30 | human (HG01361.pat 2021) GCA_018469705.1 |
n/a | n/a | 20,643 (1.86 %) |
22,265 (1.25 %) |
233,156 (4.98 %) |
40.88 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
288 (100.00 %) |
5,389,985 (52.82 %) |
1,039,540 (7.07 %) |
15,972,086 (40.01 %) |
0 (0 %) |
1,639,198 (3.24 %) |
52,246 (1.17 %) |
28,320 (0.75 %) |
| 31 | human (HG01891.mat 2021) GCA_018467155.1 |
n/a | n/a | 20,644 (1.86 %) |
22,204 (1.24 %) |
233,342 (4.96 %) |
40.82 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
331 (100.00 %) |
5,394,888 (53.00 %) |
1,057,773 (7.41 %) |
16,010,248 (40.29 %) |
0 (0 %) |
1,698,458 (3.35 %) |
52,761 (1.18 %) |
28,443 (0.76 %) |
| 32 | human (HG01891.pat 2021) GCA_018467165.1 |
n/a | n/a | 20,737 (1.84 %) |
22,422 (1.25 %) |
233,650 (4.94 %) |
40.86 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
427 (100.00 %) |
5,403,741 (53.18 %) |
1,044,828 (7.78 %) |
15,926,586 (40.45 %) |
0 (0 %) |
1,873,046 (3.60 %) |
52,966 (1.19 %) |
28,638 (0.76 %) |
| 33 | human (HG01928.mat 2021) GCA_018472695.1 |
n/a | n/a | 20,608 (1.85 %) |
22,133 (1.24 %) |
232,837 (4.94 %) |
40.81 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 244 (100.00 %) |
5,393,247 (53.12 %) |
1,066,426 (7.67 %) |
15,949,983 (40.40 %) |
0 (0 %) |
1,763,911 (3.46 %) |
51,940 (1.16 %) |
28,097 (0.75 %) |
| 34 | human (HG01928.pat 2021) GCA_018472705.1 |
n/a | n/a | 19,872 (1.85 %) |
21,396 (1.24 %) |
226,741 (4.96 %) |
40.86 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
317 (100.00 %) |
5,191,849 (53.05 %) |
1,052,422 (8.21 %) |
15,216,610 (40.53 %) |
0 (0 %) |
1,685,112 (3.48 %) |
50,940 (1.18 %) |
27,635 (0.76 %) |
| 35 | human (HG01952.mat 2021) GCA_018471545.1 |
n/a | n/a | 20,679 (1.86 %) |
22,204 (1.25 %) |
233,578 (4.98 %) |
40.85 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 307 (100.00 %) |
5,393,904 (52.87 %) |
1,041,237 (7.18 %) |
15,894,360 (39.98 %) |
0 (0 %) |
1,656,772 (3.27 %) |
52,866 (1.21 %) |
28,673 (0.77 %) |
| 36 | human (HG01952.pat 2021) GCA_018471555.1 |
n/a | n/a | 19,863 (1.85 %) |
21,383 (1.24 %) |
226,809 (4.97 %) |
40.86 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 378 (100.00 %) |
5,181,545 (52.95 %) |
1,053,224 (8.07 %) |
15,149,369 (40.47 %) |
0 (0 %) |
1,741,906 (3.59 %) |
51,292 (1.24 %) |
28,192 (0.78 %) |
| 37 | human (HG01978.mat 2021) GCA_018472865.1 |
n/a | n/a | 20,711 (1.84 %) |
22,195 (1.24 %) |
233,223 (4.92 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 247 (100.00 %) |
5,415,439 (53.41 %) |
1,076,389 (8.28 %) |
16,001,461 (40.83 %) |
0 (0 %) |
1,837,425 (3.56 %) |
52,688 (1.16 %) |
28,504 (0.75 %) |
| 38 | human (HG01978.pat 2021) GCA_018472845.1 |
n/a | n/a | 20,727 (1.84 %) |
22,443 (1.25 %) |
233,592 (4.92 %) |
40.83 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
286 (100.00 %) |
5,424,250 (53.38 %) |
1,090,520 (8.17 %) |
15,938,736 (40.68 %) |
0 (0 %) |
1,857,872 (3.63 %) |
52,674 (1.19 %) |
28,529 (0.75 %) |
| 39 | human (HG02055.mat 2021) GCA_018506125.1 |
n/a | n/a | 20,668 (1.86 %) |
22,497 (1.26 %) |
233,148 (4.96 %) |
40.83 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
306 (100.00 %) |
5,394,664 (52.96 %) |
1,054,907 (7.31 %) |
16,015,246 (40.18 %) |
0 (0 %) |
1,711,779 (3.38 %) |
52,182 (1.14 %) |
28,129 (0.74 %) |
| 40 | human (HG02055.pat 2021) GCA_018505855.1 |
n/a | n/a | 19,927 (1.83 %) |
21,549 (1.23 %) |
227,271 (4.93 %) |
40.82 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 367 (100.00 %) |
5,216,705 (53.37 %) |
1,083,360 (8.82 %) |
15,156,062 (40.89 %) |
0 (0 %) |
1,830,020 (3.73 %) |
51,291 (1.20 %) |
27,937 (0.76 %) |
| 41 | human (HG02080.mat 2021) GCA_018504085.1 |
n/a | n/a | 20,633 (1.85 %) |
22,288 (1.24 %) |
233,237 (4.94 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
422 (100.00 %) |
5,403,587 (53.12 %) |
1,056,798 (7.68 %) |
15,880,598 (40.28 %) |
0 (0 %) |
1,751,713 (3.42 %) |
52,572 (1.21 %) |
28,530 (0.77 %) |
| 42 | human (HG02080.pat 2021) GCA_018504055.1 |
n/a | n/a | 20,645 (1.85 %) |
22,426 (1.26 %) |
233,357 (4.96 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 485 (100.00 %) |
5,400,305 (52.99 %) |
1,056,100 (7.39 %) |
15,866,266 (40.12 %) |
0 (0 %) |
1,695,953 (3.33 %) |
52,798 (1.20 %) |
28,645 (0.77 %) |
| 43 | human (HG02109.mat 2021) GCA_018505825.1 |
n/a | n/a | 20,672 (1.85 %) |
22,359 (1.25 %) |
233,217 (4.95 %) |
40.86 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 445 (100.00 %) |
5,404,232 (52.99 %) |
1,059,138 (7.38 %) |
15,909,866 (40.16 %) |
0 (0 %) |
1,773,533 (3.47 %) |
52,821 (1.21 %) |
28,671 (0.77 %) |
| 44 | human (HG02109.pat 2021) GCA_018505865.1 |
n/a | n/a | 20,726 (1.85 %) |
22,416 (1.25 %) |
233,280 (4.94 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
2 (0.00 %) |
481 (100.00 %) |
5,415,046 (53.08 %) |
1,053,373 (7.55 %) |
15,926,813 (40.27 %) |
0 (0 %) |
1,725,233 (3.39 %) |
52,917 (1.18 %) |
28,556 (0.76 %) |
| 45 | human (HG02145.mat 2021) GCA_018852585.1 |
n/a | n/a | 20,626 (1.85 %) |
22,340 (1.25 %) |
233,065 (4.94 %) |
40.85 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
437 (100.00 %) |
5,406,959 (53.08 %) |
1,055,638 (7.58 %) |
15,881,847 (40.24 %) |
0 (0 %) |
1,717,173 (3.36 %) |
52,888 (1.19 %) |
28,564 (0.75 %) |
| 46 | human (HG02145.pat 2021) GCA_018852595.1 |
n/a | n/a | 19,971 (1.84 %) |
23,489 (1.40 %) |
227,332 (4.94 %) |
40.91 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
817 (100.00 %) |
5,210,152 (53.01 %) |
1,080,455 (8.52 %) |
14,936,162 (40.43 %) |
0 (0 %) |
1,741,492 (3.61 %) |
52,745 (1.32 %) |
29,473 (0.88 %) |
| 47 | human (HG02148.mat 2021) GCA_018471535.1 |
n/a | n/a | 20,622 (1.85 %) |
22,230 (1.24 %) |
233,267 (4.94 %) |
40.81 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 423 (100.00 %) |
5,415,368 (53.22 %) |
1,083,752 (7.85 %) |
16,009,690 (40.54 %) |
0 (0 %) |
1,696,856 (3.35 %) |
52,324 (1.14 %) |
28,236 (0.74 %) |
| 48 | human (HG02148.pat 2021) GCA_018471525.1 |
n/a | n/a | 20,675 (1.85 %) |
22,449 (1.25 %) |
233,621 (4.96 %) |
40.87 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 487 (100.00 %) |
5,408,728 (53.04 %) |
1,060,811 (7.55 %) |
15,818,402 (40.19 %) |
0 (0 %) |
1,744,671 (3.42 %) |
52,717 (1.23 %) |
28,850 (0.77 %) |
| 49 | human (HG02257.mat 2021) GCA_018466845.1 |
n/a | n/a | 20,636 (1.85 %) |
22,298 (1.24 %) |
233,236 (4.95 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
292 (100.00 %) |
5,409,203 (53.10 %) |
1,060,311 (7.60 %) |
16,026,213 (40.43 %) |
0 (0 %) |
1,761,022 (3.44 %) |
52,647 (1.16 %) |
28,293 (0.75 %) |
| 50 | human (HG02257.pat 2021) GCA_018466835.1 |
n/a | n/a | 20,659 (1.84 %) |
22,252 (1.23 %) |
233,332 (4.93 %) |
40.78 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 306 (100.00 %) |
5,414,841 (53.29 %) |
1,077,125 (7.99 %) |
15,891,119 (40.53 %) |
0 (0 %) |
1,858,343 (3.60 %) |
52,638 (1.18 %) |
28,403 (0.75 %) |
| 51 | human (HG02486.mat 2021) GCA_018467015.1 |
n/a | n/a | 20,626 (1.85 %) |
22,072 (1.24 %) |
232,923 (4.95 %) |
40.80 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
283 (100.00 %) |
5,409,820 (53.15 %) |
1,075,146 (7.68 %) |
15,995,649 (40.44 %) |
0 (0 %) |
1,743,020 (3.45 %) |
52,593 (1.16 %) |
28,402 (0.76 %) |
| 52 | human (HG02486.pat 2021) GCA_018467005.1 |
n/a | n/a | 20,047 (1.86 %) |
21,511 (1.24 %) |
227,472 (4.97 %) |
40.80 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
342 (100.00 %) |
5,191,769 (53.10 %) |
1,044,947 (8.26 %) |
15,239,696 (40.62 %) |
0 (0 %) |
1,739,327 (3.57 %) |
51,172 (1.16 %) |
27,863 (0.76 %) |
| 53 | human (HG02559.mat 2021) GCA_018466985.1 |
n/a | n/a | 20,748 (1.85 %) |
22,425 (1.25 %) |
233,661 (4.95 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 329 (100.00 %) |
5,409,998 (53.11 %) |
1,067,279 (7.64 %) |
15,944,107 (40.38 %) |
0 (0 %) |
1,799,081 (3.49 %) |
53,297 (1.22 %) |
28,800 (0.77 %) |
| 54 | human (HG02559.pat 2021) GCA_018466855.1 |
n/a | n/a | 20,684 (1.85 %) |
22,457 (1.26 %) |
233,500 (4.96 %) |
40.86 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
260 (100.00 %) |
5,394,499 (53.00 %) |
1,048,556 (7.39 %) |
16,015,449 (40.28 %) |
0 (0 %) |
1,772,200 (3.48 %) |
52,834 (1.17 %) |
28,486 (0.76 %) |
| 55 | human (HG02572.mat 2021) GCA_018470445.1 |
n/a | n/a | 20,823 (1.84 %) |
22,634 (1.24 %) |
232,547 (4.89 %) |
40.83 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
632 (100.00 %) |
5,435,641 (53.28 %) |
1,076,981 (7.96 %) |
15,851,923 (40.45 %) |
0 (0 %) |
1,808,343 (3.57 %) |
53,410 (1.21 %) |
28,781 (0.76 %) |
| 56 | human (HG02572.pat 2021) GCA_018470435.1 |
n/a | n/a | 20,054 (1.85 %) |
21,827 (1.25 %) |
225,951 (4.91 %) |
40.85 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
641 (100.00 %) |
5,213,929 (53.30 %) |
1,082,137 (8.76 %) |
15,068,577 (40.69 %) |
0 (0 %) |
1,884,567 (3.86 %) |
51,312 (1.19 %) |
27,939 (0.75 %) |
| 57 | human (HG02622.mat 2021) GCA_018469875.1 |
n/a | n/a | 20,669 (1.84 %) |
22,455 (1.24 %) |
233,354 (4.93 %) |
40.86 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 292 (100.00 %) |
5,446,540 (53.17 %) |
1,085,576 (7.76 %) |
15,975,207 (40.52 %) |
0 (0 %) |
1,776,427 (3.47 %) |
53,535 (1.26 %) |
28,986 (0.77 %) |
| 58 | human (HG02622.pat 2021) GCA_018469925.1 |
n/a | n/a | 20,698 (1.84 %) |
22,536 (1.25 %) |
233,733 (4.94 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
270 (100.00 %) |
5,421,378 (53.22 %) |
1,062,842 (7.81 %) |
15,934,809 (40.46 %) |
0 (0 %) |
1,803,645 (3.51 %) |
52,975 (1.21 %) |
28,639 (0.75 %) |
| 59 | human (HG02630.mat 2021) GCA_018469955.1 |
n/a | n/a | 20,674 (1.84 %) |
22,467 (1.25 %) |
233,172 (4.93 %) |
40.87 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
497 (100.00 %) |
5,432,857 (53.10 %) |
1,072,648 (7.64 %) |
15,990,876 (40.53 %) |
0 (0 %) |
1,722,501 (3.36 %) |
54,101 (1.32 %) |
29,504 (0.80 %) |
| 60 | human (HG02630.pat 2021) GCA_018469945.1 |
n/a | n/a | 20,722 (1.83 %) |
22,445 (1.24 %) |
233,268 (4.91 %) |
40.85 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
534 (100.00 %) |
5,449,816 (53.34 %) |
1,108,461 (8.05 %) |
15,985,498 (40.79 %) |
0 (0 %) |
1,803,634 (3.57 %) |
53,746 (1.28 %) |
29,112 (0.77 %) |
| 61 | human (HG02717.mat 2021) GCA_018469935.1 |
n/a | n/a | 20,621 (1.84 %) |
22,396 (1.25 %) |
233,096 (4.93 %) |
40.81 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
323 (100.00 %) |
5,411,829 (53.22 %) |
1,079,483 (7.87 %) |
15,854,981 (40.43 %) |
0 (0 %) |
1,785,077 (3.54 %) |
53,155 (1.21 %) |
28,854 (0.78 %) |
| 62 | human (HG02717.pat 2021) GCA_018470425.1 |
n/a | n/a | 19,952 (1.84 %) |
21,767 (1.25 %) |
227,273 (4.93 %) |
40.83 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
399 (100.00 %) |
5,216,997 (53.34 %) |
1,089,537 (8.70 %) |
15,132,132 (40.83 %) |
0 (0 %) |
1,819,884 (3.72 %) |
51,815 (1.21 %) |
28,146 (0.76 %) |
| 63 | human (HG02723.mat 2021) GCA_018504065.1 |
n/a | n/a | 20,697 (1.85 %) |
22,322 (1.25 %) |
233,152 (4.95 %) |
40.83 (100.00 %) |
0 (0 %) |
2 (0.00 %) |
429 (100.00 %) |
5,403,282 (53.05 %) |
1,062,881 (7.52 %) |
15,861,495 (40.19 %) |
0 (0 %) |
1,727,512 (3.39 %) |
52,733 (1.19 %) |
28,558 (0.76 %) |
| 64 | human (HG02723.pat 2021) GCA_018504075.1 |
n/a | n/a | 20,606 (1.84 %) |
22,627 (1.25 %) |
233,499 (4.92 %) |
40.82 (100.00 %) |
0 (0 %) |
2 (0.00 %) |
529 (100.00 %) |
5,419,888 (53.29 %) |
1,079,052 (8.00 %) |
15,778,626 (40.44 %) |
0 (0 %) |
1,828,728 (3.61 %) |
53,133 (1.23 %) |
28,789 (0.77 %) |
| 65 | human (HG02818.mat 2021) GCA_018503585.1 |
n/a | n/a | 20,695 (1.85 %) |
22,489 (1.25 %) |
233,161 (4.93 %) |
40.80 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
620 (100.00 %) |
5,406,404 (53.21 %) |
1,061,348 (7.77 %) |
15,879,759 (40.38 %) |
0 (0 %) |
1,755,044 (3.46 %) |
52,992 (1.18 %) |
28,591 (0.77 %) |
| 66 | human (HG02818.pat 2021) GCA_018503575.1 |
n/a | n/a | 20,696 (1.86 %) |
22,490 (1.27 %) |
233,253 (4.97 %) |
40.87 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
566 (100.00 %) |
5,397,389 (52.88 %) |
1,044,887 (7.21 %) |
16,011,018 (40.13 %) |
0 (0 %) |
1,663,167 (3.29 %) |
52,793 (1.17 %) |
28,656 (0.76 %) |
| 67 | human (HG02886.mat 2021) GCA_018470455.1 |
n/a | n/a | 20,740 (1.84 %) |
22,693 (1.25 %) |
233,895 (4.94 %) |
40.87 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 461 (100.00 %) |
5,448,421 (53.12 %) |
1,077,973 (7.55 %) |
15,956,661 (40.38 %) |
0 (0 %) |
1,776,179 (3.47 %) |
53,701 (1.29 %) |
29,198 (0.78 %) |
| 68 | human (HG02886.pat 2021) GCA_018470465.1 |
n/a | n/a | 20,705 (1.84 %) |
22,599 (1.26 %) |
233,328 (4.93 %) |
40.85 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 503 (100.00 %) |
5,438,367 (53.15 %) |
1,090,141 (7.70 %) |
16,016,158 (40.57 %) |
0 (0 %) |
1,803,515 (3.52 %) |
53,652 (1.26 %) |
29,087 (0.78 %) |
| 69 | human (HG03098.mat 2021) GCA_018506165.1 |
n/a | n/a | 20,700 (1.83 %) |
22,200 (1.24 %) |
233,714 (4.91 %) |
40.79 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 331 (100.00 %) |
5,414,502 (53.46 %) |
1,066,527 (8.36 %) |
15,926,377 (40.78 %) |
0 (0 %) |
1,890,567 (3.67 %) |
52,417 (1.18 %) |
28,468 (0.76 %) |
| 70 | human (HG03098.pat 2021) GCA_018506155.1 |
n/a | n/a | 19,900 (1.84 %) |
21,567 (1.24 %) |
226,998 (4.94 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
445 (100.00 %) |
5,201,143 (53.24 %) |
1,083,861 (8.56 %) |
15,069,721 (40.64 %) |
0 (0 %) |
1,817,407 (3.73 %) |
51,389 (1.21 %) |
28,025 (0.77 %) |
| 71 | human (HG03453.mat 2021) GCA_018472855.1 |
n/a | n/a | 20,710 (1.84 %) |
22,595 (1.25 %) |
233,614 (4.93 %) |
40.83 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
439 (100.00 %) |
5,436,784 (53.21 %) |
1,094,451 (7.82 %) |
15,990,282 (40.60 %) |
0 (0 %) |
1,790,931 (3.50 %) |
53,318 (1.27 %) |
29,023 (0.78 %) |
| 72 | human (HG03453.pat 2021) GCA_018473305.1 |
n/a | n/a | 20,661 (1.84 %) |
22,407 (1.25 %) |
233,945 (4.93 %) |
40.80 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 480 (100.00 %) |
5,418,964 (53.30 %) |
1,060,724 (7.98 %) |
15,795,098 (40.40 %) |
0 (0 %) |
1,768,342 (3.49 %) |
53,149 (1.21 %) |
28,793 (0.76 %) |
| 73 | human (HG03486.mat 2021) GCA_018503525.1 |
n/a | n/a | 20,760 (1.85 %) |
22,730 (1.26 %) |
233,655 (4.96 %) |
40.87 (100.00 %) |
0 (0 %) |
2 (0.00 %) |
480 (100.00 %) |
5,422,116 (53.02 %) |
1,069,864 (7.46 %) |
15,951,020 (40.27 %) |
0 (0 %) |
1,711,781 (3.37 %) |
53,338 (1.19 %) |
28,836 (0.77 %) |
| 74 | human (HG03486.pat 2021) GCA_018503245.1 |
n/a | n/a | 20,698 (1.84 %) |
22,539 (1.24 %) |
233,646 (4.92 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
2 (0.00 %) |
519 (100.00 %) |
5,426,413 (53.27 %) |
1,068,800 (7.93 %) |
15,812,092 (40.41 %) |
0 (0 %) |
1,763,702 (3.47 %) |
53,143 (1.26 %) |
28,964 (0.77 %) |
| 75 | human (HG03492.mat 2021) GCA_018505845.1 |
n/a | n/a | 20,677 (1.85 %) |
22,401 (1.25 %) |
233,402 (4.96 %) |
40.85 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
495 (100.00 %) |
5,393,586 (52.97 %) |
1,050,402 (7.38 %) |
15,875,935 (40.07 %) |
0 (0 %) |
1,696,294 (3.31 %) |
52,994 (1.18 %) |
28,556 (0.76 %) |
| 76 | human (HG03492.pat 2021) GCA_018505835.1 |
n/a | n/a | 19,970 (1.85 %) |
21,672 (1.25 %) |
227,277 (4.97 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 618 (100.00 %) |
5,202,430 (53.00 %) |
1,069,560 (8.18 %) |
15,071,476 (40.33 %) |
0 (0 %) |
1,723,247 (3.56 %) |
51,291 (1.19 %) |
27,972 (0.77 %) |
| 77 | human (HG03516.mat 2021) GCA_018469425.1 |
n/a | n/a | 20,766 (1.85 %) |
22,424 (1.25 %) |
233,619 (4.96 %) |
40.85 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 320 (100.00 %) |
5,437,541 (52.96 %) |
1,084,729 (7.35 %) |
16,097,675 (40.30 %) |
0 (0 %) |
1,676,970 (3.29 %) |
52,953 (1.18 %) |
28,552 (0.75 %) |
| 78 | human (HG03516.pat 2021) GCA_018469415.1 |
n/a | n/a | 20,820 (1.84 %) |
22,672 (1.25 %) |
234,068 (4.91 %) |
40.85 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
369 (100.00 %) |
5,451,270 (53.44 %) |
1,086,645 (8.28 %) |
15,991,774 (40.84 %) |
0 (0 %) |
1,839,829 (3.59 %) |
53,435 (1.18 %) |
28,828 (0.76 %) |
| 79 | human (HG03540.mat 2021) GCA_018473295.1 |
n/a | n/a | 20,665 (1.84 %) |
22,566 (1.26 %) |
233,386 (4.92 %) |
40.85 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
435 (100.00 %) |
5,436,802 (53.34 %) |
1,105,174 (8.06 %) |
15,931,296 (40.72 %) |
0 (0 %) |
1,845,562 (3.57 %) |
53,436 (1.26 %) |
28,988 (0.77 %) |
| 80 | human (HG03540.pat 2021) GCA_018473315.1 |
n/a | n/a | 20,724 (1.83 %) |
22,627 (1.25 %) |
233,360 (4.91 %) |
40.83 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
512 (100.00 %) |
5,449,110 (53.39 %) |
1,087,677 (8.16 %) |
15,936,844 (40.79 %) |
0 (0 %) |
1,879,693 (3.62 %) |
53,859 (1.30 %) |
29,476 (0.80 %) |
| 81 | human (HG03579.mat 2021) GCA_018472825.1 |
n/a | n/a | 20,702 (1.85 %) |
22,327 (1.25 %) |
233,403 (4.95 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
456 (100.00 %) |
5,423,189 (53.07 %) |
1,075,620 (7.56 %) |
15,928,710 (40.31 %) |
0 (0 %) |
1,725,858 (3.40 %) |
53,423 (1.24 %) |
28,889 (0.78 %) |
| 82 | human (HG03579.pat 2021) GCA_018472835.1 |
n/a | n/a | 19,942 (1.84 %) |
21,710 (1.25 %) |
227,313 (4.94 %) |
40.82 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 499 (100.00 %) |
5,226,752 (53.28 %) |
1,092,235 (8.58 %) |
15,143,136 (40.79 %) |
0 (0 %) |
1,814,912 (3.72 %) |
51,622 (1.24 %) |
28,360 (0.77 %) |
| 83 | human (NA18906.mat 2021) GCA_018503255.1 |
n/a | n/a | 20,739 (1.84 %) |
22,340 (1.25 %) |
233,812 (4.92 %) |
40.86 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 271 (100.00 %) |
5,464,910 (53.26 %) |
1,101,031 (7.88 %) |
15,871,098 (40.43 %) |
0 (0 %) |
1,765,214 (3.46 %) |
53,290 (1.27 %) |
29,035 (0.78 %) |
| 84 | human (NA18906.pat 2021) GCA_018503285.1 |
n/a | n/a | 20,765 (1.85 %) |
22,414 (1.25 %) |
234,102 (4.95 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 304 (100.00 %) |
5,443,478 (53.06 %) |
1,085,707 (7.53 %) |
15,888,465 (40.19 %) |
0 (0 %) |
1,786,732 (3.48 %) |
53,328 (1.24 %) |
28,936 (0.77 %) |
| 85 | human (NA19240.mat 2021) GCA_018503275.1 |
n/a | n/a | 20,678 (1.85 %) |
22,534 (1.26 %) |
233,508 (4.96 %) |
40.82 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
387 (100.00 %) |
5,404,648 (52.98 %) |
1,047,126 (7.31 %) |
15,970,133 (40.15 %) |
0 (0 %) |
1,720,710 (3.38 %) |
52,529 (1.17 %) |
28,454 (0.75 %) |
| 86 | human (NA19240.pat 2021) GCA_018503265.1 |
n/a | n/a | 20,772 (1.85 %) |
22,461 (1.25 %) |
233,684 (4.95 %) |
40.86 (100.00 %) |
0 (0 %) |
4 (0.00 %) |
453 (100.00 %) |
5,424,224 (53.08 %) |
1,063,925 (7.53 %) |
15,954,132 (40.32 %) |
0 (0 %) |
1,771,797 (3.47 %) |
53,106 (1.23 %) |
28,804 (0.77 %) |
| 87 | human (NA20129.mat 2021) GCA_018504635.1 |
n/a | n/a | 20,664 (1.84 %) |
22,511 (1.24 %) |
233,033 (4.92 %) |
40.85 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
448 (100.00 %) |
5,420,332 (53.24 %) |
1,067,867 (7.86 %) |
15,932,491 (40.50 %) |
0 (0 %) |
1,857,726 (3.61 %) |
53,011 (1.20 %) |
28,542 (0.76 %) |
| 88 | human (NA20129.pat 2021) GCA_018504625.1 |
n/a | n/a | 20,706 (1.85 %) |
22,365 (1.26 %) |
233,543 (4.96 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
n/a | 481 (100.00 %) |
5,401,495 (53.02 %) |
1,051,311 (7.46 %) |
16,041,778 (40.34 %) |
0 (0 %) |
1,700,248 (3.36 %) |
52,911 (1.18 %) |
28,488 (0.75 %) |
| 89 | human (NA21309.mat 2021) GCA_018504655.1 |
n/a | n/a | 20,635 (1.84 %) |
22,458 (1.25 %) |
233,555 (4.94 %) |
40.84 (100.00 %) |
0 (0 %) |
1 (0.00 %) |
508 (100.00 %) |
5,389,804 (53.21 %) |
1,045,498 (7.82 %) |
15,862,735 (40.38 %) |
0 (0 %) |
1,852,080 (3.61 %) |
52,479 (1.17 %) |
28,460 (0.75 %) |
| 90 | human (NA21309.pat 2021) GCA_018504665.1 |
n/a | n/a | 20,685 (1.85 %) |
22,478 (1.25 %) |
233,394 (4.95 %) |
40.81 (100.00 %) |
0 (0 %) |
4 (0.00 %) |
608 (100.00 %) |
5,399,150 (53.06 %) |
1,053,638 (7.58 %) |
15,999,929 (40.35 %) |
0 (0 %) |
1,741,217 (3.44 %) |
52,798 (1.17 %) |
28,498 (0.75 %) |
| 91 | human (NA24385.mat 2022) GCA_021951015.1 |
n/a | n/a | 20,809 (1.82 %) |
21,369 (1.18 %) |
234,089 (4.92 %) |
40.85 (99.95 %) |
0 (0 %) |
109 (0.05 %) |
355 (100.00 %) |
5,489,855 (53.93 %) |
1,085,681 (8.26 %) |
15,968,830 (40.95 %) |
0 (0 %) |
1,817,110 (3.54 %) |
53,511 (1.32 %) |
30,302 (0.84 %) |
| 92 | human (NA24385.pat 2022) GCA_021950905.1 |
n/a | n/a | 20,014 (1.81 %) |
20,716 (1.19 %) |
227,278 (4.91 %) |
40.87 (99.97 %) |
0 (0 %) |
117 (0.03 %) |
514 (100.00 %) |
5,293,356 (54.01 %) |
1,100,786 (9.09 %) |
15,122,569 (41.27 %) |
2 (0.00 %) |
1,900,161 (3.87 %) |
52,546 (1.35 %) |
29,891 (0.86 %) |
| 93 | human (NA24385.mat 2021) GCA_018852615.1 |
n/a | n/a | 20,744 (1.84 %) |
21,968 (1.22 %) |
233,779 (4.92 %) |
40.85 (100.00 %) |
0 (0 %) |
6 (0.00 %) |
445 (100.00 %) |
5,435,410 (53.40 %) |
1,086,871 (8.27 %) |
15,970,867 (40.97 %) |
0 (0 %) |
1,819,917 (3.54 %) |
53,581 (1.32 %) |
29,359 (0.79 %) |
| 94 | human (NA24385.pat 2021) GCA_018852605.1 |
n/a | n/a | 19,919 (1.83 %) |
21,582 (1.22 %) |
227,333 (4.91 %) |
40.87 (100.00 %) |
0 (0 %) |
5 (0.00 %) |
610 (100.00 %) |
5,215,774 (53.54 %) |
1,094,036 (9.09 %) |
15,125,069 (41.29 %) |
0 (0 %) |
1,903,592 (3.87 %) |
52,653 (1.34 %) |
28,881 (0.81 %) |
| 95 | human (NA24631.mat 2021) GCA_018506965.1 |
n/a | n/a | 20,683 (1.85 %) |
22,446 (1.25 %) |
233,691 (4.96 %) |
40.88 (100.00 %) |
0 (0 %) |
4 (0.00 %) |
503 (100.00 %) |
5,423,411 (52.98 %) |
1,075,094 (7.46 %) |
15,897,770 (40.32 %) |
0 (0 %) |
1,659,982 (3.29 %) |
53,731 (1.31 %) |
29,377 (0.80 %) |
| 96 | human (NA24631.pat 2021) GCA_018506945.1 |
n/a | n/a | 19,910 (1.84 %) |
21,610 (1.24 %) |
227,521 (4.95 %) |
40.90 (100.00 %) |
0 (0 %) |
2 (0.00 %) |
682 (100.00 %) |
5,224,127 (53.12 %) |
1,078,588 (8.33 %) |
15,264,128 (40.95 %) |
0 (0 %) |
1,760,557 (3.59 %) |
53,164 (1.35 %) |
29,066 (0.82 %) |
| TOTALS: | total assembly count 96 | ||||||||||||||||
| Additional hubs with collections of assemblies | |||
|---|---|---|---|
| Collection | Hub index pages: | Assembly statistics: | Track statistics: |
| Primates | 200 assemblies | assembly stats | track stats |
| Mammals | 473 assemblies | assembly stats | track stats |
| Birds | 298 assemblies | assembly stats | track stats |
| Fishes | 335 assemblies | assembly stats | track stats |
| other vertebrates | 164 assemblies | assembly stats | track stats |
| Invertebrates | 625 assemblies | assembly stats | track stats |
| Plants | 247 assemblies | assembly stats | track stats |
| Fungi | 598 assemblies | assembly stats | track stats |
| Viruses | 264 assemblies | assembly stats | track stats |
| Bacteria | 73 assemblies | assembly stats | track stats |
| legacy/superseded | 370 assemblies | assembly stats | track stats |
| collections below are subsets of the assemblies above | |||
| VGP - Vertebrate Genome Project | 472 assemblies | assembly stats | track stats |
| CCGP - The California Conservation Genomics Project | 126 assemblies | assembly stats | track stats |
| HPRC - Human Pangenome Reference Consortium | 96 assemblies | assembly stats | track stats |