HPRC - Human Pangenome Reference Consortium assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Human Pangenome Reference Consortium.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 human (HG00438.mat 2021)
GCA_018471515.1
n/a n/a 20,788
(1.85 %)
22,424
(1.25 %)
233,427
(57.20 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 258
(100.00 %)
5,426,471
(53.12 %)
1,085,458
(7.66 %)
16,023,596
(40.44 %)
0
(0 %)
1,660,644
(3.30 %)
52,702
(1.17 %)
28,454
(0.75 %)
2 human (HG00438.pat 2021)
GCA_018472595.1
n/a n/a 20,627
(1.85 %)
22,176
(1.24 %)
233,698
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
276
(100.00 %)
5,419,334
(52.97 %)
1,071,302
(7.38 %)
15,894,505
(40.10 %)
0
(0 %)
1,681,408
(3.32 %)
52,377
(1.20 %)
28,532
(0.76 %)
3 human (HG00621.mat 2021)
GCA_018472605.1
n/a n/a 20,611
(1.85 %)
22,275
(1.25 %)
233,258
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 253
(100.00 %)
5,392,161
(53.03 %)
1,048,372
(7.50 %)
15,960,374
(40.31 %)
0
(0 %)
1,701,207
(3.32 %)
52,502
(1.20 %)
28,554
(0.77 %)
4 human (HG00621.pat 2021)
GCA_018472575.1
n/a n/a 19,907
(1.86 %)
21,558
(1.26 %)
227,172
(5.00 %)
40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 287
(100.00 %)
5,174,496
(52.83 %)
1,030,071
(7.85 %)
15,147,153
(40.18 %)
0
(0 %)
1,671,972
(3.41 %)
50,988
(1.20 %)
27,845
(0.76 %)
5 human (HG00673.mat 2021)
GCA_018472565.1
n/a n/a 20,805
(1.84 %)
22,193
(1.24 %)
233,975
(4.93 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 348
(100.00 %)
5,408,639
(53.33 %)
1,056,398
(8.05 %)
16,117,475
(40.76 %)
0
(0 %)
1,829,654
(3.54 %)
52,411
(1.14 %)
28,185
(0.74 %)
6 human (HG00673.pat 2021)
GCA_018472585.1
n/a n/a 19,963
(1.85 %)
21,514
(1.25 %)
227,480
(4.97 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
420
(100.00 %)
5,185,516
(53.08 %)
1,065,657
(8.25 %)
15,183,778
(40.61 %)
0
(0 %)
1,749,434
(3.59 %)
50,883
(1.20 %)
27,934
(0.76 %)
7 human (HG00733.mat 2021)
GCA_018506975.1
n/a n/a 20,626
(1.85 %)
22,511
(1.25 %)
233,295
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
609
(100.00 %)
5,412,701
(52.97 %)
1,052,600
(7.34 %)
15,895,725
(40.14 %)
0
(0 %)
1,726,181
(3.39 %)
53,216
(1.22 %)
28,848
(0.77 %)
8 human (HG00733.pat 2021)
GCA_018506955.1
n/a n/a 20,749
(1.85 %)
22,251
(1.24 %)
233,792
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
695
(100.00 %)
5,420,299
(53.15 %)
1,076,604
(7.72 %)
15,964,663
(40.46 %)
0
(0 %)
1,774,653
(3.49 %)
53,315
(1.19 %)
28,785
(0.76 %)
9 human (HG00735.mat 2021)
GCA_018472765.1
n/a n/a 20,674
(1.84 %)
22,283
(1.25 %)
233,363
(4.94 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
244
(100.00 %)
5,406,821
(53.15 %)
1,060,553
(7.74 %)
16,051,646
(40.51 %)
0
(0 %)
1,735,619
(3.39 %)
52,343
(1.14 %)
28,228
(0.74 %)
10 human (HG00735.pat 2021)
GCA_018472715.1
n/a n/a 20,688
(1.84 %)
22,080
(1.23 %)
233,237
(4.95 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
299
(100.00 %)
5,391,900
(53.13 %)
1,050,251
(7.66 %)
16,052,188
(40.43 %)
0
(0 %)
1,770,137
(3.44 %)
52,436
(1.14 %)
28,192
(0.74 %)
11 human (HG00741.mat 2021)
GCA_018471095.1
n/a n/a 20,654
(1.85 %)
22,309
(1.25 %)
233,294
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 297
(100.00 %)
5,410,814
(53.14 %)
1,059,472
(7.72 %)
16,043,406
(40.45 %)
0
(0 %)
1,792,676
(3.47 %)
52,535
(1.14 %)
28,292
(0.75 %)
12 human (HG00741.pat 2021)
GCA_018471105.1
n/a n/a 20,657
(1.85 %)
22,458
(1.25 %)
233,356
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
289
(100.00 %)
5,397,570
(53.08 %)
1,046,743
(7.55 %)
16,021,887
(40.41 %)
0
(0 %)
1,730,728
(3.37 %)
52,164
(1.20 %)
28,347
(0.75 %)
13 human (HG01071.mat 2021)
GCA_018472685.1
n/a n/a 20,742
(1.86 %)
22,169
(1.25 %)
233,386
(4.98 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 236
(100.00 %)
5,380,815
(52.80 %)
1,031,609
(7.04 %)
16,008,178
(39.99 %)
0
(0 %)
1,619,715
(3.18 %)
52,233
(1.13 %)
28,193
(0.74 %)
14 human (HG01071.pat 2021)
GCA_018472725.1
n/a n/a 20,694
(1.84 %)
22,451
(1.25 %)
232,969
(4.90 %)
40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
330
(100.00 %)
5,420,540
(53.42 %)
1,100,044
(8.26 %)
15,926,032
(40.73 %)
0
(0 %)
1,834,663
(3.60 %)
52,706
(1.14 %)
28,522
(0.75 %)
15 human (HG01106.mat 2021)
GCA_018471345.1
n/a n/a 20,635
(1.85 %)
22,311
(1.24 %)
233,162
(4.93 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
272
(100.00 %)
5,394,949
(53.13 %)
1,045,161
(7.68 %)
15,896,292
(40.33 %)
0
(0 %)
1,825,502
(3.52 %)
52,604
(1.18 %)
28,412
(0.76 %)
16 human (HG01106.pat 2021)
GCA_018471075.1
n/a n/a 19,939
(1.84 %)
21,482
(1.25 %)
227,418
(4.97 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 284
(100.00 %)
5,199,262
(53.10 %)
1,073,766
(8.08 %)
15,085,301
(40.44 %)
0
(0 %)
1,716,731
(3.55 %)
51,050
(1.19 %)
27,890
(0.76 %)
17 human (HG01109.mat 2021)
GCA_018504365.1
n/a n/a 20,638
(1.84 %)
22,373
(1.25 %)
233,201
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
399
(100.00 %)
5,405,239
(53.13 %)
1,058,194
(7.69 %)
15,910,496
(40.38 %)
0
(0 %)
1,751,509
(3.43 %)
53,236
(1.22 %)
28,762
(0.77 %)
18 human (HG01109.pat 2021)
GCA_018504645.1
n/a n/a 19,870
(1.85 %)
21,659
(1.26 %)
227,481
(4.98 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
473
(100.00 %)
5,197,395
(52.95 %)
1,071,566
(7.99 %)
15,109,996
(40.28 %)
0
(0 %)
1,724,212
(3.57 %)
51,315
(1.20 %)
28,020
(0.77 %)
19 human (HG01123.mat 2021)
GCA_018469665.1
n/a n/a 20,643
(1.86 %)
22,373
(1.25 %)
233,154
(4.98 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
340
(100.00 %)
5,382,379
(52.86 %)
1,029,500
(7.16 %)
15,979,100
(40.07 %)
0
(0 %)
1,647,554
(3.28 %)
52,346
(1.15 %)
28,326
(0.76 %)
20 human (HG01123.pat 2021)
GCA_018469695.1
n/a n/a 20,631
(1.86 %)
22,210
(1.24 %)
233,273
(4.97 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
436
(100.00 %)
5,391,322
(52.85 %)
1,041,900
(7.14 %)
15,985,878
(40.09 %)
0
(0 %)
1,624,959
(3.21 %)
52,630
(1.16 %)
28,418
(0.76 %)
21 human (HG01175.mat 2021)
GCA_018471085.1
n/a n/a 20,587
(1.84 %)
22,094
(1.24 %)
232,602
(4.93 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
315
(100.00 %)
5,397,845
(53.20 %)
1,069,444
(7.79 %)
15,978,901
(40.45 %)
0
(0 %)
1,757,030
(3.46 %)
51,968
(1.14 %)
27,965
(0.74 %)
22 human (HG01175.pat 2021)
GCA_018471065.1
n/a n/a 20,651
(1.85 %)
22,302
(1.25 %)
233,105
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 365
(100.00 %)
5,401,789
(53.10 %)
1,061,956
(7.62 %)
16,016,635
(40.44 %)
0
(0 %)
1,703,810
(3.35 %)
52,440
(1.16 %)
28,285
(0.75 %)
23 human (HG01243.mat 2021)
GCA_018504375.1
n/a n/a 20,701
(1.85 %)
22,327
(1.24 %)
232,970
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 345
(100.00 %)
5,384,218
(53.11 %)
1,029,835
(7.61 %)
15,997,541
(40.37 %)
0
(0 %)
1,731,890
(3.37 %)
52,287
(1.16 %)
28,186
(0.75 %)
24 human (HG01243.pat 2021)
GCA_018504045.1
n/a n/a 19,886
(1.86 %)
21,597
(1.26 %)
227,249
(5.00 %)
40.90
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
436
(100.00 %)
5,188,879
(52.80 %)
1,041,178
(7.85 %)
15,168,227
(40.25 %)
0
(0 %)
1,664,015
(3.44 %)
51,387
(1.26 %)
28,132
(0.77 %)
25 human (HG01258.mat 2021)
GCA_018469405.1
n/a n/a 20,652
(1.85 %)
22,270
(1.25 %)
233,297
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
346
(100.00 %)
5,421,505
(53.06 %)
1,070,796
(7.57 %)
15,904,078
(40.29 %)
0
(0 %)
1,710,255
(3.35 %)
52,952
(1.24 %)
28,873
(0.78 %)
26 human (HG01258.pat 2021)
GCA_018469675.1
n/a n/a 19,899
(1.85 %)
21,663
(1.25 %)
227,048
(4.98 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
324
(100.00 %)
5,179,894
(52.93 %)
1,053,273
(8.01 %)
15,211,574
(40.34 %)
0
(0 %)
1,687,885
(3.50 %)
50,868
(1.15 %)
27,621
(0.75 %)
27 human (HG01358.mat 2021)
GCA_018469865.1
n/a n/a 20,620
(1.85 %)
22,173
(1.24 %)
232,988
(57.14 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
334
(100.00 %)
5,408,314
(53.13 %)
1,082,369
(7.68 %)
15,986,592
(40.42 %)
0
(0 %)
1,748,971
(3.46 %)
52,497
(1.15 %)
28,292
(0.75 %)
28 human (HG01358.pat 2021)
GCA_018469965.1
n/a n/a 19,983
(1.85 %)
21,787
(1.25 %)
227,373
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
441
(100.00 %)
5,212,793
(53.10 %)
1,073,348
(8.29 %)
15,098,284
(40.47 %)
0
(0 %)
1,745,585
(3.57 %)
51,706
(1.21 %)
28,121
(0.77 %)
29 human (HG01361.mat 2021)
GCA_018469685.1
n/a n/a 20,709
(1.85 %)
22,220
(1.24 %)
233,019
(4.95 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 295
(100.00 %)
5,400,880
(53.06 %)
1,072,673
(7.57 %)
15,970,600
(40.36 %)
0
(0 %)
1,718,918
(3.41 %)
52,279
(1.19 %)
28,479
(0.76 %)
30 human (HG01361.pat 2021)
GCA_018469705.1
n/a n/a 20,643
(1.86 %)
22,265
(1.25 %)
233,156
(4.98 %)
40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
288
(100.00 %)
5,389,985
(52.82 %)
1,039,540
(7.07 %)
15,972,086
(40.01 %)
0
(0 %)
1,639,198
(3.24 %)
52,246
(1.17 %)
28,320
(0.75 %)
31 human (HG01891.mat 2021)
GCA_018467155.1
n/a n/a 20,644
(1.86 %)
22,204
(1.24 %)
233,342
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
331
(100.00 %)
5,394,888
(53.00 %)
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(7.41 %)
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(40.29 %)
0
(0 %)
1,698,458
(3.35 %)
52,761
(1.18 %)
28,443
(0.76 %)
32 human (HG01891.pat 2021)
GCA_018467165.1
n/a n/a 20,737
(1.84 %)
22,422
(1.25 %)
233,650
(4.94 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
427
(100.00 %)
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(53.18 %)
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(7.78 %)
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(40.45 %)
0
(0 %)
1,873,046
(3.60 %)
52,966
(1.19 %)
28,638
(0.76 %)
33 human (HG01928.mat 2021)
GCA_018472695.1
n/a n/a 20,608
(1.85 %)
22,133
(1.24 %)
232,837
(4.94 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 244
(100.00 %)
5,393,247
(53.12 %)
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(7.67 %)
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(40.40 %)
0
(0 %)
1,763,911
(3.46 %)
51,940
(1.16 %)
28,097
(0.75 %)
34 human (HG01928.pat 2021)
GCA_018472705.1
n/a n/a 19,872
(1.85 %)
21,396
(1.24 %)
226,741
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
317
(100.00 %)
5,191,849
(53.05 %)
1,052,422
(8.21 %)
15,216,610
(40.53 %)
0
(0 %)
1,685,112
(3.48 %)
50,940
(1.18 %)
27,635
(0.76 %)
35 human (HG01952.mat 2021)
GCA_018471545.1
n/a n/a 20,679
(1.86 %)
22,204
(1.25 %)
233,578
(4.98 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 307
(100.00 %)
5,393,904
(52.87 %)
1,041,237
(7.18 %)
15,894,360
(39.98 %)
0
(0 %)
1,656,772
(3.27 %)
52,866
(1.21 %)
28,673
(0.77 %)
36 human (HG01952.pat 2021)
GCA_018471555.1
n/a n/a 19,863
(1.85 %)
21,383
(1.24 %)
226,809
(4.97 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 378
(100.00 %)
5,181,545
(52.95 %)
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(8.07 %)
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(40.47 %)
0
(0 %)
1,741,906
(3.59 %)
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(1.24 %)
28,192
(0.78 %)
37 human (HG01978.mat 2021)
GCA_018472865.1
n/a n/a 20,711
(1.84 %)
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(1.24 %)
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(4.92 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 247
(100.00 %)
5,415,439
(53.41 %)
1,076,389
(8.28 %)
16,001,461
(40.83 %)
0
(0 %)
1,837,425
(3.56 %)
52,688
(1.16 %)
28,504
(0.75 %)
38 human (HG01978.pat 2021)
GCA_018472845.1
n/a n/a 20,727
(1.84 %)
22,443
(1.25 %)
233,592
(4.92 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
286
(100.00 %)
5,424,250
(53.38 %)
1,090,520
(8.17 %)
15,938,736
(40.68 %)
0
(0 %)
1,857,872
(3.63 %)
52,674
(1.19 %)
28,529
(0.75 %)
39 human (HG02055.mat 2021)
GCA_018506125.1
n/a n/a 20,668
(1.86 %)
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(1.26 %)
233,148
(4.96 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
306
(100.00 %)
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(52.96 %)
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(7.31 %)
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(40.18 %)
0
(0 %)
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(3.38 %)
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(1.14 %)
28,129
(0.74 %)
40 human (HG02055.pat 2021)
GCA_018505855.1
n/a n/a 19,927
(1.83 %)
21,549
(1.23 %)
227,271
(4.93 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 367
(100.00 %)
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(53.37 %)
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(8.82 %)
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(40.89 %)
0
(0 %)
1,830,020
(3.73 %)
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(1.20 %)
27,937
(0.76 %)
41 human (HG02080.mat 2021)
GCA_018504085.1
n/a n/a 20,633
(1.85 %)
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(1.24 %)
233,237
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
422
(100.00 %)
5,403,587
(53.12 %)
1,056,798
(7.68 %)
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(40.28 %)
0
(0 %)
1,751,713
(3.42 %)
52,572
(1.21 %)
28,530
(0.77 %)
42 human (HG02080.pat 2021)
GCA_018504055.1
n/a n/a 20,645
(1.85 %)
22,426
(1.26 %)
233,357
(4.96 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 485
(100.00 %)
5,400,305
(52.99 %)
1,056,100
(7.39 %)
15,866,266
(40.12 %)
0
(0 %)
1,695,953
(3.33 %)
52,798
(1.20 %)
28,645
(0.77 %)
43 human (HG02109.mat 2021)
GCA_018505825.1
n/a n/a 20,672
(1.85 %)
22,359
(1.25 %)
233,217
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 445
(100.00 %)
5,404,232
(52.99 %)
1,059,138
(7.38 %)
15,909,866
(40.16 %)
0
(0 %)
1,773,533
(3.47 %)
52,821
(1.21 %)
28,671
(0.77 %)
44 human (HG02109.pat 2021)
GCA_018505865.1
n/a n/a 20,726
(1.85 %)
22,416
(1.25 %)
233,280
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
481
(100.00 %)
5,415,046
(53.08 %)
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(7.55 %)
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(40.27 %)
0
(0 %)
1,725,233
(3.39 %)
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(1.18 %)
28,556
(0.76 %)
45 human (HG02145.mat 2021)
GCA_018852585.1
n/a n/a 20,626
(1.85 %)
22,340
(1.25 %)
233,065
(4.94 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
437
(100.00 %)
5,406,959
(53.08 %)
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(7.58 %)
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(40.24 %)
0
(0 %)
1,717,173
(3.36 %)
52,888
(1.19 %)
28,564
(0.75 %)
46 human (HG02145.pat 2021)
GCA_018852595.1
n/a n/a 19,971
(1.84 %)
23,489
(1.40 %)
227,332
(4.94 %)
40.91
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
817
(100.00 %)
5,210,152
(53.01 %)
1,080,455
(8.52 %)
14,936,162
(40.43 %)
0
(0 %)
1,741,492
(3.61 %)
52,745
(1.32 %)
29,473
(0.88 %)
47 human (HG02148.mat 2021)
GCA_018471535.1
n/a n/a 20,622
(1.85 %)
22,230
(1.24 %)
233,267
(4.94 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 423
(100.00 %)
5,415,368
(53.22 %)
1,083,752
(7.85 %)
16,009,690
(40.54 %)
0
(0 %)
1,696,856
(3.35 %)
52,324
(1.14 %)
28,236
(0.74 %)
48 human (HG02148.pat 2021)
GCA_018471525.1
n/a n/a 20,675
(1.85 %)
22,449
(1.25 %)
233,621
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 487
(100.00 %)
5,408,728
(53.04 %)
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(7.55 %)
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(40.19 %)
0
(0 %)
1,744,671
(3.42 %)
52,717
(1.23 %)
28,850
(0.77 %)
49 human (HG02257.mat 2021)
GCA_018466845.1
n/a n/a 20,636
(1.85 %)
22,298
(1.24 %)
233,236
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
292
(100.00 %)
5,409,203
(53.10 %)
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(7.60 %)
16,026,213
(40.43 %)
0
(0 %)
1,761,022
(3.44 %)
52,647
(1.16 %)
28,293
(0.75 %)
50 human (HG02257.pat 2021)
GCA_018466835.1
n/a n/a 20,659
(1.84 %)
22,252
(1.23 %)
233,332
(4.93 %)
40.78
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 306
(100.00 %)
5,414,841
(53.29 %)
1,077,125
(7.99 %)
15,891,119
(40.53 %)
0
(0 %)
1,858,343
(3.60 %)
52,638
(1.18 %)
28,403
(0.75 %)
51 human (HG02486.mat 2021)
GCA_018467015.1
n/a n/a 20,626
(1.85 %)
22,072
(1.24 %)
232,923
(4.95 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
283
(100.00 %)
5,409,820
(53.15 %)
1,075,146
(7.68 %)
15,995,649
(40.44 %)
0
(0 %)
1,743,020
(3.45 %)
52,593
(1.16 %)
28,402
(0.76 %)
52 human (HG02486.pat 2021)
GCA_018467005.1
n/a n/a 20,047
(1.86 %)
21,511
(1.24 %)
227,472
(4.97 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
342
(100.00 %)
5,191,769
(53.10 %)
1,044,947
(8.26 %)
15,239,696
(40.62 %)
0
(0 %)
1,739,327
(3.57 %)
51,172
(1.16 %)
27,863
(0.76 %)
53 human (HG02559.mat 2021)
GCA_018466985.1
n/a n/a 20,748
(1.85 %)
22,425
(1.25 %)
233,661
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 329
(100.00 %)
5,409,998
(53.11 %)
1,067,279
(7.64 %)
15,944,107
(40.38 %)
0
(0 %)
1,799,081
(3.49 %)
53,297
(1.22 %)
28,800
(0.77 %)
54 human (HG02559.pat 2021)
GCA_018466855.1
n/a n/a 20,684
(1.85 %)
22,457
(1.26 %)
233,500
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
260
(100.00 %)
5,394,499
(53.00 %)
1,048,556
(7.39 %)
16,015,449
(40.28 %)
0
(0 %)
1,772,200
(3.48 %)
52,834
(1.17 %)
28,486
(0.76 %)
55 human (HG02572.mat 2021)
GCA_018470445.1
n/a n/a 20,823
(1.84 %)
22,634
(1.24 %)
232,547
(4.89 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
632
(100.00 %)
5,435,641
(53.28 %)
1,076,981
(7.96 %)
15,851,923
(40.45 %)
0
(0 %)
1,808,343
(3.57 %)
53,410
(1.21 %)
28,781
(0.76 %)
56 human (HG02572.pat 2021)
GCA_018470435.1
n/a n/a 20,054
(1.85 %)
21,827
(1.25 %)
225,951
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
641
(100.00 %)
5,213,929
(53.30 %)
1,082,137
(8.76 %)
15,068,577
(40.69 %)
0
(0 %)
1,884,567
(3.86 %)
51,312
(1.19 %)
27,939
(0.75 %)
57 human (HG02622.mat 2021)
GCA_018469875.1
n/a n/a 20,669
(1.84 %)
22,455
(1.24 %)
233,354
(4.93 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 292
(100.00 %)
5,446,540
(53.17 %)
1,085,576
(7.76 %)
15,975,207
(40.52 %)
0
(0 %)
1,776,427
(3.47 %)
53,535
(1.26 %)
28,986
(0.77 %)
58 human (HG02622.pat 2021)
GCA_018469925.1
n/a n/a 20,698
(1.84 %)
22,536
(1.25 %)
233,733
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
270
(100.00 %)
5,421,378
(53.22 %)
1,062,842
(7.81 %)
15,934,809
(40.46 %)
0
(0 %)
1,803,645
(3.51 %)
52,975
(1.21 %)
28,639
(0.75 %)
59 human (HG02630.mat 2021)
GCA_018469955.1
n/a n/a 20,674
(1.84 %)
22,467
(1.25 %)
233,172
(4.93 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
497
(100.00 %)
5,432,857
(53.10 %)
1,072,648
(7.64 %)
15,990,876
(40.53 %)
0
(0 %)
1,722,501
(3.36 %)
54,101
(1.32 %)
29,504
(0.80 %)
60 human (HG02630.pat 2021)
GCA_018469945.1
n/a n/a 20,722
(1.83 %)
22,445
(1.24 %)
233,268
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
534
(100.00 %)
5,449,816
(53.34 %)
1,108,461
(8.05 %)
15,985,498
(40.79 %)
0
(0 %)
1,803,634
(3.57 %)
53,746
(1.28 %)
29,112
(0.77 %)
61 human (HG02717.mat 2021)
GCA_018469935.1
n/a n/a 20,621
(1.84 %)
22,396
(1.25 %)
233,096
(4.93 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
323
(100.00 %)
5,411,829
(53.22 %)
1,079,483
(7.87 %)
15,854,981
(40.43 %)
0
(0 %)
1,785,077
(3.54 %)
53,155
(1.21 %)
28,854
(0.78 %)
62 human (HG02717.pat 2021)
GCA_018470425.1
n/a n/a 19,952
(1.84 %)
21,767
(1.25 %)
227,273
(4.93 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
399
(100.00 %)
5,216,997
(53.34 %)
1,089,537
(8.70 %)
15,132,132
(40.83 %)
0
(0 %)
1,819,884
(3.72 %)
51,815
(1.21 %)
28,146
(0.76 %)
63 human (HG02723.mat 2021)
GCA_018504065.1
n/a n/a 20,697
(1.85 %)
22,322
(1.25 %)
233,152
(4.95 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
429
(100.00 %)
5,403,282
(53.05 %)
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(7.52 %)
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(40.19 %)
0
(0 %)
1,727,512
(3.39 %)
52,733
(1.19 %)
28,558
(0.76 %)
64 human (HG02723.pat 2021)
GCA_018504075.1
n/a n/a 20,606
(1.84 %)
22,627
(1.25 %)
233,499
(4.92 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
529
(100.00 %)
5,419,888
(53.29 %)
1,079,052
(8.00 %)
15,778,626
(40.44 %)
0
(0 %)
1,828,728
(3.61 %)
53,133
(1.23 %)
28,789
(0.77 %)
65 human (HG02818.mat 2021)
GCA_018503585.1
n/a n/a 20,695
(1.85 %)
22,489
(1.25 %)
233,161
(4.93 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
620
(100.00 %)
5,406,404
(53.21 %)
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(7.77 %)
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(40.38 %)
0
(0 %)
1,755,044
(3.46 %)
52,992
(1.18 %)
28,591
(0.77 %)
66 human (HG02818.pat 2021)
GCA_018503575.1
n/a n/a 20,696
(1.86 %)
22,490
(1.27 %)
233,253
(4.97 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
566
(100.00 %)
5,397,389
(52.88 %)
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(7.21 %)
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(40.13 %)
0
(0 %)
1,663,167
(3.29 %)
52,793
(1.17 %)
28,656
(0.76 %)
67 human (HG02886.mat 2021)
GCA_018470455.1
n/a n/a 20,740
(1.84 %)
22,693
(1.25 %)
233,895
(4.94 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 461
(100.00 %)
5,448,421
(53.12 %)
1,077,973
(7.55 %)
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(40.38 %)
0
(0 %)
1,776,179
(3.47 %)
53,701
(1.29 %)
29,198
(0.78 %)
68 human (HG02886.pat 2021)
GCA_018470465.1
n/a n/a 20,705
(1.84 %)
22,599
(1.26 %)
233,328
(4.93 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 503
(100.00 %)
5,438,367
(53.15 %)
1,090,141
(7.70 %)
16,016,158
(40.57 %)
0
(0 %)
1,803,515
(3.52 %)
53,652
(1.26 %)
29,087
(0.78 %)
69 human (HG03098.mat 2021)
GCA_018506165.1
n/a n/a 20,700
(1.83 %)
22,200
(1.24 %)
233,714
(4.91 %)
40.79
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 331
(100.00 %)
5,414,502
(53.46 %)
1,066,527
(8.36 %)
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(40.78 %)
0
(0 %)
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(3.67 %)
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(1.18 %)
28,468
(0.76 %)
70 human (HG03098.pat 2021)
GCA_018506155.1
n/a n/a 19,900
(1.84 %)
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(1.24 %)
226,998
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
445
(100.00 %)
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(53.24 %)
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(8.56 %)
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(40.64 %)
0
(0 %)
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(3.73 %)
51,389
(1.21 %)
28,025
(0.77 %)
71 human (HG03453.mat 2021)
GCA_018472855.1
n/a n/a 20,710
(1.84 %)
22,595
(1.25 %)
233,614
(4.93 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
439
(100.00 %)
5,436,784
(53.21 %)
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(7.82 %)
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(40.60 %)
0
(0 %)
1,790,931
(3.50 %)
53,318
(1.27 %)
29,023
(0.78 %)
72 human (HG03453.pat 2021)
GCA_018473305.1
n/a n/a 20,661
(1.84 %)
22,407
(1.25 %)
233,945
(4.93 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 480
(100.00 %)
5,418,964
(53.30 %)
1,060,724
(7.98 %)
15,795,098
(40.40 %)
0
(0 %)
1,768,342
(3.49 %)
53,149
(1.21 %)
28,793
(0.76 %)
73 human (HG03486.mat 2021)
GCA_018503525.1
n/a n/a 20,760
(1.85 %)
22,730
(1.26 %)
233,655
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
480
(100.00 %)
5,422,116
(53.02 %)
1,069,864
(7.46 %)
15,951,020
(40.27 %)
0
(0 %)
1,711,781
(3.37 %)
53,338
(1.19 %)
28,836
(0.77 %)
74 human (HG03486.pat 2021)
GCA_018503245.1
n/a n/a 20,698
(1.84 %)
22,539
(1.24 %)
233,646
(4.92 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
519
(100.00 %)
5,426,413
(53.27 %)
1,068,800
(7.93 %)
15,812,092
(40.41 %)
0
(0 %)
1,763,702
(3.47 %)
53,143
(1.26 %)
28,964
(0.77 %)
75 human (HG03492.mat 2021)
GCA_018505845.1
n/a n/a 20,677
(1.85 %)
22,401
(1.25 %)
233,402
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
495
(100.00 %)
5,393,586
(52.97 %)
1,050,402
(7.38 %)
15,875,935
(40.07 %)
0
(0 %)
1,696,294
(3.31 %)
52,994
(1.18 %)
28,556
(0.76 %)
76 human (HG03492.pat 2021)
GCA_018505835.1
n/a n/a 19,970
(1.85 %)
21,672
(1.25 %)
227,277
(4.97 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 618
(100.00 %)
5,202,430
(53.00 %)
1,069,560
(8.18 %)
15,071,476
(40.33 %)
0
(0 %)
1,723,247
(3.56 %)
51,291
(1.19 %)
27,972
(0.77 %)
77 human (HG03516.mat 2021)
GCA_018469425.1
n/a n/a 20,766
(1.85 %)
22,424
(1.25 %)
233,619
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 320
(100.00 %)
5,437,541
(52.96 %)
1,084,729
(7.35 %)
16,097,675
(40.30 %)
0
(0 %)
1,676,970
(3.29 %)
52,953
(1.18 %)
28,552
(0.75 %)
78 human (HG03516.pat 2021)
GCA_018469415.1
n/a n/a 20,820
(1.84 %)
22,672
(1.25 %)
234,068
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
369
(100.00 %)
5,451,270
(53.44 %)
1,086,645
(8.28 %)
15,991,774
(40.84 %)
0
(0 %)
1,839,829
(3.59 %)
53,435
(1.18 %)
28,828
(0.76 %)
79 human (HG03540.mat 2021)
GCA_018473295.1
n/a n/a 20,665
(1.84 %)
22,566
(1.26 %)
233,386
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
435
(100.00 %)
5,436,802
(53.34 %)
1,105,174
(8.06 %)
15,931,296
(40.72 %)
0
(0 %)
1,845,562
(3.57 %)
53,436
(1.26 %)
28,988
(0.77 %)
80 human (HG03540.pat 2021)
GCA_018473315.1
n/a n/a 20,724
(1.83 %)
22,627
(1.25 %)
233,360
(4.91 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
512
(100.00 %)
5,449,110
(53.39 %)
1,087,677
(8.16 %)
15,936,844
(40.79 %)
0
(0 %)
1,879,693
(3.62 %)
53,859
(1.30 %)
29,476
(0.80 %)
81 human (HG03579.mat 2021)
GCA_018472825.1
n/a n/a 20,702
(1.85 %)
22,327
(1.25 %)
233,403
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
456
(100.00 %)
5,423,189
(53.07 %)
1,075,620
(7.56 %)
15,928,710
(40.31 %)
0
(0 %)
1,725,858
(3.40 %)
53,423
(1.24 %)
28,889
(0.78 %)
82 human (HG03579.pat 2021)
GCA_018472835.1
n/a n/a 19,942
(1.84 %)
21,710
(1.25 %)
227,313
(4.94 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 499
(100.00 %)
5,226,752
(53.28 %)
1,092,235
(8.58 %)
15,143,136
(40.79 %)
0
(0 %)
1,814,912
(3.72 %)
51,622
(1.24 %)
28,360
(0.77 %)
83 human (NA18906.mat 2021)
GCA_018503255.1
n/a n/a 20,739
(1.84 %)
22,340
(1.25 %)
233,812
(4.92 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 271
(100.00 %)
5,464,910
(53.26 %)
1,101,031
(7.88 %)
15,871,098
(40.43 %)
0
(0 %)
1,765,214
(3.46 %)
53,290
(1.27 %)
29,035
(0.78 %)
84 human (NA18906.pat 2021)
GCA_018503285.1
n/a n/a 20,765
(1.85 %)
22,414
(1.25 %)
234,102
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 304
(100.00 %)
5,443,478
(53.06 %)
1,085,707
(7.53 %)
15,888,465
(40.19 %)
0
(0 %)
1,786,732
(3.48 %)
53,328
(1.24 %)
28,936
(0.77 %)
85 human (NA19240.mat 2021)
GCA_018503275.1
n/a n/a 20,678
(1.85 %)
22,534
(1.26 %)
233,508
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
387
(100.00 %)
5,404,648
(52.98 %)
1,047,126
(7.31 %)
15,970,133
(40.15 %)
0
(0 %)
1,720,710
(3.38 %)
52,529
(1.17 %)
28,454
(0.75 %)
86 human (NA19240.pat 2021)
GCA_018503265.1
n/a n/a 20,772
(1.85 %)
22,461
(1.25 %)
233,684
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
453
(100.00 %)
5,424,224
(53.08 %)
1,063,925
(7.53 %)
15,954,132
(40.32 %)
0
(0 %)
1,771,797
(3.47 %)
53,106
(1.23 %)
28,804
(0.77 %)
87 human (NA20129.mat 2021)
GCA_018504635.1
n/a n/a 20,664
(1.84 %)
22,511
(1.24 %)
233,033
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
448
(100.00 %)
5,420,332
(53.24 %)
1,067,867
(7.86 %)
15,932,491
(40.50 %)
0
(0 %)
1,857,726
(3.61 %)
53,011
(1.20 %)
28,542
(0.76 %)
88 human (NA20129.pat 2021)
GCA_018504625.1
n/a n/a 20,706
(1.85 %)
22,365
(1.26 %)
233,543
(4.96 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 481
(100.00 %)
5,401,495
(53.02 %)
1,051,311
(7.46 %)
16,041,778
(40.34 %)
0
(0 %)
1,700,248
(3.36 %)
52,911
(1.18 %)
28,488
(0.75 %)
89 human (NA21309.mat 2021)
GCA_018504655.1
n/a n/a 20,635
(1.84 %)
22,458
(1.25 %)
233,555
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
508
(100.00 %)
5,389,804
(53.21 %)
1,045,498
(7.82 %)
15,862,735
(40.38 %)
0
(0 %)
1,852,080
(3.61 %)
52,479
(1.17 %)
28,460
(0.75 %)
90 human (NA21309.pat 2021)
GCA_018504665.1
n/a n/a 20,685
(1.85 %)
22,478
(1.25 %)
233,394
(4.95 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
608
(100.00 %)
5,399,150
(53.06 %)
1,053,638
(7.58 %)
15,999,929
(40.35 %)
0
(0 %)
1,741,217
(3.44 %)
52,798
(1.17 %)
28,498
(0.75 %)
91 human (NA24385.mat 2022)
GCA_021951015.1
n/a n/a 20,809
(1.82 %)
21,369
(1.18 %)
234,089
(4.92 %)
40.85
(99.95 %)
0
(0 %)
109
(0.05 %)
355
(100.00 %)
5,489,855
(53.93 %)
1,085,681
(8.26 %)
15,968,830
(40.95 %)
0
(0 %)
1,817,110
(3.54 %)
53,511
(1.32 %)
30,302
(0.84 %)
92 human (NA24385.pat 2022)
GCA_021950905.1
n/a n/a 20,014
(1.81 %)
20,716
(1.19 %)
227,278
(4.91 %)
40.87
(99.97 %)
0
(0 %)
117
(0.03 %)
514
(100.00 %)
5,293,356
(54.01 %)
1,100,786
(9.09 %)
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(41.27 %)
2
(0.00 %)
1,900,161
(3.87 %)
52,546
(1.35 %)
29,891
(0.86 %)
93 human (NA24385.mat 2021)
GCA_018852615.1
n/a n/a 20,744
(1.84 %)
21,968
(1.22 %)
233,779
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
445
(100.00 %)
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(53.40 %)
1,086,871
(8.27 %)
15,970,867
(40.97 %)
0
(0 %)
1,819,917
(3.54 %)
53,581
(1.32 %)
29,359
(0.79 %)
94 human (NA24385.pat 2021)
GCA_018852605.1
n/a n/a 19,919
(1.83 %)
21,582
(1.22 %)
227,333
(4.91 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
610
(100.00 %)
5,215,774
(53.54 %)
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(9.09 %)
15,125,069
(41.29 %)
0
(0 %)
1,903,592
(3.87 %)
52,653
(1.34 %)
28,881
(0.81 %)
95 human (NA24631.mat 2021)
GCA_018506965.1
n/a n/a 20,683
(1.85 %)
22,446
(1.25 %)
233,691
(4.96 %)
40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
503
(100.00 %)
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(52.98 %)
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(7.46 %)
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(40.32 %)
0
(0 %)
1,659,982
(3.29 %)
53,731
(1.31 %)
29,377
(0.80 %)
96 human (NA24631.pat 2021)
GCA_018506945.1
n/a n/a 19,910
(1.84 %)
21,610
(1.24 %)
227,521
(4.95 %)
40.90
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
682
(100.00 %)
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(53.12 %)
1,078,588
(8.33 %)
15,264,128
(40.95 %)
0
(0 %)
1,760,557
(3.59 %)
53,164
(1.35 %)
29,066
(0.82 %)
TOTALS:total assembly count 96

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 215 assemblies assembly stats track stats
Mammals 560 assemblies assembly stats track stats
Birds 377 assemblies assembly stats track stats
Fishes 401 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 239 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1007 assemblies assembly stats track stats
Plants 301 assemblies assembly stats track stats
Fungi 858 assemblies assembly stats track stats
Viruses 283 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 104 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 515 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 952 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 702 assemblies assembly stats track stats