BRC - Bioinformatics Research Center - track statistics

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count	common name link to genome browser	ncbiRefSeq	ncbiGene	xenoRefGene	augustus genes	Ensembl genes	gc5 base	AGP gap	all gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	gap Overlap	tandem Dups	cpg unmasked	cpg island
1	'Bacillus of abortion' Bang 1897 (544 2013) GCF_000369945.1	n/a	3,248 (88.03 %)	n/a	n/a	n/a	57.21 (99.78 %)	7 (0.22 %)	7 (0.22 %)	10 (99.78 %)	n/a	79 (0.20 %)	17,213 (9.66 %)	3 (0.06 %)	60 (0.22 %)	3 (99.97 %)	3 (99.96 %)
2	A.astronyxis (2015) GCA_000826245.1	n/a	n/a	2,016 (1.54 %)	14,515 (15.18 %)	n/a	42.72 (99.51 %)	5,685 (0.26 %)	5,685 (0.26 %)	103,933 (99.74 %)	101,856 (5.17 %)	58,925 (3.07 %)	508,018 (21.58 %)	147 (0.03 %)	7,936 (0.75 %)	2,248 (1.01 %)	1,624 (0.72 %)
3	A.castellanii (2015) GCA_000826485.1	n/a	n/a	1,645 (0.73 %)	51,566 (25.12 %)	n/a	58.90 (98.61 %)	25,887 (1.08 %)	25,887 (1.08 %)	247,635 (98.92 %)	170,520 (7.49 %)	107,479 (3.58 %)	827,275 (23.81 %)	1,189 (0.15 %)	n/a	50,703 (69.56 %)	25,394 (19.58 %)
4	A.castellanii (C3 2021) GCA_021020595.1	n/a	n/a	988 (1.33 %)	12,252 (35.90 %)	n/a	58.64 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	174 (100.00 %)	65,187 (6.84 %)	40,560 (3.93 %)	340,754 (23.92 %)	0 (0 %)	8,429 (1.44 %)	232 (98.44 %)	506 (1.47 %)
5	A.castellanii (Neff 2021) GCA_021020605.1	n/a	n/a	996 (1.40 %)	11,949 (36.92 %)	n/a	58.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	111 (100.00 %)	66,153 (7.17 %)	41,374 (3.81 %)	331,056 (24.35 %)	0 (0 %)	6,219 (1.18 %)	196 (98.46 %)	283 (0.73 %)
6	A.castellanii str. (Neff 2013) GCF_000313135.1	14,967 (50.01 %)	n/a	887 (1.39 %)	10,919 (35.24 %)	n/a	58.41 (93.89 %)	2,808 (6.13 %)	2,913 (6.13 %)	3,192 (93.87 %)	58,039 (7.75 %)	38,227 (3.62 %)	298,802 (22.73 %)	11 (0.03 %)	10,127 (3.04 %)	1,052 (92.11 %)	1,041 (2.57 %)
7	A.culbertsoni (2015) GCA_000826265.1	n/a	n/a	1,519 (1.77 %)	15,518 (30.11 %)	n/a	50.23 (99.28 %)	6,908 (0.48 %)	6,908 (0.48 %)	79,319 (99.52 %)	56,527 (4.83 %)	34,849 (2.92 %)	254,067 (18.25 %)	85 (0.02 %)	5,338 (0.78 %)	7,704 (61.93 %)	6,746 (19.20 %)
8	A.healyi (2015) GCA_000826305.1	n/a	n/a	1,608 (1.33 %)	31,219 (37.40 %)	n/a	58.66 (99.78 %)	3,582 (0.16 %)	3,582 (0.16 %)	29,770 (99.84 %)	79,512 (4.56 %)	28,532 (2.04 %)	566,712 (21.23 %)	34 (0.01 %)	6,883 (0.70 %)	12,979 (92.23 %)	5,923 (11.77 %)
9	A.lenticulata (2015) GCA_000826285.1	n/a	n/a	1,526 (1.33 %)	27,614 (33.40 %)	n/a	56.73 (99.50 %)	7,333 (0.28 %)	7,333 (0.28 %)	86,381 (99.72 %)	69,593 (4.58 %)	24,883 (1.74 %)	469,583 (20.45 %)	179 (0.04 %)	6,983 (0.90 %)	18,561 (79.68 %)	10,846 (22.54 %)
10	A.lugdunensis (2015) GCA_000826425.1	n/a	n/a	1,993 (1.11 %)	53,494 (34.97 %)	n/a	59.11 (99.53 %)	8,227 (0.36 %)	8,227 (0.36 %)	75,686 (99.64 %)	141,139 (6.79 %)	90,543 (3.59 %)	705,388 (23.79 %)	466 (0.07 %)	12,672 (1.18 %)	37,139 (86.92 %)	19,048 (24.56 %)
11	A.mauritaniensis (2015) GCA_000826465.1	n/a	n/a	2,420 (1.34 %)	57,123 (38.15 %)	n/a	58.64 (99.59 %)	6,873 (0.30 %)	6,873 (0.30 %)	74,106 (99.70 %)	126,382 (5.54 %)	67,964 (2.87 %)	709,452 (21.74 %)	397 (0.06 %)	10,082 (0.82 %)	33,983 (86.91 %)	18,590 (31.29 %)
12	A.palestinensis (2015) GCA_000826325.1	n/a	n/a	2,155 (1.14 %)	55,296 (39.97 %)	n/a	59.14 (99.69 %)	6,201 (0.23 %)	6,201 (0.23 %)	62,943 (99.77 %)	117,311 (5.27 %)	65,418 (2.61 %)	723,479 (22.50 %)	560 (0.08 %)	9,683 (0.83 %)	35,883 (88.33 %)	18,137 (31.22 %)
13	A.pearcei (2015) GCA_000826505.1	n/a	n/a	1,687 (0.75 %)	51,206 (25.03 %)	n/a	58.96 (98.57 %)	27,116 (1.12 %)	27,116 (1.12 %)	251,253 (98.88 %)	171,265 (7.00 %)	108,746 (3.61 %)	818,893 (23.51 %)	1,167 (0.15 %)	n/a	50,218 (69.20 %)	25,615 (20.35 %)
14	A.polyphaga (2015) GCA_000826345.1	n/a	n/a	1,733 (0.75 %)	53,820 (26.95 %)	n/a	59.26 (98.59 %)	27,249 (1.11 %)	27,249 (1.11 %)	251,731 (98.89 %)	172,256 (6.77 %)	109,137 (3.47 %)	864,501 (23.70 %)	1,222 (0.15 %)	n/a	50,750 (70.48 %)	25,517 (21.78 %)
15	A.quina (2015) GCA_000826445.1	n/a	n/a	1,637 (1.14 %)	38,294 (33.16 %)	n/a	59.17 (99.56 %)	6,444 (0.32 %)	6,444 (0.32 %)	66,934 (99.68 %)	118,918 (6.74 %)	77,252 (3.58 %)	638,511 (23.84 %)	174 (0.03 %)	7,801 (0.86 %)	24,029 (85.30 %)	11,701 (18.55 %)
16	A.rhysodes (2015) GCA_000826385.1	n/a	n/a	1,631 (1.21 %)	33,083 (30.62 %)	n/a	57.92 (99.07 %)	14,831 (0.83 %)	14,831 (0.83 %)	77,667 (99.17 %)	98,643 (6.13 %)	55,443 (3.28 %)	554,240 (22.69 %)	538 (0.11 %)	10,133 (1.04 %)	26,001 (81.03 %)	13,140 (17.80 %)
17	A.royreba (2015) GCA_000826365.1	n/a	n/a	2,114 (1.61 %)	18,250 (26.85 %)	n/a	51.25 (99.75 %)	4,659 (0.21 %)	4,659 (0.21 %)	28,757 (99.79 %)	37,613 (2.32 %)	18,581 (1.18 %)	410,854 (13.70 %)	128 (0.02 %)	6,149 (0.67 %)	18,414 (68.14 %)	17,964 (15.85 %)
18	A.sp. (SK_2022a 2023) GCA_027943295.1	n/a	n/a	1,114 (1.48 %)	15,005 (39.74 %)	n/a	57.44 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	2,108 (100.00 %)	41,945 (5.08 %)	27,615 (3.96 %)	292,024 (19.84 %)	0 (0 %)	9,506 (1.47 %)	2,663 (91.18 %)	1,641 (9.99 %)
19	A.sp. (SK_2022b 2023) GCA_027943245.1	n/a	n/a	1,149 (1.42 %)	16,030 (40.87 %)	n/a	57.80 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1,790 (100.00 %)	43,850 (5.03 %)	29,567 (4.14 %)	325,638 (20.70 %)	0 (0 %)	11,095 (1.54 %)	2,296 (91.76 %)	1,560 (8.62 %)
20	A.sp. (SK_2022c 2023) GCA_027944975.1	n/a	n/a	276 (0.73 %)	11,621 (33.84 %)	n/a	60.50 (99.74 %)	0 (0 %)	n/a	20,778 (100.00 %)	13,194 (3.62 %)	5,345 (1.28 %)	111,466 (18.15 %)	0 (0 %)	231 (0.11 %)	19,231 (82.88 %)	12,603 (39.91 %)
21	Adeno-associated virus - 1 (2000) GCF_000863065.1	n/a	2 (86.54 %)	n/a	n/a	n/a	56.52 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (2.86 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	1 (5.30 %)	1 (71.49 %)	1 (68.82 %)
22	Adeno-associated virus - 3 (3H 2000) GCF_000841585.1	n/a	2 (86.46 %)	n/a	n/a	n/a	53.88 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.70 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	1 (5.29 %)	1 (53.20 %)	1 (53.20 %)
23	Adeno-associated virus - 4 (ATCC VR-646 2000) GCF_000836885.1	n/a	2 (85.53 %)	n/a	n/a	n/a	57.46 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	1 (4.70 %)	2 (74.41 %)	2 (74.41 %)
24	Adeno-associated virus - 7 (2004) GCF_000845645.1	n/a	2 (86.55 %)	n/a	n/a	n/a	57.33 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	1 (5.30 %)	1 (70.20 %)	1 (70.20 %)
25	Adeno-associated virus - 8 (2004) GCF_000846525.1	n/a	2 (93.22 %)	n/a	n/a	n/a	57.06 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.84 %)	n/a	2 (0.32 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (63.24 %)	1 (63.24 %)
26	adeno-associated virus 2 (1993) GCF_000838645.1	n/a	14 (89.01 %)	n/a	n/a	n/a	53.80 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (3.18 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	1 (5.34 %)	1 (54.43 %)	1 (53.94 %)
27	adeno-associated virus 5 (2004) GCF_000846385.1	n/a	2 (86.34 %)	n/a	n/a	n/a	55.15 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (2.65 %)	n/a	4 (0.60 %)	0 (0 %)	1 (5.90 %)	2 (79.06 %)	2 (55.02 %)
28	Adult diarrheal rotavirus strain J19 (J19 2005) GCF_000864245.1	n/a	11 (95.04 %)	n/a	n/a	n/a	33.42 (99.83 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.20 %)	37 (2.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
29	African malaria mosquito (FUMOZ 2018) GCA_003951495.1	n/a	n/a	8,789 (2.01 %)	55,502 (14.58 %)	n/a	41.17 (99.99 %)	0 (0 %)	757 (0.01 %)	9,175 (100.00 %)	205,777 (6.06 %)	189,636 (11.11 %)	2,023,304 (29.26 %)	0 (0 %)	402,308 (6.67 %)	42,752 (8.33 %)	32,197 (4.22 %)
30	African malaria mosquito (PEST 2006) GCF_000005575.2	14,283 (8.94 %)	n/a	5,499 (2.34 %)	30,483 (13.88 %)	n/a	44.27 (95.26 %)	55 (0.21 %)	8,735 (4.74 %)	8,116 (99.79 %)	240,705 (14.38 %)	72,709 (2.39 %)	1,435,172 (21.28 %)	6 (0.01 %)	77,558 (3.59 %)	25,507 (8.25 %)	24,149 (5.87 %)
31	African malaria mosquito (primary hap 2022) GCF_943734735.2	33,238 (17.23 %)	n/a	5,453 (2.24 %)	28,990 (13.73 %)	n/a	44.39 (99.99 %)	0 (0 %)	41 (0.01 %)	191 (100.00 %)	172,532 (3.40 %)	82,247 (7.35 %)	1,285,970 (26.71 %)	0 (0 %)	111,125 (5.14 %)	19,578 (8.00 %)	21,712 (5.55 %)
32	African malaria mosquito (primary hap 2022) GCF_943734845.2	28,509 (18.56 %)	n/a	5,391 (2.35 %)	26,924 (13.80 %)	n/a	41.73 (100.00 %)	0 (0 %)	19 (0.00 %)	330 (100.00 %)	98,293 (2.81 %)	66,927 (15.73 %)	1,163,100 (34.06 %)	0 (0 %)	203,726 (6.69 %)	21,535 (10.89 %)	16,154 (3.83 %)
33	African malaria mosquito (S 2008) GCA_000150785.1	n/a	n/a	5,318 (2.53 %)	28,251 (13.08 %)	n/a	44.33 (96.47 %)	12,016 (3.54 %)	12,016 (3.54 %)	25,058 (96.46 %)	215,345 (10.71 %)	56,060 (1.42 %)	1,404,343 (20.91 %)	5 (0.00 %)	44,026 (2.39 %)	24,799 (8.82 %)	22,030 (5.75 %)
34	African swine fever virus (26544/OG10 2019) GCF_003032925.1	n/a	164 (88.73 %)	n/a	n/a	n/a	38.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.58 %)	59 (1.70 %)	1,341 (13.78 %)	0 (0 %)	18 (0.90 %)	17 (3.41 %)	16 (3.04 %)
35	African swine fever virus (47/Ss/2008 2019) GCF_003033005.1	n/a	235 (88.78 %)	n/a	n/a	n/a	38.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	27 (0.61 %)	59 (2.29 %)	1,387 (14.30 %)	0 (0 %)	39 (1.39 %)	17 (3.38 %)	16 (3.01 %)
36	African swine fever virus (ASFV Georgia 2007/1 2020) GCF_003047755.2	n/a	195 (89.23 %)	n/a	n/a	n/a	38.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	19 (0.33 %)	54 (1.73 %)	1,342 (13.47 %)	0 (0 %)	48 (1.63 %)	16 (3.41 %)	17 (3.23 %)
37	African swine fever virus (BA71 2019) GCF_003032875.1	n/a	161 (89.06 %)	n/a	n/a	n/a	38.81 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.57 %)	61 (2.86 %)	1,343 (14.57 %)	0 (0 %)	37 (1.30 %)	17 (3.46 %)	15 (2.95 %)
38	African swine fever virus (BA71V 2014) GCF_000858485.1	n/a	152 (88.20 %)	n/a	n/a	n/a	38.95 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.57 %)	55 (3.36 %)	1,176 (14.34 %)	0 (0 %)	38 (1.07 %)	17 (3.67 %)	15 (3.13 %)
39	African swine fever virus (Benin 97/1 2019) GCF_003047675.1	n/a	156 (88.61 %)	n/a	n/a	n/a	38.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.59 %)	59 (1.90 %)	1,380 (14.38 %)	0 (0 %)	22 (0.97 %)	17 (3.44 %)	17 (3.20 %)
40	African swine fever virus (E75 2019) GCF_003047715.1	n/a	171 (86.69 %)	n/a	n/a	n/a	38.66 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	2 (100.00 %)	25 (0.59 %)	56 (1.72 %)	1,332 (13.80 %)	0 (0 %)	19 (0.96 %)	17 (3.44 %)	17 (3.40 %)
41	African swine fever virus (Ken05/Tk1 2019) GCF_003032905.1	n/a	168 (88.02 %)	n/a	n/a	n/a	38.25 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	17 (0.33 %)	73 (2.13 %)	1,263 (12.68 %)	0 (0 %)	40 (1.75 %)	12 (2.54 %)	14 (3.05 %)
42	African swine fever virus (Ken06.Bus 2019) GCF_003032915.1	n/a	161 (87.27 %)	n/a	n/a	n/a	38.53 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	20 (0.43 %)	82 (2.27 %)	1,244 (12.87 %)	0 (0 %)	24 (0.85 %)	11 (3.08 %)	11 (3.32 %)
43	African swine fever virus (L60 2019) GCF_003032865.1	n/a	163 (89.33 %)	n/a	n/a	n/a	38.61 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.58 %)	57 (1.89 %)	1,368 (14.10 %)	0 (0 %)	19 (0.96 %)	17 (3.42 %)	15 (2.92 %)
44	African swine fever virus (NHV 2019) GCF_003032885.1	n/a	158 (89.62 %)	n/a	n/a	n/a	38.87 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	24 (0.59 %)	53 (2.09 %)	1,299 (14.32 %)	0 (0 %)	24 (1.18 %)	18 (3.77 %)	17 (3.37 %)
45	African swine fever virus (OURT 88/3 2019) GCF_003047695.1	n/a	157 (89.68 %)	n/a	n/a	n/a	38.86 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	24 (0.59 %)	49 (1.75 %)	1,293 (14.30 %)	0 (0 %)	23 (1.12 %)	18 (3.78 %)	17 (3.38 %)
46	Aichi virus 1 (A846/88 1998) GCF_000861885.1	n/a	1 (88.50 %)	n/a	n/a	n/a	58.90 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.09 %)	n/a	8 (2.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (81.27 %)	1 (81.27 %)
47	Aigai virus (AP92 2023) GCF_018594555.1	n/a	3 (95.48 %)	n/a	n/a	n/a	44.05 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	20 (1.33 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
48	Akhmeta virus (Akhmeta_2013-88 2021) GCF_006452035.1	n/a	220 (91.30 %)	n/a	n/a	n/a	33.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	46 (0.98 %)	34 (1.69 %)	1,169 (9.68 %)	0 (0 %)	3 (0.08 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
49	Alenquer virus (2021) GCF_013086385.1	n/a	4 (95.09 %)	n/a	n/a	n/a	39.86 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.29 %)	13 (1.66 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
50	Alkhumra hemorrhagic fever virus (Zaki #2 2012) GCA_031116565.1	n/a	1 (95.14 %)	n/a	n/a	n/a	54.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.40 %)	n/a	2 (0.13 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
51	Alphapapillomavirus 12 (2000) GCF_000836865.1	n/a	8 (86.97 %)	n/a	n/a	n/a	48.06 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.36 %)	1 (0.51 %)	13 (3.72 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.50 %)	0 (0.00 %)
52	Alphapapillomavirus 3 (2000) GCF_000862805.1	n/a	7 (82.89 %)	n/a	n/a	n/a	46.32 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.79 %)	1 (0.95 %)	16 (5.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
53	Alphapapillomavirus 4 (1991) GCF_000864945.1	n/a	7 (86.62 %)	n/a	n/a	n/a	48.40 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.34 %)	1 (0.50 %)	7 (2.05 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
54	American malaria mosquito (2013) GCA_000211455.3	n/a	10,793 (13.27 %)	5,132 (3.99 %)	20,580 (17.21 %)	n/a	48.31 (99.99 %)	3,727 (0.02 %)	3,727 (0.02 %)	5,947 (99.98 %)	133,596 (3.49 %)	32,043 (0.88 %)	842,313 (17.27 %)	4 (0.00 %)	4,533 (0.36 %)	3,894 (25.87 %)	6,587 (2.36 %)
55	American malaria mosquito (primary hap 2022) GCF_943734745.1	21,545 (19.01 %)	n/a	5,232 (3.14 %)	21,409 (14.46 %)	21,330 (15.71 %)	48.07 (99.99 %)	0 (0 %)	30 (0.01 %)	66 (100.00 %)	207,981 (4.75 %)	60,117 (2.88 %)	1,063,030 (20.83 %)	0 (0 %)	32,067 (2.41 %)	264 (8.42 %)	7,846 (2.10 %)
56	Anaplasma phagocytophilum str. (Webster 2015) GCF_000964685.1	n/a	1,190 (71.26 %)	n/a	n/a	n/a	41.64 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	107 (2.61 %)	2,352 (6.01 %)	0 (0 %)	513 (4.27 %)	25 (0.59 %)	17 (0.40 %)
57	Anelloviridae sp. (ctbb016 2023) GCF_004286455.1	n/a	2 (74.06 %)	n/a	n/a	n/a	37.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.56 %)	11 (7.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
58	Anelloviridae sp. (ctbc019 2023) GCF_004285675.1	n/a	2 (81.37 %)	n/a	n/a	n/a	36.92 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (6.97 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
59	Anelloviridae sp. (ctbd020 2023) GCF_004286695.1	n/a	2 (84.88 %)	n/a	n/a	n/a	37.93 (99.87 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.35 %)	7 (5.11 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
60	Anelloviridae sp. (ctbf014 2023) GCF_004286755.1	n/a	3 (79.12 %)	n/a	n/a	n/a	35.76 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (8.44 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
61	Anelloviridae sp. (ctbf050 2023) GCF_004285795.1	n/a	3 (82.06 %)	n/a	n/a	n/a	37.83 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (12.62 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
62	Anelloviridae sp. (ctbg056 2023) GCF_004285195.1	n/a	4 (89.12 %)	n/a	n/a	n/a	35.92 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.64 %)	1 (1.13 %)	19 (15.20 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
63	Anelloviridae sp. (ctbi042 2023) GCF_004286375.1	n/a	1 (85.84 %)	n/a	n/a	n/a	32.36 (99.77 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (9.17 %)	0 (0 %)	1 (14.56 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
64	Anelloviridae sp. (ctcd026 2023) GCF_004287315.1	n/a	2 (80.01 %)	n/a	n/a	n/a	37.81 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (4.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
65	Anelloviridae sp. (ctcf040 2023) GCF_004287355.1	n/a	2 (84.67 %)	n/a	n/a	n/a	35.84 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.18 %)	n/a	9 (5.57 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
66	Anelloviridae sp. (ctea38 2023) GCF_004287275.1	n/a	3 (79.81 %)	n/a	n/a	n/a	36.34 (99.85 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (6.46 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
67	Anelloviridae sp. (ctei055 2023) GCF_004286855.1	n/a	2 (66.81 %)	n/a	n/a	n/a	34.97 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.20 %)	n/a	9 (13.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
68	Anelloviridae sp. (ctga035 2023) GCF_004286675.1	n/a	2 (74.70 %)	n/a	n/a	n/a	37.19 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.54 %)	1 (2.52 %)	3 (4.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
69	Anelloviridae sp. (vzttmv5 2023) GCF_006370125.1	n/a	2 (74.68 %)	n/a	n/a	n/a	39.93 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.75 %)	1 (3.25 %)	9 (7.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
70	Angomonas (Crithidia deanei Carvalho ATCC PRA-265 2020) GCA_903995115.1	n/a	10,512 (61.62 %)	632 (1.86 %)	2,105 (60.05 %)	n/a	49.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	29 (100.00 %)	19,588 (4.09 %)	5,110 (5.53 %)	104,027 (19.32 %)	0 (0 %)	14,434 (6.93 %)	177 (47.12 %)	518 (1.93 %)
71	Anjozorobe virus (Anjozorobe/Em/MDG/2009/ATD49 2017) GCF_002145785.1	n/a	3 (93.60 %)	n/a	n/a	n/a	37.87 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (0.78 %)	1 (0.36 %)	16 (2.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
72	apicomplexans B.besnoiti (Bb-Ger1 2017) GCF_002563875.1	8,205 (34.85 %)	n/a	484 (0.50 %)	6,772 (17.05 %)	n/a	56.97 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	186 (100.00 %)	20,634 (1.95 %)	8,531 (1.19 %)	342,298 (18.11 %)	0 (0 %)	7,667 (2.25 %)	39 (97.59 %)	20 (0.20 %)
73	apicomplexans B.bigemina (BOND 2014) GCA_000723445.1	n/a	n/a	415 (1.89 %)	4,007 (57.26 %)	n/a	50.63 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	483 (100.00 %)	900 (0.51 %)	4,217 (8.52 %)	22,237 (14.14 %)	0 (0 %)	17,475 (6.16 %)	780 (73.55 %)	317 (41.77 %)
74	apicomplexans B.bovis (T2Bo 2021) GCF_000165395.2	3,977 (78.96 %)	n/a	416 (3.20 %)	1,538 (48.40 %)	n/a	41.60 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	8 (100.00 %)	483 (0.30 %)	584 (1.35 %)	20,756 (7.55 %)	0 (0 %)	2,251 (3.34 %)	353 (2.45 %)	312 (2.16 %)
75	apicomplexans B.caballi (USDA-D6B2 2022) GCF_024862765.1	5,882 (60.56 %)	n/a	410 (2.01 %)	3,937 (51.06 %)	n/a	53.63 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	937 (0.41 %)	495 (2.95 %)	35,939 (9.65 %)	0 (0 %)	3,690 (5.43 %)	25 (99.49 %)	61 (14.17 %)
76	apicomplexans B.divergens (1802A 2021) GCA_018398725.1	n/a	4,094 (68.53 %)	399 (2.89 %)	2,014 (49.92 %)	n/a	45.55 (93.04 %)	0 (0 %)	363 (6.98 %)	80 (100.00 %)	489 (0.24 %)	556 (0.64 %)	14,444 (8.55 %)	0 (0 %)	2,683 (2.03 %)	1,044 (9.51 %)	979 (8.88 %)
77	apicomplexans B.divergens (Rouen 1987 2018) GCA_001077455.2	n/a	n/a	399 (2.89 %)	2,035 (49.54 %)	n/a	45.54 (93.40 %)	0 (0 %)	331 (6.61 %)	141 (100.00 %)	472 (0.28 %)	591 (1.33 %)	15,479 (8.15 %)	67 (0.77 %)	2,771 (3.38 %)	1,069 (9.49 %)	1,008 (8.60 %)
78	apicomplexans B.duncani (WA1 2022) GCA_024586265.1	n/a	n/a	372 (3.06 %)	684 (29.00 %)	n/a	37.68 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	8 (100.00 %)	930 (0.61 %)	3,318 (5.06 %)	32,730 (15.45 %)	0 (0 %)	9,417 (10.53 %)	194 (1.60 %)	184 (1.42 %)
79	apicomplexans B.duncani (WA1 2023) GCF_028658345.1	4,165 (60.31 %)	n/a	452 (2.79 %)	1,251 (32.75 %)	n/a	37.32 (99.66 %)	0 (0 %)	11 (0.34 %)	165 (100.00 %)	1,631 (0.88 %)	8,728 (8.70 %)	26,007 (21.34 %)	0 (0 %)	21,429 (15.57 %)	232 (1.44 %)	231 (1.30 %)
80	apicomplexans B.microti (ATCC 30222 2016) GCA_001650055.1	n/a	n/a	361 (3.44 %)	295 (15.85 %)	n/a	36.49 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	234 (100.00 %)	1,012 (0.82 %)	442 (0.52 %)	40,500 (14.71 %)	0 (0 %)	136 (0.21 %)	109 (2.71 %)	111 (2.65 %)
81	apicomplexans B.microti (ATCC PRA-99 2016) GCA_001650065.1	n/a	n/a	353 (3.49 %)	279 (16.42 %)	n/a	36.25 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	82 (100.00 %)	n/a	311 (0.28 %)	38,135 (14.34 %)	0 (0 %)	103 (0.25 %)	104 (2.79 %)	106 (2.74 %)
82	apicomplexans B.microti (GI 2016) GCA_001650105.1	n/a	n/a	387 (3.52 %)	327 (15.97 %)	n/a	36.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	140 (100.00 %)	1,043 (0.79 %)	351 (0.40 %)	41,543 (14.46 %)	0 (0 %)	147 (0.16 %)	109 (2.61 %)	112 (2.56 %)
83	apicomplexans B.microti (GreenwichYale_Lab_strain_1 2016) GCA_001650075.1	n/a	n/a	380 (3.52 %)	330 (16.55 %)	n/a	36.30 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	250 (100.00 %)	976 (0.83 %)	379 (0.62 %)	41,395 (14.65 %)	0 (0 %)	182 (0.40 %)	115 (2.88 %)	119 (2.82 %)
84	apicomplexans B.microti (Nan_Hs_2011_N11-50 2016) GCA_001650145.1	n/a	n/a	353 (3.50 %)	325 (16.55 %)	n/a	36.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	131 (100.00 %)	n/a	293 (0.31 %)	38,133 (14.12 %)	0 (0 %)	111 (0.23 %)	108 (2.82 %)	110 (2.77 %)
85	apicomplexans B.microti (Naushon 2016) GCA_001650135.1	n/a	n/a	359 (3.46 %)	311 (16.37 %)	n/a	36.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	131 (100.00 %)	n/a	313 (0.34 %)	38,478 (14.13 %)	0 (0 %)	118 (0.19 %)	108 (2.76 %)	110 (2.71 %)
86	apicomplexans B.microti strain (RI 2015) GCF_000691945.2	40 (0.60 %)	n/a	355 (3.53 %)	253 (16.62 %)	n/a	36.17 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	6 (100.00 %)	959 (0.87 %)	421 (0.63 %)	38,121 (14.53 %)	0 (0 %)	257 (0.77 %)	105 (2.82 %)	107 (2.76 %)
87	apicomplexans B.ovata (Miyake 2017) GCF_002897235.1	5,044 (64.42 %)	n/a	423 (1.86 %)	3,477 (57.21 %)	n/a	49.27 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	91 (100.00 %)	1,706 (2.04 %)	2,951 (3.17 %)	26,139 (9.76 %)	0 (0 %)	11,536 (6.87 %)	591 (51.43 %)	384 (2.89 %)
88	apicomplexans B.ovis (Selcuk 2022) GCA_023705535.2	n/a	10,796 (68.42 %)	416 (3.45 %)	1,853 (52.51 %)	n/a	43.92 (99.85 %)	11 (0.15 %)	11 (0.15 %)	52 (99.85 %)	374 (0.22 %)	806 (1.05 %)	14,901 (4.80 %)	0 (0 %)	1,083 (2.04 %)	937 (5.84 %)	873 (5.37 %)
89	apicomplexans B.sp. (Xinjiang 2017) GCF_002095265.1	3,066 (62.82 %)	n/a	437 (3.36 %)	1,866 (51.46 %)	n/a	43.87 (99.41 %)	0 (0 %)	83 (0.59 %)	215 (100.00 %)	473 (0.32 %)	359 (0.91 %)	17,935 (5.63 %)	3 (0.01 %)	1,293 (1.20 %)	633 (2.99 %)	591 (2.52 %)
90	apicomplexans C.andersoni (30847 2016) GCF_001865355.1	3,876 (73.99 %)	n/a	413 (2.96 %)	111 (4.69 %)	n/a	28.47 (99.95 %)	84 (0.05 %)	84 (0.05 %)	219 (99.95 %)	3,178 (1.65 %)	978 (0.50 %)	76,825 (24.91 %)	0 (0 %)	108 (0.08 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
91	apicomplexans C.baileyi (TAMU-09Q1 2016) GCA_001593455.1	n/a	n/a	385 (2.84 %)	88 (2.79 %)	n/a	24.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	145 (100.00 %)	6,740 (4.56 %)	4,996 (3.08 %)	80,066 (42.14 %)	0 (0 %)	921 (0.62 %)	7 (0.03 %)	7 (0.03 %)
92	apicomplexans C.bovis (45015 2021) GCF_009768925.1	3,722 (74.71 %)	n/a	395 (2.74 %)	115 (4.79 %)	n/a	30.73 (100.00 %)	22 (0.00 %)	22 (0.00 %)	77 (100.00 %)	3,088 (1.80 %)	902 (0.64 %)	79,565 (23.52 %)	0 (0 %)	374 (0.27 %)	7 (0.02 %)	5 (0.02 %)
93	apicomplexans C.cayetanensis (CHN_HEN01 2016) GCF_000769155.1	7,153 (25.53 %)	n/a	420 (0.58 %)	2,185 (6.53 %)	n/a	51.84 (99.84 %)	0 (0 %)	1,901 (0.17 %)	2,297 (100.00 %)	27,499 (4.31 %)	23,058 (3.40 %)	250,567 (17.82 %)	1 (0.00 %)	7,464 (1.03 %)	11,365 (41.73 %)	7,595 (8.44 %)
94	apicomplexans C.cayetanensis (NF1_C8 2018) GCF_002999335.1	5,822 (25.10 %)	n/a	415 (0.56 %)	1,716 (6.41 %)	n/a	51.90 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	738 (100.00 %)	28,607 (4.76 %)	26,298 (4.89 %)	252,519 (18.85 %)	0 (0 %)	n/a	10,316 (43.85 %)	7,596 (8.43 %)
95	apicomplexans C.felis (Winnie 2021) GCA_020283715.1	n/a	n/a	320 (2.10 %)	257 (5.72 %)	n/a	31.80 (99.99 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	360 (100.00 %)	4,133 (2.28 %)	1,798 (1.10 %)	74,510 (35.26 %)	0 (0 %)	3,637 (2.48 %)	24 (0.12 %)	13 (0.09 %)
96	apicomplexans C.hominis (2015) GCA_002223825.1	n/a	4,546 (75.21 %)	412 (2.90 %)	118 (8.48 %)	n/a	30.14 (99.91 %)	85 (0.09 %)	85 (0.09 %)	97 (99.91 %)	4,843 (2.82 %)	2,054 (1.14 %)	74,516 (24.77 %)	7 (0.03 %)	496 (0.44 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)
97	apicomplexans C.hominis (30976 2015) GCA_001483515.1	n/a	4,004 (81.05 %)	425 (3.00 %)	132 (8.44 %)	n/a	30.13 (99.98 %)	0 (0 %)	44 (0.02 %)	53 (100.00 %)	4,883 (2.80 %)	2,066 (1.09 %)	74,516 (24.83 %)	0 (0 %)	319 (0.23 %)	3 (0.01 %)	2 (0.01 %)
98	apicomplexans C.hominis (37999 2014) GCA_000804495.1	n/a	n/a	404 (2.85 %)	134 (8.39 %)	n/a	30.14 (99.97 %)	0 (0 %)	97 (0.03 %)	78 (100.00 %)	4,823 (2.75 %)	1,983 (1.05 %)	75,630 (25.10 %)	0 (0 %)	316 (0.21 %)	4 (0.02 %)	4 (0.02 %)
99	apicomplexans C.hominis (TU502 2004 refseq) GCF_000006425.1	3,885 (60.43 %)	n/a	399 (2.92 %)	324 (8.13 %)	n/a	30.92 (99.96 %)	0 (0 %)	1,416 (0.03 %)	1,422 (100.00 %)	4,466 (3.74 %)	2,148 (2.13 %)	70,803 (24.63 %)	0 (0 %)	2,213 (0.93 %)	54 (0.29 %)	39 (0.18 %)
100	apicomplexans C.hominis (TU502_2012 2016) GCA_001593465.1	n/a	3,797 (76.08 %)	422 (2.94 %)	154 (8.37 %)	n/a	30.13 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	119 (100.00 %)	4,970 (2.85 %)	2,252 (1.22 %)	75,251 (25.07 %)	0 (0 %)	443 (0.36 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)
101	apicomplexans C.hominis (UKH1 2016) GCA_001593475.1	n/a	3,769 (75.33 %)	421 (2.94 %)	170 (8.44 %)	n/a	30.13 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	156 (100.00 %)	5,028 (2.82 %)	2,269 (1.22 %)	76,676 (25.30 %)	0 (0 %)	457 (0.37 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)
102	apicomplexans C.meleagridis (UKMEL1 2016) GCA_001593445.1	n/a	3,806 (77.45 %)	418 (3.00 %)	143 (8.92 %)	n/a	30.97 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	57 (100.00 %)	3,491 (2.01 %)	1,365 (0.89 %)	73,826 (23.12 %)	0 (0 %)	489 (0.42 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
103	apicomplexans C.muris (RN66 2008) GCF_000006515.1	3,929 (75.16 %)	n/a	422 (2.92 %)	97 (4.96 %)	n/a	28.48 (99.93 %)	13 (0.07 %)	13 (0.07 %)	97 (99.93 %)	3,260 (2.11 %)	1,176 (0.93 %)	78,474 (25.31 %)	0 (0 %)	429 (0.35 %)	7 (0.09 %)	7 (0.09 %)
104	apicomplexans C.parvum (2021) GCA_019844115.2	n/a	n/a	415 (2.91 %)	116 (8.25 %)	n/a	30.11 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	5,122 (3.09 %)	2,507 (1.52 %)	75,586 (25.36 %)	0 (0 %)	789 (0.61 %)	1 (0.00 %)	0 (0.00 %)
105	apicomplexans C.parvum (Iowa type II 2007) GCF_000165345.1	3,805 (75.13 %)	n/a	407 (2.87 %)	117 (8.60 %)	n/a	30.22 (99.83 %)	10 (0.16 %)	2,090 (0.20 %)	18 (99.84 %)	5,010 (3.02 %)	2,285 (1.40 %)	76,131 (24.82 %)	0 (0 %)	751 (0.54 %)	1 (0.00 %)	0 (0.00 %)
106	apicomplexans C.parvum (IOWA-ATCC 2020) GCA_015245375.1	n/a	4,039 (77.25 %)	416 (2.96 %)	119 (8.46 %)	n/a	30.18 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	5,023 (2.87 %)	2,359 (1.42 %)	74,905 (25.05 %)	0 (0 %)	760 (0.57 %)	1 (0.00 %)	0 (0.00 %)
107	apicomplexans C.ryanae (45019 2022) GCF_009792415.1	3,709 (74.42 %)	n/a	398 (2.79 %)	290 (11.44 %)	n/a	32.91 (99.99 %)	39 (0.00 %)	39 (0.00 %)	132 (100.00 %)	2,595 (1.40 %)	790 (0.54 %)	71,448 (21.62 %)	0 (0 %)	361 (0.26 %)	151 (2.66 %)	135 (2.41 %)
108	apicomplexans C.sp. (chipmunk LX-2015 2015) GCA_000831705.1	n/a	n/a	426 (2.83 %)	240 (11.12 %)	n/a	31.92 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	853 (100.00 %)	3,156 (1.69 %)	1,298 (0.62 %)	73,150 (21.29 %)	0 (0 %)	112 (0.08 %)	3 (0.01 %)	3 (0.01 %)
109	apicomplexans C.sp. chipmunk genotype I (37763 2021 genbank) GCA_004936735.2	n/a	3,783 (76.65 %)	426 (3.03 %)	203 (12.39 %)	n/a	32.03 (100.00 %)	0 (0 %)	10 (0.00 %)	50 (100.00 %)	3,358 (1.88 %)	1,257 (0.81 %)	67,711 (20.74 %)	1 (0.00 %)	458 (0.29 %)	4 (0.02 %)	3 (0.01 %)
110	apicomplexans C.sp. chipmunk genotype I (37763 2021 refseq) GCF_004936735.1	3,783 (76.65 %)	n/a	426 (3.03 %)	203 (12.39 %)	n/a	32.03 (100.00 %)	10 (0.00 %)	10 (0.00 %)	60 (100.00 %)	3,358 (1.88 %)	1,257 (0.81 %)	67,711 (20.74 %)	1 (0.00 %)	458 (0.29 %)	4 (0.02 %)	3 (0.01 %)
111	apicomplexans C.suis (Wien I 2017) GCF_002600585.1	11,451 (42.20 %)	n/a	437 (0.32 %)	6,674 (10.32 %)	n/a	49.38 (97.03 %)	11,195 (2.99 %)	11,195 (2.99 %)	25,822 (97.01 %)	96,259 (6.79 %)	37,667 (1.79 %)	541,349 (24.20 %)	4 (0.00 %)	3,158 (0.25 %)	10,990 (47.75 %)	7,593 (34.58 %)
112	apicomplexans C.tyzzeri (UGA55 2019) GCA_007210665.1	n/a	4,033 (78.43 %)	386 (2.83 %)	113 (8.17 %)	n/a	30.25 (99.14 %)	0 (0 %)	320 (0.87 %)	11 (100.00 %)	4,324 (2.54 %)	1,735 (1.11 %)	73,592 (23.84 %)	2 (0.04 %)	454 (0.58 %)	2 (0.00 %)	1 (0.00 %)
113	apicomplexans C.ubiquitum (39726 2016) GCF_001865345.1	3,766 (77.31 %)	n/a	415 (2.99 %)	126 (8.43 %)	n/a	30.82 (99.98 %)	0 (0 %)	27 (0.02 %)	39 (100.00 %)	3,710 (2.17 %)	1,603 (0.88 %)	72,263 (23.08 %)	0 (0 %)	223 (0.17 %)	2 (0.01 %)	1 (0.00 %)
114	apicomplexans E.acervulina (Houghton 2013) GCF_000499425.1	6,867 (30.24 %)	n/a	316 (0.41 %)	1,762 (4.01 %)	n/a	48.36 (99.66 %)	1,532 (0.33 %)	1,532 (0.33 %)	4,947 (99.67 %)	124,880 (21.30 %)	179,542 (19.28 %)	326,783 (47.38 %)	204 (0.20 %)	37,360 (4.27 %)	7,324 (13.55 %)	4,413 (6.02 %)
115	apicomplexans E.brunetti (Houghton 2013) GCA_000499725.1	n/a	38,726 (22.02 %)	290 (0.26 %)	2,273 (3.57 %)	n/a	47.93 (97.28 %)	16,072 (2.79 %)	19,411 (2.79 %)	24,647 (97.21 %)	190,255 (23.51 %)	256,061 (22.79 %)	382,230 (45.31 %)	2,761 (0.69 %)	106,686 (7.99 %)	11,443 (16.15 %)	7,861 (7.42 %)
116	apicomplexans E.falciformis (Bayer Haberkorn 1970 2017) GCA_002271815.1	n/a	n/a	401 (0.60 %)	1,434 (6.00 %)	n/a	49.87 (95.41 %)	0 (0 %)	8,445 (4.67 %)	753 (100.00 %)	69,030 (11.22 %)	72,979 (8.19 %)	322,218 (30.13 %)	0 (0 %)	18,137 (2.67 %)	7,765 (9.66 %)	3,077 (3.13 %)
117	apicomplexans E.maxima (Weybridge 2013) GCF_000499605.1	6,057 (26.37 %)	n/a	277 (0.34 %)	1,593 (4.05 %)	n/a	46.62 (99.77 %)	1,006 (0.22 %)	1,006 (0.22 %)	4,570 (99.78 %)	145,987 (20.99 %)	176,594 (16.90 %)	282,728 (42.80 %)	31 (0.01 %)	50,796 (5.16 %)	8,085 (10.99 %)	4,776 (4.95 %)
118	apicomplexans E.mitis (Houghton 2013) GCF_000499745.2	10,073 (20.15 %)	n/a	272 (0.21 %)	2,857 (3.41 %)	n/a	47.63 (92.84 %)	49,632 (7.39 %)	56,820 (7.40 %)	65,610 (92.61 %)	234,410 (25.86 %)	313,495 (23.68 %)	426,125 (44.19 %)	7,368 (1.70 %)	170,431 (15.18 %)	11,982 (15.50 %)	8,127 (7.00 %)
119	apicomplexans E.necatrix (Houghton 2013) GCF_000499385.1	8,607 (25.77 %)	n/a	301 (0.32 %)	2,120 (4.57 %)	n/a	51.06 (99.82 %)	960 (0.17 %)	960 (0.17 %)	4,667 (99.83 %)	130,891 (17.78 %)	173,394 (18.48 %)	326,547 (39.50 %)	31 (0.02 %)	67,947 (6.59 %)	13,422 (18.61 %)	5,149 (4.80 %)
120	apicomplexans E.praecox (Houghton 2013) GCA_000499445.1	n/a	32,062 (19.62 %)	278 (0.25 %)	1,547 (3.10 %)	n/a	45.78 (93.30 %)	32,011 (6.84 %)	34,977 (6.85 %)	53,359 (93.16 %)	200,524 (28.22 %)	258,669 (24.35 %)	351,391 (45.27 %)	1,972 (0.57 %)	n/a	8,122 (8.56 %)	5,940 (5.09 %)
121	apicomplexans E.tenella (2021) GCA_905310635.1	n/a	n/a	348 (0.37 %)	1,379 (5.08 %)	n/a	51.64 (99.94 %)	0 (0 %)	46 (0.06 %)	17 (100.00 %)	127,196 (15.88 %)	159,072 (19.48 %)	323,290 (38.43 %)	0 (0 %)	50,746 (8.17 %)	11,996 (24.60 %)	4,776 (5.84 %)
122	apicomplexans E.tenella (Houghton 2013) GCF_000499545.1	8,603 (25.50 %)	n/a	326 (0.37 %)	1,629 (4.94 %)	n/a	51.33 (98.72 %)	8,063 (1.32 %)	8,063 (1.32 %)	12,727 (98.68 %)	127,858 (17.49 %)	148,397 (16.77 %)	326,694 (37.33 %)	20 (0.03 %)	37,724 (6.57 %)	12,417 (22.22 %)	4,790 (5.71 %)
123	apicomplexans G.niphandrodes (2014) GCF_000223845.1	6,375 (64.29 %)	n/a	413 (1.94 %)	3,821 (61.09 %)	n/a	53.78 (97.41 %)	2,210 (2.65 %)	2,265 (2.65 %)	2,679 (97.35 %)	2,717 (1.38 %)	15,301 (8.28 %)	40,412 (7.16 %)	470 (2.17 %)	7,301 (7.98 %)	525 (94.61 %)	497 (11.93 %)
124	apicomplexans H.hammondi (H.H.34 2014) GCF_000258005.1	7,978 (28.77 %)	n/a	589 (0.50 %)	14,703 (19.30 %)	n/a	53.30 (99.61 %)	1,494 (0.36 %)	1,537 (0.36 %)	16,355 (99.64 %)	29,410 (2.93 %)	20,872 (1.52 %)	392,316 (16.84 %)	329 (0.23 %)	4,214 (0.79 %)	12,464 (97.54 %)	12,161 (7.97 %)
125	apicomplexans H.sp. ex Piliocolobus tephrosceles (2020) GCA_902459845.2	n/a	12,314 (52.96 %)	252 (0.73 %)	292 (0.82 %)	n/a	22.04 (99.68 %)	0 (0 %)	981 (0.31 %)	2,441 (100.00 %)	70,998 (18.90 %)	62,735 (15.57 %)	198,247 (62.62 %)	34 (0.04 %)	15,385 (4.12 %)	9 (0.01 %)	3 (0.00 %)
126	apicomplexans H.tartakovskyi (SISKIN1 2016) GCA_001625125.1	n/a	n/a	305 (0.84 %)	417 (2.09 %)	n/a	25.41 (98.02 %)	0 (0 %)	1,484 (1.97 %)	2,983 (100.00 %)	52,420 (13.46 %)	54,501 (10.60 %)	217,134 (50.60 %)	9 (0.02 %)	5,517 (1.36 %)	1 (0.00 %)	0 (0.00 %)
127	apicomplexans N.caninum (Liverpool 2011) GCF_000208865.1	6,934 (31.00 %)	n/a	505 (0.54 %)	5,949 (17.94 %)	n/a	54.85 (99.96 %)	234 (0.04 %)	234 (0.04 %)	248 (99.96 %)	25,326 (2.56 %)	20,547 (2.34 %)	357,961 (17.53 %)	0 (0 %)	10,335 (1.81 %)	33 (99.94 %)	40 (0.05 %)
128	apicomplexans N.caninum (Liverpool 2020) GCA_016097395.1	n/a	n/a	511 (0.51 %)	6,379 (17.83 %)	n/a	54.80 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	44 (100.00 %)	34,117 (6.78 %)	21,281 (3.75 %)	367,552 (17.22 %)	0 (0 %)	21,061 (3.74 %)	92 (99.69 %)	89 (0.44 %)
129	apicomplexans P.berghei (ANKA 2019) GCF_900002375.2	5,005 (54.68 %)	n/a	268 (0.87 %)	35 (0.68 %)	n/a	22.04 (100.00 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	21 (100.00 %)	25,676 (7.08 %)	8,590 (2.26 %)	207,549 (58.20 %)	0 (0 %)	2,889 (1.22 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
130	apicomplexans P.brasilianum (Bolivian I 2022) GCF_023973825.1	5,755 (38.17 %)	n/a	308 (0.61 %)	177 (2.44 %)	n/a	24.81 (100.00 %)	0 (0 %)	8 (0.00 %)	43 (100.00 %)	65,712 (10.87 %)	46,895 (8.03 %)	300,201 (53.67 %)	1 (0.00 %)	10,424 (1.76 %)	18 (0.01 %)	5 (0.00 %)
131	apicomplexans P.cf. gigantea (A 2021) GCF_019968955.1	8,886 (84.28 %)	n/a	440 (3.05 %)	3,311 (71.34 %)	n/a	54.25 (99.96 %)	11 (0.02 %)	11 (0.02 %)	798 (99.98 %)	405 (0.22 %)	2,456 (2.63 %)	21,706 (4.71 %)	1 (0.00 %)	1,526 (1.39 %)	919 (93.97 %)	942 (88.56 %)
132	apicomplexans P.cf. gigantea (B 2021) GCA_019968985.2	n/a	9,003 (84.27 %)	440 (3.05 %)	3,521 (73.39 %)	n/a	54.28 (99.95 %)	8 (0.03 %)	8 (0.03 %)	926 (99.97 %)	440 (0.23 %)	2,214 (2.18 %)	17,360 (3.55 %)	0 (0 %)	1,286 (1.22 %)	1,063 (92.98 %)	1,069 (90.06 %)
133	apicomplexans P.cf. gigantea (B 2021) GCF_019968985.1	8,998 (84.24 %)	n/a	440 (3.05 %)	3,521 (73.39 %)	n/a	54.28 (99.95 %)	8 (0.03 %)	8 (0.03 %)	926 (99.97 %)	440 (0.23 %)	2,214 (2.18 %)	17,360 (3.55 %)	0 (0 %)	1,286 (1.22 %)	1,063 (92.98 %)	1,069 (90.06 %)
134	apicomplexans P.chabaudi chabaudi (AS 2019) GCF_900002335.3	5,256 (55.40 %)	n/a	277 (0.86 %)	64 (1.39 %)	n/a	23.62 (100.00 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	16 (100.00 %)	21,778 (5.65 %)	7,979 (2.15 %)	213,315 (54.96 %)	0 (0 %)	2,964 (1.10 %)	6 (0.01 %)	2 (0.00 %)
135	apicomplexans P.coatneyi (Hackeri 2016) GCF_001680005.1	5,531 (42.57 %)	n/a	406 (0.94 %)	1,558 (18.20 %)	n/a	39.65 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	15 (100.00 %)	29,392 (5.30 %)	23,721 (4.55 %)	213,916 (28.46 %)	0 (0 %)	3,593 (0.79 %)	2,186 (2.80 %)	1,332 (1.50 %)
136	apicomplexans P.cynomolgi (M 2017) GCA_900180395.1	n/a	n/a	396 (0.82 %)	1,635 (13.89 %)	n/a	37.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	56 (100.00 %)	36,272 (5.23 %)	43,636 (6.91 %)	233,232 (34.34 %)	0 (0 %)	6,553 (1.27 %)	5,375 (10.24 %)	3,600 (4.53 %)
137	apicomplexans P.cynomolgi strain (B 2012) GCF_000321355.1	5,716 (41.59 %)	n/a	384 (0.94 %)	1,569 (15.59 %)	n/a	40.38 (96.79 %)	1,678 (3.22 %)	1,947 (3.22 %)	3,341 (96.78 %)	23,112 (4.20 %)	36,730 (6.66 %)	202,324 (27.29 %)	1 (0.02 %)	2,628 (0.66 %)	5,330 (11.86 %)	3,267 (4.77 %)
138	apicomplexans P.fragile (nilgiri 2015) GCF_000956335.1	5,645 (51.33 %)	n/a	386 (1.06 %)	1,523 (17.63 %)	n/a	41.21 (88.53 %)	1,522 (11.49 %)	1,522 (11.49 %)	1,770 (88.51 %)	23,189 (3.64 %)	13,060 (2.49 %)	169,337 (21.75 %)	130 (0.96 %)	3,707 (2.93 %)	3,454 (8.27 %)	2,233 (2.94 %)
139	apicomplexans P.gaboni (2021) GCA_900097045.1	n/a	13,869 (56.53 %)	317 (0.91 %)	96 (1.85 %)	n/a	18.61 (99.99 %)	0 (0 %)	11 (0.01 %)	96 (100.00 %)	69,307 (15.62 %)	65,499 (12.27 %)	173,185 (67.97 %)	0 (0 %)	19,860 (4.07 %)	3 (0.00 %)	2 (0.00 %)
140	apicomplexans P.gaboni (SY75 2016) GCF_001602025.1	5,401 (55.97 %)	n/a	301 (0.95 %)	61 (0.93 %)	n/a	18.21 (97.97 %)	0 (0 %)	1,842 (2.06 %)	833 (100.00 %)	64,748 (16.36 %)	60,362 (11.92 %)	166,894 (66.28 %)	23 (0.04 %)	16,890 (3.90 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
141	apicomplexans P.gallinaceum (8A 2016) GCF_900005855.1	5,339 (46.78 %)	n/a	293 (0.79 %)	49 (0.56 %)	n/a	17.82 (95.40 %)	0 (0 %)	1,840 (4.62 %)	154 (100.00 %)	55,576 (11.37 %)	28,854 (5.55 %)	209,490 (64.70 %)	69 (0.21 %)	10,720 (3.31 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)
142	apicomplexans P.inui (San Antonio 1 2014) GCF_000524495.1	5,836 (43.16 %)	n/a	390 (0.98 %)	1,831 (20.82 %)	n/a	42.15 (95.63 %)	1,539 (4.39 %)	1,539 (4.39 %)	1,862 (95.61 %)	16,956 (2.86 %)	16,340 (2.98 %)	179,708 (19.79 %)	83 (0.13 %)	1,304 (0.38 %)	4,850 (8.56 %)	3,324 (4.58 %)
143	apicomplexans P.knowlesi (2017) GCA_900162085.1	n/a	n/a	403 (1.06 %)	1,328 (18.26 %)	n/a	38.59 (99.39 %)	142 (0.61 %)	142 (0.61 %)	158 (99.39 %)	34,528 (7.31 %)	37,035 (10.34 %)	170,262 (31.03 %)	0 (0 %)	17,789 (3.56 %)	1,380 (1.88 %)	731 (0.87 %)
144	apicomplexans P.knowlesi (Malayan Strain Pk1 A 2017) GCA_002140095.1	n/a	5,343 (47.12 %)	394 (1.02 %)	1,312 (17.90 %)	n/a	38.69 (99.99 %)	0 (0 %)	783 (0.01 %)	28 (100.00 %)	35,228 (7.55 %)	40,752 (12.07 %)	168,884 (32.10 %)	0 (0 %)	21,791 (4.27 %)	1,389 (1.86 %)	737 (0.86 %)
145	apicomplexans P.knowlesi strain (H 2020) GCF_000006355.2	5,381 (48.00 %)	n/a	404 (1.07 %)	1,325 (18.29 %)	n/a	38.62 (99.95 %)	0 (0 %)	98 (0.05 %)	164 (100.00 %)	34,274 (7.07 %)	37,725 (10.83 %)	168,555 (31.26 %)	2 (0.00 %)	18,185 (3.57 %)	1,387 (1.88 %)	738 (0.87 %)
146	apicomplexans P.reichenowi (2018) GCA_900097025.1	n/a	14,978 (53.25 %)	303 (0.78 %)	101 (2.60 %)	n/a	19.30 (100.00 %)	0 (0 %)	4 (0.00 %)	48 (100.00 %)	80,435 (17.17 %)	79,163 (14.00 %)	191,442 (66.79 %)	0 (0 %)	30,938 (6.08 %)	13 (0.02 %)	10 (0.02 %)
147	apicomplexans P.reichenowi (CDC 2014) GCF_000723685.1	5,687 (52.82 %)	n/a	308 (0.79 %)	117 (1.94 %)	n/a	19.26 (99.46 %)	1,683 (0.57 %)	2,064 (0.57 %)	2,055 (99.43 %)	78,653 (16.95 %)	76,452 (13.70 %)	191,495 (66.47 %)	208 (0.31 %)	26,114 (5.19 %)	7 (0.01 %)	5 (0.01 %)
148	apicomplexans P.relictum (SGS1 2016) GCF_900005765.1	5,188 (48.26 %)	n/a	302 (0.86 %)	39 (0.36 %)	n/a	18.33 (99.88 %)	0 (0 %)	237 (0.12 %)	514 (100.00 %)	47,871 (10.61 %)	20,292 (4.19 %)	198,607 (67.18 %)	6 (0.05 %)	4,189 (1.45 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)
149	apicomplexans P.sp. DRC-Itaito (2020) GCA_900257145.2	n/a	13,501 (55.64 %)	303 (0.93 %)	64 (1.45 %)	n/a	18.87 (92.67 %)	215 (7.33 %)	215 (7.33 %)	229 (92.67 %)	68,747 (17.67 %)	61,046 (11.90 %)	167,574 (62.09 %)	2 (0.06 %)	22,163 (4.80 %)	14 (0.04 %)	12 (0.03 %)
150	apicomplexans P.sp. gorilla clade G1 (2018) GCA_900095595.1	n/a	16,280 (53.84 %)	306 (0.77 %)	105 (1.92 %)	n/a	19.26 (99.26 %)	0 (0 %)	70 (0.74 %)	53 (100.00 %)	79,672 (16.51 %)	77,832 (12.67 %)	194,536 (66.37 %)	1 (0.04 %)	27,823 (5.27 %)	18 (0.03 %)	13 (0.02 %)
151	apicomplexans P.sp. gorilla clade G2 (2018) GCF_900097015.1	5,428 (55.18 %)	n/a	311 (0.85 %)	92 (1.90 %)	n/a	18.63 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	82 (100.00 %)	70,141 (15.75 %)	65,995 (11.78 %)	179,122 (67.91 %)	0 (0 %)	18,084 (3.62 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)
152	apicomplexans P.sp. gorilla clade G3 (2018) GCA_900097035.1	n/a	14,103 (54.98 %)	314 (0.88 %)	87 (1.41 %)	n/a	18.49 (97.24 %)	0 (0 %)	186 (2.76 %)	97 (100.00 %)	72,561 (17.98 %)	66,711 (13.01 %)	171,619 (66.08 %)	4 (0.03 %)	22,453 (4.81 %)	4 (0.01 %)	2 (0.00 %)
153	apicomplexans P.vinckei (2020) GCA_903994265.1	n/a	14,656 (53.97 %)	269 (0.83 %)	49 (1.35 %)	n/a	23.11 (99.99 %)	0 (0 %)	11 (0.01 %)	16 (100.00 %)	23,585 (6.22 %)	8,018 (2.10 %)	217,968 (55.76 %)	0 (0 %)	4,718 (1.85 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)
154	apicomplexans P.vinckei (vinckei 2014) GCF_000709005.1	4,964 (56.28 %)	n/a	272 (0.91 %)	48 (0.83 %)	n/a	22.89 (98.01 %)	300 (2.00 %)	300 (2.00 %)	349 (98.00 %)	22,075 (6.23 %)	7,844 (1.92 %)	200,685 (55.22 %)	50 (0.05 %)	1,358 (0.57 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
155	apicomplexans P.vinckei brucechwatti (2020) GCA_903994205.1	n/a	14,379 (54.51 %)	275 (0.84 %)	47 (1.08 %)	n/a	23.11 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	16 (100.00 %)	23,577 (6.26 %)	7,763 (2.09 %)	214,765 (55.86 %)	0 (0 %)	4,123 (1.62 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)
156	apicomplexans P.vinckei lentum (2020) GCA_903994225.1	n/a	14,533 (54.36 %)	280 (0.85 %)	48 (1.19 %)	n/a	23.25 (99.99 %)	0 (0 %)	10 (0.01 %)	16 (100.00 %)	22,894 (6.06 %)	7,032 (1.82 %)	217,292 (55.56 %)	0 (0 %)	3,860 (1.53 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)
157	apicomplexans P.vinckei petteri (2020) GCA_903994235.1	n/a	14,582 (54.27 %)	276 (0.85 %)	51 (1.33 %)	n/a	23.15 (100.00 %)	0 (0 %)	5 (0.00 %)	16 (100.00 %)	23,309 (6.16 %)	7,695 (1.99 %)	217,049 (55.64 %)	0 (0 %)	5,686 (2.09 %)	0 (0.00 %)	1 (0.00 %)
158	apicomplexans P.vinckei petteri (CR 2014) GCA_000524515.1	n/a	5,213 (55.00 %)	272 (0.85 %)	54 (0.93 %)	n/a	23.16 (98.65 %)	231 (1.35 %)	231 (1.35 %)	297 (98.65 %)	22,600 (6.10 %)	7,259 (1.72 %)	210,578 (55.08 %)	25 (0.03 %)	1,812 (0.79 %)	0 (0.00 %)	1 (0.00 %)
159	apicomplexans P.vinckei vinckei (2019) GCF_900681995.1	5,030 (55.54 %)	n/a	279 (0.89 %)	41 (1.02 %)	n/a	22.89 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	16 (100.00 %)	22,424 (6.06 %)	8,164 (2.29 %)	204,726 (56.32 %)	0 (0 %)	3,275 (1.30 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
160	apicomplexans P.yoelii (17X 2019) GCF_900002385.2	6,068 (49.37 %)	n/a	303 (0.79 %)	61 (1.07 %)	n/a	21.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16 (100.00 %)	36,103 (8.16 %)	30,218 (5.93 %)	225,866 (59.61 %)	0 (0 %)	17,787 (4.79 %)	4 (0.00 %)	3 (0.00 %)
161	apicomplexans P.yoelii (YM 2014) GCA_900002395.1	n/a	15,628 (51.46 %)	288 (0.81 %)	49 (0.92 %)	n/a	21.70 (97.30 %)	0 (0 %)	1,728 (2.73 %)	197 (100.00 %)	35,715 (8.61 %)	30,474 (6.04 %)	215,473 (57.25 %)	52 (0.10 %)	10,304 (3.01 %)	4 (0.00 %)	3 (0.00 %)
162	apicomplexans P.yoelii yoelii (17XNL 2002) GCF_000003085.2	7,141 (42.65 %)	n/a	332 (0.86 %)	1,369 (4.36 %)	n/a	24.69 (99.95 %)	11,271 (0.05 %)	11,271 (0.05 %)	16,958 (99.95 %)	34,028 (7.71 %)	29,027 (7.27 %)	219,926 (57.48 %)	4 (0.00 %)	8,922 (2.17 %)	852 (4.45 %)	847 (4.43 %)
163	apicomplexans P.yoelii yoelii (17XNL clone 1.1 2023) GCA_020844765.3	n/a	7,130 (68.77 %)	289 (0.77 %)	59 (1.06 %)	n/a	21.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16 (100.00 %)	35,815 (7.89 %)	30,241 (5.93 %)	225,897 (59.61 %)	0 (0 %)	17,751 (4.79 %)	4 (0.00 %)	3 (0.00 %)
164	apicomplexans S.neurona (SN1 2015) GCA_000875885.1	n/a	n/a	407 (0.20 %)	3,186 (4.58 %)	n/a	51.51 (90.53 %)	0 (0 %)	12,352 (9.50 %)	2,862 (100.00 %)	172,742 (13.97 %)	92,778 (3.69 %)	903,586 (31.65 %)	202 (0.15 %)	7,490 (0.57 %)	8,277 (28.14 %)	8,766 (3.07 %)
165	apicomplexans S.neurona (SN3 2014) GCA_000727475.1	n/a	n/a	415 (0.21 %)	3,217 (4.52 %)	n/a	51.41 (98.41 %)	2,320 (1.59 %)	2,399 (1.59 %)	3,191 (98.41 %)	188,246 (14.97 %)	106,788 (4.50 %)	927,905 (35.25 %)	197 (0.09 %)	11,577 (0.66 %)	2,904 (90.14 %)	8,654 (3.09 %)
166	apicomplexans T.annulata (Ankara isolate clone C9 2005) GCA_000003225.1	n/a	14,654 (73.11 %)	343 (2.51 %)	327 (20.90 %)	n/a	32.54 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	8 (100.00 %)	3,920 (2.79 %)	5,067 (3.13 %)	51,568 (22.27 %)	0 (0 %)	1,747 (2.76 %)	27 (0.10 %)	27 (0.10 %)
167	apicomplexans T.annulata (Ankara isolate clone C9 2005) GCF_000003225.4	3,792 (72.85 %)	n/a	343 (2.51 %)	327 (20.90 %)	n/a	32.54 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	8 (100.00 %)	6,401 (7.86 %)	5,067 (3.13 %)	51,568 (22.27 %)	0 (0 %)	1,747 (2.76 %)	27 (0.10 %)	27 (0.10 %)
168	apicomplexans T.equi strain (WA 2012) GCF_000342415.1	5,310 (69.13 %)	n/a	409 (2.23 %)	1,224 (36.14 %)	n/a	39.48 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	12 (100.00 %)	658 (0.38 %)	174 (0.40 %)	40,389 (7.82 %)	0 (0 %)	497 (0.71 %)	243 (1.00 %)	210 (0.82 %)
169	apicomplexans T.gondii (ARI 2016) GCA_000250965.2	n/a	10,148 (31.09 %)	494 (0.47 %)	6,560 (18.60 %)	n/a	52.36 (97.51 %)	3,455 (2.50 %)	3,515 (2.50 %)	6,200 (97.50 %)	31,170 (3.39 %)	26,067 (1.89 %)	385,697 (17.53 %)	499 (0.30 %)	7,774 (1.15 %)	2,278 (96.62 %)	2,307 (2.71 %)
170	apicomplexans T.gondii (CAST 2018) GCA_000256705.2	n/a	9,697 (31.04 %)	505 (0.48 %)	6,602 (18.72 %)	n/a	52.35 (97.15 %)	3,036 (2.86 %)	3,113 (2.86 %)	5,697 (97.14 %)	31,313 (3.40 %)	26,767 (1.91 %)	385,960 (17.53 %)	380 (0.38 %)	7,809 (1.09 %)	2,352 (97.03 %)	2,629 (2.99 %)
171	apicomplexans T.gondii (COUG 2017) GCA_000338675.2	n/a	212 (0.19 %)	504 (0.48 %)	6,497 (18.36 %)	n/a	52.32 (97.89 %)	4,033 (2.12 %)	4,130 (2.12 %)	8,238 (97.88 %)	31,275 (3.49 %)	26,736 (2.08 %)	383,650 (17.45 %)	827 (0.49 %)	8,583 (1.55 %)	2,468 (96.49 %)	2,527 (2.69 %)
172	apicomplexans T.gondii (CtCo5 2012) GCA_000278365.1	n/a	n/a	475 (0.43 %)	9,203 (18.35 %)	n/a	52.35 (99.98 %)	45 (0.00 %)	45 (0.00 %)	6,222 (100.00 %)	31,112 (3.29 %)	27,645 (1.90 %)	381,125 (17.98 %)	0 (0 %)	3,603 (0.39 %)	6,533 (90.56 %)	5,686 (7.69 %)
173	apicomplexans T.gondii (FOU 2014) GCA_000224905.2	n/a	10,297 (31.38 %)	494 (0.47 %)	6,431 (18.54 %)	n/a	52.36 (95.88 %)	3,655 (4.13 %)	3,669 (4.13 %)	6,526 (95.87 %)	30,059 (3.18 %)	23,528 (1.49 %)	384,533 (17.34 %)	232 (0.20 %)	3,125 (0.33 %)	2,300 (90.12 %)	3,127 (3.12 %)
174	apicomplexans T.gondii (GAB2-2007-GAL-DOM2 2014) GCA_000325525.2	n/a	9,296 (30.56 %)	494 (0.48 %)	6,576 (18.80 %)	n/a	52.36 (99.09 %)	2,417 (0.92 %)	2,475 (0.92 %)	4,928 (99.08 %)	30,904 (3.43 %)	26,801 (2.01 %)	385,482 (17.91 %)	376 (0.21 %)	7,870 (1.16 %)	1,950 (97.87 %)	2,057 (2.08 %)
175	apicomplexans T.gondii (GT1 2013) GCA_000149715.2	n/a	8,637 (31.25 %)	500 (0.48 %)	6,741 (18.85 %)	n/a	52.40 (98.24 %)	736 (1.76 %)	736 (1.76 %)	2,352 (98.24 %)	29,853 (3.29 %)	25,799 (2.52 %)	389,856 (17.72 %)	153 (0.33 %)	11,222 (2.16 %)	1,330 (97.58 %)	1,584 (2.87 %)
176	apicomplexans T.gondii (MAS 2014) GCA_000224865.2	n/a	10,176 (31.51 %)	475 (0.47 %)	6,431 (18.69 %)	n/a	52.37 (97.12 %)	3,589 (2.90 %)	3,598 (2.90 %)	5,772 (97.10 %)	29,686 (3.08 %)	22,885 (1.43 %)	380,930 (17.47 %)	334 (0.24 %)	2,549 (0.27 %)	1,845 (93.35 %)	2,749 (2.95 %)
177	apicomplexans T.gondii (ME49xCTG S27 2020) GCA_014898695.1	n/a	n/a	466 (0.42 %)	5,775 (12.97 %)	n/a	52.44 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	50 (100.00 %)	29,587 (3.56 %)	24,239 (4.12 %)	351,276 (17.05 %)	0 (0 %)	20,297 (3.23 %)	46 (99.61 %)	86 (0.51 %)
178	apicomplexans T.gondii (p89 2014) GCA_000224885.2	n/a	9,874 (31.44 %)	488 (0.47 %)	6,489 (18.88 %)	n/a	52.36 (96.45 %)	3,217 (3.56 %)	3,221 (3.56 %)	5,370 (96.44 %)	29,938 (3.16 %)	24,004 (1.53 %)	383,727 (17.45 %)	246 (0.18 %)	3,532 (0.37 %)	1,909 (96.13 %)	2,763 (2.92 %)
179	apicomplexans T.gondii (RH 2016) GCA_001593265.1	n/a	n/a	491 (0.45 %)	6,689 (18.51 %)	n/a	52.32 (96.55 %)	0 (0 %)	5,105 (3.47 %)	441 (100.00 %)	33,389 (3.61 %)	31,479 (6.26 %)	400,919 (17.37 %)	712 (0.96 %)	18,199 (8.34 %)	575 (93.28 %)	1,259 (3.02 %)
180	apicomplexans T.gondii (RH-88 2020) GCA_013099955.1	n/a	8,654 (30.03 %)	554 (0.49 %)	6,599 (18.40 %)	n/a	52.11 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	197 (100.00 %)	30,835 (3.92 %)	25,798 (4.93 %)	359,501 (18.91 %)	0 (0 %)	24,074 (4.82 %)	155 (97.27 %)	128 (0.77 %)
181	apicomplexans T.gondii (RUB 2014) GCA_000224805.2	n/a	10,213 (31.18 %)	491 (0.47 %)	6,425 (18.66 %)	n/a	52.37 (96.39 %)	3,864 (3.63 %)	3,910 (3.63 %)	6,295 (96.37 %)	30,728 (3.41 %)	24,756 (1.64 %)	384,326 (17.35 %)	381 (0.33 %)	5,993 (1.18 %)	2,231 (96.39 %)	2,719 (2.94 %)
182	apicomplexans T.gondii (TgCATBr5 2011) GCA_000259835.1	n/a	n/a	463 (0.42 %)	9,554 (18.02 %)	n/a	52.36 (99.98 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	6,997 (100.00 %)	29,943 (3.09 %)	23,397 (1.52 %)	381,860 (18.08 %)	0 (0 %)	1,598 (0.16 %)	6,989 (89.82 %)	5,516 (7.30 %)
183	apicomplexans T.gondii (TgCATBr9 2018) GCA_000224825.2	n/a	n/a	496 (0.48 %)	6,500 (18.74 %)	n/a	52.38 (95.75 %)	3,837 (4.26 %)	3,848 (4.26 %)	6,289 (95.74 %)	29,511 (3.14 %)	22,973 (1.47 %)	383,948 (17.29 %)	224 (0.16 %)	3,211 (0.36 %)	2,104 (88.52 %)	2,875 (2.88 %)
184	apicomplexans T.gondii (TgCatPRC2 2016) GCA_000256725.2	n/a	10,300 (30.99 %)	505 (0.49 %)	6,541 (18.57 %)	n/a	52.32 (98.04 %)	4,074 (1.98 %)	4,138 (1.98 %)	7,138 (98.02 %)	31,960 (3.63 %)	27,979 (2.13 %)	384,587 (17.82 %)	589 (0.41 %)	7,180 (1.04 %)	1,842 (95.34 %)	2,216 (2.20 %)
185	apicomplexans T.gondii (VAND 2014) GCA_000224845.2	n/a	9,426 (31.36 %)	499 (0.48 %)	6,501 (18.81 %)	n/a	52.35 (96.99 %)	2,340 (3.02 %)	2,349 (3.02 %)	4,481 (96.98 %)	30,613 (3.32 %)	24,997 (1.64 %)	385,903 (17.63 %)	219 (0.17 %)	4,947 (0.59 %)	1,930 (96.36 %)	2,681 (3.17 %)
186	apicomplexans T.gondii (VEG 2013) GCA_000150015.2	n/a	8,563 (31.30 %)	486 (0.47 %)	6,668 (18.92 %)	n/a	52.39 (98.48 %)	751 (1.52 %)	751 (1.52 %)	2,110 (98.48 %)	29,699 (3.24 %)	25,711 (2.44 %)	385,917 (17.70 %)	123 (0.23 %)	10,448 (2.03 %)	1,185 (97.70 %)	1,326 (2.78 %)
187	apicomplexans T.orientalis (Fish Creek 2022) GCA_003072545.4	n/a	3,980 (68.63 %)	353 (2.41 %)	1,101 (39.90 %)	n/a	38.84 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	3,068 (7.49 %)	1,118 (1.80 %)	49,615 (14.64 %)	0 (0 %)	1,111 (2.91 %)	935 (8.49 %)	925 (8.22 %)
188	apicomplexans T.orientalis (Goon Nure 2022) GCA_003072535.4	n/a	3,924 (68.91 %)	364 (2.49 %)	890 (35.91 %)	n/a	37.46 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	3,246 (4.59 %)	1,908 (1.68 %)	50,246 (16.20 %)	0 (0 %)	1,132 (2.36 %)	637 (5.47 %)	627 (5.27 %)
189	apicomplexans T.orientalis strain (Shintoku 2012) GCF_000740895.1	4,011 (68.56 %)	n/a	354 (2.46 %)	1,576 (45.21 %)	n/a	41.55 (99.96 %)	0 (0 %)	1 (0.04 %)	6 (100.00 %)	2,902 (2.23 %)	2,777 (2.10 %)	43,742 (13.74 %)	0 (0 %)	890 (1.85 %)	1,509 (21.25 %)	1,397 (17.53 %)
190	apicomplexans T.parva strain (Muguga 2005) GCF_000165365.1	4,055 (78.84 %)	n/a	348 (2.56 %)	352 (23.06 %)	n/a	34.04 (100.00 %)	0 (0 %)	12 (0.00 %)	9 (100.00 %)	3,773 (2.88 %)	6,554 (4.15 %)	50,104 (20.81 %)	1 (0.01 %)	1,662 (2.21 %)	56 (0.22 %)	55 (0.22 %)
191	Argentinian mammarenavirus (XJ13 2003) GCF_000856545.1	n/a	4 (95.69 %)	n/a	n/a	n/a	41.57 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.24 %)	1 (0.48 %)	2 (0.58 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
192	ascomycetes A.aculeatus ATCC 16872 GCF_001890905.1	10,830 (51.29 %)	n/a	1,477 (3.20 %)	4,326 (17.68 %)	n/a	50.87 (99.33 %)	192 (0.67 %)	270 (0.67 %)	852 (99.33 %)	14,258 (1.80 %)	8,008 (0.95 %)	121,961 (11.81 %)	9 (0.04 %)	619 (0.23 %)	750 (46.74 %)	1,710 (6.55 %)
193	ascomycetes A.alternata GCF_001642055.1	13,466 (64.96 %)	n/a	1,403 (3.17 %)	8,177 (32.49 %)	n/a	51.40 (99.99 %)	12 (0.01 %)	12 (0.01 %)	91 (99.99 %)	3,033 (0.41 %)	1,515 (0.22 %)	84,571 (5.24 %)	2 (0.00 %)	60 (0.02 %)	128 (55.20 %)	130 (0.48 %)
194	ascomycetes A.apis (ARSEF 7405 2016) GCA_001636715.1	n/a	6,442 (51.59 %)	1,357 (5.14 %)	4,684 (33.98 %)	n/a	47.66 (98.68 %)	0 (0 %)	2,781 (1.37 %)	82 (100.00 %)	13,546 (3.01 %)	3,398 (0.60 %)	91,257 (10.95 %)	55 (0.09 %)	348 (0.26 %)	5,808 (23.06 %)	3,979 (10.22 %)
195	ascomycetes A.brasiliensis (CBS 101740 2016) GCA_001889945.1	n/a	13,264 (56.59 %)	1,481 (3.19 %)	5,692 (21.36 %)	n/a	50.46 (99.58 %)	185 (0.43 %)	185 (0.43 %)	288 (99.57 %)	11,686 (1.37 %)	3,243 (0.39 %)	116,939 (7.71 %)	9 (0.01 %)	243 (0.07 %)	4,895 (72.41 %)	7,119 (24.25 %)
196	ascomycetes A.brasiliensis (CBS 101740 2016) GCF_001889945.1	12,986 (56.52 %)	n/a	1,481 (3.19 %)	5,692 (21.36 %)	n/a	50.46 (99.58 %)	185 (0.43 %)	185 (0.43 %)	288 (99.57 %)	11,667 (1.35 %)	3,243 (0.39 %)	116,939 (7.71 %)	9 (0.01 %)	243 (0.07 %)	4,895 (72.41 %)	7,119 (24.25 %)
197	ascomycetes A.campestris IBT 28561 GCF_002847485.1	9,654 (56.20 %)	n/a	1,450 (3.90 %)	3,768 (18.66 %)	n/a	51.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	62 (100.00 %)	14,428 (2.56 %)	6,853 (1.06 %)	82,772 (11.18 %)	0 (0 %)	1,291 (0.74 %)	311 (53.94 %)	355 (1.69 %)
198	ascomycetes A.carbonaris (ITEM 5010 2017) GCA_001990825.1	n/a	11,738 (60.63 %)	1,570 (3.51 %)	5,385 (21.43 %)	n/a	51.72 (94.39 %)	400 (5.61 %)	400 (5.61 %)	1,229 (94.39 %)	13,457 (1.72 %)	4,908 (0.62 %)	106,246 (7.74 %)	4 (0.01 %)	222 (0.39 %)	2,489 (78.68 %)	4,108 (25.60 %)
199	ascomycetes A.clavatus NRRL 1 GCF_000002715.2	9,117 (48.58 %)	n/a	1,533 (4.22 %)	5,016 (24.52 %)	n/a	49.21 (99.97 %)	88 (0.03 %)	88 (0.03 %)	231 (99.97 %)	12,924 (2.03 %)	4,883 (0.69 %)	81,761 (11.49 %)	0 (0 %)	569 (0.17 %)	1,714 (40.34 %)	3,057 (19.94 %)
200	ascomycetes A.cristatus (GZAAS20.1005 2016) GCA_001717485.1	n/a	10,344 (52.14 %)	1,545 (4.19 %)	5,976 (26.91 %)	n/a	49.69 (99.53 %)	0 (0 %)	117 (0.48 %)	68 (100.00 %)	7,892 (1.25 %)	2,683 (0.57 %)	74,260 (8.16 %)	0 (0 %)	659 (0.45 %)	1,262 (49.95 %)	2,064 (8.14 %)
201	ascomycetes A.ellipticus (CBS 707.79 2018) GCA_003184645.1	n/a	13,179 (48.78 %)	1,560 (3.01 %)	5,809 (18.75 %)	n/a	47.38 (94.17 %)	406 (5.83 %)	406 (5.83 %)	924 (94.17 %)	23,112 (2.48 %)	20,018 (1.99 %)	116,002 (19.35 %)	54 (0.58 %)	2,168 (0.50 %)	2,788 (66.72 %)	3,131 (44.81 %)
202	ascomycetes A.eucalypticola CBS 122712 GCF_003184535.1	11,853 (55.63 %)	n/a	1,520 (3.40 %)	6,286 (23.56 %)	n/a	49.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	131 (100.00 %)	12,432 (1.58 %)	4,236 (0.54 %)	104,532 (9.46 %)	0 (0 %)	416 (0.12 %)	6,645 (56.54 %)	7,391 (28.31 %)
203	ascomycetes A.fijiensis CBS 313.89 GCF_003184825.1	12,006 (54.22 %)	n/a	1,511 (3.17 %)	4,579 (18.12 %)	n/a	50.08 (99.96 %)	69 (0.04 %)	69 (0.04 %)	218 (99.96 %)	15,116 (1.73 %)	11,009 (1.27 %)	112,186 (13.84 %)	12 (0.01 %)	848 (0.17 %)	1,168 (52.82 %)	1,801 (18.89 %)
204	ascomycetes A.fischeri (v4 NRRL 181 2006) GCF_000149645.3	10,386 (48.60 %)	n/a	1,532 (3.78 %)	6,129 (25.42 %)	n/a	49.41 (99.97 %)	89 (0.03 %)	89 (0.03 %)	252 (99.97 %)	4,922 (0.68 %)	2,244 (0.39 %)	66,838 (5.86 %)	0 (0 %)	710 (0.23 %)	2,647 (77.24 %)	3,710 (23.12 %)
205	ascomycetes A.flagrans (CBS H-5679 2019) GCA_004000055.1	n/a	10,346 (39.40 %)	1,471 (3.09 %)	7,512 (23.57 %)	n/a	45.10 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14 (100.00 %)	12,421 (2.24 %)	6,694 (1.25 %)	122,303 (11.26 %)	0 (0 %)	5,008 (1.25 %)	5,164 (10.46 %)	4,658 (6.88 %)
206	ascomycetes A.flagrans (CBS H-5679 2019) GCF_004000055.1	10,346 (39.40 %)	n/a	1,471 (3.09 %)	7,512 (23.57 %)	n/a	45.10 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14 (100.00 %)	12,076 (1.76 %)	6,694 (1.25 %)	122,303 (11.26 %)	0 (0 %)	5,008 (1.25 %)	5,164 (10.46 %)	4,658 (6.88 %)
207	ascomycetes A.flavus (NRRL 3357 2019) GCA_009017415.1	n/a	13,958 (60.54 %)	1,597 (3.25 %)	7,371 (24.63 %)	n/a	47.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	7,286 (1.19 %)	6,722 (0.76 %)	81,429 (7.62 %)	0 (0 %)	492 (0.20 %)	9,897 (37.53 %)	9,243 (24.11 %)
208	ascomycetes A.flavus (NRRL3357 2020) GCA_000006275.3	n/a	14,699 (52.12 %)	1,569 (3.25 %)	7,336 (24.82 %)	n/a	48.31 (99.84 %)	0 (0 %)	626 (0.17 %)	282 (100.00 %)	7,106 (0.86 %)	3,008 (0.37 %)	88,073 (5.61 %)	1 (0.00 %)	325 (0.07 %)	10,041 (37.77 %)	9,007 (21.95 %)
209	ascomycetes A.fumigatus (A1163 2007) GCA_000150145.1	n/a	10,109 (49.67 %)	1,544 (4.08 %)	5,507 (24.91 %)	n/a	49.55 (99.63 %)	85 (0.36 %)	168 (0.37 %)	140 (99.64 %)	5,093 (2.93 %)	2,047 (0.36 %)	65,285 (5.97 %)	1 (0.01 %)	571 (0.15 %)	3,241 (71.42 %)	4,440 (32.18 %)
210	ascomycetes A.fumigatus Af293 GCF_000002655.1	9,629 (49.43 %)	n/a	1,540 (4.10 %)	5,428 (24.84 %)	n/a	49.80 (98.04 %)	11 (1.96 %)	28 (1.96 %)	19 (98.04 %)	4,813 (2.98 %)	2,098 (0.35 %)	61,457 (5.50 %)	0 (0 %)	864 (0.25 %)	3,039 (48.73 %)	4,409 (30.80 %)
211	ascomycetes A.glaucus CBS 516.65 GCF_001890805.1	11,254 (60.03 %)	n/a	1,516 (4.17 %)	5,814 (27.09 %)	n/a	49.39 (99.25 %)	351 (0.76 %)	351 (0.76 %)	433 (99.24 %)	9,681 (1.43 %)	4,476 (0.60 %)	79,796 (7.39 %)	18 (0.03 %)	432 (0.14 %)	2,043 (27.67 %)	3,333 (11.66 %)
212	ascomycetes A.heteromorphus CBS 117.55 GCF_003184545.1	10,782 (48.32 %)	n/a	1,540 (3.34 %)	4,868 (18.75 %)	n/a	48.06 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	205 (100.00 %)	28,918 (3.97 %)	23,013 (2.64 %)	101,136 (22.03 %)	0 (0 %)	4,702 (0.98 %)	570 (40.72 %)	647 (14.26 %)
213	ascomycetes A.homomorphus CBS 101889 GCF_003184865.1	11,349 (53.96 %)	n/a	1,464 (3.35 %)	4,816 (19.82 %)	n/a	50.01 (99.90 %)	95 (0.10 %)	95 (0.10 %)	247 (99.90 %)	11,283 (1.41 %)	8,301 (1.05 %)	98,670 (11.70 %)	9 (0.00 %)	798 (0.21 %)	1,190 (52.50 %)	1,663 (8.00 %)
214	ascomycetes A.ibericus CBS 121593 GCF_003184845.1	11,674 (56.62 %)	n/a	1,512 (3.47 %)	4,970 (20.10 %)	n/a	50.55 (99.96 %)	85 (0.04 %)	85 (0.04 %)	201 (99.96 %)	11,061 (1.47 %)	4,888 (0.65 %)	106,529 (11.60 %)	11 (0.01 %)	596 (0.13 %)	1,148 (52.10 %)	1,852 (18.70 %)
215	ascomycetes A.lentulus (IFM 54703 2021) GCA_001445615.2	n/a	31,856 (50.08 %)	1,536 (3.84 %)	5,482 (23.87 %)	n/a	49.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	4,794 (0.67 %)	2,043 (0.38 %)	70,366 (6.77 %)	0 (0 %)	984 (0.39 %)	2,135 (81.65 %)	3,951 (21.86 %)
216	ascomycetes A.luchuensis (CBS 106.47 2016) GCA_001890685.1	n/a	13,785 (54.60 %)	1,507 (3.12 %)	6,320 (22.32 %)	n/a	49.07 (99.61 %)	211 (0.40 %)	211 (0.40 %)	311 (99.60 %)	12,676 (1.46 %)	4,318 (0.51 %)	120,437 (9.87 %)	10 (0.02 %)	424 (0.12 %)	6,915 (59.94 %)	7,841 (26.84 %)
217	ascomycetes A.luchuensis IFO 4308 (IFO4308 2011) GCA_000239835.2	n/a	35,969 (46.09 %)	1,504 (3.15 %)	6,229 (22.22 %)	n/a	48.96 (99.36 %)	479 (0.64 %)	519 (0.64 %)	1,639 (99.36 %)	13,236 (1.56 %)	4,235 (0.52 %)	122,740 (10.14 %)	5 (0.01 %)	306 (0.06 %)	6,993 (58.87 %)	8,006 (27.39 %)
218	ascomycetes A.nidulans (FGSC A4 2012 refseq) GCF_000149205.2	9,556 (50.66 %)	n/a	1,528 (3.90 %)	5,735 (25.53 %)	n/a	50.30 (99.43 %)	158 (0.58 %)	158 (0.58 %)	249 (99.42 %)	5,218 (3.22 %)	2,452 (0.41 %)	51,693 (4.64 %)	1 (0.00 %)	625 (0.60 %)	1,123 (78.44 %)	1,810 (9.92 %)
219	ascomycetes A.niger (ATCC 1015 2011) GCA_000230395.2	n/a	10,950 (47.39 %)	1,472 (3.28 %)	5,860 (22.57 %)	n/a	50.32 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	24 (100.00 %)	10,467 (1.31 %)	2,849 (0.40 %)	116,089 (8.05 %)	0 (0 %)	347 (0.10 %)	5,725 (67.14 %)	7,138 (23.18 %)
220	ascomycetes A.niger (ATCC 13496 2018) GCA_003344705.1	n/a	12,468 (57.24 %)	1,523 (3.32 %)	5,831 (21.80 %)	n/a	49.49 (99.95 %)	283 (0.05 %)	283 (0.05 %)	416 (99.95 %)	11,250 (1.36 %)	3,729 (0.47 %)	106,648 (8.64 %)	12 (0.01 %)	363 (0.08 %)	5,997 (63.73 %)	7,208 (28.57 %)
221	ascomycetes A.niger (LDM3 2019) GCA_009812365.1	n/a	n/a	1,504 (3.31 %)	5,647 (20.78 %)	n/a	49.51 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14 (100.00 %)	11,085 (1.39 %)	3,575 (0.48 %)	103,827 (8.73 %)	0 (0 %)	408 (0.12 %)	5,478 (66.25 %)	7,056 (28.71 %)
222	ascomycetes A.niger (N402 ATCC 64974 2018) GCA_900248155.1	n/a	11,241 (47.21 %)	1,511 (3.26 %)	5,841 (22.05 %)	n/a	49.59 (99.98 %)	0 (0 %)	19 (0.02 %)	19 (100.00 %)	11,066 (1.37 %)	3,714 (0.50 %)	119,538 (9.43 %)	4 (0.00 %)	453 (0.11 %)	5,740 (65.55 %)	7,186 (24.21 %)
223	ascomycetes A.niger (UAMH 3544 2015) GCA_001430945.1	n/a	n/a	1,592 (3.50 %)	5,535 (20.87 %)	n/a	50.11 (94.42 %)	0 (0 %)	7,784 (5.65 %)	3,481 (100.00 %)	9,824 (1.20 %)	4,011 (0.96 %)	147,037 (10.54 %)	2 (0.00 %)	675 (0.28 %)	7,909 (38.30 %)	6,727 (16.86 %)
224	ascomycetes A.niger (v4 2007) GCF_000002855.4	14,123 (55.04 %)	n/a	1,477 (3.36 %)	5,688 (22.12 %)	n/a	50.37 (99.87 %)	451 (0.13 %)	663 (0.13 %)	468 (99.87 %)	9,968 (1.25 %)	2,606 (0.36 %)	106,188 (7.69 %)	1 (0.00 %)	262 (0.07 %)	5,580 (67.37 %)	6,938 (24.46 %)
225	ascomycetes A.novofumigatus IBT 16806 GCF_002847465.1	11,423 (54.61 %)	n/a	1,570 (3.73 %)	6,191 (23.75 %)	n/a	49.14 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	62 (100.00 %)	5,497 (1.07 %)	3,622 (0.66 %)	63,777 (6.60 %)	0 (0 %)	1,833 (0.63 %)	2,353 (55.47 %)	3,049 (21.61 %)
226	ascomycetes A.ochraceoroseus IBT 24754 GCF_002846915.1	8,821 (51.88 %)	n/a	1,552 (4.30 %)	5,188 (24.80 %)	n/a	44.17 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	34 (100.00 %)	17,921 (2.69 %)	11,148 (1.86 %)	68,602 (21.70 %)	0 (0 %)	6,485 (1.74 %)	5,695 (40.92 %)	5,819 (24.47 %)
227	ascomycetes A.oryzae RIB40 GCF_000184455.2	12,077 (43.91 %)	n/a	1,572 (3.21 %)	7,460 (25.11 %)	n/a	48.24 (97.90 %)	16 (2.09 %)	18 (2.10 %)	28 (97.91 %)	7,614 (1.88 %)	3,121 (0.40 %)	96,894 (6.21 %)	0 (0 %)	350 (0.10 %)	9,956 (37.23 %)	8,820 (20.83 %)
228	ascomycetes A.parasiticus (CBS 117618 2019) GCA_009176385.1	n/a	14,005 (59.18 %)	1,597 (3.17 %)	8,307 (26.98 %)	n/a	48.07 (99.98 %)	50 (0.02 %)	50 (0.02 %)	320 (99.98 %)	7,236 (0.81 %)	2,961 (0.36 %)	86,811 (5.45 %)	3 (0.00 %)	256 (0.06 %)	10,451 (37.06 %)	9,506 (23.26 %)
229	ascomycetes A.sclerotiicarbonarius (CBS 121057 2018) GCA_003184635.1	n/a	12,893 (53.92 %)	1,540 (3.19 %)	5,869 (20.74 %)	n/a	48.59 (99.93 %)	111 (0.07 %)	111 (0.07 %)	277 (99.93 %)	14,700 (1.66 %)	10,115 (1.17 %)	109,029 (15.85 %)	27 (0.05 %)	2,689 (0.52 %)	2,430 (78.16 %)	3,370 (34.38 %)
230	ascomycetes A.steynii IBT 23096 GCF_002849105.1	12,918 (54.13 %)	n/a	1,587 (3.20 %)	6,715 (23.55 %)	n/a	49.07 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	37 (100.00 %)	14,914 (2.25 %)	7,418 (0.91 %)	98,234 (12.81 %)	0 (0 %)	1,964 (0.78 %)	436 (42.93 %)	523 (7.20 %)
231	ascomycetes A.sydowii CBS 593.65 GCF_001890705.1	13,578 (60.83 %)	n/a	1,572 (3.49 %)	6,884 (26.02 %)	n/a	49.98 (99.91 %)	1,084 (0.09 %)	1,084 (0.09 %)	1,181 (99.91 %)	6,193 (0.73 %)	2,828 (0.36 %)	77,206 (5.92 %)	8 (0.01 %)	262 (0.08 %)	767 (46.02 %)	1,025 (4.19 %)
232	ascomycetes A.tanneri (NIH1004 2019) GCA_004798825.1	n/a	13,590 (42.12 %)	1,544 (3.30 %)	6,626 (23.63 %)	n/a	47.46 (99.99 %)	0 (0 %)	15 (0.00 %)	1,715 (100.00 %)	9,852 (1.06 %)	3,847 (0.53 %)	105,634 (7.67 %)	0 (0 %)	507 (0.09 %)	8,097 (37.97 %)	7,469 (25.58 %)
233	ascomycetes A.terreus NIH2624 GCF_000149615.1	10,401 (53.42 %)	n/a	1,413 (3.73 %)	4,096 (19.69 %)	n/a	52.87 (99.55 %)	241 (0.45 %)	241 (0.45 %)	268 (99.55 %)	5,891 (1.03 %)	1,789 (0.31 %)	87,316 (6.84 %)	0 (0 %)	209 (0.07 %)	302 (32.90 %)	516 (2.85 %)
234	ascomycetes A.thermomutatus GCF_002237265.1	9,701 (49.19 %)	n/a	1,550 (3.81 %)	5,822 (24.48 %)	n/a	50.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	647 (100.00 %)	4,948 (0.73 %)	2,425 (0.37 %)	69,269 (4.99 %)	0 (0 %)	328 (0.09 %)	5,161 (64.08 %)	5,382 (35.67 %)
235	ascomycetes A.tubingensis (CBS 134.48 2016) GCA_001890745.1	n/a	12,593 (55.19 %)	1,522 (3.32 %)	6,227 (23.49 %)	n/a	49.19 (99.98 %)	54 (0.02 %)	54 (0.02 %)	87 (99.98 %)	12,180 (1.48 %)	3,718 (0.47 %)	118,166 (10.10 %)	8 (0.01 %)	212 (0.05 %)	6,367 (61.29 %)	7,274 (26.50 %)
236	ascomycetes A.uvarum CBS 121591 GCF_003184745.1	12,009 (54.34 %)	n/a	1,504 (3.21 %)	4,622 (18.54 %)	n/a	50.85 (99.97 %)	80 (0.03 %)	80 (0.03 %)	252 (99.97 %)	14,741 (1.76 %)	7,287 (0.85 %)	119,057 (11.61 %)	4 (0.00 %)	807 (0.16 %)	1,268 (49.13 %)	2,011 (13.30 %)
237	ascomycetes A.verrucosus (UAMH 3576 2015) GCA_001430935.1	n/a	n/a	1,530 (4.21 %)	5,362 (25.13 %)	n/a	49.28 (91.21 %)	0 (0 %)	9,182 (8.89 %)	3,075 (100.00 %)	5,898 (0.85 %)	1,983 (0.42 %)	81,131 (6.06 %)	0 (0 %)	207 (0.11 %)	7,975 (18.61 %)	6,940 (12.47 %)
238	ascomycetes A.versicolor CBS 583.65 GCF_001890125.1	13,219 (63.35 %)	n/a	1,556 (3.56 %)	6,723 (27.08 %)	n/a	50.08 (99.98 %)	78 (0.02 %)	78 (0.02 %)	129 (99.98 %)	5,286 (0.64 %)	2,893 (0.39 %)	79,836 (6.59 %)	6 (0.00 %)	278 (0.07 %)	545 (48.06 %)	2,035 (8.19 %)
239	ascomycetes A.wentii DTO 134E9 GCF_001890725.1	12,433 (61.32 %)	n/a	1,521 (3.74 %)	6,893 (28.56 %)	n/a	47.95 (99.82 %)	91 (0.18 %)	91 (0.18 %)	118 (99.82 %)	9,049 (1.25 %)	2,759 (0.37 %)	103,730 (8.38 %)	10 (0.02 %)	332 (0.11 %)	8,897 (38.93 %)	7,954 (21.36 %)
240	ascomycetes B.bassiana (HN6 2020) GCA_014607475.1	n/a	n/a	1,444 (2.99 %)	4,501 (18.34 %)	n/a	48.93 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	13,528 (1.62 %)	10,935 (1.46 %)	82,142 (15.29 %)	0 (0 %)	2,316 (0.69 %)	308 (62.29 %)	547 (8.08 %)
241	ascomycetes B.ceratinophila (UAMH 5669 2015) GCA_001430925.1	n/a	n/a	1,461 (4.35 %)	4,792 (24.77 %)	n/a	48.46 (93.18 %)	0 (0 %)	5,818 (6.87 %)	4,851 (100.00 %)	4,781 (0.85 %)	3,514 (1.45 %)	82,762 (7.28 %)	0 (0 %)	1,339 (0.83 %)	7,506 (27.36 %)	6,656 (15.18 %)
242	ascomycetes B.cinerea B05.10 GCF_000143535.2	13,703 (57.59 %)	n/a	1,481 (2.69 %)	9,228 (27.01 %)	n/a	42.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	18 (100.00 %)	25,169 (4.69 %)	14,588 (1.50 %)	176,502 (13.70 %)	0 (0 %)	1,286 (0.28 %)	3,415 (3.53 %)	2,539 (2.38 %)
243	ascomycetes B.dermatitidis (ATCC 26199 2010) GCA_000166155.1	n/a	11,591 (28.14 %)	1,479 (1.67 %)	5,734 (10.54 %)	n/a	36.64 (96.14 %)	2,179 (3.87 %)	2,774 (3.87 %)	5,461 (96.13 %)	41,141 (2.80 %)	29,988 (2.28 %)	288,257 (48.25 %)	218 (0.23 %)	23,763 (3.16 %)	8,032 (9.85 %)	7,490 (7.85 %)
244	ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 refseq) GCF_000003525.1	11,561 (30.20 %)	n/a	1,522 (1.76 %)	5,714 (11.07 %)	n/a	37.07 (99.50 %)	566 (0.51 %)	566 (0.51 %)	593 (99.49 %)	38,659 (2.73 %)	27,571 (2.05 %)	270,617 (48.64 %)	2 (0.00 %)	31,958 (3.92 %)	8,002 (10.69 %)	7,438 (8.47 %)
245	ascomycetes B.gilchristii (SLH14081 2009 refseq) GCF_000003855.2	11,364 (26.50 %)	n/a	1,520 (1.57 %)	5,702 (9.73 %)	n/a	35.75 (98.67 %)	1,691 (1.34 %)	1,691 (1.34 %)	1,794 (98.66 %)	42,930 (2.67 %)	27,826 (1.78 %)	328,698 (50.87 %)	0 (0 %)	32,248 (3.50 %)	7,943 (9.35 %)	7,488 (7.50 %)
246	ascomycetes B.percursus (EI222 2016) GCA_001883805.1	n/a	10,384 (41.58 %)	1,429 (3.46 %)	4,954 (20.20 %)	n/a	47.33 (99.98 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	3,868 (100.00 %)	14,584 (1.96 %)	8,289 (0.96 %)	107,848 (11.28 %)	0 (0 %)	787 (0.14 %)	9,406 (25.06 %)	7,924 (16.83 %)
247	ascomycetes B.spectabilis GCF_004022145.1	9,270 (54.40 %)	n/a	1,609 (4.09 %)	6,352 (27.19 %)	n/a	46.71 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	86 (100.00 %)	9,137 (1.28 %)	4,143 (0.72 %)	78,035 (12.79 %)	0 (0 %)	1,019 (0.28 %)	2,946 (32.16 %)	4,190 (18.47 %)
248	ascomycetes C.bantiana CBS 173.52 GCF_000835475.1	12,779 (49.81 %)	n/a	1,528 (3.20 %)	7,173 (27.50 %)	n/a	51.32 (99.77 %)	80 (0.23 %)	80 (0.23 %)	140 (99.77 %)	6,344 (0.71 %)	2,709 (0.33 %)	86,382 (6.31 %)	18 (0.04 %)	751 (0.18 %)	397 (51.48 %)	1,099 (4.38 %)
249	ascomycetes C.carrionii (KSF 2016) GCA_001700775.1	n/a	11,240 (53.12 %)	1,421 (3.64 %)	4,953 (25.68 %)	n/a	54.12 (99.99 %)	0 (0 %)	89 (0.01 %)	23 (100.00 %)	9,509 (1.44 %)	6,776 (1.16 %)	92,177 (7.19 %)	0 (0 %)	838 (0.20 %)	39 (98.59 %)	49 (90.77 %)
250	ascomycetes C.carrionii CBS 160.54 GCF_000365165.1	10,384 (52.69 %)	n/a	1,406 (3.72 %)	4,922 (26.30 %)	n/a	54.27 (99.96 %)	83 (0.04 %)	83 (0.04 %)	102 (99.96 %)	7,264 (1.07 %)	4,076 (0.66 %)	86,802 (6.29 %)	45 (0.03 %)	210 (0.05 %)	31 (30.51 %)	39 (71.65 %)
251	ascomycetes C.clavata (yc1106 2022) GCA_023920165.1	n/a	10,292 (51.81 %)	1,521 (3.50 %)	7,730 (31.60 %)	n/a	50.65 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	5,825 (0.76 %)	2,564 (0.54 %)	78,688 (6.20 %)	0 (0 %)	842 (0.49 %)	771 (92.32 %)	1,183 (5.08 %)
252	ascomycetes C.europaea CBS 101466 GCF_000365145.1	11,108 (56.56 %)	n/a	1,404 (3.71 %)	5,806 (31.08 %)	n/a	54.03 (99.79 %)	87 (0.21 %)	87 (0.21 %)	106 (99.79 %)	4,125 (0.61 %)	1,686 (0.32 %)	85,872 (6.26 %)	13 (0.04 %)	282 (0.08 %)	125 (62.07 %)	182 (34.28 %)
253	ascomycetes C.geophilum (1.58 2016) GCA_001692895.1	n/a	14,747 (11.65 %)	1,579 (0.68 %)	8,880 (6.09 %)	n/a	37.52 (99.92 %)	357 (0.08 %)	57,526 (0.12 %)	625 (99.92 %)	59,145 (1.69 %)	81,253 (3.31 %)	1,103,443 (49.94 %)	12 (0.00 %)	62,840 (2.65 %)	13,976 (10.94 %)	10,670 (8.26 %)
254	ascomycetes C.geophilum (1.58 2016) GCF_001692895.1	14,697 (11.65 %)	n/a	1,579 (0.68 %)	8,880 (6.09 %)	n/a	37.52 (99.92 %)	357 (0.08 %)	57,526 (0.12 %)	625 (99.92 %)	58,519 (1.62 %)	81,253 (3.31 %)	1,103,443 (49.94 %)	12 (0.00 %)	62,840 (2.65 %)	13,976 (10.94 %)	10,670 (8.26 %)
255	ascomycetes C.globosum CBS 148.51 GCF_000143365.1	11,040 (47.95 %)	n/a	1,281 (2.80 %)	3,410 (13.48 %)	n/a	55.56 (98.44 %)	1,208 (1.58 %)	1,208 (1.58 %)	1,245 (98.42 %)	12,702 (2.04 %)	5,551 (0.76 %)	124,116 (10.93 %)	0 (0 %)	1,046 (0.34 %)	28 (87.80 %)	48 (0.32 %)
256	ascomycetes C.graminicola M1.001 GCF_000149035.1	12,063 (33.07 %)	n/a	1,536 (2.32 %)	7,176 (18.81 %)	n/a	49.11 (98.57 %)	498 (1.43 %)	498 (1.43 %)	1,152 (98.57 %)	26,469 (2.32 %)	11,812 (1.14 %)	127,419 (19.04 %)	0 (0 %)	3,399 (0.59 %)	1,096 (48.14 %)	1,184 (34.19 %)
257	ascomycetes C.higginsianum IMI 349063 GCF_001672515.1	14,651 (40.64 %)	n/a	1,345 (1.98 %)	4,965 (13.95 %)	n/a	54.41 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25 (100.00 %)	25,251 (2.39 %)	10,210 (0.92 %)	186,324 (11.61 %)	0 (0 %)	2,389 (0.91 %)	375 (19.67 %)	547 (1.97 %)
258	ascomycetes C.immitis (H538.4 2006) GCA_000149815.1	n/a	10,709 (52.32 %)	1,384 (4.03 %)	4,907 (21.84 %)	n/a	46.92 (92.20 %)	3,789 (7.85 %)	3,789 (7.85 %)	4,345 (92.15 %)	8,435 (1.63 %)	4,407 (0.67 %)	78,943 (9.99 %)	5 (0.03 %)	1,300 (0.62 %)	5,925 (25.64 %)	5,555 (16.23 %)
259	ascomycetes C.immitis (RMSCC 2394 2006) GCA_000149895.1	n/a	10,529 (53.83 %)	1,488 (4.03 %)	5,460 (24.08 %)	n/a	46.16 (98.38 %)	496 (1.62 %)	496 (1.62 %)	527 (98.38 %)	9,656 (1.82 %)	5,391 (0.88 %)	85,470 (12.26 %)	1 (0.00 %)	3,341 (1.38 %)	4,953 (32.76 %)	4,926 (15.61 %)
260	ascomycetes C.immitis (RMSCC 3703 2007) GCA_000150085.1	n/a	10,578 (51.69 %)	1,391 (4.08 %)	4,832 (21.44 %)	n/a	47.02 (91.13 %)	4,744 (8.94 %)	4,744 (8.94 %)	5,033 (91.06 %)	8,342 (1.66 %)	4,457 (0.67 %)	80,927 (9.52 %)	5 (0.02 %)	1,549 (0.77 %)	5,821 (25.82 %)	5,471 (15.31 %)
261	ascomycetes C.immitis (WA_211 2019) GCA_004115165.2	n/a	7,936 (42.20 %)	1,488 (4.21 %)	5,414 (25.32 %)	n/a	46.47 (99.92 %)	0 (0 %)	235 (0.09 %)	62 (100.00 %)	9,834 (1.66 %)	5,332 (0.90 %)	82,247 (11.73 %)	13 (0.02 %)	2,589 (0.68 %)	4,909 (34.36 %)	4,921 (16.17 %)
262	ascomycetes C.immitis RS GCF_000149335.2	9,937 (54.94 %)	n/a	1,508 (4.02 %)	5,498 (24.19 %)	n/a	45.96 (100.00 %)	4 (0.00 %)	4 (0.00 %)	11 (100.00 %)	9,900 (1.68 %)	5,677 (0.97 %)	88,632 (12.84 %)	0 (0 %)	3,541 (0.89 %)	4,844 (31.67 %)	4,857 (15.75 %)
263	ascomycetes C.immunda GCF_000835495.1	14,048 (56.77 %)	n/a	1,529 (2.69 %)	7,383 (24.36 %)	n/a	52.83 (99.86 %)	86 (0.14 %)	86 (0.14 %)	363 (99.86 %)	7,064 (0.67 %)	3,488 (0.43 %)	113,746 (5.52 %)	28 (0.02 %)	974 (0.18 %)	505 (39.40 %)	531 (15.67 %)
264	ascomycetes C.metapsilosis (2021) GCF_017655625.1	5,726 (68.52 %)	n/a	1,855 (11.17 %)	5,347 (64.48 %)	n/a	38.08 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	10 (100.00 %)	7,283 (2.20 %)	3,193 (1.74 %)	77,436 (14.44 %)	0 (0 %)	1,702 (1.29 %)	21 (0.04 %)	15 (0.03 %)
265	ascomycetes C.militaris (ATCC 34164 2017) GCA_008080495.1	n/a	9,362 (42.60 %)	1,383 (3.14 %)	4,256 (18.73 %)	n/a	50.92 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	13,593 (1.96 %)	8,828 (1.56 %)	96,733 (16.66 %)	0 (0 %)	4,270 (1.08 %)	96 (96.74 %)	167 (4.50 %)
266	ascomycetes C.militaris CM01 GCF_000225605.1	9,651 (45.46 %)	n/a	1,313 (3.12 %)	4,235 (19.53 %)	n/a	51.42 (99.83 %)	565 (0.18 %)	582 (0.18 %)	597 (99.82 %)	11,264 (1.64 %)	8,374 (1.32 %)	107,042 (15.28 %)	3 (0.00 %)	2,623 (0.61 %)	92 (56.22 %)	118 (3.85 %)
267	ascomycetes C.posadasii (C735 delta SOWgp 2009 refseq) GCF_000151335.2	7,227 (49.91 %)	n/a	1,478 (4.26 %)	5,283 (25.22 %)	n/a	46.59 (100.00 %)	33 (0.00 %)	33 (0.00 %)	88 (100.00 %)	10,457 (5.97 %)	5,206 (0.91 %)	74,027 (11.89 %)	0 (0 %)	3,254 (0.84 %)	4,784 (34.49 %)	4,865 (16.04 %)
268	ascomycetes C.posadasii (CPA 0001 2007) GCA_000150245.1	n/a	n/a	1,356 (3.84 %)	4,492 (19.30 %)	n/a	46.03 (90.56 %)	4,739 (9.50 %)	4,739 (9.50 %)	4,995 (90.50 %)	8,692 (6.62 %)	4,590 (0.74 %)	76,749 (12.63 %)	0 (0 %)	2,136 (0.62 %)	6,544 (24.85 %)	6,080 (17.91 %)
269	ascomycetes C.posadasii (CPA 0020 2008) GCA_000150615.1	n/a	n/a	1,336 (3.92 %)	4,612 (20.58 %)	n/a	46.79 (90.88 %)	3,895 (9.18 %)	3,895 (9.18 %)	4,519 (90.82 %)	9,378 (6.01 %)	4,252 (0.66 %)	75,128 (10.59 %)	1 (0.00 %)	1,414 (0.43 %)	6,248 (26.84 %)	5,812 (17.54 %)
270	ascomycetes C.posadasii (CPA 0066 2008) GCA_000150645.1	n/a	n/a	1,367 (3.92 %)	4,556 (19.92 %)	n/a	46.25 (91.89 %)	3,794 (8.16 %)	3,794 (8.16 %)	4,269 (91.84 %)	9,506 (6.42 %)	4,297 (0.65 %)	74,783 (11.37 %)	1 (0.01 %)	1,988 (0.62 %)	6,276 (25.99 %)	5,925 (17.87 %)
271	ascomycetes C.posadasii (RMSCC 1037 2008) GCA_000150555.1	n/a	n/a	1,350 (4.09 %)	4,646 (21.15 %)	n/a	46.84 (92.61 %)	3,681 (7.44 %)	3,681 (7.44 %)	4,316 (92.56 %)	8,874 (5.68 %)	4,045 (0.63 %)	68,500 (9.85 %)	0 (0 %)	1,149 (0.40 %)	6,227 (27.15 %)	5,835 (18.09 %)
272	ascomycetes C.posadasii (RMSCC 1038 2008) GCA_000150585.1	n/a	n/a	1,310 (4.09 %)	4,537 (21.43 %)	n/a	47.13 (90.23 %)	4,339 (9.83 %)	4,339 (9.83 %)	4,893 (90.17 %)	8,365 (5.21 %)	3,764 (0.54 %)	64,152 (8.79 %)	0 (0 %)	1,077 (0.38 %)	6,305 (26.44 %)	5,850 (17.75 %)
273	ascomycetes C.posadasii (RMSCC 2133 2007) GCA_000150185.1	n/a	n/a	1,493 (4.23 %)	5,322 (24.65 %)	n/a	46.99 (97.08 %)	997 (2.94 %)	997 (2.94 %)	1,052 (97.06 %)	10,190 (5.53 %)	4,797 (0.78 %)	75,638 (10.73 %)	0 (0 %)	2,299 (0.67 %)	5,023 (32.72 %)	5,043 (15.98 %)
274	ascomycetes C.posadasii (RMSCC 3488 2007) GCA_000150055.1	n/a	10,083 (53.55 %)	1,519 (4.12 %)	5,302 (23.71 %)	n/a	46.28 (99.56 %)	278 (0.44 %)	278 (0.44 %)	287 (99.56 %)	10,863 (7.25 %)	5,139 (0.92 %)	77,443 (13.46 %)	0 (0 %)	3,290 (0.90 %)	4,878 (31.29 %)	4,984 (16.11 %)
275	ascomycetes C.posadasii (RMSCC 3700 2007) GCA_000150215.1	n/a	n/a	1,393 (4.43 %)	4,816 (24.47 %)	n/a	48.08 (91.97 %)	2,856 (8.07 %)	2,856 (8.07 %)	3,099 (91.93 %)	8,305 (3.39 %)	3,690 (0.54 %)	64,512 (6.75 %)	0 (0 %)	546 (0.23 %)	5,687 (29.81 %)	5,256 (15.95 %)
276	ascomycetes C.posadasii str. (Silveira 2022) GCA_018416015.2	n/a	8,671 (50.33 %)	1,545 (4.18 %)	5,484 (24.97 %)	n/a	46.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	10,017 (1.43 %)	5,347 (0.97 %)	76,896 (12.40 %)	0 (0 %)	3,601 (1.07 %)	4,902 (33.47 %)	4,995 (16.21 %)
277	ascomycetes C.posadasii str. (Silveira 2022) GCF_018416015.2	8,491 (50.22 %)	n/a	1,545 (4.18 %)	5,484 (24.97 %)	n/a	46.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	10,017 (1.43 %)	5,347 (0.97 %)	76,896 (12.40 %)	0 (0 %)	3,601 (1.07 %)	4,902 (33.47 %)	4,995 (16.21 %)
278	ascomycetes C.psammophila CBS 110553 GCF_000585535.1	13,421 (48.09 %)	n/a	1,556 (3.01 %)	8,091 (28.36 %)	n/a	50.62 (99.78 %)	0 (0 %)	194 (0.22 %)	123 (100.00 %)	9,174 (0.95 %)	4,416 (0.57 %)	95,565 (7.66 %)	30 (0.01 %)	1,057 (0.20 %)	671 (69.69 %)	1,089 (13.90 %)
279	ascomycetes C.queenslandicum (CBS 280.77 2015) GCA_001430955.1	n/a	n/a	1,503 (3.84 %)	5,017 (21.90 %)	n/a	53.17 (94.06 %)	0 (0 %)	6,477 (6.00 %)	2,724 (100.00 %)	4,884 (0.70 %)	1,737 (0.53 %)	124,197 (9.73 %)	1 (0.00 %)	431 (0.20 %)	7,296 (55.61 %)	6,650 (15.49 %)
280	ascomycetes C.Silveira (Silveira 2011) GCA_000170175.2	n/a	10,382 (58.65 %)	1,481 (4.16 %)	5,300 (24.54 %)	n/a	46.60 (99.44 %)	410 (0.57 %)	410 (0.57 %)	464 (99.43 %)	10,466 (6.01 %)	4,878 (0.84 %)	79,296 (12.27 %)	0 (0 %)	2,874 (0.77 %)	5,001 (31.82 %)	5,005 (16.09 %)
281	ascomycetes C.sp. (CBS 132003 2018) GCA_003709865.1	n/a	5,727 (45.33 %)	1,274 (4.14 %)	3,448 (23.52 %)	n/a	54.00 (99.99 %)	0 (0 %)	21 (0.01 %)	118 (100.00 %)	13,536 (3.20 %)	19,871 (5.22 %)	91,905 (11.32 %)	3 (0.00 %)	3,903 (1.05 %)	618 (95.09 %)	2,939 (13.45 %)
282	ascomycetes C.yegresii CBS 114405 GCF_000585515.1	10,118 (52.96 %)	n/a	1,422 (3.87 %)	4,969 (27.76 %)	n/a	54.00 (99.96 %)	0 (0 %)	55 (0.04 %)	8 (100.00 %)	4,590 (0.71 %)	2,092 (0.40 %)	80,683 (5.93 %)	33 (0.02 %)	170 (0.05 %)	10 (58.94 %)	18 (70.85 %)
283	ascomycetes E.africanus (CBS 136260 2016) GCA_001660665.1	n/a	8,860 (39.96 %)	1,419 (3.66 %)	4,811 (20.78 %)	n/a	43.45 (99.97 %)	0 (0 %)	14 (0.00 %)	4,444 (100.00 %)	20,480 (2.81 %)	9,331 (1.07 %)	134,935 (18.02 %)	0 (0 %)	309 (0.35 %)	7,283 (16.64 %)	6,359 (12.56 %)
284	ascomycetes E.aquamarina CBS 119918 GCF_000709125.1	13,118 (44.67 %)	n/a	1,586 (2.95 %)	9,420 (30.71 %)	n/a	48.98 (98.60 %)	0 (0 %)	536 (1.41 %)	151 (100.00 %)	6,742 (0.68 %)	3,230 (0.40 %)	74,032 (8.44 %)	65 (0.03 %)	1,720 (0.43 %)	9,531 (45.37 %)	10,895 (36.97 %)
285	ascomycetes E.crescens (UAMH 3008 2015) GCA_001008285.1	n/a	9,558 (42.72 %)	1,445 (3.64 %)	5,425 (23.35 %)	n/a	45.20 (99.52 %)	0 (0 %)	760 (0.48 %)	1,734 (100.00 %)	18,843 (2.58 %)	8,304 (1.29 %)	148,697 (14.00 %)	1 (0.00 %)	357 (0.17 %)	7,760 (18.63 %)	6,387 (12.25 %)
286	ascomycetes E.dermatitidis NIH/UT8656 GCF_000230625.1	9,578 (69.18 %)	n/a	1,520 (4.44 %)	5,758 (32.93 %)	n/a	51.51 (99.99 %)	228 (0.02 %)	228 (0.02 %)	239 (99.98 %)	6,131 (1.00 %)	2,479 (0.49 %)	82,208 (7.34 %)	76 (0.07 %)	461 (0.17 %)	111 (42.95 %)	172 (0.98 %)
287	ascomycetes E.festucae (Fl1 2018) GCA_003814445.1	n/a	7,137 (31.43 %)	1,467 (3.21 %)	5,918 (23.06 %)	n/a	43.71 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	21,743 (3.01 %)	18,092 (2.84 %)	86,265 (30.75 %)	0 (0 %)	10,793 (2.64 %)	1,170 (62.98 %)	1,330 (37.53 %)
288	ascomycetes E.glyceriae (E277 2011) GCA_000225285.2	n/a	n/a	1,540 (2.50 %)	8,061 (22.57 %)	n/a	44.96 (99.99 %)	33 (0.00 %)	33 (0.00 %)	3,109 (100.00 %)	17,187 (1.51 %)	13,761 (1.48 %)	131,999 (34.74 %)	0 (0 %)	12,522 (2.25 %)	2,546 (49.16 %)	2,332 (45.81 %)
289	ascomycetes E.mesophila GCF_000836275.1	10,358 (61.36 %)	n/a	1,464 (3.79 %)	7,016 (33.46 %)	n/a	50.43 (99.94 %)	55 (0.06 %)	55 (0.06 %)	64 (99.94 %)	5,487 (0.78 %)	2,700 (0.42 %)	84,646 (5.90 %)	21 (0.03 %)	179 (0.05 %)	10,077 (44.81 %)	8,639 (22.44 %)
290	ascomycetes E.oligosperma GCF_000835515.1	13,238 (57.56 %)	n/a	1,505 (2.97 %)	7,400 (26.56 %)	n/a	50.41 (99.21 %)	144 (0.80 %)	144 (0.80 %)	287 (99.20 %)	6,910 (0.70 %)	2,574 (0.34 %)	122,970 (6.81 %)	49 (0.21 %)	465 (0.20 %)	1,332 (35.30 %)	5,427 (11.83 %)
291	ascomycetes E.orientalis (5z489 2017) GCA_002110485.1	n/a	n/a	1,526 (3.27 %)	6,037 (22.12 %)	n/a	45.60 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	108 (100.00 %)	16,821 (2.02 %)	6,156 (0.76 %)	93,129 (15.19 %)	0 (0 %)	2,486 (1.20 %)	8,468 (18.05 %)	7,410 (14.01 %)
292	ascomycetes E.pasteurianus Ep9510 (UAMH 9510 2016) GCA_001883825.1	n/a	9,078 (39.69 %)	1,456 (3.51 %)	5,214 (21.24 %)	n/a	44.48 (99.90 %)	0 (0 %)	95 (0.09 %)	1,643 (100.00 %)	18,243 (2.29 %)	8,747 (1.04 %)	140,251 (14.34 %)	8 (0.01 %)	678 (0.18 %)	7,802 (16.61 %)	6,713 (12.37 %)
293	ascomycetes E.spinifera GCF_000836115.1	12,065 (54.37 %)	n/a	1,488 (3.45 %)	6,566 (28.63 %)	n/a	51.70 (99.88 %)	115 (0.12 %)	115 (0.12 %)	143 (99.88 %)	7,656 (0.92 %)	3,292 (0.48 %)	88,886 (5.83 %)	33 (0.04 %)	393 (0.12 %)	556 (30.36 %)	643 (2.17 %)
294	ascomycetes F.circinatum (NRRL 25331 2020) GCA_013396185.1	n/a	13,905 (48.91 %)	1,449 (2.51 %)	11,017 (31.56 %)	n/a	48.61 (99.99 %)	0 (0 %)	82 (0.00 %)	1,223 (100.00 %)	7,455 (0.72 %)	2,746 (0.30 %)	119,637 (6.01 %)	0 (0 %)	129 (0.02 %)	13,923 (31.88 %)	10,937 (16.40 %)
295	ascomycetes F.fujikuroi IMI 58289 GCF_900079805.1	3,788 (10.58 %)	n/a	1,511 (2.54 %)	10,413 (29.64 %)	n/a	47.47 (99.94 %)	97 (0.06 %)	97 (0.06 %)	109 (99.94 %)	8,412 (0.83 %)	3,937 (0.45 %)	114,544 (9.02 %)	1 (0.00 %)	1,667 (0.27 %)	13,683 (30.87 %)	11,623 (18.26 %)
296	ascomycetes F.graminearum (233423 2015) GCA_000966635.1	n/a	n/a	1,404 (2.86 %)	8,738 (31.06 %)	n/a	48.39 (99.29 %)	0 (0 %)	2,070 (0.73 %)	869 (100.00 %)	5,723 (0.65 %)	1,926 (0.24 %)	112,403 (6.30 %)	1 (0.00 %)	28 (0.03 %)	11,376 (29.13 %)	8,722 (14.72 %)
297	ascomycetes F.graminearum (PH-1 GZPH1RResV1 2016) GCA_900044135.1	n/a	49,544 (63.26 %)	1,442 (2.81 %)	8,783 (30.16 %)	n/a	48.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	n/a	3,339 (0.44 %)	100,688 (10.00 %)	0 (0 %)	615 (0.16 %)	11,225 (32.36 %)	9,076 (15.65 %)
298	ascomycetes F.mangiferae MRC7560 GCF_900044065.1	15,851 (50.02 %)	n/a	1,486 (2.41 %)	10,550 (28.88 %)	n/a	48.23 (98.75 %)	0 (0 %)	973 (1.25 %)	254 (100.00 %)	7,323 (0.66 %)	4,136 (0.42 %)	122,210 (6.93 %)	11 (0.01 %)	472 (0.08 %)	14,523 (32.28 %)	11,954 (17.44 %)
299	ascomycetes F.multimorphosa CBS 102226 GCF_000836435.1	12,373 (55.02 %)	n/a	1,513 (3.43 %)	6,695 (29.33 %)	n/a	52.60 (99.95 %)	66 (0.05 %)	66 (0.05 %)	133 (99.95 %)	5,879 (0.71 %)	3,151 (0.45 %)	90,070 (5.61 %)	30 (0.04 %)	273 (0.06 %)	222 (54.64 %)	685 (6.09 %)
300	ascomycetes F.odoratissimum (race 4 2013) GCA_000350365.1	n/a	14,459 (39.30 %)	1,541 (2.31 %)	11,553 (28.13 %)	n/a	48.12 (92.24 %)	2,994 (7.78 %)	2,994 (7.78 %)	3,834 (92.22 %)	8,909 (2.18 %)	3,466 (2.71 %)	138,894 (6.44 %)	140 (0.59 %)	2,171 (7.56 %)	15,716 (27.33 %)	12,581 (15.22 %)
301	ascomycetes F.odoratissimum NRRL 54006 GCF_000260195.1	22,547 (63.77 %)	n/a	1,507 (2.42 %)	11,028 (29.03 %)	n/a	47.51 (99.73 %)	298 (0.28 %)	298 (0.28 %)	716 (99.72 %)	8,724 (2.89 %)	3,353 (0.36 %)	118,646 (8.15 %)	24 (0.03 %)	1,509 (0.29 %)	14,180 (29.99 %)	12,103 (17.86 %)
302	ascomycetes F.oxysporum (f. sp. lycopersici 4287 2015) GCF_000149955.1	27,467 (57.09 %)	n/a	1,596 (1.98 %)	14,046 (27.45 %)	n/a	48.40 (97.65 %)	1,277 (2.36 %)	1,277 (2.36 %)	1,362 (97.64 %)	12,434 (4.43 %)	4,230 (0.38 %)	107,637 (6.53 %)	4 (0.01 %)	1,582 (0.69 %)	18,316 (30.75 %)	16,265 (20.54 %)
303	ascomycetes F.oxysporum (Fo47 2014) GCA_000271705.2	n/a	25,183 (63.82 %)	1,549 (2.31 %)	11,289 (28.05 %)	n/a	47.68 (99.55 %)	295 (0.45 %)	295 (0.45 %)	419 (99.55 %)	9,147 (2.47 %)	3,607 (0.38 %)	135,611 (7.46 %)	39 (0.02 %)	956 (0.15 %)	15,195 (29.44 %)	12,511 (16.71 %)
304	ascomycetes F.oxysporum (NRRL 32931 2014 refseq) GCF_000271745.1	23,795 (64.86 %)	n/a	1,502 (2.37 %)	12,354 (31.46 %)	n/a	47.63 (98.55 %)	377 (1.46 %)	377 (1.46 %)	545 (98.54 %)	8,453 (2.23 %)	3,560 (0.37 %)	129,150 (7.65 %)	11 (0.00 %)	1,096 (0.18 %)	14,398 (29.11 %)	11,860 (16.53 %)
305	ascomycetes F.oxysporum f. sp. conglutinans (Fo5176 2020) GCA_014154955.1	n/a	17,912 (41.71 %)	1,667 (1.86 %)	14,477 (28.70 %)	n/a	48.20 (99.99 %)	0 (0 %)	6 (0.01 %)	19 (100.00 %)	16,795 (9.69 %)	7,333 (0.68 %)	88,939 (11.51 %)	0 (0 %)	4,026 (1.12 %)	19,421 (34.89 %)	17,706 (24.27 %)
306	ascomycetes F.oxysporum f. sp. cubense (race 1 2013) GCA_000350345.1	n/a	15,438 (44.37 %)	1,458 (2.29 %)	10,985 (28.53 %)	n/a	48.03 (98.43 %)	844 (1.57 %)	844 (1.57 %)	2,185 (98.43 %)	8,347 (2.12 %)	3,172 (0.51 %)	139,622 (6.95 %)	7 (0.04 %)	784 (0.79 %)	14,556 (28.77 %)	11,556 (15.02 %)
307	ascomycetes F.oxysporum f. sp. melonis (26406 2014) GCA_000260495.2	n/a	27,091 (61.07 %)	1,528 (2.13 %)	11,797 (26.61 %)	n/a	47.51 (99.54 %)	679 (0.46 %)	679 (0.46 %)	1,825 (99.54 %)	10,647 (2.94 %)	4,182 (0.40 %)	135,164 (7.29 %)	103 (0.14 %)	1,328 (0.41 %)	16,507 (28.40 %)	14,109 (17.73 %)
308	ascomycetes F.pedrosoi CBS 271.37 GCF_000835455.1	12,538 (53.32 %)	n/a	1,475 (3.25 %)	5,998 (25.59 %)	n/a	52.35 (99.84 %)	87 (0.16 %)	87 (0.16 %)	98 (99.84 %)	9,141 (1.04 %)	3,007 (0.41 %)	113,468 (6.90 %)	28 (0.06 %)	430 (0.13 %)	73 (34.37 %)	784 (2.39 %)
309	ascomycetes F.proliferatum (NRRL62905 2016) GCA_900029915.1	n/a	42,894 (51.37 %)	1,466 (2.53 %)	10,108 (29.44 %)	n/a	48.72 (100.00 %)	0 (0 %)	42 (0.00 %)	155 (100.00 %)	6,899 (0.66 %)	2,616 (0.30 %)	122,137 (6.03 %)	0 (0 %)	173 (0.03 %)	14,158 (32.33 %)	11,127 (16.23 %)
310	ascomycetes F.proliferatum ET1 GCF_900067095.1	16,184 (51.27 %)	n/a	1,476 (2.43 %)	10,277 (28.77 %)	n/a	48.45 (99.32 %)	0 (0 %)	196 (0.68 %)	32 (100.00 %)	7,350 (0.68 %)	3,114 (0.32 %)	127,451 (6.63 %)	1 (0.00 %)	339 (0.06 %)	14,475 (31.60 %)	11,546 (16.34 %)
311	ascomycetes F.solani GCF_020744495.1	17,654 (53.59 %)	n/a	1,516 (2.08 %)	9,410 (22.78 %)	n/a	51.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	74 (100.00 %)	9,929 (0.81 %)	6,521 (0.62 %)	153,362 (9.03 %)	0 (0 %)	2,265 (0.29 %)	5,613 (80.66 %)	7,766 (48.94 %)
312	ascomycetes F.vanettenii 77-13-4 GCF_000151355.1	15,708 (46.10 %)	n/a	1,468 (2.10 %)	9,262 (23.14 %)	n/a	50.79 (99.89 %)	24 (0.11 %)	27 (0.11 %)	233 (99.89 %)	10,515 (1.09 %)	5,721 (0.58 %)	165,963 (8.75 %)	0 (0 %)	1,327 (0.29 %)	7,139 (35.34 %)	9,149 (18.89 %)
313	ascomycetes F.verticillioides 7600 GCF_000149555.1	20,646 (66.06 %)	n/a	1,427 (2.48 %)	8,826 (26.96 %)	n/a	48.68 (99.78 %)	189 (0.22 %)	189 (0.22 %)	211 (99.78 %)	7,242 (0.80 %)	2,787 (0.32 %)	137,484 (7.24 %)	0 (0 %)	264 (0.11 %)	13,619 (32.25 %)	10,324 (14.54 %)
314	ascomycetes G.tritici R3-111a-1 GCF_000145635.1	14,663 (60.02 %)	n/a	1,118 (2.05 %)	2,098 (7.91 %)	n/a	56.79 (93.64 %)	1,343 (6.37 %)	1,501 (6.37 %)	1,860 (93.63 %)	19,701 (2.04 %)	9,458 (1.01 %)	216,344 (14.76 %)	62 (0.13 %)	2,007 (0.64 %)	572 (28.42 %)	622 (4.38 %)
315	ascomycetes H.capsulatum (G184AR 2021) GCA_017607465.1	n/a	12,723 (70.51 %)	1,487 (3.70 %)	4,955 (21.42 %)	n/a	44.27 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	15,347 (2.07 %)	8,212 (1.32 %)	117,386 (15.92 %)	0 (0 %)	3,871 (0.86 %)	7,369 (21.57 %)	6,788 (14.48 %)
316	ascomycetes H.capsulatum (G186AR 2021) GCA_017355575.1	n/a	12,743 (70.42 %)	1,473 (3.65 %)	5,009 (21.69 %)	n/a	44.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	15,958 (2.14 %)	8,767 (1.39 %)	118,263 (16.18 %)	0 (0 %)	4,015 (0.89 %)	7,393 (21.34 %)	6,812 (14.38 %)
317	ascomycetes H.capsulatum (H143 2009) GCA_000151035.1	n/a	9,796 (35.62 %)	1,393 (2.89 %)	4,622 (15.66 %)	n/a	41.71 (92.89 %)	4,218 (7.16 %)	4,218 (7.16 %)	4,267 (92.84 %)	16,353 (2.38 %)	6,095 (0.71 %)	130,058 (22.87 %)	1 (0.02 %)	5,360 (1.47 %)	7,464 (14.46 %)	7,033 (12.06 %)
318	ascomycetes H.capsulatum (WU24 2021) GCA_017310585.1	n/a	9,195 (34.26 %)	1,493 (3.50 %)	5,639 (23.26 %)	n/a	46.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	17,528 (2.19 %)	11,139 (1.55 %)	88,572 (12.58 %)	0 (0 %)	5,362 (1.70 %)	8,087 (23.04 %)	7,273 (15.68 %)
319	ascomycetes H.capsulatum NAm1 GCF_000149585.1	9,313 (39.89 %)	n/a	1,376 (3.41 %)	4,976 (20.25 %)	n/a	46.13 (92.82 %)	2,593 (7.21 %)	2,593 (7.21 %)	2,873 (92.79 %)	16,169 (3.09 %)	9,732 (1.28 %)	93,133 (11.76 %)	0 (0 %)	3,667 (1.25 %)	7,980 (20.25 %)	6,998 (14.15 %)
320	ascomycetes H.capsulatum var. duboisii (H88 2021) GCA_017310615.1	n/a	12,289 (55.76 %)	1,464 (3.04 %)	5,147 (17.74 %)	n/a	41.97 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	22,583 (31.35 %)	6,888 (0.89 %)	128,273 (24.54 %)	0 (0 %)	7,479 (1.51 %)	7,379 (17.46 %)	7,204 (14.72 %)
321	ascomycetes H.lauricola (RL4 2020) GCA_014183025.1	n/a	n/a	1,005 (2.04 %)	1,902 (7.18 %)	n/a	55.34 (99.08 %)	0 (0 %)	456 (0.93 %)	169 (100.00 %)	21,388 (2.77 %)	12,105 (1.30 %)	197,032 (16.69 %)	26 (0.05 %)	922 (0.27 %)	871 (91.20 %)	995 (2.90 %)
322	ascomycetes H.ohiense (G217B 2021) GCA_017607445.1	n/a	12,363 (54.81 %)	1,508 (2.97 %)	5,368 (17.81 %)	n/a	42.63 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	30,743 (36.13 %)	14,920 (2.40 %)	103,999 (30.12 %)	0 (0 %)	17,186 (3.22 %)	7,244 (15.90 %)	7,033 (12.97 %)
323	ascomycetes H.werneckii (EXF-2000 2017) GCA_002127715.1	n/a	15,649 (48.60 %)	2,606 (3.88 %)	10,814 (33.27 %)	n/a	53.49 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	629 (100.00 %)	13,384 (1.17 %)	4,719 (0.56 %)	156,047 (8.38 %)	0 (0 %)	915 (0.26 %)	863 (97.46 %)	656 (31.11 %)
324	ascomycetes L.prolificans (JHH-5317 2017) GCA_002276285.1	n/a	8,767 (35.16 %)	1,381 (2.79 %)	5,327 (19.33 %)	n/a	51.46 (99.99 %)	0 (0 %)	498 (0.00 %)	1,625 (100.00 %)	11,563 (1.51 %)	5,901 (0.79 %)	110,823 (8.61 %)	2 (0.00 %)	2,093 (0.80 %)	778 (95.65 %)	625 (1.65 %)
325	ascomycetes M.anisopliae (ARSEF 549 2015) GCA_000814975.1	n/a	10,891 (42.38 %)	1,457 (2.88 %)	7,921 (27.27 %)	n/a	50.95 (99.54 %)	0 (0 %)	139 (0.46 %)	74 (100.00 %)	7,701 (0.83 %)	4,338 (0.61 %)	107,930 (7.11 %)	0 (0 %)	603 (0.19 %)	1,112 (91.60 %)	2,307 (8.33 %)
326	ascomycetes M.canis CBS 113480 GCF_000151145.1	8,765 (55.48 %)	n/a	1,418 (4.65 %)	5,194 (29.39 %)	n/a	47.50 (99.47 %)	293 (0.54 %)	293 (0.54 %)	310 (99.46 %)	7,251 (2.48 %)	2,989 (0.57 %)	85,119 (9.98 %)	0 (0 %)	844 (0.38 %)	6,048 (25.22 %)	4,972 (14.01 %)
327	ascomycetes M.fructicola (CPMC6 2021) GCA_016906325.1	n/a	10,409 (39.34 %)	1,520 (2.72 %)	8,346 (24.27 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	99 (100.00 %)	36,177 (4.40 %)	31,295 (3.37 %)	169,408 (17.84 %)	0 (0 %)	2,827 (0.51 %)	4,804 (6.64 %)	3,794 (4.60 %)
328	ascomycetes M.mycetomatis (mm55 2016) GCA_001275765.2	n/a	10,707 (43.43 %)	1,315 (2.71 %)	3,551 (13.91 %)	n/a	54.86 (99.98 %)	0 (0 %)	19,219 (0.07 %)	804 (100.00 %)	9,174 (1.08 %)	4,875 (0.67 %)	108,017 (8.05 %)	0 (0 %)	1,041 (0.24 %)	1,213 (94.15 %)	1,439 (89.38 %)
329	ascomycetes M.poae (ATCC 64411 2011) GCA_000193285.1	n/a	12,529 (64.67 %)	1,001 (2.16 %)	1,386 (6.22 %)	n/a	56.90 (87.49 %)	2,912 (12.53 %)	2,912 (12.53 %)	3,120 (87.47 %)	15,869 (2.02 %)	6,394 (0.80 %)	177,944 (11.68 %)	10 (0.01 %)	581 (0.17 %)	296 (90.41 %)	365 (3.36 %)
330	ascomycetes N.crassa OR74A GCF_000182925.2	11,200 (52.09 %)	n/a	1,439 (2.68 %)	5,971 (21.55 %)	n/a	48.23 (99.90 %)	391 (0.10 %)	391 (0.10 %)	412 (99.90 %)	24,959 (4.79 %)	11,039 (1.22 %)	182,590 (16.30 %)	11 (0.01 %)	2,809 (0.45 %)	1,317 (51.92 %)	3,659 (15.56 %)
331	ascomycetes N.gypsea CBS 118893 GCF_000150975.2	8,932 (55.49 %)	n/a	1,426 (4.67 %)	5,171 (29.24 %)	n/a	48.46 (99.33 %)	300 (0.68 %)	300 (0.68 %)	319 (99.32 %)	9,875 (1.97 %)	3,218 (0.52 %)	83,553 (9.00 %)	0 (0 %)	168 (0.14 %)	6,622 (30.46 %)	5,519 (14.08 %)
332	ascomycetes N.tetrasperma FGSC 2508 GCF_000213175.1	10,379 (42.46 %)	n/a	1,396 (2.77 %)	5,435 (21.08 %)	n/a	49.42 (98.33 %)	470 (1.67 %)	533 (1.67 %)	551 (98.33 %)	20,459 (2.29 %)	8,004 (0.88 %)	171,762 (13.38 %)	12 (0.06 %)	596 (0.20 %)	1,529 (53.92 %)	5,218 (18.75 %)
333	ascomycetes O.piceae (UAMH 11346 2013) GCA_000410735.1	n/a	8,884 (45.58 %)	1,252 (2.84 %)	3,480 (18.09 %)	n/a	53.35 (98.98 %)	336 (1.02 %)	336 (1.02 %)	381 (98.98 %)	20,440 (3.31 %)	15,202 (1.79 %)	158,836 (13.20 %)	2 (0.00 %)	753 (0.13 %)	189 (97.82 %)	686 (1.89 %)
334	ascomycetes P.anserina S mat+ GCF_000226545.1	10,514 (45.78 %)	n/a	1,310 (2.86 %)	4,398 (18.90 %)	n/a	52.23 (98.66 %)	0 (0 %)	1,002 (1.35 %)	33 (100.00 %)	12,488 (1.64 %)	6,299 (0.87 %)	154,478 (11.91 %)	1 (0.00 %)	675 (0.15 %)	5,533 (54.96 %)	9,291 (32.03 %)
335	ascomycetes P.attinorum GCF_001299255.1	11,841 (56.05 %)	n/a	1,397 (3.43 %)	6,556 (30.26 %)	n/a	53.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	131 (100.00 %)	2,440 (0.38 %)	1,592 (0.35 %)	80,616 (5.44 %)	0 (0 %)	153 (0.04 %)	91 (52.21 %)	100 (39.42 %)
336	ascomycetes P.brasiliensis (Pb03 2014) GCA_000150475.2	n/a	8,548 (40.36 %)	1,423 (3.85 %)	4,664 (21.95 %)	n/a	44.49 (99.23 %)	431 (0.78 %)	431 (0.78 %)	496 (99.22 %)	15,304 (2.39 %)	10,298 (1.32 %)	110,366 (13.19 %)	4 (0.01 %)	900 (0.40 %)	6,887 (15.80 %)	5,926 (11.22 %)
337	ascomycetes P.brasiliensis Pb18 GCF_000150735.1	8,419 (39.78 %)	n/a	1,447 (3.80 %)	4,592 (21.23 %)	n/a	44.35 (98.39 %)	499 (1.62 %)	499 (1.62 %)	556 (98.38 %)	15,836 (2.53 %)	10,643 (1.38 %)	108,444 (14.01 %)	9 (0.03 %)	1,336 (0.67 %)	6,868 (15.06 %)	5,983 (11.23 %)
338	ascomycetes P.canis (CanA 2021) GCA_017788925.1	n/a	3,113 (63.26 %)	749 (7.57 %)	433 (5.45 %)	n/a	25.86 (100.00 %)	0 (0 %)	16 (0.00 %)	33 (100.00 %)	4,295 (2.67 %)	1,289 (0.66 %)	68,030 (37.84 %)	0 (0 %)	110 (0.12 %)	2 (0.01 %)	1 (0.00 %)
339	ascomycetes P.carinii B80 GCF_001477545.1	3,650 (70.22 %)	n/a	760 (7.58 %)	602 (7.95 %)	n/a	27.76 (100.00 %)	16 (0.00 %)	16 (0.00 %)	78 (100.00 %)	4,444 (2.94 %)	2,810 (1.48 %)	70,130 (32.77 %)	0 (0 %)	658 (0.75 %)	7 (0.04 %)	5 (0.03 %)
340	ascomycetes P.comata (T 2018) GCA_900290415.1	n/a	28,785 (49.18 %)	1,327 (2.92 %)	4,431 (19.17 %)	n/a	52.42 (99.34 %)	0 (0 %)	190 (0.66 %)	8 (100.00 %)	12,497 (1.62 %)	6,253 (1.54 %)	149,339 (11.31 %)	2 (0.01 %)	540 (0.57 %)	5,988 (71.29 %)	9,418 (32.86 %)
341	ascomycetes P.destructans (20631-21 2010 refseq) GCF_000184105.1	9,179 (55.01 %)	n/a	1,446 (3.95 %)	5,551 (35.58 %)	n/a	50.12 (92.42 %)	1,732 (7.59 %)	2,066 (7.59 %)	3,579 (92.41 %)	11,499 (5.71 %)	11,754 (2.10 %)	87,648 (13.51 %)	22 (0.03 %)	2,836 (0.73 %)	4,483 (54.70 %)	4,759 (18.94 %)
342	ascomycetes P.digitatum (Pd1 2012 refseq) GCF_000315645.1	8,946 (49.27 %)	n/a	1,464 (4.52 %)	5,593 (29.87 %)	n/a	48.94 (95.52 %)	508 (4.49 %)	514 (4.49 %)	561 (95.51 %)	3,524 (0.59 %)	2,199 (0.38 %)	66,592 (6.00 %)	8 (0.02 %)	342 (0.13 %)	7,344 (38.14 %)	6,770 (25.11 %)
343	ascomycetes P.expansum (d1 2014) GCA_000769735.1	n/a	11,023 (51.98 %)	1,562 (3.74 %)	8,126 (31.40 %)	n/a	47.57 (100.00 %)	262 (0.00 %)	262 (0.00 %)	532 (100.00 %)	5,716 (0.80 %)	4,589 (0.79 %)	90,190 (7.93 %)	11 (0.00 %)	671 (0.16 %)	8,824 (36.67 %)	8,447 (26.56 %)
344	ascomycetes P.fijiensis CIRAD86 GCF_000340215.1	13,060 (24.73 %)	n/a	1,579 (1.62 %)	9,082 (16.66 %)	n/a	45.17 (99.45 %)	722 (0.55 %)	722 (0.55 %)	778 (99.45 %)	21,161 (1.27 %)	25,626 (2.64 %)	294,015 (31.02 %)	2 (0.00 %)	32,869 (3.78 %)	53 (0.14 %)	1,204 (14.12 %)
345	ascomycetes P.jirovecii (SE8 2012) GCA_000333975.2	n/a	20,425 (52.47 %)	810 (7.29 %)	474 (4.96 %)	n/a	28.38 (99.99 %)	0 (0 %)	4 (0.00 %)	357 (100.00 %)	3,855 (2.48 %)	2,292 (1.03 %)	71,472 (33.79 %)	0 (0 %)	87 (0.40 %)	101 (0.95 %)	96 (0.82 %)
346	ascomycetes P.jirovecii RU7 GCF_001477535.1	3,765 (64.09 %)	n/a	778 (6.91 %)	514 (5.59 %)	n/a	28.66 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	70 (100.00 %)	4,109 (2.60 %)	2,662 (1.17 %)	73,897 (34.84 %)	0 (0 %)	199 (0.18 %)	106 (1.60 %)	104 (1.41 %)
347	ascomycetes P.lutzii Pb01 GCF_000150705.2	8,848 (36.57 %)	n/a	1,461 (3.48 %)	4,978 (20.15 %)	n/a	42.82 (99.09 %)	562 (0.91 %)	562 (0.91 %)	672 (99.09 %)	16,168 (2.20 %)	11,561 (1.36 %)	113,069 (17.82 %)	9 (0.01 %)	1,865 (0.67 %)	6,833 (12.73 %)	6,207 (10.57 %)
348	ascomycetes P.murina B123 GCF_000349005.2	3,628 (69.78 %)	n/a	780 (7.85 %)	482 (5.89 %)	n/a	26.96 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	21 (100.00 %)	3,808 (2.42 %)	1,181 (0.68 %)	70,567 (34.93 %)	0 (0 %)	237 (0.28 %)	21 (0.08 %)	2 (0.01 %)
349	ascomycetes P.nodorum (SN15 2021) GCA_016801405.1	n/a	17,882 (55.77 %)	1,496 (3.02 %)	8,975 (31.61 %)	n/a	50.35 (100.00 %)	8 (0.00 %)	8 (0.00 %)	31 (100.00 %)	6,117 (0.77 %)	4,120 (0.90 %)	79,009 (8.53 %)	0 (0 %)	3,392 (0.90 %)	140 (95.03 %)	178 (44.52 %)
350	ascomycetes P.omphalodes (CBS 144459 2022) GCA_024516155.1	n/a	11,633 (27.54 %)	1,663 (2.09 %)	9,636 (18.44 %)	n/a	46.68 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	260 (100.00 %)	64,765 (31.51 %)	44,403 (4.10 %)	164,270 (18.97 %)	0 (0 %)	29,560 (6.38 %)	11,076 (26.80 %)	8,632 (9.74 %)
351	ascomycetes P.oryctolagi (RABM 2021) GCA_017311285.1	n/a	2,856 (60.26 %)	751 (7.56 %)	398 (4.89 %)	n/a	28.62 (97.00 %)	0 (0 %)	235 (3.01 %)	38 (100.00 %)	3,730 (2.27 %)	1,849 (1.27 %)	67,870 (33.55 %)	1 (0.02 %)	229 (0.30 %)	130 (2.92 %)	92 (1.62 %)
352	ascomycetes P.pennisetigena (Br36 2019 refseq) GCF_004337985.1	11,430 (33.47 %)	n/a	1,482 (2.32 %)	7,302 (20.85 %)	n/a	47.48 (99.41 %)	0 (0 %)	1,281 (0.60 %)	108 (100.00 %)	24,221 (1.87 %)	11,049 (1.23 %)	163,225 (20.20 %)	5 (0.01 %)	7,142 (1.57 %)	764 (17.56 %)	1,559 (15.28 %)
353	ascomycetes P.rubens (Wisconsin 54-1255 2008 refseq) GCF_000226395.1	4,800 (20.67 %)	n/a	1,560 (3.73 %)	7,756 (30.06 %)	n/a	48.96 (99.94 %)	0 (0 %)	775 (0.06 %)	49 (100.00 %)	5,709 (0.78 %)	4,560 (0.81 %)	73,645 (5.86 %)	1 (0.01 %)	1,650 (0.43 %)	7,807 (50.55 %)	7,905 (32.71 %)
354	ascomycetes P.sp. 'macacae' (P2C 2021) GCA_018127085.1	n/a	3,427 (62.58 %)	770 (6.89 %)	497 (6.26 %)	n/a	29.15 (100.00 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	19 (100.00 %)	4,072 (9.89 %)	1,666 (1.19 %)	72,436 (34.40 %)	0 (0 %)	466 (0.45 %)	171 (3.07 %)	171 (2.73 %)
355	ascomycetes P.wakefieldiae (2A 2021) GCA_017301755.1	n/a	3,223 (64.69 %)	795 (8.10 %)	538 (6.89 %)	n/a	29.80 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	18 (100.00 %)	2,638 (1.62 %)	774 (0.44 %)	65,281 (29.00 %)	0 (0 %)	33 (0.05 %)	53 (0.41 %)	43 (0.30 %)
356	ascomycetes P.zonata CBS 506.65 GCF_001890105.1	9,870 (61.29 %)	n/a	1,504 (4.42 %)	4,192 (22.13 %)	n/a	49.95 (99.72 %)	182 (0.28 %)	182 (0.28 %)	428 (99.72 %)	14,259 (2.33 %)	8,758 (1.36 %)	94,869 (12.95 %)	10 (0.01 %)	647 (0.18 %)	933 (41.44 %)	1,130 (6.41 %)
357	ascomycetes R.mackenziei CBS 650.93 GCF_000835555.1	11,386 (51.51 %)	n/a	1,515 (3.58 %)	6,824 (29.41 %)	n/a	50.42 (99.87 %)	113 (0.13 %)	113 (0.13 %)	130 (99.87 %)	3,643 (0.42 %)	1,316 (0.33 %)	79,136 (5.78 %)	26 (0.07 %)	669 (0.20 %)	699 (74.68 %)	3,906 (11.13 %)
358	ascomycetes S.apiospermum GCF_000732125.1	8,376 (31.82 %)	n/a	1,398 (2.43 %)	5,603 (17.78 %)	n/a	50.36 (99.46 %)	0 (0 %)	171 (0.54 %)	176 (100.00 %)	13,364 (1.32 %)	8,083 (0.90 %)	147,775 (10.94 %)	7 (0.04 %)	781 (0.31 %)	314 (46.36 %)	670 (1.81 %)
359	ascomycetes S.brasiliensis 5110 GCF_000820605.1	9,091 (43.85 %)	n/a	1,151 (2.53 %)	2,156 (10.95 %)	n/a	54.72 (100.00 %)	69 (0.00 %)	69 (0.00 %)	82 (100.00 %)	18,037 (2.49 %)	10,218 (1.16 %)	171,739 (14.03 %)	0 (0 %)	804 (0.16 %)	9 (32.06 %)	30 (0.12 %)
360	ascomycetes S.chartarum (IBT 40293 2014) GCA_000732565.1	n/a	11,453 (47.51 %)	1,252 (2.62 %)	6,363 (24.35 %)	n/a	53.31 (99.43 %)	1,925 (0.58 %)	1,960 (0.58 %)	4,267 (99.42 %)	7,891 (0.87 %)	3,567 (0.53 %)	121,139 (7.59 %)	0 (0 %)	491 (0.09 %)	1,767 (88.43 %)	2,087 (68.78 %)
361	ascomycetes S.japonicus yFS275 GCF_000149845.2	4,893 (77.42 %)	n/a	2,559 (22.72 %)	3,358 (44.46 %)	n/a	43.79 (94.91 %)	55 (5.09 %)	55 (5.09 %)	87 (94.91 %)	2,222 (1.07 %)	1,086 (0.64 %)	41,749 (7.85 %)	0 (0 %)	1,667 (1.83 %)	955 (11.01 %)	860 (6.65 %)
362	ascomycetes S.macrospora (v3 k-hell 2012) GCF_000182805.3	9,838 (39.57 %)	n/a	1,303 (2.59 %)	4,633 (17.87 %)	n/a	52.03 (99.65 %)	0 (0 %)	965 (0.36 %)	1,212 (100.00 %)	16,908 (1.86 %)	7,307 (0.77 %)	169,928 (11.07 %)	0 (0 %)	371 (0.08 %)	1,462 (94.20 %)	6,334 (16.07 %)
363	ascomycetes S.octosporus yFS286 GCF_000150505.1	5,069 (80.37 %)	n/a	3,612 (34.81 %)	3,301 (42.19 %)	n/a	37.55 (96.81 %)	13 (3.19 %)	13 (3.19 %)	18 (96.81 %)	3,776 (1.59 %)	1,082 (0.57 %)	64,339 (13.79 %)	0 (0 %)	634 (0.75 %)	141 (0.49 %)	127 (0.43 %)
364	ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 refseq) GCF_000961545.1	10,279 (48.37 %)	n/a	1,138 (2.55 %)	2,026 (10.60 %)	n/a	54.96 (100.00 %)	57 (0.00 %)	57 (0.00 %)	73 (100.00 %)	15,858 (2.29 %)	8,000 (0.94 %)	169,678 (13.75 %)	0 (0 %)	339 (0.06 %)	16 (52.05 %)	22 (0.11 %)
365	ascomycetes S.sclerotiorum UF-70 (1980 2016) GCA_001857865.1	n/a	11,369 (41.32 %)	1,481 (2.96 %)	8,327 (26.70 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	17 (100.00 %)	21,205 (4.36 %)	9,974 (1.23 %)	147,208 (14.62 %)	0 (0 %)	2,714 (0.72 %)	2,430 (2.44 %)	1,957 (1.86 %)
366	ascomycetes T.atroviride (JCM 9410 2016) GCA_001599035.1	n/a	n/a	1,416 (2.89 %)	6,419 (24.16 %)	n/a	49.00 (99.04 %)	0 (0 %)	2,089 (0.97 %)	23 (100.00 %)	10,654 (1.22 %)	8,831 (1.08 %)	133,778 (10.19 %)	39 (0.03 %)	1,005 (0.20 %)	3,768 (72.41 %)	7,409 (18.00 %)
367	ascomycetes T.equinum (CBS 127.97 2008) GCA_000151175.1	n/a	8,785 (51.32 %)	1,417 (4.59 %)	5,375 (28.40 %)	n/a	47.37 (97.21 %)	1,591 (2.82 %)	1,591 (2.82 %)	1,716 (97.18 %)	11,405 (2.10 %)	5,401 (0.85 %)	69,199 (12.39 %)	0 (0 %)	1,144 (0.53 %)	6,385 (27.32 %)	5,695 (16.47 %)
368	ascomycetes T.marneffei (ATCC 18224 2008 refseq) GCF_000001985.1	10,638 (60.93 %)	n/a	1,535 (4.19 %)	7,771 (34.22 %)	n/a	46.67 (99.38 %)	137 (0.62 %)	137 (0.62 %)	589 (99.38 %)	6,404 (1.04 %)	2,594 (0.58 %)	61,594 (6.70 %)	0 (0 %)	951 (0.36 %)	5,746 (15.84 %)	5,169 (10.66 %)
369	ascomycetes T.marneffei (TM4 2018) GCA_003971505.1	n/a	n/a	1,521 (4.15 %)	7,791 (34.62 %)	n/a	46.73 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	6,197 (0.93 %)	2,560 (0.54 %)	68,793 (6.72 %)	0 (0 %)	865 (0.32 %)	5,628 (15.87 %)	5,018 (10.21 %)
370	ascomycetes T.mentagrophytes (TIMM 2789 2018) GCA_003118255.1	n/a	24,869 (50.62 %)	1,458 (4.61 %)	5,459 (29.65 %)	n/a	48.11 (99.84 %)	370 (0.06 %)	370 (0.06 %)	16,913 (99.94 %)	14,912 (2.71 %)	5,959 (0.91 %)	98,737 (12.83 %)	0 (0 %)	112 (0.03 %)	6,577 (30.17 %)	5,602 (15.50 %)
371	ascomycetes T.reesei (QM6a 2017) GCA_002006585.1	n/a	n/a	1,363 (2.92 %)	3,408 (14.91 %)	n/a	51.08 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	18,326 (2.34 %)	11,676 (1.58 %)	129,728 (15.49 %)	0 (0 %)	3,188 (0.62 %)	381 (95.16 %)	668 (4.61 %)
372	ascomycetes T.reesei QM6a GCF_000167675.1	9,111 (42.48 %)	n/a	1,265 (2.86 %)	3,379 (15.58 %)	n/a	52.82 (99.86 %)	44 (0.14 %)	150 (0.14 %)	121 (99.86 %)	17,397 (2.17 %)	7,841 (1.06 %)	151,931 (12.78 %)	0 (0 %)	1,257 (0.19 %)	438 (40.31 %)	1,156 (4.14 %)
373	ascomycetes T.rubrum CBS 118892 GCF_000151425.1	10,433 (60.77 %)	n/a	1,389 (4.78 %)	4,715 (28.34 %)	n/a	48.28 (98.23 %)	588 (1.78 %)	588 (1.78 %)	624 (98.22 %)	9,453 (1.77 %)	3,813 (0.65 %)	84,503 (9.58 %)	1 (0.01 %)	228 (0.36 %)	6,130 (28.71 %)	4,925 (12.68 %)
374	ascomycetes T.stipitatus ATCC 10500 GCF_000003125.1	13,250 (56.15 %)	n/a	1,555 (3.38 %)	9,085 (30.87 %)	n/a	46.07 (99.64 %)	140 (0.36 %)	140 (0.36 %)	960 (99.64 %)	5,379 (0.87 %)	3,629 (0.75 %)	68,204 (8.29 %)	3 (0.01 %)	2,510 (0.79 %)	6,282 (11.55 %)	5,523 (8.88 %)
375	ascomycetes T.thermophilus ATCC 42464 GCF_000226095.1	9,097 (41.11 %)	n/a	1,465 (2.88 %)	3,487 (13.63 %)	n/a	51.46 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	20,281 (2.20 %)	7,727 (0.83 %)	122,614 (24.50 %)	0 (0 %)	8,821 (1.67 %)	89 (44.52 %)	193 (14.49 %)
376	ascomycetes T.tonsurans (CBS 112818 2009) GCA_000151455.1	n/a	8,625 (53.69 %)	1,390 (4.74 %)	4,980 (28.40 %)	n/a	48.12 (97.92 %)	1,053 (2.10 %)	1,053 (2.10 %)	1,164 (97.90 %)	10,131 (1.89 %)	4,923 (0.78 %)	79,798 (10.05 %)	0 (0 %)	300 (0.16 %)	6,315 (29.39 %)	5,329 (14.70 %)
377	ascomycetes T.virens Gv29-8 GCF_000170995.1	12,383 (47.70 %)	n/a	1,412 (2.71 %)	7,056 (25.05 %)	n/a	49.25 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	93 (100.00 %)	11,582 (1.31 %)	8,335 (1.03 %)	142,933 (9.44 %)	0 (0 %)	681 (0.16 %)	4,846 (52.69 %)	8,085 (17.76 %)
378	ascomycetes U.reesii 1704 GCF_000003515.1	7,759 (50.51 %)	n/a	1,431 (5.01 %)	4,863 (28.11 %)	n/a	48.66 (99.20 %)	538 (0.81 %)	538 (0.81 %)	583 (99.19 %)	2,750 (0.77 %)	920 (0.28 %)	48,695 (5.30 %)	1 (0.01 %)	611 (0.31 %)	2,297 (28.95 %)	2,971 (15.56 %)
379	ascomycetes V.dahliae (JR2 2014) GCA_000400815.2	n/a	n/a	1,309 (2.72 %)	3,758 (15.22 %)	n/a	53.89 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	13,736 (1.78 %)	8,998 (1.17 %)	106,375 (12.84 %)	0 (0 %)	4,136 (1.07 %)	34 (99.31 %)	65 (31.31 %)
380	ascomycetes V.gallopava GCF_000836295.1	11,366 (60.14 %)	n/a	1,554 (3.72 %)	7,215 (30.41 %)	n/a	49.07 (98.64 %)	198 (1.36 %)	198 (1.36 %)	565 (98.64 %)	7,529 (1.05 %)	3,079 (0.48 %)	66,788 (9.80 %)	35 (0.18 %)	1,907 (0.58 %)	799 (43.30 %)	685 (18.15 %)
381	ascomycetes X.arbuscula (CBS 124340 2022) GCA_022385695.1	n/a	13,122 (46.01 %)	1,477 (2.19 %)	8,849 (21.94 %)	n/a	44.26 (100.00 %)	52 (0.00 %)	52 (0.00 %)	141 (100.00 %)	13,755 (1.15 %)	15,097 (1.30 %)	102,158 (17.27 %)	3 (0.00 %)	3,087 (0.44 %)	5,597 (27.65 %)	6,675 (18.59 %)
382	ascomycetes Y.lipolytica (CLIB89W29 2016) GCF_001761485.1	8,056 (49.23 %)	n/a	1,760 (6.59 %)	4,813 (37.15 %)	n/a	49.05 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	7,137 (1.65 %)	9,696 (2.09 %)	81,942 (9.44 %)	0 (0 %)	864 (0.30 %)	6,254 (33.22 %)	5,354 (17.95 %)
383	ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 refseq) GCF_000219625.1	10,941 (38.49 %)	n/a	1,456 (2.81 %)	6,906 (25.36 %)	n/a	52.14 (99.98 %)	3 (0.02 %)	3 (0.02 %)	24 (99.98 %)	8,941 (1.69 %)	8,367 (1.51 %)	99,818 (11.14 %)	0 (0 %)	6,612 (1.57 %)	16 (43.15 %)	88 (1.16 %)
384	ascomycetes Z.tritici ST99CH_3D1 (2017) GCA_900184105.1	n/a	36,876 (44.64 %)	1,450 (2.76 %)	6,877 (24.77 %)	n/a	52.01 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	23 (100.00 %)	9,134 (1.80 %)	8,632 (1.65 %)	94,954 (11.46 %)	0 (0 %)	7,397 (1.74 %)	26 (97.92 %)	38 (0.87 %)
385	Asian malaria mosquito GCF_013141755.1	32,974 (18.58 %)	n/a	5,601 (2.51 %)	29,942 (14.12 %)	n/a	44.92 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	494 (100.00 %)	145,591 (7.79 %)	37,050 (5.68 %)	1,066,993 (24.73 %)	0 (0 %)	108,395 (6.15 %)	18,418 (10.44 %)	17,636 (4.48 %)
386	Asian malaria mosquito (Indian Wild Type Walter Reed 2013) GCA_000300775.2	n/a	n/a	5,326 (2.75 %)	28,440 (14.13 %)	n/a	44.80 (94.64 %)	8,390 (5.35 %)	10,928 (5.35 %)	31,761 (94.65 %)	128,514 (4.27 %)	27,601 (0.61 %)	1,275,750 (17.87 %)	60 (0.02 %)	7,812 (0.41 %)	24,261 (8.87 %)	17,910 (4.63 %)
387	Asian malaria mosquito (SDA-500 2013) GCA_000349045.1	n/a	n/a	5,361 (2.98 %)	27,357 (15.12 %)	n/a	45.02 (87.06 %)	7,836 (12.95 %)	7,836 (12.95 %)	8,946 (87.05 %)	123,660 (3.77 %)	27,395 (0.88 %)	1,221,979 (16.34 %)	367 (0.58 %)	15,107 (1.35 %)	21,651 (8.52 %)	16,434 (4.16 %)
388	Asian tiger mosquito (C6/36 2017 refseq) GCF_001876365.2	52,074 (3.05 %)	n/a	10,893 (0.53 %)	128,421 (8.33 %)	n/a	40.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,435 (100.00 %)	605,008 (2.87 %)	952,263 (7.68 %)	11,169,650 (57.07 %)	0 (0 %)	1,147,016 (4.60 %)	220,674 (10.38 %)	117,108 (3.58 %)
389	Asian tiger mosquito (Foshan BGI 2016) GCA_001444175.2	n/a	17,146 (1.32 %)	7,541 (0.43 %)	120,718 (7.86 %)	n/a	40.18 (92.37 %)	200,279 (7.66 %)	200,279 (7.66 %)	355,061 (92.34 %)	472,441 (2.12 %)	767,591 (5.16 %)	9,615,414 (49.93 %)	582 (0.06 %)	n/a	212,453 (8.14 %)	109,624 (3.51 %)
390	Asian tiger mosquito (v2 FPA 2019) GCF_006496715.2	48,522 (2.54 %)	n/a	10,280 (0.43 %)	136,667 (7.61 %)	n/a	40.37 (99.93 %)	0 (0 %)	3,359 (0.07 %)	2,114 (100.00 %)	510,394 (1.35 %)	1,083,870 (7.48 %)	12,581,322 (57.64 %)	0 (0 %)	1,196,653 (4.46 %)	250,348 (10.06 %)	127,770 (3.44 %)
391	Astrovirus (MLB1 2008) GCF_000880715.1	n/a	3 (98.83 %)	n/a	n/a	n/a	40.86 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.70 %)	n/a	4 (1.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
392	Astrovirus (VA1 2009) GCF_000885815.1	n/a	4 (97.94 %)	n/a	n/a	n/a	41.93 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.67 %)	n/a	7 (0.87 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
393	Astrovirus MLB2 (MLB2/human/Stl/WD0559/2008 2012) GCF_000895575.1	n/a	3 (99.13 %)	n/a	n/a	n/a	40.52 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (2.01 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
394	Astrovirus MLB3 (MLB3/human/Vellore/26564/2004 2012) GCF_000899535.1	n/a	3 (99.15 %)	n/a	n/a	n/a	40.00 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (2.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
395	Astrovirus VA3 (VA3/human/Vellore/28054/2005 2012) GCF_000901475.1	n/a	3 (98.01 %)	n/a	n/a	n/a	41.78 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
396	Astrovirus VA4 (VA4/human/Nepal/S5363/2008 2012) GCF_000897955.1	n/a	3 (97.62 %)	n/a	n/a	n/a	42.99 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.11 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
397	Atlantic salmon calicivirus (Nordland/2011 2014) GCF_000919195.1	n/a	2 (97.89 %)	n/a	n/a	n/a	53.49 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (56.39 %)	3 (56.39 %)
398	B.mandrillaris (2046 2015) GCA_001262475.1	n/a	n/a	1,232 (1.79 %)	5,359 (15.18 %)	n/a	46.82 (96.85 %)	3,362 (3.12 %)	3,362 (3.12 %)	18,061 (96.88 %)	74,755 (9.89 %)	42,915 (4.62 %)	326,322 (29.76 %)	2 (0.00 %)	7,242 (0.84 %)	11,084 (12.34 %)	5,285 (4.53 %)
399	B.mandrillaris (CDC-V039 2015) GCA_001185145.1	n/a	n/a	2,084 (2.01 %)	5,736 (17.17 %)	n/a	46.77 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	1,605 (100.00 %)	100,657 (9.09 %)	64,135 (5.44 %)	468,536 (32.46 %)	0 (0 %)	26,060 (3.04 %)	16,125 (13.06 %)	8,408 (5.01 %)
400	Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor' (Ames Ancestor; A2084 2004) GCF_000008445.1	n/a	5,759 (85.25 %)	n/a	n/a	n/a	35.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	321 (0.49 %)	37,990 (15.20 %)	0 (0 %)	185 (0.68 %)	28 (1.14 %)	26 (1.11 %)
401	bacteria L.abararensis (201903074 2021) GCF_016918735.1	n/a	3,978 (92.68 %)	n/a	n/a	n/a	39.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	66 (100.00 %)	n/a	36 (0.07 %)	33,364 (16.57 %)	0 (0 %)	143 (0.29 %)	48 (0.37 %)	28 (0.23 %)
402	bacteria L.adleri (FH2-B-D1 2017) GCF_002811985.1	n/a	4,462 (86.69 %)	n/a	n/a	n/a	43.55 (99.99 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	170 (100.00 %)	n/a	107 (0.36 %)	42,188 (18.59 %)	0 (0 %)	189 (0.30 %)	30 (0.34 %)	36 (0.32 %)
403	bacteria L.ainazelensis (201903071 2021) GCF_016918785.1	n/a	4,465 (86.67 %)	n/a	n/a	n/a	42.61 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	94 (100.00 %)	n/a	150 (0.56 %)	42,015 (18.64 %)	0 (0 %)	382 (0.67 %)	29 (0.21 %)	36 (0.28 %)
404	bacteria L.ainlahdjerensis (201903070 2021) GCF_016919175.1	n/a	4,444 (85.53 %)	n/a	n/a	n/a	42.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	88 (100.00 %)	n/a	115 (0.40 %)	42,317 (18.88 %)	0 (0 %)	329 (0.62 %)	41 (0.35 %)	56 (0.39 %)
405	bacteria L.alexanderi serovar Manhao 3 str. (L 60 2013) GCF_000243815.2	n/a	3,948 (83.80 %)	n/a	n/a	n/a	40.20 (100.00 %)	8 (0.00 %)	8 (0.00 %)	73 (100.00 %)	n/a	115 (0.36 %)	34,309 (17.25 %)	0 (0 %)	285 (0.74 %)	14 (0.15 %)	36 (0.35 %)
406	bacteria L.alstonii serovar Sichuan str. (79601 2013) GCF_000347175.1	n/a	4,101 (85.65 %)	n/a	n/a	n/a	42.48 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	125 (100.00 %)	n/a	105 (0.31 %)	36,409 (17.07 %)	0 (0 %)	129 (0.34 %)	16 (0.22 %)	23 (0.25 %)
407	bacteria L.andrefontaineae (201800301 2019) GCF_004770105.1	n/a	3,961 (91.62 %)	n/a	n/a	n/a	39.93 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	30 (100.00 %)	n/a	33 (0.15 %)	31,701 (14.50 %)	0 (0 %)	205 (0.31 %)	40 (0.37 %)	25 (0.24 %)
408	bacteria L.bandrabouensis (201601109 2019) GCF_004770555.1	n/a	3,930 (92.95 %)	n/a	n/a	n/a	37.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	31 (100.00 %)	n/a	37 (0.05 %)	34,476 (17.58 %)	0 (0 %)	149 (0.21 %)	39 (0.37 %)	25 (0.26 %)
409	bacteria L.barantonii (FH4-C-A1 2017) GCF_002811925.1	n/a	4,051 (91.16 %)	n/a	n/a	n/a	43.96 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	17 (100.00 %)	n/a	45 (0.10 %)	38,525 (18.03 %)	0 (0 %)	65 (0.10 %)	2 (0.11 %)	4 (0.09 %)
410	bacteria L.biflexa serovar strain 'Patoc (Patoc 1 Paris 2008) GCF_000017685.1	n/a	3,725 (93.00 %)	n/a	n/a	n/a	38.89 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	41 (0.06 %)	32,819 (17.62 %)	0 (0 %)	253 (0.45 %)	57 (0.64 %)	44 (0.52 %)
411	bacteria L.borgpetersenii serovar Ceylonica (Piyasena 2018) GCF_003516145.1	n/a	3,491 (82.71 %)	n/a	n/a	n/a	40.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	94 (0.29 %)	32,972 (17.71 %)	0 (0 %)	174 (0.66 %)	4 (0.06 %)	29 (0.38 %)
412	bacteria L.bourretii (201800267 2019) GCF_004770145.1	n/a	3,925 (92.80 %)	n/a	n/a	n/a	38.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	28 (100.00 %)	n/a	44 (0.14 %)	35,124 (17.99 %)	0 (0 %)	230 (0.37 %)	40 (0.37 %)	28 (0.28 %)
413	bacteria L.bouyouniensis (201800295 2019) GCF_004770625.1	n/a	3,840 (92.74 %)	n/a	n/a	n/a	37.10 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	23 (100.00 %)	n/a	48 (0.08 %)	34,160 (17.72 %)	0 (0 %)	42 (0.09 %)	26 (0.33 %)	18 (0.25 %)
414	bacteria L.brenneri (201800277 2019) GCF_004769295.1	n/a	3,663 (93.37 %)	n/a	n/a	n/a	38.46 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14 (100.00 %)	n/a	29 (0.05 %)	32,156 (17.18 %)	0 (0 %)	64 (0.14 %)	30 (0.33 %)	20 (0.25 %)
415	bacteria L.broomii serovar Hurstbridge str. (5399 2013) GCF_000243715.2	n/a	3,965 (88.75 %)	n/a	n/a	n/a	42.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	n/a	61 (0.20 %)	27,922 (12.01 %)	0 (0 %)	111 (0.35 %)	9 (0.06 %)	10 (0.08 %)
416	bacteria L.chreensis (201903075 2021) GCF_016919165.1	n/a	4,188 (93.06 %)	n/a	n/a	n/a	39.77 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	80 (100.00 %)	n/a	50 (0.10 %)	35,979 (16.47 %)	0 (0 %)	101 (0.16 %)	79 (0.53 %)	48 (0.31 %)
417	bacteria L.cinconiae (WS58.C1 2024) GCF_040833995.1	n/a	3,800 (91.12 %)	n/a	n/a	n/a	41.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	61 (0.25 %)	31,019 (14.89 %)	0 (0 %)	307 (0.57 %)	62 (0.64 %)	66 (0.55 %)
418	bacteria L.congkakensis (201702421 2019) GCF_004770265.1	n/a	3,703 (93.00 %)	n/a	n/a	n/a	38.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	24 (100.00 %)	n/a	48 (0.09 %)	33,553 (17.72 %)	0 (0 %)	83 (0.17 %)	25 (0.23 %)	14 (0.16 %)
419	bacteria L.dzoumogneensis (201601113 2019) GCF_004770895.1	n/a	3,810 (91.72 %)	n/a	n/a	n/a	40.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	28 (100.00 %)	n/a	44 (0.12 %)	31,764 (15.17 %)	0 (0 %)	166 (0.39 %)	89 (0.68 %)	57 (0.44 %)
420	bacteria L.ellinghausenii (E18 2018) GCF_003114815.1	n/a	3,957 (92.76 %)	n/a	n/a	n/a	37.35 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	28 (100.00 %)	n/a	46 (0.05 %)	34,431 (17.28 %)	0 (0 %)	175 (0.30 %)	14 (0.18 %)	11 (0.14 %)
421	bacteria L.fainei serovar Hurstbridge str. (BUT 6 2013) GCF_000306235.2	n/a	3,868 (89.56 %)	n/a	n/a	n/a	43.53 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	13 (100.00 %)	n/a	52 (0.16 %)	27,370 (12.02 %)	0 (0 %)	116 (0.25 %)	10 (0.10 %)	10 (0.13 %)
422	bacteria L.fletcheri (SSW15 2019) GCF_004769195.1	n/a	3,429 (91.62 %)	n/a	n/a	n/a	47.35 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14 (100.00 %)	n/a	44 (0.12 %)	28,297 (14.77 %)	0 (0 %)	68 (0.18 %)	5 (0.14 %)	6 (0.13 %)
423	bacteria L.fluminis (SCS5 2019) GCF_004771275.1	n/a	3,438 (92.19 %)	n/a	n/a	n/a	47.70 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	18 (100.00 %)	n/a	32 (0.08 %)	28,752 (15.06 %)	0 (0 %)	72 (0.17 %)	4 (0.26 %)	4 (0.12 %)
424	bacteria L.gomenensis (201800299 2019) GCF_004770155.1	n/a	3,932 (88.37 %)	n/a	n/a	n/a	46.13 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	96 (100.00 %)	n/a	158 (0.47 %)	35,209 (16.86 %)	0 (0 %)	294 (0.64 %)	40 (0.69 %)	34 (0.38 %)
425	bacteria L.haakeii (ATI7-C-A2 2017) GCF_002812225.1	n/a	3,873 (92.13 %)	n/a	n/a	n/a	39.81 (100.00 %)	0 (0 %)	8 (0.00 %)	37 (100.00 %)	n/a	36 (0.11 %)	30,829 (14.47 %)	0 (0 %)	189 (0.34 %)	37 (0.32 %)	26 (0.24 %)
426	bacteria L.harrisiae (FH2-B-A1 2017) GCF_002811945.1	n/a	3,684 (93.50 %)	n/a	n/a	n/a	37.86 (99.99 %)	0 (0 %)	1 (0.01 %)	17 (100.00 %)	n/a	44 (0.06 %)	33,435 (18.04 %)	0 (0 %)	37 (0.08 %)	20 (0.24 %)	16 (0.20 %)
427	bacteria L.hartskeerlii (MCA2-B-A3 2017) GCF_002811475.1	n/a	3,755 (92.32 %)	n/a	n/a	n/a	40.47 (100.00 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	30 (100.00 %)	n/a	43 (0.18 %)	30,024 (14.48 %)	0 (0 %)	117 (0.22 %)	55 (0.54 %)	41 (0.39 %)
428	bacteria L.idonii (201300427 2019) GCF_004770995.1	n/a	3,823 (93.09 %)	n/a	n/a	n/a	41.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	83 (100.00 %)	n/a	39 (0.17 %)	31,508 (15.73 %)	0 (0 %)	107 (0.25 %)	61 (0.48 %)	62 (0.49 %)
429	bacteria L.ilyithenensis (201400974 2019) GCF_004771005.1	n/a	3,974 (92.32 %)	n/a	n/a	n/a	40.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	74 (100.00 %)	n/a	43 (0.21 %)	33,614 (16.63 %)	0 (0 %)	144 (0.44 %)	106 (0.87 %)	84 (0.66 %)
430	bacteria L.inadai serovar Lyme str. (10 2013) GCF_000243675.2	n/a	4,001 (88.47 %)	n/a	n/a	n/a	44.61 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	28 (100.00 %)	n/a	168 (0.75 %)	28,417 (12.44 %)	0 (0 %)	370 (0.89 %)	11 (0.17 %)	10 (0.17 %)
431	bacteria L.interrogans serovar Copenhageni (FDAARGOS_203 2018) GCF_002073495.2	n/a	3,795 (76.38 %)	n/a	n/a	n/a	35.04 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	230 (0.97 %)	44,431 (24.35 %)	0 (0 %)	504 (1.04 %)	18 (0.26 %)	17 (0.25 %)
432	bacteria L.jelokensis (201702419 2019) GCF_004769775.1	n/a	3,839 (92.46 %)	n/a	n/a	n/a	38.90 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	45 (100.00 %)	n/a	42 (0.06 %)	35,532 (18.49 %)	0 (0 %)	159 (0.26 %)	39 (0.41 %)	25 (0.30 %)
433	bacteria L.johnsonii (E8 2018) GCF_003112675.1	n/a	3,783 (92.14 %)	n/a	n/a	n/a	41.26 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	20 (100.00 %)	n/a	32 (0.16 %)	30,291 (14.52 %)	0 (0 %)	120 (0.24 %)	62 (0.60 %)	39 (0.41 %)
434	bacteria L.kanakyensis (201800292 2019) GCF_004769235.1	n/a	3,885 (93.22 %)	n/a	n/a	n/a	38.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	28 (100.00 %)	n/a	50 (0.08 %)	35,195 (18.13 %)	0 (0 %)	90 (0.21 %)	20 (0.20 %)	20 (0.20 %)
435	bacteria L.kemamanensis (201702454 2019) GCF_004769665.1	n/a	3,550 (93.26 %)	n/a	n/a	n/a	38.90 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	52 (100.00 %)	n/a	47 (0.09 %)	31,344 (17.43 %)	0 (0 %)	27 (0.08 %)	28 (0.32 %)	17 (0.24 %)
436	bacteria L.kirschneri serovar Cynopteri str. (3522 CT 2013) GCF_000243695.2	n/a	3,672 (78.13 %)	n/a	n/a	n/a	35.92 (100.00 %)	5 (0.00 %)	5 (0.00 %)	29 (100.00 %)	n/a	192 (0.74 %)	41,523 (23.21 %)	0 (0 %)	471 (1.00 %)	21 (0.21 %)	20 (0.19 %)
437	bacteria L.kmetyi (LS 001/16 2018) GCF_003722295.1	n/a	4,032 (90.14 %)	n/a	n/a	n/a	44.83 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	71 (0.25 %)	40,144 (18.84 %)	0 (0 %)	211 (0.33 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
438	bacteria L.kobayashii (E30 2021) GCF_003114835.2	n/a	3,958 (92.76 %)	n/a	n/a	n/a	40.69 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	41 (0.09 %)	33,764 (16.19 %)	0 (0 %)	373 (0.63 %)	107 (0.85 %)	90 (0.73 %)
439	bacteria L.koniambonensis (201800265 2019) GCF_004769555.1	n/a	3,997 (91.61 %)	n/a	n/a	n/a	38.97 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	n/a	48 (0.13 %)	33,271 (15.28 %)	0 (0 %)	254 (0.44 %)	36 (0.28 %)	20 (0.17 %)
440	bacteria L.langatensis (SSW18 2019) GCF_004770615.1	n/a	3,754 (91.63 %)	n/a	n/a	n/a	44.79 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	n/a	33 (0.10 %)	28,769 (13.52 %)	0 (0 %)	104 (0.20 %)	259 (2.26 %)	148 (1.12 %)
441	bacteria L.levettii (MCA2-B-A1 2017) GCF_002812085.1	n/a	3,621 (93.79 %)	n/a	n/a	n/a	37.61 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	14 (100.00 %)	n/a	42 (0.07 %)	31,876 (17.16 %)	0 (0 %)	15 (0.04 %)	13 (0.19 %)	9 (0.13 %)
442	bacteria L.licerasiae (ATCC BAA-1110 2014) GCF_000526875.1	n/a	3,897 (91.77 %)	n/a	n/a	n/a	41.13 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25 (100.00 %)	n/a	47 (0.14 %)	30,634 (14.21 %)	0 (0 %)	98 (0.16 %)	76 (0.57 %)	64 (0.45 %)
443	bacteria L.limi (VSF25 2022) GCF_026151395.1	n/a	3,677 (93.28 %)	n/a	n/a	n/a	37.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	24 (100.00 %)	n/a	51 (0.09 %)	32,582 (17.46 %)	0 (0 %)	119 (0.21 %)	23 (0.26 %)	18 (0.20 %)
444	bacteria L.mayottensis (200901116 2018) GCF_000306675.2	n/a	3,722 (83.79 %)	n/a	n/a	n/a	39.57 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	97 (0.43 %)	34,933 (17.69 %)	0 (0 %)	753 (3.93 %)	29 (0.38 %)	51 (0.69 %)
445	bacteria L.meyeri (DSM 21537 2019) GCF_004368965.1	n/a	3,962 (92.67 %)	n/a	n/a	n/a	38.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16 (100.00 %)	n/a	49 (0.08 %)	35,416 (17.98 %)	0 (0 %)	134 (0.23 %)	45 (0.38 %)	26 (0.24 %)
446	bacteria L.montravelensis (201800278 2019) GCF_004770045.1	n/a	3,756 (93.13 %)	n/a	n/a	n/a	37.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	24 (100.00 %)	n/a	39 (0.09 %)	33,864 (17.97 %)	0 (0 %)	81 (0.16 %)	32 (0.33 %)	24 (0.27 %)
447	bacteria L.mtsangambouensis (201601298 2019) GCF_004770475.1	n/a	3,833 (93.17 %)	n/a	n/a	n/a	38.20 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	18 (100.00 %)	n/a	40 (0.07 %)	34,907 (18.41 %)	0 (0 %)	225 (0.33 %)	32 (0.31 %)	16 (0.20 %)
448	bacteria L.neocaledonica (ES4-C-A1 2017) GCF_002812205.1	n/a	3,914 (91.32 %)	n/a	n/a	n/a	40.17 (99.99 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	38 (100.00 %)	n/a	52 (0.16 %)	32,229 (15.15 %)	0 (0 %)	188 (0.41 %)	65 (0.52 %)	50 (0.38 %)
449	bacteria L.noguchii serovar Panama str. (CZ214 2013) GCF_000306255.2	n/a	4,079 (79.24 %)	n/a	n/a	n/a	35.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	35 (100.00 %)	n/a	226 (0.68 %)	45,225 (23.73 %)	0 (0 %)	314 (0.56 %)	20 (0.24 %)	19 (0.22 %)
450	bacteria L.noumeaensis (201800287 2019) GCF_004770765.1	n/a	3,855 (92.80 %)	n/a	n/a	n/a	38.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	40 (100.00 %)	n/a	38 (0.07 %)	35,113 (18.23 %)	0 (0 %)	116 (0.23 %)	35 (0.31 %)	21 (0.20 %)
451	bacteria L.ognonensis (201702476 2019) GCF_004770745.1	n/a	3,747 (93.68 %)	n/a	n/a	n/a	39.66 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	62 (100.00 %)	n/a	36 (0.09 %)	27,969 (14.21 %)	0 (0 %)	97 (0.18 %)	86 (0.82 %)	73 (0.65 %)
452	bacteria L.paudalimensis (VSF14 2022) GCF_026151345.1	n/a	3,767 (93.31 %)	n/a	n/a	n/a	37.42 (99.99 %)	0 (0 %)	3 (0.01 %)	5 (100.00 %)	n/a	50 (0.11 %)	33,762 (17.40 %)	0 (0 %)	247 (0.34 %)	25 (0.32 %)	15 (0.23 %)
453	bacteria L.perdikensis (201702692 2019) GCF_004769575.1	n/a	3,735 (93.38 %)	n/a	n/a	n/a	38.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	21 (100.00 %)	n/a	48 (0.08 %)	32,775 (17.19 %)	0 (0 %)	91 (0.15 %)	32 (0.30 %)	25 (0.25 %)
454	bacteria L.perolatii (FH1-B-B1 2017) GCF_002811875.1	n/a	3,640 (91.12 %)	n/a	n/a	n/a	42.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	49 (100.00 %)	n/a	64 (0.15 %)	24,229 (11.31 %)	0 (0 %)	53 (0.11 %)	111 (1.05 %)	115 (0.94 %)
455	bacteria L.ryugenii (YH101 2018) GCF_003114855.1	n/a	3,729 (93.64 %)	n/a	n/a	n/a	39.92 (99.98 %)	0 (0 %)	3 (0.02 %)	24 (100.00 %)	n/a	47 (0.09 %)	27,737 (14.08 %)	0 (0 %)	90 (0.16 %)	39 (0.43 %)	30 (0.34 %)
456	bacteria L.saintgironsiae (FH4-C-A2 2017) GCF_002811765.1	n/a	3,793 (92.24 %)	n/a	n/a	n/a	39.11 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	42 (100.00 %)	n/a	30 (0.11 %)	30,359 (14.67 %)	0 (0 %)	172 (0.28 %)	28 (0.26 %)	21 (0.20 %)
457	bacteria L.sanjuanensis (LGVF02 2022) GCF_022267325.1	n/a	4,172 (88.78 %)	n/a	n/a	n/a	45.06 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	80 (0.31 %)	36,944 (16.45 %)	0 (0 %)	401 (0.84 %)	0 (0.00 %)	23 (0.11 %)
458	bacteria L.santarosai serovar Shermani str. (LT 821 2014) GCF_000313175.2	n/a	3,660 (84.98 %)	n/a	n/a	n/a	41.82 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	129 (0.49 %)	33,291 (17.61 %)	0 (0 %)	524 (1.32 %)	0 (0.00 %)	7 (0.06 %)
459	bacteria L.sarikeiensis (201702455 2019) GCF_004769615.1	n/a	4,038 (90.91 %)	n/a	n/a	n/a	40.27 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	44 (100.00 %)	n/a	50 (0.20 %)	31,763 (14.10 %)	0 (0 %)	145 (0.27 %)	63 (0.50 %)	45 (0.38 %)
460	bacteria L.selangorensis (SSW17 2019) GCF_004769405.1	n/a	3,891 (92.19 %)	n/a	n/a	n/a	39.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	31 (100.00 %)	n/a	33 (0.11 %)	31,465 (14.80 %)	0 (0 %)	143 (0.24 %)	41 (0.33 %)	28 (0.26 %)
461	bacteria L.semungkisensis (SSS9 2019) GCF_004770055.1	n/a	3,625 (91.90 %)	n/a	n/a	n/a	42.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	26 (100.00 %)	n/a	30 (0.11 %)	26,444 (12.79 %)	0 (0 %)	110 (0.26 %)	124 (1.13 %)	75 (0.60 %)
462	bacteria L.soteropolitanensis (VSF16 2022) GCF_026151335.1	n/a	3,933 (92.14 %)	n/a	n/a	n/a	37.69 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	134 (100.00 %)	n/a	46 (0.11 %)	33,611 (17.23 %)	0 (0 %)	106 (0.20 %)	31 (0.36 %)	17 (0.21 %)
463	bacteria L.stimsonii (AMB6-RJ 2018) GCF_003545875.1	n/a	4,340 (85.62 %)	n/a	n/a	n/a	42.65 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	23 (100.00 %)	n/a	121 (0.51 %)	40,695 (18.09 %)	0 (0 %)	341 (0.49 %)	22 (0.20 %)	30 (0.24 %)
464	bacteria L.terpstrae serovar Hualin str. ATCC 700639 (LT 11-33 2013) GCF_000332495.1	n/a	3,871 (92.84 %)	n/a	n/a	n/a	38.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	23 (100.00 %)	n/a	38 (0.06 %)	32,875 (16.82 %)	0 (0 %)	218 (0.33 %)	45 (0.43 %)	27 (0.30 %)
465	bacteria L.tipperaryensis (GWTS#1 2016) GCF_001729245.1	n/a	4,157 (87.99 %)	n/a	n/a	n/a	42.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	93 (0.42 %)	40,390 (18.62 %)	0 (0 %)	233 (0.44 %)	0 (0.00 %)	12 (0.07 %)
466	bacteria L.vanthielii (201601955 2019) GCF_004770365.1	n/a	3,835 (92.69 %)	n/a	n/a	n/a	39.05 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	44 (100.00 %)	n/a	40 (0.09 %)	32,685 (16.70 %)	0 (0 %)	211 (0.38 %)	44 (0.38 %)	26 (0.24 %)
467	bacteria L.venezuelensis (CLM-U50 2017) GCF_002150035.1	n/a	4,028 (91.14 %)	n/a	n/a	n/a	39.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	22 (100.00 %)	n/a	47 (0.16 %)	31,562 (14.38 %)	0 (0 %)	211 (0.29 %)	38 (0.35 %)	25 (0.24 %)
468	bacteria L.weilii (CUDO6 2019) GCF_006874765.1	n/a	4,007 (83.41 %)	n/a	n/a	n/a	40.88 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	154 (0.72 %)	34,455 (17.13 %)	0 (0 %)	715 (2.57 %)	2 (0.02 %)	34 (0.48 %)
469	bacteria L.wolbachii serovar Codice str. (CDC 2013) GCF_000332515.2	n/a	3,866 (92.36 %)	n/a	n/a	n/a	39.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25 (100.00 %)	n/a	35 (0.13 %)	31,364 (15.78 %)	0 (0 %)	198 (0.41 %)	58 (0.55 %)	32 (0.37 %)
470	bacteria L.wolffii (201800291 2019) GCF_004770635.1	n/a	3,862 (91.11 %)	n/a	n/a	n/a	45.95 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	20 (100.00 %)	n/a	35 (0.13 %)	29,853 (13.61 %)	0 (0 %)	105 (0.20 %)	7 (0.11 %)	32 (0.27 %)
471	bacteria L.yanagawae (201800272 2019) GCF_004769275.1	n/a	3,698 (93.21 %)	n/a	n/a	n/a	38.26 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	30 (100.00 %)	n/a	46 (0.05 %)	33,564 (17.83 %)	0 (0 %)	38 (0.07 %)	18 (0.19 %)	15 (0.16 %)
472	bacteria L.yasudae (F1 2018) GCF_003545925.1	n/a	4,112 (89.40 %)	n/a	n/a	n/a	45.49 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25 (100.00 %)	n/a	82 (0.26 %)	36,579 (16.34 %)	0 (0 %)	116 (0.19 %)	15 (0.16 %)	17 (0.16 %)
473	baker's yeast S288C (2014) GCF_000146045.2	6,138 (72.17 %)	n/a	5,840 (68.70 %)	4,964 (64.10 %)	7,127 (73.31 %)	38.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	17 (100.00 %)	3,982 (5.01 %)	2,086 (0.92 %)	64,748 (13.81 %)	0 (0 %)	669 (1.21 %)	218 (0.80 %)	183 (0.65 %)
474	Banna virus strain JKT-6423 (JKT-6423 JKT-6423 2000) GCF_000858185.1	n/a	12 (86.10 %)	n/a	n/a	n/a	39.33 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (0.64 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
475	Barmah Forest virus (BH2193 1997) GCF_000847585.1	n/a	5 (95.39 %)	n/a	n/a	n/a	48.55 (99.97 %)	2 (0.02 %)	2 (0.02 %)	3 (99.98 %)	4 (0.59 %)	n/a	7 (2.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (15.26 %)	5 (15.26 %)
476	basidiomycetes A.montevideense (JCM 9937 2016) GCA_001598995.1	n/a	n/a	868 (2.59 %)	1,381 (7.59 %)	n/a	58.37 (99.67 %)	0 (0 %)	3,423 (0.36 %)	61 (100.00 %)	10,985 (2.06 %)	6,046 (1.04 %)	121,518 (11.81 %)	6 (0.01 %)	362 (0.13 %)	92 (99.38 %)	87 (53.43 %)
477	basidiomycetes C.bacillisporus (CA1873 2015) GCA_000855695.1	n/a	6,782 (56.50 %)	945 (3.91 %)	3,198 (17.55 %)	n/a	48.01 (99.72 %)	61 (0.28 %)	61 (0.28 %)	94 (99.72 %)	3,913 (1.18 %)	1,301 (0.32 %)	69,281 (8.51 %)	6 (0.06 %)	148 (0.12 %)	4,877 (22.48 %)	3,068 (8.52 %)
478	basidiomycetes C.cinerea (A43mut B43mut pab1-1 #326 2021) GCA_016772295.1	n/a	17,100 (58.31 %)	1,043 (1.94 %)	3,929 (10.49 %)	n/a	51.57 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	31 (100.00 %)	7,458 (0.89 %)	4,697 (1.18 %)	92,970 (10.14 %)	0 (0 %)	6,885 (2.83 %)	539 (97.54 %)	219 (0.81 %)
479	basidiomycetes C.cinerea (okayama7#130 2010 refseq) GCF_000182895.1	13,348 (52.60 %)	n/a	1,055 (2.05 %)	3,917 (10.89 %)	n/a	51.64 (100.00 %)	0 (0 %)	33 (0.00 %)	68 (100.00 %)	7,665 (5.04 %)	3,805 (0.81 %)	107,373 (7.81 %)	0 (0 %)	2,879 (1.50 %)	75 (51.75 %)	135 (0.47 %)
480	basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7841 2024 genbank) GCA_001720195.2	n/a	6,409 (59.64 %)	921 (4.16 %)	4,119 (24.79 %)	n/a	44.80 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	2,424 (0.66 %)	1,011 (0.30 %)	56,356 (7.99 %)	0 (0 %)	901 (0.80 %)	1,869 (7.30 %)	1,482 (5.65 %)
481	basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7841 2024 refseq) GCF_001720195.1	6,357 (59.61 %)	n/a	921 (4.16 %)	4,119 (24.79 %)	n/a	44.80 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	2,424 (0.66 %)	1,011 (0.30 %)	56,356 (7.99 %)	0 (0 %)	901 (0.80 %)	1,869 (7.30 %)	1,482 (5.65 %)
482	basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7855 2024 gebnak) GCA_001720245.2	n/a	6,395 (59.69 %)	1,007 (4.51 %)	4,259 (25.44 %)	n/a	44.81 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	9 (100.00 %)	5,334 (7.78 %)	1,092 (0.35 %)	54,479 (7.43 %)	0 (0 %)	592 (1.05 %)	1,880 (7.40 %)	1,728 (6.45 %)
483	basidiomycetes C.deuterogattii (R265 2018) GCF_002954075.1	6,463 (61.87 %)	n/a	936 (3.84 %)	3,370 (18.39 %)	n/a	47.83 (100.00 %)	27 (0.00 %)	27 (0.00 %)	41 (100.00 %)	3,736 (0.93 %)	1,407 (0.39 %)	69,039 (8.65 %)	1 (0.01 %)	406 (0.39 %)	4,808 (20.25 %)	3,041 (8.27 %)
484	basidiomycetes C.gattii (EJB2 2015) GCA_000835745.1	n/a	6,908 (58.23 %)	930 (3.86 %)	4,794 (25.58 %)	n/a	47.91 (99.21 %)	65 (0.78 %)	65 (0.78 %)	347 (99.22 %)	4,079 (1.17 %)	1,474 (0.37 %)	66,384 (8.11 %)	1 (0.01 %)	133 (0.05 %)	4,835 (21.05 %)	3,106 (8.61 %)
485	basidiomycetes C.gattii (NT-10 2015) GCA_000935105.1	n/a	6,987 (57.66 %)	964 (3.88 %)	4,832 (25.12 %)	n/a	47.89 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	226 (100.00 %)	4,167 (2.12 %)	1,556 (0.35 %)	55,064 (7.92 %)	0 (0 %)	151 (0.07 %)	4,893 (21.11 %)	3,458 (10.24 %)
486	basidiomycetes C.gattii VGV (MF34 2019) GCA_009650685.1	n/a	6,321 (58.02 %)	937 (3.76 %)	3,483 (18.54 %)	n/a	47.89 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	15 (100.00 %)	4,125 (1.48 %)	1,518 (0.37 %)	68,697 (8.30 %)	0 (0 %)	412 (0.49 %)	4,955 (21.28 %)	3,229 (8.85 %)
487	basidiomycetes C.gattii WM276 GCF_000185945.1	6,565 (55.63 %)	n/a	998 (3.96 %)	4,869 (25.02 %)	n/a	47.88 (99.93 %)	27 (0.07 %)	27 (0.07 %)	41 (99.93 %)	4,363 (2.64 %)	1,626 (0.40 %)	35,258 (6.40 %)	0 (0 %)	590 (0.49 %)	4,923 (21.36 %)	4,003 (13.66 %)
488	basidiomycetes C.neoformans (JEC21 2005 refseq) GCF_000091045.1	6,863 (68.12 %)	n/a	958 (3.66 %)	3,784 (19.12 %)	n/a	48.54 (99.99 %)	85 (0.01 %)	85 (0.01 %)	99 (99.99 %)	4,953 (5.25 %)	1,808 (0.52 %)	68,717 (8.41 %)	2 (0.00 %)	1,433 (1.21 %)	5,128 (28.73 %)	3,532 (11.09 %)
489	basidiomycetes C.neoformans (VNII 2022) GCA_022832995.1	n/a	6,698 (58.04 %)	958 (3.63 %)	3,811 (20.00 %)	n/a	48.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14 (100.00 %)	4,850 (1.13 %)	2,025 (0.53 %)	66,168 (8.42 %)	0 (0 %)	1,074 (1.68 %)	5,317 (24.64 %)	3,747 (10.67 %)
490	basidiomycetes C.neoformans var. grubii (H99 2018) GCA_003011985.1	n/a	n/a	936 (3.60 %)	3,912 (19.77 %)	n/a	48.23 (100.00 %)	0 (0 %)	62 (0.00 %)	14 (100.00 %)	5,131 (4.21 %)	1,848 (0.45 %)	71,222 (8.67 %)	0 (0 %)	1,120 (1.00 %)	5,233 (24.67 %)	3,557 (10.05 %)
491	basidiomycetes C.neoformans var. grubii (KN99 2017) GCA_002216725.1	n/a	7,819 (72.40 %)	944 (3.61 %)	3,921 (19.97 %)	n/a	48.21 (100.00 %)	0 (0 %)	77 (0.00 %)	15 (100.00 %)	5,129 (4.02 %)	1,850 (0.47 %)	69,670 (8.47 %)	0 (0 %)	1,112 (0.95 %)	5,226 (24.53 %)	3,587 (10.17 %)
492	basidiomycetes C.neoformans var. grubii H99 GCF_000149245.1	9,027 (75.51 %)	n/a	943 (3.62 %)	3,928 (19.96 %)	n/a	48.21 (100.00 %)	0 (0 %)	78 (0.00 %)	15 (100.00 %)	5,118 (4.02 %)	1,847 (0.47 %)	69,629 (8.47 %)	0 (0 %)	1,112 (0.95 %)	5,228 (24.57 %)	3,585 (10.16 %)
493	basidiomycetes C.neoformans var. neoformans (XL280 2017) GCA_002216205.1	n/a	n/a	944 (3.58 %)	3,791 (19.07 %)	n/a	48.54 (100.00 %)	0 (0 %)	62 (0.00 %)	37 (100.00 %)	4,950 (5.24 %)	1,808 (0.52 %)	68,680 (8.41 %)	0 (0 %)	1,421 (1.21 %)	5,140 (28.57 %)	3,512 (11.02 %)
494	basidiomycetes C.neoformans var. neoformans B-3501A GCF_000149385.1	6,578 (57.17 %)	n/a	934 (3.63 %)	3,731 (19.14 %)	n/a	48.47 (94.01 %)	56 (5.99 %)	58 (5.99 %)	70 (94.01 %)	4,585 (3.09 %)	1,651 (0.42 %)	74,295 (8.21 %)	0 (0 %)	603 (0.53 %)	5,077 (25.93 %)	3,351 (9.69 %)
495	basidiomycetes C.tetragattii (IND107 2024) GCA_000835755.2	n/a	6,738 (58.56 %)	945 (3.79 %)	3,403 (18.40 %)	n/a	47.90 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	15 (100.00 %)	3,939 (1.00 %)	1,508 (0.38 %)	69,273 (8.42 %)	0 (0 %)	405 (0.48 %)	4,884 (21.59 %)	3,162 (8.79 %)
496	basidiomycetes C.tetragattii (IND107 2024) GCF_000835755.1	6,654 (58.52 %)	n/a	945 (3.79 %)	3,403 (18.40 %)	n/a	47.90 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	15 (100.00 %)	3,939 (1.00 %)	1,508 (0.38 %)	69,273 (8.42 %)	0 (0 %)	405 (0.48 %)	4,884 (21.59 %)	3,162 (8.79 %)
497	basidiomycetes K.bestiolae (CBS 10118 2024 genbank) GCA_000512585.3	n/a	9,175 (54.34 %)	918 (2.66 %)	4,907 (18.38 %)	n/a	47.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	7,245 (1.32 %)	2,141 (0.47 %)	97,927 (9.78 %)	0 (0 %)	863 (0.56 %)	4,995 (11.17 %)	3,011 (4.94 %)
498	basidiomycetes K.bestiolae (CBS 10118 2024 refseq) GCF_000512585.2	9,159 (54.33 %)	n/a	918 (2.66 %)	4,907 (18.38 %)	n/a	47.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	7,245 (1.32 %)	2,141 (0.47 %)	97,927 (9.78 %)	0 (0 %)	863 (0.56 %)	4,995 (11.17 %)	3,011 (4.94 %)
499	basidiomycetes K.dejecticola (CBS 10117 2024 genbank) GCA_000512565.3	n/a	8,696 (55.58 %)	910 (2.69 %)	4,861 (19.78 %)	n/a	48.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	7,778 (1.42 %)	2,452 (0.43 %)	86,630 (7.97 %)	0 (0 %)	812 (0.23 %)	3,644 (14.24 %)	3,514 (7.22 %)
500	basidiomycetes K.dejecticola (v2 CBS 10117 2024 refseq) GCF_000512565.2	8,672 (55.58 %)	n/a	910 (2.69 %)	4,861 (19.78 %)	n/a	48.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	7,778 (1.42 %)	2,452 (0.43 %)	86,630 (7.97 %)	0 (0 %)	812 (0.23 %)	3,644 (14.24 %)	3,514 (7.22 %)
501	basidiomycetes K.heveanensis (CBS 569 2016) GCA_000507425.3	n/a	8,002 (50.40 %)	843 (2.39 %)	2,910 (12.30 %)	n/a	51.91 (99.75 %)	25 (0.24 %)	25 (0.24 %)	267 (99.76 %)	8,871 (1.45 %)	2,787 (0.45 %)	109,027 (9.58 %)	5 (0.04 %)	39 (0.01 %)	327 (98.25 %)	397 (1.00 %)
502	basidiomycetes K.mangroviensis (v2 CBS 8507 2024 genbank) GCA_000507465.4	n/a	8,582 (55.68 %)	886 (2.74 %)	5,392 (21.25 %)	n/a	44.92 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4 (100.00 %)	6,585 (1.21 %)	1,546 (0.27 %)	104,495 (10.38 %)	0 (0 %)	1,321 (0.50 %)	2,335 (5.10 %)	1,396 (2.19 %)
503	basidiomycetes K.mangroviensis (v2 CBS 8507 2024 refseq) GCF_000507465.2	8,559 (55.66 %)	n/a	886 (2.74 %)	5,392 (21.25 %)	n/a	44.92 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4 (100.00 %)	6,585 (1.21 %)	1,546 (0.27 %)	104,495 (10.38 %)	0 (0 %)	1,321 (0.50 %)	2,335 (5.10 %)	1,396 (2.19 %)
504	basidiomycetes L.tigrinus (ALCF2SS1-7 2018) GCA_003813185.1	n/a	15,677 (55.83 %)	992 (1.75 %)	1,661 (4.09 %)	n/a	56.14 (99.10 %)	296 (0.90 %)	296 (0.90 %)	503 (99.10 %)	7,276 (0.85 %)	3,745 (0.48 %)	132,886 (7.59 %)	12 (0.01 %)	2,232 (0.61 %)	324 (98.37 %)	299 (92.33 %)
505	basidiomycetes L.tigrinus (ALCF2SS1-7 2018) GCF_003813185.1	15,367 (55.75 %)	n/a	992 (1.75 %)	1,661 (4.09 %)	n/a	56.14 (99.10 %)	296 (0.90 %)	296 (0.90 %)	503 (99.10 %)	7,245 (0.83 %)	3,745 (0.48 %)	132,886 (7.59 %)	12 (0.01 %)	2,232 (0.61 %)	324 (98.37 %)	299 (92.33 %)
506	basidiomycetes M.globosa (v2 CBS 7966 2007) GCF_000181695.2	4,278 (69.41 %)	n/a	1,063 (8.81 %)	2,586 (44.99 %)	n/a	52.06 (100.00 %)	22 (0.00 %)	22 (0.00 %)	84 (100.00 %)	1,762 (0.80 %)	715 (0.47 %)	22,155 (4.71 %)	0 (0 %)	240 (0.25 %)	129 (94.62 %)	106 (34.46 %)
507	basidiomycetes M.pachydermatis GCF_001278385.1	4,202 (78.54 %)	n/a	1,049 (9.50 %)	2,386 (45.30 %)	n/a	55.07 (99.99 %)	0 (0 %)	27 (0.01 %)	91 (100.00 %)	1,207 (0.77 %)	647 (0.36 %)	27,618 (6.61 %)	0 (0 %)	133 (0.15 %)	68 (65.84 %)	63 (22.60 %)
508	basidiomycetes M.restricta GCF_003290485.1	4,444 (88.53 %)	n/a	1,061 (10.52 %)	2,009 (43.77 %)	n/a	55.66 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	871 (1.10 %)	593 (0.60 %)	26,579 (7.55 %)	0 (0 %)	228 (0.43 %)	42 (17.66 %)	59 (62.36 %)
509	basidiomycetes M.restricta (CBS 7877 2018) GCA_003691605.1	n/a	4,158 (85.11 %)	1,026 (10.34 %)	2,003 (44.01 %)	n/a	55.73 (100.00 %)	0 (0 %)	4 (0.00 %)	10 (100.00 %)	821 (0.61 %)	541 (0.41 %)	29,507 (8.50 %)	0 (0 %)	119 (0.23 %)	51 (97.19 %)	63 (65.72 %)
510	basidiomycetes M.sympodialis (ATCC 42132 2017) GCA_900149145.1	n/a	4,672 (90.13 %)	973 (8.94 %)	1,485 (28.68 %)	n/a	58.94 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	1,665 (1.47 %)	1,011 (0.75 %)	42,822 (15.18 %)	0 (0 %)	331 (0.56 %)	57 (98.05 %)	55 (0.41 %)
511	basidiomycetes N.albida (JCM 2334 2016) GCA_001599735.1	n/a	n/a	869 (3.08 %)	2,486 (12.78 %)	n/a	54.06 (99.56 %)	0 (0 %)	841 (0.45 %)	74 (100.00 %)	2,576 (0.51 %)	1,677 (0.37 %)	60,552 (5.72 %)	6 (0.01 %)	198 (0.11 %)	92 (99.66 %)	85 (83.27 %)
512	basidiomycetes N.albida (NRRL Y-1402 2015) GCA_001444555.1	n/a	n/a	876 (2.57 %)	3,496 (14.42 %)	n/a	52.67 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	834 (100.00 %)	2,742 (0.54 %)	2,262 (0.47 %)	71,898 (7.31 %)	0 (0 %)	424 (0.16 %)	979 (94.74 %)	801 (28.72 %)
513	basidiomycetes P.chrysosporium (RP-78 2004) GCA_000167175.1	n/a	n/a	985 (2.27 %)	2,271 (7.48 %)	n/a	56.97 (99.99 %)	264 (0.00 %)	264 (0.00 %)	1,587 (100.00 %)	4,786 (1.39 %)	1,459 (0.26 %)	120,638 (10.12 %)	0 (0 %)	507 (0.20 %)	1,156 (97.01 %)	835 (59.41 %)
514	basidiomycetes R.mellea (SZMC22713 2019) GCA_004355085.1	n/a	17,193 (52.69 %)	1,094 (1.77 %)	4,684 (10.67 %)	n/a	48.96 (97.26 %)	1,004 (2.75 %)	1,004 (2.75 %)	1,852 (97.25 %)	5,991 (0.61 %)	3,811 (0.69 %)	107,772 (5.24 %)	35 (0.08 %)	4,036 (1.00 %)	1,114 (5.64 %)	981 (1.63 %)
515	basidiomycetes S.commune (v2 H4-8 2022) GCF_000143185.2	16,193 (60.71 %)	n/a	906 (1.57 %)	993 (2.87 %)	n/a	57.53 (99.85 %)	47 (0.15 %)	47 (0.15 %)	72 (99.85 %)	7,378 (1.00 %)	8,843 (1.31 %)	180,972 (12.04 %)	0 (0 %)	6,108 (2.34 %)	40 (99.86 %)	42 (5.62 %)
516	basidiomycetes T.asahii var. asahii CBS 2479 GCF_000293215.1	8,300 (50.84 %)	n/a	885 (2.61 %)	1,323 (7.54 %)	n/a	59.58 (99.04 %)	264 (0.96 %)	264 (0.96 %)	342 (99.04 %)	6,970 (1.38 %)	3,844 (0.88 %)	116,907 (11.38 %)	5 (0.02 %)	576 (0.79 %)	78 (72.13 %)	68 (54.56 %)
517	Bastrovirus 7 (2017) GCF_002285025.1	n/a	3 (97.74 %)	n/a	n/a	n/a	58.36 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (52.22 %)	4 (52.22 %)
518	Bat sapovirus (Bat-SaV/Limbe65/CAM/2014 2017) GCF_002005625.1	n/a	2 (97.81 %)	n/a	n/a	n/a	46.98 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.24 %)	n/a	5 (0.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (5.51 %)	1 (5.51 %)
519	Bat sapovirus (TLC58/HK 2012) GCF_000894635.1	n/a	2 (96.96 %)	n/a	n/a	n/a	60.16 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.49 %)	n/a	6 (0.66 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (94.41 %)	1 (94.41 %)
520	bed bug GCF_000648675.2	26,639 (5.60 %)	n/a	3,756 (0.66 %)	9,989 (2.63 %)	28,065 (5.65 %)	34.82 (99.91 %)	1,295 (0.09 %)	21,364 (0.09 %)	2,869 (99.91 %)	264,973 (2.97 %)	166,587 (3.52 %)	4,017,900 (42.90 %)	29 (0.00 %)	226,793 (3.28 %)	24,731 (1.89 %)	13,732 (1.00 %)
521	Beiji nairovirus (H160 2023) GCF_029888155.1	n/a	2 (86.68 %)	n/a	n/a	n/a	43.91 (99.97 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)	4 (99.99 %)	5 (0.59 %)	n/a	17 (2.03 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
522	Betacoronavirus (England 1 H123990006 2018) GCF_002816195.1	n/a	12 (97.48 %)	n/a	n/a	n/a	41.18 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.12 %)	n/a	2 (0.06 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
523	Bhanja virus (ibAr2709 2015) GCF_001019855.1	n/a	4 (96.85 %)	n/a	n/a	n/a	45.34 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.56 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
524	black shank of tobacco agent (INRA-310 2013) GCF_000247585.1	27,944 (56.49 %)	n/a	1,354 (1.75 %)	17,918 (53.20 %)	n/a	49.51 (65.42 %)	8,083 (34.61 %)	8,083 (34.61 %)	8,791 (65.39 %)	7,133 (2.38 %)	3,777 (0.27 %)	183,621 (4.70 %)	259 (0.41 %)	4,815 (1.29 %)	6,081 (21.10 %)	4,935 (4.90 %)
525	black-legged tick (JCVI 2018) GCF_002892825.2	36,815 (2.39 %)	n/a	4,242 (0.16 %)	128,091 (7.64 %)	n/a	45.96 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	6,476 (100.00 %)	5,402,589 (63.53 %)	701,137 (4.07 %)	10,598,458 (40.46 %)	0 (0 %)	514,952 (2.17 %)	139,352 (7.73 %)	229,854 (6.67 %)
526	black-legged tick (U.Maryland v2 2021) GCF_016920785.2	38,578 (2.49 %)	n/a	3,961 (0.14 %)	127,569 (7.44 %)	47,545 (2.83 %)	46.16 (99.99 %)	0 (0 %)	2,665 (0.01 %)	648 (100.00 %)	1,125,143 (4.95 %)	733,708 (6.53 %)	10,738,669 (42.56 %)	9 (0.00 %)	717,579 (2.90 %)	70,276 (4.67 %)	228,418 (7.27 %)
527	black-legged tick (Wikel colony 2008 refseq) GCF_000208615.1	20,467 (1.41 %)	n/a	3,432 (0.19 %)	99,086 (4.65 %)	n/a	45.22 (78.65 %)	201,145 (21.35 %)	201,145 (21.35 %)	570,637 (78.65 %)	605,765 (2.71 %)	365,918 (1.61 %)	8,574,437 (27.02 %)	124 (0.01 %)	n/a	345,141 (14.15 %)	189,691 (5.45 %)
528	blackleg of rapeseed fungus GCF_000230375.1	12,469 (35.66 %)	n/a	1,530 (2.64 %)	7,522 (22.36 %)	n/a	45.19 (97.51 %)	0 (0 %)	1,658 (2.50 %)	76 (100.00 %)	25,067 (10.98 %)	14,076 (1.63 %)	77,406 (32.63 %)	1 (0.00 %)	29,154 (5.95 %)	3,054 (42.67 %)	3,995 (38.44 %)
529	blastocladiomycotan A.macrogynus (ATCC 38327 2010) GCA_000151295.1	n/a	19,955 (59.87 %)	1,659 (2.12 %)	1,036 (2.08 %)	n/a	61.59 (92.29 %)	8,872 (7.77 %)	8,872 (7.77 %)	8,973 (92.23 %)	29,871 (5.36 %)	11,776 (1.11 %)	411,240 (21.09 %)	28 (0.05 %)	12,789 (5.00 %)	554 (94.59 %)	322 (0.39 %)
530	Blastocrithidia sp. (p57 2023) GCA_028554745.1	n/a	n/a	630 (1.48 %)	1,140 (5.42 %)	n/a	34.74 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	78 (100.00 %)	23,153 (4.06 %)	4,394 (1.92 %)	184,674 (25.76 %)	0 (0 %)	5,292 (4.16 %)	990 (1.68 %)	904 (1.42 %)
531	Blechomonas ayalai (B08-376 2021) GCA_020509355.1	n/a	n/a	556 (1.62 %)	3,018 (55.04 %)	n/a	54.94 (99.40 %)	0 (0 %)	4,093 (0.67 %)	545 (100.00 %)	3,394 (0.52 %)	1,022 (0.70 %)	88,855 (9.37 %)	1 (0.00 %)	3,775 (1.47 %)	1,095 (93.21 %)	1,178 (55.27 %)
532	bloodfluke planorb (primary hap 2022) GCF_947242115.1	60,431 (10.10 %)	n/a	3,669 (0.35 %)	14,441 (4.29 %)	n/a	36.15 (100.00 %)	0 (0 %)	157 (0.00 %)	43 (100.00 %)	539,820 (3.50 %)	563,251 (14.02 %)	5,484,695 (46.47 %)	1 (0.00 %)	918,824 (7.29 %)	18,791 (0.98 %)	5,834 (0.32 %)
533	bloodfluke planorb (v2 BB02 2013 genbank) GCA_000457365.2	n/a	n/a	3,378 (0.29 %)	23,684 (2.94 %)	n/a	35.99 (98.05 %)	76,903 (1.91 %)	76,903 (1.91 %)	406,924 (98.09 %)	587,583 (3.57 %)	749,212 (9.41 %)	6,921,847 (43.04 %)	434 (0.03 %)	n/a	16,561 (0.63 %)	6,013 (0.25 %)
534	bloodfluke planorb (v2 BB02 2013 refseq) GCF_000457365.2	41,994 (5.93 %)	n/a	3,378 (0.29 %)	23,693 (2.94 %)	n/a	35.99 (98.05 %)	76,903 (1.91 %)	76,903 (1.91 %)	406,925 (98.09 %)	587,594 (3.57 %)	749,214 (9.41 %)	6,922,018 (43.04 %)	434 (0.03 %)	n/a	16,561 (0.63 %)	6,013 (0.25 %)
535	Bocaparvovirus primate1 (Salvador1 2023) GCF_003033285.1	n/a	9 (85.80 %)	n/a	n/a	n/a	42.31 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.52 %)	n/a	6 (1.64 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
536	Bodo saltans (Lake Konstanz 2015) GCA_001460835.1	n/a	19,944 (78.81 %)	717 (1.12 %)	5,396 (56.98 %)	n/a	51.79 (96.74 %)	0 (0 %)	2,523 (3.28 %)	2,247 (100.00 %)	10,955 (1.09 %)	6,099 (2.65 %)	190,644 (11.32 %)	103 (0.11 %)	11,351 (3.43 %)	3,448 (73.32 %)	3,077 (6.80 %)
537	Bordetella pertussis (H640 2019) GCF_004008975.1	n/a	3,964 (92.05 %)	n/a	n/a	n/a	67.72 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	262 (1.08 %)	29,312 (24.13 %)	0 (0 %)	311 (3.98 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
538	Borna disease virus 2 (No/98 2016) GCF_000847565.3	n/a	6 (97.61 %)	n/a	n/a	n/a	50.10 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.43 %)	n/a	3 (0.24 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (11.20 %)	3 (11.20 %)
539	Bourbon virus (MO-2013-2499 2023) GCF_023156645.1	n/a	6 (95.52 %)	n/a	n/a	n/a	45.81 (99.91 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	7 (99.99 %)	3 (0.00 %)	1 (0.36 %)	5 (0.62 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
540	Bovine adeno-associated virus (2004) GCF_000846165.1	n/a	2 (86.17 %)	n/a	n/a	n/a	53.77 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.43 %)	0 (0 %)	1 (6.35 %)	2 (50.44 %)	2 (50.44 %)
541	Bovine calicivirus strain (Kirklareli 2016) GCF_001714355.1	n/a	2 (98.04 %)	n/a	n/a	n/a	58.37 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.09 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (96.34 %)	1 (96.34 %)
542	Bowe virus (VN1512 2017) GCF_002118085.1	n/a	3 (94.38 %)	n/a	n/a	n/a	36.23 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (1.00 %)	1 (0.29 %)	12 (2.09 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
543	brain-eating amoeba (ATCC 30863 2013) GCA_000499105.1	n/a	n/a	896 (2.15 %)	1,326 (21.27 %)	n/a	36.82 (98.54 %)	0 (0 %)	1,212 (1.47 %)	574 (100.00 %)	10,605 (1.66 %)	3,384 (0.54 %)	207,411 (18.94 %)	6 (0.00 %)	502 (0.20 %)	11 (0.01 %)	7 (0.01 %)
544	brain-eating amoeba (ATCC 30894 2019) GCF_008403515.1	13,816 (74.49 %)	n/a	936 (2.12 %)	1,171 (20.52 %)	n/a	36.88 (99.99 %)	0 (0 %)	373 (0.01 %)	83 (100.00 %)	12,436 (2.15 %)	3,951 (1.27 %)	223,907 (19.88 %)	23 (0.02 %)	6,342 (1.05 %)	10 (0.01 %)	6 (0.00 %)
545	brain-eating amoeba (Ty 2020) GCA_014843625.1	n/a	n/a	897 (2.13 %)	1,113 (20.70 %)	n/a	36.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	37 (100.00 %)	11,898 (2.17 %)	3,679 (0.70 %)	214,175 (19.73 %)	0 (0 %)	1,004 (0.29 %)	10 (0.01 %)	6 (0.00 %)
546	brown dog tick (v1.4 Rsan-2018 2022) GCF_013339695.2	36,780 (2.31 %)	n/a	3,856 (0.13 %)	116,103 (5.94 %)	n/a	46.86 (99.89 %)	0 (0 %)	10,358 (0.11 %)	2,327 (100.00 %)	900,088 (2.28 %)	716,302 (3.47 %)	10,603,638 (42.78 %)	1 (0.00 %)	726,544 (3.31 %)	13,178 (0.97 %)	233,019 (6.31 %)
547	Brucella anthropi (PBO 2020) GCF_015326295.1	n/a	4,592 (87.94 %)	n/a	n/a	n/a	56.11 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	54 (0.10 %)	19,060 (6.82 %)	0 (0 %)	36 (0.11 %)	3 (99.99 %)	3 (99.99 %)
548	Brucella canis (ATCC 23365 2007) GCF_000018525.1	n/a	3,224 (88.02 %)	n/a	n/a	n/a	57.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	90 (0.15 %)	16,838 (9.39 %)	0 (0 %)	48 (0.21 %)	2 (99.97 %)	2 (99.97 %)
549	Brucella ceti (DDE002 2025) GCF_047324105.1	n/a	3,400 (87.97 %)	n/a	n/a	n/a	57.20 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	92 (0.17 %)	16,429 (9.16 %)	0 (0 %)	63 (0.51 %)	2 (100.00 %)	2 (99.99 %)
550	Brucella ciceri (DSM 22292 2024) GCF_041930145.1	n/a	4,379 (87.91 %)	n/a	n/a	n/a	57.74 (99.99 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	44 (100.00 %)	n/a	104 (0.16 %)	21,672 (8.57 %)	1 (0.00 %)	27 (0.05 %)	43 (99.68 %)	43 (99.64 %)
551	Brucella cytisi (ESC1 2024) GCF_038433355.1	n/a	5,342 (87.16 %)	n/a	n/a	n/a	55.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	55 (100.00 %)	n/a	68 (0.11 %)	19,527 (6.67 %)	0 (0 %)	51 (0.12 %)	55 (99.83 %)	54 (97.61 %)
552	Brucella daejeonensis (DSM 26944 2020) GCF_014199265.1	n/a	4,522 (87.87 %)	n/a	n/a	n/a	58.49 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	55 (100.00 %)	n/a	141 (0.20 %)	26,429 (10.70 %)	0 (0 %)	67 (0.16 %)	56 (99.67 %)	50 (82.65 %)
553	Brucella endophytica (CGMCC 1.15082 2020) GCF_014640615.1	n/a	4,778 (87.23 %)	n/a	n/a	n/a	60.73 (99.99 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	83 (100.00 %)	n/a	157 (0.25 %)	34,207 (14.25 %)	0 (0 %)	276 (0.41 %)	81 (99.70 %)	61 (48.22 %)
554	Brucella gallinifaecis (ISO 196 2019) GCF_006476605.1	n/a	3,550 (87.36 %)	n/a	n/a	n/a	50.98 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	38 (100.00 %)	n/a	77 (0.11 %)	9,819 (4.34 %)	0 (0 %)	58 (0.36 %)	43 (73.86 %)	25 (17.53 %)
555	Brucella grignonensis (OgA9a 2017) GCF_002252505.1	n/a	4,675 (87.66 %)	n/a	n/a	n/a	54.15 (99.99 %)	12 (0.00 %)	12 (0.00 %)	181 (100.00 %)	n/a	52 (0.06 %)	14,494 (5.15 %)	0 (0 %)	46 (0.09 %)	166 (99.00 %)	163 (86.60 %)
556	Brucella haematophila (CCUG 38531 2019) GCF_005938105.1	n/a	5,199 (87.70 %)	n/a	n/a	n/a	56.67 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	55 (100.00 %)	n/a	89 (0.08 %)	25,599 (9.08 %)	0 (0 %)	48 (0.11 %)	57 (99.87 %)	47 (79.06 %)
557	Brucella intermedia (NCTC12171 2018) GCF_900454225.1	n/a	4,513 (88.09 %)	n/a	n/a	n/a	57.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	109 (0.26 %)	22,125 (8.46 %)	0 (0 %)	40 (0.13 %)	3 (99.98 %)	3 (99.98 %)
558	Brucella lupini (LUP21 2017) GCF_002252535.1	n/a	5,361 (87.93 %)	n/a	n/a	n/a	56.35 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	67 (100.00 %)	n/a	68 (0.05 %)	23,935 (8.11 %)	0 (0 %)	12 (0.02 %)	64 (99.83 %)	59 (95.98 %)
559	Brucella melitensis bv. 1 str. (16M 2001) GCF_000007125.1	n/a	3,237 (88.03 %)	n/a	n/a	n/a	57.22 (100.00 %)	10 (0.00 %)	10 (0.00 %)	12 (100.00 %)	n/a	89 (0.15 %)	17,332 (9.71 %)	0 (0 %)	43 (0.21 %)	2 (99.95 %)	2 (99.94 %)
560	Brucella microti (CCM 4915 2009) GCF_000022745.1	n/a	3,258 (88.05 %)	n/a	n/a	n/a	57.25 (100.00 %)	5 (0.00 %)	5 (0.00 %)	7 (100.00 %)	n/a	117 (0.29 %)	17,449 (9.65 %)	0 (0 %)	85 (0.28 %)	2 (99.97 %)	2 (99.97 %)
561	Brucella neotomae (NCTC10084 2018) GCF_900446125.1	n/a	3,266 (88.02 %)	n/a	n/a	n/a	57.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	88 (0.17 %)	17,114 (9.49 %)	0 (0 %)	56 (0.23 %)	3 (99.97 %)	3 (99.97 %)
562	Brucella oryzae (DSM 17471 2024) GCF_041929965.1	n/a	4,570 (88.02 %)	n/a	n/a	n/a	56.17 (99.99 %)	5 (0.01 %)	5 (0.01 %)	89 (99.99 %)	n/a	77 (0.08 %)	20,030 (7.47 %)	2 (0.01 %)	36 (0.08 %)	78 (99.15 %)	71 (96.95 %)
563	Brucella ovis (ATCC 25840 2007) GCF_000016845.1	n/a	3,267 (88.10 %)	n/a	n/a	n/a	57.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	75 (0.16 %)	15,924 (9.29 %)	0 (0 %)	28 (0.27 %)	2 (99.97 %)	2 (99.97 %)
564	Brucella pecoris (08RB2639 2019) GCF_006376675.1	n/a	4,885 (88.03 %)	n/a	n/a	n/a	55.95 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	61 (100.00 %)	n/a	93 (0.09 %)	19,689 (6.82 %)	0 (0 %)	44 (0.08 %)	61 (99.82 %)	60 (98.83 %)
565	Brucella pituitosa (BU72 2017) GCF_002803535.1	n/a	4,609 (87.20 %)	n/a	n/a	n/a	53.44 (99.98 %)	0 (0 %)	12 (0.02 %)	9 (100.00 %)	n/a	51 (0.05 %)	14,215 (4.92 %)	1 (0.01 %)	49 (0.18 %)	13 (98.55 %)	11 (98.52 %)
566	Brucella pseudintermedia (ASAG-D25 2022) GCF_025118245.1	n/a	4,165 (88.08 %)	n/a	n/a	n/a	57.93 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	80 (0.11 %)	22,420 (9.63 %)	0 (0 %)	43 (0.17 %)	2 (100.00 %)	2 (100.00 %)
567	Brucella pseudogrignonensis (ESL2 2022) GCF_022024335.1	n/a	4,662 (87.57 %)	n/a	n/a	n/a	53.87 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	78 (0.17 %)	14,866 (5.02 %)	0 (0 %)	80 (0.20 %)	3 (99.99 %)	3 (99.99 %)
568	Brucella rhizosphaerae (PR17 2017) GCF_002252475.1	n/a	4,625 (87.78 %)	n/a	n/a	n/a	53.01 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	36 (100.00 %)	n/a	107 (0.14 %)	13,240 (4.40 %)	0 (0 %)	31 (0.07 %)	33 (99.78 %)	27 (78.81 %)
569	Brucella suis (1330 2005) GCF_000007505.1	n/a	3,238 (88.06 %)	n/a	n/a	n/a	57.25 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	79 (0.13 %)	16,976 (9.43 %)	0 (0 %)	44 (0.21 %)	2 (99.97 %)	2 (99.97 %)
570	Brucella thiophenivorans (DSM 7216 2017) GCF_002252445.1	n/a	4,144 (87.49 %)	n/a	n/a	n/a	51.65 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	79 (100.00 %)	n/a	41 (0.06 %)	12,078 (4.55 %)	0 (0 %)	24 (0.05 %)	63 (92.86 %)	38 (6.01 %)
571	Brucella tritici (TA93 2019) GCF_008932285.1	n/a	4,815 (88.12 %)	n/a	n/a	n/a	55.78 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	44 (100.00 %)	n/a	64 (0.13 %)	18,403 (6.35 %)	0 (0 %)	50 (0.13 %)	36 (96.28 %)	27 (95.94 %)
572	Bruges virus (BE/Vieux-Genappe/TE/2013/1 2017) GCF_002117675.1	n/a	3 (93.06 %)	n/a	n/a	n/a	38.99 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.47 %)	n/a	8 (1.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
573	budding yeast C.albicans (WO-1 2009) GCA_000149445.2	n/a	5,875 (57.23 %)	1,771 (9.77 %)	4,526 (47.88 %)	n/a	33.47 (99.61 %)	69 (0.39 %)	69 (0.39 %)	86 (99.61 %)	13,498 (4.68 %)	3,653 (1.16 %)	117,961 (22.65 %)	0 (0 %)	678 (0.64 %)	24 (0.05 %)	21 (0.04 %)
574	budding yeast C.albicans SC5314 GCF_000182965.3	6,119 (62.70 %)	n/a	1,784 (9.87 %)	4,505 (49.12 %)	n/a	33.46 (99.96 %)	1,764 (0.06 %)	1,764 (0.06 %)	1,772 (99.94 %)	13,736 (4.51 %)	3,915 (1.19 %)	117,907 (23.01 %)	2 (0.00 %)	485 (0.30 %)	18 (0.05 %)	20 (0.05 %)
575	budding yeast C.auris (6684 2015 refseq) GCF_001189475.1	7,461 (64.95 %)	n/a	1,948 (12.61 %)	4,658 (59.89 %)	n/a	45.12 (98.69 %)	0 (0 %)	689 (1.33 %)	99 (100.00 %)	3,478 (1.23 %)	2,281 (0.83 %)	48,703 (8.19 %)	27 (0.12 %)	258 (0.23 %)	1,579 (6.36 %)	1,147 (4.11 %)
576	budding yeast C.auris (B11220 2019) GCF_003013715.1	5,335 (64.90 %)	n/a	1,953 (12.68 %)	4,668 (59.97 %)	n/a	45.33 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	2,154 (0.72 %)	1,400 (0.51 %)	47,813 (7.96 %)	0 (0 %)	841 (0.47 %)	1,607 (6.89 %)	1,183 (4.39 %)
577	budding yeast C.auris (B11221 2017 refseq) GCF_002775015.1	5,558 (64.34 %)	n/a	2,030 (12.92 %)	5,039 (61.20 %)	n/a	45.32 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	20 (100.00 %)	3,478 (2.43 %)	2,436 (0.80 %)	28,524 (6.96 %)	0 (0 %)	1,194 (1.58 %)	1,757 (7.37 %)	1,331 (4.92 %)
578	budding yeast C.auris (B11243 2018) GCA_003014415.1	n/a	5,595 (65.97 %)	1,946 (12.60 %)	4,673 (60.01 %)	n/a	45.05 (99.97 %)	0 (0 %)	55 (0.03 %)	238 (100.00 %)	3,312 (1.30 %)	2,782 (1.17 %)	48,932 (8.72 %)	0 (0 %)	737 (0.23 %)	1,595 (6.48 %)	1,145 (4.08 %)
579	budding yeast C.auris (B11245 2019) GCA_008275145.1	n/a	5,675 (61.93 %)	1,936 (12.41 %)	4,662 (55.97 %)	n/a	45.33 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	2,818 (1.36 %)	1,519 (0.64 %)	45,147 (7.64 %)	0 (0 %)	1,479 (0.73 %)	1,624 (7.28 %)	1,239 (4.38 %)
580	budding yeast C.auris (B8441 2024) GCA_002759435.3	n/a	5,594 (65.73 %)	1,947 (12.41 %)	4,679 (59.89 %)	n/a	45.22 (100.00 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	7 (100.00 %)	3,563 (1.30 %)	2,422 (0.89 %)	49,467 (8.45 %)	0 (0 %)	420 (0.31 %)	1,579 (6.90 %)	1,192 (4.26 %)
581	budding yeast C.dubliniensis CD36 GCF_000026945.1	5,856 (61.01 %)	n/a	1,759 (9.56 %)	4,389 (46.85 %)	n/a	33.25 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	20,534 (5.61 %)	7,304 (2.21 %)	120,645 (24.59 %)	0 (0 %)	1,061 (0.74 %)	19 (0.04 %)	14 (0.03 %)
582	budding yeast C.duobushaemulonis GCF_002926085.2	5,184 (63.68 %)	n/a	1,936 (12.10 %)	4,875 (58.49 %)	n/a	46.84 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	1,890 (0.83 %)	2,059 (0.97 %)	49,855 (7.97 %)	0 (0 %)	303 (0.31 %)	2,290 (13.87 %)	1,609 (7.68 %)
583	budding yeast C.fabianii (65 2017) GCA_001983305.1	n/a	5,509 (64.34 %)	2,205 (14.54 %)	5,267 (63.29 %)	n/a	44.40 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25 (100.00 %)	3,616 (1.56 %)	2,634 (0.92 %)	55,063 (9.84 %)	0 (0 %)	568 (0.49 %)	1,106 (3.96 %)	815 (2.69 %)
584	budding yeast C.haemuloni GCF_002926055.2	5,256 (62.94 %)	n/a	1,918 (11.43 %)	5,065 (59.28 %)	n/a	45.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	3,560 (1.20 %)	2,556 (0.99 %)	60,483 (10.12 %)	0 (0 %)	237 (0.21 %)	1,138 (3.47 %)	695 (1.91 %)
585	budding yeast C.lusitaniae (ATCC 42720 2009 refseq) GCF_000003835.1	5,935 (65.70 %)	n/a	1,957 (12.86 %)	4,335 (54.85 %)	n/a	44.50 (99.71 %)	79 (0.29 %)	79 (0.29 %)	88 (99.71 %)	2,265 (1.18 %)	4,036 (1.77 %)	48,188 (8.66 %)	0 (0 %)	697 (0.55 %)	1,474 (15.82 %)	1,218 (9.79 %)
586	budding yeast C.metapsilosis (2021) GCA_017655625.1	n/a	5,743 (68.91 %)	1,855 (11.17 %)	5,347 (64.48 %)	n/a	38.08 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	9 (100.00 %)	7,283 (2.20 %)	3,193 (1.74 %)	77,436 (14.44 %)	0 (0 %)	1,702 (1.29 %)	21 (0.04 %)	15 (0.03 %)
587	budding yeast C.parapsilosis GCF_000182765.1	5,814 (67.48 %)	n/a	1,827 (11.13 %)	5,060 (62.06 %)	n/a	38.68 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	6,898 (2.17 %)	3,642 (1.29 %)	78,803 (14.05 %)	0 (0 %)	1,013 (0.86 %)	17 (0.06 %)	8 (0.02 %)
588	budding yeast C.pseudohaemulonis GCF_003013735.1	5,138 (64.79 %)	5,285 (64.88 %)	1,922 (12.05 %)	4,826 (60.69 %)	n/a	47.19 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	36 (100.00 %)	1,726 (0.64 %)	1,868 (0.89 %)	51,053 (8.14 %)	0 (0 %)	236 (0.16 %)	2,401 (15.70 %)	1,662 (8.66 %)
589	budding yeast C.tropicalis (MYA-3404 2020) GCA_013177555.1	n/a	n/a	1,750 (9.58 %)	4,853 (53.27 %)	n/a	33.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	14,750 (4.25 %)	4,538 (1.99 %)	117,410 (22.63 %)	0 (0 %)	1,593 (1.41 %)	32 (0.07 %)	27 (0.06 %)
590	budding yeast C.tropicalis MYA-3404 GCF_000006335.3	6,254 (62.14 %)	n/a	1,750 (9.50 %)	4,880 (52.20 %)	n/a	33.15 (99.63 %)	104 (0.37 %)	104 (0.37 %)	128 (99.63 %)	14,671 (4.27 %)	4,342 (1.68 %)	118,814 (22.63 %)	0 (0 %)	1,514 (1.06 %)	23 (0.06 %)	21 (0.05 %)
591	budding yeast D.fabryi GCF_001447935.2	6,025 (74.09 %)	n/a	2,001 (13.79 %)	5,325 (68.48 %)	n/a	35.64 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	536 (100.00 %)	2,082 (0.86 %)	1,266 (0.48 %)	70,375 (13.11 %)	0 (0 %)	114 (0.08 %)	91 (0.28 %)	80 (0.25 %)
592	budding yeast D.hansenii CBS767 GCF_000006445.2	6,295 (74.18 %)	n/a	2,011 (13.42 %)	5,387 (68.63 %)	n/a	36.33 (99.99 %)	0 (0 %)	10 (0.01 %)	8 (100.00 %)	2,513 (1.99 %)	1,598 (0.81 %)	69,246 (12.34 %)	0 (0 %)	971 (1.11 %)	179 (0.75 %)	159 (0.64 %)
593	budding yeast D.rugosa GCF_008704595.1	5,815 (61.82 %)	n/a	1,706 (9.84 %)	3,799 (43.48 %)	n/a	49.56 (99.91 %)	0 (0 %)	324 (0.09 %)	169 (100.00 %)	2,463 (0.96 %)	2,239 (0.91 %)	55,208 (8.64 %)	24 (0.04 %)	328 (0.26 %)	579 (62.23 %)	1,113 (4.79 %)
594	budding yeast H.guilliermondii (UTAD222 2016) GCA_900119595.1	n/a	4,227 (69.97 %)	1,416 (13.28 %)	3,674 (64.29 %)	n/a	30.95 (99.98 %)	0 (0 %)	287 (0.03 %)	208 (100.00 %)	7,504 (3.36 %)	1,721 (0.85 %)	65,623 (22.65 %)	0 (0 %)	288 (0.27 %)	7 (0.02 %)	7 (0.02 %)
595	budding yeast H.uvarum (AWRI3580 2016) GCA_001747055.1	n/a	4,061 (73.19 %)	1,361 (12.92 %)	3,683 (67.02 %)	n/a	31.85 (99.97 %)	0 (0 %)	69,905 (0.86 %)	18 (100.00 %)	3,251 (1.52 %)	1,152 (1.16 %)	69,161 (18.13 %)	2 (0.00 %)	701 (0.87 %)	6 (0.02 %)	6 (0.02 %)
596	budding yeast K.lactis GCF_000002515.2	5,146 (69.17 %)	n/a	3,328 (29.03 %)	4,740 (66.81 %)	n/a	38.72 (100.00 %)	0 (0 %)	17 (0.00 %)	7 (100.00 %)	2,695 (1.37 %)	1,443 (0.68 %)	50,099 (9.97 %)	0 (0 %)	282 (0.38 %)	53 (0.14 %)	42 (0.11 %)
597	budding yeast K.marxianus (DMKU3-1042 2014 refseq) GCF_001417885.1	4,958 (68.10 %)	n/a	3,347 (28.78 %)	4,665 (66.28 %)	n/a	40.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	7,406 (3.43 %)	3,781 (1.46 %)	51,732 (11.80 %)	0 (0 %)	614 (0.85 %)	742 (4.91 %)	562 (2.75 %)
598	budding yeast L.elongisporus (NRRL YB-4239 2007 refseq) GCF_000149685.1	5,799 (57.01 %)	n/a	1,905 (9.82 %)	5,004 (52.37 %)	n/a	36.94 (99.45 %)	117 (0.56 %)	117 (0.56 %)	145 (99.44 %)	30,880 (10.91 %)	18,155 (4.10 %)	100,210 (23.18 %)	0 (0 %)	1,604 (1.36 %)	22 (0.04 %)	19 (0.04 %)
599	budding yeast M.guilliermondii ATCC 6260 GCF_000149425.1	5,920 (77.75 %)	n/a	1,998 (15.12 %)	4,688 (67.73 %)	n/a	43.76 (99.67 %)	62 (0.33 %)	62 (0.33 %)	71 (99.67 %)	1,556 (0.86 %)	2,117 (1.06 %)	39,493 (7.54 %)	0 (0 %)	301 (0.39 %)	836 (4.05 %)	605 (2.47 %)
600	budding yeast N.glabratus (ATCC 2001 2020) GCF_010111755.1	5,290 (64.34 %)	n/a	3,614 (27.43 %)	4,867 (60.19 %)	n/a	39.04 (99.99 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	14 (99.99 %)	3,500 (3.55 %)	2,843 (3.45 %)	53,094 (11.64 %)	0 (0 %)	1,148 (1.26 %)	677 (4.32 %)	589 (2.58 %)
601	budding yeast N.glabratus (BG2 2020) GCA_014217725.1	n/a	5,481 (65.25 %)	3,619 (27.29 %)	4,814 (60.63 %)	n/a	39.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	13 (100.00 %)	3,153 (1.65 %)	2,824 (3.33 %)	55,778 (11.87 %)	0 (0 %)	1,108 (1.53 %)	673 (4.07 %)	598 (2.64 %)
602	budding yeast N.glabratus (BG3993 2021) GCA_020450195.1	n/a	5,487 (65.02 %)	3,612 (27.31 %)	4,839 (60.84 %)	n/a	38.97 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	13 (100.00 %)	3,637 (3.29 %)	2,941 (3.27 %)	56,516 (11.95 %)	0 (0 %)	1,243 (1.41 %)	670 (4.02 %)	581 (2.60 %)
603	budding yeast N.glabratus (CBS 138 2008 refseq) GCF_000002545.3	5,214 (64.24 %)	n/a	3,552 (27.82 %)	4,801 (61.28 %)	n/a	38.62 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	14 (100.00 %)	2,966 (1.29 %)	2,640 (1.61 %)	61,029 (11.58 %)	0 (0 %)	805 (0.77 %)	635 (3.10 %)	567 (2.52 %)
604	budding yeast N.glabratus (DSY562 2017) GCA_002219185.1	n/a	5,539 (65.02 %)	3,606 (27.33 %)	4,822 (60.76 %)	n/a	38.91 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	19 (100.00 %)	3,178 (1.34 %)	2,985 (3.32 %)	54,465 (11.73 %)	0 (0 %)	1,466 (1.31 %)	645 (3.98 %)	563 (2.43 %)
605	budding yeast P.kudriavzevii GCF_003054445.1	5,144 (73.16 %)	n/a	1,761 (12.92 %)	4,631 (68.44 %)	n/a	38.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	5 (100.00 %)	4,323 (2.06 %)	2,851 (1.29 %)	56,177 (12.16 %)	0 (0 %)	678 (1.22 %)	199 (0.78 %)	163 (0.63 %)
606	budding yeast P.kudriavzevii (CBS5147 2018) GCA_003054405.1	n/a	n/a	1,767 (12.94 %)	4,673 (67.81 %)	n/a	38.35 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	5 (100.00 %)	4,364 (2.03 %)	2,885 (1.24 %)	55,891 (12.13 %)	0 (0 %)	659 (1.14 %)	180 (0.67 %)	146 (0.54 %)
607	budding yeast S.ludwigii (UTAD17 2018) GCA_900491785.1	n/a	4,257 (64.24 %)	2,278 (19.08 %)	3,433 (54.10 %)	n/a	31.21 (99.87 %)	0 (0 %)	362 (0.11 %)	1,360 (100.00 %)	18,236 (7.45 %)	10,431 (3.63 %)	91,893 (30.19 %)	3 (0.00 %)	918 (0.56 %)	11 (0.04 %)	6 (0.02 %)
608	budding yeast S.paradoxus GCF_002079055.1	5,536 (69.25 %)	n/a	5,726 (67.33 %)	5,012 (65.68 %)	n/a	38.54 (99.86 %)	0 (0 %)	1 (0.14 %)	17 (100.00 %)	3,433 (1.87 %)	2,033 (1.00 %)	63,726 (13.09 %)	0 (0 %)	986 (1.32 %)	234 (0.91 %)	194 (0.69 %)
609	budding yeast T.ciferrii (CBS 4856 2019) GCA_008704605.1	n/a	6,909 (45.52 %)	2,044 (7.82 %)	5,322 (37.66 %)	n/a	47.46 (99.83 %)	0 (0 %)	1,224 (0.18 %)	583 (100.00 %)	5,257 (1.29 %)	5,632 (5.15 %)	91,527 (19.38 %)	71 (0.05 %)	12,678 (3.36 %)	4,428 (22.10 %)	3,609 (12.62 %)
610	budding yeast Y.lipolytica (CLIB122 2004 refseq) GCF_000002525.2	6,576 (45.99 %)	n/a	1,749 (6.56 %)	4,805 (37.68 %)	n/a	48.99 (99.99 %)	0 (0 %)	28 (0.01 %)	7 (100.00 %)	7,541 (2.97 %)	9,613 (2.12 %)	82,856 (9.77 %)	0 (0 %)	967 (0.42 %)	6,216 (33.35 %)	5,359 (18.29 %)
611	budding yeast Y.lipolytica (CLIB89W29 2016) GCA_001761485.1	n/a	8,644 (49.49 %)	1,761 (6.58 %)	4,833 (37.27 %)	n/a	48.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	7,389 (2.57 %)	9,736 (2.09 %)	82,428 (9.52 %)	0 (0 %)	871 (0.30 %)	6,254 (33.15 %)	5,356 (17.91 %)
612	Bufavirus-3 (BTN-63 2014) GCF_000924255.1	n/a	5 (95.27 %)	n/a	n/a	n/a	39.77 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.31 %)	1 (0.78 %)	18 (5.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
613	bugs R.prolixus (2015) GCA_000181055.3	n/a	n/a	3,449 (0.53 %)	6,235 (2.02 %)	n/a	33.94 (79.90 %)	31,189 (20.12 %)	35,813 (20.12 %)	47,726 (79.88 %)	607,379 (26.14 %)	124,820 (4.39 %)	3,949,021 (35.74 %)	228 (0.07 %)	393,162 (4.55 %)	4,329 (0.35 %)	2,632 (0.25 %)
614	bugs T.infestans (FIOC_28 2020) GCA_011037195.1	n/a	n/a	3,163 (0.28 %)	12,286 (1.96 %)	n/a	34.03 (99.65 %)	1,371 (0.34 %)	1,371 (0.34 %)	16,322 (99.66 %)	697,367 (3.04 %)	248,447 (1.97 %)	7,271,792 (47.96 %)	0 (0 %)	268,596 (2.67 %)	15,196 (0.99 %)	7,328 (0.65 %)
615	Burkholderia mallei (ATCC 23344 2023) GCF_033956065.1	n/a	5,381 (86.25 %)	n/a	n/a	n/a	68.49 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	1,643 (1.42 %)	61,717 (40.88 %)	0 (0 %)	144 (0.73 %)	2 (100.00 %)	0 (0.00 %)
616	Burkholderia pseudomallei (GTC3P0254T 2023) GCF_030297255.1	n/a	6,292 (86.00 %)	n/a	n/a	n/a	68.25 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	2,049 (1.57 %)	75,658 (42.05 %)	0 (0 %)	498 (0.64 %)	2 (100.00 %)	0 (0.00 %)
617	C.velia (CCMP2878 2021) GCA_018398765.1	n/a	n/a	808 (0.25 %)	13,493 (9.27 %)	n/a	49.11 (99.71 %)	8,037 (0.30 %)	8,037 (0.30 %)	14,003 (99.70 %)	271,055 (8.61 %)	174,356 (7.50 %)	1,404,943 (30.85 %)	164 (0.11 %)	128,778 (4.12 %)	56,904 (19.48 %)	26,011 (6.19 %)
618	Caaingua virus (MS681 2021) GCF_018585185.1	n/a	2 (96.38 %)	n/a	n/a	n/a	51.29 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.81 %)	n/a	5 (0.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (85.60 %)	3 (82.64 %)
619	Cache Valley virus (6V633 2019) GCF_004789995.1	n/a	4 (95.45 %)	n/a	n/a	n/a	35.43 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (0.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
620	Calicivirus chicken/V0021/Bayern/2004 (Bavaria04V0021 2023) GCF_004786895.1	n/a	2 (98.62 %)	n/a	n/a	n/a	54.02 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.64 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.06 %)	1 (4.06 %)
621	Calicivirus isolate (TCG 14 2005) GCF_000859525.1	n/a	2 (98.09 %)	n/a	n/a	n/a	56.20 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.19 %)	n/a	2 (1.07 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (69.58 %)	2 (69.58 %)
622	Calicivirus pig/AB90/CAN (AB90 2009) GCF_000883855.1	n/a	2 (99.21 %)	n/a	n/a	n/a	54.31 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.39 %)	1 (0.39 %)	10 (1.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
623	California encephalitis virus (BFS 283 2021) GCF_003972565.1	n/a	4 (94.87 %)	n/a	n/a	n/a	36.45 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.66 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
624	Camel Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (camel/Abu Dhabi/B84 2020) GCA_032106395.1	n/a	3 (96.30 %)	n/a	n/a	n/a	43.00 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.56 %)	n/a	16 (0.70 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
625	Campylobacter jejuni subsp. jejuni ATCC 700819 (NCTC 11168 2003) GCF_000009085.1	n/a	1,635 (92.40 %)	n/a	n/a	n/a	30.55 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	69 (0.33 %)	16,429 (28.46 %)	0 (0 %)	75 (1.02 %)	4 (0.22 %)	4 (0.22 %)
626	Candidatus Rickettsia colombianensi (Adcor 2 2018) GCF_003664375.1	n/a	972 (84.10 %)	n/a	n/a	n/a	32.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	13 (100.00 %)	n/a	33 (0.49 %)	7,501 (19.68 %)	0 (0 %)	49 (0.58 %)	1 (0.03 %)	0 (0.00 %)
627	Candidatus Rickettsia kedanie (KNCP2-13 2024) GCF_045865205.1	n/a	1,553 (81.08 %)	n/a	n/a	n/a	32.50 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	52 (100.00 %)	n/a	51 (0.23 %)	10,785 (18.84 %)	0 (0 %)	30 (0.16 %)	4 (0.15 %)	3 (0.14 %)
628	Canine vesivirus (2003) GCF_000851085.1	n/a	3 (97.08 %)	n/a	n/a	n/a	45.89 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.63 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
629	Capira virus (VP-366G 2015) GCA_031322265.1	n/a	4 (95.28 %)	n/a	n/a	n/a	38.38 (99.97 %)	2 (0.03 %)	2 (0.03 %)	5 (99.97 %)	4 (1.01 %)	6 (0.94 %)	4 (1.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
630	castor bean tick (Charles River 2016) GCA_000973045.2	n/a	n/a	1,387 (0.14 %)	66,874 (6.09 %)	n/a	44.98 (99.91 %)	1,504 (0.01 %)	1,504 (0.01 %)	206,020 (99.99 %)	155,866 (1.27 %)	99,582 (1.34 %)	3,026,165 (22.21 %)	2 (0.00 %)	n/a	128,567 (22.50 %)	89,543 (11.03 %)
631	cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA) GCF_002263795.3	77,808 (4.11 %)	n/a	19,428 (1.48 %)	22,236 (1.33 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	0 (0 %)	386 (0.00 %)	1,958 (100.00 %)	3,449,588 (22.63 %)	596,092 (3.13 %)	12,785,607 (42.11 %)	1 (0.00 %)	1,626,342 (4.17 %)	46,864 (1.37 %)	37,742 (0.86 %)
632	Catu virus (BeH 151 2018) GCF_002831305.1	n/a	3 (98.05 %)	n/a	n/a	n/a	37.20 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (0.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
633	cellular slime mold D.discoideum (AX4 2009) GCF_000004695.1	13,269 (61.68 %)	n/a	966 (2.05 %)	211 (3.60 %)	n/a	22.44 (99.94 %)	230 (0.07 %)	358 (0.07 %)	261 (99.93 %)	133,360 (25.23 %)	139,151 (14.86 %)	257,501 (56.19 %)	1 (0.00 %)	33,356 (6.43 %)	18 (0.01 %)	11 (0.01 %)
634	cellular slime mold D.purpureum (QSDP1 2011) GCF_000190715.1	12,395 (56.45 %)	n/a	946 (2.08 %)	538 (3.84 %)	n/a	24.47 (99.65 %)	413 (0.35 %)	413 (0.35 %)	1,212 (99.65 %)	75,750 (13.63 %)	75,374 (8.25 %)	250,995 (49.61 %)	3 (0.02 %)	13,768 (3.65 %)	9 (0.01 %)	5 (0.00 %)
635	cellular slime molds (AX4 2009) GCA_000004695.1	n/a	13,749 (61.91 %)	964 (2.05 %)	208 (3.56 %)	n/a	22.43 (99.94 %)	230 (0.07 %)	358 (0.07 %)	259 (99.93 %)	133,360 (25.28 %)	139,105 (14.89 %)	256,789 (56.21 %)	1 (0.00 %)	33,345 (6.44 %)	18 (0.01 %)	11 (0.01 %)
636	cellular slime molds (QSDP1 2011) GCA_000190715.1	n/a	12,418 (56.48 %)	946 (2.08 %)	538 (3.84 %)	n/a	24.47 (99.65 %)	413 (0.35 %)	413 (0.35 %)	1,212 (99.65 %)	77,047 (13.86 %)	75,374 (8.25 %)	250,995 (49.61 %)	3 (0.02 %)	13,768 (3.65 %)	9 (0.01 %)	5 (0.00 %)
637	Central cimpanzee simian foamy virus (Pan troglodytes troglodytes BAD327 2018) GCF_003032755.1	n/a	6 (75.24 %)	n/a	n/a	n/a	38.61 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (0.88 %)	0 (0 %)	1 (26.61 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
638	Chandipura virus (CIN 0451 2013) GCF_000906815.1	n/a	5 (96.34 %)	n/a	n/a	n/a	42.53 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.29 %)	n/a	19 (1.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
639	Chandiru virus (2011) GCF_000891915.1	n/a	4 (94.55 %)	n/a	n/a	n/a	39.54 (99.96 %)	6 (0.06 %)	6 (0.06 %)	9 (99.94 %)	4 (0.24 %)	1 (0.42 %)	21 (2.82 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
640	Changuinola virus (CGLV/BE AN 28873 2013) GCF_000911195.1	n/a	10 (96.06 %)	n/a	n/a	n/a	42.18 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	6 (0.61 %)	n/a	7 (0.79 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (3.32 %)	2 (3.32 %)
641	charcoal rot (MS6 2012) GCA_000302655.1	n/a	13,988 (36.42 %)	1,588 (2.48 %)	7,060 (19.49 %)	n/a	52.33 (99.99 %)	12 (0.00 %)	12 (0.00 %)	1,518 (100.00 %)	17,277 (1.48 %)	6,285 (0.60 %)	145,973 (14.00 %)	0 (0 %)	3,985 (0.67 %)	1,144 (84.82 %)	1,204 (80.41 %)
642	Chicken calicivirus (RS/BR/2015 2017) GCF_001963095.1	n/a	2 (95.46 %)	n/a	n/a	n/a	54.17 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.63 %)	1 (2.63 %)
643	chicken white leghorn layer X broiler (v2 broiler haplotype 2021 2021) GCF_016699485.2	84,120 (9.95 %)	n/a	13,128 (2.33 %)	23,484 (2.48 %)	72,013 (9.34 %)	42.20 (99.68 %)	463 (0.32 %)	463 (0.32 %)	677 (99.68 %)	697,827 (12.53 %)	290,892 (2.63 %)	5,887,021 (21.30 %)	1 (0.00 %)	268,636 (2.17 %)	24,469 (2.59 %)	20,885 (1.55 %)
644	Chikungunya virus (S27-African prototype 2002) GCF_000854045.1	n/a	2 (94.47 %)	n/a	n/a	n/a	50.04 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.87 %)	n/a	3 (1.76 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	7 (34.06 %)	7 (34.06 %)
645	Chimpanzee adenovirus Y25 (2012) GCF_000897015.1	n/a	37 (82.60 %)	n/a	n/a	n/a	58.78 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	13 (1.03 %)	3 (0.46 %)	100 (4.44 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (75.08 %)	4 (74.01 %)
646	chlamydias (6BC 2011) GCF_000204255.1	n/a	1,034 (91.04 %)	n/a	n/a	n/a	39.02 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	17 (0.15 %)	6,260 (9.56 %)	0 (0 %)	59 (0.38 %)	4 (0.13 %)	4 (0.13 %)
647	chytrids B.dendrobatidis (JEL423 2006) GCA_000149865.1	n/a	10,012 (59.58 %)	1,239 (4.04 %)	7,388 (33.26 %)	n/a	39.27 (98.67 %)	281 (1.34 %)	281 (1.34 %)	351 (98.66 %)	2,465 (1.08 %)	3,270 (1.20 %)	81,392 (12.56 %)	2 (0.02 %)	6,230 (3.49 %)	159 (0.20 %)	147 (0.19 %)
648	chytrids B.salamandrivorans (AMFP13 2022) GCA_002006685.2	n/a	10,867 (22.31 %)	1,891 (1.83 %)	11,986 (15.27 %)	n/a	42.93 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	165 (100.00 %)	39,302 (2.30 %)	34,075 (2.93 %)	300,621 (24.32 %)	0 (0 %)	109,680 (14.64 %)	4,299 (2.28 %)	1,839 (0.91 %)
649	chytrids S.endobioticum (MB42 2019) GCA_006535955.1	n/a	8,031 (53.31 %)	1,149 (4.04 %)	5,740 (23.49 %)	n/a	46.99 (99.51 %)	0 (0 %)	1,398 (0.50 %)	786 (100.00 %)	3,828 (0.71 %)	1,595 (0.77 %)	49,907 (8.42 %)	48 (0.12 %)	2,409 (6.60 %)	4,505 (19.84 %)	3,646 (13.04 %)
650	chytrids S.punctatus DAOM BR117 GCF_000182565.1	9,429 (68.08 %)	n/a	1,421 (4.51 %)	4,780 (22.26 %)	n/a	47.60 (99.07 %)	291 (0.93 %)	291 (0.93 %)	329 (99.07 %)	3,600 (2.36 %)	2,146 (0.75 %)	50,507 (7.47 %)	4 (0.03 %)	2,164 (1.15 %)	6,124 (21.68 %)	5,124 (13.11 %)
651	Circo-like virus-Brazil (hs1 2014) GCF_000919735.1	n/a	4 (87.77 %)	n/a	n/a	n/a	34.73 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.05 %)	1 (2.26 %)	8 (7.21 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
652	Circular ssDNA virus sp. (2023) GCF_023122845.1	n/a	2 (76.33 %)	n/a	n/a	n/a	57.82 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.59 %)	3 (1.77 %)	3 (2.41 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (83.33 %)	1 (83.33 %)
653	Circular ssDNA virus sp. (HV-CV1 2016) GCF_001678815.1	n/a	3 (73.09 %)	n/a	n/a	n/a	52.61 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (1.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (78.14 %)	1 (78.14 %)
654	Cocal virus (Indiana 2 2015) GCF_001440915.1	n/a	7 (99.82 %)	n/a	n/a	n/a	43.98 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.34 %)	n/a	7 (0.53 %)	0 (0 %)	1 (0.60 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
655	Cocle virus (GML244915 2023) GCF_013086615.1	n/a	4 (91.78 %)	n/a	n/a	n/a	40.00 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (2.05 %)	9 (1.44 %)	13 (3.57 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
656	coffee rust fungus (Race XXXIII 2019) GCA_004125335.1	n/a	n/a	1,180 (0.15 %)	12,199 (1.90 %)	n/a	33.59 (99.55 %)	65,348 (0.44 %)	65,348 (0.44 %)	182,104 (99.56 %)	284,425 (3.03 %)	227,859 (4.00 %)	3,068,698 (61.88 %)	194 (0.01 %)	n/a	3,316 (0.42 %)	2,263 (0.32 %)
657	Colobus guereza papillomavirus 2 (CgPV2 2011) GCF_000892175.1	n/a	6 (92.13 %)	n/a	n/a	n/a	47.13 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.54 %)	2 (1.95 %)	5 (2.71 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (15.12 %)	3 (12.27 %)
658	Colorado tick fever virus (Florio; N-7180 2002) GCF_000853265.1	n/a	13 (95.61 %)	n/a	n/a	n/a	46.56 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	32 (1.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	7 (8.12 %)	6 (7.22 %)
659	Corriparta virus (AUS1960/01 2018) GCF_002829365.1	n/a	12 (95.17 %)	n/a	n/a	n/a	44.27 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	4 (0.41 %)	n/a	2 (0.32 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (6.68 %)	3 (6.68 %)
660	Cosavirus A (HCoSV-A1 0553 2009) GCF_000885595.1	n/a	1 (83.53 %)	n/a	n/a	n/a	43.75 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.63 %)	n/a	5 (1.90 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
661	Cosavirus D (HCoSV-D1 5004 2009) GCF_000886475.1	n/a	1 (88.44 %)	n/a	n/a	n/a	42.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
662	Cosavirus E (HCoSV-E1 2009) GCF_000886455.1	n/a	1 (96.38 %)	n/a	n/a	n/a	41.93 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	5 (0.79 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
663	Cosavirus F (PK5006 2017) GCF_002117635.1	n/a	1 (95.96 %)	n/a	n/a	n/a	44.40 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.93 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
664	Cosavirus JMY-2014 (Cosa-CHN 2014) GCF_000930055.1	n/a	1 (88.17 %)	n/a	n/a	n/a	42.21 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
665	Coxiella burnetii (RSA 493 2016) GCF_000007765.2	n/a	1,878 (77.51 %)	n/a	n/a	n/a	42.60 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	69 (0.32 %)	12,401 (13.25 %)	0 (0 %)	70 (0.73 %)	10 (0.32 %)	51 (0.97 %)
666	Coxsackievirus A2 (Fleetwood CA2 2018) GCF_002816655.1	n/a	1 (88.90 %)	n/a	n/a	n/a	48.26 (99.96 %)	4 (0.05 %)	4 (0.05 %)	5 (99.95 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.64 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.18 %)	1 (4.18 %)
667	Coxsackievirus B3 (2018) GCF_002816685.1	n/a	1 (88.63 %)	n/a	n/a	n/a	47.67 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.11 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
668	crab-eating macaque WashU 2013 refseq GCF_000364345.1	76,196 (3.30 %)	n/a	20,209 (1.91 %)	51,427 (6.84 %)	n/a	40.90 (95.16 %)	80,163 (4.85 %)	80,474 (4.85 %)	87,764 (95.15 %)	5,251,819 (50.85 %)	941,514 (3.24 %)	15,778,510 (35.74 %)	1,138 (0.05 %)	1,213,705 (2.53 %)	76,963 (1.14 %)	27,520 (0.64 %)
669	Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (IbAr10200 2003) GCF_000854165.1	n/a	3 (95.80 %)	n/a	n/a	n/a	42.23 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.22 %)	26 (1.53 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
670	Crithidia fasciculata (Cf-Cl 2015) GCA_000331325.2	n/a	n/a	682 (0.97 %)	5,606 (45.84 %)	n/a	57.01 (100.00 %)	36 (0.00 %)	36 (0.00 %)	494 (100.00 %)	39,861 (4.03 %)	6,061 (1.76 %)	368,094 (26.68 %)	0 (0 %)	19,083 (5.73 %)	552 (98.89 %)	422 (0.93 %)
671	Crosse virus (La Crosse/original 1994) GCA_002831285.1	n/a	6 (94.68 %)	n/a	n/a	n/a	36.60 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	17 (1.43 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
672	Cuevavirus lloviuense (Lloviu virus/M.schreibersii-wt/ESP/2003/Asturias-Bat86 2011) GCF_000896415.1	n/a	9 (80.46 %)	n/a	n/a	n/a	45.99 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.18 %)	n/a	13 (0.66 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
673	Cutavirus (BR-337 2018) GCF_003033315.1	n/a	6 (99.33 %)	n/a	n/a	n/a	38.92 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (3.34 %)	n/a	15 (7.76 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
674	Cyclovirus (NG12 2018) GCF_002820165.1	n/a	2 (83.78 %)	n/a	n/a	n/a	47.65 (99.78 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
675	Cyclovirus (NG14 2018) GCF_002820185.1	n/a	2 (86.35 %)	n/a	n/a	n/a	46.41 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.56 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (40.17 %)	1 (40.17 %)
676	Cyclovirus (PK5006 2018) GCF_002820085.1	n/a	2 (86.65 %)	n/a	n/a	n/a	43.66 (99.83 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.80 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (17.18 %)	1 (17.18 %)
677	Cyclovirus (PK5034 2018) GCF_002820145.1	n/a	2 (83.54 %)	n/a	n/a	n/a	48.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
678	Cyclovirus (PK5222 2018) GCF_002820105.1	n/a	2 (85.80 %)	n/a	n/a	n/a	43.62 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (3.33 %)	n/a	4 (5.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (23.56 %)	0 (0.00 %)
679	Cyclovirus (PK5510 2018) GCF_002820065.1	n/a	2 (84.59 %)	n/a	n/a	n/a	44.67 (99.77 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
680	Cyclovirus (SL-108277 2018) GCF_002820225.1	n/a	2 (87.89 %)	n/a	n/a	n/a	41.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.99 %)	n/a	2 (1.52 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (15.67 %)	1 (15.67 %)
681	Cyclovirus (TN25 2018) GCF_002820125.1	n/a	3 (81.95 %)	n/a	n/a	n/a	45.20 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.50 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (12.37 %)	0 (0.00 %)
682	Cyclovirus VN (hcf2 2018) GCF_002820205.1	n/a	3 (81.79 %)	n/a	n/a	n/a	46.20 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.62 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
683	Dandenong virus (0710-2678 2007) GCA_031580275.1	n/a	4 (95.83 %)	n/a	n/a	n/a	43.24 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.73 %)	1 (0.31 %)	5 (1.88 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
684	Dar es Salaam virus (TZ-189 2023) GCF_018595055.1	n/a	3 (92.94 %)	n/a	n/a	n/a	40.08 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.67 %)	n/a	14 (2.66 %)	0 (0 %)	1 (1.61 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
685	Deer tick virus (ctb30 CT95 2001) GCA_004786555.1	n/a	1 (94.89 %)	n/a	n/a	n/a	52.70 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (0.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.25 %)	1 (2.25 %)
686	Dengue virus 1 (clone 45AZ5 Nauru Island 1997) GCF_000862125.1	n/a	1 (94.82 %)	n/a	n/a	n/a	46.67 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.68 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
687	Dengue virus 2 (16681/84 Thailand 1993) GCF_000871845.1	n/a	5 (98.86 %)	n/a	n/a	n/a	45.82 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	2 (0.16 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
688	Dengue virus 3 (D3/H/IMTSSA-SRI/2000/1266 Sri Lanka 2007) GCF_000866625.1	n/a	5 (98.92 %)	n/a	n/a	n/a	46.71 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.60 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
689	Dengue virus 4 (clone rDEN4 2001) GCF_000865065.1	n/a	4 (98.81 %)	n/a	n/a	n/a	47.13 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
690	Dengue virus type 3 (H87 2023) GCA_004788295.1	n/a	1 (95.11 %)	n/a	n/a	n/a	46.65 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
691	Dengue virus type 4 (814669 2023) GCA_004786575.1	n/a	1 (95.45 %)	n/a	n/a	n/a	47.05 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
692	Dhori thogotovirus (Dhori/1313/61 2017) GCF_002116195.1	n/a	6 (95.15 %)	n/a	n/a	n/a	45.84 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.33 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
693	Dianlovirus menglaense (Rousettus-wt/CHN/2015/Sharen-Bat9447-1 2021) GCF_013088285.1	n/a	7 (98.97 %)	n/a	n/a	n/a	36.55 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.22 %)	n/a	10 (0.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
694	diplomonads (AS175 2013) GCA_001493575.1	n/a	n/a	248 (1.31 %)	2,310 (64.29 %)	n/a	48.90 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1,139 (100.00 %)	533 (1.00 %)	180 (0.12 %)	22,085 (4.31 %)	0 (0 %)	67 (0.10 %)	2,605 (19.80 %)	2,224 (15.81 %)
695	diplomonads (BAH15c1 2016) GCA_001543975.1	n/a	4,990 (85.78 %)	229 (1.21 %)	2,079 (65.87 %)	n/a	46.96 (99.69 %)	0 (0 %)	6,474 (0.38 %)	508 (100.00 %)	282 (0.29 %)	130 (0.06 %)	22,846 (4.05 %)	0 (0 %)	32 (0.08 %)	1,682 (12.29 %)	1,408 (9.56 %)
696	diplomonads (beaver 2020) GCA_011634555.1	n/a	n/a	251 (1.27 %)	2,080 (61.21 %)	n/a	49.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	752 (2.09 %)	491 (1.78 %)	22,286 (6.08 %)	0 (0 %)	2,311 (2.51 %)	2,248 (25.50 %)	2,040 (19.56 %)
697	diplomonads (CIA 2022) GCA_022985015.1	n/a	n/a	252 (1.28 %)	2,118 (64.27 %)	n/a	48.97 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	93 (100.00 %)	289 (0.12 %)	277 (0.52 %)	28,049 (5.52 %)	0 (0 %)	245 (0.55 %)	2,189 (22.28 %)	1,829 (15.60 %)
698	diplomonads (DH 2013) GCA_000498715.1	n/a	5,209 (85.35 %)	255 (1.28 %)	2,200 (64.84 %)	n/a	49.04 (100.00 %)	5 (0.00 %)	5 (0.00 %)	244 (100.00 %)	518 (1.23 %)	226 (0.21 %)	27,079 (5.48 %)	0 (0 %)	93 (0.17 %)	2,289 (22.31 %)	1,902 (16.10 %)
699	diplomonads (DID 2022) GCA_022985025.1	n/a	n/a	257 (1.12 %)	2,607 (67.29 %)	n/a	41.15 (99.99 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	260 (100.00 %)	657 (0.22 %)	562 (1.76 %)	24,519 (7.76 %)	0 (0 %)	3,343 (3.24 %)	629 (3.52 %)	476 (2.65 %)
700	diplomonads (GS 2013) GCA_000498735.1	n/a	6,166 (82.30 %)	247 (1.19 %)	2,442 (62.00 %)	n/a	48.24 (99.99 %)	14 (0.00 %)	14 (0.00 %)	557 (100.00 %)	468 (0.62 %)	171 (0.28 %)	26,451 (6.23 %)	0 (0 %)	297 (0.29 %)	2,071 (21.24 %)	1,735 (12.06 %)
701	diplomonads (GS 2020) GCA_011634595.1	n/a	n/a	263 (1.20 %)	2,433 (57.37 %)	n/a	49.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	19 (100.00 %)	681 (1.61 %)	455 (2.45 %)	26,563 (7.44 %)	0 (0 %)	2,983 (1.99 %)	1,575 (29.22 %)	1,719 (15.25 %)
702	diplomonads (GS/M clone H7 2009) GCA_000182405.1	n/a	4,559 (74.60 %)	235 (1.18 %)	2,537 (62.68 %)	n/a	47.25 (99.95 %)	2,919 (0.03 %)	2,919 (0.03 %)	5,840 (99.97 %)	370 (0.44 %)	150 (0.17 %)	26,159 (4.67 %)	0 (0 %)	30 (0.05 %)	2,328 (11.92 %)	1,825 (9.39 %)
703	diplomonads (P15 2010) GCA_000182665.1	n/a	5,097 (79.82 %)	258 (1.26 %)	2,379 (64.81 %)	n/a	47.24 (99.99 %)	383 (0.00 %)	383 (0.00 %)	1,203 (100.00 %)	614 (1.11 %)	215 (0.23 %)	19,248 (4.92 %)	0 (0 %)	133 (0.35 %)	1,730 (18.72 %)	1,542 (13.15 %)
704	diplomonads (Roberts-Thomson 2019) GCA_006247105.1	n/a	4,956 (85.14 %)	260 (1.62 %)	2,648 (72.71 %)	n/a	54.71 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	59 (100.00 %)	860 (3.29 %)	550 (1.05 %)	8,733 (10.96 %)	0 (0 %)	2,650 (5.65 %)	77 (98.48 %)	144 (89.54 %)
705	diplomonads (v2 WB C6 2019) GCF_000002435.2	5,003 (81.36 %)	n/a	245 (1.25 %)	2,099 (60.77 %)	n/a	49.73 (96.65 %)	0 (0 %)	3 (3.35 %)	35 (100.00 %)	389 (0.23 %)	445 (2.49 %)	19,258 (6.73 %)	0 (0 %)	2,237 (2.60 %)	2,303 (25.33 %)	2,093 (18.78 %)
706	diplomonads (WB 2020) GCA_011634545.1	n/a	n/a	242 (1.18 %)	2,127 (59.15 %)	n/a	49.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	37 (100.00 %)	773 (1.91 %)	510 (1.53 %)	23,481 (5.65 %)	0 (0 %)	1,931 (1.89 %)	2,313 (25.33 %)	2,111 (19.37 %)
707	dog (labrador SID07034 2020) GCF_014441545.1	99,420 (3.87 %)	n/a	19,870 (1.70 %)	20,252 (1.41 %)	54,322 (3.23 %)	41.19 (99.47 %)	0 (0 %)	575 (0.53 %)	376 (100.00 %)	4,981,985 (42.28 %)	1,019,772 (1.97 %)	13,959,750 (32.77 %)	2 (0.01 %)	648,526 (1.66 %)	52,469 (2.25 %)	48,334 (1.95 %)
708	domestic guinea pig (2N 2008 refseq) GCF_000151735.1	44,762 (2.31 %)	n/a	18,301 (1.33 %)	20,111 (1.34 %)	n/a	39.95 (97.81 %)	58,460 (2.20 %)	58,460 (2.20 %)	61,604 (97.80 %)	4,257,852 (38.85 %)	658,533 (1.25 %)	14,547,726 (34.19 %)	3 (0.00 %)	423,409 (1.39 %)	37,093 (0.85 %)	27,300 (0.63 %)
709	downy mildews (10300 2018) GCA_003287315.1	n/a	24,172 (49.02 %)	1,314 (1.62 %)	22,319 (54.05 %)	n/a	50.76 (96.01 %)	0 (0 %)	6,482 (4.01 %)	4,623 (100.00 %)	4,734 (0.37 %)	3,322 (0.32 %)	198,372 (7.14 %)	103 (0.07 %)	1,278 (0.55 %)	6,165 (60.21 %)	4,698 (8.67 %)
710	downy mildews (AV1007 2017) GCA_002247145.1	n/a	n/a	1,219 (2.09 %)	16,220 (62.35 %)	n/a	51.74 (99.97 %)	0 (0 %)	21 (0.02 %)	1,897 (100.00 %)	4,916 (0.58 %)	3,749 (0.62 %)	167,896 (9.36 %)	0 (0 %)	1,744 (0.92 %)	2,578 (86.43 %)	1,594 (6.09 %)
711	downy mildews (Emoy2 2012) GCA_000173235.2	n/a	n/a	1,215 (1.20 %)	16,667 (31.82 %)	n/a	47.22 (89.67 %)	7,378 (10.36 %)	7,503 (10.36 %)	10,486 (89.64 %)	13,394 (8.57 %)	7,569 (0.78 %)	192,650 (12.35 %)	51 (0.09 %)	7,995 (1.98 %)	4,900 (11.47 %)	5,042 (10.24 %)
712	downy mildews (GKB4 2021 genbank) GCA_018691715.1	n/a	21,334 (23.20 %)	1,641 (1.07 %)	33,976 (44.50 %)	n/a	54.16 (99.69 %)	0 (0 %)	80 (0.31 %)	133 (100.00 %)	18,997 (0.80 %)	16,094 (2.84 %)	200,994 (27.68 %)	0 (0 %)	68,037 (10.52 %)	232 (99.71 %)	2,904 (21.16 %)
713	downy mildews (GKB4 2021 refseq) GCF_018691715.1	21,326 (23.20 %)	n/a	1,641 (1.07 %)	33,974 (44.50 %)	n/a	54.16 (99.69 %)	80 (0.31 %)	80 (0.31 %)	213 (99.69 %)	18,997 (0.80 %)	16,094 (2.84 %)	200,994 (27.68 %)	0 (0 %)	68,037 (10.52 %)	232 (99.71 %)	2,904 (21.16 %)
714	downy mildews (LT1534-B 2021) GCA_016618375.1	n/a	28,954 (34.63 %)	1,862 (1.40 %)	28,244 (53.04 %)	n/a	51.19 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	782 (100.00 %)	12,108 (0.73 %)	20,550 (9.55 %)	122,350 (23.24 %)	0 (0 %)	74,861 (11.18 %)	1,452 (90.00 %)	3,333 (14.96 %)
715	downy mildews (P6497 2011) GCF_000149755.1	26,489 (39.49 %)	n/a	1,585 (1.41 %)	30,945 (56.78 %)	n/a	54.61 (96.04 %)	780 (3.96 %)	796 (3.96 %)	862 (96.04 %)	25,496 (17.70 %)	12,019 (4.05 %)	220,993 (11.54 %)	9 (0.01 %)	16,740 (4.76 %)	191 (97.73 %)	739 (3.49 %)
716	downy mildews (R13 2018) GCA_003843895.1	n/a	8,603 (37.86 %)	1,184 (2.63 %)	9,398 (47.78 %)	n/a	47.49 (99.74 %)	0 (0 %)	688 (0.26 %)	784 (100.00 %)	3,429 (0.51 %)	6,621 (1.91 %)	71,907 (17.80 %)	10 (0.02 %)	8,312 (3.72 %)	2,651 (11.55 %)	2,774 (7.94 %)
717	downy mildews (sbr112.9 2018) GCA_002911725.1	n/a	24,674 (23.07 %)	2,164 (1.23 %)	43,372 (49.46 %)	n/a	48.92 (99.62 %)	3,813 (0.35 %)	3,813 (0.35 %)	28,622 (99.65 %)	6,965 (0.31 %)	10,467 (1.05 %)	265,147 (14.65 %)	1 (0.00 %)	7,589 (1.25 %)	28,238 (41.82 %)	20,834 (23.36 %)
718	Dugbe orthonairovirus (ArD44313 1995) GCF_000850985.1	n/a	3 (96.61 %)	n/a	n/a	n/a	40.19 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	41 (3.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
719	Duvenhage lyssavirus (86132SA 2013) GCF_000905375.1	n/a	5 (90.59 %)	n/a	n/a	n/a	44.22 (99.99 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.72 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
720	E. coli (K-12 MG1655 2013 refseq) GCF_000005845.2	n/a	4,544 (87.30 %)	n/a	n/a	n/a	50.79 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	93 (0.40 %)	19,730 (7.53 %)	0 (0 %)	191 (0.41 %)	1 (99.99 %)	0 (0.00 %)
721	E. coli (Sakai substr. RIMD 0509952 2018) GCF_000008865.2	n/a	5,280 (85.35 %)	n/a	n/a	n/a	50.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	169 (0.53 %)	20,656 (7.31 %)	0 (0 %)	186 (0.33 %)	15 (99.26 %)	21 (0.68 %)
722	E.dispar (SAW760 2008) GCF_000209125.1	8,811 (35.13 %)	n/a	686 (1.25 %)	625 (4.87 %)	n/a	24.06 (99.51 %)	1,295 (0.42 %)	1,295 (0.42 %)	13,553 (99.58 %)	32,724 (12.27 %)	69,502 (13.45 %)	163,536 (53.23 %)	2 (0.01 %)	16,621 (6.44 %)	23 (0.08 %)	22 (0.08 %)
723	E.histolytica (DS4-868 2021) GCA_018466815.1	n/a	n/a	573 (1.63 %)	307 (3.57 %)	n/a	24.32 (99.99 %)	110 (0.00 %)	110 (0.00 %)	1,287 (100.00 %)	15,510 (4.70 %)	11,018 (2.41 %)	175,348 (43.36 %)	0 (0 %)	1,392 (1.04 %)	3 (0.01 %)	3 (0.01 %)
724	E.histolytica (HM-1:IMSS 2008) GCF_000208925.1	8,151 (49.76 %)	n/a	601 (1.65 %)	349 (3.88 %)	n/a	24.30 (99.69 %)	643 (0.31 %)	643 (0.31 %)	2,172 (99.69 %)	16,661 (17.45 %)	11,944 (2.53 %)	179,359 (42.98 %)	6 (0.04 %)	1,576 (1.22 %)	5 (0.02 %)	5 (0.02 %)
725	E.histolytica (HM-1:IMSS-A 2013) GCA_000365475.1	n/a	6,327 (68.14 %)	350 (1.51 %)	304 (3.38 %)	n/a	25.18 (99.92 %)	6 (0.06 %)	6 (0.06 %)	1,691 (99.94 %)	8,726 (4.33 %)	3,106 (1.04 %)	120,505 (37.43 %)	0 (0 %)	179 (0.10 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
726	E.histolytica (HM-1:IMSS-B 2013) GCA_000344925.1	n/a	6,301 (65.33 %)	309 (1.31 %)	742 (6.91 %)	n/a	26.91 (99.04 %)	345 (0.94 %)	345 (0.94 %)	2,283 (99.06 %)	8,480 (4.05 %)	2,913 (0.92 %)	127,368 (39.10 %)	107 (0.32 %)	266 (0.15 %)	202 (2.96 %)	197 (2.87 %)
727	E.histolytica (HM-3:IMSS 2013) GCA_000346345.1	n/a	7,361 (66.15 %)	378 (1.52 %)	347 (3.42 %)	n/a	25.08 (98.47 %)	1,548 (1.54 %)	1,558 (1.54 %)	3,428 (98.46 %)	10,354 (4.95 %)	3,774 (1.12 %)	134,504 (38.02 %)	524 (1.16 %)	1,257 (1.33 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)
728	E.histolytica (KU27 2013) GCA_000338855.1	n/a	7,469 (60.62 %)	484 (1.64 %)	385 (3.47 %)	n/a	25.06 (99.35 %)	1,432 (0.66 %)	1,513 (0.66 %)	3,228 (99.34 %)	12,002 (6.09 %)	5,002 (3.61 %)	148,823 (39.49 %)	315 (1.48 %)	2,456 (4.70 %)	9 (0.09 %)	7 (0.08 %)
729	E.histolytica (KU48 2021) GCA_019059535.1	n/a	n/a	478 (1.53 %)	258 (3.02 %)	n/a	24.47 (99.99 %)	402 (0.00 %)	402 (0.00 %)	1,570 (100.00 %)	13,541 (4.92 %)	9,349 (2.41 %)	152,106 (44.90 %)	0 (0 %)	1,251 (0.95 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)
730	E.histolytica (KU50 2021) GCA_020283535.1	n/a	n/a	298 (1.16 %)	161 (2.01 %)	n/a	25.29 (99.98 %)	1,136 (0.01 %)	1,136 (0.01 %)	2,199 (99.99 %)	9,549 (4.67 %)	5,089 (1.86 %)	111,149 (39.91 %)	0 (0 %)	655 (0.51 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)
731	E.histolytica HM-1:IMSS (Rahman 2021) GCA_917563895.1	n/a	n/a	1,078 (2.50 %)	3,711 (10.56 %)	n/a	30.57 (92.40 %)	2,116 (7.49 %)	2,116 (7.49 %)	20,637 (92.51 %)	23,441 (16.70 %)	7,828 (1.35 %)	178,838 (36.11 %)	7 (0.01 %)	770 (0.22 %)	4,243 (8.76 %)	4,090 (8.31 %)
732	E.invadens (IP1 2013) GCF_000330505.1	11,997 (38.43 %)	n/a	602 (0.86 %)	2,713 (19.71 %)	n/a	30.19 (99.10 %)	3,823 (0.94 %)	3,823 (0.94 %)	4,967 (99.06 %)	20,914 (4.68 %)	8,763 (1.15 %)	299,107 (36.44 %)	2 (0.00 %)	1,500 (0.50 %)	176 (0.14 %)	165 (0.14 %)
733	E.moshkovskii (Laredo 2018) GCA_002914575.1	n/a	n/a	542 (1.25 %)	372 (3.44 %)	n/a	29.48 (90.06 %)	0 (0 %)	2,211 (9.94 %)	4,607 (100.00 %)	9,469 (2.10 %)	3,990 (1.15 %)	208,333 (31.48 %)	0 (0 %)	2,141 (0.68 %)	8 (0.02 %)	6 (0.02 %)
734	E.nuttalli (P19 2012) GCA_000257125.1	n/a	6,193 (56.11 %)	391 (1.42 %)	210 (1.80 %)	n/a	25.02 (99.62 %)	1,045 (0.34 %)	1,045 (0.34 %)	6,278 (99.66 %)	10,408 (4.08 %)	4,007 (1.25 %)	143,457 (39.64 %)	0 (0 %)	459 (0.24 %)	8 (0.02 %)	8 (0.02 %)
735	E.nuttalli (P19 2012) GCF_000257125.1	6,187 (56.11 %)	n/a	391 (1.42 %)	211 (1.79 %)	n/a	25.02 (99.62 %)	1,045 (0.34 %)	1,045 (0.34 %)	6,278 (99.66 %)	9,682 (3.80 %)	4,007 (1.25 %)	143,457 (39.64 %)	0 (0 %)	459 (0.24 %)	8 (0.02 %)	8 (0.02 %)
736	Eastern chimpanzee simian foamy virus (2018) GCF_003032765.1	n/a	5 (93.39 %)	n/a	n/a	n/a	37.99 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.77 %)	n/a	8 (0.77 %)	0 (0 %)	3 (18.77 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
737	Eastern equine encephalitis virus (ssp. North American variant 1991) GCF_000862705.1	n/a	5 (96.00 %)	n/a	n/a	n/a	48.71 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (0.91 %)	n/a	3 (0.64 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (23.55 %)	4 (11.72 %)
738	ebolavirus (Bundibugyo virus/H.sapiens-tc/UGA/2007/Butalya-811250 2010) GCF_000889155.1	n/a	11 (96.40 %)	n/a	n/a	n/a	42.01 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.45 %)	n/a	17 (0.92 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
739	ebolavirus (Reston virus/M.fascicularis-tc/USA/1989/Philippines89-Pennsylvania 2002) GCF_000854085.1	n/a	11 (98.80 %)	n/a	n/a	n/a	40.62 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.55 %)	n/a	6 (0.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
740	ebolavirus (Sudan virus/H.sapiens-tc/UGA/2000/Gulu-808892 2004) GCF_000855585.1	n/a	11 (96.95 %)	n/a	n/a	n/a	41.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	10 (0.49 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
741	ebolavirus (Tai Forest virus/H.sapiens-tc/CIV/1994/Pauleoula-CI 2010) GCF_000888475.1	n/a	11 (96.41 %)	n/a	n/a	n/a	42.26 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.50 %)	n/a	24 (1.26 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
742	Echarate virus (2021) GCF_013086425.1	n/a	4 (94.01 %)	n/a	n/a	n/a	39.66 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.97 %)	2 (0.45 %)	20 (2.92 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
743	Ehrlichia canis str. (Jake 2005) GCF_000012565.1	n/a	991 (72.73 %)	n/a	n/a	n/a	28.96 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	94 (2.37 %)	8,946 (15.16 %)	0 (0 %)	241 (1.63 %)	2 (0.04 %)	2 (0.04 %)
744	Ehrlichia chaffeensis str. (Arkansas 2006) GCF_000013145.1	n/a	971 (78.48 %)	n/a	n/a	n/a	30.10 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	213 (1.10 %)	157 (4.45 %)	8,909 (15.31 %)	0 (0 %)	414 (3.35 %)	2 (0.04 %)	2 (0.04 %)
745	Ehrlichia japonica (HF 2014) GCF_000632845.1	n/a	943 (76.83 %)	n/a	n/a	n/a	29.65 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	124 (4.25 %)	9,469 (16.92 %)	0 (0 %)	413 (3.20 %)	1 (0.02 %)	1 (0.02 %)
746	Ehrlichia minasensis (B11 2019) GCF_004181775.1	n/a	1,027 (71.94 %)	n/a	n/a	n/a	29.48 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	55 (100.00 %)	n/a	126 (1.96 %)	9,219 (15.25 %)	0 (0 %)	221 (1.54 %)	4 (0.41 %)	4 (0.38 %)
747	Ehrlichia muris (AS145 2013) GCF_000508225.1	n/a	950 (75.19 %)	n/a	n/a	n/a	29.66 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	169 (6.11 %)	9,879 (16.92 %)	0 (0 %)	472 (6.23 %)	2 (0.07 %)	2 (0.07 %)
748	Ekpoma virus 1 (EKV-1 2018) GCF_002815855.1	n/a	8 (98.40 %)	n/a	n/a	n/a	40.35 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (0.96 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
749	Ekpoma virus 2 (EKV-2 2018) GCF_002815875.1	n/a	8 (96.76 %)	n/a	n/a	n/a	39.26 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.54 %)	1 (3.07 %)	16 (1.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
750	Endotrypanum monterogeii (LV88 2016) GCA_000333855.2	n/a	n/a	639 (1.18 %)	2,445 (41.14 %)	n/a	52.77 (98.42 %)	1,558 (1.59 %)	1,558 (1.59 %)	3,517 (98.41 %)	33,804 (3.74 %)	14,227 (2.30 %)	202,978 (19.63 %)	56 (0.14 %)	8,752 (3.61 %)	1,475 (96.43 %)	2,129 (6.81 %)
751	Enterovirus 5666/sin/002209 (2001) GCA_031116435.1	n/a	1 (88.81 %)	n/a	n/a	n/a	48.02 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.40 %)	1 (3.40 %)
752	Enterovirus 5865/sin/000009 (2001) GCA_031116425.1	n/a	1 (88.81 %)	n/a	n/a	n/a	48.03 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.40 %)	1 (3.40 %)
753	enterovirus A114 (V13-0285 2016) GCF_001684625.1	n/a	1 (89.76 %)	n/a	n/a	n/a	47.55 (99.97 %)	4 (0.05 %)	4 (0.05 %)	5 (99.95 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (5.74 %)	1 (5.74 %)
754	Enterovirus A71 (BrCr 1996) GCA_008766895.1	n/a	1 (88.85 %)	n/a	n/a	n/a	47.66 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.63 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (5.09 %)	1 (5.09 %)
755	Enterovirus A71 (pinf7-54A 2005) GCA_031109255.1	n/a	1 (88.18 %)	n/a	n/a	n/a	47.90 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.72 %)	1 (0.72 %)	1 (0.74 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
756	enterovirus D68 (Fermon 2018) GCF_002816725.1	n/a	1 (89.14 %)	n/a	n/a	n/a	41.07 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
757	Eothenomys miletus hantavirus (LX309 2018) GCF_002827125.1	n/a	3 (91.02 %)	n/a	n/a	n/a	37.39 (99.94 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	5 (0.87 %)	n/a	18 (2.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
758	Epstein-Barr virus (Raji 2005) GCF_002402265.1	n/a	98 (77.44 %)	n/a	n/a	n/a	59.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	30 (0.66 %)	34 (5.62 %)	577 (10.56 %)	0 (0 %)	37 (4.64 %)	27 (45.97 %)	24 (34.81 %)
759	Epstein-Barr virus type 2 (AG876 2007) GCF_000872045.1	n/a	114 (68.90 %)	n/a	n/a	n/a	59.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	34 (0.79 %)	29 (5.78 %)	498 (10.10 %)	0 (0 %)	30 (4.53 %)	24 (45.98 %)	21 (35.33 %)
760	ergot fungus (20.1 2012) GCA_000347355.1	n/a	24,186 (41.52 %)	1,364 (3.37 %)	4,469 (21.12 %)	n/a	51.77 (96.31 %)	0 (0 %)	1,252 (3.71 %)	191 (100.00 %)	9,467 (1.44 %)	5,907 (1.06 %)	124,165 (9.89 %)	37 (0.07 %)	6,851 (1.78 %)	824 (68.26 %)	1,460 (4.04 %)
761	Erve virus (2012) GCA_001629985.1	n/a	3 (97.03 %)	n/a	n/a	n/a	38.56 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.67 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
762	European bat 2 lyssavirus (RV1333 2015) GCF_000871625.2	n/a	5 (90.69 %)	n/a	n/a	n/a	44.80 (100.00 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.50 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
763	European brown hare syndrome virus (EBHSV-GD 2000) GCF_000857785.1	n/a	2 (98.66 %)	n/a	n/a	n/a	49.34 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.79 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.24 %)	1 (3.24 %)
764	Fathead minnow calicivirus (FHMCV/USA/MN/2012 2017) GCF_002285005.1	n/a	2 (98.66 %)	n/a	n/a	n/a	50.67 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (65.78 %)	3 (59.02 %)
765	Feline calicivirus (2023) GCF_008767155.1	n/a	2 (95.03 %)	n/a	n/a	n/a	46.14 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
766	Feline calicivirus (Urbana 2003) GCF_000853345.1	n/a	3 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	45.17 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
767	fission yeast (v2 972h- 2019 genbank) GCA_000002945.3	n/a	17,791 (77.29 %)	5,084 (73.46 %)	3,394 (39.28 %)	n/a	36.06 (100.00 %)	6 (0.00 %)	6 (0.00 %)	9 (100.00 %)	3,053 (1.03 %)	1,034 (0.58 %)	79,714 (16.06 %)	1 (0.01 %)	411 (0.72 %)	105 (0.31 %)	95 (0.28 %)
768	fission yeast (v2 972h- 2019 refseq) GCF_000002945.2	12,401 (87.57 %)	n/a	5,085 (73.30 %)	3,402 (39.28 %)	n/a	36.05 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	4 (100.00 %)	3,060 (1.04 %)	1,034 (0.58 %)	80,463 (16.22 %)	1 (0.01 %)	411 (0.72 %)	105 (0.31 %)	95 (0.28 %)
769	Fiwi virus (FIWIV CH17 2023) GCF_023131885.1	n/a	7 (94.31 %)	n/a	n/a	n/a	53.32 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (7.96 %)	4 (7.96 %)
770	fly C.sonorensis (2021) GCA_900258525.3	n/a	n/a	4,888 (3.18 %)	3,248 (5.21 %)	n/a	28.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,858 (100.00 %)	153,327 (4.21 %)	50,490 (3.70 %)	1,549,489 (48.15 %)	0 (0 %)	38,298 (2.53 %)	65 (0.01 %)	49 (0.01 %)
771	fly D.melanogaster GCF_000001215.4	34,530 (25.13 %)	n/a	13,636 (19.60 %)	20,290 (18.02 %)	34,884 (25.28 %)	42.01 (99.20 %)	0 (0 %)	572 (0.80 %)	1,870 (100.00 %)	134,442 (20.61 %)	35,076 (2.73 %)	767,882 (23.39 %)	15 (0.00 %)	48,027 (5.21 %)	27,513 (14.85 %)	20,892 (9.79 %)
772	fly L.longipalpis (2012) GCA_000265325.1	n/a	n/a	4,900 (3.54 %)	10,763 (11.07 %)	n/a	35.01 (92.62 %)	24,164 (7.43 %)	25,223 (7.43 %)	35,696 (92.57 %)	47,662 (1.44 %)	27,227 (1.42 %)	1,173,513 (34.29 %)	211 (0.10 %)	128,553 (15.11 %)	6,564 (1.68 %)	5,469 (1.41 %)
773	fly L.longipalpis (SR_M1_2022 2022) GCF_024334085.1	21,589 (21.93 %)	n/a	5,325 (4.05 %)	9,317 (12.56 %)	n/a	35.48 (99.92 %)	251 (0.08 %)	251 (0.08 %)	255 (99.92 %)	52,585 (1.56 %)	28,741 (2.29 %)	1,157,410 (37.08 %)	8 (0.01 %)	n/a	7,100 (1.97 %)	5,813 (1.60 %)
774	fly P.argentipes (2022) GCF_947086385.1	16,117 (25.88 %)	n/a	5,401 (6.29 %)	13,675 (19.46 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	66 (100.00 %)	20,506 (0.74 %)	6,442 (0.64 %)	656,248 (19.62 %)	0 (0 %)	7,512 (0.87 %)	15,461 (14.02 %)	13,332 (10.60 %)
775	fly P.papatasi (2012) GCA_000262795.1	n/a	n/a	4,988 (1.27 %)	16,115 (4.96 %)	n/a	33.60 (94.92 %)	32,373 (5.05 %)	32,373 (5.05 %)	139,199 (94.95 %)	96,645 (1.31 %)	105,833 (2.19 %)	2,723,703 (43.70 %)	632 (0.13 %)	n/a	3,667 (0.35 %)	2,680 (0.26 %)
776	fly P.papatasi (M1 2022) GCF_024763615.1	21,696 (9.33 %)	n/a	5,466 (1.74 %)	10,123 (6.25 %)	n/a	33.78 (99.90 %)	0 (0 %)	704 (0.10 %)	646 (100.00 %)	99,587 (1.21 %)	104,588 (8.35 %)	2,281,058 (48.95 %)	8 (0.00 %)	141,672 (3.48 %)	4,094 (0.44 %)	2,945 (0.32 %)
777	Foot-and-mouth disease virus O (O6 o6pirbright iso58 2018) GCF_002816555.1	n/a	1 (85.34 %)	n/a	n/a	n/a	53.82 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.30 %)	2 (0.34 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (90.85 %)	2 (90.85 %)
778	Fort Sherman virus (86MSP18 2019) GCF_004789975.1	n/a	4 (95.36 %)	n/a	n/a	n/a	34.88 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.80 %)	n/a	19 (1.87 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
779	Francisella tularensis subsp. novicida (D9876 2015) GCF_000833355.1	n/a	1,811 (91.59 %)	n/a	n/a	n/a	32.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	35 (0.55 %)	12,202 (13.75 %)	0 (0 %)	132 (0.38 %)	11 (0.24 %)	11 (0.24 %)
780	Fugong virus (FG10 2017) GCF_002118945.1	n/a	3 (93.43 %)	n/a	n/a	n/a	36.93 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	15 (1.61 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
781	fungi A.variabilis (NCCPF 102052 2017) GCA_002749535.1	n/a	n/a	1,785 (3.31 %)	6,798 (16.19 %)	n/a	41.65 (98.52 %)	0 (0 %)	715 (1.49 %)	411 (100.00 %)	10,666 (1.24 %)	4,042 (1.08 %)	156,848 (12.68 %)	106 (0.39 %)	2,893 (1.63 %)	2,473 (2.59 %)	1,973 (1.94 %)
782	fungi L.ramosa (KPH11 2019) GCA_008728235.1	n/a	n/a	1,820 (4.04 %)	7,574 (20.61 %)	n/a	41.38 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	10,926 (2.46 %)	3,224 (0.84 %)	146,627 (13.65 %)	0 (0 %)	4,504 (3.39 %)	86 (0.07 %)	52 (0.04 %)
783	fungi M.circinelloides (1006PhL 2013) GCA_000401635.1	n/a	12,410 (47.39 %)	1,968 (4.23 %)	11,092 (31.68 %)	n/a	39.49 (93.92 %)	989 (6.09 %)	989 (6.09 %)	1,459 (93.91 %)	16,402 (1.83 %)	5,949 (0.78 %)	155,841 (14.35 %)	50 (0.07 %)	1,603 (0.60 %)	217 (0.16 %)	131 (0.10 %)
784	fungi M.lusitanicus (CBS 277.49 2016) GCA_001638945.1	n/a	11,941 (37.74 %)	1,959 (3.93 %)	10,678 (29.64 %)	n/a	42.17 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	21 (100.00 %)	13,106 (1.46 %)	5,056 (1.05 %)	155,423 (18.64 %)	0 (0 %)	4,357 (1.60 %)	2,464 (3.15 %)	1,822 (2.16 %)
785	fungi P.blakesleeanus NRRL 1555(-) GCF_001638985.1	16,543 (35.04 %)	n/a	1,830 (2.46 %)	8,050 (14.98 %)	n/a	35.78 (98.94 %)	270 (1.06 %)	290 (1.06 %)	350 (98.94 %)	84,763 (7.85 %)	36,781 (3.26 %)	374,361 (28.75 %)	2 (0.01 %)	8,913 (2.52 %)	1,774 (1.45 %)	1,595 (1.27 %)
786	fungi R.microsporus var. microsporus (ATCC 52814 2017) GCA_002083745.1	n/a	11,554 (55.78 %)	1,688 (4.95 %)	5,957 (23.51 %)	n/a	37.42 (99.76 %)	223 (0.24 %)	223 (0.24 %)	783 (99.76 %)	12,801 (2.07 %)	3,957 (0.68 %)	146,612 (17.18 %)	9 (0.01 %)	361 (0.19 %)	338 (0.49 %)	276 (0.39 %)
787	Gammapapillomavirus sp. (GammaDyskD_w07c34d 2019) GCF_004131625.1	n/a	6 (92.05 %)	n/a	n/a	n/a	35.95 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.82 %)	1 (0.86 %)	23 (5.21 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
788	Gammapapillomavirus sp. (Gammai915_ga2c70 2019) GCF_004131645.1	n/a	7 (92.78 %)	n/a	n/a	n/a	37.08 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.56 %)	8 (1.03 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
789	Gammapapillomavirus sp. (GammaiCH2_EV03c434 2019) GCF_004131665.1	n/a	7 (92.78 %)	n/a	n/a	n/a	35.74 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (2.66 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.79 %)	1 (3.79 %)
790	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_LCOSOc196 2019) GCF_004131525.1	n/a	7 (92.90 %)	n/a	n/a	n/a	37.15 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	21 (3.44 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.35 %)	1 (3.35 %)
791	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w11C51 2019) GCF_004131545.1	n/a	7 (93.37 %)	n/a	n/a	n/a	36.15 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.31 %)	n/a	9 (1.36 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
792	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w23c08c 2019) GCF_004131565.1	n/a	7 (92.58 %)	n/a	n/a	n/a	37.70 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.48 %)	n/a	12 (1.77 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
793	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w27c03a 2019) GCF_004131685.1	n/a	7 (93.31 %)	n/a	n/a	n/a	38.27 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.22 %)	1 (3.22 %)
794	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w27c157c 2019) GCF_004131585.1	n/a	6 (92.56 %)	n/a	n/a	n/a	35.63 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.28 %)	n/a	14 (1.98 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
795	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w34c04a 2019) GCF_004131605.1	n/a	6 (92.68 %)	n/a	n/a	n/a	35.88 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	21 (3.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
796	GB virus C (1996) GCF_000862005.1	n/a	1 (91.81 %)	n/a	n/a	n/a	59.09 (99.98 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (1.67 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (82.30 %)	2 (82.30 %)
797	Gemycircularvirus (HV-GcV1 2016) GCF_001679855.1	n/a	4 (85.16 %)	n/a	n/a	n/a	52.74 (99.82 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.31 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (84.05 %)	2 (84.05 %)
798	Gemycircularvirus (HV-GcV2 2016) GCF_001679875.1	n/a	3 (86.34 %)	n/a	n/a	n/a	53.63 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (88.59 %)	1 (88.59 %)
799	Gemycircularvirus (SL1 2015) GCF_000973195.1	n/a	3 (87.86 %)	n/a	n/a	n/a	50.89 (99.82 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.46 %)	1 (1.46 %)	1 (1.46 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (90.45 %)	1 (90.45 %)
800	Gemycircularvirus C1c (GemyC1c 2018) GCF_002826005.1	n/a	1 (45.38 %)	n/a	n/a	n/a	50.12 (99.81 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.42 %)	1 (2.42 %)	3 (4.36 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (56.47 %)	2 (56.47 %)
801	Gemycircularvirus sp. (Vietnam 2023) GCF_018591295.1	n/a	3 (87.17 %)	n/a	n/a	n/a	47.97 (99.82 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.32 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (44.43 %)	2 (27.87 %)
802	GIII (Norovirus Bo/GIII.2/Adam/2006/No 2016) GCF_001595675.1	n/a	3 (99.14 %)	n/a	n/a	n/a	57.11 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (1.01 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	6 (36.84 %)	6 (34.66 %)
803	glomeromycetes (A1 2016) GCA_001593125.1	n/a	26,582 (22.50 %)	1,121 (0.67 %)	6,451 (4.51 %)	n/a	27.23 (95.29 %)	14,205 (4.72 %)	14,205 (4.72 %)	25,401 (95.28 %)	106,779 (4.31 %)	75,470 (4.67 %)	1,102,046 (42.45 %)	629 (0.19 %)	42,591 (2.60 %)	109 (0.03 %)	78 (0.02 %)
804	glomeromycetes (C2 2021) GCA_020716745.1	n/a	n/a	1,177 (0.52 %)	12,480 (7.17 %)	n/a	28.23 (99.99 %)	163 (0.01 %)	163 (0.01 %)	196 (99.99 %)	134,055 (3.98 %)	121,581 (7.12 %)	1,334,821 (43.20 %)	1 (0.00 %)	110,578 (5.28 %)	278 (0.05 %)	195 (0.04 %)
805	glomeromycetes (DAOM-197198 2021) GCA_020716725.1	n/a	n/a	1,156 (0.56 %)	9,915 (6.55 %)	n/a	27.82 (100.00 %)	74 (0.01 %)	74 (0.01 %)	107 (99.99 %)	125,367 (4.04 %)	107,204 (6.85 %)	1,270,562 (44.14 %)	0 (0 %)	96,631 (5.38 %)	234 (0.05 %)	151 (0.03 %)
806	Goose calicivirus (N 2014) GCF_000920715.1	n/a	2 (97.15 %)	n/a	n/a	n/a	54.67 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (41.13 %)	1 (41.13 %)
807	grass mildew (2019) GCA_900519115.1	n/a	8,588 (6.69 %)	1,393 (0.78 %)	18,180 (17.37 %)	n/a	43.75 (99.90 %)	697 (0.10 %)	697 (0.10 %)	708 (99.90 %)	180,000 (74.24 %)	16,573 (1.14 %)	566,860 (33.28 %)	2 (0.00 %)	42,124 (5.11 %)	16,363 (11.46 %)	3,066 (1.45 %)
808	grass mildew (RACE1 RACE1 2018) GCA_900237765.1	n/a	7,147 (12.25 %)	1,381 (0.93 %)	16,370 (20.47 %)	n/a	43.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	99 (100.00 %)	135,475 (73.92 %)	10,656 (0.71 %)	454,865 (29.77 %)	0 (0 %)	34,253 (4.29 %)	13,666 (10.89 %)	3,225 (2.01 %)
809	grass mildew (THUN-12 2021) GCA_905067625.1	n/a	7,993 (7.27 %)	1,445 (0.78 %)	18,423 (17.90 %)	n/a	43.66 (100.00 %)	0 (0 %)	18 (0.00 %)	36 (100.00 %)	18,823 (0.77 %)	13,963 (1.11 %)	567,352 (33.52 %)	0 (0 %)	36,616 (4.34 %)	16,126 (11.23 %)	6,213 (2.63 %)
810	Great Island virus (CanAr 42 2010) GCF_000887635.1	n/a	11 (95.17 %)	n/a	n/a	n/a	57.79 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	4 (0.19 %)	n/a	17 (1.06 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	10 (95.67 %)	10 (95.67 %)
811	greater mouse-eared bat (2020 Bat1K) GCF_014108235.1	70,930 (3.43 %)	n/a	19,052 (1.84 %)	21,498 (1.73 %)	n/a	43.11 (98.55 %)	0 (0 %)	538 (1.45 %)	93 (100.00 %)	3,088,083 (26.27 %)	753,124 (2.84 %)	10,383,466 (35.84 %)	0 (0 %)	499,733 (1.88 %)	61,023 (2.69 %)	54,015 (1.81 %)
812	Grimontia hollisae (FDAARGOS_111 2018) GCF_001558255.2	n/a	3,659 (88.17 %)	n/a	n/a	n/a	49.51 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	86 (0.49 %)	10,545 (4.43 %)	0 (0 %)	164 (0.44 %)	166 (62.55 %)	211 (6.15 %)
813	Grotenhout virus (Gierle-1 2023) GCF_018594915.1	n/a	2 (86.62 %)	n/a	n/a	n/a	44.02 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	5 (0.45 %)	n/a	18 (1.68 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
814	Guaroa virus (BeH22063 2017) GCF_002118805.1	n/a	5 (95.03 %)	n/a	n/a	n/a	34.13 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.46 %)	n/a	10 (1.74 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
815	Guenon simian foamy virus (Cercopithecus nictitans AG16 2019) GCF_003032775.1	n/a	6 (76.21 %)	n/a	n/a	n/a	38.62 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (1.09 %)	n/a	5 (0.38 %)	0 (0 %)	1 (25.93 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
816	Gulf Coast tick (SK-2019 2022) GCA_023969395.1	n/a	n/a	4,023 (0.13 %)	138,157 (5.19 %)	n/a	45.98 (95.31 %)	94,750 (4.70 %)	94,750 (4.70 %)	220,627 (95.30 %)	741,322 (1.27 %)	402,846 (1.32 %)	9,240,218 (34.27 %)	5,734 (0.12 %)	n/a	402,250 (21.95 %)	248,857 (5.86 %)
817	Gyrovirus (Tu243 2013) GCF_000913875.1	n/a	3 (75.54 %)	n/a	n/a	n/a	48.51 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (5.69 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (17.67 %)	0 (0.00 %)
818	Gyrovirus (Tu789 2013) GCF_000912415.1	n/a	3 (80.81 %)	n/a	n/a	n/a	52.68 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (3.94 %)	12 (10.96 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (43.30 %)	1 (31.38 %)
819	Gyrovirus 4 (D137 2012) GCF_000899075.1	n/a	2 (74.58 %)	n/a	n/a	n/a	49.46 (99.80 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (3.88 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (43.41 %)	1 (43.41 %)
820	Gyrovirus GyV3 (FecGy 2012) GCF_000896975.1	n/a	3 (81.48 %)	n/a	n/a	n/a	52.70 (99.83 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.97 %)	n/a	6 (4.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (43.37 %)	1 (43.37 %)
821	H.meleagridis (2922-C6/04-10x 2021) GCA_020186115.1	n/a	11,119 (30.29 %)	1,098 (1.30 %)	1,262 (9.18 %)	n/a	28.66 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	187 (100.00 %)	18,568 (2.23 %)	13,002 (5.29 %)	392,188 (38.57 %)	0 (0 %)	17,553 (3.51 %)	239 (0.23 %)	218 (0.20 %)
822	H.meleagridis (2922-C6/04-10x 2021) GCF_020186115.1	11,119 (30.29 %)	n/a	1,098 (1.30 %)	1,262 (9.18 %)	n/a	28.66 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	190 (100.00 %)	18,568 (2.23 %)	13,002 (5.29 %)	392,188 (38.57 %)	0 (0 %)	17,555 (3.51 %)	239 (0.23 %)	218 (0.20 %)
823	H.meleagridis (2922-C6/04-290x 2021) GCA_020184695.1	n/a	11,137 (30.16 %)	1,071 (1.28 %)	1,331 (9.18 %)	n/a	28.77 (100.00 %)	12 (0.00 %)	12 (0.00 %)	293 (100.00 %)	17,978 (2.13 %)	13,344 (4.91 %)	390,447 (38.11 %)	0 (0 %)	15,807 (3.05 %)	249 (0.28 %)	228 (0.24 %)
824	Hantaan orthohantavirus (76-118 2003) GCF_000856085.1	n/a	3 (94.17 %)	n/a	n/a	n/a	38.56 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.78 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
825	Hantavirus (Z10 2004) GCF_000855785.1	n/a	3 (94.13 %)	n/a	n/a	n/a	39.29 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.38 %)	1 (0.30 %)	14 (1.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
826	Heartland virus (Patient1 2014) GCF_000922255.1	n/a	4 (96.17 %)	n/a	n/a	n/a	46.33 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
827	Heartland virus (TN 2023) GCF_013086545.1	n/a	4 (96.63 %)	n/a	n/a	n/a	46.52 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
828	heartwater rickettsia (Welgevonden 2005) GCF_000026005.1	n/a	995 (63.16 %)	n/a	n/a	n/a	27.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	205 (5.16 %)	12,505 (19.73 %)	0 (0 %)	656 (3.74 %)	2 (0.04 %)	2 (0.04 %)
829	Hendra henipavirus (1998) GCF_000852685.1	n/a	9 (82.12 %)	n/a	n/a	n/a	39.43 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.38 %)	n/a	13 (0.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
830	Hepacivirus platyrrhini (2018) GCF_002820785.1	n/a	1 (94.01 %)	n/a	n/a	n/a	50.47 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.30 %)	1 (0.30 %)	4 (0.52 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (5.22 %)	2 (5.22 %)
831	Hepatitis B virus (2015) GCF_000861825.2	n/a	4 (55.31 %)	n/a	n/a	n/a	48.46 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (12.45 %)	1 (12.45 %)
832	Hepatitis C virus genotype 3 (NZL1 2007) GCF_000874285.1	n/a	3 (95.88 %)	n/a	n/a	n/a	55.65 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.33 %)	n/a	8 (0.95 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	6 (52.40 %)	6 (52.27 %)
833	Hepatitis C virus genotype 4 (ED43 2007) GCF_000874265.1	n/a	3 (96.50 %)	n/a	n/a	n/a	56.18 (100.00 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	5 (0.66 %)	n/a	5 (0.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (70.23 %)	4 (70.23 %)
834	Hepatitis C virus genotype 5 (EUH1480 2007) GCF_000873605.1	n/a	3 (96.81 %)	n/a	n/a	n/a	57.09 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (1.62 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (70.82 %)	4 (62.64 %)
835	Hepatitis C virus genotype 7 (QC69 2016) GCF_001712785.1	n/a	3 (95.88 %)	n/a	n/a	n/a	56.81 (99.97 %)	12 (0.13 %)	12 (0.13 %)	13 (99.87 %)	4 (0.27 %)	1 (0.26 %)	8 (0.84 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	10 (48.13 %)	9 (45.23 %)
836	hepatitis D virus 1 (TW2667 2023) GCF_018547865.1	n/a	2 (38.48 %)	n/a	n/a	n/a	58.93 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (3.46 %)	1 (1.97 %)	3 (4.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (80.79 %)	1 (80.79 %)
837	hepatitis D virus 2 (TW2476 2023) GCF_018547875.1	n/a	2 (38.30 %)	n/a	n/a	n/a	59.58 (99.76 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (2.02 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (72.92 %)	1 (72.92 %)
838	hepatitis D virus 4 (TW-2b Taiwan isolate 2023) GCF_003033645.1	n/a	1 (34.90 %)	n/a	n/a	n/a	60.66 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.42 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (99.52 %)	1 (99.52 %)
839	Hepatitis delta virus (dFr2005 2023) GCF_018547925.1	n/a	1 (38.42 %)	n/a	n/a	n/a	60.24 (99.88 %)	8 (0.47 %)	8 (0.47 %)	9 (99.53 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (4.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (80.44 %)	1 (80.44 %)
840	Hepatitis delta virus (dFr2072 2023) GCF_018547915.1	n/a	1 (35.06 %)	n/a	n/a	n/a	60.78 (99.94 %)	3 (0.24 %)	3 (0.24 %)	4 (99.76 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (4.94 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (76.26 %)	1 (76.26 %)
841	Hepatitis delta virus (dFr2158 2023) GCF_018547935.1	n/a	1 (38.90 %)	n/a	n/a	n/a	60.42 (99.76 %)	15 (0.96 %)	15 (0.96 %)	16 (99.04 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (3.70 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (96.83 %)	2 (85.96 %)
842	Hepatitis delta virus (VnzD8349 2023) GCF_018547805.1	n/a	1 (35.22 %)	n/a	n/a	n/a	60.46 (99.82 %)	10 (0.72 %)	10 (0.72 %)	11 (99.28 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.54 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (87.09 %)	2 (87.09 %)
843	Hepatovirus A (1993) GCF_000860505.1	n/a	3 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	37.87 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.45 %)	1 (0.47 %)	1 (0.53 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
844	Hepatovirus A (2ID 2023) GCA_008776015.1	n/a	1 (89.26 %)	n/a	n/a	n/a	33.72 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.57 %)	n/a	12 (3.99 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
845	Herpes simplex virus type 1 (17 1990) GCF_000859985.2	n/a	81 (86.40 %)	n/a	n/a	n/a	68.30 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	81 (2.72 %)	51 (2.90 %)	932 (18.12 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (100.00 %)	5 (94.54 %)
846	HMO Astrovirus A (NI-295 2009) GCF_000884395.1	n/a	4 (97.57 %)	n/a	n/a	n/a	43.54 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.11 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
847	house fly (aabys 2013 refseq) GCF_000371365.1	23,245 (4.79 %)	n/a	7,837 (1.36 %)	12,823 (3.07 %)	n/a	35.11 (92.22 %)	83,567 (7.82 %)	102,610 (7.82 %)	104,053 (92.18 %)	415,716 (2.30 %)	376,409 (8.80 %)	4,931,104 (52.61 %)	1,284 (0.11 %)	575,203 (6.40 %)	7,139 (0.35 %)	3,214 (0.17 %)
848	house fly (aabys 2023) GCF_030504385.1	31,571 (5.28 %)	n/a	9,444 (1.28 %)	14,080 (3.72 %)	n/a	35.05 (87.88 %)	0 (0 %)	16,939 (12.13 %)	340 (100.00 %)	523,357 (2.54 %)	511,141 (12.28 %)	5,782,844 (51.27 %)	2 (0.00 %)	1,204,640 (10.45 %)	11,297 (0.48 %)	4,696 (0.19 %)
849	Hudisavirus sp. (P22 2017) GCF_002375055.1	n/a	2 (81.59 %)	n/a	n/a	n/a	51.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.86 %)	1 (1.08 %)	3 (1.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (18.65 %)	1 (10.60 %)
850	Human - Feb. 2022 (GRCh38.p14/hg38) (hg38) GCF_000001405.39	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	41.06 (95.10 %)	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a
851	human alphaherpesvirus 2 (HG52 2013) GCF_000858385.2	n/a	86 (83.37 %)	n/a	n/a	n/a	70.38 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	124 (3.80 %)	64 (3.26 %)	1,158 (23.65 %)	0 (0 %)	20 (0.79 %)	1 (99.99 %)	3 (92.59 %)
852	human associated cyclovirus 10 (7078A 2014) GCF_000918035.2	n/a	2 (86.20 %)	n/a	n/a	n/a	43.41 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
853	human associated gemyvongvirus 1 (DB1 2015) GCF_001448435.1	n/a	4 (89.04 %)	n/a	n/a	n/a	51.81 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.89 %)	1 (1.89 %)	1 (2.24 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (97.10 %)	1 (97.10 %)
854	human associated huchismacovirus 1 (Oregon/6/2011/GottageGrove/5A1 2018) GCF_003033475.1	n/a	2 (69.15 %)	n/a	n/a	n/a	42.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
855	human associated huchismacovirus 2 (France/8/2008/2444 2018) GCF_003033485.1	n/a	2 (69.81 %)	n/a	n/a	n/a	43.97 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.38 %)	2 (0.57 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
856	human associated huchismacovirus 3 (France/1/2009/3664 2018) GCF_003033495.1	n/a	2 (70.27 %)	n/a	n/a	n/a	42.28 (99.84 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (1.79 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
857	Human associated porprismacovirus (16845x3_952 2023) GCF_018583805.1	n/a	2 (70.54 %)	n/a	n/a	n/a	47.72 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.58 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
858	Human associated porprismacovirus 3 (16806x66_213 2023) GCF_018583635.1	n/a	2 (72.49 %)	n/a	n/a	n/a	48.72 (99.87 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (1.72 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (9.00 %)	1 (8.50 %)
859	human astrovirus BF34 (BF34 2014) GCF_000923215.1	n/a	4 (97.29 %)	n/a	n/a	n/a	43.77 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
860	human betaherpesvirus 5 (Merlin 2004) GCF_000845245.1	n/a	194 (84.91 %)	n/a	n/a	n/a	57.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	74 (1.33 %)	28 (0.67 %)	1,047 (7.96 %)	0 (0 %)	2 (0.05 %)	1 (99.99 %)	1 (99.64 %)
861	human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 refseq) GCF_000845685.2	n/a	115 (79.56 %)	n/a	n/a	n/a	42.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	33 (1.67 %)	36 (4.27 %)	603 (9.83 %)	0 (0 %)	52 (1.87 %)	3 (13.72 %)	2 (13.38 %)
862	human betaherpesvirus 6B (Z29 1999) GCF_000846365.1	n/a	128 (82.45 %)	n/a	n/a	n/a	42.77 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	27 (1.57 %)	20 (3.84 %)	652 (8.84 %)	0 (0 %)	49 (1.68 %)	6 (15.35 %)	4 (15.03 %)
863	human betaherpesvirus 7 (RK 1995) GCF_000848125.1	n/a	111 (79.51 %)	n/a	n/a	n/a	36.22 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	16 (1.65 %)	34 (8.04 %)	791 (15.85 %)	0 (0 %)	93 (3.17 %)	3 (5.14 %)	3 (5.14 %)
864	human bocavirus 2c PK (PK-5510 2009) GCF_000882675.1	n/a	4 (87.74 %)	n/a	n/a	n/a	41.59 (99.98 %)	1 (0.02 %)	1 (0.02 %)	2 (99.98 %)	5 (1.23 %)	n/a	5 (0.98 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
865	human bocavirus 3 (W471 2009) GCF_000882855.1	n/a	4 (88.44 %)	n/a	n/a	n/a	42.16 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (1.95 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.96 %)	1 (4.96 %)
866	human bocavirus 4 NI (HBoV4-NI-385 2009) GCF_000886375.1	n/a	6 (92.83 %)	n/a	n/a	n/a	40.41 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (1.06 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
867	human body louse GCF_000006295.1	10,818 (15.37 %)	n/a	3,036 (2.67 %)	2,113 (4.02 %)	n/a	27.47 (97.84 %)	6,673 (2.18 %)	6,673 (2.18 %)	8,555 (97.82 %)	555,824 (20.29 %)	174,660 (6.17 %)	948,197 (65.28 %)	4 (0.00 %)	40,689 (2.24 %)	600 (0.63 %)	473 (0.48 %)
868	human circovirus VS6600022 (VS6600022 2014) GCF_000924015.1	n/a	4 (85.08 %)	n/a	n/a	n/a	47.13 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.85 %)	n/a	1 (0.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (49.61 %)	2 (47.81 %)
869	human coronavirus 229E (2001) GCF_000853505.1	n/a	9 (97.14 %)	n/a	n/a	n/a	38.26 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.31 %)	2 (0.29 %)	57 (2.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
870	human coronavirus HKU1 (HKU1 2004) GCF_000858765.1	n/a	10 (98.07 %)	n/a	n/a	n/a	32.06 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (0.72 %)	1 (1.60 %)	89 (5.62 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
871	human coronavirus NL63 (Amsterdam I 2004) GCF_000853865.1	n/a	8 (97.86 %)	n/a	n/a	n/a	34.46 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (1.09 %)	n/a	84 (5.24 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
872	human coronavirus OC43 (ATCC VR-759 2019) GCF_003972325.1	n/a	11 (97.82 %)	n/a	n/a	n/a	36.79 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.43 %)	1 (0.09 %)	90 (3.88 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
873	human cosavirus (Cosavirus_Amsterdam_1994 2014) GCF_000920655.1	n/a	1 (81.59 %)	n/a	n/a	n/a	43.53 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.59 %)	0 (0 %)	1 (0.97 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
874	human cosavirus B (HCoSV-B1 2263 2009) GCF_000884955.1	n/a	1 (88.49 %)	n/a	n/a	n/a	43.79 (100.00 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.47 %)	n/a	6 (1.35 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
875	Human CSF-associated densovirus (21 2023) GCF_029883595.1	n/a	5 (90.42 %)	n/a	n/a	n/a	40.04 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.66 %)	n/a	2 (0.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
876	human cyclovirus VS5700009 (VS5700009 2013) GCF_000908835.1	n/a	3 (84.17 %)	n/a	n/a	n/a	46.45 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (13.92 %)	1 (13.92 %)
877	human DNA virus (IND-KIs-REVA-1990 2019) GCF_003727435.1	n/a	1 (6.26 %)	n/a	n/a	n/a	53.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.89 %)	n/a	3 (0.59 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (93.16 %)	1 (93.16 %)
878	human endogenous retrovirus K113 (2013) GCF_000913595.1	n/a	1 (22.17 %)	n/a	n/a	n/a	41.86 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.60 %)	n/a	14 (2.49 %)	0 (0 %)	4 (20.38 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
879	human enterovirus 71 HZ08/Hangzhou/2008 (HZ08 2011) GCA_031128755.1	n/a	1 (88.89 %)	n/a	n/a	n/a	47.98 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.14 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.77 %)	1 (4.77 %)
880	human erythrovirus V9 (V9 2001) GCF_000841965.1	n/a	6 (90.67 %)	n/a	n/a	n/a	42.09 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
881	human fecal virus Jorvi2 (Jorvi2 2017) GCF_002219885.1	n/a	5 (72.08 %)	n/a	n/a	n/a	31.11 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (5.43 %)	n/a	20 (11.11 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
882	human fecal virus Jorvi3 (Jorvi3 2017) GCF_002219525.1	n/a	2 (84.04 %)	n/a	n/a	n/a	32.53 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.60 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
883	human fecal virus Jorvi4 (Jorvi4 2017) GCF_002219705.1	n/a	2 (81.18 %)	n/a	n/a	n/a	45.77 (99.87 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.34 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
884	human feces pecovirus (PeCV-NI 2019) GCF_003726995.1	n/a	2 (72.77 %)	n/a	n/a	n/a	50.00 (99.90 %)	1 (0.03 %)	1 (0.03 %)	2 (99.97 %)	5 (2.46 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (55.12 %)	1 (23.39 %)
885	human feces smacovirus 2 (SmaCV2 2018) GCF_003033575.1	n/a	2 (74.86 %)	n/a	n/a	n/a	46.00 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.54 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (19.22 %)	1 (19.22 %)
886	human feces smacovirus 3 (SmaCV3.21 P21 2017) GCF_002271185.1	n/a	2 (72.89 %)	n/a	n/a	n/a	46.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.66 %)	1 (1.56 %)	4 (1.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
887	Human feces smacovirus 3 (SmaCV3_ETH_P15_2016 2023) GCF_003963575.1	n/a	2 (72.88 %)	n/a	n/a	n/a	47.89 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.91 %)	2 (0.56 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (24.13 %)	1 (24.13 %)
888	human gammaherpesvirus 8 (GK18 2007) GCF_000838265.1	n/a	113 (85.53 %)	n/a	n/a	n/a	53.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.18 %)	29 (2.88 %)	151 (3.93 %)	0 (0 %)	18 (0.82 %)	9 (84.42 %)	11 (81.82 %)
889	human gemycircularvirus (GeTz1 2018) GCF_002826025.1	n/a	4 (77.38 %)	n/a	n/a	n/a	49.05 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
890	human genital-associated circular DNA virus-1 (349 2015) GCF_000973295.1	n/a	4 (80.18 %)	n/a	n/a	n/a	54.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (1.21 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (91.86 %)	1 (91.86 %)
891	human hepegivirus (AK-790 2018) GCF_002821385.1	n/a	1 (96.18 %)	n/a	n/a	n/a	53.60 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (88.97 %)	2 (88.81 %)
892	human immunodeficiency virus 1 (1998) GCF_000864765.1	n/a	14 (93.78 %)	n/a	n/a	n/a	42.11 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.57 %)	1 (0.34 %)	18 (3.29 %)	0 (0 %)	1 (2.09 %)	1 (2.29 %)	1 (2.29 %)
893	human immunodeficiency virus 2 (BEN 1993) GCF_000856385.1	n/a	12 (84.81 %)	n/a	n/a	n/a	45.66 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.98 %)	10 (1.44 %)	0 (0 %)	1 (16.51 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
894	Human lung-associated brisavirus AA (2023) GCA_014883685.1	n/a	3 (85.41 %)	n/a	n/a	n/a	34.45 (99.87 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.12 %)	1 (1.25 %)	3 (6.59 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
895	Human lung-associated brisavirus II (2023) GCA_014883695.1	n/a	3 (86.04 %)	n/a	n/a	n/a	33.48 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.16 %)	1 (1.36 %)	2 (4.96 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
896	Human lung-associated brisavirus MD (2023) GCA_014883705.1	n/a	3 (77.31 %)	n/a	n/a	n/a	33.41 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.15 %)	2 (2.62 %)	5 (6.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
897	Human lung-associated brisavirus RC (2023) GCA_014883715.1	n/a	3 (88.73 %)	n/a	n/a	n/a	35.17 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (2.45 %)	1 (1.35 %)	3 (5.95 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
898	human lung-associated vientovirus FB (2021) GCF_013088445.1	n/a	3 (86.49 %)	n/a	n/a	n/a	33.94 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.15 %)	1 (1.34 %)	3 (6.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
899	human mastadenovirus A (Huie 1993) GCF_000846805.1	n/a	43 (94.41 %)	n/a	n/a	n/a	46.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (0.61 %)	n/a	73 (3.33 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	6 (30.52 %)	6 (29.41 %)
900	human mastadenovirus B (GB 2008) GCF_000880515.1	n/a	48 (93.42 %)	n/a	n/a	n/a	51.05 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (0.47 %)	1 (0.18 %)	41 (1.61 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	7 (43.26 %)	7 (42.59 %)
901	human mastadenovirus B (Slobitski 2008) GCF_000857085.1	n/a	46 (93.74 %)	n/a	n/a	n/a	48.88 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.82 %)	3 (0.30 %)	50 (2.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	6 (39.41 %)	6 (39.41 %)
902	human mastadenovirus C (1993) GCF_000845085.1	n/a	63 (97.51 %)	n/a	n/a	n/a	55.20 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	13 (0.89 %)	1 (0.12 %)	105 (4.66 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (70.08 %)	3 (67.42 %)
903	human mastadenovirus D (Hicks; NIAID V-209-003-014 2008) GCF_000845985.1	n/a	47 (93.93 %)	n/a	n/a	n/a	57.10 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.92 %)	1 (0.13 %)	59 (2.95 %)	0 (0 %)	1 (0.27 %)	3 (67.41 %)	3 (67.41 %)
904	human mastadenovirus E (vaccine (CL 68578) 2001) GCF_000859665.1	n/a	40 (96.48 %)	n/a	n/a	n/a	57.67 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (0.65 %)	n/a	107 (4.08 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (73.25 %)	5 (73.25 %)
905	human mastadenovirus F (Dugan 1993) GCF_000846685.1	n/a	44 (94.91 %)	n/a	n/a	n/a	51.22 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.32 %)	n/a	63 (2.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (62.53 %)	2 (60.52 %)
906	human metapneumovirus (00-1 2018) GCF_002815375.1	n/a	9 (93.36 %)	n/a	n/a	n/a	36.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (1.38 %)	1 (0.34 %)	27 (3.46 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
907	human orthopneumovirus (2018) GCF_002815475.1	n/a	12 (97.34 %)	n/a	n/a	n/a	33.24 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.64 %)	1 (0.24 %)	19 (3.32 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
908	human orthopneumovirus (B1 1997) GCF_000855545.1	n/a	10 (97.35 %)	n/a	n/a	n/a	33.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (1.61 %)	2 (0.52 %)	16 (3.21 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
909	human orthorubulavirus 2 (1991) GCF_000863525.1	n/a	8 (98.61 %)	n/a	n/a	n/a	38.41 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.38 %)	n/a	6 (0.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
910	human papillomavirus (SE379 2015) GCF_001274345.1	n/a	6 (93.54 %)	n/a	n/a	n/a	37.49 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.98 %)	1 (2.70 %)	21 (3.02 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
911	human papillomavirus 116 (HPV116 2009) GCF_000884175.1	n/a	7 (93.82 %)	n/a	n/a	n/a	38.50 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.73 %)	1 (4.73 %)
912	human papillomavirus 121 (NJ3301 2010) GCF_000889075.1	n/a	7 (92.45 %)	n/a	n/a	n/a	37.74 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.41 %)	n/a	9 (0.98 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
913	human papillomavirus 126 (HPV126 2011) GCF_000896435.1	n/a	7 (91.96 %)	n/a	n/a	n/a	38.05 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (2.68 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.92 %)	1 (2.92 %)
914	human papillomavirus 127 (R3a 2010) GCF_000890115.1	n/a	8 (93.50 %)	n/a	n/a	n/a	36.98 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (0.79 %)	18 (2.79 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.20 %)	0 (0.00 %)
915	human papillomavirus 132 (27-50 2011) GCF_000888015.1	n/a	7 (93.36 %)	n/a	n/a	n/a	37.94 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.89 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
916	human papillomavirus 134 (39-65 2011) GCF_000889695.1	n/a	7 (92.69 %)	n/a	n/a	n/a	38.14 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.48 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
917	human papillomavirus 135 (NJ3500 2012) GCF_000898235.1	n/a	7 (92.24 %)	n/a	n/a	n/a	36.86 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.56 %)	1 (0.67 %)	14 (2.77 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
918	human papillomavirus 136 (CL3865 2012) GCF_000899695.1	n/a	7 (91.83 %)	n/a	n/a	n/a	38.51 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.85 %)	n/a	19 (3.31 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
919	human papillomavirus 140 (NJ2801C1 2012) GCF_000898855.1	n/a	7 (91.69 %)	n/a	n/a	n/a	39.71 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.79 %)	n/a	4 (1.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
920	human papillomavirus 154 (PV77 2013) GCF_000908695.1	n/a	7 (92.75 %)	n/a	n/a	n/a	37.93 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.37 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
921	human papillomavirus 161 (KC1 2018) GCF_002826985.1	n/a	6 (92.39 %)	n/a	n/a	n/a	37.73 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.36 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
922	human papillomavirus 163 (KC3 2015) GCF_001430115.1	n/a	6 (93.54 %)	n/a	n/a	n/a	37.69 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (1.80 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
923	human papillomavirus 166 (KC9 2012) GCF_000899515.1	n/a	6 (92.72 %)	n/a	n/a	n/a	38.29 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.79 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
924	human papillomavirus 167 (KC10 2013) GCF_000913075.1	n/a	6 (92.78 %)	n/a	n/a	n/a	35.83 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	23 (5.24 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
925	human papillomavirus 172 (2018) GCF_002827005.1	n/a	7 (95.04 %)	n/a	n/a	n/a	37.77 (99.96 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	5 (1.22 %)	n/a	4 (0.60 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
926	human papillomavirus 175 (SE87 2018) GCF_002827025.1	n/a	7 (93.05 %)	n/a	n/a	n/a	38.87 (99.99 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.29 %)	n/a	8 (1.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.46 %)	1 (3.46 %)
927	human papillomavirus 178 (2014) GCF_000918095.1	n/a	7 (92.49 %)	n/a	n/a	n/a	38.15 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.53 %)	2 (0.59 %)	8 (1.35 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
928	human papillomavirus 179 (SIBX16 2013) GCF_000912535.1	n/a	6 (92.78 %)	n/a	n/a	n/a	36.76 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.87 %)	n/a	7 (1.67 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
929	human papillomavirus 18 (2000) GCF_000865665.1	n/a	8 (87.96 %)	n/a	n/a	n/a	40.43 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.70 %)	n/a	12 (3.67 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
930	human papillomavirus 184 (SIBX17 2018) GCF_002987365.1	n/a	6 (92.71 %)	n/a	n/a	n/a	36.89 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.98 %)	1 (0.53 %)	4 (0.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
931	human papillomavirus 187 (ACS447 2018) GCF_003055605.1	n/a	6 (92.85 %)	n/a	n/a	n/a	38.90 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.36 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
932	human papillomavirus 201 (HPV201 2015) GCF_001184845.1	n/a	7 (93.33 %)	n/a	n/a	n/a	37.71 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.48 %)	n/a	5 (0.95 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
933	human papillomavirus 204 (A342 2018) GCF_002827045.1	n/a	7 (92.47 %)	n/a	n/a	n/a	37.84 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.50 %)	n/a	6 (1.44 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.92 %)	1 (2.92 %)
934	human papillomavirus 30 (2018) GCF_002987345.1	n/a	6 (84.46 %)	n/a	n/a	n/a	40.39 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.31 %)	2 (1.03 %)	14 (4.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
935	human papillomavirus 5 (1993) GCF_000866505.1	n/a	8 (92.64 %)	n/a	n/a	n/a	42.39 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (2.94 %)	1 (0.39 %)	13 (3.01 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (7.11 %)	0 (0.00 %)
936	human papillomavirus 71 (2018) GCF_002826825.1	n/a	1 (24.06 %)	n/a	n/a	n/a	44.38 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (2.47 %)	3 (1.63 %)	11 (3.93 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
937	human papillomavirus 9 (1993) GCF_000863685.1	n/a	7 (94.00 %)	n/a	n/a	n/a	41.00 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.14 %)	2 (0.93 %)	13 (2.45 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.63 %)	1 (4.63 %)
938	human papillomavirus KC5 (KC5 2015) GCF_000989155.1	n/a	7 (92.99 %)	n/a	n/a	n/a	36.78 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.71 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
939	human papillomavirus type 10 (1993) GCF_000864905.1	n/a	7 (84.68 %)	n/a	n/a	n/a	45.89 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.78 %)	n/a	16 (3.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
940	human papillomavirus type 128 (2011) GCF_000889675.1	n/a	7 (92.33 %)	n/a	n/a	n/a	35.98 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (3.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
941	human papillomavirus type 129 (2011) GCF_000891495.1	n/a	7 (93.07 %)	n/a	n/a	n/a	37.31 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.82 %)	n/a	3 (0.35 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
942	human papillomavirus type 131 (27-49 2011) GCF_000890535.1	n/a	7 (93.15 %)	n/a	n/a	n/a	37.03 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	17 (2.73 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
943	human papillomavirus type 137 (NJ2801H 2012) GCF_000897255.1	n/a	7 (93.60 %)	n/a	n/a	n/a	37.57 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	16 (2.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
944	human papillomavirus type 144 (CL3740 2012) GCF_000898255.1	n/a	7 (92.09 %)	n/a	n/a	n/a	38.23 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.32 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
945	human papillomavirus type 156 (GC01 2017) GCF_002006915.1	n/a	7 (92.47 %)	n/a	n/a	n/a	36.18 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (1.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
946	human papillomavirus type 16 (1993) GCF_000863945.3	n/a	11 (87.67 %)	n/a	n/a	n/a	36.53 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (3.26 %)	1 (0.32 %)	12 (4.50 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
947	human papillomavirus type 26 (1993) GCF_000866485.1	n/a	6 (84.85 %)	n/a	n/a	n/a	38.60 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (2.74 %)	2 (0.45 %)	14 (5.89 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
948	human papillomavirus type 32 (1993) GCF_000864925.1	n/a	6 (84.42 %)	n/a	n/a	n/a	40.98 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.83 %)	n/a	9 (1.96 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
949	human papillomavirus type 34 (1993) GCF_000863965.1	n/a	6 (85.10 %)	n/a	n/a	n/a	38.25 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.33 %)	3 (1.17 %)	8 (3.52 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
950	human papillomavirus type 49 (1993) GCF_000862825.1	n/a	6 (93.19 %)	n/a	n/a	n/a	41.11 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.81 %)	n/a	11 (2.66 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
951	human papillomavirus type 53 (1993) GCF_000865685.1	n/a	7 (66.96 %)	n/a	n/a	n/a	40.14 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (2.47 %)	n/a	24 (6.16 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
952	human papillomavirus type 54 (1995) GCF_000864725.1	n/a	7 (84.57 %)	n/a	n/a	n/a	41.88 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.32 %)	n/a	9 (3.05 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
953	human papillomavirus type 63 (1993) GCF_000865565.1	n/a	7 (91.55 %)	n/a	n/a	n/a	40.44 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.20 %)	1 (0.59 %)	5 (0.53 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
954	human papillomavirus type 6b (type 6b (HPV6b) 1985) GCF_000861945.1	n/a	9 (89.64 %)	n/a	n/a	n/a	40.87 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.39 %)	1 (0.76 %)	15 (3.21 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
955	human papillomavirus type 7 (1993) GCF_000861925.1	n/a	6 (82.97 %)	n/a	n/a	n/a	39.53 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.73 %)	1 (0.59 %)	13 (3.49 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
956	human papillomavirus type 85 (114B 2017) GCF_002153865.1	n/a	8 (90.54 %)	n/a	n/a	n/a	37.76 (98.31 %)	7 (1.95 %)	7 (1.95 %)	8 (98.05 %)	3 (0.00 %)	n/a	17 (4.34 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
957	human papillomavirus type 90 (2002) GCF_000862685.1	n/a	7 (82.73 %)	n/a	n/a	n/a	46.65 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.95 %)	n/a	10 (3.96 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.53 %)	1 (2.53 %)
958	human papillomavirus type 92 (2003) GCF_000846285.1	n/a	7 (93.86 %)	n/a	n/a	n/a	39.96 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (2.48 %)	3 (1.50 %)	7 (2.92 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.21 %)	1 (3.14 %)
959	human papillomavirus type 96 (2003) GCF_000864825.1	n/a	7 (97.38 %)	n/a	n/a	n/a	40.31 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.81 %)	n/a	21 (3.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.33 %)	1 (3.93 %)
960	human parainfluenza virus 4a (M-25 2013) GCF_000910675.1	n/a	7 (83.27 %)	n/a	n/a	n/a	36.23 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.23 %)	1 (0.22 %)	13 (1.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
961	human parvovirus 4 G1 (2005) GCF_000861005.1	n/a	2 (89.92 %)	n/a	n/a	n/a	44.94 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.87 %)	2 (1.52 %)	4 (0.70 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.85 %)	0 (0.00 %)
962	human pegivirus 2 (UC0125.US 2015) GCF_001310135.2	n/a	1 (92.98 %)	n/a	n/a	n/a	53.96 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.49 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (90.06 %)	2 (90.06 %)
963	human picobirnavirus (Hy005102 2005) GCF_000859285.1	n/a	3 (92.15 %)	n/a	n/a	n/a	46.02 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
964	human poliovirus strain (Sabin 1 2023) GCA_008766755.1	n/a	1 (89.10 %)	n/a	n/a	n/a	46.26 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (7.15 %)	1 (7.15 %)
965	human polyomavirus 1 (1993) GCF_000837865.1	n/a	7 (89.15 %)	n/a	n/a	n/a	39.53 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (2.45 %)	13 (4.13 %)	0 (0 %)	3 (3.59 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
966	human polyomavirus 3 (Stockholm 60 2007) GCF_000873085.1	n/a	6 (88.17 %)	n/a	n/a	n/a	39.37 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.85 %)	26 (6.90 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
967	human polyomavirus 6 (607a 2010) GCF_000888495.1	n/a	6 (89.67 %)	n/a	n/a	n/a	42.66 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
968	human polyomavirus 7 (713a 2010) GCF_000889175.1	n/a	6 (89.14 %)	n/a	n/a	n/a	42.91 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (1.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
969	human polyomavirus 9 (HPyV9 2011) GCF_000891615.1	n/a	6 (88.18 %)	n/a	n/a	n/a	39.16 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	20 (4.74 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
970	Human PoSCV5-like circular virus (MRJ 2023) GCF_013087445.1	n/a	2 (86.31 %)	n/a	n/a	n/a	33.91 (99.90 %)	1 (0.03 %)	1 (0.03 %)	2 (99.97 %)	5 (2.29 %)	1 (1.36 %)	2 (5.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
971	human respirovirus 1 (Washington 1964 2002) GCF_000848705.1	n/a	10 (99.19 %)	n/a	n/a	n/a	37.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (2.19 %)	1 (0.25 %)	4 (1.69 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
972	Human respirovirus 3 (ZHYMgz01 Guangzhou 2023) GCF_006298365.1	n/a	6 (94.02 %)	n/a	n/a	n/a	35.29 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (1.93 %)	n/a	13 (1.30 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
973	human rhinovirus NAT001 (NAT001 2018) GCF_002816885.1	n/a	1 (92.58 %)	n/a	n/a	n/a	43.40 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
974	human rotavirus B (Bang373 2013) GCF_000907835.1	n/a	13 (95.17 %)	n/a	n/a	n/a	36.97 (99.88 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (1.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
975	human RSV respiratory syncytial virus A (S2 ts1C 2000) GCF_000856445.1	n/a	13 (98.68 %)	n/a	n/a	n/a	33.21 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.89 %)	1 (0.26 %)	23 (3.73 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
976	human smacovirus 1 (France/12/2008/3454 2015) GCF_000929235.1	n/a	2 (69.15 %)	n/a	n/a	n/a	43.94 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
977	human stool-associated circular virus NG13 (NG13 2018) GCF_002819605.1	n/a	2 (93.58 %)	n/a	n/a	n/a	43.54 (99.76 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (1.24 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
978	human T-cell leukemia virus type I (1998) GCF_000863585.1	n/a	11 (81.17 %)	n/a	n/a	n/a	53.47 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.33 %)	n/a	19 (2.50 %)	0 (0 %)	1 (5.36 %)	2 (12.06 %)	2 (9.60 %)
979	human T-lymphotropic virus 2 (1993) GCF_000847505.1	n/a	9 (94.24 %)	n/a	n/a	n/a	53.82 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.11 %)	n/a	16 (2.41 %)	0 (0 %)	1 (16.53 %)	2 (6.46 %)	2 (6.46 %)
980	human T-lymphotropic virus 4 (1863LE 2009) GCF_000882595.1	n/a	8 (77.85 %)	n/a	n/a	n/a	56.28 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.51 %)	n/a	30 (5.68 %)	0 (0 %)	2 (15.81 %)	3 (16.69 %)	2 (9.28 %)
981	human TMEV-like cardiovirus (2008) GCF_000875265.1	n/a	3 (86.45 %)	n/a	n/a	n/a	43.58 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.84 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
982	Husavirus sp. (16370_59 2016) GCF_002374975.1	n/a	1 (98.06 %)	n/a	n/a	n/a	52.82 (99.99 %)	4 (0.05 %)	4 (0.05 %)	5 (99.95 %)	4 (0.37 %)	n/a	2 (0.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (99.41 %)	1 (99.41 %)
983	I virus (Cowden 2000) GCF_000849945.1	n/a	2 (99.13 %)	n/a	n/a	n/a	53.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.57 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (10.49 %)	1 (10.49 %)
984	IAS virus (2020) GCF_003443495.1	n/a	116 (90.03 %)	n/a	n/a	n/a	32.03 (99.98 %)	180 (0.31 %)	180 (0.31 %)	181 (99.69 %)	28 (1.11 %)	2 (0.08 %)	327 (5.48 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
985	Igbo Ora virus (IBH10964 1998) GCA_002888815.1	n/a	2 (95.47 %)	n/a	n/a	n/a	48.08 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.42 %)	1 (1.24 %)	2 (0.48 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (13.59 %)	5 (13.59 %)
986	Ilesha virus (R5964 2019) GCF_004789595.1	n/a	4 (95.33 %)	n/a	n/a	n/a	32.35 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.41 %)	n/a	21 (2.74 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
987	Imjin virus (2017) GCF_002146225.1	n/a	3 (94.30 %)	n/a	n/a	n/a	36.50 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (2.23 %)	6 (1.29 %)	9 (2.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
988	Indian encephalitis associated cyclovirus (IECSF08 2017) GCF_001939215.2	n/a	3 (78.82 %)	n/a	n/a	n/a	43.78 (99.83 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.41 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
989	Influenza A virus (A/California/07/2009 2015) GCF_001343785.1	n/a	14 (99.84 %)	n/a	n/a	n/a	43.70 (99.90 %)	4 (0.03 %)	4 (0.03 %)	12 (99.97 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (0.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
990	Influenza A virus (A/Goose/Guangdong/1/96H5N1 2005) GCF_000864105.1	n/a	15 (96.68 %)	n/a	n/a	n/a	44.12 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.35 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
991	Influenza A virus (A/Hong Kong/1073/99 2003) GCF_000851145.1	n/a	12 (97.14 %)	n/a	n/a	n/a	44.07 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (0.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
992	Influenza A virus (A/Korea/426/1968 2005) GCF_000866645.1	n/a	15 (97.49 %)	n/a	n/a	n/a	43.41 (99.89 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	9 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
993	Influenza A virus (A/New York/392/2004 2005) GCF_000865085.1	n/a	15 (96.37 %)	n/a	n/a	n/a	42.94 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	4 (0.57 %)	n/a	6 (0.33 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
994	Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934 1982) GCF_000865725.1	n/a	15 (96.32 %)	n/a	n/a	n/a	43.40 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.68 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
995	Influenza A virus (A/Shanghai/02/2013 2015) GCF_000928555.1	n/a	15 (99.34 %)	n/a	n/a	n/a	44.36 (99.92 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	9 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.30 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
996	Influenza B virus (B/Lee/1940 1993) GCF_000820495.2	n/a	11 (92.51 %)	n/a	n/a	n/a	40.19 (99.88 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	5 (0.51 %)	n/a	23 (1.85 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
997	Influenza C virus (C/Ann Arbor/1/50 2004) GCF_000856665.10	n/a	11 (95.87 %)	n/a	n/a	n/a	37.28 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	42 (4.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
998	Influenza D virus (D/swine/Oklahoma/1334/2011 2018) GCF_002867775.1	n/a	9 (96.50 %)	n/a	n/a	n/a	41.45 (99.88 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	23 (2.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
999	inopinata (141012304 Brucella sp. 2016) GCF_900095155.1	n/a	3,337 (87.82 %)	n/a	n/a	n/a	57.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	122 (0.26 %)	17,323 (9.36 %)	0 (0 %)	82 (0.26 %)	2 (100.00 %)	2 (99.99 %)
1000	Isfahan virus (2013) GCF_000906835.1	n/a	5 (96.29 %)	n/a	n/a	n/a	41.93 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	20 (1.82 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1001	Issyk-Kul virus (LEIV-315K 2023) GCF_014883185.1	n/a	3 (95.40 %)	n/a	n/a	n/a	40.21 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.22 %)	6 (0.25 %)	0 (0 %)	1 (0.40 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1002	Japanese encephalitis virus (1993) GCF_000862145.1	n/a	3 (93.83 %)	n/a	n/a	n/a	51.43 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1003	JC polyomavirus (Mad1 1993) GCF_000863805.1	n/a	9 (96.55 %)	n/a	n/a	n/a	40.45 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (3.82 %)	17 (5.52 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1004	Jeju virus (10-11 2017) GCF_002117615.1	n/a	3 (93.96 %)	n/a	n/a	n/a	36.20 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (1.02 %)	1 (0.28 %)	16 (2.20 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1005	Jos virus (2023) GCF_023156725.1	n/a	6 (96.99 %)	n/a	n/a	n/a	46.01 (99.92 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	7 (99.99 %)	4 (0.39 %)	n/a	15 (1.52 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1006	Kander virus (CH17 2023) GCF_023155475.1	n/a	6 (94.29 %)	n/a	n/a	n/a	52.48 (99.99 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.32 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1007	Kasokero virus (Z-52963 2018) GCF_002288735.2	n/a	3 (96.72 %)	n/a	n/a	n/a	42.73 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.35 %)	n/a	29 (2.09 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1008	Kenkeme virus (Fuyuan-Sr-326 2017) GCF_002146025.1	n/a	3 (95.18 %)	n/a	n/a	n/a	37.73 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.26 %)	n/a	16 (1.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1009	Kunjin virus (MRM61C 2023) GCA_004786635.1	n/a	1 (96.61 %)	n/a	n/a	n/a	50.58 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.43 %)	1 (2.43 %)
1010	Kyasanur Forest disease virus (2018) GCF_002820625.1	n/a	1 (98.80 %)	n/a	n/a	n/a	55.20 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	1 (0.11 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (6.73 %)	3 (6.73 %)
1011	La Crosse virus (human/78 2002) GCF_000850965.1	n/a	4 (94.68 %)	n/a	n/a	n/a	36.68 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	26 (2.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1012	La Crosse virus (LACV/human/1960 2023) GCF_004789695.1	n/a	4 (94.68 %)	n/a	n/a	n/a	36.75 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	17 (1.56 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1013	Lake Victoria marburgvirus - (Leiden 2011) GCA_031129775.1	n/a	7 (76.60 %)	n/a	n/a	n/a	38.11 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1014	Lake Victoria marburgvirus - Angola2005 (Ang1379c 2006) GCA_031121245.1	n/a	7 (98.72 %)	n/a	n/a	n/a	38.40 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (0.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1015	Lake Victoria marburgvirus - Ci67 (2007) GCA_031121995.1	n/a	7 (98.72 %)	n/a	n/a	n/a	38.45 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1016	Lake Victoria marburgvirus - DRC1999 (07DRC99 2006) GCA_031121255.1	n/a	7 (98.72 %)	n/a	n/a	n/a	38.19 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1017	Langat virus (TP21 2000) GCF_000860805.1	n/a	1 (93.62 %)	n/a	n/a	n/a	54.31 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.56 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.18 %)	1 (2.18 %)
1018	Langya virus (SDQD_H1801 2022) GCA_031319335.1	n/a	9 (81.86 %)	n/a	n/a	n/a	38.30 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.26 %)	n/a	18 (1.31 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1019	Lassa mammarenavirus (Josiah 1998) GCF_000851705.1	n/a	4 (94.96 %)	n/a	n/a	n/a	42.06 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.37 %)	9 (1.70 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1020	Le Dantec virus (DakHD763 2017) GCF_002118505.1	n/a	6 (97.47 %)	n/a	n/a	n/a	37.82 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	18 (1.72 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1021	Lebombo virus (SAAR 3896 2018) GCF_002829425.1	n/a	11 (96.53 %)	n/a	n/a	n/a	47.16 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	5 (0.77 %)	n/a	6 (0.77 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (14.49 %)	5 (14.49 %)
1022	Leishmania aethiopica (L147 2016) GCA_000444285.2	n/a	n/a	548 (1.05 %)	4,269 (47.65 %)	n/a	60.07 (97.99 %)	1,598 (2.03 %)	1,837 (2.04 %)	1,758 (97.97 %)	29,466 (4.68 %)	6,198 (0.77 %)	248,749 (21.09 %)	81 (0.19 %)	2,775 (2.50 %)	165 (99.77 %)	103 (0.53 %)
1023	Leishmania amazonensis (2013) GCA_000438535.1	n/a	n/a	507 (1.06 %)	5,293 (48.55 %)	n/a	59.27 (99.90 %)	572 (0.09 %)	669 (0.09 %)	3,199 (99.91 %)	19,666 (2.91 %)	2,927 (0.44 %)	217,607 (19.42 %)	0 (0 %)	290 (0.28 %)	2,876 (96.56 %)	1,681 (19.41 %)
1024	Leishmania amazonensis (PH8 2022) GCA_025688915.1	n/a	n/a	603 (1.13 %)	3,933 (46.98 %)	n/a	59.66 (98.02 %)	0 (0 %)	249 (1.99 %)	77 (100.00 %)	23,611 (2.85 %)	3,692 (2.13 %)	232,082 (20.39 %)	1 (0.00 %)	7,463 (4.46 %)	89 (99.64 %)	106 (0.31 %)
1025	Leishmania arabica (LEM1108 2016) GCA_000410695.2	n/a	n/a	539 (1.02 %)	4,014 (46.88 %)	n/a	59.42 (98.42 %)	1,362 (1.60 %)	1,497 (1.60 %)	1,530 (98.40 %)	30,695 (4.82 %)	6,793 (0.85 %)	232,761 (20.03 %)	72 (0.10 %)	2,469 (1.81 %)	184 (99.74 %)	110 (0.45 %)
1026	Leishmania braziliensis (MHOM/BR/75/M2903 2016 kinetoplastids) GCA_000340355.2	n/a	n/a	643 (1.12 %)	3,614 (44.69 %)	n/a	57.78 (92.26 %)	3,190 (7.77 %)	3,190 (7.77 %)	3,934 (92.23 %)	25,754 (4.94 %)	5,336 (1.09 %)	225,468 (17.80 %)	86 (0.38 %)	12,857 (5.73 %)	790 (97.97 %)	681 (1.51 %)
1027	Leishmania braziliensis (MHOM/BR/75/M2904 2011 kinetoplastids) GCF_000002845.2	8,195 (47.81 %)	n/a	617 (1.11 %)	3,625 (45.84 %)	n/a	57.77 (99.75 %)	0 (0 %)	881 (0.26 %)	138 (100.00 %)	24,164 (4.79 %)	4,690 (1.79 %)	210,592 (18.71 %)	2 (0.00 %)	8,898 (5.14 %)	160 (50.50 %)	193 (0.85 %)
1028	Leishmania donovani (2020) GCA_900635355.2	n/a	19,556 (92.23 %)	614 (1.09 %)	4,170 (46.03 %)	n/a	59.77 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	36 (100.00 %)	24,313 (2.73 %)	4,270 (2.26 %)	249,553 (21.06 %)	0 (0 %)	6,553 (5.04 %)	47 (99.88 %)	54 (0.14 %)
1029	Leishmania donovani (BHU 1220 2013) GCA_000470725.1	n/a	n/a	556 (1.03 %)	4,017 (46.59 %)	n/a	59.50 (96.29 %)	2,230 (3.73 %)	4,424 (3.74 %)	2,266 (96.27 %)	22,236 (4.03 %)	3,081 (0.41 %)	240,559 (19.38 %)	568 (1.33 %)	4,075 (3.15 %)	77 (99.38 %)	72 (0.15 %)
1030	Leishmania donovani (BPK282A1 2011 kinetoplastids) GCF_000227135.1	8,062 (46.83 %)	n/a	559 (1.04 %)	3,984 (46.52 %)	n/a	59.50 (96.35 %)	2,141 (3.68 %)	2,141 (3.68 %)	2,177 (96.32 %)	24,113 (4.30 %)	3,267 (0.45 %)	242,579 (19.49 %)	596 (1.38 %)	4,127 (3.27 %)	56 (47.68 %)	67 (0.14 %)
1031	Leishmania donovani (LdCL 2018) GCA_003719575.1	n/a	9,757 (49.01 %)	610 (1.11 %)	4,252 (46.18 %)	n/a	59.75 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	36 (100.00 %)	26,386 (4.68 %)	4,181 (2.19 %)	245,269 (20.83 %)	0 (0 %)	6,109 (5.31 %)	43 (99.83 %)	44 (0.43 %)
1032	Leishmania enriettii (CUR178 2021) GCA_017916305.1	n/a	8,353 (46.39 %)	648 (1.20 %)	4,573 (45.71 %)	n/a	59.57 (100.00 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	54 (100.00 %)	22,410 (2.63 %)	5,744 (2.97 %)	220,272 (19.14 %)	1 (0.00 %)	8,140 (6.09 %)	55 (99.87 %)	132 (0.18 %)
1033	Leishmania enriettii (CUR178 2021) GCF_017916305.1	8,353 (46.39 %)	n/a	648 (1.20 %)	4,574 (45.71 %)	n/a	59.57 (100.00 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	54 (100.00 %)	22,410 (2.63 %)	5,744 (2.97 %)	220,272 (19.14 %)	1 (0.00 %)	8,140 (6.09 %)	55 (99.87 %)	132 (0.18 %)
1034	Leishmania enriettii (LEM3045 2016) GCA_000410755.2	n/a	n/a	557 (1.10 %)	4,562 (47.91 %)	n/a	59.24 (98.92 %)	676 (1.09 %)	739 (1.09 %)	1,171 (98.91 %)	21,100 (3.60 %)	4,873 (0.66 %)	212,050 (17.50 %)	17 (0.02 %)	2,395 (1.82 %)	520 (99.58 %)	325 (1.78 %)
1035	Leishmania gerbilli (LEM452 2013) GCA_000443025.1	n/a	n/a	551 (1.05 %)	4,304 (47.05 %)	n/a	59.80 (98.16 %)	756 (1.85 %)	937 (1.85 %)	1,248 (98.15 %)	29,922 (4.73 %)	6,601 (0.81 %)	235,726 (20.37 %)	22 (0.06 %)	2,428 (1.48 %)	549 (99.30 %)	379 (2.96 %)
1036	Leishmania infantum (2020) GCA_900500625.2	n/a	8,747 (48.69 %)	643 (1.19 %)	4,210 (46.33 %)	n/a	59.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	36 (100.00 %)	23,549 (2.72 %)	3,832 (2.13 %)	243,521 (20.52 %)	0 (0 %)	4,957 (4.63 %)	45 (99.87 %)	41 (0.26 %)
1037	Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids refseq) GCF_000002725.2	9,507 (48.33 %)	n/a	634 (1.16 %)	4,290 (46.53 %)	n/a	59.72 (100.00 %)	7 (0.00 %)	7 (0.00 %)	43 (100.00 %)	33,791 (5.30 %)	8,477 (2.43 %)	238,932 (20.91 %)	0 (0 %)	6,726 (4.51 %)	26 (63.22 %)	27 (0.06 %)
1038	Leishmania major strain (Friedlin 2021) GCA_916722125.1	n/a	19,755 (88.21 %)	644 (1.18 %)	4,364 (46.66 %)	n/a	59.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	36 (100.00 %)	32,225 (3.61 %)	8,290 (2.60 %)	240,921 (20.87 %)	0 (0 %)	5,775 (4.32 %)	40 (99.91 %)	24 (0.07 %)
1039	Leishmania major strain (LV39c5 2013) GCA_000331345.1	n/a	n/a	596 (1.10 %)	4,382 (46.71 %)	n/a	59.47 (98.75 %)	818 (1.25 %)	818 (1.25 %)	1,667 (98.75 %)	32,306 (5.37 %)	8,066 (1.57 %)	237,232 (20.23 %)	110 (0.29 %)	5,154 (3.27 %)	579 (99.24 %)	268 (0.69 %)
1040	Leishmania major strain (SD 75.1 2012) GCA_000250755.2	n/a	n/a	552 (1.07 %)	4,211 (47.32 %)	n/a	59.52 (99.74 %)	855 (0.27 %)	943 (0.27 %)	891 (99.73 %)	32,070 (5.25 %)	7,938 (1.15 %)	237,985 (20.74 %)	24 (0.06 %)	4,475 (2.68 %)	43 (99.90 %)	28 (0.07 %)
1041	Leishmania martiniquensis (LSCM1 2021 refseq) GCF_017916325.1	7,967 (45.66 %)	n/a	619 (1.14 %)	3,882 (44.58 %)	n/a	59.85 (100.00 %)	0 (0 %)	5 (0.00 %)	42 (100.00 %)	20,726 (2.91 %)	2,267 (2.64 %)	232,973 (20.45 %)	0 (0 %)	6,246 (4.12 %)	44 (99.29 %)	43 (0.15 %)
1042	Leishmania mexicana (MHOM/GT/2001/U1103 2011 kinetoplastids) GCF_000234665.1	8,146 (47.97 %)	n/a	641 (1.16 %)	4,251 (47.32 %)	n/a	59.80 (99.90 %)	0 (0 %)	582 (0.11 %)	587 (100.00 %)	26,647 (4.40 %)	4,380 (1.74 %)	233,822 (20.52 %)	21 (0.06 %)	6,344 (4.18 %)	566 (49.98 %)	347 (0.98 %)
1043	Leishmania orientalis (LSCM4 2021 refseq) GCF_017916335.1	8,158 (45.05 %)	n/a	643 (1.12 %)	4,666 (45.26 %)	n/a	59.72 (99.99 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	98 (100.00 %)	22,632 (2.47 %)	4,241 (2.74 %)	231,120 (20.18 %)	1 (0.00 %)	10,584 (6.63 %)	100 (99.82 %)	164 (0.40 %)
1044	Leishmania panamensis (MHOM/COL/81/L13 2013) GCA_000340495.1	n/a	n/a	614 (1.15 %)	3,521 (45.42 %)	n/a	57.61 (99.07 %)	2,211 (0.95 %)	2,211 (0.95 %)	3,163 (99.05 %)	23,356 (4.15 %)	4,051 (1.39 %)	215,183 (18.18 %)	444 (0.64 %)	4,174 (2.85 %)	972 (97.94 %)	931 (4.41 %)
1045	Leishmania panamensis (MHOM/PA/94/PSC-1 2014 kinetoplastids) GCF_000755165.1	7,748 (48.52 %)	n/a	582 (1.12 %)	3,102 (46.24 %)	n/a	57.56 (97.73 %)	553 (2.28 %)	553 (2.28 %)	588 (97.72 %)	22,109 (3.93 %)	3,085 (0.38 %)	213,400 (18.35 %)	3 (0.01 %)	1,857 (1.31 %)	71 (45.43 %)	97 (0.24 %)
1046	Leishmania sp. Ghana 2012 LV757 (GH5 2021) GCA_017918215.1	n/a	8,119 (41.51 %)	661 (1.10 %)	4,945 (44.33 %)	n/a	59.67 (100.00 %)	0 (0 %)	9 (0.00 %)	116 (100.00 %)	23,640 (2.58 %)	5,237 (3.11 %)	226,790 (21.41 %)	0 (0 %)	15,742 (6.97 %)	125 (99.66 %)	171 (0.63 %)
1047	Leishmania sp. Ghana 2012 LV757 (GH5 2021) GCF_017918215.1	8,119 (41.51 %)	n/a	661 (1.10 %)	4,945 (44.33 %)	n/a	59.67 (100.00 %)	0 (0 %)	9 (0.00 %)	116 (100.00 %)	23,640 (2.58 %)	5,237 (3.11 %)	226,790 (21.41 %)	0 (0 %)	15,742 (6.97 %)	125 (99.66 %)	171 (0.63 %)
1048	Leishmania sp. MAR (LEM2494 2016) GCA_000409445.2	n/a	n/a	577 (1.11 %)	3,833 (45.50 %)	n/a	59.70 (99.08 %)	377 (0.93 %)	402 (0.93 %)	628 (99.07 %)	20,121 (3.17 %)	1,591 (0.23 %)	223,208 (18.71 %)	19 (0.03 %)	1,178 (1.88 %)	273 (99.72 %)	184 (1.07 %)
1049	Leishmania sp. Namibia (253 2021) GCA_017918225.1	n/a	8,266 (45.37 %)	649 (1.14 %)	4,732 (45.84 %)	n/a	59.53 (100.00 %)	0 (0 %)	8 (0.00 %)	67 (100.00 %)	21,885 (2.64 %)	3,780 (2.94 %)	229,968 (20.05 %)	0 (0 %)	11,327 (6.18 %)	66 (99.69 %)	133 (0.41 %)
1050	Leishmania sp. Namibia (253 2021) GCF_017918225.1	8,266 (45.37 %)	n/a	649 (1.14 %)	4,732 (45.84 %)	n/a	59.53 (100.00 %)	0 (0 %)	8 (0.00 %)	67 (100.00 %)	21,885 (2.64 %)	3,780 (2.94 %)	229,968 (20.05 %)	0 (0 %)	11,327 (6.18 %)	66 (99.69 %)	133 (0.41 %)
1051	Leishmania tarentolae (Parrot Tar II 2019) GCA_009731335.1	n/a	8,703 (43.93 %)	681 (1.17 %)	4,572 (44.55 %)	n/a	57.41 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	179 (100.00 %)	27,491 (4.14 %)	8,063 (3.25 %)	171,193 (17.31 %)	0 (0 %)	20,287 (8.31 %)	340 (99.05 %)	600 (29.71 %)
1052	Leishmania tropica (L590 2013) GCA_000410715.1	n/a	n/a	553 (1.02 %)	4,423 (47.39 %)	n/a	59.90 (94.97 %)	1,490 (5.05 %)	1,840 (5.05 %)	1,938 (94.95 %)	29,626 (4.55 %)	6,717 (0.81 %)	250,442 (20.31 %)	28 (0.08 %)	4,045 (2.55 %)	577 (96.29 %)	416 (2.23 %)
1053	Leishmania turanica (LEM423 2013) GCA_000441995.1	n/a	n/a	547 (1.04 %)	4,075 (46.21 %)	n/a	60.02 (95.53 %)	1,333 (4.48 %)	1,669 (4.48 %)	1,669 (95.52 %)	36,288 (5.44 %)	10,878 (1.18 %)	243,920 (21.05 %)	27 (0.08 %)	2,787 (1.57 %)	414 (98.70 %)	312 (1.54 %)
1054	Leptomonas pyrrhocoris (H10 2015 kinetoplastids) GCF_001293395.1	14,051 (67.93 %)	n/a	595 (1.09 %)	4,586 (53.30 %)	n/a	56.65 (99.63 %)	0 (0 %)	432 (0.37 %)	60 (100.00 %)	23,514 (2.82 %)	3,272 (1.55 %)	246,420 (21.64 %)	14 (0.02 %)	1,975 (3.30 %)	55 (64.76 %)	49 (0.12 %)
1055	Leptomonas seymouri (ATCC 30220 2015) GCA_001299535.1	n/a	8,596 (57.70 %)	516 (1.10 %)	4,173 (52.36 %)	n/a	55.72 (99.44 %)	0 (0 %)	2,178 (0.59 %)	1,216 (100.00 %)	15,344 (1.97 %)	2,896 (0.39 %)	191,873 (17.21 %)	0 (0 %)	414 (0.13 %)	1,497 (94.35 %)	965 (3.90 %)
1056	Leptospira sp. patho 1 (ATI7-C-A5 2023) GCF_002811955.2	n/a	4,005 (90.05 %)	n/a	n/a	n/a	47.80 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	68 (100.00 %)	n/a	56 (0.11 %)	34,438 (16.06 %)	0 (0 %)	60 (0.17 %)	16 (0.49 %)	12 (0.17 %)
1057	lettuce downy mildew (SF5 2021) GCA_004359215.2	n/a	9,767 (15.53 %)	1,244 (0.95 %)	11,020 (19.05 %)	n/a	45.85 (78.52 %)	0 (0 %)	5,655 (21.50 %)	220 (100.00 %)	3,128 (0.14 %)	8,054 (1.08 %)	512,991 (35.78 %)	31 (0.05 %)	45,093 (7.16 %)	7,355 (5.74 %)	3,411 (3.19 %)
1058	lettuce downy mildew (SF5 2021) GCF_004359215.1	9,766 (15.53 %)	n/a	1,244 (0.95 %)	11,020 (19.05 %)	n/a	45.85 (78.52 %)	0 (0 %)	5,655 (21.50 %)	220 (100.00 %)	3,128 (0.14 %)	8,054 (1.08 %)	512,991 (35.78 %)	31 (0.05 %)	45,093 (7.16 %)	7,355 (5.74 %)	3,411 (3.19 %)
1059	LI polyomavirus (LIPyV 2017) GCF_002080215.1	n/a	6 (90.04 %)	n/a	n/a	n/a	39.85 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (3.95 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1060	Listeria monocytogenes (EGD-e 2003) GCF_000196035.1	n/a	3,051 (90.82 %)	n/a	n/a	n/a	37.98 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	n/a	68 (0.32 %)	19,806 (13.52 %)	0 (0 %)	93 (0.55 %)	19 (1.30 %)	13 (1.22 %)
1061	longhorned tick (HaeL-2018 2020) GCA_013339765.2	n/a	25,651 (0.89 %)	3,637 (0.11 %)	126,687 (5.32 %)	n/a	47.39 (99.98 %)	0 (0 %)	5,130 (0.02 %)	3,886 (100.00 %)	828,970 (1.75 %)	670,437 (2.52 %)	12,483,364 (33.26 %)	1 (0.00 %)	629,793 (2.52 %)	111,519 (6.91 %)	340,993 (8.68 %)
1062	Louping ill virus (369/T2 1997) GCF_000863165.1	n/a	1 (94.24 %)	n/a	n/a	n/a	54.86 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.52 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (12.29 %)	3 (12.29 %)
1063	Lyme disease spirochete (Bol26 2009) GCF_000181575.2	n/a	1,355 (90.61 %)	n/a	n/a	n/a	28.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	20 (100.00 %)	n/a	132 (1.33 %)	12,634 (28.57 %)	0 (0 %)	166 (1.31 %)	3 (0.05 %)	3 (0.05 %)
1064	Lymphocytic choriomeningitis mammarenavirus (Armstrong 53b 1993) GCF_000851025.1	n/a	4 (97.52 %)	n/a	n/a	n/a	42.29 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.07 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1065	M.balamuthi (2019) GCA_902651635.1	n/a	n/a	510 (0.53 %)	13,210 (37.00 %)	n/a	60.70 (94.21 %)	0 (0 %)	2,310 (5.79 %)	1,925 (100.00 %)	28,253 (2.58 %)	14,656 (2.04 %)	356,435 (20.80 %)	184 (0.25 %)	16,123 (3.81 %)	2,245 (88.11 %)	2,746 (6.82 %)
1066	M.exilis (PA203 2021) GCA_001643675.2	n/a	18,152 (55.07 %)	683 (0.51 %)	2,117 (15.55 %)	n/a	37.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	101 (100.00 %)	97,125 (7.68 %)	68,605 (4.60 %)	697,527 (37.16 %)	0 (0 %)	13,975 (1.34 %)	4,795 (3.11 %)	3,582 (2.03 %)
1067	M.exilis (PA203 2021) GCF_001643675.1	18,146 (55.06 %)	n/a	683 (0.51 %)	2,117 (15.55 %)	n/a	37.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	101 (100.00 %)	97,125 (7.68 %)	68,605 (4.60 %)	697,527 (37.16 %)	0 (0 %)	13,975 (1.34 %)	4,795 (3.11 %)	3,582 (2.03 %)
1068	Macaca fascicularis papillomavirus 2 (Mac191 2011) GCF_000892835.1	n/a	7 (91.76 %)	n/a	n/a	n/a	48.74 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.97 %)	2 (1.35 %)	3 (1.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (12.66 %)	2 (11.33 %)
1069	Macaca mulatta papillomavirus 6 (PM084S3_c170482 2019) GCF_004134585.1	n/a	7 (83.26 %)	n/a	n/a	n/a	51.82 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (2.70 %)	1 (0.34 %)	36 (7.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (16.69 %)	2 (16.69 %)
1070	Machupo mammarenavirus (Carvallo 2003) GCF_000853725.1	n/a	4 (94.98 %)	n/a	n/a	n/a	41.77 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.62 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1071	Madariaga virus (MADV/Cebus apella/BRA/BEAN5122/1956 2014) GCF_000917835.1	n/a	2 (95.96 %)	n/a	n/a	n/a	49.14 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.74 %)	1 (1.31 %)	6 (0.83 %)	0 (0 %)	1 (0.62 %)	5 (18.11 %)	5 (18.11 %)
1072	Madariaga virus (PE-3.0815 2023) GCF_002888955.1	n/a	2 (96.12 %)	n/a	n/a	n/a	49.30 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.55 %)	1 (1.31 %)	5 (0.65 %)	0 (0 %)	1 (0.62 %)	5 (17.39 %)	5 (17.39 %)
1073	Madrid virus (BT4075 2017) GCF_002118405.1	n/a	4 (93.18 %)	n/a	n/a	n/a	34.25 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	22 (2.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1074	malaria parasite P. falciparum (2018) GCA_900617135.1	n/a	n/a	317 (0.84 %)	91 (2.14 %)	n/a	19.45 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	19 (100.00 %)	80,313 (19.68 %)	79,797 (16.19 %)	188,543 (66.83 %)	0 (0 %)	34,084 (6.53 %)	26 (0.03 %)	13 (0.02 %)
1075	malaria parasite P. falciparum (2018) GCA_900631975.1	n/a	n/a	318 (0.86 %)	82 (2.09 %)	n/a	19.25 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	21 (100.00 %)	78,770 (18.90 %)	77,186 (15.21 %)	184,246 (66.95 %)	0 (0 %)	28,870 (5.76 %)	32 (0.06 %)	12 (0.02 %)
1076	malaria parasite P. falciparum (2018) GCA_900631995.1	n/a	n/a	312 (0.83 %)	99 (2.34 %)	n/a	19.46 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	19 (100.00 %)	80,380 (19.06 %)	80,145 (15.61 %)	189,223 (66.64 %)	0 (0 %)	31,950 (6.21 %)	35 (0.05 %)	21 (0.03 %)
1077	malaria parasite P. falciparum (2018) GCA_900632005.1	n/a	n/a	315 (0.84 %)	90 (2.14 %)	n/a	19.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	20 (100.00 %)	79,399 (19.15 %)	78,389 (15.55 %)	185,673 (66.81 %)	0 (0 %)	31,109 (6.50 %)	20 (0.04 %)	12 (0.02 %)
1078	malaria parasite P. falciparum (2018) GCA_900632045.1	n/a	n/a	319 (0.86 %)	81 (1.97 %)	n/a	19.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16 (100.00 %)	78,399 (18.94 %)	76,004 (15.02 %)	183,753 (67.14 %)	0 (0 %)	29,483 (5.73 %)	16 (0.03 %)	10 (0.02 %)
1079	malaria parasite P. falciparum (2018) GCA_900632065.1	n/a	n/a	315 (0.74 %)	145 (2.84 %)	n/a	19.85 (100.00 %)	0 (0 %)	4 (0.00 %)	79 (100.00 %)	83,325 (18.90 %)	84,484 (15.82 %)	203,716 (66.25 %)	0 (0 %)	35,565 (6.97 %)	50 (0.08 %)	16 (0.02 %)
1080	malaria parasite P. falciparum (2018) GCA_900632075.1	n/a	n/a	306 (0.81 %)	103 (2.16 %)	n/a	19.38 (100.00 %)	0 (0 %)	7 (0.00 %)	36 (100.00 %)	80,073 (19.04 %)	78,627 (15.40 %)	188,464 (66.75 %)	0 (0 %)	31,264 (6.03 %)	37 (0.06 %)	20 (0.03 %)
1081	malaria parasite P. falciparum (2018) GCA_900632085.1	n/a	n/a	326 (0.78 %)	144 (2.55 %)	n/a	19.68 (99.96 %)	0 (0 %)	5 (0.04 %)	117 (100.00 %)	84,773 (19.43 %)	86,243 (16.19 %)	201,753 (66.57 %)	0 (0 %)	36,823 (7.04 %)	36 (0.05 %)	17 (0.03 %)
1082	malaria parasite P. falciparum (2018) GCA_900632095.1	n/a	n/a	316 (0.86 %)	76 (1.97 %)	n/a	19.17 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	19 (100.00 %)	78,842 (18.95 %)	77,545 (15.21 %)	183,833 (67.03 %)	0 (0 %)	29,576 (5.95 %)	17 (0.03 %)	12 (0.02 %)
1083	malaria parasite P. falciparum (3D7 2016 refseq) GCF_000002765.5	5,514 (52.75 %)	n/a	n/a	n/a	n/a	19.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	15 (100.00 %)	n/a	78,154 (15.50 %)	186,910 (66.91 %)	0 (0 %)	31,278 (6.16 %)	22 (0.04 %)	14 (0.02 %)
1084	malaria parasite P. falciparum (3D7 2016) GCF_000002765.6	5,484 (52.74 %)	n/a	322 (0.86 %)	90 (2.05 %)	n/a	19.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14 (100.00 %)	77,341 (16.44 %)	78,057 (15.51 %)	187,098 (66.97 %)	0 (0 %)	31,278 (6.17 %)	22 (0.04 %)	14 (0.02 %)
1085	malaria parasite P. falciparum (7G8 2019) GCA_009761555.1	n/a	n/a	312 (0.86 %)	79 (1.93 %)	n/a	19.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	22 (100.00 %)	79,008 (19.17 %)	76,713 (15.26 %)	184,227 (67.14 %)	0 (0 %)	29,514 (5.59 %)	14 (0.02 %)	7 (0.01 %)
1086	malaria parasite P. falciparum (GB4 2018) GCA_900632035.1	n/a	n/a	314 (0.82 %)	100 (2.24 %)	n/a	19.36 (100.00 %)	0 (0 %)	5 (0.00 %)	26 (100.00 %)	80,382 (19.10 %)	78,725 (15.39 %)	188,385 (66.88 %)	0 (0 %)	31,604 (6.14 %)	25 (0.05 %)	14 (0.02 %)
1087	malaria parasite P. falciparum (HB3 2018) GCA_900631985.1	n/a	n/a	311 (0.86 %)	66 (1.75 %)	n/a	19.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	28 (100.00 %)	78,803 (19.13 %)	77,379 (15.47 %)	184,340 (67.05 %)	0 (0 %)	30,454 (5.88 %)	22 (0.04 %)	10 (0.02 %)
1088	malaria parasite P. falciparum (KH1 2018) GCA_900632025.1	n/a	n/a	316 (0.82 %)	95 (2.13 %)	n/a	19.30 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	22 (100.00 %)	79,322 (18.96 %)	78,032 (15.14 %)	187,535 (66.85 %)	0 (0 %)	29,959 (6.07 %)	23 (0.04 %)	15 (0.02 %)
1089	malaria parasite P. falciparum (KH2 2018) GCA_900632015.1	n/a	n/a	311 (0.84 %)	81 (1.93 %)	n/a	19.29 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	21 (100.00 %)	78,801 (19.09 %)	77,149 (15.35 %)	186,235 (66.99 %)	0 (0 %)	30,779 (6.13 %)	17 (0.02 %)	6 (0.01 %)
1090	malaria parasite P. falciparum (NF135.C10 2019) GCA_009761425.1	n/a	n/a	323 (0.85 %)	97 (2.12 %)	n/a	19.40 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	23 (100.00 %)	79,577 (19.41 %)	78,195 (15.78 %)	187,831 (66.99 %)	0 (0 %)	32,658 (6.13 %)	22 (0.04 %)	9 (0.01 %)
1091	malaria parasite P. falciparum (NF166 2019) GCA_009761515.1	n/a	n/a	318 (0.84 %)	93 (2.11 %)	n/a	19.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	32 (100.00 %)	80,132 (19.18 %)	77,965 (15.47 %)	187,272 (66.93 %)	0 (0 %)	30,982 (6.17 %)	20 (0.03 %)	11 (0.01 %)
1092	malaria parasite P. falciparum (NF54 2019) GCA_009761475.1	n/a	n/a	313 (0.83 %)	94 (2.10 %)	n/a	19.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	30 (100.00 %)	79,940 (19.23 %)	78,008 (15.63 %)	187,730 (67.03 %)	0 (0 %)	31,951 (6.28 %)	22 (0.04 %)	14 (0.02 %)
1093	malaria parasite P. falciparum (type strain: I 2018) GCA_900632055.1	n/a	n/a	313 (0.84 %)	94 (2.02 %)	n/a	19.35 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	27 (100.00 %)	78,887 (19.48 %)	77,343 (15.77 %)	185,847 (66.99 %)	0 (0 %)	32,144 (6.18 %)	21 (0.04 %)	14 (0.02 %)
1094	malaria parasite P. ovale (2016) GCA_900090025.2	n/a	17,512 (41.02 %)	321 (0.58 %)	896 (6.27 %)	n/a	29.25 (99.23 %)	0 (0 %)	1,260 (0.78 %)	779 (100.00 %)	46,689 (6.43 %)	33,024 (5.02 %)	307,550 (43.32 %)	19 (0.03 %)	8,213 (1.48 %)	1,019 (1.02 %)	481 (0.44 %)
1095	malaria parasite P. ovale (2016) GCA_900090035.2	n/a	19,693 (39.78 %)	313 (0.56 %)	662 (5.47 %)	n/a	28.56 (99.74 %)	0 (0 %)	894 (0.27 %)	653 (100.00 %)	43,269 (5.87 %)	24,509 (3.67 %)	309,970 (44.17 %)	8 (0.01 %)	5,990 (1.14 %)	465 (0.41 %)	258 (0.21 %)
1096	malaria parasite P. vivax (Pv01-19 2023) GCA_949152365.1	n/a	17,851 (44.34 %)	405 (0.89 %)	2,167 (19.81 %)	n/a	39.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	28 (100.00 %)	28,638 (4.11 %)	30,969 (5.11 %)	221,613 (31.61 %)	0 (0 %)	3,548 (0.71 %)	4,444 (26.45 %)	4,735 (8.25 %)
1097	malaria parasite P. vivax (PvP01 2019) GCA_900093555.2	n/a	17,755 (44.79 %)	412 (0.92 %)	2,283 (20.08 %)	n/a	39.78 (99.52 %)	0 (0 %)	635 (0.49 %)	242 (100.00 %)	28,802 (4.27 %)	31,393 (5.31 %)	219,328 (31.03 %)	28 (0.04 %)	3,880 (1.35 %)	4,508 (26.34 %)	4,703 (7.97 %)
1098	malaria parasite P. vivax (PvSal1 Salvador I 2009) GCF_000002415.2	5,424 (46.45 %)	n/a	439 (1.05 %)	2,276 (21.52 %)	n/a	42.28 (99.80 %)	16 (0.18 %)	5,134 (0.20 %)	2,764 (99.82 %)	26,547 (4.32 %)	30,383 (5.62 %)	205,833 (26.95 %)	1 (0.00 %)	3,724 (0.77 %)	4,583 (29.15 %)	4,466 (7.82 %)
1099	malaria parasite P. vivax (PvSY56 2018) GCA_003402215.1	n/a	n/a	400 (1.16 %)	2,021 (22.54 %)	n/a	44.06 (92.33 %)	0 (0 %)	7,116 (7.78 %)	14 (100.00 %)	22,210 (4.40 %)	31,764 (5.66 %)	167,076 (23.10 %)	58 (0.05 %)	1,638 (0.49 %)	5,789 (19.98 %)	3,920 (6.76 %)
1100	malaria parasite P. vivax (PvW1 2021) GCA_914969965.1	n/a	19,710 (48.38 %)	411 (0.92 %)	2,235 (20.20 %)	n/a	39.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	19 (100.00 %)	28,140 (4.07 %)	30,815 (5.13 %)	219,282 (31.12 %)	0 (0 %)	3,940 (0.91 %)	4,420 (26.21 %)	4,731 (8.06 %)
1101	Maldonado virus (FMD 0077 2021) GCF_013086435.1	n/a	4 (97.39 %)	n/a	n/a	n/a	39.95 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.84 %)	n/a	7 (1.82 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1102	Mamastrovirus 1 (V1347 2016) GCF_001736695.1	n/a	2 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	44.60 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.68 %)	n/a	6 (1.65 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1103	Mammalian orthoreovirus 3 (MPC/04 2009) GCF_000924315.1	n/a	11 (98.51 %)	n/a	n/a	n/a	47.01 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (0.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (5.61 %)	3 (5.61 %)
1104	Mammalian orthoreovirus 3 (T3D Dearing 2023) GCF_006298385.1	n/a	10 (96.87 %)	n/a	n/a	n/a	46.94 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	24 (1.20 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (4.20 %)	3 (4.20 %)
1105	Mammarenavirus chapareense (810419 2008) GCF_000879235.1	n/a	4 (96.22 %)	n/a	n/a	n/a	40.03 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1106	Mammarenavirus choriomeningitidis (Armstrong 53b 2023) GCF_004789475.1	n/a	4 (95.06 %)	n/a	n/a	n/a	43.03 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (1.05 %)	1 (0.43 %)	3 (1.37 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.40 %)	0 (0.00 %)
1107	Mammarenavirus guanaritoense (INH-95551 2003) GCF_000853765.1	n/a	4 (96.01 %)	n/a	n/a	n/a	40.64 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1108	Mammarenavirus lassaense (Alzey 2016) GCA_900094045.1	n/a	4 (94.91 %)	n/a	n/a	n/a	42.17 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.33 %)	2 (0.37 %)	7 (1.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1109	Mammarenavirus lujoense (2009) GCF_000885555.1	n/a	4 (96.94 %)	n/a	n/a	n/a	42.40 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.40 %)	n/a	7 (0.88 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1110	Maporal virus (HV 97021050 2017) GCF_002145825.3	n/a	3 (92.24 %)	n/a	n/a	n/a	38.51 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.25 %)	1 (0.22 %)	11 (1.32 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1111	Marburg marburgvirus (Marburg virus/H.sapiens-tc/KEN/1980/Mt. Elgon-Musoke 1994) GCF_000857325.2	n/a	7 (98.72 %)	n/a	n/a	n/a	38.29 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (1.05 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1112	Marburg virus - Musoke, Kenya, 1980 (Musoke 2024) GCA_000857325.3	n/a	7 (98.72 %)	n/a	n/a	n/a	38.28 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (1.05 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1113	Marmot norovirus (HT16 2019) GCF_004130475.1	n/a	1 (92.61 %)	n/a	n/a	n/a	55.57 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1114	Mayaro virus (2002) GCF_000863385.1	n/a	5 (96.78 %)	n/a	n/a	n/a	50.37 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.76 %)	n/a	4 (1.59 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (42.02 %)	5 (42.02 %)
1115	Measles morbillivirus (Ichinose-B95a 1998) GCF_000854845.1	n/a	7 (94.55 %)	n/a	n/a	n/a	47.43 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.88 %)	1 (1.81 %)
1116	Menangle virus (Australia/bat/2009/Cedar Grove 2018) GCF_002815295.1	n/a	7 (90.94 %)	n/a	n/a	n/a	42.02 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.41 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1117	Merkel cell polyomavirus (R17b 2008) GCF_000874865.1	n/a	5 (88.06 %)	n/a	n/a	n/a	40.69 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.78 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1118	microsporidians A.algerae (PRA109 2014) GCA_000385855.2	n/a	5,330 (22.47 %)	234 (0.75 %)	470 (2.51 %)	n/a	23.21 (78.94 %)	1,290 (21.01 %)	1,290 (21.01 %)	8,403 (78.99 %)	7,186 (2.65 %)	3,183 (0.91 %)	153,237 (36.15 %)	7 (0.10 %)	819 (0.49 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)
1119	microsporidians A.algerae (PRA339 2014) GCA_000385875.2	n/a	3,661 (30.10 %)	228 (1.28 %)	512 (5.59 %)	n/a	23.56 (81.30 %)	2,864 (18.79 %)	2,864 (18.79 %)	3,295 (81.21 %)	4,811 (2.53 %)	2,317 (1.29 %)	107,190 (36.02 %)	54 (0.27 %)	5,261 (6.13 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)
1120	microsporidians A.algerae (Undeen 2012) GCA_000313815.1	n/a	n/a	368 (1.28 %)	970 (5.91 %)	n/a	25.44 (99.88 %)	16,513 (0.14 %)	16,513 (0.14 %)	24,940 (99.86 %)	7,194 (3.04 %)	4,375 (1.82 %)	139,372 (39.13 %)	2 (0.00 %)	1,063 (0.50 %)	34 (0.14 %)	33 (0.14 %)
1121	microsporidians A.contejeani (T1 2020) GCA_014805555.1	n/a	2,865 (27.93 %)	352 (2.05 %)	419 (4.76 %)	n/a	26.97 (99.95 %)	0 (0 %)	31 (0.03 %)	1,391 (100.00 %)	4,314 (2.13 %)	1,026 (0.89 %)	110,014 (41.08 %)	19 (0.06 %)	1,232 (0.93 %)	6 (0.01 %)	1 (0.00 %)
1122	microsporidians A.locustae (CLX 2019) GCA_007674295.1	n/a	n/a	381 (6.93 %)	778 (33.56 %)	n/a	41.97 (100.00 %)	0 (0 %)	17 (0.00 %)	18 (100.00 %)	399 (0.77 %)	377 (2.52 %)	14,192 (12.51 %)	10 (0.12 %)	599 (1.63 %)	250 (11.74 %)	230 (9.85 %)
1123	microsporidians A.sp. (WSBS2006 2016) GCA_001875675.1	n/a	3,690 (63.80 %)	311 (3.43 %)	248 (5.31 %)	n/a	50.31 (99.78 %)	0 (0 %)	140 (0.17 %)	1,727 (100.00 %)	617 (0.62 %)	1,875 (4.30 %)	36,301 (18.08 %)	3 (0.01 %)	2,030 (3.53 %)	1,168 (53.29 %)	889 (24.48 %)
1124	microsporidians C.dikerogammari (Dv6 2020) GCA_014805705.1	n/a	4,599 (12.42 %)	106 (0.19 %)	327 (1.11 %)	n/a	26.07 (99.90 %)	192 (0.05 %)	192 (0.05 %)	7,975 (99.95 %)	16,400 (2.85 %)	25,825 (5.37 %)	350,519 (50.32 %)	113 (0.10 %)	5,746 (1.10 %)	9 (0.01 %)	7 (0.01 %)
1125	microsporidians D.muelleri (Ou54 2020) GCA_016256075.1	n/a	6,442 (12.23 %)	213 (0.30 %)	360 (0.88 %)	n/a	26.14 (99.91 %)	180 (0.03 %)	180 (0.03 %)	11,702 (99.97 %)	23,953 (3.29 %)	51,162 (7.21 %)	441,152 (51.53 %)	33 (0.02 %)	7,962 (1.16 %)	24 (0.02 %)	17 (0.01 %)
1126	microsporidians D.roeselum (Ou19 2020) GCA_016255985.1	n/a	1,201 (46.39 %)	159 (3.66 %)	273 (11.90 %)	n/a	35.37 (99.90 %)	0 (0 %)	35 (0.02 %)	1,033 (100.00 %)	425 (0.98 %)	984 (3.23 %)	17,933 (23.59 %)	0 (0 %)	350 (1.12 %)	212 (6.37 %)	201 (6.04 %)
1127	microsporidians E.aedis (USNM 41457 2015) GCA_000230595.3	n/a	4,262 (9.86 %)	232 (0.26 %)	658 (1.54 %)	n/a	22.47 (98.83 %)	0 (0 %)	985 (1.17 %)	1,429 (100.00 %)	28,417 (2.76 %)	5,619 (0.73 %)	581,263 (56.49 %)	14 (0.01 %)	2,006 (0.34 %)	29 (0.04 %)	30 (0.04 %)
1128	microsporidians E.bieneusi (H348 2009 refseq) GCF_000209485.1	3,632 (67.60 %)	n/a	238 (3.03 %)	666 (12.49 %)	n/a	33.70 (99.89 %)	10 (0.03 %)	437 (0.04 %)	1,743 (99.97 %)	1,511 (2.99 %)	268 (0.36 %)	31,900 (26.59 %)	0 (0 %)	57 (0.18 %)	373 (7.62 %)	360 (7.39 %)
1129	microsporidians E.canceri (GB1 2017) GCA_002087915.1	n/a	2,169 (58.64 %)	224 (4.08 %)	1,288 (48.96 %)	n/a	40.15 (99.96 %)	196 (0.01 %)	196 (0.01 %)	733 (99.99 %)	844 (1.72 %)	1,253 (5.65 %)	14,595 (10.49 %)	184 (3.19 %)	587 (4.26 %)	246 (5.86 %)	204 (4.79 %)
1130	microsporidians E.cuniculi (EC1 2011) GCA_000221285.2	n/a	n/a	1,465 (70.32 %)	594 (36.38 %)	n/a	46.90 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	71 (100.00 %)	125 (0.32 %)	76 (0.16 %)	9,240 (7.41 %)	0 (0 %)	17 (0.06 %)	86 (1.93 %)	64 (1.61 %)
1131	microsporidians E.cuniculi (EC2 2011) GCA_000221265.2	n/a	n/a	1,452 (70.15 %)	595 (36.68 %)	n/a	46.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	54 (100.00 %)	126 (0.33 %)	74 (0.15 %)	9,085 (7.33 %)	0 (0 %)	19 (0.05 %)	89 (1.85 %)	67 (1.52 %)
1132	microsporidians E.cuniculi (EC3 2011) GCA_000221245.2	n/a	n/a	1,448 (70.47 %)	595 (36.80 %)	n/a	46.83 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	60 (100.00 %)	107 (0.22 %)	62 (0.14 %)	10,269 (8.37 %)	0 (0 %)	6 (0.02 %)	80 (1.58 %)	55 (1.16 %)
1133	microsporidians E.cuniculi (EcunIII-L 2015) GCA_001078035.1	n/a	1,885 (85.85 %)	1,463 (70.48 %)	595 (36.64 %)	n/a	46.92 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	15 (100.00 %)	120 (0.24 %)	56 (0.11 %)	9,401 (7.52 %)	0 (0 %)	10 (0.04 %)	93 (1.97 %)	69 (1.61 %)
1134	microsporidians E.cuniculi (v2 GB-M1 2017) GCF_000091225.2	2,131 (86.51 %)	n/a	1,569 (68.26 %)	597 (33.73 %)	n/a	47.31 (99.97 %)	4 (0.03 %)	4 (0.03 %)	15 (99.97 %)	224 (0.44 %)	199 (0.40 %)	10,819 (8.68 %)	0 (0 %)	168 (0.67 %)	126 (3.52 %)	105 (3.03 %)
1135	microsporidians E.hellem (Swiss 2021) GCA_018342045.1	n/a	2,025 (89.85 %)	1,400 (60.91 %)	749 (46.22 %)	n/a	43.65 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	32 (100.00 %)	198 (0.75 %)	71 (0.15 %)	9,360 (7.61 %)	0 (0 %)	13 (0.04 %)	24 (0.39 %)	15 (0.19 %)
1136	microsporidians E.hellem ATCC 50504 GCF_000277815.2	1,960 (90.46 %)	n/a	1,419 (61.78 %)	759 (47.04 %)	n/a	43.37 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	193 (1.00 %)	38 (0.09 %)	9,361 (7.58 %)	0 (0 %)	11 (0.04 %)	19 (0.31 %)	13 (0.15 %)
1137	microsporidians E.hepatopenaei (EHP-ID16 2018) GCA_003709115.1	n/a	n/a	168 (3.51 %)	282 (11.21 %)	n/a	25.51 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	162 (100.00 %)	1,711 (5.55 %)	4,566 (7.98 %)	25,083 (45.19 %)	0 (0 %)	746 (1.19 %)	2 (0.09 %)	2 (0.09 %)
1138	microsporidians E.hepatopenaei (TH1 2017) GCA_002081675.1	n/a	2,536 (71.59 %)	171 (3.12 %)	316 (10.76 %)	n/a	25.45 (99.98 %)	0 (0 %)	1 (0.02 %)	62 (100.00 %)	1,763 (3.95 %)	4,773 (6.34 %)	29,813 (44.36 %)	0 (0 %)	445 (1.57 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1139	microsporidians E.intestinalis ATCC 50506 GCF_000146465.1	1,951 (90.34 %)	n/a	1,418 (61.98 %)	633 (39.85 %)	n/a	41.52 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	12 (100.00 %)	188 (0.80 %)	57 (0.10 %)	10,641 (8.83 %)	0 (0 %)	4 (0.02 %)	17 (0.40 %)	17 (0.32 %)
1140	microsporidians E.romaleae SJ-2008 GCF_000280035.1	1,836 (89.04 %)	n/a	1,410 (63.16 %)	772 (48.80 %)	n/a	40.35 (100.00 %)	0 (0 %)	8 (0.00 %)	13 (100.00 %)	119 (0.24 %)	40 (0.20 %)	10,138 (8.38 %)	0 (0 %)	6 (0.12 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1141	microsporidians H.eriocheir (canceri 2017) GCA_002087875.1	n/a	3,052 (40.98 %)	156 (1.55 %)	613 (12.17 %)	n/a	23.16 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	2,344 (100.00 %)	2,272 (2.46 %)	1,380 (1.88 %)	49,500 (39.62 %)	0 (0 %)	444 (0.64 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1142	microsporidians H.eriocheir (GB1 2017) GCA_002087885.1	n/a	2,691 (41.62 %)	164 (1.97 %)	534 (12.53 %)	n/a	22.61 (99.38 %)	0 (0 %)	1,576 (0.70 %)	1,300 (100.00 %)	2,233 (2.73 %)	1,826 (6.14 %)	45,718 (42.56 %)	128 (0.42 %)	3,368 (8.46 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1143	microsporidians H.magnivora (BE-OM-2 2019) GCA_004325065.1	n/a	4,658 (23.67 %)	273 (0.66 %)	365 (1.71 %)	n/a	25.80 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3,550 (100.00 %)	7,913 (2.01 %)	9,660 (3.15 %)	237,840 (44.21 %)	0 (0 %)	2,415 (0.92 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)
1144	microsporidians H.magnivora (IL-BN-2 2019) GCA_004325035.1	n/a	4,180 (24.89 %)	240 (0.73 %)	331 (1.93 %)	n/a	25.74 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3,833 (100.00 %)	6,734 (2.12 %)	8,656 (3.35 %)	197,463 (44.00 %)	0 (0 %)	2,018 (0.87 %)	5 (0.01 %)	5 (0.01 %)
1145	microsporidians H.tvaerminnensis (FI-OER-3-3 2019) GCA_004325045.1	n/a	4,121 (24.63 %)	270 (0.76 %)	462 (2.71 %)	n/a	25.82 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	2,915 (100.00 %)	6,956 (2.04 %)	9,411 (3.55 %)	211,128 (43.72 %)	0 (0 %)	2,526 (1.06 %)	5 (0.01 %)	3 (0.01 %)
1146	microsporidians H.tvaerminnensis (IL-G-3 2019) GCA_004325075.1	n/a	6,203 (26.36 %)	347 (0.72 %)	638 (2.62 %)	n/a	26.14 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	2,738 (100.00 %)	9,609 (2.05 %)	13,094 (3.59 %)	266,734 (42.79 %)	0 (0 %)	4,287 (1.22 %)	8 (0.01 %)	5 (0.01 %)
1147	microsporidians M.daphniae GCF_000760515.2	3,291 (67.45 %)	n/a	580 (6.66 %)	954 (21.41 %)	n/a	43.00 (99.98 %)	299 (0.01 %)	299 (0.01 %)	909 (99.99 %)	646 (0.53 %)	961 (1.03 %)	27,900 (10.39 %)	0 (0 %)	144 (0.26 %)	451 (6.75 %)	351 (4.22 %)
1148	microsporidians N.ausubeli (ERTm2 2012) GCA_000250695.1	n/a	2,831 (65.35 %)	218 (2.88 %)	918 (28.38 %)	n/a	38.34 (98.91 %)	87 (1.09 %)	91 (1.09 %)	289 (98.91 %)	851 (1.00 %)	1,667 (2.31 %)	29,888 (14.30 %)	0 (0 %)	797 (1.75 %)	26 (0.28 %)	17 (0.22 %)
1149	microsporidians N.ausubeli (ERTm6 2014) GCF_000738915.1	2,439 (68.30 %)	n/a	223 (3.17 %)	859 (30.50 %)	n/a	38.30 (98.89 %)	0 (0 %)	33 (1.11 %)	24 (100.00 %)	622 (0.73 %)	1,270 (1.60 %)	27,266 (13.90 %)	7 (0.07 %)	295 (0.73 %)	30 (0.46 %)	22 (0.38 %)
1150	microsporidians N.bombycis (CQ1 2013) GCA_000383075.1	n/a	4,468 (23.27 %)	486 (1.93 %)	941 (6.65 %)	n/a	30.82 (91.53 %)	1,951 (8.50 %)	2,083 (8.50 %)	3,558 (91.50 %)	3,759 (1.33 %)	3,532 (1.64 %)	147,981 (31.13 %)	27 (0.18 %)	4,394 (4.45 %)	184 (1.43 %)	177 (1.41 %)
1151	microsporidians N.ceranae GCF_000988165.1	3,211 (44.18 %)	n/a	339 (3.70 %)	260 (4.85 %)	n/a	25.36 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	536 (100.00 %)	2,166 (1.86 %)	1,165 (1.46 %)	61,165 (40.63 %)	0 (0 %)	388 (0.78 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)
1152	microsporidians N.ceranae (BRL01 2009 refseq) GCF_000182985.1	2,060 (25.73 %)	n/a	348 (2.68 %)	63 (0.61 %)	n/a	25.26 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	5,465 (100.00 %)	3,179 (1.99 %)	1,572 (1.39 %)	85,189 (41.34 %)	0 (0 %)	432 (0.38 %)	4 (0.02 %)	4 (0.02 %)
1153	microsporidians N.displodere (JUm2807 2016) GCA_001642395.1	n/a	2,278 (86.34 %)	241 (4.60 %)	474 (20.39 %)	n/a	49.23 (99.70 %)	0 (0 %)	60 (0.30 %)	42 (100.00 %)	734 (1.35 %)	1,667 (2.21 %)	15,148 (10.04 %)	11 (0.07 %)	246 (0.99 %)	647 (11.65 %)	466 (7.32 %)
1154	microsporidians N.displodere (JUm2807 2016) GCF_001642395.1	2,278 (86.35 %)	n/a	241 (4.60 %)	474 (20.39 %)	n/a	49.23 (99.70 %)	60 (0.30 %)	60 (0.30 %)	102 (99.70 %)	749 (1.26 %)	1,667 (2.21 %)	15,148 (10.04 %)	11 (0.07 %)	246 (0.99 %)	647 (11.65 %)	466 (7.32 %)
1155	microsporidians N.granulosis (Ou3-Ou53 2020) GCA_015832245.1	n/a	3,639 (38.13 %)	508 (3.72 %)	1,125 (15.67 %)	n/a	31.58 (99.69 %)	0 (0 %)	253 (0.28 %)	1,754 (100.00 %)	1,902 (1.14 %)	5,269 (4.71 %)	72,413 (25.92 %)	149 (0.48 %)	3,251 (2.47 %)	12 (0.06 %)	12 (0.06 %)
1156	microsporidians N.major (JUm2507 2022) GCF_021653875.1	2,415 (75.43 %)	n/a	233 (3.57 %)	462 (17.76 %)	n/a	49.02 (99.98 %)	0 (0 %)	10 (0.02 %)	111 (100.00 %)	410 (0.74 %)	1,364 (1.91 %)	19,818 (10.67 %)	1 (0.01 %)	553 (1.12 %)	951 (43.99 %)	839 (16.28 %)
1157	microsporidians N.parisii (ERTm3 2011) GCA_000190615.1	n/a	2,788 (78.30 %)	215 (3.16 %)	720 (24.13 %)	n/a	34.46 (99.37 %)	43 (0.63 %)	43 (0.63 %)	96 (99.37 %)	1,167 (1.96 %)	1,922 (2.62 %)	32,499 (22.16 %)	0 (0 %)	787 (1.68 %)	48 (0.50 %)	47 (0.49 %)
1158	microsporidians N.parisii ERTm1 GCF_000250985.1	2,672 (76.63 %)	n/a	218 (3.21 %)	713 (24.88 %)	n/a	34.42 (98.96 %)	61 (1.04 %)	62 (1.04 %)	126 (98.96 %)	1,146 (1.98 %)	1,929 (2.59 %)	31,259 (21.73 %)	0 (0 %)	785 (1.63 %)	48 (0.52 %)	45 (0.50 %)
1159	microsporidians N.sp. (ERTm5 2016) GCA_001642415.1	n/a	2,709 (72.90 %)	226 (3.03 %)	769 (24.63 %)	n/a	33.50 (99.92 %)	0 (0 %)	37 (0.07 %)	186 (100.00 %)	1,256 (2.02 %)	2,057 (2.65 %)	34,878 (23.38 %)	9 (0.04 %)	766 (1.26 %)	22 (0.45 %)	21 (0.39 %)
1160	microsporidians O.colligata (FI-SK-17-1 2019) GCA_004325055.1	n/a	1,849 (85.23 %)	1,085 (36.85 %)	896 (53.23 %)	n/a	38.51 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	26 (100.00 %)	n/a	185 (0.46 %)	9,996 (7.93 %)	0 (0 %)	18 (0.06 %)	2 (0.04 %)	2 (0.04 %)
1161	microsporidians O.colligata (GB-EP-1 2019) GCA_004324935.1	n/a	1,857 (84.32 %)	1,084 (36.82 %)	909 (53.14 %)	n/a	38.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	18 (100.00 %)	n/a	250 (0.64 %)	9,884 (7.79 %)	0 (0 %)	43 (0.12 %)	2 (0.03 %)	2 (0.03 %)
1162	microsporidians O.colligata (NO-V-7 2019) GCA_004324945.1	n/a	1,862 (83.99 %)	1,095 (36.69 %)	915 (53.09 %)	n/a	38.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	21 (100.00 %)	n/a	234 (0.59 %)	9,284 (7.22 %)	0 (0 %)	29 (0.08 %)	2 (0.03 %)	2 (0.03 %)
1163	microsporidians O.colligata OC4 GCF_000803265.1	1,835 (85.27 %)	n/a	1,087 (37.11 %)	903 (53.32 %)	n/a	38.52 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	16 (100.00 %)	282 (0.70 %)	194 (0.49 %)	9,413 (7.37 %)	0 (0 %)	21 (0.07 %)	2 (0.03 %)	2 (0.03 %)
1164	microsporidians O.pajunii (FI-F-10 2022) GCF_021821965.1	1,831 (87.79 %)	n/a	1,079 (38.28 %)	692 (40.73 %)	n/a	43.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	22 (100.00 %)	171 (0.36 %)	78 (0.16 %)	9,012 (7.00 %)	0 (0 %)	9 (0.03 %)	27 (0.53 %)	18 (0.40 %)
1165	microsporidians P.neurophilia (MK1 2015) GCA_001432165.1	n/a	3,645 (54.94 %)	133 (1.43 %)	586 (13.16 %)	n/a	29.55 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1,603 (100.00 %)	987 (1.12 %)	5,423 (7.08 %)	48,249 (30.41 %)	0 (0 %)	2,342 (2.93 %)	14 (0.18 %)	12 (0.17 %)
1166	microsporidians S.lophii (42_110 2013) GCA_000430065.1	n/a	2,552 (51.07 %)	197 (2.33 %)	286 (6.41 %)	n/a	23.36 (99.95 %)	900 (0.02 %)	900 (0.02 %)	2,292 (99.98 %)	3,494 (4.01 %)	2,146 (2.94 %)	56,311 (48.08 %)	0 (0 %)	419 (0.55 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)
1167	microsporidians T.hominis (2013) GCA_000316135.1	n/a	3,253 (36.35 %)	263 (1.93 %)	1,144 (18.74 %)	n/a	34.08 (90.74 %)	1,322 (9.32 %)	1,322 (9.32 %)	1,632 (90.68 %)	1,240 (0.97 %)	2,370 (1.69 %)	60,905 (18.47 %)	0 (0 %)	459 (0.39 %)	319 (3.09 %)	325 (3.07 %)
1168	microsporidians T.ratisbonensis (Franzen 2019) GCA_004000155.1	n/a	3,080 (37.58 %)	207 (1.47 %)	348 (4.44 %)	n/a	23.20 (99.88 %)	0 (0 %)	12,779 (0.31 %)	952 (100.00 %)	4,275 (2.98 %)	3,628 (1.96 %)	82,464 (49.09 %)	0 (0 %)	156 (0.16 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1169	microsporidians V.apis (BRL 01 2013) GCA_000447185.1	n/a	2,764 (26.28 %)	301 (2.11 %)	353 (4.04 %)	n/a	18.78 (99.37 %)	579 (0.65 %)	609 (0.65 %)	1,133 (99.35 %)	4,051 (2.82 %)	8,060 (5.97 %)	70,407 (59.63 %)	0 (0 %)	4,442 (5.78 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1170	microsporidians V.ceranae (BRL 2019) GCA_004919615.1	n/a	2,294 (27.34 %)	367 (2.44 %)	491 (6.13 %)	n/a	27.84 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	110 (100.00 %)	3,455 (2.27 %)	1,584 (1.40 %)	88,723 (39.57 %)	0 (0 %)	1,892 (3.25 %)	46 (5.30 %)	46 (5.30 %)
1171	microsporidians V.corneae ATCC 50505 GCF_000231115.1	2,246 (68.58 %)	n/a	331 (6.49 %)	1,002 (38.96 %)	n/a	36.47 (97.98 %)	94 (2.02 %)	99 (2.02 %)	314 (97.98 %)	253 (0.49 %)	276 (0.62 %)	19,038 (12.70 %)	0 (0 %)	239 (0.80 %)	21 (0.26 %)	22 (0.25 %)
1172	microsporidians V.culicis subsp. floridensis GCF_000192795.1	2,775 (53.76 %)	n/a	270 (2.57 %)	1,321 (29.86 %)	n/a	39.75 (98.61 %)	122 (1.39 %)	137 (1.39 %)	501 (98.61 %)	325 (0.37 %)	1,106 (1.67 %)	27,799 (11.03 %)	0 (0 %)	652 (0.79 %)	263 (3.49 %)	263 (3.35 %)
1173	Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (HCoV-EMC HCoV-EMC/2012 2012) GCF_000901155.1	n/a	12 (97.48 %)	n/a	n/a	n/a	41.24 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.12 %)	n/a	4 (0.14 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1174	Mink calicivirus (MCV-DL/2007/CN 2012) GCF_000901135.1	n/a	3 (95.62 %)	n/a	n/a	n/a	45.47 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.21 %)	n/a	1 (0.21 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1175	mite/tick D.andersoni (qqDerAnde1 alternate hap 2022) GCA_023375915.1	n/a	n/a	3,279 (0.13 %)	115,425 (5.76 %)	n/a	46.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8,198 (100.00 %)	696,055 (2.02 %)	471,378 (6.82 %)	8,809,430 (37.51 %)	0 (0 %)	842,629 (3.38 %)	161,823 (11.17 %)	192,858 (6.04 %)
1176	mite/tick H.asiaticum (Hyas-2018 2020) GCA_013339685.2	n/a	29,657 (1.66 %)	3,662 (0.17 %)	95,489 (6.14 %)	n/a	46.62 (99.97 %)	0 (0 %)	5,465 (0.03 %)	6,320 (100.00 %)	724,053 (2.01 %)	524,407 (3.24 %)	6,794,646 (33.90 %)	8 (0.00 %)	557,104 (3.85 %)	82,351 (6.19 %)	181,732 (6.63 %)
1177	mite/tick R.annulatus (Klein Grass 2020) GCA_013436015.1	n/a	n/a	3,903 (0.11 %)	138,871 (5.29 %)	n/a	45.72 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16,339 (100.00 %)	1,125,631 (4.27 %)	743,900 (3.59 %)	11,876,998 (39.12 %)	0 (0 %)	1,029,368 (3.55 %)	354,180 (18.10 %)	258,911 (5.53 %)
1178	mite/tick S.scabiei (Arlian Lab 2015) GCA_000828355.1	n/a	10,680 (21.78 %)	1,894 (2.65 %)	2,069 (5.06 %)	n/a	33.26 (99.91 %)	6,720 (0.05 %)	6,724 (0.05 %)	25,580 (99.95 %)	127,779 (8.48 %)	43,804 (3.26 %)	616,763 (41.52 %)	403 (0.10 %)	8,519 (0.99 %)	127 (0.13 %)	98 (0.11 %)
1179	mites & ticks D.andersoni (primary hap 2022) GCF_023375885.1	46,118 (3.04 %)	n/a	3,687 (0.12 %)	132,965 (5.77 %)	44,417 (2.15 %)	46.48 (100.00 %)	0 (0 %)	58 (0.00 %)	3,119 (100.00 %)	785,373 (1.83 %)	539,286 (5.65 %)	10,665,664 (37.28 %)	0 (0 %)	909,259 (3.31 %)	171,266 (10.00 %)	224,252 (5.87 %)
1180	mites & ticks D.silvarum (v2 Dsil-2018 2022) GCF_013339745.2	43,476 (2.68 %)	n/a	3,956 (0.13 %)	128,343 (5.81 %)	n/a	46.91 (99.91 %)	0 (0 %)	13,519 (0.09 %)	1,665 (100.00 %)	965,351 (1.84 %)	642,805 (3.16 %)	10,426,983 (39.18 %)	6 (0.00 %)	813,673 (3.72 %)	37,852 (2.32 %)	244,150 (6.39 %)
1181	Molluscum contagiosum virus subtype 1 (1996) GCF_000843325.1	n/a	163 (85.07 %)	n/a	n/a	n/a	63.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	128 (3.25 %)	92 (4.74 %)	1,361 (17.29 %)	0 (0 %)	82 (1.92 %)	1 (99.95 %)	1 (97.02 %)
1182	monkey B virus (8100812 2023) GCF_018580855.1	n/a	97 (76.06 %)	n/a	n/a	n/a	75.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	167 (5.56 %)	151 (4.68 %)	1,200 (33.97 %)	0 (0 %)	15 (0.82 %)	1 (99.99 %)	1 (0.14 %)
1183	monkey B virus (E2490 2003) GCF_000844145.1	n/a	80 (76.11 %)	n/a	n/a	n/a	74.46 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	139 (4.30 %)	119 (5.55 %)	1,144 (32.51 %)	0 (0 %)	19 (1.04 %)	1 (99.99 %)	6 (1.51 %)
1184	monkey B virus (KQ 2023) GCF_018580865.1	n/a	97 (76.48 %)	n/a	n/a	n/a	75.30 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	135 (4.65 %)	142 (6.00 %)	1,151 (34.13 %)	0 (0 %)	17 (0.85 %)	1 (100.00 %)	2 (0.30 %)
1185	Monkeypox virus (MPXV-M5312_HM12_Rivers 2022) GCF_014621545.1	n/a	179 (83.90 %)	n/a	n/a	n/a	33.03 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	38 (0.78 %)	22 (0.54 %)	1,097 (9.44 %)	0 (0 %)	3 (0.08 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1186	Monkeypox virus (Zaire-96-I-16 2021) GCF_000857045.1	n/a	180 (84.71 %)	n/a	n/a	n/a	33.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	37 (0.96 %)	24 (0.57 %)	1,102 (9.51 %)	0 (0 %)	5 (0.16 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1187	Mopeia Lassa virus reassortant 29 (ML29 IGS-15 2004) GCF_000855745.1	n/a	4 (95.68 %)	n/a	n/a	n/a	43.06 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (1.48 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1188	mosquito A.albimanus (ALBI9_A 2017) GCA_000349125.2	n/a	n/a	5,127 (3.40 %)	21,615 (15.39 %)	n/a	49.21 (94.33 %)	2,660 (5.68 %)	2,660 (5.68 %)	2,861 (94.32 %)	147,470 (3.48 %)	38,292 (0.87 %)	955,773 (15.06 %)	73 (0.09 %)	5,733 (0.49 %)	1,142 (6.40 %)	3,220 (1.00 %)
1189	mosquito A.albimanus (STELCA 2020) GCF_013758885.1	25,523 (22.63 %)	n/a	5,211 (3.30 %)	22,052 (15.12 %)	n/a	48.96 (99.00 %)	0 (0 %)	144 (1.00 %)	7 (100.00 %)	147,275 (3.73 %)	50,051 (2.35 %)	906,231 (16.95 %)	0 (0 %)	34,860 (1.87 %)	222 (0.58 %)	2,192 (0.79 %)
1190	mosquito A.aquasalis (primary hap 2022) GCF_943734665.1	21,677 (19.40 %)	n/a	5,251 (3.23 %)	21,406 (14.50 %)	22,347 (16.66 %)	48.21 (100.00 %)	0 (0 %)	27 (0.00 %)	91 (100.00 %)	151,297 (4.01 %)	40,814 (2.54 %)	1,012,191 (20.42 %)	0 (0 %)	23,442 (2.47 %)	306 (1.80 %)	6,691 (1.88 %)
1191	mosquito A.arabiensis (DONG5_A 2013) GCA_000349185.1	n/a	n/a	5,315 (2.75 %)	26,737 (14.08 %)	n/a	44.68 (85.77 %)	8,965 (14.25 %)	8,965 (14.25 %)	10,179 (85.75 %)	178,571 (6.31 %)	52,684 (1.23 %)	1,349,510 (17.60 %)	216 (0.28 %)	16,543 (1.06 %)	22,709 (9.17 %)	20,142 (5.24 %)
1192	mosquito A.arabiensis (DONGOLA 2021) GCF_016920715.1	28,615 (16.29 %)	n/a	5,492 (2.31 %)	28,067 (13.30 %)	n/a	44.51 (100.00 %)	0 (0 %)	17 (0.00 %)	102 (100.00 %)	203,071 (12.39 %)	64,818 (5.66 %)	1,282,879 (26.03 %)	0 (0 %)	99,230 (6.12 %)	19,321 (9.74 %)	21,320 (5.55 %)
1193	mosquito A.atroparvus (EBRO 2013) GCA_000473505.1	n/a	n/a	5,283 (3.06 %)	32,814 (17.96 %)	n/a	46.35 (84.26 %)	8,509 (15.76 %)	8,509 (15.76 %)	9,880 (84.24 %)	78,736 (2.47 %)	22,823 (0.85 %)	1,103,859 (13.72 %)	540 (0.62 %)	16,229 (1.55 %)	8,438 (3.98 %)	13,223 (3.76 %)
1194	mosquito A.bellator (2023) GCF_943735745.2	14,520 (15.86 %)	n/a	5,202 (3.43 %)	24,763 (16.71 %)	n/a	48.78 (97.90 %)	0 (0 %)	2,062 (2.10 %)	2,734 (100.00 %)	66,337 (1.51 %)	20,847 (0.55 %)	878,206 (14.77 %)	207 (0.06 %)	5,538 (0.39 %)	2,294 (1.96 %)	2,246 (1.25 %)
1195	mosquito A.christyi (ACHKN1017 2013) GCA_000349165.1	n/a	n/a	5,062 (3.03 %)	26,927 (13.40 %)	n/a	42.74 (98.42 %)	1,114 (1.55 %)	1,114 (1.55 %)	31,483 (98.45 %)	100,408 (2.95 %)	22,892 (0.55 %)	1,127,768 (19.31 %)	87 (0.15 %)	2,013 (0.22 %)	27,752 (12.17 %)	17,616 (6.30 %)
1196	mosquito A.coluzzi (MOPTI 2021) GCF_016920705.1	25,264 (14.63 %)	n/a	5,499 (2.18 %)	29,925 (13.15 %)	n/a	44.03 (100.00 %)	0 (0 %)	63 (0.00 %)	200 (100.00 %)	216,751 (13.23 %)	83,570 (8.55 %)	1,227,511 (28.25 %)	0 (0 %)	153,894 (6.41 %)	20,223 (7.37 %)	21,707 (5.48 %)
1197	mosquito A.coluzzii (M 2008) GCA_000150765.1	n/a	n/a	5,071 (2.55 %)	27,856 (13.45 %)	n/a	44.38 (93.39 %)	16,542 (6.63 %)	16,542 (6.63 %)	27,062 (93.37 %)	169,513 (6.55 %)	45,226 (1.10 %)	1,327,687 (19.58 %)	8 (0.00 %)	23,402 (1.30 %)	25,548 (9.86 %)	21,733 (5.97 %)
1198	mosquito A.coluzzii (Ngousso colony 2019) GCA_004136515.2	n/a	n/a	7,498 (2.39 %)	52,281 (20.56 %)	n/a	44.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	206 (73.82 %)	290,871 (11.30 %)	97,683 (2.60 %)	1,645,536 (23.65 %)	0 (0 %)	72,048 (2.86 %)	32,034 (9.89 %)	30,528 (6.12 %)
1199	mosquito A.coluzzii (primary hap 2022) GCF_943734685.1	26,173 (16.50 %)	n/a	5,490 (2.27 %)	29,111 (13.78 %)	n/a	44.33 (100.00 %)	0 (0 %)	35 (0.00 %)	129 (100.00 %)	167,904 (3.53 %)	80,885 (7.40 %)	1,283,919 (26.48 %)	1 (0.00 %)	92,311 (5.09 %)	19,230 (8.35 %)	21,649 (5.67 %)
1200	mosquito A.coustani (2023) GCF_943734705.1	17,108 (11.40 %)	n/a	5,505 (2.21 %)	34,477 (14.46 %)	n/a	43.94 (99.99 %)	0 (0 %)	28 (0.00 %)	419 (100.00 %)	91,434 (2.14 %)	59,796 (16.13 %)	1,147,988 (32.11 %)	0 (0 %)	245,567 (7.25 %)	9,661 (4.30 %)	15,384 (4.15 %)
1201	mosquito A.cruzii (2022) GCF_943734635.1	14,426 (14.26 %)	n/a	5,361 (3.20 %)	27,215 (16.32 %)	18,311 (13.26 %)	48.97 (99.39 %)	0 (0 %)	1,530 (0.60 %)	4,402 (100.00 %)	85,194 (1.69 %)	23,263 (0.75 %)	973,235 (16.28 %)	152 (0.05 %)	16,598 (1.64 %)	3,694 (4.41 %)	2,686 (1.32 %)
1202	mosquito A.culicifacies (species A-37_1 2013) GCA_000473375.1	n/a	n/a	5,215 (2.92 %)	27,726 (13.77 %)	n/a	42.68 (92.20 %)	8,020 (7.80 %)	8,020 (7.80 %)	24,182 (92.20 %)	73,847 (2.29 %)	15,329 (0.41 %)	1,172,483 (17.34 %)	415 (0.26 %)	7,665 (0.65 %)	25,146 (8.86 %)	18,215 (4.91 %)
1203	mosquito A.dirus (WRAIR2 2013) GCA_000349145.1	n/a	n/a	5,296 (2.91 %)	28,476 (15.16 %)	n/a	46.18 (91.43 %)	6,991 (8.58 %)	6,991 (8.58 %)	8,257 (91.42 %)	123,219 (3.51 %)	39,181 (1.00 %)	1,183,932 (16.11 %)	196 (0.15 %)	12,052 (1.00 %)	5,636 (2.83 %)	7,712 (2.60 %)
1204	mosquito A.epiroticus (epiroticus2 2013) GCA_000349105.1	n/a	n/a	5,342 (2.87 %)	25,036 (13.83 %)	n/a	43.95 (90.68 %)	5,120 (9.33 %)	5,120 (9.33 %)	7,793 (90.67 %)	112,430 (4.16 %)	30,317 (0.75 %)	1,285,051 (17.47 %)	143 (0.22 %)	8,617 (0.58 %)	28,220 (11.53 %)	21,658 (5.99 %)
1205	mosquito A.farauti (FAR1 2014) GCA_000473445.2	n/a	n/a	5,280 (3.29 %)	25,449 (15.60 %)	n/a	44.69 (96.03 %)	2,674 (3.98 %)	2,674 (3.98 %)	2,984 (96.02 %)	100,960 (2.62 %)	29,544 (0.69 %)	1,121,554 (18.29 %)	118 (0.17 %)	4,520 (0.47 %)	5,570 (2.58 %)	7,420 (2.42 %)
1206	mosquito A.maculatus (maculatus3 2013) GCA_000473185.1	n/a	n/a	3,871 (2.51 %)	29,500 (14.56 %)	n/a	44.21 (92.86 %)	6,086 (7.09 %)	6,086 (7.09 %)	53,883 (92.91 %)	72,301 (3.58 %)	13,845 (0.58 %)	785,114 (16.02 %)	249 (0.28 %)	2,683 (0.21 %)	29,058 (17.64 %)	17,513 (8.15 %)
1207	mosquito A.maculipalpis (primary hap 2022) GCF_943734695.1	15,159 (10.06 %)	n/a	5,424 (2.64 %)	25,387 (13.64 %)	17,114 (9.96 %)	42.92 (100.00 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	171 (100.00 %)	102,873 (2.93 %)	38,304 (5.79 %)	1,164,296 (24.56 %)	0 (0 %)	96,776 (3.95 %)	28,055 (10.36 %)	19,292 (4.86 %)
1208	mosquito A.marshallii (primary hap 2022) GCF_943734725.1	12,907 (9.97 %)	n/a	5,366 (2.60 %)	27,505 (14.29 %)	16,541 (9.14 %)	43.29 (100.00 %)	0 (0 %)	16 (0.00 %)	289 (100.00 %)	81,673 (2.34 %)	35,773 (11.05 %)	1,027,565 (26.41 %)	0 (0 %)	101,781 (5.08 %)	15,257 (7.93 %)	16,257 (4.20 %)
1209	mosquito A.melas (CM1001059_A 2014) GCA_000473525.2	n/a	n/a	5,361 (2.63 %)	31,754 (13.09 %)	n/a	44.83 (90.75 %)	9,237 (9.25 %)	9,237 (9.25 %)	29,466 (90.75 %)	173,937 (5.12 %)	56,093 (1.29 %)	1,327,682 (18.51 %)	185 (0.15 %)	6,662 (0.35 %)	39,343 (22.20 %)	24,451 (8.49 %)
1210	mosquito A.merus (MAF 2014) GCA_000473845.2	n/a	n/a	5,304 (2.66 %)	28,321 (14.20 %)	n/a	44.64 (75.46 %)	11,084 (24.55 %)	11,084 (24.55 %)	13,111 (75.45 %)	187,369 (6.94 %)	58,756 (1.16 %)	1,370,791 (15.60 %)	328 (0.32 %)	14,607 (0.84 %)	26,740 (10.02 %)	21,259 (4.79 %)
1211	mosquito A.merus (MAF 2021) GCF_017562075.2	31,068 (14.83 %)	n/a	5,950 (2.16 %)	33,847 (13.99 %)	n/a	44.25 (99.99 %)	0 (0 %)	272 (0.01 %)	1,328 (100.00 %)	238,320 (12.80 %)	95,368 (8.20 %)	1,412,259 (27.02 %)	0 (0 %)	153,586 (5.33 %)	23,957 (9.21 %)	23,125 (5.27 %)
1212	mosquito A.minimus (MINIMUS1 2013) GCA_000349025.1	n/a	n/a	5,292 (3.11 %)	23,555 (14.73 %)	n/a	42.70 (92.39 %)	5,490 (7.62 %)	5,490 (7.62 %)	6,168 (92.38 %)	70,979 (2.53 %)	14,364 (0.53 %)	1,176,757 (17.21 %)	191 (0.13 %)	10,626 (1.15 %)	20,796 (7.26 %)	17,229 (4.70 %)
1213	mosquito A.moucheti (primary hap 2022) GCF_943734755.1	17,184 (11.80 %)	n/a	5,353 (2.17 %)	30,480 (13.42 %)	n/a	43.16 (99.99 %)	0 (0 %)	61 (0.01 %)	345 (100.00 %)	93,414 (2.51 %)	47,713 (21.41 %)	1,008,547 (35.85 %)	2 (0.00 %)	230,455 (8.47 %)	16,069 (11.05 %)	17,879 (4.23 %)
1214	mosquito A.nili (primary hap 2022) GCF_943737925.1	12,802 (12.82 %)	n/a	5,264 (2.95 %)	22,519 (13.62 %)	16,758 (11.40 %)	45.95 (99.98 %)	0 (0 %)	100 (0.02 %)	157 (100.00 %)	86,202 (2.45 %)	46,415 (10.80 %)	886,766 (25.57 %)	0 (0 %)	99,999 (4.98 %)	872 (6.57 %)	935 (0.36 %)
1215	mosquito A.quadriannulatus (QUAD4_A 2013) GCA_000349065.1	n/a	n/a	5,290 (2.76 %)	24,191 (13.08 %)	n/a	44.76 (73.64 %)	14,767 (26.38 %)	14,767 (26.38 %)	17,590 (73.62 %)	178,467 (5.90 %)	53,305 (1.11 %)	1,346,437 (15.19 %)	307 (0.50 %)	19,943 (1.09 %)	26,320 (10.07 %)	20,519 (4.71 %)
1216	mosquito A.sinensis (2014) GCA_000441895.2	n/a	19,352 (10.21 %)	5,309 (2.67 %)	31,996 (15.26 %)	n/a	43.85 (97.19 %)	17,853 (2.84 %)	19,174 (2.84 %)	27,445 (97.16 %)	73,516 (2.14 %)	20,765 (0.72 %)	1,327,566 (18.36 %)	15 (0.00 %)	49,186 (2.77 %)	19,161 (6.60 %)	21,465 (6.15 %)
1217	mosquito A.sinensis (SINENSIS 2014) GCA_000472065.2	n/a	n/a	5,048 (2.73 %)	29,963 (15.52 %)	n/a	43.95 (50.65 %)	20,483 (49.36 %)	20,483 (49.36 %)	30,931 (50.64 %)	66,045 (1.77 %)	17,606 (0.25 %)	1,099,610 (8.93 %)	105 (0.06 %)	25,561 (1.09 %)	26,481 (6.49 %)	22,173 (4.13 %)
1218	mosquito A.ziemanni (2023) GCF_943734765.1	14,634 (9.79 %)	n/a	5,505 (2.21 %)	34,475 (14.46 %)	n/a	43.94 (99.99 %)	0 (0 %)	28 (0.00 %)	419 (100.00 %)	91,434 (2.14 %)	59,796 (16.13 %)	1,147,988 (32.11 %)	0 (0 %)	245,587 (7.25 %)	9,661 (4.30 %)	15,384 (4.15 %)
1219	mosquito S.cyaneus (primary hap 2022) GCF_943734655.1	18,693 (4.82 %)	n/a	5,662 (0.90 %)	42,214 (8.40 %)	n/a	40.04 (100.00 %)	0 (0 %)	59 (0.00 %)	8 (100.00 %)	180,568 (2.80 %)	215,178 (5.85 %)	3,441,334 (47.59 %)	0 (0 %)	242,065 (3.34 %)	57,379 (6.71 %)	27,817 (1.96 %)
1220	Mouse - Jun. 2020 (GRCm39/mm39) (mm39) GCA_000001635.9	136261 (4.84 %)	n/a	n/a	n/a	n/a	41.67 (97.30 %)	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a
1221	mucoromycotan L.corymbifera JMRC:FSU:9682 (FSU 9682 2014) GCA_000723665.1	n/a	13,551 (52.10 %)	1,678 (3.90 %)	6,202 (17.87 %)	n/a	43.43 (92.39 %)	0 (0 %)	394 (7.62 %)	209 (100.00 %)	14,329 (1.80 %)	3,741 (0.73 %)	164,228 (14.59 %)	4 (0.01 %)	2,299 (0.68 %)	1,047 (0.84 %)	409 (0.32 %)
1222	mucoromycotan R.delemar (RA 99-880 2009) GCA_000149305.1	n/a	17,703 (39.71 %)	2,199 (3.49 %)	9,243 (21.60 %)	n/a	35.59 (98.22 %)	308 (1.79 %)	308 (1.79 %)	391 (98.21 %)	26,020 (4.25 %)	11,249 (1.11 %)	273,686 (22.39 %)	0 (0 %)	5,406 (1.98 %)	900 (1.05 %)	824 (0.95 %)
1223	mucoromycotan R.delemar (RA 99-880 2009) GCF_000149305.1	17,464 (39.67 %)	n/a	2,199 (3.49 %)	9,243 (21.60 %)	n/a	35.59 (98.22 %)	308 (1.79 %)	308 (1.79 %)	391 (98.21 %)	25,104 (2.14 %)	11,249 (1.11 %)	273,686 (22.39 %)	0 (0 %)	5,406 (1.98 %)	900 (1.05 %)	824 (0.95 %)
1224	Mumps orthorubulavirus (Miyahara 2000) GCF_000856685.1	n/a	8 (92.81 %)	n/a	n/a	n/a	42.49 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.24 %)	n/a	10 (0.59 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1225	Mundri virus (A14 2023) GCF_029887105.1	n/a	8 (98.82 %)	n/a	n/a	n/a	40.65 (100.00 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	1 (0.34 %)	14 (1.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1226	Mupapillomavirus 1 (1982) GCF_000866405.1	n/a	7 (86.17 %)	n/a	n/a	n/a	40.28 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.47 %)	1 (0.40 %)	7 (1.87 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.75 %)	1 (2.75 %)
1227	Murray Valley encephalitis virus (1999) GCF_000863565.1	n/a	3 (93.56 %)	n/a	n/a	n/a	48.72 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (1.84 %)	1 (1.84 %)
1228	MW polyomavirus (MA095 2012) GCF_000898335.1	n/a	6 (91.25 %)	n/a	n/a	n/a	36.91 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (4.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1229	Mycobacterium tuberculosis (ASM19595v2 H37Rv 2013) GCF_000195955.2	n/a	3,976 (89.72 %)	n/a	n/a	n/a	65.61 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	1,059 (1.47 %)	34,168 (17.69 %)	0 (0 %)	342 (1.05 %)	1 (100.00 %)	1 (100.00 %)
1230	Mycobacterium tuberculosis (GReAT_CRyPTIC_Unmapped_H37Rv 2023) GCF_963525475.1	n/a	4,211 (91.33 %)	n/a	n/a	n/a	65.60 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	1,114 (1.68 %)	34,720 (17.82 %)	0 (0 %)	409 (1.60 %)	1 (100.00 %)	1 (100.00 %)
1231	Mycobacterium tuberculosis (H37Rv 2013) GCF_000277735.2	n/a	4,169 (91.45 %)	n/a	n/a	n/a	65.62 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	1,067 (1.49 %)	34,174 (17.70 %)	0 (0 %)	341 (1.07 %)	1 (100.00 %)	1 (100.00 %)
1232	Mycobacterium tuberculosis (MTb-Oman-3215873 2023) GCF_030566675.1	n/a	4,498 (89.24 %)	n/a	n/a	n/a	65.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	1,000 (2.30 %)	35,591 (17.10 %)	0 (0 %)	645 (2.40 %)	1 (100.00 %)	1 (99.99 %)
1233	N.gruberi (NEG-M 2010) GCF_000004985.1	15,711 (66.57 %)	n/a	921 (1.63 %)	467 (9.68 %)	n/a	33.15 (88.61 %)	1,193 (11.40 %)	1,410 (11.40 %)	1,977 (88.60 %)	13,215 (2.18 %)	6,408 (1.15 %)	297,345 (20.45 %)	0 (0 %)	4,093 (1.01 %)	16 (0.02 %)	2 (0.01 %)
1234	N.lovaniensis (ATCC 30569 2021) GCF_003324165.1	14,755 (77.18 %)	n/a	935 (2.02 %)	1,327 (22.12 %)	n/a	36.90 (99.99 %)	0 (0 %)	142 (0.01 %)	110 (100.00 %)	8,533 (1.20 %)	3,548 (0.82 %)	230,957 (18.96 %)	2 (0.01 %)	1,911 (0.91 %)	12 (0.02 %)	5 (0.01 %)
1235	N.lovaniensis (NL_76_15_250 2022) GCA_022530875.1	n/a	n/a	1,000 (2.12 %)	1,300 (21.28 %)	n/a	36.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	199 (100.00 %)	9,222 (1.31 %)	3,733 (0.71 %)	203,986 (18.52 %)	0 (0 %)	1,709 (0.84 %)	6 (0.01 %)	3 (0.00 %)
1236	Nairobi sheep disease virus (Jilin 2017) GCF_002117695.1	n/a	3 (97.66 %)	n/a	n/a	n/a	44.18 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	45 (2.54 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1237	Nebraska virus (NB 2002) GCF_000851625.1	n/a	2 (98.09 %)	n/a	n/a	n/a	56.55 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.72 %)	n/a	1 (0.30 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (68.70 %)	2 (68.70 %)
1238	Neorickettsia sennetsu str. (Miyayama 2006) GCF_000013165.1	n/a	794 (85.60 %)	n/a	n/a	n/a	41.08 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	17 (0.29 %)	3,544 (6.96 %)	0 (0 %)	23 (0.39 %)	11 (0.47 %)	9 (0.38 %)
1239	New Jersey polyomavirus-2013 (NJ-PyV-2013 2014) GCF_000922675.1	n/a	9 (89.72 %)	n/a	n/a	n/a	39.28 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.06 %)	n/a	12 (3.58 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1240	Newbury agent 1 (2006) GCF_000867125.1	n/a	2 (98.08 %)	n/a	n/a	n/a	56.20 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.19 %)	n/a	3 (1.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (62.74 %)	2 (62.74 %)
1241	Nipah henipavirus (2000) GCF_000863625.1	n/a	11 (82.06 %)	n/a	n/a	n/a	38.17 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.17 %)	n/a	8 (0.37 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1242	Nkolbisson virus (YM 31-65 2017) GCF_002145865.1	n/a	5 (97.26 %)	n/a	n/a	n/a	42.98 (99.97 %)	1 (0.02 %)	1 (0.02 %)	2 (99.98 %)	4 (0.67 %)	n/a	7 (0.52 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1243	Norovirus (dog/GVI.1/HKU_Ca026F/2007/HKG 2019) GCF_007609015.1	n/a	3 (97.97 %)	n/a	n/a	n/a	56.44 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.17 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (66.91 %)	3 (66.91 %)
1244	Norovirus GI (1993) GCF_000864005.1	n/a	3 (99.09 %)	n/a	n/a	n/a	48.03 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.52 %)	1 (0.35 %)	3 (0.31 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1245	Norovirus GI (Hu/BD/2011/GI.7PNA2/Dhaka1882 2019) GCF_008704025.1	n/a	3 (99.22 %)	n/a	n/a	n/a	48.46 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1246	Norovirus GI (Hu/JP/1998/GI.6PNA4/No20-Saitama-98-17 2019) GCF_008703965.1	n/a	3 (98.91 %)	n/a	n/a	n/a	49.94 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.56 %)	n/a	3 (0.36 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1247	Norovirus GI (Hu/JP/2000/GI.6PNA1/WUG1 2019) GCF_008703985.1	n/a	3 (98.82 %)	n/a	n/a	n/a	49.62 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.43 %)	n/a	12 (1.55 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1248	Norovirus GI/Hu/JP/2007/GI.P3_GI.3/Shimizu/KK2866 (Shimizu/KK2866 2018) GCF_003813225.1	n/a	3 (99.03 %)	n/a	n/a	n/a	48.57 (100.00 %)	2 (0.03 %)	2 (0.03 %)	3 (99.97 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.56 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.89 %)	0 (0.00 %)
1249	Norovirus GII (Hu/GII.PNA4-GII.NA4/PNV06929/2008/PER 2019) GCF_008711635.1	n/a	3 (99.19 %)	n/a	n/a	n/a	47.69 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1250	Norovirus GII (NORO_176-1_17_12_2015 2019) GCF_004193815.1	n/a	3 (99.64 %)	n/a	n/a	n/a	50.31 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1251	Norovirus GII (NORO_226_06_01_2016 2018) GCF_003638685.1	n/a	3 (99.23 %)	n/a	n/a	n/a	48.61 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1252	Norovirus GII.17 (Hu/GII.P17_GII.17/KR/2015/CAU-267 2018) GCF_003638645.1	n/a	3 (99.14 %)	n/a	n/a	n/a	48.14 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.71 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1253	Norovirus GII.2 (BJSMQ 2018) GCF_003638665.1	n/a	3 (99.36 %)	n/a	n/a	n/a	48.71 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1254	Norovirus GII/Hu/JP/2007/GII.P15_GII.15/Sapporo/HK299 (Sapporo/HK299 2019) GCF_007608995.1	n/a	3 (99.01 %)	n/a	n/a	n/a	49.25 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1255	Norovirus GII/Hu/JP/2011/GII/Yuzawa/Gira2HS (Yuzawa/Gira2HS 2019) GCF_007609035.1	n/a	3 (98.91 %)	n/a	n/a	n/a	48.63 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.30 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1256	Norovirus GIV (CU081210E/USA/2010 2020) GCF_010478905.1	n/a	3 (98.55 %)	n/a	n/a	n/a	58.56 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (98.56 %)	1 (98.56 %)
1257	Norovirus GIV (Hu/GIV.1/LakeMacquarie/NSW268O/2010/AU 2016) GCF_001595715.1	n/a	3 (98.88 %)	n/a	n/a	n/a	50.71 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.37 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.69 %)	1 (3.69 %)
1258	Norovirus GIV (Hu/US/2016/GIV.NA1PNA1/WI7002 2019) GCF_008704005.1	n/a	3 (99.96 %)	n/a	n/a	n/a	51.14 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.55 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.78 %)	1 (2.78 %)
1259	Norovirus GV (Mu/NoV/GV/MNV1/2002/USA 2006) GCF_000868425.1	n/a	4 (98.92 %)	n/a	n/a	n/a	56.72 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.42 %)	n/a	5 (0.60 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (18.84 %)	4 (18.84 %)
1260	northern house mosquito (v2 TS 2022) GCF_016801865.2	28,637 (7.92 %)	n/a	5,781 (1.09 %)	36,884 (7.75 %)	n/a	36.77 (99.97 %)	0 (0 %)	1,699 (0.03 %)	290 (100.00 %)	197,797 (4.69 %)	187,655 (9.84 %)	3,008,924 (56.45 %)	11 (0.00 %)	387,681 (5.39 %)	62,992 (9.78 %)	42,880 (6.51 %)
1261	Norwalk-like virus (Hu/Norovirus/hiroshima/1999/JP9912-02F 2016) GCF_001595695.1	n/a	3 (99.32 %)	n/a	n/a	n/a	50.06 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1262	Norway rat BN7.2 GCF_015227675.2	97,432 (4.08 %)	n/a	21,526 (1.86 %)	19,266 (1.33 %)	54,530 (2.79 %)	41.99 (99.19 %)	581 (0.81 %)	581 (0.81 %)	757 (99.19 %)	5,029,005 (45.44 %)	1,514,974 (3.57 %)	13,450,428 (35.83 %)	4 (0.00 %)	1,172,090 (3.51 %)	19,244 (0.46 %)	16,098 (0.39 %)
1263	NY_014 poxvirus (2013 2017) GCF_002270605.1	n/a	197 (91.70 %)	n/a	n/a	n/a	29.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	42 (0.94 %)	15 (0.77 %)	1,374 (12.16 %)	0 (0 %)	6 (0.31 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1264	Omsk hemorrhagic fever virus (Bogoluvovska 2003) GCF_000855505.1	n/a	1 (94.98 %)	n/a	n/a	n/a	53.64 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.20 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1265	Onyong-nyong virus (1993) GCF_000863005.1	n/a	5 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	48.32 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (1.28 %)	7 (1.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (15.80 %)	5 (15.80 %)
1266	Onyong-nyong virus (SG650 2023) GCF_002888795.1	n/a	2 (95.47 %)	n/a	n/a	n/a	48.09 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.42 %)	1 (1.22 %)	4 (0.63 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (13.44 %)	4 (13.44 %)
1267	oomycetes (APO3 2014) GCF_000520075.1	26,269 (46.65 %)	n/a	1,177 (1.37 %)	19,426 (42.61 %)	n/a	49.76 (77.24 %)	3,824 (22.77 %)	3,828 (22.77 %)	4,659 (77.23 %)	17,048 (1.33 %)	13,541 (1.35 %)	277,853 (11.14 %)	355 (1.46 %)	10,924 (3.49 %)	4,027 (15.06 %)	5,971 (8.56 %)
1268	oomycetes (ATCC 12531 2013) GCA_000387505.2	n/a	n/a	769 (1.11 %)	19,300 (54.33 %)	n/a	56.95 (96.15 %)	42,328 (4.18 %)	42,328 (4.18 %)	53,300 (95.82 %)	8,618 (1.03 %)	4,309 (0.91 %)	256,569 (13.16 %)	0 (0 %)	1,650 (0.52 %)	10,098 (88.19 %)	5,514 (12.97 %)
1269	oomycetes (CBS 223.65 2014) GCF_000151545.1	20,111 (56.18 %)	n/a	822 (0.98 %)	19,428 (49.07 %)	n/a	58.43 (90.69 %)	2,683 (9.33 %)	2,683 (9.33 %)	4,126 (90.67 %)	8,354 (0.87 %)	6,199 (0.78 %)	345,615 (16.57 %)	12 (0.03 %)	7,136 (1.59 %)	1,617 (89.01 %)	393 (1.17 %)
1270	oomycetes (DAOM BR144 2010) GCA_000143045.1	n/a	n/a	1,270 (2.05 %)	19,103 (61.92 %)	n/a	52.31 (95.28 %)	772 (4.72 %)	772 (4.72 %)	1,747 (95.28 %)	9,471 (1.06 %)	5,288 (1.28 %)	163,230 (11.43 %)	5 (0.13 %)	4,843 (2.52 %)	920 (70.13 %)	578 (1.24 %)
1271	oomycetes (DAOM BR242034 2013) GCA_000387465.2	n/a	n/a	743 (1.11 %)	21,033 (57.53 %)	n/a	55.06 (96.47 %)	7,590 (3.55 %)	7,590 (3.55 %)	19,131 (96.45 %)	8,292 (0.89 %)	3,296 (0.41 %)	263,047 (14.66 %)	0 (0 %)	845 (0.16 %)	9,266 (84.69 %)	4,741 (8.29 %)
1272	oomycetes (DAOM BR444 2013) GCA_000387445.2	n/a	n/a	1,201 (2.48 %)	14,349 (66.11 %)	n/a	53.82 (95.54 %)	4,014 (4.49 %)	4,089 (4.49 %)	5,788 (95.51 %)	4,738 (0.86 %)	2,117 (0.28 %)	128,200 (7.51 %)	19 (0.01 %)	577 (0.16 %)	2,418 (85.97 %)	1,621 (10.71 %)
1273	oomycetes (DAOM BR484 2013) GCA_000387545.2	n/a	n/a	793 (1.59 %)	18,377 (69.47 %)	n/a	58.93 (99.30 %)	7,941 (0.77 %)	7,941 (0.77 %)	11,626 (99.23 %)	8,412 (1.14 %)	4,946 (0.88 %)	208,306 (16.24 %)	0 (0 %)	1,346 (0.38 %)	3,434 (96.94 %)	1,513 (7.54 %)
1274	oomycetes (DAOM BR486 2013) GCA_000387425.2	n/a	n/a	943 (1.49 %)	18,481 (56.45 %)	n/a	53.78 (99.37 %)	8,309 (0.68 %)	8,309 (0.68 %)	14,196 (99.32 %)	13,678 (1.31 %)	4,019 (0.39 %)	253,001 (13.81 %)	0 (0 %)	365 (0.12 %)	5,862 (89.91 %)	3,027 (5.12 %)
1275	oomycetes (DAOM BR650 2013) GCA_000387525.2	n/a	n/a	908 (1.65 %)	16,450 (54.31 %)	n/a	52.05 (95.06 %)	42,793 (5.37 %)	42,793 (5.37 %)	48,275 (94.63 %)	5,845 (0.67 %)	1,596 (0.19 %)	173,583 (9.29 %)	0 (0 %)	122 (0.04 %)	3,793 (47.63 %)	2,121 (2.92 %)
1276	oomycetes (MF1 2022) GCA_021527665.1	n/a	21,894 (48.80 %)	1,340 (1.51 %)	23,062 (53.03 %)	n/a	47.47 (99.96 %)	227 (0.02 %)	227 (0.02 %)	8,016 (99.98 %)	4,162 (0.31 %)	5,897 (0.82 %)	192,389 (7.93 %)	1 (0.00 %)	5,804 (1.19 %)	7,583 (33.26 %)	5,876 (9.66 %)
1277	oomycetes (NJM9701 2014) GCF_000520115.1	20,817 (57.87 %)	n/a	1,078 (1.76 %)	14,914 (49.32 %)	n/a	54.18 (58.08 %)	4,712 (41.95 %)	4,713 (41.95 %)	5,193 (58.05 %)	2,436 (0.27 %)	1,891 (0.22 %)	178,080 (5.17 %)	146 (0.81 %)	6,904 (1.56 %)	2,821 (20.21 %)	2,491 (8.17 %)
1278	oomycetes (Pi-S 2022) GCA_001029375.2	n/a	31,005 (40.68 %)	1,542 (1.62 %)	25,539 (57.09 %)	n/a	57.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	840 (100.00 %)	62,245 (4.81 %)	51,724 (13.98 %)	254,354 (21.49 %)	0 (0 %)	50,609 (9.95 %)	1,464 (98.31 %)	1,245 (73.70 %)
1279	oomycetes (VS20 2013) GCF_000281045.1	18,229 (66.46 %)	n/a	733 (1.13 %)	16,460 (53.33 %)	n/a	58.61 (64.36 %)	3,488 (35.66 %)	3,488 (35.66 %)	3,878 (64.34 %)	6,646 (0.82 %)	4,782 (0.40 %)	290,383 (11.54 %)	77 (0.13 %)	4,258 (0.86 %)	1,340 (38.48 %)	600 (1.05 %)
1280	Orf virus (OV-SA00 ORFD 2004) GCF_000844845.1	n/a	130 (89.67 %)	n/a	n/a	n/a	63.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	56 (2.03 %)	37 (1.70 %)	1,076 (16.55 %)	0 (0 %)	4 (0.28 %)	1 (100.00 %)	1 (100.00 %)
1281	Oropouche virus (2004) GCF_000853785.1	n/a	4 (97.72 %)	n/a	n/a	n/a	35.40 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	33 (3.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1282	Orthobunyavirus bwambaense (M459 2017) GCF_002118905.1	n/a	4 (94.10 %)	n/a	n/a	n/a	31.34 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	8 (2.54 %)	5 (1.00 %)	23 (5.73 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1283	Orthohantavirus andesense (Chile-9717869 2002) GCF_000850405.1	n/a	4 (92.25 %)	n/a	n/a	n/a	38.53 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1284	Orthohantavirus asikkalaense (CZ/Beskydy/412/2010/Sm 2019) GCF_002815935.1	n/a	3 (93.28 %)	n/a	n/a	n/a	38.58 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.33 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1285	Orthohantavirus bayoui (HV F0260003 2018) GCF_002816435.1	n/a	3 (91.68 %)	n/a	n/a	n/a	39.50 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.48 %)	n/a	11 (1.72 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1286	Orthohantavirus caobangense (3 2017) GCF_002119025.1	n/a	3 (93.00 %)	n/a	n/a	n/a	36.66 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	7 (1.60 %)	2 (0.38 %)	10 (1.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1287	Orthohantavirus delgaditoense (VHV-574 2017) GCF_002145545.1	n/a	3 (91.23 %)	n/a	n/a	n/a	37.63 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.29 %)	3 (0.77 %)	6 (0.87 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1288	Orthohantavirus dobravaense (DOBV/Ano-Poroia/Afl9/1999 2003) GCF_000863045.1	n/a	3 (94.21 %)	n/a	n/a	n/a	39.24 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.68 %)	2 (0.46 %)	13 (1.44 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1289	Orthohantavirus khabarovskense (Fuyuan-Mm-217 2017) GCF_002146125.1	n/a	3 (92.38 %)	n/a	n/a	n/a	38.20 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.46 %)	n/a	17 (1.58 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1290	Orthohantavirus montanoense (104/2006 2017) GCF_002117715.1	n/a	3 (91.77 %)	n/a	n/a	n/a	36.28 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	5 (1.70 %)	15 (2.97 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1291	Orthohantavirus prospectense (PH-1 2018) GCF_002994685.1	n/a	2 (82.88 %)	n/a	n/a	n/a	39.99 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.28 %)	n/a	4 (0.55 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1292	Orthohantavirus robinaense (P17-14855 2021) GCF_018594985.1	n/a	3 (100.04 %)	n/a	n/a	n/a	40.35 (99.96 %)	5 (0.04 %)	5 (0.04 %)	8 (99.96 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.54 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1293	Orthohantavirus sangassouense (SA14 2017) GCF_002145925.1	n/a	3 (93.52 %)	n/a	n/a	n/a	38.80 (99.97 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (1.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1294	Orthohantavirus sinnombreense (NM H10 2003) GCF_000854765.1	n/a	4 (90.70 %)	n/a	n/a	n/a	38.42 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.95 %)	5 (1.33 %)	11 (1.93 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1295	Orthohantavirus sinnombreense (NM R11 2023) GCF_002830985.1	n/a	3 (90.70 %)	n/a	n/a	n/a	38.39 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.95 %)	5 (1.33 %)	11 (1.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1296	Orthohantavirus tatenalense (Upton_Heath 2021) GCF_018595015.1	n/a	3 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	38.26 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (1.55 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1297	Orthohantavirus tulaense (Moravia/5302v/95 2003) GCF_000855225.1	n/a	4 (92.64 %)	n/a	n/a	n/a	38.04 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.94 %)	n/a	9 (0.58 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1298	Orthohepevirus A (Xinjiang 1993) GCF_000861105.1	n/a	3 (98.65 %)	n/a	n/a	n/a	57.95 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.80 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (89.53 %)	1 (88.49 %)
1299	Orthomarburgvirus marburgense (Ravn virus/H.sapiens-tc/KEN/1987/Kitum Cave-810040 2014) GCF_000943645.1	n/a	7 (98.72 %)	n/a	n/a	n/a	37.76 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.17 %)	n/a	21 (1.20 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1300	Orthonairovirus tomdiense (TT1 2023) GCF_018595155.1	n/a	3 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	45.30 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.18 %)	n/a	9 (0.50 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1301	Orthorubulavirus mapueraense (BeAnn 370284 2007) GCF_000873165.1	n/a	9 (96.64 %)	n/a	n/a	n/a	44.68 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.90 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1302	Orungo virus (UGMP 359 2018) GCF_002829445.1	n/a	11 (96.63 %)	n/a	n/a	n/a	45.83 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.24 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (7.81 %)	2 (7.81 %)
1303	oyster mushroom GCF_014466165.1	11,709 (47.39 %)	n/a	1,073 (2.20 %)	4,389 (13.14 %)	n/a	50.84 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	17 (100.00 %)	6,020 (1.12 %)	5,387 (0.97 %)	70,995 (7.72 %)	0 (0 %)	3,978 (1.96 %)	76 (32.69 %)	166 (0.90 %)
1304	oyster mushroom (PC15 2014) GCA_000697685.1	n/a	12,460 (47.43 %)	1,097 (2.27 %)	4,371 (13.63 %)	n/a	50.95 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	13 (100.00 %)	5,756 (0.95 %)	4,783 (0.75 %)	70,693 (7.30 %)	0 (0 %)	2,981 (1.31 %)	26 (99.81 %)	212 (1.17 %)
1305	Oz virus (EH8 2019) GCF_004117175.1	n/a	6 (94.83 %)	n/a	n/a	n/a	43.72 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (1.36 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1306	Papio hamadryas papillomavirus 1 (Mac2085 2012) GCF_000896995.1	n/a	8 (85.63 %)	n/a	n/a	n/a	49.41 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.56 %)	1 (0.51 %)	9 (4.48 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (5.12 %)	1 (5.01 %)
1307	Parainfluenza virus 5 (W3A 2004) GCF_000854805.1	n/a	9 (99.06 %)	n/a	n/a	n/a	42.27 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.24 %)	n/a	3 (0.30 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1308	Paratrypanosoma confusum (CUL13MS 2018) GCA_002921335.1	n/a	n/a	531 (1.29 %)	4,980 (59.22 %)	n/a	61.75 (91.85 %)	0 (0 %)	4,428 (8.20 %)	2,188 (100.00 %)	16,794 (2.85 %)	3,893 (0.53 %)	168,997 (16.08 %)	110 (0.10 %)	660 (0.22 %)	2,338 (95.40 %)	1,532 (11.09 %)
1309	Parechovirus A (Gregory 1998) GCF_000861505.1	n/a	1 (89.00 %)	n/a	n/a	n/a	39.48 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.30 %)	n/a	6 (0.98 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1310	Parvovirus NIH-CQV (2013) GCF_000910875.1	n/a	3 (80.08 %)	n/a	n/a	n/a	45.77 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (2.04 %)	0 (0.00 %)	0 (0 %)	2 (6.88 %)	2 (32.09 %)	2 (32.09 %)
1311	Paslahepevirus balayani (2023) GCF_002826225.1	n/a	3 (98.54 %)	n/a	n/a	n/a	58.02 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (92.98 %)	1 (91.44 %)
1312	Paslahepevirus balayani (AlgSwe2012 2023) GCF_023120075.1	n/a	3 (97.76 %)	n/a	n/a	n/a	58.57 (99.97 %)	6 (0.09 %)	6 (0.09 %)	7 (99.91 %)	6 (1.04 %)	1 (0.37 %)	22 (4.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (97.93 %)	1 (97.93 %)
1313	Paslahepevirus balayani (little egret/kocsag02/2014/HUN 2023) GCF_023120345.1	n/a	3 (96.92 %)	n/a	n/a	n/a	51.40 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (2.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (11.05 %)	3 (11.05 %)
1314	peach leaf curl fungus (PYCC 5710 2013) GCA_000312925.2	n/a	7,666 (46.90 %)	1,530 (9.07 %)	4,375 (47.33 %)	n/a	49.52 (99.08 %)	114 (0.92 %)	119 (0.92 %)	517 (99.08 %)	2,459 (0.81 %)	1,161 (0.51 %)	30,191 (5.77 %)	9 (0.05 %)	358 (0.32 %)	2,127 (54.95 %)	2,169 (23.75 %)
1315	Pegivirus platyrrhini (2000) GCF_000847425.1	n/a	1 (93.48 %)	n/a	n/a	n/a	57.91 (100.00 %)	25 (0.26 %)	25 (0.26 %)	26 (99.74 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (1.65 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	7 (35.01 %)	6 (21.59 %)
1316	Pegivirus platyrrhini (2023) GCF_002821105.1	n/a	1 (92.91 %)	n/a	n/a	n/a	57.84 (99.97 %)	110 (1.15 %)	110 (1.15 %)	111 (98.85 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (1.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	6 (66.95 %)	4 (61.73 %)
1317	Photobacterium damselae subsp. damselae (WMD-P2 2024) GCF_038086725.1	n/a	4,057 (86.25 %)	n/a	n/a	n/a	40.79 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	135 (1.04 %)	17,089 (6.74 %)	0 (0 %)	589 (2.12 %)	72 (2.79 %)	57 (0.76 %)
1318	Piry virus (BeAn2423 2018) GCF_002816055.1	n/a	5 (96.19 %)	n/a	n/a	n/a	43.18 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.33 %)	12 (1.08 %)	0 (0 %)	1 (1.15 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1319	Plasmodium malariae (2016) GCF_900090045.1	5,965 (37.07 %)	n/a	n/a	n/a	n/a	24.38 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	62 (100.00 %)	n/a	47,855 (7.58 %)	320,327 (54.68 %)	0 (0 %)	10,972 (1.65 %)	21 (0.02 %)	4 (0.00 %)
1320	Poliovirus 2 (Lansing 2023) GCA_003108605.1	n/a	1 (89.03 %)	n/a	n/a	n/a	46.71 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.73 %)	1 (4.73 %)
1321	Poliovirus 3 (2023) GCA_008766715.1	n/a	1 (89.09 %)	n/a	n/a	n/a	46.90 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.11 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (5.49 %)	1 (5.49 %)
1322	Porcisia hertigi (C119 2021) GCA_017918235.1	n/a	7,891 (42.07 %)	695 (1.21 %)	2,951 (42.86 %)	n/a	56.02 (100.00 %)	0 (0 %)	5 (0.00 %)	74 (100.00 %)	41,628 (4.32 %)	12,596 (4.67 %)	201,002 (23.43 %)	0 (0 %)	29,607 (10.30 %)	106 (99.30 %)	750 (1.56 %)
1323	Porcisia hertigi (C119 2021) GCF_017918235.1	7,891 (42.07 %)	n/a	695 (1.21 %)	2,952 (42.86 %)	n/a	56.02 (100.00 %)	0 (0 %)	5 (0.00 %)	74 (100.00 %)	41,628 (4.32 %)	12,596 (4.67 %)	201,002 (23.43 %)	0 (0 %)	29,607 (10.30 %)	106 (99.30 %)	750 (1.56 %)
1324	potato late blight agent (T30-4 2009) GCF_000142945.1	18,384 (12.49 %)	n/a	1,607 (0.59 %)	40,824 (31.88 %)	n/a	50.97 (83.21 %)	13,367 (16.81 %)	13,367 (16.81 %)	18,288 (83.19 %)	90,146 (49.19 %)	24,906 (4.71 %)	456,029 (29.10 %)	4 (0.00 %)	149,406 (8.13 %)	10,666 (15.67 %)	20,511 (17.44 %)
1325	Powassan virus (LB 1993) GCF_000860485.1	n/a	1 (94.55 %)	n/a	n/a	n/a	53.32 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (1.20 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.47 %)	1 (3.47 %)
1326	powdery mildews (DRCT72020 2022) GCA_022627015.2	n/a	17,328 (31.97 %)	1,384 (1.93 %)	9,258 (18.88 %)	n/a	43.06 (99.92 %)	219 (0.04 %)	219 (0.04 %)	12,576 (99.96 %)	8,003 (0.57 %)	6,668 (0.68 %)	163,027 (14.56 %)	88 (0.06 %)	2,516 (0.41 %)	6,279 (7.27 %)	5,303 (6.19 %)
1327	Primate norovirus (SimianNoV-nj 2016) GCF_001755385.1	n/a	3 (97.68 %)	n/a	n/a	n/a	48.57 (99.96 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	6 (1.52 %)	1 (0.43 %)	7 (1.64 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1328	Primate T-lymphotropic virus 1 (Tan90 2000) GCF_000861125.1	n/a	4 (68.45 %)	n/a	n/a	n/a	53.76 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (2.27 %)	0 (0 %)	1 (16.73 %)	3 (15.46 %)	3 (15.46 %)
1329	Primate T-lymphotropic virus 3 (CTO-604 2002) GCF_000847845.1	n/a	7 (60.22 %)	n/a	n/a	n/a	53.22 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.66 %)	0 (0 %)	1 (15.56 %)	3 (6.99 %)	3 (6.99 %)
1330	Protoparvovirus primate1 (BF.86 2018) GCF_002827465.1	n/a	5 (93.20 %)	n/a	n/a	n/a	40.10 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.78 %)	1 (1.27 %)	20 (5.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1331	Pulau reovirus (2018) GCF_002829605.1	n/a	12 (96.55 %)	n/a	n/a	n/a	48.18 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	7 (10.97 %)	7 (10.97 %)
1332	Punta Toro virus (Adames 2018) GCF_002815115.1	n/a	4 (92.61 %)	n/a	n/a	n/a	40.36 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (1.74 %)	3 (0.77 %)	16 (3.35 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1333	Punta Toro virus (PAN472868 2015) GCA_001021295.1	n/a	4 (92.38 %)	n/a	n/a	n/a	39.48 (99.92 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	4 (0.98 %)	8 (1.26 %)	8 (2.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1334	Punta Toro virus (PAN472868 2015) GCF_001021295.1	n/a	4 (92.38 %)	n/a	n/a	n/a	39.48 (99.92 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	4 (0.98 %)	8 (1.26 %)	8 (2.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1335	Puumala orthohantavirus (Sotkamo 2003) GCF_000854405.1	n/a	3 (39.37 %)	n/a	n/a	n/a	36.97 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.66 %)	n/a	33 (3.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1336	Rabbit calicivirus Australia 1 (MIC-07 2008) GCF_000882575.1	n/a	2 (99.12 %)	n/a	n/a	n/a	47.88 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.68 %)	1 (3.68 %)
1337	Rabbit hemorrhagic disease virus (FRG 2000) GCF_000861285.1	n/a	2 (99.09 %)	n/a	n/a	n/a	50.20 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.61 %)	1 (0.56 %)	8 (1.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1338	Rabbit vesivirus (2006) GCF_000867805.1	n/a	3 (96.54 %)	n/a	n/a	n/a	47.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.01 %)	1 (1.01 %)	8 (1.87 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (7.00 %)	2 (7.00 %)
1339	Rabies lyssavirus (1993) GCF_000859625.1	n/a	5 (95.29 %)	n/a	n/a	n/a	45.10 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (1.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1340	Rhesus monkey (2019 U. Washington) GCF_003339765.1	86,732 (3.15 %)	n/a	20,455 (1.85 %)	21,565 (1.21 %)	n/a	41.00 (98.84 %)	244 (1.16 %)	248 (1.16 %)	3,268 (98.84 %)	5,469,991 (52.68 %)	993,786 (5.32 %)	16,005,457 (38.50 %)	1 (0.00 %)	1,431,525 (2.74 %)	86,250 (1.31 %)	28,575 (0.73 %)
1341	Rhinovirus A (1993) GCF_000862245.1	n/a	1 (90.81 %)	n/a	n/a	n/a	39.05 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1342	rhinovirus A1 (ATCC VR-1559 2018) GCF_002816835.1	n/a	1 (90.75 %)	n/a	n/a	n/a	37.47 (99.97 %)	3 (0.04 %)	3 (0.04 %)	4 (99.96 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (2.02 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1343	rhinovirus B14 (2000) GCF_000861265.1	n/a	1 (90.68 %)	n/a	n/a	n/a	40.58 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1344	rhinovirus B3 (2018) GCF_002816855.1	n/a	1 (90.69 %)	n/a	n/a	n/a	39.94 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1345	Rhinovirus C (024 2007) GCF_000872325.1	n/a	1 (90.65 %)	n/a	n/a	n/a	42.80 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1346	rice blast fungus GCF_000002495.2	13,029 (54.96 %)	n/a	1,453 (2.71 %)	6,896 (23.76 %)	n/a	51.61 (99.93 %)	163 (0.07 %)	163 (0.07 %)	216 (99.93 %)	14,038 (1.31 %)	6,167 (0.68 %)	85,770 (13.75 %)	4 (0.01 %)	2,297 (1.68 %)	46 (39.22 %)	1,687 (17.34 %)
1347	Rickettsia akari str. (Hartford 2007) GCF_000018205.1	n/a	1,295 (80.47 %)	n/a	n/a	n/a	32.33 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	49 (0.36 %)	11,383 (19.29 %)	0 (0 %)	44 (0.31 %)	3 (0.14 %)	2 (0.12 %)
1348	Rickettsia asembonensis (NMRCii 2016) GCF_000828125.2	n/a	1,671 (86.06 %)	n/a	n/a	n/a	32.24 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	88 (100.00 %)	n/a	55 (0.27 %)	11,795 (21.71 %)	0 (0 %)	71 (0.41 %)	6 (0.18 %)	4 (0.14 %)
1349	Rickettsia asiatica (Maytaro1284 2019) GCF_007989425.1	n/a	1,663 (83.05 %)	n/a	n/a	n/a	32.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	54 (0.41 %)	11,712 (19.66 %)	0 (0 %)	59 (0.49 %)	5 (0.17 %)	4 (0.14 %)
1350	Rickettsia australis str. (Cutlack 2012) GCF_000284155.1	n/a	1,444 (80.68 %)	n/a	n/a	n/a	32.28 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	53 (0.39 %)	11,054 (19.38 %)	0 (0 %)	95 (1.04 %)	2 (0.11 %)	2 (0.11 %)
1351	Rickettsia bellii (RML369-C 2006) GCF_000012385.1	n/a	1,537 (86.45 %)	n/a	n/a	n/a	31.65 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	94 (0.49 %)	12,640 (20.23 %)	0 (0 %)	117 (1.42 %)	3 (0.13 %)	3 (0.13 %)
1352	Rickettsia canadensis str. (CA410 2012) GCF_000283915.1	n/a	1,066 (77.84 %)	n/a	n/a	n/a	31.01 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	47 (0.61 %)	11,429 (21.81 %)	0 (0 %)	50 (0.31 %)	2 (0.13 %)	2 (0.13 %)
1353	Rickettsia conorii str. (Malish 7 2001) GCF_000007025.1	n/a	1,466 (82.15 %)	n/a	n/a	n/a	32.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	30 (0.34 %)	12,411 (21.08 %)	0 (0 %)	48 (0.32 %)	4 (0.15 %)	4 (0.15 %)
1354	Rickettsia endosymbiont of Aspidapion aeneum (54715 2024) GCF_964030775.1	n/a	1,884 (86.07 %)	n/a	n/a	n/a	34.61 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	112 (1.81 %)	12,759 (23.17 %)	0 (0 %)	639 (4.10 %)	15 (0.47 %)	10 (0.39 %)
1355	Rickettsia endosymbiont of Cantharis rufa (54716 2024) GCF_964026445.1	n/a	1,846 (80.68 %)	n/a	n/a	n/a	32.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	182 (0.86 %)	9,507 (22.31 %)	0 (0 %)	607 (7.95 %)	4 (0.13 %)	3 (0.11 %)
1356	Rickettsia endosymbiont of Cardiosporidium cionae (ESH_2018B 2020) GCF_015476335.1	n/a	945 (87.85 %)	n/a	n/a	n/a	29.06 (99.99 %)	336 (0.04 %)	336 (0.04 %)	365 (99.96 %)	n/a	129 (1.24 %)	9,961 (21.35 %)	0 (0 %)	146 (1.34 %)	1 (0.02 %)	1 (0.02 %)
1357	Rickettsia endosymbiont of Ceutorhynchus obstrictus (54717 2024) GCF_964026565.1	n/a	2,100 (85.70 %)	n/a	n/a	n/a	34.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	150 (1.85 %)	14,389 (22.91 %)	0 (0 %)	717 (4.04 %)	14 (0.37 %)	9 (0.30 %)
1358	Rickettsia endosymbiont of Culicoides newsteadi (RiCNE 2017) GCF_002259525.1	n/a	1,486 (81.93 %)	n/a	n/a	n/a	33.05 (99.96 %)	0 (0 %)	12 (0.02 %)	193 (100.00 %)	n/a	114 (0.94 %)	9,963 (16.71 %)	0 (0 %)	138 (0.80 %)	5 (0.15 %)	2 (0.10 %)
1359	Rickettsia endosymbiont of Gonocerus acuteangulatus (54736 2024) GCF_964026435.1	n/a	2,497 (85.36 %)	n/a	n/a	n/a	31.90 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	182 (1.20 %)	4,555 (20.64 %)	0 (0 %)	1,390 (16.80 %)	2 (0.08 %)	2 (0.08 %)
1360	Rickettsia endosymbiont of Halotydeus destructor (MaVIC_2019 2025) GCF_049278075.1	n/a	1,270 (84.99 %)	n/a	n/a	n/a	33.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	n/a	79 (0.47 %)	12,772 (23.07 %)	0 (0 %)	73 (0.44 %)	9 (0.26 %)	6 (0.20 %)
1361	Rickettsia endosymbiont of Lasioglossum villosulum (54739 2024) GCF_964026455.1	n/a	1,503 (86.20 %)	n/a	n/a	n/a	31.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	53 (0.56 %)	12,793 (20.33 %)	0 (0 %)	97 (0.58 %)	2 (0.09 %)	2 (0.09 %)
1362	Rickettsia endosymbiont of Nabis limbatus (54738 2025) GCF_965196655.1	n/a	2,175 (84.95 %)	n/a	n/a	n/a	32.05 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	53 (0.40 %)	8,540 (21.06 %)	0 (0 %)	664 (13.14 %)	3 (0.09 %)	3 (0.09 %)
1363	Rickettsia endosymbiont of Oedothorax gibbosus (Oegibbosus-W744x776 2022) GCF_936269705.1	n/a	2,904 (83.33 %)	n/a	n/a	n/a	32.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	91 (1.13 %)	9,163 (18.03 %)	0 (0 %)	890 (16.00 %)	3 (0.07 %)	2 (0.06 %)
1364	Rickettsia endosymbiont of Orchestes rusci (54718 2024) GCF_964030945.1	n/a	2,166 (84.76 %)	n/a	n/a	n/a	34.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	5 (100.00 %)	n/a	156 (1.61 %)	14,897 (22.38 %)	0 (0 %)	738 (3.63 %)	13 (0.30 %)	7 (0.19 %)
1365	Rickettsia endosymbiont of Pantilius tunicatus (54737 2024) GCF_964291875.1	n/a	2,059 (85.27 %)	n/a	n/a	n/a	31.67 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	86 (0.48 %)	9,545 (17.11 %)	0 (0 %)	208 (4.88 %)	3 (0.10 %)	3 (0.10 %)
1366	Rickettsia endosymbiont of Polydrusus tereticollis (54719 2024) GCF_964026385.1	n/a	2,146 (84.17 %)	n/a	n/a	n/a	33.68 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	122 (1.29 %)	4,398 (18.03 %)	0 (0 %)	811 (11.58 %)	7 (0.12 %)	5 (0.10 %)
1367	Rickettsia endosymbiont of Rhinocyllus conicus (54720 2024) GCF_964026465.1	n/a	1,872 (86.07 %)	n/a	n/a	n/a	31.84 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	70 (0.33 %)	13,747 (20.84 %)	0 (0 %)	103 (3.66 %)	2 (0.09 %)	2 (0.09 %)
1368	Rickettsia endosymbiont of Seladonia tumulorum (54740 2024) GCF_964030815.1	n/a	1,483 (86.26 %)	n/a	n/a	n/a	31.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	50 (0.50 %)	12,589 (20.25 %)	0 (0 %)	101 (0.58 %)	2 (0.10 %)	2 (0.10 %)
1369	Rickettsia endosymbiont of Urophora cardui (54735 2024) GCF_964030725.1	n/a	3,628 (81.93 %)	n/a	n/a	n/a	32.78 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	n/a	134 (2.34 %)	16,320 (29.82 %)	0 (0 %)	3,552 (32.76 %)	2 (0.05 %)	2 (0.05 %)
1370	Rickettsia felis (LSU-Lb 2014) GCF_000804505.1	n/a	1,718 (83.73 %)	n/a	n/a	n/a	32.44 (99.99 %)	31 (0.00 %)	31 (0.00 %)	74 (100.00 %)	n/a	88 (0.63 %)	13,412 (20.99 %)	0 (0 %)	180 (1.00 %)	3 (0.11 %)	2 (0.10 %)
1371	Rickettsia fournieri (AUS118 2018) GCF_900243065.1	n/a	1,605 (84.13 %)	n/a	n/a	n/a	32.36 (99.97 %)	1 (0.03 %)	6 (0.03 %)	6 (99.97 %)	n/a	51 (0.22 %)	11,039 (19.81 %)	0 (0 %)	81 (1.70 %)	2 (0.10 %)	2 (0.10 %)
1372	Rickettsia gravesii (BWI-1 2013) GCF_000485845.1	n/a	1,573 (83.61 %)	n/a	n/a	n/a	32.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	29 (100.00 %)	n/a	40 (0.20 %)	11,538 (20.03 %)	0 (0 %)	26 (0.16 %)	4 (0.15 %)	3 (0.13 %)
1373	Rickettsia helvetica (OB144 2024) GCF_963970025.1	n/a	1,630 (83.35 %)	n/a	n/a	n/a	32.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	55 (0.53 %)	11,962 (19.88 %)	0 (0 %)	104 (0.66 %)	3 (0.13 %)	3 (0.13 %)
1374	Rickettsia honei (RB 2012) GCF_000263055.1	n/a	1,492 (82.51 %)	n/a	n/a	n/a	32.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	n/a	30 (0.12 %)	12,362 (20.94 %)	0 (0 %)	21 (0.19 %)	4 (0.16 %)	4 (0.16 %)
1375	Rickettsia hoogstraalii (Croatica 2014) GCF_000825685.1	n/a	1,732 (84.46 %)	n/a	n/a	n/a	32.38 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	3 (100.00 %)	n/a	85 (0.73 %)	12,688 (21.64 %)	0 (0 %)	148 (0.77 %)	5 (0.16 %)	4 (0.14 %)
1376	Rickettsia japonica (YH 2011) GCF_000283595.1	n/a	1,481 (82.89 %)	n/a	n/a	n/a	32.35 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	50 (0.44 %)	12,569 (21.26 %)	0 (0 %)	39 (0.27 %)	3 (0.13 %)	3 (0.13 %)
1377	Rickettsia koreansis (CNH17-7 2025) GCF_046532895.1	n/a	1,582 (83.31 %)	n/a	n/a	n/a	32.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	n/a	65 (0.33 %)	11,624 (19.28 %)	0 (0 %)	35 (0.29 %)	3 (0.12 %)	3 (0.12 %)
1378	Rickettsia monacensis (IrR/Munich 2015) GCF_000499665.2	n/a	1,573 (82.82 %)	n/a	n/a	n/a	32.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	47 (0.32 %)	7,165 (21.15 %)	0 (0 %)	264 (6.23 %)	5 (0.15 %)	3 (0.12 %)
1379	Rickettsia prowazekii str. (Chernikova 2012) GCF_000277165.1	n/a	888 (77.32 %)	n/a	n/a	n/a	29.01 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	32 (0.14 %)	11,829 (24.22 %)	0 (0 %)	9 (0.14 %)	2 (0.14 %)	2 (0.14 %)
1380	Rickettsia rhipicephali str. (3-7-female6-CWPP 2012) GCF_000284075.1	n/a	1,498 (81.99 %)	n/a	n/a	n/a	32.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	48 (0.37 %)	12,708 (20.99 %)	0 (0 %)	41 (0.29 %)	4 (0.15 %)	3 (0.13 %)
1381	Rickettsia rickettsii str. 'Sheila Smith' (Sheila Smith 2007) GCF_000018225.1	n/a	1,430 (81.14 %)	n/a	n/a	n/a	32.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	39 (0.43 %)	12,114 (20.73 %)	0 (0 %)	51 (0.39 %)	4 (0.16 %)	4 (0.16 %)
1382	Rickettsia sibirica (246 2003) GCF_000166935.1	n/a	1,434 (82.46 %)	n/a	n/a	n/a	32.47 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	1 (100.00 %)	n/a	30 (0.23 %)	12,207 (21.06 %)	0 (0 %)	30 (0.25 %)	4 (0.16 %)	4 (0.16 %)
1383	Rickettsia slovaca (13-B 2011) GCF_000237845.1	n/a	1,476 (82.75 %)	n/a	n/a	n/a	32.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	40 (0.43 %)	12,412 (20.98 %)	0 (0 %)	41 (0.39 %)	4 (0.16 %)	4 (0.16 %)
1384	Rickettsia tamurae (AT-1 2014) GCF_000751075.1	n/a	1,711 (85.21 %)	n/a	n/a	n/a	32.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	27 (100.00 %)	n/a	60 (0.28 %)	12,320 (20.35 %)	0 (0 %)	70 (0.31 %)	2 (0.10 %)	2 (0.10 %)
1385	Rickettsia tillamookensis (Tillamook 23 2022) GCF_016743795.2	n/a	1,414 (85.04 %)	n/a	n/a	n/a	32.40 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	76 (0.79 %)	12,260 (21.13 %)	0 (0 %)	212 (1.18 %)	5 (0.25 %)	5 (0.25 %)
1386	Rickettsia typhi str. (Wilmington 2004) GCF_000008045.1	n/a	875 (76.56 %)	n/a	n/a	n/a	28.92 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	48 (0.30 %)	11,755 (23.68 %)	0 (0 %)	11 (0.11 %)	2 (0.14 %)	2 (0.14 %)
1387	Rift Valley fever virus (ZH-548 2010) GCF_000847345.1	n/a	4 (95.24 %)	n/a	n/a	n/a	45.11 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.49 %)	n/a	8 (1.04 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1388	Rockport virus (MSB57412 2018) GCF_002830685.1	n/a	3 (92.73 %)	n/a	n/a	n/a	35.05 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.71 %)	n/a	22 (1.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1389	Rosavirus A2 (GA7403 2014) GCF_000918175.1	n/a	1 (82.95 %)	n/a	n/a	n/a	51.41 (99.99 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.67 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.60 %)	1 (4.60 %)
1390	Ross River virus (QML 1 2023) GCF_002889255.1	n/a	2 (94.13 %)	n/a	n/a	n/a	51.05 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.26 %)	3 (2.11 %)	6 (2.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	7 (49.69 %)	7 (49.61 %)
1391	Rotavirus A (RVA/Simian-tc/ZAF/SA11-H96/1958/G3P5B[2] 2008) GCF_000880735.1	n/a	12 (94.00 %)	n/a	n/a	n/a	33.67 (99.88 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	4 (0.19 %)	n/a	21 (1.24 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1392	Rotavirus C (Bristol 2005) GCF_000864225.1	n/a	11 (95.04 %)	n/a	n/a	n/a	31.63 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	7 (1.19 %)	n/a	33 (2.72 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1393	Rubella virus (RVi/Bismarck.ND.USA/23.08/2B 2023) GCF_024749945.1	n/a	2 (97.77 %)	n/a	n/a	n/a	69.96 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.29 %)	3 (0.97 %)	54 (9.60 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (98.93 %)	1 (97.15 %)
1394	rust fungi M.larici-populina 98AG31 GCF_000204055.1	16,255 (20.30 %)	n/a	1,082 (0.79 %)	14,934 (16.66 %)	n/a	41.00 (96.60 %)	2,792 (3.41 %)	2,792 (3.41 %)	3,254 (96.59 %)	54,820 (20.89 %)	24,657 (1.82 %)	479,225 (16.38 %)	4 (0.00 %)	16,887 (2.52 %)	7,595 (3.93 %)	5,824 (2.79 %)
1395	rust fungi P.graminis f. sp. tritici CRL 75-36-700-3 GCF_000149925.1	15,986 (26.56 %)	n/a	1,101 (0.96 %)	10,591 (14.83 %)	n/a	43.35 (91.99 %)	4,170 (8.03 %)	4,170 (8.03 %)	4,563 (91.97 %)	60,389 (24.44 %)	26,202 (2.34 %)	320,740 (19.73 %)	1 (0.00 %)	18,962 (3.36 %)	13,967 (10.10 %)	10,740 (7.40 %)
1396	rust P.sorghi (RO10H11247 2015) GCA_001263375.1	n/a	21,527 (31.55 %)	1,005 (1.03 %)	6,003 (8.82 %)	n/a	43.15 (71.37 %)	13,266 (28.65 %)	13,266 (28.65 %)	28,981 (71.35 %)	25,285 (1.59 %)	15,843 (0.93 %)	369,521 (17.49 %)	388 (0.64 %)	7,416 (0.99 %)	9,453 (6.05 %)	8,171 (4.98 %)
1397	rust P.striiformis (93-210 2018) GCA_002920065.1	n/a	15,090 (21.75 %)	1,137 (0.94 %)	11,565 (12.77 %)	n/a	44.39 (100.00 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	493 (100.00 %)	60,400 (15.84 %)	27,529 (2.84 %)	307,281 (18.63 %)	0 (0 %)	28,095 (4.04 %)	14,065 (11.16 %)	11,307 (8.21 %)
1398	rust P.striiformis (93TX-2 2018) GCA_002920205.1	n/a	14,629 (22.68 %)	1,096 (0.99 %)	10,556 (12.70 %)	n/a	44.40 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	562 (100.00 %)	54,488 (15.68 %)	24,344 (2.64 %)	317,043 (15.53 %)	0 (0 %)	22,694 (3.62 %)	12,859 (11.07 %)	11,377 (8.77 %)
1399	Saint Louis encephalitis virus (Kern217 2005) GCF_000866785.1	n/a	1 (94.09 %)	n/a	n/a	n/a	49.75 (100.00 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.35 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.05 %)	1 (3.05 %)
1400	Salivirus A (02394-01 2009) GCF_000885035.1	n/a	1 (89.05 %)	n/a	n/a	n/a	56.70 (99.95 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.51 %)	n/a	14 (3.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (36.06 %)	3 (36.06 %)
1401	Salivirus FHB (SaliV-FHB 2014) GCF_000926235.1	n/a	1 (88.75 %)	n/a	n/a	n/a	57.26 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.35 %)	1 (0.38 %)	13 (1.96 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (63.43 %)	2 (63.43 %)
1402	Salivirus NG-J1 (NG-J1 2009) GCF_000886535.1	n/a	1 (89.26 %)	n/a	n/a	n/a	56.70 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	17 (2.15 %)	0 (0 %)	1 (0.80 %)	2 (48.16 %)	2 (48.16 %)
1403	Salmonella bongori (NCTC 12419 2011) GCF_000252995.1	n/a	4,225 (88.28 %)	n/a	n/a	n/a	51.33 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	90 (0.24 %)	20,125 (7.97 %)	0 (0 %)	148 (0.40 %)	1 (99.99 %)	1 (0.01 %)
1404	Salmonella enterica (Typhimurium LT2 2016) GCF_000006945.2	n/a	4,665 (87.28 %)	n/a	n/a	n/a	52.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	77 (0.25 %)	25,684 (9.55 %)	0 (0 %)	149 (0.27 %)	2 (99.99 %)	1 (0.01 %)
1405	San Miguel sea lion virus 8 (2014) GCF_000925155.1	n/a	3 (98.48 %)	n/a	n/a	n/a	51.28 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.14 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (47.28 %)	3 (47.28 %)
1406	sandfly fever Turkey virus (Izmir 19 2011) GCF_000891955.1	n/a	4 (93.98 %)	n/a	n/a	n/a	43.66 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (2.77 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1407	Sapovirus (Hu/Dresden/pJG-Sap01/DE 2004) GCF_000854265.1	n/a	3 (98.76 %)	n/a	n/a	n/a	50.63 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.06 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.94 %)	1 (3.94 %)
1408	Sapovirus (Hu/GI/Sapporo/MT-2010/1982 2023) GCF_008792745.1	n/a	3 (98.75 %)	n/a	n/a	n/a	50.70 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.09 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (5.79 %)	1 (5.79 %)
1409	Sapovirus (Mc10 2004) GCF_000853825.1	n/a	2 (98.38 %)	n/a	n/a	n/a	51.46 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1410	Sapovirus C12 (C12 2004) GCF_000855765.1	n/a	2 (98.27 %)	n/a	n/a	n/a	51.73 (99.99 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (7.50 %)	2 (7.50 %)
1411	Sapovirus Hu/Nagoya/NGY-1/2012/JPN (Hu/SaV/Nagoya/NGY-1/2012/JPN 2015) GCF_001008475.1	n/a	2 (98.47 %)	n/a	n/a	n/a	49.71 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.60 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1412	SARS coronavirus Tor2 (Tor2 2003) GCF_000864885.1	n/a	16 (97.60 %)	n/a	n/a	n/a	40.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.08 %)	n/a	18 (0.74 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1413	SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19) GCF_009858895.2	n/a	13 (97.85 %)	n/a	n/a	n/a	37.98 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.24 %)	1 (0.11 %)	33 (1.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (0.73 %)	1 (0.73 %)
1414	scrub typhus mite (UoL-UT 2018) GCA_003675905.2	n/a	14,667 (12.92 %)	2,993 (1.92 %)	10,736 (8.91 %)	n/a	33.61 (99.85 %)	267 (0.04 %)	267 (0.04 %)	66,977 (99.96 %)	31,710 (1.17 %)	9,049 (0.44 %)	996,608 (26.63 %)	28 (0.00 %)	1,579 (0.11 %)	734 (0.26 %)	761 (0.27 %)
1415	Semliki Forest virus (1987) GCF_000860285.1	n/a	4 (96.64 %)	n/a	n/a	n/a	53.22 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.66 %)	n/a	4 (1.46 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (92.56 %)	1 (92.56 %)
1416	Seoul orthohantavirus (80-39 2003) GCF_000855645.1	n/a	3 (93.29 %)	n/a	n/a	n/a	39.00 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.56 %)	n/a	14 (1.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1417	Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus (HNXH 2019) GCF_003087855.1	n/a	4 (98.45 %)	n/a	n/a	n/a	48.84 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.21 %)	n/a	5 (0.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1418	Sewage-associated gemycircularvirus-10a (BS3980 2015) GCF_000930855.1	n/a	4 (82.35 %)	n/a	n/a	n/a	52.52 (99.82 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.02 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (76.08 %)	2 (76.08 %)
1419	SFTS virus (HB29 2012) GCF_000897355.1	n/a	4 (96.58 %)	n/a	n/a	n/a	48.80 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.21 %)	n/a	2 (0.12 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1420	Shigella boydii (ESBL-W3-2 2017) GCF_002290485.1	n/a	4,719 (88.84 %)	n/a	n/a	n/a	50.63 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	154 (100.00 %)	n/a	83 (0.20 %)	18,773 (6.72 %)	0 (0 %)	94 (0.20 %)	164 (82.25 %)	84 (3.56 %)
1421	Shigella dysenteriae (SWHEFF_49 2022) GCF_022354085.1	n/a	5,020 (89.19 %)	n/a	n/a	n/a	50.62 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	121 (0.55 %)	22,011 (7.51 %)	0 (0 %)	292 (0.64 %)	11 (99.41 %)	14 (0.25 %)
1422	Shigella flexneri 2a str. (301 2011) GCF_000006925.2	n/a	4,439 (78.71 %)	n/a	n/a	n/a	50.65 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	3 (100.00 %)	n/a	88 (0.35 %)	14,141 (8.30 %)	0 (0 %)	360 (2.22 %)	18 (97.13 %)	20 (0.93 %)
1423	Shigella sonnei (ATCC 29930 2018) GCF_002950395.1	n/a	5,342 (89.24 %)	n/a	n/a	n/a	51.01 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	96 (0.59 %)	14,438 (9.03 %)	0 (0 %)	354 (2.22 %)	4 (99.85 %)	4 (0.25 %)
1424	simian adenovirus 1 (ATCC VR-195 2005) GCF_000847325.1	n/a	42 (94.47 %)	n/a	n/a	n/a	55.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (0.98 %)	1 (0.08 %)	49 (2.50 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	6 (69.90 %)	5 (68.27 %)
1425	Simian pegivirus (SPgVkrc SPgVkrc_RC08 2014) GCF_000921975.1	n/a	1 (91.31 %)	n/a	n/a	n/a	56.63 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.02 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (66.17 %)	3 (60.58 %)
1426	Simian T-cell lymphotropic virus 6 (Cmo8699AB 2008) GCF_000881775.1	n/a	8 (76.72 %)	n/a	n/a	n/a	51.89 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.79 %)	n/a	9 (1.53 %)	0 (0 %)	1 (15.84 %)	2 (8.06 %)	2 (8.06 %)
1427	Simian T-lymphotropic virus 2 (PP1664 STLV-2PP1664 2000) GCF_000860005.1	n/a	13 (80.53 %)	n/a	n/a	n/a	54.76 (100.00 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	23 (3.20 %)	0 (0 %)	1 (16.08 %)	2 (8.40 %)	2 (8.40 %)
1428	Sindbis virus (1993) GCF_000860545.1	n/a	5 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	50.91 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.34 %)	n/a	3 (0.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (93.38 %)	1 (93.38 %)
1429	Sinu virus (CoB 38d 2023) GCF_023157055.1	n/a	6 (93.02 %)	n/a	n/a	n/a	32.86 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	42 (4.53 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1430	Small anellovirus 1 (2005) GCF_000859305.1	n/a	3 (93.20 %)	n/a	n/a	n/a	38.22 (99.82 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.67 %)	10 (8.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1431	Small anellovirus 2 (2005) GCF_000860145.1	n/a	5 (91.76 %)	n/a	n/a	n/a	39.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.76 %)	n/a	4 (5.35 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1432	smallpox virus (India-1967, ssp. major Ind3 1993) GCF_000859885.1	n/a	197 (87.60 %)	n/a	n/a	n/a	32.73 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	31 (0.69 %)	7 (0.57 %)	1,031 (9.09 %)	0 (0 %)	2 (0.11 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1433	smut fungi S.reilianum SRZ2 (2011) GCA_000230245.1	n/a	9,869 (65.90 %)	1,013 (3.85 %)	1,301 (12.64 %)	n/a	59.73 (98.19 %)	0 (0 %)	873 (1.83 %)	45 (100.00 %)	9,892 (2.21 %)	2,735 (0.53 %)	117,814 (14.38 %)	1 (0.00 %)	50 (0.02 %)	40 (99.42 %)	17 (4.15 %)
1434	smut fungi U.maydis 521 GCF_000328475.2	6,814 (61.10 %)	n/a	1,248 (4.61 %)	4,425 (44.01 %)	n/a	54.03 (99.89 %)	227 (0.12 %)	227 (0.12 %)	254 (99.88 %)	8,532 (2.81 %)	5,012 (1.04 %)	84,647 (9.60 %)	4 (0.03 %)	661 (0.47 %)	31 (70.29 %)	21 (0.09 %)
1435	Soldado virus (TRVL 52214 2023) GCF_014883305.1	n/a	3 (95.70 %)	n/a	n/a	n/a	37.14 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.28 %)	1 (1.67 %)	45 (3.44 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1436	Songling virus (HLJ1202 2023) GCF_029888075.1	n/a	3 (95.45 %)	n/a	n/a	n/a	48.99 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.66 %)	5 (0.64 %)	15 (1.44 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1437	Sosuga virus (2012 2014) GCF_000924495.1	n/a	7 (90.76 %)	n/a	n/a	n/a	42.38 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.47 %)	1 (0.26 %)	7 (0.73 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1438	southern cattle tick (Rmic-2018 2020 refseq) GCF_013339725.1	28,093 (1.81 %)	n/a	3,731 (0.12 %)	117,919 (5.00 %)	35,352 (1.88 %)	45.79 (99.99 %)	0 (0 %)	1,576 (0.01 %)	7,048 (100.00 %)	1,050,956 (4.24 %)	680,148 (3.55 %)	10,994,271 (39.37 %)	0 (0 %)	n/a	304,615 (16.98 %)	234,809 (5.42 %)
1439	southern house mosquito GCF_015732765.1	27,212 (6.86 %)	n/a	5,616 (1.11 %)	35,906 (7.85 %)	28,522 (7.00 %)	36.89 (95.44 %)	0 (0 %)	3,953 (4.56 %)	57 (100.00 %)	709,409 (37.92 %)	181,822 (9.14 %)	2,841,937 (53.98 %)	0 (0 %)	437,211 (5.95 %)	61,902 (9.50 %)	41,817 (6.45 %)
1440	southern house mosquito (JHB 2007 refseq) GCF_000209185.1	18,883 (4.69 %)	n/a	5,905 (1.14 %)	40,896 (8.79 %)	n/a	37.42 (93.28 %)	45,500 (6.75 %)	45,500 (6.75 %)	48,671 (93.25 %)	735,467 (35.07 %)	171,041 (5.71 %)	3,037,349 (50.41 %)	88 (0.02 %)	323,404 (5.87 %)	65,784 (9.49 %)	44,205 (6.42 %)
1441	spirochetes (HT31 2021) GCF_019668505.1	n/a	859 (93.42 %)	n/a	n/a	n/a	28.88 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	51 (0.56 %)	8,224 (22.61 %)	0 (0 %)	29 (0.24 %)	1 (0.03 %)	1 (0.03 %)
1442	spirochetes (MN14-1420 2017) GCF_001945665.1	n/a	1,329 (87.83 %)	n/a	n/a	n/a	27.89 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16 (100.00 %)	n/a	148 (1.74 %)	12,866 (30.71 %)	0 (0 %)	198 (1.38 %)	3 (0.05 %)	3 (0.05 %)
1443	stable fly (8C7A2A5H3J4 2015 rewfseq) GCF_001015335.1	25,162 (4.09 %)	n/a	7,744 (1.16 %)	11,970 (2.65 %)	n/a	38.85 (84.55 %)	113,660 (15.50 %)	129,113 (15.50 %)	125,702 (84.50 %)	292,745 (1.79 %)	391,619 (8.42 %)	5,616,633 (48.71 %)	6,705 (0.32 %)	483,703 (3.74 %)	38,246 (1.55 %)	4,353 (0.18 %)
1444	Staphylococcus phage 6ec (2014) GCF_000921075.1	n/a	144 (88.32 %)	n/a	n/a	n/a	29.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	34 (1.71 %)	10 (0.46 %)	603 (15.13 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1445	Steller sea lion vesivirus (V1415 SSL2004-250F 2008) GCF_000879655.1	n/a	3 (97.56 %)	n/a	n/a	n/a	48.57 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.29 %)	10 (1.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (13.70 %)	3 (13.70 %)
1446	STL polyomavirus (MA138 2013) GCF_000904055.1	n/a	8 (92.55 %)	n/a	n/a	n/a	36.63 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (2.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1447	sudden oak death agent (14567 PR-15-019 primary hap 2021) GCA_020800235.1	n/a	15,587 (39.69 %)	1,527 (1.86 %)	22,614 (62.09 %)	n/a	54.31 (99.66 %)	0 (0 %)	29 (0.34 %)	27 (100.00 %)	9,735 (0.78 %)	9,605 (3.74 %)	94,890 (12.25 %)	0 (0 %)	15,072 (6.69 %)	42 (99.93 %)	161 (13.01 %)
1448	sudden oak death agent (Pr-102 primary hap 2021 genbank) GCA_020800215.1	n/a	15,507 (39.68 %)	1,461 (1.76 %)	22,413 (61.13 %)	n/a	54.37 (99.66 %)	0 (0 %)	50 (0.34 %)	28 (100.00 %)	8,935 (0.72 %)	9,528 (3.65 %)	117,380 (14.16 %)	0 (0 %)	17,976 (7.40 %)	34 (99.96 %)	156 (7.43 %)
1449	sudden oak death agent (Pr-102 primary hap 2021 refseq) GCF_020800215.1	15,506 (39.67 %)	n/a	1,461 (1.76 %)	22,415 (61.13 %)	n/a	54.37 (99.66 %)	50 (0.34 %)	50 (0.34 %)	78 (99.66 %)	8,935 (0.72 %)	9,528 (3.65 %)	117,380 (14.16 %)	0 (0 %)	17,976 (7.40 %)	34 (99.96 %)	156 (7.43 %)
1450	T.foetus (K 2016) GCA_001839685.2	n/a	25,336 (60.71 %)	885 (0.71 %)	9,265 (37.16 %)	n/a	31.17 (96.64 %)	11,448 (3.38 %)	11,448 (3.38 %)	12,927 (96.62 %)	24,925 (2.00 %)	17,837 (1.83 %)	612,529 (32.19 %)	121 (0.29 %)	11,988 (1.03 %)	727 (0.48 %)	662 (0.42 %)
1451	T.foetus (K 2016) GCF_001839685.1	25,030 (60.68 %)	n/a	885 (0.71 %)	2,811 (11.00 %)	n/a	31.17 (96.64 %)	11,448 (3.38 %)	11,448 (3.38 %)	12,927 (96.62 %)	24,925 (2.00 %)	17,837 (1.83 %)	612,529 (32.19 %)	121 (0.29 %)	11,988 (1.03 %)	727 (0.48 %)	662 (0.42 %)
1452	Tacheng Tick Virus 1 (TC253 2016) GCF_001755105.1	n/a	3 (90.86 %)	n/a	n/a	n/a	47.86 (99.97 %)	5 (0.03 %)	5 (0.03 %)	8 (99.97 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.17 %)	1 (2.17 %)
1453	taiga tick (Iper-2018 2020) GCA_013358835.2	n/a	28,510 (1.62 %)	4,029 (0.17 %)	113,601 (6.95 %)	n/a	46.00 (100.00 %)	17 (0.00 %)	17 (0.00 %)	11,614 (100.00 %)	826,632 (1.65 %)	594,326 (3.15 %)	9,982,700 (41.54 %)	0 (0 %)	463,894 (2.82 %)	119,125 (7.47 %)	206,660 (7.36 %)
1454	Tamdy virus (XJ01 2019) GCA_014883335.1	n/a	3 (93.06 %)	n/a	n/a	n/a	45.18 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.16 %)	n/a	23 (1.59 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1455	Thailand tick thogotovirus (THOV/Boophilus sp./Thailand 2023) GCF_023156685.1	n/a	7 (97.28 %)	n/a	n/a	n/a	45.06 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	24 (2.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1456	Thogotovirus thogotoense (SiAr 126 2004) GCF_000854245.1	n/a	7 (96.85 %)	n/a	n/a	n/a	48.02 (99.89 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	6 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (1.95 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1457	Thottapalayam virus (VRC 66412 2008) GCF_000879955.1	n/a	3 (94.84 %)	n/a	n/a	n/a	37.56 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.96 %)	4 (0.55 %)	9 (1.26 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1458	Tibrovirus congo (BASV-1 2019) GCF_002815815.1	n/a	8 (98.64 %)	n/a	n/a	n/a	38.79 (99.98 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.34 %)	n/a	10 (1.48 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1459	Tick-borne encephalitis virus (2000) GCF_000863125.1	n/a	1 (91.96 %)	n/a	n/a	n/a	53.78 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.48 %)	1 (0.44 %)	7 (0.87 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (7.65 %)	2 (7.65 %)
1460	Tick-borne encephalitis virus (Vasilchenko 2023) GCA_004788235.1	n/a	1 (93.76 %)	n/a	n/a	n/a	54.70 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.45 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (9.01 %)	4 (9.01 %)
1461	Torque teno midi virus 1 (MD1-032 2007) GCF_000870545.1	n/a	6 (73.90 %)	n/a	n/a	n/a	42.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (4.41 %)	2 (2.62 %)	15 (12.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (7.12 %)	0 (0.00 %)
1462	Torque teno midi virus 10 (MDJN14 2018) GCF_002818685.1	n/a	6 (73.73 %)	n/a	n/a	n/a	43.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (4.31 %)	2 (2.83 %)	7 (8.63 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (14.83 %)	0 (0.00 %)
1463	Torque teno midi virus 11 (MDJN47 2018) GCF_002818705.1	n/a	6 (73.86 %)	n/a	n/a	n/a	43.29 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (4.88 %)	1 (0.94 %)	12 (10.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.91 %)	0 (0.00 %)
1464	Torque teno midi virus 12 (MDJN51 2018) GCF_002818725.1	n/a	6 (73.45 %)	n/a	n/a	n/a	41.70 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (8.35 %)	1 (1.88 %)	9 (9.88 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1465	Torque teno midi virus 13 (MDJN69 2018) GCF_002818745.1	n/a	6 (73.78 %)	n/a	n/a	n/a	43.72 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (4.92 %)	1 (1.86 %)	13 (9.57 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.84 %)	0 (0.00 %)
1466	Torque teno midi virus 14 (MDJN97 2018) GCF_002818765.1	n/a	6 (73.84 %)	n/a	n/a	n/a	42.73 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (6.42 %)	1 (1.86 %)	12 (9.12 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.86 %)	0 (0.00 %)
1467	Torque teno midi virus 2 (MD2-013 2010) GCF_000887335.1	n/a	6 (73.90 %)	n/a	n/a	n/a	42.92 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.20 %)	1 (1.84 %)	9 (7.78 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.79 %)	0 (0.00 %)
1468	Torque teno midi virus 3 (2PoSMA 2018) GCF_002818545.1	n/a	2 (89.86 %)	n/a	n/a	n/a	38.65 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.00 %)	n/a	4 (3.85 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1469	Torque teno midi virus 4 (6PoSMA 2018) GCF_002818565.1	n/a	3 (89.24 %)	n/a	n/a	n/a	40.29 (99.84 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (5.99 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1470	Torque teno midi virus 5 (MDJHem2 2018) GCF_002818585.1	n/a	6 (73.91 %)	n/a	n/a	n/a	42.62 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (6.45 %)	2 (2.87 %)	20 (11.94 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.89 %)	0 (0.00 %)
1471	Torque teno midi virus 6 (MDJHem3-1 2018) GCF_002818605.1	n/a	6 (74.14 %)	n/a	n/a	n/a	43.04 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (4.60 %)	1 (1.88 %)	11 (10.54 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.91 %)	0 (0.00 %)
1472	Torque teno midi virus 7 (MDJHem3-2 2018) GCF_002818625.1	n/a	6 (73.98 %)	n/a	n/a	n/a	42.35 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.69 %)	2 (2.82 %)	15 (9.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.91 %)	0 (0.00 %)
1473	Torque teno midi virus 8 (MDJN1 2018) GCF_002818645.1	n/a	6 (73.75 %)	n/a	n/a	n/a	42.95 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (5.49 %)	1 (1.86 %)	9 (8.53 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.86 %)	0 (0.00 %)
1474	Torque teno midi virus 9 (MDJN2 2018) GCF_002818665.1	n/a	6 (73.45 %)	n/a	n/a	n/a	42.48 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (4.02 %)	2 (3.17 %)	11 (10.13 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1475	Torque teno mini virus (SHA 2023) GCF_018580825.1	n/a	3 (75.69 %)	n/a	n/a	n/a	38.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (9.48 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1476	Torque teno mini virus 1 (TLMV-CBD279 2010) GCF_000887355.1	n/a	3 (74.96 %)	n/a	n/a	n/a	38.14 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.84 %)	10 (6.55 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1477	Torque teno mini virus 10 (BNI-700620-G1-CSF 2023) GCF_018583595.1	n/a	4 (82.54 %)	n/a	n/a	n/a	37.16 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.87 %)	11 (9.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1478	Torque teno mini virus 10 (BNI-700835-G3-CSF 2023) GCF_018583605.1	n/a	4 (81.01 %)	n/a	n/a	n/a	39.58 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.75 %)	1 (2.78 %)	11 (7.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1479	Torque teno mini virus 10 (LIL-y1 2018) GCF_002818445.1	n/a	4 (81.09 %)	n/a	n/a	n/a	38.93 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.53 %)	1 (3.67 %)	4 (7.86 %)	0 (0 %)	1 (3.26 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1480	Torque teno mini virus 11 (LIL-y2 2018) GCF_002818465.1	n/a	3 (82.86 %)	n/a	n/a	n/a	38.33 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.51 %)	11 (6.30 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1481	Torque teno mini virus 12 (LIL-y3 2018) GCF_002818485.1	n/a	4 (81.35 %)	n/a	n/a	n/a	39.11 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.96 %)	3 (2.27 %)	6 (11.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1482	Torque teno mini virus 18 (222 2016) GCF_001661815.1	n/a	3 (74.46 %)	n/a	n/a	n/a	38.25 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.82 %)	1 (2.89 %)	10 (8.67 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1483	Torque teno mini virus 2 (TLMV-NLC023 2010) GCF_000888275.1	n/a	3 (73.96 %)	n/a	n/a	n/a	39.35 (100.00 %)	4 (0.14 %)	4 (0.14 %)	5 (99.86 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (5.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1484	Torque teno mini virus 3 (TLMV-NLC026 2010) GCF_000887315.1	n/a	3 (75.17 %)	n/a	n/a	n/a	37.98 (99.93 %)	1 (0.03 %)	1 (0.03 %)	2 (99.97 %)	3 (0.00 %)	3 (3.83 %)	22 (14.67 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1485	Torque teno mini virus 4 (Pt-TTV8-II 2010) GCF_000888295.1	n/a	2 (76.45 %)	n/a	n/a	n/a	39.93 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.15 %)	n/a	9 (8.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1486	Torque teno mini virus 5 (TGP96 2010) GCF_000888975.1	n/a	3 (75.79 %)	n/a	n/a	n/a	37.04 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.20 %)	1 (2.82 %)	6 (9.70 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1487	Torque teno mini virus 6 (TLMV-CBD203 2010) GCF_000888315.1	n/a	3 (74.32 %)	n/a	n/a	n/a	37.34 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.62 %)	2 (3.31 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1488	Torque teno mini virus 7 (TLMV-CLC156 2010) GCF_000888255.1	n/a	2 (74.00 %)	n/a	n/a	n/a	36.14 (99.93 %)	2 (0.07 %)	2 (0.07 %)	3 (99.93 %)	3 (0.00 %)	3 (3.90 %)	8 (13.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1489	Torque teno mini virus 8 (PB4TL 2010) GCF_000887215.1	n/a	2 (76.15 %)	n/a	n/a	n/a	37.80 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.27 %)	8 (7.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1490	Torque teno mini virus 9 (TLMV-CLC062 2000) GCF_000837005.1	n/a	3 (77.41 %)	n/a	n/a	n/a	38.42 (100.00 %)	3 (0.21 %)	3 (0.21 %)	4 (99.79 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (4.01 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1491	Torque teno mini virus ALA22 (TTMV-ALA22 2014) GCF_000930495.1	n/a	3 (75.94 %)	n/a	n/a	n/a	38.28 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (3.05 %)	n/a	11 (7.69 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1492	Torque teno mini virus ALH8 (TTMV-ALH8 2014) GCF_000929855.1	n/a	2 (74.78 %)	n/a	n/a	n/a	38.77 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.19 %)	1 (2.73 %)	8 (8.09 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1493	Torque teno virus (Human/Japan/KS025/2016 2023) GCF_018580895.1	n/a	3 (82.70 %)	n/a	n/a	n/a	36.62 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.17 %)	n/a	11 (8.58 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1494	Torque teno virus 1 (VT416 1998) GCF_000857545.1	n/a	5 (70.74 %)	n/a	n/a	n/a	49.06 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.80 %)	n/a	17 (6.93 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (35.41 %)	2 (30.92 %)
1495	Torque teno virus 10 (JT34F 2010) GCF_000887255.1	n/a	6 (71.49 %)	n/a	n/a	n/a	51.22 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.00 %)	n/a	5 (4.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (38.57 %)	2 (33.77 %)
1496	Torque teno virus 13 (TCHN-A 2018) GCF_002818305.1	n/a	2 (76.54 %)	n/a	n/a	n/a	52.27 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.24 %)	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (49.70 %)	2 (49.70 %)
1497	Torque teno virus 17 (2019) GCF_002986165.1	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	49.83 (99.88 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.51 %)	1 (1.26 %)	3 (2.37 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (20.50 %)	1 (20.50 %)
1498	Torque teno virus 18 (2019) GCF_002986195.1	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	52.78 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.44 %)	n/a	3 (0.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (29.67 %)	2 (24.12 %)
1499	Torque teno virus 20 (2018) GCF_002818335.1	n/a	6 (83.33 %)	n/a	n/a	n/a	50.00 (99.88 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.79 %)	1 (1.27 %)	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (20.90 %)	1 (18.68 %)
1500	Torque teno virus 21 (TCHN-B 2018) GCF_002818355.1	n/a	2 (79.99 %)	n/a	n/a	n/a	45.33 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.54 %)	n/a	10 (3.87 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (20.27 %)	1 (20.27 %)
1501	Torque teno virus 29 (TTVyon-KC009 2018) GCF_002818425.1	n/a	3 (68.19 %)	n/a	n/a	n/a	52.69 (99.97 %)	7 (0.19 %)	7 (0.19 %)	8 (99.81 %)	4 (0.95 %)	n/a	11 (3.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (36.04 %)	2 (33.76 %)
1502	Torque teno virus 3 (HEL32 2010) GCF_000888935.1	n/a	10 (70.14 %)	n/a	n/a	n/a	51.35 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.72 %)	n/a	8 (4.06 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (36.13 %)	2 (31.75 %)
1503	Torque teno virus 4 (Pt-TTV6 2010) GCF_000886355.1	n/a	2 (68.92 %)	n/a	n/a	n/a	53.55 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.92 %)	n/a	12 (7.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (37.05 %)	2 (32.09 %)
1504	Torque teno virus 5 (TCHN-C1 2018) GCF_002818195.1	n/a	2 (67.73 %)	n/a	n/a	n/a	51.69 (99.88 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.27 %)	3 (0.74 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (20.04 %)	1 (20.04 %)
1505	Torque teno virus 6 (KAV 2010) GCF_000888995.1	n/a	6 (70.15 %)	n/a	n/a	n/a	49.96 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.65 %)	n/a	4 (3.43 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (44.59 %)	2 (40.27 %)
1506	Torque teno virus 7 (PMV 2010) GCF_000887275.1	n/a	3 (73.96 %)	n/a	n/a	n/a	48.41 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.14 %)	n/a	5 (1.61 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (24.36 %)	1 (15.79 %)
1507	Torque teno virus 9 (BM1C 2018) GCF_002818245.1	n/a	1 (15.76 %)	n/a	n/a	n/a	46.54 (99.87 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.74 %)	n/a	1 (0.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (22.88 %)	1 (22.88 %)
1508	Toscana virus (181135-14 2017) GCA_031497085.1	n/a	2 (39.49 %)	n/a	n/a	n/a	44.69 (99.94 %)	13 (0.12 %)	13 (0.12 %)	16 (99.88 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (2.06 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1509	Toxoplasma gondii (ME49 2013) GCF_000006565.2	8,712 (44.71 %)	n/a	547 (0.51 %)	6,721 (18.47 %)	n/a	52.29 (99.69 %)	244 (0.31 %)	265 (0.31 %)	2,508 (99.69 %)	30,645 (3.94 %)	25,397 (3.06 %)	346,604 (16.91 %)	0 (0 %)	14,377 (2.38 %)	1,245 (97.61 %)	794 (1.53 %)
1510	Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus (2010) GCF_000887495.1	n/a	6 (85.68 %)	n/a	n/a	n/a	40.08 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.92 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1511	trichomonads (G3 2022 genbank) GCA_000002825.3	n/a	60,817 (31.94 %)	1,087 (0.32 %)	14,069 (18.36 %)	n/a	32.83 (99.48 %)	8,181 (0.46 %)	8,181 (0.46 %)	72,950 (99.54 %)	51,123 (1.26 %)	102,247 (6.60 %)	318,523 (55.40 %)	27 (0.01 %)	101,388 (4.31 %)	873 (0.25 %)	848 (0.25 %)
1512	trichomonads (G3; ATCC PRA-98 2007) GCF_000002825.2	59,679 (31.63 %)	n/a	1,087 (0.32 %)	14,822 (19.33 %)	n/a	32.83 (99.48 %)	8,181 (0.46 %)	8,181 (0.46 %)	72,950 (99.54 %)	145,257 (55.06 %)	102,247 (6.60 %)	318,523 (55.40 %)	27 (0.01 %)	101,389 (4.31 %)	873 (0.25 %)	848 (0.25 %)
1513	trichomonads (NIH4 ATCC 30207 2019) GCA_900231805.1	n/a	n/a	778 (0.89 %)	6,267 (29.04 %)	n/a	34.59 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	4,161 (100.00 %)	9,215 (1.45 %)	4,031 (0.57 %)	335,620 (22.89 %)	0 (0 %)	1,055 (0.18 %)	1,227 (1.50 %)	1,178 (1.35 %)
1514	Trichomonas vaginalis (G3 2022) GCF_026262505.1	72,428 (34.54 %)	n/a	1,110 (0.32 %)	12,472 (18.87 %)	n/a	32.69 (99.98 %)	0 (0 %)	640 (0.02 %)	218 (100.00 %)	51,774 (1.29 %)	100,344 (7.63 %)	307,599 (55.88 %)	9 (0.01 %)	135,030 (7.89 %)	951 (0.28 %)	910 (0.27 %)
1515	Trypanosoma brucei (EATRO1125 2021) GCA_019096175.1	n/a	n/a	824 (0.76 %)	4,788 (26.68 %)	n/a	42.80 (99.98 %)	0 (0 %)	146 (0.02 %)	696 (100.00 %)	40,465 (3.76 %)	43,723 (14.74 %)	239,123 (32.22 %)	0 (0 %)	64,778 (10.33 %)	10,525 (23.33 %)	8,828 (12.99 %)
1516	Trypanosoma brucei brucei (2018) GCA_900497135.1	n/a	n/a	786 (0.89 %)	4,156 (28.68 %)	n/a	43.82 (99.91 %)	0 (0 %)	49 (0.09 %)	400 (100.00 %)	35,049 (10.77 %)	16,179 (5.45 %)	201,340 (25.23 %)	0 (0 %)	36,300 (8.47 %)	8,847 (25.69 %)	7,886 (15.02 %)
1517	Trypanosoma brucei brucei (927/4 GUTat10.1 2005 kinetoplastids) GCF_000002445.2	9,250 (50.97 %)	n/a	708 (1.57 %)	2,098 (38.69 %)	n/a	46.44 (99.99 %)	28 (0.01 %)	67 (0.01 %)	134 (99.99 %)	18,383 (5.48 %)	5,033 (3.00 %)	115,204 (16.79 %)	0 (0 %)	8,560 (6.13 %)	3,876 (28.83 %)	3,964 (14.61 %)
1518	Trypanosoma brucei gambiense (Dal972 MHOM/CI/86/DAL972 2009 kinetoplastids) GCF_000210295.1	8,185 (49.86 %)	n/a	681 (1.80 %)	1,793 (42.00 %)	n/a	47.17 (99.84 %)	278 (0.17 %)	278 (0.17 %)	289 (99.83 %)	16,597 (3.78 %)	4,392 (3.02 %)	93,893 (15.68 %)	8 (0.02 %)	6,333 (5.19 %)	2,944 (28.15 %)	3,353 (15.01 %)
1519	Trypanosoma congolense (IL3000 2011) GCA_000227395.2	n/a	6,456 (40.20 %)	253 (0.86 %)	3,071 (30.48 %)	n/a	47.51 (99.96 %)	0 (0 %)	1,376 (0.02 %)	2,644 (100.00 %)	5,569 (1.36 %)	3,220 (6.63 %)	64,837 (16.53 %)	0 (0 %)	11,700 (6.39 %)	4,505 (36.16 %)	4,136 (28.91 %)
1520	Trypanosoma congolense (IL3000 2018 kinetoplastids) GCA_003013265.1	n/a	n/a	721 (1.16 %)	4,614 (29.05 %)	n/a	45.88 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1,539 (100.00 %)	11,113 (1.60 %)	17,279 (16.77 %)	113,413 (28.69 %)	0 (0 %)	60,400 (11.98 %)	5,888 (36.74 %)	5,620 (16.71 %)
1521	Trypanosoma congolense (Tc1/148 2017) GCA_002287245.1	n/a	n/a	813 (1.16 %)	4,144 (30.20 %)	n/a	47.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	536 (100.00 %)	11,499 (1.44 %)	9,962 (9.64 %)	127,852 (25.29 %)	0 (0 %)	50,319 (14.36 %)	6,858 (38.13 %)	5,819 (18.75 %)
1522	Trypanosoma cruzi (231 2018) GCA_900252365.1	n/a	n/a	736 (1.29 %)	4,458 (34.22 %)	n/a	50.83 (95.68 %)	5,109 (4.33 %)	5,109 (4.33 %)	13,578 (95.67 %)	36,088 (10.33 %)	8,999 (2.30 %)	170,757 (25.12 %)	240 (0.39 %)	7,981 (4.46 %)	12,115 (51.42 %)	7,891 (19.58 %)
1523	Trypanosoma cruzi (Berenice 2020) GCA_013358655.1	n/a	14,351 (52.67 %)	890 (1.40 %)	3,725 (32.42 %)	n/a	51.20 (99.96 %)	0 (0 %)	11 (0.03 %)	923 (100.00 %)	47,244 (14.33 %)	12,567 (6.53 %)	187,487 (29.51 %)	0 (0 %)	44,661 (14.30 %)	3,760 (74.95 %)	6,175 (16.34 %)
1524	Trypanosoma cruzi (Brazil clone A4 2020) GCA_015033625.1	n/a	14,287 (39.60 %)	870 (1.17 %)	4,200 (30.74 %)	n/a	51.58 (99.94 %)	0 (0 %)	295 (0.06 %)	402 (100.00 %)	42,103 (3.62 %)	9,732 (6.77 %)	207,127 (28.40 %)	0 (0 %)	56,689 (15.50 %)	1,704 (78.61 %)	6,835 (18.28 %)
1525	Trypanosoma cruzi (Bug2148 2017) GCA_002749415.1	n/a	n/a	1,108 (1.18 %)	4,942 (29.26 %)	n/a	51.27 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	929 (100.00 %)	53,293 (14.16 %)	11,999 (7.56 %)	266,568 (30.60 %)	0 (0 %)	64,167 (17.06 %)	3,663 (78.99 %)	7,601 (16.68 %)
1526	Trypanosoma cruzi (CL 2018) GCA_003719155.1	n/a	32,382 (67.97 %)	1,130 (1.27 %)	8,128 (38.54 %)	n/a	50.89 (78.25 %)	9,621 (21.78 %)	9,621 (21.78 %)	17,385 (78.22 %)	51,512 (8.59 %)	10,801 (0.84 %)	256,056 (18.10 %)	359 (0.58 %)	12,047 (2.74 %)	17,148 (43.18 %)	13,844 (18.17 %)
1527	Trypanosoma cruzi (CL Brener 2005 kinetoplastids) GCF_000209065.1	21,486 (32.92 %)	n/a	1,473 (0.93 %)	11,094 (27.05 %)	n/a	51.73 (99.59 %)	3,251 (0.36 %)	3,251 (0.36 %)	32,746 (99.64 %)	101,042 (18.86 %)	33,823 (9.62 %)	381,995 (41.05 %)	14 (0.01 %)	116,751 (12.27 %)	30,396 (56.78 %)	16,908 (14.68 %)
1528	Trypanosoma cruzi (Dm28c 2013) GCA_000496795.1	n/a	11,398 (58.14 %)	590 (1.35 %)	2,958 (38.12 %)	n/a	50.55 (99.90 %)	4,851 (0.16 %)	4,851 (0.16 %)	6,061 (99.84 %)	22,949 (7.38 %)	4,285 (1.01 %)	133,379 (24.83 %)	69 (0.06 %)	4,647 (2.17 %)	4,333 (60.52 %)	4,552 (14.39 %)
1529	Trypanosoma cruzi (Dm28c 2018) GCA_003177105.1	n/a	17,234 (42.21 %)	1,095 (1.17 %)	4,398 (29.12 %)	n/a	51.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	636 (100.00 %)	49,579 (15.53 %)	11,985 (10.10 %)	239,052 (32.30 %)	0 (0 %)	66,554 (16.60 %)	3,264 (81.11 %)	7,826 (18.04 %)
1530	Trypanosoma cruzi (G 2018) GCA_003719455.1	n/a	12,763 (68.03 %)	659 (1.68 %)	2,979 (45.70 %)	n/a	50.05 (94.80 %)	0 (0 %)	4,237 (5.25 %)	1,450 (100.00 %)	24,246 (7.04 %)	4,119 (1.23 %)	118,530 (19.09 %)	219 (0.60 %)	4,074 (3.39 %)	5,125 (41.93 %)	4,766 (16.20 %)
1531	Trypanosoma cruzi (JR cl. 4 2013) GCA_000331405.1	n/a	n/a	724 (1.08 %)	4,068 (29.35 %)	n/a	51.29 (96.66 %)	2,791 (3.29 %)	2,791 (3.29 %)	18,103 (96.71 %)	41,670 (13.38 %)	9,134 (2.24 %)	199,475 (30.26 %)	18 (0.04 %)	17,527 (4.81 %)	14,403 (46.63 %)	8,217 (16.29 %)
1532	Trypanosoma cruzi (S11 2018) GCA_003594385.1	n/a	n/a	607 (1.42 %)	4,171 (39.91 %)	n/a	49.13 (91.99 %)	24,596 (8.30 %)	24,596 (8.30 %)	32,451 (91.70 %)	37,547 (8.58 %)	14,660 (4.42 %)	154,171 (20.89 %)	205 (0.09 %)	n/a	9,355 (36.78 %)	6,612 (17.91 %)
1533	Trypanosoma cruzi (S15 2018) GCA_003594585.1	n/a	n/a	613 (1.44 %)	4,115 (40.50 %)	n/a	49.08 (94.39 %)	22,497 (5.88 %)	22,497 (5.88 %)	31,694 (94.12 %)	40,911 (9.36 %)	13,849 (3.81 %)	153,233 (21.61 %)	1 (0.00 %)	18,803 (6.12 %)	9,270 (39.20 %)	6,569 (17.46 %)
1534	Trypanosoma cruzi (S154a 2018) GCA_003594715.1	n/a	n/a	524 (1.88 %)	4,842 (51.37 %)	n/a	49.62 (90.66 %)	10,583 (9.49 %)	10,583 (9.49 %)	17,529 (90.51 %)	16,140 (5.04 %)	3,435 (0.80 %)	94,186 (12.84 %)	7 (0.00 %)	1,122 (0.53 %)	8,088 (37.16 %)	6,326 (22.07 %)
1535	Trypanosoma cruzi (S162a 2018) GCA_003594605.1	n/a	n/a	601 (1.47 %)	4,435 (41.13 %)	n/a	49.16 (92.38 %)	22,017 (7.88 %)	22,017 (7.88 %)	30,605 (92.12 %)	39,590 (9.26 %)	13,214 (3.74 %)	148,451 (20.91 %)	3 (0.00 %)	18,317 (6.00 %)	9,439 (37.26 %)	6,573 (18.09 %)
1536	Trypanosoma cruzi (S23b 2018) GCA_003594425.1	n/a	n/a	615 (1.44 %)	3,924 (41.13 %)	n/a	49.15 (92.22 %)	25,170 (8.09 %)	25,170 (8.09 %)	32,315 (91.91 %)	38,606 (9.07 %)	13,482 (3.91 %)	155,197 (20.88 %)	53 (0.02 %)	21,452 (6.95 %)	9,095 (36.97 %)	6,384 (16.84 %)
1537	Trypanosoma cruzi (S44a 2018) GCA_003594705.1	n/a	n/a	409 (1.56 %)	2,796 (44.75 %)	n/a	49.11 (91.80 %)	0 (0 %)	11,716 (8.42 %)	4,971 (100.00 %)	23,039 (8.26 %)	7,222 (2.55 %)	90,547 (16.60 %)	0 (0 %)	6,368 (3.10 %)	5,765 (36.46 %)	4,667 (19.64 %)
1538	Trypanosoma cruzi (S92a 2018) GCA_003594445.1	n/a	n/a	612 (1.45 %)	3,887 (40.75 %)	n/a	49.11 (94.80 %)	24,122 (5.51 %)	24,122 (5.51 %)	31,256 (94.49 %)	35,825 (8.67 %)	13,648 (4.16 %)	150,601 (21.43 %)	187 (0.08 %)	19,699 (6.81 %)	8,425 (37.98 %)	5,971 (16.42 %)
1539	Trypanosoma cruzi (Sylvio X10/1 2012) GCA_000188675.2	n/a	10,846 (39.84 %)	854 (1.22 %)	6,398 (30.09 %)	n/a	51.16 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	27,016 (100.00 %)	37,732 (11.74 %)	6,045 (0.89 %)	200,484 (28.63 %)	0 (0 %)	1,239 (0.83 %)	23,110 (52.94 %)	11,077 (22.43 %)
1540	Trypanosoma cruzi (TCC 2018) GCA_003177095.1	n/a	26,338 (41.04 %)	1,453 (1.04 %)	6,923 (28.85 %)	n/a	51.72 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,236 (100.00 %)	90,986 (20.64 %)	26,706 (14.54 %)	360,803 (40.61 %)	0 (0 %)	131,704 (17.09 %)	5,554 (79.07 %)	10,662 (13.07 %)
1541	Trypanosoma cruzi (Tula cl2 2013) GCA_000365225.1	n/a	n/a	1,183 (0.86 %)	13,858 (28.09 %)	n/a	51.43 (88.54 %)	7,372 (11.38 %)	7,372 (11.38 %)	53,083 (88.62 %)	82,389 (11.82 %)	19,826 (1.99 %)	379,343 (26.02 %)	202 (0.20 %)	21,907 (3.32 %)	36,943 (48.69 %)	21,847 (21.35 %)
1542	Trypanosoma cruzi (Y 2017) GCA_002749425.1	n/a	n/a	753 (1.18 %)	4,645 (30.43 %)	n/a	49.84 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	9,821 (100.00 %)	39,393 (10.81 %)	8,137 (1.20 %)	202,940 (28.85 %)	0 (0 %)	5,321 (1.64 %)	12,168 (55.18 %)	7,718 (16.33 %)
1543	Trypanosoma cruzi (Y clone C6 2020) GCA_015033655.1	n/a	14,336 (42.04 %)	828 (1.08 %)	3,474 (29.42 %)	n/a	51.58 (99.95 %)	0 (0 %)	231 (0.05 %)	266 (100.00 %)	54,788 (4.58 %)	18,111 (11.00 %)	206,701 (34.31 %)	0 (0 %)	71,443 (18.43 %)	1,428 (83.97 %)	6,416 (14.86 %)
1544	Trypanosoma cruzi (Ycl2 2018) GCA_003594485.1	n/a	n/a	600 (1.50 %)	4,565 (42.33 %)	n/a	49.16 (95.10 %)	19,190 (5.14 %)	19,190 (5.14 %)	26,074 (94.86 %)	34,930 (8.39 %)	12,450 (3.55 %)	142,183 (20.94 %)	1 (0.00 %)	16,047 (5.49 %)	8,858 (42.20 %)	6,419 (19.45 %)
1545	Trypanosoma cruzi (Ycl4 2018) GCA_003594405.1	n/a	n/a	598 (1.50 %)	4,533 (42.10 %)	n/a	49.17 (95.10 %)	20,293 (5.16 %)	20,293 (5.16 %)	26,957 (94.84 %)	35,571 (8.58 %)	12,514 (3.63 %)	142,007 (20.79 %)	1 (0.00 %)	16,773 (5.70 %)	8,752 (42.51 %)	6,400 (19.64 %)
1546	Trypanosoma cruzi (Ycl6 2018) GCA_003594465.1	n/a	n/a	605 (1.53 %)	4,639 (42.54 %)	n/a	49.13 (95.08 %)	19,286 (5.17 %)	19,286 (5.17 %)	26,253 (94.83 %)	37,956 (8.96 %)	12,256 (3.53 %)	139,683 (20.67 %)	2 (0.00 %)	15,501 (5.40 %)	8,654 (41.69 %)	6,359 (19.35 %)
1547	Trypanosoma cruzi cruzi (Dm28c 2017) GCA_002219105.2	n/a	16,163 (40.15 %)	1,134 (1.39 %)	4,889 (31.75 %)	n/a	51.68 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,030 (100.00 %)	53,486 (13.50 %)	11,763 (7.41 %)	236,998 (29.69 %)	0 (0 %)	51,978 (15.68 %)	3,781 (75.10 %)	7,631 (19.09 %)
1548	Trypanosoma cruzi marinkellei (B7 2012) GCA_000300495.1	n/a	10,100 (43.56 %)	842 (1.37 %)	7,131 (33.86 %)	n/a	50.95 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	23,148 (100.00 %)	39,333 (9.96 %)	10,907 (1.40 %)	172,368 (27.05 %)	0 (0 %)	1,379 (1.02 %)	20,167 (51.90 %)	10,270 (22.83 %)
1549	Trypanosoma cruzi strain (Esmeraldo cl. 3 2013) GCA_000327425.1	n/a	n/a	641 (1.15 %)	3,521 (31.83 %)	n/a	50.88 (91.79 %)	4,384 (8.18 %)	4,384 (8.18 %)	20,187 (91.82 %)	44,249 (11.85 %)	11,716 (1.40 %)	181,687 (26.43 %)	95 (0.22 %)	7,463 (1.98 %)	13,828 (43.63 %)	7,939 (16.03 %)
1550	Trypanosoma equiperdum (OVI 2016 refseq) GCF_001457755.1	7,673 (43.97 %)	n/a	576 (1.36 %)	2,998 (35.93 %)	n/a	45.94 (99.65 %)	6,447 (0.44 %)	6,447 (0.44 %)	8,473 (99.56 %)	16,822 (2.58 %)	3,925 (0.79 %)	141,656 (16.64 %)	0 (0 %)	1,684 (0.54 %)	4,877 (34.82 %)	4,352 (15.04 %)
1551	Trypanosoma evansi (2021) GCA_917563935.1	n/a	n/a	697 (1.60 %)	1,998 (37.85 %)	n/a	46.53 (100.00 %)	96 (0.00 %)	96 (0.00 %)	109 (100.00 %)	17,662 (2.87 %)	5,727 (2.93 %)	115,226 (17.28 %)	2 (0.00 %)	9,398 (6.30 %)	3,582 (29.41 %)	3,847 (14.41 %)
1552	Trypanosoma grayi (ANR4 2014 kinetoplastids) GCF_000691245.1	10,583 (66.59 %)	n/a	586 (1.65 %)	4,005 (54.75 %)	n/a	53.95 (99.32 %)	0 (0 %)	3,492 (0.68 %)	2,871 (100.00 %)	16,738 (3.13 %)	5,010 (1.91 %)	131,234 (16.24 %)	740 (0.59 %)	3,953 (2.06 %)	3,578 (81.23 %)	2,593 (10.98 %)
1553	Trypanosoma melophagium (St. Kilda St. Kilda 2022 refseq) GCF_022059095.1	10,044 (64.21 %)	n/a	742 (1.83 %)	848 (40.20 %)	n/a	41.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	64 (100.00 %)	39,141 (7.68 %)	14,366 (6.71 %)	131,898 (25.19 %)	0 (0 %)	9,068 (6.92 %)	4,119 (14.82 %)	3,546 (9.39 %)
1554	Trypanosoma rangeli (SC58 2013) GCA_000492115.1	n/a	7,475 (68.34 %)	670 (2.75 %)	7,621 (59.92 %)	n/a	52.96 (99.88 %)	2,745 (0.02 %)	2,745 (0.02 %)	11,811 (99.98 %)	11,567 (3.09 %)	2,909 (0.72 %)	82,270 (14.59 %)	0 (0 %)	267 (0.24 %)	7,546 (66.86 %)	5,934 (44.71 %)
1555	Trypanosoma theileri (Edinburgh 2017 kinetoplastids) GCF_002087225.1	11,312 (63.57 %)	n/a	665 (1.51 %)	767 (36.38 %)	n/a	40.06 (86.20 %)	0 (0 %)	4,816 (13.86 %)	319 (100.00 %)	57,547 (9.71 %)	19,568 (2.92 %)	160,176 (24.92 %)	48 (0.15 %)	16,704 (4.56 %)	3,950 (7.03 %)	3,103 (5.05 %)
1556	Trypanosoma vivax (Y486 2011) GCA_000227375.1	n/a	4,133 (18.43 %)	95 (0.17 %)	4,537 (15.45 %)	n/a	53.57 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	8,277 (100.00 %)	9,605 (2.14 %)	5,391 (2.33 %)	103,604 (16.50 %)	0 (0 %)	9,484 (4.17 %)	8,315 (72.57 %)	6,879 (48.70 %)
1557	tsetse fly (v2 IAEA_lab_2018 2020) GCF_014805625.2	24,248 (8.13 %)	n/a	7,202 (2.32 %)	6,649 (3.63 %)	n/a	33.81 (97.46 %)	0 (0 %)	9,485 (2.55 %)	7,824 (100.00 %)	415,107 (4.58 %)	185,652 (2.27 %)	3,080,653 (35.26 %)	664 (0.07 %)	40,232 (0.93 %)	3,487 (0.58 %)	1,908 (0.28 %)
1558	tsetse fly G.austeni (2014) GCA_000688735.1	n/a	n/a	7,099 (2.45 %)	6,363 (3.84 %)	n/a	34.09 (95.48 %)	16,426 (4.53 %)	21,556 (4.54 %)	18,631 (95.47 %)	397,383 (5.03 %)	212,538 (2.99 %)	2,989,075 (33.56 %)	594 (0.06 %)	48,872 (1.33 %)	2,678 (0.33 %)	1,808 (0.22 %)
1559	tsetse fly G.brevipalpis (2014) GCA_000671755.1	n/a	n/a	6,706 (2.82 %)	3,735 (3.32 %)	n/a	31.21 (93.08 %)	15,007 (6.94 %)	19,872 (6.94 %)	16,658 (93.06 %)	387,503 (6.79 %)	206,007 (3.82 %)	2,827,858 (37.89 %)	432 (0.07 %)	44,216 (1.37 %)	2,011 (0.33 %)	1,137 (0.21 %)
1560	tsetse fly G.fuscipes fuscipes (2014) GCA_000671735.1	n/a	n/a	7,083 (2.40 %)	6,464 (3.71 %)	n/a	33.60 (96.41 %)	11,173 (3.60 %)	13,535 (3.60 %)	13,567 (96.40 %)	410,032 (4.92 %)	188,436 (2.25 %)	3,048,601 (33.66 %)	546 (0.15 %)	34,919 (0.94 %)	2,456 (0.34 %)	1,865 (0.27 %)
1561	tsetse fly G.morsitans morsitans (Yale 2014) GCA_001077435.1	n/a	n/a	7,057 (2.28 %)	9,750 (3.70 %)	n/a	34.12 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	24,070 (100.00 %)	373,893 (4.73 %)	156,874 (2.49 %)	3,033,573 (34.33 %)	0 (0 %)	37,949 (0.75 %)	2,330 (0.31 %)	1,762 (0.23 %)
1562	tsetse fly G.pallidipes (2014) GCA_000688715.1	n/a	n/a	7,096 (2.48 %)	6,142 (3.84 %)	n/a	34.11 (98.49 %)	5,133 (1.51 %)	6,449 (1.52 %)	6,859 (98.49 %)	340,120 (4.37 %)	149,867 (2.10 %)	2,979,113 (33.58 %)	282 (0.03 %)	27,162 (0.69 %)	2,286 (0.32 %)	1,671 (0.23 %)
1563	tsetse fly G.palpalis gambiensis (146720 2015) GCA_000818775.1	n/a	n/a	7,119 (2.53 %)	6,579 (3.96 %)	n/a	33.61 (91.07 %)	27,394 (8.96 %)	29,785 (8.96 %)	31,320 (91.04 %)	397,519 (4.95 %)	184,417 (2.17 %)	2,904,702 (31.03 %)	829 (0.14 %)	34,343 (1.85 %)	2,283 (0.30 %)	1,775 (0.24 %)
1564	TTV-like mini virus (D11 2023) GCF_018580215.1	n/a	3 (75.99 %)	n/a	n/a	n/a	36.75 (99.89 %)	10 (0.42 %)	10 (0.42 %)	11 (99.58 %)	3 (0.00 %)	1 (1.89 %)	11 (8.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1565	TTV-like mini virus (Emory1 2023) GCF_018580655.1	n/a	3 (76.93 %)	n/a	n/a	n/a	37.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (5.05 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1566	TTV-like mini virus (Emory2 2023) GCF_018580665.1	n/a	3 (82.23 %)	n/a	n/a	n/a	36.35 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (3.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1567	TTV-like mini virus (TTMV_LY1 2013) GCF_000905335.1	n/a	3 (75.48 %)	n/a	n/a	n/a	38.63 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.72 %)	2 (2.71 %)	7 (9.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1568	TTV-like mini virus (TTMV_LY3 2023) GCF_018580125.1	n/a	3 (73.76 %)	n/a	n/a	n/a	39.86 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (4.43 %)	6 (7.51 %)	0 (0 %)	1 (2.13 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1569	TTV-like mini virus (vzttmv4 2023) GCF_018584815.1	n/a	3 (82.18 %)	n/a	n/a	n/a	38.42 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.79 %)	4 (4.88 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1570	TTV-like mini virus (zhenjiang 2023) GCF_018580875.1	n/a	3 (75.71 %)	n/a	n/a	n/a	37.86 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.65 %)	7 (6.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1571	Tulane virus (2019) GCF_004786795.1	n/a	3 (98.38 %)	n/a	n/a	n/a	46.66 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.21 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1572	Tupaia hepatovirus A (TN1 2016) GCF_001502175.1	n/a	1 (90.12 %)	n/a	n/a	n/a	39.41 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.63 %)	n/a	2 (0.97 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1573	Turkey calicivirus (L11043 2019) GCF_004786995.1	n/a	2 (98.47 %)	n/a	n/a	n/a	50.01 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (7.99 %)	2 (7.99 %)
1574	Upolu virus (2023) GCF_023156825.1	n/a	6 (94.48 %)	n/a	n/a	n/a	42.76 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	26 (2.56 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1575	V.brassicaformis CCMP3155 (2015) GCA_001179505.1	n/a	220,315 (88.11 %)	712 (0.60 %)	15,155 (31.08 %)	n/a	58.09 (98.73 %)	0 (0 %)	3,113 (1.28 %)	1,064 (100.00 %)	126,593 (6.34 %)	37,019 (1.99 %)	573,167 (25.26 %)	90 (0.13 %)	16,061 (2.82 %)	1,899 (97.95 %)	8,058 (9.23 %)
1576	Vaccinia virus (WR (Western Reserve) 2005) GCF_000860085.1	n/a	223 (88.80 %)	n/a	n/a	n/a	33.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	26 (0.57 %)	10 (3.43 %)	744 (9.15 %)	0 (0 %)	15 (0.39 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1577	Varicella-zoster virus (Dumas 1987) GCF_000858285.1	n/a	74 (89.36 %)	n/a	n/a	n/a	46.02 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	14 (0.32 %)	17 (0.92 %)	421 (5.39 %)	0 (0 %)	9 (0.44 %)	1 (0.20 %)	3 (1.21 %)
1578	Variegated bornavirus 1 (squirrel brain 2016) GCF_001698295.1	n/a	6 (99.17 %)	n/a	n/a	n/a	42.84 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.16 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1579	Venezuelan equine encephalitis virus (1993) GCF_000862105.1	n/a	6 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	50.12 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	1 (0.30 %)	6 (1.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (15.75 %)	4 (15.75 %)
1580	Venezuelan equine encephalitis virus (Trinidad donkey donkey/Trinidad/1943 2023) GCF_002889695.1	n/a	4 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	49.79 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.51 %)	1 (0.30 %)	6 (1.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (12.87 %)	3 (10.39 %)
1581	Vesicular exanthema of swine virus (2000) GCF_000847705.1	n/a	3 (97.55 %)	n/a	n/a	n/a	47.83 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.04 %)	1 (3.04 %)
1582	Vesicular stomatitis Alagoas virus (Indiana 3 2014) GCF_000924515.1	n/a	6 (99.38 %)	n/a	n/a	n/a	42.58 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.36 %)	n/a	12 (0.94 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1583	Vesicular stomatitis Indiana virus (1993) GCF_000850045.1	n/a	4 (91.34 %)	n/a	n/a	n/a	41.74 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.60 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1584	Vesicular stomatitis Indiana virus (98COE 2018) GCF_002815995.1	n/a	6 (99.37 %)	n/a	n/a	n/a	41.75 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.28 %)	n/a	5 (0.31 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1585	Vesicular stomatitis New Jersey virus (NJ1184HDB 2014) GCF_000923855.1	n/a	6 (95.91 %)	n/a	n/a	n/a	39.89 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	19 (1.57 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1586	vesivirus (Hom-1 2017) GCF_002118765.1	n/a	3 (97.57 %)	n/a	n/a	n/a	48.33 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.10 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.05 %)	1 (3.05 %)
1587	Vesivirus ferret badger/JX12/China/2012 (FBCV-JX12 2015) GCF_001019935.1	n/a	3 (98.23 %)	n/a	n/a	n/a	45.18 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.14 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1588	Vibrio alginolyticus (E110 2022) GCF_023650915.1	n/a	4,706 (86.99 %)	n/a	n/a	n/a	44.71 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	102 (0.91 %)	14,086 (4.58 %)	0 (0 %)	731 (1.59 %)	147 (2.59 %)	163 (1.87 %)
1589	Vibrio cholerae (IEC224 2012) GCF_000250855.1	n/a	3,768 (87.87 %)	n/a	n/a	n/a	47.46 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	93 (0.42 %)	11,018 (4.87 %)	0 (0 %)	534 (1.44 %)	26 (0.24 %)	31 (0.33 %)
1590	Vibrio cholerae (RFB16 2019) GCF_008369605.1	n/a	3,797 (87.74 %)	n/a	n/a	n/a	47.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	113 (0.62 %)	12,805 (5.57 %)	0 (0 %)	572 (1.56 %)	17 (0.25 %)	17 (0.20 %)
1591	Vibrio cholerae O1 (AAS91 2020) GCF_009938115.1	n/a	3,782 (88.01 %)	n/a	n/a	n/a	47.61 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	96 (0.49 %)	12,240 (5.37 %)	0 (0 %)	560 (1.95 %)	12 (0.58 %)	15 (0.15 %)
1592	Vibrio cholerae O1 biovar El Tor (C6709 2020) GCF_013085105.1	n/a	3,785 (87.89 %)	n/a	n/a	n/a	47.44 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	2 (100.00 %)	n/a	103 (0.37 %)	11,153 (4.91 %)	0 (0 %)	521 (1.70 %)	26 (0.24 %)	32 (0.34 %)
1593	Vibrio cholerae O1 biovar El Tor (DRC-193A 2020) GCF_013085145.1	n/a	3,769 (88.09 %)	n/a	n/a	n/a	47.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	92 (0.40 %)	11,303 (4.85 %)	0 (0 %)	397 (1.37 %)	24 (0.23 %)	37 (0.39 %)
1594	Vibrio cholerae O1 biovar El Tor (E7946 2020) GCF_013085165.1	n/a	3,782 (87.88 %)	n/a	n/a	n/a	47.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	95 (0.41 %)	11,786 (5.22 %)	0 (0 %)	536 (1.96 %)	26 (0.24 %)	32 (0.35 %)
1595	Vibrio cholerae O1 biovar El Tor (FJ147 2015) GCF_000963555.1	n/a	3,750 (88.13 %)	n/a	n/a	n/a	47.51 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	90 (0.41 %)	11,194 (4.83 %)	0 (0 %)	396 (1.35 %)	24 (0.23 %)	31 (0.39 %)
1596	Vibrio cholerae O1 biovar El Tor (HC1037 2018) GCF_002946655.1	n/a	3,712 (88.04 %)	n/a	n/a	n/a	47.53 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	87 (0.31 %)	10,845 (4.71 %)	0 (0 %)	372 (0.83 %)	25 (0.27 %)	39 (0.56 %)
1597	Vibrio cholerae O1 biovar El Tor (P27459 2020) GCF_013085125.1	n/a	3,716 (87.84 %)	n/a	n/a	n/a	47.49 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	2 (100.00 %)	n/a	97 (0.41 %)	10,788 (4.82 %)	0 (0 %)	522 (1.49 %)	26 (0.25 %)	31 (0.34 %)
1598	Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. (N16961 2019) GCF_900205735.1	n/a	3,715 (87.85 %)	n/a	n/a	n/a	47.49 (100.00 %)	0 (0 %)	9 (0.00 %)	2 (100.00 %)	n/a	92 (0.40 %)	10,753 (4.81 %)	0 (0 %)	535 (1.47 %)	26 (0.25 %)	30 (0.33 %)
1599	Vibrio cholerae O1 str. (2010EL-1786 2011) GCF_000166455.1	n/a	3,722 (88.06 %)	n/a	n/a	n/a	47.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	87 (0.31 %)	11,025 (4.77 %)	0 (0 %)	372 (0.83 %)	27 (0.29 %)	52 (0.72 %)
1600	Vibrio cholerae O1 str. (KW3 2015) GCF_001318185.1	n/a	3,736 (88.13 %)	n/a	n/a	n/a	47.51 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	98 (0.45 %)	11,167 (4.81 %)	0 (0 %)	371 (1.12 %)	24 (0.23 %)	32 (0.40 %)
1601	Vibrio cincinnatiensis (NCTC12012 2018) GCF_900460255.1	n/a	3,493 (87.61 %)	n/a	n/a	n/a	43.78 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	69 (0.42 %)	12,268 (5.78 %)	0 (0 %)	540 (2.59 %)	247 (3.90 %)	204 (2.35 %)
1602	Vibrio fluvialis (ATCC 33809 2018) GCF_001558415.2	n/a	4,507 (88.59 %)	n/a	n/a	n/a	49.93 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	56 (0.21 %)	13,415 (4.55 %)	0 (0 %)	131 (0.90 %)	1 (65.37 %)	0 (0.00 %)
1603	Vibrio furnissii (FDAARGOS_777 2019) GCF_006364355.1	n/a	4,633 (87.96 %)	n/a	n/a	n/a	50.60 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	181 (0.43 %)	16,118 (5.35 %)	0 (0 %)	368 (1.05 %)	5 (98.49 %)	9 (0.34 %)
1604	Vibrio harveyi (SB1 2023) GCF_030060435.1	n/a	5,367 (86.79 %)	n/a	n/a	n/a	44.98 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	129 (0.98 %)	17,202 (6.05 %)	0 (0 %)	799 (1.48 %)	238 (2.42 %)	220 (1.25 %)
1605	Vibrio injensis (M12-1144 2016) GCF_001895205.1	n/a	3,349 (87.35 %)	n/a	n/a	n/a	43.97 (100.00 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	33 (100.00 %)	n/a	74 (0.35 %)	13,002 (6.00 %)	0 (0 %)	185 (0.44 %)	131 (4.83 %)	118 (1.13 %)
1606	Vibrio metoecus (ZF102 2023) GCF_030580635.1	n/a	3,777 (87.85 %)	n/a	n/a	n/a	46.92 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4 (100.00 %)	n/a	69 (0.78 %)	9,613 (4.38 %)	0 (0 %)	823 (2.09 %)	17 (0.55 %)	63 (0.65 %)
1607	Vibrio metschnikovii (NCTC8443 2018) GCF_900460295.1	n/a	3,438 (86.36 %)	n/a	n/a	n/a	44.16 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	73 (0.31 %)	12,353 (5.63 %)	0 (0 %)	535 (0.96 %)	114 (1.82 %)	134 (2.29 %)
1608	Vibrio mimicus (NCTC11435 2018) GCF_900460385.1	n/a	4,101 (87.56 %)	n/a	n/a	n/a	46.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	50 (0.71 %)	12,049 (5.40 %)	0 (0 %)	897 (1.87 %)	177 (3.52 %)	188 (1.78 %)
1609	Vibrio parahaemolyticus (RIMD 2210633 substr. RIMD 2210633 2004) GCF_000196095.1	n/a	4,709 (87.39 %)	n/a	n/a	n/a	45.37 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	89 (0.65 %)	14,595 (4.62 %)	0 (0 %)	361 (0.99 %)	25 (0.29 %)	57 (0.61 %)
1610	Vibrio vulnificus NBRC 15645 (ATCC 27562 2017) GCF_002224265.1	n/a	4,430 (87.50 %)	n/a	n/a	n/a	46.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	157 (1.34 %)	14,064 (5.51 %)	0 (0 %)	978 (2.03 %)	13 (0.31 %)	66 (0.45 %)
1611	virus (MSSI2.225 ms23.49 2014) GCF_000923355.1	n/a	3 (85.39 %)	n/a	n/a	n/a	51.80 (99.82 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.31 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (70.83 %)	1 (70.83 %)
1612	Walrus calicivirus (2003) GCF_000852525.1	n/a	3 (97.71 %)	n/a	n/a	n/a	48.23 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.49 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (9.51 %)	3 (9.51 %)
1613	Wenling frogfish filovirus (XYHYS28627 2021) GCF_004788975.1	n/a	10 (92.19 %)	n/a	n/a	n/a	49.85 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.30 %)	n/a	3 (0.17 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (1.26 %)	1 (1.26 %)
1614	Wenling thamnaconus septentrionalis filovirus (LQMMTII17328 2021) GCF_004788995.1	n/a	6 (91.55 %)	n/a	n/a	n/a	47.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.22 %)	n/a	6 (0.57 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1615	Wesselsbron virus (SAH177 2009) GCF_000883915.1	n/a	1 (94.49 %)	n/a	n/a	n/a	47.65 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.37 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1616	West Nile virus (956 1993) GCF_000861085.1	n/a	3 (93.90 %)	n/a	n/a	n/a	51.06 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (7.47 %)	3 (7.47 %)
1617	West Nile virus (NY99 385-99 2007) GCF_000875385.1	n/a	5 (93.41 %)	n/a	n/a	n/a	51.17 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.07 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.23 %)	1 (2.23 %)
1618	Western equine encephalitis virus (71V-1658 2000) GCF_000850885.1	n/a	4 (96.79 %)	n/a	n/a	n/a	49.21 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.64 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (52.96 %)	3 (52.96 %)
1619	Western equine encephalitis virus (AG80-646 2023) GCF_002889215.1	n/a	2 (96.04 %)	n/a	n/a	n/a	48.32 (99.98 %)	8 (0.07 %)	8 (0.07 %)	9 (99.93 %)	4 (0.29 %)	n/a	5 (1.46 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (7.08 %)	3 (7.08 %)
1620	wheat leaf rust (1-1 BBBD Race 1 2016) GCA_000151525.2	n/a	16,499 (19.77 %)	1,103 (0.74 %)	13,825 (13.35 %)	n/a	46.72 (78.74 %)	10,393 (21.26 %)	10,393 (21.26 %)	25,211 (78.74 %)	53,300 (16.84 %)	32,900 (2.09 %)	424,528 (15.00 %)	45 (0.02 %)	17,440 (1.33 %)	22,905 (15.33 %)	17,567 (11.36 %)
1621	witches' butter GCF_000271645.1	8,291 (43.24 %)	n/a	888 (2.37 %)	5,732 (20.70 %)	n/a	46.73 (97.73 %)	439 (2.28 %)	439 (2.28 %)	484 (97.72 %)	10,197 (6.18 %)	7,333 (2.14 %)	80,160 (16.24 %)	3 (0.00 %)	6,408 (2.87 %)	5,354 (18.44 %)	3,300 (8.69 %)
1622	WU Polyomavirus (B0 2007) GCF_000870785.1	n/a	6 (85.79 %)	n/a	n/a	n/a	39.18 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.03 %)	1 (0.71 %)	16 (3.46 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1623	Yaba monkey tumor virus (2003) GCF_000845705.1	n/a	140 (94.29 %)	n/a	n/a	n/a	29.83 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	24 (0.67 %)	6 (0.47 %)	1,223 (18.16 %)	0 (0 %)	2 (0.15 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1624	Yaba-like disease virus (2001) GCF_000847185.1	n/a	152 (95.76 %)	n/a	n/a	n/a	27.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	39 (1.06 %)	10 (0.44 %)	1,396 (21.09 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1625	yellow fever mosquito (Aag2 2022) GCA_021653915.1	n/a	n/a	7,941 (0.49 %)	87,870 (6.84 %)	n/a	38.14 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,752 (100.00 %)	300,230 (1.06 %)	496,241 (4.60 %)	9,478,291 (53.75 %)	0 (0 %)	702,548 (4.04 %)	120,297 (6.12 %)	63,506 (2.23 %)
1626	yellow fever mosquito (LVP_AGWG 2017 refseq) GCF_002204515.2	33,026 (3.13 %)	n/a	6,622 (0.55 %)	60,584 (7.33 %)	n/a	38.18 (100.00 %)	0 (0 %)	229 (0.00 %)	2,310 (100.00 %)	1,886,359 (44.82 %)	370,739 (4.59 %)	7,710,852 (49.51 %)	0 (0 %)	458,653 (4.00 %)	90,949 (6.16 %)	51,353 (2.55 %)
1627	Yellow fever virus (17D vaccine strain 1986) GCF_000857725.1	n/a	1 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	49.72 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	1 (0.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1628	Yersinia enterocolitica subsp. palearctica (Y11 2011) GCF_000253175.1	n/a	4,240 (85.36 %)	n/a	n/a	n/a	46.97 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	144 (0.40 %)	8,173 (4.66 %)	0 (0 %)	176 (0.66 %)	391 (13.11 %)	472 (10.46 %)
1629	Yersinia pestis (A1122 2011) GCF_000222975.1	n/a	4,249 (84.43 %)	n/a	n/a	n/a	47.63 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	795 (1.20 %)	5,502 (5.05 %)	0 (0 %)	338 (1.16 %)	214 (7.84 %)	424 (13.35 %)
1630	Yezo virus (HH003-2020 2023) GCF_029888495.1	n/a	3 (95.97 %)	n/a	n/a	n/a	45.30 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	21 (1.09 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1631	Zaire ebolavirus (Ebola virus/H.sapiens-tc/COD/1976/Yambuku-Mayinga 1999) GCF_000848505.1	n/a	11 (95.31 %)	n/a	n/a	n/a	41.07 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.18 %)	n/a	4 (0.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (1.12 %)	1 (1.12 %)
1632	Zika virus (MR 766 2009) GCF_000882815.3	n/a	1 (95.05 %)	n/a	n/a	n/a	50.95 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.26 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1633	Zika virus (Natal RGN 2017) GCF_002366285.1	n/a	1 (95.04 %)	n/a	n/a	n/a	51.26 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
TOTALS:	total assembly count 1633

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	325 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	680 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	433 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	494 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	317 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	1178 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	321 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	922 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	706 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	319 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	663 assemblies	assembly stats	track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project	1303 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	96 assemblies	assembly stats	track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center	1633 assemblies	assembly stats	track stats

BRC - Bioinformatics Research Center - track statistics

See also: hub access, assembly statistics

Data resource links