Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 A. eriantha gooseberry (White 2019)
GCA_004150315.1
n/a n/a 21,507
(2.72 %)
60,050
(11.57 %)
n/a 35.92
(99.97 %)
0
(0 %)
2,344
(0.03 %)
1,735
(100.00 %)
430,950
(2.82 %)
273,041
(3.10 %)
4,895,011
(32.98 %)
1
(0.00 %)
150,033
(1.97 %)
29,695
(1.88 %)
17,294
(1.01 %)
2 A.eriantha eudicots (MHT-2021 2021)
GCF_019202715.1
71,489
(11.95 %)
n/a 23,883
(3.45 %)
59,407
(13.07 %)
n/a 35.65
(99.64 %)
0
(0 %)
710
(0.36 %)
88
(100.00 %)
430,287
(3.04 %)
350,721
(4.29 %)
3,875,064
(36.80 %)
0
(0 %)
297,935
(5.94 %)
27,794
(1.97 %)
14,196
(0.90 %)
3 adzuki bean (Jingnong 6 2015)
GCF_001190045.1
40,474
(10.62 %)
n/a 16,697
(3.71 %)
47,542
(15.07 %)
n/a 34.07
(96.37 %)
21,264
(3.63 %)
21,264
(3.63 %)
58,639
(96.37 %)
257,290
(4.08 %)
239,596
(6.43 %)
2,925,469
(36.04 %)
202
(0.09 %)
250,517
(6.42 %)
24,461
(2.99 %)
14,539
(1.51 %)
4 adzuki bean (LongXiaoDou No.4 2021)
GCF_016808095.1
50,989
(11.87 %)
n/a 16,661
(3.75 %)
45,945
(15.40 %)
n/a 33.63
(100.00 %)
0
(0 %)
32
(0.00 %)
36
(100.00 %)
263,673
(3.52 %)
264,113
(5.18 %)
2,808,981
(37.65 %)
0
(0 %)
244,636
(6.82 %)
20,402
(2.60 %)
14,051
(1.55 %)
5 African boxthorn (CSIRO_LF1 2023)
GCF_029784015.1
54,359
(4.64 %)
n/a 16,693
(1.34 %)
75,114
(9.09 %)
n/a 37.42
(99.88 %)
0
(0 %)
15,111
(0.12 %)
14,905
(100.00 %)
668,488
(2.42 %)
511,720
(3.29 %)
8,110,750
(42.79 %)
2
(0.00 %)
942,647
(9.28 %)
50,821
(2.66 %)
18,184
(0.72 %)
6 African oil palm
GCF_000442705.1
51,575
(5.06 %)
n/a 16,948
(1.48 %)
76,464
(9.29 %)
n/a 37.21
(68.90 %)
162,407
(31.14 %)
166,490
(31.14 %)
202,468
(68.86 %)
580,361
(3.63 %)
445,124
(2.25 %)
5,831,606
(30.77 %)
2,228
(0.10 %)
282,030
(1.50 %)
75,576
(3.67 %)
31,746
(0.99 %)
7 African oil palm (ETL-2024a 2024)
GCF_000442705.2
61,514
(3.59 %)
n/a 17,694
(0.94 %)
82,131
(6.45 %)
n/a 38.54
(93.07 %)
0
(0 %)
37,524
(6.94 %)
30
(100.00 %)
930,885
(3.15 %)
928,025
(5.06 %)
6,719,901
(56.47 %)
38
(0.00 %)
1,987,190
(10.92 %)
104,550
(9.50 %)
36,012
(0.94 %)
8 African rice (2021)
GCF_000147395.1
43,826
(15.96 %)
n/a 16,224
(4.82 %)
51,031
(25.64 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
13
(0.00 %)
21
(0.00 %)
73
(100.00 %)
178,763
(2.60 %)
125,689
(4.18 %)
1,761,585
(30.96 %)
1
(0.00 %)
127,354
(3.72 %)
60,891
(21.37 %)
40,209
(7.27 %)
9 algarrobo blanco (v1 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.1
62,791
(10.08 %)
n/a 25,423
(3.34 %)
69,507
(14.55 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,087
(100.00 %)
367,402
(2.31 %)
175,862
(2.27 %)
4,241,058
(38.29 %)
0
(0 %)
289,448
(4.63 %)
18,927
(1.15 %)
12,774
(0.78 %)
10 algarrobo blanco (v2 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.2
62,791
(10.08 %)
n/a 25,443
(3.35 %)
69,492
(14.56 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,085
(100.00 %)
366,178
(2.25 %)
175,852
(2.27 %)
4,240,382
(38.29 %)
0
(0 %)
289,428
(4.63 %)
18,927
(1.15 %)
12,775
(0.79 %)
11 almond
GCF_902201215.1
37,363
(19.64 %)
n/a 14,509
(6.35 %)
33,193
(24.70 %)
n/a 37.65
(98.29 %)
1,008
(0.04 %)
6,531
(1.72 %)
1,700
(99.96 %)
137,974
(2.59 %)
100,386
(3.92 %)
1,251,126
(26.07 %)
7
(0.00 %)
114,850
(6.39 %)
10,893
(2.94 %)
5,266
(1.06 %)
12 annual mercury (v1 primary hap 2022)
GCF_937616625.1
47,801
(11.07 %)
n/a 13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
0
(0 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
0
(0 %)
1,165,065
(19.31 %)
9,024
(2.18 %)
5,406
(0.45 %)
13 annual mercury (v2 primary hap 2022)
GCF_937616625.2
44,356
(10.99 %)
n/a 13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
0
(0 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
0
(0 %)
1,165,065
(19.31 %)
9,024
(2.18 %)
5,406
(0.45 %)
14 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1
73,172
(3.41 %)
n/a 26,626
(1.10 %)
228,260
(15.00 %)
n/a 44.76
(99.87 %)
0
(0 %)
31,919
(0.13 %)
1,764
(100.00 %)
639,429
(1.31 %)
739,566
(3.57 %)
6,976,583
(59.37 %)
20
(0.00 %)
2,938,091
(54.45 %)
560,429
(28.70 %)
234,787
(7.24 %)
15 ant C.braunii (S276 2018)
GCA_003427395.1
n/a 36,423
(6.45 %)
3,649
(0.20 %)
126,898
(19.85 %)
n/a 48.33
(81.70 %)
641,791
(18.38 %)
641,791
(18.38 %)
653,445
(81.62 %)
1,577,107
(5.98 %)
1,434,259
(6.24 %)
8,533,748
(36.35 %)
11,268
(0.38 %)
884,830
(4.30 %)
278,266
(17.95 %)
112,631
(3.95 %)
16 ant C.sp. (NIES-68 2022)
GCA_027943385.1
n/a 28,971
(16.48 %)
3,655
(0.79 %)
32,911
(30.45 %)
n/a 55.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,529
(100.00 %)
255,839
(6.03 %)
392,694
(15.77 %)
1,480,495
(52.16 %)
0
(0 %)
470,137
(9.98 %)
23,662
(78.57 %)
40,755
(11.50 %)
17 ant L.chinense (Lushan-1 2018)
GCA_003013855.2
n/a n/a 15,545
(0.82 %)
85,577
(6.98 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
473
(0.00 %)
473
(0.00 %)
4,183
(100.00 %)
860,506
(2.32 %)
825,722
(4.56 %)
8,205,488
(53.73 %)
0
(0 %)
1,213,231
(8.04 %)
153,728
(4.12 %)
19,945
(0.45 %)
18 ant M.endlicherianum (SAG 12.97 2019)
GCA_009602735.1
n/a n/a 2,806
(1.27 %)
21,989
(34.80 %)
n/a 51.93
(90.29 %)
24,291
(9.73 %)
24,291
(9.73 %)
38,152
(90.27 %)
147,548
(5.58 %)
92,866
(3.14 %)
715,552
(34.44 %)
304
(0.17 %)
61,445
(5.72 %)
34,833
(26.81 %)
25,521
(7.32 %)
19 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 refseq)
GCF_002114115.1
64,916
(11.38 %)
n/a 22,530
(3.52 %)
67,146
(16.22 %)
n/a 38.04
(88.96 %)
0
(0 %)
7,264
(11.05 %)
807
(100.00 %)
692,611
(50.77 %)
322,556
(4.41 %)
3,055,836
(35.69 %)
2
(0.00 %)
451,438
(6.86 %)
25,923
(1.76 %)
13,929
(0.88 %)
20 apple (hap1 2024)
GCF_042453785.1
78,522
(12.41 %)
n/a 22,548
(3.38 %)
68,116
(16.07 %)
n/a 38.09
(100.00 %)
0
(0 %)
89
(0.00 %)
19
(100.00 %)
315,260
(2.21 %)
337,450
(5.03 %)
3,018,840
(41.78 %)
0
(0 %)
504,186
(8.89 %)
26,464
(1.96 %)
15,224
(1.02 %)
21 Asian cultivated rice (Carolina Gold Select 2019)
GCA_004007595.1
n/a 68,732
(13.79 %)
16,583
(4.58 %)
55,248
(25.46 %)
n/a 43.36
(99.98 %)
0
(0 %)
696
(0.02 %)
615
(100.00 %)
495,126
(50.28 %)
124,567
(3.20 %)
1,922,072
(32.59 %)
0
(0 %)
155,586
(4.21 %)
65,220
(23.87 %)
41,812
(7.56 %)
22 Australian watermeal (WA8730 2020)
GCA_013350365.1
n/a n/a 8,508
(2.10 %)
37,551
(17.70 %)
n/a 40.80
(95.30 %)
1,778
(4.70 %)
1,778
(4.70 %)
7,026
(95.30 %)
167,876
(5.21 %)
220,174
(6.35 %)
2,006,559
(31.53 %)
0
(0 %)
127,703
(2.82 %)
43,277
(15.01 %)
30,244
(5.88 %)
23 Australian wild rice (MA-2024b 2025)
GCA_047496205.1
n/a n/a 16,434
(4.16 %)
55,282
(23.68 %)
n/a 43.56
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
16
(100.00 %)
602,996
(48.61 %)
170,830
(6.54 %)
1,845,923
(37.36 %)
0
(0 %)
218,432
(6.72 %)
69,474
(22.48 %)
48,410
(7.77 %)
24 Avena eriantha (BYU132 2022)
GCA_910589775.1
n/a n/a 17,696
(0.47 %)
237,324
(9.15 %)
n/a 43.86
(99.92 %)
196
(0.01 %)
5,576
(0.09 %)
2,848
(99.99 %)
902,202
(1.10 %)
1,084,992
(6.55 %)
13,291,939
(69.78 %)
14
(0.00 %)
1,732,871
(4.11 %)
644,302
(16.91 %)
248,956
(4.86 %)
25 avocado (Hass MH2022 2023)
GCA_029852735.1
n/a 42,442
(4.89 %)
15,968
(1.61 %)
64,612
(11.72 %)
n/a 39.99
(100.00 %)
0
(0 %)
36
(0.00 %)
482
(100.00 %)
1,348,599
(20.35 %)
427,369
(10.49 %)
4,298,119
(41.03 %)
0
(0 %)
569,002
(6.88 %)
54,543
(5.58 %)
9,989
(0.97 %)
26 Bahia grass (Cayasta R1 2024)
GCA_036689595.1
n/a 52,138
(13.42 %)
17,830
(3.66 %)
74,926
(26.22 %)
n/a 45.79
(99.95 %)
2,801
(0.05 %)
2,801
(0.05 %)
2,811
(99.95 %)
643,354
(26.01 %)
146,179
(4.41 %)
2,284,294
(38.05 %)
29
(0.00 %)
508,348
(10.78 %)
110,855
(27.67 %)
72,647
(11.45 %)
27 Balbis banana (DH-PKW 2019)
GCA_004837865.1
n/a 35,148
(10.52 %)
18,974
(3.45 %)
47,957
(15.55 %)
n/a 38.02
(99.72 %)
0
(0 %)
1,197
(0.27 %)
2,590
(100.00 %)
208,141
(3.88 %)
197,690
(7.95 %)
2,068,575
(42.39 %)
1
(0.00 %)
440,604
(8.80 %)
52,850
(9.12 %)
34,616
(5.51 %)
28 Barbados nut
GCF_014843425.1
33,622
(13.80 %)
n/a 12,687
(4.63 %)
26,511
(14.56 %)
n/a 33.40
(99.60 %)
0
(0 %)
2,151
(0.40 %)
1,232
(100.00 %)
281,490
(24.82 %)
186,260
(5.65 %)
2,028,357
(33.33 %)
0
(0 %)
87,723
(3.18 %)
8,868
(1.38 %)
5,253
(0.75 %)
29 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1
50,906
(14.28 %)
n/a 16,712
(3.68 %)
41,041
(14.51 %)
n/a 33.43
(99.87 %)
0
(0 %)
22
(0.13 %)
42
(100.00 %)
393,909
(27.89 %)
175,427
(3.92 %)
2,532,494
(37.64 %)
0
(0 %)
222,154
(8.04 %)
3,384
(0.27 %)
2,085
(0.17 %)
30 barrel medic (A17 2014)
GCF_000219495.3
48,865
(15.69 %)
n/a 16,549
(3.99 %)
40,316
(15.41 %)
n/a 33.14
(94.48 %)
5,840
(5.53 %)
8,785
(5.53 %)
8,027
(94.47 %)
366,709
(22.34 %)
146,748
(2.80 %)
2,549,499
(32.46 %)
216
(0.08 %)
147,910
(5.33 %)
3,695
(0.65 %)
2,696
(0.57 %)
31 barrel medic (HM340 2017)
GCA_002024945.1
n/a n/a 16,672
(3.96 %)
40,032
(15.19 %)
n/a 33.05
(99.32 %)
0
(0 %)
107
(0.68 %)
909
(100.00 %)
381,065
(23.82 %)
162,402
(3.97 %)
2,490,028
(35.39 %)
0
(0 %)
206,427
(6.09 %)
3,335
(0.34 %)
2,111
(0.22 %)
32 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 alternate hap 2023)
GCA_028538565.1
n/a n/a 15,063
(1.43 %)
65,125
(11.47 %)
n/a 40.34
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
197
(100.00 %)
735,552
(11.30 %)
567,295
(6.87 %)
4,176,675
(45.56 %)
2
(0.00 %)
714,025
(8.90 %)
66,834
(4.90 %)
12,024
(0.59 %)
33 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 primary hap 2023)
GCA_028534965.1
n/a n/a 15,223
(1.43 %)
65,769
(11.33 %)
n/a 40.37
(100.00 %)
0
(0 %)
36
(0.00 %)
303
(100.00 %)
744,623
(11.37 %)
571,691
(7.15 %)
4,217,655
(45.87 %)
2
(0.00 %)
721,040
(8.85 %)
68,566
(4.96 %)
12,157
(0.60 %)
34 beefsteak plant (Hoko-3 primary hap 2022)
GCA_026008535.1
n/a n/a 28,039
(2.07 %)
120,338
(15.60 %)
n/a 35.28
(100.00 %)
0
(0 %)
23
(0.00 %)
71
(100.00 %)
2,012,805
(68.74 %)
678,680
(5.87 %)
8,191,868
(44.06 %)
0
(0 %)
932,908
(8.21 %)
65,395
(2.45 %)
22,082
(0.87 %)
35 beet (v1 EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1
47,727
(9.45 %)
n/a 11,911
(2.04 %)
50,202
(16.78 %)
n/a 35.86
(99.99 %)
0
(0 %)
323
(0.01 %)
42
(100.00 %)
294,768
(3.41 %)
341,699
(6.22 %)
2,932,896
(35.20 %)
0
(0 %)
362,295
(7.68 %)
25,364
(1.79 %)
12,364
(0.80 %)
36 beet (v2 EL10 2022 USDA)
GCF_026745355.1
45,490
(9.22 %)
n/a 11,850
(2.05 %)
49,071
(15.89 %)
n/a 35.85
(94.03 %)
0
(0 %)
3,200
(5.97 %)
20
(100.00 %)
290,870
(3.40 %)
336,343
(5.76 %)
2,901,079
(33.21 %)
0
(0 %)
391,673
(6.85 %)
25,108
(1.67 %)
12,259
(0.75 %)
37 bell pepper eudicots (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1
70,848
(2.17 %)
n/a 15,922
(0.50 %)
69,601
(2.75 %)
n/a 34.91
(97.27 %)
0
(0 %)
52,577
(2.73 %)
81,202
(100.00 %)
1,192,132
(1.94 %)
1,097,384
(4.12 %)
23,393,622
(47.64 %)
4,061
(0.30 %)
1,575,258
(3.88 %)
19,517
(0.21 %)
5,887
(0.07 %)
38 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 alternate hap 2021)
GCA_019985075.1
n/a n/a 13,887
(2.34 %)
44,507
(14.12 %)
n/a 37.97
(100.00 %)
0
(0 %)
120
(0.00 %)
2,350
(100.00 %)
250,361
(2.10 %)
231,118
(13.56 %)
2,049,366
(44.58 %)
8
(0.00 %)
541,706
(10.86 %)
22,527
(6.34 %)
9,698
(0.77 %)
39 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 primary hap 2022)
GCA_019985065.2
n/a n/a 15,102
(2.62 %)
47,553
(15.64 %)
n/a 38.11
(100.00 %)
0
(0 %)
82
(0.00 %)
272
(100.00 %)
257,066
(2.22 %)
226,514
(14.63 %)
2,470,334
(38.37 %)
0
(0 %)
402,921
(8.45 %)
21,415
(5.59 %)
9,843
(0.72 %)
40 birdsfoot trefoil (B-129 2022)
GCF_012489685.1
57,539
(11.82 %)
n/a 16,919
(2.98 %)
64,687
(19.59 %)
n/a 38.05
(99.97 %)
0
(0 %)
1,625
(0.04 %)
65
(100.00 %)
236,645
(2.13 %)
205,150
(5.19 %)
2,202,942
(41.60 %)
8
(0.00 %)
405,251
(12.94 %)
32,283
(3.44 %)
14,923
(1.36 %)
41 bitter melon
GCF_001995035.1
31,725
(13.80 %)
n/a 12,858
(4.62 %)
30,539
(16.85 %)
n/a 34.58
(92.32 %)
0
(0 %)
109,310
(7.74 %)
1,052
(100.00 %)
162,837
(2.82 %)
89,571
(2.03 %)
1,951,167
(30.96 %)
511
(0.13 %)
50,890
(1.69 %)
14,100
(2.00 %)
10,345
(1.39 %)
42 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 alternate hap 2023)
GCA_028534865.1
n/a n/a 20,077
(4.66 %)
43,061
(17.16 %)
n/a 34.80
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
338
(100.00 %)
267,110
(2.88 %)
173,502
(6.32 %)
2,366,759
(39.61 %)
0
(0 %)
279,214
(8.59 %)
5,093
(4.11 %)
1,729
(0.14 %)
43 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 primary hap 2023)
GCA_028534895.1
n/a n/a 19,804
(4.58 %)
42,642
(17.03 %)
n/a 34.85
(100.00 %)
0
(0 %)
26
(0.00 %)
132
(100.00 %)
265,925
(2.85 %)
174,688
(6.70 %)
2,359,101
(40.07 %)
1
(0.00 %)
298,817
(9.06 %)
4,963
(4.10 %)
1,643
(0.13 %)
44 black cottonwood (v4.1 Nisqually-1 2022)
GCF_000002775.5
59,638
(15.94 %)
n/a 19,969
(4.99 %)
41,581
(16.22 %)
n/a 33.75
(99.85 %)
59
(0.15 %)
59
(0.15 %)
106
(99.85 %)
257,833
(2.91 %)
156,371
(4.50 %)
2,423,627
(36.28 %)
0
(0 %)
202,186
(5.63 %)
3,761
(0.66 %)
1,701
(0.17 %)
45 black gram (Urdbean 2024)
GCA_036885675.1
n/a 39,708
(11.70 %)
16,158
(3.35 %)
47,346
(15.05 %)
n/a 33.60
(99.97 %)
0
(0 %)
282
(0.03 %)
13
(100.00 %)
832,234
(57.53 %)
240,933
(5.84 %)
2,976,104
(38.95 %)
0
(0 %)
357,224
(7.24 %)
16,895
(2.01 %)
7,371
(0.67 %)
46 black tea
GCF_004153795.1
101,253
(3.17 %)
n/a 20,982
(0.66 %)
156,999
(7.69 %)
n/a 37.85
(92.12 %)
0
(0 %)
79,329
(7.89 %)
14,028
(100.00 %)
1,926,995
(3.23 %)
2,024,420
(8.06 %)
17,959,098
(50.75 %)
6
(0.00 %)
3,231,864
(10.09 %)
181,027
(2.79 %)
29,897
(0.36 %)
47 blue lilly pilly tree (NSW1041296 2022)
GCF_021117445.2
46,173
(12.87 %)
n/a 15,187
(3.49 %)
50,585
(20.61 %)
n/a 40.95
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
72
(100.00 %)
494,434
(48.54 %)
220,571
(4.98 %)
1,866,530
(29.09 %)
0
(0 %)
302,589
(7.56 %)
59,325
(10.76 %)
28,053
(3.71 %)
48 bread wheat (Chinese Spring 2020)
GCA_002220415.3
n/a 138,090
(1.09 %)
46,431
(0.31 %)
805,204
(7.93 %)
n/a 46.09
(99.87 %)
0
(0 %)
211,982
(0.14 %)
70,316
(100.00 %)
9,191,325
(44.14 %)
5,086,953
(4.53 %)
282,298
(99.86 %)
316
(0.00 %)
19,425,363
(15.62 %)
3,241,124
(28.06 %)
2,065,976
(13.12 %)
49 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1
221,450
(1.62 %)
n/a n/a 763,380
(8.08 %)
n/a 46.14
(98.27 %)
0
(0 %)
214,799
(1.73 %)
91,589
(100.00 %)
8,660,189
(44.94 %)
4,402,049
(3.94 %)
306,386
(98.27 %)
434
(0.02 %)
17,440,813
(14.18 %)
3,040,030
(27.48 %)
0
(0.00 %)
50 bread wheat (Chinese Spring IWGSC RefSeq v1.0 2018)
GCA_900519105.1
n/a n/a n/a 751,576
(8.03 %)
n/a 46.05
(98.12 %)
693,028
(1.90 %)
693,028
(1.90 %)
693,050
(98.10 %)
8,420,935
(44.23 %)
4,115,828
(3.69 %)
693,050
(98.10 %)
385
(0.01 %)
n/a 3,076,631
(26.41 %)
0
(0.00 %)
51 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1
n/a n/a n/a 773,766
(8.20 %)
n/a 46.05
(100.00 %)
0
(0 %)
1,407
(0.00 %)
3,795
(100.00 %)
8,703,192
(44.57 %)
4,569,103
(5.20 %)
5,202
(100.00 %)
12
(0.00 %)
n/a 3,001,896
(28.00 %)
0
(0.00 %)
52 bread wheat (Kariega 2021)
GCA_910594105.1
n/a n/a 47,400
(0.34 %)
778,134
(8.33 %)
n/a 46.11
(99.87 %)
7,376
(0.13 %)
7,376
(0.13 %)
7,398
(99.87 %)
14,835,099
(85.31 %)
4,570,540
(5.40 %)
7,395
(99.87 %)
41
(0.00 %)
928,524
(0.74 %)
2,994,427
(28.25 %)
606,650
(3.02 %)
53 brown mustard (Varuna 2020)
GCA_015484525.1
n/a n/a 50,825
(7.02 %)
128,133
(24.54 %)
n/a 37.47
(96.71 %)
0
(0 %)
3,070
(3.29 %)
720
(100.00 %)
905,496
(54.34 %)
440,139
(7.46 %)
4,073,637
(39.30 %)
4
(0.00 %)
843,858
(10.72 %)
54,083
(6.71 %)
25,528
(1.30 %)
54 button wrinklewort R.leptorrhynchoides (AG116_Rl617_1_P2 2025)
GCF_046630445.1
79,194
(1.39 %)
n/a 19,567
(0.31 %)
119,910
(3.26 %)
n/a 33.70
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
549
(100.00 %)
3,727,770
(5.18 %)
3,762,751
(4.98 %)
10,213,591
(82.37 %)
0
(0 %)
n/a 54,254
(0.38 %)
9,950
(0.06 %)
55 cacao
GCF_000208745.1
34,727
(13.67 %)
n/a 14,294
(4.65 %)
29,216
(14.38 %)
n/a 34.09
(94.31 %)
0
(0 %)
11,787
(5.70 %)
431
(100.00 %)
206,049
(15.64 %)
99,229
(2.66 %)
1,933,579
(33.24 %)
175
(0.02 %)
138,327
(4.02 %)
2,964
(0.34 %)
2,376
(0.27 %)
56 California black walnut (Jcal.S.LA.6 alternate hap 2022)
GCA_023349545.1
n/a n/a 18,729
(3.22 %)
57,374
(16.70 %)
n/a 36.81
(100.00 %)
0
(0 %)
78
(0.00 %)
915
(100.00 %)
421,731
(3.42 %)
300,957
(5.54 %)
2,794,242
(34.11 %)
1
(0.00 %)
264,077
(5.33 %)
25,348
(3.39 %)
12,668
(0.88 %)
57 California black walnut (Jcal.S.LA.6 primary hap 2022)
GCA_023349395.1
n/a n/a 18,579
(3.26 %)
56,295
(16.71 %)
n/a 36.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
138
(100.00 %)
414,129
(3.48 %)
293,951
(5.95 %)
3,055,420
(34.96 %)
0
(0 %)
267,374
(5.36 %)
24,749
(4.05 %)
12,091
(0.87 %)
58 California pipevine (CCGP_79_NKW_82.1479hap1 2023)
GCF_029961685.1
43,175
(7.78 %)
n/a 16,377
(2.29 %)
43,559
(11.38 %)
n/a 36.31
(100.00 %)
175
(0.00 %)
175
(0.00 %)
706
(100.00 %)
341,665
(12.46 %)
223,217
(36.36 %)
2,388,236
(58.00 %)
5
(0.00 %)
2,500,132
(20.87 %)
26,535
(3.98 %)
15,554
(1.14 %)
59 California scrub oak (Qber.S.LA.60 alternate hap 2023)
GCA_028535905.1
n/a n/a 16,153
(1.86 %)
68,653
(14.03 %)
n/a 35.79
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
807
(100.00 %)
783,798
(4.17 %)
456,025
(10.87 %)
4,951,918
(40.76 %)
2
(0.00 %)
725,680
(8.19 %)
21,783
(2.16 %)
9,330
(0.43 %)
60 California scrub oak (Qber.S.LA.60 primary hap 2023)
GCA_028535815.1
n/a n/a 15,836
(1.90 %)
66,803
(13.99 %)
n/a 35.77
(100.00 %)
0
(0 %)
32
(0.00 %)
283
(100.00 %)
762,029
(4.24 %)
448,099
(10.97 %)
4,784,968
(41.07 %)
0
(0 %)
695,512
(8.10 %)
20,384
(2.28 %)
8,472
(0.39 %)
61 Cannabis sativa ( 2020)
GCA_016165845.1
n/a n/a 18,838
(1.94 %)
71,211
(13.84 %)
n/a 33.78
(99.91 %)
0
(0 %)
8,772
(0.10 %)
147
(100.00 %)
643,488
(3.49 %)
361,843
(3.63 %)
4,074,440
(56.52 %)
36
(0.00 %)
950,351
(13.57 %)
27,745
(1.31 %)
6,939
(0.30 %)
62 Cannabis sativa (Cannatonic 2016)
GCA_001865755.1
n/a n/a 10,725
(1.71 %)
41,537
(11.41 %)
n/a 33.68
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11,110
(100.00 %)
396,112
(4.11 %)
221,932
(3.23 %)
2,389,229
(59.21 %)
0
(0 %)
623,084
(13.50 %)
17,045
(1.23 %)
4,584
(0.35 %)
63 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2
39,696
(6.07 %)
n/a 13,883
(1.80 %)
50,556
(11.19 %)
n/a 33.51
(84.07 %)
843
(15.93 %)
843
(15.93 %)
1,052
(84.07 %)
496,648
(3.63 %)
258,281
(2.28 %)
3,594,433
(47.71 %)
1
(0.00 %)
755,100
(9.25 %)
22,750
(1.69 %)
7,799
(0.33 %)
64 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2
n/a n/a 24,975
(1.79 %)
113,252
(15.69 %)
n/a 34.00
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,372
(100.00 %)
936,351
(4.13 %)
520,230
(3.65 %)
5,183,602
(58.66 %)
0
(0 %)
1,449,890
(14.90 %)
47,327
(1.58 %)
8,921
(0.24 %)
65 Cannabis sativa (Jamaican Lion Mother 2020)
GCA_012923435.1
n/a 27,358
(4.91 %)
15,253
(1.67 %)
62,228
(12.57 %)
n/a 34.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,599
(100.00 %)
595,917
(3.95 %)
335,791
(3.38 %)
3,478,519
(61.18 %)
0
(0 %)
975,634
(15.64 %)
31,738
(1.57 %)
5,423
(0.22 %)
66 Cannabis sativa (JL 2020)
GCA_013030365.1
n/a n/a 15,334
(1.80 %)
60,140
(12.83 %)
n/a 33.79
(99.92 %)
0
(0 %)
2,496
(0.09 %)
483
(100.00 %)
567,458
(3.73 %)
320,455
(3.12 %)
3,403,771
(58.38 %)
0
(0 %)
853,323
(14.39 %)
27,791
(1.48 %)
5,805
(0.25 %)
67 capsicum (Zunla-1 2015 refseq)
GCF_000710875.1
57,769
(2.07 %)
n/a 16,114
(0.55 %)
62,579
(2.93 %)
n/a 34.94
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
107,172
(3.23 %)
108,799
(96.77 %)
968,939
(3.15 %)
948,741
(4.39 %)
21,535,213
(46.15 %)
331
(0.03 %)
1,512,422
(5.05 %)
16,685
(0.21 %)
5,036
(0.06 %)
68 carrot
GCF_001625215.1
51,773
(15.95 %)
n/a 16,649
(3.96 %)
50,187
(20.50 %)
n/a 34.79
(91.77 %)
0
(0 %)
26,112
(8.24 %)
4,826
(100.00 %)
179,630
(2.41 %)
166,060
(4.97 %)
1,981,148
(31.51 %)
1,240
(0.20 %)
243,624
(9.01 %)
8,564
(0.85 %)
5,080
(0.52 %)
69 carrot (DH1 2023)
GCF_001625215.2
60,116
(15.29 %)
n/a 16,679
(3.49 %)
51,607
(18.82 %)
n/a 34.97
(99.99 %)
0
(0 %)
554
(0.01 %)
11
(100.00 %)
195,035
(2.33 %)
186,941
(8.11 %)
2,018,050
(39.61 %)
1
(0.00 %)
377,471
(12.12 %)
10,319
(1.14 %)
5,451
(0.55 %)
70 cassava (60444 2018)
GCA_003957885.1
n/a n/a 27,737
(2.70 %)
78,774
(11.79 %)
n/a 37.13
(76.51 %)
0
(0 %)
36,478
(23.50 %)
4,440
(100.00 %)
584,617
(3.41 %)
554,162
(3.52 %)
4,126,060
(43.14 %)
7
(0.00 %)
948,846
(11.29 %)
77,570
(1.78 %)
7,929
(0.25 %)
71 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2
56,386
(9.38 %)
n/a 18,790
(2.86 %)
49,944
(11.73 %)
n/a 37.52
(99.61 %)
672
(0.39 %)
672
(0.39 %)
758
(99.61 %)
377,964
(3.52 %)
356,023
(4.79 %)
2,560,255
(56.85 %)
5
(0.00 %)
693,966
(16.79 %)
52,506
(2.50 %)
5,169
(0.28 %)
72 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1
33,377
(11.52 %)
n/a 13,874
(4.00 %)
33,656
(13.67 %)
n/a 33.84
(96.11 %)
23,305
(3.90 %)
23,313
(3.90 %)
49,406
(96.10 %)
207,850
(3.52 %)
166,467
(10.85 %)
1,676,921
(43.19 %)
41
(0.02 %)
430,309
(7.84 %)
12,838
(2.54 %)
5,339
(1.40 %)
73 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCA_019578655.1
n/a n/a 13,864
(4.31 %)
29,909
(14.27 %)
n/a 33.05
(99.95 %)
0
(0 %)
331
(0.05 %)
146
(100.00 %)
328,084
(38.04 %)
128,377
(6.36 %)
1,992,583
(39.20 %)
0
(0 %)
259,158
(6.25 %)
7,290
(1.00 %)
2,878
(0.37 %)
74 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCF_019578655.1
39,358
(13.36 %)
n/a 13,841
(4.31 %)
29,805
(14.24 %)
n/a 33.03
(99.95 %)
0
(0 %)
331
(0.05 %)
140
(100.00 %)
205,974
(3.02 %)
128,354
(6.37 %)
1,998,066
(39.24 %)
0
(0 %)
259,147
(6.26 %)
7,216
(0.99 %)
2,812
(0.36 %)
75 celery A.graveolens (Ventura 2021)
GCF_009905375.1
89,565
(2.38 %)
n/a 17,560
(0.48 %)
115,390
(5.30 %)
n/a 35.68
(99.73 %)
0
(0 %)
4,633
(0.27 %)
4,854
(100.00 %)
1,247,170
(1.97 %)
1,423,285
(4.75 %)
11,041,078
(71.09 %)
17
(0.00 %)
3,456,467
(14.13 %)
31,562
(0.31 %)
17,869
(0.17 %)
76 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n 2020)
GCA_011386875.1
n/a n/a 3
(0.11 %)
117
(7.42 %)
n/a 39.35
(99.99 %)
0
(0 %)
4
(0.01 %)
35
(100.00 %)
1,139
(3.04 %)
1,677
(4.92 %)
11,074
(10.60 %)
0
(0 %)
3,401
(11.34 %)
76
(1.07 %)
36
(0.43 %)
77 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n Whitten #5841 2020)
GCA_009866685.1
n/a n/a 6,487
(0.16 %)
114,999
(4.12 %)
n/a 37.82
(62.87 %)
490,371
(37.15 %)
490,371
(37.15 %)
1,116,784
(62.85 %)
692,892
(1.67 %)
790,165
(1.22 %)
18,073,193
(31.20 %)
3,963
(0.05 %)
n/a 24,414
(0.46 %)
13,542
(0.37 %)
78 chia eudicots (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1
53,262
(17.46 %)
n/a 17,642
(4.97 %)
49,474
(23.85 %)
n/a 36.14
(99.81 %)
0
(0 %)
3,756
(0.19 %)
1,556
(100.00 %)
156,083
(2.30 %)
128,904
(3.10 %)
2,112,137
(31.93 %)
71
(0.02 %)
137,558
(5.10 %)
31,157
(5.92 %)
23,418
(3.74 %)
79 chickpea
GCF_000331145.1
42,036
(9.83 %)
n/a 15,685
(3.16 %)
30,411
(8.82 %)
n/a 31.04
(90.95 %)
31,897
(9.07 %)
31,897
(9.07 %)
39,024
(90.93 %)
339,564
(10.51 %)
318,439
(11.48 %)
2,929,750
(43.82 %)
304
(0.08 %)
536,078
(8.47 %)
3,488
(0.28 %)
2,503
(0.18 %)
80 chickpea (CDC Frontier Library 1 2024)
GCF_000331145.2
42,320
(9.82 %)
n/a 15,593
(3.16 %)
30,475
(8.82 %)
n/a 31.03
(91.05 %)
0
(0 %)
33,507
(8.98 %)
6,446
(100.00 %)
308,190
(3.39 %)
318,609
(11.50 %)
2,922,065
(43.86 %)
304
(0.07 %)
547,675
(8.64 %)
3,472
(0.28 %)
2,488
(0.18 %)
81 chicory (Punajuju 2022)
GCA_023525715.1
n/a 53,946
(3.98 %)
16,855
(1.17 %)
92,310
(11.34 %)
n/a 35.50
(99.99 %)
0
(0 %)
510
(0.01 %)
208
(100.00 %)
1,976,706
(34.89 %)
781,413
(8.81 %)
6,080,413
(49.06 %)
0
(0 %)
1,295,125
(15.07 %)
51,571
(2.99 %)
23,431
(0.70 %)
82 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2
66,337
(12.31 %)
n/a 15,432
(2.83 %)
67,569
(21.71 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
53
(100.00 %)
275,878
(2.26 %)
229,333
(3.98 %)
2,244,200
(35.17 %)
0
(0 %)
277,187
(7.19 %)
37,317
(4.17 %)
22,646
(1.74 %)
83 Chinese keys (BR_CEBAR01 2022)
GCA_024364735.1
n/a n/a 23,898
(0.89 %)
138,156
(8.52 %)
n/a 40.10
(96.58 %)
25,154
(3.42 %)
25,154
(3.42 %)
35,781
(96.58 %)
829,613
(1.78 %)
1,793,985
(6.94 %)
8,707,237
(62.53 %)
41
(0.01 %)
2,679,318
(12.88 %)
317,707
(8.50 %)
99,451
(2.46 %)
84 Chinese licorice (Kyoto 2023)
GCA_030159175.1
n/a n/a 16,920
(3.67 %)
44,776
(19.51 %)
n/a 37.70
(100.00 %)
0
(0 %)
20
(0.00 %)
89
(100.00 %)
593,642
(17.68 %)
219,391
(21.45 %)
2,088,553
(50.28 %)
0
(0 %)
363,447
(7.14 %)
15,616
(4.58 %)
8,955
(0.79 %)
85 Chinese licorice (manju 2023)
GCA_027886165.1
n/a n/a 16,877
(4.02 %)
43,800
(15.68 %)
n/a 35.67
(99.96 %)
0
(0 %)
1,409
(0.03 %)
6,467
(100.00 %)
582,162
(19.03 %)
193,998
(5.82 %)
2,492,820
(41.31 %)
2
(0.00 %)
245,273
(4.90 %)
18,054
(4.04 %)
9,752
(0.97 %)
86 Chinese medicinal orchid (niu2020 2021)
GCA_019514585.1
n/a n/a 13,666
(0.97 %)
71,763
(9.04 %)
n/a 35.33
(99.97 %)
0
(0 %)
1,170
(0.03 %)
1,621
(100.00 %)
635,445
(2.92 %)
599,600
(4.44 %)
8,101,700
(44.90 %)
0
(0 %)
922,319
(8.76 %)
75,475
(3.56 %)
40,214
(1.34 %)
87 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1
54,029
(12.78 %)
n/a 22,400
(4.38 %)
57,140
(17.42 %)
n/a 37.29
(97.86 %)
24,384
(2.15 %)
24,384
(2.15 %)
26,566
(97.85 %)
368,808
(18.26 %)
218,013
(4.36 %)
2,456,496
(34.15 %)
105
(0.03 %)
322,129
(7.53 %)
18,367
(1.88 %)
11,851
(1.15 %)
88 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1
62,514
(13.83 %)
n/a 22,289
(4.29 %)
57,502
(17.16 %)
n/a 37.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 452
(100.00 %)
290,077
(2.40 %)
209,363
(3.56 %)
2,519,627
(35.77 %)
0
(0 %)
352,108
(8.82 %)
19,299
(1.84 %)
11,854
(1.08 %)
89 Christmas fern (IRGN 58ZZQ2NR20 2022)
GCA_025802375.1
n/a n/a 2,216
(0.22 %)
115,851
(13.84 %)
n/a 40.55
(99.77 %)
6,993
(0.02 %)
6,993
(0.02 %)
496,888
(99.98 %)
1,157,849
(61.20 %)
244,472
(3.76 %)
2,756,209
(21.19 %)
8
(0.00 %)
n/a 9,107
(0.82 %)
3,721
(0.34 %)
90 clementine
GCF_000493195.1
36,454
(14.29 %)
n/a 14,126
(4.66 %)
32,820
(18.34 %)
n/a 34.96
(97.94 %)
7,564
(2.07 %)
7,564
(2.07 %)
8,962
(97.93 %)
178,443
(2.76 %)
104,853
(5.57 %)
1,933,079
(33.91 %)
29
(0.01 %)
205,572
(6.24 %)
7,930
(3.80 %)
4,793
(0.70 %)
91 climbing nightshade (primary hap 2022)
GCF_947179165.1
44,646
(5.40 %)
n/a 15,784
(1.70 %)
48,875
(7.66 %)
n/a 35.83
(100.00 %)
0
(0 %)
38
(0.00 %)
105
(100.00 %)
347,467
(1.98 %)
290,488
(4.50 %)
6,293,084
(43.53 %)
0
(0 %)
770,795
(8.60 %)
8,929
(0.83 %)
2,434
(0.09 %)
92 club-mosses (2010)
GCF_000143415.4
49,382
(28.03 %)
n/a 11,312
(4.28 %)
36,277
(36.82 %)
n/a 45.22
(98.15 %)
4,395
(1.86 %)
4,395
(1.86 %)
5,152
(98.14 %)
138,958
(36.90 %)
77,054
(2.71 %)
802,227
(32.19 %)
8
(0.01 %)
146,035
(8.10 %)
34,479
(27.80 %)
23,866
(22.56 %)
93 club-mosses (Aurea 2015)
GCA_001021135.1
n/a n/a 6,316
(4.02 %)
55,013
(41.57 %)
n/a 44.70
(99.81 %)
351
(0.00 %)
351
(0.00 %)
106,265
(100.00 %)
29,218
(1.24 %)
29,377
(1.67 %)
480,195
(13.66 %)
1
(0.00 %)
n/a 19,392
(13.60 %)
14,620
(8.38 %)
94 coffee (Caturra red CCC135-36 2018)
GCA_003713225.1
n/a n/a 23,597
(2.02 %)
86,132
(13.38 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
0
(0 %)
690
(0.21 %)
2,832
(100.00 %)
502,137
(2.12 %)
386,196
(3.95 %)
5,651,566
(41.67 %)
0
(0 %)
1,077,930
(15.36 %)
36,395
(1.62 %)
13,206
(0.75 %)
95 coffee (Red Bourbon ID1545 2023)
GCA_030873655.1
n/a n/a 25,435
(1.84 %)
94,196
(12.02 %)
n/a 37.21
(99.99 %)
44
(0.00 %)
197
(0.01 %)
1,794
(100.00 %)
1,591,482
(68.40 %)
423,470
(5.23 %)
6,621,994
(45.23 %)
0
(0 %)
2,486,578
(18.50 %)
49,710
(2.01 %)
6,187
(0.43 %)
96 coffee C.arabica (CCC135-36 2018)
GCF_003713225.1
80,737
(8.03 %)
n/a 23,574
(2.02 %)
85,662
(13.32 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
0
(0 %)
691
(0.21 %)
2,833
(100.00 %)
501,414
(2.11 %)
386,209
(3.95 %)
5,652,743
(41.66 %)
0
(0 %)
1,077,929
(15.36 %)
36,398
(1.62 %)
13,210
(0.76 %)
97 coffee C.arabica (ET-39 2024)
GCF_036785885.1
119,626
(9.97 %)
n/a 25,877
(2.06 %)
97,184
(14.13 %)
n/a 37.50
(100.00 %)
0
(0 %)
107
(0.00 %)
134
(100.00 %)
542,076
(2.06 %)
445,020
(5.76 %)
5,654,970
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,016,107
(15.27 %)
38,607
(3.43 %)
13,717
(0.69 %)
98 coffee C.eugenioides (CCC68of 2018)
GCF_003713205.1
43,829
(7.69 %)
n/a 14,911
(2.02 %)
57,408
(14.42 %)
n/a 36.89
(97.92 %)
0
(0 %)
3,482
(2.08 %)
3,530
(100.00 %)
312,360
(2.09 %)
234,658
(3.24 %)
3,464,594
(38.91 %)
5
(0.00 %)
573,244
(14.34 %)
21,553
(1.54 %)
8,893
(0.82 %)
99 Commerson's wild potato (CGN18024_1 2023)
GCA_029007595.1
n/a n/a 16,068
(2.21 %)
50,780
(10.49 %)
n/a 34.48
(99.99 %)
0
(0 %)
1
(0.01 %)
639
(100.00 %)
1,250,333
(70.08 %)
249,197
(3.97 %)
5,014,592
(38.92 %)
0
(0 %)
534,534
(6.58 %)
6,970
(0.46 %)
1,331
(0.06 %)
100 common bean
GCF_000499845.1
32,720
(9.56 %)
n/a 16,474
(3.53 %)
45,055
(14.46 %)
n/a 34.96
(90.70 %)
40,860
(9.33 %)
40,860
(9.33 %)
41,568
(90.67 %)
233,709
(2.97 %)
208,045
(3.61 %)
2,886,693
(37.28 %)
77
(0.03 %)
225,586
(4.20 %)
38,054
(5.05 %)
10,671
(0.95 %)
101 common cattail (L0001 2021)
GCF_019914945.1
37,046
(18.67 %)
n/a 14,152
(6.13 %)
28,640
(19.48 %)
n/a 37.74
(99.99 %)
0
(0 %)
66
(0.01 %)
76
(100.00 %)
129,836
(2.97 %)
80,188
(2.65 %)
1,248,248
(29.88 %)
0
(0 %)
79,595
(2.91 %)
22,935
(5.83 %)
12,606
(3.10 %)
102 common fig (Dottato GU2019 2019)
GCA_009761775.1
n/a n/a 14,992
(4.28 %)
36,350
(16.84 %)
n/a 34.41
(99.99 %)
394
(0.01 %)
394
(0.01 %)
905
(99.99 %)
475,247
(5.76 %)
230,646
(4.36 %)
2,425,030
(37.74 %)
0
(0 %)
187,932
(6.92 %)
18,611
(3.41 %)
14,658
(2.57 %)
103 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1
49,622
(12.72 %)
n/a 14,929
(3.58 %)
32,981
(12.20 %)
n/a 33.07
(99.99 %)
0
(0 %)
381
(0.01 %)
538
(100.00 %)
525,520
(5.43 %)
225,151
(3.91 %)
2,463,587
(42.86 %)
0
(0 %)
240,039
(5.90 %)
13,018
(1.79 %)
4,271
(0.48 %)
104 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1
49,976
(13.24 %)
n/a 16,949
(3.79 %)
38,488
(13.47 %)
n/a 33.40
(95.35 %)
24,158
(4.67 %)
24,158
(4.67 %)
28,947
(95.33 %)
525,525
(5.37 %)
246,475
(5.25 %)
2,603,240
(38.46 %)
78
(0.04 %)
256,779
(9.85 %)
13,597
(2.11 %)
5,462
(1.04 %)
105 common jujube (Dongzao 2023)
GCF_031755915.1
51,464
(13.54 %)
n/a 14,443
(3.56 %)
31,633
(12.06 %)
n/a 33.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 14
(100.00 %)
516,010
(5.54 %)
234,395
(5.05 %)
2,319,259
(43.64 %)
0
(0 %)
252,407
(6.74 %)
12,926
(2.66 %)
3,943
(0.43 %)
106 common jujube (Junzao 2020)
GCA_001835785.2
n/a n/a 14,443
(3.88 %)
30,773
(12.63 %)
n/a 32.95
(99.91 %)
108
(0.00 %)
222
(0.09 %)
155
(100.00 %)
478,087
(5.53 %)
206,042
(4.15 %)
2,222,289
(41.43 %)
0
(0 %)
200,514
(5.62 %)
11,860
(1.82 %)
3,925
(0.47 %)
107 common reed (primary hap 2023)
GCF_958298935.1
65,051
(8.85 %)
n/a 26,142
(3.49 %)
114,639
(23.87 %)
n/a 44.17
(100.00 %)
0
(0 %)
59
(0.00 %)
37
(100.00 %)
243,799
(1.41 %)
237,530
(2.79 %)
4,477,357
(31.45 %)
2
(0.00 %)
226,760
(3.23 %)
154,087
(19.32 %)
110,558
(9.31 %)
108 common sunflower
GCF_002127325.2
133,319
(3.74 %)
n/a 19,514
(0.59 %)
166,187
(9.16 %)
n/a 38.59
(97.94 %)
0
(0 %)
2,384
(2.06 %)
334
(100.00 %)
1,263,836
(2.20 %)
1,549,598
(4.15 %)
12,728,097
(58.39 %)
0
(0 %)
3,080,461
(20.20 %)
170,287
(2.39 %)
34,569
(0.41 %)
109 common tobacco (Basma Xanthi 2014)
GCA_000715095.1
n/a n/a 29,103
(0.75 %)
200,375
(6.85 %)
n/a 38.98
(95.11 %)
468,375
(4.88 %)
468,375
(4.88 %)
1,111,920
(95.12 %)
1,199,550
(3.27 %)
1,359,905
(4.81 %)
24,590,709
(50.95 %)
400
(0.01 %)
n/a 205,873
(1.79 %)
31,335
(0.28 %)
110 common tobacco (K326 2023)
GCA_000715075.2
n/a n/a 31,039
(0.78 %)
176,804
(6.40 %)
n/a 39.12
(100.00 %)
0
(0 %)
710
(0.00 %)
699
(100.00 %)
4,626,207
(84.12 %)
1,502,920
(6.71 %)
24,314,611
(56.69 %)
8
(0.00 %)
5,064,377
(12.27 %)
225,794
(1.93 %)
9,832
(0.10 %)
111 common tobacco (K326 2023)
GCF_000715075.1
116,106
(3.08 %)
n/a 31,018
(0.77 %)
176,913
(6.40 %)
n/a 39.12
(100.00 %)
0
(0 %)
712
(0.00 %)
701
(100.00 %)
1,205,229
(1.45 %)
1,502,955
(6.71 %)
24,316,152
(56.68 %)
8
(0.00 %)
5,064,388
(12.27 %)
225,863
(1.93 %)
39,109
(0.34 %)
112 common tobacco (TN90 2014)
GCF_000715135.1
100,875
(3.08 %)
n/a 29,968
(0.80 %)
184,998
(7.05 %)
n/a 38.95
(97.11 %)
124,354
(2.89 %)
292,325
(2.90 %)
292,601
(97.11 %)
1,134,202
(3.09 %)
1,268,208
(4.45 %)
24,013,710
(52.08 %)
127
(0.00 %)
2,554,031
(5.85 %)
204,914
(1.84 %)
31,402
(0.30 %)
113 common vetch (South Australia 2022)
GCA_021764765.1
n/a n/a 17,420
(0.99 %)
77,140
(6.43 %)
n/a 35.62
(99.97 %)
0
(0 %)
5,823
(0.04 %)
18
(100.00 %)
708,538
(2.24 %)
719,430
(5.37 %)
8,370,861
(57.87 %)
1
(0.00 %)
1,915,570
(13.64 %)
32,513
(0.96 %)
11,904
(0.30 %)
114 cork oak (v2 HL8 2018)
GCF_002906115.2
53,587
(7.04 %)
n/a 17,804
(1.85 %)
77,741
(13.65 %)
n/a 35.35
(97.95 %)
0
(0 %)
25,649
(2.05 %)
22,642
(100.00 %)
860,049
(3.78 %)
485,854
(6.14 %)
5,989,180
(36.35 %)
218
(0.02 %)
685,954
(9.84 %)
20,674
(1.12 %)
10,386
(0.56 %)
115 cork oak (v3 HL8 2024)
GCF_002906115.3
56,406
(8.63 %)
n/a 16,303
(2.05 %)
63,990
(13.73 %)
n/a 34.91
(95.70 %)
26,066
(4.30 %)
26,066
(4.30 %)
28,407
(95.70 %)
743,470
(3.99 %)
393,077
(5.53 %)
4,897,193
(34.87 %)
234
(0.08 %)
535,347
(10.58 %)
16,140
(0.90 %)
8,912
(0.49 %)
116 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1
112,410
(5.51 %)
n/a 35,047
(1.61 %)
101,814
(6.75 %)
n/a 34.45
(97.16 %)
48,736
(2.84 %)
48,742
(2.84 %)
57,884
(97.16 %)
829,774
(2.69 %)
808,839
(3.64 %)
12,556,104
(52.01 %)
202
(0.01 %)
1,489,112
(8.44 %)
31,946
(0.61 %)
9,983
(0.20 %)
117 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1
154,134
(6.02 %)
n/a 37,839
(1.61 %)
107,764
(6.56 %)
n/a 34.36
(99.87 %)
5,708
(0.13 %)
5,708
(0.13 %)
6,735
(99.87 %)
996,701
(2.36 %)
903,817
(3.56 %)
13,123,355
(54.75 %)
6
(0.00 %)
2,053,660
(12.23 %)
35,220
(0.59 %)
11,349
(0.19 %)
118 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1
72,590
(8.99 %)
n/a 20,368
(2.64 %)
86,941
(18.36 %)
n/a 33.22
(98.25 %)
19,717
(1.76 %)
19,717
(1.76 %)
20,751
(98.24 %)
367,610
(3.53 %)
300,200
(3.32 %)
5,199,574
(40.83 %)
36
(0.01 %)
386,729
(4.92 %)
10,926
(0.55 %)
5,495
(0.26 %)
119 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2
48,588
(10.55 %)
n/a 16,925
(3.30 %)
44,689
(13.01 %)
n/a 32.95
(99.48 %)
0
(0 %)
68
(0.52 %)
676
(100.00 %)
344,688
(3.92 %)
283,941
(8.14 %)
3,091,888
(41.66 %)
1
(0.00 %)
420,714
(7.57 %)
24,507
(2.34 %)
11,817
(1.10 %)
120 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1
49,636
(19.79 %)
n/a 18,863
(6.83 %)
34,588
(19.24 %)
n/a 36.43
(97.43 %)
0
(0 %)
13,813
(2.58 %)
3,500
(100.00 %)
181,838
(3.12 %)
140,936
(7.42 %)
1,550,544
(33.30 %)
519
(0.13 %)
210,153
(7.41 %)
13,714
(2.69 %)
9,612
(1.52 %)
121 cucumber
GCF_000004075.3
37,079
(18.45 %)
n/a 13,349
(5.61 %)
23,889
(15.73 %)
n/a 32.84
(99.98 %)
0
(0 %)
89
(0.02 %)
88
(100.00 %)
158,454
(3.72 %)
77,247
(3.20 %)
1,739,467
(33.72 %)
0
(0 %)
67,519
(3.18 %)
5,730
(1.35 %)
4,446
(0.78 %)
122 cultivated vanilla (Daphna alternate hap 2020)
GCA_016413885.1
n/a 29,180
(3.86 %)
14,128
(1.63 %)
42,460
(7.33 %)
n/a 30.78
(99.98 %)
0
(0 %)
2,018
(0.02 %)
668
(100.00 %)
377,357
(3.69 %)
183,159
(2.82 %)
5,560,199
(36.58 %)
0
(0 %)
236,375
(2.51 %)
30,878
(2.75 %)
24,670
(2.23 %)
123 cultivated vanilla (Daphna primary hap 2020)
GCA_016413895.1
n/a 29,167
(3.89 %)
13,933
(1.63 %)
40,035
(6.93 %)
n/a 30.80
(99.98 %)
0
(0 %)
1,977
(0.02 %)
667
(100.00 %)
373,612
(3.67 %)
181,531
(2.84 %)
5,483,268
(36.45 %)
0
(0 %)
238,255
(2.57 %)
30,829
(2.75 %)
24,652
(2.23 %)
124 currant tomato (LA2093 2020)
GCA_014964335.1
n/a n/a 15,541
(2.01 %)
39,725
(7.40 %)
n/a 34.48
(99.94 %)
0
(0 %)
373
(0.06 %)
127
(100.00 %)
369,651
(3.79 %)
256,146
(4.80 %)
5,523,685
(41.09 %)
1
(0.00 %)
667,017
(7.35 %)
32,203
(2.29 %)
2,428
(0.11 %)
125 damask rose (2016)
GCA_001662545.1
n/a n/a 16,060
(1.87 %)
117,610
(18.87 %)
n/a 38.73
(97.06 %)
101,982
(2.91 %)
101,982
(2.91 %)
409,854
(97.09 %)
329,911
(1.95 %)
258,478
(2.82 %)
3,747,902
(31.42 %)
54
(0.00 %)
n/a 48,987
(3.05 %)
30,432
(1.60 %)
126 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1
61,678
(8.40 %)
n/a 18,582
(2.20 %)
70,121
(14.29 %)
n/a 40.29
(100.00 %)
0
(0 %)
317
(0.00 %)
2,391
(100.00 %)
431,923
(8.92 %)
371,389
(4.19 %)
2,721,501
(44.16 %)
0
(0 %)
589,858
(11.41 %)
89,481
(12.47 %)
43,324
(3.17 %)
127 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1
48,949
(10.55 %)
n/a 16,697
(2.99 %)
64,523
(16.24 %)
n/a 39.33
(91.22 %)
63,065
(8.79 %)
64,723
(8.79 %)
143,382
(91.21 %)
284,003
(7.58 %)
185,641
(2.23 %)
2,574,645
(27.52 %)
1,389
(0.09 %)
103,949
(2.07 %)
62,332
(7.21 %)
34,074
(3.23 %)
128 date-plum (Yz01 2020)
GCF_014633365.1
48,290
(8.05 %)
n/a 15,110
(2.28 %)
57,536
(14.48 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
0
(0 %)
606
(0.01 %)
43
(100.00 %)
445,970
(3.39 %)
319,468
(5.39 %)
3,687,072
(36.31 %)
0
(0 %)
392,987
(6.21 %)
41,402
(3.02 %)
25,722
(1.62 %)
129 desmid P.margaritaceum (SKD-8 2022)
GCA_023375785.1
n/a n/a 6,643
(0.13 %)
342,902
(20.03 %)
n/a 51.10
(86.42 %)
704,233
(13.62 %)
704,233
(13.62 %)
1,037,019
(86.38 %)
4,516,716
(76.58 %)
2,687,996
(21.25 %)
15,150,374
(48.80 %)
39,894
(0.65 %)
n/a 680,776
(31.03 %)
201,505
(3.32 %)
130 dessert banana (baxijiao 2024)
GCF_036884655.1
193,799
(12.81 %)
n/a 52,060
(3.07 %)
144,859
(15.37 %)
n/a 39.78
(99.99 %)
0
(0 %)
219
(0.01 %)
1,085
(100.00 %)
713,274
(2.40 %)
840,280
(6.39 %)
4,419,734
(51.60 %)
2
(0.00 %)
1,727,746
(13.45 %)
203,906
(13.78 %)
99,332
(4.84 %)
131 domesticated barley (Golden Promise 2019)
GCA_902500625.1
n/a n/a 17,386
(0.43 %)
252,520
(9.04 %)
n/a 44.38
(97.83 %)
0
(0 %)
621,008
(2.23 %)
8
(100.00 %)
3,098,901
(53.34 %)
2,055,561
(5.88 %)
14,404,046
(70.52 %)
48,027
(0.70 %)
n/a 706,795
(16.04 %)
267,631
(4.90 %)
132 domesticated barley (H.vulgare 2021 refseq)
GCF_904849725.1
63,364
(1.67 %)
n/a 17,849
(0.43 %)
260,921
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
0
(0 %)
162
(0.03 %)
291
(100.00 %)
2,720,197
(55.13 %)
1,726,335
(5.40 %)
14,010,390
(72.58 %)
0
(0 %)
5,823,234
(14.08 %)
732,834
(17.24 %)
271,782
(4.92 %)
133 durian
GCF_002303985.1
68,467
(10.35 %)
n/a 24,627
(3.34 %)
48,130
(9.41 %)
n/a 32.64
(99.58 %)
0
(0 %)
3,044
(0.43 %)
677
(100.00 %)
490,482
(3.80 %)
509,842
(12.92 %)
4,397,155
(48.22 %)
4
(0.00 %)
1,062,720
(8.92 %)
56,957
(6.23 %)
3,948
(0.21 %)
134 durum wheat (2019)
GCA_900231445.1
n/a 190,472
(0.87 %)
32,523
(0.34 %)
530,488
(8.17 %)
n/a 46.01
(98.73 %)
330,230
(1.28 %)
330,230
(1.28 %)
330,244
(98.72 %)
2,723,974
(3.46 %)
2,746,444
(3.02 %)
330,244
(98.72 %)
106
(0.00 %)
n/a 2,108,395
(25.96 %)
369,452
(2.43 %)
135 durum wheat (PI 192051 2025)
GCA_052818315.1
n/a n/a 32,793
(0.32 %)
569,058
(8.46 %)
n/a 46.13
(100.00 %)
0
(0 %)
801
(0.00 %)
856
(100.00 %)
2,706,273
(1.65 %)
3,201,406
(5.03 %)
30,830,875
(76.90 %)
1
(0.00 %)
n/a 2,152,748
(27.40 %)
567,944
(4.04 %)
136 eggplant (2014)
GCA_000787875.1
n/a n/a 15,481
(1.92 %)
48,974
(7.98 %)
n/a 35.72
(95.30 %)
109,175
(4.75 %)
118,249
(4.75 %)
143,048
(95.25 %)
317,711
(2.21 %)
307,772
(4.55 %)
6,006,653
(38.61 %)
139
(0.00 %)
405,018
(4.41 %)
7,570
(0.50 %)
3,023
(0.14 %)
137 elephant grass (2022)
GCA_022644695.1
n/a n/a 34,754
(1.95 %)
231,748
(22.13 %)
n/a 46.97
(99.99 %)
1,574
(0.01 %)
1,574
(0.01 %)
1,588
(99.99 %)
587,262
(1.41 %)
551,392
(2.62 %)
9,678,348
(46.32 %)
1
(0.00 %)
1,420,820
(7.19 %)
398,884
(36.81 %)
249,949
(10.95 %)
138 emerald green okra A.esculentus (Green Star 2024)
GCA_035048815.1
n/a n/a 57,092
(4.66 %)
139,785
(17.31 %)
n/a 33.78
(99.95 %)
104
(0.05 %)
104
(0.05 %)
182
(99.95 %)
665,897
(3.33 %)
561,368
(7.98 %)
6,809,885
(45.67 %)
6
(0.00 %)
1,164,866
(8.06 %)
31,360
(1.27 %)
20,601
(0.67 %)
139 English oak (primary hap 2022)
GCF_932294415.1
69,211
(8.60 %)
n/a 15,792
(1.92 %)
66,872
(14.31 %)
n/a 35.68
(100.00 %)
0
(0 %)
119
(0.00 %)
96
(100.00 %)
773,652
(4.18 %)
429,695
(8.87 %)
4,823,216
(39.65 %)
0
(0 %)
671,979
(7.81 %)
21,654
(2.15 %)
8,337
(0.38 %)
140 English walnut
GCF_001411555.2
52,962
(10.18 %)
n/a 18,927
(3.19 %)
60,210
(17.37 %)
n/a 36.21
(99.89 %)
0
(0 %)
1,051
(0.11 %)
24,757
(100.00 %)
434,989
(3.86 %)
303,673
(3.70 %)
3,318,114
(33.94 %)
1
(0.00 %)
243,788
(4.94 %)
24,028
(1.83 %)
12,484
(0.84 %)
141 eudicot A.cruentus (Arusha 2021)
GCA_019425755.1
n/a n/a 12,903
(3.20 %)
33,445
(14.99 %)
n/a 33.08
(99.96 %)
0
(0 %)
983
(0.04 %)
625
(100.00 %)
891,822
(54.95 %)
181,416
(3.89 %)
2,376,097
(36.79 %)
0
(0 %)
145,312
(3.92 %)
4,821
(0.53 %)
664
(0.09 %)
142 eudicot A.glutinosa (primary hap 2023)
GCF_958979055.1
42,218
(10.92 %)
n/a 14,784
(3.18 %)
46,293
(16.46 %)
n/a 36.73
(100.00 %)
0
(0 %)
96
(0.00 %)
15
(100.00 %)
433,802
(3.92 %)
270,411
(4.15 %)
2,634,547
(36.26 %)
5
(0.00 %)
320,176
(6.73 %)
29,535
(3.72 %)
14,829
(1.30 %)
143 eudicot A.graveolens (Ventura 2020)
GCA_009905375.1
n/a 1,660
(0.06 %)
17,520
(0.48 %)
115,295
(5.30 %)
n/a 35.68
(99.73 %)
0
(0 %)
4,633
(0.27 %)
4,852
(100.00 %)
1,247,334
(1.96 %)
1,423,238
(4.75 %)
11,040,179
(71.10 %)
17
(0.00 %)
4,171,101
(17.32 %)
31,499
(0.31 %)
17,805
(0.17 %)
144 eudicot C.lanceoleosa (SQ_2022a 2022)
GCA_025200525.1
n/a 54,167
(1.84 %)
21,858
(0.67 %)
153,069
(7.18 %)
n/a 37.63
(99.99 %)
0
(0 %)
2,949
(0.01 %)
790
(100.00 %)
4,031,259
(23.47 %)
2,174,993
(6.70 %)
18,920,250
(54.60 %)
1
(0.00 %)
2,248,121
(7.14 %)
200,005
(3.83 %)
35,786
(0.43 %)
145 eudicot C.lavandulifolium (G1 2022)
GCA_022545495.1
n/a n/a 18,954
(0.61 %)
117,628
(6.04 %)
n/a 36.02
(99.96 %)
0
(0 %)
10,291
(0.04 %)
178
(100.00 %)
2,596,263
(19.70 %)
1,222,904
(3.44 %)
12,327,164
(55.80 %)
1
(0.00 %)
2,936,447
(12.99 %)
67,370
(0.88 %)
12,524
(0.17 %)
146 eudicot C.sativa (Pink pepper KNU-18-1 2023)
GCF_029168945.1
47,822
(7.37 %)
n/a 14,132
(1.76 %)
52,606
(11.89 %)
n/a 34.09
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
18
(100.00 %)
490,095
(3.26 %)
291,432
(3.68 %)
3,197,241
(60.23 %)
0
(0 %)
860,217
(15.10 %)
29,385
(2.13 %)
5,327
(0.25 %)
147 eudicot C.seticuspe (Gojo-0 2021)
GCA_019973895.1
n/a n/a 17,958
(0.52 %)
141,880
(7.25 %)
n/a 36.23
(98.03 %)
37,176
(1.97 %)
37,176
(1.97 %)
45,671
(98.03 %)
3,118,877
(21.04 %)
1,512,311
(3.93 %)
10,481,296
(59.70 %)
29
(0.00 %)
2,398,260
(14.63 %)
63,123
(0.67 %)
7,667
(0.08 %)
148 eudicot D.spatulata (IRGN DVMQU6P362 2024)
GCA_035668315.1
n/a n/a 16,707
(3.49 %)
62,287
(20.90 %)
n/a 37.76
(99.96 %)
1,083
(0.03 %)
1,083
(0.03 %)
24,058
(99.97 %)
274,473
(12.37 %)
110,623
(2.62 %)
2,103,310
(28.32 %)
44
(0.00 %)
51,737
(1.03 %)
22,076
(2.40 %)
14,298
(1.43 %)
149 eudicot E.lathyris (primary hap 2023)
GCF_963576675.1
54,052
(4.78 %)
n/a 14,372
(1.33 %)
80,776
(14.35 %)
n/a 36.88
(100.00 %)
24
(0.00 %)
24
(0.00 %)
57
(100.00 %)
496,928
(2.45 %)
491,703
(4.75 %)
4,850,176
(50.53 %)
0
(0 %)
930,309
(12.08 %)
57,897
(3.26 %)
16,706
(0.73 %)
150 eudicot E.russellianum (2023)
GCA_036186865.1
n/a n/a 18,823
(1.28 %)
96,845
(13.58 %)
n/a 37.91
(99.98 %)
0
(0 %)
26,521
(0.02 %)
100
(100.00 %)
1,526,493
(77.75 %)
539,134
(3.70 %)
6,307,362
(47.97 %)
3,016
(0.08 %)
1,490,109
(16.56 %)
31,022
(0.81 %)
3,764
(0.11 %)
151 eudicot G.bilobum (WA Gb01-03AN 2023)
GCF_033153095.1
45,049
(8.43 %)
n/a 18,010
(3.03 %)
54,840
(15.32 %)
n/a 35.23
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
5,089
(100.00 %)
397,210
(3.11 %)
254,173
(4.10 %)
3,228,435
(42.44 %)
0
(0 %)
390,432
(7.07 %)
15,343
(0.97 %)
7,316
(0.48 %)
152 eudicot H.pumila (YLH828 2023)
GCF_033568475.1
51,602
(5.64 %)
n/a 14,506
(1.52 %)
55,054
(9.40 %)
n/a 37.18
(100.00 %)
0
(0 %)
411
(0.00 %)
133
(100.00 %)
397,610
(2.13 %)
326,774
(3.20 %)
4,120,854
(57.35 %)
2
(0.00 %)
717,826
(10.89 %)
63,233
(2.52 %)
11,505
(0.54 %)
153 eudicot M.micrantha (NLD-2019 2019)
GCA_009363875.1
n/a 46,351
(3.22 %)
19,940
(1.00 %)
96,066
(8.14 %)
n/a 36.20
(99.99 %)
0
(0 %)
1,599
(0.01 %)
2,815
(100.00 %)
908,702
(2.54 %)
980,385
(4.65 %)
9,286,677
(54.99 %)
0
(0 %)
1,406,907
(15.84 %)
89,410
(1.77 %)
30,371
(0.58 %)
154 eudicot N.benthamiana (KLAB 2023)
GCA_034376525.1
n/a n/a 27,772
(0.99 %)
128,971
(6.28 %)
n/a 37.84
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
667
(100.00 %)
4,744,181
(80.09 %)
1,261,453
(5.53 %)
18,063,531
(49.81 %)
0
(0 %)
1,987,721
(7.10 %)
86,419
(1.62 %)
5,110
(0.06 %)
155 eudicot N.caerulescens (Cira 2024)
GCA_046127275.1
n/a n/a 20,205
(8.11 %)
49,304
(30.44 %)
n/a 39.42
(99.99 %)
4
(0.00 %)
41
(0.01 %)
1,181
(100.00 %)
413,962
(43.41 %)
125,005
(11.92 %)
1,047,909
(36.93 %)
0
(0 %)
211,265
(12.17 %)
24,840
(5.52 %)
15,334
(2.33 %)
156 eudicot P.eburnea (SZY01 2022)
GCF_022965805.1
61,645
(7.70 %)
n/a 19,490
(2.24 %)
62,769
(12.34 %)
n/a 37.11
(99.83 %)
0
(0 %)
1,024
(0.17 %)
1,225
(100.00 %)
314,817
(1.84 %)
291,276
(6.35 %)
3,964,714
(53.25 %)
1
(0.00 %)
706,428
(13.41 %)
61,424
(2.69 %)
11,909
(0.61 %)
157 eudicot P.frutescens var. frutescens (PF040 2021)
GCA_019511825.2
n/a 38,941
(3.97 %)
28,418
(2.15 %)
120,101
(15.79 %)
n/a 35.13
(99.99 %)
0
(0 %)
763
(0.01 %)
1,465
(100.00 %)
1,497,762
(21.02 %)
662,726
(4.46 %)
8,218,287
(43.32 %)
1
(0.00 %)
863,856
(8.05 %)
65,299
(2.16 %)
38,244
(1.31 %)
158 eudicot P.huaijiensis (GDHJ02 2020)
GCF_012295235.1
55,830
(12.29 %)
n/a 19,054
(3.86 %)
48,657
(15.27 %)
n/a 35.65
(97.46 %)
0
(0 %)
31,613
(2.54 %)
21,121
(100.00 %)
195,798
(1.99 %)
128,140
(2.47 %)
2,568,483
(41.18 %)
392
(0.07 %)
283,219
(7.80 %)
16,399
(1.28 %)
8,272
(0.72 %)
159 eudicot P.nigra (primary hap 2023)
GCF_951802175.1
55,369
(16.07 %)
n/a 19,591
(4.65 %)
41,748
(16.14 %)
n/a 34.95
(99.99 %)
0
(0 %)
277
(0.01 %)
21
(100.00 %)
256,070
(2.83 %)
178,940
(8.44 %)
2,317,187
(40.87 %)
5
(0.00 %)
309,693
(9.69 %)
3,317
(6.62 %)
1,591
(0.12 %)
160 eudicot P.vulgaris (G19833 2024)
GCF_000499845.2
48,620
(10.29 %)
n/a 16,779
(3.20 %)
47,438
(13.87 %)
n/a 35.62
(98.95 %)
566
(1.05 %)
566
(1.05 %)
1,034
(98.95 %)
245,672
(2.41 %)
239,601
(4.78 %)
2,887,505
(44.41 %)
0
(0 %)
323,051
(6.68 %)
44,689
(7.20 %)
11,348
(1.02 %)
161 eudicot R.rugosa (primary hap 2023)
GCF_958449725.1
62,563
(15.19 %)
n/a 15,236
(3.45 %)
60,387
(23.53 %)
n/a 39.30
(99.95 %)
0
(0 %)
1,014
(0.05 %)
77
(100.00 %)
226,730
(2.23 %)
196,099
(4.12 %)
1,632,269
(33.79 %)
8
(0.00 %)
202,155
(7.85 %)
38,448
(5.69 %)
22,749
(2.22 %)
162 eudicot S.americanum (SP2273 SP2273 2023)
GCA_030463325.1
n/a n/a 15,767
(1.56 %)
57,615
(9.26 %)
n/a 36.15
(100.00 %)
0
(0 %)
214
(0.00 %)
90
(100.00 %)
2,179,570
(59.21 %)
301,263
(3.51 %)
5,651,338
(51.90 %)
0
(0 %)
1,489,004
(15.63 %)
28,868
(1.00 %)
8,877
(0.27 %)
163 eudicot S.americanum (SP2275 SP2275 2023)
GCA_030463385.1
n/a n/a 15,677
(1.56 %)
57,771
(9.32 %)
n/a 36.18
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 540
(100.00 %)
2,161,174
(59.26 %)
298,020
(3.34 %)
5,624,901
(52.02 %)
0
(0 %)
1,470,347
(15.61 %)
29,520
(1.04 %)
9,472
(0.30 %)
164 eudicot S.miltiorrhiza (Shanhuang shh 2023)
GCA_028751815.1
n/a n/a 15,144
(2.60 %)
67,052
(21.48 %)
n/a 37.46
(99.58 %)
0
(0 %)
695
(0.42 %)
171
(100.00 %)
614,263
(17.32 %)
364,006
(5.05 %)
2,679,398
(42.13 %)
0
(0 %)
345,733
(12.00 %)
64,170
(6.16 %)
38,463
(3.35 %)
165 eudicot T.arvense (2022)
GCA_911865555.2
n/a 26,392
(7.18 %)
23,487
(5.55 %)
54,244
(16.93 %)
n/a 38.39
(100.00 %)
0
(0 %)
24
(0.00 %)
964
(100.00 %)
204,363
(1.86 %)
150,149
(5.58 %)
2,245,900
(50.03 %)
0
(0 %)
610,766
(11.85 %)
35,971
(3.77 %)
15,237
(1.56 %)
166 eudicot V.riparia x Vitis rupestris (2022)
GCA_946000675.1
n/a n/a 29,137
(2.81 %)
89,605
(14.72 %)
n/a 35.15
(99.99 %)
102
(0.01 %)
102
(0.01 %)
596
(99.99 %)
664,293
(2.97 %)
503,960
(9.26 %)
5,715,446
(39.21 %)
0
(0 %)
820,251
(7.58 %)
22,264
(1.77 %)
13,165
(0.52 %)
167 eudicot V.rotundifolia (Noble 2022)
GCA_022557335.1
n/a n/a 13,992
(3.39 %)
38,479
(14.93 %)
n/a 33.54
(99.82 %)
17,084
(0.19 %)
17,084
(0.19 %)
17,104
(99.81 %)
696,697
(51.55 %)
178,090
(4.22 %)
2,480,890
(32.65 %)
6,786
(0.70 %)
226,981
(6.44 %)
6,497
(0.70 %)
4,345
(0.46 %)
168 Euphrates poplar (v2 2014)
GCF_000495115.2
56,366
(12.92 %)
n/a 20,853
(4.29 %)
41,483
(12.40 %)
n/a 32.05
(95.31 %)
22,764
(4.70 %)
22,764
(4.70 %)
32,266
(95.30 %)
357,310
(3.64 %)
246,638
(4.06 %)
2,660,781
(43.22 %)
21
(0.01 %)
283,033
(6.42 %)
2,691
(0.38 %)
1,682
(0.12 %)
169 European chestnut (Marrone di Chiusa Pesio 2024)
GCF_040712315.1
49,645
(7.87 %)
n/a 15,653
(2.10 %)
61,041
(13.43 %)
n/a 35.42
(100.00 %)
0
(0 %)
65
(0.00 %)
13
(100.00 %)
595,120
(3.41 %)
355,816
(4.98 %)
4,680,964
(38.07 %)
0
(0 %)
480,528
(5.67 %)
20,075
(1.41 %)
7,608
(0.40 %)
170 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2
77,800
(12.38 %)
n/a 22,539
(3.42 %)
67,761
(16.26 %)
n/a 38.07
(99.99 %)
0
(0 %)
101
(0.01 %)
34
(100.00 %)
309,302
(2.18 %)
331,724
(5.06 %)
2,996,468
(41.19 %)
1
(0.00 %)
501,459
(8.86 %)
25,597
(2.08 %)
15,213
(1.03 %)
171 European hazelnut (Tombul 2020)
GCF_901000735.1
39,203
(13.04 %)
n/a 15,600
(4.11 %)
42,096
(18.23 %)
n/a 35.90
(99.54 %)
0
(0 %)
14,532
(0.48 %)
12
(100.00 %)
358,479
(3.69 %)
179,807
(3.40 %)
2,234,313
(32.05 %)
66
(0.01 %)
338,416
(13.59 %)
12,963
(1.47 %)
9,205
(1.06 %)
172 European hop (primary hap 2023)
GCF_963169125.1
72,613
(2.92 %)
n/a 14,868
(0.56 %)
135,918
(7.87 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
0
(0 %)
129
(0.00 %)
319
(100.00 %)
1,077,704
(2.26 %)
853,368
(5.27 %)
13,477,464
(61.64 %)
0
(0 %)
1,654,055
(7.66 %)
152,063
(4.18 %)
31,956
(0.51 %)
173 European hop (Shinshu Wase 2014)
GCA_000831365.1
n/a n/a 17,158
(0.86 %)
191,202
(13.47 %)
n/a 38.57
(86.69 %)
160,222
(13.33 %)
530,762
(13.34 %)
292,698
(86.67 %)
770,031
(2.12 %)
637,135
(3.75 %)
13,484,203
(41.57 %)
8,594
(0.10 %)
n/a 81,500
(2.36 %)
40,113
(1.30 %)
174 European mistletoe (primary hap 2023)
GCA_963277665.1
n/a n/a 12,110
(0.01 %)
960,545
(1.07 %)
n/a 31.25
(100.00 %)
855
(0.00 %)
6,368
(0.00 %)
5,951
(100.00 %)
61,111,090
(11.87 %)
29,667,857
(2.75 %)
11,464
(100.00 %)
81
(0.00 %)
60,812,395
(6.42 %)
1,680,995
(2.36 %)
239,293
(0.15 %)
175 false flax
GCF_000633955.1
123,030
(22.63 %)
n/a 61,894
(13.77 %)
113,219
(31.09 %)
n/a 36.55
(92.99 %)
568
(0.01 %)
74,428
(7.02 %)
37,780
(99.99 %)
346,267
(2.46 %)
233,837
(5.56 %)
3,452,066
(27.34 %)
8,995
(2.52 %)
326,960
(10.10 %)
32,235
(2.62 %)
20,198
(1.48 %)
176 fava bean (2023)
GCA_948472305.1
n/a 47,586
(0.35 %)
18,459
(0.14 %)
221,591
(2.78 %)
n/a 37.44
(100.00 %)
10
(0.00 %)
5,330
(0.00 %)
3,992
(100.00 %)
4,140,168
(2.97 %)
4,673,353
(13.95 %)
36,694,276
(79.21 %)
23
(0.00 %)
1,288,824
(1.25 %)
59,853
(0.73 %)
27,946
(0.08 %)
177 Fendler's bladderpod (2019)
GCA_900406525.1
n/a n/a 29,791
(9.22 %)
82,813
(26.56 %)
n/a 34.83
(99.51 %)
109,570
(0.49 %)
109,570
(0.49 %)
209,502
(99.51 %)
193,365
(2.63 %)
165,270
(4.54 %)
2,180,278
(29.35 %)
9,235
(0.29 %)
99,774
(2.82 %)
8,339
(0.91 %)
5,475
(0.59 %)
178 Fendler's bladderpod (WCL-YS1 PI 610492 2024)
GCA_036630335.1
n/a n/a 23,679
(9.84 %)
43,179
(26.89 %)
n/a 34.92
(96.38 %)
0
(0 %)
98,816
(3.75 %)
9,891
(100.00 %)
373,519
(23.21 %)
328,539
(16.37 %)
1,720,493
(26.70 %)
149
(0.02 %)
253,434
(11.51 %)
5,729
(0.77 %)
4,009
(0.51 %)
179 ferns C-fern (Hn-n Whitten #5841 2021)
GCA_020310875.1
n/a 75,211
(0.95 %)
9,421
(0.09 %)
135,222
(2.48 %)
n/a 38.64
(99.38 %)
4,604
(0.62 %)
4,604
(0.62 %)
10,776
(99.38 %)
2,992,638
(8.23 %)
4,552,105
(9.86 %)
24,840,439
(73.42 %)
3
(0.00 %)
6,236,111
(7.07 %)
166,309
(1.00 %)
26,330
(0.16 %)
180 field dodder (2020)
GCA_900332095.2
n/a 45,474
(18.20 %)
20,063
(4.21 %)
57,416
(19.19 %)
n/a 35.99
(94.55 %)
29,211
(5.47 %)
29,211
(5.47 %)
36,112
(94.53 %)
448,370
(12.07 %)
208,393
(3.46 %)
2,648,975
(35.75 %)
3,649
(0.58 %)
189,061
(4.55 %)
35,117
(3.87 %)
24,846
(2.66 %)
181 field mustard (Chiifu-401-42 2020)
GCF_000309985.2
73,442
(34.55 %)
n/a 30,193
(10.12 %)
57,010
(25.57 %)
n/a 36.83
(99.39 %)
0
(0 %)
408
(0.61 %)
1,100
(100.00 %)
261,522
(15.13 %)
196,553
(8.43 %)
1,533,242
(38.01 %)
0
(0 %)
376,874
(10.72 %)
24,895
(5.44 %)
14,510
(1.98 %)
182 field pennycress (KM-2021 2021)
GCA_018983045.1
n/a n/a 22,245
(5.38 %)
51,310
(16.10 %)
n/a 39.02
(99.92 %)
0
(0 %)
1,923
(0.08 %)
2,298
(100.00 %)
172,036
(1.52 %)
129,452
(6.55 %)
2,388,667
(53.91 %)
0
(0 %)
804,147
(15.04 %)
37,074
(4.98 %)
14,496
(1.54 %)
183 finger millet (KNE 796-S 2023)
GCA_032690845.1
n/a 48,836
(5.52 %)
31,097
(3.07 %)
140,467
(22.19 %)
n/a 43.87
(99.87 %)
142
(0.13 %)
142
(0.13 %)
674
(99.87 %)
1,168,206
(39.18 %)
229,202
(4.14 %)
4,910,934
(41.23 %)
0
(0 %)
816,546
(6.87 %)
205,561
(17.19 %)
128,841
(9.82 %)
184 finger millet (ML-365 2017)
GCA_002180455.1
n/a n/a 30,000
(2.41 %)
346,692
(27.97 %)
n/a 45.34
(98.74 %)
507,646
(1.30 %)
507,646
(1.30 %)
1,033,269
(98.70 %)
323,234
(1.19 %)
394,943
(6.28 %)
6,129,348
(33.00 %)
116,821
(2.67 %)
n/a 325,103
(21.18 %)
245,703
(14.05 %)
185 flowering dogwood (Cherokee Brave 2023)
GCF_030987335.1
63,465
(6.03 %)
n/a 17,263
(1.31 %)
78,564
(9.37 %)
n/a 35.95
(100.00 %)
96
(0.00 %)
96
(0.00 %)
459
(100.00 %)
982,341
(3.33 %)
719,891
(7.87 %)
6,810,592
(50.46 %)
0
(0 %)
1,484,349
(12.26 %)
27,883
(2.10 %)
14,303
(0.44 %)
186 foxtail millet
GCF_000263155.2
40,951
(13.47 %)
n/a 17,758
(5.07 %)
60,598
(30.59 %)
n/a 46.14
(98.82 %)
6,442
(1.19 %)
6,442
(1.19 %)
6,779
(98.81 %)
115,365
(1.46 %)
116,980
(2.45 %)
1,691,260
(29.31 %)
8
(0.00 %)
160,655
(4.99 %)
78,297
(28.27 %)
56,591
(11.82 %)
187 fried-egg orchid (Lindl 2021)
GCA_019925795.1
n/a 30,041
(2.24 %)
13,889
(0.88 %)
71,188
(7.43 %)
n/a 35.53
(99.95 %)
0
(0 %)
1,481
(0.05 %)
822
(100.00 %)
671,921
(2.91 %)
624,024
(4.46 %)
7,792,634
(47.85 %)
0
(0 %)
780,249
(7.12 %)
76,668
(3.16 %)
34,814
(1.23 %)
188 garden asparagus (2017)
GCF_001876935.1
45,159
(4.02 %)
n/a 13,440
(1.02 %)
85,207
(11.07 %)
n/a 39.02
(97.02 %)
44,390
(2.99 %)
47,391
(2.99 %)
56,182
(97.01 %)
427,496
(2.02 %)
885,946
(8.32 %)
6,075,356
(46.49 %)
46
(0.01 %)
1,014,228
(9.26 %)
111,109
(6.80 %)
35,931
(1.35 %)
189 garden lettuce (Salinas v11 2022)
GCF_002870075.4
69,048
(2.69 %)
n/a 16,407
(0.56 %)
105,654
(5.75 %)
n/a 37.92
(99.95 %)
0
(0 %)
384
(0.05 %)
93
(100.00 %)
1,192,578
(2.37 %)
1,282,344
(4.72 %)
12,843,881
(61.50 %)
2
(0.00 %)
2,596,117
(14.22 %)
160,781
(2.86 %)
21,226
(0.27 %)
190 garden pea (Zhongwan6 2022)
GCF_024323335.1
74,264
(1.88 %)
n/a 17,744
(0.43 %)
129,692
(4.97 %)
n/a 37.94
(99.73 %)
0
(0 %)
826
(0.27 %)
1,566
(100.00 %)
1,517,586
(2.16 %)
1,541,702
(5.89 %)
13,206,825
(66.95 %)
4
(0.00 %)
n/a 105,766
(0.97 %)
9,528
(0.15 %)
191 garlic-fruit tree (guangnan 2023)
GCF_029873635.1
43,473
(2.84 %)
n/a 13,544
(0.88 %)
64,877
(5.24 %)
n/a 36.06
(100.00 %)
0
(0 %)
596
(0.00 %)
510
(100.00 %)
1,556,970
(22.50 %)
788,188
(5.25 %)
10,081,845
(53.72 %)
1
(0.00 %)
1,139,226
(6.25 %)
41,032
(1.09 %)
17,380
(0.48 %)
192 ghaf (Desert tree PC_DT_omini 2023)
GCF_029017545.1
59,652
(8.73 %)
n/a 18,917
(2.55 %)
47,052
(9.22 %)
n/a 32.09
(99.98 %)
0
(0 %)
1,693
(0.02 %)
2,266
(100.00 %)
452,206
(3.00 %)
195,931
(2.27 %)
4,921,469
(39.63 %)
1
(0.00 %)
167,024
(3.12 %)
9,731
(0.69 %)
8,007
(0.51 %)
193 ginger
GCF_018446385.1
127,579
(4.07 %)
n/a 33,995
(0.96 %)
186,756
(7.79 %)
n/a 39.16
(100.00 %)
0
(0 %)
901
(0.00 %)
211
(100.00 %)
1,187,168
(2.18 %)
2,088,683
(6.47 %)
12,917,773
(61.42 %)
1
(0.00 %)
3,992,139
(15.45 %)
398,512
(10.38 %)
143,324
(2.40 %)
194 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2
42,106
(6.72 %)
n/a 15,819
(2.23 %)
49,753
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
5,305
(0.07 %)
310,402
(9.76 %)
13,479
(99.93 %)
394,793
(2.75 %)
364,336
(3.37 %)
4,190,750
(39.49 %)
3,050
(0.15 %)
283,527
(3.56 %)
12,198
(0.64 %)
7,327
(0.39 %)
195 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1
87,385
(2.18 %)
n/a 17,963
(0.44 %)
263,708
(10.29 %)
n/a 46.32
(97.73 %)
0
(0 %)
107,163
(2.27 %)
109,126
(100.00 %)
1,490,873
(15.60 %)
1,415,562
(5.65 %)
12,540,551
(71.59 %)
522
(0.02 %)
5,380,929
(14.74 %)
881,849
(29.81 %)
257,498
(5.22 %)
196 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1
69,195
(1.77 %)
n/a 18,614
(0.43 %)
300,274
(11.28 %)
n/a 46.38
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 68,537
(100.00 %)
1,555,328
(15.65 %)
1,485,488
(4.71 %)
13,133,338
(73.17 %)
0
(0 %)
4,874,338
(13.46 %)
928,327
(30.84 %)
269,584
(5.36 %)
197 goatgrass A.tauschii.strangulata (AL8/78 2024)
GCF_002575655.3
93,689
(2.58 %)
n/a 18,524
(0.46 %)
261,939
(10.44 %)
n/a 46.35
(99.97 %)
0
(0 %)
347
(0.03 %)
1,115
(100.00 %)
1,094,634
(1.42 %)
1,403,604
(6.42 %)
12,367,986
(72.90 %)
9
(0.00 %)
134,619
(0.42 %)
849,453
(31.38 %)
258,839
(5.41 %)
198 goji berry (Lr01 2021)
GCF_019175385.1
69,808
(4.35 %)
n/a 17,353
(1.01 %)
81,347
(7.68 %)
n/a 38.10
(99.95 %)
0
(0 %)
1,565
(0.05 %)
166
(100.00 %)
816,909
(2.29 %)
708,412
(4.09 %)
8,106,901
(53.67 %)
0
(0 %)
1,891,734
(16.01 %)
66,433
(1.82 %)
7,517
(0.15 %)
199 golden kiwifruit (Hongyang 2019)
GCA_009663005.1
n/a n/a 21,161
(2.89 %)
55,843
(11.78 %)
n/a 35.63
(99.99 %)
646
(0.01 %)
646
(0.01 %)
2,366
(99.99 %)
423,518
(2.92 %)
293,299
(3.76 %)
4,466,312
(33.71 %)
0
(0 %)
198,622
(2.97 %)
25,250
(1.74 %)
15,816
(1.02 %)
200 golden kiwifruit (Red5 2018)
GCA_003024255.1
n/a 33,115
(10.82 %)
22,332
(3.88 %)
51,709
(13.62 %)
n/a 35.31
(96.44 %)
0
(0 %)
25,521
(3.57 %)
1,234
(100.00 %)
347,035
(2.87 %)
241,862
(4.11 %)
3,578,217
(30.95 %)
1,207
(0.28 %)
151,895
(5.62 %)
19,259
(1.41 %)
12,861
(0.94 %)
201 grain amaranth (AhG2s 2020)
GCA_000753965.2
n/a n/a 13,698
(3.27 %)
34,546
(14.58 %)
n/a 32.99
(90.06 %)
0
(0 %)
7,031
(9.94 %)
1,567
(100.00 %)
217,772
(3.32 %)
181,251
(3.71 %)
2,391,775
(32.66 %)
19
(0.00 %)
160,684
(4.10 %)
4,425
(0.40 %)
1,763
(0.17 %)
202 great duckweed (2018)
GCA_900492545.1
n/a n/a 10,264
(6.56 %)
16,841
(26.52 %)
n/a 42.27
(99.98 %)
0
(0 %)
84
(0.02 %)
20
(100.00 %)
96,389
(3.49 %)
54,278
(2.54 %)
843,136
(22.61 %)
0
(0 %)
46,685
(3.00 %)
18,978
(24.35 %)
16,615
(11.45 %)
203 great duckweed (9509 2017)
GCA_001981405.1
n/a n/a 10,023
(7.00 %)
16,353
(26.89 %)
n/a 42.30
(92.78 %)
89,257
(7.32 %)
89,257
(7.32 %)
89,277
(92.68 %)
80,787
(2.86 %)
45,432
(1.93 %)
786,155
(19.70 %)
95
(0.04 %)
26,883
(1.77 %)
19,057
(20.99 %)
16,325
(10.84 %)
204 green algae (1602 2018)
GCA_002245835.2
n/a 10,384
(34.00 %)
770
(0.70 %)
5,466
(68.75 %)
n/a 63.95
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 159
(100.00 %)
62,109
(5.65 %)
29,993
(4.25 %)
581,123
(37.15 %)
0
(0 %)
17,475
(3.70 %)
127
(97.30 %)
11,018
(7.36 %)
205 green algae (18125 2025)
GCA_048595725.1
n/a n/a 865
(2.16 %)
3,109
(76.75 %)
n/a 67.78
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 55
(100.00 %)
35,578
(6.99 %)
19,197
(3.61 %)
216,318
(31.95 %)
0
(0 %)
3,119
(1.09 %)
54
(99.88 %)
7
(0.08 %)
206 green algae (211/11P 2022)
GCA_023343905.1
n/a 11,168
(42.76 %)
1,009
(1.60 %)
4,892
(65.40 %)
n/a 61.60
(98.43 %)
12
(1.57 %)
12
(1.57 %)
57
(98.43 %)
48,271
(5.94 %)
22,435
(3.81 %)
358,729
(31.71 %)
0
(0 %)
12,590
(4.35 %)
405
(96.46 %)
9,279
(12.54 %)
207 green algae (ATCC 16529 2021)
GCA_016906385.1
n/a n/a 748
(2.62 %)
2,222
(71.29 %)
n/a 64.15
(97.91 %)
0
(0 %)
6,559
(2.25 %)
19
(100.00 %)
268
(0.10 %)
2,320
(1.18 %)
110,762
(22.64 %)
0
(0 %)
1,898
(0.84 %)
29
(99.25 %)
70
(0.88 %)
208 green algae (CCAP 19/42 2023)
GCA_031753455.1
n/a n/a 1,362
(0.45 %)
15,767
(32.44 %)
n/a 49.19
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 300
(100.00 %)
442,436
(43.24 %)
171,808
(11.44 %)
978,912
(31.81 %)
0
(0 %)
138,366
(4.83 %)
10,820
(2.10 %)
5,333
(0.93 %)
209 green algae (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.4
10,237
(66.85 %)
n/a 988
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
476
(1.14 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
37,284
(8.77 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
10
(0.02 %)
8,269
(2.70 %)
43
(99.34 %)
317
(0.67 %)
210 green algae (HMC1 2018)
GCA_003255715.1
n/a n/a 1,000
(1.89 %)
7,921
(69.96 %)
n/a 62.97
(97.56 %)
0
(0 %)
2,472
(2.45 %)
3,774
(100.00 %)
10,519
(1.96 %)
4,558
(1.31 %)
172,635
(22.08 %)
1,126
(1.31 %)
5,264
(2.71 %)
3,978
(96.84 %)
4,849
(23.61 %)
211 green algae (JCM 15793 2018)
GCA_002897115.2
n/a n/a 1,087
(3.87 %)
3,215
(73.44 %)
n/a 61.27
(98.39 %)
0
(0 %)
10,986
(1.68 %)
46
(100.00 %)
8,982
(1.85 %)
3,745
(0.85 %)
119,487
(14.35 %)
11
(0.02 %)
806
(0.37 %)
79
(99.57 %)
276
(44.19 %)
212 green algae (JCM 9641 2017)
GCA_002794665.1
n/a n/a 928
(3.73 %)
2,196
(76.87 %)
n/a 73.37
(97.42 %)
0
(0 %)
12,055
(2.67 %)
27
(100.00 %)
15,929
(5.38 %)
7,990
(2.29 %)
164,687
(38.62 %)
22
(0.05 %)
971
(0.63 %)
30
(99.90 %)
25
(0.09 %)
213 green algae (KO-2023 2023)
GCA_030272585.1
n/a 85,190
(21.68 %)
1,751
(1.39 %)
15,265
(40.46 %)
n/a 46.07
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 29
(100.00 %)
60,131
(4.76 %)
34,318
(3.34 %)
393,810
(24.33 %)
0
(0 %)
29,057
(5.52 %)
19,071
(23.42 %)
14,844
(12.46 %)
214 green algae (LANL1001 2019)
GCA_006384855.1
n/a n/a 2,016
(0.62 %)
31,585
(41.01 %)
n/a 57.91
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,614
(100.00 %)
183,076
(3.30 %)
101,860
(5.85 %)
972,524
(32.54 %)
0
(0 %)
128,092
(5.45 %)
4,760
(98.23 %)
17,087
(19.73 %)
215 green algae (RCC4221 2014)
GCA_000214015.2
n/a 7,670
(82.78 %)
1,108
(6.57 %)
3,692
(76.52 %)
n/a 59.39
(99.94 %)
0
(0 %)
477
(0.07 %)
20
(100.00 %)
8,604
(3.92 %)
4,944
(2.18 %)
102,578
(28.06 %)
3
(0.01 %)
1,462
(1.35 %)
20
(99.94 %)
0
(0.00 %)
216 green algae (SAG 2063 2018)
GCA_003613005.1
n/a n/a 869
(2.13 %)
9,821
(78.63 %)
n/a 67.62
(98.00 %)
579
(1.95 %)
579
(1.95 %)
7,535
(98.05 %)
35,537
(6.91 %)
19,692
(3.56 %)
218,412
(30.60 %)
1
(0.01 %)
2,387
(0.83 %)
6,958
(98.59 %)
2,763
(17.54 %)
217 green algae (YS-2018 2019)
GCA_004138255.1
n/a n/a 1,365
(1.08 %)
11,070
(58.24 %)
n/a 55.95
(98.44 %)
0
(0 %)
780
(1.56 %)
597
(100.00 %)
25,537
(1.66 %)
27,257
(3.92 %)
365,387
(19.48 %)
2
(0.01 %)
35,173
(4.02 %)
3,732
(86.39 %)
9,364
(18.16 %)
218 green algae A.protothecoides (0710 2014)
GCF_000733215.1
7,014
(37.71 %)
n/a 966
(2.72 %)
2,947
(70.38 %)
n/a 63.54
(95.35 %)
1,012
(4.66 %)
1,012
(4.66 %)
1,386
(95.34 %)
8,655
(1.88 %)
3,803
(1.89 %)
147,537
(20.31 %)
4
(0.02 %)
1,495
(1.63 %)
604
(53.91 %)
7,583
(28.42 %)
219 green algae B.prasinos (RCC1105 2012)
GCF_002220235.1
7,904
(82.34 %)
n/a 1,231
(6.04 %)
4,460
(76.24 %)
n/a 48.02
(99.76 %)
0
(0 %)
20
(0.24 %)
21
(100.00 %)
17,900
(4.88 %)
5,674
(1.75 %)
113,699
(21.91 %)
0
(0 %)
1,171
(0.89 %)
7
(0.01 %)
10
(0.02 %)
220 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1
n/a n/a 1,057
(0.55 %)
9,735
(58.02 %)
n/a 64.03
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 17
(100.00 %)
166,909
(9.00 %)
120,034
(10.13 %)
750,946
(37.60 %)
0
(0 %)
64,728
(6.10 %)
166
(99.31 %)
15,012
(11.67 %)
221 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 refseq)
GCF_000002595.2
19,527
(53.99 %)
n/a 990
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
174,119
(17.13 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
26
(0.03 %)
48,564
(5.08 %)
92
(46.06 %)
15,883
(12.21 %)
222 green algae C.subellipsoidea (C-169 2012)
GCF_000258705.1
9,839
(29.70 %)
n/a 1,307
(1.78 %)
8,108
(53.71 %)
n/a 52.94
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 29
(100.00 %)
8,446
(0.85 %)
5,471
(0.85 %)
265,761
(14.34 %)
0
(0 %)
3,585
(1.15 %)
11,329
(19.64 %)
6,821
(5.93 %)
223 green algae C.variabilis (NC64A 2010 refseq)
GCF_000147415.1
9,780
(32.79 %)
n/a 744
(1.00 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,396
(8.55 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
64,770
(8.22 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
0
(0 %)
6,856
(2.06 %)
756
(45.48 %)
9,593
(9.00 %)
224 green algae K.nitens (NIES-2285 2014)
GCA_000708835.1
n/a 16,374
(32.04 %)
2,471
(1.78 %)
14,771
(54.27 %)
n/a 52.42
(98.98 %)
1,917
(1.02 %)
2,081
(1.02 %)
3,731
(98.98 %)
10,051
(0.46 %)
14,278
(1.14 %)
388,120
(8.55 %)
82
(0.05 %)
6,137
(0.53 %)
8,698
(83.31 %)
13,320
(16.04 %)
225 green algae M.commoda (RCC299 2009)
GCF_000090985.2
10,137
(72.46 %)
10,212
(72.56 %)
1,301
(4.51 %)
5,667
(86.20 %)
n/a 63.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 19
(100.00 %)
14,619
(3.58 %)
8,937
(2.75 %)
178,499
(27.69 %)
0
(0 %)
2,391
(1.08 %)
10
(25.23 %)
9
(0.01 %)
226 green algae M.neglectum (SAG 48.87 2015)
GCF_000611645.1
16,734
(25.96 %)
n/a 666
(0.47 %)
12,122
(60.02 %)
n/a 64.75
(96.59 %)
5,358
(3.43 %)
5,358
(3.43 %)
12,077
(96.57 %)
73,343
(6.73 %)
43,518
(3.04 %)
568,630
(31.80 %)
611
(0.45 %)
8,128
(0.78 %)
7,776
(96.69 %)
18,971
(14.42 %)
227 green algae M.pusilla (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.2
10,242
(66.86 %)
n/a 990
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
476
(1.14 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
36,818
(8.73 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
10
(0.02 %)
8,269
(2.70 %)
32
(47.70 %)
317
(0.67 %)
228 green algae O.lucimarinus (CCE9901 2007)
GCF_000092065.1
7,603
(72.01 %)
n/a 1,064
(6.25 %)
3,493
(72.08 %)
n/a 60.44
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 21
(100.00 %)
11,026
(5.45 %)
11,732
(3.90 %)
107,661
(34.88 %)
0
(0 %)
1,022
(1.03 %)
12
(61.27 %)
2
(0.00 %)
229 green algae O.tauri (RCC4221 2014)
GCF_000214015.3
7,766
(82.33 %)
n/a 1,131
(6.60 %)
3,714
(76.22 %)
n/a 59.21
(99.94 %)
0
(0 %)
477
(0.07 %)
22
(100.00 %)
8,503
(3.84 %)
4,946
(2.16 %)
102,428
(27.87 %)
3
(0.01 %)
1,462
(1.34 %)
16
(57.14 %)
6
(0.02 %)
230 green algae V.carteri (Eve 2010)
GCF_000143455.1
14,333
(21.46 %)
n/a 1,411
(0.77 %)
13,095
(47.93 %)
n/a 55.97
(91.15 %)
10,101
(8.87 %)
12,014
(8.87 %)
11,352
(91.13 %)
175,729
(14.69 %)
105,113
(5.10 %)
667,226
(23.91 %)
10
(0.01 %)
60,616
(5.34 %)
4,325
(42.65 %)
20,517
(13.87 %)
231 green chiretta (2019)
GCF_009805555.1
46,094
(16.56 %)
n/a 14,632
(4.66 %)
34,242
(19.36 %)
n/a 33.53
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 271
(100.00 %)
293,800
(4.64 %)
151,157
(7.38 %)
1,732,880
(41.88 %)
0
(0 %)
175,025
(5.40 %)
21,835
(6.05 %)
15,493
(3.32 %)
232 green foxtail
GCF_005286985.1
47,022
(14.66 %)
n/a 17,750
(5.12 %)
60,106
(30.88 %)
n/a 46.17
(99.85 %)
61
(0.15 %)
61
(0.15 %)
76
(99.85 %)
116,493
(1.51 %)
120,039
(2.72 %)
1,676,017
(29.11 %)
0
(0 %)
157,544
(4.99 %)
75,497
(29.44 %)
55,605
(12.11 %)
233 green foxtail (2024)
GCF_005286985.2
43,377
(14.56 %)
n/a 17,909
(5.15 %)
60,312
(30.80 %)
n/a 46.17
(99.96 %)
14
(0.04 %)
14
(0.04 %)
40
(99.96 %)
117,054
(1.49 %)
121,212
(2.84 %)
1,685,787
(29.32 %)
0
(0 %)
159,497
(5.00 %)
75,777
(29.49 %)
55,702
(12.04 %)
234 green foxtail (ME034v 2020)
GCA_012934335.1
n/a n/a 18,040
(5.19 %)
61,671
(31.38 %)
n/a 45.99
(100.00 %)
54
(0.00 %)
54
(0.00 %)
63
(100.00 %)
105,738
(1.38 %)
87,424
(2.22 %)
1,777,815
(26.85 %)
0
(0 %)
131,241
(3.67 %)
74,932
(30.30 %)
61,081
(13.91 %)
235 guar (PI 68867901 SD 2022)
GCA_026586085.1
n/a n/a 16,149
(3.62 %)
40,368
(13.76 %)
n/a 32.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 627
(100.00 %)
724,179
(25.31 %)
196,353
(10.67 %)
2,757,251
(41.21 %)
0
(0 %)
577,163
(7.64 %)
9,690
(0.94 %)
6,761
(0.65 %)
236 guar (short-day 2024)
GCA_037177725.1
n/a n/a 16,198
(3.33 %)
43,918
(13.95 %)
n/a 33.41
(100.00 %)
0
(0 %)
24
(0.00 %)
237
(100.00 %)
813,394
(29.89 %)
243,439
(13.12 %)
2,549,208
(42.63 %)
0
(0 %)
755,453
(9.28 %)
10,217
(1.78 %)
6,909
(0.59 %)
237 Guinea yam (TDr96_F1 2017)
GCA_002240015.2
n/a n/a 11,944
(2.63 %)
37,372
(13.64 %)
n/a 35.58
(88.95 %)
0
(0 %)
1,032,823
(11.31 %)
21
(100.00 %)
293,868
(3.21 %)
174,614
(3.18 %)
2,690,184
(32.53 %)
1,884
(0.17 %)
180,755
(4.15 %)
15,323
(1.42 %)
8,394
(0.81 %)
238 habanero-type pepper (PI159236 2017)
GCA_002271895.2
n/a 34,974
(1.29 %)
16,562
(0.53 %)
72,911
(2.91 %)
n/a 34.88
(98.35 %)
0
(0 %)
196,261
(1.66 %)
87,978
(100.00 %)
1,136,015
(1.95 %)
1,019,921
(4.33 %)
22,445,162
(47.06 %)
529
(0.02 %)
1,752,629
(5.46 %)
20,737
(0.24 %)
7,465
(0.08 %)
239 hairy vetch (HV-30 2023)
GCF_029867415.1
88,183
(5.03 %)
n/a 22,129
(1.02 %)
118,243
(9.15 %)
n/a 35.63
(99.98 %)
0
(0 %)
3,486
(0.02 %)
1,888
(100.00 %)
1,001,308
(2.63 %)
1,132,664
(5.72 %)
8,340,755
(56.16 %)
24
(0.00 %)
1,749,179
(17.10 %)
43,665
(1.21 %)
15,567
(0.31 %)
240 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1
43,787
(9.63 %)
n/a 17,635
(3.85 %)
66,270
(23.98 %)
n/a 46.87
(98.63 %)
736
(1.37 %)
736
(1.37 %)
1,027
(98.63 %)
157,811
(1.55 %)
119,571
(2.57 %)
2,107,254
(45.30 %)
0
(0 %)
384,333
(11.74 %)
102,278
(32.16 %)
57,387
(11.00 %)
241 Hawaiian beggarticks (Kalapana, Puna primary hap 2024)
GCF_021521415.1
100,198
(3.70 %)
n/a 41,058
(1.06 %)
207,532
(8.30 %)
n/a 37.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 15,833
(100.00 %)
2,024,684
(2.90 %)
1,837,742
(5.29 %)
17,556,257
(56.19 %)
0
(0 %)
2,633,832
(10.88 %)
201,310
(3.34 %)
36,167
(0.41 %)
242 Himalayan balsam (dImpGla2.1 2021)
GCF_907164915.1
40,392
(7.39 %)
n/a 16,711
(2.29 %)
50,292
(11.24 %)
n/a 32.12
(99.95 %)
0
(0 %)
858
(0.05 %)
1,115
(100.00 %)
439,789
(3.56 %)
574,639
(8.97 %)
4,147,814
(47.01 %)
3
(0.00 %)
679,567
(9.30 %)
16,291
(1.13 %)
7,961
(0.43 %)
243 Himalayan yew (Yunnan 2021)
GCA_018340775.1
n/a n/a 11,782
(0.08 %)
129,658
(1.42 %)
n/a 36.91
(99.99 %)
0
(0 %)
11,130
(0.01 %)
150
(100.00 %)
2,861,102
(1.57 %)
2,476,232
(2.57 %)
65,436,741
(53.97 %)
2
(0.00 %)
7,302,742
(6.61 %)
157,149
(0.72 %)
21,849
(0.08 %)
244 horseweed
GCF_010389155.1
39,622
(11.54 %)
n/a 14,718
(3.15 %)
42,194
(16.23 %)
n/a 34.08
(99.99 %)
0
(0 %)
502
(0.01 %)
357
(100.00 %)
267,124
(2.84 %)
155,729
(2.71 %)
2,475,353
(36.48 %)
0
(0 %)
170,084
(5.26 %)
5,205
(0.40 %)
2,461
(0.20 %)
245 Indian licorice
GCF_003935025.1
44,610
(13.60 %)
n/a 17,108
(4.95 %)
34,097
(14.33 %)
n/a 31.84
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
160
(100.00 %)
217,674
(3.40 %)
106,243
(4.04 %)
2,232,509
(38.91 %)
0
(0 %)
136,457
(3.95 %)
5,438
(1.06 %)
4,124
(0.55 %)
246 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 alternate hap 2022)
GCA_023055485.1
n/a n/a 16,184
(2.02 %)
66,215
(14.16 %)
n/a 35.37
(100.00 %)
0
(0 %)
82
(0.00 %)
689
(100.00 %)
739,891
(4.58 %)
435,389
(7.62 %)
4,843,419
(38.03 %)
1
(0.00 %)
573,724
(7.60 %)
13,298
(2.56 %)
7,653
(0.38 %)
247 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 primary hap 2022)
GCA_023055345.1
n/a n/a 15,832
(2.09 %)
63,488
(14.36 %)
n/a 35.19
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
358
(100.00 %)
703,028
(4.29 %)
399,798
(6.48 %)
4,662,881
(36.96 %)
1
(0.00 %)
508,474
(6.86 %)
12,534
(1.92 %)
7,167
(0.36 %)
248 island oak (RSA801373 alternate hap 2023)
GCA_028535165.1
n/a n/a 15,893
(1.97 %)
68,998
(15.27 %)
n/a 35.87
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
156
(100.00 %)
746,424
(4.43 %)
451,117
(7.39 %)
4,820,434
(38.55 %)
0
(0 %)
642,456
(7.81 %)
20,367
(2.62 %)
9,619
(0.45 %)
249 island oak (RSA801373 primary hap 2023)
GCA_028535515.1
n/a n/a 15,880
(1.95 %)
69,093
(15.25 %)
n/a 35.97
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
274
(100.00 %)
751,691
(4.60 %)
457,914
(7.61 %)
4,850,082
(38.95 %)
0
(0 %)
656,668
(8.21 %)
20,561
(3.01 %)
9,683
(0.46 %)
250 J.microcarpa x regia eudicots (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1
50,504
(10.14 %)
n/a 18,451
(3.41 %)
55,094
(16.89 %)
n/a 36.30
(99.18 %)
0
(0 %)
54
(0.82 %)
154
(100.00 %)
411,290
(3.65 %)
260,413
(3.49 %)
3,023,907
(31.93 %)
0
(0 %)
195,435
(3.60 %)
23,270
(1.88 %)
11,316
(0.85 %)
251 Japanese apricot
GCF_000346735.1
32,312
(19.60 %)
n/a 14,463
(6.46 %)
33,049
(23.94 %)
n/a 37.45
(92.82 %)
15,597
(7.20 %)
15,597
(7.20 %)
23,761
(92.80 %)
118,757
(2.25 %)
84,983
(4.53 %)
1,374,244
(23.24 %)
87
(0.15 %)
129,116
(6.07 %)
7,808
(1.87 %)
5,295
(1.28 %)
252 Japanese cedar (2023)
GCF_030272615.1
80,727
(1.01 %)
n/a 14,175
(0.13 %)
225,166
(3.69 %)
n/a 36.42
(99.98 %)
0
(0 %)
3,031
(0.02 %)
2,699
(100.00 %)
2,873,672
(2.01 %)
4,198,037
(4.24 %)
5,730
(99.98 %)
5
(0.00 %)
7,632,920
(8.60 %)
71,102
(1.16 %)
67,733
(1.15 %)
253 Japanese morning glory
GCF_001879475.1
58,979
(8.37 %)
n/a 16,977
(2.14 %)
77,626
(18.21 %)
n/a 37.61
(99.97 %)
0
(0 %)
449
(0.03 %)
3,418
(100.00 %)
641,896
(6.26 %)
639,051
(8.97 %)
3,622,236
(46.63 %)
0
(0 %)
878,090
(12.19 %)
77,860
(10.47 %)
41,089
(3.11 %)
254 Japanese rice (2023)
GCF_034140825.1
55,725
(16.73 %)
n/a 16,338
(4.37 %)
54,077
(25.00 %)
n/a 43.72
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
15
(100.00 %)
196,712
(2.76 %)
141,936
(4.82 %)
1,727,479
(35.05 %)
0
(0 %)
154,436
(5.38 %)
63,894
(25.90 %)
41,819
(6.86 %)
255 Japanese rice (Kitaake 2020)
GCA_009797565.1
n/a 48,428
(16.53 %)
16,562
(4.59 %)
53,878
(24.77 %)
n/a 43.61
(98.95 %)
443
(1.05 %)
474
(1.05 %)
476
(98.95 %)
494,831
(50.75 %)
141,079
(3.52 %)
1,728,936
(33.69 %)
1
(0.00 %)
153,320
(5.62 %)
64,216
(25.20 %)
41,086
(7.31 %)
256 Japanese rice (Nipponbare 2015)
GCF_001433935.1
53,454
(17.22 %)
47,331
(15.87 %)
16,804
(4.69 %)
53,712
(24.95 %)
n/a 43.57
(99.97 %)
0
(0 %)
925
(0.03 %)
58
(100.00 %)
402,182
(39.07 %)
138,035
(3.47 %)
1,719,939
(33.46 %)
4
(0.00 %)
142,261
(5.16 %)
63,485
(25.25 %)
49,534
(9.51 %)
257 jewel orchid monocots (Aro_GA 2025)
GCA_051820535.1
n/a n/a 41,719
(0.73 %)
293,147
(8.18 %)
n/a 39.10
(100.00 %)
0
(0 %)
283
(0.00 %)
3,452
(100.00 %)
3,539,676
(12.83 %)
1,885,641
(6.09 %)
19,476,248
(61.01 %)
1
(0.00 %)
8,155,644
(20.27 %)
583,795
(7.68 %)
158,186
(1.33 %)
258 Joseph's coat eudicots (Red AtriRed21 2022)
GCF_026212465.1
44,756
(10.39 %)
n/a 13,649
(2.41 %)
38,664
(12.08 %)
n/a 31.93
(99.74 %)
0
(0 %)
2,496
(0.26 %)
49
(100.00 %)
270,085
(9.40 %)
247,307
(22.95 %)
2,428,999
(49.81 %)
12
(0.00 %)
797,844
(12.43 %)
5,914
(1.27 %)
1,633
(0.12 %)
259 Korean lawngrass (Nagirizaki 2016)
GCA_001602275.1
n/a n/a 21,051
(6.88 %)
57,023
(32.54 %)
n/a 44.09
(96.75 %)
14,848
(3.26 %)
14,848
(3.26 %)
26,634
(96.74 %)
101,349
(1.46 %)
71,657
(2.17 %)
1,693,252
(21.97 %)
640
(0.13 %)
78,613
(2.03 %)
60,198
(24.06 %)
53,023
(14.28 %)
260 lamb's quarters (primary hap 2023)
GCA_948465745.1
n/a n/a 32,598
(1.94 %)
125,993
(12.58 %)
n/a 36.17
(100.00 %)
0
(0 %)
67
(0.00 %)
158
(100.00 %)
2,407,940
(63.57 %)
996,815
(6.91 %)
7,383,118
(51.29 %)
4
(0.00 %)
1,262,227
(8.49 %)
84,154
(2.40 %)
6,947
(0.15 %)
261 large cranberry (Ben Lear CNJ99-125-1 inbred clone 2014)
GCA_000775335.2
n/a n/a 14,225
(2.70 %)
66,262
(14.87 %)
n/a 37.74
(99.90 %)
1,293
(0.01 %)
1,390
(0.01 %)
201,496
(99.99 %)
201,938
(1.93 %)
136,145
(2.39 %)
2,755,676
(26.83 %)
841
(0.05 %)
n/a 12,815
(1.29 %)
8,740
(0.90 %)
262 lemon (UCLL1 2023)
GCA_034663555.1
n/a n/a 27,668
(4.03 %)
72,915
(18.34 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
85
(0.01 %)
136
(0.01 %)
624
(99.99 %)
382,061
(2.62 %)
254,813
(8.31 %)
3,593,274
(41.24 %)
2
(0.00 %)
710,196
(9.84 %)
14,758
(7.59 %)
9,423
(0.56 %)
263 lettuce eudicots (Salinas 2011)
GCA_000227445.1
n/a n/a 15,031
(1.06 %)
140,751
(10.18 %)
n/a 36.82
(99.85 %)
0
(0 %)
n/a 876,110
(100.00 %)
505,796
(3.85 %)
318,171
(2.09 %)
9,808,138
(33.85 %)
0
(0 %)
n/a 30,057
(0.85 %)
16,755
(0.48 %)
264 liverwort (2024)
GCA_039105155.1
n/a 22,778
(17.26 %)
5,119
(1.70 %)
26,429
(24.22 %)
n/a 43.50
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
12
(100.00 %)
178,255
(36.35 %)
53,790
(2.08 %)
834,624
(30.68 %)
0
(0 %)
145,563
(8.78 %)
25,774
(29.87 %)
20,479
(8.79 %)
265 long-grained rice (Zhenshan 97 2020)
GCA_001623345.3
n/a n/a 16,254
(4.30 %)
54,135
(24.00 %)
n/a 43.62
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 13
(100.00 %)
204,282
(2.82 %)
143,681
(3.92 %)
1,729,033
(36.62 %)
0
(0 %)
180,035
(7.08 %)
65,538
(25.47 %)
41,142
(6.62 %)
266 lyrate rockcress
GCF_000004255.2
44,526
(28.52 %)
n/a 25,416
(19.36 %)
34,938
(31.66 %)
n/a 36.08
(88.90 %)
2,950
(11.10 %)
2,950
(11.10 %)
3,646
(88.90 %)
141,441
(20.58 %)
72,583
(3.25 %)
1,012,438
(24.68 %)
6
(0.00 %)
85,990
(5.46 %)
8,053
(2.48 %)
5,275
(1.16 %)
267 macadamia nut
GCF_013358625.1
58,226
(8.43 %)
n/a 16,723
(2.11 %)
62,465
(13.23 %)
n/a 39.13
(98.51 %)
0
(0 %)
22,059
(1.50 %)
2,644
(100.00 %)
463,575
(3.09 %)
304,057
(3.39 %)
4,183,445
(34.36 %)
8
(0.00 %)
364,799
(4.77 %)
18,956
(1.40 %)
5,087
(0.27 %)
268 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot 2015)
GCA_000949345.1
n/a n/a 13,013
(2.26 %)
38,671
(8.42 %)
n/a 33.59
(99.19 %)
123,798
(0.85 %)
123,798
(0.85 %)
203,100
(99.15 %)
329,865
(3.57 %)
244,018
(4.63 %)
3,737,818
(40.09 %)
5,255
(0.16 %)
167,323
(2.37 %)
4,827
(0.29 %)
3,120
(0.19 %)
269 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot FGT_2020_1 2023)
GCA_028651295.1
n/a n/a 12,929
(2.13 %)
34,499
(7.89 %)
n/a 33.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
174
(100.00 %)
560,407
(20.53 %)
306,275
(8.15 %)
3,716,838
(44.45 %)
0
(0 %)
572,203
(7.72 %)
6,827
(0.40 %)
3,596
(0.21 %)
270 Magnolia sinica (HGM2019 2023)
GCF_029962835.1
69,307
(3.21 %)
n/a 14,466
(0.72 %)
84,219
(6.52 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
0
(0 %)
73
(0.00 %)
127
(100.00 %)
1,415,484
(14.07 %)
1,154,832
(6.29 %)
10,231,412
(50.86 %)
0
(0 %)
1,584,398
(7.44 %)
107,342
(2.63 %)
20,756
(0.44 %)
271 maize
GCF_902167145.1
76,701
(3.66 %)
n/a 23,553
(1.55 %)
154,773
(10.70 %)
n/a 46.77
(99.83 %)
10
(0.00 %)
708
(0.17 %)
697
(100.00 %)
1,340,549
(78.65 %)
843,168
(5.20 %)
5,886,498
(69.23 %)
11
(0.00 %)
2,444,910
(17.04 %)
372,641
(31.10 %)
154,423
(5.59 %)
272 maize (2020)
GCA_905067065.1
n/a n/a 23,433
(1.61 %)
150,853
(10.66 %)
n/a 46.83
(98.14 %)
56,163
(1.87 %)
56,163
(1.87 %)
56,173
(98.13 %)
581,502
(1.40 %)
753,129
(3.49 %)
5,867,216
(67.88 %)
107
(0.01 %)
2,413,494
(16.48 %)
377,414
(31.33 %)
151,565
(5.65 %)
273 maize (B104 2021)
GCA_910593975.1
n/a n/a 23,680
(1.58 %)
153,453
(10.69 %)
n/a 46.83
(99.71 %)
22
(0.00 %)
1,223
(0.29 %)
697
(100.00 %)
593,292
(1.41 %)
805,647
(4.47 %)
5,887,178
(69.17 %)
13
(0.00 %)
2,341,058
(16.82 %)
370,755
(32.34 %)
151,573
(5.74 %)
274 maize (B73 2017)
GCA_000005005.6
n/a 131,270
(3.70 %)
23,511
(1.62 %)
151,975
(10.84 %)
n/a 46.87
(98.56 %)
2,522
(1.44 %)
2,523
(1.44 %)
3,128
(98.56 %)
1,308,956
(78.59 %)
771,560
(3.39 %)
5,850,966
(67.94 %)
15
(0.00 %)
2,173,513
(16.77 %)
367,973
(32.21 %)
150,546
(5.55 %)
275 maize (OH43 2020)
GCA_902167015.1
n/a n/a 23,864
(1.57 %)
154,358
(10.67 %)
n/a 46.77
(99.88 %)
20
(0.00 %)
551
(0.12 %)
777
(100.00 %)
1,341,834
(78.70 %)
834,042
(5.01 %)
5,916,520
(69.26 %)
0
(0 %)
2,430,892
(17.02 %)
372,114
(32.08 %)
153,258
(5.50 %)
276 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2
34,262
(16.98 %)
n/a 15,545
(6.13 %)
36,746
(24.10 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
14
(0.00 %)
14
(0.00 %)
74
(100.00 %)
140,519
(2.59 %)
67,337
(3.89 %)
1,493,779
(29.32 %)
0
(0 %)
94,864
(3.66 %)
41,044
(18.43 %)
30,094
(7.78 %)
277 Manchurian ash (Dongfeng_Y6 2025)
GCA_050941835.1
n/a n/a 21,875
(2.60 %)
65,892
(12.45 %)
n/a 34.37
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 23
(100.00 %)
1,378,182
(52.01 %)
240,241
(3.28 %)
5,127,474
(35.91 %)
0
(0 %)
318,538
(4.49 %)
18,208
(1.03 %)
8,293
(0.34 %)
278 mango
GCF_011075055.1
60,349
(16.06 %)
n/a 20,653
(5.13 %)
40,887
(15.20 %)
n/a 32.71
(99.98 %)
0
(0 %)
169
(0.02 %)
250
(100.00 %)
213,445
(3.09 %)
125,929
(3.29 %)
2,447,401
(32.63 %)
0
(0 %)
235,235
(5.50 %)
7,059
(0.98 %)
3,330
(0.31 %)
279 Tausch's goatgrass monocots
GCF_002575655.2
84,334
(2.18 %)
n/a 17,888
(0.44 %)
263,541
(10.26 %)
n/a 46.33
(97.97 %)
0
(0 %)
69,858
(2.04 %)
109,197
(100.00 %)
1,492,485
(15.65 %)
1,422,870
(5.39 %)
12,521,384
(71.80 %)
234
(0.01 %)
n/a 881,939
(30.07 %)
257,833
(5.24 %)
280 bulbous barley monocots (2017)
GCA_900070015.1
n/a n/a 13,790
(0.81 %)
584,401
(17.92 %)
n/a 44.69
(99.26 %)
714,678
(0.49 %)
714,678
(0.49 %)
3,598,227
(99.51 %)
405,591
(2.31 %)
383,580
(1.94 %)
9,713,864
(28.00 %)
15
(0.00 %)
n/a 392,202
(11.97 %)
257,344
(7.86 %)
281 pearl millet monocots (2023)
GCA_947561735.1
n/a n/a 17,702
(1.12 %)
131,056
(12.62 %)
n/a 49.54
(99.71 %)
154
(0.29 %)
154
(0.29 %)
161
(99.71 %)
2,363,767
(55.11 %)
562,150
(3.01 %)
6,046,063
(67.25 %)
1
(0.00 %)
1,752,801
(12.30 %)
78,069
(17.77 %)
130,183
(6.25 %)
282 least duckweed monocots (lm5633 2022)
GCA_024174645.1
n/a n/a 10,209
(2.40 %)
33,920
(14.90 %)
n/a 39.23
(99.63 %)
0
(0 %)
2,722
(0.38 %)
2,381
(100.00 %)
339,295
(20.82 %)
149,186
(3.14 %)
1,958,662
(44.97 %)
0
(0 %)
154,234
(4.42 %)
37,690
(12.52 %)
21,318
(5.13 %)
283 coastal wild rice monocots (Oco-Bangladesh 2023)
GCA_030770085.1
n/a n/a 22,601
(4.02 %)
78,799
(21.93 %)
n/a 42.06
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
450
(100.00 %)
708,554
(36.63 %)
97,691
(2.08 %)
2,711,269
(26.55 %)
0
(0 %)
96,983
(1.91 %)
87,312
(19.47 %)
76,593
(9.96 %)
284 mosses
GCF_000002425.4
55,044
(11.86 %)
n/a 8,425
(1.46 %)
30,452
(12.55 %)
n/a 33.69
(98.74 %)
0
(0 %)
2,645
(1.27 %)
359
(100.00 %)
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(48.35 %)
241,826
(2.56 %)
2,413,326
(52.52 %)
8
(0.00 %)
165,635
(4.02 %)
22,664
(3.06 %)
20,673
(2.66 %)
285 mosses (Gransden 2004 2024)
GCA_000002425.3
n/a n/a 8,471
(1.47 %)
30,401
(12.59 %)
n/a 33.71
(99.04 %)
0
(0 %)
1,792
(0.96 %)
357
(100.00 %)
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(2.79 %)
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(2.68 %)
2,405,125
(52.64 %)
4
(0.00 %)
168,303
(4.17 %)
22,652
(3.11 %)
20,677
(2.70 %)
286 mosses (MN 2022)
GCA_021442195.1
n/a 45,611
(15.03 %)
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(1.65 %)
29,076
(15.54 %)
n/a 36.47
(99.90 %)
38
(0.10 %)
38
(0.10 %)
74
(99.90 %)
202,616
(2.17 %)
147,367
(3.31 %)
2,577,180
(28.93 %)
0
(0 %)
83,271
(1.71 %)
12,940
(1.51 %)
7,739
(0.88 %)
287 mosses (SZ-1 2022)
GCA_026122775.1
n/a n/a 8,528
(1.45 %)
30,650
(12.43 %)
n/a 33.77
(100.00 %)
0
(0 %)
29
(0.00 %)
26
(100.00 %)
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(2.82 %)
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(2.86 %)
2,464,328
(53.57 %)
0
(0 %)
207,216
(4.76 %)
23,310
(3.24 %)
20,924
(2.78 %)
288 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1
29,893
(12.15 %)
n/a 14,092
(4.40 %)
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(17.73 %)
n/a 34.86
(94.92 %)
15,541
(5.08 %)
15,541
(5.08 %)
46,842
(94.92 %)
317,532
(5.00 %)
190,192
(6.25 %)
2,095,631
(34.49 %)
23
(0.02 %)
174,377
(5.38 %)
20,490
(3.43 %)
14,377
(2.15 %)
289 mung bean (VC1973A 2015 refseq)
GCF_000741045.1
47,653
(11.89 %)
n/a 16,644
(3.87 %)
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(14.67 %)
n/a 33.18
(92.80 %)
0
(0 %)
96,870
(7.24 %)
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(100.00 %)
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(3.31 %)
198,963
(3.34 %)
2,842,720
(34.86 %)
1,607
(0.24 %)
171,020
(3.41 %)
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(1.49 %)
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(1.19 %)
290 muskmelon (AY 2022)
GCF_025177605.1
47,062
(10.58 %)
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(2.95 %)
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(13.20 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
0
(0 %)
239
(0.01 %)
1,310
(100.00 %)
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(3.23 %)
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(11.70 %)
2,016,709
(43.94 %)
2
(0.00 %)
208,817
(5.97 %)
18,232
(10.96 %)
10,389
(0.88 %)
291 muskmelon (DHL92 2012)
GCF_000313045.1
35,384
(11.55 %)
n/a 13,191
(3.74 %)
28,295
(11.09 %)
n/a 33.23
(89.51 %)
28,289
(10.51 %)
29,172
(10.51 %)
60,751
(89.49 %)
239,295
(7.85 %)
172,598
(3.17 %)
2,304,858
(33.21 %)
2,241
(0.31 %)
65,619
(1.53 %)
12,855
(1.38 %)
8,985
(0.89 %)
292 Nalta jute (JRO-524 2017)
GCA_002141455.1
n/a n/a 15,450
(3.86 %)
57,930
(23.73 %)
n/a 36.82
(99.97 %)
0
(0 %)
n/a 52,373
(100.00 %)
189,007
(2.22 %)
129,697
(4.38 %)
1,872,307
(38.03 %)
0
(0 %)
152,437
(3.44 %)
11,963
(5.74 %)
8,849
(5.43 %)
293 narrow-leaf cattail (Huaian 2025)
GCF_048772165.1
35,080
(19.76 %)
n/a 14,109
(6.33 %)
27,978
(20.09 %)
n/a 37.69
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 15
(100.00 %)
124,433
(3.10 %)
69,868
(2.56 %)
1,208,522
(27.94 %)
0
(0 %)
73,768
(3.39 %)
21,007
(5.28 %)
12,522
(3.24 %)
294 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1
57,263
(9.83 %)
n/a 22,097
(3.53 %)
51,774
(13.22 %)
n/a 33.46
(99.34 %)
41,534
(0.68 %)
44,657
(0.68 %)
55,107
(99.32 %)
280,867
(4.25 %)
210,750
(5.67 %)
3,920,315
(38.10 %)
91
(0.01 %)
317,435
(5.80 %)
6,462
(0.46 %)
4,024
(0.30 %)
295 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1
44,477
(5.41 %)
n/a 16,928
(1.94 %)
77,682
(16.06 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
0
(0 %)
2,037
(0.00 %)
1,289
(100.00 %)
437,997
(2.33 %)
266,149
(5.08 %)
4,764,252
(34.25 %)
0
(0 %)
733,036
(7.03 %)
20,667
(1.81 %)
10,430
(0.52 %)
296 opium poppy
GCF_003573695.1
127,893
(4.57 %)
n/a 25,532
(0.85 %)
162,032
(9.31 %)
n/a 37.28
(99.80 %)
0
(0 %)
31,183
(0.20 %)
34,381
(100.00 %)
819,294
(1.49 %)
1,050,181
(6.80 %)
10,625,631
(55.85 %)
1,258
(0.01 %)
3,892,620
(14.88 %)
67,521
(1.21 %)
8,156
(0.11 %)
297 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2
39,386
(3.85 %)
n/a 12,208
(0.99 %)
72,906
(8.22 %)
n/a 34.70
(96.03 %)
25,751
(3.92 %)
25,751
(3.92 %)
311,841
(96.08 %)
506,361
(2.45 %)
413,770
(3.23 %)
8,074,114
(39.07 %)
30
(0.00 %)
333,128
(2.81 %)
56,900
(2.34 %)
33,146
(1.22 %)
298 orchid P.equestris
GCF_001263595.1
32,146
(3.36 %)
n/a 11,541
(1.01 %)
54,049
(6.11 %)
n/a 34.46
(92.46 %)
98,814
(7.56 %)
98,814
(7.56 %)
188,398
(92.44 %)
487,071
(2.96 %)
511,903
(4.00 %)
7,060,408
(42.20 %)
338
(0.01 %)
299,811
(3.23 %)
31,179
(1.22 %)
24,162
(0.91 %)
299 Pacific Island silvergrass (M001 2021)
GCF_019320115.1
120,534
(4.81 %)
n/a 39,902
(1.95 %)
276,967
(16.36 %)
n/a 45.32
(99.56 %)
0
(0 %)
4,932
(0.44 %)
2,420
(100.00 %)
764,083
(1.38 %)
810,723
(3.95 %)
11,118,925
(53.40 %)
2
(0.00 %)
2,206,875
(9.93 %)
520,091
(23.03 %)
297,537
(8.57 %)
300 papaya
GCF_000150535.2
29,883
(11.99 %)
n/a 12,860
(4.47 %)
24,403
(11.58 %)
n/a 35.31
(73.55 %)
29,719
(26.47 %)
29,719
(26.47 %)
47,485
(73.53 %)
260,082
(34.69 %)
101,644
(3.59 %)
1,640,647
(28.88 %)
27
(0.03 %)
104,755
(2.22 %)
21,200
(2.95 %)
7,379
(0.74 %)
301 papaya (Sunset 2022)
GCA_022788785.1
n/a n/a 13,725
(4.02 %)
25,348
(10.65 %)
n/a 36.01
(99.88 %)
0
(0 %)
337
(0.12 %)
67
(100.00 %)
385,123
(61.33 %)
131,783
(9.99 %)
2,029,883
(43.40 %)
1
(0.00 %)
469,366
(7.44 %)
25,597
(4.44 %)
4,080
(0.53 %)
302 patchouli (Gaoche1L2016 2018)
GCA_003675935.1
n/a n/a 43,905
(2.21 %)
174,920
(14.40 %)
n/a 35.02
(93.97 %)
170,266
(6.06 %)
170,266
(6.06 %)
211,964
(93.94 %)
1,021,699
(2.86 %)
1,125,321
(8.02 %)
9,388,626
(47.60 %)
4,968
(0.09 %)
1,891,289
(7.85 %)
102,661
(4.26 %)
62,606
(3.39 %)
303 patchouli (shipai S1-5 2022)
GCA_023678885.1
n/a n/a 47,432
(2.32 %)
168,583
(12.17 %)
n/a 34.43
(99.98 %)
0
(0 %)
764
(0.02 %)
966
(100.00 %)
2,043,616
(19.48 %)
1,147,892
(9.18 %)
9,501,180
(53.37 %)
2
(0.00 %)
2,151,784
(10.11 %)
110,140
(2.86 %)
61,261
(1.58 %)
304 peach
GCF_000346465.2
36,201
(20.87 %)
n/a 14,368
(6.26 %)
32,245
(24.09 %)
n/a 37.51
(98.79 %)
2,339
(1.22 %)
2,368
(1.22 %)
2,531
(98.78 %)
150,957
(10.06 %)
96,381
(5.52 %)
1,221,263
(28.72 %)
5
(0.00 %)
160,697
(6.34 %)
7,885
(2.07 %)
5,236
(1.25 %)
305 peanut
GCF_003086295.2
155,835
(5.15 %)
n/a 31,810
(1.19 %)
160,574
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
0
(0 %)
3,655
(0.15 %)
385
(100.00 %)
1,684,814
(3.52 %)
1,488,297
(4.81 %)
11,059,688
(62.32 %)
4
(0.00 %)
2,758,605
(13.90 %)
140,570
(2.45 %)
53,465
(0.84 %)
306 peanut (GDAAS-fuhuasheng2018 2019)
GCA_004170445.1
n/a 118,090
(5.15 %)
31,065
(1.17 %)
158,578
(8.79 %)
n/a 36.33
(98.97 %)
0
(0 %)
32,692
(1.04 %)
29
(100.00 %)
1,735,218
(3.66 %)
1,490,806
(4.26 %)
11,072,983
(61.75 %)
46
(0.00 %)
2,848,217
(13.99 %)
138,890
(2.46 %)
53,191
(0.83 %)
307 peanut (Tifrunner 2023)
GCF_003086295.3
173,169
(5.54 %)
n/a 31,897
(1.19 %)
160,532
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
0
(0 %)
3,697
(0.15 %)
443
(100.00 %)
1,676,149
(3.49 %)
1,489,126
(4.81 %)
11,105,477
(62.30 %)
4
(0.00 %)
2,760,250
(13.91 %)
140,609
(2.45 %)
53,473
(0.84 %)
308 pear (primary hap 2023)
GCF_963583255.1
48,939
(13.04 %)
n/a 22,082
(4.44 %)
56,235
(17.69 %)
n/a 37.45
(99.99 %)
145
(0.01 %)
145
(0.01 %)
176
(99.99 %)
289,539
(2.54 %)
223,443
(3.84 %)
2,308,351
(35.91 %)
0
(0 %)
346,323
(9.15 %)
19,559
(2.15 %)
11,607
(1.07 %)
309 pearl millet (Tift 23D2B1-P1-P5 2018)
GCA_002174835.2
n/a n/a 17,949
(1.26 %)
134,829
(14.30 %)
n/a 47.95
(86.95 %)
0
(0 %)
156,852
(13.08 %)
52,033
(100.00 %)
380,858
(1.16 %)
466,997
(2.83 %)
5,117,134
(56.89 %)
67
(0.01 %)
1,301,284
(8.79 %)
380,989
(29.47 %)
133,080
(5.69 %)
310 pecan
GCF_018687715.1
71,340
(9.93 %)
n/a 18,671
(2.67 %)
60,632
(15.16 %)
n/a 36.30
(99.97 %)
22
(0.03 %)
22
(0.03 %)
39
(99.97 %)
473,853
(3.66 %)
367,846
(6.75 %)
3,301,121
(39.03 %)
0
(0 %)
415,847
(6.45 %)
27,274
(2.22 %)
9,483
(0.57 %)
311 pepperwort (EHA205 2019)
GCA_009757365.2
n/a n/a 19,770
(7.79 %)
48,832
(21.86 %)
n/a 34.40
(96.79 %)
105,378
(3.36 %)
105,378
(3.36 %)
146,054
(96.64 %)
298,974
(31.14 %)
68,767
(2.63 %)
1,422,489
(26.49 %)
22
(0.00 %)
51,628
(2.04 %)
6,844
(1.17 %)
5,500
(0.89 %)
312 perennial ryegrass (Kyuss_39 2021)
GCF_019359855.1
89,789
(3.75 %)
n/a 17,693
(0.79 %)
174,787
(12.15 %)
n/a 44.32
(100.00 %)
0
(0 %)
238
(0.00 %)
1,677
(100.00 %)
605,852
(1.36 %)
760,915
(5.68 %)
5,216,229
(69.24 %)
1
(0.00 %)
3,457,114
(21.97 %)
542,998
(24.23 %)
170,460
(5.85 %)
313 perennial ryegrass (Kyuss_39 2024)
GCF_019359855.2
81,335
(3.75 %)
n/a 17,678
(0.79 %)
172,584
(12.06 %)
n/a 44.29
(100.00 %)
0
(0 %)
61
(0.00 %)
105
(100.00 %)
610,404
(1.37 %)
758,029
(5.51 %)
5,039,192
(69.30 %)
0
(0 %)
n/a 542,208
(23.92 %)
169,813
(5.85 %)
314 Peruvian cotton (G.raimondii 2012 DOE)
GCF_000327365.2
72,518
(8.99 %)
n/a 20,368
(2.64 %)
52,295
(10.15 %)
n/a 33.21
(98.25 %)
19,685
(1.76 %)
19,685
(1.76 %)
20,680
(98.24 %)
404,885
(2.81 %)
300,062
(3.31 %)
5,198,170
(40.84 %)
35
(0.01 %)
386,235
(4.92 %)
10,912
(0.59 %)
5,481
(0.26 %)
315 Peruvian cotton (GPD5lz 2022)
GCF_025698545.1
63,582
(8.69 %)
n/a 20,265
(2.62 %)
51,815
(10.02 %)
n/a 33.24
(100.00 %)
0
(0 %)
79
(0.00 %)
289
(100.00 %)
405,385
(2.83 %)
306,302
(3.81 %)
5,192,105
(41.79 %)
0
(0 %)
459,153
(6.01 %)
10,481
(0.65 %)
5,557
(0.30 %)
316 Phtheirospermum japonicum (okayama 2020)
GCA_014905375.1
n/a 141,963
(2.71 %)
15,868
(1.22 %)
104,104
(13.39 %)
n/a 36.03
(91.65 %)
318,321
(8.39 %)
318,321
(8.39 %)
328,880
(91.61 %)
810,727
(3.49 %)
710,744
(4.84 %)
7,339,863
(41.43 %)
1,919
(0.27 %)
701,331
(6.60 %)
104,967
(3.98 %)
53,512
(2.02 %)
317 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2
46,412
(9.42 %)
n/a 17,396
(3.13 %)
49,710
(12.66 %)
n/a 32.76
(94.18 %)
36,323
(5.83 %)
36,323
(5.83 %)
67,834
(94.17 %)
395,663
(3.40 %)
306,602
(4.71 %)
3,749,364
(39.19 %)
431
(0.18 %)
218,995
(6.80 %)
26,504
(2.90 %)
13,804
(1.15 %)
318 pineapple
GCF_001540865.1
43,025
(11.65 %)
n/a 13,649
(3.36 %)
38,917
(14.95 %)
n/a 38.34
(98.23 %)
0
(0 %)
25,542
(1.78 %)
3,129
(100.00 %)
352,802
(7.31 %)
274,578
(4.75 %)
2,360,455
(38.94 %)
1,024
(0.08 %)
181,776
(4.90 %)
56,724
(11.73 %)
25,940
(3.75 %)
319 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1
37,318
(33.25 %)
n/a 22,836
(23.08 %)
26,822
(33.93 %)
n/a 35.63
(97.53 %)
6,294
(2.49 %)
6,294
(2.49 %)
7,067
(97.51 %)
74,470
(2.42 %)
42,509
(3.39 %)
814,442
(24.99 %)
17
(0.02 %)
72,030
(4.47 %)
5,817
(2.14 %)
4,656
(1.61 %)
320 pistachio
GCF_008641045.1
47,948
(7.92 %)
n/a 18,462
(2.58 %)
62,898
(14.05 %)
n/a 35.95
(99.84 %)
0
(0 %)
16,367
(0.16 %)
1,865
(100.00 %)
363,793
(2.43 %)
253,408
(4.08 %)
4,200,417
(36.34 %)
328
(0.03 %)
912,368
(13.98 %)
22,340
(1.78 %)
7,227
(0.40 %)
321 pocket water lily (Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2
41,223
(10.98 %)
n/a 11,576
(2.50 %)
38,220
(15.70 %)
n/a 38.61
(99.84 %)
624
(0.16 %)
626
(0.16 %)
1,409
(99.84 %)
236,190
(2.95 %)
153,746
(4.02 %)
2,151,579
(26.72 %)
1
(0.00 %)
233,307
(6.34 %)
24,561
(4.48 %)
18,159
(2.45 %)
322 pomegranate
GCF_007655135.1
43,277
(14.87 %)
n/a 14,635
(4.26 %)
39,381
(19.97 %)
n/a 40.38
(99.99 %)
0
(0 %)
188
(0.01 %)
474
(100.00 %)
173,182
(2.28 %)
174,872
(6.81 %)
1,640,973
(32.89 %)
0
(0 %)
305,785
(9.75 %)
26,506
(9.18 %)
19,716
(2.82 %)
323 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1
43,754
(6.67 %)
n/a 16,547
(2.25 %)
54,186
(11.30 %)
n/a 34.71
(88.41 %)
0
(0 %)
37,060
(11.60 %)
17,084
(100.00 %)
321,938
(2.14 %)
250,793
(4.04 %)
5,136,691
(33.92 %)
622
(0.03 %)
635,238
(7.14 %)
8,536
(0.30 %)
2,755
(0.11 %)
324 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1
n/a n/a 16,861
(1.98 %)
58,882
(12.19 %)
n/a 35.40
(99.95 %)
0
(0 %)
4,397
(0.05 %)
3,012
(100.00 %)
774,417
(46.83 %)
392,378
(8.45 %)
5,068,449
(42.72 %)
5
(0.00 %)
683,257
(6.89 %)
14,548
(1.32 %)
5,450
(0.63 %)
325 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1
n/a n/a 17,614
(2.86 %)
45,684
(10.75 %)
n/a 34.49
(83.57 %)
0
(0 %)
10,041,161
(17.84 %)
12
(100.00 %)
606,573
(40.80 %)
168,871
(2.58 %)
5,508,800
(26.36 %)
2,083
(0.22 %)
353,156
(3.75 %)
5,550
(0.22 %)
1,730
(0.08 %)
326 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1
43,158
(7.63 %)
n/a 16,423
(2.55 %)
50,333
(11.79 %)
n/a 34.83
(93.98 %)
45,215
(6.04 %)
45,215
(6.04 %)
60,069
(93.96 %)
662,626
(43.42 %)
212,315
(4.38 %)
4,691,843
(34.91 %)
197
(0.07 %)
495,920
(6.36 %)
9,851
(0.45 %)
2,428
(0.13 %)
327 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1
n/a 38,210
(5.48 %)
16,415
(2.15 %)
54,766
(12.48 %)
n/a 35.21
(99.98 %)
0
(0 %)
1,476
(0.02 %)
25
(100.00 %)
329,233
(2.28 %)
285,101
(5.66 %)
4,832,189
(40.28 %)
7
(0.00 %)
779,042
(9.76 %)
12,944
(0.99 %)
3,186
(0.15 %)
328 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1
n/a 38,661
(5.67 %)
16,694
(2.26 %)
53,990
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
0
(0 %)
1,499
(0.02 %)
28
(100.00 %)
323,447
(2.25 %)
283,098
(5.39 %)
4,727,964
(39.87 %)
9
(0.00 %)
709,848
(9.38 %)
12,316
(1.34 %)
3,210
(0.16 %)
329 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1
n/a 37,965
(5.56 %)
16,713
(2.23 %)
54,380
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
0
(0 %)
1,299
(0.02 %)
27
(100.00 %)
329,807
(2.31 %)
282,372
(6.11 %)
4,718,807
(40.25 %)
6
(0.00 %)
757,191
(9.75 %)
11,812
(1.00 %)
3,132
(0.16 %)
330 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1
n/a 37,999
(5.47 %)
16,640
(2.18 %)
54,937
(12.38 %)
n/a 35.18
(99.98 %)
0
(0 %)
1,383
(0.02 %)
26
(100.00 %)
329,665
(2.30 %)
285,993
(6.03 %)
4,858,802
(40.32 %)
5
(0.00 %)
770,923
(9.65 %)
12,792
(1.32 %)
3,224
(0.15 %)
331 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1
n/a n/a 16,312
(2.05 %)
54,438
(12.18 %)
n/a 35.23
(99.95 %)
0
(0 %)
4,448
(0.05 %)
12
(100.00 %)
730,464
(46.17 %)
338,389
(7.95 %)
4,903,557
(41.90 %)
3
(0.00 %)
602,727
(6.48 %)
12,226
(0.72 %)
3,229
(0.36 %)
332 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1
35,846
(6.75 %)
n/a 16,408
(2.54 %)
48,924
(11.75 %)
n/a 34.59
(99.55 %)
0
(0 %)
1,612
(0.45 %)
1,332
(100.00 %)
297,683
(2.31 %)
234,616
(4.68 %)
4,308,149
(38.02 %)
6
(0.00 %)
555,565
(8.09 %)
8,192
(0.47 %)
2,567
(0.16 %)
333 Primulina tabacum (GXHZ01 2022)
GCF_025594145.1
69,821
(7.75 %)
n/a 19,604
(2.27 %)
61,800
(12.08 %)
n/a 36.89
(99.89 %)
0
(0 %)
1,710
(0.11 %)
541
(100.00 %)
310,321
(1.81 %)
229,404
(3.84 %)
4,409,199
(51.65 %)
4
(0.00 %)
929,563
(14.37 %)
40,094
(1.87 %)
11,101
(0.59 %)
334 proso millet (2018)
GCA_003046395.2
n/a 56,011
(10.30 %)
31,203
(4.33 %)
106,251
(25.92 %)
n/a 46.82
(98.02 %)
0
(0 %)
4,232
(1.98 %)
1,306
(100.00 %)
252,710
(1.48 %)
176,920
(3.16 %)
3,051,223
(41.53 %)
5
(0.00 %)
527,825
(6.53 %)
159,364
(32.38 %)
90,391
(10.54 %)
335 quinoa
GCF_001683475.1
74,918
(7.49 %)
n/a 22,914
(1.61 %)
105,619
(12.97 %)
n/a 36.87
(99.16 %)
0
(0 %)
725
(0.84 %)
3,487
(100.00 %)
810,277
(3.58 %)
762,903
(10.88 %)
6,551,884
(49.49 %)
4
(0.00 %)
1,419,103
(10.00 %)
93,630
(2.98 %)
16,962
(0.42 %)
336 radish (v2 WK10039 2023)
GCF_000801105.2
80,681
(20.53 %)
n/a 36,039
(9.58 %)
74,081
(26.98 %)
n/a 36.00
(99.94 %)
0
(0 %)
2,853
(0.06 %)
6,424
(100.00 %)
224,524
(2.48 %)
193,525
(5.49 %)
2,234,480
(35.04 %)
14
(0.00 %)
283,224
(8.64 %)
25,972
(4.13 %)
19,291
(2.12 %)
337 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1
152,744
(19.27 %)
n/a 57,668
(6.87 %)
143,092
(23.51 %)
n/a 37.13
(99.99 %)
0
(0 %)
840
(0.01 %)
3,167
(100.00 %)
470,302
(2.29 %)
578,281
(9.24 %)
4,662,467
(42.41 %)
1
(0.00 %)
1,025,228
(11.11 %)
64,287
(5.62 %)
37,609
(1.71 %)
338 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2
144,991
(17.51 %)
n/a 59,743
(7.71 %)
146,391
(26.97 %)
n/a 36.47
(92.96 %)
32,639
(7.05 %)
32,639
(7.05 %)
34,110
(92.95 %)
449,257
(2.67 %)
441,269
(5.84 %)
4,867,601
(32.91 %)
89
(0.03 %)
658,497
(14.71 %)
60,082
(3.53 %)
39,673
(1.84 %)
339 red clover eudicots (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1
63,238
(17.01 %)
n/a 17,857
(4.13 %)
43,079
(17.27 %)
n/a 33.71
(99.97 %)
0
(0 %)
231
(0.03 %)
90
(100.00 %)
241,481
(2.65 %)
187,674
(4.85 %)
2,251,582
(37.03 %)
1
(0.00 %)
244,435
(10.76 %)
6,474
(1.93 %)
2,754
(0.26 %)
340 red sage (Shanhuang shh 2023)
GCF_028751815.1
62,715
(12.27 %)
n/a 15,176
(2.61 %)
67,175
(21.50 %)
n/a 37.47
(99.58 %)
0
(0 %)
695
(0.42 %)
173
(100.00 %)
377,231
(3.52 %)
364,027
(5.05 %)
2,679,528
(42.07 %)
0
(0 %)
345,738
(11.98 %)
64,243
(6.17 %)
38,544
(3.36 %)
341 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2
71,160
(1.59 %)
n/a 18,911
(0.39 %)
321,741
(10.16 %)
n/a 45.91
(99.38 %)
0
(0 %)
33,814
(0.62 %)
10,205
(100.00 %)
1,208,165
(1.25 %)
1,319,817
(2.96 %)
15,480,313
(71.93 %)
63
(0.00 %)
4,311,556
(9.89 %)
975,234
(26.52 %)
315,788
(5.36 %)
342 redroot sage (bh2-7 2020)
GCA_016432925.1
n/a n/a 15,208
(2.55 %)
68,573
(21.07 %)
n/a 37.68
(99.37 %)
0
(0 %)
2,815
(0.63 %)
1,118
(100.00 %)
628,541
(17.44 %)
380,078
(5.18 %)
2,710,697
(43.28 %)
3
(0.00 %)
448,238
(11.28 %)
66,987
(6.29 %)
38,723
(3.32 %)
343 Rhododendron vialii eudicots (Sample 1 2023)
GCF_030253575.1
62,168
(11.90 %)
n/a 15,363
(2.73 %)
54,203
(18.86 %)
n/a 39.52
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
18
(100.00 %)
253,965
(2.10 %)
235,379
(9.36 %)
2,668,584
(34.08 %)
0
(0 %)
473,456
(8.03 %)
31,789
(3.72 %)
15,314
(1.18 %)
344 rice bean (VRB3 2023)
GCA_029865625.1
n/a n/a 18,823
(3.07 %)
63,430
(18.52 %)
n/a 34.56
(96.54 %)
0
(0 %)
4,440
(3.46 %)
232
(100.00 %)
1,016,591
(59.80 %)
384,326
(8.33 %)
3,318,479
(40.76 %)
2
(0.00 %)
720,793
(11.00 %)
30,562
(3.41 %)
9,362
(0.63 %)
345 rice bean eudicots (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1
38,736
(11.89 %)
n/a 16,669
(4.18 %)
43,369
(14.64 %)
n/a 32.90
(93.47 %)
0
(0 %)
20,717
(6.53 %)
15,445
(100.00 %)
233,635
(3.33 %)
204,141
(4.85 %)
2,682,022
(32.58 %)
1,663
(0.61 %)
168,485
(17.02 %)
16,828
(2.07 %)
12,921
(1.48 %)
346 riverbank grape
GCF_004353265.1
44,851
(10.22 %)
n/a 15,302
(3.01 %)
46,011
(14.96 %)
n/a 34.32
(98.79 %)
0
(0 %)
1,095
(1.21 %)
175
(100.00 %)
339,984
(3.03 %)
233,259
(4.71 %)
2,925,914
(35.27 %)
0
(0 %)
315,118
(6.27 %)
11,055
(0.93 %)
6,847
(0.55 %)
347 robusta coffee (DH200=94 2014)
GCA_900059795.1
n/a 151,088
(19.99 %)
13,770
(2.74 %)
46,992
(16.51 %)
n/a 36.65
(82.89 %)
12,209
(17.11 %)
12,714
(17.11 %)
25,216
(82.89 %)
219,723
(2.15 %)
140,449
(2.62 %)
2,590,105
(28.19 %)
58
(0.02 %)
240,126
(5.03 %)
12,700
(1.66 %)
6,826
(1.25 %)
348 rose gum (2021)
GCF_016545825.1
54,676
(10.44 %)
n/a 16,291
(2.42 %)
69,492
(17.92 %)
n/a 39.39
(99.97 %)
0
(0 %)
1,712
(0.03 %)
37
(100.00 %)
358,171
(2.83 %)
259,031
(3.65 %)
3,353,128
(29.52 %)
0
(0 %)
415,146
(6.29 %)
78,731
(7.66 %)
52,846
(4.32 %)
349 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1
65,107
(11.08 %)
n/a 16,389
(2.33 %)
74,557
(18.16 %)
n/a 39.28
(92.69 %)
27,773
(7.32 %)
27,773
(7.32 %)
32,724
(92.68 %)
357,835
(2.50 %)
266,806
(3.22 %)
3,496,176
(27.34 %)
26
(0.01 %)
382,719
(5.52 %)
79,393
(6.54 %)
53,321
(3.81 %)
350 rose of Sharon
GCF_006381635.1
91,942
(5.18 %)
n/a 44,363
(2.23 %)
136,768
(10.14 %)
n/a 34.23
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
1,789
(100.00 %)
889,945
(2.72 %)
968,890
(4.91 %)
9,836,479
(51.73 %)
0
(0 %)
1,733,920
(9.74 %)
42,560
(0.89 %)
24,846
(0.50 %)
351 rubber tree (MT/VB/25A 57/8 2023)
GCF_030052815.1
71,258
(4.21 %)
n/a 22,208
(1.24 %)
63,302
(5.13 %)
n/a 34.70
(91.68 %)
0
(0 %)
1,428
(8.32 %)
755
(100.00 %)
1,078,590
(2.96 %)
730,314
(3.70 %)
6,031,831
(65.59 %)
1
(0.00 %)
2,789,876
(17.34 %)
24,263
(0.70 %)
3,609
(0.09 %)
352 rubber tree (reyan7-33-97 2016)
GCF_001654055.1
66,124
(5.23 %)
n/a 22,033
(1.63 %)
59,727
(6.42 %)
n/a 34.84
(94.20 %)
0
(0 %)
40,863
(5.81 %)
7,453
(100.00 %)
827,088
(3.02 %)
565,394
(5.23 %)
5,065,470
(61.59 %)
175
(0.01 %)
1,757,812
(14.15 %)
13,573
(0.45 %)
3,195
(0.09 %)
353 S.splendens huo1 eudicots (BFU 2021)
GCF_004379255.1
94,414
(12.61 %)
n/a 31,218
(3.57 %)
108,219
(21.49 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
471
(0.00 %)
1,178
(100.00 %)
360,314
(2.17 %)
419,051
(4.85 %)
3,875,932
(41.07 %)
0
(0 %)
569,178
(10.09 %)
105,227
(10.14 %)
53,473
(3.53 %)
354 sacred lotus
GCF_000365185.1
43,140
(7.01 %)
n/a 15,920
(2.13 %)
61,231
(13.11 %)
n/a 38.30
(87.98 %)
54,825
(12.04 %)
175,846
(12.06 %)
58,428
(87.96 %)
408,351
(2.83 %)
275,384
(2.52 %)
4,643,876
(30.20 %)
1,786
(0.17 %)
181,461
(2.08 %)
40,599
(2.68 %)
14,757
(0.70 %)
355 saltwater cress
GCF_000478725.1
38,705
(18.07 %)
n/a 21,851
(11.68 %)
39,487
(28.65 %)
n/a 37.71
(98.09 %)
3,020
(1.92 %)
3,020
(1.92 %)
3,658
(98.08 %)
102,162
(1.93 %)
70,755
(3.25 %)
1,162,538
(32.09 %)
12
(0.00 %)
173,482
(8.35 %)
15,272
(3.87 %)
8,448
(1.72 %)
356 sandblossoms (Phelan CA IGA184 alternate hap 2022)
GCA_023055565.1
n/a n/a 14,138
(0.74 %)
125,370
(12.27 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
581
(100.00 %)
655,331
(1.73 %)
500,899
(4.88 %)
7,172,490
(54.24 %)
0
(0 %)
1,964,428
(14.05 %)
140,800
(5.87 %)
37,685
(0.83 %)
357 sandblossoms (Phelan CA IGA184 primary hap 2022)
GCA_023055425.1
n/a n/a 15,588
(0.93 %)
117,831
(12.94 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
0
(0 %)
85
(0.00 %)
123
(100.00 %)
597,532
(1.81 %)
430,194
(3.80 %)
6,075,115
(49.91 %)
0
(0 %)
1,442,089
(12.90 %)
129,512
(5.41 %)
37,172
(1.01 %)
358 scarlet sage (huo1 2021)
GCF_004379255.2
94,251
(12.60 %)
n/a 31,266
(3.58 %)
108,141
(21.47 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
471
(0.00 %)
1,162
(100.00 %)
357,482
(2.10 %)
419,009
(4.86 %)
3,874,047
(41.08 %)
0
(0 %)
569,081
(10.09 %)
105,216
(10.11 %)
53,473
(3.50 %)
359 scented satinash
GCF_900635055.1
42,531
(12.21 %)
n/a 15,353
(3.67 %)
53,811
(20.61 %)
n/a 40.64
(89.65 %)
0
(0 %)
11,862
(10.35 %)
19,039
(100.00 %)
179,421
(2.10 %)
174,902
(3.34 %)
1,785,894
(25.35 %)
754
(0.12 %)
147,815
(3.18 %)
55,685
(7.69 %)
32,621
(3.67 %)
360 sesame
GCF_000512975.1
38,693
(16.95 %)
n/a 15,555
(5.41 %)
35,316
(19.66 %)
n/a 35.00
(98.34 %)
9,940
(1.66 %)
9,940
(1.66 %)
26,176
(98.34 %)
161,123
(2.85 %)
79,750
(3.97 %)
1,807,029
(31.02 %)
30
(0.02 %)
138,850
(4.01 %)
9,873
(1.80 %)
8,633
(1.51 %)
361 shrubby jointvetch A. evenia (CIAT22838 2020)
GCA_013621005.1
n/a n/a 16,242
(4.30 %)
39,583
(17.06 %)
n/a 35.22
(98.66 %)
0
(0 %)
2,946
(1.35 %)
1,451
(100.00 %)
253,228
(3.98 %)
186,657
(9.89 %)
1,792,662
(45.14 %)
3
(0.00 %)
432,106
(10.05 %)
19,928
(3.29 %)
10,449
(1.27 %)
362 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1
46,475
(12.62 %)
n/a 17,469
(4.11 %)
51,531
(21.75 %)
n/a 40.30
(93.72 %)
0
(0 %)
7,529
(6.28 %)
15,781
(100.00 %)
194,855
(2.07 %)
116,828
(2.25 %)
1,801,472
(25.38 %)
688
(0.10 %)
103,430
(2.38 %)
44,191
(5.74 %)
32,233
(3.75 %)
363 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1
43,419
(12.78 %)
n/a 14,758
(4.01 %)
41,180
(19.74 %)
n/a 40.38
(100.00 %)
0
(0 %)
36
(0.00 %)
75
(100.00 %)
160,749
(1.91 %)
114,741
(3.07 %)
1,619,569
(28.25 %)
0
(0 %)
213,237
(6.51 %)
43,290
(7.15 %)
31,834
(4.39 %)
364 silver poplar
GCF_005239225.1
53,066
(14.64 %)
n/a 20,299
(4.74 %)
44,556
(16.36 %)
n/a 33.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,287
(100.00 %)
309,097
(3.34 %)
175,288
(4.77 %)
2,457,634
(38.38 %)
0
(0 %)
273,621
(6.75 %)
4,613
(0.67 %)
2,159
(0.21 %)
365 silverweed cinquefoil (primary hap 2022)
GCF_933775445.1
28,734
(15.21 %)
n/a 13,143
(5.29 %)
32,007
(22.39 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
147
(100.00 %)
89,958
(1.86 %)
351,649
(15.29 %)
884,646
(35.58 %)
1
(0.00 %)
145,999
(6.99 %)
14,711
(4.52 %)
10,781
(1.93 %)
366 sorghum (BTx623 2017)
GCF_000003195.3
48,290
(8.57 %)
n/a 17,901
(3.45 %)
73,969
(19.64 %)
n/a 43.88
(95.30 %)
3,906
(4.70 %)
3,906
(4.70 %)
4,775
(95.30 %)
556,607
(65.39 %)
177,271
(4.54 %)
2,371,199
(48.20 %)
8
(0.00 %)
681,841
(11.76 %)
110,115
(18.82 %)
53,717
(5.80 %)
367 sorghum (Tx430 2018)
GCA_003482435.1
n/a n/a 18,138
(3.63 %)
75,180
(20.67 %)
n/a 43.67
(97.96 %)
0
(0 %)
2,108
(2.04 %)
308
(100.00 %)
559,950
(63.17 %)
156,952
(3.01 %)
2,481,716
(46.70 %)
0
(0 %)
578,722
(10.40 %)
109,923
(19.06 %)
54,889
(6.80 %)
368 soybean (EMBRAPA BRS 537 2021)
GCA_012273815.2
n/a 88,253
(9.67 %)
27,746
(3.01 %)
77,617
(11.66 %)
n/a 34.80
(97.95 %)
0
(0 %)
340
(2.05 %)
95
(100.00 %)
1,182,211
(56.35 %)
444,701
(6.81 %)
5,365,860
(45.98 %)
0
(0 %)
724,080
(6.80 %)
35,684
(1.48 %)
10,676
(0.46 %)
369 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6
88,006
(9.87 %)
n/a 27,705
(3.08 %)
77,033
(11.88 %)
n/a 34.74
(97.36 %)
8,916
(2.65 %)
8,918
(2.65 %)
9,199
(97.35 %)
848,398
(38.02 %)
434,042
(5.29 %)
5,346,884
(45.07 %)
27
(0.00 %)
622,402
(6.12 %)
35,893
(1.55 %)
13,146
(0.57 %)
370 soybean (Williams 82 2023)
GCA_030864155.1
n/a n/a 27,960
(2.93 %)
77,762
(11.36 %)
n/a 35.02
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 20
(100.00 %)
549,577
(2.73 %)
453,208
(9.60 %)
5,325,393
(48.31 %)
0
(0 %)
864,597
(7.83 %)
36,641
(1.53 %)
13,322
(0.59 %)
371 spider flower
GCF_000463585.1
45,524
(22.00 %)
n/a 21,103
(10.40 %)
38,184
(27.17 %)
n/a 39.40
(87.71 %)
24,824
(12.32 %)
24,824
(12.32 %)
37,073
(87.68 %)
144,827
(3.22 %)
103,970
(4.10 %)
1,118,840
(31.64 %)
50
(0.05 %)
164,935
(7.42 %)
29,313
(6.47 %)
16,566
(3.30 %)
372 spinach (Sp75 2017)
GCF_002007265.1
41,411
(5.75 %)
n/a 12,540
(1.38 %)
68,522
(12.26 %)
n/a 37.82
(95.53 %)
0
(0 %)
137,086
(4.48 %)
78,263
(100.00 %)
374,336
(2.48 %)
670,331
(6.78 %)
3,213,561
(52.82 %)
65,364
(1.04 %)
758,332
(10.61 %)
89,520
(4.54 %)
17,491
(0.71 %)
373 spinach (Varoflay 2021)
GCF_020520425.1
58,433
(7.11 %)
n/a 12,431
(1.27 %)
61,084
(11.35 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
0
(0 %)
63
(0.00 %)
246
(100.00 %)
378,521
(2.27 %)
722,814
(6.29 %)
2,950,586
(58.17 %)
0
(0 %)
972,333
(15.38 %)
92,256
(5.21 %)
18,749
(0.72 %)
374 spotted monkey flower
GCF_000504015.1
34,441
(15.56 %)
n/a 14,508
(4.41 %)
34,904
(18.83 %)
n/a 35.50
(93.50 %)
15,528
(6.52 %)
15,528
(6.52 %)
17,740
(93.48 %)
227,143
(4.28 %)
204,234
(11.85 %)
1,776,879
(40.60 %)
19
(0.01 %)
338,940
(10.42 %)
21,718
(3.89 %)
14,899
(2.46 %)
375 spreading earthmoss (2024)
GCF_000002425.5
52,765
(10.63 %)
n/a 8,496
(1.48 %)
30,423
(12.59 %)
n/a 33.71
(99.04 %)
0
(0 %)
1,794
(0.96 %)
359
(100.00 %)
293,130
(2.79 %)
242,633
(2.68 %)
2,405,680
(52.61 %)
4
(0.00 %)
168,306
(4.17 %)
22,672
(3.11 %)
20,700
(2.71 %)
376 stiff brome
GCF_000005505.3
47,531
(20.35 %)
n/a 15,530
(6.01 %)
45,735
(34.29 %)
n/a 46.40
(99.84 %)
25
(0.16 %)
27
(0.16 %)
36
(99.84 %)
108,976
(17.41 %)
54,391
(1.94 %)
1,197,052
(21.34 %)
0
(0 %)
71,157
(2.72 %)
48,209
(34.43 %)
42,088
(12.51 %)
377 strawberry (Benihoppe 2023)
GCA_034370585.1
n/a n/a 45,858
(5.68 %)
123,100
(24.81 %)
n/a 39.34
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28
(100.00 %)
934,221
(35.80 %)
376,936
(6.46 %)
3,304,328
(31.01 %)
0
(0 %)
428,062
(6.06 %)
69,530
(5.73 %)
39,124
(2.30 %)
378 strawberry (Reikou 2013)
GCA_000511835.1
n/a n/a 15,045
(1.35 %)
164,045
(15.16 %)
n/a 38.82
(94.24 %)
88,316
(5.63 %)
89,898
(5.63 %)
714,282
(94.37 %)
278,640
(1.91 %)
388,660
(6.94 %)
3,639,568
(28.92 %)
271
(0.01 %)
n/a 64,180
(3.80 %)
21,117
(1.05 %)
379 sugarcane (2018)
GCA_900465005.1
n/a n/a 18,847
(4.51 %)
76,529
(27.07 %)
n/a 45.11
(99.96 %)
1,423
(0.03 %)
1,423
(0.03 %)
7,128
(99.97 %)
258,594
(29.31 %)
144,716
(2.51 %)
1,976,510
(35.41 %)
436
(0.05 %)
268,312
(8.56 %)
113,324
(26.96 %)
87,385
(13.10 %)
380 sugarcane (CC_01_1940 2021)
GCA_020102875.1
n/a n/a 25,299
(3.45 %)
146,261
(29.51 %)
n/a 45.01
(99.92 %)
36
(0.00 %)
7,046
(0.08 %)
35,074
(100.00 %)
302,307
(1.66 %)
272,248
(3.71 %)
4,068,281
(29.60 %)
3
(0.00 %)
439,969
(6.05 %)
204,656
(25.44 %)
162,729
(13.61 %)
381 sugarcane (SP80-3280 WGSA1 2019)
GCA_008692665.1
n/a n/a 78,903
(2.31 %)
756,432
(27.56 %)
n/a 43.71
(99.98 %)
36
(0.00 %)
36
(0.00 %)
398,389
(100.00 %)
1,981,854
(25.32 %)
926,250
(3.55 %)
15,903,748
(41.06 %)
0
(0 %)
n/a 829,054
(16.97 %)
583,556
(9.83 %)
382 sweet cherry
GCF_002207925.1
39,968
(19.06 %)
n/a 15,007
(5.83 %)
38,107
(23.61 %)
n/a 37.72
(90.64 %)
0
(0 %)
22,628
(9.39 %)
10,148
(100.00 %)
136,700
(2.47 %)
104,376
(7.20 %)
1,484,591
(25.20 %)
40
(0.03 %)
225,280
(8.38 %)
9,956
(2.27 %)
6,378
(1.39 %)
383 sweet cherry (Tieton 2020)
GCA_014155035.1
n/a n/a 15,140
(4.31 %)
39,977
(20.09 %)
n/a 38.44
(99.98 %)
0
(0 %)
2,194
(0.02 %)
61
(100.00 %)
189,726
(2.51 %)
150,018
(21.96 %)
1,231,274
(44.86 %)
0
(0 %)
701,846
(16.32 %)
12,897
(3.14 %)
6,700
(0.94 %)
384 sweet orange
GCF_000317415.1
46,820
(15.94 %)
n/a 14,390
(4.63 %)
34,480
(18.04 %)
n/a 34.07
(91.90 %)
12,539
(8.11 %)
12,539
(8.11 %)
17,383
(91.89 %)
185,212
(2.95 %)
104,182
(4.92 %)
2,119,183
(29.53 %)
106
(0.11 %)
143,275
(8.59 %)
6,540
(0.93 %)
4,953
(0.65 %)
385 sweet potato (Taizhong6 2017)
GCA_002525835.2
n/a n/a 23,319
(2.45 %)
98,107
(18.19 %)
n/a 35.14
(88.01 %)
0
(0 %)
171,925
(12.06 %)
28,461
(100.00 %)
579,745
(3.87 %)
473,175
(3.79 %)
4,850,126
(32.44 %)
96
(0.01 %)
493,077
(6.15 %)
52,715
(3.15 %)
42,259
(2.50 %)
386 sweet wormwood (Huhao1# 2018)
GCA_003112345.1
n/a 66,918
(4.98 %)
22,279
(1.15 %)
121,694
(10.54 %)
n/a 35.34
(91.81 %)
275,164
(8.22 %)
275,710
(8.22 %)
314,564
(91.78 %)
856,470
(2.64 %)
970,252
(5.69 %)
7,570,175
(42.39 %)
33,170
(1.01 %)
1,556,972
(12.95 %)
29,072
(0.54 %)
6,559
(0.13 %)
387 switchgrass
GCF_016808335.1
114,876
(10.54 %)
n/a 31,534
(3.21 %)
152,844
(27.54 %)
n/a 46.79
(99.59 %)
464
(0.41 %)
464
(0.41 %)
1,091
(99.59 %)
395,905
(1.77 %)
323,173
(5.10 %)
4,922,182
(39.47 %)
0
(0 %)
921,472
(10.02 %)
213,249
(32.45 %)
151,346
(11.21 %)
388 Tartarian buckwheat (Pinku1 2017)
GCA_002319775.1
n/a n/a 15,605
(2.84 %)
50,437
(14.57 %)
n/a 38.53
(96.71 %)
0
(0 %)
2,456
(3.29 %)
7,020
(100.00 %)
257,784
(2.74 %)
211,756
(3.88 %)
2,209,417
(41.80 %)
2
(0.00 %)
363,246
(7.54 %)
54,125
(5.80 %)
14,956
(1.19 %)
389 Tasmanian pepperberry (RefF3 2024)
GCF_043159265.1
65,925
(7.32 %)
n/a 16,247
(1.53 %)
76,786
(13.23 %)
n/a 39.37
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,338
(100.00 %)
1,968,661
(26.22 %)
626,214
(13.70 %)
4,298,324
(45.52 %)
0
(0 %)
1,135,617
(13.56 %)
32,932
(4.92 %)
11,768
(0.50 %)
390 thale cress (Landsberg erecta 2016)
GCA_001651475.1
n/a 30,849
(38.15 %)
26,053
(33.97 %)
25,713
(36.19 %)
n/a 36.01
(98.51 %)
0
(0 %)
3,479
(1.50 %)
30
(100.00 %)
65,429
(14.19 %)
24,979
(1.85 %)
739,651
(21.49 %)
24
(0.01 %)
27,629
(3.21 %)
4,443
(1.81 %)
3,496
(1.38 %)
391 thale cress (tair10.1 Columbia 2018)
GCF_000001735.4
53,852
(40.10 %)
n/a 26,582
(34.47 %)
11,416
(18.70 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
0
(0 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
68,517
(16.50 %)
27,064
(2.77 %)
749,005
(22.64 %)
1
(0.00 %)
42,547
(3.36 %)
4,601
(1.63 %)
3,518
(1.15 %)
392 thunder duke vine
GCF_013401445.1
56,436
(17.59 %)
n/a 20,174
(5.61 %)
42,326
(19.85 %)
n/a 37.58
(99.96 %)
0
(0 %)
146
(0.04 %)
321
(100.00 %)
125,395
(2.23 %)
102,179
(22.89 %)
1,226,273
(38.50 %)
0
(0 %)
599,313
(13.69 %)
6,893
(1.71 %)
5,408
(0.61 %)
393 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1
50,668
(2.79 %)
n/a 17,479
(0.82 %)
117,543
(8.63 %)
n/a 40.23
(88.38 %)
0
(0 %)
119,817
(11.63 %)
37,194
(100.00 %)
622,838
(1.51 %)
788,520
(3.46 %)
11,822,060
(48.66 %)
133
(0.01 %)
2,124,644
(8.96 %)
174,838
(3.17 %)
26,771
(0.55 %)
394 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2
66,966
(3.67 %)
n/a 17,141
(1.02 %)
81,513
(6.82 %)
n/a 38.89
(97.29 %)
56,061
(2.71 %)
213,074
(2.72 %)
215,609
(97.29 %)
486,556
(1.53 %)
669,040
(5.52 %)
10,446,746
(53.83 %)
19,953
(0.37 %)
1,327,454
(6.88 %)
118,807
(2.33 %)
10,195
(0.20 %)
395 tomato (2024)
GCF_036512215.1
59,947
(8.20 %)
n/a 15,474
(1.94 %)
40,638
(7.50 %)
n/a 35.17
(99.99 %)
0
(0 %)
166
(0.01 %)
14
(100.00 %)
333,077
(2.31 %)
259,232
(7.09 %)
5,402,596
(43.04 %)
8
(0.00 %)
851,692
(8.46 %)
31,740
(4.85 %)
2,381
(0.10 %)
396 tomato (Micro-Tom 2020)
GCA_012431665.1
n/a n/a 15,607
(2.04 %)
39,981
(7.57 %)
n/a 34.32
(97.69 %)
0
(0 %)
1,323
(2.31 %)
391
(100.00 %)
433,628
(20.28 %)
248,928
(3.94 %)
5,440,564
(39.72 %)
0
(0 %)
581,883
(6.70 %)
31,891
(1.72 %)
2,440
(0.12 %)
397 tomato (Micro-Tom S9 2023)
GCA_030162295.1
n/a n/a 15,496
(2.07 %)
38,799
(7.36 %)
n/a 34.40
(98.25 %)
0
(0 %)
32,234
(1.76 %)
165
(100.00 %)
1,028,324
(71.24 %)
249,749
(4.56 %)
5,384,286
(39.87 %)
177
(0.03 %)
610,496
(6.85 %)
27,343
(1.53 %)
1,333
(0.06 %)
398 tomato (v3.1 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.5
45,958
(6.93 %)
n/a 15,425
(2.15 %)
38,319
(7.54 %)
n/a 34.12
(90.19 %)
0
(0 %)
19,539
(9.82 %)
3,066
(100.00 %)
311,852
(2.14 %)
229,773
(3.18 %)
5,390,626
(35.26 %)
224
(0.02 %)
412,055
(4.41 %)
25,196
(1.27 %)
2,324
(0.10 %)
399 toyon (HeAr 88 alternate hap 2022)
GCA_024363235.1
n/a n/a 22,795
(3.47 %)
67,418
(16.40 %)
n/a 38.17
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
75
(100.00 %)
347,375
(3.07 %)
304,988
(3.96 %)
3,119,641
(40.22 %)
0
(0 %)
481,094
(9.09 %)
30,300
(3.29 %)
15,155
(0.98 %)
400 toyon (HeAr 88 primary hap 2022)
GCA_024362995.1
n/a n/a 22,897
(3.50 %)
67,595
(16.43 %)
n/a 38.12
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
118
(100.00 %)
344,928
(2.90 %)
299,566
(3.87 %)
3,139,734
(39.86 %)
0
(0 %)
474,790
(8.82 %)
30,533
(2.95 %)
15,260
(0.99 %)
401 tree cotton (Shixiya-1 2022)
GCF_025698485.1
69,134
(4.11 %)
n/a 20,169
(1.21 %)
55,515
(4.75 %)
n/a 35.17
(100.00 %)
0
(0 %)
225
(0.00 %)
948
(100.00 %)
618,195
(1.97 %)
622,748
(3.28 %)
8,002,633
(61.80 %)
0
(0 %)
1,982,971
(15.63 %)
27,646
(0.67 %)
5,410
(0.15 %)
402 tree cotton (Shixiya1 2015 BGI)
GCF_000612285.1
53,446
(3.92 %)
n/a 20,707
(1.29 %)
56,318
(5.01 %)
n/a 35.03
(92.12 %)
45,766
(7.88 %)
45,768
(7.88 %)
121,185
(92.12 %)
618,119
(2.07 %)
589,954
(3.54 %)
8,098,351
(55.57 %)
587
(0.14 %)
1,280,735
(10.74 %)
28,949
(0.57 %)
5,345
(0.12 %)
403 trifoliate orange (ZK8 2021)
GCA_018350135.1
n/a n/a 14,955
(4.81 %)
32,433
(16.97 %)
n/a 34.13
(99.99 %)
222
(0.01 %)
222
(0.01 %)
707
(99.99 %)
181,106
(2.67 %)
98,804
(3.46 %)
2,031,768
(34.51 %)
0
(0 %)
162,916
(6.03 %)
6,294
(1.72 %)
5,218
(0.79 %)
404 trilobed morning glory
GCF_003576645.1
49,472
(13.00 %)
n/a 16,803
(3.58 %)
50,448
(18.68 %)
n/a 35.68
(94.76 %)
0
(0 %)
31,256
(5.25 %)
17
(100.00 %)
333,211
(3.67 %)
335,317
(10.66 %)
2,341,085
(36.54 %)
1,908
(0.26 %)
378,228
(11.60 %)
27,290
(3.24 %)
20,629
(2.28 %)
405 turmeric (G26 2024)
GCF_044706935.1
40,834
(13.17 %)
n/a 18,067
(4.25 %)
53,196
(20.85 %)
n/a 37.76
(99.88 %)
0
(0 %)
4,668
(0.12 %)
7,139
(100.00 %)
169,406
(2.24 %)
191,181
(4.26 %)
2,052,731
(28.24 %)
1
(0.00 %)
168,829
(5.27 %)
50,044
(9.42 %)
37,292
(6.31 %)
406 Valencia sweet orange 2022
GCF_022201045.2
49,199
(16.33 %)
n/a 14,451
(4.70 %)
33,670
(18.59 %)
n/a 34.22
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
11
(100.00 %)
184,421
(2.80 %)
106,732
(3.28 %)
1,996,057
(33.86 %)
0
(0 %)
138,933
(5.87 %)
6,824
(1.28 %)
4,933
(0.78 %)
407 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2
63,531
(8.16 %)
n/a 16,883
(1.90 %)
72,901
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
0
(0 %)
1,673
(0.23 %)
2,002
(100.00 %)
800,288
(3.71 %)
460,119
(7.41 %)
5,438,715
(37.84 %)
3
(0.00 %)
746,272
(7.48 %)
19,628
(1.10 %)
9,136
(0.41 %)
408 Van Houtte's columbine (alt pseudohaplotype PFEx6 2022)
GCA_023053535.1
n/a n/a 13,357
(3.39 %)
37,446
(17.24 %)
n/a 37.56
(100.00 %)
0
(0 %)
63
(0.00 %)
249
(100.00 %)
244,573
(10.74 %)
180,141
(13.98 %)
1,184,686
(42.28 %)
0
(0 %)
428,570
(12.48 %)
6,470
(2.86 %)
617
(0.10 %)
409 Van Houtte's columbine (PFEx6 2022)
GCA_023053565.1
n/a n/a 13,575
(3.44 %)
38,113
(17.59 %)
n/a 37.58
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
463
(100.00 %)
245,892
(11.25 %)
158,855
(13.35 %)
1,221,056
(41.58 %)
0
(0 %)
400,137
(11.97 %)
6,436
(2.63 %)
718
(0.10 %)
410 vegetable marrow (v2 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.2
48,839
(21.95 %)
n/a 19,452
(7.44 %)
35,987
(20.77 %)
n/a 36.49
(94.38 %)
0
(0 %)
49,199
(5.63 %)
24,194
(100.00 %)
181,473
(3.18 %)
143,114
(7.42 %)
1,614,901
(29.14 %)
3,445
(0.84 %)
135,437
(7.93 %)
13,094
(2.48 %)
9,563
(1.55 %)
411 water chestnut (Nanhuling F231 2024)
GCA_035582545.1
n/a 32,263
(10.45 %)
19,879
(3.81 %)
38,349
(12.06 %)
n/a 38.10
(100.00 %)
0
(0 %)
216
(0.00 %)
32
(100.00 %)
116,633
(1.34 %)
123,546
(2.75 %)
2,308,826
(51.78 %)
0
(0 %)
223,520
(3.82 %)
20,598
(2.37 %)
16,595
(1.81 %)
412 watermelon (97103 2019)
GCA_000238415.2
n/a n/a 13,387
(3.57 %)
27,414
(10.73 %)
n/a 33.57
(98.45 %)
0
(0 %)
245
(1.55 %)
113
(100.00 %)
292,830
(3.56 %)
169,773
(2.91 %)
2,260,362
(43.24 %)
0
(0 %)
115,033
(3.03 %)
14,898
(1.47 %)
6,499
(0.72 %)
413 watermelon (Charleston Gray 2019)
GCA_004801215.2
n/a n/a 13,662
(3.47 %)
28,811
(10.60 %)
n/a 33.52
(94.83 %)
0
(0 %)
19,579
(5.18 %)
6,794
(100.00 %)
314,974
(3.65 %)
193,157
(4.04 %)
2,390,687
(41.95 %)
982
(0.50 %)
126,636
(4.51 %)
15,527
(1.38 %)
6,745
(0.67 %)
414 watermelon (Kordofan 2021)
GCA_018142915.1
n/a n/a 13,494
(3.54 %)
27,976
(10.71 %)
n/a 33.60
(100.00 %)
0
(0 %)
47
(0.00 %)
33
(100.00 %)
780,860
(60.44 %)
173,577
(3.01 %)
2,295,095
(44.07 %)
1
(0.00 %)
118,855
(3.07 %)
15,356
(1.51 %)
4,862
(0.55 %)
415 wax gourd
GCF_009727055.1
40,406
(4.66 %)
n/a 13,481
(1.43 %)
43,071
(6.68 %)
n/a 34.85
(98.39 %)
0
(0 %)
24,524
(1.62 %)
1,791
(100.00 %)
481,638
(2.55 %)
364,998
(3.11 %)
6,236,506
(49.68 %)
4,691
(0.08 %)
383,939
(3.89 %)
21,741
(0.93 %)
14,484
(0.55 %)
416 weeping love grass (Victoria 2019)
GCA_007726485.1
n/a 56,849
(13.20 %)
22,395
(3.96 %)
101,555
(33.88 %)
n/a 45.70
(99.78 %)
0
(0 %)
2,245
(0.22 %)
1,143
(100.00 %)
206,645
(1.57 %)
174,457
(2.79 %)
2,244,665
(26.11 %)
6
(0.00 %)
285,716
(7.93 %)
117,743
(29.88 %)
94,408
(12.80 %)
417 white cockle S.latifolia (original U9 population 2025)
GCF_048544455.1
89,156
(3.16 %)
n/a 15,292
(0.51 %)
135,024
(8.39 %)
n/a 38.77
(98.57 %)
0
(0 %)
827
(1.43 %)
720
(100.00 %)
1,158,845
(2.32 %)
1,353,517
(6.28 %)
10,836,475
(64.19 %)
1
(0.00 %)
2,427,207
(12.18 %)
161,610
(4.19 %)
21,180
(0.27 %)
418 white fonio (2020)
GCA_902806635.1
n/a n/a 33,011
(5.39 %)
109,615
(30.77 %)
n/a 45.47
(97.23 %)
29,136
(2.79 %)
29,136
(2.79 %)
29,155
(97.21 %)
215,374
(1.42 %)
159,137
(1.91 %)
2,776,488
(28.15 %)
5,190
(0.27 %)
250,897
(4.54 %)
136,308
(27.74 %)
101,170
(11.60 %)
419 white lupine (Amiga GWH2020 2020)
GCA_010261695.1
n/a 47,603
(13.29 %)
21,959
(3.77 %)
51,652
(20.18 %)
n/a 36.92
(99.73 %)
1,591
(0.03 %)
1,764
(0.27 %)
3,171
(99.97 %)
215,169
(3.21 %)
247,660
(10.71 %)
2,556,478
(43.72 %)
1
(0.00 %)
723,439
(10.94 %)
14,520
(10.46 %)
5,911
(9.75 %)
420 white poplar (2024)
GCF_005239225.2
53,525
(15.07 %)
n/a 20,195
(4.72 %)
44,116
(16.35 %)
n/a 33.73
(99.86 %)
0
(0 %)
1,182
(0.14 %)
97
(100.00 %)
307,548
(3.27 %)
174,946
(4.79 %)
2,453,000
(38.39 %)
1
(0.00 %)
277,603
(7.00 %)
4,493
(0.61 %)
2,065
(0.19 %)
421 white poplar P.alba x Populus glandulosa (maternal hap 84K 2023)
GCA_033621325.1
n/a n/a 19,540
(4.79 %)
41,183
(15.85 %)
n/a 34.67
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
21
(100.00 %)
265,758
(2.98 %)
150,154
(12.12 %)
2,138,699
(41.34 %)
0
(0 %)
379,436
(8.93 %)
3,578
(0.99 %)
1,749
(0.14 %)
422 white poplar P.alba x Populus glandulosa (paternal hap 84K 2023)
GCA_033617975.1
n/a n/a 19,599
(4.60 %)
42,133
(16.21 %)
n/a 35.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 27
(100.00 %)
268,999
(2.93 %)
165,404
(12.23 %)
2,153,763
(42.62 %)
0
(0 %)
410,373
(9.69 %)
5,857
(2.24 %)
2,015
(0.15 %)
423 white yam
GCF_009730915.1
43,902
(7.41 %)
n/a 13,647
(2.09 %)
49,877
(12.79 %)
n/a 36.25
(99.19 %)
0
(0 %)
4,760
(0.81 %)
2,254
(100.00 %)
391,299
(3.19 %)
258,918
(3.96 %)
3,588,023
(40.59 %)
0
(0 %)
287,001
(4.23 %)
28,929
(2.37 %)
14,044
(1.13 %)
424 wild cabbage
GCF_000695525.1
66,716
(15.60 %)
n/a 31,142
(8.08 %)
103,348
(35.10 %)
n/a 36.11
(91.23 %)
874
(0.02 %)
52,140
(8.80 %)
33,760
(99.98 %)
197,515
(3.12 %)
214,463
(4.43 %)
2,535,207
(31.20 %)
226
(0.10 %)
221,975
(4.62 %)
29,995
(2.99 %)
19,922
(1.82 %)
425 wild cabbage (2018)
GCA_900416815.2
n/a n/a 31,163
(6.66 %)
79,290
(25.04 %)
n/a 36.57
(98.21 %)
11
(0.00 %)
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(1.79 %)
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(100.00 %)
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(6.41 %)
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0
(0 %)
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(8.08 %)
33,071
(3.37 %)
21,309
(1.78 %)
426 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1
29,804
(16.68 %)
n/a 13,252
(5.90 %)
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(14.89 %)
n/a 32.94
(94.65 %)
0
(0 %)
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(100.00 %)
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(2.19 %)
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(0.01 %)
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(3.41 %)
2,481
(0.48 %)
2,112
(0.40 %)
427 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2
131,285
(1.34 %)
n/a n/a 567,570
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
0
(0 %)
344,589
(3.31 %)
148,296
(100.00 %)
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(3.37 %)
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(96.69 %)
210
(0.02 %)
n/a 2,220,880
(25.34 %)
0
(0.00 %)
428 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2
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n/a 18,878
(4.31 %)
45,554
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n/a 38.87
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(17.29 %)
22,178
(17.31 %)
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(82.71 %)
214,040
(7.81 %)
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(2.42 %)
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(0.30 %)
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(3.00 %)
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429 wild olive
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(6.69 %)
n/a 19,793
(1.69 %)
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n/a 35.40
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0
(0 %)
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(9.59 %)
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(100.00 %)
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(40.81 %)
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(0.11 %)
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(14.57 %)
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(0.42 %)
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430 wild peanut A.duranensis (v2 V14167 2020)
GCF_000817695.3
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(0.85 %)
431 wild peanut A.ipaensis (K30076 2017)
GCF_000816755.2
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(0.10 %)
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(10.04 %)
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432 wild peanut A.stenosperma (V10309 2020)
GCF_014773155.1
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(5.06 %)
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(1.28 %)
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(9.77 %)
n/a 36.78
(93.48 %)
0
(0 %)
14,157
(6.52 %)
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(100.00 %)
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4
(0.00 %)
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433 wild soybean
GCF_004193775.1
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(9.20 %)
n/a 27,977
(2.99 %)
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(11.64 %)
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0
(0 %)
752
(2.42 %)
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(100.00 %)
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(6.65 %)
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(46.22 %)
5
(0.01 %)
778,567
(7.38 %)
37,183
(1.52 %)
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(0.57 %)
434 wild strawberry (2011 refseq)
GCF_000184155.1
25,210
(19.38 %)
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(6.63 %)
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(1.51 %)
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(2.78 %)
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(0.01 %)
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(1.93 %)
435 wild sugarcane (AP85-441 2018)
GCA_003544955.1
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(2.77 %)
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(99.75 %)
0
(0 %)
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(0.00 %)
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436 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1
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(1.87 %)
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(7.63 %)
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(7.67 %)
41,684
(7.67 %)
41,696
(92.33 %)
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(2.48 %)
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(4.15 %)
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(0.10 %)
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(1.20 %)
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437 wine grape (Chardonnay FPS 04 2020)
GCA_011037095.1
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(0 %)
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(5.71 %)
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(0.96 %)
8,413
(0.56 %)
438 wine grape (Chkhaveri 2017)
GCA_002922885.1
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40,033
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n/a 34.56
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0
(0 %)
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(2.34 %)
21
(100.00 %)
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(35.69 %)
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(0.04 %)
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439 wine grape (Pinot Noir 40024 2023)
GCF_030704535.1
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0
(0 %)
n/a 21
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0
(0 %)
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(7.00 %)
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(1.05 %)
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440 wine grape (PN40024 2009)
GCF_000003745.3
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(96.91 %)
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(3.10 %)
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(3.10 %)
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(96.90 %)
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(35.59 %)
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(4.83 %)
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(34.80 %)
345
(0.04 %)
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(5.97 %)
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(1.00 %)
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(0.55 %)
441 winter cress (G-type 2016)
GCA_001920985.1
n/a n/a 22,511
(18.61 %)
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n/a 35.60
(90.69 %)
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(9.35 %)
22,839
(9.35 %)
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(90.65 %)
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(2.39 %)
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(2.78 %)
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(23.86 %)
13
(0.01 %)
47,590
(2.53 %)
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(1.74 %)
5,207
(1.30 %)
442 winter squash (2017)
GCF_002738345.1
49,714
(19.34 %)
n/a 18,860
(6.74 %)
33,884
(18.55 %)
n/a 36.33
(97.81 %)
0
(0 %)
17,224
(2.20 %)
8,299
(100.00 %)
169,605
(3.09 %)
134,380
(10.82 %)
1,493,623
(35.66 %)
439
(0.08 %)
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(8.27 %)
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443 wood tobacco (2013)
GCF_000393655.1
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444 wood tobacco (2023)
GCF_000393655.2
69,980
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(0.00 %)
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445 wooly tobacco N.tomentosiformis (2023)
GCF_000390325.3
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446 zha cai (T84-66 inbred line 2016)
GCA_001687265.1
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TOTALS:total assembly count 446

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Mammals 840 assemblies assembly stats track stats
Birds 543 assemblies assembly stats track stats
Fishes 637 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 406 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1945 assemblies assembly stats track stats
Plants 446 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4128 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15061 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2702 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 22351 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 690 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5519 assemblies assembly stats track stats