BRC - Bioinformatics Research Center - track statistics

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count	common name link to genome browser	ncbiRefSeq	ncbiGene	xenoRefGene	augustus genes	Ensembl genes	gc5 base	AGP gap	all gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	gap Overlap	tandem Dups	cpg unmasked	cpg island
1	A.astronyxis (2015) GCA_000826245.1	n/a	n/a	2,016 (1.54 %)	14,515 (15.18 %)	n/a	42.72 (99.51 %)	5,685 (0.26 %)	5,685 (0.26 %)	103,933 (99.74 %)	101,856 (5.17 %)	58,925 (3.07 %)	508,018 (21.58 %)	147 (0.03 %)	7,936 (0.75 %)	2,248 (1.01 %)	1,624 (0.72 %)
2	A.castellanii (2015) GCA_000826485.1	n/a	n/a	1,645 (0.73 %)	51,566 (25.12 %)	n/a	58.90 (98.61 %)	25,887 (1.08 %)	25,887 (1.08 %)	247,635 (98.92 %)	170,520 (7.49 %)	107,479 (3.58 %)	827,275 (23.81 %)	1,189 (0.15 %)	n/a	50,703 (69.56 %)	25,394 (19.58 %)
3	A.castellanii (C3 2021) GCA_021020595.1	n/a	n/a	988 (1.33 %)	12,252 (35.90 %)	n/a	58.64 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	174 (100.00 %)	65,187 (6.84 %)	40,560 (3.93 %)	340,754 (23.92 %)	0 (0 %)	8,429 (1.44 %)	232 (98.44 %)	506 (1.47 %)
4	A.castellanii (Neff 2021) GCA_021020605.1	n/a	n/a	996 (1.40 %)	11,949 (36.92 %)	n/a	58.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	111 (100.00 %)	66,153 (7.17 %)	41,374 (3.81 %)	331,056 (24.35 %)	0 (0 %)	6,219 (1.18 %)	196 (98.46 %)	283 (0.73 %)
5	A.castellanii str. (Neff 2013) GCF_000313135.1	14,967 (50.01 %)	n/a	887 (1.39 %)	10,919 (35.24 %)	n/a	58.41 (93.89 %)	2,808 (6.13 %)	2,913 (6.13 %)	3,192 (93.87 %)	58,039 (7.75 %)	38,227 (3.62 %)	298,802 (22.73 %)	11 (0.03 %)	10,127 (3.04 %)	1,052 (92.11 %)	1,041 (2.57 %)
6	A.culbertsoni (2015) GCA_000826265.1	n/a	n/a	1,519 (1.77 %)	15,518 (30.11 %)	n/a	50.23 (99.28 %)	6,908 (0.48 %)	6,908 (0.48 %)	79,319 (99.52 %)	56,527 (4.83 %)	34,849 (2.92 %)	254,067 (18.25 %)	85 (0.02 %)	5,338 (0.78 %)	7,704 (61.93 %)	6,746 (19.20 %)
7	A.healyi (2015) GCA_000826305.1	n/a	n/a	1,608 (1.33 %)	31,219 (37.40 %)	n/a	58.66 (99.78 %)	3,582 (0.16 %)	3,582 (0.16 %)	29,770 (99.84 %)	79,512 (4.56 %)	28,532 (2.04 %)	566,712 (21.23 %)	34 (0.01 %)	6,883 (0.70 %)	12,979 (92.23 %)	5,923 (11.77 %)
8	A.lenticulata (2015) GCA_000826285.1	n/a	n/a	1,526 (1.33 %)	27,614 (33.40 %)	n/a	56.73 (99.50 %)	7,333 (0.28 %)	7,333 (0.28 %)	86,381 (99.72 %)	69,593 (4.58 %)	24,883 (1.74 %)	469,583 (20.45 %)	179 (0.04 %)	6,983 (0.90 %)	18,561 (79.68 %)	10,846 (22.54 %)
9	A.lugdunensis (2015) GCA_000826425.1	n/a	n/a	1,993 (1.11 %)	53,494 (34.97 %)	n/a	59.11 (99.53 %)	8,227 (0.36 %)	8,227 (0.36 %)	75,686 (99.64 %)	141,139 (6.79 %)	90,543 (3.59 %)	705,388 (23.79 %)	466 (0.07 %)	12,672 (1.18 %)	37,139 (86.92 %)	19,048 (24.56 %)
10	A.mauritaniensis (2015) GCA_000826465.1	n/a	n/a	2,420 (1.34 %)	57,123 (38.15 %)	n/a	58.64 (99.59 %)	6,873 (0.30 %)	6,873 (0.30 %)	74,106 (99.70 %)	126,382 (5.54 %)	67,964 (2.87 %)	709,452 (21.74 %)	397 (0.06 %)	10,082 (0.82 %)	33,983 (86.91 %)	18,590 (31.29 %)
11	A.palestinensis (2015) GCA_000826325.1	n/a	n/a	2,155 (1.14 %)	55,296 (39.97 %)	n/a	59.14 (99.69 %)	6,201 (0.23 %)	6,201 (0.23 %)	62,943 (99.77 %)	117,311 (5.27 %)	65,418 (2.61 %)	723,479 (22.50 %)	560 (0.08 %)	9,683 (0.83 %)	35,883 (88.33 %)	18,137 (31.22 %)
12	A.pearcei (2015) GCA_000826505.1	n/a	n/a	1,687 (0.75 %)	51,206 (25.03 %)	n/a	58.96 (98.57 %)	27,116 (1.12 %)	27,116 (1.12 %)	251,253 (98.88 %)	171,265 (7.00 %)	108,746 (3.61 %)	818,893 (23.51 %)	1,167 (0.15 %)	n/a	50,218 (69.20 %)	25,615 (20.35 %)
13	A.polyphaga (2015) GCA_000826345.1	n/a	n/a	1,733 (0.75 %)	53,820 (26.95 %)	n/a	59.26 (98.59 %)	27,249 (1.11 %)	27,249 (1.11 %)	251,731 (98.89 %)	172,256 (6.77 %)	109,137 (3.47 %)	864,501 (23.70 %)	1,222 (0.15 %)	n/a	50,750 (70.48 %)	25,517 (21.78 %)
14	A.quina (2015) GCA_000826445.1	n/a	n/a	1,637 (1.14 %)	38,294 (33.16 %)	n/a	59.17 (99.56 %)	6,444 (0.32 %)	6,444 (0.32 %)	66,934 (99.68 %)	118,918 (6.74 %)	77,252 (3.58 %)	638,511 (23.84 %)	174 (0.03 %)	7,801 (0.86 %)	24,029 (85.30 %)	11,701 (18.55 %)
15	A.rhysodes (2015) GCA_000826385.1	n/a	n/a	1,631 (1.21 %)	33,083 (30.62 %)	n/a	57.92 (99.07 %)	14,831 (0.83 %)	14,831 (0.83 %)	77,667 (99.17 %)	98,643 (6.13 %)	55,443 (3.28 %)	554,240 (22.69 %)	538 (0.11 %)	10,133 (1.04 %)	26,001 (81.03 %)	13,140 (17.80 %)
16	A.royreba (2015) GCA_000826365.1	n/a	n/a	2,114 (1.61 %)	18,250 (26.85 %)	n/a	51.25 (99.75 %)	4,659 (0.21 %)	4,659 (0.21 %)	28,757 (99.79 %)	37,613 (2.32 %)	18,581 (1.18 %)	410,854 (13.70 %)	128 (0.02 %)	6,149 (0.67 %)	18,414 (68.14 %)	17,964 (15.85 %)
17	A.sp. (SK_2022a 2023) GCA_027943295.1	n/a	n/a	1,114 (1.48 %)	15,005 (39.74 %)	n/a	57.44 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	2,108 (100.00 %)	41,945 (5.08 %)	27,615 (3.96 %)	292,024 (19.84 %)	0 (0 %)	9,506 (1.47 %)	2,663 (91.18 %)	1,641 (9.99 %)
18	A.sp. (SK_2022b 2023) GCA_027943245.1	n/a	n/a	1,149 (1.42 %)	16,030 (40.87 %)	n/a	57.80 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1,790 (100.00 %)	43,850 (5.03 %)	29,567 (4.14 %)	325,638 (20.70 %)	0 (0 %)	11,095 (1.54 %)	2,296 (91.76 %)	1,560 (8.62 %)
19	A.sp. (SK_2022c 2023) GCA_027944975.1	n/a	n/a	276 (0.73 %)	11,621 (33.84 %)	n/a	60.50 (99.74 %)	0 (0 %)	n/a	20,778 (100.00 %)	13,194 (3.62 %)	5,345 (1.28 %)	111,466 (18.15 %)	0 (0 %)	231 (0.11 %)	19,231 (82.88 %)	12,603 (39.91 %)
20	Abiotrophia defectiva (FDAARGOS_785 2020) GCF_013267415.1	n/a	1,896 (89.97 %)	n/a	n/a	n/a	47.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	133 (2.06 %)	5,709 (4.82 %)	0 (0 %)	263 (0.99 %)	338 (10.11 %)	258 (6.81 %)
21	Achromobacter xylosoxidans (FDAARGOS_1091 2021) GCF_016728825.1	n/a	6,446 (90.68 %)	n/a	n/a	n/a	67.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	450 (0.41 %)	70,682 (29.79 %)	0 (0 %)	174 (0.29 %)	1 (99.91 %)	0 (0.00 %)
22	Acinetobacter baumannii (ATCC 19606 2019) GCF_009035845.1	n/a	3,831 (88.49 %)	n/a	n/a	n/a	39.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	119 (0.62 %)	22,483 (11.42 %)	0 (0 %)	154 (0.32 %)	50 (1.20 %)	43 (1.13 %)
23	Actinomyces israelii (F0345 2023) GCF_030253495.1	n/a	3,340 (85.50 %)	n/a	n/a	n/a	71.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	748 (1.07 %)	39,387 (26.92 %)	0 (0 %)	421 (1.22 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
24	Adeno-associated virus - 1 (2000) GCF_000863065.1	n/a	2 (86.54 %)	n/a	n/a	n/a	56.52 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (2.86 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	1 (5.30 %)	1 (71.49 %)	1 (68.82 %)
25	Adeno-associated virus - 3 (3H 2000) GCF_000841585.1	n/a	2 (86.46 %)	n/a	n/a	n/a	53.88 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.70 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	1 (5.29 %)	1 (53.20 %)	1 (53.20 %)
26	Adeno-associated virus - 4 (ATCC VR-646 2000) GCF_000836885.1	n/a	2 (85.53 %)	n/a	n/a	n/a	57.46 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	1 (4.70 %)	2 (74.41 %)	2 (74.41 %)
27	Adeno-associated virus - 7 (2004) GCF_000845645.1	n/a	2 (86.55 %)	n/a	n/a	n/a	57.33 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	1 (5.30 %)	1 (70.20 %)	1 (70.20 %)
28	Adeno-associated virus - 8 (2004) GCF_000846525.1	n/a	2 (93.22 %)	n/a	n/a	n/a	57.06 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.84 %)	n/a	2 (0.32 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (63.24 %)	1 (63.24 %)
29	adeno-associated virus 2 (1993) GCF_000838645.1	n/a	14 (89.01 %)	n/a	n/a	n/a	53.80 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (3.18 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	1 (5.34 %)	1 (54.43 %)	1 (53.94 %)
30	adeno-associated virus 5 (2004) GCF_000846385.1	n/a	2 (86.34 %)	n/a	n/a	n/a	55.15 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (2.65 %)	n/a	4 (0.60 %)	0 (0 %)	1 (5.90 %)	2 (79.06 %)	2 (55.02 %)
31	Adult diarrheal rotavirus strain J19 (J19 2005) GCF_000864245.1	n/a	11 (95.04 %)	n/a	n/a	n/a	33.42 (99.83 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.20 %)	37 (2.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
32	Aerococcus urinae (CCUG 36881 2016) GCF_001543175.1	n/a	1,805 (87.66 %)	n/a	n/a	n/a	42.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	71 (1.21 %)	8,774 (8.25 %)	0 (0 %)	167 (0.82 %)	125 (3.97 %)	93 (3.00 %)
33	Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila (ATCC 7966 2006) GCF_000014805.1	n/a	4,354 (88.57 %)	n/a	n/a	n/a	61.55 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	155 (0.74 %)	38,147 (17.15 %)	0 (0 %)	266 (0.44 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
34	African eye worm (CAT 2014) GCA_000733445.1	n/a	n/a	2,766 (2.21 %)	3,017 (5.46 %)	n/a	30.83 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,250 (100.00 %)	84,294 (5.42 %)	55,547 (4.83 %)	740,054 (33.11 %)	0 (0 %)	27,206 (2.56 %)	233 (0.08 %)	187 (0.06 %)
35	African malaria mosquito (FUMOZ 2018) GCA_003951495.1	n/a	n/a	8,789 (2.01 %)	55,502 (14.58 %)	n/a	41.17 (99.99 %)	0 (0 %)	757 (0.01 %)	9,175 (100.00 %)	205,777 (6.06 %)	189,636 (11.11 %)	2,023,304 (29.26 %)	0 (0 %)	402,308 (6.67 %)	42,752 (8.33 %)	32,197 (4.22 %)
36	African malaria mosquito (PEST 2006) GCF_000005575.2	14,283 (8.94 %)	n/a	5,499 (2.34 %)	30,483 (13.88 %)	n/a	44.27 (95.26 %)	55 (0.21 %)	8,735 (4.74 %)	8,116 (99.79 %)	240,705 (14.38 %)	72,709 (2.39 %)	1,435,172 (21.28 %)	6 (0.01 %)	77,558 (3.59 %)	25,507 (8.25 %)	24,149 (5.87 %)
37	African malaria mosquito (primary hap DQ-416_04 2022) GCF_943734845.2	28,509 (18.56 %)	n/a	5,391 (2.35 %)	26,924 (13.80 %)	n/a	41.73 (100.00 %)	0 (0 %)	19 (0.00 %)	330 (100.00 %)	98,293 (2.81 %)	66,927 (15.73 %)	1,163,100 (34.06 %)	0 (0 %)	203,726 (6.69 %)	21,535 (10.89 %)	16,154 (3.83 %)
38	African malaria mosquito (primary hap NW_F1_1 2022) GCF_943734735.2	33,238 (17.23 %)	n/a	5,453 (2.24 %)	28,990 (13.73 %)	n/a	44.39 (99.99 %)	0 (0 %)	41 (0.01 %)	191 (100.00 %)	172,532 (3.40 %)	82,247 (7.35 %)	1,285,970 (26.71 %)	0 (0 %)	111,125 (5.14 %)	19,578 (8.00 %)	21,712 (5.55 %)
39	African malaria mosquito (S 2008) GCA_000150785.1	n/a	n/a	5,318 (2.53 %)	28,251 (13.08 %)	n/a	44.33 (96.47 %)	12,016 (3.54 %)	12,016 (3.54 %)	25,058 (96.46 %)	215,345 (10.71 %)	56,060 (1.42 %)	1,404,343 (20.91 %)	5 (0.00 %)	44,026 (2.39 %)	24,799 (8.82 %)	22,030 (5.75 %)
40	African swine fever virus (26544/OG10 2019) GCF_003032925.1	n/a	164 (88.73 %)	n/a	n/a	n/a	38.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.58 %)	59 (1.70 %)	1,341 (13.78 %)	0 (0 %)	18 (0.90 %)	17 (3.41 %)	16 (3.04 %)
41	African swine fever virus (47/Ss/2008 2019) GCF_003033005.1	n/a	235 (88.78 %)	n/a	n/a	n/a	38.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	27 (0.61 %)	59 (2.29 %)	1,387 (14.30 %)	0 (0 %)	39 (1.39 %)	17 (3.38 %)	16 (3.01 %)
42	African swine fever virus (ASFV Georgia 2007/1 2020) GCF_003047755.2	n/a	195 (89.23 %)	n/a	n/a	n/a	38.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	19 (0.33 %)	54 (1.73 %)	1,342 (13.47 %)	0 (0 %)	48 (1.63 %)	16 (3.41 %)	17 (3.23 %)
43	African swine fever virus (BA71 2019) GCF_003032875.1	n/a	161 (89.06 %)	n/a	n/a	n/a	38.81 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.57 %)	61 (2.86 %)	1,343 (14.57 %)	0 (0 %)	37 (1.30 %)	17 (3.46 %)	15 (2.95 %)
44	African swine fever virus (BA71V 2014) GCF_000858485.1	n/a	152 (88.20 %)	n/a	n/a	n/a	38.95 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.57 %)	55 (3.36 %)	1,176 (14.34 %)	0 (0 %)	38 (1.07 %)	17 (3.67 %)	15 (3.13 %)
45	African swine fever virus (Benin 97/1 2019) GCF_003047675.1	n/a	156 (88.61 %)	n/a	n/a	n/a	38.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.59 %)	59 (1.90 %)	1,380 (14.38 %)	0 (0 %)	22 (0.97 %)	17 (3.44 %)	17 (3.20 %)
46	African swine fever virus (E75 2019) GCF_003047715.1	n/a	171 (86.69 %)	n/a	n/a	n/a	38.66 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	2 (100.00 %)	25 (0.59 %)	56 (1.72 %)	1,332 (13.80 %)	0 (0 %)	19 (0.96 %)	17 (3.44 %)	17 (3.40 %)
47	African swine fever virus (Ken05/Tk1 2019) GCF_003032905.1	n/a	168 (88.02 %)	n/a	n/a	n/a	38.25 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	17 (0.33 %)	73 (2.13 %)	1,263 (12.68 %)	0 (0 %)	40 (1.75 %)	12 (2.54 %)	14 (3.05 %)
48	African swine fever virus (Ken06.Bus 2019) GCF_003032915.1	n/a	161 (87.27 %)	n/a	n/a	n/a	38.53 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	20 (0.43 %)	82 (2.27 %)	1,244 (12.87 %)	0 (0 %)	24 (0.85 %)	11 (3.08 %)	11 (3.32 %)
49	African swine fever virus (L60 2019) GCF_003032865.1	n/a	163 (89.33 %)	n/a	n/a	n/a	38.61 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.58 %)	57 (1.89 %)	1,368 (14.10 %)	0 (0 %)	19 (0.96 %)	17 (3.42 %)	15 (2.92 %)
50	African swine fever virus (NHV 2019) GCF_003032885.1	n/a	158 (89.62 %)	n/a	n/a	n/a	38.87 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	24 (0.59 %)	53 (2.09 %)	1,299 (14.32 %)	0 (0 %)	24 (1.18 %)	18 (3.77 %)	17 (3.37 %)
51	African swine fever virus (OURT 88/3 2019) GCF_003047695.1	n/a	157 (89.68 %)	n/a	n/a	n/a	38.86 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	24 (0.59 %)	49 (1.75 %)	1,293 (14.30 %)	0 (0 %)	23 (1.12 %)	18 (3.78 %)	17 (3.38 %)
52	Aichi virus 1 (A846/88 1998) GCF_000861885.1	n/a	1 (88.50 %)	n/a	n/a	n/a	58.90 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.09 %)	n/a	8 (2.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (81.27 %)	1 (81.27 %)
53	Aigai virus (AP92 2023) GCF_018594555.1	n/a	3 (95.48 %)	n/a	n/a	n/a	44.05 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	20 (1.33 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
54	Akhmeta virus (Akhmeta_2013-88 2021) GCF_006452035.1	n/a	220 (91.30 %)	n/a	n/a	n/a	33.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	46 (0.98 %)	34 (1.69 %)	1,169 (9.68 %)	0 (0 %)	3 (0.08 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
55	Alcaligenes faecalis (ZD02 2015) GCF_000967305.2	n/a	3,869 (89.39 %)	n/a	n/a	n/a	56.83 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	3 (100.00 %)	n/a	135 (0.35 %)	21,829 (9.27 %)	0 (0 %)	137 (0.17 %)	2 (100.00 %)	2 (100.00 %)
56	Alenquer virus (2021) GCF_013086385.1	n/a	4 (95.09 %)	n/a	n/a	n/a	39.86 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.29 %)	13 (1.66 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
57	Alkhumra hemorrhagic fever virus (Zaki #2 2012) GCA_031116565.1	n/a	1 (95.14 %)	n/a	n/a	n/a	54.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.40 %)	n/a	2 (0.13 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
58	Alphapapillomavirus 12 (2000) GCF_000836865.1	n/a	8 (86.97 %)	n/a	n/a	n/a	48.06 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.36 %)	1 (0.51 %)	13 (3.72 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.50 %)	0 (0.00 %)
59	Alphapapillomavirus 3 (2000) GCF_000862805.1	n/a	7 (82.89 %)	n/a	n/a	n/a	46.32 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.79 %)	1 (0.95 %)	16 (5.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
60	Alphapapillomavirus 4 (1991) GCF_000864945.1	n/a	7 (86.62 %)	n/a	n/a	n/a	48.40 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.34 %)	1 (0.50 %)	7 (2.05 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
61	American malaria mosquito (2013) GCA_000211455.3	n/a	10,793 (13.27 %)	5,132 (3.99 %)	20,580 (17.21 %)	n/a	48.31 (99.99 %)	3,727 (0.02 %)	3,727 (0.02 %)	5,947 (99.98 %)	133,596 (3.49 %)	32,043 (0.88 %)	842,313 (17.27 %)	4 (0.00 %)	4,533 (0.36 %)	3,894 (25.87 %)	6,587 (2.36 %)
62	American malaria mosquito (primary hap 2022) GCF_943734745.1	21,545 (19.01 %)	n/a	5,232 (3.14 %)	21,409 (14.46 %)	21,330 (15.71 %)	48.07 (99.99 %)	0 (0 %)	30 (0.01 %)	66 (100.00 %)	207,981 (4.75 %)	60,117 (2.88 %)	1,063,030 (20.83 %)	0 (0 %)	32,067 (2.41 %)	264 (8.42 %)	7,846 (2.10 %)
63	American rat lungworm (Costa Rica 2018) GCA_900624975.1	n/a	13,417 (5.07 %)	4,599 (1.45 %)	12,731 (4.92 %)	n/a	41.24 (99.72 %)	4,869 (0.28 %)	4,869 (0.28 %)	11,253 (99.72 %)	47,104 (0.94 %)	30,490 (1.26 %)	1,443,224 (29.61 %)	846 (0.22 %)	33,906 (1.53 %)	16,508 (2.03 %)	3,663 (0.44 %)
64	Anaplasma phagocytophilum str. (Webster 2015) GCF_000964685.1	n/a	1,190 (71.26 %)	n/a	n/a	n/a	41.64 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	107 (2.61 %)	2,352 (6.01 %)	0 (0 %)	513 (4.27 %)	25 (0.59 %)	17 (0.40 %)
65	Anelloviridae sp. (ctbb016 2023) GCF_004286455.1	n/a	2 (74.06 %)	n/a	n/a	n/a	37.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.56 %)	11 (7.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
66	Anelloviridae sp. (ctbc019 2023) GCF_004285675.1	n/a	2 (81.37 %)	n/a	n/a	n/a	36.92 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (6.97 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
67	Anelloviridae sp. (ctbd020 2023) GCF_004286695.1	n/a	2 (84.88 %)	n/a	n/a	n/a	37.93 (99.87 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.35 %)	7 (5.11 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
68	Anelloviridae sp. (ctbf014 2023) GCF_004286755.1	n/a	3 (79.12 %)	n/a	n/a	n/a	35.76 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (8.44 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
69	Anelloviridae sp. (ctbf050 2023) GCF_004285795.1	n/a	3 (82.06 %)	n/a	n/a	n/a	37.83 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (12.62 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
70	Anelloviridae sp. (ctbg056 2023) GCF_004285195.1	n/a	4 (89.12 %)	n/a	n/a	n/a	35.92 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.64 %)	1 (1.13 %)	19 (15.20 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
71	Anelloviridae sp. (ctbi042 2023) GCF_004286375.1	n/a	1 (85.84 %)	n/a	n/a	n/a	32.36 (99.77 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (9.17 %)	0 (0 %)	1 (14.56 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
72	Anelloviridae sp. (ctcd026 2023) GCF_004287315.1	n/a	2 (80.01 %)	n/a	n/a	n/a	37.81 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (4.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
73	Anelloviridae sp. (ctcf040 2023) GCF_004287355.1	n/a	2 (84.67 %)	n/a	n/a	n/a	35.84 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.18 %)	n/a	9 (5.57 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
74	Anelloviridae sp. (ctea38 2023) GCF_004287275.1	n/a	3 (79.81 %)	n/a	n/a	n/a	36.34 (99.85 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (6.46 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
75	Anelloviridae sp. (ctei055 2023) GCF_004286855.1	n/a	2 (66.81 %)	n/a	n/a	n/a	34.97 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.20 %)	n/a	9 (13.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
76	Anelloviridae sp. (ctga035 2023) GCF_004286675.1	n/a	2 (74.70 %)	n/a	n/a	n/a	37.19 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.54 %)	1 (2.52 %)	3 (4.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
77	Anelloviridae sp. (vzttmv5 2023) GCF_006370125.1	n/a	2 (74.68 %)	n/a	n/a	n/a	39.93 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.75 %)	1 (3.25 %)	9 (7.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
78	Angomonas (Crithidia deanei Carvalho ATCC PRA-265 2020) GCA_903995115.1	n/a	10,512 (61.62 %)	632 (1.86 %)	2,105 (60.05 %)	n/a	49.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	29 (100.00 %)	19,588 (4.09 %)	5,110 (5.53 %)	104,027 (19.32 %)	0 (0 %)	14,434 (6.93 %)	177 (47.12 %)	518 (1.93 %)
79	Anjozorobe virus (Anjozorobe/Em/MDG/2009/ATD49 2017) GCF_002145785.1	n/a	3 (93.60 %)	n/a	n/a	n/a	37.87 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (0.78 %)	1 (0.36 %)	16 (2.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
80	apicomplexans B.besnoiti (Bb-Ger1 2017) GCF_002563875.1	8,205 (34.85 %)	n/a	484 (0.50 %)	6,772 (17.05 %)	n/a	56.97 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	186 (100.00 %)	20,634 (1.95 %)	8,531 (1.19 %)	342,298 (18.11 %)	0 (0 %)	7,667 (2.25 %)	39 (97.59 %)	20 (0.20 %)
81	apicomplexans B.bigemina (BOND 2014) GCA_000723445.1	n/a	n/a	415 (1.89 %)	4,007 (57.26 %)	n/a	50.63 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	483 (100.00 %)	900 (0.51 %)	4,217 (8.52 %)	22,237 (14.14 %)	0 (0 %)	17,475 (6.16 %)	780 (73.55 %)	317 (41.77 %)
82	apicomplexans B.bovis (T2Bo 2021) GCF_000165395.2	3,977 (78.96 %)	n/a	416 (3.20 %)	1,538 (48.40 %)	n/a	41.60 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	8 (100.00 %)	483 (0.30 %)	584 (1.35 %)	20,756 (7.55 %)	0 (0 %)	2,251 (3.34 %)	353 (2.45 %)	312 (2.16 %)
83	apicomplexans B.caballi (USDA-D6B2 2022) GCF_024862765.1	5,882 (60.56 %)	n/a	410 (2.01 %)	3,937 (51.06 %)	n/a	53.63 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	937 (0.41 %)	495 (2.95 %)	35,939 (9.65 %)	0 (0 %)	3,690 (5.43 %)	25 (99.49 %)	61 (14.17 %)
84	apicomplexans B.divergens (1802A 2021) GCA_018398725.1	n/a	4,094 (68.53 %)	399 (2.89 %)	2,014 (49.92 %)	n/a	45.55 (93.04 %)	0 (0 %)	363 (6.98 %)	80 (100.00 %)	489 (0.24 %)	556 (0.64 %)	14,444 (8.55 %)	0 (0 %)	2,683 (2.03 %)	1,044 (9.51 %)	979 (8.88 %)
85	apicomplexans B.divergens (Rouen 1987 2018) GCA_001077455.2	n/a	n/a	399 (2.89 %)	2,035 (49.54 %)	n/a	45.54 (93.40 %)	0 (0 %)	331 (6.61 %)	141 (100.00 %)	472 (0.28 %)	591 (1.33 %)	15,479 (8.15 %)	67 (0.77 %)	2,771 (3.38 %)	1,069 (9.49 %)	1,008 (8.60 %)
86	apicomplexans B.duncani (WA1 2022) GCA_024586265.1	n/a	n/a	372 (3.06 %)	684 (29.00 %)	n/a	37.68 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	8 (100.00 %)	930 (0.61 %)	3,318 (5.06 %)	32,730 (15.45 %)	0 (0 %)	9,417 (10.53 %)	194 (1.60 %)	184 (1.42 %)
87	apicomplexans B.duncani (WA1 2023) GCF_028658345.1	4,165 (60.31 %)	n/a	452 (2.79 %)	1,251 (32.75 %)	n/a	37.32 (99.66 %)	0 (0 %)	11 (0.34 %)	165 (100.00 %)	1,631 (0.88 %)	8,728 (8.70 %)	26,007 (21.34 %)	0 (0 %)	21,429 (15.57 %)	232 (1.44 %)	231 (1.30 %)
88	apicomplexans B.microti (ATCC 30222 2016) GCA_001650055.1	n/a	n/a	361 (3.44 %)	295 (15.85 %)	n/a	36.49 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	234 (100.00 %)	1,012 (0.82 %)	442 (0.52 %)	40,500 (14.71 %)	0 (0 %)	136 (0.21 %)	109 (2.71 %)	111 (2.65 %)
89	apicomplexans B.microti (ATCC PRA-99 2016) GCA_001650065.1	n/a	n/a	353 (3.49 %)	279 (16.42 %)	n/a	36.25 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	82 (100.00 %)	n/a	311 (0.28 %)	38,135 (14.34 %)	0 (0 %)	103 (0.25 %)	104 (2.79 %)	106 (2.74 %)
90	apicomplexans B.microti (GI 2016) GCA_001650105.1	n/a	n/a	387 (3.52 %)	327 (15.97 %)	n/a	36.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	140 (100.00 %)	1,043 (0.79 %)	351 (0.40 %)	41,543 (14.46 %)	0 (0 %)	147 (0.16 %)	109 (2.61 %)	112 (2.56 %)
91	apicomplexans B.microti (GreenwichYale_Lab_strain_1 2016) GCA_001650075.1	n/a	n/a	380 (3.52 %)	330 (16.55 %)	n/a	36.30 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	250 (100.00 %)	976 (0.83 %)	379 (0.62 %)	41,395 (14.65 %)	0 (0 %)	182 (0.40 %)	115 (2.88 %)	119 (2.82 %)
92	apicomplexans B.microti (Nan_Hs_2011_N11-50 2016) GCA_001650145.1	n/a	n/a	353 (3.50 %)	325 (16.55 %)	n/a	36.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	131 (100.00 %)	n/a	293 (0.31 %)	38,133 (14.12 %)	0 (0 %)	111 (0.23 %)	108 (2.82 %)	110 (2.77 %)
93	apicomplexans B.microti (Naushon 2016) GCA_001650135.1	n/a	n/a	359 (3.46 %)	311 (16.37 %)	n/a	36.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	131 (100.00 %)	n/a	313 (0.34 %)	38,478 (14.13 %)	0 (0 %)	118 (0.19 %)	108 (2.76 %)	110 (2.71 %)
94	apicomplexans B.microti strain (RI 2015) GCF_000691945.2	40 (0.60 %)	n/a	355 (3.53 %)	253 (16.62 %)	n/a	36.17 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	6 (100.00 %)	959 (0.87 %)	421 (0.63 %)	38,121 (14.53 %)	0 (0 %)	257 (0.77 %)	105 (2.82 %)	107 (2.76 %)
95	apicomplexans B.ovata (Miyake 2017) GCF_002897235.1	5,044 (64.42 %)	n/a	423 (1.86 %)	3,477 (57.21 %)	n/a	49.27 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	91 (100.00 %)	1,706 (2.04 %)	2,951 (3.17 %)	26,139 (9.76 %)	0 (0 %)	11,536 (6.87 %)	591 (51.43 %)	384 (2.89 %)
96	apicomplexans B.ovis (Selcuk 2022) GCA_023705535.2	n/a	10,796 (68.42 %)	416 (3.45 %)	1,853 (52.51 %)	n/a	43.92 (99.85 %)	11 (0.15 %)	11 (0.15 %)	52 (99.85 %)	374 (0.22 %)	806 (1.05 %)	14,901 (4.80 %)	0 (0 %)	1,083 (2.04 %)	937 (5.84 %)	873 (5.37 %)
97	apicomplexans B.sp. (Xinjiang 2017) GCF_002095265.1	3,066 (62.82 %)	n/a	437 (3.36 %)	1,866 (51.46 %)	n/a	43.87 (99.41 %)	0 (0 %)	83 (0.59 %)	215 (100.00 %)	473 (0.32 %)	359 (0.91 %)	17,935 (5.63 %)	3 (0.01 %)	1,293 (1.20 %)	633 (2.99 %)	591 (2.52 %)
98	apicomplexans C.andersoni (30847 2016) GCF_001865355.1	3,876 (73.99 %)	n/a	413 (2.96 %)	111 (4.69 %)	n/a	28.47 (99.95 %)	84 (0.05 %)	84 (0.05 %)	219 (99.95 %)	3,178 (1.65 %)	978 (0.50 %)	76,825 (24.91 %)	0 (0 %)	108 (0.08 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
99	apicomplexans C.baileyi (TAMU-09Q1 2016) GCA_001593455.1	n/a	n/a	385 (2.84 %)	88 (2.79 %)	n/a	24.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	145 (100.00 %)	6,740 (4.56 %)	4,996 (3.08 %)	80,066 (42.14 %)	0 (0 %)	921 (0.62 %)	7 (0.03 %)	7 (0.03 %)
100	apicomplexans C.bovis (45015 2021) GCF_009768925.1	3,722 (74.71 %)	n/a	395 (2.74 %)	115 (4.79 %)	n/a	30.73 (100.00 %)	22 (0.00 %)	22 (0.00 %)	77 (100.00 %)	3,088 (1.80 %)	902 (0.64 %)	79,565 (23.52 %)	0 (0 %)	374 (0.27 %)	7 (0.02 %)	5 (0.02 %)
101	apicomplexans C.cayetanensis (CHN_HEN01 2016) GCF_000769155.1	7,153 (25.53 %)	n/a	420 (0.58 %)	2,185 (6.53 %)	n/a	51.84 (99.84 %)	0 (0 %)	1,901 (0.17 %)	2,297 (100.00 %)	27,499 (4.31 %)	23,058 (3.40 %)	250,567 (17.82 %)	1 (0.00 %)	7,464 (1.03 %)	11,365 (41.73 %)	7,595 (8.44 %)
102	apicomplexans C.cayetanensis (NF1_C8 2018) GCF_002999335.1	5,822 (25.10 %)	n/a	415 (0.56 %)	1,716 (6.41 %)	n/a	51.90 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	738 (100.00 %)	28,607 (4.76 %)	26,298 (4.89 %)	252,519 (18.85 %)	0 (0 %)	n/a	10,316 (43.85 %)	7,596 (8.43 %)
103	apicomplexans C.felis (Winnie 2021) GCA_020283715.1	n/a	n/a	320 (2.10 %)	257 (5.72 %)	n/a	31.80 (99.99 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	360 (100.00 %)	4,133 (2.28 %)	1,798 (1.10 %)	74,510 (35.26 %)	0 (0 %)	3,637 (2.48 %)	24 (0.12 %)	13 (0.09 %)
104	apicomplexans C.hominis (2015) GCA_002223825.1	n/a	4,546 (75.21 %)	412 (2.90 %)	118 (8.48 %)	n/a	30.14 (99.91 %)	85 (0.09 %)	85 (0.09 %)	97 (99.91 %)	4,843 (2.82 %)	2,054 (1.14 %)	74,516 (24.77 %)	7 (0.03 %)	496 (0.44 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)
105	apicomplexans C.hominis (30976 2015) GCA_001483515.1	n/a	4,004 (81.05 %)	425 (3.00 %)	132 (8.44 %)	n/a	30.13 (99.98 %)	0 (0 %)	44 (0.02 %)	53 (100.00 %)	4,883 (2.80 %)	2,066 (1.09 %)	74,516 (24.83 %)	0 (0 %)	319 (0.23 %)	3 (0.01 %)	2 (0.01 %)
106	apicomplexans C.hominis (37999 2014) GCA_000804495.1	n/a	n/a	404 (2.85 %)	134 (8.39 %)	n/a	30.14 (99.97 %)	0 (0 %)	97 (0.03 %)	78 (100.00 %)	4,823 (2.75 %)	1,983 (1.05 %)	75,630 (25.10 %)	0 (0 %)	316 (0.21 %)	4 (0.02 %)	4 (0.02 %)
107	apicomplexans C.hominis (TU502 2004 refseq) GCF_000006425.1	3,885 (60.43 %)	n/a	399 (2.92 %)	324 (8.13 %)	n/a	30.92 (99.96 %)	0 (0 %)	1,416 (0.03 %)	1,422 (100.00 %)	4,466 (3.74 %)	2,148 (2.13 %)	70,803 (24.63 %)	0 (0 %)	2,213 (0.93 %)	54 (0.29 %)	39 (0.18 %)
108	apicomplexans C.hominis (TU502_2012 2016) GCA_001593465.1	n/a	3,797 (76.08 %)	422 (2.94 %)	154 (8.37 %)	n/a	30.13 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	119 (100.00 %)	4,970 (2.85 %)	2,252 (1.22 %)	75,251 (25.07 %)	0 (0 %)	443 (0.36 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)
109	apicomplexans C.hominis (UKH1 2016) GCA_001593475.1	n/a	3,769 (75.33 %)	421 (2.94 %)	170 (8.44 %)	n/a	30.13 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	156 (100.00 %)	5,028 (2.82 %)	2,269 (1.22 %)	76,676 (25.30 %)	0 (0 %)	457 (0.37 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)
110	apicomplexans C.meleagridis (UKMEL1 2016) GCA_001593445.1	n/a	3,806 (77.45 %)	418 (3.00 %)	143 (8.92 %)	n/a	30.97 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	57 (100.00 %)	3,491 (2.01 %)	1,365 (0.89 %)	73,826 (23.12 %)	0 (0 %)	489 (0.42 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
111	apicomplexans C.muris (RN66 2008) GCF_000006515.1	3,929 (75.16 %)	n/a	422 (2.92 %)	97 (4.96 %)	n/a	28.48 (99.93 %)	13 (0.07 %)	13 (0.07 %)	97 (99.93 %)	3,260 (2.11 %)	1,176 (0.93 %)	78,474 (25.31 %)	0 (0 %)	429 (0.35 %)	7 (0.09 %)	7 (0.09 %)
112	apicomplexans C.parvum (2021) GCA_019844115.2	n/a	n/a	415 (2.91 %)	116 (8.25 %)	n/a	30.11 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	5,122 (3.09 %)	2,507 (1.52 %)	75,586 (25.36 %)	0 (0 %)	789 (0.61 %)	1 (0.00 %)	0 (0.00 %)
113	apicomplexans C.parvum (Iowa type II 2007) GCF_000165345.1	3,805 (75.13 %)	n/a	407 (2.87 %)	117 (8.60 %)	n/a	30.22 (99.83 %)	10 (0.16 %)	2,090 (0.20 %)	18 (99.84 %)	5,010 (3.02 %)	2,285 (1.40 %)	76,131 (24.82 %)	0 (0 %)	751 (0.54 %)	1 (0.00 %)	0 (0.00 %)
114	apicomplexans C.parvum (IOWA-ATCC 2020) GCA_015245375.1	n/a	4,039 (77.25 %)	416 (2.96 %)	119 (8.46 %)	n/a	30.18 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	5,023 (2.87 %)	2,359 (1.42 %)	74,905 (25.05 %)	0 (0 %)	760 (0.57 %)	1 (0.00 %)	0 (0.00 %)
115	apicomplexans C.ryanae (45019 2022) GCF_009792415.1	3,709 (74.42 %)	n/a	398 (2.79 %)	290 (11.44 %)	n/a	32.91 (99.99 %)	39 (0.00 %)	39 (0.00 %)	132 (100.00 %)	2,595 (1.40 %)	790 (0.54 %)	71,448 (21.62 %)	0 (0 %)	361 (0.26 %)	151 (2.66 %)	135 (2.41 %)
116	apicomplexans C.sp. (chipmunk LX-2015 2015) GCA_000831705.1	n/a	n/a	426 (2.83 %)	240 (11.12 %)	n/a	31.92 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	853 (100.00 %)	3,156 (1.69 %)	1,298 (0.62 %)	73,150 (21.29 %)	0 (0 %)	112 (0.08 %)	3 (0.01 %)	3 (0.01 %)
117	apicomplexans C.sp. chipmunk genotype I (37763 2021 refseq) GCF_004936735.1	3,783 (76.65 %)	n/a	426 (3.03 %)	203 (12.39 %)	n/a	32.03 (100.00 %)	10 (0.00 %)	10 (0.00 %)	60 (100.00 %)	3,358 (1.88 %)	1,257 (0.81 %)	67,711 (20.74 %)	1 (0.00 %)	458 (0.29 %)	4 (0.02 %)	3 (0.01 %)
118	apicomplexans C.suis (Wien I 2017) GCF_002600585.1	11,451 (42.20 %)	n/a	437 (0.32 %)	6,674 (10.32 %)	n/a	49.38 (97.03 %)	11,195 (2.99 %)	11,195 (2.99 %)	25,822 (97.01 %)	96,259 (6.79 %)	37,667 (1.79 %)	541,349 (24.20 %)	4 (0.00 %)	3,158 (0.25 %)	10,990 (47.75 %)	7,593 (34.58 %)
119	apicomplexans C.tyzzeri (UGA55 2019) GCA_007210665.1	n/a	4,033 (78.43 %)	386 (2.83 %)	113 (8.17 %)	n/a	30.25 (99.14 %)	0 (0 %)	320 (0.87 %)	11 (100.00 %)	4,324 (2.54 %)	1,735 (1.11 %)	73,592 (23.84 %)	2 (0.04 %)	454 (0.58 %)	2 (0.00 %)	1 (0.00 %)
120	apicomplexans C.ubiquitum (39726 2016) GCF_001865345.1	3,766 (77.31 %)	n/a	415 (2.99 %)	126 (8.43 %)	n/a	30.82 (99.98 %)	0 (0 %)	27 (0.02 %)	39 (100.00 %)	3,710 (2.17 %)	1,603 (0.88 %)	72,263 (23.08 %)	0 (0 %)	223 (0.17 %)	2 (0.01 %)	1 (0.00 %)
121	apicomplexans E.acervulina (Houghton 2013) GCF_000499425.1	6,867 (30.24 %)	n/a	316 (0.41 %)	1,762 (4.01 %)	n/a	48.36 (99.66 %)	1,532 (0.33 %)	1,532 (0.33 %)	4,947 (99.67 %)	124,880 (21.30 %)	179,542 (19.28 %)	326,783 (47.38 %)	204 (0.20 %)	37,360 (4.27 %)	7,324 (13.55 %)	4,413 (6.02 %)
122	apicomplexans E.brunetti (Houghton 2013) GCA_000499725.1	n/a	38,726 (22.02 %)	290 (0.26 %)	2,273 (3.57 %)	n/a	47.93 (97.28 %)	16,072 (2.79 %)	19,411 (2.79 %)	24,647 (97.21 %)	190,255 (23.51 %)	256,061 (22.79 %)	382,230 (45.31 %)	2,761 (0.69 %)	106,686 (7.99 %)	11,443 (16.15 %)	7,861 (7.42 %)
123	apicomplexans E.falciformis (Bayer Haberkorn 1970 2017) GCA_002271815.1	n/a	n/a	401 (0.60 %)	1,434 (6.00 %)	n/a	49.87 (95.41 %)	0 (0 %)	8,445 (4.67 %)	753 (100.00 %)	69,030 (11.22 %)	72,979 (8.19 %)	322,218 (30.13 %)	0 (0 %)	18,137 (2.67 %)	7,765 (9.66 %)	3,077 (3.13 %)
124	apicomplexans E.maxima (Weybridge 2013) GCF_000499605.1	6,057 (26.37 %)	n/a	277 (0.34 %)	1,593 (4.05 %)	n/a	46.62 (99.77 %)	1,006 (0.22 %)	1,006 (0.22 %)	4,570 (99.78 %)	145,987 (20.99 %)	176,594 (16.90 %)	282,728 (42.80 %)	31 (0.01 %)	50,796 (5.16 %)	8,085 (10.99 %)	4,776 (4.95 %)
125	apicomplexans E.mitis (Houghton 2013) GCF_000499745.2	10,073 (20.15 %)	n/a	272 (0.21 %)	2,857 (3.41 %)	n/a	47.63 (92.84 %)	49,632 (7.39 %)	56,820 (7.40 %)	65,610 (92.61 %)	234,410 (25.86 %)	313,495 (23.68 %)	426,125 (44.19 %)	7,368 (1.70 %)	170,431 (15.18 %)	11,982 (15.50 %)	8,127 (7.00 %)
126	apicomplexans E.necatrix (Houghton 2013) GCF_000499385.1	8,607 (25.77 %)	n/a	301 (0.32 %)	2,120 (4.57 %)	n/a	51.06 (99.82 %)	960 (0.17 %)	960 (0.17 %)	4,667 (99.83 %)	130,891 (17.78 %)	173,394 (18.48 %)	326,547 (39.50 %)	31 (0.02 %)	67,947 (6.59 %)	13,422 (18.61 %)	5,149 (4.80 %)
127	apicomplexans E.praecox (Houghton 2013) GCA_000499445.1	n/a	32,062 (19.62 %)	278 (0.25 %)	1,547 (3.10 %)	n/a	45.78 (93.30 %)	32,011 (6.84 %)	34,977 (6.85 %)	53,359 (93.16 %)	200,524 (28.22 %)	258,669 (24.35 %)	351,391 (45.27 %)	1,972 (0.57 %)	n/a	8,122 (8.56 %)	5,940 (5.09 %)
128	apicomplexans E.tenella (2021) GCA_905310635.1	n/a	n/a	348 (0.37 %)	1,379 (5.08 %)	n/a	51.64 (99.94 %)	0 (0 %)	46 (0.06 %)	17 (100.00 %)	127,196 (15.88 %)	159,072 (19.48 %)	323,290 (38.43 %)	0 (0 %)	50,746 (8.17 %)	11,996 (24.60 %)	4,776 (5.84 %)
129	apicomplexans E.tenella (v1 Houghton 2013) GCF_000499545.1	8,603 (25.50 %)	n/a	326 (0.37 %)	1,629 (4.94 %)	n/a	51.33 (98.72 %)	8,063 (1.32 %)	8,063 (1.32 %)	12,727 (98.68 %)	127,858 (17.49 %)	148,397 (16.77 %)	326,694 (37.33 %)	20 (0.03 %)	37,724 (6.57 %)	12,417 (22.22 %)	4,790 (5.71 %)
130	apicomplexans G.niphandrodes (2014) GCF_000223845.1	6,375 (64.29 %)	n/a	413 (1.94 %)	3,821 (61.09 %)	n/a	53.78 (97.41 %)	2,210 (2.65 %)	2,265 (2.65 %)	2,679 (97.35 %)	2,717 (1.38 %)	15,301 (8.28 %)	40,412 (7.16 %)	470 (2.17 %)	7,301 (7.98 %)	525 (94.61 %)	497 (11.93 %)
131	apicomplexans H.hammondi (H.H.34 2014) GCF_000258005.1	7,978 (28.77 %)	n/a	589 (0.50 %)	14,703 (19.30 %)	n/a	53.30 (99.61 %)	1,494 (0.36 %)	1,537 (0.36 %)	16,355 (99.64 %)	29,410 (2.93 %)	20,872 (1.52 %)	392,316 (16.84 %)	329 (0.23 %)	4,214 (0.79 %)	12,464 (97.54 %)	12,161 (7.97 %)
132	apicomplexans H.sp. ex Piliocolobus tephrosceles (2020) GCA_902459845.2	n/a	12,314 (52.96 %)	252 (0.73 %)	292 (0.82 %)	n/a	22.04 (99.68 %)	0 (0 %)	981 (0.31 %)	2,441 (100.00 %)	70,998 (18.90 %)	62,735 (15.57 %)	198,247 (62.62 %)	34 (0.04 %)	15,385 (4.12 %)	9 (0.01 %)	3 (0.00 %)
133	apicomplexans H.tartakovskyi (SISKIN1 2016) GCA_001625125.1	n/a	n/a	305 (0.84 %)	417 (2.09 %)	n/a	25.41 (98.02 %)	0 (0 %)	1,484 (1.97 %)	2,983 (100.00 %)	52,420 (13.46 %)	54,501 (10.60 %)	217,134 (50.60 %)	9 (0.02 %)	5,517 (1.36 %)	1 (0.00 %)	0 (0.00 %)
134	apicomplexans N.caninum (Liverpool 2011) GCF_000208865.1	6,934 (31.00 %)	n/a	505 (0.54 %)	5,949 (17.94 %)	n/a	54.85 (99.96 %)	234 (0.04 %)	234 (0.04 %)	248 (99.96 %)	25,326 (2.56 %)	20,547 (2.34 %)	357,961 (17.53 %)	0 (0 %)	10,335 (1.81 %)	33 (99.94 %)	40 (0.05 %)
135	apicomplexans N.caninum (Liverpool 2020) GCA_016097395.1	n/a	n/a	511 (0.51 %)	6,379 (17.83 %)	n/a	54.80 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	44 (100.00 %)	34,117 (6.78 %)	21,281 (3.75 %)	367,552 (17.22 %)	0 (0 %)	21,061 (3.74 %)	92 (99.69 %)	89 (0.44 %)
136	apicomplexans P.berghei (ANKA 2019) GCF_900002375.2	5,005 (54.68 %)	n/a	268 (0.87 %)	35 (0.68 %)	n/a	22.04 (100.00 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	21 (100.00 %)	25,676 (7.08 %)	8,590 (2.26 %)	207,549 (58.20 %)	0 (0 %)	2,889 (1.22 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
137	apicomplexans P.brasilianum (Bolivian I 2022) GCF_023973825.1	5,755 (38.17 %)	n/a	308 (0.61 %)	177 (2.44 %)	n/a	24.81 (100.00 %)	0 (0 %)	8 (0.00 %)	43 (100.00 %)	65,712 (10.87 %)	46,895 (8.03 %)	300,201 (53.67 %)	1 (0.00 %)	10,424 (1.76 %)	18 (0.01 %)	5 (0.00 %)
138	apicomplexans P.cf. gigantea (A 2021) GCF_019968955.1	8,886 (84.28 %)	n/a	440 (3.05 %)	3,311 (71.34 %)	n/a	54.25 (99.96 %)	11 (0.02 %)	11 (0.02 %)	798 (99.98 %)	405 (0.22 %)	2,456 (2.63 %)	21,706 (4.71 %)	1 (0.00 %)	1,526 (1.39 %)	919 (93.97 %)	942 (88.56 %)
139	apicomplexans P.cf. gigantea (B 2021 refseq) GCF_019968985.1	8,998 (84.24 %)	n/a	440 (3.05 %)	3,521 (73.39 %)	n/a	54.28 (99.95 %)	8 (0.03 %)	8 (0.03 %)	926 (99.97 %)	440 (0.23 %)	2,214 (2.18 %)	17,360 (3.55 %)	0 (0 %)	1,286 (1.22 %)	1,063 (92.98 %)	1,069 (90.06 %)
140	apicomplexans P.chabaudi chabaudi (AS 2019) GCF_900002335.3	5,256 (55.40 %)	n/a	277 (0.86 %)	64 (1.39 %)	n/a	23.62 (100.00 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	16 (100.00 %)	21,778 (5.65 %)	7,979 (2.15 %)	213,315 (54.96 %)	0 (0 %)	2,964 (1.10 %)	6 (0.01 %)	2 (0.00 %)
141	apicomplexans P.coatneyi (Hackeri 2016) GCF_001680005.1	5,531 (42.57 %)	n/a	406 (0.94 %)	1,558 (18.20 %)	n/a	39.65 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	15 (100.00 %)	29,392 (5.30 %)	23,721 (4.55 %)	213,916 (28.46 %)	0 (0 %)	3,593 (0.79 %)	2,186 (2.80 %)	1,332 (1.50 %)
142	apicomplexans P.cynomolgi (M 2017) GCA_900180395.1	n/a	n/a	396 (0.82 %)	1,635 (13.89 %)	n/a	37.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	56 (100.00 %)	36,272 (5.23 %)	43,636 (6.91 %)	233,232 (34.34 %)	0 (0 %)	6,553 (1.27 %)	5,375 (10.24 %)	3,600 (4.53 %)
143	apicomplexans P.cynomolgi strain (B 2012) GCF_000321355.1	5,716 (41.59 %)	n/a	384 (0.94 %)	1,569 (15.59 %)	n/a	40.38 (96.79 %)	1,678 (3.22 %)	1,947 (3.22 %)	3,341 (96.78 %)	23,112 (4.20 %)	36,730 (6.66 %)	202,324 (27.29 %)	1 (0.02 %)	2,628 (0.66 %)	5,330 (11.86 %)	3,267 (4.77 %)
144	apicomplexans P.fragile (nilgiri 2015) GCF_000956335.1	5,645 (51.33 %)	n/a	386 (1.06 %)	1,523 (17.63 %)	n/a	41.21 (88.53 %)	1,522 (11.49 %)	1,522 (11.49 %)	1,770 (88.51 %)	23,189 (3.64 %)	13,060 (2.49 %)	169,337 (21.75 %)	130 (0.96 %)	3,707 (2.93 %)	3,454 (8.27 %)	2,233 (2.94 %)
145	apicomplexans P.gaboni (2021) GCA_900097045.1	n/a	13,869 (56.53 %)	317 (0.91 %)	96 (1.85 %)	n/a	18.61 (99.99 %)	0 (0 %)	11 (0.01 %)	96 (100.00 %)	69,307 (15.62 %)	65,499 (12.27 %)	173,185 (67.97 %)	0 (0 %)	19,860 (4.07 %)	3 (0.00 %)	2 (0.00 %)
146	apicomplexans P.gaboni (SY75 2016) GCF_001602025.1	5,401 (55.97 %)	n/a	301 (0.95 %)	61 (0.93 %)	n/a	18.21 (97.97 %)	0 (0 %)	1,842 (2.06 %)	833 (100.00 %)	64,748 (16.36 %)	60,362 (11.92 %)	166,894 (66.28 %)	23 (0.04 %)	16,890 (3.90 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
147	apicomplexans P.gallinaceum (8A 2016) GCF_900005855.1	5,339 (46.78 %)	n/a	293 (0.79 %)	49 (0.56 %)	n/a	17.82 (95.40 %)	0 (0 %)	1,840 (4.62 %)	154 (100.00 %)	55,576 (11.37 %)	28,854 (5.55 %)	209,490 (64.70 %)	69 (0.21 %)	10,720 (3.31 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)
148	apicomplexans P.inui (San Antonio 1 2014) GCF_000524495.1	5,836 (43.16 %)	n/a	390 (0.98 %)	1,831 (20.82 %)	n/a	42.15 (95.63 %)	1,539 (4.39 %)	1,539 (4.39 %)	1,862 (95.61 %)	16,956 (2.86 %)	16,340 (2.98 %)	179,708 (19.79 %)	83 (0.13 %)	1,304 (0.38 %)	4,850 (8.56 %)	3,324 (4.58 %)
149	apicomplexans P.knowlesi (2017) GCA_900162085.1	n/a	n/a	403 (1.06 %)	1,328 (18.26 %)	n/a	38.59 (99.39 %)	142 (0.61 %)	142 (0.61 %)	158 (99.39 %)	34,528 (7.31 %)	37,035 (10.34 %)	170,262 (31.03 %)	0 (0 %)	17,789 (3.56 %)	1,380 (1.88 %)	731 (0.87 %)
150	apicomplexans P.knowlesi (Malayan Strain Pk1 A 2017) GCA_002140095.1	n/a	5,343 (47.12 %)	394 (1.02 %)	1,312 (17.90 %)	n/a	38.69 (99.99 %)	0 (0 %)	783 (0.01 %)	28 (100.00 %)	35,228 (7.55 %)	40,752 (12.07 %)	168,884 (32.10 %)	0 (0 %)	21,791 (4.27 %)	1,389 (1.86 %)	737 (0.86 %)
151	apicomplexans P.knowlesi strain (H 2020) GCF_000006355.2	5,381 (48.00 %)	n/a	404 (1.07 %)	1,325 (18.29 %)	n/a	38.62 (99.95 %)	0 (0 %)	98 (0.05 %)	164 (100.00 %)	34,274 (7.07 %)	37,725 (10.83 %)	168,555 (31.26 %)	2 (0.00 %)	18,185 (3.57 %)	1,387 (1.88 %)	738 (0.87 %)
152	apicomplexans P.reichenowi (2018) GCA_900097025.1	n/a	14,978 (53.25 %)	303 (0.78 %)	101 (2.60 %)	n/a	19.30 (100.00 %)	0 (0 %)	4 (0.00 %)	48 (100.00 %)	80,435 (17.17 %)	79,163 (14.00 %)	191,442 (66.79 %)	0 (0 %)	30,938 (6.08 %)	13 (0.02 %)	10 (0.02 %)
153	apicomplexans P.reichenowi (CDC 2014) GCF_000723685.1	5,687 (52.82 %)	n/a	308 (0.79 %)	117 (1.94 %)	n/a	19.26 (99.46 %)	1,683 (0.57 %)	2,064 (0.57 %)	2,055 (99.43 %)	78,653 (16.95 %)	76,452 (13.70 %)	191,495 (66.47 %)	208 (0.31 %)	26,114 (5.19 %)	7 (0.01 %)	5 (0.01 %)
154	apicomplexans P.relictum (SGS1 2016) GCF_900005765.1	5,188 (48.26 %)	n/a	302 (0.86 %)	39 (0.36 %)	n/a	18.33 (99.88 %)	0 (0 %)	237 (0.12 %)	514 (100.00 %)	47,871 (10.61 %)	20,292 (4.19 %)	198,607 (67.18 %)	6 (0.05 %)	4,189 (1.45 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)
155	apicomplexans P.sp. DRC-Itaito (2020) GCA_900257145.2	n/a	13,501 (55.64 %)	303 (0.93 %)	64 (1.45 %)	n/a	18.87 (92.67 %)	215 (7.33 %)	215 (7.33 %)	229 (92.67 %)	68,747 (17.67 %)	61,046 (11.90 %)	167,574 (62.09 %)	2 (0.06 %)	22,163 (4.80 %)	14 (0.04 %)	12 (0.03 %)
156	apicomplexans P.sp. gorilla clade G1 (2018) GCA_900095595.1	n/a	16,280 (53.84 %)	306 (0.77 %)	105 (1.92 %)	n/a	19.26 (99.26 %)	0 (0 %)	70 (0.74 %)	53 (100.00 %)	79,672 (16.51 %)	77,832 (12.67 %)	194,536 (66.37 %)	1 (0.04 %)	27,823 (5.27 %)	18 (0.03 %)	13 (0.02 %)
157	apicomplexans P.sp. gorilla clade G2 (2018) GCF_900097015.1	5,428 (55.18 %)	n/a	311 (0.85 %)	92 (1.90 %)	n/a	18.63 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	82 (100.00 %)	70,141 (15.75 %)	65,995 (11.78 %)	179,122 (67.91 %)	0 (0 %)	18,084 (3.62 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)
158	apicomplexans P.sp. gorilla clade G3 (2018) GCA_900097035.1	n/a	14,103 (54.98 %)	314 (0.88 %)	87 (1.41 %)	n/a	18.49 (97.24 %)	0 (0 %)	186 (2.76 %)	97 (100.00 %)	72,561 (17.98 %)	66,711 (13.01 %)	171,619 (66.08 %)	4 (0.03 %)	22,453 (4.81 %)	4 (0.01 %)	2 (0.00 %)
159	apicomplexans P.vinckei (2020) GCA_903994265.1	n/a	14,656 (53.97 %)	269 (0.83 %)	49 (1.35 %)	n/a	23.11 (99.99 %)	0 (0 %)	11 (0.01 %)	16 (100.00 %)	23,585 (6.22 %)	8,018 (2.10 %)	217,968 (55.76 %)	0 (0 %)	4,718 (1.85 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)
160	apicomplexans P.vinckei (vinckei 2014) GCF_000709005.1	4,964 (56.28 %)	n/a	272 (0.91 %)	48 (0.83 %)	n/a	22.89 (98.01 %)	300 (2.00 %)	300 (2.00 %)	349 (98.00 %)	22,075 (6.23 %)	7,844 (1.92 %)	200,685 (55.22 %)	50 (0.05 %)	1,358 (0.57 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
161	apicomplexans P.vinckei brucechwatti (2020) GCA_903994205.1	n/a	14,379 (54.51 %)	275 (0.84 %)	47 (1.08 %)	n/a	23.11 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	16 (100.00 %)	23,577 (6.26 %)	7,763 (2.09 %)	214,765 (55.86 %)	0 (0 %)	4,123 (1.62 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)
162	apicomplexans P.vinckei lentum (2020) GCA_903994225.1	n/a	14,533 (54.36 %)	280 (0.85 %)	48 (1.19 %)	n/a	23.25 (99.99 %)	0 (0 %)	10 (0.01 %)	16 (100.00 %)	22,894 (6.06 %)	7,032 (1.82 %)	217,292 (55.56 %)	0 (0 %)	3,860 (1.53 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)
163	apicomplexans P.vinckei petteri (2020) GCA_903994235.1	n/a	14,582 (54.27 %)	276 (0.85 %)	51 (1.33 %)	n/a	23.15 (100.00 %)	0 (0 %)	5 (0.00 %)	16 (100.00 %)	23,309 (6.16 %)	7,695 (1.99 %)	217,049 (55.64 %)	0 (0 %)	5,686 (2.09 %)	0 (0.00 %)	1 (0.00 %)
164	apicomplexans P.vinckei petteri (CR 2014) GCA_000524515.1	n/a	5,213 (55.00 %)	272 (0.85 %)	54 (0.93 %)	n/a	23.16 (98.65 %)	231 (1.35 %)	231 (1.35 %)	297 (98.65 %)	22,600 (6.10 %)	7,259 (1.72 %)	210,578 (55.08 %)	25 (0.03 %)	1,812 (0.79 %)	0 (0.00 %)	1 (0.00 %)
165	apicomplexans P.vinckei vinckei (2019) GCF_900681995.1	5,030 (55.54 %)	n/a	279 (0.89 %)	41 (1.02 %)	n/a	22.89 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	16 (100.00 %)	22,424 (6.06 %)	8,164 (2.29 %)	204,726 (56.32 %)	0 (0 %)	3,275 (1.30 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
166	apicomplexans P.yoelii (17X 2019) GCF_900002385.2	6,068 (49.37 %)	n/a	303 (0.79 %)	61 (1.07 %)	n/a	21.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16 (100.00 %)	36,103 (8.16 %)	30,218 (5.93 %)	225,866 (59.61 %)	0 (0 %)	17,787 (4.79 %)	4 (0.00 %)	3 (0.00 %)
167	apicomplexans P.yoelii (YM 2014) GCA_900002395.1	n/a	15,628 (51.46 %)	288 (0.81 %)	49 (0.92 %)	n/a	21.70 (97.30 %)	0 (0 %)	1,728 (2.73 %)	197 (100.00 %)	35,715 (8.61 %)	30,474 (6.04 %)	215,473 (57.25 %)	52 (0.10 %)	10,304 (3.01 %)	4 (0.00 %)	3 (0.00 %)
168	apicomplexans P.yoelii yoelii (17XNL 2002) GCF_000003085.2	7,141 (42.65 %)	n/a	332 (0.86 %)	1,369 (4.36 %)	n/a	24.69 (99.95 %)	11,271 (0.05 %)	11,271 (0.05 %)	16,958 (99.95 %)	34,028 (7.71 %)	29,027 (7.27 %)	219,926 (57.48 %)	4 (0.00 %)	8,922 (2.17 %)	852 (4.45 %)	847 (4.43 %)
169	apicomplexans P.yoelii yoelii (17XNL clone 1.1 2023) GCA_020844765.3	n/a	7,130 (68.77 %)	289 (0.77 %)	59 (1.06 %)	n/a	21.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16 (100.00 %)	35,815 (7.89 %)	30,241 (5.93 %)	225,897 (59.61 %)	0 (0 %)	17,751 (4.79 %)	4 (0.00 %)	3 (0.00 %)
170	apicomplexans S.neurona (SN1 2015) GCA_000875885.1	n/a	n/a	407 (0.20 %)	3,186 (4.58 %)	n/a	51.51 (90.53 %)	0 (0 %)	12,352 (9.50 %)	2,862 (100.00 %)	172,742 (13.97 %)	92,778 (3.69 %)	903,586 (31.65 %)	202 (0.15 %)	7,490 (0.57 %)	8,277 (28.14 %)	8,766 (3.07 %)
171	apicomplexans S.neurona (SN3 2014) GCA_000727475.1	n/a	n/a	415 (0.21 %)	3,217 (4.52 %)	n/a	51.41 (98.41 %)	2,320 (1.59 %)	2,399 (1.59 %)	3,191 (98.41 %)	188,246 (14.97 %)	106,788 (4.50 %)	927,905 (35.25 %)	197 (0.09 %)	11,577 (0.66 %)	2,904 (90.14 %)	8,654 (3.09 %)
172	apicomplexans T.annulata (v1 Ankara isolate clone C9 2005) GCA_000003225.1	n/a	14,654 (73.11 %)	343 (2.51 %)	327 (20.90 %)	n/a	32.54 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	8 (100.00 %)	3,920 (2.79 %)	5,067 (3.13 %)	51,568 (22.27 %)	0 (0 %)	1,747 (2.76 %)	27 (0.10 %)	27 (0.10 %)
173	apicomplexans T.equi strain (WA 2012) GCF_000342415.1	5,310 (69.13 %)	n/a	409 (2.23 %)	1,224 (36.14 %)	n/a	39.48 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	12 (100.00 %)	658 (0.38 %)	174 (0.40 %)	40,389 (7.82 %)	0 (0 %)	497 (0.71 %)	243 (1.00 %)	210 (0.82 %)
174	apicomplexans T.gondii (ARI 2016) GCA_000250965.2	n/a	10,148 (31.09 %)	494 (0.47 %)	6,560 (18.60 %)	n/a	52.36 (97.51 %)	3,455 (2.50 %)	3,515 (2.50 %)	6,200 (97.50 %)	31,170 (3.39 %)	26,067 (1.89 %)	385,697 (17.53 %)	499 (0.30 %)	7,774 (1.15 %)	2,278 (96.62 %)	2,307 (2.71 %)
175	apicomplexans T.gondii (CAST 2018) GCA_000256705.2	n/a	9,697 (31.04 %)	505 (0.48 %)	6,602 (18.72 %)	n/a	52.35 (97.15 %)	3,036 (2.86 %)	3,113 (2.86 %)	5,697 (97.14 %)	31,313 (3.40 %)	26,767 (1.91 %)	385,960 (17.53 %)	380 (0.38 %)	7,809 (1.09 %)	2,352 (97.03 %)	2,629 (2.99 %)
176	apicomplexans T.gondii (COUG 2017) GCA_000338675.2	n/a	212 (0.19 %)	504 (0.48 %)	6,497 (18.36 %)	n/a	52.32 (97.89 %)	4,033 (2.12 %)	4,130 (2.12 %)	8,238 (97.88 %)	31,275 (3.49 %)	26,736 (2.08 %)	383,650 (17.45 %)	827 (0.49 %)	8,583 (1.55 %)	2,468 (96.49 %)	2,527 (2.69 %)
177	apicomplexans T.gondii (CtCo5 2012) GCA_000278365.1	n/a	n/a	475 (0.43 %)	9,203 (18.35 %)	n/a	52.35 (99.98 %)	45 (0.00 %)	45 (0.00 %)	6,222 (100.00 %)	31,112 (3.29 %)	27,645 (1.90 %)	381,125 (17.98 %)	0 (0 %)	3,603 (0.39 %)	6,533 (90.56 %)	5,686 (7.69 %)
178	apicomplexans T.gondii (FOU 2014) GCA_000224905.2	n/a	10,297 (31.38 %)	494 (0.47 %)	6,431 (18.54 %)	n/a	52.36 (95.88 %)	3,655 (4.13 %)	3,669 (4.13 %)	6,526 (95.87 %)	30,059 (3.18 %)	23,528 (1.49 %)	384,533 (17.34 %)	232 (0.20 %)	3,125 (0.33 %)	2,300 (90.12 %)	3,127 (3.12 %)
179	apicomplexans T.gondii (GAB2-2007-GAL-DOM2 2014) GCA_000325525.2	n/a	9,296 (30.56 %)	494 (0.48 %)	6,576 (18.80 %)	n/a	52.36 (99.09 %)	2,417 (0.92 %)	2,475 (0.92 %)	4,928 (99.08 %)	30,904 (3.43 %)	26,801 (2.01 %)	385,482 (17.91 %)	376 (0.21 %)	7,870 (1.16 %)	1,950 (97.87 %)	2,057 (2.08 %)
180	apicomplexans T.gondii (GT1 2013) GCA_000149715.2	n/a	8,637 (31.25 %)	500 (0.48 %)	6,741 (18.85 %)	n/a	52.40 (98.24 %)	736 (1.76 %)	736 (1.76 %)	2,352 (98.24 %)	29,853 (3.29 %)	25,799 (2.52 %)	389,856 (17.72 %)	153 (0.33 %)	11,222 (2.16 %)	1,330 (97.58 %)	1,584 (2.87 %)
181	apicomplexans T.gondii (MAS 2014) GCA_000224865.2	n/a	10,176 (31.51 %)	475 (0.47 %)	6,431 (18.69 %)	n/a	52.37 (97.12 %)	3,589 (2.90 %)	3,598 (2.90 %)	5,772 (97.10 %)	29,686 (3.08 %)	22,885 (1.43 %)	380,930 (17.47 %)	334 (0.24 %)	2,549 (0.27 %)	1,845 (93.35 %)	2,749 (2.95 %)
182	apicomplexans T.gondii (ME49xCTG S27 2020) GCA_014898695.1	n/a	n/a	466 (0.42 %)	5,775 (12.97 %)	n/a	52.44 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	50 (100.00 %)	29,587 (3.56 %)	24,239 (4.12 %)	351,276 (17.05 %)	0 (0 %)	20,297 (3.23 %)	46 (99.61 %)	86 (0.51 %)
183	apicomplexans T.gondii (p89 2014) GCA_000224885.2	n/a	9,874 (31.44 %)	488 (0.47 %)	6,489 (18.88 %)	n/a	52.36 (96.45 %)	3,217 (3.56 %)	3,221 (3.56 %)	5,370 (96.44 %)	29,938 (3.16 %)	24,004 (1.53 %)	383,727 (17.45 %)	246 (0.18 %)	3,532 (0.37 %)	1,909 (96.13 %)	2,763 (2.92 %)
184	apicomplexans T.gondii (RH 2016) GCA_001593265.1	n/a	n/a	491 (0.45 %)	6,689 (18.51 %)	n/a	52.32 (96.55 %)	0 (0 %)	5,105 (3.47 %)	441 (100.00 %)	33,389 (3.61 %)	31,479 (6.26 %)	400,919 (17.37 %)	712 (0.96 %)	18,199 (8.34 %)	575 (93.28 %)	1,259 (3.02 %)
185	apicomplexans T.gondii (RH-88 2020) GCA_013099955.1	n/a	8,654 (30.03 %)	554 (0.49 %)	6,599 (18.40 %)	n/a	52.11 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	197 (100.00 %)	30,835 (3.92 %)	25,798 (4.93 %)	359,501 (18.91 %)	0 (0 %)	24,074 (4.82 %)	155 (97.27 %)	128 (0.77 %)
186	apicomplexans T.gondii (RUB 2014) GCA_000224805.2	n/a	10,213 (31.18 %)	491 (0.47 %)	6,425 (18.66 %)	n/a	52.37 (96.39 %)	3,864 (3.63 %)	3,910 (3.63 %)	6,295 (96.37 %)	30,728 (3.41 %)	24,756 (1.64 %)	384,326 (17.35 %)	381 (0.33 %)	5,993 (1.18 %)	2,231 (96.39 %)	2,719 (2.94 %)
187	apicomplexans T.gondii (TgCATBr5 2011) GCA_000259835.1	n/a	n/a	463 (0.42 %)	9,554 (18.02 %)	n/a	52.36 (99.98 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	6,997 (100.00 %)	29,943 (3.09 %)	23,397 (1.52 %)	381,860 (18.08 %)	0 (0 %)	1,598 (0.16 %)	6,989 (89.82 %)	5,516 (7.30 %)
188	apicomplexans T.gondii (TgCATBr9 2018) GCA_000224825.2	n/a	n/a	496 (0.48 %)	6,500 (18.74 %)	n/a	52.38 (95.75 %)	3,837 (4.26 %)	3,848 (4.26 %)	6,289 (95.74 %)	29,511 (3.14 %)	22,973 (1.47 %)	383,948 (17.29 %)	224 (0.16 %)	3,211 (0.36 %)	2,104 (88.52 %)	2,875 (2.88 %)
189	apicomplexans T.gondii (TgCatPRC2 2016) GCA_000256725.2	n/a	10,300 (30.99 %)	505 (0.49 %)	6,541 (18.57 %)	n/a	52.32 (98.04 %)	4,074 (1.98 %)	4,138 (1.98 %)	7,138 (98.02 %)	31,960 (3.63 %)	27,979 (2.13 %)	384,587 (17.82 %)	589 (0.41 %)	7,180 (1.04 %)	1,842 (95.34 %)	2,216 (2.20 %)
190	apicomplexans T.gondii (VAND 2014) GCA_000224845.2	n/a	9,426 (31.36 %)	499 (0.48 %)	6,501 (18.81 %)	n/a	52.35 (96.99 %)	2,340 (3.02 %)	2,349 (3.02 %)	4,481 (96.98 %)	30,613 (3.32 %)	24,997 (1.64 %)	385,903 (17.63 %)	219 (0.17 %)	4,947 (0.59 %)	1,930 (96.36 %)	2,681 (3.17 %)
191	apicomplexans T.gondii (VEG 2013) GCA_000150015.2	n/a	8,563 (31.30 %)	486 (0.47 %)	6,668 (18.92 %)	n/a	52.39 (98.48 %)	751 (1.52 %)	751 (1.52 %)	2,110 (98.48 %)	29,699 (3.24 %)	25,711 (2.44 %)	385,917 (17.70 %)	123 (0.23 %)	10,448 (2.03 %)	1,185 (97.70 %)	1,326 (2.78 %)
192	apicomplexans T.orientalis (Fish Creek 2022) GCA_003072545.4	n/a	3,980 (68.63 %)	353 (2.41 %)	1,101 (39.90 %)	n/a	38.84 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	3,068 (7.49 %)	1,118 (1.80 %)	49,615 (14.64 %)	0 (0 %)	1,111 (2.91 %)	935 (8.49 %)	925 (8.22 %)
193	apicomplexans T.orientalis (Goon Nure 2022) GCA_003072535.4	n/a	3,924 (68.91 %)	364 (2.49 %)	890 (35.91 %)	n/a	37.46 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	3,246 (4.59 %)	1,908 (1.68 %)	50,246 (16.20 %)	0 (0 %)	1,132 (2.36 %)	637 (5.47 %)	627 (5.27 %)
194	apicomplexans T.orientalis strain (Shintoku 2012) GCF_000740895.1	4,011 (68.56 %)	n/a	354 (2.46 %)	1,576 (45.21 %)	n/a	41.55 (99.96 %)	0 (0 %)	1 (0.04 %)	6 (100.00 %)	2,902 (2.23 %)	2,777 (2.10 %)	43,742 (13.74 %)	0 (0 %)	890 (1.85 %)	1,509 (21.25 %)	1,397 (17.53 %)
195	apicomplexans T.parva strain (Muguga 2005) GCF_000165365.1	4,055 (78.84 %)	n/a	348 (2.56 %)	352 (23.06 %)	n/a	34.04 (100.00 %)	0 (0 %)	12 (0.00 %)	9 (100.00 %)	3,773 (2.88 %)	6,554 (4.15 %)	50,104 (20.81 %)	1 (0.01 %)	1,662 (2.21 %)	56 (0.22 %)	55 (0.22 %)
196	Argentinian mammarenavirus (XJ13 2003) GCF_000856545.1	n/a	4 (95.69 %)	n/a	n/a	n/a	41.57 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.24 %)	1 (0.48 %)	2 (0.58 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
197	ascomycetes A.aculeatus ATCC 16872 GCF_001890905.1	10,830 (51.29 %)	n/a	1,477 (3.20 %)	4,326 (17.68 %)	n/a	50.87 (99.33 %)	192 (0.67 %)	270 (0.67 %)	852 (99.33 %)	14,258 (1.80 %)	8,008 (0.95 %)	121,961 (11.81 %)	9 (0.04 %)	619 (0.23 %)	750 (46.74 %)	1,710 (6.55 %)
198	ascomycetes A.alternata GCF_001642055.1	13,466 (64.96 %)	n/a	1,403 (3.17 %)	8,177 (32.49 %)	n/a	51.40 (99.99 %)	12 (0.01 %)	12 (0.01 %)	91 (99.99 %)	3,033 (0.41 %)	1,515 (0.22 %)	84,571 (5.24 %)	2 (0.00 %)	60 (0.02 %)	128 (55.20 %)	130 (0.48 %)
199	ascomycetes A.apis (ARSEF 7405 2016) GCA_001636715.1	n/a	6,442 (51.59 %)	1,357 (5.14 %)	4,684 (33.98 %)	n/a	47.66 (98.68 %)	0 (0 %)	2,781 (1.37 %)	82 (100.00 %)	13,546 (3.01 %)	3,398 (0.60 %)	91,257 (10.95 %)	55 (0.09 %)	348 (0.26 %)	5,808 (23.06 %)	3,979 (10.22 %)
200	ascomycetes A.brasiliensis (CBS 101740 2016 refseq) GCF_001889945.1	12,986 (56.52 %)	n/a	1,481 (3.19 %)	5,692 (21.36 %)	n/a	50.46 (99.58 %)	185 (0.43 %)	185 (0.43 %)	288 (99.57 %)	11,667 (1.35 %)	3,243 (0.39 %)	116,939 (7.71 %)	9 (0.01 %)	243 (0.07 %)	4,895 (72.41 %)	7,119 (24.25 %)
201	ascomycetes A.campestris IBT 28561 GCF_002847485.1	9,654 (56.20 %)	n/a	1,450 (3.90 %)	3,768 (18.66 %)	n/a	51.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	62 (100.00 %)	14,428 (2.56 %)	6,853 (1.06 %)	82,772 (11.18 %)	0 (0 %)	1,291 (0.74 %)	311 (53.94 %)	355 (1.69 %)
202	ascomycetes A.carbonaris (ITEM 5010 2017) GCA_001990825.1	n/a	11,738 (60.63 %)	1,570 (3.51 %)	5,385 (21.43 %)	n/a	51.72 (94.39 %)	400 (5.61 %)	400 (5.61 %)	1,229 (94.39 %)	13,457 (1.72 %)	4,908 (0.62 %)	106,246 (7.74 %)	4 (0.01 %)	222 (0.39 %)	2,489 (78.68 %)	4,108 (25.60 %)
203	ascomycetes A.clavatus NRRL 1 GCF_000002715.2	9,117 (48.58 %)	n/a	1,533 (4.22 %)	5,016 (24.52 %)	n/a	49.21 (99.97 %)	88 (0.03 %)	88 (0.03 %)	231 (99.97 %)	12,924 (2.03 %)	4,883 (0.69 %)	81,761 (11.49 %)	0 (0 %)	569 (0.17 %)	1,714 (40.34 %)	3,057 (19.94 %)
204	ascomycetes A.cristatus (GZAAS20.1005 2016) GCA_001717485.1	n/a	10,344 (52.14 %)	1,545 (4.19 %)	5,976 (26.91 %)	n/a	49.69 (99.53 %)	0 (0 %)	117 (0.48 %)	68 (100.00 %)	7,892 (1.25 %)	2,683 (0.57 %)	74,260 (8.16 %)	0 (0 %)	659 (0.45 %)	1,262 (49.95 %)	2,064 (8.14 %)
205	ascomycetes A.ellipticus (CBS 707.79 2018) GCA_003184645.1	n/a	13,179 (48.78 %)	1,560 (3.01 %)	5,809 (18.75 %)	n/a	47.38 (94.17 %)	406 (5.83 %)	406 (5.83 %)	924 (94.17 %)	23,112 (2.48 %)	20,018 (1.99 %)	116,002 (19.35 %)	54 (0.58 %)	2,168 (0.50 %)	2,788 (66.72 %)	3,131 (44.81 %)
206	ascomycetes A.eucalypticola CBS 122712 GCF_003184535.1	11,853 (55.63 %)	n/a	1,520 (3.40 %)	6,286 (23.56 %)	n/a	49.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	131 (100.00 %)	12,432 (1.58 %)	4,236 (0.54 %)	104,532 (9.46 %)	0 (0 %)	416 (0.12 %)	6,645 (56.54 %)	7,391 (28.31 %)
207	ascomycetes A.fijiensis CBS 313.89 GCF_003184825.1	12,006 (54.22 %)	n/a	1,511 (3.17 %)	4,579 (18.12 %)	n/a	50.08 (99.96 %)	69 (0.04 %)	69 (0.04 %)	218 (99.96 %)	15,116 (1.73 %)	11,009 (1.27 %)	112,186 (13.84 %)	12 (0.01 %)	848 (0.17 %)	1,168 (52.82 %)	1,801 (18.89 %)
208	ascomycetes A.fischeri (v4 NRRL 181 2006) GCF_000149645.3	10,386 (48.60 %)	n/a	1,532 (3.78 %)	6,129 (25.42 %)	n/a	49.41 (99.97 %)	89 (0.03 %)	89 (0.03 %)	252 (99.97 %)	4,922 (0.68 %)	2,244 (0.39 %)	66,838 (5.86 %)	0 (0 %)	710 (0.23 %)	2,647 (77.24 %)	3,710 (23.12 %)
209	ascomycetes A.flagrans (CBS H-5679 2019 refseq) GCF_004000055.1	10,346 (39.40 %)	n/a	1,471 (3.09 %)	7,512 (23.57 %)	n/a	45.10 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14 (100.00 %)	12,076 (1.76 %)	6,694 (1.25 %)	122,303 (11.26 %)	0 (0 %)	5,008 (1.25 %)	5,164 (10.46 %)	4,658 (6.88 %)
210	ascomycetes A.flavus (NRRL 3357 2019) GCA_009017415.1	n/a	13,958 (60.54 %)	1,597 (3.25 %)	7,371 (24.63 %)	n/a	47.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	7,286 (1.19 %)	6,722 (0.76 %)	81,429 (7.62 %)	0 (0 %)	492 (0.20 %)	9,897 (37.53 %)	9,243 (24.11 %)
211	ascomycetes A.flavus (NRRL3357 2020) GCA_000006275.3	n/a	14,699 (52.12 %)	1,569 (3.25 %)	7,336 (24.82 %)	n/a	48.31 (99.84 %)	0 (0 %)	626 (0.17 %)	282 (100.00 %)	7,106 (0.86 %)	3,008 (0.37 %)	88,073 (5.61 %)	1 (0.00 %)	325 (0.07 %)	10,041 (37.77 %)	9,007 (21.95 %)
212	ascomycetes A.fumigatus (08-19-02-30 2024) GCA_040142875.1	n/a	10,688 (59.43 %)	1,526 (4.08 %)	5,444 (24.87 %)	n/a	49.61 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16 (100.00 %)	4,975 (0.74 %)	2,334 (0.40 %)	64,149 (7.13 %)	0 (0 %)	1,747 (0.73 %)	2,971 (73.61 %)	4,466 (36.23 %)
213	ascomycetes A.fumigatus (47-10 2024) GCA_040142855.1	n/a	10,650 (58.78 %)	1,529 (4.05 %)	5,476 (24.72 %)	n/a	49.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	4,976 (0.73 %)	2,161 (0.38 %)	71,054 (6.92 %)	0 (0 %)	770 (0.26 %)	3,059 (72.36 %)	4,386 (32.30 %)
214	ascomycetes A.fumigatus (47-4 2024) GCA_040142865.1	n/a	10,794 (59.40 %)	1,532 (4.08 %)	5,430 (24.67 %)	n/a	49.35 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	26 (100.00 %)	5,009 (0.75 %)	2,155 (0.37 %)	71,499 (6.88 %)	0 (0 %)	671 (0.23 %)	3,102 (71.80 %)	4,340 (33.05 %)
215	ascomycetes A.fumigatus (A1160 2022) GCA_024220425.1	n/a	n/a	1,512 (4.01 %)	5,506 (24.83 %)	n/a	49.45 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	4,902 (0.72 %)	2,193 (0.39 %)	69,488 (6.72 %)	0 (0 %)	773 (0.20 %)	3,147 (71.84 %)	4,438 (31.29 %)
216	ascomycetes A.fumigatus (A1163 2007) GCA_000150145.1	n/a	10,109 (49.67 %)	1,544 (4.08 %)	5,507 (24.91 %)	n/a	49.55 (99.63 %)	85 (0.36 %)	168 (0.37 %)	140 (99.64 %)	5,093 (2.93 %)	2,047 (0.36 %)	65,285 (5.97 %)	1 (0.01 %)	571 (0.15 %)	3,241 (71.42 %)	4,440 (32.18 %)
217	ascomycetes A.fumigatus (AF100-9B 2024) GCA_040126065.1	n/a	10,622 (60.37 %)	1,536 (4.16 %)	5,371 (24.97 %)	n/a	49.37 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	4,944 (0.74 %)	2,082 (0.33 %)	63,931 (6.55 %)	0 (0 %)	718 (0.26 %)	2,752 (73.61 %)	4,140 (35.78 %)
218	ascomycetes A.fumigatus (Afir964 2023) GCA_028752205.1	n/a	n/a	1,523 (4.16 %)	5,322 (24.76 %)	n/a	49.20 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	4,905 (0.74 %)	1,944 (0.33 %)	63,506 (7.56 %)	0 (0 %)	1,261 (0.39 %)	3,034 (71.12 %)	4,204 (35.59 %)
219	ascomycetes A.fumigatus (Afir974 2023) GCA_028752175.1	n/a	n/a	1,557 (4.21 %)	5,336 (24.68 %)	n/a	49.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	4,972 (0.74 %)	2,016 (0.34 %)	63,966 (7.56 %)	0 (0 %)	1,447 (0.46 %)	3,144 (70.42 %)	4,266 (36.67 %)
220	ascomycetes A.fumigatus (ATCC 13073 2024) GCA_040142885.1	n/a	10,612 (60.10 %)	1,519 (4.15 %)	5,323 (24.65 %)	n/a	49.26 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	5,010 (0.74 %)	1,918 (0.34 %)	64,235 (7.67 %)	0 (0 %)	980 (0.38 %)	3,189 (70.47 %)	4,315 (36.79 %)
221	ascomycetes A.fumigatus (ATCC 42202 2024) GCA_040142845.1	n/a	10,789 (59.40 %)	1,533 (4.16 %)	5,389 (24.65 %)	n/a	49.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	15 (100.00 %)	5,167 (0.77 %)	2,330 (0.39 %)	51,002 (6.38 %)	0 (0 %)	906 (0.39 %)	2,468 (75.86 %)	4,209 (45.42 %)
222	ascomycetes A.fumigatus (ATCC 46645 2024) GCA_040142955.1	n/a	11,235 (58.45 %)	1,541 (3.92 %)	5,603 (24.05 %)	n/a	49.17 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	20 (100.00 %)	5,126 (0.71 %)	2,143 (0.39 %)	65,042 (7.48 %)	0 (0 %)	1,448 (0.41 %)	3,593 (68.31 %)	4,631 (36.32 %)
223	ascomycetes A.fumigatus (B5233 2024) GCA_040142945.1	n/a	10,594 (59.51 %)	1,551 (4.21 %)	5,357 (24.54 %)	n/a	49.30 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	13 (100.00 %)	5,111 (0.75 %)	1,960 (0.35 %)	53,560 (7.39 %)	0 (0 %)	1,113 (0.52 %)	3,208 (70.53 %)	4,261 (44.98 %)
224	ascomycetes A.fumigatus (CEA10 2022) GCA_051225625.1	n/a	n/a	1,517 (4.02 %)	5,520 (24.80 %)	n/a	49.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	4,925 (0.72 %)	2,199 (0.39 %)	69,730 (6.77 %)	0 (0 %)	756 (0.23 %)	3,151 (71.80 %)	4,453 (31.34 %)
225	ascomycetes A.fumigatus (D141 2024) GCA_040167805.1	n/a	10,047 (56.55 %)	1,554 (4.20 %)	5,299 (24.55 %)	n/a	49.23 (99.96 %)	0 (0 %)	3 (0.04 %)	25 (100.00 %)	5,079 (0.75 %)	2,020 (0.34 %)	57,066 (7.47 %)	0 (0 %)	1,230 (0.46 %)	3,229 (69.90 %)	4,271 (40.99 %)
226	ascomycetes A.fumigatus (H237 2024) GCA_040142975.1	n/a	10,673 (58.66 %)	1,528 (4.11 %)	5,455 (24.57 %)	n/a	49.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	23 (100.00 %)	5,010 (0.73 %)	2,143 (0.36 %)	61,646 (6.63 %)	0 (0 %)	877 (0.34 %)	2,833 (73.71 %)	4,317 (37.09 %)
227	ascomycetes A.fumigatus (W72310 2024) GCA_040167795.1	n/a	10,721 (61.44 %)	1,510 (4.21 %)	5,490 (25.81 %)	n/a	49.96 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	4,557 (0.66 %)	1,813 (0.29 %)	48,948 (4.77 %)	0 (0 %)	450 (0.29 %)	2,489 (78.99 %)	4,144 (37.96 %)
228	ascomycetes A.fumigatus Af293 GCF_000002655.1	9,629 (49.43 %)	n/a	1,540 (4.10 %)	5,428 (24.84 %)	n/a	49.80 (98.04 %)	11 (1.96 %)	28 (1.96 %)	19 (98.04 %)	4,813 (2.98 %)	2,098 (0.35 %)	61,457 (5.50 %)	0 (0 %)	864 (0.25 %)	3,039 (48.73 %)	4,409 (30.80 %)
229	ascomycetes A.glaucus CBS 516.65 GCF_001890805.1	11,254 (60.03 %)	n/a	1,516 (4.17 %)	5,814 (27.09 %)	n/a	49.39 (99.25 %)	351 (0.76 %)	351 (0.76 %)	433 (99.24 %)	9,681 (1.43 %)	4,476 (0.60 %)	79,796 (7.39 %)	18 (0.03 %)	432 (0.14 %)	2,043 (27.67 %)	3,333 (11.66 %)
230	ascomycetes A.heteromorphus CBS 117.55 GCF_003184545.1	10,782 (48.32 %)	n/a	1,540 (3.34 %)	4,868 (18.75 %)	n/a	48.06 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	205 (100.00 %)	28,918 (3.97 %)	23,013 (2.64 %)	101,136 (22.03 %)	0 (0 %)	4,702 (0.98 %)	570 (40.72 %)	647 (14.26 %)
231	ascomycetes A.homomorphus CBS 101889 GCF_003184865.1	11,349 (53.96 %)	n/a	1,464 (3.35 %)	4,816 (19.82 %)	n/a	50.01 (99.90 %)	95 (0.10 %)	95 (0.10 %)	247 (99.90 %)	11,283 (1.41 %)	8,301 (1.05 %)	98,670 (11.70 %)	9 (0.00 %)	798 (0.21 %)	1,190 (52.50 %)	1,663 (8.00 %)
232	ascomycetes A.ibericus CBS 121593 GCF_003184845.1	11,674 (56.62 %)	n/a	1,512 (3.47 %)	4,970 (20.10 %)	n/a	50.55 (99.96 %)	85 (0.04 %)	85 (0.04 %)	201 (99.96 %)	11,061 (1.47 %)	4,888 (0.65 %)	106,529 (11.60 %)	11 (0.01 %)	596 (0.13 %)	1,148 (52.10 %)	1,852 (18.70 %)
233	ascomycetes A.lentulus (IFM 54703 2021) GCA_001445615.2	n/a	31,856 (50.08 %)	1,536 (3.84 %)	5,482 (23.87 %)	n/a	49.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	4,794 (0.67 %)	2,043 (0.38 %)	70,366 (6.77 %)	0 (0 %)	984 (0.39 %)	2,135 (81.65 %)	3,951 (21.86 %)
234	ascomycetes A.luchuensis (CBS 106.47 2016) GCA_001890685.1	n/a	13,785 (54.60 %)	1,507 (3.12 %)	6,320 (22.32 %)	n/a	49.07 (99.61 %)	211 (0.40 %)	211 (0.40 %)	311 (99.60 %)	12,676 (1.46 %)	4,318 (0.51 %)	120,437 (9.87 %)	10 (0.02 %)	424 (0.12 %)	6,915 (59.94 %)	7,841 (26.84 %)
235	ascomycetes A.luchuensis IFO 4308 (IFO4308 2011) GCA_000239835.2	n/a	35,969 (46.09 %)	1,504 (3.15 %)	6,229 (22.22 %)	n/a	48.96 (99.36 %)	479 (0.64 %)	519 (0.64 %)	1,639 (99.36 %)	13,236 (1.56 %)	4,235 (0.52 %)	122,740 (10.14 %)	5 (0.01 %)	306 (0.06 %)	6,993 (58.87 %)	8,006 (27.39 %)
236	ascomycetes A.nidulans (FGSC A4 2012 refseq) GCF_000149205.2	9,556 (50.66 %)	n/a	1,528 (3.90 %)	5,735 (25.53 %)	n/a	50.30 (99.43 %)	158 (0.58 %)	158 (0.58 %)	249 (99.42 %)	5,218 (3.22 %)	2,452 (0.41 %)	51,693 (4.64 %)	1 (0.00 %)	625 (0.60 %)	1,123 (78.44 %)	1,810 (9.92 %)
237	ascomycetes A.niger (ATCC 1015 2011) GCA_000230395.2	n/a	10,950 (47.39 %)	1,472 (3.28 %)	5,860 (22.57 %)	n/a	50.32 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	24 (100.00 %)	10,467 (1.31 %)	2,849 (0.40 %)	116,089 (8.05 %)	0 (0 %)	347 (0.10 %)	5,725 (67.14 %)	7,138 (23.18 %)
238	ascomycetes A.niger (ATCC 13496 2018) GCA_003344705.1	n/a	12,468 (57.24 %)	1,523 (3.32 %)	5,831 (21.80 %)	n/a	49.49 (99.95 %)	283 (0.05 %)	283 (0.05 %)	416 (99.95 %)	11,250 (1.36 %)	3,729 (0.47 %)	106,648 (8.64 %)	12 (0.01 %)	363 (0.08 %)	5,997 (63.73 %)	7,208 (28.57 %)
239	ascomycetes A.niger (LDM3 2019) GCA_009812365.1	n/a	n/a	1,504 (3.31 %)	5,647 (20.78 %)	n/a	49.51 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14 (100.00 %)	11,085 (1.39 %)	3,575 (0.48 %)	103,827 (8.73 %)	0 (0 %)	408 (0.12 %)	5,478 (66.25 %)	7,056 (28.71 %)
240	ascomycetes A.niger (N402 ATCC 64974 2018) GCA_900248155.1	n/a	11,241 (47.21 %)	1,511 (3.26 %)	5,841 (22.05 %)	n/a	49.59 (99.98 %)	0 (0 %)	19 (0.02 %)	19 (100.00 %)	11,066 (1.37 %)	3,714 (0.50 %)	119,538 (9.43 %)	4 (0.00 %)	453 (0.11 %)	5,740 (65.55 %)	7,186 (24.21 %)
241	ascomycetes A.niger (UAMH 3544 2015) GCA_001430945.1	n/a	n/a	1,592 (3.50 %)	5,535 (20.87 %)	n/a	50.11 (94.42 %)	0 (0 %)	7,784 (5.65 %)	3,481 (100.00 %)	9,824 (1.20 %)	4,011 (0.96 %)	147,037 (10.54 %)	2 (0.00 %)	675 (0.28 %)	7,909 (38.30 %)	6,727 (16.86 %)
242	ascomycetes A.niger (v4 2007) GCF_000002855.4	14,123 (55.04 %)	n/a	1,477 (3.36 %)	5,688 (22.12 %)	n/a	50.37 (99.87 %)	451 (0.13 %)	663 (0.13 %)	468 (99.87 %)	9,968 (1.25 %)	2,606 (0.36 %)	106,188 (7.69 %)	1 (0.00 %)	262 (0.07 %)	5,580 (67.37 %)	6,938 (24.46 %)
243	ascomycetes A.novofumigatus IBT 16806 GCF_002847465.1	11,423 (54.61 %)	n/a	1,570 (3.73 %)	6,191 (23.75 %)	n/a	49.14 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	62 (100.00 %)	5,497 (1.07 %)	3,622 (0.66 %)	63,777 (6.60 %)	0 (0 %)	1,833 (0.63 %)	2,353 (55.47 %)	3,049 (21.61 %)
244	ascomycetes A.ochraceoroseus IBT 24754 GCF_002846915.1	8,821 (51.88 %)	n/a	1,552 (4.30 %)	5,188 (24.80 %)	n/a	44.17 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	34 (100.00 %)	17,921 (2.69 %)	11,148 (1.86 %)	68,602 (21.70 %)	0 (0 %)	6,485 (1.74 %)	5,695 (40.92 %)	5,819 (24.47 %)
245	ascomycetes A.oryzae RIB40 GCF_000184455.2	12,077 (43.91 %)	n/a	1,572 (3.21 %)	7,460 (25.11 %)	n/a	48.24 (97.90 %)	16 (2.09 %)	18 (2.10 %)	28 (97.91 %)	7,614 (1.88 %)	3,121 (0.40 %)	96,894 (6.21 %)	0 (0 %)	350 (0.10 %)	9,956 (37.23 %)	8,820 (20.83 %)
246	ascomycetes A.parasiticus (CBS 117618 2019) GCA_009176385.1	n/a	14,005 (59.18 %)	1,597 (3.17 %)	8,307 (26.98 %)	n/a	48.07 (99.98 %)	50 (0.02 %)	50 (0.02 %)	320 (99.98 %)	7,236 (0.81 %)	2,961 (0.36 %)	86,811 (5.45 %)	3 (0.00 %)	256 (0.06 %)	10,451 (37.06 %)	9,506 (23.26 %)
247	ascomycetes A.sclerotiicarbonarius (CBS 121057 2018) GCA_003184635.1	n/a	12,893 (53.92 %)	1,540 (3.19 %)	5,869 (20.74 %)	n/a	48.59 (99.93 %)	111 (0.07 %)	111 (0.07 %)	277 (99.93 %)	14,700 (1.66 %)	10,115 (1.17 %)	109,029 (15.85 %)	27 (0.05 %)	2,689 (0.52 %)	2,430 (78.16 %)	3,370 (34.38 %)
248	ascomycetes A.steynii IBT 23096 GCF_002849105.1	12,918 (54.13 %)	n/a	1,587 (3.20 %)	6,715 (23.55 %)	n/a	49.07 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	37 (100.00 %)	14,914 (2.25 %)	7,418 (0.91 %)	98,234 (12.81 %)	0 (0 %)	1,964 (0.78 %)	436 (42.93 %)	523 (7.20 %)
249	ascomycetes A.sydowii CBS 593.65 GCF_001890705.1	13,578 (60.83 %)	n/a	1,572 (3.49 %)	6,884 (26.02 %)	n/a	49.98 (99.91 %)	1,084 (0.09 %)	1,084 (0.09 %)	1,181 (99.91 %)	6,193 (0.73 %)	2,828 (0.36 %)	77,206 (5.92 %)	8 (0.01 %)	262 (0.08 %)	767 (46.02 %)	1,025 (4.19 %)
250	ascomycetes A.tanneri (NIH1004 2019) GCA_004798825.1	n/a	13,590 (42.12 %)	1,544 (3.30 %)	6,626 (23.63 %)	n/a	47.46 (99.99 %)	0 (0 %)	15 (0.00 %)	1,715 (100.00 %)	9,852 (1.06 %)	3,847 (0.53 %)	105,634 (7.67 %)	0 (0 %)	507 (0.09 %)	8,097 (37.97 %)	7,469 (25.58 %)
251	ascomycetes A.terreus NIH2624 GCF_000149615.1	10,401 (53.42 %)	n/a	1,413 (3.73 %)	4,096 (19.69 %)	n/a	52.87 (99.55 %)	241 (0.45 %)	241 (0.45 %)	268 (99.55 %)	5,891 (1.03 %)	1,789 (0.31 %)	87,316 (6.84 %)	0 (0 %)	209 (0.07 %)	302 (32.90 %)	516 (2.85 %)
252	ascomycetes A.thermomutatus GCF_002237265.1	9,701 (49.19 %)	n/a	1,550 (3.81 %)	5,822 (24.48 %)	n/a	50.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	647 (100.00 %)	4,948 (0.73 %)	2,425 (0.37 %)	69,269 (4.99 %)	0 (0 %)	328 (0.09 %)	5,161 (64.08 %)	5,382 (35.67 %)
253	ascomycetes A.tubingensis (CBS 134.48 2016) GCA_001890745.1	n/a	12,593 (55.19 %)	1,522 (3.32 %)	6,227 (23.49 %)	n/a	49.19 (99.98 %)	54 (0.02 %)	54 (0.02 %)	87 (99.98 %)	12,180 (1.48 %)	3,718 (0.47 %)	118,166 (10.10 %)	8 (0.01 %)	212 (0.05 %)	6,367 (61.29 %)	7,274 (26.50 %)
254	ascomycetes A.uvarum CBS 121591 GCF_003184745.1	12,009 (54.34 %)	n/a	1,504 (3.21 %)	4,622 (18.54 %)	n/a	50.85 (99.97 %)	80 (0.03 %)	80 (0.03 %)	252 (99.97 %)	14,741 (1.76 %)	7,287 (0.85 %)	119,057 (11.61 %)	4 (0.00 %)	807 (0.16 %)	1,268 (49.13 %)	2,011 (13.30 %)
255	ascomycetes A.verrucosus (UAMH 3576 2015) GCA_001430935.1	n/a	n/a	1,530 (4.21 %)	5,362 (25.13 %)	n/a	49.28 (91.21 %)	0 (0 %)	9,182 (8.89 %)	3,075 (100.00 %)	5,898 (0.85 %)	1,983 (0.42 %)	81,131 (6.06 %)	0 (0 %)	207 (0.11 %)	7,975 (18.61 %)	6,940 (12.47 %)
256	ascomycetes A.versicolor CBS 583.65 GCF_001890125.1	13,219 (63.35 %)	n/a	1,556 (3.56 %)	6,723 (27.08 %)	n/a	50.08 (99.98 %)	78 (0.02 %)	78 (0.02 %)	129 (99.98 %)	5,286 (0.64 %)	2,893 (0.39 %)	79,836 (6.59 %)	6 (0.00 %)	278 (0.07 %)	545 (48.06 %)	2,035 (8.19 %)
257	ascomycetes A.wentii DTO 134E9 GCF_001890725.1	12,433 (61.32 %)	n/a	1,521 (3.74 %)	6,893 (28.56 %)	n/a	47.95 (99.82 %)	91 (0.18 %)	91 (0.18 %)	118 (99.82 %)	9,049 (1.25 %)	2,759 (0.37 %)	103,730 (8.38 %)	10 (0.02 %)	332 (0.11 %)	8,897 (38.93 %)	7,954 (21.36 %)
258	ascomycetes B.bassiana (HN6 2020) GCA_014607475.1	n/a	n/a	1,444 (2.99 %)	4,501 (18.34 %)	n/a	48.93 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	13,528 (1.62 %)	10,935 (1.46 %)	82,142 (15.29 %)	0 (0 %)	2,316 (0.69 %)	308 (62.29 %)	547 (8.08 %)
259	ascomycetes B.ceratinophila (UAMH 5669 2015) GCA_001430925.1	n/a	n/a	1,461 (4.35 %)	4,792 (24.77 %)	n/a	48.46 (93.18 %)	0 (0 %)	5,818 (6.87 %)	4,851 (100.00 %)	4,781 (0.85 %)	3,514 (1.45 %)	82,762 (7.28 %)	0 (0 %)	1,339 (0.83 %)	7,506 (27.36 %)	6,656 (15.18 %)
260	ascomycetes B.cinerea B05.10 GCF_000143535.2	13,703 (57.59 %)	n/a	1,481 (2.69 %)	9,228 (27.01 %)	n/a	42.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	18 (100.00 %)	25,169 (4.69 %)	14,588 (1.50 %)	176,502 (13.70 %)	0 (0 %)	1,286 (0.28 %)	3,415 (3.53 %)	2,539 (2.38 %)
261	ascomycetes B.dermatitidis (ATCC 26199 2010) GCA_000166155.1	n/a	11,591 (28.14 %)	1,479 (1.67 %)	5,734 (10.54 %)	n/a	36.64 (96.14 %)	2,179 (3.87 %)	2,774 (3.87 %)	5,461 (96.13 %)	41,141 (2.80 %)	29,988 (2.28 %)	288,257 (48.25 %)	218 (0.23 %)	23,763 (3.16 %)	8,032 (9.85 %)	7,490 (7.85 %)
262	ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 refseq) GCF_000003525.1	11,561 (30.20 %)	n/a	1,522 (1.76 %)	5,714 (11.07 %)	n/a	37.07 (99.50 %)	566 (0.51 %)	566 (0.51 %)	593 (99.49 %)	38,659 (2.73 %)	27,571 (2.05 %)	270,617 (48.64 %)	2 (0.00 %)	31,958 (3.92 %)	8,002 (10.69 %)	7,438 (8.47 %)
263	ascomycetes B.gilchristii (SLH14081 2009 refseq) GCF_000003855.2	11,364 (26.50 %)	n/a	1,520 (1.57 %)	5,702 (9.73 %)	n/a	35.75 (98.67 %)	1,691 (1.34 %)	1,691 (1.34 %)	1,794 (98.66 %)	42,930 (2.67 %)	27,826 (1.78 %)	328,698 (50.87 %)	0 (0 %)	32,248 (3.50 %)	7,943 (9.35 %)	7,488 (7.50 %)
264	ascomycetes B.percursus (EI222 2016) GCA_001883805.1	n/a	10,384 (41.58 %)	1,429 (3.46 %)	4,954 (20.20 %)	n/a	47.33 (99.98 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	3,868 (100.00 %)	14,584 (1.96 %)	8,289 (0.96 %)	107,848 (11.28 %)	0 (0 %)	787 (0.14 %)	9,406 (25.06 %)	7,924 (16.83 %)
265	ascomycetes B.spectabilis GCF_004022145.1	9,270 (54.40 %)	n/a	1,609 (4.09 %)	6,352 (27.19 %)	n/a	46.71 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	86 (100.00 %)	9,137 (1.28 %)	4,143 (0.72 %)	78,035 (12.79 %)	0 (0 %)	1,019 (0.28 %)	2,946 (32.16 %)	4,190 (18.47 %)
266	ascomycetes C.bantiana CBS 173.52 GCF_000835475.1	12,779 (49.81 %)	n/a	1,528 (3.20 %)	7,173 (27.50 %)	n/a	51.32 (99.77 %)	80 (0.23 %)	80 (0.23 %)	140 (99.77 %)	6,344 (0.71 %)	2,709 (0.33 %)	86,382 (6.31 %)	18 (0.04 %)	751 (0.18 %)	397 (51.48 %)	1,099 (4.38 %)
267	ascomycetes C.carrionii (KSF 2016) GCA_001700775.1	n/a	11,240 (53.12 %)	1,421 (3.64 %)	4,953 (25.68 %)	n/a	54.12 (99.99 %)	0 (0 %)	89 (0.01 %)	23 (100.00 %)	9,509 (1.44 %)	6,776 (1.16 %)	92,177 (7.19 %)	0 (0 %)	838 (0.20 %)	39 (98.59 %)	49 (90.77 %)
268	ascomycetes C.carrionii CBS 160.54 GCF_000365165.1	10,384 (52.69 %)	n/a	1,406 (3.72 %)	4,922 (26.30 %)	n/a	54.27 (99.96 %)	83 (0.04 %)	83 (0.04 %)	102 (99.96 %)	7,264 (1.07 %)	4,076 (0.66 %)	86,802 (6.29 %)	45 (0.03 %)	210 (0.05 %)	31 (30.51 %)	39 (71.65 %)
269	ascomycetes C.clavata (yc1106 2022) GCA_023920165.1	n/a	10,292 (51.81 %)	1,521 (3.50 %)	7,730 (31.60 %)	n/a	50.65 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	5,825 (0.76 %)	2,564 (0.54 %)	78,688 (6.20 %)	0 (0 %)	842 (0.49 %)	771 (92.32 %)	1,183 (5.08 %)
270	ascomycetes C.europaea CBS 101466 GCF_000365145.1	11,108 (56.56 %)	n/a	1,404 (3.71 %)	5,806 (31.08 %)	n/a	54.03 (99.79 %)	87 (0.21 %)	87 (0.21 %)	106 (99.79 %)	4,125 (0.61 %)	1,686 (0.32 %)	85,872 (6.26 %)	13 (0.04 %)	282 (0.08 %)	125 (62.07 %)	182 (34.28 %)
271	ascomycetes C.geophilum (1.58 2016 refseq) GCF_001692895.1	14,697 (11.65 %)	n/a	1,579 (0.68 %)	8,880 (6.09 %)	n/a	37.52 (99.92 %)	357 (0.08 %)	57,526 (0.12 %)	625 (99.92 %)	58,519 (1.62 %)	81,253 (3.31 %)	1,103,443 (49.94 %)	12 (0.00 %)	62,840 (2.65 %)	13,976 (10.94 %)	10,670 (8.26 %)
272	ascomycetes C.globosum CBS 148.51 GCF_000143365.1	11,040 (47.95 %)	n/a	1,281 (2.80 %)	3,410 (13.48 %)	n/a	55.56 (98.44 %)	1,208 (1.58 %)	1,208 (1.58 %)	1,245 (98.42 %)	12,702 (2.04 %)	5,551 (0.76 %)	124,116 (10.93 %)	0 (0 %)	1,046 (0.34 %)	28 (87.80 %)	48 (0.32 %)
273	ascomycetes C.graminicola M1.001 GCF_000149035.1	12,063 (33.07 %)	n/a	1,536 (2.32 %)	7,176 (18.81 %)	n/a	49.11 (98.57 %)	498 (1.43 %)	498 (1.43 %)	1,152 (98.57 %)	26,469 (2.32 %)	11,812 (1.14 %)	127,419 (19.04 %)	0 (0 %)	3,399 (0.59 %)	1,096 (48.14 %)	1,184 (34.19 %)
274	ascomycetes C.higginsianum IMI 349063 GCF_001672515.1	14,651 (40.64 %)	n/a	1,345 (1.98 %)	4,965 (13.95 %)	n/a	54.41 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25 (100.00 %)	25,251 (2.39 %)	10,210 (0.92 %)	186,324 (11.61 %)	0 (0 %)	2,389 (0.91 %)	375 (19.67 %)	547 (1.97 %)
275	ascomycetes C.immitis (H538.4 2006) GCA_000149815.1	n/a	10,709 (52.32 %)	1,384 (4.03 %)	4,907 (21.84 %)	n/a	46.92 (92.20 %)	3,789 (7.85 %)	3,789 (7.85 %)	4,345 (92.15 %)	8,435 (1.63 %)	4,407 (0.67 %)	78,943 (9.99 %)	5 (0.03 %)	1,300 (0.62 %)	5,925 (25.64 %)	5,555 (16.23 %)
276	ascomycetes C.immitis (RMSCC 2394 2006) GCA_000149895.1	n/a	10,529 (53.83 %)	1,488 (4.03 %)	5,460 (24.08 %)	n/a	46.16 (98.38 %)	496 (1.62 %)	496 (1.62 %)	527 (98.38 %)	9,656 (1.82 %)	5,391 (0.88 %)	85,470 (12.26 %)	1 (0.00 %)	3,341 (1.38 %)	4,953 (32.76 %)	4,926 (15.61 %)
277	ascomycetes C.immitis (RMSCC 3703 2007) GCA_000150085.1	n/a	10,578 (51.69 %)	1,391 (4.08 %)	4,832 (21.44 %)	n/a	47.02 (91.13 %)	4,744 (8.94 %)	4,744 (8.94 %)	5,033 (91.06 %)	8,342 (1.66 %)	4,457 (0.67 %)	80,927 (9.52 %)	5 (0.02 %)	1,549 (0.77 %)	5,821 (25.82 %)	5,471 (15.31 %)
278	ascomycetes C.immitis (WA_211 2019) GCA_004115165.2	n/a	7,936 (42.20 %)	1,488 (4.21 %)	5,414 (25.32 %)	n/a	46.47 (99.92 %)	0 (0 %)	235 (0.09 %)	62 (100.00 %)	9,834 (1.66 %)	5,332 (0.90 %)	82,247 (11.73 %)	13 (0.02 %)	2,589 (0.68 %)	4,909 (34.36 %)	4,921 (16.17 %)
279	ascomycetes C.immitis RS GCF_000149335.2	9,937 (54.94 %)	n/a	1,508 (4.02 %)	5,498 (24.19 %)	n/a	45.96 (100.00 %)	4 (0.00 %)	4 (0.00 %)	11 (100.00 %)	9,900 (1.68 %)	5,677 (0.97 %)	88,632 (12.84 %)	0 (0 %)	3,541 (0.89 %)	4,844 (31.67 %)	4,857 (15.75 %)
280	ascomycetes C.immunda GCF_000835495.1	14,048 (56.77 %)	n/a	1,529 (2.69 %)	7,383 (24.36 %)	n/a	52.83 (99.86 %)	86 (0.14 %)	86 (0.14 %)	363 (99.86 %)	7,064 (0.67 %)	3,488 (0.43 %)	113,746 (5.52 %)	28 (0.02 %)	974 (0.18 %)	505 (39.40 %)	531 (15.67 %)
281	ascomycetes C.metapsilosis (2021) GCF_017655625.1	5,726 (68.52 %)	n/a	1,855 (11.17 %)	5,347 (64.48 %)	n/a	38.08 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	10 (100.00 %)	7,283 (2.20 %)	3,193 (1.74 %)	77,436 (14.44 %)	0 (0 %)	1,702 (1.29 %)	21 (0.04 %)	15 (0.03 %)
282	ascomycetes C.militaris (ATCC 34164 2017) GCA_008080495.1	n/a	9,362 (42.60 %)	1,383 (3.14 %)	4,256 (18.73 %)	n/a	50.92 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	13,593 (1.96 %)	8,828 (1.56 %)	96,733 (16.66 %)	0 (0 %)	4,270 (1.08 %)	96 (96.74 %)	167 (4.50 %)
283	ascomycetes C.militaris CM01 GCF_000225605.1	9,651 (45.46 %)	n/a	1,313 (3.12 %)	4,235 (19.53 %)	n/a	51.42 (99.83 %)	565 (0.18 %)	582 (0.18 %)	597 (99.82 %)	11,264 (1.64 %)	8,374 (1.32 %)	107,042 (15.28 %)	3 (0.00 %)	2,623 (0.61 %)	92 (56.22 %)	118 (3.85 %)
284	ascomycetes C.posadasii (C735 delta SOWgp 2009 refseq) GCF_000151335.2	7,227 (49.91 %)	n/a	1,478 (4.26 %)	5,283 (25.22 %)	n/a	46.59 (100.00 %)	33 (0.00 %)	33 (0.00 %)	88 (100.00 %)	10,457 (5.97 %)	5,206 (0.91 %)	74,027 (11.89 %)	0 (0 %)	3,254 (0.84 %)	4,784 (34.49 %)	4,865 (16.04 %)
285	ascomycetes C.posadasii (CPA 0001 2007) GCA_000150245.1	n/a	n/a	1,356 (3.84 %)	4,492 (19.30 %)	n/a	46.03 (90.56 %)	4,739 (9.50 %)	4,739 (9.50 %)	4,995 (90.50 %)	8,692 (6.62 %)	4,590 (0.74 %)	76,749 (12.63 %)	0 (0 %)	2,136 (0.62 %)	6,544 (24.85 %)	6,080 (17.91 %)
286	ascomycetes C.posadasii (CPA 0020 2008) GCA_000150615.1	n/a	n/a	1,336 (3.92 %)	4,612 (20.58 %)	n/a	46.79 (90.88 %)	3,895 (9.18 %)	3,895 (9.18 %)	4,519 (90.82 %)	9,378 (6.01 %)	4,252 (0.66 %)	75,128 (10.59 %)	1 (0.00 %)	1,414 (0.43 %)	6,248 (26.84 %)	5,812 (17.54 %)
287	ascomycetes C.posadasii (CPA 0066 2008) GCA_000150645.1	n/a	n/a	1,367 (3.92 %)	4,556 (19.92 %)	n/a	46.25 (91.89 %)	3,794 (8.16 %)	3,794 (8.16 %)	4,269 (91.84 %)	9,506 (6.42 %)	4,297 (0.65 %)	74,783 (11.37 %)	1 (0.01 %)	1,988 (0.62 %)	6,276 (25.99 %)	5,925 (17.87 %)
288	ascomycetes C.posadasii (RMSCC 1037 2008) GCA_000150555.1	n/a	n/a	1,350 (4.09 %)	4,646 (21.15 %)	n/a	46.84 (92.61 %)	3,681 (7.44 %)	3,681 (7.44 %)	4,316 (92.56 %)	8,874 (5.68 %)	4,045 (0.63 %)	68,500 (9.85 %)	0 (0 %)	1,149 (0.40 %)	6,227 (27.15 %)	5,835 (18.09 %)
289	ascomycetes C.posadasii (RMSCC 1038 2008) GCA_000150585.1	n/a	n/a	1,310 (4.09 %)	4,537 (21.43 %)	n/a	47.13 (90.23 %)	4,339 (9.83 %)	4,339 (9.83 %)	4,893 (90.17 %)	8,365 (5.21 %)	3,764 (0.54 %)	64,152 (8.79 %)	0 (0 %)	1,077 (0.38 %)	6,305 (26.44 %)	5,850 (17.75 %)
290	ascomycetes C.posadasii (RMSCC 2133 2007) GCA_000150185.1	n/a	n/a	1,493 (4.23 %)	5,322 (24.65 %)	n/a	46.99 (97.08 %)	997 (2.94 %)	997 (2.94 %)	1,052 (97.06 %)	10,190 (5.53 %)	4,797 (0.78 %)	75,638 (10.73 %)	0 (0 %)	2,299 (0.67 %)	5,023 (32.72 %)	5,043 (15.98 %)
291	ascomycetes C.posadasii (RMSCC 3488 2007) GCA_000150055.1	n/a	10,083 (53.55 %)	1,519 (4.12 %)	5,302 (23.71 %)	n/a	46.28 (99.56 %)	278 (0.44 %)	278 (0.44 %)	287 (99.56 %)	10,863 (7.25 %)	5,139 (0.92 %)	77,443 (13.46 %)	0 (0 %)	3,290 (0.90 %)	4,878 (31.29 %)	4,984 (16.11 %)
292	ascomycetes C.posadasii (RMSCC 3700 2007) GCA_000150215.1	n/a	n/a	1,393 (4.43 %)	4,816 (24.47 %)	n/a	48.08 (91.97 %)	2,856 (8.07 %)	2,856 (8.07 %)	3,099 (91.93 %)	8,305 (3.39 %)	3,690 (0.54 %)	64,512 (6.75 %)	0 (0 %)	546 (0.23 %)	5,687 (29.81 %)	5,256 (15.95 %)
293	ascomycetes C.posadasii str. (Silveira 2022 refseq) GCF_018416015.2	8,491 (50.22 %)	n/a	1,545 (4.18 %)	5,484 (24.97 %)	n/a	46.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	10,017 (1.43 %)	5,347 (0.97 %)	76,896 (12.40 %)	0 (0 %)	3,601 (1.07 %)	4,902 (33.47 %)	4,995 (16.21 %)
294	ascomycetes C.psammophila CBS 110553 GCF_000585535.1	13,421 (48.09 %)	n/a	1,556 (3.01 %)	8,091 (28.36 %)	n/a	50.62 (99.78 %)	0 (0 %)	194 (0.22 %)	123 (100.00 %)	9,174 (0.95 %)	4,416 (0.57 %)	95,565 (7.66 %)	30 (0.01 %)	1,057 (0.20 %)	671 (69.69 %)	1,089 (13.90 %)
295	ascomycetes C.queenslandicum (CBS 280.77 2015) GCA_001430955.1	n/a	n/a	1,503 (3.84 %)	5,017 (21.90 %)	n/a	53.17 (94.06 %)	0 (0 %)	6,477 (6.00 %)	2,724 (100.00 %)	4,884 (0.70 %)	1,737 (0.53 %)	124,197 (9.73 %)	1 (0.00 %)	431 (0.20 %)	7,296 (55.61 %)	6,650 (15.49 %)
296	ascomycetes C.Silveira (Silveira 2011) GCA_000170175.2	n/a	10,382 (58.65 %)	1,481 (4.16 %)	5,300 (24.54 %)	n/a	46.60 (99.44 %)	410 (0.57 %)	410 (0.57 %)	464 (99.43 %)	10,466 (6.01 %)	4,878 (0.84 %)	79,296 (12.27 %)	0 (0 %)	2,874 (0.77 %)	5,001 (31.82 %)	5,005 (16.09 %)
297	ascomycetes C.sp. (CBS 132003 2018) GCA_003709865.1	n/a	5,727 (45.33 %)	1,274 (4.14 %)	3,448 (23.52 %)	n/a	54.00 (99.99 %)	0 (0 %)	21 (0.01 %)	118 (100.00 %)	13,536 (3.20 %)	19,871 (5.22 %)	91,905 (11.32 %)	3 (0.00 %)	3,903 (1.05 %)	618 (95.09 %)	2,939 (13.45 %)
298	ascomycetes C.yegresii CBS 114405 GCF_000585515.1	10,118 (52.96 %)	n/a	1,422 (3.87 %)	4,969 (27.76 %)	n/a	54.00 (99.96 %)	0 (0 %)	55 (0.04 %)	8 (100.00 %)	4,590 (0.71 %)	2,092 (0.40 %)	80,683 (5.93 %)	33 (0.02 %)	170 (0.05 %)	10 (58.94 %)	18 (70.85 %)
299	ascomycetes E.africanus (CBS 136260 2016) GCA_001660665.1	n/a	8,860 (39.96 %)	1,419 (3.66 %)	4,811 (20.78 %)	n/a	43.45 (99.97 %)	0 (0 %)	14 (0.00 %)	4,444 (100.00 %)	20,480 (2.81 %)	9,331 (1.07 %)	134,935 (18.02 %)	0 (0 %)	309 (0.35 %)	7,283 (16.64 %)	6,359 (12.56 %)
300	ascomycetes E.aquamarina CBS 119918 GCF_000709125.1	13,118 (44.67 %)	n/a	1,586 (2.95 %)	9,420 (30.71 %)	n/a	48.98 (98.60 %)	0 (0 %)	536 (1.41 %)	151 (100.00 %)	6,742 (0.68 %)	3,230 (0.40 %)	74,032 (8.44 %)	65 (0.03 %)	1,720 (0.43 %)	9,531 (45.37 %)	10,895 (36.97 %)
301	ascomycetes E.crescens (UAMH 3008 2015) GCA_001008285.1	n/a	9,558 (42.72 %)	1,445 (3.64 %)	5,425 (23.35 %)	n/a	45.20 (99.52 %)	0 (0 %)	760 (0.48 %)	1,734 (100.00 %)	18,843 (2.58 %)	8,304 (1.29 %)	148,697 (14.00 %)	1 (0.00 %)	357 (0.17 %)	7,760 (18.63 %)	6,387 (12.25 %)
302	ascomycetes E.dermatitidis NIH/UT8656 GCF_000230625.1	9,578 (69.18 %)	n/a	1,520 (4.44 %)	5,758 (32.93 %)	n/a	51.51 (99.99 %)	228 (0.02 %)	228 (0.02 %)	239 (99.98 %)	6,131 (1.00 %)	2,479 (0.49 %)	82,208 (7.34 %)	76 (0.07 %)	461 (0.17 %)	111 (42.95 %)	172 (0.98 %)
303	ascomycetes E.festucae (Fl1 2018) GCA_003814445.1	n/a	7,137 (31.43 %)	1,467 (3.21 %)	5,918 (23.06 %)	n/a	43.71 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	21,743 (3.01 %)	18,092 (2.84 %)	86,265 (30.75 %)	0 (0 %)	10,793 (2.64 %)	1,170 (62.98 %)	1,330 (37.53 %)
304	ascomycetes E.glyceriae (E277 2011) GCA_000225285.2	n/a	n/a	1,540 (2.50 %)	8,061 (22.57 %)	n/a	44.96 (99.99 %)	33 (0.00 %)	33 (0.00 %)	3,109 (100.00 %)	17,187 (1.51 %)	13,761 (1.48 %)	131,999 (34.74 %)	0 (0 %)	12,522 (2.25 %)	2,546 (49.16 %)	2,332 (45.81 %)
305	ascomycetes E.mesophila GCF_000836275.1	10,358 (61.36 %)	n/a	1,464 (3.79 %)	7,016 (33.46 %)	n/a	50.43 (99.94 %)	55 (0.06 %)	55 (0.06 %)	64 (99.94 %)	5,487 (0.78 %)	2,700 (0.42 %)	84,646 (5.90 %)	21 (0.03 %)	179 (0.05 %)	10,077 (44.81 %)	8,639 (22.44 %)
306	ascomycetes E.oligosperma GCF_000835515.1	13,238 (57.56 %)	n/a	1,505 (2.97 %)	7,400 (26.56 %)	n/a	50.41 (99.21 %)	144 (0.80 %)	144 (0.80 %)	287 (99.20 %)	6,910 (0.70 %)	2,574 (0.34 %)	122,970 (6.81 %)	49 (0.21 %)	465 (0.20 %)	1,332 (35.30 %)	5,427 (11.83 %)
307	ascomycetes E.orientalis (5z489 2017) GCA_002110485.1	n/a	n/a	1,526 (3.27 %)	6,037 (22.12 %)	n/a	45.60 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	108 (100.00 %)	16,821 (2.02 %)	6,156 (0.76 %)	93,129 (15.19 %)	0 (0 %)	2,486 (1.20 %)	8,468 (18.05 %)	7,410 (14.01 %)
308	ascomycetes E.pasteurianus Ep9510 (UAMH 9510 2016) GCA_001883825.1	n/a	9,078 (39.69 %)	1,456 (3.51 %)	5,214 (21.24 %)	n/a	44.48 (99.90 %)	0 (0 %)	95 (0.09 %)	1,643 (100.00 %)	18,243 (2.29 %)	8,747 (1.04 %)	140,251 (14.34 %)	8 (0.01 %)	678 (0.18 %)	7,802 (16.61 %)	6,713 (12.37 %)
309	ascomycetes E.spinifera GCF_000836115.1	12,065 (54.37 %)	n/a	1,488 (3.45 %)	6,566 (28.63 %)	n/a	51.70 (99.88 %)	115 (0.12 %)	115 (0.12 %)	143 (99.88 %)	7,656 (0.92 %)	3,292 (0.48 %)	88,886 (5.83 %)	33 (0.04 %)	393 (0.12 %)	556 (30.36 %)	643 (2.17 %)
310	ascomycetes F.circinatum (NRRL 25331 2020) GCA_013396185.1	n/a	13,905 (48.91 %)	1,449 (2.51 %)	11,017 (31.56 %)	n/a	48.61 (99.99 %)	0 (0 %)	82 (0.00 %)	1,223 (100.00 %)	7,455 (0.72 %)	2,746 (0.30 %)	119,637 (6.01 %)	0 (0 %)	129 (0.02 %)	13,923 (31.88 %)	10,937 (16.40 %)
311	ascomycetes F.fujikuroi IMI 58289 GCF_900079805.1	3,788 (10.58 %)	n/a	1,511 (2.54 %)	10,413 (29.64 %)	n/a	47.47 (99.94 %)	97 (0.06 %)	97 (0.06 %)	109 (99.94 %)	8,412 (0.83 %)	3,937 (0.45 %)	114,544 (9.02 %)	1 (0.00 %)	1,667 (0.27 %)	13,683 (30.87 %)	11,623 (18.26 %)
312	ascomycetes F.graminearum (233423 2015) GCA_000966635.1	n/a	n/a	1,404 (2.86 %)	8,738 (31.06 %)	n/a	48.39 (99.29 %)	0 (0 %)	2,070 (0.73 %)	869 (100.00 %)	5,723 (0.65 %)	1,926 (0.24 %)	112,403 (6.30 %)	1 (0.00 %)	28 (0.03 %)	11,376 (29.13 %)	8,722 (14.72 %)
313	ascomycetes F.graminearum (PH-1 GZPH1RResV1 2016) GCA_900044135.1	n/a	49,544 (63.26 %)	1,442 (2.81 %)	8,783 (30.16 %)	n/a	48.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	n/a	3,339 (0.44 %)	100,688 (10.00 %)	0 (0 %)	615 (0.16 %)	11,225 (32.36 %)	9,076 (15.65 %)
314	ascomycetes F.mangiferae MRC7560 GCF_900044065.1	15,851 (50.02 %)	n/a	1,486 (2.41 %)	10,550 (28.88 %)	n/a	48.23 (98.75 %)	0 (0 %)	973 (1.25 %)	254 (100.00 %)	7,323 (0.66 %)	4,136 (0.42 %)	122,210 (6.93 %)	11 (0.01 %)	472 (0.08 %)	14,523 (32.28 %)	11,954 (17.44 %)
315	ascomycetes F.multimorphosa CBS 102226 GCF_000836435.1	12,373 (55.02 %)	n/a	1,513 (3.43 %)	6,695 (29.33 %)	n/a	52.60 (99.95 %)	66 (0.05 %)	66 (0.05 %)	133 (99.95 %)	5,879 (0.71 %)	3,151 (0.45 %)	90,070 (5.61 %)	30 (0.04 %)	273 (0.06 %)	222 (54.64 %)	685 (6.09 %)
316	ascomycetes F.odoratissimum (race 4 2013) GCA_000350365.1	n/a	14,459 (39.30 %)	1,541 (2.31 %)	11,553 (28.13 %)	n/a	48.12 (92.24 %)	2,994 (7.78 %)	2,994 (7.78 %)	3,834 (92.22 %)	8,909 (2.18 %)	3,466 (2.71 %)	138,894 (6.44 %)	140 (0.59 %)	2,171 (7.56 %)	15,716 (27.33 %)	12,581 (15.22 %)
317	ascomycetes F.odoratissimum NRRL 54006 GCF_000260195.1	22,547 (63.77 %)	n/a	1,507 (2.42 %)	11,028 (29.03 %)	n/a	47.51 (99.73 %)	298 (0.28 %)	298 (0.28 %)	716 (99.72 %)	8,724 (2.89 %)	3,353 (0.36 %)	118,646 (8.15 %)	24 (0.03 %)	1,509 (0.29 %)	14,180 (29.99 %)	12,103 (17.86 %)
318	ascomycetes F.oxysporum (f. sp. lycopersici 4287 2015) GCF_000149955.1	27,467 (57.09 %)	n/a	1,596 (1.98 %)	14,046 (27.45 %)	n/a	48.40 (97.65 %)	1,277 (2.36 %)	1,277 (2.36 %)	1,362 (97.64 %)	12,434 (4.43 %)	4,230 (0.38 %)	107,637 (6.53 %)	4 (0.01 %)	1,582 (0.69 %)	18,316 (30.75 %)	16,265 (20.54 %)
319	ascomycetes F.oxysporum (Fo47 2014) GCA_000271705.2	n/a	25,183 (63.82 %)	1,549 (2.31 %)	11,289 (28.05 %)	n/a	47.68 (99.55 %)	295 (0.45 %)	295 (0.45 %)	419 (99.55 %)	9,147 (2.47 %)	3,607 (0.38 %)	135,611 (7.46 %)	39 (0.02 %)	956 (0.15 %)	15,195 (29.44 %)	12,511 (16.71 %)
320	ascomycetes F.oxysporum (NRRL 32931 2014 refseq) GCF_000271745.1	23,795 (64.86 %)	n/a	1,502 (2.37 %)	12,354 (31.46 %)	n/a	47.63 (98.55 %)	377 (1.46 %)	377 (1.46 %)	545 (98.54 %)	8,453 (2.23 %)	3,560 (0.37 %)	129,150 (7.65 %)	11 (0.00 %)	1,096 (0.18 %)	14,398 (29.11 %)	11,860 (16.53 %)
321	ascomycetes F.oxysporum f. sp. conglutinans (Fo5176 2020) GCA_014154955.1	n/a	17,912 (41.71 %)	1,667 (1.86 %)	14,477 (28.70 %)	n/a	48.20 (99.99 %)	0 (0 %)	6 (0.01 %)	19 (100.00 %)	16,795 (9.69 %)	7,333 (0.68 %)	88,939 (11.51 %)	0 (0 %)	4,026 (1.12 %)	19,421 (34.89 %)	17,706 (24.27 %)
322	ascomycetes F.oxysporum f. sp. cubense (race 1 2013) GCA_000350345.1	n/a	15,438 (44.37 %)	1,458 (2.29 %)	10,985 (28.53 %)	n/a	48.03 (98.43 %)	844 (1.57 %)	844 (1.57 %)	2,185 (98.43 %)	8,347 (2.12 %)	3,172 (0.51 %)	139,622 (6.95 %)	7 (0.04 %)	784 (0.79 %)	14,556 (28.77 %)	11,556 (15.02 %)
323	ascomycetes F.oxysporum f. sp. melonis (26406 2014) GCA_000260495.2	n/a	27,091 (61.07 %)	1,528 (2.13 %)	11,797 (26.61 %)	n/a	47.51 (99.54 %)	679 (0.46 %)	679 (0.46 %)	1,825 (99.54 %)	10,647 (2.94 %)	4,182 (0.40 %)	135,164 (7.29 %)	103 (0.14 %)	1,328 (0.41 %)	16,507 (28.40 %)	14,109 (17.73 %)
324	ascomycetes F.pedrosoi CBS 271.37 GCF_000835455.1	12,538 (53.32 %)	n/a	1,475 (3.25 %)	5,998 (25.59 %)	n/a	52.35 (99.84 %)	87 (0.16 %)	87 (0.16 %)	98 (99.84 %)	9,141 (1.04 %)	3,007 (0.41 %)	113,468 (6.90 %)	28 (0.06 %)	430 (0.13 %)	73 (34.37 %)	784 (2.39 %)
325	ascomycetes F.proliferatum (NRRL62905 2016) GCA_900029915.1	n/a	42,894 (51.37 %)	1,466 (2.53 %)	10,108 (29.44 %)	n/a	48.72 (100.00 %)	0 (0 %)	42 (0.00 %)	155 (100.00 %)	6,899 (0.66 %)	2,616 (0.30 %)	122,137 (6.03 %)	0 (0 %)	173 (0.03 %)	14,158 (32.33 %)	11,127 (16.23 %)
326	ascomycetes F.proliferatum ET1 GCF_900067095.1	16,184 (51.27 %)	n/a	1,476 (2.43 %)	10,277 (28.77 %)	n/a	48.45 (99.32 %)	0 (0 %)	196 (0.68 %)	32 (100.00 %)	7,350 (0.68 %)	3,114 (0.32 %)	127,451 (6.63 %)	1 (0.00 %)	339 (0.06 %)	14,475 (31.60 %)	11,546 (16.34 %)
327	ascomycetes F.solani GCF_020744495.1	17,654 (53.59 %)	n/a	1,516 (2.08 %)	9,410 (22.78 %)	n/a	51.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	74 (100.00 %)	9,929 (0.81 %)	6,521 (0.62 %)	153,362 (9.03 %)	0 (0 %)	2,265 (0.29 %)	5,613 (80.66 %)	7,766 (48.94 %)
328	ascomycetes F.vanettenii 77-13-4 GCF_000151355.1	15,708 (46.10 %)	n/a	1,468 (2.10 %)	9,262 (23.14 %)	n/a	50.79 (99.89 %)	24 (0.11 %)	27 (0.11 %)	233 (99.89 %)	10,515 (1.09 %)	5,721 (0.58 %)	165,963 (8.75 %)	0 (0 %)	1,327 (0.29 %)	7,139 (35.34 %)	9,149 (18.89 %)
329	ascomycetes F.verticillioides 7600 GCF_000149555.1	20,646 (66.06 %)	n/a	1,427 (2.48 %)	8,826 (26.96 %)	n/a	48.68 (99.78 %)	189 (0.22 %)	189 (0.22 %)	211 (99.78 %)	7,242 (0.80 %)	2,787 (0.32 %)	137,484 (7.24 %)	0 (0 %)	264 (0.11 %)	13,619 (32.25 %)	10,324 (14.54 %)
330	ascomycetes G.tritici R3-111a-1 GCF_000145635.1	14,663 (60.02 %)	n/a	1,118 (2.05 %)	2,098 (7.91 %)	n/a	56.79 (93.64 %)	1,343 (6.37 %)	1,501 (6.37 %)	1,860 (93.63 %)	19,701 (2.04 %)	9,458 (1.01 %)	216,344 (14.76 %)	62 (0.13 %)	2,007 (0.64 %)	572 (28.42 %)	622 (4.38 %)
331	ascomycetes H.capsulatum (G184AR 2021) GCA_017607465.1	n/a	12,723 (70.51 %)	1,487 (3.70 %)	4,955 (21.42 %)	n/a	44.27 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	15,347 (2.07 %)	8,212 (1.32 %)	117,386 (15.92 %)	0 (0 %)	3,871 (0.86 %)	7,369 (21.57 %)	6,788 (14.48 %)
332	ascomycetes H.capsulatum (G186AR 2021) GCA_017355575.1	n/a	12,743 (70.42 %)	1,473 (3.65 %)	5,009 (21.69 %)	n/a	44.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	15,958 (2.14 %)	8,767 (1.39 %)	118,263 (16.18 %)	0 (0 %)	4,015 (0.89 %)	7,393 (21.34 %)	6,812 (14.38 %)
333	ascomycetes H.capsulatum (H143 2009) GCA_000151035.1	n/a	9,796 (35.62 %)	1,393 (2.89 %)	4,622 (15.66 %)	n/a	41.71 (92.89 %)	4,218 (7.16 %)	4,218 (7.16 %)	4,267 (92.84 %)	16,353 (2.38 %)	6,095 (0.71 %)	130,058 (22.87 %)	1 (0.02 %)	5,360 (1.47 %)	7,464 (14.46 %)	7,033 (12.06 %)
334	ascomycetes H.capsulatum (WU24 2021) GCA_017310585.1	n/a	9,195 (34.26 %)	1,493 (3.50 %)	5,639 (23.26 %)	n/a	46.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	17,528 (2.19 %)	11,139 (1.55 %)	88,572 (12.58 %)	0 (0 %)	5,362 (1.70 %)	8,087 (23.04 %)	7,273 (15.68 %)
335	ascomycetes H.capsulatum NAm1 GCF_000149585.1	9,313 (39.89 %)	n/a	1,376 (3.41 %)	4,976 (20.25 %)	n/a	46.13 (92.82 %)	2,593 (7.21 %)	2,593 (7.21 %)	2,873 (92.79 %)	16,169 (3.09 %)	9,732 (1.28 %)	93,133 (11.76 %)	0 (0 %)	3,667 (1.25 %)	7,980 (20.25 %)	6,998 (14.15 %)
336	ascomycetes H.capsulatum var. duboisii (H88 2021) GCA_017310615.1	n/a	12,289 (55.76 %)	1,464 (3.04 %)	5,147 (17.74 %)	n/a	41.97 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	22,583 (31.35 %)	6,888 (0.89 %)	128,273 (24.54 %)	0 (0 %)	7,479 (1.51 %)	7,379 (17.46 %)	7,204 (14.72 %)
337	ascomycetes H.lauricola (RL4 2020) GCA_014183025.1	n/a	n/a	1,005 (2.04 %)	1,902 (7.18 %)	n/a	55.34 (99.08 %)	0 (0 %)	456 (0.93 %)	169 (100.00 %)	21,388 (2.77 %)	12,105 (1.30 %)	197,032 (16.69 %)	26 (0.05 %)	922 (0.27 %)	871 (91.20 %)	995 (2.90 %)
338	ascomycetes H.ohiense (G217B 2021) GCA_017607445.1	n/a	12,363 (54.81 %)	1,508 (2.97 %)	5,368 (17.81 %)	n/a	42.63 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	30,743 (36.13 %)	14,920 (2.40 %)	103,999 (30.12 %)	0 (0 %)	17,186 (3.22 %)	7,244 (15.90 %)	7,033 (12.97 %)
339	ascomycetes H.werneckii (EXF-2000 2017) GCA_002127715.1	n/a	15,649 (48.60 %)	2,606 (3.88 %)	10,814 (33.27 %)	n/a	53.49 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	629 (100.00 %)	13,384 (1.17 %)	4,719 (0.56 %)	156,047 (8.38 %)	0 (0 %)	915 (0.26 %)	863 (97.46 %)	656 (31.11 %)
340	ascomycetes L.prolificans (JHH-5317 2017) GCA_002276285.1	n/a	8,767 (35.16 %)	1,381 (2.79 %)	5,327 (19.33 %)	n/a	51.46 (99.99 %)	0 (0 %)	498 (0.00 %)	1,625 (100.00 %)	11,563 (1.51 %)	5,901 (0.79 %)	110,823 (8.61 %)	2 (0.00 %)	2,093 (0.80 %)	778 (95.65 %)	625 (1.65 %)
341	ascomycetes M.anisopliae (ARSEF 549 2015) GCA_000814975.1	n/a	10,891 (42.38 %)	1,457 (2.88 %)	7,921 (27.27 %)	n/a	50.95 (99.54 %)	0 (0 %)	139 (0.46 %)	74 (100.00 %)	7,701 (0.83 %)	4,338 (0.61 %)	107,930 (7.11 %)	0 (0 %)	603 (0.19 %)	1,112 (91.60 %)	2,307 (8.33 %)
342	ascomycetes M.canis CBS 113480 GCF_000151145.1	8,765 (55.48 %)	n/a	1,418 (4.65 %)	5,194 (29.39 %)	n/a	47.50 (99.47 %)	293 (0.54 %)	293 (0.54 %)	310 (99.46 %)	7,251 (2.48 %)	2,989 (0.57 %)	85,119 (9.98 %)	0 (0 %)	844 (0.38 %)	6,048 (25.22 %)	4,972 (14.01 %)
343	ascomycetes M.fructicola (CPMC6 2021) GCA_016906325.1	n/a	10,409 (39.34 %)	1,520 (2.72 %)	8,346 (24.27 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	99 (100.00 %)	36,177 (4.40 %)	31,295 (3.37 %)	169,408 (17.84 %)	0 (0 %)	2,827 (0.51 %)	4,804 (6.64 %)	3,794 (4.60 %)
344	ascomycetes M.mycetomatis (mm55 2016) GCA_001275765.2	n/a	10,707 (43.43 %)	1,315 (2.71 %)	3,551 (13.91 %)	n/a	54.86 (99.98 %)	0 (0 %)	19,219 (0.07 %)	804 (100.00 %)	9,174 (1.08 %)	4,875 (0.67 %)	108,017 (8.05 %)	0 (0 %)	1,041 (0.24 %)	1,213 (94.15 %)	1,439 (89.38 %)
345	ascomycetes M.poae (ATCC 64411 2011) GCA_000193285.1	n/a	12,529 (64.67 %)	1,001 (2.16 %)	1,386 (6.22 %)	n/a	56.90 (87.49 %)	2,912 (12.53 %)	2,912 (12.53 %)	3,120 (87.47 %)	15,869 (2.02 %)	6,394 (0.80 %)	177,944 (11.68 %)	10 (0.01 %)	581 (0.17 %)	296 (90.41 %)	365 (3.36 %)
346	ascomycetes N.crassa OR74A GCF_000182925.2	11,200 (52.09 %)	n/a	1,439 (2.68 %)	5,971 (21.55 %)	n/a	48.23 (99.90 %)	391 (0.10 %)	391 (0.10 %)	412 (99.90 %)	24,959 (4.79 %)	11,039 (1.22 %)	182,590 (16.30 %)	11 (0.01 %)	2,809 (0.45 %)	1,317 (51.92 %)	3,659 (15.56 %)
347	ascomycetes N.gypsea CBS 118893 GCF_000150975.2	8,932 (55.49 %)	n/a	1,426 (4.67 %)	5,171 (29.24 %)	n/a	48.46 (99.33 %)	300 (0.68 %)	300 (0.68 %)	319 (99.32 %)	9,875 (1.97 %)	3,218 (0.52 %)	83,553 (9.00 %)	0 (0 %)	168 (0.14 %)	6,622 (30.46 %)	5,519 (14.08 %)
348	ascomycetes N.tetrasperma FGSC 2508 GCF_000213175.1	10,379 (42.46 %)	n/a	1,396 (2.77 %)	5,435 (21.08 %)	n/a	49.42 (98.33 %)	470 (1.67 %)	533 (1.67 %)	551 (98.33 %)	20,459 (2.29 %)	8,004 (0.88 %)	171,762 (13.38 %)	12 (0.06 %)	596 (0.20 %)	1,529 (53.92 %)	5,218 (18.75 %)
349	ascomycetes O.piceae (UAMH 11346 2013) GCA_000410735.1	n/a	8,884 (45.58 %)	1,252 (2.84 %)	3,480 (18.09 %)	n/a	53.35 (98.98 %)	336 (1.02 %)	336 (1.02 %)	381 (98.98 %)	20,440 (3.31 %)	15,202 (1.79 %)	158,836 (13.20 %)	2 (0.00 %)	753 (0.13 %)	189 (97.82 %)	686 (1.89 %)
350	ascomycetes P.anserina S mat+ GCF_000226545.1	10,514 (45.78 %)	n/a	1,310 (2.86 %)	4,398 (18.90 %)	n/a	52.23 (98.66 %)	0 (0 %)	1,002 (1.35 %)	33 (100.00 %)	12,488 (1.64 %)	6,299 (0.87 %)	154,478 (11.91 %)	1 (0.00 %)	675 (0.15 %)	5,533 (54.96 %)	9,291 (32.03 %)
351	ascomycetes P.attinorum GCF_001299255.1	11,841 (56.05 %)	n/a	1,397 (3.43 %)	6,556 (30.26 %)	n/a	53.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	131 (100.00 %)	2,440 (0.38 %)	1,592 (0.35 %)	80,616 (5.44 %)	0 (0 %)	153 (0.04 %)	91 (52.21 %)	100 (39.42 %)
352	ascomycetes P.brasiliensis (Pb03 2014) GCA_000150475.2	n/a	8,548 (40.36 %)	1,423 (3.85 %)	4,664 (21.95 %)	n/a	44.49 (99.23 %)	431 (0.78 %)	431 (0.78 %)	496 (99.22 %)	15,304 (2.39 %)	10,298 (1.32 %)	110,366 (13.19 %)	4 (0.01 %)	900 (0.40 %)	6,887 (15.80 %)	5,926 (11.22 %)
353	ascomycetes P.brasiliensis Pb18 GCF_000150735.1	8,419 (39.78 %)	n/a	1,447 (3.80 %)	4,592 (21.23 %)	n/a	44.35 (98.39 %)	499 (1.62 %)	499 (1.62 %)	556 (98.38 %)	15,836 (2.53 %)	10,643 (1.38 %)	108,444 (14.01 %)	9 (0.03 %)	1,336 (0.67 %)	6,868 (15.06 %)	5,983 (11.23 %)
354	ascomycetes P.canis (CanA 2021) GCA_017788925.1	n/a	3,113 (63.26 %)	749 (7.57 %)	433 (5.45 %)	n/a	25.86 (100.00 %)	0 (0 %)	16 (0.00 %)	33 (100.00 %)	4,295 (2.67 %)	1,289 (0.66 %)	68,030 (37.84 %)	0 (0 %)	110 (0.12 %)	2 (0.01 %)	1 (0.00 %)
355	ascomycetes P.carinii B80 GCF_001477545.1	3,650 (70.22 %)	n/a	760 (7.58 %)	602 (7.95 %)	n/a	27.76 (100.00 %)	16 (0.00 %)	16 (0.00 %)	78 (100.00 %)	4,444 (2.94 %)	2,810 (1.48 %)	70,130 (32.77 %)	0 (0 %)	658 (0.75 %)	7 (0.04 %)	5 (0.03 %)
356	ascomycetes P.comata (T 2018) GCA_900290415.1	n/a	28,785 (49.18 %)	1,327 (2.92 %)	4,431 (19.17 %)	n/a	52.42 (99.34 %)	0 (0 %)	190 (0.66 %)	8 (100.00 %)	12,497 (1.62 %)	6,253 (1.54 %)	149,339 (11.31 %)	2 (0.01 %)	540 (0.57 %)	5,988 (71.29 %)	9,418 (32.86 %)
357	ascomycetes P.destructans (20631-21 2010 refseq) GCF_000184105.1	9,179 (55.01 %)	n/a	1,446 (3.95 %)	5,551 (35.58 %)	n/a	50.12 (92.42 %)	1,732 (7.59 %)	2,066 (7.59 %)	3,579 (92.41 %)	11,499 (5.71 %)	11,754 (2.10 %)	87,648 (13.51 %)	22 (0.03 %)	2,836 (0.73 %)	4,483 (54.70 %)	4,759 (18.94 %)
358	ascomycetes P.digitatum (Pd1 2012 refseq) GCF_000315645.1	8,946 (49.27 %)	n/a	1,464 (4.52 %)	5,593 (29.87 %)	n/a	48.94 (95.52 %)	508 (4.49 %)	514 (4.49 %)	561 (95.51 %)	3,524 (0.59 %)	2,199 (0.38 %)	66,592 (6.00 %)	8 (0.02 %)	342 (0.13 %)	7,344 (38.14 %)	6,770 (25.11 %)
359	ascomycetes P.expansum (d1 2014) GCA_000769735.1	n/a	11,023 (51.98 %)	1,562 (3.74 %)	8,126 (31.40 %)	n/a	47.57 (100.00 %)	262 (0.00 %)	262 (0.00 %)	532 (100.00 %)	5,716 (0.80 %)	4,589 (0.79 %)	90,190 (7.93 %)	11 (0.00 %)	671 (0.16 %)	8,824 (36.67 %)	8,447 (26.56 %)
360	ascomycetes P.fijiensis CIRAD86 GCF_000340215.1	13,060 (24.73 %)	n/a	1,579 (1.62 %)	9,082 (16.66 %)	n/a	45.17 (99.45 %)	722 (0.55 %)	722 (0.55 %)	778 (99.45 %)	21,161 (1.27 %)	25,626 (2.64 %)	294,015 (31.02 %)	2 (0.00 %)	32,869 (3.78 %)	53 (0.14 %)	1,204 (14.12 %)
361	ascomycetes P.jirovecii (SE8 2012) GCA_000333975.2	n/a	20,425 (52.47 %)	810 (7.29 %)	474 (4.96 %)	n/a	28.38 (99.99 %)	0 (0 %)	4 (0.00 %)	357 (100.00 %)	3,855 (2.48 %)	2,292 (1.03 %)	71,472 (33.79 %)	0 (0 %)	87 (0.40 %)	101 (0.95 %)	96 (0.82 %)
362	ascomycetes P.jirovecii RU7 GCF_001477535.1	3,765 (64.09 %)	n/a	778 (6.91 %)	514 (5.59 %)	n/a	28.66 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	70 (100.00 %)	4,109 (2.60 %)	2,662 (1.17 %)	73,897 (34.84 %)	0 (0 %)	199 (0.18 %)	106 (1.60 %)	104 (1.41 %)
363	ascomycetes P.lutzii Pb01 GCF_000150705.2	8,848 (36.57 %)	n/a	1,461 (3.48 %)	4,978 (20.15 %)	n/a	42.82 (99.09 %)	562 (0.91 %)	562 (0.91 %)	672 (99.09 %)	16,168 (2.20 %)	11,561 (1.36 %)	113,069 (17.82 %)	9 (0.01 %)	1,865 (0.67 %)	6,833 (12.73 %)	6,207 (10.57 %)
364	ascomycetes P.murina B123 GCF_000349005.2	3,628 (69.78 %)	n/a	780 (7.85 %)	482 (5.89 %)	n/a	26.96 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	21 (100.00 %)	3,808 (2.42 %)	1,181 (0.68 %)	70,567 (34.93 %)	0 (0 %)	237 (0.28 %)	21 (0.08 %)	2 (0.01 %)
365	ascomycetes P.nodorum (SN15 2021) GCA_016801405.1	n/a	17,882 (55.77 %)	1,496 (3.02 %)	8,975 (31.61 %)	n/a	50.35 (100.00 %)	8 (0.00 %)	8 (0.00 %)	31 (100.00 %)	6,117 (0.77 %)	4,120 (0.90 %)	79,009 (8.53 %)	0 (0 %)	3,392 (0.90 %)	140 (95.03 %)	178 (44.52 %)
366	ascomycetes P.omphalodes (CBS 144459 2022) GCA_024516155.1	n/a	11,633 (27.54 %)	1,663 (2.09 %)	9,636 (18.44 %)	n/a	46.68 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	260 (100.00 %)	64,765 (31.51 %)	44,403 (4.10 %)	164,270 (18.97 %)	0 (0 %)	29,560 (6.38 %)	11,076 (26.80 %)	8,632 (9.74 %)
367	ascomycetes P.oryctolagi (RABM 2021) GCA_017311285.1	n/a	2,856 (60.26 %)	751 (7.56 %)	398 (4.89 %)	n/a	28.62 (97.00 %)	0 (0 %)	235 (3.01 %)	38 (100.00 %)	3,730 (2.27 %)	1,849 (1.27 %)	67,870 (33.55 %)	1 (0.02 %)	229 (0.30 %)	130 (2.92 %)	92 (1.62 %)
368	ascomycetes P.pennisetigena (Br36 2019 refseq) GCF_004337985.1	11,430 (33.47 %)	n/a	1,482 (2.32 %)	7,302 (20.85 %)	n/a	47.48 (99.41 %)	0 (0 %)	1,281 (0.60 %)	108 (100.00 %)	24,221 (1.87 %)	11,049 (1.23 %)	163,225 (20.20 %)	5 (0.01 %)	7,142 (1.57 %)	764 (17.56 %)	1,559 (15.28 %)
369	ascomycetes P.rubens (Wisconsin 54-1255 2008 refseq) GCF_000226395.1	4,800 (20.67 %)	n/a	1,560 (3.73 %)	7,756 (30.06 %)	n/a	48.96 (99.94 %)	0 (0 %)	775 (0.06 %)	49 (100.00 %)	5,709 (0.78 %)	4,560 (0.81 %)	73,645 (5.86 %)	1 (0.01 %)	1,650 (0.43 %)	7,807 (50.55 %)	7,905 (32.71 %)
370	ascomycetes P.sp. 'macacae' (P2C 2021) GCA_018127085.1	n/a	3,427 (62.58 %)	770 (6.89 %)	497 (6.26 %)	n/a	29.15 (100.00 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	19 (100.00 %)	4,072 (9.89 %)	1,666 (1.19 %)	72,436 (34.40 %)	0 (0 %)	466 (0.45 %)	171 (3.07 %)	171 (2.73 %)
371	ascomycetes P.wakefieldiae (2A 2021) GCA_017301755.1	n/a	3,223 (64.69 %)	795 (8.10 %)	538 (6.89 %)	n/a	29.80 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	18 (100.00 %)	2,638 (1.62 %)	774 (0.44 %)	65,281 (29.00 %)	0 (0 %)	33 (0.05 %)	53 (0.41 %)	43 (0.30 %)
372	ascomycetes P.zonata CBS 506.65 GCF_001890105.1	9,870 (61.29 %)	n/a	1,504 (4.42 %)	4,192 (22.13 %)	n/a	49.95 (99.72 %)	182 (0.28 %)	182 (0.28 %)	428 (99.72 %)	14,259 (2.33 %)	8,758 (1.36 %)	94,869 (12.95 %)	10 (0.01 %)	647 (0.18 %)	933 (41.44 %)	1,130 (6.41 %)
373	ascomycetes R.mackenziei CBS 650.93 GCF_000835555.1	11,386 (51.51 %)	n/a	1,515 (3.58 %)	6,824 (29.41 %)	n/a	50.42 (99.87 %)	113 (0.13 %)	113 (0.13 %)	130 (99.87 %)	3,643 (0.42 %)	1,316 (0.33 %)	79,136 (5.78 %)	26 (0.07 %)	669 (0.20 %)	699 (74.68 %)	3,906 (11.13 %)
374	ascomycetes S.apiospermum GCF_000732125.1	8,376 (31.82 %)	n/a	1,398 (2.43 %)	5,603 (17.78 %)	n/a	50.36 (99.46 %)	0 (0 %)	171 (0.54 %)	176 (100.00 %)	13,364 (1.32 %)	8,083 (0.90 %)	147,775 (10.94 %)	7 (0.04 %)	781 (0.31 %)	314 (46.36 %)	670 (1.81 %)
375	ascomycetes S.brasiliensis 5110 GCF_000820605.1	9,091 (43.85 %)	n/a	1,151 (2.53 %)	2,156 (10.95 %)	n/a	54.72 (100.00 %)	69 (0.00 %)	69 (0.00 %)	82 (100.00 %)	18,037 (2.49 %)	10,218 (1.16 %)	171,739 (14.03 %)	0 (0 %)	804 (0.16 %)	9 (32.06 %)	30 (0.12 %)
376	ascomycetes S.chartarum (IBT 40293 2014) GCA_000732565.1	n/a	11,453 (47.51 %)	1,252 (2.62 %)	6,363 (24.35 %)	n/a	53.31 (99.43 %)	1,925 (0.58 %)	1,960 (0.58 %)	4,267 (99.42 %)	7,891 (0.87 %)	3,567 (0.53 %)	121,139 (7.59 %)	0 (0 %)	491 (0.09 %)	1,767 (88.43 %)	2,087 (68.78 %)
377	ascomycetes S.japonicus yFS275 GCF_000149845.2	4,893 (77.42 %)	n/a	2,559 (22.72 %)	3,358 (44.46 %)	n/a	43.79 (94.91 %)	55 (5.09 %)	55 (5.09 %)	87 (94.91 %)	2,222 (1.07 %)	1,086 (0.64 %)	41,749 (7.85 %)	0 (0 %)	1,667 (1.83 %)	955 (11.01 %)	860 (6.65 %)
378	ascomycetes S.macrospora (v3 k-hell 2012) GCF_000182805.3	9,838 (39.57 %)	n/a	1,303 (2.59 %)	4,633 (17.87 %)	n/a	52.03 (99.65 %)	0 (0 %)	965 (0.36 %)	1,212 (100.00 %)	16,908 (1.86 %)	7,307 (0.77 %)	169,928 (11.07 %)	0 (0 %)	371 (0.08 %)	1,462 (94.20 %)	6,334 (16.07 %)
379	ascomycetes S.octosporus yFS286 GCF_000150505.1	5,069 (80.37 %)	n/a	3,612 (34.81 %)	3,301 (42.19 %)	n/a	37.55 (96.81 %)	13 (3.19 %)	13 (3.19 %)	18 (96.81 %)	3,776 (1.59 %)	1,082 (0.57 %)	64,339 (13.79 %)	0 (0 %)	634 (0.75 %)	141 (0.49 %)	127 (0.43 %)
380	ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 refseq) GCF_000961545.1	10,279 (48.37 %)	n/a	1,138 (2.55 %)	2,026 (10.60 %)	n/a	54.96 (100.00 %)	57 (0.00 %)	57 (0.00 %)	73 (100.00 %)	15,858 (2.29 %)	8,000 (0.94 %)	169,678 (13.75 %)	0 (0 %)	339 (0.06 %)	16 (52.05 %)	22 (0.11 %)
381	ascomycetes S.sclerotiorum UF-70 (1980 2016) GCA_001857865.1	n/a	11,369 (41.32 %)	1,481 (2.96 %)	8,327 (26.70 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	17 (100.00 %)	21,205 (4.36 %)	9,974 (1.23 %)	147,208 (14.62 %)	0 (0 %)	2,714 (0.72 %)	2,430 (2.44 %)	1,957 (1.86 %)
382	ascomycetes T.atroviride (JCM 9410 2016) GCA_001599035.1	n/a	n/a	1,416 (2.89 %)	6,419 (24.16 %)	n/a	49.00 (99.04 %)	0 (0 %)	2,089 (0.97 %)	23 (100.00 %)	10,654 (1.22 %)	8,831 (1.08 %)	133,778 (10.19 %)	39 (0.03 %)	1,005 (0.20 %)	3,768 (72.41 %)	7,409 (18.00 %)
383	ascomycetes T.equinum (CBS 127.97 2008) GCA_000151175.1	n/a	8,785 (51.32 %)	1,417 (4.59 %)	5,375 (28.40 %)	n/a	47.37 (97.21 %)	1,591 (2.82 %)	1,591 (2.82 %)	1,716 (97.18 %)	11,405 (2.10 %)	5,401 (0.85 %)	69,199 (12.39 %)	0 (0 %)	1,144 (0.53 %)	6,385 (27.32 %)	5,695 (16.47 %)
384	ascomycetes T.marneffei (ATCC 18224 2008 refseq) GCF_000001985.1	10,638 (60.93 %)	n/a	1,535 (4.19 %)	7,771 (34.22 %)	n/a	46.67 (99.38 %)	137 (0.62 %)	137 (0.62 %)	589 (99.38 %)	6,404 (1.04 %)	2,594 (0.58 %)	61,594 (6.70 %)	0 (0 %)	951 (0.36 %)	5,746 (15.84 %)	5,169 (10.66 %)
385	ascomycetes T.marneffei (TM4 2018) GCA_003971505.1	n/a	n/a	1,521 (4.15 %)	7,791 (34.62 %)	n/a	46.73 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	6,197 (0.93 %)	2,560 (0.54 %)	68,793 (6.72 %)	0 (0 %)	865 (0.32 %)	5,628 (15.87 %)	5,018 (10.21 %)
386	ascomycetes T.mentagrophytes (TIMM 2789 2018) GCA_003118255.1	n/a	24,869 (50.62 %)	1,458 (4.61 %)	5,459 (29.65 %)	n/a	48.11 (99.84 %)	370 (0.06 %)	370 (0.06 %)	16,913 (99.94 %)	14,912 (2.71 %)	5,959 (0.91 %)	98,737 (12.83 %)	0 (0 %)	112 (0.03 %)	6,577 (30.17 %)	5,602 (15.50 %)
387	ascomycetes T.reesei (QM6a 2017) GCA_002006585.1	n/a	n/a	1,363 (2.92 %)	3,408 (14.91 %)	n/a	51.08 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	18,326 (2.34 %)	11,676 (1.58 %)	129,728 (15.49 %)	0 (0 %)	3,188 (0.62 %)	381 (95.16 %)	668 (4.61 %)
388	ascomycetes T.reesei QM6a GCF_000167675.1	9,111 (42.48 %)	n/a	1,265 (2.86 %)	3,379 (15.58 %)	n/a	52.82 (99.86 %)	44 (0.14 %)	150 (0.14 %)	121 (99.86 %)	17,397 (2.17 %)	7,841 (1.06 %)	151,931 (12.78 %)	0 (0 %)	1,257 (0.19 %)	438 (40.31 %)	1,156 (4.14 %)
389	ascomycetes T.rubrum CBS 118892 GCF_000151425.1	10,433 (60.77 %)	n/a	1,389 (4.78 %)	4,715 (28.34 %)	n/a	48.28 (98.23 %)	588 (1.78 %)	588 (1.78 %)	624 (98.22 %)	9,453 (1.77 %)	3,813 (0.65 %)	84,503 (9.58 %)	1 (0.01 %)	228 (0.36 %)	6,130 (28.71 %)	4,925 (12.68 %)
390	ascomycetes T.stipitatus ATCC 10500 GCF_000003125.1	13,250 (56.15 %)	n/a	1,555 (3.38 %)	9,085 (30.87 %)	n/a	46.07 (99.64 %)	140 (0.36 %)	140 (0.36 %)	960 (99.64 %)	5,379 (0.87 %)	3,629 (0.75 %)	68,204 (8.29 %)	3 (0.01 %)	2,510 (0.79 %)	6,282 (11.55 %)	5,523 (8.88 %)
391	ascomycetes T.thermophilus ATCC 42464 GCF_000226095.1	9,097 (41.11 %)	n/a	1,465 (2.88 %)	3,487 (13.63 %)	n/a	51.46 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	20,281 (2.20 %)	7,727 (0.83 %)	122,614 (24.50 %)	0 (0 %)	8,821 (1.67 %)	89 (44.52 %)	193 (14.49 %)
392	ascomycetes T.tonsurans (CBS 112818 2009) GCA_000151455.1	n/a	8,625 (53.69 %)	1,390 (4.74 %)	4,980 (28.40 %)	n/a	48.12 (97.92 %)	1,053 (2.10 %)	1,053 (2.10 %)	1,164 (97.90 %)	10,131 (1.89 %)	4,923 (0.78 %)	79,798 (10.05 %)	0 (0 %)	300 (0.16 %)	6,315 (29.39 %)	5,329 (14.70 %)
393	ascomycetes T.virens Gv29-8 GCF_000170995.1	12,383 (47.70 %)	n/a	1,412 (2.71 %)	7,056 (25.05 %)	n/a	49.25 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	93 (100.00 %)	11,582 (1.31 %)	8,335 (1.03 %)	142,933 (9.44 %)	0 (0 %)	681 (0.16 %)	4,846 (52.69 %)	8,085 (17.76 %)
394	ascomycetes U.reesii 1704 GCF_000003515.1	7,759 (50.51 %)	n/a	1,431 (5.01 %)	4,863 (28.11 %)	n/a	48.66 (99.20 %)	538 (0.81 %)	538 (0.81 %)	583 (99.19 %)	2,750 (0.77 %)	920 (0.28 %)	48,695 (5.30 %)	1 (0.01 %)	611 (0.31 %)	2,297 (28.95 %)	2,971 (15.56 %)
395	ascomycetes V.dahliae (JR2 2014) GCA_000400815.2	n/a	n/a	1,309 (2.72 %)	3,758 (15.22 %)	n/a	53.89 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	13,736 (1.78 %)	8,998 (1.17 %)	106,375 (12.84 %)	0 (0 %)	4,136 (1.07 %)	34 (99.31 %)	65 (31.31 %)
396	ascomycetes V.gallopava GCF_000836295.1	11,366 (60.14 %)	n/a	1,554 (3.72 %)	7,215 (30.41 %)	n/a	49.07 (98.64 %)	198 (1.36 %)	198 (1.36 %)	565 (98.64 %)	7,529 (1.05 %)	3,079 (0.48 %)	66,788 (9.80 %)	35 (0.18 %)	1,907 (0.58 %)	799 (43.30 %)	685 (18.15 %)
397	ascomycetes X.arbuscula (CBS 124340 2022) GCA_022385695.1	n/a	13,122 (46.01 %)	1,477 (2.19 %)	8,849 (21.94 %)	n/a	44.26 (100.00 %)	52 (0.00 %)	52 (0.00 %)	141 (100.00 %)	13,755 (1.15 %)	15,097 (1.30 %)	102,158 (17.27 %)	3 (0.00 %)	3,087 (0.44 %)	5,597 (27.65 %)	6,675 (18.59 %)
398	ascomycetes Y.lipolytica (CLIB89W29 2016) GCF_001761485.1	8,056 (49.23 %)	n/a	1,760 (6.59 %)	4,813 (37.15 %)	n/a	49.05 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	7,137 (1.65 %)	9,696 (2.09 %)	81,942 (9.44 %)	0 (0 %)	864 (0.30 %)	6,254 (33.22 %)	5,354 (17.95 %)
399	ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 refseq) GCF_000219625.1	10,941 (38.49 %)	n/a	1,456 (2.81 %)	6,906 (25.36 %)	n/a	52.14 (99.98 %)	3 (0.02 %)	3 (0.02 %)	24 (99.98 %)	8,941 (1.69 %)	8,367 (1.51 %)	99,818 (11.14 %)	0 (0 %)	6,612 (1.57 %)	16 (43.15 %)	88 (1.16 %)
400	ascomycetes Z.tritici ST99CH_3D1 (2017) GCA_900184105.1	n/a	36,876 (44.64 %)	1,450 (2.76 %)	6,877 (24.77 %)	n/a	52.01 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	23 (100.00 %)	9,134 (1.80 %)	8,632 (1.65 %)	94,954 (11.46 %)	0 (0 %)	7,397 (1.74 %)	26 (97.92 %)	38 (0.87 %)
401	Asian malaria mosquito GCF_013141755.1	32,974 (18.58 %)	n/a	5,601 (2.51 %)	29,942 (14.12 %)	n/a	44.92 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	494 (100.00 %)	145,591 (7.79 %)	37,050 (5.68 %)	1,066,993 (24.73 %)	0 (0 %)	108,395 (6.15 %)	18,418 (10.44 %)	17,636 (4.48 %)
402	Asian malaria mosquito (Indian Wild Type Walter Reed 2013) GCA_000300775.2	n/a	n/a	5,326 (2.75 %)	28,440 (14.13 %)	n/a	44.80 (94.64 %)	8,390 (5.35 %)	10,928 (5.35 %)	31,761 (94.65 %)	128,514 (4.27 %)	27,601 (0.61 %)	1,275,750 (17.87 %)	60 (0.02 %)	7,812 (0.41 %)	24,261 (8.87 %)	17,910 (4.63 %)
403	Asian malaria mosquito (SDA-500 2013) GCA_000349045.1	n/a	n/a	5,361 (2.98 %)	27,357 (15.12 %)	n/a	45.02 (87.06 %)	7,836 (12.95 %)	7,836 (12.95 %)	8,946 (87.05 %)	123,660 (3.77 %)	27,395 (0.88 %)	1,221,979 (16.34 %)	367 (0.58 %)	15,107 (1.35 %)	21,651 (8.52 %)	16,434 (4.16 %)
404	Asian tapeworm (2018) GCA_900618005.1	n/a	10,331 (11.27 %)	1,545 (0.86 %)	10,320 (9.53 %)	n/a	42.88 (98.33 %)	9,974 (1.67 %)	9,974 (1.67 %)	34,111 (98.33 %)	20,183 (0.63 %)	6,581 (0.29 %)	582,448 (10.88 %)	101 (0.01 %)	3,870 (0.26 %)	12,741 (3.66 %)	9,557 (2.54 %)
405	Asian tapeworm (TASYD01 2016) GCA_001693035.2	n/a	n/a	1,668 (0.77 %)	10,338 (8.91 %)	n/a	43.15 (97.47 %)	7,133 (2.53 %)	7,133 (2.53 %)	14,033 (97.47 %)	25,146 (0.68 %)	13,572 (2.53 %)	686,537 (10.32 %)	328 (0.07 %)	19,146 (3.14 %)	15,796 (3.82 %)	11,302 (2.45 %)
406	Asian tiger mosquito (C6/36 2017 refseq) GCF_001876365.2	52,074 (3.05 %)	n/a	10,893 (0.53 %)	128,421 (8.33 %)	n/a	40.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,435 (100.00 %)	605,008 (2.87 %)	952,263 (7.68 %)	11,169,650 (57.07 %)	0 (0 %)	1,147,016 (4.60 %)	220,674 (10.38 %)	117,108 (3.58 %)
407	Asian tiger mosquito (Foshan BGI 2016) GCA_001444175.2	n/a	17,146 (1.32 %)	7,541 (0.43 %)	120,718 (7.86 %)	n/a	40.18 (92.37 %)	200,279 (7.66 %)	200,279 (7.66 %)	355,061 (92.34 %)	472,441 (2.12 %)	767,591 (5.16 %)	9,615,414 (49.93 %)	582 (0.06 %)	n/a	212,453 (8.14 %)	109,624 (3.51 %)
408	Asian tiger mosquito (v2 FPA 2019) GCF_006496715.2	48,522 (2.54 %)	n/a	10,280 (0.43 %)	136,667 (7.61 %)	n/a	40.37 (99.93 %)	0 (0 %)	3,359 (0.07 %)	2,114 (100.00 %)	510,394 (1.35 %)	1,083,870 (7.48 %)	12,581,322 (57.64 %)	0 (0 %)	1,196,653 (4.46 %)	250,348 (10.06 %)	127,770 (3.44 %)
409	Astrovirus (MLB1 2008) GCF_000880715.1	n/a	3 (98.83 %)	n/a	n/a	n/a	40.86 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.70 %)	n/a	4 (1.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
410	Astrovirus (VA1 2009) GCF_000885815.1	n/a	4 (97.94 %)	n/a	n/a	n/a	41.93 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.67 %)	n/a	7 (0.87 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
411	Astrovirus MLB2 (MLB2/human/Stl/WD0559/2008 2012) GCF_000895575.1	n/a	3 (99.13 %)	n/a	n/a	n/a	40.52 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (2.01 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
412	Astrovirus MLB3 (MLB3/human/Vellore/26564/2004 2012) GCF_000899535.1	n/a	3 (99.15 %)	n/a	n/a	n/a	40.00 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (2.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
413	Astrovirus VA3 (VA3/human/Vellore/28054/2005 2012) GCF_000901475.1	n/a	3 (98.01 %)	n/a	n/a	n/a	41.78 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
414	Astrovirus VA4 (VA4/human/Nepal/S5363/2008 2012) GCF_000897955.1	n/a	3 (97.62 %)	n/a	n/a	n/a	42.99 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.11 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
415	Atlantic salmon calicivirus (Nordland/2011 2014) GCF_000919195.1	n/a	2 (97.89 %)	n/a	n/a	n/a	53.49 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (56.39 %)	3 (56.39 %)
416	B.malayi (v4 2019 agent of lymphatic filariasis) GCF_000002995.4	14,731 (17.18 %)	n/a	2,891 (2.46 %)	1,675 (4.90 %)	n/a	28.42 (99.68 %)	0 (0 %)	8 (0.32 %)	196 (100.00 %)	123,466 (8.77 %)	49,551 (6.01 %)	697,501 (40.47 %)	0 (0 %)	40,402 (3.40 %)	134 (0.05 %)	96 (0.03 %)
417	B.mandrillaris (2046 2015) GCA_001262475.1	n/a	n/a	1,232 (1.79 %)	5,359 (15.18 %)	n/a	46.82 (96.85 %)	3,362 (3.12 %)	3,362 (3.12 %)	18,061 (96.88 %)	74,755 (9.89 %)	42,915 (4.62 %)	326,322 (29.76 %)	2 (0.00 %)	7,242 (0.84 %)	11,084 (12.34 %)	5,285 (4.53 %)
418	B.mandrillaris (CDC-V039 2015) GCA_001185145.1	n/a	n/a	2,084 (2.01 %)	5,736 (17.17 %)	n/a	46.77 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	1,605 (100.00 %)	100,657 (9.09 %)	64,135 (5.44 %)	468,536 (32.46 %)	0 (0 %)	26,060 (3.04 %)	16,125 (13.06 %)	8,408 (5.01 %)
419	Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor' (Ames Ancestor; A2084 2004) GCF_000008445.1	n/a	5,759 (85.25 %)	n/a	n/a	n/a	35.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	321 (0.49 %)	37,990 (15.20 %)	0 (0 %)	185 (0.68 %)	28 (1.14 %)	26 (1.11 %)
420	Bacillus of abortion Bang 1897 (544 2013) GCF_000369945.1	n/a	3,248 (88.03 %)	n/a	n/a	n/a	57.21 (99.78 %)	7 (0.22 %)	7 (0.22 %)	10 (99.78 %)	n/a	79 (0.20 %)	17,213 (9.66 %)	3 (0.06 %)	60 (0.22 %)	3 (99.97 %)	3 (99.96 %)
421	Bacteroides fragilis (NCTC 9343 2005) GCF_000025985.1	n/a	4,322 (89.36 %)	n/a	n/a	n/a	43.11 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	165 (0.21 %)	21,126 (7.58 %)	0 (0 %)	171 (0.31 %)	296 (5.32 %)	283 (3.46 %)
422	baker's yeast S288C (2014) GCF_000146045.2	6,138 (72.17 %)	n/a	5,840 (68.70 %)	4,964 (64.10 %)	7,127 (73.31 %)	38.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	17 (100.00 %)	3,982 (5.01 %)	2,086 (0.92 %)	64,748 (13.81 %)	0 (0 %)	669 (1.21 %)	218 (0.80 %)	183 (0.65 %)
423	Banna virus strain JKT-6423 (JKT-6423 JKT-6423 2000) GCF_000858185.1	n/a	12 (86.10 %)	n/a	n/a	n/a	39.33 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (0.64 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
424	barber pole worm (ISE/inbred ISE 2018) GCA_000469685.2	n/a	n/a	5,033 (1.56 %)	16,521 (8.08 %)	n/a	43.09 (97.99 %)	0 (0 %)	185 (2.01 %)	7 (100.00 %)	53,553 (2.27 %)	41,653 (3.19 %)	1,213,307 (19.55 %)	3 (0.04 %)	43,348 (1.56 %)	33,178 (6.03 %)	12,525 (1.96 %)
425	barber pole worm (McMaster 2013) GCA_000442195.1	n/a	n/a	4,412 (1.05 %)	22,527 (7.01 %)	n/a	42.43 (93.61 %)	40,861 (6.41 %)	40,861 (6.41 %)	55,249 (93.59 %)	38,910 (0.59 %)	118,199 (7.86 %)	1,489,249 (13.05 %)	274 (0.05 %)	282,404 (11.16 %)	22,934 (2.80 %)	11,960 (1.34 %)
426	Barmah Forest virus (BH2193 1997) GCF_000847585.1	n/a	5 (95.39 %)	n/a	n/a	n/a	48.55 (99.97 %)	2 (0.02 %)	2 (0.02 %)	3 (99.98 %)	4 (0.59 %)	n/a	7 (2.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (15.26 %)	5 (15.26 %)
427	Bartonella henselae (FDAARGOS_1462 2021) GCF_019930925.1	n/a	1,642 (75.65 %)	n/a	n/a	n/a	38.26 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	117 (2.57 %)	11,901 (13.27 %)	0 (0 %)	572 (4.04 %)	26 (0.65 %)	22 (0.56 %)
428	basidiomycetes A.montevideense (JCM 9937 2016) GCA_001598995.1	n/a	n/a	868 (2.59 %)	1,381 (7.59 %)	n/a	58.37 (99.67 %)	0 (0 %)	3,423 (0.36 %)	61 (100.00 %)	10,985 (2.06 %)	6,046 (1.04 %)	121,518 (11.81 %)	6 (0.01 %)	362 (0.13 %)	92 (99.38 %)	87 (53.43 %)
429	basidiomycetes C.bacillisporus (CA1873 2015) GCA_000855695.1	n/a	6,782 (56.50 %)	945 (3.91 %)	3,198 (17.55 %)	n/a	48.01 (99.72 %)	61 (0.28 %)	61 (0.28 %)	94 (99.72 %)	3,913 (1.18 %)	1,301 (0.32 %)	69,281 (8.51 %)	6 (0.06 %)	148 (0.12 %)	4,877 (22.48 %)	3,068 (8.52 %)
430	basidiomycetes C.cinerea (A43mut B43mut pab1-1 #326 2021) GCA_016772295.1	n/a	17,100 (58.31 %)	1,043 (1.94 %)	3,929 (10.49 %)	n/a	51.57 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	31 (100.00 %)	7,458 (0.89 %)	4,697 (1.18 %)	92,970 (10.14 %)	0 (0 %)	6,885 (2.83 %)	539 (97.54 %)	219 (0.81 %)
431	basidiomycetes C.cinerea (okayama7#130 2010 refseq) GCF_000182895.1	13,348 (52.60 %)	n/a	1,055 (2.05 %)	3,917 (10.89 %)	n/a	51.64 (100.00 %)	0 (0 %)	33 (0.00 %)	68 (100.00 %)	7,665 (5.04 %)	3,805 (0.81 %)	107,373 (7.81 %)	0 (0 %)	2,879 (1.50 %)	75 (51.75 %)	135 (0.47 %)
432	basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7841 2024 refseq) GCF_001720195.1	6,357 (59.61 %)	n/a	921 (4.16 %)	4,119 (24.79 %)	n/a	44.80 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	2,424 (0.66 %)	1,011 (0.30 %)	56,356 (7.99 %)	0 (0 %)	901 (0.80 %)	1,869 (7.30 %)	1,482 (5.65 %)
433	basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7855 2024 gebnak) GCA_001720245.2	n/a	6,395 (59.69 %)	1,007 (4.51 %)	4,259 (25.44 %)	n/a	44.81 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	9 (100.00 %)	5,334 (7.78 %)	1,092 (0.35 %)	54,479 (7.43 %)	0 (0 %)	592 (1.05 %)	1,880 (7.40 %)	1,728 (6.45 %)
434	basidiomycetes C.deuterogattii (R265 2018) GCF_002954075.1	6,463 (61.87 %)	n/a	936 (3.84 %)	3,370 (18.39 %)	n/a	47.83 (100.00 %)	27 (0.00 %)	27 (0.00 %)	41 (100.00 %)	3,736 (0.93 %)	1,407 (0.39 %)	69,039 (8.65 %)	1 (0.01 %)	406 (0.39 %)	4,808 (20.25 %)	3,041 (8.27 %)
435	basidiomycetes C.gattii (EJB2 2015) GCA_000835745.1	n/a	6,908 (58.23 %)	930 (3.86 %)	4,794 (25.58 %)	n/a	47.91 (99.21 %)	65 (0.78 %)	65 (0.78 %)	347 (99.22 %)	4,079 (1.17 %)	1,474 (0.37 %)	66,384 (8.11 %)	1 (0.01 %)	133 (0.05 %)	4,835 (21.05 %)	3,106 (8.61 %)
436	basidiomycetes C.gattii (NT-10 2015) GCA_000935105.1	n/a	6,987 (57.66 %)	964 (3.88 %)	4,832 (25.12 %)	n/a	47.89 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	226 (100.00 %)	4,167 (2.12 %)	1,556 (0.35 %)	55,064 (7.92 %)	0 (0 %)	151 (0.07 %)	4,893 (21.11 %)	3,458 (10.24 %)
437	basidiomycetes C.gattii VGV (MF34 2019) GCA_009650685.1	n/a	6,321 (58.02 %)	937 (3.76 %)	3,483 (18.54 %)	n/a	47.89 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	15 (100.00 %)	4,125 (1.48 %)	1,518 (0.37 %)	68,697 (8.30 %)	0 (0 %)	412 (0.49 %)	4,955 (21.28 %)	3,229 (8.85 %)
438	basidiomycetes C.gattii WM276 GCF_000185945.1	6,565 (55.63 %)	n/a	998 (3.96 %)	4,869 (25.02 %)	n/a	47.88 (99.93 %)	27 (0.07 %)	27 (0.07 %)	41 (99.93 %)	4,363 (2.64 %)	1,626 (0.40 %)	35,258 (6.40 %)	0 (0 %)	590 (0.49 %)	4,923 (21.36 %)	4,003 (13.66 %)
439	basidiomycetes C.neoformans (JEC21 2005 refseq) GCF_000091045.1	6,863 (68.12 %)	n/a	958 (3.66 %)	3,784 (19.12 %)	n/a	48.54 (99.99 %)	85 (0.01 %)	85 (0.01 %)	99 (99.99 %)	4,953 (5.25 %)	1,808 (0.52 %)	68,717 (8.41 %)	2 (0.00 %)	1,433 (1.21 %)	5,128 (28.73 %)	3,532 (11.09 %)
440	basidiomycetes C.neoformans (VNII 2022) GCA_022832995.1	n/a	6,698 (58.04 %)	958 (3.63 %)	3,811 (20.00 %)	n/a	48.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14 (100.00 %)	4,850 (1.13 %)	2,025 (0.53 %)	66,168 (8.42 %)	0 (0 %)	1,074 (1.68 %)	5,317 (24.64 %)	3,747 (10.67 %)
441	basidiomycetes C.neoformans var. grubii (H99 2018) GCA_003011985.1	n/a	n/a	936 (3.60 %)	3,912 (19.77 %)	n/a	48.23 (100.00 %)	0 (0 %)	62 (0.00 %)	14 (100.00 %)	5,131 (4.21 %)	1,848 (0.45 %)	71,222 (8.67 %)	0 (0 %)	1,120 (1.00 %)	5,233 (24.67 %)	3,557 (10.05 %)
442	basidiomycetes C.neoformans var. grubii (KN99 2017) GCA_002216725.1	n/a	7,819 (72.40 %)	944 (3.61 %)	3,921 (19.97 %)	n/a	48.21 (100.00 %)	0 (0 %)	77 (0.00 %)	15 (100.00 %)	5,129 (4.02 %)	1,850 (0.47 %)	69,670 (8.47 %)	0 (0 %)	1,112 (0.95 %)	5,226 (24.53 %)	3,587 (10.17 %)
443	basidiomycetes C.neoformans var. grubii H99 GCF_000149245.1	9,027 (75.51 %)	n/a	943 (3.62 %)	3,928 (19.96 %)	n/a	48.21 (100.00 %)	0 (0 %)	78 (0.00 %)	15 (100.00 %)	5,118 (4.02 %)	1,847 (0.47 %)	69,629 (8.47 %)	0 (0 %)	1,112 (0.95 %)	5,228 (24.57 %)	3,585 (10.16 %)
444	basidiomycetes C.neoformans var. neoformans (XL280 2017) GCA_002216205.1	n/a	n/a	944 (3.58 %)	3,791 (19.07 %)	n/a	48.54 (100.00 %)	0 (0 %)	62 (0.00 %)	37 (100.00 %)	4,950 (5.24 %)	1,808 (0.52 %)	68,680 (8.41 %)	0 (0 %)	1,421 (1.21 %)	5,140 (28.57 %)	3,512 (11.02 %)
445	basidiomycetes C.neoformans var. neoformans B-3501A GCF_000149385.1	6,578 (57.17 %)	n/a	934 (3.63 %)	3,731 (19.14 %)	n/a	48.47 (94.01 %)	56 (5.99 %)	58 (5.99 %)	70 (94.01 %)	4,585 (3.09 %)	1,651 (0.42 %)	74,295 (8.21 %)	0 (0 %)	603 (0.53 %)	5,077 (25.93 %)	3,351 (9.69 %)
446	basidiomycetes C.tetragattii (IND107 2024 refseq) GCF_000835755.1	6,654 (58.52 %)	n/a	945 (3.79 %)	3,403 (18.40 %)	n/a	47.90 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	15 (100.00 %)	3,939 (1.00 %)	1,508 (0.38 %)	69,273 (8.42 %)	0 (0 %)	405 (0.48 %)	4,884 (21.59 %)	3,162 (8.79 %)
447	basidiomycetes K.bestiolae (CBS 10118 2024 refseq) GCF_000512585.2	9,159 (54.33 %)	n/a	918 (2.66 %)	4,907 (18.38 %)	n/a	47.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	7,245 (1.32 %)	2,141 (0.47 %)	97,927 (9.78 %)	0 (0 %)	863 (0.56 %)	4,995 (11.17 %)	3,011 (4.94 %)
448	basidiomycetes K.dejecticola (v2 CBS 10117 2024 refseq) GCF_000512565.2	8,672 (55.58 %)	n/a	910 (2.69 %)	4,861 (19.78 %)	n/a	48.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	7,778 (1.42 %)	2,452 (0.43 %)	86,630 (7.97 %)	0 (0 %)	812 (0.23 %)	3,644 (14.24 %)	3,514 (7.22 %)
449	basidiomycetes K.heveanensis (CBS 569 2016) GCA_000507425.3	n/a	8,002 (50.40 %)	843 (2.39 %)	2,910 (12.30 %)	n/a	51.91 (99.75 %)	25 (0.24 %)	25 (0.24 %)	267 (99.76 %)	8,871 (1.45 %)	2,787 (0.45 %)	109,027 (9.58 %)	5 (0.04 %)	39 (0.01 %)	327 (98.25 %)	397 (1.00 %)
450	basidiomycetes K.mangroviensis (v2 CBS 8507 2024 refseq) GCF_000507465.2	8,559 (55.66 %)	n/a	886 (2.74 %)	5,392 (21.25 %)	n/a	44.92 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4 (100.00 %)	6,585 (1.21 %)	1,546 (0.27 %)	104,495 (10.38 %)	0 (0 %)	1,321 (0.50 %)	2,335 (5.10 %)	1,396 (2.19 %)
451	basidiomycetes L.tigrinus (ALCF2SS1-7 2018 refseq) GCF_003813185.1	15,367 (55.75 %)	n/a	992 (1.75 %)	1,661 (4.09 %)	n/a	56.14 (99.10 %)	296 (0.90 %)	296 (0.90 %)	503 (99.10 %)	7,245 (0.83 %)	3,745 (0.48 %)	132,886 (7.59 %)	12 (0.01 %)	2,232 (0.61 %)	324 (98.37 %)	299 (92.33 %)
452	basidiomycetes M.globosa (v2 CBS 7966 2007) GCF_000181695.2	4,278 (69.41 %)	n/a	1,063 (8.81 %)	2,586 (44.99 %)	n/a	52.06 (100.00 %)	22 (0.00 %)	22 (0.00 %)	84 (100.00 %)	1,762 (0.80 %)	715 (0.47 %)	22,155 (4.71 %)	0 (0 %)	240 (0.25 %)	129 (94.62 %)	106 (34.46 %)
453	basidiomycetes M.pachydermatis GCF_001278385.1	4,202 (78.54 %)	n/a	1,049 (9.50 %)	2,386 (45.30 %)	n/a	55.07 (99.99 %)	0 (0 %)	27 (0.01 %)	91 (100.00 %)	1,207 (0.77 %)	647 (0.36 %)	27,618 (6.61 %)	0 (0 %)	133 (0.15 %)	68 (65.84 %)	63 (22.60 %)
454	basidiomycetes M.restricta GCF_003290485.1	4,444 (88.53 %)	n/a	1,061 (10.52 %)	2,009 (43.77 %)	n/a	55.66 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	871 (1.10 %)	593 (0.60 %)	26,579 (7.55 %)	0 (0 %)	228 (0.43 %)	42 (17.66 %)	59 (62.36 %)
455	basidiomycetes M.restricta (CBS 7877 2018) GCA_003691605.1	n/a	4,158 (85.11 %)	1,026 (10.34 %)	2,003 (44.01 %)	n/a	55.73 (100.00 %)	0 (0 %)	4 (0.00 %)	10 (100.00 %)	821 (0.61 %)	541 (0.41 %)	29,507 (8.50 %)	0 (0 %)	119 (0.23 %)	51 (97.19 %)	63 (65.72 %)
456	basidiomycetes M.sympodialis (ATCC 42132 2017) GCA_900149145.1	n/a	4,672 (90.13 %)	973 (8.94 %)	1,485 (28.68 %)	n/a	58.94 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	1,665 (1.47 %)	1,011 (0.75 %)	42,822 (15.18 %)	0 (0 %)	331 (0.56 %)	57 (98.05 %)	55 (0.41 %)
457	basidiomycetes N.albida (JCM 2334 2016) GCA_001599735.1	n/a	n/a	869 (3.08 %)	2,486 (12.78 %)	n/a	54.06 (99.56 %)	0 (0 %)	841 (0.45 %)	74 (100.00 %)	2,576 (0.51 %)	1,677 (0.37 %)	60,552 (5.72 %)	6 (0.01 %)	198 (0.11 %)	92 (99.66 %)	85 (83.27 %)
458	basidiomycetes N.albida (NRRL Y-1402 2015) GCA_001444555.1	n/a	n/a	876 (2.57 %)	3,496 (14.42 %)	n/a	52.67 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	834 (100.00 %)	2,742 (0.54 %)	2,262 (0.47 %)	71,898 (7.31 %)	0 (0 %)	424 (0.16 %)	979 (94.74 %)	801 (28.72 %)
459	basidiomycetes P.chrysosporium (RP-78 2004) GCA_000167175.1	n/a	n/a	985 (2.27 %)	2,271 (7.48 %)	n/a	56.97 (99.99 %)	264 (0.00 %)	264 (0.00 %)	1,587 (100.00 %)	4,786 (1.39 %)	1,459 (0.26 %)	120,638 (10.12 %)	0 (0 %)	507 (0.20 %)	1,156 (97.01 %)	835 (59.41 %)
460	basidiomycetes R.mellea (SZMC22713 2019) GCA_004355085.1	n/a	17,193 (52.69 %)	1,094 (1.77 %)	4,684 (10.67 %)	n/a	48.96 (97.26 %)	1,004 (2.75 %)	1,004 (2.75 %)	1,852 (97.25 %)	5,991 (0.61 %)	3,811 (0.69 %)	107,772 (5.24 %)	35 (0.08 %)	4,036 (1.00 %)	1,114 (5.64 %)	981 (1.63 %)
461	basidiomycetes S.commune (v2 H4-8 2022) GCF_000143185.2	16,193 (60.71 %)	n/a	906 (1.57 %)	993 (2.87 %)	n/a	57.53 (99.85 %)	47 (0.15 %)	47 (0.15 %)	72 (99.85 %)	7,378 (1.00 %)	8,843 (1.31 %)	180,972 (12.04 %)	0 (0 %)	6,108 (2.34 %)	40 (99.86 %)	42 (5.62 %)
462	basidiomycetes T.asahii var. asahii CBS 2479 GCF_000293215.1	8,300 (50.84 %)	n/a	885 (2.61 %)	1,323 (7.54 %)	n/a	59.58 (99.04 %)	264 (0.96 %)	264 (0.96 %)	342 (99.04 %)	6,970 (1.38 %)	3,844 (0.88 %)	116,907 (11.38 %)	5 (0.02 %)	576 (0.79 %)	78 (72.13 %)	68 (54.56 %)
463	Bastrovirus 7 (2017) GCF_002285025.1	n/a	3 (97.74 %)	n/a	n/a	n/a	58.36 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (52.22 %)	4 (52.22 %)
464	Bat sapovirus (Bat-SaV/Limbe65/CAM/2014 2017) GCF_002005625.1	n/a	2 (97.81 %)	n/a	n/a	n/a	46.98 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.24 %)	n/a	5 (0.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (5.51 %)	1 (5.51 %)
465	Bat sapovirus (TLC58/HK 2012) GCF_000894635.1	n/a	2 (96.96 %)	n/a	n/a	n/a	60.16 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.49 %)	n/a	6 (0.66 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (94.41 %)	1 (94.41 %)
466	bed bug GCF_000648675.2	26,639 (5.60 %)	n/a	3,756 (0.66 %)	9,989 (2.63 %)	28,065 (5.65 %)	34.82 (99.91 %)	1,295 (0.09 %)	21,364 (0.09 %)	2,869 (99.91 %)	264,973 (2.97 %)	166,587 (3.52 %)	4,017,900 (42.90 %)	29 (0.00 %)	226,793 (3.28 %)	24,731 (1.89 %)	13,732 (1.00 %)
467	beef tapeworm (TSAYD01 2016) GCA_001693075.2	n/a	n/a	1,664 (0.74 %)	10,340 (8.91 %)	n/a	43.19 (98.36 %)	0 (0 %)	16,726 (1.65 %)	3,626 (100.00 %)	25,805 (0.74 %)	23,041 (2.86 %)	669,340 (10.35 %)	2,982 (0.60 %)	38,111 (4.40 %)	16,060 (3.92 %)	11,376 (2.48 %)
468	Beiji nairovirus (H160 2023) GCF_029888155.1	n/a	2 (86.68 %)	n/a	n/a	n/a	43.91 (99.97 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)	4 (99.99 %)	5 (0.59 %)	n/a	17 (2.03 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
469	Bergeyella zoohelcum (NCTC11660 2018) GCF_900445655.1	n/a	2,161 (88.18 %)	n/a	n/a	n/a	36.18 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	281 (1.26 %)	17,545 (17.00 %)	0 (0 %)	387 (2.03 %)	7 (0.16 %)	8 (0.17 %)
470	Betacoronavirus (England 1 H123990006 2018) GCF_002816195.1	n/a	12 (97.48 %)	n/a	n/a	n/a	41.18 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.12 %)	n/a	2 (0.06 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
471	Bhanja virus (ibAr2709 2015) GCF_001019855.1	n/a	4 (96.85 %)	n/a	n/a	n/a	45.34 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.56 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
472	black shank of tobacco agent (INRA-310 2013) GCF_000247585.1	27,944 (56.49 %)	n/a	1,354 (1.75 %)	17,918 (53.20 %)	n/a	49.51 (65.42 %)	8,083 (34.61 %)	8,083 (34.61 %)	8,791 (65.39 %)	7,133 (2.38 %)	3,777 (0.27 %)	183,621 (4.70 %)	259 (0.41 %)	4,815 (1.29 %)	6,081 (21.10 %)	4,935 (4.90 %)
473	black-legged tick (JCVI 2018) GCF_002892825.2	36,815 (2.39 %)	n/a	4,242 (0.16 %)	128,091 (7.64 %)	n/a	45.96 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	6,476 (100.00 %)	5,402,589 (63.53 %)	701,137 (4.07 %)	10,598,458 (40.46 %)	0 (0 %)	514,952 (2.17 %)	139,352 (7.73 %)	229,854 (6.67 %)
474	black-legged tick (U.Maryland v2 2021) GCF_016920785.2	38,578 (2.49 %)	n/a	3,961 (0.14 %)	127,569 (7.44 %)	47,545 (2.83 %)	46.16 (99.99 %)	0 (0 %)	2,665 (0.01 %)	648 (100.00 %)	1,125,143 (4.95 %)	733,708 (6.53 %)	10,738,669 (42.56 %)	9 (0.00 %)	717,579 (2.90 %)	70,276 (4.67 %)	228,418 (7.27 %)
475	black-legged tick (Wikel colony 2008 refseq) GCF_000208615.1	20,467 (1.41 %)	n/a	3,432 (0.19 %)	99,086 (4.65 %)	n/a	45.22 (78.65 %)	201,145 (21.35 %)	201,145 (21.35 %)	570,637 (78.65 %)	605,765 (2.71 %)	365,918 (1.61 %)	8,574,437 (27.02 %)	124 (0.01 %)	n/a	345,141 (14.15 %)	189,691 (5.45 %)
476	blackleg of rapeseed fungus GCF_000230375.1	12,469 (35.66 %)	n/a	1,530 (2.64 %)	7,522 (22.36 %)	n/a	45.19 (97.51 %)	0 (0 %)	1,658 (2.50 %)	76 (100.00 %)	25,067 (10.98 %)	14,076 (1.63 %)	77,406 (32.63 %)	1 (0.00 %)	29,154 (5.95 %)	3,054 (42.67 %)	3,995 (38.44 %)
477	blastocladiomycotan A.macrogynus (ATCC 38327 2010) GCA_000151295.1	n/a	19,955 (59.87 %)	1,659 (2.12 %)	1,036 (2.08 %)	n/a	61.59 (92.29 %)	8,872 (7.77 %)	8,872 (7.77 %)	8,973 (92.23 %)	29,871 (5.36 %)	11,776 (1.11 %)	411,240 (21.09 %)	28 (0.05 %)	12,789 (5.00 %)	554 (94.59 %)	322 (0.39 %)
478	Blastocrithidia sp. (p57 2023) GCA_028554745.1	n/a	n/a	630 (1.48 %)	1,140 (5.42 %)	n/a	34.74 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	78 (100.00 %)	23,153 (4.06 %)	4,394 (1.92 %)	184,674 (25.76 %)	0 (0 %)	5,292 (4.16 %)	990 (1.68 %)	904 (1.42 %)
479	Blechomonas ayalai (B08-376 2021) GCA_020509355.1	n/a	n/a	556 (1.62 %)	3,018 (55.04 %)	n/a	54.94 (99.40 %)	0 (0 %)	4,093 (0.67 %)	545 (100.00 %)	3,394 (0.52 %)	1,022 (0.70 %)	88,855 (9.37 %)	1 (0.00 %)	3,775 (1.47 %)	1,095 (93.21 %)	1,178 (55.27 %)
480	bloodfluke planorb (primary hap 2022) GCF_947242115.1	60,431 (10.10 %)	n/a	3,669 (0.35 %)	14,441 (4.29 %)	n/a	36.15 (100.00 %)	0 (0 %)	157 (0.00 %)	43 (100.00 %)	539,820 (3.50 %)	563,251 (14.02 %)	5,484,695 (46.47 %)	1 (0.00 %)	918,824 (7.29 %)	18,791 (0.98 %)	5,834 (0.32 %)
481	bloodfluke planorb (v2 BB02 2013 refseq) GCF_000457365.2	41,994 (5.93 %)	n/a	3,378 (0.29 %)	23,693 (2.94 %)	n/a	35.99 (98.05 %)	76,903 (1.91 %)	76,903 (1.91 %)	406,925 (98.09 %)	587,594 (3.57 %)	749,214 (9.41 %)	6,922,018 (43.04 %)	434 (0.03 %)	n/a	16,561 (0.63 %)	6,013 (0.25 %)
482	bloodworm (2018) GCA_900624965.1	n/a	21,079 (4.58 %)	3,288 (0.62 %)	13,177 (1.85 %)	n/a	37.89 (91.40 %)	230,521 (8.81 %)	230,521 (8.81 %)	397,831 (91.19 %)	32,396 (0.69 %)	34,295 (2.20 %)	1,798,874 (18.27 %)	2,972 (0.14 %)	n/a	8,558 (0.97 %)	3,747 (0.39 %)
483	Bocaparvovirus primate1 (Salvador1 2023) GCF_003033285.1	n/a	9 (85.80 %)	n/a	n/a	n/a	42.31 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.52 %)	n/a	6 (1.64 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
484	Bodo saltans (Lake Konstanz 2015) GCA_001460835.1	n/a	19,944 (78.81 %)	717 (1.12 %)	5,396 (56.98 %)	n/a	51.79 (96.74 %)	0 (0 %)	2,523 (3.28 %)	2,247 (100.00 %)	10,955 (1.09 %)	6,099 (2.65 %)	190,644 (11.32 %)	103 (0.11 %)	11,351 (3.43 %)	3,448 (73.32 %)	3,077 (6.80 %)
485	Bordetella pertussis (H640 2019) GCF_004008975.1	n/a	3,964 (92.05 %)	n/a	n/a	n/a	67.72 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	262 (1.08 %)	29,312 (24.13 %)	0 (0 %)	311 (3.98 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
486	Borna disease virus 2 (No/98 2016) GCF_000847565.3	n/a	6 (97.61 %)	n/a	n/a	n/a	50.10 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.43 %)	n/a	3 (0.24 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (11.20 %)	3 (11.20 %)
487	Bourbon virus (MO-2013-2499 2023) GCF_023156645.1	n/a	6 (95.52 %)	n/a	n/a	n/a	45.81 (99.91 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	7 (99.99 %)	3 (0.00 %)	1 (0.36 %)	5 (0.62 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
488	Bovine adeno-associated virus (2004) GCF_000846165.1	n/a	2 (86.17 %)	n/a	n/a	n/a	53.77 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.43 %)	0 (0 %)	1 (6.35 %)	2 (50.44 %)	2 (50.44 %)
489	Bovine calicivirus strain (Kirklareli 2016) GCF_001714355.1	n/a	2 (98.04 %)	n/a	n/a	n/a	58.37 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.09 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (96.34 %)	1 (96.34 %)
490	bovine lungworm (HannoverDv2000 2015) GCA_000816705.1	n/a	14,463 (8.90 %)	4,262 (2.29 %)	4,275 (3.77 %)	n/a	34.80 (97.51 %)	17,367 (2.53 %)	17,367 (2.53 %)	24,524 (97.47 %)	46,775 (1.34 %)	20,102 (0.66 %)	1,196,546 (24.15 %)	713 (0.26 %)	39,765 (3.73 %)	1,466 (0.28 %)	482 (0.09 %)
491	Bowe virus (VN1512 2017) GCF_002118085.1	n/a	3 (94.38 %)	n/a	n/a	n/a	36.23 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (1.00 %)	1 (0.29 %)	12 (2.09 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
492	brain-eating amoeba (ATCC 30863 2013) GCA_000499105.1	n/a	n/a	896 (2.15 %)	1,326 (21.27 %)	n/a	36.82 (98.54 %)	0 (0 %)	1,212 (1.47 %)	574 (100.00 %)	10,605 (1.66 %)	3,384 (0.54 %)	207,411 (18.94 %)	6 (0.00 %)	502 (0.20 %)	11 (0.01 %)	7 (0.01 %)
493	brain-eating amoeba (ATCC 30894 2019) GCF_008403515.1	13,816 (74.49 %)	n/a	936 (2.12 %)	1,171 (20.52 %)	n/a	36.88 (99.99 %)	0 (0 %)	373 (0.01 %)	83 (100.00 %)	12,436 (2.15 %)	3,951 (1.27 %)	223,907 (19.88 %)	23 (0.02 %)	6,342 (1.05 %)	10 (0.01 %)	6 (0.00 %)
494	brain-eating amoeba (Ty 2020) GCA_014843625.1	n/a	n/a	897 (2.13 %)	1,113 (20.70 %)	n/a	36.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	37 (100.00 %)	11,898 (2.17 %)	3,679 (0.70 %)	214,175 (19.73 %)	0 (0 %)	1,004 (0.29 %)	10 (0.01 %)	6 (0.00 %)
495	Brevibacillus laterosporus (DSM 25 2017) GCF_002706795.1	n/a	5,006 (85.51 %)	n/a	n/a	n/a	40.66 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	183 (0.46 %)	19,320 (7.21 %)	0 (0 %)	386 (0.46 %)	101 (2.02 %)	84 (1.67 %)
496	broad fish tapeworm (2018) GCA_900617775.1	n/a	19,966 (2.58 %)	1,218 (0.14 %)	32,311 (3.44 %)	n/a	43.19 (92.94 %)	283,578 (7.22 %)	283,578 (7.22 %)	423,872 (92.78 %)	67,786 (0.72 %)	44,877 (0.73 %)	2,920,741 (23.44 %)	273 (0.01 %)	n/a	89,944 (6.50 %)	31,990 (1.96 %)
497	brown dog tick (v1.4 Rsan-2018 2022) GCF_013339695.2	36,780 (2.31 %)	n/a	3,856 (0.13 %)	116,103 (5.94 %)	n/a	46.86 (99.89 %)	0 (0 %)	10,358 (0.11 %)	2,327 (100.00 %)	900,088 (2.28 %)	716,302 (3.47 %)	10,603,638 (42.78 %)	1 (0.00 %)	726,544 (3.31 %)	13,178 (0.97 %)	233,019 (6.31 %)
498	Brucella anthropi (PBO 2020) GCF_015326295.1	n/a	4,592 (87.94 %)	n/a	n/a	n/a	56.11 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	54 (0.10 %)	19,060 (6.82 %)	0 (0 %)	36 (0.11 %)	3 (99.99 %)	3 (99.99 %)
499	Brucella canis (ATCC 23365 2007) GCF_000018525.1	n/a	3,224 (88.02 %)	n/a	n/a	n/a	57.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	90 (0.15 %)	16,838 (9.39 %)	0 (0 %)	48 (0.21 %)	2 (99.97 %)	2 (99.97 %)
500	Brucella ceti (DDE002 2025) GCF_047324105.1	n/a	3,400 (87.97 %)	n/a	n/a	n/a	57.20 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	92 (0.17 %)	16,429 (9.16 %)	0 (0 %)	63 (0.51 %)	2 (100.00 %)	2 (99.99 %)
501	Brucella ciceri (DSM 22292 2024) GCF_041930145.1	n/a	4,379 (87.91 %)	n/a	n/a	n/a	57.74 (99.99 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	44 (100.00 %)	n/a	104 (0.16 %)	21,672 (8.57 %)	1 (0.00 %)	27 (0.05 %)	43 (99.68 %)	43 (99.64 %)
502	Brucella cytisi (ESC1 2024) GCF_038433355.1	n/a	5,342 (87.16 %)	n/a	n/a	n/a	55.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	55 (100.00 %)	n/a	68 (0.11 %)	19,527 (6.67 %)	0 (0 %)	51 (0.12 %)	55 (99.83 %)	54 (97.61 %)
503	Brucella daejeonensis (DSM 26944 2020) GCF_014199265.1	n/a	4,522 (87.87 %)	n/a	n/a	n/a	58.49 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	55 (100.00 %)	n/a	141 (0.20 %)	26,429 (10.70 %)	0 (0 %)	67 (0.16 %)	56 (99.67 %)	50 (82.65 %)
504	Brucella endophytica (CGMCC 1.15082 2020) GCF_014640615.1	n/a	4,778 (87.23 %)	n/a	n/a	n/a	60.73 (99.99 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	83 (100.00 %)	n/a	157 (0.25 %)	34,207 (14.25 %)	0 (0 %)	276 (0.41 %)	81 (99.70 %)	61 (48.22 %)
505	Brucella gallinifaecis (ISO 196 2019) GCF_006476605.1	n/a	3,550 (87.36 %)	n/a	n/a	n/a	50.98 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	38 (100.00 %)	n/a	77 (0.11 %)	9,819 (4.34 %)	0 (0 %)	58 (0.36 %)	43 (73.86 %)	25 (17.53 %)
506	Brucella grignonensis (OgA9a 2017) GCF_002252505.1	n/a	4,675 (87.66 %)	n/a	n/a	n/a	54.15 (99.99 %)	12 (0.00 %)	12 (0.00 %)	181 (100.00 %)	n/a	52 (0.06 %)	14,494 (5.15 %)	0 (0 %)	46 (0.09 %)	166 (99.00 %)	163 (86.60 %)
507	Brucella haematophila (CCUG 38531 2019) GCF_005938105.1	n/a	5,199 (87.70 %)	n/a	n/a	n/a	56.67 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	55 (100.00 %)	n/a	89 (0.08 %)	25,599 (9.08 %)	0 (0 %)	48 (0.11 %)	57 (99.87 %)	47 (79.06 %)
508	Brucella intermedia (NCTC12171 2018) GCF_900454225.1	n/a	4,513 (88.09 %)	n/a	n/a	n/a	57.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	109 (0.26 %)	22,125 (8.46 %)	0 (0 %)	40 (0.13 %)	3 (99.98 %)	3 (99.98 %)
509	Brucella lupini (LUP21 2017) GCF_002252535.1	n/a	5,361 (87.93 %)	n/a	n/a	n/a	56.35 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	67 (100.00 %)	n/a	68 (0.05 %)	23,935 (8.11 %)	0 (0 %)	12 (0.02 %)	64 (99.83 %)	59 (95.98 %)
510	Brucella melitensis bv. 1 str. (16M 2001) GCF_000007125.1	n/a	3,237 (88.03 %)	n/a	n/a	n/a	57.22 (100.00 %)	10 (0.00 %)	10 (0.00 %)	12 (100.00 %)	n/a	89 (0.15 %)	17,332 (9.71 %)	0 (0 %)	43 (0.21 %)	2 (99.95 %)	2 (99.94 %)
511	Brucella microti (CCM 4915 2009) GCF_000022745.1	n/a	3,258 (88.05 %)	n/a	n/a	n/a	57.25 (100.00 %)	5 (0.00 %)	5 (0.00 %)	7 (100.00 %)	n/a	117 (0.29 %)	17,449 (9.65 %)	0 (0 %)	85 (0.28 %)	2 (99.97 %)	2 (99.97 %)
512	Brucella neotomae (NCTC10084 2018) GCF_900446125.1	n/a	3,266 (88.02 %)	n/a	n/a	n/a	57.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	88 (0.17 %)	17,114 (9.49 %)	0 (0 %)	56 (0.23 %)	3 (99.97 %)	3 (99.97 %)
513	Brucella oryzae (DSM 17471 2024) GCF_041929965.1	n/a	4,570 (88.02 %)	n/a	n/a	n/a	56.17 (99.99 %)	5 (0.01 %)	5 (0.01 %)	89 (99.99 %)	n/a	77 (0.08 %)	20,030 (7.47 %)	2 (0.01 %)	36 (0.08 %)	78 (99.15 %)	71 (96.95 %)
514	Brucella ovis (ATCC 25840 2007) GCF_000016845.1	n/a	3,267 (88.10 %)	n/a	n/a	n/a	57.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	75 (0.16 %)	15,924 (9.29 %)	0 (0 %)	28 (0.27 %)	2 (99.97 %)	2 (99.97 %)
515	Brucella pecoris (08RB2639 2019) GCF_006376675.1	n/a	4,885 (88.03 %)	n/a	n/a	n/a	55.95 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	61 (100.00 %)	n/a	93 (0.09 %)	19,689 (6.82 %)	0 (0 %)	44 (0.08 %)	61 (99.82 %)	60 (98.83 %)
516	Brucella pituitosa (BU72 2017) GCF_002803535.1	n/a	4,609 (87.20 %)	n/a	n/a	n/a	53.44 (99.98 %)	0 (0 %)	12 (0.02 %)	9 (100.00 %)	n/a	51 (0.05 %)	14,215 (4.92 %)	1 (0.01 %)	49 (0.18 %)	13 (98.55 %)	11 (98.52 %)
517	Brucella pseudintermedia (ASAG-D25 2022) GCF_025118245.1	n/a	4,165 (88.08 %)	n/a	n/a	n/a	57.93 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	80 (0.11 %)	22,420 (9.63 %)	0 (0 %)	43 (0.17 %)	2 (100.00 %)	2 (100.00 %)
518	Brucella pseudogrignonensis (ESL2 2022) GCF_022024335.1	n/a	4,662 (87.57 %)	n/a	n/a	n/a	53.87 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	78 (0.17 %)	14,866 (5.02 %)	0 (0 %)	80 (0.20 %)	3 (99.99 %)	3 (99.99 %)
519	Brucella rhizosphaerae (PR17 2017) GCF_002252475.1	n/a	4,625 (87.78 %)	n/a	n/a	n/a	53.01 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	36 (100.00 %)	n/a	107 (0.14 %)	13,240 (4.40 %)	0 (0 %)	31 (0.07 %)	33 (99.78 %)	27 (78.81 %)
520	Brucella suis (1330 2005) GCF_000007505.1	n/a	3,238 (88.06 %)	n/a	n/a	n/a	57.25 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	79 (0.13 %)	16,976 (9.43 %)	0 (0 %)	44 (0.21 %)	2 (99.97 %)	2 (99.97 %)
521	Brucella thiophenivorans (DSM 7216 2017) GCF_002252445.1	n/a	4,144 (87.49 %)	n/a	n/a	n/a	51.65 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	79 (100.00 %)	n/a	41 (0.06 %)	12,078 (4.55 %)	0 (0 %)	24 (0.05 %)	63 (92.86 %)	38 (6.01 %)
522	Brucella tritici (TA93 2019) GCF_008932285.1	n/a	4,815 (88.12 %)	n/a	n/a	n/a	55.78 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	44 (100.00 %)	n/a	64 (0.13 %)	18,403 (6.35 %)	0 (0 %)	50 (0.13 %)	36 (96.28 %)	27 (95.94 %)
523	Bruges virus (BE/Vieux-Genappe/TE/2013/1 2017) GCF_002117675.1	n/a	3 (93.06 %)	n/a	n/a	n/a	38.99 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.47 %)	n/a	8 (1.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
524	budding yeast C.albicans (WO-1 2009) GCA_000149445.2	n/a	5,875 (57.23 %)	1,771 (9.77 %)	4,526 (47.88 %)	n/a	33.47 (99.61 %)	69 (0.39 %)	69 (0.39 %)	86 (99.61 %)	13,498 (4.68 %)	3,653 (1.16 %)	117,961 (22.65 %)	0 (0 %)	678 (0.64 %)	24 (0.05 %)	21 (0.04 %)
525	budding yeast C.albicans SC5314 GCF_000182965.3	6,119 (62.70 %)	n/a	1,784 (9.87 %)	4,505 (49.12 %)	n/a	33.46 (99.96 %)	1,764 (0.06 %)	1,764 (0.06 %)	1,772 (99.94 %)	13,736 (4.51 %)	3,915 (1.19 %)	117,907 (23.01 %)	2 (0.00 %)	485 (0.30 %)	18 (0.05 %)	20 (0.05 %)
526	budding yeast C.auris (6684 2015 refseq) GCF_001189475.1	7,461 (64.95 %)	n/a	1,948 (12.61 %)	4,658 (59.89 %)	n/a	45.12 (98.69 %)	0 (0 %)	689 (1.33 %)	99 (100.00 %)	3,478 (1.23 %)	2,281 (0.83 %)	48,703 (8.19 %)	27 (0.12 %)	258 (0.23 %)	1,579 (6.36 %)	1,147 (4.11 %)
527	budding yeast C.auris (B11220 2019) GCF_003013715.1	5,335 (64.90 %)	n/a	1,953 (12.68 %)	4,668 (59.97 %)	n/a	45.33 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	2,154 (0.72 %)	1,400 (0.51 %)	47,813 (7.96 %)	0 (0 %)	841 (0.47 %)	1,607 (6.89 %)	1,183 (4.39 %)
528	budding yeast C.auris (B11221 2017 refseq) GCF_002775015.1	5,558 (64.34 %)	n/a	2,030 (12.92 %)	5,039 (61.20 %)	n/a	45.32 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	20 (100.00 %)	3,478 (2.43 %)	2,436 (0.80 %)	28,524 (6.96 %)	0 (0 %)	1,194 (1.58 %)	1,757 (7.37 %)	1,331 (4.92 %)
529	budding yeast C.auris (B11243 2018) GCA_003014415.1	n/a	5,595 (65.97 %)	1,946 (12.60 %)	4,673 (60.01 %)	n/a	45.05 (99.97 %)	0 (0 %)	55 (0.03 %)	238 (100.00 %)	3,312 (1.30 %)	2,782 (1.17 %)	48,932 (8.72 %)	0 (0 %)	737 (0.23 %)	1,595 (6.48 %)	1,145 (4.08 %)
530	budding yeast C.auris (B11245 2019) GCA_008275145.1	n/a	5,675 (61.93 %)	1,936 (12.41 %)	4,662 (55.97 %)	n/a	45.33 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	2,818 (1.36 %)	1,519 (0.64 %)	45,147 (7.64 %)	0 (0 %)	1,479 (0.73 %)	1,624 (7.28 %)	1,239 (4.38 %)
531	budding yeast C.auris (B8441 2024) GCA_002759435.3	n/a	5,594 (65.73 %)	1,947 (12.41 %)	4,679 (59.89 %)	n/a	45.22 (100.00 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	7 (100.00 %)	3,563 (1.30 %)	2,422 (0.89 %)	49,467 (8.45 %)	0 (0 %)	420 (0.31 %)	1,579 (6.90 %)	1,192 (4.26 %)
532	budding yeast C.dubliniensis CD36 GCF_000026945.1	5,856 (61.01 %)	n/a	1,759 (9.56 %)	4,389 (46.85 %)	n/a	33.25 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	20,534 (5.61 %)	7,304 (2.21 %)	120,645 (24.59 %)	0 (0 %)	1,061 (0.74 %)	19 (0.04 %)	14 (0.03 %)
533	budding yeast C.duobushaemulonis GCF_002926085.2	5,184 (63.68 %)	n/a	1,936 (12.10 %)	4,875 (58.49 %)	n/a	46.84 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	1,890 (0.83 %)	2,059 (0.97 %)	49,855 (7.97 %)	0 (0 %)	303 (0.31 %)	2,290 (13.87 %)	1,609 (7.68 %)
534	budding yeast C.fabianii (65 2017) GCA_001983305.1	n/a	5,509 (64.34 %)	2,205 (14.54 %)	5,267 (63.29 %)	n/a	44.40 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25 (100.00 %)	3,616 (1.56 %)	2,634 (0.92 %)	55,063 (9.84 %)	0 (0 %)	568 (0.49 %)	1,106 (3.96 %)	815 (2.69 %)
535	budding yeast C.haemuloni GCF_002926055.2	5,256 (62.94 %)	n/a	1,918 (11.43 %)	5,065 (59.28 %)	n/a	45.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	3,560 (1.20 %)	2,556 (0.99 %)	60,483 (10.12 %)	0 (0 %)	237 (0.21 %)	1,138 (3.47 %)	695 (1.91 %)
536	budding yeast C.lusitaniae (ATCC 42720 2009 refseq) GCF_000003835.1	5,935 (65.70 %)	n/a	1,957 (12.86 %)	4,335 (54.85 %)	n/a	44.50 (99.71 %)	79 (0.29 %)	79 (0.29 %)	88 (99.71 %)	2,265 (1.18 %)	4,036 (1.77 %)	48,188 (8.66 %)	0 (0 %)	697 (0.55 %)	1,474 (15.82 %)	1,218 (9.79 %)
537	budding yeast C.parapsilosis GCF_000182765.1	5,814 (67.48 %)	n/a	1,827 (11.13 %)	5,060 (62.06 %)	n/a	38.68 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	6,898 (2.17 %)	3,642 (1.29 %)	78,803 (14.05 %)	0 (0 %)	1,013 (0.86 %)	17 (0.06 %)	8 (0.02 %)
538	budding yeast C.pseudohaemulonis GCF_003013735.1	5,138 (64.79 %)	5,285 (64.88 %)	1,922 (12.05 %)	4,826 (60.69 %)	n/a	47.19 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	36 (100.00 %)	1,726 (0.64 %)	1,868 (0.89 %)	51,053 (8.14 %)	0 (0 %)	236 (0.16 %)	2,401 (15.70 %)	1,662 (8.66 %)
539	budding yeast C.tropicalis (MYA-3404 2020) GCA_013177555.1	n/a	n/a	1,750 (9.58 %)	4,853 (53.27 %)	n/a	33.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	14,750 (4.25 %)	4,538 (1.99 %)	117,410 (22.63 %)	0 (0 %)	1,593 (1.41 %)	32 (0.07 %)	27 (0.06 %)
540	budding yeast C.tropicalis MYA-3404 GCF_000006335.3	6,254 (62.14 %)	n/a	1,750 (9.50 %)	4,880 (52.20 %)	n/a	33.15 (99.63 %)	104 (0.37 %)	104 (0.37 %)	128 (99.63 %)	14,671 (4.27 %)	4,342 (1.68 %)	118,814 (22.63 %)	0 (0 %)	1,514 (1.06 %)	23 (0.06 %)	21 (0.05 %)
541	budding yeast D.fabryi GCF_001447935.2	6,025 (74.09 %)	n/a	2,001 (13.79 %)	5,325 (68.48 %)	n/a	35.64 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	536 (100.00 %)	2,082 (0.86 %)	1,266 (0.48 %)	70,375 (13.11 %)	0 (0 %)	114 (0.08 %)	91 (0.28 %)	80 (0.25 %)
542	budding yeast D.hansenii CBS767 GCF_000006445.2	6,295 (74.18 %)	n/a	2,011 (13.42 %)	5,387 (68.63 %)	n/a	36.33 (99.99 %)	0 (0 %)	10 (0.01 %)	8 (100.00 %)	2,513 (1.99 %)	1,598 (0.81 %)	69,246 (12.34 %)	0 (0 %)	971 (1.11 %)	179 (0.75 %)	159 (0.64 %)
543	budding yeast D.rugosa GCF_008704595.1	5,815 (61.82 %)	n/a	1,706 (9.84 %)	3,799 (43.48 %)	n/a	49.56 (99.91 %)	0 (0 %)	324 (0.09 %)	169 (100.00 %)	2,463 (0.96 %)	2,239 (0.91 %)	55,208 (8.64 %)	24 (0.04 %)	328 (0.26 %)	579 (62.23 %)	1,113 (4.79 %)
544	budding yeast H.guilliermondii (UTAD222 2016) GCA_900119595.1	n/a	4,227 (69.97 %)	1,416 (13.28 %)	3,674 (64.29 %)	n/a	30.95 (99.98 %)	0 (0 %)	287 (0.03 %)	208 (100.00 %)	7,504 (3.36 %)	1,721 (0.85 %)	65,623 (22.65 %)	0 (0 %)	288 (0.27 %)	7 (0.02 %)	7 (0.02 %)
545	budding yeast H.uvarum (AWRI3580 2016) GCA_001747055.1	n/a	4,061 (73.19 %)	1,361 (12.92 %)	3,683 (67.02 %)	n/a	31.85 (99.97 %)	0 (0 %)	69,905 (0.86 %)	18 (100.00 %)	3,251 (1.52 %)	1,152 (1.16 %)	69,161 (18.13 %)	2 (0.00 %)	701 (0.87 %)	6 (0.02 %)	6 (0.02 %)
546	budding yeast K.lactis GCF_000002515.2	5,146 (69.17 %)	n/a	3,328 (29.03 %)	4,740 (66.81 %)	n/a	38.72 (100.00 %)	0 (0 %)	17 (0.00 %)	7 (100.00 %)	2,695 (1.37 %)	1,443 (0.68 %)	50,099 (9.97 %)	0 (0 %)	282 (0.38 %)	53 (0.14 %)	42 (0.11 %)
547	budding yeast K.marxianus (DMKU3-1042 2014 refseq) GCF_001417885.1	4,958 (68.10 %)	n/a	3,347 (28.78 %)	4,665 (66.28 %)	n/a	40.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	7,406 (3.43 %)	3,781 (1.46 %)	51,732 (11.80 %)	0 (0 %)	614 (0.85 %)	742 (4.91 %)	562 (2.75 %)
548	budding yeast L.elongisporus (NRRL YB-4239 2007 refseq) GCF_000149685.1	5,799 (57.01 %)	n/a	1,905 (9.82 %)	5,004 (52.37 %)	n/a	36.94 (99.45 %)	117 (0.56 %)	117 (0.56 %)	145 (99.44 %)	30,880 (10.91 %)	18,155 (4.10 %)	100,210 (23.18 %)	0 (0 %)	1,604 (1.36 %)	22 (0.04 %)	19 (0.04 %)
549	budding yeast M.guilliermondii ATCC 6260 GCF_000149425.1	5,920 (77.75 %)	n/a	1,998 (15.12 %)	4,688 (67.73 %)	n/a	43.76 (99.67 %)	62 (0.33 %)	62 (0.33 %)	71 (99.67 %)	1,556 (0.86 %)	2,117 (1.06 %)	39,493 (7.54 %)	0 (0 %)	301 (0.39 %)	836 (4.05 %)	605 (2.47 %)
550	budding yeast N.glabratus (ATCC 2001 2020) GCF_010111755.1	5,290 (64.34 %)	n/a	3,614 (27.43 %)	4,867 (60.19 %)	n/a	39.04 (99.99 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	14 (99.99 %)	3,500 (3.55 %)	2,843 (3.45 %)	53,094 (11.64 %)	0 (0 %)	1,148 (1.26 %)	677 (4.32 %)	589 (2.58 %)
551	budding yeast N.glabratus (BG2 2020) GCA_014217725.1	n/a	5,481 (65.25 %)	3,619 (27.29 %)	4,814 (60.63 %)	n/a	39.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	13 (100.00 %)	3,153 (1.65 %)	2,824 (3.33 %)	55,778 (11.87 %)	0 (0 %)	1,108 (1.53 %)	673 (4.07 %)	598 (2.64 %)
552	budding yeast N.glabratus (BG3993 2021) GCA_020450195.1	n/a	5,487 (65.02 %)	3,612 (27.31 %)	4,839 (60.84 %)	n/a	38.97 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	13 (100.00 %)	3,637 (3.29 %)	2,941 (3.27 %)	56,516 (11.95 %)	0 (0 %)	1,243 (1.41 %)	670 (4.02 %)	581 (2.60 %)
553	budding yeast N.glabratus (CBS 138 2008 refseq) GCF_000002545.3	5,214 (64.24 %)	n/a	3,552 (27.82 %)	4,801 (61.28 %)	n/a	38.62 (100.00 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	14 (100.00 %)	2,966 (1.29 %)	2,640 (1.61 %)	61,029 (11.58 %)	0 (0 %)	805 (0.77 %)	635 (3.10 %)	567 (2.52 %)
554	budding yeast N.glabratus (DSY562 2017) GCA_002219185.1	n/a	5,539 (65.02 %)	3,606 (27.33 %)	4,822 (60.76 %)	n/a	38.91 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	19 (100.00 %)	3,178 (1.34 %)	2,985 (3.32 %)	54,465 (11.73 %)	0 (0 %)	1,466 (1.31 %)	645 (3.98 %)	563 (2.43 %)
555	budding yeast P.kudriavzevii GCF_003054445.1	5,144 (73.16 %)	n/a	1,761 (12.92 %)	4,631 (68.44 %)	n/a	38.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	5 (100.00 %)	4,323 (2.06 %)	2,851 (1.29 %)	56,177 (12.16 %)	0 (0 %)	678 (1.22 %)	199 (0.78 %)	163 (0.63 %)
556	budding yeast P.kudriavzevii (CBS5147 2018) GCA_003054405.1	n/a	n/a	1,767 (12.94 %)	4,673 (67.81 %)	n/a	38.35 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	5 (100.00 %)	4,364 (2.03 %)	2,885 (1.24 %)	55,891 (12.13 %)	0 (0 %)	659 (1.14 %)	180 (0.67 %)	146 (0.54 %)
557	budding yeast S.ludwigii (UTAD17 2018) GCA_900491785.1	n/a	4,257 (64.24 %)	2,278 (19.08 %)	3,433 (54.10 %)	n/a	31.21 (99.87 %)	0 (0 %)	362 (0.11 %)	1,360 (100.00 %)	18,236 (7.45 %)	10,431 (3.63 %)	91,893 (30.19 %)	3 (0.00 %)	918 (0.56 %)	11 (0.04 %)	6 (0.02 %)
558	budding yeast S.paradoxus GCF_002079055.1	5,536 (69.25 %)	n/a	5,726 (67.33 %)	5,012 (65.68 %)	n/a	38.54 (99.86 %)	0 (0 %)	1 (0.14 %)	17 (100.00 %)	3,433 (1.87 %)	2,033 (1.00 %)	63,726 (13.09 %)	0 (0 %)	986 (1.32 %)	234 (0.91 %)	194 (0.69 %)
559	budding yeast T.ciferrii (CBS 4856 2019) GCA_008704605.1	n/a	6,909 (45.52 %)	2,044 (7.82 %)	5,322 (37.66 %)	n/a	47.46 (99.83 %)	0 (0 %)	1,224 (0.18 %)	583 (100.00 %)	5,257 (1.29 %)	5,632 (5.15 %)	91,527 (19.38 %)	71 (0.05 %)	12,678 (3.36 %)	4,428 (22.10 %)	3,609 (12.62 %)
560	budding yeast Y.lipolytica (CLIB122 2004 refseq) GCF_000002525.2	6,576 (45.99 %)	n/a	1,749 (6.56 %)	4,805 (37.68 %)	n/a	48.99 (99.99 %)	0 (0 %)	28 (0.01 %)	7 (100.00 %)	7,541 (2.97 %)	9,613 (2.12 %)	82,856 (9.77 %)	0 (0 %)	967 (0.42 %)	6,216 (33.35 %)	5,359 (18.29 %)
561	Bufavirus-3 (BTN-63 2014) GCF_000924255.1	n/a	5 (95.27 %)	n/a	n/a	n/a	39.77 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.31 %)	1 (0.78 %)	18 (5.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
562	bugs R.prolixus (2015) GCA_000181055.3	n/a	n/a	3,449 (0.53 %)	6,235 (2.02 %)	n/a	33.94 (79.90 %)	31,189 (20.12 %)	35,813 (20.12 %)	47,726 (79.88 %)	607,379 (26.14 %)	124,820 (4.39 %)	3,949,021 (35.74 %)	228 (0.07 %)	393,162 (4.55 %)	4,329 (0.35 %)	2,632 (0.25 %)
563	bugs T.infestans (FIOC_28 2020) GCA_011037195.1	n/a	n/a	3,163 (0.28 %)	12,286 (1.96 %)	n/a	34.03 (99.65 %)	1,371 (0.34 %)	1,371 (0.34 %)	16,322 (99.66 %)	697,367 (3.04 %)	248,447 (1.97 %)	7,271,792 (47.96 %)	0 (0 %)	268,596 (2.67 %)	15,196 (0.99 %)	7,328 (0.65 %)
564	Burkholderia mallei (ATCC 23344 2023) GCF_033956065.1	n/a	5,381 (86.25 %)	n/a	n/a	n/a	68.49 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	1,643 (1.42 %)	61,717 (40.88 %)	0 (0 %)	144 (0.73 %)	2 (100.00 %)	0 (0.00 %)
565	Burkholderia pseudomallei (GTC3P0254T 2023) GCF_030297255.1	n/a	6,292 (86.00 %)	n/a	n/a	n/a	68.25 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	2,049 (1.57 %)	75,658 (42.05 %)	0 (0 %)	498 (0.64 %)	2 (100.00 %)	0 (0.00 %)
566	C.velia (CCMP2878 2021) GCA_018398765.1	n/a	n/a	808 (0.25 %)	13,493 (9.27 %)	n/a	49.11 (99.71 %)	8,037 (0.30 %)	8,037 (0.30 %)	14,003 (99.70 %)	271,055 (8.61 %)	174,356 (7.50 %)	1,404,943 (30.85 %)	164 (0.11 %)	128,778 (4.12 %)	56,904 (19.48 %)	26,011 (6.19 %)
567	Caaingua virus (MS681 2021) GCF_018585185.1	n/a	2 (96.38 %)	n/a	n/a	n/a	51.29 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.81 %)	n/a	5 (0.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (85.60 %)	3 (82.64 %)
568	Cache Valley virus (6V633 2019) GCF_004789995.1	n/a	4 (95.45 %)	n/a	n/a	n/a	35.43 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (0.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
569	Calicivirus chicken/V0021/Bayern/2004 (Bavaria04V0021 2023) GCF_004786895.1	n/a	2 (98.62 %)	n/a	n/a	n/a	54.02 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.64 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.06 %)	1 (4.06 %)
570	Calicivirus isolate (TCG 14 2005) GCF_000859525.1	n/a	2 (98.09 %)	n/a	n/a	n/a	56.20 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.19 %)	n/a	2 (1.07 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (69.58 %)	2 (69.58 %)
571	Calicivirus pig/AB90/CAN (AB90 2009) GCF_000883855.1	n/a	2 (99.21 %)	n/a	n/a	n/a	54.31 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.39 %)	1 (0.39 %)	10 (1.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
572	California encephalitis virus (BFS 283 2021) GCF_003972565.1	n/a	4 (94.87 %)	n/a	n/a	n/a	36.45 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.66 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
573	Camel Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (camel/Abu Dhabi/B84 2020) GCA_032106395.1	n/a	3 (96.30 %)	n/a	n/a	n/a	43.00 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.56 %)	n/a	16 (0.70 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
574	Campylobacter jejuni subsp. jejuni ATCC 700819 (NCTC 11168 2003) GCF_000009085.1	n/a	1,635 (92.40 %)	n/a	n/a	n/a	30.55 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	69 (0.33 %)	16,429 (28.46 %)	0 (0 %)	75 (1.02 %)	4 (0.22 %)	4 (0.22 %)
575	Candidatus Rickettsia colombianensi (Adcor 2 2018) GCF_003664375.1	n/a	972 (84.10 %)	n/a	n/a	n/a	32.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	13 (100.00 %)	n/a	33 (0.49 %)	7,501 (19.68 %)	0 (0 %)	49 (0.58 %)	1 (0.03 %)	0 (0.00 %)
576	Candidatus Rickettsia kedanie (KNCP2-13 2024) GCF_045865205.1	n/a	1,553 (81.08 %)	n/a	n/a	n/a	32.50 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	52 (100.00 %)	n/a	51 (0.23 %)	10,785 (18.84 %)	0 (0 %)	30 (0.16 %)	4 (0.15 %)	3 (0.14 %)
577	Canine vesivirus (2003) GCF_000851085.1	n/a	3 (97.08 %)	n/a	n/a	n/a	45.89 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.63 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
578	Capira virus (VP-366G 2015) GCA_031322265.1	n/a	4 (95.28 %)	n/a	n/a	n/a	38.38 (99.97 %)	2 (0.03 %)	2 (0.03 %)	5 (99.97 %)	4 (1.01 %)	6 (0.94 %)	4 (1.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
579	Capnocytophaga canimorsus (7120 2017) GCF_002302565.1	n/a	2,132 (89.02 %)	n/a	n/a	n/a	36.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	164 (0.60 %)	17,536 (16.66 %)	0 (0 %)	147 (0.58 %)	19 (0.33 %)	19 (0.28 %)
580	Capnocytophaga sputigena (D1179 2017) GCF_002302495.1	n/a	2,559 (91.88 %)	n/a	n/a	n/a	38.78 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	341 (1.40 %)	15,302 (11.21 %)	0 (0 %)	389 (1.18 %)	84 (1.20 %)	76 (1.04 %)
581	castor bean tick (Charles River 2016) GCA_000973045.2	n/a	n/a	1,387 (0.14 %)	66,874 (6.09 %)	n/a	44.98 (99.91 %)	1,504 (0.01 %)	1,504 (0.01 %)	206,020 (99.99 %)	155,866 (1.27 %)	99,582 (1.34 %)	3,026,165 (22.21 %)	2 (0.00 %)	n/a	128,567 (22.50 %)	89,543 (11.03 %)
582	cat liver fluke (AK-0245 2019) GCA_004794785.1	n/a	20,866 (4.16 %)	1,737 (0.22 %)	n/a	n/a	44.05 (89.37 %)	26,705 (10.64 %)	26,705 (10.64 %)	40,011 (89.36 %)	53,935 (0.49 %)	31,328 (0.38 %)	2,350,472 (15.53 %)	703 (0.46 %)	59,831 (1.92 %)	66,730 (4.52 %)	23,829 (1.16 %)
583	cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA) GCF_002263795.3	77,808 (4.11 %)	n/a	19,428 (1.48 %)	22,236 (1.33 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	0 (0 %)	386 (0.00 %)	1,958 (100.00 %)	3,449,588 (22.63 %)	596,092 (3.13 %)	12,785,607 (42.11 %)	1 (0.00 %)	1,626,342 (4.17 %)	46,864 (1.37 %)	37,742 (0.86 %)
584	Catu virus (BeH 151 2018) GCF_002831305.1	n/a	3 (98.05 %)	n/a	n/a	n/a	37.20 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (0.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
585	CDC Enteric Group 75 (FDAARGOS 1433 2021) GCF_019048245.1	n/a	4,791 (90.29 %)	n/a	n/a	n/a	55.14 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	75 (0.20 %)	27,877 (10.72 %)	0 (0 %)	103 (0.20 %)	10 (99.33 %)	12 (0.35 %)
586	cellular slime mold D.discoideum (AX4 2009) GCF_000004695.1	13,269 (61.68 %)	n/a	966 (2.05 %)	211 (3.60 %)	n/a	22.44 (99.94 %)	230 (0.07 %)	358 (0.07 %)	261 (99.93 %)	133,360 (25.23 %)	139,151 (14.86 %)	257,501 (56.19 %)	1 (0.00 %)	33,356 (6.43 %)	18 (0.01 %)	11 (0.01 %)
587	cellular slime mold D.purpureum (QSDP1 2011) GCF_000190715.1	12,395 (56.45 %)	n/a	946 (2.08 %)	538 (3.84 %)	n/a	24.47 (99.65 %)	413 (0.35 %)	413 (0.35 %)	1,212 (99.65 %)	75,750 (13.63 %)	75,374 (8.25 %)	250,995 (49.61 %)	3 (0.02 %)	13,768 (3.65 %)	9 (0.01 %)	5 (0.00 %)
588	Central cimpanzee simian foamy virus (Pan troglodytes troglodytes BAD327 2018) GCF_003032755.1	n/a	6 (75.24 %)	n/a	n/a	n/a	38.61 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (0.88 %)	0 (0 %)	1 (26.61 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
589	Chandipura virus (CIN 0451 2013) GCF_000906815.1	n/a	5 (96.34 %)	n/a	n/a	n/a	42.53 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.29 %)	n/a	19 (1.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
590	Chandiru virus (2011) GCF_000891915.1	n/a	4 (94.55 %)	n/a	n/a	n/a	39.54 (99.96 %)	6 (0.06 %)	6 (0.06 %)	9 (99.94 %)	4 (0.24 %)	1 (0.42 %)	21 (2.82 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
591	Changuinola virus (CGLV/BE AN 28873 2013) GCF_000911195.1	n/a	10 (96.06 %)	n/a	n/a	n/a	42.18 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	6 (0.61 %)	n/a	7 (0.79 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (3.32 %)	2 (3.32 %)
592	charcoal rot (MS6 2012) GCA_000302655.1	n/a	13,988 (36.42 %)	1,588 (2.48 %)	7,060 (19.49 %)	n/a	52.33 (99.99 %)	12 (0.00 %)	12 (0.00 %)	1,518 (100.00 %)	17,277 (1.48 %)	6,285 (0.60 %)	145,973 (14.00 %)	0 (0 %)	3,985 (0.67 %)	1,144 (84.82 %)	1,204 (80.41 %)
593	Chicken calicivirus (RS/BR/2015 2017) GCF_001963095.1	n/a	2 (95.46 %)	n/a	n/a	n/a	54.17 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.63 %)	1 (2.63 %)
594	chicken white leghorn layer X broiler (v2 broiler haplotype 2021 2021) GCF_016699485.2	84,120 (9.95 %)	n/a	13,128 (2.33 %)	23,484 (2.48 %)	72,013 (9.34 %)	42.20 (99.68 %)	463 (0.32 %)	463 (0.32 %)	677 (99.68 %)	697,827 (12.53 %)	290,892 (2.63 %)	5,887,021 (21.30 %)	1 (0.00 %)	268,636 (2.17 %)	24,469 (2.59 %)	20,885 (1.55 %)
595	Chikungunya virus (S27-African prototype 2002) GCF_000854045.1	n/a	2 (94.47 %)	n/a	n/a	n/a	50.04 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.87 %)	n/a	3 (1.76 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	7 (34.06 %)	7 (34.06 %)
596	Chimpanzee adenovirus Y25 (2012) GCF_000897015.1	n/a	37 (82.60 %)	n/a	n/a	n/a	58.78 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	13 (1.03 %)	3 (0.46 %)	100 (4.44 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (75.08 %)	4 (74.01 %)
597	chlamydias (6BC 2011) GCF_000204255.1	n/a	1,034 (91.04 %)	n/a	n/a	n/a	39.02 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	17 (0.15 %)	6,260 (9.56 %)	0 (0 %)	59 (0.38 %)	4 (0.13 %)	4 (0.13 %)
598	Chromobacterium violaceum (FDAARGOS_1273 2021) GCF_016890085.1	n/a	4,581 (89.77 %)	n/a	n/a	n/a	64.89 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	206 (0.71 %)	49,917 (27.41 %)	0 (0 %)	433 (0.84 %)	2 (100.00 %)	0 (0.00 %)
599	chytrids B.dendrobatidis (JEL423 2006) GCA_000149865.1	n/a	10,012 (59.58 %)	1,239 (4.04 %)	7,388 (33.26 %)	n/a	39.27 (98.67 %)	281 (1.34 %)	281 (1.34 %)	351 (98.66 %)	2,465 (1.08 %)	3,270 (1.20 %)	81,392 (12.56 %)	2 (0.02 %)	6,230 (3.49 %)	159 (0.20 %)	147 (0.19 %)
600	chytrids B.salamandrivorans (AMFP13 2022) GCA_002006685.2	n/a	10,867 (22.31 %)	1,891 (1.83 %)	11,986 (15.27 %)	n/a	42.93 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	165 (100.00 %)	39,302 (2.30 %)	34,075 (2.93 %)	300,621 (24.32 %)	0 (0 %)	109,680 (14.64 %)	4,299 (2.28 %)	1,839 (0.91 %)
601	chytrids S.endobioticum (MB42 2019) GCA_006535955.1	n/a	8,031 (53.31 %)	1,149 (4.04 %)	5,740 (23.49 %)	n/a	46.99 (99.51 %)	0 (0 %)	1,398 (0.50 %)	786 (100.00 %)	3,828 (0.71 %)	1,595 (0.77 %)	49,907 (8.42 %)	48 (0.12 %)	2,409 (6.60 %)	4,505 (19.84 %)	3,646 (13.04 %)
602	chytrids S.punctatus DAOM BR117 GCF_000182565.1	9,429 (68.08 %)	n/a	1,421 (4.51 %)	4,780 (22.26 %)	n/a	47.60 (99.07 %)	291 (0.93 %)	291 (0.93 %)	329 (99.07 %)	3,600 (2.36 %)	2,146 (0.75 %)	50,507 (7.47 %)	4 (0.03 %)	2,164 (1.15 %)	6,124 (21.68 %)	5,124 (13.11 %)
603	Circo-like virus-Brazil (hs1 2014) GCF_000919735.1	n/a	4 (87.77 %)	n/a	n/a	n/a	34.73 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.05 %)	1 (2.26 %)	8 (7.21 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
604	Circular ssDNA virus sp. (2023) GCF_023122845.1	n/a	2 (76.33 %)	n/a	n/a	n/a	57.82 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.59 %)	3 (1.77 %)	3 (2.41 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (83.33 %)	1 (83.33 %)
605	Circular ssDNA virus sp. (HV-CV1 2016) GCF_001678815.1	n/a	3 (73.09 %)	n/a	n/a	n/a	52.61 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (1.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (78.14 %)	1 (78.14 %)
606	Citrobacter freundii (2020) GCF_904859905.1	n/a	5,049 (89.26 %)	n/a	n/a	n/a	51.72 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	84 (0.14 %)	21,409 (7.24 %)	0 (0 %)	70 (0.13 %)	48 (98.63 %)	50 (0.98 %)
607	Clostridioides difficile (630 2017) GCF_000009205.2	n/a	3,974 (84.35 %)	n/a	n/a	n/a	29.06 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	630 (1.16 %)	38,168 (24.03 %)	0 (0 %)	461 (1.40 %)	47 (0.94 %)	45 (0.53 %)
608	Clostridioides difficile (M120 2010) GCF_000210435.1	n/a	3,723 (83.93 %)	n/a	n/a	n/a	28.67 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	471 (0.86 %)	36,524 (24.43 %)	0 (0 %)	404 (1.41 %)	40 (0.53 %)	40 (0.53 %)
609	Clostridioides difficile (R20291 2009 refseq) GCF_000027105.1	n/a	3,825 (84.26 %)	n/a	n/a	n/a	28.81 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	3 (100.00 %)	n/a	567 (1.03 %)	37,432 (24.20 %)	0 (0 %)	376 (1.35 %)	40 (1.03 %)	40 (1.02 %)
610	Clostridioides difficile (S-0253 2021) GCF_018885085.1	n/a	3,735 (84.21 %)	n/a	n/a	n/a	28.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	617 (1.30 %)	36,392 (24.04 %)	0 (0 %)	444 (1.38 %)	42 (0.55 %)	42 (0.55 %)
611	Clostridium botulinum A str. (ATCC 3502 2007) GCF_000063585.1	n/a	3,704 (82.92 %)	n/a	n/a	n/a	28.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	413 (0.91 %)	40,583 (30.87 %)	0 (0 %)	299 (1.26 %)	23 (0.45 %)	23 (0.45 %)
612	Clostridium perfringens (FDAARGOS_903 2020) GCF_016027375.1	n/a	3,058 (84.88 %)	n/a	n/a	n/a	28.33 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	277 (0.67 %)	31,200 (26.08 %)	0 (0 %)	144 (1.01 %)	32 (0.99 %)	32 (0.99 %)
613	Clostridium tetani (Massachusetts substr. E88 2003) GCF_000007625.1	n/a	2,871 (88.79 %)	n/a	n/a	n/a	28.64 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	180 (0.50 %)	29,275 (27.68 %)	0 (0 %)	158 (0.91 %)	19 (0.52 %)	19 (0.52 %)
614	Cocal virus (Indiana 2 2015) GCF_001440915.1	n/a	7 (99.82 %)	n/a	n/a	n/a	43.98 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.34 %)	n/a	7 (0.53 %)	0 (0 %)	1 (0.60 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
615	Cocle virus (GML244915 2023) GCF_013086615.1	n/a	4 (91.78 %)	n/a	n/a	n/a	40.00 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (2.05 %)	9 (1.44 %)	13 (3.57 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
616	coffee rust fungus (Race XXXIII 2019) GCA_004125335.1	n/a	n/a	1,180 (0.15 %)	12,199 (1.90 %)	n/a	33.59 (99.55 %)	65,348 (0.44 %)	65,348 (0.44 %)	182,104 (99.56 %)	284,425 (3.03 %)	227,859 (4.00 %)	3,068,698 (61.88 %)	194 (0.01 %)	n/a	3,316 (0.42 %)	2,263 (0.32 %)
617	Colobus guereza papillomavirus 2 (CgPV2 2011) GCF_000892175.1	n/a	6 (92.13 %)	n/a	n/a	n/a	47.13 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.54 %)	2 (1.95 %)	5 (2.71 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (15.12 %)	3 (12.27 %)
618	Colorado tick fever virus (Florio; N-7180 2002) GCF_000853265.1	n/a	13 (95.61 %)	n/a	n/a	n/a	46.56 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	32 (1.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	7 (8.12 %)	6 (7.22 %)
619	Corriparta virus (AUS1960/01 2018) GCF_002829365.1	n/a	12 (95.17 %)	n/a	n/a	n/a	44.27 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	4 (0.41 %)	n/a	2 (0.32 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (6.68 %)	3 (6.68 %)
620	Corynebacterium diphtheriae (2015) GCF_001457455.1	n/a	2,378 (89.60 %)	n/a	n/a	n/a	53.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	77 (0.16 %)	6,688 (4.84 %)	0 (0 %)	50 (0.21 %)	2 (99.99 %)	1 (99.97 %)
621	Corynebacterium diphtheriae (NCTC 13129 2003) GCF_000195815.1	n/a	2,365 (90.18 %)	n/a	n/a	n/a	53.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	n/a	75 (0.22 %)	6,542 (4.63 %)	0 (0 %)	59 (0.30 %)	1 (99.98 %)	1 (99.98 %)
622	Corynebacterium diphtheriae (PW8 2012) GCF_000255275.1	n/a	2,413 (89.35 %)	n/a	n/a	n/a	53.70 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	56 (0.11 %)	6,443 (4.49 %)	0 (0 %)	62 (0.32 %)	2 (99.99 %)	1 (99.97 %)
623	Cosavirus A (HCoSV-A1 0553 2009) GCF_000885595.1	n/a	1 (83.53 %)	n/a	n/a	n/a	43.75 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.63 %)	n/a	5 (1.90 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
624	Cosavirus D (HCoSV-D1 5004 2009) GCF_000886475.1	n/a	1 (88.44 %)	n/a	n/a	n/a	42.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
625	Cosavirus E (HCoSV-E1 2009) GCF_000886455.1	n/a	1 (96.38 %)	n/a	n/a	n/a	41.93 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	5 (0.79 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
626	Cosavirus F (PK5006 2017) GCF_002117635.1	n/a	1 (95.96 %)	n/a	n/a	n/a	44.40 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.93 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
627	Cosavirus JMY-2014 (Cosa-CHN 2014) GCF_000930055.1	n/a	1 (88.17 %)	n/a	n/a	n/a	42.21 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
628	Coxiella burnetii (RSA 493 2016) GCF_000007765.2	n/a	1,878 (77.51 %)	n/a	n/a	n/a	42.60 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	69 (0.32 %)	12,401 (13.25 %)	0 (0 %)	70 (0.73 %)	10 (0.32 %)	51 (0.97 %)
629	Coxsackievirus A2 (Fleetwood CA2 2018) GCF_002816655.1	n/a	1 (88.90 %)	n/a	n/a	n/a	48.26 (99.96 %)	4 (0.05 %)	4 (0.05 %)	5 (99.95 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.64 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.18 %)	1 (4.18 %)
630	Coxsackievirus B3 (2018) GCF_002816685.1	n/a	1 (88.63 %)	n/a	n/a	n/a	47.67 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.11 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
631	crab-eating macaque WashU 2013 refseq GCF_000364345.1	76,196 (3.30 %)	n/a	20,209 (1.91 %)	51,427 (6.84 %)	n/a	40.90 (95.16 %)	80,163 (4.85 %)	80,474 (4.85 %)	87,764 (95.15 %)	5,251,819 (50.85 %)	941,514 (3.24 %)	15,778,510 (35.74 %)	1,138 (0.05 %)	1,213,705 (2.53 %)	76,963 (1.14 %)	27,520 (0.64 %)
632	Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (IbAr10200 2003) GCF_000854165.1	n/a	3 (95.80 %)	n/a	n/a	n/a	42.23 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.22 %)	26 (1.53 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
633	Crithidia fasciculata (Cf-Cl 2015) GCA_000331325.2	n/a	n/a	682 (0.97 %)	5,606 (45.84 %)	n/a	57.01 (100.00 %)	36 (0.00 %)	36 (0.00 %)	494 (100.00 %)	39,861 (4.03 %)	6,061 (1.76 %)	368,094 (26.68 %)	0 (0 %)	19,083 (5.73 %)	552 (98.89 %)	422 (0.93 %)
634	Crosse virus (La Crosse/original 1994) GCA_002831285.1	n/a	6 (94.68 %)	n/a	n/a	n/a	36.60 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	17 (1.43 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
635	Cuevavirus lloviuense (Lloviu virus/M.schreibersii-wt/ESP/2003/Asturias-Bat86 2011) GCF_000896415.1	n/a	9 (80.46 %)	n/a	n/a	n/a	45.99 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.18 %)	n/a	13 (0.66 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
636	Cupriavidus metallidurans (NDB4MOL1 2017) GCF_900185755.1	n/a	6,331 (88.10 %)	n/a	n/a	n/a	63.57 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	48 (100.00 %)	n/a	343 (0.40 %)	50,054 (16.42 %)	0 (0 %)	185 (0.25 %)	47 (99.93 %)	45 (85.57 %)
637	Cutavirus (BR-337 2018) GCF_003033315.1	n/a	6 (99.33 %)	n/a	n/a	n/a	38.92 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (3.34 %)	n/a	15 (7.76 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
638	Cutibacterium acnes subsp. acnes (NBRC 107605 2019) GCF_006739385.1	n/a	2,439 (90.42 %)	n/a	n/a	n/a	60.03 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	51 (0.08 %)	11,649 (8.56 %)	0 (0 %)	22 (0.19 %)	1 (99.99 %)	1 (99.99 %)
639	Cyclovirus (NG12 2018) GCF_002820165.1	n/a	2 (83.78 %)	n/a	n/a	n/a	47.65 (99.78 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
640	Cyclovirus (NG14 2018) GCF_002820185.1	n/a	2 (86.35 %)	n/a	n/a	n/a	46.41 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.56 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (40.17 %)	1 (40.17 %)
641	Cyclovirus (PK5006 2018) GCF_002820085.1	n/a	2 (86.65 %)	n/a	n/a	n/a	43.66 (99.83 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.80 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (17.18 %)	1 (17.18 %)
642	Cyclovirus (PK5034 2018) GCF_002820145.1	n/a	2 (83.54 %)	n/a	n/a	n/a	48.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
643	Cyclovirus (PK5222 2018) GCF_002820105.1	n/a	2 (85.80 %)	n/a	n/a	n/a	43.62 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (3.33 %)	n/a	4 (5.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (23.56 %)	0 (0.00 %)
644	Cyclovirus (PK5510 2018) GCF_002820065.1	n/a	2 (84.59 %)	n/a	n/a	n/a	44.67 (99.77 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
645	Cyclovirus (SL-108277 2018) GCF_002820225.1	n/a	2 (87.89 %)	n/a	n/a	n/a	41.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.99 %)	n/a	2 (1.52 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (15.67 %)	1 (15.67 %)
646	Cyclovirus (TN25 2018) GCF_002820125.1	n/a	3 (81.95 %)	n/a	n/a	n/a	45.20 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.50 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (12.37 %)	0 (0.00 %)
647	Cyclovirus VN (hcf2 2018) GCF_002820205.1	n/a	3 (81.79 %)	n/a	n/a	n/a	46.20 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.62 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
648	Dandenong virus (0710-2678 2007) GCA_031580275.1	n/a	4 (95.83 %)	n/a	n/a	n/a	43.24 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.73 %)	1 (0.31 %)	5 (1.88 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
649	Dar es Salaam virus (TZ-189 2023) GCF_018595055.1	n/a	3 (92.94 %)	n/a	n/a	n/a	40.08 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.67 %)	n/a	14 (2.66 %)	0 (0 %)	1 (1.61 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
650	Deer tick virus (ctb30 CT95 2001) GCA_004786555.1	n/a	1 (94.89 %)	n/a	n/a	n/a	52.70 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (0.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.25 %)	1 (2.25 %)
651	Dengue virus 1 (clone 45AZ5 Nauru Island 1997) GCF_000862125.1	n/a	1 (94.82 %)	n/a	n/a	n/a	46.67 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.68 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
652	Dengue virus 2 (16681/84 Thailand 1993) GCF_000871845.1	n/a	5 (98.86 %)	n/a	n/a	n/a	45.82 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	2 (0.16 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
653	Dengue virus 3 (D3/H/IMTSSA-SRI/2000/1266 Sri Lanka 2007) GCF_000866625.1	n/a	5 (98.92 %)	n/a	n/a	n/a	46.71 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.60 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
654	Dengue virus 4 (clone rDEN4 2001) GCF_000865065.1	n/a	4 (98.81 %)	n/a	n/a	n/a	47.13 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
655	Dengue virus type 3 (H87 2023) GCA_004788295.1	n/a	1 (95.11 %)	n/a	n/a	n/a	46.65 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
656	Dengue virus type 4 (814669 2023) GCA_004786575.1	n/a	1 (95.45 %)	n/a	n/a	n/a	47.05 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
657	Dhori thogotovirus (Dhori/1313/61 2017) GCF_002116195.1	n/a	6 (95.15 %)	n/a	n/a	n/a	45.84 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.33 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
658	Dianlovirus menglaense (Rousettus-wt/CHN/2015/Sharen-Bat9447-1 2021) GCF_013088285.1	n/a	7 (98.97 %)	n/a	n/a	n/a	36.55 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.22 %)	n/a	10 (0.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
659	diplomonads (AS175 2013) GCA_001493575.1	n/a	n/a	248 (1.31 %)	2,310 (64.29 %)	n/a	48.90 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1,139 (100.00 %)	533 (1.00 %)	180 (0.12 %)	22,085 (4.31 %)	0 (0 %)	67 (0.10 %)	2,605 (19.80 %)	2,224 (15.81 %)
660	diplomonads (BAH15c1 2016) GCA_001543975.1	n/a	4,990 (85.78 %)	229 (1.21 %)	2,079 (65.87 %)	n/a	46.96 (99.69 %)	0 (0 %)	6,474 (0.38 %)	508 (100.00 %)	282 (0.29 %)	130 (0.06 %)	22,846 (4.05 %)	0 (0 %)	32 (0.08 %)	1,682 (12.29 %)	1,408 (9.56 %)
661	diplomonads (beaver 2020) GCA_011634555.1	n/a	n/a	251 (1.27 %)	2,080 (61.21 %)	n/a	49.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	752 (2.09 %)	491 (1.78 %)	22,286 (6.08 %)	0 (0 %)	2,311 (2.51 %)	2,248 (25.50 %)	2,040 (19.56 %)
662	diplomonads (CIA 2022) GCA_022985015.1	n/a	n/a	252 (1.28 %)	2,118 (64.27 %)	n/a	48.97 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	93 (100.00 %)	289 (0.12 %)	277 (0.52 %)	28,049 (5.52 %)	0 (0 %)	245 (0.55 %)	2,189 (22.28 %)	1,829 (15.60 %)
663	diplomonads (DH 2013) GCA_000498715.1	n/a	5,209 (85.35 %)	255 (1.28 %)	2,200 (64.84 %)	n/a	49.04 (100.00 %)	5 (0.00 %)	5 (0.00 %)	244 (100.00 %)	518 (1.23 %)	226 (0.21 %)	27,079 (5.48 %)	0 (0 %)	93 (0.17 %)	2,289 (22.31 %)	1,902 (16.10 %)
664	diplomonads (DID 2022) GCA_022985025.1	n/a	n/a	257 (1.12 %)	2,607 (67.29 %)	n/a	41.15 (99.99 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	260 (100.00 %)	657 (0.22 %)	562 (1.76 %)	24,519 (7.76 %)	0 (0 %)	3,343 (3.24 %)	629 (3.52 %)	476 (2.65 %)
665	diplomonads (GS 2013) GCA_000498735.1	n/a	6,166 (82.30 %)	247 (1.19 %)	2,442 (62.00 %)	n/a	48.24 (99.99 %)	14 (0.00 %)	14 (0.00 %)	557 (100.00 %)	468 (0.62 %)	171 (0.28 %)	26,451 (6.23 %)	0 (0 %)	297 (0.29 %)	2,071 (21.24 %)	1,735 (12.06 %)
666	diplomonads (GS 2020) GCA_011634595.1	n/a	n/a	263 (1.20 %)	2,433 (57.37 %)	n/a	49.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	19 (100.00 %)	681 (1.61 %)	455 (2.45 %)	26,563 (7.44 %)	0 (0 %)	2,983 (1.99 %)	1,575 (29.22 %)	1,719 (15.25 %)
667	diplomonads (GS/M clone H7 2009) GCA_000182405.1	n/a	4,559 (74.60 %)	235 (1.18 %)	2,537 (62.68 %)	n/a	47.25 (99.95 %)	2,919 (0.03 %)	2,919 (0.03 %)	5,840 (99.97 %)	370 (0.44 %)	150 (0.17 %)	26,159 (4.67 %)	0 (0 %)	30 (0.05 %)	2,328 (11.92 %)	1,825 (9.39 %)
668	diplomonads (P15 2010) GCA_000182665.1	n/a	5,097 (79.82 %)	258 (1.26 %)	2,379 (64.81 %)	n/a	47.24 (99.99 %)	383 (0.00 %)	383 (0.00 %)	1,203 (100.00 %)	614 (1.11 %)	215 (0.23 %)	19,248 (4.92 %)	0 (0 %)	133 (0.35 %)	1,730 (18.72 %)	1,542 (13.15 %)
669	diplomonads (Roberts-Thomson 2019) GCA_006247105.1	n/a	4,956 (85.14 %)	260 (1.62 %)	2,648 (72.71 %)	n/a	54.71 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	59 (100.00 %)	860 (3.29 %)	550 (1.05 %)	8,733 (10.96 %)	0 (0 %)	2,650 (5.65 %)	77 (98.48 %)	144 (89.54 %)
670	diplomonads (v2 WB C6 2019) GCF_000002435.2	5,003 (81.36 %)	n/a	245 (1.25 %)	2,099 (60.77 %)	n/a	49.73 (96.65 %)	0 (0 %)	3 (3.35 %)	35 (100.00 %)	389 (0.23 %)	445 (2.49 %)	19,258 (6.73 %)	0 (0 %)	2,237 (2.60 %)	2,303 (25.33 %)	2,093 (18.78 %)
671	diplomonads (WB 2020) GCA_011634545.1	n/a	n/a	242 (1.18 %)	2,127 (59.15 %)	n/a	49.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	37 (100.00 %)	773 (1.91 %)	510 (1.53 %)	23,481 (5.65 %)	0 (0 %)	1,931 (1.89 %)	2,313 (25.33 %)	2,111 (19.37 %)
672	dog (labrador SID07034 2020) GCF_014441545.1	99,420 (3.87 %)	n/a	19,870 (1.70 %)	20,252 (1.41 %)	54,322 (3.23 %)	41.19 (99.47 %)	0 (0 %)	575 (0.53 %)	376 (100.00 %)	4,981,985 (42.28 %)	1,019,772 (1.97 %)	13,959,750 (32.77 %)	2 (0.01 %)	648,526 (1.66 %)	52,469 (2.25 %)	48,334 (1.95 %)
673	dog heartworm nematode (2013) GCA_001077395.1	n/a	n/a	2,414 (2.12 %)	3,623 (3.89 %)	n/a	28.02 (99.94 %)	3,931 (0.01 %)	3,931 (0.01 %)	29,483 (99.99 %)	75,735 (4.27 %)	33,627 (2.39 %)	806,755 (39.07 %)	279 (0.27 %)	2,524 (0.60 %)	90 (0.03 %)	80 (0.03 %)
674	dog heartworm nematode (North_Portugal 2022) GCA_024305405.1	n/a	9,820 (15.90 %)	2,476 (2.20 %)	1,296 (3.57 %)	n/a	27.75 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	110 (100.00 %)	74,392 (4.65 %)	41,461 (3.60 %)	788,342 (40.35 %)	0 (0 %)	13,893 (1.41 %)	90 (0.03 %)	73 (0.02 %)
675	dog hookworm (Baltimore 2018) GCA_003336725.1	n/a	30,664 (5.84 %)	6,061 (1.21 %)	27,710 (6.60 %)	n/a	42.78 (86.52 %)	52,523 (13.52 %)	52,523 (13.52 %)	77,858 (86.48 %)	84,555 (0.99 %)	75,209 (1.21 %)	2,161,250 (20.04 %)	1,337 (0.24 %)	54,599 (1.22 %)	66,718 (7.03 %)	25,811 (2.15 %)
676	dog roundworm (PN_DK_2014 2014) GCA_000803305.1	n/a	18,596 (7.18 %)	3,809 (0.99 %)	14,508 (5.47 %)	n/a	39.95 (94.19 %)	29,112 (5.83 %)	29,112 (5.83 %)	51,969 (94.17 %)	86,572 (1.68 %)	95,130 (6.36 %)	1,867,362 (17.75 %)	100 (0.07 %)	77,240 (8.99 %)	12,786 (1.83 %)	9,676 (1.22 %)
677	Dolosigranulum pigrum (ATCC 51524 2012) GCF_000245815.1	n/a	1,724 (88.48 %)	n/a	n/a	n/a	39.57 (99.14 %)	14 (0.86 %)	14 (0.86 %)	16 (99.14 %)	n/a	37 (0.22 %)	8,763 (8.92 %)	2 (0.03 %)	62 (0.29 %)	39 (1.52 %)	41 (1.53 %)
678	domestic guinea pig (2N 2008 refseq) GCF_000151735.1	44,762 (2.31 %)	n/a	18,301 (1.33 %)	20,111 (1.34 %)	n/a	39.95 (97.81 %)	58,460 (2.20 %)	58,460 (2.20 %)	61,604 (97.80 %)	4,257,852 (38.85 %)	658,533 (1.25 %)	14,547,726 (34.19 %)	3 (0.00 %)	423,409 (1.39 %)	37,093 (0.85 %)	27,300 (0.63 %)
679	downy mildews (10300 2018) GCA_003287315.1	n/a	24,172 (49.02 %)	1,314 (1.62 %)	22,319 (54.05 %)	n/a	50.76 (96.01 %)	0 (0 %)	6,482 (4.01 %)	4,623 (100.00 %)	4,734 (0.37 %)	3,322 (0.32 %)	198,372 (7.14 %)	103 (0.07 %)	1,278 (0.55 %)	6,165 (60.21 %)	4,698 (8.67 %)
680	downy mildews (AV1007 2017) GCA_002247145.1	n/a	n/a	1,219 (2.09 %)	16,220 (62.35 %)	n/a	51.74 (99.97 %)	0 (0 %)	21 (0.02 %)	1,897 (100.00 %)	4,916 (0.58 %)	3,749 (0.62 %)	167,896 (9.36 %)	0 (0 %)	1,744 (0.92 %)	2,578 (86.43 %)	1,594 (6.09 %)
681	downy mildews (Emoy2 2012) GCA_000173235.2	n/a	n/a	1,215 (1.20 %)	16,667 (31.82 %)	n/a	47.22 (89.67 %)	7,378 (10.36 %)	7,503 (10.36 %)	10,486 (89.64 %)	13,394 (8.57 %)	7,569 (0.78 %)	192,650 (12.35 %)	51 (0.09 %)	7,995 (1.98 %)	4,900 (11.47 %)	5,042 (10.24 %)
682	downy mildews (GKB4 2021 refseq) GCF_018691715.1	21,326 (23.20 %)	n/a	1,641 (1.07 %)	33,974 (44.50 %)	n/a	54.16 (99.69 %)	80 (0.31 %)	80 (0.31 %)	213 (99.69 %)	18,997 (0.80 %)	16,094 (2.84 %)	200,994 (27.68 %)	0 (0 %)	68,037 (10.52 %)	232 (99.71 %)	2,904 (21.16 %)
683	downy mildews (LT1534-B 2021) GCA_016618375.1	n/a	28,954 (34.63 %)	1,862 (1.40 %)	28,244 (53.04 %)	n/a	51.19 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	782 (100.00 %)	12,108 (0.73 %)	20,550 (9.55 %)	122,350 (23.24 %)	0 (0 %)	74,861 (11.18 %)	1,452 (90.00 %)	3,333 (14.96 %)
684	downy mildews (P6497 2011) GCF_000149755.1	26,489 (39.49 %)	n/a	1,585 (1.41 %)	30,945 (56.78 %)	n/a	54.61 (96.04 %)	780 (3.96 %)	796 (3.96 %)	862 (96.04 %)	25,496 (17.70 %)	12,019 (4.05 %)	220,993 (11.54 %)	9 (0.01 %)	16,740 (4.76 %)	191 (97.73 %)	739 (3.49 %)
685	downy mildews (R13 2018) GCA_003843895.1	n/a	8,603 (37.86 %)	1,184 (2.63 %)	9,398 (47.78 %)	n/a	47.49 (99.74 %)	0 (0 %)	688 (0.26 %)	784 (100.00 %)	3,429 (0.51 %)	6,621 (1.91 %)	71,907 (17.80 %)	10 (0.02 %)	8,312 (3.72 %)	2,651 (11.55 %)	2,774 (7.94 %)
686	downy mildews (sbr112.9 2018) GCA_002911725.1	n/a	24,674 (23.07 %)	2,164 (1.23 %)	43,372 (49.46 %)	n/a	48.92 (99.62 %)	3,813 (0.35 %)	3,813 (0.35 %)	28,622 (99.65 %)	6,965 (0.31 %)	10,467 (1.05 %)	265,147 (14.65 %)	1 (0.00 %)	7,589 (1.25 %)	28,238 (41.82 %)	20,834 (23.36 %)
687	Dugbe orthonairovirus (ArD44313 1995) GCF_000850985.1	n/a	3 (96.61 %)	n/a	n/a	n/a	40.19 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	41 (3.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
688	Duvenhage lyssavirus (86132SA 2013) GCF_000905375.1	n/a	5 (90.59 %)	n/a	n/a	n/a	44.22 (99.99 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.72 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
689	Dysgonomonas gadei (ATCC BAA-286 2011) GCF_000213555.1	n/a	4,145 (87.99 %)	n/a	n/a	n/a	39.61 (99.81 %)	40 (0.19 %)	40 (0.19 %)	65 (99.81 %)	n/a	158 (0.15 %)	27,807 (10.89 %)	7 (0.15 %)	62 (0.31 %)	215 (1.50 %)	154 (0.99 %)
690	E. coli (K-12 MG1655 2013 refseq) GCF_000005845.2	n/a	4,544 (87.30 %)	n/a	n/a	n/a	50.79 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	93 (0.40 %)	19,730 (7.53 %)	0 (0 %)	191 (0.41 %)	1 (99.99 %)	0 (0.00 %)
691	E. coli (Sakai substr. RIMD 0509952 2018) GCF_000008865.2	n/a	5,280 (85.35 %)	n/a	n/a	n/a	50.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	169 (0.53 %)	20,656 (7.31 %)	0 (0 %)	186 (0.33 %)	15 (99.26 %)	21 (0.68 %)
692	E.dispar (SAW760 2008) GCF_000209125.1	8,811 (35.13 %)	n/a	686 (1.25 %)	625 (4.87 %)	n/a	24.06 (99.51 %)	1,295 (0.42 %)	1,295 (0.42 %)	13,553 (99.58 %)	32,724 (12.27 %)	69,502 (13.45 %)	163,536 (53.23 %)	2 (0.01 %)	16,621 (6.44 %)	23 (0.08 %)	22 (0.08 %)
693	E.histolytica (DS4-868 2021) GCA_018466815.1	n/a	n/a	573 (1.63 %)	307 (3.57 %)	n/a	24.32 (99.99 %)	110 (0.00 %)	110 (0.00 %)	1,287 (100.00 %)	15,510 (4.70 %)	11,018 (2.41 %)	175,348 (43.36 %)	0 (0 %)	1,392 (1.04 %)	3 (0.01 %)	3 (0.01 %)
694	E.histolytica (HM-1:IMSS 2008) GCF_000208925.1	8,151 (49.76 %)	n/a	601 (1.65 %)	349 (3.88 %)	n/a	24.30 (99.69 %)	643 (0.31 %)	643 (0.31 %)	2,172 (99.69 %)	16,661 (17.45 %)	11,944 (2.53 %)	179,359 (42.98 %)	6 (0.04 %)	1,576 (1.22 %)	5 (0.02 %)	5 (0.02 %)
695	E.histolytica (HM-1:IMSS-A 2013) GCA_000365475.1	n/a	6,327 (68.14 %)	350 (1.51 %)	304 (3.38 %)	n/a	25.18 (99.92 %)	6 (0.06 %)	6 (0.06 %)	1,691 (99.94 %)	8,726 (4.33 %)	3,106 (1.04 %)	120,505 (37.43 %)	0 (0 %)	179 (0.10 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
696	E.histolytica (HM-1:IMSS-B 2013) GCA_000344925.1	n/a	6,301 (65.33 %)	309 (1.31 %)	742 (6.91 %)	n/a	26.91 (99.04 %)	345 (0.94 %)	345 (0.94 %)	2,283 (99.06 %)	8,480 (4.05 %)	2,913 (0.92 %)	127,368 (39.10 %)	107 (0.32 %)	266 (0.15 %)	202 (2.96 %)	197 (2.87 %)
697	E.histolytica (HM-3:IMSS 2013) GCA_000346345.1	n/a	7,361 (66.15 %)	378 (1.52 %)	347 (3.42 %)	n/a	25.08 (98.47 %)	1,548 (1.54 %)	1,558 (1.54 %)	3,428 (98.46 %)	10,354 (4.95 %)	3,774 (1.12 %)	134,504 (38.02 %)	524 (1.16 %)	1,257 (1.33 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)
698	E.histolytica (KU27 2013) GCA_000338855.1	n/a	7,469 (60.62 %)	484 (1.64 %)	385 (3.47 %)	n/a	25.06 (99.35 %)	1,432 (0.66 %)	1,513 (0.66 %)	3,228 (99.34 %)	12,002 (6.09 %)	5,002 (3.61 %)	148,823 (39.49 %)	315 (1.48 %)	2,456 (4.70 %)	9 (0.09 %)	7 (0.08 %)
699	E.histolytica (KU48 2021) GCA_019059535.1	n/a	n/a	478 (1.53 %)	258 (3.02 %)	n/a	24.47 (99.99 %)	402 (0.00 %)	402 (0.00 %)	1,570 (100.00 %)	13,541 (4.92 %)	9,349 (2.41 %)	152,106 (44.90 %)	0 (0 %)	1,251 (0.95 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)
700	E.histolytica (KU50 2021) GCA_020283535.1	n/a	n/a	298 (1.16 %)	161 (2.01 %)	n/a	25.29 (99.98 %)	1,136 (0.01 %)	1,136 (0.01 %)	2,199 (99.99 %)	9,549 (4.67 %)	5,089 (1.86 %)	111,149 (39.91 %)	0 (0 %)	655 (0.51 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)
701	E.histolytica HM-1:IMSS (Rahman 2021) GCA_917563895.1	n/a	n/a	1,078 (2.50 %)	3,711 (10.56 %)	n/a	30.57 (92.40 %)	2,116 (7.49 %)	2,116 (7.49 %)	20,637 (92.51 %)	23,441 (16.70 %)	7,828 (1.35 %)	178,838 (36.11 %)	7 (0.01 %)	770 (0.22 %)	4,243 (8.76 %)	4,090 (8.31 %)
702	E.invadens (IP1 2013) GCF_000330505.1	11,997 (38.43 %)	n/a	602 (0.86 %)	2,713 (19.71 %)	n/a	30.19 (99.10 %)	3,823 (0.94 %)	3,823 (0.94 %)	4,967 (99.06 %)	20,914 (4.68 %)	8,763 (1.15 %)	299,107 (36.44 %)	2 (0.00 %)	1,500 (0.50 %)	176 (0.14 %)	165 (0.14 %)
703	E.moshkovskii (Laredo 2018) GCA_002914575.1	n/a	n/a	542 (1.25 %)	372 (3.44 %)	n/a	29.48 (90.06 %)	0 (0 %)	2,211 (9.94 %)	4,607 (100.00 %)	9,469 (2.10 %)	3,990 (1.15 %)	208,333 (31.48 %)	0 (0 %)	2,141 (0.68 %)	8 (0.02 %)	6 (0.02 %)
704	E.nuttalli (P19 2012 refseq) GCF_000257125.1	6,187 (56.11 %)	n/a	391 (1.42 %)	211 (1.79 %)	n/a	25.02 (99.62 %)	1,045 (0.34 %)	1,045 (0.34 %)	6,278 (99.66 %)	9,682 (3.80 %)	4,007 (1.25 %)	143,457 (39.64 %)	0 (0 %)	459 (0.24 %)	8 (0.02 %)	8 (0.02 %)
705	Eastern chimpanzee simian foamy virus (2018) GCF_003032765.1	n/a	5 (93.39 %)	n/a	n/a	n/a	37.99 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.77 %)	n/a	8 (0.77 %)	0 (0 %)	3 (18.77 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
706	Eastern equine encephalitis virus (ssp. North American variant 1991) GCF_000862705.1	n/a	5 (96.00 %)	n/a	n/a	n/a	48.71 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (0.91 %)	n/a	3 (0.64 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (23.55 %)	4 (11.72 %)
707	ebolavirus (Bundibugyo virus/H.sapiens-tc/UGA/2007/Butalya-811250 2010) GCF_000889155.1	n/a	11 (96.40 %)	n/a	n/a	n/a	42.01 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.45 %)	n/a	17 (0.92 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
708	ebolavirus (Reston virus/M.fascicularis-tc/USA/1989/Philippines89-Pennsylvania 2002) GCF_000854085.1	n/a	11 (98.80 %)	n/a	n/a	n/a	40.62 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.55 %)	n/a	6 (0.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
709	ebolavirus (Sudan virus/H.sapiens-tc/UGA/2000/Gulu-808892 2004) GCF_000855585.1	n/a	11 (96.95 %)	n/a	n/a	n/a	41.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	10 (0.49 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
710	ebolavirus (Tai Forest virus/H.sapiens-tc/CIV/1994/Pauleoula-CI 2010) GCF_000888475.1	n/a	11 (96.41 %)	n/a	n/a	n/a	42.26 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.50 %)	n/a	24 (1.26 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
711	Echarate virus (2021) GCF_013086425.1	n/a	4 (94.01 %)	n/a	n/a	n/a	39.66 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.97 %)	2 (0.45 %)	20 (2.92 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
712	Ehrlichia canis str. (Jake 2005) GCF_000012565.1	n/a	991 (72.73 %)	n/a	n/a	n/a	28.96 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	94 (2.37 %)	8,946 (15.16 %)	0 (0 %)	241 (1.63 %)	2 (0.04 %)	2 (0.04 %)
713	Ehrlichia chaffeensis str. (Arkansas 2006) GCF_000013145.1	n/a	971 (78.48 %)	n/a	n/a	n/a	30.10 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	213 (1.10 %)	157 (4.45 %)	8,909 (15.31 %)	0 (0 %)	414 (3.35 %)	2 (0.04 %)	2 (0.04 %)
714	Ehrlichia japonica (HF 2014) GCF_000632845.1	n/a	943 (76.83 %)	n/a	n/a	n/a	29.65 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	124 (4.25 %)	9,469 (16.92 %)	0 (0 %)	413 (3.20 %)	1 (0.02 %)	1 (0.02 %)
715	Ehrlichia minasensis (B11 2019) GCF_004181775.1	n/a	1,027 (71.94 %)	n/a	n/a	n/a	29.48 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	55 (100.00 %)	n/a	126 (1.96 %)	9,219 (15.25 %)	0 (0 %)	221 (1.54 %)	4 (0.41 %)	4 (0.38 %)
716	Ehrlichia muris (AS145 2013) GCF_000508225.1	n/a	950 (75.19 %)	n/a	n/a	n/a	29.66 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	169 (6.11 %)	9,879 (16.92 %)	0 (0 %)	472 (6.23 %)	2 (0.07 %)	2 (0.07 %)
717	Eikenella corrodens (NCTC10596 2017) GCF_900187105.1	n/a	2,221 (85.14 %)	n/a	n/a	n/a	55.65 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	62 (0.34 %)	16,287 (15.74 %)	0 (0 %)	57 (0.60 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
718	Ekpoma virus 1 (EKV-1 2018) GCF_002815855.1	n/a	8 (98.40 %)	n/a	n/a	n/a	40.35 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (0.96 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
719	Ekpoma virus 2 (EKV-2 2018) GCF_002815875.1	n/a	8 (96.76 %)	n/a	n/a	n/a	39.26 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.54 %)	1 (3.07 %)	16 (1.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
720	Elizabethkingia meningoseptica (NCTC10016 2018) GCF_900475375.1	n/a	3,488 (88.14 %)	n/a	n/a	n/a	36.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	168 (0.67 %)	27,159 (14.89 %)	0 (0 %)	282 (0.69 %)	17 (0.20 %)	9 (0.11 %)
721	Empedobacter brevis NBRC 14943 (ATCC 43319 2013) GCF_000382425.1	n/a	3,611 (90.05 %)	n/a	n/a	n/a	32.74 (99.95 %)	4 (0.05 %)	4 (0.05 %)	32 (99.95 %)	n/a	102 (0.18 %)	33,156 (20.05 %)	0 (0 %)	128 (0.34 %)	9 (0.06 %)	9 (0.06 %)
722	Endotrypanum monterogeii (LV88 2016) GCA_000333855.2	n/a	n/a	639 (1.18 %)	2,445 (41.14 %)	n/a	52.77 (98.42 %)	1,558 (1.59 %)	1,558 (1.59 %)	3,517 (98.41 %)	33,804 (3.74 %)	14,227 (2.30 %)	202,978 (19.63 %)	56 (0.14 %)	8,752 (3.61 %)	1,475 (96.43 %)	2,129 (6.81 %)
723	Enterobacter adelaidei (ECC3473 2024) GCF_041937165.1	n/a	5,018 (89.15 %)	n/a	n/a	n/a	52.86 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	n/a	90 (0.40 %)	22,846 (7.96 %)	0 (0 %)	169 (0.57 %)	18 (92.91 %)	54 (1.80 %)
724	Enterobacter asburiae (17Nkhm-UP2 2019) GCF_007035805.1	n/a	4,566 (89.94 %)	n/a	n/a	n/a	55.79 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	78 (0.38 %)	28,541 (11.58 %)	0 (0 %)	120 (0.26 %)	2 (99.97 %)	4 (0.28 %)
725	Enterobacter bugandensis (2018) GCF_900324475.1	n/a	4,495 (90.75 %)	n/a	n/a	n/a	56.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	69 (0.30 %)	29,321 (12.02 %)	0 (0 %)	104 (0.23 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
726	Enterobacter cancerogenus (JY65 2021) GCF_019665745.1	n/a	4,465 (90.10 %)	n/a	n/a	n/a	55.77 (99.63 %)	9 (0.37 %)	9 (0.37 %)	10 (99.63 %)	n/a	94 (0.38 %)	27,642 (11.00 %)	0 (0 %)	151 (0.35 %)	1 (99.99 %)	0 (0.00 %)
727	Enterobacter chengduensis (WCHECl-C4 = WCHECh050004 2019) GCF_001984825.2	n/a	5,029 (89.59 %)	n/a	n/a	n/a	55.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	68 (0.24 %)	31,125 (11.62 %)	0 (0 %)	160 (0.33 %)	2 (99.93 %)	0 (0.00 %)
728	Enterobacter chinensis (170198 2023) GCF_034008295.1	n/a	4,671 (90.20 %)	n/a	n/a	n/a	55.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	28 (100.00 %)	n/a	51 (0.17 %)	27,217 (10.63 %)	0 (0 %)	59 (0.11 %)	24 (99.21 %)	15 (0.29 %)
729	Enterobacter chuandaensis (E20191216 2024) GCF_039718975.1	n/a	4,748 (90.15 %)	n/a	n/a	n/a	55.63 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	64 (0.14 %)	29,080 (11.35 %)	0 (0 %)	58 (0.35 %)	8 (99.42 %)	9 (0.27 %)
730	Enterobacter cloacae (1382 2022) GCF_905331265.2	n/a	4,831 (90.32 %)	n/a	n/a	n/a	54.88 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	65 (0.24 %)	27,607 (10.23 %)	0 (0 %)	103 (0.23 %)	7 (99.38 %)	15 (0.67 %)
731	Enterobacter dykesii (E1 2024) GCF_008364625.2	n/a	4,360 (90.53 %)	n/a	n/a	n/a	55.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	59 (0.20 %)	27,911 (11.77 %)	0 (0 %)	76 (0.19 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
732	Enterobacter huaxiensis (090008 2022) GCF_003594935.2	n/a	4,819 (90.13 %)	n/a	n/a	n/a	55.71 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	56 (0.30 %)	30,233 (11.58 %)	0 (0 %)	141 (0.26 %)	3 (99.97 %)	7 (0.24 %)
733	Enterobacter intestinihominis (JNQH618 2025) GCF_048568405.1	n/a	4,861 (89.76 %)	n/a	n/a	n/a	54.98 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	96 (0.39 %)	27,153 (10.25 %)	0 (0 %)	229 (0.51 %)	8 (99.77 %)	6 (0.09 %)
734	Enterobacter kobei (11778-yvys 2022) GCF_023023125.1	n/a	4,580 (90.43 %)	n/a	n/a	n/a	55.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	68 (0.39 %)	25,169 (9.74 %)	0 (0 %)	168 (0.32 %)	5 (99.82 %)	2 (2.53 %)
735	Enterobacter ludwigii (EN-119 2016) GCF_001750725.1	n/a	4,716 (90.40 %)	n/a	n/a	n/a	54.60 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	5 (100.00 %)	n/a	70 (0.33 %)	25,057 (9.14 %)	0 (0 %)	127 (0.27 %)	2 (99.98 %)	0 (0.00 %)
736	Enterobacter mori (ACYC.E9L 2022) GCF_022014715.1	n/a	4,603 (90.40 %)	n/a	n/a	n/a	55.55 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	62 (0.22 %)	28,431 (11.26 %)	0 (0 %)	165 (0.35 %)	14 (99.69 %)	10 (1.77 %)
737	Enterobacter nematophilus (E-TC7 2022) GCF_026344075.1	n/a	4,423 (90.64 %)	n/a	n/a	n/a	56.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	19 (100.00 %)	n/a	74 (0.36 %)	30,496 (12.70 %)	0 (0 %)	158 (0.34 %)	18 (99.90 %)	2 (0.02 %)
738	Enterobacter oligotrophicus (CCA6 2019) GCF_009176645.1	n/a	4,271 (90.42 %)	n/a	n/a	n/a	54.30 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	48 (0.17 %)	23,127 (9.47 %)	0 (0 %)	94 (0.19 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
739	Enterobacter pasteurii (P40RS 2020) GCF_014930725.1	n/a	4,461 (90.61 %)	n/a	n/a	n/a	56.72 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	50 (100.00 %)	n/a	67 (0.44 %)	30,456 (12.55 %)	1 (0.00 %)	138 (0.32 %)	51 (98.97 %)	16 (0.56 %)
740	Enterobacter pseudoroggenkampii (FY158 2023) GCF_030406165.1	n/a	4,547 (90.06 %)	n/a	n/a	n/a	55.61 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	53 (0.22 %)	28,159 (11.44 %)	0 (0 %)	108 (0.25 %)	1 (99.99 %)	0 (0.00 %)
741	Enterobacter quasihormaechei (WCHEQ120003 2019) GCF_004331385.1	n/a	4,348 (90.19 %)	n/a	n/a	n/a	55.91 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	51 (100.00 %)	n/a	62 (0.13 %)	28,028 (11.88 %)	0 (0 %)	88 (0.14 %)	55 (98.89 %)	22 (1.42 %)
742	Enterobacter quasimori (120130 2021) GCF_018597345.1	n/a	4,447 (90.62 %)	n/a	n/a	n/a	55.95 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	30 (100.00 %)	n/a	58 (0.32 %)	28,665 (12.03 %)	0 (0 %)	109 (0.23 %)	19 (99.67 %)	7 (0.14 %)
743	Enterobacter quasiroggenkampii (ECC-072 2024) GCF_043972695.1	n/a	4,499 (90.44 %)	n/a	n/a	n/a	56.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	63 (0.34 %)	28,277 (11.51 %)	0 (0 %)	144 (0.28 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
744	Enterobacter roggenkampii (DSM 16690 2016) GCF_001729805.1	n/a	4,660 (90.24 %)	n/a	n/a	n/a	56.04 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	83 (0.39 %)	29,732 (11.76 %)	0 (0 %)	159 (0.28 %)	7 (99.26 %)	8 (0.29 %)
745	Enterobacter rongchengensis (170250 2023) GCF_034008275.1	n/a	4,991 (89.86 %)	n/a	n/a	n/a	56.18 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	89 (100.00 %)	n/a	67 (0.29 %)	31,354 (12.45 %)	0 (0 %)	179 (0.33 %)	98 (98.06 %)	57 (1.72 %)
746	Enterobacter sichuanensis (SGAir0282 2019) GCF_009036245.1	n/a	4,514 (90.39 %)	n/a	n/a	n/a	55.55 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	60 (0.31 %)	27,152 (10.92 %)	0 (0 %)	190 (0.44 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
747	Enterobacter soli (LF7a 2011) GCF_000224675.1	n/a	4,808 (89.83 %)	n/a	n/a	n/a	53.79 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	68 (0.26 %)	23,087 (8.22 %)	0 (0 %)	154 (0.32 %)	10 (99.67 %)	9 (2.74 %)
748	Enterobacter vonholyi (STK80-C 2024) GCF_040834095.1	n/a	4,199 (90.65 %)	n/a	n/a	n/a	55.88 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	60 (0.23 %)	26,708 (11.41 %)	0 (0 %)	64 (0.15 %)	3 (99.93 %)	2 (0.03 %)
749	Enterobacter wuhouensis (AV1 2024) GCF_035835995.1	n/a	4,603 (90.24 %)	n/a	n/a	n/a	56.04 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	65 (0.27 %)	29,853 (12.16 %)	0 (0 %)	115 (0.23 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
750	Enterococcus avium (FDAARGOS_182 2018) GCF_002891025.1	n/a	4,511 (86.93 %)	n/a	n/a	n/a	39.07 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	79 (0.50 %)	29,703 (13.15 %)	0 (0 %)	152 (0.60 %)	54 (0.96 %)	56 (0.67 %)
751	Enterococcus casseliflavus (EC20 2013) GCF_000157355.2	n/a	3,195 (88.17 %)	n/a	n/a	n/a	42.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	76 (0.49 %)	20,971 (11.86 %)	0 (0 %)	149 (0.34 %)	166 (2.66 %)	155 (2.24 %)
752	Enterococcus durans (BDGP3 2017) GCF_002277935.1	n/a	2,857 (84.70 %)	n/a	n/a	n/a	38.04 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	95 (0.31 %)	20,661 (15.61 %)	0 (0 %)	213 (0.62 %)	18 (1.09 %)	25 (0.72 %)
753	Enterococcus faecalis EnGen0336 (T5 2013) GCF_000393015.1	n/a	2,755 (89.24 %)	n/a	n/a	n/a	37.47 (99.73 %)	13 (0.27 %)	13 (0.27 %)	16 (99.73 %)	n/a	58 (0.13 %)	21,331 (15.64 %)	2 (0.02 %)	35 (0.12 %)	25 (0.92 %)	22 (0.85 %)
754	Enterococcus faecium (SRR24 2020) GCF_009734005.1	n/a	2,905 (86.66 %)	n/a	n/a	n/a	37.88 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	90 (0.42 %)	20,648 (15.14 %)	0 (0 %)	140 (0.78 %)	16 (1.18 %)	30 (0.78 %)
755	Enterococcus gallinarum (EG81 2022) GCF_021496385.1	n/a	3,383 (87.54 %)	n/a	n/a	n/a	40.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	141 (0.72 %)	21,059 (11.93 %)	0 (0 %)	224 (0.65 %)	90 (1.48 %)	75 (1.06 %)
756	Enterococcus hirae (FDAARGOS_234 2018) GCF_002278015.2	n/a	2,581 (84.74 %)	n/a	n/a	n/a	36.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	112 (0.89 %)	21,094 (15.97 %)	0 (0 %)	306 (1.09 %)	14 (1.21 %)	12 (0.24 %)
757	Enterococcus raffinosus (F162_2 2021) GCF_019175485.1	n/a	4,134 (87.99 %)	n/a	n/a	n/a	39.53 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	111 (0.49 %)	27,691 (13.27 %)	0 (0 %)	196 (0.56 %)	63 (1.17 %)	79 (0.92 %)
758	Enterovirus 5666/sin/002209 (2001) GCA_031116435.1	n/a	1 (88.81 %)	n/a	n/a	n/a	48.02 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.40 %)	1 (3.40 %)
759	Enterovirus 5865/sin/000009 (2001) GCA_031116425.1	n/a	1 (88.81 %)	n/a	n/a	n/a	48.03 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.40 %)	1 (3.40 %)
760	enterovirus A114 (V13-0285 2016) GCF_001684625.1	n/a	1 (89.76 %)	n/a	n/a	n/a	47.55 (99.97 %)	4 (0.05 %)	4 (0.05 %)	5 (99.95 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (5.74 %)	1 (5.74 %)
761	Enterovirus A71 (BrCr 1996) GCA_008766895.1	n/a	1 (88.85 %)	n/a	n/a	n/a	47.66 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.63 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (5.09 %)	1 (5.09 %)
762	Enterovirus A71 (pinf7-54A 2005) GCA_031109255.1	n/a	1 (88.18 %)	n/a	n/a	n/a	47.90 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.72 %)	1 (0.72 %)	1 (0.74 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
763	enterovirus D68 (Fermon 2018) GCF_002816725.1	n/a	1 (89.14 %)	n/a	n/a	n/a	41.07 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
764	Eothenomys miletus hantavirus (LX309 2018) GCF_002827125.1	n/a	3 (91.02 %)	n/a	n/a	n/a	37.39 (99.94 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	5 (0.87 %)	n/a	18 (2.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
765	Epstein-Barr virus (Raji 2005) GCF_002402265.1	n/a	98 (77.44 %)	n/a	n/a	n/a	59.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	30 (0.66 %)	34 (5.62 %)	577 (10.56 %)	0 (0 %)	37 (4.64 %)	27 (45.97 %)	24 (34.81 %)
766	Epstein-Barr virus type 2 (AG876 2007) GCF_000872045.1	n/a	114 (68.90 %)	n/a	n/a	n/a	59.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	34 (0.79 %)	29 (5.78 %)	498 (10.10 %)	0 (0 %)	30 (4.53 %)	24 (45.98 %)	21 (35.33 %)
767	ergot fungus (20.1 2012) GCA_000347355.1	n/a	24,186 (41.52 %)	1,364 (3.37 %)	4,469 (21.12 %)	n/a	51.77 (96.31 %)	0 (0 %)	1,252 (3.71 %)	191 (100.00 %)	9,467 (1.44 %)	5,907 (1.06 %)	124,165 (9.89 %)	37 (0.07 %)	6,851 (1.78 %)	824 (68.26 %)	1,460 (4.04 %)
768	Erve virus (2012) GCA_001629985.1	n/a	3 (97.03 %)	n/a	n/a	n/a	38.56 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.67 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
769	Erysipelothrix rhusiopathiae str. (Fujisawa 2011) GCF_000270085.1	n/a	1,763 (91.51 %)	n/a	n/a	n/a	36.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	56 (0.41 %)	9,007 (9.29 %)	0 (0 %)	58 (0.95 %)	21 (0.96 %)	21 (0.96 %)
770	European bat 2 lyssavirus (RV1333 2015) GCF_000871625.2	n/a	5 (90.69 %)	n/a	n/a	n/a	44.80 (100.00 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.50 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
771	European brown hare syndrome virus (EBHSV-GD 2000) GCF_000857785.1	n/a	2 (98.66 %)	n/a	n/a	n/a	49.34 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.79 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.24 %)	1 (3.24 %)
772	eye worm GCF_000183805.2	15,453 (18.82 %)	n/a	2,833 (2.36 %)	2,610 (5.25 %)	n/a	30.97 (95.82 %)	8,559 (4.21 %)	9,291 (4.21 %)	14,323 (95.79 %)	67,544 (4.54 %)	46,878 (3.24 %)	704,412 (30.76 %)	376 (0.37 %)	15,876 (2.52 %)	170 (0.06 %)	144 (0.04 %)
773	Facklamia hominis (UMB2355B 2023) GCF_033876835.1	n/a	2,070 (88.75 %)	n/a	n/a	n/a	38.38 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	79 (1.09 %)	11,656 (11.05 %)	0 (0 %)	166 (0.93 %)	32 (1.34 %)	33 (1.35 %)
774	Fathead minnow calicivirus (FHMCV/USA/MN/2012 2017) GCF_002285005.1	n/a	2 (98.66 %)	n/a	n/a	n/a	50.67 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (65.78 %)	3 (59.02 %)
775	Feline calicivirus (2023) GCF_008767155.1	n/a	2 (95.03 %)	n/a	n/a	n/a	46.14 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
776	Feline calicivirus (Urbana 2003) GCF_000853345.1	n/a	3 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	45.17 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
777	Finegoldia magna (12T306 2017) GCF_002243135.1	n/a	1,776 (91.07 %)	n/a	n/a	n/a	31.94 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	42 (100.00 %)	n/a	109 (0.62 %)	13,908 (17.31 %)	0 (0 %)	185 (0.85 %)	1 (0.05 %)	1 (0.05 %)
778	fission yeast (v2 972h- 2019 refseq) GCF_000002945.2	12,401 (87.57 %)	n/a	5,085 (73.30 %)	3,402 (39.28 %)	n/a	36.05 (100.00 %)	0 (0 %)	6 (0.00 %)	4 (100.00 %)	3,060 (1.04 %)	1,034 (0.58 %)	80,463 (16.22 %)	1 (0.01 %)	411 (0.72 %)	105 (0.31 %)	95 (0.28 %)
779	Fiwi virus (FIWIV CH17 2023) GCF_023131885.1	n/a	7 (94.31 %)	n/a	n/a	n/a	53.32 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (7.96 %)	4 (7.96 %)
780	flatworm A.winterbourni (NZ2018 2020) GCA_013407085.1	n/a	n/a	2,183 (0.24 %)	31,725 (5.25 %)	n/a	40.73 (99.61 %)	3,125 (0.39 %)	3,125 (0.39 %)	29,239 (99.61 %)	87,844 (0.79 %)	65,868 (2.72 %)	2,734,000 (40.60 %)	2 (0.00 %)	293,295 (5.24 %)	37,643 (3.30 %)	10,893 (0.64 %)
781	flatworm E.canadensis (2016) GCA_900004735.1	n/a	n/a	1,571 (1.02 %)	9,779 (11.09 %)	n/a	41.86 (99.98 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	9,331 (100.00 %)	14,521 (0.58 %)	2,658 (0.13 %)	509,107 (11.23 %)	1 (0.00 %)	771 (0.15 %)	11,618 (4.00 %)	9,843 (3.20 %)
782	flatworm E.caproni (Egypt 2018) GCA_900618425.1	n/a	18,607 (2.27 %)	1,469 (0.12 %)	37,899 (4.23 %)	n/a	42.55 (92.18 %)	174,723 (7.86 %)	174,723 (7.86 %)	260,806 (92.14 %)	176,204 (1.20 %)	82,973 (1.19 %)	4,195,145 (24.19 %)	2,164 (0.14 %)	66,587 (0.68 %)	79,113 (4.07 %)	21,322 (0.96 %)
783	flatworm E.granulosus GCF_000524195.1	11,319 (14.41 %)	n/a	1,588 (1.08 %)	7,425 (10.98 %)	11,319 (14.41 %)	41.77 (99.37 %)	0 (0 %)	7,349 (0.66 %)	957 (100.00 %)	13,600 (0.55 %)	2,560 (0.44 %)	549,757 (12.14 %)	10 (0.00 %)	2,732 (0.35 %)	11,123 (3.93 %)	9,365 (3.08 %)
784	flatworm E.granulosus (EgG1s_protoscolex 2022) GCA_021556725.1	n/a	9,985 (9.17 %)	1,618 (0.72 %)	9,446 (9.03 %)	n/a	42.22 (97.67 %)	0 (0 %)	511 (2.33 %)	31 (100.00 %)	31,456 (1.02 %)	9,863 (1.28 %)	603,546 (13.58 %)	0 (0 %)	23,807 (3.13 %)	14,905 (3.99 %)	11,149 (2.45 %)
785	flatworm E.multilocularis (2015) GCA_000469725.3	n/a	72,063 (14.03 %)	1,636 (1.10 %)	8,033 (11.63 %)	n/a	42.21 (97.54 %)	30 (2.46 %)	2,538 (2.46 %)	1,246 (97.54 %)	16,529 (0.71 %)	4,520 (0.93 %)	444,684 (11.00 %)	1 (0.00 %)	5,994 (1.60 %)	11,353 (4.50 %)	9,375 (3.08 %)
786	flatworm E.oligarthrus (DaMi1 2019) GCA_900683695.1	n/a	n/a	803 (0.32 %)	9,750 (3.65 %)	n/a	39.02 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	74,513 (100.00 %)	14,332 (0.60 %)	4,209 (0.16 %)	583,266 (14.29 %)	0 (0 %)	604 (0.07 %)	1,122 (0.32 %)	999 (0.28 %)
787	flatworm G.bullatarudis (Rox2016 2020) GCA_012064415.1	n/a	n/a	1,449 (1.28 %)	2,363 (7.72 %)	n/a	31.26 (98.76 %)	0 (0 %)	753 (1.23 %)	4,331 (100.00 %)	17,280 (0.88 %)	4,999 (0.59 %)	688,174 (32.30 %)	49 (0.07 %)	7,123 (1.12 %)	135 (0.07 %)	114 (0.05 %)
788	flatworm H.microstoma (2019) GCA_000469805.3	n/a	n/a	1,637 (0.74 %)	5,552 (7.48 %)	n/a	36.38 (96.16 %)	0 (0 %)	85 (3.84 %)	7 (100.00 %)	41,150 (1.14 %)	13,481 (1.13 %)	1,062,815 (19.82 %)	0 (0 %)	32,111 (5.53 %)	1,645 (0.72 %)	1,217 (0.26 %)
789	flatworm H.taeniaeformis (2018) GCA_900622495.1	n/a	11,649 (14.00 %)	1,394 (0.97 %)	11,216 (10.94 %)	n/a	42.98 (96.96 %)	15,830 (3.04 %)	15,830 (3.04 %)	45,921 (96.96 %)	19,509 (0.76 %)	4,825 (0.35 %)	392,521 (9.43 %)	437 (0.05 %)	5,642 (0.55 %)	8,911 (2.96 %)	6,668 (2.09 %)
790	flatworm M.corti (2018) GCA_900604375.1	n/a	10,614 (12.79 %)	1,570 (0.97 %)	11,543 (11.81 %)	n/a	41.83 (99.22 %)	3,101 (0.77 %)	3,101 (0.77 %)	10,169 (99.23 %)	14,609 (0.48 %)	3,953 (0.31 %)	566,210 (12.99 %)	21 (0.00 %)	4,612 (0.38 %)	15,840 (8.85 %)	12,418 (5.27 %)
791	flatworm M.lignano (dv1 2015) GCA_001188465.1	n/a	n/a	10,063 (0.70 %)	n/a	n/a	45.99 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	49,174 (100.00 %)	459,060 (7.91 %)	1,745,062 (30.31 %)	4,452,352 (33.75 %)	0 (0 %)	2,772,111 (14.12 %)	242,033 (21.60 %)	199,556 (12.75 %)
792	flatworm M.lignano (DV1 2017) GCA_002269645.1	n/a	49,027 (17.81 %)	9,843 (0.99 %)	117,608 (20.75 %)	n/a	45.90 (99.79 %)	710 (0.21 %)	710 (0.21 %)	5,979 (99.79 %)	312,961 (6.29 %)	815,435 (29.08 %)	2,869,503 (32.39 %)	0 (0 %)	2,109,588 (15.19 %)	170,413 (21.84 %)	147,124 (13.64 %)
793	flatworm P.kellicotti (Missouri 2020) GCA_014220965.1	n/a	13,309 (4.53 %)	1,449 (0.16 %)	n/a	n/a	42.97 (88.56 %)	77,141 (11.48 %)	77,141 (11.48 %)	106,518 (88.52 %)	53,283 (0.41 %)	32,544 (0.58 %)	1,847,609 (18.75 %)	754 (0.16 %)	261,117 (9.85 %)	67,886 (5.16 %)	21,976 (1.08 %)
794	flatworm P.skrjabini miyazakii (Japan 2020) GCA_014338405.1	n/a	13,918 (2.92 %)	1,706 (0.15 %)	n/a	n/a	42.19 (91.36 %)	72,605 (8.66 %)	72,605 (8.66 %)	94,923 (91.34 %)	60,503 (0.26 %)	34,530 (0.31 %)	3,609,715 (20.07 %)	884 (0.12 %)	45,580 (0.77 %)	70,673 (3.82 %)	20,393 (0.74 %)
795	flatworm P.westermani (180907_Pwestermani 2020) GCA_015252655.1	n/a	13,272 (2.70 %)	1,646 (0.15 %)	36,801 (5.50 %)	n/a	43.35 (84.70 %)	43,954 (15.31 %)	43,954 (15.31 %)	66,431 (84.69 %)	49,492 (0.29 %)	23,786 (0.16 %)	3,047,956 (14.34 %)	1,554 (0.65 %)	49,115 (1.01 %)	80,801 (4.49 %)	33,325 (1.34 %)
796	flatworm P.westermani (IND2009 2019) GCA_008508345.1	n/a	12,805 (1.97 %)	1,821 (0.15 %)	38,108 (5.03 %)	n/a	43.34 (94.97 %)	47,428 (5.04 %)	47,428 (5.04 %)	77,884 (94.96 %)	57,040 (0.33 %)	38,680 (0.67 %)	3,360,588 (16.95 %)	3,690 (0.25 %)	51,077 (1.97 %)	87,581 (5.17 %)	33,980 (1.28 %)
797	flatworm P.xenopodis (2019) GCA_900617795.1	n/a	37,906 (3.70 %)	1,119 (0.09 %)	21,714 (1.94 %)	n/a	37.72 (96.03 %)	114,405 (3.94 %)	114,405 (3.94 %)	430,803 (96.06 %)	131,200 (1.41 %)	65,894 (1.40 %)	4,294,556 (37.79 %)	1,668 (0.04 %)	n/a	18,635 (1.50 %)	14,510 (1.16 %)
798	flatworm R.nana (2018) GCA_900617975.1	n/a	13,777 (10.03 %)	1,459 (0.65 %)	11,251 (6.89 %)	n/a	36.71 (96.21 %)	7,924 (3.78 %)	7,924 (3.78 %)	24,136 (96.22 %)	44,935 (1.00 %)	33,882 (1.74 %)	1,021,833 (28.39 %)	125 (0.05 %)	32,910 (1.98 %)	1,649 (0.33 %)	1,017 (0.19 %)
799	flatworm S.bovis (TAN1997 2019) GCA_003958945.1	n/a	11,601 (4.68 %)	1,649 (0.32 %)	6,209 (2.69 %)	n/a	34.37 (96.65 %)	0 (0 %)	141,786 (3.39 %)	4,774 (100.00 %)	126,801 (1.53 %)	84,149 (4.39 %)	2,485,463 (31.81 %)	5,246 (0.90 %)	133,819 (9.24 %)	4,121 (0.37 %)	600 (0.08 %)
800	flatworm S.curassoni (Dakar, Senegal 2018) GCA_900618015.1	n/a	23,546 (5.19 %)	1,263 (0.22 %)	8,385 (1.92 %)	n/a	34.19 (97.29 %)	58,187 (2.74 %)	58,187 (2.74 %)	118,327 (97.26 %)	118,571 (1.58 %)	31,280 (0.54 %)	2,362,045 (32.28 %)	892 (0.04 %)	18,456 (0.50 %)	2,711 (0.24 %)	437 (0.04 %)
801	flatworm S.haematobium (v3 2022) GCF_000699445.3	14,696 (11.02 %)	n/a	1,623 (0.30 %)	4,828 (2.87 %)	n/a	35.16 (99.99 %)	0 (0 %)	45 (0.01 %)	163 (100.00 %)	145,250 (1.92 %)	47,410 (3.11 %)	2,319,564 (36.90 %)	0 (0 %)	67,332 (3.69 %)	5,818 (0.54 %)	853 (0.10 %)
802	flatworm S.japonicum (Anhui 2009) GCA_000151775.1	n/a	n/a	1,318 (0.24 %)	4,952 (1.84 %)	n/a	34.08 (91.69 %)	70,230 (8.37 %)	84,875 (8.37 %)	95,265 (91.63 %)	152,300 (9.01 %)	36,620 (1.46 %)	2,371,877 (25.81 %)	48 (0.00 %)	123,423 (3.12 %)	3,120 (0.27 %)	283 (0.03 %)
803	flatworm S.japonicum (F4M4 2022) GCA_025215515.1	n/a	n/a	1,525 (0.28 %)	3,449 (2.13 %)	n/a	33.92 (99.46 %)	0 (0 %)	555 (0.54 %)	100 (100.00 %)	104,426 (1.34 %)	33,339 (1.28 %)	2,695,465 (28.21 %)	5 (0.01 %)	73,904 (3.06 %)	3,285 (0.28 %)	299 (0.03 %)
804	flatworm S.japonicum (HuSjv2 2019) GCA_006368765.1	n/a	18,263 (7.45 %)	1,532 (0.31 %)	3,542 (2.18 %)	n/a	33.76 (99.99 %)	0 (0 %)	325 (0.01 %)	1,789 (100.00 %)	142,663 (9.34 %)	36,129 (1.76 %)	2,516,570 (28.21 %)	1 (0.00 %)	70,845 (1.90 %)	2,636 (0.25 %)	405 (0.05 %)
805	flatworm S.margrebowiei (2022) GCA_944470205.2	n/a	19,527 (6.48 %)	1,563 (0.29 %)	4,333 (2.64 %)	n/a	34.62 (99.98 %)	0 (0 %)	334 (0.02 %)	36 (100.00 %)	139,847 (1.79 %)	43,151 (1.46 %)	2,506,099 (36.67 %)	0 (0 %)	80,930 (4.14 %)	4,794 (0.45 %)	708 (0.09 %)
806	flatworm S.solidus (NST_G2 2018) GCA_900618435.1	n/a	20,228 (3.84 %)	1,594 (0.21 %)	22,998 (4.31 %)	n/a	43.04 (95.91 %)	84,868 (4.10 %)	84,868 (4.10 %)	141,646 (95.90 %)	94,549 (1.19 %)	94,358 (4.49 %)	2,903,833 (28.93 %)	976 (0.09 %)	189,063 (3.62 %)	83,436 (10.03 %)	33,920 (2.49 %)
807	flatworm T.multiceps (Gns01 2018) GCA_001923025.3	n/a	n/a	1,672 (0.52 %)	13,049 (8.07 %)	n/a	43.78 (99.95 %)	0 (0 %)	1,305 (0.05 %)	738 (100.00 %)	55,986 (1.93 %)	110,577 (12.15 %)	675,595 (21.50 %)	0 (0 %)	157,454 (5.51 %)	20,445 (5.20 %)	12,747 (1.95 %)
808	fly C.sonorensis (2021) GCA_900258525.3	n/a	n/a	4,888 (3.18 %)	3,248 (5.21 %)	n/a	28.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,858 (100.00 %)	153,327 (4.21 %)	50,490 (3.70 %)	1,549,489 (48.15 %)	0 (0 %)	38,298 (2.53 %)	65 (0.01 %)	49 (0.01 %)
809	fly D.melanogaster GCF_000001215.4	34,530 (25.13 %)	n/a	13,636 (19.60 %)	20,290 (18.02 %)	34,884 (25.28 %)	42.01 (99.20 %)	0 (0 %)	572 (0.80 %)	1,870 (100.00 %)	134,442 (20.61 %)	35,076 (2.73 %)	767,882 (23.39 %)	15 (0.00 %)	48,027 (5.21 %)	27,513 (14.85 %)	20,892 (9.79 %)
810	fly L.longipalpis (2012) GCA_000265325.1	n/a	n/a	4,900 (3.54 %)	10,763 (11.07 %)	n/a	35.01 (92.62 %)	24,164 (7.43 %)	25,223 (7.43 %)	35,696 (92.57 %)	47,662 (1.44 %)	27,227 (1.42 %)	1,173,513 (34.29 %)	211 (0.10 %)	128,553 (15.11 %)	6,564 (1.68 %)	5,469 (1.41 %)
811	fly L.longipalpis (SR_M1_2022 2022) GCF_024334085.1	21,589 (21.93 %)	n/a	5,325 (4.05 %)	9,317 (12.56 %)	n/a	35.48 (99.92 %)	251 (0.08 %)	251 (0.08 %)	255 (99.92 %)	52,585 (1.56 %)	28,741 (2.29 %)	1,157,410 (37.08 %)	8 (0.01 %)	n/a	7,100 (1.97 %)	5,813 (1.60 %)
812	fly P.argentipes (2022) GCF_947086385.1	16,117 (25.88 %)	n/a	5,401 (6.29 %)	13,675 (19.46 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)	66 (100.00 %)	20,506 (0.74 %)	6,442 (0.64 %)	656,248 (19.62 %)	0 (0 %)	7,512 (0.87 %)	15,461 (14.02 %)	13,332 (10.60 %)
813	fly P.papatasi (2012) GCA_000262795.1	n/a	n/a	4,988 (1.27 %)	16,115 (4.96 %)	n/a	33.60 (94.92 %)	32,373 (5.05 %)	32,373 (5.05 %)	139,199 (94.95 %)	96,645 (1.31 %)	105,833 (2.19 %)	2,723,703 (43.70 %)	632 (0.13 %)	n/a	3,667 (0.35 %)	2,680 (0.26 %)
814	fly P.papatasi (M1 2022) GCF_024763615.1	21,696 (9.33 %)	n/a	5,466 (1.74 %)	10,123 (6.25 %)	n/a	33.78 (99.90 %)	0 (0 %)	704 (0.10 %)	646 (100.00 %)	99,587 (1.21 %)	104,588 (8.35 %)	2,281,058 (48.95 %)	8 (0.00 %)	141,672 (3.48 %)	4,094 (0.44 %)	2,945 (0.32 %)
815	Foot-and-mouth disease virus O (O6 o6pirbright iso58 2018) GCF_002816555.1	n/a	1 (85.34 %)	n/a	n/a	n/a	53.82 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.30 %)	2 (0.34 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (90.85 %)	2 (90.85 %)
816	Fort Sherman virus (86MSP18 2019) GCF_004789975.1	n/a	4 (95.36 %)	n/a	n/a	n/a	34.88 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.80 %)	n/a	19 (1.87 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
817	Francisella tularensis subsp. novicida (D9876 2015) GCF_000833355.1	n/a	1,811 (91.59 %)	n/a	n/a	n/a	32.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	35 (0.55 %)	12,202 (13.75 %)	0 (0 %)	132 (0.38 %)	11 (0.24 %)	11 (0.24 %)
818	French heartworm (ZH-2019-22 2021) GCA_018806985.1	n/a	n/a	4,884 (1.53 %)	12,210 (5.35 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	0 (0 %)	45 (0.00 %)	468 (100.00 %)	305,810 (23.78 %)	38,323 (2.93 %)	1,517,938 (29.48 %)	1 (0.00 %)	73,505 (1.91 %)	20,015 (2.84 %)	4,341 (0.50 %)
819	freshwater planarian (S2F2 2007) GCA_000181075.1	n/a	n/a	2,341 (0.18 %)	30,142 (2.71 %)	n/a	29.91 (99.98 %)	4,543 (0.00 %)	4,543 (0.00 %)	99,225 (100.00 %)	1,021,606 (47.55 %)	565,545 (5.36 %)	5,648,785 (54.58 %)	0 (0 %)	268,890 (2.03 %)	34,552 (1.79 %)	14,103 (0.79 %)
820	Fugong virus (FG10 2017) GCF_002118945.1	n/a	3 (93.43 %)	n/a	n/a	n/a	36.93 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	15 (1.61 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
821	fungi A.variabilis (NCCPF 102052 2017) GCA_002749535.1	n/a	n/a	1,785 (3.31 %)	6,798 (16.19 %)	n/a	41.65 (98.52 %)	0 (0 %)	715 (1.49 %)	411 (100.00 %)	10,666 (1.24 %)	4,042 (1.08 %)	156,848 (12.68 %)	106 (0.39 %)	2,893 (1.63 %)	2,473 (2.59 %)	1,973 (1.94 %)
822	fungi L.ramosa (KPH11 2019) GCA_008728235.1	n/a	n/a	1,820 (4.04 %)	7,574 (20.61 %)	n/a	41.38 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	10,926 (2.46 %)	3,224 (0.84 %)	146,627 (13.65 %)	0 (0 %)	4,504 (3.39 %)	86 (0.07 %)	52 (0.04 %)
823	fungi M.circinelloides (1006PhL 2013) GCA_000401635.1	n/a	12,410 (47.39 %)	1,968 (4.23 %)	11,092 (31.68 %)	n/a	39.49 (93.92 %)	989 (6.09 %)	989 (6.09 %)	1,459 (93.91 %)	16,402 (1.83 %)	5,949 (0.78 %)	155,841 (14.35 %)	50 (0.07 %)	1,603 (0.60 %)	217 (0.16 %)	131 (0.10 %)
824	fungi M.lusitanicus (CBS 277.49 2016) GCA_001638945.1	n/a	11,941 (37.74 %)	1,959 (3.93 %)	10,678 (29.64 %)	n/a	42.17 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	21 (100.00 %)	13,106 (1.46 %)	5,056 (1.05 %)	155,423 (18.64 %)	0 (0 %)	4,357 (1.60 %)	2,464 (3.15 %)	1,822 (2.16 %)
825	fungi P.blakesleeanus NRRL 1555(-) GCF_001638985.1	16,543 (35.04 %)	n/a	1,830 (2.46 %)	8,050 (14.98 %)	n/a	35.78 (98.94 %)	270 (1.06 %)	290 (1.06 %)	350 (98.94 %)	84,763 (7.85 %)	36,781 (3.26 %)	374,361 (28.75 %)	2 (0.01 %)	8,913 (2.52 %)	1,774 (1.45 %)	1,595 (1.27 %)
826	fungi R.microsporus var. microsporus (ATCC 52814 2017) GCA_002083745.1	n/a	11,554 (55.78 %)	1,688 (4.95 %)	5,957 (23.51 %)	n/a	37.42 (99.76 %)	223 (0.24 %)	223 (0.24 %)	783 (99.76 %)	12,801 (2.07 %)	3,957 (0.68 %)	146,612 (17.18 %)	9 (0.01 %)	361 (0.19 %)	338 (0.49 %)	276 (0.39 %)
827	Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum (ATCC 25586 2018) GCF_003019295.1	n/a	2,068 (92.40 %)	n/a	n/a	n/a	27.14 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	133 (0.35 %)	21,165 (29.29 %)	0 (0 %)	59 (0.47 %)	13 (0.37 %)	12 (0.32 %)
828	Gammapapillomavirus sp. (GammaDyskD_w07c34d 2019) GCF_004131625.1	n/a	6 (92.05 %)	n/a	n/a	n/a	35.95 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.82 %)	1 (0.86 %)	23 (5.21 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
829	Gammapapillomavirus sp. (Gammai915_ga2c70 2019) GCF_004131645.1	n/a	7 (92.78 %)	n/a	n/a	n/a	37.08 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.56 %)	8 (1.03 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
830	Gammapapillomavirus sp. (GammaiCH2_EV03c434 2019) GCF_004131665.1	n/a	7 (92.78 %)	n/a	n/a	n/a	35.74 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (2.66 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.79 %)	1 (3.79 %)
831	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_LCOSOc196 2019) GCF_004131525.1	n/a	7 (92.90 %)	n/a	n/a	n/a	37.15 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	21 (3.44 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.35 %)	1 (3.35 %)
832	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w11C51 2019) GCF_004131545.1	n/a	7 (93.37 %)	n/a	n/a	n/a	36.15 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.31 %)	n/a	9 (1.36 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
833	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w23c08c 2019) GCF_004131565.1	n/a	7 (92.58 %)	n/a	n/a	n/a	37.70 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.48 %)	n/a	12 (1.77 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
834	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w27c03a 2019) GCF_004131685.1	n/a	7 (93.31 %)	n/a	n/a	n/a	38.27 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.22 %)	1 (3.22 %)
835	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w27c157c 2019) GCF_004131585.1	n/a	6 (92.56 %)	n/a	n/a	n/a	35.63 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.28 %)	n/a	14 (1.98 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
836	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w34c04a 2019) GCF_004131605.1	n/a	6 (92.68 %)	n/a	n/a	n/a	35.88 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	21 (3.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
837	Gardnerella vaginalis ATCC 14018 (JCM 11026 2015) GCF_001042655.1	n/a	1,327 (87.64 %)	n/a	n/a	n/a	41.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	315 (0.73 %)	5,384 (6.47 %)	0 (0 %)	82 (0.40 %)	43 (2.40 %)	40 (1.57 %)
838	GB virus C (1996) GCF_000862005.1	n/a	1 (91.81 %)	n/a	n/a	n/a	59.09 (99.98 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (1.67 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (82.30 %)	2 (82.30 %)
839	Gemella morbillorum (NCTC11323 2018) GCF_900476045.1	n/a	1,714 (88.13 %)	n/a	n/a	n/a	30.58 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	120 (1.13 %)	15,551 (22.68 %)	0 (0 %)	143 (0.93 %)	10 (0.27 %)	9 (0.25 %)
840	Gemycircularvirus (HV-GcV1 2016) GCF_001679855.1	n/a	4 (85.16 %)	n/a	n/a	n/a	52.74 (99.82 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.31 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (84.05 %)	2 (84.05 %)
841	Gemycircularvirus (HV-GcV2 2016) GCF_001679875.1	n/a	3 (86.34 %)	n/a	n/a	n/a	53.63 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (88.59 %)	1 (88.59 %)
842	Gemycircularvirus (SL1 2015) GCF_000973195.1	n/a	3 (87.86 %)	n/a	n/a	n/a	50.89 (99.82 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.46 %)	1 (1.46 %)	1 (1.46 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (90.45 %)	1 (90.45 %)
843	Gemycircularvirus C1c (GemyC1c 2018) GCF_002826005.1	n/a	1 (45.38 %)	n/a	n/a	n/a	50.12 (99.81 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.42 %)	1 (2.42 %)	3 (4.36 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (56.47 %)	2 (56.47 %)
844	Gemycircularvirus sp. (Vietnam 2023) GCF_018591295.1	n/a	3 (87.17 %)	n/a	n/a	n/a	47.97 (99.82 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.32 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (44.43 %)	2 (27.87 %)
845	Geobacillus stearothermophilus (LuGst23 2023) GCF_030339115.1	n/a	3,065 (85.61 %)	n/a	n/a	n/a	52.73 (99.99 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	108 (100.00 %)	n/a	73 (0.16 %)	14,472 (9.36 %)	0 (0 %)	44 (0.17 %)	89 (89.73 %)	35 (1.12 %)
846	GIII (Norovirus Bo/GIII.2/Adam/2006/No 2016) GCF_001595675.1	n/a	3 (99.14 %)	n/a	n/a	n/a	57.11 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (1.01 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	6 (36.84 %)	6 (34.66 %)
847	Globicatella sanguinis (UMB0514 2023) GCF_002847845.2	n/a	2,329 (83.63 %)	n/a	n/a	n/a	35.83 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	239 (1.53 %)	17,925 (14.49 %)	0 (0 %)	294 (1.57 %)	20 (0.83 %)	17 (0.81 %)
848	glomeromycetes (A1 2016) GCA_001593125.1	n/a	26,582 (22.50 %)	1,121 (0.67 %)	6,451 (4.51 %)	n/a	27.23 (95.29 %)	14,205 (4.72 %)	14,205 (4.72 %)	25,401 (95.28 %)	106,779 (4.31 %)	75,470 (4.67 %)	1,102,046 (42.45 %)	629 (0.19 %)	42,591 (2.60 %)	109 (0.03 %)	78 (0.02 %)
849	glomeromycetes (C2 2021) GCA_020716745.1	n/a	n/a	1,177 (0.52 %)	12,480 (7.17 %)	n/a	28.23 (99.99 %)	163 (0.01 %)	163 (0.01 %)	196 (99.99 %)	134,055 (3.98 %)	121,581 (7.12 %)	1,334,821 (43.20 %)	1 (0.00 %)	110,578 (5.28 %)	278 (0.05 %)	195 (0.04 %)
850	glomeromycetes (DAOM-197198 2021) GCA_020716725.1	n/a	n/a	1,156 (0.56 %)	9,915 (6.55 %)	n/a	27.82 (100.00 %)	74 (0.01 %)	74 (0.01 %)	107 (99.99 %)	125,367 (4.04 %)	107,204 (6.85 %)	1,270,562 (44.14 %)	0 (0 %)	96,631 (5.38 %)	234 (0.05 %)	151 (0.03 %)
851	Goose calicivirus (N 2014) GCF_000920715.1	n/a	2 (97.15 %)	n/a	n/a	n/a	54.67 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (41.13 %)	1 (41.13 %)
852	Granulicatella adiacens (FDAARGOS_1477 2021) GCF_019931005.1	n/a	1,949 (89.01 %)	n/a	n/a	n/a	37.78 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	79 (1.00 %)	10,943 (10.78 %)	0 (0 %)	157 (0.80 %)	18 (1.39 %)	18 (1.38 %)
853	grass mildew (2019) GCA_900519115.1	n/a	8,588 (6.69 %)	1,393 (0.78 %)	18,180 (17.37 %)	n/a	43.75 (99.90 %)	697 (0.10 %)	697 (0.10 %)	708 (99.90 %)	180,000 (74.24 %)	16,573 (1.14 %)	566,860 (33.28 %)	2 (0.00 %)	42,124 (5.11 %)	16,363 (11.46 %)	3,066 (1.45 %)
854	grass mildew (RACE1 RACE1 2018) GCA_900237765.1	n/a	7,147 (12.25 %)	1,381 (0.93 %)	16,370 (20.47 %)	n/a	43.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	99 (100.00 %)	135,475 (73.92 %)	10,656 (0.71 %)	454,865 (29.77 %)	0 (0 %)	34,253 (4.29 %)	13,666 (10.89 %)	3,225 (2.01 %)
855	grass mildew (THUN-12 2021) GCA_905067625.1	n/a	7,993 (7.27 %)	1,445 (0.78 %)	18,423 (17.90 %)	n/a	43.66 (100.00 %)	0 (0 %)	18 (0.00 %)	36 (100.00 %)	18,823 (0.77 %)	13,963 (1.11 %)	567,352 (33.52 %)	0 (0 %)	36,616 (4.34 %)	16,126 (11.23 %)	6,213 (2.63 %)
856	Great Island virus (CanAr 42 2010) GCF_000887635.1	n/a	11 (95.17 %)	n/a	n/a	n/a	57.79 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	4 (0.19 %)	n/a	17 (1.06 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	10 (95.67 %)	10 (95.67 %)
857	greater mouse-eared bat (2020 Bat1K) GCF_014108235.1	70,930 (3.43 %)	n/a	19,052 (1.84 %)	21,498 (1.73 %)	n/a	43.11 (98.55 %)	0 (0 %)	538 (1.45 %)	93 (100.00 %)	3,088,083 (26.27 %)	753,124 (2.84 %)	10,383,466 (35.84 %)	0 (0 %)	499,733 (1.88 %)	61,023 (2.69 %)	54,015 (1.81 %)
858	Grimontia hollisae (FDAARGOS_111 2018) GCF_001558255.2	n/a	3,659 (88.17 %)	n/a	n/a	n/a	49.51 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	86 (0.49 %)	10,545 (4.43 %)	0 (0 %)	164 (0.44 %)	166 (62.55 %)	211 (6.15 %)
859	Grotenhout virus (Gierle-1 2023) GCF_018594915.1	n/a	2 (86.62 %)	n/a	n/a	n/a	44.02 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	5 (0.45 %)	n/a	18 (1.68 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
860	Guaroa virus (BeH22063 2017) GCF_002118805.1	n/a	5 (95.03 %)	n/a	n/a	n/a	34.13 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.46 %)	n/a	10 (1.74 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
861	Guenon simian foamy virus (Cercopithecus nictitans AG16 2019) GCF_003032775.1	n/a	6 (76.21 %)	n/a	n/a	n/a	38.62 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (1.09 %)	n/a	5 (0.38 %)	0 (0 %)	1 (25.93 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
862	Guinea worm (2018) GCA_900625125.1	n/a	10,969 (12.02 %)	2,518 (1.90 %)	1,196 (2.22 %)	n/a	30.20 (99.84 %)	0 (0 %)	418 (0.16 %)	1,347 (100.00 %)	80,056 (4.01 %)	63,191 (2.32 %)	950,607 (42.69 %)	18 (0.01 %)	7,384 (0.87 %)	205 (0.05 %)	101 (0.03 %)
863	Gulf Coast tick (SK-2019 2022) GCA_023969395.1	n/a	n/a	4,023 (0.13 %)	138,157 (5.19 %)	n/a	45.98 (95.31 %)	94,750 (4.70 %)	94,750 (4.70 %)	220,627 (95.30 %)	741,322 (1.27 %)	402,846 (1.32 %)	9,240,218 (34.27 %)	5,734 (0.12 %)	n/a	402,250 (21.95 %)	248,857 (5.86 %)
864	gyrodactylosis fluke (Lier 2014) GCA_000715275.1	n/a	n/a	1,418 (1.45 %)	7,497 (12.48 %)	n/a	33.85 (99.94 %)	1,190 (0.05 %)	1,403 (0.05 %)	7,265 (99.95 %)	6,121 (0.39 %)	2,510 (0.23 %)	565,571 (28.86 %)	3 (0.00 %)	3,297 (0.62 %)	1,631 (0.83 %)	1,550 (0.77 %)
865	Gyrovirus (Tu243 2013) GCF_000913875.1	n/a	3 (75.54 %)	n/a	n/a	n/a	48.51 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (5.69 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (17.67 %)	0 (0.00 %)
866	Gyrovirus (Tu789 2013) GCF_000912415.1	n/a	3 (80.81 %)	n/a	n/a	n/a	52.68 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (3.94 %)	12 (10.96 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (43.30 %)	1 (31.38 %)
867	Gyrovirus 4 (D137 2012) GCF_000899075.1	n/a	2 (74.58 %)	n/a	n/a	n/a	49.46 (99.80 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (3.88 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (43.41 %)	1 (43.41 %)
868	Gyrovirus GyV3 (FecGy 2012) GCF_000896975.1	n/a	3 (81.48 %)	n/a	n/a	n/a	52.70 (99.83 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.97 %)	n/a	6 (4.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (43.37 %)	1 (43.37 %)
869	H.meleagridis (2922-C6/04-10x 2021 refseq) GCF_020186115.1	11,119 (30.29 %)	n/a	1,098 (1.30 %)	1,262 (9.18 %)	n/a	28.66 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (0.00 %)	190 (100.00 %)	18,568 (2.23 %)	13,002 (5.29 %)	392,188 (38.57 %)	0 (0 %)	17,555 (3.51 %)	239 (0.23 %)	218 (0.20 %)
870	H.meleagridis (2922-C6/04-290x 2021) GCA_020184695.1	n/a	11,137 (30.16 %)	1,071 (1.28 %)	1,331 (9.18 %)	n/a	28.77 (100.00 %)	12 (0.00 %)	12 (0.00 %)	293 (100.00 %)	17,978 (2.13 %)	13,344 (4.91 %)	390,447 (38.11 %)	0 (0 %)	15,807 (3.05 %)	249 (0.28 %)	228 (0.24 %)
871	Haemophilus ducreyi (VAN2 2016) GCF_001647695.1	n/a	1,549 (90.01 %)	n/a	n/a	n/a	37.92 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	23 (0.52 %)	8,554 (10.11 %)	0 (0 %)	14 (0.12 %)	18 (0.88 %)	19 (0.89 %)
872	Haemophilus influenzae (FDAARGOS_1560 2021) GCF_020736045.1	n/a	1,886 (90.20 %)	n/a	n/a	n/a	38.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	94 (0.68 %)	11,146 (12.03 %)	0 (0 %)	80 (0.36 %)	24 (1.11 %)	23 (1.04 %)
873	Hantaan orthohantavirus (76-118 2003) GCF_000856085.1	n/a	3 (94.17 %)	n/a	n/a	n/a	38.56 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.78 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
874	Hantavirus (Z10 2004) GCF_000855785.1	n/a	3 (94.13 %)	n/a	n/a	n/a	39.29 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.38 %)	1 (0.30 %)	14 (1.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
875	Heartland virus (Patient1 2014) GCF_000922255.1	n/a	4 (96.17 %)	n/a	n/a	n/a	46.33 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
876	Heartland virus (TN 2023) GCF_013086545.1	n/a	4 (96.63 %)	n/a	n/a	n/a	46.52 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
877	heartwater rickettsia (Welgevonden 2005) GCF_000026005.1	n/a	995 (63.16 %)	n/a	n/a	n/a	27.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	205 (5.16 %)	12,505 (19.73 %)	0 (0 %)	656 (3.74 %)	2 (0.04 %)	2 (0.04 %)
878	Helcococcus kunzii (ATCC 51366 2012) GCF_000245755.1	n/a	1,911 (88.03 %)	n/a	n/a	n/a	29.35 (99.37 %)	37 (0.63 %)	37 (0.63 %)	39 (99.37 %)	n/a	346 (1.24 %)	18,507 (22.85 %)	9 (0.11 %)	118 (0.81 %)	4 (0.15 %)	4 (0.15 %)
879	Helicobacter pylori (26695 2012) GCF_000307795.1	n/a	1,599 (92.23 %)	n/a	n/a	n/a	38.87 (100.00 %)	40 (0.00 %)	40 (0.00 %)	41 (100.00 %)	n/a	192 (0.70 %)	14,562 (19.67 %)	0 (0 %)	93 (0.60 %)	30 (0.52 %)	16 (0.25 %)
880	Helicobacter pylori (CHC155 2022) GCF_025998455.1	n/a	1,626 (92.23 %)	n/a	n/a	n/a	38.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	179 (0.76 %)	13,965 (18.48 %)	0 (0 %)	94 (0.99 %)	23 (0.40 %)	11 (0.21 %)
881	Helicobacter pylori (HPAG1 2006) GCF_000013245.1	n/a	1,538 (92.22 %)	n/a	n/a	n/a	39.07 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	170 (0.68 %)	13,706 (19.27 %)	0 (0 %)	138 (0.97 %)	24 (0.45 %)	17 (0.31 %)
882	Helicobacter pylori (J99 2015) GCF_000982695.1	n/a	1,613 (91.65 %)	n/a	n/a	n/a	39.05 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	205 (1.09 %)	14,196 (18.72 %)	0 (0 %)	82 (2.07 %)	34 (0.60 %)	19 (0.34 %)
883	Hendra henipavirus (1998) GCF_000852685.1	n/a	9 (82.12 %)	n/a	n/a	n/a	39.43 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.38 %)	n/a	13 (0.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
884	Hepacivirus platyrrhini (2018) GCF_002820785.1	n/a	1 (94.01 %)	n/a	n/a	n/a	50.47 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.30 %)	1 (0.30 %)	4 (0.52 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (5.22 %)	2 (5.22 %)
885	Hepatitis B virus (2015) GCF_000861825.2	n/a	4 (55.31 %)	n/a	n/a	n/a	48.46 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (12.45 %)	1 (12.45 %)
886	Hepatitis C virus genotype 3 (NZL1 2007) GCF_000874285.1	n/a	3 (95.88 %)	n/a	n/a	n/a	55.65 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.33 %)	n/a	8 (0.95 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	6 (52.40 %)	6 (52.27 %)
887	Hepatitis C virus genotype 4 (ED43 2007) GCF_000874265.1	n/a	3 (96.50 %)	n/a	n/a	n/a	56.18 (100.00 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	5 (0.66 %)	n/a	5 (0.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (70.23 %)	4 (70.23 %)
888	Hepatitis C virus genotype 5 (EUH1480 2007) GCF_000873605.1	n/a	3 (96.81 %)	n/a	n/a	n/a	57.09 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (1.62 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (70.82 %)	4 (62.64 %)
889	Hepatitis C virus genotype 7 (QC69 2016) GCF_001712785.1	n/a	3 (95.88 %)	n/a	n/a	n/a	56.81 (99.97 %)	12 (0.13 %)	12 (0.13 %)	13 (99.87 %)	4 (0.27 %)	1 (0.26 %)	8 (0.84 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	10 (48.13 %)	9 (45.23 %)
890	hepatitis D virus 1 (TW2667 2023) GCF_018547865.1	n/a	2 (38.48 %)	n/a	n/a	n/a	58.93 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (3.46 %)	1 (1.97 %)	3 (4.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (80.79 %)	1 (80.79 %)
891	hepatitis D virus 2 (TW2476 2023) GCF_018547875.1	n/a	2 (38.30 %)	n/a	n/a	n/a	59.58 (99.76 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (2.02 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (72.92 %)	1 (72.92 %)
892	hepatitis D virus 4 (TW-2b Taiwan isolate 2023) GCF_003033645.1	n/a	1 (34.90 %)	n/a	n/a	n/a	60.66 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.42 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (99.52 %)	1 (99.52 %)
893	Hepatitis delta virus (dFr2005 2023) GCF_018547925.1	n/a	1 (38.42 %)	n/a	n/a	n/a	60.24 (99.88 %)	8 (0.47 %)	8 (0.47 %)	9 (99.53 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (4.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (80.44 %)	1 (80.44 %)
894	Hepatitis delta virus (dFr2072 2023) GCF_018547915.1	n/a	1 (35.06 %)	n/a	n/a	n/a	60.78 (99.94 %)	3 (0.24 %)	3 (0.24 %)	4 (99.76 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (4.94 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (76.26 %)	1 (76.26 %)
895	Hepatitis delta virus (dFr2158 2023) GCF_018547935.1	n/a	1 (38.90 %)	n/a	n/a	n/a	60.42 (99.76 %)	15 (0.96 %)	15 (0.96 %)	16 (99.04 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (3.70 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (96.83 %)	2 (85.96 %)
896	Hepatitis delta virus (VnzD8349 2023) GCF_018547805.1	n/a	1 (35.22 %)	n/a	n/a	n/a	60.46 (99.82 %)	10 (0.72 %)	10 (0.72 %)	11 (99.28 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.54 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (87.09 %)	2 (87.09 %)
897	Hepatovirus A (1993) GCF_000860505.1	n/a	3 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	37.87 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.45 %)	1 (0.47 %)	1 (0.53 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
898	Hepatovirus A (2ID 2023) GCA_008776015.1	n/a	1 (89.26 %)	n/a	n/a	n/a	33.72 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.57 %)	n/a	12 (3.99 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
899	Herpes simplex virus type 1 (17 1990) GCF_000859985.2	n/a	81 (86.40 %)	n/a	n/a	n/a	68.30 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	81 (2.72 %)	51 (2.90 %)	932 (18.12 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (100.00 %)	5 (94.54 %)
900	herring worm (2018) GCA_900617985.1	n/a	20,971 (14.07 %)	2,938 (1.63 %)	9,364 (5.41 %)	n/a	36.74 (96.82 %)	23,955 (3.15 %)	23,955 (3.15 %)	65,960 (96.85 %)	49,748 (2.20 %)	34,720 (1.65 %)	874,550 (19.72 %)	1,045 (0.20 %)	9,587 (0.71 %)	2,413 (0.68 %)	1,817 (0.49 %)
901	HMO Astrovirus A (NI-295 2009) GCF_000884395.1	n/a	4 (97.57 %)	n/a	n/a	n/a	43.54 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.11 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
902	house fly (aabys 2013 refseq) GCF_000371365.1	23,245 (4.79 %)	n/a	7,837 (1.36 %)	12,823 (3.07 %)	n/a	35.11 (92.22 %)	83,567 (7.82 %)	102,610 (7.82 %)	104,053 (92.18 %)	415,716 (2.30 %)	376,409 (8.80 %)	4,931,104 (52.61 %)	1,284 (0.11 %)	575,203 (6.40 %)	7,139 (0.35 %)	3,214 (0.17 %)
903	house fly (aabys 2023) GCF_030504385.1	31,571 (5.28 %)	n/a	9,444 (1.28 %)	14,080 (3.72 %)	n/a	35.05 (87.88 %)	0 (0 %)	16,939 (12.13 %)	340 (100.00 %)	523,357 (2.54 %)	511,141 (12.28 %)	5,782,844 (51.27 %)	2 (0.00 %)	1,204,640 (10.45 %)	11,297 (0.48 %)	4,696 (0.19 %)
904	house mouse C57BL/6J 2020 GRC GCF_000001635.27	136,224 (4.84 %)	n/a	22,409 (2.02 %)	19,480 (1.31 %)	140,725 (4.83 %)	41.67 (97.30 %)	324 (2.70 %)	334 (2.70 %)	22,273 (97.30 %)	5,361,085 (45.51 %)	1,641,063 (3.41 %)	12,722,791 (36.04 %)	1 (0.00 %)	858,983 (2.44 %)	23,794 (0.53 %)	15,980 (0.39 %)
905	Hudisavirus sp. (P22 2017) GCF_002375055.1	n/a	2 (81.59 %)	n/a	n/a	n/a	51.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.86 %)	1 (1.08 %)	3 (1.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (18.65 %)	1 (10.60 %)
906	human alphaherpesvirus 2 (HG52 2013) GCF_000858385.2	n/a	86 (83.37 %)	n/a	n/a	n/a	70.38 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	124 (3.80 %)	64 (3.26 %)	1,158 (23.65 %)	0 (0 %)	20 (0.79 %)	1 (99.99 %)	3 (92.59 %)
907	human associated cyclovirus 10 (7078A 2014) GCF_000918035.2	n/a	2 (86.20 %)	n/a	n/a	n/a	43.41 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
908	human associated gemyvongvirus 1 (DB1 2015) GCF_001448435.1	n/a	4 (89.04 %)	n/a	n/a	n/a	51.81 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.89 %)	1 (1.89 %)	1 (2.24 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (97.10 %)	1 (97.10 %)
909	human associated huchismacovirus 1 (Oregon/6/2011/GottageGrove/5A1 2018) GCF_003033475.1	n/a	2 (69.15 %)	n/a	n/a	n/a	42.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
910	human associated huchismacovirus 2 (France/8/2008/2444 2018) GCF_003033485.1	n/a	2 (69.81 %)	n/a	n/a	n/a	43.97 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.38 %)	2 (0.57 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
911	human associated huchismacovirus 3 (France/1/2009/3664 2018) GCF_003033495.1	n/a	2 (70.27 %)	n/a	n/a	n/a	42.28 (99.84 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (1.79 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
912	human associated porprismacovirus (16845x3_952 2023) GCF_018583805.1	n/a	2 (70.54 %)	n/a	n/a	n/a	47.72 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.58 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
913	human associated porprismacovirus 3 (16806x66_213 2023) GCF_018583635.1	n/a	2 (72.49 %)	n/a	n/a	n/a	48.72 (99.87 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (1.72 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (9.00 %)	1 (8.50 %)
914	human astrovirus BF34 (BF34 2014) GCF_000923215.1	n/a	4 (97.29 %)	n/a	n/a	n/a	43.77 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
915	human betaherpesvirus 5 (Merlin 2004) GCF_000845245.1	n/a	194 (84.91 %)	n/a	n/a	n/a	57.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	74 (1.33 %)	28 (0.67 %)	1,047 (7.96 %)	0 (0 %)	2 (0.05 %)	1 (99.99 %)	1 (99.64 %)
916	human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 refseq) GCF_000845685.2	n/a	115 (79.56 %)	n/a	n/a	n/a	42.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	33 (1.67 %)	36 (4.27 %)	603 (9.83 %)	0 (0 %)	52 (1.87 %)	3 (13.72 %)	2 (13.38 %)
917	human betaherpesvirus 6B (Z29 1999) GCF_000846365.1	n/a	128 (82.45 %)	n/a	n/a	n/a	42.77 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	27 (1.57 %)	20 (3.84 %)	652 (8.84 %)	0 (0 %)	49 (1.68 %)	6 (15.35 %)	4 (15.03 %)
918	human betaherpesvirus 7 (RK 1995) GCF_000848125.1	n/a	111 (79.51 %)	n/a	n/a	n/a	36.22 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	16 (1.65 %)	34 (8.04 %)	791 (15.85 %)	0 (0 %)	93 (3.17 %)	3 (5.14 %)	3 (5.14 %)
919	human bocavirus 2c PK (PK-5510 2009) GCF_000882675.1	n/a	4 (87.74 %)	n/a	n/a	n/a	41.59 (99.98 %)	1 (0.02 %)	1 (0.02 %)	2 (99.98 %)	5 (1.23 %)	n/a	5 (0.98 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
920	human bocavirus 3 (W471 2009) GCF_000882855.1	n/a	4 (88.44 %)	n/a	n/a	n/a	42.16 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (1.95 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.96 %)	1 (4.96 %)
921	human bocavirus 4 NI (HBoV4-NI-385 2009) GCF_000886375.1	n/a	6 (92.83 %)	n/a	n/a	n/a	40.41 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (1.06 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
922	human body louse GCF_000006295.1	10,818 (15.37 %)	n/a	3,036 (2.67 %)	2,113 (4.02 %)	n/a	27.47 (97.84 %)	6,673 (2.18 %)	6,673 (2.18 %)	8,555 (97.82 %)	555,824 (20.29 %)	174,660 (6.17 %)	948,197 (65.28 %)	4 (0.00 %)	40,689 (2.24 %)	600 (0.63 %)	473 (0.48 %)
923	human circovirus VS6600022 (VS6600022 2014) GCF_000924015.1	n/a	4 (85.08 %)	n/a	n/a	n/a	47.13 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.85 %)	n/a	1 (0.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (49.61 %)	2 (47.81 %)
924	human coronavirus 229E (2001) GCF_000853505.1	n/a	9 (97.14 %)	n/a	n/a	n/a	38.26 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.31 %)	2 (0.29 %)	57 (2.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
925	human coronavirus HKU1 (HKU1 2004) GCF_000858765.1	n/a	10 (98.07 %)	n/a	n/a	n/a	32.06 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (0.72 %)	1 (1.60 %)	89 (5.62 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
926	human coronavirus NL63 (Amsterdam I 2004) GCF_000853865.1	n/a	8 (97.86 %)	n/a	n/a	n/a	34.46 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (1.09 %)	n/a	84 (5.24 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
927	human coronavirus OC43 (ATCC VR-759 2019) GCF_003972325.1	n/a	11 (97.82 %)	n/a	n/a	n/a	36.79 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.43 %)	1 (0.09 %)	90 (3.88 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
928	human cosavirus (Cosavirus_Amsterdam_1994 2014) GCF_000920655.1	n/a	1 (81.59 %)	n/a	n/a	n/a	43.53 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.59 %)	0 (0 %)	1 (0.97 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
929	human cosavirus B (HCoSV-B1 2263 2009) GCF_000884955.1	n/a	1 (88.49 %)	n/a	n/a	n/a	43.79 (100.00 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.47 %)	n/a	6 (1.35 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
930	human CSF-associated densovirus (21 2023) GCF_029883595.1	n/a	5 (90.42 %)	n/a	n/a	n/a	40.04 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.66 %)	n/a	2 (0.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
931	human cyclovirus VS5700009 (VS5700009 2013) GCF_000908835.1	n/a	3 (84.17 %)	n/a	n/a	n/a	46.45 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (13.92 %)	1 (13.92 %)
932	human DNA virus (IND-KIs-REVA-1990 2019) GCF_003727435.1	n/a	1 (6.26 %)	n/a	n/a	n/a	53.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.89 %)	n/a	3 (0.59 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (93.16 %)	1 (93.16 %)
933	human endogenous retrovirus K113 (2013) GCF_000913595.1	n/a	1 (22.17 %)	n/a	n/a	n/a	41.86 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.60 %)	n/a	14 (2.49 %)	0 (0 %)	4 (20.38 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
934	human enterovirus 71 HZ08/Hangzhou/2008 (HZ08 2011) GCA_031128755.1	n/a	1 (88.89 %)	n/a	n/a	n/a	47.98 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.14 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.77 %)	1 (4.77 %)
935	human erythrovirus V9 (V9 2001) GCF_000841965.1	n/a	6 (90.67 %)	n/a	n/a	n/a	42.09 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
936	human fecal virus Jorvi2 (Jorvi2 2017) GCF_002219885.1	n/a	5 (72.08 %)	n/a	n/a	n/a	31.11 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (5.43 %)	n/a	20 (11.11 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
937	human fecal virus Jorvi3 (Jorvi3 2017) GCF_002219525.1	n/a	2 (84.04 %)	n/a	n/a	n/a	32.53 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.60 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
938	human fecal virus Jorvi4 (Jorvi4 2017) GCF_002219705.1	n/a	2 (81.18 %)	n/a	n/a	n/a	45.77 (99.87 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.34 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
939	human feces pecovirus (PeCV-NI 2019) GCF_003726995.1	n/a	2 (72.77 %)	n/a	n/a	n/a	50.00 (99.90 %)	1 (0.03 %)	1 (0.03 %)	2 (99.97 %)	5 (2.46 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (55.12 %)	1 (23.39 %)
940	human feces smacovirus 2 (SmaCV2 2018) GCF_003033575.1	n/a	2 (74.86 %)	n/a	n/a	n/a	46.00 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.54 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (19.22 %)	1 (19.22 %)
941	human feces smacovirus 3 (SmaCV3.21 P21 2017) GCF_002271185.1	n/a	2 (72.89 %)	n/a	n/a	n/a	46.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.66 %)	1 (1.56 %)	4 (1.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
942	human feces smacovirus 3 (SmaCV3_ETH_P15_2016 2023) GCF_003963575.1	n/a	2 (72.88 %)	n/a	n/a	n/a	47.89 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.91 %)	2 (0.56 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (24.13 %)	1 (24.13 %)
943	human gammaherpesvirus 8 (GK18 2007) GCF_000838265.1	n/a	113 (85.53 %)	n/a	n/a	n/a	53.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.18 %)	29 (2.88 %)	151 (3.93 %)	0 (0 %)	18 (0.82 %)	9 (84.42 %)	11 (81.82 %)
944	human gemycircularvirus (GeTz1 2018) GCF_002826025.1	n/a	4 (77.38 %)	n/a	n/a	n/a	49.05 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
945	human genital-associated circular DNA virus-1 (349 2015) GCF_000973295.1	n/a	4 (80.18 %)	n/a	n/a	n/a	54.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (1.21 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (91.86 %)	1 (91.86 %)
946	human hepegivirus (AK-790 2018) GCF_002821385.1	n/a	1 (96.18 %)	n/a	n/a	n/a	53.60 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (88.97 %)	2 (88.81 %)
947	human immunodeficiency virus 1 (1998) GCF_000864765.1	n/a	14 (93.78 %)	n/a	n/a	n/a	42.11 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.57 %)	1 (0.34 %)	18 (3.29 %)	0 (0 %)	1 (2.09 %)	1 (2.29 %)	1 (2.29 %)
948	human immunodeficiency virus 2 (BEN 1993) GCF_000856385.1	n/a	12 (84.81 %)	n/a	n/a	n/a	45.66 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.98 %)	10 (1.44 %)	0 (0 %)	1 (16.51 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
949	human lung-associated brisavirus AA (2023) GCA_014883685.1	n/a	3 (85.41 %)	n/a	n/a	n/a	34.45 (99.87 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.12 %)	1 (1.25 %)	3 (6.59 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
950	human lung-associated brisavirus II (2023) GCA_014883695.1	n/a	3 (86.04 %)	n/a	n/a	n/a	33.48 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.16 %)	1 (1.36 %)	2 (4.96 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
951	human lung-associated brisavirus MD (2023) GCA_014883705.1	n/a	3 (77.31 %)	n/a	n/a	n/a	33.41 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.15 %)	2 (2.62 %)	5 (6.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
952	human lung-associated brisavirus RC (2023) GCA_014883715.1	n/a	3 (88.73 %)	n/a	n/a	n/a	35.17 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (2.45 %)	1 (1.35 %)	3 (5.95 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
953	human lung-associated vientovirus FB (2021) GCF_013088445.1	n/a	3 (86.49 %)	n/a	n/a	n/a	33.94 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.15 %)	1 (1.34 %)	3 (6.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
954	human mastadenovirus A (Huie 1993) GCF_000846805.1	n/a	43 (94.41 %)	n/a	n/a	n/a	46.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (0.61 %)	n/a	73 (3.33 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	6 (30.52 %)	6 (29.41 %)
955	human mastadenovirus B (GB 2008) GCF_000880515.1	n/a	48 (93.42 %)	n/a	n/a	n/a	51.05 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (0.47 %)	1 (0.18 %)	41 (1.61 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	7 (43.26 %)	7 (42.59 %)
956	human mastadenovirus B (Slobitski 2008) GCF_000857085.1	n/a	46 (93.74 %)	n/a	n/a	n/a	48.88 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.82 %)	3 (0.30 %)	50 (2.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	6 (39.41 %)	6 (39.41 %)
957	human mastadenovirus C (1993) GCF_000845085.1	n/a	63 (97.51 %)	n/a	n/a	n/a	55.20 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	13 (0.89 %)	1 (0.12 %)	105 (4.66 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (70.08 %)	3 (67.42 %)
958	human mastadenovirus D (Hicks; NIAID V-209-003-014 2008) GCF_000845985.1	n/a	47 (93.93 %)	n/a	n/a	n/a	57.10 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.92 %)	1 (0.13 %)	59 (2.95 %)	0 (0 %)	1 (0.27 %)	3 (67.41 %)	3 (67.41 %)
959	human mastadenovirus E (vaccine (CL 68578) 2001) GCF_000859665.1	n/a	40 (96.48 %)	n/a	n/a	n/a	57.67 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (0.65 %)	n/a	107 (4.08 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (73.25 %)	5 (73.25 %)
960	human mastadenovirus F (Dugan 1993) GCF_000846685.1	n/a	44 (94.91 %)	n/a	n/a	n/a	51.22 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.32 %)	n/a	63 (2.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (62.53 %)	2 (60.52 %)
961	human metapneumovirus (00-1 2018) GCF_002815375.1	n/a	9 (93.36 %)	n/a	n/a	n/a	36.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (1.38 %)	1 (0.34 %)	27 (3.46 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
962	human orthopneumovirus (2018) GCF_002815475.1	n/a	12 (97.34 %)	n/a	n/a	n/a	33.24 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.64 %)	1 (0.24 %)	19 (3.32 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
963	human orthopneumovirus (B1 1997) GCF_000855545.1	n/a	10 (97.35 %)	n/a	n/a	n/a	33.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (1.61 %)	2 (0.52 %)	16 (3.21 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
964	human orthorubulavirus 2 (1991) GCF_000863525.1	n/a	8 (98.61 %)	n/a	n/a	n/a	38.41 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.38 %)	n/a	6 (0.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
965	human papillomavirus (SE379 2015) GCF_001274345.1	n/a	6 (93.54 %)	n/a	n/a	n/a	37.49 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.98 %)	1 (2.70 %)	21 (3.02 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
966	human papillomavirus 116 (HPV116 2009) GCF_000884175.1	n/a	7 (93.82 %)	n/a	n/a	n/a	38.50 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.73 %)	1 (4.73 %)
967	human papillomavirus 121 (NJ3301 2010) GCF_000889075.1	n/a	7 (92.45 %)	n/a	n/a	n/a	37.74 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.41 %)	n/a	9 (0.98 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
968	human papillomavirus 126 (HPV126 2011) GCF_000896435.1	n/a	7 (91.96 %)	n/a	n/a	n/a	38.05 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (2.68 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.92 %)	1 (2.92 %)
969	human papillomavirus 127 (R3a 2010) GCF_000890115.1	n/a	8 (93.50 %)	n/a	n/a	n/a	36.98 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (0.79 %)	18 (2.79 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.20 %)	0 (0.00 %)
970	human papillomavirus 132 (27-50 2011) GCF_000888015.1	n/a	7 (93.36 %)	n/a	n/a	n/a	37.94 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.89 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
971	human papillomavirus 134 (39-65 2011) GCF_000889695.1	n/a	7 (92.69 %)	n/a	n/a	n/a	38.14 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.48 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
972	human papillomavirus 135 (NJ3500 2012) GCF_000898235.1	n/a	7 (92.24 %)	n/a	n/a	n/a	36.86 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.56 %)	1 (0.67 %)	14 (2.77 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
973	human papillomavirus 136 (CL3865 2012) GCF_000899695.1	n/a	7 (91.83 %)	n/a	n/a	n/a	38.51 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.85 %)	n/a	19 (3.31 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
974	human papillomavirus 140 (NJ2801C1 2012) GCF_000898855.1	n/a	7 (91.69 %)	n/a	n/a	n/a	39.71 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.79 %)	n/a	4 (1.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
975	human papillomavirus 154 (PV77 2013) GCF_000908695.1	n/a	7 (92.75 %)	n/a	n/a	n/a	37.93 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.37 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
976	human papillomavirus 161 (KC1 2018) GCF_002826985.1	n/a	6 (92.39 %)	n/a	n/a	n/a	37.73 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.36 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
977	human papillomavirus 163 (KC3 2015) GCF_001430115.1	n/a	6 (93.54 %)	n/a	n/a	n/a	37.69 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (1.80 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
978	human papillomavirus 166 (KC9 2012) GCF_000899515.1	n/a	6 (92.72 %)	n/a	n/a	n/a	38.29 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.79 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
979	human papillomavirus 167 (KC10 2013) GCF_000913075.1	n/a	6 (92.78 %)	n/a	n/a	n/a	35.83 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	23 (5.24 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
980	human papillomavirus 172 (2018) GCF_002827005.1	n/a	7 (95.04 %)	n/a	n/a	n/a	37.77 (99.96 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	5 (1.22 %)	n/a	4 (0.60 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
981	human papillomavirus 175 (SE87 2018) GCF_002827025.1	n/a	7 (93.05 %)	n/a	n/a	n/a	38.87 (99.99 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.29 %)	n/a	8 (1.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.46 %)	1 (3.46 %)
982	human papillomavirus 178 (2014) GCF_000918095.1	n/a	7 (92.49 %)	n/a	n/a	n/a	38.15 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.53 %)	2 (0.59 %)	8 (1.35 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
983	human papillomavirus 179 (SIBX16 2013) GCF_000912535.1	n/a	6 (92.78 %)	n/a	n/a	n/a	36.76 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.87 %)	n/a	7 (1.67 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
984	human papillomavirus 18 (2000) GCF_000865665.1	n/a	8 (87.96 %)	n/a	n/a	n/a	40.43 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.70 %)	n/a	12 (3.67 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
985	human papillomavirus 184 (SIBX17 2018) GCF_002987365.1	n/a	6 (92.71 %)	n/a	n/a	n/a	36.89 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.98 %)	1 (0.53 %)	4 (0.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
986	human papillomavirus 187 (ACS447 2018) GCF_003055605.1	n/a	6 (92.85 %)	n/a	n/a	n/a	38.90 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.36 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
987	human papillomavirus 201 (HPV201 2015) GCF_001184845.1	n/a	7 (93.33 %)	n/a	n/a	n/a	37.71 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.48 %)	n/a	5 (0.95 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
988	human papillomavirus 204 (A342 2018) GCF_002827045.1	n/a	7 (92.47 %)	n/a	n/a	n/a	37.84 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.50 %)	n/a	6 (1.44 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.92 %)	1 (2.92 %)
989	human papillomavirus 30 (2018) GCF_002987345.1	n/a	6 (84.46 %)	n/a	n/a	n/a	40.39 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.31 %)	2 (1.03 %)	14 (4.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
990	human papillomavirus 5 (1993) GCF_000866505.1	n/a	8 (92.64 %)	n/a	n/a	n/a	42.39 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (2.94 %)	1 (0.39 %)	13 (3.01 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (7.11 %)	0 (0.00 %)
991	human papillomavirus 71 (2018) GCF_002826825.1	n/a	1 (24.06 %)	n/a	n/a	n/a	44.38 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (2.47 %)	3 (1.63 %)	11 (3.93 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
992	human papillomavirus 9 (1993) GCF_000863685.1	n/a	7 (94.00 %)	n/a	n/a	n/a	41.00 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.14 %)	2 (0.93 %)	13 (2.45 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.63 %)	1 (4.63 %)
993	human papillomavirus KC5 (KC5 2015) GCF_000989155.1	n/a	7 (92.99 %)	n/a	n/a	n/a	36.78 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.71 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
994	human papillomavirus type 10 (1993) GCF_000864905.1	n/a	7 (84.68 %)	n/a	n/a	n/a	45.89 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.78 %)	n/a	16 (3.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
995	human papillomavirus type 128 (2011) GCF_000889675.1	n/a	7 (92.33 %)	n/a	n/a	n/a	35.98 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (3.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
996	human papillomavirus type 129 (2011) GCF_000891495.1	n/a	7 (93.07 %)	n/a	n/a	n/a	37.31 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.82 %)	n/a	3 (0.35 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
997	human papillomavirus type 131 (27-49 2011) GCF_000890535.1	n/a	7 (93.15 %)	n/a	n/a	n/a	37.03 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	17 (2.73 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
998	human papillomavirus type 137 (NJ2801H 2012) GCF_000897255.1	n/a	7 (93.60 %)	n/a	n/a	n/a	37.57 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	16 (2.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
999	human papillomavirus type 144 (CL3740 2012) GCF_000898255.1	n/a	7 (92.09 %)	n/a	n/a	n/a	38.23 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.32 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1000	human papillomavirus type 156 (GC01 2017) GCF_002006915.1	n/a	7 (92.47 %)	n/a	n/a	n/a	36.18 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (1.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1001	human papillomavirus type 16 (1993) GCF_000863945.3	n/a	11 (87.67 %)	n/a	n/a	n/a	36.53 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (3.26 %)	1 (0.32 %)	12 (4.50 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1002	human papillomavirus type 26 (1993) GCF_000866485.1	n/a	6 (84.85 %)	n/a	n/a	n/a	38.60 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (2.74 %)	2 (0.45 %)	14 (5.89 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1003	human papillomavirus type 32 (1993) GCF_000864925.1	n/a	6 (84.42 %)	n/a	n/a	n/a	40.98 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.83 %)	n/a	9 (1.96 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1004	human papillomavirus type 34 (1993) GCF_000863965.1	n/a	6 (85.10 %)	n/a	n/a	n/a	38.25 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.33 %)	3 (1.17 %)	8 (3.52 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1005	human papillomavirus type 49 (1993) GCF_000862825.1	n/a	6 (93.19 %)	n/a	n/a	n/a	41.11 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.81 %)	n/a	11 (2.66 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1006	human papillomavirus type 53 (1993) GCF_000865685.1	n/a	7 (66.96 %)	n/a	n/a	n/a	40.14 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (2.47 %)	n/a	24 (6.16 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1007	human papillomavirus type 54 (1995) GCF_000864725.1	n/a	7 (84.57 %)	n/a	n/a	n/a	41.88 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.32 %)	n/a	9 (3.05 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1008	human papillomavirus type 63 (1993) GCF_000865565.1	n/a	7 (91.55 %)	n/a	n/a	n/a	40.44 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.20 %)	1 (0.59 %)	5 (0.53 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1009	human papillomavirus type 6b (type 6b (HPV6b) 1985) GCF_000861945.1	n/a	9 (89.64 %)	n/a	n/a	n/a	40.87 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.39 %)	1 (0.76 %)	15 (3.21 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1010	human papillomavirus type 7 (1993) GCF_000861925.1	n/a	6 (82.97 %)	n/a	n/a	n/a	39.53 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.73 %)	1 (0.59 %)	13 (3.49 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1011	human papillomavirus type 85 (114B 2017) GCF_002153865.1	n/a	8 (90.54 %)	n/a	n/a	n/a	37.76 (98.31 %)	7 (1.95 %)	7 (1.95 %)	8 (98.05 %)	3 (0.00 %)	n/a	17 (4.34 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1012	human papillomavirus type 90 (2002) GCF_000862685.1	n/a	7 (82.73 %)	n/a	n/a	n/a	46.65 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.95 %)	n/a	10 (3.96 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.53 %)	1 (2.53 %)
1013	human papillomavirus type 92 (2003) GCF_000846285.1	n/a	7 (93.86 %)	n/a	n/a	n/a	39.96 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (2.48 %)	3 (1.50 %)	7 (2.92 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.21 %)	1 (3.14 %)
1014	human papillomavirus type 96 (2003) GCF_000864825.1	n/a	7 (97.38 %)	n/a	n/a	n/a	40.31 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.81 %)	n/a	21 (3.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.33 %)	1 (3.93 %)
1015	human parainfluenza virus 4a (M-25 2013) GCF_000910675.1	n/a	7 (83.27 %)	n/a	n/a	n/a	36.23 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.23 %)	1 (0.22 %)	13 (1.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1016	human parvovirus 4 G1 (2005) GCF_000861005.1	n/a	2 (89.92 %)	n/a	n/a	n/a	44.94 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.87 %)	2 (1.52 %)	4 (0.70 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.85 %)	0 (0.00 %)
1017	human pegivirus 2 (UC0125.US 2015) GCF_001310135.2	n/a	1 (92.98 %)	n/a	n/a	n/a	53.96 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.49 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (90.06 %)	2 (90.06 %)
1018	human picobirnavirus (Hy005102 2005) GCF_000859285.1	n/a	3 (92.15 %)	n/a	n/a	n/a	46.02 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1019	human pinworm (2018) GCA_900576705.1	n/a	12,895 (10.21 %)	2,668 (1.43 %)	5,121 (3.16 %)	n/a	32.53 (96.24 %)	55,298 (3.88 %)	55,298 (3.88 %)	75,130 (96.12 %)	160,132 (4.84 %)	52,030 (1.49 %)	1,312,093 (34.94 %)	2 (0.00 %)	6,204 (0.30 %)	561 (0.14 %)	406 (0.11 %)
1020	human poliovirus strain (Sabin 1 2023) GCA_008766755.1	n/a	1 (89.10 %)	n/a	n/a	n/a	46.26 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (7.15 %)	1 (7.15 %)
1021	human polyomavirus 1 (1993) GCF_000837865.1	n/a	7 (89.15 %)	n/a	n/a	n/a	39.53 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (2.45 %)	13 (4.13 %)	0 (0 %)	3 (3.59 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1022	human polyomavirus 3 (Stockholm 60 2007) GCF_000873085.1	n/a	6 (88.17 %)	n/a	n/a	n/a	39.37 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.85 %)	26 (6.90 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1023	human polyomavirus 6 (607a 2010) GCF_000888495.1	n/a	6 (89.67 %)	n/a	n/a	n/a	42.66 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1024	human polyomavirus 7 (713a 2010) GCF_000889175.1	n/a	6 (89.14 %)	n/a	n/a	n/a	42.91 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (1.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1025	human polyomavirus 9 (HPyV9 2011) GCF_000891615.1	n/a	6 (88.18 %)	n/a	n/a	n/a	39.16 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	20 (4.74 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1026	human PoSCV5-like circular virus (MRJ 2023) GCF_013087445.1	n/a	2 (86.31 %)	n/a	n/a	n/a	33.91 (99.90 %)	1 (0.03 %)	1 (0.03 %)	2 (99.97 %)	5 (2.29 %)	1 (1.36 %)	2 (5.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1027	human respirovirus 1 (Washington 1964 2002) GCF_000848705.1	n/a	10 (99.19 %)	n/a	n/a	n/a	37.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (2.19 %)	1 (0.25 %)	4 (1.69 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1028	human respirovirus 3 (ZHYMgz01 Guangzhou 2023) GCF_006298365.1	n/a	6 (94.02 %)	n/a	n/a	n/a	35.29 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (1.93 %)	n/a	13 (1.30 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1029	human rhinovirus NAT001 (NAT001 2018) GCF_002816885.1	n/a	1 (92.58 %)	n/a	n/a	n/a	43.40 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1030	human rotavirus B (Bang373 2013) GCF_000907835.1	n/a	13 (95.17 %)	n/a	n/a	n/a	36.97 (99.88 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (1.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1031	human RSV respiratory syncytial virus A (S2 ts1C 2000) GCF_000856445.1	n/a	13 (98.68 %)	n/a	n/a	n/a	33.21 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.89 %)	1 (0.26 %)	23 (3.73 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1032	human smacovirus 1 (France/12/2008/3454 2015) GCF_000929235.1	n/a	2 (69.15 %)	n/a	n/a	n/a	43.94 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1033	human stool-associated circular virus NG13 (NG13 2018) GCF_002819605.1	n/a	2 (93.58 %)	n/a	n/a	n/a	43.54 (99.76 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (1.24 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1034	human T-cell leukemia virus type I (1998) GCF_000863585.1	n/a	11 (81.17 %)	n/a	n/a	n/a	53.47 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.33 %)	n/a	19 (2.50 %)	0 (0 %)	1 (5.36 %)	2 (12.06 %)	2 (9.60 %)
1035	human T-lymphotropic virus 2 (1993) GCF_000847505.1	n/a	9 (94.24 %)	n/a	n/a	n/a	53.82 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.11 %)	n/a	16 (2.41 %)	0 (0 %)	1 (16.53 %)	2 (6.46 %)	2 (6.46 %)
1036	human T-lymphotropic virus 4 (1863LE 2009) GCF_000882595.1	n/a	8 (77.85 %)	n/a	n/a	n/a	56.28 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.51 %)	n/a	30 (5.68 %)	0 (0 %)	2 (15.81 %)	3 (16.69 %)	2 (9.28 %)
1037	human TMEV-like cardiovirus (2008) GCF_000875265.1	n/a	3 (86.45 %)	n/a	n/a	n/a	43.58 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.84 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1038	human whipworm (2014) GCA_000613005.1	n/a	55,156 (16.67 %)	2,032 (1.92 %)	9,436 (14.99 %)	n/a	42.22 (99.97 %)	275 (0.02 %)	656 (0.02 %)	4,431 (99.98 %)	9,067 (0.61 %)	6,615 (1.43 %)	367,813 (14.70 %)	8 (0.00 %)	9,564 (1.09 %)	4,207 (5.21 %)	2,999 (3.49 %)
1039	Husavirus sp. (16370_59 2016) GCF_002374975.1	n/a	1 (98.06 %)	n/a	n/a	n/a	52.82 (99.99 %)	4 (0.05 %)	4 (0.05 %)	5 (99.95 %)	4 (0.37 %)	n/a	2 (0.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (99.41 %)	1 (99.41 %)
1040	I virus (Cowden 2000) GCF_000849945.1	n/a	2 (99.13 %)	n/a	n/a	n/a	53.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.57 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (10.49 %)	1 (10.49 %)
1041	IAS virus (2020) GCF_003443495.1	n/a	116 (90.03 %)	n/a	n/a	n/a	32.03 (99.98 %)	180 (0.31 %)	180 (0.31 %)	181 (99.69 %)	28 (1.11 %)	2 (0.08 %)	327 (5.48 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1042	Igbo Ora virus (IBH10964 1998) GCA_002888815.1	n/a	2 (95.47 %)	n/a	n/a	n/a	48.08 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.42 %)	1 (1.24 %)	2 (0.48 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (13.59 %)	5 (13.59 %)
1043	Ignavigranum ruoffiae (CPL 242382-20 2022) GCF_023195815.2	n/a	1,861 (88.15 %)	n/a	n/a	n/a	39.68 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	52 (0.45 %)	9,943 (9.40 %)	0 (0 %)	145 (0.78 %)	40 (1.41 %)	33 (1.31 %)
1044	Ilesha virus (R5964 2019) GCF_004789595.1	n/a	4 (95.33 %)	n/a	n/a	n/a	32.35 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.41 %)	n/a	21 (2.74 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1045	Imjin virus (2017) GCF_002146225.1	n/a	3 (94.30 %)	n/a	n/a	n/a	36.50 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (2.23 %)	6 (1.29 %)	9 (2.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1046	Indian encephalitis associated cyclovirus (IECSF08 2017) GCF_001939215.2	n/a	3 (78.82 %)	n/a	n/a	n/a	43.78 (99.83 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.41 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1047	Influenza A virus (A/California/07/2009 2015) GCF_001343785.1	n/a	14 (99.84 %)	n/a	n/a	n/a	43.70 (99.90 %)	4 (0.03 %)	4 (0.03 %)	12 (99.97 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (0.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1048	Influenza A virus (A/Goose/Guangdong/1/96H5N1 2005) GCF_000864105.1	n/a	15 (96.68 %)	n/a	n/a	n/a	44.12 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.35 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1049	Influenza A virus (A/Hong Kong/1073/99 2003) GCF_000851145.1	n/a	12 (97.14 %)	n/a	n/a	n/a	44.07 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (0.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1050	Influenza A virus (A/Korea/426/1968 2005) GCF_000866645.1	n/a	15 (97.49 %)	n/a	n/a	n/a	43.41 (99.89 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	9 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1051	Influenza A virus (A/New York/392/2004 2005) GCF_000865085.1	n/a	15 (96.37 %)	n/a	n/a	n/a	42.94 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	4 (0.57 %)	n/a	6 (0.33 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1052	Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934 1982) GCF_000865725.1	n/a	15 (96.32 %)	n/a	n/a	n/a	43.40 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.68 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1053	Influenza A virus (A/Shanghai/02/2013 2015) GCF_000928555.1	n/a	15 (99.34 %)	n/a	n/a	n/a	44.36 (99.92 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	9 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.30 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1054	Influenza B virus (B/Lee/1940 1993) GCF_000820495.2	n/a	11 (92.51 %)	n/a	n/a	n/a	40.19 (99.88 %)	0 (0 %)	n/a	8 (100.00 %)	5 (0.51 %)	n/a	23 (1.85 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1055	Influenza C virus (C/Ann Arbor/1/50 2004) GCF_000856665.10	n/a	11 (95.87 %)	n/a	n/a	n/a	37.28 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	42 (4.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1056	Influenza D virus (D/swine/Oklahoma/1334/2011 2018) GCF_002867775.1	n/a	9 (96.50 %)	n/a	n/a	n/a	41.45 (99.88 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	23 (2.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1057	inopinata (141012304 Brucella sp. 2016) GCF_900095155.1	n/a	3,337 (87.82 %)	n/a	n/a	n/a	57.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	122 (0.26 %)	17,323 (9.36 %)	0 (0 %)	82 (0.26 %)	2 (100.00 %)	2 (99.99 %)
1058	Isfahan virus (2013) GCF_000906835.1	n/a	5 (96.29 %)	n/a	n/a	n/a	41.93 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	20 (1.82 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1059	Issyk-Kul virus (LEIV-315K 2023) GCF_014883185.1	n/a	3 (95.40 %)	n/a	n/a	n/a	40.21 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.22 %)	6 (0.25 %)	0 (0 %)	1 (0.40 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1060	Japanese encephalitis virus (1993) GCF_000862145.1	n/a	3 (93.83 %)	n/a	n/a	n/a	51.43 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1061	JC polyomavirus (Mad1 1993) GCF_000863805.1	n/a	9 (96.55 %)	n/a	n/a	n/a	40.45 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (3.82 %)	17 (5.52 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1062	Jeju virus (10-11 2017) GCF_002117615.1	n/a	3 (93.96 %)	n/a	n/a	n/a	36.20 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (1.02 %)	1 (0.28 %)	16 (2.20 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1063	Jos virus (2023) GCF_023156725.1	n/a	6 (96.99 %)	n/a	n/a	n/a	46.01 (99.92 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	7 (99.99 %)	4 (0.39 %)	n/a	15 (1.52 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1064	Kander virus (CH17 2023) GCF_023155475.1	n/a	6 (94.29 %)	n/a	n/a	n/a	52.48 (99.99 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.32 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1065	Kasokero virus (Z-52963 2018) GCF_002288735.2	n/a	3 (96.72 %)	n/a	n/a	n/a	42.73 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.35 %)	n/a	29 (2.09 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1066	Kenkeme virus (Fuyuan-Sr-326 2017) GCF_002146025.1	n/a	3 (95.18 %)	n/a	n/a	n/a	37.73 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.26 %)	n/a	16 (1.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1067	Kingella kingae (NCTC10529 2018) GCF_900475905.1	n/a	2,130 (88.65 %)	n/a	n/a	n/a	46.57 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	45 (0.25 %)	12,010 (12.38 %)	0 (0 %)	135 (0.80 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)
1068	Klebsiella pneumoniae (342 2025) GCF_048819275.1	n/a	5,495 (89.08 %)	n/a	n/a	n/a	57.18 (100.00 %)	9 (0.00 %)	9 (0.00 %)	75 (100.00 %)	n/a	109 (0.39 %)	40,388 (16.09 %)	3 (0.01 %)	224 (0.31 %)	62 (97.55 %)	32 (1.00 %)
1069	Klebsiella pneumoniae (MGH 78578 2022) GCA_022305115.1	n/a	5,699 (89.34 %)	n/a	n/a	n/a	57.21 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	204 (100.00 %)	n/a	139 (0.26 %)	40,499 (16.18 %)	0 (0 %)	146 (0.18 %)	210 (96.28 %)	125 (3.39 %)
1070	Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae (HS11286 2011) GCF_000240185.1	n/a	5,866 (88.54 %)	n/a	n/a	n/a	57.12 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	8 (100.00 %)	n/a	109 (0.35 %)	41,489 (16.43 %)	0 (0 %)	186 (0.30 %)	28 (97.27 %)	27 (0.32 %)
1071	Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae (NTUH-K2044 2009) GCF_000009885.1	n/a	5,316 (89.13 %)	n/a	n/a	n/a	57.37 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	99 (0.40 %)	41,370 (17.13 %)	0 (0 %)	246 (0.35 %)	4 (99.71 %)	3 (0.04 %)
1072	Klebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis (ATCC 13884 2009) GCF_000163455.1	n/a	5,464 (89.17 %)	n/a	n/a	n/a	57.22 (96.89 %)	213 (3.12 %)	213 (3.12 %)	268 (96.88 %)	n/a	117 (0.24 %)	37,503 (15.23 %)	3 (0.02 %)	105 (0.15 %)	58 (98.19 %)	41 (0.94 %)
1073	Kunjin virus (MRM61C 2023) GCA_004786635.1	n/a	1 (96.61 %)	n/a	n/a	n/a	50.58 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.43 %)	1 (2.43 %)
1074	Kyasanur Forest disease virus (2018) GCF_002820625.1	n/a	1 (98.80 %)	n/a	n/a	n/a	55.20 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	1 (0.11 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (6.73 %)	3 (6.73 %)
1075	La Crosse virus (human/78 2002) GCF_000850965.1	n/a	4 (94.68 %)	n/a	n/a	n/a	36.68 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	26 (2.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1076	La Crosse virus (LACV/human/1960 2023) GCF_004789695.1	n/a	4 (94.68 %)	n/a	n/a	n/a	36.75 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	17 (1.56 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1077	Lacticaseibacillus rhamnosus (1.0320 2019) GCF_006151905.1	n/a	2,738 (85.20 %)	n/a	n/a	n/a	46.75 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	148 (1.42 %)	8,686 (5.73 %)	0 (0 %)	211 (0.78 %)	0 (0.00 %)	2 (0.04 %)
1078	Lactococcus garvieae (FDAARGOS_929 2020) GCF_016026695.1	n/a	2,108 (88.16 %)	n/a	n/a	n/a	38.67 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	57 (0.44 %)	12,319 (12.41 %)	0 (0 %)	86 (0.45 %)	35 (0.84 %)	33 (0.82 %)
1079	Lake Victoria marburgvirus - (Leiden 2011) GCA_031129775.1	n/a	7 (76.60 %)	n/a	n/a	n/a	38.11 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1080	Lake Victoria marburgvirus - Angola2005 (Ang1379c 2006) GCA_031121245.1	n/a	7 (98.72 %)	n/a	n/a	n/a	38.40 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (0.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1081	Lake Victoria marburgvirus - Ci67 (2007) GCA_031121995.1	n/a	7 (98.72 %)	n/a	n/a	n/a	38.45 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1082	Lake Victoria marburgvirus - DRC1999 (07DRC99 2006) GCA_031121255.1	n/a	7 (98.72 %)	n/a	n/a	n/a	38.19 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1083	Langat virus (TP21 2000) GCF_000860805.1	n/a	1 (93.62 %)	n/a	n/a	n/a	54.31 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.56 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.18 %)	1 (2.18 %)
1084	Langya virus (SDQD_H1801 2022) GCA_031319335.1	n/a	9 (81.86 %)	n/a	n/a	n/a	38.30 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.26 %)	n/a	18 (1.31 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1085	Lassa mammarenavirus (Josiah 1998) GCF_000851705.1	n/a	4 (94.96 %)	n/a	n/a	n/a	42.06 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.37 %)	9 (1.70 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1086	Le Dantec virus (DakHD763 2017) GCF_002118505.1	n/a	6 (97.47 %)	n/a	n/a	n/a	37.82 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	18 (1.72 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1087	Lebombo virus (SAAR 3896 2018) GCF_002829425.1	n/a	11 (96.53 %)	n/a	n/a	n/a	47.16 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	5 (0.77 %)	n/a	6 (0.77 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (14.49 %)	5 (14.49 %)
1088	Legionella pneumophila (130b 2024) GCF_041734345.1	n/a	3,191 (88.56 %)	n/a	n/a	n/a	38.38 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	1 (100.00 %)	n/a	85 (0.62 %)	22,761 (12.95 %)	0 (0 %)	187 (0.50 %)	30 (0.84 %)	29 (0.73 %)
1089	Legionella pneumophila (Philadelphia-1 AE 2017) GCF_001941585.1	n/a	3,058 (88.98 %)	n/a	n/a	n/a	38.33 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	60 (0.59 %)	22,384 (13.17 %)	0 (0 %)	127 (0.60 %)	24 (0.90 %)	29 (0.72 %)
1090	Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. (Philadelphia 1 2004) GCF_000008485.1	n/a	3,056 (88.94 %)	n/a	n/a	n/a	38.27 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	2 (100.00 %)	n/a	60 (0.29 %)	22,326 (13.18 %)	0 (0 %)	111 (0.52 %)	24 (0.61 %)	29 (0.43 %)
1091	Leishmania aethiopica (L147 2016) GCA_000444285.2	n/a	n/a	548 (1.05 %)	4,269 (47.65 %)	n/a	60.07 (97.99 %)	1,598 (2.03 %)	1,837 (2.04 %)	1,758 (97.97 %)	29,466 (4.68 %)	6,198 (0.77 %)	248,749 (21.09 %)	81 (0.19 %)	2,775 (2.50 %)	165 (99.77 %)	103 (0.53 %)
1092	Leishmania amazonensis (2013) GCA_000438535.1	n/a	n/a	507 (1.06 %)	5,293 (48.55 %)	n/a	59.27 (99.90 %)	572 (0.09 %)	669 (0.09 %)	3,199 (99.91 %)	19,666 (2.91 %)	2,927 (0.44 %)	217,607 (19.42 %)	0 (0 %)	290 (0.28 %)	2,876 (96.56 %)	1,681 (19.41 %)
1093	Leishmania amazonensis (PH8 2022) GCA_025688915.1	n/a	n/a	603 (1.13 %)	3,933 (46.98 %)	n/a	59.66 (98.02 %)	0 (0 %)	249 (1.99 %)	77 (100.00 %)	23,611 (2.85 %)	3,692 (2.13 %)	232,082 (20.39 %)	1 (0.00 %)	7,463 (4.46 %)	89 (99.64 %)	106 (0.31 %)
1094	Leishmania arabica (LEM1108 2016) GCA_000410695.2	n/a	n/a	539 (1.02 %)	4,014 (46.88 %)	n/a	59.42 (98.42 %)	1,362 (1.60 %)	1,497 (1.60 %)	1,530 (98.40 %)	30,695 (4.82 %)	6,793 (0.85 %)	232,761 (20.03 %)	72 (0.10 %)	2,469 (1.81 %)	184 (99.74 %)	110 (0.45 %)
1095	Leishmania braziliensis (MHOM/BR/75/M2903 2016 kinetoplastids) GCA_000340355.2	n/a	n/a	643 (1.12 %)	3,614 (44.69 %)	n/a	57.78 (92.26 %)	3,190 (7.77 %)	3,190 (7.77 %)	3,934 (92.23 %)	25,754 (4.94 %)	5,336 (1.09 %)	225,468 (17.80 %)	86 (0.38 %)	12,857 (5.73 %)	790 (97.97 %)	681 (1.51 %)
1096	Leishmania braziliensis (MHOM/BR/75/M2904 2011 kinetoplastids) GCF_000002845.2	8,195 (47.81 %)	n/a	617 (1.11 %)	3,625 (45.84 %)	n/a	57.77 (99.75 %)	0 (0 %)	881 (0.26 %)	138 (100.00 %)	24,164 (4.79 %)	4,690 (1.79 %)	210,592 (18.71 %)	2 (0.00 %)	8,898 (5.14 %)	160 (50.50 %)	193 (0.85 %)
1097	Leishmania donovani (2020) GCA_900635355.2	n/a	19,556 (92.23 %)	614 (1.09 %)	4,170 (46.03 %)	n/a	59.77 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	36 (100.00 %)	24,313 (2.73 %)	4,270 (2.26 %)	249,553 (21.06 %)	0 (0 %)	6,553 (5.04 %)	47 (99.88 %)	54 (0.14 %)
1098	Leishmania donovani (BHU 1220 2013) GCA_000470725.1	n/a	n/a	556 (1.03 %)	4,017 (46.59 %)	n/a	59.50 (96.29 %)	2,230 (3.73 %)	4,424 (3.74 %)	2,266 (96.27 %)	22,236 (4.03 %)	3,081 (0.41 %)	240,559 (19.38 %)	568 (1.33 %)	4,075 (3.15 %)	77 (99.38 %)	72 (0.15 %)
1099	Leishmania donovani (BPK282A1 2011 kinetoplastids) GCF_000227135.1	8,062 (46.83 %)	n/a	559 (1.04 %)	3,984 (46.52 %)	n/a	59.50 (96.35 %)	2,141 (3.68 %)	2,141 (3.68 %)	2,177 (96.32 %)	24,113 (4.30 %)	3,267 (0.45 %)	242,579 (19.49 %)	596 (1.38 %)	4,127 (3.27 %)	56 (47.68 %)	67 (0.14 %)
1100	Leishmania donovani (LdCL 2018) GCA_003719575.1	n/a	9,757 (49.01 %)	610 (1.11 %)	4,252 (46.18 %)	n/a	59.75 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	36 (100.00 %)	26,386 (4.68 %)	4,181 (2.19 %)	245,269 (20.83 %)	0 (0 %)	6,109 (5.31 %)	43 (99.83 %)	44 (0.43 %)
1101	Leishmania enriettii (CUR178 2021 refseq) GCF_017916305.1	8,353 (46.39 %)	n/a	648 (1.20 %)	4,574 (45.71 %)	n/a	59.57 (100.00 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	54 (100.00 %)	22,410 (2.63 %)	5,744 (2.97 %)	220,272 (19.14 %)	1 (0.00 %)	8,140 (6.09 %)	55 (99.87 %)	132 (0.18 %)
1102	Leishmania enriettii (LEM3045 2016) GCA_000410755.2	n/a	n/a	557 (1.10 %)	4,562 (47.91 %)	n/a	59.24 (98.92 %)	676 (1.09 %)	739 (1.09 %)	1,171 (98.91 %)	21,100 (3.60 %)	4,873 (0.66 %)	212,050 (17.50 %)	17 (0.02 %)	2,395 (1.82 %)	520 (99.58 %)	325 (1.78 %)
1103	Leishmania gerbilli (LEM452 2013) GCA_000443025.1	n/a	n/a	551 (1.05 %)	4,304 (47.05 %)	n/a	59.80 (98.16 %)	756 (1.85 %)	937 (1.85 %)	1,248 (98.15 %)	29,922 (4.73 %)	6,601 (0.81 %)	235,726 (20.37 %)	22 (0.06 %)	2,428 (1.48 %)	549 (99.30 %)	379 (2.96 %)
1104	Leishmania infantum (2020) GCA_900500625.2	n/a	8,747 (48.69 %)	643 (1.19 %)	4,210 (46.33 %)	n/a	59.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	36 (100.00 %)	23,549 (2.72 %)	3,832 (2.13 %)	243,521 (20.52 %)	0 (0 %)	4,957 (4.63 %)	45 (99.87 %)	41 (0.26 %)
1105	Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids refseq) GCF_000002725.2	9,507 (48.33 %)	n/a	634 (1.16 %)	4,290 (46.53 %)	n/a	59.72 (100.00 %)	7 (0.00 %)	7 (0.00 %)	43 (100.00 %)	33,791 (5.30 %)	8,477 (2.43 %)	238,932 (20.91 %)	0 (0 %)	6,726 (4.51 %)	26 (63.22 %)	27 (0.06 %)
1106	Leishmania major strain (Friedlin 2021) GCA_916722125.1	n/a	19,755 (88.21 %)	644 (1.18 %)	4,364 (46.66 %)	n/a	59.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	36 (100.00 %)	32,225 (3.61 %)	8,290 (2.60 %)	240,921 (20.87 %)	0 (0 %)	5,775 (4.32 %)	40 (99.91 %)	24 (0.07 %)
1107	Leishmania major strain (LV39c5 2013) GCA_000331345.1	n/a	n/a	596 (1.10 %)	4,382 (46.71 %)	n/a	59.47 (98.75 %)	818 (1.25 %)	818 (1.25 %)	1,667 (98.75 %)	32,306 (5.37 %)	8,066 (1.57 %)	237,232 (20.23 %)	110 (0.29 %)	5,154 (3.27 %)	579 (99.24 %)	268 (0.69 %)
1108	Leishmania major strain (SD 75.1 2012) GCA_000250755.2	n/a	n/a	552 (1.07 %)	4,211 (47.32 %)	n/a	59.52 (99.74 %)	855 (0.27 %)	943 (0.27 %)	891 (99.73 %)	32,070 (5.25 %)	7,938 (1.15 %)	237,985 (20.74 %)	24 (0.06 %)	4,475 (2.68 %)	43 (99.90 %)	28 (0.07 %)
1109	Leishmania martiniquensis (LSCM1 2021 refseq) GCF_017916325.1	7,967 (45.66 %)	n/a	619 (1.14 %)	3,882 (44.58 %)	n/a	59.85 (100.00 %)	0 (0 %)	5 (0.00 %)	42 (100.00 %)	20,726 (2.91 %)	2,267 (2.64 %)	232,973 (20.45 %)	0 (0 %)	6,246 (4.12 %)	44 (99.29 %)	43 (0.15 %)
1110	Leishmania mexicana (MHOM/GT/2001/U1103 2011 kinetoplastids) GCF_000234665.1	8,146 (47.97 %)	n/a	641 (1.16 %)	4,251 (47.32 %)	n/a	59.80 (99.90 %)	0 (0 %)	582 (0.11 %)	587 (100.00 %)	26,647 (4.40 %)	4,380 (1.74 %)	233,822 (20.52 %)	21 (0.06 %)	6,344 (4.18 %)	566 (49.98 %)	347 (0.98 %)
1111	Leishmania orientalis (LSCM4 2021 refseq) GCF_017916335.1	8,158 (45.05 %)	n/a	643 (1.12 %)	4,666 (45.26 %)	n/a	59.72 (99.99 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	98 (100.00 %)	22,632 (2.47 %)	4,241 (2.74 %)	231,120 (20.18 %)	1 (0.00 %)	10,584 (6.63 %)	100 (99.82 %)	164 (0.40 %)
1112	Leishmania panamensis (MHOM/COL/81/L13 2013) GCA_000340495.1	n/a	n/a	614 (1.15 %)	3,521 (45.42 %)	n/a	57.61 (99.07 %)	2,211 (0.95 %)	2,211 (0.95 %)	3,163 (99.05 %)	23,356 (4.15 %)	4,051 (1.39 %)	215,183 (18.18 %)	444 (0.64 %)	4,174 (2.85 %)	972 (97.94 %)	931 (4.41 %)
1113	Leishmania panamensis (MHOM/PA/94/PSC-1 2014 kinetoplastids) GCF_000755165.1	7,748 (48.52 %)	n/a	582 (1.12 %)	3,102 (46.24 %)	n/a	57.56 (97.73 %)	553 (2.28 %)	553 (2.28 %)	588 (97.72 %)	22,109 (3.93 %)	3,085 (0.38 %)	213,400 (18.35 %)	3 (0.01 %)	1,857 (1.31 %)	71 (45.43 %)	97 (0.24 %)
1114	Leishmania sp. Ghana 2012 LV757 (GH5 2021 refseq) GCF_017918215.1	8,119 (41.51 %)	n/a	661 (1.10 %)	4,945 (44.33 %)	n/a	59.67 (100.00 %)	0 (0 %)	9 (0.00 %)	116 (100.00 %)	23,640 (2.58 %)	5,237 (3.11 %)	226,790 (21.41 %)	0 (0 %)	15,742 (6.97 %)	125 (99.66 %)	171 (0.63 %)
1115	Leishmania sp. MAR (LEM2494 2016) GCA_000409445.2	n/a	n/a	577 (1.11 %)	3,833 (45.50 %)	n/a	59.70 (99.08 %)	377 (0.93 %)	402 (0.93 %)	628 (99.07 %)	20,121 (3.17 %)	1,591 (0.23 %)	223,208 (18.71 %)	19 (0.03 %)	1,178 (1.88 %)	273 (99.72 %)	184 (1.07 %)
1116	Leishmania sp. Namibia (253 2021 refseq) GCF_017918225.1	8,266 (45.37 %)	n/a	649 (1.14 %)	4,732 (45.84 %)	n/a	59.53 (100.00 %)	0 (0 %)	8 (0.00 %)	67 (100.00 %)	21,885 (2.64 %)	3,780 (2.94 %)	229,968 (20.05 %)	0 (0 %)	11,327 (6.18 %)	66 (99.69 %)	133 (0.41 %)
1117	Leishmania tarentolae (Parrot Tar II 2019) GCA_009731335.1	n/a	8,703 (43.93 %)	681 (1.17 %)	4,572 (44.55 %)	n/a	57.41 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	179 (100.00 %)	27,491 (4.14 %)	8,063 (3.25 %)	171,193 (17.31 %)	0 (0 %)	20,287 (8.31 %)	340 (99.05 %)	600 (29.71 %)
1118	Leishmania tropica (L590 2013) GCA_000410715.1	n/a	n/a	553 (1.02 %)	4,423 (47.39 %)	n/a	59.90 (94.97 %)	1,490 (5.05 %)	1,840 (5.05 %)	1,938 (94.95 %)	29,626 (4.55 %)	6,717 (0.81 %)	250,442 (20.31 %)	28 (0.08 %)	4,045 (2.55 %)	577 (96.29 %)	416 (2.23 %)
1119	Leishmania turanica (LEM423 2013) GCA_000441995.1	n/a	n/a	547 (1.04 %)	4,075 (46.21 %)	n/a	60.02 (95.53 %)	1,333 (4.48 %)	1,669 (4.48 %)	1,669 (95.52 %)	36,288 (5.44 %)	10,878 (1.18 %)	243,920 (21.05 %)	27 (0.08 %)	2,787 (1.57 %)	414 (98.70 %)	312 (1.54 %)
1120	Leptomonas pyrrhocoris (H10 2015 kinetoplastids) GCF_001293395.1	14,051 (67.93 %)	n/a	595 (1.09 %)	4,586 (53.30 %)	n/a	56.65 (99.63 %)	0 (0 %)	432 (0.37 %)	60 (100.00 %)	23,514 (2.82 %)	3,272 (1.55 %)	246,420 (21.64 %)	14 (0.02 %)	1,975 (3.30 %)	55 (64.76 %)	49 (0.12 %)
1121	Leptomonas seymouri (ATCC 30220 2015) GCA_001299535.1	n/a	8,596 (57.70 %)	516 (1.10 %)	4,173 (52.36 %)	n/a	55.72 (99.44 %)	0 (0 %)	2,178 (0.59 %)	1,216 (100.00 %)	15,344 (1.97 %)	2,896 (0.39 %)	191,873 (17.21 %)	0 (0 %)	414 (0.13 %)	1,497 (94.35 %)	965 (3.90 %)
1122	Leptospira abararensis (201903074 2021) GCF_016918735.1	n/a	3,978 (92.68 %)	n/a	n/a	n/a	39.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	66 (100.00 %)	n/a	36 (0.07 %)	33,364 (16.57 %)	0 (0 %)	143 (0.29 %)	48 (0.37 %)	28 (0.23 %)
1123	Leptospira adleri (FH2-B-D1 2017) GCF_002811985.1	n/a	4,462 (86.69 %)	n/a	n/a	n/a	43.55 (99.99 %)	0 (0 %)	3 (0.00 %)	170 (100.00 %)	n/a	107 (0.36 %)	42,188 (18.59 %)	0 (0 %)	189 (0.30 %)	30 (0.34 %)	36 (0.32 %)
1124	Leptospira ainazelensis (201903071 2021) GCF_016918785.1	n/a	4,465 (86.67 %)	n/a	n/a	n/a	42.61 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	94 (100.00 %)	n/a	150 (0.56 %)	42,015 (18.64 %)	0 (0 %)	382 (0.67 %)	29 (0.21 %)	36 (0.28 %)
1125	Leptospira ainlahdjerensis (201903070 2021) GCF_016919175.1	n/a	4,444 (85.53 %)	n/a	n/a	n/a	42.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	88 (100.00 %)	n/a	115 (0.40 %)	42,317 (18.88 %)	0 (0 %)	329 (0.62 %)	41 (0.35 %)	56 (0.39 %)
1126	Leptospira alexanderi serovar Manhao 3 str. (L 60 2013) GCF_000243815.2	n/a	3,948 (83.80 %)	n/a	n/a	n/a	40.20 (100.00 %)	8 (0.00 %)	8 (0.00 %)	73 (100.00 %)	n/a	115 (0.36 %)	34,309 (17.25 %)	0 (0 %)	285 (0.74 %)	14 (0.15 %)	36 (0.35 %)
1127	Leptospira alstonii serovar Sichuan str. (79601 2013) GCF_000347175.1	n/a	4,101 (85.65 %)	n/a	n/a	n/a	42.48 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	125 (100.00 %)	n/a	105 (0.31 %)	36,409 (17.07 %)	0 (0 %)	129 (0.34 %)	16 (0.22 %)	23 (0.25 %)
1128	Leptospira andrefontaineae (201800301 2019) GCF_004770105.1	n/a	3,961 (91.62 %)	n/a	n/a	n/a	39.93 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	30 (100.00 %)	n/a	33 (0.15 %)	31,701 (14.50 %)	0 (0 %)	205 (0.31 %)	40 (0.37 %)	25 (0.24 %)
1129	Leptospira bandrabouensis (201601109 2019) GCF_004770555.1	n/a	3,930 (92.95 %)	n/a	n/a	n/a	37.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	31 (100.00 %)	n/a	37 (0.05 %)	34,476 (17.58 %)	0 (0 %)	149 (0.21 %)	39 (0.37 %)	25 (0.26 %)
1130	Leptospira barantonii (FH4-C-A1 2017) GCF_002811925.1	n/a	4,051 (91.16 %)	n/a	n/a	n/a	43.96 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	17 (100.00 %)	n/a	45 (0.10 %)	38,525 (18.03 %)	0 (0 %)	65 (0.10 %)	2 (0.11 %)	4 (0.09 %)
1131	Leptospira biflexa serovar strain 'Patoc (Patoc 1 Paris 2008) GCF_000017685.1	n/a	3,725 (93.00 %)	n/a	n/a	n/a	38.89 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	41 (0.06 %)	32,819 (17.62 %)	0 (0 %)	253 (0.45 %)	57 (0.64 %)	44 (0.52 %)
1132	Leptospira borgpetersenii serovar Ceylonica (Piyasena 2018) GCF_003516145.1	n/a	3,491 (82.71 %)	n/a	n/a	n/a	40.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	94 (0.29 %)	32,972 (17.71 %)	0 (0 %)	174 (0.66 %)	4 (0.06 %)	29 (0.38 %)
1133	Leptospira bourretii (201800267 2019) GCF_004770145.1	n/a	3,925 (92.80 %)	n/a	n/a	n/a	38.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	28 (100.00 %)	n/a	44 (0.14 %)	35,124 (17.99 %)	0 (0 %)	230 (0.37 %)	40 (0.37 %)	28 (0.28 %)
1134	Leptospira bouyouniensis (201800295 2019) GCF_004770625.1	n/a	3,840 (92.74 %)	n/a	n/a	n/a	37.10 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	23 (100.00 %)	n/a	48 (0.08 %)	34,160 (17.72 %)	0 (0 %)	42 (0.09 %)	26 (0.33 %)	18 (0.25 %)
1135	Leptospira brenneri (201800277 2019) GCF_004769295.1	n/a	3,663 (93.37 %)	n/a	n/a	n/a	38.46 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14 (100.00 %)	n/a	29 (0.05 %)	32,156 (17.18 %)	0 (0 %)	64 (0.14 %)	30 (0.33 %)	20 (0.25 %)
1136	Leptospira broomii serovar Hurstbridge str. (5399 2013) GCF_000243715.2	n/a	3,965 (88.75 %)	n/a	n/a	n/a	42.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	n/a	61 (0.20 %)	27,922 (12.01 %)	0 (0 %)	111 (0.35 %)	9 (0.06 %)	10 (0.08 %)
1137	Leptospira chreensis (201903075 2021) GCF_016919165.1	n/a	4,188 (93.06 %)	n/a	n/a	n/a	39.77 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	80 (100.00 %)	n/a	50 (0.10 %)	35,979 (16.47 %)	0 (0 %)	101 (0.16 %)	79 (0.53 %)	48 (0.31 %)
1138	Leptospira cinconiae (WS58.C1 2024) GCF_040833995.1	n/a	3,800 (91.12 %)	n/a	n/a	n/a	41.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	61 (0.25 %)	31,019 (14.89 %)	0 (0 %)	307 (0.57 %)	62 (0.64 %)	66 (0.55 %)
1139	Leptospira congkakensis (201702421 2019) GCF_004770265.1	n/a	3,703 (93.00 %)	n/a	n/a	n/a	38.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	24 (100.00 %)	n/a	48 (0.09 %)	33,553 (17.72 %)	0 (0 %)	83 (0.17 %)	25 (0.23 %)	14 (0.16 %)
1140	Leptospira dzoumogneensis (201601113 2019) GCF_004770895.1	n/a	3,810 (91.72 %)	n/a	n/a	n/a	40.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	28 (100.00 %)	n/a	44 (0.12 %)	31,764 (15.17 %)	0 (0 %)	166 (0.39 %)	89 (0.68 %)	57 (0.44 %)
1141	Leptospira ellinghausenii (E18 2018) GCF_003114815.1	n/a	3,957 (92.76 %)	n/a	n/a	n/a	37.35 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	28 (100.00 %)	n/a	46 (0.05 %)	34,431 (17.28 %)	0 (0 %)	175 (0.30 %)	14 (0.18 %)	11 (0.14 %)
1142	Leptospira fainei serovar Hurstbridge str. (BUT 6 2013) GCF_000306235.2	n/a	3,868 (89.56 %)	n/a	n/a	n/a	43.53 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	13 (100.00 %)	n/a	52 (0.16 %)	27,370 (12.02 %)	0 (0 %)	116 (0.25 %)	10 (0.10 %)	10 (0.13 %)
1143	Leptospira fletcheri (SSW15 2019) GCF_004769195.1	n/a	3,429 (91.62 %)	n/a	n/a	n/a	47.35 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14 (100.00 %)	n/a	44 (0.12 %)	28,297 (14.77 %)	0 (0 %)	68 (0.18 %)	5 (0.14 %)	6 (0.13 %)
1144	Leptospira fluminis (SCS5 2019) GCF_004771275.1	n/a	3,438 (92.19 %)	n/a	n/a	n/a	47.70 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	18 (100.00 %)	n/a	32 (0.08 %)	28,752 (15.06 %)	0 (0 %)	72 (0.17 %)	4 (0.26 %)	4 (0.12 %)
1145	Leptospira gomenensis (201800299 2019) GCF_004770155.1	n/a	3,932 (88.37 %)	n/a	n/a	n/a	46.13 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	96 (100.00 %)	n/a	158 (0.47 %)	35,209 (16.86 %)	0 (0 %)	294 (0.64 %)	40 (0.69 %)	34 (0.38 %)
1146	Leptospira haakeii (ATI7-C-A2 2017) GCF_002812225.1	n/a	3,873 (92.13 %)	n/a	n/a	n/a	39.81 (100.00 %)	0 (0 %)	8 (0.00 %)	37 (100.00 %)	n/a	36 (0.11 %)	30,829 (14.47 %)	0 (0 %)	189 (0.34 %)	37 (0.32 %)	26 (0.24 %)
1147	Leptospira harrisiae (FH2-B-A1 2017) GCF_002811945.1	n/a	3,684 (93.50 %)	n/a	n/a	n/a	37.86 (99.99 %)	0 (0 %)	1 (0.01 %)	17 (100.00 %)	n/a	44 (0.06 %)	33,435 (18.04 %)	0 (0 %)	37 (0.08 %)	20 (0.24 %)	16 (0.20 %)
1148	Leptospira hartskeerlii (MCA2-B-A3 2017) GCF_002811475.1	n/a	3,755 (92.32 %)	n/a	n/a	n/a	40.47 (100.00 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	30 (100.00 %)	n/a	43 (0.18 %)	30,024 (14.48 %)	0 (0 %)	117 (0.22 %)	55 (0.54 %)	41 (0.39 %)
1149	Leptospira idonii (201300427 2019) GCF_004770995.1	n/a	3,823 (93.09 %)	n/a	n/a	n/a	41.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	83 (100.00 %)	n/a	39 (0.17 %)	31,508 (15.73 %)	0 (0 %)	107 (0.25 %)	61 (0.48 %)	62 (0.49 %)
1150	Leptospira ilyithenensis (201400974 2019) GCF_004771005.1	n/a	3,974 (92.32 %)	n/a	n/a	n/a	40.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	74 (100.00 %)	n/a	43 (0.21 %)	33,614 (16.63 %)	0 (0 %)	144 (0.44 %)	106 (0.87 %)	84 (0.66 %)
1151	Leptospira inadai serovar Lyme str. (10 2013) GCF_000243675.2	n/a	4,001 (88.47 %)	n/a	n/a	n/a	44.61 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	28 (100.00 %)	n/a	168 (0.75 %)	28,417 (12.44 %)	0 (0 %)	370 (0.89 %)	11 (0.17 %)	10 (0.17 %)
1152	Leptospira interrogans serovar Copenhageni (FDAARGOS_203 2018) GCF_002073495.2	n/a	3,795 (76.38 %)	n/a	n/a	n/a	35.04 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	230 (0.97 %)	44,431 (24.35 %)	0 (0 %)	504 (1.04 %)	18 (0.26 %)	17 (0.25 %)
1153	Leptospira jelokensis (201702419 2019) GCF_004769775.1	n/a	3,839 (92.46 %)	n/a	n/a	n/a	38.90 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	45 (100.00 %)	n/a	42 (0.06 %)	35,532 (18.49 %)	0 (0 %)	159 (0.26 %)	39 (0.41 %)	25 (0.30 %)
1154	Leptospira johnsonii (E8 2018) GCF_003112675.1	n/a	3,783 (92.14 %)	n/a	n/a	n/a	41.26 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	20 (100.00 %)	n/a	32 (0.16 %)	30,291 (14.52 %)	0 (0 %)	120 (0.24 %)	62 (0.60 %)	39 (0.41 %)
1155	Leptospira kanakyensis (201800292 2019) GCF_004769235.1	n/a	3,885 (93.22 %)	n/a	n/a	n/a	38.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	28 (100.00 %)	n/a	50 (0.08 %)	35,195 (18.13 %)	0 (0 %)	90 (0.21 %)	20 (0.20 %)	20 (0.20 %)
1156	Leptospira kemamanensis (201702454 2019) GCF_004769665.1	n/a	3,550 (93.26 %)	n/a	n/a	n/a	38.90 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	52 (100.00 %)	n/a	47 (0.09 %)	31,344 (17.43 %)	0 (0 %)	27 (0.08 %)	28 (0.32 %)	17 (0.24 %)
1157	Leptospira kirschneri serovar Cynopteri str. (3522 CT 2013) GCF_000243695.2	n/a	3,672 (78.13 %)	n/a	n/a	n/a	35.92 (100.00 %)	5 (0.00 %)	5 (0.00 %)	29 (100.00 %)	n/a	192 (0.74 %)	41,523 (23.21 %)	0 (0 %)	471 (1.00 %)	21 (0.21 %)	20 (0.19 %)
1158	Leptospira kmetyi (LS 001/16 2018) GCF_003722295.1	n/a	4,032 (90.14 %)	n/a	n/a	n/a	44.83 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	71 (0.25 %)	40,144 (18.84 %)	0 (0 %)	211 (0.33 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1159	Leptospira kobayashii (E30 2021) GCF_003114835.2	n/a	3,958 (92.76 %)	n/a	n/a	n/a	40.69 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	41 (0.09 %)	33,764 (16.19 %)	0 (0 %)	373 (0.63 %)	107 (0.85 %)	90 (0.73 %)
1160	Leptospira koniambonensis (201800265 2019) GCF_004769555.1	n/a	3,997 (91.61 %)	n/a	n/a	n/a	38.97 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	n/a	48 (0.13 %)	33,271 (15.28 %)	0 (0 %)	254 (0.44 %)	36 (0.28 %)	20 (0.17 %)
1161	Leptospira langatensis (SSW18 2019) GCF_004770615.1	n/a	3,754 (91.63 %)	n/a	n/a	n/a	44.79 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	n/a	33 (0.10 %)	28,769 (13.52 %)	0 (0 %)	104 (0.20 %)	259 (2.26 %)	148 (1.12 %)
1162	Leptospira levettii (MCA2-B-A1 2017) GCF_002812085.1	n/a	3,621 (93.79 %)	n/a	n/a	n/a	37.61 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	14 (100.00 %)	n/a	42 (0.07 %)	31,876 (17.16 %)	0 (0 %)	15 (0.04 %)	13 (0.19 %)	9 (0.13 %)
1163	Leptospira licerasiae (ATCC BAA-1110 2014) GCF_000526875.1	n/a	3,897 (91.77 %)	n/a	n/a	n/a	41.13 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25 (100.00 %)	n/a	47 (0.14 %)	30,634 (14.21 %)	0 (0 %)	98 (0.16 %)	76 (0.57 %)	64 (0.45 %)
1164	Leptospira limi (VSF25 2022) GCF_026151395.1	n/a	3,677 (93.28 %)	n/a	n/a	n/a	37.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	24 (100.00 %)	n/a	51 (0.09 %)	32,582 (17.46 %)	0 (0 %)	119 (0.21 %)	23 (0.26 %)	18 (0.20 %)
1165	Leptospira mayottensis (200901116 2018) GCF_000306675.2	n/a	3,722 (83.79 %)	n/a	n/a	n/a	39.57 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	97 (0.43 %)	34,933 (17.69 %)	0 (0 %)	753 (3.93 %)	29 (0.38 %)	51 (0.69 %)
1166	Leptospira meyeri (DSM 21537 2019) GCF_004368965.1	n/a	3,962 (92.67 %)	n/a	n/a	n/a	38.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16 (100.00 %)	n/a	49 (0.08 %)	35,416 (17.98 %)	0 (0 %)	134 (0.23 %)	45 (0.38 %)	26 (0.24 %)
1167	Leptospira montravelensis (201800278 2019) GCF_004770045.1	n/a	3,756 (93.13 %)	n/a	n/a	n/a	37.48 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	24 (100.00 %)	n/a	39 (0.09 %)	33,864 (17.97 %)	0 (0 %)	81 (0.16 %)	32 (0.33 %)	24 (0.27 %)
1168	Leptospira mtsangambouensis (201601298 2019) GCF_004770475.1	n/a	3,833 (93.17 %)	n/a	n/a	n/a	38.20 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	18 (100.00 %)	n/a	40 (0.07 %)	34,907 (18.41 %)	0 (0 %)	225 (0.33 %)	32 (0.31 %)	16 (0.20 %)
1169	Leptospira neocaledonica (ES4-C-A1 2017) GCF_002812205.1	n/a	3,914 (91.32 %)	n/a	n/a	n/a	40.17 (99.99 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	38 (100.00 %)	n/a	52 (0.16 %)	32,229 (15.15 %)	0 (0 %)	188 (0.41 %)	65 (0.52 %)	50 (0.38 %)
1170	Leptospira noguchii serovar Panama str. (CZ214 2013) GCF_000306255.2	n/a	4,079 (79.24 %)	n/a	n/a	n/a	35.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	35 (100.00 %)	n/a	226 (0.68 %)	45,225 (23.73 %)	0 (0 %)	314 (0.56 %)	20 (0.24 %)	19 (0.22 %)
1171	Leptospira noumeaensis (201800287 2019) GCF_004770765.1	n/a	3,855 (92.80 %)	n/a	n/a	n/a	38.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	40 (100.00 %)	n/a	38 (0.07 %)	35,113 (18.23 %)	0 (0 %)	116 (0.23 %)	35 (0.31 %)	21 (0.20 %)
1172	Leptospira ognonensis (201702476 2019) GCF_004770745.1	n/a	3,747 (93.68 %)	n/a	n/a	n/a	39.66 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	62 (100.00 %)	n/a	36 (0.09 %)	27,969 (14.21 %)	0 (0 %)	97 (0.18 %)	86 (0.82 %)	73 (0.65 %)
1173	Leptospira paudalimensis (VSF14 2022) GCF_026151345.1	n/a	3,767 (93.31 %)	n/a	n/a	n/a	37.42 (99.99 %)	0 (0 %)	3 (0.01 %)	5 (100.00 %)	n/a	50 (0.11 %)	33,762 (17.40 %)	0 (0 %)	247 (0.34 %)	25 (0.32 %)	15 (0.23 %)
1174	Leptospira perdikensis (201702692 2019) GCF_004769575.1	n/a	3,735 (93.38 %)	n/a	n/a	n/a	38.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	21 (100.00 %)	n/a	48 (0.08 %)	32,775 (17.19 %)	0 (0 %)	91 (0.15 %)	32 (0.30 %)	25 (0.25 %)
1175	Leptospira perolatii (FH1-B-B1 2017) GCF_002811875.1	n/a	3,640 (91.12 %)	n/a	n/a	n/a	42.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	49 (100.00 %)	n/a	64 (0.15 %)	24,229 (11.31 %)	0 (0 %)	53 (0.11 %)	111 (1.05 %)	115 (0.94 %)
1176	Leptospira ryugenii (YH101 2018) GCF_003114855.1	n/a	3,729 (93.64 %)	n/a	n/a	n/a	39.92 (99.98 %)	0 (0 %)	3 (0.02 %)	24 (100.00 %)	n/a	47 (0.09 %)	27,737 (14.08 %)	0 (0 %)	90 (0.16 %)	39 (0.43 %)	30 (0.34 %)
1177	Leptospira saintgironsiae (FH4-C-A2 2017) GCF_002811765.1	n/a	3,793 (92.24 %)	n/a	n/a	n/a	39.11 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	42 (100.00 %)	n/a	30 (0.11 %)	30,359 (14.67 %)	0 (0 %)	172 (0.28 %)	28 (0.26 %)	21 (0.20 %)
1178	Leptospira sanjuanensis (LGVF02 2022) GCF_022267325.1	n/a	4,172 (88.78 %)	n/a	n/a	n/a	45.06 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	80 (0.31 %)	36,944 (16.45 %)	0 (0 %)	401 (0.84 %)	0 (0.00 %)	23 (0.11 %)
1179	Leptospira santarosai serovar Shermani str. (LT 821 2014) GCF_000313175.2	n/a	3,660 (84.98 %)	n/a	n/a	n/a	41.82 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	129 (0.49 %)	33,291 (17.61 %)	0 (0 %)	524 (1.32 %)	0 (0.00 %)	7 (0.06 %)
1180	Leptospira sarikeiensis (201702455 2019) GCF_004769615.1	n/a	4,038 (90.91 %)	n/a	n/a	n/a	40.27 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	44 (100.00 %)	n/a	50 (0.20 %)	31,763 (14.10 %)	0 (0 %)	145 (0.27 %)	63 (0.50 %)	45 (0.38 %)
1181	Leptospira selangorensis (SSW17 2019) GCF_004769405.1	n/a	3,891 (92.19 %)	n/a	n/a	n/a	39.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	31 (100.00 %)	n/a	33 (0.11 %)	31,465 (14.80 %)	0 (0 %)	143 (0.24 %)	41 (0.33 %)	28 (0.26 %)
1182	Leptospira semungkisensis (SSS9 2019) GCF_004770055.1	n/a	3,625 (91.90 %)	n/a	n/a	n/a	42.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	26 (100.00 %)	n/a	30 (0.11 %)	26,444 (12.79 %)	0 (0 %)	110 (0.26 %)	124 (1.13 %)	75 (0.60 %)
1183	Leptospira soteropolitanensis (VSF16 2022) GCF_026151335.1	n/a	3,933 (92.14 %)	n/a	n/a	n/a	37.69 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	134 (100.00 %)	n/a	46 (0.11 %)	33,611 (17.23 %)	0 (0 %)	106 (0.20 %)	31 (0.36 %)	17 (0.21 %)
1184	Leptospira sp. patho 1 (ATI7-C-A5 2023) GCF_002811955.2	n/a	4,005 (90.05 %)	n/a	n/a	n/a	47.80 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	68 (100.00 %)	n/a	56 (0.11 %)	34,438 (16.06 %)	0 (0 %)	60 (0.17 %)	16 (0.49 %)	12 (0.17 %)
1185	Leptospira stimsonii (AMB6-RJ 2018) GCF_003545875.1	n/a	4,340 (85.62 %)	n/a	n/a	n/a	42.65 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	23 (100.00 %)	n/a	121 (0.51 %)	40,695 (18.09 %)	0 (0 %)	341 (0.49 %)	22 (0.20 %)	30 (0.24 %)
1186	Leptospira terpstrae serovar Hualin str. ATCC 700639 (LT 11-33 2013) GCF_000332495.1	n/a	3,871 (92.84 %)	n/a	n/a	n/a	38.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	23 (100.00 %)	n/a	38 (0.06 %)	32,875 (16.82 %)	0 (0 %)	218 (0.33 %)	45 (0.43 %)	27 (0.30 %)
1187	Leptospira tipperaryensis (GWTS#1 2016) GCF_001729245.1	n/a	4,157 (87.99 %)	n/a	n/a	n/a	42.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	93 (0.42 %)	40,390 (18.62 %)	0 (0 %)	233 (0.44 %)	0 (0.00 %)	12 (0.07 %)
1188	Leptospira vanthielii (201601955 2019) GCF_004770365.1	n/a	3,835 (92.69 %)	n/a	n/a	n/a	39.05 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	44 (100.00 %)	n/a	40 (0.09 %)	32,685 (16.70 %)	0 (0 %)	211 (0.38 %)	44 (0.38 %)	26 (0.24 %)
1189	Leptospira venezuelensis (CLM-U50 2017) GCF_002150035.1	n/a	4,028 (91.14 %)	n/a	n/a	n/a	39.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	22 (100.00 %)	n/a	47 (0.16 %)	31,562 (14.38 %)	0 (0 %)	211 (0.29 %)	38 (0.35 %)	25 (0.24 %)
1190	Leptospira weilii (CUDO6 2019) GCF_006874765.1	n/a	4,007 (83.41 %)	n/a	n/a	n/a	40.88 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	154 (0.72 %)	34,455 (17.13 %)	0 (0 %)	715 (2.57 %)	2 (0.02 %)	34 (0.48 %)
1191	Leptospira wolbachii serovar Codice str. (CDC 2013) GCF_000332515.2	n/a	3,866 (92.36 %)	n/a	n/a	n/a	39.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25 (100.00 %)	n/a	35 (0.13 %)	31,364 (15.78 %)	0 (0 %)	198 (0.41 %)	58 (0.55 %)	32 (0.37 %)
1192	Leptospira wolffii (201800291 2019) GCF_004770635.1	n/a	3,862 (91.11 %)	n/a	n/a	n/a	45.95 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	20 (100.00 %)	n/a	35 (0.13 %)	29,853 (13.61 %)	0 (0 %)	105 (0.20 %)	7 (0.11 %)	32 (0.27 %)
1193	Leptospira yanagawae (201800272 2019) GCF_004769275.1	n/a	3,698 (93.21 %)	n/a	n/a	n/a	38.26 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	30 (100.00 %)	n/a	46 (0.05 %)	33,564 (17.83 %)	0 (0 %)	38 (0.07 %)	18 (0.19 %)	15 (0.16 %)
1194	Leptospira yasudae (F1 2018) GCF_003545925.1	n/a	4,112 (89.40 %)	n/a	n/a	n/a	45.49 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	25 (100.00 %)	n/a	82 (0.26 %)	36,579 (16.34 %)	0 (0 %)	116 (0.19 %)	15 (0.16 %)	17 (0.16 %)
1195	lettuce downy mildew (SF5 2021 refseq) GCF_004359215.1	9,766 (15.53 %)	n/a	1,244 (0.95 %)	11,020 (19.05 %)	n/a	45.85 (78.52 %)	0 (0 %)	5,655 (21.50 %)	220 (100.00 %)	3,128 (0.14 %)	8,054 (1.08 %)	512,991 (35.78 %)	31 (0.05 %)	45,093 (7.16 %)	7,355 (5.74 %)	3,411 (3.19 %)
1196	Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides (ATCC 8293 2006) GCF_000014445.1	n/a	2,098 (89.65 %)	n/a	n/a	n/a	37.67 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	76 (0.33 %)	11,692 (10.81 %)	0 (0 %)	125 (0.63 %)	7 (0.18 %)	7 (0.18 %)
1197	LI polyomavirus (LIPyV 2017) GCF_002080215.1	n/a	6 (90.04 %)	n/a	n/a	n/a	39.85 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (3.95 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1198	Listeria monocytogenes (EGD-e 2003) GCF_000196035.1	n/a	3,051 (90.82 %)	n/a	n/a	n/a	37.98 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	n/a	68 (0.32 %)	19,806 (13.52 %)	0 (0 %)	93 (0.55 %)	19 (1.30 %)	13 (1.22 %)
1199	liver fluke (2019) GCA_002763495.2	n/a	12,425 (3.75 %)	1,745 (0.12 %)	n/a	n/a	44.06 (94.90 %)	71,429 (5.12 %)	71,429 (5.12 %)	95,033 (94.88 %)	151,386 (0.74 %)	73,685 (0.42 %)	5,305,174 (19.81 %)	520 (0.04 %)	107,472 (1.65 %)	130,208 (6.20 %)	49,609 (1.54 %)
1200	liver fluke (2024) GCA_948099385.2	n/a	914 (0.22 %)	1,862 (0.09 %)	38,773 (3.73 %)	n/a	44.10 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	741 (100.00 %)	273,606 (2.44 %)	176,164 (10.01 %)	5,909,023 (37.92 %)	0 (0 %)	682,539 (5.14 %)	154,761 (8.70 %)	45,735 (1.04 %)
1201	longhorned tick (HaeL-2018 2020) GCA_013339765.2	n/a	25,651 (0.89 %)	3,637 (0.11 %)	126,687 (5.32 %)	n/a	47.39 (99.98 %)	0 (0 %)	5,130 (0.02 %)	3,886 (100.00 %)	828,970 (1.75 %)	670,437 (2.52 %)	12,483,364 (33.26 %)	1 (0.00 %)	629,793 (2.52 %)	111,519 (6.91 %)	340,993 (8.68 %)
1202	Louping ill virus (369/T2 1997) GCF_000863165.1	n/a	1 (94.24 %)	n/a	n/a	n/a	54.86 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.52 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (12.29 %)	3 (12.29 %)
1203	Lyme disease spirochete (Bol26 2009) GCF_000181575.2	n/a	1,355 (90.61 %)	n/a	n/a	n/a	28.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	20 (100.00 %)	n/a	132 (1.33 %)	12,634 (28.57 %)	0 (0 %)	166 (1.31 %)	3 (0.05 %)	3 (0.05 %)
1204	Lymphocytic choriomeningitis mammarenavirus (Armstrong 53b 1993) GCF_000851025.1	n/a	4 (97.52 %)	n/a	n/a	n/a	42.29 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.07 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1205	M.balamuthi (2019) GCA_902651635.1	n/a	n/a	510 (0.53 %)	13,210 (37.00 %)	n/a	60.70 (94.21 %)	0 (0 %)	2,310 (5.79 %)	1,925 (100.00 %)	28,253 (2.58 %)	14,656 (2.04 %)	356,435 (20.80 %)	184 (0.25 %)	16,123 (3.81 %)	2,245 (88.11 %)	2,746 (6.82 %)
1206	M.exilis (PA203 2021 refseq) GCF_001643675.1	18,146 (55.06 %)	n/a	683 (0.51 %)	2,117 (15.55 %)	n/a	37.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	101 (100.00 %)	97,125 (7.68 %)	68,605 (4.60 %)	697,527 (37.16 %)	0 (0 %)	13,975 (1.34 %)	4,795 (3.11 %)	3,582 (2.03 %)
1207	Macaca fascicularis papillomavirus 2 (Mac191 2011) GCF_000892835.1	n/a	7 (91.76 %)	n/a	n/a	n/a	48.74 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.97 %)	2 (1.35 %)	3 (1.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (12.66 %)	2 (11.33 %)
1208	Macaca mulatta papillomavirus 6 (PM084S3_c170482 2019) GCF_004134585.1	n/a	7 (83.26 %)	n/a	n/a	n/a	51.82 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (2.70 %)	1 (0.34 %)	36 (7.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (16.69 %)	2 (16.69 %)
1209	Machupo mammarenavirus (Carvallo 2003) GCF_000853725.1	n/a	4 (94.98 %)	n/a	n/a	n/a	41.77 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.62 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1210	Madariaga virus (MADV/Cebus apella/BRA/BEAN5122/1956 2014) GCF_000917835.1	n/a	2 (95.96 %)	n/a	n/a	n/a	49.14 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.74 %)	1 (1.31 %)	6 (0.83 %)	0 (0 %)	1 (0.62 %)	5 (18.11 %)	5 (18.11 %)
1211	Madariaga virus (PE-3.0815 2023) GCF_002888955.1	n/a	2 (96.12 %)	n/a	n/a	n/a	49.30 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.55 %)	1 (1.31 %)	5 (0.65 %)	0 (0 %)	1 (0.62 %)	5 (17.39 %)	5 (17.39 %)
1212	Madrid virus (BT4075 2017) GCF_002118405.1	n/a	4 (93.18 %)	n/a	n/a	n/a	34.25 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	22 (2.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1213	malaria parasite P. falciparum (7G8 2019) GCA_009761555.1	n/a	n/a	312 (0.86 %)	79 (1.93 %)	n/a	19.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	22 (100.00 %)	79,008 (19.17 %)	76,713 (15.26 %)	184,227 (67.14 %)	0 (0 %)	29,514 (5.59 %)	14 (0.02 %)	7 (0.01 %)
1214	malaria parasite P. falciparum (GB4 2018) GCA_900632035.1	n/a	n/a	314 (0.82 %)	100 (2.24 %)	n/a	19.36 (100.00 %)	0 (0 %)	5 (0.00 %)	26 (100.00 %)	80,382 (19.10 %)	78,725 (15.39 %)	188,385 (66.88 %)	0 (0 %)	31,604 (6.14 %)	25 (0.05 %)	14 (0.02 %)
1215	malaria parasite P. falciparum (HB3 2018) GCA_900631985.1	n/a	n/a	311 (0.86 %)	66 (1.75 %)	n/a	19.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	28 (100.00 %)	78,803 (19.13 %)	77,379 (15.47 %)	184,340 (67.05 %)	0 (0 %)	30,454 (5.88 %)	22 (0.04 %)	10 (0.02 %)
1216	malaria parasite P. falciparum (KH1 2018) GCA_900632025.1	n/a	n/a	316 (0.82 %)	95 (2.13 %)	n/a	19.30 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	22 (100.00 %)	79,322 (18.96 %)	78,032 (15.14 %)	187,535 (66.85 %)	0 (0 %)	29,959 (6.07 %)	23 (0.04 %)	15 (0.02 %)
1217	malaria parasite P. falciparum (KH2 2018) GCA_900632015.1	n/a	n/a	311 (0.84 %)	81 (1.93 %)	n/a	19.29 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	21 (100.00 %)	78,801 (19.09 %)	77,149 (15.35 %)	186,235 (66.99 %)	0 (0 %)	30,779 (6.13 %)	17 (0.02 %)	6 (0.01 %)
1218	malaria parasite P. falciparum (NF135.C10 2019) GCA_009761425.1	n/a	n/a	323 (0.85 %)	97 (2.12 %)	n/a	19.40 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	23 (100.00 %)	79,577 (19.41 %)	78,195 (15.78 %)	187,831 (66.99 %)	0 (0 %)	32,658 (6.13 %)	22 (0.04 %)	9 (0.01 %)
1219	malaria parasite P. falciparum (NF166 2019) GCA_009761515.1	n/a	n/a	318 (0.84 %)	93 (2.11 %)	n/a	19.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	32 (100.00 %)	80,132 (19.18 %)	77,965 (15.47 %)	187,272 (66.93 %)	0 (0 %)	30,982 (6.17 %)	20 (0.03 %)	11 (0.01 %)
1220	malaria parasite P. falciparum (NF54 2019) GCA_009761475.1	n/a	n/a	313 (0.83 %)	94 (2.10 %)	n/a	19.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	30 (100.00 %)	79,940 (19.23 %)	78,008 (15.63 %)	187,730 (67.03 %)	0 (0 %)	31,951 (6.28 %)	22 (0.04 %)	14 (0.02 %)
1221	malaria parasite P. falciparum (PfCD01-2 2018) GCA_900617135.1	n/a	n/a	317 (0.84 %)	91 (2.14 %)	n/a	19.45 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	19 (100.00 %)	80,313 (19.68 %)	79,797 (16.19 %)	188,543 (66.83 %)	0 (0 %)	34,084 (6.53 %)	26 (0.03 %)	13 (0.02 %)
1222	malaria parasite P. falciparum (PfDd2-3 2018) GCA_900632045.1	n/a	n/a	319 (0.86 %)	81 (1.97 %)	n/a	19.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16 (100.00 %)	78,399 (18.94 %)	76,004 (15.02 %)	183,753 (67.14 %)	0 (0 %)	29,483 (5.73 %)	16 (0.03 %)	10 (0.02 %)
1223	malaria parasite P. falciparum (PfGA01-3 2018) GCA_900632005.1	n/a	n/a	315 (0.84 %)	90 (2.14 %)	n/a	19.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	20 (100.00 %)	79,399 (19.15 %)	78,389 (15.55 %)	185,673 (66.81 %)	0 (0 %)	31,109 (6.50 %)	20 (0.04 %)	12 (0.02 %)
1224	malaria parasite P. falciparum (PfGN01-3 2018) GCA_900631995.1	n/a	n/a	312 (0.83 %)	99 (2.34 %)	n/a	19.46 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	19 (100.00 %)	80,380 (19.06 %)	80,145 (15.61 %)	189,223 (66.64 %)	0 (0 %)	31,950 (6.21 %)	35 (0.05 %)	21 (0.03 %)
1225	malaria parasite P. falciparum (PfKE01-3 2018) GCA_900631975.1	n/a	n/a	318 (0.86 %)	82 (2.09 %)	n/a	19.25 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	21 (100.00 %)	78,770 (18.90 %)	77,186 (15.21 %)	184,246 (66.95 %)	0 (0 %)	28,870 (5.76 %)	32 (0.06 %)	12 (0.02 %)
1226	malaria parasite P. falciparum (PfML01-3 2018) GCA_900632085.1	n/a	n/a	326 (0.78 %)	144 (2.55 %)	n/a	19.68 (99.96 %)	0 (0 %)	5 (0.04 %)	117 (100.00 %)	84,773 (19.43 %)	86,243 (16.19 %)	201,753 (66.57 %)	0 (0 %)	36,823 (7.04 %)	36 (0.05 %)	17 (0.03 %)
1227	malaria parasite P. falciparum (PfSD01-3 2018) GCA_900632095.1	n/a	n/a	316 (0.86 %)	76 (1.97 %)	n/a	19.17 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	19 (100.00 %)	78,842 (18.95 %)	77,545 (15.21 %)	183,833 (67.03 %)	0 (0 %)	29,576 (5.95 %)	17 (0.03 %)	12 (0.02 %)
1228	malaria parasite P. falciparum (PfSN01-3 2018) GCA_900632075.1	n/a	n/a	306 (0.81 %)	103 (2.16 %)	n/a	19.38 (100.00 %)	0 (0 %)	7 (0.00 %)	36 (100.00 %)	80,073 (19.04 %)	78,627 (15.40 %)	188,464 (66.75 %)	0 (0 %)	31,264 (6.03 %)	37 (0.06 %)	20 (0.03 %)
1229	malaria parasite P. falciparum (PfTG01-3 2018) GCA_900632065.1	n/a	n/a	315 (0.74 %)	145 (2.84 %)	n/a	19.85 (100.00 %)	0 (0 %)	4 (0.00 %)	79 (100.00 %)	83,325 (18.90 %)	84,484 (15.82 %)	203,716 (66.25 %)	0 (0 %)	35,565 (6.97 %)	50 (0.08 %)	16 (0.02 %)
1230	malaria parasite P. falciparum (type strain: I 2018) GCA_900632055.1	n/a	n/a	313 (0.84 %)	94 (2.02 %)	n/a	19.35 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	27 (100.00 %)	78,887 (19.48 %)	77,343 (15.77 %)	185,847 (66.99 %)	0 (0 %)	32,144 (6.18 %)	21 (0.04 %)	14 (0.02 %)
1231	malaria parasite P. falciparum (v5 3D7 2016 refseq) GCF_000002765.5	5,514 (52.75 %)	n/a	n/a	n/a	n/a	19.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	15 (100.00 %)	n/a	78,154 (15.50 %)	186,910 (66.91 %)	0 (0 %)	31,278 (6.16 %)	22 (0.04 %)	14 (0.02 %)
1232	malaria parasite P. falciparum (v6 3D7 2016) GCF_000002765.6	5,484 (52.74 %)	n/a	322 (0.86 %)	90 (2.05 %)	n/a	19.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14 (100.00 %)	77,341 (16.44 %)	78,057 (15.51 %)	187,098 (66.97 %)	0 (0 %)	31,278 (6.17 %)	22 (0.04 %)	14 (0.02 %)
1233	malaria parasite P. ovale (PocGH01 2016) GCA_900090035.2	n/a	19,693 (39.78 %)	313 (0.56 %)	662 (5.47 %)	n/a	28.56 (99.74 %)	0 (0 %)	894 (0.27 %)	653 (100.00 %)	43,269 (5.87 %)	24,509 (3.67 %)	309,970 (44.17 %)	8 (0.01 %)	5,990 (1.14 %)	465 (0.41 %)	258 (0.21 %)
1234	malaria parasite P. ovale (PowCR01 2016) GCA_900090025.2	n/a	17,512 (41.02 %)	321 (0.58 %)	896 (6.27 %)	n/a	29.25 (99.23 %)	0 (0 %)	1,260 (0.78 %)	779 (100.00 %)	46,689 (6.43 %)	33,024 (5.02 %)	307,550 (43.32 %)	19 (0.03 %)	8,213 (1.48 %)	1,019 (1.02 %)	481 (0.44 %)
1235	malaria parasite P. vivax (Pv01-19 2023) GCA_949152365.1	n/a	17,851 (44.34 %)	405 (0.89 %)	2,167 (19.81 %)	n/a	39.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	28 (100.00 %)	28,638 (4.11 %)	30,969 (5.11 %)	221,613 (31.61 %)	0 (0 %)	3,548 (0.71 %)	4,444 (26.45 %)	4,735 (8.25 %)
1236	malaria parasite P. vivax (PvP01 2019) GCA_900093555.2	n/a	17,755 (44.79 %)	412 (0.92 %)	2,283 (20.08 %)	n/a	39.78 (99.52 %)	0 (0 %)	635 (0.49 %)	242 (100.00 %)	28,802 (4.27 %)	31,393 (5.31 %)	219,328 (31.03 %)	28 (0.04 %)	3,880 (1.35 %)	4,508 (26.34 %)	4,703 (7.97 %)
1237	malaria parasite P. vivax (PvSal1 Salvador I 2009) GCF_000002415.2	5,424 (46.45 %)	n/a	439 (1.05 %)	2,276 (21.52 %)	n/a	42.28 (99.80 %)	16 (0.18 %)	5,134 (0.20 %)	2,764 (99.82 %)	26,547 (4.32 %)	30,383 (5.62 %)	205,833 (26.95 %)	1 (0.00 %)	3,724 (0.77 %)	4,583 (29.15 %)	4,466 (7.82 %)
1238	malaria parasite P. vivax (PvSY56 2018) GCA_003402215.1	n/a	n/a	400 (1.16 %)	2,021 (22.54 %)	n/a	44.06 (92.33 %)	0 (0 %)	7,116 (7.78 %)	14 (100.00 %)	22,210 (4.40 %)	31,764 (5.66 %)	167,076 (23.10 %)	58 (0.05 %)	1,638 (0.49 %)	5,789 (19.98 %)	3,920 (6.76 %)
1239	malaria parasite P. vivax (PvW1 2021) GCA_914969965.1	n/a	19,710 (48.38 %)	411 (0.92 %)	2,235 (20.20 %)	n/a	39.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	19 (100.00 %)	28,140 (4.07 %)	30,815 (5.13 %)	219,282 (31.12 %)	0 (0 %)	3,940 (0.91 %)	4,420 (26.21 %)	4,731 (8.06 %)
1240	Maldonado virus (FMD 0077 2021) GCF_013086435.1	n/a	4 (97.39 %)	n/a	n/a	n/a	39.95 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.84 %)	n/a	7 (1.82 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1241	Mamastrovirus 1 (V1347 2016) GCF_001736695.1	n/a	2 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	44.60 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.68 %)	n/a	6 (1.65 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1242	Mammalian orthoreovirus 3 (MPC/04 2009) GCF_000924315.1	n/a	11 (98.51 %)	n/a	n/a	n/a	47.01 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (0.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (5.61 %)	3 (5.61 %)
1243	Mammalian orthoreovirus 3 (T3D Dearing 2023) GCF_006298385.1	n/a	10 (96.87 %)	n/a	n/a	n/a	46.94 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	24 (1.20 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (4.20 %)	3 (4.20 %)
1244	Mammarenavirus chapareense (810419 2008) GCF_000879235.1	n/a	4 (96.22 %)	n/a	n/a	n/a	40.03 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1245	Mammarenavirus choriomeningitidis (Armstrong 53b 2023) GCF_004789475.1	n/a	4 (95.06 %)	n/a	n/a	n/a	43.03 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (1.05 %)	1 (0.43 %)	3 (1.37 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.40 %)	0 (0.00 %)
1246	Mammarenavirus guanaritoense (INH-95551 2003) GCF_000853765.1	n/a	4 (96.01 %)	n/a	n/a	n/a	40.64 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1247	Mammarenavirus lassaense (Alzey 2016) GCA_900094045.1	n/a	4 (94.91 %)	n/a	n/a	n/a	42.17 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.33 %)	2 (0.37 %)	7 (1.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1248	Mammarenavirus lujoense (2009) GCF_000885555.1	n/a	4 (96.94 %)	n/a	n/a	n/a	42.40 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.40 %)	n/a	7 (0.88 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1249	Maporal virus (HV 97021050 2017) GCF_002145825.3	n/a	3 (92.24 %)	n/a	n/a	n/a	38.51 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.25 %)	1 (0.22 %)	11 (1.32 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1250	Marburg marburgvirus (Marburg virus/H.sapiens-tc/KEN/1980/Mt. Elgon-Musoke 1994) GCF_000857325.2	n/a	7 (98.72 %)	n/a	n/a	n/a	38.29 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (1.05 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1251	Marburg virus - Musoke, Kenya, 1980 (Musoke 2024) GCA_000857325.3	n/a	7 (98.72 %)	n/a	n/a	n/a	38.28 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (1.05 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1252	Marmot norovirus (HT16 2019) GCF_004130475.1	n/a	1 (92.61 %)	n/a	n/a	n/a	55.57 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1253	Mayaro virus (2002) GCF_000863385.1	n/a	5 (96.78 %)	n/a	n/a	n/a	50.37 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.76 %)	n/a	4 (1.59 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (42.02 %)	5 (42.02 %)
1254	Measles morbillivirus (Ichinose-B95a 1998) GCF_000854845.1	n/a	7 (94.55 %)	n/a	n/a	n/a	47.43 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.88 %)	1 (1.81 %)
1255	Menangle virus (Australia/bat/2009/Cedar Grove 2018) GCF_002815295.1	n/a	7 (90.94 %)	n/a	n/a	n/a	42.02 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.41 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1256	Merkel cell polyomavirus (R17b 2008) GCF_000874865.1	n/a	5 (88.06 %)	n/a	n/a	n/a	40.69 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.78 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1257	Methanobrevibacter oralis (YH 2021) GCF_912073625.1	n/a	1,941 (85.54 %)	n/a	n/a	n/a	27.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	14 (100.00 %)	n/a	188 (0.75 %)	17,670 (26.32 %)	0 (0 %)	190 (1.11 %)	4 (0.08 %)	4 (0.08 %)
1258	Methanobrevibacter smithii 35061 (ATCC 35061; PS; DSMZ 861 2007) GCF_000016525.1	n/a	1,812 (90.79 %)	n/a	n/a	n/a	31.03 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	158 (1.46 %)	14,769 (20.66 %)	0 (0 %)	156 (0.96 %)	5 (0.11 %)	4 (0.10 %)
1259	microsporidians A.algerae (PRA109 2014) GCA_000385855.2	n/a	5,330 (22.47 %)	234 (0.75 %)	470 (2.51 %)	n/a	23.21 (78.94 %)	1,290 (21.01 %)	1,290 (21.01 %)	8,403 (78.99 %)	7,186 (2.65 %)	3,183 (0.91 %)	153,237 (36.15 %)	7 (0.10 %)	819 (0.49 %)	2 (0.00 %)	2 (0.00 %)
1260	microsporidians A.algerae (PRA339 2014) GCA_000385875.2	n/a	3,661 (30.10 %)	228 (1.28 %)	512 (5.59 %)	n/a	23.56 (81.30 %)	2,864 (18.79 %)	2,864 (18.79 %)	3,295 (81.21 %)	4,811 (2.53 %)	2,317 (1.29 %)	107,190 (36.02 %)	54 (0.27 %)	5,261 (6.13 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)
1261	microsporidians A.algerae (Undeen 2012) GCA_000313815.1	n/a	n/a	368 (1.28 %)	970 (5.91 %)	n/a	25.44 (99.88 %)	16,513 (0.14 %)	16,513 (0.14 %)	24,940 (99.86 %)	7,194 (3.04 %)	4,375 (1.82 %)	139,372 (39.13 %)	2 (0.00 %)	1,063 (0.50 %)	34 (0.14 %)	33 (0.14 %)
1262	microsporidians A.contejeani (T1 2020) GCA_014805555.1	n/a	2,865 (27.93 %)	352 (2.05 %)	419 (4.76 %)	n/a	26.97 (99.95 %)	0 (0 %)	31 (0.03 %)	1,391 (100.00 %)	4,314 (2.13 %)	1,026 (0.89 %)	110,014 (41.08 %)	19 (0.06 %)	1,232 (0.93 %)	6 (0.01 %)	1 (0.00 %)
1263	microsporidians A.locustae (CLX 2019) GCA_007674295.1	n/a	n/a	381 (6.93 %)	778 (33.56 %)	n/a	41.97 (100.00 %)	0 (0 %)	17 (0.00 %)	18 (100.00 %)	399 (0.77 %)	377 (2.52 %)	14,192 (12.51 %)	10 (0.12 %)	599 (1.63 %)	250 (11.74 %)	230 (9.85 %)
1264	microsporidians A.sp. (WSBS2006 2016) GCA_001875675.1	n/a	3,690 (63.80 %)	311 (3.43 %)	248 (5.31 %)	n/a	50.31 (99.78 %)	0 (0 %)	140 (0.17 %)	1,727 (100.00 %)	617 (0.62 %)	1,875 (4.30 %)	36,301 (18.08 %)	3 (0.01 %)	2,030 (3.53 %)	1,168 (53.29 %)	889 (24.48 %)
1265	microsporidians C.dikerogammari (Dv6 2020) GCA_014805705.1	n/a	4,599 (12.42 %)	106 (0.19 %)	327 (1.11 %)	n/a	26.07 (99.90 %)	192 (0.05 %)	192 (0.05 %)	7,975 (99.95 %)	16,400 (2.85 %)	25,825 (5.37 %)	350,519 (50.32 %)	113 (0.10 %)	5,746 (1.10 %)	9 (0.01 %)	7 (0.01 %)
1266	microsporidians D.muelleri (Ou54 2020) GCA_016256075.1	n/a	6,442 (12.23 %)	213 (0.30 %)	360 (0.88 %)	n/a	26.14 (99.91 %)	180 (0.03 %)	180 (0.03 %)	11,702 (99.97 %)	23,953 (3.29 %)	51,162 (7.21 %)	441,152 (51.53 %)	33 (0.02 %)	7,962 (1.16 %)	24 (0.02 %)	17 (0.01 %)
1267	microsporidians D.roeselum (Ou19 2020) GCA_016255985.1	n/a	1,201 (46.39 %)	159 (3.66 %)	273 (11.90 %)	n/a	35.37 (99.90 %)	0 (0 %)	35 (0.02 %)	1,033 (100.00 %)	425 (0.98 %)	984 (3.23 %)	17,933 (23.59 %)	0 (0 %)	350 (1.12 %)	212 (6.37 %)	201 (6.04 %)
1268	microsporidians E.aedis (USNM 41457 2015) GCA_000230595.3	n/a	4,262 (9.86 %)	232 (0.26 %)	658 (1.54 %)	n/a	22.47 (98.83 %)	0 (0 %)	985 (1.17 %)	1,429 (100.00 %)	28,417 (2.76 %)	5,619 (0.73 %)	581,263 (56.49 %)	14 (0.01 %)	2,006 (0.34 %)	29 (0.04 %)	30 (0.04 %)
1269	microsporidians E.bieneusi (H348 2009 refseq) GCF_000209485.1	3,632 (67.60 %)	n/a	238 (3.03 %)	666 (12.49 %)	n/a	33.70 (99.89 %)	10 (0.03 %)	437 (0.04 %)	1,743 (99.97 %)	1,511 (2.99 %)	268 (0.36 %)	31,900 (26.59 %)	0 (0 %)	57 (0.18 %)	373 (7.62 %)	360 (7.39 %)
1270	microsporidians E.canceri (GB1 2017) GCA_002087915.1	n/a	2,169 (58.64 %)	224 (4.08 %)	1,288 (48.96 %)	n/a	40.15 (99.96 %)	196 (0.01 %)	196 (0.01 %)	733 (99.99 %)	844 (1.72 %)	1,253 (5.65 %)	14,595 (10.49 %)	184 (3.19 %)	587 (4.26 %)	246 (5.86 %)	204 (4.79 %)
1271	microsporidians E.cuniculi (EC1 2011) GCA_000221285.2	n/a	n/a	1,465 (70.32 %)	594 (36.38 %)	n/a	46.90 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	71 (100.00 %)	125 (0.32 %)	76 (0.16 %)	9,240 (7.41 %)	0 (0 %)	17 (0.06 %)	86 (1.93 %)	64 (1.61 %)
1272	microsporidians E.cuniculi (EC2 2011) GCA_000221265.2	n/a	n/a	1,452 (70.15 %)	595 (36.68 %)	n/a	46.85 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	54 (100.00 %)	126 (0.33 %)	74 (0.15 %)	9,085 (7.33 %)	0 (0 %)	19 (0.05 %)	89 (1.85 %)	67 (1.52 %)
1273	microsporidians E.cuniculi (EC3 2011) GCA_000221245.2	n/a	n/a	1,448 (70.47 %)	595 (36.80 %)	n/a	46.83 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	60 (100.00 %)	107 (0.22 %)	62 (0.14 %)	10,269 (8.37 %)	0 (0 %)	6 (0.02 %)	80 (1.58 %)	55 (1.16 %)
1274	microsporidians E.cuniculi (EcunIII-L 2015) GCA_001078035.1	n/a	1,885 (85.85 %)	1,463 (70.48 %)	595 (36.64 %)	n/a	46.92 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	15 (100.00 %)	120 (0.24 %)	56 (0.11 %)	9,401 (7.52 %)	0 (0 %)	10 (0.04 %)	93 (1.97 %)	69 (1.61 %)
1275	microsporidians E.cuniculi (v2 GB-M1 2017) GCF_000091225.2	2,131 (86.51 %)	n/a	1,569 (68.26 %)	597 (33.73 %)	n/a	47.31 (99.97 %)	4 (0.03 %)	4 (0.03 %)	15 (99.97 %)	224 (0.44 %)	199 (0.40 %)	10,819 (8.68 %)	0 (0 %)	168 (0.67 %)	126 (3.52 %)	105 (3.03 %)
1276	microsporidians E.hellem (Swiss 2021) GCA_018342045.1	n/a	2,025 (89.85 %)	1,400 (60.91 %)	749 (46.22 %)	n/a	43.65 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	32 (100.00 %)	198 (0.75 %)	71 (0.15 %)	9,360 (7.61 %)	0 (0 %)	13 (0.04 %)	24 (0.39 %)	15 (0.19 %)
1277	microsporidians E.hellem ATCC 50504 GCF_000277815.2	1,960 (90.46 %)	n/a	1,419 (61.78 %)	759 (47.04 %)	n/a	43.37 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	12 (100.00 %)	193 (1.00 %)	38 (0.09 %)	9,361 (7.58 %)	0 (0 %)	11 (0.04 %)	19 (0.31 %)	13 (0.15 %)
1278	microsporidians E.hepatopenaei (EHP-ID16 2018) GCA_003709115.1	n/a	n/a	168 (3.51 %)	282 (11.21 %)	n/a	25.51 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	162 (100.00 %)	1,711 (5.55 %)	4,566 (7.98 %)	25,083 (45.19 %)	0 (0 %)	746 (1.19 %)	2 (0.09 %)	2 (0.09 %)
1279	microsporidians E.hepatopenaei (TH1 2017) GCA_002081675.1	n/a	2,536 (71.59 %)	171 (3.12 %)	316 (10.76 %)	n/a	25.45 (99.98 %)	0 (0 %)	1 (0.02 %)	62 (100.00 %)	1,763 (3.95 %)	4,773 (6.34 %)	29,813 (44.36 %)	0 (0 %)	445 (1.57 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1280	microsporidians E.intestinalis ATCC 50506 GCF_000146465.1	1,951 (90.34 %)	n/a	1,418 (61.98 %)	633 (39.85 %)	n/a	41.52 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	12 (100.00 %)	188 (0.80 %)	57 (0.10 %)	10,641 (8.83 %)	0 (0 %)	4 (0.02 %)	17 (0.40 %)	17 (0.32 %)
1281	microsporidians E.romaleae SJ-2008 GCF_000280035.1	1,836 (89.04 %)	n/a	1,410 (63.16 %)	772 (48.80 %)	n/a	40.35 (100.00 %)	0 (0 %)	8 (0.00 %)	13 (100.00 %)	119 (0.24 %)	40 (0.20 %)	10,138 (8.38 %)	0 (0 %)	6 (0.12 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1282	microsporidians H.eriocheir (canceri 2017) GCA_002087875.1	n/a	3,052 (40.98 %)	156 (1.55 %)	613 (12.17 %)	n/a	23.16 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	2,344 (100.00 %)	2,272 (2.46 %)	1,380 (1.88 %)	49,500 (39.62 %)	0 (0 %)	444 (0.64 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1283	microsporidians H.eriocheir (GB1 2017) GCA_002087885.1	n/a	2,691 (41.62 %)	164 (1.97 %)	534 (12.53 %)	n/a	22.61 (99.38 %)	0 (0 %)	1,576 (0.70 %)	1,300 (100.00 %)	2,233 (2.73 %)	1,826 (6.14 %)	45,718 (42.56 %)	128 (0.42 %)	3,368 (8.46 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1284	microsporidians H.magnivora (BE-OM-2 2019) GCA_004325065.1	n/a	4,658 (23.67 %)	273 (0.66 %)	365 (1.71 %)	n/a	25.80 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3,550 (100.00 %)	7,913 (2.01 %)	9,660 (3.15 %)	237,840 (44.21 %)	0 (0 %)	2,415 (0.92 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)
1285	microsporidians H.magnivora (IL-BN-2 2019) GCA_004325035.1	n/a	4,180 (24.89 %)	240 (0.73 %)	331 (1.93 %)	n/a	25.74 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3,833 (100.00 %)	6,734 (2.12 %)	8,656 (3.35 %)	197,463 (44.00 %)	0 (0 %)	2,018 (0.87 %)	5 (0.01 %)	5 (0.01 %)
1286	microsporidians H.tvaerminnensis (FI-OER-3-3 2019) GCA_004325045.1	n/a	4,121 (24.63 %)	270 (0.76 %)	462 (2.71 %)	n/a	25.82 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	2,915 (100.00 %)	6,956 (2.04 %)	9,411 (3.55 %)	211,128 (43.72 %)	0 (0 %)	2,526 (1.06 %)	5 (0.01 %)	3 (0.01 %)
1287	microsporidians H.tvaerminnensis (IL-G-3 2019) GCA_004325075.1	n/a	6,203 (26.36 %)	347 (0.72 %)	638 (2.62 %)	n/a	26.14 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	2,738 (100.00 %)	9,609 (2.05 %)	13,094 (3.59 %)	266,734 (42.79 %)	0 (0 %)	4,287 (1.22 %)	8 (0.01 %)	5 (0.01 %)
1288	microsporidians M.daphniae GCF_000760515.2	3,291 (67.45 %)	n/a	580 (6.66 %)	954 (21.41 %)	n/a	43.00 (99.98 %)	299 (0.01 %)	299 (0.01 %)	909 (99.99 %)	646 (0.53 %)	961 (1.03 %)	27,900 (10.39 %)	0 (0 %)	144 (0.26 %)	451 (6.75 %)	351 (4.22 %)
1289	microsporidians N.ausubeli (ERTm2 2012) GCA_000250695.1	n/a	2,831 (65.35 %)	218 (2.88 %)	918 (28.38 %)	n/a	38.34 (98.91 %)	87 (1.09 %)	91 (1.09 %)	289 (98.91 %)	851 (1.00 %)	1,667 (2.31 %)	29,888 (14.30 %)	0 (0 %)	797 (1.75 %)	26 (0.28 %)	17 (0.22 %)
1290	microsporidians N.ausubeli (ERTm6 2014) GCF_000738915.1	2,439 (68.30 %)	n/a	223 (3.17 %)	859 (30.50 %)	n/a	38.30 (98.89 %)	0 (0 %)	33 (1.11 %)	24 (100.00 %)	622 (0.73 %)	1,270 (1.60 %)	27,266 (13.90 %)	7 (0.07 %)	295 (0.73 %)	30 (0.46 %)	22 (0.38 %)
1291	microsporidians N.bombycis (CQ1 2013) GCA_000383075.1	n/a	4,468 (23.27 %)	486 (1.93 %)	941 (6.65 %)	n/a	30.82 (91.53 %)	1,951 (8.50 %)	2,083 (8.50 %)	3,558 (91.50 %)	3,759 (1.33 %)	3,532 (1.64 %)	147,981 (31.13 %)	27 (0.18 %)	4,394 (4.45 %)	184 (1.43 %)	177 (1.41 %)
1292	microsporidians N.ceranae GCF_000988165.1	3,211 (44.18 %)	n/a	339 (3.70 %)	260 (4.85 %)	n/a	25.36 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	536 (100.00 %)	2,166 (1.86 %)	1,165 (1.46 %)	61,165 (40.63 %)	0 (0 %)	388 (0.78 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)
1293	microsporidians N.ceranae (BRL01 2009 refseq) GCF_000182985.1	2,060 (25.73 %)	n/a	348 (2.68 %)	63 (0.61 %)	n/a	25.26 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	5,465 (100.00 %)	3,179 (1.99 %)	1,572 (1.39 %)	85,189 (41.34 %)	0 (0 %)	432 (0.38 %)	4 (0.02 %)	4 (0.02 %)
1294	microsporidians N.displodere (JUm2807 2016 refseq) GCF_001642395.1	2,278 (86.35 %)	n/a	241 (4.60 %)	474 (20.39 %)	n/a	49.23 (99.70 %)	60 (0.30 %)	60 (0.30 %)	102 (99.70 %)	749 (1.26 %)	1,667 (2.21 %)	15,148 (10.04 %)	11 (0.07 %)	246 (0.99 %)	647 (11.65 %)	466 (7.32 %)
1295	microsporidians N.granulosis (Ou3-Ou53 2020) GCA_015832245.1	n/a	3,639 (38.13 %)	508 (3.72 %)	1,125 (15.67 %)	n/a	31.58 (99.69 %)	0 (0 %)	253 (0.28 %)	1,754 (100.00 %)	1,902 (1.14 %)	5,269 (4.71 %)	72,413 (25.92 %)	149 (0.48 %)	3,251 (2.47 %)	12 (0.06 %)	12 (0.06 %)
1296	microsporidians N.major (JUm2507 2022) GCF_021653875.1	2,415 (75.43 %)	n/a	233 (3.57 %)	462 (17.76 %)	n/a	49.02 (99.98 %)	0 (0 %)	10 (0.02 %)	111 (100.00 %)	410 (0.74 %)	1,364 (1.91 %)	19,818 (10.67 %)	1 (0.01 %)	553 (1.12 %)	951 (43.99 %)	839 (16.28 %)
1297	microsporidians N.parisii (ERTm3 2011) GCA_000190615.1	n/a	2,788 (78.30 %)	215 (3.16 %)	720 (24.13 %)	n/a	34.46 (99.37 %)	43 (0.63 %)	43 (0.63 %)	96 (99.37 %)	1,167 (1.96 %)	1,922 (2.62 %)	32,499 (22.16 %)	0 (0 %)	787 (1.68 %)	48 (0.50 %)	47 (0.49 %)
1298	microsporidians N.parisii ERTm1 GCF_000250985.1	2,672 (76.63 %)	n/a	218 (3.21 %)	713 (24.88 %)	n/a	34.42 (98.96 %)	61 (1.04 %)	62 (1.04 %)	126 (98.96 %)	1,146 (1.98 %)	1,929 (2.59 %)	31,259 (21.73 %)	0 (0 %)	785 (1.63 %)	48 (0.52 %)	45 (0.50 %)
1299	microsporidians N.sp. (ERTm5 2016) GCA_001642415.1	n/a	2,709 (72.90 %)	226 (3.03 %)	769 (24.63 %)	n/a	33.50 (99.92 %)	0 (0 %)	37 (0.07 %)	186 (100.00 %)	1,256 (2.02 %)	2,057 (2.65 %)	34,878 (23.38 %)	9 (0.04 %)	766 (1.26 %)	22 (0.45 %)	21 (0.39 %)
1300	microsporidians O.colligata (FI-SK-17-1 2019) GCA_004325055.1	n/a	1,849 (85.23 %)	1,085 (36.85 %)	896 (53.23 %)	n/a	38.51 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	26 (100.00 %)	n/a	185 (0.46 %)	9,996 (7.93 %)	0 (0 %)	18 (0.06 %)	2 (0.04 %)	2 (0.04 %)
1301	microsporidians O.colligata (GB-EP-1 2019) GCA_004324935.1	n/a	1,857 (84.32 %)	1,084 (36.82 %)	909 (53.14 %)	n/a	38.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	18 (100.00 %)	n/a	250 (0.64 %)	9,884 (7.79 %)	0 (0 %)	43 (0.12 %)	2 (0.03 %)	2 (0.03 %)
1302	microsporidians O.colligata (NO-V-7 2019) GCA_004324945.1	n/a	1,862 (83.99 %)	1,095 (36.69 %)	915 (53.09 %)	n/a	38.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	21 (100.00 %)	n/a	234 (0.59 %)	9,284 (7.22 %)	0 (0 %)	29 (0.08 %)	2 (0.03 %)	2 (0.03 %)
1303	microsporidians O.colligata OC4 GCF_000803265.1	1,835 (85.27 %)	n/a	1,087 (37.11 %)	903 (53.32 %)	n/a	38.52 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	16 (100.00 %)	282 (0.70 %)	194 (0.49 %)	9,413 (7.37 %)	0 (0 %)	21 (0.07 %)	2 (0.03 %)	2 (0.03 %)
1304	microsporidians O.pajunii (FI-F-10 2022) GCF_021821965.1	1,831 (87.79 %)	n/a	1,079 (38.28 %)	692 (40.73 %)	n/a	43.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	22 (100.00 %)	171 (0.36 %)	78 (0.16 %)	9,012 (7.00 %)	0 (0 %)	9 (0.03 %)	27 (0.53 %)	18 (0.40 %)
1305	microsporidians P.neurophilia (MK1 2015) GCA_001432165.1	n/a	3,645 (54.94 %)	133 (1.43 %)	586 (13.16 %)	n/a	29.55 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1,603 (100.00 %)	987 (1.12 %)	5,423 (7.08 %)	48,249 (30.41 %)	0 (0 %)	2,342 (2.93 %)	14 (0.18 %)	12 (0.17 %)
1306	microsporidians S.lophii (42_110 2013) GCA_000430065.1	n/a	2,552 (51.07 %)	197 (2.33 %)	286 (6.41 %)	n/a	23.36 (99.95 %)	900 (0.02 %)	900 (0.02 %)	2,292 (99.98 %)	3,494 (4.01 %)	2,146 (2.94 %)	56,311 (48.08 %)	0 (0 %)	419 (0.55 %)	2 (0.01 %)	2 (0.01 %)
1307	microsporidians T.hominis (2013) GCA_000316135.1	n/a	3,253 (36.35 %)	263 (1.93 %)	1,144 (18.74 %)	n/a	34.08 (90.74 %)	1,322 (9.32 %)	1,322 (9.32 %)	1,632 (90.68 %)	1,240 (0.97 %)	2,370 (1.69 %)	60,905 (18.47 %)	0 (0 %)	459 (0.39 %)	319 (3.09 %)	325 (3.07 %)
1308	microsporidians T.ratisbonensis (Franzen 2019) GCA_004000155.1	n/a	3,080 (37.58 %)	207 (1.47 %)	348 (4.44 %)	n/a	23.20 (99.88 %)	0 (0 %)	12,779 (0.31 %)	952 (100.00 %)	4,275 (2.98 %)	3,628 (1.96 %)	82,464 (49.09 %)	0 (0 %)	156 (0.16 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1309	microsporidians V.apis (BRL 01 2013) GCA_000447185.1	n/a	2,764 (26.28 %)	301 (2.11 %)	353 (4.04 %)	n/a	18.78 (99.37 %)	579 (0.65 %)	609 (0.65 %)	1,133 (99.35 %)	4,051 (2.82 %)	8,060 (5.97 %)	70,407 (59.63 %)	0 (0 %)	4,442 (5.78 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1310	microsporidians V.ceranae (BRL 2019) GCA_004919615.1	n/a	2,294 (27.34 %)	367 (2.44 %)	491 (6.13 %)	n/a	27.84 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	110 (100.00 %)	3,455 (2.27 %)	1,584 (1.40 %)	88,723 (39.57 %)	0 (0 %)	1,892 (3.25 %)	46 (5.30 %)	46 (5.30 %)
1311	microsporidians V.corneae ATCC 50505 GCF_000231115.1	2,246 (68.58 %)	n/a	331 (6.49 %)	1,002 (38.96 %)	n/a	36.47 (97.98 %)	94 (2.02 %)	99 (2.02 %)	314 (97.98 %)	253 (0.49 %)	276 (0.62 %)	19,038 (12.70 %)	0 (0 %)	239 (0.80 %)	21 (0.26 %)	22 (0.25 %)
1312	microsporidians V.culicis subsp. floridensis GCF_000192795.1	2,775 (53.76 %)	n/a	270 (2.57 %)	1,321 (29.86 %)	n/a	39.75 (98.61 %)	122 (1.39 %)	137 (1.39 %)	501 (98.61 %)	325 (0.37 %)	1,106 (1.67 %)	27,799 (11.03 %)	0 (0 %)	652 (0.79 %)	263 (3.49 %)	263 (3.35 %)
1313	Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (HCoV-EMC HCoV-EMC/2012 2012) GCF_000901155.1	n/a	12 (97.48 %)	n/a	n/a	n/a	41.24 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.12 %)	n/a	4 (0.14 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1314	Mink calicivirus (MCV-DL/2007/CN 2012) GCF_000901135.1	n/a	3 (95.62 %)	n/a	n/a	n/a	45.47 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.21 %)	n/a	1 (0.21 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1315	mite/tick D.andersoni (qqDerAnde1 alternate hap 2022) GCA_023375915.1	n/a	n/a	3,279 (0.13 %)	115,425 (5.76 %)	n/a	46.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	8,198 (100.00 %)	696,055 (2.02 %)	471,378 (6.82 %)	8,809,430 (37.51 %)	0 (0 %)	842,629 (3.38 %)	161,823 (11.17 %)	192,858 (6.04 %)
1316	mite/tick H.asiaticum (Hyas-2018 2020) GCA_013339685.2	n/a	29,657 (1.66 %)	3,662 (0.17 %)	95,489 (6.14 %)	n/a	46.62 (99.97 %)	0 (0 %)	5,465 (0.03 %)	6,320 (100.00 %)	724,053 (2.01 %)	524,407 (3.24 %)	6,794,646 (33.90 %)	8 (0.00 %)	557,104 (3.85 %)	82,351 (6.19 %)	181,732 (6.63 %)
1317	mite/tick R.annulatus (Klein Grass 2020) GCA_013436015.1	n/a	n/a	3,903 (0.11 %)	138,871 (5.29 %)	n/a	45.72 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16,339 (100.00 %)	1,125,631 (4.27 %)	743,900 (3.59 %)	11,876,998 (39.12 %)	0 (0 %)	1,029,368 (3.55 %)	354,180 (18.10 %)	258,911 (5.53 %)
1318	mite/tick S.scabiei (Arlian Lab 2015) GCA_000828355.1	n/a	10,680 (21.78 %)	1,894 (2.65 %)	2,069 (5.06 %)	n/a	33.26 (99.91 %)	6,720 (0.05 %)	6,724 (0.05 %)	25,580 (99.95 %)	127,779 (8.48 %)	43,804 (3.26 %)	616,763 (41.52 %)	403 (0.10 %)	8,519 (0.99 %)	127 (0.13 %)	98 (0.11 %)
1319	mites & ticks D.andersoni (primary hap 2022) GCF_023375885.1	46,118 (3.04 %)	n/a	3,687 (0.12 %)	132,965 (5.77 %)	44,417 (2.15 %)	46.48 (100.00 %)	0 (0 %)	58 (0.00 %)	3,119 (100.00 %)	785,373 (1.83 %)	539,286 (5.65 %)	10,665,664 (37.28 %)	0 (0 %)	909,259 (3.31 %)	171,266 (10.00 %)	224,252 (5.87 %)
1320	mites & ticks D.silvarum (v2 Dsil-2018 2022) GCF_013339745.2	43,476 (2.68 %)	n/a	3,956 (0.13 %)	128,343 (5.81 %)	n/a	46.91 (99.91 %)	0 (0 %)	13,519 (0.09 %)	1,665 (100.00 %)	965,351 (1.84 %)	642,805 (3.16 %)	10,426,983 (39.18 %)	6 (0.00 %)	813,673 (3.72 %)	37,852 (2.32 %)	244,150 (6.39 %)
1321	mole cricket nematode (FL 2014) GCA_000757745.1	n/a	n/a	4,139 (4.22 %)	22,284 (28.42 %)	n/a	47.98 (99.12 %)	16,684 (0.96 %)	16,684 (0.96 %)	19,548 (99.04 %)	9,708 (0.60 %)	8,286 (1.11 %)	338,840 (9.16 %)	66 (0.01 %)	n/a	5,461 (16.38 %)	4,798 (3.34 %)
1322	Molluscum contagiosum virus subtype 1 (1996) GCF_000843325.1	n/a	163 (85.07 %)	n/a	n/a	n/a	63.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	128 (3.25 %)	92 (4.74 %)	1,361 (17.29 %)	0 (0 %)	82 (1.92 %)	1 (99.95 %)	1 (97.02 %)
1323	monkey B virus (8100812 2023) GCF_018580855.1	n/a	97 (76.06 %)	n/a	n/a	n/a	75.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	167 (5.56 %)	151 (4.68 %)	1,200 (33.97 %)	0 (0 %)	15 (0.82 %)	1 (99.99 %)	1 (0.14 %)
1324	monkey B virus (E2490 2003) GCF_000844145.1	n/a	80 (76.11 %)	n/a	n/a	n/a	74.46 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	139 (4.30 %)	119 (5.55 %)	1,144 (32.51 %)	0 (0 %)	19 (1.04 %)	1 (99.99 %)	6 (1.51 %)
1325	monkey B virus (KQ 2023) GCF_018580865.1	n/a	97 (76.48 %)	n/a	n/a	n/a	75.30 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	135 (4.65 %)	142 (6.00 %)	1,151 (34.13 %)	0 (0 %)	17 (0.85 %)	1 (100.00 %)	2 (0.30 %)
1326	Monkeypox virus (MPXV-M5312_HM12_Rivers 2022) GCF_014621545.1	n/a	179 (83.90 %)	n/a	n/a	n/a	33.03 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	38 (0.78 %)	22 (0.54 %)	1,097 (9.44 %)	0 (0 %)	3 (0.08 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1327	Monkeypox virus (Zaire-96-I-16 2021) GCF_000857045.1	n/a	180 (84.71 %)	n/a	n/a	n/a	33.09 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	37 (0.96 %)	24 (0.57 %)	1,102 (9.51 %)	0 (0 %)	5 (0.16 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1328	Mopeia Lassa virus reassortant 29 (ML29 IGS-15 2004) GCF_000855745.1	n/a	4 (95.68 %)	n/a	n/a	n/a	43.06 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (1.48 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1329	Moraxella catarrhalis (CCRI-195ME 2017) GCF_002080125.1	n/a	1,903 (86.94 %)	n/a	n/a	n/a	41.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	180 (0.50 %)	11,798 (11.28 %)	0 (0 %)	119 (0.73 %)	89 (1.87 %)	68 (1.27 %)
1330	Morganella morganii subsp. morganii (ATCC 25830 2019) GCF_006094455.1	n/a	3,741 (87.60 %)	n/a	n/a	n/a	51.04 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	76 (0.33 %)	18,930 (8.49 %)	0 (0 %)	106 (0.28 %)	1 (99.99 %)	0 (0.00 %)
1331	mosquito A.albimanus (ALBI9_A 2017) GCA_000349125.2	n/a	n/a	5,127 (3.40 %)	21,615 (15.39 %)	n/a	49.21 (94.33 %)	2,660 (5.68 %)	2,660 (5.68 %)	2,861 (94.32 %)	147,470 (3.48 %)	38,292 (0.87 %)	955,773 (15.06 %)	73 (0.09 %)	5,733 (0.49 %)	1,142 (6.40 %)	3,220 (1.00 %)
1332	mosquito A.albimanus (STELCA 2020) GCF_013758885.1	25,523 (22.63 %)	n/a	5,211 (3.30 %)	22,052 (15.12 %)	n/a	48.96 (99.00 %)	0 (0 %)	144 (1.00 %)	7 (100.00 %)	147,275 (3.73 %)	50,051 (2.35 %)	906,231 (16.95 %)	0 (0 %)	34,860 (1.87 %)	222 (0.58 %)	2,192 (0.79 %)
1333	mosquito A.aquasalis (primary hap 2022) GCF_943734665.1	21,677 (19.40 %)	n/a	5,251 (3.23 %)	21,406 (14.50 %)	22,347 (16.66 %)	48.21 (100.00 %)	0 (0 %)	27 (0.00 %)	91 (100.00 %)	151,297 (4.01 %)	40,814 (2.54 %)	1,012,191 (20.42 %)	0 (0 %)	23,442 (2.47 %)	306 (1.80 %)	6,691 (1.88 %)
1334	mosquito A.arabiensis (DONG5_A 2013) GCA_000349185.1	n/a	n/a	5,315 (2.75 %)	26,737 (14.08 %)	n/a	44.68 (85.77 %)	8,965 (14.25 %)	8,965 (14.25 %)	10,179 (85.75 %)	178,571 (6.31 %)	52,684 (1.23 %)	1,349,510 (17.60 %)	216 (0.28 %)	16,543 (1.06 %)	22,709 (9.17 %)	20,142 (5.24 %)
1335	mosquito A.arabiensis (DONGOLA 2021) GCF_016920715.1	28,615 (16.29 %)	n/a	5,492 (2.31 %)	28,067 (13.30 %)	n/a	44.51 (100.00 %)	0 (0 %)	17 (0.00 %)	102 (100.00 %)	203,071 (12.39 %)	64,818 (5.66 %)	1,282,879 (26.03 %)	0 (0 %)	99,230 (6.12 %)	19,321 (9.74 %)	21,320 (5.55 %)
1336	mosquito A.atroparvus (EBRO 2013) GCA_000473505.1	n/a	n/a	5,283 (3.06 %)	32,814 (17.96 %)	n/a	46.35 (84.26 %)	8,509 (15.76 %)	8,509 (15.76 %)	9,880 (84.24 %)	78,736 (2.47 %)	22,823 (0.85 %)	1,103,859 (13.72 %)	540 (0.62 %)	16,229 (1.55 %)	8,438 (3.98 %)	13,223 (3.76 %)
1337	mosquito A.bellator (2023) GCF_943735745.2	14,520 (15.86 %)	n/a	5,202 (3.43 %)	24,763 (16.71 %)	n/a	48.78 (97.90 %)	0 (0 %)	2,062 (2.10 %)	2,734 (100.00 %)	66,337 (1.51 %)	20,847 (0.55 %)	878,206 (14.77 %)	207 (0.06 %)	5,538 (0.39 %)	2,294 (1.96 %)	2,246 (1.25 %)
1338	mosquito A.christyi (ACHKN1017 2013) GCA_000349165.1	n/a	n/a	5,062 (3.03 %)	26,927 (13.40 %)	n/a	42.74 (98.42 %)	1,114 (1.55 %)	1,114 (1.55 %)	31,483 (98.45 %)	100,408 (2.95 %)	22,892 (0.55 %)	1,127,768 (19.31 %)	87 (0.15 %)	2,013 (0.22 %)	27,752 (12.17 %)	17,616 (6.30 %)
1339	mosquito A.coluzzi (MOPTI 2021) GCF_016920705.1	25,264 (14.63 %)	n/a	5,499 (2.18 %)	29,925 (13.15 %)	n/a	44.03 (100.00 %)	0 (0 %)	63 (0.00 %)	200 (100.00 %)	216,751 (13.23 %)	83,570 (8.55 %)	1,227,511 (28.25 %)	0 (0 %)	153,894 (6.41 %)	20,223 (7.37 %)	21,707 (5.48 %)
1340	mosquito A.coluzzii (M 2008) GCA_000150765.1	n/a	n/a	5,071 (2.55 %)	27,856 (13.45 %)	n/a	44.38 (93.39 %)	16,542 (6.63 %)	16,542 (6.63 %)	27,062 (93.37 %)	169,513 (6.55 %)	45,226 (1.10 %)	1,327,687 (19.58 %)	8 (0.00 %)	23,402 (1.30 %)	25,548 (9.86 %)	21,733 (5.97 %)
1341	mosquito A.coluzzii (Ngousso colony 2019) GCA_004136515.2	n/a	n/a	7,498 (2.39 %)	52,281 (20.56 %)	n/a	44.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	206 (73.82 %)	290,871 (11.30 %)	97,683 (2.60 %)	1,645,536 (23.65 %)	0 (0 %)	72,048 (2.86 %)	32,034 (9.89 %)	30,528 (6.12 %)
1342	mosquito A.coluzzii (primary hap 2022) GCF_943734685.1	26,173 (16.50 %)	n/a	5,490 (2.27 %)	29,111 (13.78 %)	n/a	44.33 (100.00 %)	0 (0 %)	35 (0.00 %)	129 (100.00 %)	167,904 (3.53 %)	80,885 (7.40 %)	1,283,919 (26.48 %)	1 (0.00 %)	92,311 (5.09 %)	19,230 (8.35 %)	21,649 (5.67 %)
1343	mosquito A.coustani (2023) GCF_943734705.1	17,108 (11.40 %)	n/a	5,505 (2.21 %)	34,477 (14.46 %)	n/a	43.94 (99.99 %)	0 (0 %)	28 (0.00 %)	419 (100.00 %)	91,434 (2.14 %)	59,796 (16.13 %)	1,147,988 (32.11 %)	0 (0 %)	245,567 (7.25 %)	9,661 (4.30 %)	15,384 (4.15 %)
1344	mosquito A.cruzii (2022) GCF_943734635.1	14,426 (14.26 %)	n/a	5,361 (3.20 %)	27,215 (16.32 %)	18,311 (13.26 %)	48.97 (99.39 %)	0 (0 %)	1,530 (0.60 %)	4,402 (100.00 %)	85,194 (1.69 %)	23,263 (0.75 %)	973,235 (16.28 %)	152 (0.05 %)	16,598 (1.64 %)	3,694 (4.41 %)	2,686 (1.32 %)
1345	mosquito A.culicifacies (species A-37_1 2013) GCA_000473375.1	n/a	n/a	5,215 (2.92 %)	27,726 (13.77 %)	n/a	42.68 (92.20 %)	8,020 (7.80 %)	8,020 (7.80 %)	24,182 (92.20 %)	73,847 (2.29 %)	15,329 (0.41 %)	1,172,483 (17.34 %)	415 (0.26 %)	7,665 (0.65 %)	25,146 (8.86 %)	18,215 (4.91 %)
1346	mosquito A.dirus (WRAIR2 2013) GCA_000349145.1	n/a	n/a	5,296 (2.91 %)	28,476 (15.16 %)	n/a	46.18 (91.43 %)	6,991 (8.58 %)	6,991 (8.58 %)	8,257 (91.42 %)	123,219 (3.51 %)	39,181 (1.00 %)	1,183,932 (16.11 %)	196 (0.15 %)	12,052 (1.00 %)	5,636 (2.83 %)	7,712 (2.60 %)
1347	mosquito A.epiroticus (epiroticus2 2013) GCA_000349105.1	n/a	n/a	5,342 (2.87 %)	25,036 (13.83 %)	n/a	43.95 (90.68 %)	5,120 (9.33 %)	5,120 (9.33 %)	7,793 (90.67 %)	112,430 (4.16 %)	30,317 (0.75 %)	1,285,051 (17.47 %)	143 (0.22 %)	8,617 (0.58 %)	28,220 (11.53 %)	21,658 (5.99 %)
1348	mosquito A.farauti (FAR1 2014) GCA_000473445.2	n/a	n/a	5,280 (3.29 %)	25,449 (15.60 %)	n/a	44.69 (96.03 %)	2,674 (3.98 %)	2,674 (3.98 %)	2,984 (96.02 %)	100,960 (2.62 %)	29,544 (0.69 %)	1,121,554 (18.29 %)	118 (0.17 %)	4,520 (0.47 %)	5,570 (2.58 %)	7,420 (2.42 %)
1349	mosquito A.maculatus (maculatus3 2013) GCA_000473185.1	n/a	n/a	3,871 (2.51 %)	29,500 (14.56 %)	n/a	44.21 (92.86 %)	6,086 (7.09 %)	6,086 (7.09 %)	53,883 (92.91 %)	72,301 (3.58 %)	13,845 (0.58 %)	785,114 (16.02 %)	249 (0.28 %)	2,683 (0.21 %)	29,058 (17.64 %)	17,513 (8.15 %)
1350	mosquito A.maculipalpis (primary hap 2022) GCF_943734695.1	15,159 (10.06 %)	n/a	5,424 (2.64 %)	25,387 (13.64 %)	17,114 (9.96 %)	42.92 (100.00 %)	0 (0 %)	11 (0.00 %)	171 (100.00 %)	102,873 (2.93 %)	38,304 (5.79 %)	1,164,296 (24.56 %)	0 (0 %)	96,776 (3.95 %)	28,055 (10.36 %)	19,292 (4.86 %)
1351	mosquito A.marshallii (primary hap 2022) GCF_943734725.1	12,907 (9.97 %)	n/a	5,366 (2.60 %)	27,505 (14.29 %)	16,541 (9.14 %)	43.29 (100.00 %)	0 (0 %)	16 (0.00 %)	289 (100.00 %)	81,673 (2.34 %)	35,773 (11.05 %)	1,027,565 (26.41 %)	0 (0 %)	101,781 (5.08 %)	15,257 (7.93 %)	16,257 (4.20 %)
1352	mosquito A.melas (CM1001059_A 2014) GCA_000473525.2	n/a	n/a	5,361 (2.63 %)	31,754 (13.09 %)	n/a	44.83 (90.75 %)	9,237 (9.25 %)	9,237 (9.25 %)	29,466 (90.75 %)	173,937 (5.12 %)	56,093 (1.29 %)	1,327,682 (18.51 %)	185 (0.15 %)	6,662 (0.35 %)	39,343 (22.20 %)	24,451 (8.49 %)
1353	mosquito A.merus (MAF 2014) GCA_000473845.2	n/a	n/a	5,304 (2.66 %)	28,321 (14.20 %)	n/a	44.64 (75.46 %)	11,084 (24.55 %)	11,084 (24.55 %)	13,111 (75.45 %)	187,369 (6.94 %)	58,756 (1.16 %)	1,370,791 (15.60 %)	328 (0.32 %)	14,607 (0.84 %)	26,740 (10.02 %)	21,259 (4.79 %)
1354	mosquito A.merus (MAF 2021) GCF_017562075.2	31,068 (14.83 %)	n/a	5,950 (2.16 %)	33,847 (13.99 %)	n/a	44.25 (99.99 %)	0 (0 %)	272 (0.01 %)	1,328 (100.00 %)	238,320 (12.80 %)	95,368 (8.20 %)	1,412,259 (27.02 %)	0 (0 %)	153,586 (5.33 %)	23,957 (9.21 %)	23,125 (5.27 %)
1355	mosquito A.minimus (MINIMUS1 2013) GCA_000349025.1	n/a	n/a	5,292 (3.11 %)	23,555 (14.73 %)	n/a	42.70 (92.39 %)	5,490 (7.62 %)	5,490 (7.62 %)	6,168 (92.38 %)	70,979 (2.53 %)	14,364 (0.53 %)	1,176,757 (17.21 %)	191 (0.13 %)	10,626 (1.15 %)	20,796 (7.26 %)	17,229 (4.70 %)
1356	mosquito A.moucheti (primary hap 2022) GCF_943734755.1	17,184 (11.80 %)	n/a	5,353 (2.17 %)	30,480 (13.42 %)	n/a	43.16 (99.99 %)	0 (0 %)	61 (0.01 %)	345 (100.00 %)	93,414 (2.51 %)	47,713 (21.41 %)	1,008,547 (35.85 %)	2 (0.00 %)	230,455 (8.47 %)	16,069 (11.05 %)	17,879 (4.23 %)
1357	mosquito A.nili (primary hap 2022) GCF_943737925.1	12,802 (12.82 %)	n/a	5,264 (2.95 %)	22,519 (13.62 %)	16,758 (11.40 %)	45.95 (99.98 %)	0 (0 %)	100 (0.02 %)	157 (100.00 %)	86,202 (2.45 %)	46,415 (10.80 %)	886,766 (25.57 %)	0 (0 %)	99,999 (4.98 %)	872 (6.57 %)	935 (0.36 %)
1358	mosquito A.quadriannulatus (QUAD4_A 2013) GCA_000349065.1	n/a	n/a	5,290 (2.76 %)	24,191 (13.08 %)	n/a	44.76 (73.64 %)	14,767 (26.38 %)	14,767 (26.38 %)	17,590 (73.62 %)	178,467 (5.90 %)	53,305 (1.11 %)	1,346,437 (15.19 %)	307 (0.50 %)	19,943 (1.09 %)	26,320 (10.07 %)	20,519 (4.71 %)
1359	mosquito A.sinensis (2014) GCA_000441895.2	n/a	19,352 (10.21 %)	5,309 (2.67 %)	31,996 (15.26 %)	n/a	43.85 (97.19 %)	17,853 (2.84 %)	19,174 (2.84 %)	27,445 (97.16 %)	73,516 (2.14 %)	20,765 (0.72 %)	1,327,566 (18.36 %)	15 (0.00 %)	49,186 (2.77 %)	19,161 (6.60 %)	21,465 (6.15 %)
1360	mosquito A.sinensis (SINENSIS 2014) GCA_000472065.2	n/a	n/a	5,048 (2.73 %)	29,963 (15.52 %)	n/a	43.95 (50.65 %)	20,483 (49.36 %)	20,483 (49.36 %)	30,931 (50.64 %)	66,045 (1.77 %)	17,606 (0.25 %)	1,099,610 (8.93 %)	105 (0.06 %)	25,561 (1.09 %)	26,481 (6.49 %)	22,173 (4.13 %)
1361	mosquito A.ziemanni (2023) GCF_943734765.1	14,634 (9.79 %)	n/a	5,505 (2.21 %)	34,475 (14.46 %)	n/a	43.94 (99.99 %)	0 (0 %)	28 (0.00 %)	419 (100.00 %)	91,434 (2.14 %)	59,796 (16.13 %)	1,147,988 (32.11 %)	0 (0 %)	245,587 (7.25 %)	9,661 (4.30 %)	15,384 (4.15 %)
1362	mosquito S.cyaneus (primary hap 2022) GCF_943734655.1	18,693 (4.82 %)	n/a	5,662 (0.90 %)	42,214 (8.40 %)	n/a	40.04 (100.00 %)	0 (0 %)	59 (0.00 %)	8 (100.00 %)	180,568 (2.80 %)	215,178 (5.85 %)	3,441,334 (47.59 %)	0 (0 %)	242,065 (3.34 %)	57,379 (6.71 %)	27,817 (1.96 %)
1363	mucoromycotan L.corymbifera JMRC:FSU:9682 (FSU 9682 2014) GCA_000723665.1	n/a	13,551 (52.10 %)	1,678 (3.90 %)	6,202 (17.87 %)	n/a	43.43 (92.39 %)	0 (0 %)	394 (7.62 %)	209 (100.00 %)	14,329 (1.80 %)	3,741 (0.73 %)	164,228 (14.59 %)	4 (0.01 %)	2,299 (0.68 %)	1,047 (0.84 %)	409 (0.32 %)
1364	mucoromycotan R.delemar (RA 99-880 2009 refseq) GCF_000149305.1	17,464 (39.67 %)	n/a	2,199 (3.49 %)	9,243 (21.60 %)	n/a	35.59 (98.22 %)	308 (1.79 %)	308 (1.79 %)	391 (98.21 %)	25,104 (2.14 %)	11,249 (1.11 %)	273,686 (22.39 %)	0 (0 %)	5,406 (1.98 %)	900 (1.05 %)	824 (0.95 %)
1365	Mumps orthorubulavirus (Miyahara 2000) GCF_000856685.1	n/a	8 (92.81 %)	n/a	n/a	n/a	42.49 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.24 %)	n/a	10 (0.59 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1366	Mundri virus (A14 2023) GCF_029887105.1	n/a	8 (98.82 %)	n/a	n/a	n/a	40.65 (100.00 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	1 (0.34 %)	14 (1.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1367	Mupapillomavirus 1 (1982) GCF_000866405.1	n/a	7 (86.17 %)	n/a	n/a	n/a	40.28 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.47 %)	1 (0.40 %)	7 (1.87 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.75 %)	1 (2.75 %)
1368	Murray Valley encephalitis virus (1999) GCF_000863565.1	n/a	3 (93.56 %)	n/a	n/a	n/a	48.72 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (1.84 %)	1 (1.84 %)
1369	MW polyomavirus (MA095 2012) GCF_000898335.1	n/a	6 (91.25 %)	n/a	n/a	n/a	36.91 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (4.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1370	Mycobacterium tuberculosis (ASM19595v2 H37Rv 2013) GCF_000195955.2	n/a	3,976 (89.72 %)	n/a	n/a	n/a	65.61 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	1,059 (1.47 %)	34,168 (17.69 %)	0 (0 %)	342 (1.05 %)	1 (100.00 %)	1 (100.00 %)
1371	Mycobacterium tuberculosis (GReAT_CRyPTIC_Unmapped_H37Rv 2023) GCF_963525475.1	n/a	4,211 (91.33 %)	n/a	n/a	n/a	65.60 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	1,114 (1.68 %)	34,720 (17.82 %)	0 (0 %)	409 (1.60 %)	1 (100.00 %)	1 (100.00 %)
1372	Mycobacterium tuberculosis (H37Rv 2013) GCF_000277735.2	n/a	4,169 (91.45 %)	n/a	n/a	n/a	65.62 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	1,067 (1.49 %)	34,174 (17.70 %)	0 (0 %)	341 (1.07 %)	1 (100.00 %)	1 (100.00 %)
1373	Mycobacterium tuberculosis (MTb-Oman-3215873 2023) GCF_030566675.1	n/a	4,498 (89.24 %)	n/a	n/a	n/a	65.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	1,000 (2.30 %)	35,591 (17.10 %)	0 (0 %)	645 (2.40 %)	1 (100.00 %)	1 (99.99 %)
1374	Mycoplasmoides pneumoniae (NCTC10119 2019) GCF_900660465.1	n/a	779 (91.69 %)	n/a	n/a	n/a	39.94 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	44 (0.34 %)	3,912 (8.55 %)	0 (0 %)	136 (1.85 %)	36 (4.74 %)	34 (4.57 %)
1375	Myroides odoratus (FDAARGOS_1131 2021) GCF_016726985.1	n/a	3,796 (87.25 %)	n/a	n/a	n/a	35.87 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	535 (2.11 %)	27,579 (14.14 %)	0 (0 %)	865 (1.94 %)	17 (0.12 %)	17 (0.12 %)
1376	N.gruberi (NEG-M 2010) GCF_000004985.1	15,711 (66.57 %)	n/a	921 (1.63 %)	467 (9.68 %)	n/a	33.15 (88.61 %)	1,193 (11.40 %)	1,410 (11.40 %)	1,977 (88.60 %)	13,215 (2.18 %)	6,408 (1.15 %)	297,345 (20.45 %)	0 (0 %)	4,093 (1.01 %)	16 (0.02 %)	2 (0.01 %)
1377	N.lovaniensis (ATCC 30569 2021) GCF_003324165.1	14,755 (77.18 %)	n/a	935 (2.02 %)	1,327 (22.12 %)	n/a	36.90 (99.99 %)	0 (0 %)	142 (0.01 %)	110 (100.00 %)	8,533 (1.20 %)	3,548 (0.82 %)	230,957 (18.96 %)	2 (0.01 %)	1,911 (0.91 %)	12 (0.02 %)	5 (0.01 %)
1378	N.lovaniensis (NL_76_15_250 2022) GCA_022530875.1	n/a	n/a	1,000 (2.12 %)	1,300 (21.28 %)	n/a	36.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	199 (100.00 %)	9,222 (1.31 %)	3,733 (0.71 %)	203,986 (18.52 %)	0 (0 %)	1,709 (0.84 %)	6 (0.01 %)	3 (0.00 %)
1379	Nairobi sheep disease virus (Jilin 2017) GCF_002117695.1	n/a	3 (97.66 %)	n/a	n/a	n/a	44.18 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	45 (2.54 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1380	Nebraska virus (NB 2002) GCF_000851625.1	n/a	2 (98.09 %)	n/a	n/a	n/a	56.55 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.72 %)	n/a	1 (0.30 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (68.70 %)	2 (68.70 %)
1381	Neisseria gonorrhoeae (TUM19854 2020) GCF_013030075.1	n/a	2,274 (85.91 %)	n/a	n/a	n/a	52.60 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	128 (0.74 %)	14,906 (14.42 %)	0 (0 %)	329 (1.72 %)	2 (99.99 %)	1 (0.01 %)
1382	Neisseria gonorrhoeae (WHO_A 2024 refseq) GCF_040404645.1	n/a	2,426 (85.93 %)	n/a	n/a	n/a	52.06 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	139 (0.64 %)	15,445 (13.99 %)	0 (0 %)	402 (1.72 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
1383	Neisseria gonorrhoeae (WHO_alpha 2024 refseq) GCF_040388595.1	n/a	2,350 (86.00 %)	n/a	n/a	n/a	52.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	116 (0.66 %)	15,390 (14.47 %)	0 (0 %)	393 (1.84 %)	2 (99.98 %)	0 (0.00 %)
1384	Neisseria gonorrhoeae (WHO_B 2024 refseq) GCF_040404575.1	n/a	2,332 (86.14 %)	n/a	n/a	n/a	52.40 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	134 (0.87 %)	15,270 (14.37 %)	0 (0 %)	330 (1.72 %)	2 (99.98 %)	0 (0.00 %)
1385	Neisseria gonorrhoeae (WHO_beta 2024 refseq) GCF_040385865.1	n/a	2,326 (86.06 %)	n/a	n/a	n/a	52.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4 (100.00 %)	n/a	131 (0.65 %)	15,303 (14.51 %)	0 (0 %)	368 (1.81 %)	5 (97.83 %)	5 (0.43 %)
1386	Neisseria gonorrhoeae (WHO_C 2024 refseq) GCF_040404485.1	n/a	2,285 (85.97 %)	n/a	n/a	n/a	52.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	123 (0.65 %)	14,989 (14.49 %)	0 (0 %)	385 (1.82 %)	2 (99.98 %)	0 (0.00 %)
1387	Neisseria gonorrhoeae (WHO_D 2024 refseq) GCF_040404415.1	n/a	2,348 (86.16 %)	n/a	n/a	n/a	52.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	131 (0.74 %)	15,481 (14.65 %)	0 (0 %)	380 (1.81 %)	4 (99.69 %)	2 (0.03 %)
1388	Neisseria gonorrhoeae (WHO_E 2024 refseq) GCF_040404365.1	n/a	2,334 (86.00 %)	n/a	n/a	n/a	52.43 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	143 (0.92 %)	15,265 (14.44 %)	0 (0 %)	355 (1.50 %)	4 (99.77 %)	2 (0.03 %)
1389	Neisseria gonorrhoeae (WHO_F 2024 refseq) GCF_040383235.1	n/a	2,434 (85.90 %)	n/a	n/a	n/a	52.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	131 (0.67 %)	15,297 (14.00 %)	0 (0 %)	397 (1.80 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
1390	Neisseria gonorrhoeae (WHO_G 2024 refseq) GCF_040404335.1	n/a	2,324 (85.93 %)	n/a	n/a	n/a	52.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	127 (0.83 %)	15,199 (14.43 %)	0 (0 %)	347 (1.68 %)	3 (98.10 %)	5 (0.42 %)
1391	Neisseria gonorrhoeae (WHO_H 2024 refseq) GCF_040380425.1	n/a	2,360 (85.94 %)	n/a	n/a	n/a	52.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	130 (0.70 %)	15,319 (14.41 %)	0 (0 %)	367 (1.88 %)	2 (99.98 %)	0 (0.00 %)
1392	Neisseria gonorrhoeae (WHO_I 2024 refseq) GCF_040404325.1	n/a	2,325 (86.05 %)	n/a	n/a	n/a	52.49 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	125 (0.72 %)	15,254 (14.46 %)	0 (0 %)	399 (2.16 %)	4 (99.69 %)	2 (0.03 %)
1393	Neisseria gonorrhoeae (WHO_J 2024 refseq) GCF_040403735.1	n/a	2,282 (85.88 %)	n/a	n/a	n/a	52.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	135 (0.97 %)	15,080 (14.55 %)	0 (0 %)	387 (1.86 %)	4 (99.68 %)	2 (0.03 %)
1394	Neisseria gonorrhoeae (WHO_K 2024 refseq) GCF_040377535.1	n/a	2,274 (85.90 %)	n/a	n/a	n/a	52.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	129 (0.75 %)	14,867 (14.46 %)	0 (0 %)	331 (1.76 %)	2 (99.98 %)	0 (0.00 %)
1395	Neisseria gonorrhoeae (WHO_L 2024 refseq) GCF_040374935.1	n/a	2,329 (86.12 %)	n/a	n/a	n/a	52.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	134 (0.85 %)	15,260 (14.54 %)	0 (0 %)	374 (1.64 %)	4 (99.69 %)	2 (0.03 %)
1396	Neisseria gonorrhoeae (WHO_M 2024 refseq) GCF_040373345.1	n/a	2,347 (85.98 %)	n/a	n/a	n/a	52.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4 (100.00 %)	n/a	119 (0.71 %)	15,493 (14.62 %)	0 (0 %)	387 (1.85 %)	5 (98.02 %)	4 (0.06 %)
1397	Neisseria gonorrhoeae (WHO_N 2024 refseq) GCF_040400385.1	n/a	2,343 (85.86 %)	n/a	n/a	n/a	52.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4 (100.00 %)	n/a	134 (0.90 %)	15,452 (14.62 %)	0 (0 %)	377 (1.84 %)	5 (97.81 %)	7 (0.45 %)
1398	Neisseria gonorrhoeae (WHO_O 2024 refseq) GCF_040373215.1	n/a	2,334 (86.06 %)	n/a	n/a	n/a	52.53 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4 (100.00 %)	n/a	133 (0.68 %)	15,435 (14.63 %)	0 (0 %)	368 (1.77 %)	6 (99.48 %)	4 (0.06 %)
1399	Neisseria gonorrhoeae (WHO_P 2024 refseq) GCF_040373105.1	n/a	2,291 (86.06 %)	n/a	n/a	n/a	52.57 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	120 (0.72 %)	14,923 (14.45 %)	0 (0 %)	378 (1.82 %)	2 (99.98 %)	0 (0.00 %)
1400	Neisseria gonorrhoeae (WHO_Q 2024 refseq) GCF_040373035.1	n/a	2,341 (86.00 %)	n/a	n/a	n/a	52.49 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	131 (0.82 %)	15,467 (14.65 %)	0 (0 %)	379 (1.79 %)	3 (98.11 %)	5 (0.42 %)
1401	Neisseria gonorrhoeae (WHO_R 2024 refseq) GCF_040372445.1	n/a	2,390 (86.18 %)	n/a	n/a	n/a	52.28 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4 (100.00 %)	n/a	127 (0.67 %)	15,528 (14.37 %)	0 (0 %)	363 (1.96 %)	5 (99.39 %)	4 (0.06 %)
1402	Neisseria gonorrhoeae (WHO_S 2024 refseq) GCF_040397295.1	n/a	2,382 (86.13 %)	n/a	n/a	n/a	52.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	135 (0.68 %)	15,683 (14.57 %)	0 (0 %)	421 (1.79 %)	4 (99.70 %)	2 (0.03 %)
1403	Neisseria gonorrhoeae (WHO_S2 2024 refseq) GCF_040371445.1	n/a	2,284 (86.01 %)	n/a	n/a	n/a	52.58 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	129 (0.76 %)	14,709 (14.22 %)	0 (0 %)	336 (1.72 %)	2 (99.98 %)	0 (0.00 %)
1404	Neisseria gonorrhoeae (WHO_T 2024 refseq) GCF_040394165.1	n/a	2,361 (86.13 %)	n/a	n/a	n/a	52.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	128 (0.64 %)	15,052 (13.98 %)	0 (0 %)	315 (1.51 %)	2 (99.98 %)	0 (0.00 %)
1405	Neisseria gonorrhoeae (WHO_U 2024 refseq) GCF_040370845.1	n/a	2,355 (86.07 %)	n/a	n/a	n/a	52.35 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	116 (0.69 %)	15,389 (14.47 %)	0 (0 %)	373 (1.80 %)	2 (99.98 %)	0 (0.00 %)
1406	Neisseria gonorrhoeae (WHO_V 2024 refseq) GCF_040369685.1	n/a	2,363 (85.99 %)	n/a	n/a	n/a	52.33 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	123 (0.56 %)	15,147 (14.27 %)	0 (0 %)	323 (1.72 %)	4 (99.68 %)	2 (0.03 %)
1407	Neisseria gonorrhoeae (WHO_W 2024 refseq) GCF_040391575.1	n/a	2,398 (86.19 %)	n/a	n/a	n/a	52.32 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	129 (0.74 %)	15,512 (14.39 %)	0 (0 %)	327 (1.61 %)	3 (98.27 %)	2 (0.03 %)
1408	Neisseria gonorrhoeae (WHO_X 2024 refseq) GCF_040368535.1	n/a	2,280 (85.80 %)	n/a	n/a	n/a	52.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	122 (0.65 %)	14,942 (14.44 %)	0 (0 %)	325 (1.75 %)	2 (99.98 %)	0 (0.00 %)
1409	Neisseria gonorrhoeae (WHO_Y 2024 refseq) GCF_040367275.1	n/a	2,356 (86.02 %)	n/a	n/a	n/a	52.35 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	127 (0.68 %)	15,235 (14.34 %)	0 (0 %)	357 (1.75 %)	2 (99.98 %)	0 (0.00 %)
1410	Neisseria gonorrhoeae (WHO_Z 2024 refseq) GCF_040366825.1	n/a	2,356 (85.86 %)	n/a	n/a	n/a	52.38 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	135 (0.70 %)	15,307 (14.42 %)	0 (0 %)	356 (1.76 %)	2 (99.98 %)	0 (0.00 %)
1411	Neisseria meningitidis (FAM18 2007) GCF_000009465.1	n/a	2,202 (83.88 %)	n/a	n/a	n/a	51.62 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	222 (1.99 %)	13,283 (14.85 %)	0 (0 %)	996 (3.69 %)	1 (99.97 %)	0 (0.00 %)
1412	Neisseria meningitidis (MC58 2005) GCF_000008805.1	n/a	2,264 (84.01 %)	n/a	n/a	n/a	51.53 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	214 (1.81 %)	14,587 (15.58 %)	0 (0 %)	1,093 (3.78 %)	1 (99.98 %)	0 (0.00 %)
1413	Neisseria meningitidis (PartJ-Nmeningitidis-RM8376 2022) GCF_022869645.1	n/a	2,217 (84.15 %)	n/a	n/a	n/a	51.89 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	197 (1.59 %)	13,580 (15.31 %)	0 (0 %)	944 (3.49 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
1414	Neisseria meningitidis (Z2491 2001 refseq) GCF_000009105.1	n/a	2,208 (83.87 %)	n/a	n/a	n/a	51.81 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	190 (1.51 %)	13,500 (15.34 %)	0 (0 %)	1,006 (3.60 %)	1 (99.91 %)	0 (0.00 %)
1415	nematode A.besseyi (AORJ 2022) GCA_024699835.1	n/a	12,297 (37.42 %)	2,694 (4.46 %)	9,719 (23.84 %)	n/a	41.78 (99.99 %)	0 (0 %)	29 (0.01 %)	32 (100.00 %)	2,498 (0.47 %)	1,619 (0.53 %)	277,708 (13.67 %)	0 (0 %)	3,444 (1.49 %)	20 (0.04 %)	380 (0.32 %)
1416	nematode A.ceylanicum (2013) GCA_000402015.1	n/a	16,205 (5.06 %)	5,366 (1.49 %)	21,638 (7.67 %)	n/a	43.55 (87.10 %)	67,841 (12.97 %)	67,841 (12.97 %)	75,939 (87.03 %)	53,166 (0.79 %)	52,623 (1.20 %)	1,622,944 (20.54 %)	679 (0.15 %)	76,183 (3.05 %)	58,263 (8.33 %)	22,720 (2.64 %)
1417	nematode A.ceylanicum (HY135 2014) GCA_000688135.1	n/a	65,583 (10.31 %)	5,274 (1.50 %)	20,508 (7.91 %)	n/a	43.41 (96.13 %)	0 (0 %)	30,443 (3.89 %)	1,736 (100.00 %)	72,078 (1.33 %)	72,392 (2.51 %)	1,638,078 (21.18 %)	805 (0.14 %)	55,040 (1.95 %)	54,596 (9.32 %)	24,284 (3.20 %)
1418	nematode A.nanus (2018) GCA_900406225.1	n/a	n/a	4,100 (1.22 %)	13,676 (4.61 %)	n/a	35.47 (99.89 %)	21,685 (0.10 %)	21,685 (0.10 %)	52,444 (99.90 %)	54,431 (1.70 %)	198,629 (5.53 %)	1,955,611 (49.06 %)	6,264 (0.55 %)	106,946 (4.15 %)	5,841 (1.11 %)	2,737 (0.69 %)
1419	nematode A.sp. (JU1783 2022) GCA_943334845.2	n/a	13,149 (28.56 %)	4,486 (7.08 %)	2,237 (7.72 %)	n/a	37.14 (90.33 %)	3,945 (9.66 %)	3,945 (9.66 %)	11,456 (90.34 %)	34,212 (2.99 %)	12,101 (1.62 %)	385,610 (19.38 %)	611 (0.88 %)	7,864 (1.05 %)	476 (0.37 %)	328 (0.27 %)
1420	nematode A.viteae (2018) GCA_900537255.1	n/a	10,397 (17.87 %)	2,421 (2.32 %)	3,527 (4.61 %)	n/a	29.92 (99.77 %)	3,735 (0.23 %)	3,735 (0.23 %)	10,531 (99.77 %)	48,514 (3.00 %)	22,818 (1.32 %)	762,901 (37.10 %)	73 (0.01 %)	1,683 (0.18 %)	118 (0.05 %)	94 (0.04 %)
1421	nematode B.listronoti (AAFC-BrLi-01_J3_LR_R9 2022) GCA_024678965.1	n/a	n/a	2,925 (2.78 %)	10,147 (13.97 %)	n/a	33.06 (100.00 %)	9 (0.00 %)	9 (0.00 %)	161 (100.00 %)	49,082 (3.79 %)	45,390 (5.59 %)	652,148 (46.24 %)	0 (0 %)	47,238 (6.90 %)	4,746 (2.79 %)	5,122 (2.57 %)
1422	nematode B.okinawaensis (SH1 SH1 2021) GCA_904066225.2	n/a	94,321 (52.37 %)	3,232 (3.74 %)	9,696 (19.88 %)	n/a	36.17 (100.00 %)	0 (0 %)	4 (0.00 %)	7 (100.00 %)	32,627 (4.34 %)	51,270 (7.10 %)	545,385 (34.32 %)	0 (0 %)	23,272 (1.86 %)	4,325 (2.31 %)	3,611 (1.80 %)
1423	nematode B.pahangi (2018) GCA_900618355.1	n/a	14,674 (17.08 %)	2,560 (2.13 %)	3,350 (4.39 %)	n/a	27.96 (98.58 %)	1,926 (1.40 %)	1,926 (1.40 %)	15,955 (98.60 %)	116,512 (6.32 %)	57,180 (4.60 %)	749,653 (40.86 %)	18 (0.01 %)	24,481 (2.24 %)	114 (0.04 %)	84 (0.02 %)
1424	nematode B.timori (2018) GCA_900618025.1	n/a	16,203 (18.82 %)	1,787 (1.64 %)	5,485 (4.37 %)	n/a	30.18 (98.86 %)	16,893 (1.16 %)	16,893 (1.16 %)	40,856 (98.84 %)	53,497 (3.95 %)	22,151 (1.88 %)	608,924 (35.43 %)	1,849 (0.43 %)	4,297 (0.65 %)	1,275 (1.65 %)	1,259 (1.62 %)
1425	nematode C.angaria (PS1010 2010) GCA_000165025.1	n/a	n/a	7,918 (9.77 %)	11,426 (11.92 %)	n/a	36.31 (94.65 %)	80,201 (5.65 %)	80,201 (5.65 %)	113,760 (94.35 %)	26,575 (1.70 %)	31,032 (5.60 %)	758,497 (35.91 %)	414 (0.04 %)	100,045 (9.93 %)	4,761 (4.80 %)	4,087 (4.41 %)
1426	nematode C.auriculariae (NKZ352 2022) GCA_904845305.1	n/a	189,890 (66.92 %)	6,573 (5.57 %)	10,067 (9.86 %)	n/a	37.99 (100.00 %)	0 (0 %)	13 (0.00 %)	433 (100.00 %)	18,633 (0.85 %)	18,994 (3.01 %)	946,538 (37.62 %)	0 (0 %)	27,190 (2.14 %)	13,740 (4.94 %)	11,045 (3.57 %)
1427	nematode C.becei (QG2083 2019) GCA_900536315.3	n/a	n/a	11,799 (15.44 %)	13,459 (21.93 %)	n/a	42.36 (98.27 %)	2,920 (1.74 %)	2,920 (1.74 %)	4,485 (98.26 %)	28,695 (2.31 %)	27,754 (2.80 %)	535,989 (26.75 %)	28 (0.02 %)	35,077 (3.25 %)	9,530 (6.26 %)	7,933 (4.32 %)
1428	nematode C.bovis (2020) GCA_902829315.1	n/a	15,307 (29.91 %)	8,101 (13.23 %)	8,267 (14.99 %)	n/a	38.15 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	35 (100.00 %)	25,449 (3.60 %)	10,975 (1.94 %)	524,434 (30.32 %)	0 (0 %)	11,086 (2.28 %)	1,907 (1.41 %)	2,375 (1.61 %)
1429	nematode C.briggsae (AF16 CB4 2014) GCF_000004555.2	21,982 (24.79 %)	n/a	12,094 (12.65 %)	7,779 (12.84 %)	n/a	37.36 (97.28 %)	4,704 (2.74 %)	6,357 (2.74 %)	5,604 (97.26 %)	125,817 (20.00 %)	45,386 (4.22 %)	820,395 (35.43 %)	86 (0.06 %)	36,647 (4.00 %)	4,886 (1.66 %)	2,965 (0.93 %)
1430	nematode C.briggsae (QX1410_ONT 2022) GCA_021491975.1	n/a	29,683 (26.69 %)	12,605 (13.72 %)	7,573 (12.95 %)	n/a	37.34 (100.00 %)	0 (0 %)	7 (0.00 %)	7 (100.00 %)	32,811 (2.90 %)	46,159 (5.92 %)	811,984 (37.75 %)	0 (0 %)	39,786 (3.28 %)	4,928 (1.76 %)	2,980 (0.95 %)
1431	nematode C.elegans (Bristol N2 2013) GCA_000002985.3	n/a	47,061 (33.49 %)	18,986 (22.59 %)	6,524 (12.56 %)	n/a	35.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,267 (100.00 %)	77,785 (12.31 %)	39,099 (4.37 %)	797,382 (36.72 %)	0 (0 %)	33,815 (2.88 %)	3,706 (1.40 %)	2,759 (0.98 %)
1432	nematode C.goldi (2018) GCA_900617965.1	n/a	13,906 (4.71 %)	2,123 (0.56 %)	11,859 (2.46 %)	n/a	40.23 (95.10 %)	81,110 (4.91 %)	81,110 (4.91 %)	235,619 (95.09 %)	17,731 (0.47 %)	18,632 (0.73 %)	1,126,310 (18.11 %)	18 (0.00 %)	n/a	11,654 (2.27 %)	6,144 (1.13 %)
1433	nematode C.japonica (DF5081 2010) GCA_000147155.1	n/a	n/a	11,794 (7.90 %)	18,412 (11.57 %)	n/a	39.22 (92.68 %)	17,114 (7.34 %)	17,114 (7.34 %)	35,931 (92.66 %)	73,240 (4.17 %)	95,287 (4.76 %)	1,023,418 (43.25 %)	16 (0.00 %)	66,567 (3.41 %)	13,090 (3.55 %)	10,772 (2.77 %)
1434	nematode C.johnstoni (2021) GCA_916381525.1	n/a	11,712 (18.12 %)	2,442 (2.49 %)	2,357 (4.91 %)	n/a	29.57 (99.99 %)	0 (0 %)	414 (0.01 %)	2,092 (100.00 %)	56,604 (3.95 %)	45,223 (4.00 %)	719,820 (37.93 %)	267 (0.10 %)	10,960 (1.17 %)	92 (0.03 %)	78 (0.03 %)
1435	nematode C.latens (PX534 2023) GCA_002259235.3	n/a	n/a	13,092 (12.67 %)	9,775 (15.04 %)	n/a	38.53 (99.99 %)	0 (0 %)	66 (0.01 %)	38 (100.00 %)	41,576 (2.66 %)	32,227 (6.01 %)	889,562 (30.76 %)	3 (0.00 %)	57,202 (5.20 %)	5,270 (1.75 %)	3,532 (1.04 %)
1436	nematode C.nassatus (Nouzilly 2023) GCA_958299035.1	n/a	22,717 (5.71 %)	5,560 (0.91 %)	22,696 (6.22 %)	n/a	41.47 (99.85 %)	1,757 (0.15 %)	1,757 (0.15 %)	2,126 (99.85 %)	91,412 (0.92 %)	136,779 (6.16 %)	2,774,324 (35.99 %)	2 (0.00 %)	155,083 (3.47 %)	55,889 (7.54 %)	15,029 (1.48 %)
1437	nematode C.nigoni (JU1422 2017) GCA_002742825.1	n/a	44,605 (25.87 %)	12,849 (11.40 %)	9,560 (13.46 %)	n/a	37.75 (99.96 %)	0 (0 %)	58 (0.04 %)	155 (100.00 %)	40,381 (3.50 %)	59,631 (7.86 %)	986,989 (37.18 %)	0 (0 %)	82,943 (5.20 %)	6,214 (1.99 %)	3,546 (0.94 %)
1438	nematode C.panamensis (QG2080 2018) GCA_900536275.1	n/a	n/a	11,881 (17.21 %)	11,305 (22.10 %)	n/a	42.12 (98.84 %)	0 (0 %)	1,928 (1.16 %)	986 (100.00 %)	25,748 (2.02 %)	16,275 (2.53 %)	508,095 (22.63 %)	23 (0.01 %)	24,055 (2.42 %)	9,111 (6.36 %)	7,051 (4.05 %)
1439	nematode C.remanei (PX356 2023) GCA_001643735.4	n/a	n/a	13,146 (12.29 %)	9,539 (14.62 %)	n/a	37.96 (100.00 %)	0 (0 %)	70 (0.01 %)	17 (100.00 %)	34,167 (1.31 %)	38,318 (4.10 %)	947,145 (30.81 %)	1 (0.00 %)	63,346 (4.98 %)	5,048 (1.61 %)	3,288 (0.94 %)
1440	nematode C.remanei (PX439 2023) GCA_002259225.3	n/a	n/a	13,123 (11.59 %)	10,367 (14.71 %)	n/a	37.96 (100.00 %)	1 (0.00 %)	49 (0.00 %)	18 (100.00 %)	35,517 (1.34 %)	43,304 (5.84 %)	966,059 (32.06 %)	3 (0.00 %)	72,335 (5.51 %)	5,281 (1.57 %)	3,510 (0.96 %)
1441	nematode C.remanei (PX506 2020 genbank) GCA_010183535.1	n/a	26,332 (22.32 %)	13,226 (11.74 %)	10,322 (14.72 %)	n/a	38.00 (100.00 %)	0 (0 %)	64 (0.00 %)	187 (100.00 %)	38,474 (2.32 %)	41,114 (4.72 %)	980,237 (31.17 %)	0 (0 %)	71,359 (5.58 %)	5,310 (1.60 %)	3,482 (0.99 %)
1442	nematode C.sp. 21 LS-2015 (NIC534 2019) GCA_900536235.3	n/a	n/a	6,225 (6.02 %)	10,055 (11.68 %)	n/a	39.30 (98.92 %)	10,236 (1.11 %)	10,236 (1.11 %)	15,952 (98.89 %)	47,667 (3.66 %)	62,815 (6.44 %)	594,053 (30.73 %)	101 (0.02 %)	56,301 (3.98 %)	5,806 (2.34 %)	3,471 (1.31 %)
1443	nematode C.sp. 26 LS-2015 (JU2190 2019) GCA_900536285.3	n/a	n/a	12,828 (14.52 %)	11,027 (15.04 %)	n/a	38.31 (99.79 %)	2,723 (0.22 %)	2,723 (0.22 %)	5,850 (99.78 %)	26,937 (1.47 %)	51,950 (4.58 %)	784,101 (33.73 %)	68 (0.02 %)	35,515 (2.53 %)	6,406 (2.72 %)	4,692 (1.87 %)
1444	nematode C.sp. 31 LS-2015 (JU2585 2019) GCA_900536295.3	n/a	n/a	9,374 (9.33 %)	6,393 (10.75 %)	n/a	36.01 (99.02 %)	5,722 (0.99 %)	5,722 (0.99 %)	8,944 (99.01 %)	34,176 (2.05 %)	31,341 (3.68 %)	844,910 (27.88 %)	163 (0.04 %)	50,447 (3.60 %)	1,735 (0.54 %)	1,172 (0.34 %)
1445	nematode C.sp. 32 LS-2015 (JU2788 2019) GCA_900536325.3	n/a	n/a	11,436 (19.84 %)	13,657 (25.48 %)	n/a	46.42 (99.43 %)	4,831 (0.59 %)	4,831 (0.59 %)	6,875 (99.41 %)	40,402 (2.72 %)	28,001 (3.67 %)	457,332 (24.14 %)	465 (0.16 %)	24,878 (3.11 %)	2,772 (8.60 %)	3,437 (2.65 %)
1446	nematode C.sp. 38 MB-2015 (JU2809 2019) GCA_900536415.3	n/a	n/a	8,932 (9.08 %)	7,337 (11.69 %)	n/a	34.81 (99.91 %)	3,054 (0.09 %)	3,054 (0.09 %)	7,944 (99.91 %)	35,563 (1.74 %)	36,586 (5.61 %)	869,172 (35.49 %)	440 (0.18 %)	56,174 (5.32 %)	3,759 (1.30 %)	2,296 (0.79 %)
1447	nematode C.sp. 39 LS-2015 (NIC564 2019) GCA_900536345.3	n/a	n/a	12,820 (14.59 %)	21,599 (20.44 %)	n/a	41.91 (98.71 %)	6,554 (1.27 %)	6,554 (1.27 %)	27,757 (98.73 %)	47,847 (2.36 %)	27,463 (2.10 %)	591,878 (28.20 %)	3,809 (1.24 %)	19,455 (2.21 %)	13,679 (7.46 %)	9,673 (4.34 %)
1448	nematode C.sp. 40 LS-2015 (JU2818 2019) GCA_900536305.3	n/a	n/a	12,802 (14.50 %)	13,637 (19.18 %)	n/a	41.51 (99.85 %)	3,743 (0.15 %)	3,743 (0.15 %)	7,019 (99.85 %)	27,878 (1.33 %)	29,791 (3.41 %)	731,525 (25.31 %)	588 (0.10 %)	44,264 (3.81 %)	9,732 (4.98 %)	7,329 (3.17 %)
1449	nematode C.tropicalis (JU1373 2011) GCA_000186765.1	n/a	n/a	12,546 (18.22 %)	5,870 (14.18 %)	n/a	37.73 (96.47 %)	6,244 (3.56 %)	6,244 (3.56 %)	6,909 (96.44 %)	29,313 (1.79 %)	23,383 (1.92 %)	654,646 (28.08 %)	4 (0.00 %)	16,576 (1.73 %)	2,928 (1.60 %)	1,971 (1.00 %)
1450	nematode D.destructor (Dd01 2016) GCA_001579705.1	n/a	n/a	2,761 (1.93 %)	8,951 (10.34 %)	n/a	36.84 (97.93 %)	0 (0 %)	5,661 (2.08 %)	1,761 (100.00 %)	18,643 (0.89 %)	39,329 (3.02 %)	772,209 (27.82 %)	183 (0.14 %)	23,514 (3.34 %)	7,097 (2.24 %)	3,291 (0.89 %)
1451	nematode D.dipsaci (pooled J2 2019) GCA_004194705.1	n/a	n/a	3,133 (0.95 %)	8,230 (4.45 %)	n/a	37.50 (100.00 %)	0 (0 %)	237 (0.00 %)	1,394 (100.00 %)	56,991 (1.38 %)	193,789 (5.13 %)	1,794,181 (40.17 %)	0 (0 %)	79,543 (3.87 %)	5,340 (0.84 %)	1,442 (0.23 %)
1452	nematode D.pachys (PF1309 2017) GCA_002287525.1	n/a	38,423 (27.86 %)	7,603 (4.26 %)	21,351 (14.67 %)	n/a	38.20 (99.24 %)	9,352 (0.77 %)	9,352 (0.77 %)	20,127 (99.23 %)	37,374 (1.04 %)	6,953 (0.31 %)	1,221,903 (26.75 %)	14 (0.00 %)	8,975 (0.57 %)	10,423 (5.00 %)	9,135 (4.59 %)
1453	nematode E.elaphi (2013) GCA_000499685.1	n/a	n/a	75 (3.06 %)	824 (80.51 %)	n/a	56.60 (99.85 %)	20 (0.15 %)	20 (0.15 %)	21 (99.85 %)	42 (0.13 %)	16 (0.04 %)	5,024 (5.77 %)	0 (0 %)	3 (0.04 %)	1 (100.00 %)	1 (100.00 %)
1454	nematode E.sp. (ZAB3_2 2023) GCA_030247985.1	n/a	n/a	3,556 (1.42 %)	25,292 (17.47 %)	n/a	45.88 (99.99 %)	30 (0.00 %)	30 (0.00 %)	7,810 (100.00 %)	93,312 (3.21 %)	109,272 (4.84 %)	833,942 (33.76 %)	0 (0 %)	84,436 (4.57 %)	28,849 (17.38 %)	25,132 (7.46 %)
1455	nematode G.pallida (D383 2021) GCA_020449905.1	n/a	n/a	2,305 (1.50 %)	8,718 (9.98 %)	n/a	37.17 (99.20 %)	0 (0 %)	22,788 (0.83 %)	163 (100.00 %)	73,249 (3.24 %)	67,667 (8.48 %)	888,529 (41.70 %)	111 (0.03 %)	105,938 (9.09 %)	10,609 (7.24 %)	7,154 (3.39 %)
1456	nematode G.pallida (Lindley 2014) GCA_000724045.1	n/a	n/a	2,055 (1.40 %)	10,664 (9.72 %)	n/a	36.74 (83.86 %)	11,541 (16.16 %)	24,207 (16.17 %)	18,405 (83.84 %)	62,298 (3.04 %)	49,009 (3.41 %)	869,340 (34.26 %)	131 (0.06 %)	69,663 (7.05 %)	10,838 (5.80 %)	7,309 (2.86 %)
1457	nematode G.pallida (Newton 2022) GCA_023343765.1	n/a	8,217 (9.27 %)	2,278 (1.42 %)	9,072 (9.40 %)	n/a	36.53 (98.97 %)	0 (0 %)	543 (1.03 %)	173 (100.00 %)	76,672 (3.05 %)	66,745 (6.40 %)	976,675 (42.73 %)	0 (0 %)	87,417 (7.78 %)	10,526 (6.26 %)	7,041 (3.07 %)
1458	nematode G.pulchrum (2018) GCA_900617915.1	n/a	27,158 (4.95 %)	2,389 (0.39 %)	19,632 (3.00 %)	n/a	41.52 (93.93 %)	152,182 (6.18 %)	152,182 (6.18 %)	280,583 (93.82 %)	139,151 (2.36 %)	134,471 (5.31 %)	2,087,168 (33.59 %)	2,962 (0.13 %)	n/a	26,382 (3.08 %)	7,838 (0.88 %)
1459	nematode G.rostochiensis (Ro1 2016) GCA_900079975.1	n/a	n/a	2,245 (1.83 %)	9,548 (10.92 %)	n/a	38.15 (95.47 %)	0 (0 %)	29,434 (4.61 %)	4,281 (100.00 %)	51,400 (2.65 %)	53,310 (6.01 %)	753,497 (37.10 %)	355 (0.25 %)	84,178 (11.06 %)	9,995 (6.83 %)	6,782 (3.56 %)
1460	nematode G.rostochiensis (Ro5 L22 2021) GCA_018350315.1	n/a	n/a	2,312 (1.68 %)	8,672 (10.80 %)	n/a	38.32 (99.65 %)	0 (0 %)	4,517 (0.36 %)	135 (100.00 %)	57,654 (2.98 %)	70,214 (9.61 %)	785,395 (40.20 %)	13 (0.01 %)	90,781 (9.64 %)	9,873 (7.76 %)	6,955 (3.71 %)
1461	nematode H.bacteriophora (M31e 2011) GCA_000223415.1	n/a	n/a	5,122 (6.00 %)	2,725 (6.48 %)	n/a	33.31 (96.60 %)	722 (3.40 %)	722 (3.40 %)	1,962 (96.60 %)	15,525 (1.32 %)	3,950 (0.48 %)	605,917 (23.62 %)	3 (0.00 %)	3,292 (0.85 %)	1,042 (0.57 %)	565 (0.39 %)
1462	nematode H.mephisto (m2B 2019) GCA_009193035.1	n/a	n/a	3,390 (4.59 %)	5,134 (16.22 %)	n/a	32.12 (100.00 %)	0 (0 %)	10 (0.00 %)	877 (100.00 %)	18,995 (1.83 %)	98,730 (13.73 %)	437,686 (40.62 %)	0 (0 %)	54,509 (6.49 %)	1,690 (1.19 %)	1,434 (0.98 %)
1463	nematode H.placei (MHpl1 2018) GCA_900617895.1	n/a	21,928 (7.42 %)	4,755 (1.50 %)	19,159 (6.74 %)	n/a	42.83 (95.74 %)	40,367 (4.27 %)	40,367 (4.27 %)	65,290 (95.73 %)	46,325 (0.86 %)	33,063 (1.34 %)	1,240,869 (15.70 %)	714 (0.11 %)	25,095 (1.16 %)	26,861 (4.50 %)	11,656 (1.81 %)
1464	nematode H.polygyrus bakeri (2016) GCA_900096555.1	n/a	n/a	5,201 (0.62 %)	39,204 (5.45 %)	n/a	45.64 (99.37 %)	39,371 (0.65 %)	39,371 (0.65 %)	63,018 (99.35 %)	153,820 (1.05 %)	155,623 (2.24 %)	3,885,378 (36.72 %)	38 (0.00 %)	315,960 (4.61 %)	116,499 (14.27 %)	69,436 (5.13 %)
1465	nematode H.schachtii (Bonn 2022) GCA_023374025.1	n/a	n/a	2,262 (0.96 %)	10,323 (7.90 %)	n/a	33.23 (97.25 %)	0 (0 %)	1,399 (2.76 %)	395 (100.00 %)	139,348 (4.30 %)	101,340 (5.90 %)	1,424,347 (50.41 %)	0 (0 %)	105,672 (7.17 %)	15,366 (5.19 %)	9,584 (2.60 %)
1466	nematode H.schachtii (IRS 2021) GCA_020449115.1	n/a	n/a	2,344 (0.93 %)	11,250 (7.33 %)	n/a	32.22 (98.33 %)	0 (0 %)	517,260 (2.25 %)	705 (100.00 %)	149,709 (4.61 %)	108,366 (6.15 %)	1,611,016 (50.54 %)	0 (0 %)	118,637 (7.06 %)	15,570 (5.04 %)	10,373 (2.71 %)
1467	nematode H.sp. (NKZ332 2019) GCA_009761265.1	n/a	10,997 (35.16 %)	3,538 (6.22 %)	7,064 (23.00 %)	n/a	36.98 (99.39 %)	1,003 (0.60 %)	1,003 (0.60 %)	6,087 (99.40 %)	9,162 (1.04 %)	7,339 (1.02 %)	347,897 (24.45 %)	39 (0.02 %)	3,643 (0.72 %)	2,163 (2.00 %)	1,976 (1.70 %)
1468	nematode K.luziae (NKZ323 2020) GCA_014805365.1	n/a	n/a	1,878 (0.64 %)	36,665 (8.24 %)	n/a	41.34 (99.80 %)	5,419 (0.12 %)	5,419 (0.12 %)	88,751 (99.88 %)	40,506 (1.01 %)	36,401 (1.04 %)	1,214,917 (29.87 %)	355 (0.05 %)	7,342 (0.36 %)	21,744 (4.85 %)	13,259 (2.65 %)
1469	nematode L.sigmodontis (2018) GCA_900537275.1	n/a	10,246 (21.24 %)	2,470 (2.97 %)	3,322 (6.60 %)	n/a	34.07 (98.53 %)	0 (0 %)	13,720 (1.54 %)	3,165 (100.00 %)	37,692 (2.61 %)	15,514 (0.95 %)	554,056 (27.79 %)	32 (0.01 %)	761 (0.10 %)	549 (0.27 %)	372 (0.17 %)
1470	nematode M.arenaria (A2-O Okinawa_01 2018) GCA_003133805.1	n/a	n/a	4,565 (1.11 %)	4,373 (2.76 %)	n/a	30.01 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2,224 (100.00 %)	193,518 (3.62 %)	212,997 (7.30 %)	2,452,569 (50.66 %)	0 (0 %)	137,976 (6.78 %)	4,414 (0.79 %)	1,641 (0.19 %)
1471	nematode M.belari (JU2817 2023) GCA_958450365.1	n/a	23,226 (12.96 %)	4,572 (1.70 %)	11,191 (6.76 %)	n/a	37.19 (99.93 %)	9 (0.07 %)	9 (0.07 %)	948 (99.93 %)	118,121 (4.30 %)	263,740 (10.41 %)	1,529,419 (35.79 %)	0 (0 %)	228,292 (8.20 %)	6,955 (1.54 %)	3,122 (0.67 %)
1472	nematode M.chitwoodi (Roza 2020) GCA_015183025.1	n/a	n/a	1,476 (2.17 %)	462 (2.57 %)	n/a	24.84 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	38 (100.00 %)	57,348 (5.81 %)	43,409 (7.24 %)	390,052 (58.53 %)	0 (0 %)	14,017 (2.99 %)	325 (0.29 %)	123 (0.07 %)
1473	nematode M.floridensis (2014) GCA_000751915.1	n/a	n/a	1,406 (0.73 %)	1,679 (0.80 %)	n/a	29.57 (98.28 %)	57,631 (1.84 %)	57,631 (1.84 %)	116,327 (98.16 %)	64,703 (3.31 %)	70,285 (6.26 %)	893,170 (47.12 %)	959 (0.11 %)	79,355 (7.49 %)	641 (0.35 %)	273 (0.24 %)
1474	nematode M.graminicola (IARI 2022) GCA_002778205.2	n/a	n/a	1,507 (2.84 %)	601 (2.21 %)	n/a	24.26 (99.96 %)	0 (0 %)	321 (0.04 %)	513 (100.00 %)	49,033 (6.40 %)	25,387 (3.76 %)	311,514 (57.47 %)	1 (0.00 %)	7,038 (2.24 %)	120 (0.14 %)	71 (0.09 %)
1475	nematode M.spiculigera (AF72 2023) GCA_958295435.1	n/a	26,802 (15.72 %)	5,578 (2.21 %)	28,577 (12.76 %)	n/a	44.64 (99.95 %)	20 (0.05 %)	20 (0.05 %)	2,827 (99.95 %)	122,406 (4.68 %)	141,248 (6.78 %)	1,294,288 (30.23 %)	0 (0 %)	n/a	24,585 (7.91 %)	24,686 (5.56 %)
1476	nematode N.brasiliensis (2018) GCA_900618405.1	n/a	22,796 (7.06 %)	5,394 (1.45 %)	33,016 (8.94 %)	n/a	42.75 (95.72 %)	26,001 (4.28 %)	26,001 (4.28 %)	55,376 (95.72 %)	79,354 (1.25 %)	56,489 (1.69 %)	1,603,167 (23.85 %)	738 (0.15 %)	35,980 (1.42 %)	46,032 (6.81 %)	22,859 (2.77 %)
1477	nematode N.brasiliensis (MIMR 2023) GCA_030553155.1	n/a	29,473 (8.55 %)	5,222 (1.75 %)	21,859 (9.97 %)	n/a	43.17 (99.93 %)	373 (0.07 %)	373 (0.07 %)	379 (99.93 %)	73,294 (1.53 %)	59,456 (2.77 %)	1,363,917 (25.98 %)	4 (0.00 %)	56,402 (2.33 %)	38,552 (8.44 %)	22,024 (3.54 %)
1478	nematode O.flexuosa (2018) GCA_900618345.1	n/a	16,119 (13.59 %)	1,929 (1.31 %)	4,297 (2.44 %)	n/a	29.44 (98.16 %)	8,443 (1.78 %)	8,443 (1.78 %)	53,915 (98.22 %)	66,657 (3.55 %)	36,981 (2.42 %)	777,961 (34.84 %)	1,151 (0.18 %)	8,943 (0.91 %)	134 (0.06 %)	109 (0.05 %)
1479	nematode O.flexuosa (Red Deer 2017) GCA_002249935.1	n/a	8,230 (16.09 %)	1,932 (2.37 %)	1,494 (4.67 %)	n/a	30.62 (92.63 %)	3,720 (7.39 %)	3,720 (7.39 %)	5,324 (92.61 %)	42,405 (2.93 %)	20,187 (1.49 %)	602,908 (30.78 %)	104 (0.19 %)	3,292 (0.80 %)	126 (0.07 %)	98 (0.05 %)
1480	nematode O.ochengi (2016) GCA_000950515.2	n/a	n/a	2,436 (1.90 %)	4,269 (4.00 %)	n/a	29.77 (99.57 %)	9,025 (0.42 %)	9,025 (0.42 %)	29,268 (99.58 %)	73,782 (3.56 %)	29,702 (1.65 %)	830,001 (35.36 %)	350 (0.06 %)	2,050 (0.18 %)	137 (0.05 %)	119 (0.04 %)
1481	nematode O.ochengi (2018) GCA_900537205.1	n/a	13,990 (15.35 %)	2,514 (1.88 %)	4,924 (3.99 %)	n/a	29.38 (99.80 %)	6,135 (0.17 %)	6,135 (0.17 %)	30,192 (99.83 %)	76,556 (3.48 %)	26,276 (1.35 %)	884,303 (35.89 %)	312 (0.05 %)	2,617 (0.23 %)	119 (0.04 %)	99 (0.03 %)
1482	nematode O.tipulae (CEW1 2020) GCA_013425905.1	n/a	n/a	5,257 (7.66 %)	7,457 (17.79 %)	n/a	44.56 (98.75 %)	0 (0 %)	1 (1.25 %)	7 (100.00 %)	10,753 (1.30 %)	5,771 (1.26 %)	296,763 (12.82 %)	0 (0 %)	10,946 (0.97 %)	8,887 (7.23 %)	5,985 (3.91 %)
1483	nematode O.volvulus (2014) GCA_000499405.2	n/a	n/a	2,605 (2.17 %)	1,609 (4.43 %)	n/a	29.19 (96.81 %)	576 (3.19 %)	576 (3.19 %)	1,250 (96.81 %)	82,941 (3.94 %)	32,435 (1.77 %)	855,678 (35.91 %)	9 (0.02 %)	5,050 (0.82 %)	118 (0.04 %)	97 (0.03 %)
1484	nematode P.arcanus (2018) GCA_900490705.1	n/a	n/a	3,721 (1.39 %)	19,596 (10.83 %)	n/a	42.17 (95.95 %)	7,382 (4.06 %)	7,382 (4.06 %)	11,642 (95.94 %)	83,019 (2.03 %)	48,786 (2.60 %)	1,313,579 (22.62 %)	49 (0.04 %)	38,913 (2.85 %)	16,730 (4.78 %)	7,229 (1.48 %)
1485	nematode P.exspectatus (2022) GCA_911812115.1	n/a	n/a	3,681 (1.61 %)	16,632 (11.46 %)	n/a	43.05 (99.98 %)	85 (0.03 %)	85 (0.03 %)	109 (99.97 %)	77,698 (2.38 %)	64,086 (8.16 %)	957,156 (26.32 %)	0 (0 %)	77,357 (5.41 %)	13,799 (6.49 %)	6,871 (1.80 %)
1486	nematode P.giblindavisi (2022) GCA_943737045.1	n/a	n/a	3,893 (1.15 %)	11,844 (6.59 %)	n/a	37.88 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	735 (100.00 %)	190,691 (4.59 %)	187,924 (18.18 %)	1,534,118 (43.85 %)	0 (0 %)	209,012 (9.20 %)	10,750 (1.88 %)	4,788 (0.79 %)
1487	nematode P.pacificus (PS312 2020) GCA_000180635.4	n/a	28,149 (21.78 %)	3,613 (1.73 %)	14,696 (10.83 %)	n/a	42.83 (97.78 %)	0 (0 %)	90 (2.22 %)	46 (100.00 %)	73,664 (2.44 %)	42,728 (4.77 %)	898,762 (24.54 %)	0 (0 %)	40,628 (2.99 %)	13,652 (5.38 %)	6,233 (1.62 %)
1488	nematode P.redivivus (MT8872 2013) GCA_000341325.1	n/a	n/a	3,639 (4.85 %)	14,569 (29.92 %)	n/a	44.25 (95.47 %)	18,776 (4.64 %)	18,776 (4.64 %)	19,716 (95.36 %)	6,663 (0.58 %)	6,356 (1.16 %)	344,872 (13.84 %)	122 (0.02 %)	23,297 (3.05 %)	6,713 (8.02 %)	7,046 (6.07 %)
1489	nematode P.sambesii (ES601 2017) GCA_002796945.1	n/a	n/a	4,951 (1.87 %)	50,109 (21.06 %)	n/a	42.48 (99.94 %)	6,637 (0.04 %)	6,637 (0.04 %)	25,612 (99.96 %)	25,553 (0.65 %)	36,496 (1.69 %)	929,613 (16.07 %)	787 (0.09 %)	28,101 (1.52 %)	15,322 (9.41 %)	15,718 (5.19 %)
1490	nematode P.tenuis (MNPRO001-30 2021) GCA_019055375.1	n/a	39,236 (4.74 %)	4,810 (0.80 %)	16,243 (3.29 %)	n/a	40.07 (100.00 %)	54 (0.00 %)	54 (0.00 %)	7,561 (100.00 %)	279,943 (13.14 %)	64,740 (2.15 %)	3,077,581 (28.18 %)	2 (0.00 %)	104,656 (1.40 %)	23,061 (1.80 %)	5,616 (0.39 %)
1491	nematode P.univalens (PG01 2017) GCA_002259205.1	n/a	n/a	3,755 (1.18 %)	10,996 (5.57 %)	n/a	39.06 (99.60 %)	0 (0 %)	37,957 (0.42 %)	1,263 (100.00 %)	44,518 (1.18 %)	62,920 (6.61 %)	1,562,060 (17.34 %)	3,121 (0.36 %)	139,837 (7.06 %)	7,238 (1.14 %)	6,437 (0.86 %)
1492	nematode Panagrolaimus (JU765 2019) GCA_901765185.1	n/a	n/a	3,049 (3.54 %)	6,273 (11.53 %)	n/a	35.90 (98.98 %)	44,088 (1.26 %)	44,088 (1.26 %)	57,356 (98.74 %)	14,606 (1.02 %)	16,693 (6.52 %)	624,362 (36.37 %)	44 (0.01 %)	73,096 (10.80 %)	2,355 (1.79 %)	1,481 (1.15 %)
1493	nematode R.culicivorax (2014) GCA_001039655.1	n/a	n/a	1,813 (0.47 %)	13,439 (3.78 %)	n/a	36.27 (83.23 %)	303,605 (17.07 %)	303,605 (17.07 %)	366,142 (82.93 %)	55,531 (1.53 %)	151,637 (3.26 %)	2,392,413 (29.50 %)	261 (0.01 %)	38,904 (0.93 %)	7,639 (0.90 %)	5,584 (0.62 %)
1494	nematode S.baturini (2018) GCA_900618415.1	n/a	13,193 (5.36 %)	1,750 (0.52 %)	20,592 (7.41 %)	n/a	41.47 (97.66 %)	71,547 (2.45 %)	71,547 (2.45 %)	93,883 (97.55 %)	26,464 (0.71 %)	10,586 (0.36 %)	1,150,387 (15.71 %)	257 (0.01 %)	4,053 (0.13 %)	17,232 (3.82 %)	10,462 (2.37 %)
1495	nematode S.carpocapsae (ALL 2019) GCA_000757645.3	n/a	36,561 (32.46 %)	4,210 (4.14 %)	20,619 (24.15 %)	n/a	45.67 (99.46 %)	0 (0 %)	16 (0.54 %)	16 (100.00 %)	10,397 (0.64 %)	9,365 (1.52 %)	387,385 (15.13 %)	0 (0 %)	22,456 (3.60 %)	3,895 (3.09 %)	4,930 (3.02 %)
1496	nematode S.digitata (RSCHEM2018 2018) GCA_003640385.1	n/a	n/a	2,549 (2.55 %)	2,467 (5.39 %)	n/a	31.44 (99.99 %)	0 (0 %)	4,392 (0.01 %)	1,879 (100.00 %)	74,862 (4.18 %)	26,692 (2.13 %)	720,619 (33.98 %)	172 (0.05 %)	6,608 (0.86 %)	386 (0.17 %)	307 (0.13 %)
1497	nematode S.feltiae (NW 2019) GCA_007213375.1	n/a	n/a	5,077 (3.26 %)	33,884 (27.73 %)	n/a	46.45 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	4,678 (100.00 %)	27,038 (1.02 %)	18,887 (1.66 %)	589,546 (15.12 %)	0 (0 %)	45,976 (4.19 %)	3,597 (18.50 %)	3,739 (7.81 %)
1498	nematode S.feltiae (SN 2014) GCA_000757705.1	n/a	n/a	4,047 (4.02 %)	23,710 (27.44 %)	n/a	46.99 (96.86 %)	53,190 (3.39 %)	53,190 (3.39 %)	59,024 (96.61 %)	13,552 (0.73 %)	12,109 (2.91 %)	388,474 (10.78 %)	597 (0.09 %)	n/a	3,639 (8.89 %)	3,492 (2.92 %)
1499	nematode S.glaseri (NC 2014) GCA_000757755.1	n/a	n/a	3,903 (3.38 %)	25,462 (25.15 %)	n/a	47.64 (96.68 %)	79,030 (3.64 %)	79,030 (3.64 %)	86,540 (96.36 %)	10,923 (0.59 %)	18,792 (3.83 %)	354,463 (9.47 %)	4 (0.00 %)	90,584 (7.66 %)	17,314 (25.08 %)	16,206 (9.71 %)
1500	nematode S.hermaphroditum (PS9179 2023) GCA_030435675.2	n/a	36,269 (30.72 %)	4,388 (3.97 %)	22,916 (25.88 %)	n/a	47.02 (99.96 %)	13 (0.01 %)	70 (0.04 %)	101 (99.99 %)	10,210 (0.66 %)	17,117 (6.71 %)	243,659 (15.81 %)	0 (0 %)	30,314 (3.40 %)	1,316 (0.84 %)	5,868 (3.53 %)
1501	nematode S.monticolum (2013) GCA_000505645.1	n/a	n/a	4,093 (3.73 %)	24,743 (23.24 %)	n/a	41.98 (95.39 %)	66,861 (4.88 %)	66,861 (4.88 %)	81,113 (95.12 %)	13,219 (0.91 %)	15,337 (2.11 %)	463,983 (14.30 %)	16 (0.00 %)	45,491 (3.94 %)	7,468 (4.69 %)	6,849 (3.94 %)
1502	nematode S.ratti (ED321 Heterogonic 2014) GCF_001040885.1	12,445 (40.83 %)	n/a	2,731 (4.84 %)	207 (3.35 %)	n/a	21.43 (99.41 %)	0 (0 %)	175 (0.59 %)	135 (100.00 %)	39,665 (4.55 %)	12,501 (2.72 %)	376,582 (55.30 %)	2 (0.00 %)	8,546 (1.94 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)
1503	nematode S.stercoralis (PV001 2023) GCA_029582065.1	n/a	n/a	2,534 (4.60 %)	205 (3.38 %)	n/a	22.20 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	38,005 (4.22 %)	16,286 (3.08 %)	386,737 (54.58 %)	0 (0 %)	13,258 (2.25 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)
1504	nematode T.circumcincta (S 2017) GCA_002352805.1	n/a	26,182 (2.87 %)	5,706 (0.72 %)	30,598 (4.12 %)	n/a	44.78 (82.28 %)	131,658 (17.77 %)	131,658 (17.77 %)	213,388 (82.23 %)	80,710 (0.63 %)	72,236 (0.75 %)	3,350,392 (21.73 %)	1,820 (0.17 %)	58,502 (0.87 %)	127,980 (8.04 %)	30,452 (1.55 %)
1505	nematode T.muris (Edinburgh 2019) GCA_000612645.2	n/a	n/a	2,406 (1.58 %)	15,827 (19.30 %)	n/a	44.64 (98.45 %)	0 (0 %)	91 (1.54 %)	803 (100.00 %)	21,847 (1.10 %)	24,160 (3.17 %)	296,736 (19.91 %)	0 (0 %)	33,756 (3.08 %)	4,749 (4.43 %)	5,490 (6.28 %)
1506	nematode T.murrelli (ISS417 2015) GCA_001447425.1	n/a	18,645 (33.84 %)	1,630 (2.42 %)	4,049 (13.97 %)	n/a	33.58 (99.35 %)	1,173 (0.64 %)	1,173 (0.64 %)	6,415 (99.36 %)	40,864 (3.41 %)	10,173 (1.40 %)	441,525 (34.28 %)	6 (0.02 %)	8,294 (2.49 %)	2,397 (4.27 %)	2,026 (3.34 %)
1507	nematode T.nativa (ISS45 2017) GCA_002148645.1	n/a	10,792 (23.08 %)	1,723 (2.23 %)	6,417 (12.01 %)	n/a	33.60 (99.91 %)	2,900 (0.01 %)	2,900 (0.01 %)	27,174 (99.99 %)	42,561 (3.50 %)	8,528 (0.65 %)	475,112 (34.06 %)	0 (0 %)	722 (0.14 %)	3,092 (4.11 %)	2,560 (3.24 %)
1508	nematode T.spiralis (ISS 195 2011) GCF_000181795.1	16,380 (26.83 %)	n/a	1,899 (2.18 %)	4,304 (12.14 %)	n/a	33.91 (92.15 %)	2,404 (7.85 %)	3,951 (7.85 %)	9,267 (92.15 %)	47,760 (3.83 %)	11,209 (1.13 %)	535,166 (31.28 %)	3 (0.00 %)	11,338 (3.52 %)	3,135 (4.03 %)	2,539 (3.19 %)
1509	Neorickettsia sennetsu str. (Miyayama 2006) GCF_000013165.1	n/a	794 (85.60 %)	n/a	n/a	n/a	41.08 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	17 (0.29 %)	3,544 (6.96 %)	0 (0 %)	23 (0.39 %)	11 (0.47 %)	9 (0.38 %)
1510	New Jersey polyomavirus-2013 (NJ-PyV-2013 2014) GCF_000922675.1	n/a	9 (89.72 %)	n/a	n/a	n/a	39.28 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.06 %)	n/a	12 (3.58 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1511	New World hookworm (2013) GCA_000507365.1	n/a	19,643 (7.45 %)	4,650 (1.84 %)	11,658 (5.90 %)	n/a	40.22 (85.37 %)	53,349 (14.71 %)	53,349 (14.71 %)	65,213 (85.29 %)	57,920 (1.27 %)	30,098 (0.60 %)	1,397,718 (21.96 %)	459 (0.06 %)	30,870 (1.39 %)	27,966 (4.74 %)	7,398 (1.13 %)
1512	New World hookworm (Aroian 2023) GCF_031761385.1	41,951 (12.42 %)	n/a	5,076 (1.88 %)	11,524 (6.05 %)	n/a	40.09 (99.91 %)	0 (0 %)	135 (0.09 %)	38 (100.00 %)	87,962 (2.10 %)	57,283 (2.36 %)	1,523,085 (27.96 %)	1 (0.00 %)	46,499 (1.76 %)	28,946 (6.44 %)	7,924 (1.24 %)
1513	Newbury agent 1 (2006) GCF_000867125.1	n/a	2 (98.08 %)	n/a	n/a	n/a	56.20 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.19 %)	n/a	3 (1.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (62.74 %)	2 (62.74 %)
1514	Nipah henipavirus (2000) GCF_000863625.1	n/a	11 (82.06 %)	n/a	n/a	n/a	38.17 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.17 %)	n/a	8 (0.37 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1515	Nkolbisson virus (YM 31-65 2017) GCF_002145865.1	n/a	5 (97.26 %)	n/a	n/a	n/a	42.98 (99.97 %)	1 (0.02 %)	1 (0.02 %)	2 (99.98 %)	4 (0.67 %)	n/a	7 (0.52 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1516	Nocardia asteroides (NCTC11293 2018) GCF_900637185.1	n/a	6,483 (90.43 %)	n/a	n/a	n/a	69.88 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	652 (0.59 %)	68,821 (26.87 %)	0 (0 %)	265 (0.26 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
1517	nodular worm (OD-Hann 2014) GCA_000797555.1	n/a	25,583 (4.71 %)	4,822 (0.91 %)	28,729 (4.94 %)	n/a	41.35 (79.40 %)	73,323 (20.63 %)	76,129 (20.63 %)	137,578 (79.37 %)	39,463 (0.54 %)	38,774 (0.53 %)	2,139,309 (18.25 %)	818 (0.12 %)	42,754 (1.09 %)	40,375 (3.84 %)	15,532 (1.28 %)
1518	Norovirus (dog/GVI.1/HKU_Ca026F/2007/HKG 2019) GCF_007609015.1	n/a	3 (97.97 %)	n/a	n/a	n/a	56.44 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.17 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (66.91 %)	3 (66.91 %)
1519	Norovirus GI (1993) GCF_000864005.1	n/a	3 (99.09 %)	n/a	n/a	n/a	48.03 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.52 %)	1 (0.35 %)	3 (0.31 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1520	Norovirus GI (Hu/BD/2011/GI.7PNA2/Dhaka1882 2019) GCF_008704025.1	n/a	3 (99.22 %)	n/a	n/a	n/a	48.46 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.27 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1521	Norovirus GI (Hu/JP/1998/GI.6PNA4/No20-Saitama-98-17 2019) GCF_008703965.1	n/a	3 (98.91 %)	n/a	n/a	n/a	49.94 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.56 %)	n/a	3 (0.36 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1522	Norovirus GI (Hu/JP/2000/GI.6PNA1/WUG1 2019) GCF_008703985.1	n/a	3 (98.82 %)	n/a	n/a	n/a	49.62 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.43 %)	n/a	12 (1.55 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1523	Norovirus GI/Hu/JP/2007/GI.P3_GI.3/Shimizu/KK2866 (Shimizu/KK2866 2018) GCF_003813225.1	n/a	3 (99.03 %)	n/a	n/a	n/a	48.57 (100.00 %)	2 (0.03 %)	2 (0.03 %)	3 (99.97 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.56 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.89 %)	0 (0.00 %)
1524	Norovirus GII (Hu/GII.PNA4-GII.NA4/PNV06929/2008/PER 2019) GCF_008711635.1	n/a	3 (99.19 %)	n/a	n/a	n/a	47.69 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1525	Norovirus GII (NORO_176-1_17_12_2015 2019) GCF_004193815.1	n/a	3 (99.64 %)	n/a	n/a	n/a	50.31 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1526	Norovirus GII (NORO_226_06_01_2016 2018) GCF_003638685.1	n/a	3 (99.23 %)	n/a	n/a	n/a	48.61 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1527	Norovirus GII.17 (Hu/GII.P17_GII.17/KR/2015/CAU-267 2018) GCF_003638645.1	n/a	3 (99.14 %)	n/a	n/a	n/a	48.14 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.71 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1528	Norovirus GII.2 (BJSMQ 2018) GCF_003638665.1	n/a	3 (99.36 %)	n/a	n/a	n/a	48.71 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1529	Norovirus GII/Hu/JP/2007/GII.P15_GII.15/Sapporo/HK299 (Sapporo/HK299 2019) GCF_007608995.1	n/a	3 (99.01 %)	n/a	n/a	n/a	49.25 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1530	Norovirus GII/Hu/JP/2011/GII/Yuzawa/Gira2HS (Yuzawa/Gira2HS 2019) GCF_007609035.1	n/a	3 (98.91 %)	n/a	n/a	n/a	48.63 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.30 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1531	Norovirus GIV (CU081210E/USA/2010 2020) GCF_010478905.1	n/a	3 (98.55 %)	n/a	n/a	n/a	58.56 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (98.56 %)	1 (98.56 %)
1532	Norovirus GIV (Hu/GIV.1/LakeMacquarie/NSW268O/2010/AU 2016) GCF_001595715.1	n/a	3 (98.88 %)	n/a	n/a	n/a	50.71 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.37 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.69 %)	1 (3.69 %)
1533	Norovirus GIV (Hu/US/2016/GIV.NA1PNA1/WI7002 2019) GCF_008704005.1	n/a	3 (99.96 %)	n/a	n/a	n/a	51.14 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.55 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.78 %)	1 (2.78 %)
1534	Norovirus GV (Mu/NoV/GV/MNV1/2002/USA 2006) GCF_000868425.1	n/a	4 (98.92 %)	n/a	n/a	n/a	56.72 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.42 %)	n/a	5 (0.60 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (18.84 %)	4 (18.84 %)
1535	northern house mosquito (v2 TS 2022) GCF_016801865.2	28,637 (7.92 %)	n/a	5,781 (1.09 %)	36,884 (7.75 %)	n/a	36.77 (99.97 %)	0 (0 %)	1,699 (0.03 %)	290 (100.00 %)	197,797 (4.69 %)	187,655 (9.84 %)	3,008,924 (56.45 %)	11 (0.00 %)	387,681 (5.39 %)	62,992 (9.78 %)	42,880 (6.51 %)
1536	northern root-knot nematode M.hapla (VW9 2008) GCA_000172435.1	n/a	n/a	1,482 (1.96 %)	1,526 (2.85 %)	n/a	27.40 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	3,450 (100.00 %)	45,772 (4.71 %)	38,518 (4.72 %)	477,254 (52.96 %)	0 (0 %)	12,515 (2.72 %)	449 (0.58 %)	302 (0.46 %)
1537	Norwalk-like virus (Hu/Norovirus/hiroshima/1999/JP9912-02F 2016) GCF_001595695.1	n/a	3 (99.32 %)	n/a	n/a	n/a	50.06 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1538	Norway rat BN7.2 GCF_015227675.2	97,432 (4.08 %)	n/a	21,526 (1.86 %)	19,266 (1.33 %)	54,530 (2.79 %)	41.99 (99.19 %)	581 (0.81 %)	581 (0.81 %)	757 (99.19 %)	5,029,005 (45.44 %)	1,514,974 (3.57 %)	13,450,428 (35.83 %)	4 (0.00 %)	1,172,090 (3.51 %)	19,244 (0.46 %)	16,098 (0.39 %)
1539	NY_014 poxvirus (2013 2017) GCF_002270605.1	n/a	197 (91.70 %)	n/a	n/a	n/a	29.52 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	42 (0.94 %)	15 (0.77 %)	1,374 (12.16 %)	0 (0 %)	6 (0.31 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1540	Oligella urethralis (NCTC12964 2018) GCF_900454345.1	n/a	2,222 (90.05 %)	n/a	n/a	n/a	46.49 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	43 (0.16 %)	9,024 (6.44 %)	0 (0 %)	145 (0.75 %)	164 (3.78 %)	233 (5.28 %)
1541	Omsk hemorrhagic fever virus (Bogoluvovska 2003) GCF_000855505.1	n/a	1 (94.98 %)	n/a	n/a	n/a	53.64 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.20 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1542	Onyong-nyong virus (1993) GCF_000863005.1	n/a	5 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	48.32 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (1.28 %)	7 (1.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	5 (15.80 %)	5 (15.80 %)
1543	Onyong-nyong virus (SG650 2023) GCF_002888795.1	n/a	2 (95.47 %)	n/a	n/a	n/a	48.09 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.42 %)	1 (1.22 %)	4 (0.63 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (13.44 %)	4 (13.44 %)
1544	oomycetes (APO3 2014) GCF_000520075.1	26,269 (46.65 %)	n/a	1,177 (1.37 %)	19,426 (42.61 %)	n/a	49.76 (77.24 %)	3,824 (22.77 %)	3,828 (22.77 %)	4,659 (77.23 %)	17,048 (1.33 %)	13,541 (1.35 %)	277,853 (11.14 %)	355 (1.46 %)	10,924 (3.49 %)	4,027 (15.06 %)	5,971 (8.56 %)
1545	oomycetes (ATCC 12531 2013) GCA_000387505.2	n/a	n/a	769 (1.11 %)	19,300 (54.33 %)	n/a	56.95 (96.15 %)	42,328 (4.18 %)	42,328 (4.18 %)	53,300 (95.82 %)	8,618 (1.03 %)	4,309 (0.91 %)	256,569 (13.16 %)	0 (0 %)	1,650 (0.52 %)	10,098 (88.19 %)	5,514 (12.97 %)
1546	oomycetes (CBS 223.65 2014) GCF_000151545.1	20,111 (56.18 %)	n/a	822 (0.98 %)	19,428 (49.07 %)	n/a	58.43 (90.69 %)	2,683 (9.33 %)	2,683 (9.33 %)	4,126 (90.67 %)	8,354 (0.87 %)	6,199 (0.78 %)	345,615 (16.57 %)	12 (0.03 %)	7,136 (1.59 %)	1,617 (89.01 %)	393 (1.17 %)
1547	oomycetes (DAOM BR144 2010) GCA_000143045.1	n/a	n/a	1,270 (2.05 %)	19,103 (61.92 %)	n/a	52.31 (95.28 %)	772 (4.72 %)	772 (4.72 %)	1,747 (95.28 %)	9,471 (1.06 %)	5,288 (1.28 %)	163,230 (11.43 %)	5 (0.13 %)	4,843 (2.52 %)	920 (70.13 %)	578 (1.24 %)
1548	oomycetes (DAOM BR242034 2013) GCA_000387465.2	n/a	n/a	743 (1.11 %)	21,033 (57.53 %)	n/a	55.06 (96.47 %)	7,590 (3.55 %)	7,590 (3.55 %)	19,131 (96.45 %)	8,292 (0.89 %)	3,296 (0.41 %)	263,047 (14.66 %)	0 (0 %)	845 (0.16 %)	9,266 (84.69 %)	4,741 (8.29 %)
1549	oomycetes (DAOM BR444 2013) GCA_000387445.2	n/a	n/a	1,201 (2.48 %)	14,349 (66.11 %)	n/a	53.82 (95.54 %)	4,014 (4.49 %)	4,089 (4.49 %)	5,788 (95.51 %)	4,738 (0.86 %)	2,117 (0.28 %)	128,200 (7.51 %)	19 (0.01 %)	577 (0.16 %)	2,418 (85.97 %)	1,621 (10.71 %)
1550	oomycetes (DAOM BR484 2013) GCA_000387545.2	n/a	n/a	793 (1.59 %)	18,377 (69.47 %)	n/a	58.93 (99.30 %)	7,941 (0.77 %)	7,941 (0.77 %)	11,626 (99.23 %)	8,412 (1.14 %)	4,946 (0.88 %)	208,306 (16.24 %)	0 (0 %)	1,346 (0.38 %)	3,434 (96.94 %)	1,513 (7.54 %)
1551	oomycetes (DAOM BR486 2013) GCA_000387425.2	n/a	n/a	943 (1.49 %)	18,481 (56.45 %)	n/a	53.78 (99.37 %)	8,309 (0.68 %)	8,309 (0.68 %)	14,196 (99.32 %)	13,678 (1.31 %)	4,019 (0.39 %)	253,001 (13.81 %)	0 (0 %)	365 (0.12 %)	5,862 (89.91 %)	3,027 (5.12 %)
1552	oomycetes (DAOM BR650 2013) GCA_000387525.2	n/a	n/a	908 (1.65 %)	16,450 (54.31 %)	n/a	52.05 (95.06 %)	42,793 (5.37 %)	42,793 (5.37 %)	48,275 (94.63 %)	5,845 (0.67 %)	1,596 (0.19 %)	173,583 (9.29 %)	0 (0 %)	122 (0.04 %)	3,793 (47.63 %)	2,121 (2.92 %)
1553	oomycetes (MF1 2022) GCA_021527665.1	n/a	21,894 (48.80 %)	1,340 (1.51 %)	23,062 (53.03 %)	n/a	47.47 (99.96 %)	227 (0.02 %)	227 (0.02 %)	8,016 (99.98 %)	4,162 (0.31 %)	5,897 (0.82 %)	192,389 (7.93 %)	1 (0.00 %)	5,804 (1.19 %)	7,583 (33.26 %)	5,876 (9.66 %)
1554	oomycetes (NJM9701 2014) GCF_000520115.1	20,817 (57.87 %)	n/a	1,078 (1.76 %)	14,914 (49.32 %)	n/a	54.18 (58.08 %)	4,712 (41.95 %)	4,713 (41.95 %)	5,193 (58.05 %)	2,436 (0.27 %)	1,891 (0.22 %)	178,080 (5.17 %)	146 (0.81 %)	6,904 (1.56 %)	2,821 (20.21 %)	2,491 (8.17 %)
1555	oomycetes (Pi-S 2022) GCA_001029375.2	n/a	31,005 (40.68 %)	1,542 (1.62 %)	25,539 (57.09 %)	n/a	57.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	840 (100.00 %)	62,245 (4.81 %)	51,724 (13.98 %)	254,354 (21.49 %)	0 (0 %)	50,609 (9.95 %)	1,464 (98.31 %)	1,245 (73.70 %)
1556	oomycetes (VS20 2013) GCF_000281045.1	18,229 (66.46 %)	n/a	733 (1.13 %)	16,460 (53.33 %)	n/a	58.61 (64.36 %)	3,488 (35.66 %)	3,488 (35.66 %)	3,878 (64.34 %)	6,646 (0.82 %)	4,782 (0.40 %)	290,383 (11.54 %)	77 (0.13 %)	4,258 (0.86 %)	1,340 (38.48 %)	600 (1.05 %)
1557	Orf virus (OV-SA00 ORFD 2004) GCF_000844845.1	n/a	130 (89.67 %)	n/a	n/a	n/a	63.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	56 (2.03 %)	37 (1.70 %)	1,076 (16.55 %)	0 (0 %)	4 (0.28 %)	1 (100.00 %)	1 (100.00 %)
1558	oriental liver fluke (Cs-k2 2021) GCA_003604175.2	n/a	14,408 (4.16 %)	1,765 (0.24 %)	17,217 (4.70 %)	n/a	44.07 (99.48 %)	0 (0 %)	1,724 (0.52 %)	78 (100.00 %)	56,338 (0.57 %)	44,964 (1.42 %)	2,064,446 (18.49 %)	2 (0.00 %)	57,089 (1.90 %)	61,568 (5.57 %)	21,938 (1.30 %)
1559	Orientia tsutsugamushi (2018) GCF_900327255.1	n/a	2,240 (80.09 %)	n/a	n/a	n/a	30.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	205 (1.41 %)	13,271 (14.80 %)	0 (0 %)	693 (3.17 %)	2 (0.05 %)	2 (0.05 %)
1560	Oropouche virus (2004) GCF_000853785.1	n/a	4 (97.72 %)	n/a	n/a	n/a	35.40 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	33 (3.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1561	Orthobunyavirus bwambaense (M459 2017) GCF_002118905.1	n/a	4 (94.10 %)	n/a	n/a	n/a	31.34 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	8 (2.54 %)	5 (1.00 %)	23 (5.73 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1562	Orthohantavirus andesense (Chile-9717869 2002) GCF_000850405.1	n/a	4 (92.25 %)	n/a	n/a	n/a	38.53 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1563	Orthohantavirus asikkalaense (CZ/Beskydy/412/2010/Sm 2019) GCF_002815935.1	n/a	3 (93.28 %)	n/a	n/a	n/a	38.58 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.33 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1564	Orthohantavirus bayoui (HV F0260003 2018) GCF_002816435.1	n/a	3 (91.68 %)	n/a	n/a	n/a	39.50 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.48 %)	n/a	11 (1.72 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1565	Orthohantavirus caobangense (3 2017) GCF_002119025.1	n/a	3 (93.00 %)	n/a	n/a	n/a	36.66 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	7 (1.60 %)	2 (0.38 %)	10 (1.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1566	Orthohantavirus delgaditoense (VHV-574 2017) GCF_002145545.1	n/a	3 (91.23 %)	n/a	n/a	n/a	37.63 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.29 %)	3 (0.77 %)	6 (0.87 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1567	Orthohantavirus dobravaense (DOBV/Ano-Poroia/Afl9/1999 2003) GCF_000863045.1	n/a	3 (94.21 %)	n/a	n/a	n/a	39.24 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.68 %)	2 (0.46 %)	13 (1.44 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1568	Orthohantavirus khabarovskense (Fuyuan-Mm-217 2017) GCF_002146125.1	n/a	3 (92.38 %)	n/a	n/a	n/a	38.20 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.46 %)	n/a	17 (1.58 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1569	Orthohantavirus montanoense (104/2006 2017) GCF_002117715.1	n/a	3 (91.77 %)	n/a	n/a	n/a	36.28 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	5 (1.70 %)	15 (2.97 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1570	Orthohantavirus prospectense (PH-1 2018) GCF_002994685.1	n/a	2 (82.88 %)	n/a	n/a	n/a	39.99 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.28 %)	n/a	4 (0.55 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1571	Orthohantavirus robinaense (P17-14855 2021) GCF_018594985.1	n/a	3 (100.04 %)	n/a	n/a	n/a	40.35 (99.96 %)	5 (0.04 %)	5 (0.04 %)	8 (99.96 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.54 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1572	Orthohantavirus sangassouense (SA14 2017) GCF_002145925.1	n/a	3 (93.52 %)	n/a	n/a	n/a	38.80 (99.97 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (1.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1573	Orthohantavirus sinnombreense (NM H10 2003) GCF_000854765.1	n/a	4 (90.70 %)	n/a	n/a	n/a	38.42 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.95 %)	5 (1.33 %)	11 (1.93 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1574	Orthohantavirus sinnombreense (NM R11 2023) GCF_002830985.1	n/a	3 (90.70 %)	n/a	n/a	n/a	38.39 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.95 %)	5 (1.33 %)	11 (1.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1575	Orthohantavirus tatenalense (Upton_Heath 2021) GCF_018595015.1	n/a	3 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	38.26 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (1.55 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1576	Orthohantavirus tulaense (Moravia/5302v/95 2003) GCF_000855225.1	n/a	4 (92.64 %)	n/a	n/a	n/a	38.04 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.94 %)	n/a	9 (0.58 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1577	Orthohepevirus A (Xinjiang 1993) GCF_000861105.1	n/a	3 (98.65 %)	n/a	n/a	n/a	57.95 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.80 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (89.53 %)	1 (88.49 %)
1578	Orthomarburgvirus marburgense (Ravn virus/H.sapiens-tc/KEN/1987/Kitum Cave-810040 2014) GCF_000943645.1	n/a	7 (98.72 %)	n/a	n/a	n/a	37.76 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.17 %)	n/a	21 (1.20 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1579	Orthonairovirus tomdiense (TT1 2023) GCF_018595155.1	n/a	3 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	45.30 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.18 %)	n/a	9 (0.50 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1580	Orthorubulavirus mapueraense (BeAnn 370284 2007) GCF_000873165.1	n/a	9 (96.64 %)	n/a	n/a	n/a	44.68 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.90 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1581	Orungo virus (UGMP 359 2018) GCF_002829445.1	n/a	11 (96.63 %)	n/a	n/a	n/a	45.83 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.24 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (7.81 %)	2 (7.81 %)
1582	oyster mushroom GCF_014466165.1	11,709 (47.39 %)	n/a	1,073 (2.20 %)	4,389 (13.14 %)	n/a	50.84 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	17 (100.00 %)	6,020 (1.12 %)	5,387 (0.97 %)	70,995 (7.72 %)	0 (0 %)	3,978 (1.96 %)	76 (32.69 %)	166 (0.90 %)
1583	oyster mushroom (PC15 2014) GCA_000697685.1	n/a	12,460 (47.43 %)	1,097 (2.27 %)	4,371 (13.63 %)	n/a	50.95 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	13 (100.00 %)	5,756 (0.95 %)	4,783 (0.75 %)	70,693 (7.30 %)	0 (0 %)	2,981 (1.31 %)	26 (99.81 %)	212 (1.17 %)
1584	Oz virus (EH8 2019) GCF_004117175.1	n/a	6 (94.83 %)	n/a	n/a	n/a	43.72 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (1.36 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1585	Paenibacillus alvei (32 2024) GCF_025547055.2	n/a	6,258 (85.64 %)	n/a	n/a	n/a	45.93 (99.99 %)	81 (0.01 %)	81 (0.01 %)	107 (99.99 %)	n/a	208 (0.38 %)	22,139 (6.13 %)	0 (0 %)	573 (0.80 %)	155 (2.27 %)	172 (1.69 %)
1586	Pandoraea apista (DSM 16535 2016) GCF_001465595.2	n/a	5,068 (87.26 %)	n/a	n/a	n/a	62.63 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	207 (0.24 %)	36,481 (13.73 %)	0 (0 %)	92 (0.97 %)	2 (100.00 %)	2 (100.00 %)
1587	Papio hamadryas papillomavirus 1 (Mac2085 2012) GCF_000896995.1	n/a	8 (85.63 %)	n/a	n/a	n/a	49.41 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.56 %)	1 (0.51 %)	9 (4.48 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (5.12 %)	1 (5.01 %)
1588	Parainfluenza virus 5 (W3A 2004) GCF_000854805.1	n/a	9 (99.06 %)	n/a	n/a	n/a	42.27 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.24 %)	n/a	3 (0.30 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1589	Paratrypanosoma confusum (CUL13MS 2018) GCA_002921335.1	n/a	n/a	531 (1.29 %)	4,980 (59.22 %)	n/a	61.75 (91.85 %)	0 (0 %)	4,428 (8.20 %)	2,188 (100.00 %)	16,794 (2.85 %)	3,893 (0.53 %)	168,997 (16.08 %)	110 (0.10 %)	660 (0.22 %)	2,338 (95.40 %)	1,532 (11.09 %)
1590	Parechovirus A (Gregory 1998) GCF_000861505.1	n/a	1 (89.00 %)	n/a	n/a	n/a	39.48 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.30 %)	n/a	6 (0.98 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1591	Parvovirus NIH-CQV (2013) GCF_000910875.1	n/a	3 (80.08 %)	n/a	n/a	n/a	45.77 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (2.04 %)	0 (0.00 %)	0 (0 %)	2 (6.88 %)	2 (32.09 %)	2 (32.09 %)
1592	Paslahepevirus balayani (2023) GCF_002826225.1	n/a	3 (98.54 %)	n/a	n/a	n/a	58.02 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (92.98 %)	1 (91.44 %)
1593	Paslahepevirus balayani (AlgSwe2012 2023) GCF_023120075.1	n/a	3 (97.76 %)	n/a	n/a	n/a	58.57 (99.97 %)	6 (0.09 %)	6 (0.09 %)	7 (99.91 %)	6 (1.04 %)	1 (0.37 %)	22 (4.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (97.93 %)	1 (97.93 %)
1594	Paslahepevirus balayani (little egret/kocsag02/2014/HUN 2023) GCF_023120345.1	n/a	3 (96.92 %)	n/a	n/a	n/a	51.40 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (2.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (11.05 %)	3 (11.05 %)
1595	Pasteurella multocida (FDAARGOS_218 2018) GCF_002073255.2	n/a	2,198 (90.14 %)	n/a	n/a	n/a	40.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	60 (0.27 %)	11,847 (9.80 %)	0 (0 %)	155 (0.60 %)	52 (1.23 %)	46 (1.14 %)
1596	Pasteurella multocida subsp. septica (CIRMBP-0873 2017) GCF_002068175.1	n/a	2,433 (90.06 %)	n/a	n/a	n/a	40.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	77 (0.44 %)	11,599 (9.00 %)	0 (0 %)	118 (0.42 %)	54 (1.09 %)	51 (1.04 %)
1597	Pasteurella multocida subsp. septica (NCTC11619 2018) GCF_900638315.1	n/a	2,183 (89.83 %)	n/a	n/a	n/a	40.45 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	63 (0.28 %)	11,608 (9.74 %)	0 (0 %)	180 (0.62 %)	50 (1.22 %)	49 (1.21 %)
1598	peach leaf curl fungus (PYCC 5710 2013) GCA_000312925.2	n/a	7,666 (46.90 %)	1,530 (9.07 %)	4,375 (47.33 %)	n/a	49.52 (99.08 %)	114 (0.92 %)	119 (0.92 %)	517 (99.08 %)	2,459 (0.81 %)	1,161 (0.51 %)	30,191 (5.77 %)	9 (0.05 %)	358 (0.32 %)	2,127 (54.95 %)	2,169 (23.75 %)
1599	Pediococcus pentosaceus (ATCC 25745 2006) GCF_000014505.1	n/a	1,819 (89.81 %)	n/a	n/a	n/a	37.36 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	51 (0.68 %)	10,646 (11.34 %)	0 (0 %)	108 (0.43 %)	26 (0.94 %)	25 (0.76 %)
1600	Pegivirus platyrrhini (2000) GCF_000847425.1	n/a	1 (93.48 %)	n/a	n/a	n/a	57.91 (100.00 %)	25 (0.26 %)	25 (0.26 %)	26 (99.74 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (1.65 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	7 (35.01 %)	6 (21.59 %)
1601	Pegivirus platyrrhini (2023) GCF_002821105.1	n/a	1 (92.91 %)	n/a	n/a	n/a	57.84 (99.97 %)	110 (1.15 %)	110 (1.15 %)	111 (98.85 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (1.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	6 (66.95 %)	4 (61.73 %)
1602	Photobacterium damselae subsp. damselae (WMD-P2 2024) GCF_038086725.1	n/a	4,057 (86.25 %)	n/a	n/a	n/a	40.79 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	135 (1.04 %)	17,089 (6.74 %)	0 (0 %)	589 (2.12 %)	72 (2.79 %)	57 (0.76 %)
1603	pig roundworm (2012) GCA_000298755.1	n/a	n/a	3,699 (1.11 %)	10,472 (5.00 %)	n/a	37.96 (97.43 %)	17,854 (2.59 %)	17,854 (2.59 %)	30,842 (97.41 %)	77,270 (1.43 %)	49,239 (2.13 %)	1,826,357 (20.90 %)	9 (0.01 %)	26,862 (2.09 %)	8,414 (1.13 %)	6,871 (0.86 %)
1604	pig roundworm (AG01 2017) GCA_000187025.3	n/a	n/a	3,827 (1.00 %)	11,087 (4.94 %)	n/a	37.79 (99.68 %)	0 (0 %)	46,919 (0.34 %)	415 (100.00 %)	94,767 (2.06 %)	69,337 (3.76 %)	2,030,673 (21.73 %)	1,632 (0.21 %)	144,797 (7.44 %)	9,531 (1.26 %)	7,751 (0.93 %)
1605	pig whipworm (2014) GCA_000797535.1	n/a	10,159 (19.42 %)	1,892 (2.20 %)	7,181 (14.99 %)	n/a	43.31 (98.57 %)	5,192 (1.46 %)	5,627 (1.46 %)	5,498 (98.54 %)	7,478 (0.54 %)	6,885 (0.81 %)	301,715 (11.88 %)	75 (0.05 %)	5,785 (1.05 %)	4,187 (4.15 %)	3,508 (3.06 %)
1606	pig whipworm (DCEP-RM93F 2014) GCA_000701025.1	n/a	14,262 (29.49 %)	1,966 (2.06 %)	8,042 (15.53 %)	n/a	43.48 (97.44 %)	1,720 (2.56 %)	1,751 (2.56 %)	5,004 (97.44 %)	8,643 (0.76 %)	11,222 (2.38 %)	286,926 (11.97 %)	24 (0.10 %)	14,728 (3.80 %)	5,126 (5.48 %)	4,181 (3.93 %)
1607	pig whipworm (DCEP-RM93M 2014) GCA_000701005.1	n/a	14,434 (27.71 %)	1,988 (2.01 %)	8,292 (15.45 %)	n/a	43.57 (96.74 %)	2,173 (3.26 %)	2,204 (3.27 %)	6,465 (96.74 %)	8,929 (0.78 %)	12,424 (2.67 %)	290,151 (11.94 %)	37 (0.13 %)	17,370 (4.02 %)	5,418 (5.46 %)	4,463 (4.16 %)
1608	pine wood nematode (Ka4C1 2021) GCA_904066235.2	n/a	105,527 (53.99 %)	3,271 (3.43 %)	12,843 (19.56 %)	n/a	40.37 (99.98 %)	0 (0 %)	43 (0.02 %)	11 (100.00 %)	10,513 (0.63 %)	21,439 (7.24 %)	511,018 (31.52 %)	5 (0.00 %)	28,975 (3.38 %)	8,519 (4.56 %)	7,744 (3.69 %)
1609	pine wood nematode (Ka4C1 inbred line 2011) GCA_000231135.1	n/a	n/a	3,173 (3.44 %)	17,812 (20.00 %)	n/a	40.37 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	10,432 (100.00 %)	10,016 (0.73 %)	16,766 (2.29 %)	513,575 (28.90 %)	0 (0 %)	8,365 (1.01 %)	8,737 (4.83 %)	7,687 (3.85 %)
1610	Piry virus (BeAn2423 2018) GCF_002816055.1	n/a	5 (96.19 %)	n/a	n/a	n/a	43.18 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.33 %)	12 (1.08 %)	0 (0 %)	1 (1.15 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1611	Plasmodium malariae (2016) GCF_900090045.1	5,965 (37.07 %)	n/a	n/a	n/a	n/a	24.38 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	62 (100.00 %)	n/a	47,855 (7.58 %)	320,327 (54.68 %)	0 (0 %)	10,972 (1.65 %)	21 (0.02 %)	4 (0.00 %)
1612	Plesiomonas shigelloides (7A 2021) GCF_020991025.1	n/a	3,477 (84.32 %)	n/a	n/a	n/a	51.72 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	192 (0.54 %)	15,818 (7.45 %)	0 (0 %)	565 (1.84 %)	4 (99.81 %)	2 (0.08 %)
1613	Poliovirus 2 (Lansing 2023) GCA_003108605.1	n/a	1 (89.03 %)	n/a	n/a	n/a	46.71 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.73 %)	1 (4.73 %)
1614	Poliovirus 3 (2023) GCA_008766715.1	n/a	1 (89.09 %)	n/a	n/a	n/a	46.90 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.11 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (5.49 %)	1 (5.49 %)
1615	Porcisia hertigi (C119 2021 refseq) GCF_017918235.1	7,891 (42.07 %)	n/a	695 (1.21 %)	2,952 (42.86 %)	n/a	56.02 (100.00 %)	0 (0 %)	5 (0.00 %)	74 (100.00 %)	41,628 (4.32 %)	12,596 (4.67 %)	201,002 (23.43 %)	0 (0 %)	29,607 (10.30 %)	106 (99.30 %)	750 (1.56 %)
1616	pork tapeworm (TsM 2016) GCA_001870725.1	n/a	11,854 (11.28 %)	1,585 (0.91 %)	8,936 (9.77 %)	n/a	43.00 (99.98 %)	42,701 (0.04 %)	42,701 (0.04 %)	55,832 (99.96 %)	18,673 (0.65 %)	6,510 (0.49 %)	547,721 (10.54 %)	1 (0.00 %)	4,364 (0.55 %)	13,165 (4.00 %)	9,952 (2.79 %)
1617	potato late blight agent (T30-4 2009) GCF_000142945.1	18,384 (12.49 %)	n/a	1,607 (0.59 %)	40,824 (31.88 %)	n/a	50.97 (83.21 %)	13,367 (16.81 %)	13,367 (16.81 %)	18,288 (83.19 %)	90,146 (49.19 %)	24,906 (4.71 %)	456,029 (29.10 %)	4 (0.00 %)	149,406 (8.13 %)	10,666 (15.67 %)	20,511 (17.44 %)
1618	Powassan virus (LB 1993) GCF_000860485.1	n/a	1 (94.55 %)	n/a	n/a	n/a	53.32 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (1.20 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.47 %)	1 (3.47 %)
1619	powdery mildews (DRCT72020 2022) GCA_022627015.2	n/a	17,328 (31.97 %)	1,384 (1.93 %)	9,258 (18.88 %)	n/a	43.06 (99.92 %)	219 (0.04 %)	219 (0.04 %)	12,576 (99.96 %)	8,003 (0.57 %)	6,668 (0.68 %)	163,027 (14.56 %)	88 (0.06 %)	2,516 (0.41 %)	6,279 (7.27 %)	5,303 (6.19 %)
1620	Primate norovirus (SimianNoV-nj 2016) GCF_001755385.1	n/a	3 (97.68 %)	n/a	n/a	n/a	48.57 (99.96 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	6 (1.52 %)	1 (0.43 %)	7 (1.64 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1621	Primate T-lymphotropic virus 1 (Tan90 2000) GCF_000861125.1	n/a	4 (68.45 %)	n/a	n/a	n/a	53.76 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (2.27 %)	0 (0 %)	1 (16.73 %)	3 (15.46 %)	3 (15.46 %)
1622	Primate T-lymphotropic virus 3 (CTO-604 2002) GCF_000847845.1	n/a	7 (60.22 %)	n/a	n/a	n/a	53.22 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.66 %)	0 (0 %)	1 (15.56 %)	3 (6.99 %)	3 (6.99 %)
1623	Proteus mirabilis (ATCC 29906 2009) GCF_000160755.1	n/a	3,719 (85.77 %)	n/a	n/a	n/a	38.61 (98.71 %)	61 (1.29 %)	62 (1.29 %)	115 (98.71 %)	n/a	107 (0.19 %)	23,643 (12.54 %)	0 (0 %)	148 (0.35 %)	48 (1.46 %)	43 (1.30 %)
1624	Proteus mirabilis (HI4320 2008) GCF_000069965.1	n/a	3,801 (85.97 %)	n/a	n/a	n/a	38.88 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	138 (0.63 %)	23,800 (12.46 %)	0 (0 %)	361 (0.83 %)	82 (2.40 %)	75 (2.21 %)
1625	Proteus vulgaris (USDA-ARS-USMARC-49741 2022) GCF_025200655.1	n/a	3,721 (85.75 %)	n/a	n/a	n/a	37.95 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	126 (0.22 %)	24,613 (13.20 %)	0 (0 %)	98 (0.27 %)	30 (1.40 %)	28 (1.14 %)
1626	Protoparvovirus primate1 (BF.86 2018) GCF_002827465.1	n/a	5 (93.20 %)	n/a	n/a	n/a	40.10 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.78 %)	1 (1.27 %)	20 (5.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1627	Providencia stuartii (41 2024) GCF_035747985.1	n/a	4,274 (84.50 %)	n/a	n/a	n/a	41.62 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	103 (0.37 %)	20,283 (8.88 %)	0 (0 %)	204 (0.65 %)	201 (4.60 %)	197 (4.44 %)
1628	Pseudomonas aeruginosa (PA14 2024) GCF_045689255.1	n/a	6,050 (90.13 %)	n/a	n/a	n/a	66.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	222 (0.42 %)	60,849 (23.81 %)	0 (0 %)	343 (0.60 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
1629	Pseudomonas aeruginosa (PAO1 2006) GCF_000006765.1	n/a	5,677 (89.62 %)	n/a	n/a	n/a	66.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	208 (0.43 %)	58,643 (23.70 %)	0 (0 %)	293 (0.54 %)	1 (100.00 %)	0 (0.00 %)
1630	Pulau reovirus (2018) GCF_002829605.1	n/a	12 (96.55 %)	n/a	n/a	n/a	48.18 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	7 (10.97 %)	7 (10.97 %)
1631	Punta Toro virus (Adames 2018) GCF_002815115.1	n/a	4 (92.61 %)	n/a	n/a	n/a	40.36 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (1.74 %)	3 (0.77 %)	16 (3.35 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1632	Punta Toro virus (PAN472868 2015) GCF_001021295.1	n/a	4 (92.38 %)	n/a	n/a	n/a	39.48 (99.92 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	4 (0.98 %)	8 (1.26 %)	8 (2.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1633	Puumala orthohantavirus (Sotkamo 2003) GCF_000854405.1	n/a	3 (39.37 %)	n/a	n/a	n/a	36.97 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.66 %)	n/a	33 (3.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1634	Rabbit calicivirus Australia 1 (MIC-07 2008) GCF_000882575.1	n/a	2 (99.12 %)	n/a	n/a	n/a	47.88 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.68 %)	1 (3.68 %)
1635	Rabbit hemorrhagic disease virus (FRG 2000) GCF_000861285.1	n/a	2 (99.09 %)	n/a	n/a	n/a	50.20 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.61 %)	1 (0.56 %)	8 (1.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1636	Rabbit vesivirus (2006) GCF_000867805.1	n/a	3 (96.54 %)	n/a	n/a	n/a	47.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.01 %)	1 (1.01 %)	8 (1.87 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (7.00 %)	2 (7.00 %)
1637	Rabies lyssavirus (1993) GCF_000859625.1	n/a	5 (95.29 %)	n/a	n/a	n/a	45.10 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (1.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1638	Ralstonia pickettii (2019) GCF_902374465.1	n/a	4,974 (89.33 %)	n/a	n/a	n/a	63.65 (99.79 %)	0 (0 %)	12 (0.21 %)	17 (100.00 %)	n/a	157 (0.17 %)	36,066 (14.74 %)	4 (0.02 %)	73 (0.14 %)	18 (99.97 %)	17 (99.94 %)
1639	rat lungworm (Guangzhou 2019) GCA_009735665.1	n/a	10,314 (5.22 %)	4,594 (1.43 %)	11,452 (4.82 %)	n/a	41.51 (93.28 %)	8,801 (6.72 %)	8,801 (6.72 %)	35,378 (93.28 %)	47,839 (0.91 %)	38,514 (3.52 %)	1,516,389 (28.17 %)	78 (0.05 %)	80,819 (6.42 %)	19,259 (2.44 %)	3,847 (0.62 %)
1640	rat tapeworm (2018) GCA_900618445.1	n/a	11,271 (8.98 %)	1,456 (0.64 %)	9,408 (6.90 %)	n/a	35.19 (99.31 %)	4,831 (0.68 %)	4,831 (0.68 %)	18,741 (99.32 %)	28,303 (0.69 %)	6,167 (0.19 %)	1,254,549 (22.82 %)	32 (0.00 %)	2,997 (0.19 %)	1,308 (0.23 %)	1,160 (0.20 %)
1641	rat tapeworm (WMS-il1 laboratory inbred isolate 2019) GCA_902177915.1	n/a	19,651 (10.41 %)	1,548 (0.69 %)	5,656 (7.10 %)	n/a	35.26 (94.86 %)	0 (0 %)	8,764 (5.15 %)	719 (100.00 %)	27,836 (0.67 %)	5,493 (0.18 %)	1,271,243 (21.59 %)	214 (0.14 %)	3,752 (0.76 %)	1,340 (0.22 %)	1,199 (0.20 %)
1642	Rhesus monkey (2019 U. Washington) GCF_003339765.1	86,732 (3.15 %)	n/a	20,455 (1.85 %)	21,565 (1.21 %)	n/a	41.00 (98.84 %)	244 (1.16 %)	248 (1.16 %)	3,268 (98.84 %)	5,469,991 (52.68 %)	993,786 (5.32 %)	16,005,457 (38.50 %)	1 (0.00 %)	1,431,525 (2.74 %)	86,250 (1.31 %)	28,575 (0.73 %)
1643	Rhinovirus A (1993) GCF_000862245.1	n/a	1 (90.81 %)	n/a	n/a	n/a	39.05 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1644	rhinovirus A1 (ATCC VR-1559 2018) GCF_002816835.1	n/a	1 (90.75 %)	n/a	n/a	n/a	37.47 (99.97 %)	3 (0.04 %)	3 (0.04 %)	4 (99.96 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (2.02 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1645	rhinovirus B14 (2000) GCF_000861265.1	n/a	1 (90.68 %)	n/a	n/a	n/a	40.58 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1646	rhinovirus B3 (2018) GCF_002816855.1	n/a	1 (90.69 %)	n/a	n/a	n/a	39.94 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1647	Rhinovirus C (024 2007) GCF_000872325.1	n/a	1 (90.65 %)	n/a	n/a	n/a	42.80 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1648	rice blast fungus GCF_000002495.2	13,029 (54.96 %)	n/a	1,453 (2.71 %)	6,896 (23.76 %)	n/a	51.61 (99.93 %)	163 (0.07 %)	163 (0.07 %)	216 (99.93 %)	14,038 (1.31 %)	6,167 (0.68 %)	85,770 (13.75 %)	4 (0.01 %)	2,297 (1.68 %)	46 (39.22 %)	1,687 (17.34 %)
1649	Rickettsia akari str. (Hartford 2007) GCF_000018205.1	n/a	1,295 (80.47 %)	n/a	n/a	n/a	32.33 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	49 (0.36 %)	11,383 (19.29 %)	0 (0 %)	44 (0.31 %)	3 (0.14 %)	2 (0.12 %)
1650	Rickettsia asembonensis (NMRCii 2016) GCF_000828125.2	n/a	1,671 (86.06 %)	n/a	n/a	n/a	32.24 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	88 (100.00 %)	n/a	55 (0.27 %)	11,795 (21.71 %)	0 (0 %)	71 (0.41 %)	6 (0.18 %)	4 (0.14 %)
1651	Rickettsia asiatica (Maytaro1284 2019) GCF_007989425.1	n/a	1,663 (83.05 %)	n/a	n/a	n/a	32.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	54 (0.41 %)	11,712 (19.66 %)	0 (0 %)	59 (0.49 %)	5 (0.17 %)	4 (0.14 %)
1652	Rickettsia australis str. (Cutlack 2012) GCF_000284155.1	n/a	1,444 (80.68 %)	n/a	n/a	n/a	32.28 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	53 (0.39 %)	11,054 (19.38 %)	0 (0 %)	95 (1.04 %)	2 (0.11 %)	2 (0.11 %)
1653	Rickettsia bellii (RML369-C 2006) GCF_000012385.1	n/a	1,537 (86.45 %)	n/a	n/a	n/a	31.65 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	94 (0.49 %)	12,640 (20.23 %)	0 (0 %)	117 (1.42 %)	3 (0.13 %)	3 (0.13 %)
1654	Rickettsia canadensis str. (CA410 2012) GCF_000283915.1	n/a	1,066 (77.84 %)	n/a	n/a	n/a	31.01 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	47 (0.61 %)	11,429 (21.81 %)	0 (0 %)	50 (0.31 %)	2 (0.13 %)	2 (0.13 %)
1655	Rickettsia conorii str. (Malish 7 2001) GCF_000007025.1	n/a	1,466 (82.15 %)	n/a	n/a	n/a	32.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	30 (0.34 %)	12,411 (21.08 %)	0 (0 %)	48 (0.32 %)	4 (0.15 %)	4 (0.15 %)
1656	Rickettsia endosymbiont of Aspidapion aeneum (54715 2024) GCF_964030775.1	n/a	1,884 (86.07 %)	n/a	n/a	n/a	34.61 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	112 (1.81 %)	12,759 (23.17 %)	0 (0 %)	639 (4.10 %)	15 (0.47 %)	10 (0.39 %)
1657	Rickettsia endosymbiont of Cantharis rufa (54716 2024) GCF_964026445.1	n/a	1,846 (80.68 %)	n/a	n/a	n/a	32.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	182 (0.86 %)	9,507 (22.31 %)	0 (0 %)	607 (7.95 %)	4 (0.13 %)	3 (0.11 %)
1658	Rickettsia endosymbiont of Cardiosporidium cionae (ESH_2018B 2020) GCF_015476335.1	n/a	945 (87.85 %)	n/a	n/a	n/a	29.06 (99.99 %)	336 (0.04 %)	336 (0.04 %)	365 (99.96 %)	n/a	129 (1.24 %)	9,961 (21.35 %)	0 (0 %)	146 (1.34 %)	1 (0.02 %)	1 (0.02 %)
1659	Rickettsia endosymbiont of Ceutorhynchus obstrictus (54717 2024) GCF_964026565.1	n/a	2,100 (85.70 %)	n/a	n/a	n/a	34.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	150 (1.85 %)	14,389 (22.91 %)	0 (0 %)	717 (4.04 %)	14 (0.37 %)	9 (0.30 %)
1660	Rickettsia endosymbiont of Culicoides newsteadi (RiCNE 2017) GCF_002259525.1	n/a	1,486 (81.93 %)	n/a	n/a	n/a	33.05 (99.96 %)	0 (0 %)	12 (0.02 %)	193 (100.00 %)	n/a	114 (0.94 %)	9,963 (16.71 %)	0 (0 %)	138 (0.80 %)	5 (0.15 %)	2 (0.10 %)
1661	Rickettsia endosymbiont of Gonocerus acuteangulatus (54736 2024) GCF_964026435.1	n/a	2,497 (85.36 %)	n/a	n/a	n/a	31.90 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	182 (1.20 %)	4,555 (20.64 %)	0 (0 %)	1,390 (16.80 %)	2 (0.08 %)	2 (0.08 %)
1662	Rickettsia endosymbiont of Halotydeus destructor (MaVIC_2019 2025) GCF_049278075.1	n/a	1,270 (84.99 %)	n/a	n/a	n/a	33.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	n/a	79 (0.47 %)	12,772 (23.07 %)	0 (0 %)	73 (0.44 %)	9 (0.26 %)	6 (0.20 %)
1663	Rickettsia endosymbiont of Lasioglossum villosulum (54739 2024) GCF_964026455.1	n/a	1,503 (86.20 %)	n/a	n/a	n/a	31.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	53 (0.56 %)	12,793 (20.33 %)	0 (0 %)	97 (0.58 %)	2 (0.09 %)	2 (0.09 %)
1664	Rickettsia endosymbiont of Nabis limbatus (54738 2025) GCF_965196655.1	n/a	2,175 (84.95 %)	n/a	n/a	n/a	32.05 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	53 (0.40 %)	8,540 (21.06 %)	0 (0 %)	664 (13.14 %)	3 (0.09 %)	3 (0.09 %)
1665	Rickettsia endosymbiont of Oedothorax gibbosus (Oegibbosus-W744x776 2022) GCF_936269705.1	n/a	2,904 (83.33 %)	n/a	n/a	n/a	32.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	91 (1.13 %)	9,163 (18.03 %)	0 (0 %)	890 (16.00 %)	3 (0.07 %)	2 (0.06 %)
1666	Rickettsia endosymbiont of Orchestes rusci (54718 2024) GCF_964030945.1	n/a	2,166 (84.76 %)	n/a	n/a	n/a	34.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	5 (100.00 %)	n/a	156 (1.61 %)	14,897 (22.38 %)	0 (0 %)	738 (3.63 %)	13 (0.30 %)	7 (0.19 %)
1667	Rickettsia endosymbiont of Pantilius tunicatus (54737 2024) GCF_964291875.1	n/a	2,059 (85.27 %)	n/a	n/a	n/a	31.67 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	86 (0.48 %)	9,545 (17.11 %)	0 (0 %)	208 (4.88 %)	3 (0.10 %)	3 (0.10 %)
1668	Rickettsia endosymbiont of Polydrusus tereticollis (54719 2024) GCF_964026385.1	n/a	2,146 (84.17 %)	n/a	n/a	n/a	33.68 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	122 (1.29 %)	4,398 (18.03 %)	0 (0 %)	811 (11.58 %)	7 (0.12 %)	5 (0.10 %)
1669	Rickettsia endosymbiont of Rhinocyllus conicus (54720 2024) GCF_964026465.1	n/a	1,872 (86.07 %)	n/a	n/a	n/a	31.84 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	70 (0.33 %)	13,747 (20.84 %)	0 (0 %)	103 (3.66 %)	2 (0.09 %)	2 (0.09 %)
1670	Rickettsia endosymbiont of Seladonia tumulorum (54740 2024) GCF_964030815.1	n/a	1,483 (86.26 %)	n/a	n/a	n/a	31.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	50 (0.50 %)	12,589 (20.25 %)	0 (0 %)	101 (0.58 %)	2 (0.10 %)	2 (0.10 %)
1671	Rickettsia endosymbiont of Urophora cardui (54735 2024) GCF_964030725.1	n/a	3,628 (81.93 %)	n/a	n/a	n/a	32.78 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	7 (100.00 %)	n/a	134 (2.34 %)	16,320 (29.82 %)	0 (0 %)	3,552 (32.76 %)	2 (0.05 %)	2 (0.05 %)
1672	Rickettsia felis (LSU-Lb 2014) GCF_000804505.1	n/a	1,718 (83.73 %)	n/a	n/a	n/a	32.44 (99.99 %)	31 (0.00 %)	31 (0.00 %)	74 (100.00 %)	n/a	88 (0.63 %)	13,412 (20.99 %)	0 (0 %)	180 (1.00 %)	3 (0.11 %)	2 (0.10 %)
1673	Rickettsia fournieri (AUS118 2018) GCF_900243065.1	n/a	1,605 (84.13 %)	n/a	n/a	n/a	32.36 (99.97 %)	1 (0.03 %)	6 (0.03 %)	6 (99.97 %)	n/a	51 (0.22 %)	11,039 (19.81 %)	0 (0 %)	81 (1.70 %)	2 (0.10 %)	2 (0.10 %)
1674	Rickettsia gravesii (BWI-1 2013) GCF_000485845.1	n/a	1,573 (83.61 %)	n/a	n/a	n/a	32.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	29 (100.00 %)	n/a	40 (0.20 %)	11,538 (20.03 %)	0 (0 %)	26 (0.16 %)	4 (0.15 %)	3 (0.13 %)
1675	Rickettsia helvetica (OB144 2024) GCF_963970025.1	n/a	1,630 (83.35 %)	n/a	n/a	n/a	32.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	55 (0.53 %)	11,962 (19.88 %)	0 (0 %)	104 (0.66 %)	3 (0.13 %)	3 (0.13 %)
1676	Rickettsia honei (RB 2012) GCF_000263055.1	n/a	1,492 (82.51 %)	n/a	n/a	n/a	32.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	n/a	30 (0.12 %)	12,362 (20.94 %)	0 (0 %)	21 (0.19 %)	4 (0.16 %)	4 (0.16 %)
1677	Rickettsia hoogstraalii (Croatica 2014) GCF_000825685.1	n/a	1,732 (84.46 %)	n/a	n/a	n/a	32.38 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	3 (100.00 %)	n/a	85 (0.73 %)	12,688 (21.64 %)	0 (0 %)	148 (0.77 %)	5 (0.16 %)	4 (0.14 %)
1678	Rickettsia japonica (YH 2011) GCF_000283595.1	n/a	1,481 (82.89 %)	n/a	n/a	n/a	32.35 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	50 (0.44 %)	12,569 (21.26 %)	0 (0 %)	39 (0.27 %)	3 (0.13 %)	3 (0.13 %)
1679	Rickettsia koreansis (CNH17-7 2025) GCF_046532895.1	n/a	1,582 (83.31 %)	n/a	n/a	n/a	32.44 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	9 (100.00 %)	n/a	65 (0.33 %)	11,624 (19.28 %)	0 (0 %)	35 (0.29 %)	3 (0.12 %)	3 (0.12 %)
1680	Rickettsia monacensis (IrR/Munich 2015) GCF_000499665.2	n/a	1,573 (82.82 %)	n/a	n/a	n/a	32.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	47 (0.32 %)	7,165 (21.15 %)	0 (0 %)	264 (6.23 %)	5 (0.15 %)	3 (0.12 %)
1681	Rickettsia prowazekii str. (Chernikova 2012) GCF_000277165.1	n/a	888 (77.32 %)	n/a	n/a	n/a	29.01 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	32 (0.14 %)	11,829 (24.22 %)	0 (0 %)	9 (0.14 %)	2 (0.14 %)	2 (0.14 %)
1682	Rickettsia rhipicephali str. (3-7-female6-CWPP 2012) GCF_000284075.1	n/a	1,498 (81.99 %)	n/a	n/a	n/a	32.39 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	48 (0.37 %)	12,708 (20.99 %)	0 (0 %)	41 (0.29 %)	4 (0.15 %)	3 (0.13 %)
1683	Rickettsia rickettsii str. 'Sheila Smith' (Sheila Smith 2007) GCF_000018225.1	n/a	1,430 (81.14 %)	n/a	n/a	n/a	32.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	39 (0.43 %)	12,114 (20.73 %)	0 (0 %)	51 (0.39 %)	4 (0.16 %)	4 (0.16 %)
1684	Rickettsia sibirica (246 2003) GCF_000166935.1	n/a	1,434 (82.46 %)	n/a	n/a	n/a	32.47 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	1 (100.00 %)	n/a	30 (0.23 %)	12,207 (21.06 %)	0 (0 %)	30 (0.25 %)	4 (0.16 %)	4 (0.16 %)
1685	Rickettsia slovaca (13-B 2011) GCF_000237845.1	n/a	1,476 (82.75 %)	n/a	n/a	n/a	32.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	40 (0.43 %)	12,412 (20.98 %)	0 (0 %)	41 (0.39 %)	4 (0.16 %)	4 (0.16 %)
1686	Rickettsia tamurae (AT-1 2014) GCF_000751075.1	n/a	1,711 (85.21 %)	n/a	n/a	n/a	32.47 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	27 (100.00 %)	n/a	60 (0.28 %)	12,320 (20.35 %)	0 (0 %)	70 (0.31 %)	2 (0.10 %)	2 (0.10 %)
1687	Rickettsia tillamookensis (Tillamook 23 2022) GCF_016743795.2	n/a	1,414 (85.04 %)	n/a	n/a	n/a	32.40 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	76 (0.79 %)	12,260 (21.13 %)	0 (0 %)	212 (1.18 %)	5 (0.25 %)	5 (0.25 %)
1688	Rickettsia typhi str. (Wilmington 2004) GCF_000008045.1	n/a	875 (76.56 %)	n/a	n/a	n/a	28.92 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	48 (0.30 %)	11,755 (23.68 %)	0 (0 %)	11 (0.11 %)	2 (0.14 %)	2 (0.14 %)
1689	Rift Valley fever virus (ZH-548 2010) GCF_000847345.1	n/a	4 (95.24 %)	n/a	n/a	n/a	45.11 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.49 %)	n/a	8 (1.04 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1690	Rockport virus (MSB57412 2018) GCF_002830685.1	n/a	3 (92.73 %)	n/a	n/a	n/a	35.05 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.71 %)	n/a	22 (1.83 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1691	root-knot nematode (2017) GCA_900003945.1	n/a	n/a	3,900 (1.03 %)	7,442 (2.19 %)	n/a	29.97 (99.86 %)	36,721 (0.13 %)	36,721 (0.13 %)	68,062 (99.87 %)	163,607 (3.47 %)	186,149 (7.43 %)	2,165,769 (49.90 %)	5,152 (0.75 %)	120,724 (8.42 %)	2,637 (0.40 %)	773 (0.10 %)
1692	Rosavirus A2 (GA7403 2014) GCF_000918175.1	n/a	1 (82.95 %)	n/a	n/a	n/a	51.41 (99.99 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.67 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (4.60 %)	1 (4.60 %)
1693	Ross River virus (QML 1 2023) GCF_002889255.1	n/a	2 (94.13 %)	n/a	n/a	n/a	51.05 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.26 %)	3 (2.11 %)	6 (2.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	7 (49.69 %)	7 (49.61 %)
1694	Rotavirus A (RVA/Simian-tc/ZAF/SA11-H96/1958/G3P5B[2] 2008) GCF_000880735.1	n/a	12 (94.00 %)	n/a	n/a	n/a	33.67 (99.88 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	4 (0.19 %)	n/a	21 (1.24 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1695	Rotavirus C (Bristol 2005) GCF_000864225.1	n/a	11 (95.04 %)	n/a	n/a	n/a	31.63 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	11 (100.00 %)	7 (1.19 %)	n/a	33 (2.72 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1696	Rubella virus (RVi/Bismarck.ND.USA/23.08/2B 2023) GCF_024749945.1	n/a	2 (97.77 %)	n/a	n/a	n/a	69.96 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.29 %)	3 (0.97 %)	54 (9.60 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (98.93 %)	1 (97.15 %)
1697	rust fungi M.larici-populina 98AG31 GCF_000204055.1	16,255 (20.30 %)	n/a	1,082 (0.79 %)	14,934 (16.66 %)	n/a	41.00 (96.60 %)	2,792 (3.41 %)	2,792 (3.41 %)	3,254 (96.59 %)	54,820 (20.89 %)	24,657 (1.82 %)	479,225 (16.38 %)	4 (0.00 %)	16,887 (2.52 %)	7,595 (3.93 %)	5,824 (2.79 %)
1698	rust fungi P.graminis f. sp. tritici CRL 75-36-700-3 GCF_000149925.1	15,986 (26.56 %)	n/a	1,101 (0.96 %)	10,591 (14.83 %)	n/a	43.35 (91.99 %)	4,170 (8.03 %)	4,170 (8.03 %)	4,563 (91.97 %)	60,389 (24.44 %)	26,202 (2.34 %)	320,740 (19.73 %)	1 (0.00 %)	18,962 (3.36 %)	13,967 (10.10 %)	10,740 (7.40 %)
1699	rust P.sorghi (RO10H11247 2015) GCA_001263375.1	n/a	21,527 (31.55 %)	1,005 (1.03 %)	6,003 (8.82 %)	n/a	43.15 (71.37 %)	13,266 (28.65 %)	13,266 (28.65 %)	28,981 (71.35 %)	25,285 (1.59 %)	15,843 (0.93 %)	369,521 (17.49 %)	388 (0.64 %)	7,416 (0.99 %)	9,453 (6.05 %)	8,171 (4.98 %)
1700	rust P.striiformis (93-210 2018) GCA_002920065.1	n/a	15,090 (21.75 %)	1,137 (0.94 %)	11,565 (12.77 %)	n/a	44.39 (100.00 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	493 (100.00 %)	60,400 (15.84 %)	27,529 (2.84 %)	307,281 (18.63 %)	0 (0 %)	28,095 (4.04 %)	14,065 (11.16 %)	11,307 (8.21 %)
1701	rust P.striiformis (93TX-2 2018) GCA_002920205.1	n/a	14,629 (22.68 %)	1,096 (0.99 %)	10,556 (12.70 %)	n/a	44.40 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	562 (100.00 %)	54,488 (15.68 %)	24,344 (2.64 %)	317,043 (15.53 %)	0 (0 %)	22,694 (3.62 %)	12,859 (11.07 %)	11,377 (8.77 %)
1702	Saint Louis encephalitis virus (Kern217 2005) GCF_000866785.1	n/a	1 (94.09 %)	n/a	n/a	n/a	49.75 (100.00 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.35 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.05 %)	1 (3.05 %)
1703	Salivirus A (02394-01 2009) GCF_000885035.1	n/a	1 (89.05 %)	n/a	n/a	n/a	56.70 (99.95 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.51 %)	n/a	14 (3.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (36.06 %)	3 (36.06 %)
1704	Salivirus FHB (SaliV-FHB 2014) GCF_000926235.1	n/a	1 (88.75 %)	n/a	n/a	n/a	57.26 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.35 %)	1 (0.38 %)	13 (1.96 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (63.43 %)	2 (63.43 %)
1705	Salivirus NG-J1 (NG-J1 2009) GCF_000886535.1	n/a	1 (89.26 %)	n/a	n/a	n/a	56.70 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	17 (2.15 %)	0 (0 %)	1 (0.80 %)	2 (48.16 %)	2 (48.16 %)
1706	Salmonella bongori (NCTC 12419 2011) GCF_000252995.1	n/a	4,225 (88.28 %)	n/a	n/a	n/a	51.33 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	90 (0.24 %)	20,125 (7.97 %)	0 (0 %)	148 (0.40 %)	1 (99.99 %)	1 (0.01 %)
1707	Salmonella enterica (Typhimurium LT2 2016) GCF_000006945.2	n/a	4,665 (87.28 %)	n/a	n/a	n/a	52.24 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	77 (0.25 %)	25,684 (9.55 %)	0 (0 %)	149 (0.27 %)	2 (99.99 %)	1 (0.01 %)
1708	San Miguel sea lion virus 8 (2014) GCF_000925155.1	n/a	3 (98.48 %)	n/a	n/a	n/a	51.28 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.14 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (47.28 %)	3 (47.28 %)
1709	sandfly fever Turkey virus (Izmir 19 2011) GCF_000891955.1	n/a	4 (93.98 %)	n/a	n/a	n/a	43.66 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (2.77 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1710	Sapovirus (Hu/Dresden/pJG-Sap01/DE 2004) GCF_000854265.1	n/a	3 (98.76 %)	n/a	n/a	n/a	50.63 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.06 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.94 %)	1 (3.94 %)
1711	Sapovirus (Hu/GI/Sapporo/MT-2010/1982 2023) GCF_008792745.1	n/a	3 (98.75 %)	n/a	n/a	n/a	50.70 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.09 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (5.79 %)	1 (5.79 %)
1712	Sapovirus (Mc10 2004) GCF_000853825.1	n/a	2 (98.38 %)	n/a	n/a	n/a	51.46 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1713	Sapovirus C12 (C12 2004) GCF_000855765.1	n/a	2 (98.27 %)	n/a	n/a	n/a	51.73 (99.99 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (7.50 %)	2 (7.50 %)
1714	Sapovirus Hu/Nagoya/NGY-1/2012/JPN (Hu/SaV/Nagoya/NGY-1/2012/JPN 2015) GCF_001008475.1	n/a	2 (98.47 %)	n/a	n/a	n/a	49.71 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.60 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1715	SARS coronavirus Tor2 (Tor2 2003) GCF_000864885.1	n/a	16 (97.60 %)	n/a	n/a	n/a	40.76 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.08 %)	n/a	18 (0.74 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1716	SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19) GCF_009858895.2	n/a	13 (97.85 %)	n/a	n/a	n/a	37.98 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.24 %)	1 (0.11 %)	33 (1.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (0.73 %)	1 (0.73 %)
1717	scrub typhus mite (UoL-UT 2018) GCA_003675905.2	n/a	14,667 (12.92 %)	2,993 (1.92 %)	10,736 (8.91 %)	n/a	33.61 (99.85 %)	267 (0.04 %)	267 (0.04 %)	66,977 (99.96 %)	31,710 (1.17 %)	9,049 (0.44 %)	996,608 (26.63 %)	28 (0.00 %)	1,579 (0.11 %)	734 (0.26 %)	761 (0.27 %)
1718	Semliki Forest virus (1987) GCF_000860285.1	n/a	4 (96.64 %)	n/a	n/a	n/a	53.22 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.66 %)	n/a	4 (1.46 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (92.56 %)	1 (92.56 %)
1719	Seoul orthohantavirus (80-39 2003) GCF_000855645.1	n/a	3 (93.29 %)	n/a	n/a	n/a	39.00 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.56 %)	n/a	14 (1.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1720	Serratia marcescens (ELP1.10 2023) GCF_030291735.1	n/a	4,903 (88.60 %)	n/a	n/a	n/a	59.66 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	112 (0.16 %)	46,736 (20.72 %)	0 (0 %)	104 (0.31 %)	3 (99.77 %)	1 (0.00 %)
1721	Serratia marcescens subsp. marcescens (ATCC 13880 2021) GCF_017654245.1	n/a	4,920 (88.60 %)	n/a	n/a	n/a	59.78 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	117 (0.39 %)	46,807 (20.90 %)	0 (0 %)	103 (0.26 %)	1 (99.99 %)	0 (0.00 %)
1722	Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus (HNXH 2019) GCF_003087855.1	n/a	4 (98.45 %)	n/a	n/a	n/a	48.84 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.21 %)	n/a	5 (0.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1723	Sewage-associated gemycircularvirus-10a (BS3980 2015) GCF_000930855.1	n/a	4 (82.35 %)	n/a	n/a	n/a	52.52 (99.82 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.02 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (76.08 %)	2 (76.08 %)
1724	SFTS virus (HB29 2012) GCF_000897355.1	n/a	4 (96.58 %)	n/a	n/a	n/a	48.80 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.21 %)	n/a	2 (0.12 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1725	Shigella boydii (ESBL-W3-2 2017) GCF_002290485.1	n/a	4,719 (88.84 %)	n/a	n/a	n/a	50.63 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	154 (100.00 %)	n/a	83 (0.20 %)	18,773 (6.72 %)	0 (0 %)	94 (0.20 %)	164 (82.25 %)	84 (3.56 %)
1726	Shigella dysenteriae (SWHEFF_49 2022) GCF_022354085.1	n/a	5,020 (89.19 %)	n/a	n/a	n/a	50.62 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	121 (0.55 %)	22,011 (7.51 %)	0 (0 %)	292 (0.64 %)	11 (99.41 %)	14 (0.25 %)
1727	Shigella flexneri 2a str. (301 2011) GCF_000006925.2	n/a	4,439 (78.71 %)	n/a	n/a	n/a	50.65 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	3 (100.00 %)	n/a	88 (0.35 %)	14,141 (8.30 %)	0 (0 %)	360 (2.22 %)	18 (97.13 %)	20 (0.93 %)
1728	Shigella sonnei (ATCC 29930 2018) GCF_002950395.1	n/a	5,342 (89.24 %)	n/a	n/a	n/a	51.01 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	96 (0.59 %)	14,438 (9.03 %)	0 (0 %)	354 (2.22 %)	4 (99.85 %)	4 (0.25 %)
1729	simian adenovirus 1 (ATCC VR-195 2005) GCF_000847325.1	n/a	42 (94.47 %)	n/a	n/a	n/a	55.21 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (0.98 %)	1 (0.08 %)	49 (2.50 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	6 (69.90 %)	5 (68.27 %)
1730	Simian pegivirus (SPgVkrc SPgVkrc_RC08 2014) GCF_000921975.1	n/a	1 (91.31 %)	n/a	n/a	n/a	56.63 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.02 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (66.17 %)	3 (60.58 %)
1731	Simian T-cell lymphotropic virus 6 (Cmo8699AB 2008) GCF_000881775.1	n/a	8 (76.72 %)	n/a	n/a	n/a	51.89 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.79 %)	n/a	9 (1.53 %)	0 (0 %)	1 (15.84 %)	2 (8.06 %)	2 (8.06 %)
1732	Simian T-lymphotropic virus 2 (PP1664 STLV-2PP1664 2000) GCF_000860005.1	n/a	13 (80.53 %)	n/a	n/a	n/a	54.76 (100.00 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	23 (3.20 %)	0 (0 %)	1 (16.08 %)	2 (8.40 %)	2 (8.40 %)
1733	Sindbis virus (1993) GCF_000860545.1	n/a	5 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	50.91 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.34 %)	n/a	3 (0.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (93.38 %)	1 (93.38 %)
1734	Sinu virus (CoB 38d 2023) GCF_023157055.1	n/a	6 (93.02 %)	n/a	n/a	n/a	32.86 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	42 (4.53 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1735	Small anellovirus 1 (2005) GCF_000859305.1	n/a	3 (93.20 %)	n/a	n/a	n/a	38.22 (99.82 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.67 %)	10 (8.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1736	Small anellovirus 2 (2005) GCF_000860145.1	n/a	5 (91.76 %)	n/a	n/a	n/a	39.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.76 %)	n/a	4 (5.35 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1737	smallpox virus (India-1967, ssp. major Ind3 1993) GCF_000859885.1	n/a	197 (87.60 %)	n/a	n/a	n/a	32.73 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	31 (0.69 %)	7 (0.57 %)	1,031 (9.09 %)	0 (0 %)	2 (0.11 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1738	smut fungi S.reilianum SRZ2 (2011) GCA_000230245.1	n/a	9,869 (65.90 %)	1,013 (3.85 %)	1,301 (12.64 %)	n/a	59.73 (98.19 %)	0 (0 %)	873 (1.83 %)	45 (100.00 %)	9,892 (2.21 %)	2,735 (0.53 %)	117,814 (14.38 %)	1 (0.00 %)	50 (0.02 %)	40 (99.42 %)	17 (4.15 %)
1739	smut fungi U.maydis 521 GCF_000328475.2	6,814 (61.10 %)	n/a	1,248 (4.61 %)	4,425 (44.01 %)	n/a	54.03 (99.89 %)	227 (0.12 %)	227 (0.12 %)	254 (99.88 %)	8,532 (2.81 %)	5,012 (1.04 %)	84,647 (9.60 %)	4 (0.03 %)	661 (0.47 %)	31 (70.29 %)	21 (0.09 %)
1740	Soldado virus (TRVL 52214 2023) GCF_014883305.1	n/a	3 (95.70 %)	n/a	n/a	n/a	37.14 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.28 %)	1 (1.67 %)	45 (3.44 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1741	Songling virus (HLJ1202 2023) GCF_029888075.1	n/a	3 (95.45 %)	n/a	n/a	n/a	48.99 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.66 %)	5 (0.64 %)	15 (1.44 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1742	Sosuga virus (2012 2014) GCF_000924495.1	n/a	7 (90.76 %)	n/a	n/a	n/a	42.38 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.47 %)	1 (0.26 %)	7 (0.73 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1743	Southeast Asian liver fluke GCF_000715545.1	16,356 (4.12 %)	n/a	1,806 (0.23 %)	18,848 (4.82 %)	n/a	43.79 (92.22 %)	28,790 (7.79 %)	38,428 (7.79 %)	71,006 (92.21 %)	55,319 (0.59 %)	68,060 (3.01 %)	2,256,239 (16.36 %)	391 (0.12 %)	116,975 (5.54 %)	59,620 (4.15 %)	21,299 (1.14 %)
1744	southern cattle tick (Rmic-2018 2020 refseq) GCF_013339725.1	28,093 (1.81 %)	n/a	3,731 (0.12 %)	117,919 (5.00 %)	35,352 (1.88 %)	45.79 (99.99 %)	0 (0 %)	1,576 (0.01 %)	7,048 (100.00 %)	1,050,956 (4.24 %)	680,148 (3.55 %)	10,994,271 (39.37 %)	0 (0 %)	n/a	304,615 (16.98 %)	234,809 (5.42 %)
1745	southern house mosquito GCF_015732765.1	27,212 (6.86 %)	n/a	5,616 (1.11 %)	35,906 (7.85 %)	28,522 (7.00 %)	36.89 (95.44 %)	0 (0 %)	3,953 (4.56 %)	57 (100.00 %)	709,409 (37.92 %)	181,822 (9.14 %)	2,841,937 (53.98 %)	0 (0 %)	437,211 (5.95 %)	61,902 (9.50 %)	41,817 (6.45 %)
1746	southern house mosquito (JHB 2007 refseq) GCF_000209185.1	18,883 (4.69 %)	n/a	5,905 (1.14 %)	40,896 (8.79 %)	n/a	37.42 (93.28 %)	45,500 (6.75 %)	45,500 (6.75 %)	48,671 (93.25 %)	735,467 (35.07 %)	171,041 (5.71 %)	3,037,349 (50.41 %)	88 (0.02 %)	323,404 (5.87 %)	65,784 (9.49 %)	44,205 (6.42 %)
1747	soybean cyst nematode (TN10 2021) GCA_004148225.2	n/a	n/a	2,572 (1.17 %)	13,353 (11.47 %)	n/a	36.66 (98.94 %)	2,174 (1.06 %)	2,174 (1.06 %)	2,183 (98.94 %)	95,509 (3.35 %)	92,374 (7.88 %)	1,154,870 (43.12 %)	8 (0.00 %)	138,343 (13.04 %)	18,252 (7.26 %)	12,601 (4.01 %)
1748	Sphingobacterium multivorum (FDAARGOS_1203 2021) GCF_016894225.1	n/a	5,164 (87.90 %)	n/a	n/a	n/a	39.99 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	1 (100.00 %)	n/a	190 (0.17 %)	26,012 (9.53 %)	0 (0 %)	206 (0.47 %)	165 (1.37 %)	160 (1.42 %)
1749	spirochetes (HT31 2021) GCF_019668505.1	n/a	859 (93.42 %)	n/a	n/a	n/a	28.88 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	51 (0.56 %)	8,224 (22.61 %)	0 (0 %)	29 (0.24 %)	1 (0.03 %)	1 (0.03 %)
1750	spirochetes (MN14-1420 2017) GCF_001945665.1	n/a	1,329 (87.83 %)	n/a	n/a	n/a	27.89 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	16 (100.00 %)	n/a	148 (1.74 %)	12,866 (30.71 %)	0 (0 %)	198 (1.38 %)	3 (0.05 %)	3 (0.05 %)
1751	stable fly (8C7A2A5H3J4 2015 rewfseq) GCF_001015335.1	25,162 (4.09 %)	n/a	7,744 (1.16 %)	11,970 (2.65 %)	n/a	38.85 (84.55 %)	113,660 (15.50 %)	129,113 (15.50 %)	125,702 (84.50 %)	292,745 (1.79 %)	391,619 (8.42 %)	5,616,633 (48.71 %)	6,705 (0.32 %)	483,703 (3.74 %)	38,246 (1.55 %)	4,353 (0.18 %)
1752	Staphylococcus aureus subsp. aureus (COL 2005) GCF_000012045.1	n/a	2,794 (85.53 %)	n/a	n/a	n/a	32.81 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	138 (1.13 %)	21,581 (16.09 %)	0 (0 %)	401 (1.38 %)	16 (0.80 %)	14 (0.74 %)
1753	Staphylococcus aureus subsp. aureus (N315 2003) GCF_000009645.1	n/a	2,814 (85.23 %)	n/a	n/a	n/a	32.81 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	133 (0.97 %)	21,705 (16.00 %)	0 (0 %)	326 (0.91 %)	9 (0.51 %)	10 (0.56 %)
1754	Staphylococcus aureus subsp. aureus (NCTC 8325 2006) GCF_000013425.1	n/a	2,842 (84.14 %)	n/a	n/a	n/a	32.87 (100.00 %)	1 (0.00 %)	1 (0.00 %)	2 (100.00 %)	n/a	123 (0.93 %)	21,883 (16.18 %)	0 (0 %)	267 (0.77 %)	13 (0.63 %)	12 (0.60 %)
1755	Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 (FPR3757 2006) GCF_000013465.1	n/a	2,927 (85.46 %)	n/a	n/a	n/a	32.69 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4 (100.00 %)	n/a	145 (1.00 %)	22,236 (16.02 %)	0 (0 %)	375 (0.97 %)	13 (0.63 %)	12 (0.61 %)
1756	Staphylococcus phage 6ec (2014) GCF_000921075.1	n/a	144 (88.32 %)	n/a	n/a	n/a	29.29 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	34 (1.71 %)	10 (0.46 %)	603 (15.13 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1757	Steller sea lion vesivirus (V1415 SSL2004-250F 2008) GCF_000879655.1	n/a	3 (97.56 %)	n/a	n/a	n/a	48.57 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.29 %)	10 (1.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (13.70 %)	3 (13.70 %)
1758	Stenotrophomonas maltophilia (K279a 2008) GCF_000072485.1	n/a	4,524 (89.35 %)	n/a	n/a	n/a	66.32 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	337 (0.76 %)	44,643 (20.90 %)	0 (0 %)	423 (1.16 %)	1 (100.00 %)	1 (100.00 %)
1759	Stenotrophomonas maltophilia (NCTC10257 2017) GCF_900186865.1	n/a	4,686 (89.30 %)	n/a	n/a	n/a	66.12 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	370 (0.72 %)	45,386 (20.71 %)	0 (0 %)	376 (1.00 %)	1 (100.00 %)	1 (100.00 %)
1760	STL polyomavirus (MA138 2013) GCF_000904055.1	n/a	8 (92.55 %)	n/a	n/a	n/a	36.63 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (2.91 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1761	Streptobacillus moniliformis (DSM 12112 2009) GCF_000024565.1	n/a	1,568 (92.24 %)	n/a	n/a	n/a	26.28 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	128 (0.55 %)	15,317 (26.60 %)	0 (0 %)	192 (1.68 %)	12 (0.20 %)	12 (0.20 %)
1762	Streptococcus agalactiae (2603V/R 2002) GCF_000007265.1	n/a	2,230 (90.13 %)	n/a	n/a	n/a	35.65 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	69 (0.42 %)	13,098 (11.97 %)	0 (0 %)	54 (0.86 %)	26 (0.92 %)	25 (0.87 %)
1763	Streptococcus agalactiae (A909 2005) GCF_000012705.1	n/a	2,185 (90.12 %)	n/a	n/a	n/a	35.62 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	89 (0.55 %)	12,517 (11.49 %)	0 (0 %)	83 (0.92 %)	26 (0.97 %)	26 (0.97 %)
1764	Streptococcus agalactiae (NGBS128 2016) GCF_001552035.1	n/a	2,089 (90.05 %)	n/a	n/a	n/a	35.73 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	54 (0.66 %)	12,045 (11.29 %)	0 (0 %)	80 (0.95 %)	26 (0.91 %)	26 (0.91 %)
1765	Streptococcus mutans (FDAARGOS 1458 2021) GCF_019048645.1	n/a	2,007 (87.79 %)	n/a	n/a	n/a	36.87 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	31 (0.17 %)	12,755 (12.63 %)	0 (0 %)	63 (0.76 %)	13 (1.56 %)	11 (1.53 %)
1766	Streptococcus pneumoniae (2015) GCF_001457635.1	n/a	2,187 (88.32 %)	n/a	n/a	n/a	39.73 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	100 (0.84 %)	9,860 (9.60 %)	0 (0 %)	195 (0.92 %)	30 (0.94 %)	28 (0.83 %)
1767	Streptococcus pneumoniae (D39 2018) GCF_000014365.2	n/a	2,101 (88.44 %)	n/a	n/a	n/a	39.71 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	82 (0.59 %)	9,464 (9.43 %)	0 (0 %)	211 (0.91 %)	27 (0.83 %)	22 (0.75 %)
1768	Streptococcus pneumoniae (R6 2001) GCF_000007045.1	n/a	2,095 (88.44 %)	n/a	n/a	n/a	39.72 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	83 (0.60 %)	9,357 (9.34 %)	0 (0 %)	211 (0.91 %)	27 (0.83 %)	22 (0.75 %)
1769	Streptococcus pneumoniae (TIGR4 2012) GCF_000273445.1	n/a	2,212 (88.21 %)	n/a	n/a	n/a	39.69 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	114 (1.22 %)	10,233 (10.40 %)	0 (0 %)	328 (1.44 %)	30 (1.34 %)	26 (0.77 %)
1770	Streptococcus pyogenes (MGAS5005 2014) GCF_000011765.3	n/a	1,850 (88.04 %)	n/a	n/a	n/a	38.54 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	45 (0.20 %)	9,541 (9.96 %)	0 (0 %)	25 (0.77 %)	20 (1.13 %)	18 (1.00 %)
1771	Streptococcus pyogenes (NCTC12064 2018) GCF_900475035.1	n/a	1,738 (87.76 %)	n/a	n/a	n/a	38.55 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	38 (0.23 %)	8,844 (9.66 %)	0 (0 %)	33 (0.95 %)	16 (0.91 %)	14 (0.84 %)
1772	sudden oak death agent (14567 PR-15-019 primary hap 2021) GCA_020800235.1	n/a	15,587 (39.69 %)	1,527 (1.86 %)	22,614 (62.09 %)	n/a	54.31 (99.66 %)	0 (0 %)	29 (0.34 %)	27 (100.00 %)	9,735 (0.78 %)	9,605 (3.74 %)	94,890 (12.25 %)	0 (0 %)	15,072 (6.69 %)	42 (99.93 %)	161 (13.01 %)
1773	sudden oak death agent (Pr-102 primary hap 2021 refseq) GCF_020800215.1	15,506 (39.67 %)	n/a	1,461 (1.76 %)	22,415 (61.13 %)	n/a	54.37 (99.66 %)	50 (0.34 %)	50 (0.34 %)	78 (99.66 %)	8,935 (0.72 %)	9,528 (3.65 %)	117,380 (14.16 %)	0 (0 %)	17,976 (7.40 %)	34 (99.96 %)	156 (7.43 %)
1774	T.foetus (K 2016 refseq) GCF_001839685.1	25,030 (60.68 %)	n/a	885 (0.71 %)	2,811 (11.00 %)	n/a	31.17 (96.64 %)	11,448 (3.38 %)	11,448 (3.38 %)	12,927 (96.62 %)	24,925 (2.00 %)	17,837 (1.83 %)	612,529 (32.19 %)	121 (0.29 %)	11,988 (1.03 %)	727 (0.48 %)	662 (0.42 %)
1775	Tacheng Tick Virus 1 (TC253 2016) GCF_001755105.1	n/a	3 (90.86 %)	n/a	n/a	n/a	47.86 (99.97 %)	5 (0.03 %)	5 (0.03 %)	8 (99.97 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.17 %)	1 (2.17 %)
1776	taiga tick (Iper-2018 2020) GCA_013358835.2	n/a	28,510 (1.62 %)	4,029 (0.17 %)	113,601 (6.95 %)	n/a	46.00 (100.00 %)	17 (0.00 %)	17 (0.00 %)	11,614 (100.00 %)	826,632 (1.65 %)	594,326 (3.15 %)	9,982,700 (41.54 %)	0 (0 %)	463,894 (2.82 %)	119,125 (7.47 %)	206,660 (7.36 %)
1777	Tamdy virus (XJ01 2019) GCA_014883335.1	n/a	3 (93.06 %)	n/a	n/a	n/a	45.18 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.16 %)	n/a	23 (1.59 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1778	Tetragenococcus halophilus (MJ4 2016) GCF_001712815.1	n/a	2,347 (86.59 %)	n/a	n/a	n/a	35.99 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	80 (0.36 %)	17,869 (15.88 %)	0 (0 %)	113 (0.86 %)	11 (1.23 %)	11 (1.23 %)
1779	Thailand tick thogotovirus (THOV/Boophilus sp./Thailand 2023) GCF_023156685.1	n/a	7 (97.28 %)	n/a	n/a	n/a	45.06 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	24 (2.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1780	thelaziosis nematode (2018) GCA_900618365.1	n/a	10,912 (18.00 %)	2,482 (2.50 %)	2,066 (3.61 %)	n/a	29.95 (98.97 %)	2,627 (1.03 %)	2,627 (1.03 %)	8,405 (98.97 %)	32,475 (2.26 %)	16,151 (1.10 %)	716,857 (33.20 %)	0 (0 %)	2,115 (0.23 %)	55 (0.02 %)	50 (0.02 %)
1781	Thogotovirus thogotoense (SiAr 126 2004) GCF_000854245.1	n/a	7 (96.85 %)	n/a	n/a	n/a	48.02 (99.89 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	6 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (1.95 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1782	Thottapalayam virus (VRC 66412 2008) GCF_000879955.1	n/a	3 (94.84 %)	n/a	n/a	n/a	37.56 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.96 %)	4 (0.55 %)	9 (1.26 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1783	Tibrovirus congo (BASV-1 2019) GCF_002815815.1	n/a	8 (98.64 %)	n/a	n/a	n/a	38.79 (99.98 %)	1 (0.01 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.34 %)	n/a	10 (1.48 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1784	Tick-borne encephalitis virus (2000) GCF_000863125.1	n/a	1 (91.96 %)	n/a	n/a	n/a	53.78 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.48 %)	1 (0.44 %)	7 (0.87 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (7.65 %)	2 (7.65 %)
1785	Tick-borne encephalitis virus (Vasilchenko 2023) GCA_004788235.1	n/a	1 (93.76 %)	n/a	n/a	n/a	54.70 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.45 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (9.01 %)	4 (9.01 %)
1786	Torque teno midi virus 1 (MD1-032 2007) GCF_000870545.1	n/a	6 (73.90 %)	n/a	n/a	n/a	42.59 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (4.41 %)	2 (2.62 %)	15 (12.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (7.12 %)	0 (0.00 %)
1787	Torque teno midi virus 10 (MDJN14 2018) GCF_002818685.1	n/a	6 (73.73 %)	n/a	n/a	n/a	43.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (4.31 %)	2 (2.83 %)	7 (8.63 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (14.83 %)	0 (0.00 %)
1788	Torque teno midi virus 11 (MDJN47 2018) GCF_002818705.1	n/a	6 (73.86 %)	n/a	n/a	n/a	43.29 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (4.88 %)	1 (0.94 %)	12 (10.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.91 %)	0 (0.00 %)
1789	Torque teno midi virus 12 (MDJN51 2018) GCF_002818725.1	n/a	6 (73.45 %)	n/a	n/a	n/a	41.70 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (8.35 %)	1 (1.88 %)	9 (9.88 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1790	Torque teno midi virus 13 (MDJN69 2018) GCF_002818745.1	n/a	6 (73.78 %)	n/a	n/a	n/a	43.72 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (4.92 %)	1 (1.86 %)	13 (9.57 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.84 %)	0 (0.00 %)
1791	Torque teno midi virus 14 (MDJN97 2018) GCF_002818765.1	n/a	6 (73.84 %)	n/a	n/a	n/a	42.73 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (6.42 %)	1 (1.86 %)	12 (9.12 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.86 %)	0 (0.00 %)
1792	Torque teno midi virus 2 (MD2-013 2010) GCF_000887335.1	n/a	6 (73.90 %)	n/a	n/a	n/a	42.92 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.20 %)	1 (1.84 %)	9 (7.78 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.79 %)	0 (0.00 %)
1793	Torque teno midi virus 3 (2PoSMA 2018) GCF_002818545.1	n/a	2 (89.86 %)	n/a	n/a	n/a	38.65 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.00 %)	n/a	4 (3.85 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1794	Torque teno midi virus 4 (6PoSMA 2018) GCF_002818565.1	n/a	3 (89.24 %)	n/a	n/a	n/a	40.29 (99.84 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (5.99 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1795	Torque teno midi virus 5 (MDJHem2 2018) GCF_002818585.1	n/a	6 (73.91 %)	n/a	n/a	n/a	42.62 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (6.45 %)	2 (2.87 %)	20 (11.94 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.89 %)	0 (0.00 %)
1796	Torque teno midi virus 6 (MDJHem3-1 2018) GCF_002818605.1	n/a	6 (74.14 %)	n/a	n/a	n/a	43.04 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (4.60 %)	1 (1.88 %)	11 (10.54 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.91 %)	0 (0.00 %)
1797	Torque teno midi virus 7 (MDJHem3-2 2018) GCF_002818625.1	n/a	6 (73.98 %)	n/a	n/a	n/a	42.35 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.69 %)	2 (2.82 %)	15 (9.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.91 %)	0 (0.00 %)
1798	Torque teno midi virus 8 (MDJN1 2018) GCF_002818645.1	n/a	6 (73.75 %)	n/a	n/a	n/a	42.95 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (5.49 %)	1 (1.86 %)	9 (8.53 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (6.86 %)	0 (0.00 %)
1799	Torque teno midi virus 9 (MDJN2 2018) GCF_002818665.1	n/a	6 (73.45 %)	n/a	n/a	n/a	42.48 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (4.02 %)	2 (3.17 %)	11 (10.13 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1800	Torque teno mini virus (SHA 2023) GCF_018580825.1	n/a	3 (75.69 %)	n/a	n/a	n/a	38.19 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (9.48 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1801	Torque teno mini virus 1 (TLMV-CBD279 2010) GCF_000887355.1	n/a	3 (74.96 %)	n/a	n/a	n/a	38.14 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.84 %)	10 (6.55 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1802	Torque teno mini virus 10 (BNI-700620-G1-CSF 2023) GCF_018583595.1	n/a	4 (82.54 %)	n/a	n/a	n/a	37.16 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.87 %)	11 (9.75 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1803	Torque teno mini virus 10 (BNI-700835-G3-CSF 2023) GCF_018583605.1	n/a	4 (81.01 %)	n/a	n/a	n/a	39.58 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.75 %)	1 (2.78 %)	11 (7.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1804	Torque teno mini virus 10 (LIL-y1 2018) GCF_002818445.1	n/a	4 (81.09 %)	n/a	n/a	n/a	38.93 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.53 %)	1 (3.67 %)	4 (7.86 %)	0 (0 %)	1 (3.26 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1805	Torque teno mini virus 11 (LIL-y2 2018) GCF_002818465.1	n/a	3 (82.86 %)	n/a	n/a	n/a	38.33 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.51 %)	11 (6.30 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1806	Torque teno mini virus 12 (LIL-y3 2018) GCF_002818485.1	n/a	4 (81.35 %)	n/a	n/a	n/a	39.11 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.96 %)	3 (2.27 %)	6 (11.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1807	Torque teno mini virus 18 (222 2016) GCF_001661815.1	n/a	3 (74.46 %)	n/a	n/a	n/a	38.25 (99.89 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.82 %)	1 (2.89 %)	10 (8.67 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1808	Torque teno mini virus 2 (TLMV-NLC023 2010) GCF_000888275.1	n/a	3 (73.96 %)	n/a	n/a	n/a	39.35 (100.00 %)	4 (0.14 %)	4 (0.14 %)	5 (99.86 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (5.39 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1809	Torque teno mini virus 3 (TLMV-NLC026 2010) GCF_000887315.1	n/a	3 (75.17 %)	n/a	n/a	n/a	37.98 (99.93 %)	1 (0.03 %)	1 (0.03 %)	2 (99.97 %)	3 (0.00 %)	3 (3.83 %)	22 (14.67 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1810	Torque teno mini virus 4 (Pt-TTV8-II 2010) GCF_000888295.1	n/a	2 (76.45 %)	n/a	n/a	n/a	39.93 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.15 %)	n/a	9 (8.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1811	Torque teno mini virus 5 (TGP96 2010) GCF_000888975.1	n/a	3 (75.79 %)	n/a	n/a	n/a	37.04 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.20 %)	1 (2.82 %)	6 (9.70 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1812	Torque teno mini virus 6 (TLMV-CBD203 2010) GCF_000888315.1	n/a	3 (74.32 %)	n/a	n/a	n/a	37.34 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.62 %)	2 (3.31 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1813	Torque teno mini virus 7 (TLMV-CLC156 2010) GCF_000888255.1	n/a	2 (74.00 %)	n/a	n/a	n/a	36.14 (99.93 %)	2 (0.07 %)	2 (0.07 %)	3 (99.93 %)	3 (0.00 %)	3 (3.90 %)	8 (13.25 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1814	Torque teno mini virus 8 (PB4TL 2010) GCF_000887215.1	n/a	2 (76.15 %)	n/a	n/a	n/a	37.80 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.27 %)	8 (7.29 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1815	Torque teno mini virus 9 (TLMV-CLC062 2000) GCF_000837005.1	n/a	3 (77.41 %)	n/a	n/a	n/a	38.42 (100.00 %)	3 (0.21 %)	3 (0.21 %)	4 (99.79 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (4.01 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1816	Torque teno mini virus ALA22 (TTMV-ALA22 2014) GCF_000930495.1	n/a	3 (75.94 %)	n/a	n/a	n/a	38.28 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (3.05 %)	n/a	11 (7.69 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1817	Torque teno mini virus ALH8 (TTMV-ALH8 2014) GCF_000929855.1	n/a	2 (74.78 %)	n/a	n/a	n/a	38.77 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.19 %)	1 (2.73 %)	8 (8.09 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1818	Torque teno virus (Human/Japan/KS025/2016 2023) GCF_018580895.1	n/a	3 (82.70 %)	n/a	n/a	n/a	36.62 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.17 %)	n/a	11 (8.58 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1819	Torque teno virus 1 (VT416 1998) GCF_000857545.1	n/a	5 (70.74 %)	n/a	n/a	n/a	49.06 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.80 %)	n/a	17 (6.93 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (35.41 %)	2 (30.92 %)
1820	Torque teno virus 10 (JT34F 2010) GCF_000887255.1	n/a	6 (71.49 %)	n/a	n/a	n/a	51.22 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.00 %)	n/a	5 (4.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (38.57 %)	2 (33.77 %)
1821	Torque teno virus 13 (TCHN-A 2018) GCF_002818305.1	n/a	2 (76.54 %)	n/a	n/a	n/a	52.27 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.24 %)	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (49.70 %)	2 (49.70 %)
1822	Torque teno virus 17 (2019) GCF_002986165.1	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	49.83 (99.88 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.51 %)	1 (1.26 %)	3 (2.37 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (20.50 %)	1 (20.50 %)
1823	Torque teno virus 18 (2019) GCF_002986195.1	n/a	n/a	n/a	n/a	n/a	52.78 (99.91 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.44 %)	n/a	3 (0.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (29.67 %)	2 (24.12 %)
1824	Torque teno virus 20 (2018) GCF_002818335.1	n/a	6 (83.33 %)	n/a	n/a	n/a	50.00 (99.88 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.79 %)	1 (1.27 %)	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (20.90 %)	1 (18.68 %)
1825	Torque teno virus 21 (TCHN-B 2018) GCF_002818355.1	n/a	2 (79.99 %)	n/a	n/a	n/a	45.33 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.54 %)	n/a	10 (3.87 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (20.27 %)	1 (20.27 %)
1826	Torque teno virus 29 (TTVyon-KC009 2018) GCF_002818425.1	n/a	3 (68.19 %)	n/a	n/a	n/a	52.69 (99.97 %)	7 (0.19 %)	7 (0.19 %)	8 (99.81 %)	4 (0.95 %)	n/a	11 (3.81 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (36.04 %)	2 (33.76 %)
1827	Torque teno virus 3 (HEL32 2010) GCF_000888935.1	n/a	10 (70.14 %)	n/a	n/a	n/a	51.35 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.72 %)	n/a	8 (4.06 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (36.13 %)	2 (31.75 %)
1828	Torque teno virus 4 (Pt-TTV6 2010) GCF_000886355.1	n/a	2 (68.92 %)	n/a	n/a	n/a	53.55 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.92 %)	n/a	12 (7.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (37.05 %)	2 (32.09 %)
1829	Torque teno virus 5 (TCHN-C1 2018) GCF_002818195.1	n/a	2 (67.73 %)	n/a	n/a	n/a	51.69 (99.88 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.27 %)	3 (0.74 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (20.04 %)	1 (20.04 %)
1830	Torque teno virus 6 (KAV 2010) GCF_000888995.1	n/a	6 (70.15 %)	n/a	n/a	n/a	49.96 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.65 %)	n/a	4 (3.43 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (44.59 %)	2 (40.27 %)
1831	Torque teno virus 7 (PMV 2010) GCF_000887275.1	n/a	3 (73.96 %)	n/a	n/a	n/a	48.41 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.14 %)	n/a	5 (1.61 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (24.36 %)	1 (15.79 %)
1832	Torque teno virus 9 (BM1C 2018) GCF_002818245.1	n/a	1 (15.76 %)	n/a	n/a	n/a	46.54 (99.87 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.74 %)	n/a	1 (0.23 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (22.88 %)	1 (22.88 %)
1833	Toscana virus (181135-14 2017) GCA_031497085.1	n/a	2 (39.49 %)	n/a	n/a	n/a	44.69 (99.94 %)	13 (0.12 %)	13 (0.12 %)	16 (99.88 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (2.06 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1834	Toxoplasma gondii (ME49 2013) GCF_000006565.2	8,712 (44.71 %)	n/a	547 (0.51 %)	6,721 (18.47 %)	n/a	52.29 (99.69 %)	244 (0.31 %)	265 (0.31 %)	2,508 (99.69 %)	30,645 (3.94 %)	25,397 (3.06 %)	346,604 (16.91 %)	0 (0 %)	14,377 (2.38 %)	1,245 (97.61 %)	794 (1.53 %)
1835	Treponema pallidum subsp. pallidum str. (Nichols 2013) GCF_000410535.2	n/a	1,038 (93.55 %)	n/a	n/a	n/a	52.79 (100.00 %)	5 (0.00 %)	5 (0.00 %)	6 (100.00 %)	n/a	12 (0.17 %)	5,208 (7.59 %)	0 (0 %)	21 (0.49 %)	1 (99.66 %)	0 (0.00 %)
1836	Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus (2010) GCF_000887495.1	n/a	6 (85.68 %)	n/a	n/a	n/a	40.08 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.92 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1837	trichomonads (G3 2022 genbank) GCA_000002825.3	n/a	60,817 (31.94 %)	1,087 (0.32 %)	14,069 (18.36 %)	n/a	32.83 (99.48 %)	8,181 (0.46 %)	8,181 (0.46 %)	72,950 (99.54 %)	51,123 (1.26 %)	102,247 (6.60 %)	318,523 (55.40 %)	27 (0.01 %)	101,388 (4.31 %)	873 (0.25 %)	848 (0.25 %)
1838	trichomonads (G3; ATCC PRA-98 2007) GCF_000002825.2	59,679 (31.63 %)	n/a	1,087 (0.32 %)	14,822 (19.33 %)	n/a	32.83 (99.48 %)	8,181 (0.46 %)	8,181 (0.46 %)	72,950 (99.54 %)	145,257 (55.06 %)	102,247 (6.60 %)	318,523 (55.40 %)	27 (0.01 %)	101,389 (4.31 %)	873 (0.25 %)	848 (0.25 %)
1839	trichomonads (NIH4 ATCC 30207 2019) GCA_900231805.1	n/a	n/a	778 (0.89 %)	6,267 (29.04 %)	n/a	34.59 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	4,161 (100.00 %)	9,215 (1.45 %)	4,031 (0.57 %)	335,620 (22.89 %)	0 (0 %)	1,055 (0.18 %)	1,227 (1.50 %)	1,178 (1.35 %)
1840	Trichomonas vaginalis (G3 2022) GCF_026262505.1	72,428 (34.54 %)	n/a	1,110 (0.32 %)	12,472 (18.87 %)	n/a	32.69 (99.98 %)	0 (0 %)	640 (0.02 %)	218 (100.00 %)	51,774 (1.29 %)	100,344 (7.63 %)	307,599 (55.88 %)	9 (0.01 %)	135,030 (7.89 %)	951 (0.28 %)	910 (0.27 %)
1841	Tropheryma whipplei (TW08/27 2003) GCF_000196075.1	n/a	899 (87.37 %)	n/a	n/a	n/a	46.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	159 (0.93 %)	2,141 (3.71 %)	0 (0 %)	326 (3.47 %)	160 (10.42 %)	137 (7.69 %)
1842	Trypanosoma brucei (EATRO1125 2021) GCA_019096175.1	n/a	n/a	824 (0.76 %)	4,788 (26.68 %)	n/a	42.80 (99.98 %)	0 (0 %)	146 (0.02 %)	696 (100.00 %)	40,465 (3.76 %)	43,723 (14.74 %)	239,123 (32.22 %)	0 (0 %)	64,778 (10.33 %)	10,525 (23.33 %)	8,828 (12.99 %)
1843	Trypanosoma brucei brucei (2018) GCA_900497135.1	n/a	n/a	786 (0.89 %)	4,156 (28.68 %)	n/a	43.82 (99.91 %)	0 (0 %)	49 (0.09 %)	400 (100.00 %)	35,049 (10.77 %)	16,179 (5.45 %)	201,340 (25.23 %)	0 (0 %)	36,300 (8.47 %)	8,847 (25.69 %)	7,886 (15.02 %)
1844	Trypanosoma brucei brucei (927/4 GUTat10.1 2005 kinetoplastids) GCF_000002445.2	9,250 (50.97 %)	n/a	708 (1.57 %)	2,098 (38.69 %)	n/a	46.44 (99.99 %)	28 (0.01 %)	67 (0.01 %)	134 (99.99 %)	18,383 (5.48 %)	5,033 (3.00 %)	115,204 (16.79 %)	0 (0 %)	8,560 (6.13 %)	3,876 (28.83 %)	3,964 (14.61 %)
1845	Trypanosoma brucei gambiense (Dal972 MHOM/CI/86/DAL972 2009 kinetoplastids) GCF_000210295.1	8,185 (49.86 %)	n/a	681 (1.80 %)	1,793 (42.00 %)	n/a	47.17 (99.84 %)	278 (0.17 %)	278 (0.17 %)	289 (99.83 %)	16,597 (3.78 %)	4,392 (3.02 %)	93,893 (15.68 %)	8 (0.02 %)	6,333 (5.19 %)	2,944 (28.15 %)	3,353 (15.01 %)
1846	Trypanosoma congolense (IL3000 2011) GCA_000227395.2	n/a	6,456 (40.20 %)	253 (0.86 %)	3,071 (30.48 %)	n/a	47.51 (99.96 %)	0 (0 %)	1,376 (0.02 %)	2,644 (100.00 %)	5,569 (1.36 %)	3,220 (6.63 %)	64,837 (16.53 %)	0 (0 %)	11,700 (6.39 %)	4,505 (36.16 %)	4,136 (28.91 %)
1847	Trypanosoma congolense (IL3000 2018 kinetoplastids) GCA_003013265.1	n/a	n/a	721 (1.16 %)	4,614 (29.05 %)	n/a	45.88 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1,539 (100.00 %)	11,113 (1.60 %)	17,279 (16.77 %)	113,413 (28.69 %)	0 (0 %)	60,400 (11.98 %)	5,888 (36.74 %)	5,620 (16.71 %)
1848	Trypanosoma congolense (Tc1/148 2017) GCA_002287245.1	n/a	n/a	813 (1.16 %)	4,144 (30.20 %)	n/a	47.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	536 (100.00 %)	11,499 (1.44 %)	9,962 (9.64 %)	127,852 (25.29 %)	0 (0 %)	50,319 (14.36 %)	6,858 (38.13 %)	5,819 (18.75 %)
1849	Trypanosoma cruzi (231 2018) GCA_900252365.1	n/a	n/a	736 (1.29 %)	4,458 (34.22 %)	n/a	50.83 (95.68 %)	5,109 (4.33 %)	5,109 (4.33 %)	13,578 (95.67 %)	36,088 (10.33 %)	8,999 (2.30 %)	170,757 (25.12 %)	240 (0.39 %)	7,981 (4.46 %)	12,115 (51.42 %)	7,891 (19.58 %)
1850	Trypanosoma cruzi (Berenice 2020) GCA_013358655.1	n/a	14,351 (52.67 %)	890 (1.40 %)	3,725 (32.42 %)	n/a	51.20 (99.96 %)	0 (0 %)	11 (0.03 %)	923 (100.00 %)	47,244 (14.33 %)	12,567 (6.53 %)	187,487 (29.51 %)	0 (0 %)	44,661 (14.30 %)	3,760 (74.95 %)	6,175 (16.34 %)
1851	Trypanosoma cruzi (Brazil clone A4 2020) GCA_015033625.1	n/a	14,287 (39.60 %)	870 (1.17 %)	4,200 (30.74 %)	n/a	51.58 (99.94 %)	0 (0 %)	295 (0.06 %)	402 (100.00 %)	42,103 (3.62 %)	9,732 (6.77 %)	207,127 (28.40 %)	0 (0 %)	56,689 (15.50 %)	1,704 (78.61 %)	6,835 (18.28 %)
1852	Trypanosoma cruzi (Bug2148 2017) GCA_002749415.1	n/a	n/a	1,108 (1.18 %)	4,942 (29.26 %)	n/a	51.27 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	929 (100.00 %)	53,293 (14.16 %)	11,999 (7.56 %)	266,568 (30.60 %)	0 (0 %)	64,167 (17.06 %)	3,663 (78.99 %)	7,601 (16.68 %)
1853	Trypanosoma cruzi (CL 2018) GCA_003719155.1	n/a	32,382 (67.97 %)	1,130 (1.27 %)	8,128 (38.54 %)	n/a	50.89 (78.25 %)	9,621 (21.78 %)	9,621 (21.78 %)	17,385 (78.22 %)	51,512 (8.59 %)	10,801 (0.84 %)	256,056 (18.10 %)	359 (0.58 %)	12,047 (2.74 %)	17,148 (43.18 %)	13,844 (18.17 %)
1854	Trypanosoma cruzi (CL Brener 2005 kinetoplastids) GCF_000209065.1	21,486 (32.92 %)	n/a	1,473 (0.93 %)	11,094 (27.05 %)	n/a	51.73 (99.59 %)	3,251 (0.36 %)	3,251 (0.36 %)	32,746 (99.64 %)	101,042 (18.86 %)	33,823 (9.62 %)	381,995 (41.05 %)	14 (0.01 %)	116,751 (12.27 %)	30,396 (56.78 %)	16,908 (14.68 %)
1855	Trypanosoma cruzi (Dm28c 2013) GCA_000496795.1	n/a	11,398 (58.14 %)	590 (1.35 %)	2,958 (38.12 %)	n/a	50.55 (99.90 %)	4,851 (0.16 %)	4,851 (0.16 %)	6,061 (99.84 %)	22,949 (7.38 %)	4,285 (1.01 %)	133,379 (24.83 %)	69 (0.06 %)	4,647 (2.17 %)	4,333 (60.52 %)	4,552 (14.39 %)
1856	Trypanosoma cruzi (Dm28c 2018) GCA_003177105.1	n/a	17,234 (42.21 %)	1,095 (1.17 %)	4,398 (29.12 %)	n/a	51.56 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	636 (100.00 %)	49,579 (15.53 %)	11,985 (10.10 %)	239,052 (32.30 %)	0 (0 %)	66,554 (16.60 %)	3,264 (81.11 %)	7,826 (18.04 %)
1857	Trypanosoma cruzi (G 2018) GCA_003719455.1	n/a	12,763 (68.03 %)	659 (1.68 %)	2,979 (45.70 %)	n/a	50.05 (94.80 %)	0 (0 %)	4,237 (5.25 %)	1,450 (100.00 %)	24,246 (7.04 %)	4,119 (1.23 %)	118,530 (19.09 %)	219 (0.60 %)	4,074 (3.39 %)	5,125 (41.93 %)	4,766 (16.20 %)
1858	Trypanosoma cruzi (JR cl. 4 2013) GCA_000331405.1	n/a	n/a	724 (1.08 %)	4,068 (29.35 %)	n/a	51.29 (96.66 %)	2,791 (3.29 %)	2,791 (3.29 %)	18,103 (96.71 %)	41,670 (13.38 %)	9,134 (2.24 %)	199,475 (30.26 %)	18 (0.04 %)	17,527 (4.81 %)	14,403 (46.63 %)	8,217 (16.29 %)
1859	Trypanosoma cruzi (S11 2018) GCA_003594385.1	n/a	n/a	607 (1.42 %)	4,171 (39.91 %)	n/a	49.13 (91.99 %)	24,596 (8.30 %)	24,596 (8.30 %)	32,451 (91.70 %)	37,547 (8.58 %)	14,660 (4.42 %)	154,171 (20.89 %)	205 (0.09 %)	n/a	9,355 (36.78 %)	6,612 (17.91 %)
1860	Trypanosoma cruzi (S15 2018) GCA_003594585.1	n/a	n/a	613 (1.44 %)	4,115 (40.50 %)	n/a	49.08 (94.39 %)	22,497 (5.88 %)	22,497 (5.88 %)	31,694 (94.12 %)	40,911 (9.36 %)	13,849 (3.81 %)	153,233 (21.61 %)	1 (0.00 %)	18,803 (6.12 %)	9,270 (39.20 %)	6,569 (17.46 %)
1861	Trypanosoma cruzi (S154a 2018) GCA_003594715.1	n/a	n/a	524 (1.88 %)	4,842 (51.37 %)	n/a	49.62 (90.66 %)	10,583 (9.49 %)	10,583 (9.49 %)	17,529 (90.51 %)	16,140 (5.04 %)	3,435 (0.80 %)	94,186 (12.84 %)	7 (0.00 %)	1,122 (0.53 %)	8,088 (37.16 %)	6,326 (22.07 %)
1862	Trypanosoma cruzi (S162a 2018) GCA_003594605.1	n/a	n/a	601 (1.47 %)	4,435 (41.13 %)	n/a	49.16 (92.38 %)	22,017 (7.88 %)	22,017 (7.88 %)	30,605 (92.12 %)	39,590 (9.26 %)	13,214 (3.74 %)	148,451 (20.91 %)	3 (0.00 %)	18,317 (6.00 %)	9,439 (37.26 %)	6,573 (18.09 %)
1863	Trypanosoma cruzi (S23b 2018) GCA_003594425.1	n/a	n/a	615 (1.44 %)	3,924 (41.13 %)	n/a	49.15 (92.22 %)	25,170 (8.09 %)	25,170 (8.09 %)	32,315 (91.91 %)	38,606 (9.07 %)	13,482 (3.91 %)	155,197 (20.88 %)	53 (0.02 %)	21,452 (6.95 %)	9,095 (36.97 %)	6,384 (16.84 %)
1864	Trypanosoma cruzi (S44a 2018) GCA_003594705.1	n/a	n/a	409 (1.56 %)	2,796 (44.75 %)	n/a	49.11 (91.80 %)	0 (0 %)	11,716 (8.42 %)	4,971 (100.00 %)	23,039 (8.26 %)	7,222 (2.55 %)	90,547 (16.60 %)	0 (0 %)	6,368 (3.10 %)	5,765 (36.46 %)	4,667 (19.64 %)
1865	Trypanosoma cruzi (S92a 2018) GCA_003594445.1	n/a	n/a	612 (1.45 %)	3,887 (40.75 %)	n/a	49.11 (94.80 %)	24,122 (5.51 %)	24,122 (5.51 %)	31,256 (94.49 %)	35,825 (8.67 %)	13,648 (4.16 %)	150,601 (21.43 %)	187 (0.08 %)	19,699 (6.81 %)	8,425 (37.98 %)	5,971 (16.42 %)
1866	Trypanosoma cruzi (Sylvio X10/1 2012) GCA_000188675.2	n/a	10,846 (39.84 %)	854 (1.22 %)	6,398 (30.09 %)	n/a	51.16 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	27,016 (100.00 %)	37,732 (11.74 %)	6,045 (0.89 %)	200,484 (28.63 %)	0 (0 %)	1,239 (0.83 %)	23,110 (52.94 %)	11,077 (22.43 %)
1867	Trypanosoma cruzi (TCC 2018) GCA_003177095.1	n/a	26,338 (41.04 %)	1,453 (1.04 %)	6,923 (28.85 %)	n/a	51.72 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,236 (100.00 %)	90,986 (20.64 %)	26,706 (14.54 %)	360,803 (40.61 %)	0 (0 %)	131,704 (17.09 %)	5,554 (79.07 %)	10,662 (13.07 %)
1868	Trypanosoma cruzi (Tula cl2 2013) GCA_000365225.1	n/a	n/a	1,183 (0.86 %)	13,858 (28.09 %)	n/a	51.43 (88.54 %)	7,372 (11.38 %)	7,372 (11.38 %)	53,083 (88.62 %)	82,389 (11.82 %)	19,826 (1.99 %)	379,343 (26.02 %)	202 (0.20 %)	21,907 (3.32 %)	36,943 (48.69 %)	21,847 (21.35 %)
1869	Trypanosoma cruzi (Y 2017) GCA_002749425.1	n/a	n/a	753 (1.18 %)	4,645 (30.43 %)	n/a	49.84 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	9,821 (100.00 %)	39,393 (10.81 %)	8,137 (1.20 %)	202,940 (28.85 %)	0 (0 %)	5,321 (1.64 %)	12,168 (55.18 %)	7,718 (16.33 %)
1870	Trypanosoma cruzi (Y clone C6 2020) GCA_015033655.1	n/a	14,336 (42.04 %)	828 (1.08 %)	3,474 (29.42 %)	n/a	51.58 (99.95 %)	0 (0 %)	231 (0.05 %)	266 (100.00 %)	54,788 (4.58 %)	18,111 (11.00 %)	206,701 (34.31 %)	0 (0 %)	71,443 (18.43 %)	1,428 (83.97 %)	6,416 (14.86 %)
1871	Trypanosoma cruzi (Ycl2 2018) GCA_003594485.1	n/a	n/a	600 (1.50 %)	4,565 (42.33 %)	n/a	49.16 (95.10 %)	19,190 (5.14 %)	19,190 (5.14 %)	26,074 (94.86 %)	34,930 (8.39 %)	12,450 (3.55 %)	142,183 (20.94 %)	1 (0.00 %)	16,047 (5.49 %)	8,858 (42.20 %)	6,419 (19.45 %)
1872	Trypanosoma cruzi (Ycl4 2018) GCA_003594405.1	n/a	n/a	598 (1.50 %)	4,533 (42.10 %)	n/a	49.17 (95.10 %)	20,293 (5.16 %)	20,293 (5.16 %)	26,957 (94.84 %)	35,571 (8.58 %)	12,514 (3.63 %)	142,007 (20.79 %)	1 (0.00 %)	16,773 (5.70 %)	8,752 (42.51 %)	6,400 (19.64 %)
1873	Trypanosoma cruzi (Ycl6 2018) GCA_003594465.1	n/a	n/a	605 (1.53 %)	4,639 (42.54 %)	n/a	49.13 (95.08 %)	19,286 (5.17 %)	19,286 (5.17 %)	26,253 (94.83 %)	37,956 (8.96 %)	12,256 (3.53 %)	139,683 (20.67 %)	2 (0.00 %)	15,501 (5.40 %)	8,654 (41.69 %)	6,359 (19.35 %)
1874	Trypanosoma cruzi cruzi (Dm28c 2017) GCA_002219105.2	n/a	16,163 (40.15 %)	1,134 (1.39 %)	4,889 (31.75 %)	n/a	51.68 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1,030 (100.00 %)	53,486 (13.50 %)	11,763 (7.41 %)	236,998 (29.69 %)	0 (0 %)	51,978 (15.68 %)	3,781 (75.10 %)	7,631 (19.09 %)
1875	Trypanosoma cruzi marinkellei (B7 2012) GCA_000300495.1	n/a	10,100 (43.56 %)	842 (1.37 %)	7,131 (33.86 %)	n/a	50.95 (99.86 %)	0 (0 %)	n/a	23,148 (100.00 %)	39,333 (9.96 %)	10,907 (1.40 %)	172,368 (27.05 %)	0 (0 %)	1,379 (1.02 %)	20,167 (51.90 %)	10,270 (22.83 %)
1876	Trypanosoma cruzi strain (Esmeraldo cl. 3 2013) GCA_000327425.1	n/a	n/a	641 (1.15 %)	3,521 (31.83 %)	n/a	50.88 (91.79 %)	4,384 (8.18 %)	4,384 (8.18 %)	20,187 (91.82 %)	44,249 (11.85 %)	11,716 (1.40 %)	181,687 (26.43 %)	95 (0.22 %)	7,463 (1.98 %)	13,828 (43.63 %)	7,939 (16.03 %)
1877	Trypanosoma equiperdum (OVI 2016 refseq) GCF_001457755.1	7,673 (43.97 %)	n/a	576 (1.36 %)	2,998 (35.93 %)	n/a	45.94 (99.65 %)	6,447 (0.44 %)	6,447 (0.44 %)	8,473 (99.56 %)	16,822 (2.58 %)	3,925 (0.79 %)	141,656 (16.64 %)	0 (0 %)	1,684 (0.54 %)	4,877 (34.82 %)	4,352 (15.04 %)
1878	Trypanosoma evansi (2021) GCA_917563935.1	n/a	n/a	697 (1.60 %)	1,998 (37.85 %)	n/a	46.53 (100.00 %)	96 (0.00 %)	96 (0.00 %)	109 (100.00 %)	17,662 (2.87 %)	5,727 (2.93 %)	115,226 (17.28 %)	2 (0.00 %)	9,398 (6.30 %)	3,582 (29.41 %)	3,847 (14.41 %)
1879	Trypanosoma grayi (ANR4 2014 kinetoplastids) GCF_000691245.1	10,583 (66.59 %)	n/a	586 (1.65 %)	4,005 (54.75 %)	n/a	53.95 (99.32 %)	0 (0 %)	3,492 (0.68 %)	2,871 (100.00 %)	16,738 (3.13 %)	5,010 (1.91 %)	131,234 (16.24 %)	740 (0.59 %)	3,953 (2.06 %)	3,578 (81.23 %)	2,593 (10.98 %)
1880	Trypanosoma melophagium (St. Kilda St. Kilda 2022 refseq) GCF_022059095.1	10,044 (64.21 %)	n/a	742 (1.83 %)	848 (40.20 %)	n/a	41.23 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	64 (100.00 %)	39,141 (7.68 %)	14,366 (6.71 %)	131,898 (25.19 %)	0 (0 %)	9,068 (6.92 %)	4,119 (14.82 %)	3,546 (9.39 %)
1881	Trypanosoma rangeli (SC58 2013) GCA_000492115.1	n/a	7,475 (68.34 %)	670 (2.75 %)	7,621 (59.92 %)	n/a	52.96 (99.88 %)	2,745 (0.02 %)	2,745 (0.02 %)	11,811 (99.98 %)	11,567 (3.09 %)	2,909 (0.72 %)	82,270 (14.59 %)	0 (0 %)	267 (0.24 %)	7,546 (66.86 %)	5,934 (44.71 %)
1882	Trypanosoma theileri (Edinburgh 2017 kinetoplastids) GCF_002087225.1	11,312 (63.57 %)	n/a	665 (1.51 %)	767 (36.38 %)	n/a	40.06 (86.20 %)	0 (0 %)	4,816 (13.86 %)	319 (100.00 %)	57,547 (9.71 %)	19,568 (2.92 %)	160,176 (24.92 %)	48 (0.15 %)	16,704 (4.56 %)	3,950 (7.03 %)	3,103 (5.05 %)
1883	Trypanosoma vivax (Y486 2011) GCA_000227375.1	n/a	4,133 (18.43 %)	95 (0.17 %)	4,537 (15.45 %)	n/a	53.57 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	8,277 (100.00 %)	9,605 (2.14 %)	5,391 (2.33 %)	103,604 (16.50 %)	0 (0 %)	9,484 (4.17 %)	8,315 (72.57 %)	6,879 (48.70 %)
1884	tsetse fly (v2 IAEA_lab_2018 2020) GCF_014805625.2	24,248 (8.13 %)	n/a	7,202 (2.32 %)	6,649 (3.63 %)	n/a	33.81 (97.46 %)	0 (0 %)	9,485 (2.55 %)	7,824 (100.00 %)	415,107 (4.58 %)	185,652 (2.27 %)	3,080,653 (35.26 %)	664 (0.07 %)	40,232 (0.93 %)	3,487 (0.58 %)	1,908 (0.28 %)
1885	tsetse fly G.austeni (2014) GCA_000688735.1	n/a	n/a	7,099 (2.45 %)	6,363 (3.84 %)	n/a	34.09 (95.48 %)	16,426 (4.53 %)	21,556 (4.54 %)	18,631 (95.47 %)	397,383 (5.03 %)	212,538 (2.99 %)	2,989,075 (33.56 %)	594 (0.06 %)	48,872 (1.33 %)	2,678 (0.33 %)	1,808 (0.22 %)
1886	tsetse fly G.brevipalpis (2014) GCA_000671755.1	n/a	n/a	6,706 (2.82 %)	3,735 (3.32 %)	n/a	31.21 (93.08 %)	15,007 (6.94 %)	19,872 (6.94 %)	16,658 (93.06 %)	387,503 (6.79 %)	206,007 (3.82 %)	2,827,858 (37.89 %)	432 (0.07 %)	44,216 (1.37 %)	2,011 (0.33 %)	1,137 (0.21 %)
1887	tsetse fly G.fuscipes fuscipes (2014) GCA_000671735.1	n/a	n/a	7,083 (2.40 %)	6,464 (3.71 %)	n/a	33.60 (96.41 %)	11,173 (3.60 %)	13,535 (3.60 %)	13,567 (96.40 %)	410,032 (4.92 %)	188,436 (2.25 %)	3,048,601 (33.66 %)	546 (0.15 %)	34,919 (0.94 %)	2,456 (0.34 %)	1,865 (0.27 %)
1888	tsetse fly G.morsitans morsitans (Yale 2014) GCA_001077435.1	n/a	n/a	7,057 (2.28 %)	9,750 (3.70 %)	n/a	34.12 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	24,070 (100.00 %)	373,893 (4.73 %)	156,874 (2.49 %)	3,033,573 (34.33 %)	0 (0 %)	37,949 (0.75 %)	2,330 (0.31 %)	1,762 (0.23 %)
1889	tsetse fly G.pallidipes (2014) GCA_000688715.1	n/a	n/a	7,096 (2.48 %)	6,142 (3.84 %)	n/a	34.11 (98.49 %)	5,133 (1.51 %)	6,449 (1.52 %)	6,859 (98.49 %)	340,120 (4.37 %)	149,867 (2.10 %)	2,979,113 (33.58 %)	282 (0.03 %)	27,162 (0.69 %)	2,286 (0.32 %)	1,671 (0.23 %)
1890	tsetse fly G.palpalis gambiensis (146720 2015) GCA_000818775.1	n/a	n/a	7,119 (2.53 %)	6,579 (3.96 %)	n/a	33.61 (91.07 %)	27,394 (8.96 %)	29,785 (8.96 %)	31,320 (91.04 %)	397,519 (4.95 %)	184,417 (2.17 %)	2,904,702 (31.03 %)	829 (0.14 %)	34,343 (1.85 %)	2,283 (0.30 %)	1,775 (0.24 %)
1891	TTV-like mini virus (D11 2023) GCF_018580215.1	n/a	3 (75.99 %)	n/a	n/a	n/a	36.75 (99.89 %)	10 (0.42 %)	10 (0.42 %)	11 (99.58 %)	3 (0.00 %)	1 (1.89 %)	11 (8.38 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1892	TTV-like mini virus (Emory1 2023) GCF_018580655.1	n/a	3 (76.93 %)	n/a	n/a	n/a	37.31 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (5.05 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1893	TTV-like mini virus (Emory2 2023) GCF_018580665.1	n/a	3 (82.23 %)	n/a	n/a	n/a	36.35 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (3.40 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1894	TTV-like mini virus (TTMV_LY1 2013) GCF_000905335.1	n/a	3 (75.48 %)	n/a	n/a	n/a	38.63 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.72 %)	2 (2.71 %)	7 (9.51 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1895	TTV-like mini virus (TTMV_LY3 2023) GCF_018580125.1	n/a	3 (73.76 %)	n/a	n/a	n/a	39.86 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (4.43 %)	6 (7.51 %)	0 (0 %)	1 (2.13 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1896	TTV-like mini virus (vzttmv4 2023) GCF_018584815.1	n/a	3 (82.18 %)	n/a	n/a	n/a	38.42 (99.93 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.79 %)	4 (4.88 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1897	TTV-like mini virus (zhenjiang 2023) GCF_018580875.1	n/a	3 (75.71 %)	n/a	n/a	n/a	37.86 (99.90 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.65 %)	7 (6.22 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1898	Tulane virus (2019) GCF_004786795.1	n/a	3 (98.38 %)	n/a	n/a	n/a	46.66 (99.94 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.21 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1899	Tupaia hepatovirus A (TN1 2016) GCF_001502175.1	n/a	1 (90.12 %)	n/a	n/a	n/a	39.41 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.63 %)	n/a	2 (0.97 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1900	Turkey calicivirus (L11043 2019) GCF_004786995.1	n/a	2 (98.47 %)	n/a	n/a	n/a	50.01 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	2 (7.99 %)	2 (7.99 %)
1901	Upolu virus (2023) GCF_023156825.1	n/a	6 (94.48 %)	n/a	n/a	n/a	42.76 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	26 (2.56 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1902	V.brassicaformis CCMP3155 (2015) GCA_001179505.1	n/a	220,315 (88.11 %)	712 (0.60 %)	15,155 (31.08 %)	n/a	58.09 (98.73 %)	0 (0 %)	3,113 (1.28 %)	1,064 (100.00 %)	126,593 (6.34 %)	37,019 (1.99 %)	573,167 (25.26 %)	90 (0.13 %)	16,061 (2.82 %)	1,899 (97.95 %)	8,058 (9.23 %)
1903	Vaccinia virus (WR (Western Reserve) 2005) GCF_000860085.1	n/a	223 (88.80 %)	n/a	n/a	n/a	33.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	26 (0.57 %)	10 (3.43 %)	744 (9.15 %)	0 (0 %)	15 (0.39 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1904	Vagococcus fluvialis (DSM 5731 2018) GCF_003337315.1	n/a	2,655 (90.57 %)	n/a	n/a	n/a	32.40 (99.99 %)	0 (0 %)	2 (0.01 %)	29 (100.00 %)	n/a	54 (0.28 %)	22,251 (18.10 %)	1 (0.01 %)	42 (0.17 %)	5 (0.18 %)	4 (0.12 %)
1905	Varicella-zoster virus (Dumas 1987) GCF_000858285.1	n/a	74 (89.36 %)	n/a	n/a	n/a	46.02 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	14 (0.32 %)	17 (0.92 %)	421 (5.39 %)	0 (0 %)	9 (0.44 %)	1 (0.20 %)	3 (1.21 %)
1906	Variegated bornavirus 1 (squirrel brain 2016) GCF_001698295.1	n/a	6 (99.17 %)	n/a	n/a	n/a	42.84 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.16 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1907	Venezuelan equine encephalitis virus (1993) GCF_000862105.1	n/a	6 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	50.12 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	1 (0.30 %)	6 (1.47 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (15.75 %)	4 (15.75 %)
1908	Venezuelan equine encephalitis virus (Trinidad donkey donkey/Trinidad/1943 2023) GCF_002889695.1	n/a	4 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	49.79 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.51 %)	1 (0.30 %)	6 (1.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	4 (12.87 %)	3 (10.39 %)
1909	Vesicular exanthema of swine virus (2000) GCF_000847705.1	n/a	3 (97.55 %)	n/a	n/a	n/a	47.83 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.86 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.04 %)	1 (3.04 %)
1910	Vesicular stomatitis Alagoas virus (Indiana 3 2014) GCF_000924515.1	n/a	6 (99.38 %)	n/a	n/a	n/a	42.58 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.36 %)	n/a	12 (0.94 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1911	Vesicular stomatitis Indiana virus (1993) GCF_000850045.1	n/a	4 (91.34 %)	n/a	n/a	n/a	41.74 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.60 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1912	Vesicular stomatitis Indiana virus (98COE 2018) GCF_002815995.1	n/a	6 (99.37 %)	n/a	n/a	n/a	41.75 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.28 %)	n/a	5 (0.31 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1913	Vesicular stomatitis New Jersey virus (NJ1184HDB 2014) GCF_000923855.1	n/a	6 (95.91 %)	n/a	n/a	n/a	39.89 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	19 (1.57 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1914	vesivirus (Hom-1 2017) GCF_002118765.1	n/a	3 (97.57 %)	n/a	n/a	n/a	48.33 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.10 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (3.05 %)	1 (3.05 %)
1915	Vesivirus ferret badger/JX12/China/2012 (FBCV-JX12 2015) GCF_001019935.1	n/a	3 (98.23 %)	n/a	n/a	n/a	45.18 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.14 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1916	Vibrio alginolyticus (E110 2022) GCF_023650915.1	n/a	4,706 (86.99 %)	n/a	n/a	n/a	44.71 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	102 (0.91 %)	14,086 (4.58 %)	0 (0 %)	731 (1.59 %)	147 (2.59 %)	163 (1.87 %)
1917	Vibrio cholerae (IEC224 2012) GCF_000250855.1	n/a	3,768 (87.87 %)	n/a	n/a	n/a	47.46 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	93 (0.42 %)	11,018 (4.87 %)	0 (0 %)	534 (1.44 %)	26 (0.24 %)	31 (0.33 %)
1918	Vibrio cholerae (RFB16 2019) GCF_008369605.1	n/a	3,797 (87.74 %)	n/a	n/a	n/a	47.42 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	113 (0.62 %)	12,805 (5.57 %)	0 (0 %)	572 (1.56 %)	17 (0.25 %)	17 (0.20 %)
1919	Vibrio cholerae O1 (AAS91 2020) GCF_009938115.1	n/a	3,782 (88.01 %)	n/a	n/a	n/a	47.61 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	96 (0.49 %)	12,240 (5.37 %)	0 (0 %)	560 (1.95 %)	12 (0.58 %)	15 (0.15 %)
1920	Vibrio cholerae O1 biovar El Tor (C6709 2020) GCF_013085105.1	n/a	3,785 (87.89 %)	n/a	n/a	n/a	47.44 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	2 (100.00 %)	n/a	103 (0.37 %)	11,153 (4.91 %)	0 (0 %)	521 (1.70 %)	26 (0.24 %)	32 (0.34 %)
1921	Vibrio cholerae O1 biovar El Tor (DRC-193A 2020) GCF_013085145.1	n/a	3,769 (88.09 %)	n/a	n/a	n/a	47.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	92 (0.40 %)	11,303 (4.85 %)	0 (0 %)	397 (1.37 %)	24 (0.23 %)	37 (0.39 %)
1922	Vibrio cholerae O1 biovar El Tor (E7946 2020) GCF_013085165.1	n/a	3,782 (87.88 %)	n/a	n/a	n/a	47.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	95 (0.41 %)	11,786 (5.22 %)	0 (0 %)	536 (1.96 %)	26 (0.24 %)	32 (0.35 %)
1923	Vibrio cholerae O1 biovar El Tor (FJ147 2015) GCF_000963555.1	n/a	3,750 (88.13 %)	n/a	n/a	n/a	47.51 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	90 (0.41 %)	11,194 (4.83 %)	0 (0 %)	396 (1.35 %)	24 (0.23 %)	31 (0.39 %)
1924	Vibrio cholerae O1 biovar El Tor (HC1037 2018) GCF_002946655.1	n/a	3,712 (88.04 %)	n/a	n/a	n/a	47.53 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	87 (0.31 %)	10,845 (4.71 %)	0 (0 %)	372 (0.83 %)	25 (0.27 %)	39 (0.56 %)
1925	Vibrio cholerae O1 biovar El Tor (P27459 2020) GCF_013085125.1	n/a	3,716 (87.84 %)	n/a	n/a	n/a	47.49 (100.00 %)	0 (0 %)	1 (0.00 %)	2 (100.00 %)	n/a	97 (0.41 %)	10,788 (4.82 %)	0 (0 %)	522 (1.49 %)	26 (0.25 %)	31 (0.34 %)
1926	Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. (N16961 2019) GCF_900205735.1	n/a	3,715 (87.85 %)	n/a	n/a	n/a	47.49 (100.00 %)	0 (0 %)	9 (0.00 %)	2 (100.00 %)	n/a	92 (0.40 %)	10,753 (4.81 %)	0 (0 %)	535 (1.47 %)	26 (0.25 %)	30 (0.33 %)
1927	Vibrio cholerae O1 str. (2010EL-1786 2011) GCF_000166455.1	n/a	3,722 (88.06 %)	n/a	n/a	n/a	47.50 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	87 (0.31 %)	11,025 (4.77 %)	0 (0 %)	372 (0.83 %)	27 (0.29 %)	52 (0.72 %)
1928	Vibrio cholerae O1 str. (KW3 2015) GCF_001318185.1	n/a	3,736 (88.13 %)	n/a	n/a	n/a	47.51 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	98 (0.45 %)	11,167 (4.81 %)	0 (0 %)	371 (1.12 %)	24 (0.23 %)	32 (0.40 %)
1929	Vibrio cincinnatiensis (NCTC12012 2018) GCF_900460255.1	n/a	3,493 (87.61 %)	n/a	n/a	n/a	43.78 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	69 (0.42 %)	12,268 (5.78 %)	0 (0 %)	540 (2.59 %)	247 (3.90 %)	204 (2.35 %)
1930	Vibrio fluvialis (ATCC 33809 2018) GCF_001558415.2	n/a	4,507 (88.59 %)	n/a	n/a	n/a	49.93 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	56 (0.21 %)	13,415 (4.55 %)	0 (0 %)	131 (0.90 %)	1 (65.37 %)	0 (0.00 %)
1931	Vibrio furnissii (FDAARGOS_777 2019) GCF_006364355.1	n/a	4,633 (87.96 %)	n/a	n/a	n/a	50.60 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	181 (0.43 %)	16,118 (5.35 %)	0 (0 %)	368 (1.05 %)	5 (98.49 %)	9 (0.34 %)
1932	Vibrio harveyi (SB1 2023) GCF_030060435.1	n/a	5,367 (86.79 %)	n/a	n/a	n/a	44.98 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	129 (0.98 %)	17,202 (6.05 %)	0 (0 %)	799 (1.48 %)	238 (2.42 %)	220 (1.25 %)
1933	Vibrio injensis (M12-1144 2016) GCF_001895205.1	n/a	3,349 (87.35 %)	n/a	n/a	n/a	43.97 (100.00 %)	0 (0 %)	2 (0.00 %)	33 (100.00 %)	n/a	74 (0.35 %)	13,002 (6.00 %)	0 (0 %)	185 (0.44 %)	131 (4.83 %)	118 (1.13 %)
1934	Vibrio metoecus (ZF102 2023) GCF_030580635.1	n/a	3,777 (87.85 %)	n/a	n/a	n/a	46.92 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	4 (100.00 %)	n/a	69 (0.78 %)	9,613 (4.38 %)	0 (0 %)	823 (2.09 %)	17 (0.55 %)	63 (0.65 %)
1935	Vibrio metschnikovii (NCTC8443 2018) GCF_900460295.1	n/a	3,438 (86.36 %)	n/a	n/a	n/a	44.16 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	73 (0.31 %)	12,353 (5.63 %)	0 (0 %)	535 (0.96 %)	114 (1.82 %)	134 (2.29 %)
1936	Vibrio mimicus (NCTC11435 2018) GCF_900460385.1	n/a	4,101 (87.56 %)	n/a	n/a	n/a	46.34 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	50 (0.71 %)	12,049 (5.40 %)	0 (0 %)	897 (1.87 %)	177 (3.52 %)	188 (1.78 %)
1937	Vibrio parahaemolyticus (RIMD 2210633 substr. RIMD 2210633 2004) GCF_000196095.1	n/a	4,709 (87.39 %)	n/a	n/a	n/a	45.37 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	89 (0.65 %)	14,595 (4.62 %)	0 (0 %)	361 (0.99 %)	25 (0.29 %)	57 (0.61 %)
1938	Vibrio vulnificus NBRC 15645 (ATCC 27562 2017) GCF_002224265.1	n/a	4,430 (87.50 %)	n/a	n/a	n/a	46.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	157 (1.34 %)	14,064 (5.51 %)	0 (0 %)	978 (2.03 %)	13 (0.31 %)	66 (0.45 %)
1939	virus (MSSI2.225 ms23.49 2014) GCF_000923355.1	n/a	3 (85.39 %)	n/a	n/a	n/a	51.80 (99.82 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.31 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (70.83 %)	1 (70.83 %)
1940	Walrus calicivirus (2003) GCF_000852525.1	n/a	3 (97.71 %)	n/a	n/a	n/a	48.23 (99.95 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.49 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (9.51 %)	3 (9.51 %)
1941	Weeksella virosa (NCTC11634 2018) GCF_900637795.1	n/a	2,201 (90.71 %)	n/a	n/a	n/a	35.94 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	67 (0.32 %)	16,928 (16.10 %)	0 (0 %)	80 (0.54 %)	19 (0.28 %)	9 (0.12 %)
1942	Weissella confusa (VTT E-133279 2019) GCF_004771075.1	n/a	2,100 (89.51 %)	n/a	n/a	n/a	45.06 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	43 (0.34 %)	8,115 (6.13 %)	0 (0 %)	75 (0.86 %)	74 (2.04 %)	80 (1.68 %)
1943	Wenling frogfish filovirus (XYHYS28627 2021) GCF_004788975.1	n/a	10 (92.19 %)	n/a	n/a	n/a	49.85 (99.99 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.30 %)	n/a	3 (0.17 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (1.26 %)	1 (1.26 %)
1944	Wenling thamnaconus septentrionalis filovirus (LQMMTII17328 2021) GCF_004788995.1	n/a	6 (91.55 %)	n/a	n/a	n/a	47.74 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.22 %)	n/a	6 (0.57 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1945	Wesselsbron virus (SAH177 2009) GCF_000883915.1	n/a	1 (94.49 %)	n/a	n/a	n/a	47.65 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.37 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1946	West Nile virus (956 1993) GCF_000861085.1	n/a	3 (93.90 %)	n/a	n/a	n/a	51.06 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (7.47 %)	3 (7.47 %)
1947	West Nile virus (NY99 385-99 2007) GCF_000875385.1	n/a	5 (93.41 %)	n/a	n/a	n/a	51.17 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.07 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (2.23 %)	1 (2.23 %)
1948	Western equine encephalitis virus (71V-1658 2000) GCF_000850885.1	n/a	4 (96.79 %)	n/a	n/a	n/a	49.21 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.64 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (52.96 %)	3 (52.96 %)
1949	Western equine encephalitis virus (AG80-646 2023) GCF_002889215.1	n/a	2 (96.04 %)	n/a	n/a	n/a	48.32 (99.98 %)	8 (0.07 %)	8 (0.07 %)	9 (99.93 %)	4 (0.29 %)	n/a	5 (1.46 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	3 (7.08 %)	3 (7.08 %)
1950	wheat leaf rust (1-1 BBBD Race 1 2016) GCA_000151525.2	n/a	16,499 (19.77 %)	1,103 (0.74 %)	13,825 (13.35 %)	n/a	46.72 (78.74 %)	10,393 (21.26 %)	10,393 (21.26 %)	25,211 (78.74 %)	53,300 (16.84 %)	32,900 (2.09 %)	424,528 (15.00 %)	45 (0.02 %)	17,440 (1.33 %)	22,905 (15.33 %)	17,567 (11.36 %)
1951	witches' butter GCF_000271645.1	8,291 (43.24 %)	n/a	888 (2.37 %)	5,732 (20.70 %)	n/a	46.73 (97.73 %)	439 (2.28 %)	439 (2.28 %)	484 (97.72 %)	10,197 (6.18 %)	7,333 (2.14 %)	80,160 (16.24 %)	3 (0.00 %)	6,408 (2.87 %)	5,354 (18.44 %)	3,300 (8.69 %)
1952	WU Polyomavirus (B0 2007) GCF_000870785.1	n/a	6 (85.79 %)	n/a	n/a	n/a	39.18 (99.92 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.03 %)	1 (0.71 %)	16 (3.46 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1953	Wuchereria bancrofti (2018) GCA_900622535.1	n/a	13,058 (17.06 %)	2,122 (1.83 %)	4,499 (4.14 %)	n/a	28.82 (99.88 %)	3,280 (0.09 %)	3,280 (0.09 %)	16,800 (99.91 %)	73,596 (4.74 %)	33,170 (2.46 %)	723,871 (40.20 %)	64 (0.01 %)	5,547 (0.67 %)	102 (0.12 %)	90 (0.12 %)
1954	Wuchereria bancrofti (PNG22 2016) GCA_001555675.1	n/a	n/a	2,726 (2.27 %)	3,329 (4.76 %)	n/a	29.12 (99.96 %)	14,926 (0.05 %)	14,926 (0.05 %)	20,031 (99.95 %)	91,157 (5.82 %)	49,464 (4.57 %)	762,581 (38.33 %)	250 (0.05 %)	19,433 (1.83 %)	154 (0.07 %)	125 (0.05 %)
1955	Yaba monkey tumor virus (2003) GCF_000845705.1	n/a	140 (94.29 %)	n/a	n/a	n/a	29.83 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	24 (0.67 %)	6 (0.47 %)	1,223 (18.16 %)	0 (0 %)	2 (0.15 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1956	Yaba-like disease virus (2001) GCF_000847185.1	n/a	152 (95.76 %)	n/a	n/a	n/a	27.00 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	39 (1.06 %)	10 (0.44 %)	1,396 (21.09 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1957	yellow fever mosquito (Aag2 2022) GCA_021653915.1	n/a	n/a	7,941 (0.49 %)	87,870 (6.84 %)	n/a	38.14 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3,752 (100.00 %)	300,230 (1.06 %)	496,241 (4.60 %)	9,478,291 (53.75 %)	0 (0 %)	702,548 (4.04 %)	120,297 (6.12 %)	63,506 (2.23 %)
1958	yellow fever mosquito (LVP_AGWG 2017 refseq) GCF_002204515.2	33,026 (3.13 %)	n/a	6,622 (0.55 %)	60,584 (7.33 %)	n/a	38.18 (100.00 %)	0 (0 %)	229 (0.00 %)	2,310 (100.00 %)	1,886,359 (44.82 %)	370,739 (4.59 %)	7,710,852 (49.51 %)	0 (0 %)	458,653 (4.00 %)	90,949 (6.16 %)	51,353 (2.55 %)
1959	Yellow fever virus (17D vaccine strain 1986) GCF_000857725.1	n/a	1 (100.00 %)	n/a	n/a	n/a	49.72 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	1 (0.28 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1960	Yersinia enterocolitica subsp. palearctica (Y11 2011) GCF_000253175.1	n/a	4,240 (85.36 %)	n/a	n/a	n/a	46.97 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	2 (100.00 %)	n/a	144 (0.40 %)	8,173 (4.66 %)	0 (0 %)	176 (0.66 %)	391 (13.11 %)	472 (10.46 %)
1961	Yersinia pestis (A1122 2011) GCF_000222975.1	n/a	4,249 (84.43 %)	n/a	n/a	n/a	47.63 (100.00 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	n/a	795 (1.20 %)	5,502 (5.05 %)	0 (0 %)	338 (1.16 %)	214 (7.84 %)	424 (13.35 %)
1962	Yezo virus (HH003-2020 2023) GCF_029888495.1	n/a	3 (95.97 %)	n/a	n/a	n/a	45.30 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	21 (1.09 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1963	Zaire ebolavirus (Ebola virus/H.sapiens-tc/COD/1976/Yambuku-Mayinga 1999) GCF_000848505.1	n/a	11 (95.31 %)	n/a	n/a	n/a	41.07 (99.98 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.18 %)	n/a	4 (0.15 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	1 (1.12 %)	1 (1.12 %)
1964	Zika virus (MR 766 2009) GCF_000882815.3	n/a	1 (95.05 %)	n/a	n/a	n/a	50.95 (99.96 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.26 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
1965	Zika virus (Natal RGN 2017) GCF_002366285.1	n/a	1 (95.04 %)	n/a	n/a	n/a	51.26 (99.97 %)	0 (0 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.18 %)	0 (0 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
TOTALS:	total assembly count 1965

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	601 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	690 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	442 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	500 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	324 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	1365 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	342 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	948 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	710 assemblies	assembly stats	track stats
Archaea	757 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	21350 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	686 assemblies	assembly stats	track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project	1303 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	464 assemblies	assembly stats	track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center	1965 assemblies	assembly stats	track stats

BRC - Bioinformatics Research Center - track statistics

See also: hub access, assembly statistics

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