VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of primary assemblies)

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Abyssinian ground-hornbill (primary hap 2019)
GCA_009769605.1
n/a n/a 12,926
(1.90 %)
23,453
(2.26 %)
n/a 43.30
(99.29 %)
0
(0 %)
204
(0.71 %)
112
(100.00 %)
401,839
(5.61 %)
145,540
(0.78 %)
6,556,090
(19.22 %)
0
(0 %)
65,601
(0.62 %)
40,986
(3.65 %)
34,700
(2.27 %)
2 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024)
GCA_043250625.1
n/a n/a 15,735
(2.44 %)
50,184
(6.16 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
0
(0 %)
471
(0.01 %)
203
(100.00 %)
1,781,283
(37.65 %)
444,047
(7.93 %)
4,765,080
(37.01 %)
6
(0.00 %)
706,869
(5.97 %)
39,918
(2.01 %)
18,319
(0.92 %)
3 adder (hap1 2024)
GCA_964194415.1
n/a n/a 13,898
(1.18 %)
20,039
(1.94 %)
n/a 41.09
(99.99 %)
1
(0.00 %)
1,057
(0.01 %)
480
(100.00 %)
3,740,180
(50.44 %)
792,731
(6.25 %)
7,621,640
(45.94 %)
0
(0 %)
n/a 116,506
(4.68 %)
23,244
(0.88 %)
4 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1
57,514
(4.49 %)
n/a 14,340
(1.37 %)
20,053
(2.31 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
0
(0 %)
30
(0.00 %)
27
(100.00 %)
832,937
(4.17 %)
474,203
(4.04 %)
7,020,288
(38.29 %)
2
(0.00 %)
631,733
(3.50 %)
94,745
(2.70 %)
19,879
(0.76 %)
5 African grass rat (v3 paternal hap 2024)
GCA_011762505.3
n/a n/a 20,986
(2.01 %)
19,611
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,532,782
(33.95 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,612,916
(32.71 %)
2
(0.00 %)
1,064,933
(2.09 %)
17,767
(0.51 %)
16,931
(0.46 %)
6 African hunting dog (LycPic1hap2 2024)
GCA_040955705.1
n/a n/a 19,463
(1.58 %)
20,378
(1.42 %)
n/a 41.30
(100.00 %)
1
(0.00 %)
91
(0.00 %)
77
(100.00 %)
4,513,580
(32.16 %)
1,008,611
(2.91 %)
13,570,452
(33.71 %)
2
(0.00 %)
686,092
(1.77 %)
50,954
(2.21 %)
46,966
(1.51 %)
7 African ostrich (bStrCam1hap1 2024)
GCF_040807025.1
70,988
(5.69 %)
n/a 14,024
(1.60 %)
24,944
(1.95 %)
n/a 44.34
(100.00 %)
0
(0 %)
116
(0.00 %)
262
(100.00 %)
710,321
(8.33 %)
473,161
(7.22 %)
5,692,215
(24.23 %)
1
(0.00 %)
627,732
(4.53 %)
46,493
(8.90 %)
36,805
(2.48 %)
8 African savanna elephant (hap2 2023 refseq)
GCF_030014295.1
64,034
(3.35 %)
n/a 18,980
(1.10 %)
21,593
(1.06 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
0
(0 %)
231
(0.10 %)
879
(100.00 %)
4,426,749
(29.95 %)
832,904
(4.08 %)
16,118,888
(49.47 %)
1
(0.00 %)
1,082,957
(2.38 %)
62,314
(1.49 %)
23,783
(0.48 %)
9 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1
n/a n/a 19,086
(1.55 %)
22,040
(1.52 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,182
(0.01 %)
1,182
(0.01 %)
1,369
(99.99 %)
3,846,728
(31.78 %)
639,852
(2.90 %)
11,937,936
(38.98 %)
24
(0.00 %)
819,376
(2.67 %)
75,377
(2.21 %)
66,761
(1.68 %)
10 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1
n/a n/a 18,980
(1.50 %)
22,394
(1.50 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
326
(100.00 %)
3,896,863
(31.56 %)
659,711
(4.74 %)
11,945,162
(40.81 %)
3
(0.00 %)
979,504
(2.79 %)
76,769
(2.57 %)
66,591
(1.63 %)
11 Amazon manatee (hap2 2025)
GCA_046562895.1
n/a n/a 18,949
(1.23 %)
21,655
(1.08 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
294
(0.00 %)
401
(100.00 %)
6,218,266
(57.31 %)
470,437
(3.04 %)
15,241,157
(48.91 %)
1
(0.00 %)
714,873
(1.68 %)
37,124
(0.86 %)
30,784
(0.66 %)
12 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1
60,799
(4.33 %)
n/a 14,383
(0.98 %)
18,600
(1.45 %)
n/a 45.01
(99.30 %)
0
(0 %)
161
(0.70 %)
195
(100.00 %)
3,322,624
(43.19 %)
478,208
(1.77 %)
12,316,424
(32.01 %)
0
(0 %)
334,854
(1.31 %)
49,792
(2.45 %)
29,504
(1.51 %)
13 American beaver (hap1 2025)
GCA_047511655.1
n/a n/a 19,828
(1.45 %)
20,376
(1.31 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
1
(0.00 %)
181
(0.00 %)
503
(100.00 %)
4,030,880
(35.35 %)
566,770
(2.63 %)
14,198,970
(35.24 %)
9
(0.00 %)
640,099
(2.12 %)
24,454
(0.96 %)
23,257
(0.88 %)
14 American flamingo (primary hap 2019)
GCA_009819775.1
n/a n/a 13,100
(1.79 %)
23,372
(2.04 %)
n/a 43.27
(99.31 %)
0
(0 %)
280
(0.69 %)
90
(100.00 %)
538,004
(7.73 %)
183,346
(0.79 %)
7,056,270
(20.92 %)
0
(0 %)
91,554
(0.80 %)
52,012
(5.96 %)
50,946
(3.06 %)
15 American mink (hap1 2024)
GCA_964106545.1
n/a n/a 19,203
(1.43 %)
22,174
(1.33 %)
n/a 42.39
(99.98 %)
0
(0 %)
2,957
(0.02 %)
435
(100.00 %)
4,188,829
(30.04 %)
802,295
(5.81 %)
14,041,290
(37.98 %)
19
(0.00 %)
1,190,442
(3.02 %)
65,430
(2.64 %)
54,362
(1.78 %)
16 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1
45,008
(1.93 %)
n/a 17,997
(1.35 %)
23,185
(1.49 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
0
(0 %)
432
(0.00 %)
5,864
(100.00 %)
4,126,248
(43.60 %)
628,344
(15.71 %)
11,100,962
(42.69 %)
18
(0.00 %)
1,888,430
(5.34 %)
60,350
(1.67 %)
30,970
(1.18 %)
17 American shad (primary hap 2021)
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
n/a 16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
76,974
(8.55 %)
43.18
(99.45 %)
0
(0 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
14
(0.00 %)
934,014
(6.61 %)
42,699
(2.23 %)
25,608
(1.23 %)
18 amphioxus (hap2 2024 genbank)
GCA_035083965.1
n/a n/a 5,217
(0.97 %)
41,736
(12.73 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
0
(0 %)
103
(0.00 %)
34
(100.00 %)
128,505
(1.65 %)
182,123
(8.03 %)
2,157,899
(27.45 %)
0
(0 %)
274,077
(4.65 %)
44,261
(5.21 %)
29,041
(2.94 %)
19 Andian cavefish (hap1 2023 refseq)
GCF_030014385.1
42,881
(5.97 %)
n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,939
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
20 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024)
GCA_043748645.1
n/a n/a 18,528
(1.65 %)
22,359
(1.64 %)
n/a 42.89
(100.00 %)
6
(0.00 %)
88
(0.00 %)
44
(100.00 %)
3,531,044
(35.70 %)
555,304
(2.07 %)
11,439,853
(36.03 %)
0
(0 %)
663,932
(1.99 %)
102,112
(3.75 %)
92,727
(2.81 %)
21 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq)
GCF_003957555.1
31,091
(4.24 %)
n/a 12,257
(1.95 %)
14,633
(2.35 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
0
(0 %)
429
(1.52 %)
159
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,055
(1.51 %)
6,092,276
(20.84 %)
0
(0 %)
152,103
(1.27 %)
17,130
(1.48 %)
15,125
(1.04 %)
22 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1
n/a n/a 16,678
(0.56 %)
151,361
(4.03 %)
n/a 44.57
(99.91 %)
0
(0 %)
15,113
(0.09 %)
5,983
(100.00 %)
12,251,532
(51.73 %)
3,521,157
(17.69 %)
10,051,020
(68.37 %)
71
(0.00 %)
5,101,423
(13.15 %)
494,595
(10.52 %)
74,823
(1.04 %)
23 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1
n/a n/a 17,342
(1.44 %)
78,914
(5.48 %)
n/a 43.57
(99.96 %)
0
(0 %)
3,179
(0.04 %)
1,901
(100.00 %)
5,980,457
(37.18 %)
1,633,782
(21.76 %)
6,279,725
(52.83 %)
12
(0.00 %)
2,013,978
(10.83 %)
104,688
(3.57 %)
33,790
(1.15 %)
24 Arabian camel (paternal hap 2024 refseq)
GCF_036321535.1
62,940
(3.46 %)
n/a 18,078
(1.66 %)
21,071
(1.56 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
0
(0 %)
195
(0.00 %)
171
(100.00 %)
3,040,467
(29.22 %)
343,480
(10.93 %)
11,796,955
(33.50 %)
2
(0.00 %)
1,611,842
(4.73 %)
55,427
(1.61 %)
47,478
(1.18 %)
25 Arctic char (CBP00131 primary hap 2024)
GCA_036784965.1
n/a n/a 22,376
(1.44 %)
97,559
(4.71 %)
n/a 43.37
(99.97 %)
3,235
(0.03 %)
3,235
(0.03 %)
4,404
(99.97 %)
999,920
(4.22 %)
1,630,911
(26.08 %)
7,875,105
(58.08 %)
17
(0.00 %)
1,400,966
(4.23 %)
70,947
(2.59 %)
16,782
(0.35 %)
26 Arctic ground squirrel (hap1 2024)
GCA_045843805.1
n/a n/a 20,255
(1.35 %)
21,401
(1.44 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
0
(0 %)
694
(0.00 %)
2,530
(100.00 %)
4,287,108
(25.85 %)
895,123
(5.96 %)
15,722,314
(36.45 %)
3
(0.00 %)
1,383,542
(4.24 %)
34,781
(0.82 %)
29,107
(0.60 %)
27 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1
n/a n/a 15,455
(2.53 %)
40,077
(4.90 %)
86,346
(8.45 %)
38.90
(99.98 %)
0
(0 %)
795
(0.02 %)
241
(100.00 %)
2,045,691
(38.70 %)
669,975
(11.72 %)
4,638,765
(42.07 %)
1
(0.00 %)
693,282
(5.96 %)
28,277
(1.93 %)
15,766
(0.94 %)
28 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1
50,315
(9.13 %)
n/a 16,526
(2.73 %)
38,780
(6.64 %)
72,662
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
0
(0 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
504,673
(3.06 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
0
(0 %)
157,330
(1.72 %)
88,517
(10.73 %)
67,281
(4.98 %)
29 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1
61,202
(2.60 %)
n/a 18,887
(1.13 %)
21,194
(1.06 %)
n/a 41.14
(99.90 %)
0
(0 %)
126
(0.10 %)
64
(100.00 %)
4,358,470
(31.27 %)
663,094
(4.56 %)
16,261,778
(48.66 %)
1
(0.00 %)
851,540
(1.93 %)
69,120
(1.32 %)
23,319
(0.49 %)
30 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1
n/a n/a 18,931
(1.76 %)
19,988
(1.37 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
0
(0 %)
92
(0.00 %)
193
(100.00 %)
3,632,286
(38.21 %)
350,074
(2.22 %)
14,785,531
(30.90 %)
1
(0.00 %)
254,432
(0.91 %)
36,699
(1.70 %)
36,659
(1.49 %)
31 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924715.1
54,426
(12.09 %)
n/a 15,720
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
0
(0 %)
468
(0.01 %)
119
(100.00 %)
1,608,682
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,078
(27.80 %)
3
(0.00 %)
390,196
(3.88 %)
14,488
(0.90 %)
9,706
(0.46 %)
32 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1
51,642
(11.92 %)
n/a 14,055
(2.62 %)
36,761
(8.42 %)
68,438
(9.50 %)
45.64
(96.48 %)
0
(0 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
790,946
(10.54 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
4
(0.00 %)
741,285
(7.34 %)
97,133
(7.82 %)
51,623
(3.50 %)
33 Atlantic hagfish (primary hap 2024)
GCA_964187855.1
n/a n/a 6,662
(0.20 %)
45,484
(2.63 %)
n/a 44.32
(99.97 %)
0
(0 %)
4,412
(0.03 %)
4,004
(100.00 %)
1,698,449
(3.61 %)
2,644,659
(27.70 %)
7,620,145
(74.29 %)
43
(0.00 %)
n/a 331,404
(12.87 %)
49,019
(0.82 %)
34 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
n/a 14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
69,662
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
0
(0 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
0
(0 %)
240,110
(3.16 %)
31,325
(2.25 %)
20,749
(1.34 %)
35 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2
n/a n/a 15,262
(2.42 %)
51,857
(6.86 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
222
(0.00 %)
153
(100.00 %)
1,454,219
(18.25 %)
384,609
(4.72 %)
4,338,083
(32.80 %)
5
(0.00 %)
449,712
(4.53 %)
56,553
(3.08 %)
20,550
(1.04 %)
36 Atlantic mackerel (primary hap 2023 refseq)
GCF_963691925.1
34,357
(8.10 %)
n/a 15,289
(2.56 %)
43,205
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
665
(100.00 %)
1,496,240
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,726
(29.93 %)
9
(0.00 %)
555,074
(5.00 %)
13,308
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
37 Atlantic ridley (rLepKem1 hap1 2025)
GCA_965140285.1
n/a 26,407
(1.93 %)
14,835
(1.03 %)
17,938
(1.53 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
219
(0.00 %)
219
(0.00 %)
273
(100.00 %)
1,346,135
(12.58 %)
326,849
(2.26 %)
10,620,784
(34.46 %)
0
(0 %)
636,273
(2.45 %)
46,936
(1.44 %)
25,019
(0.62 %)
38 Atlantic silverside (fMenMen1 hap1 2025)
GCA_048628825.1
n/a n/a 14,247
(3.16 %)
47,091
(7.94 %)
n/a 42.17
(99.99 %)
21
(0.00 %)
867
(0.02 %)
478
(100.00 %)
352,705
(4.33 %)
432,013
(10.15 %)
2,954,922
(28.67 %)
13
(0.00 %)
641,504
(7.18 %)
41,876
(4.47 %)
27,639
(2.13 %)
39 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1
60,922
(2.51 %)
n/a 12,544
(0.38 %)
28,250
(1.22 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,648
(0.01 %)
2,989
(100.00 %)
8,579,099
(49.81 %)
831,222
(15.75 %)
21,718,178
(51.79 %)
9
(0.00 %)
4,445,369
(7.00 %)
105,821
(2.42 %)
35,197
(0.42 %)
40 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024)
GCA_964270905.1
n/a n/a 18,773
(1.50 %)
21,069
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1
(0.00 %)
1,034
(0.01 %)
900
(100.00 %)
3,975,427
(35.64 %)
1,054,000
(10.27 %)
12,281,095
(41.92 %)
6
(0.00 %)
2,009,438
(5.51 %)
79,762
(4.08 %)
42,028
(1.04 %)
41 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
n/a 14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
0
(0 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
1
(0.00 %)
4,597,115
(10.42 %)
78,364
(2.73 %)
45,620
(1.05 %)
42 Australian ruff (RE-2024a hap2 2024)
GCA_042242135.1
n/a n/a 15,534
(2.50 %)
39,464
(5.26 %)
n/a 39.77
(100.00 %)
0
(0 %)
98
(0.00 %)
552
(100.00 %)
498,493
(3.22 %)
271,314
(7.61 %)
4,161,752
(38.16 %)
2
(0.00 %)
436,316
(4.99 %)
9,637
(0.93 %)
6,725
(0.31 %)
43 axolotl (Mex_15411 2024)
GCF_040938575.1
96,841
(0.40 %)
n/a 18,564
(0.07 %)
184,527
(1.17 %)
n/a 46.34
(100.00 %)
0
(0 %)
2,095
(0.00 %)
221
(100.00 %)
27,951,551
(67.11 %)
8,561,025
(9.70 %)
2,316
(100.00 %)
25
(0.00 %)
1,448,410
(0.36 %)
2,452,305
(5.31 %)
417,603
(0.63 %)
44 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1
48,592
(12.09 %)
n/a 15,140
(2.66 %)
43,304
(6.14 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
815
(0.02 %)
815
(0.02 %)
946
(99.98 %)
1,221,797
(30.10 %)
290,736
(7.79 %)
4,164,799
(30.34 %)
4
(0.00 %)
525,920
(5.43 %)
17,126
(0.94 %)
10,131
(0.54 %)
45 band-tailed pigeon (hap1 2025)
GCF_037038585.1
53,396
(5.03 %)
n/a 13,483
(1.56 %)
27,248
(2.08 %)
n/a 44.11
(99.81 %)
0
(0 %)
137
(0.19 %)
360
(100.00 %)
559,611
(7.44 %)
512,210
(15.22 %)
4,524,890
(33.96 %)
1
(0.00 %)
1,197,250
(5.92 %)
44,009
(7.81 %)
31,711
(1.57 %)
46 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 refseq)
GCF_036971685.1
36,326
(4.04 %)
n/a 13,317
(1.60 %)
25,993
(2.05 %)
n/a 43.83
(99.41 %)
0
(0 %)
219
(0.59 %)
452
(100.00 %)
700,166
(13.18 %)
457,543
(13.85 %)
4,522,973
(31.73 %)
2
(0.00 %)
1,089,421
(5.57 %)
42,686
(7.00 %)
31,415
(1.62 %)
47 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
n/a 15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
0
(0 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
1
(0.00 %)
297,814
(3.49 %)
15,089
(0.96 %)
9,304
(0.55 %)
48 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1
n/a n/a 15,122
(1.44 %)
65,809
(4.50 %)
n/a 41.23
(99.74 %)
0
(0 %)
293
(0.26 %)
331
(100.00 %)
2,545,429
(50.53 %)
451,939
(5.50 %)
5,807,705
(42.18 %)
0
(0 %)
863,582
(6.37 %)
94,695
(3.92 %)
37,528
(1.27 %)
49 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1
n/a n/a 31,876
(3.30 %)
85,063
(5.65 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
0
(0 %)
108
(0.00 %)
92
(100.00 %)
4,839,533
(52.47 %)
646,636
(4.57 %)
8,240,279
(42.13 %)
2
(0.00 %)
569,819
(3.17 %)
71,384
(3.04 %)
22,137
(0.56 %)
50 barn swallow (v3 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.2
41,925
(5.13 %)
n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,661
(1.56 %)
36,548
(2.85 %)
29,760
(1.66 %)
51 basking shark (sCetMax3.hap1.1 2024)
GCA_964194155.1
n/a n/a 13,757
(0.41 %)
22,690
(1.04 %)
n/a 44.49
(99.99 %)
0
(0 %)
2,778
(0.01 %)
5,088
(100.00 %)
6,693,687
(65.70 %)
1,238,350
(12.60 %)
21,698,294
(51.34 %)
20
(0.00 %)
5,335,615
(7.60 %)
113,759
(1.90 %)
28,476
(0.65 %)
52 beardfish (hap1 2025)
GCA_047511565.1
n/a n/a 15,938
(3.00 %)
52,921
(7.52 %)
n/a 43.38
(99.98 %)
0
(0 %)
752
(0.02 %)
327
(100.00 %)
993,554
(11.81 %)
755,389
(11.75 %)
3,469,352
(30.25 %)
8
(0.00 %)
770,561
(6.90 %)
68,008
(5.51 %)
40,885
(2.43 %)
53 Bellinger river turtle (v2 BRST_UC0152H_USYD 2025)
GCA_040894355.2
n/a n/a 14,713
(1.14 %)
18,959
(1.77 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
1
(0.00 %)
77
(0.00 %)
110
(100.00 %)
1,130,167
(11.21 %)
213,193
(1.80 %)
11,049,207
(26.48 %)
1
(0.00 %)
311,436
(1.26 %)
53,921
(2.09 %)
34,762
(1.11 %)
54 Bermuda beardfish (OG660 hap1 2025)
GCA_048537225.1
n/a n/a 15,950
(2.82 %)
53,175
(7.04 %)
n/a 42.97
(99.99 %)
0
(0 %)
481
(0.01 %)
846
(100.00 %)
1,017,817
(12.34 %)
764,426
(15.65 %)
3,524,564
(32.87 %)
4
(0.00 %)
953,480
(7.90 %)
60,800
(4.43 %)
35,606
(1.84 %)
55 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1
46,266
(2.61 %)
n/a 18,620
(1.80 %)
21,271
(1.72 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
48
(100.00 %)
3,041,145
(25.08 %)
904,075
(3.80 %)
10,530,666
(37.05 %)
0
(0 %)
647,994
(2.05 %)
77,605
(3.68 %)
62,105
(2.31 %)
56 bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.2
78,636
(2.63 %)
n/a 19,459
(1.36 %)
21,150
(1.33 %)
n/a 43.91
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
42
(100.00 %)
3,963,383
(22.89 %)
826,353
(11.67 %)
12,918,743
(46.86 %)
0
(0 %)
2,225,863
(5.63 %)
52,254
(10.67 %)
39,631
(0.85 %)
57 bight redfish (hap1 2025)
GCA_048128805.1
n/a n/a 16,025
(2.63 %)
53,351
(6.76 %)
n/a 42.47
(99.98 %)
43
(0.00 %)
699
(0.02 %)
322
(100.00 %)
995,401
(9.22 %)
626,617
(9.80 %)
4,302,378
(31.80 %)
10
(0.00 %)
535,484
(4.68 %)
38,231
(2.50 %)
23,342
(1.21 %)
58 bilby (mMagLag1 2024)
GCA_037893015.1
n/a n/a 18,686
(0.72 %)
17,238
(0.81 %)
n/a 37.35
(99.66 %)
0
(0 %)
4,431
(0.34 %)
609
(100.00 %)
6,263,094
(27.34 %)
2,223,995
(5.89 %)
23,994,844
(43.69 %)
70
(0.01 %)
1,521,039
(3.02 %)
51,039
(3.47 %)
15,234
(0.24 %)
59 bird A.albertisi (hap1 2024)
GCA_039906565.1
n/a n/a 13,007
(1.87 %)
23,375
(2.27 %)
n/a 42.52
(99.99 %)
0
(0 %)
439
(0.01 %)
592
(100.00 %)
467,217
(6.83 %)
273,604
(2.43 %)
6,154,114
(21.83 %)
4
(0.00 %)
268,509
(1.94 %)
23,203
(2.12 %)
18,788
(1.00 %)
60 bird E.chinensis (hap2 2024)
GCA_039878825.1
n/a n/a 12,731
(2.42 %)
22,580
(2.63 %)
n/a 41.64
(99.99 %)
0
(0 %)
330
(0.01 %)
191
(100.00 %)
520,888
(5.33 %)
274,030
(2.07 %)
5,360,112
(20.48 %)
0
(0 %)
186,943
(1.97 %)
19,673
(2.18 %)
16,622
(1.40 %)
61 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024)
GCA_043290085.1
n/a n/a 20,713
(0.64 %)
21,469
(0.64 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
1
(0.00 %)
770
(0.00 %)
470
(100.00 %)
3,860,121
(14.52 %)
1,230,113
(2.81 %)
1,239
(100.00 %)
7
(0.00 %)
n/a 49,878
(0.73 %)
48,556
(0.69 %)
62 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1
n/a n/a 14,455
(2.06 %)
56,488
(6.31 %)
n/a 42.10
(99.99 %)
0
(0 %)
636
(0.01 %)
298
(100.00 %)
3,230,397
(55.09 %)
494,440
(10.43 %)
4,359,169
(40.46 %)
2
(0.00 %)
950,976
(6.99 %)
81,684
(4.81 %)
45,797
(2.02 %)
63 black porgy (SG-2024 2024)
GCA_041753875.1
n/a n/a 15,257
(2.73 %)
47,477
(6.62 %)
n/a 42.03
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 24
(100.00 %)
488,582
(3.19 %)
254,655
(4.13 %)
4,385,401
(24.08 %)
0
(0 %)
311,552
(3.23 %)
32,461
(1.90 %)
20,388
(1.03 %)
64 black rhinoceros (primary hap 2021 refseq)
GCF_020826845.1
56,255
(2.28 %)
n/a 18,774
(1.38 %)
22,348
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
0
(0 %)
215
(0.05 %)
1,076
(100.00 %)
4,200,390
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,693
(40.14 %)
2
(0.00 %)
984,722
(2.61 %)
43,525
(1.14 %)
33,963
(0.76 %)
65 black-capped chickadee (hap1 2023)
GCF_030490865.1
44,388
(4.96 %)
n/a 13,738
(1.81 %)
26,691
(2.34 %)
n/a 42.41
(99.92 %)
0
(0 %)
404
(0.08 %)
307
(100.00 %)
730,165
(12.91 %)
566,529
(6.51 %)
6,499,984
(24.36 %)
2
(0.00 %)
632,539
(3.23 %)
42,650
(2.59 %)
24,153
(1.20 %)
66 black-headed gull (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924245.1
46,133
(4.67 %)
n/a 13,243
(1.58 %)
24,048
(1.89 %)
n/a 44.66
(99.99 %)
0
(0 %)
462
(0.01 %)
728
(100.00 %)
516,346
(4.84 %)
268,169
(14.83 %)
5,880,218
(31.31 %)
1
(0.00 %)
746,091
(4.07 %)
45,313
(4.92 %)
37,373
(1.57 %)
67 black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq)
GCF_028500815.1
51,115
(5.11 %)
n/a 13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
0
(0 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
8
(0.00 %)
651,837
(3.67 %)
45,318
(4.71 %)
36,668
(1.67 %)
68 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1
n/a n/a 15,043
(2.96 %)
50,860
(7.54 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
366
(0.01 %)
109
(100.00 %)
1,210,142
(29.44 %)
340,820
(9.19 %)
2,986,750
(29.89 %)
0
(0 %)
547,550
(6.92 %)
52,010
(4.20 %)
28,373
(1.72 %)
69 blackcap (primary hap 2019 refseq)
GCF_009819655.1
31,610
(4.74 %)
n/a 12,379
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
0
(0 %)
413
(1.12 %)
190
(100.00 %)
582,016
(10.36 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,626
(19.76 %)
0
(0 %)
190,212
(1.30 %)
26,838
(2.34 %)
22,667
(1.33 %)
70 blackspot tuskfish (SL-2024 2025)
GCA_047301625.1
n/a n/a 15,085
(2.21 %)
48,479
(5.71 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
43
(100.00 %)
499,447
(3.15 %)
285,392
(5.12 %)
5,443,017
(30.00 %)
0
(0 %)
339,248
(2.90 %)
23,550
(1.23 %)
11,868
(0.48 %)
71 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1
n/a n/a 17,486
(2.97 %)
46,833
(5.41 %)
n/a 38.79
(99.99 %)
0
(0 %)
720
(0.01 %)
413
(100.00 %)
2,165,269
(36.18 %)
490,692
(17.84 %)
4,251,333
(47.54 %)
10
(0.00 %)
1,058,863
(8.47 %)
42,744
(2.37 %)
19,312
(0.98 %)
72 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1
47,540
(2.07 %)
n/a 19,041
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
0
(0 %)
97
(0.03 %)
74
(100.00 %)
3,964,038
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,229
(41.78 %)
1
(0.00 %)
1,795,618
(5.01 %)
70,851
(1.80 %)
37,949
(0.93 %)
73 blonde ray (primary hap 2023)
GCA_963514005.1
n/a n/a 11,900
(0.54 %)
27,568
(1.55 %)
n/a 44.98
(99.98 %)
0
(0 %)
2,269
(0.02 %)
1,647
(100.00 %)
8,972,805
(66.20 %)
1,061,811
(8.11 %)
11,599,498
(58.72 %)
6
(0.00 %)
2,430,580
(6.13 %)
278,499
(6.42 %)
59,922
(2.12 %)
74 blue jay (hap1 2024)
GCA_046129655.1
n/a n/a 13,064
(1.75 %)
25,241
(2.27 %)
n/a 43.65
(99.99 %)
0
(0 %)
393
(0.01 %)
316
(100.00 %)
727,985
(19.18 %)
342,327
(5.00 %)
5,822,377
(25.13 %)
2
(0.00 %)
387,058
(3.06 %)
40,586
(3.99 %)
25,543
(1.21 %)
75 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2
58,750
(2.71 %)
n/a 19,162
(1.80 %)
20,576
(1.41 %)
36,291
(1.99 %)
40.88
(98.91 %)
0
(0 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,870
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,384
(34.60 %)
4
(0.00 %)
422,171
(1.33 %)
67,032
(1.73 %)
46,602
(1.41 %)
76 blue whiting (primary hap 2024)
GCA_964030765.1
n/a n/a 13,097
(2.93 %)
55,097
(8.76 %)
n/a 45.82
(99.88 %)
0
(0 %)
3,055
(0.12 %)
3,832
(100.00 %)
1,337,604
(32.27 %)
749,185
(17.27 %)
2,363,606
(35.06 %)
7
(0.00 %)
596,931
(7.20 %)
78,815
(8.25 %)
42,300
(3.48 %)
77 blue-and-yellow macaw (hap1 2023)
GCA_028858755.1
n/a n/a 12,919
(1.77 %)
22,770
(2.15 %)
n/a 42.69
(99.92 %)
0
(0 %)
107
(0.08 %)
246
(100.00 %)
711,670
(17.55 %)
242,430
(5.04 %)
5,545,074
(24.84 %)
0
(0 %)
506,592
(3.20 %)
25,153
(2.06 %)
19,988
(1.21 %)
78 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2
n/a n/a 14,499
(1.97 %)
51,213
(5.47 %)
n/a 38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
442
(100.00 %)
731,731
(4.21 %)
471,623
(4.92 %)
5,974,055
(42.88 %)
0
(0 %)
455,138
(4.01 %)
29,052
(1.48 %)
14,673
(0.63 %)
79 Boeseman's rainbowfish (primary hap 2021)
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
n/a 15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
0
(0 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
1
(0.00 %)
441,845
(3.68 %)
18,525
(1.10 %)
10,661
(0.59 %)
80 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1
n/a n/a 16,964
(1.77 %)
67,673
(5.93 %)
n/a 42.61
(99.97 %)
28
(0.00 %)
1,785
(0.03 %)
979
(100.00 %)
4,285,965
(30.73 %)
1,222,431
(20.69 %)
6,105,881
(46.99 %)
11
(0.00 %)
1,356,343
(8.48 %)
73,543
(3.28 %)
32,534
(1.37 %)
81 Bolivian squirrel monkey (mSaiBol1 primary hap 2025)
GCA_048565385.1
n/a n/a 20,765
(1.92 %)
20,951
(1.28 %)
n/a 41.00
(100.00 %)
0
(0 %)
73
(0.00 %)
63
(100.00 %)
5,214,762
(46.97 %)
990,724
(4.68 %)
14,779,707
(38.32 %)
0
(0 %)
1,532,950
(3.25 %)
38,916
(1.05 %)
33,742
(0.90 %)
82 bonti-bonti (primary hap 2022)
GCA_933228915.1
n/a n/a 14,929
(1.93 %)
55,343
(5.90 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
0
(0 %)
1,329
(0.03 %)
146
(100.00 %)
998,246
(14.90 %)
443,155
(22.40 %)
4,319,947
(40.01 %)
2
(0.00 %)
1,529,147
(9.19 %)
34,018
(4.16 %)
15,066
(0.86 %)
83 bony fish R.nasutus (DBWJ_T2T 2025)
GCA_048301585.1
n/a n/a 17,715
(2.98 %)
44,183
(4.64 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
70
(100.00 %)
613,768
(4.88 %)
440,668
(11.76 %)
5,264,302
(45.25 %)
0
(0 %)
759,216
(5.63 %)
39,351
(3.96 %)
13,535
(0.57 %)
84 Bornean orangutan (v2 AG05252 primary hap 2024 refseq)
GCF_028885625.2
92,658
(2.98 %)
n/a 20,708
(1.74 %)
21,361
(1.14 %)
n/a 40.88
(99.75 %)
0
(0 %)
8
(0.25 %)
26
(100.00 %)
5,544,151
(54.41 %)
1,072,960
(9.60 %)
16,187,641
(42.16 %)
0
(0 %)
2,505,849
(4.22 %)
43,604
(1.09 %)
29,685
(0.76 %)
85 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1
n/a n/a 18,247
(1.61 %)
22,673
(1.83 %)
n/a 41.12
(99.99 %)
205
(0.00 %)
775
(0.01 %)
835
(100.00 %)
2,918,285
(18.64 %)
868,090
(5.77 %)
9,427,604
(40.78 %)
2
(0.00 %)
1,601,923
(4.79 %)
27,049
(1.25 %)
22,545
(0.76 %)
86 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1
n/a n/a 18,667
(1.46 %)
20,817
(1.26 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
284
(0.00 %)
903
(100.00 %)
4,004,895
(35.23 %)
925,158
(12.15 %)
11,999,784
(42.65 %)
3
(0.00 %)
1,841,091
(5.04 %)
63,428
(1.55 %)
38,329
(0.93 %)
87 bowfin (hap1 2024 refseq)
GCF_036373705.1
55,474
(7.85 %)
n/a 13,848
(1.83 %)
27,055
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
97
(0.00 %)
389
(100.00 %)
953,492
(13.69 %)
387,699
(7.91 %)
4,552,359
(37.72 %)
4
(0.00 %)
613,799
(6.38 %)
46,301
(2.99 %)
26,437
(1.15 %)
88 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1
n/a n/a 17,865
(1.56 %)
76,506
(5.59 %)
n/a 42.15
(99.96 %)
0
(0 %)
2,704
(0.04 %)
676
(100.00 %)
6,391,921
(39.62 %)
1,227,487
(11.70 %)
6,669,558
(49.73 %)
11
(0.00 %)
1,301,019
(7.83 %)
76,828
(3.96 %)
26,877
(0.90 %)
89 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1
n/a n/a 19,039
(1.66 %)
21,660
(1.59 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
20
(0.00 %)
148
(100.00 %)
3,805,818
(31.80 %)
640,446
(2.50 %)
11,793,353
(36.15 %)
1
(0.00 %)
609,574
(1.94 %)
68,896
(2.40 %)
57,812
(1.49 %)
90 Brazilian merganser (hap1 2024)
GCA_036873955.1
n/a n/a 13,202
(1.80 %)
24,416
(2.14 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
0
(0 %)
327
(0.00 %)
569
(100.00 %)
832,469
(7.06 %)
531,644
(7.37 %)
6,294,434
(28.49 %)
0
(0 %)
618,430
(3.89 %)
34,786
(3.61 %)
27,553
(1.39 %)
91 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap1 2025)
GCA_048301445.1
n/a n/a 13,406
(4.62 %)
41,458
(10.33 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
3
(0.00 %)
78
(0.00 %)
155
(100.00 %)
205,224
(2.93 %)
217,943
(13.58 %)
1,368,592
(36.56 %)
0
(0 %)
232,608
(6.06 %)
48,018
(12.44 %)
32,621
(5.13 %)
92 Brown anole (maternal hap 2024 refseq)
GCF_037176765.1
41,782
(3.73 %)
n/a 14,463
(1.05 %)
20,186
(1.84 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
0
(0 %)
191
(0.00 %)
29
(100.00 %)
1,456,556
(7.33 %)
1,162,200
(6.85 %)
9,275,690
(46.71 %)
0
(0 %)
1,512,000
(5.23 %)
44,738
(1.08 %)
17,370
(0.40 %)
93 brown argus butterfly (refseq 2021)
GCF_905147365.1
23,611
(6.61 %)
n/a 4,734
(1.03 %)
24,265
(6.80 %)
24,237
(6.16 %)
36.86
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
25
(100.00 %)
264,358
(2.90 %)
144,234
(3.35 %)
2,650,845
(48.44 %)
0
(0 %)
205,173
(4.19 %)
35,431
(4.56 %)
15,409
(1.89 %)
94 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1
n/a n/a 19,138
(1.72 %)
20,370
(1.54 %)
n/a 43.08
(99.99 %)
0
(0 %)
1,237
(0.01 %)
65
(100.00 %)
3,201,470
(26.24 %)
957,903
(4.27 %)
10,687,995
(39.65 %)
8
(0.00 %)
881,577
(2.81 %)
60,671
(2.39 %)
52,889
(1.71 %)
95 budgerigar (maternal Z 2020 refseq)
GCF_012275295.1
32,026
(4.32 %)
n/a 13,239
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
26,324
(3.11 %)
41.80
(99.72 %)
0
(0 %)
284
(0.28 %)
864
(100.00 %)
538,374
(10.19 %)
279,504
(3.12 %)
5,874,531
(22.08 %)
1
(0.00 %)
324,793
(2.05 %)
21,155
(1.61 %)
17,590
(1.10 %)
96 butterfish (primary hap 2021)
GCF_020382885.2
52,828
(14.10 %)
n/a 15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
0
(0 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
1
(0.00 %)
96,783
(1.70 %)
15,574
(1.13 %)
10,807
(0.72 %)
97 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1
n/a n/a 14,403
(2.47 %)
61,860
(7.37 %)
n/a 43.15
(99.96 %)
0
(0 %)
1,625
(0.04 %)
525
(100.00 %)
959,651
(12.16 %)
517,137
(13.14 %)
3,775,081
(32.47 %)
9
(0.00 %)
784,659
(7.82 %)
81,881
(6.68 %)
50,317
(3.10 %)
98 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2
70,801
(3.05 %)
n/a 20,915
(1.77 %)
20,179
(1.40 %)
44,926
(2.10 %)
41.40
(99.23 %)
0
(0 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,525,652
(43.65 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,648
(33.76 %)
2
(0.00 %)
495,451
(1.44 %)
51,899
(1.50 %)
48,201
(1.32 %)
99 Canada goose (primary hap 2025)
GCA_965231335.1
n/a n/a 13,367
(1.74 %)
24,033
(2.05 %)
n/a 44.13
(99.99 %)
0
(0 %)
531
(0.01 %)
614
(100.00 %)
686,641
(5.40 %)
437,049
(11.66 %)
6,060,316
(29.86 %)
2
(0.00 %)
915,238
(5.76 %)
41,213
(4.57 %)
35,522
(2.13 %)
100 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2
50,142
(2.69 %)
n/a 18,273
(1.65 %)
19,264
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
0
(0 %)
842
(0.12 %)
54
(100.00 %)
5,011,165
(43.72 %)
904,525
(1.75 %)
13,467,551
(34.19 %)
0
(0 %)
572,384
(1.64 %)
66,799
(2.48 %)
60,482
(2.02 %)
101 Caribbean electric ray (hap1 2024 refseq)
GCF_036971445.1
77,919
(2.56 %)
n/a 11,965
(0.44 %)
20,833
(1.25 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,443
(0.01 %)
595
(100.00 %)
4,902,644
(34.96 %)
1,040,891
(17.82 %)
16,403,243
(54.79 %)
2
(0.00 %)
1,425,690
(2.88 %)
113,936
(1.69 %)
22,323
(0.31 %)
102 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1
n/a n/a 11,692
(0.46 %)
19,961
(1.22 %)
n/a 42.79
(99.99 %)
0
(0 %)
1,507
(0.01 %)
445
(100.00 %)
4,781,152
(36.16 %)
876,063
(14.65 %)
16,060,040
(52.49 %)
7
(0.00 %)
2,994,548
(6.81 %)
101,598
(1.64 %)
21,263
(0.33 %)
103 carmine bee-eater (primary hap 2019)
GCA_009819595.1
n/a n/a 12,740
(1.82 %)
28,031
(2.77 %)
n/a 42.88
(99.47 %)
0
(0 %)
269
(0.53 %)
109
(100.00 %)
556,926
(7.87 %)
213,180
(1.09 %)
6,641,077
(21.58 %)
0
(0 %)
132,076
(1.14 %)
30,881
(2.41 %)
23,550
(1.23 %)
104 chaffinch (primary hap 2023)
GCA_963513975.1
n/a n/a 12,708
(1.72 %)
24,978
(2.26 %)
n/a 44.06
(99.99 %)
7
(0.00 %)
573
(0.01 %)
467
(100.00 %)
495,590
(3.15 %)
493,628
(13.34 %)
6,163,336
(28.37 %)
2
(0.00 %)
729,875
(4.06 %)
39,042
(6.25 %)
24,111
(1.21 %)
105 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
n/a 14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
0
(0 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
0
(0 %)
452,303
(4.62 %)
20,453
(1.39 %)
10,802
(0.65 %)
106 chevron butterflyfish (hap1 2024 refseq)
GCF_039877785.1
38,623
(10.62 %)
n/a 15,604
(3.07 %)
48,037
(7.05 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
0
(0 %)
49
(0.00 %)
36
(100.00 %)
1,224,649
(24.57 %)
254,015
(3.62 %)
3,657,926
(23.28 %)
1
(0.00 %)
186,571
(2.20 %)
30,971
(2.02 %)
21,708
(1.31 %)
107 chimpanzee (v2 AG18354 primary hap 2024 refseq)
GCF_028858775.2
134,453
(3.48 %)
n/a 20,832
(1.77 %)
22,081
(1.17 %)
n/a 40.57
(99.84 %)
0
(0 %)
5
(0.16 %)
26
(100.00 %)
5,408,047
(49.94 %)
1,021,513
(10.88 %)
15,986,329
(42.21 %)
0
(0 %)
3,108,843
(5.27 %)
49,727
(1.09 %)
29,844
(0.76 %)
108 chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128725.1
n/a n/a 15,739
(1.88 %)
46,290
(4.42 %)
n/a 39.31
(100.00 %)
3
(0.00 %)
70
(0.00 %)
89
(100.00 %)
663,559
(2.79 %)
371,107
(3.14 %)
7,519,173
(32.84 %)
1
(0.00 %)
254,294
(1.89 %)
17,824
(0.70 %)
12,286
(0.46 %)
109 Chinese crocodile lizard (Guangxi GXDGS128 2021)
GCA_021292165.1
n/a n/a 15,365
(1.01 %)
20,233
(1.64 %)
n/a 44.88
(100.00 %)
0
(0 %)
852
(0.00 %)
1,553
(100.00 %)
2,058,732
(7.85 %)
845,208
(2.04 %)
11,639,209
(43.21 %)
5
(0.00 %)
745,074
(3.17 %)
116,459
(3.04 %)
33,234
(0.76 %)
110 Chinese pangolin (hap1 2023)
GCF_030020395.1
71,445
(2.98 %)
n/a 18,379
(1.34 %)
21,837
(1.29 %)
n/a 41.07
(99.77 %)
0
(0 %)
383
(0.23 %)
661
(100.00 %)
3,318,871
(34.65 %)
618,193
(3.68 %)
12,009,669
(39.02 %)
8
(0.00 %)
1,132,160
(3.87 %)
47,708
(1.22 %)
34,214
(0.79 %)
111 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1
34,390
(6.95 %)
n/a 15,348
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
0
(0 %)
1,572
(0.08 %)
360
(100.00 %)
1,669,322
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,373
(32.38 %)
3
(0.00 %)
927,880
(7.23 %)
16,290
(0.85 %)
8,913
(0.42 %)
112 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3
n/a n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
67,055
(11.68 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
633,883
(15.28 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,008
(21.31 %)
0
(0 %)
169,790
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
113 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1
81,219
(3.62 %)
n/a 18,300
(1.65 %)
20,361
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
0
(0 %)
181
(0.06 %)
33
(100.00 %)
4,224,269
(34.84 %)
992,668
(2.08 %)
13,618,866
(34.42 %)
3
(0.00 %)
647,739
(1.89 %)
67,830
(2.45 %)
58,781
(1.98 %)
114 coelacanth (fLatCha1 primary hap 2024)
GCF_037176945.1
40,046
(2.75 %)
n/a 13,820
(0.63 %)
17,285
(1.40 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
154
(0.00 %)
197
(100.00 %)
2,064,326
(2.75 %)
1,047,267
(3.01 %)
15,613,479
(54.45 %)
1
(0.00 %)
1,146,128
(3.27 %)
140,027
(2.34 %)
11,143
(0.16 %)
115 Columbretes wall lizard (hap1.1 2025)
GCA_965112155.1
n/a n/a 14,276
(1.31 %)
20,158
(2.24 %)
n/a 44.06
(99.99 %)
0
(0 %)
921
(0.01 %)
290
(100.00 %)
871,508
(4.31 %)
539,525
(6.79 %)
7,116,593
(40.00 %)
2
(0.00 %)
754,520
(4.30 %)
97,685
(3.45 %)
20,472
(0.73 %)
116 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1
n/a n/a 13,266
(1.21 %)
16,750
(1.98 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
0
(0 %)
372
(0.00 %)
350
(100.00 %)
782,672
(6.46 %)
434,795
(2.20 %)
7,788,697
(37.04 %)
0
(0 %)
506,831
(2.74 %)
28,089
(0.98 %)
14,987
(0.51 %)
117 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1
67,207
(3.31 %)
n/a 18,766
(1.77 %)
20,528
(1.42 %)
35,852
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
0
(0 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,069,115
(46.17 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,891
(35.29 %)
1
(0.00 %)
629,903
(1.85 %)
65,551
(1.90 %)
43,136
(1.35 %)
118 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1
n/a n/a 18,114
(2.63 %)
66,549
(6.11 %)
n/a 38.62
(99.99 %)
7
(0.00 %)
685
(0.01 %)
215
(100.00 %)
2,639,968
(48.46 %)
659,243
(7.55 %)
5,950,358
(40.47 %)
3
(0.00 %)
963,199
(6.67 %)
62,337
(3.61 %)
19,726
(0.79 %)
119 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1
37,674
(1.80 %)
n/a 18,653
(0.80 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,116
(38.90 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,306
(40.56 %)
0
(0 %)
455,717
(1.17 %)
17,762
(0.38 %)
13,986
(0.24 %)
120 common buzzard (bButBut1.hap1.1 2024)
GCA_964188355.1
n/a n/a 13,512
(1.75 %)
24,417
(2.13 %)
n/a 43.17
(99.99 %)
2
(0.00 %)
471
(0.01 %)
546
(100.00 %)
439,018
(4.62 %)
244,865
(6.73 %)
6,778,625
(23.94 %)
2
(0.00 %)
258,825
(1.67 %)
43,400
(4.80 %)
34,405
(1.72 %)
121 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq)
GCF_017976375.1
50,206
(6.30 %)
n/a 13,190
(1.85 %)
24,284
(2.29 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
0
(0 %)
296
(0.42 %)
150
(100.00 %)
566,161
(11.56 %)
310,430
(2.36 %)
6,712,791
(21.76 %)
0
(0 %)
326,395
(1.83 %)
25,268
(1.73 %)
20,672
(1.05 %)
122 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1
36,211
(8.34 %)
n/a 14,995
(2.62 %)
50,844
(6.89 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
0
(0 %)
275
(0.01 %)
338
(100.00 %)
1,186,799
(32.17 %)
307,864
(16.34 %)
3,562,802
(35.00 %)
2
(0.00 %)
481,477
(5.21 %)
41,657
(2.72 %)
22,630
(1.29 %)
123 common dace (hap1.1 2025)
GCA_965113295.1
n/a n/a 18,484
(2.43 %)
69,931
(5.95 %)
n/a 39.03
(99.98 %)
0
(0 %)
1,202
(0.02 %)
876
(100.00 %)
938,148
(4.74 %)
828,944
(9.34 %)
5,833,273
(42.65 %)
14
(0.00 %)
987,377
(7.00 %)
78,182
(4.87 %)
26,569
(1.15 %)
124 common goldeneye (primary hap 2024)
GCA_964059595.1
n/a n/a 13,374
(1.90 %)
24,308
(2.28 %)
n/a 42.07
(99.99 %)
6
(0.00 %)
454
(0.01 %)
544
(100.00 %)
751,865
(6.78 %)
400,294
(3.80 %)
6,184,781
(24.97 %)
4
(0.00 %)
321,327
(2.30 %)
35,712
(2.66 %)
29,614
(1.59 %)
125 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1
45,869
(6.34 %)
n/a 14,279
(1.46 %)
19,710
(2.38 %)
n/a 44.05
(99.99 %)
0
(0 %)
683
(0.01 %)
48
(100.00 %)
4,128,183
(45.62 %)
513,318
(3.73 %)
7,172,928
(37.61 %)
7
(0.00 %)
477,389
(3.08 %)
92,858
(2.90 %)
22,863
(0.95 %)
126 common moorhen (bGalChl1.hap1.1 2024)
GCA_964237585.1
n/a n/a 12,976
(1.68 %)
23,758
(2.12 %)
n/a 44.70
(99.99 %)
27
(0.00 %)
603
(0.01 %)
845
(100.00 %)
499,923
(5.57 %)
250,214
(7.38 %)
6,350,978
(25.68 %)
9
(0.00 %)
537,046
(3.31 %)
27,790
(2.32 %)
21,858
(1.17 %)
127 common myna (bArcTri1 primary hap 2023)
GCA_027559615.1
n/a n/a 12,560
(1.73 %)
23,740
(2.16 %)
n/a 42.32
(99.80 %)
0
(0 %)
435
(0.20 %)
455
(100.00 %)
395,254
(5.40 %)
937,774
(11.00 %)
6,145,808
(28.07 %)
2
(0.00 %)
825,681
(4.71 %)
32,293
(3.87 %)
21,576
(1.15 %)
128 common newt (primary hap 2024)
GCA_964263255.1
n/a n/a 17,972
(0.09 %)
229,830
(1.61 %)
n/a 45.06
(100.00 %)
0
(0 %)
4,030
(0.00 %)
15,265
(100.00 %)
4,807,454
(1.50 %)
10,258,109
(12.52 %)
19,295
(100.00 %)
27
(0.00 %)
3,799,915
(1.53 %)
2,684,793
(7.99 %)
2,631,420
(7.74 %)
129 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1
n/a n/a 17,216
(1.82 %)
19,202
(1.79 %)
n/a 42.55
(99.97 %)
0
(0 %)
1,546
(0.03 %)
323
(100.00 %)
2,953,532
(23.94 %)
805,142
(2.83 %)
9,964,846
(34.69 %)
0
(0 %)
446,836
(1.61 %)
57,295
(2.83 %)
54,882
(1.90 %)
130 common pochard (bAytFer1.hap1.1 2024)
GCA_964211825.1
n/a n/a 13,505
(1.83 %)
24,961
(2.21 %)
n/a 42.19
(99.99 %)
8
(0.00 %)
474
(0.01 %)
870
(100.00 %)
833,892
(8.17 %)
576,230
(8.04 %)
6,149,355
(27.84 %)
14
(0.00 %)
632,907
(3.94 %)
34,089
(2.69 %)
28,890
(1.45 %)
131 common seabream (hap1.1 2025)
GCA_965226575.1
n/a n/a 15,435
(2.40 %)
54,036
(6.66 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
0
(0 %)
536
(0.01 %)
576
(100.00 %)
495,544
(2.96 %)
454,601
(9.69 %)
4,614,163
(29.34 %)
3
(0.00 %)
380,594
(3.48 %)
29,859
(1.71 %)
17,482
(0.84 %)
132 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1
55,359
(12.02 %)
n/a 14,844
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
242
(100.00 %)
1,149,243
(19.12 %)
342,238
(9.71 %)
3,906,753
(32.84 %)
2
(0.00 %)
440,509
(5.18 %)
27,772
(2.71 %)
15,561
(0.92 %)
133 common spadefoot toad (primary hap 2024 refseq)
GCF_036172605.1
42,170
(1.55 %)
n/a 14,560
(0.56 %)
46,435
(2.21 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
0
(0 %)
349
(0.00 %)
159
(100.00 %)
1,677,374
(3.51 %)
3,229,434
(13.31 %)
15,027,049
(51.43 %)
12
(0.00 %)
3,799,232
(9.03 %)
282,389
(3.86 %)
79,263
(0.96 %)
134 common swift (primary hap 2021 refseq)
GCF_020740795.1
39,986
(4.95 %)
n/a 12,292
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
0
(0 %)
256
(0.16 %)
110
(100.00 %)
499,695
(6.70 %)
199,749
(1.12 %)
6,354,003
(21.19 %)
1
(0.00 %)
113,872
(0.91 %)
20,393
(1.74 %)
16,313
(0.88 %)
135 common tern (primary hap 2019)
GCA_009819605.1
n/a n/a 13,103
(1.81 %)
24,044
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.16 %)
0
(0 %)
205
(0.84 %)
123
(100.00 %)
570,312
(7.91 %)
216,895
(1.04 %)
7,043,151
(20.98 %)
1
(0.00 %)
112,065
(1.02 %)
45,694
(3.73 %)
41,720
(2.13 %)
136 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1
45,085
(1.10 %)
n/a 14,240
(0.38 %)
46,470
(1.68 %)
37,594
(0.91 %)
44.49
(99.80 %)
0
(0 %)
4,199
(0.20 %)
1,306
(100.00 %)
1,658,204
(1.79 %)
3,099,513
(13.49 %)
19,236,510
(62.70 %)
18
(0.00 %)
6,217,888
(10.17 %)
539,919
(4.45 %)
78,985
(0.67 %)
137 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.2
n/a n/a 18,311
(1.71 %)
19,456
(1.59 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
0
(0 %)
615
(0.01 %)
573
(100.00 %)
2,767,071
(28.35 %)
431,575
(3.90 %)
11,286,853
(32.63 %)
37
(0.00 %)
330,061
(1.50 %)
71,506
(2.50 %)
45,001
(1.26 %)
138 common wall lizard (hap1 2024)
GCA_964188315.1
n/a n/a 14,322
(1.36 %)
19,700
(2.31 %)
n/a 44.23
(99.99 %)
0
(0 %)
827
(0.01 %)
185
(100.00 %)
868,785
(4.15 %)
544,999
(4.79 %)
7,097,077
(38.69 %)
10
(0.00 %)
713,068
(4.14 %)
120,725
(3.71 %)
20,707
(0.76 %)
139 common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024)
GCA_964263955.1
n/a n/a 29,103
(1.36 %)
124,287
(3.94 %)
n/a 43.87
(99.96 %)
0
(0 %)
5,995
(0.04 %)
11,150
(100.00 %)
1,655,140
(4.68 %)
1,843,550
(17.63 %)
9,367,555
(61.56 %)
26
(0.00 %)
4,094,607
(11.22 %)
112,654
(3.84 %)
19,454
(0.27 %)
140 common yellowthroat (primary hap 2019)
GCA_009764595.1
n/a n/a 11,741
(1.82 %)
22,382
(2.29 %)
n/a 42.01
(98.73 %)
0
(0 %)
1,479
(1.27 %)
278
(100.00 %)
476,049
(6.38 %)
367,108
(3.16 %)
6,576,957
(20.43 %)
0
(0 %)
333,263
(2.08 %)
25,004
(2.02 %)
20,494
(1.18 %)
141 convict blenny (primary hap 2021)
GCA_020510985.1
n/a n/a n/a 134,417
(1.50 %)
n/a 44.52
(99.13 %)
0
(0 %)
2,580
(0.87 %)
512
(100.00 %)
9,062,541
(49.33 %)
2,097,650
(2.66 %)
3,092
(99.13 %)
5
(0.00 %)
3,135,536
(6.36 %)
568,042
(10.14 %)
0
(0.00 %)
142 copperband butterflyfish (primary hap 2021)
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
n/a 15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
61,755
(8.99 %)
42.57
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
1
(0.00 %)
158,516
(2.15 %)
29,106
(1.85 %)
19,302
(1.11 %)
143 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1
n/a n/a 14,740
(2.91 %)
45,483
(7.26 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
0
(0 %)
1,379
(0.04 %)
395
(100.00 %)
936,676
(24.41 %)
306,192
(9.29 %)
3,495,456
(28.75 %)
2
(0.00 %)
463,889
(5.20 %)
29,142
(2.35 %)
16,622
(1.09 %)
144 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1
140,657
(1.12 %)
n/a 15,461
(0.24 %)
54,344
(1.07 %)
n/a 45.66
(99.76 %)
0
(0 %)
2,699
(0.24 %)
3,127
(100.00 %)
3,521,281
(2.88 %)
5,902,115
(18.63 %)
5,826
(99.76 %)
23
(0.00 %)
n/a 990,274
(4.84 %)
952,582
(4.53 %)
145 Cory's shearwater (hap1.2 2024)
GCA_964195595.2
n/a n/a 13,703
(1.71 %)
25,586
(2.06 %)
n/a 43.29
(99.99 %)
7
(0.00 %)
525
(0.01 %)
362
(100.00 %)
478,943
(5.03 %)
336,466
(4.95 %)
5,910,061
(24.89 %)
4
(0.00 %)
487,078
(3.38 %)
48,046
(4.19 %)
40,252
(2.00 %)
146 crab-eating macaque (582-1 2024)
GCF_037993035.1
100,896
(3.93 %)
n/a 20,528
(1.79 %)
21,741
(1.19 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 21
(100.00 %)
5,357,498
(52.90 %)
1,017,190
(8.58 %)
15,617,344
(40.74 %)
0
(0 %)
2,146,978
(4.41 %)
94,759
(1.56 %)
30,541
(0.76 %)
147 crested bigscale (hap1.1 2025)
GCA_964638095.1
n/a n/a 17,935
(1.34 %)
104,307
(6.12 %)
n/a 44.53
(99.96 %)
142
(0.00 %)
2,975
(0.04 %)
2,930
(100.00 %)
5,608,839
(57.44 %)
1,825,932
(20.35 %)
6,375,759
(51.18 %)
16
(0.00 %)
2,419,022
(10.51 %)
149,374
(4.78 %)
37,609
(1.23 %)
148 crested eagle (hap2 2024)
GCA_045345515.1
n/a n/a 13,656
(1.49 %)
27,669
(2.31 %)
n/a 44.30
(100.00 %)
0
(0 %)
164
(0.00 %)
544
(100.00 %)
765,672
(26.88 %)
431,376
(14.19 %)
5,221,201
(33.63 %)
0
(0 %)
1,019,182
(5.63 %)
63,565
(10.48 %)
31,804
(1.32 %)
149 crested weedfish (hap1 OG76 2025)
GCA_049082185.1
n/a n/a 14,740
(2.96 %)
58,554
(8.04 %)
n/a 44.56
(99.96 %)
0
(0 %)
1,180
(0.04 %)
793
(100.00 %)
711,944
(7.44 %)
537,707
(8.17 %)
3,418,045
(29.92 %)
5
(0.00 %)
354,340
(3.87 %)
95,750
(8.49 %)
51,515
(3.32 %)
150 Cretan wall lizard (primary hap 2023)
GCA_951804945.1
n/a n/a 14,249
(1.37 %)
19,304
(2.27 %)
n/a 43.87
(100.00 %)
4
(0.00 %)
47
(0.00 %)
55
(100.00 %)
882,564
(4.30 %)
511,174
(3.24 %)
7,094,363
(38.65 %)
2
(0.00 %)
586,225
(3.38 %)
117,222
(3.18 %)
18,707
(0.71 %)
151 Crete spiny mouse (2024)
GCA_964271855.1
n/a n/a 19,467
(1.76 %)
18,734
(1.43 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
113
(100.00 %)
4,718,848
(32.83 %)
1,327,449
(6.80 %)
12,893,458
(34.03 %)
0
(0 %)
1,009,136
(2.74 %)
21,236
(0.61 %)
17,412
(0.44 %)
152 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1
90,094
(6.75 %)
n/a 29,386
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
0
(0 %)
832
(0.01 %)
277
(100.00 %)
3,481,382
(45.81 %)
802,773
(6.54 %)
8,190,783
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,003,533
(5.09 %)
83,696
(3.82 %)
26,039
(0.81 %)
153 cuckoo roller (hap2 2023)
GCA_034619465.1
n/a n/a 13,044
(1.66 %)
30,275
(2.65 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
17
(0.00 %)
271
(0.00 %)
295
(100.00 %)
603,184
(8.76 %)
324,082
(7.37 %)
6,147,876
(25.10 %)
0
(0 %)
633,504
(3.50 %)
44,051
(8.95 %)
36,565
(2.19 %)
154 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1
51,190
(10.37 %)
n/a 15,144
(2.59 %)
43,207
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.98 %)
0
(0 %)
570
(0.02 %)
324
(100.00 %)
1,435,625
(29.39 %)
330,276
(12.54 %)
4,196,830
(33.83 %)
1
(0.00 %)
689,646
(5.54 %)
19,310
(1.01 %)
11,155
(0.57 %)
155 cunner (primary hap 2021)
GCA_020745685.1
n/a n/a 15,192
(2.74 %)
43,564
(6.38 %)
n/a 41.31
(99.41 %)
0
(0 %)
283
(0.59 %)
64
(100.00 %)
1,419,667
(30.50 %)
243,024
(4.81 %)
4,334,690
(27.65 %)
2
(0.00 %)
297,510
(2.95 %)
17,974
(1.06 %)
9,021
(0.52 %)
156 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024)
GCA_043880285.1
n/a n/a 18,610
(1.67 %)
19,098
(1.39 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
7
(0.00 %)
334
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,077,286
(41.85 %)
754,689
(2.64 %)
11,873,386
(36.16 %)
1
(0.00 %)
1,326,571
(3.53 %)
48,137
(1.04 %)
24,623
(0.71 %)
157 Dalmatian pelican (primary hap 2023)
GCA_030463565.1
n/a n/a 13,457
(1.72 %)
25,299
(2.10 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
0
(0 %)
390
(0.01 %)
311
(100.00 %)
660,747
(14.47 %)
294,268
(5.22 %)
6,840,996
(24.63 %)
5
(0.00 %)
318,407
(2.04 %)
39,705
(5.14 %)
36,802
(1.98 %)
158 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
n/a 15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
0
(0 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
4
(0.00 %)
383,250
(3.60 %)
32,973
(1.28 %)
9,764
(0.33 %)
159 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1
64,558
(3.32 %)
n/a 19,141
(1.72 %)
22,133
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
0
(0 %)
1,099
(0.01 %)
121
(100.00 %)
3,040,232
(24.03 %)
796,911
(6.38 %)
10,478,180
(38.84 %)
9
(0.00 %)
756,429
(2.76 %)
64,920
(2.51 %)
57,806
(1.88 %)
160 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2
n/a n/a 16,559
(3.78 %)
58,823
(8.66 %)
74,128
(10.47 %)
43.69
(99.18 %)
0
(0 %)
464
(0.82 %)
461
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,284
(4.61 %)
2,948,738
(28.79 %)
0
(0 %)
306,165
(4.31 %)
64,661
(9.49 %)
52,867
(4.93 %)
161 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1
50,318
(3.53 %)
n/a 15,109
(1.08 %)
19,280
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.92 %)
0
(0 %)
141
(0.08 %)
76
(100.00 %)
4,088,064
(46.33 %)
403,943
(1.72 %)
11,014,504
(33.74 %)
0
(0 %)
407,696
(1.71 %)
110,838
(2.71 %)
30,093
(0.82 %)
162 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1
96,734
(3.71 %)
n/a 20,135
(1.64 %)
20,871
(1.38 %)
56,772
(3.19 %)
41.50
(100.00 %)
585
(0.00 %)
585
(0.00 %)
2,782
(100.00 %)
20,264,827
(43.87 %)
1,152,879
(3.22 %)
13,784,690
(34.30 %)
9
(0.00 %)
1,226,639
(2.84 %)
53,518
(2.23 %)
49,021
(1.97 %)
163 Domestic goose (bAnsAns1.hap1.1 2024)
GCA_964211835.1
n/a n/a 13,401
(1.75 %)
24,999
(2.15 %)
n/a 43.53
(99.99 %)
0
(0 %)
930
(0.01 %)
819
(100.00 %)
685,992
(5.59 %)
452,303
(8.91 %)
5,976,185
(28.48 %)
16
(0.00 %)
797,996
(5.01 %)
43,672
(4.38 %)
36,919
(2.25 %)
164 dorado (hap2 2023 refseq)
GCF_030463535.1
45,512
(7.65 %)
n/a 16,797
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
0
(0 %)
726
(0.85 %)
103
(100.00 %)
871,278
(4.83 %)
805,806
(14.65 %)
5,615,217
(36.69 %)
2
(0.00 %)
1,425,793
(8.96 %)
30,083
(1.31 %)
21,157
(0.81 %)
165 downy woodpecker (primary hap 2020)
GCF_014839835.1
25,483
(3.24 %)
n/a 12,410
(1.70 %)
22,416
(2.11 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
0
(0 %)
187
(0.34 %)
180
(100.00 %)
1,259,627
(26.52 %)
378,533
(3.38 %)
5,846,661
(32.04 %)
0
(0 %)
791,075
(4.25 %)
26,005
(1.75 %)
19,919
(1.16 %)
166 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1
n/a n/a 18,354
(1.22 %)
20,434
(1.08 %)
n/a 40.65
(100.00 %)
0
(0 %)
96
(0.00 %)
198
(100.00 %)
4,458,084
(33.00 %)
444,499
(1.79 %)
15,031,940
(47.42 %)
0
(0 %)
508,936
(1.29 %)
29,863
(0.83 %)
24,007
(0.54 %)
167 East African grey crowned-crane (primary hap 2020)
GCA_011004875.1
n/a n/a 13,276
(1.84 %)
25,393
(2.30 %)
n/a 42.38
(99.61 %)
0
(0 %)
144
(0.39 %)
105
(100.00 %)
548,862
(7.06 %)
187,966
(0.97 %)
7,004,597
(21.19 %)
0
(0 %)
102,622
(1.00 %)
36,626
(3.69 %)
36,347
(2.31 %)
168 Eastern black-eared wheatear (GR-GAL-2019-014 2023)
GCF_029582105.1
38,171
(5.79 %)
n/a 12,559
(1.96 %)
23,642
(2.48 %)
n/a 42.01
(99.99 %)
0
(0 %)
582
(0.01 %)
587
(100.00 %)
599,051
(9.46 %)
453,954
(3.77 %)
6,287,657
(20.75 %)
0
(0 %)
382,912
(2.31 %)
27,831
(2.52 %)
21,991
(1.27 %)
169 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1
n/a n/a 18,522
(1.26 %)
22,314
(1.28 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
0
(0 %)
316
(0.00 %)
99
(100.00 %)
3,699,683
(20.55 %)
935,350
(11.22 %)
13,112,318
(44.07 %)
1
(0.00 %)
n/a 99,224
(2.27 %)
68,695
(1.75 %)
170 eastern happy (primary hap 2024)
GCA_964374335.1
n/a n/a 15,554
(2.13 %)
55,328
(6.30 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
31
(100.00 %)
933,060
(24.43 %)
252,509
(4.84 %)
4,460,314
(32.70 %)
1
(0.00 %)
344,099
(4.07 %)
34,184
(2.09 %)
17,316
(0.94 %)
171 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5
n/a n/a 15,552
(2.29 %)
52,465
(6.26 %)
86,437
(9.40 %)
41.07
(99.87 %)
115
(0.00 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
1,309,350
(35.93 %)
217,916
(1.89 %)
4,547,434
(30.78 %)
2
(0.00 %)
212,425
(2.79 %)
33,005
(1.88 %)
15,205
(0.74 %)
172 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1
n/a n/a 13,413
(1.19 %)
18,038
(1.85 %)
n/a 44.58
(99.99 %)
553
(0.01 %)
553
(0.01 %)
771
(99.99 %)
1,003,504
(9.02 %)
621,617
(3.54 %)
8,327,948
(30.44 %)
3
(0.00 %)
583,206
(2.41 %)
117,734
(4.05 %)
30,498
(1.01 %)
173 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1
n/a n/a 13,882
(0.43 %)
35,323
(1.46 %)
n/a 46.78
(99.99 %)
0
(0 %)
1,745
(0.01 %)
1,002
(100.00 %)
1,769,293
(1.99 %)
2,023,109
(16.33 %)
16,148,710
(60.55 %)
22
(0.00 %)
5,852,023
(9.72 %)
618,204
(5.89 %)
74,394
(0.76 %)
174 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1
65,163
(4.76 %)
n/a 17,642
(2.07 %)
22,317
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
0
(0 %)
242
(1.41 %)
29
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,414
(1.02 %)
12,031,597
(26.52 %)
0
(0 %)
65,562
(0.33 %)
53,573
(4.84 %)
57,281
(4.47 %)
175 electric eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
n/a 15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
54,541
(8.42 %)
42.49
(98.20 %)
0
(0 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
1
(0.00 %)
629,918
(5.96 %)
44,501
(3.93 %)
34,390
(2.63 %)
176 electric eel (QZ-2024a 2024)
GCA_041902795.1
n/a n/a 16,358
(2.62 %)
62,068
(6.39 %)
n/a 41.74
(99.75 %)
0
(0 %)
49
(0.25 %)
460
(100.00 %)
701,679
(6.15 %)
756,011
(21.53 %)
2,660,355
(42.28 %)
0
(0 %)
1,091,071
(11.13 %)
50,381
(3.85 %)
36,095
(1.97 %)
177 elegant crested-tinamou (YG026_01 primary hap 2025)
GCA_047922985.1
n/a n/a 13,193
(1.91 %)
25,746
(2.48 %)
n/a 44.32
(100.00 %)
0
(0 %)
299
(0.00 %)
397
(100.00 %)
486,339
(4.61 %)
408,335
(8.96 %)
5,589,546
(25.37 %)
8
(0.00 %)
468,720
(3.29 %)
51,487
(9.83 %)
48,288
(3.36 %)
178 emu (hap1 2024)
GCF_036370855.1
54,479
(5.65 %)
n/a 13,972
(1.59 %)
25,695
(1.97 %)
n/a 43.79
(100.00 %)
0
(0 %)
129
(0.00 %)
271
(100.00 %)
713,839
(12.11 %)
418,774
(7.08 %)
5,668,105
(24.04 %)
2
(0.00 %)
825,273
(5.02 %)
51,137
(7.32 %)
43,488
(2.92 %)
179 emu (v2 ZJU1.0 2023)
GCA_016128335.2
n/a n/a 13,213
(1.74 %)
24,562
(2.10 %)
n/a 42.41
(99.99 %)
0
(0 %)
539
(0.01 %)
767
(100.00 %)
567,285
(7.79 %)
258,030
(2.59 %)
7,108,005
(19.16 %)
9
(0.00 %)
314,931
(1.79 %)
41,752
(6.24 %)
41,181
(3.35 %)
180 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1
43,156
(1.65 %)
n/a 12,749
(0.40 %)
19,519
(1.06 %)
n/a 42.76
(98.05 %)
0
(0 %)
3,716
(1.95 %)
1,962
(100.00 %)
9,420,365
(63.82 %)
935,037
(6.51 %)
20,660,566
(43.88 %)
0
(0 %)
2,903,280
(4.44 %)
41,682
(1.08 %)
16,895
(0.30 %)
181 ermine (2020)
GCF_009829155.1
74,332
(3.19 %)
n/a 18,855
(1.65 %)
20,667
(1.43 %)
44,584
(2.07 %)
41.56
(99.12 %)
0
(0 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,647,934
(41.44 %)
714,174
(1.30 %)
13,845,904
(33.42 %)
3
(0.01 %)
452,963
(1.26 %)
56,065
(2.25 %)
56,447
(2.07 %)
182 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1
57,138
(2.48 %)
n/a 19,265
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,487,951
(32.73 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,723
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,258
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
54,563
(1.83 %)
183 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap1.1 2024)
GCA_964273445.1
n/a n/a 13,292
(1.69 %)
25,387
(2.13 %)
n/a 41.80
(99.99 %)
0
(0 %)
696
(0.01 %)
2,451
(100.00 %)
489,065
(4.78 %)
331,025
(13.58 %)
6,196,233
(29.98 %)
13
(0.00 %)
727,368
(4.14 %)
37,567
(3.51 %)
32,763
(1.74 %)
184 Eurasian crane (hap1 2024)
GCA_964106855.1
n/a n/a 13,457
(1.70 %)
24,519
(2.05 %)
n/a 44.24
(99.99 %)
0
(0 %)
593
(0.01 %)
754
(100.00 %)
516,462
(4.57 %)
262,941
(8.12 %)
5,356,948
(26.79 %)
2
(0.00 %)
400,278
(3.09 %)
48,488
(7.36 %)
38,193
(2.16 %)
185 Eurasian curlew (hap1 2024)
GCA_964106895.1
n/a n/a 13,239
(1.66 %)
24,512
(2.02 %)
n/a 43.98
(99.99 %)
15
(0.00 %)
785
(0.01 %)
1,834
(100.00 %)
600,399
(6.45 %)
616,756
(7.75 %)
5,607,190
(28.35 %)
45
(0.00 %)
483,497
(3.48 %)
39,863
(3.53 %)
26,424
(1.08 %)
186 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1
n/a n/a 17,661
(3.01 %)
58,218
(6.54 %)
n/a 39.21
(99.98 %)
0
(0 %)
881
(0.02 %)
125
(100.00 %)
2,346,939
(44.27 %)
502,415
(11.23 %)
4,890,830
(40.45 %)
0
(0 %)
873,838
(6.63 %)
60,482
(4.22 %)
24,091
(1.23 %)
187 Eurasian nightjar (primary hap 2021)
GCA_907165065.1
n/a n/a 13,040
(1.86 %)
22,823
(2.21 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
153
(0.00 %)
121
(100.00 %)
595,803
(8.38 %)
248,128
(1.78 %)
6,744,611
(22.18 %)
2
(0.00 %)
193,177
(1.31 %)
24,805
(1.90 %)
20,997
(1.31 %)
188 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2
n/a n/a 21,309
(1.58 %)
21,026
(1.36 %)
33,465
(1.53 %)
40.08
(94.33 %)
0
(0 %)
1,177
(5.67 %)
639
(100.00 %)
4,677,412
(35.73 %)
704,218
(1.42 %)
14,992,063
(31.49 %)
5
(0.00 %)
419,661
(1.29 %)
48,159
(1.04 %)
45,470
(0.95 %)
189 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1
67,145
(2.95 %)
n/a 18,842
(1.54 %)
20,178
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
0
(0 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,259,294
(33.39 %)
713,721
(1.36 %)
13,626,048
(34.37 %)
1
(0.00 %)
695,796
(1.86 %)
57,073
(1.82 %)
47,446
(1.36 %)
190 Eurasian spoonbill (hap1.1 2025)
GCA_965183815.1
n/a n/a 13,660
(1.73 %)
24,623
(2.04 %)
n/a 43.62
(99.99 %)
0
(0 %)
703
(0.01 %)
669
(100.00 %)
956,977
(14.04 %)
311,174
(4.10 %)
5,758,263
(23.26 %)
9
(0.00 %)
320,487
(2.38 %)
48,161
(5.09 %)
37,366
(1.88 %)
191 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
n/a 19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
36,935
(2.27 %)
42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
5
(0.00 %)
518,667
(1.69 %)
19,000
(0.58 %)
16,851
(0.46 %)
192 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1
n/a n/a 18,028
(2.64 %)
64,206
(6.04 %)
n/a 38.73
(99.99 %)
0
(0 %)
588
(0.01 %)
106
(100.00 %)
2,649,943
(48.88 %)
666,129
(9.08 %)
5,751,610
(41.56 %)
5
(0.00 %)
1,113,756
(7.21 %)
58,471
(3.64 %)
19,602
(0.84 %)
193 European common frog (2021)
GCF_905171775.1
51,633
(1.57 %)
n/a 13,864
(0.46 %)
39,978
(1.88 %)
57,578
(1.85 %)
44.15
(99.36 %)
0
(0 %)
1,860
(0.64 %)
554
(100.00 %)
1,804,642
(3.42 %)
2,925,830
(9.39 %)
18,921,726
(55.43 %)
8
(0.00 %)
3,384,162
(6.05 %)
641,799
(7.66 %)
62,649
(0.67 %)
194 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1
54,631
(7.46 %)
n/a 17,072
(1.89 %)
34,801
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
0
(0 %)
1,009
(0.02 %)
380
(100.00 %)
761,522
(5.99 %)
913,306
(13.25 %)
5,767,879
(35.48 %)
3
(0.00 %)
1,603,437
(8.94 %)
120,990
(6.12 %)
81,342
(2.93 %)
195 European eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013347855.1
64,143
(9.57 %)
n/a 17,054
(2.22 %)
34,278
(5.56 %)
79,684
(7.37 %)
43.64
(99.61 %)
0
(0 %)
640
(0.40 %)
54
(100.00 %)
831,037
(5.48 %)
786,521
(8.15 %)
5,700,890
(27.40 %)
2
(0.00 %)
774,914
(5.14 %)
130,346
(8.19 %)
94,446
(4.12 %)
196 European flounder (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316205.1
48,969
(12.45 %)
n/a 14,751
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
108
(100.00 %)
1,160,781
(27.06 %)
251,983
(5.23 %)
3,353,086
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,298
(3.81 %)
37,129
(2.79 %)
27,431
(1.88 %)
197 European golden plover (primary hap 2021)
GCA_017639485.1
n/a n/a 12,984
(1.78 %)
22,854
(2.04 %)
n/a 42.70
(99.01 %)
0
(0 %)
268
(0.99 %)
107
(100.00 %)
558,587
(8.35 %)
180,400
(0.83 %)
7,132,381
(21.18 %)
0
(0 %)
102,461
(0.84 %)
40,661
(3.41 %)
37,600
(2.03 %)
198 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1
n/a n/a 20,236
(1.71 %)
19,368
(1.32 %)
n/a 40.05
(99.99 %)
0
(0 %)
2,020
(0.02 %)
894
(100.00 %)
4,892,811
(36.49 %)
1,223,387
(18.26 %)
11,907,631
(42.51 %)
10
(0.00 %)
4,679,739
(9.91 %)
17,423
(0.62 %)
15,264
(0.35 %)
199 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1
24,643
(2.02 %)
n/a 14,238
(1.16 %)
21,782
(2.17 %)
n/a 44.68
(99.77 %)
0
(0 %)
153
(0.23 %)
591
(100.00 %)
1,174,615
(6.99 %)
436,937
(2.95 %)
8,308,817
(39.80 %)
0
(0 %)
824,335
(3.45 %)
83,089
(2.82 %)
33,674
(0.93 %)
200 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1
69,556
(3.13 %)
n/a 18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
25
(100.00 %)
4,237,791
(30.90 %)
792,897
(2.69 %)
13,417,195
(36.59 %)
0
(0 %)
894,272
(2.55 %)
67,132
(2.54 %)
51,333
(1.62 %)
201 European mole (hap1 2024)
GCA_964194135.1
n/a n/a 18,085
(1.69 %)
19,509
(1.58 %)
n/a 42.08
(99.99 %)
0
(0 %)
1,056
(0.01 %)
464
(100.00 %)
2,569,380
(23.32 %)
565,465
(2.18 %)
10,506,666
(33.68 %)
42
(0.00 %)
704,393
(2.62 %)
46,367
(3.09 %)
42,313
(2.40 %)
202 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1
n/a n/a 18,336
(1.50 %)
20,807
(1.41 %)
n/a 42.38
(99.98 %)
0
(0 %)
2,250
(0.02 %)
477
(100.00 %)
4,096,160
(31.55 %)
707,337
(3.28 %)
13,715,382
(34.73 %)
10
(0.00 %)
626,861
(1.84 %)
61,481
(4.29 %)
56,462
(1.94 %)
203 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1
46,468
(10.51 %)
n/a 14,818
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
0
(0 %)
1,072
(0.03 %)
355
(100.00 %)
476,314
(3.63 %)
520,729
(13.27 %)
3,283,360
(33.55 %)
2
(0.00 %)
525,277
(6.36 %)
47,050
(4.45 %)
21,878
(1.29 %)
204 European pond turtle (hap1 2023 refseq)
GCF_028017835.1
27,890
(1.81 %)
n/a 14,802
(0.99 %)
19,772
(1.60 %)
n/a 44.74
(99.86 %)
0
(0 %)
148
(0.14 %)
106
(100.00 %)
1,526,737
(12.44 %)
460,562
(2.12 %)
11,130,580
(35.42 %)
5
(0.00 %)
495,938
(2.08 %)
136,002
(2.92 %)
30,671
(0.72 %)
205 European river lamprey (primary hap 2024)
GCA_964198595.1
n/a n/a 7,757
(0.73 %)
36,797
(4.29 %)
n/a 49.25
(99.97 %)
0
(0 %)
1,795
(0.03 %)
1,497
(100.00 %)
657,405
(7.80 %)
1,165,422
(20.23 %)
4,931,883
(50.78 %)
4
(0.00 %)
2,442,653
(12.79 %)
149,123
(44.61 %)
116,679
(5.22 %)
206 European robin (primary hap 2021)
GCA_903797595.2
n/a n/a 12,344
(1.85 %)
23,934
(2.37 %)
n/a 42.10
(99.97 %)
0
(0 %)
990
(0.03 %)
1,119
(100.00 %)
532,973
(5.96 %)
401,820
(3.43 %)
6,320,210
(21.42 %)
0
(0 %)
338,954
(2.13 %)
30,391
(2.60 %)
21,664
(1.21 %)
207 European shag (primary hap 2023)
GCA_949628215.1
n/a n/a 13,203
(1.74 %)
22,959
(2.04 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
3
(0.00 %)
222
(0.00 %)
356
(100.00 %)
436,838
(4.84 %)
471,070
(3.20 %)
6,601,537
(22.79 %)
1
(0.00 %)
334,549
(2.25 %)
37,247
(3.95 %)
29,099
(1.42 %)
208 European shrew (primary hap 2023)
GCF_027595985.1
44,643
(2.60 %)
n/a 17,479
(1.26 %)
21,293
(1.37 %)
n/a 43.24
(99.46 %)
0
(0 %)
1,427
(0.54 %)
65
(100.00 %)
2,474,584
(15.18 %)
1,107,884
(3.28 %)
13,638,467
(41.72 %)
10
(0.00 %)
822,159
(2.15 %)
79,785
(2.86 %)
77,901
(2.13 %)
209 European smelt (primary hap 2023 refseq)
GCF_963692335.1
46,762
(14.07 %)
n/a 15,639
(3.79 %)
50,238
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
0
(0 %)
2,462
(0.10 %)
1,007
(100.00 %)
1,648,428
(31.34 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,793
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
210 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1
47,025
(2.69 %)
n/a 19,592
(1.78 %)
21,173
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
197
(0.00 %)
160
(100.00 %)
5,048,186
(44.12 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,053
(34.97 %)
4
(0.00 %)
954,164
(3.20 %)
20,725
(0.63 %)
18,727
(0.52 %)
211 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1
n/a n/a 16,181
(2.44 %)
63,544
(7.17 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
0
(0 %)
1,501
(0.04 %)
387
(100.00 %)
2,109,362
(31.42 %)
1,300,159
(14.91 %)
3,634,744
(35.44 %)
6
(0.00 %)
1,178,448
(8.78 %)
35,552
(1.87 %)
19,823
(1.00 %)
212 European starfish (2020)
GCF_902459465.1
26,326
(11.67 %)
n/a 4,121
(0.84 %)
21,080
(8.48 %)
23,775
(14.13 %)
38.76
(99.96 %)
0
(0 %)
471
(0.04 %)
150
(100.00 %)
131,898
(1.43 %)
159,226
(7.04 %)
2,504,013
(37.40 %)
12
(0.00 %)
310,360
(6.00 %)
15,392
(1.50 %)
7,483
(0.79 %)
213 European suslik (primary hap 2024)
GCA_964194105.1
n/a n/a 20,075
(1.28 %)
20,274
(1.19 %)
n/a 39.90
(99.99 %)
4
(0.00 %)
1,436
(0.01 %)
502
(100.00 %)
4,357,247
(31.78 %)
882,536
(12.27 %)
14,882,486
(41.66 %)
9
(0.00 %)
1,833,125
(4.49 %)
39,275
(0.88 %)
27,165
(0.54 %)
214 European turtle dove (v1.2 2021)
GCA_901699155.2
n/a n/a 12,391
(1.76 %)
23,333
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
0
(0 %)
940
(0.33 %)
311
(100.00 %)
550,895
(7.50 %)
227,532
(1.16 %)
6,767,530
(21.05 %)
4
(0.00 %)
181,526
(1.65 %)
34,682
(2.57 %)
30,656
(1.68 %)
215 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1
54,114
(2.24 %)
n/a 19,959
(1.65 %)
19,953
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
0
(0 %)
1,129
(0.01 %)
497
(100.00 %)
4,863,650
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,732
(40.58 %)
17
(0.00 %)
2,516,593
(5.37 %)
23,961
(0.53 %)
17,318
(0.36 %)
216 fallow deer (maternal hap SK-2024 2025)
GCA_048126745.1
n/a n/a 20,072
(1.51 %)
22,668
(1.37 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
65
(0.00 %)
147
(0.00 %)
1,369
(100.00 %)
4,623,335
(34.75 %)
475,143
(7.51 %)
13,000,703
(41.56 %)
1
(0.00 %)
2,295,952
(5.37 %)
112,581
(2.00 %)
41,372
(0.95 %)
217 false killer whale (hap1 2024 refseq)
GCF_039906515.1
75,958
(3.31 %)
n/a 18,718
(1.50 %)
20,982
(1.32 %)
n/a 42.08
(99.90 %)
0
(0 %)
123
(0.10 %)
438
(100.00 %)
3,958,926
(35.76 %)
1,002,329
(11.61 %)
12,193,061
(41.85 %)
3
(0.00 %)
1,441,777
(4.23 %)
79,158
(3.74 %)
41,701
(1.03 %)
218 fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025)
GCA_048593235.1
n/a n/a 15,762
(0.77 %)
16,035
(0.89 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
1,908
(0.01 %)
1,908
(0.01 %)
1,915
(99.99 %)
5,302,372
(24.47 %)
1,450,220
(3.79 %)
20,870,654
(44.26 %)
5
(0.00 %)
1,034,421
(2.56 %)
24,585
(0.65 %)
24,216
(0.53 %)
219 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap1.1 2024)
GCA_964270895.1
n/a n/a 14,292
(1.37 %)
20,325
(2.33 %)
n/a 43.79
(99.99 %)
4
(0.00 %)
872
(0.01 %)
353
(100.00 %)
840,209
(4.04 %)
484,479
(4.00 %)
7,010,158
(37.94 %)
7
(0.00 %)
632,285
(3.51 %)
87,924
(2.61 %)
19,744
(0.76 %)
220 fin whale (hap1.1 2025)
GCA_965194825.1
n/a n/a 19,491
(1.21 %)
22,538
(1.06 %)
n/a 42.19
(99.99 %)
0
(0 %)
1,516
(0.01 %)
2,612
(100.00 %)
4,598,236
(35.34 %)
1,716,315
(24.14 %)
12,260,919
(52.40 %)
7
(0.00 %)
3,173,278
(8.14 %)
82,683
(1.47 %)
44,824
(0.87 %)
221 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1
38,238
(0.68 %)
n/a 15,452
(0.21 %)
47,500
(0.88 %)
n/a 38.98
(98.02 %)
0
(0 %)
7,009
(1.99 %)
2,467
(100.00 %)
4,258,941
(3.44 %)
7,150,261
(12.27 %)
9,476
(98.01 %)
3
(0.00 %)
n/a n/a n/a
222 flatback sea turtle (hap1 2025)
GCA_965152275.1
n/a 26,709
(2.00 %)
15,046
(1.09 %)
18,089
(1.57 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
2
(0.00 %)
171
(0.00 %)
43
(100.00 %)
4,516,775
(43.62 %)
319,645
(1.38 %)
10,785,223
(32.95 %)
3
(0.00 %)
442,908
(1.94 %)
52,168
(1.81 %)
27,004
(0.88 %)
223 flavescent peacock cichlid (primary hap 2025)
GCA_965226115.1
n/a n/a 15,528
(2.10 %)
55,124
(6.16 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
0
(0 %)
31
(0.00 %)
23
(100.00 %)
946,588
(24.66 %)
252,409
(5.14 %)
4,403,110
(33.26 %)
2
(0.00 %)
319,693
(3.93 %)
35,478
(2.07 %)
17,725
(0.97 %)
224 Fleay's barred frog (hap1 2024)
GCA_038048845.1
n/a n/a 14,321
(0.67 %)
22,672
(1.51 %)
n/a 40.32
(99.87 %)
0
(0 %)
1,421
(0.13 %)
2,806
(100.00 %)
1,320,578
(5.87 %)
1,506,550
(13.49 %)
13,293,397
(46.37 %)
2
(0.00 %)
3,318,438
(8.11 %)
63,677
(0.85 %)
12,950
(0.19 %)
225 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
n/a 15,434
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
0
(0 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
0
(0 %)
227,442
(2.84 %)
24,130
(1.26 %)
11,082
(0.48 %)
226 Florida worm lizard (hap2 2023 refseq)
GCF_030035675.1
65,314
(3.47 %)
n/a 14,331
(0.90 %)
17,853
(1.51 %)
n/a 42.86
(99.72 %)
0
(0 %)
242
(0.28 %)
76
(100.00 %)
1,426,827
(7.17 %)
616,687
(2.63 %)
10,819,019
(45.31 %)
1
(0.00 %)
531,660
(2.36 %)
47,453
(1.03 %)
18,399
(0.42 %)
227 freshwater garfish (primary hap 2020)
GCA_014839995.1
n/a n/a 14,625
(2.57 %)
52,879
(6.72 %)
n/a 41.41
(98.98 %)
0
(0 %)
1,373
(1.02 %)
410
(100.00 %)
492,828
(4.29 %)
318,631
(5.94 %)
3,977,536
(27.41 %)
0
(0 %)
521,102
(4.91 %)
32,390
(2.33 %)
21,612
(1.34 %)
228 frog A.baeobatrachus (hap1 2025)
GCA_048569485.1
n/a n/a 13,963
(0.31 %)
43,460
(1.20 %)
n/a 46.27
(99.99 %)
0
(0 %)
3,772
(0.01 %)
3,642
(100.00 %)
2,033,935
(2.50 %)
4,040,311
(20.45 %)
20,439,907
(69.96 %)
60
(0.00 %)
7,481,063
(9.87 %)
1,159,163
(12.74 %)
63,455
(0.51 %)
229 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2
n/a n/a 14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,331,879
(1.68 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,806
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,995
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
230 garden warbler (primary hap 2020)
GCA_014839755.1
n/a n/a 12,520
(1.95 %)
23,459
(2.46 %)
n/a 42.08
(99.82 %)
0
(0 %)
134
(0.18 %)
176
(100.00 %)
491,810
(6.09 %)
376,746
(2.55 %)
6,461,292
(20.23 %)
0
(0 %)
225,297
(1.39 %)
27,799
(2.40 %)
23,088
(1.32 %)
231 Geoffroy's bat (hap1.1 2025)
GCA_965115925.1
n/a n/a 19,320
(1.74 %)
21,940
(1.65 %)
n/a 42.55
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,540
(0.01 %)
404
(100.00 %)
3,707,500
(37.60 %)
733,107
(7.78 %)
10,515,474
(39.35 %)
11
(0.00 %)
903,956
(3.14 %)
60,200
(2.41 %)
51,657
(1.64 %)
232 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1
n/a n/a 14,151
(0.94 %)
23,338
(1.95 %)
n/a 45.15
(99.95 %)
0
(0 %)
118
(0.05 %)
160
(100.00 %)
1,232,693
(12.81 %)
332,737
(2.19 %)
11,907,298
(32.91 %)
3
(0.00 %)
284,469
(1.22 %)
40,660
(1.87 %)
25,990
(0.77 %)
233 giant grouper (andai-2023 2024)
GCA_041903045.1
n/a n/a 15,652
(1.85 %)
56,048
(5.08 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
0
(0 %)
7
(0.00 %)
176
(100.00 %)
640,534
(2.88 %)
384,479
(4.59 %)
6,438,939
(33.27 %)
0
(0 %)
443,481
(3.30 %)
28,221
(1.10 %)
10,419
(0.37 %)
234 giant manta (hap1 2023 refseq)
GCF_030028105.1
53,223
(2.04 %)
n/a 12,432
(0.38 %)
25,243
(1.14 %)
n/a 43.26
(99.23 %)
0
(0 %)
1,810
(0.77 %)
4,715
(100.00 %)
863,834
(1.59 %)
947,015
(13.41 %)
20,234,736
(54.42 %)
17
(0.00 %)
4,636,741
(7.12 %)
110,678
(1.74 %)
30,504
(0.36 %)
235 giant South American river turtle (hap2 2024)
GCA_045364815.1
n/a n/a 14,571
(0.87 %)
18,363
(1.38 %)
n/a 44.25
(100.00 %)
0
(0 %)
224
(0.00 %)
725
(100.00 %)
1,243,321
(10.35 %)
434,716
(4.30 %)
12,200,714
(33.86 %)
2
(0.00 %)
769,881
(2.27 %)
51,411
(1.88 %)
16,569
(0.37 %)
236 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2
n/a n/a 15,752
(2.45 %)
56,395
(6.58 %)
n/a 41.94
(99.96 %)
0
(0 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
1,474,134
(29.50 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,691
(25.69 %)
0
(0 %)
355,475
(3.53 %)
47,327
(2.41 %)
29,914
(1.44 %)
237 golden eagle (v1.4 2021)
GCF_900496995.4
60,920
(5.98 %)
n/a 13,334
(1.84 %)
23,261
(2.12 %)
n/a 42.16
(99.58 %)
0
(0 %)
228
(0.42 %)
144
(100.00 %)
544,341
(5.93 %)
186,461
(0.80 %)
7,090,610
(20.01 %)
1
(0.00 %)
68,348
(0.66 %)
38,495
(3.10 %)
35,039
(1.94 %)
238 golden mantella (hap1 2025)
GCA_048565345.1
n/a n/a 13,675
(0.56 %)
30,568
(1.85 %)
n/a 41.00
(99.98 %)
0
(0 %)
4,138
(0.02 %)
3,088
(100.00 %)
1,225,842
(2.74 %)
2,478,484
(16.71 %)
14,761,187
(53.21 %)
51
(0.00 %)
5,379,974
(9.98 %)
164,021
(2.52 %)
33,788
(0.51 %)
239 golden parakeet (hap1 2024)
GCA_045345405.1
n/a n/a 13,156
(1.63 %)
23,633
(1.97 %)
n/a 43.34
(100.00 %)
0
(0 %)
173
(0.00 %)
216
(100.00 %)
515,745
(6.36 %)
283,125
(12.39 %)
4,289,389
(30.87 %)
1
(0.00 %)
868,953
(4.79 %)
27,612
(1.85 %)
20,022
(1.11 %)
240 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1
36,997
(1.96 %)
n/a 20,006
(1.91 %)
19,132
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
0
(0 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,785,907
(32.61 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,958,061
(32.33 %)
0
(0 %)
684,879
(1.84 %)
20,760
(0.59 %)
18,457
(0.52 %)
241 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025)
GCA_048772815.1
n/a n/a 20,967
(0.89 %)
24,137
(0.94 %)
n/a 39.52
(99.99 %)
0
(0 %)
1,448
(0.01 %)
8,087
(100.00 %)
5,547,018
(29.30 %)
1,312,047
(10.07 %)
15,174,898
(52.73 %)
10
(0.00 %)
5,076,603
(7.43 %)
40,182
(0.59 %)
29,493
(0.39 %)
242 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2
57,442
(3.17 %)
n/a 14,852
(1.00 %)
18,125
(1.49 %)
31,841
(1.80 %)
44.14
(98.71 %)
0
(0 %)
562
(1.29 %)
383
(100.00 %)
1,630,271
(13.86 %)
387,796
(2.00 %)
11,572,827
(33.36 %)
0
(0 %)
474,978
(1.73 %)
71,687
(2.29 %)
21,793
(0.54 %)
243 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1
n/a n/a 14,094
(1.03 %)
17,875
(1.65 %)
n/a 41.62
(99.95 %)
0
(0 %)
28
(0.05 %)
30
(100.00 %)
1,100,228
(6.21 %)
423,695
(1.33 %)
11,521,828
(32.55 %)
2
(0.00 %)
258,014
(1.05 %)
62,978
(2.00 %)
24,755
(0.81 %)
244 gray seal (hap1.1 2025)
GCA_964656455.1
n/a n/a 19,291
(1.73 %)
20,301
(1.41 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
0
(0 %)
1,130
(0.01 %)
171
(100.00 %)
4,245,582
(34.81 %)
600,624
(2.16 %)
13,240,803
(34.28 %)
4
(0.00 %)
615,950
(1.85 %)
56,932
(1.78 %)
54,064
(1.60 %)
245 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1
73,383
(3.04 %)
n/a 16,637
(0.72 %)
16,036
(0.85 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
0
(0 %)
2,255
(0.89 %)
13
(100.00 %)
5,562,359
(25.40 %)
1,096,620
(2.60 %)
22,322,748
(43.37 %)
13
(0.00 %)
793,648
(1.81 %)
28,894
(0.57 %)
22,987
(0.42 %)
246 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1
58,884
(2.46 %)
n/a 20,752
(1.49 %)
21,107
(1.31 %)
32,732
(1.45 %)
40.06
(99.98 %)
0
(0 %)
1,824
(0.02 %)
752
(100.00 %)
4,605,578
(34.50 %)
728,192
(1.65 %)
15,467,412
(33.91 %)
2
(0.00 %)
504,786
(1.54 %)
51,878
(1.11 %)
49,715
(1.03 %)
247 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2
n/a n/a 19,474
(1.55 %)
20,394
(1.40 %)
72,806
(4.12 %)
41.49
(100.00 %)
0
(0 %)
166
(0.00 %)
82
(100.00 %)
4,550,524
(31.76 %)
1,063,944
(3.96 %)
13,588,117
(34.74 %)
23
(0.00 %)
1,048,956
(2.49 %)
51,996
(2.15 %)
47,971
(1.53 %)
248 great cormorant (primary hap 2024 refseq)
GCF_963921805.1
46,253
(5.46 %)
n/a 13,432
(1.76 %)
23,419
(2.08 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
0
(0 %)
493
(0.01 %)
350
(100.00 %)
556,733
(10.18 %)
303,277
(3.45 %)
6,599,550
(22.65 %)
1
(0.00 %)
355,894
(2.29 %)
38,340
(5.45 %)
31,912
(1.57 %)
249 great fruit-eating bat (hap1 2024)
GCA_038363145.1
n/a n/a 18,022
(1.56 %)
19,824
(1.51 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
419
(100.00 %)
2,827,417
(26.82 %)
371,479
(4.97 %)
11,603,093
(34.64 %)
1
(0.00 %)
522,672
(1.87 %)
71,574
(2.28 %)
54,020
(1.50 %)
250 great fruit-eating bat (v2 hap1 2024)
GCA_038363095.2
n/a n/a 18,051
(1.56 %)
19,955
(1.51 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
0
(0 %)
45
(0.00 %)
487
(100.00 %)
2,841,143
(26.67 %)
379,430
(5.52 %)
11,651,542
(35.11 %)
0
(0 %)
569,322
(2.01 %)
72,337
(2.76 %)
54,165
(1.48 %)
251 great potoo (primary hap 2020 refseq)
GCF_013368605.1
33,115
(3.89 %)
n/a 13,120
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
0
(0 %)
243
(0.49 %)
190
(100.00 %)
610,506
(15.46 %)
210,373
(1.13 %)
6,501,918
(23.95 %)
0
(0 %)
244,223
(1.92 %)
35,788
(2.78 %)
29,280
(1.65 %)
252 great scallop (2019)
GCF_902652985.1
46,811
(9.29 %)
n/a 4,090
(0.36 %)
32,743
(7.09 %)
n/a 36.65
(99.92 %)
0
(0 %)
1,827
(0.08 %)
3,983
(100.00 %)
281,310
(1.71 %)
706,978
(26.84 %)
5,249,556
(32.64 %)
0
(0 %)
2,449,994
(15.30 %)
13,101
(0.87 %)
7,209
(0.42 %)
253 great white shark (primary hap 2021)
GCF_017639515.1
49,865
(1.46 %)
n/a 13,010
(0.37 %)
19,263
(0.92 %)
46,152
(1.30 %)
45.21
(99.55 %)
0
(0 %)
2,645
(0.45 %)
719
(100.00 %)
1,046,023
(4.00 %)
1,584,100
(21.25 %)
23,278,563
(52.42 %)
11
(0.00 %)
8,687,289
(11.05 %)
77,021
(1.94 %)
14,712
(0.15 %)
254 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1
n/a n/a 16,553
(3.15 %)
51,766
(7.37 %)
n/a 44.75
(99.95 %)
61
(0.00 %)
1,752
(0.05 %)
1,085
(100.00 %)
1,674,762
(26.07 %)
900,455
(18.62 %)
2,849,256
(39.22 %)
0
(0 %)
824,383
(7.94 %)
26,022
(2.30 %)
13,322
(0.79 %)
255 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1
n/a 41,563
(2.11 %)
18,531
(1.97 %)
20,309
(1.67 %)
n/a 40.52
(99.19 %)
0
(0 %)
292
(0.81 %)
50
(100.00 %)
3,284,473
(35.00 %)
559,653
(1.29 %)
12,043,562
(29.15 %)
0
(0 %)
155,142
(0.71 %)
32,047
(1.05 %)
30,235
(0.96 %)
256 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2
53,353
(3.13 %)
n/a 18,641
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,218,744
(34.52 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,641
(0.98 %)
257 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
n/a 19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
0
(0 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
0
(0 %)
499,733
(1.88 %)
61,023
(2.69 %)
54,015
(1.81 %)
258 greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024)
GCA_043880545.1
n/a n/a 18,582
(1.55 %)
20,954
(1.35 %)
n/a 42.46
(100.00 %)
0
(0 %)
152
(0.00 %)
106
(100.00 %)
4,158,629
(40.30 %)
696,150
(4.67 %)
0
(0.00 %)
1
(0.00 %)
1,418,508
(3.67 %)
257,446
(3.38 %)
44,752
(1.05 %)
259 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
n/a 13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
37,563
(15.76 %)
43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
0
(0 %)
112,918
(3.25 %)
46,327
(10.97 %)
32,897
(5.93 %)
260 greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850765.1
55,259
(2.53 %)
n/a 18,321
(1.40 %)
21,048
(1.35 %)
n/a 41.71
(98.73 %)
0
(0 %)
468
(1.27 %)
256
(100.00 %)
4,247,145
(29.53 %)
1,031,385
(2.50 %)
12,465,157
(43.30 %)
3
(0.00 %)
1,113,639
(2.95 %)
101,620
(2.01 %)
44,590
(1.04 %)
261 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1
n/a n/a 15,028
(2.35 %)
50,436
(6.30 %)
n/a 41.10
(99.97 %)
0
(0 %)
1,188
(0.03 %)
1,568
(100.00 %)
2,688,222
(39.74 %)
549,362
(7.60 %)
3,564,661
(40.05 %)
4
(0.00 %)
605,421
(5.26 %)
37,043
(1.94 %)
11,494
(0.60 %)
262 greater scaup (hap1 2025)
GCA_965140915.1
n/a n/a 13,410
(1.86 %)
25,527
(2.30 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
21
(0.00 %)
693
(0.01 %)
1,290
(100.00 %)
944,720
(17.84 %)
522,593
(6.27 %)
6,100,900
(26.44 %)
32
(0.00 %)
587,893
(3.78 %)
33,827
(2.73 %)
28,765
(1.49 %)
263 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2
84,366
(4.63 %)
n/a 14,725
(1.06 %)
17,444
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
0
(0 %)
298
(0.56 %)
93
(100.00 %)
1,701,640
(14.83 %)
304,306
(1.25 %)
11,135,147
(31.96 %)
0
(0 %)
429,994
(1.68 %)
49,025
(1.44 %)
26,933
(0.68 %)
264 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1
n/a n/a 14,752
(2.74 %)
58,725
(8.49 %)
n/a 43.13
(99.98 %)
3
(0.00 %)
553
(0.02 %)
322
(100.00 %)
1,860,845
(35.64 %)
378,045
(9.39 %)
3,208,482
(30.12 %)
0
(0 %)
450,213
(5.20 %)
66,857
(4.99 %)
44,052
(2.67 %)
265 grey whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_028021215.1
49,276
(1.90 %)
n/a 19,295
(1.38 %)
21,790
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
0
(0 %)
279
(0.00 %)
703
(100.00 %)
4,116,894
(35.85 %)
966,064
(16.74 %)
12,154,101
(46.39 %)
3
(0.00 %)
2,154,240
(5.67 %)
77,011
(1.59 %)
42,884
(0.96 %)
266 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1
n/a n/a 17,136
(1.90 %)
63,611
(4.50 %)
n/a 39.74
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,046
(0.01 %)
233
(100.00 %)
5,662,029
(68.75 %)
825,757
(11.99 %)
6,236,024
(55.15 %)
4
(0.00 %)
1,606,132
(7.98 %)
99,559
(5.68 %)
16,304
(0.51 %)
267 gyrfalcon (primary hap 2020)
GCF_015220075.1
47,961
(5.90 %)
n/a 13,016
(1.82 %)
21,266
(2.02 %)
n/a 42.20
(99.55 %)
0
(0 %)
635
(0.45 %)
133
(100.00 %)
484,104
(5.60 %)
186,430
(0.85 %)
7,162,723
(18.83 %)
0
(0 %)
59,799
(0.59 %)
24,760
(2.03 %)
20,013
(0.97 %)
268 Hanaki's dwarf bat (2024)
GCA_964339955.1
n/a n/a 17,856
(1.76 %)
20,604
(1.75 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
306
(0.00 %)
141
(100.00 %)
3,697,250
(33.21 %)
842,827
(8.27 %)
10,094,062
(38.40 %)
2
(0.00 %)
752,759
(2.71 %)
61,715
(2.96 %)
59,765
(1.96 %)
269 harbor porpoise (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924675.1
33,578
(1.54 %)
n/a 18,528
(1.58 %)
20,582
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
966
(0.01 %)
966
(0.01 %)
1,405
(99.99 %)
3,760,713
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,181
(39.04 %)
4
(0.00 %)
1,410,168
(3.71 %)
71,530
(2.69 %)
40,160
(1.06 %)
270 Harpy eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_026419915.1
51,641
(5.08 %)
n/a 13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
0
(0 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
1
(0.00 %)
480,025
(2.70 %)
60,606
(5.66 %)
30,636
(1.52 %)
271 Hawaiian crow (primary hap 2021 refseq)
GCF_020740725.1
51,593
(6.18 %)
n/a 12,739
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
0
(0 %)
294
(0.16 %)
188
(100.00 %)
409,129
(0.00 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,375
(23.59 %)
3
(0.00 %)
336,844
(2.41 %)
46,118
(3.85 %)
24,228
(1.26 %)
272 hawksbill sea turtle (hap1 2025)
GCA_965152235.1
n/a 25,702
(1.84 %)
14,710
(1.02 %)
17,589
(1.52 %)
n/a 44.04
(99.88 %)
6
(0.00 %)
131
(0.12 %)
63
(100.00 %)
1,289,035
(12.18 %)
310,918
(1.75 %)
10,994,433
(33.64 %)
0
(0 %)
544,623
(2.10 %)
46,532
(1.40 %)
25,322
(0.62 %)
273 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1
n/a n/a 18,620
(1.42 %)
22,403
(1.38 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
1
(0.00 %)
1,805
(0.01 %)
214
(100.00 %)
6,063,911
(41.66 %)
1,593,657
(4.46 %)
12,229,281
(43.98 %)
8
(0.00 %)
1,313,148
(3.16 %)
71,058
(1.88 %)
45,398
(0.93 %)
274 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v2 hap1 2025)
GCA_040954625.2
n/a n/a 4,887
(1.28 %)
35,452
(15.87 %)
n/a 39.74
(99.99 %)
0
(0 %)
221
(0.01 %)
100
(100.00 %)
87,343
(1.66 %)
120,271
(13.20 %)
1,311,438
(29.26 %)
5
(0.00 %)
343,022
(9.12 %)
21,344
(4.17 %)
15,842
(2.58 %)
275 herring gull (hap1 2024)
GCA_964417175.1
n/a n/a 13,382
(1.61 %)
25,785
(2.15 %)
n/a 44.80
(99.99 %)
3
(0.00 %)
559
(0.01 %)
404
(100.00 %)
535,852
(5.32 %)
233,906
(10.46 %)
5,597,180
(29.50 %)
2
(0.00 %)
619,465
(3.61 %)
46,309
(7.00 %)
37,622
(1.62 %)
276 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1
64,153
(2.73 %)
n/a 20,331
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
0
(0 %)
226
(0.00 %)
357
(100.00 %)
3,783,440
(35.17 %)
567,797
(3.38 %)
13,462,531
(35.48 %)
2
(0.00 %)
396,368
(1.55 %)
48,365
(1.91 %)
44,048
(1.34 %)
277 hoatzin (hap1 2023)
GCA_030867145.1
n/a n/a 13,089
(1.50 %)
29,621
(2.22 %)
n/a 45.56
(100.00 %)
268
(0.00 %)
268
(0.00 %)
683
(100.00 %)
610,333
(22.07 %)
252,997
(12.56 %)
5,154,598
(31.67 %)
3
(0.00 %)
1,034,232
(5.77 %)
58,754
(5.54 %)
47,065
(2.35 %)
278 honeycomb rockfish (primary hap 2020)
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
n/a 15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
63,546
(8.88 %)
40.77
(99.83 %)
0
(0 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
1
(0.00 %)
627,017
(5.28 %)
37,878
(1.84 %)
15,343
(0.71 %)
279 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1
n/a n/a 12,766
(0.30 %)
21,591
(0.87 %)
n/a 44.88
(99.43 %)
0
(0 %)
2,790
(0.57 %)
1,496
(100.00 %)
1,008,880
(5.19 %)
1,596,129
(22.32 %)
22,180,341
(62.98 %)
2
(0.00 %)
9,762,254
(11.27 %)
82,276
(1.85 %)
14,696
(0.13 %)
280 horn shark (sHetFra1hap1 2024)
GCF_036365525.1
60,844
(1.44 %)
n/a 15,004
(0.28 %)
22,510
(0.76 %)
n/a 45.05
(99.53 %)
0
(0 %)
2,781
(0.47 %)
2,306
(100.00 %)
1,344,541
(5.76 %)
2,364,824
(28.34 %)
5,087
(99.53 %)
5
(0.00 %)
14,350,134
(14.12 %)
89,340
(2.10 %)
82,092
(1.20 %)
281 horse (paternal hap 2024)
GCA_036426135.1
n/a n/a 19,073
(1.67 %)
20,636
(1.38 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
114
(0.00 %)
602
(100.00 %)
3,521,953
(35.39 %)
461,571
(5.26 %)
14,833,688
(32.77 %)
2
(0.00 %)
728,239
(2.01 %)
43,527
(2.54 %)
41,129
(2.38 %)
282 hourglass treefrog (paternal 2023 refseq)
GCF_027789765.1
50,542
(2.91 %)
n/a 14,058
(0.89 %)
30,599
(2.64 %)
n/a 43.97
(99.70 %)
0
(0 %)
804
(0.30 %)
2,200
(100.00 %)
906,816
(2.43 %)
1,710,859
(17.48 %)
10,069,798
(51.41 %)
3
(0.00 %)
1,978,464
(5.31 %)
235,277
(5.56 %)
28,414
(0.63 %)
283 house finch (primary hap 2022 refseq)
GCF_027477595.1
43,228
(5.71 %)
n/a 12,702
(1.83 %)
24,568
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
0
(0 %)
296
(0.98 %)
184
(100.00 %)
440,384
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,138
(23.47 %)
1
(0.00 %)
573,830
(3.39 %)
30,897
(2.53 %)
22,852
(1.24 %)
284 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1
n/a n/a 22,351
(1.96 %)
19,629
(1.26 %)
n/a 41.38
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
179
(100.00 %)
4,774,018
(45.31 %)
1,620,102
(10.50 %)
13,181,250
(40.47 %)
0
(0 %)
1,650,132
(4.47 %)
23,955
(0.54 %)
16,164
(0.39 %)
285 house sparrow (hap1 2024 refseq)
GCF_036417665.1
75,216
(7.36 %)
n/a 12,832
(1.61 %)
26,124
(2.26 %)
n/a 43.99
(100.00 %)
0
(0 %)
204
(0.00 %)
335
(100.00 %)
647,402
(12.37 %)
646,615
(14.14 %)
5,906,561
(30.36 %)
2
(0.00 %)
873,292
(5.23 %)
36,193
(2.91 %)
24,212
(1.05 %)
286 Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022)
GCA_027474245.1
n/a n/a 13,233
(1.67 %)
23,010
(1.93 %)
n/a 43.91
(99.92 %)
0
(0 %)
253
(0.08 %)
136
(100.00 %)
610,144
(11.51 %)
214,393
(5.75 %)
6,069,916
(25.74 %)
1
(0.00 %)
314,812
(2.19 %)
33,172
(3.38 %)
26,788
(1.37 %)
287 humpback whale (KW2013002 2024)
GCA_041834305.1
n/a n/a 19,463
(1.32 %)
22,424
(1.19 %)
n/a 42.05
(100.00 %)
0
(0 %)
88
(0.00 %)
1,355
(100.00 %)
4,164,459
(34.02 %)
1,281,751
(18.33 %)
12,412,281
(48.28 %)
0
(0 %)
2,009,593
(5.80 %)
82,412
(1.67 %)
44,791
(0.96 %)
288 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1
63,234
(2.88 %)
n/a 19,601
(1.57 %)
21,699
(1.34 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
0
(0 %)
302
(0.06 %)
1,250
(100.00 %)
5,524,454
(47.57 %)
459,928
(1.40 %)
13,208,799
(41.21 %)
0
(0 %)
1,222,662
(3.37 %)
41,359
(1.10 %)
37,367
(0.98 %)
289 Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024)
GCA_036172795.1
n/a n/a 14,141
(0.97 %)
22,232
(2.16 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
262
(0.00 %)
99
(100.00 %)
944,742
(4.86 %)
1,927,659
(22.26 %)
8,988,510
(49.29 %)
1
(0.00 %)
3,465,509
(10.62 %)
77,721
(1.73 %)
13,802
(0.30 %)
290 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022 genbank)
GCA_026652325.1
n/a 139,896
(0.54 %)
15,136
(0.10 %)
n/a n/a 45.95
(100.00 %)
29
(0.00 %)
922
(0.00 %)
296
(100.00 %)
4,478,794
(1.33 %)
6,452,537
(8.86 %)
1,189
(100.00 %)
26
(0.00 %)
n/a 1,581,360
(4.00 %)
144,588
(0.32 %)
291 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2
n/a n/a 15,339
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
57,867
(10.10 %)
42.38
(98.08 %)
0
(0 %)
1,523
(1.92 %)
157
(100.00 %)
346,399
(3.02 %)
163,524
(3.00 %)
2,755,274
(25.07 %)
0
(0 %)
235,504
(4.25 %)
17,931
(1.47 %)
9,749
(0.74 %)
292 Indian roofed turtle (hap2 2024)
GCA_045781085.1
n/a n/a 14,682
(1.03 %)
18,600
(1.58 %)
n/a 44.26
(100.00 %)
0
(0 %)
260
(0.00 %)
449
(100.00 %)
1,290,818
(11.46 %)
301,464
(1.79 %)
10,704,595
(32.71 %)
0
(0 %)
436,958
(2.04 %)
74,354
(2.05 %)
27,125
(0.71 %)
293 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1
41,583
(6.91 %)
n/a 18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
74,968
(7.01 %)
43.02
(99.97 %)
0
(0 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
0
(0 %)
319,481
(2.18 %)
78,561
(3.69 %)
58,460
(2.33 %)
294 Inner Mongolia cashmere goat (2024)
GCA_041735815.1
n/a n/a 19,123
(1.40 %)
21,508
(1.26 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 31
(100.00 %)
3,982,368
(23.76 %)
650,129
(7.44 %)
12,858,872
(44.33 %)
0
(0 %)
2,309,715
(5.29 %)
99,144
(2.87 %)
39,833
(0.88 %)
295 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024)
GCA_043728065.1
n/a n/a 18,239
(1.76 %)
20,378
(1.53 %)
n/a 41.40
(100.00 %)
1
(0.00 %)
37
(0.00 %)
2,195
(100.00 %)
3,438,644
(42.82 %)
584,006
(9.54 %)
12,207,998
(35.49 %)
0
(0 %)
1,679,263
(3.77 %)
34,491
(1.02 %)
29,817
(0.90 %)
296 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1
n/a n/a 19,064
(1.67 %)
20,800
(1.49 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
0
(0 %)
119
(0.00 %)
69
(100.00 %)
3,393,548
(30.92 %)
723,545
(6.58 %)
12,073,117
(35.40 %)
0
(0 %)
1,106,960
(3.54 %)
43,736
(1.20 %)
30,847
(0.87 %)
297 Italian wall lizard (rPodSic1.hap1.1 2024)
GCA_964188175.1
n/a n/a 14,241
(1.31 %)
20,399
(2.26 %)
n/a 44.32
(99.99 %)
2
(0.00 %)
762
(0.01 %)
296
(100.00 %)
832,389
(5.27 %)
530,449
(8.28 %)
6,937,083
(40.38 %)
2
(0.00 %)
908,580
(4.73 %)
106,667
(3.79 %)
20,531
(0.75 %)
298 jackdaw (hap1.1 2025)
GCA_965178545.1
n/a n/a 13,233
(1.72 %)
30,094
(2.51 %)
n/a 44.16
(99.99 %)
4
(0.00 %)
648
(0.01 %)
733
(100.00 %)
532,540
(3.59 %)
553,881
(6.97 %)
5,338,663
(26.88 %)
10
(0.00 %)
488,826
(3.54 %)
54,918
(4.96 %)
25,802
(1.20 %)
299 jaguar (hap1 2025)
GCA_046562885.1
n/a n/a 17,882
(1.68 %)
19,103
(1.41 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
0
(0 %)
140
(0.00 %)
115
(100.00 %)
4,622,385
(41.25 %)
893,297
(1.89 %)
12,851,116
(33.53 %)
1
(0.00 %)
402,314
(1.33 %)
61,319
(2.55 %)
55,085
(2.08 %)
300 Japanese sawshark (hap1 2024 refseq)
GCF_044704955.1
54,879
(1.24 %)
n/a 12,978
(0.27 %)
30,195
(0.79 %)
n/a 47.02
(99.98 %)
0
(0 %)
5,985
(0.02 %)
4,318
(100.00 %)
11,412,024
(71.47 %)
2,399,500
(18.16 %)
20,051,385
(71.80 %)
38
(0.00 %)
11,403,077
(11.92 %)
503,637
(6.56 %)
48,183
(0.32 %)
301 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1
42,877
(8.61 %)
n/a 15,188
(2.40 %)
41,262
(7.86 %)
58,418
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
0
(0 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
667,122
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
0
(0 %)
422,332
(3.88 %)
121,464
(9.36 %)
77,061
(4.51 %)
302 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1
n/a n/a 14,906
(2.33 %)
72,029
(6.72 %)
n/a 43.92
(99.98 %)
0
(0 %)
887
(0.02 %)
191
(100.00 %)
1,609,654
(22.82 %)
897,264
(13.58 %)
4,548,467
(39.80 %)
11
(0.00 %)
875,374
(6.46 %)
129,147
(11.75 %)
77,287
(4.33 %)
303 kagu (bRhyJub1 primary hap 2023)
GCA_027574665.1
n/a n/a 13,042
(1.63 %)
24,142
(2.01 %)
n/a 45.07
(99.96 %)
0
(0 %)
300
(0.04 %)
148
(100.00 %)
563,851
(12.90 %)
270,861
(12.36 %)
6,191,106
(28.24 %)
2
(0.00 %)
905,468
(5.08 %)
54,426
(4.92 %)
40,156
(2.73 %)
304 kakapo (v2 Jane 2020 refseq)
GCF_004027225.2
49,757
(5.76 %)
n/a 13,110
(1.92 %)
22,782
(2.26 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
0
(0 %)
373
(0.92 %)
89
(100.00 %)
507,148
(7.85 %)
208,178
(1.08 %)
6,258,087
(20.50 %)
0
(0 %)
165,530
(1.34 %)
22,278
(1.77 %)
19,230
(1.21 %)
305 killer whale (2022)
GCF_937001465.1
78,470
(3.76 %)
n/a 18,710
(1.51 %)
21,101
(1.30 %)
34,448
(1.49 %)
41.91
(100.00 %)
0
(0 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
3,955,401
(36.81 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,568
(41.63 %)
2
(0.00 %)
1,982,992
(5.71 %)
77,307
(3.08 %)
40,935
(1.02 %)
306 king vulture (hap1 2024)
GCA_037962945.1
n/a n/a 13,641
(1.52 %)
24,293
(1.78 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
6
(0.00 %)
154
(0.00 %)
130
(100.00 %)
484,661
(3.34 %)
252,569
(16.01 %)
5,595,734
(32.51 %)
1
(0.00 %)
776,309
(4.15 %)
77,942
(3.59 %)
33,020
(1.50 %)
307 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2
n/a n/a 17,087
(0.81 %)
14,711
(0.86 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
0
(0 %)
669
(0.00 %)
1,246
(100.00 %)
6,280,029
(29.77 %)
1,123,294
(2.02 %)
21,796,316
(39.24 %)
2
(0.00 %)
412,593
(0.92 %)
15,957
(0.35 %)
13,996
(0.24 %)
308 Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3
33,236
(8.44 %)
n/a 14,601
(2.46 %)
44,145
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
701
(0.95 %)
122
(100.00 %)
1,755,227
(42.93 %)
551,482
(7.22 %)
4,887,087
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,179
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
22,350
(1.21 %)
309 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1
63,293
(2.96 %)
n/a 17,918
(1.89 %)
20,819
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
0
(0 %)
394
(0.69 %)
202
(100.00 %)
2,897,422
(23.58 %)
797,420
(2.76 %)
10,057,100
(34.56 %)
2
(0.00 %)
425,636
(1.52 %)
55,965
(2.99 %)
57,667
(2.01 %)
310 lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023)
GCA_028022735.1
n/a n/a 13,529
(1.69 %)
23,672
(1.98 %)
n/a 43.50
(99.85 %)
0
(0 %)
259
(0.15 %)
232
(100.00 %)
491,653
(3.53 %)
349,011
(9.83 %)
5,955,030
(26.51 %)
5
(0.00 %)
404,016
(2.60 %)
32,237
(2.61 %)
27,504
(1.23 %)
311 lance-tailed manakin (2020)
GCF_009829145.1
46,366
(5.56 %)
n/a 12,594
(1.91 %)
22,763
(2.31 %)
26,057
(3.91 %)
41.97
(99.70 %)
0
(0 %)
206
(0.30 %)
93
(100.00 %)
485,121
(7.13 %)
247,189
(1.64 %)
6,498,294
(20.04 %)
0
(0 %)
149,431
(1.05 %)
25,377
(1.97 %)
21,424
(1.14 %)
312 lancelets B.floridae x B.belcheri (bbbf 2021)
GCA_019207075.1
n/a n/a 5,191
(1.10 %)
42,331
(14.51 %)
n/a 41.51
(99.88 %)
0
(0 %)
108
(0.12 %)
79
(100.00 %)
132,673
(2.15 %)
174,485
(7.81 %)
1,945,047
(28.91 %)
0
(0 %)
311,722
(5.56 %)
42,166
(6.02 %)
28,034
(3.24 %)
313 lancelets B.floridae x B.japonicum (bjbf 2020)
GCA_015852565.1
n/a n/a 5,384
(0.92 %)
47,467
(13.75 %)
n/a 41.37
(99.98 %)
0
(0 %)
168
(0.02 %)
341
(100.00 %)
146,622
(1.62 %)
202,162
(9.26 %)
2,291,900
(27.75 %)
0
(0 %)
366,245
(5.52 %)
44,443
(4.78 %)
27,446
(2.56 %)
314 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023638135.1
48,561
(5.70 %)
n/a 12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
0
(0 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
2
(0.00 %)
479,269
(2.67 %)
32,398
(2.65 %)
19,870
(0.89 %)
315 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1
n/a n/a 17,851
(1.28 %)
83,249
(5.18 %)
n/a 42.69
(99.97 %)
36
(0.00 %)
2,397
(0.03 %)
709
(100.00 %)
7,797,173
(37.37 %)
1,593,818
(10.64 %)
7,610,300
(54.05 %)
15
(0.00 %)
1,726,634
(9.03 %)
127,942
(3.84 %)
34,520
(0.93 %)
316 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1
n/a n/a 21,678
(1.34 %)
22,317
(1.25 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
1,188
(0.00 %)
1,198
(100.00 %)
5,530,547
(22.20 %)
1,357,640
(10.13 %)
14,334,312
(46.09 %)
5
(0.00 %)
2,400,830
(5.08 %)
123,453
(2.17 %)
59,337
(1.38 %)
317 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1
n/a n/a 16,376
(2.19 %)
82,947
(7.99 %)
n/a 46.31
(99.94 %)
144
(0.00 %)
2,631
(0.06 %)
1,522
(100.00 %)
3,333,323
(43.58 %)
1,553,932
(25.91 %)
3,393,507
(46.78 %)
9
(0.00 %)
1,764,517
(12.32 %)
99,668
(6.39 %)
51,378
(2.60 %)
318 largemouth bass (2-A1 2021)
GCA_019677235.1
n/a n/a 15,790
(2.31 %)
50,332
(5.65 %)
n/a 40.87
(99.96 %)
0
(0 %)
672
(0.04 %)
202
(100.00 %)
464,845
(2.71 %)
255,513
(3.69 %)
5,124,388
(29.65 %)
2
(0.00 %)
390,854
(3.63 %)
25,920
(1.67 %)
12,277
(0.62 %)
319 largescale foureyes (primary hap 2020)
GCA_014839685.1
n/a n/a 14,774
(2.18 %)
42,858
(4.83 %)
58,247
(6.94 %)
38.54
(99.96 %)
0
(0 %)
107
(0.04 %)
33
(100.00 %)
506,950
(2.73 %)
305,170
(2.13 %)
6,194,879
(29.85 %)
0
(0 %)
131,664
(1.39 %)
17,881
(0.94 %)
14,233
(0.68 %)
320 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1
n/a n/a 13,350
(1.17 %)
18,904
(1.93 %)
n/a 40.96
(99.78 %)
0
(0 %)
769
(0.22 %)
56
(100.00 %)
1,209,793
(7.69 %)
762,735
(5.06 %)
7,424,674
(44.80 %)
4
(0.00 %)
794,949
(4.07 %)
110,631
(4.07 %)
23,739
(0.88 %)
321 least weasel (hap1.1 2025)
GCA_964662115.1
n/a n/a 19,085
(1.11 %)
23,074
(1.09 %)
n/a 43.54
(99.98 %)
9
(0.00 %)
2,938
(0.02 %)
3,189
(100.00 %)
4,687,333
(25.05 %)
908,610
(10.98 %)
12,922,050
(49.64 %)
17
(0.00 %)
4,143,372
(9.39 %)
68,749
(2.22 %)
53,921
(1.35 %)
322 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq)
GCF_009764565.3
73,318
(3.97 %)
n/a 14,610
(1.03 %)
16,358
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
0
(0 %)
668
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,694,449
(14.90 %)
304,773
(1.14 %)
11,121,962
(34.21 %)
3
(0.00 %)
670,729
(2.51 %)
35,485
(1.36 %)
19,615
(0.51 %)
323 lemon sole (primary hap 2024)
GCA_964266715.1
n/a n/a 14,961
(2.55 %)
52,234
(6.83 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
20
(0.00 %)
409
(0.01 %)
1,601
(100.00 %)
1,233,052
(39.33 %)
366,741
(18.98 %)
3,296,338
(36.77 %)
1
(0.00 %)
538,414
(6.03 %)
44,712
(2.85 %)
31,908
(1.76 %)
324 leopard gecko (TG4126 2023)
GCF_028583425.1
37,120
(2.89 %)
n/a 14,358
(0.93 %)
23,080
(1.92 %)
n/a 44.06
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
76
(100.00 %)
969,188
(4.21 %)
557,245
(2.88 %)
11,096,222
(37.91 %)
0
(0 %)
608,752
(2.77 %)
82,956
(2.56 %)
27,406
(0.84 %)
325 lesser black-backed gull (primary hap 2024)
GCA_963932225.1
n/a n/a 13,333
(1.68 %)
24,731
(2.05 %)
n/a 44.40
(99.99 %)
15
(0.00 %)
537
(0.01 %)
1,382
(100.00 %)
509,160
(5.11 %)
266,609
(9.64 %)
6,827,304
(27.15 %)
3
(0.00 %)
575,179
(3.19 %)
44,108
(6.34 %)
37,502
(1.70 %)
326 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1
51,730
(1.99 %)
n/a 20,129
(1.24 %)
22,089
(1.24 %)
40,414
(1.76 %)
42.00
(99.52 %)
0
(0 %)
561
(0.48 %)
160
(100.00 %)
7,346,291
(41.25 %)
1,187,587
(2.92 %)
14,222,177
(44.13 %)
1
(0.00 %)
1,219,048
(2.53 %)
34,688
(0.86 %)
25,175
(0.54 %)
327 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024)
GCA_043880595.1
n/a n/a 18,484
(1.87 %)
24,356
(1.84 %)
n/a 41.88
(97.91 %)
198
(0.32 %)
866
(2.09 %)
617
(99.68 %)
3,419,622
(36.65 %)
663,182
(2.53 %)
11,508,574
(30.58 %)
15
(0.00 %)
639,747
(2.02 %)
84,174
(4.85 %)
81,198
(4.01 %)
328 lesser horseshoe bat (hap1 2024)
GCA_964194185.1
n/a n/a 19,031
(1.88 %)
21,003
(1.63 %)
n/a 40.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,627
(0.01 %)
723
(100.00 %)
3,133,745
(33.46 %)
660,064
(3.79 %)
11,720,176
(32.32 %)
8
(0.00 %)
718,567
(2.35 %)
35,414
(1.75 %)
34,111
(1.64 %)
329 lesser kestrel (v2 2021)
GCF_017639655.2
47,420
(5.64 %)
n/a 13,098
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
0
(0 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,499
(5.58 %)
210,234
(1.26 %)
7,133,934
(19.19 %)
1
(0.00 %)
132,967
(0.79 %)
27,558
(2.21 %)
21,862
(1.03 %)
330 lesser noctule (v2 hap1 2025)
GCA_964264875.2
n/a n/a 18,342
(1.54 %)
22,974
(1.62 %)
n/a 43.04
(100.00 %)
3
(0.00 %)
302
(0.00 %)
588
(100.00 %)
4,258,096
(37.31 %)
1,289,911
(11.51 %)
9,694,758
(42.52 %)
2
(0.00 %)
1,992,418
(5.41 %)
65,974
(2.80 %)
61,273
(1.84 %)
331 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028389875.1
39,024
(4.18 %)
n/a 13,360
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
0
(0 %)
128
(0.11 %)
180
(100.00 %)
674,149
(6.73 %)
329,124
(5.34 %)
6,820,245
(22.78 %)
1
(0.00 %)
266,226
(1.85 %)
45,073
(5.83 %)
38,575
(2.59 %)
332 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850995.1
53,210
(2.49 %)
n/a 18,323
(1.42 %)
21,350
(1.39 %)
n/a 41.84
(99.24 %)
0
(0 %)
573
(0.76 %)
168
(100.00 %)
4,224,344
(28.69 %)
1,030,576
(2.60 %)
12,591,989
(42.30 %)
1
(0.00 %)
1,128,543
(2.95 %)
98,189
(2.06 %)
48,427
(1.15 %)
333 lesser salmon catfish (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1
53,323
(3.35 %)
n/a 15,955
(0.92 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
6,041,262
(71.88 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
16,535
(0.37 %)
334 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1
n/a n/a 13,908
(2.19 %)
50,634
(6.50 %)
n/a 41.22
(99.97 %)
84
(0.00 %)
1,017
(0.03 %)
701
(100.00 %)
2,698,640
(39.19 %)
577,328
(8.51 %)
3,615,231
(39.17 %)
5
(0.00 %)
691,324
(6.04 %)
33,251
(1.82 %)
14,917
(0.69 %)
335 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1
n/a n/a 15,269
(2.44 %)
52,449
(6.28 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
606
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,879,201
(31.40 %)
449,901
(9.89 %)
4,248,556
(33.21 %)
1
(0.00 %)
727,189
(5.72 %)
43,864
(3.01 %)
19,108
(1.01 %)
336 light-bulb sea squirt (2022)
GCA_947623445.1
n/a n/a 3,318
(1.37 %)
10,846
(10.58 %)
n/a 35.93
(99.99 %)
2
(0.00 %)
58
(0.01 %)
105
(100.00 %)
34,121
(1.61 %)
31,117
(17.32 %)
1,008,995
(33.48 %)
0
(0 %)
167,504
(8.33 %)
4,203
(2.12 %)
2,308
(0.42 %)
337 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1
n/a n/a 15,060
(2.89 %)
50,064
(7.31 %)
n/a 41.88
(99.98 %)
0
(0 %)
589
(0.02 %)
534
(100.00 %)
1,116,427
(28.18 %)
315,489
(13.14 %)
2,598,812
(33.21 %)
2
(0.00 %)
680,706
(7.88 %)
50,192
(3.82 %)
27,472
(1.61 %)
338 little owl (hap1.1 2025)
GCA_965140245.1
n/a n/a 13,385
(1.67 %)
23,822
(2.00 %)
n/a 43.44
(99.99 %)
0
(0 %)
572
(0.01 %)
717
(100.00 %)
653,518
(17.99 %)
588,381
(7.88 %)
5,739,624
(25.13 %)
3
(0.00 %)
448,405
(3.11 %)
34,531
(9.97 %)
27,876
(1.39 %)
339 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2
n/a n/a 14,975
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
n/a 41.43
(99.89 %)
0
(0 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
772,309
(14.49 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,473
(21.79 %)
0
(0 %)
109,664
(1.83 %)
16,807
(1.33 %)
12,095
(0.89 %)
340 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap1 2025)
GCA_047715975.1
n/a n/a 13,605
(0.80 %)
18,928
(1.32 %)
n/a 44.97
(100.00 %)
0
(0 %)
109
(0.00 %)
73
(100.00 %)
1,038,607
(4.70 %)
891,233
(5.94 %)
9,004,935
(56.47 %)
1
(0.00 %)
1,639,727
(6.17 %)
245,845
(10.83 %)
19,287
(0.34 %)
341 lizards B.pumilum (Western Cape Province JTBG20231 2024)
GCA_035047305.1
n/a n/a 13,670
(0.79 %)
19,028
(1.31 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
18
(0.00 %)
18
(0.00 %)
39
(100.00 %)
1,040,467
(4.86 %)
924,221
(6.37 %)
9,015,048
(56.81 %)
1
(0.00 %)
1,768,582
(6.35 %)
248,142
(10.84 %)
19,296
(0.34 %)
342 lizards D.cf. smithi (hap1 2024)
GCA_046126795.1
n/a n/a 14,308
(0.91 %)
19,761
(1.58 %)
n/a 45.95
(100.00 %)
2
(0.00 %)
274
(0.00 %)
329
(100.00 %)
1,376,454
(8.31 %)
744,560
(3.94 %)
11,383,198
(44.04 %)
5
(0.00 %)
843,674
(3.07 %)
208,005
(7.18 %)
27,218
(0.55 %)
343 lizards F.pardalis (Fpa_1 2023)
GCA_030440675.1
n/a n/a 13,625
(1.22 %)
18,049
(1.96 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
23
(100.00 %)
833,693
(2.81 %)
607,040
(2.82 %)
7,939,139
(42.05 %)
0
(0 %)
421,243
(2.11 %)
52,987
(2.59 %)
18,249
(0.61 %)
344 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap1.1 2024)
GCA_964188305.1
n/a n/a 14,091
(1.26 %)
20,552
(2.20 %)
n/a 44.36
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,005
(0.01 %)
509
(100.00 %)
932,842
(5.02 %)
555,337
(4.34 %)
6,595,536
(41.39 %)
10
(0.00 %)
772,110
(4.54 %)
119,467
(4.32 %)
20,701
(0.72 %)
345 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap1.1 2024)
GCA_964252035.1
n/a n/a 13,858
(1.33 %)
19,727
(2.31 %)
n/a 43.80
(99.99 %)
0
(0 %)
836
(0.01 %)
326
(100.00 %)
885,596
(4.43 %)
527,127
(3.30 %)
7,008,185
(38.56 %)
2
(0.00 %)
527,173
(3.21 %)
89,737
(2.87 %)
18,878
(0.71 %)
346 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap1.1 2024)
GCA_964234715.1
n/a n/a 14,289
(1.31 %)
20,112
(2.23 %)
n/a 44.03
(99.99 %)
1
(0.00 %)
823
(0.01 %)
387
(100.00 %)
830,352
(7.87 %)
552,452
(8.32 %)
6,838,068
(40.20 %)
2
(0.00 %)
932,658
(4.44 %)
90,074
(2.82 %)
20,501
(0.74 %)
347 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap1.2 2024)
GCA_964106645.2
n/a n/a 14,314
(1.36 %)
20,522
(2.35 %)
n/a 43.98
(99.98 %)
1
(0.00 %)
1,506
(0.02 %)
337
(100.00 %)
858,648
(4.22 %)
473,134
(2.71 %)
7,061,380
(38.21 %)
40
(0.00 %)
544,982
(3.43 %)
96,600
(3.21 %)
19,808
(0.82 %)
348 lizards P.vaucheri (hap1.1 2025)
GCA_965113315.1
n/a n/a 14,329
(1.28 %)
20,152
(2.19 %)
n/a 44.23
(99.99 %)
0
(0 %)
949
(0.01 %)
285
(100.00 %)
893,567
(5.89 %)
524,077
(6.62 %)
7,052,308
(41.37 %)
8
(0.00 %)
922,684
(4.86 %)
109,507
(3.61 %)
21,052
(0.73 %)
349 loggerhead turtle (hap1 2025)
GCA_965140235.1
n/a 24,360
(1.83 %)
14,764
(1.02 %)
17,699
(1.53 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
61
(0.03 %)
61
(0.03 %)
97
(99.97 %)
1,308,886
(12.45 %)
334,985
(1.41 %)
10,765,956
(34.66 %)
1
(0.00 %)
593,928
(2.38 %)
54,290
(1.49 %)
25,037
(0.61 %)
350 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_963455315.2
61,447
(2.80 %)
n/a 18,725
(1.51 %)
20,946
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
1,084
(0.01 %)
1,084
(0.01 %)
2,076
(99.99 %)
4,125,452
(35.62 %)
1,577,896
(12.03 %)
12,347,170
(42.01 %)
10
(0.00 %)
1,284,155
(3.89 %)
71,822
(5.51 %)
41,663
(1.04 %)
351 long-tailed duck (primary hap 2024)
GCA_963989345.1
n/a n/a 13,329
(1.88 %)
23,888
(2.25 %)
n/a 42.30
(99.99 %)
0
(0 %)
544
(0.01 %)
272
(100.00 %)
784,647
(6.78 %)
501,860
(7.36 %)
6,388,957
(26.13 %)
53
(0.00 %)
600,275
(3.74 %)
34,028
(3.04 %)
29,568
(1.51 %)
352 long-tailed hermit (v2 PSU5 primary hap 2025)
GCA_023637945.2
n/a n/a 12,322
(2.02 %)
20,234
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
12
(0.00 %)
140
(0.37 %)
77
(100.00 %)
497,376
(5.06 %)
265,823
(1.51 %)
6,044,278
(20.09 %)
0
(0 %)
100,037
(0.84 %)
15,921
(1.43 %)
13,767
(0.94 %)
353 longspined bullhead (.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1
n/a n/a 15,027
(3.10 %)
51,137
(7.71 %)
n/a 42.22
(99.99 %)
0
(0 %)
242
(0.01 %)
27
(100.00 %)
452,844
(4.81 %)
417,308
(9.63 %)
3,262,282
(28.51 %)
2
(0.00 %)
530,802
(5.05 %)
55,527
(4.38 %)
34,004
(2.27 %)
354 lumpfish (v1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
n/a 14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
0
(0 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
1
(0.00 %)
655,785
(6.31 %)
53,321
(5.09 %)
32,722
(2.40 %)
355 Macqueen's bustard (maternal hap 2024)
GCA_036417535.1
n/a n/a 13,082
(1.73 %)
27,150
(2.44 %)
n/a 43.25
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
329
(100.00 %)
669,243
(14.71 %)
211,387
(6.69 %)
6,514,716
(27.07 %)
0
(0 %)
589,996
(3.41 %)
47,331
(8.09 %)
32,791
(2.71 %)
356 maguari stork (primary hap 2021)
GCA_017639555.1
n/a n/a 12,905
(1.81 %)
22,204
(2.01 %)
n/a 42.12
(98.21 %)
0
(0 %)
232
(1.79 %)
153
(100.00 %)
485,318
(6.35 %)
184,992
(0.78 %)
7,064,965
(19.56 %)
0
(0 %)
58,168
(0.52 %)
31,653
(3.02 %)
31,174
(1.88 %)
357 Malawi cichlid R.sp.'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1
n/a n/a 15,501
(2.18 %)
54,090
(6.20 %)
n/a 41.17
(99.99 %)
0
(0 %)
422
(0.01 %)
82
(100.00 %)
1,727,328
(38.16 %)
259,351
(4.71 %)
4,381,278
(33.25 %)
2
(0.00 %)
338,853
(3.90 %)
35,281
(1.93 %)
14,746
(0.71 %)
358 mallard (hap1 2024)
GCA_964188345.1
n/a n/a 13,680
(1.77 %)
26,845
(2.33 %)
n/a 42.87
(99.99 %)
0
(0 %)
571
(0.01 %)
936
(100.00 %)
941,876
(15.92 %)
570,703
(9.50 %)
6,169,980
(28.67 %)
58
(0.00 %)
840,239
(5.08 %)
41,791
(3.18 %)
29,249
(1.36 %)
359 mallard (Pekin duck Z2 2020 Zhejiang U)
GCF_015476345.1
59,854
(7.33 %)
n/a 12,988
(1.87 %)
23,709
(2.20 %)
86,787
(8.80 %)
42.27
(99.64 %)
0
(0 %)
905
(0.36 %)
756
(100.00 %)
803,558
(8.04 %)
417,575
(5.02 %)
6,627,843
(24.59 %)
5
(0.00 %)
487,092
(3.05 %)
35,030
(3.06 %)
27,683
(1.41 %)
360 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1
n/a n/a 15,070
(1.79 %)
71,367
(6.50 %)
n/a 41.46
(99.92 %)
0
(0 %)
4,157
(0.08 %)
943
(100.00 %)
1,717,591
(42.63 %)
474,348
(12.30 %)
4,011,319
(44.93 %)
3
(0.00 %)
n/a 59,531
(2.83 %)
15,998
(0.74 %)
361 marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025)
GCA_048126345.1
n/a n/a 25,281
(0.80 %)
18,740
(0.87 %)
n/a 37.80
(99.99 %)
196
(0.01 %)
196
(0.01 %)
889
(99.99 %)
6,538,990
(26.08 %)
1,450,668
(2.40 %)
21,374,371
(47.19 %)
1
(0.00 %)
1,242,479
(2.55 %)
17,923
(0.30 %)
14,429
(0.21 %)
362 Mauritius kestrel (primary hap 2023)
GCA_963210335.1
n/a n/a 13,064
(1.72 %)
22,269
(1.98 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
0
(0 %)
407
(0.01 %)
316
(100.00 %)
459,578
(3.87 %)
315,686
(6.19 %)
6,650,507
(22.84 %)
0
(0 %)
244,086
(1.64 %)
36,076
(2.82 %)
21,430
(0.96 %)
363 Mauritius parakeet (primary hap 2023)
GCA_963264785.1
n/a n/a 13,133
(1.81 %)
23,396
(2.19 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
358
(0.01 %)
172
(100.00 %)
511,156
(7.05 %)
238,915
(5.05 %)
5,764,523
(25.19 %)
2
(0.00 %)
442,454
(2.96 %)
24,675
(1.70 %)
20,376
(1.26 %)
364 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1
n/a n/a 13,282
(1.16 %)
18,653
(1.90 %)
n/a 40.93
(99.98 %)
0
(0 %)
1,819
(0.02 %)
384
(100.00 %)
1,187,501
(7.72 %)
762,639
(6.28 %)
7,428,147
(45.35 %)
13
(0.00 %)
770,603
(3.87 %)
101,007
(3.95 %)
24,179
(0.84 %)
365 meadow vole (hap1 2024)
GCA_037038515.1
n/a n/a 19,134
(1.78 %)
20,672
(1.55 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
181
(100.00 %)
4,818,689
(41.90 %)
962,362
(4.16 %)
12,161,222
(34.42 %)
0
(0 %)
1,559,409
(4.65 %)
23,781
(0.74 %)
19,793
(0.55 %)
366 Merriam's long-tongued bat (hap1 2024)
GCA_039655065.1
n/a n/a 18,172
(1.67 %)
20,736
(1.60 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
0
(0 %)
47
(0.00 %)
82
(100.00 %)
2,998,913
(29.48 %)
418,833
(1.07 %)
11,783,716
(32.96 %)
1
(0.00 %)
317,774
(1.27 %)
65,956
(4.38 %)
57,781
(3.83 %)
367 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1
n/a n/a 14,442
(0.44 %)
24,630
(1.28 %)
n/a 41.94
(99.99 %)
0
(0 %)
2,032
(0.01 %)
464
(100.00 %)
1,928,361
(2.22 %)
2,955,095
(11.97 %)
25,178,773
(53.55 %)
7
(0.00 %)
5,022,575
(7.68 %)
165,699
(1.23 %)
16,842
(0.16 %)
368 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1
62,007
(3.15 %)
n/a 14,883
(0.96 %)
18,524
(1.48 %)
n/a 44.69
(96.36 %)
0
(0 %)
1,866
(3.64 %)
621
(100.00 %)
1,372,189
(11.32 %)
472,501
(3.42 %)
11,362,604
(34.69 %)
1
(0.00 %)
910,675
(2.73 %)
73,700
(2.04 %)
22,443
(0.52 %)
369 Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq)
GCF_048164855.1
112,768
(4.40 %)
n/a 19,582
(1.52 %)
20,911
(1.39 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
0
(0 %)
167
(0.00 %)
249
(100.00 %)
4,598,813
(31.70 %)
1,102,136
(4.40 %)
13,591,364
(35.18 %)
1
(0.00 %)
1,132,845
(2.70 %)
53,470
(2.24 %)
48,664
(1.52 %)
370 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1
71,254
(7.50 %)
n/a 16,674
(1.63 %)
52,903
(4.12 %)
101,896
(6.64 %)
38.24
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,155,823
(4.90 %)
1,363,316
(12.23 %)
7,667,721
(47.23 %)
0
(0 %)
1,394,951
(7.13 %)
48,358
(1.88 %)
24,894
(0.73 %)
371 milkfish (2019)
GCF_902362185.1
30,812
(7.61 %)
n/a 16,869
(3.41 %)
21,377
(6.58 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
0
(0 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
958,774
(8.18 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
2
(0.01 %)
611,774
(5.32 %)
22,089
(1.27 %)
14,000
(0.76 %)
372 mimic poison frog (primary hap 2023 refseq)
GCF_032444005.1
53,268
(1.27 %)
n/a 14,955
(0.34 %)
42,108
(1.16 %)
n/a 44.95
(100.00 %)
0
(0 %)
765
(0.00 %)
1,672
(100.00 %)
1,716,755
(1.89 %)
4,088,682
(23.45 %)
2,436
(100.00 %)
14
(0.00 %)
4,114,618
(5.60 %)
694,865
(6.34 %)
674,154
(5.93 %)
373 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1
n/a n/a 17,701
(1.62 %)
73,433
(5.69 %)
n/a 42.20
(99.98 %)
14
(0.00 %)
1,398
(0.02 %)
388
(100.00 %)
6,438,444
(40.32 %)
1,202,669
(11.51 %)
7,055,665
(47.04 %)
6
(0.00 %)
1,343,489
(8.04 %)
74,954
(3.44 %)
26,325
(0.98 %)
374 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1
61,711
(2.51 %)
n/a 19,550
(1.49 %)
21,499
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
0
(0 %)
1,177
(0.01 %)
1,374
(100.00 %)
4,006,927
(35.92 %)
1,058,105
(12.08 %)
12,708,103
(42.66 %)
4
(0.00 %)
1,500,515
(4.32 %)
72,756
(1.59 %)
44,094
(1.06 %)
375 monito del monte (primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1
47,034
(2.02 %)
n/a 18,399
(0.80 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
0
(0 %)
260
(0.09 %)
17
(100.00 %)
9,107,968
(41.08 %)
1,249,635
(2.12 %)
21,135,324
(42.80 %)
0
(0 %)
1,546,314
(2.55 %)
16,598
(0.36 %)
13,911
(0.23 %)
376 mute swan (v2 primary hap 2021)
GCF_009769625.2
59,524
(6.76 %)
n/a 12,983
(1.98 %)
22,400
(2.22 %)
33,839
(5.17 %)
41.92
(99.13 %)
0
(0 %)
451
(0.87 %)
171
(100.00 %)
700,051
(7.55 %)
301,579
(1.34 %)
6,791,838
(21.30 %)
1
(0.00 %)
78,712
(0.74 %)
31,278
(3.07 %)
30,009
(2.01 %)
377 narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022)
GCA_005190385.3
n/a n/a 18,681
(1.79 %)
19,816
(1.40 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
313
(0.00 %)
101
(100.00 %)
3,618,235
(37.24 %)
612,229
(1.52 %)
12,641,632
(35.02 %)
0
(0 %)
550,897
(1.69 %)
60,518
(1.78 %)
57,655
(1.47 %)
378 Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_964656225.1
n/a n/a 18,001
(1.75 %)
21,219
(1.77 %)
n/a 42.26
(99.98 %)
0
(0 %)
1,836
(0.02 %)
1,062
(100.00 %)
3,664,854
(32.90 %)
906,692
(8.55 %)
10,164,440
(37.98 %)
12
(0.00 %)
783,617
(2.68 %)
56,705
(2.75 %)
55,975
(1.86 %)
379 Natterer's bat (hap1.2 2025)
GCA_964212035.2
n/a n/a 19,475
(1.82 %)
22,424
(1.68 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
0
(0 %)
225
(0.00 %)
212
(100.00 %)
3,841,654
(38.99 %)
801,041
(5.78 %)
10,278,311
(38.66 %)
2
(0.00 %)
750,791
(2.61 %)
64,639
(2.57 %)
58,753
(2.26 %)
380 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579445.1
31,033
(4.42 %)
n/a 12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
0
(0 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
5
(0.00 %)
478,923
(3.35 %)
31,693
(3.88 %)
22,817
(1.16 %)
381 New Caledonian crow (primary hap 2019)
GCF_009650955.1
50,821
(6.95 %)
n/a 12,747
(1.94 %)
23,372
(2.37 %)
30,299
(3.60 %)
42.57
(97.41 %)
0
(0 %)
289
(2.59 %)
105
(100.00 %)
452,690
(6.21 %)
231,546
(1.70 %)
6,265,995
(19.54 %)
0
(0 %)
191,789
(1.34 %)
31,909
(2.48 %)
24,362
(1.33 %)
382 New Zealand spotty (primary hap refseq)
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
n/a 14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,987
(4.42 %)
18,299
(0.85 %)
7,999
(0.35 %)
383 Nicobar pigeon (hap1 2024 refseq)
GCF_036013445.1
34,506
(4.09 %)
n/a 13,358
(1.72 %)
24,851
(2.13 %)
n/a 44.64
(100.00 %)
0
(0 %)
117
(0.00 %)
806
(100.00 %)
705,074
(18.28 %)
342,297
(9.55 %)
6,410,054
(28.06 %)
0
(0 %)
778,929
(4.34 %)
38,589
(9.40 %)
31,815
(1.47 %)
384 nine-banded armadillo (v1 hap2 2023)
GCF_030445035.1
69,043
(2.70 %)
n/a 20,516
(1.05 %)
n/a n/a 41.00
(99.68 %)
0
(0 %)
771
(0.32 %)
539
(100.00 %)
4,656,325
(32.86 %)
726,574
(1.99 %)
19,585,522
(43.65 %)
4
(0.00 %)
720,053
(1.59 %)
140,990
(2.86 %)
76,550
(1.81 %)
385 ninespine stickleback (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316345.1
57,816
(15.11 %)
n/a 14,598
(3.83 %)
49,473
(9.87 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
174
(100.00 %)
599,085
(14.68 %)
186,746
(10.27 %)
2,273,889
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
386 North African catfish (Netherlands MV-2021 primary hap 2022)
GCA_024256435.1
n/a n/a 15,762
(2.12 %)
43,732
(4.51 %)
n/a 38.98
(100.00 %)
159
(0.00 %)
180
(0.00 %)
278
(100.00 %)
1,071,044
(5.64 %)
581,680
(6.16 %)
6,228,783
(39.01 %)
0
(0 %)
442,882
(3.77 %)
42,159
(2.70 %)
19,632
(0.84 %)
387 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1
n/a n/a 19,700
(1.54 %)
22,354
(1.46 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
244
(0.00 %)
244
(0.00 %)
2,082
(100.00 %)
6,089,884
(47.99 %)
1,358,786
(9.39 %)
13,799,349
(39.08 %)
3
(0.00 %)
1,511,691
(3.84 %)
24,733
(0.70 %)
22,588
(0.58 %)
388 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1
n/a n/a 18,102
(1.58 %)
20,073
(1.40 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
0
(0 %)
277
(0.00 %)
116
(100.00 %)
4,958,089
(41.64 %)
719,163
(1.59 %)
13,867,662
(33.89 %)
7
(0.00 %)
506,727
(1.48 %)
51,299
(1.36 %)
33,440
(0.96 %)
389 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1
49,646
(1.86 %)
n/a 19,562
(1.46 %)
21,631
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
367
(0.17 %)
789
(100.00 %)
1,368,536
(2.24 %)
841,303
(13.08 %)
12,527,582
(43.92 %)
11
(0.00 %)
1,404,448
(3.90 %)
94,259
(1.92 %)
41,005
(0.96 %)
390 North Island brown kiwi (hap1 2024 refseq)
GCF_036417845.1
39,806
(3.75 %)
n/a 13,668
(1.52 %)
25,226
(1.90 %)
n/a 44.01
(100.00 %)
0
(0 %)
170
(0.00 %)
408
(100.00 %)
713,264
(8.42 %)
603,930
(6.25 %)
5,379,069
(27.65 %)
1
(0.00 %)
501,448
(3.32 %)
50,913
(9.74 %)
40,971
(3.07 %)
391 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1
n/a n/a 18,636
(1.75 %)
21,446
(1.68 %)
n/a 43.32
(99.99 %)
0
(0 %)
1,423
(0.01 %)
207
(100.00 %)
1,259,729
(2.95 %)
905,676
(6.25 %)
10,554,535
(38.21 %)
3
(0.00 %)
780,081
(2.54 %)
77,656
(3.27 %)
60,964
(2.14 %)
392 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1
n/a n/a 18,924
(1.53 %)
22,934
(1.58 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
199
(0.00 %)
146
(100.00 %)
3,850,624
(31.21 %)
648,359
(3.76 %)
11,788,702
(39.25 %)
2
(0.00 %)
811,589
(2.31 %)
85,908
(2.60 %)
73,781
(1.91 %)
393 northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024)
GCA_039880945.1
n/a n/a 18,933
(1.44 %)
23,629
(1.50 %)
n/a 42.60
(100.00 %)
0
(0 %)
113
(0.00 %)
366
(100.00 %)
4,027,155
(30.73 %)
712,278
(5.22 %)
12,003,034
(41.58 %)
3
(0.00 %)
975,691
(2.71 %)
96,116
(3.02 %)
75,017
(1.84 %)
394 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1
n/a n/a 19,073
(1.44 %)
20,821
(1.21 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,098
(0.01 %)
757
(100.00 %)
3,997,911
(34.76 %)
769,275
(14.94 %)
12,133,820
(44.83 %)
6
(0.00 %)
3,171,972
(7.30 %)
67,258
(2.00 %)
38,513
(0.89 %)
395 northern cavefish (hap1 2024)
GCA_046255685.1
n/a n/a 14,295
(2.22 %)
50,623
(6.07 %)
n/a 42.09
(99.99 %)
0
(0 %)
466
(0.01 %)
892
(100.00 %)
1,941,831
(49.35 %)
650,256
(17.85 %)
3,210,410
(44.77 %)
0
(0 %)
978,430
(8.94 %)
55,251
(4.79 %)
22,975
(1.21 %)
396 northern gannet (hap2 2023)
GCA_031468815.1
n/a n/a 13,477
(1.77 %)
23,613
(2.08 %)
n/a 42.44
(100.00 %)
6
(0.00 %)
248
(0.00 %)
427
(100.00 %)
474,930
(4.45 %)
237,604
(2.75 %)
5,847,260
(21.07 %)
30
(0.00 %)
226,420
(1.83 %)
30,873
(3.03 %)
26,071
(1.23 %)
397 northern goshawk (v2 primary hap 2022 genbank)
GCA_929443795.2
n/a n/a 13,527
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
183
(0.00 %)
455
(100.00 %)
511,000
(3.76 %)
325,992
(9.82 %)
5,542,342
(27.30 %)
4
(0.00 %)
458,026
(3.08 %)
43,070
(4.44 %)
32,753
(1.47 %)
398 northern gundi (hap1 2025)
GCA_048771875.1
n/a n/a 16,996
(1.51 %)
21,787
(1.66 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
117
(0.00 %)
535
(100.00 %)
3,293,772
(27.51 %)
602,403
(3.02 %)
11,827,700
(30.64 %)
2
(0.00 %)
353,736
(1.31 %)
44,220
(1.55 %)
38,845
(1.17 %)
399 northern lapwing (hap1.1 2025)
GCA_965231255.1
n/a n/a 13,331
(1.54 %)
24,472
(1.83 %)
n/a 44.53
(99.99 %)
0
(0 %)
936
(0.01 %)
2,408
(100.00 %)
863,726
(25.27 %)
320,840
(14.03 %)
5,397,999
(32.53 %)
29
(0.00 %)
786,646
(4.59 %)
69,579
(4.22 %)
42,129
(1.88 %)
400 northern pike (primary hap 2020 refseq)
GCF_011004845.1
63,733
(9.28 %)
n/a 16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,941
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
0
(0 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
1
(0.00 %)
602,569
(4.43 %)
42,910
(2.52 %)
22,099
(1.02 %)
401 northern pintail (primary hap 2024 refseq)
GCF_963932015.1
61,479
(7.27 %)
n/a 13,217
(1.88 %)
23,886
(2.27 %)
n/a 42.56
(99.99 %)
0
(0 %)
631
(0.01 %)
394
(100.00 %)
734,760
(5.74 %)
422,946
(7.08 %)
6,491,116
(25.88 %)
10
(0.00 %)
474,748
(3.08 %)
34,601
(2.98 %)
28,080
(1.42 %)
402 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024)
GCA_043748575.1
n/a n/a 18,475
(1.82 %)
19,990
(1.56 %)
n/a 40.72
(100.00 %)
2
(0.00 %)
63
(0.00 %)
68
(100.00 %)
3,507,612
(39.92 %)
711,081
(2.15 %)
11,788,205
(32.17 %)
0
(0 %)
524,992
(2.03 %)
35,670
(1.25 %)
28,616
(1.05 %)
403 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
99,139
(4.10 %)
n/a 21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
4
(0.00 %)
1,172,090
(3.51 %)
19,244
(0.46 %)
16,098
(0.39 %)
404 Obi paradise-crow (lycPyr6 2020)
GCA_014706295.1
n/a n/a 12,592
(1.89 %)
24,002
(2.35 %)
n/a 42.94
(99.48 %)
0
(0 %)
1,602
(0.52 %)
1,695
(100.00 %)
466,546
(6.40 %)
235,283
(1.98 %)
6,371,421
(20.17 %)
15
(0.01 %)
202,970
(1.78 %)
34,247
(3.02 %)
26,600
(1.39 %)
405 ocellated dragonet (captive hap1 2024)
GCA_044231665.1
n/a n/a 13,787
(3.68 %)
60,819
(10.07 %)
n/a 45.42
(100.00 %)
1
(0.00 %)
99
(0.00 %)
108
(100.00 %)
259,874
(3.38 %)
94,885
(3.76 %)
2,302,967
(21.04 %)
2
(0.00 %)
145,739
(2.25 %)
58,433
(13.25 %)
46,364
(6.81 %)
406 old wife E.armatus (hap1 2024)
GCF_043641665.1
32,231
(8.81 %)
n/a 15,382
(3.41 %)
41,015
(7.24 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
114
(0.00 %)
136
(100.00 %)
1,143,877
(18.90 %)
219,801
(2.87 %)
3,652,133
(23.09 %)
3
(0.00 %)
154,745
(1.82 %)
19,721
(1.34 %)
13,176
(0.82 %)
407 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1
n/a n/a 13,448
(1.31 %)
17,745
(2.07 %)
n/a 40.20
(99.98 %)
73
(0.02 %)
73
(0.02 %)
116
(99.98 %)
741,052
(2.98 %)
411,477
(3.31 %)
7,668,994
(30.14 %)
0
(0 %)
318,343
(2.06 %)
34,560
(2.18 %)
21,974
(1.10 %)
408 orange-tipped seq squirt (primary hap 2023)
GCA_963082875.1
n/a n/a 3,120
(1.99 %)
3,357
(8.53 %)
n/a 31.55
(99.96 %)
1
(0.00 %)
244
(0.04 %)
106
(100.00 %)
56,509
(6.44 %)
43,313
(12.97 %)
962,614
(51.07 %)
8
(0.01 %)
176,523
(12.45 %)
1,079
(6.77 %)
694
(0.37 %)
409 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
n/a 15,761
(1.50 %)
31,563
(4.00 %)
59,905
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
0
(0 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,257,250
(5.57 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
0
(0 %)
1,304,958
(6.34 %)
29,320
(0.87 %)
15,066
(0.43 %)
410 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap2 2025)
GCA_048544225.1
n/a n/a 15,600
(2.30 %)
54,714
(6.21 %)
n/a 43.99
(99.99 %)
0
(0 %)
1,132
(0.01 %)
184
(100.00 %)
1,505,689
(14.07 %)
1,691,834
(17.30 %)
4,407,291
(38.23 %)
5
(0.00 %)
1,262,019
(8.51 %)
38,205
(2.14 %)
21,645
(1.07 %)
411 Pacific ridley (hap1 2025)
GCA_965140295.1
n/a 21,497
(1.67 %)
14,698
(1.03 %)
17,429
(1.50 %)
n/a 44.13
(99.98 %)
0
(0 %)
69
(0.02 %)
44
(100.00 %)
1,340,389
(12.41 %)
313,433
(2.43 %)
10,832,333
(34.73 %)
1
(0.00 %)
642,980
(2.58 %)
47,256
(1.42 %)
24,677
(0.61 %)
412 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1
n/a n/a 14,522
(0.54 %)
21,861
(1.14 %)
n/a 39.52
(98.39 %)
0
(0 %)
3,681
(1.61 %)
1,318
(100.00 %)
1,928,844
(4.34 %)
3,684,477
(13.44 %)
19,091,818
(55.21 %)
1
(0.00 %)
4,715,600
(8.73 %)
127,760
(1.34 %)
9,458
(0.10 %)
413 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2
54,932
(3.31 %)
n/a 18,171
(1.69 %)
20,025
(1.62 %)
42,786
(3.39 %)
42.38
(99.28 %)
0
(0 %)
884
(0.72 %)
77
(100.00 %)
3,069,141
(30.00 %)
385,664
(0.81 %)
12,050,232
(30.57 %)
1
(0.00 %)
174,292
(0.75 %)
63,905
(3.75 %)
66,744
(3.26 %)
414 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
n/a 18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
0
(0 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
1
(0.00 %)
714,726
(2.00 %)
79,984
(2.45 %)
71,436
(1.91 %)
415 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1
n/a n/a 19,688
(1.69 %)
21,998
(1.64 %)
n/a 43.04
(99.72 %)
19
(0.01 %)
234
(0.28 %)
112
(99.99 %)
2,794,986
(22.60 %)
938,016
(3.72 %)
11,241,518
(39.41 %)
0
(0 %)
704,408
(2.03 %)
70,272
(2.89 %)
61,250
(1.98 %)
416 palmate newt (primary hap 2024)
GCA_964261635.1
n/a n/a 17,611
(0.09 %)
227,382
(1.73 %)
n/a 45.09
(100.00 %)
0
(0 %)
5,245
(0.00 %)
448
(100.00 %)
4,668,195
(1.49 %)
9,253,372
(10.94 %)
5,693
(100.00 %)
48
(0.00 %)
1,460,718
(0.63 %)
2,493,727
(7.98 %)
2,437,739
(7.71 %)
417 Papuan ground boa (hap2 2024 refseq)
GCF_035149785.1
31,826
(3.55 %)
n/a 13,389
(1.26 %)
17,495
(1.99 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
149
(100.00 %)
728,567
(2.82 %)
348,603
(2.13 %)
7,199,026
(33.55 %)
1
(0.00 %)
318,786
(2.43 %)
51,807
(2.69 %)
19,758
(0.92 %)
418 parallel lanternfish (primary hap 2024)
GCA_964188405.1
n/a n/a 16,917
(1.64 %)
72,190
(5.85 %)
n/a 42.91
(99.96 %)
0
(0 %)
2,729
(0.04 %)
24
(100.00 %)
4,976,327
(35.08 %)
1,258,755
(18.52 %)
6,268,804
(48.21 %)
12
(0.00 %)
1,744,372
(10.22 %)
81,193
(3.23 %)
34,135
(1.37 %)
419 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1
n/a n/a 17,913
(1.72 %)
20,720
(1.72 %)
n/a 43.54
(99.99 %)
7
(0.00 %)
980
(0.01 %)
185
(100.00 %)
2,932,869
(21.94 %)
874,665
(4.83 %)
10,263,103
(37.46 %)
2
(0.00 %)
742,499
(2.50 %)
77,397
(4.55 %)
76,849
(2.51 %)
420 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1
n/a n/a 15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
0
(0 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
975,354
(15.76 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,904
(35.09 %)
1
(0.00 %)
865,727
(6.60 %)
49,121
(3.07 %)
20,467
(0.93 %)
421 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1
n/a n/a 15,317
(2.02 %)
61,647
(6.35 %)
n/a 41.37
(99.99 %)
135
(0.01 %)
135
(0.01 %)
469
(99.99 %)
981,519
(15.40 %)
319,637
(12.45 %)
3,706,473
(36.77 %)
0
(0 %)
952,761
(6.98 %)
50,353
(2.98 %)
20,537
(0.91 %)
422 peladilla (primary hap 2021)
GCA_017639675.1
n/a n/a 13,829
(3.83 %)
41,932
(8.64 %)
n/a 45.01
(98.24 %)
0
(0 %)
1,158
(1.77 %)
41
(100.00 %)
930,246
(18.49 %)
660,569
(13.71 %)
2,316,198
(27.66 %)
6
(0.00 %)
537,418
(6.48 %)
41,023
(4.40 %)
27,287
(2.49 %)
423 pencil smelt N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1
n/a n/a 17,996
(2.00 %)
89,591
(7.93 %)
n/a 45.22
(99.94 %)
0
(0 %)
3,299
(0.06 %)
1,177
(100.00 %)
2,828,457
(30.93 %)
1,676,413
(19.87 %)
4,137,400
(48.69 %)
14
(0.00 %)
1,929,538
(11.96 %)
78,669
(4.37 %)
29,960
(1.34 %)
424 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634155.1
49,100
(5.64 %)
n/a 13,021
(1.66 %)
21,794
(1.95 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
0
(0 %)
241
(0.31 %)
125
(100.00 %)
586,320
(11.83 %)
335,218
(8.05 %)
7,038,851
(24.65 %)
0
(0 %)
405,474
(2.46 %)
26,085
(2.25 %)
20,023
(0.87 %)
425 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501925.1
n/a n/a 23,766
(1.52 %)
34,093
(2.42 %)
n/a 39.52
(100.00 %)
9
(0.00 %)
500
(0.00 %)
897
(100.00 %)
919,152
(1.89 %)
1,157,711
(8.01 %)
14,217,996
(45.44 %)
0
(0 %)
1,995,399
(5.51 %)
108,139
(1.26 %)
16,761
(0.21 %)
426 Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1
44,950
(1.91 %)
n/a 20,385
(1.64 %)
22,123
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
116
(0.00 %)
130
(100.00 %)
4,492,417
(39.31 %)
627,841
(4.79 %)
15,561,458
(36.57 %)
2
(0.00 %)
862,813
(2.91 %)
45,336
(1.27 %)
44,264
(1.15 %)
427 picturesque dragonet (SynPic1 hap2 2024)
GCA_044231675.1
n/a n/a 13,816
(3.52 %)
52,689
(9.01 %)
n/a 43.48
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
300
(100.00 %)
223,762
(3.25 %)
105,291
(6.28 %)
2,579,336
(24.55 %)
0
(0 %)
233,535
(3.55 %)
41,114
(5.50 %)
32,452
(3.61 %)
428 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1
n/a n/a 18,472
(1.44 %)
19,911
(1.28 %)
n/a 42.63
(99.98 %)
0
(0 %)
878
(0.02 %)
379
(100.00 %)
3,996,827
(27.97 %)
2,094,728
(7.23 %)
12,677,118
(40.57 %)
4
(0.00 %)
1,289,995
(3.44 %)
81,791
(2.82 %)
46,045
(1.12 %)
429 pig (Wuzhishan WZS1 2025)
GCA_048338725.1
n/a n/a 18,525
(1.46 %)
19,792
(1.29 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 20
(100.00 %)
4,084,482
(28.40 %)
1,424,314
(5.35 %)
12,927,595
(39.56 %)
0
(0 %)
1,032,116
(2.85 %)
81,967
(2.96 %)
46,624
(1.14 %)
430 pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 refseq)
GCF_043159975.1
103,003
(4.05 %)
n/a 20,760
(1.76 %)
21,155
(1.14 %)
n/a 41.04
(100.00 %)
0
(0 %)
260
(0.00 %)
361
(100.00 %)
5,396,194
(53.53 %)
1,039,569
(9.75 %)
15,407,787
(41.73 %)
1
(0.00 %)
2,204,399
(4.61 %)
99,854
(1.52 %)
30,377
(0.77 %)
431 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
n/a 15,738
(2.42 %)
26,691
(5.69 %)
57,069
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
0
(0 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,063,888
(5.90 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
0
(0 %)
374,590
(3.12 %)
41,636
(2.04 %)
21,488
(0.92 %)
432 pink pigeon (primary hap 2023)
GCA_963082525.1
n/a n/a 13,140
(1.85 %)
25,111
(2.31 %)
n/a 42.27
(99.99 %)
0
(0 %)
509
(0.01 %)
143
(100.00 %)
488,313
(5.48 %)
331,962
(3.50 %)
6,243,204
(22.87 %)
0
(0 %)
441,492
(2.54 %)
36,343
(3.63 %)
31,102
(1.89 %)
433 pink sea squirt (2022)
GCA_947561715.1
n/a n/a 3,449
(1.48 %)
14,588
(13.45 %)
n/a 39.19
(100.00 %)
0
(0 %)
32
(0.00 %)
96
(100.00 %)
18,369
(1.83 %)
33,783
(9.73 %)
1,032,597
(26.20 %)
4
(0.00 %)
242,360
(12.34 %)
7,713
(4.85 %)
6,762
(1.51 %)
434 pink-footed goose (primary hap 2024)
GCA_964034855.1
n/a n/a 13,275
(1.76 %)
24,103
(2.11 %)
n/a 43.68
(99.98 %)
0
(0 %)
1,137
(0.02 %)
715
(100.00 %)
792,215
(9.76 %)
471,286
(10.34 %)
6,448,623
(29.48 %)
7
(0.00 %)
821,367
(5.38 %)
49,485
(4.41 %)
36,058
(2.18 %)
435 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023)
GCA_033958435.1
n/a n/a 14,675
(1.05 %)
16,697
(1.47 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
134
(100.00 %)
3,772,260
(47.94 %)
322,081
(1.52 %)
11,123,166
(34.14 %)
0
(0 %)
448,027
(1.56 %)
129,645
(3.29 %)
28,529
(1.18 %)
436 plains spadefoot toad (primary hap 2022)
GCF_027358695.1
41,009
(4.67 %)
n/a 13,912
(2.00 %)
25,745
(4.50 %)
n/a 40.45
(99.61 %)
0
(0 %)
102
(0.39 %)
17
(100.00 %)
497,976
(3.84 %)
645,915
(10.08 %)
5,232,342
(36.26 %)
1
(0.00 %)
748,493
(5.83 %)
72,598
(4.35 %)
32,385
(1.89 %)
437 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2
51,392
(3.07 %)
n/a 14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
0
(0 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
0
(0 %)
1,130,252
(3.59 %)
87,796
(6.47 %)
74,209
(2.87 %)
438 plumbeous ibis (primary hap 2021)
GCA_020745775.1
n/a n/a 13,028
(1.84 %)
22,722
(2.10 %)
n/a 42.37
(99.81 %)
0
(0 %)
104
(0.19 %)
88
(100.00 %)
488,030
(6.66 %)
188,606
(1.01 %)
6,982,793
(20.08 %)
0
(0 %)
89,388
(0.77 %)
32,920
(3.37 %)
32,773
(1.95 %)
439 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1
n/a n/a 14,126
(2.81 %)
61,907
(8.75 %)
n/a 45.67
(99.94 %)
0
(0 %)
1,810
(0.06 %)
616
(100.00 %)
753,034
(10.17 %)
850,189
(15.72 %)
2,888,555
(33.70 %)
7
(0.00 %)
642,528
(6.84 %)
80,883
(8.43 %)
46,894
(3.34 %)
440 pool frog (hap1 2025)
GCA_965119305.1
n/a n/a 14,446
(0.34 %)
39,585
(1.24 %)
n/a 43.75
(99.99 %)
33
(0.00 %)
3,044
(0.01 %)
1,361
(100.00 %)
2,734,844
(2.59 %)
3,759,979
(13.10 %)
24,289,849
(60.22 %)
22
(0.00 %)
6,436,651
(8.33 %)
558,423
(4.11 %)
48,365
(0.35 %)
441 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
n/a 14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
0
(0 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
3
(0.00 %)
1,746,915
(7.91 %)
172,199
(5.45 %)
18,080
(0.31 %)
442 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1
n/a n/a 17,919
(1.46 %)
19,330
(1.31 %)
n/a 40.78
(100.00 %)
0
(0 %)
68
(0.00 %)
41
(100.00 %)
3,707,234
(28.28 %)
643,817
(2.22 %)
12,106,384
(41.48 %)
5
(0.00 %)
871,436
(2.63 %)
54,438
(1.38 %)
34,899
(0.85 %)
443 Puerto Rican coqui (hap1 2024 refseq)
GCF_035609145.1
44,598
(2.13 %)
n/a 13,879
(0.57 %)
31,890
(1.61 %)
n/a 44.91
(100.00 %)
0
(0 %)
659
(0.00 %)
956
(100.00 %)
1,044,176
(1.98 %)
1,442,184
(16.51 %)
14,710,122
(54.00 %)
6
(0.00 %)
4,070,191
(8.73 %)
501,931
(8.81 %)
49,483
(0.82 %)
444 pygmy chimpanzee (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_029289425.2
95,418
(4.20 %)
n/a 21,182
(1.74 %)
23,352
(1.22 %)
n/a 40.43
(99.84 %)
0
(0 %)
6
(0.16 %)
31
(100.00 %)
5,436,203
(50.57 %)
1,021,767
(12.45 %)
15,964,628
(43.17 %)
1
(0.03 %)
3,743,841
(6.31 %)
48,818
(1.07 %)
29,887
(0.74 %)
445 pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq)
GCF_026419965.1
56,261
(2.22 %)
n/a 18,496
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
0
(0 %)
143
(0.19 %)
581
(100.00 %)
3,817,659
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,998
(39.96 %)
0
(0 %)
1,197,809
(3.53 %)
101,353
(2.90 %)
50,216
(1.47 %)
446 rabbit (primary hap 2024 refseq)
GCF_964237555.1
95,289
(4.22 %)
n/a 19,385
(1.31 %)
22,631
(1.31 %)
n/a 44.02
(99.98 %)
0
(0 %)
2,276
(0.02 %)
221
(100.00 %)
4,099,586
(21.20 %)
1,062,900
(3.78 %)
13,416,814
(41.72 %)
5
(0.00 %)
1,560,076
(3.77 %)
116,523
(2.66 %)
74,863
(1.94 %)
447 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1
n/a n/a 15,639
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
0
(0 %)
1,907
(0.07 %)
365
(100.00 %)
1,655,350
(30.53 %)
511,512
(12.09 %)
2,015,264
(35.19 %)
4
(0.00 %)
468,697
(7.41 %)
32,410
(4.33 %)
18,662
(1.57 %)
448 Rankin cod (hap1 2025)
GCA_048129235.1
n/a n/a 15,661
(1.94 %)
54,906
(5.30 %)
n/a 41.36
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
386
(100.00 %)
591,994
(2.64 %)
396,424
(6.16 %)
6,144,028
(31.24 %)
0
(0 %)
569,694
(4.19 %)
24,792
(1.05 %)
12,339
(0.46 %)
449 razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658365.1
n/a n/a 12,787
(1.83 %)
22,839
(2.13 %)
n/a 42.67
(99.70 %)
0
(0 %)
227
(0.30 %)
95
(100.00 %)
543,517
(7.16 %)
212,546
(1.12 %)
6,930,708
(20.10 %)
0
(0 %)
103,901
(0.79 %)
38,960
(3.02 %)
35,213
(1.80 %)
450 red deer (2021)
GCF_910594005.1
68,992
(2.68 %)
n/a 20,470
(1.48 %)
22,563
(1.32 %)
n/a 42.98
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
144
(100.00 %)
5,501,063
(44.60 %)
503,301
(12.23 %)
13,102,622
(44.55 %)
1
(0.00 %)
2,197,198
(5.57 %)
88,756
(1.66 %)
46,960
(1.12 %)
451 red fox (hap1 2024)
GCA_964106825.2
n/a n/a 19,622
(1.57 %)
20,371
(1.38 %)
n/a 41.34
(99.98 %)
0
(0 %)
1,845
(0.02 %)
461
(100.00 %)
4,519,485
(31.91 %)
1,018,114
(2.59 %)
13,810,284
(32.99 %)
9
(0.00 %)
712,146
(1.92 %)
52,053
(2.31 %)
47,294
(1.54 %)
452 red-bellied piranha (primary hap 2020)
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
n/a 16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
76,011
(5.65 %)
40.58
(99.17 %)
0
(0 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
2
(0.00 %)
1,005,141
(5.14 %)
33,087
(1.38 %)
20,822
(0.79 %)
453 red-billed tropicbird (maternal hap 2024)
GCA_964289735.1
n/a n/a 13,231
(1.68 %)
24,060
(2.00 %)
n/a 43.15
(99.98 %)
3
(0.00 %)
1,269
(0.02 %)
660
(100.00 %)
440,963
(5.78 %)
187,847
(3.22 %)
6,601,610
(24.99 %)
24
(0.00 %)
232,304
(1.91 %)
54,002
(5.24 %)
46,380
(3.01 %)
454 red-crested pochard (primary hap 2024)
GCA_964035555.1
n/a n/a 13,234
(1.92 %)
23,753
(2.26 %)
n/a 42.08
(99.99 %)
0
(0 %)
714
(0.01 %)
141
(100.00 %)
772,537
(6.34 %)
437,831
(4.05 %)
6,488,340
(24.52 %)
27
(0.00 %)
332,911
(2.45 %)
31,577
(2.49 %)
28,022
(1.51 %)
455 red-crested turaco (primary hap 2019)
GCA_009769465.1
n/a n/a 12,744
(1.75 %)
25,706
(2.29 %)
n/a 42.60
(97.89 %)
0
(0 %)
344
(2.11 %)
140
(100.00 %)
551,885
(8.95 %)
176,530
(0.80 %)
6,805,042
(22.19 %)
0
(0 %)
138,426
(1.12 %)
43,051
(3.40 %)
34,997
(2.03 %)
456 red-fronted tinkerbird (primary hap 2020 refseq)
GCF_015220805.1
44,843
(4.51 %)
n/a 12,341
(1.60 %)
23,205
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
0
(0 %)
307
(0.47 %)
252
(100.00 %)
981,758
(15.82 %)
378,855
(4.28 %)
6,003,474
(35.88 %)
0
(0 %)
1,148,439
(6.01 %)
26,519
(1.76 %)
21,399
(1.21 %)
457 red-legged seriema (primary hap 2019)
GCA_009819825.1
n/a n/a 13,229
(1.84 %)
25,580
(2.35 %)
n/a 42.20
(99.59 %)
0
(0 %)
194
(0.41 %)
110
(100.00 %)
483,784
(6.50 %)
160,481
(0.73 %)
6,960,060
(19.71 %)
0
(0 %)
64,843
(0.56 %)
32,899
(2.77 %)
30,208
(1.91 %)
458 red-throated loon (hap2 2023 refseq)
GCF_030936135.1
25,173
(3.02 %)
n/a 13,216
(1.71 %)
24,050
(2.10 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
1,185
(100.00 %)
544,422
(8.81 %)
223,672
(5.77 %)
6,669,433
(23.63 %)
3
(0.00 %)
398,584
(2.64 %)
38,305
(3.37 %)
35,068
(1.78 %)
459 red-winged blackbird (BioBank_ID:100140 2023)
GCF_020745825.1
29,994
(3.93 %)
n/a 12,687
(1.75 %)
25,287
(2.30 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
106
(0.00 %)
106
(0.00 %)
516
(100.00 %)
785,960
(17.62 %)
522,256
(9.27 %)
6,371,580
(25.40 %)
0
(0 %)
496,798
(2.87 %)
32,643
(2.66 %)
23,497
(1.27 %)
460 reedfish (2021)
GCF_900747795.2
44,479
(2.01 %)
n/a 13,108
(0.46 %)
23,157
(1.29 %)
n/a 39.37
(99.18 %)
0
(0 %)
1,431
(0.82 %)
169
(100.00 %)
8,636,520
(39.34 %)
1,069,643
(2.91 %)
19,980,572
(47.52 %)
17
(0.00 %)
1,256,071
(2.69 %)
89,023
(1.13 %)
22,697
(0.30 %)
461 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1
n/a n/a 18,947
(1.29 %)
24,114
(1.28 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,892
(100.00 %)
3,375,476
(23.21 %)
654,539
(6.64 %)
11,132,469
(48.29 %)
0
(0 %)
3,008,562
(7.07 %)
79,357
(2.66 %)
41,548
(0.93 %)
462 Reeves' muntjac (primary hap 2024)
GCF_963930625.1
52,442
(2.57 %)
n/a 19,577
(1.52 %)
22,283
(1.38 %)
n/a 41.89
(99.99 %)
0
(0 %)
682
(0.01 %)
267
(100.00 %)
3,294,672
(23.89 %)
527,436
(2.98 %)
13,137,581
(39.89 %)
1
(0.00 %)
1,222,379
(3.05 %)
57,436
(1.81 %)
44,949
(1.09 %)
463 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1
59,888
(2.34 %)
n/a 19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
0
(0 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
4
(0.00 %)
1,071,329
(3.37 %)
73,126
(1.69 %)
43,865
(1.11 %)
464 rifleman (primary hap 2021)
GCA_016904835.1
n/a n/a 12,620
(1.92 %)
24,568
(2.61 %)
n/a 42.41
(99.61 %)
0
(0 %)
195
(0.39 %)
206
(100.00 %)
495,673
(9.14 %)
253,008
(2.04 %)
5,936,177
(19.93 %)
0
(0 %)
269,642
(1.76 %)
20,145
(1.83 %)
15,953
(0.89 %)
465 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 primary hap 2024)
GCF_040937935.1
62,635
(1.63 %)
n/a 14,072
(0.39 %)
44,953
(1.74 %)
n/a 44.98
(99.99 %)
0
(0 %)
3,039
(0.01 %)
477
(100.00 %)
2,058,700
(2.53 %)
3,206,511
(15.84 %)
20,407,989
(60.26 %)
40
(0.00 %)
n/a 741,520
(6.10 %)
65,051
(0.49 %)
466 ring-tailed lemur (primary hap 2021)
GCF_020740605.2
55,883
(2.78 %)
n/a 18,659
(1.98 %)
20,542
(1.50 %)
n/a 41.36
(99.84 %)
0
(0 %)
210
(0.16 %)
185
(100.00 %)
3,432,734
(37.67 %)
518,071
(6.84 %)
12,916,577
(32.91 %)
0
(0 %)
864,748
(2.57 %)
50,626
(1.88 %)
48,082
(1.65 %)
467 Risso's dolphin (hap1.1 2024)
GCA_964374135.1
n/a n/a 18,825
(1.58 %)
20,986
(1.29 %)
n/a 42.25
(99.99 %)
4
(0.00 %)
1,138
(0.01 %)
1,150
(100.00 %)
4,405,513
(43.51 %)
1,342,544
(11.28 %)
12,274,096
(41.76 %)
9
(0.00 %)
1,663,930
(5.05 %)
76,936
(4.65 %)
55,192
(2.62 %)
468 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2
n/a n/a 27,928
(1.66 %)
110,791
(4.44 %)
n/a 43.36
(96.90 %)
0
(0 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
4,690,842
(57.30 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,763
(52.37 %)
2
(0.00 %)
3,475,805
(8.76 %)
70,821
(1.77 %)
19,956
(0.39 %)
469 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1
n/a n/a 18,132
(2.65 %)
63,523
(6.01 %)
n/a 38.80
(99.99 %)
1
(0.00 %)
471
(0.01 %)
86
(100.00 %)
2,613,900
(48.90 %)
625,102
(8.21 %)
5,738,444
(41.24 %)
1
(0.00 %)
1,070,552
(7.36 %)
65,328
(3.68 %)
20,458
(0.81 %)
470 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2
n/a n/a 15,181
(3.34 %)
44,153
(7.53 %)
51,135
(7.40 %)
42.31
(99.98 %)
0
(0 %)
418
(0.02 %)
101
(100.00 %)
1,121,704
(25.48 %)
269,467
(4.88 %)
3,358,709
(24.69 %)
5
(0.00 %)
255,676
(3.48 %)
36,987
(3.02 %)
28,368
(1.91 %)
471 rock pigeon (v2 racing homer 2024 refseq)
GCF_036013475.1
70,874
(7.24 %)
n/a 13,145
(1.66 %)
25,462
(2.12 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
869
(100.00 %)
656,963
(11.76 %)
412,665
(12.92 %)
6,047,535
(29.90 %)
0
(0 %)
1,266,447
(5.89 %)
36,847
(3.12 %)
31,115
(1.65 %)
472 rock ptarmigan (primary hap 2022 refseq)
GCF_023343835.1
51,619
(7.29 %)
n/a 12,832
(2.31 %)
23,047
(2.56 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
0
(0 %)
210
(0.01 %)
165
(100.00 %)
526,839
(5.87 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,345
(21.73 %)
0
(0 %)
216,565
(1.89 %)
21,346
(2.37 %)
19,067
(1.48 %)
473 rouch bullseye (RE-2024b hap1 2024 refseq)
GCF_042242105.1
32,256
(9.05 %)
n/a 15,283
(3.03 %)
44,299
(6.93 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
87
(0.00 %)
441
(100.00 %)
1,115,191
(21.73 %)
271,391
(5.93 %)
3,651,073
(24.53 %)
2
(0.00 %)
299,227
(3.11 %)
19,771
(1.39 %)
13,537
(0.81 %)
474 royal ground snake (hap1 2023 refseq)
GCF_031021105.1
45,143
(3.26 %)
n/a 13,488
(0.98 %)
20,353
(1.68 %)
n/a 41.25
(99.99 %)
0
(0 %)
1,391
(0.01 %)
400
(100.00 %)
6,118,914
(59.42 %)
1,698,731
(7.29 %)
9,084,283
(53.44 %)
11
(0.00 %)
1,523,662
(5.77 %)
130,852
(4.47 %)
24,852
(0.74 %)
475 rudd (fScaEry2.hap1.1 2024)
GCA_964197995.1
n/a n/a 18,254
(2.38 %)
68,852
(5.71 %)
n/a 39.02
(99.99 %)
4
(0.00 %)
836
(0.01 %)
759
(100.00 %)
2,854,977
(51.13 %)
754,287
(11.81 %)
5,942,764
(44.17 %)
2
(0.00 %)
1,392,734
(8.61 %)
72,686
(4.52 %)
23,184
(0.94 %)
476 rufous frog (hap2 2023)
GCA_031893055.1
n/a n/a 13,538
(0.88 %)
24,311
(2.15 %)
n/a 42.96
(99.07 %)
0
(0 %)
976
(0.93 %)
1,266
(100.00 %)
711,895
(2.18 %)
1,219,160
(21.56 %)
7,988,458
(54.14 %)
3
(0.00 %)
3,097,457
(9.48 %)
170,920
(3.48 %)
17,791
(0.40 %)
477 saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_949987515.2
46,014
(2.36 %)
n/a 18,616
(1.49 %)
20,618
(1.32 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
968
(0.01 %)
1,598
(99.99 %)
4,020,525
(35.99 %)
1,258,165
(13.09 %)
12,359,758
(42.64 %)
0
(0 %)
1,475,119
(4.19 %)
66,188
(3.91 %)
41,466
(1.03 %)
478 Saker falcon (primary hap 2022 refseq)
GCF_023634085.1
50,290
(5.75 %)
n/a 12,973
(1.67 %)
21,670
(1.90 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
0
(0 %)
258
(0.30 %)
283
(100.00 %)
548,090
(7.21 %)
201,488
(8.55 %)
7,030,877
(24.94 %)
0
(0 %)
469,777
(2.60 %)
31,791
(2.57 %)
20,215
(0.89 %)
479 salamanderfish (hap1 2025)
GCA_049190665.1
n/a n/a 15,661
(2.59 %)
68,929
(8.14 %)
n/a 45.02
(99.96 %)
0
(0 %)
1,365
(0.04 %)
2,987
(100.00 %)
2,234,544
(43.47 %)
1,192,255
(16.84 %)
3,383,827
(41.37 %)
24
(0.00 %)
1,076,867
(10.26 %)
108,808
(9.86 %)
61,891
(4.06 %)
480 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887145.1
27,528
(4.03 %)
n/a 12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
0
(0 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
1
(0.00 %)
651,029
(4.07 %)
35,549
(5.05 %)
23,802
(1.15 %)
481 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1
n/a n/a 14,065
(1.09 %)
19,430
(1.84 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
21
(0.00 %)
21
(0.00 %)
155
(100.00 %)
1,307,771
(5.32 %)
672,054
(3.42 %)
9,846,806
(39.03 %)
0
(0 %)
665,794
(3.10 %)
83,805
(3.99 %)
26,762
(0.80 %)
482 San Diegan tiger whiptail (v1.1 HBS 135688 primary hap 2025)
GCA_023333525.2
n/a n/a 13,255
(1.15 %)
17,876
(1.96 %)
n/a 43.28
(100.00 %)
0
(0 %)
110
(0.00 %)
186
(100.00 %)
907,854
(6.31 %)
539,629
(5.57 %)
8,277,961
(39.11 %)
3
(0.00 %)
940,971
(3.87 %)
51,910
(2.22 %)
19,860
(0.82 %)
483 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 refseq)
GCF_023053635.1
33,415
(3.07 %)
n/a 14,091
(1.15 %)
19,337
(1.96 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
0
(0 %)
73
(0.00 %)
34
(100.00 %)
1,577,747
(7.81 %)
774,112
(3.78 %)
9,248,016
(40.42 %)
1
(0.00 %)
823,646
(3.44 %)
80,183
(2.48 %)
27,586
(0.82 %)
484 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1
41,701
(3.64 %)
n/a 14,350
(1.48 %)
19,231
(2.45 %)
32,804
(4.14 %)
43.75
(99.75 %)
0
(0 %)
379
(0.25 %)
29
(100.00 %)
975,474
(5.32 %)
425,414
(1.76 %)
7,135,165
(34.49 %)
0
(0 %)
365,268
(2.50 %)
76,053
(2.68 %)
21,615
(0.85 %)
485 sardine (primary hap 2023 refseq)
GCF_963854185.1
48,146
(9.15 %)
n/a 16,069
(2.33 %)
64,178
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
240
(100.00 %)
1,503,108
(11.74 %)
1,507,022
(15.48 %)
4,027,614
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,852
(8.48 %)
68,873
(3.56 %)
38,589
(1.78 %)
486 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1
108,406
(1.98 %)
n/a 13,959
(0.46 %)
n/a n/a 43.90
(99.99 %)
0
(0 %)
2,297
(0.01 %)
3,474
(100.00 %)
1,903,654
(2.85 %)
2,970,691
(16.56 %)
15,354,577
(64.31 %)
20
(0.00 %)
n/a 652,708
(8.36 %)
43,665
(0.45 %)
487 Savannah sparrow (primary hap 2023)
GCA_031885435.1
n/a n/a 12,986
(1.66 %)
27,028
(2.29 %)
n/a 43.66
(99.78 %)
0
(0 %)
249
(0.22 %)
110
(100.00 %)
464,600
(3.28 %)
681,402
(9.28 %)
6,314,744
(26.92 %)
0
(0 %)
939,361
(5.26 %)
39,406
(5.26 %)
25,911
(1.19 %)
488 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025)
GCA_964146895.2
n/a n/a 18,109
(2.10 %)
21,263
(1.89 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
0
(0 %)
140
(0.00 %)
186
(100.00 %)
2,812,261
(34.39 %)
457,565
(5.58 %)
10,220,083
(31.02 %)
0
(0 %)
662,735
(2.58 %)
59,522
(2.81 %)
54,315
(2.29 %)
489 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1
41,241
(6.50 %)
n/a 7,638
(0.70 %)
36,336
(4.06 %)
83,714
(10.03 %)
48.31
(98.62 %)
0
(0 %)
930
(1.38 %)
1,434
(100.00 %)
1,920,851
(39.36 %)
1,194,165
(21.47 %)
5,320,620
(50.50 %)
4
(0.00 %)
2,982,736
(13.77 %)
178,590
(35.88 %)
120,128
(5.32 %)
490 sea stickleback (SK-2024b hap1 2025)
GCA_048126635.1
n/a n/a 14,310
(4.44 %)
47,336
(10.19 %)
n/a 44.83
(99.99 %)
0
(0 %)
241
(0.01 %)
38
(100.00 %)
446,827
(13.86 %)
192,599
(8.52 %)
2,033,160
(22.85 %)
1
(0.00 %)
175,997
(3.04 %)
61,012
(13.03 %)
47,420
(5.99 %)
491 seaside sparrow (bAmmMar1 primary hap 2024)
GCA_036010785.1
n/a n/a 12,858
(1.52 %)
25,777
(2.02 %)
n/a 44.04
(99.85 %)
0
(0 %)
365
(0.15 %)
501
(100.00 %)
580,376
(4.24 %)
636,266
(12.18 %)
4,804,433
(34.52 %)
0
(0 %)
1,048,820
(7.41 %)
48,871
(4.18 %)
23,097
(1.00 %)
492 sei whale (hap1.1 2025)
GCA_965194805.1
n/a n/a 19,292
(1.27 %)
21,865
(1.14 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
0
(0 %)
1,179
(0.01 %)
2,572
(100.00 %)
4,525,289
(42.25 %)
1,097,216
(21.14 %)
12,203,884
(50.47 %)
12
(0.00 %)
2,217,448
(6.14 %)
80,128
(1.58 %)
44,102
(0.91 %)
493 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1
n/a n/a 15,032
(2.44 %)
62,625
(6.97 %)
n/a 42.07
(99.98 %)
0
(0 %)
598
(0.02 %)
847
(100.00 %)
967,197
(11.85 %)
498,286
(8.15 %)
4,397,828
(28.96 %)
9
(0.00 %)
531,478
(4.46 %)
65,744
(4.06 %)
42,870
(2.25 %)
494 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 refseq)
GCA_035084215.1
n/a n/a 12,780
(0.49 %)
24,543
(1.38 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
0
(0 %)
1,834
(0.01 %)
1,880
(100.00 %)
597,122
(2.28 %)
1,112,137
(17.97 %)
12,108,056
(57.48 %)
2
(0.00 %)
4,824,033
(9.23 %)
117,585
(3.42 %)
24,151
(0.35 %)
495 sharptooth jobfish (hap1 2024)
GCA_045363895.1
n/a n/a 15,800
(1.77 %)
51,791
(4.52 %)
n/a 39.82
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
283
(100.00 %)
777,839
(3.19 %)
459,791
(3.90 %)
7,958,604
(35.17 %)
0
(0 %)
375,713
(2.47 %)
21,711
(0.94 %)
12,537
(0.40 %)
496 sheep (hu hu3095 2024)
GCA_040805955.1
n/a 21,525
(1.22 %)
19,388
(1.42 %)
21,612
(1.28 %)
n/a 43.17
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28
(100.00 %)
5,311,536
(44.06 %)
653,238
(7.29 %)
12,937,231
(44.10 %)
0
(0 %)
1,552,087
(3.95 %)
63,230
(6.03 %)
40,222
(0.90 %)
497 siamang (v2.1 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.3
105,374
(3.05 %)
n/a 20,434
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
0
(0 %)
2
(0.03 %)
27
(100.00 %)
5,354,446
(55.80 %)
935,620
(14.70 %)
14,917,515
(46.01 %)
0
(0 %)
2,398,386
(4.90 %)
92,243
(1.42 %)
27,998
(0.68 %)
498 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4
59,278
(19.85 %)
n/a 14,594
(4.32 %)
55,265
(10.96 %)
n/a 45.31
(99.99 %)
0
(0 %)
321
(0.01 %)
36
(100.00 %)
384,203
(19.38 %)
175,898
(4.39 %)
1,946,630
(23.16 %)
2
(0.00 %)
209,905
(4.10 %)
70,331
(13.13 %)
54,790
(7.31 %)
499 silver spinyfin (hap1 2025)
GCA_048569125.1
n/a n/a 16,906
(1.39 %)
115,931
(7.77 %)
n/a 44.10
(99.96 %)
0
(0 %)
3,365
(0.04 %)
5,504
(100.00 %)
4,606,608
(53.63 %)
1,428,326
(25.54 %)
4,395,832
(51.22 %)
36
(0.00 %)
3,286,557
(14.58 %)
166,807
(7.52 %)
42,772
(1.63 %)
500 silver-eye (hap1.1 2025)
GCA_965231275.1
n/a n/a 13,156
(1.86 %)
25,666
(2.48 %)
n/a 42.29
(99.99 %)
0
(0 %)
703
(0.01 %)
427
(100.00 %)
484,761
(3.51 %)
588,871
(4.76 %)
6,251,918
(22.33 %)
3
(0.00 %)
361,727
(2.40 %)
33,754
(2.58 %)
21,736
(1.04 %)
501 Skyros wall lizard (v2 hap1 2024)
GCA_964106915.2
n/a n/a 14,245
(1.36 %)
19,892
(2.29 %)
n/a 43.82
(99.99 %)
0
(0 %)
883
(0.01 %)
211
(100.00 %)
838,357
(3.88 %)
479,922
(4.42 %)
7,039,963
(38.21 %)
7
(0.00 %)
598,611
(3.50 %)
93,005
(2.80 %)
19,317
(0.73 %)
502 slow loris (primary hap 2022)
GCF_027406575.1
67,211
(2.59 %)
n/a 22,193
(1.49 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 40.82
(99.86 %)
0
(0 %)
218
(0.14 %)
84
(100.00 %)
4,625,872
(39.88 %)
579,983
(1.59 %)
14,405,367
(40.78 %)
2
(0.00 %)
991,294
(2.40 %)
38,257
(0.77 %)
22,955
(0.54 %)
503 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2
n/a n/a 12,587
(0.36 %)
23,986
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
0
(0 %)
7,146
(1.52 %)
645
(100.00 %)
1,451,634
(1.94 %)
1,448,619
(6.25 %)
20,884,741
(51.41 %)
10
(0.00 %)
3,334,909
(4.99 %)
456,658
(8.18 %)
31,096
(0.32 %)
504 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1
34,018
(4.17 %)
n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
0
(0 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
17
(0.00 %)
1,796,705
(8.53 %)
143,632
(7.43 %)
65,914
(2.15 %)
505 smalltooth sawfish (v2.1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1
40,257
(2.94 %)
n/a 12,157
(0.69 %)
18,627
(1.55 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
0
(0 %)
698
(0.91 %)
172
(100.00 %)
4,824,261
(54.91 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,260
(38.19 %)
0
(0 %)
471,344
(1.50 %)
45,398
(1.34 %)
18,410
(0.41 %)
506 snake N.helvetica (rNatHel1.hap1.1 2024)
GCA_964273705.1
n/a n/a 13,534
(1.08 %)
19,681
(1.86 %)
n/a 41.70
(99.98 %)
7
(0.00 %)
2,010
(0.02 %)
494
(100.00 %)
1,264,981
(8.07 %)
885,992
(7.35 %)
8,475,795
(46.16 %)
10
(0.00 %)
746,296
(3.32 %)
117,174
(4.31 %)
24,893
(0.73 %)
507 song sparrow (primary hap 2024 refseq)
GCF_035770615.1
41,069
(3.95 %)
n/a 12,946
(1.39 %)
26,698
(1.87 %)
n/a 44.96
(99.93 %)
0
(0 %)
299
(0.07 %)
353
(100.00 %)
515,851
(3.07 %)
681,436
(15.73 %)
5,004,851
(39.23 %)
1
(0.00 %)
1,925,213
(9.14 %)
47,268
(3.90 %)
25,117
(0.99 %)
508 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1
n/a n/a 18,056
(1.78 %)
21,158
(1.79 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
6
(0.00 %)
161
(0.00 %)
249
(100.00 %)
2,899,535
(21.64 %)
853,717
(7.80 %)
10,162,216
(37.72 %)
1
(0.00 %)
802,761
(2.85 %)
63,256
(3.06 %)
61,642
(2.03 %)
509 South Island takahe (primary hap 2021)
GCA_020800305.1
n/a n/a 12,942
(1.69 %)
23,221
(2.13 %)
n/a 43.74
(99.58 %)
0
(0 %)
327
(0.42 %)
174
(100.00 %)
577,553
(9.77 %)
259,017
(5.20 %)
6,430,968
(25.90 %)
1
(0.00 %)
437,634
(2.97 %)
23,810
(2.02 %)
20,060
(1.16 %)
510 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
n/a 15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
0
(0 %)
326,254
(3.37 %)
14,097
(0.88 %)
8,860
(0.42 %)
511 Southern dwarf chameleon (Gauteng JTBG20232 2024)
GCA_035047345.1
n/a n/a 13,671
(0.83 %)
18,931
(1.39 %)
n/a 44.53
(100.00 %)
22
(0.00 %)
22
(0.00 %)
135
(100.00 %)
1,004,404
(4.81 %)
870,596
(5.97 %)
9,017,362
(54.42 %)
0
(0 %)
1,622,797
(5.80 %)
217,977
(8.25 %)
19,831
(0.36 %)
512 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1
47,152
(2.39 %)
n/a 19,356
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
0
(0 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,460
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,540,762
(32.73 %)
0
(0 %)
547,538
(1.62 %)
18,046
(0.54 %)
16,132
(0.42 %)
513 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1
n/a n/a 20,058
(1.26 %)
22,196
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
961
(0.56 %)
201
(100.00 %)
4,037,291
(46.02 %)
593,019
(1.17 %)
18,033,833
(40.56 %)
9
(0.00 %)
500,101
(1.40 %)
65,039
(1.33 %)
38,121
(0.86 %)
514 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1
63,054
(2.39 %)
n/a 21,998
(1.29 %)
23,177
(1.18 %)
45,345
(1.69 %)
39.89
(97.48 %)
0
(0 %)
1,243
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,559,690
(39.66 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,630
(40.50 %)
4
(0.00 %)
492,026
(1.69 %)
51,430
(1.14 %)
40,148
(0.81 %)
515 Sowerby's beaked whale (hap1 2024)
GCA_964165515.1
n/a n/a 19,471
(1.39 %)
22,951
(1.24 %)
n/a 42.04
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,095
(0.01 %)
1,604
(100.00 %)
4,307,839
(34.31 %)
825,475
(10.97 %)
11,375,945
(45.31 %)
11
(0.00 %)
3,517,431
(7.94 %)
76,527
(3.10 %)
39,378
(0.86 %)
516 spangled emperor (hap1 2024)
GCA_045362495.1
n/a n/a 15,554
(1.75 %)
58,641
(5.19 %)
n/a 40.59
(100.00 %)
0
(0 %)
196
(0.00 %)
226
(100.00 %)
682,449
(3.01 %)
409,809
(4.43 %)
7,114,584
(28.98 %)
6
(0.00 %)
539,832
(3.67 %)
37,214
(1.53 %)
18,727
(0.64 %)
517 speckled mousebird (hap1 2023 refseq)
GCF_028858725.1
37,067
(4.23 %)
n/a 12,815
(1.76 %)
23,175
(2.17 %)
n/a 42.29
(99.52 %)
0
(0 %)
161
(0.48 %)
191
(100.00 %)
572,944
(12.88 %)
256,368
(3.55 %)
5,868,966
(23.42 %)
1
(0.00 %)
412,827
(2.70 %)
27,158
(2.30 %)
20,935
(1.20 %)
518 speckled wood butterfly (refseq 2021)
GCF_905163445.1
21,720
(6.53 %)
n/a 4,713
(0.87 %)
17,001
(4.33 %)
29,238
(7.81 %)
35.99
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
70
(100.00 %)
304,062
(2.97 %)
110,824
(4.09 %)
3,704,161
(44.42 %)
1
(0.00 %)
144,758
(2.93 %)
28,108
(2.75 %)
11,566
(0.96 %)
519 spotted gar (fLepOcu1hap2 2024)
GCF_040954835.1
64,638
(7.15 %)
n/a 13,839
(1.51 %)
23,965
(3.48 %)
n/a 40.66
(100.00 %)
0
(0 %)
95
(0.00 %)
816
(100.00 %)
1,319,033
(34.80 %)
245,717
(12.50 %)
5,536,919
(38.20 %)
0
(0 %)
787,990
(5.83 %)
57,935
(3.78 %)
37,077
(1.64 %)
520 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1
n/a n/a 10,694
(1.38 %)
13,221
(2.62 %)
n/a 42.85
(99.96 %)
0
(0 %)
1,952
(0.04 %)
532
(100.00 %)
3,108,151
(44.68 %)
498,592
(6.00 %)
5,634,132
(43.16 %)
4
(0.00 %)
685,165
(4.19 %)
50,785
(2.94 %)
25,542
(1.57 %)
521 spotted sea bass (ZS-2023 2023)
GCA_031216445.1
n/a n/a 15,425
(3.14 %)
43,414
(6.98 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 109
(100.00 %)
447,804
(3.49 %)
241,876
(3.25 %)
3,757,088
(26.25 %)
0
(0 %)
249,394
(3.97 %)
23,346
(2.49 %)
17,158
(1.22 %)
522 spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025)
GCA_048593285.1
n/a n/a 15,188
(0.80 %)
15,406
(0.90 %)
n/a 36.07
(99.97 %)
151
(0.03 %)
151
(0.03 %)
157
(99.97 %)
4,933,924
(23.65 %)
1,239,006
(2.76 %)
20,612,787
(41.98 %)
1
(0.00 %)
575,621
(1.68 %)
21,700
(0.64 %)
21,289
(0.49 %)
523 starry smooth-hound (sMusAst1.hap1.1 2024)
GCA_964213995.1
n/a n/a 12,755
(0.42 %)
23,706
(1.15 %)
n/a 45.69
(99.98 %)
0
(0 %)
3,590
(0.02 %)
5,314
(100.00 %)
1,153,000
(3.16 %)
1,250,073
(11.36 %)
14,207,513
(54.93 %)
42
(0.00 %)
4,695,339
(7.91 %)
114,313
(3.65 %)
15,576
(0.19 %)
524 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1
110,154
(7.62 %)
n/a 25,364
(1.76 %)
40,715
(4.06 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
0
(0 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
10
(0.00 %)
1,593,747
(6.87 %)
64,522
(2.85 %)
21,984
(0.89 %)
525 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024)
GCA_043727835.1
n/a n/a 19,605
(1.80 %)
20,075
(1.48 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
5
(0.00 %)
87
(0.00 %)
80
(100.00 %)
4,110,913
(40.46 %)
838,212
(2.48 %)
11,938,168
(33.52 %)
2
(0.00 %)
646,825
(2.22 %)
40,424
(1.32 %)
35,299
(1.15 %)
526 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1
n/a n/a 16,419
(3.98 %)
40,677
(7.21 %)
n/a 39.69
(99.97 %)
0
(0 %)
825
(0.03 %)
100
(100.00 %)
1,324,513
(39.84 %)
143,170
(9.30 %)
3,000,881
(34.30 %)
1
(0.00 %)
392,291
(5.75 %)
30,130
(3.71 %)
15,123
(1.03 %)
527 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1
53,860
(11.99 %)
n/a 16,033
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
0
(0 %)
236
(0.51 %)
58
(100.00 %)
1,870,234
(37.80 %)
605,570
(6.82 %)
5,059,429
(32.43 %)
2
(0.00 %)
531,388
(4.26 %)
17,919
(1.29 %)
12,796
(0.75 %)
528 striped dolphin (primary hap 2023)
GCA_951394435.1
n/a n/a 18,595
(1.48 %)
20,637
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1
(0.00 %)
993
(0.01 %)
639
(100.00 %)
4,097,623
(35.88 %)
1,442,973
(13.60 %)
12,327,244
(43.08 %)
1
(0.00 %)
1,896,129
(5.45 %)
68,498
(4.29 %)
42,011
(1.04 %)
529 Sumatran orangutan (v2 AG06213 primary hap 2024 refseq)
GCF_028885655.2
102,148
(3.49 %)
n/a 20,870
(1.72 %)
21,383
(1.14 %)
n/a 40.88
(99.75 %)
0
(0 %)
11
(0.25 %)
30
(100.00 %)
5,567,810
(54.83 %)
1,092,396
(10.36 %)
16,195,884
(42.80 %)
0
(0 %)
2,491,180
(4.29 %)
44,397
(1.13 %)
30,587
(0.77 %)
530 Suruca trogon (primary hap 2021)
GCA_020746105.1
n/a n/a 12,884
(1.85 %)
23,805
(2.23 %)
n/a 42.80
(99.12 %)
0
(0 %)
253
(0.88 %)
182
(100.00 %)
539,771
(9.26 %)
181,564
(1.14 %)
6,538,228
(22.49 %)
1
(0.00 %)
138,653
(1.22 %)
41,376
(3.37 %)
36,105
(2.01 %)
531 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1
n/a n/a 12,226
(1.01 %)
14,117
(1.42 %)
n/a 43.77
(100.00 %)
0
(0 %)
361
(0.00 %)
199
(100.00 %)
1,202,345
(11.93 %)
304,674
(1.45 %)
9,752,924
(32.81 %)
0
(0 %)
314,037
(1.63 %)
92,993
(2.75 %)
20,902
(0.60 %)
532 Swainson's thrush (v2 primary hap 2020)
GCF_009819885.2
40,121
(5.41 %)
n/a 13,004
(1.87 %)
24,795
(2.41 %)
n/a 42.48
(98.86 %)
0
(0 %)
429
(1.14 %)
160
(100.00 %)
493,071
(5.80 %)
589,858
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
1
(0.00 %)
449,511
(2.41 %)
49,404
(3.53 %)
22,206
(1.16 %)
533 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018845.1
29,544
(4.27 %)
n/a 12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
0
(0 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
1
(0.00 %)
578,723
(3.93 %)
32,064
(3.27 %)
22,996
(1.19 %)
534 Swan (goose HZ-2024a 2024)
GCF_040182565.1
68,379
(7.95 %)
n/a 13,715
(1.90 %)
24,704
(2.28 %)
n/a 43.07
(100.00 %)
0
(0 %)
42
(0.00 %)
75
(100.00 %)
780,603
(10.80 %)
463,894
(5.65 %)
6,593,404
(24.63 %)
0
(0 %)
490,134
(3.23 %)
41,265
(4.48 %)
36,805
(2.27 %)
535 swift parrot (hap1 2024)
GCF_037157495.1
50,082
(5.09 %)
n/a 12,974
(1.75 %)
22,545
(2.07 %)
n/a 42.67
(99.82 %)
0
(0 %)
186
(0.18 %)
367
(100.00 %)
541,918
(6.97 %)
347,387
(6.90 %)
5,657,314
(26.08 %)
2
(0.01 %)
468,943
(3.28 %)
25,816
(2.01 %)
22,033
(1.31 %)
536 tailed frog (A.truei hap1 2024)
GCA_040206685.1
n/a n/a 14,490
(0.54 %)
41,227
(1.77 %)
n/a 44.92
(99.97 %)
0
(0 %)
6,020
(0.03 %)
3,549
(100.00 %)
1,783,455
(4.78 %)
3,426,339
(20.31 %)
15,662,323
(55.70 %)
33
(0.00 %)
5,614,148
(11.20 %)
442,764
(6.61 %)
73,225
(0.88 %)
537 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq)
GCF_028372415.1
73,219
(3.07 %)
n/a 17,615
(0.77 %)
15,415
(0.86 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
0
(0 %)
515
(0.19 %)
272
(100.00 %)
5,866,314
(26.30 %)
1,193,604
(2.72 %)
22,677,480
(39.53 %)
4
(0.00 %)
565,991
(1.21 %)
23,590
(0.47 %)
14,746
(0.29 %)
538 Tasmanian devil (McLovin hap1 2025)
GCA_048593225.1
n/a n/a 15,725
(0.77 %)
16,721
(0.92 %)
n/a 36.17
(99.49 %)
1,514
(0.51 %)
1,514
(0.51 %)
1,521
(99.49 %)
5,222,976
(23.42 %)
1,357,438
(3.95 %)
21,705,122
(42.26 %)
2
(0.00 %)
779,205
(1.97 %)
24,443
(0.70 %)
24,411
(0.52 %)
539 Tasmanian devil (primary hap 2019)
GCF_902635505.1
52,057
(2.36 %)
n/a 15,918
(0.85 %)
16,111
(0.91 %)
n/a 36.16
(100.00 %)
0
(0 %)
354
(0.00 %)
106
(100.00 %)
6,789,158
(44.28 %)
1,246,027
(2.19 %)
21,434,803
(41.20 %)
1
(0.00 %)
454,463
(1.20 %)
23,609
(0.65 %)
23,356
(0.61 %)
540 tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023)
GCA_028020825.1
n/a n/a 13,321
(1.76 %)
24,102
(2.15 %)
n/a 42.35
(99.83 %)
0
(0 %)
203
(0.17 %)
1,038
(100.00 %)
593,409
(10.51 %)
202,463
(9.29 %)
6,160,173
(27.65 %)
1
(0.00 %)
529,082
(2.97 %)
25,785
(2.35 %)
21,960
(1.26 %)
541 tawny owl (hap1 2023)
GCA_031877795.1
n/a n/a 13,204
(1.60 %)
23,981
(1.99 %)
n/a 42.70
(99.70 %)
9
(0.15 %)
281
(0.30 %)
212
(99.85 %)
443,228
(4.74 %)
272,738
(10.86 %)
5,812,837
(27.42 %)
1
(0.00 %)
406,171
(2.45 %)
30,602
(2.52 %)
26,399
(1.26 %)
542 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1
n/a n/a 14,720
(2.58 %)
45,918
(6.44 %)
n/a 40.37
(99.99 %)
0
(0 %)
454
(0.01 %)
188
(100.00 %)
1,242,704
(17.37 %)
518,293
(15.23 %)
3,986,694
(40.18 %)
1
(0.00 %)
670,254
(6.56 %)
51,441
(3.53 %)
22,258
(1.30 %)
543 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1
n/a n/a 15,347
(2.73 %)
50,294
(7.25 %)
n/a 42.30
(99.98 %)
30
(0.00 %)
610
(0.02 %)
393
(100.00 %)
1,157,324
(26.70 %)
229,196
(4.33 %)
3,694,790
(27.54 %)
1
(0.00 %)
385,033
(4.63 %)
38,929
(2.20 %)
24,476
(1.25 %)
544 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020)
GCF_010909765.2
45,968
(2.40 %)
n/a 11,437
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
n/a 44.30
(92.54 %)
0
(0 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
888,163
(2.58 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
26
(0.00 %)
1,634,606
(4.98 %)
242,676
(4.73 %)
31,030
(0.57 %)
545 three-spined stickleback (hap1 2024)
GCA_964276395.1
n/a n/a 14,939
(3.72 %)
56,284
(10.07 %)
n/a 44.71
(99.99 %)
3
(0.00 %)
331
(0.01 %)
133
(100.00 %)
573,569
(20.53 %)
206,699
(9.01 %)
2,335,009
(27.29 %)
7
(0.00 %)
213,153
(3.82 %)
84,009
(12.41 %)
57,803
(5.54 %)
546 tiny Cayenne caecilian (v2 2021)
GCA_901765095.2
n/a n/a 14,569
(0.43 %)
30,498
(1.16 %)
n/a 44.01
(98.99 %)
0
(0 %)
2,452
(1.01 %)
1,081
(100.00 %)
1,894,383
(1.68 %)
1,670,443
(3.30 %)
22,207,143
(52.43 %)
5
(0.00 %)
1,718,803
(3.44 %)
414,828
(3.91 %)
47,796
(0.38 %)
547 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3
n/a n/a 14,527
(4.79 %)
51,181
(11.72 %)
n/a 45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
325,077
(14.03 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,754
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,975
(9.63 %)
37,920
(5.08 %)
548 tourmaline sunangel (hap1 2024 refseq)
GCF_036169615.1
50,562
(5.87 %)
n/a 12,509
(1.97 %)
21,020
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.99 %)
0
(0 %)
437
(0.01 %)
131
(100.00 %)
532,200
(5.46 %)
332,284
(2.69 %)
6,084,721
(21.20 %)
0
(0 %)
215,258
(1.71 %)
19,080
(1.72 %)
15,764
(1.09 %)
549 Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230055.1
n/a n/a 19,370
(1.77 %)
21,062
(1.61 %)
n/a 42.81
(100.00 %)
219
(0.00 %)
219
(0.00 %)
610
(100.00 %)
2,923,694
(25.49 %)
772,382
(3.25 %)
10,654,074
(37.41 %)
2
(0.00 %)
500,435
(1.74 %)
48,226
(2.42 %)
50,955
(1.88 %)
550 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1
n/a n/a 18,627
(1.82 %)
20,108
(1.67 %)
n/a 42.95
(100.00 %)
0
(0 %)
217
(0.00 %)
182
(100.00 %)
2,733,927
(24.79 %)
715,258
(3.17 %)
10,099,456
(36.35 %)
1
(0.00 %)
459,634
(1.69 %)
47,139
(2.58 %)
49,626
(1.96 %)
551 trahira (v1 hap2 2023)
GCA_029633875.1
n/a n/a 16,216
(2.00 %)
45,209
(4.32 %)
n/a 41.03
(96.02 %)
0
(0 %)
907
(3.98 %)
452
(100.00 %)
2,280,303
(30.80 %)
708,327
(15.59 %)
5,394,248
(39.01 %)
7
(0.00 %)
1,246,906
(7.61 %)
28,386
(2.18 %)
12,439
(0.46 %)
552 trahira (v2 hap1 2024 genbank)
GCA_029633855.2
n/a n/a 17,256
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
0
(0 %)
989
(5.49 %)
597
(100.00 %)
2,407,631
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,418
(37.52 %)
3
(0.00 %)
1,264,125
(7.29 %)
29,012
(2.12 %)
12,979
(0.45 %)
553 trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024)
GCA_043728145.1
n/a n/a 18,871
(1.79 %)
20,351
(1.55 %)
n/a 40.66
(99.99 %)
10
(0.00 %)
397
(0.01 %)
136
(100.00 %)
3,580,957
(40.75 %)
683,947
(2.19 %)
11,464,418
(33.39 %)
23
(0.00 %)
658,821
(2.63 %)
37,175
(1.31 %)
29,161
(1.04 %)
554 True's beaked whale (hap1.1 2024)
GCA_964341445.1
n/a n/a 19,530
(1.21 %)
24,576
(1.13 %)
n/a 42.48
(99.99 %)
0
(0 %)
1,240
(0.01 %)
2,757
(100.00 %)
4,847,855
(34.88 %)
949,927
(20.01 %)
10,981,914
(51.51 %)
11
(0.00 %)
5,641,807
(11.20 %)
91,880
(2.74 %)
39,724
(0.76 %)
555 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301465.1
n/a n/a 14,730
(2.84 %)
50,956
(7.07 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
179
(0.00 %)
161
(100.00 %)
548,208
(5.35 %)
356,364
(7.30 %)
3,448,877
(26.01 %)
2
(0.00 %)
449,816
(4.07 %)
26,685
(1.80 %)
17,280
(1.06 %)
556 tufted duck (2019)
GCF_009819795.1
29,492
(4.02 %)
n/a 12,972
(1.98 %)
22,757
(2.27 %)
n/a 41.66
(99.16 %)
0
(0 %)
163
(0.84 %)
105
(100.00 %)
826,451
(8.47 %)
411,356
(1.71 %)
6,691,445
(22.36 %)
1
(0.00 %)
93,916
(0.94 %)
29,882
(2.41 %)
27,027
(1.51 %)
557 tundra swan (primary hap 2025)
GCA_965151615.1
n/a n/a 13,371
(1.77 %)
23,897
(2.09 %)
n/a 45.04
(99.99 %)
5
(0.00 %)
540
(0.01 %)
608
(100.00 %)
745,129
(5.82 %)
484,265
(9.62 %)
6,249,520
(28.78 %)
0
(0 %)
756,733
(4.48 %)
46,110
(11.14 %)
32,575
(1.93 %)
558 Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 refseq)
GCF_040894005.1
55,552
(3.50 %)
n/a 13,678
(0.88 %)
29,722
(2.41 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
0
(0 %)
436
(0.00 %)
936
(100.00 %)
734,279
(2.54 %)
1,217,326
(21.42 %)
8,925,807
(52.53 %)
6
(0.00 %)
3,231,587
(10.49 %)
211,590
(5.08 %)
23,983
(0.47 %)
559 tunicate A.aspersa (primary hap 2024)
GCA_963924565.1
n/a n/a 3,379
(0.93 %)
17,530
(9.16 %)
n/a 37.03
(99.98 %)
0
(0 %)
393
(0.02 %)
75
(100.00 %)
67,051
(2.43 %)
80,550
(6.04 %)
2,322,081
(35.06 %)
15
(0.01 %)
203,240
(7.43 %)
18,716
(4.75 %)
16,318
(2.10 %)
560 tunicate A.turbinatum (primary hap 2021)
GCA_918807975.1
n/a n/a 4,108
(0.57 %)
18,445
(6.84 %)
n/a 37.60
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
27
(100.00 %)
104,021
(0.79 %)
186,953
(6.27 %)
2,895,772
(42.71 %)
0
(0 %)
297,254
(4.86 %)
23,070
(1.74 %)
4,064
(0.29 %)
561 tunicate S.clava (kaStyClav1.hap1.1 2024)
GCA_964204865.1
n/a n/a 3,512
(0.79 %)
12,277
(7.12 %)
n/a 36.05
(100.00 %)
0
(0 %)
34
(0.00 %)
389
(100.00 %)
83,928
(2.38 %)
78,714
(9.97 %)
2,178,959
(38.34 %)
1
(0.00 %)
404,850
(10.78 %)
5,872
(4.08 %)
1,012
(0.10 %)
562 tunicate T.clinides (primary hap 2023)
GCA_963675345.1
n/a n/a 3,900
(0.35 %)
20,903
(5.18 %)
n/a 38.10
(99.99 %)
8
(0.00 %)
646
(0.01 %)
200
(100.00 %)
132,343
(0.70 %)
116,603
(1.88 %)
5,956,725
(36.56 %)
11
(0.00 %)
202,574
(2.96 %)
17,996
(2.20 %)
4,411
(1.45 %)
563 tunicate T.democratica (hap1.1 2025)
GCA_965202585.1
n/a n/a 3,181
(0.26 %)
8,354
(2.15 %)
n/a 25.37
(99.99 %)
0
(0 %)
412
(0.01 %)
1,833
(100.00 %)
408,834
(2.66 %)
227,187
(6.88 %)
7,546,269
(60.01 %)
1
(0.00 %)
543,432
(7.14 %)
12,208
(0.89 %)
7,844
(0.45 %)
564 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1
n/a n/a 14,816
(3.44 %)
49,680
(8.16 %)
n/a 43.40
(99.97 %)
0
(0 %)
805
(0.03 %)
108
(100.00 %)
808,348
(19.20 %)
301,230
(7.15 %)
3,267,772
(25.91 %)
4
(0.00 %)
311,531
(3.41 %)
66,132
(6.90 %)
41,801
(3.31 %)
565 two-lined caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_901001135.2
n/a n/a 14,449
(0.38 %)
40,573
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
0
(0 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,274,606
(1.91 %)
2,036,107
(4.34 %)
29,400,957
(44.09 %)
9
(0.01 %)
2,193,249
(3.24 %)
602,911
(6.66 %)
94,934
(0.82 %)
566 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025)
GCA_965153285.1
n/a n/a 14,267
(1.41 %)
20,319
(2.40 %)
n/a 44.04
(99.99 %)
0
(0 %)
1,024
(0.01 %)
258
(100.00 %)
833,273
(4.46 %)
456,881
(4.04 %)
6,995,048
(37.06 %)
8
(0.00 %)
625,845
(3.64 %)
97,620
(3.04 %)
19,840
(0.78 %)
567 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1
60,106
(3.00 %)
n/a 18,611
(1.76 %)
20,103
(1.39 %)
35,176
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
0
(0 %)
212
(0.34 %)
64
(100.00 %)
4,067,454
(44.25 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,582
(35.55 %)
3
(0.00 %)
550,113
(1.71 %)
66,806
(1.79 %)
48,624
(1.46 %)
568 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 refseq)
GCF_026979565.1
44,961
(5.49 %)
n/a 12,817
(1.94 %)
24,245
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
0
(0 %)
458
(0.02 %)
177
(100.00 %)
616,746
(11.96 %)
411,917
(3.57 %)
6,385,057
(20.91 %)
6
(0.00 %)
306,942
(1.90 %)
37,940
(2.83 %)
24,967
(1.41 %)
569 village indigobird (purged dups hap OUT-0048 2022)
GCA_026979555.1
n/a n/a 2,176
(1.79 %)
7,719
(4.37 %)
n/a 49.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,939
(100.00 %)
136,312
(29.31 %)
157,341
(15.03 %)
648,725
(34.67 %)
0
(0 %)
221,251
(9.52 %)
15,490
(8.23 %)
7,383
(2.86 %)
570 warty frogfish (primary hap 2020)
GCA_013358685.1
n/a n/a 14,494
(3.34 %)
45,310
(7.77 %)
n/a 41.86
(99.87 %)
0
(0 %)
219
(0.13 %)
155
(100.00 %)
413,753
(4.95 %)
290,313
(6.11 %)
3,010,996
(29.71 %)
3
(0.00 %)
305,411
(3.51 %)
36,840
(4.18 %)
22,433
(1.95 %)
571 warty newt (primary hap 2024)
GCA_964204655.1
n/a n/a 16,124
(0.09 %)
186,006
(1.43 %)
n/a 45.53
(100.00 %)
118
(0.00 %)
4,698
(0.00 %)
1,422
(100.00 %)
4,239,451
(1.37 %)
8,714,648
(13.78 %)
84,859,372
(50.88 %)
38
(0.00 %)
10,611,791
(4.91 %)
2,159,665
(8.20 %)
541,086
(1.34 %)
572 West African lungfish (Aquariam Glaser DD20220218a primary hap 2024)
GCA_040939525.1
n/a n/a 14,330
(0.04 %)
83,285
(0.50 %)
n/a 39.97
(99.99 %)
0
(0 %)
24,438
(0.01 %)
7,125
(100.00 %)
17,253,560
(4.05 %)
15,370,489
(7.85 %)
31,563
(99.99 %)
127
(0.00 %)
2,868,526
(0.33 %)
548,408
(0.58 %)
524,351
(0.55 %)
573 western capercaillie (primary hap 2023)
GCA_951394365.1
n/a n/a 12,775
(2.33 %)
22,516
(2.50 %)
n/a 41.49
(99.98 %)
0
(0 %)
973
(0.02 %)
318
(100.00 %)
518,194
(5.54 %)
276,294
(2.21 %)
5,866,033
(21.12 %)
9
(0.00 %)
148,912
(1.44 %)
21,287
(2.50 %)
19,248
(1.54 %)
574 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1
61,103
(2.36 %)
n/a 18,125
(1.16 %)
20,689
(1.21 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
0
(0 %)
3,760
(0.03 %)
1,174
(100.00 %)
4,891,329
(19.68 %)
1,507,929
(3.81 %)
12,571,105
(54.50 %)
7
(0.00 %)
1,975,693
(4.67 %)
32,667
(0.90 %)
24,067
(0.56 %)
575 western lowland gorilla (v2.1 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.3
n/a n/a 21,010
(1.59 %)
50,695
(1.83 %)
n/a 40.49
(99.94 %)
0
(0 %)
2
(0.06 %)
26
(100.00 %)
5,456,271
(50.77 %)
1,060,267
(19.55 %)
15,870,225
(47.77 %)
0
(0 %)
1,391,066
(2.32 %)
69,745
(1.19 %)
30,644
(0.70 %)
576 western terrestrial garter snake (primary hap 2019)
GCF_009769535.1
33,492
(3.42 %)
n/a 13,074
(1.13 %)
18,807
(1.93 %)
31,660
(2.61 %)
40.95
(97.72 %)
0
(0 %)
1,518
(2.28 %)
365
(100.00 %)
1,271,255
(7.73 %)
979,057
(4.48 %)
8,396,200
(42.63 %)
0
(0 %)
801,068
(3.60 %)
81,829
(2.47 %)
23,152
(0.75 %)
577 whiskered bat (hap1 2024)
GCA_964094495.2
n/a n/a 19,504
(1.78 %)
22,272
(1.73 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
7
(0.00 %)
1,566
(0.02 %)
533
(100.00 %)
3,046,246
(25.06 %)
753,151
(4.86 %)
10,596,418
(37.62 %)
7
(0.00 %)
729,123
(2.57 %)
66,785
(2.55 %)
53,825
(1.76 %)
578 whiskered treeswift (primary hap 2021)
GCA_020745705.1
n/a n/a 12,681
(1.84 %)
21,784
(2.14 %)
n/a 42.12
(99.13 %)
0
(0 %)
218
(0.87 %)
146
(100.00 %)
520,200
(9.32 %)
170,778
(0.83 %)
6,455,910
(21.44 %)
0
(0 %)
98,619
(0.96 %)
24,061
(1.62 %)
17,982
(1.11 %)
579 white leghorn X broiler chicken (v2 leghorn haplotype 2021)
GCF_016700215.2
83,834
(10.16 %)
n/a 13,005
(2.32 %)
23,329
(2.48 %)
72,360
(9.39 %)
42.16
(99.57 %)
409
(0.43 %)
409
(0.43 %)
685
(99.57 %)
536,869
(6.00 %)
268,230
(2.28 %)
5,845,184
(20.93 %)
2
(0.00 %)
247,373
(2.08 %)
24,409
(2.60 %)
20,761
(1.55 %)
580 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1
59,982
(2.43 %)
n/a 18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
0
(0 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
2
(0.00 %)
1,117,804
(3.60 %)
68,551
(3.58 %)
41,698
(1.09 %)
581 white-crowned manakin (hap1 2024 refseq)
GCF_036250125.1
55,558
(6.99 %)
n/a 12,807
(1.82 %)
23,359
(2.28 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
323
(0.01 %)
696
(100.00 %)
429,643
(4.10 %)
293,428
(3.59 %)
6,059,402
(21.89 %)
0
(0 %)
366,452
(2.74 %)
29,574
(2.42 %)
21,946
(1.07 %)
582 white-rumped munia (maternal hap 2024)
GCA_046129695.1
n/a n/a 12,487
(1.71 %)
29,990
(2.73 %)
n/a 43.26
(100.00 %)
0
(0 %)
176
(0.00 %)
161
(100.00 %)
427,385
(3.06 %)
507,421
(10.23 %)
5,759,740
(27.66 %)
1
(0.00 %)
704,704
(4.47 %)
36,849
(5.10 %)
23,680
(1.12 %)
583 white-tailed eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_947461875.1
52,797
(5.74 %)
n/a 13,736
(1.76 %)
24,846
(2.12 %)
n/a 43.15
(99.99 %)
0
(0 %)
424
(0.01 %)
189
(100.00 %)
585,279
(12.89 %)
291,297
(6.10 %)
6,474,102
(23.66 %)
0
(0 %)
238,727
(1.67 %)
54,851
(4.05 %)
31,757
(1.50 %)
584 white-throated dipper (primary hap 2023 refseq)
GCF_963662255.1
29,618
(3.60 %)
n/a 12,854
(1.79 %)
23,825
(2.25 %)
n/a 42.82
(99.99 %)
0
(0 %)
658
(0.01 %)
277
(100.00 %)
431,531
(3.38 %)
345,532
(10.59 %)
5,840,421
(26.59 %)
1
(0.00 %)
617,892
(3.85 %)
29,711
(3.56 %)
21,555
(1.20 %)
585 white-throated sparrow (hap1 2025)
GCA_047830755.1
n/a n/a 12,983
(1.65 %)
33,925
(3.13 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
229
(0.00 %)
180
(100.00 %)
449,053
(3.16 %)
631,898
(8.80 %)
6,189,242
(27.24 %)
0
(0 %)
952,785
(5.59 %)
40,133
(2.67 %)
25,012
(1.16 %)
586 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1
40,430
(1.81 %)
n/a 17,575
(1.21 %)
21,880
(1.35 %)
47,496
(1.55 %)
39.81
(99.57 %)
0
(0 %)
1,010
(0.43 %)
147
(100.00 %)
2,846,063
(18.57 %)
1,252,362
(3.89 %)
13,776,063
(46.50 %)
14
(0.00 %)
1,059,317
(2.87 %)
24,589
(0.78 %)
20,877
(0.55 %)
587 white-tufted-ear marmoset (240 primary hap 2025)
GCA_049354715.1
n/a n/a 21,911
(1.84 %)
21,599
(1.26 %)
n/a 40.84
(99.99 %)
3
(0.01 %)
3
(0.01 %)
27
(99.99 %)
5,159,459
(47.46 %)
852,115
(5.34 %)
15,179,157
(39.68 %)
0
(0 %)
1,738,948
(3.39 %)
37,686
(0.94 %)
34,619
(0.82 %)
588 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 refseq)
GCF_011100555.1
104,419
(4.84 %)
n/a 21,801
(1.88 %)
21,467
(1.27 %)
n/a 40.92
(99.52 %)
0
(0 %)
1,165
(0.48 %)
1,233
(100.00 %)
5,036,591
(47.71 %)
842,846
(3.26 %)
15,161,534
(38.08 %)
2
(0.00 %)
1,256,018
(2.62 %)
37,603
(0.93 %)
34,471
(0.83 %)
589 whooping crane (maternal hap 2023 refseq)
GCF_028858705.1
55,408
(5.57 %)
n/a 13,574
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
0
(0 %)
262
(0.37 %)
930
(100.00 %)
616,300
(10.57 %)
211,558
(2.90 %)
6,785,192
(22.11 %)
0
(0 %)
591,955
(1.89 %)
42,795
(4.66 %)
39,036
(2.34 %)
590 Xingu scale-backed antbird (hap1 2024)
GCA_045364795.1
n/a n/a 12,848
(1.71 %)
24,293
(2.19 %)
n/a 43.77
(99.99 %)
0
(0 %)
773
(0.01 %)
1,510
(100.00 %)
688,169
(20.12 %)
440,901
(9.03 %)
5,858,667
(26.62 %)
8
(0.00 %)
932,948
(5.28 %)
39,419
(4.07 %)
19,631
(0.96 %)
591 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129055.1
n/a n/a 15,666
(1.88 %)
53,049
(5.01 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
29
(0.00 %)
324
(100.00 %)
620,903
(2.64 %)
305,809
(5.18 %)
6,707,330
(33.41 %)
2
(0.00 %)
551,663
(3.78 %)
45,863
(1.88 %)
18,859
(0.64 %)
592 yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq)
GCF_047511675.1
55,299
(2.52 %)
n/a 19,502
(1.44 %)
20,297
(1.34 %)
n/a 39.90
(100.00 %)
0
(0 %)
330
(0.00 %)
813
(100.00 %)
4,038,893
(29.07 %)
978,915
(3.28 %)
14,404,633
(34.97 %)
4
(0.00 %)
446,138
(1.44 %)
36,674
(1.05 %)
27,659
(0.61 %)
593 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205295.1
n/a n/a n/a n/a n/a n/a 0
(0 %)
n/a n/a 19,544,300
(70.77 %)
n/a n/a n/a n/a n/a n/a
594 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap1 2024)
GCA_039720435.1
n/a n/a 13,169
(1.63 %)
23,545
(1.98 %)
n/a 43.42
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
1,679
(100.00 %)
579,903
(8.32 %)
295,345
(9.90 %)
4,361,776
(30.37 %)
1
(0.00 %)
776,875
(4.65 %)
28,647
(1.82 %)
20,581
(1.14 %)
595 yellow-legged gull (primary hap 2024)
GCA_964199755.1
n/a n/a 13,396
(1.62 %)
25,176
(2.03 %)
n/a 44.64
(99.99 %)
0
(0 %)
500
(0.01 %)
618
(100.00 %)
521,539
(5.15 %)
267,365
(11.68 %)
5,827,639
(29.76 %)
3
(0.00 %)
655,588
(3.77 %)
44,532
(6.28 %)
37,224
(1.61 %)
596 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1
n/a n/a 17,610
(1.00 %)
20,322
(1.04 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
276
(0.00 %)
62
(100.00 %)
3,295,935
(23.58 %)
389,907
(6.37 %)
19,525,382
(45.90 %)
0
(0 %)
1,020,287
(2.23 %)
31,831
(0.63 %)
26,588
(0.47 %)
597 yellow-throated sandgrouse (primary hap 2019)
GCA_009769525.1
n/a n/a 12,697
(1.89 %)
25,289
(2.53 %)
n/a 42.40
(99.62 %)
0
(0 %)
242
(0.38 %)
89
(100.00 %)
510,633
(7.10 %)
213,742
(1.12 %)
6,627,716
(21.17 %)
0
(0 %)
113,802
(0.93 %)
28,848
(2.23 %)
25,343
(1.45 %)
598 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
n/a 15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
84,160
(11.62 %)
42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
0
(0 %)
188,182
(2.04 %)
31,005
(1.79 %)
19,757
(1.03 %)
599 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
n/a 15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
1
(0.00 %)
375,976
(3.80 %)
14,420
(0.88 %)
9,087
(0.42 %)
600 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024)
GCA_043880425.1
n/a n/a 18,352
(1.71 %)
20,233
(1.46 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
44
(0.00 %)
196
(0.00 %)
1,530
(100.00 %)
3,466,695
(41.95 %)
934,524
(8.81 %)
11,690,112
(36.30 %)
0
(0 %)
1,908,821
(5.07 %)
35,257
(5.20 %)
27,363
(0.98 %)
601 zebra finch (bTaeGut7 maternal hap 2025)
GCA_048771995.1
n/a n/a 12,949
(1.86 %)
26,010
(2.49 %)
n/a 42.68
(99.97 %)
0
(0 %)
9
(0.03 %)
42
(100.00 %)
411,962
(3.12 %)
511,516
(6.75 %)
5,958,859
(23.49 %)
0
(0 %)
551,129
(3.32 %)
35,953
(3.51 %)
22,778
(1.16 %)
602 zebra finch (v1.4 Blue55 female primary hap 2021 refseq)
GCF_003957565.2
49,311
(7.41 %)
n/a 12,747
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
0
(0 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
544,577
(9.57 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,748
(20.92 %)
3
(0.00 %)
312,137
(1.80 %)
29,202
(2.47 %)
22,084
(1.22 %)
603 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1
58,105
(2.61 %)
n/a 12,291
(0.48 %)
16,769
(1.14 %)
n/a 43.41
(99.47 %)
0
(0 %)
1,159
(0.53 %)
835
(100.00 %)
8,087,543
(64.92 %)
798,373
(9.17 %)
14,838,773
(42.39 %)
4
(0.00 %)
2,946,119
(5.37 %)
45,284
(1.67 %)
14,105
(0.37 %)
604 zebrafish (WGS:CALUEM01 primary hap 2022)
GCA_944039275.1
n/a n/a 18,065
(2.46 %)
44,526
(3.30 %)
n/a 37.08
(99.99 %)
0
(0 %)
381
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,804,769
(44.04 %)
954,645
(10.72 %)
8,694,743
(51.88 %)
4
(0.00 %)
1,207,649
(5.79 %)
44,936
(2.02 %)
11,380
(0.33 %)
605 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3
n/a n/a 15,036
(3.35 %)
40,234
(7.28 %)
n/a 40.66
(97.76 %)
0
(0 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
671,614
(20.98 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,040
(23.44 %)
0
(0 %)
175,881
(3.08 %)
12,807
(1.08 %)
8,703
(0.67 %)
TOTALS:total assembly count 605

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies