Primates Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of primates only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Angolan colobus
GCF_000951035.1
42,929
(2.28 %)
n/a 20,358
(1.94 %)
18,701
(1.25 %)
47,034
(1.83 %)
40.80
(90.25 %)
184,000
(9.77 %)
184,001
(9.77 %)
197,124
(90.23 %)
5,089,134
(49.30 %)
752,280
(2.06 %)
15,645,270
(32.03 %)
5,690
(0.09 %)
732,292
(1.96 %)
59,852
(0.82 %)
25,355
(0.49 %)
2 Assam macaque (KIZ-2021_13 2022)
GCA_023783095.1
n/a n/a 20,012
(1.94 %)
20,934
(1.27 %)
n/a 40.98
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,153
(100.00 %)
5,181,961
(49.79 %)
884,735
(2.46 %)
15,449,956
(37.02 %)
0
(0 %)
1,097,262
(2.72 %)
80,386
(1.30 %)
27,202
(0.74 %)
3 aye-aye (BS11 Broad 2019)
GCA_004027145.1
n/a n/a 20,687
(1.84 %)
25,007
(1.35 %)
37,179
(1.61 %)
39.96
(99.96 %)
2,527
(0.01 %)
2,527
(0.01 %)
344,978
(99.99 %)
4,030,997
(43.30 %)
358,965
(0.72 %)
15,568,152
(32.48 %)
5
(0.00 %)
n/a 36,248
(1.03 %)
34,443
(0.94 %)
4 aye-aye (KIZ-2021_6 2022)
GCA_023783475.1
n/a n/a 18,996
(1.93 %)
20,400
(1.40 %)
n/a 39.89
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,701
(100.00 %)
3,755,381
(42.51 %)
324,667
(0.59 %)
15,231,943
(30.90 %)
0
(0 %)
98,521
(0.36 %)
32,342
(1.05 %)
30,976
(0.96 %)
5 babakoto
GCA_004363605.1
n/a n/a 23,765
(1.47 %)
45,432
(1.22 %)
n/a 41.26
(99.89 %)
4,885
(0.02 %)
4,885
(0.02 %)
1,248,425
(99.98 %)
4,664,535
(39.88 %)
529,666
(1.21 %)
16,469,880
(32.15 %)
35
(0.00 %)
n/a 71,607
(1.62 %)
63,719
(1.39 %)
6 Bengal slow loris (KIZ-2021_18 2022)
GCA_023898255.1
n/a n/a 21,573
(1.47 %)
19,515
(1.17 %)
n/a 40.65
(99.99 %)
0
(0 %)
966
(0.01 %)
3,383
(100.00 %)
4,593,886
(40.08 %)
630,409
(3.44 %)
14,431,317
(40.72 %)
0
(0 %)
1,231,818
(5.25 %)
25,083
(0.65 %)
21,275
(0.53 %)
7 Bennett's brown lemur (Redbay 2024)
GCF_041146395.1
47,054
(2.18 %)
n/a 19,230
(1.89 %)
21,438
(1.47 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
647
(100.00 %)
3,630,885
(40.90 %)
990,359
(8.87 %)
13,169,326
(35.96 %)
1
(0.00 %)
2,408,745
(5.62 %)
54,189
(2.02 %)
52,251
(1.69 %)
8 black crested mangabey (KIZ-2021_11 2022)
GCA_023783235.1
n/a n/a 20,337
(1.86 %)
21,431
(1.22 %)
n/a 40.93
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,389
(100.00 %)
5,435,251
(50.92 %)
1,045,972
(5.40 %)
16,182,435
(38.30 %)
0
(0 %)
1,441,727
(5.23 %)
89,767
(1.34 %)
27,354
(0.70 %)
9 black snub-nosed monkey (Rb0 v2 refseq 2016)
GCF_001698545.2
59,194
(2.48 %)
n/a 21,210
(1.88 %)
22,226
(1.22 %)
n/a 40.93
(94.12 %)
0
(0 %)
149,839
(5.89 %)
103,881
(100.00 %)
5,531,353
(50.33 %)
991,662
(2.45 %)
16,353,330
(34.27 %)
4,262
(0.14 %)
n/a 80,076
(1.15 %)
29,543
(0.66 %)
10 black-handed spider monkey (BS17 Broad 2019)
GCA_004024785.1
n/a n/a 25,398
(1.69 %)
39,133
(1.17 %)
36,843
(0.90 %)
40.69
(99.91 %)
9,415
(0.03 %)
9,415
(0.03 %)
878,490
(99.97 %)
5,570,166
(47.38 %)
971,371
(2.96 %)
16,050,074
(38.92 %)
95
(0.00 %)
n/a 35,079
(0.81 %)
31,810
(0.73 %)
11 black-handed spider monkey (KIZ-2021_1 2022)
GCA_023783555.1
n/a n/a 20,598
(1.97 %)
20,597
(1.30 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,723
(100.00 %)
4,899,911
(47.20 %)
777,720
(4.23 %)
15,012,553
(36.30 %)
0
(0 %)
864,254
(3.82 %)
32,917
(0.89 %)
29,262
(0.79 %)
12 black-shanked douc langur (KIZ-2021_22 2022)
GCA_023764695.1
n/a n/a 20,233
(1.82 %)
19,753
(1.14 %)
n/a 40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,753
(100.00 %)
5,372,784
(51.34 %)
910,290
(4.72 %)
15,892,070
(38.54 %)
0
(0 %)
1,631,440
(5.74 %)
46,118
(0.88 %)
25,156
(0.63 %)
13 blue monkey (Sample3913 2023)
GCA_028627265.1
n/a n/a 23,087
(1.63 %)
28,535
(1.07 %)
n/a 40.90
(99.15 %)
0
(0 %)
60,547
(0.77 %)
1,396,160
(100.00 %)
6,282,612
(48.44 %)
1,088,988
(2.43 %)
18,272,192
(35.96 %)
2,521
(0.06 %)
n/a 58,284
(1.03 %)
33,303
(0.75 %)
14 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.1 BCM 2021)
GCF_016699345.2
53,017
(2.41 %)
n/a 20,575
(1.98 %)
21,201
(1.34 %)
n/a 40.96
(99.56 %)
1,073
(0.44 %)
1,073
(0.44 %)
2,786
(99.56 %)
5,041,616
(47.75 %)
946,197
(3.04 %)
14,604,089
(36.98 %)
14
(0.00 %)
1,335,299
(2.84 %)
37,271
(1.03 %)
32,302
(0.89 %)
15 Bolivian squirrel monkey (mSaiBol1 primary hap 2025)
GCA_048565385.1
n/a n/a 20,765
(1.92 %)
20,951
(1.28 %)
n/a 41.00
(100.00 %)
0
(0 %)
73
(0.00 %)
63
(100.00 %)
5,214,762
(46.97 %)
990,724
(4.68 %)
14,779,707
(38.32 %)
0
(0 %)
1,532,950
(3.25 %)
38,916
(1.05 %)
33,742
(0.90 %)
16 Bolivian titi
GCA_004027715.1
n/a n/a 25,728
(1.58 %)
43,866
(1.11 %)
n/a 41.02
(99.91 %)
7,382
(0.02 %)
7,382
(0.02 %)
1,041,365
(99.98 %)
5,701,983
(47.08 %)
971,231
(2.78 %)
16,165,964
(39.80 %)
86
(0.00 %)
n/a 58,357
(1.13 %)
51,906
(0.98 %)
17 bonobo (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_029289425.2
95,418
(4.20 %)
n/a 21,182
(1.74 %)
23,352
(1.22 %)
n/a 40.43
(99.84 %)
0
(0 %)
6
(0.16 %)
31
(100.00 %)
5,436,203
(50.57 %)
1,021,767
(12.45 %)
15,964,628
(43.17 %)
1
(0.03 %)
3,743,841
(6.31 %)
48,818
(1.07 %)
29,887
(0.74 %)
18 Bornean orangutan (KIZ-2021_21 2022)
GCA_023767775.1
n/a n/a 19,901
(1.88 %)
22,760
(1.27 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
3,442
(100.00 %)
5,274,756
(51.44 %)
957,490
(4.99 %)
15,869,735
(38.59 %)
0
(0 %)
1,394,273
(4.39 %)
38,783
(1.01 %)
25,425
(0.80 %)
19 Bornean orangutan (v2 AG05252 alternate hap 2024)
GCA_028885525.2
n/a n/a 19,761
(1.78 %)
20,268
(1.16 %)
n/a 40.95
(99.70 %)
0
(0 %)
10
(0.30 %)
33
(100.00 %)
5,201,908
(53.67 %)
980,696
(9.42 %)
15,105,351
(41.63 %)
0
(0 %)
2,340,777
(4.18 %)
41,454
(1.11 %)
28,219
(0.76 %)
20 Bornean orangutan (v2 AG05252 primary hap 2024 genbank)
GCA_028885625.2
92,658
(42.57 %)
n/a 20,708
(1.74 %)
21,361
(1.14 %)
n/a 40.88
(99.75 %)
0
(0 %)
8
(0.25 %)
25
(100.00 %)
5,544,145
(54.41 %)
1,072,960
(9.60 %)
16,187,593
(42.16 %)
0
(0 %)
2,505,849
(4.22 %)
43,604
(1.09 %)
29,685
(0.76 %)
21 Bornean orangutan (v2 AG05252 primary hap 2024 refseq)
GCF_028885625.2
92,658
(2.98 %)
n/a 20,708
(1.74 %)
21,361
(1.14 %)
n/a 40.88
(99.75 %)
0
(0 %)
8
(0.25 %)
26
(100.00 %)
5,544,151
(54.41 %)
1,072,960
(9.60 %)
16,187,641
(42.16 %)
0
(0 %)
2,505,849
(4.22 %)
43,604
(1.09 %)
29,685
(0.76 %)
22 brown lemur
GCA_004027275.1
n/a n/a 25,130
(1.40 %)
50,986
(1.20 %)
n/a 41.37
(99.87 %)
3,706
(0.01 %)
3,706
(0.01 %)
1,697,619
(99.99 %)
4,981,207
(40.80 %)
1,645,565
(2.98 %)
15,859,279
(37.12 %)
10
(0.00 %)
n/a 71,873
(1.66 %)
65,173
(1.45 %)
23 Burmese snub-nosed monkey (KIZ-2021_23 2022)
GCA_023764705.1
n/a n/a 20,284
(1.81 %)
20,291
(1.15 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,623
(100.00 %)
5,410,232
(52.26 %)
1,050,727
(6.93 %)
15,721,056
(39.86 %)
0
(0 %)
2,189,948
(6.92 %)
58,087
(1.00 %)
26,362
(0.66 %)
24 chimpanzee (Clint C0471 2018 refseq)
GCF_002880755.1
102,458
(3.40 %)
n/a 20,447
(1.83 %)
21,467
(1.18 %)
n/a 40.71
(98.96 %)
715
(1.04 %)
715
(1.04 %)
5,254
(98.96 %)
5,444,680
(53.75 %)
996,217
(7.30 %)
16,057,940
(39.54 %)
5
(0.00 %)
2,570,600
(4.39 %)
46,151
(0.97 %)
28,416
(0.73 %)
25 chimpanzee (v2 AG18354 alternate hap 2024)
GCA_028858805.2
n/a n/a 19,981
(1.80 %)
20,886
(1.18 %)
n/a 40.63
(99.83 %)
0
(0 %)
5
(0.17 %)
23
(100.00 %)
5,080,229
(48.83 %)
937,411
(11.36 %)
14,905,102
(42.22 %)
0
(0 %)
3,051,376
(5.48 %)
46,330
(1.11 %)
28,554
(0.78 %)
26 chimpanzee (v2 AG18354 primary hap 2024 genbank)
GCA_028858775.2
134,453
(48.11 %)
n/a 20,831
(1.77 %)
22,081
(1.17 %)
n/a 40.57
(99.84 %)
0
(0 %)
5
(0.16 %)
25
(100.00 %)
5,408,044
(49.94 %)
1,021,513
(10.88 %)
15,986,286
(42.21 %)
0
(0 %)
3,108,843
(5.27 %)
49,727
(1.09 %)
29,844
(0.76 %)
27 chimpanzee (v2 AG18354 primary hap 2024 refseq)
GCF_028858775.2
134,453
(3.48 %)
n/a 20,832
(1.77 %)
22,081
(1.17 %)
n/a 40.57
(99.84 %)
0
(0 %)
5
(0.16 %)
26
(100.00 %)
5,408,047
(49.94 %)
1,021,513
(10.88 %)
15,986,329
(42.21 %)
0
(0 %)
3,108,843
(5.27 %)
49,727
(1.09 %)
29,844
(0.76 %)
28 common marmoset (240 primary hap 2025)
GCA_049354715.1
n/a n/a 21,911
(1.84 %)
21,599
(1.26 %)
n/a 40.84
(99.99 %)
3
(0.01 %)
3
(0.01 %)
27
(99.99 %)
5,159,459
(47.46 %)
852,115
(5.34 %)
15,179,157
(39.68 %)
0
(0 %)
1,738,948
(3.39 %)
37,686
(0.94 %)
34,619
(0.82 %)
29 Coquerel's mouse lemur
GCA_004024645.1
n/a n/a 24,097
(1.75 %)
40,335
(1.41 %)
n/a 40.86
(99.92 %)
10,667
(0.05 %)
10,667
(0.05 %)
451,546
(99.95 %)
4,093,701
(41.14 %)
571,851
(1.36 %)
14,292,721
(33.40 %)
28
(0.00 %)
398,003
(0.99 %)
70,569
(2.29 %)
66,048
(1.95 %)
30 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 refseq)
GCF_000956105.1
29,369
(2.19 %)
n/a 19,298
(2.12 %)
21,783
(1.63 %)
n/a 41.24
(74.51 %)
276,531
(25.53 %)
276,544
(25.53 %)
299,070
(74.47 %)
3,419,964
(39.32 %)
304,035
(0.59 %)
13,333,892
(21.06 %)
1,491
(0.03 %)
288,331
(2.06 %)
56,694
(1.59 %)
52,596
(1.34 %)
31 cotton-top tamarin (B95-8 2023)
GCA_031835075.1
n/a 41,012
(0.99 %)
23,539
(1.72 %)
23,067
(1.20 %)
n/a 40.93
(100.00 %)
7
(0.00 %)
34
(0.00 %)
447
(100.00 %)
5,808,669
(48.92 %)
1,120,340
(7.96 %)
15,375,687
(43.53 %)
0
(0 %)
2,431,770
(4.82 %)
37,293
(0.89 %)
32,559
(0.75 %)
32 crab-eating macaque (2020 cy0333)
GCA_011100615.1
n/a n/a 20,178
(1.86 %)
20,316
(1.21 %)
65,343
(2.60 %)
41.01
(98.70 %)
560
(1.30 %)
560
(1.30 %)
1,496
(98.70 %)
5,424,163
(51.37 %)
894,914
(3.04 %)
16,026,015
(36.93 %)
0
(0 %)
1,191,942
(2.38 %)
72,765
(1.24 %)
28,957
(0.75 %)
33 crab-eating macaque (582-1 2024)
GCF_037993035.1
100,896
(3.93 %)
n/a 20,528
(1.79 %)
21,741
(1.19 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 21
(100.00 %)
5,357,498
(52.90 %)
1,017,190
(8.58 %)
15,617,344
(40.74 %)
0
(0 %)
2,146,978
(4.41 %)
94,759
(1.56 %)
30,541
(0.76 %)
34 crab-eating macaque CE1976F Keio U/RIKEN 2021
GCF_012559485.2
87,255
(3.15 %)
n/a 20,054
(1.91 %)
20,456
(1.23 %)
n/a 40.98
(99.99 %)
0
(0 %)
605
(0.01 %)
401
(100.00 %)
5,272,147
(51.07 %)
941,877
(2.83 %)
15,772,147
(37.48 %)
0
(0 %)
1,143,709
(2.32 %)
90,103
(1.40 %)
27,646
(0.74 %)
35 De Brazza's monkey
GCA_004027615.1
n/a n/a 26,901
(1.31 %)
46,619
(0.90 %)
n/a 41.18
(99.85 %)
7,534
(0.02 %)
7,534
(0.02 %)
2,126,734
(99.98 %)
6,751,052
(54.69 %)
1,804,857
(10.22 %)
16,954,884
(44.26 %)
60
(0.00 %)
n/a 104,630
(1.53 %)
73,704
(1.17 %)
36 drill (KB7577 Baylor 2015)
GCF_000951045.1
42,567
(2.25 %)
n/a 20,205
(1.90 %)
18,407
(1.23 %)
n/a 40.73
(88.91 %)
233,233
(11.12 %)
233,234
(11.12 %)
246,054
(88.88 %)
5,166,355
(49.05 %)
834,739
(2.92 %)
15,970,905
(31.27 %)
6,092
(0.16 %)
797,612
(4.39 %)
42,242
(0.62 %)
24,683
(0.44 %)
37 drill (KIZ-2021_15 2022)
GCA_023783495.1
n/a n/a 20,480
(1.89 %)
23,070
(1.28 %)
n/a 40.89
(98.32 %)
37,125
(1.69 %)
37,125
(1.69 %)
66,385
(98.31 %)
5,269,129
(50.29 %)
919,725
(3.55 %)
16,051,151
(36.57 %)
557
(0.01 %)
1,141,808
(2.18 %)
56,450
(1.02 %)
27,570
(0.71 %)
38 Eastern hoolock gibbon (KIZ-2021_9 2022)
GCA_023748175.1
n/a n/a 19,896
(1.91 %)
19,642
(1.17 %)
n/a 41.13
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
2,969
(100.00 %)
5,269,435
(50.46 %)
908,964
(4.57 %)
15,559,847
(37.92 %)
2
(0.00 %)
1,573,820
(5.86 %)
51,887
(1.09 %)
27,622
(0.75 %)
39 Francois's langur
GCF_009764315.1
80,215
(2.83 %)
n/a 20,478
(1.87 %)
20,685
(1.19 %)
39,950
(1.50 %)
41.12
(100.00 %)
0
(0 %)
766
(0.00 %)
1,016
(100.00 %)
5,471,638
(52.57 %)
928,320
(2.95 %)
15,652,774
(38.76 %)
1
(0.00 %)
1,414,211
(3.13 %)
129,321
(1.71 %)
26,074
(0.69 %)
40 gelada
GCF_003255815.1
59,570
(2.42 %)
n/a 20,532
(1.90 %)
21,017
(1.20 %)
n/a 40.96
(98.37 %)
0
(0 %)
27,860
(1.63 %)
15,308
(100.00 %)
5,467,919
(51.71 %)
982,616
(2.99 %)
15,865,443
(36.88 %)
1,573
(0.02 %)
1,150,551
(2.25 %)
93,504
(1.36 %)
27,070
(0.70 %)
41 golden lion tamarin (Coari 2023)
GCA_028533165.1
n/a n/a 22,271
(1.84 %)
23,146
(1.16 %)
n/a 41.06
(99.29 %)
0
(0 %)
58,924
(0.69 %)
342,831
(100.00 %)
5,350,617
(47.06 %)
1,060,421
(2.75 %)
16,004,031
(37.43 %)
2,403
(0.07 %)
n/a 34,561
(0.83 %)
30,488
(0.73 %)
42 golden snub-nosed monkey (2019 Northwest U)
GCF_007565055.1
64,150
(2.41 %)
n/a 21,162
(1.81 %)
20,993
(1.14 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
0
(0 %)
2,832
(0.01 %)
3,257
(100.00 %)
5,619,018
(53.60 %)
1,226,902
(6.20 %)
15,833,648
(40.58 %)
4
(0.00 %)
2,135,971
(4.12 %)
99,771
(1.51 %)
26,930
(0.77 %)
43 golden-brown mouse lemur (RMR55 2019)
GCA_008750975.1
n/a n/a 26,464
(1.54 %)
54,472
(1.31 %)
n/a 40.98
(99.97 %)
814
(0.00 %)
814
(0.00 %)
334,832
(100.00 %)
4,188,541
(40.59 %)
597,399
(1.53 %)
14,651,061
(32.28 %)
297
(0.00 %)
n/a 76,716
(2.17 %)
70,210
(1.84 %)
44 gorilla (v2.1 KB3781 2024 refseq)
GCF_029281585.2
98,428
(2.94 %)
n/a 21,013
(1.59 %)
50,697
(1.83 %)
n/a 40.49
(99.94 %)
0
(0 %)
2
(0.06 %)
26
(100.00 %)
5,462,311
(50.79 %)
1,060,267
(19.55 %)
15,870,229
(47.77 %)
0
(0 %)
5,140,568
(8.53 %)
69,745
(1.19 %)
30,648
(0.70 %)
45 gray mouse lemur
GCF_000165445.2
74,341
(3.53 %)
n/a 20,032
(1.90 %)
22,619
(1.50 %)
n/a 40.98
(95.94 %)
43,305
(4.06 %)
43,364
(4.06 %)
50,983
(95.94 %)
4,083,660
(41.60 %)
582,431
(1.47 %)
14,808,653
(30.05 %)
325
(0.02 %)
1,168,691
(4.77 %)
74,772
(2.61 %)
69,260
(2.12 %)
46 greater bamboo lemur (KIAN8.4 2018)
GCA_003258685.1
n/a n/a 19,563
(2.02 %)
23,129
(1.54 %)
n/a 40.83
(92.61 %)
82,304
(7.39 %)
82,304
(7.39 %)
210,900
(92.61 %)
3,715,845
(39.74 %)
509,680
(1.94 %)
14,012,100
(27.69 %)
9,889
(1.07 %)
n/a 54,553
(1.48 %)
50,409
(1.30 %)
47 green monkey 1994-021 (2014 refseq)
GCF_000409795.2
76,050
(3.13 %)
n/a 19,995
(1.95 %)
50,732
(6.99 %)
n/a 40.81
(98.67 %)
160,731
(1.35 %)
178,940
(1.35 %)
163,018
(98.65 %)
5,266,458
(49.55 %)
980,479
(2.63 %)
16,076,224
(35.62 %)
23,631
(0.16 %)
934,123
(2.70 %)
50,033
(1.04 %)
27,028
(0.72 %)
48 green monkey WHO RCB 10-87
GCF_015252025.1
73,115
(2.94 %)
n/a 20,320
(1.83 %)
21,251
(1.19 %)
n/a 41.07
(99.75 %)
0
(0 %)
8,419
(0.25 %)
6,872
(100.00 %)
5,517,731
(51.10 %)
1,158,729
(3.95 %)
16,622,084
(37.82 %)
635
(0.01 %)
1,490,668
(3.10 %)
67,267
(1.70 %)
34,986
(1.20 %)
49 grivet (KIZ-2021_4 2022)
GCA_023783515.1
n/a n/a 20,163
(1.90 %)
23,239
(1.31 %)
n/a 40.91
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,565
(100.00 %)
5,282,136
(50.09 %)
1,128,849
(3.92 %)
15,914,826
(37.76 %)
0
(0 %)
1,254,396
(3.93 %)
64,915
(1.62 %)
28,495
(1.06 %)
50 hamadryas baboon (KIZ-2021_19 2022)
GCA_023781915.1
n/a n/a 20,269
(1.76 %)
20,902
(1.16 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,047
(100.00 %)
5,615,229
(52.09 %)
1,010,666
(6.83 %)
16,542,749
(39.79 %)
0
(0 %)
2,938,631
(13.72 %)
96,913
(1.36 %)
27,983
(0.69 %)
51 Hanuman langur
GCA_004025065.1
n/a n/a 27,338
(1.54 %)
46,486
(1.04 %)
n/a 41.28
(99.89 %)
13,786
(0.05 %)
13,786
(0.05 %)
1,077,535
(99.95 %)
6,409,019
(52.08 %)
1,008,391
(1.92 %)
16,519,816
(39.37 %)
103
(0.00 %)
n/a 95,794
(1.26 %)
31,098
(0.68 %)
52 Horsfield's tarsier (2022)
GCA_027257055.1
n/a n/a 20,200
(1.48 %)
22,821
(1.21 %)
n/a 41.17
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,942
(100.00 %)
5,175,266
(44.51 %)
750,825
(1.82 %)
16,115,126
(39.41 %)
0
(0 %)
1,276,846
(2.44 %)
90,999
(1.90 %)
38,859
(1.21 %)
53 human (HG00438.mat 2021)
GCA_018471515.1
n/a n/a 20,788
(1.85 %)
22,424
(1.25 %)
233,427
(57.20 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 258
(100.00 %)
5,426,471
(53.12 %)
1,085,458
(7.66 %)
16,023,596
(40.44 %)
0
(0 %)
1,660,644
(3.30 %)
52,702
(1.17 %)
28,454
(0.75 %)
54 human (HG00438.pat 2021)
GCA_018472595.1
n/a n/a 20,627
(1.85 %)
22,176
(1.24 %)
233,698
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
276
(100.00 %)
5,419,334
(52.97 %)
1,071,302
(7.38 %)
15,894,505
(40.10 %)
0
(0 %)
1,681,408
(3.32 %)
52,377
(1.20 %)
28,532
(0.76 %)
55 human (HG00621.mat 2021)
GCA_018472605.1
n/a n/a 20,611
(1.85 %)
22,275
(1.25 %)
233,258
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 253
(100.00 %)
5,392,161
(53.03 %)
1,048,372
(7.50 %)
15,960,374
(40.31 %)
0
(0 %)
1,701,207
(3.32 %)
52,502
(1.20 %)
28,554
(0.77 %)
56 human (HG00621.pat 2021)
GCA_018472575.1
n/a n/a 19,907
(1.86 %)
21,558
(1.26 %)
227,172
(5.00 %)
40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 287
(100.00 %)
5,174,496
(52.83 %)
1,030,071
(7.85 %)
15,147,153
(40.18 %)
0
(0 %)
1,671,972
(3.41 %)
50,988
(1.20 %)
27,845
(0.76 %)
57 human (HG00673.mat 2021)
GCA_018472565.1
n/a n/a 20,805
(1.84 %)
22,193
(1.24 %)
233,975
(4.93 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 348
(100.00 %)
5,408,639
(53.33 %)
1,056,398
(8.05 %)
16,117,475
(40.76 %)
0
(0 %)
1,829,654
(3.54 %)
52,411
(1.14 %)
28,185
(0.74 %)
58 human (HG00673.pat 2021)
GCA_018472585.1
n/a n/a 19,963
(1.85 %)
21,514
(1.25 %)
227,480
(4.97 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
420
(100.00 %)
5,185,516
(53.08 %)
1,065,657
(8.25 %)
15,183,778
(40.61 %)
0
(0 %)
1,749,434
(3.59 %)
50,883
(1.20 %)
27,934
(0.76 %)
59 human (HG00733.mat 2021)
GCA_018506975.1
n/a n/a 20,626
(1.85 %)
22,511
(1.25 %)
233,295
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
609
(100.00 %)
5,412,701
(52.97 %)
1,052,600
(7.34 %)
15,895,725
(40.14 %)
0
(0 %)
1,726,181
(3.39 %)
53,216
(1.22 %)
28,848
(0.77 %)
60 human (HG00733.pat 2021)
GCA_018506955.1
n/a n/a 20,749
(1.85 %)
22,251
(1.24 %)
233,792
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
695
(100.00 %)
5,420,299
(53.15 %)
1,076,604
(7.72 %)
15,964,663
(40.46 %)
0
(0 %)
1,774,653
(3.49 %)
53,315
(1.19 %)
28,785
(0.76 %)
61 human (HG00735.mat 2021)
GCA_018472765.1
n/a n/a 20,674
(1.84 %)
22,283
(1.25 %)
233,363
(4.94 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
244
(100.00 %)
5,406,821
(53.15 %)
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(7.74 %)
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(40.51 %)
0
(0 %)
1,735,619
(3.39 %)
52,343
(1.14 %)
28,228
(0.74 %)
62 human (HG00735.pat 2021)
GCA_018472715.1
n/a n/a 20,688
(1.84 %)
22,080
(1.23 %)
233,237
(4.95 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
299
(100.00 %)
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(53.13 %)
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(7.66 %)
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(40.43 %)
0
(0 %)
1,770,137
(3.44 %)
52,436
(1.14 %)
28,192
(0.74 %)
63 human (HG00741.mat 2021)
GCA_018471095.1
n/a n/a 20,654
(1.85 %)
22,309
(1.25 %)
233,294
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 297
(100.00 %)
5,410,814
(53.14 %)
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(7.72 %)
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(40.45 %)
0
(0 %)
1,792,676
(3.47 %)
52,535
(1.14 %)
28,292
(0.75 %)
64 human (HG00741.pat 2021)
GCA_018471105.1
n/a n/a 20,657
(1.85 %)
22,458
(1.25 %)
233,356
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
289
(100.00 %)
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(53.08 %)
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(7.55 %)
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(40.41 %)
0
(0 %)
1,730,728
(3.37 %)
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(1.20 %)
28,347
(0.75 %)
65 human (HG01071.mat 2021)
GCA_018472685.1
n/a n/a 20,742
(1.86 %)
22,169
(1.25 %)
233,386
(4.98 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 236
(100.00 %)
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(52.80 %)
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(7.04 %)
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(39.99 %)
0
(0 %)
1,619,715
(3.18 %)
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(1.13 %)
28,193
(0.74 %)
66 human (HG01071.pat 2021)
GCA_018472725.1
n/a n/a 20,694
(1.84 %)
22,451
(1.25 %)
232,969
(4.90 %)
40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
330
(100.00 %)
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(53.42 %)
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(8.26 %)
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(40.73 %)
0
(0 %)
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(3.60 %)
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(1.14 %)
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(0.75 %)
67 human (HG01106.mat 2021)
GCA_018471345.1
n/a n/a 20,635
(1.85 %)
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(1.24 %)
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(4.93 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
272
(100.00 %)
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(53.13 %)
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(7.68 %)
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(40.33 %)
0
(0 %)
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(3.52 %)
52,604
(1.18 %)
28,412
(0.76 %)
68 human (HG01106.pat 2021)
GCA_018471075.1
n/a n/a 19,939
(1.84 %)
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(1.25 %)
227,418
(4.97 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 284
(100.00 %)
5,199,262
(53.10 %)
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(8.08 %)
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(40.44 %)
0
(0 %)
1,716,731
(3.55 %)
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(1.19 %)
27,890
(0.76 %)
69 human (HG01109.mat 2021)
GCA_018504365.1
n/a n/a 20,638
(1.84 %)
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(1.25 %)
233,201
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
399
(100.00 %)
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(53.13 %)
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(7.69 %)
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(40.38 %)
0
(0 %)
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(3.43 %)
53,236
(1.22 %)
28,762
(0.77 %)
70 human (HG01109.pat 2021)
GCA_018504645.1
n/a n/a 19,870
(1.85 %)
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(1.26 %)
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(4.98 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
473
(100.00 %)
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(7.99 %)
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(40.28 %)
0
(0 %)
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(3.57 %)
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(1.20 %)
28,020
(0.77 %)
71 human (HG01123.mat 2021)
GCA_018469665.1
n/a n/a 20,643
(1.86 %)
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(1.25 %)
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(4.98 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
340
(100.00 %)
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(52.86 %)
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(7.16 %)
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(40.07 %)
0
(0 %)
1,647,554
(3.28 %)
52,346
(1.15 %)
28,326
(0.76 %)
72 human (HG01123.pat 2021)
GCA_018469695.1
n/a n/a 20,631
(1.86 %)
22,210
(1.24 %)
233,273
(4.97 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
436
(100.00 %)
5,391,322
(52.85 %)
1,041,900
(7.14 %)
15,985,878
(40.09 %)
0
(0 %)
1,624,959
(3.21 %)
52,630
(1.16 %)
28,418
(0.76 %)
73 human (HG01175.mat 2021)
GCA_018471085.1
n/a n/a 20,587
(1.84 %)
22,094
(1.24 %)
232,602
(4.93 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
315
(100.00 %)
5,397,845
(53.20 %)
1,069,444
(7.79 %)
15,978,901
(40.45 %)
0
(0 %)
1,757,030
(3.46 %)
51,968
(1.14 %)
27,965
(0.74 %)
74 human (HG01175.pat 2021)
GCA_018471065.1
n/a n/a 20,651
(1.85 %)
22,302
(1.25 %)
233,105
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 365
(100.00 %)
5,401,789
(53.10 %)
1,061,956
(7.62 %)
16,016,635
(40.44 %)
0
(0 %)
1,703,810
(3.35 %)
52,440
(1.16 %)
28,285
(0.75 %)
75 human (HG01243 John Hopkins 2021)
GCA_018873775.2
n/a 136,220
(3.63 %)
20,695
(1.80 %)
21,215
(1.16 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 89
(100.00 %)
5,500,678
(53.98 %)
1,144,246
(8.84 %)
16,158,123
(41.58 %)
0
(0 %)
1,986,274
(3.76 %)
52,048
(1.37 %)
29,325
(0.77 %)
76 human (HG01243.mat 2021)
GCA_018504375.1
n/a n/a 20,701
(1.85 %)
22,327
(1.24 %)
232,970
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 345
(100.00 %)
5,384,218
(53.11 %)
1,029,835
(7.61 %)
15,997,541
(40.37 %)
0
(0 %)
1,731,890
(3.37 %)
52,287
(1.16 %)
28,186
(0.75 %)
77 human (HG01243.pat 2021)
GCA_018504045.1
n/a n/a 19,886
(1.86 %)
21,597
(1.26 %)
227,249
(5.00 %)
40.90
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
436
(100.00 %)
5,188,879
(52.80 %)
1,041,178
(7.85 %)
15,168,227
(40.25 %)
0
(0 %)
1,664,015
(3.44 %)
51,387
(1.26 %)
28,132
(0.77 %)
78 human (HG01258.mat 2021)
GCA_018469405.1
n/a n/a 20,652
(1.85 %)
22,270
(1.25 %)
233,297
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
346
(100.00 %)
5,421,505
(53.06 %)
1,070,796
(7.57 %)
15,904,078
(40.29 %)
0
(0 %)
1,710,255
(3.35 %)
52,952
(1.24 %)
28,873
(0.78 %)
79 human (HG01258.pat 2021)
GCA_018469675.1
n/a n/a 19,899
(1.85 %)
21,663
(1.25 %)
227,048
(4.98 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
324
(100.00 %)
5,179,894
(52.93 %)
1,053,273
(8.01 %)
15,211,574
(40.34 %)
0
(0 %)
1,687,885
(3.50 %)
50,868
(1.15 %)
27,621
(0.75 %)
80 human (HG01358.mat 2021)
GCA_018469865.1
n/a n/a 20,620
(1.85 %)
22,173
(1.24 %)
232,988
(57.14 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
334
(100.00 %)
5,408,314
(53.13 %)
1,082,369
(7.68 %)
15,986,592
(40.42 %)
0
(0 %)
1,748,971
(3.46 %)
52,497
(1.15 %)
28,292
(0.75 %)
81 human (HG01358.pat 2021)
GCA_018469965.1
n/a n/a 19,983
(1.85 %)
21,787
(1.25 %)
227,373
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
441
(100.00 %)
5,212,793
(53.10 %)
1,073,348
(8.29 %)
15,098,284
(40.47 %)
0
(0 %)
1,745,585
(3.57 %)
51,706
(1.21 %)
28,121
(0.77 %)
82 human (HG01361.mat 2021)
GCA_018469685.1
n/a n/a 20,709
(1.85 %)
22,220
(1.24 %)
233,019
(4.95 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 295
(100.00 %)
5,400,880
(53.06 %)
1,072,673
(7.57 %)
15,970,600
(40.36 %)
0
(0 %)
1,718,918
(3.41 %)
52,279
(1.19 %)
28,479
(0.76 %)
83 human (HG01361.pat 2021)
GCA_018469705.1
n/a n/a 20,643
(1.86 %)
22,265
(1.25 %)
233,156
(4.98 %)
40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
288
(100.00 %)
5,389,985
(52.82 %)
1,039,540
(7.07 %)
15,972,086
(40.01 %)
0
(0 %)
1,639,198
(3.24 %)
52,246
(1.17 %)
28,320
(0.75 %)
84 human (HG01891.mat 2021)
GCA_018467155.1
n/a n/a 20,644
(1.86 %)
22,204
(1.24 %)
233,342
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
331
(100.00 %)
5,394,888
(53.00 %)
1,057,773
(7.41 %)
16,010,248
(40.29 %)
0
(0 %)
1,698,458
(3.35 %)
52,761
(1.18 %)
28,443
(0.76 %)
85 human (HG01891.pat 2021)
GCA_018467165.1
n/a n/a 20,737
(1.84 %)
22,422
(1.25 %)
233,650
(4.94 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
427
(100.00 %)
5,403,741
(53.18 %)
1,044,828
(7.78 %)
15,926,586
(40.45 %)
0
(0 %)
1,873,046
(3.60 %)
52,966
(1.19 %)
28,638
(0.76 %)
86 human (HG01928.mat 2021)
GCA_018472695.1
n/a n/a 20,608
(1.85 %)
22,133
(1.24 %)
232,837
(4.94 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 244
(100.00 %)
5,393,247
(53.12 %)
1,066,426
(7.67 %)
15,949,983
(40.40 %)
0
(0 %)
1,763,911
(3.46 %)
51,940
(1.16 %)
28,097
(0.75 %)
87 human (HG01928.pat 2021)
GCA_018472705.1
n/a n/a 19,872
(1.85 %)
21,396
(1.24 %)
226,741
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
317
(100.00 %)
5,191,849
(53.05 %)
1,052,422
(8.21 %)
15,216,610
(40.53 %)
0
(0 %)
1,685,112
(3.48 %)
50,940
(1.18 %)
27,635
(0.76 %)
88 human (HG01952.mat 2021)
GCA_018471545.1
n/a n/a 20,679
(1.86 %)
22,204
(1.25 %)
233,578
(4.98 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 307
(100.00 %)
5,393,904
(52.87 %)
1,041,237
(7.18 %)
15,894,360
(39.98 %)
0
(0 %)
1,656,772
(3.27 %)
52,866
(1.21 %)
28,673
(0.77 %)
89 human (HG01952.pat 2021)
GCA_018471555.1
n/a n/a 19,863
(1.85 %)
21,383
(1.24 %)
226,809
(4.97 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 378
(100.00 %)
5,181,545
(52.95 %)
1,053,224
(8.07 %)
15,149,369
(40.47 %)
0
(0 %)
1,741,906
(3.59 %)
51,292
(1.24 %)
28,192
(0.78 %)
90 human (HG01978.mat 2021)
GCA_018472865.1
n/a n/a 20,711
(1.84 %)
22,195
(1.24 %)
233,223
(4.92 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 247
(100.00 %)
5,415,439
(53.41 %)
1,076,389
(8.28 %)
16,001,461
(40.83 %)
0
(0 %)
1,837,425
(3.56 %)
52,688
(1.16 %)
28,504
(0.75 %)
91 human (HG01978.pat 2021)
GCA_018472845.1
n/a n/a 20,727
(1.84 %)
22,443
(1.25 %)
233,592
(4.92 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
286
(100.00 %)
5,424,250
(53.38 %)
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(8.17 %)
15,938,736
(40.68 %)
0
(0 %)
1,857,872
(3.63 %)
52,674
(1.19 %)
28,529
(0.75 %)
92 human (HG02055.mat 2021)
GCA_018506125.1
n/a n/a 20,668
(1.86 %)
22,497
(1.26 %)
233,148
(4.96 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
306
(100.00 %)
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(52.96 %)
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(7.31 %)
16,015,246
(40.18 %)
0
(0 %)
1,711,779
(3.38 %)
52,182
(1.14 %)
28,129
(0.74 %)
93 human (HG02055.pat 2021)
GCA_018505855.1
n/a n/a 19,927
(1.83 %)
21,549
(1.23 %)
227,271
(4.93 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 367
(100.00 %)
5,216,705
(53.37 %)
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(8.82 %)
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(40.89 %)
0
(0 %)
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(3.73 %)
51,291
(1.20 %)
27,937
(0.76 %)
94 human (HG02080.mat 2021)
GCA_018504085.1
n/a n/a 20,633
(1.85 %)
22,288
(1.24 %)
233,237
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
422
(100.00 %)
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(53.12 %)
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(7.68 %)
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(40.28 %)
0
(0 %)
1,751,713
(3.42 %)
52,572
(1.21 %)
28,530
(0.77 %)
95 human (HG02080.pat 2021)
GCA_018504055.1
n/a n/a 20,645
(1.85 %)
22,426
(1.26 %)
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(4.96 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 485
(100.00 %)
5,400,305
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(7.39 %)
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(40.12 %)
0
(0 %)
1,695,953
(3.33 %)
52,798
(1.20 %)
28,645
(0.77 %)
96 human (HG02109.mat 2021)
GCA_018505825.1
n/a n/a 20,672
(1.85 %)
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(1.25 %)
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(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 445
(100.00 %)
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(52.99 %)
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(7.38 %)
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(40.16 %)
0
(0 %)
1,773,533
(3.47 %)
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(1.21 %)
28,671
(0.77 %)
97 human (HG02109.pat 2021)
GCA_018505865.1
n/a n/a 20,726
(1.85 %)
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(1.25 %)
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(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
481
(100.00 %)
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(53.08 %)
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(7.55 %)
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(40.27 %)
0
(0 %)
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(3.39 %)
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(1.18 %)
28,556
(0.76 %)
98 human (HG02145.mat 2021)
GCA_018852585.1
n/a n/a 20,626
(1.85 %)
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(1.25 %)
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(4.94 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
437
(100.00 %)
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(53.08 %)
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(7.58 %)
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(40.24 %)
0
(0 %)
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(3.36 %)
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(1.19 %)
28,564
(0.75 %)
99 human (HG02145.pat 2021)
GCA_018852595.1
n/a n/a 19,971
(1.84 %)
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(1.40 %)
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(4.94 %)
40.91
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
817
(100.00 %)
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(8.52 %)
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(40.43 %)
0
(0 %)
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(3.61 %)
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(1.32 %)
29,473
(0.88 %)
100 human (HG02148.mat 2021)
GCA_018471535.1
n/a n/a 20,622
(1.85 %)
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(1.24 %)
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(4.94 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 423
(100.00 %)
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(7.85 %)
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0
(0 %)
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(3.35 %)
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(1.14 %)
28,236
(0.74 %)
101 human (HG02148.pat 2021)
GCA_018471525.1
n/a n/a 20,675
(1.85 %)
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(1.25 %)
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(4.96 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 487
(100.00 %)
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(53.04 %)
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(7.55 %)
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(40.19 %)
0
(0 %)
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(3.42 %)
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(1.23 %)
28,850
(0.77 %)
102 human (HG02257.mat 2021)
GCA_018466845.1
n/a n/a 20,636
(1.85 %)
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(1.24 %)
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(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
292
(100.00 %)
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(53.10 %)
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(7.60 %)
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(40.43 %)
0
(0 %)
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(3.44 %)
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(1.16 %)
28,293
(0.75 %)
103 human (HG02257.pat 2021)
GCA_018466835.1
n/a n/a 20,659
(1.84 %)
22,252
(1.23 %)
233,332
(4.93 %)
40.78
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 306
(100.00 %)
5,414,841
(53.29 %)
1,077,125
(7.99 %)
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(40.53 %)
0
(0 %)
1,858,343
(3.60 %)
52,638
(1.18 %)
28,403
(0.75 %)
104 human (HG02486.mat 2021)
GCA_018467015.1
n/a n/a 20,626
(1.85 %)
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(1.24 %)
232,923
(4.95 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
283
(100.00 %)
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(53.15 %)
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(7.68 %)
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(40.44 %)
0
(0 %)
1,743,020
(3.45 %)
52,593
(1.16 %)
28,402
(0.76 %)
105 human (HG02486.pat 2021)
GCA_018467005.1
n/a n/a 20,047
(1.86 %)
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(1.24 %)
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(4.97 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
342
(100.00 %)
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(53.10 %)
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(8.26 %)
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(40.62 %)
0
(0 %)
1,739,327
(3.57 %)
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(1.16 %)
27,863
(0.76 %)
106 human (HG02559.mat 2021)
GCA_018466985.1
n/a n/a 20,748
(1.85 %)
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(1.25 %)
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(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 329
(100.00 %)
5,409,998
(53.11 %)
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(7.64 %)
15,944,107
(40.38 %)
0
(0 %)
1,799,081
(3.49 %)
53,297
(1.22 %)
28,800
(0.77 %)
107 human (HG02559.pat 2021)
GCA_018466855.1
n/a n/a 20,684
(1.85 %)
22,457
(1.26 %)
233,500
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
260
(100.00 %)
5,394,499
(53.00 %)
1,048,556
(7.39 %)
16,015,449
(40.28 %)
0
(0 %)
1,772,200
(3.48 %)
52,834
(1.17 %)
28,486
(0.76 %)
108 human (HG02572.mat 2021)
GCA_018470445.1
n/a n/a 20,823
(1.84 %)
22,634
(1.24 %)
232,547
(4.89 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
632
(100.00 %)
5,435,641
(53.28 %)
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(7.96 %)
15,851,923
(40.45 %)
0
(0 %)
1,808,343
(3.57 %)
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(1.21 %)
28,781
(0.76 %)
109 human (HG02572.pat 2021)
GCA_018470435.1
n/a n/a 20,054
(1.85 %)
21,827
(1.25 %)
225,951
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
641
(100.00 %)
5,213,929
(53.30 %)
1,082,137
(8.76 %)
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(40.69 %)
0
(0 %)
1,884,567
(3.86 %)
51,312
(1.19 %)
27,939
(0.75 %)
110 human (HG02622.mat 2021)
GCA_018469875.1
n/a n/a 20,669
(1.84 %)
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(1.24 %)
233,354
(4.93 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 292
(100.00 %)
5,446,540
(53.17 %)
1,085,576
(7.76 %)
15,975,207
(40.52 %)
0
(0 %)
1,776,427
(3.47 %)
53,535
(1.26 %)
28,986
(0.77 %)
111 human (HG02622.pat 2021)
GCA_018469925.1
n/a n/a 20,698
(1.84 %)
22,536
(1.25 %)
233,733
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
270
(100.00 %)
5,421,378
(53.22 %)
1,062,842
(7.81 %)
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(40.46 %)
0
(0 %)
1,803,645
(3.51 %)
52,975
(1.21 %)
28,639
(0.75 %)
112 human (HG02630.mat 2021)
GCA_018469955.1
n/a n/a 20,674
(1.84 %)
22,467
(1.25 %)
233,172
(4.93 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
497
(100.00 %)
5,432,857
(53.10 %)
1,072,648
(7.64 %)
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(40.53 %)
0
(0 %)
1,722,501
(3.36 %)
54,101
(1.32 %)
29,504
(0.80 %)
113 human (HG02630.pat 2021)
GCA_018469945.1
n/a n/a 20,722
(1.83 %)
22,445
(1.24 %)
233,268
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
534
(100.00 %)
5,449,816
(53.34 %)
1,108,461
(8.05 %)
15,985,498
(40.79 %)
0
(0 %)
1,803,634
(3.57 %)
53,746
(1.28 %)
29,112
(0.77 %)
114 human (HG02717.mat 2021)
GCA_018469935.1
n/a n/a 20,621
(1.84 %)
22,396
(1.25 %)
233,096
(4.93 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
323
(100.00 %)
5,411,829
(53.22 %)
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(7.87 %)
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(40.43 %)
0
(0 %)
1,785,077
(3.54 %)
53,155
(1.21 %)
28,854
(0.78 %)
115 human (HG02717.pat 2021)
GCA_018470425.1
n/a n/a 19,952
(1.84 %)
21,767
(1.25 %)
227,273
(4.93 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
399
(100.00 %)
5,216,997
(53.34 %)
1,089,537
(8.70 %)
15,132,132
(40.83 %)
0
(0 %)
1,819,884
(3.72 %)
51,815
(1.21 %)
28,146
(0.76 %)
116 human (HG02723.mat 2021)
GCA_018504065.1
n/a n/a 20,697
(1.85 %)
22,322
(1.25 %)
233,152
(4.95 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
429
(100.00 %)
5,403,282
(53.05 %)
1,062,881
(7.52 %)
15,861,495
(40.19 %)
0
(0 %)
1,727,512
(3.39 %)
52,733
(1.19 %)
28,558
(0.76 %)
117 human (HG02723.pat 2021)
GCA_018504075.1
n/a n/a 20,606
(1.84 %)
22,627
(1.25 %)
233,499
(4.92 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
529
(100.00 %)
5,419,888
(53.29 %)
1,079,052
(8.00 %)
15,778,626
(40.44 %)
0
(0 %)
1,828,728
(3.61 %)
53,133
(1.23 %)
28,789
(0.77 %)
118 human (HG02818.mat 2021)
GCA_018503585.1
n/a n/a 20,695
(1.85 %)
22,489
(1.25 %)
233,161
(4.93 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
620
(100.00 %)
5,406,404
(53.21 %)
1,061,348
(7.77 %)
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(40.38 %)
0
(0 %)
1,755,044
(3.46 %)
52,992
(1.18 %)
28,591
(0.77 %)
119 human (HG02818.pat 2021)
GCA_018503575.1
n/a n/a 20,696
(1.86 %)
22,490
(1.27 %)
233,253
(4.97 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
566
(100.00 %)
5,397,389
(52.88 %)
1,044,887
(7.21 %)
16,011,018
(40.13 %)
0
(0 %)
1,663,167
(3.29 %)
52,793
(1.17 %)
28,656
(0.76 %)
120 human (HG02886.mat 2021)
GCA_018470455.1
n/a n/a 20,740
(1.84 %)
22,693
(1.25 %)
233,895
(4.94 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 461
(100.00 %)
5,448,421
(53.12 %)
1,077,973
(7.55 %)
15,956,661
(40.38 %)
0
(0 %)
1,776,179
(3.47 %)
53,701
(1.29 %)
29,198
(0.78 %)
121 human (HG02886.pat 2021)
GCA_018470465.1
n/a n/a 20,705
(1.84 %)
22,599
(1.26 %)
233,328
(4.93 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 503
(100.00 %)
5,438,367
(53.15 %)
1,090,141
(7.70 %)
16,016,158
(40.57 %)
0
(0 %)
1,803,515
(3.52 %)
53,652
(1.26 %)
29,087
(0.78 %)
122 human (HG03098.mat 2021)
GCA_018506165.1
n/a n/a 20,700
(1.83 %)
22,200
(1.24 %)
233,714
(4.91 %)
40.79
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 331
(100.00 %)
5,414,502
(53.46 %)
1,066,527
(8.36 %)
15,926,377
(40.78 %)
0
(0 %)
1,890,567
(3.67 %)
52,417
(1.18 %)
28,468
(0.76 %)
123 human (HG03098.pat 2021)
GCA_018506155.1
n/a n/a 19,900
(1.84 %)
21,567
(1.24 %)
226,998
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
445
(100.00 %)
5,201,143
(53.24 %)
1,083,861
(8.56 %)
15,069,721
(40.64 %)
0
(0 %)
1,817,407
(3.73 %)
51,389
(1.21 %)
28,025
(0.77 %)
124 human (HG03453.mat 2021)
GCA_018472855.1
n/a n/a 20,710
(1.84 %)
22,595
(1.25 %)
233,614
(4.93 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
439
(100.00 %)
5,436,784
(53.21 %)
1,094,451
(7.82 %)
15,990,282
(40.60 %)
0
(0 %)
1,790,931
(3.50 %)
53,318
(1.27 %)
29,023
(0.78 %)
125 human (HG03453.pat 2021)
GCA_018473305.1
n/a n/a 20,661
(1.84 %)
22,407
(1.25 %)
233,945
(4.93 %)
40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 480
(100.00 %)
5,418,964
(53.30 %)
1,060,724
(7.98 %)
15,795,098
(40.40 %)
0
(0 %)
1,768,342
(3.49 %)
53,149
(1.21 %)
28,793
(0.76 %)
126 human (HG03486.mat 2021)
GCA_018503525.1
n/a n/a 20,760
(1.85 %)
22,730
(1.26 %)
233,655
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
480
(100.00 %)
5,422,116
(53.02 %)
1,069,864
(7.46 %)
15,951,020
(40.27 %)
0
(0 %)
1,711,781
(3.37 %)
53,338
(1.19 %)
28,836
(0.77 %)
127 human (HG03486.pat 2021)
GCA_018503245.1
n/a n/a 20,698
(1.84 %)
22,539
(1.24 %)
233,646
(4.92 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
519
(100.00 %)
5,426,413
(53.27 %)
1,068,800
(7.93 %)
15,812,092
(40.41 %)
0
(0 %)
1,763,702
(3.47 %)
53,143
(1.26 %)
28,964
(0.77 %)
128 human (HG03492.mat 2021)
GCA_018505845.1
n/a n/a 20,677
(1.85 %)
22,401
(1.25 %)
233,402
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
495
(100.00 %)
5,393,586
(52.97 %)
1,050,402
(7.38 %)
15,875,935
(40.07 %)
0
(0 %)
1,696,294
(3.31 %)
52,994
(1.18 %)
28,556
(0.76 %)
129 human (HG03492.pat 2021)
GCA_018505835.1
n/a n/a 19,970
(1.85 %)
21,672
(1.25 %)
227,277
(4.97 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 618
(100.00 %)
5,202,430
(53.00 %)
1,069,560
(8.18 %)
15,071,476
(40.33 %)
0
(0 %)
1,723,247
(3.56 %)
51,291
(1.19 %)
27,972
(0.77 %)
130 human (HG03516.mat 2021)
GCA_018469425.1
n/a n/a 20,766
(1.85 %)
22,424
(1.25 %)
233,619
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 320
(100.00 %)
5,437,541
(52.96 %)
1,084,729
(7.35 %)
16,097,675
(40.30 %)
0
(0 %)
1,676,970
(3.29 %)
52,953
(1.18 %)
28,552
(0.75 %)
131 human (HG03516.pat 2021)
GCA_018469415.1
n/a n/a 20,820
(1.84 %)
22,672
(1.25 %)
234,068
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
369
(100.00 %)
5,451,270
(53.44 %)
1,086,645
(8.28 %)
15,991,774
(40.84 %)
0
(0 %)
1,839,829
(3.59 %)
53,435
(1.18 %)
28,828
(0.76 %)
132 human (HG03540.mat 2021)
GCA_018473295.1
n/a n/a 20,665
(1.84 %)
22,566
(1.26 %)
233,386
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
435
(100.00 %)
5,436,802
(53.34 %)
1,105,174
(8.06 %)
15,931,296
(40.72 %)
0
(0 %)
1,845,562
(3.57 %)
53,436
(1.26 %)
28,988
(0.77 %)
133 human (HG03540.pat 2021)
GCA_018473315.1
n/a n/a 20,724
(1.83 %)
22,627
(1.25 %)
233,360
(4.91 %)
40.83
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
512
(100.00 %)
5,449,110
(53.39 %)
1,087,677
(8.16 %)
15,936,844
(40.79 %)
0
(0 %)
1,879,693
(3.62 %)
53,859
(1.30 %)
29,476
(0.80 %)
134 human (HG03579.mat 2021)
GCA_018472825.1
n/a n/a 20,702
(1.85 %)
22,327
(1.25 %)
233,403
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
456
(100.00 %)
5,423,189
(53.07 %)
1,075,620
(7.56 %)
15,928,710
(40.31 %)
0
(0 %)
1,725,858
(3.40 %)
53,423
(1.24 %)
28,889
(0.78 %)
135 human (HG03579.pat 2021)
GCA_018472835.1
n/a n/a 19,942
(1.84 %)
21,710
(1.25 %)
227,313
(4.94 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 499
(100.00 %)
5,226,752
(53.28 %)
1,092,235
(8.58 %)
15,143,136
(40.79 %)
0
(0 %)
1,814,912
(3.72 %)
51,622
(1.24 %)
28,360
(0.77 %)
136 human (mHomSap3 WGS:JACSEX01 2021)
GCA_016695395.2
n/a n/a 20,401
(1.92 %)
20,682
(1.21 %)
n/a 40.87
(99.64 %)
0
(0 %)
1,217
(0.36 %)
950
(100.00 %)
5,350,025
(52.32 %)
1,006,502
(4.68 %)
15,969,368
(38.50 %)
5
(0.00 %)
1,469,922
(2.89 %)
50,826
(1.08 %)
27,969
(0.75 %)
137 human (NA12878 2018)
GCA_002077035.3
n/a n/a 20,167
(1.92 %)
20,287
(1.19 %)
n/a 40.87
(92.33 %)
1,178
(7.67 %)
1,124
(7.67 %)
3,663
(92.33 %)
5,377,551
(52.07 %)
998,908
(3.46 %)
15,892,349
(35.13 %)
0
(0 %)
1,266,150
(2.30 %)
49,940
(0.97 %)
27,544
(0.69 %)
138 human (NA18906.mat 2021)
GCA_018503255.1
n/a n/a 20,739
(1.84 %)
22,340
(1.25 %)
233,812
(4.92 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 271
(100.00 %)
5,464,910
(53.26 %)
1,101,031
(7.88 %)
15,871,098
(40.43 %)
0
(0 %)
1,765,214
(3.46 %)
53,290
(1.27 %)
29,035
(0.78 %)
139 human (NA18906.pat 2021)
GCA_018503285.1
n/a n/a 20,765
(1.85 %)
22,414
(1.25 %)
234,102
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 304
(100.00 %)
5,443,478
(53.06 %)
1,085,707
(7.53 %)
15,888,465
(40.19 %)
0
(0 %)
1,786,732
(3.48 %)
53,328
(1.24 %)
28,936
(0.77 %)
140 human (NA19240.mat 2021)
GCA_018503275.1
n/a n/a 20,678
(1.85 %)
22,534
(1.26 %)
233,508
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
387
(100.00 %)
5,404,648
(52.98 %)
1,047,126
(7.31 %)
15,970,133
(40.15 %)
0
(0 %)
1,720,710
(3.38 %)
52,529
(1.17 %)
28,454
(0.75 %)
141 human (NA19240.pat 2021)
GCA_018503265.1
n/a n/a 20,772
(1.85 %)
22,461
(1.25 %)
233,684
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
453
(100.00 %)
5,424,224
(53.08 %)
1,063,925
(7.53 %)
15,954,132
(40.32 %)
0
(0 %)
1,771,797
(3.47 %)
53,106
(1.23 %)
28,804
(0.77 %)
142 human (NA20129.mat 2021)
GCA_018504635.1
n/a n/a 20,664
(1.84 %)
22,511
(1.24 %)
233,033
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
448
(100.00 %)
5,420,332
(53.24 %)
1,067,867
(7.86 %)
15,932,491
(40.50 %)
0
(0 %)
1,857,726
(3.61 %)
53,011
(1.20 %)
28,542
(0.76 %)
143 human (NA20129.pat 2021)
GCA_018504625.1
n/a n/a 20,706
(1.85 %)
22,365
(1.26 %)
233,543
(4.96 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 481
(100.00 %)
5,401,495
(53.02 %)
1,051,311
(7.46 %)
16,041,778
(40.34 %)
0
(0 %)
1,700,248
(3.36 %)
52,911
(1.18 %)
28,488
(0.75 %)
144 human (NA21309.mat 2021)
GCA_018504655.1
n/a n/a 20,635
(1.84 %)
22,458
(1.25 %)
233,555
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
508
(100.00 %)
5,389,804
(53.21 %)
1,045,498
(7.82 %)
15,862,735
(40.38 %)
0
(0 %)
1,852,080
(3.61 %)
52,479
(1.17 %)
28,460
(0.75 %)
145 human (NA21309.pat 2021)
GCA_018504665.1
n/a n/a 20,685
(1.85 %)
22,478
(1.25 %)
233,394
(4.95 %)
40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
608
(100.00 %)
5,399,150
(53.06 %)
1,053,638
(7.58 %)
15,999,929
(40.35 %)
0
(0 %)
1,741,217
(3.44 %)
52,798
(1.17 %)
28,498
(0.75 %)
146 human (NA24385 2024)
GCA_018852605.3
n/a n/a 19,911
(1.84 %)
20,386
(1.19 %)
n/a 40.79
(99.74 %)
4
(0.26 %)
4
(0.26 %)
27
(99.74 %)
5,196,876
(53.37 %)
1,083,107
(8.63 %)
15,221,623
(40.81 %)
0
(0 %)
1,762,169
(3.62 %)
50,567
(1.11 %)
27,431
(0.73 %)
147 human (NA24385 2024)
GCA_018852615.3
n/a n/a 20,672
(1.86 %)
21,183
(1.20 %)
n/a 40.82
(99.23 %)
0
(0 %)
5
(0.77 %)
24
(100.00 %)
5,394,318
(53.04 %)
1,041,890
(7.44 %)
16,039,468
(40.04 %)
0
(0 %)
1,747,805
(3.36 %)
52,111
(1.11 %)
28,051
(0.73 %)
148 human (NA24385 HG002 alt pat 2023)
GCA_018852605.2
n/a n/a 19,962
(1.84 %)
20,471
(1.19 %)
n/a 40.79
(99.74 %)
4
(0.26 %)
4
(0.26 %)
27
(99.74 %)
5,196,926
(53.37 %)
1,083,984
(8.63 %)
15,221,567
(40.81 %)
0
(0 %)
1,762,077
(3.62 %)
50,569
(1.11 %)
27,432
(0.73 %)
149 human (NA24385 HG002 pri mat 2023)
GCA_018852615.2
n/a n/a 20,637
(1.85 %)
21,256
(1.20 %)
n/a 40.82
(99.23 %)
0
(0 %)
5
(0.77 %)
24
(100.00 %)
5,394,439
(53.04 %)
1,041,946
(7.44 %)
16,039,487
(40.04 %)
0
(0 %)
1,747,868
(3.36 %)
52,111
(1.11 %)
28,050
(0.73 %)
150 human (NA24631.mat 2021)
GCA_018506965.1
n/a n/a 20,683
(1.85 %)
22,446
(1.25 %)
233,691
(4.96 %)
40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
503
(100.00 %)
5,423,411
(52.98 %)
1,075,094
(7.46 %)
15,897,770
(40.32 %)
0
(0 %)
1,659,982
(3.29 %)
53,731
(1.31 %)
29,377
(0.80 %)
151 human (NA24631.pat 2021)
GCA_018506945.1
n/a n/a 19,910
(1.84 %)
21,610
(1.24 %)
227,521
(4.95 %)
40.90
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
682
(100.00 %)
5,224,127
(53.12 %)
1,078,588
(8.33 %)
15,264,128
(40.95 %)
0
(0 %)
1,760,557
(3.59 %)
53,164
(1.35 %)
29,066
(0.82 %)
152 human (WGS:JACSEW01 2021 alternate hap)
GCA_016700455.2
n/a n/a 19,667
(1.95 %)
20,065
(1.23 %)
n/a 40.96
(99.60 %)
0
(0 %)
1,172
(0.40 %)
994
(100.00 %)
5,086,372
(51.37 %)
932,450
(3.67 %)
15,152,141
(37.48 %)
3
(0.00 %)
1,198,599
(2.54 %)
49,325
(1.10 %)
27,202
(0.77 %)
153 lesser dwarf lemur
GCA_004024725.1
n/a n/a 22,605
(1.80 %)
35,000
(1.46 %)
93,377
(1.59 %)
40.49
(99.93 %)
7,529
(0.03 %)
7,529
(0.03 %)
555,280
(99.97 %)
3,959,297
(40.17 %)
448,919
(1.48 %)
14,173,023
(34.36 %)
17
(0.00 %)
384,937
(0.93 %)
59,165
(1.83 %)
55,410
(1.57 %)
154 liontail macaque (KIZ-2021_14 2022)
GCA_023807365.1
n/a n/a 20,076
(1.92 %)
21,253
(1.27 %)
n/a 41.00
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,809
(100.00 %)
5,224,024
(50.13 %)
966,236
(2.84 %)
15,526,314
(37.59 %)
0
(0 %)
1,150,596
(2.67 %)
95,662
(1.45 %)
27,277
(0.74 %)
155 Ma's night monkey (86115 2017)
GCF_000952055.2
55,061
(2.59 %)
n/a 21,075
(1.93 %)
22,284
(1.31 %)
n/a 40.74
(94.86 %)
83,929
(5.15 %)
83,930
(5.15 %)
112,851
(94.85 %)
5,110,193
(47.72 %)
734,754
(2.02 %)
15,854,219
(33.62 %)
2,334
(0.15 %)
767,103
(3.42 %)
36,070
(0.90 %)
31,861
(0.80 %)
156 Ma's night monkey (86718 primary hap 2023)
GCF_030222135.1
68,130
(2.77 %)
n/a 21,473
(1.75 %)
22,864
(1.27 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
1,279
(100.00 %)
6,068,780
(50.14 %)
1,323,878
(14.77 %)
14,791,453
(44.23 %)
0
(0 %)
2,354,421
(5.14 %)
39,298
(0.97 %)
33,941
(0.82 %)
157 mandrill (KIZ-2021_16 2022)
GCA_023783085.1
n/a n/a 19,791
(1.87 %)
20,371
(1.22 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,118
(100.00 %)
5,243,719
(50.36 %)
887,893
(4.65 %)
15,735,772
(37.47 %)
0
(0 %)
2,048,518
(8.45 %)
56,250
(1.08 %)
27,360
(0.73 %)
158 mantled guereza (KIZ-2021_5 2022)
GCA_021498455.1
n/a n/a 20,513
(1.82 %)
19,660
(1.13 %)
n/a 41.04
(100.00 %)
0
(0 %)
1,497
(0.01 %)
1,657
(100.00 %)
5,461,121
(51.32 %)
883,213
(4.71 %)
16,070,936
(39.09 %)
1
(0.00 %)
2,635,865
(11.84 %)
88,240
(1.32 %)
29,065
(0.71 %)
159 mantled howler monkey
GCA_004027835.1
n/a n/a 26,541
(1.65 %)
40,210
(1.16 %)
41,017
(1.17 %)
40.83
(99.88 %)
16,130
(0.05 %)
16,130
(0.05 %)
1,152,695
(99.95 %)
6,216,031
(48.47 %)
1,428,462
(4.68 %)
16,106,098
(41.41 %)
49
(0.00 %)
n/a 41,196
(0.86 %)
32,546
(0.73 %)
160 Midas tamarin (KIZ-2021_24 2022)
GCA_021498475.1
n/a n/a 22,338
(1.81 %)
21,018
(1.21 %)
n/a 40.83
(99.99 %)
0
(0 %)
2,202
(0.01 %)
1,785
(100.00 %)
5,279,304
(49.24 %)
891,690
(5.38 %)
15,489,304
(40.20 %)
1
(0.00 %)
2,792,535
(12.12 %)
33,273
(0.87 %)
30,251
(0.77 %)
161 Mittermeier's mouse lemur (MBB011 2019)
GCA_008750955.1
n/a n/a 29,260
(1.35 %)
67,847
(1.24 %)
n/a 41.40
(99.97 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
519,784
(100.00 %)
5,222,743
(40.21 %)
829,392
(2.00 %)
18,470,705
(32.22 %)
0
(0 %)
n/a 114,172
(2.72 %)
106,390
(2.28 %)
162 Moholi bushbaby (KIZ-2021_8 2022)
GCA_023783435.1
n/a n/a 21,770
(1.69 %)
22,699
(1.34 %)
n/a 41.24
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11,899
(100.00 %)
4,165,183
(35.88 %)
517,791
(1.28 %)
14,030,905
(35.05 %)
0
(0 %)
826,207
(2.16 %)
24,950
(0.68 %)
23,799
(0.63 %)
163 mongoose lemur (Sample1262 2023)
GCA_028534055.1
n/a n/a 21,099
(1.77 %)
26,747
(1.35 %)
n/a 41.07
(99.28 %)
0
(0 %)
50,948
(0.64 %)
1,055,658
(100.00 %)
4,281,042
(38.54 %)
463,179
(0.85 %)
15,648,643
(29.74 %)
2,912
(0.10 %)
n/a 60,222
(1.53 %)
55,511
(1.35 %)
164 northern giant mouse lemur (DLC2301 2019)
GCA_008750895.1
n/a n/a 24,310
(1.79 %)
41,143
(1.48 %)
n/a 40.89
(99.98 %)
8,621
(0.01 %)
8,621
(0.01 %)
150,551
(99.99 %)
3,988,204
(40.75 %)
558,305
(1.67 %)
14,391,423
(31.84 %)
1,404
(0.01 %)
n/a 69,842
(2.42 %)
66,570
(2.05 %)
165 northern rufous mouse lemur (RMR71 2019)
GCA_008750935.1
n/a n/a 26,930
(1.57 %)
53,040
(1.36 %)
n/a 41.19
(99.96 %)
21,784
(0.02 %)
21,784
(0.02 %)
367,864
(99.98 %)
4,447,327
(40.51 %)
735,909
(2.38 %)
15,424,516
(33.03 %)
4,084
(0.03 %)
n/a 91,576
(2.46 %)
85,360
(2.10 %)
166 northern white-cheeked gibbon (2019 U. Washington)
GCF_006542625.1
60,700
(2.64 %)
55,100
(2.50 %)
20,360
(1.92 %)
21,533
(1.26 %)
50,062
(2.05 %)
41.03
(99.47 %)
509
(0.53 %)
510
(0.53 %)
2,762
(99.47 %)
5,237,782
(51.76 %)
902,578
(4.06 %)
15,431,824
(38.31 %)
0
(0 %)
1,541,603
(3.07 %)
71,450
(1.25 %)
26,815
(0.72 %)
167 olive baboon (2019 UCSF)
GCF_008728515.1
93,385
(3.84 %)
n/a 20,382
(1.88 %)
21,115
(1.19 %)
56,345
(1.82 %)
40.89
(99.92 %)
0
(0 %)
4,098
(0.08 %)
11,145
(100.00 %)
5,514,823
(51.36 %)
937,126
(2.31 %)
16,410,891
(37.14 %)
103
(0.00 %)
903,508
(1.85 %)
77,919
(1.22 %)
27,080
(0.70 %)
168 Panamanian white-faced capuchin
GCF_001604975.1
68,109
(2.82 %)
n/a 21,215
(2.01 %)
21,494
(1.35 %)
48,384
(2.19 %)
40.71
(96.08 %)
133,441
(3.94 %)
152,704
(3.94 %)
140,597
(96.06 %)
4,992,577
(47.59 %)
760,554
(1.72 %)
15,071,867
(33.72 %)
1,519
(0.02 %)
523,650
(1.38 %)
30,688
(0.83 %)
28,266
(0.75 %)
169 Pere David's macaque
GCF_024542745.1
74,798
(3.50 %)
n/a 20,233
(1.92 %)
20,671
(1.23 %)
56,171
(2.40 %)
41.00
(99.99 %)
0
(0 %)
367
(0.01 %)
623
(100.00 %)
5,363,770
(51.19 %)
1,033,990
(2.95 %)
15,744,042
(37.44 %)
1
(0.00 %)
1,250,849
(2.38 %)
90,119
(1.42 %)
28,221
(0.77 %)
170 Phayre's leaf monkey (KIZ-2021_27 2022)
GCA_023762245.1
n/a n/a 20,209
(1.84 %)
19,385
(1.14 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,946
(100.00 %)
5,406,430
(51.05 %)
923,398
(4.93 %)
15,879,389
(38.48 %)
0
(0 %)
1,701,018
(6.29 %)
53,257
(0.95 %)
25,291
(0.63 %)
171 Philippine tarsier
GCF_000164805.1
35,786
(1.36 %)
n/a 21,606
(1.23 %)
25,636
(1.04 %)
n/a 40.96
(98.61 %)
155,714
(1.39 %)
155,714
(1.39 %)
492,903
(98.61 %)
6,462,952
(48.20 %)
1,062,043
(2.47 %)
18,768,491
(40.02 %)
189
(0.00 %)
n/a 78,629
(1.04 %)
43,074
(0.68 %)
172 pig-tailed macaque
GCF_000956065.1
90,971
(3.40 %)
n/a 20,184
(1.89 %)
21,096
(1.24 %)
n/a 40.98
(96.27 %)
84,324
(3.74 %)
84,363
(3.74 %)
94,057
(96.26 %)
5,479,257
(50.37 %)
936,458
(2.35 %)
16,932,843
(34.70 %)
1,828
(0.04 %)
914,925
(2.56 %)
82,528
(1.29 %)
29,840
(0.74 %)
173 pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 refseq)
GCF_043159975.1
103,003
(4.05 %)
n/a 20,760
(1.76 %)
21,155
(1.14 %)
n/a 41.04
(100.00 %)
0
(0 %)
260
(0.00 %)
361
(100.00 %)
5,396,194
(53.53 %)
1,039,569
(9.75 %)
15,407,787
(41.73 %)
1
(0.00 %)
2,204,399
(4.61 %)
99,854
(1.52 %)
30,377
(0.77 %)
174 pig-tailed macaque (mMacNem1hap2 2024)
GCA_043161795.1
n/a n/a 19,859
(1.78 %)
20,597
(1.19 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
0
(0 %)
232
(0.00 %)
233
(100.00 %)
5,125,011
(53.00 %)
956,928
(9.12 %)
14,621,759
(41.68 %)
3
(0.00 %)
2,124,372
(4.63 %)
96,199
(1.55 %)
29,958
(0.79 %)
175 pileated gibbon (KIZ-2021_10 2022)
GCA_021498465.1
n/a n/a 19,878
(1.87 %)
19,755
(1.17 %)
49,811
(2.04 %)
41.16
(100.00 %)
0
(0 %)
824
(0.00 %)
743
(100.00 %)
5,336,929
(51.61 %)
960,136
(5.35 %)
15,409,711
(39.22 %)
0
(0 %)
1,909,054
(9.69 %)
93,447
(1.65 %)
26,056
(0.71 %)
176 proboscis monkey
GCA_004027105.1
n/a n/a 26,778
(1.60 %)
43,314
(1.07 %)
n/a 41.01
(99.89 %)
18,289
(0.06 %)
18,289
(0.06 %)
942,104
(99.94 %)
6,402,701
(53.25 %)
1,093,958
(2.69 %)
16,752,195
(39.70 %)
110
(0.00 %)
n/a 90,071
(1.21 %)
27,798
(0.64 %)
177 pygmy chimpanzee (maternal 2024)
GCA_028858845.2
n/a n/a 21,057
(1.75 %)
23,202
(1.22 %)
n/a 40.39
(99.88 %)
0
(0 %)
5
(0.12 %)
32
(100.00 %)
5,376,557
(50.39 %)
977,561
(12.42 %)
15,866,049
(43.26 %)
1
(0.03 %)
3,690,588
(6.27 %)
48,064
(1.07 %)
29,641
(0.75 %)
178 pygmy chimpanzee (Mhudiblu Carbone 601152 2020)
GCF_013052645.1
85,047
(3.05 %)
n/a n/a 21,403
(1.16 %)
n/a 40.57
(98.80 %)
683
(1.20 %)
683
(1.20 %)
4,976
(98.80 %)
4,937,695
(46.41 %)
960,717
(8.41 %)
15,846,875
(40.31 %)
1
(0.00 %)
3,019,527
(5.19 %)
45,540
(0.95 %)
29,429
(0.74 %)
179 pygmy chimpanzee (paternal 2024)
GCA_028858825.2
n/a n/a 20,282
(1.77 %)
21,509
(1.17 %)
n/a 40.46
(99.84 %)
0
(0 %)
7
(0.16 %)
38
(100.00 %)
5,163,745
(50.07 %)
970,057
(12.58 %)
15,047,429
(42.91 %)
0
(0 %)
3,587,013
(6.37 %)
47,029
(1.08 %)
28,919
(0.75 %)
180 pygmy chimpanzee (Ulindi refseq 2015)
GCF_000258655.2
59,345
(2.62 %)
n/a 19,943
(1.95 %)
18,807
(1.18 %)
n/a 40.74
(82.95 %)
111,087
(17.06 %)
156,797
(17.06 %)
121,337
(82.94 %)
5,134,959
(50.88 %)
775,493
(1.63 %)
15,570,598
(30.28 %)
70
(0.03 %)
729,770
(1.34 %)
43,049
(0.71 %)
26,731
(0.52 %)
181 pygmy chimpanzee (v2 primary hap 2024 genbank)
GCA_029289425.2
95,418
(45.95 %)
n/a 21,181
(1.74 %)
23,352
(1.22 %)
n/a 40.43
(99.84 %)
0
(0 %)
6
(0.16 %)
30
(100.00 %)
5,436,198
(50.57 %)
1,021,767
(12.45 %)
15,964,580
(43.17 %)
1
(0.03 %)
3,743,841
(6.31 %)
48,818
(1.07 %)
29,887
(0.74 %)
182 red guenon (BS28 Broad 2019)
GCA_004027335.1
n/a n/a 26,554
(1.40 %)
43,056
(0.94 %)
n/a 41.19
(99.83 %)
13,075
(0.04 %)
13,075
(0.04 %)
2,577,035
(99.96 %)
7,718,970
(56.55 %)
2,223,871
(8.85 %)
18,186,363
(47.01 %)
88
(0.00 %)
n/a 109,358
(1.37 %)
68,069
(0.96 %)
183 red guenon (KIZ-2021_7 2022)
GCA_023783455.1
n/a n/a 20,288
(1.73 %)
20,892
(1.15 %)
n/a 40.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,898
(100.00 %)
5,459,763
(52.49 %)
1,156,816
(8.57 %)
16,254,962
(40.87 %)
0
(0 %)
3,656,746
(14.23 %)
61,197
(1.47 %)
33,814
(0.87 %)
184 red shanked douc langur
GCA_004024825.1
n/a n/a 25,296
(1.59 %)
37,062
(1.07 %)
n/a 41.05
(99.87 %)
14,638
(0.05 %)
14,638
(0.05 %)
1,445,731
(99.95 %)
6,884,034
(54.54 %)
1,201,033
(2.95 %)
16,938,986
(42.00 %)
79
(0.00 %)
n/a 84,642
(1.12 %)
30,069
(0.64 %)
185 reddish-gray mouse lemur (RMR66 2019)
GCA_008750995.1
n/a n/a 28,284
(1.38 %)
64,198
(1.25 %)
n/a 41.32
(99.96 %)
16,590
(0.01 %)
16,590
(0.01 %)
496,470
(99.99 %)
4,941,897
(40.30 %)
757,406
(1.81 %)
17,239,695
(32.13 %)
4,577
(0.03 %)
n/a 109,156
(2.79 %)
101,325
(2.32 %)
186 Rhesus monkey (2019 U. Washington)
GCF_003339765.1
86,719
(3.15 %)
n/a 20,455
(1.85 %)
21,565
(1.21 %)
n/a 41.00
(98.84 %)
244
(1.16 %)
248
(1.16 %)
3,268
(98.84 %)
5,469,991
(52.68 %)
993,786
(5.32 %)
16,005,457
(38.50 %)
1
(0.00 %)
1,431,525
(2.74 %)
86,250
(1.31 %)
28,575
(0.73 %)
187 ring-tailed lemur (KIZ-2021_28 2022)
GCA_023759835.1
n/a n/a 18,759
(2.14 %)
21,046
(1.64 %)
n/a 40.84
(99.28 %)
0
(0 %)
377
(0.72 %)
141
(100.00 %)
3,366,830
(38.74 %)
358,575
(0.94 %)
13,276,207
(29.01 %)
0
(0 %)
252,698
(0.81 %)
48,332
(1.71 %)
45,700
(1.56 %)
188 ring-tailed lemur (mLemCat1 alternate hap 2021)
GCA_020740595.1
n/a n/a 18,683
(1.98 %)
21,178
(1.55 %)
n/a 41.29
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
312
(100.00 %)
3,400,356
(36.84 %)
511,707
(7.13 %)
13,027,744
(33.21 %)
0
(0 %)
889,687
(2.62 %)
50,614
(1.83 %)
47,997
(1.60 %)
189 ring-tailed lemur (primary hap 2021)
GCF_020740605.2
55,883
(2.78 %)
n/a 18,659
(1.98 %)
20,542
(1.50 %)
n/a 41.36
(99.84 %)
0
(0 %)
210
(0.16 %)
185
(100.00 %)
3,432,734
(37.67 %)
518,071
(6.84 %)
12,916,577
(32.91 %)
0
(0 %)
864,748
(2.57 %)
50,626
(1.88 %)
48,082
(1.65 %)
190 ruffed lemur (Sample0354 2023)
GCA_028533085.1
n/a n/a 21,372
(1.82 %)
26,571
(1.36 %)
n/a 41.08
(99.19 %)
0
(0 %)
45,655
(0.74 %)
984,208
(100.00 %)
4,143,503
(38.33 %)
474,523
(1.05 %)
15,408,098
(29.48 %)
2,598
(0.09 %)
n/a 61,201
(1.54 %)
56,473
(1.39 %)
191 Sclater's lemur (Harlow 2015)
GCA_001262665.1
n/a n/a 19,832
(2.09 %)
23,882
(1.58 %)
n/a 40.77
(99.01 %)
254,375
(1.01 %)
254,375
(1.01 %)
292,741
(98.99 %)
3,621,134
(39.99 %)
434,393
(1.73 %)
13,470,199
(29.03 %)
29,206
(0.45 %)
326,249
(1.59 %)
47,664
(1.66 %)
44,426
(1.45 %)
192 siamang gibbon (v2.1 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.3
105,374
(3.05 %)
n/a 20,434
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
0
(0 %)
2
(0.03 %)
27
(100.00 %)
5,354,446
(55.80 %)
935,620
(14.70 %)
14,917,515
(46.01 %)
0
(0 %)
2,398,386
(4.90 %)
92,243
(1.42 %)
27,998
(0.68 %)
193 siamang gibbon (v3 Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.3
n/a n/a 19,572
(1.70 %)
20,107
(1.11 %)
n/a 40.45
(99.93 %)
0
(0 %)
3
(0.07 %)
40
(100.00 %)
5,057,491
(55.54 %)
869,279
(15.07 %)
14,090,400
(46.04 %)
0
(0 %)
1,893,854
(4.08 %)
87,907
(1.41 %)
26,874
(0.68 %)
194 siamang (KIZ-2021_26 2022)
GCA_023761135.1
n/a n/a 20,252
(1.97 %)
19,183
(1.17 %)
n/a 41.06
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
1,409
(100.00 %)
5,185,231
(50.44 %)
853,966
(2.06 %)
15,282,516
(37.75 %)
0
(0 %)
1,056,503
(2.26 %)
86,013
(1.38 %)
25,884
(0.72 %)
195 siamang (v2 Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.2
n/a n/a 19,572
(1.70 %)
20,107
(1.11 %)
n/a 40.45
(99.93 %)
0
(0 %)
3
(0.07 %)
40
(100.00 %)
5,057,491
(55.54 %)
869,279
(15.07 %)
14,090,400
(46.04 %)
0
(0 %)
2,292,373
(4.98 %)
87,907
(1.41 %)
26,874
(0.68 %)
196 silvery gibbon (v3 HMO894 2021 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.3
71,182
(2.77 %)
n/a 20,473
(1.95 %)
21,198
(1.20 %)
42,343
(1.45 %)
41.02
(97.81 %)
25,102
(2.19 %)
25,102
(2.19 %)
43,501
(97.81 %)
5,238,212
(50.30 %)
857,561
(2.26 %)
15,565,288
(36.84 %)
736
(0.02 %)
997,754
(2.11 %)
80,124
(1.26 %)
26,375
(0.70 %)
197 slender loris (KIZ-2021_12 2022)
GCA_023783135.1
n/a n/a 21,119
(1.53 %)
20,944
(1.30 %)
n/a 40.33
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,586
(100.00 %)
4,366,787
(38.90 %)
712,115
(1.34 %)
14,063,325
(39.26 %)
0
(0 %)
560,462
(1.57 %)
23,070
(0.64 %)
21,329
(0.53 %)
198 slow loris (alternate hap 2022)
GCA_027406535.1
n/a n/a 21,660
(1.50 %)
22,771
(1.32 %)
n/a 40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,485
(100.00 %)
4,275,926
(39.13 %)
533,324
(1.57 %)
13,459,597
(39.86 %)
0
(0 %)
855,097
(2.22 %)
35,720
(0.78 %)
21,807
(0.55 %)
199 slow loris (primary hap 2022)
GCF_027406575.1
67,211
(2.59 %)
n/a 22,193
(1.49 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 40.82
(99.86 %)
0
(0 %)
218
(0.14 %)
84
(100.00 %)
4,625,872
(39.88 %)
579,983
(1.59 %)
14,405,367
(40.78 %)
2
(0.00 %)
991,294
(2.40 %)
38,257
(0.77 %)
22,955
(0.54 %)
200 small-eared galago
GCF_000181295.1
38,532
(2.11 %)
n/a 20,477
(1.82 %)
19,107
(1.43 %)
n/a 41.11
(93.67 %)
192,447
(6.36 %)
192,447
(6.36 %)
200,099
(93.64 %)
4,369,204
(39.41 %)
454,913
(1.11 %)
13,579,820
(30.37 %)
3,569
(0.05 %)
400,875
(1.05 %)
21,834
(0.62 %)
21,048
(0.57 %)
201 sooty mangabey
GCF_000955945.1
76,860
(3.18 %)
n/a 20,065
(1.92 %)
21,156
(1.27 %)
n/a 40.92
(97.87 %)
65,319
(2.14 %)
65,329
(2.14 %)
76,752
(97.86 %)
5,287,418
(49.49 %)
908,575
(2.58 %)
16,543,149
(35.26 %)
433
(0.01 %)
846,685
(2.14 %)
70,987
(1.22 %)
28,538
(0.73 %)
202 southern white-cheeked gibbon (KIZ-2021_17 2022)
GCA_023783065.1
n/a n/a 19,823
(1.91 %)
20,366
(1.23 %)
n/a 41.00
(100.00 %)
0
(0 %)
1,118
(0.00 %)
2,647
(100.00 %)
5,227,312
(50.63 %)
931,266
(5.19 %)
15,489,839
(38.00 %)
0
(0 %)
1,531,870
(5.51 %)
68,528
(1.21 %)
25,894
(0.71 %)
203 Sumatran orangutan (Susie 2018 refseq)
GCF_002880775.1
58,185
(2.32 %)
n/a 20,151
(1.79 %)
21,000
(1.15 %)
47,843
(1.68 %)
40.80
(99.29 %)
553
(0.70 %)
553
(0.70 %)
5,814
(99.30 %)
5,483,266
(54.37 %)
1,048,361
(8.01 %)
15,948,624
(40.68 %)
0
(0 %)
2,413,942
(4.00 %)
39,481
(0.87 %)
26,385
(0.67 %)
204 Sumatran orangutan (v2 AG06213 alternate hap 2024)
GCA_028885685.2
n/a n/a 19,884
(1.79 %)
20,383
(1.18 %)
n/a 40.95
(99.75 %)
0
(0 %)
10
(0.25 %)
48
(100.00 %)
5,192,176
(53.57 %)
950,166
(9.22 %)
15,240,038
(41.74 %)
0
(0 %)
2,007,170
(3.80 %)
41,928
(1.16 %)
29,154
(0.81 %)
205 Sumatran orangutan (v2 AG06213 primary hap 2024 genbank)
GCA_028885655.2
102,148
(44.55 %)
n/a 20,870
(1.72 %)
21,383
(1.14 %)
n/a 40.88
(99.75 %)
0
(0 %)
11
(0.25 %)
29
(100.00 %)
5,567,804
(54.83 %)
1,092,396
(10.36 %)
16,195,828
(42.80 %)
0
(0 %)
2,491,180
(4.29 %)
44,397
(1.13 %)
30,587
(0.77 %)
206 Sumatran orangutan (v2 AG06213 primary hap 2024 refseq)
GCF_028885655.2
102,148
(3.49 %)
n/a 20,870
(1.72 %)
21,383
(1.14 %)
n/a 40.88
(99.75 %)
0
(0 %)
11
(0.25 %)
30
(100.00 %)
5,567,810
(54.83 %)
1,092,396
(10.36 %)
16,195,884
(42.80 %)
0
(0 %)
2,491,180
(4.29 %)
44,397
(1.13 %)
30,587
(0.77 %)
207 Sykes' monkey (KIZ-2021_3 2022)
GCA_023783535.1
n/a n/a 20,020
(1.91 %)
21,417
(1.26 %)
n/a 40.95
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,544
(100.00 %)
5,194,608
(49.70 %)
1,130,857
(4.69 %)
15,669,171
(37.68 %)
0
(0 %)
1,372,955
(4.32 %)
62,090
(1.70 %)
29,041
(1.19 %)
208 tamarin
GCA_004024885.1
n/a n/a 27,243
(1.48 %)
39,487
(1.07 %)
n/a 40.80
(99.88 %)
8,881
(0.03 %)
8,881
(0.03 %)
1,675,070
(99.97 %)
6,528,752
(48.25 %)
1,388,724
(3.61 %)
16,922,829
(45.18 %)
46
(0.00 %)
n/a 38,319
(0.73 %)
33,561
(0.64 %)
209 tufted capuchin (KIZ-2021_25 2022)
GCA_023762875.2
n/a n/a 20,999
(1.92 %)
21,502
(1.28 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,172
(100.00 %)
5,167,318
(47.46 %)
855,869
(5.15 %)
15,361,132
(37.38 %)
0
(0 %)
1,304,444
(4.52 %)
33,858
(0.88 %)
29,407
(0.77 %)
210 tufted capuchin (Saskatoon/1434 2019)
GCF_009761245.1
80,991
(3.26 %)
n/a 21,426
(1.96 %)
22,733
(1.32 %)
41,366
(1.58 %)
40.84
(98.69 %)
42,559
(1.31 %)
43,216
(1.31 %)
59,885
(98.69 %)
5,056,660
(48.03 %)
783,505
(2.08 %)
15,052,178
(35.96 %)
1,921
(0.03 %)
741,312
(1.65 %)
32,890
(0.86 %)
29,675
(0.77 %)
211 Ugandan red Colobus (RC106 v5 2019)
GCF_002776525.5
63,486
(2.54 %)
n/a 21,357
(1.88 %)
22,980
(1.19 %)
n/a 40.87
(97.07 %)
0
(0 %)
56,505
(2.93 %)
32,287
(100.00 %)
5,425,300
(50.81 %)
949,826
(2.73 %)
16,126,286
(36.98 %)
4,682
(0.08 %)
1,061,868
(2.08 %)
71,044
(1.10 %)
29,351
(0.69 %)
212 western lowland gorilla (Kamilah 2019)
GCF_008122165.1
61,950
(2.48 %)
n/a 20,030
(1.78 %)
20,511
(1.13 %)
n/a 40.65
(98.49 %)
859
(1.51 %)
859
(1.51 %)
6,345
(98.49 %)
5,311,418
(50.53 %)
928,667
(8.55 %)
15,660,901
(40.30 %)
1
(0.01 %)
2,822,307
(5.10 %)
44,578
(0.92 %)
25,951
(0.67 %)
213 western lowland gorilla (maternal KB3781 2024)
GCA_028885495.2
n/a n/a 20,949
(1.58 %)
61,054
(2.07 %)
n/a 40.52
(99.94 %)
0
(0 %)
5
(0.06 %)
225
(100.00 %)
5,421,917
(50.94 %)
1,053,588
(20.37 %)
15,761,557
(48.26 %)
0
(0 %)
n/a 74,868
(1.19 %)
30,664
(0.70 %)
214 western lowland gorilla (paternal KB3781 2024)
GCA_028885475.2
n/a n/a 20,265
(1.62 %)
40,901
(1.63 %)
n/a 40.53
(99.94 %)
0
(0 %)
2
(0.06 %)
24
(100.00 %)
5,171,525
(50.35 %)
1,002,906
(19.45 %)
15,064,682
(47.42 %)
0
(0 %)
n/a 64,337
(1.17 %)
29,235
(0.71 %)
215 white-faced saki (BS33 Broad 2019)
GCA_004026645.1
n/a n/a 24,422
(1.69 %)
35,685
(1.16 %)
n/a 40.61
(99.91 %)
11,316
(0.04 %)
11,316
(0.04 %)
903,646
(99.96 %)
5,716,344
(47.85 %)
1,234,286
(3.25 %)
16,179,207
(39.57 %)
42
(0.00 %)
n/a 41,862
(0.89 %)
32,090
(0.74 %)
216 white-faced saki (KIZ-2021_20 2022)
GCA_023779675.1
n/a n/a 20,493
(1.97 %)
19,054
(1.21 %)
n/a 40.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,360
(100.00 %)
4,973,394
(47.65 %)
847,663
(1.77 %)
15,296,297
(36.49 %)
0
(0 %)
550,437
(1.30 %)
42,149
(0.99 %)
30,442
(0.79 %)
217 white-fronted capuchin (BS31 Broad 2019)
GCA_004027755.1
n/a n/a 27,984
(1.50 %)
47,384
(1.05 %)
n/a 41.14
(99.86 %)
13,723
(0.04 %)
13,723
(0.04 %)
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(99.96 %)
6,023,876
(46.47 %)
1,002,459
(2.29 %)
16,673,880
(41.02 %)
99
(0.00 %)
n/a 37,693
(0.79 %)
33,666
(0.70 %)
218 white-fronted capuchin (KIZ-2021_2 2022)
GCA_023783575.1
n/a n/a 21,215
(1.84 %)
21,192
(1.25 %)
n/a 40.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,079
(100.00 %)
5,245,303
(48.38 %)
857,966
(4.71 %)
15,838,894
(37.91 %)
0
(0 %)
2,486,236
(13.15 %)
34,161
(0.89 %)
29,980
(0.77 %)
219 white-tufted-ear marmoset (cj1700 2020)
GCF_009663435.1
107,273
(3.59 %)
n/a 21,782
(1.87 %)
21,450
(1.28 %)
n/a 40.85
(98.69 %)
378
(1.31 %)
380
(1.31 %)
1,429
(98.69 %)
5,135,344
(49.42 %)
823,949
(3.69 %)
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(38.06 %)
0
(0 %)
1,402,773
(2.77 %)
36,875
(0.90 %)
26,738
(0.72 %)
220 white-tufted-ear marmoset (220 alternate hap 2025)
GCA_049354675.1
n/a n/a 21,815
(1.86 %)
21,774
(1.27 %)
n/a 40.83
(99.98 %)
16
(0.02 %)
16
(0.02 %)
39
(99.98 %)
5,129,888
(47.53 %)
824,075
(5.08 %)
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(39.51 %)
0
(0 %)
1,631,593
(3.24 %)
36,707
(0.91 %)
33,920
(0.81 %)
221 white-tufted-ear marmoset (220 primary hap 2025)
GCA_049354665.1
n/a n/a 21,835
(1.85 %)
21,653
(1.27 %)
n/a 40.81
(99.98 %)
9
(0.02 %)
9
(0.02 %)
32
(99.98 %)
5,124,845
(47.45 %)
822,962
(5.19 %)
15,096,857
(39.61 %)
0
(0 %)
1,684,668
(3.31 %)
36,962
(0.90 %)
34,072
(0.81 %)
222 white-tufted-ear marmoset (240 alternate hap 2025)
GCA_049354655.1
n/a n/a 20,992
(1.89 %)
20,825
(1.29 %)
n/a 40.93
(99.99 %)
7
(0.01 %)
7
(0.01 %)
29
(99.99 %)
4,874,970
(46.96 %)
792,611
(5.17 %)
14,189,375
(39.15 %)
0
(0 %)
1,551,483
(3.21 %)
35,398
(0.93 %)
32,611
(0.82 %)
223 white-tufted-ear marmoset (maternal 2020)
GCA_011078405.1
n/a n/a 21,684
(1.92 %)
21,053
(1.29 %)
n/a 40.97
(99.58 %)
0
(0 %)
1,068
(0.42 %)
216
(100.00 %)
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(50.01 %)
797,450
(2.45 %)
15,059,591
(37.67 %)
1
(0.00 %)
1,026,612
(2.27 %)
36,133
(0.92 %)
26,329
(0.73 %)
224 white-tufted-ear marmoset (paternal X 2020)
GCA_011100555.1
n/a n/a 21,709
(1.91 %)
21,245
(1.29 %)
70,349
(2.24 %)
40.95
(99.53 %)
0
(0 %)
959
(0.47 %)
353
(100.00 %)
5,123,971
(49.94 %)
785,181
(2.64 %)
15,163,086
(37.93 %)
1
(0.00 %)
1,081,175
(2.37 %)
36,768
(0.93 %)
26,641
(0.74 %)
225 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 refseq)
GCF_011100555.1
104,419
(4.84 %)
n/a 21,801
(1.88 %)
21,467
(1.27 %)
n/a 40.92
(99.52 %)
0
(0 %)
1,165
(0.48 %)
1,233
(100.00 %)
5,036,591
(47.71 %)
842,846
(3.26 %)
15,161,534
(38.08 %)
2
(0.00 %)
1,256,018
(2.62 %)
37,603
(0.93 %)
34,471
(0.83 %)
226 white-tufted-ear marmoset (v1.2 paternal 2021)
GCA_011100535.2
n/a n/a 21,014
(1.91 %)
20,671
(1.30 %)
n/a 41.00
(99.58 %)
0
(0 %)
994
(0.42 %)
1,217
(100.00 %)
4,785,940
(47.16 %)
804,242
(3.32 %)
14,427,732
(38.00 %)
1
(0.00 %)
1,201,179
(2.61 %)
36,057
(0.95 %)
33,049
(0.84 %)
TOTALS:total assembly count 226

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 226 assemblies assembly stats track stats
Mammals 680 assemblies assembly stats track stats
Birds 433 assemblies assembly stats track stats
Fishes 493 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 317 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1175 assemblies assembly stats track stats
Plants 319 assemblies assembly stats track stats
Fungi 921 assemblies assembly stats track stats
Viruses 424 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 314 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 588 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 1172 assemblies assembly stats track stats