VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of primary assemblies)

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Abyssinian ground-hornbill
GCA_009769605.1
n/a n/a 12,926
(1.90 %)
23,453
(2.26 %)
n/a 43.30
(99.29 %)
0
(0 %)
204
(0.71 %)
112
(100.00 %)
401,839
(5.61 %)
145,540
(0.78 %)
6,556,090
(19.22 %)
0
(0 %)
65,601
(0.62 %)
40,986
(3.65 %)
34,700
(2.27 %)
2 Aeolian wall lizard (rPodRaf1 primary hap 2022)
GCF_027172205.1
57,514
(4.49 %)
n/a 14,340
(1.37 %)
20,053
(2.31 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
0
(0 %)
30
(0.00 %)
27
(100.00 %)
832,937
(4.17 %)
474,203
(4.04 %)
7,020,288
(38.29 %)
2
(0.00 %)
631,733
(3.50 %)
94,745
(2.70 %)
19,879
(0.76 %)
3 African savanna elephant (hap2 2023)
GCF_030014295.1
64,034
(3.35 %)
n/a 18,980
(1.10 %)
21,593
(1.06 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
0
(0 %)
231
(0.10 %)
879
(100.00 %)
4,426,749
(29.95 %)
832,904
(4.08 %)
16,118,888
(49.47 %)
1
(0.00 %)
1,082,957
(2.38 %)
62,314
(1.49 %)
23,783
(0.48 %)
4 African savanna elephant (hap2 mLoxAfr1 2023)
GCA_030014295.1
n/a n/a 18,981
(1.10 %)
22,759
(1.12 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
0
(0 %)
231
(0.10 %)
880
(100.00 %)
4,426,756
(29.95 %)
832,908
(4.08 %)
16,118,910
(49.47 %)
1
(0.00 %)
1,082,958
(2.38 %)
62,315
(1.49 %)
23,783
(0.48 %)
5 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1
n/a n/a 19,086
(1.55 %)
22,040
(1.52 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,182
(0.01 %)
1,182
(0.01 %)
1,369
(99.99 %)
3,846,728
(31.78 %)
639,852
(2.90 %)
11,937,936
(38.98 %)
24
(0.00 %)
819,376
(2.67 %)
75,377
(2.21 %)
66,761
(1.68 %)
6 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1
n/a n/a 18,980
(1.50 %)
22,394
(1.50 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
326
(100.00 %)
3,896,863
(31.56 %)
659,711
(4.74 %)
11,945,162
(40.81 %)
3
(0.00 %)
979,504
(2.79 %)
76,769
(2.57 %)
66,591
(1.63 %)
7 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1
60,799
(4.33 %)
n/a 14,383
(0.98 %)
18,600
(1.45 %)
n/a 45.01
(99.30 %)
0
(0 %)
161
(0.70 %)
195
(100.00 %)
3,322,624
(43.19 %)
478,208
(1.77 %)
12,316,424
(32.01 %)
0
(0 %)
334,854
(1.31 %)
49,792
(2.45 %)
29,504
(1.51 %)
8 American flamingo
GCA_009819775.1
n/a n/a 13,100
(1.79 %)
23,372
(2.04 %)
n/a 43.27
(99.31 %)
0
(0 %)
280
(0.69 %)
90
(100.00 %)
538,004
(7.73 %)
183,346
(0.79 %)
7,056,270
(20.92 %)
0
(0 %)
91,554
(0.80 %)
52,012
(5.96 %)
50,946
(3.06 %)
9 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1
45,008
(1.93 %)
n/a 17,997
(1.35 %)
23,185
(1.49 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
0
(0 %)
432
(0.00 %)
5,864
(100.00 %)
4,126,248
(43.60 %)
628,344
(15.71 %)
11,100,962
(42.69 %)
18
(0.00 %)
1,888,430
(5.34 %)
60,350
(1.67 %)
30,970
(1.18 %)
10 American shad
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
n/a 16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
76,974
(8.55 %)
43.18
(99.45 %)
0
(0 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
14
(0.00 %)
934,014
(6.61 %)
42,699
(2.23 %)
25,608
(1.23 %)
11 amphioxus (hap2 2024)
GCA_035083965.1
n/a n/a 5,217
(0.97 %)
41,736
(12.73 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
0
(0 %)
103
(0.00 %)
34
(100.00 %)
128,505
(1.65 %)
182,123
(8.03 %)
2,157,899
(27.45 %)
0
(0 %)
274,077
(4.65 %)
44,261
(5.21 %)
29,041
(2.94 %)
12 Andian cavefish (hap1 2023)
GCF_030014385.1
42,881
(5.97 %)
n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,939
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
13 Anna's hummingbird
GCA_003957555.2
n/a n/a 12,258
(1.95 %)
20,580
(2.26 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
0
(0 %)
429
(1.52 %)
160
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,056
(1.51 %)
6,092,351
(20.84 %)
0
(0 %)
152,105
(1.27 %)
17,130
(1.48 %)
15,125
(1.04 %)
14 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1
n/a n/a 16,678
(0.56 %)
151,361
(4.03 %)
n/a 44.57
(99.91 %)
0
(0 %)
15,113
(0.09 %)
5,983
(100.00 %)
12,251,532
(51.73 %)
3,521,157
(17.69 %)
10,051,020
(68.37 %)
71
(0.00 %)
5,101,423
(13.15 %)
494,595
(10.52 %)
74,823
(1.04 %)
15 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1
n/a n/a 17,342
(1.44 %)
78,914
(5.48 %)
n/a 43.57
(99.96 %)
0
(0 %)
3,179
(0.04 %)
1,901
(100.00 %)
5,980,457
(37.18 %)
1,633,782
(21.76 %)
6,279,725
(52.83 %)
12
(0.00 %)
2,013,978
(10.83 %)
104,688
(3.57 %)
33,790
(1.15 %)
16 Arabian camel (mCamDro1 2024)
GCF_036321535.1
62,940
(3.46 %)
n/a 18,078
(1.66 %)
21,071
(1.56 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
0
(0 %)
195
(0.00 %)
171
(100.00 %)
3,040,467
(29.22 %)
343,480
(10.93 %)
11,796,955
(33.50 %)
2
(0.00 %)
1,611,842
(4.73 %)
55,427
(1.61 %)
47,478
(1.18 %)
17 Arabian camel (paternal hap 2024)
GCA_036321535.1
n/a n/a 18,080
(1.66 %)
20,345
(1.52 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
0
(0 %)
195
(0.00 %)
172
(100.00 %)
3,040,473
(29.22 %)
343,482
(10.93 %)
11,797,012
(33.50 %)
2
(0.00 %)
1,611,842
(4.73 %)
55,428
(1.61 %)
47,478
(1.18 %)
18 Aristotle's catfish (2022)
GCA_946808225.1
n/a n/a 15,455
(2.53 %)
40,077
(4.90 %)
86,346
(8.45 %)
38.90
(99.98 %)
0
(0 %)
795
(0.02 %)
241
(100.00 %)
2,045,691
(38.70 %)
669,975
(11.72 %)
4,638,765
(42.07 %)
1
(0.00 %)
693,282
(5.96 %)
28,277
(1.93 %)
15,766
(0.94 %)
19 Asian bonytongue
GCF_900964775.1
50,315
(9.13 %)
n/a 16,526
(2.73 %)
38,780
(6.64 %)
72,662
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
0
(0 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
504,673
(3.06 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
0
(0 %)
157,330
(1.72 %)
88,517
(10.73 %)
67,281
(4.98 %)
20 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1
61,202
(2.60 %)
n/a 18,887
(1.13 %)
21,194
(1.06 %)
n/a 41.14
(99.90 %)
0
(0 %)
126
(0.10 %)
64
(100.00 %)
4,358,470
(31.27 %)
663,094
(4.56 %)
16,261,778
(48.66 %)
1
(0.00 %)
851,540
(1.93 %)
69,120
(1.32 %)
23,319
(0.49 %)
21 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1
n/a n/a 18,931
(1.76 %)
19,988
(1.37 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
0
(0 %)
92
(0.00 %)
193
(100.00 %)
3,632,286
(38.21 %)
350,074
(2.22 %)
14,785,531
(30.90 %)
1
(0.00 %)
254,432
(0.91 %)
36,699
(1.70 %)
36,659
(1.49 %)
22 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024)
GCA_963924715.1
n/a n/a 15,722
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
0
(0 %)
468
(0.01 %)
120
(100.00 %)
1,608,686
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,115
(27.80 %)
3
(0.00 %)
390,196
(3.88 %)
14,488
(0.90 %)
9,706
(0.46 %)
23 Atlantic cod
GCF_902167405.1
51,642
(11.92 %)
n/a 14,055
(2.62 %)
36,761
(8.42 %)
68,438
(9.50 %)
45.64
(96.48 %)
0
(0 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
790,946
(10.54 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
4
(0.00 %)
741,285
(7.34 %)
97,133
(7.82 %)
51,623
(3.50 %)
24 Atlantic halibut (refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
n/a 14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
69,662
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
0
(0 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
0
(0 %)
240,110
(3.16 %)
31,325
(2.25 %)
20,749
(1.34 %)
25 Atlantic horse mackerel (2021)
GCA_905171665.2
n/a n/a 15,262
(2.42 %)
51,857
(6.86 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
222
(0.00 %)
153
(100.00 %)
1,454,219
(18.25 %)
384,609
(4.72 %)
4,338,083
(32.80 %)
5
(0.00 %)
449,712
(4.53 %)
56,553
(3.08 %)
20,550
(1.04 %)
26 Atlantic mackerel (primary hap 2023)
GCA_963691925.1
n/a n/a 15,291
(2.56 %)
43,206
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
666
(100.00 %)
1,496,244
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,761
(29.92 %)
9
(0.00 %)
555,075
(5.00 %)
13,309
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
27 Atlantic mackerel (primary hap 2023)
GCF_963691925.1
34,357
(8.10 %)
n/a 15,289
(2.56 %)
43,205
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
665
(100.00 %)
1,496,240
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,726
(29.93 %)
9
(0.00 %)
555,074
(5.00 %)
13,308
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
28 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1
60,922
(45.62 %)
n/a 12,545
(0.38 %)
29,428
(1.34 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,648
(0.01 %)
2,990
(100.00 %)
8,579,105
(49.81 %)
831,224
(15.75 %)
21,718,213
(51.79 %)
9
(0.00 %)
4,445,293
(7.00 %)
105,821
(2.42 %)
35,197
(0.42 %)
29 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1
60,922
(2.51 %)
n/a 12,544
(0.38 %)
28,250
(1.22 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,648
(0.01 %)
2,989
(100.00 %)
8,579,099
(49.81 %)
831,222
(15.75 %)
21,718,178
(51.79 %)
9
(0.00 %)
4,445,369
(7.00 %)
105,821
(2.42 %)
35,197
(0.42 %)
30 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
n/a 14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
0
(0 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
1
(0.00 %)
4,597,115
(10.42 %)
78,364
(2.73 %)
45,620
(1.05 %)
31 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3
n/a n/a 16,280
(0.07 %)
186,628
(1.11 %)
n/a 46.01
(99.99 %)
0
(0 %)
184,422
(0.01 %)
27,157
(100.00 %)
28,291,633
(68.19 %)
7,299,053
(4.96 %)
211,579
(99.99 %)
189
(0.00 %)
n/a 2,388,998
(5.24 %)
429,355
(0.66 %)
32 ballan wrasse (primary hap 2024)
GCA_963930695.1
n/a n/a 15,142
(2.66 %)
43,601
(6.21 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
1
(0.00 %)
815
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,221,802
(30.10 %)
290,738
(7.79 %)
4,164,845
(30.34 %)
4
(0.00 %)
525,923
(5.43 %)
17,126
(0.94 %)
10,131
(0.54 %)
33 band-tailed pigeon (hap2 2024)
GCA_036971685.1
n/a n/a 13,319
(1.60 %)
25,993
(2.05 %)
n/a 43.83
(99.41 %)
0
(0 %)
219
(0.59 %)
453
(100.00 %)
700,173
(13.18 %)
457,546
(13.85 %)
4,523,003
(31.73 %)
2
(0.00 %)
1,089,353
(5.57 %)
42,686
(7.00 %)
31,415
(1.62 %)
34 banded archerfish
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
n/a 15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
0
(0 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
1
(0.00 %)
297,814
(3.49 %)
15,089
(0.96 %)
9,304
(0.55 %)
35 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1
n/a n/a 15,122
(1.44 %)
65,809
(4.50 %)
n/a 41.23
(99.74 %)
0
(0 %)
293
(0.26 %)
331
(100.00 %)
2,545,429
(50.53 %)
451,939
(5.50 %)
5,807,705
(42.18 %)
0
(0 %)
863,582
(6.37 %)
94,695
(3.92 %)
37,528
(1.27 %)
36 barbel (2022)
GCA_936440315.1
n/a n/a 31,876
(3.30 %)
85,063
(5.65 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
0
(0 %)
108
(0.00 %)
92
(100.00 %)
4,839,533
(52.47 %)
646,636
(4.57 %)
8,240,279
(42.13 %)
2
(0.00 %)
569,819
(3.17 %)
71,384
(3.04 %)
22,137
(0.56 %)
37 Barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.2
41,925
(5.13 %)
n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,661
(1.56 %)
36,548
(2.85 %)
29,760
(1.66 %)
38 barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021)
GCA_015227805.3
n/a n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,664
(1.56 %)
36,548
(2.85 %)
29,760
(1.66 %)
39 bats (hap1 2024)
GCA_038363145.1
n/a n/a 18,022
(1.56 %)
19,824
(1.51 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
419
(100.00 %)
2,827,417
(26.82 %)
371,479
(4.97 %)
11,603,093
(34.64 %)
1
(0.00 %)
522,672
(1.87 %)
71,574
(2.28 %)
54,020
(1.50 %)
40 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1
46,266
(2.61 %)
n/a 18,620
(1.80 %)
21,271
(1.72 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
48
(100.00 %)
3,041,145
(25.08 %)
904,075
(3.80 %)
10,530,666
(37.05 %)
0
(0 %)
647,994
(2.05 %)
77,605
(3.68 %)
62,105
(2.31 %)
41 bird P.pipra (hap1 2024)
GCF_036250125.1
55,558
(6.99 %)
n/a 12,807
(1.82 %)
23,359
(2.28 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
323
(0.01 %)
696
(100.00 %)
429,643
(4.10 %)
293,428
(3.59 %)
6,059,402
(21.89 %)
0
(0 %)
366,452
(2.74 %)
29,574
(2.42 %)
21,946
(1.07 %)
42 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1
n/a n/a 14,455
(2.06 %)
56,488
(6.31 %)
n/a 42.10
(99.99 %)
0
(0 %)
636
(0.01 %)
298
(100.00 %)
3,230,397
(55.09 %)
494,440
(10.43 %)
4,359,169
(40.46 %)
2
(0.00 %)
950,976
(6.99 %)
81,684
(4.81 %)
45,797
(2.02 %)
43 black rhinoceros (mBicDic1 primary hap 2021 refseq)
GCF_020826845.1
56,255
(2.28 %)
n/a 18,774
(1.38 %)
22,348
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
0
(0 %)
215
(0.05 %)
1,076
(100.00 %)
4,200,390
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,693
(40.14 %)
2
(0.00 %)
984,722
(2.61 %)
43,525
(1.14 %)
33,963
(0.76 %)
44 black-capped chickadee (bPoeAtr1 2023)
GCF_030490865.1
44,388
(4.96 %)
n/a 13,738
(1.81 %)
26,691
(2.34 %)
n/a 42.41
(99.92 %)
0
(0 %)
404
(0.08 %)
307
(100.00 %)
730,165
(12.91 %)
566,529
(6.51 %)
6,499,984
(24.36 %)
2
(0.00 %)
632,539
(3.23 %)
42,650
(2.59 %)
24,153
(1.20 %)
45 black-headed gull (primary hap 2024)
GCA_963924245.1
n/a n/a 13,244
(1.58 %)
25,111
(1.96 %)
n/a 44.66
(99.99 %)
0
(0 %)
462
(0.01 %)
729
(100.00 %)
516,350
(4.84 %)
268,175
(14.83 %)
5,880,256
(31.31 %)
1
(0.00 %)
746,095
(4.07 %)
45,313
(4.92 %)
37,372
(1.57 %)
46 black-headed gull (primary hap 2024)
GCF_963924245.1
46,133
(4.67 %)
n/a 13,243
(1.58 %)
24,048
(1.89 %)
n/a 44.66
(99.99 %)
0
(0 %)
462
(0.01 %)
728
(100.00 %)
516,346
(4.84 %)
268,169
(14.83 %)
5,880,218
(31.31 %)
1
(0.00 %)
746,091
(4.07 %)
45,313
(4.92 %)
37,373
(1.57 %)
47 black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq)
GCF_028500815.1
51,115
(5.11 %)
n/a 13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
0
(0 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
8
(0.00 %)
651,837
(3.67 %)
45,318
(4.71 %)
36,668
(1.67 %)
48 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1
n/a n/a 15,043
(2.96 %)
50,860
(7.54 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
366
(0.01 %)
109
(100.00 %)
1,210,142
(29.44 %)
340,820
(9.19 %)
2,986,750
(29.89 %)
0
(0 %)
547,550
(6.92 %)
52,010
(4.20 %)
28,373
(1.72 %)
49 blackcap
GCA_009819655.1
n/a n/a 12,378
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
0
(0 %)
413
(1.12 %)
189
(100.00 %)
506,242
(6.14 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,567
(19.76 %)
0
(0 %)
190,210
(1.30 %)
26,838
(2.34 %)
22,667
(1.33 %)
50 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1
n/a n/a 17,486
(2.97 %)
46,833
(5.41 %)
n/a 38.79
(99.99 %)
0
(0 %)
720
(0.01 %)
413
(100.00 %)
2,165,269
(36.18 %)
490,692
(17.84 %)
4,251,333
(47.54 %)
10
(0.00 %)
1,058,863
(8.47 %)
42,744
(2.37 %)
19,312
(0.98 %)
51 Blainville's beaked whale (mMesDen1 primary hap 2022)
GCA_025265405.1
47,540
(38.02 %)
n/a 19,042
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
0
(0 %)
97
(0.03 %)
73
(100.00 %)
3,964,035
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,162
(41.78 %)
1
(0.00 %)
1,795,618
(5.01 %)
70,851
(1.80 %)
37,949
(0.93 %)
52 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1
47,540
(2.07 %)
n/a 19,041
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
0
(0 %)
97
(0.03 %)
74
(100.00 %)
3,964,038
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,229
(41.78 %)
1
(0.00 %)
1,795,618
(5.01 %)
70,851
(1.80 %)
37,949
(0.93 %)
53 blonde ray (primary hap 2023)
GCA_963514005.1
n/a n/a 11,900
(0.54 %)
27,568
(1.55 %)
n/a 44.98
(99.98 %)
0
(0 %)
2,269
(0.02 %)
1,647
(100.00 %)
8,972,805
(66.20 %)
1,061,811
(8.11 %)
11,599,498
(58.72 %)
6
(0.00 %)
2,430,580
(6.13 %)
278,499
(6.42 %)
59,922
(2.12 %)
54 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2
58,750
(2.71 %)
n/a 19,162
(1.80 %)
20,576
(1.41 %)
36,291
(1.99 %)
40.88
(98.91 %)
0
(0 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,870
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,384
(34.60 %)
4
(0.00 %)
422,171
(1.33 %)
67,032
(1.73 %)
46,602
(1.41 %)
55 blue-and-yellow macaw (hap1 2023)
GCA_028858755.1
n/a n/a 12,919
(1.77 %)
22,770
(2.15 %)
n/a 42.69
(99.92 %)
0
(0 %)
107
(0.08 %)
246
(100.00 %)
711,670
(17.55 %)
242,430
(5.04 %)
5,545,074
(24.84 %)
0
(0 %)
506,592
(3.20 %)
25,153
(2.06 %)
19,988
(1.21 %)
56 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2
n/a n/a 14,499
(1.97 %)
51,213
(5.47 %)
n/a 38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
442
(100.00 %)
731,731
(4.21 %)
471,623
(4.92 %)
5,974,055
(42.88 %)
0
(0 %)
455,138
(4.01 %)
29,052
(1.48 %)
14,673
(0.63 %)
57 Boeseman's rainbowfish
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
n/a 15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
0
(0 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
1
(0.00 %)
441,845
(3.68 %)
18,525
(1.10 %)
10,661
(0.59 %)
58 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1
n/a n/a 16,964
(1.77 %)
67,673
(5.93 %)
n/a 42.61
(99.97 %)
28
(0.00 %)
1,785
(0.03 %)
979
(100.00 %)
4,285,965
(30.73 %)
1,222,431
(20.69 %)
6,105,881
(46.99 %)
11
(0.00 %)
1,356,343
(8.48 %)
73,543
(3.28 %)
32,534
(1.37 %)
59 bonti-bonti (T.bonti 2022)
GCA_933228915.1
n/a n/a 14,929
(1.93 %)
55,343
(5.90 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
0
(0 %)
1,329
(0.03 %)
146
(100.00 %)
998,246
(14.90 %)
443,155
(22.40 %)
4,319,947
(40.01 %)
2
(0.00 %)
1,529,147
(9.19 %)
34,018
(4.16 %)
15,066
(0.86 %)
60 bony fish N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1
n/a n/a 17,996
(2.00 %)
89,591
(7.93 %)
n/a 45.22
(99.94 %)
0
(0 %)
3,299
(0.06 %)
1,177
(100.00 %)
2,828,457
(30.93 %)
1,676,413
(19.87 %)
4,137,400
(48.69 %)
14
(0.00 %)
1,929,538
(11.96 %)
78,669
(4.37 %)
29,960
(1.34 %)
61 bony fish R.sp. 'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1
n/a n/a 15,501
(2.18 %)
54,090
(6.20 %)
n/a 41.17
(99.99 %)
0
(0 %)
422
(0.01 %)
82
(100.00 %)
1,727,328
(38.16 %)
259,351
(4.71 %)
4,381,278
(33.25 %)
2
(0.00 %)
338,853
(3.90 %)
35,281
(1.93 %)
14,746
(0.71 %)
62 Bornean orangutan (v2 AG05252 primary hap 2024 refseq)
GCF_028885625.2
92,658
(2.98 %)
n/a 20,708
(1.74 %)
21,361
(1.14 %)
n/a 40.88
(99.75 %)
0
(0 %)
8
(0.25 %)
26
(100.00 %)
5,544,151
(54.41 %)
1,072,960
(9.60 %)
16,187,641
(42.16 %)
0
(0 %)
2,505,849
(4.22 %)
43,604
(1.09 %)
29,685
(0.76 %)
63 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1
n/a n/a 18,247
(1.61 %)
22,673
(1.83 %)
n/a 41.12
(99.99 %)
205
(0.00 %)
775
(0.01 %)
835
(100.00 %)
2,918,285
(18.64 %)
868,090
(5.77 %)
9,427,604
(40.78 %)
2
(0.00 %)
1,601,923
(4.79 %)
27,049
(1.25 %)
22,545
(0.76 %)
64 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1
n/a n/a 18,667
(1.46 %)
20,817
(1.26 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
284
(0.00 %)
903
(100.00 %)
4,004,895
(35.23 %)
925,158
(12.15 %)
11,999,784
(42.65 %)
3
(0.00 %)
1,841,091
(5.04 %)
63,428
(1.55 %)
38,329
(0.93 %)
65 bowfin (hap1 2024)
GCA_036373705.1
n/a n/a 13,851
(1.83 %)
27,058
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
97
(0.00 %)
390
(100.00 %)
953,497
(13.69 %)
387,700
(7.91 %)
4,552,410
(37.72 %)
4
(0.00 %)
613,799
(6.38 %)
46,301
(2.99 %)
26,437
(1.15 %)
66 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1
n/a n/a 17,865
(1.56 %)
76,506
(5.59 %)
n/a 42.15
(99.96 %)
0
(0 %)
2,704
(0.04 %)
676
(100.00 %)
6,391,921
(39.62 %)
1,227,487
(11.70 %)
6,669,558
(49.73 %)
11
(0.00 %)
1,301,019
(7.83 %)
76,828
(3.96 %)
26,877
(0.90 %)
67 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1
n/a n/a 19,039
(1.66 %)
21,660
(1.59 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
20
(0.00 %)
148
(100.00 %)
3,805,818
(31.80 %)
640,446
(2.50 %)
11,793,353
(36.15 %)
1
(0.00 %)
609,574
(1.94 %)
68,896
(2.40 %)
57,812
(1.49 %)
68 Brazilian merganser (hap1 2024)
GCA_036873955.1
n/a n/a 13,202
(1.80 %)
24,416
(2.14 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
0
(0 %)
327
(0.00 %)
569
(100.00 %)
832,469
(7.06 %)
531,644
(7.37 %)
6,294,434
(28.49 %)
0
(0 %)
618,430
(3.89 %)
34,786
(3.61 %)
27,553
(1.39 %)
69 Brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176765.1
n/a n/a 14,463
(1.05 %)
20,625
(1.90 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
0
(0 %)
191
(0.00 %)
29
(100.00 %)
1,456,556
(7.33 %)
1,162,200
(6.85 %)
9,275,690
(46.71 %)
0
(0 %)
1,512,000
(5.23 %)
44,738
(1.08 %)
17,370
(0.40 %)
70 brown argus butterfly
GCF_905147365.1
23,611
(6.61 %)
n/a 4,734
(1.03 %)
24,265
(6.80 %)
24,237
(6.16 %)
36.86
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
25
(100.00 %)
264,358
(2.90 %)
144,234
(3.35 %)
2,650,845
(48.44 %)
0
(0 %)
205,173
(4.19 %)
35,431
(4.56 %)
15,409
(1.89 %)
71 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1
n/a n/a 19,138
(1.72 %)
20,370
(1.54 %)
n/a 43.08
(99.99 %)
0
(0 %)
1,237
(0.01 %)
65
(100.00 %)
3,201,470
(26.24 %)
957,903
(4.27 %)
10,687,995
(39.65 %)
8
(0.00 %)
881,577
(2.81 %)
60,671
(2.39 %)
52,889
(1.71 %)
72 butterfish (2021 G10K)
GCF_020382885.2
52,828
(14.10 %)
n/a 15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
0
(0 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
1
(0.00 %)
96,783
(1.70 %)
15,574
(1.13 %)
10,807
(0.72 %)
73 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1
n/a n/a 14,403
(2.47 %)
61,860
(7.37 %)
n/a 43.15
(99.96 %)
0
(0 %)
1,625
(0.04 %)
525
(100.00 %)
959,651
(12.16 %)
517,137
(13.14 %)
3,775,081
(32.47 %)
9
(0.00 %)
784,659
(7.82 %)
81,881
(6.68 %)
50,317
(3.10 %)
74 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2
70,801
(3.05 %)
n/a 20,915
(1.77 %)
20,179
(1.40 %)
44,926
(2.10 %)
41.40
(99.23 %)
0
(0 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,525,652
(43.65 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,648
(33.76 %)
2
(0.00 %)
495,451
(1.44 %)
51,899
(1.50 %)
48,201
(1.32 %)
75 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2
50,142
(2.69 %)
n/a 18,273
(1.65 %)
19,264
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
0
(0 %)
842
(0.12 %)
54
(100.00 %)
5,011,165
(43.72 %)
904,525
(1.75 %)
13,467,551
(34.19 %)
0
(0 %)
572,384
(1.64 %)
66,799
(2.48 %)
60,482
(2.02 %)
76 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1
n/a n/a 11,692
(0.46 %)
19,961
(1.22 %)
n/a 42.79
(99.99 %)
0
(0 %)
1,507
(0.01 %)
445
(100.00 %)
4,781,152
(36.16 %)
876,063
(14.65 %)
16,060,040
(52.49 %)
7
(0.00 %)
2,994,548
(6.81 %)
101,598
(1.64 %)
21,263
(0.33 %)
77 carmine bee-eater
GCA_009819595.1
n/a n/a 12,740
(1.82 %)
28,031
(2.77 %)
n/a 42.88
(99.47 %)
0
(0 %)
269
(0.53 %)
109
(100.00 %)
556,926
(7.87 %)
213,180
(1.09 %)
6,641,077
(21.58 %)
0
(0 %)
132,076
(1.14 %)
30,881
(2.41 %)
23,550
(1.23 %)
78 chaffinch (primary hap 2023)
GCA_963513975.1
n/a n/a 12,708
(1.72 %)
24,978
(2.26 %)
n/a 44.06
(99.99 %)
7
(0.00 %)
573
(0.01 %)
467
(100.00 %)
495,590
(3.15 %)
493,628
(13.34 %)
6,163,336
(28.37 %)
2
(0.00 %)
729,875
(4.06 %)
39,042
(6.25 %)
24,111
(1.21 %)
79 channel bull blenny
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
n/a 14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
0
(0 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
0
(0 %)
452,303
(4.62 %)
20,453
(1.39 %)
10,802
(0.65 %)
80 chimpanzee (v2 AG18354 primary hap 2024 refseq)
GCF_028858775.2
134,453
(3.48 %)
n/a 20,832
(1.77 %)
22,081
(1.17 %)
n/a 40.57
(99.84 %)
0
(0 %)
5
(0.16 %)
26
(100.00 %)
5,408,047
(49.94 %)
1,021,513
(10.88 %)
15,986,329
(42.21 %)
0
(0 %)
3,108,843
(5.27 %)
49,727
(1.09 %)
29,844
(0.76 %)
81 Chinese pangolin (mManPen7 2023)
GCF_030020395.1
71,445
(2.98 %)
n/a 18,379
(1.34 %)
21,837
(1.29 %)
n/a 41.07
(99.77 %)
0
(0 %)
383
(0.23 %)
661
(100.00 %)
3,318,871
(34.65 %)
618,193
(3.68 %)
12,009,669
(39.02 %)
8
(0.00 %)
1,132,160
(3.87 %)
47,708
(1.22 %)
34,214
(0.79 %)
82 chub mackerel (fScoJap1 primary hap 2022)
GCF_027409825.1
34,390
(6.95 %)
n/a 15,348
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
0
(0 %)
1,572
(0.08 %)
360
(100.00 %)
1,669,322
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,373
(32.38 %)
3
(0.00 %)
927,880
(7.23 %)
16,290
(0.85 %)
8,913
(0.42 %)
83 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3
n/a n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
67,055
(11.68 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
633,883
(15.28 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,008
(21.31 %)
0
(0 %)
169,790
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
84 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1
81,219
(3.62 %)
n/a 18,300
(1.65 %)
20,361
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
0
(0 %)
181
(0.06 %)
33
(100.00 %)
4,224,269
(34.84 %)
992,668
(2.08 %)
13,618,866
(34.42 %)
3
(0.00 %)
647,739
(1.89 %)
67,830
(2.45 %)
58,781
(1.98 %)
85 coelacanth (fLatCha1 primary hap 2024)
GCF_037176945.1
40,046
(2.75 %)
n/a 13,820
(0.63 %)
17,285
(1.40 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
154
(0.00 %)
197
(100.00 %)
2,064,326
(2.75 %)
1,047,267
(3.01 %)
15,613,479
(54.45 %)
1
(0.00 %)
1,146,128
(3.27 %)
140,027
(2.34 %)
11,143
(0.16 %)
86 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1
n/a n/a 13,266
(1.21 %)
16,750
(1.98 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
0
(0 %)
372
(0.00 %)
350
(100.00 %)
782,672
(6.46 %)
434,795
(2.20 %)
7,788,697
(37.04 %)
0
(0 %)
506,831
(2.74 %)
28,089
(0.98 %)
14,987
(0.51 %)
87 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1
n/a n/a 18,114
(2.63 %)
66,549
(6.11 %)
n/a 38.62
(99.99 %)
7
(0.00 %)
685
(0.01 %)
215
(100.00 %)
2,639,968
(48.46 %)
659,243
(7.55 %)
5,950,358
(40.47 %)
3
(0.00 %)
963,199
(6.67 %)
62,337
(3.61 %)
19,726
(0.79 %)
88 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1
37,674
(1.80 %)
n/a 18,653
(0.80 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,116
(38.90 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,306
(40.56 %)
0
(0 %)
455,717
(1.17 %)
17,762
(0.38 %)
13,986
(0.24 %)
89 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq)
GCF_017976375.1
50,206
(6.30 %)
n/a 13,190
(1.85 %)
24,284
(2.29 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
0
(0 %)
296
(0.42 %)
150
(100.00 %)
566,161
(11.56 %)
310,430
(2.36 %)
6,712,791
(21.76 %)
0
(0 %)
326,395
(1.83 %)
25,268
(1.73 %)
20,672
(1.05 %)
90 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1
36,211
(8.34 %)
n/a 14,995
(2.62 %)
50,844
(6.89 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
0
(0 %)
275
(0.01 %)
338
(100.00 %)
1,186,799
(32.17 %)
307,864
(16.34 %)
3,562,802
(35.00 %)
2
(0.00 %)
481,477
(5.21 %)
41,657
(2.72 %)
22,630
(1.29 %)
91 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1
45,869
(6.34 %)
n/a 14,279
(1.46 %)
19,710
(2.38 %)
n/a 44.05
(99.99 %)
0
(0 %)
683
(0.01 %)
48
(100.00 %)
4,128,183
(45.62 %)
513,318
(3.73 %)
7,172,928
(37.61 %)
7
(0.00 %)
477,389
(3.08 %)
92,858
(2.90 %)
22,863
(0.95 %)
92 common myna (bArcTri1 primary hap 2023)
GCA_027559615.1
n/a n/a 12,560
(1.73 %)
23,740
(2.16 %)
n/a 42.32
(99.80 %)
0
(0 %)
435
(0.20 %)
455
(100.00 %)
395,254
(5.40 %)
937,774
(11.00 %)
6,145,808
(28.07 %)
2
(0.00 %)
825,681
(4.71 %)
32,293
(3.87 %)
21,576
(1.15 %)
93 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1
n/a n/a 17,216
(1.82 %)
19,202
(1.79 %)
n/a 42.55
(99.97 %)
0
(0 %)
1,546
(0.03 %)
323
(100.00 %)
2,953,532
(23.94 %)
805,142
(2.83 %)
9,964,846
(34.69 %)
0
(0 %)
446,836
(1.61 %)
57,295
(2.83 %)
54,882
(1.90 %)
94 common sole (primary hap 2023)
GCF_958295425.1
55,359
(12.02 %)
n/a 14,844
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
242
(100.00 %)
1,149,243
(19.12 %)
342,238
(9.71 %)
3,906,753
(32.84 %)
2
(0.00 %)
440,509
(5.18 %)
27,772
(2.71 %)
15,561
(0.92 %)
95 common spadefoot toad (aPelFus1 2024)
GCA_036172605.1
n/a n/a 14,564
(0.56 %)
46,435
(2.21 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
1
(0.00 %)
349
(0.00 %)
161
(100.00 %)
1,677,382
(3.51 %)
3,229,435
(13.31 %)
15,027,089
(51.43 %)
12
(0.00 %)
3,799,247
(9.03 %)
282,389
(3.86 %)
79,263
(0.96 %)
96 common spadefoot toad (aPelFus1 2024)
GCF_036172605.1
42,170
(1.55 %)
n/a 14,560
(0.56 %)
46,435
(2.21 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
0
(0 %)
349
(0.00 %)
159
(100.00 %)
1,677,374
(3.51 %)
3,229,434
(13.31 %)
15,027,049
(51.43 %)
12
(0.00 %)
3,799,232
(9.03 %)
282,389
(3.86 %)
79,263
(0.96 %)
97 common swift (bApuApu2 2021 refseq)
GCF_020740795.1
39,986
(4.95 %)
n/a 12,292
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
0
(0 %)
256
(0.16 %)
110
(100.00 %)
499,695
(6.70 %)
199,749
(1.12 %)
6,354,003
(21.19 %)
1
(0.00 %)
113,872
(0.91 %)
20,393
(1.74 %)
16,313
(0.88 %)
98 common tern
GCA_009819605.1
n/a n/a 13,103
(1.81 %)
24,044
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.16 %)
0
(0 %)
205
(0.84 %)
123
(100.00 %)
570,312
(7.91 %)
216,895
(1.04 %)
7,043,151
(20.98 %)
1
(0.00 %)
112,065
(1.02 %)
45,694
(3.73 %)
41,720
(2.13 %)
99 common toad
GCF_905171765.1
45,085
(1.10 %)
n/a 14,240
(0.38 %)
46,470
(1.68 %)
37,594
(0.91 %)
44.49
(99.80 %)
0
(0 %)
4,199
(0.20 %)
1,306
(100.00 %)
1,658,204
(1.79 %)
3,099,513
(13.49 %)
19,236,510
(62.70 %)
18
(0.00 %)
6,217,888
(10.17 %)
539,919
(4.45 %)
78,985
(0.67 %)
100 common vampire bat (HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1
58,054
(45.51 %)
n/a 18,280
(1.71 %)
19,514
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
611
(0.01 %)
572
(100.00 %)
2,761,820
(28.38 %)
427,940
(3.89 %)
11,250,492
(32.57 %)
37
(0.00 %)
360,489
(1.62 %)
70,700
(2.48 %)
44,288
(1.24 %)
101 common vampire bat (HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.1
58,054
(3.40 %)
n/a 18,280
(1.71 %)
19,515
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
611
(0.01 %)
573
(100.00 %)
2,761,826
(28.38 %)
427,942
(3.89 %)
11,250,529
(32.57 %)
37
(0.00 %)
360,489
(1.62 %)
70,701
(2.48 %)
44,289
(1.24 %)
102 common yellowthroat
GCA_009764595.1
n/a n/a 11,741
(1.82 %)
22,382
(2.29 %)
n/a 42.01
(98.73 %)
0
(0 %)
1,479
(1.27 %)
278
(100.00 %)
476,049
(6.38 %)
367,108
(3.16 %)
6,576,957
(20.43 %)
0
(0 %)
333,263
(2.08 %)
25,004
(2.02 %)
20,494
(1.18 %)
103 convict blenny (chichlid 2021)
GCA_020510985.1
n/a n/a n/a 134,417
(1.50 %)
n/a 44.52
(99.13 %)
0
(0 %)
2,580
(0.87 %)
512
(100.00 %)
9,062,541
(49.33 %)
2,097,650
(2.66 %)
3,092
(99.13 %)
5
(0.00 %)
3,135,536
(6.36 %)
568,042
(10.14 %)
0
(0.00 %)
104 copperband butterflyfish
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
n/a 15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
61,755
(8.99 %)
42.57
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
1
(0.00 %)
158,516
(2.15 %)
29,106
(1.85 %)
19,302
(1.11 %)
105 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1
n/a n/a 14,740
(2.91 %)
45,483
(7.26 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
0
(0 %)
1,379
(0.04 %)
395
(100.00 %)
936,676
(24.41 %)
306,192
(9.29 %)
3,495,456
(28.75 %)
2
(0.00 %)
463,889
(5.20 %)
29,142
(2.35 %)
16,622
(1.09 %)
106 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1
140,657
(1.12 %)
n/a 15,461
(0.24 %)
54,344
(1.07 %)
n/a 45.66
(99.76 %)
0
(0 %)
2,699
(0.24 %)
3,127
(100.00 %)
3,521,281
(2.88 %)
5,902,115
(18.63 %)
5,826
(99.76 %)
23
(0.00 %)
n/a 990,274
(4.84 %)
952,582
(4.53 %)
107 corroboree frog (hap2 2023)
GCA_028390025.1
n/a n/a n/a 54,346
(1.07 %)
n/a 45.66
(99.76 %)
0
(0 %)
2,699
(0.24 %)
3,127
(100.00 %)
18,782,633
(75.22 %)
5,902,115
(18.63 %)
5,826
(99.76 %)
23
(0.00 %)
n/a 990,274
(4.84 %)
90,184
(0.51 %)
108 Cretan wall lizard (primary hap 2023)
GCA_951804945.1
n/a n/a 14,249
(1.37 %)
19,304
(2.27 %)
n/a 43.87
(100.00 %)
4
(0.00 %)
47
(0.00 %)
55
(100.00 %)
882,564
(4.30 %)
511,174
(3.24 %)
7,094,363
(38.65 %)
2
(0.00 %)
586,225
(3.38 %)
117,222
(3.18 %)
18,707
(0.71 %)
109 crucian carp (primary hap 2023)
GCF_963082965.1
90,094
(6.75 %)
n/a 29,386
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
0
(0 %)
832
(0.01 %)
277
(100.00 %)
3,481,382
(45.81 %)
802,773
(6.54 %)
8,190,783
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,003,533
(5.09 %)
83,696
(3.82 %)
26,039
(0.81 %)
110 cuckoo roller (hap2 2023)
GCA_034619465.1
n/a n/a 13,044
(1.66 %)
30,275
(2.65 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
17
(0.00 %)
271
(0.00 %)
295
(100.00 %)
603,184
(8.76 %)
324,082
(7.37 %)
6,147,876
(25.10 %)
0
(0 %)
633,504
(3.50 %)
44,051
(8.95 %)
36,565
(2.19 %)
111 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1
51,190
(10.37 %)
n/a 15,144
(2.59 %)
43,207
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.98 %)
0
(0 %)
570
(0.02 %)
324
(100.00 %)
1,435,625
(29.39 %)
330,276
(12.54 %)
4,196,830
(33.83 %)
1
(0.00 %)
689,646
(5.54 %)
19,310
(1.01 %)
11,155
(0.57 %)
112 cunner (2021)
GCA_020745685.1
n/a n/a 15,192
(2.74 %)
43,564
(6.38 %)
n/a 41.31
(99.41 %)
0
(0 %)
283
(0.59 %)
64
(100.00 %)
1,419,667
(30.50 %)
243,024
(4.81 %)
4,334,690
(27.65 %)
2
(0.00 %)
297,510
(2.95 %)
17,974
(1.06 %)
9,021
(0.52 %)
113 Dalmatian pelican (primary hap 2023)
GCA_030463565.1
n/a n/a 13,457
(1.72 %)
25,299
(2.10 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
0
(0 %)
390
(0.01 %)
311
(100.00 %)
660,747
(14.47 %)
294,268
(5.22 %)
6,840,996
(24.63 %)
5
(0.00 %)
318,407
(2.04 %)
39,705
(5.14 %)
36,802
(1.98 %)
114 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022)
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
n/a 15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
0
(0 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
4
(0.00 %)
383,250
(3.60 %)
32,973
(1.28 %)
9,764
(0.33 %)
115 Daubenton's bat (primary hap 2023)
GCF_963259705.1
64,558
(3.32 %)
n/a 19,141
(1.72 %)
22,133
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
0
(0 %)
1,099
(0.01 %)
121
(100.00 %)
3,040,232
(24.03 %)
796,911
(6.38 %)
10,478,180
(38.84 %)
9
(0.00 %)
756,429
(2.76 %)
64,920
(2.51 %)
57,806
(1.88 %)
116 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2
n/a n/a 16,559
(3.78 %)
58,823
(8.66 %)
74,128
(10.47 %)
43.69
(99.18 %)
0
(0 %)
464
(0.82 %)
461
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,284
(4.61 %)
2,948,738
(28.79 %)
0
(0 %)
306,165
(4.31 %)
64,661
(9.49 %)
52,867
(4.93 %)
117 diamondback terrapin (rMalTer1 2023)
GCF_027887155.1
50,318
(3.53 %)
n/a 15,109
(1.08 %)
19,280
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.92 %)
0
(0 %)
141
(0.08 %)
76
(100.00 %)
4,088,064
(46.33 %)
403,943
(1.72 %)
11,014,504
(33.74 %)
0
(0 %)
407,696
(1.71 %)
110,838
(2.71 %)
30,093
(0.82 %)
118 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1
96,734
(3.71 %)
n/a 20,135
(1.64 %)
20,871
(1.38 %)
56,772
(3.19 %)
41.50
(100.00 %)
585
(0.00 %)
585
(0.00 %)
2,782
(100.00 %)
20,264,827
(43.87 %)
1,152,879
(3.22 %)
13,784,690
(34.30 %)
9
(0.00 %)
1,226,639
(2.84 %)
53,518
(2.23 %)
49,021
(1.97 %)
119 dorado (hap2 2023)
GCA_030463535.1
n/a n/a 16,799
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
0
(0 %)
726
(0.85 %)
104
(100.00 %)
2,693,928
(34.60 %)
805,807
(14.65 %)
5,615,731
(36.69 %)
2
(0.00 %)
1,425,798
(8.96 %)
30,083
(1.31 %)
21,157
(0.81 %)
120 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCF_014839835.1
25,483
(3.24 %)
n/a 12,410
(1.70 %)
22,416
(2.11 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
0
(0 %)
187
(0.34 %)
180
(100.00 %)
1,259,627
(26.52 %)
378,533
(3.38 %)
5,846,661
(32.04 %)
0
(0 %)
791,075
(4.25 %)
26,005
(1.75 %)
19,919
(1.16 %)
121 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1
n/a n/a 18,354
(1.22 %)
20,434
(1.08 %)
n/a 40.65
(100.00 %)
0
(0 %)
96
(0.00 %)
198
(100.00 %)
4,458,084
(33.00 %)
444,499
(1.79 %)
15,031,940
(47.42 %)
0
(0 %)
508,936
(1.29 %)
29,863
(0.83 %)
24,007
(0.54 %)
122 East African grey crowned-crane
GCA_011004875.1
n/a n/a 13,276
(1.84 %)
25,393
(2.30 %)
n/a 42.38
(99.61 %)
0
(0 %)
144
(0.39 %)
105
(100.00 %)
548,862
(7.06 %)
187,966
(0.97 %)
7,004,597
(21.19 %)
0
(0 %)
102,622
(1.00 %)
36,626
(3.69 %)
36,347
(2.31 %)
123 Eastern black-eared wheatear (GR-GAL-2019-014 2023)
GCF_029582105.1
38,171
(5.79 %)
n/a 12,559
(1.96 %)
23,642
(2.48 %)
n/a 42.01
(99.99 %)
0
(0 %)
582
(0.01 %)
587
(100.00 %)
599,051
(9.46 %)
453,954
(3.77 %)
6,287,657
(20.75 %)
0
(0 %)
382,912
(2.31 %)
27,831
(2.52 %)
21,991
(1.27 %)
124 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1
n/a n/a 18,522
(1.26 %)
22,314
(1.28 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
0
(0 %)
316
(0.00 %)
99
(100.00 %)
3,699,683
(20.55 %)
935,350
(11.22 %)
13,112,318
(44.07 %)
1
(0.00 %)
n/a 99,224
(2.27 %)
68,695
(1.75 %)
125 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5
n/a n/a 15,552
(2.29 %)
52,465
(6.26 %)
86,437
(9.40 %)
41.07
(99.87 %)
115
(0.00 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
1,309,350
(35.93 %)
217,916
(1.89 %)
4,547,434
(30.78 %)
2
(0.00 %)
212,425
(2.79 %)
33,005
(1.88 %)
15,205
(0.74 %)
126 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1
n/a n/a 13,413
(1.19 %)
18,038
(1.85 %)
n/a 44.58
(99.99 %)
553
(0.01 %)
553
(0.01 %)
771
(99.99 %)
1,003,504
(9.02 %)
621,617
(3.54 %)
8,327,948
(30.44 %)
3
(0.00 %)
583,206
(2.41 %)
117,734
(4.05 %)
30,498
(1.01 %)
127 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1
n/a n/a 13,882
(0.43 %)
35,323
(1.46 %)
n/a 46.78
(99.99 %)
0
(0 %)
1,745
(0.01 %)
1,002
(100.00 %)
1,769,293
(1.99 %)
2,023,109
(16.33 %)
16,148,710
(60.55 %)
22
(0.00 %)
5,852,023
(9.72 %)
618,204
(5.89 %)
74,394
(0.76 %)
128 Egyptian rousette (2020)
GCF_014176215.1
65,163
(4.76 %)
n/a 17,642
(2.07 %)
22,317
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
0
(0 %)
242
(1.41 %)
29
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,414
(1.02 %)
12,031,597
(26.52 %)
0
(0 %)
65,562
(0.33 %)
53,573
(4.84 %)
57,281
(4.47 %)
129 electric eel
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
n/a 15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
54,541
(8.42 %)
42.49
(98.20 %)
0
(0 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
1
(0.00 %)
629,918
(5.96 %)
44,501
(3.93 %)
34,390
(2.63 %)
130 emu (hap1 2024)
GCF_036370855.1
54,479
(5.65 %)
n/a 13,972
(1.59 %)
25,695
(1.97 %)
n/a 43.79
(100.00 %)
0
(0 %)
129
(0.00 %)
271
(100.00 %)
713,839
(12.11 %)
418,774
(7.08 %)
5,668,105
(24.04 %)
2
(0.00 %)
825,273
(5.02 %)
51,137
(7.32 %)
43,488
(2.92 %)
131 emu (v2 ZJU1.0 2023)
GCA_016128335.2
n/a n/a 13,213
(1.74 %)
24,562
(2.10 %)
n/a 42.41
(99.99 %)
0
(0 %)
539
(0.01 %)
767
(100.00 %)
567,285
(7.79 %)
258,030
(2.59 %)
7,108,005
(19.16 %)
9
(0.00 %)
314,931
(1.79 %)
41,752
(6.24 %)
41,181
(3.35 %)
132 epaulette shark (sHemOce1 2021 refseq)
GCF_020745735.1
43,156
(1.65 %)
n/a 12,749
(0.40 %)
19,519
(1.06 %)
n/a 42.76
(98.05 %)
0
(0 %)
3,716
(1.95 %)
1,962
(100.00 %)
9,420,365
(63.82 %)
935,037
(6.51 %)
20,660,566
(43.88 %)
0
(0 %)
2,903,280
(4.44 %)
41,682
(1.08 %)
16,895
(0.30 %)
133 ermine (2020)
GCF_009829155.1
74,332
(3.19 %)
n/a 18,855
(1.65 %)
20,667
(1.43 %)
44,584
(2.07 %)
41.56
(99.12 %)
0
(0 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,647,934
(41.44 %)
714,174
(1.30 %)
13,845,904
(33.42 %)
3
(0.01 %)
452,963
(1.26 %)
56,065
(2.25 %)
56,447
(2.07 %)
134 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1
57,138
(2.48 %)
n/a 19,265
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,487,951
(32.73 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,723
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,258
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
54,563
(1.83 %)
135 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1
n/a n/a 17,661
(3.01 %)
58,218
(6.54 %)
n/a 39.21
(99.98 %)
0
(0 %)
881
(0.02 %)
125
(100.00 %)
2,346,939
(44.27 %)
502,415
(11.23 %)
4,890,830
(40.45 %)
0
(0 %)
873,838
(6.63 %)
60,482
(4.22 %)
24,091
(1.23 %)
136 Eurasian nightjar
GCA_907165065.1
n/a n/a 13,040
(1.86 %)
22,823
(2.21 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
153
(0.00 %)
121
(100.00 %)
595,803
(8.38 %)
248,128
(1.78 %)
6,744,611
(22.18 %)
2
(0.00 %)
193,177
(1.31 %)
24,805
(1.90 %)
20,997
(1.31 %)
137 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2
n/a n/a 21,309
(1.58 %)
21,026
(1.36 %)
33,465
(1.53 %)
40.08
(94.33 %)
0
(0 %)
1,177
(5.67 %)
639
(100.00 %)
4,677,412
(35.73 %)
704,218
(1.42 %)
14,992,063
(31.49 %)
5
(0.00 %)
419,661
(1.29 %)
48,159
(1.04 %)
45,470
(0.95 %)
138 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1
67,145
(2.95 %)
n/a 18,842
(1.54 %)
20,178
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
0
(0 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,259,294
(33.39 %)
713,721
(1.36 %)
13,626,048
(34.37 %)
1
(0.00 %)
695,796
(1.86 %)
57,073
(1.82 %)
47,446
(1.36 %)
139 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
n/a 19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
36,935
(2.27 %)
42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
5
(0.00 %)
518,667
(1.69 %)
19,000
(0.58 %)
16,851
(0.46 %)
140 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1
n/a n/a 18,028
(2.64 %)
64,206
(6.04 %)
n/a 38.73
(99.99 %)
0
(0 %)
588
(0.01 %)
106
(100.00 %)
2,649,943
(48.88 %)
666,129
(9.08 %)
5,751,610
(41.56 %)
5
(0.00 %)
1,113,756
(7.21 %)
58,471
(3.64 %)
19,602
(0.84 %)
141 European common frog
GCF_905171775.1
51,633
(1.57 %)
n/a 13,864
(0.46 %)
39,978
(1.88 %)
57,578
(1.85 %)
44.15
(99.36 %)
0
(0 %)
1,860
(0.64 %)
554
(100.00 %)
1,804,642
(3.42 %)
2,925,830
(9.39 %)
18,921,726
(55.43 %)
8
(0.00 %)
3,384,162
(6.05 %)
641,799
(7.66 %)
62,649
(0.67 %)
142 European conger
GCF_963514075.1
54,631
(7.46 %)
n/a 17,072
(1.89 %)
34,801
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
0
(0 %)
1,009
(0.02 %)
380
(100.00 %)
761,522
(5.99 %)
913,306
(13.25 %)
5,767,879
(35.48 %)
3
(0.00 %)
1,603,437
(8.94 %)
120,990
(6.12 %)
81,342
(2.93 %)
143 European eel
GCF_013347855.1
64,143
(9.57 %)
n/a 17,054
(2.22 %)
34,278
(5.56 %)
79,684
(7.37 %)
43.64
(99.61 %)
0
(0 %)
640
(0.40 %)
54
(100.00 %)
831,037
(5.48 %)
786,521
(8.15 %)
5,700,890
(27.40 %)
2
(0.00 %)
774,914
(5.14 %)
130,346
(8.19 %)
94,446
(4.12 %)
144 European flounder (primary hap 2023)
GCA_949316205.1
n/a n/a 14,753
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
109
(100.00 %)
1,160,784
(27.06 %)
251,985
(5.23 %)
3,353,121
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,297
(3.81 %)
37,130
(2.79 %)
27,432
(1.88 %)
145 European flounder (primary hap 2023)
GCF_949316205.1
48,969
(12.45 %)
n/a 14,751
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
108
(100.00 %)
1,160,781
(27.06 %)
251,983
(5.23 %)
3,353,086
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,298
(3.81 %)
37,129
(2.79 %)
27,431
(1.88 %)
146 European golden plover
GCA_017639485.1
n/a n/a 12,984
(1.78 %)
22,854
(2.04 %)
n/a 42.70
(99.01 %)
0
(0 %)
268
(0.99 %)
107
(100.00 %)
558,587
(8.35 %)
180,400
(0.83 %)
7,132,381
(21.18 %)
0
(0 %)
102,461
(0.84 %)
40,661
(3.41 %)
37,600
(2.03 %)
147 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1
n/a n/a 20,236
(1.71 %)
19,368
(1.32 %)
n/a 40.05
(99.99 %)
0
(0 %)
2,020
(0.02 %)
894
(100.00 %)
4,892,811
(36.49 %)
1,223,387
(18.26 %)
11,907,631
(42.51 %)
10
(0.00 %)
4,679,739
(9.91 %)
17,423
(0.62 %)
15,264
(0.35 %)
148 European mink (mMusLut2 primary hap 2023)
GCF_030435805.1
69,556
(3.13 %)
n/a 18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
25
(100.00 %)
4,237,791
(30.90 %)
792,897
(2.69 %)
13,417,195
(36.59 %)
0
(0 %)
894,272
(2.55 %)
67,132
(2.54 %)
51,333
(1.62 %)
149 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1
n/a n/a 18,336
(1.50 %)
20,807
(1.41 %)
n/a 42.38
(99.98 %)
0
(0 %)
2,250
(0.02 %)
477
(100.00 %)
4,096,160
(31.55 %)
707,337
(3.28 %)
13,715,382
(34.73 %)
10
(0.00 %)
626,861
(1.84 %)
61,481
(4.29 %)
56,462
(1.94 %)
150 European plaice (primary hap 2022)
GCF_947347685.1
46,468
(10.51 %)
n/a 14,818
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
0
(0 %)
1,072
(0.03 %)
355
(100.00 %)
476,314
(3.63 %)
520,729
(13.27 %)
3,283,360
(33.55 %)
2
(0.00 %)
525,277
(6.36 %)
47,050
(4.45 %)
21,878
(1.29 %)
151 European pond turtle (hap1 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017835.1
n/a n/a 14,802
(0.99 %)
19,772
(1.60 %)
n/a 44.74
(99.86 %)
0
(0 %)
148
(0.14 %)
106
(100.00 %)
1,526,737
(12.44 %)
460,562
(2.12 %)
11,130,580
(35.42 %)
5
(0.00 %)
495,884
(2.08 %)
136,002
(2.92 %)
30,671
(0.72 %)
152 European robin
GCA_903797595.2
n/a n/a 12,344
(1.85 %)
23,934
(2.37 %)
n/a 42.10
(99.97 %)
0
(0 %)
990
(0.03 %)
1,119
(100.00 %)
532,973
(5.96 %)
401,820
(3.43 %)
6,320,210
(21.42 %)
0
(0 %)
338,954
(2.13 %)
30,391
(2.60 %)
21,664
(1.21 %)
153 European shag (primary hap 2023)
GCA_949628215.1
n/a n/a 13,203
(1.74 %)
22,959
(2.04 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
3
(0.00 %)
222
(0.00 %)
356
(100.00 %)
436,838
(4.84 %)
471,070
(3.20 %)
6,601,537
(22.79 %)
1
(0.00 %)
334,549
(2.25 %)
37,247
(3.95 %)
29,099
(1.42 %)
154 European shrew (mSorAra2 primary hap 2023)
GCF_027595985.1
44,643
(2.60 %)
n/a 17,479
(1.26 %)
21,293
(1.37 %)
n/a 43.24
(99.46 %)
0
(0 %)
1,427
(0.54 %)
65
(100.00 %)
2,474,584
(15.18 %)
1,107,884
(3.28 %)
13,638,467
(41.72 %)
10
(0.00 %)
822,159
(2.15 %)
79,785
(2.86 %)
77,901
(2.13 %)
155 European smelt (primary hap 2023)
GCA_963692335.1
n/a n/a 15,640
(3.79 %)
50,248
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
30
(0.00 %)
2,462
(0.10 %)
1,038
(100.00 %)
1,648,435
(31.35 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,832
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
156 European smelt (primary hap 2023)
GCF_963692335.1
46,762
(14.07 %)
n/a 15,639
(3.79 %)
50,238
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
0
(0 %)
2,462
(0.10 %)
1,007
(100.00 %)
1,648,428
(31.34 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,793
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
157 European snow vole (primary hap 2023)
GCF_950005125.1
47,025
(2.69 %)
n/a 19,592
(1.78 %)
21,173
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
197
(0.00 %)
160
(100.00 %)
5,048,186
(44.12 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,053
(34.97 %)
4
(0.00 %)
954,164
(3.20 %)
20,725
(0.63 %)
18,727
(0.52 %)
158 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1
n/a n/a 16,181
(2.44 %)
63,544
(7.17 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
0
(0 %)
1,501
(0.04 %)
387
(100.00 %)
2,109,362
(31.42 %)
1,300,159
(14.91 %)
3,634,744
(35.44 %)
6
(0.00 %)
1,178,448
(8.78 %)
35,552
(1.87 %)
19,823
(1.00 %)
159 European starfish
GCF_902459465.1
26,326
(11.67 %)
n/a 4,121
(0.84 %)
21,080
(8.48 %)
23,775
(14.13 %)
38.76
(99.96 %)
0
(0 %)
471
(0.04 %)
150
(100.00 %)
131,898
(1.43 %)
159,226
(7.04 %)
2,504,013
(37.40 %)
12
(0.00 %)
310,360
(6.00 %)
15,392
(1.50 %)
7,483
(0.79 %)
160 European turtle dove (v1.2 2021)
GCA_901699155.2
n/a n/a 12,391
(1.76 %)
23,333
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
0
(0 %)
940
(0.33 %)
311
(100.00 %)
550,895
(7.50 %)
227,532
(1.16 %)
6,767,530
(21.05 %)
4
(0.00 %)
181,526
(1.65 %)
34,682
(2.57 %)
30,656
(1.68 %)
161 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1
54,114
(2.24 %)
n/a 19,959
(1.65 %)
19,953
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
0
(0 %)
1,129
(0.01 %)
497
(100.00 %)
4,863,650
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,732
(40.58 %)
17
(0.00 %)
2,516,593
(5.37 %)
23,961
(0.53 %)
17,318
(0.36 %)
162 fire-bellied toad (aBomBom1 primary hap 2023)
GCF_027579735.1
38,238
(0.68 %)
n/a 15,452
(0.21 %)
47,500
(0.88 %)
n/a 38.98
(98.02 %)
0
(0 %)
7,009
(1.99 %)
2,467
(100.00 %)
4,258,941
(3.44 %)
7,150,261
(12.27 %)
9,476
(98.01 %)
3
(0.00 %)
n/a n/a n/a
163 Fleay's barred frog (hap1 2024)
GCA_038048845.1
n/a n/a 14,321
(0.67 %)
22,672
(1.51 %)
n/a 40.32
(99.87 %)
0
(0 %)
1,421
(0.13 %)
2,806
(100.00 %)
1,320,578
(5.87 %)
1,506,550
(13.49 %)
13,293,397
(46.37 %)
2
(0.00 %)
3,318,438
(8.11 %)
63,677
(0.85 %)
12,950
(0.19 %)
164 flier cichlid
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
n/a 15,434
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
0
(0 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
0
(0 %)
227,442
(2.84 %)
24,130
(1.26 %)
11,082
(0.48 %)
165 Florida worm lizard (hap2 2023)
GCF_030035675.1
65,314
(3.47 %)
n/a 14,331
(0.90 %)
17,853
(1.51 %)
n/a 42.86
(99.72 %)
0
(0 %)
242
(0.28 %)
76
(100.00 %)
1,426,827
(7.17 %)
616,687
(2.63 %)
10,819,019
(45.31 %)
1
(0.00 %)
531,660
(2.36 %)
47,453
(1.03 %)
18,399
(0.42 %)
166 Florida worm lizard (hap2 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035675.1
n/a n/a 14,331
(0.90 %)
17,854
(1.51 %)
n/a 42.86
(99.72 %)
1
(0.00 %)
242
(0.28 %)
78
(100.00 %)
1,426,833
(7.17 %)
616,690
(2.63 %)
10,819,054
(45.31 %)
1
(0.00 %)
531,662
(2.36 %)
47,454
(1.03 %)
18,400
(0.42 %)
167 freshwater garfish (fXenCan1 2020)
GCA_014839995.1
n/a n/a 14,625
(2.57 %)
52,879
(6.72 %)
n/a 41.41
(98.98 %)
0
(0 %)
1,373
(1.02 %)
410
(100.00 %)
492,828
(4.29 %)
318,631
(5.94 %)
3,977,536
(27.41 %)
0
(0 %)
521,102
(4.91 %)
32,390
(2.33 %)
21,612
(1.34 %)
168 Gabon caecilian
GCF_902459505.1
54,713
(1.72 %)
n/a 14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,310,970
(1.64 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,802
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,977
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
169 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2
n/a n/a 14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,331,879
(1.68 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,806
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,995
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
170 garden warbler
GCA_014839755.1
n/a n/a 12,520
(1.95 %)
23,459
(2.46 %)
n/a 42.08
(99.82 %)
0
(0 %)
134
(0.18 %)
176
(100.00 %)
491,810
(6.09 %)
376,746
(2.55 %)
6,461,292
(20.23 %)
0
(0 %)
225,297
(1.39 %)
27,799
(2.40 %)
23,088
(1.32 %)
171 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1
n/a n/a 14,151
(0.94 %)
23,338
(1.95 %)
n/a 45.15
(99.95 %)
0
(0 %)
118
(0.05 %)
160
(100.00 %)
1,232,693
(12.81 %)
332,737
(2.19 %)
11,907,298
(32.91 %)
3
(0.00 %)
284,469
(1.22 %)
40,660
(1.87 %)
25,990
(0.77 %)
172 giant manta (hap1 2023)
GCA_030028105.1
n/a n/a 12,432
(0.38 %)
24,821
(1.16 %)
n/a 43.26
(99.23 %)
0
(0 %)
1,810
(0.77 %)
4,715
(100.00 %)
7,913,208
(49.68 %)
969,352
(14.22 %)
20,235,210
(54.42 %)
17
(0.00 %)
4,636,724
(7.12 %)
110,678
(1.74 %)
30,504
(0.36 %)
173 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2
n/a n/a 15,752
(2.45 %)
56,395
(6.58 %)
n/a 41.94
(99.96 %)
0
(0 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
1,474,134
(29.50 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,691
(25.69 %)
0
(0 %)
355,475
(3.53 %)
47,327
(2.41 %)
29,914
(1.44 %)
174 golden eagle (2021)
GCF_900496995.4
60,920
(5.98 %)
n/a 13,334
(1.84 %)
23,261
(2.12 %)
n/a 42.16
(99.58 %)
0
(0 %)
228
(0.42 %)
144
(100.00 %)
544,341
(5.93 %)
186,461
(0.80 %)
7,090,610
(20.01 %)
1
(0.00 %)
68,348
(0.66 %)
38,495
(3.10 %)
35,039
(1.94 %)
175 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1
36,997
(1.96 %)
n/a 20,006
(1.91 %)
19,132
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
0
(0 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,785,907
(32.61 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,958,061
(32.33 %)
0
(0 %)
684,879
(1.84 %)
20,760
(0.59 %)
18,457
(0.52 %)
176 Goodes thornscrub tortoise
GCF_007399415.2
57,442
(3.17 %)
n/a 14,852
(1.00 %)
18,125
(1.49 %)
31,841
(1.80 %)
44.14
(98.71 %)
0
(0 %)
562
(1.29 %)
383
(100.00 %)
1,630,271
(13.86 %)
387,796
(2.00 %)
11,572,827
(33.36 %)
0
(0 %)
474,978
(1.73 %)
71,687
(2.29 %)
21,793
(0.54 %)
177 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1
n/a n/a 14,094
(1.03 %)
17,875
(1.65 %)
n/a 41.62
(99.95 %)
0
(0 %)
28
(0.05 %)
30
(100.00 %)
1,100,228
(6.21 %)
423,695
(1.33 %)
11,521,828
(32.55 %)
2
(0.00 %)
258,014
(1.05 %)
62,978
(2.00 %)
24,755
(0.81 %)
178 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1
73,383
(3.04 %)
n/a 16,637
(0.72 %)
16,036
(0.85 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
0
(0 %)
2,255
(0.89 %)
13
(100.00 %)
5,562,359
(25.40 %)
1,096,620
(2.60 %)
22,322,748
(43.37 %)
13
(0.00 %)
793,648
(1.81 %)
28,894
(0.57 %)
22,987
(0.42 %)
179 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1
58,884
(2.46 %)
n/a 20,752
(1.49 %)
21,107
(1.31 %)
32,732
(1.45 %)
40.06
(99.98 %)
0
(0 %)
1,824
(0.02 %)
752
(100.00 %)
4,605,578
(34.50 %)
728,192
(1.65 %)
15,467,412
(33.91 %)
2
(0.00 %)
504,786
(1.54 %)
51,878
(1.11 %)
49,715
(1.03 %)
180 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2
n/a n/a 19,474
(1.55 %)
20,394
(1.40 %)
72,806
(4.12 %)
41.49
(100.00 %)
0
(0 %)
166
(0.00 %)
82
(100.00 %)
4,550,524
(31.76 %)
1,063,944
(3.96 %)
13,588,117
(34.74 %)
23
(0.00 %)
1,048,956
(2.49 %)
51,996
(2.15 %)
47,971
(1.53 %)
181 great cormorant (primary hap 2024)
GCA_963921805.1
n/a n/a 13,434
(1.76 %)
30,619
(3.17 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
0
(0 %)
493
(0.01 %)
351
(100.00 %)
556,740
(10.18 %)
303,279
(3.45 %)
6,599,611
(22.65 %)
1
(0.00 %)
355,900
(2.29 %)
38,341
(5.45 %)
31,913
(1.57 %)
182 great fruit-eating bat (mArtLit1 hap1 2024)
GCA_038363095.1
n/a n/a 18,022
(1.56 %)
20,018
(1.52 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
419
(100.00 %)
2,827,417
(26.82 %)
371,479
(4.97 %)
11,603,093
(34.64 %)
1
(0.00 %)
522,672
(1.87 %)
71,574
(2.28 %)
54,020
(1.50 %)
183 great potoo
GCA_013368605.1
n/a n/a 13,116
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
0
(0 %)
243
(0.49 %)
191
(100.00 %)
514,142
(9.71 %)
210,381
(1.13 %)
6,501,989
(23.95 %)
0
(0 %)
244,232
(1.92 %)
35,785
(2.69 %)
29,281
(1.64 %)
184 great scallop
GCF_902652985.1
46,811
(9.29 %)
n/a 4,090
(0.36 %)
32,743
(7.09 %)
n/a 36.65
(99.92 %)
0
(0 %)
1,827
(0.08 %)
3,983
(100.00 %)
281,310
(1.71 %)
706,978
(26.84 %)
5,249,556
(32.64 %)
0
(0 %)
2,449,994
(15.30 %)
13,101
(0.87 %)
7,209
(0.42 %)
185 great white shark
GCF_017639515.1
49,865
(1.46 %)
n/a 13,010
(0.37 %)
19,263
(0.92 %)
46,152
(1.30 %)
45.21
(99.55 %)
0
(0 %)
2,645
(0.45 %)
719
(100.00 %)
1,046,023
(4.00 %)
1,584,100
(21.25 %)
23,278,563
(52.42 %)
11
(0.00 %)
8,687,289
(11.05 %)
77,021
(1.94 %)
14,712
(0.15 %)
186 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1
n/a n/a 16,553
(3.15 %)
51,766
(7.37 %)
n/a 44.75
(99.95 %)
61
(0.00 %)
1,752
(0.05 %)
1,085
(100.00 %)
1,674,762
(26.07 %)
900,455
(18.62 %)
2,849,256
(39.22 %)
0
(0 %)
824,383
(7.94 %)
26,022
(2.30 %)
13,322
(0.79 %)
187 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1
n/a 41,563
(2.11 %)
18,531
(1.97 %)
20,309
(1.67 %)
n/a 40.52
(99.19 %)
0
(0 %)
292
(0.81 %)
50
(100.00 %)
3,284,473
(35.00 %)
559,653
(1.29 %)
12,043,562
(29.15 %)
0
(0 %)
155,142
(0.71 %)
32,047
(1.05 %)
30,235
(0.96 %)
188 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2
53,353
(3.13 %)
n/a 18,641
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,218,744
(34.52 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,641
(0.98 %)
189 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
n/a 19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
0
(0 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
0
(0 %)
499,733
(1.88 %)
61,023
(2.69 %)
54,015
(1.81 %)
190 greater pipefish
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
n/a 13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
37,563
(15.76 %)
43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
0
(0 %)
112,918
(3.25 %)
46,327
(10.97 %)
32,897
(5.93 %)
191 greater sac-winged bat (mSacBil1 primary hap 2024)
GCA_036850765.1
n/a n/a 18,322
(1.40 %)
21,049
(1.35 %)
n/a 41.71
(98.73 %)
102
(0.41 %)
468
(1.27 %)
359
(99.59 %)
4,247,148
(29.53 %)
1,031,385
(2.50 %)
12,465,194
(43.30 %)
3
(0.00 %)
1,113,639
(2.95 %)
101,620
(2.01 %)
44,590
(1.04 %)
192 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1
n/a n/a 15,028
(2.35 %)
50,436
(6.30 %)
n/a 41.10
(99.97 %)
0
(0 %)
1,188
(0.03 %)
1,568
(100.00 %)
2,688,222
(39.74 %)
549,362
(7.60 %)
3,564,661
(40.05 %)
4
(0.00 %)
605,421
(5.26 %)
37,043
(1.94 %)
11,494
(0.60 %)
193 green sea turtle (v2 2021)
GCF_015237465.2
84,366
(4.63 %)
n/a 14,725
(1.06 %)
17,444
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
0
(0 %)
298
(0.56 %)
93
(100.00 %)
1,701,640
(14.83 %)
304,306
(1.25 %)
11,135,147
(31.96 %)
0
(0 %)
429,994
(1.68 %)
49,025
(1.44 %)
26,933
(0.68 %)
194 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1
n/a n/a 14,752
(2.74 %)
58,725
(8.49 %)
n/a 43.13
(99.98 %)
3
(0.00 %)
553
(0.02 %)
322
(100.00 %)
1,860,845
(35.64 %)
378,045
(9.39 %)
3,208,482
(30.12 %)
0
(0 %)
450,213
(5.20 %)
66,857
(4.99 %)
44,052
(2.67 %)
195 grey whale (mEscRob2 primary hap 2023)
GCA_028021215.1
n/a n/a 19,288
(1.38 %)
21,791
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
0
(0 %)
279
(0.00 %)
704
(100.00 %)
4,116,900
(35.85 %)
966,065
(16.74 %)
12,154,173
(46.39 %)
3
(0.00 %)
2,154,240
(5.67 %)
77,011
(1.59 %)
42,884
(0.96 %)
196 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1
n/a n/a 17,136
(1.90 %)
63,611
(4.50 %)
n/a 39.74
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,046
(0.01 %)
233
(100.00 %)
5,662,029
(68.75 %)
825,757
(11.99 %)
6,236,024
(55.15 %)
4
(0.00 %)
1,606,132
(7.98 %)
99,559
(5.68 %)
16,304
(0.51 %)
197 gyrfalcon
GCF_015220075.1
47,961
(5.90 %)
n/a 13,016
(1.82 %)
21,266
(2.02 %)
n/a 42.20
(99.55 %)
0
(0 %)
635
(0.45 %)
133
(100.00 %)
484,104
(5.60 %)
186,430
(0.85 %)
7,162,723
(18.83 %)
0
(0 %)
59,799
(0.59 %)
24,760
(2.03 %)
20,013
(0.97 %)
198 harbor porpoise (primary hap 2024)
GCA_963924675.1
n/a n/a 18,529
(1.58 %)
20,583
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
2
(0.00 %)
966
(0.01 %)
442
(100.00 %)
3,760,716
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,240
(39.04 %)
4
(0.00 %)
1,410,168
(3.71 %)
71,530
(2.69 %)
40,160
(1.06 %)
199 Harpy eagle (bHarHar1 2022)
GCF_026419915.1
51,641
(5.08 %)
n/a 13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
0
(0 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
1
(0.00 %)
480,025
(2.70 %)
60,606
(5.66 %)
30,636
(1.52 %)
200 Hawaiian crow (2021 refseq)
GCF_020740725.1
51,593
(6.18 %)
n/a 12,739
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
0
(0 %)
294
(0.16 %)
188
(100.00 %)
409,129
(0.00 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,375
(23.59 %)
3
(0.00 %)
336,844
(2.41 %)
46,118
(3.85 %)
24,228
(1.26 %)
201 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1
n/a n/a 18,620
(1.42 %)
22,403
(1.38 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
1
(0.00 %)
1,805
(0.01 %)
214
(100.00 %)
6,063,911
(41.66 %)
1,593,657
(4.46 %)
12,229,281
(43.98 %)
8
(0.00 %)
1,313,148
(3.16 %)
71,058
(1.88 %)
45,398
(0.93 %)
202 hippopotamus (mHipAmp2 2023)
GCF_030028045.1
64,153
(2.73 %)
n/a 20,331
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
0
(0 %)
226
(0.00 %)
357
(100.00 %)
3,783,440
(35.17 %)
567,797
(3.38 %)
13,462,531
(35.48 %)
2
(0.00 %)
396,368
(1.55 %)
48,365
(1.91 %)
44,048
(1.34 %)
203 hoatzin (hap1 2023)
GCA_030867145.1
n/a n/a 13,089
(1.50 %)
29,621
(2.22 %)
n/a 45.56
(100.00 %)
268
(0.00 %)
268
(0.00 %)
683
(100.00 %)
610,333
(22.07 %)
252,997
(12.56 %)
5,154,598
(31.67 %)
3
(0.00 %)
1,034,232
(5.77 %)
58,754
(5.54 %)
47,065
(2.35 %)
204 honeycomb rockfish
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
n/a 15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
63,546
(8.88 %)
40.77
(99.83 %)
0
(0 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
1
(0.00 %)
627,017
(5.28 %)
37,878
(1.84 %)
15,343
(0.71 %)
205 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1
n/a n/a 12,766
(0.30 %)
21,591
(0.87 %)
n/a 44.88
(99.43 %)
0
(0 %)
2,790
(0.57 %)
1,496
(100.00 %)
1,008,880
(5.19 %)
1,596,129
(22.32 %)
22,180,341
(62.98 %)
2
(0.00 %)
9,762,254
(11.27 %)
82,276
(1.85 %)
14,696
(0.13 %)
206 horse (mEquCab1 2024)
GCA_036426135.1
n/a n/a 19,073
(1.67 %)
20,636
(1.38 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
114
(0.00 %)
602
(100.00 %)
3,521,953
(35.39 %)
461,571
(5.26 %)
14,833,688
(32.77 %)
2
(0.00 %)
728,239
(2.01 %)
43,527
(2.54 %)
41,129
(2.38 %)
207 hourglass treefrog (paternal 2023)
GCA_027789765.1
n/a n/a 14,058
(0.89 %)
31,050
(2.69 %)
n/a 43.97
(99.70 %)
0
(0 %)
804
(0.30 %)
2,200
(100.00 %)
906,816
(2.43 %)
1,710,859
(17.48 %)
10,069,798
(51.41 %)
3
(0.00 %)
3,539,111
(9.05 %)
235,277
(5.56 %)
28,414
(0.63 %)
208 house finch (bHaeMex1 primary hap 2022 refseq)
GCF_027477595.1
43,228
(5.71 %)
n/a 12,702
(1.83 %)
24,568
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
0
(0 %)
296
(0.98 %)
184
(100.00 %)
440,384
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,138
(23.47 %)
1
(0.00 %)
573,830
(3.39 %)
30,897
(2.53 %)
22,852
(1.24 %)
209 house finch (bHaeMex1 primary hap 2022)
GCA_027477595.1
43,228
(49.63 %)
n/a 12,700
(1.83 %)
24,567
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
0
(0 %)
295
(0.98 %)
183
(100.00 %)
440,379
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,100
(23.47 %)
1
(0.00 %)
573,829
(3.39 %)
30,897
(2.53 %)
22,852
(1.24 %)
210 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1
n/a n/a 22,351
(1.96 %)
19,629
(1.26 %)
n/a 41.38
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
179
(100.00 %)
4,774,018
(45.31 %)
1,620,102
(10.50 %)
13,181,250
(40.47 %)
0
(0 %)
1,650,132
(4.47 %)
23,955
(0.54 %)
16,164
(0.39 %)
211 house sparrow (hap1 2024)
GCA_036417665.1
n/a n/a 12,831
(1.61 %)
26,124
(2.26 %)
n/a 43.99
(100.00 %)
0
(0 %)
202
(0.00 %)
334
(100.00 %)
647,396
(12.37 %)
646,615
(14.14 %)
5,906,524
(30.36 %)
2
(0.00 %)
873,292
(5.23 %)
36,193
(2.91 %)
24,212
(1.05 %)
212 Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022)
GCA_027474245.1
n/a n/a 13,233
(1.67 %)
23,010
(1.93 %)
n/a 43.91
(99.92 %)
0
(0 %)
253
(0.08 %)
136
(100.00 %)
610,144
(11.51 %)
214,393
(5.75 %)
6,069,916
(25.74 %)
1
(0.00 %)
314,812
(2.19 %)
33,172
(3.38 %)
26,788
(1.37 %)
213 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1
63,234
(2.88 %)
n/a 19,601
(1.57 %)
21,699
(1.34 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
0
(0 %)
302
(0.06 %)
1,250
(100.00 %)
5,524,454
(47.57 %)
459,928
(1.40 %)
13,208,799
(41.21 %)
0
(0 %)
1,222,662
(3.37 %)
41,359
(1.10 %)
37,367
(0.98 %)
214 Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024)
GCA_036172795.1
n/a n/a 14,141
(0.97 %)
22,232
(2.16 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
262
(0.00 %)
99
(100.00 %)
944,742
(4.86 %)
1,927,659
(22.26 %)
8,988,510
(49.29 %)
1
(0.00 %)
3,465,509
(10.62 %)
77,721
(1.73 %)
13,802
(0.30 %)
215 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022)
GCA_026652325.1
n/a 139,896
(0.54 %)
15,136
(0.10 %)
n/a n/a 45.95
(100.00 %)
29
(0.00 %)
922
(0.00 %)
296
(100.00 %)
4,478,794
(1.33 %)
6,452,537
(8.86 %)
1,189
(100.00 %)
26
(0.00 %)
n/a 1,581,360
(4.00 %)
144,588
(0.32 %)
216 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2
n/a n/a 15,339
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
57,867
(10.10 %)
42.38
(98.08 %)
0
(0 %)
1,523
(1.92 %)
157
(100.00 %)
346,399
(3.02 %)
163,524
(3.00 %)
2,755,274
(25.07 %)
0
(0 %)
235,504
(4.25 %)
17,931
(1.47 %)
9,749
(0.74 %)
217 Indo-Pacific tarpon
GCF_013368585.1
41,583
(6.91 %)
n/a 18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
74,968
(7.01 %)
43.02
(99.97 %)
0
(0 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
0
(0 %)
319,481
(2.18 %)
78,561
(3.69 %)
58,460
(2.33 %)
218 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1
n/a n/a 19,064
(1.67 %)
20,800
(1.49 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
0
(0 %)
119
(0.00 %)
69
(100.00 %)
3,393,548
(30.92 %)
723,545
(6.58 %)
12,073,117
(35.40 %)
0
(0 %)
1,106,960
(3.54 %)
43,736
(1.20 %)
30,847
(0.87 %)
219 jewelled blenny
GCF_902148845.1
42,877
(8.61 %)
n/a 15,188
(2.40 %)
41,262
(7.86 %)
58,418
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
0
(0 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
667,122
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
0
(0 %)
422,332
(3.88 %)
121,464
(9.36 %)
77,061
(4.51 %)
220 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1
n/a n/a 14,906
(2.33 %)
72,029
(6.72 %)
n/a 43.92
(99.98 %)
0
(0 %)
887
(0.02 %)
191
(100.00 %)
1,609,654
(22.82 %)
897,264
(13.58 %)
4,548,467
(39.80 %)
11
(0.00 %)
875,374
(6.46 %)
129,147
(11.75 %)
77,287
(4.33 %)
221 kagu (bRhyJub1 primary hap 2023)
GCA_027574665.1
n/a n/a 13,042
(1.63 %)
24,142
(2.01 %)
n/a 45.07
(99.96 %)
0
(0 %)
300
(0.04 %)
148
(100.00 %)
563,851
(12.90 %)
270,861
(12.36 %)
6,191,106
(28.24 %)
2
(0.00 %)
905,468
(5.08 %)
54,426
(4.92 %)
40,156
(2.73 %)
222 kakapo (Jane v2 2020 refseq)
GCF_004027225.2
49,757
(5.76 %)
n/a 13,110
(1.92 %)
22,782
(2.26 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
0
(0 %)
373
(0.92 %)
89
(100.00 %)
507,148
(7.85 %)
208,178
(1.08 %)
6,258,087
(20.50 %)
0
(0 %)
165,530
(1.34 %)
22,278
(1.77 %)
19,230
(1.21 %)
223 killer whale (2022)
GCF_937001465.1
78,470
(3.76 %)
n/a 18,710
(1.51 %)
21,101
(1.30 %)
34,448
(1.49 %)
41.91
(100.00 %)
0
(0 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
3,955,401
(36.81 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,568
(41.63 %)
2
(0.00 %)
1,982,992
(5.71 %)
77,307
(3.08 %)
40,935
(1.02 %)
224 king vulture (hap1 2024)
GCA_037962945.1
n/a n/a 13,641
(1.52 %)
24,293
(1.78 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
6
(0.00 %)
154
(0.00 %)
130
(100.00 %)
484,661
(3.34 %)
252,569
(16.01 %)
5,595,734
(32.51 %)
1
(0.00 %)
776,309
(4.15 %)
77,942
(3.59 %)
33,020
(1.50 %)
225 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2
n/a n/a 17,087
(0.81 %)
14,711
(0.86 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
0
(0 %)
669
(0.00 %)
1,246
(100.00 %)
6,280,029
(29.77 %)
1,123,294
(2.02 %)
21,796,316
(39.24 %)
2
(0.00 %)
412,593
(0.92 %)
15,957
(0.35 %)
13,996
(0.24 %)
226 Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3
33,236
(8.44 %)
n/a 14,601
(2.46 %)
44,145
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
701
(0.95 %)
122
(100.00 %)
1,755,227
(42.93 %)
551,482
(7.22 %)
4,887,087
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,179
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
22,350
(1.21 %)
227 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1
63,293
(2.96 %)
n/a 17,918
(1.89 %)
20,819
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
0
(0 %)
394
(0.69 %)
202
(100.00 %)
2,897,422
(23.58 %)
797,420
(2.76 %)
10,057,100
(34.56 %)
2
(0.00 %)
425,636
(1.52 %)
55,965
(2.99 %)
57,667
(2.01 %)
228 lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023)
GCA_028022735.1
n/a n/a 13,529
(1.69 %)
23,672
(1.98 %)
n/a 43.50
(99.85 %)
0
(0 %)
259
(0.15 %)
232
(100.00 %)
491,653
(3.53 %)
349,011
(9.83 %)
5,955,030
(26.51 %)
5
(0.00 %)
404,016
(2.60 %)
32,237
(2.61 %)
27,504
(1.23 %)
229 lance-tailed manakin
GCF_009829145.1
46,366
(5.56 %)
n/a 12,594
(1.91 %)
22,763
(2.31 %)
26,057
(3.91 %)
41.97
(99.70 %)
0
(0 %)
206
(0.30 %)
93
(100.00 %)
485,121
(7.13 %)
247,189
(1.64 %)
6,498,294
(20.04 %)
0
(0 %)
149,431
(1.05 %)
25,377
(1.97 %)
21,424
(1.14 %)
230 lancelets B.floridae x B.belcheri (bbbf 2021)
GCA_019207075.1
n/a n/a 5,191
(1.10 %)
42,331
(14.51 %)
n/a 41.51
(99.88 %)
0
(0 %)
108
(0.12 %)
79
(100.00 %)
132,673
(2.15 %)
174,485
(7.81 %)
1,945,047
(28.91 %)
0
(0 %)
311,722
(5.56 %)
42,166
(6.02 %)
28,034
(3.24 %)
231 lancelets B.floridae x B.japonicum (bjbf 2020)
GCA_015852565.1
n/a n/a 5,384
(0.92 %)
47,467
(13.75 %)
n/a 41.37
(99.98 %)
0
(0 %)
168
(0.02 %)
341
(100.00 %)
146,622
(1.62 %)
202,162
(9.26 %)
2,291,900
(27.75 %)
0
(0 %)
366,245
(5.52 %)
44,443
(4.78 %)
27,446
(2.56 %)
232 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023638135.1
48,561
(5.70 %)
n/a 12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
0
(0 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
2
(0.00 %)
479,269
(2.67 %)
32,398
(2.65 %)
19,870
(0.89 %)
233 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1
n/a n/a 17,851
(1.28 %)
83,249
(5.18 %)
n/a 42.69
(99.97 %)
36
(0.00 %)
2,397
(0.03 %)
709
(100.00 %)
7,797,173
(37.37 %)
1,593,818
(10.64 %)
7,610,300
(54.05 %)
15
(0.00 %)
1,726,634
(9.03 %)
127,942
(3.84 %)
34,520
(0.93 %)
234 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1
n/a n/a 21,678
(1.34 %)
22,317
(1.25 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
1,188
(0.00 %)
1,198
(100.00 %)
5,530,547
(22.20 %)
1,357,640
(10.13 %)
14,334,312
(46.09 %)
5
(0.00 %)
2,400,830
(5.08 %)
123,453
(2.17 %)
59,337
(1.38 %)
235 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1
n/a n/a 16,376
(2.19 %)
82,947
(7.99 %)
n/a 46.31
(99.94 %)
144
(0.00 %)
2,631
(0.06 %)
1,522
(100.00 %)
3,333,323
(43.58 %)
1,553,932
(25.91 %)
3,393,507
(46.78 %)
9
(0.00 %)
1,764,517
(12.32 %)
99,668
(6.39 %)
51,378
(2.60 %)
236 largescale foureyes (2020)
GCA_014839685.1
n/a n/a 14,774
(2.18 %)
42,858
(4.83 %)
58,247
(6.94 %)
38.54
(99.96 %)
0
(0 %)
107
(0.04 %)
33
(100.00 %)
506,950
(2.73 %)
305,170
(2.13 %)
6,194,879
(29.85 %)
0
(0 %)
131,664
(1.39 %)
17,881
(0.94 %)
14,233
(0.68 %)
237 Lataste's viper (rVipLat1 2022)
GCA_024294585.1
n/a n/a 13,350
(1.17 %)
18,904
(1.93 %)
n/a 40.96
(99.78 %)
0
(0 %)
769
(0.22 %)
56
(100.00 %)
1,209,793
(7.69 %)
762,735
(5.06 %)
7,424,674
(44.80 %)
4
(0.00 %)
794,949
(4.07 %)
110,631
(4.07 %)
23,739
(0.88 %)
238 leatherback sea turtle (v4 2021 refseq G10K)
GCF_009764565.3
73,318
(3.97 %)
n/a 14,610
(1.03 %)
16,358
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
0
(0 %)
668
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,694,449
(14.90 %)
304,773
(1.14 %)
11,121,962
(34.21 %)
3
(0.00 %)
670,729
(2.51 %)
35,485
(1.36 %)
19,615
(0.51 %)
239 lesser black-backed gull (primary hap 2024)
GCA_963932225.1
n/a n/a 13,333
(1.68 %)
24,731
(2.05 %)
n/a 44.40
(99.99 %)
15
(0.00 %)
537
(0.01 %)
1,382
(100.00 %)
509,160
(5.11 %)
266,609
(9.64 %)
6,827,304
(27.15 %)
3
(0.00 %)
575,179
(3.19 %)
44,108
(6.34 %)
37,502
(1.70 %)
240 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1
51,730
(1.99 %)
n/a 20,129
(1.24 %)
22,089
(1.24 %)
40,414
(1.76 %)
42.00
(99.52 %)
0
(0 %)
561
(0.48 %)
160
(100.00 %)
7,346,291
(41.25 %)
1,187,587
(2.92 %)
14,222,177
(44.13 %)
1
(0.00 %)
1,219,048
(2.53 %)
34,688
(0.86 %)
25,175
(0.54 %)
241 lesser kestrel (v2 2021)
GCF_017639655.2
47,420
(5.64 %)
n/a 13,098
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
0
(0 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,499
(5.58 %)
210,234
(1.26 %)
7,133,934
(19.19 %)
1
(0.00 %)
132,967
(0.79 %)
27,558
(2.21 %)
21,862
(1.03 %)
242 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028389875.1
39,024
(4.18 %)
n/a 13,360
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
0
(0 %)
128
(0.11 %)
180
(100.00 %)
674,149
(6.73 %)
329,124
(5.34 %)
6,820,245
(22.78 %)
1
(0.00 %)
266,226
(1.85 %)
45,073
(5.83 %)
38,575
(2.59 %)
243 lesser sac-winged bat (mSacLep1 primary hap 2024)
GCA_036850995.1
n/a n/a 18,322
(1.42 %)
21,350
(1.39 %)
n/a 41.84
(99.24 %)
178
(0.49 %)
573
(0.76 %)
345
(99.51 %)
4,224,340
(28.69 %)
1,030,574
(2.60 %)
12,591,928
(42.30 %)
1
(0.00 %)
1,128,543
(2.95 %)
98,189
(2.06 %)
48,427
(1.15 %)
244 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1
53,323
(3.35 %)
n/a 15,955
(0.92 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
6,041,262
(71.88 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
16,535
(0.37 %)
245 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023)
GCA_027579695.1
53,323
(53.05 %)
n/a 15,841
(0.90 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
5,905,868
(49.76 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
15,646
(0.27 %)
246 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1
n/a n/a 13,908
(2.19 %)
50,634
(6.50 %)
n/a 41.22
(99.97 %)
84
(0.00 %)
1,017
(0.03 %)
701
(100.00 %)
2,698,640
(39.19 %)
577,328
(8.51 %)
3,615,231
(39.17 %)
5
(0.00 %)
691,324
(6.04 %)
33,251
(1.82 %)
14,917
(0.69 %)
247 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1
n/a n/a 15,269
(2.44 %)
52,449
(6.28 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
606
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,879,201
(31.40 %)
449,901
(9.89 %)
4,248,556
(33.21 %)
1
(0.00 %)
727,189
(5.72 %)
43,864
(3.01 %)
19,108
(1.01 %)
248 light-bulb sea squirt (2022)
GCA_947623445.1
n/a n/a 3,318
(1.37 %)
10,846
(10.58 %)
n/a 35.93
(99.99 %)
2
(0.00 %)
58
(0.01 %)
105
(100.00 %)
34,121
(1.61 %)
31,117
(17.32 %)
1,008,995
(33.48 %)
0
(0 %)
167,504
(8.33 %)
4,203
(2.12 %)
2,308
(0.42 %)
249 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1
n/a n/a 15,060
(2.89 %)
50,064
(7.31 %)
n/a 41.88
(99.98 %)
0
(0 %)
589
(0.02 %)
534
(100.00 %)
1,116,427
(28.18 %)
315,489
(13.14 %)
2,598,812
(33.21 %)
2
(0.00 %)
680,706
(7.88 %)
50,192
(3.82 %)
27,472
(1.61 %)
250 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2
n/a n/a 14,975
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
n/a 41.43
(99.89 %)
0
(0 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
772,309
(14.49 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,473
(21.79 %)
0
(0 %)
109,664
(1.83 %)
16,807
(1.33 %)
12,095
(0.89 %)
251 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 refseq)
GCF_023053635.1
33,415
(3.07 %)
n/a 14,091
(1.15 %)
19,337
(1.96 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
0
(0 %)
73
(0.00 %)
34
(100.00 %)
1,577,747
(7.81 %)
774,112
(3.78 %)
9,248,016
(40.42 %)
1
(0.00 %)
823,646
(3.44 %)
80,183
(2.48 %)
27,586
(0.82 %)
252 long-finned pilot whale (primary hap 2023)
GCF_963455315.1
61,797
(2.84 %)
n/a 18,712
(1.51 %)
20,920
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
0
(0 %)
1,084
(0.01 %)
993
(100.00 %)
4,125,420
(35.62 %)
1,577,899
(12.03 %)
12,347,226
(42.01 %)
10
(0.00 %)
1,284,155
(3.89 %)
71,821
(5.51 %)
41,663
(1.04 %)
253 long-tailed duck (primary hap 2024)
GCA_963989345.1
n/a n/a 13,329
(1.88 %)
23,888
(2.25 %)
n/a 42.30
(99.99 %)
0
(0 %)
544
(0.01 %)
272
(100.00 %)
784,647
(6.78 %)
501,860
(7.36 %)
6,388,957
(26.13 %)
53
(0.00 %)
600,275
(3.74 %)
34,028
(3.04 %)
29,568
(1.51 %)
254 long-tailed hermit (PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1
n/a n/a 12,328
(2.02 %)
20,312
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
141
(0.37 %)
141
(0.37 %)
211
(99.63 %)
497,506
(5.06 %)
265,815
(1.51 %)
6,045,702
(20.10 %)
0
(0 %)
100,035
(0.84 %)
15,922
(1.43 %)
13,768
(0.94 %)
255 longspined bullhead (2021)
GCA_910589615.1
n/a n/a 15,027
(3.10 %)
51,137
(7.71 %)
n/a 42.22
(99.99 %)
0
(0 %)
242
(0.01 %)
27
(100.00 %)
452,844
(4.81 %)
417,308
(9.63 %)
3,262,282
(28.51 %)
2
(0.00 %)
530,802
(5.05 %)
55,527
(4.38 %)
34,004
(2.27 %)
256 lumpfish (refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
n/a 14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
0
(0 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
1
(0.00 %)
655,785
(6.31 %)
53,321
(5.09 %)
32,722
(2.40 %)
257 Macqueen's bustard (bChlMac1 2024)
GCA_036417535.1
n/a n/a 13,082
(1.73 %)
27,150
(2.44 %)
n/a 43.25
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
329
(100.00 %)
669,243
(14.71 %)
211,387
(6.69 %)
6,514,716
(27.07 %)
0
(0 %)
589,996
(3.41 %)
47,331
(8.09 %)
32,791
(2.71 %)
258 maguari stork (2021)
GCA_017639555.1
n/a n/a 12,905
(1.81 %)
22,204
(2.01 %)
n/a 42.12
(98.21 %)
0
(0 %)
232
(1.79 %)
153
(100.00 %)
485,318
(6.35 %)
184,992
(0.78 %)
7,064,965
(19.56 %)
0
(0 %)
58,168
(0.52 %)
31,653
(3.02 %)
31,174
(1.88 %)
259 mallard (Pekin duck Z2 2020 Zhejiang U)
GCF_015476345.1
59,854
(7.33 %)
n/a 12,988
(1.87 %)
23,709
(2.20 %)
86,787
(8.80 %)
42.27
(99.64 %)
0
(0 %)
905
(0.36 %)
756
(100.00 %)
803,558
(8.04 %)
417,575
(5.02 %)
6,627,843
(24.59 %)
5
(0.00 %)
487,092
(3.05 %)
35,030
(3.06 %)
27,683
(1.41 %)
260 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1
n/a n/a 15,070
(1.79 %)
71,367
(6.50 %)
n/a 41.46
(99.92 %)
0
(0 %)
4,157
(0.08 %)
943
(100.00 %)
1,717,591
(42.63 %)
474,348
(12.30 %)
4,011,319
(44.93 %)
3
(0.00 %)
n/a 59,531
(2.83 %)
15,998
(0.74 %)
261 Mauritius kestrel (primary hap 2023)
GCA_963210335.1
n/a n/a 13,064
(1.72 %)
22,269
(1.98 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
0
(0 %)
407
(0.01 %)
316
(100.00 %)
459,578
(3.87 %)
315,686
(6.19 %)
6,650,507
(22.84 %)
0
(0 %)
244,086
(1.64 %)
36,076
(2.82 %)
21,430
(0.96 %)
262 Mauritius parakeet (primary hap 2023)
GCA_963264785.1
n/a n/a 13,133
(1.81 %)
23,396
(2.19 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
358
(0.01 %)
172
(100.00 %)
511,156
(7.05 %)
238,915
(5.05 %)
5,764,523
(25.19 %)
2
(0.00 %)
442,454
(2.96 %)
24,675
(1.70 %)
20,376
(1.26 %)
263 meadow viper (2022)
GCA_947247035.1
n/a n/a 13,282
(1.16 %)
18,653
(1.90 %)
n/a 40.93
(99.98 %)
0
(0 %)
1,819
(0.02 %)
384
(100.00 %)
1,187,501
(7.72 %)
762,639
(6.28 %)
7,428,147
(45.35 %)
13
(0.00 %)
770,603
(3.87 %)
101,007
(3.95 %)
24,179
(0.84 %)
264 meadow vole (hap1 2024)
GCA_037038515.1
n/a n/a 19,134
(1.78 %)
20,672
(1.55 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
181
(100.00 %)
4,818,689
(41.90 %)
962,362
(4.16 %)
12,161,222
(34.42 %)
0
(0 %)
1,559,409
(4.65 %)
23,781
(0.74 %)
19,793
(0.55 %)
265 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1
n/a n/a 14,442
(0.44 %)
24,630
(1.28 %)
n/a 41.94
(99.99 %)
0
(0 %)
2,032
(0.01 %)
464
(100.00 %)
1,928,361
(2.22 %)
2,955,095
(11.97 %)
25,178,773
(53.55 %)
7
(0.00 %)
5,022,575
(7.68 %)
165,699
(1.23 %)
16,842
(0.16 %)
266 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1
62,007
(3.15 %)
n/a 14,883
(0.96 %)
18,524
(1.48 %)
n/a 44.69
(96.36 %)
0
(0 %)
1,866
(3.64 %)
621
(100.00 %)
1,372,189
(11.32 %)
472,501
(3.42 %)
11,362,604
(34.69 %)
1
(0.00 %)
910,675
(2.73 %)
73,700
(2.04 %)
22,443
(0.52 %)
267 milkfish
GCF_902362185.1
30,812
(7.61 %)
n/a 16,869
(3.41 %)
21,377
(6.58 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
0
(0 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
958,774
(8.18 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
2
(0.01 %)
611,774
(5.32 %)
22,089
(1.27 %)
14,000
(0.76 %)
268 mimic poison frog (primary hap 2023)
GCA_032444005.1
n/a n/a 14,957
(0.34 %)
n/a n/a 44.95
(100.00 %)
13
(0.00 %)
765
(0.00 %)
1,686
(100.00 %)
1,716,760
(1.89 %)
4,088,695
(23.45 %)
2,437
(100.00 %)
14
(0.00 %)
10,590,500
(14.66 %)
n/a n/a
269 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1
n/a n/a 17,701
(1.62 %)
73,433
(5.69 %)
n/a 42.20
(99.98 %)
14
(0.00 %)
1,398
(0.02 %)
388
(100.00 %)
6,438,444
(40.32 %)
1,202,669
(11.51 %)
7,055,665
(47.04 %)
6
(0.00 %)
1,343,489
(8.04 %)
74,954
(3.44 %)
26,325
(0.98 %)
270 minke whale (primary hap 2023)
GCF_949987535.1
61,711
(2.51 %)
n/a 19,550
(1.49 %)
21,499
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
0
(0 %)
1,177
(0.01 %)
1,374
(100.00 %)
4,006,927
(35.92 %)
1,058,105
(12.08 %)
12,708,103
(42.66 %)
4
(0.00 %)
1,500,515
(4.32 %)
72,756
(1.59 %)
44,094
(1.06 %)
271 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021)
GCF_019393635.1
47,034
(2.02 %)
n/a 18,399
(0.80 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
0
(0 %)
260
(0.09 %)
17
(100.00 %)
9,107,968
(41.08 %)
1,249,635
(2.12 %)
21,135,324
(42.80 %)
0
(0 %)
1,546,314
(2.55 %)
16,598
(0.36 %)
13,911
(0.23 %)
272 mute swan (v2 2021)
GCF_009769625.2
59,524
(6.76 %)
n/a 12,983
(1.98 %)
22,400
(2.22 %)
33,839
(5.17 %)
41.92
(99.13 %)
0
(0 %)
451
(0.87 %)
171
(100.00 %)
700,051
(7.55 %)
301,579
(1.34 %)
6,791,838
(21.30 %)
1
(0.00 %)
78,712
(0.74 %)
31,278
(3.07 %)
30,009
(2.01 %)
273 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579445.1
31,033
(4.42 %)
n/a 12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
0
(0 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
5
(0.00 %)
478,923
(3.35 %)
31,693
(3.88 %)
22,817
(1.16 %)
274 New Caledonian crow
GCF_009650955.1
50,821
(6.95 %)
n/a 12,747
(1.94 %)
23,372
(2.37 %)
30,299
(3.60 %)
42.57
(97.41 %)
0
(0 %)
289
(2.59 %)
105
(100.00 %)
452,690
(6.21 %)
231,546
(1.70 %)
6,265,995
(19.54 %)
0
(0 %)
191,789
(1.34 %)
31,909
(2.48 %)
24,362
(1.33 %)
275 New Zealand spotty (refseq)
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
n/a 14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,987
(4.42 %)
18,299
(0.85 %)
7,999
(0.35 %)
276 Nicobar pigeon (hap1 2024)
GCA_036013445.1
n/a n/a 13,359
(1.72 %)
24,921
(2.13 %)
n/a 44.64
(100.00 %)
0
(0 %)
117
(0.00 %)
807
(100.00 %)
705,078
(18.28 %)
342,299
(9.55 %)
6,410,095
(28.06 %)
0
(0 %)
778,929
(4.34 %)
38,589
(9.40 %)
31,814
(1.47 %)
277 nine-banded armadillo (mDasNov1 2023)
GCF_030445035.1
69,043
(2.70 %)
n/a 20,516
(1.05 %)
n/a n/a 41.00
(99.68 %)
0
(0 %)
771
(0.32 %)
539
(100.00 %)
4,656,325
(32.86 %)
726,574
(1.99 %)
19,585,522
(43.65 %)
4
(0.00 %)
720,053
(1.59 %)
140,990
(2.86 %)
76,550
(1.81 %)
278 ninespine stickleback (primary hap 2023)
GCA_949316345.1
n/a n/a 14,600
(3.83 %)
49,927
(9.98 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
175
(100.00 %)
599,088
(14.68 %)
186,747
(10.27 %)
2,273,942
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
279 ninespine stickleback (primary hap 2023)
GCF_949316345.1
57,816
(15.11 %)
n/a 14,598
(3.83 %)
49,473
(9.87 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
174
(100.00 %)
599,085
(14.68 %)
186,746
(10.27 %)
2,273,889
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
280 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1
n/a n/a 19,700
(1.54 %)
22,354
(1.46 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
244
(0.00 %)
244
(0.00 %)
2,082
(100.00 %)
6,089,884
(47.99 %)
1,358,786
(9.39 %)
13,799,349
(39.08 %)
3
(0.00 %)
1,511,691
(3.84 %)
24,733
(0.70 %)
22,588
(0.58 %)
281 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1
n/a n/a 18,102
(1.58 %)
20,073
(1.40 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
0
(0 %)
277
(0.00 %)
116
(100.00 %)
4,958,089
(41.64 %)
719,163
(1.59 %)
13,867,662
(33.89 %)
7
(0.00 %)
506,727
(1.48 %)
51,299
(1.36 %)
33,440
(0.96 %)
282 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1
49,646
(1.86 %)
n/a 19,562
(1.46 %)
21,631
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
367
(0.17 %)
789
(100.00 %)
1,368,536
(2.24 %)
841,303
(13.08 %)
12,527,582
(43.92 %)
11
(0.00 %)
1,404,448
(3.90 %)
94,259
(1.92 %)
41,005
(0.96 %)
283 North Island brown kiwi (hap1 2024)
GCA_036417845.1
n/a n/a 13,670
(1.52 %)
33,383
(2.64 %)
n/a 44.01
(100.00 %)
0
(0 %)
170
(0.00 %)
409
(100.00 %)
713,271
(8.42 %)
603,937
(6.25 %)
5,379,113
(27.65 %)
1
(0.00 %)
501,455
(3.32 %)
50,913
(9.74 %)
40,971
(3.07 %)
284 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1
n/a n/a 18,636
(1.75 %)
21,446
(1.68 %)
n/a 43.32
(99.99 %)
0
(0 %)
1,423
(0.01 %)
207
(100.00 %)
1,259,729
(2.95 %)
905,676
(6.25 %)
10,554,535
(38.21 %)
3
(0.00 %)
780,081
(2.54 %)
77,656
(3.27 %)
60,964
(2.14 %)
285 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1
n/a n/a 18,924
(1.53 %)
22,934
(1.58 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
199
(0.00 %)
146
(100.00 %)
3,850,624
(31.21 %)
648,359
(3.76 %)
11,788,702
(39.25 %)
2
(0.00 %)
811,589
(2.31 %)
85,908
(2.60 %)
73,781
(1.91 %)
286 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1
n/a n/a 19,073
(1.44 %)
20,821
(1.21 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,098
(0.01 %)
757
(100.00 %)
3,997,911
(34.76 %)
769,275
(14.94 %)
12,133,820
(44.83 %)
6
(0.00 %)
3,171,972
(7.30 %)
67,258
(2.00 %)
38,513
(0.89 %)
287 northern gannet (hap2 2023)
GCA_031468815.1
n/a n/a 13,477
(1.77 %)
23,613
(2.08 %)
n/a 42.44
(100.00 %)
6
(0.00 %)
248
(0.00 %)
427
(100.00 %)
474,930
(4.45 %)
237,604
(2.75 %)
5,847,260
(21.07 %)
30
(0.00 %)
226,420
(1.83 %)
30,873
(3.03 %)
26,071
(1.23 %)
288 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v1 2022 refseq)
GCF_929443795.1
50,663
(4.74 %)
n/a 13,528
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
183
(0.00 %)
454
(100.00 %)
521,768
(3.86 %)
325,987
(9.82 %)
5,542,269
(27.30 %)
4
(0.00 %)
458,030
(3.08 %)
43,070
(4.44 %)
32,753
(1.47 %)
289 northern goshawk (bAccGen1 v2 2022 genbank)
GCA_929443795.2
n/a n/a 13,527
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
183
(0.00 %)
455
(100.00 %)
511,000
(3.76 %)
325,992
(9.82 %)
5,542,342
(27.30 %)
4
(0.00 %)
458,026
(3.08 %)
43,070
(4.44 %)
32,753
(1.47 %)
290 northern pike
GCF_011004845.1
63,733
(9.28 %)
n/a 16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,941
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
0
(0 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
1
(0.00 %)
602,569
(4.43 %)
42,910
(2.52 %)
22,099
(1.02 %)
291 northern pintail (primary hap 2024)
GCA_963932015.1
n/a n/a 13,218
(1.88 %)
23,888
(2.27 %)
n/a 42.56
(99.99 %)
0
(0 %)
631
(0.01 %)
395
(100.00 %)
734,763
(5.74 %)
422,947
(7.08 %)
6,491,165
(25.88 %)
10
(0.00 %)
474,751
(3.08 %)
34,601
(2.98 %)
28,080
(1.42 %)
292 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
99,139
(4.10 %)
n/a 21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
4
(0.00 %)
1,172,090
(3.51 %)
19,244
(0.46 %)
16,098
(0.39 %)
293 Obi paradise-crow (lycPyr6 2020)
GCA_014706295.1
n/a n/a 12,592
(1.89 %)
24,002
(2.35 %)
n/a 42.94
(99.48 %)
0
(0 %)
1,602
(0.52 %)
1,695
(100.00 %)
466,546
(6.40 %)
235,283
(1.98 %)
6,371,421
(20.17 %)
15
(0.01 %)
202,970
(1.78 %)
34,247
(3.02 %)
26,600
(1.39 %)
294 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1
n/a n/a 13,448
(1.31 %)
17,745
(2.07 %)
n/a 40.20
(99.98 %)
73
(0.02 %)
73
(0.02 %)
116
(99.98 %)
741,052
(2.98 %)
411,477
(3.31 %)
7,668,994
(30.14 %)
0
(0 %)
318,343
(2.06 %)
34,560
(2.18 %)
21,974
(1.10 %)
295 one-colored caecilian (2021)
GCA_901765095.2
n/a n/a 14,569
(0.43 %)
30,498
(1.16 %)
n/a 44.01
(98.99 %)
0
(0 %)
2,452
(1.01 %)
1,081
(100.00 %)
1,894,383
(1.68 %)
1,670,443
(3.30 %)
22,207,143
(52.43 %)
5
(0.00 %)
1,718,803
(3.44 %)
414,828
(3.91 %)
47,796
(0.38 %)
296 orange-tipped seq squirt (primary hap 2023)
GCA_963082875.1
n/a n/a 3,120
(1.99 %)
3,357
(8.53 %)
n/a 31.55
(99.96 %)
1
(0.00 %)
244
(0.04 %)
106
(100.00 %)
56,509
(6.44 %)
43,313
(12.97 %)
962,614
(51.07 %)
8
(0.01 %)
176,523
(12.45 %)
1,079
(6.77 %)
694
(0.37 %)
297 orbiculate cardinalfish
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
n/a 15,761
(1.50 %)
31,563
(4.00 %)
59,905
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
0
(0 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,257,250
(5.57 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
0
(0 %)
1,304,958
(6.34 %)
29,320
(0.87 %)
15,066
(0.43 %)
298 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1
n/a n/a 14,522
(0.54 %)
21,861
(1.14 %)
n/a 39.52
(98.39 %)
0
(0 %)
3,681
(1.61 %)
1,318
(100.00 %)
1,928,844
(4.34 %)
3,684,477
(13.44 %)
19,091,818
(55.21 %)
1
(0.00 %)
4,715,600
(8.73 %)
127,760
(1.34 %)
9,458
(0.10 %)
299 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2
54,932
(3.31 %)
n/a 18,171
(1.69 %)
20,025
(1.62 %)
42,786
(3.39 %)
42.38
(99.28 %)
0
(0 %)
884
(0.72 %)
77
(100.00 %)
3,069,141
(30.00 %)
385,664
(0.81 %)
12,050,232
(30.57 %)
1
(0.00 %)
174,292
(0.75 %)
63,905
(3.75 %)
66,744
(3.26 %)
300 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
n/a 18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
0
(0 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
1
(0.00 %)
714,726
(2.00 %)
79,984
(2.45 %)
71,436
(1.91 %)
301 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1
n/a n/a 19,688
(1.69 %)
21,998
(1.64 %)
n/a 43.04
(99.72 %)
19
(0.01 %)
234
(0.28 %)
112
(99.99 %)
2,794,986
(22.60 %)
938,016
(3.72 %)
11,241,518
(39.41 %)
0
(0 %)
704,408
(2.03 %)
70,272
(2.89 %)
61,250
(1.98 %)
302 Papuan ground boa (hap2 2024)
GCA_035149785.1
n/a n/a 13,390
(1.26 %)
17,496
(1.99 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
150
(100.00 %)
728,574
(2.82 %)
348,605
(2.13 %)
7,199,124
(33.55 %)
1
(0.00 %)
318,788
(2.43 %)
51,807
(2.69 %)
19,758
(0.92 %)
303 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1
n/a n/a 17,913
(1.72 %)
20,720
(1.72 %)
n/a 43.54
(99.99 %)
7
(0.00 %)
980
(0.01 %)
185
(100.00 %)
2,932,869
(21.94 %)
874,665
(4.83 %)
10,263,103
(37.46 %)
2
(0.00 %)
742,499
(2.50 %)
77,397
(4.55 %)
76,849
(2.51 %)
304 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1
n/a n/a 15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
0
(0 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
975,354
(15.76 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,904
(35.09 %)
1
(0.00 %)
865,727
(6.60 %)
49,121
(3.07 %)
20,467
(0.93 %)
305 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1
n/a n/a 15,317
(2.02 %)
61,647
(6.35 %)
n/a 41.37
(99.99 %)
135
(0.01 %)
135
(0.01 %)
469
(99.99 %)
981,519
(15.40 %)
319,637
(12.45 %)
3,706,473
(36.77 %)
0
(0 %)
952,761
(6.98 %)
50,353
(2.98 %)
20,537
(0.91 %)
306 peladilla (galaxoid fish 2021)
GCA_017639675.1
n/a n/a 13,829
(3.83 %)
41,932
(8.64 %)
n/a 45.01
(98.24 %)
0
(0 %)
1,158
(1.77 %)
41
(100.00 %)
930,246
(18.49 %)
660,569
(13.71 %)
2,316,198
(27.66 %)
6
(0.00 %)
537,418
(6.48 %)
41,023
(4.40 %)
27,287
(2.49 %)
307 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634155.1
49,100
(5.64 %)
n/a 13,021
(1.66 %)
21,794
(1.95 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
0
(0 %)
241
(0.31 %)
125
(100.00 %)
586,320
(11.83 %)
335,218
(8.05 %)
7,038,851
(24.65 %)
0
(0 %)
405,474
(2.46 %)
26,085
(2.25 %)
20,023
(0.87 %)
308 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501925.1
n/a n/a 23,766
(1.52 %)
34,093
(2.42 %)
n/a 39.52
(100.00 %)
9
(0.00 %)
500
(0.00 %)
897
(100.00 %)
919,152
(1.89 %)
1,157,711
(8.01 %)
14,217,996
(45.44 %)
0
(0 %)
1,995,399
(5.51 %)
108,139
(1.26 %)
16,761
(0.21 %)
309 Philippine flying lemur (mCynVol1 primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1
44,950
(1.91 %)
n/a 20,385
(1.64 %)
22,123
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
116
(0.00 %)
130
(100.00 %)
4,492,417
(39.31 %)
627,841
(4.79 %)
15,561,458
(36.57 %)
2
(0.00 %)
862,813
(2.91 %)
45,336
(1.27 %)
44,264
(1.15 %)
310 Philippine flying lemur (mCynVol1 primary hap 2022)
GCA_027409185.1
n/a n/a 20,384
(1.64 %)
22,124
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
116
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,492,423
(39.31 %)
627,842
(4.79 %)
15,561,515
(36.57 %)
2
(0.00 %)
n/a 45,336
(1.27 %)
44,264
(1.15 %)
311 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1
n/a n/a 18,472
(1.44 %)
19,911
(1.28 %)
n/a 42.63
(99.98 %)
0
(0 %)
878
(0.02 %)
379
(100.00 %)
3,996,827
(27.97 %)
2,094,728
(7.23 %)
12,677,118
(40.57 %)
4
(0.00 %)
1,289,995
(3.44 %)
81,791
(2.82 %)
46,045
(1.12 %)
312 pinecone soldierfish
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
n/a 15,738
(2.42 %)
26,691
(5.69 %)
57,069
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
0
(0 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,063,888
(5.90 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
0
(0 %)
374,590
(3.12 %)
41,636
(2.04 %)
21,488
(0.92 %)
313 pink pigeon (primary hap 2023)
GCA_963082525.1
n/a n/a 13,140
(1.85 %)
25,111
(2.31 %)
n/a 42.27
(99.99 %)
0
(0 %)
509
(0.01 %)
143
(100.00 %)
488,313
(5.48 %)
331,962
(3.50 %)
6,243,204
(22.87 %)
0
(0 %)
441,492
(2.54 %)
36,343
(3.63 %)
31,102
(1.89 %)
314 pink sea squirt (2022)
GCA_947561715.1
n/a n/a 3,449
(1.48 %)
14,588
(13.45 %)
n/a 39.19
(100.00 %)
0
(0 %)
32
(0.00 %)
96
(100.00 %)
18,369
(1.83 %)
33,783
(9.73 %)
1,032,597
(26.20 %)
4
(0.00 %)
242,360
(12.34 %)
7,713
(4.85 %)
6,762
(1.51 %)
315 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023)
GCA_033958435.1
n/a n/a 14,675
(1.05 %)
16,697
(1.47 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
134
(100.00 %)
3,772,260
(47.94 %)
322,081
(1.52 %)
11,123,166
(34.14 %)
0
(0 %)
448,027
(1.56 %)
129,645
(3.29 %)
28,529
(1.18 %)
316 plains spadefoot toad (aSpeBom1 primary hap 2022)
GCF_027358695.1
41,009
(4.67 %)
n/a 13,912
(2.00 %)
25,745
(4.50 %)
n/a 40.45
(99.61 %)
0
(0 %)
102
(0.39 %)
17
(100.00 %)
497,976
(3.84 %)
645,915
(10.08 %)
5,232,342
(36.26 %)
1
(0.00 %)
748,493
(5.83 %)
72,598
(4.35 %)
32,385
(1.89 %)
317 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2
51,392
(3.07 %)
n/a 14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
0
(0 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
0
(0 %)
1,130,252
(3.59 %)
87,796
(6.47 %)
74,209
(2.87 %)
318 plumbeous ibis (2021)
GCA_020745775.1
n/a n/a 13,028
(1.84 %)
22,722
(2.10 %)
n/a 42.37
(99.81 %)
0
(0 %)
104
(0.19 %)
88
(100.00 %)
488,030
(6.66 %)
188,606
(1.01 %)
6,982,793
(20.08 %)
0
(0 %)
89,388
(0.77 %)
32,920
(3.37 %)
32,773
(1.95 %)
319 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1
n/a n/a 14,126
(2.81 %)
61,907
(8.75 %)
n/a 45.67
(99.94 %)
0
(0 %)
1,810
(0.06 %)
616
(100.00 %)
753,034
(10.17 %)
850,189
(15.72 %)
2,888,555
(33.70 %)
7
(0.00 %)
642,528
(6.84 %)
80,883
(8.43 %)
46,894
(3.34 %)
320 prehistoric monster fish
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
n/a 14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
0
(0 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
3
(0.00 %)
1,746,915
(7.91 %)
172,199
(5.45 %)
18,080
(0.31 %)
321 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1
n/a n/a 17,919
(1.46 %)
19,330
(1.31 %)
n/a 40.78
(100.00 %)
0
(0 %)
68
(0.00 %)
41
(100.00 %)
3,707,234
(28.28 %)
643,817
(2.22 %)
12,106,384
(41.48 %)
5
(0.00 %)
871,436
(2.63 %)
54,438
(1.38 %)
34,899
(0.85 %)
322 Puerto Rican coqui (hap1 2024)
GCA_035609145.1
n/a n/a 13,881
(0.57 %)
32,313
(1.67 %)
n/a 44.91
(100.00 %)
6
(0.00 %)
659
(0.00 %)
963
(100.00 %)
1,044,181
(1.98 %)
1,442,189
(16.51 %)
14,710,175
(54.00 %)
6
(0.00 %)
4,070,195
(8.73 %)
501,931
(8.81 %)
49,483
(0.82 %)
323 pygmy chimpanzee (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_029289425.2
95,418
(4.20 %)
n/a 21,182
(1.74 %)
23,352
(1.22 %)
n/a 40.43
(99.84 %)
0
(0 %)
6
(0.16 %)
31
(100.00 %)
5,436,203
(50.57 %)
1,021,767
(12.45 %)
15,964,628
(43.17 %)
1
(0.03 %)
3,743,841
(6.31 %)
48,818
(1.07 %)
29,887
(0.74 %)
324 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 refseq)
GCF_026419965.1
56,261
(2.22 %)
n/a 18,496
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
0
(0 %)
143
(0.19 %)
581
(100.00 %)
3,817,659
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,998
(39.96 %)
0
(0 %)
1,197,809
(3.53 %)
101,353
(2.90 %)
50,216
(1.47 %)
325 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1
n/a n/a 15,639
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
0
(0 %)
1,907
(0.07 %)
365
(100.00 %)
1,655,350
(30.53 %)
511,512
(12.09 %)
2,015,264
(35.19 %)
4
(0.00 %)
468,697
(7.41 %)
32,410
(4.33 %)
18,662
(1.57 %)
326 razorbill
GCA_008658365.1
n/a n/a 12,787
(1.83 %)
22,839
(2.13 %)
n/a 42.67
(99.70 %)
0
(0 %)
227
(0.30 %)
95
(100.00 %)
543,517
(7.16 %)
212,546
(1.12 %)
6,930,708
(20.10 %)
0
(0 %)
103,901
(0.79 %)
38,960
(3.02 %)
35,213
(1.80 %)
327 red deer (2021)
GCF_910594005.1
68,992
(2.68 %)
n/a 20,470
(1.48 %)
22,563
(1.32 %)
n/a 42.98
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
144
(100.00 %)
5,501,063
(44.60 %)
503,301
(12.23 %)
13,102,622
(44.55 %)
1
(0.00 %)
2,197,198
(5.57 %)
88,756
(1.66 %)
46,960
(1.12 %)
328 red-bellied piranha
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
n/a 16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
76,011
(5.65 %)
40.58
(99.17 %)
0
(0 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
2
(0.00 %)
1,005,141
(5.14 %)
33,087
(1.38 %)
20,822
(0.79 %)
329 red-crested turaco
GCA_009769465.1
n/a n/a 12,744
(1.75 %)
25,706
(2.29 %)
n/a 42.60
(97.89 %)
0
(0 %)
344
(2.11 %)
140
(100.00 %)
551,885
(8.95 %)
176,530
(0.80 %)
6,805,042
(22.19 %)
0
(0 %)
138,426
(1.12 %)
43,051
(3.40 %)
34,997
(2.03 %)
330 red-fronted tinkerbird
GCA_015220805.1
n/a n/a 12,345
(1.60 %)
23,206
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
0
(0 %)
307
(0.47 %)
253
(100.00 %)
1,082,064
(22.90 %)
378,866
(4.28 %)
6,003,548
(35.88 %)
0
(0 %)
1,148,448
(6.01 %)
26,519
(1.76 %)
21,399
(1.21 %)
331 Red-fronted tinkerbird (bPogPus1 primary hap 2020)
GCF_015220805.1
44,843
(4.51 %)
n/a 12,341
(1.60 %)
23,205
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
0
(0 %)
307
(0.47 %)
252
(100.00 %)
981,758
(15.82 %)
378,855
(4.28 %)
6,003,474
(35.88 %)
0
(0 %)
1,148,439
(6.01 %)
26,519
(1.76 %)
21,399
(1.21 %)
332 red-legged seriema
GCA_009819825.1
n/a n/a 13,229
(1.84 %)
25,580
(2.35 %)
n/a 42.20
(99.59 %)
0
(0 %)
194
(0.41 %)
110
(100.00 %)
483,784
(6.50 %)
160,481
(0.73 %)
6,960,060
(19.71 %)
0
(0 %)
64,843
(0.56 %)
32,899
(2.77 %)
30,208
(1.91 %)
333 red-throated loon (hap2 2023 refseq)
GCF_030936135.1
25,173
(3.02 %)
n/a 13,216
(1.71 %)
24,050
(2.10 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
1,185
(100.00 %)
544,422
(8.81 %)
223,672
(5.77 %)
6,669,433
(23.63 %)
3
(0.00 %)
398,584
(2.64 %)
38,305
(3.37 %)
35,068
(1.78 %)
334 reedfish (2021)
GCF_900747795.2
44,479
(2.01 %)
n/a 13,108
(0.46 %)
23,157
(1.29 %)
n/a 39.37
(99.18 %)
0
(0 %)
1,431
(0.82 %)
169
(100.00 %)
8,636,520
(39.34 %)
1,069,643
(2.91 %)
19,980,572
(47.52 %)
17
(0.00 %)
1,256,071
(2.69 %)
89,023
(1.13 %)
22,697
(0.30 %)
335 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1
n/a n/a 18,947
(1.29 %)
24,114
(1.28 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,892
(100.00 %)
3,375,476
(23.21 %)
654,539
(6.64 %)
11,132,469
(48.29 %)
0
(0 %)
3,008,562
(7.07 %)
79,357
(2.66 %)
41,548
(0.93 %)
336 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1
59,888
(2.34 %)
n/a 19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
0
(0 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
4
(0.00 %)
1,071,329
(3.37 %)
73,126
(1.69 %)
43,865
(1.11 %)
337 rifleman (2021)
GCA_016904835.1
n/a n/a 12,620
(1.92 %)
24,568
(2.61 %)
n/a 42.41
(99.61 %)
0
(0 %)
195
(0.39 %)
206
(100.00 %)
495,673
(9.14 %)
253,008
(2.04 %)
5,936,177
(19.93 %)
0
(0 %)
269,642
(1.76 %)
20,145
(1.83 %)
15,953
(0.89 %)
338 ring-tailed lemur (2021)
GCF_020740605.2
55,883
(2.78 %)
n/a 18,659
(1.98 %)
20,542
(1.50 %)
n/a 41.36
(99.84 %)
0
(0 %)
210
(0.16 %)
185
(100.00 %)
3,432,734
(37.67 %)
518,071
(6.84 %)
12,916,577
(32.91 %)
0
(0 %)
864,748
(2.57 %)
50,626
(1.88 %)
48,082
(1.65 %)
339 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2
n/a n/a 27,928
(1.66 %)
110,791
(4.44 %)
n/a 43.36
(96.90 %)
0
(0 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
4,690,842
(57.30 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,763
(52.37 %)
2
(0.00 %)
3,475,805
(8.76 %)
70,821
(1.77 %)
19,956
(0.39 %)
340 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1
n/a n/a 18,132
(2.65 %)
63,523
(6.01 %)
n/a 38.80
(99.99 %)
1
(0.00 %)
471
(0.01 %)
86
(100.00 %)
2,613,900
(48.90 %)
625,102
(8.21 %)
5,738,444
(41.24 %)
1
(0.00 %)
1,070,552
(7.36 %)
65,328
(3.68 %)
20,458
(0.81 %)
341 rock gunnel (2021)
GCA_910591455.2
n/a n/a 15,181
(3.34 %)
44,153
(7.53 %)
51,135
(7.40 %)
42.31
(99.98 %)
0
(0 %)
418
(0.02 %)
101
(100.00 %)
1,121,704
(25.48 %)
269,467
(4.88 %)
3,358,709
(24.69 %)
5
(0.00 %)
255,676
(3.48 %)
36,987
(3.02 %)
28,368
(1.91 %)
342 rock pigeon (v2 racing homer 2024)
GCA_036013475.2
n/a n/a 13,146
(1.66 %)
25,463
(2.12 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,969
(11.76 %)
412,670
(12.92 %)
6,047,584
(29.90 %)
0
(0 %)
1,266,456
(5.89 %)
36,847
(3.12 %)
31,115
(1.65 %)
343 rock ptarmigan (2022)
GCF_023343835.1
51,619
(7.29 %)
n/a 12,832
(2.31 %)
23,047
(2.56 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
0
(0 %)
210
(0.01 %)
165
(100.00 %)
526,839
(5.87 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,345
(21.73 %)
0
(0 %)
216,565
(1.89 %)
21,346
(2.37 %)
19,067
(1.48 %)
344 Rosablanca catfish (hap1 2023)
GCA_030014385.1
n/a n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,920
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
345 royal ground snake (hap1 2023)
GCA_031021105.1
n/a n/a 13,327
(0.96 %)
20,347
(1.68 %)
n/a 41.25
(99.99 %)
0
(0 %)
1,391
(0.01 %)
400
(100.00 %)
1,983,903
(10.40 %)
1,698,731
(7.29 %)
9,084,707
(53.44 %)
11
(0.00 %)
1,523,664
(5.77 %)
130,852
(4.47 %)
27,815
(0.70 %)
346 rufous frog (hap2 2023)
GCA_031893055.1
n/a n/a 13,538
(0.88 %)
24,311
(2.15 %)
n/a 42.96
(99.07 %)
0
(0 %)
976
(0.93 %)
1,266
(100.00 %)
711,895
(2.18 %)
1,219,160
(21.56 %)
7,988,458
(54.14 %)
3
(0.00 %)
3,097,457
(9.48 %)
170,920
(3.48 %)
17,791
(0.40 %)
347 saddleback dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1
46,746
(40.70 %)
n/a 18,625
(1.49 %)
20,451
(1.28 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
0
(0 %)
968
(0.01 %)
631
(100.00 %)
4,020,682
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,818
(42.64 %)
0
(0 %)
1,785,427
(5.07 %)
66,179
(3.91 %)
41,466
(1.03 %)
348 saddleback dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1
46,746
(2.39 %)
n/a 18,624
(1.49 %)
20,662
(1.31 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
0
(0 %)
968
(0.01 %)
630
(100.00 %)
4,020,676
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,748
(42.64 %)
0
(0 %)
1,785,427
(5.07 %)
66,179
(3.91 %)
41,466
(1.03 %)
349 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634085.1
50,290
(5.75 %)
n/a 12,973
(1.67 %)
21,670
(1.90 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
0
(0 %)
258
(0.30 %)
283
(100.00 %)
548,090
(7.21 %)
201,488
(8.55 %)
7,030,877
(24.94 %)
0
(0 %)
469,777
(2.60 %)
31,791
(2.57 %)
20,215
(0.89 %)
350 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887145.1
27,528
(4.03 %)
n/a 12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
0
(0 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
1
(0.00 %)
651,029
(4.07 %)
35,549
(5.05 %)
23,802
(1.15 %)
351 sand lizard
GCF_009819535.1
41,701
(3.64 %)
n/a 14,350
(1.48 %)
19,231
(2.45 %)
32,804
(4.14 %)
43.75
(99.75 %)
0
(0 %)
379
(0.25 %)
29
(100.00 %)
975,474
(5.32 %)
425,414
(1.76 %)
7,135,165
(34.49 %)
0
(0 %)
365,268
(2.50 %)
76,053
(2.68 %)
21,615
(0.85 %)
352 sardine (primary hap 2023)
GCA_963854185.1
n/a n/a 16,071
(2.33 %)
64,180
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
241
(100.00 %)
1,503,111
(11.74 %)
1,507,024
(15.48 %)
4,027,638
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,853
(8.48 %)
68,874
(3.56 %)
38,590
(1.78 %)
353 sardine (primary hap 2023)
GCF_963854185.1
48,146
(9.15 %)
n/a 16,069
(2.33 %)
64,178
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
240
(100.00 %)
1,503,108
(11.74 %)
1,507,022
(15.48 %)
4,027,614
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,852
(8.48 %)
68,873
(3.56 %)
38,589
(1.78 %)
354 Sardinian treefrog (aHylSar1 2023)
GCF_029499605.1
108,406
(1.98 %)
n/a 13,959
(0.46 %)
n/a n/a 43.90
(99.99 %)
0
(0 %)
2,297
(0.01 %)
3,474
(100.00 %)
1,903,654
(2.85 %)
2,970,691
(16.56 %)
15,354,577
(64.31 %)
20
(0.00 %)
n/a 652,708
(8.36 %)
43,665
(0.45 %)
355 Savannah sparrow (primary hap 2023)
GCA_031885435.1
n/a n/a 12,986
(1.66 %)
27,028
(2.29 %)
n/a 43.66
(99.78 %)
0
(0 %)
249
(0.22 %)
110
(100.00 %)
464,600
(3.28 %)
681,402
(9.28 %)
6,314,744
(26.92 %)
0
(0 %)
939,361
(5.26 %)
39,406
(5.26 %)
25,911
(1.19 %)
356 sea lamprey
GCF_010993605.1
41,241
(6.50 %)
n/a 7,638
(0.70 %)
36,336
(4.06 %)
83,714
(10.03 %)
48.31
(98.62 %)
0
(0 %)
930
(1.38 %)
1,434
(100.00 %)
1,920,851
(39.36 %)
1,194,165
(21.47 %)
5,320,620
(50.50 %)
4
(0.00 %)
2,982,736
(13.77 %)
178,590
(35.88 %)
120,128
(5.32 %)
357 seaside sparrow (bAmmMar1 primary hap 2024)
GCA_036010785.1
n/a n/a 12,858
(1.52 %)
25,777
(2.02 %)
n/a 44.04
(99.85 %)
0
(0 %)
365
(0.15 %)
501
(100.00 %)
580,376
(4.24 %)
636,266
(12.18 %)
4,804,433
(34.52 %)
0
(0 %)
1,048,820
(7.41 %)
48,871
(4.18 %)
23,097
(1.00 %)
358 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1
n/a n/a 15,032
(2.44 %)
62,625
(6.97 %)
n/a 42.07
(99.98 %)
0
(0 %)
598
(0.02 %)
847
(100.00 %)
967,197
(11.85 %)
498,286
(8.15 %)
4,397,828
(28.96 %)
9
(0.00 %)
531,478
(4.46 %)
65,744
(4.06 %)
42,870
(2.25 %)
359 sharpnose sevengill shark (hap1 2024)
GCA_035084215.1
n/a n/a 12,780
(0.49 %)
24,543
(1.38 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
0
(0 %)
1,834
(0.01 %)
1,880
(100.00 %)
597,122
(2.28 %)
1,112,137
(17.97 %)
12,108,056
(57.48 %)
2
(0.00 %)
4,824,033
(9.23 %)
117,585
(3.42 %)
24,151
(0.35 %)
360 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.2
105,373
(3.05 %)
n/a 20,434
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
0
(0 %)
2
(0.03 %)
27
(100.00 %)
5,354,446
(55.80 %)
935,620
(14.70 %)
14,917,515
(46.01 %)
0
(0 %)
2,398,386
(4.90 %)
92,243
(1.42 %)
27,998
(0.68 %)
361 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4
59,278
(19.85 %)
n/a 14,594
(4.32 %)
55,265
(10.96 %)
n/a 45.31
(99.99 %)
0
(0 %)
321
(0.01 %)
36
(100.00 %)
384,203
(19.38 %)
175,898
(4.39 %)
1,946,630
(23.16 %)
2
(0.00 %)
209,905
(4.10 %)
70,331
(13.13 %)
54,790
(7.31 %)
362 slow loris (mNycCou1 primary hap 2022)
GCF_027406575.1
67,211
(2.59 %)
n/a 22,193
(1.49 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 40.82
(99.86 %)
0
(0 %)
218
(0.14 %)
84
(100.00 %)
4,625,872
(39.88 %)
579,983
(1.59 %)
14,405,367
(40.78 %)
2
(0.00 %)
991,294
(2.40 %)
38,257
(0.77 %)
22,955
(0.54 %)
363 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1
55,762
(1.62 %)
n/a 12,597
(0.36 %)
23,987
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
0
(0 %)
7,146
(1.52 %)
646
(100.00 %)
1,185,832
(1.72 %)
1,448,620
(6.25 %)
20,884,767
(51.41 %)
10
(0.00 %)
3,334,926
(4.99 %)
456,658
(8.18 %)
31,096
(0.32 %)
364 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2
n/a n/a 12,587
(0.36 %)
23,986
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
0
(0 %)
7,146
(1.52 %)
645
(100.00 %)
1,451,634
(1.94 %)
1,448,619
(6.25 %)
20,884,741
(51.41 %)
10
(0.00 %)
3,334,909
(4.99 %)
456,658
(8.18 %)
31,096
(0.32 %)
365 smalleye Pacific opah (fLamInc1 2023)
GCF_029633865.1
34,018
(4.17 %)
n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
0
(0 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
17
(0.00 %)
1,796,705
(8.53 %)
143,632
(7.43 %)
65,914
(2.15 %)
366 smalltooth sawfish (v2.1 2019 refseq)
GCF_009764475.1
40,257
(2.94 %)
n/a 12,157
(0.69 %)
18,627
(1.55 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
0
(0 %)
698
(0.91 %)
172
(100.00 %)
4,824,261
(54.91 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,260
(38.19 %)
0
(0 %)
471,344
(1.50 %)
45,398
(1.34 %)
18,410
(0.41 %)
367 snake C.aspera (hap2 2024)
GCF_035149785.1
31,826
(3.55 %)
n/a 13,389
(1.26 %)
17,495
(1.99 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
149
(100.00 %)
728,567
(2.82 %)
348,603
(2.13 %)
7,199,026
(33.55 %)
1
(0.00 %)
318,786
(2.43 %)
51,807
(2.69 %)
19,758
(0.92 %)
368 song sparrow (bMelMel2 primary hap 2024)
GCF_035770615.1
41,069
(3.95 %)
n/a 12,946
(1.39 %)
26,698
(1.87 %)
n/a 44.96
(99.93 %)
0
(0 %)
299
(0.07 %)
353
(100.00 %)
515,851
(3.07 %)
681,436
(15.73 %)
5,004,851
(39.23 %)
1
(0.00 %)
1,925,213
(9.14 %)
47,268
(3.90 %)
25,117
(0.99 %)
369 song sparrow (primary hap 2024)
GCA_035770615.1
n/a n/a 12,940
(1.39 %)
26,698
(1.87 %)
n/a 44.96
(99.93 %)
0
(0 %)
299
(0.07 %)
354
(100.00 %)
515,857
(3.07 %)
681,436
(15.73 %)
5,004,880
(39.23 %)
1
(0.00 %)
1,925,221
(9.14 %)
47,269
(3.90 %)
25,118
(0.99 %)
370 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1
n/a n/a 18,056
(1.78 %)
21,158
(1.79 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
6
(0.00 %)
161
(0.00 %)
249
(100.00 %)
2,899,535
(21.64 %)
853,717
(7.80 %)
10,162,216
(37.72 %)
1
(0.00 %)
802,761
(2.85 %)
63,256
(3.06 %)
61,642
(2.03 %)
371 South Island takahe (primary hap 2021)
GCA_020800305.1
n/a n/a 12,942
(1.69 %)
23,221
(2.13 %)
n/a 43.74
(99.58 %)
0
(0 %)
327
(0.42 %)
174
(100.00 %)
577,553
(9.77 %)
259,017
(5.20 %)
6,430,968
(25.90 %)
1
(0.00 %)
437,634
(2.97 %)
23,810
(2.02 %)
20,060
(1.16 %)
372 southern bluefin tuna (2021)
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
n/a 15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
0
(0 %)
326,254
(3.37 %)
14,097
(0.88 %)
8,860
(0.42 %)
373 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1
47,152
(2.39 %)
n/a 19,356
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
0
(0 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,460
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,540,762
(32.73 %)
0
(0 %)
547,538
(1.62 %)
18,046
(0.54 %)
16,132
(0.42 %)
374 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1
n/a n/a 20,058
(1.26 %)
22,196
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
961
(0.56 %)
201
(100.00 %)
4,037,291
(46.02 %)
593,019
(1.17 %)
18,033,833
(40.56 %)
9
(0.00 %)
500,101
(1.40 %)
65,039
(1.33 %)
38,121
(0.86 %)
375 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1
63,054
(2.39 %)
n/a 21,998
(1.29 %)
23,177
(1.18 %)
45,345
(1.69 %)
39.89
(97.48 %)
0
(0 %)
1,243
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,559,690
(39.66 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,630
(40.50 %)
4
(0.00 %)
492,026
(1.69 %)
51,430
(1.14 %)
40,148
(0.81 %)
376 specked wood butterfly
GCF_905163445.1
21,720
(6.53 %)
n/a 4,713
(0.87 %)
17,001
(4.33 %)
29,238
(7.81 %)
35.99
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
70
(100.00 %)
304,062
(2.97 %)
110,824
(4.09 %)
3,704,161
(44.42 %)
1
(0.00 %)
144,758
(2.93 %)
28,108
(2.75 %)
11,566
(0.96 %)
377 speckled mousebird (bColStr4 hap1 2023)
GCF_028858725.1
37,067
(4.23 %)
n/a 12,815
(1.76 %)
23,175
(2.17 %)
n/a 42.29
(99.52 %)
0
(0 %)
161
(0.48 %)
191
(100.00 %)
572,944
(12.88 %)
256,368
(3.55 %)
5,868,966
(23.42 %)
1
(0.00 %)
412,827
(2.70 %)
27,158
(2.30 %)
20,935
(1.20 %)
378 speckled mousebird (hap1 2023)
GCA_028858725.1
n/a n/a 11,956
(1.78 %)
25,177
(2.60 %)
n/a 42.38
(99.48 %)
0
(0 %)
143
(0.52 %)
189
(100.00 %)
523,056
(12.47 %)
243,547
(3.72 %)
5,408,003
(23.43 %)
1
(0.00 %)
397,635
(2.78 %)
25,552
(2.34 %)
19,232
(1.18 %)
379 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1
n/a n/a 10,694
(1.38 %)
13,221
(2.62 %)
n/a 42.85
(99.96 %)
0
(0 %)
1,952
(0.04 %)
532
(100.00 %)
3,108,151
(44.68 %)
498,592
(6.00 %)
5,634,132
(43.16 %)
4
(0.00 %)
685,165
(4.19 %)
50,785
(2.94 %)
25,542
(1.57 %)
380 sterlet (maternal fAciRut3.2 2022)
GCF_902713425.1
110,154
(7.62 %)
n/a 25,364
(1.76 %)
40,715
(4.06 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
0
(0 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
10
(0.00 %)
1,593,747
(6.87 %)
64,522
(2.85 %)
21,984
(0.89 %)
381 stone loach (2022)
GCA_947034865.1
n/a n/a 16,419
(3.98 %)
40,677
(7.21 %)
n/a 39.69
(99.97 %)
0
(0 %)
825
(0.03 %)
100
(100.00 %)
1,324,513
(39.84 %)
143,170
(9.30 %)
3,000,881
(34.30 %)
1
(0.00 %)
392,291
(5.75 %)
30,130
(3.71 %)
15,123
(1.03 %)
382 striped catfish (fPanHyp1 primary hap 2022)
GCF_027358585.1
53,860
(11.99 %)
n/a 16,033
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
0
(0 %)
236
(0.51 %)
58
(100.00 %)
1,870,234
(37.80 %)
605,570
(6.82 %)
5,059,429
(32.43 %)
2
(0.00 %)
531,388
(4.26 %)
17,919
(1.29 %)
12,796
(0.75 %)
383 striped dolphin (primary hap 2023)
GCA_951394435.1
n/a n/a 18,595
(1.48 %)
20,637
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1
(0.00 %)
993
(0.01 %)
639
(100.00 %)
4,097,623
(35.88 %)
1,442,973
(13.60 %)
12,327,244
(43.08 %)
1
(0.00 %)
1,896,129
(5.45 %)
68,498
(4.29 %)
42,011
(1.04 %)
384 Sumatran orangutan (v2 AG06213 primary hap 2024 refseq)
GCF_028885655.2
102,148
(3.49 %)
n/a 20,870
(1.72 %)
21,383
(1.14 %)
n/a 40.88
(99.75 %)
0
(0 %)
11
(0.25 %)
30
(100.00 %)
5,567,810
(54.83 %)
1,092,396
(10.36 %)
16,195,884
(42.80 %)
0
(0 %)
2,491,180
(4.29 %)
44,397
(1.13 %)
30,587
(0.77 %)
385 Suruca trogon (2021)
GCA_020746105.1
n/a n/a 12,884
(1.85 %)
23,805
(2.23 %)
n/a 42.80
(99.12 %)
0
(0 %)
253
(0.88 %)
182
(100.00 %)
539,771
(9.26 %)
181,564
(1.14 %)
6,538,228
(22.49 %)
1
(0.00 %)
138,653
(1.22 %)
41,376
(3.37 %)
36,105
(2.01 %)
386 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1
n/a n/a 12,226
(1.01 %)
14,117
(1.42 %)
n/a 43.77
(100.00 %)
0
(0 %)
361
(0.00 %)
199
(100.00 %)
1,202,345
(11.93 %)
304,674
(1.45 %)
9,752,924
(32.81 %)
0
(0 %)
314,037
(1.63 %)
92,993
(2.75 %)
20,902
(0.60 %)
387 Swainson's thrush (v2 2020)
GCF_009819885.2
40,121
(5.41 %)
n/a 13,004
(1.87 %)
24,795
(2.41 %)
n/a 42.48
(98.86 %)
0
(0 %)
429
(1.14 %)
160
(100.00 %)
493,071
(5.80 %)
589,858
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
1
(0.00 %)
449,511
(2.41 %)
49,404
(3.53 %)
22,206
(1.16 %)
388 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018845.1
29,544
(4.27 %)
n/a 12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
0
(0 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
1
(0.00 %)
578,723
(3.93 %)
32,064
(3.27 %)
22,996
(1.19 %)
389 tammar wallaby (mMacEug1 primary hap 2023)
GCA_028372415.1
n/a n/a 17,652
(0.77 %)
15,774
(0.88 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
0
(0 %)
515
(0.19 %)
315
(100.00 %)
5,836,160
(26.14 %)
1,193,709
(2.72 %)
22,682,658
(39.52 %)
4
(0.00 %)
566,172
(1.21 %)
23,629
(0.48 %)
14,785
(0.29 %)
390 tarantolino (rEulEur1 2023)
GCF_029931775.1
24,643
(2.02 %)
n/a 14,238
(1.16 %)
21,782
(2.17 %)
n/a 44.68
(99.77 %)
0
(0 %)
153
(0.23 %)
591
(100.00 %)
1,174,615
(6.99 %)
436,937
(2.95 %)
8,308,817
(39.80 %)
0
(0 %)
824,335
(3.45 %)
83,089
(2.82 %)
33,674
(0.93 %)
391 tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023)
GCA_028020825.1
n/a n/a 13,321
(1.76 %)
24,102
(2.15 %)
n/a 42.35
(99.83 %)
0
(0 %)
203
(0.17 %)
1,038
(100.00 %)
593,409
(10.51 %)
202,463
(9.29 %)
6,160,173
(27.65 %)
1
(0.00 %)
529,082
(2.97 %)
25,785
(2.35 %)
21,960
(1.26 %)
392 tawny owl (hap1 2023)
GCA_031877795.1
n/a n/a 13,204
(1.60 %)
23,981
(1.99 %)
n/a 42.70
(99.70 %)
9
(0.15 %)
281
(0.30 %)
212
(99.85 %)
443,228
(4.74 %)
272,738
(10.86 %)
5,812,837
(27.42 %)
1
(0.00 %)
406,171
(2.45 %)
30,602
(2.52 %)
26,399
(1.26 %)
393 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1
n/a n/a 14,720
(2.58 %)
45,918
(6.44 %)
n/a 40.37
(99.99 %)
0
(0 %)
454
(0.01 %)
188
(100.00 %)
1,242,704
(17.37 %)
518,293
(15.23 %)
3,986,694
(40.18 %)
1
(0.00 %)
670,254
(6.56 %)
51,441
(3.53 %)
22,258
(1.30 %)
394 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1
n/a n/a 15,347
(2.73 %)
50,294
(7.25 %)
n/a 42.30
(99.98 %)
30
(0.00 %)
610
(0.02 %)
393
(100.00 %)
1,157,324
(26.70 %)
229,196
(4.33 %)
3,694,790
(27.54 %)
1
(0.00 %)
385,033
(4.63 %)
38,929
(2.20 %)
24,476
(1.25 %)
395 thorny skate (v2 2020)
GCF_010909765.2
45,968
(2.40 %)
n/a 11,437
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
n/a 44.30
(92.54 %)
0
(0 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
888,163
(2.58 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
26
(0.00 %)
1,634,606
(4.98 %)
242,676
(4.73 %)
31,030
(0.57 %)
396 tiny Cayenne caecilian
GCF_901765095.1
41,333
(1.27 %)
n/a 14,569
(0.43 %)
30,499
(1.16 %)
n/a 44.01
(98.99 %)
0
(0 %)
2,452
(1.01 %)
1,081
(100.00 %)
1,835,191
(1.59 %)
1,670,443
(3.30 %)
22,207,145
(52.43 %)
5
(0.00 %)
1,513,727
(3.00 %)
414,828
(3.91 %)
47,796
(0.38 %)
397 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3
n/a n/a 14,527
(4.79 %)
51,181
(11.72 %)
n/a 45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
325,077
(14.03 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,754
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,975
(9.63 %)
37,920
(5.08 %)
398 tourmaline sunangel (hap1 2024)
GCA_036169615.1
n/a n/a 12,509
(1.97 %)
21,020
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.99 %)
0
(0 %)
437
(0.01 %)
131
(100.00 %)
532,267
(5.46 %)
332,284
(2.69 %)
6,084,978
(21.20 %)
0
(0 %)
215,264
(1.71 %)
19,080
(1.72 %)
15,764
(1.09 %)
399 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1
n/a n/a 18,627
(1.82 %)
20,108
(1.67 %)
n/a 42.95
(100.00 %)
0
(0 %)
217
(0.00 %)
182
(100.00 %)
2,733,927
(24.79 %)
715,258
(3.17 %)
10,099,456
(36.35 %)
1
(0.00 %)
459,634
(1.69 %)
47,139
(2.58 %)
49,626
(1.96 %)
400 trahira (hap2 2023)
GCA_029633875.1
n/a n/a 16,216
(2.00 %)
45,209
(4.32 %)
n/a 41.03
(96.02 %)
0
(0 %)
907
(3.98 %)
452
(100.00 %)
2,280,303
(30.80 %)
708,327
(15.59 %)
5,394,248
(39.01 %)
7
(0.00 %)
1,246,906
(7.61 %)
28,386
(2.18 %)
12,439
(0.46 %)
401 tufted duck
GCF_009819795.1
29,492
(4.02 %)
n/a 12,972
(1.98 %)
22,757
(2.27 %)
n/a 41.66
(99.16 %)
0
(0 %)
163
(0.84 %)
105
(100.00 %)
826,451
(8.47 %)
411,356
(1.71 %)
6,691,445
(22.36 %)
1
(0.00 %)
93,916
(0.94 %)
29,882
(2.41 %)
27,027
(1.51 %)
402 tunicate A.turbinatum (primary hap 2021)
GCA_918807975.1
n/a n/a 4,108
(0.57 %)
18,445
(6.84 %)
n/a 37.60
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
27
(100.00 %)
104,021
(0.79 %)
186,953
(6.27 %)
2,895,772
(42.71 %)
0
(0 %)
297,254
(4.86 %)
23,070
(1.74 %)
4,064
(0.29 %)
403 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1
n/a n/a 14,816
(3.44 %)
49,680
(8.16 %)
n/a 43.40
(99.97 %)
0
(0 %)
805
(0.03 %)
108
(100.00 %)
808,348
(19.20 %)
301,230
(7.15 %)
3,267,772
(25.91 %)
4
(0.00 %)
311,531
(3.41 %)
66,132
(6.90 %)
41,801
(3.31 %)
404 two-lined caecilian
GCF_901001135.1
56,617
(1.50 %)
n/a 14,448
(0.38 %)
40,572
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
0
(0 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,263,606
(1.94 %)
2,036,108
(4.34 %)
29,400,958
(44.09 %)
9
(0.01 %)
2,193,249
(3.24 %)
602,912
(6.66 %)
94,935
(0.82 %)
405 two-lined caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_901001135.2
n/a n/a 14,449
(0.38 %)
40,573
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
0
(0 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,274,606
(1.91 %)
2,036,107
(4.34 %)
29,400,957
(44.09 %)
9
(0.01 %)
2,193,249
(3.24 %)
602,911
(6.66 %)
94,934
(0.82 %)
406 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1
60,106
(3.00 %)
n/a 18,611
(1.76 %)
20,103
(1.39 %)
35,176
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
0
(0 %)
212
(0.34 %)
64
(100.00 %)
4,067,454
(44.25 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,582
(35.55 %)
3
(0.00 %)
550,113
(1.71 %)
66,806
(1.79 %)
48,624
(1.46 %)
407 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 refseq)
GCF_026979565.1
44,961
(5.49 %)
n/a 12,817
(1.94 %)
24,245
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
0
(0 %)
458
(0.02 %)
177
(100.00 %)
616,746
(11.96 %)
411,917
(3.57 %)
6,385,057
(20.91 %)
6
(0.00 %)
306,942
(1.90 %)
37,940
(2.83 %)
24,967
(1.41 %)
408 village indigobird (purged dups hap OUT-0048 2022)
GCA_026979555.1
n/a n/a 2,176
(1.79 %)
7,719
(4.37 %)
n/a 49.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,939
(100.00 %)
136,312
(29.31 %)
157,341
(15.03 %)
648,725
(34.67 %)
0
(0 %)
221,251
(9.52 %)
15,490
(8.23 %)
7,383
(2.86 %)
409 warty frogfish (2020)
GCA_013358685.1
n/a n/a 14,494
(3.34 %)
45,310
(7.77 %)
n/a 41.86
(99.87 %)
0
(0 %)
219
(0.13 %)
155
(100.00 %)
413,753
(4.95 %)
290,313
(6.11 %)
3,010,996
(29.71 %)
3
(0.00 %)
305,411
(3.51 %)
36,840
(4.18 %)
22,433
(1.95 %)
410 western capercaillie (primary hap 2023)
GCA_951394365.1
n/a n/a 12,775
(2.33 %)
22,516
(2.50 %)
n/a 41.49
(99.98 %)
0
(0 %)
973
(0.02 %)
318
(100.00 %)
518,194
(5.54 %)
276,294
(2.21 %)
5,866,033
(21.12 %)
9
(0.00 %)
148,912
(1.44 %)
21,287
(2.50 %)
19,248
(1.54 %)
411 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1
61,103
(44.10 %)
n/a 18,126
(1.16 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
0
(0 %)
3,760
(0.03 %)
1,175
(100.00 %)
4,891,344
(19.68 %)
1,507,933
(3.81 %)
12,571,193
(54.50 %)
7
(0.00 %)
1,975,693
(4.67 %)
32,667
(0.90 %)
24,067
(0.56 %)
412 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1
61,103
(2.36 %)
n/a 18,125
(1.16 %)
20,689
(1.21 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
0
(0 %)
3,760
(0.03 %)
1,174
(100.00 %)
4,891,329
(19.68 %)
1,507,929
(3.81 %)
12,571,105
(54.50 %)
7
(0.00 %)
1,975,693
(4.67 %)
32,667
(0.90 %)
24,067
(0.56 %)
413 western lowland gorilla (v2 KB3781 2024 refseq)
GCF_029281585.2
98,428
(2.94 %)
n/a 21,010
(1.59 %)
50,697
(1.83 %)
n/a 40.49
(99.94 %)
0
(0 %)
2
(0.06 %)
26
(100.00 %)
5,456,274
(50.77 %)
1,060,267
(19.55 %)
15,870,229
(47.77 %)
0
(0 %)
5,413,767
(8.98 %)
69,745
(1.19 %)
30,644
(0.70 %)
414 Western terrestrial garter snake
GCF_009769535.1
33,492
(3.42 %)
n/a 13,074
(1.13 %)
18,807
(1.93 %)
31,660
(2.61 %)
40.95
(97.72 %)
0
(0 %)
1,518
(2.28 %)
365
(100.00 %)
1,271,255
(7.73 %)
979,057
(4.48 %)
8,396,200
(42.63 %)
0
(0 %)
801,068
(3.60 %)
81,829
(2.47 %)
23,152
(0.75 %)
415 whiskered treeswift (2021)
GCA_020745705.1
n/a n/a 12,681
(1.84 %)
21,784
(2.14 %)
n/a 42.12
(99.13 %)
0
(0 %)
218
(0.87 %)
146
(100.00 %)
520,200
(9.32 %)
170,778
(0.83 %)
6,455,910
(21.44 %)
0
(0 %)
98,619
(0.96 %)
24,061
(1.62 %)
17,982
(1.11 %)
416 white leghorn X broiler chicken (leghorn haplotype v2 2021)
GCF_016700215.2
83,834
(10.16 %)
n/a 13,005
(2.32 %)
23,329
(2.48 %)
72,360
(9.39 %)
42.16
(99.57 %)
409
(0.43 %)
409
(0.43 %)
685
(99.57 %)
536,869
(6.00 %)
268,230
(2.28 %)
5,845,184
(20.93 %)
2
(0.00 %)
247,373
(2.08 %)
24,409
(2.60 %)
20,761
(1.55 %)
417 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1
59,982
(41.87 %)
n/a 18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
0
(0 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
2
(0.00 %)
1,117,804
(3.60 %)
68,551
(3.58 %)
41,698
(1.09 %)
418 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1
59,982
(2.43 %)
n/a 18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
0
(0 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
2
(0.00 %)
1,117,804
(3.60 %)
68,551
(3.58 %)
41,698
(1.09 %)
419 white-crowned manakin (hap1 2024)
GCA_036250125.1
n/a n/a 12,807
(1.82 %)
25,568
(2.46 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
323
(0.01 %)
697
(100.00 %)
429,646
(4.10 %)
293,431
(3.59 %)
6,059,494
(21.89 %)
0
(0 %)
366,430
(2.74 %)
29,574
(2.42 %)
21,946
(1.07 %)
420 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 2022)
GCA_947461875.1
n/a n/a 13,735
(1.76 %)
28,993
(2.53 %)
n/a 43.15
(99.99 %)
0
(0 %)
424
(0.01 %)
188
(100.00 %)
585,276
(12.89 %)
291,289
(6.10 %)
6,474,027
(23.66 %)
0
(0 %)
312,204
(2.16 %)
54,851
(4.05 %)
31,757
(1.50 %)
421 white-throated dipper (primary hap 2023)
GCA_963662255.1
n/a n/a 12,856
(1.79 %)
23,827
(2.25 %)
n/a 42.82
(99.99 %)
0
(0 %)
658
(0.01 %)
278
(100.00 %)
431,536
(3.38 %)
345,533
(10.59 %)
5,840,462
(26.59 %)
1
(0.00 %)
617,894
(3.85 %)
29,711
(3.56 %)
21,555
(1.20 %)
422 white-throated dipper (primary hap 2023)
GCF_963662255.1
29,618
(3.60 %)
n/a 12,854
(1.79 %)
23,825
(2.25 %)
n/a 42.82
(99.99 %)
0
(0 %)
658
(0.01 %)
277
(100.00 %)
431,531
(3.38 %)
345,532
(10.59 %)
5,840,421
(26.59 %)
1
(0.00 %)
617,892
(3.85 %)
29,711
(3.56 %)
21,555
(1.20 %)
423 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1
40,430
(1.81 %)
n/a 17,575
(1.21 %)
21,880
(1.35 %)
47,496
(1.55 %)
39.81
(99.57 %)
0
(0 %)
1,010
(0.43 %)
147
(100.00 %)
2,846,063
(18.57 %)
1,252,362
(3.89 %)
13,776,063
(46.50 %)
14
(0.00 %)
1,059,317
(2.87 %)
24,589
(0.78 %)
20,877
(0.55 %)
424 white-tufted-ear marmoset (mCalJac1 2021)
GCF_011100555.1
104,419
(4.84 %)
n/a 21,801
(1.88 %)
21,467
(1.27 %)
n/a 40.92
(99.52 %)
0
(0 %)
1,165
(0.48 %)
1,233
(100.00 %)
5,036,591
(47.71 %)
842,846
(3.26 %)
15,161,534
(38.08 %)
2
(0.00 %)
1,256,018
(2.62 %)
37,603
(0.93 %)
34,471
(0.83 %)
425 whooping crane (bGruAme1 2023)
GCF_028858705.1
55,408
(5.57 %)
n/a 13,574
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
0
(0 %)
262
(0.37 %)
930
(100.00 %)
616,300
(10.57 %)
211,558
(2.90 %)
6,785,192
(22.11 %)
0
(0 %)
591,955
(1.89 %)
42,795
(4.66 %)
39,036
(2.34 %)
426 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1
n/a n/a 17,610
(1.00 %)
20,322
(1.04 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
276
(0.00 %)
62
(100.00 %)
3,295,935
(23.58 %)
389,907
(6.37 %)
19,525,382
(45.90 %)
0
(0 %)
1,020,287
(2.23 %)
31,831
(0.63 %)
26,588
(0.47 %)
427 yellow-throated sandgrouse
GCA_009769525.1
n/a n/a 12,697
(1.89 %)
25,289
(2.53 %)
n/a 42.40
(99.62 %)
0
(0 %)
242
(0.38 %)
89
(100.00 %)
510,633
(7.10 %)
213,742
(1.12 %)
6,627,716
(21.17 %)
0
(0 %)
113,802
(0.93 %)
28,848
(2.23 %)
25,343
(1.45 %)
428 yellowfin seabream
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
n/a 15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
84,160
(11.62 %)
42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
0
(0 %)
188,182
(2.04 %)
31,005
(1.79 %)
19,757
(1.03 %)
429 yellowfin tuna (2021)
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
n/a 15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
1
(0.00 %)
375,976
(3.80 %)
14,420
(0.88 %)
9,087
(0.42 %)
430 zebra finch (refseq 2021 Blue55 female)
GCF_003957565.2
49,311
(7.41 %)
n/a 12,747
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
0
(0 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
544,577
(9.57 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,748
(20.92 %)
3
(0.00 %)
312,137
(1.80 %)
29,202
(2.47 %)
22,084
(1.22 %)
431 zebra shark (sSteTig4 primary hap 2023)
GCF_030684315.1
58,105
(2.61 %)
n/a 12,291
(0.48 %)
16,769
(1.14 %)
n/a 43.41
(99.47 %)
0
(0 %)
1,159
(0.53 %)
835
(100.00 %)
8,087,543
(64.92 %)
798,373
(9.17 %)
14,838,773
(42.39 %)
4
(0.00 %)
2,946,119
(5.37 %)
45,284
(1.67 %)
14,105
(0.37 %)
432 zebrafish (WGS:CALUEM01 2022)
GCA_944039275.1
n/a n/a 18,065
(2.46 %)
44,526
(3.30 %)
n/a 37.08
(99.99 %)
0
(0 %)
381
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,804,769
(44.04 %)
954,645
(10.72 %)
8,694,743
(51.88 %)
4
(0.00 %)
1,207,649
(5.79 %)
44,936
(2.02 %)
11,380
(0.33 %)
433 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3
n/a n/a 15,036
(3.35 %)
40,234
(7.28 %)
n/a 40.66
(97.76 %)
0
(0 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
671,614
(20.98 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,040
(23.44 %)
0
(0 %)
175,881
(3.08 %)
12,807
(1.08 %)
8,703
(0.67 %)
TOTALS:total assembly count 433

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies