VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of primary assemblies)

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Abyssinian ground-hornbill (primary hap 2019)
GCA_009769605.1
n/a n/a 12,926
(1.90 %)
23,453
(2.26 %)
n/a 43.30
(99.29 %)
0
(0 %)
204
(0.71 %)
112
(100.00 %)
401,839
(5.61 %)
145,540
(0.78 %)
6,556,090
(19.22 %)
0
(0 %)
65,601
(0.62 %)
40,986
(3.65 %)
34,700
(2.27 %)
2 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024)
GCA_043250625.1
n/a n/a 15,735
(2.44 %)
50,184
(6.16 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
0
(0 %)
471
(0.01 %)
203
(100.00 %)
1,781,283
(37.65 %)
444,047
(7.93 %)
4,765,080
(37.01 %)
6
(0.00 %)
706,869
(5.97 %)
39,918
(2.01 %)
18,319
(0.92 %)
3 adder (hap1 2024)
GCA_964194415.1
n/a n/a 13,898
(1.18 %)
20,039
(1.94 %)
n/a 41.09
(99.99 %)
1
(0.00 %)
1,057
(0.01 %)
480
(100.00 %)
3,740,180
(50.44 %)
792,731
(6.25 %)
7,621,640
(45.94 %)
0
(0 %)
n/a 116,506
(4.68 %)
23,244
(0.88 %)
4 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1
57,514
(4.49 %)
n/a 14,340
(1.37 %)
20,053
(2.31 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
0
(0 %)
30
(0.00 %)
27
(100.00 %)
832,937
(4.17 %)
474,203
(4.04 %)
7,020,288
(38.29 %)
2
(0.00 %)
631,733
(3.50 %)
94,745
(2.70 %)
19,879
(0.76 %)
5 African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank)
GCA_011762505.2
n/a n/a 19,637
(1.95 %)
19,610
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
5,399,465
(42.90 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
2
(0.00 %)
979,697
(2.05 %)
17,767
(0.51 %)
15,566
(0.42 %)
6 African hunting dog (LycPic1hap2 2024)
GCA_040955705.1
n/a n/a 19,463
(1.58 %)
20,378
(1.42 %)
n/a 41.30
(100.00 %)
1
(0.00 %)
91
(0.00 %)
77
(100.00 %)
4,513,580
(32.16 %)
1,008,611
(2.91 %)
13,570,452
(33.71 %)
2
(0.00 %)
686,092
(1.77 %)
50,954
(2.21 %)
46,966
(1.51 %)
7 African ostrich (bStrCam1hap1 2024)
GCF_040807025.1
70,988
(5.69 %)
n/a 14,024
(1.60 %)
24,944
(1.95 %)
n/a 44.34
(100.00 %)
0
(0 %)
116
(0.00 %)
262
(100.00 %)
710,321
(8.33 %)
473,161
(7.22 %)
5,692,215
(24.23 %)
1
(0.00 %)
627,732
(4.53 %)
46,493
(8.90 %)
36,805
(2.48 %)
8 African savanna elephant (hap2 2023 refseq)
GCF_030014295.1
64,034
(3.35 %)
n/a 18,980
(1.10 %)
21,593
(1.06 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
0
(0 %)
231
(0.10 %)
879
(100.00 %)
4,426,749
(29.95 %)
832,904
(4.08 %)
16,118,888
(49.47 %)
1
(0.00 %)
1,082,957
(2.38 %)
62,314
(1.49 %)
23,783
(0.48 %)
9 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1
n/a n/a 19,086
(1.55 %)
22,040
(1.52 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,182
(0.01 %)
1,182
(0.01 %)
1,369
(99.99 %)
3,846,728
(31.78 %)
639,852
(2.90 %)
11,937,936
(38.98 %)
24
(0.00 %)
819,376
(2.67 %)
75,377
(2.21 %)
66,761
(1.68 %)
10 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1
n/a n/a 18,980
(1.50 %)
22,394
(1.50 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
326
(100.00 %)
3,896,863
(31.56 %)
659,711
(4.74 %)
11,945,162
(40.81 %)
3
(0.00 %)
979,504
(2.79 %)
76,769
(2.57 %)
66,591
(1.63 %)
11 Amazon manatee (hap2 2025)
GCA_046562895.1
n/a n/a 18,949
(1.23 %)
21,655
(1.08 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
294
(0.00 %)
401
(100.00 %)
6,218,266
(57.31 %)
470,437
(3.04 %)
15,241,157
(48.91 %)
1
(0.00 %)
714,873
(1.68 %)
37,124
(0.86 %)
30,784
(0.66 %)
12 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1
60,799
(4.33 %)
n/a 14,383
(0.98 %)
18,600
(1.45 %)
n/a 45.01
(99.30 %)
0
(0 %)
161
(0.70 %)
195
(100.00 %)
3,322,624
(43.19 %)
478,208
(1.77 %)
12,316,424
(32.01 %)
0
(0 %)
334,854
(1.31 %)
49,792
(2.45 %)
29,504
(1.51 %)
13 American beaver (hap1 2025)
GCA_047511655.1
n/a n/a 19,828
(1.45 %)
20,376
(1.31 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
1
(0.00 %)
181
(0.00 %)
503
(100.00 %)
4,030,880
(35.35 %)
566,770
(2.63 %)
14,198,970
(35.24 %)
9
(0.00 %)
640,099
(2.12 %)
24,454
(0.96 %)
23,257
(0.88 %)
14 American flamingo (primary hap 2019)
GCA_009819775.1
n/a n/a 13,100
(1.79 %)
23,372
(2.04 %)
n/a 43.27
(99.31 %)
0
(0 %)
280
(0.69 %)
90
(100.00 %)
538,004
(7.73 %)
183,346
(0.79 %)
7,056,270
(20.92 %)
0
(0 %)
91,554
(0.80 %)
52,012
(5.96 %)
50,946
(3.06 %)
15 American mink (hap1 2024)
GCA_964106545.1
n/a n/a 19,203
(1.43 %)
22,174
(1.33 %)
n/a 42.39
(99.98 %)
0
(0 %)
2,957
(0.02 %)
435
(100.00 %)
4,188,829
(30.04 %)
802,295
(5.81 %)
14,041,290
(37.98 %)
19
(0.00 %)
1,190,442
(3.02 %)
65,430
(2.64 %)
54,362
(1.78 %)
16 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1
45,008
(1.93 %)
n/a 17,997
(1.35 %)
23,185
(1.49 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
0
(0 %)
432
(0.00 %)
5,864
(100.00 %)
4,126,248
(43.60 %)
628,344
(15.71 %)
11,100,962
(42.69 %)
18
(0.00 %)
1,888,430
(5.34 %)
60,350
(1.67 %)
30,970
(1.18 %)
17 American shad (primary hap 2021)
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
n/a 16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
76,974
(8.55 %)
43.18
(99.45 %)
0
(0 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
14
(0.00 %)
934,014
(6.61 %)
42,699
(2.23 %)
25,608
(1.23 %)
18 amphioxus (hap2 2024 genbank)
GCA_035083965.1
n/a n/a 5,217
(0.97 %)
41,736
(12.73 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
0
(0 %)
103
(0.00 %)
34
(100.00 %)
128,505
(1.65 %)
182,123
(8.03 %)
2,157,899
(27.45 %)
0
(0 %)
274,077
(4.65 %)
44,261
(5.21 %)
29,041
(2.94 %)
19 Andian cavefish (hap1 2023 refseq)
GCF_030014385.1
42,881
(5.97 %)
n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,939
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
20 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024)
GCA_043748645.1
n/a n/a 18,528
(1.65 %)
22,359
(1.64 %)
n/a 42.89
(100.00 %)
6
(0.00 %)
88
(0.00 %)
44
(100.00 %)
3,531,044
(35.70 %)
555,304
(2.07 %)
11,439,853
(36.03 %)
0
(0 %)
663,932
(1.99 %)
102,112
(3.75 %)
92,727
(2.81 %)
21 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq)
GCF_003957555.1
31,091
(4.24 %)
n/a 12,257
(1.95 %)
14,633
(2.35 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
0
(0 %)
429
(1.52 %)
159
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,055
(1.51 %)
6,092,276
(20.84 %)
0
(0 %)
152,103
(1.27 %)
17,130
(1.48 %)
15,125
(1.04 %)
22 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1
n/a n/a 16,678
(0.56 %)
151,361
(4.03 %)
n/a 44.57
(99.91 %)
0
(0 %)
15,113
(0.09 %)
5,983
(100.00 %)
12,251,532
(51.73 %)
3,521,157
(17.69 %)
10,051,020
(68.37 %)
71
(0.00 %)
5,101,423
(13.15 %)
494,595
(10.52 %)
74,823
(1.04 %)
23 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1
n/a n/a 17,342
(1.44 %)
78,914
(5.48 %)
n/a 43.57
(99.96 %)
0
(0 %)
3,179
(0.04 %)
1,901
(100.00 %)
5,980,457
(37.18 %)
1,633,782
(21.76 %)
6,279,725
(52.83 %)
12
(0.00 %)
2,013,978
(10.83 %)
104,688
(3.57 %)
33,790
(1.15 %)
24 Arabian camel (paternal hap 2024 refseq)
GCF_036321535.1
62,940
(3.46 %)
n/a 18,078
(1.66 %)
21,071
(1.56 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
0
(0 %)
195
(0.00 %)
171
(100.00 %)
3,040,467
(29.22 %)
343,480
(10.93 %)
11,796,955
(33.50 %)
2
(0.00 %)
1,611,842
(4.73 %)
55,427
(1.61 %)
47,478
(1.18 %)
25 Arctic char (CBP00131 primary hap 2024)
GCA_036784965.1
n/a n/a 22,376
(1.44 %)
97,559
(4.71 %)
n/a 43.37
(99.97 %)
3,235
(0.03 %)
3,235
(0.03 %)
4,404
(99.97 %)
999,920
(4.22 %)
1,630,911
(26.08 %)
7,875,105
(58.08 %)
17
(0.00 %)
1,400,966
(4.23 %)
70,947
(2.59 %)
16,782
(0.35 %)
26 Arctic ground squirrel (hap1 2024)
GCA_045843805.1
n/a n/a 20,255
(1.35 %)
21,401
(1.44 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
0
(0 %)
694
(0.00 %)
2,530
(100.00 %)
4,287,108
(25.85 %)
895,123
(5.96 %)
15,722,314
(36.45 %)
3
(0.00 %)
1,383,542
(4.24 %)
34,781
(0.82 %)
29,107
(0.60 %)
27 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1
n/a n/a 15,455
(2.53 %)
40,077
(4.90 %)
86,346
(8.45 %)
38.90
(99.98 %)
0
(0 %)
795
(0.02 %)
241
(100.00 %)
2,045,691
(38.70 %)
669,975
(11.72 %)
4,638,765
(42.07 %)
1
(0.00 %)
693,282
(5.96 %)
28,277
(1.93 %)
15,766
(0.94 %)
28 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1
50,315
(9.13 %)
n/a 16,526
(2.73 %)
38,780
(6.64 %)
72,662
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
0
(0 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
504,673
(3.06 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
0
(0 %)
157,330
(1.72 %)
88,517
(10.73 %)
67,281
(4.98 %)
29 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1
61,202
(2.60 %)
n/a 18,887
(1.13 %)
21,194
(1.06 %)
n/a 41.14
(99.90 %)
0
(0 %)
126
(0.10 %)
64
(100.00 %)
4,358,470
(31.27 %)
663,094
(4.56 %)
16,261,778
(48.66 %)
1
(0.00 %)
851,540
(1.93 %)
69,120
(1.32 %)
23,319
(0.49 %)
30 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1
n/a n/a 18,931
(1.76 %)
19,988
(1.37 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
0
(0 %)
92
(0.00 %)
193
(100.00 %)
3,632,286
(38.21 %)
350,074
(2.22 %)
14,785,531
(30.90 %)
1
(0.00 %)
254,432
(0.91 %)
36,699
(1.70 %)
36,659
(1.49 %)
31 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924715.1
54,426
(12.09 %)
n/a 15,720
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
0
(0 %)
468
(0.01 %)
119
(100.00 %)
1,608,682
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,078
(27.80 %)
3
(0.00 %)
390,196
(3.88 %)
14,488
(0.90 %)
9,706
(0.46 %)
32 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1
51,642
(11.92 %)
n/a 14,055
(2.62 %)
36,761
(8.42 %)
68,438
(9.50 %)
45.64
(96.48 %)
0
(0 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
790,946
(10.54 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
4
(0.00 %)
741,285
(7.34 %)
97,133
(7.82 %)
51,623
(3.50 %)
33 Atlantic hagfish (primary hap 2024)
GCA_964187855.1
n/a n/a 6,662
(0.20 %)
45,484
(2.63 %)
n/a 44.32
(99.97 %)
0
(0 %)
4,412
(0.03 %)
4,004
(100.00 %)
1,698,449
(3.61 %)
2,644,659
(27.70 %)
7,620,145
(74.29 %)
43
(0.00 %)
n/a 331,404
(12.87 %)
49,019
(0.82 %)
34 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
n/a 14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
69,662
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
0
(0 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
0
(0 %)
240,110
(3.16 %)
31,325
(2.25 %)
20,749
(1.34 %)
35 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2
n/a n/a 15,262
(2.42 %)
51,857
(6.86 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
222
(0.00 %)
153
(100.00 %)
1,454,219
(18.25 %)
384,609
(4.72 %)
4,338,083
(32.80 %)
5
(0.00 %)
449,712
(4.53 %)
56,553
(3.08 %)
20,550
(1.04 %)
36 Atlantic mackerel (primary hap 2023 refseq)
GCF_963691925.1
34,357
(8.10 %)
n/a 15,289
(2.56 %)
43,205
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
665
(100.00 %)
1,496,240
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,726
(29.93 %)
9
(0.00 %)
555,074
(5.00 %)
13,308
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
37 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1
60,922
(2.51 %)
n/a 12,544
(0.38 %)
28,250
(1.22 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,648
(0.01 %)
2,989
(100.00 %)
8,579,099
(49.81 %)
831,222
(15.75 %)
21,718,178
(51.79 %)
9
(0.00 %)
4,445,369
(7.00 %)
105,821
(2.42 %)
35,197
(0.42 %)
38 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024)
GCA_964270905.1
n/a n/a 18,773
(1.50 %)
21,069
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1
(0.00 %)
1,034
(0.01 %)
900
(100.00 %)
3,975,427
(35.64 %)
1,054,000
(10.27 %)
12,281,095
(41.92 %)
6
(0.00 %)
2,009,438
(5.51 %)
79,762
(4.08 %)
42,028
(1.04 %)
39 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
n/a 14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
0
(0 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
1
(0.00 %)
4,597,115
(10.42 %)
78,364
(2.73 %)
45,620
(1.05 %)
40 Australian ruff (RE-2024a hap2 2024)
GCA_042242135.1
n/a n/a 15,534
(2.50 %)
39,464
(5.26 %)
n/a 39.77
(100.00 %)
0
(0 %)
98
(0.00 %)
552
(100.00 %)
498,493
(3.22 %)
271,314
(7.61 %)
4,161,752
(38.16 %)
2
(0.00 %)
436,316
(4.99 %)
9,637
(0.93 %)
6,725
(0.31 %)
41 axolotl (Mex_15411 2024)
GCF_040938575.1
96,841
(0.40 %)
n/a 18,564
(0.07 %)
184,527
(1.17 %)
n/a 46.34
(100.00 %)
0
(0 %)
2,095
(0.00 %)
221
(100.00 %)
27,951,551
(67.11 %)
8,561,025
(9.70 %)
2,316
(100.00 %)
25
(0.00 %)
1,448,410
(0.36 %)
2,452,305
(5.31 %)
417,603
(0.63 %)
42 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1
48,592
(12.09 %)
n/a 15,140
(2.66 %)
43,304
(6.14 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
815
(0.02 %)
815
(0.02 %)
946
(99.98 %)
1,221,797
(30.10 %)
290,736
(7.79 %)
4,164,799
(30.34 %)
4
(0.00 %)
525,920
(5.43 %)
17,126
(0.94 %)
10,131
(0.54 %)
43 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 refseq)
GCF_036971685.1
36,326
(4.04 %)
n/a 13,317
(1.60 %)
25,993
(2.05 %)
n/a 43.83
(99.41 %)
0
(0 %)
219
(0.59 %)
452
(100.00 %)
700,166
(13.18 %)
457,543
(13.85 %)
4,522,973
(31.73 %)
2
(0.00 %)
1,089,421
(5.57 %)
42,686
(7.00 %)
31,415
(1.62 %)
44 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
n/a 15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
0
(0 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
1
(0.00 %)
297,814
(3.49 %)
15,089
(0.96 %)
9,304
(0.55 %)
45 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1
n/a n/a 15,122
(1.44 %)
65,809
(4.50 %)
n/a 41.23
(99.74 %)
0
(0 %)
293
(0.26 %)
331
(100.00 %)
2,545,429
(50.53 %)
451,939
(5.50 %)
5,807,705
(42.18 %)
0
(0 %)
863,582
(6.37 %)
94,695
(3.92 %)
37,528
(1.27 %)
46 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1
n/a n/a 31,876
(3.30 %)
85,063
(5.65 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
0
(0 %)
108
(0.00 %)
92
(100.00 %)
4,839,533
(52.47 %)
646,636
(4.57 %)
8,240,279
(42.13 %)
2
(0.00 %)
569,819
(3.17 %)
71,384
(3.04 %)
22,137
(0.56 %)
47 barn swallow (v3 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.2
41,925
(5.13 %)
n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
0
(0 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
0
(0 %)
237,661
(1.56 %)
36,548
(2.85 %)
29,760
(1.66 %)
48 basking shark (sCetMax3.hap1.1 2024)
GCA_964194155.1
n/a n/a 13,757
(0.41 %)
22,690
(1.04 %)
n/a 44.49
(99.99 %)
0
(0 %)
2,778
(0.01 %)
5,088
(100.00 %)
6,693,687
(65.70 %)
1,238,350
(12.60 %)
21,698,294
(51.34 %)
20
(0.00 %)
5,335,615
(7.60 %)
113,759
(1.90 %)
28,476
(0.65 %)
49 beardfish (hap1 2025)
GCA_047511565.1
n/a n/a 15,938
(3.00 %)
52,921
(7.52 %)
n/a 43.38
(99.98 %)
0
(0 %)
752
(0.02 %)
327
(100.00 %)
993,554
(11.81 %)
755,389
(11.75 %)
3,469,352
(30.25 %)
8
(0.00 %)
770,561
(6.90 %)
68,008
(5.51 %)
40,885
(2.43 %)
50 Bellinger river turtle (v1 BRST_UC0152H_USYD 2024)
GCA_040894355.1
n/a n/a 14,732
(1.14 %)
18,988
(1.77 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
0
(0 %)
57
(0.00 %)
129
(100.00 %)
1,130,950
(11.22 %)
213,212
(1.80 %)
11,049,280
(26.48 %)
1
(0.00 %)
312,478
(1.26 %)
53,923
(2.09 %)
34,762
(1.11 %)
51 Bellinger river turtle (v2 BRST_UC0152H_USYD 2025)
GCA_040894355.2
n/a n/a 14,713
(1.14 %)
18,959
(1.77 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
1
(0.00 %)
77
(0.00 %)
110
(100.00 %)
1,130,167
(11.21 %)
213,193
(1.80 %)
11,049,207
(26.48 %)
1
(0.00 %)
311,436
(1.26 %)
53,921
(2.09 %)
34,762
(1.11 %)
52 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1
46,266
(2.61 %)
n/a 18,620
(1.80 %)
21,271
(1.72 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
48
(100.00 %)
3,041,145
(25.08 %)
904,075
(3.80 %)
10,530,666
(37.05 %)
0
(0 %)
647,994
(2.05 %)
77,605
(3.68 %)
62,105
(2.31 %)
53 bilby (mMagLag1 2024)
GCA_037893015.1
n/a n/a 18,686
(0.72 %)
17,238
(0.81 %)
n/a 37.35
(99.66 %)
0
(0 %)
4,431
(0.34 %)
609
(100.00 %)
6,263,094
(27.34 %)
2,223,995
(5.89 %)
23,994,844
(43.69 %)
70
(0.01 %)
1,521,039
(3.02 %)
51,039
(3.47 %)
15,234
(0.24 %)
54 bird A.albertisi (hap1 2024)
GCA_039906565.1
n/a n/a 13,007
(1.87 %)
23,375
(2.27 %)
n/a 42.52
(99.99 %)
0
(0 %)
439
(0.01 %)
592
(100.00 %)
467,217
(6.83 %)
273,604
(2.43 %)
6,154,114
(21.83 %)
4
(0.00 %)
268,509
(1.94 %)
23,203
(2.12 %)
18,788
(1.00 %)
55 bird E.chinensis (hap2 2024)
GCA_039878825.1
n/a n/a 12,731
(2.42 %)
22,580
(2.63 %)
n/a 41.64
(99.99 %)
0
(0 %)
330
(0.01 %)
191
(100.00 %)
520,888
(5.33 %)
274,030
(2.07 %)
5,360,112
(20.48 %)
0
(0 %)
186,943
(1.97 %)
19,673
(2.18 %)
16,622
(1.40 %)
56 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024)
GCA_043290085.1
n/a n/a 20,713
(0.64 %)
21,469
(0.64 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
1
(0.00 %)
770
(0.00 %)
470
(100.00 %)
3,860,121
(14.52 %)
1,230,113
(2.81 %)
1,239
(100.00 %)
7
(0.00 %)
n/a 49,878
(0.73 %)
48,556
(0.69 %)
57 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1
n/a n/a 14,455
(2.06 %)
56,488
(6.31 %)
n/a 42.10
(99.99 %)
0
(0 %)
636
(0.01 %)
298
(100.00 %)
3,230,397
(55.09 %)
494,440
(10.43 %)
4,359,169
(40.46 %)
2
(0.00 %)
950,976
(6.99 %)
81,684
(4.81 %)
45,797
(2.02 %)
58 black rhinoceros (primary hap 2021 refseq)
GCF_020826845.1
56,255
(2.28 %)
n/a 18,774
(1.38 %)
22,348
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
0
(0 %)
215
(0.05 %)
1,076
(100.00 %)
4,200,390
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,693
(40.14 %)
2
(0.00 %)
984,722
(2.61 %)
43,525
(1.14 %)
33,963
(0.76 %)
59 black-capped chickadee (hap1 2023)
GCF_030490865.1
44,388
(4.96 %)
n/a 13,738
(1.81 %)
26,691
(2.34 %)
n/a 42.41
(99.92 %)
0
(0 %)
404
(0.08 %)
307
(100.00 %)
730,165
(12.91 %)
566,529
(6.51 %)
6,499,984
(24.36 %)
2
(0.00 %)
632,539
(3.23 %)
42,650
(2.59 %)
24,153
(1.20 %)
60 black-headed gull (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924245.1
46,133
(4.67 %)
n/a 13,243
(1.58 %)
24,048
(1.89 %)
n/a 44.66
(99.99 %)
0
(0 %)
462
(0.01 %)
728
(100.00 %)
516,346
(4.84 %)
268,169
(14.83 %)
5,880,218
(31.31 %)
1
(0.00 %)
746,091
(4.07 %)
45,313
(4.92 %)
37,373
(1.57 %)
61 black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq)
GCF_028500815.1
51,115
(5.11 %)
n/a 13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
0
(0 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
8
(0.00 %)
651,837
(3.67 %)
45,318
(4.71 %)
36,668
(1.67 %)
62 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1
n/a n/a 15,043
(2.96 %)
50,860
(7.54 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
366
(0.01 %)
109
(100.00 %)
1,210,142
(29.44 %)
340,820
(9.19 %)
2,986,750
(29.89 %)
0
(0 %)
547,550
(6.92 %)
52,010
(4.20 %)
28,373
(1.72 %)
63 blackcap (primary hap 2019 refseq)
GCF_009819655.1
31,610
(4.74 %)
n/a 12,379
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
0
(0 %)
413
(1.12 %)
190
(100.00 %)
582,016
(10.36 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,626
(19.76 %)
0
(0 %)
190,212
(1.30 %)
26,838
(2.34 %)
22,667
(1.33 %)
64 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1
n/a n/a 17,486
(2.97 %)
46,833
(5.41 %)
n/a 38.79
(99.99 %)
0
(0 %)
720
(0.01 %)
413
(100.00 %)
2,165,269
(36.18 %)
490,692
(17.84 %)
4,251,333
(47.54 %)
10
(0.00 %)
1,058,863
(8.47 %)
42,744
(2.37 %)
19,312
(0.98 %)
65 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1
47,540
(2.07 %)
n/a 19,041
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
0
(0 %)
97
(0.03 %)
74
(100.00 %)
3,964,038
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,229
(41.78 %)
1
(0.00 %)
1,795,618
(5.01 %)
70,851
(1.80 %)
37,949
(0.93 %)
66 blonde ray (primary hap 2023)
GCA_963514005.1
n/a n/a 11,900
(0.54 %)
27,568
(1.55 %)
n/a 44.98
(99.98 %)
0
(0 %)
2,269
(0.02 %)
1,647
(100.00 %)
8,972,805
(66.20 %)
1,061,811
(8.11 %)
11,599,498
(58.72 %)
6
(0.00 %)
2,430,580
(6.13 %)
278,499
(6.42 %)
59,922
(2.12 %)
67 blue jay (hap1 2024)
GCA_046129655.1
n/a n/a 13,064
(1.75 %)
25,241
(2.27 %)
n/a 43.65
(99.99 %)
0
(0 %)
393
(0.01 %)
316
(100.00 %)
727,985
(19.18 %)
342,327
(5.00 %)
5,822,377
(25.13 %)
2
(0.00 %)
387,058
(3.06 %)
40,586
(3.99 %)
25,543
(1.21 %)
68 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2
58,750
(2.71 %)
n/a 19,162
(1.80 %)
20,576
(1.41 %)
36,291
(1.99 %)
40.88
(98.91 %)
0
(0 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,870
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,384
(34.60 %)
4
(0.00 %)
422,171
(1.33 %)
67,032
(1.73 %)
46,602
(1.41 %)
69 blue whiting (primary hap 2024)
GCA_964030765.1
n/a n/a 13,097
(2.93 %)
55,097
(8.76 %)
n/a 45.82
(99.88 %)
0
(0 %)
3,055
(0.12 %)
3,832
(100.00 %)
1,337,604
(32.27 %)
749,185
(17.27 %)
2,363,606
(35.06 %)
7
(0.00 %)
596,931
(7.20 %)
78,815
(8.25 %)
42,300
(3.48 %)
70 blue-and-yellow macaw (hap1 2023)
GCA_028858755.1
n/a n/a 12,919
(1.77 %)
22,770
(2.15 %)
n/a 42.69
(99.92 %)
0
(0 %)
107
(0.08 %)
246
(100.00 %)
711,670
(17.55 %)
242,430
(5.04 %)
5,545,074
(24.84 %)
0
(0 %)
506,592
(3.20 %)
25,153
(2.06 %)
19,988
(1.21 %)
71 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2
n/a n/a 14,499
(1.97 %)
51,213
(5.47 %)
n/a 38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
442
(100.00 %)
731,731
(4.21 %)
471,623
(4.92 %)
5,974,055
(42.88 %)
0
(0 %)
455,138
(4.01 %)
29,052
(1.48 %)
14,673
(0.63 %)
72 Boeseman's rainbowfish (primary hap 2021)
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
n/a 15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
0
(0 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
1
(0.00 %)
441,845
(3.68 %)
18,525
(1.10 %)
10,661
(0.59 %)
73 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1
n/a n/a 16,964
(1.77 %)
67,673
(5.93 %)
n/a 42.61
(99.97 %)
28
(0.00 %)
1,785
(0.03 %)
979
(100.00 %)
4,285,965
(30.73 %)
1,222,431
(20.69 %)
6,105,881
(46.99 %)
11
(0.00 %)
1,356,343
(8.48 %)
73,543
(3.28 %)
32,534
(1.37 %)
74 bonti-bonti (primary hap 2022)
GCA_933228915.1
n/a n/a 14,929
(1.93 %)
55,343
(5.90 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
0
(0 %)
1,329
(0.03 %)
146
(100.00 %)
998,246
(14.90 %)
443,155
(22.40 %)
4,319,947
(40.01 %)
2
(0.00 %)
1,529,147
(9.19 %)
34,018
(4.16 %)
15,066
(0.86 %)
75 Bornean orangutan (v2 AG05252 primary hap 2024 refseq)
GCF_028885625.2
92,658
(2.98 %)
n/a 20,708
(1.74 %)
21,361
(1.14 %)
n/a 40.88
(99.75 %)
0
(0 %)
8
(0.25 %)
26
(100.00 %)
5,544,151
(54.41 %)
1,072,960
(9.60 %)
16,187,641
(42.16 %)
0
(0 %)
2,505,849
(4.22 %)
43,604
(1.09 %)
29,685
(0.76 %)
76 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1
n/a n/a 18,247
(1.61 %)
22,673
(1.83 %)
n/a 41.12
(99.99 %)
205
(0.00 %)
775
(0.01 %)
835
(100.00 %)
2,918,285
(18.64 %)
868,090
(5.77 %)
9,427,604
(40.78 %)
2
(0.00 %)
1,601,923
(4.79 %)
27,049
(1.25 %)
22,545
(0.76 %)
77 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1
n/a n/a 18,667
(1.46 %)
20,817
(1.26 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
284
(0.00 %)
903
(100.00 %)
4,004,895
(35.23 %)
925,158
(12.15 %)
11,999,784
(42.65 %)
3
(0.00 %)
1,841,091
(5.04 %)
63,428
(1.55 %)
38,329
(0.93 %)
78 bowfin (hap1 2024 refseq)
GCF_036373705.1
55,474
(7.85 %)
n/a 13,848
(1.83 %)
27,055
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
97
(0.00 %)
389
(100.00 %)
953,492
(13.69 %)
387,699
(7.91 %)
4,552,359
(37.72 %)
4
(0.00 %)
613,799
(6.38 %)
46,301
(2.99 %)
26,437
(1.15 %)
79 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1
n/a n/a 17,865
(1.56 %)
76,506
(5.59 %)
n/a 42.15
(99.96 %)
0
(0 %)
2,704
(0.04 %)
676
(100.00 %)
6,391,921
(39.62 %)
1,227,487
(11.70 %)
6,669,558
(49.73 %)
11
(0.00 %)
1,301,019
(7.83 %)
76,828
(3.96 %)
26,877
(0.90 %)
80 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1
n/a n/a 19,039
(1.66 %)
21,660
(1.59 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
20
(0.00 %)
148
(100.00 %)
3,805,818
(31.80 %)
640,446
(2.50 %)
11,793,353
(36.15 %)
1
(0.00 %)
609,574
(1.94 %)
68,896
(2.40 %)
57,812
(1.49 %)
81 Brazilian merganser (hap1 2024)
GCA_036873955.1
n/a n/a 13,202
(1.80 %)
24,416
(2.14 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
0
(0 %)
327
(0.00 %)
569
(100.00 %)
832,469
(7.06 %)
531,644
(7.37 %)
6,294,434
(28.49 %)
0
(0 %)
618,430
(3.89 %)
34,786
(3.61 %)
27,553
(1.39 %)
82 Brown anole (maternal hap 2024 refseq)
GCF_037176765.1
41,782
(3.73 %)
n/a 14,463
(1.05 %)
20,186
(1.84 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
0
(0 %)
191
(0.00 %)
29
(100.00 %)
1,456,556
(7.33 %)
1,162,200
(6.85 %)
9,275,690
(46.71 %)
0
(0 %)
1,512,000
(5.23 %)
44,738
(1.08 %)
17,370
(0.40 %)
83 brown argus butterfly (refseq 2021)
GCF_905147365.1
23,611
(6.61 %)
n/a 4,734
(1.03 %)
24,265
(6.80 %)
24,237
(6.16 %)
36.86
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
25
(100.00 %)
264,358
(2.90 %)
144,234
(3.35 %)
2,650,845
(48.44 %)
0
(0 %)
205,173
(4.19 %)
35,431
(4.56 %)
15,409
(1.89 %)
84 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1
n/a n/a 19,138
(1.72 %)
20,370
(1.54 %)
n/a 43.08
(99.99 %)
0
(0 %)
1,237
(0.01 %)
65
(100.00 %)
3,201,470
(26.24 %)
957,903
(4.27 %)
10,687,995
(39.65 %)
8
(0.00 %)
881,577
(2.81 %)
60,671
(2.39 %)
52,889
(1.71 %)
85 budgerigar (maternal Z 2020 refseq)
GCF_012275295.1
32,026
(4.32 %)
n/a 13,239
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
26,324
(3.11 %)
41.80
(99.72 %)
0
(0 %)
284
(0.28 %)
864
(100.00 %)
538,374
(10.19 %)
279,504
(3.12 %)
5,874,531
(22.08 %)
1
(0.00 %)
324,793
(2.05 %)
21,155
(1.61 %)
17,590
(1.10 %)
86 butterfish (primary hap 2021)
GCF_020382885.2
52,828
(14.10 %)
n/a 15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
0
(0 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
1
(0.00 %)
96,783
(1.70 %)
15,574
(1.13 %)
10,807
(0.72 %)
87 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1
n/a n/a 14,403
(2.47 %)
61,860
(7.37 %)
n/a 43.15
(99.96 %)
0
(0 %)
1,625
(0.04 %)
525
(100.00 %)
959,651
(12.16 %)
517,137
(13.14 %)
3,775,081
(32.47 %)
9
(0.00 %)
784,659
(7.82 %)
81,881
(6.68 %)
50,317
(3.10 %)
88 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2
70,801
(3.05 %)
n/a 20,915
(1.77 %)
20,179
(1.40 %)
44,926
(2.10 %)
41.40
(99.23 %)
0
(0 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,525,652
(43.65 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,648
(33.76 %)
2
(0.00 %)
495,451
(1.44 %)
51,899
(1.50 %)
48,201
(1.32 %)
89 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2
50,142
(2.69 %)
n/a 18,273
(1.65 %)
19,264
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
0
(0 %)
842
(0.12 %)
54
(100.00 %)
5,011,165
(43.72 %)
904,525
(1.75 %)
13,467,551
(34.19 %)
0
(0 %)
572,384
(1.64 %)
66,799
(2.48 %)
60,482
(2.02 %)
90 Caribbean electric ray (hap1 2024 refseq)
GCF_036971445.1
77,919
(2.56 %)
n/a 11,965
(0.44 %)
20,833
(1.25 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,443
(0.01 %)
595
(100.00 %)
4,902,644
(34.96 %)
1,040,891
(17.82 %)
16,403,243
(54.79 %)
2
(0.00 %)
1,425,690
(2.88 %)
113,936
(1.69 %)
22,323
(0.31 %)
91 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1
n/a n/a 11,692
(0.46 %)
19,961
(1.22 %)
n/a 42.79
(99.99 %)
0
(0 %)
1,507
(0.01 %)
445
(100.00 %)
4,781,152
(36.16 %)
876,063
(14.65 %)
16,060,040
(52.49 %)
7
(0.00 %)
2,994,548
(6.81 %)
101,598
(1.64 %)
21,263
(0.33 %)
92 carmine bee-eater (primary hap 2019)
GCA_009819595.1
n/a n/a 12,740
(1.82 %)
28,031
(2.77 %)
n/a 42.88
(99.47 %)
0
(0 %)
269
(0.53 %)
109
(100.00 %)
556,926
(7.87 %)
213,180
(1.09 %)
6,641,077
(21.58 %)
0
(0 %)
132,076
(1.14 %)
30,881
(2.41 %)
23,550
(1.23 %)
93 chaffinch (primary hap 2023)
GCA_963513975.1
n/a n/a 12,708
(1.72 %)
24,978
(2.26 %)
n/a 44.06
(99.99 %)
7
(0.00 %)
573
(0.01 %)
467
(100.00 %)
495,590
(3.15 %)
493,628
(13.34 %)
6,163,336
(28.37 %)
2
(0.00 %)
729,875
(4.06 %)
39,042
(6.25 %)
24,111
(1.21 %)
94 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
n/a 14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
0
(0 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
0
(0 %)
452,303
(4.62 %)
20,453
(1.39 %)
10,802
(0.65 %)
95 chevron butterflyfish (hap1 2024 genbank)
GCA_039877785.1
n/a n/a 15,255
(2.94 %)
48,037
(7.05 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
0
(0 %)
49
(0.00 %)
37
(100.00 %)
465,710
(3.82 %)
254,015
(3.62 %)
3,657,999
(23.28 %)
1
(0.00 %)
186,571
(2.20 %)
30,971
(2.02 %)
18,241
(1.05 %)
96 chevron butterflyfish (hap1 2024 refseq)
GCF_039877785.1
38,623
(10.62 %)
n/a 15,604
(3.07 %)
48,037
(7.05 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
0
(0 %)
49
(0.00 %)
36
(100.00 %)
1,224,649
(24.57 %)
254,015
(3.62 %)
3,657,926
(23.28 %)
1
(0.00 %)
186,571
(2.20 %)
30,971
(2.02 %)
21,708
(1.31 %)
97 chimpanzee (v2 AG18354 primary hap 2024 refseq)
GCF_028858775.2
134,453
(3.48 %)
n/a 20,832
(1.77 %)
22,081
(1.17 %)
n/a 40.57
(99.84 %)
0
(0 %)
5
(0.16 %)
26
(100.00 %)
5,408,047
(49.94 %)
1,021,513
(10.88 %)
15,986,329
(42.21 %)
0
(0 %)
3,108,843
(5.27 %)
49,727
(1.09 %)
29,844
(0.76 %)
98 Chinese pangolin (hap1 2023)
GCF_030020395.1
71,445
(2.98 %)
n/a 18,379
(1.34 %)
21,837
(1.29 %)
n/a 41.07
(99.77 %)
0
(0 %)
383
(0.23 %)
661
(100.00 %)
3,318,871
(34.65 %)
618,193
(3.68 %)
12,009,669
(39.02 %)
8
(0.00 %)
1,132,160
(3.87 %)
47,708
(1.22 %)
34,214
(0.79 %)
99 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1
34,390
(6.95 %)
n/a 15,348
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
0
(0 %)
1,572
(0.08 %)
360
(100.00 %)
1,669,322
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,373
(32.38 %)
3
(0.00 %)
927,880
(7.23 %)
16,290
(0.85 %)
8,913
(0.42 %)
100 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3
n/a n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
67,055
(11.68 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
633,883
(15.28 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,008
(21.31 %)
0
(0 %)
169,790
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
101 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1
81,219
(3.62 %)
n/a 18,300
(1.65 %)
20,361
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
0
(0 %)
181
(0.06 %)
33
(100.00 %)
4,224,269
(34.84 %)
992,668
(2.08 %)
13,618,866
(34.42 %)
3
(0.00 %)
647,739
(1.89 %)
67,830
(2.45 %)
58,781
(1.98 %)
102 coelacanth (fLatCha1 primary hap 2024)
GCF_037176945.1
40,046
(2.75 %)
n/a 13,820
(0.63 %)
17,285
(1.40 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
154
(0.00 %)
197
(100.00 %)
2,064,326
(2.75 %)
1,047,267
(3.01 %)
15,613,479
(54.45 %)
1
(0.00 %)
1,146,128
(3.27 %)
140,027
(2.34 %)
11,143
(0.16 %)
103 Columbretes wall lizard (hap1.1 2025)
GCA_965112155.1
n/a n/a 14,276
(1.31 %)
20,158
(2.24 %)
n/a 44.06
(99.99 %)
0
(0 %)
921
(0.01 %)
290
(100.00 %)
871,508
(4.31 %)
539,525
(6.79 %)
7,116,593
(40.00 %)
2
(0.00 %)
754,520
(4.30 %)
97,685
(3.45 %)
20,472
(0.73 %)
104 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1
n/a n/a 13,266
(1.21 %)
16,750
(1.98 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
0
(0 %)
372
(0.00 %)
350
(100.00 %)
782,672
(6.46 %)
434,795
(2.20 %)
7,788,697
(37.04 %)
0
(0 %)
506,831
(2.74 %)
28,089
(0.98 %)
14,987
(0.51 %)
105 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1
67,207
(3.31 %)
n/a 18,766
(1.77 %)
20,528
(1.42 %)
35,852
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
0
(0 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,069,115
(46.17 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,891
(35.29 %)
1
(0.00 %)
629,903
(1.85 %)
65,551
(1.90 %)
43,136
(1.35 %)
106 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1
n/a n/a 18,114
(2.63 %)
66,549
(6.11 %)
n/a 38.62
(99.99 %)
7
(0.00 %)
685
(0.01 %)
215
(100.00 %)
2,639,968
(48.46 %)
659,243
(7.55 %)
5,950,358
(40.47 %)
3
(0.00 %)
963,199
(6.67 %)
62,337
(3.61 %)
19,726
(0.79 %)
107 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1
37,674
(1.80 %)
n/a 18,653
(0.80 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,116
(38.90 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,306
(40.56 %)
0
(0 %)
455,717
(1.17 %)
17,762
(0.38 %)
13,986
(0.24 %)
108 common buzzard (bButBut1.hap1.1 2024)
GCA_964188355.1
n/a n/a 13,512
(1.75 %)
24,417
(2.13 %)
n/a 43.17
(99.99 %)
2
(0.00 %)
471
(0.01 %)
546
(100.00 %)
439,018
(4.62 %)
244,865
(6.73 %)
6,778,625
(23.94 %)
2
(0.00 %)
258,825
(1.67 %)
43,400
(4.80 %)
34,405
(1.72 %)
109 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq)
GCF_017976375.1
50,206
(6.30 %)
n/a 13,190
(1.85 %)
24,284
(2.29 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
0
(0 %)
296
(0.42 %)
150
(100.00 %)
566,161
(11.56 %)
310,430
(2.36 %)
6,712,791
(21.76 %)
0
(0 %)
326,395
(1.83 %)
25,268
(1.73 %)
20,672
(1.05 %)
110 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1
36,211
(8.34 %)
n/a 14,995
(2.62 %)
50,844
(6.89 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
0
(0 %)
275
(0.01 %)
338
(100.00 %)
1,186,799
(32.17 %)
307,864
(16.34 %)
3,562,802
(35.00 %)
2
(0.00 %)
481,477
(5.21 %)
41,657
(2.72 %)
22,630
(1.29 %)
111 common dace (hap1.1 2025)
GCA_965113295.1
n/a n/a 18,484
(2.43 %)
69,931
(5.95 %)
n/a 39.03
(99.98 %)
0
(0 %)
1,202
(0.02 %)
876
(100.00 %)
938,148
(4.74 %)
828,944
(9.34 %)
5,833,273
(42.65 %)
14
(0.00 %)
987,377
(7.00 %)
78,182
(4.87 %)
26,569
(1.15 %)
112 common goldeneye (primary hap 2024)
GCA_964059595.1
n/a n/a 13,374
(1.90 %)
24,308
(2.28 %)
n/a 42.07
(99.99 %)
6
(0.00 %)
454
(0.01 %)
544
(100.00 %)
751,865
(6.78 %)
400,294
(3.80 %)
6,184,781
(24.97 %)
4
(0.00 %)
321,327
(2.30 %)
35,712
(2.66 %)
29,614
(1.59 %)
113 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1
45,869
(6.34 %)
n/a 14,279
(1.46 %)
19,710
(2.38 %)
n/a 44.05
(99.99 %)
0
(0 %)
683
(0.01 %)
48
(100.00 %)
4,128,183
(45.62 %)
513,318
(3.73 %)
7,172,928
(37.61 %)
7
(0.00 %)
477,389
(3.08 %)
92,858
(2.90 %)
22,863
(0.95 %)
114 common moorhen (bGalChl1.hap1.1 2024)
GCA_964237585.1
n/a n/a 12,976
(1.68 %)
23,758
(2.12 %)
n/a 44.70
(99.99 %)
27
(0.00 %)
603
(0.01 %)
845
(100.00 %)
499,923
(5.57 %)
250,214
(7.38 %)
6,350,978
(25.68 %)
9
(0.00 %)
537,046
(3.31 %)
27,790
(2.32 %)
21,858
(1.17 %)
115 common myna (bArcTri1 primary hap 2023)
GCA_027559615.1
n/a n/a 12,560
(1.73 %)
23,740
(2.16 %)
n/a 42.32
(99.80 %)
0
(0 %)
435
(0.20 %)
455
(100.00 %)
395,254
(5.40 %)
937,774
(11.00 %)
6,145,808
(28.07 %)
2
(0.00 %)
825,681
(4.71 %)
32,293
(3.87 %)
21,576
(1.15 %)
116 common newt (primary hap 2024)
GCA_964263255.1
n/a n/a 17,972
(0.09 %)
229,830
(1.61 %)
n/a 45.06
(100.00 %)
0
(0 %)
4,030
(0.00 %)
15,265
(100.00 %)
4,807,454
(1.50 %)
10,258,109
(12.52 %)
19,295
(100.00 %)
27
(0.00 %)
3,799,915
(1.53 %)
2,684,793
(7.99 %)
2,631,420
(7.74 %)
117 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1
n/a n/a 17,216
(1.82 %)
19,202
(1.79 %)
n/a 42.55
(99.97 %)
0
(0 %)
1,546
(0.03 %)
323
(100.00 %)
2,953,532
(23.94 %)
805,142
(2.83 %)
9,964,846
(34.69 %)
0
(0 %)
446,836
(1.61 %)
57,295
(2.83 %)
54,882
(1.90 %)
118 common pochard (bAytFer1.hap1.1 2024)
GCA_964211825.1
n/a n/a 13,505
(1.83 %)
24,961
(2.21 %)
n/a 42.19
(99.99 %)
8
(0.00 %)
474
(0.01 %)
870
(100.00 %)
833,892
(8.17 %)
576,230
(8.04 %)
6,149,355
(27.84 %)
14
(0.00 %)
632,907
(3.94 %)
34,089
(2.69 %)
28,890
(1.45 %)
119 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1
55,359
(12.02 %)
n/a 14,844
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
242
(100.00 %)
1,149,243
(19.12 %)
342,238
(9.71 %)
3,906,753
(32.84 %)
2
(0.00 %)
440,509
(5.18 %)
27,772
(2.71 %)
15,561
(0.92 %)
120 common spadefoot toad (primary hap 2024 refseq)
GCF_036172605.1
42,170
(1.55 %)
n/a 14,560
(0.56 %)
46,435
(2.21 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
0
(0 %)
349
(0.00 %)
159
(100.00 %)
1,677,374
(3.51 %)
3,229,434
(13.31 %)
15,027,049
(51.43 %)
12
(0.00 %)
3,799,232
(9.03 %)
282,389
(3.86 %)
79,263
(0.96 %)
121 common swift (primary hap 2021 refseq)
GCF_020740795.1
39,986
(4.95 %)
n/a 12,292
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
0
(0 %)
256
(0.16 %)
110
(100.00 %)
499,695
(6.70 %)
199,749
(1.12 %)
6,354,003
(21.19 %)
1
(0.00 %)
113,872
(0.91 %)
20,393
(1.74 %)
16,313
(0.88 %)
122 common tern (primary hap 2019)
GCA_009819605.1
n/a n/a 13,103
(1.81 %)
24,044
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.16 %)
0
(0 %)
205
(0.84 %)
123
(100.00 %)
570,312
(7.91 %)
216,895
(1.04 %)
7,043,151
(20.98 %)
1
(0.00 %)
112,065
(1.02 %)
45,694
(3.73 %)
41,720
(2.13 %)
123 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1
45,085
(1.10 %)
n/a 14,240
(0.38 %)
46,470
(1.68 %)
37,594
(0.91 %)
44.49
(99.80 %)
0
(0 %)
4,199
(0.20 %)
1,306
(100.00 %)
1,658,204
(1.79 %)
3,099,513
(13.49 %)
19,236,510
(62.70 %)
18
(0.00 %)
6,217,888
(10.17 %)
539,919
(4.45 %)
78,985
(0.67 %)
124 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022)
GCA_022682495.2
n/a n/a 18,311
(1.71 %)
19,456
(1.59 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
0
(0 %)
615
(0.01 %)
573
(100.00 %)
2,767,071
(28.35 %)
431,575
(3.90 %)
11,286,853
(32.63 %)
37
(0.00 %)
330,061
(1.50 %)
71,506
(2.50 %)
45,001
(1.26 %)
125 common wall lizard (hap1 2024)
GCA_964188315.1
n/a n/a 14,322
(1.36 %)
19,700
(2.31 %)
n/a 44.23
(99.99 %)
0
(0 %)
827
(0.01 %)
185
(100.00 %)
868,785
(4.15 %)
544,999
(4.79 %)
7,097,077
(38.69 %)
10
(0.00 %)
713,068
(4.14 %)
120,725
(3.71 %)
20,707
(0.76 %)
126 common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024)
GCA_964263955.1
n/a n/a 29,103
(1.36 %)
124,287
(3.94 %)
n/a 43.87
(99.96 %)
0
(0 %)
5,995
(0.04 %)
11,150
(100.00 %)
1,655,140
(4.68 %)
1,843,550
(17.63 %)
9,367,555
(61.56 %)
26
(0.00 %)
4,094,607
(11.22 %)
112,654
(3.84 %)
19,454
(0.27 %)
127 common yellowthroat (primary hap 2019)
GCA_009764595.1
n/a n/a 11,741
(1.82 %)
22,382
(2.29 %)
n/a 42.01
(98.73 %)
0
(0 %)
1,479
(1.27 %)
278
(100.00 %)
476,049
(6.38 %)
367,108
(3.16 %)
6,576,957
(20.43 %)
0
(0 %)
333,263
(2.08 %)
25,004
(2.02 %)
20,494
(1.18 %)
128 convict blenny (primary hap 2021)
GCA_020510985.1
n/a n/a n/a 134,417
(1.50 %)
n/a 44.52
(99.13 %)
0
(0 %)
2,580
(0.87 %)
512
(100.00 %)
9,062,541
(49.33 %)
2,097,650
(2.66 %)
3,092
(99.13 %)
5
(0.00 %)
3,135,536
(6.36 %)
568,042
(10.14 %)
0
(0.00 %)
129 copperband butterflyfish (primary hap 2021)
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
n/a 15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
61,755
(8.99 %)
42.57
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
1
(0.00 %)
158,516
(2.15 %)
29,106
(1.85 %)
19,302
(1.11 %)
130 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1
n/a n/a 14,740
(2.91 %)
45,483
(7.26 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
0
(0 %)
1,379
(0.04 %)
395
(100.00 %)
936,676
(24.41 %)
306,192
(9.29 %)
3,495,456
(28.75 %)
2
(0.00 %)
463,889
(5.20 %)
29,142
(2.35 %)
16,622
(1.09 %)
131 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1
140,657
(1.12 %)
n/a 15,461
(0.24 %)
54,344
(1.07 %)
n/a 45.66
(99.76 %)
0
(0 %)
2,699
(0.24 %)
3,127
(100.00 %)
3,521,281
(2.88 %)
5,902,115
(18.63 %)
5,826
(99.76 %)
23
(0.00 %)
n/a 990,274
(4.84 %)
952,582
(4.53 %)
132 Cory's shearwater (bCalBor7.hap1.1 2024)
GCA_964195595.1
n/a n/a 13,703
(1.71 %)
26,310
(2.10 %)
n/a 43.29
(99.99 %)
59
(0.00 %)
525
(0.01 %)
414
(100.00 %)
479,045
(5.03 %)
336,466
(4.95 %)
5,910,298
(24.89 %)
4
(0.00 %)
487,078
(3.38 %)
48,046
(4.19 %)
40,252
(2.00 %)
133 crab-eating macaque (582-1 2024)
GCF_037993035.1
100,896
(3.93 %)
n/a 20,528
(1.79 %)
21,741
(1.19 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 21
(100.00 %)
5,357,498
(52.90 %)
1,017,190
(8.58 %)
15,617,344
(40.74 %)
0
(0 %)
2,146,978
(4.41 %)
94,759
(1.56 %)
30,541
(0.76 %)
134 crested bigscale (hap1.1 2025)
GCA_964638095.1
n/a n/a 17,935
(1.34 %)
104,307
(6.12 %)
n/a 44.53
(99.96 %)
142
(0.00 %)
2,975
(0.04 %)
2,930
(100.00 %)
5,608,839
(57.44 %)
1,825,932
(20.35 %)
6,375,759
(51.18 %)
16
(0.00 %)
2,419,022
(10.51 %)
149,374
(4.78 %)
37,609
(1.23 %)
135 crested eagle (hap2 2024)
GCA_045345515.1
n/a n/a 13,656
(1.49 %)
27,669
(2.31 %)
n/a 44.30
(100.00 %)
0
(0 %)
164
(0.00 %)
544
(100.00 %)
765,672
(26.88 %)
431,376
(14.19 %)
5,221,201
(33.63 %)
0
(0 %)
1,019,182
(5.63 %)
63,565
(10.48 %)
31,804
(1.32 %)
136 Cretan wall lizard (primary hap 2023)
GCA_951804945.1
n/a n/a 14,249
(1.37 %)
19,304
(2.27 %)
n/a 43.87
(100.00 %)
4
(0.00 %)
47
(0.00 %)
55
(100.00 %)
882,564
(4.30 %)
511,174
(3.24 %)
7,094,363
(38.65 %)
2
(0.00 %)
586,225
(3.38 %)
117,222
(3.18 %)
18,707
(0.71 %)
137 Crete spiny mouse (2024)
GCA_964271855.1
n/a n/a 19,467
(1.76 %)
18,734
(1.43 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
113
(100.00 %)
4,718,848
(32.83 %)
1,327,449
(6.80 %)
12,893,458
(34.03 %)
0
(0 %)
1,009,136
(2.74 %)
21,236
(0.61 %)
17,412
(0.44 %)
138 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1
90,094
(6.75 %)
n/a 29,386
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
0
(0 %)
832
(0.01 %)
277
(100.00 %)
3,481,382
(45.81 %)
802,773
(6.54 %)
8,190,783
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,003,533
(5.09 %)
83,696
(3.82 %)
26,039
(0.81 %)
139 cuckoo roller (hap2 2023)
GCA_034619465.1
n/a n/a 13,044
(1.66 %)
30,275
(2.65 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
17
(0.00 %)
271
(0.00 %)
295
(100.00 %)
603,184
(8.76 %)
324,082
(7.37 %)
6,147,876
(25.10 %)
0
(0 %)
633,504
(3.50 %)
44,051
(8.95 %)
36,565
(2.19 %)
140 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1
51,190
(10.37 %)
n/a 15,144
(2.59 %)
43,207
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.98 %)
0
(0 %)
570
(0.02 %)
324
(100.00 %)
1,435,625
(29.39 %)
330,276
(12.54 %)
4,196,830
(33.83 %)
1
(0.00 %)
689,646
(5.54 %)
19,310
(1.01 %)
11,155
(0.57 %)
141 cunner (primary hap 2021)
GCA_020745685.1
n/a n/a 15,192
(2.74 %)
43,564
(6.38 %)
n/a 41.31
(99.41 %)
0
(0 %)
283
(0.59 %)
64
(100.00 %)
1,419,667
(30.50 %)
243,024
(4.81 %)
4,334,690
(27.65 %)
2
(0.00 %)
297,510
(2.95 %)
17,974
(1.06 %)
9,021
(0.52 %)
142 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024)
GCA_043880285.1
n/a n/a 18,610
(1.67 %)
19,098
(1.39 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
7
(0.00 %)
334
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,077,286
(41.85 %)
754,689
(2.64 %)
11,873,386
(36.16 %)
1
(0.00 %)
1,326,571
(3.53 %)
48,137
(1.04 %)
24,623
(0.71 %)
143 Dalmatian pelican (primary hap 2023)
GCA_030463565.1
n/a n/a 13,457
(1.72 %)
25,299
(2.10 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
0
(0 %)
390
(0.01 %)
311
(100.00 %)
660,747
(14.47 %)
294,268
(5.22 %)
6,840,996
(24.63 %)
5
(0.00 %)
318,407
(2.04 %)
39,705
(5.14 %)
36,802
(1.98 %)
144 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
n/a 15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
0
(0 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
4
(0.00 %)
383,250
(3.60 %)
32,973
(1.28 %)
9,764
(0.33 %)
145 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1
64,558
(3.32 %)
n/a 19,141
(1.72 %)
22,133
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
0
(0 %)
1,099
(0.01 %)
121
(100.00 %)
3,040,232
(24.03 %)
796,911
(6.38 %)
10,478,180
(38.84 %)
9
(0.00 %)
756,429
(2.76 %)
64,920
(2.51 %)
57,806
(1.88 %)
146 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2
n/a n/a 16,559
(3.78 %)
58,823
(8.66 %)
74,128
(10.47 %)
43.69
(99.18 %)
0
(0 %)
464
(0.82 %)
461
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,284
(4.61 %)
2,948,738
(28.79 %)
0
(0 %)
306,165
(4.31 %)
64,661
(9.49 %)
52,867
(4.93 %)
147 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1
50,318
(3.53 %)
n/a 15,109
(1.08 %)
19,280
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.92 %)
0
(0 %)
141
(0.08 %)
76
(100.00 %)
4,088,064
(46.33 %)
403,943
(1.72 %)
11,014,504
(33.74 %)
0
(0 %)
407,696
(1.71 %)
110,838
(2.71 %)
30,093
(0.82 %)
148 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1
96,734
(3.71 %)
n/a 20,135
(1.64 %)
20,871
(1.38 %)
56,772
(3.19 %)
41.50
(100.00 %)
585
(0.00 %)
585
(0.00 %)
2,782
(100.00 %)
20,264,827
(43.87 %)
1,152,879
(3.22 %)
13,784,690
(34.30 %)
9
(0.00 %)
1,226,639
(2.84 %)
53,518
(2.23 %)
49,021
(1.97 %)
149 Domestic goose (bAnsAns1.hap1.1 2024)
GCA_964211835.1
n/a n/a 13,401
(1.75 %)
24,999
(2.15 %)
n/a 43.53
(99.99 %)
0
(0 %)
930
(0.01 %)
819
(100.00 %)
685,992
(5.59 %)
452,303
(8.91 %)
5,976,185
(28.48 %)
16
(0.00 %)
797,996
(5.01 %)
43,672
(4.38 %)
36,919
(2.25 %)
150 dorado (hap2 2023)
GCA_030463535.1
n/a n/a 16,799
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
0
(0 %)
726
(0.85 %)
104
(100.00 %)
2,693,928
(34.60 %)
805,807
(14.65 %)
5,615,731
(36.69 %)
2
(0.00 %)
1,425,798
(8.96 %)
30,083
(1.31 %)
21,157
(0.81 %)
151 downy woodpecker (primary hap 2020)
GCF_014839835.1
25,483
(3.24 %)
n/a 12,410
(1.70 %)
22,416
(2.11 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
0
(0 %)
187
(0.34 %)
180
(100.00 %)
1,259,627
(26.52 %)
378,533
(3.38 %)
5,846,661
(32.04 %)
0
(0 %)
791,075
(4.25 %)
26,005
(1.75 %)
19,919
(1.16 %)
152 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1
n/a n/a 18,354
(1.22 %)
20,434
(1.08 %)
n/a 40.65
(100.00 %)
0
(0 %)
96
(0.00 %)
198
(100.00 %)
4,458,084
(33.00 %)
444,499
(1.79 %)
15,031,940
(47.42 %)
0
(0 %)
508,936
(1.29 %)
29,863
(0.83 %)
24,007
(0.54 %)
153 East African grey crowned-crane (primary hap 2020)
GCA_011004875.1
n/a n/a 13,276
(1.84 %)
25,393
(2.30 %)
n/a 42.38
(99.61 %)
0
(0 %)
144
(0.39 %)
105
(100.00 %)
548,862
(7.06 %)
187,966
(0.97 %)
7,004,597
(21.19 %)
0
(0 %)
102,622
(1.00 %)
36,626
(3.69 %)
36,347
(2.31 %)
154 Eastern black-eared wheatear (GR-GAL-2019-014 2023)
GCF_029582105.1
38,171
(5.79 %)
n/a 12,559
(1.96 %)
23,642
(2.48 %)
n/a 42.01
(99.99 %)
0
(0 %)
582
(0.01 %)
587
(100.00 %)
599,051
(9.46 %)
453,954
(3.77 %)
6,287,657
(20.75 %)
0
(0 %)
382,912
(2.31 %)
27,831
(2.52 %)
21,991
(1.27 %)
155 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1
n/a n/a 18,522
(1.26 %)
22,314
(1.28 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
0
(0 %)
316
(0.00 %)
99
(100.00 %)
3,699,683
(20.55 %)
935,350
(11.22 %)
13,112,318
(44.07 %)
1
(0.00 %)
n/a 99,224
(2.27 %)
68,695
(1.75 %)
156 eastern happy (primary hap 2024)
GCA_964374335.1
n/a n/a 15,554
(2.13 %)
55,328
(6.30 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
31
(100.00 %)
933,060
(24.43 %)
252,509
(4.84 %)
4,460,314
(32.70 %)
1
(0.00 %)
344,099
(4.07 %)
34,184
(2.09 %)
17,316
(0.94 %)
157 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5
n/a n/a 15,552
(2.29 %)
52,465
(6.26 %)
86,437
(9.40 %)
41.07
(99.87 %)
115
(0.00 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
1,309,350
(35.93 %)
217,916
(1.89 %)
4,547,434
(30.78 %)
2
(0.00 %)
212,425
(2.79 %)
33,005
(1.88 %)
15,205
(0.74 %)
158 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1
n/a n/a 13,413
(1.19 %)
18,038
(1.85 %)
n/a 44.58
(99.99 %)
553
(0.01 %)
553
(0.01 %)
771
(99.99 %)
1,003,504
(9.02 %)
621,617
(3.54 %)
8,327,948
(30.44 %)
3
(0.00 %)
583,206
(2.41 %)
117,734
(4.05 %)
30,498
(1.01 %)
159 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1
n/a n/a 13,882
(0.43 %)
35,323
(1.46 %)
n/a 46.78
(99.99 %)
0
(0 %)
1,745
(0.01 %)
1,002
(100.00 %)
1,769,293
(1.99 %)
2,023,109
(16.33 %)
16,148,710
(60.55 %)
22
(0.00 %)
5,852,023
(9.72 %)
618,204
(5.89 %)
74,394
(0.76 %)
160 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1
65,163
(4.76 %)
n/a 17,642
(2.07 %)
22,317
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
0
(0 %)
242
(1.41 %)
29
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,414
(1.02 %)
12,031,597
(26.52 %)
0
(0 %)
65,562
(0.33 %)
53,573
(4.84 %)
57,281
(4.47 %)
161 electric eel (fEleEle1 primary hap 2020)
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
n/a 15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
54,541
(8.42 %)
42.49
(98.20 %)
0
(0 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
1
(0.00 %)
629,918
(5.96 %)
44,501
(3.93 %)
34,390
(2.63 %)
162 elegant crested-tinamou (YG026_01 primary hap 2025)
GCA_047922985.1
n/a n/a 13,193
(1.91 %)
25,746
(2.48 %)
n/a 44.32
(100.00 %)
0
(0 %)
299
(0.00 %)
397
(100.00 %)
486,339
(4.61 %)
408,335
(8.96 %)
5,589,546
(25.37 %)
8
(0.00 %)
468,720
(3.29 %)
51,487
(9.83 %)
48,288
(3.36 %)
163 emu (hap1 2024)
GCF_036370855.1
54,479
(5.65 %)
n/a 13,972
(1.59 %)
25,695
(1.97 %)
n/a 43.79
(100.00 %)
0
(0 %)
129
(0.00 %)
271
(100.00 %)
713,839
(12.11 %)
418,774
(7.08 %)
5,668,105
(24.04 %)
2
(0.00 %)
825,273
(5.02 %)
51,137
(7.32 %)
43,488
(2.92 %)
164 emu (v2 ZJU1.0 2023)
GCA_016128335.2
n/a n/a 13,213
(1.74 %)
24,562
(2.10 %)
n/a 42.41
(99.99 %)
0
(0 %)
539
(0.01 %)
767
(100.00 %)
567,285
(7.79 %)
258,030
(2.59 %)
7,108,005
(19.16 %)
9
(0.00 %)
314,931
(1.79 %)
41,752
(6.24 %)
41,181
(3.35 %)
165 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1
43,156
(1.65 %)
n/a 12,749
(0.40 %)
19,519
(1.06 %)
n/a 42.76
(98.05 %)
0
(0 %)
3,716
(1.95 %)
1,962
(100.00 %)
9,420,365
(63.82 %)
935,037
(6.51 %)
20,660,566
(43.88 %)
0
(0 %)
2,903,280
(4.44 %)
41,682
(1.08 %)
16,895
(0.30 %)
166 ermine (2020)
GCF_009829155.1
74,332
(3.19 %)
n/a 18,855
(1.65 %)
20,667
(1.43 %)
44,584
(2.07 %)
41.56
(99.12 %)
0
(0 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,647,934
(41.44 %)
714,174
(1.30 %)
13,845,904
(33.42 %)
3
(0.01 %)
452,963
(1.26 %)
56,065
(2.25 %)
56,447
(2.07 %)
167 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1
57,138
(2.48 %)
n/a 19,265
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,487,951
(32.73 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,723
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,258
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
54,563
(1.83 %)
168 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap1.1 2024)
GCA_964273445.1
n/a n/a 13,292
(1.69 %)
25,387
(2.13 %)
n/a 41.80
(99.99 %)
0
(0 %)
696
(0.01 %)
2,451
(100.00 %)
489,065
(4.78 %)
331,025
(13.58 %)
6,196,233
(29.98 %)
13
(0.00 %)
727,368
(4.14 %)
37,567
(3.51 %)
32,763
(1.74 %)
169 Eurasian crane (hap1 2024)
GCA_964106855.1
n/a n/a 13,457
(1.70 %)
24,519
(2.05 %)
n/a 44.24
(99.99 %)
0
(0 %)
593
(0.01 %)
754
(100.00 %)
516,462
(4.57 %)
262,941
(8.12 %)
5,356,948
(26.79 %)
2
(0.00 %)
400,278
(3.09 %)
48,488
(7.36 %)
38,193
(2.16 %)
170 Eurasian curlew (hap1 2024)
GCA_964106895.1
n/a n/a 13,239
(1.66 %)
24,512
(2.02 %)
n/a 43.98
(99.99 %)
15
(0.00 %)
785
(0.01 %)
1,834
(100.00 %)
600,399
(6.45 %)
616,756
(7.75 %)
5,607,190
(28.35 %)
45
(0.00 %)
483,497
(3.48 %)
39,863
(3.53 %)
26,424
(1.08 %)
171 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1
n/a n/a 17,661
(3.01 %)
58,218
(6.54 %)
n/a 39.21
(99.98 %)
0
(0 %)
881
(0.02 %)
125
(100.00 %)
2,346,939
(44.27 %)
502,415
(11.23 %)
4,890,830
(40.45 %)
0
(0 %)
873,838
(6.63 %)
60,482
(4.22 %)
24,091
(1.23 %)
172 Eurasian nightjar (primary hap 2021)
GCA_907165065.1
n/a n/a 13,040
(1.86 %)
22,823
(2.21 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
153
(0.00 %)
121
(100.00 %)
595,803
(8.38 %)
248,128
(1.78 %)
6,744,611
(22.18 %)
2
(0.00 %)
193,177
(1.31 %)
24,805
(1.90 %)
20,997
(1.31 %)
173 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2
n/a n/a 21,309
(1.58 %)
21,026
(1.36 %)
33,465
(1.53 %)
40.08
(94.33 %)
0
(0 %)
1,177
(5.67 %)
639
(100.00 %)
4,677,412
(35.73 %)
704,218
(1.42 %)
14,992,063
(31.49 %)
5
(0.00 %)
419,661
(1.29 %)
48,159
(1.04 %)
45,470
(0.95 %)
174 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1
67,145
(2.95 %)
n/a 18,842
(1.54 %)
20,178
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
0
(0 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,259,294
(33.39 %)
713,721
(1.36 %)
13,626,048
(34.37 %)
1
(0.00 %)
695,796
(1.86 %)
57,073
(1.82 %)
47,446
(1.36 %)
175 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
n/a 19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
36,935
(2.27 %)
42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
5
(0.00 %)
518,667
(1.69 %)
19,000
(0.58 %)
16,851
(0.46 %)
176 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1
n/a n/a 18,028
(2.64 %)
64,206
(6.04 %)
n/a 38.73
(99.99 %)
0
(0 %)
588
(0.01 %)
106
(100.00 %)
2,649,943
(48.88 %)
666,129
(9.08 %)
5,751,610
(41.56 %)
5
(0.00 %)
1,113,756
(7.21 %)
58,471
(3.64 %)
19,602
(0.84 %)
177 European common frog (2021)
GCF_905171775.1
51,633
(1.57 %)
n/a 13,864
(0.46 %)
39,978
(1.88 %)
57,578
(1.85 %)
44.15
(99.36 %)
0
(0 %)
1,860
(0.64 %)
554
(100.00 %)
1,804,642
(3.42 %)
2,925,830
(9.39 %)
18,921,726
(55.43 %)
8
(0.00 %)
3,384,162
(6.05 %)
641,799
(7.66 %)
62,649
(0.67 %)
178 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1
54,631
(7.46 %)
n/a 17,072
(1.89 %)
34,801
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
0
(0 %)
1,009
(0.02 %)
380
(100.00 %)
761,522
(5.99 %)
913,306
(13.25 %)
5,767,879
(35.48 %)
3
(0.00 %)
1,603,437
(8.94 %)
120,990
(6.12 %)
81,342
(2.93 %)
179 European eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013347855.1
64,143
(9.57 %)
n/a 17,054
(2.22 %)
34,278
(5.56 %)
79,684
(7.37 %)
43.64
(99.61 %)
0
(0 %)
640
(0.40 %)
54
(100.00 %)
831,037
(5.48 %)
786,521
(8.15 %)
5,700,890
(27.40 %)
2
(0.00 %)
774,914
(5.14 %)
130,346
(8.19 %)
94,446
(4.12 %)
180 European flounder (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316205.1
48,969
(12.45 %)
n/a 14,751
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
108
(100.00 %)
1,160,781
(27.06 %)
251,983
(5.23 %)
3,353,086
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,298
(3.81 %)
37,129
(2.79 %)
27,431
(1.88 %)
181 European golden plover (primary hap 2021)
GCA_017639485.1
n/a n/a 12,984
(1.78 %)
22,854
(2.04 %)
n/a 42.70
(99.01 %)
0
(0 %)
268
(0.99 %)
107
(100.00 %)
558,587
(8.35 %)
180,400
(0.83 %)
7,132,381
(21.18 %)
0
(0 %)
102,461
(0.84 %)
40,661
(3.41 %)
37,600
(2.03 %)
182 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1
n/a n/a 20,236
(1.71 %)
19,368
(1.32 %)
n/a 40.05
(99.99 %)
0
(0 %)
2,020
(0.02 %)
894
(100.00 %)
4,892,811
(36.49 %)
1,223,387
(18.26 %)
11,907,631
(42.51 %)
10
(0.00 %)
4,679,739
(9.91 %)
17,423
(0.62 %)
15,264
(0.35 %)
183 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1
24,643
(2.02 %)
n/a 14,238
(1.16 %)
21,782
(2.17 %)
n/a 44.68
(99.77 %)
0
(0 %)
153
(0.23 %)
591
(100.00 %)
1,174,615
(6.99 %)
436,937
(2.95 %)
8,308,817
(39.80 %)
0
(0 %)
824,335
(3.45 %)
83,089
(2.82 %)
33,674
(0.93 %)
184 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1
69,556
(3.13 %)
n/a 18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
25
(100.00 %)
4,237,791
(30.90 %)
792,897
(2.69 %)
13,417,195
(36.59 %)
0
(0 %)
894,272
(2.55 %)
67,132
(2.54 %)
51,333
(1.62 %)
185 European mole (hap1 2024)
GCA_964194135.1
n/a n/a 18,085
(1.69 %)
19,509
(1.58 %)
n/a 42.08
(99.99 %)
0
(0 %)
1,056
(0.01 %)
464
(100.00 %)
2,569,380
(23.32 %)
565,465
(2.18 %)
10,506,666
(33.68 %)
42
(0.00 %)
704,393
(2.62 %)
46,367
(3.09 %)
42,313
(2.40 %)
186 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1
n/a n/a 18,336
(1.50 %)
20,807
(1.41 %)
n/a 42.38
(99.98 %)
0
(0 %)
2,250
(0.02 %)
477
(100.00 %)
4,096,160
(31.55 %)
707,337
(3.28 %)
13,715,382
(34.73 %)
10
(0.00 %)
626,861
(1.84 %)
61,481
(4.29 %)
56,462
(1.94 %)
187 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1
46,468
(10.51 %)
n/a 14,818
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
0
(0 %)
1,072
(0.03 %)
355
(100.00 %)
476,314
(3.63 %)
520,729
(13.27 %)
3,283,360
(33.55 %)
2
(0.00 %)
525,277
(6.36 %)
47,050
(4.45 %)
21,878
(1.29 %)
188 European pond turtle (hap1 2023 refseq)
GCF_028017835.1
27,890
(1.81 %)
n/a 14,802
(0.99 %)
19,772
(1.60 %)
n/a 44.74
(99.86 %)
0
(0 %)
148
(0.14 %)
106
(100.00 %)
1,526,737
(12.44 %)
460,562
(2.12 %)
11,130,580
(35.42 %)
5
(0.00 %)
495,938
(2.08 %)
136,002
(2.92 %)
30,671
(0.72 %)
189 European river lamprey (primary hap 2024)
GCA_964198595.1
n/a n/a 7,757
(0.73 %)
36,797
(4.29 %)
n/a 49.25
(99.97 %)
0
(0 %)
1,795
(0.03 %)
1,497
(100.00 %)
657,405
(7.80 %)
1,165,422
(20.23 %)
4,931,883
(50.78 %)
4
(0.00 %)
2,442,653
(12.79 %)
149,123
(44.61 %)
116,679
(5.22 %)
190 European robin (primary hap 2021)
GCA_903797595.2
n/a n/a 12,344
(1.85 %)
23,934
(2.37 %)
n/a 42.10
(99.97 %)
0
(0 %)
990
(0.03 %)
1,119
(100.00 %)
532,973
(5.96 %)
401,820
(3.43 %)
6,320,210
(21.42 %)
0
(0 %)
338,954
(2.13 %)
30,391
(2.60 %)
21,664
(1.21 %)
191 European shag (primary hap 2023)
GCA_949628215.1
n/a n/a 13,203
(1.74 %)
22,959
(2.04 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
3
(0.00 %)
222
(0.00 %)
356
(100.00 %)
436,838
(4.84 %)
471,070
(3.20 %)
6,601,537
(22.79 %)
1
(0.00 %)
334,549
(2.25 %)
37,247
(3.95 %)
29,099
(1.42 %)
192 European shrew (primary hap 2023)
GCF_027595985.1
44,643
(2.60 %)
n/a 17,479
(1.26 %)
21,293
(1.37 %)
n/a 43.24
(99.46 %)
0
(0 %)
1,427
(0.54 %)
65
(100.00 %)
2,474,584
(15.18 %)
1,107,884
(3.28 %)
13,638,467
(41.72 %)
10
(0.00 %)
822,159
(2.15 %)
79,785
(2.86 %)
77,901
(2.13 %)
193 European smelt (primary hap 2023 refseq)
GCF_963692335.1
46,762
(14.07 %)
n/a 15,639
(3.79 %)
50,238
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
0
(0 %)
2,462
(0.10 %)
1,007
(100.00 %)
1,648,428
(31.34 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,793
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
194 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1
47,025
(2.69 %)
n/a 19,592
(1.78 %)
21,173
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
197
(0.00 %)
160
(100.00 %)
5,048,186
(44.12 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,053
(34.97 %)
4
(0.00 %)
954,164
(3.20 %)
20,725
(0.63 %)
18,727
(0.52 %)
195 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1
n/a n/a 16,181
(2.44 %)
63,544
(7.17 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
0
(0 %)
1,501
(0.04 %)
387
(100.00 %)
2,109,362
(31.42 %)
1,300,159
(14.91 %)
3,634,744
(35.44 %)
6
(0.00 %)
1,178,448
(8.78 %)
35,552
(1.87 %)
19,823
(1.00 %)
196 European starfish (2020)
GCF_902459465.1
26,326
(11.67 %)
n/a 4,121
(0.84 %)
21,080
(8.48 %)
23,775
(14.13 %)
38.76
(99.96 %)
0
(0 %)
471
(0.04 %)
150
(100.00 %)
131,898
(1.43 %)
159,226
(7.04 %)
2,504,013
(37.40 %)
12
(0.00 %)
310,360
(6.00 %)
15,392
(1.50 %)
7,483
(0.79 %)
197 European suslik (primary hap 2024)
GCA_964194105.1
n/a n/a 20,075
(1.28 %)
20,274
(1.19 %)
n/a 39.90
(99.99 %)
4
(0.00 %)
1,436
(0.01 %)
502
(100.00 %)
4,357,247
(31.78 %)
882,536
(12.27 %)
14,882,486
(41.66 %)
9
(0.00 %)
1,833,125
(4.49 %)
39,275
(0.88 %)
27,165
(0.54 %)
198 European turtle dove (v1.2 2021)
GCA_901699155.2
n/a n/a 12,391
(1.76 %)
23,333
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
0
(0 %)
940
(0.33 %)
311
(100.00 %)
550,895
(7.50 %)
227,532
(1.16 %)
6,767,530
(21.05 %)
4
(0.00 %)
181,526
(1.65 %)
34,682
(2.57 %)
30,656
(1.68 %)
199 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1
54,114
(2.24 %)
n/a 19,959
(1.65 %)
19,953
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
0
(0 %)
1,129
(0.01 %)
497
(100.00 %)
4,863,650
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,732
(40.58 %)
17
(0.00 %)
2,516,593
(5.37 %)
23,961
(0.53 %)
17,318
(0.36 %)
200 fallow deer (maternal hap SK-2024 2025)
GCA_048126745.1
n/a n/a 20,072
(1.51 %)
22,668
(1.37 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
65
(0.00 %)
147
(0.00 %)
1,369
(100.00 %)
4,623,335
(34.75 %)
475,143
(7.51 %)
13,000,703
(41.56 %)
1
(0.00 %)
2,295,952
(5.37 %)
112,581
(2.00 %)
41,372
(0.95 %)
201 false killer whale (hap1 2024 refseq)
GCF_039906515.1
75,958
(3.31 %)
n/a 18,718
(1.50 %)
20,982
(1.32 %)
n/a 42.08
(99.90 %)
0
(0 %)
123
(0.10 %)
438
(100.00 %)
3,958,926
(35.76 %)
1,002,329
(11.61 %)
12,193,061
(41.85 %)
3
(0.00 %)
1,441,777
(4.23 %)
79,158
(3.74 %)
41,701
(1.03 %)
202 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap1.1 2024)
GCA_964270895.1
n/a n/a 14,292
(1.37 %)
20,325
(2.33 %)
n/a 43.79
(99.99 %)
4
(0.00 %)
872
(0.01 %)
353
(100.00 %)
840,209
(4.04 %)
484,479
(4.00 %)
7,010,158
(37.94 %)
7
(0.00 %)
632,285
(3.51 %)
87,924
(2.61 %)
19,744
(0.76 %)
203 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1
38,238
(0.68 %)
n/a 15,452
(0.21 %)
47,500
(0.88 %)
n/a 38.98
(98.02 %)
0
(0 %)
7,009
(1.99 %)
2,467
(100.00 %)
4,258,941
(3.44 %)
7,150,261
(12.27 %)
9,476
(98.01 %)
3
(0.00 %)
n/a n/a n/a
204 flatback sea turtle (hap1 2025)
GCA_965152275.1
n/a 26,709
(2.00 %)
15,046
(1.09 %)
18,089
(1.57 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
2
(0.00 %)
171
(0.00 %)
43
(100.00 %)
4,516,775
(43.62 %)
319,645
(1.38 %)
10,785,223
(32.95 %)
3
(0.00 %)
442,908
(1.94 %)
52,168
(1.81 %)
27,004
(0.88 %)
205 Fleay's barred frog (hap1 2024)
GCA_038048845.1
n/a n/a 14,321
(0.67 %)
22,672
(1.51 %)
n/a 40.32
(99.87 %)
0
(0 %)
1,421
(0.13 %)
2,806
(100.00 %)
1,320,578
(5.87 %)
1,506,550
(13.49 %)
13,293,397
(46.37 %)
2
(0.00 %)
3,318,438
(8.11 %)
63,677
(0.85 %)
12,950
(0.19 %)
206 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
n/a 15,434
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
0
(0 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
0
(0 %)
227,442
(2.84 %)
24,130
(1.26 %)
11,082
(0.48 %)
207 Florida worm lizard (hap2 2023 refseq)
GCF_030035675.1
65,314
(3.47 %)
n/a 14,331
(0.90 %)
17,853
(1.51 %)
n/a 42.86
(99.72 %)
0
(0 %)
242
(0.28 %)
76
(100.00 %)
1,426,827
(7.17 %)
616,687
(2.63 %)
10,819,019
(45.31 %)
1
(0.00 %)
531,660
(2.36 %)
47,453
(1.03 %)
18,399
(0.42 %)
208 freshwater garfish (primary hap 2020)
GCA_014839995.1
n/a n/a 14,625
(2.57 %)
52,879
(6.72 %)
n/a 41.41
(98.98 %)
0
(0 %)
1,373
(1.02 %)
410
(100.00 %)
492,828
(4.29 %)
318,631
(5.94 %)
3,977,536
(27.41 %)
0
(0 %)
521,102
(4.91 %)
32,390
(2.33 %)
21,612
(1.34 %)
209 Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_902459505.1
54,713
(1.72 %)
n/a 14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,310,970
(1.64 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,802
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,977
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
210 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2
n/a n/a 14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
0
(0 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,331,879
(1.68 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,806
(52.85 %)
3
(0.00 %)
1,182,995
(2.68 %)
270,923
(4.52 %)
38,622
(0.50 %)
211 garden warbler (primary hap 2020)
GCA_014839755.1
n/a n/a 12,520
(1.95 %)
23,459
(2.46 %)
n/a 42.08
(99.82 %)
0
(0 %)
134
(0.18 %)
176
(100.00 %)
491,810
(6.09 %)
376,746
(2.55 %)
6,461,292
(20.23 %)
0
(0 %)
225,297
(1.39 %)
27,799
(2.40 %)
23,088
(1.32 %)
212 Geoffroy's bat (hap1.1 2025)
GCA_965115925.1
n/a n/a 19,320
(1.74 %)
21,940
(1.65 %)
n/a 42.55
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,540
(0.01 %)
404
(100.00 %)
3,707,500
(37.60 %)
733,107
(7.78 %)
10,515,474
(39.35 %)
11
(0.00 %)
903,956
(3.14 %)
60,200
(2.41 %)
51,657
(1.64 %)
213 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1
n/a n/a 14,151
(0.94 %)
23,338
(1.95 %)
n/a 45.15
(99.95 %)
0
(0 %)
118
(0.05 %)
160
(100.00 %)
1,232,693
(12.81 %)
332,737
(2.19 %)
11,907,298
(32.91 %)
3
(0.00 %)
284,469
(1.22 %)
40,660
(1.87 %)
25,990
(0.77 %)
214 giant manta (hap1 2023)
GCA_030028105.1
n/a n/a 12,432
(0.38 %)
24,821
(1.16 %)
n/a 43.26
(99.23 %)
0
(0 %)
1,810
(0.77 %)
4,715
(100.00 %)
7,913,208
(49.68 %)
969,352
(14.22 %)
20,235,210
(54.42 %)
17
(0.00 %)
4,636,724
(7.12 %)
110,678
(1.74 %)
30,504
(0.36 %)
215 giant South American river turtle (hap2 2024)
GCA_045364815.1
n/a n/a 14,571
(0.87 %)
18,363
(1.38 %)
n/a 44.25
(100.00 %)
0
(0 %)
224
(0.00 %)
725
(100.00 %)
1,243,321
(10.35 %)
434,716
(4.30 %)
12,200,714
(33.86 %)
2
(0.00 %)
769,881
(2.27 %)
51,411
(1.88 %)
16,569
(0.37 %)
216 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2
n/a n/a 15,752
(2.45 %)
56,395
(6.58 %)
n/a 41.94
(99.96 %)
0
(0 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
1,474,134
(29.50 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,691
(25.69 %)
0
(0 %)
355,475
(3.53 %)
47,327
(2.41 %)
29,914
(1.44 %)
217 golden eagle (v1.4 2021)
GCF_900496995.4
60,920
(5.98 %)
n/a 13,334
(1.84 %)
23,261
(2.12 %)
n/a 42.16
(99.58 %)
0
(0 %)
228
(0.42 %)
144
(100.00 %)
544,341
(5.93 %)
186,461
(0.80 %)
7,090,610
(20.01 %)
1
(0.00 %)
68,348
(0.66 %)
38,495
(3.10 %)
35,039
(1.94 %)
218 golden parakeet (hap1 2024)
GCA_045345405.1
n/a n/a 13,156
(1.63 %)
23,633
(1.97 %)
n/a 43.34
(100.00 %)
0
(0 %)
173
(0.00 %)
216
(100.00 %)
515,745
(6.36 %)
283,125
(12.39 %)
4,289,389
(30.87 %)
1
(0.00 %)
868,953
(4.79 %)
27,612
(1.85 %)
20,022
(1.11 %)
219 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1
36,997
(1.96 %)
n/a 20,006
(1.91 %)
19,132
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
0
(0 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,785,907
(32.61 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,958,061
(32.33 %)
0
(0 %)
684,879
(1.84 %)
20,760
(0.59 %)
18,457
(0.52 %)
220 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2
57,442
(3.17 %)
n/a 14,852
(1.00 %)
18,125
(1.49 %)
31,841
(1.80 %)
44.14
(98.71 %)
0
(0 %)
562
(1.29 %)
383
(100.00 %)
1,630,271
(13.86 %)
387,796
(2.00 %)
11,572,827
(33.36 %)
0
(0 %)
474,978
(1.73 %)
71,687
(2.29 %)
21,793
(0.54 %)
221 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1
n/a n/a 14,094
(1.03 %)
17,875
(1.65 %)
n/a 41.62
(99.95 %)
0
(0 %)
28
(0.05 %)
30
(100.00 %)
1,100,228
(6.21 %)
423,695
(1.33 %)
11,521,828
(32.55 %)
2
(0.00 %)
258,014
(1.05 %)
62,978
(2.00 %)
24,755
(0.81 %)
222 gray seal (hap1.1 2025)
GCA_964656455.1
n/a n/a 19,291
(1.73 %)
20,301
(1.41 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
0
(0 %)
1,130
(0.01 %)
171
(100.00 %)
4,245,582
(34.81 %)
600,624
(2.16 %)
13,240,803
(34.28 %)
4
(0.00 %)
615,950
(1.85 %)
56,932
(1.78 %)
54,064
(1.60 %)
223 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1
73,383
(3.04 %)
n/a 16,637
(0.72 %)
16,036
(0.85 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
0
(0 %)
2,255
(0.89 %)
13
(100.00 %)
5,562,359
(25.40 %)
1,096,620
(2.60 %)
22,322,748
(43.37 %)
13
(0.00 %)
793,648
(1.81 %)
28,894
(0.57 %)
22,987
(0.42 %)
224 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1
58,884
(2.46 %)
n/a 20,752
(1.49 %)
21,107
(1.31 %)
32,732
(1.45 %)
40.06
(99.98 %)
0
(0 %)
1,824
(0.02 %)
752
(100.00 %)
4,605,578
(34.50 %)
728,192
(1.65 %)
15,467,412
(33.91 %)
2
(0.00 %)
504,786
(1.54 %)
51,878
(1.11 %)
49,715
(1.03 %)
225 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2
n/a n/a 19,474
(1.55 %)
20,394
(1.40 %)
72,806
(4.12 %)
41.49
(100.00 %)
0
(0 %)
166
(0.00 %)
82
(100.00 %)
4,550,524
(31.76 %)
1,063,944
(3.96 %)
13,588,117
(34.74 %)
23
(0.00 %)
1,048,956
(2.49 %)
51,996
(2.15 %)
47,971
(1.53 %)
226 great cormorant (primary hap 2024 refseq)
GCF_963921805.1
46,253
(5.46 %)
n/a 13,432
(1.76 %)
23,419
(2.08 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
0
(0 %)
493
(0.01 %)
350
(100.00 %)
556,733
(10.18 %)
303,277
(3.45 %)
6,599,550
(22.65 %)
1
(0.00 %)
355,894
(2.29 %)
38,340
(5.45 %)
31,912
(1.57 %)
227 great fruit-eating bat (hap1 2024)
GCA_038363145.1
n/a n/a 18,022
(1.56 %)
19,824
(1.51 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
419
(100.00 %)
2,827,417
(26.82 %)
371,479
(4.97 %)
11,603,093
(34.64 %)
1
(0.00 %)
522,672
(1.87 %)
71,574
(2.28 %)
54,020
(1.50 %)
228 great fruit-eating bat (v2 hap1 2024)
GCA_038363095.2
n/a n/a 18,051
(1.56 %)
19,955
(1.51 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
0
(0 %)
45
(0.00 %)
487
(100.00 %)
2,841,143
(26.67 %)
379,430
(5.52 %)
11,651,542
(35.11 %)
0
(0 %)
569,322
(2.01 %)
72,337
(2.76 %)
54,165
(1.48 %)
229 great potoo (primary hap 2020 refseq)
GCF_013368605.1
33,115
(3.89 %)
n/a 13,120
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
0
(0 %)
243
(0.49 %)
190
(100.00 %)
610,506
(15.46 %)
210,373
(1.13 %)
6,501,918
(23.95 %)
0
(0 %)
244,223
(1.92 %)
35,788
(2.78 %)
29,280
(1.65 %)
230 great scallop (2019)
GCF_902652985.1
46,811
(9.29 %)
n/a 4,090
(0.36 %)
32,743
(7.09 %)
n/a 36.65
(99.92 %)
0
(0 %)
1,827
(0.08 %)
3,983
(100.00 %)
281,310
(1.71 %)
706,978
(26.84 %)
5,249,556
(32.64 %)
0
(0 %)
2,449,994
(15.30 %)
13,101
(0.87 %)
7,209
(0.42 %)
231 great white shark (primary hap 2021)
GCF_017639515.1
49,865
(1.46 %)
n/a 13,010
(0.37 %)
19,263
(0.92 %)
46,152
(1.30 %)
45.21
(99.55 %)
0
(0 %)
2,645
(0.45 %)
719
(100.00 %)
1,046,023
(4.00 %)
1,584,100
(21.25 %)
23,278,563
(52.42 %)
11
(0.00 %)
8,687,289
(11.05 %)
77,021
(1.94 %)
14,712
(0.15 %)
232 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1
n/a n/a 16,553
(3.15 %)
51,766
(7.37 %)
n/a 44.75
(99.95 %)
61
(0.00 %)
1,752
(0.05 %)
1,085
(100.00 %)
1,674,762
(26.07 %)
900,455
(18.62 %)
2,849,256
(39.22 %)
0
(0 %)
824,383
(7.94 %)
26,022
(2.30 %)
13,322
(0.79 %)
233 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1
n/a 41,563
(2.11 %)
18,531
(1.97 %)
20,309
(1.67 %)
n/a 40.52
(99.19 %)
0
(0 %)
292
(0.81 %)
50
(100.00 %)
3,284,473
(35.00 %)
559,653
(1.29 %)
12,043,562
(29.15 %)
0
(0 %)
155,142
(0.71 %)
32,047
(1.05 %)
30,235
(0.96 %)
234 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2
53,353
(3.13 %)
n/a 18,641
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
0
(0 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,218,744
(34.52 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
0
(0 %)
171,202
(0.67 %)
32,445
(1.06 %)
30,641
(0.98 %)
235 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
n/a 19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
0
(0 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
0
(0 %)
499,733
(1.88 %)
61,023
(2.69 %)
54,015
(1.81 %)
236 greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024)
GCA_043880545.1
n/a n/a 18,582
(1.55 %)
20,954
(1.35 %)
n/a 42.46
(100.00 %)
0
(0 %)
152
(0.00 %)
106
(100.00 %)
4,158,629
(40.30 %)
696,150
(4.67 %)
0
(0.00 %)
1
(0.00 %)
1,418,508
(3.67 %)
257,446
(3.38 %)
44,752
(1.05 %)
237 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
n/a 13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
37,563
(15.76 %)
43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
0
(0 %)
112,918
(3.25 %)
46,327
(10.97 %)
32,897
(5.93 %)
238 greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850765.1
55,259
(2.53 %)
n/a 18,321
(1.40 %)
21,048
(1.35 %)
n/a 41.71
(98.73 %)
0
(0 %)
468
(1.27 %)
256
(100.00 %)
4,247,145
(29.53 %)
1,031,385
(2.50 %)
12,465,157
(43.30 %)
3
(0.00 %)
1,113,639
(2.95 %)
101,620
(2.01 %)
44,590
(1.04 %)
239 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1
n/a n/a 15,028
(2.35 %)
50,436
(6.30 %)
n/a 41.10
(99.97 %)
0
(0 %)
1,188
(0.03 %)
1,568
(100.00 %)
2,688,222
(39.74 %)
549,362
(7.60 %)
3,564,661
(40.05 %)
4
(0.00 %)
605,421
(5.26 %)
37,043
(1.94 %)
11,494
(0.60 %)
240 greater scaup (hap1 2025)
GCA_965140915.1
n/a n/a 13,410
(1.86 %)
25,527
(2.30 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
21
(0.00 %)
693
(0.01 %)
1,290
(100.00 %)
944,720
(17.84 %)
522,593
(6.27 %)
6,100,900
(26.44 %)
32
(0.00 %)
587,893
(3.78 %)
33,827
(2.73 %)
28,765
(1.49 %)
241 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2
84,366
(4.63 %)
n/a 14,725
(1.06 %)
17,444
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
0
(0 %)
298
(0.56 %)
93
(100.00 %)
1,701,640
(14.83 %)
304,306
(1.25 %)
11,135,147
(31.96 %)
0
(0 %)
429,994
(1.68 %)
49,025
(1.44 %)
26,933
(0.68 %)
242 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1
n/a n/a 14,752
(2.74 %)
58,725
(8.49 %)
n/a 43.13
(99.98 %)
3
(0.00 %)
553
(0.02 %)
322
(100.00 %)
1,860,845
(35.64 %)
378,045
(9.39 %)
3,208,482
(30.12 %)
0
(0 %)
450,213
(5.20 %)
66,857
(4.99 %)
44,052
(2.67 %)
243 grey whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_028021215.1
49,276
(1.90 %)
n/a 19,295
(1.38 %)
21,790
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
0
(0 %)
279
(0.00 %)
703
(100.00 %)
4,116,894
(35.85 %)
966,064
(16.74 %)
12,154,101
(46.39 %)
3
(0.00 %)
2,154,240
(5.67 %)
77,011
(1.59 %)
42,884
(0.96 %)
244 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1
n/a n/a 17,136
(1.90 %)
63,611
(4.50 %)
n/a 39.74
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,046
(0.01 %)
233
(100.00 %)
5,662,029
(68.75 %)
825,757
(11.99 %)
6,236,024
(55.15 %)
4
(0.00 %)
1,606,132
(7.98 %)
99,559
(5.68 %)
16,304
(0.51 %)
245 gyrfalcon (primary hap 2020)
GCF_015220075.1
47,961
(5.90 %)
n/a 13,016
(1.82 %)
21,266
(2.02 %)
n/a 42.20
(99.55 %)
0
(0 %)
635
(0.45 %)
133
(100.00 %)
484,104
(5.60 %)
186,430
(0.85 %)
7,162,723
(18.83 %)
0
(0 %)
59,799
(0.59 %)
24,760
(2.03 %)
20,013
(0.97 %)
246 Hanaki's dwarf bat (2024)
GCA_964339955.1
n/a n/a 17,856
(1.76 %)
20,604
(1.75 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
0
(0 %)
306
(0.00 %)
141
(100.00 %)
3,697,250
(33.21 %)
842,827
(8.27 %)
10,094,062
(38.40 %)
2
(0.00 %)
752,759
(2.71 %)
61,715
(2.96 %)
59,765
(1.96 %)
247 harbor porpoise (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924675.1
33,578
(1.54 %)
n/a 18,528
(1.58 %)
20,582
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
966
(0.01 %)
966
(0.01 %)
1,405
(99.99 %)
3,760,713
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,181
(39.04 %)
4
(0.00 %)
1,410,168
(3.71 %)
71,530
(2.69 %)
40,160
(1.06 %)
248 Harpy eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_026419915.1
51,641
(5.08 %)
n/a 13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
0
(0 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
1
(0.00 %)
480,025
(2.70 %)
60,606
(5.66 %)
30,636
(1.52 %)
249 Hawaiian crow (primary hap 2021 refseq)
GCF_020740725.1
51,593
(6.18 %)
n/a 12,739
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
0
(0 %)
294
(0.16 %)
188
(100.00 %)
409,129
(0.00 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,375
(23.59 %)
3
(0.00 %)
336,844
(2.41 %)
46,118
(3.85 %)
24,228
(1.26 %)
250 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1
n/a n/a 18,620
(1.42 %)
22,403
(1.38 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
1
(0.00 %)
1,805
(0.01 %)
214
(100.00 %)
6,063,911
(41.66 %)
1,593,657
(4.46 %)
12,229,281
(43.98 %)
8
(0.00 %)
1,313,148
(3.16 %)
71,058
(1.88 %)
45,398
(0.93 %)
251 hemichordates Saccoglossus (HW-2024a hap1 2024)
GCA_040954625.1
n/a n/a 4,944
(1.30 %)
35,031
(15.53 %)
n/a 39.72
(99.96 %)
0
(0 %)
254
(0.04 %)
77
(100.00 %)
87,841
(1.67 %)
119,697
(13.20 %)
1,309,907
(29.40 %)
5
(0.00 %)
336,770
(8.96 %)
21,623
(4.17 %)
15,834
(2.51 %)
252 herring gull (hap1 2024)
GCA_964417175.1
n/a n/a 13,382
(1.61 %)
25,785
(2.15 %)
n/a 44.80
(99.99 %)
3
(0.00 %)
559
(0.01 %)
404
(100.00 %)
535,852
(5.32 %)
233,906
(10.46 %)
5,597,180
(29.50 %)
2
(0.00 %)
619,465
(3.61 %)
46,309
(7.00 %)
37,622
(1.62 %)
253 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1
64,153
(2.73 %)
n/a 20,331
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
0
(0 %)
226
(0.00 %)
357
(100.00 %)
3,783,440
(35.17 %)
567,797
(3.38 %)
13,462,531
(35.48 %)
2
(0.00 %)
396,368
(1.55 %)
48,365
(1.91 %)
44,048
(1.34 %)
254 hoatzin (hap1 2023)
GCA_030867145.1
n/a n/a 13,089
(1.50 %)
29,621
(2.22 %)
n/a 45.56
(100.00 %)
268
(0.00 %)
268
(0.00 %)
683
(100.00 %)
610,333
(22.07 %)
252,997
(12.56 %)
5,154,598
(31.67 %)
3
(0.00 %)
1,034,232
(5.77 %)
58,754
(5.54 %)
47,065
(2.35 %)
255 honeycomb rockfish (primary hap 2020)
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
n/a 15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
63,546
(8.88 %)
40.77
(99.83 %)
0
(0 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
1
(0.00 %)
627,017
(5.28 %)
37,878
(1.84 %)
15,343
(0.71 %)
256 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1
n/a n/a 12,766
(0.30 %)
21,591
(0.87 %)
n/a 44.88
(99.43 %)
0
(0 %)
2,790
(0.57 %)
1,496
(100.00 %)
1,008,880
(5.19 %)
1,596,129
(22.32 %)
22,180,341
(62.98 %)
2
(0.00 %)
9,762,254
(11.27 %)
82,276
(1.85 %)
14,696
(0.13 %)
257 horn shark (sHetFra1hap1 2024)
GCF_036365525.1
60,844
(1.44 %)
n/a 15,004
(0.28 %)
22,510
(0.76 %)
n/a 45.05
(99.53 %)
0
(0 %)
2,781
(0.47 %)
2,306
(100.00 %)
1,344,541
(5.76 %)
2,364,824
(28.34 %)
5,087
(99.53 %)
5
(0.00 %)
14,350,134
(14.12 %)
89,340
(2.10 %)
82,092
(1.20 %)
258 horse (paternal hap 2024)
GCA_036426135.1
n/a n/a 19,073
(1.67 %)
20,636
(1.38 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
114
(0.00 %)
602
(100.00 %)
3,521,953
(35.39 %)
461,571
(5.26 %)
14,833,688
(32.77 %)
2
(0.00 %)
728,239
(2.01 %)
43,527
(2.54 %)
41,129
(2.38 %)
259 hourglass treefrog (paternal 2023 refseq)
GCF_027789765.1
50,542
(2.91 %)
n/a 14,058
(0.89 %)
30,599
(2.64 %)
n/a 43.97
(99.70 %)
0
(0 %)
804
(0.30 %)
2,200
(100.00 %)
906,816
(2.43 %)
1,710,859
(17.48 %)
10,069,798
(51.41 %)
3
(0.00 %)
1,978,464
(5.31 %)
235,277
(5.56 %)
28,414
(0.63 %)
260 house finch (primary hap 2022 refseq)
GCF_027477595.1
43,228
(5.71 %)
n/a 12,702
(1.83 %)
24,568
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
0
(0 %)
296
(0.98 %)
184
(100.00 %)
440,384
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,138
(23.47 %)
1
(0.00 %)
573,830
(3.39 %)
30,897
(2.53 %)
22,852
(1.24 %)
261 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1
n/a n/a 22,351
(1.96 %)
19,629
(1.26 %)
n/a 41.38
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
179
(100.00 %)
4,774,018
(45.31 %)
1,620,102
(10.50 %)
13,181,250
(40.47 %)
0
(0 %)
1,650,132
(4.47 %)
23,955
(0.54 %)
16,164
(0.39 %)
262 house sparrow (hap1 2024 refseq)
GCF_036417665.1
75,216
(7.36 %)
n/a 12,832
(1.61 %)
26,124
(2.26 %)
n/a 43.99
(100.00 %)
0
(0 %)
204
(0.00 %)
335
(100.00 %)
647,402
(12.37 %)
646,615
(14.14 %)
5,906,561
(30.36 %)
2
(0.00 %)
873,292
(5.23 %)
36,193
(2.91 %)
24,212
(1.05 %)
263 Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022)
GCA_027474245.1
n/a n/a 13,233
(1.67 %)
23,010
(1.93 %)
n/a 43.91
(99.92 %)
0
(0 %)
253
(0.08 %)
136
(100.00 %)
610,144
(11.51 %)
214,393
(5.75 %)
6,069,916
(25.74 %)
1
(0.00 %)
314,812
(2.19 %)
33,172
(3.38 %)
26,788
(1.37 %)
264 humpback whale (KW2013002 2024)
GCA_041834305.1
n/a n/a 19,463
(1.32 %)
22,424
(1.19 %)
n/a 42.05
(100.00 %)
0
(0 %)
88
(0.00 %)
1,355
(100.00 %)
4,164,459
(34.02 %)
1,281,751
(18.33 %)
12,412,281
(48.28 %)
0
(0 %)
2,009,593
(5.80 %)
82,412
(1.67 %)
44,791
(0.96 %)
265 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1
63,234
(2.88 %)
n/a 19,601
(1.57 %)
21,699
(1.34 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
0
(0 %)
302
(0.06 %)
1,250
(100.00 %)
5,524,454
(47.57 %)
459,928
(1.40 %)
13,208,799
(41.21 %)
0
(0 %)
1,222,662
(3.37 %)
41,359
(1.10 %)
37,367
(0.98 %)
266 Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024)
GCA_036172795.1
n/a n/a 14,141
(0.97 %)
22,232
(2.16 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
262
(0.00 %)
99
(100.00 %)
944,742
(4.86 %)
1,927,659
(22.26 %)
8,988,510
(49.29 %)
1
(0.00 %)
3,465,509
(10.62 %)
77,721
(1.73 %)
13,802
(0.30 %)
267 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022 genbank)
GCA_026652325.1
n/a 139,896
(0.54 %)
15,136
(0.10 %)
n/a n/a 45.95
(100.00 %)
29
(0.00 %)
922
(0.00 %)
296
(100.00 %)
4,478,794
(1.33 %)
6,452,537
(8.86 %)
1,189
(100.00 %)
26
(0.00 %)
n/a 1,581,360
(4.00 %)
144,588
(0.32 %)
268 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2
n/a n/a 15,339
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
57,867
(10.10 %)
42.38
(98.08 %)
0
(0 %)
1,523
(1.92 %)
157
(100.00 %)
346,399
(3.02 %)
163,524
(3.00 %)
2,755,274
(25.07 %)
0
(0 %)
235,504
(4.25 %)
17,931
(1.47 %)
9,749
(0.74 %)
269 Indian roofed turtle (hap2 2024)
GCA_045781085.1
n/a n/a 14,682
(1.03 %)
18,600
(1.58 %)
n/a 44.26
(100.00 %)
0
(0 %)
260
(0.00 %)
449
(100.00 %)
1,290,818
(11.46 %)
301,464
(1.79 %)
10,704,595
(32.71 %)
0
(0 %)
436,958
(2.04 %)
74,354
(2.05 %)
27,125
(0.71 %)
270 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1
41,583
(6.91 %)
n/a 18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
74,968
(7.01 %)
43.02
(99.97 %)
0
(0 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
0
(0 %)
319,481
(2.18 %)
78,561
(3.69 %)
58,460
(2.33 %)
271 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024)
GCA_043728065.1
n/a n/a 18,239
(1.76 %)
20,378
(1.53 %)
n/a 41.40
(100.00 %)
1
(0.00 %)
37
(0.00 %)
2,195
(100.00 %)
3,438,644
(42.82 %)
584,006
(9.54 %)
12,207,998
(35.49 %)
0
(0 %)
1,679,263
(3.77 %)
34,491
(1.02 %)
29,817
(0.90 %)
272 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1
n/a n/a 19,064
(1.67 %)
20,800
(1.49 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
0
(0 %)
119
(0.00 %)
69
(100.00 %)
3,393,548
(30.92 %)
723,545
(6.58 %)
12,073,117
(35.40 %)
0
(0 %)
1,106,960
(3.54 %)
43,736
(1.20 %)
30,847
(0.87 %)
273 Italian wall lizard (rPodSic1.hap1.1 2024)
GCA_964188175.1
n/a n/a 14,241
(1.31 %)
20,399
(2.26 %)
n/a 44.32
(99.99 %)
2
(0.00 %)
762
(0.01 %)
296
(100.00 %)
832,389
(5.27 %)
530,449
(8.28 %)
6,937,083
(40.38 %)
2
(0.00 %)
908,580
(4.73 %)
106,667
(3.79 %)
20,531
(0.75 %)
274 jaguar (hap1 2025)
GCA_046562885.1
n/a n/a 17,882
(1.68 %)
19,103
(1.41 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
0
(0 %)
140
(0.00 %)
115
(100.00 %)
4,622,385
(41.25 %)
893,297
(1.89 %)
12,851,116
(33.53 %)
1
(0.00 %)
402,314
(1.33 %)
61,319
(2.55 %)
55,085
(2.08 %)
275 Japanese sawshark (hap1 2024 genbank)
GCA_044704955.1
n/a n/a 14,672
(0.28 %)
30,181
(0.79 %)
n/a 47.02
(99.98 %)
0
(0 %)
5,985
(0.02 %)
4,317
(100.00 %)
1,167,498
(3.08 %)
2,399,496
(18.16 %)
10,302
(99.98 %)
38
(0.00 %)
5,044,826
(4.94 %)
503,637
(6.56 %)
489,893
(6.05 %)
276 Japanese sawshark (hap1 2024 refseq)
GCF_044704955.1
54,879
(1.24 %)
n/a 12,978
(0.27 %)
30,195
(0.79 %)
n/a 47.02
(99.98 %)
0
(0 %)
5,985
(0.02 %)
4,318
(100.00 %)
11,412,024
(71.47 %)
2,399,500
(18.16 %)
20,051,385
(71.80 %)
38
(0.00 %)
11,403,077
(11.92 %)
503,637
(6.56 %)
48,183
(0.32 %)
277 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1
42,877
(8.61 %)
n/a 15,188
(2.40 %)
41,262
(7.86 %)
58,418
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
0
(0 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
667,122
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
0
(0 %)
422,332
(3.88 %)
121,464
(9.36 %)
77,061
(4.51 %)
278 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1
n/a n/a 14,906
(2.33 %)
72,029
(6.72 %)
n/a 43.92
(99.98 %)
0
(0 %)
887
(0.02 %)
191
(100.00 %)
1,609,654
(22.82 %)
897,264
(13.58 %)
4,548,467
(39.80 %)
11
(0.00 %)
875,374
(6.46 %)
129,147
(11.75 %)
77,287
(4.33 %)
279 kagu (bRhyJub1 primary hap 2023)
GCA_027574665.1
n/a n/a 13,042
(1.63 %)
24,142
(2.01 %)
n/a 45.07
(99.96 %)
0
(0 %)
300
(0.04 %)
148
(100.00 %)
563,851
(12.90 %)
270,861
(12.36 %)
6,191,106
(28.24 %)
2
(0.00 %)
905,468
(5.08 %)
54,426
(4.92 %)
40,156
(2.73 %)
280 kakapo (v2 Jane 2020 refseq)
GCF_004027225.2
49,757
(5.76 %)
n/a 13,110
(1.92 %)
22,782
(2.26 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
0
(0 %)
373
(0.92 %)
89
(100.00 %)
507,148
(7.85 %)
208,178
(1.08 %)
6,258,087
(20.50 %)
0
(0 %)
165,530
(1.34 %)
22,278
(1.77 %)
19,230
(1.21 %)
281 killer whale (2022)
GCF_937001465.1
78,470
(3.76 %)
n/a 18,710
(1.51 %)
21,101
(1.30 %)
34,448
(1.49 %)
41.91
(100.00 %)
0
(0 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
3,955,401
(36.81 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,568
(41.63 %)
2
(0.00 %)
1,982,992
(5.71 %)
77,307
(3.08 %)
40,935
(1.02 %)
282 king vulture (hap1 2024)
GCA_037962945.1
n/a n/a 13,641
(1.52 %)
24,293
(1.78 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
6
(0.00 %)
154
(0.00 %)
130
(100.00 %)
484,661
(3.34 %)
252,569
(16.01 %)
5,595,734
(32.51 %)
1
(0.00 %)
776,309
(4.15 %)
77,942
(3.59 %)
33,020
(1.50 %)
283 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2
n/a n/a 17,087
(0.81 %)
14,711
(0.86 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
0
(0 %)
669
(0.00 %)
1,246
(100.00 %)
6,280,029
(29.77 %)
1,123,294
(2.02 %)
21,796,316
(39.24 %)
2
(0.00 %)
412,593
(0.92 %)
15,957
(0.35 %)
13,996
(0.24 %)
284 Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3
33,236
(8.44 %)
n/a 14,601
(2.46 %)
44,145
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
701
(0.95 %)
122
(100.00 %)
1,755,227
(42.93 %)
551,482
(7.22 %)
4,887,087
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,179
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
22,350
(1.21 %)
285 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1
63,293
(2.96 %)
n/a 17,918
(1.89 %)
20,819
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
0
(0 %)
394
(0.69 %)
202
(100.00 %)
2,897,422
(23.58 %)
797,420
(2.76 %)
10,057,100
(34.56 %)
2
(0.00 %)
425,636
(1.52 %)
55,965
(2.99 %)
57,667
(2.01 %)
286 lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023)
GCA_028022735.1
n/a n/a 13,529
(1.69 %)
23,672
(1.98 %)
n/a 43.50
(99.85 %)
0
(0 %)
259
(0.15 %)
232
(100.00 %)
491,653
(3.53 %)
349,011
(9.83 %)
5,955,030
(26.51 %)
5
(0.00 %)
404,016
(2.60 %)
32,237
(2.61 %)
27,504
(1.23 %)
287 lance-tailed manakin (2020)
GCF_009829145.1
46,366
(5.56 %)
n/a 12,594
(1.91 %)
22,763
(2.31 %)
26,057
(3.91 %)
41.97
(99.70 %)
0
(0 %)
206
(0.30 %)
93
(100.00 %)
485,121
(7.13 %)
247,189
(1.64 %)
6,498,294
(20.04 %)
0
(0 %)
149,431
(1.05 %)
25,377
(1.97 %)
21,424
(1.14 %)
288 lancelets B.floridae x B.belcheri (bbbf 2021)
GCA_019207075.1
n/a n/a 5,191
(1.10 %)
42,331
(14.51 %)
n/a 41.51
(99.88 %)
0
(0 %)
108
(0.12 %)
79
(100.00 %)
132,673
(2.15 %)
174,485
(7.81 %)
1,945,047
(28.91 %)
0
(0 %)
311,722
(5.56 %)
42,166
(6.02 %)
28,034
(3.24 %)
289 lancelets B.floridae x B.japonicum (bjbf 2020)
GCA_015852565.1
n/a n/a 5,384
(0.92 %)
47,467
(13.75 %)
n/a 41.37
(99.98 %)
0
(0 %)
168
(0.02 %)
341
(100.00 %)
146,622
(1.62 %)
202,162
(9.26 %)
2,291,900
(27.75 %)
0
(0 %)
366,245
(5.52 %)
44,443
(4.78 %)
27,446
(2.56 %)
290 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023638135.1
48,561
(5.70 %)
n/a 12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
0
(0 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
2
(0.00 %)
479,269
(2.67 %)
32,398
(2.65 %)
19,870
(0.89 %)
291 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1
n/a n/a 17,851
(1.28 %)
83,249
(5.18 %)
n/a 42.69
(99.97 %)
36
(0.00 %)
2,397
(0.03 %)
709
(100.00 %)
7,797,173
(37.37 %)
1,593,818
(10.64 %)
7,610,300
(54.05 %)
15
(0.00 %)
1,726,634
(9.03 %)
127,942
(3.84 %)
34,520
(0.93 %)
292 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1
n/a n/a 21,678
(1.34 %)
22,317
(1.25 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
1,188
(0.00 %)
1,198
(100.00 %)
5,530,547
(22.20 %)
1,357,640
(10.13 %)
14,334,312
(46.09 %)
5
(0.00 %)
2,400,830
(5.08 %)
123,453
(2.17 %)
59,337
(1.38 %)
293 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1
n/a n/a 16,376
(2.19 %)
82,947
(7.99 %)
n/a 46.31
(99.94 %)
144
(0.00 %)
2,631
(0.06 %)
1,522
(100.00 %)
3,333,323
(43.58 %)
1,553,932
(25.91 %)
3,393,507
(46.78 %)
9
(0.00 %)
1,764,517
(12.32 %)
99,668
(6.39 %)
51,378
(2.60 %)
294 largemouth bass (2-A1 2021)
GCA_019677235.1
n/a n/a 15,790
(2.31 %)
50,332
(5.65 %)
n/a 40.87
(99.96 %)
0
(0 %)
672
(0.04 %)
202
(100.00 %)
464,845
(2.71 %)
255,513
(3.69 %)
5,124,388
(29.65 %)
2
(0.00 %)
390,854
(3.63 %)
25,920
(1.67 %)
12,277
(0.62 %)
295 largescale foureyes (primary hap 2020)
GCA_014839685.1
n/a n/a 14,774
(2.18 %)
42,858
(4.83 %)
58,247
(6.94 %)
38.54
(99.96 %)
0
(0 %)
107
(0.04 %)
33
(100.00 %)
506,950
(2.73 %)
305,170
(2.13 %)
6,194,879
(29.85 %)
0
(0 %)
131,664
(1.39 %)
17,881
(0.94 %)
14,233
(0.68 %)
296 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1
n/a n/a 13,350
(1.17 %)
18,904
(1.93 %)
n/a 40.96
(99.78 %)
0
(0 %)
769
(0.22 %)
56
(100.00 %)
1,209,793
(7.69 %)
762,735
(5.06 %)
7,424,674
(44.80 %)
4
(0.00 %)
794,949
(4.07 %)
110,631
(4.07 %)
23,739
(0.88 %)
297 least weasel (hap1.1 2025)
GCA_964662115.1
n/a n/a 19,085
(1.11 %)
23,074
(1.09 %)
n/a 43.54
(99.98 %)
9
(0.00 %)
2,938
(0.02 %)
3,189
(100.00 %)
4,687,333
(25.05 %)
908,610
(10.98 %)
12,922,050
(49.64 %)
17
(0.00 %)
4,143,372
(9.39 %)
68,749
(2.22 %)
53,921
(1.35 %)
298 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq)
GCF_009764565.3
73,318
(3.97 %)
n/a 14,610
(1.03 %)
16,358
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
0
(0 %)
668
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,694,449
(14.90 %)
304,773
(1.14 %)
11,121,962
(34.21 %)
3
(0.00 %)
670,729
(2.51 %)
35,485
(1.36 %)
19,615
(0.51 %)
299 lemon sole (primary hap 2024)
GCA_964266715.1
n/a n/a 14,961
(2.55 %)
52,234
(6.83 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
20
(0.00 %)
409
(0.01 %)
1,601
(100.00 %)
1,233,052
(39.33 %)
366,741
(18.98 %)
3,296,338
(36.77 %)
1
(0.00 %)
538,414
(6.03 %)
44,712
(2.85 %)
31,908
(1.76 %)
300 leopard gecko (TG4126 2023)
GCF_028583425.1
37,120
(2.89 %)
n/a 14,358
(0.93 %)
23,080
(1.92 %)
n/a 44.06
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
76
(100.00 %)
969,188
(4.21 %)
557,245
(2.88 %)
11,096,222
(37.91 %)
0
(0 %)
608,752
(2.77 %)
82,956
(2.56 %)
27,406
(0.84 %)
301 lesser black-backed gull (primary hap 2024)
GCA_963932225.1
n/a n/a 13,333
(1.68 %)
24,731
(2.05 %)
n/a 44.40
(99.99 %)
15
(0.00 %)
537
(0.01 %)
1,382
(100.00 %)
509,160
(5.11 %)
266,609
(9.64 %)
6,827,304
(27.15 %)
3
(0.00 %)
575,179
(3.19 %)
44,108
(6.34 %)
37,502
(1.70 %)
302 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1
51,730
(1.99 %)
n/a 20,129
(1.24 %)
22,089
(1.24 %)
40,414
(1.76 %)
42.00
(99.52 %)
0
(0 %)
561
(0.48 %)
160
(100.00 %)
7,346,291
(41.25 %)
1,187,587
(2.92 %)
14,222,177
(44.13 %)
1
(0.00 %)
1,219,048
(2.53 %)
34,688
(0.86 %)
25,175
(0.54 %)
303 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024)
GCA_043880595.1
n/a n/a 18,484
(1.87 %)
24,356
(1.84 %)
n/a 41.88
(97.91 %)
198
(0.32 %)
866
(2.09 %)
617
(99.68 %)
3,419,622
(36.65 %)
663,182
(2.53 %)
11,508,574
(30.58 %)
15
(0.00 %)
639,747
(2.02 %)
84,174
(4.85 %)
81,198
(4.01 %)
304 lesser horseshoe bat (hap1 2024)
GCA_964194185.1
n/a n/a 19,031
(1.88 %)
21,003
(1.63 %)
n/a 40.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,627
(0.01 %)
723
(100.00 %)
3,133,745
(33.46 %)
660,064
(3.79 %)
11,720,176
(32.32 %)
8
(0.00 %)
718,567
(2.35 %)
35,414
(1.75 %)
34,111
(1.64 %)
305 lesser kestrel (v2 2021)
GCF_017639655.2
47,420
(5.64 %)
n/a 13,098
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
0
(0 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,499
(5.58 %)
210,234
(1.26 %)
7,133,934
(19.19 %)
1
(0.00 %)
132,967
(0.79 %)
27,558
(2.21 %)
21,862
(1.03 %)
306 lesser noctule (hap1 2024)
GCA_964264875.1
n/a n/a 18,260
(1.53 %)
23,046
(1.60 %)
n/a 43.05
(99.99 %)
0
(0 %)
1,662
(0.01 %)
1,281
(100.00 %)
3,246,021
(21.13 %)
1,298,965
(12.06 %)
9,752,193
(42.90 %)
10
(0.00 %)
2,023,792
(5.54 %)
66,137
(2.85 %)
61,169
(1.82 %)
307 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028389875.1
39,024
(4.18 %)
n/a 13,360
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
0
(0 %)
128
(0.11 %)
180
(100.00 %)
674,149
(6.73 %)
329,124
(5.34 %)
6,820,245
(22.78 %)
1
(0.00 %)
266,226
(1.85 %)
45,073
(5.83 %)
38,575
(2.59 %)
308 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850995.1
53,210
(2.49 %)
n/a 18,323
(1.42 %)
21,350
(1.39 %)
n/a 41.84
(99.24 %)
0
(0 %)
573
(0.76 %)
168
(100.00 %)
4,224,344
(28.69 %)
1,030,576
(2.60 %)
12,591,989
(42.30 %)
1
(0.00 %)
1,128,543
(2.95 %)
98,189
(2.06 %)
48,427
(1.15 %)
309 lesser salmon catfish (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1
53,323
(3.35 %)
n/a 15,955
(0.92 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
6,041,262
(71.88 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
16,535
(0.37 %)
310 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1
n/a n/a 13,908
(2.19 %)
50,634
(6.50 %)
n/a 41.22
(99.97 %)
84
(0.00 %)
1,017
(0.03 %)
701
(100.00 %)
2,698,640
(39.19 %)
577,328
(8.51 %)
3,615,231
(39.17 %)
5
(0.00 %)
691,324
(6.04 %)
33,251
(1.82 %)
14,917
(0.69 %)
311 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1
n/a n/a 15,269
(2.44 %)
52,449
(6.28 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
606
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,879,201
(31.40 %)
449,901
(9.89 %)
4,248,556
(33.21 %)
1
(0.00 %)
727,189
(5.72 %)
43,864
(3.01 %)
19,108
(1.01 %)
312 light-bulb sea squirt (2022)
GCA_947623445.1
n/a n/a 3,318
(1.37 %)
10,846
(10.58 %)
n/a 35.93
(99.99 %)
2
(0.00 %)
58
(0.01 %)
105
(100.00 %)
34,121
(1.61 %)
31,117
(17.32 %)
1,008,995
(33.48 %)
0
(0 %)
167,504
(8.33 %)
4,203
(2.12 %)
2,308
(0.42 %)
313 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1
n/a n/a 15,060
(2.89 %)
50,064
(7.31 %)
n/a 41.88
(99.98 %)
0
(0 %)
589
(0.02 %)
534
(100.00 %)
1,116,427
(28.18 %)
315,489
(13.14 %)
2,598,812
(33.21 %)
2
(0.00 %)
680,706
(7.88 %)
50,192
(3.82 %)
27,472
(1.61 %)
314 little owl (hap1.1 2025)
GCA_965140245.1
n/a n/a 13,385
(1.67 %)
23,822
(2.00 %)
n/a 43.44
(99.99 %)
0
(0 %)
572
(0.01 %)
717
(100.00 %)
653,518
(17.99 %)
588,381
(7.88 %)
5,739,624
(25.13 %)
3
(0.00 %)
448,405
(3.11 %)
34,531
(9.97 %)
27,876
(1.39 %)
315 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2
n/a n/a 14,975
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
n/a 41.43
(99.89 %)
0
(0 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
772,309
(14.49 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,473
(21.79 %)
0
(0 %)
109,664
(1.83 %)
16,807
(1.33 %)
12,095
(0.89 %)
316 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap1 2025)
GCA_047715975.1
n/a n/a 13,605
(0.80 %)
18,928
(1.32 %)
n/a 44.97
(100.00 %)
0
(0 %)
109
(0.00 %)
73
(100.00 %)
1,038,607
(4.70 %)
891,233
(5.94 %)
9,004,935
(56.47 %)
1
(0.00 %)
1,639,727
(6.17 %)
245,845
(10.83 %)
19,287
(0.34 %)
317 lizards B.pumilum (Western Cape Province JTBG20231 2024)
GCA_035047305.1
n/a n/a 13,670
(0.79 %)
19,028
(1.31 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
18
(0.00 %)
18
(0.00 %)
39
(100.00 %)
1,040,467
(4.86 %)
924,221
(6.37 %)
9,015,048
(56.81 %)
1
(0.00 %)
1,768,582
(6.35 %)
248,142
(10.84 %)
19,296
(0.34 %)
318 lizards D.cf. smithi (hap1 2024)
GCA_046126795.1
n/a n/a 14,308
(0.91 %)
19,761
(1.58 %)
n/a 45.95
(100.00 %)
2
(0.00 %)
274
(0.00 %)
329
(100.00 %)
1,376,454
(8.31 %)
744,560
(3.94 %)
11,383,198
(44.04 %)
5
(0.00 %)
843,674
(3.07 %)
208,005
(7.18 %)
27,218
(0.55 %)
319 lizards F.pardalis (Fpa_1 2023)
GCA_030440675.1
n/a n/a 13,625
(1.22 %)
18,049
(1.96 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
23
(100.00 %)
833,693
(2.81 %)
607,040
(2.82 %)
7,939,139
(42.05 %)
0
(0 %)
421,243
(2.11 %)
52,987
(2.59 %)
18,249
(0.61 %)
320 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap1.1 2024)
GCA_964188305.1
n/a n/a 14,091
(1.26 %)
20,552
(2.20 %)
n/a 44.36
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,005
(0.01 %)
509
(100.00 %)
932,842
(5.02 %)
555,337
(4.34 %)
6,595,536
(41.39 %)
10
(0.00 %)
772,110
(4.54 %)
119,467
(4.32 %)
20,701
(0.72 %)
321 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap1.1 2024)
GCA_964252035.1
n/a n/a 13,858
(1.33 %)
19,727
(2.31 %)
n/a 43.80
(99.99 %)
0
(0 %)
836
(0.01 %)
326
(100.00 %)
885,596
(4.43 %)
527,127
(3.30 %)
7,008,185
(38.56 %)
2
(0.00 %)
527,173
(3.21 %)
89,737
(2.87 %)
18,878
(0.71 %)
322 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap1.1 2024)
GCA_964234715.1
n/a n/a 14,289
(1.31 %)
20,112
(2.23 %)
n/a 44.03
(99.99 %)
1
(0.00 %)
823
(0.01 %)
387
(100.00 %)
830,352
(7.87 %)
552,452
(8.32 %)
6,838,068
(40.20 %)
2
(0.00 %)
932,658
(4.44 %)
90,074
(2.82 %)
20,501
(0.74 %)
323 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap1.2 2024)
GCA_964106645.2
n/a n/a 14,314
(1.36 %)
20,522
(2.35 %)
n/a 43.98
(99.98 %)
1
(0.00 %)
1,506
(0.02 %)
337
(100.00 %)
858,648
(4.22 %)
473,134
(2.71 %)
7,061,380
(38.21 %)
40
(0.00 %)
544,982
(3.43 %)
96,600
(3.21 %)
19,808
(0.82 %)
324 lizards P.vaucheri (hap1.1 2025)
GCA_965113315.1
n/a n/a 14,329
(1.28 %)
20,152
(2.19 %)
n/a 44.23
(99.99 %)
0
(0 %)
949
(0.01 %)
285
(100.00 %)
893,567
(5.89 %)
524,077
(6.62 %)
7,052,308
(41.37 %)
8
(0.00 %)
922,684
(4.86 %)
109,507
(3.61 %)
21,052
(0.73 %)
325 loggerhead turtle (hap1 2025)
GCA_965140235.1
n/a 24,360
(1.83 %)
14,764
(1.02 %)
17,699
(1.53 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
61
(0.03 %)
61
(0.03 %)
97
(99.97 %)
1,308,886
(12.45 %)
334,985
(1.41 %)
10,765,956
(34.66 %)
1
(0.00 %)
593,928
(2.38 %)
54,290
(1.49 %)
25,037
(0.61 %)
326 long-finned pilot whale (primary hap 2023)
GCF_963455315.1
61,797
(2.84 %)
n/a 18,712
(1.51 %)
20,920
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
0
(0 %)
1,084
(0.01 %)
993
(100.00 %)
4,125,420
(35.62 %)
1,577,899
(12.03 %)
12,347,226
(42.01 %)
10
(0.00 %)
1,284,155
(3.89 %)
71,821
(5.51 %)
41,663
(1.04 %)
327 long-finned pilot whale (primary hap 2024)
GCA_963455315.2
n/a n/a 18,726
(1.51 %)
20,948
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,084
(0.01 %)
995
(100.00 %)
4,125,459
(35.62 %)
1,577,896
(12.03 %)
12,347,226
(42.01 %)
10
(0.00 %)
1,284,155
(3.89 %)
71,822
(5.51 %)
41,663
(1.04 %)
328 long-finned pilot whale (primary hap 2024)
GCF_963455315.2
61,447
(2.80 %)
n/a 18,725
(1.51 %)
20,946
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
1,084
(0.01 %)
1,084
(0.01 %)
2,076
(99.99 %)
4,125,452
(35.62 %)
1,577,896
(12.03 %)
12,347,170
(42.01 %)
10
(0.00 %)
1,284,155
(3.89 %)
71,822
(5.51 %)
41,663
(1.04 %)
329 long-tailed duck (primary hap 2024)
GCA_963989345.1
n/a n/a 13,329
(1.88 %)
23,888
(2.25 %)
n/a 42.30
(99.99 %)
0
(0 %)
544
(0.01 %)
272
(100.00 %)
784,647
(6.78 %)
501,860
(7.36 %)
6,388,957
(26.13 %)
53
(0.00 %)
600,275
(3.74 %)
34,028
(3.04 %)
29,568
(1.51 %)
330 long-tailed hermit (v1 PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1
n/a n/a 12,328
(2.02 %)
20,312
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
141
(0.37 %)
141
(0.37 %)
211
(99.63 %)
497,506
(5.06 %)
265,815
(1.51 %)
6,045,702
(20.10 %)
0
(0 %)
100,035
(0.84 %)
15,922
(1.43 %)
13,768
(0.94 %)
331 long-tailed hermit (v2 PSU5 primary hap 2025)
GCA_023637945.2
n/a n/a 12,322
(2.02 %)
20,234
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
12
(0.00 %)
140
(0.37 %)
77
(100.00 %)
497,376
(5.06 %)
265,823
(1.51 %)
6,044,278
(20.09 %)
0
(0 %)
100,037
(0.84 %)
15,921
(1.43 %)
13,767
(0.94 %)
332 longspined bullhead (.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1
n/a n/a 15,027
(3.10 %)
51,137
(7.71 %)
n/a 42.22
(99.99 %)
0
(0 %)
242
(0.01 %)
27
(100.00 %)
452,844
(4.81 %)
417,308
(9.63 %)
3,262,282
(28.51 %)
2
(0.00 %)
530,802
(5.05 %)
55,527
(4.38 %)
34,004
(2.27 %)
333 lumpfish (v1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
n/a 14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
0
(0 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
1
(0.00 %)
655,785
(6.31 %)
53,321
(5.09 %)
32,722
(2.40 %)
334 Macqueen's bustard (maternal hap 2024)
GCA_036417535.1
n/a n/a 13,082
(1.73 %)
27,150
(2.44 %)
n/a 43.25
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
329
(100.00 %)
669,243
(14.71 %)
211,387
(6.69 %)
6,514,716
(27.07 %)
0
(0 %)
589,996
(3.41 %)
47,331
(8.09 %)
32,791
(2.71 %)
335 maguari stork (primary hap 2021)
GCA_017639555.1
n/a n/a 12,905
(1.81 %)
22,204
(2.01 %)
n/a 42.12
(98.21 %)
0
(0 %)
232
(1.79 %)
153
(100.00 %)
485,318
(6.35 %)
184,992
(0.78 %)
7,064,965
(19.56 %)
0
(0 %)
58,168
(0.52 %)
31,653
(3.02 %)
31,174
(1.88 %)
336 Malawi cichlid R.sp.'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1
n/a n/a 15,501
(2.18 %)
54,090
(6.20 %)
n/a 41.17
(99.99 %)
0
(0 %)
422
(0.01 %)
82
(100.00 %)
1,727,328
(38.16 %)
259,351
(4.71 %)
4,381,278
(33.25 %)
2
(0.00 %)
338,853
(3.90 %)
35,281
(1.93 %)
14,746
(0.71 %)
337 mallard (hap1 2024)
GCA_964188345.1
n/a n/a 13,680
(1.77 %)
26,845
(2.33 %)
n/a 42.87
(99.99 %)
0
(0 %)
571
(0.01 %)
936
(100.00 %)
941,876
(15.92 %)
570,703
(9.50 %)
6,169,980
(28.67 %)
58
(0.00 %)
840,239
(5.08 %)
41,791
(3.18 %)
29,249
(1.36 %)
338 mallard (Pekin duck Z2 2020 Zhejiang U)
GCF_015476345.1
59,854
(7.33 %)
n/a 12,988
(1.87 %)
23,709
(2.20 %)
86,787
(8.80 %)
42.27
(99.64 %)
0
(0 %)
905
(0.36 %)
756
(100.00 %)
803,558
(8.04 %)
417,575
(5.02 %)
6,627,843
(24.59 %)
5
(0.00 %)
487,092
(3.05 %)
35,030
(3.06 %)
27,683
(1.41 %)
339 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1
n/a n/a 15,070
(1.79 %)
71,367
(6.50 %)
n/a 41.46
(99.92 %)
0
(0 %)
4,157
(0.08 %)
943
(100.00 %)
1,717,591
(42.63 %)
474,348
(12.30 %)
4,011,319
(44.93 %)
3
(0.00 %)
n/a 59,531
(2.83 %)
15,998
(0.74 %)
340 Mauritius kestrel (primary hap 2023)
GCA_963210335.1
n/a n/a 13,064
(1.72 %)
22,269
(1.98 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
0
(0 %)
407
(0.01 %)
316
(100.00 %)
459,578
(3.87 %)
315,686
(6.19 %)
6,650,507
(22.84 %)
0
(0 %)
244,086
(1.64 %)
36,076
(2.82 %)
21,430
(0.96 %)
341 Mauritius parakeet (primary hap 2023)
GCA_963264785.1
n/a n/a 13,133
(1.81 %)
23,396
(2.19 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
358
(0.01 %)
172
(100.00 %)
511,156
(7.05 %)
238,915
(5.05 %)
5,764,523
(25.19 %)
2
(0.00 %)
442,454
(2.96 %)
24,675
(1.70 %)
20,376
(1.26 %)
342 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1
n/a n/a 13,282
(1.16 %)
18,653
(1.90 %)
n/a 40.93
(99.98 %)
0
(0 %)
1,819
(0.02 %)
384
(100.00 %)
1,187,501
(7.72 %)
762,639
(6.28 %)
7,428,147
(45.35 %)
13
(0.00 %)
770,603
(3.87 %)
101,007
(3.95 %)
24,179
(0.84 %)
343 meadow vole (hap1 2024)
GCA_037038515.1
n/a n/a 19,134
(1.78 %)
20,672
(1.55 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
181
(100.00 %)
4,818,689
(41.90 %)
962,362
(4.16 %)
12,161,222
(34.42 %)
0
(0 %)
1,559,409
(4.65 %)
23,781
(0.74 %)
19,793
(0.55 %)
344 Merriam's long-tongued bat (hap1 2024)
GCA_039655065.1
n/a n/a 18,172
(1.67 %)
20,736
(1.60 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
0
(0 %)
47
(0.00 %)
82
(100.00 %)
2,998,913
(29.48 %)
418,833
(1.07 %)
11,783,716
(32.96 %)
1
(0.00 %)
317,774
(1.27 %)
65,956
(4.38 %)
57,781
(3.83 %)
345 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1
n/a n/a 14,442
(0.44 %)
24,630
(1.28 %)
n/a 41.94
(99.99 %)
0
(0 %)
2,032
(0.01 %)
464
(100.00 %)
1,928,361
(2.22 %)
2,955,095
(11.97 %)
25,178,773
(53.55 %)
7
(0.00 %)
5,022,575
(7.68 %)
165,699
(1.23 %)
16,842
(0.16 %)
346 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1
62,007
(3.15 %)
n/a 14,883
(0.96 %)
18,524
(1.48 %)
n/a 44.69
(96.36 %)
0
(0 %)
1,866
(3.64 %)
621
(100.00 %)
1,372,189
(11.32 %)
472,501
(3.42 %)
11,362,604
(34.69 %)
1
(0.00 %)
910,675
(2.73 %)
73,700
(2.04 %)
22,443
(0.52 %)
347 milkfish (2019)
GCF_902362185.1
30,812
(7.61 %)
n/a 16,869
(3.41 %)
21,377
(6.58 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
0
(0 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
958,774
(8.18 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
2
(0.01 %)
611,774
(5.32 %)
22,089
(1.27 %)
14,000
(0.76 %)
348 mimic poison frog (primary hap 2023 refseq)
GCF_032444005.1
53,268
(1.27 %)
n/a 14,955
(0.34 %)
42,108
(1.16 %)
n/a 44.95
(100.00 %)
0
(0 %)
765
(0.00 %)
1,672
(100.00 %)
1,716,755
(1.89 %)
4,088,682
(23.45 %)
2,436
(100.00 %)
14
(0.00 %)
4,114,618
(5.60 %)
694,865
(6.34 %)
674,154
(5.93 %)
349 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1
n/a n/a 17,701
(1.62 %)
73,433
(5.69 %)
n/a 42.20
(99.98 %)
14
(0.00 %)
1,398
(0.02 %)
388
(100.00 %)
6,438,444
(40.32 %)
1,202,669
(11.51 %)
7,055,665
(47.04 %)
6
(0.00 %)
1,343,489
(8.04 %)
74,954
(3.44 %)
26,325
(0.98 %)
350 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1
61,711
(2.51 %)
n/a 19,550
(1.49 %)
21,499
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
0
(0 %)
1,177
(0.01 %)
1,374
(100.00 %)
4,006,927
(35.92 %)
1,058,105
(12.08 %)
12,708,103
(42.66 %)
4
(0.00 %)
1,500,515
(4.32 %)
72,756
(1.59 %)
44,094
(1.06 %)
351 monito del monte (primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1
47,034
(2.02 %)
n/a 18,399
(0.80 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
0
(0 %)
260
(0.09 %)
17
(100.00 %)
9,107,968
(41.08 %)
1,249,635
(2.12 %)
21,135,324
(42.80 %)
0
(0 %)
1,546,314
(2.55 %)
16,598
(0.36 %)
13,911
(0.23 %)
352 mute swan (v2 primary hap 2021)
GCF_009769625.2
59,524
(6.76 %)
n/a 12,983
(1.98 %)
22,400
(2.22 %)
33,839
(5.17 %)
41.92
(99.13 %)
0
(0 %)
451
(0.87 %)
171
(100.00 %)
700,051
(7.55 %)
301,579
(1.34 %)
6,791,838
(21.30 %)
1
(0.00 %)
78,712
(0.74 %)
31,278
(3.07 %)
30,009
(2.01 %)
353 narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022)
GCA_005190385.3
n/a n/a 18,681
(1.79 %)
19,816
(1.40 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
313
(0.00 %)
101
(100.00 %)
3,618,235
(37.24 %)
612,229
(1.52 %)
12,641,632
(35.02 %)
0
(0 %)
550,897
(1.69 %)
60,518
(1.78 %)
57,655
(1.47 %)
354 Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_964656225.1
n/a n/a 18,001
(1.75 %)
21,219
(1.77 %)
n/a 42.26
(99.98 %)
0
(0 %)
1,836
(0.02 %)
1,062
(100.00 %)
3,664,854
(32.90 %)
906,692
(8.55 %)
10,164,440
(37.98 %)
12
(0.00 %)
783,617
(2.68 %)
56,705
(2.75 %)
55,975
(1.86 %)
355 Natterer's bat (mMyoNat1.hap1.1 2024)
GCA_964212035.1
n/a n/a 19,180
(1.72 %)
22,635
(1.71 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
0
(0 %)
1,620
(0.02 %)
343
(100.00 %)
3,081,500
(24.27 %)
797,071
(5.37 %)
10,372,159
(38.30 %)
18
(0.00 %)
729,559
(2.57 %)
64,460
(2.57 %)
57,628
(1.87 %)
356 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579445.1
31,033
(4.42 %)
n/a 12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
0
(0 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
5
(0.00 %)
478,923
(3.35 %)
31,693
(3.88 %)
22,817
(1.16 %)
357 New Caledonian crow (primary hap 2019)
GCF_009650955.1
50,821
(6.95 %)
n/a 12,747
(1.94 %)
23,372
(2.37 %)
30,299
(3.60 %)
42.57
(97.41 %)
0
(0 %)
289
(2.59 %)
105
(100.00 %)
452,690
(6.21 %)
231,546
(1.70 %)
6,265,995
(19.54 %)
0
(0 %)
191,789
(1.34 %)
31,909
(2.48 %)
24,362
(1.33 %)
358 New Zealand spotty (primary hap refseq)
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
n/a 14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,987
(4.42 %)
18,299
(0.85 %)
7,999
(0.35 %)
359 Nicobar pigeon (hap1 2024 refseq)
GCF_036013445.1
34,506
(4.09 %)
n/a 13,358
(1.72 %)
24,851
(2.13 %)
n/a 44.64
(100.00 %)
0
(0 %)
117
(0.00 %)
806
(100.00 %)
705,074
(18.28 %)
342,297
(9.55 %)
6,410,054
(28.06 %)
0
(0 %)
778,929
(4.34 %)
38,589
(9.40 %)
31,815
(1.47 %)
360 Nile rat (paternal hap 2024)
GCA_011762505.3
n/a n/a 20,986
(2.01 %)
19,611
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
0
(0 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,532,782
(33.95 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,612,916
(32.71 %)
2
(0.00 %)
1,064,933
(2.09 %)
17,767
(0.51 %)
16,931
(0.46 %)
361 nine-banded armadillo (hap2 2023)
GCF_030445035.1
69,043
(2.70 %)
n/a 20,516
(1.05 %)
n/a n/a 41.00
(99.68 %)
0
(0 %)
771
(0.32 %)
539
(100.00 %)
4,656,325
(32.86 %)
726,574
(1.99 %)
19,585,522
(43.65 %)
4
(0.00 %)
720,053
(1.59 %)
140,990
(2.86 %)
76,550
(1.81 %)
362 ninespine stickleback (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316345.1
57,816
(15.11 %)
n/a 14,598
(3.83 %)
49,473
(9.87 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
174
(100.00 %)
599,085
(14.68 %)
186,746
(10.27 %)
2,273,889
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
363 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1
n/a n/a 19,700
(1.54 %)
22,354
(1.46 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
244
(0.00 %)
244
(0.00 %)
2,082
(100.00 %)
6,089,884
(47.99 %)
1,358,786
(9.39 %)
13,799,349
(39.08 %)
3
(0.00 %)
1,511,691
(3.84 %)
24,733
(0.70 %)
22,588
(0.58 %)
364 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1
n/a n/a 18,102
(1.58 %)
20,073
(1.40 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
0
(0 %)
277
(0.00 %)
116
(100.00 %)
4,958,089
(41.64 %)
719,163
(1.59 %)
13,867,662
(33.89 %)
7
(0.00 %)
506,727
(1.48 %)
51,299
(1.36 %)
33,440
(0.96 %)
365 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1
49,646
(1.86 %)
n/a 19,562
(1.46 %)
21,631
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
367
(0.17 %)
789
(100.00 %)
1,368,536
(2.24 %)
841,303
(13.08 %)
12,527,582
(43.92 %)
11
(0.00 %)
1,404,448
(3.90 %)
94,259
(1.92 %)
41,005
(0.96 %)
366 North Island brown kiwi (hap1 2024 refseq)
GCF_036417845.1
39,806
(3.75 %)
n/a 13,668
(1.52 %)
25,226
(1.90 %)
n/a 44.01
(100.00 %)
0
(0 %)
170
(0.00 %)
408
(100.00 %)
713,264
(8.42 %)
603,930
(6.25 %)
5,379,069
(27.65 %)
1
(0.00 %)
501,448
(3.32 %)
50,913
(9.74 %)
40,971
(3.07 %)
367 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1
n/a n/a 18,636
(1.75 %)
21,446
(1.68 %)
n/a 43.32
(99.99 %)
0
(0 %)
1,423
(0.01 %)
207
(100.00 %)
1,259,729
(2.95 %)
905,676
(6.25 %)
10,554,535
(38.21 %)
3
(0.00 %)
780,081
(2.54 %)
77,656
(3.27 %)
60,964
(2.14 %)
368 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1
n/a n/a 18,924
(1.53 %)
22,934
(1.58 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
0
(0 %)
199
(0.00 %)
146
(100.00 %)
3,850,624
(31.21 %)
648,359
(3.76 %)
11,788,702
(39.25 %)
2
(0.00 %)
811,589
(2.31 %)
85,908
(2.60 %)
73,781
(1.91 %)
369 northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024)
GCA_039880945.1
n/a n/a 18,933
(1.44 %)
23,629
(1.50 %)
n/a 42.60
(100.00 %)
0
(0 %)
113
(0.00 %)
366
(100.00 %)
4,027,155
(30.73 %)
712,278
(5.22 %)
12,003,034
(41.58 %)
3
(0.00 %)
975,691
(2.71 %)
96,116
(3.02 %)
75,017
(1.84 %)
370 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1
n/a n/a 19,073
(1.44 %)
20,821
(1.21 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
1,098
(0.01 %)
757
(100.00 %)
3,997,911
(34.76 %)
769,275
(14.94 %)
12,133,820
(44.83 %)
6
(0.00 %)
3,171,972
(7.30 %)
67,258
(2.00 %)
38,513
(0.89 %)
371 northern cavefish (hap1 2024)
GCA_046255685.1
n/a n/a 14,295
(2.22 %)
50,623
(6.07 %)
n/a 42.09
(99.99 %)
0
(0 %)
466
(0.01 %)
892
(100.00 %)
1,941,831
(49.35 %)
650,256
(17.85 %)
3,210,410
(44.77 %)
0
(0 %)
978,430
(8.94 %)
55,251
(4.79 %)
22,975
(1.21 %)
372 northern gannet (hap2 2023)
GCA_031468815.1
n/a n/a 13,477
(1.77 %)
23,613
(2.08 %)
n/a 42.44
(100.00 %)
6
(0.00 %)
248
(0.00 %)
427
(100.00 %)
474,930
(4.45 %)
237,604
(2.75 %)
5,847,260
(21.07 %)
30
(0.00 %)
226,420
(1.83 %)
30,873
(3.03 %)
26,071
(1.23 %)
373 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v1 2022 refseq)
GCF_929443795.1
50,663
(4.74 %)
n/a 13,528
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
183
(0.00 %)
454
(100.00 %)
521,768
(3.86 %)
325,987
(9.82 %)
5,542,269
(27.30 %)
4
(0.00 %)
458,030
(3.08 %)
43,070
(4.44 %)
32,753
(1.47 %)
374 northern goshawk (v2 primary hap 2022 genbank)
GCA_929443795.2
n/a n/a 13,527
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
183
(0.00 %)
455
(100.00 %)
511,000
(3.76 %)
325,992
(9.82 %)
5,542,342
(27.30 %)
4
(0.00 %)
458,026
(3.08 %)
43,070
(4.44 %)
32,753
(1.47 %)
375 northern pike (primary hap 2020 refseq)
GCF_011004845.1
63,733
(9.28 %)
n/a 16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,941
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
0
(0 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
1
(0.00 %)
602,569
(4.43 %)
42,910
(2.52 %)
22,099
(1.02 %)
376 northern pintail (primary hap 2024 refseq)
GCF_963932015.1
61,479
(7.27 %)
n/a 13,217
(1.88 %)
23,886
(2.27 %)
n/a 42.56
(99.99 %)
0
(0 %)
631
(0.01 %)
394
(100.00 %)
734,760
(5.74 %)
422,946
(7.08 %)
6,491,116
(25.88 %)
10
(0.00 %)
474,748
(3.08 %)
34,601
(2.98 %)
28,080
(1.42 %)
377 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024)
GCA_043748575.1
n/a n/a 18,475
(1.82 %)
19,990
(1.56 %)
n/a 40.72
(100.00 %)
2
(0.00 %)
63
(0.00 %)
68
(100.00 %)
3,507,612
(39.92 %)
711,081
(2.15 %)
11,788,205
(32.17 %)
0
(0 %)
524,992
(2.03 %)
35,670
(1.25 %)
28,616
(1.05 %)
378 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
99,139
(4.10 %)
n/a 21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
4
(0.00 %)
1,172,090
(3.51 %)
19,244
(0.46 %)
16,098
(0.39 %)
379 Obi paradise-crow (lycPyr6 2020)
GCA_014706295.1
n/a n/a 12,592
(1.89 %)
24,002
(2.35 %)
n/a 42.94
(99.48 %)
0
(0 %)
1,602
(0.52 %)
1,695
(100.00 %)
466,546
(6.40 %)
235,283
(1.98 %)
6,371,421
(20.17 %)
15
(0.01 %)
202,970
(1.78 %)
34,247
(3.02 %)
26,600
(1.39 %)
380 ocellated dragonet (captive hap1 2024)
GCA_044231665.1
n/a n/a 13,787
(3.68 %)
60,819
(10.07 %)
n/a 45.42
(100.00 %)
1
(0.00 %)
99
(0.00 %)
108
(100.00 %)
259,874
(3.38 %)
94,885
(3.76 %)
2,302,967
(21.04 %)
2
(0.00 %)
145,739
(2.25 %)
58,433
(13.25 %)
46,364
(6.81 %)
381 old wife E.armatus (hap1 2024)
GCF_043641665.1
32,231
(8.81 %)
n/a 15,382
(3.41 %)
41,015
(7.24 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
114
(0.00 %)
136
(100.00 %)
1,143,877
(18.90 %)
219,801
(2.87 %)
3,652,133
(23.09 %)
3
(0.00 %)
154,745
(1.82 %)
19,721
(1.34 %)
13,176
(0.82 %)
382 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1
n/a n/a 13,448
(1.31 %)
17,745
(2.07 %)
n/a 40.20
(99.98 %)
73
(0.02 %)
73
(0.02 %)
116
(99.98 %)
741,052
(2.98 %)
411,477
(3.31 %)
7,668,994
(30.14 %)
0
(0 %)
318,343
(2.06 %)
34,560
(2.18 %)
21,974
(1.10 %)
383 one-colored caecilian (2021)
GCA_901765095.2
n/a n/a 14,569
(0.43 %)
30,498
(1.16 %)
n/a 44.01
(98.99 %)
0
(0 %)
2,452
(1.01 %)
1,081
(100.00 %)
1,894,383
(1.68 %)
1,670,443
(3.30 %)
22,207,143
(52.43 %)
5
(0.00 %)
1,718,803
(3.44 %)
414,828
(3.91 %)
47,796
(0.38 %)
384 orange-tipped seq squirt (primary hap 2023)
GCA_963082875.1
n/a n/a 3,120
(1.99 %)
3,357
(8.53 %)
n/a 31.55
(99.96 %)
1
(0.00 %)
244
(0.04 %)
106
(100.00 %)
56,509
(6.44 %)
43,313
(12.97 %)
962,614
(51.07 %)
8
(0.01 %)
176,523
(12.45 %)
1,079
(6.77 %)
694
(0.37 %)
385 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
n/a 15,761
(1.50 %)
31,563
(4.00 %)
59,905
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
0
(0 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,257,250
(5.57 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
0
(0 %)
1,304,958
(6.34 %)
29,320
(0.87 %)
15,066
(0.43 %)
386 Pacific ridley (hap1 2025)
GCA_965140295.1
n/a 21,497
(1.67 %)
14,698
(1.03 %)
17,429
(1.50 %)
n/a 44.13
(99.98 %)
0
(0 %)
69
(0.02 %)
44
(100.00 %)
1,340,389
(12.41 %)
313,433
(2.43 %)
10,832,333
(34.73 %)
1
(0.00 %)
642,980
(2.58 %)
47,256
(1.42 %)
24,677
(0.61 %)
387 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1
n/a n/a 14,522
(0.54 %)
21,861
(1.14 %)
n/a 39.52
(98.39 %)
0
(0 %)
3,681
(1.61 %)
1,318
(100.00 %)
1,928,844
(4.34 %)
3,684,477
(13.44 %)
19,091,818
(55.21 %)
1
(0.00 %)
4,715,600
(8.73 %)
127,760
(1.34 %)
9,458
(0.10 %)
388 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2
54,932
(3.31 %)
n/a 18,171
(1.69 %)
20,025
(1.62 %)
42,786
(3.39 %)
42.38
(99.28 %)
0
(0 %)
884
(0.72 %)
77
(100.00 %)
3,069,141
(30.00 %)
385,664
(0.81 %)
12,050,232
(30.57 %)
1
(0.00 %)
174,292
(0.75 %)
63,905
(3.75 %)
66,744
(3.26 %)
389 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
n/a 18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
0
(0 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
1
(0.00 %)
714,726
(2.00 %)
79,984
(2.45 %)
71,436
(1.91 %)
390 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1
n/a n/a 19,688
(1.69 %)
21,998
(1.64 %)
n/a 43.04
(99.72 %)
19
(0.01 %)
234
(0.28 %)
112
(99.99 %)
2,794,986
(22.60 %)
938,016
(3.72 %)
11,241,518
(39.41 %)
0
(0 %)
704,408
(2.03 %)
70,272
(2.89 %)
61,250
(1.98 %)
391 palmate newt (primary hap 2024)
GCA_964261635.1
n/a n/a 17,611
(0.09 %)
227,382
(1.73 %)
n/a 45.09
(100.00 %)
0
(0 %)
5,245
(0.00 %)
448
(100.00 %)
4,668,195
(1.49 %)
9,253,372
(10.94 %)
5,693
(100.00 %)
48
(0.00 %)
1,460,718
(0.63 %)
2,493,727
(7.98 %)
2,437,739
(7.71 %)
392 Papuan ground boa (hap2 2024 refseq)
GCF_035149785.1
31,826
(3.55 %)
n/a 13,389
(1.26 %)
17,495
(1.99 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
149
(100.00 %)
728,567
(2.82 %)
348,603
(2.13 %)
7,199,026
(33.55 %)
1
(0.00 %)
318,786
(2.43 %)
51,807
(2.69 %)
19,758
(0.92 %)
393 parallel lanternfish (primary hap 2024)
GCA_964188405.1
n/a n/a 16,917
(1.64 %)
72,190
(5.85 %)
n/a 42.91
(99.96 %)
0
(0 %)
2,729
(0.04 %)
24
(100.00 %)
4,976,327
(35.08 %)
1,258,755
(18.52 %)
6,268,804
(48.21 %)
12
(0.00 %)
1,744,372
(10.22 %)
81,193
(3.23 %)
34,135
(1.37 %)
394 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1
n/a n/a 17,913
(1.72 %)
20,720
(1.72 %)
n/a 43.54
(99.99 %)
7
(0.00 %)
980
(0.01 %)
185
(100.00 %)
2,932,869
(21.94 %)
874,665
(4.83 %)
10,263,103
(37.46 %)
2
(0.00 %)
742,499
(2.50 %)
77,397
(4.55 %)
76,849
(2.51 %)
395 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1
n/a n/a 15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
0
(0 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
975,354
(15.76 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,904
(35.09 %)
1
(0.00 %)
865,727
(6.60 %)
49,121
(3.07 %)
20,467
(0.93 %)
396 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1
n/a n/a 15,317
(2.02 %)
61,647
(6.35 %)
n/a 41.37
(99.99 %)
135
(0.01 %)
135
(0.01 %)
469
(99.99 %)
981,519
(15.40 %)
319,637
(12.45 %)
3,706,473
(36.77 %)
0
(0 %)
952,761
(6.98 %)
50,353
(2.98 %)
20,537
(0.91 %)
397 peladilla (primary hap 2021)
GCA_017639675.1
n/a n/a 13,829
(3.83 %)
41,932
(8.64 %)
n/a 45.01
(98.24 %)
0
(0 %)
1,158
(1.77 %)
41
(100.00 %)
930,246
(18.49 %)
660,569
(13.71 %)
2,316,198
(27.66 %)
6
(0.00 %)
537,418
(6.48 %)
41,023
(4.40 %)
27,287
(2.49 %)
398 pencil smelt N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1
n/a n/a 17,996
(2.00 %)
89,591
(7.93 %)
n/a 45.22
(99.94 %)
0
(0 %)
3,299
(0.06 %)
1,177
(100.00 %)
2,828,457
(30.93 %)
1,676,413
(19.87 %)
4,137,400
(48.69 %)
14
(0.00 %)
1,929,538
(11.96 %)
78,669
(4.37 %)
29,960
(1.34 %)
399 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634155.1
49,100
(5.64 %)
n/a 13,021
(1.66 %)
21,794
(1.95 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
0
(0 %)
241
(0.31 %)
125
(100.00 %)
586,320
(11.83 %)
335,218
(8.05 %)
7,038,851
(24.65 %)
0
(0 %)
405,474
(2.46 %)
26,085
(2.25 %)
20,023
(0.87 %)
400 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501925.1
n/a n/a 23,766
(1.52 %)
34,093
(2.42 %)
n/a 39.52
(100.00 %)
9
(0.00 %)
500
(0.00 %)
897
(100.00 %)
919,152
(1.89 %)
1,157,711
(8.01 %)
14,217,996
(45.44 %)
0
(0 %)
1,995,399
(5.51 %)
108,139
(1.26 %)
16,761
(0.21 %)
401 Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1
44,950
(1.91 %)
n/a 20,385
(1.64 %)
22,123
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
116
(0.00 %)
130
(100.00 %)
4,492,417
(39.31 %)
627,841
(4.79 %)
15,561,458
(36.57 %)
2
(0.00 %)
862,813
(2.91 %)
45,336
(1.27 %)
44,264
(1.15 %)
402 picturesque dragonet (SynPic1 hap2 2024)
GCA_044231675.1
n/a n/a 13,816
(3.52 %)
52,689
(9.01 %)
n/a 43.48
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
300
(100.00 %)
223,762
(3.25 %)
105,291
(6.28 %)
2,579,336
(24.55 %)
0
(0 %)
233,535
(3.55 %)
41,114
(5.50 %)
32,452
(3.61 %)
403 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1
n/a n/a 18,472
(1.44 %)
19,911
(1.28 %)
n/a 42.63
(99.98 %)
0
(0 %)
878
(0.02 %)
379
(100.00 %)
3,996,827
(27.97 %)
2,094,728
(7.23 %)
12,677,118
(40.57 %)
4
(0.00 %)
1,289,995
(3.44 %)
81,791
(2.82 %)
46,045
(1.12 %)
404 pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 refseq)
GCF_043159975.1
103,003
(4.05 %)
n/a 20,760
(1.76 %)
21,155
(1.14 %)
n/a 41.04
(100.00 %)
0
(0 %)
260
(0.00 %)
361
(100.00 %)
5,396,194
(53.53 %)
1,039,569
(9.75 %)
15,407,787
(41.73 %)
1
(0.00 %)
2,204,399
(4.61 %)
99,854
(1.52 %)
30,377
(0.77 %)
405 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
n/a 15,738
(2.42 %)
26,691
(5.69 %)
57,069
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
0
(0 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,063,888
(5.90 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
0
(0 %)
374,590
(3.12 %)
41,636
(2.04 %)
21,488
(0.92 %)
406 pink pigeon (primary hap 2023)
GCA_963082525.1
n/a n/a 13,140
(1.85 %)
25,111
(2.31 %)
n/a 42.27
(99.99 %)
0
(0 %)
509
(0.01 %)
143
(100.00 %)
488,313
(5.48 %)
331,962
(3.50 %)
6,243,204
(22.87 %)
0
(0 %)
441,492
(2.54 %)
36,343
(3.63 %)
31,102
(1.89 %)
407 pink sea squirt (2022)
GCA_947561715.1
n/a n/a 3,449
(1.48 %)
14,588
(13.45 %)
n/a 39.19
(100.00 %)
0
(0 %)
32
(0.00 %)
96
(100.00 %)
18,369
(1.83 %)
33,783
(9.73 %)
1,032,597
(26.20 %)
4
(0.00 %)
242,360
(12.34 %)
7,713
(4.85 %)
6,762
(1.51 %)
408 pink-footed goose (primary hap 2024)
GCA_964034855.1
n/a n/a 13,275
(1.76 %)
24,103
(2.11 %)
n/a 43.68
(99.98 %)
0
(0 %)
1,137
(0.02 %)
715
(100.00 %)
792,215
(9.76 %)
471,286
(10.34 %)
6,448,623
(29.48 %)
7
(0.00 %)
821,367
(5.38 %)
49,485
(4.41 %)
36,058
(2.18 %)
409 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023)
GCA_033958435.1
n/a n/a 14,675
(1.05 %)
16,697
(1.47 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
134
(100.00 %)
3,772,260
(47.94 %)
322,081
(1.52 %)
11,123,166
(34.14 %)
0
(0 %)
448,027
(1.56 %)
129,645
(3.29 %)
28,529
(1.18 %)
410 plains spadefoot toad (primary hap 2022)
GCF_027358695.1
41,009
(4.67 %)
n/a 13,912
(2.00 %)
25,745
(4.50 %)
n/a 40.45
(99.61 %)
0
(0 %)
102
(0.39 %)
17
(100.00 %)
497,976
(3.84 %)
645,915
(10.08 %)
5,232,342
(36.26 %)
1
(0.00 %)
748,493
(5.83 %)
72,598
(4.35 %)
32,385
(1.89 %)
411 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2
51,392
(3.07 %)
n/a 14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
0
(0 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
0
(0 %)
1,130,252
(3.59 %)
87,796
(6.47 %)
74,209
(2.87 %)
412 plumbeous ibis (primary hap 2021)
GCA_020745775.1
n/a n/a 13,028
(1.84 %)
22,722
(2.10 %)
n/a 42.37
(99.81 %)
0
(0 %)
104
(0.19 %)
88
(100.00 %)
488,030
(6.66 %)
188,606
(1.01 %)
6,982,793
(20.08 %)
0
(0 %)
89,388
(0.77 %)
32,920
(3.37 %)
32,773
(1.95 %)
413 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1
n/a n/a 14,126
(2.81 %)
61,907
(8.75 %)
n/a 45.67
(99.94 %)
0
(0 %)
1,810
(0.06 %)
616
(100.00 %)
753,034
(10.17 %)
850,189
(15.72 %)
2,888,555
(33.70 %)
7
(0.00 %)
642,528
(6.84 %)
80,883
(8.43 %)
46,894
(3.34 %)
414 pool frog (hap1 2025)
GCA_965119305.1
n/a n/a 14,446
(0.34 %)
39,585
(1.24 %)
n/a 43.75
(99.99 %)
33
(0.00 %)
3,044
(0.01 %)
1,361
(100.00 %)
2,734,844
(2.59 %)
3,759,979
(13.10 %)
24,289,849
(60.22 %)
22
(0.00 %)
6,436,651
(8.33 %)
558,423
(4.11 %)
48,365
(0.35 %)
415 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
n/a 14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
0
(0 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
3
(0.00 %)
1,746,915
(7.91 %)
172,199
(5.45 %)
18,080
(0.31 %)
416 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1
n/a n/a 17,919
(1.46 %)
19,330
(1.31 %)
n/a 40.78
(100.00 %)
0
(0 %)
68
(0.00 %)
41
(100.00 %)
3,707,234
(28.28 %)
643,817
(2.22 %)
12,106,384
(41.48 %)
5
(0.00 %)
871,436
(2.63 %)
54,438
(1.38 %)
34,899
(0.85 %)
417 Puerto Rican coqui (hap1 2024)
GCA_035609145.1
n/a n/a 13,881
(0.57 %)
32,313
(1.67 %)
n/a 44.91
(100.00 %)
6
(0.00 %)
659
(0.00 %)
963
(100.00 %)
1,044,181
(1.98 %)
1,442,189
(16.51 %)
14,710,175
(54.00 %)
6
(0.00 %)
4,070,195
(8.73 %)
501,931
(8.81 %)
49,483
(0.82 %)
418 pygmy chimpanzee (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_029289425.2
95,418
(4.20 %)
n/a 21,182
(1.74 %)
23,352
(1.22 %)
n/a 40.43
(99.84 %)
0
(0 %)
6
(0.16 %)
31
(100.00 %)
5,436,203
(50.57 %)
1,021,767
(12.45 %)
15,964,628
(43.17 %)
1
(0.03 %)
3,743,841
(6.31 %)
48,818
(1.07 %)
29,887
(0.74 %)
419 pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq)
GCF_026419965.1
56,261
(2.22 %)
n/a 18,496
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
0
(0 %)
143
(0.19 %)
581
(100.00 %)
3,817,659
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,998
(39.96 %)
0
(0 %)
1,197,809
(3.53 %)
101,353
(2.90 %)
50,216
(1.47 %)
420 rabbit (primary hap 2024)
GCA_964237555.1
n/a n/a 19,386
(1.31 %)
22,863
(1.35 %)
n/a 44.02
(99.98 %)
0
(0 %)
2,276
(0.02 %)
222
(100.00 %)
4,099,590
(21.20 %)
1,062,902
(3.78 %)
13,416,878
(41.72 %)
5
(0.00 %)
1,560,079
(3.77 %)
116,524
(2.66 %)
74,863
(1.94 %)
421 rabbit (primary hap 2024)
GCF_964237555.1
95,289
(4.22 %)
n/a 19,385
(1.31 %)
22,631
(1.31 %)
n/a 44.02
(99.98 %)
0
(0 %)
2,276
(0.02 %)
221
(100.00 %)
4,099,586
(21.20 %)
1,062,900
(3.78 %)
13,416,814
(41.72 %)
5
(0.00 %)
1,560,076
(3.77 %)
116,523
(2.66 %)
74,863
(1.94 %)
422 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1
n/a n/a 15,639
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
0
(0 %)
1,907
(0.07 %)
365
(100.00 %)
1,655,350
(30.53 %)
511,512
(12.09 %)
2,015,264
(35.19 %)
4
(0.00 %)
468,697
(7.41 %)
32,410
(4.33 %)
18,662
(1.57 %)
423 razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658365.1
n/a n/a 12,787
(1.83 %)
22,839
(2.13 %)
n/a 42.67
(99.70 %)
0
(0 %)
227
(0.30 %)
95
(100.00 %)
543,517
(7.16 %)
212,546
(1.12 %)
6,930,708
(20.10 %)
0
(0 %)
103,901
(0.79 %)
38,960
(3.02 %)
35,213
(1.80 %)
424 red deer (2021)
GCF_910594005.1
68,992
(2.68 %)
n/a 20,470
(1.48 %)
22,563
(1.32 %)
n/a 42.98
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
144
(100.00 %)
5,501,063
(44.60 %)
503,301
(12.23 %)
13,102,622
(44.55 %)
1
(0.00 %)
2,197,198
(5.57 %)
88,756
(1.66 %)
46,960
(1.12 %)
425 red fox (hap1 2024)
GCA_964106825.2
n/a n/a 19,622
(1.57 %)
20,371
(1.38 %)
n/a 41.34
(99.98 %)
0
(0 %)
1,845
(0.02 %)
461
(100.00 %)
4,519,485
(31.91 %)
1,018,114
(2.59 %)
13,810,284
(32.99 %)
9
(0.00 %)
712,146
(1.92 %)
52,053
(2.31 %)
47,294
(1.54 %)
426 red-bellied piranha (primary hap 2020)
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
n/a 16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
76,011
(5.65 %)
40.58
(99.17 %)
0
(0 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
2
(0.00 %)
1,005,141
(5.14 %)
33,087
(1.38 %)
20,822
(0.79 %)
427 red-billed tropicbird (maternal hap 2024)
GCA_964289735.1
n/a n/a 13,231
(1.68 %)
24,060
(2.00 %)
n/a 43.15
(99.98 %)
3
(0.00 %)
1,269
(0.02 %)
660
(100.00 %)
440,963
(5.78 %)
187,847
(3.22 %)
6,601,610
(24.99 %)
24
(0.00 %)
232,304
(1.91 %)
54,002
(5.24 %)
46,380
(3.01 %)
428 red-crested pochard (primary hap 2024)
GCA_964035555.1
n/a n/a 13,234
(1.92 %)
23,753
(2.26 %)
n/a 42.08
(99.99 %)
0
(0 %)
714
(0.01 %)
141
(100.00 %)
772,537
(6.34 %)
437,831
(4.05 %)
6,488,340
(24.52 %)
27
(0.00 %)
332,911
(2.45 %)
31,577
(2.49 %)
28,022
(1.51 %)
429 red-crested turaco (primary hap 2019)
GCA_009769465.1
n/a n/a 12,744
(1.75 %)
25,706
(2.29 %)
n/a 42.60
(97.89 %)
0
(0 %)
344
(2.11 %)
140
(100.00 %)
551,885
(8.95 %)
176,530
(0.80 %)
6,805,042
(22.19 %)
0
(0 %)
138,426
(1.12 %)
43,051
(3.40 %)
34,997
(2.03 %)
430 red-fronted tinkerbird (primary hap 2020 refseq)
GCF_015220805.1
44,843
(4.51 %)
n/a 12,341
(1.60 %)
23,205
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
0
(0 %)
307
(0.47 %)
252
(100.00 %)
981,758
(15.82 %)
378,855
(4.28 %)
6,003,474
(35.88 %)
0
(0 %)
1,148,439
(6.01 %)
26,519
(1.76 %)
21,399
(1.21 %)
431 red-legged seriema (primary hap 2019)
GCA_009819825.1
n/a n/a 13,229
(1.84 %)
25,580
(2.35 %)
n/a 42.20
(99.59 %)
0
(0 %)
194
(0.41 %)
110
(100.00 %)
483,784
(6.50 %)
160,481
(0.73 %)
6,960,060
(19.71 %)
0
(0 %)
64,843
(0.56 %)
32,899
(2.77 %)
30,208
(1.91 %)
432 red-throated loon (hap2 2023 refseq)
GCF_030936135.1
25,173
(3.02 %)
n/a 13,216
(1.71 %)
24,050
(2.10 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
1,185
(100.00 %)
544,422
(8.81 %)
223,672
(5.77 %)
6,669,433
(23.63 %)
3
(0.00 %)
398,584
(2.64 %)
38,305
(3.37 %)
35,068
(1.78 %)
433 red-winged blackbird (BioBank_ID:100140 2023)
GCF_020745825.1
29,994
(3.93 %)
n/a 12,687
(1.75 %)
25,287
(2.30 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
106
(0.00 %)
106
(0.00 %)
516
(100.00 %)
785,960
(17.62 %)
522,256
(9.27 %)
6,371,580
(25.40 %)
0
(0 %)
496,798
(2.87 %)
32,643
(2.66 %)
23,497
(1.27 %)
434 reedfish (2021)
GCF_900747795.2
44,479
(2.01 %)
n/a 13,108
(0.46 %)
23,157
(1.29 %)
n/a 39.37
(99.18 %)
0
(0 %)
1,431
(0.82 %)
169
(100.00 %)
8,636,520
(39.34 %)
1,069,643
(2.91 %)
19,980,572
(47.52 %)
17
(0.00 %)
1,256,071
(2.69 %)
89,023
(1.13 %)
22,697
(0.30 %)
435 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1
n/a n/a 18,947
(1.29 %)
24,114
(1.28 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,892
(100.00 %)
3,375,476
(23.21 %)
654,539
(6.64 %)
11,132,469
(48.29 %)
0
(0 %)
3,008,562
(7.07 %)
79,357
(2.66 %)
41,548
(0.93 %)
436 Reeves' muntjac (primary hap 2024)
GCF_963930625.1
52,442
(2.57 %)
n/a 19,577
(1.52 %)
22,283
(1.38 %)
n/a 41.89
(99.99 %)
0
(0 %)
682
(0.01 %)
267
(100.00 %)
3,294,672
(23.89 %)
527,436
(2.98 %)
13,137,581
(39.89 %)
1
(0.00 %)
1,222,379
(3.05 %)
57,436
(1.81 %)
44,949
(1.09 %)
437 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1
59,888
(2.34 %)
n/a 19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
0
(0 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
4
(0.00 %)
1,071,329
(3.37 %)
73,126
(1.69 %)
43,865
(1.11 %)
438 rifleman (primary hap 2021)
GCA_016904835.1
n/a n/a 12,620
(1.92 %)
24,568
(2.61 %)
n/a 42.41
(99.61 %)
0
(0 %)
195
(0.39 %)
206
(100.00 %)
495,673
(9.14 %)
253,008
(2.04 %)
5,936,177
(19.93 %)
0
(0 %)
269,642
(1.76 %)
20,145
(1.83 %)
15,953
(0.89 %)
439 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 primary hap 2024)
GCF_040937935.1
62,635
(1.63 %)
n/a 14,072
(0.39 %)
44,953
(1.74 %)
n/a 44.98
(99.99 %)
0
(0 %)
3,039
(0.01 %)
477
(100.00 %)
2,058,700
(2.53 %)
3,206,511
(15.84 %)
20,407,989
(60.26 %)
40
(0.00 %)
n/a 741,520
(6.10 %)
65,051
(0.49 %)
440 ring-tailed lemur (primary hap 2021)
GCF_020740605.2
55,883
(2.78 %)
n/a 18,659
(1.98 %)
20,542
(1.50 %)
n/a 41.36
(99.84 %)
0
(0 %)
210
(0.16 %)
185
(100.00 %)
3,432,734
(37.67 %)
518,071
(6.84 %)
12,916,577
(32.91 %)
0
(0 %)
864,748
(2.57 %)
50,626
(1.88 %)
48,082
(1.65 %)
441 Risso's dolphin (hap1.1 2024)
GCA_964374135.1
n/a n/a 18,825
(1.58 %)
20,986
(1.29 %)
n/a 42.25
(99.99 %)
4
(0.00 %)
1,138
(0.01 %)
1,150
(100.00 %)
4,405,513
(43.51 %)
1,342,544
(11.28 %)
12,274,096
(41.76 %)
9
(0.00 %)
1,663,930
(5.05 %)
76,936
(4.65 %)
55,192
(2.62 %)
442 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2
n/a n/a 27,928
(1.66 %)
110,791
(4.44 %)
n/a 43.36
(96.90 %)
0
(0 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
4,690,842
(57.30 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,763
(52.37 %)
2
(0.00 %)
3,475,805
(8.76 %)
70,821
(1.77 %)
19,956
(0.39 %)
443 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1
n/a n/a 18,132
(2.65 %)
63,523
(6.01 %)
n/a 38.80
(99.99 %)
1
(0.00 %)
471
(0.01 %)
86
(100.00 %)
2,613,900
(48.90 %)
625,102
(8.21 %)
5,738,444
(41.24 %)
1
(0.00 %)
1,070,552
(7.36 %)
65,328
(3.68 %)
20,458
(0.81 %)
444 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2
n/a n/a 15,181
(3.34 %)
44,153
(7.53 %)
51,135
(7.40 %)
42.31
(99.98 %)
0
(0 %)
418
(0.02 %)
101
(100.00 %)
1,121,704
(25.48 %)
269,467
(4.88 %)
3,358,709
(24.69 %)
5
(0.00 %)
255,676
(3.48 %)
36,987
(3.02 %)
28,368
(1.91 %)
445 rock pigeon (v2 racing homer 2024 refseq)
GCF_036013475.1
70,874
(7.24 %)
n/a 13,145
(1.66 %)
25,462
(2.12 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
869
(100.00 %)
656,963
(11.76 %)
412,665
(12.92 %)
6,047,535
(29.90 %)
0
(0 %)
1,266,447
(5.89 %)
36,847
(3.12 %)
31,115
(1.65 %)
446 rock ptarmigan (primary hap 2022 refseq)
GCF_023343835.1
51,619
(7.29 %)
n/a 12,832
(2.31 %)
23,047
(2.56 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
0
(0 %)
210
(0.01 %)
165
(100.00 %)
526,839
(5.87 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,345
(21.73 %)
0
(0 %)
216,565
(1.89 %)
21,346
(2.37 %)
19,067
(1.48 %)
447 rouch bullseye (RE-2024b hap1 2024 refseq)
GCF_042242105.1
32,256
(9.05 %)
n/a 15,283
(3.03 %)
44,299
(6.93 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
87
(0.00 %)
441
(100.00 %)
1,115,191
(21.73 %)
271,391
(5.93 %)
3,651,073
(24.53 %)
2
(0.00 %)
299,227
(3.11 %)
19,771
(1.39 %)
13,537
(0.81 %)
448 rough bullseye (RE-2024b hap1 2024 genbank)
GCA_042242105.1
n/a n/a 14,592
(2.84 %)
44,299
(6.93 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
87
(0.00 %)
442
(100.00 %)
1,764,545
(30.13 %)
271,391
(5.93 %)
3,651,092
(24.53 %)
2
(0.00 %)
299,227
(3.11 %)
19,771
(1.39 %)
14,337
(0.85 %)
449 royal ground snake (hap1 2023 genbank)
GCA_031021105.1
n/a n/a 13,327
(0.96 %)
20,347
(1.68 %)
n/a 41.25
(99.99 %)
0
(0 %)
1,391
(0.01 %)
400
(100.00 %)
1,983,903
(10.40 %)
1,698,731
(7.29 %)
9,084,707
(53.44 %)
11
(0.00 %)
1,523,664
(5.77 %)
130,852
(4.47 %)
27,815
(0.70 %)
450 royal ground snake (hap1 2023 refseq)
GCF_031021105.1
45,143
(3.26 %)
n/a 13,488
(0.98 %)
20,353
(1.68 %)
n/a 41.25
(99.99 %)
0
(0 %)
1,391
(0.01 %)
400
(100.00 %)
6,118,914
(59.42 %)
1,698,731
(7.29 %)
9,084,283
(53.44 %)
11
(0.00 %)
1,523,662
(5.77 %)
130,852
(4.47 %)
24,852
(0.74 %)
451 rudd (fScaEry2.hap1.1 2024)
GCA_964197995.1
n/a n/a 18,254
(2.38 %)
68,852
(5.71 %)
n/a 39.02
(99.99 %)
4
(0.00 %)
836
(0.01 %)
759
(100.00 %)
2,854,977
(51.13 %)
754,287
(11.81 %)
5,942,764
(44.17 %)
2
(0.00 %)
1,392,734
(8.61 %)
72,686
(4.52 %)
23,184
(0.94 %)
452 rufous frog (hap2 2023)
GCA_031893055.1
n/a n/a 13,538
(0.88 %)
24,311
(2.15 %)
n/a 42.96
(99.07 %)
0
(0 %)
976
(0.93 %)
1,266
(100.00 %)
711,895
(2.18 %)
1,219,160
(21.56 %)
7,988,458
(54.14 %)
3
(0.00 %)
3,097,457
(9.48 %)
170,920
(3.48 %)
17,791
(0.40 %)
453 saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_949987515.2
46,014
(2.36 %)
n/a 18,616
(1.49 %)
20,618
(1.32 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
968
(0.01 %)
1,598
(99.99 %)
4,020,525
(35.99 %)
1,258,165
(13.09 %)
12,359,758
(42.64 %)
0
(0 %)
1,475,119
(4.19 %)
66,188
(3.91 %)
41,466
(1.03 %)
454 Saker falcon (primary hap 2022 refseq)
GCF_023634085.1
50,290
(5.75 %)
n/a 12,973
(1.67 %)
21,670
(1.90 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
0
(0 %)
258
(0.30 %)
283
(100.00 %)
548,090
(7.21 %)
201,488
(8.55 %)
7,030,877
(24.94 %)
0
(0 %)
469,777
(2.60 %)
31,791
(2.57 %)
20,215
(0.89 %)
455 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887145.1
27,528
(4.03 %)
n/a 12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
0
(0 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
1
(0.00 %)
651,029
(4.07 %)
35,549
(5.05 %)
23,802
(1.15 %)
456 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1
n/a n/a 14,065
(1.09 %)
19,430
(1.84 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
21
(0.00 %)
21
(0.00 %)
155
(100.00 %)
1,307,771
(5.32 %)
672,054
(3.42 %)
9,846,806
(39.03 %)
0
(0 %)
665,794
(3.10 %)
83,805
(3.99 %)
26,762
(0.80 %)
457 San Diegan tiger whiptail (HBS 135688 2022)
GCA_023333525.1
n/a n/a 10,727
(1.18 %)
14,669
(1.99 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
39
(0.00 %)
39
(0.00 %)
113
(100.00 %)
741,937
(6.29 %)
448,194
(5.60 %)
7,227,870
(36.97 %)
0
(0 %)
769,111
(3.76 %)
42,621
(2.15 %)
17,889
(0.90 %)
458 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 refseq)
GCF_023053635.1
33,415
(3.07 %)
n/a 14,091
(1.15 %)
19,337
(1.96 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
0
(0 %)
73
(0.00 %)
34
(100.00 %)
1,577,747
(7.81 %)
774,112
(3.78 %)
9,248,016
(40.42 %)
1
(0.00 %)
823,646
(3.44 %)
80,183
(2.48 %)
27,586
(0.82 %)
459 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1
41,701
(3.64 %)
n/a 14,350
(1.48 %)
19,231
(2.45 %)
32,804
(4.14 %)
43.75
(99.75 %)
0
(0 %)
379
(0.25 %)
29
(100.00 %)
975,474
(5.32 %)
425,414
(1.76 %)
7,135,165
(34.49 %)
0
(0 %)
365,268
(2.50 %)
76,053
(2.68 %)
21,615
(0.85 %)
460 sardine (primary hap 2023 refseq)
GCF_963854185.1
48,146
(9.15 %)
n/a 16,069
(2.33 %)
64,178
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
240
(100.00 %)
1,503,108
(11.74 %)
1,507,022
(15.48 %)
4,027,614
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,852
(8.48 %)
68,873
(3.56 %)
38,589
(1.78 %)
461 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1
108,406
(1.98 %)
n/a 13,959
(0.46 %)
n/a n/a 43.90
(99.99 %)
0
(0 %)
2,297
(0.01 %)
3,474
(100.00 %)
1,903,654
(2.85 %)
2,970,691
(16.56 %)
15,354,577
(64.31 %)
20
(0.00 %)
n/a 652,708
(8.36 %)
43,665
(0.45 %)
462 Savannah sparrow (primary hap 2023)
GCA_031885435.1
n/a n/a 12,986
(1.66 %)
27,028
(2.29 %)
n/a 43.66
(99.78 %)
0
(0 %)
249
(0.22 %)
110
(100.00 %)
464,600
(3.28 %)
681,402
(9.28 %)
6,314,744
(26.92 %)
0
(0 %)
939,361
(5.26 %)
39,406
(5.26 %)
25,911
(1.19 %)
463 Schreibers' long-fingered bat (hap1 2024)
GCA_964146895.1
n/a n/a 17,882
(1.96 %)
21,291
(1.88 %)
n/a 42.53
(99.99 %)
0
(0 %)
1,322
(0.01 %)
265
(100.00 %)
2,639,522
(28.12 %)
453,024
(5.66 %)
10,206,715
(31.11 %)
6
(0.00 %)
673,573
(2.67 %)
59,363
(2.86 %)
53,151
(1.93 %)
464 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1
41,241
(6.50 %)
n/a 7,638
(0.70 %)
36,336
(4.06 %)
83,714
(10.03 %)
48.31
(98.62 %)
0
(0 %)
930
(1.38 %)
1,434
(100.00 %)
1,920,851
(39.36 %)
1,194,165
(21.47 %)
5,320,620
(50.50 %)
4
(0.00 %)
2,982,736
(13.77 %)
178,590
(35.88 %)
120,128
(5.32 %)
465 sea stickleback (SK-2024b hap1 2025)
GCA_048126635.1
n/a n/a 14,310
(4.44 %)
47,336
(10.19 %)
n/a 44.83
(99.99 %)
0
(0 %)
241
(0.01 %)
38
(100.00 %)
446,827
(13.86 %)
192,599
(8.52 %)
2,033,160
(22.85 %)
1
(0.00 %)
175,997
(3.04 %)
61,012
(13.03 %)
47,420
(5.99 %)
466 seaside sparrow (bAmmMar1 primary hap 2024)
GCA_036010785.1
n/a n/a 12,858
(1.52 %)
25,777
(2.02 %)
n/a 44.04
(99.85 %)
0
(0 %)
365
(0.15 %)
501
(100.00 %)
580,376
(4.24 %)
636,266
(12.18 %)
4,804,433
(34.52 %)
0
(0 %)
1,048,820
(7.41 %)
48,871
(4.18 %)
23,097
(1.00 %)
467 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1
n/a n/a 15,032
(2.44 %)
62,625
(6.97 %)
n/a 42.07
(99.98 %)
0
(0 %)
598
(0.02 %)
847
(100.00 %)
967,197
(11.85 %)
498,286
(8.15 %)
4,397,828
(28.96 %)
9
(0.00 %)
531,478
(4.46 %)
65,744
(4.06 %)
42,870
(2.25 %)
468 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 refseq)
GCA_035084215.1
n/a n/a 12,780
(0.49 %)
24,543
(1.38 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
0
(0 %)
1,834
(0.01 %)
1,880
(100.00 %)
597,122
(2.28 %)
1,112,137
(17.97 %)
12,108,056
(57.48 %)
2
(0.00 %)
4,824,033
(9.23 %)
117,585
(3.42 %)
24,151
(0.35 %)
469 sharptooth jobfish (hap1 2024)
GCA_045363895.1
n/a n/a 15,800
(1.77 %)
51,791
(4.52 %)
n/a 39.82
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
283
(100.00 %)
777,839
(3.19 %)
459,791
(3.90 %)
7,958,604
(35.17 %)
0
(0 %)
375,713
(2.47 %)
21,711
(0.94 %)
12,537
(0.40 %)
470 siamang (v2.1 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.3
105,374
(3.05 %)
n/a 20,434
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
0
(0 %)
2
(0.03 %)
27
(100.00 %)
5,354,446
(55.80 %)
935,620
(14.70 %)
14,917,515
(46.01 %)
0
(0 %)
2,398,386
(4.90 %)
92,243
(1.42 %)
27,998
(0.68 %)
471 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4
59,278
(19.85 %)
n/a 14,594
(4.32 %)
55,265
(10.96 %)
n/a 45.31
(99.99 %)
0
(0 %)
321
(0.01 %)
36
(100.00 %)
384,203
(19.38 %)
175,898
(4.39 %)
1,946,630
(23.16 %)
2
(0.00 %)
209,905
(4.10 %)
70,331
(13.13 %)
54,790
(7.31 %)
472 Skyros wall lizard (v2 hap1 2024)
GCA_964106915.2
n/a n/a 14,245
(1.36 %)
19,892
(2.29 %)
n/a 43.82
(99.99 %)
0
(0 %)
883
(0.01 %)
211
(100.00 %)
838,357
(3.88 %)
479,922
(4.42 %)
7,039,963
(38.21 %)
7
(0.00 %)
598,611
(3.50 %)
93,005
(2.80 %)
19,317
(0.73 %)
473 slow loris (primary hap 2022)
GCF_027406575.1
67,211
(2.59 %)
n/a 22,193
(1.49 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 40.82
(99.86 %)
0
(0 %)
218
(0.14 %)
84
(100.00 %)
4,625,872
(39.88 %)
579,983
(1.59 %)
14,405,367
(40.78 %)
2
(0.00 %)
991,294
(2.40 %)
38,257
(0.77 %)
22,955
(0.54 %)
474 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1
55,762
(1.62 %)
n/a 12,597
(0.36 %)
23,987
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
0
(0 %)
7,146
(1.52 %)
646
(100.00 %)
1,185,832
(1.72 %)
1,448,620
(6.25 %)
20,884,767
(51.41 %)
10
(0.00 %)
3,334,926
(4.99 %)
456,658
(8.18 %)
31,096
(0.32 %)
475 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2
n/a n/a 12,587
(0.36 %)
23,986
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
0
(0 %)
7,146
(1.52 %)
645
(100.00 %)
1,451,634
(1.94 %)
1,448,619
(6.25 %)
20,884,741
(51.41 %)
10
(0.00 %)
3,334,909
(4.99 %)
456,658
(8.18 %)
31,096
(0.32 %)
476 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1
34,018
(4.17 %)
n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
0
(0 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
17
(0.00 %)
1,796,705
(8.53 %)
143,632
(7.43 %)
65,914
(2.15 %)
477 smalltooth sawfish (v2.1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1
40,257
(2.94 %)
n/a 12,157
(0.69 %)
18,627
(1.55 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
0
(0 %)
698
(0.91 %)
172
(100.00 %)
4,824,261
(54.91 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,260
(38.19 %)
0
(0 %)
471,344
(1.50 %)
45,398
(1.34 %)
18,410
(0.41 %)
478 snake N.helvetica (rNatHel1.hap1.1 2024)
GCA_964273705.1
n/a n/a 13,534
(1.08 %)
19,681
(1.86 %)
n/a 41.70
(99.98 %)
7
(0.00 %)
2,010
(0.02 %)
494
(100.00 %)
1,264,981
(8.07 %)
885,992
(7.35 %)
8,475,795
(46.16 %)
10
(0.00 %)
746,296
(3.32 %)
117,174
(4.31 %)
24,893
(0.73 %)
479 song sparrow (primary hap 2024 refseq)
GCF_035770615.1
41,069
(3.95 %)
n/a 12,946
(1.39 %)
26,698
(1.87 %)
n/a 44.96
(99.93 %)
0
(0 %)
299
(0.07 %)
353
(100.00 %)
515,851
(3.07 %)
681,436
(15.73 %)
5,004,851
(39.23 %)
1
(0.00 %)
1,925,213
(9.14 %)
47,268
(3.90 %)
25,117
(0.99 %)
480 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1
n/a n/a 18,056
(1.78 %)
21,158
(1.79 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
6
(0.00 %)
161
(0.00 %)
249
(100.00 %)
2,899,535
(21.64 %)
853,717
(7.80 %)
10,162,216
(37.72 %)
1
(0.00 %)
802,761
(2.85 %)
63,256
(3.06 %)
61,642
(2.03 %)
481 South Island takahe (primary hap 2021)
GCA_020800305.1
n/a n/a 12,942
(1.69 %)
23,221
(2.13 %)
n/a 43.74
(99.58 %)
0
(0 %)
327
(0.42 %)
174
(100.00 %)
577,553
(9.77 %)
259,017
(5.20 %)
6,430,968
(25.90 %)
1
(0.00 %)
437,634
(2.97 %)
23,810
(2.02 %)
20,060
(1.16 %)
482 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
n/a 15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
0
(0 %)
326,254
(3.37 %)
14,097
(0.88 %)
8,860
(0.42 %)
483 Southern dwarf chameleon (Gauteng JTBG20232 2024)
GCA_035047345.1
n/a n/a 13,671
(0.83 %)
18,931
(1.39 %)
n/a 44.53
(100.00 %)
22
(0.00 %)
22
(0.00 %)
135
(100.00 %)
1,004,404
(4.81 %)
870,596
(5.97 %)
9,017,362
(54.42 %)
0
(0 %)
1,622,797
(5.80 %)
217,977
(8.25 %)
19,831
(0.36 %)
484 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1
47,152
(2.39 %)
n/a 19,356
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
0
(0 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,460
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,540,762
(32.73 %)
0
(0 %)
547,538
(1.62 %)
18,046
(0.54 %)
16,132
(0.42 %)
485 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1
n/a n/a 20,058
(1.26 %)
22,196
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
0
(0 %)
961
(0.56 %)
201
(100.00 %)
4,037,291
(46.02 %)
593,019
(1.17 %)
18,033,833
(40.56 %)
9
(0.00 %)
500,101
(1.40 %)
65,039
(1.33 %)
38,121
(0.86 %)
486 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1
63,054
(2.39 %)
n/a 21,998
(1.29 %)
23,177
(1.18 %)
45,345
(1.69 %)
39.89
(97.48 %)
0
(0 %)
1,243
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,559,690
(39.66 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,630
(40.50 %)
4
(0.00 %)
492,026
(1.69 %)
51,430
(1.14 %)
40,148
(0.81 %)
487 Sowerby's beaked whale (hap1 2024)
GCA_964165515.1
n/a n/a 19,471
(1.39 %)
22,951
(1.24 %)
n/a 42.04
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,095
(0.01 %)
1,604
(100.00 %)
4,307,839
(34.31 %)
825,475
(10.97 %)
11,375,945
(45.31 %)
11
(0.00 %)
3,517,431
(7.94 %)
76,527
(3.10 %)
39,378
(0.86 %)
488 spangled emperor (hap1 2024)
GCA_045362495.1
n/a n/a 15,554
(1.75 %)
58,641
(5.19 %)
n/a 40.59
(100.00 %)
0
(0 %)
196
(0.00 %)
226
(100.00 %)
682,449
(3.01 %)
409,809
(4.43 %)
7,114,584
(28.98 %)
6
(0.00 %)
539,832
(3.67 %)
37,214
(1.53 %)
18,727
(0.64 %)
489 speckled mousebird (hap1 2023 refseq)
GCF_028858725.1
37,067
(4.23 %)
n/a 12,815
(1.76 %)
23,175
(2.17 %)
n/a 42.29
(99.52 %)
0
(0 %)
161
(0.48 %)
191
(100.00 %)
572,944
(12.88 %)
256,368
(3.55 %)
5,868,966
(23.42 %)
1
(0.00 %)
412,827
(2.70 %)
27,158
(2.30 %)
20,935
(1.20 %)
490 speckled wood butterfly (refseq 2021)
GCF_905163445.1
21,720
(6.53 %)
n/a 4,713
(0.87 %)
17,001
(4.33 %)
29,238
(7.81 %)
35.99
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
70
(100.00 %)
304,062
(2.97 %)
110,824
(4.09 %)
3,704,161
(44.42 %)
1
(0.00 %)
144,758
(2.93 %)
28,108
(2.75 %)
11,566
(0.96 %)
491 spotted gar (fLepOcu1hap2 2024)
GCF_040954835.1
64,638
(7.15 %)
n/a 13,839
(1.51 %)
23,965
(3.48 %)
n/a 40.66
(100.00 %)
0
(0 %)
95
(0.00 %)
816
(100.00 %)
1,319,033
(34.80 %)
245,717
(12.50 %)
5,536,919
(38.20 %)
0
(0 %)
787,990
(5.83 %)
57,935
(3.78 %)
37,077
(1.64 %)
492 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1
n/a n/a 10,694
(1.38 %)
13,221
(2.62 %)
n/a 42.85
(99.96 %)
0
(0 %)
1,952
(0.04 %)
532
(100.00 %)
3,108,151
(44.68 %)
498,592
(6.00 %)
5,634,132
(43.16 %)
4
(0.00 %)
685,165
(4.19 %)
50,785
(2.94 %)
25,542
(1.57 %)
493 starry smooth-hound (sMusAst1.hap1.1 2024)
GCA_964213995.1
n/a n/a 12,755
(0.42 %)
23,706
(1.15 %)
n/a 45.69
(99.98 %)
0
(0 %)
3,590
(0.02 %)
5,314
(100.00 %)
1,153,000
(3.16 %)
1,250,073
(11.36 %)
14,207,513
(54.93 %)
42
(0.00 %)
4,695,339
(7.91 %)
114,313
(3.65 %)
15,576
(0.19 %)
494 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1
110,154
(7.62 %)
n/a 25,364
(1.76 %)
40,715
(4.06 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
0
(0 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
10
(0.00 %)
1,593,747
(6.87 %)
64,522
(2.85 %)
21,984
(0.89 %)
495 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024)
GCA_043727835.1
n/a n/a 19,605
(1.80 %)
20,075
(1.48 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
5
(0.00 %)
87
(0.00 %)
80
(100.00 %)
4,110,913
(40.46 %)
838,212
(2.48 %)
11,938,168
(33.52 %)
2
(0.00 %)
646,825
(2.22 %)
40,424
(1.32 %)
35,299
(1.15 %)
496 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1
n/a n/a 16,419
(3.98 %)
40,677
(7.21 %)
n/a 39.69
(99.97 %)
0
(0 %)
825
(0.03 %)
100
(100.00 %)
1,324,513
(39.84 %)
143,170
(9.30 %)
3,000,881
(34.30 %)
1
(0.00 %)
392,291
(5.75 %)
30,130
(3.71 %)
15,123
(1.03 %)
497 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1
53,860
(11.99 %)
n/a 16,033
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
0
(0 %)
236
(0.51 %)
58
(100.00 %)
1,870,234
(37.80 %)
605,570
(6.82 %)
5,059,429
(32.43 %)
2
(0.00 %)
531,388
(4.26 %)
17,919
(1.29 %)
12,796
(0.75 %)
498 striped dolphin (primary hap 2023)
GCA_951394435.1
n/a n/a 18,595
(1.48 %)
20,637
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1
(0.00 %)
993
(0.01 %)
639
(100.00 %)
4,097,623
(35.88 %)
1,442,973
(13.60 %)
12,327,244
(43.08 %)
1
(0.00 %)
1,896,129
(5.45 %)
68,498
(4.29 %)
42,011
(1.04 %)
499 Sumatran orangutan (v2 AG06213 primary hap 2024 refseq)
GCF_028885655.2
102,148
(3.49 %)
n/a 20,870
(1.72 %)
21,383
(1.14 %)
n/a 40.88
(99.75 %)
0
(0 %)
11
(0.25 %)
30
(100.00 %)
5,567,810
(54.83 %)
1,092,396
(10.36 %)
16,195,884
(42.80 %)
0
(0 %)
2,491,180
(4.29 %)
44,397
(1.13 %)
30,587
(0.77 %)
500 Suruca trogon (primary hap 2021)
GCA_020746105.1
n/a n/a 12,884
(1.85 %)
23,805
(2.23 %)
n/a 42.80
(99.12 %)
0
(0 %)
253
(0.88 %)
182
(100.00 %)
539,771
(9.26 %)
181,564
(1.14 %)
6,538,228
(22.49 %)
1
(0.00 %)
138,653
(1.22 %)
41,376
(3.37 %)
36,105
(2.01 %)
501 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1
n/a n/a 12,226
(1.01 %)
14,117
(1.42 %)
n/a 43.77
(100.00 %)
0
(0 %)
361
(0.00 %)
199
(100.00 %)
1,202,345
(11.93 %)
304,674
(1.45 %)
9,752,924
(32.81 %)
0
(0 %)
314,037
(1.63 %)
92,993
(2.75 %)
20,902
(0.60 %)
502 Swainson's thrush (v2 primary hap 2020)
GCF_009819885.2
40,121
(5.41 %)
n/a 13,004
(1.87 %)
24,795
(2.41 %)
n/a 42.48
(98.86 %)
0
(0 %)
429
(1.14 %)
160
(100.00 %)
493,071
(5.80 %)
589,858
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
1
(0.00 %)
449,511
(2.41 %)
49,404
(3.53 %)
22,206
(1.16 %)
503 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018845.1
29,544
(4.27 %)
n/a 12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
0
(0 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
1
(0.00 %)
578,723
(3.93 %)
32,064
(3.27 %)
22,996
(1.19 %)
504 swift parrot (hap1 2024)
GCF_037157495.1
50,082
(5.09 %)
n/a 12,974
(1.75 %)
22,545
(2.07 %)
n/a 42.67
(99.82 %)
0
(0 %)
186
(0.18 %)
367
(100.00 %)
541,918
(6.97 %)
347,387
(6.90 %)
5,657,314
(26.08 %)
2
(0.01 %)
468,943
(3.28 %)
25,816
(2.01 %)
22,033
(1.31 %)
505 tailed frog (A.truei hap1 2024)
GCA_040206685.1
n/a n/a 14,490
(0.54 %)
41,227
(1.77 %)
n/a 44.92
(99.97 %)
0
(0 %)
6,020
(0.03 %)
3,549
(100.00 %)
1,783,455
(4.78 %)
3,426,339
(20.31 %)
15,662,323
(55.70 %)
33
(0.00 %)
5,614,148
(11.20 %)
442,764
(6.61 %)
73,225
(0.88 %)
506 tammar wallaby (mMacEug1 primary hap 2023)
GCA_028372415.1
n/a n/a 17,652
(0.77 %)
15,774
(0.88 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
0
(0 %)
515
(0.19 %)
315
(100.00 %)
5,836,160
(26.14 %)
1,193,709
(2.72 %)
22,682,658
(39.52 %)
4
(0.00 %)
566,172
(1.21 %)
23,629
(0.48 %)
14,785
(0.29 %)
507 Tasmanian devil
GCF_902635505.1
52,057
(2.36 %)
n/a 15,918
(0.85 %)
16,111
(0.91 %)
n/a 36.16
(100.00 %)
0
(0 %)
354
(0.00 %)
106
(100.00 %)
6,789,158
(44.28 %)
1,246,027
(2.19 %)
21,434,803
(41.20 %)
1
(0.00 %)
454,463
(1.20 %)
23,609
(0.65 %)
23,356
(0.61 %)
508 tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023)
GCA_028020825.1
n/a n/a 13,321
(1.76 %)
24,102
(2.15 %)
n/a 42.35
(99.83 %)
0
(0 %)
203
(0.17 %)
1,038
(100.00 %)
593,409
(10.51 %)
202,463
(9.29 %)
6,160,173
(27.65 %)
1
(0.00 %)
529,082
(2.97 %)
25,785
(2.35 %)
21,960
(1.26 %)
509 tawny owl (hap1 2023)
GCA_031877795.1
n/a n/a 13,204
(1.60 %)
23,981
(1.99 %)
n/a 42.70
(99.70 %)
9
(0.15 %)
281
(0.30 %)
212
(99.85 %)
443,228
(4.74 %)
272,738
(10.86 %)
5,812,837
(27.42 %)
1
(0.00 %)
406,171
(2.45 %)
30,602
(2.52 %)
26,399
(1.26 %)
510 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1
n/a n/a 14,720
(2.58 %)
45,918
(6.44 %)
n/a 40.37
(99.99 %)
0
(0 %)
454
(0.01 %)
188
(100.00 %)
1,242,704
(17.37 %)
518,293
(15.23 %)
3,986,694
(40.18 %)
1
(0.00 %)
670,254
(6.56 %)
51,441
(3.53 %)
22,258
(1.30 %)
511 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1
n/a n/a 15,347
(2.73 %)
50,294
(7.25 %)
n/a 42.30
(99.98 %)
30
(0.00 %)
610
(0.02 %)
393
(100.00 %)
1,157,324
(26.70 %)
229,196
(4.33 %)
3,694,790
(27.54 %)
1
(0.00 %)
385,033
(4.63 %)
38,929
(2.20 %)
24,476
(1.25 %)
512 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020)
GCF_010909765.2
45,968
(2.40 %)
n/a 11,437
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
n/a 44.30
(92.54 %)
0
(0 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
888,163
(2.58 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
26
(0.00 %)
1,634,606
(4.98 %)
242,676
(4.73 %)
31,030
(0.57 %)
513 three-spined stickleback (hap1 2024)
GCA_964276395.1
n/a n/a 14,939
(3.72 %)
56,284
(10.07 %)
n/a 44.71
(99.99 %)
3
(0.00 %)
331
(0.01 %)
133
(100.00 %)
573,569
(20.53 %)
206,699
(9.01 %)
2,335,009
(27.29 %)
7
(0.00 %)
213,153
(3.82 %)
84,009
(12.41 %)
57,803
(5.54 %)
514 tiny Cayenne caecilian
GCF_901765095.1
41,333
(1.27 %)
n/a 14,569
(0.43 %)
30,499
(1.16 %)
n/a 44.01
(98.99 %)
0
(0 %)
2,452
(1.01 %)
1,081
(100.00 %)
1,835,191
(1.59 %)
1,670,443
(3.30 %)
22,207,145
(52.43 %)
5
(0.00 %)
1,513,727
(3.00 %)
414,828
(3.91 %)
47,796
(0.38 %)
515 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3
n/a n/a 14,527
(4.79 %)
51,181
(11.72 %)
n/a 45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
325,077
(14.03 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,754
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,975
(9.63 %)
37,920
(5.08 %)
516 tourmaline sunangel (hap1 2024)
GCA_036169615.1
n/a n/a 12,509
(1.97 %)
21,020
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.99 %)
0
(0 %)
437
(0.01 %)
131
(100.00 %)
532,267
(5.46 %)
332,284
(2.69 %)
6,084,978
(21.20 %)
0
(0 %)
215,264
(1.71 %)
19,080
(1.72 %)
15,764
(1.09 %)
517 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1
n/a n/a 18,627
(1.82 %)
20,108
(1.67 %)
n/a 42.95
(100.00 %)
0
(0 %)
217
(0.00 %)
182
(100.00 %)
2,733,927
(24.79 %)
715,258
(3.17 %)
10,099,456
(36.35 %)
1
(0.00 %)
459,634
(1.69 %)
47,139
(2.58 %)
49,626
(1.96 %)
518 trahira (v1 hap2 2023)
GCA_029633875.1
n/a n/a 16,216
(2.00 %)
45,209
(4.32 %)
n/a 41.03
(96.02 %)
0
(0 %)
907
(3.98 %)
452
(100.00 %)
2,280,303
(30.80 %)
708,327
(15.59 %)
5,394,248
(39.01 %)
7
(0.00 %)
1,246,906
(7.61 %)
28,386
(2.18 %)
12,439
(0.46 %)
519 trahira (v2 hap1 2024 genbank)
GCA_029633855.2
n/a n/a 17,256
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
0
(0 %)
989
(5.49 %)
597
(100.00 %)
2,407,631
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,418
(37.52 %)
3
(0.00 %)
1,264,125
(7.29 %)
29,012
(2.12 %)
12,979
(0.45 %)
520 trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024)
GCA_043728145.1
n/a n/a 18,871
(1.79 %)
20,351
(1.55 %)
n/a 40.66
(99.99 %)
10
(0.00 %)
397
(0.01 %)
136
(100.00 %)
3,580,957
(40.75 %)
683,947
(2.19 %)
11,464,418
(33.39 %)
23
(0.00 %)
658,821
(2.63 %)
37,175
(1.31 %)
29,161
(1.04 %)
521 True's beaked whale (hap1.1 2024)
GCA_964341445.1
n/a n/a 19,530
(1.21 %)
24,576
(1.13 %)
n/a 42.48
(99.99 %)
0
(0 %)
1,240
(0.01 %)
2,757
(100.00 %)
4,847,855
(34.88 %)
949,927
(20.01 %)
10,981,914
(51.51 %)
11
(0.00 %)
5,641,807
(11.20 %)
91,880
(2.74 %)
39,724
(0.76 %)
522 tufted duck (2019)
GCF_009819795.1
29,492
(4.02 %)
n/a 12,972
(1.98 %)
22,757
(2.27 %)
n/a 41.66
(99.16 %)
0
(0 %)
163
(0.84 %)
105
(100.00 %)
826,451
(8.47 %)
411,356
(1.71 %)
6,691,445
(22.36 %)
1
(0.00 %)
93,916
(0.94 %)
29,882
(2.41 %)
27,027
(1.51 %)
523 tundra swan (primary hap 2025)
GCA_965151615.1
n/a n/a 13,371
(1.77 %)
23,897
(2.09 %)
n/a 45.04
(99.99 %)
5
(0.00 %)
540
(0.01 %)
608
(100.00 %)
745,129
(5.82 %)
484,265
(9.62 %)
6,249,520
(28.78 %)
0
(0 %)
756,733
(4.48 %)
46,110
(11.14 %)
32,575
(1.93 %)
524 Tungara frog (aEngPut4 2024)
GCA_040894005.1
n/a n/a 13,678
(0.88 %)
29,720
(2.41 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
25
(0.00 %)
436
(0.00 %)
961
(100.00 %)
734,036
(2.54 %)
1,217,326
(21.42 %)
8,925,883
(52.53 %)
6
(0.00 %)
691,991
(2.19 %)
211,590
(5.08 %)
23,983
(0.47 %)
525 tunicate A.aspersa (primary hap 2024)
GCA_963924565.1
n/a n/a 3,379
(0.93 %)
17,530
(9.16 %)
n/a 37.03
(99.98 %)
0
(0 %)
393
(0.02 %)
75
(100.00 %)
67,051
(2.43 %)
80,550
(6.04 %)
2,322,081
(35.06 %)
15
(0.01 %)
203,240
(7.43 %)
18,716
(4.75 %)
16,318
(2.10 %)
526 tunicate A.turbinatum (primary hap 2021)
GCA_918807975.1
n/a n/a 4,108
(0.57 %)
18,445
(6.84 %)
n/a 37.60
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
27
(100.00 %)
104,021
(0.79 %)
186,953
(6.27 %)
2,895,772
(42.71 %)
0
(0 %)
297,254
(4.86 %)
23,070
(1.74 %)
4,064
(0.29 %)
527 tunicate S.clava (kaStyClav1.hap1.1 2024)
GCA_964204865.1
n/a n/a 3,512
(0.79 %)
12,277
(7.12 %)
n/a 36.05
(100.00 %)
0
(0 %)
34
(0.00 %)
389
(100.00 %)
83,928
(2.38 %)
78,714
(9.97 %)
2,178,959
(38.34 %)
1
(0.00 %)
404,850
(10.78 %)
5,872
(4.08 %)
1,012
(0.10 %)
528 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1
n/a n/a 14,816
(3.44 %)
49,680
(8.16 %)
n/a 43.40
(99.97 %)
0
(0 %)
805
(0.03 %)
108
(100.00 %)
808,348
(19.20 %)
301,230
(7.15 %)
3,267,772
(25.91 %)
4
(0.00 %)
311,531
(3.41 %)
66,132
(6.90 %)
41,801
(3.31 %)
529 two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_901001135.1
56,617
(1.50 %)
n/a 14,448
(0.38 %)
40,572
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
0
(0 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,263,606
(1.94 %)
2,036,108
(4.34 %)
29,400,958
(44.09 %)
9
(0.01 %)
2,193,249
(3.24 %)
602,912
(6.66 %)
94,935
(0.82 %)
530 two-lined caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_901001135.2
n/a n/a 14,449
(0.38 %)
40,573
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
0
(0 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,274,606
(1.91 %)
2,036,107
(4.34 %)
29,400,957
(44.09 %)
9
(0.01 %)
2,193,249
(3.24 %)
602,911
(6.66 %)
94,934
(0.82 %)
531 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025)
GCA_965153285.1
n/a n/a 14,267
(1.41 %)
20,319
(2.40 %)
n/a 44.04
(99.99 %)
0
(0 %)
1,024
(0.01 %)
258
(100.00 %)
833,273
(4.46 %)
456,881
(4.04 %)
6,995,048
(37.06 %)
8
(0.00 %)
625,845
(3.64 %)
97,620
(3.04 %)
19,840
(0.78 %)
532 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1
60,106
(3.00 %)
n/a 18,611
(1.76 %)
20,103
(1.39 %)
35,176
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
0
(0 %)
212
(0.34 %)
64
(100.00 %)
4,067,454
(44.25 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,582
(35.55 %)
3
(0.00 %)
550,113
(1.71 %)
66,806
(1.79 %)
48,624
(1.46 %)
533 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 refseq)
GCF_026979565.1
44,961
(5.49 %)
n/a 12,817
(1.94 %)
24,245
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
0
(0 %)
458
(0.02 %)
177
(100.00 %)
616,746
(11.96 %)
411,917
(3.57 %)
6,385,057
(20.91 %)
6
(0.00 %)
306,942
(1.90 %)
37,940
(2.83 %)
24,967
(1.41 %)
534 village indigobird (purged dups hap OUT-0048 2022)
GCA_026979555.1
n/a n/a 2,176
(1.79 %)
7,719
(4.37 %)
n/a 49.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,939
(100.00 %)
136,312
(29.31 %)
157,341
(15.03 %)
648,725
(34.67 %)
0
(0 %)
221,251
(9.52 %)
15,490
(8.23 %)
7,383
(2.86 %)
535 warty frogfish (primary hap 2020)
GCA_013358685.1
n/a n/a 14,494
(3.34 %)
45,310
(7.77 %)
n/a 41.86
(99.87 %)
0
(0 %)
219
(0.13 %)
155
(100.00 %)
413,753
(4.95 %)
290,313
(6.11 %)
3,010,996
(29.71 %)
3
(0.00 %)
305,411
(3.51 %)
36,840
(4.18 %)
22,433
(1.95 %)
536 warty newt (primary hap 2024)
GCA_964204655.1
n/a n/a 16,124
(0.09 %)
186,006
(1.43 %)
n/a 45.53
(100.00 %)
118
(0.00 %)
4,698
(0.00 %)
1,422
(100.00 %)
4,239,451
(1.37 %)
8,714,648
(13.78 %)
84,859,372
(50.88 %)
38
(0.00 %)
10,611,791
(4.91 %)
2,159,665
(8.20 %)
541,086
(1.34 %)
537 West African lungfish (Aquariam Glaser DD20220218a primary hap 2024)
GCA_040939525.1
n/a n/a 14,330
(0.04 %)
83,285
(0.50 %)
n/a 39.97
(99.99 %)
0
(0 %)
24,438
(0.01 %)
7,125
(100.00 %)
17,253,560
(4.05 %)
15,370,489
(7.85 %)
31,563
(99.99 %)
127
(0.00 %)
2,868,526
(0.33 %)
548,408
(0.58 %)
524,351
(0.55 %)
538 western capercaillie (primary hap 2023)
GCA_951394365.1
n/a n/a 12,775
(2.33 %)
22,516
(2.50 %)
n/a 41.49
(99.98 %)
0
(0 %)
973
(0.02 %)
318
(100.00 %)
518,194
(5.54 %)
276,294
(2.21 %)
5,866,033
(21.12 %)
9
(0.00 %)
148,912
(1.44 %)
21,287
(2.50 %)
19,248
(1.54 %)
539 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1
61,103
(2.36 %)
n/a 18,125
(1.16 %)
20,689
(1.21 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
0
(0 %)
3,760
(0.03 %)
1,174
(100.00 %)
4,891,329
(19.68 %)
1,507,929
(3.81 %)
12,571,105
(54.50 %)
7
(0.00 %)
1,975,693
(4.67 %)
32,667
(0.90 %)
24,067
(0.56 %)
540 western lowland gorilla (v2 KB3781 2024 refseq)
GCF_029281585.2
98,428
(2.94 %)
n/a 21,010
(1.59 %)
50,697
(1.83 %)
n/a 40.49
(99.94 %)
0
(0 %)
2
(0.06 %)
26
(100.00 %)
5,456,274
(50.77 %)
1,060,267
(19.55 %)
15,870,229
(47.77 %)
0
(0 %)
5,413,767
(8.98 %)
69,745
(1.19 %)
30,644
(0.70 %)
541 western lowland gorilla (v2.1 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.3
n/a n/a 21,010
(1.59 %)
50,695
(1.83 %)
n/a 40.49
(99.94 %)
0
(0 %)
2
(0.06 %)
26
(100.00 %)
5,456,271
(50.77 %)
1,060,267
(19.55 %)
15,870,225
(47.77 %)
0
(0 %)
1,391,066
(2.32 %)
69,745
(1.19 %)
30,644
(0.70 %)
542 western terrestrial garter snake (primary hap 2019)
GCF_009769535.1
33,492
(3.42 %)
n/a 13,074
(1.13 %)
18,807
(1.93 %)
31,660
(2.61 %)
40.95
(97.72 %)
0
(0 %)
1,518
(2.28 %)
365
(100.00 %)
1,271,255
(7.73 %)
979,057
(4.48 %)
8,396,200
(42.63 %)
0
(0 %)
801,068
(3.60 %)
81,829
(2.47 %)
23,152
(0.75 %)
543 whiskered bat (hap1 2024)
GCA_964094495.2
n/a n/a 19,504
(1.78 %)
22,272
(1.73 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
7
(0.00 %)
1,566
(0.02 %)
533
(100.00 %)
3,046,246
(25.06 %)
753,151
(4.86 %)
10,596,418
(37.62 %)
7
(0.00 %)
729,123
(2.57 %)
66,785
(2.55 %)
53,825
(1.76 %)
544 whiskered treeswift (primary hap 2021)
GCA_020745705.1
n/a n/a 12,681
(1.84 %)
21,784
(2.14 %)
n/a 42.12
(99.13 %)
0
(0 %)
218
(0.87 %)
146
(100.00 %)
520,200
(9.32 %)
170,778
(0.83 %)
6,455,910
(21.44 %)
0
(0 %)
98,619
(0.96 %)
24,061
(1.62 %)
17,982
(1.11 %)
545 white leghorn X broiler chicken (v2 leghorn haplotype 2021)
GCF_016700215.2
83,834
(10.16 %)
n/a 13,005
(2.32 %)
23,329
(2.48 %)
72,360
(9.39 %)
42.16
(99.57 %)
409
(0.43 %)
409
(0.43 %)
685
(99.57 %)
536,869
(6.00 %)
268,230
(2.28 %)
5,845,184
(20.93 %)
2
(0.00 %)
247,373
(2.08 %)
24,409
(2.60 %)
20,761
(1.55 %)
546 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1
59,982
(2.43 %)
n/a 18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
0
(0 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
2
(0.00 %)
1,117,804
(3.60 %)
68,551
(3.58 %)
41,698
(1.09 %)
547 white-crowned manakin (hap1 2024 refseq)
GCF_036250125.1
55,558
(6.99 %)
n/a 12,807
(1.82 %)
23,359
(2.28 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
0
(0 %)
323
(0.01 %)
696
(100.00 %)
429,643
(4.10 %)
293,428
(3.59 %)
6,059,402
(21.89 %)
0
(0 %)
366,452
(2.74 %)
29,574
(2.42 %)
21,946
(1.07 %)
548 white-rumped munia (maternal hap 2024)
GCA_046129695.1
n/a n/a 12,487
(1.71 %)
29,990
(2.73 %)
n/a 43.26
(100.00 %)
0
(0 %)
176
(0.00 %)
161
(100.00 %)
427,385
(3.06 %)
507,421
(10.23 %)
5,759,740
(27.66 %)
1
(0.00 %)
704,704
(4.47 %)
36,849
(5.10 %)
23,680
(1.12 %)
549 white-tailed eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_947461875.1
52,797
(5.74 %)
n/a 13,736
(1.76 %)
24,846
(2.12 %)
n/a 43.15
(99.99 %)
0
(0 %)
424
(0.01 %)
189
(100.00 %)
585,279
(12.89 %)
291,297
(6.10 %)
6,474,102
(23.66 %)
0
(0 %)
238,727
(1.67 %)
54,851
(4.05 %)
31,757
(1.50 %)
550 white-throated dipper (primary hap 2023 refseq)
GCF_963662255.1
29,618
(3.60 %)
n/a 12,854
(1.79 %)
23,825
(2.25 %)
n/a 42.82
(99.99 %)
0
(0 %)
658
(0.01 %)
277
(100.00 %)
431,531
(3.38 %)
345,532
(10.59 %)
5,840,421
(26.59 %)
1
(0.00 %)
617,892
(3.85 %)
29,711
(3.56 %)
21,555
(1.20 %)
551 white-throated sparrow (hap1 2025)
GCA_047830755.1
n/a n/a 12,983
(1.65 %)
33,925
(3.13 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
0
(0 %)
229
(0.00 %)
180
(100.00 %)
449,053
(3.16 %)
631,898
(8.80 %)
6,189,242
(27.24 %)
0
(0 %)
952,785
(5.59 %)
40,133
(2.67 %)
25,012
(1.16 %)
552 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1
40,430
(1.81 %)
n/a 17,575
(1.21 %)
21,880
(1.35 %)
47,496
(1.55 %)
39.81
(99.57 %)
0
(0 %)
1,010
(0.43 %)
147
(100.00 %)
2,846,063
(18.57 %)
1,252,362
(3.89 %)
13,776,063
(46.50 %)
14
(0.00 %)
1,059,317
(2.87 %)
24,589
(0.78 %)
20,877
(0.55 %)
553 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 refseq)
GCF_011100555.1
104,419
(4.84 %)
n/a 21,801
(1.88 %)
21,467
(1.27 %)
n/a 40.92
(99.52 %)
0
(0 %)
1,165
(0.48 %)
1,233
(100.00 %)
5,036,591
(47.71 %)
842,846
(3.26 %)
15,161,534
(38.08 %)
2
(0.00 %)
1,256,018
(2.62 %)
37,603
(0.93 %)
34,471
(0.83 %)
554 whooping crane (maternal hap 2023 refseq)
GCF_028858705.1
55,408
(5.57 %)
n/a 13,574
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
0
(0 %)
262
(0.37 %)
930
(100.00 %)
616,300
(10.57 %)
211,558
(2.90 %)
6,785,192
(22.11 %)
0
(0 %)
591,955
(1.89 %)
42,795
(4.66 %)
39,036
(2.34 %)
555 Xingu scale-backed antbird (hap1 2024)
GCA_045364795.1
n/a n/a 12,848
(1.71 %)
24,293
(2.19 %)
n/a 43.77
(99.99 %)
0
(0 %)
773
(0.01 %)
1,510
(100.00 %)
688,169
(20.12 %)
440,901
(9.03 %)
5,858,667
(26.62 %)
8
(0.00 %)
932,948
(5.28 %)
39,419
(4.07 %)
19,631
(0.96 %)
556 yellow-bellied marmot (hap1 2025)
GCA_047511675.1
n/a n/a 19,503
(1.44 %)
20,301
(1.35 %)
n/a 39.90
(100.00 %)
0
(0 %)
330
(0.00 %)
814
(100.00 %)
4,038,897
(29.07 %)
978,915
(3.28 %)
14,404,740
(34.97 %)
4
(0.00 %)
446,138
(1.44 %)
36,674
(1.05 %)
27,659
(0.61 %)
557 yellow-bellied toad (maternal hap 2024)
GCA_964205295.1
n/a n/a 16,029
(0.23 %)
46,442
(0.92 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
130
(0.00 %)
6,671
(0.01 %)
4,887
(100.00 %)
4,307,097
(3.52 %)
7,435,469
(14.36 %)
11,428
(99.99 %)
51
(0.00 %)
2,406,047
(1.89 %)
423,705
(1.55 %)
414,271
(1.46 %)
558 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap1 2024)
GCA_039720435.1
n/a n/a 13,169
(1.63 %)
23,545
(1.98 %)
n/a 43.42
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
1,679
(100.00 %)
579,903
(8.32 %)
295,345
(9.90 %)
4,361,776
(30.37 %)
1
(0.00 %)
776,875
(4.65 %)
28,647
(1.82 %)
20,581
(1.14 %)
559 yellow-legged gull (primary hap 2024)
GCA_964199755.1
n/a n/a 13,396
(1.62 %)
25,176
(2.03 %)
n/a 44.64
(99.99 %)
0
(0 %)
500
(0.01 %)
618
(100.00 %)
521,539
(5.15 %)
267,365
(11.68 %)
5,827,639
(29.76 %)
3
(0.00 %)
655,588
(3.77 %)
44,532
(6.28 %)
37,224
(1.61 %)
560 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1
n/a n/a 17,610
(1.00 %)
20,322
(1.04 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
276
(0.00 %)
62
(100.00 %)
3,295,935
(23.58 %)
389,907
(6.37 %)
19,525,382
(45.90 %)
0
(0 %)
1,020,287
(2.23 %)
31,831
(0.63 %)
26,588
(0.47 %)
561 yellow-throated sandgrouse (primary hap 2019)
GCA_009769525.1
n/a n/a 12,697
(1.89 %)
25,289
(2.53 %)
n/a 42.40
(99.62 %)
0
(0 %)
242
(0.38 %)
89
(100.00 %)
510,633
(7.10 %)
213,742
(1.12 %)
6,627,716
(21.17 %)
0
(0 %)
113,802
(0.93 %)
28,848
(2.23 %)
25,343
(1.45 %)
562 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
n/a 15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
84,160
(11.62 %)
42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
0
(0 %)
188,182
(2.04 %)
31,005
(1.79 %)
19,757
(1.03 %)
563 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
n/a 15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
1
(0.00 %)
375,976
(3.80 %)
14,420
(0.88 %)
9,087
(0.42 %)
564 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024)
GCA_043880425.1
n/a n/a 18,352
(1.71 %)
20,233
(1.46 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
44
(0.00 %)
196
(0.00 %)
1,530
(100.00 %)
3,466,695
(41.95 %)
934,524
(8.81 %)
11,690,112
(36.30 %)
0
(0 %)
1,908,821
(5.07 %)
35,257
(5.20 %)
27,363
(0.98 %)
565 zebra finch (v1.4 Blue55 female primary hap 2021 refseq)
GCF_003957565.2
49,311
(7.41 %)
n/a 12,747
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
0
(0 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
544,577
(9.57 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,748
(20.92 %)
3
(0.00 %)
312,137
(1.80 %)
29,202
(2.47 %)
22,084
(1.22 %)
566 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1
58,105
(2.61 %)
n/a 12,291
(0.48 %)
16,769
(1.14 %)
n/a 43.41
(99.47 %)
0
(0 %)
1,159
(0.53 %)
835
(100.00 %)
8,087,543
(64.92 %)
798,373
(9.17 %)
14,838,773
(42.39 %)
4
(0.00 %)
2,946,119
(5.37 %)
45,284
(1.67 %)
14,105
(0.37 %)
567 zebrafish (WGS:CALUEM01 primary hap 2022)
GCA_944039275.1
n/a n/a 18,065
(2.46 %)
44,526
(3.30 %)
n/a 37.08
(99.99 %)
0
(0 %)
381
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,804,769
(44.04 %)
954,645
(10.72 %)
8,694,743
(51.88 %)
4
(0.00 %)
1,207,649
(5.79 %)
44,936
(2.02 %)
11,380
(0.33 %)
568 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3
n/a n/a 15,036
(3.35 %)
40,234
(7.28 %)
n/a 40.66
(97.76 %)
0
(0 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
671,614
(20.98 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,040
(23.44 %)
0
(0 %)
175,881
(3.08 %)
12,807
(1.08 %)
8,703
(0.67 %)
TOTALS:total assembly count 568

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies