Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Christmas fern (IRGN 58ZZQ2NR20 2022)
GCA_025802375.1
n/a n/a 2,216
(0.22 %)
115,851
(13.84 %)
n/a 40.55
(99.77 %)
6,993
(0.02 %)
6,993
(0.02 %)
496,888
(99.98 %)
1,157,849
(61.20 %)
244,472
(3.76 %)
2,756,209
(21.19 %)
8
(0.00 %)
n/a 9,107
(0.82 %)
3,721
(0.34 %)
2 A. eriantha gooseberry (White 2019)
GCA_004150315.1
n/a n/a 21,507
(2.72 %)
60,050
(11.57 %)
n/a 35.92
(99.97 %)
0
(0 %)
2,344
(0.03 %)
1,735
(100.00 %)
430,950
(2.82 %)
273,041
(3.10 %)
4,895,011
(32.98 %)
1
(0.00 %)
150,033
(1.97 %)
29,695
(1.88 %)
17,294
(1.01 %)
3 A.eriantha eudicots (MHT-2021 2021)
GCF_019202715.1
71,489
(11.95 %)
n/a 23,883
(3.45 %)
59,407
(13.07 %)
n/a 35.65
(99.64 %)
0
(0 %)
710
(0.36 %)
88
(100.00 %)
430,287
(3.04 %)
350,721
(4.29 %)
3,875,064
(36.80 %)
0
(0 %)
297,935
(5.94 %)
27,794
(1.97 %)
14,196
(0.90 %)
4 adzuki bean (Jingnong 6 2015)
GCF_001190045.1
40,474
(10.62 %)
n/a 16,697
(3.71 %)
47,542
(15.07 %)
n/a 34.07
(96.37 %)
21,264
(3.63 %)
21,264
(3.63 %)
58,639
(96.37 %)
257,290
(4.08 %)
239,596
(6.43 %)
2,925,469
(36.04 %)
202
(0.09 %)
250,517
(6.42 %)
24,461
(2.99 %)
14,539
(1.51 %)
5 adzuki bean (LongXiaoDou No.4 2021)
GCF_016808095.1
50,989
(11.87 %)
n/a 16,661
(3.75 %)
45,945
(15.40 %)
n/a 33.63
(100.00 %)
0
(0 %)
32
(0.00 %)
36
(100.00 %)
263,673
(3.52 %)
264,113
(5.18 %)
2,808,981
(37.65 %)
0
(0 %)
244,636
(6.82 %)
20,402
(2.60 %)
14,051
(1.55 %)
6 African boxthorn (CSIRO_LF1 2023)
GCF_029784015.1
54,359
(4.64 %)
n/a 16,693
(1.34 %)
75,114
(9.09 %)
n/a 37.42
(99.88 %)
0
(0 %)
15,111
(0.12 %)
14,905
(100.00 %)
668,488
(2.42 %)
511,720
(3.29 %)
8,110,750
(42.79 %)
2
(0.00 %)
942,647
(9.28 %)
50,821
(2.66 %)
18,184
(0.72 %)
7 African oil palm
GCF_000442705.1
51,575
(5.06 %)
n/a 16,948
(1.48 %)
76,464
(9.29 %)
n/a 37.21
(68.90 %)
162,407
(31.14 %)
166,490
(31.14 %)
202,468
(68.86 %)
580,361
(3.63 %)
445,124
(2.25 %)
5,831,606
(30.77 %)
2,228
(0.10 %)
282,030
(1.50 %)
75,576
(3.67 %)
31,746
(0.99 %)
8 African oil palm (ETL-2024a 2024)
GCF_000442705.2
61,514
(3.59 %)
n/a 17,694
(0.94 %)
82,131
(6.45 %)
n/a 38.54
(93.07 %)
0
(0 %)
37,524
(6.94 %)
30
(100.00 %)
930,885
(3.15 %)
928,025
(5.06 %)
6,719,901
(56.47 %)
38
(0.00 %)
1,987,190
(10.92 %)
104,550
(9.50 %)
36,012
(0.94 %)
9 African rice (2021)
GCF_000147395.1
43,826
(15.96 %)
n/a 16,224
(4.82 %)
51,031
(25.64 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
13
(0.00 %)
21
(0.00 %)
73
(100.00 %)
178,763
(2.60 %)
125,689
(4.18 %)
1,761,585
(30.96 %)
1
(0.00 %)
127,354
(3.72 %)
60,891
(21.37 %)
40,209
(7.27 %)
10 algarrobo blanco (v1 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.1
62,791
(10.08 %)
n/a 25,423
(3.34 %)
69,507
(14.55 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,087
(100.00 %)
367,402
(2.31 %)
175,862
(2.27 %)
4,241,058
(38.29 %)
0
(0 %)
289,448
(4.63 %)
18,927
(1.15 %)
12,774
(0.78 %)
11 algarrobo blanco (v2 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.2
62,791
(10.08 %)
n/a 25,443
(3.35 %)
69,492
(14.56 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,085
(100.00 %)
366,178
(2.25 %)
175,852
(2.27 %)
4,240,382
(38.29 %)
0
(0 %)
289,428
(4.63 %)
18,927
(1.15 %)
12,775
(0.79 %)
12 almond
GCF_902201215.1
37,363
(19.64 %)
n/a 14,509
(6.35 %)
33,193
(24.70 %)
n/a 37.65
(98.29 %)
1,008
(0.04 %)
6,531
(1.72 %)
1,700
(99.96 %)
137,974
(2.59 %)
100,386
(3.92 %)
1,251,126
(26.07 %)
7
(0.00 %)
114,850
(6.39 %)
10,893
(2.94 %)
5,266
(1.06 %)
13 annual mercury (v1 primary hap 2022)
GCF_937616625.1
47,801
(11.07 %)
n/a 13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
0
(0 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
0
(0 %)
1,165,065
(19.31 %)
9,024
(2.18 %)
5,406
(0.45 %)
14 annual mercury (v2 primary hap 2022)
GCF_937616625.2
44,356
(10.99 %)
n/a 13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
0
(0 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
0
(0 %)
1,165,065
(19.31 %)
9,024
(2.18 %)
5,406
(0.45 %)
15 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1
73,172
(3.41 %)
n/a 26,626
(1.10 %)
228,260
(15.00 %)
n/a 44.76
(99.87 %)
0
(0 %)
31,919
(0.13 %)
1,764
(100.00 %)
639,429
(1.31 %)
739,566
(3.57 %)
6,976,583
(59.37 %)
20
(0.00 %)
2,938,091
(54.45 %)
560,429
(28.70 %)
234,787
(7.24 %)
16 ant C.braunii (S276 2018)
GCA_003427395.1
n/a 36,423
(6.45 %)
3,649
(0.20 %)
126,898
(19.85 %)
n/a 48.33
(81.70 %)
641,791
(18.38 %)
641,791
(18.38 %)
653,445
(81.62 %)
1,577,107
(5.98 %)
1,434,259
(6.24 %)
8,533,748
(36.35 %)
11,268
(0.38 %)
884,830
(4.30 %)
278,266
(17.95 %)
112,631
(3.95 %)
17 ant C.sp. (NIES-68 2022)
GCA_027943385.1
n/a 28,971
(16.48 %)
3,655
(0.79 %)
32,911
(30.45 %)
n/a 55.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,529
(100.00 %)
255,839
(6.03 %)
392,694
(15.77 %)
1,480,495
(52.16 %)
0
(0 %)
470,137
(9.98 %)
23,662
(78.57 %)
40,755
(11.50 %)
18 ant L.chinense (Lushan-1 2018)
GCA_003013855.2
n/a n/a 15,545
(0.82 %)
85,577
(6.98 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
473
(0.00 %)
473
(0.00 %)
4,183
(100.00 %)
860,506
(2.32 %)
825,722
(4.56 %)
8,205,488
(53.73 %)
0
(0 %)
1,213,231
(8.04 %)
153,728
(4.12 %)
19,945
(0.45 %)
19 ant M.endlicherianum (SAG 12.97 2019)
GCA_009602735.1
n/a n/a 2,806
(1.27 %)
21,989
(34.80 %)
n/a 51.93
(90.29 %)
24,291
(9.73 %)
24,291
(9.73 %)
38,152
(90.27 %)
147,548
(5.58 %)
92,866
(3.14 %)
715,552
(34.44 %)
304
(0.17 %)
61,445
(5.72 %)
34,833
(26.81 %)
25,521
(7.32 %)
20 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 refseq)
GCF_002114115.1
64,916
(11.38 %)
n/a 22,530
(3.52 %)
67,146
(16.22 %)
n/a 38.04
(88.96 %)
0
(0 %)
7,264
(11.05 %)
807
(100.00 %)
692,611
(50.77 %)
322,556
(4.41 %)
3,055,836
(35.69 %)
2
(0.00 %)
451,438
(6.86 %)
25,923
(1.76 %)
13,929
(0.88 %)
21 apple (hap1 2024)
GCF_042453785.1
78,522
(12.41 %)
n/a 22,548
(3.38 %)
68,116
(16.07 %)
n/a 38.09
(100.00 %)
0
(0 %)
89
(0.00 %)
19
(100.00 %)
315,260
(2.21 %)
337,450
(5.03 %)
3,018,840
(41.78 %)
0
(0 %)
504,186
(8.89 %)
26,464
(1.96 %)
15,224
(1.02 %)
22 Asian cultivated rice (Carolina Gold Select 2019)
GCA_004007595.1
n/a 68,732
(13.79 %)
16,583
(4.58 %)
55,248
(25.46 %)
n/a 43.36
(99.98 %)
0
(0 %)
696
(0.02 %)
615
(100.00 %)
495,126
(50.28 %)
124,567
(3.20 %)
1,922,072
(32.59 %)
0
(0 %)
155,586
(4.21 %)
65,220
(23.87 %)
41,812
(7.56 %)
23 Australian watermeal (7733 2023)
GCF_029677425.1
25,687
(7.34 %)
n/a 8,705
(2.10 %)
36,382
(16.93 %)
n/a 40.84
(99.89 %)
0
(0 %)
11
(0.11 %)
21
(100.00 %)
349,798
(22.56 %)
247,654
(8.32 %)
2,073,176
(34.59 %)
0
(0 %)
230,212
(4.87 %)
43,900
(16.21 %)
31,614
(6.14 %)
24 Australian watermeal (WA8730 2020)
GCA_013350365.1
n/a n/a 8,508
(2.10 %)
37,551
(17.70 %)
n/a 40.80
(95.30 %)
1,778
(4.70 %)
1,778
(4.70 %)
7,026
(95.30 %)
167,876
(5.21 %)
220,174
(6.35 %)
2,006,559
(31.53 %)
0
(0 %)
127,703
(2.82 %)
43,277
(15.01 %)
30,244
(5.88 %)
25 Australian wild rice (MA-2024b 2025)
GCA_047496205.1
n/a n/a 16,434
(4.16 %)
55,282
(23.68 %)
n/a 43.56
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
16
(100.00 %)
602,996
(48.61 %)
170,830
(6.54 %)
1,845,923
(37.36 %)
0
(0 %)
218,432
(6.72 %)
69,474
(22.48 %)
48,410
(7.77 %)
26 Avena eriantha (BYU132 2022)
GCA_910589775.1
n/a n/a 17,696
(0.47 %)
237,324
(9.15 %)
n/a 43.86
(99.92 %)
196
(0.01 %)
5,576
(0.09 %)
2,848
(99.99 %)
902,202
(1.10 %)
1,084,992
(6.55 %)
13,291,939
(69.78 %)
14
(0.00 %)
1,732,871
(4.11 %)
644,302
(16.91 %)
248,956
(4.86 %)
27 avocado (Hass MH2022 2023)
GCA_029852735.1
n/a 42,442
(4.89 %)
15,968
(1.61 %)
64,612
(11.72 %)
n/a 39.99
(100.00 %)
0
(0 %)
36
(0.00 %)
482
(100.00 %)
1,348,599
(20.35 %)
427,369
(10.49 %)
4,298,119
(41.03 %)
0
(0 %)
569,002
(6.88 %)
54,543
(5.58 %)
9,989
(0.97 %)
28 Bahia grass (Cayasta R1 2024)
GCA_036689595.1
n/a 52,138
(13.42 %)
17,830
(3.66 %)
74,926
(26.22 %)
n/a 45.79
(99.95 %)
2,801
(0.05 %)
2,801
(0.05 %)
2,811
(99.95 %)
643,354
(26.01 %)
146,179
(4.41 %)
2,284,294
(38.05 %)
29
(0.00 %)
508,348
(10.78 %)
110,855
(27.67 %)
72,647
(11.45 %)
29 Balbis banana (DH-PKW 2019)
GCA_004837865.1
n/a 35,148
(10.52 %)
18,974
(3.45 %)
47,957
(15.55 %)
n/a 38.02
(99.72 %)
0
(0 %)
1,197
(0.27 %)
2,590
(100.00 %)
208,141
(3.88 %)
197,690
(7.95 %)
2,068,575
(42.39 %)
1
(0.00 %)
440,604
(8.80 %)
52,850
(9.12 %)
34,616
(5.51 %)
30 Barbados nut
GCF_014843425.1
33,622
(13.80 %)
n/a 12,687
(4.63 %)
26,511
(14.56 %)
n/a 33.40
(99.60 %)
0
(0 %)
2,151
(0.40 %)
1,232
(100.00 %)
281,490
(24.82 %)
186,260
(5.65 %)
2,028,357
(33.33 %)
0
(0 %)
87,723
(3.18 %)
8,868
(1.38 %)
5,253
(0.75 %)
31 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1
50,906
(14.28 %)
n/a 16,712
(3.68 %)
41,041
(14.51 %)
n/a 33.43
(99.87 %)
0
(0 %)
22
(0.13 %)
42
(100.00 %)
393,909
(27.89 %)
175,427
(3.92 %)
2,532,494
(37.64 %)
0
(0 %)
222,154
(8.04 %)
3,384
(0.27 %)
2,085
(0.17 %)
32 barrel medic (A17 2014)
GCF_000219495.3
48,865
(15.69 %)
n/a 16,549
(3.99 %)
40,316
(15.41 %)
n/a 33.14
(94.48 %)
5,840
(5.53 %)
8,785
(5.53 %)
8,027
(94.47 %)
366,709
(22.34 %)
146,748
(2.80 %)
2,549,499
(32.46 %)
216
(0.08 %)
147,910
(5.33 %)
3,695
(0.65 %)
2,696
(0.57 %)
33 barrel medic (HM340 2017)
GCA_002024945.1
n/a n/a 16,672
(3.96 %)
40,032
(15.19 %)
n/a 33.05
(99.32 %)
0
(0 %)
107
(0.68 %)
909
(100.00 %)
381,065
(23.82 %)
162,402
(3.97 %)
2,490,028
(35.39 %)
0
(0 %)
206,427
(6.09 %)
3,335
(0.34 %)
2,111
(0.22 %)
34 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 alternate hap 2023)
GCA_028538565.1
n/a n/a 15,063
(1.43 %)
65,125
(11.47 %)
n/a 40.34
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
197
(100.00 %)
735,552
(11.30 %)
567,295
(6.87 %)
4,176,675
(45.56 %)
2
(0.00 %)
714,025
(8.90 %)
66,834
(4.90 %)
12,024
(0.59 %)
35 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 primary hap 2023)
GCA_028534965.1
n/a n/a 15,223
(1.43 %)
65,769
(11.33 %)
n/a 40.37
(100.00 %)
0
(0 %)
36
(0.00 %)
303
(100.00 %)
744,623
(11.37 %)
571,691
(7.15 %)
4,217,655
(45.87 %)
2
(0.00 %)
721,040
(8.85 %)
68,566
(4.96 %)
12,157
(0.60 %)
36 Beaked sedge (primary hap 2024)
GCF_964058835.1
45,471
(13.00 %)
n/a 12,576
(2.89 %)
37,235
(14.57 %)
n/a 34.33
(100.00 %)
46
(0.00 %)
46
(0.00 %)
119
(100.00 %)
426,798
(12.51 %)
241,324
(8.02 %)
2,385,410
(42.61 %)
2
(0.00 %)
370,127
(8.90 %)
12,286
(3.13 %)
5,777
(0.51 %)
37 beefsteak plant (Hoko-3 primary hap 2022)
GCA_026008535.1
n/a n/a 28,039
(2.07 %)
120,338
(15.60 %)
n/a 35.28
(100.00 %)
0
(0 %)
23
(0.00 %)
71
(100.00 %)
2,012,805
(68.74 %)
678,680
(5.87 %)
8,191,868
(44.06 %)
0
(0 %)
932,908
(8.21 %)
65,395
(2.45 %)
22,082
(0.87 %)
38 beet (v1 EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1
47,727
(9.45 %)
n/a 11,911
(2.04 %)
50,202
(16.78 %)
n/a 35.86
(99.99 %)
0
(0 %)
323
(0.01 %)
42
(100.00 %)
294,768
(3.41 %)
341,699
(6.22 %)
2,932,896
(35.20 %)
0
(0 %)
362,295
(7.68 %)
25,364
(1.79 %)
12,364
(0.80 %)
39 beet (v2 EL10 2022 USDA)
GCF_026745355.1
45,490
(9.22 %)
n/a 11,850
(2.05 %)
49,071
(15.89 %)
n/a 35.85
(94.03 %)
0
(0 %)
3,200
(5.97 %)
20
(100.00 %)
290,870
(3.40 %)
336,343
(5.76 %)
2,901,079
(33.21 %)
0
(0 %)
391,673
(6.85 %)
25,108
(1.67 %)
12,259
(0.75 %)
40 bell pepper eudicots (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1
70,848
(2.17 %)
n/a 15,922
(0.50 %)
69,601
(2.75 %)
n/a 34.91
(97.27 %)
0
(0 %)
52,577
(2.73 %)
81,202
(100.00 %)
1,192,132
(1.94 %)
1,097,384
(4.12 %)
23,393,622
(47.64 %)
4,061
(0.30 %)
1,575,258
(3.88 %)
19,517
(0.21 %)
5,887
(0.07 %)
41 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 alternate hap 2021)
GCA_019985075.1
n/a n/a 13,887
(2.34 %)
44,507
(14.12 %)
n/a 37.97
(100.00 %)
0
(0 %)
120
(0.00 %)
2,350
(100.00 %)
250,361
(2.10 %)
231,118
(13.56 %)
2,049,366
(44.58 %)
8
(0.00 %)
541,706
(10.86 %)
22,527
(6.34 %)
9,698
(0.77 %)
42 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 primary hap 2022)
GCA_019985065.2
n/a n/a 15,102
(2.62 %)
47,553
(15.64 %)
n/a 38.11
(100.00 %)
0
(0 %)
82
(0.00 %)
272
(100.00 %)
257,066
(2.22 %)
226,514
(14.63 %)
2,470,334
(38.37 %)
0
(0 %)
402,921
(8.45 %)
21,415
(5.59 %)
9,843
(0.72 %)
43 birdsfoot trefoil (B-129 2022)
GCF_012489685.1
57,539
(11.82 %)
n/a 16,919
(2.98 %)
64,687
(19.59 %)
n/a 38.05
(99.97 %)
0
(0 %)
1,625
(0.04 %)
65
(100.00 %)
236,645
(2.13 %)
205,150
(5.19 %)
2,202,942
(41.60 %)
8
(0.00 %)
405,251
(12.94 %)
32,283
(3.44 %)
14,923
(1.36 %)
44 bitter melon
GCF_001995035.1
31,725
(13.80 %)
n/a 12,858
(4.62 %)
30,539
(16.85 %)
n/a 34.58
(92.32 %)
0
(0 %)
109,310
(7.74 %)
1,052
(100.00 %)
162,837
(2.82 %)
89,571
(2.03 %)
1,951,167
(30.96 %)
511
(0.13 %)
50,890
(1.69 %)
14,100
(2.00 %)
10,345
(1.39 %)
45 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 alternate hap 2023)
GCA_028534865.1
n/a n/a 20,077
(4.66 %)
43,061
(17.16 %)
n/a 34.80
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
338
(100.00 %)
267,110
(2.88 %)
173,502
(6.32 %)
2,366,759
(39.61 %)
0
(0 %)
279,214
(8.59 %)
5,093
(4.11 %)
1,729
(0.14 %)
46 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 primary hap 2023)
GCA_028534895.1
n/a n/a 19,804
(4.58 %)
42,642
(17.03 %)
n/a 34.85
(100.00 %)
0
(0 %)
26
(0.00 %)
132
(100.00 %)
265,925
(2.85 %)
174,688
(6.70 %)
2,359,101
(40.07 %)
1
(0.00 %)
298,817
(9.06 %)
4,963
(4.10 %)
1,643
(0.13 %)
47 black cottonwood (v4.1 Nisqually-1 2022)
GCF_000002775.5
59,638
(15.94 %)
n/a 19,969
(4.99 %)
41,581
(16.22 %)
n/a 33.75
(99.85 %)
59
(0.15 %)
59
(0.15 %)
106
(99.85 %)
257,833
(2.91 %)
156,371
(4.50 %)
2,423,627
(36.28 %)
0
(0 %)
202,186
(5.63 %)
3,761
(0.66 %)
1,701
(0.17 %)
48 black gram (Urdbean 2024)
GCA_036885675.1
n/a 39,708
(11.70 %)
16,158
(3.35 %)
47,346
(15.05 %)
n/a 33.60
(99.97 %)
0
(0 %)
282
(0.03 %)
13
(100.00 %)
832,234
(57.53 %)
240,933
(5.84 %)
2,976,104
(38.95 %)
0
(0 %)
357,224
(7.24 %)
16,895
(2.01 %)
7,371
(0.67 %)
49 black tea
GCF_004153795.1
101,253
(3.17 %)
n/a 20,982
(0.66 %)
156,999
(7.69 %)
n/a 37.85
(92.12 %)
0
(0 %)
79,329
(7.89 %)
14,028
(100.00 %)
1,926,995
(3.23 %)
2,024,420
(8.06 %)
17,959,098
(50.75 %)
6
(0.00 %)
3,231,864
(10.09 %)
181,027
(2.79 %)
29,897
(0.36 %)
50 blue lilly pilly tree (NSW1041296 2022)
GCF_021117445.2
46,173
(12.87 %)
n/a 15,187
(3.49 %)
50,585
(20.61 %)
n/a 40.95
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
72
(100.00 %)
494,434
(48.54 %)
220,571
(4.98 %)
1,866,530
(29.09 %)
0
(0 %)
302,589
(7.56 %)
59,325
(10.76 %)
28,053
(3.71 %)
51 bread wheat (Chinese Spring 2020)
GCA_002220415.3
n/a 138,090
(1.09 %)
46,431
(0.31 %)
805,204
(7.93 %)
n/a 46.09
(99.87 %)
0
(0 %)
211,982
(0.14 %)
70,316
(100.00 %)
9,191,325
(44.14 %)
5,086,953
(4.53 %)
282,298
(99.86 %)
316
(0.00 %)
19,425,363
(15.62 %)
3,241,124
(28.06 %)
2,065,976
(13.12 %)
52 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1
221,450
(1.62 %)
n/a n/a 763,380
(8.08 %)
n/a 46.14
(98.27 %)
0
(0 %)
214,799
(1.73 %)
91,589
(100.00 %)
8,660,189
(44.94 %)
4,402,049
(3.94 %)
306,386
(98.27 %)
434
(0.02 %)
17,440,813
(14.18 %)
3,040,030
(27.48 %)
0
(0.00 %)
53 bread wheat (Chinese Spring IWGSC RefSeq v1.0 2018)
GCA_900519105.1
n/a n/a n/a 751,576
(8.03 %)
n/a 46.05
(98.12 %)
693,028
(1.90 %)
693,028
(1.90 %)
693,050
(98.10 %)
8,420,935
(44.23 %)
4,115,828
(3.69 %)
693,050
(98.10 %)
385
(0.01 %)
n/a 3,076,631
(26.41 %)
0
(0.00 %)
54 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1
n/a n/a n/a 773,766
(8.20 %)
n/a 46.05
(100.00 %)
0
(0 %)
1,407
(0.00 %)
3,795
(100.00 %)
8,703,192
(44.57 %)
4,569,103
(5.20 %)
5,202
(100.00 %)
12
(0.00 %)
n/a 3,001,896
(28.00 %)
0
(0.00 %)
55 bread wheat (Kariega 2021)
GCA_910594105.1
n/a n/a 47,400
(0.34 %)
778,134
(8.33 %)
n/a 46.11
(99.87 %)
7,376
(0.13 %)
7,376
(0.13 %)
7,398
(99.87 %)
14,835,099
(85.31 %)
4,570,540
(5.40 %)
7,395
(99.87 %)
41
(0.00 %)
928,524
(0.74 %)
2,994,427
(28.25 %)
606,650
(3.02 %)
56 brown mustard (Varuna 2020)
GCA_015484525.1
n/a n/a 50,825
(7.02 %)
128,133
(24.54 %)
n/a 37.47
(96.71 %)
0
(0 %)
3,070
(3.29 %)
720
(100.00 %)
905,496
(54.34 %)
440,139
(7.46 %)
4,073,637
(39.30 %)
4
(0.00 %)
843,858
(10.72 %)
54,083
(6.71 %)
25,528
(1.30 %)
57 bulbous barley monocots (2017)
GCA_900070015.1
n/a n/a 13,790
(0.81 %)
584,401
(17.92 %)
n/a 44.69
(99.26 %)
714,678
(0.49 %)
714,678
(0.49 %)
3,598,227
(99.51 %)
405,591
(2.31 %)
383,580
(1.94 %)
9,713,864
(28.00 %)
15
(0.00 %)
n/a 392,202
(11.97 %)
257,344
(7.86 %)
58 button wrinklewort R.leptorrhynchoides (AG116_Rl617_1_P2 2025)
GCF_046630445.1
79,194
(1.39 %)
n/a 19,567
(0.31 %)
119,910
(3.26 %)
n/a 33.70
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
549
(100.00 %)
3,727,770
(5.18 %)
3,762,751
(4.98 %)
10,213,591
(82.37 %)
0
(0 %)
n/a 54,254
(0.38 %)
9,950
(0.06 %)
59 cacao
GCF_000208745.1
34,727
(13.67 %)
n/a 14,294
(4.65 %)
29,216
(14.38 %)
n/a 34.09
(94.31 %)
0
(0 %)
11,787
(5.70 %)
431
(100.00 %)
206,049
(15.64 %)
99,229
(2.66 %)
1,933,579
(33.24 %)
175
(0.02 %)
138,327
(4.02 %)
2,964
(0.34 %)
2,376
(0.27 %)
60 California black walnut (Jcal.S.LA.6 alternate hap 2022)
GCA_023349545.1
n/a n/a 18,729
(3.22 %)
57,374
(16.70 %)
n/a 36.81
(100.00 %)
0
(0 %)
78
(0.00 %)
915
(100.00 %)
421,731
(3.42 %)
300,957
(5.54 %)
2,794,242
(34.11 %)
1
(0.00 %)
264,077
(5.33 %)
25,348
(3.39 %)
12,668
(0.88 %)
61 California black walnut (Jcal.S.LA.6 primary hap 2022)
GCA_023349395.1
n/a n/a 18,579
(3.26 %)
56,295
(16.71 %)
n/a 36.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
138
(100.00 %)
414,129
(3.48 %)
293,951
(5.95 %)
3,055,420
(34.96 %)
0
(0 %)
267,374
(5.36 %)
24,749
(4.05 %)
12,091
(0.87 %)
62 California pipevine (CCGP_79_NKW_82.1479hap1 2023)
GCF_029961685.1
43,175
(7.78 %)
n/a 16,377
(2.29 %)
43,559
(11.38 %)
n/a 36.31
(100.00 %)
175
(0.00 %)
175
(0.00 %)
706
(100.00 %)
341,665
(12.46 %)
223,217
(36.36 %)
2,388,236
(58.00 %)
5
(0.00 %)
2,500,132
(20.87 %)
26,535
(3.98 %)
15,554
(1.14 %)
63 California scrub oak (Qber.S.LA.60 alternate hap 2023)
GCA_028535905.1
n/a n/a 16,153
(1.86 %)
68,653
(14.03 %)
n/a 35.79
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
807
(100.00 %)
783,798
(4.17 %)
456,025
(10.87 %)
4,951,918
(40.76 %)
2
(0.00 %)
725,680
(8.19 %)
21,783
(2.16 %)
9,330
(0.43 %)
64 California scrub oak (Qber.S.LA.60 primary hap 2023)
GCA_028535815.1
n/a n/a 15,836
(1.90 %)
66,803
(13.99 %)
n/a 35.77
(100.00 %)
0
(0 %)
32
(0.00 %)
283
(100.00 %)
762,029
(4.24 %)
448,099
(10.97 %)
4,784,968
(41.07 %)
0
(0 %)
695,512
(8.10 %)
20,384
(2.28 %)
8,472
(0.39 %)
65 Cannabis sativa ( 2020)
GCA_016165845.1
n/a n/a 18,838
(1.94 %)
71,211
(13.84 %)
n/a 33.78
(99.91 %)
0
(0 %)
8,772
(0.10 %)
147
(100.00 %)
643,488
(3.49 %)
361,843
(3.63 %)
4,074,440
(56.52 %)
36
(0.00 %)
950,351
(13.57 %)
27,745
(1.31 %)
6,939
(0.30 %)
66 Cannabis sativa (Cannatonic 2016)
GCA_001865755.1
n/a n/a 10,725
(1.71 %)
41,537
(11.41 %)
n/a 33.68
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11,110
(100.00 %)
396,112
(4.11 %)
221,932
(3.23 %)
2,389,229
(59.21 %)
0
(0 %)
623,084
(13.50 %)
17,045
(1.23 %)
4,584
(0.35 %)
67 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2
39,696
(6.07 %)
n/a 13,883
(1.80 %)
50,556
(11.19 %)
n/a 33.51
(84.07 %)
843
(15.93 %)
843
(15.93 %)
1,052
(84.07 %)
496,648
(3.63 %)
258,281
(2.28 %)
3,594,433
(47.71 %)
1
(0.00 %)
755,100
(9.25 %)
22,750
(1.69 %)
7,799
(0.33 %)
68 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2
n/a n/a 24,975
(1.79 %)
113,252
(15.69 %)
n/a 34.00
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,372
(100.00 %)
936,351
(4.13 %)
520,230
(3.65 %)
5,183,602
(58.66 %)
0
(0 %)
1,449,890
(14.90 %)
47,327
(1.58 %)
8,921
(0.24 %)
69 Cannabis sativa (Jamaican Lion Mother 2020)
GCA_012923435.1
n/a 27,358
(4.91 %)
15,253
(1.67 %)
62,228
(12.57 %)
n/a 34.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,599
(100.00 %)
595,917
(3.95 %)
335,791
(3.38 %)
3,478,519
(61.18 %)
0
(0 %)
975,634
(15.64 %)
31,738
(1.57 %)
5,423
(0.22 %)
70 Cannabis sativa (JL 2020)
GCA_013030365.1
n/a n/a 15,334
(1.80 %)
60,140
(12.83 %)
n/a 33.79
(99.92 %)
0
(0 %)
2,496
(0.09 %)
483
(100.00 %)
567,458
(3.73 %)
320,455
(3.12 %)
3,403,771
(58.38 %)
0
(0 %)
853,323
(14.39 %)
27,791
(1.48 %)
5,805
(0.25 %)
71 capsicum (Zunla-1 2015 refseq)
GCF_000710875.1
57,769
(2.07 %)
n/a 16,114
(0.55 %)
62,579
(2.93 %)
n/a 34.94
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
107,172
(3.23 %)
108,799
(96.77 %)
968,939
(3.15 %)
948,741
(4.39 %)
21,535,213
(46.15 %)
331
(0.03 %)
1,512,422
(5.05 %)
16,685
(0.21 %)
5,036
(0.06 %)
72 carrot
GCF_001625215.1
51,773
(15.95 %)
n/a 16,649
(3.96 %)
50,187
(20.50 %)
n/a 34.79
(91.77 %)
0
(0 %)
26,112
(8.24 %)
4,826
(100.00 %)
179,630
(2.41 %)
166,060
(4.97 %)
1,981,148
(31.51 %)
1,240
(0.20 %)
243,624
(9.01 %)
8,564
(0.85 %)
5,080
(0.52 %)
73 carrot (DH1 2023)
GCF_001625215.2
60,116
(15.29 %)
n/a 16,679
(3.49 %)
51,607
(18.82 %)
n/a 34.97
(99.99 %)
0
(0 %)
554
(0.01 %)
11
(100.00 %)
195,035
(2.33 %)
186,941
(8.11 %)
2,018,050
(39.61 %)
1
(0.00 %)
377,471
(12.12 %)
10,319
(1.14 %)
5,451
(0.55 %)
74 cassava (60444 2018)
GCA_003957885.1
n/a n/a 27,737
(2.70 %)
78,774
(11.79 %)
n/a 37.13
(76.51 %)
0
(0 %)
36,478
(23.50 %)
4,440
(100.00 %)
584,617
(3.41 %)
554,162
(3.52 %)
4,126,060
(43.14 %)
7
(0.00 %)
948,846
(11.29 %)
77,570
(1.78 %)
7,929
(0.25 %)
75 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2
56,386
(9.38 %)
n/a 18,790
(2.86 %)
49,944
(11.73 %)
n/a 37.52
(99.61 %)
672
(0.39 %)
672
(0.39 %)
758
(99.61 %)
377,964
(3.52 %)
356,023
(4.79 %)
2,560,255
(56.85 %)
5
(0.00 %)
693,966
(16.79 %)
52,506
(2.50 %)
5,169
(0.28 %)
76 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1
33,377
(11.52 %)
n/a 13,874
(4.00 %)
33,656
(13.67 %)
n/a 33.84
(96.11 %)
23,305
(3.90 %)
23,313
(3.90 %)
49,406
(96.10 %)
207,850
(3.52 %)
166,467
(10.85 %)
1,676,921
(43.19 %)
41
(0.02 %)
430,309
(7.84 %)
12,838
(2.54 %)
5,339
(1.40 %)
77 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCA_019578655.1
n/a n/a 13,864
(4.31 %)
29,909
(14.27 %)
n/a 33.05
(99.95 %)
0
(0 %)
331
(0.05 %)
146
(100.00 %)
328,084
(38.04 %)
128,377
(6.36 %)
1,992,583
(39.20 %)
0
(0 %)
259,158
(6.25 %)
7,290
(1.00 %)
2,878
(0.37 %)
78 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCF_019578655.1
39,358
(13.36 %)
n/a 13,841
(4.31 %)
29,805
(14.24 %)
n/a 33.03
(99.95 %)
0
(0 %)
331
(0.05 %)
140
(100.00 %)
205,974
(3.02 %)
128,354
(6.37 %)
1,998,066
(39.24 %)
0
(0 %)
259,147
(6.26 %)
7,216
(0.99 %)
2,812
(0.36 %)
79 celery A.graveolens (Ventura 2021)
GCF_009905375.1
89,565
(2.38 %)
n/a 17,560
(0.48 %)
115,390
(5.30 %)
n/a 35.68
(99.73 %)
0
(0 %)
4,633
(0.27 %)
4,854
(100.00 %)
1,247,170
(1.97 %)
1,423,285
(4.75 %)
11,041,078
(71.09 %)
17
(0.00 %)
3,456,467
(14.13 %)
31,562
(0.31 %)
17,869
(0.17 %)
80 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n 2020)
GCA_011386875.1
n/a n/a 3
(0.11 %)
117
(7.42 %)
n/a 39.35
(99.99 %)
0
(0 %)
4
(0.01 %)
35
(100.00 %)
1,139
(3.04 %)
1,677
(4.92 %)
11,074
(10.60 %)
0
(0 %)
3,401
(11.34 %)
76
(1.07 %)
36
(0.43 %)
81 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n Whitten #5841 2020)
GCA_009866685.1
n/a n/a 6,487
(0.16 %)
114,999
(4.12 %)
n/a 37.82
(62.87 %)
490,371
(37.15 %)
490,371
(37.15 %)
1,116,784
(62.85 %)
692,892
(1.67 %)
790,165
(1.22 %)
18,073,193
(31.20 %)
3,963
(0.05 %)
n/a 24,414
(0.46 %)
13,542
(0.37 %)
82 chia eudicots (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1
53,262
(17.46 %)
n/a 17,642
(4.97 %)
49,474
(23.85 %)
n/a 36.14
(99.81 %)
0
(0 %)
3,756
(0.19 %)
1,556
(100.00 %)
156,083
(2.30 %)
128,904
(3.10 %)
2,112,137
(31.93 %)
71
(0.02 %)
137,558
(5.10 %)
31,157
(5.92 %)
23,418
(3.74 %)
83 chickpea
GCF_000331145.1
42,036
(9.83 %)
n/a 15,685
(3.16 %)
30,411
(8.82 %)
n/a 31.04
(90.95 %)
31,897
(9.07 %)
31,897
(9.07 %)
39,024
(90.93 %)
339,564
(10.51 %)
318,439
(11.48 %)
2,929,750
(43.82 %)
304
(0.08 %)
536,078
(8.47 %)
3,488
(0.28 %)
2,503
(0.18 %)
84 chickpea (CDC Frontier Library 1 2024)
GCF_000331145.2
42,320
(9.82 %)
n/a 15,593
(3.16 %)
30,475
(8.82 %)
n/a 31.03
(91.05 %)
0
(0 %)
33,507
(8.98 %)
6,446
(100.00 %)
308,190
(3.39 %)
318,609
(11.50 %)
2,922,065
(43.86 %)
304
(0.07 %)
547,675
(8.64 %)
3,472
(0.28 %)
2,488
(0.18 %)
85 chicory (Punajuju 2022)
GCA_023525715.1
n/a 53,946
(3.98 %)
16,855
(1.17 %)
92,310
(11.34 %)
n/a 35.50
(99.99 %)
0
(0 %)
510
(0.01 %)
208
(100.00 %)
1,976,706
(34.89 %)
781,413
(8.81 %)
6,080,413
(49.06 %)
0
(0 %)
1,295,125
(15.07 %)
51,571
(2.99 %)
23,431
(0.70 %)
86 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2
66,337
(12.31 %)
n/a 15,432
(2.83 %)
67,569
(21.71 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
53
(100.00 %)
275,878
(2.26 %)
229,333
(3.98 %)
2,244,200
(35.17 %)
0
(0 %)
277,187
(7.19 %)
37,317
(4.17 %)
22,646
(1.74 %)
87 Chinese keys (BR_CEBAR01 2022)
GCA_024364735.1
n/a n/a 23,898
(0.89 %)
138,156
(8.52 %)
n/a 40.10
(96.58 %)
25,154
(3.42 %)
25,154
(3.42 %)
35,781
(96.58 %)
829,613
(1.78 %)
1,793,985
(6.94 %)
8,707,237
(62.53 %)
41
(0.01 %)
2,679,318
(12.88 %)
317,707
(8.50 %)
99,451
(2.46 %)
88 Chinese licorice (Kyoto 2023)
GCA_030159175.1
n/a n/a 16,920
(3.67 %)
44,776
(19.51 %)
n/a 37.70
(100.00 %)
0
(0 %)
20
(0.00 %)
89
(100.00 %)
593,642
(17.68 %)
219,391
(21.45 %)
2,088,553
(50.28 %)
0
(0 %)
363,447
(7.14 %)
15,616
(4.58 %)
8,955
(0.79 %)
89 Chinese licorice (manju 2023)
GCA_027886165.1
n/a n/a 16,877
(4.02 %)
43,800
(15.68 %)
n/a 35.67
(99.96 %)
0
(0 %)
1,409
(0.03 %)
6,467
(100.00 %)
582,162
(19.03 %)
193,998
(5.82 %)
2,492,820
(41.31 %)
2
(0.00 %)
245,273
(4.90 %)
18,054
(4.04 %)
9,752
(0.97 %)
90 Chinese medicinal orchid (niu2020 2021)
GCA_019514585.1
n/a n/a 13,666
(0.97 %)
71,763
(9.04 %)
n/a 35.33
(99.97 %)
0
(0 %)
1,170
(0.03 %)
1,621
(100.00 %)
635,445
(2.92 %)
599,600
(4.44 %)
8,101,700
(44.90 %)
0
(0 %)
922,319
(8.76 %)
75,475
(3.56 %)
40,214
(1.34 %)
91 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1
54,029
(12.78 %)
n/a 22,400
(4.38 %)
57,140
(17.42 %)
n/a 37.29
(97.86 %)
24,384
(2.15 %)
24,384
(2.15 %)
26,566
(97.85 %)
368,808
(18.26 %)
218,013
(4.36 %)
2,456,496
(34.15 %)
105
(0.03 %)
322,129
(7.53 %)
18,367
(1.88 %)
11,851
(1.15 %)
92 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1
62,514
(13.83 %)
n/a 22,289
(4.29 %)
57,502
(17.16 %)
n/a 37.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 452
(100.00 %)
290,077
(2.40 %)
209,363
(3.56 %)
2,519,627
(35.77 %)
0
(0 %)
352,108
(8.82 %)
19,299
(1.84 %)
11,854
(1.08 %)
93 clementine
GCF_000493195.1
36,454
(14.29 %)
n/a 14,126
(4.66 %)
32,820
(18.34 %)
n/a 34.96
(97.94 %)
7,564
(2.07 %)
7,564
(2.07 %)
8,962
(97.93 %)
178,443
(2.76 %)
104,853
(5.57 %)
1,933,079
(33.91 %)
29
(0.01 %)
205,572
(6.24 %)
7,930
(3.80 %)
4,793
(0.70 %)
94 climbing nightshade (primary hap 2022)
GCF_947179165.1
44,646
(5.40 %)
n/a 15,784
(1.70 %)
48,875
(7.66 %)
n/a 35.83
(100.00 %)
0
(0 %)
38
(0.00 %)
105
(100.00 %)
347,467
(1.98 %)
290,488
(4.50 %)
6,293,084
(43.53 %)
0
(0 %)
770,795
(8.60 %)
8,929
(0.83 %)
2,434
(0.09 %)
95 club-mosses (2010)
GCF_000143415.4
49,382
(28.03 %)
n/a 11,312
(4.28 %)
36,277
(36.82 %)
n/a 45.22
(98.15 %)
4,395
(1.86 %)
4,395
(1.86 %)
5,152
(98.14 %)
138,958
(36.90 %)
77,054
(2.71 %)
802,227
(32.19 %)
8
(0.01 %)
146,035
(8.10 %)
34,479
(27.80 %)
23,866
(22.56 %)
96 club-mosses (Aurea 2015)
GCA_001021135.1
n/a n/a 6,316
(4.02 %)
55,013
(41.57 %)
n/a 44.70
(99.81 %)
351
(0.00 %)
351
(0.00 %)
106,265
(100.00 %)
29,218
(1.24 %)
29,377
(1.67 %)
480,195
(13.66 %)
1
(0.00 %)
n/a 19,392
(13.60 %)
14,620
(8.38 %)
97 coastal wild rice monocots (Oco-Bangladesh 2023)
GCA_030770085.1
n/a n/a 22,601
(4.02 %)
78,799
(21.93 %)
n/a 42.06
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
450
(100.00 %)
708,554
(36.63 %)
97,691
(2.08 %)
2,711,269
(26.55 %)
0
(0 %)
96,983
(1.91 %)
87,312
(19.47 %)
76,593
(9.96 %)
98 coffee (Caturra red CCC135-36 2018)
GCA_003713225.1
n/a n/a 23,597
(2.02 %)
86,132
(13.38 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
0
(0 %)
690
(0.21 %)
2,832
(100.00 %)
502,137
(2.12 %)
386,196
(3.95 %)
5,651,566
(41.67 %)
0
(0 %)
1,077,930
(15.36 %)
36,395
(1.62 %)
13,206
(0.75 %)
99 coffee (Red Bourbon ID1545 2023)
GCA_030873655.1
n/a n/a 25,435
(1.84 %)
94,196
(12.02 %)
n/a 37.21
(99.99 %)
44
(0.00 %)
197
(0.01 %)
1,794
(100.00 %)
1,591,482
(68.40 %)
423,470
(5.23 %)
6,621,994
(45.23 %)
0
(0 %)
2,486,578
(18.50 %)
49,710
(2.01 %)
6,187
(0.43 %)
100 coffee C.arabica (CCC135-36 2018)
GCF_003713225.1
80,737
(8.03 %)
n/a 23,574
(2.02 %)
85,662
(13.32 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
0
(0 %)
691
(0.21 %)
2,833
(100.00 %)
501,414
(2.11 %)
386,209
(3.95 %)
5,652,743
(41.66 %)
0
(0 %)
1,077,929
(15.36 %)
36,398
(1.62 %)
13,210
(0.76 %)
101 coffee C.arabica (ET-39 2024)
GCF_036785885.1
119,626
(9.97 %)
n/a 25,877
(2.06 %)
97,184
(14.13 %)
n/a 37.50
(100.00 %)
0
(0 %)
107
(0.00 %)
134
(100.00 %)
542,076
(2.06 %)
445,020
(5.76 %)
5,654,970
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,016,107
(15.27 %)
38,607
(3.43 %)
13,717
(0.69 %)
102 coffee C.eugenioides (CCC68of 2018)
GCF_003713205.1
43,829
(7.69 %)
n/a 14,911
(2.02 %)
57,408
(14.42 %)
n/a 36.89
(97.92 %)
0
(0 %)
3,482
(2.08 %)
3,530
(100.00 %)
312,360
(2.09 %)
234,658
(3.24 %)
3,464,594
(38.91 %)
5
(0.00 %)
573,244
(14.34 %)
21,553
(1.54 %)
8,893
(0.82 %)
103 Commerson's wild potato (CGN18024_1 2023)
GCA_029007595.1
n/a n/a 16,068
(2.21 %)
50,780
(10.49 %)
n/a 34.48
(99.99 %)
0
(0 %)
1
(0.01 %)
639
(100.00 %)
1,250,333
(70.08 %)
249,197
(3.97 %)
5,014,592
(38.92 %)
0
(0 %)
534,534
(6.58 %)
6,970
(0.46 %)
1,331
(0.06 %)
104 common bean
GCF_000499845.1
32,720
(9.56 %)
n/a 16,474
(3.53 %)
45,055
(14.46 %)
n/a 34.96
(90.70 %)
40,860
(9.33 %)
40,860
(9.33 %)
41,568
(90.67 %)
233,709
(2.97 %)
208,045
(3.61 %)
2,886,693
(37.28 %)
77
(0.03 %)
225,586
(4.20 %)
38,054
(5.05 %)
10,671
(0.95 %)
105 common cattail (L0001 2021)
GCF_019914945.1
37,046
(18.67 %)
n/a 14,152
(6.13 %)
28,640
(19.48 %)
n/a 37.74
(99.99 %)
0
(0 %)
66
(0.01 %)
76
(100.00 %)
129,836
(2.97 %)
80,188
(2.65 %)
1,248,248
(29.88 %)
0
(0 %)
79,595
(2.91 %)
22,935
(5.83 %)
12,606
(3.10 %)
106 common fig (Dottato GU2019 2019)
GCA_009761775.1
n/a n/a 14,992
(4.28 %)
36,350
(16.84 %)
n/a 34.41
(99.99 %)
394
(0.01 %)
394
(0.01 %)
905
(99.99 %)
475,247
(5.76 %)
230,646
(4.36 %)
2,425,030
(37.74 %)
0
(0 %)
187,932
(6.92 %)
18,611
(3.41 %)
14,658
(2.57 %)
107 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1
49,622
(12.72 %)
n/a 14,929
(3.58 %)
32,981
(12.20 %)
n/a 33.07
(99.99 %)
0
(0 %)
381
(0.01 %)
538
(100.00 %)
525,520
(5.43 %)
225,151
(3.91 %)
2,463,587
(42.86 %)
0
(0 %)
240,039
(5.90 %)
13,018
(1.79 %)
4,271
(0.48 %)
108 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1
49,976
(13.24 %)
n/a 16,949
(3.79 %)
38,488
(13.47 %)
n/a 33.40
(95.35 %)
24,158
(4.67 %)
24,158
(4.67 %)
28,947
(95.33 %)
525,525
(5.37 %)
246,475
(5.25 %)
2,603,240
(38.46 %)
78
(0.04 %)
256,779
(9.85 %)
13,597
(2.11 %)
5,462
(1.04 %)
109 common jujube (Dongzao 2023)
GCF_031755915.1
51,464
(13.54 %)
n/a 14,443
(3.56 %)
31,633
(12.06 %)
n/a 33.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 14
(100.00 %)
516,010
(5.54 %)
234,395
(5.05 %)
2,319,259
(43.64 %)
0
(0 %)
252,407
(6.74 %)
12,926
(2.66 %)
3,943
(0.43 %)
110 common jujube (Junzao 2020)
GCA_001835785.2
n/a n/a 14,443
(3.88 %)
30,773
(12.63 %)
n/a 32.95
(99.91 %)
108
(0.00 %)
222
(0.09 %)
155
(100.00 %)
478,087
(5.53 %)
206,042
(4.15 %)
2,222,289
(41.43 %)
0
(0 %)
200,514
(5.62 %)
11,860
(1.82 %)
3,925
(0.47 %)
111 common reed (primary hap 2023)
GCF_958298935.1
65,051
(8.85 %)
n/a 26,142
(3.49 %)
114,639
(23.87 %)
n/a 44.17
(100.00 %)
0
(0 %)
59
(0.00 %)
37
(100.00 %)
243,799
(1.41 %)
237,530
(2.79 %)
4,477,357
(31.45 %)
2
(0.00 %)
226,760
(3.23 %)
154,087
(19.32 %)
110,558
(9.31 %)
112 common sunflower
GCF_002127325.2
133,319
(3.74 %)
n/a 19,514
(0.59 %)
166,187
(9.16 %)
n/a 38.59
(97.94 %)
0
(0 %)
2,384
(2.06 %)
334
(100.00 %)
1,263,836
(2.20 %)
1,549,598
(4.15 %)
12,728,097
(58.39 %)
0
(0 %)
3,080,461
(20.20 %)
170,287
(2.39 %)
34,569
(0.41 %)
113 common tobacco (Basma Xanthi 2014)
GCA_000715095.1
n/a n/a 29,103
(0.75 %)
200,375
(6.85 %)
n/a 38.98
(95.11 %)
468,375
(4.88 %)
468,375
(4.88 %)
1,111,920
(95.12 %)
1,199,550
(3.27 %)
1,359,905
(4.81 %)
24,590,709
(50.95 %)
400
(0.01 %)
n/a 205,873
(1.79 %)
31,335
(0.28 %)
114 common tobacco (K326 2023)
GCA_000715075.2
n/a n/a 31,039
(0.78 %)
176,804
(6.40 %)
n/a 39.12
(100.00 %)
0
(0 %)
710
(0.00 %)
699
(100.00 %)
4,626,207
(84.12 %)
1,502,920
(6.71 %)
24,314,611
(56.69 %)
8
(0.00 %)
5,064,377
(12.27 %)
225,794
(1.93 %)
9,832
(0.10 %)
115 common tobacco (K326 2023)
GCF_000715075.1
116,106
(3.08 %)
n/a 31,018
(0.77 %)
176,913
(6.40 %)
n/a 39.12
(100.00 %)
0
(0 %)
712
(0.00 %)
701
(100.00 %)
1,205,229
(1.45 %)
1,502,955
(6.71 %)
24,316,152
(56.68 %)
8
(0.00 %)
5,064,388
(12.27 %)
225,863
(1.93 %)
39,109
(0.34 %)
116 common tobacco (TN90 2014)
GCF_000715135.1
100,875
(3.08 %)
n/a 29,968
(0.80 %)
184,998
(7.05 %)
n/a 38.95
(97.11 %)
124,354
(2.89 %)
292,325
(2.90 %)
292,601
(97.11 %)
1,134,202
(3.09 %)
1,268,208
(4.45 %)
24,013,710
(52.08 %)
127
(0.00 %)
2,554,031
(5.85 %)
204,914
(1.84 %)
31,402
(0.30 %)
117 common vetch (South Australia 2022)
GCA_021764765.1
n/a n/a 17,420
(0.99 %)
77,140
(6.43 %)
n/a 35.62
(99.97 %)
0
(0 %)
5,823
(0.04 %)
18
(100.00 %)
708,538
(2.24 %)
719,430
(5.37 %)
8,370,861
(57.87 %)
1
(0.00 %)
1,915,570
(13.64 %)
32,513
(0.96 %)
11,904
(0.30 %)
118 cork oak (v2 HL8 2018)
GCF_002906115.2
53,587
(7.04 %)
n/a 17,804
(1.85 %)
77,741
(13.65 %)
n/a 35.35
(97.95 %)
0
(0 %)
25,649
(2.05 %)
22,642
(100.00 %)
860,049
(3.78 %)
485,854
(6.14 %)
5,989,180
(36.35 %)
218
(0.02 %)
685,954
(9.84 %)
20,674
(1.12 %)
10,386
(0.56 %)
119 cork oak (v3 HL8 2024)
GCF_002906115.3
56,406
(8.63 %)
n/a 16,303
(2.05 %)
63,990
(13.73 %)
n/a 34.91
(95.70 %)
26,066
(4.30 %)
26,066
(4.30 %)
28,407
(95.70 %)
743,470
(3.99 %)
393,077
(5.53 %)
4,897,193
(34.87 %)
234
(0.08 %)
535,347
(10.58 %)
16,140
(0.90 %)
8,912
(0.49 %)
120 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1
112,410
(5.51 %)
n/a 35,047
(1.61 %)
101,814
(6.75 %)
n/a 34.45
(97.16 %)
48,736
(2.84 %)
48,742
(2.84 %)
57,884
(97.16 %)
829,774
(2.69 %)
808,839
(3.64 %)
12,556,104
(52.01 %)
202
(0.01 %)
1,489,112
(8.44 %)
31,946
(0.61 %)
9,983
(0.20 %)
121 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1
154,134
(6.02 %)
n/a 37,839
(1.61 %)
107,764
(6.56 %)
n/a 34.36
(99.87 %)
5,708
(0.13 %)
5,708
(0.13 %)
6,735
(99.87 %)
996,701
(2.36 %)
903,817
(3.56 %)
13,123,355
(54.75 %)
6
(0.00 %)
2,053,660
(12.23 %)
35,220
(0.59 %)
11,349
(0.19 %)
122 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1
72,590
(8.99 %)
n/a 20,368
(2.64 %)
86,941
(18.36 %)
n/a 33.22
(98.25 %)
19,717
(1.76 %)
19,717
(1.76 %)
20,751
(98.24 %)
367,610
(3.53 %)
300,200
(3.32 %)
5,199,574
(40.83 %)
36
(0.01 %)
386,729
(4.92 %)
10,926
(0.55 %)
5,495
(0.26 %)
123 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2
48,588
(10.55 %)
n/a 16,925
(3.30 %)
44,689
(13.01 %)
n/a 32.95
(99.48 %)
0
(0 %)
68
(0.52 %)
676
(100.00 %)
344,688
(3.92 %)
283,941
(8.14 %)
3,091,888
(41.66 %)
1
(0.00 %)
420,714
(7.57 %)
24,507
(2.34 %)
11,817
(1.10 %)
124 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1
49,636
(19.79 %)
n/a 18,863
(6.83 %)
34,588
(19.24 %)
n/a 36.43
(97.43 %)
0
(0 %)
13,813
(2.58 %)
3,500
(100.00 %)
181,838
(3.12 %)
140,936
(7.42 %)
1,550,544
(33.30 %)
519
(0.13 %)
210,153
(7.41 %)
13,714
(2.69 %)
9,612
(1.52 %)
125 cucumber
GCF_000004075.3
37,079
(18.45 %)
n/a 13,349
(5.61 %)
23,889
(15.73 %)
n/a 32.84
(99.98 %)
0
(0 %)
89
(0.02 %)
88
(100.00 %)
158,454
(3.72 %)
77,247
(3.20 %)
1,739,467
(33.72 %)
0
(0 %)
67,519
(3.18 %)
5,730
(1.35 %)
4,446
(0.78 %)
126 cultivated vanilla (Daphna alternate hap 2020)
GCA_016413885.1
n/a 29,180
(3.86 %)
14,128
(1.63 %)
42,460
(7.33 %)
n/a 30.78
(99.98 %)
0
(0 %)
2,018
(0.02 %)
668
(100.00 %)
377,357
(3.69 %)
183,159
(2.82 %)
5,560,199
(36.58 %)
0
(0 %)
236,375
(2.51 %)
30,878
(2.75 %)
24,670
(2.23 %)
127 cultivated vanilla (Daphna primary hap 2020)
GCA_016413895.1
n/a 29,167
(3.89 %)
13,933
(1.63 %)
40,035
(6.93 %)
n/a 30.80
(99.98 %)
0
(0 %)
1,977
(0.02 %)
667
(100.00 %)
373,612
(3.67 %)
181,531
(2.84 %)
5,483,268
(36.45 %)
0
(0 %)
238,255
(2.57 %)
30,829
(2.75 %)
24,652
(2.23 %)
128 currant tomato (LA2093 2020)
GCA_014964335.1
n/a n/a 15,541
(2.01 %)
39,725
(7.40 %)
n/a 34.48
(99.94 %)
0
(0 %)
373
(0.06 %)
127
(100.00 %)
369,651
(3.79 %)
256,146
(4.80 %)
5,523,685
(41.09 %)
1
(0.00 %)
667,017
(7.35 %)
32,203
(2.29 %)
2,428
(0.11 %)
129 damask rose (2016)
GCA_001662545.1
n/a n/a 16,060
(1.87 %)
117,610
(18.87 %)
n/a 38.73
(97.06 %)
101,982
(2.91 %)
101,982
(2.91 %)
409,854
(97.09 %)
329,911
(1.95 %)
258,478
(2.82 %)
3,747,902
(31.42 %)
54
(0.00 %)
n/a 48,987
(3.05 %)
30,432
(1.60 %)
130 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1
61,678
(8.40 %)
n/a 18,582
(2.20 %)
70,121
(14.29 %)
n/a 40.29
(100.00 %)
0
(0 %)
317
(0.00 %)
2,391
(100.00 %)
431,923
(8.92 %)
371,389
(4.19 %)
2,721,501
(44.16 %)
0
(0 %)
589,858
(11.41 %)
89,481
(12.47 %)
43,324
(3.17 %)
131 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1
48,949
(10.55 %)
n/a 16,697
(2.99 %)
64,523
(16.24 %)
n/a 39.33
(91.22 %)
63,065
(8.79 %)
64,723
(8.79 %)
143,382
(91.21 %)
284,003
(7.58 %)
185,641
(2.23 %)
2,574,645
(27.52 %)
1,389
(0.09 %)
103,949
(2.07 %)
62,332
(7.21 %)
34,074
(3.23 %)
132 date-plum (Yz01 2020)
GCF_014633365.1
48,290
(8.05 %)
n/a 15,110
(2.28 %)
57,536
(14.48 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
0
(0 %)
606
(0.01 %)
43
(100.00 %)
445,970
(3.39 %)
319,468
(5.39 %)
3,687,072
(36.31 %)
0
(0 %)
392,987
(6.21 %)
41,402
(3.02 %)
25,722
(1.62 %)
133 desmid P.margaritaceum (SKD-8 2022)
GCA_023375785.1
n/a n/a 6,643
(0.13 %)
342,902
(20.03 %)
n/a 51.10
(86.42 %)
704,233
(13.62 %)
704,233
(13.62 %)
1,037,019
(86.38 %)
4,516,716
(76.58 %)
2,687,996
(21.25 %)
15,150,374
(48.80 %)
39,894
(0.65 %)
n/a 680,776
(31.03 %)
201,505
(3.32 %)
134 dessert banana (baxijiao 2024)
GCF_036884655.1
193,799
(12.81 %)
n/a 52,060
(3.07 %)
144,859
(15.37 %)
n/a 39.78
(99.99 %)
0
(0 %)
219
(0.01 %)
1,085
(100.00 %)
713,274
(2.40 %)
840,280
(6.39 %)
4,419,734
(51.60 %)
2
(0.00 %)
1,727,746
(13.45 %)
203,906
(13.78 %)
99,332
(4.84 %)
135 domesticated barley (Golden Promise 2019)
GCA_902500625.1
n/a n/a 17,386
(0.43 %)
252,520
(9.04 %)
n/a 44.38
(97.83 %)
0
(0 %)
621,008
(2.23 %)
8
(100.00 %)
3,098,901
(53.34 %)
2,055,561
(5.88 %)
14,404,046
(70.52 %)
48,027
(0.70 %)
n/a 706,795
(16.04 %)
267,631
(4.90 %)
136 domesticated barley (H.vulgare 2021 refseq)
GCF_904849725.1
63,364
(1.67 %)
n/a 17,849
(0.43 %)
260,921
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
0
(0 %)
162
(0.03 %)
291
(100.00 %)
2,720,197
(55.13 %)
1,726,335
(5.40 %)
14,010,390
(72.58 %)
0
(0 %)
5,823,234
(14.08 %)
732,834
(17.24 %)
271,782
(4.92 %)
137 durian
GCF_002303985.1
68,467
(10.35 %)
n/a 24,627
(3.34 %)
48,130
(9.41 %)
n/a 32.64
(99.58 %)
0
(0 %)
3,044
(0.43 %)
677
(100.00 %)
490,482
(3.80 %)
509,842
(12.92 %)
4,397,155
(48.22 %)
4
(0.00 %)
1,062,720
(8.92 %)
56,957
(6.23 %)
3,948
(0.21 %)
138 durum wheat (2019)
GCA_900231445.1
n/a 190,472
(0.87 %)
32,523
(0.34 %)
530,488
(8.17 %)
n/a 46.01
(98.73 %)
330,230
(1.28 %)
330,230
(1.28 %)
330,244
(98.72 %)
2,723,974
(3.46 %)
2,746,444
(3.02 %)
330,244
(98.72 %)
106
(0.00 %)
n/a 2,108,395
(25.96 %)
369,452
(2.43 %)
139 durum wheat (PI 192051 2025)
GCA_052818315.1
n/a n/a 32,793
(0.32 %)
569,058
(8.46 %)
n/a 46.13
(100.00 %)
0
(0 %)
801
(0.00 %)
856
(100.00 %)
2,706,273
(1.65 %)
3,201,406
(5.03 %)
30,830,875
(76.90 %)
1
(0.00 %)
n/a 2,152,748
(27.40 %)
567,944
(4.04 %)
140 eggplant (2014)
GCA_000787875.1
n/a n/a 15,481
(1.92 %)
48,974
(7.98 %)
n/a 35.72
(95.30 %)
109,175
(4.75 %)
118,249
(4.75 %)
143,048
(95.25 %)
317,711
(2.21 %)
307,772
(4.55 %)
6,006,653
(38.61 %)
139
(0.00 %)
405,018
(4.41 %)
7,570
(0.50 %)
3,023
(0.14 %)
141 elephant grass (2022)
GCA_022644695.1
n/a n/a 34,754
(1.95 %)
231,748
(22.13 %)
n/a 46.97
(99.99 %)
1,574
(0.01 %)
1,574
(0.01 %)
1,588
(99.99 %)
587,262
(1.41 %)
551,392
(2.62 %)
9,678,348
(46.32 %)
1
(0.00 %)
1,420,820
(7.19 %)
398,884
(36.81 %)
249,949
(10.95 %)
142 emerald green okra A.esculentus (Green Star 2024)
GCA_035048815.1
n/a n/a 57,092
(4.66 %)
139,785
(17.31 %)
n/a 33.78
(99.95 %)
104
(0.05 %)
104
(0.05 %)
182
(99.95 %)
665,897
(3.33 %)
561,368
(7.98 %)
6,809,885
(45.67 %)
6
(0.00 %)
1,164,866
(8.06 %)
31,360
(1.27 %)
20,601
(0.67 %)
143 English oak (primary hap 2022)
GCF_932294415.1
69,211
(8.60 %)
n/a 15,792
(1.92 %)
66,872
(14.31 %)
n/a 35.68
(100.00 %)
0
(0 %)
119
(0.00 %)
96
(100.00 %)
773,652
(4.18 %)
429,695
(8.87 %)
4,823,216
(39.65 %)
0
(0 %)
671,979
(7.81 %)
21,654
(2.15 %)
8,337
(0.38 %)
144 English walnut
GCF_001411555.2
52,962
(10.18 %)
n/a 18,927
(3.19 %)
60,210
(17.37 %)
n/a 36.21
(99.89 %)
0
(0 %)
1,051
(0.11 %)
24,757
(100.00 %)
434,989
(3.86 %)
303,673
(3.70 %)
3,318,114
(33.94 %)
1
(0.00 %)
243,788
(4.94 %)
24,028
(1.83 %)
12,484
(0.84 %)
145 eudicot A.cruentus (Arusha 2021)
GCA_019425755.1
n/a n/a 12,903
(3.20 %)
33,445
(14.99 %)
n/a 33.08
(99.96 %)
0
(0 %)
983
(0.04 %)
625
(100.00 %)
891,822
(54.95 %)
181,416
(3.89 %)
2,376,097
(36.79 %)
0
(0 %)
145,312
(3.92 %)
4,821
(0.53 %)
664
(0.09 %)
146 eudicot A.glutinosa (primary hap 2023)
GCF_958979055.1
42,218
(10.92 %)
n/a 14,784
(3.18 %)
46,293
(16.46 %)
n/a 36.73
(100.00 %)
0
(0 %)
96
(0.00 %)
15
(100.00 %)
433,802
(3.92 %)
270,411
(4.15 %)
2,634,547
(36.26 %)
5
(0.00 %)
320,176
(6.73 %)
29,535
(3.72 %)
14,829
(1.30 %)
147 eudicot A.graveolens (Ventura 2020)
GCA_009905375.1
n/a 1,660
(0.06 %)
17,520
(0.48 %)
115,295
(5.30 %)
n/a 35.68
(99.73 %)
0
(0 %)
4,633
(0.27 %)
4,852
(100.00 %)
1,247,334
(1.96 %)
1,423,238
(4.75 %)
11,040,179
(71.10 %)
17
(0.00 %)
4,171,101
(17.32 %)
31,499
(0.31 %)
17,805
(0.17 %)
148 eudicot C.lanceoleosa (SQ_2022a 2022)
GCA_025200525.1
n/a 54,167
(1.84 %)
21,858
(0.67 %)
153,069
(7.18 %)
n/a 37.63
(99.99 %)
0
(0 %)
2,949
(0.01 %)
790
(100.00 %)
4,031,259
(23.47 %)
2,174,993
(6.70 %)
18,920,250
(54.60 %)
1
(0.00 %)
2,248,121
(7.14 %)
200,005
(3.83 %)
35,786
(0.43 %)
149 eudicot C.lavandulifolium (G1 2022)
GCA_022545495.1
n/a n/a 18,954
(0.61 %)
117,628
(6.04 %)
n/a 36.02
(99.96 %)
0
(0 %)
10,291
(0.04 %)
178
(100.00 %)
2,596,263
(19.70 %)
1,222,904
(3.44 %)
12,327,164
(55.80 %)
1
(0.00 %)
2,936,447
(12.99 %)
67,370
(0.88 %)
12,524
(0.17 %)
150 eudicot C.sativa (Pink pepper KNU-18-1 2023)
GCF_029168945.1
47,822
(7.37 %)
n/a 14,132
(1.76 %)
52,606
(11.89 %)
n/a 34.09
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
18
(100.00 %)
490,095
(3.26 %)
291,432
(3.68 %)
3,197,241
(60.23 %)
0
(0 %)
860,217
(15.10 %)
29,385
(2.13 %)
5,327
(0.25 %)
151 eudicot C.seticuspe (Gojo-0 2021)
GCA_019973895.1
n/a n/a 17,958
(0.52 %)
141,880
(7.25 %)
n/a 36.23
(98.03 %)
37,176
(1.97 %)
37,176
(1.97 %)
45,671
(98.03 %)
3,118,877
(21.04 %)
1,512,311
(3.93 %)
10,481,296
(59.70 %)
29
(0.00 %)
2,398,260
(14.63 %)
63,123
(0.67 %)
7,667
(0.08 %)
152 eudicot D.spatulata (IRGN DVMQU6P362 2024)
GCA_035668315.1
n/a n/a 16,707
(3.49 %)
62,287
(20.90 %)
n/a 37.76
(99.96 %)
1,083
(0.03 %)
1,083
(0.03 %)
24,058
(99.97 %)
274,473
(12.37 %)
110,623
(2.62 %)
2,103,310
(28.32 %)
44
(0.00 %)
51,737
(1.03 %)
22,076
(2.40 %)
14,298
(1.43 %)
153 eudicot E.lathyris (primary hap 2023)
GCF_963576675.1
54,052
(4.78 %)
n/a 14,372
(1.33 %)
80,776
(14.35 %)
n/a 36.88
(100.00 %)
24
(0.00 %)
24
(0.00 %)
57
(100.00 %)
496,928
(2.45 %)
491,703
(4.75 %)
4,850,176
(50.53 %)
0
(0 %)
930,309
(12.08 %)
57,897
(3.26 %)
16,706
(0.73 %)
154 eudicot E.russellianum (2023)
GCA_036186865.1
n/a n/a 18,823
(1.28 %)
96,845
(13.58 %)
n/a 37.91
(99.98 %)
0
(0 %)
26,521
(0.02 %)
100
(100.00 %)
1,526,493
(77.75 %)
539,134
(3.70 %)
6,307,362
(47.97 %)
3,016
(0.08 %)
1,490,109
(16.56 %)
31,022
(0.81 %)
3,764
(0.11 %)
155 eudicot G.bilobum (WA Gb01-03AN 2023)
GCF_033153095.1
45,049
(8.43 %)
n/a 18,010
(3.03 %)
54,840
(15.32 %)
n/a 35.23
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
5,089
(100.00 %)
397,210
(3.11 %)
254,173
(4.10 %)
3,228,435
(42.44 %)
0
(0 %)
390,432
(7.07 %)
15,343
(0.97 %)
7,316
(0.48 %)
156 eudicot H.pumila (YLH828 2023)
GCF_033568475.1
51,602
(5.64 %)
n/a 14,506
(1.52 %)
55,054
(9.40 %)
n/a 37.18
(100.00 %)
0
(0 %)
411
(0.00 %)
133
(100.00 %)
397,610
(2.13 %)
326,774
(3.20 %)
4,120,854
(57.35 %)
2
(0.00 %)
717,826
(10.89 %)
63,233
(2.52 %)
11,505
(0.54 %)
157 eudicot M.micrantha (NLD-2019 2019)
GCA_009363875.1
n/a 46,351
(3.22 %)
19,940
(1.00 %)
96,066
(8.14 %)
n/a 36.20
(99.99 %)
0
(0 %)
1,599
(0.01 %)
2,815
(100.00 %)
908,702
(2.54 %)
980,385
(4.65 %)
9,286,677
(54.99 %)
0
(0 %)
1,406,907
(15.84 %)
89,410
(1.77 %)
30,371
(0.58 %)
158 eudicot N.benthamiana (KLAB 2023)
GCA_034376525.1
n/a n/a 27,772
(0.99 %)
128,971
(6.28 %)
n/a 37.84
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
667
(100.00 %)
4,744,181
(80.09 %)
1,261,453
(5.53 %)
18,063,531
(49.81 %)
0
(0 %)
1,987,721
(7.10 %)
86,419
(1.62 %)
5,110
(0.06 %)
159 eudicot N.caerulescens (Cira 2024)
GCA_046127275.1
n/a n/a 20,205
(8.11 %)
49,304
(30.44 %)
n/a 39.42
(99.99 %)
4
(0.00 %)
41
(0.01 %)
1,181
(100.00 %)
413,962
(43.41 %)
125,005
(11.92 %)
1,047,909
(36.93 %)
0
(0 %)
211,265
(12.17 %)
24,840
(5.52 %)
15,334
(2.33 %)
160 eudicot P.eburnea (SZY01 2022)
GCF_022965805.1
61,645
(7.70 %)
n/a 19,490
(2.24 %)
62,769
(12.34 %)
n/a 37.11
(99.83 %)
0
(0 %)
1,024
(0.17 %)
1,225
(100.00 %)
314,817
(1.84 %)
291,276
(6.35 %)
3,964,714
(53.25 %)
1
(0.00 %)
706,428
(13.41 %)
61,424
(2.69 %)
11,909
(0.61 %)
161 eudicot P.frutescens var. frutescens (PF040 2021)
GCA_019511825.2
n/a 38,941
(3.97 %)
28,418
(2.15 %)
120,101
(15.79 %)
n/a 35.13
(99.99 %)
0
(0 %)
763
(0.01 %)
1,465
(100.00 %)
1,497,762
(21.02 %)
662,726
(4.46 %)
8,218,287
(43.32 %)
1
(0.00 %)
863,856
(8.05 %)
65,299
(2.16 %)
38,244
(1.31 %)
162 eudicot P.huaijiensis (GDHJ02 2020)
GCF_012295235.1
55,830
(12.29 %)
n/a 19,054
(3.86 %)
48,657
(15.27 %)
n/a 35.65
(97.46 %)
0
(0 %)
31,613
(2.54 %)
21,121
(100.00 %)
195,798
(1.99 %)
128,140
(2.47 %)
2,568,483
(41.18 %)
392
(0.07 %)
283,219
(7.80 %)
16,399
(1.28 %)
8,272
(0.72 %)
163 eudicot P.nigra (primary hap 2023)
GCF_951802175.1
55,369
(16.07 %)
n/a 19,591
(4.65 %)
41,748
(16.14 %)
n/a 34.95
(99.99 %)
0
(0 %)
277
(0.01 %)
21
(100.00 %)
256,070
(2.83 %)
178,940
(8.44 %)
2,317,187
(40.87 %)
5
(0.00 %)
309,693
(9.69 %)
3,317
(6.62 %)
1,591
(0.12 %)
164 eudicot P.vulgaris (G19833 2024)
GCF_000499845.2
48,620
(10.29 %)
n/a 16,779
(3.20 %)
47,438
(13.87 %)
n/a 35.62
(98.95 %)
566
(1.05 %)
566
(1.05 %)
1,034
(98.95 %)
245,672
(2.41 %)
239,601
(4.78 %)
2,887,505
(44.41 %)
0
(0 %)
323,051
(6.68 %)
44,689
(7.20 %)
11,348
(1.02 %)
165 eudicot R.rugosa (primary hap 2023)
GCF_958449725.1
62,563
(15.19 %)
n/a 15,236
(3.45 %)
60,387
(23.53 %)
n/a 39.30
(99.95 %)
0
(0 %)
1,014
(0.05 %)
77
(100.00 %)
226,730
(2.23 %)
196,099
(4.12 %)
1,632,269
(33.79 %)
8
(0.00 %)
202,155
(7.85 %)
38,448
(5.69 %)
22,749
(2.22 %)
166 eudicot S.americanum (SP2273 SP2273 2023)
GCA_030463325.1
n/a n/a 15,767
(1.56 %)
57,615
(9.26 %)
n/a 36.15
(100.00 %)
0
(0 %)
214
(0.00 %)
90
(100.00 %)
2,179,570
(59.21 %)
301,263
(3.51 %)
5,651,338
(51.90 %)
0
(0 %)
1,489,004
(15.63 %)
28,868
(1.00 %)
8,877
(0.27 %)
167 eudicot S.americanum (SP2275 SP2275 2023)
GCA_030463385.1
n/a n/a 15,677
(1.56 %)
57,771
(9.32 %)
n/a 36.18
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 540
(100.00 %)
2,161,174
(59.26 %)
298,020
(3.34 %)
5,624,901
(52.02 %)
0
(0 %)
1,470,347
(15.61 %)
29,520
(1.04 %)
9,472
(0.30 %)
168 eudicot S.miltiorrhiza (Shanhuang shh 2023)
GCA_028751815.1
n/a n/a 15,144
(2.60 %)
67,052
(21.48 %)
n/a 37.46
(99.58 %)
0
(0 %)
695
(0.42 %)
171
(100.00 %)
614,263
(17.32 %)
364,006
(5.05 %)
2,679,398
(42.13 %)
0
(0 %)
345,733
(12.00 %)
64,170
(6.16 %)
38,463
(3.35 %)
169 eudicot T.arvense (2022)
GCA_911865555.2
n/a 26,392
(7.18 %)
23,487
(5.55 %)
54,244
(16.93 %)
n/a 38.39
(100.00 %)
0
(0 %)
24
(0.00 %)
964
(100.00 %)
204,363
(1.86 %)
150,149
(5.58 %)
2,245,900
(50.03 %)
0
(0 %)
610,766
(11.85 %)
35,971
(3.77 %)
15,237
(1.56 %)
170 eudicot V.riparia x Vitis rupestris (2022)
GCA_946000675.1
n/a n/a 29,137
(2.81 %)
89,605
(14.72 %)
n/a 35.15
(99.99 %)
102
(0.01 %)
102
(0.01 %)
596
(99.99 %)
664,293
(2.97 %)
503,960
(9.26 %)
5,715,446
(39.21 %)
0
(0 %)
820,251
(7.58 %)
22,264
(1.77 %)
13,165
(0.52 %)
171 eudicot V.rotundifolia (Noble 2022)
GCA_022557335.1
n/a n/a 13,992
(3.39 %)
38,479
(14.93 %)
n/a 33.54
(99.82 %)
17,084
(0.19 %)
17,084
(0.19 %)
17,104
(99.81 %)
696,697
(51.55 %)
178,090
(4.22 %)
2,480,890
(32.65 %)
6,786
(0.70 %)
226,981
(6.44 %)
6,497
(0.70 %)
4,345
(0.46 %)
172 Euphrates poplar (v2 2014)
GCF_000495115.2
56,366
(12.92 %)
n/a 20,853
(4.29 %)
41,483
(12.40 %)
n/a 32.05
(95.31 %)
22,764
(4.70 %)
22,764
(4.70 %)
32,266
(95.30 %)
357,310
(3.64 %)
246,638
(4.06 %)
2,660,781
(43.22 %)
21
(0.01 %)
283,033
(6.42 %)
2,691
(0.38 %)
1,682
(0.12 %)
173 European chestnut (Marrone di Chiusa Pesio 2024)
GCF_040712315.1
49,645
(7.87 %)
n/a 15,653
(2.10 %)
61,041
(13.43 %)
n/a 35.42
(100.00 %)
0
(0 %)
65
(0.00 %)
13
(100.00 %)
595,120
(3.41 %)
355,816
(4.98 %)
4,680,964
(38.07 %)
0
(0 %)
480,528
(5.67 %)
20,075
(1.41 %)
7,608
(0.40 %)
174 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2
77,800
(12.38 %)
n/a 22,539
(3.42 %)
67,761
(16.26 %)
n/a 38.07
(99.99 %)
0
(0 %)
101
(0.01 %)
34
(100.00 %)
309,302
(2.18 %)
331,724
(5.06 %)
2,996,468
(41.19 %)
1
(0.00 %)
501,459
(8.86 %)
25,597
(2.08 %)
15,213
(1.03 %)
175 European hazelnut (Tombul 2020)
GCF_901000735.1
39,203
(13.04 %)
n/a 15,600
(4.11 %)
42,096
(18.23 %)
n/a 35.90
(99.54 %)
0
(0 %)
14,532
(0.48 %)
12
(100.00 %)
358,479
(3.69 %)
179,807
(3.40 %)
2,234,313
(32.05 %)
66
(0.01 %)
338,416
(13.59 %)
12,963
(1.47 %)
9,205
(1.06 %)
176 European hop (primary hap 2023)
GCF_963169125.1
72,613
(2.92 %)
n/a 14,868
(0.56 %)
135,918
(7.87 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
0
(0 %)
129
(0.00 %)
319
(100.00 %)
1,077,704
(2.26 %)
853,368
(5.27 %)
13,477,464
(61.64 %)
0
(0 %)
1,654,055
(7.66 %)
152,063
(4.18 %)
31,956
(0.51 %)
177 European hop (Shinshu Wase 2014)
GCA_000831365.1
n/a n/a 17,158
(0.86 %)
191,202
(13.47 %)
n/a 38.57
(86.69 %)
160,222
(13.33 %)
530,762
(13.34 %)
292,698
(86.67 %)
770,031
(2.12 %)
637,135
(3.75 %)
13,484,203
(41.57 %)
8,594
(0.10 %)
n/a 81,500
(2.36 %)
40,113
(1.30 %)
178 European mistletoe (primary hap 2023)
GCA_963277665.1
n/a n/a 12,110
(0.01 %)
960,545
(1.07 %)
n/a 31.25
(100.00 %)
855
(0.00 %)
6,368
(0.00 %)
5,951
(100.00 %)
61,111,090
(11.87 %)
29,667,857
(2.75 %)
11,464
(100.00 %)
81
(0.00 %)
60,812,395
(6.42 %)
1,680,995
(2.36 %)
239,293
(0.15 %)
179 false flax
GCF_000633955.1
123,030
(22.63 %)
n/a 61,894
(13.77 %)
113,219
(31.09 %)
n/a 36.55
(92.99 %)
568
(0.01 %)
74,428
(7.02 %)
37,780
(99.99 %)
346,267
(2.46 %)
233,837
(5.56 %)
3,452,066
(27.34 %)
8,995
(2.52 %)
326,960
(10.10 %)
32,235
(2.62 %)
20,198
(1.48 %)
180 fava bean (2023)
GCA_948472305.1
n/a 47,586
(0.35 %)
18,459
(0.14 %)
221,591
(2.78 %)
n/a 37.44
(100.00 %)
10
(0.00 %)
5,330
(0.00 %)
3,992
(100.00 %)
4,140,168
(2.97 %)
4,673,353
(13.95 %)
36,694,276
(79.21 %)
23
(0.00 %)
1,288,824
(1.25 %)
59,853
(0.73 %)
27,946
(0.08 %)
181 Fendler's bladderpod (2019)
GCA_900406525.1
n/a n/a 29,791
(9.22 %)
82,813
(26.56 %)
n/a 34.83
(99.51 %)
109,570
(0.49 %)
109,570
(0.49 %)
209,502
(99.51 %)
193,365
(2.63 %)
165,270
(4.54 %)
2,180,278
(29.35 %)
9,235
(0.29 %)
99,774
(2.82 %)
8,339
(0.91 %)
5,475
(0.59 %)
182 Fendler's bladderpod (WCL-YS1 PI 610492 2024)
GCA_036630335.1
n/a n/a 23,679
(9.84 %)
43,179
(26.89 %)
n/a 34.92
(96.38 %)
0
(0 %)
98,816
(3.75 %)
9,891
(100.00 %)
373,519
(23.21 %)
328,539
(16.37 %)
1,720,493
(26.70 %)
149
(0.02 %)
253,434
(11.51 %)
5,729
(0.77 %)
4,009
(0.51 %)
183 ferns C-fern (Hn-n Whitten #5841 2021)
GCA_020310875.1
n/a 75,211
(0.95 %)
9,421
(0.09 %)
135,222
(2.48 %)
n/a 38.64
(99.38 %)
4,604
(0.62 %)
4,604
(0.62 %)
10,776
(99.38 %)
2,992,638
(8.23 %)
4,552,105
(9.86 %)
24,840,439
(73.42 %)
3
(0.00 %)
6,236,111
(7.07 %)
166,309
(1.00 %)
26,330
(0.16 %)
184 field dodder (2020)
GCA_900332095.2
n/a 45,474
(18.20 %)
20,063
(4.21 %)
57,416
(19.19 %)
n/a 35.99
(94.55 %)
29,211
(5.47 %)
29,211
(5.47 %)
36,112
(94.53 %)
448,370
(12.07 %)
208,393
(3.46 %)
2,648,975
(35.75 %)
3,649
(0.58 %)
189,061
(4.55 %)
35,117
(3.87 %)
24,846
(2.66 %)
185 field mustard (Chiifu-401-42 2020)
GCF_000309985.2
73,442
(34.55 %)
n/a 30,193
(10.12 %)
57,010
(25.57 %)
n/a 36.83
(99.39 %)
0
(0 %)
408
(0.61 %)
1,100
(100.00 %)
261,522
(15.13 %)
196,553
(8.43 %)
1,533,242
(38.01 %)
0
(0 %)
376,874
(10.72 %)
24,895
(5.44 %)
14,510
(1.98 %)
186 field pennycress (KM-2021 2021)
GCA_018983045.1
n/a n/a 22,245
(5.38 %)
51,310
(16.10 %)
n/a 39.02
(99.92 %)
0
(0 %)
1,923
(0.08 %)
2,298
(100.00 %)
172,036
(1.52 %)
129,452
(6.55 %)
2,388,667
(53.91 %)
0
(0 %)
804,147
(15.04 %)
37,074
(4.98 %)
14,496
(1.54 %)
187 finger millet (KNE 796-S 2023)
GCA_032690845.1
n/a 48,836
(5.52 %)
31,097
(3.07 %)
140,467
(22.19 %)
n/a 43.87
(99.87 %)
142
(0.13 %)
142
(0.13 %)
674
(99.87 %)
1,168,206
(39.18 %)
229,202
(4.14 %)
4,910,934
(41.23 %)
0
(0 %)
816,546
(6.87 %)
205,561
(17.19 %)
128,841
(9.82 %)
188 finger millet (ML-365 2017)
GCA_002180455.1
n/a n/a 30,000
(2.41 %)
346,692
(27.97 %)
n/a 45.34
(98.74 %)
507,646
(1.30 %)
507,646
(1.30 %)
1,033,269
(98.70 %)
323,234
(1.19 %)
394,943
(6.28 %)
6,129,348
(33.00 %)
116,821
(2.67 %)
n/a 325,103
(21.18 %)
245,703
(14.05 %)
189 flowering dogwood (Cherokee Brave 2023)
GCF_030987335.1
63,465
(6.03 %)
n/a 17,263
(1.31 %)
78,564
(9.37 %)
n/a 35.95
(100.00 %)
96
(0.00 %)
96
(0.00 %)
459
(100.00 %)
982,341
(3.33 %)
719,891
(7.87 %)
6,810,592
(50.46 %)
0
(0 %)
1,484,349
(12.26 %)
27,883
(2.10 %)
14,303
(0.44 %)
190 foxtail millet
GCF_000263155.2
40,951
(13.47 %)
n/a 17,758
(5.07 %)
60,598
(30.59 %)
n/a 46.14
(98.82 %)
6,442
(1.19 %)
6,442
(1.19 %)
6,779
(98.81 %)
115,365
(1.46 %)
116,980
(2.45 %)
1,691,260
(29.31 %)
8
(0.00 %)
160,655
(4.99 %)
78,297
(28.27 %)
56,591
(11.82 %)
191 fried-egg orchid (Lindl 2021)
GCA_019925795.1
n/a 30,041
(2.24 %)
13,889
(0.88 %)
71,188
(7.43 %)
n/a 35.53
(99.95 %)
0
(0 %)
1,481
(0.05 %)
822
(100.00 %)
671,921
(2.91 %)
624,024
(4.46 %)
7,792,634
(47.85 %)
0
(0 %)
780,249
(7.12 %)
76,668
(3.16 %)
34,814
(1.23 %)
192 garden asparagus (2017)
GCF_001876935.1
45,159
(4.02 %)
n/a 13,440
(1.02 %)
85,207
(11.07 %)
n/a 39.02
(97.02 %)
44,390
(2.99 %)
47,391
(2.99 %)
56,182
(97.01 %)
427,496
(2.02 %)
885,946
(8.32 %)
6,075,356
(46.49 %)
46
(0.01 %)
1,014,228
(9.26 %)
111,109
(6.80 %)
35,931
(1.35 %)
193 garden lettuce (Salinas v11 2022)
GCF_002870075.4
69,048
(2.69 %)
n/a 16,407
(0.56 %)
105,654
(5.75 %)
n/a 37.92
(99.95 %)
0
(0 %)
384
(0.05 %)
93
(100.00 %)
1,192,578
(2.37 %)
1,282,344
(4.72 %)
12,843,881
(61.50 %)
2
(0.00 %)
2,596,117
(14.22 %)
160,781
(2.86 %)
21,226
(0.27 %)
194 garden pea (Zhongwan6 2022)
GCF_024323335.1
74,264
(1.88 %)
n/a 17,744
(0.43 %)
129,692
(4.97 %)
n/a 37.94
(99.73 %)
0
(0 %)
826
(0.27 %)
1,566
(100.00 %)
1,517,586
(2.16 %)
1,541,702
(5.89 %)
13,206,825
(66.95 %)
4
(0.00 %)
n/a 105,766
(0.97 %)
9,528
(0.15 %)
195 garlic-fruit tree (guangnan 2023)
GCF_029873635.1
43,473
(2.84 %)
n/a 13,544
(0.88 %)
64,877
(5.24 %)
n/a 36.06
(100.00 %)
0
(0 %)
596
(0.00 %)
510
(100.00 %)
1,556,970
(22.50 %)
788,188
(5.25 %)
10,081,845
(53.72 %)
1
(0.00 %)
1,139,226
(6.25 %)
41,032
(1.09 %)
17,380
(0.48 %)
196 ghaf (Desert tree PC_DT_omini 2023)
GCF_029017545.1
59,652
(8.73 %)
n/a 18,917
(2.55 %)
47,052
(9.22 %)
n/a 32.09
(99.98 %)
0
(0 %)
1,693
(0.02 %)
2,266
(100.00 %)
452,206
(3.00 %)
195,931
(2.27 %)
4,921,469
(39.63 %)
1
(0.00 %)
167,024
(3.12 %)
9,731
(0.69 %)
8,007
(0.51 %)
197 ginger
GCF_018446385.1
127,579
(4.07 %)
n/a 33,995
(0.96 %)
186,756
(7.79 %)
n/a 39.16
(100.00 %)
0
(0 %)
901
(0.00 %)
211
(100.00 %)
1,187,168
(2.18 %)
2,088,683
(6.47 %)
12,917,773
(61.42 %)
1
(0.00 %)
3,992,139
(15.45 %)
398,512
(10.38 %)
143,324
(2.40 %)
198 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2
42,106
(6.72 %)
n/a 15,819
(2.23 %)
49,753
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
5,305
(0.07 %)
310,402
(9.76 %)
13,479
(99.93 %)
394,793
(2.75 %)
364,336
(3.37 %)
4,190,750
(39.49 %)
3,050
(0.15 %)
283,527
(3.56 %)
12,198
(0.64 %)
7,327
(0.39 %)
199 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1
87,385
(2.18 %)
n/a 17,963
(0.44 %)
263,708
(10.29 %)
n/a 46.32
(97.73 %)
0
(0 %)
107,163
(2.27 %)
109,126
(100.00 %)
1,490,873
(15.60 %)
1,415,562
(5.65 %)
12,540,551
(71.59 %)
522
(0.02 %)
5,380,929
(14.74 %)
881,849
(29.81 %)
257,498
(5.22 %)
200 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1
69,195
(1.77 %)
n/a 18,614
(0.43 %)
300,274
(11.28 %)
n/a 46.38
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 68,537
(100.00 %)
1,555,328
(15.65 %)
1,485,488
(4.71 %)
13,133,338
(73.17 %)
0
(0 %)
4,874,338
(13.46 %)
928,327
(30.84 %)
269,584
(5.36 %)
201 goatgrass A.tauschii.strangulata (AL8/78 2024)
GCF_002575655.3
93,689
(2.58 %)
n/a 18,524
(0.46 %)
261,939
(10.44 %)
n/a 46.35
(99.97 %)
0
(0 %)
347
(0.03 %)
1,115
(100.00 %)
1,094,634
(1.42 %)
1,403,604
(6.42 %)
12,367,986
(72.90 %)
9
(0.00 %)
134,619
(0.42 %)
849,453
(31.38 %)
258,839
(5.41 %)
202 goji berry (Lr01 2021)
GCF_019175385.1
69,808
(4.35 %)
n/a 17,353
(1.01 %)
81,347
(7.68 %)
n/a 38.10
(99.95 %)
0
(0 %)
1,565
(0.05 %)
166
(100.00 %)
816,909
(2.29 %)
708,412
(4.09 %)
8,106,901
(53.67 %)
0
(0 %)
1,891,734
(16.01 %)
66,433
(1.82 %)
7,517
(0.15 %)
203 golden kiwifruit (Hongyang 2019)
GCA_009663005.1
n/a n/a 21,161
(2.89 %)
55,843
(11.78 %)
n/a 35.63
(99.99 %)
646
(0.01 %)
646
(0.01 %)
2,366
(99.99 %)
423,518
(2.92 %)
293,299
(3.76 %)
4,466,312
(33.71 %)
0
(0 %)
198,622
(2.97 %)
25,250
(1.74 %)
15,816
(1.02 %)
204 golden kiwifruit (Red5 2018)
GCA_003024255.1
n/a 33,115
(10.82 %)
22,332
(3.88 %)
51,709
(13.62 %)
n/a 35.31
(96.44 %)
0
(0 %)
25,521
(3.57 %)
1,234
(100.00 %)
347,035
(2.87 %)
241,862
(4.11 %)
3,578,217
(30.95 %)
1,207
(0.28 %)
151,895
(5.62 %)
19,259
(1.41 %)
12,861
(0.94 %)
205 grain amaranth (AhG2s 2020)
GCA_000753965.2
n/a n/a 13,698
(3.27 %)
34,546
(14.58 %)
n/a 32.99
(90.06 %)
0
(0 %)
7,031
(9.94 %)
1,567
(100.00 %)
217,772
(3.32 %)
181,251
(3.71 %)
2,391,775
(32.66 %)
19
(0.00 %)
160,684
(4.10 %)
4,425
(0.40 %)
1,763
(0.17 %)
206 great duckweed (2018)
GCA_900492545.1
n/a n/a 10,264
(6.56 %)
16,841
(26.52 %)
n/a 42.27
(99.98 %)
0
(0 %)
84
(0.02 %)
20
(100.00 %)
96,389
(3.49 %)
54,278
(2.54 %)
843,136
(22.61 %)
0
(0 %)
46,685
(3.00 %)
18,978
(24.35 %)
16,615
(11.45 %)
207 great duckweed (9509 2017)
GCA_001981405.1
n/a n/a 10,023
(7.00 %)
16,353
(26.89 %)
n/a 42.30
(92.78 %)
89,257
(7.32 %)
89,257
(7.32 %)
89,277
(92.68 %)
80,787
(2.86 %)
45,432
(1.93 %)
786,155
(19.70 %)
95
(0.04 %)
26,883
(1.77 %)
19,057
(20.99 %)
16,325
(10.84 %)
208 green algae (1602 2018)
GCA_002245835.2
n/a 10,384
(34.00 %)
770
(0.70 %)
5,466
(68.75 %)
n/a 63.95
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 159
(100.00 %)
62,109
(5.65 %)
29,993
(4.25 %)
581,123
(37.15 %)
0
(0 %)
17,475
(3.70 %)
127
(97.30 %)
11,018
(7.36 %)
209 green algae (18125 2025)
GCA_048595725.1
n/a n/a 865
(2.16 %)
3,109
(76.75 %)
n/a 67.78
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 55
(100.00 %)
35,578
(6.99 %)
19,197
(3.61 %)
216,318
(31.95 %)
0
(0 %)
3,119
(1.09 %)
54
(99.88 %)
7
(0.08 %)
210 green algae (211/11P 2022)
GCA_023343905.1
n/a 11,168
(42.76 %)
1,009
(1.60 %)
4,892
(65.40 %)
n/a 61.60
(98.43 %)
12
(1.57 %)
12
(1.57 %)
57
(98.43 %)
48,271
(5.94 %)
22,435
(3.81 %)
358,729
(31.71 %)
0
(0 %)
12,590
(4.35 %)
405
(96.46 %)
9,279
(12.54 %)
211 green algae (ATCC 16529 2021)
GCA_016906385.1
n/a n/a 748
(2.62 %)
2,222
(71.29 %)
n/a 64.15
(97.91 %)
0
(0 %)
6,559
(2.25 %)
19
(100.00 %)
268
(0.10 %)
2,320
(1.18 %)
110,762
(22.64 %)
0
(0 %)
1,898
(0.84 %)
29
(99.25 %)
70
(0.88 %)
212 green algae (CCAP 19/42 2023)
GCA_031753455.1
n/a n/a 1,362
(0.45 %)
15,767
(32.44 %)
n/a 49.19
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 300
(100.00 %)
442,436
(43.24 %)
171,808
(11.44 %)
978,912
(31.81 %)
0
(0 %)
138,366
(4.83 %)
10,820
(2.10 %)
5,333
(0.93 %)
213 green algae (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.4
10,237
(66.85 %)
n/a 988
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
476
(1.14 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
37,284
(8.77 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
10
(0.02 %)
8,269
(2.70 %)
43
(99.34 %)
317
(0.67 %)
214 green algae (HMC1 2018)
GCA_003255715.1
n/a n/a 1,000
(1.89 %)
7,921
(69.96 %)
n/a 62.97
(97.56 %)
0
(0 %)
2,472
(2.45 %)
3,774
(100.00 %)
10,519
(1.96 %)
4,558
(1.31 %)
172,635
(22.08 %)
1,126
(1.31 %)
5,264
(2.71 %)
3,978
(96.84 %)
4,849
(23.61 %)
215 green algae (JCM 15793 2018)
GCA_002897115.2
n/a n/a 1,087
(3.87 %)
3,215
(73.44 %)
n/a 61.27
(98.39 %)
0
(0 %)
10,986
(1.68 %)
46
(100.00 %)
8,982
(1.85 %)
3,745
(0.85 %)
119,487
(14.35 %)
11
(0.02 %)
806
(0.37 %)
79
(99.57 %)
276
(44.19 %)
216 green algae (JCM 9641 2017)
GCA_002794665.1
n/a n/a 928
(3.73 %)
2,196
(76.87 %)
n/a 73.37
(97.42 %)
0
(0 %)
12,055
(2.67 %)
27
(100.00 %)
15,929
(5.38 %)
7,990
(2.29 %)
164,687
(38.62 %)
22
(0.05 %)
971
(0.63 %)
30
(99.90 %)
25
(0.09 %)
217 green algae (KO-2023 2023)
GCA_030272585.1
n/a 85,190
(21.68 %)
1,751
(1.39 %)
15,265
(40.46 %)
n/a 46.07
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 29
(100.00 %)
60,131
(4.76 %)
34,318
(3.34 %)
393,810
(24.33 %)
0
(0 %)
29,057
(5.52 %)
19,071
(23.42 %)
14,844
(12.46 %)
218 green algae (LANL1001 2019)
GCA_006384855.1
n/a n/a 2,016
(0.62 %)
31,585
(41.01 %)
n/a 57.91
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,614
(100.00 %)
183,076
(3.30 %)
101,860
(5.85 %)
972,524
(32.54 %)
0
(0 %)
128,092
(5.45 %)
4,760
(98.23 %)
17,087
(19.73 %)
219 green algae (RCC4221 2014)
GCA_000214015.2
n/a 7,670
(82.78 %)
1,108
(6.57 %)
3,692
(76.52 %)
n/a 59.39
(99.94 %)
0
(0 %)
477
(0.07 %)
20
(100.00 %)
8,604
(3.92 %)
4,944
(2.18 %)
102,578
(28.06 %)
3
(0.01 %)
1,462
(1.35 %)
20
(99.94 %)
0
(0.00 %)
220 green algae (SAG 2063 2018)
GCA_003613005.1
n/a n/a 869
(2.13 %)
9,821
(78.63 %)
n/a 67.62
(98.00 %)
579
(1.95 %)
579
(1.95 %)
7,535
(98.05 %)
35,537
(6.91 %)
19,692
(3.56 %)
218,412
(30.60 %)
1
(0.01 %)
2,387
(0.83 %)
6,958
(98.59 %)
2,763
(17.54 %)
221 green algae (YS-2018 2019)
GCA_004138255.1
n/a n/a 1,365
(1.08 %)
11,070
(58.24 %)
n/a 55.95
(98.44 %)
0
(0 %)
780
(1.56 %)
597
(100.00 %)
25,537
(1.66 %)
27,257
(3.92 %)
365,387
(19.48 %)
2
(0.01 %)
35,173
(4.02 %)
3,732
(86.39 %)
9,364
(18.16 %)
222 green algae A.protothecoides (0710 2014)
GCF_000733215.1
7,014
(37.71 %)
n/a 966
(2.72 %)
2,947
(70.38 %)
n/a 63.54
(95.35 %)
1,012
(4.66 %)
1,012
(4.66 %)
1,386
(95.34 %)
8,655
(1.88 %)
3,803
(1.89 %)
147,537
(20.31 %)
4
(0.02 %)
1,495
(1.63 %)
604
(53.91 %)
7,583
(28.42 %)
223 green algae B.prasinos (RCC1105 2012)
GCF_002220235.1
7,904
(82.34 %)
n/a 1,231
(6.04 %)
4,460
(76.24 %)
n/a 48.02
(99.76 %)
0
(0 %)
20
(0.24 %)
21
(100.00 %)
17,900
(4.88 %)
5,674
(1.75 %)
113,699
(21.91 %)
0
(0 %)
1,171
(0.89 %)
7
(0.01 %)
10
(0.02 %)
224 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1
n/a n/a 1,057
(0.55 %)
9,735
(58.02 %)
n/a 64.03
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 17
(100.00 %)
166,909
(9.00 %)
120,034
(10.13 %)
750,946
(37.60 %)
0
(0 %)
64,728
(6.10 %)
166
(99.31 %)
15,012
(11.67 %)
225 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 refseq)
GCF_000002595.2
19,527
(53.99 %)
n/a 990
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
174,119
(17.13 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
26
(0.03 %)
48,564
(5.08 %)
92
(46.06 %)
15,883
(12.21 %)
226 green algae C.subellipsoidea (C-169 2012)
GCF_000258705.1
9,839
(29.70 %)
n/a 1,307
(1.78 %)
8,108
(53.71 %)
n/a 52.94
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 29
(100.00 %)
8,446
(0.85 %)
5,471
(0.85 %)
265,761
(14.34 %)
0
(0 %)
3,585
(1.15 %)
11,329
(19.64 %)
6,821
(5.93 %)
227 green algae C.variabilis (NC64A 2010 refseq)
GCF_000147415.1
9,780
(32.79 %)
n/a 744
(1.00 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,396
(8.55 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
64,770
(8.22 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
0
(0 %)
6,856
(2.06 %)
756
(45.48 %)
9,593
(9.00 %)
228 green algae K.nitens (NIES-2285 2014)
GCA_000708835.1
n/a 16,374
(32.04 %)
2,471
(1.78 %)
14,771
(54.27 %)
n/a 52.42
(98.98 %)
1,917
(1.02 %)
2,081
(1.02 %)
3,731
(98.98 %)
10,051
(0.46 %)
14,278
(1.14 %)
388,120
(8.55 %)
82
(0.05 %)
6,137
(0.53 %)
8,698
(83.31 %)
13,320
(16.04 %)
229 green algae M.commoda (RCC299 2009)
GCF_000090985.2
10,137
(72.46 %)
10,212
(72.56 %)
1,301
(4.51 %)
5,667
(86.20 %)
n/a 63.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 19
(100.00 %)
14,619
(3.58 %)
8,937
(2.75 %)
178,499
(27.69 %)
0
(0 %)
2,391
(1.08 %)
10
(25.23 %)
9
(0.01 %)
230 green algae M.neglectum (SAG 48.87 2015)
GCF_000611645.1
16,734
(25.96 %)
n/a 666
(0.47 %)
12,122
(60.02 %)
n/a 64.75
(96.59 %)
5,358
(3.43 %)
5,358
(3.43 %)
12,077
(96.57 %)
73,343
(6.73 %)
43,518
(3.04 %)
568,630
(31.80 %)
611
(0.45 %)
8,128
(0.78 %)
7,776
(96.69 %)
18,971
(14.42 %)
231 green algae M.pusilla (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.2
10,242
(66.86 %)
n/a 990
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
476
(1.14 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
36,818
(8.73 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
10
(0.02 %)
8,269
(2.70 %)
32
(47.70 %)
317
(0.67 %)
232 green algae O.lucimarinus (CCE9901 2007)
GCF_000092065.1
7,603
(72.01 %)
n/a 1,064
(6.25 %)
3,493
(72.08 %)
n/a 60.44
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 21
(100.00 %)
11,026
(5.45 %)
11,732
(3.90 %)
107,661
(34.88 %)
0
(0 %)
1,022
(1.03 %)
12
(61.27 %)
2
(0.00 %)
233 green algae O.tauri (RCC4221 2014)
GCF_000214015.3
7,766
(82.33 %)
n/a 1,131
(6.60 %)
3,714
(76.22 %)
n/a 59.21
(99.94 %)
0
(0 %)
477
(0.07 %)
22
(100.00 %)
8,503
(3.84 %)
4,946
(2.16 %)
102,428
(27.87 %)
3
(0.01 %)
1,462
(1.34 %)
16
(57.14 %)
6
(0.02 %)
234 green algae V.carteri (Eve 2010)
GCF_000143455.1
14,333
(21.46 %)
n/a 1,411
(0.77 %)
13,095
(47.93 %)
n/a 55.97
(91.15 %)
10,101
(8.87 %)
12,014
(8.87 %)
11,352
(91.13 %)
175,729
(14.69 %)
105,113
(5.10 %)
667,226
(23.91 %)
10
(0.01 %)
60,616
(5.34 %)
4,325
(42.65 %)
20,517
(13.87 %)
235 green chiretta (2019)
GCF_009805555.1
46,094
(16.56 %)
n/a 14,632
(4.66 %)
34,242
(19.36 %)
n/a 33.53
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 271
(100.00 %)
293,800
(4.64 %)
151,157
(7.38 %)
1,732,880
(41.88 %)
0
(0 %)
175,025
(5.40 %)
21,835
(6.05 %)
15,493
(3.32 %)
236 green foxtail
GCF_005286985.1
47,022
(14.66 %)
n/a 17,750
(5.12 %)
60,106
(30.88 %)
n/a 46.17
(99.85 %)
61
(0.15 %)
61
(0.15 %)
76
(99.85 %)
116,493
(1.51 %)
120,039
(2.72 %)
1,676,017
(29.11 %)
0
(0 %)
157,544
(4.99 %)
75,497
(29.44 %)
55,605
(12.11 %)
237 green foxtail (2024)
GCF_005286985.2
43,377
(14.56 %)
n/a 17,909
(5.15 %)
60,312
(30.80 %)
n/a 46.17
(99.96 %)
14
(0.04 %)
14
(0.04 %)
40
(99.96 %)
117,054
(1.49 %)
121,212
(2.84 %)
1,685,787
(29.32 %)
0
(0 %)
159,497
(5.00 %)
75,777
(29.49 %)
55,702
(12.04 %)
238 green foxtail (ME034v 2020)
GCA_012934335.1
n/a n/a 18,040
(5.19 %)
61,671
(31.38 %)
n/a 45.99
(100.00 %)
54
(0.00 %)
54
(0.00 %)
63
(100.00 %)
105,738
(1.38 %)
87,424
(2.22 %)
1,777,815
(26.85 %)
0
(0 %)
131,241
(3.67 %)
74,932
(30.30 %)
61,081
(13.91 %)
239 guar (PI 68867901 SD 2022)
GCA_026586085.1
n/a n/a 16,149
(3.62 %)
40,368
(13.76 %)
n/a 32.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 627
(100.00 %)
724,179
(25.31 %)
196,353
(10.67 %)
2,757,251
(41.21 %)
0
(0 %)
577,163
(7.64 %)
9,690
(0.94 %)
6,761
(0.65 %)
240 guar (short-day 2024)
GCA_037177725.1
n/a n/a 16,198
(3.33 %)
43,918
(13.95 %)
n/a 33.41
(100.00 %)
0
(0 %)
24
(0.00 %)
237
(100.00 %)
813,394
(29.89 %)
243,439
(13.12 %)
2,549,208
(42.63 %)
0
(0 %)
755,453
(9.28 %)
10,217
(1.78 %)
6,909
(0.59 %)
241 Guinea yam (TDr96_F1 2017)
GCA_002240015.2
n/a n/a 11,944
(2.63 %)
37,372
(13.64 %)
n/a 35.58
(88.95 %)
0
(0 %)
1,032,823
(11.31 %)
21
(100.00 %)
293,868
(3.21 %)
174,614
(3.18 %)
2,690,184
(32.53 %)
1,884
(0.17 %)
180,755
(4.15 %)
15,323
(1.42 %)
8,394
(0.81 %)
242 habanero-type pepper (PI159236 2017)
GCA_002271895.2
n/a 34,974
(1.29 %)
16,562
(0.53 %)
72,911
(2.91 %)
n/a 34.88
(98.35 %)
0
(0 %)
196,261
(1.66 %)
87,978
(100.00 %)
1,136,015
(1.95 %)
1,019,921
(4.33 %)
22,445,162
(47.06 %)
529
(0.02 %)
1,752,629
(5.46 %)
20,737
(0.24 %)
7,465
(0.08 %)
243 hairy vetch (HV-30 2023)
GCF_029867415.1
88,183
(5.03 %)
n/a 22,129
(1.02 %)
118,243
(9.15 %)
n/a 35.63
(99.98 %)
0
(0 %)
3,486
(0.02 %)
1,888
(100.00 %)
1,001,308
(2.63 %)
1,132,664
(5.72 %)
8,340,755
(56.16 %)
24
(0.00 %)
1,749,179
(17.10 %)
43,665
(1.21 %)
15,567
(0.31 %)
244 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1
43,787
(9.63 %)
n/a 17,635
(3.85 %)
66,270
(23.98 %)
n/a 46.87
(98.63 %)
736
(1.37 %)
736
(1.37 %)
1,027
(98.63 %)
157,811
(1.55 %)
119,571
(2.57 %)
2,107,254
(45.30 %)
0
(0 %)
384,333
(11.74 %)
102,278
(32.16 %)
57,387
(11.00 %)
245 Hawaiian beggarticks (Kalapana, Puna primary hap 2024)
GCF_021521415.1
100,198
(3.70 %)
n/a 41,058
(1.06 %)
207,532
(8.30 %)
n/a 37.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 15,833
(100.00 %)
2,024,684
(2.90 %)
1,837,742
(5.29 %)
17,556,257
(56.19 %)
0
(0 %)
2,633,832
(10.88 %)
201,310
(3.34 %)
36,167
(0.41 %)
246 Himalayan balsam (dImpGla2.1 2021)
GCF_907164915.1
40,392
(7.39 %)
n/a 16,711
(2.29 %)
50,292
(11.24 %)
n/a 32.12
(99.95 %)
0
(0 %)
858
(0.05 %)
1,115
(100.00 %)
439,789
(3.56 %)
574,639
(8.97 %)
4,147,814
(47.01 %)
3
(0.00 %)
679,567
(9.30 %)
16,291
(1.13 %)
7,961
(0.43 %)
247 Himalayan yew (Yunnan 2021)
GCA_018340775.1
n/a n/a 11,782
(0.08 %)
129,658
(1.42 %)
n/a 36.91
(99.99 %)
0
(0 %)
11,130
(0.01 %)
150
(100.00 %)
2,861,102
(1.57 %)
2,476,232
(2.57 %)
65,436,741
(53.97 %)
2
(0.00 %)
7,302,742
(6.61 %)
157,149
(0.72 %)
21,849
(0.08 %)
248 horseweed
GCF_010389155.1
39,622
(11.54 %)
n/a 14,718
(3.15 %)
42,194
(16.23 %)
n/a 34.08
(99.99 %)
0
(0 %)
502
(0.01 %)
357
(100.00 %)
267,124
(2.84 %)
155,729
(2.71 %)
2,475,353
(36.48 %)
0
(0 %)
170,084
(5.26 %)
5,205
(0.40 %)
2,461
(0.20 %)
249 Indian licorice
GCF_003935025.1
44,610
(13.60 %)
n/a 17,108
(4.95 %)
34,097
(14.33 %)
n/a 31.84
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
160
(100.00 %)
217,674
(3.40 %)
106,243
(4.04 %)
2,232,509
(38.91 %)
0
(0 %)
136,457
(3.95 %)
5,438
(1.06 %)
4,124
(0.55 %)
250 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 alternate hap 2022)
GCA_023055485.1
n/a n/a 16,184
(2.02 %)
66,215
(14.16 %)
n/a 35.37
(100.00 %)
0
(0 %)
82
(0.00 %)
689
(100.00 %)
739,891
(4.58 %)
435,389
(7.62 %)
4,843,419
(38.03 %)
1
(0.00 %)
573,724
(7.60 %)
13,298
(2.56 %)
7,653
(0.38 %)
251 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 primary hap 2022)
GCA_023055345.1
n/a n/a 15,832
(2.09 %)
63,488
(14.36 %)
n/a 35.19
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
358
(100.00 %)
703,028
(4.29 %)
399,798
(6.48 %)
4,662,881
(36.96 %)
1
(0.00 %)
508,474
(6.86 %)
12,534
(1.92 %)
7,167
(0.36 %)
252 island oak (RSA801373 alternate hap 2023)
GCA_028535165.1
n/a n/a 15,893
(1.97 %)
68,998
(15.27 %)
n/a 35.87
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
156
(100.00 %)
746,424
(4.43 %)
451,117
(7.39 %)
4,820,434
(38.55 %)
0
(0 %)
642,456
(7.81 %)
20,367
(2.62 %)
9,619
(0.45 %)
253 island oak (RSA801373 primary hap 2023)
GCA_028535515.1
n/a n/a 15,880
(1.95 %)
69,093
(15.25 %)
n/a 35.97
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
274
(100.00 %)
751,691
(4.60 %)
457,914
(7.61 %)
4,850,082
(38.95 %)
0
(0 %)
656,668
(8.21 %)
20,561
(3.01 %)
9,683
(0.46 %)
254 J.microcarpa x regia eudicots (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1
50,504
(10.14 %)
n/a 18,451
(3.41 %)
55,094
(16.89 %)
n/a 36.30
(99.18 %)
0
(0 %)
54
(0.82 %)
154
(100.00 %)
411,290
(3.65 %)
260,413
(3.49 %)
3,023,907
(31.93 %)
0
(0 %)
195,435
(3.60 %)
23,270
(1.88 %)
11,316
(0.85 %)
255 Japanese apricot
GCF_000346735.1
32,312
(19.60 %)
n/a 14,463
(6.46 %)
33,049
(23.94 %)
n/a 37.45
(92.82 %)
15,597
(7.20 %)
15,597
(7.20 %)
23,761
(92.80 %)
118,757
(2.25 %)
84,983
(4.53 %)
1,374,244
(23.24 %)
87
(0.15 %)
129,116
(6.07 %)
7,808
(1.87 %)
5,295
(1.28 %)
256 Japanese cedar (2023)
GCF_030272615.1
80,727
(1.01 %)
n/a 14,175
(0.13 %)
225,166
(3.69 %)
n/a 36.42
(99.98 %)
0
(0 %)
3,031
(0.02 %)
2,699
(100.00 %)
2,873,672
(2.01 %)
4,198,037
(4.24 %)
5,730
(99.98 %)
5
(0.00 %)
7,632,920
(8.60 %)
71,102
(1.16 %)
67,733
(1.15 %)
257 Japanese morning glory
GCF_001879475.1
58,979
(8.37 %)
n/a 16,977
(2.14 %)
77,626
(18.21 %)
n/a 37.61
(99.97 %)
0
(0 %)
449
(0.03 %)
3,418
(100.00 %)
641,896
(6.26 %)
639,051
(8.97 %)
3,622,236
(46.63 %)
0
(0 %)
878,090
(12.19 %)
77,860
(10.47 %)
41,089
(3.11 %)
258 Japanese rice (2023)
GCF_034140825.1
55,725
(16.73 %)
n/a 16,338
(4.37 %)
54,077
(25.00 %)
n/a 43.72
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
15
(100.00 %)
196,712
(2.76 %)
141,936
(4.82 %)
1,727,479
(35.05 %)
0
(0 %)
154,436
(5.38 %)
63,894
(25.90 %)
41,819
(6.86 %)
259 Japanese rice (Kitaake 2020)
GCA_009797565.1
n/a 48,428
(16.53 %)
16,562
(4.59 %)
53,878
(24.77 %)
n/a 43.61
(98.95 %)
443
(1.05 %)
474
(1.05 %)
476
(98.95 %)
494,831
(50.75 %)
141,079
(3.52 %)
1,728,936
(33.69 %)
1
(0.00 %)
153,320
(5.62 %)
64,216
(25.20 %)
41,086
(7.31 %)
260 Japanese rice (Nipponbare 2015)
GCF_001433935.1
53,454
(17.22 %)
47,331
(15.87 %)
16,804
(4.69 %)
53,712
(24.95 %)
n/a 43.57
(99.97 %)
0
(0 %)
925
(0.03 %)
58
(100.00 %)
402,182
(39.07 %)
138,035
(3.47 %)
1,719,939
(33.46 %)
4
(0.00 %)
142,261
(5.16 %)
63,485
(25.25 %)
49,534
(9.51 %)
261 jewel orchid monocots (Aro_GA 2025)
GCA_051820535.1
n/a n/a 41,719
(0.73 %)
293,147
(8.18 %)
n/a 39.10
(100.00 %)
0
(0 %)
283
(0.00 %)
3,452
(100.00 %)
3,539,676
(12.83 %)
1,885,641
(6.09 %)
19,476,248
(61.01 %)
1
(0.00 %)
8,155,644
(20.27 %)
583,795
(7.68 %)
158,186
(1.33 %)
262 Joseph's coat eudicots (Red AtriRed21 2022)
GCF_026212465.1
44,756
(10.39 %)
n/a 13,649
(2.41 %)
38,664
(12.08 %)
n/a 31.93
(99.74 %)
0
(0 %)
2,496
(0.26 %)
49
(100.00 %)
270,085
(9.40 %)
247,307
(22.95 %)
2,428,999
(49.81 %)
12
(0.00 %)
797,844
(12.43 %)
5,914
(1.27 %)
1,633
(0.12 %)
263 Korean lawngrass (Nagirizaki 2016)
GCA_001602275.1
n/a n/a 21,051
(6.88 %)
57,023
(32.54 %)
n/a 44.09
(96.75 %)
14,848
(3.26 %)
14,848
(3.26 %)
26,634
(96.74 %)
101,349
(1.46 %)
71,657
(2.17 %)
1,693,252
(21.97 %)
640
(0.13 %)
78,613
(2.03 %)
60,198
(24.06 %)
53,023
(14.28 %)
264 lamb's quarters (primary hap 2023)
GCA_948465745.1
n/a n/a 32,598
(1.94 %)
125,993
(12.58 %)
n/a 36.17
(100.00 %)
0
(0 %)
67
(0.00 %)
158
(100.00 %)
2,407,940
(63.57 %)
996,815
(6.91 %)
7,383,118
(51.29 %)
4
(0.00 %)
1,262,227
(8.49 %)
84,154
(2.40 %)
6,947
(0.15 %)
265 large cranberry (Ben Lear CNJ99-125-1 inbred clone 2014)
GCA_000775335.2
n/a n/a 14,225
(2.70 %)
66,262
(14.87 %)
n/a 37.74
(99.90 %)
1,293
(0.01 %)
1,390
(0.01 %)
201,496
(99.99 %)
201,938
(1.93 %)
136,145
(2.39 %)
2,755,676
(26.83 %)
841
(0.05 %)
n/a 12,815
(1.29 %)
8,740
(0.90 %)
266 least duckweed monocots (lm5633 2022)
GCA_024174645.1
n/a n/a 10,209
(2.40 %)
33,920
(14.90 %)
n/a 39.23
(99.63 %)
0
(0 %)
2,722
(0.38 %)
2,381
(100.00 %)
339,295
(20.82 %)
149,186
(3.14 %)
1,958,662
(44.97 %)
0
(0 %)
154,234
(4.42 %)
37,690
(12.52 %)
21,318
(5.13 %)
267 lemon (UCLL1 2023)
GCA_034663555.1
n/a n/a 27,668
(4.03 %)
72,915
(18.34 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
85
(0.01 %)
136
(0.01 %)
624
(99.99 %)
382,061
(2.62 %)
254,813
(8.31 %)
3,593,274
(41.24 %)
2
(0.00 %)
710,196
(9.84 %)
14,758
(7.59 %)
9,423
(0.56 %)
268 lettuce eudicots (Salinas 2011)
GCA_000227445.1
n/a n/a 15,031
(1.06 %)
140,751
(10.18 %)
n/a 36.82
(99.85 %)
0
(0 %)
n/a 876,110
(100.00 %)
505,796
(3.85 %)
318,171
(2.09 %)
9,808,138
(33.85 %)
0
(0 %)
n/a 30,057
(0.85 %)
16,755
(0.48 %)
269 liverwort (2024)
GCA_039105155.1
n/a 22,778
(17.26 %)
5,119
(1.70 %)
26,429
(24.22 %)
n/a 43.50
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
12
(100.00 %)
178,255
(36.35 %)
53,790
(2.08 %)
834,624
(30.68 %)
0
(0 %)
145,563
(8.78 %)
25,774
(29.87 %)
20,479
(8.79 %)
270 long-grained rice (Zhenshan 97 2020)
GCA_001623345.3
n/a n/a 16,254
(4.30 %)
54,135
(24.00 %)
n/a 43.62
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 13
(100.00 %)
204,282
(2.82 %)
143,681
(3.92 %)
1,729,033
(36.62 %)
0
(0 %)
180,035
(7.08 %)
65,538
(25.47 %)
41,142
(6.62 %)
271 lyrate rockcress
GCF_000004255.2
44,526
(28.52 %)
n/a 25,416
(19.36 %)
34,938
(31.66 %)
n/a 36.08
(88.90 %)
2,950
(11.10 %)
2,950
(11.10 %)
3,646
(88.90 %)
141,441
(20.58 %)
72,583
(3.25 %)
1,012,438
(24.68 %)
6
(0.00 %)
85,990
(5.46 %)
8,053
(2.48 %)
5,275
(1.16 %)
272 macadamia nut
GCF_013358625.1
58,226
(8.43 %)
n/a 16,723
(2.11 %)
62,465
(13.23 %)
n/a 39.13
(98.51 %)
0
(0 %)
22,059
(1.50 %)
2,644
(100.00 %)
463,575
(3.09 %)
304,057
(3.39 %)
4,183,445
(34.36 %)
8
(0.00 %)
364,799
(4.77 %)
18,956
(1.40 %)
5,087
(0.27 %)
273 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot 2015)
GCA_000949345.1
n/a n/a 13,013
(2.26 %)
38,671
(8.42 %)
n/a 33.59
(99.19 %)
123,798
(0.85 %)
123,798
(0.85 %)
203,100
(99.15 %)
329,865
(3.57 %)
244,018
(4.63 %)
3,737,818
(40.09 %)
5,255
(0.16 %)
167,323
(2.37 %)
4,827
(0.29 %)
3,120
(0.19 %)
274 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot FGT_2020_1 2023)
GCA_028651295.1
n/a n/a 12,929
(2.13 %)
34,499
(7.89 %)
n/a 33.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
174
(100.00 %)
560,407
(20.53 %)
306,275
(8.15 %)
3,716,838
(44.45 %)
0
(0 %)
572,203
(7.72 %)
6,827
(0.40 %)
3,596
(0.21 %)
275 Magnolia sinica (HGM2019 2023)
GCF_029962835.1
69,307
(3.21 %)
n/a 14,466
(0.72 %)
84,219
(6.52 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
0
(0 %)
73
(0.00 %)
127
(100.00 %)
1,415,484
(14.07 %)
1,154,832
(6.29 %)
10,231,412
(50.86 %)
0
(0 %)
1,584,398
(7.44 %)
107,342
(2.63 %)
20,756
(0.44 %)
276 maize
GCF_902167145.1
76,701
(3.66 %)
n/a 23,553
(1.55 %)
154,773
(10.70 %)
n/a 46.77
(99.83 %)
10
(0.00 %)
708
(0.17 %)
697
(100.00 %)
1,340,549
(78.65 %)
843,168
(5.20 %)
5,886,498
(69.23 %)
11
(0.00 %)
2,444,910
(17.04 %)
372,641
(31.10 %)
154,423
(5.59 %)
277 maize (2020)
GCA_905067065.1
n/a n/a 23,433
(1.61 %)
150,853
(10.66 %)
n/a 46.83
(98.14 %)
56,163
(1.87 %)
56,163
(1.87 %)
56,173
(98.13 %)
581,502
(1.40 %)
753,129
(3.49 %)
5,867,216
(67.88 %)
107
(0.01 %)
2,413,494
(16.48 %)
377,414
(31.33 %)
151,565
(5.65 %)
278 maize (B104 2021)
GCA_910593975.1
n/a n/a 23,680
(1.58 %)
153,453
(10.69 %)
n/a 46.83
(99.71 %)
22
(0.00 %)
1,223
(0.29 %)
697
(100.00 %)
593,292
(1.41 %)
805,647
(4.47 %)
5,887,178
(69.17 %)
13
(0.00 %)
2,341,058
(16.82 %)
370,755
(32.34 %)
151,573
(5.74 %)
279 maize (B73 2017)
GCA_000005005.6
n/a 131,270
(3.70 %)
23,511
(1.62 %)
151,975
(10.84 %)
n/a 46.87
(98.56 %)
2,522
(1.44 %)
2,523
(1.44 %)
3,128
(98.56 %)
1,308,956
(78.59 %)
771,560
(3.39 %)
5,850,966
(67.94 %)
15
(0.00 %)
2,173,513
(16.77 %)
367,973
(32.21 %)
150,546
(5.55 %)
280 maize (OH43 2020)
GCA_902167015.1
n/a n/a 23,864
(1.57 %)
154,358
(10.67 %)
n/a 46.77
(99.88 %)
20
(0.00 %)
551
(0.12 %)
777
(100.00 %)
1,341,834
(78.70 %)
834,042
(5.01 %)
5,916,520
(69.26 %)
0
(0 %)
2,430,892
(17.02 %)
372,114
(32.08 %)
153,258
(5.50 %)
281 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2
34,262
(16.98 %)
n/a 15,545
(6.13 %)
36,746
(24.10 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
14
(0.00 %)
14
(0.00 %)
74
(100.00 %)
140,519
(2.59 %)
67,337
(3.89 %)
1,493,779
(29.32 %)
0
(0 %)
94,864
(3.66 %)
41,044
(18.43 %)
30,094
(7.78 %)
282 Manchurian ash (Dongfeng_Y6 2025)
GCA_050941835.1
n/a n/a 21,875
(2.60 %)
65,892
(12.45 %)
n/a 34.37
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 23
(100.00 %)
1,378,182
(52.01 %)
240,241
(3.28 %)
5,127,474
(35.91 %)
0
(0 %)
318,538
(4.49 %)
18,208
(1.03 %)
8,293
(0.34 %)
283 mango
GCF_011075055.1
60,349
(16.06 %)
n/a 20,653
(5.13 %)
40,887
(15.20 %)
n/a 32.71
(99.98 %)
0
(0 %)
169
(0.02 %)
250
(100.00 %)
213,445
(3.09 %)
125,929
(3.29 %)
2,447,401
(32.63 %)
0
(0 %)
235,235
(5.50 %)
7,059
(0.98 %)
3,330
(0.31 %)
284 mosses
GCF_000002425.4
55,044
(11.86 %)
n/a 8,425
(1.46 %)
30,452
(12.55 %)
n/a 33.69
(98.74 %)
0
(0 %)
2,645
(1.27 %)
359
(100.00 %)
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(48.35 %)
241,826
(2.56 %)
2,413,326
(52.52 %)
8
(0.00 %)
165,635
(4.02 %)
22,664
(3.06 %)
20,673
(2.66 %)
285 mosses (Gransden 2004 2024)
GCA_000002425.3
n/a n/a 8,471
(1.47 %)
30,401
(12.59 %)
n/a 33.71
(99.04 %)
0
(0 %)
1,792
(0.96 %)
357
(100.00 %)
296,167
(2.79 %)
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(2.68 %)
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(52.64 %)
4
(0.00 %)
168,303
(4.17 %)
22,652
(3.11 %)
20,677
(2.70 %)
286 mosses (MN 2022)
GCA_021442195.1
n/a 45,611
(15.03 %)
8,227
(1.65 %)
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(15.54 %)
n/a 36.47
(99.90 %)
38
(0.10 %)
38
(0.10 %)
74
(99.90 %)
202,616
(2.17 %)
147,367
(3.31 %)
2,577,180
(28.93 %)
0
(0 %)
83,271
(1.71 %)
12,940
(1.51 %)
7,739
(0.88 %)
287 mosses (SZ-1 2022)
GCA_026122775.1
n/a n/a 8,528
(1.45 %)
30,650
(12.43 %)
n/a 33.77
(100.00 %)
0
(0 %)
29
(0.00 %)
26
(100.00 %)
300,802
(2.82 %)
246,537
(2.86 %)
2,464,328
(53.57 %)
0
(0 %)
207,216
(4.76 %)
23,310
(3.24 %)
20,924
(2.78 %)
288 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1
29,893
(12.15 %)
n/a 14,092
(4.40 %)
37,376
(17.73 %)
n/a 34.86
(94.92 %)
15,541
(5.08 %)
15,541
(5.08 %)
46,842
(94.92 %)
317,532
(5.00 %)
190,192
(6.25 %)
2,095,631
(34.49 %)
23
(0.02 %)
174,377
(5.38 %)
20,490
(3.43 %)
14,377
(2.15 %)
289 mung bean (VC1973A 2015 refseq)
GCF_000741045.1
47,653
(11.89 %)
n/a 16,644
(3.87 %)
43,967
(14.67 %)
n/a 33.18
(92.80 %)
0
(0 %)
96,870
(7.24 %)
2,465
(100.00 %)
264,597
(3.31 %)
198,963
(3.34 %)
2,842,720
(34.86 %)
1,607
(0.24 %)
171,020
(3.41 %)
13,975
(1.49 %)
11,070
(1.19 %)
290 muskmelon (AY 2022)
GCF_025177605.1
47,062
(10.58 %)
n/a 13,502
(2.95 %)
32,332
(13.20 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
0
(0 %)
239
(0.01 %)
1,310
(100.00 %)
282,171
(3.23 %)
229,959
(11.70 %)
2,016,709
(43.94 %)
2
(0.00 %)
208,817
(5.97 %)
18,232
(10.96 %)
10,389
(0.88 %)
291 muskmelon (DHL92 2012)
GCF_000313045.1
35,384
(11.55 %)
n/a 13,191
(3.74 %)
28,295
(11.09 %)
n/a 33.23
(89.51 %)
28,289
(10.51 %)
29,172
(10.51 %)
60,751
(89.49 %)
239,295
(7.85 %)
172,598
(3.17 %)
2,304,858
(33.21 %)
2,241
(0.31 %)
65,619
(1.53 %)
12,855
(1.38 %)
8,985
(0.89 %)
292 Nalta jute (JRO-524 2017)
GCA_002141455.1
n/a n/a 15,450
(3.86 %)
57,930
(23.73 %)
n/a 36.82
(99.97 %)
0
(0 %)
n/a 52,373
(100.00 %)
189,007
(2.22 %)
129,697
(4.38 %)
1,872,307
(38.03 %)
0
(0 %)
152,437
(3.44 %)
11,963
(5.74 %)
8,849
(5.43 %)
293 narrow-leaf cattail (Huaian 2025)
GCF_048772165.1
35,080
(19.76 %)
n/a 14,109
(6.33 %)
27,978
(20.09 %)
n/a 37.69
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 15
(100.00 %)
124,433
(3.10 %)
69,868
(2.56 %)
1,208,522
(27.94 %)
0
(0 %)
73,768
(3.39 %)
21,007
(5.28 %)
12,522
(3.24 %)
294 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1
57,263
(9.83 %)
n/a 22,097
(3.53 %)
51,774
(13.22 %)
n/a 33.46
(99.34 %)
41,534
(0.68 %)
44,657
(0.68 %)
55,107
(99.32 %)
280,867
(4.25 %)
210,750
(5.67 %)
3,920,315
(38.10 %)
91
(0.01 %)
317,435
(5.80 %)
6,462
(0.46 %)
4,024
(0.30 %)
295 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1
44,477
(5.41 %)
n/a 16,928
(1.94 %)
77,682
(16.06 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
0
(0 %)
2,037
(0.00 %)
1,289
(100.00 %)
437,997
(2.33 %)
266,149
(5.08 %)
4,764,252
(34.25 %)
0
(0 %)
733,036
(7.03 %)
20,667
(1.81 %)
10,430
(0.52 %)
296 opium poppy
GCF_003573695.1
127,893
(4.57 %)
n/a 25,532
(0.85 %)
162,032
(9.31 %)
n/a 37.28
(99.80 %)
0
(0 %)
31,183
(0.20 %)
34,381
(100.00 %)
819,294
(1.49 %)
1,050,181
(6.80 %)
10,625,631
(55.85 %)
1,258
(0.01 %)
3,892,620
(14.88 %)
67,521
(1.21 %)
8,156
(0.11 %)
297 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2
39,386
(3.85 %)
n/a 12,208
(0.99 %)
72,906
(8.22 %)
n/a 34.70
(96.03 %)
25,751
(3.92 %)
25,751
(3.92 %)
311,841
(96.08 %)
506,361
(2.45 %)
413,770
(3.23 %)
8,074,114
(39.07 %)
30
(0.00 %)
333,128
(2.81 %)
56,900
(2.34 %)
33,146
(1.22 %)
298 orchid P.equestris
GCF_001263595.1
32,146
(3.36 %)
n/a 11,541
(1.01 %)
54,049
(6.11 %)
n/a 34.46
(92.46 %)
98,814
(7.56 %)
98,814
(7.56 %)
188,398
(92.44 %)
487,071
(2.96 %)
511,903
(4.00 %)
7,060,408
(42.20 %)
338
(0.01 %)
299,811
(3.23 %)
31,179
(1.22 %)
24,162
(0.91 %)
299 Pacific Island silvergrass (M001 2021)
GCF_019320115.1
120,534
(4.81 %)
n/a 39,902
(1.95 %)
276,967
(16.36 %)
n/a 45.32
(99.56 %)
0
(0 %)
4,932
(0.44 %)
2,420
(100.00 %)
764,083
(1.38 %)
810,723
(3.95 %)
11,118,925
(53.40 %)
2
(0.00 %)
2,206,875
(9.93 %)
520,091
(23.03 %)
297,537
(8.57 %)
300 papaya
GCF_000150535.2
29,883
(11.99 %)
n/a 12,860
(4.47 %)
24,403
(11.58 %)
n/a 35.31
(73.55 %)
29,719
(26.47 %)
29,719
(26.47 %)
47,485
(73.53 %)
260,082
(34.69 %)
101,644
(3.59 %)
1,640,647
(28.88 %)
27
(0.03 %)
104,755
(2.22 %)
21,200
(2.95 %)
7,379
(0.74 %)
301 papaya (Sunset 2022)
GCA_022788785.1
n/a n/a 13,725
(4.02 %)
25,348
(10.65 %)
n/a 36.01
(99.88 %)
0
(0 %)
337
(0.12 %)
67
(100.00 %)
385,123
(61.33 %)
131,783
(9.99 %)
2,029,883
(43.40 %)
1
(0.00 %)
469,366
(7.44 %)
25,597
(4.44 %)
4,080
(0.53 %)
302 patchouli (Gaoche1L2016 2018)
GCA_003675935.1
n/a n/a 43,905
(2.21 %)
174,920
(14.40 %)
n/a 35.02
(93.97 %)
170,266
(6.06 %)
170,266
(6.06 %)
211,964
(93.94 %)
1,021,699
(2.86 %)
1,125,321
(8.02 %)
9,388,626
(47.60 %)
4,968
(0.09 %)
1,891,289
(7.85 %)
102,661
(4.26 %)
62,606
(3.39 %)
303 patchouli (shipai S1-5 2022)
GCA_023678885.1
n/a n/a 47,432
(2.32 %)
168,583
(12.17 %)
n/a 34.43
(99.98 %)
0
(0 %)
764
(0.02 %)
966
(100.00 %)
2,043,616
(19.48 %)
1,147,892
(9.18 %)
9,501,180
(53.37 %)
2
(0.00 %)
2,151,784
(10.11 %)
110,140
(2.86 %)
61,261
(1.58 %)
304 peach
GCF_000346465.2
36,201
(20.87 %)
n/a 14,368
(6.26 %)
32,245
(24.09 %)
n/a 37.51
(98.79 %)
2,339
(1.22 %)
2,368
(1.22 %)
2,531
(98.78 %)
150,957
(10.06 %)
96,381
(5.52 %)
1,221,263
(28.72 %)
5
(0.00 %)
160,697
(6.34 %)
7,885
(2.07 %)
5,236
(1.25 %)
305 peanut
GCF_003086295.2
155,835
(5.15 %)
n/a 31,810
(1.19 %)
160,574
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
0
(0 %)
3,655
(0.15 %)
385
(100.00 %)
1,684,814
(3.52 %)
1,488,297
(4.81 %)
11,059,688
(62.32 %)
4
(0.00 %)
2,758,605
(13.90 %)
140,570
(2.45 %)
53,465
(0.84 %)
306 peanut (GDAAS-fuhuasheng2018 2019)
GCA_004170445.1
n/a 118,090
(5.15 %)
31,065
(1.17 %)
158,578
(8.79 %)
n/a 36.33
(98.97 %)
0
(0 %)
32,692
(1.04 %)
29
(100.00 %)
1,735,218
(3.66 %)
1,490,806
(4.26 %)
11,072,983
(61.75 %)
46
(0.00 %)
2,848,217
(13.99 %)
138,890
(2.46 %)
53,191
(0.83 %)
307 peanut (Tifrunner 2023)
GCF_003086295.3
173,169
(5.54 %)
n/a 31,897
(1.19 %)
160,532
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
0
(0 %)
3,697
(0.15 %)
443
(100.00 %)
1,676,149
(3.49 %)
1,489,126
(4.81 %)
11,105,477
(62.30 %)
4
(0.00 %)
2,760,250
(13.91 %)
140,609
(2.45 %)
53,473
(0.84 %)
308 pear (primary hap 2023)
GCF_963583255.1
48,939
(13.04 %)
n/a 22,082
(4.44 %)
56,235
(17.69 %)
n/a 37.45
(99.99 %)
145
(0.01 %)
145
(0.01 %)
176
(99.99 %)
289,539
(2.54 %)
223,443
(3.84 %)
2,308,351
(35.91 %)
0
(0 %)
346,323
(9.15 %)
19,559
(2.15 %)
11,607
(1.07 %)
309 pearl millet (Tift 23D2B1-P1-P5 2018)
GCA_002174835.2
n/a n/a 17,949
(1.26 %)
134,829
(14.30 %)
n/a 47.95
(86.95 %)
0
(0 %)
156,852
(13.08 %)
52,033
(100.00 %)
380,858
(1.16 %)
466,997
(2.83 %)
5,117,134
(56.89 %)
67
(0.01 %)
1,301,284
(8.79 %)
380,989
(29.47 %)
133,080
(5.69 %)
310 pearl millet monocots (2023)
GCA_947561735.1
n/a n/a 17,702
(1.12 %)
131,056
(12.62 %)
n/a 49.54
(99.71 %)
154
(0.29 %)
154
(0.29 %)
161
(99.71 %)
2,363,767
(55.11 %)
562,150
(3.01 %)
6,046,063
(67.25 %)
1
(0.00 %)
1,752,801
(12.30 %)
78,069
(17.77 %)
130,183
(6.25 %)
311 pecan
GCF_018687715.1
71,340
(9.93 %)
n/a 18,671
(2.67 %)
60,632
(15.16 %)
n/a 36.30
(99.97 %)
22
(0.03 %)
22
(0.03 %)
39
(99.97 %)
473,853
(3.66 %)
367,846
(6.75 %)
3,301,121
(39.03 %)
0
(0 %)
415,847
(6.45 %)
27,274
(2.22 %)
9,483
(0.57 %)
312 pepperwort (EHA205 2019)
GCA_009757365.2
n/a n/a 19,770
(7.79 %)
48,832
(21.86 %)
n/a 34.40
(96.79 %)
105,378
(3.36 %)
105,378
(3.36 %)
146,054
(96.64 %)
298,974
(31.14 %)
68,767
(2.63 %)
1,422,489
(26.49 %)
22
(0.00 %)
51,628
(2.04 %)
6,844
(1.17 %)
5,500
(0.89 %)
313 perennial ryegrass (Kyuss_39 2021)
GCF_019359855.1
89,789
(3.75 %)
n/a 17,693
(0.79 %)
174,787
(12.15 %)
n/a 44.32
(100.00 %)
0
(0 %)
238
(0.00 %)
1,677
(100.00 %)
605,852
(1.36 %)
760,915
(5.68 %)
5,216,229
(69.24 %)
1
(0.00 %)
3,457,114
(21.97 %)
542,998
(24.23 %)
170,460
(5.85 %)
314 perennial ryegrass (Kyuss_39 2024)
GCF_019359855.2
81,335
(3.75 %)
n/a 17,678
(0.79 %)
172,584
(12.06 %)
n/a 44.29
(100.00 %)
0
(0 %)
61
(0.00 %)
105
(100.00 %)
610,404
(1.37 %)
758,029
(5.51 %)
5,039,192
(69.30 %)
0
(0 %)
n/a 542,208
(23.92 %)
169,813
(5.85 %)
315 Peruvian cotton (G.raimondii 2012 DOE)
GCF_000327365.2
72,518
(8.99 %)
n/a 20,368
(2.64 %)
52,295
(10.15 %)
n/a 33.21
(98.25 %)
19,685
(1.76 %)
19,685
(1.76 %)
20,680
(98.24 %)
404,885
(2.81 %)
300,062
(3.31 %)
5,198,170
(40.84 %)
35
(0.01 %)
386,235
(4.92 %)
10,912
(0.59 %)
5,481
(0.26 %)
316 Peruvian cotton (GPD5lz 2022)
GCF_025698545.1
63,582
(8.69 %)
n/a 20,265
(2.62 %)
51,815
(10.02 %)
n/a 33.24
(100.00 %)
0
(0 %)
79
(0.00 %)
289
(100.00 %)
405,385
(2.83 %)
306,302
(3.81 %)
5,192,105
(41.79 %)
0
(0 %)
459,153
(6.01 %)
10,481
(0.65 %)
5,557
(0.30 %)
317 Phtheirospermum japonicum (okayama 2020)
GCA_014905375.1
n/a 141,963
(2.71 %)
15,868
(1.22 %)
104,104
(13.39 %)
n/a 36.03
(91.65 %)
318,321
(8.39 %)
318,321
(8.39 %)
328,880
(91.61 %)
810,727
(3.49 %)
710,744
(4.84 %)
7,339,863
(41.43 %)
1,919
(0.27 %)
701,331
(6.60 %)
104,967
(3.98 %)
53,512
(2.02 %)
318 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2
46,412
(9.42 %)
n/a 17,396
(3.13 %)
49,710
(12.66 %)
n/a 32.76
(94.18 %)
36,323
(5.83 %)
36,323
(5.83 %)
67,834
(94.17 %)
395,663
(3.40 %)
306,602
(4.71 %)
3,749,364
(39.19 %)
431
(0.18 %)
218,995
(6.80 %)
26,504
(2.90 %)
13,804
(1.15 %)
319 pineapple
GCF_001540865.1
43,025
(11.65 %)
n/a 13,649
(3.36 %)
38,917
(14.95 %)
n/a 38.34
(98.23 %)
0
(0 %)
25,542
(1.78 %)
3,129
(100.00 %)
352,802
(7.31 %)
274,578
(4.75 %)
2,360,455
(38.94 %)
1,024
(0.08 %)
181,776
(4.90 %)
56,724
(11.73 %)
25,940
(3.75 %)
320 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1
37,318
(33.25 %)
n/a 22,836
(23.08 %)
26,822
(33.93 %)
n/a 35.63
(97.53 %)
6,294
(2.49 %)
6,294
(2.49 %)
7,067
(97.51 %)
74,470
(2.42 %)
42,509
(3.39 %)
814,442
(24.99 %)
17
(0.02 %)
72,030
(4.47 %)
5,817
(2.14 %)
4,656
(1.61 %)
321 pistachio
GCF_008641045.1
47,948
(7.92 %)
n/a 18,462
(2.58 %)
62,898
(14.05 %)
n/a 35.95
(99.84 %)
0
(0 %)
16,367
(0.16 %)
1,865
(100.00 %)
363,793
(2.43 %)
253,408
(4.08 %)
4,200,417
(36.34 %)
328
(0.03 %)
912,368
(13.98 %)
22,340
(1.78 %)
7,227
(0.40 %)
322 pocket water lily (Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2
41,223
(10.98 %)
n/a 11,576
(2.50 %)
38,220
(15.70 %)
n/a 38.61
(99.84 %)
624
(0.16 %)
626
(0.16 %)
1,409
(99.84 %)
236,190
(2.95 %)
153,746
(4.02 %)
2,151,579
(26.72 %)
1
(0.00 %)
233,307
(6.34 %)
24,561
(4.48 %)
18,159
(2.45 %)
323 pomegranate
GCF_007655135.1
43,277
(14.87 %)
n/a 14,635
(4.26 %)
39,381
(19.97 %)
n/a 40.38
(99.99 %)
0
(0 %)
188
(0.01 %)
474
(100.00 %)
173,182
(2.28 %)
174,872
(6.81 %)
1,640,973
(32.89 %)
0
(0 %)
305,785
(9.75 %)
26,506
(9.18 %)
19,716
(2.82 %)
324 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1
43,754
(6.67 %)
n/a 16,547
(2.25 %)
54,186
(11.30 %)
n/a 34.71
(88.41 %)
0
(0 %)
37,060
(11.60 %)
17,084
(100.00 %)
321,938
(2.14 %)
250,793
(4.04 %)
5,136,691
(33.92 %)
622
(0.03 %)
635,238
(7.14 %)
8,536
(0.30 %)
2,755
(0.11 %)
325 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1
n/a n/a 16,861
(1.98 %)
58,882
(12.19 %)
n/a 35.40
(99.95 %)
0
(0 %)
4,397
(0.05 %)
3,012
(100.00 %)
774,417
(46.83 %)
392,378
(8.45 %)
5,068,449
(42.72 %)
5
(0.00 %)
683,257
(6.89 %)
14,548
(1.32 %)
5,450
(0.63 %)
326 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1
n/a n/a 17,614
(2.86 %)
45,684
(10.75 %)
n/a 34.49
(83.57 %)
0
(0 %)
10,041,161
(17.84 %)
12
(100.00 %)
606,573
(40.80 %)
168,871
(2.58 %)
5,508,800
(26.36 %)
2,083
(0.22 %)
353,156
(3.75 %)
5,550
(0.22 %)
1,730
(0.08 %)
327 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1
43,158
(7.63 %)
n/a 16,423
(2.55 %)
50,333
(11.79 %)
n/a 34.83
(93.98 %)
45,215
(6.04 %)
45,215
(6.04 %)
60,069
(93.96 %)
662,626
(43.42 %)
212,315
(4.38 %)
4,691,843
(34.91 %)
197
(0.07 %)
495,920
(6.36 %)
9,851
(0.45 %)
2,428
(0.13 %)
328 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1
n/a 38,210
(5.48 %)
16,415
(2.15 %)
54,766
(12.48 %)
n/a 35.21
(99.98 %)
0
(0 %)
1,476
(0.02 %)
25
(100.00 %)
329,233
(2.28 %)
285,101
(5.66 %)
4,832,189
(40.28 %)
7
(0.00 %)
779,042
(9.76 %)
12,944
(0.99 %)
3,186
(0.15 %)
329 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1
n/a 38,661
(5.67 %)
16,694
(2.26 %)
53,990
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
0
(0 %)
1,499
(0.02 %)
28
(100.00 %)
323,447
(2.25 %)
283,098
(5.39 %)
4,727,964
(39.87 %)
9
(0.00 %)
709,848
(9.38 %)
12,316
(1.34 %)
3,210
(0.16 %)
330 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1
n/a 37,965
(5.56 %)
16,713
(2.23 %)
54,380
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
0
(0 %)
1,299
(0.02 %)
27
(100.00 %)
329,807
(2.31 %)
282,372
(6.11 %)
4,718,807
(40.25 %)
6
(0.00 %)
757,191
(9.75 %)
11,812
(1.00 %)
3,132
(0.16 %)
331 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1
n/a 37,999
(5.47 %)
16,640
(2.18 %)
54,937
(12.38 %)
n/a 35.18
(99.98 %)
0
(0 %)
1,383
(0.02 %)
26
(100.00 %)
329,665
(2.30 %)
285,993
(6.03 %)
4,858,802
(40.32 %)
5
(0.00 %)
770,923
(9.65 %)
12,792
(1.32 %)
3,224
(0.15 %)
332 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1
n/a n/a 16,312
(2.05 %)
54,438
(12.18 %)
n/a 35.23
(99.95 %)
0
(0 %)
4,448
(0.05 %)
12
(100.00 %)
730,464
(46.17 %)
338,389
(7.95 %)
4,903,557
(41.90 %)
3
(0.00 %)
602,727
(6.48 %)
12,226
(0.72 %)
3,229
(0.36 %)
333 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1
35,846
(6.75 %)
n/a 16,408
(2.54 %)
48,924
(11.75 %)
n/a 34.59
(99.55 %)
0
(0 %)
1,612
(0.45 %)
1,332
(100.00 %)
297,683
(2.31 %)
234,616
(4.68 %)
4,308,149
(38.02 %)
6
(0.00 %)
555,565
(8.09 %)
8,192
(0.47 %)
2,567
(0.16 %)
334 Primulina tabacum (GXHZ01 2022)
GCF_025594145.1
69,821
(7.75 %)
n/a 19,604
(2.27 %)
61,800
(12.08 %)
n/a 36.89
(99.89 %)
0
(0 %)
1,710
(0.11 %)
541
(100.00 %)
310,321
(1.81 %)
229,404
(3.84 %)
4,409,199
(51.65 %)
4
(0.00 %)
929,563
(14.37 %)
40,094
(1.87 %)
11,101
(0.59 %)
335 proso millet (2018)
GCA_003046395.2
n/a 56,011
(10.30 %)
31,203
(4.33 %)
106,251
(25.92 %)
n/a 46.82
(98.02 %)
0
(0 %)
4,232
(1.98 %)
1,306
(100.00 %)
252,710
(1.48 %)
176,920
(3.16 %)
3,051,223
(41.53 %)
5
(0.00 %)
527,825
(6.53 %)
159,364
(32.38 %)
90,391
(10.54 %)
336 quinoa
GCF_001683475.1
74,918
(7.49 %)
n/a 22,914
(1.61 %)
105,619
(12.97 %)
n/a 36.87
(99.16 %)
0
(0 %)
725
(0.84 %)
3,487
(100.00 %)
810,277
(3.58 %)
762,903
(10.88 %)
6,551,884
(49.49 %)
4
(0.00 %)
1,419,103
(10.00 %)
93,630
(2.98 %)
16,962
(0.42 %)
337 radish (v2 WK10039 2023)
GCF_000801105.2
80,681
(20.53 %)
n/a 36,039
(9.58 %)
74,081
(26.98 %)
n/a 36.00
(99.94 %)
0
(0 %)
2,853
(0.06 %)
6,424
(100.00 %)
224,524
(2.48 %)
193,525
(5.49 %)
2,234,480
(35.04 %)
14
(0.00 %)
283,224
(8.64 %)
25,972
(4.13 %)
19,291
(2.12 %)
338 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1
152,744
(19.27 %)
n/a 57,668
(6.87 %)
143,092
(23.51 %)
n/a 37.13
(99.99 %)
0
(0 %)
840
(0.01 %)
3,167
(100.00 %)
470,302
(2.29 %)
578,281
(9.24 %)
4,662,467
(42.41 %)
1
(0.00 %)
1,025,228
(11.11 %)
64,287
(5.62 %)
37,609
(1.71 %)
339 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2
144,991
(17.51 %)
n/a 59,743
(7.71 %)
146,391
(26.97 %)
n/a 36.47
(92.96 %)
32,639
(7.05 %)
32,639
(7.05 %)
34,110
(92.95 %)
449,257
(2.67 %)
441,269
(5.84 %)
4,867,601
(32.91 %)
89
(0.03 %)
658,497
(14.71 %)
60,082
(3.53 %)
39,673
(1.84 %)
340 red clover eudicots (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1
63,238
(17.01 %)
n/a 17,857
(4.13 %)
43,079
(17.27 %)
n/a 33.71
(99.97 %)
0
(0 %)
231
(0.03 %)
90
(100.00 %)
241,481
(2.65 %)
187,674
(4.85 %)
2,251,582
(37.03 %)
1
(0.00 %)
244,435
(10.76 %)
6,474
(1.93 %)
2,754
(0.26 %)
341 red sage (Shanhuang shh 2023)
GCF_028751815.1
62,715
(12.27 %)
n/a 15,176
(2.61 %)
67,175
(21.50 %)
n/a 37.47
(99.58 %)
0
(0 %)
695
(0.42 %)
173
(100.00 %)
377,231
(3.52 %)
364,027
(5.05 %)
2,679,528
(42.07 %)
0
(0 %)
345,738
(11.98 %)
64,243
(6.17 %)
38,544
(3.36 %)
342 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2
71,160
(1.59 %)
n/a 18,911
(0.39 %)
321,741
(10.16 %)
n/a 45.91
(99.38 %)
0
(0 %)
33,814
(0.62 %)
10,205
(100.00 %)
1,208,165
(1.25 %)
1,319,817
(2.96 %)
15,480,313
(71.93 %)
63
(0.00 %)
4,311,556
(9.89 %)
975,234
(26.52 %)
315,788
(5.36 %)
343 redroot sage (bh2-7 2020)
GCA_016432925.1
n/a n/a 15,208
(2.55 %)
68,573
(21.07 %)
n/a 37.68
(99.37 %)
0
(0 %)
2,815
(0.63 %)
1,118
(100.00 %)
628,541
(17.44 %)
380,078
(5.18 %)
2,710,697
(43.28 %)
3
(0.00 %)
448,238
(11.28 %)
66,987
(6.29 %)
38,723
(3.32 %)
344 Rhododendron vialii eudicots (Sample 1 2023)
GCF_030253575.1
62,168
(11.90 %)
n/a 15,363
(2.73 %)
54,203
(18.86 %)
n/a 39.52
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
18
(100.00 %)
253,965
(2.10 %)
235,379
(9.36 %)
2,668,584
(34.08 %)
0
(0 %)
473,456
(8.03 %)
31,789
(3.72 %)
15,314
(1.18 %)
345 rice bean (VRB3 2023)
GCA_029865625.1
n/a n/a 18,823
(3.07 %)
63,430
(18.52 %)
n/a 34.56
(96.54 %)
0
(0 %)
4,440
(3.46 %)
232
(100.00 %)
1,016,591
(59.80 %)
384,326
(8.33 %)
3,318,479
(40.76 %)
2
(0.00 %)
720,793
(11.00 %)
30,562
(3.41 %)
9,362
(0.63 %)
346 rice bean eudicots (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1
38,736
(11.89 %)
n/a 16,669
(4.18 %)
43,369
(14.64 %)
n/a 32.90
(93.47 %)
0
(0 %)
20,717
(6.53 %)
15,445
(100.00 %)
233,635
(3.33 %)
204,141
(4.85 %)
2,682,022
(32.58 %)
1,663
(0.61 %)
168,485
(17.02 %)
16,828
(2.07 %)
12,921
(1.48 %)
347 riverbank grape
GCF_004353265.1
44,851
(10.22 %)
n/a 15,302
(3.01 %)
46,011
(14.96 %)
n/a 34.32
(98.79 %)
0
(0 %)
1,095
(1.21 %)
175
(100.00 %)
339,984
(3.03 %)
233,259
(4.71 %)
2,925,914
(35.27 %)
0
(0 %)
315,118
(6.27 %)
11,055
(0.93 %)
6,847
(0.55 %)
348 robusta coffee (DH200=94 2014)
GCA_900059795.1
n/a 151,088
(19.99 %)
13,770
(2.74 %)
46,992
(16.51 %)
n/a 36.65
(82.89 %)
12,209
(17.11 %)
12,714
(17.11 %)
25,216
(82.89 %)
219,723
(2.15 %)
140,449
(2.62 %)
2,590,105
(28.19 %)
58
(0.02 %)
240,126
(5.03 %)
12,700
(1.66 %)
6,826
(1.25 %)
349 rose gum (2021)
GCF_016545825.1
54,676
(10.44 %)
n/a 16,291
(2.42 %)
69,492
(17.92 %)
n/a 39.39
(99.97 %)
0
(0 %)
1,712
(0.03 %)
37
(100.00 %)
358,171
(2.83 %)
259,031
(3.65 %)
3,353,128
(29.52 %)
0
(0 %)
415,146
(6.29 %)
78,731
(7.66 %)
52,846
(4.32 %)
350 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1
65,107
(11.08 %)
n/a 16,389
(2.33 %)
74,557
(18.16 %)
n/a 39.28
(92.69 %)
27,773
(7.32 %)
27,773
(7.32 %)
32,724
(92.68 %)
357,835
(2.50 %)
266,806
(3.22 %)
3,496,176
(27.34 %)
26
(0.01 %)
382,719
(5.52 %)
79,393
(6.54 %)
53,321
(3.81 %)
351 rose of Sharon
GCF_006381635.1
91,942
(5.18 %)
n/a 44,363
(2.23 %)
136,768
(10.14 %)
n/a 34.23
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
1,789
(100.00 %)
889,945
(2.72 %)
968,890
(4.91 %)
9,836,479
(51.73 %)
0
(0 %)
1,733,920
(9.74 %)
42,560
(0.89 %)
24,846
(0.50 %)
352 rubber tree (MT/VB/25A 57/8 2023)
GCF_030052815.1
71,258
(4.21 %)
n/a 22,208
(1.24 %)
63,302
(5.13 %)
n/a 34.70
(91.68 %)
0
(0 %)
1,428
(8.32 %)
755
(100.00 %)
1,078,590
(2.96 %)
730,314
(3.70 %)
6,031,831
(65.59 %)
1
(0.00 %)
2,789,876
(17.34 %)
24,263
(0.70 %)
3,609
(0.09 %)
353 rubber tree (reyan7-33-97 2016)
GCF_001654055.1
66,124
(5.23 %)
n/a 22,033
(1.63 %)
59,727
(6.42 %)
n/a 34.84
(94.20 %)
0
(0 %)
40,863
(5.81 %)
7,453
(100.00 %)
827,088
(3.02 %)
565,394
(5.23 %)
5,065,470
(61.59 %)
175
(0.01 %)
1,757,812
(14.15 %)
13,573
(0.45 %)
3,195
(0.09 %)
354 S.splendens huo1 eudicots (BFU 2021)
GCF_004379255.1
94,414
(12.61 %)
n/a 31,218
(3.57 %)
108,219
(21.49 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
471
(0.00 %)
1,178
(100.00 %)
360,314
(2.17 %)
419,051
(4.85 %)
3,875,932
(41.07 %)
0
(0 %)
569,178
(10.09 %)
105,227
(10.14 %)
53,473
(3.53 %)
355 sacred lotus
GCF_000365185.1
43,140
(7.01 %)
n/a 15,920
(2.13 %)
61,231
(13.11 %)
n/a 38.30
(87.98 %)
54,825
(12.04 %)
175,846
(12.06 %)
58,428
(87.96 %)
408,351
(2.83 %)
275,384
(2.52 %)
4,643,876
(30.20 %)
1,786
(0.17 %)
181,461
(2.08 %)
40,599
(2.68 %)
14,757
(0.70 %)
356 saltwater cress
GCF_000478725.1
38,705
(18.07 %)
n/a 21,851
(11.68 %)
39,487
(28.65 %)
n/a 37.71
(98.09 %)
3,020
(1.92 %)
3,020
(1.92 %)
3,658
(98.08 %)
102,162
(1.93 %)
70,755
(3.25 %)
1,162,538
(32.09 %)
12
(0.00 %)
173,482
(8.35 %)
15,272
(3.87 %)
8,448
(1.72 %)
357 sandblossoms (Phelan CA IGA184 alternate hap 2022)
GCA_023055565.1
n/a n/a 14,138
(0.74 %)
125,370
(12.27 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
581
(100.00 %)
655,331
(1.73 %)
500,899
(4.88 %)
7,172,490
(54.24 %)
0
(0 %)
1,964,428
(14.05 %)
140,800
(5.87 %)
37,685
(0.83 %)
358 sandblossoms (Phelan CA IGA184 primary hap 2022)
GCA_023055425.1
n/a n/a 15,588
(0.93 %)
117,831
(12.94 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
0
(0 %)
85
(0.00 %)
123
(100.00 %)
597,532
(1.81 %)
430,194
(3.80 %)
6,075,115
(49.91 %)
0
(0 %)
1,442,089
(12.90 %)
129,512
(5.41 %)
37,172
(1.01 %)
359 scarlet sage (huo1 2021)
GCF_004379255.2
94,251
(12.60 %)
n/a 31,266
(3.58 %)
108,141
(21.47 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
0
(0 %)
471
(0.00 %)
1,162
(100.00 %)
357,482
(2.10 %)
419,009
(4.86 %)
3,874,047
(41.08 %)
0
(0 %)
569,081
(10.09 %)
105,216
(10.11 %)
53,473
(3.50 %)
360 scented satinash
GCF_900635055.1
42,531
(12.21 %)
n/a 15,353
(3.67 %)
53,811
(20.61 %)
n/a 40.64
(89.65 %)
0
(0 %)
11,862
(10.35 %)
19,039
(100.00 %)
179,421
(2.10 %)
174,902
(3.34 %)
1,785,894
(25.35 %)
754
(0.12 %)
147,815
(3.18 %)
55,685
(7.69 %)
32,621
(3.67 %)
361 sesame
GCF_000512975.1
38,693
(16.95 %)
n/a 15,555
(5.41 %)
35,316
(19.66 %)
n/a 35.00
(98.34 %)
9,940
(1.66 %)
9,940
(1.66 %)
26,176
(98.34 %)
161,123
(2.85 %)
79,750
(3.97 %)
1,807,029
(31.02 %)
30
(0.02 %)
138,850
(4.01 %)
9,873
(1.80 %)
8,633
(1.51 %)
362 shrubby jointvetch A. evenia (CIAT22838 2020)
GCA_013621005.1
n/a n/a 16,242
(4.30 %)
39,583
(17.06 %)
n/a 35.22
(98.66 %)
0
(0 %)
2,946
(1.35 %)
1,451
(100.00 %)
253,228
(3.98 %)
186,657
(9.89 %)
1,792,662
(45.14 %)
3
(0.00 %)
432,106
(10.05 %)
19,928
(3.29 %)
10,449
(1.27 %)
363 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1
46,475
(12.62 %)
n/a 17,469
(4.11 %)
51,531
(21.75 %)
n/a 40.30
(93.72 %)
0
(0 %)
7,529
(6.28 %)
15,781
(100.00 %)
194,855
(2.07 %)
116,828
(2.25 %)
1,801,472
(25.38 %)
688
(0.10 %)
103,430
(2.38 %)
44,191
(5.74 %)
32,233
(3.75 %)
364 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1
43,419
(12.78 %)
n/a 14,758
(4.01 %)
41,180
(19.74 %)
n/a 40.38
(100.00 %)
0
(0 %)
36
(0.00 %)
75
(100.00 %)
160,749
(1.91 %)
114,741
(3.07 %)
1,619,569
(28.25 %)
0
(0 %)
213,237
(6.51 %)
43,290
(7.15 %)
31,834
(4.39 %)
365 silver poplar
GCF_005239225.1
53,066
(14.64 %)
n/a 20,299
(4.74 %)
44,556
(16.36 %)
n/a 33.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,287
(100.00 %)
309,097
(3.34 %)
175,288
(4.77 %)
2,457,634
(38.38 %)
0
(0 %)
273,621
(6.75 %)
4,613
(0.67 %)
2,159
(0.21 %)
366 silverweed cinquefoil (primary hap 2022)
GCF_933775445.1
28,734
(15.21 %)
n/a 13,143
(5.29 %)
32,007
(22.39 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
147
(100.00 %)
89,958
(1.86 %)
351,649
(15.29 %)
884,646
(35.58 %)
1
(0.00 %)
145,999
(6.99 %)
14,711
(4.52 %)
10,781
(1.93 %)
367 sorghum (BTx623 2017)
GCF_000003195.3
48,290
(8.57 %)
n/a 17,901
(3.45 %)
73,969
(19.64 %)
n/a 43.88
(95.30 %)
3,906
(4.70 %)
3,906
(4.70 %)
4,775
(95.30 %)
556,607
(65.39 %)
177,271
(4.54 %)
2,371,199
(48.20 %)
8
(0.00 %)
681,841
(11.76 %)
110,115
(18.82 %)
53,717
(5.80 %)
368 sorghum (Tx430 2018)
GCA_003482435.1
n/a n/a 18,138
(3.63 %)
75,180
(20.67 %)
n/a 43.67
(97.96 %)
0
(0 %)
2,108
(2.04 %)
308
(100.00 %)
559,950
(63.17 %)
156,952
(3.01 %)
2,481,716
(46.70 %)
0
(0 %)
578,722
(10.40 %)
109,923
(19.06 %)
54,889
(6.80 %)
369 soybean (EMBRAPA BRS 537 2021)
GCA_012273815.2
n/a 88,253
(9.67 %)
27,746
(3.01 %)
77,617
(11.66 %)
n/a 34.80
(97.95 %)
0
(0 %)
340
(2.05 %)
95
(100.00 %)
1,182,211
(56.35 %)
444,701
(6.81 %)
5,365,860
(45.98 %)
0
(0 %)
724,080
(6.80 %)
35,684
(1.48 %)
10,676
(0.46 %)
370 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6
88,006
(9.87 %)
n/a 27,705
(3.08 %)
77,033
(11.88 %)
n/a 34.74
(97.36 %)
8,916
(2.65 %)
8,918
(2.65 %)
9,199
(97.35 %)
848,398
(38.02 %)
434,042
(5.29 %)
5,346,884
(45.07 %)
27
(0.00 %)
622,402
(6.12 %)
35,893
(1.55 %)
13,146
(0.57 %)
371 soybean (Williams 82 2023)
GCA_030864155.1
n/a n/a 27,960
(2.93 %)
77,762
(11.36 %)
n/a 35.02
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 20
(100.00 %)
549,577
(2.73 %)
453,208
(9.60 %)
5,325,393
(48.31 %)
0
(0 %)
864,597
(7.83 %)
36,641
(1.53 %)
13,322
(0.59 %)
372 spider flower
GCF_000463585.1
45,524
(22.00 %)
n/a 21,103
(10.40 %)
38,184
(27.17 %)
n/a 39.40
(87.71 %)
24,824
(12.32 %)
24,824
(12.32 %)
37,073
(87.68 %)
144,827
(3.22 %)
103,970
(4.10 %)
1,118,840
(31.64 %)
50
(0.05 %)
164,935
(7.42 %)
29,313
(6.47 %)
16,566
(3.30 %)
373 spinach (Sp75 2017)
GCF_002007265.1
41,411
(5.75 %)
n/a 12,540
(1.38 %)
68,522
(12.26 %)
n/a 37.82
(95.53 %)
0
(0 %)
137,086
(4.48 %)
78,263
(100.00 %)
374,336
(2.48 %)
670,331
(6.78 %)
3,213,561
(52.82 %)
65,364
(1.04 %)
758,332
(10.61 %)
89,520
(4.54 %)
17,491
(0.71 %)
374 spinach (Varoflay 2021)
GCF_020520425.1
58,433
(7.11 %)
n/a 12,431
(1.27 %)
61,084
(11.35 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
0
(0 %)
63
(0.00 %)
246
(100.00 %)
378,521
(2.27 %)
722,814
(6.29 %)
2,950,586
(58.17 %)
0
(0 %)
972,333
(15.38 %)
92,256
(5.21 %)
18,749
(0.72 %)
375 spotted monkey flower
GCF_000504015.1
34,441
(15.56 %)
n/a 14,508
(4.41 %)
34,904
(18.83 %)
n/a 35.50
(93.50 %)
15,528
(6.52 %)
15,528
(6.52 %)
17,740
(93.48 %)
227,143
(4.28 %)
204,234
(11.85 %)
1,776,879
(40.60 %)
19
(0.01 %)
338,940
(10.42 %)
21,718
(3.89 %)
14,899
(2.46 %)
376 spreading earthmoss (2024)
GCF_000002425.5
52,765
(10.63 %)
n/a 8,496
(1.48 %)
30,423
(12.59 %)
n/a 33.71
(99.04 %)
0
(0 %)
1,794
(0.96 %)
359
(100.00 %)
293,130
(2.79 %)
242,633
(2.68 %)
2,405,680
(52.61 %)
4
(0.00 %)
168,306
(4.17 %)
22,672
(3.11 %)
20,700
(2.71 %)
377 stiff brome
GCF_000005505.3
47,531
(20.35 %)
n/a 15,530
(6.01 %)
45,735
(34.29 %)
n/a 46.40
(99.84 %)
25
(0.16 %)
27
(0.16 %)
36
(99.84 %)
108,976
(17.41 %)
54,391
(1.94 %)
1,197,052
(21.34 %)
0
(0 %)
71,157
(2.72 %)
48,209
(34.43 %)
42,088
(12.51 %)
378 strawberry (Benihoppe 2023)
GCA_034370585.1
n/a n/a 45,858
(5.68 %)
123,100
(24.81 %)
n/a 39.34
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28
(100.00 %)
934,221
(35.80 %)
376,936
(6.46 %)
3,304,328
(31.01 %)
0
(0 %)
428,062
(6.06 %)
69,530
(5.73 %)
39,124
(2.30 %)
379 strawberry (Reikou 2013)
GCA_000511835.1
n/a n/a 15,045
(1.35 %)
164,045
(15.16 %)
n/a 38.82
(94.24 %)
88,316
(5.63 %)
89,898
(5.63 %)
714,282
(94.37 %)
278,640
(1.91 %)
388,660
(6.94 %)
3,639,568
(28.92 %)
271
(0.01 %)
n/a 64,180
(3.80 %)
21,117
(1.05 %)
380 sugarcane (2018)
GCA_900465005.1
n/a n/a 18,847
(4.51 %)
76,529
(27.07 %)
n/a 45.11
(99.96 %)
1,423
(0.03 %)
1,423
(0.03 %)
7,128
(99.97 %)
258,594
(29.31 %)
144,716
(2.51 %)
1,976,510
(35.41 %)
436
(0.05 %)
268,312
(8.56 %)
113,324
(26.96 %)
87,385
(13.10 %)
381 sugarcane (CC_01_1940 2021)
GCA_020102875.1
n/a n/a 25,299
(3.45 %)
146,261
(29.51 %)
n/a 45.01
(99.92 %)
36
(0.00 %)
7,046
(0.08 %)
35,074
(100.00 %)
302,307
(1.66 %)
272,248
(3.71 %)
4,068,281
(29.60 %)
3
(0.00 %)
439,969
(6.05 %)
204,656
(25.44 %)
162,729
(13.61 %)
382 sugarcane (SP80-3280 WGSA1 2019)
GCA_008692665.1
n/a n/a 78,903
(2.31 %)
756,432
(27.56 %)
n/a 43.71
(99.98 %)
36
(0.00 %)
36
(0.00 %)
398,389
(100.00 %)
1,981,854
(25.32 %)
926,250
(3.55 %)
15,903,748
(41.06 %)
0
(0 %)
n/a 829,054
(16.97 %)
583,556
(9.83 %)
383 sweet cherry
GCF_002207925.1
39,968
(19.06 %)
n/a 15,007
(5.83 %)
38,107
(23.61 %)
n/a 37.72
(90.64 %)
0
(0 %)
22,628
(9.39 %)
10,148
(100.00 %)
136,700
(2.47 %)
104,376
(7.20 %)
1,484,591
(25.20 %)
40
(0.03 %)
225,280
(8.38 %)
9,956
(2.27 %)
6,378
(1.39 %)
384 sweet cherry (Tieton 2020)
GCA_014155035.1
n/a n/a 15,140
(4.31 %)
39,977
(20.09 %)
n/a 38.44
(99.98 %)
0
(0 %)
2,194
(0.02 %)
61
(100.00 %)
189,726
(2.51 %)
150,018
(21.96 %)
1,231,274
(44.86 %)
0
(0 %)
701,846
(16.32 %)
12,897
(3.14 %)
6,700
(0.94 %)
385 sweet orange
GCF_000317415.1
46,820
(15.94 %)
n/a 14,390
(4.63 %)
34,480
(18.04 %)
n/a 34.07
(91.90 %)
12,539
(8.11 %)
12,539
(8.11 %)
17,383
(91.89 %)
185,212
(2.95 %)
104,182
(4.92 %)
2,119,183
(29.53 %)
106
(0.11 %)
143,275
(8.59 %)
6,540
(0.93 %)
4,953
(0.65 %)
386 sweet potato (Taizhong6 2017)
GCA_002525835.2
n/a n/a 23,319
(2.45 %)
98,107
(18.19 %)
n/a 35.14
(88.01 %)
0
(0 %)
171,925
(12.06 %)
28,461
(100.00 %)
579,745
(3.87 %)
473,175
(3.79 %)
4,850,126
(32.44 %)
96
(0.01 %)
493,077
(6.15 %)
52,715
(3.15 %)
42,259
(2.50 %)
387 sweet wormwood (Huhao1# 2018)
GCA_003112345.1
n/a 66,918
(4.98 %)
22,279
(1.15 %)
121,694
(10.54 %)
n/a 35.34
(91.81 %)
275,164
(8.22 %)
275,710
(8.22 %)
314,564
(91.78 %)
856,470
(2.64 %)
970,252
(5.69 %)
7,570,175
(42.39 %)
33,170
(1.01 %)
1,556,972
(12.95 %)
29,072
(0.54 %)
6,559
(0.13 %)
388 switchgrass
GCF_016808335.1
114,876
(10.54 %)
n/a 31,534
(3.21 %)
152,844
(27.54 %)
n/a 46.79
(99.59 %)
464
(0.41 %)
464
(0.41 %)
1,091
(99.59 %)
395,905
(1.77 %)
323,173
(5.10 %)
4,922,182
(39.47 %)
0
(0 %)
921,472
(10.02 %)
213,249
(32.45 %)
151,346
(11.21 %)
389 Tartarian buckwheat (Pinku1 2017)
GCA_002319775.1
n/a n/a 15,605
(2.84 %)
50,437
(14.57 %)
n/a 38.53
(96.71 %)
0
(0 %)
2,456
(3.29 %)
7,020
(100.00 %)
257,784
(2.74 %)
211,756
(3.88 %)
2,209,417
(41.80 %)
2
(0.00 %)
363,246
(7.54 %)
54,125
(5.80 %)
14,956
(1.19 %)
390 Tasmanian pepperberry (RefF3 2024)
GCF_043159265.1
65,925
(7.32 %)
n/a 16,247
(1.53 %)
76,786
(13.23 %)
n/a 39.37
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,338
(100.00 %)
1,968,661
(26.22 %)
626,214
(13.70 %)
4,298,324
(45.52 %)
0
(0 %)
1,135,617
(13.56 %)
32,932
(4.92 %)
11,768
(0.50 %)
391 Tausch's goatgrass monocots
GCF_002575655.2
84,334
(2.18 %)
n/a 17,888
(0.44 %)
263,541
(10.26 %)
n/a 46.33
(97.97 %)
0
(0 %)
69,858
(2.04 %)
109,197
(100.00 %)
1,492,485
(15.65 %)
1,422,870
(5.39 %)
12,521,384
(71.80 %)
234
(0.01 %)
n/a 881,939
(30.07 %)
257,833
(5.24 %)
392 thale cress (Landsberg erecta 2016)
GCA_001651475.1
n/a 30,849
(38.15 %)
26,053
(33.97 %)
25,713
(36.19 %)
n/a 36.01
(98.51 %)
0
(0 %)
3,479
(1.50 %)
30
(100.00 %)
65,429
(14.19 %)
24,979
(1.85 %)
739,651
(21.49 %)
24
(0.01 %)
27,629
(3.21 %)
4,443
(1.81 %)
3,496
(1.38 %)
393 thale cress (tair10.1 Columbia 2018)
GCF_000001735.4
53,852
(40.10 %)
n/a 26,582
(34.47 %)
11,416
(18.70 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
0
(0 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
68,517
(16.50 %)
27,064
(2.77 %)
749,005
(22.64 %)
1
(0.00 %)
42,547
(3.36 %)
4,601
(1.63 %)
3,518
(1.15 %)
394 thunder duke vine
GCF_013401445.1
56,436
(17.59 %)
n/a 20,174
(5.61 %)
42,326
(19.85 %)
n/a 37.58
(99.96 %)
0
(0 %)
146
(0.04 %)
321
(100.00 %)
125,395
(2.23 %)
102,179
(22.89 %)
1,226,273
(38.50 %)
0
(0 %)
599,313
(13.69 %)
6,893
(1.71 %)
5,408
(0.61 %)
395 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1
50,668
(2.79 %)
n/a 17,479
(0.82 %)
117,543
(8.63 %)
n/a 40.23
(88.38 %)
0
(0 %)
119,817
(11.63 %)
37,194
(100.00 %)
622,838
(1.51 %)
788,520
(3.46 %)
11,822,060
(48.66 %)
133
(0.01 %)
2,124,644
(8.96 %)
174,838
(3.17 %)
26,771
(0.55 %)
396 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2
66,966
(3.67 %)
n/a 17,141
(1.02 %)
81,513
(6.82 %)
n/a 38.89
(97.29 %)
56,061
(2.71 %)
213,074
(2.72 %)
215,609
(97.29 %)
486,556
(1.53 %)
669,040
(5.52 %)
10,446,746
(53.83 %)
19,953
(0.37 %)
1,327,454
(6.88 %)
118,807
(2.33 %)
10,195
(0.20 %)
397 tomato (2024)
GCF_036512215.1
59,947
(8.20 %)
n/a 15,474
(1.94 %)
40,638
(7.50 %)
n/a 35.17
(99.99 %)
0
(0 %)
166
(0.01 %)
14
(100.00 %)
333,077
(2.31 %)
259,232
(7.09 %)
5,402,596
(43.04 %)
8
(0.00 %)
851,692
(8.46 %)
31,740
(4.85 %)
2,381
(0.10 %)
398 tomato (Micro-Tom 2020)
GCA_012431665.1
n/a n/a 15,607
(2.04 %)
39,981
(7.57 %)
n/a 34.32
(97.69 %)
0
(0 %)
1,323
(2.31 %)
391
(100.00 %)
433,628
(20.28 %)
248,928
(3.94 %)
5,440,564
(39.72 %)
0
(0 %)
581,883
(6.70 %)
31,891
(1.72 %)
2,440
(0.12 %)
399 tomato (Micro-Tom S9 2023)
GCA_030162295.1
n/a n/a 15,496
(2.07 %)
38,799
(7.36 %)
n/a 34.40
(98.25 %)
0
(0 %)
32,234
(1.76 %)
165
(100.00 %)
1,028,324
(71.24 %)
249,749
(4.56 %)
5,384,286
(39.87 %)
177
(0.03 %)
610,496
(6.85 %)
27,343
(1.53 %)
1,333
(0.06 %)
400 tomato (v3.1 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.5
45,958
(6.93 %)
n/a 15,425
(2.15 %)
38,319
(7.54 %)
n/a 34.12
(90.19 %)
0
(0 %)
19,539
(9.82 %)
3,066
(100.00 %)
311,852
(2.14 %)
229,773
(3.18 %)
5,390,626
(35.26 %)
224
(0.02 %)
412,055
(4.41 %)
25,196
(1.27 %)
2,324
(0.10 %)
401 toyon (HeAr 88 alternate hap 2022)
GCA_024363235.1
n/a n/a 22,795
(3.47 %)
67,418
(16.40 %)
n/a 38.17
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
75
(100.00 %)
347,375
(3.07 %)
304,988
(3.96 %)
3,119,641
(40.22 %)
0
(0 %)
481,094
(9.09 %)
30,300
(3.29 %)
15,155
(0.98 %)
402 toyon (HeAr 88 primary hap 2022)
GCA_024362995.1
n/a n/a 22,897
(3.50 %)
67,595
(16.43 %)
n/a 38.12
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
118
(100.00 %)
344,928
(2.90 %)
299,566
(3.87 %)
3,139,734
(39.86 %)
0
(0 %)
474,790
(8.82 %)
30,533
(2.95 %)
15,260
(0.99 %)
403 tree cotton (Shixiya-1 2022)
GCF_025698485.1
69,134
(4.11 %)
n/a 20,169
(1.21 %)
55,515
(4.75 %)
n/a 35.17
(100.00 %)
0
(0 %)
225
(0.00 %)
948
(100.00 %)
618,195
(1.97 %)
622,748
(3.28 %)
8,002,633
(61.80 %)
0
(0 %)
1,982,971
(15.63 %)
27,646
(0.67 %)
5,410
(0.15 %)
404 tree cotton (Shixiya1 2015 BGI)
GCF_000612285.1
53,446
(3.92 %)
n/a 20,707
(1.29 %)
56,318
(5.01 %)
n/a 35.03
(92.12 %)
45,766
(7.88 %)
45,768
(7.88 %)
121,185
(92.12 %)
618,119
(2.07 %)
589,954
(3.54 %)
8,098,351
(55.57 %)
587
(0.14 %)
1,280,735
(10.74 %)
28,949
(0.57 %)
5,345
(0.12 %)
405 trifoliate orange (ZK8 2021)
GCA_018350135.1
n/a n/a 14,955
(4.81 %)
32,433
(16.97 %)
n/a 34.13
(99.99 %)
222
(0.01 %)
222
(0.01 %)
707
(99.99 %)
181,106
(2.67 %)
98,804
(3.46 %)
2,031,768
(34.51 %)
0
(0 %)
162,916
(6.03 %)
6,294
(1.72 %)
5,218
(0.79 %)
406 trilobed morning glory
GCF_003576645.1
49,472
(13.00 %)
n/a 16,803
(3.58 %)
50,448
(18.68 %)
n/a 35.68
(94.76 %)
0
(0 %)
31,256
(5.25 %)
17
(100.00 %)
333,211
(3.67 %)
335,317
(10.66 %)
2,341,085
(36.54 %)
1,908
(0.26 %)
378,228
(11.60 %)
27,290
(3.24 %)
20,629
(2.28 %)
407 turmeric (G26 2024)
GCF_044706935.1
40,834
(13.17 %)
n/a 18,067
(4.25 %)
53,196
(20.85 %)
n/a 37.76
(99.88 %)
0
(0 %)
4,668
(0.12 %)
7,139
(100.00 %)
169,406
(2.24 %)
191,181
(4.26 %)
2,052,731
(28.24 %)
1
(0.00 %)
168,829
(5.27 %)
50,044
(9.42 %)
37,292
(6.31 %)
408 Valencia sweet orange 2022
GCF_022201045.2
49,199
(16.33 %)
n/a 14,451
(4.70 %)
33,670
(18.59 %)
n/a 34.22
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
11
(100.00 %)
184,421
(2.80 %)
106,732
(3.28 %)
1,996,057
(33.86 %)
0
(0 %)
138,933
(5.87 %)
6,824
(1.28 %)
4,933
(0.78 %)
409 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2
63,531
(8.16 %)
n/a 16,883
(1.90 %)
72,901
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
0
(0 %)
1,673
(0.23 %)
2,002
(100.00 %)
800,288
(3.71 %)
460,119
(7.41 %)
5,438,715
(37.84 %)
3
(0.00 %)
746,272
(7.48 %)
19,628
(1.10 %)
9,136
(0.41 %)
410 Van Houtte's columbine (alt pseudohaplotype PFEx6 2022)
GCA_023053535.1
n/a n/a 13,357
(3.39 %)
37,446
(17.24 %)
n/a 37.56
(100.00 %)
0
(0 %)
63
(0.00 %)
249
(100.00 %)
244,573
(10.74 %)
180,141
(13.98 %)
1,184,686
(42.28 %)
0
(0 %)
428,570
(12.48 %)
6,470
(2.86 %)
617
(0.10 %)
411 Van Houtte's columbine (PFEx6 2022)
GCA_023053565.1
n/a n/a 13,575
(3.44 %)
38,113
(17.59 %)
n/a 37.58
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
463
(100.00 %)
245,892
(11.25 %)
158,855
(13.35 %)
1,221,056
(41.58 %)
0
(0 %)
400,137
(11.97 %)
6,436
(2.63 %)
718
(0.10 %)
412 vegetable marrow (v2 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.2
48,839
(21.95 %)
n/a 19,452
(7.44 %)
35,987
(20.77 %)
n/a 36.49
(94.38 %)
0
(0 %)
49,199
(5.63 %)
24,194
(100.00 %)
181,473
(3.18 %)
143,114
(7.42 %)
1,614,901
(29.14 %)
3,445
(0.84 %)
135,437
(7.93 %)
13,094
(2.48 %)
9,563
(1.55 %)
413 water chestnut (Nanhuling F231 2024)
GCA_035582545.1
n/a 32,263
(10.45 %)
19,879
(3.81 %)
38,349
(12.06 %)
n/a 38.10
(100.00 %)
0
(0 %)
216
(0.00 %)
32
(100.00 %)
116,633
(1.34 %)
123,546
(2.75 %)
2,308,826
(51.78 %)
0
(0 %)
223,520
(3.82 %)
20,598
(2.37 %)
16,595
(1.81 %)
414 watermelon (97103 2019)
GCA_000238415.2
n/a n/a 13,387
(3.57 %)
27,414
(10.73 %)
n/a 33.57
(98.45 %)
0
(0 %)
245
(1.55 %)
113
(100.00 %)
292,830
(3.56 %)
169,773
(2.91 %)
2,260,362
(43.24 %)
0
(0 %)
115,033
(3.03 %)
14,898
(1.47 %)
6,499
(0.72 %)
415 watermelon (Charleston Gray 2019)
GCA_004801215.2
n/a n/a 13,662
(3.47 %)
28,811
(10.60 %)
n/a 33.52
(94.83 %)
0
(0 %)
19,579
(5.18 %)
6,794
(100.00 %)
314,974
(3.65 %)
193,157
(4.04 %)
2,390,687
(41.95 %)
982
(0.50 %)
126,636
(4.51 %)
15,527
(1.38 %)
6,745
(0.67 %)
416 watermelon (Kordofan 2021)
GCA_018142915.1
n/a n/a 13,494
(3.54 %)
27,976
(10.71 %)
n/a 33.60
(100.00 %)
0
(0 %)
47
(0.00 %)
33
(100.00 %)
780,860
(60.44 %)
173,577
(3.01 %)
2,295,095
(44.07 %)
1
(0.00 %)
118,855
(3.07 %)
15,356
(1.51 %)
4,862
(0.55 %)
417 wax gourd
GCF_009727055.1
40,406
(4.66 %)
n/a 13,481
(1.43 %)
43,071
(6.68 %)
n/a 34.85
(98.39 %)
0
(0 %)
24,524
(1.62 %)
1,791
(100.00 %)
481,638
(2.55 %)
364,998
(3.11 %)
6,236,506
(49.68 %)
4,691
(0.08 %)
383,939
(3.89 %)
21,741
(0.93 %)
14,484
(0.55 %)
418 weeping love grass (Victoria 2019)
GCA_007726485.1
n/a 56,849
(13.20 %)
22,395
(3.96 %)
101,555
(33.88 %)
n/a 45.70
(99.78 %)
0
(0 %)
2,245
(0.22 %)
1,143
(100.00 %)
206,645
(1.57 %)
174,457
(2.79 %)
2,244,665
(26.11 %)
6
(0.00 %)
285,716
(7.93 %)
117,743
(29.88 %)
94,408
(12.80 %)
419 white cockle S.latifolia (original U9 population 2025)
GCF_048544455.1
89,156
(3.16 %)
n/a 15,292
(0.51 %)
135,024
(8.39 %)
n/a 38.77
(98.57 %)
0
(0 %)
827
(1.43 %)
720
(100.00 %)
1,158,845
(2.32 %)
1,353,517
(6.28 %)
10,836,475
(64.19 %)
1
(0.00 %)
2,427,207
(12.18 %)
161,610
(4.19 %)
21,180
(0.27 %)
420 white fonio (2020)
GCA_902806635.1
n/a n/a 33,011
(5.39 %)
109,615
(30.77 %)
n/a 45.47
(97.23 %)
29,136
(2.79 %)
29,136
(2.79 %)
29,155
(97.21 %)
215,374
(1.42 %)
159,137
(1.91 %)
2,776,488
(28.15 %)
5,190
(0.27 %)
250,897
(4.54 %)
136,308
(27.74 %)
101,170
(11.60 %)
421 white lupine (Amiga GWH2020 2020)
GCA_010261695.1
n/a 47,603
(13.29 %)
21,959
(3.77 %)
51,652
(20.18 %)
n/a 36.92
(99.73 %)
1,591
(0.03 %)
1,764
(0.27 %)
3,171
(99.97 %)
215,169
(3.21 %)
247,660
(10.71 %)
2,556,478
(43.72 %)
1
(0.00 %)
723,439
(10.94 %)
14,520
(10.46 %)
5,911
(9.75 %)
422 white poplar (2024)
GCF_005239225.2
53,525
(15.07 %)
n/a 20,195
(4.72 %)
44,116
(16.35 %)
n/a 33.73
(99.86 %)
0
(0 %)
1,182
(0.14 %)
97
(100.00 %)
307,548
(3.27 %)
174,946
(4.79 %)
2,453,000
(38.39 %)
1
(0.00 %)
277,603
(7.00 %)
4,493
(0.61 %)
2,065
(0.19 %)
423 white poplar P.alba x Populus glandulosa (maternal hap 84K 2023)
GCA_033621325.1
n/a n/a 19,540
(4.79 %)
41,183
(15.85 %)
n/a 34.67
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
21
(100.00 %)
265,758
(2.98 %)
150,154
(12.12 %)
2,138,699
(41.34 %)
0
(0 %)
379,436
(8.93 %)
3,578
(0.99 %)
1,749
(0.14 %)
424 white poplar P.alba x Populus glandulosa (paternal hap 84K 2023)
GCA_033617975.1
n/a n/a 19,599
(4.60 %)
42,133
(16.21 %)
n/a 35.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 27
(100.00 %)
268,999
(2.93 %)
165,404
(12.23 %)
2,153,763
(42.62 %)
0
(0 %)
410,373
(9.69 %)
5,857
(2.24 %)
2,015
(0.15 %)
425 white yam
GCF_009730915.1
43,902
(7.41 %)
n/a 13,647
(2.09 %)
49,877
(12.79 %)
n/a 36.25
(99.19 %)
0
(0 %)
4,760
(0.81 %)
2,254
(100.00 %)
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(3.19 %)
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(3.96 %)
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(40.59 %)
0
(0 %)
287,001
(4.23 %)
28,929
(2.37 %)
14,044
(1.13 %)
426 wild cabbage
GCF_000695525.1
66,716
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(8.08 %)
103,348
(35.10 %)
n/a 36.11
(91.23 %)
874
(0.02 %)
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(8.80 %)
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(3.12 %)
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(31.20 %)
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(0.10 %)
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(4.62 %)
29,995
(2.99 %)
19,922
(1.82 %)
427 wild cabbage (2018)
GCA_900416815.2
n/a n/a 31,163
(6.66 %)
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(25.04 %)
n/a 36.57
(98.21 %)
11
(0.00 %)
135
(1.79 %)
140
(100.00 %)
273,972
(2.76 %)
284,806
(6.41 %)
2,750,803
(38.77 %)
0
(0 %)
470,826
(8.08 %)
33,071
(3.37 %)
21,309
(1.78 %)
428 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1
29,804
(16.68 %)
n/a 13,252
(5.90 %)
22,247
(14.89 %)
n/a 32.94
(94.65 %)
0
(0 %)
119,056
(5.55 %)
6,074
(100.00 %)
107,979
(2.19 %)
67,029
(6.76 %)
1,525,353
(32.45 %)
62
(0.01 %)
137,522
(3.41 %)
2,481
(0.48 %)
2,112
(0.40 %)
429 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2
131,285
(1.34 %)
n/a n/a 567,570
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
0
(0 %)
344,589
(3.31 %)
148,296
(100.00 %)
2,573,102
(1.23 %)
2,990,888
(3.37 %)
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(96.69 %)
210
(0.02 %)
n/a 2,220,880
(25.34 %)
0
(0.00 %)
430 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2
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(14.87 %)
n/a 18,878
(4.31 %)
45,554
(18.36 %)
n/a 38.87
(82.70 %)
17,164
(17.29 %)
22,178
(17.31 %)
24,423
(82.71 %)
214,040
(7.81 %)
136,453
(2.42 %)
1,656,678
(31.15 %)
1,372
(0.30 %)
160,195
(3.00 %)
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(5.44 %)
431 wild olive
GCF_002742605.1
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(6.69 %)
n/a 19,793
(1.69 %)
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(9.17 %)
n/a 35.40
(90.41 %)
0
(0 %)
47,638
(9.59 %)
41,226
(100.00 %)
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(1.79 %)
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(18.98 %)
5,982,070
(40.81 %)
1,739
(0.11 %)
2,654,630
(14.57 %)
12,534
(0.42 %)
7,470
(0.21 %)
432 wild peanut A.duranensis (v2 V14167 2020)
GCF_000817695.3
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(6.21 %)
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n/a 35.80
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8
(0.00 %)
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(0.02 %)
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(1.91 %)
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(0.85 %)
433 wild peanut A.ipaensis (K30076 2017)
GCF_000816755.2
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(1.26 %)
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(9.95 %)
n/a 36.84
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(0.10 %)
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(10.04 %)
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(0.87 %)
434 wild peanut A.stenosperma (V10309 2020)
GCF_014773155.1
67,384
(5.06 %)
n/a 16,850
(1.28 %)
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(9.77 %)
n/a 36.78
(93.48 %)
0
(0 %)
14,157
(6.52 %)
30
(100.00 %)
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(3.15 %)
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4
(0.00 %)
1,299,909
(14.23 %)
71,885
(2.45 %)
24,953
(0.81 %)
435 wild soybean
GCF_004193775.1
81,537
(9.20 %)
n/a 27,977
(2.99 %)
78,144
(11.64 %)
n/a 34.88
(97.58 %)
0
(0 %)
752
(2.42 %)
1,120
(100.00 %)
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(2.79 %)
450,287
(6.65 %)
5,379,409
(46.22 %)
5
(0.01 %)
778,567
(7.38 %)
37,183
(1.52 %)
13,293
(0.57 %)
436 wild strawberry (2011 refseq)
GCF_000184155.1
25,210
(19.38 %)
n/a 13,996
(6.63 %)
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(35.89 %)
n/a 38.40
(94.27 %)
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(5.75 %)
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(5.76 %)
16,460
(94.25 %)
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(1.51 %)
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(2.78 %)
1,034,180
(21.44 %)
25
(0.01 %)
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(3.11 %)
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(3.21 %)
9,028
(1.93 %)
437 wild sugarcane (AP85-441 2018)
GCA_003544955.1
n/a n/a 67,698
(2.77 %)
385,590
(22.40 %)
n/a 44.92
(99.75 %)
0
(0 %)
76,230
(0.26 %)
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(100.00 %)
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(1.60 %)
910,932
(3.64 %)
10,425,387
(46.78 %)
70
(0.00 %)
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(13.29 %)
637,314
(24.52 %)
426,307
(10.34 %)
438 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1
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(5.99 %)
n/a 15,458
(1.87 %)
42,907
(7.63 %)
n/a 34.50
(92.34 %)
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(7.67 %)
41,684
(7.67 %)
41,696
(92.33 %)
363,460
(2.48 %)
271,129
(4.15 %)
6,330,153
(36.93 %)
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(0.10 %)
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(5.37 %)
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(1.20 %)
3,088
(0.12 %)
439 wine grape (Chardonnay FPS 04 2020)
GCA_011037095.1
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(2.85 %)
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(99.33 %)
0
(0 %)
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(0.67 %)
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(100.00 %)
586,981
(35.31 %)
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(4.57 %)
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0
(0 %)
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(5.71 %)
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(0.96 %)
8,413
(0.56 %)
440 wine grape (Chkhaveri 2017)
GCA_002922885.1
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(3.33 %)
40,033
(15.32 %)
n/a 34.56
(97.67 %)
0
(0 %)
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(2.34 %)
21
(100.00 %)
410,680
(35.69 %)
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(4.45 %)
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(0.04 %)
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(5.81 %)
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(0.52 %)
441 wine grape (Pinot Noir 40024 2023)
GCF_030704535.1
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(10.71 %)
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(2.93 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 21
(100.00 %)
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0
(0 %)
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(7.00 %)
11,751
(1.05 %)
6,644
(0.55 %)
442 wine grape (PN40024 2009)
GCF_000003745.3
46,797
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n/a 14,907
(3.07 %)
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(3.10 %)
13,440
(3.10 %)
14,644
(96.90 %)
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(35.59 %)
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(4.83 %)
2,745,513
(34.80 %)
345
(0.04 %)
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(5.97 %)
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(1.00 %)
6,661
(0.55 %)
443 winter cress (G-type 2016)
GCA_001920985.1
n/a n/a 22,511
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(90.69 %)
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(9.35 %)
22,839
(9.35 %)
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(90.65 %)
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(2.39 %)
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(2.78 %)
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(23.86 %)
13
(0.01 %)
47,590
(2.53 %)
6,701
(1.74 %)
5,207
(1.30 %)
444 winter squash (2017)
GCF_002738345.1
49,714
(19.34 %)
n/a 18,860
(6.74 %)
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(18.55 %)
n/a 36.33
(97.81 %)
0
(0 %)
17,224
(2.20 %)
8,299
(100.00 %)
169,605
(3.09 %)
134,380
(10.82 %)
1,493,623
(35.66 %)
439
(0.08 %)
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(8.27 %)
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(2.64 %)
9,029
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445 wood tobacco (2013)
GCF_000393655.1
58,358
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(1.49 %)
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446 wood tobacco (2023)
GCF_000393655.2
69,980
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(0.00 %)
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447 wooly tobacco N.tomentosiformis (2023)
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448 zha cai (T84-66 inbred line 2016)
GCA_001687265.1
n/a n/a 56,069
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TOTALS:total assembly count 448

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Invertebrates 1957 assemblies assembly stats track stats
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Archaea 2732 assemblies assembly stats track stats
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CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
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