VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of primary assemblies)

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Abyssinian ground-hornbill
GCA_009769605.1
n/a n/a 12,926
(1.90 %)
23,453
(2.26 %)
n/a 43.30
(99.29 %)
0
(0 %)
204
(0.71 %)
112
(100.00 %)
401,839
(5.61 %)
145,540
(0.78 %)
6,556,090
(19.22 %)
0
(0 %)
65,601
(0.62 %)
40,986
(3.65 %)
34,700
(2.27 %)
2 Aeolian wall lizard (rPodRaf1 primary hap 2022)
GCF_027172205.1
57,514
(4.49 %)
n/a 14,340
(1.37 %)
20,053
(2.31 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
0
(0 %)
30
(0.00 %)
27
(100.00 %)
832,937
(4.17 %)
474,203
(4.04 %)
7,020,288
(38.29 %)
2
(0.00 %)
631,733
(3.50 %)
94,745
(2.70 %)
19,879
(0.76 %)
3 African savanna elephant (hap2 mLoxAfr1 2023)
GCA_030014295.1
n/a n/a 18,981
(1.10 %)
22,759
(1.12 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
0
(0 %)
231
(0.10 %)
880
(100.00 %)
4,426,756
(29.95 %)
832,908
(4.08 %)
16,118,910
(49.47 %)
1
(0.00 %)
1,082,958
(2.38 %)
62,315
(1.49 %)
23,783
(0.48 %)
4 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1
n/a n/a 19,086
(1.55 %)
22,040
(1.52 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,182
(0.01 %)
1,182
(0.01 %)
1,369
(99.99 %)
3,846,728
(31.78 %)
639,852
(2.90 %)
11,937,936
(38.98 %)
24
(0.00 %)
819,376
(2.67 %)
75,377
(2.21 %)
66,761
(1.68 %)
5 American flamingo
GCA_009819775.1
n/a n/a 13,100
(1.79 %)
23,372
(2.04 %)
n/a 43.27
(99.31 %)
0
(0 %)
280
(0.69 %)
90
(100.00 %)
538,004
(7.73 %)
183,346
(0.79 %)
7,056,270
(20.92 %)
0
(0 %)
91,554
(0.80 %)
52,012
(5.96 %)
50,946
(3.06 %)
6 American shad
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
n/a 16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
76,974
(8.55 %)
43.18
(99.45 %)
0
(0 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
14
(0.00 %)
934,014
(6.61 %)
42,699
(2.23 %)
25,608
(1.23 %)
7 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1
45,008
(1.93 %)
n/a 17,997
(1.35 %)
23,185
(1.49 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
0
(0 %)
432
(0.00 %)
5,864
(100.00 %)
4,126,248
(43.60 %)
628,344
(15.71 %)
11,100,962
(42.69 %)
18
(0.00 %)
1,888,430
(5.34 %)
60,350
(1.67 %)
30,970
(1.18 %)
8 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1
60,799
(4.33 %)
n/a 14,383
(0.98 %)
18,600
(1.45 %)
n/a 45.01
(99.30 %)
0
(0 %)
161
(0.70 %)
195
(100.00 %)
3,322,624
(43.19 %)
478,208
(1.77 %)
12,316,424
(32.01 %)
0
(0 %)
334,854
(1.31 %)
49,792
(2.45 %)
29,504
(1.51 %)
9 amphioxus (hap2 2024)
GCA_035083965.1
n/a n/a 5,217
(0.97 %)
41,736
(12.73 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
0
(0 %)
103
(0.00 %)
34
(100.00 %)
128,505
(1.65 %)
182,123
(8.03 %)
2,157,899
(27.45 %)
0
(0 %)
274,077
(4.65 %)
44,261
(5.21 %)
29,041
(2.94 %)
10 Andian cavefish (hap1 2023)
GCF_030014385.1
42,881
(5.97 %)
n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,939
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
11 Anna's hummingbird
GCA_003957555.2
n/a n/a 12,258
(1.95 %)
20,580
(2.26 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
0
(0 %)
429
(1.52 %)
160
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,056
(1.51 %)
6,092,351
(20.84 %)
0
(0 %)
152,105
(1.27 %)
17,130
(1.48 %)
15,125
(1.04 %)
12 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1
n/a n/a 17,342
(1.44 %)
78,914
(5.48 %)
n/a 43.57
(99.96 %)
0
(0 %)
3,179
(0.04 %)
1,901
(100.00 %)
5,980,457
(37.18 %)
1,633,782
(21.76 %)
6,279,725
(52.83 %)
12
(0.00 %)
2,013,978
(10.83 %)
104,688
(3.57 %)
33,790
(1.15 %)
13 Arabian camel (paternal hap 2024)
GCA_036321535.1
n/a n/a 18,080
(1.66 %)
20,345
(1.52 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
0
(0 %)
195
(0.00 %)
172
(100.00 %)
3,040,473
(29.22 %)
343,482
(10.93 %)
11,797,012
(33.50 %)
2
(0.00 %)
1,611,842
(4.73 %)
55,428
(1.61 %)
47,478
(1.18 %)
14 Aristotle's catfish (2022)
GCA_946808225.1
n/a n/a 15,455
(2.53 %)
40,077
(4.90 %)
86,346
(8.45 %)
38.90
(99.98 %)
0
(0 %)
795
(0.02 %)
241
(100.00 %)
2,045,691
(38.70 %)
669,975
(11.72 %)
4,638,765
(42.07 %)
1
(0.00 %)
693,282
(5.96 %)
28,277
(1.93 %)
15,766
(0.94 %)
15 Asian bonytongue
GCF_900964775.1
50,315
(9.13 %)
n/a 16,526
(2.73 %)
38,780
(6.64 %)
72,662
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
0
(0 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
504,673
(3.06 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
0
(0 %)
157,330
(1.72 %)
88,517
(10.73 %)
67,281
(4.98 %)
16 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1
n/a n/a 18,931
(1.76 %)
19,988
(1.37 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
0
(0 %)
92
(0.00 %)
193
(100.00 %)
3,632,286
(38.21 %)
350,074
(2.22 %)
14,785,531
(30.90 %)
1
(0.00 %)
254,432
(0.91 %)
36,699
(1.70 %)
36,659
(1.49 %)
17 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1
61,202
(2.60 %)
n/a 18,887
(1.13 %)
21,194
(1.06 %)
n/a 41.14
(99.90 %)
0
(0 %)
126
(0.10 %)
64
(100.00 %)
4,358,470
(31.27 %)
663,094
(4.56 %)
16,261,778
(48.66 %)
1
(0.00 %)
851,540
(1.93 %)
69,120
(1.32 %)
23,319
(0.49 %)
18 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1
n/a n/a 12,545
(0.38 %)
29,428
(1.34 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,648
(0.01 %)
2,990
(100.00 %)
8,579,105
(49.81 %)
831,224
(15.75 %)
21,718,213
(51.79 %)
9
(0.00 %)
4,445,293
(7.00 %)
105,821
(2.42 %)
35,197
(0.42 %)
19 Atlantic horse mackerel (2021)
GCA_905171665.2
n/a n/a 15,262
(2.42 %)
51,857
(6.86 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
222
(0.00 %)
153
(100.00 %)
1,454,219
(18.25 %)
384,609
(4.72 %)
4,338,083
(32.80 %)
5
(0.00 %)
449,712
(4.53 %)
56,553
(3.08 %)
20,550
(1.04 %)
20 Atlantic mackerel (primary hap 2023)
GCA_963691925.1
n/a n/a 15,291
(2.56 %)
43,206
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
666
(100.00 %)
1,496,244
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,761
(29.92 %)
9
(0.00 %)
555,075
(5.00 %)
13,309
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
21 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024)
GCA_963924715.1
n/a n/a 15,722
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
0
(0 %)
468
(0.01 %)
120
(100.00 %)
1,608,686
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,115
(27.80 %)
3
(0.00 %)
390,196
(3.88 %)
14,488
(0.90 %)
9,706
(0.46 %)
22 Atlantic halibut (refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
n/a 14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
69,662
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
0
(0 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
0
(0 %)
240,110
(3.16 %)
31,325
(2.25 %)
20,749
(1.34 %)
23 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1
60,922
(2.51 %)
n/a 12,544
(0.38 %)
28,250
(1.22 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,648
(0.01 %)
2,989
(100.00 %)
8,579,099
(49.81 %)
831,222
(15.75 %)
21,718,178
(51.79 %)
9
(0.00 %)
4,445,369
(7.00 %)
105,821
(2.42 %)
35,197
(0.42 %)
24 Atlantic cod
GCF_902167405.1
51,642
(11.92 %)
n/a 14,055
(2.62 %)
36,761
(8.42 %)
68,438
(9.50 %)
45.64
(96.48 %)
0
(0 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
790,946
(10.54 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
4
(0.00 %)
741,285
(7.34 %)
97,133
(7.82 %)
51,623
(3.50 %)
25 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
n/a 14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
0
(0 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
1
(0.00 %)
4,597,115
(10.42 %)
78,364
(2.73 %)
45,620
(1.05 %)
26 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3
n/a n/a 16,280
(0.07 %)
186,628
(1.11 %)
n/a 46.01
(99.99 %)
0
(0 %)
184,422
(0.01 %)
27,157
(100.00 %)
28,291,633
(68.19 %)
7,299,053
(4.96 %)
211,579
(99.99 %)
189
(0.00 %)
n/a 2,388,998
(5.24 %)
429,355
(0.66 %)
27 ballan wrasse (primary hap 2024)
GCA_963930695.1
n/a n/a 15,142
(2.66 %)
43,601
(6.21 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
1
(0.00 %)
815
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,221,802
(30.10 %)
290,738
(7.79 %)
4,164,845
(30.34 %)
4
(0.00 %)
525,923
(5.43 %)
17,126
(0.94 %)
10,131
(0.54 %)
28 banded archerfish
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
n/a 15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
0
(0 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
1
(0.00 %)
297,814
(3.49 %)
15,089
(0.96 %)
9,304
(0.55 %)
29 barbel (2022)
GCA_936440315.1
n/a n/a 31,876
(3.30 %)
85,063
(5.65 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
0
(0 %)
108
(0.00 %)
92
(100.00 %)
4,839,533
(52.47 %)
646,636
(4.57 %)
8,240,279
(42.13 %)
2
(0.00 %)
569,819
(3.17 %)
71,384
(3.04 %)
22,137
(0.56 %)
30 barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021)
GCA_015227805.3
n/a n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,548
(2.85 %)
29,760
(1.66 %)
31 Barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.2
41,925
(5.13 %)
n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,661
(1.56 %)
36,548
(2.85 %)
29,760
(1.66 %)
32 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1
46,266
(2.61 %)
n/a 18,620
(1.80 %)
21,271
(1.72 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
48
(100.00 %)
3,041,145
(25.08 %)
904,075
(3.80 %)
10,530,666
(37.05 %)
0
(0 %)
647,994
(2.05 %)
77,605
(3.68 %)
62,105
(2.31 %)
33 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1
n/a n/a 14,455
(2.06 %)
56,488
(6.31 %)
n/a 42.10
(99.99 %)
0
(0 %)
636
(0.01 %)
298
(100.00 %)
3,230,397
(55.09 %)
494,440
(10.43 %)
4,359,169
(40.46 %)
2
(0.00 %)
950,976
(6.99 %)
81,684
(4.81 %)
45,797
(2.02 %)
34 black rhinoceros (mBicDic1 primary hap 2021 refseq)
GCF_020826845.1
56,255
(2.28 %)
n/a 18,774
(1.38 %)
22,348
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
0
(0 %)
215
(0.05 %)
1,076
(100.00 %)
4,200,390
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,693
(40.14 %)
2
(0.00 %)
984,722
(2.61 %)
43,525
(1.14 %)
33,963
(0.76 %)
35 black-capped chickadee (bPoeAtr1 2023)
GCF_030490865.1
44,388
(4.96 %)
n/a 13,738
(1.81 %)
26,691
(2.34 %)
n/a 42.41
(99.92 %)
0
(0 %)
404
(0.08 %)
307
(100.00 %)
730,165
(12.91 %)
566,529
(6.51 %)
6,499,984
(24.36 %)
2
(0.00 %)
632,539
(3.23 %)
42,650
(2.59 %)
24,153
(1.20 %)
36 black-headed gull (primary hap 2024)
GCA_963924245.1
n/a n/a 13,244
(1.58 %)
25,111
(1.96 %)
n/a 44.66
(99.99 %)
0
(0 %)
462
(0.01 %)
729
(100.00 %)
516,350
(4.84 %)
268,175
(14.83 %)
5,880,256
(31.31 %)
1
(0.00 %)
746,095
(4.07 %)
45,313
(4.92 %)
37,372
(1.57 %)
37 black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq)
GCF_028500815.1
51,115
(5.11 %)
n/a 13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
0
(0 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
8
(0.00 %)
651,837
(3.67 %)
45,318
(4.71 %)
36,668
(1.67 %)
38 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1
n/a n/a 15,043
(2.96 %)
50,860
(7.54 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
366
(0.01 %)
109
(100.00 %)
1,210,142
(29.44 %)
340,820
(9.19 %)
2,986,750
(29.89 %)
0
(0 %)
547,550
(6.92 %)
52,010
(4.20 %)
28,373
(1.72 %)
39 blackcap
GCA_009819655.1
n/a n/a 12,378
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
0
(0 %)
413
(1.12 %)
189
(100.00 %)
506,242
(6.14 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,567
(19.76 %)
0
(0 %)
190,210
(1.30 %)
26,838
(2.34 %)
22,667
(1.33 %)
40 Blainville's beaked whale (mMesDen1 primary hap 2022)
GCA_025265405.1
n/a n/a 19,042
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
0
(0 %)
97
(0.03 %)
73
(100.00 %)
3,964,035
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,162
(41.78 %)
1
(0.00 %)
1,795,618
(5.01 %)
70,851
(1.80 %)
37,949
(0.93 %)
41 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1
47,540
(2.07 %)
n/a 19,041
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
0
(0 %)
97
(0.03 %)
74
(100.00 %)
3,964,038
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,229
(41.78 %)
1
(0.00 %)
1,795,618
(5.01 %)
70,851
(1.80 %)
37,949
(0.93 %)
42 blonde ray (primary hap 2023)
GCA_963514005.1
n/a n/a 11,900
(0.54 %)
27,568
(1.55 %)
n/a 44.98
(99.98 %)
0
(0 %)
2,269
(0.02 %)
1,647
(100.00 %)
8,972,805
(66.20 %)
1,061,811
(8.11 %)
11,599,498
(58.72 %)
6
(0.00 %)
2,430,580
(6.13 %)
278,499
(6.42 %)
59,922
(2.12 %)
43 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2
58,750
(2.71 %)
n/a 19,162
(1.80 %)
20,576
(1.41 %)
36,291
(1.99 %)
40.88
(98.91 %)
0
(0 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,870
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,384
(34.60 %)
4
(0.00 %)
422,171
(1.33 %)
67,032
(1.73 %)
46,602
(1.41 %)
44 blue-and-yellow macaw (hap1 2023)
GCA_028858755.1
n/a n/a 12,919
(1.77 %)
22,770
(2.15 %)
n/a 42.69
(99.92 %)
0
(0 %)
107
(0.08 %)
246
(100.00 %)
711,670
(17.55 %)
242,430
(5.04 %)
5,545,074
(24.84 %)
0
(0 %)
506,592
(3.20 %)
25,153
(2.06 %)
19,988
(1.21 %)
45 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2
n/a n/a 14,499
(1.97 %)
51,213
(5.47 %)
n/a 38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
442
(100.00 %)
731,731
(4.21 %)
471,623
(4.92 %)
5,974,055
(42.88 %)
0
(0 %)
455,138
(4.01 %)
29,052
(1.48 %)
14,673
(0.63 %)
46 Boeseman's rainbowfish
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
n/a 15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
0
(0 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
1
(0.00 %)
441,845
(3.68 %)
18,525
(1.10 %)
10,661
(0.59 %)
47 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1
n/a n/a 16,964
(1.77 %)
67,673
(5.93 %)
n/a 42.61
(99.97 %)
28
(0.00 %)
1,785
(0.03 %)
979
(100.00 %)
4,285,965
(30.73 %)
1,222,431
(20.69 %)
6,105,881
(46.99 %)
11
(0.00 %)
1,356,343
(8.48 %)
73,543
(3.28 %)
32,534
(1.37 %)
48 bonti-bonti (T.bonti 2022)
GCA_933228915.1
n/a n/a 14,929
(1.93 %)
55,343
(5.90 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
0
(0 %)
1,329
(0.03 %)
146
(100.00 %)
998,246
(14.90 %)
443,155
(22.40 %)
4,319,947
(40.01 %)
2
(0.00 %)
1,529,147
(9.19 %)
34,018
(4.16 %)
15,066
(0.86 %)
49 Bornean orangutan (AG05252 primary hap 2023)
GCF_028885625.1
81,966
(2.93 %)
n/a 20,794
(1.72 %)
21,307
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.86 %)
39
(0.14 %)
39
(0.14 %)
1,593
(99.86 %)
5,651,267
(54.21 %)
1,155,151
(9.33 %)
16,242,823
(42.82 %)
0
(0 %)
2,513,241
(4.25 %)
52,294
(2.02 %)
36,160
(1.02 %)
50 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1
n/a n/a 18,247
(1.61 %)
22,673
(1.83 %)
n/a 41.12
(99.99 %)
205
(0.00 %)
775
(0.01 %)
835
(100.00 %)
2,918,285
(18.64 %)
868,090
(5.77 %)
9,427,604
(40.78 %)
2
(0.00 %)
1,601,923
(4.79 %)
27,049
(1.25 %)
22,545
(0.76 %)
51 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1
n/a n/a 18,667
(1.46 %)
20,817
(1.26 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
284
(0.00 %)
903
(100.00 %)
4,004,895
(35.23 %)
925,158
(12.15 %)
11,999,784
(42.65 %)
3
(0.00 %)
1,841,091
(5.04 %)
63,428
(1.55 %)
38,329
(0.93 %)
52 bowfin (hap1 2024)
GCA_036373705.1
n/a n/a 13,851
(1.83 %)
27,058
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
97
(0.00 %)
390
(100.00 %)
953,497
(13.69 %)
387,700
(7.91 %)
4,552,410
(37.72 %)
4
(0.00 %)
613,799
(6.38 %)
46,301
(2.99 %)
26,437
(1.15 %)
53 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1
n/a n/a 17,865
(1.56 %)
76,506
(5.59 %)
n/a 42.15
(99.96 %)
0
(0 %)
2,704
(0.04 %)
676
(100.00 %)
6,391,921
(39.62 %)
1,227,487
(11.70 %)
6,669,558
(49.73 %)
11
(0.00 %)
1,301,019
(7.83 %)
76,828
(3.96 %)
26,877
(0.90 %)
54 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1
n/a n/a 19,039
(1.66 %)
21,660
(1.59 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
20
(0.00 %)
148
(100.00 %)
3,805,818
(31.80 %)
640,446
(2.50 %)
11,793,353
(36.15 %)
1
(0.00 %)
609,574
(1.94 %)
68,896
(2.40 %)
57,812
(1.49 %)
55 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1
n/a n/a 19,138
(1.72 %)
20,370
(1.54 %)
n/a 43.08
(99.99 %)
0
(0 %)
1,237
(0.01 %)
65
(100.00 %)
3,201,470
(26.24 %)
957,903
(4.27 %)
10,687,995
(39.65 %)
8
(0.00 %)
881,577
(2.81 %)
60,671
(2.39 %)
52,889
(1.71 %)
56 brown argus butterfly
GCF_905147365.1
23,611
(6.61 %)
n/a 4,734
(1.03 %)
24,265
(6.80 %)
24,237
(6.16 %)
36.86
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
25
(100.00 %)
264,358
(2.90 %)
144,234
(3.35 %)
2,650,845
(48.44 %)
0
(0 %)
205,173
(4.19 %)
35,431
(4.56 %)
15,409
(1.89 %)
57 butterfish (2021 G10K)
GCF_020382885.2
52,828
(14.10 %)
n/a 15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
0
(0 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
1
(0.00 %)
96,783
(1.70 %)
15,574
(1.13 %)
10,807
(0.72 %)
58 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1
n/a n/a 14,403
(2.47 %)
61,860
(7.37 %)
n/a 43.15
(99.96 %)
0
(0 %)
1,625
(0.04 %)
525
(100.00 %)
959,651
(12.16 %)
517,137
(13.14 %)
3,775,081
(32.47 %)
9
(0.00 %)
784,659
(7.82 %)
81,881
(6.68 %)
50,317
(3.10 %)
59 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2
70,801
(3.05 %)
n/a 20,915
(1.77 %)
20,179
(1.40 %)
44,926
(2.10 %)
41.40
(99.23 %)
0
(0 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,525,652
(43.65 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,648
(33.76 %)
2
(0.00 %)
495,451
(1.44 %)
51,899
(1.50 %)
48,201
(1.32 %)
60 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2
50,142
(2.69 %)
n/a 18,273
(1.65 %)
19,264
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
0
(0 %)
842
(0.12 %)
54
(100.00 %)
5,011,165
(43.72 %)
904,525
(1.75 %)
13,467,551
(34.19 %)
0
(0 %)
572,384
(1.64 %)
66,799
(2.48 %)
60,482
(2.02 %)
61 carmine bee-eater
GCA_009819595.1
n/a n/a 12,740
(1.82 %)
28,031
(2.77 %)
n/a 42.88
(99.47 %)
0
(0 %)
269
(0.53 %)
109
(100.00 %)
556,926
(7.87 %)
213,180
(1.09 %)
6,641,077
(21.58 %)
0
(0 %)
132,076
(1.14 %)
30,881
(2.41 %)
23,550
(1.23 %)
62 chaffinch (primary hap 2023)
GCA_963513975.1
n/a n/a 12,708
(1.72 %)
24,978
(2.26 %)
n/a 44.06
(99.99 %)
7
(0.00 %)
573
(0.01 %)
467
(100.00 %)
495,590
(3.15 %)
493,628
(13.34 %)
6,163,336
(28.37 %)
2
(0.00 %)
729,875
(4.06 %)
39,042
(6.25 %)
24,111
(1.21 %)
63 channel bull blenny
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
n/a 14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
0
(0 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
0
(0 %)
452,303
(4.62 %)
20,453
(1.39 %)
10,802
(0.65 %)
64 chimpanzee (AG18354 primary hap 2023)
GCF_028858775.1
111,282
(4.36 %)
n/a 20,990
(1.75 %)
21,705
(1.15 %)
n/a 40.94
(99.90 %)
29
(0.10 %)
29
(0.10 %)
1,500
(99.90 %)
5,581,205
(50.06 %)
1,158,792
(10.59 %)
15,972,274
(43.09 %)
0
(0 %)
3,093,549
(5.27 %)
61,901
(2.29 %)
38,043
(1.17 %)
65 Chinese pangolin (mManPen7 2023)
GCF_030020395.1
71,445
(2.98 %)
n/a 18,379
(1.34 %)
21,837
(1.29 %)
n/a 41.07
(99.77 %)
0
(0 %)
383
(0.23 %)
661
(100.00 %)
3,318,871
(34.65 %)
618,193
(3.68 %)
12,009,669
(39.02 %)
8
(0.00 %)
1,132,160
(3.87 %)
47,708
(1.22 %)
34,214
(0.79 %)
66 chub mackerel (fScoJap1 primary hap 2022)
GCF_027409825.1
34,390
(6.95 %)
n/a 15,348
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
0
(0 %)
1,572
(0.08 %)
360
(100.00 %)
1,669,322
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,373
(32.38 %)
3
(0.00 %)
927,880
(7.23 %)
16,290
(0.85 %)
8,913
(0.42 %)
67 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3
n/a n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
67,055
(11.68 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
633,883
(15.28 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,008
(21.31 %)
0
(0 %)
169,790
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
68 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1
81,219
(3.62 %)
n/a 18,300
(1.65 %)
20,361
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
0
(0 %)
181
(0.06 %)
33
(100.00 %)
4,224,269
(34.84 %)
992,668
(2.08 %)
13,618,866
(34.42 %)
3
(0.00 %)
647,739
(1.89 %)
67,830
(2.45 %)
58,781
(1.98 %)
69 common yellowthroat
GCA_009764595.1
n/a n/a 11,741
(1.82 %)
22,382
(2.29 %)
n/a 42.01
(98.73 %)
0
(0 %)
1,479
(1.27 %)
278
(100.00 %)
476,049
(6.38 %)
367,108
(3.16 %)
6,576,957
(20.43 %)
0
(0 %)
333,263
(2.08 %)
25,004
(2.02 %)
20,494
(1.18 %)
70 common tern
GCA_009819605.1
n/a n/a 13,103
(1.81 %)
24,044
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.16 %)
0
(0 %)
205
(0.84 %)
123
(100.00 %)
570,312
(7.91 %)
216,895
(1.04 %)
7,043,151
(20.98 %)
1
(0.00 %)
112,065
(1.02 %)
45,694
(3.73 %)
41,720
(2.13 %)
71 common vampire bat (HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1
n/a n/a 18,280
(1.71 %)
19,514
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
611
(0.01 %)
572
(100.00 %)
2,761,820
(28.38 %)
427,940
(3.89 %)
11,250,492
(32.57 %)
37
(0.00 %)
360,489
(1.62 %)
70,700
(2.48 %)
44,288
(1.24 %)
72 common myna (bArcTri1 primary hap 2023)
GCA_027559615.1
n/a n/a 12,560
(1.73 %)
23,740
(2.16 %)
n/a 42.32
(99.80 %)
0
(0 %)
435
(0.20 %)
455
(100.00 %)
395,254
(5.40 %)
937,774
(11.00 %)
6,145,808
(28.07 %)
2
(0.00 %)
825,681
(4.71 %)
32,293
(3.87 %)
21,576
(1.15 %)
73 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1
n/a n/a 13,266
(1.21 %)
16,750
(1.98 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
0
(0 %)
372
(0.00 %)
350
(100.00 %)
782,672
(6.46 %)
434,795
(2.20 %)
7,788,697
(37.04 %)
0
(0 %)
506,831
(2.74 %)
28,089
(0.98 %)
14,987
(0.51 %)
74 common spadefoot toad (aPelFus1 2024)
GCA_036172605.1
n/a n/a 14,564
(0.56 %)
46,435
(2.21 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
1
(0.00 %)
349
(0.00 %)
161
(100.00 %)
1,677,382
(3.51 %)
3,229,435
(13.31 %)
15,027,089
(51.43 %)
12
(0.00 %)
3,799,247
(9.03 %)
282,389
(3.86 %)
79,263
(0.96 %)
75 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1
n/a n/a 17,216
(1.82 %)
19,202
(1.79 %)
n/a 42.55
(99.97 %)
0
(0 %)
1,546
(0.03 %)
323
(100.00 %)
2,953,532
(23.94 %)
805,142
(2.83 %)
9,964,846
(34.69 %)
0
(0 %)
446,836
(1.61 %)
57,295
(2.83 %)
54,882
(1.90 %)
76 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1
37,674
(1.80 %)
n/a 18,653
(0.80 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,116
(38.90 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,306
(40.56 %)
0
(0 %)
455,717
(1.17 %)
17,762
(0.38 %)
13,986
(0.24 %)
77 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq)
GCF_017976375.1
50,206
(6.30 %)
n/a 13,190
(1.85 %)
24,284
(2.29 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
0
(0 %)
296
(0.42 %)
150
(100.00 %)
566,161
(11.56 %)
310,430
(2.36 %)
6,712,791
(21.76 %)
0
(0 %)
326,395
(1.83 %)
25,268
(1.73 %)
20,672
(1.05 %)
78 common swift (bApuApu2 2021 refseq)
GCF_020740795.1
39,986
(4.95 %)
n/a 12,292
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
0
(0 %)
256
(0.16 %)
110
(100.00 %)
499,695
(6.70 %)
199,749
(1.12 %)
6,354,003
(21.19 %)
1
(0.00 %)
113,872
(0.91 %)
20,393
(1.74 %)
16,313
(0.88 %)
79 common toad
GCF_905171765.1
45,085
(1.10 %)
n/a 14,240
(0.38 %)
46,470
(1.68 %)
37,594
(0.91 %)
44.49
(99.80 %)
0
(0 %)
4,199
(0.20 %)
1,306
(100.00 %)
1,658,204
(1.79 %)
3,099,513
(13.49 %)
19,236,510
(62.70 %)
18
(0.00 %)
6,217,888
(10.17 %)
539,919
(4.45 %)
78,985
(0.67 %)
80 common sole (primary hap 2023)
GCF_958295425.1
55,359
(12.02 %)
n/a 14,844
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
242
(100.00 %)
1,149,243
(19.12 %)
342,238
(9.71 %)
3,906,753
(32.84 %)
2
(0.00 %)
440,509
(5.18 %)
27,772
(2.71 %)
15,561
(0.92 %)
81 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1
45,869
(6.34 %)
n/a 14,279
(1.46 %)
19,710
(2.38 %)
n/a 44.05
(99.99 %)
0
(0 %)
683
(0.01 %)
48
(100.00 %)
4,128,183
(45.62 %)
513,318
(3.73 %)
7,172,928
(37.61 %)
7
(0.00 %)
477,389
(3.08 %)
92,858
(2.90 %)
22,863
(0.95 %)
82 convict blenny (chichlid 2021)
GCA_020510985.1
n/a n/a n/a 134,417
(1.50 %)
n/a 44.52
(99.13 %)
0
(0 %)
2,580
(0.87 %)
512
(100.00 %)
9,062,541
(49.33 %)
2,097,650
(2.66 %)
3,092
(99.13 %)
5
(0.00 %)
3,135,536
(6.36 %)
568,042
(10.14 %)
0
(0.00 %)
83 copperband butterflyfish
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
n/a 15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
61,755
(8.99 %)
42.57
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
1
(0.00 %)
158,516
(2.15 %)
29,106
(1.85 %)
19,302
(1.11 %)
84 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1
n/a n/a 14,740
(2.91 %)
45,483
(7.26 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
0
(0 %)
1,379
(0.04 %)
395
(100.00 %)
936,676
(24.41 %)
306,192
(9.29 %)
3,495,456
(28.75 %)
2
(0.00 %)
463,889
(5.20 %)
29,142
(2.35 %)
16,622
(1.09 %)
85 corroboree frog (hap2 2023)
GCA_028390025.1
n/a n/a n/a 54,346
(1.07 %)
n/a 45.66
(99.76 %)
0
(0 %)
2,699
(0.24 %)
3,127
(100.00 %)
18,782,633
(75.22 %)
5,902,115
(18.63 %)
5,826
(99.76 %)
23
(0.00 %)
n/a 990,274
(4.84 %)
90,184
(0.51 %)
86 Cretan wall lizard (primary hap 2023)
GCA_951804945.1
n/a n/a 14,249
(1.37 %)
19,304
(2.27 %)
n/a 43.87
(100.00 %)
4
(0.00 %)
47
(0.00 %)
55
(100.00 %)
882,564
(4.30 %)
511,174
(3.24 %)
7,094,363
(38.65 %)
2
(0.00 %)
586,225
(3.38 %)
117,222
(3.18 %)
18,707
(0.71 %)
87 crucian carp (primary hap 2023)
GCF_963082965.1
90,094
(6.75 %)
n/a 29,386
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
0
(0 %)
832
(0.01 %)
277
(100.00 %)
3,481,382
(45.81 %)
802,773
(6.54 %)
8,190,783
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,003,533
(5.09 %)
83,696
(3.82 %)
26,039
(0.81 %)
88 cuckoo roller (hap2 2023)
GCA_034619465.1
n/a n/a 13,044
(1.66 %)
30,275
(2.65 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
17
(0.00 %)
271
(0.00 %)
295
(100.00 %)
603,184
(8.76 %)
324,082
(7.37 %)
6,147,876
(25.10 %)
0
(0 %)
633,504
(3.50 %)
44,051
(8.95 %)
36,565
(2.19 %)
89 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1
51,190
(10.37 %)
n/a 15,144
(2.59 %)
43,207
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.98 %)
0
(0 %)
570
(0.02 %)
324
(100.00 %)
1,435,625
(29.39 %)
330,276
(12.54 %)
4,196,830
(33.83 %)
1
(0.00 %)
689,646
(5.54 %)
19,310
(1.01 %)
11,155
(0.57 %)
90 cunner (2021)
GCA_020745685.1
n/a n/a 15,192
(2.74 %)
43,564
(6.38 %)
n/a 41.31
(99.41 %)
0
(0 %)
283
(0.59 %)
64
(100.00 %)
1,419,667
(30.50 %)
243,024
(4.81 %)
4,334,690
(27.65 %)
2
(0.00 %)
297,510
(2.95 %)
17,974
(1.06 %)
9,021
(0.52 %)
91 Dalmatian pelican (primary hap 2023)
GCA_030463565.1
n/a n/a 13,457
(1.72 %)
25,299
(2.10 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
0
(0 %)
390
(0.01 %)
311
(100.00 %)
660,747
(14.47 %)
294,268
(5.22 %)
6,840,996
(24.63 %)
5
(0.00 %)
318,407
(2.04 %)
39,705
(5.14 %)
36,802
(1.98 %)
92 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022)
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
n/a 15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
0
(0 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
4
(0.00 %)
383,250
(3.60 %)
32,973
(1.28 %)
9,764
(0.33 %)
93 Daubenton's bat (primary hap 2023)
GCF_963259705.1
64,558
(3.32 %)
n/a 19,141
(1.72 %)
22,133
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
0
(0 %)
1,099
(0.01 %)
121
(100.00 %)
3,040,232
(24.03 %)
796,911
(6.38 %)
10,478,180
(38.84 %)
9
(0.00 %)
756,429
(2.76 %)
64,920
(2.51 %)
57,806
(1.88 %)
94 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2
n/a n/a 16,559
(3.78 %)
58,823
(8.66 %)
74,128
(10.47 %)
43.69
(99.18 %)
0
(0 %)
464
(0.82 %)
461
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,284
(4.61 %)
2,948,738
(28.79 %)
0
(0 %)
306,165
(4.31 %)
64,661
(9.49 %)
52,867
(4.93 %)
95 diamondback terrapin (rMalTer1 2023)
GCF_027887155.1
50,318
(3.53 %)
n/a 15,109
(1.08 %)
19,280
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.92 %)
0
(0 %)
141
(0.08 %)
76
(100.00 %)
4,088,064
(46.33 %)
403,943
(1.72 %)
11,014,504
(33.74 %)
0
(0 %)
407,696
(1.71 %)
110,838
(2.71 %)
30,093
(0.82 %)
96 dorado (hap2 2023)
GCA_030463535.1
n/a n/a 16,799
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
0
(0 %)
726
(0.85 %)
104
(100.00 %)
2,693,928
(34.60 %)
805,807
(14.65 %)
5,615,731
(36.69 %)
2
(0.00 %)
1,425,798
(8.96 %)
30,083
(1.31 %)
21,157
(0.81 %)
97 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCF_014839835.1
25,483
(3.24 %)
n/a 12,410
(1.70 %)
22,416
(2.11 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
0
(0 %)
187
(0.34 %)
180
(100.00 %)
1,259,627
(26.52 %)
378,533
(3.38 %)
5,846,661
(32.04 %)
0
(0 %)
791,075
(4.25 %)
26,005
(1.75 %)
19,919
(1.16 %)
98 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1
n/a n/a 18,354
(1.22 %)
20,434
(1.08 %)
n/a 40.65
(100.00 %)
0
(0 %)
96
(0.00 %)
198
(100.00 %)
4,458,084
(33.00 %)
444,499
(1.79 %)
15,031,940
(47.42 %)
0
(0 %)
508,936
(1.29 %)
29,863
(0.83 %)
24,007
(0.54 %)
99 East African grey crowned-crane
GCA_011004875.1
n/a n/a 13,276
(1.84 %)
25,393
(2.30 %)
n/a 42.38
(99.61 %)
0
(0 %)
144
(0.39 %)
105
(100.00 %)
548,862
(7.06 %)
187,966
(0.97 %)
7,004,597
(21.19 %)
0
(0 %)
102,622
(1.00 %)
36,626
(3.69 %)
36,347
(2.31 %)
100 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1
n/a n/a 13,882
(0.43 %)
35,323
(1.46 %)
n/a 46.78
(99.99 %)
0
(0 %)
1,745
(0.01 %)
1,002
(100.00 %)
1,769,293
(1.99 %)
2,023,109
(16.33 %)
16,148,710
(60.55 %)
22
(0.00 %)
5,852,023
(9.72 %)
618,204
(5.89 %)
74,394
(0.76 %)
101 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1
n/a n/a 13,413
(1.19 %)
18,038
(1.85 %)
n/a 44.58
(99.99 %)
553
(0.01 %)
553
(0.01 %)
771
(99.99 %)
1,003,504
(9.02 %)
621,617
(3.54 %)
8,327,948
(30.44 %)
3
(0.00 %)
583,206
(2.41 %)
117,734
(4.05 %)
30,498
(1.01 %)
102 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5
n/a n/a 15,552
(2.29 %)
52,465
(6.26 %)
86,437
(9.40 %)
41.07
(99.87 %)
115
(0.00 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
1,309,350
(35.93 %)
217,916
(1.89 %)
4,547,434
(30.78 %)
2
(0.00 %)
212,425
(2.79 %)
33,005
(1.88 %)
15,205
(0.74 %)
103 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1
n/a n/a 18,522
(1.26 %)
22,314
(1.28 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
0
(0 %)
316
(0.00 %)
99
(100.00 %)
3,699,683
(20.55 %)
935,350
(11.22 %)
13,112,318
(44.07 %)
1
(0.00 %)
n/a 99,224
(2.27 %)
68,695
(1.75 %)
104 Eastern black-eared wheatear (GR-GAL-2019-014 2023)
GCF_029582105.1
38,171
(5.79 %)
n/a 12,559
(1.96 %)
23,642
(2.48 %)
n/a 42.01
(99.99 %)
0
(0 %)
582
(0.01 %)
587
(100.00 %)
599,051
(9.46 %)
453,954
(3.77 %)
6,287,657
(20.75 %)
0
(0 %)
382,912
(2.31 %)
27,831
(2.52 %)
21,991
(1.27 %)
105 Egyptian rousette (2020)
GCF_014176215.1
65,163
(4.76 %)
n/a 17,642
(2.07 %)
22,317
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
0
(0 %)
242
(1.41 %)
29
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,414
(1.02 %)
12,031,597
(26.52 %)
0
(0 %)
65,562
(0.33 %)
53,573
(4.84 %)
57,281
(4.47 %)
106 electric eel
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
n/a 15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
54,541
(8.42 %)
42.49
(98.20 %)
0
(0 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
1
(0.00 %)
629,918
(5.96 %)
44,501
(3.93 %)
34,390
(2.63 %)
107 emu (v2 ZJU1.0 2023)
GCA_016128335.2
n/a n/a 13,213
(1.74 %)
24,562
(2.10 %)
n/a 42.41
(99.99 %)
0
(0 %)
539
(0.01 %)
767
(100.00 %)
567,285
(7.79 %)
258,030
(2.59 %)
7,108,005
(19.16 %)
9
(0.00 %)
314,931
(1.79 %)
41,752
(6.24 %)
41,181
(3.35 %)
108 epaulette shark (sHemOce1 2021 refseq)
GCF_020745735.1
43,156
(1.65 %)
n/a 12,749
(0.40 %)
19,519
(1.06 %)
n/a 42.76
(98.05 %)
0
(0 %)
3,716
(1.95 %)
1,962
(100.00 %)
9,420,365
(63.82 %)
935,037
(6.51 %)
20,660,566
(43.88 %)
0
(0 %)
2,903,280
(4.44 %)
41,682
(1.08 %)
16,895
(0.30 %)
109 ermine (2020)
GCF_009829155.1
74,332
(3.19 %)
n/a 18,855
(1.65 %)
20,667
(1.43 %)
44,584
(2.07 %)
41.56
(99.12 %)
0
(0 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,647,934
(41.44 %)
714,174
(1.30 %)
13,845,904
(33.42 %)
3
(0.01 %)
452,963
(1.26 %)
56,065
(2.25 %)
56,447
(2.07 %)
110 Eurasian red squirrel (2019)
GCA_902686455.1
n/a n/a 21,298
(1.58 %)
21,024
(1.36 %)
36,645
(1.54 %)
40.08
(94.33 %)
0
(0 %)
1,177
(5.67 %)
638
(100.00 %)
4,680,964
(35.76 %)
704,218
(1.42 %)
14,991,981
(31.49 %)
5
(0.00 %)
419,662
(1.29 %)
48,159
(1.04 %)
45,455
(0.95 %)
111 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2
n/a n/a 21,309
(1.58 %)
21,026
(1.36 %)
33,465
(1.53 %)
40.08
(94.33 %)
0
(0 %)
1,177
(5.67 %)
639
(100.00 %)
4,677,412
(35.73 %)
704,218
(1.42 %)
14,992,063
(31.49 %)
5
(0.00 %)
419,661
(1.29 %)
48,159
(1.04 %)
45,470
(0.95 %)
112 Eurasian nightjar
GCA_907165065.1
n/a n/a 13,040
(1.86 %)
22,823
(2.21 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
153
(0.00 %)
121
(100.00 %)
595,803
(8.38 %)
248,128
(1.78 %)
6,744,611
(22.18 %)
2
(0.00 %)
193,177
(1.31 %)
24,805
(1.90 %)
20,997
(1.31 %)
113 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1
n/a n/a 17,661
(3.01 %)
58,218
(6.54 %)
n/a 39.21
(99.98 %)
0
(0 %)
881
(0.02 %)
125
(100.00 %)
2,346,939
(44.27 %)
502,415
(11.23 %)
4,890,830
(40.45 %)
0
(0 %)
873,838
(6.63 %)
60,482
(4.22 %)
24,091
(1.23 %)
114 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1
67,145
(2.95 %)
n/a 18,842
(1.54 %)
20,178
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
0
(0 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,259,294
(33.39 %)
713,721
(1.36 %)
13,626,048
(34.37 %)
1
(0.00 %)
695,796
(1.86 %)
57,073
(1.82 %)
47,446
(1.36 %)
115 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
n/a 19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
36,935
(2.27 %)
42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
5
(0.00 %)
518,667
(1.69 %)
19,000
(0.58 %)
16,851
(0.46 %)
116 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1
57,138
(2.48 %)
n/a 19,265
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,487,951
(32.73 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,723
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,258
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
54,563
(1.83 %)
117 European golden plover
GCA_017639485.1
n/a n/a 12,984
(1.78 %)
22,854
(2.04 %)
n/a 42.70
(99.01 %)
0
(0 %)
268
(0.99 %)
107
(100.00 %)
558,587
(8.35 %)
180,400
(0.83 %)
7,132,381
(21.18 %)
0
(0 %)
102,461
(0.84 %)
40,661
(3.41 %)
37,600
(2.03 %)
118 European pond turtle (hap1 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017835.1
n/a n/a 14,802
(0.99 %)
19,772
(1.60 %)
n/a 44.74
(99.86 %)
0
(0 %)
148
(0.14 %)
106
(100.00 %)
1,526,737
(12.44 %)
460,562
(2.12 %)
11,130,580
(35.42 %)
5
(0.00 %)
495,884
(2.08 %)
136,002
(2.92 %)
30,671
(0.72 %)
119 European turtle dove (v1.2 2021)
GCA_901699155.2
n/a n/a 12,391
(1.76 %)
23,333
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
0
(0 %)
940
(0.33 %)
311
(100.00 %)
550,895
(7.50 %)
227,532
(1.16 %)
6,767,530
(21.05 %)
4
(0.00 %)
181,526
(1.65 %)
34,682
(2.57 %)
30,656
(1.68 %)
120 European robin
GCA_903797595.2
n/a n/a 12,344
(1.85 %)
23,934
(2.37 %)
n/a 42.10
(99.97 %)
0
(0 %)
990
(0.03 %)
1,119
(100.00 %)
532,973
(5.96 %)
401,820
(3.43 %)
6,320,210
(21.42 %)
0
(0 %)
338,954
(2.13 %)
30,391
(2.60 %)
21,664
(1.21 %)
121 European flounder (primary hap 2023)
GCA_949316205.1
n/a n/a 14,753
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
109
(100.00 %)
1,160,784
(27.06 %)
251,985
(5.23 %)
3,353,121
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,297
(3.81 %)
37,130
(2.79 %)
27,432
(1.88 %)
122 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1
n/a n/a 18,028
(2.64 %)
64,206
(6.04 %)
n/a 38.73
(99.99 %)
0
(0 %)
588
(0.01 %)
106
(100.00 %)
2,649,943
(48.88 %)
666,129
(9.08 %)
5,751,610
(41.56 %)
5
(0.00 %)
1,113,756
(7.21 %)
58,471
(3.64 %)
19,602
(0.84 %)
123 European shag (primary hap 2023)
GCA_949628215.1
n/a n/a 13,203
(1.74 %)
22,959
(2.04 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
3
(0.00 %)
222
(0.00 %)
356
(100.00 %)
436,838
(4.84 %)
471,070
(3.20 %)
6,601,537
(22.79 %)
1
(0.00 %)
334,549
(2.25 %)
37,247
(3.95 %)
29,099
(1.42 %)
124 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1
n/a n/a 18,336
(1.50 %)
20,807
(1.41 %)
n/a 42.38
(99.98 %)
0
(0 %)
2,250
(0.02 %)
477
(100.00 %)
4,096,160
(31.55 %)
707,337
(3.28 %)
13,715,382
(34.73 %)
10
(0.00 %)
626,861
(1.84 %)
61,481
(4.29 %)
56,462
(1.94 %)
125 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1
n/a n/a 16,181
(2.44 %)
63,544
(7.17 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
0
(0 %)
1,501
(0.04 %)
387
(100.00 %)
2,109,362
(31.42 %)
1,300,159
(14.91 %)
3,634,744
(35.44 %)
6
(0.00 %)
1,178,448
(8.78 %)
35,552
(1.87 %)
19,823
(1.00 %)
126 European smelt (primary hap 2023)
GCA_963692335.1
n/a n/a 15,640
(3.79 %)
50,248
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
30
(0.00 %)
2,462
(0.10 %)
1,038
(100.00 %)
1,648,435
(31.35 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,832
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
127 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1
n/a n/a 20,236
(1.71 %)
19,368
(1.32 %)
n/a 40.05
(99.99 %)
0
(0 %)
2,020
(0.02 %)
894
(100.00 %)
4,892,811
(36.49 %)
1,223,387
(18.26 %)
11,907,631
(42.51 %)
10
(0.00 %)
4,679,739
(9.91 %)
17,423
(0.62 %)
15,264
(0.35 %)
128 European eel
GCF_013347855.1
64,143
(9.57 %)
n/a 17,054
(2.22 %)
34,278
(5.56 %)
79,684
(7.37 %)
43.64
(99.61 %)
0
(0 %)
640
(0.40 %)
54
(100.00 %)
831,037
(5.48 %)
786,521
(8.15 %)
5,700,890
(27.40 %)
2
(0.00 %)
774,914
(5.14 %)
130,346
(8.19 %)
94,446
(4.12 %)
129 European shrew (mSorAra2 primary hap 2023)
GCF_027595985.1
44,643
(2.60 %)
n/a 17,479
(1.26 %)
21,293
(1.37 %)
n/a 43.24
(99.46 %)
0
(0 %)
1,427
(0.54 %)
65
(100.00 %)
2,474,584
(15.18 %)
1,107,884
(3.28 %)
13,638,467
(41.72 %)
10
(0.00 %)
822,159
(2.15 %)
79,785
(2.86 %)
77,901
(2.13 %)
130 European mink (mMusLut2 primary hap 2023)
GCF_030435805.1
69,556
(3.13 %)
n/a 18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
25
(100.00 %)
4,237,791
(30.90 %)
792,897
(2.69 %)
13,417,195
(36.59 %)
0
(0 %)
894,272
(2.55 %)
67,132
(2.54 %)
51,333
(1.62 %)
131 European starfish
GCF_902459465.1
26,326
(11.67 %)
n/a 4,121
(0.84 %)
21,080
(8.48 %)
23,775
(14.13 %)
38.76
(99.96 %)
0
(0 %)
471
(0.04 %)
150
(100.00 %)
131,898
(1.43 %)
159,226
(7.04 %)
2,504,013
(37.40 %)
12
(0.00 %)
310,360
(6.00 %)
15,392
(1.50 %)
7,483
(0.79 %)
132 European common frog
GCF_905171775.1
51,633
(1.57 %)
n/a 13,864
(0.46 %)
39,978
(1.88 %)
57,578
(1.85 %)
44.15
(99.36 %)
0
(0 %)
1,860
(0.64 %)
554
(100.00 %)
1,804,642
(3.42 %)
2,925,830
(9.39 %)
18,921,726
(55.43 %)
8
(0.00 %)
3,384,162
(6.05 %)
641,799
(7.66 %)
62,649
(0.67 %)
133 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1
54,114
(2.24 %)
n/a 19,959
(1.65 %)
19,953
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
0
(0 %)
1,129
(0.01 %)
497
(100.00 %)
4,863,650
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,732
(40.58 %)
17
(0.00 %)
2,516,593
(5.37 %)
23,961
(0.53 %)
17,318
(0.36 %)
134 European plaice (primary hap 2022)
GCF_947347685.1
46,468
(10.51 %)
n/a 14,818
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
0
(0 %)
1,072
(0.03 %)
355
(100.00 %)
476,314
(3.63 %)
520,729
(13.27 %)
3,283,360
(33.55 %)
2
(0.00 %)
525,277
(6.36 %)
47,050
(4.45 %)
21,878
(1.29 %)
135 European snow vole (primary hap 2023)
GCF_950005125.1
47,025
(2.69 %)
n/a 19,592
(1.78 %)
21,173
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
197
(0.00 %)
160
(100.00 %)
5,048,186
(44.12 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,053
(34.97 %)
4
(0.00 %)
954,164
(3.20 %)
20,725
(0.63 %)
18,727
(0.52 %)
136 European conger
GCF_963514075.1
54,631
(7.46 %)
n/a 17,072
(1.89 %)
34,801
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
0
(0 %)
1,009
(0.02 %)
380
(100.00 %)
761,522
(5.99 %)
913,306
(13.25 %)
5,767,879
(35.48 %)
3
(0.00 %)
1,603,437
(8.94 %)
120,990
(6.12 %)
81,342
(2.93 %)
137 fire-bellied toad (aBomBom1 primary hap 2023)
GCF_027579735.1
38,238
(0.68 %)
n/a 15,452
(0.21 %)
47,500
(0.88 %)
n/a 38.98
(98.02 %)
0
(0 %)
7,009
(1.99 %)
2,467
(100.00 %)
4,258,941
(3.44 %)
7,150,261
(12.27 %)
9,476
(98.01 %)
3
(0.00 %)
n/a n/a n/a
138 flier cichlid
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
n/a 15,434
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
0
(0 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
0
(0 %)
227,442
(2.84 %)
24,130
(1.26 %)
11,082
(0.48 %)
139 Florida worm lizard (hap2 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035675.1
n/a n/a 14,331
(0.90 %)
17,854
(1.51 %)
n/a 42.86
(99.72 %)
1
(0.00 %)
242
(0.28 %)
78
(100.00 %)
1,426,833
(7.17 %)
616,690
(2.63 %)
10,819,054
(45.31 %)
1
(0.00 %)
531,662
(2.36 %)
47,454
(1.03 %)
18,400
(0.42 %)
140 freshwater garfish (fXenCan1 2020)
GCA_014839995.1
n/a n/a 14,625
(2.57 %)
52,879
(6.72 %)
n/a 41.41
(98.98 %)
0
(0 %)
1,373
(1.02 %)
410
(100.00 %)
492,828
(4.29 %)
318,631
(5.94 %)
3,977,536
(27.41 %)
0
(0 %)
521,102
(4.91 %)
32,390
(2.33 %)
21,612
(1.34 %)
141 Gabon caecilian
GCF_902459505.1
54,713
(1.72 %)
n/a 14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,310,970
(1.64 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,802
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,977
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
142 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2
n/a n/a 14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,331,879
(1.68 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,806
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,995
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
143 garden warbler
GCA_014839755.1
n/a n/a 12,520
(1.95 %)
23,459
(2.46 %)
n/a 42.08
(99.82 %)
0
(0 %)
134
(0.18 %)
176
(100.00 %)
491,810
(6.09 %)
376,746
(2.55 %)
6,461,292
(20.23 %)
0
(0 %)
225,297
(1.39 %)
27,799
(2.40 %)
23,088
(1.32 %)
144 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1
n/a n/a 14,151
(0.94 %)
23,338
(1.95 %)
n/a 45.15
(99.95 %)
0
(0 %)
118
(0.05 %)
160
(100.00 %)
1,232,693
(12.81 %)
332,737
(2.19 %)
11,907,298
(32.91 %)
3
(0.00 %)
284,469
(1.22 %)
40,660
(1.87 %)
25,990
(0.77 %)
145 giant manta (hap1 2023)
GCA_030028105.1
n/a n/a 12,432
(0.38 %)
24,821
(1.16 %)
n/a 43.26
(99.23 %)
0
(0 %)
1,810
(0.77 %)
4,715
(100.00 %)
7,913,208
(49.68 %)
969,352
(14.22 %)
20,235,210
(54.42 %)
17
(0.00 %)
4,636,724
(7.12 %)
110,678
(1.74 %)
30,504
(0.36 %)
146 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2
n/a n/a 15,752
(2.45 %)
56,395
(6.58 %)
n/a 41.94
(99.96 %)
0
(0 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
1,474,134
(29.50 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,691
(25.69 %)
0
(0 %)
355,475
(3.53 %)
47,327
(2.41 %)
29,914
(1.44 %)
147 golden eagle (2021)
GCF_900496995.4
60,920
(5.98 %)
n/a 13,334
(1.84 %)
23,261
(2.12 %)
n/a 42.16
(99.58 %)
0
(0 %)
228
(0.42 %)
144
(100.00 %)
544,341
(5.93 %)
186,461
(0.80 %)
7,090,610
(20.01 %)
1
(0.00 %)
68,348
(0.66 %)
38,495
(3.10 %)
35,039
(1.94 %)
148 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1
36,997
(1.96 %)
n/a 20,006
(1.91 %)
19,132
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
0
(0 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,785,907
(32.61 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,958,061
(32.33 %)
0
(0 %)
684,879
(1.84 %)
20,760
(0.59 %)
18,457
(0.52 %)
149 Goodes thornscrub tortoise
GCF_007399415.2
57,442
(3.17 %)
n/a 14,852
(1.00 %)
18,125
(1.49 %)
31,841
(1.80 %)
44.14
(98.71 %)
0
(0 %)
562
(1.29 %)
383
(100.00 %)
1,630,271
(13.86 %)
387,796
(2.00 %)
11,572,827
(33.36 %)
0
(0 %)
474,978
(1.73 %)
71,687
(2.29 %)
21,793
(0.54 %)
150 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1
n/a n/a 14,094
(1.03 %)
17,875
(1.65 %)
n/a 41.62
(99.95 %)
0
(0 %)
28
(0.05 %)
30
(100.00 %)
1,100,228
(6.21 %)
423,695
(1.33 %)
11,521,828
(32.55 %)
2
(0.00 %)
258,014
(1.05 %)
62,978
(2.00 %)
24,755
(0.81 %)
151 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2
n/a n/a 19,474
(1.55 %)
20,394
(1.40 %)
72,806
(4.12 %)
41.49
(100.00 %)
0
(0 %)
166
(0.00 %)
82
(100.00 %)
4,550,524
(31.76 %)
1,063,944
(3.96 %)
13,588,117
(34.74 %)
23
(0.00 %)
1,048,956
(2.49 %)
51,996
(2.15 %)
47,971
(1.53 %)
152 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1
73,383
(3.04 %)
n/a 16,637
(0.72 %)
16,036
(0.85 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
0
(0 %)
2,255
(0.89 %)
13
(100.00 %)
5,562,359
(25.40 %)
1,096,620
(2.60 %)
22,322,748
(43.37 %)
13
(0.00 %)
793,648
(1.81 %)
28,894
(0.57 %)
22,987
(0.42 %)
153 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1
58,884
(2.46 %)
n/a 20,752
(1.49 %)
21,107
(1.31 %)
32,732
(1.45 %)
40.06
(99.98 %)
0
(0 %)
1,824
(0.02 %)
752
(100.00 %)
4,605,578
(34.50 %)
728,192
(1.65 %)
15,467,412
(33.91 %)
2
(0.00 %)
504,786
(1.54 %)
51,878
(1.11 %)
49,715
(1.03 %)
154 great potoo
GCA_013368605.1
n/a n/a 13,116
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
0
(0 %)
243
(0.49 %)
191
(100.00 %)
514,142
(9.71 %)
210,381
(1.13 %)
6,501,989
(23.95 %)
0
(0 %)
244,232
(1.92 %)
35,785
(2.69 %)
29,281
(1.64 %)
155 great cormorant (primary hap 2024)
GCA_963921805.1
n/a n/a 13,434
(1.76 %)
30,619
(3.17 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
0
(0 %)
493
(0.01 %)
351
(100.00 %)
556,740
(10.18 %)
303,279
(3.45 %)
6,599,611
(22.65 %)
1
(0.00 %)
355,900
(2.29 %)
38,341
(5.45 %)
31,913
(1.57 %)
156 great white shark
GCF_017639515.1
49,865
(1.46 %)
n/a 13,010
(0.37 %)
19,263
(0.92 %)
46,152
(1.30 %)
45.21
(99.55 %)
0
(0 %)
2,645
(0.45 %)
719
(100.00 %)
1,046,023
(4.00 %)
1,584,100
(21.25 %)
23,278,563
(52.42 %)
11
(0.00 %)
8,687,289
(11.05 %)
77,021
(1.94 %)
14,712
(0.15 %)
157 great scallop
GCF_902652985.1
46,811
(9.29 %)
n/a 4,090
(0.36 %)
32,743
(7.09 %)
n/a 36.65
(99.92 %)
0
(0 %)
1,827
(0.08 %)
3,983
(100.00 %)
281,310
(1.71 %)
706,978
(26.84 %)
5,249,556
(32.64 %)
0
(0 %)
2,449,994
(15.30 %)
13,101
(0.87 %)
7,209
(0.42 %)
158 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1
n/a 41,563
(2.11 %)
18,531
(1.97 %)
20,309
(1.67 %)
n/a 40.52
(99.19 %)
0
(0 %)
292
(0.81 %)
50
(100.00 %)
3,284,473
(35.00 %)
559,653
(1.29 %)
12,043,562
(29.15 %)
0
(0 %)
155,142
(0.71 %)
32,047
(1.05 %)
30,235
(0.96 %)
159 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1
n/a n/a 15,028
(2.35 %)
50,436
(6.30 %)
n/a 41.10
(99.97 %)
0
(0 %)
1,188
(0.03 %)
1,568
(100.00 %)
2,688,222
(39.74 %)
549,362
(7.60 %)
3,564,661
(40.05 %)
4
(0.00 %)
605,421
(5.26 %)
37,043
(1.94 %)
11,494
(0.60 %)
160 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1
n/a n/a 16,553
(3.15 %)
51,766
(7.37 %)
n/a 44.75
(99.95 %)
61
(0.00 %)
1,752
(0.05 %)
1,085
(100.00 %)
1,674,762
(26.07 %)
900,455
(18.62 %)
2,849,256
(39.22 %)
0
(0 %)
824,383
(7.94 %)
26,022
(2.30 %)
13,322
(0.79 %)
161 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2
53,353
(3.13 %)
n/a 18,641
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,218,744
(34.52 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,641
(0.98 %)
162 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
n/a 19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
0
(0 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
0
(0 %)
499,733
(1.88 %)
61,023
(2.69 %)
54,015
(1.81 %)
163 greater pipefish
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
n/a 13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
37,563
(15.76 %)
43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
0
(0 %)
112,918
(3.25 %)
46,327
(10.97 %)
32,897
(5.93 %)
164 green sea turtle (v2 2021)
GCF_015237465.2
84,366
(4.63 %)
n/a 14,725
(1.06 %)
17,444
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
0
(0 %)
298
(0.56 %)
93
(100.00 %)
1,701,640
(14.83 %)
304,306
(1.25 %)
11,135,147
(31.96 %)
0
(0 %)
429,994
(1.68 %)
49,025
(1.44 %)
26,933
(0.68 %)
165 grey whale (mEscRob2 primary hap 2023)
GCA_028021215.1
n/a n/a 19,288
(1.38 %)
21,791
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
0
(0 %)
279
(0.00 %)
704
(100.00 %)
4,116,900
(35.85 %)
966,065
(16.74 %)
12,154,173
(46.39 %)
3
(0.00 %)
2,154,240
(5.67 %)
77,011
(1.59 %)
42,884
(0.96 %)
166 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1
n/a n/a 14,752
(2.74 %)
58,725
(8.49 %)
n/a 43.13
(99.98 %)
3
(0.00 %)
553
(0.02 %)
322
(100.00 %)
1,860,845
(35.64 %)
378,045
(9.39 %)
3,208,482
(30.12 %)
0
(0 %)
450,213
(5.20 %)
66,857
(4.99 %)
44,052
(2.67 %)
167 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1
n/a n/a 17,136
(1.90 %)
63,611
(4.50 %)
n/a 39.74
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,046
(0.01 %)
233
(100.00 %)
5,662,029
(68.75 %)
825,757
(11.99 %)
6,236,024
(55.15 %)
4
(0.00 %)
1,606,132
(7.98 %)
99,559
(5.68 %)
16,304
(0.51 %)
168 gyrfalcon
GCF_015220075.1
47,961
(5.90 %)
n/a 13,016
(1.82 %)
21,266
(2.02 %)
n/a 42.20
(99.55 %)
0
(0 %)
635
(0.45 %)
133
(100.00 %)
484,104
(5.60 %)
186,430
(0.85 %)
7,162,723
(18.83 %)
0
(0 %)
59,799
(0.59 %)
24,760
(2.03 %)
20,013
(0.97 %)
169 harbor porpoise (primary hap 2024)
GCA_963924675.1
n/a n/a 18,529
(1.58 %)
20,583
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
2
(0.00 %)
966
(0.01 %)
442
(100.00 %)
3,760,716
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,240
(39.04 %)
4
(0.00 %)
1,410,168
(3.71 %)
71,530
(2.69 %)
40,160
(1.06 %)
170 Harpy eagle (bHarHar1 2022)
GCF_026419915.1
51,641
(5.08 %)
n/a 13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
0
(0 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
1
(0.00 %)
480,025
(2.70 %)
60,606
(5.66 %)
30,636
(1.52 %)
171 Hawaiian crow (2021 refseq)
GCF_020740725.1
51,593
(6.18 %)
n/a 12,739
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
0
(0 %)
294
(0.16 %)
188
(100.00 %)
409,129
(0.00 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,375
(23.59 %)
3
(0.00 %)
336,844
(2.41 %)
46,118
(3.85 %)
24,228
(1.26 %)
172 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1
n/a n/a 18,620
(1.42 %)
22,403
(1.38 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
1
(0.00 %)
1,805
(0.01 %)
214
(100.00 %)
6,063,911
(41.66 %)
1,593,657
(4.46 %)
12,229,281
(43.98 %)
8
(0.00 %)
1,313,148
(3.16 %)
71,058
(1.88 %)
45,398
(0.93 %)
173 hippopotamus (mHipAmp2 2023)
GCF_030028045.1
64,153
(2.73 %)
n/a 20,331
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
0
(0 %)
226
(0.00 %)
357
(100.00 %)
3,783,440
(35.17 %)
567,797
(3.38 %)
13,462,531
(35.48 %)
2
(0.00 %)
396,368
(1.55 %)
48,365
(1.91 %)
44,048
(1.34 %)
174 hoatzin (hap1 2023)
GCA_030867145.1
n/a n/a 13,089
(1.50 %)
29,621
(2.22 %)
n/a 45.56
(100.00 %)
268
(0.00 %)
268
(0.00 %)
683
(100.00 %)
610,333
(22.07 %)
252,997
(12.56 %)
5,154,598
(31.67 %)
3
(0.00 %)
1,034,232
(5.77 %)
58,754
(5.54 %)
47,065
(2.35 %)
175 honeycomb rockfish
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
n/a 15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
63,546
(8.88 %)
40.77
(99.83 %)
0
(0 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
1
(0.00 %)
627,017
(5.28 %)
37,878
(1.84 %)
15,343
(0.71 %)
176 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1
n/a n/a 12,766
(0.30 %)
21,591
(0.87 %)
n/a 44.88
(99.43 %)
0
(0 %)
2,790
(0.57 %)
1,496
(100.00 %)
1,008,880
(5.19 %)
1,596,129
(22.32 %)
22,180,341
(62.98 %)
2
(0.00 %)
9,762,254
(11.27 %)
82,276
(1.85 %)
14,696
(0.13 %)
177 horse (mEquCab1 2024)
GCA_036426135.1
n/a n/a 19,073
(1.67 %)
20,636
(1.38 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
114
(0.00 %)
602
(100.00 %)
3,521,953
(35.39 %)
461,571
(5.26 %)
14,833,688
(32.77 %)
2
(0.00 %)
728,239
(2.01 %)
43,527
(2.54 %)
41,129
(2.38 %)
178 hourglass treefrog (paternal 2023)
GCA_027789765.1
n/a n/a 14,058
(0.89 %)
31,050
(2.69 %)
n/a 43.97
(99.70 %)
0
(0 %)
804
(0.30 %)
2,200
(100.00 %)
906,816
(2.43 %)
1,710,859
(17.48 %)
10,069,798
(51.41 %)
3
(0.00 %)
3,539,111
(9.05 %)
235,277
(5.56 %)
28,414
(0.63 %)
179 house finch (bHaeMex1 primary hap 2022)
GCA_027477595.1
n/a n/a 12,700
(1.83 %)
24,567
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
0
(0 %)
295
(0.98 %)
183
(100.00 %)
440,379
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,100
(23.47 %)
1
(0.00 %)
573,829
(3.39 %)
30,897
(2.53 %)
22,852
(1.24 %)
180 house sparrow (hap1 2024)
GCA_036417665.1
n/a n/a 12,831
(1.61 %)
26,124
(2.26 %)
n/a 43.99
(100.00 %)
0
(0 %)
202
(0.00 %)
334
(100.00 %)
647,396
(12.37 %)
646,615
(14.14 %)
5,906,524
(30.36 %)
2
(0.00 %)
873,292
(5.23 %)
36,193
(2.91 %)
24,212
(1.05 %)
181 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1
n/a n/a 22,351
(1.96 %)
19,629
(1.26 %)
n/a 41.38
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
179
(100.00 %)
4,774,018
(45.31 %)
1,620,102
(10.50 %)
13,181,250
(40.47 %)
0
(0 %)
1,650,132
(4.47 %)
23,955
(0.54 %)
16,164
(0.39 %)
182 house finch (bHaeMex1 primary hap 2022 refseq)
GCF_027477595.1
43,228
(5.71 %)
n/a 12,702
(1.83 %)
24,568
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
0
(0 %)
296
(0.98 %)
184
(100.00 %)
440,384
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,138
(23.47 %)
1
(0.00 %)
573,830
(3.39 %)
30,897
(2.53 %)
22,852
(1.24 %)
183 Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022)
GCA_027474245.1
n/a n/a 13,233
(1.67 %)
23,010
(1.93 %)
n/a 43.91
(99.92 %)
0
(0 %)
253
(0.08 %)
136
(100.00 %)
610,144
(11.51 %)
214,393
(5.75 %)
6,069,916
(25.74 %)
1
(0.00 %)
314,812
(2.19 %)
33,172
(3.38 %)
26,788
(1.37 %)
184 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1
63,234
(2.88 %)
n/a 19,601
(1.57 %)
21,699
(1.34 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
0
(0 %)
302
(0.06 %)
1,250
(100.00 %)
5,524,454
(47.57 %)
459,928
(1.40 %)
13,208,799
(41.21 %)
0
(0 %)
1,222,662
(3.37 %)
41,359
(1.10 %)
37,367
(0.98 %)
185 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022)
GCA_026652325.1
n/a 139,896
(0.54 %)
15,136
(0.10 %)
n/a n/a 45.95
(100.00 %)
29
(0.00 %)
922
(0.00 %)
296
(100.00 %)
4,478,794
(1.33 %)
6,452,537
(8.86 %)
1,189
(100.00 %)
26
(0.00 %)
n/a 1,581,360
(4.00 %)
144,588
(0.32 %)
186 Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024)
GCA_036172795.1
n/a n/a 14,141
(0.97 %)
22,232
(2.16 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
262
(0.00 %)
99
(100.00 %)
944,742
(4.86 %)
1,927,659
(22.26 %)
8,988,510
(49.29 %)
1
(0.00 %)
3,465,509
(10.62 %)
77,721
(1.73 %)
13,802
(0.30 %)
187 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2
n/a n/a 15,339
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
57,867
(10.10 %)
42.38
(98.08 %)
0
(0 %)
1,523
(1.92 %)
157
(100.00 %)
346,399
(3.02 %)
163,524
(3.00 %)
2,755,274
(25.07 %)
0
(0 %)
235,504
(4.25 %)
17,931
(1.47 %)
9,749
(0.74 %)
188 Indo-Pacific tarpon
GCF_013368585.1
41,583
(6.91 %)
n/a 18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
74,968
(7.01 %)
43.02
(99.97 %)
0
(0 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
0
(0 %)
319,481
(2.18 %)
78,561
(3.69 %)
58,460
(2.33 %)
189 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1
n/a n/a 19,064
(1.67 %)
20,800
(1.49 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
0
(0 %)
119
(0.00 %)
69
(100.00 %)
3,393,548
(30.92 %)
723,545
(6.58 %)
12,073,117
(35.40 %)
0
(0 %)
1,106,960
(3.54 %)
43,736
(1.20 %)
30,847
(0.87 %)
190 jewelled blenny
GCF_902148845.1
42,877
(8.61 %)
n/a 15,188
(2.40 %)
41,262
(7.86 %)
58,418
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
0
(0 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
667,122
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
0
(0 %)
422,332
(3.88 %)
121,464
(9.36 %)
77,061
(4.51 %)
191 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1
n/a n/a 14,906
(2.33 %)
72,029
(6.72 %)
n/a 43.92
(99.98 %)
0
(0 %)
887
(0.02 %)
191
(100.00 %)
1,609,654
(22.82 %)
897,264
(13.58 %)
4,548,467
(39.80 %)
11
(0.00 %)
875,374
(6.46 %)
129,147
(11.75 %)
77,287
(4.33 %)
192 kagu (bRhyJub1 primary hap 2023)
GCA_027574665.1
n/a n/a 13,042
(1.63 %)
24,142
(2.01 %)
n/a 45.07
(99.96 %)
0
(0 %)
300
(0.04 %)
148
(100.00 %)
563,851
(12.90 %)
270,861
(12.36 %)
6,191,106
(28.24 %)
2
(0.00 %)
905,468
(5.08 %)
54,426
(4.92 %)
40,156
(2.73 %)
193 kakapo (Jane v2 2020 refseq)
GCF_004027225.2
49,757
(5.76 %)
n/a 13,110
(1.92 %)
22,782
(2.26 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
0
(0 %)
373
(0.92 %)
89
(100.00 %)
507,148
(7.85 %)
208,178
(1.08 %)
6,258,087
(20.50 %)
0
(0 %)
165,530
(1.34 %)
22,278
(1.77 %)
19,230
(1.21 %)
194 killer whale (2022)
GCF_937001465.1
78,470
(3.76 %)
n/a 18,710
(1.51 %)
21,101
(1.30 %)
34,448
(1.49 %)
41.91
(100.00 %)
0
(0 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
3,955,401
(36.81 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,568
(41.63 %)
2
(0.00 %)
1,982,992
(5.71 %)
77,307
(3.08 %)
40,935
(1.02 %)
195 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2
n/a n/a 17,087
(0.81 %)
14,711
(0.86 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
0
(0 %)
669
(0.00 %)
1,246
(100.00 %)
6,280,029
(29.77 %)
1,123,294
(2.02 %)
21,796,316
(39.24 %)
2
(0.00 %)
412,593
(0.92 %)
15,957
(0.35 %)
13,996
(0.24 %)
196 Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3
33,236
(8.44 %)
n/a 14,601
(2.46 %)
44,145
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
701
(0.95 %)
122
(100.00 %)
1,755,227
(42.93 %)
551,482
(7.22 %)
4,887,087
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,179
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
22,350
(1.21 %)
197 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1
63,293
(2.96 %)
n/a 17,918
(1.89 %)
20,819
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
0
(0 %)
394
(0.69 %)
202
(100.00 %)
2,897,422
(23.58 %)
797,420
(2.76 %)
10,057,100
(34.56 %)
2
(0.00 %)
425,636
(1.52 %)
55,965
(2.99 %)
57,667
(2.01 %)
198 lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023)
GCA_028022735.1
n/a n/a 13,529
(1.69 %)
23,672
(1.98 %)
n/a 43.50
(99.85 %)
0
(0 %)
259
(0.15 %)
232
(100.00 %)
491,653
(3.53 %)
349,011
(9.83 %)
5,955,030
(26.51 %)
5
(0.00 %)
404,016
(2.60 %)
32,237
(2.61 %)
27,504
(1.23 %)
199 lance-tailed manakin
GCF_009829145.1
46,366
(5.56 %)
n/a 12,594
(1.91 %)
22,763
(2.31 %)
26,057
(3.91 %)
41.97
(99.70 %)
0
(0 %)
206
(0.30 %)
93
(100.00 %)
485,121
(7.13 %)
247,189
(1.64 %)
6,498,294
(20.04 %)
0
(0 %)
149,431
(1.05 %)
25,377
(1.97 %)
21,424
(1.14 %)
200 lancelets B.floridae x B.japonicum (bjbf 2020)
GCA_015852565.1
n/a n/a 5,384
(0.92 %)
47,467
(13.75 %)
n/a 41.37
(99.98 %)
0
(0 %)
168
(0.02 %)
341
(100.00 %)
146,622
(1.62 %)
202,162
(9.26 %)
2,291,900
(27.75 %)
0
(0 %)
366,245
(5.52 %)
44,443
(4.78 %)
27,446
(2.56 %)
201 lancelets B.floridae x B.belcheri (bbbf 2021)
GCA_019207075.1
n/a n/a 5,191
(1.10 %)
42,331
(14.51 %)
n/a 41.51
(99.88 %)
0
(0 %)
108
(0.12 %)
79
(100.00 %)
132,673
(2.15 %)
174,485
(7.81 %)
1,945,047
(28.91 %)
0
(0 %)
311,722
(5.56 %)
42,166
(6.02 %)
28,034
(3.24 %)
202 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023638135.1
48,561
(5.70 %)
n/a 12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
0
(0 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
2
(0.00 %)
479,269
(2.67 %)
32,398
(2.65 %)
19,870
(0.89 %)
203 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1
n/a n/a 17,851
(1.28 %)
83,249
(5.18 %)
n/a 42.69
(99.97 %)
36
(0.00 %)
2,397
(0.03 %)
709
(100.00 %)
7,797,173
(37.37 %)
1,593,818
(10.64 %)
7,610,300
(54.05 %)
15
(0.00 %)
1,726,634
(9.03 %)
127,942
(3.84 %)
34,520
(0.93 %)
204 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1
n/a n/a 21,678
(1.34 %)
22,317
(1.25 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
1,188
(0.00 %)
1,198
(100.00 %)
5,530,547
(22.20 %)
1,357,640
(10.13 %)
14,334,312
(46.09 %)
5
(0.00 %)
2,400,830
(5.08 %)
123,453
(2.17 %)
59,337
(1.38 %)
205 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1
n/a n/a 16,376
(2.19 %)
82,947
(7.99 %)
n/a 46.31
(99.94 %)
144
(0.00 %)
2,631
(0.06 %)
1,522
(100.00 %)
3,333,323
(43.58 %)
1,553,932
(25.91 %)
3,393,507
(46.78 %)
9
(0.00 %)
1,764,517
(12.32 %)
99,668
(6.39 %)
51,378
(2.60 %)
206 largescale foureyes (2020)
GCA_014839685.1
n/a n/a 14,774
(2.18 %)
42,858
(4.83 %)
58,247
(6.94 %)
38.54
(99.96 %)
0
(0 %)
107
(0.04 %)
33
(100.00 %)
506,950
(2.73 %)
305,170
(2.13 %)
6,194,879
(29.85 %)
0
(0 %)
131,664
(1.39 %)
17,881
(0.94 %)
14,233
(0.68 %)
207 Lataste's viper (rVipLat1 2022)
GCA_024294585.1
n/a n/a 13,350
(1.17 %)
18,904
(1.93 %)
n/a 40.96
(99.78 %)
0
(0 %)
769
(0.22 %)
56
(100.00 %)
1,209,793
(7.69 %)
762,735
(5.06 %)
7,424,674
(44.80 %)
4
(0.00 %)
794,949
(4.07 %)
110,631
(4.07 %)
23,739
(0.88 %)
208 leatherback sea turtle (v4 2021 refseq G10K)
GCF_009764565.3
73,318
(3.97 %)
n/a 14,610
(1.03 %)
16,358
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
0
(0 %)
668
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,694,449
(14.90 %)
304,773
(1.14 %)
11,121,962
(34.21 %)
3
(0.00 %)
670,729
(2.51 %)
35,485
(1.36 %)
19,615
(0.51 %)
209 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023)
GCA_027579695.1
n/a n/a 15,841
(0.90 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
5,905,868
(49.76 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
15,646
(0.27 %)
210 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028389875.1
39,024
(4.18 %)
n/a 13,360
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
0
(0 %)
128
(0.11 %)
180
(100.00 %)
674,149
(6.73 %)
329,124
(5.34 %)
6,820,245
(22.78 %)
1
(0.00 %)
266,226
(1.85 %)
45,073
(5.83 %)
38,575
(2.59 %)
211 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1
n/a n/a 13,908
(2.19 %)
50,634
(6.50 %)
n/a 41.22
(99.97 %)
84
(0.00 %)
1,017
(0.03 %)
701
(100.00 %)
2,698,640
(39.19 %)
577,328
(8.51 %)
3,615,231
(39.17 %)
5
(0.00 %)
691,324
(6.04 %)
33,251
(1.82 %)
14,917
(0.69 %)
212 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1
n/a n/a 15,269
(2.44 %)
52,449
(6.28 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
606
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,879,201
(31.40 %)
449,901
(9.89 %)
4,248,556
(33.21 %)
1
(0.00 %)
727,189
(5.72 %)
43,864
(3.01 %)
19,108
(1.01 %)
213 lesser black-backed gull (primary hap 2024)
GCA_963932225.1
n/a n/a 13,333
(1.68 %)
24,731
(2.05 %)
n/a 44.40
(99.99 %)
15
(0.00 %)
537
(0.01 %)
1,382
(100.00 %)
509,160
(5.11 %)
266,609
(9.64 %)
6,827,304
(27.15 %)
3
(0.00 %)
575,179
(3.19 %)
44,108
(6.34 %)
37,502
(1.70 %)
214 lesser kestrel (v2 2021)
GCF_017639655.2
47,420
(5.64 %)
n/a 13,098
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
0
(0 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,499
(5.58 %)
210,234
(1.26 %)
7,133,934
(19.19 %)
1
(0.00 %)
132,967
(0.79 %)
27,558
(2.21 %)
21,862
(1.03 %)
215 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1
51,730
(1.99 %)
n/a 20,129
(1.24 %)
22,089
(1.24 %)
40,414
(1.76 %)
42.00
(99.52 %)
0
(0 %)
561
(0.48 %)
160
(100.00 %)
7,346,291
(41.25 %)
1,187,587
(2.92 %)
14,222,177
(44.13 %)
1
(0.00 %)
1,219,048
(2.53 %)
34,688
(0.86 %)
25,175
(0.54 %)
216 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1
53,323
(3.35 %)
n/a 15,955
(0.92 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
6,041,262
(71.88 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
16,535
(0.37 %)
217 light-bulb sea squirt (2022)
GCA_947623445.1
n/a n/a 3,318
(1.37 %)
10,846
(10.58 %)
n/a 35.93
(99.99 %)
2
(0.00 %)
58
(0.01 %)
105
(100.00 %)
34,121
(1.61 %)
31,117
(17.32 %)
1,008,995
(33.48 %)
0
(0 %)
167,504
(8.33 %)
4,203
(2.12 %)
2,308
(0.42 %)
218 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1
n/a n/a 15,060
(2.89 %)
50,064
(7.31 %)
n/a 41.88
(99.98 %)
0
(0 %)
589
(0.02 %)
534
(100.00 %)
1,116,427
(28.18 %)
315,489
(13.14 %)
2,598,812
(33.21 %)
2
(0.00 %)
680,706
(7.88 %)
50,192
(3.82 %)
27,472
(1.61 %)
219 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2
n/a n/a 14,975
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
n/a 41.43
(99.89 %)
0
(0 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
772,309
(14.49 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,473
(21.79 %)
0
(0 %)
109,664
(1.83 %)
16,807
(1.33 %)
12,095
(0.89 %)
220 long-finned pilot whale (primary hap 2023)
GCF_963455315.1
61,797
(2.84 %)
n/a 18,712
(1.51 %)
20,920
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
0
(0 %)
1,084
(0.01 %)
993
(100.00 %)
4,125,420
(35.62 %)
1,577,899
(12.03 %)
12,347,226
(42.01 %)
10
(0.00 %)
1,284,155
(3.89 %)
71,821
(5.51 %)
41,663
(1.04 %)
221 long-tailed hermit (PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1
n/a n/a 12,328
(2.02 %)
20,312
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
141
(0.37 %)
141
(0.37 %)
211
(99.63 %)
497,506
(5.06 %)
265,815
(1.51 %)
6,045,702
(20.10 %)
0
(0 %)
100,035
(0.84 %)
15,922
(1.43 %)
13,768
(0.94 %)
222 longspined bullhead (2021)
GCA_910589615.1
n/a n/a 15,027
(3.10 %)
51,137
(7.71 %)
n/a 42.22
(99.99 %)
0
(0 %)
242
(0.01 %)
27
(100.00 %)
452,844
(4.81 %)
417,308
(9.63 %)
3,262,282
(28.51 %)
2
(0.00 %)
530,802
(5.05 %)
55,527
(4.38 %)
34,004
(2.27 %)
223 lumpfish (refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
n/a 14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
0
(0 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
1
(0.00 %)
655,785
(6.31 %)
53,321
(5.09 %)
32,722
(2.40 %)
224 Macqueen's bustard (bChlMac1 2024)
GCA_036417535.1
n/a n/a 13,082
(1.73 %)
27,150
(2.44 %)
n/a 43.25
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
329
(100.00 %)
669,243
(14.71 %)
211,387
(6.69 %)
6,514,716
(27.07 %)
0
(0 %)
589,996
(3.41 %)
47,331
(8.09 %)
32,791
(2.71 %)
225 maguari stork (2021)
GCA_017639555.1
n/a n/a 12,905
(1.81 %)
22,204
(2.01 %)
n/a 42.12
(98.21 %)
0
(0 %)
232
(1.79 %)
153
(100.00 %)
485,318
(6.35 %)
184,992
(0.78 %)
7,064,965
(19.56 %)
0
(0 %)
58,168
(0.52 %)
31,653
(3.02 %)
31,174
(1.88 %)
226 mallard (Pekin duck Z2 2020 Zhejiang U)
GCF_015476345.1
59,854
(7.33 %)
n/a 12,988
(1.87 %)
23,709
(2.20 %)
86,787
(8.80 %)
42.27
(99.64 %)
0
(0 %)
905
(0.36 %)
756
(100.00 %)
803,558
(8.04 %)
417,575
(5.02 %)
6,627,843
(24.59 %)
5
(0.00 %)
487,092
(3.05 %)
35,030
(3.06 %)
27,683
(1.41 %)
227 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1
n/a n/a 15,070
(1.79 %)
71,367
(6.50 %)
n/a 41.46
(99.92 %)
0
(0 %)
4,157
(0.08 %)
943
(100.00 %)
1,717,591
(42.63 %)
474,348
(12.30 %)
4,011,319
(44.93 %)
3
(0.00 %)
n/a 59,531
(2.83 %)
15,998
(0.74 %)
228 Mauritius kestrel (primary hap 2023)
GCA_963210335.1
n/a n/a 13,064
(1.72 %)
22,269
(1.98 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
0
(0 %)
407
(0.01 %)
316
(100.00 %)
459,578
(3.87 %)
315,686
(6.19 %)
6,650,507
(22.84 %)
0
(0 %)
244,086
(1.64 %)
36,076
(2.82 %)
21,430
(0.96 %)
229 Mauritius parakeet (primary hap 2023)
GCA_963264785.1
n/a n/a 13,133
(1.81 %)
23,396
(2.19 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
358
(0.01 %)
172
(100.00 %)
511,156
(7.05 %)
238,915
(5.05 %)
5,764,523
(25.19 %)
2
(0.00 %)
442,454
(2.96 %)
24,675
(1.70 %)
20,376
(1.26 %)
230 meadow viper (2022)
GCA_947247035.1
n/a n/a 13,282
(1.16 %)
18,653
(1.90 %)
n/a 40.93
(99.98 %)
0
(0 %)
1,819
(0.02 %)
384
(100.00 %)
1,187,501
(7.72 %)
762,639
(6.28 %)
7,428,147
(45.35 %)
13
(0.00 %)
770,603
(3.87 %)
101,007
(3.95 %)
24,179
(0.84 %)
231 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1
62,007
(3.15 %)
n/a 14,883
(0.96 %)
18,524
(1.48 %)
n/a 44.69
(96.36 %)
0
(0 %)
1,866
(3.64 %)
621
(100.00 %)
1,372,189
(11.32 %)
472,501
(3.42 %)
11,362,604
(34.69 %)
1
(0.00 %)
910,675
(2.73 %)
73,700
(2.04 %)
22,443
(0.52 %)
232 milkfish
GCF_902362185.1
30,812
(7.61 %)
n/a 16,869
(3.41 %)
21,377
(6.58 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
0
(0 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
958,774
(8.18 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
2
(0.01 %)
611,774
(5.32 %)
22,089
(1.27 %)
14,000
(0.76 %)
233 mimic poison frog (primary hap 2023)
GCA_032444005.1
n/a n/a 14,957
(0.34 %)
n/a n/a 44.95
(100.00 %)
13
(0.00 %)
765
(0.00 %)
1,686
(100.00 %)
1,716,760
(1.89 %)
4,088,695
(23.45 %)
2,437
(100.00 %)
14
(0.00 %)
10,590,500
(14.66 %)
n/a n/a
234 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1
n/a n/a 17,701
(1.62 %)
73,433
(5.69 %)
n/a 42.20
(99.98 %)
14
(0.00 %)
1,398
(0.02 %)
388
(100.00 %)
6,438,444
(40.32 %)
1,202,669
(11.51 %)
7,055,665
(47.04 %)
6
(0.00 %)
1,343,489
(8.04 %)
74,954
(3.44 %)
26,325
(0.98 %)
235 minke whale (primary hap 2023)
GCF_949987535.1
61,711
(2.51 %)
n/a 19,550
(1.49 %)
21,499
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
0
(0 %)
1,177
(0.01 %)
1,374
(100.00 %)
4,006,927
(35.92 %)
1,058,105
(12.08 %)
12,708,103
(42.66 %)
4
(0.00 %)
1,500,515
(4.32 %)
72,756
(1.59 %)
44,094
(1.06 %)
236 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021)
GCF_019393635.1
47,034
(2.02 %)
n/a 18,399
(0.80 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
0
(0 %)
260
(0.09 %)
17
(100.00 %)
9,107,968
(41.08 %)
1,249,635
(2.12 %)
21,135,324
(42.80 %)
0
(0 %)
1,546,314
(2.55 %)
16,598
(0.36 %)
13,911
(0.23 %)
237 mute swan (v2 2021)
GCF_009769625.2
59,524
(6.76 %)
n/a 12,983
(1.98 %)
22,400
(2.22 %)
33,839
(5.17 %)
41.92
(99.13 %)
0
(0 %)
451
(0.87 %)
171
(100.00 %)
700,051
(7.55 %)
301,579
(1.34 %)
6,791,838
(21.30 %)
1
(0.00 %)
78,712
(0.74 %)
31,278
(3.07 %)
30,009
(2.01 %)
238 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579445.1
31,033
(4.42 %)
n/a 12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
0
(0 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
5
(0.00 %)
478,923
(3.35 %)
31,693
(3.88 %)
22,817
(1.16 %)
239 New Caledonian crow
GCF_009650955.1
50,821
(6.95 %)
n/a 12,747
(1.94 %)
23,372
(2.37 %)
30,299
(3.60 %)
42.57
(97.41 %)
0
(0 %)
289
(2.59 %)
105
(100.00 %)
452,690
(6.21 %)
231,546
(1.70 %)
6,265,995
(19.54 %)
0
(0 %)
191,789
(1.34 %)
31,909
(2.48 %)
24,362
(1.33 %)
240 New Zealand spotty (refseq)
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
n/a 14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,987
(4.42 %)
18,299
(0.85 %)
7,999
(0.35 %)
241 Nicobar pigeon (hap1 2024)
GCA_036013445.1
n/a n/a 13,359
(1.72 %)
24,921
(2.13 %)
n/a 44.64
(100.00 %)
0
(0 %)
117
(0.00 %)
807
(100.00 %)
705,078
(18.28 %)
342,299
(9.55 %)
6,410,095
(28.06 %)
0
(0 %)
778,929
(4.34 %)
38,589
(9.40 %)
31,814
(1.47 %)
242 nine-banded armadillo (mDasNov1 2023)
GCF_030445035.1
69,043
(2.70 %)
n/a 20,516
(1.05 %)
n/a n/a 41.00
(99.68 %)
0
(0 %)
771
(0.32 %)
539
(100.00 %)
4,656,325
(32.86 %)
726,574
(1.99 %)
19,585,522
(43.65 %)
4
(0.00 %)
720,053
(1.59 %)
140,990
(2.86 %)
76,550
(1.81 %)
243 ninespine stickleback (primary hap 2023)
GCA_949316345.1
n/a n/a 14,600
(3.83 %)
49,927
(9.98 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
175
(100.00 %)
599,088
(14.68 %)
186,747
(10.27 %)
2,273,942
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
244 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1
n/a n/a 19,700
(1.54 %)
22,354
(1.46 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
244
(0.00 %)
244
(0.00 %)
2,082
(100.00 %)
6,089,884
(47.99 %)
1,358,786
(9.39 %)
13,799,349
(39.08 %)
3
(0.00 %)
1,511,691
(3.84 %)
24,733
(0.70 %)
22,588
(0.58 %)
245 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1
n/a n/a 18,102
(1.58 %)
20,073
(1.40 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
0
(0 %)
277
(0.00 %)
116
(100.00 %)
4,958,089
(41.64 %)
719,163
(1.59 %)
13,867,662
(33.89 %)
7
(0.00 %)
506,727
(1.48 %)
51,299
(1.36 %)
33,440
(0.96 %)
246 North Island brown kiwi (hap1 2024)
GCA_036417845.1
n/a n/a 13,670
(1.52 %)
33,383
(2.64 %)
n/a 44.01
(100.00 %)
0
(0 %)
170
(0.00 %)
409
(100.00 %)
713,271
(8.42 %)
603,937
(6.25 %)
5,379,113
(27.65 %)
1
(0.00 %)
501,455
(3.32 %)
50,913
(9.74 %)
40,971
(3.07 %)
247 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1
49,646
(1.86 %)
n/a 19,562
(1.46 %)
21,631
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
367
(0.17 %)
789
(100.00 %)
1,368,536
(2.24 %)
841,303
(13.08 %)
12,527,582
(43.92 %)
11
(0.00 %)
1,404,448
(3.90 %)
94,259
(1.92 %)
41,005
(0.96 %)
248 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1
n/a n/a 18,924
(1.53 %)
22,934
(1.58 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
199
(0.00 %)
146
(100.00 %)
3,850,624
(31.21 %)
648,359
(3.76 %)
11,788,702
(39.25 %)
2
(0.00 %)
811,589
(2.31 %)
85,908
(2.60 %)
73,781
(1.91 %)
249 northern gannet (hap2 2023)
GCA_031468815.1
n/a n/a 13,477
(1.77 %)
23,613
(2.08 %)
n/a 42.44
(100.00 %)
6
(0.00 %)
248
(0.00 %)
427
(100.00 %)
474,930
(4.45 %)
237,604
(2.75 %)
5,847,260
(21.07 %)
30
(0.00 %)
226,420
(1.83 %)
30,873
(3.03 %)
26,071
(1.23 %)
250 northern goshawk (bAccGen1 v2 2022 genbank)
GCA_929443795.2
n/a n/a 13,527
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
183
(0.00 %)
455
(100.00 %)
511,000
(3.76 %)
325,992
(9.82 %)
5,542,342
(27.30 %)
4
(0.00 %)
458,026
(3.08 %)
43,070
(4.44 %)
32,753
(1.47 %)
251 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1
n/a n/a 19,073
(1.44 %)
20,821
(1.21 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,098
(0.01 %)
757
(100.00 %)
3,997,911
(34.76 %)
769,275
(14.94 %)
12,133,820
(44.83 %)
6
(0.00 %)
3,171,972
(7.30 %)
67,258
(2.00 %)
38,513
(0.89 %)
252 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1
n/a n/a 18,636
(1.75 %)
21,446
(1.68 %)
n/a 43.32
(99.99 %)
0
(0 %)
1,423
(0.01 %)
207
(100.00 %)
1,259,729
(2.95 %)
905,676
(6.25 %)
10,554,535
(38.21 %)
3
(0.00 %)
780,081
(2.54 %)
77,656
(3.27 %)
60,964
(2.14 %)
253 northern pintail (primary hap 2024)
GCA_963932015.1
n/a n/a 13,218
(1.88 %)
23,888
(2.27 %)
n/a 42.56
(99.99 %)
0
(0 %)
631
(0.01 %)
395
(100.00 %)
734,763
(5.74 %)
422,947
(7.08 %)
6,491,165
(25.88 %)
10
(0.00 %)
474,751
(3.08 %)
34,601
(2.98 %)
28,080
(1.42 %)
254 northern pike
GCF_011004845.1
63,733
(9.28 %)
n/a 16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,941
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
0
(0 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
1
(0.00 %)
602,569
(4.43 %)
42,910
(2.52 %)
22,099
(1.02 %)
255 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v1 2022 refseq)
GCF_929443795.1
50,663
(4.74 %)
n/a 13,528
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
183
(0.00 %)
454
(100.00 %)
521,768
(3.86 %)
325,987
(9.82 %)
5,542,269
(27.30 %)
4
(0.00 %)
458,030
(3.08 %)
43,070
(4.44 %)
32,753
(1.47 %)
256 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
99,139
(4.10 %)
n/a 21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
4
(0.00 %)
1,172,090
(3.51 %)
19,244
(0.46 %)
16,098
(0.39 %)
257 Obi paradise-crow (lycPyr6 2020)
GCA_014706295.1
n/a n/a 12,592
(1.89 %)
24,002
(2.35 %)
n/a 42.94
(99.48 %)
0
(0 %)
1,602
(0.52 %)
1,695
(100.00 %)
466,546
(6.40 %)
235,283
(1.98 %)
6,371,421
(20.17 %)
15
(0.01 %)
202,970
(1.78 %)
34,247
(3.02 %)
26,600
(1.39 %)
258 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1
n/a n/a 13,448
(1.31 %)
17,745
(2.07 %)
n/a 40.20
(99.98 %)
73
(0.02 %)
73
(0.02 %)
116
(99.98 %)
741,052
(2.98 %)
411,477
(3.31 %)
7,668,994
(30.14 %)
0
(0 %)
318,343
(2.06 %)
34,560
(2.18 %)
21,974
(1.10 %)
259 one-colored caecilian (2021)
GCA_901765095.2
n/a n/a 14,569
(0.43 %)
30,498
(1.16 %)
n/a 44.01
(98.99 %)
0
(0 %)
2,452
(1.01 %)
1,081
(100.00 %)
1,894,383
(1.68 %)
1,670,443
(3.30 %)
22,207,143
(52.43 %)
5
(0.00 %)
1,718,803
(3.44 %)
414,828
(3.91 %)
47,796
(0.38 %)
260 orange-tipped seq squirt (primary hap 2023)
GCA_963082875.1
n/a n/a 3,120
(1.99 %)
3,357
(8.53 %)
n/a 31.55
(99.96 %)
1
(0.00 %)
244
(0.04 %)
106
(100.00 %)
56,509
(6.44 %)
43,313
(12.97 %)
962,614
(51.07 %)
8
(0.01 %)
176,523
(12.45 %)
1,079
(6.77 %)
694
(0.37 %)
261 orbiculate cardinalfish
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
n/a 15,761
(1.50 %)
31,563
(4.00 %)
59,905
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
0
(0 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,257,250
(5.57 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
0
(0 %)
1,304,958
(6.34 %)
29,320
(0.87 %)
15,066
(0.43 %)
262 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1
n/a n/a 14,522
(0.54 %)
21,861
(1.14 %)
n/a 39.52
(98.39 %)
0
(0 %)
3,681
(1.61 %)
1,318
(100.00 %)
1,928,844
(4.34 %)
3,684,477
(13.44 %)
19,091,818
(55.21 %)
1
(0.00 %)
4,715,600
(8.73 %)
127,760
(1.34 %)
9,458
(0.10 %)
263 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2
54,932
(3.31 %)
n/a 18,171
(1.69 %)
20,025
(1.62 %)
42,786
(3.39 %)
42.38
(99.28 %)
0
(0 %)
884
(0.72 %)
77
(100.00 %)
3,069,141
(30.00 %)
385,664
(0.81 %)
12,050,232
(30.57 %)
1
(0.00 %)
174,292
(0.75 %)
63,905
(3.75 %)
66,744
(3.26 %)
264 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
n/a 18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
0
(0 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
1
(0.00 %)
714,726
(2.00 %)
79,984
(2.45 %)
71,436
(1.91 %)
265 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1
n/a n/a 19,688
(1.69 %)
21,998
(1.64 %)
n/a 43.04
(99.72 %)
19
(0.01 %)
234
(0.28 %)
112
(99.99 %)
2,794,986
(22.60 %)
938,016
(3.72 %)
11,241,518
(39.41 %)
0
(0 %)
704,408
(2.03 %)
70,272
(2.89 %)
61,250
(1.98 %)
266 Papuan ground boa (hap2 2024)
GCA_035149785.1
n/a n/a 13,390
(1.26 %)
17,496
(1.99 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
150
(100.00 %)
728,574
(2.82 %)
348,605
(2.13 %)
7,199,124
(33.55 %)
1
(0.00 %)
318,788
(2.43 %)
51,807
(2.69 %)
19,758
(0.92 %)
267 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1
n/a n/a 17,913
(1.72 %)
20,720
(1.72 %)
n/a 43.54
(99.99 %)
7
(0.00 %)
980
(0.01 %)
185
(100.00 %)
2,932,869
(21.94 %)
874,665
(4.83 %)
10,263,103
(37.46 %)
2
(0.00 %)
742,499
(2.50 %)
77,397
(4.55 %)
76,849
(2.51 %)
268 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1
n/a n/a 15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
0
(0 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
975,354
(15.76 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,904
(35.09 %)
1
(0.00 %)
865,727
(6.60 %)
49,121
(3.07 %)
20,467
(0.93 %)
269 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1
n/a n/a 15,317
(2.02 %)
61,647
(6.35 %)
n/a 41.37
(99.99 %)
135
(0.01 %)
135
(0.01 %)
469
(99.99 %)
981,519
(15.40 %)
319,637
(12.45 %)
3,706,473
(36.77 %)
0
(0 %)
952,761
(6.98 %)
50,353
(2.98 %)
20,537
(0.91 %)
270 peladilla (galaxoid fish 2021)
GCA_017639675.1
n/a n/a 13,829
(3.83 %)
41,932
(8.64 %)
n/a 45.01
(98.24 %)
0
(0 %)
1,158
(1.77 %)
41
(100.00 %)
930,246
(18.49 %)
660,569
(13.71 %)
2,316,198
(27.66 %)
6
(0.00 %)
537,418
(6.48 %)
41,023
(4.40 %)
27,287
(2.49 %)
271 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634155.1
49,100
(5.64 %)
n/a 13,021
(1.66 %)
21,794
(1.95 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
0
(0 %)
241
(0.31 %)
125
(100.00 %)
586,320
(11.83 %)
335,218
(8.05 %)
7,038,851
(24.65 %)
0
(0 %)
405,474
(2.46 %)
26,085
(2.25 %)
20,023
(0.87 %)
272 Philippine flying lemur (mCynVol1 primary hap 2022)
GCA_027409185.1
n/a n/a 20,384
(1.64 %)
22,124
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
116
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,492,423
(39.31 %)
627,842
(4.79 %)
15,561,515
(36.57 %)
2
(0.00 %)
n/a 45,336
(1.27 %)
44,264
(1.15 %)
273 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1
n/a n/a 18,472
(1.44 %)
19,911
(1.28 %)
n/a 42.63
(99.98 %)
0
(0 %)
878
(0.02 %)
379
(100.00 %)
3,996,827
(27.97 %)
2,094,728
(7.23 %)
12,677,118
(40.57 %)
4
(0.00 %)
1,289,995
(3.44 %)
81,791
(2.82 %)
46,045
(1.12 %)
274 pinecone soldierfish
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
n/a 15,738
(2.42 %)
26,691
(5.69 %)
57,069
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
0
(0 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,063,888
(5.90 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
0
(0 %)
374,590
(3.12 %)
41,636
(2.04 %)
21,488
(0.92 %)
275 pink sea squirt (2022)
GCA_947561715.1
n/a n/a 3,449
(1.48 %)
14,588
(13.45 %)
n/a 39.19
(100.00 %)
0
(0 %)
32
(0.00 %)
96
(100.00 %)
18,369
(1.83 %)
33,783
(9.73 %)
1,032,597
(26.20 %)
4
(0.00 %)
242,360
(12.34 %)
7,713
(4.85 %)
6,762
(1.51 %)
276 pink pigeon (primary hap 2023)
GCA_963082525.1
n/a n/a 13,140
(1.85 %)
25,111
(2.31 %)
n/a 42.27
(99.99 %)
0
(0 %)
509
(0.01 %)
143
(100.00 %)
488,313
(5.48 %)
331,962
(3.50 %)
6,243,204
(22.87 %)
0
(0 %)
441,492
(2.54 %)
36,343
(3.63 %)
31,102
(1.89 %)
277 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023)
GCA_033958435.1
n/a n/a 14,675
(1.05 %)
16,697
(1.47 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
134
(100.00 %)
3,772,260
(47.94 %)
322,081
(1.52 %)
11,123,166
(34.14 %)
0
(0 %)
448,027
(1.56 %)
129,645
(3.29 %)
28,529
(1.18 %)
278 plains spadefoot toad (aSpeBom1 primary hap 2022)
GCF_027358695.1
41,009
(4.67 %)
n/a 13,912
(2.00 %)
25,745
(4.50 %)
n/a 40.45
(99.61 %)
0
(0 %)
102
(0.39 %)
17
(100.00 %)
497,976
(3.84 %)
645,915
(10.08 %)
5,232,342
(36.26 %)
1
(0.00 %)
748,493
(5.83 %)
72,598
(4.35 %)
32,385
(1.89 %)
279 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2
51,392
(3.07 %)
n/a 14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
0
(0 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
0
(0 %)
1,130,252
(3.59 %)
87,796
(6.47 %)
74,209
(2.87 %)
280 plumbeous ibis (2021)
GCA_020745775.1
n/a n/a 13,028
(1.84 %)
22,722
(2.10 %)
n/a 42.37
(99.81 %)
0
(0 %)
104
(0.19 %)
88
(100.00 %)
488,030
(6.66 %)
188,606
(1.01 %)
6,982,793
(20.08 %)
0
(0 %)
89,388
(0.77 %)
32,920
(3.37 %)
32,773
(1.95 %)
281 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1
n/a n/a 14,126
(2.81 %)
61,907
(8.75 %)
n/a 45.67
(99.94 %)
0
(0 %)
1,810
(0.06 %)
616
(100.00 %)
753,034
(10.17 %)
850,189
(15.72 %)
2,888,555
(33.70 %)
7
(0.00 %)
642,528
(6.84 %)
80,883
(8.43 %)
46,894
(3.34 %)
282 prehistoric monster fish
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
n/a 14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
0
(0 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
3
(0.00 %)
1,746,915
(7.91 %)
172,199
(5.45 %)
18,080
(0.31 %)
283 Puerto Rican coqui (hap1 2024)
GCA_035609145.1
n/a n/a 13,881
(0.57 %)
32,313
(1.67 %)
n/a 44.91
(100.00 %)
6
(0.00 %)
659
(0.00 %)
963
(100.00 %)
1,044,181
(1.98 %)
1,442,189
(16.51 %)
14,710,175
(54.00 %)
6
(0.00 %)
4,070,195
(8.73 %)
501,931
(8.81 %)
49,483
(0.82 %)
284 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 refseq)
GCF_026419965.1
56,261
(2.22 %)
n/a 18,496
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
0
(0 %)
143
(0.19 %)
581
(100.00 %)
3,817,659
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,998
(39.96 %)
0
(0 %)
1,197,809
(3.53 %)
101,353
(2.90 %)
50,216
(1.47 %)
285 pygmy chimpanzee (NHGRI 2023)
GCF_029289425.1
84,858
(3.73 %)
n/a 20,765
(1.73 %)
22,666
(1.18 %)
n/a 40.49
(99.96 %)
0
(0 %)
8
(0.04 %)
443
(100.00 %)
5,487,575
(50.65 %)
1,054,555
(12.79 %)
15,952,698
(43.80 %)
0
(0 %)
3,830,835
(6.42 %)
53,329
(1.37 %)
27,996
(0.60 %)
286 razorbill
GCA_008658365.1
n/a n/a 12,787
(1.83 %)
22,839
(2.13 %)
n/a 42.67
(99.70 %)
0
(0 %)
227
(0.30 %)
95
(100.00 %)
543,517
(7.16 %)
212,546
(1.12 %)
6,930,708
(20.10 %)
0
(0 %)
103,901
(0.79 %)
38,960
(3.02 %)
35,213
(1.80 %)
287 red deer (2021)
GCF_910594005.1
68,992
(2.68 %)
n/a 20,470
(1.48 %)
22,563
(1.32 %)
n/a 42.98
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
144
(100.00 %)
5,501,063
(44.60 %)
503,301
(12.23 %)
13,102,622
(44.55 %)
1
(0.00 %)
2,197,198
(5.57 %)
88,756
(1.66 %)
46,960
(1.12 %)
288 red-bellied piranha
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
n/a 16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
76,011
(5.65 %)
40.58
(99.17 %)
0
(0 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
2
(0.00 %)
1,005,141
(5.14 %)
33,087
(1.38 %)
20,822
(0.79 %)
289 red-crested turaco
GCA_009769465.1
n/a n/a 12,744
(1.75 %)
25,706
(2.29 %)
n/a 42.60
(97.89 %)
0
(0 %)
344
(2.11 %)
140
(100.00 %)
551,885
(8.95 %)
176,530
(0.80 %)
6,805,042
(22.19 %)
0
(0 %)
138,426
(1.12 %)
43,051
(3.40 %)
34,997
(2.03 %)
290 red-fronted tinkerbird
GCA_015220805.1
n/a n/a 12,345
(1.60 %)
23,206
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
0
(0 %)
307
(0.47 %)
253
(100.00 %)
1,082,064
(22.90 %)
378,866
(4.28 %)
6,003,548
(35.88 %)
0
(0 %)
1,148,448
(6.01 %)
26,519
(1.76 %)
21,399
(1.21 %)
291 red-legged seriema
GCA_009819825.1
n/a n/a 13,229
(1.84 %)
25,580
(2.35 %)
n/a 42.20
(99.59 %)
0
(0 %)
194
(0.41 %)
110
(100.00 %)
483,784
(6.50 %)
160,481
(0.73 %)
6,960,060
(19.71 %)
0
(0 %)
64,843
(0.56 %)
32,899
(2.77 %)
30,208
(1.91 %)
292 red-throated loon (hap2 2023 refseq)
GCF_030936135.1
25,173
(3.02 %)
n/a 13,216
(1.71 %)
24,050
(2.10 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
1,185
(100.00 %)
544,422
(8.81 %)
223,672
(5.77 %)
6,669,433
(23.63 %)
3
(0.00 %)
398,584
(2.64 %)
38,305
(3.37 %)
35,068
(1.78 %)
293 reedfish (2021)
GCF_900747795.2
44,479
(2.01 %)
n/a 13,108
(0.46 %)
23,157
(1.29 %)
n/a 39.37
(99.18 %)
0
(0 %)
1,431
(0.82 %)
169
(100.00 %)
8,636,520
(39.34 %)
1,069,643
(2.91 %)
19,980,572
(47.52 %)
17
(0.00 %)
1,256,071
(2.69 %)
89,023
(1.13 %)
22,697
(0.30 %)
294 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1
n/a n/a 18,947
(1.29 %)
24,114
(1.28 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,892
(100.00 %)
3,375,476
(23.21 %)
654,539
(6.64 %)
11,132,469
(48.29 %)
0
(0 %)
3,008,562
(7.07 %)
79,357
(2.66 %)
41,548
(0.93 %)
295 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1
59,888
(2.34 %)
n/a 19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
0
(0 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
4
(0.00 %)
1,071,329
(3.37 %)
73,126
(1.69 %)
43,865
(1.11 %)
296 rifleman (2021)
GCA_016904835.1
n/a n/a 12,620
(1.92 %)
24,568
(2.61 %)
n/a 42.41
(99.61 %)
0
(0 %)
195
(0.39 %)
206
(100.00 %)
495,673
(9.14 %)
253,008
(2.04 %)
5,936,177
(19.93 %)
0
(0 %)
269,642
(1.76 %)
20,145
(1.83 %)
15,953
(0.89 %)
297 ring-tailed lemur (2021)
GCF_020740605.2
55,883
(2.78 %)
n/a 18,659
(1.98 %)
20,542
(1.50 %)
n/a 41.36
(99.84 %)
0
(0 %)
210
(0.16 %)
185
(100.00 %)
3,432,734
(37.67 %)
518,071
(6.84 %)
12,916,577
(32.91 %)
0
(0 %)
864,748
(2.57 %)
50,626
(1.88 %)
48,082
(1.65 %)
298 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2
n/a n/a 27,928
(1.66 %)
110,791
(4.44 %)
n/a 43.36
(96.90 %)
0
(0 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
4,690,842
(57.30 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,763
(52.37 %)
2
(0.00 %)
3,475,805
(8.76 %)
70,821
(1.77 %)
19,956
(0.39 %)
299 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1
n/a n/a 18,132
(2.65 %)
63,523
(6.01 %)
n/a 38.80
(99.99 %)
1
(0.00 %)
471
(0.01 %)
86
(100.00 %)
2,613,900
(48.90 %)
625,102
(8.21 %)
5,738,444
(41.24 %)
1
(0.00 %)
1,070,552
(7.36 %)
65,328
(3.68 %)
20,458
(0.81 %)
300 rock pigeon (racing homer 2024)
GCA_036013475.1
n/a n/a 13,145
(1.66 %)
28,883
(2.53 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
248
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,923
(11.76 %)
412,678
(12.92 %)
6,047,578
(29.90 %)
0
(0 %)
1,266,126
(5.89 %)
36,847
(3.12 %)
31,114
(1.65 %)
301 rock gunnel (2021)
GCA_910591455.2
n/a n/a 15,181
(3.34 %)
44,153
(7.53 %)
51,135
(7.40 %)
42.31
(99.98 %)
0
(0 %)
418
(0.02 %)
101
(100.00 %)
1,121,704
(25.48 %)
269,467
(4.88 %)
3,358,709
(24.69 %)
5
(0.00 %)
255,676
(3.48 %)
36,987
(3.02 %)
28,368
(1.91 %)
302 rock ptarmigan (2022)
GCF_023343835.1
51,619
(7.29 %)
n/a 12,832
(2.31 %)
23,047
(2.56 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
0
(0 %)
210
(0.01 %)
165
(100.00 %)
526,839
(5.87 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,345
(21.73 %)
0
(0 %)
216,565
(1.89 %)
21,346
(2.37 %)
19,067
(1.48 %)
303 Rosablanca catfish (hap1 2023)
GCA_030014385.1
n/a n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,920
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
304 royal ground snake (hap1 2023)
GCA_031021105.1
n/a n/a 13,327
(0.96 %)
20,347
(1.68 %)
n/a 41.25
(99.99 %)
0
(0 %)
1,391
(0.01 %)
400
(100.00 %)
1,983,903
(10.40 %)
1,698,731
(7.29 %)
9,084,707
(53.44 %)
11
(0.00 %)
1,523,664
(5.77 %)
130,852
(4.47 %)
27,815
(0.70 %)
305 rufous frog (hap2 2023)
GCA_031893055.1
n/a n/a 13,538
(0.88 %)
24,311
(2.15 %)
n/a 42.96
(99.07 %)
0
(0 %)
976
(0.93 %)
1,266
(100.00 %)
711,895
(2.18 %)
1,219,160
(21.56 %)
7,988,458
(54.14 %)
3
(0.00 %)
3,097,457
(9.48 %)
170,920
(3.48 %)
17,791
(0.40 %)
306 saddleback dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1
n/a n/a 18,625
(1.49 %)
20,451
(1.28 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
0
(0 %)
968
(0.01 %)
631
(100.00 %)
4,020,682
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,818
(42.64 %)
0
(0 %)
1,785,427
(5.07 %)
66,179
(3.91 %)
41,466
(1.03 %)
307 saddleback dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1
46,746
(2.39 %)
n/a 18,624
(1.49 %)
20,662
(1.31 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
0
(0 %)
968
(0.01 %)
630
(100.00 %)
4,020,676
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,748
(42.64 %)
0
(0 %)
1,785,427
(5.07 %)
66,179
(3.91 %)
41,466
(1.03 %)
308 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634085.1
50,290
(5.75 %)
n/a 12,973
(1.67 %)
21,670
(1.90 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
0
(0 %)
258
(0.30 %)
283
(100.00 %)
548,090
(7.21 %)
201,488
(8.55 %)
7,030,877
(24.94 %)
0
(0 %)
469,777
(2.60 %)
31,791
(2.57 %)
20,215
(0.89 %)
309 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887145.1
27,528
(4.03 %)
n/a 12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
0
(0 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
1
(0.00 %)
651,029
(4.07 %)
35,549
(5.05 %)
23,802
(1.15 %)
310 San Diego alligator lizard (HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1
n/a n/a 14,075
(1.15 %)
19,587
(1.99 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
0
(0 %)
23
(0.00 %)
85
(100.00 %)
1,577,744
(7.81 %)
774,690
(3.78 %)
9,248,062
(40.42 %)
0
(0 %)
832,326
(3.45 %)
80,183
(2.48 %)
27,587
(0.82 %)
311 sand lizard
GCF_009819535.1
41,701
(3.64 %)
n/a 14,350
(1.48 %)
19,231
(2.45 %)
32,804
(4.14 %)
43.75
(99.75 %)
0
(0 %)
379
(0.25 %)
29
(100.00 %)
975,474
(5.32 %)
425,414
(1.76 %)
7,135,165
(34.49 %)
0
(0 %)
365,268
(2.50 %)
76,053
(2.68 %)
21,615
(0.85 %)
312 sardine (primary hap 2023)
GCA_963854185.1
n/a n/a 16,071
(2.33 %)
64,180
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
241
(100.00 %)
1,503,111
(11.74 %)
1,507,024
(15.48 %)
4,027,638
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,853
(8.48 %)
68,874
(3.56 %)
38,590
(1.78 %)
313 Sardinian treefrog (aHylSar1 2023)
GCF_029499605.1
108,406
(1.98 %)
n/a 13,959
(0.46 %)
n/a n/a 43.90
(99.99 %)
0
(0 %)
2,297
(0.01 %)
3,474
(100.00 %)
1,903,654
(2.85 %)
2,970,691
(16.56 %)
15,354,577
(64.31 %)
20
(0.00 %)
n/a 652,708
(8.36 %)
43,665
(0.45 %)
314 Savannah sparrow (primary hap 2023)
GCA_031885435.1
n/a n/a 12,986
(1.66 %)
27,028
(2.29 %)
n/a 43.66
(99.78 %)
0
(0 %)
249
(0.22 %)
110
(100.00 %)
464,600
(3.28 %)
681,402
(9.28 %)
6,314,744
(26.92 %)
0
(0 %)
939,361
(5.26 %)
39,406
(5.26 %)
25,911
(1.19 %)
315 sea lamprey
GCF_010993605.1
41,241
(6.50 %)
n/a 7,638
(0.70 %)
36,336
(4.06 %)
83,714
(10.03 %)
48.31
(98.62 %)
0
(0 %)
930
(1.38 %)
1,434
(100.00 %)
1,920,851
(39.36 %)
1,194,165
(21.47 %)
5,320,620
(50.50 %)
4
(0.00 %)
2,982,736
(13.77 %)
178,590
(35.88 %)
120,128
(5.32 %)
316 seaside sparrow (bAmmMar1 primary hap 2024)
GCA_036010785.1
n/a n/a 12,858
(1.52 %)
25,777
(2.02 %)
n/a 44.04
(99.85 %)
0
(0 %)
365
(0.15 %)
501
(100.00 %)
580,376
(4.24 %)
636,266
(12.18 %)
4,804,433
(34.52 %)
0
(0 %)
1,048,820
(7.41 %)
48,871
(4.18 %)
23,097
(1.00 %)
317 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1
n/a n/a 15,032
(2.44 %)
62,625
(6.97 %)
n/a 42.07
(99.98 %)
0
(0 %)
598
(0.02 %)
847
(100.00 %)
967,197
(11.85 %)
498,286
(8.15 %)
4,397,828
(28.96 %)
9
(0.00 %)
531,478
(4.46 %)
65,744
(4.06 %)
42,870
(2.25 %)
318 sharpnose sevengill shark (hap1 2024)
GCA_035084215.1
n/a n/a 12,780
(0.49 %)
24,543
(1.38 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
0
(0 %)
1,834
(0.01 %)
1,880
(100.00 %)
597,122
(2.28 %)
1,112,137
(17.97 %)
12,108,056
(57.48 %)
2
(0.00 %)
4,824,033
(9.23 %)
117,585
(3.42 %)
24,151
(0.35 %)
319 siamang (Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1
79,118
(2.62 %)
n/a 20,139
(1.70 %)
21,232
(1.14 %)
n/a 40.62
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
606
(100.00 %)
5,278,880
(55.89 %)
946,219
(14.68 %)
14,395,605
(46.26 %)
0
(0 %)
2,376,584
(4.99 %)
95,573
(1.75 %)
30,053
(0.74 %)
320 Siamese fighting fish (2020)
GCF_900634795.3
54,864
(17.78 %)
n/a 14,745
(4.20 %)
56,808
(10.87 %)
69,466
(16.34 %)
45.30
(99.99 %)
0
(0 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
255,550
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
0
(0 %)
232,435
(4.41 %)
72,126
(13.08 %)
55,959
(7.25 %)
321 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4
59,278
(19.85 %)
n/a 14,594
(4.32 %)
55,265
(10.96 %)
n/a 45.31
(99.99 %)
0
(0 %)
321
(0.01 %)
36
(100.00 %)
384,203
(19.38 %)
175,898
(4.39 %)
1,946,630
(23.16 %)
2
(0.00 %)
209,905
(4.10 %)
70,331
(13.13 %)
54,790
(7.31 %)
322 slow loris (mNycCou1 primary hap 2022)
GCF_027406575.1
67,211
(2.59 %)
n/a 22,193
(1.49 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 40.82
(99.86 %)
0
(0 %)
218
(0.14 %)
84
(100.00 %)
4,625,872
(39.88 %)
579,983
(1.59 %)
14,405,367
(40.78 %)
2
(0.00 %)
991,294
(2.40 %)
38,257
(0.77 %)
22,955
(0.54 %)
323 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2
n/a n/a 12,587
(0.36 %)
23,986
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
0
(0 %)
7,146
(1.52 %)
645
(100.00 %)
1,451,634
(1.94 %)
1,448,619
(6.25 %)
20,884,741
(51.41 %)
10
(0.00 %)
3,334,909
(4.99 %)
456,658
(8.18 %)
31,096
(0.32 %)
324 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1
55,762
(1.62 %)
n/a 12,597
(0.36 %)
23,987
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
0
(0 %)
7,146
(1.52 %)
646
(100.00 %)
1,185,832
(1.72 %)
1,448,620
(6.25 %)
20,884,767
(51.41 %)
10
(0.00 %)
3,334,926
(4.99 %)
456,658
(8.18 %)
31,096
(0.32 %)
325 smalleye Pacific opah (fLamInc1 2023)
GCF_029633865.1
34,018
(4.17 %)
n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
0
(0 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
17
(0.00 %)
1,796,705
(8.53 %)
143,632
(7.43 %)
65,914
(2.15 %)
326 smalltooth sawfish (v2.1 2019 refseq)
GCF_009764475.1
40,257
(2.94 %)
n/a 12,157
(0.69 %)
18,627
(1.55 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
0
(0 %)
698
(0.91 %)
172
(100.00 %)
4,824,261
(54.91 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,260
(38.19 %)
0
(0 %)
471,344
(1.50 %)
45,398
(1.34 %)
18,410
(0.41 %)
327 song sparrow (primary hap 2024)
GCA_035770615.1
n/a n/a 12,940
(1.39 %)
26,698
(1.87 %)
n/a 44.96
(99.93 %)
0
(0 %)
299
(0.07 %)
354
(100.00 %)
515,857
(3.07 %)
681,436
(15.73 %)
5,004,880
(39.23 %)
1
(0.00 %)
1,925,221
(9.14 %)
47,269
(3.90 %)
25,118
(0.99 %)
328 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1
n/a n/a 18,056
(1.78 %)
21,158
(1.79 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
6
(0.00 %)
161
(0.00 %)
249
(100.00 %)
2,899,535
(21.64 %)
853,717
(7.80 %)
10,162,216
(37.72 %)
1
(0.00 %)
802,761
(2.85 %)
63,256
(3.06 %)
61,642
(2.03 %)
329 South Island takahe (primary hap 2021)
GCA_020800305.1
n/a n/a 12,942
(1.69 %)
23,221
(2.13 %)
n/a 43.74
(99.58 %)
0
(0 %)
327
(0.42 %)
174
(100.00 %)
577,553
(9.77 %)
259,017
(5.20 %)
6,430,968
(25.90 %)
1
(0.00 %)
437,634
(2.97 %)
23,810
(2.02 %)
20,060
(1.16 %)
330 Southern alligator lizard (San Diego HBS135686 primary hap 2024)
GCA_023053635.2
n/a n/a 14,093
(1.15 %)
19,338
(1.96 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
0
(0 %)
73
(0.00 %)
35
(100.00 %)
1,577,751
(7.81 %)
774,117
(3.78 %)
9,248,069
(40.42 %)
1
(0.00 %)
823,656
(3.44 %)
80,183
(2.48 %)
27,586
(0.82 %)
331 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1
n/a n/a 20,058
(1.26 %)
22,196
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
961
(0.56 %)
201
(100.00 %)
4,037,291
(46.02 %)
593,019
(1.17 %)
18,033,833
(40.56 %)
9
(0.00 %)
500,101
(1.40 %)
65,039
(1.33 %)
38,121
(0.86 %)
332 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1
63,054
(2.39 %)
n/a 21,998
(1.29 %)
23,177
(1.18 %)
45,345
(1.69 %)
39.89
(97.48 %)
0
(0 %)
1,243
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,559,690
(39.66 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,630
(40.50 %)
4
(0.00 %)
492,026
(1.69 %)
51,430
(1.14 %)
40,148
(0.81 %)
333 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1
47,152
(2.39 %)
n/a 19,356
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
0
(0 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,460
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,540,762
(32.73 %)
0
(0 %)
547,538
(1.62 %)
18,046
(0.54 %)
16,132
(0.42 %)
334 southern bluefin tuna (2021)
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
n/a 15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
0
(0 %)
326,254
(3.37 %)
14,097
(0.88 %)
8,860
(0.42 %)
335 specked wood butterfly
GCF_905163445.1
21,720
(6.53 %)
n/a 4,713
(0.87 %)
17,001
(4.33 %)
29,238
(7.81 %)
35.99
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
70
(100.00 %)
304,062
(2.97 %)
110,824
(4.09 %)
3,704,161
(44.42 %)
1
(0.00 %)
144,758
(2.93 %)
28,108
(2.75 %)
11,566
(0.96 %)
336 speckled mousebird (hap1 2023)
GCA_028858725.1
n/a n/a 11,956
(1.78 %)
25,177
(2.60 %)
n/a 42.38
(99.48 %)
0
(0 %)
143
(0.52 %)
189
(100.00 %)
523,056
(12.47 %)
243,547
(3.72 %)
5,408,003
(23.43 %)
1
(0.00 %)
397,635
(2.78 %)
25,552
(2.34 %)
19,232
(1.18 %)
337 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1
n/a n/a 10,694
(1.38 %)
13,221
(2.62 %)
n/a 42.85
(99.96 %)
0
(0 %)
1,952
(0.04 %)
532
(100.00 %)
3,108,151
(44.68 %)
498,592
(6.00 %)
5,634,132
(43.16 %)
4
(0.00 %)
685,165
(4.19 %)
50,785
(2.94 %)
25,542
(1.57 %)
338 sterlet (maternal fAciRut3.2 2022)
GCF_902713425.1
110,154
(7.62 %)
n/a 25,364
(1.76 %)
40,715
(4.06 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
0
(0 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
10
(0.00 %)
1,593,747
(6.87 %)
64,522
(2.85 %)
21,984
(0.89 %)
339 stone loach (2022)
GCA_947034865.1
n/a n/a 16,419
(3.98 %)
40,677
(7.21 %)
n/a 39.69
(99.97 %)
0
(0 %)
825
(0.03 %)
100
(100.00 %)
1,324,513
(39.84 %)
143,170
(9.30 %)
3,000,881
(34.30 %)
1
(0.00 %)
392,291
(5.75 %)
30,130
(3.71 %)
15,123
(1.03 %)
340 striped dolphin (primary hap 2023)
GCA_951394435.1
n/a n/a 18,595
(1.48 %)
20,637
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1
(0.00 %)
993
(0.01 %)
639
(100.00 %)
4,097,623
(35.88 %)
1,442,973
(13.60 %)
12,327,244
(43.08 %)
1
(0.00 %)
1,896,129
(5.45 %)
68,498
(4.29 %)
42,011
(1.04 %)
341 striped catfish (fPanHyp1 primary hap 2022)
GCF_027358585.1
53,860
(11.99 %)
n/a 16,033
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
0
(0 %)
236
(0.51 %)
58
(100.00 %)
1,870,234
(37.80 %)
605,570
(6.82 %)
5,059,429
(32.43 %)
2
(0.00 %)
531,388
(4.26 %)
17,919
(1.29 %)
12,796
(0.75 %)
342 Sumatran orangutan (AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1
98,046
(3.46 %)
n/a 21,162
(1.68 %)
21,714
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.79 %)
59
(0.21 %)
59
(0.21 %)
2,670
(99.79 %)
5,730,768
(55.05 %)
1,175,314
(11.19 %)
16,323,507
(44.05 %)
0
(0 %)
2,553,363
(4.41 %)
55,799
(2.08 %)
39,159
(1.10 %)
343 Suruca trogon (2021)
GCA_020746105.1
n/a n/a 12,884
(1.85 %)
23,805
(2.23 %)
n/a 42.80
(99.12 %)
0
(0 %)
253
(0.88 %)
182
(100.00 %)
539,771
(9.26 %)
181,564
(1.14 %)
6,538,228
(22.49 %)
1
(0.00 %)
138,653
(1.22 %)
41,376
(3.37 %)
36,105
(2.01 %)
344 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1
n/a n/a 12,226
(1.01 %)
14,117
(1.42 %)
n/a 43.77
(100.00 %)
0
(0 %)
361
(0.00 %)
199
(100.00 %)
1,202,345
(11.93 %)
304,674
(1.45 %)
9,752,924
(32.81 %)
0
(0 %)
314,037
(1.63 %)
92,993
(2.75 %)
20,902
(0.60 %)
345 Swainson's thrush (v2 2020)
GCF_009819885.2
40,121
(5.41 %)
n/a 13,004
(1.87 %)
24,795
(2.41 %)
n/a 42.48
(98.86 %)
0
(0 %)
429
(1.14 %)
160
(100.00 %)
493,071
(5.80 %)
589,858
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
1
(0.00 %)
449,511
(2.41 %)
49,404
(3.53 %)
22,206
(1.16 %)
346 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018845.1
29,544
(4.27 %)
n/a 12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
0
(0 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
1
(0.00 %)
578,723
(3.93 %)
32,064
(3.27 %)
22,996
(1.19 %)
347 tammar wallaby (mMacEug1 primary hap 2023)
GCA_028372415.1
n/a n/a 17,652
(0.77 %)
15,774
(0.88 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
0
(0 %)
515
(0.19 %)
315
(100.00 %)
5,836,160
(26.14 %)
1,193,709
(2.72 %)
22,682,658
(39.52 %)
4
(0.00 %)
566,172
(1.21 %)
23,629
(0.48 %)
14,785
(0.29 %)
348 tarantolino (rEulEur1 2023)
GCF_029931775.1
24,643
(2.02 %)
n/a 14,238
(1.16 %)
21,782
(2.17 %)
n/a 44.68
(99.77 %)
0
(0 %)
153
(0.23 %)
591
(100.00 %)
1,174,615
(6.99 %)
436,937
(2.95 %)
8,308,817
(39.80 %)
0
(0 %)
824,335
(3.45 %)
83,089
(2.82 %)
33,674
(0.93 %)
349 tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023)
GCA_028020825.1
n/a n/a 13,321
(1.76 %)
24,102
(2.15 %)
n/a 42.35
(99.83 %)
0
(0 %)
203
(0.17 %)
1,038
(100.00 %)
593,409
(10.51 %)
202,463
(9.29 %)
6,160,173
(27.65 %)
1
(0.00 %)
529,082
(2.97 %)
25,785
(2.35 %)
21,960
(1.26 %)
350 tawny owl (hap1 2023)
GCA_031877795.1
n/a n/a 13,204
(1.60 %)
23,981
(1.99 %)
n/a 42.70
(99.70 %)
9
(0.15 %)
281
(0.30 %)
212
(99.85 %)
443,228
(4.74 %)
272,738
(10.86 %)
5,812,837
(27.42 %)
1
(0.00 %)
406,171
(2.45 %)
30,602
(2.52 %)
26,399
(1.26 %)
351 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1
n/a n/a 14,720
(2.58 %)
45,918
(6.44 %)
n/a 40.37
(99.99 %)
0
(0 %)
454
(0.01 %)
188
(100.00 %)
1,242,704
(17.37 %)
518,293
(15.23 %)
3,986,694
(40.18 %)
1
(0.00 %)
670,254
(6.56 %)
51,441
(3.53 %)
22,258
(1.30 %)
352 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1
n/a n/a 15,347
(2.73 %)
50,294
(7.25 %)
n/a 42.30
(99.98 %)
30
(0.00 %)
610
(0.02 %)
393
(100.00 %)
1,157,324
(26.70 %)
229,196
(4.33 %)
3,694,790
(27.54 %)
1
(0.00 %)
385,033
(4.63 %)
38,929
(2.20 %)
24,476
(1.25 %)
353 thorny skate (v2 2020)
GCF_010909765.2
45,968
(2.40 %)
n/a 11,437
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
n/a 44.30
(92.54 %)
0
(0 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
888,163
(2.58 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
26
(0.00 %)
1,634,606
(4.98 %)
242,676
(4.73 %)
31,030
(0.57 %)
354 tiny Cayenne caecilian
GCF_901765095.1
41,333
(1.27 %)
n/a 14,569
(0.43 %)
30,499
(1.16 %)
n/a 44.01
(98.99 %)
0
(0 %)
2,452
(1.01 %)
1,081
(100.00 %)
1,835,191
(1.59 %)
1,670,443
(3.30 %)
22,207,145
(52.43 %)
5
(0.00 %)
1,513,727
(3.00 %)
414,828
(3.91 %)
47,796
(0.38 %)
355 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3
n/a n/a 14,527
(4.79 %)
51,181
(11.72 %)
n/a 45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
325,077
(14.03 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,754
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,975
(9.63 %)
37,920
(5.08 %)
356 tourmaline sunangel (hap1 2024)
GCA_036169615.1
n/a n/a 12,509
(1.97 %)
21,020
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.99 %)
0
(0 %)
437
(0.01 %)
131
(100.00 %)
532,267
(5.46 %)
332,284
(2.69 %)
6,084,978
(21.20 %)
0
(0 %)
215,264
(1.71 %)
19,080
(1.72 %)
15,764
(1.09 %)
357 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1
n/a n/a 18,627
(1.82 %)
20,108
(1.67 %)
n/a 42.95
(100.00 %)
0
(0 %)
217
(0.00 %)
182
(100.00 %)
2,733,927
(24.79 %)
715,258
(3.17 %)
10,099,456
(36.35 %)
1
(0.00 %)
459,634
(1.69 %)
47,139
(2.58 %)
49,626
(1.96 %)
358 trahira (hap2 2023)
GCA_029633875.1
n/a n/a 16,216
(2.00 %)
45,209
(4.32 %)
n/a 41.03
(96.02 %)
0
(0 %)
907
(3.98 %)
452
(100.00 %)
2,280,303
(30.80 %)
708,327
(15.59 %)
5,394,248
(39.01 %)
7
(0.00 %)
1,246,906
(7.61 %)
28,386
(2.18 %)
12,439
(0.46 %)
359 tufted duck
GCF_009819795.1
29,492
(4.02 %)
n/a 12,972
(1.98 %)
22,757
(2.27 %)
n/a 41.66
(99.16 %)
0
(0 %)
163
(0.84 %)
105
(100.00 %)
826,451
(8.47 %)
411,356
(1.71 %)
6,691,445
(22.36 %)
1
(0.00 %)
93,916
(0.94 %)
29,882
(2.41 %)
27,027
(1.51 %)
360 tunicate A.turbinatum (primary hap 2021)
GCA_918807975.1
n/a n/a 4,108
(0.57 %)
18,445
(6.84 %)
n/a 37.60
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
27
(100.00 %)
104,021
(0.79 %)
186,953
(6.27 %)
2,895,772
(42.71 %)
0
(0 %)
297,254
(4.86 %)
23,070
(1.74 %)
4,064
(0.29 %)
361 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1
n/a n/a 14,816
(3.44 %)
49,680
(8.16 %)
n/a 43.40
(99.97 %)
0
(0 %)
805
(0.03 %)
108
(100.00 %)
808,348
(19.20 %)
301,230
(7.15 %)
3,267,772
(25.91 %)
4
(0.00 %)
311,531
(3.41 %)
66,132
(6.90 %)
41,801
(3.31 %)
362 two-lined caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_901001135.2
n/a n/a 14,449
(0.38 %)
40,573
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
0
(0 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,274,606
(1.91 %)
2,036,107
(4.34 %)
29,400,957
(44.09 %)
9
(0.01 %)
2,193,249
(3.24 %)
602,911
(6.66 %)
94,934
(0.82 %)
363 two-lined caecilian
GCF_901001135.1
56,617
(1.50 %)
n/a 14,448
(0.38 %)
40,572
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
0
(0 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,263,606
(1.94 %)
2,036,108
(4.34 %)
29,400,958
(44.09 %)
9
(0.01 %)
2,193,249
(3.24 %)
602,912
(6.66 %)
94,935
(0.82 %)
364 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1
60,106
(3.00 %)
n/a 18,611
(1.76 %)
20,103
(1.39 %)
35,176
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
0
(0 %)
212
(0.34 %)
64
(100.00 %)
4,067,454
(44.25 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,582
(35.55 %)
3
(0.00 %)
550,113
(1.71 %)
66,806
(1.79 %)
48,624
(1.46 %)
365 village indigobird (purged dups hap OUT-0048 2022)
GCA_026979555.1
n/a n/a 2,176
(1.79 %)
7,719
(4.37 %)
n/a 49.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,939
(100.00 %)
136,312
(29.31 %)
157,341
(15.03 %)
648,725
(34.67 %)
0
(0 %)
221,251
(9.52 %)
15,490
(8.23 %)
7,383
(2.86 %)
366 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 refseq)
GCF_026979565.1
44,961
(5.49 %)
n/a 12,817
(1.94 %)
24,245
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
0
(0 %)
458
(0.02 %)
177
(100.00 %)
616,746
(11.96 %)
411,917
(3.57 %)
6,385,057
(20.91 %)
6
(0.00 %)
306,942
(1.90 %)
37,940
(2.83 %)
24,967
(1.41 %)
367 warty frogfish (2020)
GCA_013358685.1
n/a n/a 14,494
(3.34 %)
45,310
(7.77 %)
n/a 41.86
(99.87 %)
0
(0 %)
219
(0.13 %)
155
(100.00 %)
413,753
(4.95 %)
290,313
(6.11 %)
3,010,996
(29.71 %)
3
(0.00 %)
305,411
(3.51 %)
36,840
(4.18 %)
22,433
(1.95 %)
368 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1
n/a n/a 18,126
(1.16 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
0
(0 %)
3,760
(0.03 %)
1,175
(100.00 %)
4,891,344
(19.68 %)
1,507,933
(3.81 %)
12,571,193
(54.50 %)
7
(0.00 %)
1,975,693
(4.67 %)
32,667
(0.90 %)
24,067
(0.56 %)
369 western capercaillie (primary hap 2023)
GCA_951394365.1
n/a n/a 12,775
(2.33 %)
22,516
(2.50 %)
n/a 41.49
(99.98 %)
0
(0 %)
973
(0.02 %)
318
(100.00 %)
518,194
(5.54 %)
276,294
(2.21 %)
5,866,033
(21.12 %)
9
(0.00 %)
148,912
(1.44 %)
21,287
(2.50 %)
19,248
(1.54 %)
370 Western terrestrial garter snake
GCF_009769535.1
33,492
(3.42 %)
n/a 13,074
(1.13 %)
18,807
(1.93 %)
31,660
(2.61 %)
40.95
(97.72 %)
0
(0 %)
1,518
(2.28 %)
365
(100.00 %)
1,271,255
(7.73 %)
979,057
(4.48 %)
8,396,200
(42.63 %)
0
(0 %)
801,068
(3.60 %)
81,829
(2.47 %)
23,152
(0.75 %)
371 western lowland gorilla (KB3781 2023)
GCF_029281585.1
101,242
(3.18 %)
n/a 20,994
(1.57 %)
41,945
(1.53 %)
n/a 40.59
(99.85 %)
0
(0 %)
38
(0.15 %)
637
(100.00 %)
5,526,927
(51.16 %)
1,080,693
(20.38 %)
15,929,020
(48.46 %)
0
(0 %)
5,690,867
(9.25 %)
76,432
(1.35 %)
30,764
(0.70 %)
372 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1
61,103
(2.36 %)
n/a 18,125
(1.16 %)
20,689
(1.21 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
0
(0 %)
3,760
(0.03 %)
1,174
(100.00 %)
4,891,329
(19.68 %)
1,507,929
(3.81 %)
12,571,105
(54.50 %)
7
(0.00 %)
1,975,693
(4.67 %)
32,667
(0.90 %)
24,067
(0.56 %)
373 whiskered treeswift (2021)
GCA_020745705.1
n/a n/a 12,681
(1.84 %)
21,784
(2.14 %)
n/a 42.12
(99.13 %)
0
(0 %)
218
(0.87 %)
146
(100.00 %)
520,200
(9.32 %)
170,778
(0.83 %)
6,455,910
(21.44 %)
0
(0 %)
98,619
(0.96 %)
24,061
(1.62 %)
17,982
(1.11 %)
374 white leghorn X broiler chicken (leghorn haplotype v2 2021)
GCF_016700215.2
83,834
(10.16 %)
n/a 13,005
(2.32 %)
23,329
(2.48 %)
72,360
(9.39 %)
42.16
(99.57 %)
409
(0.43 %)
409
(0.43 %)
685
(99.57 %)
536,869
(6.00 %)
268,230
(2.28 %)
5,845,184
(20.93 %)
2
(0.00 %)
247,373
(2.08 %)
24,409
(2.60 %)
20,761
(1.55 %)
375 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1
n/a n/a 18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
0
(0 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
2
(0.00 %)
1,117,804
(3.60 %)
68,551
(3.58 %)
41,698
(1.09 %)
376 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1
59,982
(2.43 %)
n/a 18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
0
(0 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
2
(0.00 %)
1,117,804
(3.60 %)
68,551
(3.58 %)
41,698
(1.09 %)
377 white-crowned manakin (hap1 2024)
GCA_036250125.1
n/a n/a 12,807
(1.82 %)
25,568
(2.46 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
323
(0.01 %)
697
(100.00 %)
429,646
(4.10 %)
293,431
(3.59 %)
6,059,494
(21.89 %)
0
(0 %)
366,430
(2.74 %)
29,574
(2.42 %)
21,946
(1.07 %)
378 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 2022)
GCA_947461875.1
n/a n/a 13,735
(1.76 %)
28,993
(2.53 %)
n/a 43.15
(99.99 %)
0
(0 %)
424
(0.01 %)
188
(100.00 %)
585,276
(12.89 %)
291,289
(6.10 %)
6,474,027
(23.66 %)
0
(0 %)
312,204
(2.16 %)
54,851
(4.05 %)
31,757
(1.50 %)
379 white-throated dipper (primary hap 2023)
GCA_963662255.1
n/a n/a 12,856
(1.79 %)
23,827
(2.25 %)
n/a 42.82
(99.99 %)
0
(0 %)
658
(0.01 %)
278
(100.00 %)
431,536
(3.38 %)
345,533
(10.59 %)
5,840,462
(26.59 %)
1
(0.00 %)
617,894
(3.85 %)
29,711
(3.56 %)
21,555
(1.20 %)
380 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1
40,430
(1.81 %)
n/a 17,575
(1.21 %)
21,880
(1.35 %)
47,496
(1.55 %)
39.81
(99.57 %)
0
(0 %)
1,010
(0.43 %)
147
(100.00 %)
2,846,063
(18.57 %)
1,252,362
(3.89 %)
13,776,063
(46.50 %)
14
(0.00 %)
1,059,317
(2.87 %)
24,589
(0.78 %)
20,877
(0.55 %)
381 white-tufted-ear marmoset (mCalJac1 2021)
GCF_011100555.1
104,419
(4.84 %)
n/a 21,801
(1.88 %)
21,467
(1.27 %)
n/a 40.92
(99.52 %)
0
(0 %)
1,165
(0.48 %)
1,233
(100.00 %)
5,036,591
(47.71 %)
842,846
(3.26 %)
15,161,534
(38.08 %)
2
(0.00 %)
1,256,018
(2.62 %)
37,603
(0.93 %)
34,471
(0.83 %)
382 whooping crane (bGruAme1 2023)
GCF_028858705.1
55,408
(5.57 %)
n/a 13,574
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
0
(0 %)
262
(0.37 %)
930
(100.00 %)
616,300
(10.57 %)
211,558
(2.90 %)
6,785,192
(22.11 %)
0
(0 %)
591,955
(1.89 %)
42,795
(4.66 %)
39,036
(2.34 %)
383 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1
n/a n/a 17,610
(1.00 %)
20,322
(1.04 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
276
(0.00 %)
62
(100.00 %)
3,295,935
(23.58 %)
389,907
(6.37 %)
19,525,382
(45.90 %)
0
(0 %)
1,020,287
(2.23 %)
31,831
(0.63 %)
26,588
(0.47 %)
384 yellow-throated sandgrouse
GCA_009769525.1
n/a n/a 12,697
(1.89 %)
25,289
(2.53 %)
n/a 42.40
(99.62 %)
0
(0 %)
242
(0.38 %)
89
(100.00 %)
510,633
(7.10 %)
213,742
(1.12 %)
6,627,716
(21.17 %)
0
(0 %)
113,802
(0.93 %)
28,848
(2.23 %)
25,343
(1.45 %)
385 yellowfin seabream
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
n/a 15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
84,160
(11.62 %)
42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
0
(0 %)
188,182
(2.04 %)
31,005
(1.79 %)
19,757
(1.03 %)
386 yellowfin tuna (2021)
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
n/a 15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
1
(0.00 %)
375,976
(3.80 %)
14,420
(0.88 %)
9,087
(0.42 %)
387 zebra finch (refseq 2021 Blue55 female)
GCF_003957565.2
49,311
(7.41 %)
n/a 12,747
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
0
(0 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
544,577
(9.57 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,748
(20.92 %)
3
(0.00 %)
312,137
(1.80 %)
29,202
(2.47 %)
22,084
(1.22 %)
388 zebra shark (sSteTig4 primary hap 2023)
GCF_030684315.1
58,105
(2.61 %)
n/a 12,291
(0.48 %)
16,769
(1.14 %)
n/a 43.41
(99.47 %)
0
(0 %)
1,159
(0.53 %)
835
(100.00 %)
8,087,543
(64.92 %)
798,373
(9.17 %)
14,838,773
(42.39 %)
4
(0.00 %)
2,946,119
(5.37 %)
45,284
(1.67 %)
14,105
(0.37 %)
389 zebrafish (WGS:CALUEM01 2022)
GCA_944039275.1
n/a n/a 18,065
(2.46 %)
44,526
(3.30 %)
n/a 37.08
(99.99 %)
0
(0 %)
381
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,804,769
(44.04 %)
954,645
(10.72 %)
8,694,743
(51.88 %)
4
(0.00 %)
1,207,649
(5.79 %)
44,936
(2.02 %)
11,380
(0.33 %)
390 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3
n/a n/a 15,036
(3.35 %)
40,234
(7.28 %)
n/a 40.66
(97.76 %)
0
(0 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
671,614
(20.98 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,040
(23.44 %)
0
(0 %)
175,881
(3.08 %)
12,807
(1.08 %)
8,703
(0.67 %)
TOTALS:total assembly count 390

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies