Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 A. eriantha gooseberry (White 2019)
GCA_004150315.1
n/a n/a 21,507
(2.72 %)
60,050
(11.57 %)
n/a 35.92
(99.97 %)
0
(0 %)
2,344
(0.03 %)
1,735
(100.00 %)
430,950
(2.82 %)
273,041
(3.10 %)
4,895,011
(32.98 %)
1
(0.00 %)
150,033
(1.97 %)
29,695
(1.88 %)
17,294
(1.01 %)
2 A.eriantha eudicots (MHT-2021 2021)
GCF_019202715.1
71,407
(11.93 %)
n/a 23,883
(3.45 %)
59,407
(13.07 %)
n/a 35.65
(99.64 %)
0
(0 %)
710
(0.36 %)
88
(100.00 %)
430,287
(3.04 %)
350,721
(4.29 %)
3,875,064
(36.80 %)
0
(0 %)
297,935
(5.94 %)
27,794
(1.97 %)
14,196
(0.90 %)
3 adzuki bean (Jingnong 6 2015)
GCF_001190045.1
40,475
(10.62 %)
n/a 16,697
(3.71 %)
47,542
(15.07 %)
n/a 34.07
(96.37 %)
21,264
(3.63 %)
21,264
(3.63 %)
58,639
(96.37 %)
257,290
(4.08 %)
239,596
(6.43 %)
2,925,469
(36.04 %)
202
(0.09 %)
250,517
(6.42 %)
24,461
(2.99 %)
14,539
(1.51 %)
4 adzuki bean (LongXiaoDou No.4 2021)
GCF_016808095.1
50,883
(11.85 %)
n/a 16,661
(3.75 %)
45,945
(15.40 %)
n/a 33.63
(100.00 %)
0
(0 %)
32
(0.00 %)
36
(100.00 %)
263,673
(3.52 %)
264,113
(5.18 %)
2,808,981
(37.65 %)
0
(0 %)
244,636
(6.82 %)
20,402
(2.60 %)
14,051
(1.55 %)
5 African boxthorn (CSIRO_LF1 2023)
GCF_029784015.1
54,359
(4.64 %)
n/a 16,693
(1.34 %)
75,114
(9.09 %)
n/a 37.42
(99.88 %)
0
(0 %)
15,111
(0.12 %)
14,905
(100.00 %)
668,488
(2.42 %)
511,720
(3.29 %)
8,110,750
(42.79 %)
2
(0.00 %)
942,647
(9.28 %)
50,821
(2.66 %)
18,184
(0.72 %)
6 African oil palm
GCF_000442705.1
51,575
(5.06 %)
n/a 16,948
(1.48 %)
76,464
(9.29 %)
n/a 37.21
(68.90 %)
162,407
(31.14 %)
166,490
(31.14 %)
202,468
(68.86 %)
580,361
(3.63 %)
445,124
(2.25 %)
5,831,606
(30.77 %)
2,228
(0.10 %)
282,030
(1.50 %)
75,576
(3.67 %)
31,746
(0.99 %)
7 African rice (2021)
GCF_000147395.1
43,755
(15.95 %)
n/a 16,224
(4.82 %)
51,031
(25.64 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
13
(0.00 %)
21
(0.00 %)
73
(100.00 %)
178,763
(2.60 %)
125,689
(4.18 %)
1,761,585
(30.96 %)
1
(0.00 %)
127,354
(3.72 %)
60,891
(21.37 %)
40,209
(7.27 %)
8 algarrobo blanco (v1 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.1
62,791
(10.08 %)
n/a 25,423
(3.34 %)
69,507
(14.55 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,087
(100.00 %)
367,402
(2.31 %)
175,862
(2.27 %)
4,241,058
(38.29 %)
0
(0 %)
289,448
(4.63 %)
18,927
(1.15 %)
12,774
(0.78 %)
9 algarrobo blanco (v2 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.2
62,791
(10.08 %)
n/a 25,443
(3.35 %)
69,492
(14.56 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,085
(100.00 %)
366,178
(2.25 %)
175,852
(2.27 %)
4,240,382
(38.29 %)
0
(0 %)
289,428
(4.63 %)
18,927
(1.15 %)
12,775
(0.79 %)
10 almond
GCF_902201215.1
37,363
(19.64 %)
n/a 14,509
(6.35 %)
33,193
(24.70 %)
n/a 37.65
(98.29 %)
1,008
(0.04 %)
6,531
(1.72 %)
1,700
(99.96 %)
137,974
(2.59 %)
100,386
(3.92 %)
1,251,126
(26.07 %)
7
(0.00 %)
114,850
(6.39 %)
10,893
(2.94 %)
5,266
(1.06 %)
11 annual mercury (primary hap 2022)
GCF_937616625.1
47,801
(11.07 %)
n/a 13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
0
(0 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
0
(0 %)
1,165,065
(19.31 %)
9,024
(2.18 %)
5,406
(0.45 %)
12 annual mercury (primary hap 2022)
GCF_937616625.2
44,356
(10.99 %)
n/a 13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
0
(0 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
0
(0 %)
1,165,065
(19.31 %)
9,024
(2.18 %)
5,406
(0.45 %)
13 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1
73,172
(3.41 %)
n/a 26,626
(1.10 %)
228,260
(15.00 %)
n/a 44.76
(99.87 %)
0
(0 %)
31,919
(0.13 %)
1,764
(100.00 %)
639,429
(1.31 %)
739,566
(3.57 %)
6,976,583
(59.37 %)
20
(0.00 %)
2,938,091
(54.45 %)
560,429
(28.70 %)
234,787
(7.24 %)
14 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 refseq)
GCF_002114115.1
64,918
(11.39 %)
n/a 22,530
(3.52 %)
67,146
(16.22 %)
n/a 38.04
(88.96 %)
0
(0 %)
7,264
(11.05 %)
807
(100.00 %)
692,611
(50.77 %)
322,556
(4.41 %)
3,055,836
(35.69 %)
2
(0.00 %)
451,438
(6.86 %)
25,923
(1.76 %)
13,929
(0.88 %)
15 Asian cultivated rice (Carolina Gold Select 2019)
GCA_004007595.1
n/a 68,732
(13.79 %)
16,583
(4.58 %)
55,248
(25.46 %)
n/a 43.36
(99.98 %)
0
(0 %)
696
(0.02 %)
615
(100.00 %)
495,126
(50.28 %)
124,567
(3.20 %)
1,922,072
(32.59 %)
0
(0 %)
155,586
(4.21 %)
65,220
(23.87 %)
41,812
(7.56 %)
16 Barbados nut
GCF_014843425.1
33,622
(13.80 %)
n/a 12,687
(4.63 %)
26,511
(14.56 %)
n/a 33.40
(99.60 %)
0
(0 %)
2,151
(0.40 %)
1,232
(100.00 %)
281,490
(24.82 %)
186,260
(5.65 %)
2,028,357
(33.33 %)
0
(0 %)
87,723
(3.18 %)
8,868
(1.38 %)
5,253
(0.75 %)
17 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1
50,905
(14.29 %)
n/a 16,712
(3.68 %)
41,041
(14.51 %)
n/a 33.43
(99.87 %)
0
(0 %)
22
(0.13 %)
42
(100.00 %)
393,909
(27.89 %)
175,427
(3.92 %)
2,532,494
(37.64 %)
0
(0 %)
222,154
(8.04 %)
3,384
(0.27 %)
2,085
(0.17 %)
18 barrel medic (A17 2014)
GCF_000219495.3
48,865
(15.69 %)
n/a 16,549
(3.99 %)
40,316
(15.41 %)
n/a 33.14
(94.48 %)
5,840
(5.53 %)
8,785
(5.53 %)
8,027
(94.47 %)
366,709
(22.34 %)
146,748
(2.80 %)
2,549,499
(32.46 %)
216
(0.08 %)
147,910
(5.33 %)
3,695
(0.65 %)
2,696
(0.57 %)
19 barrel medic (HM340 2017)
GCA_002024945.1
n/a n/a 16,672
(3.96 %)
40,032
(15.19 %)
n/a 33.05
(99.32 %)
0
(0 %)
107
(0.68 %)
909
(100.00 %)
381,065
(23.82 %)
162,402
(3.97 %)
2,490,028
(35.39 %)
0
(0 %)
206,427
(6.09 %)
3,335
(0.34 %)
2,111
(0.22 %)
20 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 alternate hap 2023)
GCA_028538565.1
n/a n/a 15,063
(1.43 %)
65,125
(11.47 %)
n/a 40.34
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
197
(100.00 %)
735,552
(11.30 %)
567,295
(6.87 %)
4,176,675
(45.56 %)
2
(0.00 %)
714,025
(8.90 %)
66,834
(4.90 %)
12,024
(0.59 %)
21 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 primary hap 2023)
GCA_028534965.1
n/a n/a 15,223
(1.43 %)
65,769
(11.33 %)
n/a 40.37
(100.00 %)
0
(0 %)
36
(0.00 %)
303
(100.00 %)
744,623
(11.37 %)
571,691
(7.15 %)
4,217,655
(45.87 %)
2
(0.00 %)
721,040
(8.85 %)
68,566
(4.96 %)
12,157
(0.60 %)
22 beet (v1 EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1
47,718
(9.45 %)
n/a 11,911
(2.04 %)
50,202
(16.78 %)
n/a 35.86
(99.99 %)
0
(0 %)
323
(0.01 %)
42
(100.00 %)
294,768
(3.41 %)
341,699
(6.22 %)
2,932,896
(35.20 %)
0
(0 %)
362,295
(7.68 %)
25,364
(1.79 %)
12,364
(0.80 %)
23 beet (v2 EL10 2022 USDA)
GCF_026745355.1
45,481
(9.22 %)
n/a 11,850
(2.05 %)
49,071
(15.89 %)
n/a 35.85
(94.03 %)
0
(0 %)
3,200
(5.97 %)
20
(100.00 %)
290,870
(3.40 %)
336,343
(5.76 %)
2,901,079
(33.21 %)
0
(0 %)
391,673
(6.85 %)
25,108
(1.67 %)
12,259
(0.75 %)
24 bell pepper eudicots (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1
70,848
(2.17 %)
n/a 15,922
(0.50 %)
69,601
(2.75 %)
n/a 34.91
(97.27 %)
0
(0 %)
52,577
(2.73 %)
81,202
(100.00 %)
1,192,132
(1.94 %)
1,097,384
(4.12 %)
23,393,622
(47.64 %)
4,061
(0.30 %)
1,575,258
(3.88 %)
19,517
(0.21 %)
5,887
(0.07 %)
25 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 alternate hap 2021)
GCA_019985075.1
n/a n/a 13,887
(2.34 %)
44,507
(14.12 %)
n/a 37.97
(100.00 %)
0
(0 %)
120
(0.00 %)
2,350
(100.00 %)
250,361
(2.10 %)
231,118
(13.56 %)
2,049,366
(44.58 %)
8
(0.00 %)
541,706
(10.86 %)
22,527
(6.34 %)
9,698
(0.77 %)
26 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 primary hap 2022)
GCA_019985065.2
n/a n/a 15,102
(2.62 %)
47,553
(15.64 %)
n/a 38.11
(100.00 %)
0
(0 %)
82
(0.00 %)
272
(100.00 %)
257,066
(2.22 %)
226,514
(14.63 %)
2,470,334
(38.37 %)
0
(0 %)
402,921
(8.45 %)
21,415
(5.59 %)
9,843
(0.72 %)
27 birdsfoot trefoil (B-129 2022)
GCF_012489685.1
57,539
(11.82 %)
n/a 16,919
(2.98 %)
64,687
(19.59 %)
n/a 38.05
(99.97 %)
0
(0 %)
1,625
(0.04 %)
65
(100.00 %)
236,645
(2.13 %)
205,150
(5.19 %)
2,202,942
(41.60 %)
8
(0.00 %)
405,251
(12.94 %)
32,283
(3.44 %)
14,923
(1.36 %)
28 bitter melon
GCF_001995035.1
31,725
(13.80 %)
n/a 12,858
(4.62 %)
30,539
(16.85 %)
n/a 34.58
(92.32 %)
0
(0 %)
109,310
(7.74 %)
1,052
(100.00 %)
162,837
(2.82 %)
89,571
(2.03 %)
1,951,167
(30.96 %)
511
(0.13 %)
50,890
(1.69 %)
14,100
(2.00 %)
10,345
(1.39 %)
29 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 alternate hap 2023)
GCA_028534865.1
n/a n/a 20,077
(4.66 %)
43,061
(17.16 %)
n/a 34.80
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
338
(100.00 %)
267,110
(2.88 %)
173,502
(6.32 %)
2,366,759
(39.61 %)
0
(0 %)
279,214
(8.59 %)
5,093
(4.11 %)
1,729
(0.14 %)
30 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 primary hap 2023)
GCA_028534895.1
n/a n/a 19,804
(4.58 %)
42,642
(17.03 %)
n/a 34.85
(100.00 %)
0
(0 %)
26
(0.00 %)
132
(100.00 %)
265,925
(2.85 %)
174,688
(6.70 %)
2,359,101
(40.07 %)
1
(0.00 %)
298,817
(9.06 %)
4,963
(4.10 %)
1,643
(0.13 %)
31 black cottonwood (v4.1 Nisqually-1 2022)
GCF_000002775.5
59,542
(15.92 %)
n/a 19,969
(4.99 %)
41,581
(16.22 %)
n/a 33.75
(99.85 %)
59
(0.15 %)
59
(0.15 %)
106
(99.85 %)
257,833
(2.91 %)
156,371
(4.50 %)
2,423,627
(36.28 %)
0
(0 %)
202,186
(5.63 %)
3,761
(0.66 %)
1,701
(0.17 %)
32 black tea
GCF_004153795.1
101,253
(3.17 %)
n/a 20,982
(0.66 %)
156,999
(7.69 %)
n/a 37.85
(92.12 %)
0
(0 %)
79,329
(7.89 %)
14,028
(100.00 %)
1,926,995
(3.23 %)
2,024,420
(8.06 %)
17,959,098
(50.75 %)
6
(0.00 %)
3,231,864
(10.09 %)
181,027
(2.79 %)
29,897
(0.36 %)
33 blue lilly pilly tree (NSW1041296 2022)
GCF_021117445.2
46,173
(12.87 %)
n/a 15,187
(3.49 %)
50,585
(20.61 %)
n/a 40.95
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
72
(100.00 %)
494,434
(48.54 %)
220,571
(4.98 %)
1,866,530
(29.09 %)
0
(0 %)
302,589
(7.56 %)
59,325
(10.76 %)
28,053
(3.71 %)
34 bread wheat (Chinese Spring 2020)
GCA_002220415.3
n/a 138,090
(1.09 %)
46,431
(0.31 %)
805,204
(7.93 %)
n/a 46.09
(99.87 %)
0
(0 %)
211,982
(0.14 %)
70,316
(100.00 %)
9,191,325
(44.14 %)
5,086,953
(4.53 %)
282,298
(99.86 %)
316
(0.00 %)
19,425,363
(15.62 %)
3,241,124
(28.06 %)
2,065,976
(13.12 %)
35 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1
221,449
(1.62 %)
n/a n/a 763,380
(8.08 %)
n/a 46.14
(98.27 %)
0
(0 %)
214,799
(1.73 %)
91,589
(100.00 %)
8,660,189
(44.94 %)
4,402,049
(3.94 %)
306,386
(98.27 %)
434
(0.02 %)
17,440,813
(14.18 %)
3,040,030
(27.48 %)
0
(0.00 %)
36 bread wheat (Chinese Spring IWGSC RefSeq v1.0 2018)
GCA_900519105.1
n/a n/a n/a 751,576
(8.03 %)
n/a 46.05
(98.12 %)
693,028
(1.90 %)
693,028
(1.90 %)
693,050
(98.10 %)
8,420,935
(44.23 %)
4,115,828
(3.69 %)
693,050
(98.10 %)
385
(0.01 %)
n/a 3,076,631
(26.41 %)
0
(0.00 %)
37 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1
n/a n/a n/a 773,766
(8.20 %)
n/a 46.05
(100.00 %)
0
(0 %)
1,407
(0.00 %)
3,795
(100.00 %)
8,703,192
(44.57 %)
4,569,103
(5.20 %)
5,202
(100.00 %)
12
(0.00 %)
n/a 3,001,896
(28.00 %)
0
(0.00 %)
38 cacao
GCF_000208745.1
34,727
(13.67 %)
n/a 14,294
(4.65 %)
29,216
(14.38 %)
n/a 34.09
(94.31 %)
0
(0 %)
11,787
(5.70 %)
431
(100.00 %)
206,049
(15.64 %)
99,229
(2.66 %)
1,933,579
(33.24 %)
175
(0.02 %)
138,327
(4.02 %)
2,964
(0.34 %)
2,376
(0.27 %)
39 California black walnut (Jcal.S.LA.6 alternate hap 2022)
GCA_023349545.1
n/a n/a 18,729
(3.22 %)
57,374
(16.70 %)
n/a 36.81
(100.00 %)
0
(0 %)
78
(0.00 %)
915
(100.00 %)
421,731
(3.42 %)
300,957
(5.54 %)
2,794,242
(34.11 %)
1
(0.00 %)
264,077
(5.33 %)
25,348
(3.39 %)
12,668
(0.88 %)
40 California black walnut (Jcal.S.LA.6 primary hap 2022)
GCA_023349395.1
n/a n/a 18,579
(3.26 %)
56,295
(16.71 %)
n/a 36.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
138
(100.00 %)
414,129
(3.48 %)
293,951
(5.95 %)
3,055,420
(34.96 %)
0
(0 %)
267,374
(5.36 %)
24,749
(4.05 %)
12,091
(0.87 %)
41 California pipevine (CCGP_79_NKW_82.1479hap1 2023)
GCF_029961685.1
43,175
(7.78 %)
n/a 16,377
(2.29 %)
43,559
(11.38 %)
n/a 36.31
(100.00 %)
175
(0.00 %)
175
(0.00 %)
706
(100.00 %)
341,665
(12.46 %)
223,217
(36.36 %)
2,388,236
(58.00 %)
5
(0.00 %)
2,500,132
(20.87 %)
26,535
(3.98 %)
15,554
(1.14 %)
42 California scrub oak (Qber.S.LA.60 alternate hap 2023)
GCA_028535905.1
n/a n/a 16,153
(1.86 %)
68,653
(14.03 %)
n/a 35.79
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
807
(100.00 %)
783,798
(4.17 %)
456,025
(10.87 %)
4,951,918
(40.76 %)
2
(0.00 %)
725,680
(8.19 %)
21,783
(2.16 %)
9,330
(0.43 %)
43 California scrub oak (Qber.S.LA.60 primary hap 2023)
GCA_028535815.1
n/a n/a 15,836
(1.90 %)
66,803
(13.99 %)
n/a 35.77
(100.00 %)
0
(0 %)
32
(0.00 %)
283
(100.00 %)
762,029
(4.24 %)
448,099
(10.97 %)
4,784,968
(41.07 %)
0
(0 %)
695,512
(8.10 %)
20,384
(2.28 %)
8,472
(0.39 %)
44 Cannabis sativa ( 2020)
GCA_016165845.1
n/a n/a 18,838
(1.94 %)
71,211
(13.84 %)
n/a 33.78
(99.91 %)
0
(0 %)
8,772
(0.10 %)
147
(100.00 %)
643,488
(3.49 %)
361,843
(3.63 %)
4,074,440
(56.52 %)
36
(0.00 %)
950,351
(13.57 %)
27,745
(1.31 %)
6,939
(0.30 %)
45 Cannabis sativa (Cannatonic 2016)
GCA_001865755.1
n/a n/a 10,725
(1.71 %)
41,537
(11.41 %)
n/a 33.68
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11,110
(100.00 %)
396,112
(4.11 %)
221,932
(3.23 %)
2,389,229
(59.21 %)
0
(0 %)
623,084
(13.50 %)
17,045
(1.23 %)
4,584
(0.35 %)
46 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2
39,696
(6.07 %)
n/a 13,883
(1.80 %)
50,556
(11.19 %)
n/a 33.51
(84.07 %)
843
(15.93 %)
843
(15.93 %)
1,052
(84.07 %)
496,648
(3.63 %)
258,281
(2.28 %)
3,594,433
(47.71 %)
1
(0.00 %)
755,100
(9.25 %)
22,750
(1.69 %)
7,799
(0.33 %)
47 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2
n/a n/a 24,975
(1.79 %)
113,252
(15.69 %)
n/a 34.00
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,372
(100.00 %)
936,351
(4.13 %)
520,230
(3.65 %)
5,183,602
(58.66 %)
0
(0 %)
1,449,890
(14.90 %)
47,327
(1.58 %)
8,921
(0.24 %)
48 Cannabis sativa (Jamaican Lion Mother 2020)
GCA_012923435.1
n/a 27,358
(4.91 %)
15,253
(1.67 %)
62,228
(12.57 %)
n/a 34.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,599
(100.00 %)
595,917
(3.95 %)
335,791
(3.38 %)
3,478,519
(61.18 %)
0
(0 %)
975,634
(15.64 %)
31,738
(1.57 %)
5,423
(0.22 %)
49 Cannabis sativa (JL 2020)
GCA_013030365.1
n/a n/a 15,334
(1.80 %)
60,140
(12.83 %)
n/a 33.79
(99.92 %)
0
(0 %)
2,496
(0.09 %)
483
(100.00 %)
567,458
(3.73 %)
320,455
(3.12 %)
3,403,771
(58.38 %)
0
(0 %)
853,323
(14.39 %)
27,791
(1.48 %)
5,805
(0.25 %)
50 capsicum (Zunla-1 2015 refseq)
GCF_000710875.1
57,769
(2.07 %)
n/a 16,114
(0.55 %)
62,579
(2.93 %)
n/a 34.94
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
107,172
(3.23 %)
108,799
(96.77 %)
968,939
(3.15 %)
948,741
(4.39 %)
21,535,213
(46.15 %)
331
(0.03 %)
1,512,422
(5.05 %)
16,685
(0.21 %)
5,036
(0.06 %)
51 carrot
GCF_001625215.1
51,773
(15.95 %)
n/a 16,649
(3.96 %)
50,187
(20.50 %)
n/a 34.79
(91.77 %)
0
(0 %)
26,112
(8.24 %)
4,826
(100.00 %)
179,630
(2.41 %)
166,060
(4.97 %)
1,981,148
(31.51 %)
1,240
(0.20 %)
243,624
(9.01 %)
8,564
(0.85 %)
5,080
(0.52 %)
52 carrot (DH1 2023)
GCF_001625215.2
60,116
(15.29 %)
n/a 16,679
(3.49 %)
51,607
(18.82 %)
n/a 34.97
(99.99 %)
0
(0 %)
554
(0.01 %)
11
(100.00 %)
195,035
(2.33 %)
186,941
(8.11 %)
2,018,050
(39.61 %)
1
(0.00 %)
377,471
(12.12 %)
10,319
(1.14 %)
5,451
(0.55 %)
53 cassava (60444 2018)
GCA_003957885.1
n/a n/a 27,737
(2.70 %)
78,774
(11.79 %)
n/a 37.13
(76.51 %)
0
(0 %)
36,478
(23.50 %)
4,440
(100.00 %)
584,617
(3.41 %)
554,162
(3.52 %)
4,126,060
(43.14 %)
7
(0.00 %)
948,846
(11.29 %)
77,570
(1.78 %)
7,929
(0.25 %)
54 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2
56,386
(9.38 %)
n/a 18,790
(2.86 %)
49,944
(11.73 %)
n/a 37.52
(99.61 %)
672
(0.39 %)
672
(0.39 %)
758
(99.61 %)
377,964
(3.52 %)
356,023
(4.79 %)
2,560,255
(56.85 %)
5
(0.00 %)
693,966
(16.79 %)
52,506
(2.50 %)
5,169
(0.28 %)
55 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1
33,377
(11.52 %)
n/a 13,874
(4.00 %)
33,656
(13.67 %)
n/a 33.84
(96.11 %)
23,305
(3.90 %)
23,313
(3.90 %)
49,406
(96.10 %)
207,850
(3.52 %)
166,467
(10.85 %)
1,676,921
(43.19 %)
41
(0.02 %)
430,309
(7.84 %)
12,838
(2.54 %)
5,339
(1.40 %)
56 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCF_019578655.1
39,358
(13.36 %)
n/a 13,841
(4.31 %)
29,805
(14.24 %)
n/a 33.03
(99.95 %)
0
(0 %)
331
(0.05 %)
140
(100.00 %)
205,974
(3.02 %)
128,354
(6.37 %)
1,998,066
(39.24 %)
0
(0 %)
259,147
(6.26 %)
7,216
(0.99 %)
2,812
(0.36 %)
57 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n 2020)
GCA_011386875.1
n/a n/a 3
(0.11 %)
117
(7.42 %)
n/a 39.35
(99.99 %)
0
(0 %)
4
(0.01 %)
35
(100.00 %)
1,139
(3.04 %)
1,677
(4.92 %)
11,074
(10.60 %)
0
(0 %)
3,401
(11.34 %)
76
(1.07 %)
36
(0.43 %)
58 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n Whitten #5841 2020)
GCA_009866685.1
n/a n/a 6,487
(0.16 %)
114,999
(4.12 %)
n/a 37.82
(62.87 %)
490,371
(37.15 %)
490,371
(37.15 %)
1,116,784
(62.85 %)
692,892
(1.67 %)
790,165
(1.22 %)
18,073,193
(31.20 %)
3,963
(0.05 %)
n/a 24,414
(0.46 %)
13,542
(0.37 %)
59 chia eudicots (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1
53,262
(17.46 %)
n/a 17,642
(4.97 %)
49,474
(23.85 %)
n/a 36.14
(99.81 %)
0
(0 %)
3,756
(0.19 %)
1,556
(100.00 %)
156,083
(2.30 %)
128,904
(3.10 %)
2,112,137
(31.93 %)
71
(0.02 %)
137,558
(5.10 %)
31,157
(5.92 %)
23,418
(3.74 %)
60 chickpea
GCF_000331145.1
41,971
(9.82 %)
n/a 15,685
(3.16 %)
30,411
(8.82 %)
n/a 31.04
(90.95 %)
31,897
(9.07 %)
31,897
(9.07 %)
39,024
(90.93 %)
339,564
(10.51 %)
318,439
(11.48 %)
2,929,750
(43.82 %)
304
(0.08 %)
536,078
(8.47 %)
3,488
(0.28 %)
2,503
(0.18 %)
61 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2
66,337
(12.31 %)
n/a 15,432
(2.83 %)
67,569
(21.71 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
53
(100.00 %)
275,878
(2.26 %)
229,333
(3.98 %)
2,244,200
(35.17 %)
0
(0 %)
277,187
(7.19 %)
37,317
(4.17 %)
22,646
(1.74 %)
62 Chinese keys (BR_CEBAR01 2022)
GCA_024364735.1
n/a n/a 23,898
(0.89 %)
138,156
(8.52 %)
n/a 40.10
(96.58 %)
25,154
(3.42 %)
25,154
(3.42 %)
35,781
(96.58 %)
829,613
(1.78 %)
1,793,985
(6.94 %)
8,707,237
(62.53 %)
41
(0.01 %)
2,679,318
(12.88 %)
317,707
(8.50 %)
99,451
(2.46 %)
63 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1
54,029
(12.78 %)
n/a 22,400
(4.38 %)
57,140
(17.42 %)
n/a 37.29
(97.86 %)
24,384
(2.15 %)
24,384
(2.15 %)
26,566
(97.85 %)
368,808
(18.26 %)
218,013
(4.36 %)
2,456,496
(34.15 %)
105
(0.03 %)
322,129
(7.53 %)
18,367
(1.88 %)
11,851
(1.15 %)
64 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1
62,514
(13.83 %)
n/a 22,289
(4.29 %)
57,502
(17.16 %)
n/a 37.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 452
(100.00 %)
290,077
(2.40 %)
209,363
(3.56 %)
2,519,627
(35.77 %)
0
(0 %)
352,108
(8.82 %)
19,299
(1.84 %)
11,854
(1.08 %)
65 clementine
GCF_000493195.1
36,454
(14.29 %)
n/a 14,126
(4.66 %)
32,820
(18.34 %)
n/a 34.96
(97.94 %)
7,564
(2.07 %)
7,564
(2.07 %)
8,962
(97.93 %)
178,443
(2.76 %)
104,853
(5.57 %)
1,933,079
(33.91 %)
29
(0.01 %)
205,572
(6.24 %)
7,930
(3.80 %)
4,793
(0.70 %)
66 climbing nightshade (primary hap 2022)
GCF_947179165.1
44,646
(5.40 %)
n/a 15,784
(1.70 %)
48,875
(7.66 %)
n/a 35.83
(100.00 %)
0
(0 %)
38
(0.00 %)
105
(100.00 %)
347,467
(1.98 %)
290,488
(4.50 %)
6,293,084
(43.53 %)
0
(0 %)
770,795
(8.60 %)
8,929
(0.83 %)
2,434
(0.09 %)
67 club-mosses (2010)
GCF_000143415.4
49,382
(28.03 %)
n/a 11,312
(4.28 %)
36,277
(36.82 %)
n/a 45.22
(98.15 %)
4,395
(1.86 %)
4,395
(1.86 %)
5,152
(98.14 %)
138,958
(36.90 %)
77,054
(2.71 %)
802,227
(32.19 %)
8
(0.01 %)
146,035
(8.10 %)
34,479
(27.80 %)
23,866
(22.56 %)
68 club-mosses (Aurea 2015)
GCA_001021135.1
n/a n/a 6,316
(4.02 %)
55,013
(41.57 %)
n/a 44.70
(99.81 %)
351
(0.00 %)
351
(0.00 %)
106,265
(100.00 %)
29,218
(1.24 %)
29,377
(1.67 %)
480,195
(13.66 %)
1
(0.00 %)
n/a 19,392
(13.60 %)
14,620
(8.38 %)
69 coffee C.arabica
GCF_003713225.1
80,738
(8.03 %)
n/a 23,574
(2.02 %)
85,662
(13.32 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
0
(0 %)
691
(0.21 %)
2,833
(100.00 %)
501,414
(2.11 %)
386,209
(3.95 %)
5,652,743
(41.66 %)
0
(0 %)
1,077,929
(15.36 %)
36,398
(1.62 %)
13,210
(0.76 %)
70 coffee C.eugenioides
GCF_003713205.1
43,829
(7.69 %)
n/a 14,911
(2.02 %)
57,408
(14.42 %)
n/a 36.89
(97.92 %)
0
(0 %)
3,482
(2.08 %)
3,530
(100.00 %)
312,360
(2.09 %)
234,658
(3.24 %)
3,464,594
(38.91 %)
5
(0.00 %)
573,244
(14.34 %)
21,553
(1.54 %)
8,893
(0.82 %)
71 common bean
GCF_000499845.1
32,720
(9.56 %)
n/a 16,474
(3.53 %)
45,055
(14.46 %)
n/a 34.96
(90.70 %)
40,860
(9.33 %)
40,860
(9.33 %)
41,568
(90.67 %)
233,709
(2.97 %)
208,045
(3.61 %)
2,886,693
(37.28 %)
77
(0.03 %)
225,586
(4.20 %)
38,054
(5.05 %)
10,671
(0.95 %)
72 common fig (Dottato GU2019 2019)
GCA_009761775.1
n/a n/a 14,992
(4.28 %)
36,350
(16.84 %)
n/a 34.41
(99.99 %)
394
(0.01 %)
394
(0.01 %)
905
(99.99 %)
475,247
(5.76 %)
230,646
(4.36 %)
2,425,030
(37.74 %)
0
(0 %)
187,932
(6.92 %)
18,611
(3.41 %)
14,658
(2.57 %)
73 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1
49,622
(12.72 %)
n/a 14,929
(3.58 %)
32,981
(12.20 %)
n/a 33.07
(99.99 %)
0
(0 %)
381
(0.01 %)
538
(100.00 %)
525,520
(5.43 %)
225,151
(3.91 %)
2,463,587
(42.86 %)
0
(0 %)
240,039
(5.90 %)
13,018
(1.79 %)
4,271
(0.48 %)
74 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1
49,976
(13.24 %)
n/a 16,949
(3.79 %)
38,488
(13.47 %)
n/a 33.40
(95.35 %)
24,158
(4.67 %)
24,158
(4.67 %)
28,947
(95.33 %)
525,525
(5.37 %)
246,475
(5.25 %)
2,603,240
(38.46 %)
78
(0.04 %)
256,779
(9.85 %)
13,597
(2.11 %)
5,462
(1.04 %)
75 common jujube (Dongzao 2023)
GCF_031755915.1
51,464
(13.54 %)
n/a 14,443
(3.56 %)
31,633
(12.06 %)
n/a 33.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 14
(100.00 %)
516,010
(5.54 %)
234,395
(5.05 %)
2,319,259
(43.64 %)
0
(0 %)
252,407
(6.74 %)
12,926
(2.66 %)
3,943
(0.43 %)
76 common reed (primary hap 2023)
GCF_958298935.1
65,051
(8.85 %)
n/a 26,142
(3.49 %)
114,639
(23.87 %)
n/a 44.17
(100.00 %)
0
(0 %)
59
(0.00 %)
37
(100.00 %)
243,799
(1.41 %)
237,530
(2.79 %)
4,477,357
(31.45 %)
2
(0.00 %)
226,760
(3.23 %)
154,087
(19.32 %)
110,558
(9.31 %)
77 common sunflower
GCF_002127325.2
133,319
(3.74 %)
n/a 19,514
(0.59 %)
166,187
(9.16 %)
n/a 38.59
(97.94 %)
0
(0 %)
2,384
(2.06 %)
334
(100.00 %)
1,263,836
(2.20 %)
1,549,598
(4.15 %)
12,728,097
(58.39 %)
0
(0 %)
3,080,461
(20.20 %)
170,287
(2.39 %)
34,569
(0.41 %)
78 common tobacco
GCF_000715135.1
100,805
(3.09 %)
n/a 29,968
(0.80 %)
184,998
(7.05 %)
n/a 38.95
(97.11 %)
124,354
(2.89 %)
292,325
(2.90 %)
292,601
(97.11 %)
1,134,202
(3.09 %)
1,268,208
(4.45 %)
24,013,710
(52.08 %)
127
(0.00 %)
2,554,031
(5.85 %)
204,914
(1.84 %)
31,402
(0.30 %)
79 cork oak (v2 HL8 2018)
GCF_002906115.2
53,587
(7.04 %)
n/a 17,804
(1.85 %)
77,741
(13.65 %)
n/a 35.35
(97.95 %)
0
(0 %)
25,649
(2.05 %)
22,642
(100.00 %)
860,049
(3.78 %)
485,854
(6.14 %)
5,989,180
(36.35 %)
218
(0.02 %)
685,954
(9.84 %)
20,674
(1.12 %)
10,386
(0.56 %)
80 cork oak (v3 HL8 2024)
GCF_002906115.3
56,406
(8.63 %)
n/a 16,303
(2.05 %)
63,990
(13.73 %)
n/a 34.91
(95.70 %)
26,066
(4.30 %)
26,066
(4.30 %)
28,407
(95.70 %)
743,470
(3.99 %)
393,077
(5.53 %)
4,897,193
(34.87 %)
234
(0.08 %)
535,347
(10.58 %)
16,140
(0.90 %)
8,912
(0.49 %)
81 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1
112,410
(5.51 %)
n/a 35,047
(1.61 %)
101,814
(6.75 %)
n/a 34.45
(97.16 %)
48,736
(2.84 %)
48,742
(2.84 %)
57,884
(97.16 %)
829,774
(2.69 %)
808,839
(3.64 %)
12,556,104
(52.01 %)
202
(0.01 %)
1,489,112
(8.44 %)
31,946
(0.61 %)
9,983
(0.20 %)
82 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1
154,180
(6.02 %)
n/a 37,839
(1.61 %)
107,764
(6.56 %)
n/a 34.36
(99.87 %)
5,708
(0.13 %)
5,708
(0.13 %)
6,735
(99.87 %)
996,701
(2.36 %)
903,817
(3.56 %)
13,123,355
(54.75 %)
6
(0.00 %)
2,053,660
(12.23 %)
35,220
(0.59 %)
11,349
(0.19 %)
83 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1
72,590
(8.99 %)
n/a 20,368
(2.64 %)
86,941
(18.36 %)
n/a 33.22
(98.25 %)
19,717
(1.76 %)
19,717
(1.76 %)
20,751
(98.24 %)
367,610
(3.53 %)
300,200
(3.32 %)
5,199,574
(40.83 %)
36
(0.01 %)
386,729
(4.92 %)
10,926
(0.55 %)
5,495
(0.26 %)
84 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2
48,519
(10.54 %)
n/a 16,925
(3.30 %)
44,689
(13.01 %)
n/a 32.95
(99.48 %)
0
(0 %)
68
(0.52 %)
676
(100.00 %)
344,688
(3.92 %)
283,941
(8.14 %)
3,091,888
(41.66 %)
1
(0.00 %)
420,714
(7.57 %)
24,507
(2.34 %)
11,817
(1.10 %)
85 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1
49,636
(19.79 %)
n/a 18,863
(6.83 %)
34,588
(19.24 %)
n/a 36.43
(97.43 %)
0
(0 %)
13,813
(2.58 %)
3,500
(100.00 %)
181,838
(3.12 %)
140,936
(7.42 %)
1,550,544
(33.30 %)
519
(0.13 %)
210,153
(7.41 %)
13,714
(2.69 %)
9,612
(1.52 %)
86 cucumber
GCF_000004075.3
37,079
(18.45 %)
n/a 13,349
(5.61 %)
23,889
(15.73 %)
n/a 32.84
(99.98 %)
0
(0 %)
89
(0.02 %)
88
(100.00 %)
158,454
(3.72 %)
77,247
(3.20 %)
1,739,467
(33.72 %)
0
(0 %)
67,519
(3.18 %)
5,730
(1.35 %)
4,446
(0.78 %)
87 cultivated vanilla (Daphna alternate hap 2020)
GCA_016413885.1
n/a 29,180
(3.86 %)
14,128
(1.63 %)
42,460
(7.33 %)
n/a 30.78
(99.98 %)
0
(0 %)
2,018
(0.02 %)
668
(100.00 %)
377,357
(3.69 %)
183,159
(2.82 %)
5,560,199
(36.58 %)
0
(0 %)
236,375
(2.51 %)
30,878
(2.75 %)
24,670
(2.23 %)
88 cultivated vanilla (Daphna primary hap 2020)
GCA_016413895.1
n/a 29,167
(3.89 %)
13,933
(1.63 %)
40,035
(6.93 %)
n/a 30.80
(99.98 %)
0
(0 %)
1,977
(0.02 %)
667
(100.00 %)
373,612
(3.67 %)
181,531
(2.84 %)
5,483,268
(36.45 %)
0
(0 %)
238,255
(2.57 %)
30,829
(2.75 %)
24,652
(2.23 %)
89 damask rose (2016)
GCA_001662545.1
n/a n/a 16,060
(1.87 %)
117,610
(18.87 %)
n/a 38.73
(97.06 %)
101,982
(2.91 %)
101,982
(2.91 %)
409,854
(97.09 %)
329,911
(1.95 %)
258,478
(2.82 %)
3,747,902
(31.42 %)
54
(0.00 %)
n/a 48,987
(3.05 %)
30,432
(1.60 %)
90 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1
61,678
(8.40 %)
n/a 18,582
(2.20 %)
70,121
(14.29 %)
n/a 40.29
(100.00 %)
0
(0 %)
317
(0.00 %)
2,391
(100.00 %)
431,923
(8.92 %)
371,389
(4.19 %)
2,721,501
(44.16 %)
0
(0 %)
589,858
(11.41 %)
89,481
(12.47 %)
43,324
(3.17 %)
91 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1
48,949
(10.55 %)
n/a 16,697
(2.99 %)
64,523
(16.24 %)
n/a 39.33
(91.22 %)
63,065
(8.79 %)
64,723
(8.79 %)
143,382
(91.21 %)
284,003
(7.58 %)
185,641
(2.23 %)
2,574,645
(27.52 %)
1,389
(0.09 %)
103,949
(2.07 %)
62,332
(7.21 %)
34,074
(3.23 %)
92 date-plum (Yz01 2020)
GCF_014633365.1
48,204
(8.04 %)
n/a 15,110
(2.28 %)
57,536
(14.48 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
0
(0 %)
606
(0.01 %)
43
(100.00 %)
445,970
(3.39 %)
319,468
(5.39 %)
3,687,072
(36.31 %)
0
(0 %)
392,987
(6.21 %)
41,402
(3.02 %)
25,722
(1.62 %)
93 dessert banana (baxijiao 2024)
GCF_036884655.1
193,799
(12.81 %)
n/a 52,060
(3.07 %)
144,859
(15.37 %)
n/a 39.78
(99.99 %)
0
(0 %)
219
(0.01 %)
1,085
(100.00 %)
713,274
(2.40 %)
840,280
(6.39 %)
4,419,734
(51.60 %)
2
(0.00 %)
1,727,746
(13.45 %)
203,906
(13.78 %)
99,332
(4.84 %)
94 domesticated barley (H.vulgare 2021 refseq)
GCF_904849725.1
63,294
(1.67 %)
n/a 17,849
(0.43 %)
260,921
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
0
(0 %)
162
(0.03 %)
291
(100.00 %)
2,720,197
(55.13 %)
1,726,335
(5.40 %)
14,010,390
(72.58 %)
0
(0 %)
5,823,234
(14.08 %)
732,834
(17.24 %)
271,782
(4.92 %)
95 durian
GCF_002303985.1
68,467
(10.35 %)
n/a 24,627
(3.34 %)
48,130
(9.41 %)
n/a 32.64
(99.58 %)
0
(0 %)
3,044
(0.43 %)
677
(100.00 %)
490,482
(3.80 %)
509,842
(12.92 %)
4,397,155
(48.22 %)
4
(0.00 %)
1,062,720
(8.92 %)
56,957
(6.23 %)
3,948
(0.21 %)
96 eggplant (2014)
GCA_000787875.1
n/a n/a 15,481
(1.92 %)
48,974
(7.98 %)
n/a 35.72
(95.30 %)
109,175
(4.75 %)
118,249
(4.75 %)
143,048
(95.25 %)
317,711
(2.21 %)
307,772
(4.55 %)
6,006,653
(38.61 %)
139
(0.00 %)
405,018
(4.41 %)
7,570
(0.50 %)
3,023
(0.14 %)
97 English oak (primary hap 2022)
GCF_932294415.1
69,123
(8.58 %)
n/a 15,792
(1.92 %)
66,872
(14.31 %)
n/a 35.68
(100.00 %)
0
(0 %)
119
(0.00 %)
96
(100.00 %)
773,652
(4.18 %)
429,695
(8.87 %)
4,823,216
(39.65 %)
0
(0 %)
671,979
(7.81 %)
21,654
(2.15 %)
8,337
(0.38 %)
98 English walnut
GCF_001411555.2
52,962
(10.18 %)
n/a 18,927
(3.19 %)
60,210
(17.37 %)
n/a 36.21
(99.89 %)
0
(0 %)
1,051
(0.11 %)
24,757
(100.00 %)
434,989
(3.86 %)
303,673
(3.70 %)
3,318,114
(33.94 %)
1
(0.00 %)
243,788
(4.94 %)
24,028
(1.83 %)
12,484
(0.84 %)
99 eudicot A.glutinosa (primary hap 2023)
GCF_958979055.1
42,218
(10.92 %)
n/a 14,784
(3.18 %)
46,293
(16.46 %)
n/a 36.73
(100.00 %)
0
(0 %)
96
(0.00 %)
15
(100.00 %)
433,802
(3.92 %)
270,411
(4.15 %)
2,634,547
(36.26 %)
5
(0.00 %)
320,176
(6.73 %)
29,535
(3.72 %)
14,829
(1.30 %)
100 eudicot C.sativa (Pink pepper KNU-18-1 2023)
GCF_029168945.1
47,822
(7.37 %)
n/a 14,132
(1.76 %)
52,606
(11.89 %)
n/a 34.09
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
18
(100.00 %)
490,095
(3.26 %)
291,432
(3.68 %)
3,197,241
(60.23 %)
0
(0 %)
860,217
(15.10 %)
29,385
(2.13 %)
5,327
(0.25 %)
101 eudicot E.lathyris (primary hap 2023)
GCF_963576675.1
54,052
(4.78 %)
n/a 14,372
(1.33 %)
80,776
(14.35 %)
n/a 36.88
(100.00 %)
24
(0.00 %)
24
(0.00 %)
57
(100.00 %)
496,928
(2.45 %)
491,703
(4.75 %)
4,850,176
(50.53 %)
0
(0 %)
930,309
(12.08 %)
57,897
(3.26 %)
16,706
(0.73 %)
102 eudicot G.bilobum (WA Gb01-03AN 2023)
GCF_033153095.1
45,049
(8.43 %)
n/a 18,010
(3.03 %)
54,840
(15.32 %)
n/a 35.23
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
5,089
(100.00 %)
397,210
(3.11 %)
254,173
(4.10 %)
3,228,435
(42.44 %)
0
(0 %)
390,432
(7.07 %)
15,343
(0.97 %)
7,316
(0.48 %)
103 eudicot P.nigra (primary hap 2023)
GCF_951802175.1
55,369
(16.07 %)
n/a 19,591
(4.65 %)
41,748
(16.14 %)
n/a 34.95
(99.99 %)
0
(0 %)
277
(0.01 %)
21
(100.00 %)
256,070
(2.83 %)
178,940
(8.44 %)
2,317,187
(40.87 %)
5
(0.00 %)
309,693
(9.69 %)
3,317
(6.62 %)
1,591
(0.12 %)
104 eudicot P.vulgaris (G19833 2024)
GCF_000499845.2
48,620
(10.29 %)
n/a 16,779
(3.20 %)
47,438
(13.87 %)
n/a 35.62
(98.95 %)
566
(1.05 %)
566
(1.05 %)
1,034
(98.95 %)
245,672
(2.41 %)
239,601
(4.78 %)
2,887,505
(44.41 %)
0
(0 %)
323,051
(6.68 %)
44,689
(7.20 %)
11,348
(1.02 %)
105 eudicot R.rugosa (primary hap 2023)
GCF_958449725.1
62,563
(15.19 %)
n/a 15,236
(3.45 %)
60,387
(23.53 %)
n/a 39.30
(99.95 %)
0
(0 %)
1,014
(0.05 %)
77
(100.00 %)
226,730
(2.23 %)
196,099
(4.12 %)
1,632,269
(33.79 %)
8
(0.00 %)
202,155
(7.85 %)
38,448
(5.69 %)
22,749
(2.22 %)
106 Euphrates poplar (v2 2014)
GCF_000495115.2
56,366
(12.92 %)
n/a 20,853
(4.29 %)
41,483
(12.40 %)
n/a 32.05
(95.31 %)
22,764
(4.70 %)
22,764
(4.70 %)
32,266
(95.30 %)
357,310
(3.64 %)
246,638
(4.06 %)
2,660,781
(43.22 %)
21
(0.01 %)
283,033
(6.42 %)
2,691
(0.38 %)
1,682
(0.12 %)
107 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2
77,682
(12.36 %)
n/a 22,539
(3.42 %)
67,761
(16.26 %)
n/a 38.07
(99.99 %)
0
(0 %)
101
(0.01 %)
34
(100.00 %)
309,302
(2.18 %)
331,724
(5.06 %)
2,996,468
(41.19 %)
1
(0.00 %)
501,459
(8.86 %)
25,597
(2.08 %)
15,213
(1.03 %)
108 European hazelnut (Tombul 2020)
GCF_901000735.1
39,127
(13.03 %)
n/a 15,600
(4.11 %)
42,096
(18.23 %)
n/a 35.90
(99.54 %)
0
(0 %)
14,532
(0.48 %)
12
(100.00 %)
358,479
(3.69 %)
179,807
(3.40 %)
2,234,313
(32.05 %)
66
(0.01 %)
338,416
(13.59 %)
12,963
(1.47 %)
9,205
(1.06 %)
109 European hop (primary hap 2023)
GCF_963169125.1
72,613
(2.92 %)
n/a 14,868
(0.56 %)
135,918
(7.87 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
0
(0 %)
129
(0.00 %)
319
(100.00 %)
1,077,704
(2.26 %)
853,368
(5.27 %)
13,477,464
(61.64 %)
0
(0 %)
1,654,055
(7.66 %)
152,063
(4.18 %)
31,956
(0.51 %)
110 European hop (Shinshu Wase 2014)
GCA_000831365.1
n/a n/a 17,158
(0.86 %)
191,202
(13.47 %)
n/a 38.57
(86.69 %)
160,222
(13.33 %)
530,762
(13.34 %)
292,698
(86.67 %)
770,031
(2.12 %)
637,135
(3.75 %)
13,484,203
(41.57 %)
8,594
(0.10 %)
n/a 81,500
(2.36 %)
40,113
(1.30 %)
111 European mistletoe (primary hap 2023)
GCA_963277665.1
n/a n/a 12,110
(0.01 %)
960,545
(1.07 %)
n/a 31.25
(100.00 %)
855
(0.00 %)
6,368
(0.00 %)
5,951
(100.00 %)
61,111,090
(11.87 %)
29,667,857
(2.75 %)
11,464
(100.00 %)
81
(0.00 %)
60,812,395
(6.42 %)
1,680,995
(2.36 %)
239,293
(0.15 %)
112 false flax
GCF_000633955.1
123,030
(22.63 %)
n/a 61,894
(13.77 %)
113,219
(31.09 %)
n/a 36.55
(92.99 %)
568
(0.01 %)
74,428
(7.02 %)
37,780
(99.99 %)
346,267
(2.46 %)
233,837
(5.56 %)
3,452,066
(27.34 %)
8,995
(2.52 %)
326,960
(10.10 %)
32,235
(2.62 %)
20,198
(1.48 %)
113 field mustard
GCF_000309985.2
73,446
(34.56 %)
n/a 30,193
(10.12 %)
57,010
(25.57 %)
n/a 36.83
(99.39 %)
0
(0 %)
408
(0.61 %)
1,100
(100.00 %)
261,522
(15.13 %)
196,553
(8.43 %)
1,533,242
(38.01 %)
0
(0 %)
376,874
(10.72 %)
24,895
(5.44 %)
14,510
(1.98 %)
114 finger millet (ML-365 2017)
GCA_002180455.1
n/a n/a 30,000
(2.41 %)
346,692
(27.97 %)
n/a 45.34
(98.74 %)
507,646
(1.30 %)
507,646
(1.30 %)
1,033,269
(98.70 %)
323,234
(1.19 %)
394,943
(6.28 %)
6,129,348
(33.00 %)
116,821
(2.67 %)
n/a 325,103
(21.18 %)
245,703
(14.05 %)
115 flowering dogwood (Cherokee Brave 2023)
GCF_030987335.1
63,465
(6.03 %)
n/a 17,263
(1.31 %)
78,564
(9.37 %)
n/a 35.95
(100.00 %)
96
(0.00 %)
96
(0.00 %)
459
(100.00 %)
982,341
(3.33 %)
719,891
(7.87 %)
6,810,592
(50.46 %)
0
(0 %)
1,484,349
(12.26 %)
27,883
(2.10 %)
14,303
(0.44 %)
116 foxtail millet
GCF_000263155.2
40,951
(13.47 %)
n/a 17,758
(5.07 %)
60,598
(30.59 %)
n/a 46.14
(98.82 %)
6,442
(1.19 %)
6,442
(1.19 %)
6,779
(98.81 %)
115,365
(1.46 %)
116,980
(2.45 %)
1,691,260
(29.31 %)
8
(0.00 %)
160,655
(4.99 %)
78,297
(28.27 %)
56,591
(11.82 %)
117 garden asparagus (2017)
GCF_001876935.1
45,159
(4.02 %)
n/a 13,440
(1.02 %)
85,207
(11.07 %)
n/a 39.02
(97.02 %)
44,390
(2.99 %)
47,391
(2.99 %)
56,182
(97.01 %)
427,496
(2.02 %)
885,946
(8.32 %)
6,075,356
(46.49 %)
46
(0.01 %)
1,014,228
(9.26 %)
111,109
(6.80 %)
35,931
(1.35 %)
118 garden lettuce (Salinas v11 2022)
GCF_002870075.4
69,048
(2.69 %)
n/a 16,407
(0.56 %)
105,654
(5.75 %)
n/a 37.92
(99.95 %)
0
(0 %)
384
(0.05 %)
93
(100.00 %)
1,192,578
(2.37 %)
1,282,344
(4.72 %)
12,843,881
(61.50 %)
2
(0.00 %)
2,596,117
(14.22 %)
160,781
(2.86 %)
21,226
(0.27 %)
119 garden pea (Zhongwan6 2022)
GCF_024323335.1
74,264
(1.88 %)
n/a 17,744
(0.43 %)
129,692
(4.97 %)
n/a 37.94
(99.73 %)
0
(0 %)
826
(0.27 %)
1,566
(100.00 %)
1,517,586
(2.16 %)
1,541,702
(5.89 %)
13,206,825
(66.95 %)
4
(0.00 %)
n/a 105,766
(0.97 %)
9,528
(0.15 %)
120 garlic-fruit tree (guangnan 2023)
GCF_029873635.1
43,473
(2.84 %)
n/a 13,544
(0.88 %)
64,877
(5.24 %)
n/a 36.06
(100.00 %)
0
(0 %)
596
(0.00 %)
510
(100.00 %)
1,556,970
(22.50 %)
788,188
(5.25 %)
10,081,845
(53.72 %)
1
(0.00 %)
1,139,226
(6.25 %)
41,032
(1.09 %)
17,380
(0.48 %)
121 ghaf (Desert tree PC_DT_omini 2023)
GCF_029017545.1
59,652
(8.73 %)
n/a 18,917
(2.55 %)
47,052
(9.22 %)
n/a 32.09
(99.98 %)
0
(0 %)
1,693
(0.02 %)
2,266
(100.00 %)
452,206
(3.00 %)
195,931
(2.27 %)
4,921,469
(39.63 %)
1
(0.00 %)
167,024
(3.12 %)
9,731
(0.69 %)
8,007
(0.51 %)
122 ginger
GCF_018446385.1
127,579
(4.07 %)
n/a 33,995
(0.96 %)
186,756
(7.79 %)
n/a 39.16
(100.00 %)
0
(0 %)
901
(0.00 %)
211
(100.00 %)
1,187,168
(2.18 %)
2,088,683
(6.47 %)
12,917,773
(61.42 %)
1
(0.00 %)
3,992,139
(15.45 %)
398,512
(10.38 %)
143,324
(2.40 %)
123 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2
42,106
(6.72 %)
n/a 15,819
(2.23 %)
49,753
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
5,305
(0.07 %)
310,402
(9.76 %)
13,479
(99.93 %)
394,793
(2.75 %)
364,336
(3.37 %)
4,190,750
(39.49 %)
3,050
(0.15 %)
283,527
(3.56 %)
12,198
(0.64 %)
7,327
(0.39 %)
124 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1
87,385
(2.18 %)
n/a 17,963
(0.44 %)
263,708
(10.29 %)
n/a 46.32
(97.73 %)
0
(0 %)
107,163
(2.27 %)
109,126
(100.00 %)
1,490,873
(15.60 %)
1,415,562
(5.65 %)
12,540,551
(71.59 %)
522
(0.02 %)
5,380,929
(14.74 %)
881,849
(29.81 %)
257,498
(5.22 %)
125 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1
69,195
(1.77 %)
n/a 18,614
(0.43 %)
300,274
(11.28 %)
n/a 46.38
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 68,537
(100.00 %)
1,555,328
(15.65 %)
1,485,488
(4.71 %)
13,133,338
(73.17 %)
0
(0 %)
4,874,338
(13.46 %)
928,327
(30.84 %)
269,584
(5.36 %)
126 goji berry (Lr01 2021)
GCF_019175385.1
69,722
(4.35 %)
n/a 17,353
(1.01 %)
81,347
(7.68 %)
n/a 38.10
(99.95 %)
0
(0 %)
1,565
(0.05 %)
166
(100.00 %)
816,909
(2.29 %)
708,412
(4.09 %)
8,106,901
(53.67 %)
0
(0 %)
1,891,734
(16.01 %)
66,433
(1.82 %)
7,517
(0.15 %)
127 golden kiwifruit (Hongyang 2019)
GCA_009663005.1
n/a n/a 21,161
(2.89 %)
55,843
(11.78 %)
n/a 35.63
(99.99 %)
646
(0.01 %)
646
(0.01 %)
2,366
(99.99 %)
423,518
(2.92 %)
293,299
(3.76 %)
4,466,312
(33.71 %)
0
(0 %)
198,622
(2.97 %)
25,250
(1.74 %)
15,816
(1.02 %)
128 golden kiwifruit (Red5 2018)
GCA_003024255.1
n/a 33,115
(10.82 %)
22,332
(3.88 %)
51,709
(13.62 %)
n/a 35.31
(96.44 %)
0
(0 %)
25,521
(3.57 %)
1,234
(100.00 %)
347,035
(2.87 %)
241,862
(4.11 %)
3,578,217
(30.95 %)
1,207
(0.28 %)
151,895
(5.62 %)
19,259
(1.41 %)
12,861
(0.94 %)
129 great duckweed (9509 2017)
GCA_001981405.1
n/a n/a 10,023
(7.00 %)
16,353
(26.89 %)
n/a 42.30
(92.78 %)
89,257
(7.32 %)
89,257
(7.32 %)
89,277
(92.68 %)
80,787
(2.86 %)
45,432
(1.93 %)
786,155
(19.70 %)
95
(0.04 %)
26,883
(1.77 %)
19,057
(20.99 %)
16,325
(10.84 %)
130 green algae (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.4
10,237
(66.85 %)
n/a 988
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
476
(1.14 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
37,284
(8.77 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
10
(0.02 %)
8,269
(2.70 %)
43
(99.34 %)
317
(0.67 %)
131 green algae (LANL1001 2019)
GCA_006384855.1
n/a n/a 2,016
(0.62 %)
31,585
(41.01 %)
n/a 57.91
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,614
(100.00 %)
183,076
(3.30 %)
101,860
(5.85 %)
972,524
(32.54 %)
0
(0 %)
128,092
(5.45 %)
4,760
(98.23 %)
17,087
(19.73 %)
132 green algae (YS-2018 2019)
GCA_004138255.1
n/a n/a 1,365
(1.08 %)
11,070
(58.24 %)
n/a 55.95
(98.44 %)
0
(0 %)
780
(1.56 %)
597
(100.00 %)
25,537
(1.66 %)
27,257
(3.92 %)
365,387
(19.48 %)
2
(0.01 %)
35,173
(4.02 %)
3,732
(86.39 %)
9,364
(18.16 %)
133 green algae A.protothecoides (0710 2014)
GCF_000733215.1
7,014
(37.71 %)
n/a 966
(2.72 %)
2,947
(70.38 %)
n/a 63.54
(95.35 %)
1,012
(4.66 %)
1,012
(4.66 %)
1,386
(95.34 %)
8,655
(1.88 %)
3,803
(1.89 %)
147,537
(20.31 %)
4
(0.02 %)
1,495
(1.63 %)
604
(53.91 %)
7,583
(28.42 %)
134 green algae B.prasinos (RCC1105 2012)
GCF_002220235.1
7,852
(82.09 %)
n/a 1,231
(6.04 %)
4,460
(76.24 %)
n/a 48.02
(99.76 %)
0
(0 %)
20
(0.24 %)
21
(100.00 %)
17,900
(4.88 %)
5,674
(1.75 %)
113,699
(21.91 %)
0
(0 %)
1,171
(0.89 %)
7
(0.01 %)
10
(0.02 %)
135 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1
n/a n/a 1,057
(0.55 %)
9,735
(58.02 %)
n/a 64.03
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 17
(100.00 %)
166,909
(9.00 %)
120,034
(10.13 %)
750,946
(37.60 %)
0
(0 %)
64,728
(6.10 %)
166
(99.31 %)
15,012
(11.67 %)
136 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 refseq)
GCF_000002595.2
19,527
(53.99 %)
n/a 990
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
174,119
(17.13 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
26
(0.03 %)
48,564
(5.08 %)
92
(46.06 %)
15,883
(12.21 %)
137 green algae C.subellipsoidea (C-169 2012)
GCF_000258705.1
9,839
(29.70 %)
n/a 1,307
(1.78 %)
8,108
(53.71 %)
n/a 52.94
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 29
(100.00 %)
8,446
(0.85 %)
5,471
(0.85 %)
265,761
(14.34 %)
0
(0 %)
3,585
(1.15 %)
11,329
(19.64 %)
6,821
(5.93 %)
138 green algae C.variabilis (NC64A 2010 refseq)
GCF_000147415.1
9,780
(32.79 %)
n/a 744
(1.00 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,396
(8.55 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
64,770
(8.22 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
0
(0 %)
6,856
(2.06 %)
756
(45.48 %)
9,593
(9.00 %)
139 green algae K.nitens (NIES-2285 2014)
GCA_000708835.1
n/a 16,374
(32.04 %)
2,471
(1.78 %)
14,771
(54.27 %)
n/a 52.42
(98.98 %)
1,917
(1.02 %)
2,081
(1.02 %)
3,731
(98.98 %)
10,051
(0.46 %)
14,278
(1.14 %)
388,120
(8.55 %)
82
(0.05 %)
6,137
(0.53 %)
8,698
(83.31 %)
13,320
(16.04 %)
140 green algae M.commoda (RCC299 2009)
GCF_000090985.2
n/a 10,212
(72.56 %)
1,301
(4.51 %)
5,667
(86.20 %)
n/a 63.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 19
(100.00 %)
14,619
(3.58 %)
8,937
(2.75 %)
178,499
(27.69 %)
0
(0 %)
2,391
(1.08 %)
10
(25.23 %)
9
(0.01 %)
141 green algae M.neglectum (SAG 48.87 2015)
GCF_000611645.1
16,734
(25.96 %)
n/a 666
(0.47 %)
12,122
(60.02 %)
n/a 64.75
(96.59 %)
5,358
(3.43 %)
5,358
(3.43 %)
12,077
(96.57 %)
73,343
(6.73 %)
43,518
(3.04 %)
568,630
(31.80 %)
611
(0.45 %)
8,128
(0.78 %)
7,776
(96.69 %)
18,971
(14.42 %)
142 green algae M.pusilla (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.2
10,242
(66.86 %)
n/a 990
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
476
(1.14 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
36,818
(8.73 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
10
(0.02 %)
8,269
(2.70 %)
32
(47.70 %)
317
(0.67 %)
143 green algae O.lucimarinus (CCE9901 2007)
GCF_000092065.1
7,603
(72.01 %)
n/a 1,064
(6.25 %)
3,493
(72.08 %)
n/a 60.44
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 21
(100.00 %)
11,026
(5.45 %)
11,732
(3.90 %)
107,661
(34.88 %)
0
(0 %)
1,022
(1.03 %)
12
(61.27 %)
2
(0.00 %)
144 green algae O.tauri (RCC4221 2014)
GCF_000214015.3
7,766
(82.33 %)
n/a 1,131
(6.60 %)
3,714
(76.22 %)
n/a 59.21
(99.94 %)
0
(0 %)
477
(0.07 %)
22
(100.00 %)
8,503
(3.84 %)
4,946
(2.16 %)
102,428
(27.87 %)
3
(0.01 %)
1,462
(1.34 %)
16
(57.14 %)
6
(0.02 %)
145 green algae V.carteri (Eve 2010)
GCF_000143455.1
14,436
(21.51 %)
n/a 1,411
(0.77 %)
13,095
(47.93 %)
n/a 55.97
(91.15 %)
10,101
(8.87 %)
12,014
(8.87 %)
11,352
(91.13 %)
175,729
(14.69 %)
105,113
(5.10 %)
667,226
(23.91 %)
10
(0.01 %)
60,616
(5.34 %)
4,325
(42.65 %)
20,517
(13.87 %)
146 green chiretta (2019)
GCF_009805555.1
46,021
(16.54 %)
n/a 14,632
(4.66 %)
34,242
(19.36 %)
n/a 33.53
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 271
(100.00 %)
293,800
(4.64 %)
151,157
(7.38 %)
1,732,880
(41.88 %)
0
(0 %)
175,025
(5.40 %)
21,835
(6.05 %)
15,493
(3.32 %)
147 green foxtail
GCF_005286985.1
47,022
(14.66 %)
n/a 17,750
(5.12 %)
60,106
(30.88 %)
n/a 46.17
(99.85 %)
61
(0.15 %)
61
(0.15 %)
76
(99.85 %)
116,493
(1.51 %)
120,039
(2.72 %)
1,676,017
(29.11 %)
0
(0 %)
157,544
(4.99 %)
75,497
(29.44 %)
55,605
(12.11 %)
148 green foxtail (ME034v 2020)
GCA_012934335.1
n/a n/a 18,040
(5.19 %)
61,671
(31.38 %)
n/a 45.99
(100.00 %)
54
(0.00 %)
54
(0.00 %)
63
(100.00 %)
105,738
(1.38 %)
87,424
(2.22 %)
1,777,815
(26.85 %)
0
(0 %)
131,241
(3.67 %)
74,932
(30.30 %)
61,081
(13.91 %)
149 Guinea yam (TDr96_F1 2017)
GCA_002240015.2
n/a n/a 11,944
(2.63 %)
37,372
(13.64 %)
n/a 35.58
(88.95 %)
0
(0 %)
1,032,823
(11.31 %)
21
(100.00 %)
293,868
(3.21 %)
174,614
(3.18 %)
2,690,184
(32.53 %)
1,884
(0.17 %)
180,755
(4.15 %)
15,323
(1.42 %)
8,394
(0.81 %)
150 habanero-type pepper (PI159236 2017)
GCA_002271895.2
n/a 34,974
(1.29 %)
16,562
(0.53 %)
72,911
(2.91 %)
n/a 34.88
(98.35 %)
0
(0 %)
196,261
(1.66 %)
87,978
(100.00 %)
1,136,015
(1.95 %)
1,019,921
(4.33 %)
22,445,162
(47.06 %)
529
(0.02 %)
1,752,629
(5.46 %)
20,737
(0.24 %)
7,465
(0.08 %)
151 hairy vetch (HV-30 2023)
GCF_029867415.1
88,183
(5.03 %)
n/a 22,129
(1.02 %)
118,243
(9.15 %)
n/a 35.63
(99.98 %)
0
(0 %)
3,486
(0.02 %)
1,888
(100.00 %)
1,001,308
(2.63 %)
1,132,664
(5.72 %)
8,340,755
(56.16 %)
24
(0.00 %)
1,749,179
(17.10 %)
43,665
(1.21 %)
15,567
(0.31 %)
152 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1
43,787
(9.63 %)
n/a 17,635
(3.85 %)
66,270
(23.98 %)
n/a 46.87
(98.63 %)
736
(1.37 %)
736
(1.37 %)
1,027
(98.63 %)
157,811
(1.55 %)
119,571
(2.57 %)
2,107,254
(45.30 %)
0
(0 %)
384,333
(11.74 %)
102,278
(32.16 %)
57,387
(11.00 %)
153 Himalayan balsam (dImpGla2.1 2021)
GCF_907164915.1
40,307
(7.38 %)
n/a 16,711
(2.29 %)
50,292
(11.24 %)
n/a 32.12
(99.95 %)
0
(0 %)
858
(0.05 %)
1,115
(100.00 %)
439,789
(3.56 %)
574,639
(8.97 %)
4,147,814
(47.01 %)
3
(0.00 %)
679,567
(9.30 %)
16,291
(1.13 %)
7,961
(0.43 %)
154 horseweed
GCF_010389155.1
39,621
(11.54 %)
n/a 14,718
(3.15 %)
42,194
(16.23 %)
n/a 34.08
(99.99 %)
0
(0 %)
502
(0.01 %)
357
(100.00 %)
267,124
(2.84 %)
155,729
(2.71 %)
2,475,353
(36.48 %)
0
(0 %)
170,084
(5.26 %)
5,205
(0.40 %)
2,461
(0.20 %)
155 Indian licorice
GCF_003935025.1
44,610
(13.60 %)
n/a 17,108
(4.95 %)
34,097
(14.33 %)
n/a 31.84
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
160
(100.00 %)
217,674
(3.40 %)
106,243
(4.04 %)
2,232,509
(38.91 %)
0
(0 %)
136,457
(3.95 %)
5,438
(1.06 %)
4,124
(0.55 %)
156 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 alternate hap 2022)
GCA_023055485.1
n/a n/a 16,184
(2.02 %)
66,215
(14.16 %)
n/a 35.37
(100.00 %)
0
(0 %)
82
(0.00 %)
689
(100.00 %)
739,891
(4.58 %)
435,389
(7.62 %)
4,843,419
(38.03 %)
1
(0.00 %)
573,724
(7.60 %)
13,298
(2.56 %)
7,653
(0.38 %)
157 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 primary hap 2022)
GCA_023055345.1
n/a n/a 15,832
(2.09 %)
63,488
(14.36 %)
n/a 35.19
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
358
(100.00 %)
703,028
(4.29 %)
399,798
(6.48 %)
4,662,881
(36.96 %)
1
(0.00 %)
508,474
(6.86 %)
12,534
(1.92 %)
7,167
(0.36 %)
158 island oak (RSA801373 alternate hap 2023)
GCA_028535165.1
n/a n/a 15,893
(1.97 %)
68,998
(15.27 %)
n/a 35.87
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
156
(100.00 %)
746,424
(4.43 %)
451,117
(7.39 %)
4,820,434
(38.55 %)
0
(0 %)
642,456
(7.81 %)
20,367
(2.62 %)
9,619
(0.45 %)
159 island oak (RSA801373 primary hap 2023)
GCA_028535515.1
n/a n/a 15,880
(1.95 %)
69,093
(15.25 %)
n/a 35.97
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
274
(100.00 %)
751,691
(4.60 %)
457,914
(7.61 %)
4,850,082
(38.95 %)
0
(0 %)
656,668
(8.21 %)
20,561
(3.01 %)
9,683
(0.46 %)
160 J.microcarpa x regia eudicots (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1
50,504
(10.14 %)
n/a 18,451
(3.41 %)
55,094
(16.89 %)
n/a 36.30
(99.18 %)
0
(0 %)
54
(0.82 %)
154
(100.00 %)
411,290
(3.65 %)
260,413
(3.49 %)
3,023,907
(31.93 %)
0
(0 %)
195,435
(3.60 %)
23,270
(1.88 %)
11,316
(0.85 %)
161 Japanese apricot
GCF_000346735.1
32,312
(19.60 %)
n/a 14,463
(6.46 %)
33,049
(23.94 %)
n/a 37.45
(92.82 %)
15,597
(7.20 %)
15,597
(7.20 %)
23,761
(92.80 %)
118,757
(2.25 %)
84,983
(4.53 %)
1,374,244
(23.24 %)
87
(0.15 %)
129,116
(6.07 %)
7,808
(1.87 %)
5,295
(1.28 %)
162 Japanese cedar (2023)
GCF_030272615.1
80,727
(1.01 %)
n/a 14,175
(0.13 %)
225,166
(3.69 %)
n/a 36.42
(99.98 %)
0
(0 %)
3,031
(0.02 %)
2,699
(100.00 %)
2,873,672
(2.01 %)
4,198,037
(4.24 %)
5,730
(99.98 %)
5
(0.00 %)
7,632,920
(8.60 %)
71,102
(1.16 %)
67,733
(1.15 %)
163 Japanese morning glory
GCF_001879475.1
58,978
(8.37 %)
n/a 16,977
(2.14 %)
77,626
(18.21 %)
n/a 37.61
(99.97 %)
0
(0 %)
449
(0.03 %)
3,418
(100.00 %)
641,896
(6.26 %)
639,051
(8.97 %)
3,622,236
(46.63 %)
0
(0 %)
878,090
(12.19 %)
77,860
(10.47 %)
41,089
(3.11 %)
164 Japanese rice (2023)
GCF_034140825.1
55,725
(16.73 %)
n/a 16,338
(4.37 %)
54,077
(25.00 %)
n/a 43.72
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
15
(100.00 %)
196,712
(2.76 %)
141,936
(4.82 %)
1,727,479
(35.05 %)
0
(0 %)
154,436
(5.38 %)
63,894
(25.90 %)
41,819
(6.86 %)
165 Japanese rice (Kitaake 2020)
GCA_009797565.1
n/a 48,428
(16.53 %)
16,562
(4.59 %)
53,878
(24.77 %)
n/a 43.61
(98.95 %)
443
(1.05 %)
474
(1.05 %)
476
(98.95 %)
494,831
(50.75 %)
141,079
(3.52 %)
1,728,936
(33.69 %)
1
(0.00 %)
153,320
(5.62 %)
64,216
(25.20 %)
41,086
(7.31 %)
166 Japanese rice (Nipponbare 2015)
GCF_001433935.1
53,556
(17.24 %)
47,331
(15.87 %)
16,804
(4.69 %)
53,712
(24.95 %)
n/a 43.57
(99.97 %)
0
(0 %)
925
(0.03 %)
58
(100.00 %)
402,182
(39.07 %)
138,035
(3.47 %)
1,719,939
(33.46 %)
4
(0.00 %)
142,261
(5.16 %)
63,485
(25.25 %)
49,534
(9.51 %)
167 Joseph's coat eudicots (Red AtriRed21 2022)
GCF_026212465.1
44,669
(10.38 %)
n/a 13,649
(2.41 %)
38,664
(12.08 %)
n/a 31.93
(99.74 %)
0
(0 %)
2,496
(0.26 %)
49
(100.00 %)
270,085
(9.40 %)
247,307
(22.95 %)
2,428,999
(49.81 %)
12
(0.00 %)
797,844
(12.43 %)
5,914
(1.27 %)
1,633
(0.12 %)
168 Korean lawngrass (Nagirizaki 2016)
GCA_001602275.1
n/a n/a 21,051
(6.88 %)
57,023
(32.54 %)
n/a 44.09
(96.75 %)
14,848
(3.26 %)
14,848
(3.26 %)
26,634
(96.74 %)
101,349
(1.46 %)
71,657
(2.17 %)
1,693,252
(21.97 %)
640
(0.13 %)
78,613
(2.03 %)
60,198
(24.06 %)
53,023
(14.28 %)
169 lettuce eudicots (Salinas 2011)
GCA_000227445.1
n/a n/a 15,031
(1.06 %)
140,751
(10.18 %)
n/a 36.82
(99.85 %)
0
(0 %)
n/a 876,110
(100.00 %)
505,796
(3.85 %)
318,171
(2.09 %)
9,808,138
(33.85 %)
0
(0 %)
n/a 30,057
(0.85 %)
16,755
(0.48 %)
170 lyrate rockcress
GCF_000004255.2
44,525
(28.52 %)
n/a 25,416
(19.36 %)
34,938
(31.66 %)
n/a 36.08
(88.90 %)
2,950
(11.10 %)
2,950
(11.10 %)
3,646
(88.90 %)
141,441
(20.58 %)
72,583
(3.25 %)
1,012,438
(24.68 %)
6
(0.00 %)
85,990
(5.46 %)
8,053
(2.48 %)
5,275
(1.16 %)
171 macadamia nut
GCF_013358625.1
58,226
(8.43 %)
n/a 16,723
(2.11 %)
62,465
(13.23 %)
n/a 39.13
(98.51 %)
0
(0 %)
22,059
(1.50 %)
2,644
(100.00 %)
463,575
(3.09 %)
304,057
(3.39 %)
4,183,445
(34.36 %)
8
(0.00 %)
364,799
(4.77 %)
18,956
(1.40 %)
5,087
(0.27 %)
172 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot 2015)
GCA_000949345.1
n/a n/a 13,013
(2.26 %)
38,671
(8.42 %)
n/a 33.59
(99.19 %)
123,798
(0.85 %)
123,798
(0.85 %)
203,100
(99.15 %)
329,865
(3.57 %)
244,018
(4.63 %)
3,737,818
(40.09 %)
5,255
(0.16 %)
167,323
(2.37 %)
4,827
(0.29 %)
3,120
(0.19 %)
173 Magnolia sinica (HGM2019 2023)
GCF_029962835.1
69,307
(3.21 %)
n/a 14,466
(0.72 %)
84,219
(6.52 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
0
(0 %)
73
(0.00 %)
127
(100.00 %)
1,415,484
(14.07 %)
1,154,832
(6.29 %)
10,231,412
(50.86 %)
0
(0 %)
1,584,398
(7.44 %)
107,342
(2.63 %)
20,756
(0.44 %)
174 maize
GCF_902167145.1
76,921
(3.66 %)
n/a 23,553
(1.55 %)
154,773
(10.70 %)
n/a 46.77
(99.83 %)
10
(0.00 %)
708
(0.17 %)
697
(100.00 %)
1,340,549
(78.65 %)
843,168
(5.20 %)
5,886,498
(69.23 %)
11
(0.00 %)
2,444,910
(17.04 %)
372,641
(31.10 %)
154,423
(5.59 %)
175 maize (2020)
GCA_905067065.1
n/a n/a 23,433
(1.61 %)
150,853
(10.66 %)
n/a 46.83
(98.14 %)
56,163
(1.87 %)
56,163
(1.87 %)
56,173
(98.13 %)
581,502
(1.40 %)
753,129
(3.49 %)
5,867,216
(67.88 %)
107
(0.01 %)
2,413,494
(16.48 %)
377,414
(31.33 %)
151,565
(5.65 %)
176 maize (B104 2021)
GCA_910593975.1
n/a n/a 23,680
(1.58 %)
153,453
(10.69 %)
n/a 46.83
(99.71 %)
22
(0.00 %)
1,223
(0.29 %)
697
(100.00 %)
593,292
(1.41 %)
805,647
(4.47 %)
5,887,178
(69.17 %)
13
(0.00 %)
2,341,058
(16.82 %)
370,755
(32.34 %)
151,573
(5.74 %)
177 maize (OH43 2020)
GCA_902167015.1
n/a n/a 23,864
(1.57 %)
154,358
(10.67 %)
n/a 46.77
(99.88 %)
20
(0.00 %)
551
(0.12 %)
777
(100.00 %)
1,341,834
(78.70 %)
834,042
(5.01 %)
5,916,520
(69.26 %)
0
(0 %)
2,430,892
(17.02 %)
372,114
(32.08 %)
153,258
(5.50 %)
178 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2
34,262
(16.98 %)
n/a 15,545
(6.13 %)
36,746
(24.10 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
14
(0.00 %)
14
(0.00 %)
74
(100.00 %)
140,519
(2.59 %)
67,337
(3.89 %)
1,493,779
(29.32 %)
0
(0 %)
94,864
(3.66 %)
41,044
(18.43 %)
30,094
(7.78 %)
179 mango
GCF_011075055.1
60,349
(16.06 %)
n/a 20,653
(5.13 %)
40,887
(15.20 %)
n/a 32.71
(99.98 %)
0
(0 %)
169
(0.02 %)
250
(100.00 %)
213,445
(3.09 %)
125,929
(3.29 %)
2,447,401
(32.63 %)
0
(0 %)
235,235
(5.50 %)
7,059
(0.98 %)
3,330
(0.31 %)
180 monocots
GCF_002575655.2
84,263
(2.17 %)
n/a 17,888
(0.44 %)
263,541
(10.26 %)
n/a 46.33
(97.97 %)
0
(0 %)
69,858
(2.04 %)
109,197
(100.00 %)
1,492,485
(15.65 %)
1,422,870
(5.39 %)
12,521,384
(71.80 %)
234
(0.01 %)
n/a 881,939
(30.07 %)
257,833
(5.24 %)
181 mosses
GCF_000002425.4
55,129
(11.87 %)
n/a 8,425
(1.46 %)
30,452
(12.55 %)
n/a 33.69
(98.74 %)
0
(0 %)
2,645
(1.27 %)
359
(100.00 %)
454,786
(48.35 %)
241,826
(2.56 %)
2,413,326
(52.52 %)
8
(0.00 %)
165,635
(4.02 %)
22,664
(3.06 %)
20,673
(2.66 %)
182 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1
29,893
(12.15 %)
n/a 14,092
(4.40 %)
37,376
(17.73 %)
n/a 34.86
(94.92 %)
15,541
(5.08 %)
15,541
(5.08 %)
46,842
(94.92 %)
317,532
(5.00 %)
190,192
(6.25 %)
2,095,631
(34.49 %)
23
(0.02 %)
174,377
(5.38 %)
20,490
(3.43 %)
14,377
(2.15 %)
183 mung bean (VC1973A 2015 refseq)
GCF_000741045.1
47,653
(11.89 %)
n/a 16,644
(3.87 %)
43,967
(14.67 %)
n/a 33.18
(92.80 %)
0
(0 %)
96,870
(7.24 %)
2,465
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264,597
(3.31 %)
198,963
(3.34 %)
2,842,720
(34.86 %)
1,607
(0.24 %)
171,020
(3.41 %)
13,975
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11,070
(1.19 %)
184 muskmelon (AY 2022)
GCF_025177605.1
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(13.20 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
0
(0 %)
239
(0.01 %)
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(100.00 %)
282,171
(3.23 %)
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(11.70 %)
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2
(0.00 %)
208,817
(5.97 %)
18,232
(10.96 %)
10,389
(0.88 %)
185 muskmelon (DHL92 2012)
GCF_000313045.1
35,384
(11.55 %)
n/a 13,191
(3.74 %)
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(11.09 %)
n/a 33.23
(89.51 %)
28,289
(10.51 %)
29,172
(10.51 %)
60,751
(89.49 %)
239,295
(7.85 %)
172,598
(3.17 %)
2,304,858
(33.21 %)
2,241
(0.31 %)
65,619
(1.53 %)
12,855
(1.38 %)
8,985
(0.89 %)
186 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1
57,263
(9.83 %)
n/a 22,097
(3.53 %)
51,774
(13.22 %)
n/a 33.46
(99.34 %)
41,534
(0.68 %)
44,657
(0.68 %)
55,107
(99.32 %)
280,867
(4.25 %)
210,750
(5.67 %)
3,920,315
(38.10 %)
91
(0.01 %)
317,435
(5.80 %)
6,462
(0.46 %)
4,024
(0.30 %)
187 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1
44,477
(5.41 %)
n/a 16,928
(1.94 %)
77,682
(16.06 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
0
(0 %)
2,037
(0.00 %)
1,289
(100.00 %)
437,997
(2.33 %)
266,149
(5.08 %)
4,764,252
(34.25 %)
0
(0 %)
733,036
(7.03 %)
20,667
(1.81 %)
10,430
(0.52 %)
188 opium poppy
GCF_003573695.1
127,893
(4.57 %)
n/a 25,532
(0.85 %)
162,032
(9.31 %)
n/a 37.28
(99.80 %)
0
(0 %)
31,183
(0.20 %)
34,381
(100.00 %)
819,294
(1.49 %)
1,050,181
(6.80 %)
10,625,631
(55.85 %)
1,258
(0.01 %)
3,892,620
(14.88 %)
67,521
(1.21 %)
8,156
(0.11 %)
189 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2
39,386
(3.85 %)
n/a 12,208
(0.99 %)
72,906
(8.22 %)
n/a 34.70
(96.03 %)
25,751
(3.92 %)
25,751
(3.92 %)
311,841
(96.08 %)
506,361
(2.45 %)
413,770
(3.23 %)
8,074,114
(39.07 %)
30
(0.00 %)
333,128
(2.81 %)
56,900
(2.34 %)
33,146
(1.22 %)
190 orchid P.equestris
GCF_001263595.1
32,146
(3.36 %)
n/a 11,541
(1.01 %)
54,049
(6.11 %)
n/a 34.46
(92.46 %)
98,814
(7.56 %)
98,814
(7.56 %)
188,398
(92.44 %)
487,071
(2.96 %)
511,903
(4.00 %)
7,060,408
(42.20 %)
338
(0.01 %)
299,811
(3.23 %)
31,179
(1.22 %)
24,162
(0.91 %)
191 Pacific Island silvergrass (M001 2021)
GCF_019320115.1
120,534
(4.81 %)
n/a 39,902
(1.95 %)
276,967
(16.36 %)
n/a 45.32
(99.56 %)
0
(0 %)
4,932
(0.44 %)
2,420
(100.00 %)
764,083
(1.38 %)
810,723
(3.95 %)
11,118,925
(53.40 %)
2
(0.00 %)
2,206,875
(9.93 %)
520,091
(23.03 %)
297,537
(8.57 %)
192 papaya
GCF_000150535.2
29,883
(11.99 %)
n/a 12,860
(4.47 %)
24,403
(11.58 %)
n/a 35.31
(73.55 %)
29,719
(26.47 %)
29,719
(26.47 %)
47,485
(73.53 %)
260,082
(34.69 %)
101,644
(3.59 %)
1,640,647
(28.88 %)
27
(0.03 %)
104,755
(2.22 %)
21,200
(2.95 %)
7,379
(0.74 %)
193 patchouli (Gaoche1L2016 2018)
GCA_003675935.1
n/a n/a 43,905
(2.21 %)
174,920
(14.40 %)
n/a 35.02
(93.97 %)
170,266
(6.06 %)
170,266
(6.06 %)
211,964
(93.94 %)
1,021,699
(2.86 %)
1,125,321
(8.02 %)
9,388,626
(47.60 %)
4,968
(0.09 %)
1,891,289
(7.85 %)
102,661
(4.26 %)
62,606
(3.39 %)
194 peach
GCF_000346465.2
36,201
(20.87 %)
n/a 14,368
(6.26 %)
32,245
(24.09 %)
n/a 37.51
(98.79 %)
2,339
(1.22 %)
2,368
(1.22 %)
2,531
(98.78 %)
150,957
(10.06 %)
96,381
(5.52 %)
1,221,263
(28.72 %)
5
(0.00 %)
160,697
(6.34 %)
7,885
(2.07 %)
5,236
(1.25 %)
195 peanut
GCF_003086295.2
155,835
(5.15 %)
n/a 31,810
(1.19 %)
160,574
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
0
(0 %)
3,655
(0.15 %)
385
(100.00 %)
1,684,814
(3.52 %)
1,488,297
(4.81 %)
11,059,688
(62.32 %)
4
(0.00 %)
2,758,605
(13.90 %)
140,570
(2.45 %)
53,465
(0.84 %)
196 peanut (GDAAS-fuhuasheng2018 2019)
GCA_004170445.1
n/a 118,090
(5.15 %)
31,065
(1.17 %)
158,578
(8.79 %)
n/a 36.33
(98.97 %)
0
(0 %)
32,692
(1.04 %)
29
(100.00 %)
1,735,218
(3.66 %)
1,490,806
(4.26 %)
11,072,983
(61.75 %)
46
(0.00 %)
2,848,217
(13.99 %)
138,890
(2.46 %)
53,191
(0.83 %)
197 pear (primary hap 2023)
GCF_963583255.1
48,939
(13.04 %)
n/a 22,082
(4.44 %)
56,235
(17.69 %)
n/a 37.45
(99.99 %)
145
(0.01 %)
145
(0.01 %)
176
(99.99 %)
289,539
(2.54 %)
223,443
(3.84 %)
2,308,351
(35.91 %)
0
(0 %)
346,323
(9.15 %)
19,559
(2.15 %)
11,607
(1.07 %)
198 pearl millet (Tift 23D2B1-P1-P5 2018)
GCA_002174835.2
n/a n/a 17,949
(1.26 %)
134,829
(14.30 %)
n/a 47.95
(86.95 %)
0
(0 %)
156,852
(13.08 %)
52,033
(100.00 %)
380,858
(1.16 %)
466,997
(2.83 %)
5,117,134
(56.89 %)
67
(0.01 %)
1,301,284
(8.79 %)
380,989
(29.47 %)
133,080
(5.69 %)
199 pecan
GCF_018687715.1
71,340
(9.93 %)
n/a 18,671
(2.67 %)
60,632
(15.16 %)
n/a 36.30
(99.97 %)
22
(0.03 %)
22
(0.03 %)
39
(99.97 %)
473,853
(3.66 %)
367,846
(6.75 %)
3,301,121
(39.03 %)
0
(0 %)
415,847
(6.45 %)
27,274
(2.22 %)
9,483
(0.57 %)
200 perennial ryegrass (Kyuss_39 2021)
GCF_019359855.1
89,789
(3.75 %)
n/a 17,693
(0.79 %)
174,787
(12.15 %)
n/a 44.32
(100.00 %)
0
(0 %)
238
(0.00 %)
1,677
(100.00 %)
605,852
(1.36 %)
760,915
(5.68 %)
5,216,229
(69.24 %)
1
(0.00 %)
3,457,114
(21.97 %)
542,998
(24.23 %)
170,460
(5.85 %)
201 Peruvian cotton (G.raimondii 2012 DOE)
GCF_000327365.2
72,518
(8.99 %)
n/a 20,368
(2.64 %)
52,295
(10.15 %)
n/a 33.21
(98.25 %)
19,685
(1.76 %)
19,685
(1.76 %)
20,680
(98.24 %)
404,885
(2.81 %)
300,062
(3.31 %)
5,198,170
(40.84 %)
35
(0.01 %)
386,235
(4.92 %)
10,912
(0.59 %)
5,481
(0.26 %)
202 Peruvian cotton (GPD5lz 2022)
GCF_025698545.1
63,476
(8.67 %)
n/a 20,265
(2.62 %)
51,815
(10.02 %)
n/a 33.24
(100.00 %)
0
(0 %)
79
(0.00 %)
289
(100.00 %)
405,385
(2.83 %)
306,302
(3.81 %)
5,192,105
(41.79 %)
0
(0 %)
459,153
(6.01 %)
10,481
(0.65 %)
5,557
(0.30 %)
203 Phtheirospermum japonicum (okayama 2020)
GCA_014905375.1
n/a 141,963
(2.71 %)
15,868
(1.22 %)
104,104
(13.39 %)
n/a 36.03
(91.65 %)
318,321
(8.39 %)
318,321
(8.39 %)
328,880
(91.61 %)
810,727
(3.49 %)
710,744
(4.84 %)
7,339,863
(41.43 %)
1,919
(0.27 %)
701,331
(6.60 %)
104,967
(3.98 %)
53,512
(2.02 %)
204 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2
46,412
(9.42 %)
n/a 17,396
(3.13 %)
49,710
(12.66 %)
n/a 32.76
(94.18 %)
36,323
(5.83 %)
36,323
(5.83 %)
67,834
(94.17 %)
395,663
(3.40 %)
306,602
(4.71 %)
3,749,364
(39.19 %)
431
(0.18 %)
218,995
(6.80 %)
26,504
(2.90 %)
13,804
(1.15 %)
205 pineapple
GCF_001540865.1
43,024
(11.65 %)
n/a 13,649
(3.36 %)
38,917
(14.95 %)
n/a 38.34
(98.23 %)
0
(0 %)
25,542
(1.78 %)
3,129
(100.00 %)
352,802
(7.31 %)
274,578
(4.75 %)
2,360,455
(38.94 %)
1,024
(0.08 %)
181,776
(4.90 %)
56,724
(11.73 %)
25,940
(3.75 %)
206 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1
37,318
(33.25 %)
n/a 22,836
(23.08 %)
26,822
(33.93 %)
n/a 35.63
(97.53 %)
6,294
(2.49 %)
6,294
(2.49 %)
7,067
(97.51 %)
74,470
(2.42 %)
42,509
(3.39 %)
814,442
(24.99 %)
17
(0.02 %)
72,030
(4.47 %)
5,817
(2.14 %)
4,656
(1.61 %)
207 pistachio
GCF_008641045.1
47,948
(7.92 %)
n/a 18,462
(2.58 %)
62,898
(14.05 %)
n/a 35.95
(99.84 %)
0
(0 %)
16,367
(0.16 %)
1,865
(100.00 %)
363,793
(2.43 %)
253,408
(4.08 %)
4,200,417
(36.34 %)
328
(0.03 %)
912,368
(13.98 %)
22,340
(1.78 %)
7,227
(0.40 %)
208 pocket water lily (Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2
41,101
(10.95 %)
n/a 11,576
(2.50 %)
38,220
(15.70 %)
n/a 38.61
(99.84 %)
624
(0.16 %)
626
(0.16 %)
1,409
(99.84 %)
236,190
(2.95 %)
153,746
(4.02 %)
2,151,579
(26.72 %)
1
(0.00 %)
233,307
(6.34 %)
24,561
(4.48 %)
18,159
(2.45 %)
209 pomegranate
GCF_007655135.1
43,277
(14.87 %)
n/a 14,635
(4.26 %)
39,381
(19.97 %)
n/a 40.38
(99.99 %)
0
(0 %)
188
(0.01 %)
474
(100.00 %)
173,182
(2.28 %)
174,872
(6.81 %)
1,640,973
(32.89 %)
0
(0 %)
305,785
(9.75 %)
26,506
(9.18 %)
19,716
(2.82 %)
210 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1
43,670
(6.66 %)
n/a 16,547
(2.25 %)
54,186
(11.30 %)
n/a 34.71
(88.41 %)
0
(0 %)
37,060
(11.60 %)
17,084
(100.00 %)
321,938
(2.14 %)
250,793
(4.04 %)
5,136,691
(33.92 %)
622
(0.03 %)
635,238
(7.14 %)
8,536
(0.30 %)
2,755
(0.11 %)
211 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1
n/a n/a 16,861
(1.98 %)
58,882
(12.19 %)
n/a 35.40
(99.95 %)
0
(0 %)
4,397
(0.05 %)
3,012
(100.00 %)
774,417
(46.83 %)
392,378
(8.45 %)
5,068,449
(42.72 %)
5
(0.00 %)
683,257
(6.89 %)
14,548
(1.32 %)
5,450
(0.63 %)
212 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1
n/a n/a 17,614
(2.86 %)
45,684
(10.75 %)
n/a 34.49
(83.57 %)
0
(0 %)
10,041,161
(17.84 %)
12
(100.00 %)
606,573
(40.80 %)
168,871
(2.58 %)
5,508,800
(26.36 %)
2,083
(0.22 %)
353,156
(3.75 %)
5,550
(0.22 %)
1,730
(0.08 %)
213 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1
43,155
(20.86 %)
n/a 16,423
(2.55 %)
50,333
(11.79 %)
n/a 34.83
(93.98 %)
45,215
(6.04 %)
45,215
(6.04 %)
60,069
(93.96 %)
662,626
(43.42 %)
212,315
(4.38 %)
4,691,843
(34.91 %)
197
(0.07 %)
495,920
(6.36 %)
9,851
(0.45 %)
2,428
(0.13 %)
214 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1
n/a 38,210
(5.48 %)
16,415
(2.15 %)
54,766
(12.48 %)
n/a 35.21
(99.98 %)
0
(0 %)
1,476
(0.02 %)
25
(100.00 %)
329,233
(2.28 %)
285,101
(5.66 %)
4,832,189
(40.28 %)
7
(0.00 %)
779,042
(9.76 %)
12,944
(0.99 %)
3,186
(0.15 %)
215 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1
n/a 38,661
(5.67 %)
16,694
(2.26 %)
53,990
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
0
(0 %)
1,499
(0.02 %)
28
(100.00 %)
323,447
(2.25 %)
283,098
(5.39 %)
4,727,964
(39.87 %)
9
(0.00 %)
709,848
(9.38 %)
12,316
(1.34 %)
3,210
(0.16 %)
216 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1
n/a 37,965
(5.56 %)
16,713
(2.23 %)
54,380
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
0
(0 %)
1,299
(0.02 %)
27
(100.00 %)
329,807
(2.31 %)
282,372
(6.11 %)
4,718,807
(40.25 %)
6
(0.00 %)
757,191
(9.75 %)
11,812
(1.00 %)
3,132
(0.16 %)
217 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1
n/a 37,999
(5.47 %)
16,640
(2.18 %)
54,937
(12.38 %)
n/a 35.18
(99.98 %)
0
(0 %)
1,383
(0.02 %)
26
(100.00 %)
329,665
(2.30 %)
285,993
(6.03 %)
4,858,802
(40.32 %)
5
(0.00 %)
770,923
(9.65 %)
12,792
(1.32 %)
3,224
(0.15 %)
218 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1
n/a n/a 16,312
(2.05 %)
54,438
(12.18 %)
n/a 35.23
(99.95 %)
0
(0 %)
4,448
(0.05 %)
12
(100.00 %)
730,464
(46.17 %)
338,389
(7.95 %)
4,903,557
(41.90 %)
3
(0.00 %)
602,727
(6.48 %)
12,226
(0.72 %)
3,229
(0.36 %)
219 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1
35,762
(6.74 %)
n/a 16,408
(2.54 %)
48,924
(11.75 %)
n/a 34.59
(99.55 %)
0
(0 %)
1,612
(0.45 %)
1,332
(100.00 %)
297,683
(2.31 %)
234,616
(4.68 %)
4,308,149
(38.02 %)
6
(0.00 %)
555,565
(8.09 %)
8,192
(0.47 %)
2,567
(0.16 %)
220 quinoa
GCF_001683475.1
74,918
(7.49 %)
n/a 22,914
(1.61 %)
105,619
(12.97 %)
n/a 36.87
(99.16 %)
0
(0 %)
725
(0.84 %)
3,487
(100.00 %)
810,277
(3.58 %)
762,903
(10.88 %)
6,551,884
(49.49 %)
4
(0.00 %)
1,419,103
(10.00 %)
93,630
(2.98 %)
16,962
(0.42 %)
221 radish (v2 WK10039 2023)
GCF_000801105.2
80,563
(20.51 %)
n/a 36,039
(9.58 %)
74,081
(26.98 %)
n/a 36.00
(99.94 %)
0
(0 %)
2,853
(0.06 %)
6,424
(100.00 %)
224,524
(2.48 %)
193,525
(5.49 %)
2,234,480
(35.04 %)
14
(0.00 %)
283,224
(8.64 %)
25,972
(4.13 %)
19,291
(2.12 %)
222 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1
152,583
(19.25 %)
n/a 57,668
(6.87 %)
143,092
(23.51 %)
n/a 37.13
(99.99 %)
0
(0 %)
840
(0.01 %)
3,167
(100.00 %)
470,302
(2.29 %)
578,281
(9.24 %)
4,662,467
(42.41 %)
1
(0.00 %)
1,025,228
(11.11 %)
64,287
(5.62 %)
37,609
(1.71 %)
223 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2
144,997
(17.51 %)
n/a 59,743
(7.71 %)
146,391
(26.97 %)
n/a 36.47
(92.96 %)
32,639
(7.05 %)
32,639
(7.05 %)
34,110
(92.95 %)
449,257
(2.67 %)
441,269
(5.84 %)
4,867,601
(32.91 %)
89
(0.03 %)
658,497
(14.71 %)
60,082
(3.53 %)
39,673
(1.84 %)
224 red clover eudicots (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1
63,238
(17.01 %)
n/a 17,857
(4.13 %)
43,079
(17.27 %)
n/a 33.71
(99.97 %)
0
(0 %)
231
(0.03 %)
90
(100.00 %)
241,481
(2.65 %)
187,674
(4.85 %)
2,251,582
(37.03 %)
1
(0.00 %)
244,435
(10.76 %)
6,474
(1.93 %)
2,754
(0.26 %)
225 red sage (Shanhuang shh 2023)
GCF_028751815.1
62,516
(12.25 %)
n/a 15,176
(2.61 %)
67,175
(21.50 %)
n/a 37.47
(99.58 %)
0
(0 %)
695
(0.42 %)
173
(100.00 %)
377,231
(3.52 %)
364,027
(5.05 %)
2,679,528
(42.07 %)
0
(0 %)
345,738
(11.98 %)
64,243
(6.17 %)
38,544
(3.36 %)
226 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2
71,107
(1.58 %)
n/a 18,911
(0.39 %)
321,741
(10.16 %)
n/a 45.91
(99.38 %)
0
(0 %)
33,814
(0.62 %)
10,205
(100.00 %)
1,208,165
(1.25 %)
1,319,817
(2.96 %)
15,480,313
(71.93 %)
63
(0.00 %)
4,311,556
(9.89 %)
975,234
(26.52 %)
315,788
(5.36 %)
227 Rhododendron vialii eudicots (Sample 1 2023)
GCF_030253575.1
62,168
(11.90 %)
n/a 15,363
(2.73 %)
54,203
(18.86 %)
n/a 39.52
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
18
(100.00 %)
253,965
(2.10 %)
235,379
(9.36 %)
2,668,584
(34.08 %)
0
(0 %)
473,456
(8.03 %)
31,789
(3.72 %)
15,314
(1.18 %)
228 rice bean eudicots (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1
38,736
(11.89 %)
n/a 16,669
(4.18 %)
43,369
(14.64 %)
n/a 32.90
(93.47 %)
0
(0 %)
20,717
(6.53 %)
15,445
(100.00 %)
233,635
(3.33 %)
204,141
(4.85 %)
2,682,022
(32.58 %)
1,663
(0.61 %)
168,485
(17.02 %)
16,828
(2.07 %)
12,921
(1.48 %)
229 riverbank grape
GCF_004353265.1
44,851
(10.22 %)
n/a 15,302
(3.01 %)
46,011
(14.96 %)
n/a 34.32
(98.79 %)
0
(0 %)
1,095
(1.21 %)
175
(100.00 %)
339,984
(3.03 %)
233,259
(4.71 %)
2,925,914
(35.27 %)
0
(0 %)
315,118
(6.27 %)
11,055
(0.93 %)
6,847
(0.55 %)
230 rose gum (2021)
GCF_016545825.1
54,676
(10.44 %)
n/a 16,291
(2.42 %)
69,492
(17.92 %)
n/a 39.39
(99.97 %)
0
(0 %)
1,712
(0.03 %)
37
(100.00 %)
358,171
(2.83 %)
259,031
(3.65 %)
3,353,128
(29.52 %)
0
(0 %)
415,146
(6.29 %)
78,731
(7.66 %)
52,846
(4.32 %)
231 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1
65,107
(11.08 %)
n/a 16,389
(2.33 %)
74,557
(18.16 %)
n/a 39.28
(92.69 %)
27,773
(7.32 %)
27,773
(7.32 %)
32,724
(92.68 %)
357,835
(2.50 %)
266,806
(3.22 %)
3,496,176
(27.34 %)
26
(0.01 %)
382,719
(5.52 %)
79,393
(6.54 %)
53,321
(3.81 %)
232 rose of Sharon
GCF_006381635.1
91,942
(5.18 %)
n/a 44,363
(2.23 %)
136,768
(10.14 %)
n/a 34.23
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
1,789
(100.00 %)
889,945
(2.72 %)
968,890
(4.91 %)
9,836,479
(51.73 %)
0
(0 %)
1,733,920
(9.74 %)
42,560
(0.89 %)
24,846
(0.50 %)
233 rubber tree (MT/VB/25A 57/8 2023)
GCF_030052815.1
71,175
(4.21 %)
n/a 22,208
(1.24 %)
63,302
(5.13 %)
n/a 34.70
(91.68 %)
0
(0 %)
1,428
(8.32 %)
755
(100.00 %)
1,078,590
(2.96 %)
730,314
(3.70 %)
6,031,831
(65.59 %)
1
(0.00 %)
2,789,876
(17.34 %)
24,263
(0.70 %)
3,609
(0.09 %)
234 rubber tree (reyan7-33-97 2016)
GCF_001654055.1
66,125
(5.23 %)
n/a 22,033
(1.63 %)
59,727
(6.42 %)
n/a 34.84
(94.20 %)
0
(0 %)
40,863
(5.81 %)
7,453
(100.00 %)
827,088
(3.02 %)
565,394
(5.23 %)
5,065,470
(61.59 %)
175
(0.01 %)
1,757,812
(14.15 %)
13,573
(0.45 %)
3,195
(0.09 %)
235 S.splendens huo1 eudicots (BFU 2021)
GCF_004379255.1
94,413
(12.61 %)
n/a 31,218
(3.57 %)
108,219
(21.49 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
471
(0.00 %)
1,178
(100.00 %)
360,314
(2.17 %)
419,051
(4.85 %)
3,875,932
(41.07 %)
0
(0 %)
569,178
(10.09 %)
105,227
(10.14 %)
53,473
(3.53 %)
236 sacred lotus
GCF_000365185.1
43,140
(7.01 %)
n/a 15,920
(2.13 %)
61,231
(13.11 %)
n/a 38.30
(87.98 %)
54,825
(12.04 %)
175,846
(12.06 %)
58,428
(87.96 %)
408,351
(2.83 %)
275,384
(2.52 %)
4,643,876
(30.20 %)
1,786
(0.17 %)
181,461
(2.08 %)
40,599
(2.68 %)
14,757
(0.70 %)
237 saltwater cress
GCF_000478725.1
38,705
(18.07 %)
n/a 21,851
(11.68 %)
39,487
(28.65 %)
n/a 37.71
(98.09 %)
3,020
(1.92 %)
3,020
(1.92 %)
3,658
(98.08 %)
102,162
(1.93 %)
70,755
(3.25 %)
1,162,538
(32.09 %)
12
(0.00 %)
173,482
(8.35 %)
15,272
(3.87 %)
8,448
(1.72 %)
238 sandblossoms (Phelan CA IGA184 alternate hap 2022)
GCA_023055565.1
n/a n/a 14,138
(0.74 %)
125,370
(12.27 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
581
(100.00 %)
655,331
(1.73 %)
500,899
(4.88 %)
7,172,490
(54.24 %)
0
(0 %)
1,964,428
(14.05 %)
140,800
(5.87 %)
37,685
(0.83 %)
239 sandblossoms (Phelan CA IGA184 primary hap 2022)
GCA_023055425.1
n/a n/a 15,588
(0.93 %)
117,831
(12.94 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
0
(0 %)
85
(0.00 %)
123
(100.00 %)
597,532
(1.81 %)
430,194
(3.80 %)
6,075,115
(49.91 %)
0
(0 %)
1,442,089
(12.90 %)
129,512
(5.41 %)
37,172
(1.01 %)
240 scarlet sage (huo1 2021)
GCF_004379255.2
94,251
(12.60 %)
n/a 31,266
(3.58 %)
108,141
(21.47 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
471
(0.00 %)
1,162
(100.00 %)
357,482
(2.10 %)
419,009
(4.86 %)
3,874,047
(41.08 %)
0
(0 %)
569,081
(10.09 %)
105,216
(10.11 %)
53,473
(3.50 %)
241 scented satinash
GCF_900635055.1
42,531
(12.21 %)
n/a 15,353
(3.67 %)
53,811
(20.61 %)
n/a 40.64
(89.65 %)
0
(0 %)
11,862
(10.35 %)
19,039
(100.00 %)
179,421
(2.10 %)
174,902
(3.34 %)
1,785,894
(25.35 %)
754
(0.12 %)
147,815
(3.18 %)
55,685
(7.69 %)
32,621
(3.67 %)
242 sesame
GCF_000512975.1
38,693
(16.95 %)
n/a 15,555
(5.41 %)
35,316
(19.66 %)
n/a 35.00
(98.34 %)
9,940
(1.66 %)
9,940
(1.66 %)
26,176
(98.34 %)
161,123
(2.85 %)
79,750
(3.97 %)
1,807,029
(31.02 %)
30
(0.02 %)
138,850
(4.01 %)
9,873
(1.80 %)
8,633
(1.51 %)
243 shrubby jointvetch A. evenia (CIAT22838 2020)
GCA_013621005.1
n/a n/a 16,242
(4.30 %)
39,583
(17.06 %)
n/a 35.22
(98.66 %)
0
(0 %)
2,946
(1.35 %)
1,451
(100.00 %)
253,228
(3.98 %)
186,657
(9.89 %)
1,792,662
(45.14 %)
3
(0.00 %)
432,106
(10.05 %)
19,928
(3.29 %)
10,449
(1.27 %)
244 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1
46,475
(12.62 %)
n/a 17,469
(4.11 %)
51,531
(21.75 %)
n/a 40.30
(93.72 %)
0
(0 %)
7,529
(6.28 %)
15,781
(100.00 %)
194,855
(2.07 %)
116,828
(2.25 %)
1,801,472
(25.38 %)
688
(0.10 %)
103,430
(2.38 %)
44,191
(5.74 %)
32,233
(3.75 %)
245 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1
43,419
(12.78 %)
n/a 14,758
(4.01 %)
41,180
(19.74 %)
n/a 40.38
(100.00 %)
0
(0 %)
36
(0.00 %)
75
(100.00 %)
160,749
(1.91 %)
114,741
(3.07 %)
1,619,569
(28.25 %)
0
(0 %)
213,237
(6.51 %)
43,290
(7.15 %)
31,834
(4.39 %)
246 silver poplar
GCF_005239225.1
53,068
(14.65 %)
n/a 20,299
(4.74 %)
44,556
(16.36 %)
n/a 33.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,287
(100.00 %)
309,097
(3.34 %)
175,288
(4.77 %)
2,457,634
(38.38 %)
0
(0 %)
273,621
(6.75 %)
4,613
(0.67 %)
2,159
(0.21 %)
247 silverweed cinquefoil (primary hap 2022)
GCF_933775445.1
28,735
(15.21 %)
n/a 13,143
(5.29 %)
32,007
(22.39 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
147
(100.00 %)
89,958
(1.86 %)
351,649
(15.29 %)
884,646
(35.58 %)
1
(0.00 %)
145,999
(6.99 %)
14,711
(4.52 %)
10,781
(1.93 %)
248 sorghum (BTx623 2017)
GCF_000003195.3
48,290
(8.57 %)
n/a 17,901
(3.45 %)
73,969
(19.64 %)
n/a 43.88
(95.30 %)
3,906
(4.70 %)
3,906
(4.70 %)
4,775
(95.30 %)
556,607
(65.39 %)
177,271
(4.54 %)
2,371,199
(48.20 %)
8
(0.00 %)
681,841
(11.76 %)
110,115
(18.82 %)
53,717
(5.80 %)
249 sorghum (Tx430 2018)
GCA_003482435.1
n/a n/a 18,138
(3.63 %)
75,180
(20.67 %)
n/a 43.67
(97.96 %)
0
(0 %)
2,108
(2.04 %)
308
(100.00 %)
559,950
(63.17 %)
156,952
(3.01 %)
2,481,716
(46.70 %)
0
(0 %)
578,722
(10.40 %)
109,923
(19.06 %)
54,889
(6.80 %)
250 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6
88,003
(9.85 %)
n/a 27,705
(3.08 %)
77,033
(11.88 %)
n/a 34.74
(97.36 %)
8,916
(2.65 %)
8,918
(2.65 %)
9,199
(97.35 %)
848,398
(38.02 %)
434,042
(5.29 %)
5,346,884
(45.07 %)
27
(0.00 %)
622,402
(6.12 %)
35,893
(1.55 %)
13,146
(0.57 %)
251 spider flower
GCF_000463585.1
45,524
(22.00 %)
n/a 21,103
(10.40 %)
38,184
(27.17 %)
n/a 39.40
(87.71 %)
24,824
(12.32 %)
24,824
(12.32 %)
37,073
(87.68 %)
144,827
(3.22 %)
103,970
(4.10 %)
1,118,840
(31.64 %)
50
(0.05 %)
164,935
(7.42 %)
29,313
(6.47 %)
16,566
(3.30 %)
252 spinach (Sp75 2017)
GCF_002007265.1
41,494
(5.76 %)
n/a 12,540
(1.38 %)
68,522
(12.26 %)
n/a 37.82
(95.53 %)
0
(0 %)
137,086
(4.48 %)
78,263
(100.00 %)
374,336
(2.48 %)
670,331
(6.78 %)
3,213,561
(52.82 %)
65,364
(1.04 %)
758,332
(10.61 %)
89,520
(4.54 %)
17,491
(0.71 %)
253 spinach (Varoflay 2021)
GCF_020520425.1
58,405
(7.11 %)
n/a 12,431
(1.27 %)
61,084
(11.35 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
0
(0 %)
63
(0.00 %)
246
(100.00 %)
378,521
(2.27 %)
722,814
(6.29 %)
2,950,586
(58.17 %)
0
(0 %)
972,333
(15.38 %)
92,256
(5.21 %)
18,749
(0.72 %)
254 spotted monkey flower
GCF_000504015.1
34,441
(15.56 %)
n/a 14,508
(4.41 %)
34,904
(18.83 %)
n/a 35.50
(93.50 %)
15,528
(6.52 %)
15,528
(6.52 %)
17,740
(93.48 %)
227,143
(4.28 %)
204,234
(11.85 %)
1,776,879
(40.60 %)
19
(0.01 %)
338,940
(10.42 %)
21,718
(3.89 %)
14,899
(2.46 %)
255 stiff brome
GCF_000005505.3
47,531
(20.35 %)
n/a 15,530
(6.01 %)
45,735
(34.29 %)
n/a 46.40
(99.84 %)
25
(0.16 %)
27
(0.16 %)
36
(99.84 %)
108,976
(17.41 %)
54,391
(1.94 %)
1,197,052
(21.34 %)
0
(0 %)
71,157
(2.72 %)
48,209
(34.43 %)
42,088
(12.51 %)
256 strawberry (Reikou 2013)
GCA_000511835.1
n/a n/a 15,045
(1.35 %)
164,045
(15.16 %)
n/a 38.82
(94.24 %)
88,316
(5.63 %)
89,898
(5.63 %)
714,282
(94.37 %)
278,640
(1.91 %)
388,660
(6.94 %)
3,639,568
(28.92 %)
271
(0.01 %)
n/a 64,180
(3.80 %)
21,117
(1.05 %)
257 sugarcane (2018)
GCA_900465005.1
n/a n/a 18,847
(4.51 %)
76,529
(27.07 %)
n/a 45.11
(99.96 %)
1,423
(0.03 %)
1,423
(0.03 %)
7,128
(99.97 %)
258,594
(29.31 %)
144,716
(2.51 %)
1,976,510
(35.41 %)
436
(0.05 %)
268,312
(8.56 %)
113,324
(26.96 %)
87,385
(13.10 %)
258 sweet cherry
GCF_002207925.1
39,968
(19.06 %)
n/a 15,007
(5.83 %)
38,107
(23.61 %)
n/a 37.72
(90.64 %)
0
(0 %)
22,628
(9.39 %)
10,148
(100.00 %)
136,700
(2.47 %)
104,376
(7.20 %)
1,484,591
(25.20 %)
40
(0.03 %)
225,280
(8.38 %)
9,956
(2.27 %)
6,378
(1.39 %)
259 sweet orange
GCF_000317415.1
46,820
(15.94 %)
n/a 14,390
(4.63 %)
34,480
(18.04 %)
n/a 34.07
(91.90 %)
12,539
(8.11 %)
12,539
(8.11 %)
17,383
(91.89 %)
185,212
(2.95 %)
104,182
(4.92 %)
2,119,183
(29.53 %)
106
(0.11 %)
143,275
(8.59 %)
6,540
(0.93 %)
4,953
(0.65 %)
260 sweet potato (Taizhong6 2017)
GCA_002525835.2
n/a n/a 23,319
(2.45 %)
98,107
(18.19 %)
n/a 35.14
(88.01 %)
0
(0 %)
171,925
(12.06 %)
28,461
(100.00 %)
579,745
(3.87 %)
473,175
(3.79 %)
4,850,126
(32.44 %)
96
(0.01 %)
493,077
(6.15 %)
52,715
(3.15 %)
42,259
(2.50 %)
261 sweet wormwood (Huhao1# 2018)
GCA_003112345.1
n/a 66,918
(4.98 %)
22,279
(1.15 %)
121,694
(10.54 %)
n/a 35.34
(91.81 %)
275,164
(8.22 %)
275,710
(8.22 %)
314,564
(91.78 %)
856,470
(2.64 %)
970,252
(5.69 %)
7,570,175
(42.39 %)
33,170
(1.01 %)
1,556,972
(12.95 %)
29,072
(0.54 %)
6,559
(0.13 %)
262 switchgrass
GCF_016808335.1
114,876
(10.54 %)
n/a 31,534
(3.21 %)
152,844
(27.54 %)
n/a 46.79
(99.59 %)
464
(0.41 %)
464
(0.41 %)
1,091
(99.59 %)
395,905
(1.77 %)
323,173
(5.10 %)
4,922,182
(39.47 %)
0
(0 %)
921,472
(10.02 %)
213,249
(32.45 %)
151,346
(11.21 %)
263 Tartarian buckwheat (Pinku1 2017)
GCA_002319775.1
n/a n/a 15,605
(2.84 %)
50,437
(14.57 %)
n/a 38.53
(96.71 %)
0
(0 %)
2,456
(3.29 %)
7,020
(100.00 %)
257,784
(2.74 %)
211,756
(3.88 %)
2,209,417
(41.80 %)
2
(0.00 %)
363,246
(7.54 %)
54,125
(5.80 %)
14,956
(1.19 %)
264 thale cress (tair10.1 Columbia 2018)
GCF_000001735.4
53,928
(40.16 %)
n/a 26,582
(34.47 %)
11,416
(18.70 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
0
(0 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
68,517
(16.50 %)
27,064
(2.77 %)
749,005
(22.64 %)
1
(0.00 %)
42,547
(3.36 %)
4,601
(1.63 %)
3,518
(1.15 %)
265 thunder duke vine
GCF_013401445.1
56,436
(17.59 %)
n/a 20,174
(5.61 %)
42,326
(19.85 %)
n/a 37.58
(99.96 %)
0
(0 %)
146
(0.04 %)
321
(100.00 %)
125,395
(2.23 %)
102,179
(22.89 %)
1,226,273
(38.50 %)
0
(0 %)
599,313
(13.69 %)
6,893
(1.71 %)
5,408
(0.61 %)
266 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1
50,668
(2.79 %)
n/a 17,479
(0.82 %)
117,543
(8.63 %)
n/a 40.23
(88.38 %)
0
(0 %)
119,817
(11.63 %)
37,194
(100.00 %)
622,838
(1.51 %)
788,520
(3.46 %)
11,822,060
(48.66 %)
133
(0.01 %)
2,124,644
(8.96 %)
174,838
(3.17 %)
26,771
(0.55 %)
267 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2
66,966
(3.67 %)
n/a 17,141
(1.02 %)
81,513
(6.82 %)
n/a 38.89
(97.29 %)
56,061
(2.71 %)
213,074
(2.72 %)
215,609
(97.29 %)
486,556
(1.53 %)
669,040
(5.52 %)
10,446,746
(53.83 %)
19,953
(0.37 %)
1,327,454
(6.88 %)
118,807
(2.33 %)
10,195
(0.20 %)
268 tomato (2024)
GCF_036512215.1
59,947
(8.20 %)
n/a 15,474
(1.94 %)
40,638
(7.50 %)
n/a 35.17
(99.99 %)
0
(0 %)
166
(0.01 %)
14
(100.00 %)
333,077
(2.31 %)
259,232
(7.09 %)
5,402,596
(43.04 %)
8
(0.00 %)
851,692
(8.46 %)
31,740
(4.85 %)
2,381
(0.10 %)
269 tomato (v3.1 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.5
45,847
(6.92 %)
n/a 15,425
(2.15 %)
38,319
(7.54 %)
n/a 34.12
(90.19 %)
0
(0 %)
19,539
(9.82 %)
3,066
(100.00 %)
311,852
(2.14 %)
229,773
(3.18 %)
5,390,626
(35.26 %)
224
(0.02 %)
412,055
(4.41 %)
25,196
(1.27 %)
2,324
(0.10 %)
270 toyon (HeAr 88 alternate hap 2022)
GCA_024363235.1
n/a n/a 22,795
(3.47 %)
67,418
(16.40 %)
n/a 38.17
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
75
(100.00 %)
347,375
(3.07 %)
304,988
(3.96 %)
3,119,641
(40.22 %)
0
(0 %)
481,094
(9.09 %)
30,300
(3.29 %)
15,155
(0.98 %)
271 toyon (HeAr 88 primary hap 2022)
GCA_024362995.1
n/a n/a 22,897
(3.50 %)
67,595
(16.43 %)
n/a 38.12
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
118
(100.00 %)
344,928
(2.90 %)
299,566
(3.87 %)
3,139,734
(39.86 %)
0
(0 %)
474,790
(8.82 %)
30,533
(2.95 %)
15,260
(0.99 %)
272 tree cotton (Shixiya-1 2022)
GCF_025698485.1
69,030
(4.11 %)
n/a 20,169
(1.21 %)
55,515
(4.75 %)
n/a 35.17
(100.00 %)
0
(0 %)
225
(0.00 %)
948
(100.00 %)
618,195
(1.97 %)
622,748
(3.28 %)
8,002,633
(61.80 %)
0
(0 %)
1,982,971
(15.63 %)
27,646
(0.67 %)
5,410
(0.15 %)
273 tree cotton (Shixiya1 2015 BGI)
GCF_000612285.1
53,446
(3.92 %)
n/a 20,707
(1.29 %)
56,318
(5.01 %)
n/a 35.03
(92.12 %)
45,766
(7.88 %)
45,768
(7.88 %)
121,185
(92.12 %)
618,119
(2.07 %)
589,954
(3.54 %)
8,098,351
(55.57 %)
587
(0.14 %)
1,280,735
(10.74 %)
28,949
(0.57 %)
5,345
(0.12 %)
274 trilobed morning glory
GCF_003576645.1
49,472
(13.00 %)
n/a 16,803
(3.58 %)
50,448
(18.68 %)
n/a 35.68
(94.76 %)
0
(0 %)
31,256
(5.25 %)
17
(100.00 %)
333,211
(3.67 %)
335,317
(10.66 %)
2,341,085
(36.54 %)
1,908
(0.26 %)
378,228
(11.60 %)
27,290
(3.24 %)
20,629
(2.28 %)
275 Valencia sweet orange 2022
GCF_022201045.2
49,094
(16.30 %)
n/a 14,451
(4.70 %)
33,670
(18.59 %)
n/a 34.22
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
11
(100.00 %)
184,421
(2.80 %)
106,732
(3.28 %)
1,996,057
(33.86 %)
0
(0 %)
138,933
(5.87 %)
6,824
(1.28 %)
4,933
(0.78 %)
276 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2
63,531
(8.16 %)
n/a 16,883
(1.90 %)
72,901
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
0
(0 %)
1,673
(0.23 %)
2,002
(100.00 %)
800,288
(3.71 %)
460,119
(7.41 %)
5,438,715
(37.84 %)
3
(0.00 %)
746,272
(7.48 %)
19,628
(1.10 %)
9,136
(0.41 %)
277 Van Houtte's columbine (alt pseudohaplotype PFEx6 2022)
GCA_023053535.1
n/a n/a 13,357
(3.39 %)
37,446
(17.24 %)
n/a 37.56
(100.00 %)
0
(0 %)
63
(0.00 %)
249
(100.00 %)
244,573
(10.74 %)
180,141
(13.98 %)
1,184,686
(42.28 %)
0
(0 %)
428,570
(12.48 %)
6,470
(2.86 %)
617
(0.10 %)
278 Van Houtte's columbine (PFEx6 2022)
GCA_023053565.1
n/a n/a 13,575
(3.44 %)
38,113
(17.59 %)
n/a 37.58
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
463
(100.00 %)
245,892
(11.25 %)
158,855
(13.35 %)
1,221,056
(41.58 %)
0
(0 %)
400,137
(11.97 %)
6,436
(2.63 %)
718
(0.10 %)
279 vegetable marrow (v2 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.2
48,839
(21.95 %)
n/a 19,452
(7.44 %)
35,987
(20.77 %)
n/a 36.49
(94.38 %)
0
(0 %)
49,199
(5.63 %)
24,194
(100.00 %)
181,473
(3.18 %)
143,114
(7.42 %)
1,614,901
(29.14 %)
3,445
(0.84 %)
135,437
(7.93 %)
13,094
(2.48 %)
9,563
(1.55 %)
280 wax gourd
GCF_009727055.1
40,406
(4.66 %)
n/a 13,481
(1.43 %)
43,071
(6.68 %)
n/a 34.85
(98.39 %)
0
(0 %)
24,524
(1.62 %)
1,791
(100.00 %)
481,638
(2.55 %)
364,998
(3.11 %)
6,236,506
(49.68 %)
4,691
(0.08 %)
383,939
(3.89 %)
21,741
(0.93 %)
14,484
(0.55 %)
281 weeping love grass (Victoria 2019)
GCA_007726485.1
n/a 56,849
(13.20 %)
22,395
(3.96 %)
101,555
(33.88 %)
n/a 45.70
(99.78 %)
0
(0 %)
2,245
(0.22 %)
1,143
(100.00 %)
206,645
(1.57 %)
174,457
(2.79 %)
2,244,665
(26.11 %)
6
(0.00 %)
285,716
(7.93 %)
117,743
(29.88 %)
94,408
(12.80 %)
282 white fonio (2020)
GCA_902806635.1
n/a n/a 33,011
(5.39 %)
109,615
(30.77 %)
n/a 45.47
(97.23 %)
29,136
(2.79 %)
29,136
(2.79 %)
29,155
(97.21 %)
215,374
(1.42 %)
159,137
(1.91 %)
2,776,488
(28.15 %)
5,190
(0.27 %)
250,897
(4.54 %)
136,308
(27.74 %)
101,170
(11.60 %)
283 white lupine (Amiga GWH2020 2020)
GCA_010261695.1
n/a 47,603
(13.29 %)
21,959
(3.77 %)
51,652
(20.18 %)
n/a 36.92
(99.73 %)
1,591
(0.03 %)
1,764
(0.27 %)
3,171
(99.97 %)
215,169
(3.21 %)
247,660
(10.71 %)
2,556,478
(43.72 %)
1
(0.00 %)
723,439
(10.94 %)
14,520
(10.46 %)
5,911
(9.75 %)
284 white yam
GCF_009730915.1
43,902
(7.41 %)
n/a 13,647
(2.09 %)
49,877
(12.79 %)
n/a 36.25
(99.19 %)
0
(0 %)
4,760
(0.81 %)
2,254
(100.00 %)
391,299
(3.19 %)
258,918
(3.96 %)
3,588,023
(40.59 %)
0
(0 %)
287,001
(4.23 %)
28,929
(2.37 %)
14,044
(1.13 %)
285 wild cabbage
GCF_000695525.1
66,717
(15.60 %)
n/a 31,142
(8.08 %)
103,348
(35.10 %)
n/a 36.11
(91.23 %)
874
(0.02 %)
52,140
(8.80 %)
33,760
(99.98 %)
197,515
(3.12 %)
214,463
(4.43 %)
2,535,207
(31.20 %)
226
(0.10 %)
221,975
(4.62 %)
29,995
(2.99 %)
19,922
(1.82 %)
286 wild cabbage (2018)
GCA_900416815.2
n/a n/a 31,163
(6.66 %)
79,290
(25.04 %)
n/a 36.57
(98.21 %)
11
(0.00 %)
135
(1.79 %)
140
(100.00 %)
273,972
(2.76 %)
284,806
(6.41 %)
2,750,803
(38.77 %)
0
(0 %)
470,826
(8.08 %)
33,071
(3.37 %)
21,309
(1.78 %)
287 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1
29,804
(16.68 %)
n/a 13,252
(5.90 %)
22,247
(14.89 %)
n/a 32.94
(94.65 %)
0
(0 %)
119,056
(5.55 %)
6,074
(100.00 %)
107,979
(2.19 %)
67,029
(6.76 %)
1,525,353
(32.45 %)
62
(0.01 %)
137,522
(3.41 %)
2,481
(0.48 %)
2,112
(0.40 %)
288 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2
131,285
(1.34 %)
n/a n/a 567,570
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
0
(0 %)
344,589
(3.31 %)
148,296
(100.00 %)
2,573,102
(1.23 %)
2,990,888
(3.37 %)
492,885
(96.69 %)
210
(0.02 %)
n/a 2,220,880
(25.34 %)
0
(0.00 %)
289 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2
53,171
(14.87 %)
n/a 18,878
(4.31 %)
45,554
(18.36 %)
n/a 38.87
(82.70 %)
17,164
(17.29 %)
22,178
(17.31 %)
24,423
(82.71 %)
214,040
(7.81 %)
136,453
(2.42 %)
1,656,678
(31.15 %)
1,372
(0.30 %)
160,195
(3.00 %)
53,687
(8.28 %)
32,795
(5.44 %)
290 wild olive
GCF_002742605.1
67,081
(6.69 %)
n/a 19,793
(1.69 %)
68,749
(9.17 %)
n/a 35.40
(90.41 %)
0
(0 %)
47,638
(9.59 %)
41,226
(100.00 %)
425,922
(1.79 %)
378,656
(18.98 %)
5,982,070
(40.81 %)
1,739
(0.11 %)
2,654,630
(14.57 %)
12,534
(0.42 %)
7,470
(0.21 %)
291 wild peanut A.duranensis (v2 V14167 2020)
GCF_000817695.3
57,082
(6.20 %)
n/a 17,102
(1.68 %)
76,760
(11.48 %)
n/a 35.80
(88.03 %)
8
(0.00 %)
135,554
(12.02 %)
1,589
(100.00 %)
596,136
(3.37 %)
499,251
(3.39 %)
5,279,103
(45.94 %)
66
(0.02 %)
723,949
(6.61 %)
48,556
(1.91 %)
22,182
(0.85 %)
292 wild peanut A.ipaensis (K30076 2017)
GCF_000816755.2
78,441
(5.58 %)
n/a 16,952
(1.26 %)
89,380
(9.95 %)
n/a 36.84
(92.91 %)
449
(0.33 %)
122,617
(7.13 %)
997
(99.67 %)
777,978
(3.35 %)
619,944
(3.82 %)
5,823,472
(53.61 %)
535
(0.10 %)
1,221,848
(10.04 %)
79,537
(2.58 %)
30,634
(0.87 %)
293 wild peanut A.stenosperma (V10309 2020)
GCF_014773155.1
67,384
(5.06 %)
n/a 16,850
(1.28 %)
83,780
(9.77 %)
n/a 36.78
(93.48 %)
0
(0 %)
14,157
(6.52 %)
30
(100.00 %)
767,054
(3.15 %)
754,355
(3.89 %)
5,146,558
(56.74 %)
4
(0.00 %)
1,299,909
(14.23 %)
71,885
(2.45 %)
24,953
(0.81 %)
294 wild soybean
GCF_004193775.1
81,537
(9.20 %)
n/a 27,977
(2.99 %)
78,144
(11.64 %)
n/a 34.88
(97.58 %)
0
(0 %)
752
(2.42 %)
1,120
(100.00 %)
551,217
(2.79 %)
450,287
(6.65 %)
5,379,409
(46.22 %)
5
(0.01 %)
778,567
(7.38 %)
37,183
(1.52 %)
13,293
(0.57 %)
295 wild strawberry (2011 refseq)
GCF_000184155.1
36,435
(23.91 %)
n/a 13,996
(6.63 %)
46,505
(35.89 %)
n/a 38.40
(94.27 %)
13,412
(5.75 %)
16,253
(5.76 %)
16,460
(94.25 %)
71,057
(1.51 %)
74,581
(2.78 %)
1,034,180
(21.44 %)
25
(0.01 %)
71,241
(3.11 %)
14,806
(3.21 %)
9,028
(1.93 %)
296 wild sugarcane (AP85-441 2018)
GCA_003544955.1
n/a n/a 67,698
(2.77 %)
385,590
(22.40 %)
n/a 44.92
(99.75 %)
0
(0 %)
76,230
(0.26 %)
15,303
(100.00 %)
1,015,234
(1.60 %)
910,932
(3.64 %)
10,425,387
(46.78 %)
70
(0.00 %)
2,210,284
(13.29 %)
637,314
(24.52 %)
426,307
(10.34 %)
297 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1
46,114
(5.99 %)
n/a 15,458
(1.87 %)
42,907
(7.63 %)
n/a 34.50
(92.34 %)
41,684
(7.67 %)
41,684
(7.67 %)
41,696
(92.33 %)
363,460
(2.48 %)
271,129
(4.15 %)
6,330,153
(36.93 %)
559
(0.10 %)
539,878
(5.37 %)
19,639
(1.20 %)
3,088
(0.12 %)
298 wine grape (Chardonnay FPS 04 2020)
GCA_011037095.1
n/a n/a 17,733
(2.85 %)
55,354
(14.76 %)
n/a 34.32
(99.33 %)
0
(0 %)
780
(0.67 %)
683
(100.00 %)
586,981
(35.31 %)
275,412
(4.57 %)
3,561,395
(35.28 %)
0
(0 %)
351,841
(5.71 %)
14,172
(0.96 %)
8,413
(0.56 %)
299 wine grape (Chkhaveri 2017)
GCA_002922885.1
n/a n/a 14,109
(3.33 %)
40,033
(15.32 %)
n/a 34.56
(97.67 %)
0
(0 %)
9,429
(2.34 %)
21
(100.00 %)
410,680
(35.69 %)
189,467
(4.45 %)
2,405,053
(34.36 %)
236
(0.04 %)
246,055
(5.81 %)
10,620
(1.04 %)
5,070
(0.52 %)
300 wine grape (Pinot Noir 40024 2023)
GCF_030704535.1
46,287
(10.68 %)
n/a 14,823
(2.93 %)
44,674
(15.11 %)
n/a 35.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 21
(100.00 %)
310,377
(2.83 %)
242,451
(9.17 %)
2,706,407
(38.52 %)
0
(0 %)
369,814
(7.00 %)
11,751
(1.05 %)
6,644
(0.55 %)
301 wine grape (PN40024 2009)
GCF_000003745.3
46,797
(11.01 %)
n/a 14,907
(3.07 %)
44,949
(15.02 %)
n/a 34.56
(96.91 %)
12,727
(3.10 %)
13,440
(3.10 %)
14,644
(96.90 %)
462,807
(35.59 %)
222,647
(4.83 %)
2,745,513
(34.80 %)
345
(0.04 %)
302,175
(5.97 %)
11,591
(1.00 %)
6,661
(0.55 %)
302 winter cress (G-type 2016)
GCA_001920985.1
n/a n/a 22,511
(18.61 %)
30,519
(28.94 %)
n/a 35.60
(90.69 %)
22,839
(9.35 %)
22,839
(9.35 %)
30,649
(90.65 %)
86,568
(2.39 %)
44,616
(2.78 %)
1,035,105
(23.86 %)
13
(0.01 %)
47,590
(2.53 %)
6,701
(1.74 %)
5,207
(1.30 %)
303 winter squash
GCF_002738345.1
49,714
(19.34 %)
n/a 18,860
(6.74 %)
33,884
(18.55 %)
n/a 36.33
(97.81 %)
0
(0 %)
17,224
(2.20 %)
8,299
(100.00 %)
169,605
(3.09 %)
134,380
(10.82 %)
1,493,623
(35.66 %)
439
(0.08 %)
282,805
(8.27 %)
12,619
(2.64 %)
9,029
(1.47 %)
304 wood tobacco
GCF_000393655.1
58,358
(2.93 %)
n/a 17,332
(0.82 %)
111,663
(7.17 %)
n/a 39.09
(92.17 %)
139,080
(7.84 %)
338,901
(7.84 %)
392,998
(92.16 %)
598,929
(1.44 %)
776,240
(4.57 %)
13,228,149
(49.11 %)
18,173
(0.88 %)
1,444,692
(6.99 %)
100,864
(1.49 %)
21,222
(0.32 %)
305 zha cai (T84-66 inbred line 2016)
GCA_001687265.1
n/a n/a 56,069
(8.51 %)
138,660
(27.88 %)
n/a 36.22
(79.66 %)
0
(0 %)
22,714
(20.35 %)
9,746
(100.00 %)
367,321
(2.38 %)
303,381
(3.03 %)
4,551,648
(26.34 %)
264
(0.05 %)
380,691
(8.39 %)
50,430
(3.81 %)
37,478
(1.85 %)
TOTALS:total assembly count 305

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 221 assemblies assembly stats track stats
Mammals 608 assemblies assembly stats track stats
Birds 399 assemblies assembly stats track stats
Fishes 425 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 279 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1111 assemblies assembly stats track stats
Plants 305 assemblies assembly stats track stats
Fungi 912 assemblies assembly stats track stats
Viruses 287 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 107 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 527 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1060 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 775 assemblies assembly stats track stats