VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of primary assemblies)

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Abyssinian ground-hornbill
GCA_009769605.1
n/a n/a 12,918
(1.90 %)
17,214
(2.53 %)
n/a 43.30
(99.29 %)
0
(0 %)
204
(0.71 %)
112
(100.00 %)
401,836
(5.61 %)
145,540
(0.78 %)
6,556,090
(19.22 %)
0
(0 %)
65,601
(0.62 %)
40,983
(3.62 %)
34,699
(2.23 %)
2 American flamingo
GCA_009819775.1
n/a n/a 13,081
(1.79 %)
22,162
(2.64 %)
n/a 43.27
(99.31 %)
0
(0 %)
280
(0.69 %)
90
(100.00 %)
538,001
(7.73 %)
183,346
(0.79 %)
7,056,270
(20.92 %)
0
(0 %)
91,554
(0.80 %)
51,972
(4.83 %)
50,941
(2.93 %)
3 American shad
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
n/a 16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
n/a 43.18
(99.45 %)
0
(0 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
14
(0.00 %)
934,014
(6.61 %)
42,699
(2.23 %)
25,608
(1.23 %)
4 Anna's hummingbird
GCA_003957555.2
n/a n/a 12,249
(1.95 %)
14,848
(2.40 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
0
(0 %)
429
(1.52 %)
160
(100.00 %)
535,312
(7.95 %)
262,056
(1.51 %)
6,092,351
(20.84 %)
0
(0 %)
152,105
(1.27 %)
17,130
(1.48 %)
15,125
(1.04 %)
5 Asian bonytongue
GCF_900964775.1
50,328
(9.13 %)
50,520
(9.03 %)
16,528
(2.72 %)
76,597
(7.29 %)
72,696
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
0
(0 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
505,816
(2.98 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
0
(0 %)
157,330
(1.72 %)
88,514
(10.63 %)
67,281
(4.98 %)
6 Atlantic cod
GCF_902167405.1
51,655
(11.92 %)
51,617
(11.12 %)
14,072
(2.62 %)
70,314
(9.10 %)
68,853
(9.51 %)
45.64
(96.48 %)
0
(0 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
804,201
(10.41 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
4
(0.00 %)
741,293
(7.34 %)
97,133
(7.82 %)
51,623
(3.50 %)
7 Atlantic halibut (refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
n/a 14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
n/a 42.21
(99.43 %)
0
(0 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
0
(0 %)
240,110
(3.16 %)
31,325
(2.25 %)
20,749
(1.34 %)
8 Australian echidna
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
n/a 14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
0
(0 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
1
(0.00 %)
4,597,115
(10.42 %)
78,364
(2.73 %)
45,620
(1.05 %)
9 banded archerfish
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
n/a 15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
n/a 41.11
(99.82 %)
0
(0 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
1
(0.00 %)
297,814
(3.49 %)
15,089
(0.96 %)
9,304
(0.55 %)
10 barn swallow
GCF_015227805.1
43,374
(5.14 %)
n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,546
(2.82 %)
29,760
(1.66 %)
11 blackcap
GCA_009819655.1
n/a n/a 12,367
(1.92 %)
17,080
(2.58 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
0
(0 %)
413
(1.12 %)
189
(100.00 %)
506,239
(6.14 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,567
(19.76 %)
0
(0 %)
190,210
(1.30 %)
26,837
(2.32 %)
22,667
(1.33 %)
12 blue whale
GCF_009873245.2
58,750
(2.71 %)
n/a 19,162
(1.80 %)
20,576
(1.41 %)
n/a 40.88
(98.91 %)
0
(0 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,870
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,384
(34.60 %)
4
(0.00 %)
422,171
(1.33 %)
67,032
(1.73 %)
46,602
(1.41 %)
13 blunt-snouted clingfish
GCF_900634775.1
47,312
(7.12 %)
46,311
(6.88 %)
14,502
(1.97 %)
51,211
(5.47 %)
60,993
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
739,980
(4.26 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
0
(0 %)
455,135
(4.01 %)
29,050
(1.48 %)
14,672
(0.63 %)
14 Boeseman's rainbowfish
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
n/a 15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
0
(0 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
1
(0.00 %)
441,845
(3.68 %)
18,525
(1.10 %)
10,661
(0.59 %)
15 brown argus butterfly
GCF_905147365.1
23,611
(6.61 %)
n/a 4,734
(1.03 %)
24,265
(6.80 %)
n/a 36.86
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
25
(100.00 %)
264,358
(2.90 %)
144,234
(3.35 %)
2,650,845
(48.44 %)
0
(0 %)
205,173
(4.19 %)
35,431
(4.56 %)
15,409
(1.89 %)
16 butterfish (2021 G10K VGP)
GCF_020382885.2
52,828
(14.10 %)
n/a 15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
0
(0 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
1
(0.00 %)
96,783
(1.70 %)
15,574
(1.13 %)
10,807
(0.72 %)
17 California sea lion
GCF_009762305.2
70,801
(3.05 %)
n/a 20,915
(1.77 %)
20,179
(1.40 %)
n/a 41.40
(99.23 %)
0
(0 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,525,652
(43.65 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,648
(33.76 %)
2
(0.00 %)
495,451
(1.44 %)
51,899
(1.50 %)
48,201
(1.32 %)
18 Canada lynx
GCF_007474595.2
50,142
(2.69 %)
n/a 18,273
(1.65 %)
19,264
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
0
(0 %)
842
(0.12 %)
54
(100.00 %)
5,011,165
(43.72 %)
904,525
(1.75 %)
13,467,551
(34.19 %)
0
(0 %)
572,384
(1.64 %)
66,799
(2.48 %)
60,482
(2.02 %)
19 carmine bee-eater
GCA_009819595.1
n/a n/a 12,724
(1.82 %)
20,356
(2.83 %)
n/a 42.88
(99.47 %)
0
(0 %)
269
(0.53 %)
109
(100.00 %)
556,923
(7.87 %)
213,180
(1.09 %)
6,641,077
(21.58 %)
0
(0 %)
132,076
(1.14 %)
30,884
(2.47 %)
23,550
(1.23 %)
20 channel bull blenny
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
40,958
(10.85 %)
14,477
(3.02 %)
42,362
(6.73 %)
60,811
(10.44 %)
40.96
(99.58 %)
0
(0 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
427,781
(5.47 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
0
(0 %)
452,303
(4.62 %)
20,453
(1.39 %)
10,802
(0.65 %)
21 climbing perch
GCF_900324465.2
42,759
(13.53 %)
n/a 15,243
(3.53 %)
22,714
(7.45 %)
64,006
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
325,346
(2.66 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,009
(21.31 %)
0
(0 %)
169,785
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
22 common brushtail
GCF_011100635.1
37,674
(1.80 %)
n/a 18,653
(0.80 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,116
(38.90 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,306
(40.56 %)
0
(0 %)
455,717
(1.17 %)
17,762
(0.38 %)
13,986
(0.24 %)
23 common cuckoo (VGP 2021)
GCA_017976375.1
n/a n/a 13,179
(1.84 %)
25,859
(2.41 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
0
(0 %)
296
(0.42 %)
151
(100.00 %)
521,043
(9.61 %)
310,469
(2.36 %)
6,712,849
(21.76 %)
0
(0 %)
326,521
(1.83 %)
25,267
(1.71 %)
20,672
(1.05 %)
24 common swift (2021 VGP)
GCA_020740795.1
n/a n/a 12,277
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
0
(0 %)
256
(0.16 %)
109
(100.00 %)
533,758
(8.66 %)
199,748
(1.12 %)
6,353,957
(21.19 %)
1
(0.00 %)
113,872
(0.91 %)
20,393
(1.74 %)
16,313
(0.88 %)
25 common tern
GCA_009819605.1
n/a n/a 13,094
(1.80 %)
17,911
(2.48 %)
n/a 43.03
(99.16 %)
0
(0 %)
205
(0.84 %)
123
(100.00 %)
570,309
(7.91 %)
216,895
(1.04 %)
7,043,151
(20.98 %)
1
(0.00 %)
112,065
(1.02 %)
45,683
(3.53 %)
41,720
(2.13 %)
26 common toad
GCF_905171765.1
45,085
(1.10 %)
n/a 14,240
(0.38 %)
46,470
(1.68 %)
n/a 44.49
(99.80 %)
0
(0 %)
4,199
(0.20 %)
1,306
(100.00 %)
1,658,204
(1.79 %)
3,099,513
(13.49 %)
19,236,510
(62.70 %)
18
(0.00 %)
6,217,888
(10.17 %)
539,919
(4.45 %)
78,985
(0.67 %)
27 common yellowthroat
GCA_009764595.1
n/a n/a 11,736
(1.82 %)
16,696
(2.52 %)
n/a 42.01
(98.73 %)
0
(0 %)
1,479
(1.27 %)
278
(100.00 %)
476,046
(6.38 %)
367,108
(3.16 %)
6,576,957
(20.43 %)
0
(0 %)
333,263
(2.08 %)
25,004
(2.02 %)
20,494
(1.18 %)
28 copperband butterflyfish
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
n/a 15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
n/a 42.57
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
1
(0.00 %)
158,516
(2.15 %)
29,106
(1.85 %)
19,302
(1.11 %)
29 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 VGP)
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
n/a 15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
0
(0 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
4
(0.00 %)
383,250
(3.60 %)
32,973
(1.28 %)
9,764
(0.33 %)
30 denticle herring
GCF_900700375.1
59,645
(12.74 %)
60,109
(12.34 %)
16,567
(3.77 %)
58,823
(8.66 %)
72,751
(10.66 %)
43.69
(99.18 %)
0
(0 %)
464
(0.82 %)
460
(100.00 %)
408,046
(3.23 %)
224,282
(4.61 %)
2,948,671
(28.79 %)
0
(0 %)
306,165
(4.31 %)
64,661
(9.49 %)
52,867
(4.93 %)
31 downy woodpecker (VGP 2020)
GCA_014839835.1
n/a n/a 12,405
(1.70 %)
23,073
(2.18 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
0
(0 %)
187
(0.34 %)
181
(100.00 %)
1,008,118
(21.51 %)
378,537
(3.38 %)
5,846,717
(32.04 %)
0
(0 %)
791,076
(4.25 %)
26,005
(1.75 %)
19,919
(1.16 %)
32 East African grey crowned-crane
GCA_011004875.1
n/a n/a 13,263
(1.84 %)
20,787
(2.66 %)
n/a 42.38
(99.61 %)
0
(0 %)
144
(0.39 %)
105
(100.00 %)
548,859
(7.06 %)
187,966
(0.97 %)
7,004,597
(21.19 %)
0
(0 %)
102,622
(1.00 %)
36,610
(3.33 %)
36,344
(2.25 %)
33 eastern happy
GCF_900246225.1
57,628
(9.59 %)
54,681
(9.27 %)
15,359
(2.22 %)
52,466
(6.26 %)
42,580
(8.31 %)
41.07
(99.87 %)
115
(0.00 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
960,962
(21.85 %)
217,915
(1.89 %)
4,547,443
(30.78 %)
2
(0.00 %)
212,425
(2.79 %)
33,005
(1.88 %)
16,748
(0.95 %)
34 Egyptian rousette
GCF_014176215.1
65,163
(4.76 %)
n/a 17,642
(2.07 %)
22,317
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
0
(0 %)
242
(1.41 %)
29
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,414
(1.02 %)
12,031,597
(26.52 %)
0
(0 %)
65,562
(0.33 %)
53,573
(4.84 %)
57,281
(4.47 %)
35 electric eel
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
n/a 15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
n/a 42.49
(98.20 %)
0
(0 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
1
(0.00 %)
629,918
(5.96 %)
44,501
(3.93 %)
34,390
(2.63 %)
36 emu (2020)
GCA_016128335.1
n/a n/a 13,181
(1.74 %)
24,708
(2.10 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
512
(0.00 %)
802
(100.00 %)
504,527
(4.38 %)
259,276
(2.59 %)
7,105,965
(19.15 %)
8
(0.00 %)
316,149
(1.79 %)
41,784
(5.52 %)
41,105
(3.30 %)
37 ermine
GCF_009829155.1
74,345
(3.19 %)
n/a 18,862
(1.65 %)
21,246
(1.48 %)
n/a 41.56
(99.12 %)
0
(0 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,560,766
(40.92 %)
714,174
(1.30 %)
13,845,904
(33.42 %)
3
(0.01 %)
530,336
(1.47 %)
56,063
(2.27 %)
56,558
(2.04 %)
38 Eurasian nightjar
GCA_907165065.1
n/a n/a 13,040
(1.86 %)
22,823
(2.21 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
153
(0.00 %)
121
(100.00 %)
595,803
(8.38 %)
248,128
(1.78 %)
6,744,611
(22.18 %)
2
(0.00 %)
193,177
(1.31 %)
24,805
(1.90 %)
20,997
(1.31 %)
39 Eurasian red squirrel
GCA_902686455.1
n/a n/a 21,292
(1.58 %)
21,930
(1.42 %)
36,836
(1.54 %)
40.08
(94.33 %)
0
(0 %)
1,177
(5.67 %)
638
(100.00 %)
4,680,961
(35.76 %)
704,218
(1.42 %)
14,991,981
(31.49 %)
5
(0.00 %)
419,662
(1.29 %)
48,159
(1.04 %)
45,455
(0.95 %)
40 Eurasian river otter (2020 VGP)
GCF_902655055.1
67,145
(2.95 %)
n/a 18,842
(1.54 %)
20,178
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
0
(0 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,259,294
(33.39 %)
713,721
(1.36 %)
13,626,048
(34.37 %)
1
(0.00 %)
695,796
(1.86 %)
57,073
(1.82 %)
47,446
(1.36 %)
41 Eurasian water vole (2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
n/a 19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
5
(0.00 %)
518,667
(1.69 %)
19,000
(0.58 %)
16,851
(0.46 %)
42 European common frog
GCF_905171775.1
51,633
(1.57 %)
n/a 13,864
(0.46 %)
39,978
(1.88 %)
n/a 44.15
(99.36 %)
0
(0 %)
1,860
(0.64 %)
554
(100.00 %)
1,804,642
(3.42 %)
2,925,830
(9.39 %)
18,921,726
(55.43 %)
8
(0.00 %)
3,384,162
(6.05 %)
641,799
(7.66 %)
62,649
(0.67 %)
43 European eel
GCF_013347855.1
64,143
(9.57 %)
n/a 17,054
(2.22 %)
34,278
(5.56 %)
n/a 43.64
(99.61 %)
0
(0 %)
640
(0.40 %)
54
(100.00 %)
831,037
(5.48 %)
786,521
(8.15 %)
5,700,890
(27.40 %)
2
(0.00 %)
774,914
(5.14 %)
130,346
(8.19 %)
94,446
(4.12 %)
44 European golden plover
GCA_017639485.1
n/a n/a 12,984
(1.78 %)
22,854
(2.04 %)
n/a 42.70
(99.01 %)
0
(0 %)
268
(0.99 %)
107
(100.00 %)
558,587
(8.35 %)
180,400
(0.83 %)
7,132,381
(21.18 %)
0
(0 %)
102,461
(0.84 %)
40,661
(3.41 %)
37,600
(2.03 %)
45 European robin
GCA_903797595.2
n/a n/a 12,344
(1.85 %)
23,934
(2.37 %)
n/a 42.10
(99.97 %)
0
(0 %)
990
(0.03 %)
1,119
(100.00 %)
532,973
(5.96 %)
401,820
(3.43 %)
6,320,210
(21.42 %)
0
(0 %)
338,954
(2.13 %)
30,391
(2.60 %)
21,664
(1.21 %)
46 European starfish
GCF_902459465.1
26,326
(11.67 %)
n/a 4,143
(0.84 %)
21,071
(8.48 %)
n/a 38.76
(99.96 %)
0
(0 %)
471
(0.04 %)
150
(100.00 %)
132,287
(1.42 %)
159,226
(7.04 %)
2,504,013
(37.40 %)
12
(0.00 %)
310,355
(6.00 %)
15,392
(1.50 %)
7,483
(0.79 %)
47 European turtle dove (v1.2 2021 VGP)
GCA_901699155.2
n/a n/a 12,391
(1.76 %)
23,333
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
0
(0 %)
940
(0.33 %)
311
(100.00 %)
550,895
(7.50 %)
227,532
(1.16 %)
6,767,530
(21.05 %)
4
(0.00 %)
181,526
(1.65 %)
34,682
(2.57 %)
30,656
(1.68 %)
48 flier cichlid
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
42,986
(7.87 %)
15,440
(2.15 %)
51,452
(5.98 %)
n/a 41.23
(98.19 %)
0
(0 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,049,840
(17.13 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
0
(0 %)
227,442
(2.84 %)
24,130
(1.26 %)
11,082
(0.48 %)
49 Gabon caecilian
GCF_902459505.1
54,726
(1.72 %)
n/a 14,266
(0.51 %)
30,710
(1.49 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,315,377
(1.64 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,802
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,183,011
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
50 garden warbler
GCA_014839755.1
n/a n/a 12,520
(1.95 %)
23,459
(2.46 %)
n/a 42.08
(99.82 %)
0
(0 %)
134
(0.18 %)
176
(100.00 %)
491,810
(6.09 %)
376,746
(2.55 %)
6,461,292
(20.23 %)
0
(0 %)
225,297
(1.39 %)
27,799
(2.40 %)
23,088
(1.32 %)
51 gilthead seabream
GCF_900880675.1
59,040
(10.97 %)
55,827
(10.54 %)
15,415
(2.36 %)
56,395
(6.58 %)
73,317
(7.97 %)
41.94
(99.96 %)
0
(0 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
533,781
(3.04 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,694
(25.69 %)
0
(0 %)
355,475
(3.53 %)
47,327
(2.41 %)
23,697
(1.07 %)
52 golden eagle (2021)
GCF_900496995.4
60,920
(5.98 %)
n/a 13,334
(1.84 %)
23,261
(2.12 %)
n/a 42.16
(99.58 %)
0
(0 %)
228
(0.42 %)
144
(100.00 %)
544,341
(5.93 %)
186,461
(0.80 %)
7,090,610
(20.01 %)
1
(0.00 %)
68,348
(0.66 %)
38,495
(3.10 %)
35,039
(1.94 %)
53 Goodes thornscrub tortoise
GCF_007399415.2
57,455
(51.33 %)
54,153
(49.82 %)
14,859
(1.00 %)
79,415
(2.33 %)
31,974
(1.80 %)
44.14
(98.71 %)
0
(0 %)
562
(1.29 %)
383
(100.00 %)
1,699,240
(13.65 %)
387,796
(2.00 %)
11,572,827
(33.36 %)
0
(0 %)
474,978
(1.73 %)
71,687
(2.29 %)
21,793
(0.54 %)
54 gray squirrel (2020 VGP)
GCF_902686445.1
58,884
(2.46 %)
n/a 20,752
(1.49 %)
21,107
(1.31 %)
n/a 40.06
(99.98 %)
0
(0 %)
1,824
(0.02 %)
752
(100.00 %)
4,605,578
(34.50 %)
728,192
(1.65 %)
15,467,412
(33.91 %)
2
(0.00 %)
504,786
(1.54 %)
51,878
(1.11 %)
49,715
(1.03 %)
55 great potoo
GCA_013368605.1
n/a n/a 13,116
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
0
(0 %)
243
(0.49 %)
191
(100.00 %)
514,142
(9.71 %)
210,381
(1.13 %)
6,501,989
(23.95 %)
0
(0 %)
244,232
(1.92 %)
35,785
(2.69 %)
29,281
(1.64 %)
56 great scallop
GCF_902652985.1
46,811
(9.29 %)
n/a 4,090
(0.36 %)
32,743
(7.09 %)
n/a 36.65
(99.92 %)
0
(0 %)
1,827
(0.08 %)
3,983
(100.00 %)
281,310
(1.71 %)
706,978
(26.84 %)
5,249,556
(32.64 %)
0
(0 %)
2,449,994
(15.30 %)
13,101
(0.87 %)
7,209
(0.42 %)
57 great white shark
GCF_017639515.1
49,865
(1.46 %)
n/a 13,010
(0.37 %)
19,263
(0.92 %)
n/a 45.21
(99.55 %)
0
(0 %)
2,645
(0.45 %)
719
(100.00 %)
1,046,023
(4.00 %)
1,584,100
(21.25 %)
23,278,563
(52.42 %)
11
(0.00 %)
8,687,289
(11.05 %)
77,021
(1.94 %)
14,712
(0.15 %)
58 greater horseshoe bat
GCA_004115265.2
n/a n/a 18,651
(1.96 %)
20,392
(1.68 %)
36,525
(2.28 %)
40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,301,017
(34.99 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,069
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,625
(0.98 %)
59 greater pipefish
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
n/a 13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
0
(0 %)
112,918
(3.25 %)
46,327
(10.97 %)
32,897
(5.93 %)
60 greater mouse-eared bat
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
n/a 19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
0
(0 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
0
(0 %)
499,733
(1.88 %)
61,023
(2.69 %)
54,015
(1.81 %)
61 green sea turtle (v2 2021)
GCF_015237465.2
84,366
(4.63 %)
n/a 14,725
(1.06 %)
17,444
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
0
(0 %)
298
(0.56 %)
93
(100.00 %)
1,701,640
(14.83 %)
304,306
(1.25 %)
11,135,147
(31.96 %)
0
(0 %)
429,994
(1.68 %)
49,025
(1.44 %)
26,933
(0.68 %)
62 gyrfalcon
GCF_015220075.1
47,961
(5.90 %)
n/a 13,016
(1.82 %)
21,266
(2.02 %)
n/a 42.20
(99.55 %)
0
(0 %)
635
(0.45 %)
133
(100.00 %)
484,104
(5.60 %)
186,430
(0.85 %)
7,162,723
(18.83 %)
0
(0 %)
59,799
(0.59 %)
24,760
(2.03 %)
20,013
(0.97 %)
63 Hawaiian crow (2021 refseq VGP)
GCF_020740725.1
51,593
(6.18 %)
n/a 12,739
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
0
(0 %)
294
(0.16 %)
188
(100.00 %)
409,129
(0.00 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,375
(23.59 %)
3
(0.00 %)
336,844
(2.41 %)
46,118
(3.85 %)
24,228
(1.26 %)
64 honeycomb rockfish
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
n/a 15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.83 %)
0
(0 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
1
(0.00 %)
627,017
(5.28 %)
37,878
(1.84 %)
15,343
(0.71 %)
65 hybrid cattle
GCA_003369685.2
n/a n/a 19,100
(1.59 %)
21,093
(1.37 %)
52,201
(2.64 %)
41.99
(99.75 %)
0
(0 %)
277
(0.25 %)
1,435
(100.00 %)
5,290,419
(47.51 %)
478,946
(1.94 %)
12,568,313
(41.15 %)
0
(0 %)
1,196,257
(3.44 %)
45,850
(1.37 %)
36,573
(1.00 %)
66 hybrid cattle
GCF_003369695.1
63,234
(2.88 %)
58,356
(2.67 %)
19,602
(1.56 %)
21,960
(1.36 %)
54,700
(2.65 %)
41.83
(99.94 %)
0
(0 %)
302
(0.06 %)
1,250
(100.00 %)
5,458,622
(47.18 %)
459,928
(1.40 %)
13,208,799
(41.21 %)
0
(0 %)
1,222,675
(3.37 %)
41,359
(1.10 %)
37,392
(0.98 %)
67 Indian glassy fish
GCF_900634625.1
44,096
(12.32 %)
43,920
(11.93 %)
15,354
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
60,337
(10.41 %)
42.38
(98.08 %)
0
(0 %)
1,523
(1.92 %)
156
(100.00 %)
349,914
(3.01 %)
163,522
(3.00 %)
2,755,229
(25.07 %)
0
(0 %)
235,502
(4.25 %)
17,929
(1.44 %)
9,747
(0.71 %)
68 Indo-Pacific tarpon
GCF_013368585.1
41,583
(6.91 %)
n/a 18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
n/a 43.02
(99.97 %)
0
(0 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
0
(0 %)
319,481
(2.18 %)
78,561
(3.69 %)
58,460
(2.33 %)
69 jewelled blenny
GCF_902148845.1
42,890
(8.61 %)
41,689
(8.35 %)
15,200
(2.40 %)
86,752
(9.03 %)
58,518
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
0
(0 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
671,028
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
0
(0 %)
422,328
(3.88 %)
121,462
(9.27 %)
77,061
(4.51 %)
70 Kakapo
GCF_004027225.2
49,757
(5.76 %)
n/a 13,102
(1.92 %)
17,781
(2.51 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
0
(0 %)
373
(0.92 %)
89
(100.00 %)
517,233
(7.76 %)
208,178
(1.08 %)
6,258,087
(20.50 %)
0
(0 %)
165,530
(1.34 %)
22,279
(1.79 %)
19,230
(1.21 %)
71 Korean giant-fin mudskipper (refseq)
GCF_009829125.1
29,517
(6.48 %)
n/a 14,243
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,274
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,142
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,224
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
18,380
(0.95 %)
72 Kuhl's pipistrelle
GCF_014108245.1
63,293
(2.96 %)
n/a 17,918
(1.89 %)
20,819
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
0
(0 %)
394
(0.69 %)
202
(100.00 %)
2,897,422
(23.58 %)
797,420
(2.76 %)
10,057,100
(34.56 %)
2
(0.00 %)
425,636
(1.52 %)
55,965
(2.99 %)
57,667
(2.01 %)
73 lance-tailed manakin
GCF_009829145.1
46,366
(5.56 %)
n/a 12,580
(1.91 %)
16,669
(2.52 %)
n/a 41.97
(99.70 %)
0
(0 %)
206
(0.30 %)
93
(100.00 %)
494,225
(7.09 %)
247,189
(1.64 %)
6,498,294
(20.04 %)
0
(0 %)
149,431
(1.05 %)
25,376
(1.95 %)
21,424
(1.14 %)
74 leatherback sea turtle (v4 2021 refseq G10K VGP)
GCF_009764565.3
73,318
(3.97 %)
n/a 14,610
(1.03 %)
16,358
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
0
(0 %)
668
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,694,449
(14.90 %)
304,773
(1.14 %)
11,121,962
(34.21 %)
3
(0.00 %)
670,729
(2.51 %)
35,485
(1.36 %)
19,615
(0.51 %)
75 lesser Egyptian jerboa (2021 VGP)
GCF_020740685.1
51,730
(1.99 %)
n/a 20,129
(1.24 %)
22,089
(1.24 %)
n/a 42.00
(99.52 %)
0
(0 %)
561
(0.48 %)
160
(100.00 %)
7,346,291
(41.25 %)
1,187,587
(2.92 %)
14,222,177
(44.13 %)
1
(0.00 %)
1,219,048
(2.53 %)
34,688
(0.86 %)
25,175
(0.54 %)
76 lesser kestrel
GCF_017639655.2
47,420
(5.64 %)
n/a 13,098
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
0
(0 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,499
(5.58 %)
210,234
(1.26 %)
7,133,934
(19.19 %)
1
(0.00 %)
132,967
(0.79 %)
27,558
(2.21 %)
21,862
(1.03 %)
77 live sharksucker
GCF_900963305.1
40,268
(11.91 %)
43,524
(11.83 %)
14,989
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
56,376
(9.51 %)
41.43
(99.89 %)
0
(0 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
449,887
(3.55 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,476
(21.79 %)
0
(0 %)
109,664
(1.83 %)
16,807
(1.33 %)
12,095
(0.89 %)
78 lumpfish (refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
n/a 14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,794
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
0
(0 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
1
(0.00 %)
655,785
(6.31 %)
53,321
(5.09 %)
32,722
(2.40 %)
79 maguari stork (2021 VGP)
GCA_017639555.1
n/a n/a 12,905
(1.81 %)
22,204
(2.01 %)
n/a 42.12
(98.21 %)
0
(0 %)
232
(1.79 %)
153
(100.00 %)
485,318
(6.35 %)
184,992
(0.78 %)
7,064,965
(19.56 %)
0
(0 %)
58,168
(0.52 %)
31,653
(3.02 %)
31,174
(1.88 %)
80 mallard (Pekin duck Z2 2020 Zhejiang U)
GCF_015476345.1
59,854
(7.33 %)
n/a 12,988
(1.87 %)
23,709
(2.20 %)
n/a 42.27
(99.64 %)
0
(0 %)
905
(0.36 %)
756
(100.00 %)
803,558
(8.04 %)
417,575
(5.02 %)
6,627,843
(24.59 %)
5
(0.00 %)
487,092
(3.05 %)
35,030
(3.06 %)
27,683
(1.41 %)
81 milkfish
GCF_902362185.1
30,825
(7.61 %)
31,590
(7.56 %)
16,880
(3.41 %)
42,123
(6.75 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
0
(0 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
969,140
(8.12 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
2
(0.01 %)
611,768
(5.32 %)
22,089
(1.27 %)
14,000
(0.76 %)
82 monito del monte (2021 VGP)
GCF_019393635.1
47,034
(2.02 %)
n/a 18,399
(0.80 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
0
(0 %)
260
(0.09 %)
17
(100.00 %)
9,107,968
(41.08 %)
1,249,635
(2.12 %)
21,135,324
(42.80 %)
0
(0 %)
1,546,314
(2.55 %)
16,598
(0.36 %)
13,911
(0.23 %)
83 mute swan (v2 2021)
GCF_009769625.2
59,524
(6.76 %)
n/a 12,983
(1.98 %)
22,400
(2.22 %)
n/a 41.92
(99.13 %)
0
(0 %)
451
(0.87 %)
171
(100.00 %)
700,051
(7.55 %)
301,579
(1.34 %)
6,791,838
(21.30 %)
1
(0.00 %)
78,712
(0.74 %)
31,278
(3.07 %)
30,009
(2.01 %)
84 New Caledonian crow
GCF_009650955.1
50,821
(6.95 %)
n/a 12,735
(1.93 %)
17,289
(2.60 %)
n/a 42.57
(97.41 %)
0
(0 %)
289
(2.59 %)
105
(100.00 %)
460,676
(6.16 %)
231,546
(1.70 %)
6,265,995
(19.54 %)
0
(0 %)
191,789
(1.34 %)
31,907
(2.46 %)
24,362
(1.33 %)
85 New Zealand spotty (refseq)
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
n/a 14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
n/a 40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,987
(4.42 %)
18,299
(0.85 %)
7,999
(0.35 %)
86 northern pike
GCF_011004845.1
63,733
(9.28 %)
n/a 16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
n/a 42.22
(99.89 %)
0
(0 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
1
(0.00 %)
602,569
(4.43 %)
42,910
(2.52 %)
22,099
(1.02 %)
87 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
99,139
(4.10 %)
n/a 21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
n/a 41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
4
(0.00 %)
1,172,090
(3.51 %)
19,244
(0.46 %)
16,098
(0.39 %)
88 orbiculate cardinalfish
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
44,304
(5.34 %)
15,772
(1.50 %)
52,078
(3.82 %)
60,005
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
0
(0 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,270,059
(5.42 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
0
(0 %)
1,304,960
(6.34 %)
29,320
(0.87 %)
15,066
(0.43 %)
89 pale spear-nosed bat
GCF_004126475.2
54,932
(3.31 %)
n/a 18,171
(1.69 %)
20,025
(1.62 %)
n/a 42.38
(99.28 %)
0
(0 %)
884
(0.72 %)
77
(100.00 %)
3,069,141
(30.00 %)
385,664
(0.81 %)
12,050,232
(30.57 %)
1
(0.00 %)
174,292
(0.75 %)
63,905
(3.75 %)
66,744
(3.26 %)
90 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
n/a 18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
0
(0 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
1
(0.00 %)
714,726
(2.00 %)
79,984
(2.45 %)
71,436
(1.91 %)
91 pinecone soldierfish
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
40,293
(8.61 %)
15,756
(2.42 %)
53,616
(6.20 %)
57,173
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
0
(0 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,066,671
(5.88 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
0
(0 %)
374,591
(3.12 %)
41,636
(2.04 %)
21,488
(0.92 %)
92 platypus (v4 2020)
GCF_004115215.2
51,392
(3.07 %)
n/a 14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
0
(0 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
0
(0 %)
1,130,252
(3.59 %)
87,796
(6.47 %)
74,209
(2.87 %)
93 plumbeous ibis (2021 VGP)
GCA_020745775.1
n/a n/a 13,028
(1.84 %)
22,722
(2.10 %)
n/a 42.37
(99.81 %)
0
(0 %)
104
(0.19 %)
88
(100.00 %)
488,030
(6.66 %)
188,606
(1.01 %)
6,982,793
(20.08 %)
0
(0 %)
89,388
(0.77 %)
32,920
(3.37 %)
32,773
(1.95 %)
94 prehistoric monster fish
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
n/a 14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
n/a 41.99
(99.49 %)
0
(0 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
3
(0.00 %)
1,746,915
(7.91 %)
172,199
(5.45 %)
18,080
(0.31 %)
95 razorbill
GCA_008658365.1
n/a n/a 12,776
(1.83 %)
16,521
(2.42 %)
n/a 42.67
(99.70 %)
0
(0 %)
227
(0.30 %)
95
(100.00 %)
543,514
(7.16 %)
212,546
(1.12 %)
6,930,708
(20.10 %)
0
(0 %)
103,901
(0.79 %)
38,955
(2.90 %)
35,212
(1.78 %)
96 ring-tailed lemur (2021 VGP)
GCF_020740605.2
55,883
(2.78 %)
n/a 18,659
(1.98 %)
20,542
(1.50 %)
n/a 41.36
(99.84 %)
0
(0 %)
210
(0.16 %)
185
(100.00 %)
3,432,734
(37.67 %)
518,071
(6.84 %)
12,916,577
(32.91 %)
0
(0 %)
864,748
(2.57 %)
50,626
(1.88 %)
48,082
(1.65 %)
97 red deer (2021 VGP)
GCF_910594005.1
68,992
(2.68 %)
n/a 20,470
(1.48 %)
22,563
(1.32 %)
n/a 42.98
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
144
(100.00 %)
5,501,063
(44.60 %)
503,301
(12.23 %)
13,102,622
(44.55 %)
1
(0.00 %)
2,197,198
(5.57 %)
88,756
(1.66 %)
46,960
(1.12 %)
98 red-bellied piranha
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
n/a 16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
n/a 40.58
(99.17 %)
0
(0 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
2
(0.00 %)
1,005,141
(5.14 %)
33,087
(1.38 %)
20,822
(0.79 %)
99 red-crested turaco
GCA_009769465.1
n/a n/a 12,726
(1.75 %)
21,173
(2.64 %)
n/a 42.60
(97.89 %)
0
(0 %)
344
(2.11 %)
140
(100.00 %)
551,882
(8.95 %)
176,530
(0.80 %)
6,805,042
(22.19 %)
0
(0 %)
138,427
(1.12 %)
43,046
(3.29 %)
34,995
(1.97 %)
100 red-fronted tinkerbird
GCA_015220805.1
n/a n/a 12,345
(1.60 %)
23,206
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
0
(0 %)
307
(0.47 %)
253
(100.00 %)
1,082,064
(22.90 %)
378,866
(4.28 %)
6,003,548
(35.88 %)
0
(0 %)
1,148,448
(6.01 %)
26,519
(1.76 %)
21,399
(1.21 %)
101 red-legged seriema
GCA_009819825.1
n/a n/a 13,220
(1.83 %)
19,960
(2.64 %)
n/a 42.20
(99.59 %)
0
(0 %)
194
(0.41 %)
110
(100.00 %)
483,781
(6.50 %)
160,481
(0.73 %)
6,960,060
(19.71 %)
0
(0 %)
64,843
(0.56 %)
32,894
(2.67 %)
30,207
(1.89 %)
102 reedfish
GCF_900747795.1
40,558
(43.70 %)
37,987
(42.69 %)
13,160
(0.46 %)
48,082
(1.04 %)
34,872
(1.34 %)
39.44
(93.75 %)
0
(0 %)
5,614
(6.25 %)
1,885
(100.00 %)
1,852,335
(2.79 %)
1,018,031
(2.36 %)
20,081,632
(44.56 %)
4
(0.00 %)
1,039,695
(2.44 %)
88,254
(1.06 %)
22,510
(0.28 %)
103 rifleman (VGP 2021)
GCA_016904835.1
n/a n/a 12,620
(1.92 %)
24,568
(2.61 %)
n/a 42.41
(99.61 %)
0
(0 %)
195
(0.39 %)
206
(100.00 %)
495,673
(9.14 %)
253,008
(2.04 %)
5,936,177
(19.93 %)
0
(0 %)
269,642
(1.76 %)
20,145
(1.83 %)
15,953
(0.89 %)
104 river trout
GCF_901001165.1
102,785
(6.02 %)
97,836
(5.57 %)
27,433
(1.62 %)
110,789
(4.44 %)
122,381
(5.28 %)
43.36
(96.90 %)
0
(0 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
1,488,597
(5.68 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,761
(52.37 %)
2
(0.00 %)
3,475,786
(8.76 %)
70,821
(1.77 %)
18,627
(0.33 %)
105 sand lizard
GCF_009819535.1
41,714
(3.65 %)
n/a 14,356
(1.48 %)
19,592
(2.50 %)
n/a 43.75
(99.75 %)
0
(0 %)
379
(0.25 %)
29
(100.00 %)
1,019,541
(5.39 %)
425,414
(1.76 %)
7,135,165
(34.49 %)
0
(0 %)
365,268
(2.50 %)
76,053
(2.68 %)
21,615
(0.85 %)
106 sea lamprey
GCF_010993605.1
41,254
(6.50 %)
n/a 7,662
(0.70 %)
36,337
(4.06 %)
n/a 48.31
(98.62 %)
0
(0 %)
930
(1.38 %)
1,434
(100.00 %)
2,075,622
(39.58 %)
1,194,165
(21.47 %)
5,320,620
(50.50 %)
4
(0.00 %)
2,982,746
(13.77 %)
178,447
(30.55 %)
120,128
(5.32 %)
107 Siamese fighting fish (2020)
GCF_900634795.3
54,864
(17.78 %)
n/a 14,745
(4.20 %)
56,808
(10.87 %)
n/a 45.30
(99.99 %)
0
(0 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
255,550
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
0
(0 %)
232,435
(4.41 %)
72,126
(13.08 %)
55,959
(7.25 %)
108 smalltooth sawfish
GCA_009764475.1
n/a n/a 11,845
(0.66 %)
19,597
(1.63 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
0
(0 %)
698
(0.91 %)
173
(100.00 %)
405,018
(1.14 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,302
(38.19 %)
0
(0 %)
471,344
(1.50 %)
45,398
(1.34 %)
18,572
(0.38 %)
109 South Island takahe (VGP primary 2021)
GCA_020800305.1
n/a n/a 12,942
(1.69 %)
23,221
(2.13 %)
n/a 43.74
(99.58 %)
0
(0 %)
327
(0.42 %)
174
(100.00 %)
577,553
(9.77 %)
259,017
(5.20 %)
6,430,968
(25.90 %)
1
(0.00 %)
437,634
(2.97 %)
23,810
(2.02 %)
20,060
(1.16 %)
110 southern bluefin tuna (2021 VGP)
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
n/a 15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
0
(0 %)
326,254
(3.37 %)
14,097
(0.88 %)
8,860
(0.42 %)
111 southern grasshopper mouse
GCF_903995425.1
47,152
(2.39 %)
n/a 19,356
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
0
(0 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,460
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,540,762
(32.73 %)
0
(0 %)
547,538
(1.62 %)
18,046
(0.54 %)
16,132
(0.42 %)
112 southern two-toed sloth
GCF_015220235.1
63,054
(2.39 %)
n/a 21,998
(1.29 %)
23,177
(1.18 %)
n/a 39.89
(97.48 %)
0
(0 %)
1,243
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,559,690
(39.66 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,630
(40.50 %)
4
(0.00 %)
492,026
(1.69 %)
51,430
(1.14 %)
40,148
(0.81 %)
113 specked wood butterfly
GCF_905163445.1
21,720
(6.53 %)
n/a 4,713
(0.87 %)
17,001
(4.33 %)
n/a 35.99
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
70
(100.00 %)
304,062
(2.97 %)
110,824
(4.09 %)
3,704,161
(44.42 %)
1
(0.00 %)
144,758
(2.93 %)
28,108
(2.75 %)
11,566
(0.96 %)
114 Suruca trogon (2021 VGP)
GCA_020746105.1
n/a n/a 12,884
(1.85 %)
23,805
(2.23 %)
n/a 42.80
(99.12 %)
0
(0 %)
253
(0.88 %)
182
(100.00 %)
539,771
(9.26 %)
181,564
(1.14 %)
6,538,228
(22.49 %)
1
(0.00 %)
138,653
(1.22 %)
41,376
(3.37 %)
36,105
(2.01 %)
115 Swainson's thrush (v2 2020 VGP)
GCF_009819885.2
40,121
(5.41 %)
n/a 13,004
(1.87 %)
24,795
(2.41 %)
n/a 42.48
(98.86 %)
0
(0 %)
429
(1.14 %)
160
(100.00 %)
493,071
(5.80 %)
589,858
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
1
(0.00 %)
449,511
(2.41 %)
49,404
(3.53 %)
22,206
(1.16 %)
116 thorny skate (v2 2020)
GCF_010909765.2
45,968
(2.40 %)
n/a 11,437
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
n/a 44.30
(92.54 %)
0
(0 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
888,163
(2.58 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
26
(0.00 %)
1,634,606
(4.98 %)
242,676
(4.73 %)
31,030
(0.57 %)
117 tiny Cayenne caecilian
GCF_901765095.1
41,346
(53.62 %)
38,993
(52.83 %)
14,572
(0.43 %)
88,603
(1.29 %)
n/a 44.01
(98.99 %)
0
(0 %)
2,452
(1.01 %)
1,081
(100.00 %)
1,847,289
(1.60 %)
1,670,443
(3.30 %)
22,207,145
(52.43 %)
5
(0.00 %)
1,718,803
(3.44 %)
414,828
(3.91 %)
47,796
(0.38 %)
118 torafugu
GCF_901000725.2
53,492
(18.31 %)
49,574
(17.35 %)
14,548
(4.79 %)
51,180
(11.72 %)
55,740
(14.38 %)
45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
290,056
(10.32 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,756
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,973
(9.53 %)
37,920
(5.08 %)
119 tufted duck
GCF_009819795.1
29,505
(4.02 %)
n/a 12,959
(1.97 %)
16,252
(2.50 %)
n/a 41.66
(99.16 %)
0
(0 %)
163
(0.84 %)
105
(100.00 %)
836,786
(8.36 %)
411,356
(1.71 %)
6,691,445
(22.36 %)
1
(0.00 %)
93,916
(0.94 %)
29,883
(2.48 %)
27,027
(1.51 %)
120 two-lined caecilian
GCF_901001135.1
56,630
(53.09 %)
52,356
(51.16 %)
14,452
(0.38 %)
180,328
(2.13 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
0
(0 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,273,617
(1.93 %)
2,036,108
(4.34 %)
29,400,958
(44.09 %)
9
(0.01 %)
2,173,581
(3.22 %)
602,912
(6.66 %)
94,935
(0.82 %)
121 vaquita
GCF_008692025.1
60,106
(3.00 %)
n/a 18,607
(1.76 %)
20,488
(1.43 %)
35,398
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
0
(0 %)
212
(0.34 %)
64
(100.00 %)
4,010,529
(43.76 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,582
(35.55 %)
3
(0.00 %)
549,962
(1.71 %)
66,806
(1.79 %)
48,702
(1.46 %)
122 yellowfin seabream
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
n/a 15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
0
(0 %)
188,182
(2.04 %)
31,005
(1.79 %)
19,757
(1.03 %)
123 Western terrestrial garter snake
GCF_009769535.1
33,492
(3.42 %)
n/a 13,072
(1.13 %)
19,161
(1.98 %)
n/a 40.95
(97.72 %)
0
(0 %)
1,518
(2.28 %)
365
(100.00 %)
1,326,233
(7.79 %)
979,057
(4.48 %)
8,396,200
(42.63 %)
0
(0 %)
801,068
(3.60 %)
81,829
(2.47 %)
23,152
(0.75 %)
124 whiskered treeswift (2021 VGP)
GCA_020745705.1
n/a n/a 12,681
(1.84 %)
21,784
(2.14 %)
n/a 42.12
(99.13 %)
0
(0 %)
218
(0.87 %)
146
(100.00 %)
520,200
(9.32 %)
170,778
(0.83 %)
6,455,910
(21.44 %)
0
(0 %)
98,619
(0.96 %)
24,061
(1.62 %)
17,982
(1.11 %)
125 white leghorn X broiler chicken (leghorn haplotype v2 VGP 2021)
GCF_016700215.2
83,834
(10.16 %)
n/a 13,005
(2.32 %)
23,329
(2.48 %)
n/a 42.16
(99.57 %)
409
(0.43 %)
409
(0.43 %)
685
(99.57 %)
536,869
(6.00 %)
268,230
(2.28 %)
5,845,184
(20.93 %)
2
(0.00 %)
247,373
(2.08 %)
24,409
(2.60 %)
20,761
(1.55 %)
126 yellow-throated sandgrouse
GCA_009769525.1
n/a n/a 12,693
(1.89 %)
18,187
(2.69 %)
n/a 42.40
(99.62 %)
0
(0 %)
242
(0.38 %)
89
(100.00 %)
510,630
(7.10 %)
213,742
(1.12 %)
6,627,716
(21.17 %)
0
(0 %)
113,802
(0.93 %)
28,846
(2.19 %)
25,343
(1.45 %)
127 yellowfin tuna (2021 VGP)
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
n/a 15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
1
(0.00 %)
375,976
(3.80 %)
14,420
(0.88 %)
9,087
(0.42 %)
128 zebra finch (refseq 2021 Blue55 female)
GCF_003957565.2
49,311
(7.41 %)
n/a 12,747
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
0
(0 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
544,577
(9.57 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,748
(20.92 %)
3
(0.00 %)
312,137
(1.80 %)
29,202
(2.47 %)
22,084
(1.22 %)
129 zig-zag eel
GCF_900324485.2
45,001
(12.01 %)
n/a 15,052
(3.35 %)
21,643
(6.89 %)
60,604
(9.39 %)
40.66
(97.76 %)
0
(0 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
349,298
(2.86 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,025
(23.44 %)
0
(0 %)
175,881
(3.08 %)
12,807
(1.08 %)
8,703
(0.67 %)
TOTALS:total assembly count 129

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies