Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Christmas fern (IRGN 58ZZQ2NR20 2022)
GCA_025802375.1
n/a n/a 2,216
(0.22 %)
115,851
(13.84 %)
n/a 40.55
(99.77 %)
6,993
(0.02 %)
6,993
(0.02 %)
496,888
(99.98 %)
1,157,849
(61.20 %)
244,472
(3.76 %)
2,756,209
(21.19 %)
8
(0.00 %)
n/a 9,107
(0.82 %)
3,721
(0.34 %)
2 A. eriantha gooseberry (White 2019)
GCA_004150315.1
n/a n/a 21,507
(2.72 %)
60,050
(11.57 %)
n/a 35.92
(99.97 %)
0
(0 %)
2,344
(0.03 %)
1,735
(100.00 %)
430,950
(2.82 %)
273,041
(3.10 %)
4,895,011
(32.98 %)
1
(0.00 %)
150,033
(1.97 %)
29,695
(1.88 %)
17,294
(1.01 %)
3 A.eriantha eudicots (MHT-2021 2021)
GCF_019202715.1
71,489
(11.95 %)
n/a 23,883
(3.45 %)
59,407
(13.07 %)
n/a 35.65
(99.64 %)
0
(0 %)
710
(0.36 %)
88
(100.00 %)
430,287
(3.04 %)
350,721
(4.29 %)
3,875,064
(36.80 %)
0
(0 %)
297,935
(5.94 %)
27,794
(1.97 %)
14,196
(0.90 %)
4 adzuki bean (Jingnong 6 2015)
GCF_001190045.1
40,474
(10.62 %)
n/a 16,697
(3.71 %)
47,542
(15.07 %)
n/a 34.07
(96.37 %)
21,264
(3.63 %)
21,264
(3.63 %)
58,639
(96.37 %)
257,290
(4.08 %)
239,596
(6.43 %)
2,925,469
(36.04 %)
202
(0.09 %)
250,517
(6.42 %)
24,461
(2.99 %)
14,539
(1.51 %)
5 adzuki bean (LongXiaoDou No.4 2021)
GCF_016808095.1
50,989
(11.87 %)
n/a 16,661
(3.75 %)
45,945
(15.40 %)
n/a 33.63
(100.00 %)
0
(0 %)
32
(0.00 %)
36
(100.00 %)
263,673
(3.52 %)
264,113
(5.18 %)
2,808,981
(37.65 %)
0
(0 %)
244,636
(6.82 %)
20,402
(2.60 %)
14,051
(1.55 %)
6 African boxthorn (CSIRO_LF1 2023)
GCF_029784015.1
54,359
(4.64 %)
n/a 16,693
(1.34 %)
75,114
(9.09 %)
n/a 37.42
(99.88 %)
0
(0 %)
15,111
(0.12 %)
14,905
(100.00 %)
668,488
(2.42 %)
511,720
(3.29 %)
8,110,750
(42.79 %)
2
(0.00 %)
942,647
(9.28 %)
50,821
(2.66 %)
18,184
(0.72 %)
7 African oil palm
GCF_000442705.1
51,575
(5.06 %)
n/a 16,948
(1.48 %)
76,464
(9.29 %)
n/a 37.21
(68.90 %)
162,407
(31.14 %)
166,490
(31.14 %)
202,468
(68.86 %)
580,361
(3.63 %)
445,124
(2.25 %)
5,831,606
(30.77 %)
2,228
(0.10 %)
282,030
(1.50 %)
75,576
(3.67 %)
31,746
(0.99 %)
8 African oil palm (ETL-2024a 2024)
GCF_000442705.2
61,514
(3.59 %)
n/a 17,694
(0.94 %)
82,131
(6.45 %)
n/a 38.54
(93.07 %)
0
(0 %)
37,524
(6.94 %)
30
(100.00 %)
930,885
(3.15 %)
928,025
(5.06 %)
6,719,901
(56.47 %)
38
(0.00 %)
1,987,190
(10.92 %)
104,550
(9.50 %)
36,012
(0.94 %)
9 African rice (2021)
GCF_000147395.1
43,826
(15.96 %)
n/a 16,224
(4.82 %)
51,031
(25.64 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
13
(0.00 %)
21
(0.00 %)
73
(100.00 %)
178,763
(2.60 %)
125,689
(4.18 %)
1,761,585
(30.96 %)
1
(0.00 %)
127,354
(3.72 %)
60,891
(21.37 %)
40,209
(7.27 %)
10 alfalfa (Bolivia 2025)
GCF_051527215.1
87,594
(11.49 %)
n/a 17,202
(2.08 %)
58,286
(12.10 %)
n/a 34.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 10
(100.00 %)
369,695
(2.32 %)
412,171
(16.42 %)
3,858,885
(47.46 %)
0
(0 %)
323,305
(6.78 %)
9,428
(0.41 %)
4,303
(0.24 %)
11 algarrobo blanco (v1 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.1
62,791
(10.08 %)
n/a 25,423
(3.34 %)
69,507
(14.55 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,087
(100.00 %)
367,402
(2.31 %)
175,862
(2.27 %)
4,241,058
(38.29 %)
0
(0 %)
289,448
(4.63 %)
18,927
(1.15 %)
12,774
(0.78 %)
12 algarrobo blanco (v2 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.2
62,791
(10.08 %)
n/a 25,443
(3.35 %)
69,492
(14.56 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,085
(100.00 %)
366,178
(2.25 %)
175,852
(2.27 %)
4,240,382
(38.29 %)
0
(0 %)
289,428
(4.63 %)
18,927
(1.15 %)
12,775
(0.79 %)
13 almond
GCF_902201215.1
37,363
(19.64 %)
n/a 14,509
(6.35 %)
33,193
(24.70 %)
n/a 37.65
(98.29 %)
1,008
(0.04 %)
6,531
(1.72 %)
1,700
(99.96 %)
137,974
(2.59 %)
100,386
(3.92 %)
1,251,126
(26.07 %)
7
(0.00 %)
114,850
(6.39 %)
10,893
(2.94 %)
5,266
(1.06 %)
14 annual mercury (v1 primary hap 2022)
GCF_937616625.1
47,801
(11.07 %)
n/a 13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
0
(0 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
0
(0 %)
1,165,065
(19.31 %)
9,024
(2.18 %)
5,406
(0.45 %)
15 annual mercury (v2 primary hap 2022)
GCF_937616625.2
44,356
(10.99 %)
n/a 13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
0
(0 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
0
(0 %)
1,165,065
(19.31 %)
9,024
(2.18 %)
5,406
(0.45 %)
16 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1
73,172
(3.41 %)
n/a 26,626
(1.10 %)
228,260
(15.00 %)
n/a 44.76
(99.87 %)
0
(0 %)
31,919
(0.13 %)
1,764
(100.00 %)
639,429
(1.31 %)
739,566
(3.57 %)
6,976,583
(59.37 %)
20
(0.00 %)
2,938,091
(54.45 %)
560,429
(28.70 %)
234,787
(7.24 %)
17 ant A.trifoliata (2021)
GCF_017979445.1
56,507
(8.80 %)
n/a 15,638
(2.23 %)
40,465
(9.18 %)
n/a 35.00
(99.99 %)
0
(0 %)
642
(0.01 %)
914
(100.00 %)
605,507
(11.15 %)
358,356
(5.45 %)
4,117,291
(42.61 %)
0
(0 %)
469,444
(6.54 %)
5,597
(0.36 %)
1,808
(0.13 %)
18 ant C.braunii (S276 2018)
GCA_003427395.1
n/a 36,423
(6.45 %)
3,649
(0.20 %)
126,898
(19.85 %)
n/a 48.33
(81.70 %)
641,791
(18.38 %)
641,791
(18.38 %)
653,445
(81.62 %)
1,577,107
(5.98 %)
1,434,259
(6.24 %)
8,533,748
(36.35 %)
11,268
(0.38 %)
884,830
(4.30 %)
278,266
(17.95 %)
112,631
(3.95 %)
19 ant C.chinensis (HL-2020 2020)
GCF_015680905.1
80,691
(7.72 %)
n/a 14,824
(1.38 %)
74,253
(13.51 %)
n/a 37.33
(100.00 %)
0
(0 %)
10
(0.00 %)
117
(100.00 %)
801,813
(18.63 %)
388,497
(4.06 %)
4,517,066
(43.10 %)
0
(0 %)
653,127
(6.78 %)
23,291
(1.45 %)
6,898
(0.35 %)
20 ant C.sp. (NIES-68 2022)
GCA_027943385.1
n/a 28,971
(16.48 %)
3,655
(0.79 %)
32,911
(30.45 %)
n/a 55.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,529
(100.00 %)
255,839
(6.03 %)
392,694
(15.77 %)
1,480,495
(52.16 %)
0
(0 %)
470,137
(9.98 %)
23,662
(78.57 %)
40,755
(11.50 %)
21 ant L.chinense (Lushan-1 2018)
GCA_003013855.2
n/a n/a 15,545
(0.82 %)
85,577
(6.98 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
473
(0.00 %)
473
(0.00 %)
4,183
(100.00 %)
860,506
(2.32 %)
825,722
(4.56 %)
8,205,488
(53.73 %)
0
(0 %)
1,213,231
(8.04 %)
153,728
(4.12 %)
19,945
(0.45 %)
22 ant M.endlicherianum (SAG 12.97 2019)
GCA_009602735.1
n/a n/a 2,806
(1.27 %)
21,989
(34.80 %)
n/a 51.93
(90.29 %)
24,291
(9.73 %)
24,291
(9.73 %)
38,152
(90.27 %)
147,548
(5.58 %)
92,866
(3.14 %)
715,552
(34.44 %)
304
(0.17 %)
61,445
(5.72 %)
34,833
(26.81 %)
25,521
(7.32 %)
23 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 refseq)
GCF_002114115.1
64,916
(11.38 %)
n/a 22,530
(3.52 %)
67,146
(16.22 %)
n/a 38.04
(88.96 %)
0
(0 %)
7,264
(11.05 %)
807
(100.00 %)
692,611
(50.77 %)
322,556
(4.41 %)
3,055,836
(35.69 %)
2
(0.00 %)
451,438
(6.86 %)
25,923
(1.76 %)
13,929
(0.88 %)
24 apple (hap1 2024)
GCF_042453785.1
78,522
(12.41 %)
n/a 22,548
(3.38 %)
68,116
(16.07 %)
n/a 38.09
(100.00 %)
0
(0 %)
89
(0.00 %)
19
(100.00 %)
315,260
(2.21 %)
337,450
(5.03 %)
3,018,840
(41.78 %)
0
(0 %)
504,186
(8.89 %)
26,464
(1.96 %)
15,224
(1.02 %)
25 Asian cultivated rice (Carolina Gold Select 2019)
GCA_004007595.1
n/a 68,732
(13.79 %)
16,583
(4.58 %)
55,248
(25.46 %)
n/a 43.36
(99.98 %)
0
(0 %)
696
(0.02 %)
615
(100.00 %)
495,126
(50.28 %)
124,567
(3.20 %)
1,922,072
(32.59 %)
0
(0 %)
155,586
(4.21 %)
65,220
(23.87 %)
41,812
(7.56 %)
26 Australian watermeal (7733 2023)
GCF_029677425.1
25,687
(7.34 %)
n/a 8,705
(2.10 %)
36,382
(16.93 %)
n/a 40.84
(99.89 %)
0
(0 %)
11
(0.11 %)
21
(100.00 %)
349,798
(22.56 %)
247,654
(8.32 %)
2,073,176
(34.59 %)
0
(0 %)
230,212
(4.87 %)
43,900
(16.21 %)
31,614
(6.14 %)
27 Australian watermeal (WA8730 2020)
GCA_013350365.1
n/a n/a 8,508
(2.10 %)
37,551
(17.70 %)
n/a 40.80
(95.30 %)
1,778
(4.70 %)
1,778
(4.70 %)
7,026
(95.30 %)
167,876
(5.21 %)
220,174
(6.35 %)
2,006,559
(31.53 %)
0
(0 %)
127,703
(2.82 %)
43,277
(15.01 %)
30,244
(5.88 %)
28 Australian wild rice (MA-2024b 2025)
GCA_047496205.1
n/a n/a 16,434
(4.16 %)
55,282
(23.68 %)
n/a 43.56
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
16
(100.00 %)
602,996
(48.61 %)
170,830
(6.54 %)
1,845,923
(37.36 %)
0
(0 %)
218,432
(6.72 %)
69,474
(22.48 %)
48,410
(7.77 %)
29 Avena eriantha (BYU132 2022)
GCA_910589775.1
n/a n/a 17,696
(0.47 %)
237,324
(9.15 %)
n/a 43.86
(99.92 %)
196
(0.01 %)
5,576
(0.09 %)
2,848
(99.99 %)
902,202
(1.10 %)
1,084,992
(6.55 %)
13,291,939
(69.78 %)
14
(0.00 %)
1,732,871
(4.11 %)
644,302
(16.91 %)
248,956
(4.86 %)
30 avocado (Hass MH2022 2023)
GCA_029852735.1
n/a 42,442
(4.89 %)
15,968
(1.61 %)
64,612
(11.72 %)
n/a 39.99
(100.00 %)
0
(0 %)
36
(0.00 %)
482
(100.00 %)
1,348,599
(20.35 %)
427,369
(10.49 %)
4,298,119
(41.03 %)
0
(0 %)
569,002
(6.88 %)
54,543
(5.58 %)
9,989
(0.97 %)
31 Bahia grass (Cayasta R1 2024)
GCA_036689595.1
n/a 52,138
(13.42 %)
17,830
(3.66 %)
74,926
(26.22 %)
n/a 45.79
(99.95 %)
2,801
(0.05 %)
2,801
(0.05 %)
2,811
(99.95 %)
643,354
(26.01 %)
146,179
(4.41 %)
2,284,294
(38.05 %)
29
(0.00 %)
508,348
(10.78 %)
110,855
(27.67 %)
72,647
(11.45 %)
32 Balbis banana (DH-PKW 2019)
GCA_004837865.1
n/a 35,148
(10.52 %)
18,974
(3.45 %)
47,957
(15.55 %)
n/a 38.02
(99.72 %)
0
(0 %)
1,197
(0.27 %)
2,590
(100.00 %)
208,141
(3.88 %)
197,690
(7.95 %)
2,068,575
(42.39 %)
1
(0.00 %)
440,604
(8.80 %)
52,850
(9.12 %)
34,616
(5.51 %)
33 Barbados nut
GCF_014843425.1
33,622
(13.80 %)
n/a 12,687
(4.63 %)
26,511
(14.56 %)
n/a 33.40
(99.60 %)
0
(0 %)
2,151
(0.40 %)
1,232
(100.00 %)
281,490
(24.82 %)
186,260
(5.65 %)
2,028,357
(33.33 %)
0
(0 %)
87,723
(3.18 %)
8,868
(1.38 %)
5,253
(0.75 %)
34 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1
50,906
(14.28 %)
n/a 16,712
(3.68 %)
41,041
(14.51 %)
n/a 33.43
(99.87 %)
0
(0 %)
22
(0.13 %)
42
(100.00 %)
393,909
(27.89 %)
175,427
(3.92 %)
2,532,494
(37.64 %)
0
(0 %)
222,154
(8.04 %)
3,384
(0.27 %)
2,085
(0.17 %)
35 barrel medic (A17 2014)
GCF_000219495.3
48,865
(15.69 %)
n/a 16,549
(3.99 %)
40,316
(15.41 %)
n/a 33.14
(94.48 %)
5,840
(5.53 %)
8,785
(5.53 %)
8,027
(94.47 %)
366,709
(22.34 %)
146,748
(2.80 %)
2,549,499
(32.46 %)
216
(0.08 %)
147,910
(5.33 %)
3,695
(0.65 %)
2,696
(0.57 %)
36 barrel medic (HM340 2017)
GCA_002024945.1
n/a n/a 16,672
(3.96 %)
40,032
(15.19 %)
n/a 33.05
(99.32 %)
0
(0 %)
107
(0.68 %)
909
(100.00 %)
381,065
(23.82 %)
162,402
(3.97 %)
2,490,028
(35.39 %)
0
(0 %)
206,427
(6.09 %)
3,335
(0.34 %)
2,111
(0.22 %)
37 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 alternate hap 2023)
GCA_028538565.1
n/a n/a 15,063
(1.43 %)
65,125
(11.47 %)
n/a 40.34
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
197
(100.00 %)
735,552
(11.30 %)
567,295
(6.87 %)
4,176,675
(45.56 %)
2
(0.00 %)
714,025
(8.90 %)
66,834
(4.90 %)
12,024
(0.59 %)
38 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 primary hap 2023)
GCA_028534965.1
n/a n/a 15,223
(1.43 %)
65,769
(11.33 %)
n/a 40.37
(100.00 %)
0
(0 %)
36
(0.00 %)
303
(100.00 %)
744,623
(11.37 %)
571,691
(7.15 %)
4,217,655
(45.87 %)
2
(0.00 %)
721,040
(8.85 %)
68,566
(4.96 %)
12,157
(0.60 %)
39 Beaked sedge (primary hap 2024)
GCF_964058835.1
45,471
(13.00 %)
n/a 12,576
(2.89 %)
37,235
(14.57 %)
n/a 34.33
(100.00 %)
46
(0.00 %)
46
(0.00 %)
119
(100.00 %)
426,798
(12.51 %)
241,324
(8.02 %)
2,385,410
(42.61 %)
2
(0.00 %)
370,127
(8.90 %)
12,286
(3.13 %)
5,777
(0.51 %)
40 beefsteak plant (Hoko-3 primary hap 2022)
GCA_026008535.1
n/a n/a 28,039
(2.07 %)
120,338
(15.60 %)
n/a 35.28
(100.00 %)
0
(0 %)
23
(0.00 %)
71
(100.00 %)
2,012,805
(68.74 %)
678,680
(5.87 %)
8,191,868
(44.06 %)
0
(0 %)
932,908
(8.21 %)
65,395
(2.45 %)
22,082
(0.87 %)
41 beet (v1 EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1
47,727
(9.45 %)
n/a 11,911
(2.04 %)
50,202
(16.78 %)
n/a 35.86
(99.99 %)
0
(0 %)
323
(0.01 %)
42
(100.00 %)
294,768
(3.41 %)
341,699
(6.22 %)
2,932,896
(35.20 %)
0
(0 %)
362,295
(7.68 %)
25,364
(1.79 %)
12,364
(0.80 %)
42 beet (v2 EL10 2022 USDA)
GCF_026745355.1
45,490
(9.22 %)
n/a 11,850
(2.05 %)
49,071
(15.89 %)
n/a 35.85
(94.03 %)
0
(0 %)
3,200
(5.97 %)
20
(100.00 %)
290,870
(3.40 %)
336,343
(5.76 %)
2,901,079
(33.21 %)
0
(0 %)
391,673
(6.85 %)
25,108
(1.67 %)
12,259
(0.75 %)
43 bell pepper eudicots (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1
70,848
(2.17 %)
n/a 15,922
(0.50 %)
69,601
(2.75 %)
n/a 34.91
(97.27 %)
0
(0 %)
52,577
(2.73 %)
81,202
(100.00 %)
1,192,132
(1.94 %)
1,097,384
(4.12 %)
23,393,622
(47.64 %)
4,061
(0.30 %)
1,575,258
(3.88 %)
19,517
(0.21 %)
5,887
(0.07 %)
44 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 alternate hap 2021)
GCA_019985075.1
n/a n/a 13,887
(2.34 %)
44,507
(14.12 %)
n/a 37.97
(100.00 %)
0
(0 %)
120
(0.00 %)
2,350
(100.00 %)
250,361
(2.10 %)
231,118
(13.56 %)
2,049,366
(44.58 %)
8
(0.00 %)
541,706
(10.86 %)
22,527
(6.34 %)
9,698
(0.77 %)
45 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 primary hap 2022)
GCA_019985065.2
n/a n/a 15,102
(2.62 %)
47,553
(15.64 %)
n/a 38.11
(100.00 %)
0
(0 %)
82
(0.00 %)
272
(100.00 %)
257,066
(2.22 %)
226,514
(14.63 %)
2,470,334
(38.37 %)
0
(0 %)
402,921
(8.45 %)
21,415
(5.59 %)
9,843
(0.72 %)
46 birdsfoot trefoil (B-129 2022)
GCF_012489685.1
57,539
(11.82 %)
n/a 16,919
(2.98 %)
64,687
(19.59 %)
n/a 38.05
(99.97 %)
0
(0 %)
1,625
(0.04 %)
65
(100.00 %)
236,645
(2.13 %)
205,150
(5.19 %)
2,202,942
(41.60 %)
8
(0.00 %)
405,251
(12.94 %)
32,283
(3.44 %)
14,923
(1.36 %)
47 bitter melon
GCF_001995035.1
31,725
(13.80 %)
n/a 12,858
(4.62 %)
30,539
(16.85 %)
n/a 34.58
(92.32 %)
0
(0 %)
109,310
(7.74 %)
1,052
(100.00 %)
162,837
(2.82 %)
89,571
(2.03 %)
1,951,167
(30.96 %)
511
(0.13 %)
50,890
(1.69 %)
14,100
(2.00 %)
10,345
(1.39 %)
48 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 alternate hap 2023)
GCA_028534865.1
n/a n/a 20,077
(4.66 %)
43,061
(17.16 %)
n/a 34.80
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
338
(100.00 %)
267,110
(2.88 %)
173,502
(6.32 %)
2,366,759
(39.61 %)
0
(0 %)
279,214
(8.59 %)
5,093
(4.11 %)
1,729
(0.14 %)
49 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 primary hap 2023)
GCA_028534895.1
n/a n/a 19,804
(4.58 %)
42,642
(17.03 %)
n/a 34.85
(100.00 %)
0
(0 %)
26
(0.00 %)
132
(100.00 %)
265,925
(2.85 %)
174,688
(6.70 %)
2,359,101
(40.07 %)
1
(0.00 %)
298,817
(9.06 %)
4,963
(4.10 %)
1,643
(0.13 %)
50 black cottonwood (v4.1 Nisqually-1 2022)
GCF_000002775.5
59,638
(15.94 %)
n/a 19,969
(4.99 %)
41,581
(16.22 %)
n/a 33.75
(99.85 %)
59
(0.15 %)
59
(0.15 %)
106
(99.85 %)
257,833
(2.91 %)
156,371
(4.50 %)
2,423,627
(36.28 %)
0
(0 %)
202,186
(5.63 %)
3,761
(0.66 %)
1,701
(0.17 %)
51 black gram (Urdbean 2024)
GCA_036885675.1
n/a 39,708
(11.70 %)
16,158
(3.35 %)
47,346
(15.05 %)
n/a 33.60
(99.97 %)
0
(0 %)
282
(0.03 %)
13
(100.00 %)
832,234
(57.53 %)
240,933
(5.84 %)
2,976,104
(38.95 %)
0
(0 %)
357,224
(7.24 %)
16,895
(2.01 %)
7,371
(0.67 %)
52 black tea
GCF_004153795.1
101,253
(3.17 %)
n/a 20,982
(0.66 %)
156,999
(7.69 %)
n/a 37.85
(92.12 %)
0
(0 %)
79,329
(7.89 %)
14,028
(100.00 %)
1,926,995
(3.23 %)
2,024,420
(8.06 %)
17,959,098
(50.75 %)
6
(0.00 %)
3,231,864
(10.09 %)
181,027
(2.79 %)
29,897
(0.36 %)
53 black tea (2026)
GCF_055761805.1
133,207
(3.72 %)
n/a 20,969
(0.61 %)
154,021
(7.73 %)
n/a 38.78
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
577
(100.00 %)
4,008,401
(23.66 %)
2,647,406
(12.78 %)
16,111,872
(60.88 %)
0
(0 %)
2,316,999
(7.50 %)
226,033
(4.42 %)
30,362
(0.34 %)
54 blue lilly pilly tree (NSW1041296 2022)
GCF_021117445.2
46,173
(12.87 %)
n/a 15,187
(3.49 %)
50,585
(20.61 %)
n/a 40.95
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
72
(100.00 %)
494,434
(48.54 %)
220,571
(4.98 %)
1,866,530
(29.09 %)
0
(0 %)
302,589
(7.56 %)
59,325
(10.76 %)
28,053
(3.71 %)
55 bread wheat (Chinese Spring 2020)
GCA_002220415.3
n/a 138,090
(1.09 %)
46,431
(0.31 %)
805,204
(7.93 %)
n/a 46.09
(99.87 %)
0
(0 %)
211,982
(0.14 %)
70,316
(100.00 %)
9,191,325
(44.14 %)
5,086,953
(4.53 %)
282,298
(99.86 %)
316
(0.00 %)
19,425,363
(15.62 %)
3,241,124
(28.06 %)
2,065,976
(13.12 %)
56 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1
221,450
(1.62 %)
n/a n/a 763,380
(8.08 %)
n/a 46.14
(98.27 %)
0
(0 %)
214,799
(1.73 %)
91,589
(100.00 %)
8,660,189
(44.94 %)
4,402,049
(3.94 %)
306,386
(98.27 %)
434
(0.02 %)
17,440,813
(14.18 %)
3,040,030
(27.48 %)
0
(0.00 %)
57 bread wheat (Chinese Spring IWGSC RefSeq v1.0 2018)
GCA_900519105.1
n/a n/a n/a 751,576
(8.03 %)
n/a 46.05
(98.12 %)
693,028
(1.90 %)
693,028
(1.90 %)
693,050
(98.10 %)
8,420,935
(44.23 %)
4,115,828
(3.69 %)
693,050
(98.10 %)
385
(0.01 %)
n/a 3,076,631
(26.41 %)
0
(0.00 %)
58 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1
n/a n/a n/a 773,766
(8.20 %)
n/a 46.05
(100.00 %)
0
(0 %)
1,407
(0.00 %)
3,795
(100.00 %)
8,703,192
(44.57 %)
4,569,103
(5.20 %)
5,202
(100.00 %)
12
(0.00 %)
n/a 3,001,896
(28.00 %)
0
(0.00 %)
59 bread wheat (Kariega 2021)
GCA_910594105.1
n/a n/a 47,400
(0.34 %)
778,134
(8.33 %)
n/a 46.11
(99.87 %)
7,376
(0.13 %)
7,376
(0.13 %)
7,398
(99.87 %)
14,835,099
(85.31 %)
4,570,540
(5.40 %)
7,395
(99.87 %)
41
(0.00 %)
928,524
(0.74 %)
2,994,427
(28.25 %)
606,650
(3.02 %)
60 brown mustard (Varuna 2020)
GCA_015484525.1
n/a n/a 50,825
(7.02 %)
128,133
(24.54 %)
n/a 37.47
(96.71 %)
0
(0 %)
3,070
(3.29 %)
720
(100.00 %)
905,496
(54.34 %)
440,139
(7.46 %)
4,073,637
(39.30 %)
4
(0.00 %)
843,858
(10.72 %)
54,083
(6.71 %)
25,528
(1.30 %)
61 bulbous barley monocots (2017)
GCA_900070015.1
n/a n/a 13,790
(0.81 %)
584,401
(17.92 %)
n/a 44.69
(99.26 %)
714,678
(0.49 %)
714,678
(0.49 %)
3,598,227
(99.51 %)
405,591
(2.31 %)
383,580
(1.94 %)
9,713,864
(28.00 %)
15
(0.00 %)
n/a 392,202
(11.97 %)
257,344
(7.86 %)
62 button wrinklewort R.leptorrhynchoides (AG116_Rl617_1_P2 2025)
GCF_046630445.1
79,194
(1.39 %)
n/a 19,567
(0.31 %)
119,910
(3.26 %)
n/a 33.70
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
549
(100.00 %)
3,727,770
(5.18 %)
3,762,751
(4.98 %)
10,213,591
(82.37 %)
0
(0 %)
n/a 54,254
(0.38 %)
9,950
(0.06 %)
63 cacao
GCF_000208745.1
34,727
(13.67 %)
n/a 14,294
(4.65 %)
29,216
(14.38 %)
n/a 34.09
(94.31 %)
0
(0 %)
11,787
(5.70 %)
431
(100.00 %)
206,049
(15.64 %)
99,229
(2.66 %)
1,933,579
(33.24 %)
175
(0.02 %)
138,327
(4.02 %)
2,964
(0.34 %)
2,376
(0.27 %)
64 California black walnut (Jcal.S.LA.6 alternate hap 2022)
GCA_023349545.1
n/a n/a 18,729
(3.22 %)
57,374
(16.70 %)
n/a 36.81
(100.00 %)
0
(0 %)
78
(0.00 %)
915
(100.00 %)
421,731
(3.42 %)
300,957
(5.54 %)
2,794,242
(34.11 %)
1
(0.00 %)
264,077
(5.33 %)
25,348
(3.39 %)
12,668
(0.88 %)
65 California black walnut (Jcal.S.LA.6 primary hap 2022)
GCA_023349395.1
n/a n/a 18,579
(3.26 %)
56,295
(16.71 %)
n/a 36.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
138
(100.00 %)
414,129
(3.48 %)
293,951
(5.95 %)
3,055,420
(34.96 %)
0
(0 %)
267,374
(5.36 %)
24,749
(4.05 %)
12,091
(0.87 %)
66 California pipevine (CCGP_79_NKW_82.1479hap1 2023)
GCF_029961685.1
43,175
(7.78 %)
n/a 16,377
(2.29 %)
43,559
(11.38 %)
n/a 36.31
(100.00 %)
175
(0.00 %)
175
(0.00 %)
706
(100.00 %)
341,665
(12.46 %)
223,217
(36.36 %)
2,388,236
(58.00 %)
5
(0.00 %)
2,500,132
(20.87 %)
26,535
(3.98 %)
15,554
(1.14 %)
67 California poppy (CP2 primary hap 2024)
GCF_041429995.1
58,896
(17.29 %)
n/a 15,480
(3.56 %)
38,111
(16.12 %)
n/a 37.59
(100.00 %)
38
(0.00 %)
38
(0.00 %)
367
(100.00 %)
291,410
(13.66 %)
250,201
(4.95 %)
1,957,432
(35.13 %)
1
(0.00 %)
270,421
(11.09 %)
12,337
(5.40 %)
4,318
(0.35 %)
68 California scrub oak (Qber.S.LA.60 alternate hap 2023)
GCA_028535905.1
n/a n/a 16,153
(1.86 %)
68,653
(14.03 %)
n/a 35.79
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
807
(100.00 %)
783,798
(4.17 %)
456,025
(10.87 %)
4,951,918
(40.76 %)
2
(0.00 %)
725,680
(8.19 %)
21,783
(2.16 %)
9,330
(0.43 %)
69 California scrub oak (Qber.S.LA.60 primary hap 2023)
GCA_028535815.1
n/a n/a 15,836
(1.90 %)
66,803
(13.99 %)
n/a 35.77
(100.00 %)
0
(0 %)
32
(0.00 %)
283
(100.00 %)
762,029
(4.24 %)
448,099
(10.97 %)
4,784,968
(41.07 %)
0
(0 %)
695,512
(8.10 %)
20,384
(2.28 %)
8,472
(0.39 %)
70 Cannabis sativa ( 2020)
GCA_016165845.1
n/a n/a 18,838
(1.94 %)
71,211
(13.84 %)
n/a 33.78
(99.91 %)
0
(0 %)
8,772
(0.10 %)
147
(100.00 %)
643,488
(3.49 %)
361,843
(3.63 %)
4,074,440
(56.52 %)
36
(0.00 %)
950,351
(13.57 %)
27,745
(1.31 %)
6,939
(0.30 %)
71 Cannabis sativa (Cannatonic 2016)
GCA_001865755.1
n/a n/a 10,725
(1.71 %)
41,537
(11.41 %)
n/a 33.68
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11,110
(100.00 %)
396,112
(4.11 %)
221,932
(3.23 %)
2,389,229
(59.21 %)
0
(0 %)
623,084
(13.50 %)
17,045
(1.23 %)
4,584
(0.35 %)
72 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2
39,696
(6.07 %)
n/a 13,883
(1.80 %)
50,556
(11.19 %)
n/a 33.51
(84.07 %)
843
(15.93 %)
843
(15.93 %)
1,052
(84.07 %)
496,648
(3.63 %)
258,281
(2.28 %)
3,594,433
(47.71 %)
1
(0.00 %)
755,100
(9.25 %)
22,750
(1.69 %)
7,799
(0.33 %)
73 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2
n/a n/a 24,975
(1.79 %)
113,252
(15.69 %)
n/a 34.00
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,372
(100.00 %)
936,351
(4.13 %)
520,230
(3.65 %)
5,183,602
(58.66 %)
0
(0 %)
1,449,890
(14.90 %)
47,327
(1.58 %)
8,921
(0.24 %)
74 Cannabis sativa (Jamaican Lion Mother 2020)
GCA_012923435.1
n/a 27,358
(4.91 %)
15,253
(1.67 %)
62,228
(12.57 %)
n/a 34.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,599
(100.00 %)
595,917
(3.95 %)
335,791
(3.38 %)
3,478,519
(61.18 %)
0
(0 %)
975,634
(15.64 %)
31,738
(1.57 %)
5,423
(0.22 %)
75 Cannabis sativa (JL 2020)
GCA_013030365.1
n/a n/a 15,334
(1.80 %)
60,140
(12.83 %)
n/a 33.79
(99.92 %)
0
(0 %)
2,496
(0.09 %)
483
(100.00 %)
567,458
(3.73 %)
320,455
(3.12 %)
3,403,771
(58.38 %)
0
(0 %)
853,323
(14.39 %)
27,791
(1.48 %)
5,805
(0.25 %)
76 capsicum (Zunla-1 2015 refseq)
GCF_000710875.1
57,769
(2.07 %)
n/a 16,114
(0.55 %)
62,579
(2.93 %)
n/a 34.94
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
107,172
(3.23 %)
108,799
(96.77 %)
968,939
(3.15 %)
948,741
(4.39 %)
21,535,213
(46.15 %)
331
(0.03 %)
1,512,422
(5.05 %)
16,685
(0.21 %)
5,036
(0.06 %)
77 carrot
GCF_001625215.1
51,773
(15.95 %)
n/a 16,649
(3.96 %)
50,187
(20.50 %)
n/a 34.79
(91.77 %)
0
(0 %)
26,112
(8.24 %)
4,826
(100.00 %)
179,630
(2.41 %)
166,060
(4.97 %)
1,981,148
(31.51 %)
1,240
(0.20 %)
243,624
(9.01 %)
8,564
(0.85 %)
5,080
(0.52 %)
78 carrot (DH1 2023)
GCF_001625215.2
60,116
(15.29 %)
n/a 16,679
(3.49 %)
51,607
(18.82 %)
n/a 34.97
(99.99 %)
0
(0 %)
554
(0.01 %)
11
(100.00 %)
195,035
(2.33 %)
186,941
(8.11 %)
2,018,050
(39.61 %)
1
(0.00 %)
377,471
(12.12 %)
10,319
(1.14 %)
5,451
(0.55 %)
79 cassava (60444 2018)
GCA_003957885.1
n/a n/a 27,737
(2.70 %)
78,774
(11.79 %)
n/a 37.13
(76.51 %)
0
(0 %)
36,478
(23.50 %)
4,440
(100.00 %)
584,617
(3.41 %)
554,162
(3.52 %)
4,126,060
(43.14 %)
7
(0.00 %)
948,846
(11.29 %)
77,570
(1.78 %)
7,929
(0.25 %)
80 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2
56,386
(9.38 %)
n/a 18,790
(2.86 %)
49,944
(11.73 %)
n/a 37.52
(99.61 %)
672
(0.39 %)
672
(0.39 %)
758
(99.61 %)
377,964
(3.52 %)
356,023
(4.79 %)
2,560,255
(56.85 %)
5
(0.00 %)
693,966
(16.79 %)
52,506
(2.50 %)
5,169
(0.28 %)
81 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1
33,377
(11.52 %)
n/a 13,874
(4.00 %)
33,656
(13.67 %)
n/a 33.84
(96.11 %)
23,305
(3.90 %)
23,313
(3.90 %)
49,406
(96.10 %)
207,850
(3.52 %)
166,467
(10.85 %)
1,676,921
(43.19 %)
41
(0.02 %)
430,309
(7.84 %)
12,838
(2.54 %)
5,339
(1.40 %)
82 castor bean (wild-type WT05 2021 genbank)
GCA_019578655.1
n/a n/a 13,864
(4.31 %)
29,909
(14.27 %)
n/a 33.05
(99.95 %)
0
(0 %)
331
(0.05 %)
146
(100.00 %)
328,084
(38.04 %)
128,377
(6.36 %)
1,992,583
(39.20 %)
0
(0 %)
259,158
(6.25 %)
7,290
(1.00 %)
2,878
(0.37 %)
83 castor bean (wild-type WT05 2021 refseq)
GCF_019578655.1
39,358
(13.36 %)
n/a 13,841
(4.31 %)
29,805
(14.24 %)
n/a 33.03
(99.95 %)
0
(0 %)
331
(0.05 %)
140
(100.00 %)
205,974
(3.02 %)
128,354
(6.37 %)
1,998,066
(39.24 %)
0
(0 %)
259,147
(6.26 %)
7,216
(0.99 %)
2,812
(0.36 %)
84 celery A.graveolens (Ventura 2021)
GCF_009905375.1
89,565
(2.38 %)
n/a 17,560
(0.48 %)
115,390
(5.30 %)
n/a 35.68
(99.73 %)
0
(0 %)
4,633
(0.27 %)
4,854
(100.00 %)
1,247,170
(1.97 %)
1,423,285
(4.75 %)
11,041,078
(71.09 %)
17
(0.00 %)
3,456,467
(14.13 %)
31,562
(0.31 %)
17,869
(0.17 %)
85 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n 2020)
GCA_011386875.1
n/a n/a 3
(0.11 %)
117
(7.42 %)
n/a 39.35
(99.99 %)
0
(0 %)
4
(0.01 %)
35
(100.00 %)
1,139
(3.04 %)
1,677
(4.92 %)
11,074
(10.60 %)
0
(0 %)
3,401
(11.34 %)
76
(1.07 %)
36
(0.43 %)
86 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n Whitten #5841 2020)
GCA_009866685.1
n/a n/a 6,487
(0.16 %)
114,999
(4.12 %)
n/a 37.82
(62.87 %)
490,371
(37.15 %)
490,371
(37.15 %)
1,116,784
(62.85 %)
692,892
(1.67 %)
790,165
(1.22 %)
18,073,193
(31.20 %)
3,963
(0.05 %)
n/a 24,414
(0.46 %)
13,542
(0.37 %)
87 chia eudicots (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1
53,262
(17.46 %)
n/a 17,642
(4.97 %)
49,474
(23.85 %)
n/a 36.14
(99.81 %)
0
(0 %)
3,756
(0.19 %)
1,556
(100.00 %)
156,083
(2.30 %)
128,904
(3.10 %)
2,112,137
(31.93 %)
71
(0.02 %)
137,558
(5.10 %)
31,157
(5.92 %)
23,418
(3.74 %)
88 chickpea
GCF_000331145.1
42,036
(9.83 %)
n/a 15,685
(3.16 %)
30,411
(8.82 %)
n/a 31.04
(90.95 %)
31,897
(9.07 %)
31,897
(9.07 %)
39,024
(90.93 %)
339,564
(10.51 %)
318,439
(11.48 %)
2,929,750
(43.82 %)
304
(0.08 %)
536,078
(8.47 %)
3,488
(0.28 %)
2,503
(0.18 %)
89 chickpea (CDC Frontier Library 1 2024)
GCF_000331145.2
42,320
(9.82 %)
n/a 15,593
(3.16 %)
30,475
(8.82 %)
n/a 31.03
(91.05 %)
0
(0 %)
33,507
(8.98 %)
6,446
(100.00 %)
308,190
(3.39 %)
318,609
(11.50 %)
2,922,065
(43.86 %)
304
(0.07 %)
547,675
(8.64 %)
3,472
(0.28 %)
2,488
(0.18 %)
90 chicory (Punajuju 2022)
GCA_023525715.1
n/a 53,946
(3.98 %)
16,855
(1.17 %)
92,310
(11.34 %)
n/a 35.50
(99.99 %)
0
(0 %)
510
(0.01 %)
208
(100.00 %)
1,976,706
(34.89 %)
781,413
(8.81 %)
6,080,413
(49.06 %)
0
(0 %)
1,295,125
(15.07 %)
51,571
(2.99 %)
23,431
(0.70 %)
91 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2
66,337
(12.31 %)
n/a 15,432
(2.83 %)
67,569
(21.71 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
53
(100.00 %)
275,878
(2.26 %)
229,333
(3.98 %)
2,244,200
(35.17 %)
0
(0 %)
277,187
(7.19 %)
37,317
(4.17 %)
22,646
(1.74 %)
92 Chinese keys (BR_CEBAR01 2022)
GCA_024364735.1
n/a n/a 23,898
(0.89 %)
138,156
(8.52 %)
n/a 40.10
(96.58 %)
25,154
(3.42 %)
25,154
(3.42 %)
35,781
(96.58 %)
829,613
(1.78 %)
1,793,985
(6.94 %)
8,707,237
(62.53 %)
41
(0.01 %)
2,679,318
(12.88 %)
317,707
(8.50 %)
99,451
(2.46 %)
93 Chinese licorice (Kyoto 2023)
GCA_030159175.1
n/a n/a 16,920
(3.67 %)
44,776
(19.51 %)
n/a 37.70
(100.00 %)
0
(0 %)
20
(0.00 %)
89
(100.00 %)
593,642
(17.68 %)
219,391
(21.45 %)
2,088,553
(50.28 %)
0
(0 %)
363,447
(7.14 %)
15,616
(4.58 %)
8,955
(0.79 %)
94 Chinese licorice (manju 2023)
GCA_027886165.1
n/a n/a 16,877
(4.02 %)
43,800
(15.68 %)
n/a 35.67
(99.96 %)
0
(0 %)
1,409
(0.03 %)
6,467
(100.00 %)
582,162
(19.03 %)
193,998
(5.82 %)
2,492,820
(41.31 %)
2
(0.00 %)
245,273
(4.90 %)
18,054
(4.04 %)
9,752
(0.97 %)
95 Chinese medicinal orchid (niu2020 2021)
GCA_019514585.1
n/a n/a 13,666
(0.97 %)
71,763
(9.04 %)
n/a 35.33
(99.97 %)
0
(0 %)
1,170
(0.03 %)
1,621
(100.00 %)
635,445
(2.92 %)
599,600
(4.44 %)
8,101,700
(44.90 %)
0
(0 %)
922,319
(8.76 %)
75,475
(3.56 %)
40,214
(1.34 %)
96 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1
54,029
(12.78 %)
n/a 22,400
(4.38 %)
57,140
(17.42 %)
n/a 37.29
(97.86 %)
24,384
(2.15 %)
24,384
(2.15 %)
26,566
(97.85 %)
368,808
(18.26 %)
218,013
(4.36 %)
2,456,496
(34.15 %)
105
(0.03 %)
322,129
(7.53 %)
18,367
(1.88 %)
11,851
(1.15 %)
97 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1
62,514
(13.83 %)
n/a 22,289
(4.29 %)
57,502
(17.16 %)
n/a 37.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 452
(100.00 %)
290,077
(2.40 %)
209,363
(3.56 %)
2,519,627
(35.77 %)
0
(0 %)
352,108
(8.82 %)
19,299
(1.84 %)
11,854
(1.08 %)
98 clementine
GCF_000493195.1
36,454
(14.29 %)
n/a 14,126
(4.66 %)
32,820
(18.34 %)
n/a 34.96
(97.94 %)
7,564
(2.07 %)
7,564
(2.07 %)
8,962
(97.93 %)
178,443
(2.76 %)
104,853
(5.57 %)
1,933,079
(33.91 %)
29
(0.01 %)
205,572
(6.24 %)
7,930
(3.80 %)
4,793
(0.70 %)
99 climbing nightshade (primary hap 2022)
GCF_947179165.1
44,646
(5.40 %)
n/a 15,784
(1.70 %)
48,875
(7.66 %)
n/a 35.83
(100.00 %)
0
(0 %)
38
(0.00 %)
105
(100.00 %)
347,467
(1.98 %)
290,488
(4.50 %)
6,293,084
(43.53 %)
0
(0 %)
770,795
(8.60 %)
8,929
(0.83 %)
2,434
(0.09 %)
100 club-mosses (2010)
GCF_000143415.4
49,382
(28.03 %)
n/a 11,312
(4.28 %)
36,277
(36.82 %)
n/a 45.22
(98.15 %)
4,395
(1.86 %)
4,395
(1.86 %)
5,152
(98.14 %)
138,958
(36.90 %)
77,054
(2.71 %)
802,227
(32.19 %)
8
(0.01 %)
146,035
(8.10 %)
34,479
(27.80 %)
23,866
(22.56 %)
101 club-mosses (Aurea 2015)
GCA_001021135.1
n/a n/a 6,316
(4.02 %)
55,013
(41.57 %)
n/a 44.70
(99.81 %)
351
(0.00 %)
351
(0.00 %)
106,265
(100.00 %)
29,218
(1.24 %)
29,377
(1.67 %)
480,195
(13.66 %)
1
(0.00 %)
n/a 19,392
(13.60 %)
14,620
(8.38 %)
102 coastal wild rice monocots (Oco-Bangladesh 2023)
GCA_030770085.1
n/a n/a 22,601
(4.02 %)
78,799
(21.93 %)
n/a 42.06
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
450
(100.00 %)
708,554
(36.63 %)
97,691
(2.08 %)
2,711,269
(26.55 %)
0
(0 %)
96,983
(1.91 %)
87,312
(19.47 %)
76,593
(9.96 %)
103 coffee (Caturra red CCC135-36 2018)
GCA_003713225.1
n/a n/a 23,597
(2.02 %)
86,132
(13.38 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
0
(0 %)
690
(0.21 %)
2,832
(100.00 %)
502,137
(2.12 %)
386,196
(3.95 %)
5,651,566
(41.67 %)
0
(0 %)
1,077,930
(15.36 %)
36,395
(1.62 %)
13,206
(0.75 %)
104 coffee (Red Bourbon ID1545 2023)
GCA_030873655.1
n/a n/a 25,435
(1.84 %)
94,196
(12.02 %)
n/a 37.21
(99.99 %)
44
(0.00 %)
197
(0.01 %)
1,794
(100.00 %)
1,591,482
(68.40 %)
423,470
(5.23 %)
6,621,994
(45.23 %)
0
(0 %)
2,486,578
(18.50 %)
49,710
(2.01 %)
6,187
(0.43 %)
105 coffee C.arabica (CCC135-36 2018)
GCF_003713225.1
80,737
(8.03 %)
n/a 23,574
(2.02 %)
85,662
(13.32 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
0
(0 %)
691
(0.21 %)
2,833
(100.00 %)
501,414
(2.11 %)
386,209
(3.95 %)
5,652,743
(41.66 %)
0
(0 %)
1,077,929
(15.36 %)
36,398
(1.62 %)
13,210
(0.76 %)
106 coffee C.arabica (ET-39 2024)
GCF_036785885.1
119,626
(9.97 %)
n/a 25,877
(2.06 %)
97,184
(14.13 %)
n/a 37.50
(100.00 %)
0
(0 %)
107
(0.00 %)
134
(100.00 %)
542,076
(2.06 %)
445,020
(5.76 %)
5,654,970
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,016,107
(15.27 %)
38,607
(3.43 %)
13,717
(0.69 %)
107 coffee C.eugenioides (CCC68of 2018)
GCF_003713205.1
43,829
(7.69 %)
n/a 14,911
(2.02 %)
57,408
(14.42 %)
n/a 36.89
(97.92 %)
0
(0 %)
3,482
(2.08 %)
3,530
(100.00 %)
312,360
(2.09 %)
234,658
(3.24 %)
3,464,594
(38.91 %)
5
(0.00 %)
573,244
(14.34 %)
21,553
(1.54 %)
8,893
(0.82 %)
108 Commerson's wild potato (CGN18024_1 2023)
GCA_029007595.1
n/a n/a 16,068
(2.21 %)
50,780
(10.49 %)
n/a 34.48
(99.99 %)
0
(0 %)
1
(0.01 %)
639
(100.00 %)
1,250,333
(70.08 %)
249,197
(3.97 %)
5,014,592
(38.92 %)
0
(0 %)
534,534
(6.58 %)
6,970
(0.46 %)
1,331
(0.06 %)
109 common bean
GCF_000499845.1
32,720
(9.56 %)
n/a 16,474
(3.53 %)
45,055
(14.46 %)
n/a 34.96
(90.70 %)
40,860
(9.33 %)
40,860
(9.33 %)
41,568
(90.67 %)
233,709
(2.97 %)
208,045
(3.61 %)
2,886,693
(37.28 %)
77
(0.03 %)
225,586
(4.20 %)
38,054
(5.05 %)
10,671
(0.95 %)
110 common cattail (L0001 2021)
GCF_019914945.1
37,046
(18.67 %)
n/a 14,152
(6.13 %)
28,640
(19.48 %)
n/a 37.74
(99.99 %)
0
(0 %)
66
(0.01 %)
76
(100.00 %)
129,836
(2.97 %)
80,188
(2.65 %)
1,248,248
(29.88 %)
0
(0 %)
79,595
(2.91 %)
22,935
(5.83 %)
12,606
(3.10 %)
111 common fig (Dottato GU2019 2019)
GCA_009761775.1
n/a n/a 14,992
(4.28 %)
36,350
(16.84 %)
n/a 34.41
(99.99 %)
394
(0.01 %)
394
(0.01 %)
905
(99.99 %)
475,247
(5.76 %)
230,646
(4.36 %)
2,425,030
(37.74 %)
0
(0 %)
187,932
(6.92 %)
18,611
(3.41 %)
14,658
(2.57 %)
112 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1
49,622
(12.72 %)
n/a 14,929
(3.58 %)
32,981
(12.20 %)
n/a 33.07
(99.99 %)
0
(0 %)
381
(0.01 %)
538
(100.00 %)
525,520
(5.43 %)
225,151
(3.91 %)
2,463,587
(42.86 %)
0
(0 %)
240,039
(5.90 %)
13,018
(1.79 %)
4,271
(0.48 %)
113 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1
49,976
(13.24 %)
n/a 16,949
(3.79 %)
38,488
(13.47 %)
n/a 33.40
(95.35 %)
24,158
(4.67 %)
24,158
(4.67 %)
28,947
(95.33 %)
525,525
(5.37 %)
246,475
(5.25 %)
2,603,240
(38.46 %)
78
(0.04 %)
256,779
(9.85 %)
13,597
(2.11 %)
5,462
(1.04 %)
114 common jujube (Dongzao 2023)
GCF_031755915.1
51,464
(13.54 %)
n/a 14,443
(3.56 %)
31,633
(12.06 %)
n/a 33.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 14
(100.00 %)
516,010
(5.54 %)
234,395
(5.05 %)
2,319,259
(43.64 %)
0
(0 %)
252,407
(6.74 %)
12,926
(2.66 %)
3,943
(0.43 %)
115 common jujube (Junzao 2020)
GCA_001835785.2
n/a n/a 14,443
(3.88 %)
30,773
(12.63 %)
n/a 32.95
(99.91 %)
108
(0.00 %)
222
(0.09 %)
155
(100.00 %)
478,087
(5.53 %)
206,042
(4.15 %)
2,222,289
(41.43 %)
0
(0 %)
200,514
(5.62 %)
11,860
(1.82 %)
3,925
(0.47 %)
116 common reed (primary hap 2023)
GCF_958298935.1
65,051
(8.85 %)
n/a 26,142
(3.49 %)
114,639
(23.87 %)
n/a 44.17
(100.00 %)
0
(0 %)
59
(0.00 %)
37
(100.00 %)
243,799
(1.41 %)
237,530
(2.79 %)
4,477,357
(31.45 %)
2
(0.00 %)
226,760
(3.23 %)
154,087
(19.32 %)
110,558
(9.31 %)
117 common sunflower
GCF_002127325.2
133,319
(3.74 %)
n/a 19,514
(0.59 %)
166,187
(9.16 %)
n/a 38.59
(97.94 %)
0
(0 %)
2,384
(2.06 %)
334
(100.00 %)
1,263,836
(2.20 %)
1,549,598
(4.15 %)
12,728,097
(58.39 %)
0
(0 %)
3,080,461
(20.20 %)
170,287
(2.39 %)
34,569
(0.41 %)
118 common tobacco (Basma Xanthi 2014)
GCA_000715095.1
n/a n/a 29,103
(0.75 %)
200,375
(6.85 %)
n/a 38.98
(95.11 %)
468,375
(4.88 %)
468,375
(4.88 %)
1,111,920
(95.12 %)
1,199,550
(3.27 %)
1,359,905
(4.81 %)
24,590,709
(50.95 %)
400
(0.01 %)
n/a 205,873
(1.79 %)
31,335
(0.28 %)
119 common tobacco (K326 2023 genbank)
GCA_000715075.2
n/a n/a 31,039
(0.78 %)
176,804
(6.40 %)
n/a 39.12
(100.00 %)
0
(0 %)
710
(0.00 %)
699
(100.00 %)
4,626,207
(84.12 %)
1,502,920
(6.71 %)
24,314,611
(56.69 %)
8
(0.00 %)
5,064,377
(12.27 %)
225,794
(1.93 %)
9,832
(0.10 %)
120 common tobacco (K326 2023 refseq)
GCF_000715075.1
116,106
(3.08 %)
n/a 31,018
(0.77 %)
176,913
(6.40 %)
n/a 39.12
(100.00 %)
0
(0 %)
712
(0.00 %)
701
(100.00 %)
1,205,229
(1.45 %)
1,502,955
(6.71 %)
24,316,152
(56.68 %)
8
(0.00 %)
5,064,388
(12.27 %)
225,863
(1.93 %)
39,109
(0.34 %)
121 common tobacco (TN90 2014)
GCF_000715135.1
100,875
(3.08 %)
n/a 29,968
(0.80 %)
184,998
(7.05 %)
n/a 38.95
(97.11 %)
124,354
(2.89 %)
292,325
(2.90 %)
292,601
(97.11 %)
1,134,202
(3.09 %)
1,268,208
(4.45 %)
24,013,710
(52.08 %)
127
(0.00 %)
2,554,031
(5.85 %)
204,914
(1.84 %)
31,402
(0.30 %)
122 common vetch (South Australia 2022)
GCA_021764765.1
n/a n/a 17,420
(0.99 %)
77,140
(6.43 %)
n/a 35.62
(99.97 %)
0
(0 %)
5,823
(0.04 %)
18
(100.00 %)
708,538
(2.24 %)
719,430
(5.37 %)
8,370,861
(57.87 %)
1
(0.00 %)
1,915,570
(13.64 %)
32,513
(0.96 %)
11,904
(0.30 %)
123 cork oak (v2 HL8 2018)
GCF_002906115.2
53,587
(7.04 %)
n/a 17,804
(1.85 %)
77,741
(13.65 %)
n/a 35.35
(97.95 %)
0
(0 %)
25,649
(2.05 %)
22,642
(100.00 %)
860,049
(3.78 %)
485,854
(6.14 %)
5,989,180
(36.35 %)
218
(0.02 %)
685,954
(9.84 %)
20,674
(1.12 %)
10,386
(0.56 %)
124 cork oak (v3 HL8 2024)
GCF_002906115.3
56,406
(8.63 %)
n/a 16,303
(2.05 %)
63,990
(13.73 %)
n/a 34.91
(95.70 %)
26,066
(4.30 %)
26,066
(4.30 %)
28,407
(95.70 %)
743,470
(3.99 %)
393,077
(5.53 %)
4,897,193
(34.87 %)
234
(0.08 %)
535,347
(10.58 %)
16,140
(0.90 %)
8,912
(0.49 %)
125 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1
112,410
(5.51 %)
n/a 35,047
(1.61 %)
101,814
(6.75 %)
n/a 34.45
(97.16 %)
48,736
(2.84 %)
48,742
(2.84 %)
57,884
(97.16 %)
829,774
(2.69 %)
808,839
(3.64 %)
12,556,104
(52.01 %)
202
(0.01 %)
1,489,112
(8.44 %)
31,946
(0.61 %)
9,983
(0.20 %)
126 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1
154,134
(6.02 %)
n/a 37,839
(1.61 %)
107,764
(6.56 %)
n/a 34.36
(99.87 %)
5,708
(0.13 %)
5,708
(0.13 %)
6,735
(99.87 %)
996,701
(2.36 %)
903,817
(3.56 %)
13,123,355
(54.75 %)
6
(0.00 %)
2,053,660
(12.23 %)
35,220
(0.59 %)
11,349
(0.19 %)
127 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1
72,590
(8.99 %)
n/a 20,368
(2.64 %)
86,941
(18.36 %)
n/a 33.22
(98.25 %)
19,717
(1.76 %)
19,717
(1.76 %)
20,751
(98.24 %)
367,610
(3.53 %)
300,200
(3.32 %)
5,199,574
(40.83 %)
36
(0.01 %)
386,729
(4.92 %)
10,926
(0.55 %)
5,495
(0.26 %)
128 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2
48,588
(10.55 %)
n/a 16,925
(3.30 %)
44,689
(13.01 %)
n/a 32.95
(99.48 %)
0
(0 %)
68
(0.52 %)
676
(100.00 %)
344,688
(3.92 %)
283,941
(8.14 %)
3,091,888
(41.66 %)
1
(0.00 %)
420,714
(7.57 %)
24,507
(2.34 %)
11,817
(1.10 %)
129 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1
49,636
(19.79 %)
n/a 18,863
(6.83 %)
34,588
(19.24 %)
n/a 36.43
(97.43 %)
0
(0 %)
13,813
(2.58 %)
3,500
(100.00 %)
181,838
(3.12 %)
140,936
(7.42 %)
1,550,544
(33.30 %)
519
(0.13 %)
210,153
(7.41 %)
13,714
(2.69 %)
9,612
(1.52 %)
130 cucumber
GCF_000004075.3
37,079
(18.45 %)
n/a 13,349
(5.61 %)
23,889
(15.73 %)
n/a 32.84
(99.98 %)
0
(0 %)
89
(0.02 %)
88
(100.00 %)
158,454
(3.72 %)
77,247
(3.20 %)
1,739,467
(33.72 %)
0
(0 %)
67,519
(3.18 %)
5,730
(1.35 %)
4,446
(0.78 %)
131 cultivated vanilla (Daphna alternate hap 2020)
GCA_016413885.1
n/a 29,180
(3.86 %)
14,128
(1.63 %)
42,460
(7.33 %)
n/a 30.78
(99.98 %)
0
(0 %)
2,018
(0.02 %)
668
(100.00 %)
377,357
(3.69 %)
183,159
(2.82 %)
5,560,199
(36.58 %)
0
(0 %)
236,375
(2.51 %)
30,878
(2.75 %)
24,670
(2.23 %)
132 cultivated vanilla (Daphna primary hap 2020)
GCA_016413895.1
n/a 29,167
(3.89 %)
13,933
(1.63 %)
40,035
(6.93 %)
n/a 30.80
(99.98 %)
0
(0 %)
1,977
(0.02 %)
667
(100.00 %)
373,612
(3.67 %)
181,531
(2.84 %)
5,483,268
(36.45 %)
0
(0 %)
238,255
(2.57 %)
30,829
(2.75 %)
24,652
(2.23 %)
133 currant tomato (LA2093 2020)
GCA_014964335.1
n/a n/a 15,541
(2.01 %)
39,725
(7.40 %)
n/a 34.48
(99.94 %)
0
(0 %)
373
(0.06 %)
127
(100.00 %)
369,651
(3.79 %)
256,146
(4.80 %)
5,523,685
(41.09 %)
1
(0.00 %)
667,017
(7.35 %)
32,203
(2.29 %)
2,428
(0.11 %)
134 damask rose (2016)
GCA_001662545.1
n/a n/a 16,060
(1.87 %)
117,610
(18.87 %)
n/a 38.73
(97.06 %)
101,982
(2.91 %)
101,982
(2.91 %)
409,854
(97.09 %)
329,911
(1.95 %)
258,478
(2.82 %)
3,747,902
(31.42 %)
54
(0.00 %)
n/a 48,987
(3.05 %)
30,432
(1.60 %)
135 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1
61,678
(8.40 %)
n/a 18,582
(2.20 %)
70,121
(14.29 %)
n/a 40.29
(100.00 %)
0
(0 %)
317
(0.00 %)
2,391
(100.00 %)
431,923
(8.92 %)
371,389
(4.19 %)
2,721,501
(44.16 %)
0
(0 %)
589,858
(11.41 %)
89,481
(12.47 %)
43,324
(3.17 %)
136 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1
48,949
(10.55 %)
n/a 16,697
(2.99 %)
64,523
(16.24 %)
n/a 39.33
(91.22 %)
63,065
(8.79 %)
64,723
(8.79 %)
143,382
(91.21 %)
284,003
(7.58 %)
185,641
(2.23 %)
2,574,645
(27.52 %)
1,389
(0.09 %)
103,949
(2.07 %)
62,332
(7.21 %)
34,074
(3.23 %)
137 date-plum (Yz01 2020)
GCF_014633365.1
48,290
(8.05 %)
n/a 15,110
(2.28 %)
57,536
(14.48 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
0
(0 %)
606
(0.01 %)
43
(100.00 %)
445,970
(3.39 %)
319,468
(5.39 %)
3,687,072
(36.31 %)
0
(0 %)
392,987
(6.21 %)
41,402
(3.02 %)
25,722
(1.62 %)
138 desmid P.margaritaceum (SKD-8 2022)
GCA_023375785.1
n/a n/a 6,643
(0.13 %)
342,902
(20.03 %)
n/a 51.10
(86.42 %)
704,233
(13.62 %)
704,233
(13.62 %)
1,037,019
(86.38 %)
4,516,716
(76.58 %)
2,687,996
(21.25 %)
15,150,374
(48.80 %)
39,894
(0.65 %)
n/a 680,776
(31.03 %)
201,505
(3.32 %)
139 dessert banana (baxijiao 2024)
GCF_036884655.1
193,799
(12.81 %)
n/a 52,060
(3.07 %)
144,859
(15.37 %)
n/a 39.78
(99.99 %)
0
(0 %)
219
(0.01 %)
1,085
(100.00 %)
713,274
(2.40 %)
840,280
(6.39 %)
4,419,734
(51.60 %)
2
(0.00 %)
1,727,746
(13.45 %)
203,906
(13.78 %)
99,332
(4.84 %)
140 domesticated barley (Golden Promise 2019)
GCA_902500625.1
n/a n/a 17,386
(0.43 %)
252,520
(9.04 %)
n/a 44.38
(97.83 %)
0
(0 %)
621,008
(2.23 %)
8
(100.00 %)
3,098,901
(53.34 %)
2,055,561
(5.88 %)
14,404,046
(70.52 %)
48,027
(0.70 %)
n/a 706,795
(16.04 %)
267,631
(4.90 %)
141 domesticated barley (H.vulgare 2021 refseq)
GCF_904849725.1
63,364
(1.67 %)
n/a 17,849
(0.43 %)
260,921
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
0
(0 %)
162
(0.03 %)
291
(100.00 %)
2,720,197
(55.13 %)
1,726,335
(5.40 %)
14,010,390
(72.58 %)
0
(0 %)
5,823,234
(14.08 %)
732,834
(17.24 %)
271,782
(4.92 %)
142 durian
GCF_002303985.1
68,467
(10.35 %)
n/a 24,627
(3.34 %)
48,130
(9.41 %)
n/a 32.64
(99.58 %)
0
(0 %)
3,044
(0.43 %)
677
(100.00 %)
490,482
(3.80 %)
509,842
(12.92 %)
4,397,155
(48.22 %)
4
(0.00 %)
1,062,720
(8.92 %)
56,957
(6.23 %)
3,948
(0.21 %)
143 durum wheat (2019)
GCA_900231445.1
n/a 190,472
(0.87 %)
32,523
(0.34 %)
530,488
(8.17 %)
n/a 46.01
(98.73 %)
330,230
(1.28 %)
330,230
(1.28 %)
330,244
(98.72 %)
2,723,974
(3.46 %)
2,746,444
(3.02 %)
330,244
(98.72 %)
106
(0.00 %)
n/a 2,108,395
(25.96 %)
369,452
(2.43 %)
144 durum wheat (PI 192051 2025)
GCA_052818315.1
n/a n/a 32,793
(0.32 %)
569,058
(8.46 %)
n/a 46.13
(100.00 %)
0
(0 %)
801
(0.00 %)
856
(100.00 %)
2,706,273
(1.65 %)
3,201,406
(5.03 %)
30,830,875
(76.90 %)
1
(0.00 %)
n/a 2,152,748
(27.40 %)
567,944
(4.04 %)
145 eggplant (2014)
GCA_000787875.1
n/a n/a 15,481
(1.92 %)
48,974
(7.98 %)
n/a 35.72
(95.30 %)
109,175
(4.75 %)
118,249
(4.75 %)
143,048
(95.25 %)
317,711
(2.21 %)
307,772
(4.55 %)
6,006,653
(38.61 %)
139
(0.00 %)
405,018
(4.41 %)
7,570
(0.50 %)
3,023
(0.14 %)
146 eightpetal mountain-avens (primary hap 2024)
GCF_963921425.1
35,086
(18.38 %)
n/a 14,466
(6.17 %)
30,987
(22.21 %)
n/a 36.61
(99.96 %)
438
(0.04 %)
438
(0.04 %)
463
(99.96 %)
400,187
(24.04 %)
123,284
(3.99 %)
1,413,057
(28.87 %)
7
(0.00 %)
119,932
(6.76 %)
11,924
(3.23 %)
7,389
(1.36 %)
147 elephant grass (2022)
GCA_022644695.1
n/a n/a 34,754
(1.95 %)
231,748
(22.13 %)
n/a 46.97
(99.99 %)
1,574
(0.01 %)
1,574
(0.01 %)
1,588
(99.99 %)
587,262
(1.41 %)
551,392
(2.62 %)
9,678,348
(46.32 %)
1
(0.00 %)
1,420,820
(7.19 %)
398,884
(36.81 %)
249,949
(10.95 %)
148 emerald green okra A.esculentus (Green Star 2024)
GCA_035048815.1
n/a n/a 57,092
(4.66 %)
139,785
(17.31 %)
n/a 33.78
(99.95 %)
104
(0.05 %)
104
(0.05 %)
182
(99.95 %)
665,897
(3.33 %)
561,368
(7.98 %)
6,809,885
(45.67 %)
6
(0.00 %)
1,164,866
(8.06 %)
31,360
(1.27 %)
20,601
(0.67 %)
149 English oak (primary hap 2022)
GCF_932294415.1
69,211
(8.60 %)
n/a 15,792
(1.92 %)
66,872
(14.31 %)
n/a 35.68
(100.00 %)
0
(0 %)
119
(0.00 %)
96
(100.00 %)
773,652
(4.18 %)
429,695
(8.87 %)
4,823,216
(39.65 %)
0
(0 %)
671,979
(7.81 %)
21,654
(2.15 %)
8,337
(0.38 %)
150 English walnut
GCF_001411555.2
52,962
(10.18 %)
n/a 18,927
(3.19 %)
60,210
(17.37 %)
n/a 36.21
(99.89 %)
0
(0 %)
1,051
(0.11 %)
24,757
(100.00 %)
434,989
(3.86 %)
303,673
(3.70 %)
3,318,114
(33.94 %)
1
(0.00 %)
243,788
(4.94 %)
24,028
(1.83 %)
12,484
(0.84 %)
151 eudicot A.cruentus (Arusha 2021)
GCA_019425755.1
n/a n/a 12,903
(3.20 %)
33,445
(14.99 %)
n/a 33.08
(99.96 %)
0
(0 %)
983
(0.04 %)
625
(100.00 %)
891,822
(54.95 %)
181,416
(3.89 %)
2,376,097
(36.79 %)
0
(0 %)
145,312
(3.92 %)
4,821
(0.53 %)
664
(0.09 %)
152 eudicot A.glutinosa (primary hap 2023)
GCF_958979055.1
42,218
(10.92 %)
n/a 14,784
(3.18 %)
46,293
(16.46 %)
n/a 36.73
(100.00 %)
0
(0 %)
96
(0.00 %)
15
(100.00 %)
433,802
(3.92 %)
270,411
(4.15 %)
2,634,547
(36.26 %)
5
(0.00 %)
320,176
(6.73 %)
29,535
(3.72 %)
14,829
(1.30 %)
153 eudicot A.graveolens (Ventura 2020)
GCA_009905375.1
n/a 1,660
(0.06 %)
17,520
(0.48 %)
115,295
(5.30 %)
n/a 35.68
(99.73 %)
0
(0 %)
4,633
(0.27 %)
4,852
(100.00 %)
1,247,334
(1.96 %)
1,423,238
(4.75 %)
11,040,179
(71.10 %)
17
(0.00 %)
4,171,101
(17.32 %)
31,499
(0.31 %)
17,805
(0.17 %)
154 eudicot C.lanceoleosa (SQ_2022a 2022)
GCA_025200525.1
n/a 54,167
(1.84 %)
21,858
(0.67 %)
153,069
(7.18 %)
n/a 37.63
(99.99 %)
0
(0 %)
2,949
(0.01 %)
790
(100.00 %)
4,031,259
(23.47 %)
2,174,993
(6.70 %)
18,920,250
(54.60 %)
1
(0.00 %)
2,248,121
(7.14 %)
200,005
(3.83 %)
35,786
(0.43 %)
155 eudicot C.lavandulifolium (G1 2022)
GCA_022545495.1
n/a n/a 18,954
(0.61 %)
117,628
(6.04 %)
n/a 36.02
(99.96 %)
0
(0 %)
10,291
(0.04 %)
178
(100.00 %)
2,596,263
(19.70 %)
1,222,904
(3.44 %)
12,327,164
(55.80 %)
1
(0.00 %)
2,936,447
(12.99 %)
67,370
(0.88 %)
12,524
(0.17 %)
156 eudicot C.sativa (Pink pepper KNU-18-1 2023)
GCF_029168945.1
47,822
(7.37 %)
n/a 14,132
(1.76 %)
52,606
(11.89 %)
n/a 34.09
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
18
(100.00 %)
490,095
(3.26 %)
291,432
(3.68 %)
3,197,241
(60.23 %)
0
(0 %)
860,217
(15.10 %)
29,385
(2.13 %)
5,327
(0.25 %)
157 eudicot C.seticuspe (Gojo-0 2021)
GCA_019973895.1
n/a n/a 17,958
(0.52 %)
141,880
(7.25 %)
n/a 36.23
(98.03 %)
37,176
(1.97 %)
37,176
(1.97 %)
45,671
(98.03 %)
3,118,877
(21.04 %)
1,512,311
(3.93 %)
10,481,296
(59.70 %)
29
(0.00 %)
2,398,260
(14.63 %)
63,123
(0.67 %)
7,667
(0.08 %)
158 eudicot D.spatulata (IRGN DVMQU6P362 2024)
GCA_035668315.1
n/a n/a 16,707
(3.49 %)
62,287
(20.90 %)
n/a 37.76
(99.96 %)
1,083
(0.03 %)
1,083
(0.03 %)
24,058
(99.97 %)
274,473
(12.37 %)
110,623
(2.62 %)
2,103,310
(28.32 %)
44
(0.00 %)
51,737
(1.03 %)
22,076
(2.40 %)
14,298
(1.43 %)
159 eudicot E.lathyris (primary hap 2023)
GCF_963576675.1
54,052
(4.78 %)
n/a 14,372
(1.33 %)
80,776
(14.35 %)
n/a 36.88
(100.00 %)
24
(0.00 %)
24
(0.00 %)
57
(100.00 %)
496,928
(2.45 %)
491,703
(4.75 %)
4,850,176
(50.53 %)
0
(0 %)
930,309
(12.08 %)
57,897
(3.26 %)
16,706
(0.73 %)
160 eudicot E.russellianum (2023)
GCA_036186865.1
n/a n/a 18,823
(1.28 %)
96,845
(13.58 %)
n/a 37.91
(99.98 %)
0
(0 %)
26,521
(0.02 %)
100
(100.00 %)
1,526,493
(77.75 %)
539,134
(3.70 %)
6,307,362
(47.97 %)
3,016
(0.08 %)
1,490,109
(16.56 %)
31,022
(0.81 %)
3,764
(0.11 %)
161 eudicot G.bilobum (WA Gb01-03AN 2023)
GCF_033153095.1
45,049
(8.43 %)
n/a 18,010
(3.03 %)
54,840
(15.32 %)
n/a 35.23
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
5,089
(100.00 %)
397,210
(3.11 %)
254,173
(4.10 %)
3,228,435
(42.44 %)
0
(0 %)
390,432
(7.07 %)
15,343
(0.97 %)
7,316
(0.48 %)
162 eudicot H.pumila (YLH828 2023)
GCF_033568475.1
51,602
(5.64 %)
n/a 14,506
(1.52 %)
55,054
(9.40 %)
n/a 37.18
(100.00 %)
0
(0 %)
411
(0.00 %)
133
(100.00 %)
397,610
(2.13 %)
326,774
(3.20 %)
4,120,854
(57.35 %)
2
(0.00 %)
717,826
(10.89 %)
63,233
(2.52 %)
11,505
(0.54 %)
163 eudicot M.micrantha (NLD-2019 2019)
GCA_009363875.1
n/a 46,351
(3.22 %)
19,940
(1.00 %)
96,066
(8.14 %)
n/a 36.20
(99.99 %)
0
(0 %)
1,599
(0.01 %)
2,815
(100.00 %)
908,702
(2.54 %)
980,385
(4.65 %)
9,286,677
(54.99 %)
0
(0 %)
1,406,907
(15.84 %)
89,410
(1.77 %)
30,371
(0.58 %)
164 eudicot N.benthamiana (KLAB 2023)
GCA_034376525.1
n/a n/a 27,772
(0.99 %)
128,971
(6.28 %)
n/a 37.84
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
667
(100.00 %)
4,744,181
(80.09 %)
1,261,453
(5.53 %)
18,063,531
(49.81 %)
0
(0 %)
1,987,721
(7.10 %)
86,419
(1.62 %)
5,110
(0.06 %)
165 eudicot N.caerulescens (Cira 2024)
GCA_046127275.1
n/a n/a 20,205
(8.11 %)
49,304
(30.44 %)
n/a 39.42
(99.99 %)
4
(0.00 %)
41
(0.01 %)
1,181
(100.00 %)
413,962
(43.41 %)
125,005
(11.92 %)
1,047,909
(36.93 %)
0
(0 %)
211,265
(12.17 %)
24,840
(5.52 %)
15,334
(2.33 %)
166 eudicot P.eburnea (SZY01 2022)
GCF_022965805.1
61,645
(7.70 %)
n/a 19,490
(2.24 %)
62,769
(12.34 %)
n/a 37.11
(99.83 %)
0
(0 %)
1,024
(0.17 %)
1,225
(100.00 %)
314,817
(1.84 %)
291,276
(6.35 %)
3,964,714
(53.25 %)
1
(0.00 %)
706,428
(13.41 %)
61,424
(2.69 %)
11,909
(0.61 %)
167 eudicot P.frutescens var. frutescens (PF040 2021)
GCA_019511825.2
n/a 38,941
(3.97 %)
28,418
(2.15 %)
120,101
(15.79 %)
n/a 35.13
(99.99 %)
0
(0 %)
763
(0.01 %)
1,465
(100.00 %)
1,497,762
(21.02 %)
662,726
(4.46 %)
8,218,287
(43.32 %)
1
(0.00 %)
863,856
(8.05 %)
65,299
(2.16 %)
38,244
(1.31 %)
168 eudicot P.huaijiensis (GDHJ02 2020)
GCF_012295235.1
55,830
(12.29 %)
n/a 19,054
(3.86 %)
48,657
(15.27 %)
n/a 35.65
(97.46 %)
0
(0 %)
31,613
(2.54 %)
21,121
(100.00 %)
195,798
(1.99 %)
128,140
(2.47 %)
2,568,483
(41.18 %)
392
(0.07 %)
283,219
(7.80 %)
16,399
(1.28 %)
8,272
(0.72 %)
169 eudicot P.nigra (primary hap 2023)
GCF_951802175.1
55,369
(16.07 %)
n/a 19,591
(4.65 %)
41,748
(16.14 %)
n/a 34.95
(99.99 %)
0
(0 %)
277
(0.01 %)
21
(100.00 %)
256,070
(2.83 %)
178,940
(8.44 %)
2,317,187
(40.87 %)
5
(0.00 %)
309,693
(9.69 %)
3,317
(6.62 %)
1,591
(0.12 %)
170 eudicot P.vulgaris (G19833 2024)
GCF_000499845.2
48,620
(10.29 %)
n/a 16,779
(3.20 %)
47,438
(13.87 %)
n/a 35.62
(98.95 %)
566
(1.05 %)
566
(1.05 %)
1,034
(98.95 %)
245,672
(2.41 %)
239,601
(4.78 %)
2,887,505
(44.41 %)
0
(0 %)
323,051
(6.68 %)
44,689
(7.20 %)
11,348
(1.02 %)
171 eudicot R.rugosa (primary hap 2023)
GCF_958449725.1
62,563
(15.19 %)
n/a 15,236
(3.45 %)
60,387
(23.53 %)
n/a 39.30
(99.95 %)
0
(0 %)
1,014
(0.05 %)
77
(100.00 %)
226,730
(2.23 %)
196,099
(4.12 %)
1,632,269
(33.79 %)
8
(0.00 %)
202,155
(7.85 %)
38,448
(5.69 %)
22,749
(2.22 %)
172 eudicot S.americanum (SP2273 SP2273 2023)
GCA_030463325.1
n/a n/a 15,767
(1.56 %)
57,615
(9.26 %)
n/a 36.15
(100.00 %)
0
(0 %)
214
(0.00 %)
90
(100.00 %)
2,179,570
(59.21 %)
301,263
(3.51 %)
5,651,338
(51.90 %)
0
(0 %)
1,489,004
(15.63 %)
28,868
(1.00 %)
8,877
(0.27 %)
173 eudicot S.americanum (SP2275 SP2275 2023)
GCA_030463385.1
n/a n/a 15,677
(1.56 %)
57,771
(9.32 %)
n/a 36.18
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 540
(100.00 %)
2,161,174
(59.26 %)
298,020
(3.34 %)
5,624,901
(52.02 %)
0
(0 %)
1,470,347
(15.61 %)
29,520
(1.04 %)
9,472
(0.30 %)
174 eudicot S.miltiorrhiza (Shanhuang shh 2023)
GCA_028751815.1
n/a n/a 15,144
(2.60 %)
67,052
(21.48 %)
n/a 37.46
(99.58 %)
0
(0 %)
695
(0.42 %)
171
(100.00 %)
614,263
(17.32 %)
364,006
(5.05 %)
2,679,398
(42.13 %)
0
(0 %)
345,733
(12.00 %)
64,170
(6.16 %)
38,463
(3.35 %)
175 eudicot T.arvense (2022)
GCA_911865555.2
n/a 26,392
(7.18 %)
23,487
(5.55 %)
54,244
(16.93 %)
n/a 38.39
(100.00 %)
0
(0 %)
24
(0.00 %)
964
(100.00 %)
204,363
(1.86 %)
150,149
(5.58 %)
2,245,900
(50.03 %)
0
(0 %)
610,766
(11.85 %)
35,971
(3.77 %)
15,237
(1.56 %)
176 eudicot V.riparia x Vitis rupestris (2022)
GCA_946000675.1
n/a n/a 29,137
(2.81 %)
89,605
(14.72 %)
n/a 35.15
(99.99 %)
102
(0.01 %)
102
(0.01 %)
596
(99.99 %)
664,293
(2.97 %)
503,960
(9.26 %)
5,715,446
(39.21 %)
0
(0 %)
820,251
(7.58 %)
22,264
(1.77 %)
13,165
(0.52 %)
177 eudicot V.rotundifolia (Noble 2022)
GCA_022557335.1
n/a n/a 13,992
(3.39 %)
38,479
(14.93 %)
n/a 33.54
(99.82 %)
17,084
(0.19 %)
17,084
(0.19 %)
17,104
(99.81 %)
696,697
(51.55 %)
178,090
(4.22 %)
2,480,890
(32.65 %)
6,786
(0.70 %)
226,981
(6.44 %)
6,497
(0.70 %)
4,345
(0.46 %)
178 Euphrates poplar (v2 2014)
GCF_000495115.2
56,366
(12.92 %)
n/a 20,853
(4.29 %)
41,483
(12.40 %)
n/a 32.05
(95.31 %)
22,764
(4.70 %)
22,764
(4.70 %)
32,266
(95.30 %)
357,310
(3.64 %)
246,638
(4.06 %)
2,660,781
(43.22 %)
21
(0.01 %)
283,033
(6.42 %)
2,691
(0.38 %)
1,682
(0.12 %)
179 European chestnut (Marrone di Chiusa Pesio 2024)
GCF_040712315.1
49,645
(7.87 %)
n/a 15,653
(2.10 %)
61,041
(13.43 %)
n/a 35.42
(100.00 %)
0
(0 %)
65
(0.00 %)
13
(100.00 %)
595,120
(3.41 %)
355,816
(4.98 %)
4,680,964
(38.07 %)
0
(0 %)
480,528
(5.67 %)
20,075
(1.41 %)
7,608
(0.40 %)
180 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2
77,800
(12.38 %)
n/a 22,539
(3.42 %)
67,761
(16.26 %)
n/a 38.07
(99.99 %)
0
(0 %)
101
(0.01 %)
34
(100.00 %)
309,302
(2.18 %)
331,724
(5.06 %)
2,996,468
(41.19 %)
1
(0.00 %)
501,459
(8.86 %)
25,597
(2.08 %)
15,213
(1.03 %)
181 European crab apple (primary hap 2022)
GCF_916048215.3
66,006
(11.78 %)
n/a 21,790
(3.28 %)
67,661
(16.24 %)
n/a 38.06
(99.99 %)
0
(0 %)
101
(0.01 %)
32
(100.00 %)
943,453
(63.51 %)
331,624
(5.07 %)
2,996,821
(41.23 %)
1
(0.00 %)
501,452
(8.86 %)
25,540
(2.07 %)
12,635
(0.87 %)
182 European elder (primary hap 2023)
GCA_949130495.1
n/a n/a 18,703
(0.14 %)
222,632
(2.18 %)
n/a 37.48
(100.00 %)
0
(0 %)
1,110
(0.00 %)
666
(100.00 %)
9,311,611
(14.46 %)
5,094,919
(7.65 %)
62,491,167
(63.34 %)
25
(0.00 %)
15,426,468
(12.38 %)
327,351
(1.94 %)
31,404
(0.08 %)
183 European hazelnut (Tombul 2020)
GCF_901000735.1
39,203
(13.04 %)
n/a 15,600
(4.11 %)
42,096
(18.23 %)
n/a 35.90
(99.54 %)
0
(0 %)
14,532
(0.48 %)
12
(100.00 %)
358,479
(3.69 %)
179,807
(3.40 %)
2,234,313
(32.05 %)
66
(0.01 %)
338,416
(13.59 %)
12,963
(1.47 %)
9,205
(1.06 %)
184 European hop (primary hap 2023)
GCF_963169125.1
72,613
(2.92 %)
n/a 14,868
(0.56 %)
135,918
(7.87 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
0
(0 %)
129
(0.00 %)
319
(100.00 %)
1,077,704
(2.26 %)
853,368
(5.27 %)
13,477,464
(61.64 %)
0
(0 %)
1,654,055
(7.66 %)
152,063
(4.18 %)
31,956
(0.51 %)
185 European hop (Shinshu Wase 2014)
GCA_000831365.1
n/a n/a 17,158
(0.86 %)
191,202
(13.47 %)
n/a 38.57
(86.69 %)
160,222
(13.33 %)
530,762
(13.34 %)
292,698
(86.67 %)
770,031
(2.12 %)
637,135
(3.75 %)
13,484,203
(41.57 %)
8,594
(0.10 %)
n/a 81,500
(2.36 %)
40,113
(1.30 %)
186 European mistletoe (primary hap 2023)
GCA_963277665.1
n/a n/a 12,110
(0.01 %)
960,545
(1.07 %)
n/a 31.25
(100.00 %)
855
(0.00 %)
6,368
(0.00 %)
5,951
(100.00 %)
61,111,090
(11.87 %)
29,667,857
(2.75 %)
11,464
(100.00 %)
81
(0.00 %)
60,812,395
(6.42 %)
1,680,995
(2.36 %)
239,293
(0.15 %)
187 false flax
GCF_000633955.1
123,030
(22.63 %)
n/a 61,894
(13.77 %)
113,219
(31.09 %)
n/a 36.55
(92.99 %)
568
(0.01 %)
74,428
(7.02 %)
37,780
(99.99 %)
346,267
(2.46 %)
233,837
(5.56 %)
3,452,066
(27.34 %)
8,995
(2.52 %)
326,960
(10.10 %)
32,235
(2.62 %)
20,198
(1.48 %)
188 fava bean (2023)
GCA_948472305.1
n/a 47,586
(0.35 %)
18,459
(0.14 %)
221,591
(2.78 %)
n/a 37.44
(100.00 %)
10
(0.00 %)
5,330
(0.00 %)
3,992
(100.00 %)
4,140,168
(2.97 %)
4,673,353
(13.95 %)
36,694,276
(79.21 %)
23
(0.00 %)
1,288,824
(1.25 %)
59,853
(0.73 %)
27,946
(0.08 %)
189 Fendler's bladderpod (2019)
GCA_900406525.1
n/a n/a 29,791
(9.22 %)
82,813
(26.56 %)
n/a 34.83
(99.51 %)
109,570
(0.49 %)
109,570
(0.49 %)
209,502
(99.51 %)
193,365
(2.63 %)
165,270
(4.54 %)
2,180,278
(29.35 %)
9,235
(0.29 %)
99,774
(2.82 %)
8,339
(0.91 %)
5,475
(0.59 %)
190 Fendler's bladderpod (WCL-YS1 PI 610492 2024)
GCA_036630335.1
n/a n/a 23,679
(9.84 %)
43,179
(26.89 %)
n/a 34.92
(96.38 %)
0
(0 %)
98,816
(3.75 %)
9,891
(100.00 %)
373,519
(23.21 %)
328,539
(16.37 %)
1,720,493
(26.70 %)
149
(0.02 %)
253,434
(11.51 %)
5,729
(0.77 %)
4,009
(0.51 %)
191 ferns C-fern (Hn-n Whitten #5841 2021)
GCA_020310875.1
n/a 75,211
(0.95 %)
9,421
(0.09 %)
135,222
(2.48 %)
n/a 38.64
(99.38 %)
4,604
(0.62 %)
4,604
(0.62 %)
10,776
(99.38 %)
2,992,638
(8.23 %)
4,552,105
(9.86 %)
24,840,439
(73.42 %)
3
(0.00 %)
6,236,111
(7.07 %)
166,309
(1.00 %)
26,330
(0.16 %)
192 field dodder (2020)
GCA_900332095.2
n/a 45,474
(18.20 %)
20,063
(4.21 %)
57,416
(19.19 %)
n/a 35.99
(94.55 %)
29,211
(5.47 %)
29,211
(5.47 %)
36,112
(94.53 %)
448,370
(12.07 %)
208,393
(3.46 %)
2,648,975
(35.75 %)
3,649
(0.58 %)
189,061
(4.55 %)
35,117
(3.87 %)
24,846
(2.66 %)
193 field mustard (Chiifu-401-42 2020)
GCF_000309985.2
73,442
(34.55 %)
n/a 30,193
(10.12 %)
57,010
(25.57 %)
n/a 36.83
(99.39 %)
0
(0 %)
408
(0.61 %)
1,100
(100.00 %)
261,522
(15.13 %)
196,553
(8.43 %)
1,533,242
(38.01 %)
0
(0 %)
376,874
(10.72 %)
24,895
(5.44 %)
14,510
(1.98 %)
194 field pennycress (KM-2021 2021)
GCA_018983045.1
n/a n/a 22,245
(5.38 %)
51,310
(16.10 %)
n/a 39.02
(99.92 %)
0
(0 %)
1,923
(0.08 %)
2,298
(100.00 %)
172,036
(1.52 %)
129,452
(6.55 %)
2,388,667
(53.91 %)
0
(0 %)
804,147
(15.04 %)
37,074
(4.98 %)
14,496
(1.54 %)
195 finger millet (KNE 796-S 2023)
GCA_032690845.1
n/a 48,836
(5.52 %)
31,097
(3.07 %)
140,467
(22.19 %)
n/a 43.87
(99.87 %)
142
(0.13 %)
142
(0.13 %)
674
(99.87 %)
1,168,206
(39.18 %)
229,202
(4.14 %)
4,910,934
(41.23 %)
0
(0 %)
816,546
(6.87 %)
205,561
(17.19 %)
128,841
(9.82 %)
196 finger millet (ML-365 2017)
GCA_002180455.1
n/a n/a 30,000
(2.41 %)
346,692
(27.97 %)
n/a 45.34
(98.74 %)
507,646
(1.30 %)
507,646
(1.30 %)
1,033,269
(98.70 %)
323,234
(1.19 %)
394,943
(6.28 %)
6,129,348
(33.00 %)
116,821
(2.67 %)
n/a 325,103
(21.18 %)
245,703
(14.05 %)
197 flowering dogwood (Cherokee Brave 2023)
GCF_030987335.1
63,465
(6.03 %)
n/a 17,263
(1.31 %)
78,564
(9.37 %)
n/a 35.95
(100.00 %)
96
(0.00 %)
96
(0.00 %)
459
(100.00 %)
982,341
(3.33 %)
719,891
(7.87 %)
6,810,592
(50.46 %)
0
(0 %)
1,484,349
(12.26 %)
27,883
(2.10 %)
14,303
(0.44 %)
198 foxtail millet
GCF_000263155.2
40,951
(13.47 %)
n/a 17,758
(5.07 %)
60,598
(30.59 %)
n/a 46.14
(98.82 %)
6,442
(1.19 %)
6,442
(1.19 %)
6,779
(98.81 %)
115,365
(1.46 %)
116,980
(2.45 %)
1,691,260
(29.31 %)
8
(0.00 %)
160,655
(4.99 %)
78,297
(28.27 %)
56,591
(11.82 %)
199 fried-egg orchid (Lindl 2021)
GCA_019925795.1
n/a 30,041
(2.24 %)
13,889
(0.88 %)
71,188
(7.43 %)
n/a 35.53
(99.95 %)
0
(0 %)
1,481
(0.05 %)
822
(100.00 %)
671,921
(2.91 %)
624,024
(4.46 %)
7,792,634
(47.85 %)
0
(0 %)
780,249
(7.12 %)
76,668
(3.16 %)
34,814
(1.23 %)
200 garden asparagus (2017)
GCF_001876935.1
45,159
(4.02 %)
n/a 13,440
(1.02 %)
85,207
(11.07 %)
n/a 39.02
(97.02 %)
44,390
(2.99 %)
47,391
(2.99 %)
56,182
(97.01 %)
427,496
(2.02 %)
885,946
(8.32 %)
6,075,356
(46.49 %)
46
(0.01 %)
1,014,228
(9.26 %)
111,109
(6.80 %)
35,931
(1.35 %)
201 garden lettuce (Salinas v15 2025)
GCF_002870075.5
74,480
(2.94 %)
n/a 16,545
(0.57 %)
108,085
(5.99 %)
n/a 37.99
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11
(100.00 %)
3,571,045
(84.65 %)
1,291,547
(4.80 %)
12,856,914
(61.76 %)
0
(0 %)
1,750,402
(9.51 %)
160,850
(3.31 %)
9,428
(0.67 %)
202 garden lettuce (Salinas v11 2022)
GCF_002870075.4
69,048
(2.69 %)
n/a 16,407
(0.56 %)
105,654
(5.75 %)
n/a 37.92
(99.95 %)
0
(0 %)
384
(0.05 %)
93
(100.00 %)
1,192,578
(2.37 %)
1,282,344
(4.72 %)
12,843,881
(61.50 %)
2
(0.00 %)
2,596,117
(14.22 %)
160,781
(2.86 %)
21,226
(0.27 %)
203 garden pea (Zhongwan6 2022)
GCF_024323335.1
74,264
(1.88 %)
n/a 17,744
(0.43 %)
129,692
(4.97 %)
n/a 37.94
(99.73 %)
0
(0 %)
826
(0.27 %)
1,566
(100.00 %)
1,517,586
(2.16 %)
1,541,702
(5.89 %)
13,206,825
(66.95 %)
4
(0.00 %)
n/a 105,766
(0.97 %)
9,528
(0.15 %)
204 garlic-fruit tree (guangnan 2023)
GCF_029873635.1
43,473
(2.84 %)
n/a 13,544
(0.88 %)
64,877
(5.24 %)
n/a 36.06
(100.00 %)
0
(0 %)
596
(0.00 %)
510
(100.00 %)
1,556,970
(22.50 %)
788,188
(5.25 %)
10,081,845
(53.72 %)
1
(0.00 %)
1,139,226
(6.25 %)
41,032
(1.09 %)
17,380
(0.48 %)
205 ghaf (Desert tree PC_DT_omini 2023)
GCF_029017545.1
59,652
(8.73 %)
n/a 18,917
(2.55 %)
47,052
(9.22 %)
n/a 32.09
(99.98 %)
0
(0 %)
1,693
(0.02 %)
2,266
(100.00 %)
452,206
(3.00 %)
195,931
(2.27 %)
4,921,469
(39.63 %)
1
(0.00 %)
167,024
(3.12 %)
9,731
(0.69 %)
8,007
(0.51 %)
206 ginger
GCF_018446385.1
127,579
(4.07 %)
n/a 33,995
(0.96 %)
186,756
(7.79 %)
n/a 39.16
(100.00 %)
0
(0 %)
901
(0.00 %)
211
(100.00 %)
1,187,168
(2.18 %)
2,088,683
(6.47 %)
12,917,773
(61.42 %)
1
(0.00 %)
3,992,139
(15.45 %)
398,512
(10.38 %)
143,324
(2.40 %)
207 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2
42,106
(6.72 %)
n/a 15,819
(2.23 %)
49,753
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
5,305
(0.07 %)
310,402
(9.76 %)
13,479
(99.93 %)
394,793
(2.75 %)
364,336
(3.37 %)
4,190,750
(39.49 %)
3,050
(0.15 %)
283,527
(3.56 %)
12,198
(0.64 %)
7,327
(0.39 %)
208 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1
87,385
(2.18 %)
n/a 17,963
(0.44 %)
263,708
(10.29 %)
n/a 46.32
(97.73 %)
0
(0 %)
107,163
(2.27 %)
109,126
(100.00 %)
1,490,873
(15.60 %)
1,415,562
(5.65 %)
12,540,551
(71.59 %)
522
(0.02 %)
5,380,929
(14.74 %)
881,849
(29.81 %)
257,498
(5.22 %)
209 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1
69,195
(1.77 %)
n/a 18,614
(0.43 %)
300,274
(11.28 %)
n/a 46.38
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 68,537
(100.00 %)
1,555,328
(15.65 %)
1,485,488
(4.71 %)
13,133,338
(73.17 %)
0
(0 %)
4,874,338
(13.46 %)
928,327
(30.84 %)
269,584
(5.36 %)
210 goatgrass A.tauschii.strangulata (AL8/78 2024)
GCF_002575655.3
93,689
(2.58 %)
n/a 18,524
(0.46 %)
261,939
(10.44 %)
n/a 46.35
(99.97 %)
0
(0 %)
347
(0.03 %)
1,115
(100.00 %)
1,094,634
(1.42 %)
1,403,604
(6.42 %)
12,367,986
(72.90 %)
9
(0.00 %)
134,619
(0.42 %)
849,453
(31.38 %)
258,839
(5.41 %)
211 goji berry (Lr01 2021)
GCF_019175385.1
69,808
(4.35 %)
n/a 17,353
(1.01 %)
81,347
(7.68 %)
n/a 38.10
(99.95 %)
0
(0 %)
1,565
(0.05 %)
166
(100.00 %)
816,909
(2.29 %)
708,412
(4.09 %)
8,106,901
(53.67 %)
0
(0 %)
1,891,734
(16.01 %)
66,433
(1.82 %)
7,517
(0.15 %)
212 golden chicken fern (CiBa-2024 2024)
GCF_041138505.1
62,249
(2.04 %)
n/a 10,687
(0.24 %)
192,062
(8.35 %)
n/a 40.49
(100.00 %)
0
(0 %)
790
(0.00 %)
94
(100.00 %)
1,473,081
(3.35 %)
3,801,384
(11.16 %)
12,327,923
(59.58 %)
3
(0.00 %)
5,814,639
(15.80 %)
114,312
(1.45 %)
42,048
(0.51 %)
213 golden kiwifruit (Hongyang 2019)
GCA_009663005.1
n/a n/a 21,161
(2.89 %)
55,843
(11.78 %)
n/a 35.63
(99.99 %)
646
(0.01 %)
646
(0.01 %)
2,366
(99.99 %)
423,518
(2.92 %)
293,299
(3.76 %)
4,466,312
(33.71 %)
0
(0 %)
198,622
(2.97 %)
25,250
(1.74 %)
15,816
(1.02 %)
214 golden kiwifruit (Red5 2018)
GCA_003024255.1
n/a 33,115
(10.82 %)
22,332
(3.88 %)
51,709
(13.62 %)
n/a 35.31
(96.44 %)
0
(0 %)
25,521
(3.57 %)
1,234
(100.00 %)
347,035
(2.87 %)
241,862
(4.11 %)
3,578,217
(30.95 %)
1,207
(0.28 %)
151,895
(5.62 %)
19,259
(1.41 %)
12,861
(0.94 %)
215 grain amaranth (AhG2s 2020)
GCA_000753965.2
n/a n/a 13,698
(3.27 %)
34,546
(14.58 %)
n/a 32.99
(90.06 %)
0
(0 %)
7,031
(9.94 %)
1,567
(100.00 %)
217,772
(3.32 %)
181,251
(3.71 %)
2,391,775
(32.66 %)
19
(0.00 %)
160,684
(4.10 %)
4,425
(0.40 %)
1,763
(0.17 %)
216 grain cowpea (G323 2024)
GCF_037176805.1
57,653
(10.99 %)
n/a 16,960
(2.87 %)
47,953
(12.41 %)
n/a 33.81
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
511
(100.00 %)
863,728
(61.29 %)
315,359
(15.47 %)
2,985,058
(47.02 %)
3
(0.00 %)
622,483
(10.92 %)
29,426
(3.44 %)
7,056
(0.55 %)
217 great duckweed (2018)
GCA_900492545.1
n/a n/a 10,264
(6.56 %)
16,841
(26.52 %)
n/a 42.27
(99.98 %)
0
(0 %)
84
(0.02 %)
20
(100.00 %)
96,389
(3.49 %)
54,278
(2.54 %)
843,136
(22.61 %)
0
(0 %)
46,685
(3.00 %)
18,978
(24.35 %)
16,615
(11.45 %)
218 great duckweed (9509 2017)
GCA_001981405.1
n/a n/a 10,023
(7.00 %)
16,353
(26.89 %)
n/a 42.30
(92.78 %)
89,257
(7.32 %)
89,257
(7.32 %)
89,277
(92.68 %)
80,787
(2.86 %)
45,432
(1.93 %)
786,155
(19.70 %)
95
(0.04 %)
26,883
(1.77 %)
19,057
(20.99 %)
16,325
(10.84 %)
219 green algae (1602 2018)
GCA_002245835.2
n/a 10,384
(34.00 %)
770
(0.70 %)
5,466
(68.75 %)
n/a 63.95
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 159
(100.00 %)
62,109
(5.65 %)
29,993
(4.25 %)
581,123
(37.15 %)
0
(0 %)
17,475
(3.70 %)
127
(97.30 %)
11,018
(7.36 %)
220 green algae (18125 2025)
GCA_048595725.1
n/a n/a 865
(2.16 %)
3,109
(76.75 %)
n/a 67.78
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 55
(100.00 %)
35,578
(6.99 %)
19,197
(3.61 %)
216,318
(31.95 %)
0
(0 %)
3,119
(1.09 %)
54
(99.88 %)
7
(0.08 %)
221 green algae (211/11P 2022)
GCA_023343905.1
n/a 11,168
(42.76 %)
1,009
(1.60 %)
4,892
(65.40 %)
n/a 61.60
(98.43 %)
12
(1.57 %)
12
(1.57 %)
57
(98.43 %)
48,271
(5.94 %)
22,435
(3.81 %)
358,729
(31.71 %)
0
(0 %)
12,590
(4.35 %)
405
(96.46 %)
9,279
(12.54 %)
222 green algae (ATCC 16529 2021)
GCA_016906385.1
n/a n/a 748
(2.62 %)
2,222
(71.29 %)
n/a 64.15
(97.91 %)
0
(0 %)
6,559
(2.25 %)
19
(100.00 %)
268
(0.10 %)
2,320
(1.18 %)
110,762
(22.64 %)
0
(0 %)
1,898
(0.84 %)
29
(99.25 %)
70
(0.88 %)
223 green algae (CCAP 19/42 2023)
GCA_031753455.1
n/a n/a 1,362
(0.45 %)
15,767
(32.44 %)
n/a 49.19
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 300
(100.00 %)
442,436
(43.24 %)
171,808
(11.44 %)
978,912
(31.81 %)
0
(0 %)
138,366
(4.83 %)
10,820
(2.10 %)
5,333
(0.93 %)
224 green algae (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.4
10,237
(66.85 %)
n/a 988
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
476
(1.14 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
37,284
(8.77 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
10
(0.02 %)
8,269
(2.70 %)
43
(99.34 %)
317
(0.67 %)
225 green algae (HMC1 2018)
GCA_003255715.1
n/a n/a 1,000
(1.89 %)
7,921
(69.96 %)
n/a 62.97
(97.56 %)
0
(0 %)
2,472
(2.45 %)
3,774
(100.00 %)
10,519
(1.96 %)
4,558
(1.31 %)
172,635
(22.08 %)
1,126
(1.31 %)
5,264
(2.71 %)
3,978
(96.84 %)
4,849
(23.61 %)
226 green algae (JCM 15793 2018)
GCA_002897115.2
n/a n/a 1,087
(3.87 %)
3,215
(73.44 %)
n/a 61.27
(98.39 %)
0
(0 %)
10,986
(1.68 %)
46
(100.00 %)
8,982
(1.85 %)
3,745
(0.85 %)
119,487
(14.35 %)
11
(0.02 %)
806
(0.37 %)
79
(99.57 %)
276
(44.19 %)
227 green algae (JCM 9641 2017)
GCA_002794665.1
n/a n/a 928
(3.73 %)
2,196
(76.87 %)
n/a 73.37
(97.42 %)
0
(0 %)
12,055
(2.67 %)
27
(100.00 %)
15,929
(5.38 %)
7,990
(2.29 %)
164,687
(38.62 %)
22
(0.05 %)
971
(0.63 %)
30
(99.90 %)
25
(0.09 %)
228 green algae (KO-2023 2023)
GCA_030272585.1
n/a 85,190
(21.68 %)
1,751
(1.39 %)
15,265
(40.46 %)
n/a 46.07
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 29
(100.00 %)
60,131
(4.76 %)
34,318
(3.34 %)
393,810
(24.33 %)
0
(0 %)
29,057
(5.52 %)
19,071
(23.42 %)
14,844
(12.46 %)
229 green algae (LANL1001 2019)
GCA_006384855.1
n/a n/a 2,016
(0.62 %)
31,585
(41.01 %)
n/a 57.91
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,614
(100.00 %)
183,076
(3.30 %)
101,860
(5.85 %)
972,524
(32.54 %)
0
(0 %)
128,092
(5.45 %)
4,760
(98.23 %)
17,087
(19.73 %)
230 green algae (RCC4221 2014)
GCA_000214015.2
n/a 7,670
(82.78 %)
1,108
(6.57 %)
3,692
(76.52 %)
n/a 59.39
(99.94 %)
0
(0 %)
477
(0.07 %)
20
(100.00 %)
8,604
(3.92 %)
4,944
(2.18 %)
102,578
(28.06 %)
3
(0.01 %)
1,462
(1.35 %)
20
(99.94 %)
0
(0.00 %)
231 green algae (SAG 2063 2018)
GCA_003613005.1
n/a n/a 869
(2.13 %)
9,821
(78.63 %)
n/a 67.62
(98.00 %)
579
(1.95 %)
579
(1.95 %)
7,535
(98.05 %)
35,537
(6.91 %)
19,692
(3.56 %)
218,412
(30.60 %)
1
(0.01 %)
2,387
(0.83 %)
6,958
(98.59 %)
2,763
(17.54 %)
232 green algae (YS-2018 2019)
GCA_004138255.1
n/a n/a 1,365
(1.08 %)
11,070
(58.24 %)
n/a 55.95
(98.44 %)
0
(0 %)
780
(1.56 %)
597
(100.00 %)
25,537
(1.66 %)
27,257
(3.92 %)
365,387
(19.48 %)
2
(0.01 %)
35,173
(4.02 %)
3,732
(86.39 %)
9,364
(18.16 %)
233 green algae A.protothecoides (0710 2014)
GCF_000733215.1
7,014
(37.71 %)
n/a 966
(2.72 %)
2,947
(70.38 %)
n/a 63.54
(95.35 %)
1,012
(4.66 %)
1,012
(4.66 %)
1,386
(95.34 %)
8,655
(1.88 %)
3,803
(1.89 %)
147,537
(20.31 %)
4
(0.02 %)
1,495
(1.63 %)
604
(53.91 %)
7,583
(28.42 %)
234 green algae B.prasinos (RCC1105 2012)
GCF_002220235.1
7,904
(82.34 %)
n/a 1,231
(6.04 %)
4,460
(76.24 %)
n/a 48.02
(99.76 %)
0
(0 %)
20
(0.24 %)
21
(100.00 %)
17,900
(4.88 %)
5,674
(1.75 %)
113,699
(21.91 %)
0
(0 %)
1,171
(0.89 %)
7
(0.01 %)
10
(0.02 %)
235 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1
n/a n/a 1,057
(0.55 %)
9,735
(58.02 %)
n/a 64.03
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 17
(100.00 %)
166,909
(9.00 %)
120,034
(10.13 %)
750,946
(37.60 %)
0
(0 %)
64,728
(6.10 %)
166
(99.31 %)
15,012
(11.67 %)
236 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 refseq)
GCF_000002595.2
19,527
(53.99 %)
n/a 990
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
174,119
(17.13 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
26
(0.03 %)
48,564
(5.08 %)
92
(46.06 %)
15,883
(12.21 %)
237 green algae C.subellipsoidea (C-169 2012)
GCF_000258705.1
9,839
(29.70 %)
n/a 1,307
(1.78 %)
8,108
(53.71 %)
n/a 52.94
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 29
(100.00 %)
8,446
(0.85 %)
5,471
(0.85 %)
265,761
(14.34 %)
0
(0 %)
3,585
(1.15 %)
11,329
(19.64 %)
6,821
(5.93 %)
238 green algae C.variabilis (NC64A 2010 refseq)
GCF_000147415.1
9,780
(32.79 %)
n/a 744
(1.00 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,396
(8.55 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
64,770
(8.22 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
0
(0 %)
6,856
(2.06 %)
756
(45.48 %)
9,593
(9.00 %)
239 green algae K.nitens (NIES-2285 2014)
GCA_000708835.1
n/a 16,374
(32.04 %)
2,471
(1.78 %)
14,771
(54.27 %)
n/a 52.42
(98.98 %)
1,917
(1.02 %)
2,081
(1.02 %)
3,731
(98.98 %)
10,051
(0.46 %)
14,278
(1.14 %)
388,120
(8.55 %)
82
(0.05 %)
6,137
(0.53 %)
8,698
(83.31 %)
13,320
(16.04 %)
240 green algae M.commoda (RCC299 2009)
GCF_000090985.2
10,137
(72.46 %)
10,212
(72.56 %)
1,301
(4.51 %)
5,667
(86.20 %)
n/a 63.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 19
(100.00 %)
14,619
(3.58 %)
8,937
(2.75 %)
178,499
(27.69 %)
0
(0 %)
2,391
(1.08 %)
10
(25.23 %)
9
(0.01 %)
241 green algae M.neglectum (SAG 48.87 2015)
GCF_000611645.1
16,734
(25.96 %)
n/a 666
(0.47 %)
12,122
(60.02 %)
n/a 64.75
(96.59 %)
5,358
(3.43 %)
5,358
(3.43 %)
12,077
(96.57 %)
73,343
(6.73 %)
43,518
(3.04 %)
568,630
(31.80 %)
611
(0.45 %)
8,128
(0.78 %)
7,776
(96.69 %)
18,971
(14.42 %)
242 green algae M.pusilla (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.2
10,242
(66.86 %)
n/a 990
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
476
(1.14 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
36,818
(8.73 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
10
(0.02 %)
8,269
(2.70 %)
32
(47.70 %)
317
(0.67 %)
243 green algae O.lucimarinus (CCE9901 2007)
GCF_000092065.1
7,603
(72.01 %)
n/a 1,064
(6.25 %)
3,493
(72.08 %)
n/a 60.44
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 21
(100.00 %)
11,026
(5.45 %)
11,732
(3.90 %)
107,661
(34.88 %)
0
(0 %)
1,022
(1.03 %)
12
(61.27 %)
2
(0.00 %)
244 green algae O.tauri (RCC4221 2014)
GCF_000214015.3
7,766
(82.33 %)
n/a 1,131
(6.60 %)
3,714
(76.22 %)
n/a 59.21
(99.94 %)
0
(0 %)
477
(0.07 %)
22
(100.00 %)
8,503
(3.84 %)
4,946
(2.16 %)
102,428
(27.87 %)
3
(0.01 %)
1,462
(1.34 %)
16
(57.14 %)
6
(0.02 %)
245 green algae V.carteri (Eve 2010)
GCF_000143455.1
14,333
(21.46 %)
n/a 1,411
(0.77 %)
13,095
(47.93 %)
n/a 55.97
(91.15 %)
10,101
(8.87 %)
12,014
(8.87 %)
11,352
(91.13 %)
175,729
(14.69 %)
105,113
(5.10 %)
667,226
(23.91 %)
10
(0.01 %)
60,616
(5.34 %)
4,325
(42.65 %)
20,517
(13.87 %)
246 green chiretta (2019)
GCF_009805555.1
46,094
(16.56 %)
n/a 14,632
(4.66 %)
34,242
(19.36 %)
n/a 33.53
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 271
(100.00 %)
293,800
(4.64 %)
151,157
(7.38 %)
1,732,880
(41.88 %)
0
(0 %)
175,025
(5.40 %)
21,835
(6.05 %)
15,493
(3.32 %)
247 green foxtail
GCF_005286985.1
47,022
(14.66 %)
n/a 17,750
(5.12 %)
60,106
(30.88 %)
n/a 46.17
(99.85 %)
61
(0.15 %)
61
(0.15 %)
76
(99.85 %)
116,493
(1.51 %)
120,039
(2.72 %)
1,676,017
(29.11 %)
0
(0 %)
157,544
(4.99 %)
75,497
(29.44 %)
55,605
(12.11 %)
248 green foxtail (2024)
GCF_005286985.2
43,377
(14.56 %)
n/a 17,909
(5.15 %)
60,312
(30.80 %)
n/a 46.17
(99.96 %)
14
(0.04 %)
14
(0.04 %)
40
(99.96 %)
117,054
(1.49 %)
121,212
(2.84 %)
1,685,787
(29.32 %)
0
(0 %)
159,497
(5.00 %)
75,777
(29.49 %)
55,702
(12.04 %)
249 green foxtail (ME034v 2020)
GCA_012934335.1
n/a n/a 18,040
(5.19 %)
61,671
(31.38 %)
n/a 45.99
(100.00 %)
54
(0.00 %)
54
(0.00 %)
63
(100.00 %)
105,738
(1.38 %)
87,424
(2.22 %)
1,777,815
(26.85 %)
0
(0 %)
131,241
(3.67 %)
74,932
(30.30 %)
61,081
(13.91 %)
250 guar (PI 68867901 SD 2022)
GCA_026586085.1
n/a n/a 16,149
(3.62 %)
40,368
(13.76 %)
n/a 32.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 627
(100.00 %)
724,179
(25.31 %)
196,353
(10.67 %)
2,757,251
(41.21 %)
0
(0 %)
577,163
(7.64 %)
9,690
(0.94 %)
6,761
(0.65 %)
251 guar (short-day 2024)
GCA_037177725.1
n/a n/a 16,198
(3.33 %)
43,918
(13.95 %)
n/a 33.41
(100.00 %)
0
(0 %)
24
(0.00 %)
237
(100.00 %)
813,394
(29.89 %)
243,439
(13.12 %)
2,549,208
(42.63 %)
0
(0 %)
755,453
(9.28 %)
10,217
(1.78 %)
6,909
(0.59 %)
252 Guinea yam (TDr96_F1 2017)
GCA_002240015.2
n/a n/a 11,944
(2.63 %)
37,372
(13.64 %)
n/a 35.58
(88.95 %)
0
(0 %)
1,032,823
(11.31 %)
21
(100.00 %)
293,868
(3.21 %)
174,614
(3.18 %)
2,690,184
(32.53 %)
1,884
(0.17 %)
180,755
(4.15 %)
15,323
(1.42 %)
8,394
(0.81 %)
253 habanero-type pepper (PI159236 2017)
GCA_002271895.2
n/a 34,974
(1.29 %)
16,562
(0.53 %)
72,911
(2.91 %)
n/a 34.88
(98.35 %)
0
(0 %)
196,261
(1.66 %)
87,978
(100.00 %)
1,136,015
(1.95 %)
1,019,921
(4.33 %)
22,445,162
(47.06 %)
529
(0.02 %)
1,752,629
(5.46 %)
20,737
(0.24 %)
7,465
(0.08 %)
254 hairy vetch (HV-30 2023)
GCF_029867415.1
88,183
(5.03 %)
n/a 22,129
(1.02 %)
118,243
(9.15 %)
n/a 35.63
(99.98 %)
0
(0 %)
3,486
(0.02 %)
1,888
(100.00 %)
1,001,308
(2.63 %)
1,132,664
(5.72 %)
8,340,755
(56.16 %)
24
(0.00 %)
1,749,179
(17.10 %)
43,665
(1.21 %)
15,567
(0.31 %)
255 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1
43,787
(9.63 %)
n/a 17,635
(3.85 %)
66,270
(23.98 %)
n/a 46.87
(98.63 %)
736
(1.37 %)
736
(1.37 %)
1,027
(98.63 %)
157,811
(1.55 %)
119,571
(2.57 %)
2,107,254
(45.30 %)
0
(0 %)
384,333
(11.74 %)
102,278
(32.16 %)
57,387
(11.00 %)
256 Hawaiian beggarticks (Kalapana, Puna primary hap 2024)
GCF_021521415.1
100,198
(3.70 %)
n/a 41,058
(1.06 %)
207,532
(8.30 %)
n/a 37.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 15,833
(100.00 %)
2,024,684
(2.90 %)
1,837,742
(5.29 %)
17,556,257
(56.19 %)
0
(0 %)
2,633,832
(10.88 %)
201,310
(3.34 %)
36,167
(0.41 %)
257 Himalayan balsam (dImpGla2.1 2021)
GCF_907164915.1
40,392
(7.39 %)
n/a 16,711
(2.29 %)
50,292
(11.24 %)
n/a 32.12
(99.95 %)
0
(0 %)
858
(0.05 %)
1,115
(100.00 %)
439,789
(3.56 %)
574,639
(8.97 %)
4,147,814
(47.01 %)
3
(0.00 %)
679,567
(9.30 %)
16,291
(1.13 %)
7,961
(0.43 %)
258 Himalayan yew (Yunnan 2021)
GCA_018340775.1
n/a n/a 11,782
(0.08 %)
129,658
(1.42 %)
n/a 36.91
(99.99 %)
0
(0 %)
11,130
(0.01 %)
150
(100.00 %)
2,861,102
(1.57 %)
2,476,232
(2.57 %)
65,436,741
(53.97 %)
2
(0.00 %)
7,302,742
(6.61 %)
157,149
(0.72 %)
21,849
(0.08 %)
259 horseweed
GCF_010389155.1
39,622
(11.54 %)
n/a 14,718
(3.15 %)
42,194
(16.23 %)
n/a 34.08
(99.99 %)
0
(0 %)
502
(0.01 %)
357
(100.00 %)
267,124
(2.84 %)
155,729
(2.71 %)
2,475,353
(36.48 %)
0
(0 %)
170,084
(5.26 %)
5,205
(0.40 %)
2,461
(0.20 %)
260 Indian licorice
GCF_003935025.1
44,610
(13.60 %)
n/a 17,108
(4.95 %)
34,097
(14.33 %)
n/a 31.84
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
160
(100.00 %)
217,674
(3.40 %)
106,243
(4.04 %)
2,232,509
(38.91 %)
0
(0 %)
136,457
(3.95 %)
5,438
(1.06 %)
4,124
(0.55 %)
261 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 alternate hap 2022)
GCA_023055485.1
n/a n/a 16,184
(2.02 %)
66,215
(14.16 %)
n/a 35.37
(100.00 %)
0
(0 %)
82
(0.00 %)
689
(100.00 %)
739,891
(4.58 %)
435,389
(7.62 %)
4,843,419
(38.03 %)
1
(0.00 %)
573,724
(7.60 %)
13,298
(2.56 %)
7,653
(0.38 %)
262 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 primary hap 2022)
GCA_023055345.1
n/a n/a 15,832
(2.09 %)
63,488
(14.36 %)
n/a 35.19
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
358
(100.00 %)
703,028
(4.29 %)
399,798
(6.48 %)
4,662,881
(36.96 %)
1
(0.00 %)
508,474
(6.86 %)
12,534
(1.92 %)
7,167
(0.36 %)
263 island oak (RSA801373 alternate hap 2023)
GCA_028535165.1
n/a n/a 15,893
(1.97 %)
68,998
(15.27 %)
n/a 35.87
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
156
(100.00 %)
746,424
(4.43 %)
451,117
(7.39 %)
4,820,434
(38.55 %)
0
(0 %)
642,456
(7.81 %)
20,367
(2.62 %)
9,619
(0.45 %)
264 island oak (RSA801373 primary hap 2023)
GCA_028535515.1
n/a n/a 15,880
(1.95 %)
69,093
(15.25 %)
n/a 35.97
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
274
(100.00 %)
751,691
(4.60 %)
457,914
(7.61 %)
4,850,082
(38.95 %)
0
(0 %)
656,668
(8.21 %)
20,561
(3.01 %)
9,683
(0.46 %)
265 J.microcarpa x regia eudicots (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1
50,504
(10.14 %)
n/a 18,451
(3.41 %)
55,094
(16.89 %)
n/a 36.30
(99.18 %)
0
(0 %)
54
(0.82 %)
154
(100.00 %)
411,290
(3.65 %)
260,413
(3.49 %)
3,023,907
(31.93 %)
0
(0 %)
195,435
(3.60 %)
23,270
(1.88 %)
11,316
(0.85 %)
266 Japanese apricot
GCF_000346735.1
32,312
(19.60 %)
n/a 14,463
(6.46 %)
33,049
(23.94 %)
n/a 37.45
(92.82 %)
15,597
(7.20 %)
15,597
(7.20 %)
23,761
(92.80 %)
118,757
(2.25 %)
84,983
(4.53 %)
1,374,244
(23.24 %)
87
(0.15 %)
129,116
(6.07 %)
7,808
(1.87 %)
5,295
(1.28 %)
267 Japanese cedar (2023)
GCF_030272615.1
80,727
(1.01 %)
n/a 14,175
(0.13 %)
225,166
(3.69 %)
n/a 36.42
(99.98 %)
0
(0 %)
3,031
(0.02 %)
2,699
(100.00 %)
2,873,672
(2.01 %)
4,198,037
(4.24 %)
5,730
(99.98 %)
5
(0.00 %)
7,632,920
(8.60 %)
71,102
(1.16 %)
67,733
(1.15 %)
268 Japanese morning glory
GCF_001879475.1
58,979
(8.37 %)
n/a 16,977
(2.14 %)
77,626
(18.21 %)
n/a 37.61
(99.97 %)
0
(0 %)
449
(0.03 %)
3,418
(100.00 %)
641,896
(6.26 %)
639,051
(8.97 %)
3,622,236
(46.63 %)
0
(0 %)
878,090
(12.19 %)
77,860
(10.47 %)
41,089
(3.11 %)
269 Japanese rice (2023)
GCF_034140825.1
55,725
(16.73 %)
n/a 16,338
(4.37 %)
54,077
(25.00 %)
n/a 43.72
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
15
(100.00 %)
196,712
(2.76 %)
141,936
(4.82 %)
1,727,479
(35.05 %)
0
(0 %)
154,436
(5.38 %)
63,894
(25.90 %)
41,819
(6.86 %)
270 Japanese rice (Kitaake 2020)
GCA_009797565.1
n/a 48,428
(16.53 %)
16,562
(4.59 %)
53,878
(24.77 %)
n/a 43.61
(98.95 %)
443
(1.05 %)
474
(1.05 %)
476
(98.95 %)
494,831
(50.75 %)
141,079
(3.52 %)
1,728,936
(33.69 %)
1
(0.00 %)
153,320
(5.62 %)
64,216
(25.20 %)
41,086
(7.31 %)
271 Japanese rice (Nipponbare 2015)
GCF_001433935.1
53,454
(17.22 %)
47,331
(15.87 %)
16,804
(4.69 %)
53,712
(24.95 %)
n/a 43.57
(99.97 %)
0
(0 %)
925
(0.03 %)
58
(100.00 %)
402,182
(39.07 %)
138,035
(3.47 %)
1,719,939
(33.46 %)
4
(0.00 %)
142,261
(5.16 %)
63,485
(25.25 %)
49,534
(9.51 %)
272 jewel orchid monocots (Aro_GA 2025)
GCA_051820535.1
n/a n/a 41,719
(0.73 %)
293,147
(8.18 %)
n/a 39.10
(100.00 %)
0
(0 %)
283
(0.00 %)
3,452
(100.00 %)
3,539,676
(12.83 %)
1,885,641
(6.09 %)
19,476,248
(61.01 %)
1
(0.00 %)
8,155,644
(20.27 %)
583,795
(7.68 %)
158,186
(1.33 %)
273 Joseph's coat eudicots (Red AtriRed21 2022)
GCF_026212465.1
44,756
(10.39 %)
n/a 13,649
(2.41 %)
38,664
(12.08 %)
n/a 31.93
(99.74 %)
0
(0 %)
2,496
(0.26 %)
49
(100.00 %)
270,085
(9.40 %)
247,307
(22.95 %)
2,428,999
(49.81 %)
12
(0.00 %)
797,844
(12.43 %)
5,914
(1.27 %)
1,633
(0.12 %)
274 Korean lawngrass (Nagirizaki 2016)
GCA_001602275.1
n/a n/a 21,051
(6.88 %)
57,023
(32.54 %)
n/a 44.09
(96.75 %)
14,848
(3.26 %)
14,848
(3.26 %)
26,634
(96.74 %)
101,349
(1.46 %)
71,657
(2.17 %)
1,693,252
(21.97 %)
640
(0.13 %)
78,613
(2.03 %)
60,198
(24.06 %)
53,023
(14.28 %)
275 lamb's quarters (primary hap 2023)
GCA_948465745.1
n/a n/a 32,598
(1.94 %)
125,993
(12.58 %)
n/a 36.17
(100.00 %)
0
(0 %)
67
(0.00 %)
158
(100.00 %)
2,407,940
(63.57 %)
996,815
(6.91 %)
7,383,118
(51.29 %)
4
(0.00 %)
1,262,227
(8.49 %)
84,154
(2.40 %)
6,947
(0.15 %)
276 large cranberry (Ben Lear CNJ99-125-1 inbred clone 2014)
GCA_000775335.2
n/a n/a 14,225
(2.70 %)
66,262
(14.87 %)
n/a 37.74
(99.90 %)
1,293
(0.01 %)
1,390
(0.01 %)
201,496
(99.99 %)
201,938
(1.93 %)
136,145
(2.39 %)
2,755,676
(26.83 %)
841
(0.05 %)
n/a 12,815
(1.29 %)
8,740
(0.90 %)
277 least duckweed monocots (lm5633 2022)
GCA_024174645.1
n/a n/a 10,209
(2.40 %)
33,920
(14.90 %)
n/a 39.23
(99.63 %)
0
(0 %)
2,722
(0.38 %)
2,381
(100.00 %)
339,295
(20.82 %)
149,186
(3.14 %)
1,958,662
(44.97 %)
0
(0 %)
154,234
(4.42 %)
37,690
(12.52 %)
21,318
(5.13 %)
278 least lettuce (CGN05327 2025)
GCF_052625555.1
64,642
(3.18 %)
n/a 17,131
(0.68 %)
87,490
(5.63 %)
n/a 37.71
(100.00 %)
0
(0 %)
17
(0.00 %)
178
(100.00 %)
3,096,058
(83.52 %)
1,087,399
(4.54 %)
10,556,719
(60.68 %)
0
(0 %)
2,182,378
(14.48 %)
121,402
(3.51 %)
9,675
(0.81 %)
279 lemon (UCLL1 2023)
GCA_034663555.1
n/a n/a 27,668
(4.03 %)
72,915
(18.34 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
85
(0.01 %)
136
(0.01 %)
624
(99.99 %)
382,061
(2.62 %)
254,813
(8.31 %)
3,593,274
(41.24 %)
2
(0.00 %)
710,196
(9.84 %)
14,758
(7.59 %)
9,423
(0.56 %)
280 lettuce eudicots (Salinas 2011)
GCA_000227445.1
n/a n/a 15,031
(1.06 %)
140,751
(10.18 %)
n/a 36.82
(99.85 %)
0
(0 %)
n/a 876,110
(100.00 %)
505,796
(3.85 %)
318,171
(2.09 %)
9,808,138
(33.85 %)
0
(0 %)
n/a 30,057
(0.85 %)
16,755
(0.48 %)
281 liverwort (2024)
GCA_039105155.1
n/a 22,778
(17.26 %)
5,119
(1.70 %)
26,429
(24.22 %)
n/a 43.50
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
12
(100.00 %)
178,255
(36.35 %)
53,790
(2.08 %)
834,624
(30.68 %)
0
(0 %)
145,563
(8.78 %)
25,774
(29.87 %)
20,479
(8.79 %)
282 long-grained rice (Zhenshan 97 2020)
GCA_001623345.3
n/a n/a 16,254
(4.30 %)
54,135
(24.00 %)
n/a 43.62
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 13
(100.00 %)
204,282
(2.82 %)
143,681
(3.92 %)
1,729,033
(36.62 %)
0
(0 %)
180,035
(7.08 %)
65,538
(25.47 %)
41,142
(6.62 %)
283 lyrate rockcress
GCF_000004255.2
44,526
(28.52 %)
n/a 25,416
(19.36 %)
34,938
(31.66 %)
n/a 36.08
(88.90 %)
2,950
(11.10 %)
2,950
(11.10 %)
3,646
(88.90 %)
141,441
(20.58 %)
72,583
(3.25 %)
1,012,438
(24.68 %)
6
(0.00 %)
85,990
(5.46 %)
8,053
(2.48 %)
5,275
(1.16 %)
284 macadamia nut
GCF_013358625.1
58,226
(8.43 %)
n/a 16,723
(2.11 %)
62,465
(13.23 %)
n/a 39.13
(98.51 %)
0
(0 %)
22,059
(1.50 %)
2,644
(100.00 %)
463,575
(3.09 %)
304,057
(3.39 %)
4,183,445
(34.36 %)
8
(0.00 %)
364,799
(4.77 %)
18,956
(1.40 %)
5,087
(0.27 %)
285 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot 2015)
GCA_000949345.1
n/a n/a 13,013
(2.26 %)
38,671
(8.42 %)
n/a 33.59
(99.19 %)
123,798
(0.85 %)
123,798
(0.85 %)
203,100
(99.15 %)
329,865
(3.57 %)
244,018
(4.63 %)
3,737,818
(40.09 %)
5,255
(0.16 %)
167,323
(2.37 %)
4,827
(0.29 %)
3,120
(0.19 %)
286 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot FGT_2020_1 2023)
GCA_028651295.1
n/a n/a 12,929
(2.13 %)
34,499
(7.89 %)
n/a 33.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
174
(100.00 %)
560,407
(20.53 %)
306,275
(8.15 %)
3,716,838
(44.45 %)
0
(0 %)
572,203
(7.72 %)
6,827
(0.40 %)
3,596
(0.21 %)
287 Magnolia sinica (HGM2019 2023)
GCF_029962835.1
69,307
(3.21 %)
n/a 14,466
(0.72 %)
84,219
(6.52 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
0
(0 %)
73
(0.00 %)
127
(100.00 %)
1,415,484
(14.07 %)
1,154,832
(6.29 %)
10,231,412
(50.86 %)
0
(0 %)
1,584,398
(7.44 %)
107,342
(2.63 %)
20,756
(0.44 %)
288 maidenhair fern (2022)
GCF_014529385.1
53,974
(1.34 %)
n/a 8,589
(0.13 %)
187,285
(5.69 %)
n/a 41.71
(99.74 %)
0
(0 %)
3,151
(0.26 %)
602
(100.00 %)
2,572,134
(2.67 %)
2,565,316
(5.04 %)
19,821,583
(63.37 %)
0
(0 %)
4,217,437
(9.39 %)
168,543
(1.22 %)
31,656
(0.24 %)
289 maize
GCF_902167145.1
76,701
(3.66 %)
n/a 23,553
(1.55 %)
154,773
(10.70 %)
n/a 46.77
(99.83 %)
10
(0.00 %)
708
(0.17 %)
697
(100.00 %)
1,340,549
(78.65 %)
843,168
(5.20 %)
5,886,498
(69.23 %)
11
(0.00 %)
2,444,910
(17.04 %)
372,641
(31.10 %)
154,423
(5.59 %)
290 maize (2020)
GCA_905067065.1
n/a n/a 23,433
(1.61 %)
150,853
(10.66 %)
n/a 46.83
(98.14 %)
56,163
(1.87 %)
56,163
(1.87 %)
56,173
(98.13 %)
581,502
(1.40 %)
753,129
(3.49 %)
5,867,216
(67.88 %)
107
(0.01 %)
2,413,494
(16.48 %)
377,414
(31.33 %)
151,565
(5.65 %)
291 maize (B104 2021)
GCA_910593975.1
n/a n/a 23,680
(1.58 %)
153,453
(10.69 %)
n/a 46.83
(99.71 %)
22
(0.00 %)
1,223
(0.29 %)
697
(100.00 %)
593,292
(1.41 %)
805,647
(4.47 %)
5,887,178
(69.17 %)
13
(0.00 %)
2,341,058
(16.82 %)
370,755
(32.34 %)
151,573
(5.74 %)
292 maize (B73 2017)
GCA_000005005.6
n/a 131,270
(3.70 %)
23,511
(1.62 %)
151,975
(10.84 %)
n/a 46.87
(98.56 %)
2,522
(1.44 %)
2,523
(1.44 %)
3,128
(98.56 %)
1,308,956
(78.59 %)
771,560
(3.39 %)
5,850,966
(67.94 %)
15
(0.00 %)
2,173,513
(16.77 %)
367,973
(32.21 %)
150,546
(5.55 %)
293 maize (OH43 2020)
GCA_902167015.1
n/a n/a 23,864
(1.57 %)
154,358
(10.67 %)
n/a 46.77
(99.88 %)
20
(0.00 %)
551
(0.12 %)
777
(100.00 %)
1,341,834
(78.70 %)
834,042
(5.01 %)
5,916,520
(69.26 %)
0
(0 %)
2,430,892
(17.02 %)
372,114
(32.08 %)
153,258
(5.50 %)
294 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2
34,262
(16.98 %)
n/a 15,545
(6.13 %)
36,746
(24.10 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
14
(0.00 %)
14
(0.00 %)
74
(100.00 %)
140,519
(2.59 %)
67,337
(3.89 %)
1,493,779
(29.32 %)
0
(0 %)
94,864
(3.66 %)
41,044
(18.43 %)
30,094
(7.78 %)
295 Manchurian ash (Dongfeng_Y6 2025)
GCA_050941835.1
n/a n/a 21,875
(2.60 %)
65,892
(12.45 %)
n/a 34.37
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 23
(100.00 %)
1,378,182
(52.01 %)
240,241
(3.28 %)
5,127,474
(35.91 %)
0
(0 %)
318,538
(4.49 %)
18,208
(1.03 %)
8,293
(0.34 %)
296 mango
GCF_011075055.1
60,349
(16.06 %)
n/a 20,653
(5.13 %)
40,887
(15.20 %)
n/a 32.71
(99.98 %)
0
(0 %)
169
(0.02 %)
250
(100.00 %)
213,445
(3.09 %)
125,929
(3.29 %)
2,447,401
(32.63 %)
0
(0 %)
235,235
(5.50 %)
7,059
(0.98 %)
3,330
(0.31 %)
297 mosses
GCF_000002425.4
55,044
(11.86 %)
n/a 8,425
(1.46 %)
30,452
(12.55 %)
n/a 33.69
(98.74 %)
0
(0 %)
2,645
(1.27 %)
359
(100.00 %)
454,786
(48.35 %)
241,826
(2.56 %)
2,413,326
(52.52 %)
8
(0.00 %)
165,635
(4.02 %)
22,664
(3.06 %)
20,673
(2.66 %)
298 mosses (Gransden 2004 2024)
GCA_000002425.3
n/a n/a 8,471
(1.47 %)
30,401
(12.59 %)
n/a 33.71
(99.04 %)
0
(0 %)
1,792
(0.96 %)
357
(100.00 %)
296,167
(2.79 %)
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(2.68 %)
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(52.64 %)
4
(0.00 %)
168,303
(4.17 %)
22,652
(3.11 %)
20,677
(2.70 %)
299 mosses (MN 2022)
GCA_021442195.1
n/a 45,611
(15.03 %)
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(1.65 %)
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(15.54 %)
n/a 36.47
(99.90 %)
38
(0.10 %)
38
(0.10 %)
74
(99.90 %)
202,616
(2.17 %)
147,367
(3.31 %)
2,577,180
(28.93 %)
0
(0 %)
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(1.71 %)
12,940
(1.51 %)
7,739
(0.88 %)
300 mosses (SZ-1 2022)
GCA_026122775.1
n/a n/a 8,528
(1.45 %)
30,650
(12.43 %)
n/a 33.77
(100.00 %)
0
(0 %)
29
(0.00 %)
26
(100.00 %)
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(2.82 %)
246,537
(2.86 %)
2,464,328
(53.57 %)
0
(0 %)
207,216
(4.76 %)
23,310
(3.24 %)
20,924
(2.78 %)
301 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1
29,893
(12.15 %)
n/a 14,092
(4.40 %)
37,376
(17.73 %)
n/a 34.86
(94.92 %)
15,541
(5.08 %)
15,541
(5.08 %)
46,842
(94.92 %)
317,532
(5.00 %)
190,192
(6.25 %)
2,095,631
(34.49 %)
23
(0.02 %)
174,377
(5.38 %)
20,490
(3.43 %)
14,377
(2.15 %)
302 mung bean (VC1973A 2015 refseq)
GCF_000741045.1
47,653
(11.89 %)
n/a 16,644
(3.87 %)
43,967
(14.67 %)
n/a 33.18
(92.80 %)
0
(0 %)
96,870
(7.24 %)
2,465
(100.00 %)
264,597
(3.31 %)
198,963
(3.34 %)
2,842,720
(34.86 %)
1,607
(0.24 %)
171,020
(3.41 %)
13,975
(1.49 %)
11,070
(1.19 %)
303 muskmelon (AY 2022)
GCF_025177605.1
47,062
(10.58 %)
n/a 13,502
(2.95 %)
32,332
(13.20 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
0
(0 %)
239
(0.01 %)
1,310
(100.00 %)
282,171
(3.23 %)
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(11.70 %)
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(43.94 %)
2
(0.00 %)
208,817
(5.97 %)
18,232
(10.96 %)
10,389
(0.88 %)
304 muskmelon (DHL92 2012)
GCF_000313045.1
35,384
(11.55 %)
n/a 13,191
(3.74 %)
28,295
(11.09 %)
n/a 33.23
(89.51 %)
28,289
(10.51 %)
29,172
(10.51 %)
60,751
(89.49 %)
239,295
(7.85 %)
172,598
(3.17 %)
2,304,858
(33.21 %)
2,241
(0.31 %)
65,619
(1.53 %)
12,855
(1.38 %)
8,985
(0.89 %)
305 Nalta jute (JRO-524 2017)
GCA_002141455.1
n/a n/a 15,450
(3.86 %)
57,930
(23.73 %)
n/a 36.82
(99.97 %)
0
(0 %)
n/a 52,373
(100.00 %)
189,007
(2.22 %)
129,697
(4.38 %)
1,872,307
(38.03 %)
0
(0 %)
152,437
(3.44 %)
11,963
(5.74 %)
8,849
(5.43 %)
306 narrow-leaf cattail (Huaian 2025)
GCF_048772165.1
35,080
(19.76 %)
n/a 14,109
(6.33 %)
27,978
(20.09 %)
n/a 37.69
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 15
(100.00 %)
124,433
(3.10 %)
69,868
(2.56 %)
1,208,522
(27.94 %)
0
(0 %)
73,768
(3.39 %)
21,007
(5.28 %)
12,522
(3.24 %)
307 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1
57,263
(9.83 %)
n/a 22,097
(3.53 %)
51,774
(13.22 %)
n/a 33.46
(99.34 %)
41,534
(0.68 %)
44,657
(0.68 %)
55,107
(99.32 %)
280,867
(4.25 %)
210,750
(5.67 %)
3,920,315
(38.10 %)
91
(0.01 %)
317,435
(5.80 %)
6,462
(0.46 %)
4,024
(0.30 %)
308 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1
44,477
(5.41 %)
n/a 16,928
(1.94 %)
77,682
(16.06 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
0
(0 %)
2,037
(0.00 %)
1,289
(100.00 %)
437,997
(2.33 %)
266,149
(5.08 %)
4,764,252
(34.25 %)
0
(0 %)
733,036
(7.03 %)
20,667
(1.81 %)
10,430
(0.52 %)
309 opium poppy
GCF_003573695.1
127,893
(4.57 %)
n/a 25,532
(0.85 %)
162,032
(9.31 %)
n/a 37.28
(99.80 %)
0
(0 %)
31,183
(0.20 %)
34,381
(100.00 %)
819,294
(1.49 %)
1,050,181
(6.80 %)
10,625,631
(55.85 %)
1,258
(0.01 %)
3,892,620
(14.88 %)
67,521
(1.21 %)
8,156
(0.11 %)
310 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2
39,386
(3.85 %)
n/a 12,208
(0.99 %)
72,906
(8.22 %)
n/a 34.70
(96.03 %)
25,751
(3.92 %)
25,751
(3.92 %)
311,841
(96.08 %)
506,361
(2.45 %)
413,770
(3.23 %)
8,074,114
(39.07 %)
30
(0.00 %)
333,128
(2.81 %)
56,900
(2.34 %)
33,146
(1.22 %)
311 orchid P.equestris
GCF_001263595.1
32,146
(3.36 %)
n/a 11,541
(1.01 %)
54,049
(6.11 %)
n/a 34.46
(92.46 %)
98,814
(7.56 %)
98,814
(7.56 %)
188,398
(92.44 %)
487,071
(2.96 %)
511,903
(4.00 %)
7,060,408
(42.20 %)
338
(0.01 %)
299,811
(3.23 %)
31,179
(1.22 %)
24,162
(0.91 %)
312 Pacific Island silvergrass (M001 2021)
GCF_019320115.1
120,534
(4.81 %)
n/a 39,902
(1.95 %)
276,967
(16.36 %)
n/a 45.32
(99.56 %)
0
(0 %)
4,932
(0.44 %)
2,420
(100.00 %)
764,083
(1.38 %)
810,723
(3.95 %)
11,118,925
(53.40 %)
2
(0.00 %)
2,206,875
(9.93 %)
520,091
(23.03 %)
297,537
(8.57 %)
313 papaya
GCF_000150535.2
29,883
(11.99 %)
n/a 12,860
(4.47 %)
24,403
(11.58 %)
n/a 35.31
(73.55 %)
29,719
(26.47 %)
29,719
(26.47 %)
47,485
(73.53 %)
260,082
(34.69 %)
101,644
(3.59 %)
1,640,647
(28.88 %)
27
(0.03 %)
104,755
(2.22 %)
21,200
(2.95 %)
7,379
(0.74 %)
314 papaya (Sunset 2022)
GCA_022788785.1
n/a n/a 13,725
(4.02 %)
25,348
(10.65 %)
n/a 36.01
(99.88 %)
0
(0 %)
337
(0.12 %)
67
(100.00 %)
385,123
(61.33 %)
131,783
(9.99 %)
2,029,883
(43.40 %)
1
(0.00 %)
469,366
(7.44 %)
25,597
(4.44 %)
4,080
(0.53 %)
315 patchouli (Gaoche1L2016 2018)
GCA_003675935.1
n/a n/a 43,905
(2.21 %)
174,920
(14.40 %)
n/a 35.02
(93.97 %)
170,266
(6.06 %)
170,266
(6.06 %)
211,964
(93.94 %)
1,021,699
(2.86 %)
1,125,321
(8.02 %)
9,388,626
(47.60 %)
4,968
(0.09 %)
1,891,289
(7.85 %)
102,661
(4.26 %)
62,606
(3.39 %)
316 patchouli (shipai S1-5 2022)
GCA_023678885.1
n/a n/a 47,432
(2.32 %)
168,583
(12.17 %)
n/a 34.43
(99.98 %)
0
(0 %)
764
(0.02 %)
966
(100.00 %)
2,043,616
(19.48 %)
1,147,892
(9.18 %)
9,501,180
(53.37 %)
2
(0.00 %)
2,151,784
(10.11 %)
110,140
(2.86 %)
61,261
(1.58 %)
317 peach
GCF_000346465.2
36,201
(20.87 %)
n/a 14,368
(6.26 %)
32,245
(24.09 %)
n/a 37.51
(98.79 %)
2,339
(1.22 %)
2,368
(1.22 %)
2,531
(98.78 %)
150,957
(10.06 %)
96,381
(5.52 %)
1,221,263
(28.72 %)
5
(0.00 %)
160,697
(6.34 %)
7,885
(2.07 %)
5,236
(1.25 %)
318 peanut
GCF_003086295.2
155,835
(5.15 %)
n/a 31,810
(1.19 %)
160,574
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
0
(0 %)
3,655
(0.15 %)
385
(100.00 %)
1,684,814
(3.52 %)
1,488,297
(4.81 %)
11,059,688
(62.32 %)
4
(0.00 %)
2,758,605
(13.90 %)
140,570
(2.45 %)
53,465
(0.84 %)
319 peanut (GDAAS-fuhuasheng2018 2019)
GCA_004170445.1
n/a 118,090
(5.15 %)
31,065
(1.17 %)
158,578
(8.79 %)
n/a 36.33
(98.97 %)
0
(0 %)
32,692
(1.04 %)
29
(100.00 %)
1,735,218
(3.66 %)
1,490,806
(4.26 %)
11,072,983
(61.75 %)
46
(0.00 %)
2,848,217
(13.99 %)
138,890
(2.46 %)
53,191
(0.83 %)
320 peanut (Tifrunner 2023)
GCF_003086295.3
173,169
(5.54 %)
n/a 31,897
(1.19 %)
160,532
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
0
(0 %)
3,697
(0.15 %)
443
(100.00 %)
1,676,149
(3.49 %)
1,489,126
(4.81 %)
11,105,477
(62.30 %)
4
(0.00 %)
2,760,250
(13.91 %)
140,609
(2.45 %)
53,473
(0.84 %)
321 pear (primary hap 2023)
GCF_963583255.1
48,939
(13.04 %)
n/a 22,082
(4.44 %)
56,235
(17.69 %)
n/a 37.45
(99.99 %)
145
(0.01 %)
145
(0.01 %)
176
(99.99 %)
289,539
(2.54 %)
223,443
(3.84 %)
2,308,351
(35.91 %)
0
(0 %)
346,323
(9.15 %)
19,559
(2.15 %)
11,607
(1.07 %)
322 pearl millet (Tift 23D2B1-P1-P5 2018)
GCA_002174835.2
n/a n/a 17,949
(1.26 %)
134,829
(14.30 %)
n/a 47.95
(86.95 %)
0
(0 %)
156,852
(13.08 %)
52,033
(100.00 %)
380,858
(1.16 %)
466,997
(2.83 %)
5,117,134
(56.89 %)
67
(0.01 %)
1,301,284
(8.79 %)
380,989
(29.47 %)
133,080
(5.69 %)
323 pearl millet monocots (2023)
GCA_947561735.1
n/a n/a 17,702
(1.12 %)
131,056
(12.62 %)
n/a 49.54
(99.71 %)
154
(0.29 %)
154
(0.29 %)
161
(99.71 %)
2,363,767
(55.11 %)
562,150
(3.01 %)
6,046,063
(67.25 %)
1
(0.00 %)
1,752,801
(12.30 %)
78,069
(17.77 %)
130,183
(6.25 %)
324 pecan
GCF_018687715.1
71,340
(9.93 %)
n/a 18,671
(2.67 %)
60,632
(15.16 %)
n/a 36.30
(99.97 %)
22
(0.03 %)
22
(0.03 %)
39
(99.97 %)
473,853
(3.66 %)
367,846
(6.75 %)
3,301,121
(39.03 %)
0
(0 %)
415,847
(6.45 %)
27,274
(2.22 %)
9,483
(0.57 %)
325 pepperwort (EHA205 2019)
GCA_009757365.2
n/a n/a 19,770
(7.79 %)
48,832
(21.86 %)
n/a 34.40
(96.79 %)
105,378
(3.36 %)
105,378
(3.36 %)
146,054
(96.64 %)
298,974
(31.14 %)
68,767
(2.63 %)
1,422,489
(26.49 %)
22
(0.00 %)
51,628
(2.04 %)
6,844
(1.17 %)
5,500
(0.89 %)
326 perennial ryegrass (Kyuss_39 2021)
GCF_019359855.1
89,789
(3.75 %)
n/a 17,693
(0.79 %)
174,787
(12.15 %)
n/a 44.32
(100.00 %)
0
(0 %)
238
(0.00 %)
1,677
(100.00 %)
605,852
(1.36 %)
760,915
(5.68 %)
5,216,229
(69.24 %)
1
(0.00 %)
3,457,114
(21.97 %)
542,998
(24.23 %)
170,460
(5.85 %)
327 perennial ryegrass (Kyuss_39 2024)
GCF_019359855.2
81,335
(3.75 %)
n/a 17,678
(0.79 %)
172,584
(12.06 %)
n/a 44.29
(100.00 %)
0
(0 %)
61
(0.00 %)
105
(100.00 %)
610,404
(1.37 %)
758,029
(5.51 %)
5,039,192
(69.30 %)
0
(0 %)
n/a 542,208
(23.92 %)
169,813
(5.85 %)
328 Peruvian cotton (G.raimondii 2012 DOE)
GCF_000327365.2
72,518
(8.99 %)
n/a 20,368
(2.64 %)
52,295
(10.15 %)
n/a 33.21
(98.25 %)
19,685
(1.76 %)
19,685
(1.76 %)
20,680
(98.24 %)
404,885
(2.81 %)
300,062
(3.31 %)
5,198,170
(40.84 %)
35
(0.01 %)
386,235
(4.92 %)
10,912
(0.59 %)
5,481
(0.26 %)
329 Peruvian cotton (GPD5lz 2022)
GCF_025698545.1
63,582
(8.69 %)
n/a 20,265
(2.62 %)
51,815
(10.02 %)
n/a 33.24
(100.00 %)
0
(0 %)
79
(0.00 %)
289
(100.00 %)
405,385
(2.83 %)
306,302
(3.81 %)
5,192,105
(41.79 %)
0
(0 %)
459,153
(6.01 %)
10,481
(0.65 %)
5,557
(0.30 %)
330 Phtheirospermum japonicum (okayama 2020)
GCA_014905375.1
n/a 141,963
(2.71 %)
15,868
(1.22 %)
104,104
(13.39 %)
n/a 36.03
(91.65 %)
318,321
(8.39 %)
318,321
(8.39 %)
328,880
(91.61 %)
810,727
(3.49 %)
710,744
(4.84 %)
7,339,863
(41.43 %)
1,919
(0.27 %)
701,331
(6.60 %)
104,967
(3.98 %)
53,512
(2.02 %)
331 pigeon pea (Asha 2025)
GCF_000230855.2
57,353
(9.44 %)
n/a 16,914
(2.28 %)
54,306
(11.95 %)
n/a 34.70
(100.00 %)
0
(0 %)
72
(0.00 %)
12
(100.00 %)
1,402,691
(69.45 %)
575,837
(7.78 %)
3,503,333
(52.33 %)
1
(0.00 %)
732,900
(12.69 %)
37,233
(3.48 %)
7,341
(0.47 %)
332 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2
46,412
(9.42 %)
n/a 17,396
(3.13 %)
49,710
(12.66 %)
n/a 32.76
(94.18 %)
36,323
(5.83 %)
36,323
(5.83 %)
67,834
(94.17 %)
395,663
(3.40 %)
306,602
(4.71 %)
3,749,364
(39.19 %)
431
(0.18 %)
218,995
(6.80 %)
26,504
(2.90 %)
13,804
(1.15 %)
333 pineapple
GCF_001540865.1
43,025
(11.65 %)
n/a 13,649
(3.36 %)
38,917
(14.95 %)
n/a 38.34
(98.23 %)
0
(0 %)
25,542
(1.78 %)
3,129
(100.00 %)
352,802
(7.31 %)
274,578
(4.75 %)
2,360,455
(38.94 %)
1,024
(0.08 %)
181,776
(4.90 %)
56,724
(11.73 %)
25,940
(3.75 %)
334 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1
37,318
(33.25 %)
n/a 22,836
(23.08 %)
26,822
(33.93 %)
n/a 35.63
(97.53 %)
6,294
(2.49 %)
6,294
(2.49 %)
7,067
(97.51 %)
74,470
(2.42 %)
42,509
(3.39 %)
814,442
(24.99 %)
17
(0.02 %)
72,030
(4.47 %)
5,817
(2.14 %)
4,656
(1.61 %)
335 pistachio
GCF_008641045.1
47,948
(7.92 %)
n/a 18,462
(2.58 %)
62,898
(14.05 %)
n/a 35.95
(99.84 %)
0
(0 %)
16,367
(0.16 %)
1,865
(100.00 %)
363,793
(2.43 %)
253,408
(4.08 %)
4,200,417
(36.34 %)
328
(0.03 %)
912,368
(13.98 %)
22,340
(1.78 %)
7,227
(0.40 %)
336 pocket water lily (Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2
41,223
(10.98 %)
n/a 11,576
(2.50 %)
38,220
(15.70 %)
n/a 38.61
(99.84 %)
624
(0.16 %)
626
(0.16 %)
1,409
(99.84 %)
236,190
(2.95 %)
153,746
(4.02 %)
2,151,579
(26.72 %)
1
(0.00 %)
233,307
(6.34 %)
24,561
(4.48 %)
18,159
(2.45 %)
337 pomegranate
GCF_007655135.1
43,277
(14.87 %)
n/a 14,635
(4.26 %)
39,381
(19.97 %)
n/a 40.38
(99.99 %)
0
(0 %)
188
(0.01 %)
474
(100.00 %)
173,182
(2.28 %)
174,872
(6.81 %)
1,640,973
(32.89 %)
0
(0 %)
305,785
(9.75 %)
26,506
(9.18 %)
19,716
(2.82 %)
338 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1
43,754
(6.67 %)
n/a 16,547
(2.25 %)
54,186
(11.30 %)
n/a 34.71
(88.41 %)
0
(0 %)
37,060
(11.60 %)
17,084
(100.00 %)
321,938
(2.14 %)
250,793
(4.04 %)
5,136,691
(33.92 %)
622
(0.03 %)
635,238
(7.14 %)
8,536
(0.30 %)
2,755
(0.11 %)
339 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1
n/a n/a 16,861
(1.98 %)
58,882
(12.19 %)
n/a 35.40
(99.95 %)
0
(0 %)
4,397
(0.05 %)
3,012
(100.00 %)
774,417
(46.83 %)
392,378
(8.45 %)
5,068,449
(42.72 %)
5
(0.00 %)
683,257
(6.89 %)
14,548
(1.32 %)
5,450
(0.63 %)
340 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1
n/a n/a 17,614
(2.86 %)
45,684
(10.75 %)
n/a 34.49
(83.57 %)
0
(0 %)
10,041,161
(17.84 %)
12
(100.00 %)
606,573
(40.80 %)
168,871
(2.58 %)
5,508,800
(26.36 %)
2,083
(0.22 %)
353,156
(3.75 %)
5,550
(0.22 %)
1,730
(0.08 %)
341 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1
43,158
(7.63 %)
n/a 16,423
(2.55 %)
50,333
(11.79 %)
n/a 34.83
(93.98 %)
45,215
(6.04 %)
45,215
(6.04 %)
60,069
(93.96 %)
662,626
(43.42 %)
212,315
(4.38 %)
4,691,843
(34.91 %)
197
(0.07 %)
495,920
(6.36 %)
9,851
(0.45 %)
2,428
(0.13 %)
342 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1
n/a 38,210
(5.48 %)
16,415
(2.15 %)
54,766
(12.48 %)
n/a 35.21
(99.98 %)
0
(0 %)
1,476
(0.02 %)
25
(100.00 %)
329,233
(2.28 %)
285,101
(5.66 %)
4,832,189
(40.28 %)
7
(0.00 %)
779,042
(9.76 %)
12,944
(0.99 %)
3,186
(0.15 %)
343 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1
n/a 38,661
(5.67 %)
16,694
(2.26 %)
53,990
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
0
(0 %)
1,499
(0.02 %)
28
(100.00 %)
323,447
(2.25 %)
283,098
(5.39 %)
4,727,964
(39.87 %)
9
(0.00 %)
709,848
(9.38 %)
12,316
(1.34 %)
3,210
(0.16 %)
344 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1
n/a 37,965
(5.56 %)
16,713
(2.23 %)
54,380
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
0
(0 %)
1,299
(0.02 %)
27
(100.00 %)
329,807
(2.31 %)
282,372
(6.11 %)
4,718,807
(40.25 %)
6
(0.00 %)
757,191
(9.75 %)
11,812
(1.00 %)
3,132
(0.16 %)
345 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1
n/a 37,999
(5.47 %)
16,640
(2.18 %)
54,937
(12.38 %)
n/a 35.18
(99.98 %)
0
(0 %)
1,383
(0.02 %)
26
(100.00 %)
329,665
(2.30 %)
285,993
(6.03 %)
4,858,802
(40.32 %)
5
(0.00 %)
770,923
(9.65 %)
12,792
(1.32 %)
3,224
(0.15 %)
346 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1
n/a n/a 16,312
(2.05 %)
54,438
(12.18 %)
n/a 35.23
(99.95 %)
0
(0 %)
4,448
(0.05 %)
12
(100.00 %)
730,464
(46.17 %)
338,389
(7.95 %)
4,903,557
(41.90 %)
3
(0.00 %)
602,727
(6.48 %)
12,226
(0.72 %)
3,229
(0.36 %)
347 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1
35,846
(6.75 %)
n/a 16,408
(2.54 %)
48,924
(11.75 %)
n/a 34.59
(99.55 %)
0
(0 %)
1,612
(0.45 %)
1,332
(100.00 %)
297,683
(2.31 %)
234,616
(4.68 %)
4,308,149
(38.02 %)
6
(0.00 %)
555,565
(8.09 %)
8,192
(0.47 %)
2,567
(0.16 %)
348 prickly lettuce (US96UC23 2025)
GCF_051521515.1
66,922
(2.53 %)
n/a 16,788
(0.59 %)
105,592
(5.80 %)
n/a 37.85
(99.99 %)
0
(0 %)
20
(0.01 %)
111
(100.00 %)
3,552,511
(84.61 %)
1,265,144
(4.63 %)
12,820,045
(61.14 %)
0
(0 %)
2,588,443
(13.98 %)
147,439
(2.62 %)
9,959
(0.22 %)
349 Primulina tabacum (GXHZ01 2022)
GCF_025594145.1
69,821
(7.75 %)
n/a 19,604
(2.27 %)
61,800
(12.08 %)
n/a 36.89
(99.89 %)
0
(0 %)
1,710
(0.11 %)
541
(100.00 %)
310,321
(1.81 %)
229,404
(3.84 %)
4,409,199
(51.65 %)
4
(0.00 %)
929,563
(14.37 %)
40,094
(1.87 %)
11,101
(0.59 %)
350 proso millet (2018)
GCA_003046395.2
n/a 56,011
(10.30 %)
31,203
(4.33 %)
106,251
(25.92 %)
n/a 46.82
(98.02 %)
0
(0 %)
4,232
(1.98 %)
1,306
(100.00 %)
252,710
(1.48 %)
176,920
(3.16 %)
3,051,223
(41.53 %)
5
(0.00 %)
527,825
(6.53 %)
159,364
(32.38 %)
90,391
(10.54 %)
351 quinoa
GCF_001683475.1
74,918
(7.49 %)
n/a 22,914
(1.61 %)
105,619
(12.97 %)
n/a 36.87
(99.16 %)
0
(0 %)
725
(0.84 %)
3,487
(100.00 %)
810,277
(3.58 %)
762,903
(10.88 %)
6,551,884
(49.49 %)
4
(0.00 %)
1,419,103
(10.00 %)
93,630
(2.98 %)
16,962
(0.42 %)
352 radish (v2 WK10039 2023)
GCF_000801105.2
80,681
(20.53 %)
n/a 36,039
(9.58 %)
74,081
(26.98 %)
n/a 36.00
(99.94 %)
0
(0 %)
2,853
(0.06 %)
6,424
(100.00 %)
224,524
(2.48 %)
193,525
(5.49 %)
2,234,480
(35.04 %)
14
(0.00 %)
283,224
(8.64 %)
25,972
(4.13 %)
19,291
(2.12 %)
353 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1
152,744
(19.27 %)
n/a 57,668
(6.87 %)
143,092
(23.51 %)
n/a 37.13
(99.99 %)
0
(0 %)
840
(0.01 %)
3,167
(100.00 %)
470,302
(2.29 %)
578,281
(9.24 %)
4,662,467
(42.41 %)
1
(0.00 %)
1,025,228
(11.11 %)
64,287
(5.62 %)
37,609
(1.71 %)
354 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2
144,991
(17.51 %)
n/a 59,743
(7.71 %)
146,391
(26.97 %)
n/a 36.47
(92.96 %)
32,639
(7.05 %)
32,639
(7.05 %)
34,110
(92.95 %)
449,257
(2.67 %)
441,269
(5.84 %)
4,867,601
(32.91 %)
89
(0.03 %)
658,497
(14.71 %)
60,082
(3.53 %)
39,673
(1.84 %)
355 red clover eudicots (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1
63,238
(17.01 %)
n/a 17,857
(4.13 %)
43,079
(17.27 %)
n/a 33.71
(99.97 %)
0
(0 %)
231
(0.03 %)
90
(100.00 %)
241,481
(2.65 %)
187,674
(4.85 %)
2,251,582
(37.03 %)
1
(0.00 %)
244,435
(10.76 %)
6,474
(1.93 %)
2,754
(0.26 %)
356 red sage (Shanhuang shh 2023)
GCF_028751815.1
62,715
(12.27 %)
n/a 15,176
(2.61 %)
67,175
(21.50 %)
n/a 37.47
(99.58 %)
0
(0 %)
695
(0.42 %)
173
(100.00 %)
377,231
(3.52 %)
364,027
(5.05 %)
2,679,528
(42.07 %)
0
(0 %)
345,738
(11.98 %)
64,243
(6.17 %)
38,544
(3.36 %)
357 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2
71,160
(1.59 %)
n/a 18,911
(0.39 %)
321,741
(10.16 %)
n/a 45.91
(99.38 %)
0
(0 %)
33,814
(0.62 %)
10,205
(100.00 %)
1,208,165
(1.25 %)
1,319,817
(2.96 %)
15,480,313
(71.93 %)
63
(0.00 %)
4,311,556
(9.89 %)
975,234
(26.52 %)
315,788
(5.36 %)
358 redroot sage (bh2-7 2020)
GCA_016432925.1
n/a n/a 15,208
(2.55 %)
68,573
(21.07 %)
n/a 37.68
(99.37 %)
0
(0 %)
2,815
(0.63 %)
1,118
(100.00 %)
628,541
(17.44 %)
380,078
(5.18 %)
2,710,697
(43.28 %)
3
(0.00 %)
448,238
(11.28 %)
66,987
(6.29 %)
38,723
(3.32 %)
359 Rhododendron vialii eudicots (Sample 1 2023)
GCF_030253575.1
62,168
(11.90 %)
n/a 15,363
(2.73 %)
54,203
(18.86 %)
n/a 39.52
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
18
(100.00 %)
253,965
(2.10 %)
235,379
(9.36 %)
2,668,584
(34.08 %)
0
(0 %)
473,456
(8.03 %)
31,789
(3.72 %)
15,314
(1.18 %)
360 rice bean (VRB3 2023)
GCA_029865625.1
n/a n/a 18,823
(3.07 %)
63,430
(18.52 %)
n/a 34.56
(96.54 %)
0
(0 %)
4,440
(3.46 %)
232
(100.00 %)
1,016,591
(59.80 %)
384,326
(8.33 %)
3,318,479
(40.76 %)
2
(0.00 %)
720,793
(11.00 %)
30,562
(3.41 %)
9,362
(0.63 %)
361 rice bean eudicots (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1
38,736
(11.89 %)
n/a 16,669
(4.18 %)
43,369
(14.64 %)
n/a 32.90
(93.47 %)
0
(0 %)
20,717
(6.53 %)
15,445
(100.00 %)
233,635
(3.33 %)
204,141
(4.85 %)
2,682,022
(32.58 %)
1,663
(0.61 %)
168,485
(17.02 %)
16,828
(2.07 %)
12,921
(1.48 %)
362 riverbank grape
GCF_004353265.1
44,851
(10.22 %)
n/a 15,302
(3.01 %)
46,011
(14.96 %)
n/a 34.32
(98.79 %)
0
(0 %)
1,095
(1.21 %)
175
(100.00 %)
339,984
(3.03 %)
233,259
(4.71 %)
2,925,914
(35.27 %)
0
(0 %)
315,118
(6.27 %)
11,055
(0.93 %)
6,847
(0.55 %)
363 robusta coffee (DH200=94 2014)
GCA_900059795.1
n/a 151,088
(19.99 %)
13,770
(2.74 %)
46,992
(16.51 %)
n/a 36.65
(82.89 %)
12,209
(17.11 %)
12,714
(17.11 %)
25,216
(82.89 %)
219,723
(2.15 %)
140,449
(2.62 %)
2,590,105
(28.19 %)
58
(0.02 %)
240,126
(5.03 %)
12,700
(1.66 %)
6,826
(1.25 %)
364 rose gum (2021)
GCF_016545825.1
54,676
(10.44 %)
n/a 16,291
(2.42 %)
69,492
(17.92 %)
n/a 39.39
(99.97 %)
0
(0 %)
1,712
(0.03 %)
37
(100.00 %)
358,171
(2.83 %)
259,031
(3.65 %)
3,353,128
(29.52 %)
0
(0 %)
415,146
(6.29 %)
78,731
(7.66 %)
52,846
(4.32 %)
365 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1
65,107
(11.08 %)
n/a 16,389
(2.33 %)
74,557
(18.16 %)
n/a 39.28
(92.69 %)
27,773
(7.32 %)
27,773
(7.32 %)
32,724
(92.68 %)
357,835
(2.50 %)
266,806
(3.22 %)
3,496,176
(27.34 %)
26
(0.01 %)
382,719
(5.52 %)
79,393
(6.54 %)
53,321
(3.81 %)
366 rose of Sharon
GCF_006381635.1
91,942
(5.18 %)
n/a 44,363
(2.23 %)
136,768
(10.14 %)
n/a 34.23
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
1,789
(100.00 %)
889,945
(2.72 %)
968,890
(4.91 %)
9,836,479
(51.73 %)
0
(0 %)
1,733,920
(9.74 %)
42,560
(0.89 %)
24,846
(0.50 %)
367 rubber tree (MT/VB/25A 57/8 2023)
GCF_030052815.1
71,258
(4.21 %)
n/a 22,208
(1.24 %)
63,302
(5.13 %)
n/a 34.70
(91.68 %)
0
(0 %)
1,428
(8.32 %)
755
(100.00 %)
1,078,590
(2.96 %)
730,314
(3.70 %)
6,031,831
(65.59 %)
1
(0.00 %)
2,789,876
(17.34 %)
24,263
(0.70 %)
3,609
(0.09 %)
368 rubber tree (reyan7-33-97 2016)
GCF_001654055.1
66,124
(5.23 %)
n/a 22,033
(1.63 %)
59,727
(6.42 %)
n/a 34.84
(94.20 %)
0
(0 %)
40,863
(5.81 %)
7,453
(100.00 %)
827,088
(3.02 %)
565,394
(5.23 %)
5,065,470
(61.59 %)
175
(0.01 %)
1,757,812
(14.15 %)
13,573
(0.45 %)
3,195
(0.09 %)
369 S.splendens huo1 eudicots (BFU 2021)
GCF_004379255.1
94,414
(12.61 %)
n/a 31,218
(3.57 %)
108,219
(21.49 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
471
(0.00 %)
1,178
(100.00 %)
360,314
(2.17 %)
419,051
(4.85 %)
3,875,932
(41.07 %)
0
(0 %)
569,178
(10.09 %)
105,227
(10.14 %)
53,473
(3.53 %)
370 sacred lotus
GCF_000365185.1
43,140
(7.01 %)
n/a 15,920
(2.13 %)
61,231
(13.11 %)
n/a 38.30
(87.98 %)
54,825
(12.04 %)
175,846
(12.06 %)
58,428
(87.96 %)
408,351
(2.83 %)
275,384
(2.52 %)
4,643,876
(30.20 %)
1,786
(0.17 %)
181,461
(2.08 %)
40,599
(2.68 %)
14,757
(0.70 %)
371 saltwater cress
GCF_000478725.1
38,705
(18.07 %)
n/a 21,851
(11.68 %)
39,487
(28.65 %)
n/a 37.71
(98.09 %)
3,020
(1.92 %)
3,020
(1.92 %)
3,658
(98.08 %)
102,162
(1.93 %)
70,755
(3.25 %)
1,162,538
(32.09 %)
12
(0.00 %)
173,482
(8.35 %)
15,272
(3.87 %)
8,448
(1.72 %)
372 sandblossoms (Phelan CA IGA184 alternate hap 2022)
GCA_023055565.1
n/a n/a 14,138
(0.74 %)
125,370
(12.27 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
581
(100.00 %)
655,331
(1.73 %)
500,899
(4.88 %)
7,172,490
(54.24 %)
0
(0 %)
1,964,428
(14.05 %)
140,800
(5.87 %)
37,685
(0.83 %)
373 sandblossoms (Phelan CA IGA184 primary hap 2022)
GCA_023055425.1
n/a n/a 15,588
(0.93 %)
117,831
(12.94 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
0
(0 %)
85
(0.00 %)
123
(100.00 %)
597,532
(1.81 %)
430,194
(3.80 %)
6,075,115
(49.91 %)
0
(0 %)
1,442,089
(12.90 %)
129,512
(5.41 %)
37,172
(1.01 %)
374 scarlet sage (huo1 2021)
GCF_004379255.2
94,251
(12.60 %)
n/a 31,266
(3.58 %)
108,141
(21.47 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
471
(0.00 %)
1,162
(100.00 %)
357,482
(2.10 %)
419,009
(4.86 %)
3,874,047
(41.08 %)
0
(0 %)
569,081
(10.09 %)
105,216
(10.11 %)
53,473
(3.50 %)
375 scented satinash
GCF_900635055.1
42,531
(12.21 %)
n/a 15,353
(3.67 %)
53,811
(20.61 %)
n/a 40.64
(89.65 %)
0
(0 %)
11,862
(10.35 %)
19,039
(100.00 %)
179,421
(2.10 %)
174,902
(3.34 %)
1,785,894
(25.35 %)
754
(0.12 %)
147,815
(3.18 %)
55,685
(7.69 %)
32,621
(3.67 %)
376 sesame
GCF_000512975.1
38,693
(16.95 %)
n/a 15,555
(5.41 %)
35,316
(19.66 %)
n/a 35.00
(98.34 %)
9,940
(1.66 %)
9,940
(1.66 %)
26,176
(98.34 %)
161,123
(2.85 %)
79,750
(3.97 %)
1,807,029
(31.02 %)
30
(0.02 %)
138,850
(4.01 %)
9,873
(1.80 %)
8,633
(1.51 %)
377 shrubby jointvetch A. evenia (CIAT22838 2020)
GCA_013621005.1
n/a n/a 16,242
(4.30 %)
39,583
(17.06 %)
n/a 35.22
(98.66 %)
0
(0 %)
2,946
(1.35 %)
1,451
(100.00 %)
253,228
(3.98 %)
186,657
(9.89 %)
1,792,662
(45.14 %)
3
(0.00 %)
432,106
(10.05 %)
19,928
(3.29 %)
10,449
(1.27 %)
378 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1
46,475
(12.62 %)
n/a 17,469
(4.11 %)
51,531
(21.75 %)
n/a 40.30
(93.72 %)
0
(0 %)
7,529
(6.28 %)
15,781
(100.00 %)
194,855
(2.07 %)
116,828
(2.25 %)
1,801,472
(25.38 %)
688
(0.10 %)
103,430
(2.38 %)
44,191
(5.74 %)
32,233
(3.75 %)
379 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1
43,419
(12.78 %)
n/a 14,758
(4.01 %)
41,180
(19.74 %)
n/a 40.38
(100.00 %)
0
(0 %)
36
(0.00 %)
75
(100.00 %)
160,749
(1.91 %)
114,741
(3.07 %)
1,619,569
(28.25 %)
0
(0 %)
213,237
(6.51 %)
43,290
(7.15 %)
31,834
(4.39 %)
380 silver poplar
GCF_005239225.1
53,066
(14.64 %)
n/a 20,299
(4.74 %)
44,556
(16.36 %)
n/a 33.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,287
(100.00 %)
309,097
(3.34 %)
175,288
(4.77 %)
2,457,634
(38.38 %)
0
(0 %)
273,621
(6.75 %)
4,613
(0.67 %)
2,159
(0.21 %)
381 silverweed cinquefoil (primary hap 2022)
GCF_933775445.1
28,734
(15.21 %)
n/a 13,143
(5.29 %)
32,007
(22.39 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
147
(100.00 %)
89,958
(1.86 %)
351,649
(15.29 %)
884,646
(35.58 %)
1
(0.00 %)
145,999
(6.99 %)
14,711
(4.52 %)
10,781
(1.93 %)
382 sorghum (BTx623 2017)
GCF_000003195.3
48,290
(8.57 %)
n/a 17,901
(3.45 %)
73,969
(19.64 %)
n/a 43.88
(95.30 %)
3,906
(4.70 %)
3,906
(4.70 %)
4,775
(95.30 %)
556,607
(65.39 %)
177,271
(4.54 %)
2,371,199
(48.20 %)
8
(0.00 %)
681,841
(11.76 %)
110,115
(18.82 %)
53,717
(5.80 %)
383 sorghum (Tx430 2018)
GCA_003482435.1
n/a n/a 18,138
(3.63 %)
75,180
(20.67 %)
n/a 43.67
(97.96 %)
0
(0 %)
2,108
(2.04 %)
308
(100.00 %)
559,950
(63.17 %)
156,952
(3.01 %)
2,481,716
(46.70 %)
0
(0 %)
578,722
(10.40 %)
109,923
(19.06 %)
54,889
(6.80 %)
384 soybean (EMBRAPA BRS 537 2021)
GCA_012273815.2
n/a 88,253
(9.67 %)
27,746
(3.01 %)
77,617
(11.66 %)
n/a 34.80
(97.95 %)
0
(0 %)
340
(2.05 %)
95
(100.00 %)
1,182,211
(56.35 %)
444,701
(6.81 %)
5,365,860
(45.98 %)
0
(0 %)
724,080
(6.80 %)
35,684
(1.48 %)
10,676
(0.46 %)
385 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6
88,006
(9.87 %)
n/a 27,705
(3.08 %)
77,033
(11.88 %)
n/a 34.74
(97.36 %)
8,916
(2.65 %)
8,918
(2.65 %)
9,199
(97.35 %)
848,398
(38.02 %)
434,042
(5.29 %)
5,346,884
(45.07 %)
27
(0.00 %)
622,402
(6.12 %)
35,893
(1.55 %)
13,146
(0.57 %)
386 soybean (Williams 82 2023)
GCA_030864155.1
n/a n/a 27,960
(2.93 %)
77,762
(11.36 %)
n/a 35.02
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 20
(100.00 %)
549,577
(2.73 %)
453,208
(9.60 %)
5,325,393
(48.31 %)
0
(0 %)
864,597
(7.83 %)
36,641
(1.53 %)
13,322
(0.59 %)
387 spider flower
GCF_000463585.1
45,524
(22.00 %)
n/a 21,103
(10.40 %)
38,184
(27.17 %)
n/a 39.40
(87.71 %)
24,824
(12.32 %)
24,824
(12.32 %)
37,073
(87.68 %)
144,827
(3.22 %)
103,970
(4.10 %)
1,118,840
(31.64 %)
50
(0.05 %)
164,935
(7.42 %)
29,313
(6.47 %)
16,566
(3.30 %)
388 spinach (Sp75 2017)
GCF_002007265.1
41,411
(5.75 %)
n/a 12,540
(1.38 %)
68,522
(12.26 %)
n/a 37.82
(95.53 %)
0
(0 %)
137,086
(4.48 %)
78,263
(100.00 %)
374,336
(2.48 %)
670,331
(6.78 %)
3,213,561
(52.82 %)
65,364
(1.04 %)
758,332
(10.61 %)
89,520
(4.54 %)
17,491
(0.71 %)
389 spinach (Varoflay 2021)
GCF_020520425.1
58,433
(7.11 %)
n/a 12,431
(1.27 %)
61,084
(11.35 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
0
(0 %)
63
(0.00 %)
246
(100.00 %)
378,521
(2.27 %)
722,814
(6.29 %)
2,950,586
(58.17 %)
0
(0 %)
972,333
(15.38 %)
92,256
(5.21 %)
18,749
(0.72 %)
390 spotted monkey flower
GCF_000504015.1
34,441
(15.56 %)
n/a 14,508
(4.41 %)
34,904
(18.83 %)
n/a 35.50
(93.50 %)
15,528
(6.52 %)
15,528
(6.52 %)
17,740
(93.48 %)
227,143
(4.28 %)
204,234
(11.85 %)
1,776,879
(40.60 %)
19
(0.01 %)
338,940
(10.42 %)
21,718
(3.89 %)
14,899
(2.46 %)
391 spreading earthmoss (2024)
GCF_000002425.5
52,765
(10.63 %)
n/a 8,496
(1.48 %)
30,423
(12.59 %)
n/a 33.71
(99.04 %)
0
(0 %)
1,794
(0.96 %)
359
(100.00 %)
293,130
(2.79 %)
242,633
(2.68 %)
2,405,680
(52.61 %)
4
(0.00 %)
168,306
(4.17 %)
22,672
(3.11 %)
20,700
(2.71 %)
392 stiff brome
GCF_000005505.3
47,531
(20.35 %)
n/a 15,530
(6.01 %)
45,735
(34.29 %)
n/a 46.40
(99.84 %)
25
(0.16 %)
27
(0.16 %)
36
(99.84 %)
108,976
(17.41 %)
54,391
(1.94 %)
1,197,052
(21.34 %)
0
(0 %)
71,157
(2.72 %)
48,209
(34.43 %)
42,088
(12.51 %)
393 strawberry (Benihoppe 2023)
GCA_034370585.1
n/a n/a 45,858
(5.68 %)
123,100
(24.81 %)
n/a 39.34
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28
(100.00 %)
934,221
(35.80 %)
376,936
(6.46 %)
3,304,328
(31.01 %)
0
(0 %)
428,062
(6.06 %)
69,530
(5.73 %)
39,124
(2.30 %)
394 strawberry (Reikou 2013)
GCA_000511835.1
n/a n/a 15,045
(1.35 %)
164,045
(15.16 %)
n/a 38.82
(94.24 %)
88,316
(5.63 %)
89,898
(5.63 %)
714,282
(94.37 %)
278,640
(1.91 %)
388,660
(6.94 %)
3,639,568
(28.92 %)
271
(0.01 %)
n/a 64,180
(3.80 %)
21,117
(1.05 %)
395 sugarcane (2018)
GCA_900465005.1
n/a n/a 18,847
(4.51 %)
76,529
(27.07 %)
n/a 45.11
(99.96 %)
1,423
(0.03 %)
1,423
(0.03 %)
7,128
(99.97 %)
258,594
(29.31 %)
144,716
(2.51 %)
1,976,510
(35.41 %)
436
(0.05 %)
268,312
(8.56 %)
113,324
(26.96 %)
87,385
(13.10 %)
396 sugarcane (CC_01_1940 2021)
GCA_020102875.1
n/a n/a 25,299
(3.45 %)
146,261
(29.51 %)
n/a 45.01
(99.92 %)
36
(0.00 %)
7,046
(0.08 %)
35,074
(100.00 %)
302,307
(1.66 %)
272,248
(3.71 %)
4,068,281
(29.60 %)
3
(0.00 %)
439,969
(6.05 %)
204,656
(25.44 %)
162,729
(13.61 %)
397 sugarcane (SP80-3280 WGSA1 2019)
GCA_008692665.1
n/a n/a 78,903
(2.31 %)
756,432
(27.56 %)
n/a 43.71
(99.98 %)
36
(0.00 %)
36
(0.00 %)
398,389
(100.00 %)
1,981,854
(25.32 %)
926,250
(3.55 %)
15,903,748
(41.06 %)
0
(0 %)
n/a 829,054
(16.97 %)
583,556
(9.83 %)
398 sweet cherry
GCF_002207925.1
39,968
(19.06 %)
n/a 15,007
(5.83 %)
38,107
(23.61 %)
n/a 37.72
(90.64 %)
0
(0 %)
22,628
(9.39 %)
10,148
(100.00 %)
136,700
(2.47 %)
104,376
(7.20 %)
1,484,591
(25.20 %)
40
(0.03 %)
225,280
(8.38 %)
9,956
(2.27 %)
6,378
(1.39 %)
399 sweet cherry (Tieton 2020)
GCA_014155035.1
n/a n/a 15,140
(4.31 %)
39,977
(20.09 %)
n/a 38.44
(99.98 %)
0
(0 %)
2,194
(0.02 %)
61
(100.00 %)
189,726
(2.51 %)
150,018
(21.96 %)
1,231,274
(44.86 %)
0
(0 %)
701,846
(16.32 %)
12,897
(3.14 %)
6,700
(0.94 %)
400 sweet orange
GCF_000317415.1
46,820
(15.94 %)
n/a 14,390
(4.63 %)
34,480
(18.04 %)
n/a 34.07
(91.90 %)
12,539
(8.11 %)
12,539
(8.11 %)
17,383
(91.89 %)
185,212
(2.95 %)
104,182
(4.92 %)
2,119,183
(29.53 %)
106
(0.11 %)
143,275
(8.59 %)
6,540
(0.93 %)
4,953
(0.65 %)
401 sweet potato (Taizhong6 2017)
GCA_002525835.2
n/a n/a 23,319
(2.45 %)
98,107
(18.19 %)
n/a 35.14
(88.01 %)
0
(0 %)
171,925
(12.06 %)
28,461
(100.00 %)
579,745
(3.87 %)
473,175
(3.79 %)
4,850,126
(32.44 %)
96
(0.01 %)
493,077
(6.15 %)
52,715
(3.15 %)
42,259
(2.50 %)
402 sweet wormwood (Huhao1# 2018)
GCA_003112345.1
n/a 66,918
(4.98 %)
22,279
(1.15 %)
121,694
(10.54 %)
n/a 35.34
(91.81 %)
275,164
(8.22 %)
275,710
(8.22 %)
314,564
(91.78 %)
856,470
(2.64 %)
970,252
(5.69 %)
7,570,175
(42.39 %)
33,170
(1.01 %)
1,556,972
(12.95 %)
29,072
(0.54 %)
6,559
(0.13 %)
403 switchgrass
GCF_016808335.1
114,876
(10.54 %)
n/a 31,534
(3.21 %)
152,844
(27.54 %)
n/a 46.79
(99.59 %)
464
(0.41 %)
464
(0.41 %)
1,091
(99.59 %)
395,905
(1.77 %)
323,173
(5.10 %)
4,922,182
(39.47 %)
0
(0 %)
921,472
(10.02 %)
213,249
(32.45 %)
151,346
(11.21 %)
404 Tartarian buckwheat (Pinku1 2017)
GCA_002319775.1
n/a n/a 15,605
(2.84 %)
50,437
(14.57 %)
n/a 38.53
(96.71 %)
0
(0 %)
2,456
(3.29 %)
7,020
(100.00 %)
257,784
(2.74 %)
211,756
(3.88 %)
2,209,417
(41.80 %)
2
(0.00 %)
363,246
(7.54 %)
54,125
(5.80 %)
14,956
(1.19 %)
405 Tasmanian pepperberry (RefF3 2024)
GCF_043159265.1
65,925
(7.32 %)
n/a 16,247
(1.53 %)
76,786
(13.23 %)
n/a 39.37
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,338
(100.00 %)
1,968,661
(26.22 %)
626,214
(13.70 %)
4,298,324
(45.52 %)
0
(0 %)
1,135,617
(13.56 %)
32,932
(4.92 %)
11,768
(0.50 %)
406 Tausch's goatgrass monocots
GCF_002575655.2
84,334
(2.18 %)
n/a 17,888
(0.44 %)
263,541
(10.26 %)
n/a 46.33
(97.97 %)
0
(0 %)
69,858
(2.04 %)
109,197
(100.00 %)
1,492,485
(15.65 %)
1,422,870
(5.39 %)
12,521,384
(71.80 %)
234
(0.01 %)
n/a 881,939
(30.07 %)
257,833
(5.24 %)
407 thale cress (Landsberg erecta 2016)
GCA_001651475.1
n/a 30,849
(38.15 %)
26,053
(33.97 %)
25,713
(36.19 %)
n/a 36.01
(98.51 %)
0
(0 %)
3,479
(1.50 %)
30
(100.00 %)
65,429
(14.19 %)
24,979
(1.85 %)
739,651
(21.49 %)
24
(0.01 %)
27,629
(3.21 %)
4,443
(1.81 %)
3,496
(1.38 %)
408 thale cress (tair10.1 Columbia 2018)
GCF_000001735.4
53,852
(40.10 %)
n/a 26,582
(34.47 %)
11,416
(18.70 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
0
(0 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
68,517
(16.50 %)
27,064
(2.77 %)
749,005
(22.64 %)
1
(0.00 %)
42,547
(3.36 %)
4,601
(1.63 %)
3,518
(1.15 %)
409 thunder duke vine
GCF_013401445.1
56,436
(17.59 %)
n/a 20,174
(5.61 %)
42,326
(19.85 %)
n/a 37.58
(99.96 %)
0
(0 %)
146
(0.04 %)
321
(100.00 %)
125,395
(2.23 %)
102,179
(22.89 %)
1,226,273
(38.50 %)
0
(0 %)
599,313
(13.69 %)
6,893
(1.71 %)
5,408
(0.61 %)
410 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1
50,668
(2.79 %)
n/a 17,479
(0.82 %)
117,543
(8.63 %)
n/a 40.23
(88.38 %)
0
(0 %)
119,817
(11.63 %)
37,194
(100.00 %)
622,838
(1.51 %)
788,520
(3.46 %)
11,822,060
(48.66 %)
133
(0.01 %)
2,124,644
(8.96 %)
174,838
(3.17 %)
26,771
(0.55 %)
411 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2
66,966
(3.67 %)
n/a 17,141
(1.02 %)
81,513
(6.82 %)
n/a 38.89
(97.29 %)
56,061
(2.71 %)
213,074
(2.72 %)
215,609
(97.29 %)
486,556
(1.53 %)
669,040
(5.52 %)
10,446,746
(53.83 %)
19,953
(0.37 %)
1,327,454
(6.88 %)
118,807
(2.33 %)
10,195
(0.20 %)
412 tomato (2024)
GCF_036512215.1
59,947
(8.20 %)
n/a 15,474
(1.94 %)
40,638
(7.50 %)
n/a 35.17
(99.99 %)
0
(0 %)
166
(0.01 %)
14
(100.00 %)
333,077
(2.31 %)
259,232
(7.09 %)
5,402,596
(43.04 %)
8
(0.00 %)
851,692
(8.46 %)
31,740
(4.85 %)
2,381
(0.10 %)
413 tomato (Micro-Tom 2020)
GCA_012431665.1
n/a n/a 15,607
(2.04 %)
39,981
(7.57 %)
n/a 34.32
(97.69 %)
0
(0 %)
1,323
(2.31 %)
391
(100.00 %)
433,628
(20.28 %)
248,928
(3.94 %)
5,440,564
(39.72 %)
0
(0 %)
581,883
(6.70 %)
31,891
(1.72 %)
2,440
(0.12 %)
414 tomato (Micro-Tom S9 2023)
GCA_030162295.1
n/a n/a 15,496
(2.07 %)
38,799
(7.36 %)
n/a 34.40
(98.25 %)
0
(0 %)
32,234
(1.76 %)
165
(100.00 %)
1,028,324
(71.24 %)
249,749
(4.56 %)
5,384,286
(39.87 %)
177
(0.03 %)
610,496
(6.85 %)
27,343
(1.53 %)
1,333
(0.06 %)
415 tomato (SL2.40 Heinz 1706 2011)
GCF_000188115.2
27,494
(5.67 %)
28,387
(16.03 %)
15,425
(2.18 %)
38,304
(7.61 %)
n/a 34.05
(94.42 %)
23,733
(5.59 %)
23,821
(5.59 %)
26,878
(94.41 %)
401,908
(17.67 %)
226,398
(3.30 %)
5,383,317
(36.48 %)
247
(0.02 %)
386,262
(4.26 %)
23,490
(1.26 %)
2,344
(0.12 %)
416 tomato (SL3.1 Heinz 1706 2018 refseq)
GCF_000188115.5
45,958
(6.93 %)
n/a 15,425
(2.15 %)
38,319
(7.54 %)
n/a 34.12
(90.19 %)
0
(0 %)
19,539
(9.82 %)
3,066
(100.00 %)
311,852
(2.14 %)
229,773
(3.18 %)
5,390,626
(35.26 %)
224
(0.02 %)
412,055
(4.41 %)
25,196
(1.27 %)
2,324
(0.10 %)
417 tomato (SL4.0 Heinz 1706 2025 genbank)
GCA_000188115.5
n/a n/a 15,635
(2.10 %)
39,369
(7.58 %)
n/a 34.33
(100.00 %)
26
(0.00 %)
285
(0.00 %)
178
(100.00 %)
1,007,736
(71.07 %)
244,768
(4.08 %)
5,371,841
(40.42 %)
0
(0 %)
560,796
(6.70 %)
30,469
(1.95 %)
1,541
(0.09 %)
418 toyon (HeAr 88 alternate hap 2022)
GCA_024363235.1
n/a n/a 22,795
(3.47 %)
67,418
(16.40 %)
n/a 38.17
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
75
(100.00 %)
347,375
(3.07 %)
304,988
(3.96 %)
3,119,641
(40.22 %)
0
(0 %)
481,094
(9.09 %)
30,300
(3.29 %)
15,155
(0.98 %)
419 toyon (HeAr 88 primary hap 2022)
GCA_024362995.1
n/a n/a 22,897
(3.50 %)
67,595
(16.43 %)
n/a 38.12
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
118
(100.00 %)
344,928
(2.90 %)
299,566
(3.87 %)
3,139,734
(39.86 %)
0
(0 %)
474,790
(8.82 %)
30,533
(2.95 %)
15,260
(0.99 %)
420 tree cotton (Shixiya-1 2022)
GCF_025698485.1
69,134
(4.11 %)
n/a 20,169
(1.21 %)
55,515
(4.75 %)
n/a 35.17
(100.00 %)
0
(0 %)
225
(0.00 %)
948
(100.00 %)
618,195
(1.97 %)
622,748
(3.28 %)
8,002,633
(61.80 %)
0
(0 %)
1,982,971
(15.63 %)
27,646
(0.67 %)
5,410
(0.15 %)
421 tree cotton (Shixiya1 2015 BGI)
GCF_000612285.1
53,446
(3.92 %)
n/a 20,707
(1.29 %)
56,318
(5.01 %)
n/a 35.03
(92.12 %)
45,766
(7.88 %)
45,768
(7.88 %)
121,185
(92.12 %)
618,119
(2.07 %)
589,954
(3.54 %)
8,098,351
(55.57 %)
587
(0.14 %)
1,280,735
(10.74 %)
28,949
(0.57 %)
5,345
(0.12 %)
422 trifoliate orange (ZK8 2021)
GCA_018350135.1
n/a n/a 14,955
(4.81 %)
32,433
(16.97 %)
n/a 34.13
(99.99 %)
222
(0.01 %)
222
(0.01 %)
707
(99.99 %)
181,106
(2.67 %)
98,804
(3.46 %)
2,031,768
(34.51 %)
0
(0 %)
162,916
(6.03 %)
6,294
(1.72 %)
5,218
(0.79 %)
423 trilobed morning glory
GCF_003576645.1
49,472
(13.00 %)
n/a 16,803
(3.58 %)
50,448
(18.68 %)
n/a 35.68
(94.76 %)
0
(0 %)
31,256
(5.25 %)
17
(100.00 %)
333,211
(3.67 %)
335,317
(10.66 %)
2,341,085
(36.54 %)
1,908
(0.26 %)
378,228
(11.60 %)
27,290
(3.24 %)
20,629
(2.28 %)
424 turmeric (G26 2024)
GCF_044706935.1
40,834
(13.17 %)
n/a 18,067
(4.25 %)
53,196
(20.85 %)
n/a 37.76
(99.88 %)
0
(0 %)
4,668
(0.12 %)
7,139
(100.00 %)
169,406
(2.24 %)
191,181
(4.26 %)
2,052,731
(28.24 %)
1
(0.00 %)
168,829
(5.27 %)
50,044
(9.42 %)
37,292
(6.31 %)
425 Valencia sweet orange 2022
GCF_022201045.2
49,199
(16.33 %)
n/a 14,451
(4.70 %)
33,670
(18.59 %)
n/a 34.22
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
11
(100.00 %)
184,421
(2.80 %)
106,732
(3.28 %)
1,996,057
(33.86 %)
0
(0 %)
138,933
(5.87 %)
6,824
(1.28 %)
4,933
(0.78 %)
426 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2
63,531
(8.16 %)
n/a 16,883
(1.90 %)
72,901
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
0
(0 %)
1,673
(0.23 %)
2,002
(100.00 %)
800,288
(3.71 %)
460,119
(7.41 %)
5,438,715
(37.84 %)
3
(0.00 %)
746,272
(7.48 %)
19,628
(1.10 %)
9,136
(0.41 %)
427 Van Houtte's columbine (alt pseudohaplotype PFEx6 2022)
GCA_023053535.1
n/a n/a 13,357
(3.39 %)
37,446
(17.24 %)
n/a 37.56
(100.00 %)
0
(0 %)
63
(0.00 %)
249
(100.00 %)
244,573
(10.74 %)
180,141
(13.98 %)
1,184,686
(42.28 %)
0
(0 %)
428,570
(12.48 %)
6,470
(2.86 %)
617
(0.10 %)
428 Van Houtte's columbine (PFEx6 2022)
GCA_023053565.1
n/a n/a 13,575
(3.44 %)
38,113
(17.59 %)
n/a 37.58
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
463
(100.00 %)
245,892
(11.25 %)
158,855
(13.35 %)
1,221,056
(41.58 %)
0
(0 %)
400,137
(11.97 %)
6,436
(2.63 %)
718
(0.10 %)
429 vegetable marrow (v2 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.2
48,839
(21.95 %)
n/a 19,452
(7.44 %)
35,987
(20.77 %)
n/a 36.49
(94.38 %)
0
(0 %)
49,199
(5.63 %)
24,194
(100.00 %)
181,473
(3.18 %)
143,114
(7.42 %)
1,614,901
(29.14 %)
3,445
(0.84 %)
135,437
(7.93 %)
13,094
(2.48 %)
9,563
(1.55 %)
430 water chestnut (Nanhuling F231 2024)
GCA_035582545.1
n/a 32,263
(10.45 %)
19,879
(3.81 %)
38,349
(12.06 %)
n/a 38.10
(100.00 %)
0
(0 %)
216
(0.00 %)
32
(100.00 %)
116,633
(1.34 %)
123,546
(2.75 %)
2,308,826
(51.78 %)
0
(0 %)
223,520
(3.82 %)
20,598
(2.37 %)
16,595
(1.81 %)
431 watermelon (97103 2019)
GCA_000238415.2
n/a n/a 13,387
(3.57 %)
27,414
(10.73 %)
n/a 33.57
(98.45 %)
0
(0 %)
245
(1.55 %)
113
(100.00 %)
292,830
(3.56 %)
169,773
(2.91 %)
2,260,362
(43.24 %)
0
(0 %)
115,033
(3.03 %)
14,898
(1.47 %)
6,499
(0.72 %)
432 watermelon (Charleston Gray 2019)
GCA_004801215.2
n/a n/a 13,662
(3.47 %)
28,811
(10.60 %)
n/a 33.52
(94.83 %)
0
(0 %)
19,579
(5.18 %)
6,794
(100.00 %)
314,974
(3.65 %)
193,157
(4.04 %)
2,390,687
(41.95 %)
982
(0.50 %)
126,636
(4.51 %)
15,527
(1.38 %)
6,745
(0.67 %)
433 watermelon (Kordofan 2021)
GCA_018142915.1
n/a n/a 13,494
(3.54 %)
27,976
(10.71 %)
n/a 33.60
(100.00 %)
0
(0 %)
47
(0.00 %)
33
(100.00 %)
780,860
(60.44 %)
173,577
(3.01 %)
2,295,095
(44.07 %)
1
(0.00 %)
118,855
(3.07 %)
15,356
(1.51 %)
4,862
(0.55 %)
434 wax gourd
GCF_009727055.1
40,406
(4.66 %)
n/a 13,481
(1.43 %)
43,071
(6.68 %)
n/a 34.85
(98.39 %)
0
(0 %)
24,524
(1.62 %)
1,791
(100.00 %)
481,638
(2.55 %)
364,998
(3.11 %)
6,236,506
(49.68 %)
4,691
(0.08 %)
383,939
(3.89 %)
21,741
(0.93 %)
14,484
(0.55 %)
435 weeping love grass (Victoria 2019)
GCA_007726485.1
n/a 56,849
(13.20 %)
22,395
(3.96 %)
101,555
(33.88 %)
n/a 45.70
(99.78 %)
0
(0 %)
2,245
(0.22 %)
1,143
(100.00 %)
206,645
(1.57 %)
174,457
(2.79 %)
2,244,665
(26.11 %)
6
(0.00 %)
285,716
(7.93 %)
117,743
(29.88 %)
94,408
(12.80 %)
436 white cockle S.latifolia (original U9 population 2025)
GCF_048544455.1
89,156
(3.16 %)
n/a 15,292
(0.51 %)
135,024
(8.39 %)
n/a 38.77
(98.57 %)
0
(0 %)
827
(1.43 %)
720
(100.00 %)
1,158,845
(2.32 %)
1,353,517
(6.28 %)
10,836,475
(64.19 %)
1
(0.00 %)
2,427,207
(12.18 %)
161,610
(4.19 %)
21,180
(0.27 %)
437 white fonio (2020)
GCA_902806635.1
n/a n/a 33,011
(5.39 %)
109,615
(30.77 %)
n/a 45.47
(97.23 %)
29,136
(2.79 %)
29,136
(2.79 %)
29,155
(97.21 %)
215,374
(1.42 %)
159,137
(1.91 %)
2,776,488
(28.15 %)
5,190
(0.27 %)
250,897
(4.54 %)
136,308
(27.74 %)
101,170
(11.60 %)
438 white lupine (Amiga GWH2020 2020)
GCA_010261695.1
n/a 47,603
(13.29 %)
21,959
(3.77 %)
51,652
(20.18 %)
n/a 36.92
(99.73 %)
1,591
(0.03 %)
1,764
(0.27 %)
3,171
(99.97 %)
215,169
(3.21 %)
247,660
(10.71 %)
2,556,478
(43.72 %)
1
(0.00 %)
723,439
(10.94 %)
14,520
(10.46 %)
5,911
(9.75 %)
439 white poplar (2024)
GCF_005239225.2
53,525
(15.07 %)
n/a 20,195
(4.72 %)
44,116
(16.35 %)
n/a 33.73
(99.86 %)
0
(0 %)
1,182
(0.14 %)
97
(100.00 %)
307,548
(3.27 %)
174,946
(4.79 %)
2,453,000
(38.39 %)
1
(0.00 %)
277,603
(7.00 %)
4,493
(0.61 %)
2,065
(0.19 %)
440 white poplar P.alba x Populus glandulosa (maternal hap 84K 2023)
GCA_033621325.1
n/a n/a 19,540
(4.79 %)
41,183
(15.85 %)
n/a 34.67
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
21
(100.00 %)
265,758
(2.98 %)
150,154
(12.12 %)
2,138,699
(41.34 %)
0
(0 %)
379,436
(8.93 %)
3,578
(0.99 %)
1,749
(0.14 %)
441 white poplar P.alba x Populus glandulosa (paternal hap 84K 2023)
GCA_033617975.1
n/a n/a 19,599
(4.60 %)
42,133
(16.21 %)
n/a 35.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 27
(100.00 %)
268,999
(2.93 %)
165,404
(12.23 %)
2,153,763
(42.62 %)
0
(0 %)
410,373
(9.69 %)
5,857
(2.24 %)
2,015
(0.15 %)
442 white yam
GCF_009730915.1
43,902
(7.41 %)
n/a 13,647
(2.09 %)
49,877
(12.79 %)
n/a 36.25
(99.19 %)
0
(0 %)
4,760
(0.81 %)
2,254
(100.00 %)
391,299
(3.19 %)
258,918
(3.96 %)
3,588,023
(40.59 %)
0
(0 %)
287,001
(4.23 %)
28,929
(2.37 %)
14,044
(1.13 %)
443 wild cabbage
GCF_000695525.1
66,716
(15.60 %)
n/a 31,142
(8.08 %)
103,348
(35.10 %)
n/a 36.11
(91.23 %)
874
(0.02 %)
52,140
(8.80 %)
33,760
(99.98 %)
197,515
(3.12 %)
214,463
(4.43 %)
2,535,207
(31.20 %)
226
(0.10 %)
221,975
(4.62 %)
29,995
(2.99 %)
19,922
(1.82 %)
444 wild cabbage (2018)
GCA_900416815.2
n/a n/a 31,163
(6.66 %)
79,290
(25.04 %)
n/a 36.57
(98.21 %)
11
(0.00 %)
135
(1.79 %)
140
(100.00 %)
273,972
(2.76 %)
284,806
(6.41 %)
2,750,803
(38.77 %)
0
(0 %)
470,826
(8.08 %)
33,071
(3.37 %)
21,309
(1.78 %)
445 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1
29,804
(16.68 %)
n/a 13,252
(5.90 %)
22,247
(14.89 %)
n/a 32.94
(94.65 %)
0
(0 %)
119,056
(5.55 %)
6,074
(100.00 %)
107,979
(2.19 %)
67,029
(6.76 %)
1,525,353
(32.45 %)
62
(0.01 %)
137,522
(3.41 %)
2,481
(0.48 %)
2,112
(0.40 %)
446 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2
131,285
(1.34 %)
n/a n/a 567,570
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
0
(0 %)
344,589
(3.31 %)
148,296
(100.00 %)
2,573,102
(1.23 %)
2,990,888
(3.37 %)
492,885
(96.69 %)
210
(0.02 %)
n/a 2,220,880
(25.34 %)
0
(0.00 %)
447 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2
53,171
(14.87 %)
n/a 18,878
(4.31 %)
45,554
(18.36 %)
n/a 38.87
(82.70 %)
17,164
(17.29 %)
22,178
(17.31 %)
24,423
(82.71 %)
214,040
(7.81 %)
136,453
(2.42 %)
1,656,678
(31.15 %)
1,372
(0.30 %)
160,195
(3.00 %)
53,687
(8.28 %)
32,795
(5.44 %)
448 wild olive
GCF_002742605.1
67,081
(6.69 %)
n/a 19,793
(1.69 %)
68,749
(9.17 %)
n/a 35.40
(90.41 %)
0
(0 %)
47,638
(9.59 %)
41,226
(100.00 %)
425,922
(1.79 %)
378,656
(18.98 %)
5,982,070
(40.81 %)
1,739
(0.11 %)
2,654,630
(14.57 %)
12,534
(0.42 %)
7,470
(0.21 %)
449 wild peanut A.duranensis (v2 V14167 2020)
GCF_000817695.3
57,163
(6.21 %)
n/a 17,102
(1.68 %)
76,760
(11.48 %)
n/a 35.80
(88.03 %)
8
(0.00 %)
135,554
(12.02 %)
1,589
(100.00 %)
596,136
(3.37 %)
499,251
(3.39 %)
5,279,103
(45.94 %)
66
(0.02 %)
723,949
(6.61 %)
48,556
(1.91 %)
22,182
(0.85 %)
450 wild peanut A.ipaensis (K30076 2017)
GCF_000816755.2
78,441
(5.58 %)
n/a 16,952
(1.26 %)
89,380
(9.95 %)
n/a 36.84
(92.91 %)
449
(0.33 %)
122,617
(7.13 %)
997
(99.67 %)
777,978
(3.35 %)
619,944
(3.82 %)
5,823,472
(53.61 %)
535
(0.10 %)
1,221,848
(10.04 %)
79,537
(2.58 %)
30,634
(0.87 %)
451 wild peanut A.stenosperma (V10309 2020)
GCF_014773155.1
67,384
(5.06 %)
n/a 16,850
(1.28 %)
83,780
(9.77 %)
n/a 36.78
(93.48 %)
0
(0 %)
14,157
(6.52 %)
30
(100.00 %)
767,054
(3.15 %)
754,355
(3.89 %)
5,146,558
(56.74 %)
4
(0.00 %)
1,299,909
(14.23 %)
71,885
(2.45 %)
24,953
(0.81 %)
452 wild soybean
GCF_004193775.1
81,537
(9.20 %)
n/a 27,977
(2.99 %)
78,144
(11.64 %)
n/a 34.88
(97.58 %)
0
(0 %)
752
(2.42 %)
1,120
(100.00 %)
551,217
(2.79 %)
450,287
(6.65 %)
5,379,409
(46.22 %)
5
(0.01 %)
778,567
(7.38 %)
37,183
(1.52 %)
13,293
(0.57 %)
453 wild strawberry (2011 refseq)
GCF_000184155.1
25,210
(19.38 %)
n/a 13,996
(6.63 %)
46,505
(35.89 %)
n/a 38.40
(94.27 %)
13,412
(5.75 %)
16,253
(5.76 %)
16,460
(94.25 %)
71,057
(1.51 %)
74,581
(2.78 %)
1,034,180
(21.44 %)
25
(0.01 %)
71,241
(3.11 %)
14,806
(3.21 %)
9,028
(1.93 %)
454 wild sugarcane (AP85-441 2018)
GCA_003544955.1
n/a n/a 67,698
(2.77 %)
385,590
(22.40 %)
n/a 44.92
(99.75 %)
0
(0 %)
76,230
(0.26 %)
15,303
(100.00 %)
1,015,234
(1.60 %)
910,932
(3.64 %)
10,425,387
(46.78 %)
70
(0.00 %)
2,210,284
(13.29 %)
637,314
(24.52 %)
426,307
(10.34 %)
455 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1
46,114
(5.99 %)
n/a 15,458
(1.87 %)
42,907
(7.63 %)
n/a 34.50
(92.34 %)
41,684
(7.67 %)
41,684
(7.67 %)
41,696
(92.33 %)
363,460
(2.48 %)
271,129
(4.15 %)
6,330,153
(36.93 %)
559
(0.10 %)
539,878
(5.37 %)
19,639
(1.20 %)
3,088
(0.12 %)
456 wine grape (Chardonnay FPS 04 2020)
GCA_011037095.1
n/a n/a 17,733
(2.85 %)
55,354
(14.76 %)
n/a 34.32
(99.33 %)
0
(0 %)
780
(0.67 %)
683
(100.00 %)
586,981
(35.31 %)
275,412
(4.57 %)
3,561,395
(35.28 %)
0
(0 %)
351,841
(5.71 %)
14,172
(0.96 %)
8,413
(0.56 %)
457 wine grape (Chkhaveri 2017)
GCA_002922885.1
n/a n/a 14,109
(3.33 %)
40,033
(15.32 %)
n/a 34.56
(97.67 %)
0
(0 %)
9,429
(2.34 %)
21
(100.00 %)
410,680
(35.69 %)
189,467
(4.45 %)
2,405,053
(34.36 %)
236
(0.04 %)
246,055
(5.81 %)
10,620
(1.04 %)
5,070
(0.52 %)
458 wine grape (Pinot Noir 40024 2023)
GCF_030704535.1
46,430
(10.71 %)
n/a 14,823
(2.93 %)
44,674
(15.11 %)
n/a 35.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 21
(100.00 %)
310,377
(2.83 %)
242,451
(9.17 %)
2,706,407
(38.52 %)
0
(0 %)
369,814
(7.00 %)
11,751
(1.05 %)
6,644
(0.55 %)
459 wine grape (PN40024 2009)
GCF_000003745.3
46,797
(11.01 %)
n/a 14,907
(3.07 %)
44,949
(15.02 %)
n/a 34.56
(96.91 %)
12,727
(3.10 %)
13,440
(3.10 %)
14,644
(96.90 %)
462,807
(35.59 %)
222,647
(4.83 %)
2,745,513
(34.80 %)
345
(0.04 %)
302,175
(5.97 %)
11,591
(1.00 %)
6,661
(0.55 %)
460 winter cress (G-type 2016)
GCA_001920985.1
n/a n/a 22,511
(18.61 %)
30,519
(28.94 %)
n/a 35.60
(90.69 %)
22,839
(9.35 %)
22,839
(9.35 %)
30,649
(90.65 %)
86,568
(2.39 %)
44,616
(2.78 %)
1,035,105
(23.86 %)
13
(0.01 %)
47,590
(2.53 %)
6,701
(1.74 %)
5,207
(1.30 %)
461 winter squash (2017)
GCF_002738345.1
49,714
(19.34 %)
n/a 18,860
(6.74 %)
33,884
(18.55 %)
n/a 36.33
(97.81 %)
0
(0 %)
17,224
(2.20 %)
8,299
(100.00 %)
169,605
(3.09 %)
134,380
(10.82 %)
1,493,623
(35.66 %)
439
(0.08 %)
282,805
(8.27 %)
12,619
(2.64 %)
9,029
(1.47 %)
462 wood tobacco (2013)
GCF_000393655.1
58,358
(2.93 %)
n/a 17,332
(0.82 %)
111,663
(7.17 %)
n/a 39.09
(92.17 %)
139,080
(7.84 %)
338,901
(7.84 %)
392,998
(92.16 %)
598,929
(1.44 %)
776,240
(4.57 %)
13,228,149
(49.11 %)
18,173
(0.88 %)
1,444,692
(6.99 %)
100,864
(1.49 %)
21,222
(0.32 %)
463 wood tobacco (2023)
GCF_000393655.2
69,980
(3.08 %)
n/a 17,329
(0.74 %)
106,002
(6.66 %)
n/a 39.22
(100.00 %)
0
(0 %)
351
(0.00 %)
153
(100.00 %)
757,555
(1.52 %)
896,381
(6.23 %)
12,682,761
(57.52 %)
7
(0.00 %)
2,796,047
(13.35 %)
112,643
(1.70 %)
24,569
(0.36 %)
464 wooly tobacco N.tomentosiformis (2023)
GCF_000390325.3
73,963
(4.14 %)
n/a 17,122
(0.98 %)
74,889
(6.28 %)
n/a 39.02
(99.99 %)
0
(0 %)
471
(0.01 %)
570
(100.00 %)
496,695
(1.39 %)
640,139
(8.47 %)
10,077,793
(57.60 %)
4
(0.00 %)
2,481,624
(11.56 %)
115,283
(2.23 %)
11,039
(0.21 %)
465 zha cai (T84-66 inbred line 2016)
GCA_001687265.1
n/a n/a 56,069
(8.51 %)
138,660
(27.88 %)
n/a 36.22
(79.66 %)
0
(0 %)
22,714
(20.35 %)
9,746
(100.00 %)
367,321
(2.38 %)
303,381
(3.03 %)
4,551,648
(26.34 %)
264
(0.05 %)
380,691
(8.39 %)
50,430
(3.81 %)
37,478
(1.85 %)
TOTALS:total assembly count 465

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Primates 627 assemblies assembly stats track stats
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Invertebrates 1998 assemblies assembly stats track stats
Plants 465 assemblies assembly stats track stats
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Archaea 2977 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5522 assemblies assembly stats track stats