Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024)
GCA_043250625.1
n/a n/a 15,735
(2.44 %)
50,184
(6.16 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
0
(0 %)
471
(0.01 %)
203
(100.00 %)
1,781,283
(37.65 %)
444,047
(7.93 %)
4,765,080
(37.01 %)
6
(0.00 %)
706,869
(5.97 %)
39,918
(2.01 %)
18,319
(0.92 %)
2 alligator pipefish (LvHL_M 2021)
GCF_019802595.1
54,226
(11.15 %)
n/a 13,427
(2.67 %)
46,903
(5.94 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
144
(0.00 %)
143
(100.00 %)
1,200,994
(30.62 %)
143,062
(2.20 %)
3,921,676
(38.03 %)
0
(0 %)
164,363
(2.07 %)
67,978
(8.92 %)
47,265
(3.34 %)
3 allis shad
GCF_017589495.1
48,507
(8.47 %)
n/a 15,371
(2.28 %)
58,686
(5.84 %)
n/a 42.99
(99.91 %)
0
(0 %)
1,541
(0.09 %)
1,095
(100.00 %)
1,190,406
(9.30 %)
1,205,679
(11.28 %)
3,960,328
(38.81 %)
0
(0 %)
936,797
(6.49 %)
36,494
(1.83 %)
23,714
(1.20 %)
4 Amazon molly
GCF_000485575.1
56,958
(11.69 %)
n/a 15,117
(2.64 %)
30,114
(6.60 %)
n/a 39.16
(95.38 %)
27,073
(4.64 %)
36,429
(4.64 %)
31,058
(95.36 %)
346,461
(2.03 %)
188,557
(1.44 %)
5,139,633
(26.01 %)
848
(0.07 %)
161,806
(7.35 %)
35,229
(1.82 %)
27,404
(1.38 %)
5 amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021)
GCF_021018895.1
47,198
(13.10 %)
n/a 15,500
(3.14 %)
41,230
(6.67 %)
n/a 40.79
(99.99 %)
0
(0 %)
150
(0.01 %)
31
(100.00 %)
1,230,524
(26.57 %)
398,694
(5.41 %)
4,106,609
(25.60 %)
0
(0 %)
335,552
(3.38 %)
15,656
(0.99 %)
12,171
(0.69 %)
6 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1
n/a n/a 15,901
(2.25 %)
61,133
(6.37 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,411
(100.00 %)
2,043,181
(23.64 %)
1,141,539
(11.35 %)
3,668,314
(38.60 %)
0
(0 %)
805,945
(6.00 %)
40,218
(2.14 %)
24,243
(1.22 %)
7 American shad (fAloSap1 primary hap 2021)
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
n/a 16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
76,974
(8.55 %)
43.18
(99.45 %)
0
(0 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
14
(0.00 %)
934,014
(6.61 %)
42,699
(2.23 %)
25,608
(1.23 %)
8 Andian cavefish (hap1 2023)
GCF_030014385.1
42,881
(5.97 %)
n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,939
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
9 annual killifish
GCF_001266775.1
38,517
(8.87 %)
n/a 14,027
(2.45 %)
27,798
(5.86 %)
n/a 39.29
(80.23 %)
138,584
(19.83 %)
1,025,519
(19.94 %)
168,368
(80.17 %)
349,927
(2.63 %)
296,826
(3.18 %)
5,039,517
(28.69 %)
2,323
(0.21 %)
261,101
(1.92 %)
26,364
(1.18 %)
17,566
(0.78 %)
10 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1
n/a n/a 16,678
(0.56 %)
151,361
(4.03 %)
n/a 44.57
(99.91 %)
0
(0 %)
15,113
(0.09 %)
5,983
(100.00 %)
12,251,532
(51.73 %)
3,521,157
(17.69 %)
10,051,020
(68.37 %)
71
(0.00 %)
5,101,423
(13.15 %)
494,595
(10.52 %)
74,823
(1.04 %)
11 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1
n/a n/a 17,318
(1.49 %)
80,097
(5.79 %)
n/a 43.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11,436
(100.00 %)
5,482,467
(36.71 %)
1,454,729
(18.84 %)
6,756,226
(47.56 %)
0
(0 %)
1,722,514
(9.86 %)
92,057
(3.50 %)
34,309
(1.32 %)
12 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1
n/a n/a 17,342
(1.44 %)
78,914
(5.48 %)
n/a 43.57
(99.96 %)
0
(0 %)
3,179
(0.04 %)
1,901
(100.00 %)
5,980,457
(37.18 %)
1,633,782
(21.76 %)
6,279,725
(52.83 %)
12
(0.00 %)
2,013,978
(10.83 %)
104,688
(3.57 %)
33,790
(1.15 %)
13 Antarctic spiny plunderfish (primary hap 2020)
GCA_902827135.1
n/a n/a 14,859
(1.97 %)
60,431
(5.73 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
0
(0 %)
1,039
(0.01 %)
1,541
(100.00 %)
461,253
(3.08 %)
434,124
(6.81 %)
3,499,945
(42.99 %)
6
(0.00 %)
656,220
(6.54 %)
60,941
(3.20 %)
13,823
(0.61 %)
14 Arctic char
GCF_002910315.2
67,196
(4.99 %)
n/a 23,967
(1.55 %)
45,775
(3.69 %)
n/a 43.16
(93.25 %)
1,447
(0.01 %)
1,718,015
(6.84 %)
16,700
(99.99 %)
1,011,348
(4.06 %)
1,666,148
(10.50 %)
10,597,529
(44.77 %)
5,986
(0.15 %)
2,192,365
(6.51 %)
76,282
(1.94 %)
25,064
(0.53 %)
15 Arctic char (CBP00131 primary hap 2024)
GCA_036784965.1
n/a n/a 22,376
(1.44 %)
97,559
(4.71 %)
n/a 43.37
(99.97 %)
3,235
(0.03 %)
3,235
(0.03 %)
4,404
(99.97 %)
999,920
(4.22 %)
1,630,911
(26.08 %)
7,875,105
(58.08 %)
17
(0.00 %)
1,400,966
(4.23 %)
70,947
(2.59 %)
16,782
(0.35 %)
16 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1
n/a n/a 14,032
(2.44 %)
39,770
(4.92 %)
n/a 38.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,617
(100.00 %)
1,808,149
(37.98 %)
583,449
(10.56 %)
4,203,368
(40.67 %)
0
(0 %)
559,424
(5.24 %)
24,867
(2.06 %)
14,134
(0.93 %)
17 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1
n/a n/a 15,455
(2.53 %)
40,077
(4.90 %)
86,346
(8.45 %)
38.90
(99.98 %)
0
(0 %)
795
(0.02 %)
241
(100.00 %)
2,045,691
(38.70 %)
669,975
(11.72 %)
4,638,765
(42.07 %)
1
(0.00 %)
693,282
(5.96 %)
28,277
(1.93 %)
15,766
(0.94 %)
18 Arkansas darter
GCF_013103735.1
51,282
(9.79 %)
n/a 14,588
(2.90 %)
42,306
(6.27 %)
n/a 40.52
(99.50 %)
0
(0 %)
35,052
(0.52 %)
4,664
(100.00 %)
418,294
(3.29 %)
331,380
(3.74 %)
4,153,309
(26.60 %)
762
(0.03 %)
207,110
(1.75 %)
15,489
(0.95 %)
10,148
(0.62 %)
19 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1
n/a n/a 17,862
(2.29 %)
70,667
(5.50 %)
n/a 40.01
(100.00 %)
0
(0 %)
327
(0.00 %)
179
(100.00 %)
2,876,989
(50.39 %)
700,511
(9.88 %)
5,977,913
(44.08 %)
2
(0.00 %)
1,066,043
(6.53 %)
104,320
(8.02 %)
23,254
(0.86 %)
20 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1
n/a n/a 18,025
(2.28 %)
71,255
(5.50 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
0
(0 %)
318
(0.00 %)
341
(100.00 %)
2,884,301
(50.42 %)
702,464
(9.98 %)
5,989,299
(44.18 %)
2
(0.00 %)
1,090,542
(6.63 %)
105,945
(8.03 %)
23,683
(0.88 %)
21 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1
50,315
(9.13 %)
n/a 16,526
(2.73 %)
38,780
(6.64 %)
72,662
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
0
(0 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
504,673
(3.06 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
0
(0 %)
157,330
(1.72 %)
88,517
(10.73 %)
67,281
(4.98 %)
22 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2
n/a n/a 16,053
(2.73 %)
74,777
(7.26 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,351
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
0
(0 %)
142,849
(1.57 %)
85,546
(10.82 %)
65,542
(5.07 %)
23 Asian redtail catfish (EC202008001 2021)
GCF_019097595.1
51,017
(10.40 %)
n/a 15,549
(2.60 %)
42,858
(5.39 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
0
(0 %)
107
(0.00 %)
73
(100.00 %)
1,718,992
(31.80 %)
749,009
(14.09 %)
4,206,758
(37.30 %)
0
(0 %)
1,161,068
(7.86 %)
19,230
(1.16 %)
12,900
(0.65 %)
24 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024)
GCA_963924715.1
n/a n/a 15,722
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
0
(0 %)
468
(0.01 %)
120
(100.00 %)
1,608,686
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,115
(27.80 %)
3
(0.00 %)
390,196
(3.88 %)
14,488
(0.90 %)
9,706
(0.46 %)
25 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024)
GCF_963924715.1
54,426
(12.09 %)
n/a 15,720
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
0
(0 %)
468
(0.01 %)
119
(100.00 %)
1,608,682
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,078
(27.80 %)
3
(0.00 %)
390,196
(3.88 %)
14,488
(0.90 %)
9,706
(0.46 %)
26 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1
51,642
(11.92 %)
n/a 14,055
(2.62 %)
36,761
(8.42 %)
68,438
(9.50 %)
45.64
(96.48 %)
0
(0 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
790,946
(10.54 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
4
(0.00 %)
741,285
(7.34 %)
97,133
(7.82 %)
51,623
(3.50 %)
27 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1
n/a n/a 13,366
(2.68 %)
66,599
(9.29 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,727
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
0
(0 %)
635,348
(7.05 %)
87,167
(8.03 %)
47,003
(3.66 %)
28 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
n/a 14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
69,662
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
0
(0 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
0
(0 %)
240,110
(3.16 %)
31,325
(2.25 %)
20,749
(1.34 %)
29 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1
n/a n/a 16,554
(3.01 %)
54,832
(7.45 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,008
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
0
(0 %)
297,396
(3.46 %)
36,868
(2.33 %)
24,401
(1.38 %)
30 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2
50,946
(10.35 %)
n/a 16,394
(2.60 %)
61,637
(7.20 %)
n/a 44.16
(99.89 %)
1,963
(0.11 %)
1,990
(0.11 %)
3,687
(99.89 %)
1,269,688
(11.71 %)
1,318,661
(13.43 %)
3,732,801
(32.49 %)
2
(0.00 %)
1,134,686
(8.55 %)
35,959
(1.97 %)
21,835
(1.09 %)
31 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2
n/a n/a 15,331
(2.42 %)
52,370
(6.91 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
0
(0 %)
74
(0.00 %)
1,049
(100.00 %)
1,454,631
(18.29 %)
383,946
(4.34 %)
4,363,016
(32.69 %)
0
(0 %)
445,382
(4.43 %)
56,416
(3.08 %)
20,355
(1.02 %)
32 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2
n/a n/a 15,262
(2.42 %)
51,857
(6.86 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
222
(0.00 %)
153
(100.00 %)
1,454,219
(18.25 %)
384,609
(4.72 %)
4,338,083
(32.80 %)
5
(0.00 %)
449,712
(4.53 %)
56,553
(3.08 %)
20,550
(1.04 %)
33 Atlantic mackerel (primary hap 2023)
GCA_963691925.1
n/a n/a 15,291
(2.56 %)
43,206
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
666
(100.00 %)
1,496,244
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,761
(29.92 %)
9
(0.00 %)
555,075
(5.00 %)
13,309
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
34 Atlantic mackerel (primary hap 2023)
GCF_963691925.1
34,357
(8.10 %)
n/a 15,289
(2.56 %)
43,205
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
665
(100.00 %)
1,496,240
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,726
(29.93 %)
9
(0.00 %)
555,074
(5.00 %)
13,308
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
35 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1
112,906
(5.61 %)
n/a 28,077
(1.40 %)
115,207
(3.75 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
1,300,611
(4.84 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
0
(0 %)
3,295,334
(6.78 %)
77,089
(1.86 %)
20,127
(0.31 %)
36 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1
109,794
(5.45 %)
n/a 26,968
(1.35 %)
202,772
(19.11 %)
n/a 43.10
(88.27 %)
9,418
(0.03 %)
138,207
(11.73 %)
241,570
(99.97 %)
1,628,119
(9.46 %)
2,496,917
(19.18 %)
10,390,780
(51.80 %)
602
(0.04 %)
n/a 79,791
(1.60 %)
18,955
(0.25 %)
37 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1
60,214
(14.44 %)
n/a 14,860
(3.40 %)
50,921
(8.07 %)
76,242
(9.93 %)
43.38
(100.00 %)
0
(0 %)
51
(0.00 %)
127
(100.00 %)
449,865
(5.00 %)
299,255
(7.03 %)
3,274,219
(25.77 %)
0
(0 %)
378,660
(3.73 %)
67,338
(7.00 %)
43,189
(3.43 %)
38 ballan wrasse (2016)
GCF_900080235.1
42,362
(9.30 %)
n/a 16,129
(2.44 %)
33,854
(5.87 %)
n/a 40.89
(99.98 %)
0
(0 %)
257
(0.02 %)
13,466
(100.00 %)
503,078
(3.93 %)
321,407
(5.60 %)
4,329,412
(30.36 %)
5
(0.00 %)
563,079
(4.68 %)
21,221
(1.07 %)
11,680
(0.58 %)
39 ballan wrasse (primary hap 2024 genbank)
GCA_963930695.1
n/a n/a 15,142
(2.66 %)
43,601
(6.21 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
1
(0.00 %)
815
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,221,802
(30.10 %)
290,738
(7.79 %)
4,164,845
(30.34 %)
4
(0.00 %)
525,923
(5.43 %)
17,126
(0.94 %)
10,131
(0.54 %)
40 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1
48,592
(12.09 %)
n/a 15,140
(2.66 %)
43,304
(6.14 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
815
(0.02 %)
815
(0.02 %)
946
(99.98 %)
1,221,797
(30.10 %)
290,736
(7.79 %)
4,164,799
(30.34 %)
4
(0.00 %)
525,920
(5.43 %)
17,126
(0.94 %)
10,131
(0.54 %)
41 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1
n/a n/a 15,211
(3.23 %)
41,620
(7.14 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
2,393
(100.00 %)
785,178
(17.57 %)
249,148
(8.36 %)
3,391,653
(26.49 %)
0
(0 %)
274,110
(3.20 %)
13,787
(0.93 %)
9,087
(0.56 %)
42 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
n/a 15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
0
(0 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
1
(0.00 %)
297,814
(3.49 %)
15,089
(0.96 %)
9,304
(0.55 %)
43 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1
n/a n/a 15,122
(1.44 %)
65,809
(4.50 %)
n/a 41.23
(99.74 %)
0
(0 %)
293
(0.26 %)
331
(100.00 %)
2,545,429
(50.53 %)
451,939
(5.50 %)
5,807,705
(42.18 %)
0
(0 %)
863,582
(6.37 %)
94,695
(3.92 %)
37,528
(1.27 %)
44 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1
n/a n/a 15,024
(1.45 %)
65,141
(4.53 %)
n/a 41.23
(99.52 %)
0
(0 %)
373
(0.48 %)
196
(100.00 %)
2,509,508
(50.53 %)
441,892
(5.11 %)
6,245,443
(38.22 %)
2
(0.00 %)
822,138
(6.12 %)
93,198
(3.82 %)
36,988
(1.26 %)
45 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1
n/a n/a 26,794
(3.15 %)
76,434
(5.64 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
8,035
(100.00 %)
4,084,361
(52.18 %)
538,411
(4.25 %)
7,659,980
(38.94 %)
0
(0 %)
450,884
(2.88 %)
58,008
(2.90 %)
19,160
(0.57 %)
46 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1
n/a n/a 31,876
(3.30 %)
85,063
(5.65 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
0
(0 %)
108
(0.00 %)
92
(100.00 %)
4,839,533
(52.47 %)
646,636
(4.57 %)
8,240,279
(42.13 %)
2
(0.00 %)
569,819
(3.17 %)
71,384
(3.04 %)
22,137
(0.56 %)
47 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2
53,646
(13.68 %)
n/a 16,073
(3.06 %)
44,214
(6.63 %)
n/a 40.76
(98.88 %)
0
(0 %)
674
(1.12 %)
2,997
(100.00 %)
986,469
(19.78 %)
237,272
(4.32 %)
3,983,840
(23.58 %)
0
(0 %)
251,048
(3.40 %)
16,237
(1.03 %)
9,089
(0.52 %)
48 bicolor damselfish
GCF_000690725.1
32,951
(8.67 %)
n/a 15,181
(2.55 %)
31,420
(5.94 %)
n/a 41.66
(93.68 %)
36,242
(6.34 %)
44,409
(6.34 %)
42,059
(93.66 %)
351,453
(2.61 %)
180,113
(1.20 %)
5,016,154
(23.41 %)
554
(0.03 %)
96,483
(1.91 %)
46,423
(2.30 %)
31,358
(1.43 %)
49 black goby (alternate hap 2023)
GCA_951799965.1
n/a n/a 14,534
(2.11 %)
56,906
(6.41 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,523
(100.00 %)
2,445,373
(45.07 %)
452,878
(9.46 %)
4,195,077
(39.49 %)
0
(0 %)
841,978
(6.49 %)
77,592
(4.86 %)
50,068
(2.69 %)
50 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1
n/a n/a 14,455
(2.06 %)
56,488
(6.31 %)
n/a 42.10
(99.99 %)
0
(0 %)
636
(0.01 %)
298
(100.00 %)
3,230,397
(55.09 %)
494,440
(10.43 %)
4,359,169
(40.46 %)
2
(0.00 %)
950,976
(6.99 %)
81,684
(4.81 %)
45,797
(2.02 %)
51 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1
n/a n/a 31,847
(2.01 %)
153,565
(6.53 %)
n/a 41.78
(99.99 %)
639
(0.00 %)
639
(0.00 %)
63,422
(100.00 %)
2,786,840
(18.28 %)
1,016,389
(7.50 %)
8,844,631
(26.90 %)
18
(0.00 %)
1,160,777
(4.13 %)
130,556
(4.42 %)
82,861
(2.07 %)
52 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 refseq)
GCF_022577435.1
42,351
(12.09 %)
n/a 14,988
(3.02 %)
47,106
(6.98 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
234
(0.00 %)
234
(0.00 %)
463
(100.00 %)
1,017,142
(18.99 %)
360,899
(8.75 %)
3,761,447
(28.91 %)
0
(0 %)
469,043
(4.64 %)
48,360
(4.43 %)
30,659
(2.06 %)
53 black rockcod
GCF_000735185.1
35,176
(8.54 %)
n/a 12,601
(2.15 %)
42,589
(6.13 %)
n/a 40.62
(97.93 %)
33,914
(2.08 %)
59,164
(2.09 %)
72,571
(97.92 %)
268,591
(2.71 %)
238,334
(3.18 %)
3,425,479
(29.48 %)
174
(0.01 %)
164,483
(1.70 %)
31,009
(2.11 %)
14,188
(1.03 %)
54 black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023)
GCF_030273125.1
43,392
(8.45 %)
n/a 15,522
(2.13 %)
48,255
(5.50 %)
n/a 38.69
(100.00 %)
0
(0 %)
341
(0.00 %)
92
(100.00 %)
1,651,919
(22.26 %)
782,601
(7.55 %)
5,398,047
(38.87 %)
2
(0.00 %)
810,395
(6.16 %)
24,508
(1.19 %)
12,928
(0.57 %)
55 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1
n/a n/a 15,274
(2.92 %)
51,453
(7.45 %)
n/a 43.07
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,239,364
(29.69 %)
354,703
(9.63 %)
3,006,556
(30.35 %)
2
(0.00 %)
588,441
(7.05 %)
53,503
(4.48 %)
28,830
(1.72 %)
56 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1
n/a n/a 15,043
(2.96 %)
50,860
(7.54 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
366
(0.01 %)
109
(100.00 %)
1,210,142
(29.44 %)
340,820
(9.19 %)
2,986,750
(29.89 %)
0
(0 %)
547,550
(6.92 %)
52,010
(4.20 %)
28,373
(1.72 %)
57 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1
44,847
(11.30 %)
n/a 15,364
(2.86 %)
51,122
(6.88 %)
n/a 39.48
(99.99 %)
0
(0 %)
89
(0.01 %)
415
(100.00 %)
1,160,519
(28.33 %)
183,082
(4.75 %)
4,354,804
(27.83 %)
4
(0.00 %)
435,884
(4.37 %)
40,207
(2.97 %)
32,779
(2.13 %)
58 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1
n/a n/a 17,403
(2.99 %)
45,903
(5.38 %)
n/a 38.64
(99.99 %)
0
(0 %)
709
(0.01 %)
673
(100.00 %)
2,141,901
(35.77 %)
482,931
(17.18 %)
4,297,133
(46.82 %)
4
(0.00 %)
991,826
(7.99 %)
41,889
(2.32 %)
19,281
(0.97 %)
59 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1
n/a n/a 17,486
(2.97 %)
46,833
(5.41 %)
n/a 38.79
(99.99 %)
0
(0 %)
720
(0.01 %)
413
(100.00 %)
2,165,269
(36.18 %)
490,692
(17.84 %)
4,251,333
(47.54 %)
10
(0.00 %)
1,058,863
(8.47 %)
42,744
(2.37 %)
19,312
(0.98 %)
60 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1
48,916
(10.27 %)
n/a 15,574
(2.62 %)
44,035
(5.21 %)
n/a 39.80
(98.04 %)
0
(0 %)
171
(1.96 %)
43
(100.00 %)
2,180,806
(45.14 %)
625,260
(6.63 %)
5,137,199
(35.52 %)
1
(0.00 %)
571,071
(4.17 %)
31,164
(1.89 %)
20,363
(1.02 %)
61 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1
36,881
(7.40 %)
n/a 15,408
(2.38 %)
27,235
(5.59 %)
n/a 40.42
(89.87 %)
0
(0 %)
53,539
(10.15 %)
12,952
(100.00 %)
867,639
(16.39 %)
195,137
(1.62 %)
5,293,484
(23.10 %)
124
(0.05 %)
97,164
(2.26 %)
21,238
(1.02 %)
14,191
(0.64 %)
62 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1
57,860
(9.04 %)
n/a 15,494
(1.98 %)
57,878
(5.63 %)
56,939
(8.11 %)
40.66
(99.97 %)
0
(0 %)
723
(0.03 %)
304
(100.00 %)
1,055,724
(20.14 %)
324,841
(3.27 %)
5,000,753
(32.08 %)
4
(0.00 %)
594,081
(5.09 %)
32,357
(1.59 %)
17,357
(0.80 %)
63 blue whiting (primary hap 2024)
GCA_964030765.1
n/a n/a 13,097
(2.93 %)
55,097
(8.76 %)
n/a 45.82
(99.88 %)
0
(0 %)
3,055
(0.12 %)
3,832
(100.00 %)
1,337,604
(32.27 %)
749,185
(17.27 %)
2,363,606
(35.06 %)
7
(0.00 %)
596,931
(7.20 %)
78,815
(8.25 %)
42,300
(3.48 %)
64 bluestreak cleaner wrasse (JK-2023 2023)
GCA_030710495.1
n/a n/a 14,996
(2.68 %)
44,244
(6.44 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
2
(0.00 %)
211
(0.00 %)
59
(100.00 %)
1,619,681
(30.07 %)
337,749
(4.31 %)
4,541,709
(29.20 %)
4
(0.00 %)
273,269
(2.99 %)
14,576
(0.85 %)
10,610
(0.55 %)
65 bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023)
GCF_030265055.1
63,345
(14.83 %)
n/a 14,387
(3.54 %)
43,563
(7.96 %)
n/a 41.68
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
57
(100.00 %)
842,739
(18.67 %)
356,558
(12.86 %)
2,720,911
(41.08 %)
0
(0 %)
847,608
(10.65 %)
40,187
(4.66 %)
29,700
(2.69 %)
66 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1
n/a n/a 12,494
(1.93 %)
44,967
(5.14 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,174
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
0
(0 %)
344,768
(3.42 %)
23,532
(1.46 %)
12,368
(0.66 %)
67 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2
n/a n/a 14,499
(1.97 %)
51,213
(5.47 %)
n/a 38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
442
(100.00 %)
731,731
(4.21 %)
471,623
(4.92 %)
5,974,055
(42.88 %)
0
(0 %)
455,138
(4.01 %)
29,052
(1.48 %)
14,673
(0.63 %)
68 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1
n/a n/a 13,882
(2.27 %)
45,919
(5.98 %)
n/a 39.50
(99.99 %)
0
(0 %)
45
(0.01 %)
3,194
(100.00 %)
803,073
(13.60 %)
258,404
(4.19 %)
4,674,614
(28.36 %)
0
(0 %)
339,851
(3.09 %)
15,524
(1.02 %)
9,057
(0.56 %)
69 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 primary hap 2021)
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
n/a 15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
0
(0 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
1
(0.00 %)
441,845
(3.68 %)
18,525
(1.10 %)
10,661
(0.59 %)
70 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1
n/a n/a 16,964
(1.77 %)
67,673
(5.93 %)
n/a 42.61
(99.97 %)
28
(0.00 %)
1,785
(0.03 %)
979
(100.00 %)
4,285,965
(30.73 %)
1,222,431
(20.69 %)
6,105,881
(46.99 %)
11
(0.00 %)
1,356,343
(8.48 %)
73,543
(3.28 %)
32,534
(1.37 %)
71 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1
n/a n/a 12,424
(1.95 %)
46,550
(6.00 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,619
(100.00 %)
789,207
(14.61 %)
348,482
(20.98 %)
3,447,241
(38.72 %)
0
(0 %)
1,174,378
(8.68 %)
27,035
(4.16 %)
12,167
(0.85 %)
72 bonti-bonti (fTelBon1 primary hap 2022)
GCA_933228915.1
n/a n/a 14,929
(1.93 %)
55,343
(5.90 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
0
(0 %)
1,329
(0.03 %)
146
(100.00 %)
998,246
(14.90 %)
443,155
(22.40 %)
4,319,947
(40.01 %)
2
(0.00 %)
1,529,147
(9.19 %)
34,018
(4.16 %)
15,066
(0.86 %)
73 bony fish B.hirsutus (HB-005 2024)
GCF_040956055.1
24,050
(11.30 %)
n/a 14,596
(4.48 %)
52,760
(11.00 %)
n/a 44.75
(99.96 %)
0
(0 %)
1,486
(0.04 %)
1,370
(100.00 %)
471,281
(10.94 %)
181,798
(7.38 %)
2,008,576
(24.90 %)
13
(0.00 %)
259,160
(4.57 %)
46,438
(14.87 %)
34,692
(4.88 %)
74 bony fish P.dabryanus (BB 2023)
GCF_030506205.1
86,420
(8.25 %)
n/a 22,100
(2.28 %)
59,296
(4.66 %)
n/a 38.32
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
610
(100.00 %)
3,555,303
(40.49 %)
538,181
(9.64 %)
6,137,303
(50.16 %)
0
(0 %)
1,400,924
(8.09 %)
71,533
(4.06 %)
19,783
(0.63 %)
75 bony fish S.pulcher (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCF_022749685.1
37,003
(8.79 %)
n/a 15,275
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
186
(100.00 %)
1,369,180
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,024
(31.90 %)
0
(0 %)
387,124
(4.11 %)
27,133
(1.64 %)
12,517
(0.55 %)
76 bony fish T.vachellii (PV-2020 2023)
GCF_030014155.1
43,278
(10.19 %)
n/a 15,613
(2.96 %)
39,340
(5.77 %)
n/a 39.31
(99.98 %)
0
(0 %)
291
(0.02 %)
78
(100.00 %)
1,563,305
(33.23 %)
689,312
(9.96 %)
3,954,578
(35.31 %)
1
(0.00 %)
844,788
(7.26 %)
20,152
(1.50 %)
10,778
(0.73 %)
77 bowfin (hap1 2024)
GCA_036373705.1
n/a n/a 13,851
(1.83 %)
27,058
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
97
(0.00 %)
390
(100.00 %)
953,497
(13.69 %)
387,700
(7.91 %)
4,552,410
(37.72 %)
4
(0.00 %)
613,799
(6.38 %)
46,301
(2.99 %)
26,437
(1.15 %)
78 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1
n/a n/a 17,999
(1.60 %)
76,655
(5.58 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
10,799
(100.00 %)
5,994,257
(39.29 %)
1,126,685
(10.35 %)
6,996,991
(46.02 %)
0
(0 %)
1,131,145
(6.97 %)
71,016
(3.36 %)
27,805
(1.08 %)
79 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1
n/a n/a 17,865
(1.56 %)
76,506
(5.59 %)
n/a 42.15
(99.96 %)
0
(0 %)
2,704
(0.04 %)
676
(100.00 %)
6,391,921
(39.62 %)
1,227,487
(11.70 %)
6,669,558
(49.73 %)
11
(0.00 %)
1,301,019
(7.83 %)
76,828
(3.96 %)
26,877
(0.90 %)
80 broad-nosed pipefish (Sweden RoL2023-S1 2023)
GCF_033458585.1
49,639
(15.87 %)
n/a 13,630
(3.98 %)
43,263
(9.12 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
495
(100.00 %)
727,223
(20.88 %)
290,624
(20.53 %)
1,369,709
(43.82 %)
0
(0 %)
347,124
(7.41 %)
51,671
(14.43 %)
34,210
(4.62 %)
81 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1
92,568
(6.87 %)
n/a 26,875
(1.47 %)
114,101
(4.26 %)
n/a 43.70
(99.83 %)
0
(0 %)
4,299
(0.17 %)
2,721
(100.00 %)
5,005,012
(52.10 %)
2,055,293
(26.66 %)
9,701,968
(57.04 %)
69
(0.00 %)
4,551,597
(10.95 %)
89,897
(2.49 %)
20,734
(0.38 %)
82 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1
49,205
(8.52 %)
n/a 15,634
(1.92 %)
53,710
(4.99 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
0
(0 %)
205
(0.00 %)
26
(100.00 %)
632,147
(3.01 %)
371,482
(3.01 %)
6,438,110
(31.32 %)
1
(0.00 %)
370,750
(2.74 %)
26,136
(0.96 %)
10,272
(0.37 %)
83 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1
47,805
(10.97 %)
n/a 14,997
(2.72 %)
25,504
(5.86 %)
n/a 40.51
(84.10 %)
61,073
(15.93 %)
61,073
(15.93 %)
69,067
(84.07 %)
311,174
(3.20 %)
125,534
(0.72 %)
4,461,288
(20.25 %)
965
(0.08 %)
34,584
(0.52 %)
17,722
(0.91 %)
12,829
(0.64 %)
84 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1
52,584
(12.38 %)
n/a 15,229
(2.54 %)
47,264
(5.92 %)
n/a 40.68
(89.05 %)
0
(0 %)
32,418
(10.97 %)
7,421
(100.00 %)
812,382
(17.52 %)
158,486
(1.12 %)
4,571,794
(23.61 %)
710
(0.05 %)
88,277
(2.15 %)
22,763
(1.21 %)
14,293
(0.75 %)
85 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1
n/a n/a 15,228
(3.42 %)
41,322
(7.36 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,592
(100.00 %)
972,098
(18.43 %)
155,031
(1.41 %)
3,452,400
(21.36 %)
0
(0 %)
85,576
(1.51 %)
15,255
(1.12 %)
10,648
(0.72 %)
86 butterfish (fScaArg1 primary hap 2021)
GCF_020382885.2
52,828
(14.10 %)
n/a 15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
0
(0 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
1
(0.00 %)
96,783
(1.70 %)
15,574
(1.13 %)
10,807
(0.72 %)
87 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1
n/a n/a 14,403
(2.47 %)
61,860
(7.37 %)
n/a 43.15
(99.96 %)
0
(0 %)
1,625
(0.04 %)
525
(100.00 %)
959,651
(12.16 %)
517,137
(13.14 %)
3,775,081
(32.47 %)
9
(0.00 %)
784,659
(7.82 %)
81,881
(6.68 %)
50,317
(3.10 %)
88 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1
n/a n/a 19,842
(2.16 %)
72,007
(6.04 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
2,679
(0.02 %)
2,679
(0.02 %)
15,877
(99.98 %)
1,911,945
(24.70 %)
364,933
(8.56 %)
6,201,042
(32.00 %)
26
(0.00 %)
834,109
(8.34 %)
39,114
(1.56 %)
17,823
(0.57 %)
89 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1
n/a n/a 15,277
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
179
(100.00 %)
1,369,186
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,065
(31.90 %)
0
(0 %)
469,842
(4.88 %)
27,134
(1.64 %)
12,518
(0.55 %)
90 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
n/a 14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
0
(0 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
0
(0 %)
452,303
(4.62 %)
20,453
(1.39 %)
10,802
(0.65 %)
91 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1
n/a n/a 15,980
(2.79 %)
53,680
(6.62 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,656
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
0
(0 %)
386,762
(3.56 %)
20,338
(1.21 %)
10,996
(0.60 %)
92 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3
59,187
(10.70 %)
n/a 15,782
(2.57 %)
45,562
(5.15 %)
n/a 39.82
(99.35 %)
0
(0 %)
100
(0.65 %)
137
(100.00 %)
2,257,240
(46.82 %)
671,926
(8.67 %)
5,043,664
(36.53 %)
0
(0 %)
696,803
(4.91 %)
34,284
(2.16 %)
22,417
(1.13 %)
93 cherry salmon (Uvic2021 2024)
GCF_036934945.1
80,307
(5.31 %)
n/a 27,171
(1.38 %)
123,048
(4.00 %)
n/a 44.12
(99.94 %)
1,043
(0.00 %)
4,047
(0.06 %)
18,306
(100.00 %)
1,207,353
(5.23 %)
2,779,869
(27.93 %)
11,429,057
(55.56 %)
21
(0.00 %)
6,696,647
(13.29 %)
83,137
(1.99 %)
20,398
(0.34 %)
94 chevron butterflyfish (hap1 2024)
GCA_039877785.1
n/a n/a 15,255
(2.94 %)
48,037
(7.05 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
0
(0 %)
49
(0.00 %)
37
(100.00 %)
465,710
(3.82 %)
254,015
(3.62 %)
3,657,999
(23.28 %)
1
(0.00 %)
186,571
(2.20 %)
30,971
(2.02 %)
18,241
(1.05 %)
95 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1
n/a n/a 15,116
(2.91 %)
47,839
(7.01 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
71
(100.00 %)
463,848
(3.80 %)
254,561
(4.23 %)
3,654,295
(24.08 %)
2
(0.00 %)
196,606
(2.28 %)
30,593
(1.99 %)
17,996
(1.03 %)
96 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1
61,496
(12.33 %)
n/a 15,296
(2.30 %)
50,818
(6.10 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
0
(0 %)
942
(0.00 %)
823
(100.00 %)
920,881
(19.96 %)
193,629
(1.36 %)
4,724,179
(28.98 %)
1
(0.00 %)
184,981
(2.73 %)
28,565
(1.65 %)
15,987
(0.90 %)
97 Chinese cavefish (2022)
GCF_024868665.1
48,058
(11.91 %)
n/a 16,738
(3.72 %)
46,295
(6.80 %)
n/a 39.61
(98.56 %)
0
(0 %)
9,510
(1.45 %)
1,039
(100.00 %)
1,469,931
(44.44 %)
188,838
(2.34 %)
3,624,116
(35.94 %)
299
(0.05 %)
177,963
(3.81 %)
44,615
(5.01 %)
16,470
(0.98 %)
98 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1
49,677
(9.64 %)
n/a 15,266
(2.70 %)
40,151
(5.21 %)
n/a 38.75
(99.82 %)
0
(0 %)
597
(0.18 %)
286
(100.00 %)
772,209
(6.45 %)
630,039
(7.45 %)
4,729,261
(37.48 %)
0
(0 %)
607,904
(5.63 %)
24,310
(1.76 %)
15,715
(0.95 %)
99 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2
89,005
(6.31 %)
n/a 26,613
(1.64 %)
77,184
(3.14 %)
n/a 39.08
(100.00 %)
0
(0 %)
224
(0.00 %)
353
(100.00 %)
9,298,177
(59.91 %)
977,119
(3.49 %)
13,499,422
(52.38 %)
0
(0 %)
882,883
(2.63 %)
100,309
(2.90 %)
18,261
(0.24 %)
100 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1
81,340
(5.14 %)
n/a 27,462
(1.53 %)
54,538
(3.80 %)
n/a 43.55
(97.26 %)
1,916
(0.01 %)
272,151
(2.76 %)
15,944
(99.99 %)
1,207,194
(4.55 %)
2,524,408
(13.75 %)
12,127,831
(47.56 %)
4,183
(0.05 %)
2,790,142
(6.34 %)
87,959
(2.02 %)
29,706
(0.70 %)
101 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1
92,383
(5.73 %)
n/a 26,372
(1.57 %)
107,059
(4.12 %)
157,582
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,313
(0.01 %)
2,334
(0.01 %)
9,978
(99.99 %)
1,483,168
(7.79 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,888
(54.54 %)
10
(0.00 %)
5,031,483
(11.16 %)
62,726
(1.40 %)
17,444
(0.31 %)
102 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1
n/a n/a 15,165
(2.44 %)
46,105
(6.16 %)
n/a 39.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,163
(100.00 %)
1,546,066
(27.08 %)
537,737
(9.87 %)
4,485,153
(30.70 %)
0
(0 %)
726,611
(6.01 %)
14,774
(0.81 %)
8,304
(0.43 %)
103 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1
34,390
(6.95 %)
n/a 15,348
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
0
(0 %)
1,572
(0.08 %)
360
(100.00 %)
1,669,322
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,373
(32.38 %)
3
(0.00 %)
927,880
(7.23 %)
16,290
(0.85 %)
8,913
(0.42 %)
104 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1
76,338
(6.27 %)
n/a 23,186
(1.70 %)
90,881
(4.14 %)
n/a 43.06
(95.36 %)
2,844
(0.02 %)
242,238
(4.66 %)
28,109
(99.98 %)
1,143,292
(6.07 %)
1,487,818
(12.14 %)
8,992,314
(46.24 %)
3,734
(0.11 %)
2,132,411
(5.90 %)
51,797
(1.25 %)
15,414
(0.35 %)
105 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1
205,915
(6.68 %)
n/a 26,582
(1.42 %)
119,437
(4.14 %)
120,379
(5.87 %)
43.89
(99.99 %)
3,405
(0.01 %)
3,433
(0.01 %)
17,480
(99.99 %)
1,160,500
(5.63 %)
2,584,312
(31.72 %)
10,621,107
(55.67 %)
8
(0.00 %)
6,422,106
(12.88 %)
68,538
(1.53 %)
20,126
(0.36 %)
106 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1
n/a n/a 14,940
(3.51 %)
39,688
(7.41 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
0
(0 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,993
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
0
(0 %)
150,484
(2.39 %)
10,131
(0.86 %)
7,444
(0.57 %)
107 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3
n/a n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
67,055
(11.68 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
633,883
(15.28 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,008
(21.31 %)
0
(0 %)
169,790
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
108 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1
53,567
(9.24 %)
n/a 15,685
(2.23 %)
33,477
(5.63 %)
n/a 39.47
(99.94 %)
0
(0 %)
1,406
(0.06 %)
6,405
(100.00 %)
431,950
(2.92 %)
381,394
(4.84 %)
4,952,343
(31.95 %)
20
(0.00 %)
378,594
(2.99 %)
23,543
(1.15 %)
15,582
(0.70 %)
109 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1
53,912
(11.11 %)
n/a 15,702
(2.37 %)
47,805
(5.50 %)
n/a 39.59
(99.98 %)
0
(0 %)
1,454
(0.02 %)
354
(100.00 %)
1,346,903
(35.25 %)
401,782
(5.36 %)
4,891,035
(31.59 %)
10
(0.00 %)
410,292
(3.79 %)
23,489
(1.28 %)
17,390
(0.95 %)
110 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2
100,850
(6.58 %)
n/a 27,072
(1.56 %)
50,811
(3.95 %)
125,873
(5.26 %)
43.55
(99.98 %)
395
(0.00 %)
5,631
(0.02 %)
4,482
(100.00 %)
1,491,966
(6.88 %)
2,135,217
(25.52 %)
10,152,659
(54.74 %)
5
(0.00 %)
4,738,432
(11.52 %)
65,662
(1.36 %)
18,054
(0.31 %)
111 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1
n/a n/a 18,114
(2.63 %)
66,549
(6.11 %)
n/a 38.62
(99.99 %)
7
(0.00 %)
685
(0.01 %)
215
(100.00 %)
2,639,968
(48.46 %)
659,243
(7.55 %)
5,950,358
(40.47 %)
3
(0.00 %)
963,199
(6.67 %)
62,337
(3.61 %)
19,726
(0.79 %)
112 common carp (R8XR3 2021)
GCA_905221575.1
n/a n/a 30,973
(3.47 %)
83,657
(5.95 %)
n/a 37.06
(100.00 %)
0
(0 %)
372
(0.00 %)
674
(100.00 %)
3,324,121
(41.45 %)
707,134
(4.72 %)
8,110,561
(39.08 %)
3
(0.00 %)
600,903
(3.39 %)
44,388
(1.60 %)
23,824
(0.66 %)
113 common carp (SPL01 2021)
GCF_018340385.1
91,210
(7.89 %)
n/a 31,041
(2.89 %)
89,244
(5.01 %)
n/a 37.11
(99.53 %)
0
(0 %)
26,351
(0.48 %)
6,701
(100.00 %)
1,634,612
(6.00 %)
919,239
(3.97 %)
10,192,037
(38.56 %)
0
(0 %)
703,885
(3.08 %)
52,638
(1.62 %)
30,904
(0.80 %)
114 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1
36,211
(8.34 %)
n/a 14,995
(2.62 %)
50,844
(6.89 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
0
(0 %)
275
(0.01 %)
338
(100.00 %)
1,186,799
(32.17 %)
307,864
(16.34 %)
3,562,802
(35.00 %)
2
(0.00 %)
481,477
(5.21 %)
41,657
(2.72 %)
22,630
(1.29 %)
115 common seadragon (TA_2022b 2022)
GCF_024500385.1
60,947
(12.28 %)
n/a 13,706
(2.67 %)
42,956
(5.71 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
196
(0.00 %)
1,259
(100.00 %)
1,417,848
(37.47 %)
173,323
(3.85 %)
3,968,694
(40.23 %)
3
(0.00 %)
319,133
(3.25 %)
70,253
(6.29 %)
38,941
(2.56 %)
116 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1
n/a n/a 14,904
(2.99 %)
43,194
(7.09 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,318
(100.00 %)
1,128,080
(18.77 %)
328,975
(8.35 %)
3,952,898
(31.64 %)
0
(0 %)
410,353
(4.52 %)
26,979
(2.08 %)
15,469
(0.95 %)
117 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1
55,359
(12.02 %)
n/a 14,844
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
242
(100.00 %)
1,149,243
(19.12 %)
342,238
(9.71 %)
3,906,753
(32.84 %)
2
(0.00 %)
440,509
(5.18 %)
27,772
(2.71 %)
15,561
(0.92 %)
118 common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024)
GCA_964263955.1
n/a n/a 29,103
(1.36 %)
124,287
(3.94 %)
n/a 43.87
(99.96 %)
0
(0 %)
5,995
(0.04 %)
11,150
(100.00 %)
1,655,140
(4.68 %)
1,843,550
(17.63 %)
9,367,555
(61.56 %)
26
(0.00 %)
4,094,607
(11.22 %)
112,654
(3.84 %)
19,454
(0.27 %)
119 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1
n/a n/a 25,968
(1.48 %)
104,922
(4.18 %)
n/a 43.67
(99.96 %)
4,689
(0.04 %)
4,689
(0.04 %)
8,669
(99.96 %)
1,320,339
(4.08 %)
1,364,334
(15.61 %)
7,674,742
(61.10 %)
11
(0.00 %)
2,973,556
(10.43 %)
94,019
(3.82 %)
16,046
(0.28 %)
120 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1
n/a n/a 5,231
(0.27 %)
47,644
(1.48 %)
n/a 44.62
(99.99 %)
144
(0.01 %)
144
(0.01 %)
21,561
(99.99 %)
2,803,873
(49.20 %)
655,416
(2.69 %)
7,558,550
(67.05 %)
0
(0 %)
912,917
(5.74 %)
181,626
(10.52 %)
19,591
(0.39 %)
121 convict blenny (fPhoLeu1 primary hap 2021)
GCA_020510985.1
n/a n/a n/a 134,417
(1.50 %)
n/a 44.52
(99.13 %)
0
(0 %)
2,580
(0.87 %)
512
(100.00 %)
9,062,541
(49.33 %)
2,097,650
(2.66 %)
3,092
(99.13 %)
5
(0.00 %)
3,135,536
(6.36 %)
568,042
(10.14 %)
0
(0.00 %)
122 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1
n/a n/a 13,622
(2.81 %)
43,285
(6.93 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,125
(100.00 %)
1,741,373
(32.89 %)
182,926
(2.01 %)
3,659,106
(21.68 %)
1
(0.00 %)
138,669
(1.93 %)
27,693
(1.89 %)
19,848
(1.23 %)
123 copperband butterflyfish (fCheRos1 primary hap 2021)
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
n/a 15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
61,755
(8.99 %)
42.57
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
1
(0.00 %)
158,516
(2.15 %)
29,106
(1.85 %)
19,302
(1.11 %)
124 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1
n/a n/a 14,740
(2.91 %)
45,483
(7.26 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
0
(0 %)
1,379
(0.04 %)
395
(100.00 %)
936,676
(24.41 %)
306,192
(9.29 %)
3,495,456
(28.75 %)
2
(0.00 %)
463,889
(5.20 %)
29,142
(2.35 %)
16,622
(1.09 %)
125 Corydoras catfish unclassified (C115 2021)
GCA_019802505.1
n/a n/a 14,695
(2.68 %)
51,799
(6.37 %)
n/a 42.12
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,080
(100.00 %)
1,969,654
(37.02 %)
663,295
(11.19 %)
3,764,275
(45.19 %)
0
(0 %)
1,764,080
(12.85 %)
67,226
(8.43 %)
47,724
(3.53 %)
126 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1
n/a n/a 4,509
(3.03 %)
16,936
(7.22 %)
n/a 38.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,713
(100.00 %)
430,197
(46.38 %)
101,926
(7.54 %)
1,077,239
(32.21 %)
0
(0 %)
149,644
(6.00 %)
10,612
(4.11 %)
3,661
(0.96 %)
127 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1
90,094
(6.75 %)
n/a 29,386
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
0
(0 %)
832
(0.01 %)
277
(100.00 %)
3,481,382
(45.81 %)
802,773
(6.54 %)
8,190,783
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,003,533
(5.09 %)
83,696
(3.82 %)
26,039
(0.81 %)
128 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1
51,190
(10.37 %)
n/a 15,144
(2.59 %)
43,207
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.98 %)
0
(0 %)
570
(0.02 %)
324
(100.00 %)
1,435,625
(29.39 %)
330,276
(12.54 %)
4,196,830
(33.83 %)
1
(0.00 %)
689,646
(5.54 %)
19,310
(1.01 %)
11,155
(0.57 %)
129 cunner (fRauAds1 primary hap 2021)
GCA_020745685.1
n/a n/a 15,192
(2.74 %)
43,564
(6.38 %)
n/a 41.31
(99.41 %)
0
(0 %)
283
(0.59 %)
64
(100.00 %)
1,419,667
(30.50 %)
243,024
(4.81 %)
4,334,690
(27.65 %)
2
(0.00 %)
297,510
(2.95 %)
17,974
(1.06 %)
9,021
(0.52 %)
130 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1
n/a n/a 14,861
(2.74 %)
42,996
(6.34 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
0
(0 %)
31
(0.01 %)
1,476
(100.00 %)
1,373,727
(30.17 %)
220,572
(4.38 %)
4,176,936
(27.32 %)
0
(0 %)
274,559
(2.86 %)
17,129
(1.04 %)
8,648
(0.51 %)
131 Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020)
GCF_015846415.1
49,108
(12.72 %)
n/a 16,501
(4.06 %)
40,671
(7.11 %)
n/a 38.77
(100.00 %)
116
(0.00 %)
116
(0.00 %)
167
(100.00 %)
1,213,719
(40.21 %)
134,299
(3.43 %)
3,676,403
(30.98 %)
0
(0 %)
240,696
(3.68 %)
29,879
(3.18 %)
13,593
(0.92 %)
132 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1
n/a 47,476
(8.36 %)
16,341
(3.18 %)
41,545
(5.47 %)
n/a 38.57
(98.69 %)
8,366
(1.31 %)
8,366
(1.31 %)
36,005
(98.69 %)
300,659
(2.50 %)
212,357
(6.15 %)
4,267,143
(35.05 %)
53
(0.01 %)
572,127
(5.71 %)
23,311
(2.18 %)
10,121
(0.71 %)
133 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1
n/a n/a 15,965
(3.73 %)
37,421
(5.87 %)
n/a 38.52
(94.12 %)
18,487
(5.88 %)
18,487
(5.88 %)
29,831
(94.12 %)
251,333
(2.28 %)
132,120
(1.41 %)
4,061,554
(28.83 %)
1,201
(0.07 %)
63,401
(0.80 %)
16,871
(1.57 %)
9,058
(0.64 %)
134 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
n/a 15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
0
(0 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
4
(0.00 %)
383,250
(3.60 %)
32,973
(1.28 %)
9,764
(0.33 %)
135 delta smelt
GCF_021917145.1
41,807
(14.97 %)
n/a 14,549
(4.09 %)
44,849
(9.74 %)
n/a 44.99
(99.92 %)
0
(0 %)
1,474
(0.08 %)
376
(100.00 %)
387,882
(5.57 %)
383,522
(9.22 %)
1,814,696
(32.48 %)
5
(0.00 %)
335,886
(5.91 %)
28,299
(3.33 %)
15,642
(1.48 %)
136 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2
n/a n/a 14,119
(3.95 %)
47,988
(8.57 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,660
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
0
(0 %)
175,500
(3.05 %)
50,830
(8.72 %)
41,064
(4.69 %)
137 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2
n/a n/a 16,559
(3.78 %)
58,823
(8.66 %)
74,128
(10.47 %)
43.69
(99.18 %)
0
(0 %)
464
(0.82 %)
461
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,284
(4.61 %)
2,948,738
(28.79 %)
0
(0 %)
306,165
(4.31 %)
64,661
(9.49 %)
52,867
(4.93 %)
138 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1
n/a n/a 16,788
(2.12 %)
50,338
(4.68 %)
n/a 41.27
(98.12 %)
0
(0 %)
641
(1.88 %)
182
(100.00 %)
2,709,759
(34.74 %)
798,364
(14.84 %)
5,418,190
(36.02 %)
1
(0.00 %)
1,397,111
(8.85 %)
30,055
(1.31 %)
21,119
(0.80 %)
139 dorado (hap2 2023)
GCA_030463535.1
n/a n/a 16,799
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
0
(0 %)
726
(0.85 %)
104
(100.00 %)
2,693,928
(34.60 %)
805,807
(14.65 %)
5,615,731
(36.69 %)
2
(0.00 %)
1,425,798
(8.96 %)
30,083
(1.31 %)
21,157
(0.81 %)
140 double-spotted pufferfish T.bimaculatus (TB-2018 2019)
GCA_004026145.2
n/a 20,142
(10.63 %)
14,760
(4.56 %)
56,353
(11.37 %)
n/a 45.56
(99.97 %)
0
(0 %)
1,033
(0.03 %)
1,158
(100.00 %)
292,029
(9.69 %)
192,568
(5.53 %)
1,623,924
(22.71 %)
2
(0.00 %)
336,852
(6.81 %)
51,743
(9.31 %)
39,457
(5.10 %)
141 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1
51,353
(12.50 %)
n/a 13,736
(3.19 %)
50,537
(7.64 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
0
(0 %)
79
(0.00 %)
213
(100.00 %)
986,789
(36.30 %)
235,862
(13.25 %)
2,323,084
(41.85 %)
0
(0 %)
428,926
(7.18 %)
68,121
(17.75 %)
37,525
(4.04 %)
142 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5
n/a n/a 15,552
(2.29 %)
52,465
(6.26 %)
86,437
(9.40 %)
41.07
(99.87 %)
115
(0.00 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
1,309,350
(35.93 %)
217,916
(1.89 %)
4,547,434
(30.78 %)
2
(0.00 %)
212,425
(2.79 %)
33,005
(1.88 %)
15,205
(0.74 %)
143 electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020)
GCA_013347915.1
n/a n/a 12,020
(3.63 %)
38,881
(7.31 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,629
(100.00 %)
429,509
(7.66 %)
432,260
(11.41 %)
2,049,609
(24.32 %)
0
(0 %)
486,181
(6.19 %)
35,597
(4.37 %)
27,662
(2.94 %)
144 electric eel (fEleEle1 primary hap 2020)
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
n/a 15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
54,541
(8.42 %)
42.49
(98.20 %)
0
(0 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
1
(0.00 %)
629,918
(5.96 %)
44,501
(3.93 %)
34,390
(2.63 %)
145 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1
40,618
(11.48 %)
n/a 15,837
(3.85 %)
23,074
(6.63 %)
n/a 42.56
(96.95 %)
0
(0 %)
119,361
(3.09 %)
8,786
(100.00 %)
519,014
(5.41 %)
516,718
(6.65 %)
3,020,801
(21.49 %)
1,953
(0.21 %)
261,654
(3.62 %)
41,947
(3.71 %)
33,441
(2.64 %)
146 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1
82,153
(9.98 %)
n/a 16,513
(2.13 %)
79,047
(6.37 %)
n/a 44.15
(99.99 %)
0
(0 %)
234
(0.01 %)
1,425
(100.00 %)
923,543
(11.79 %)
425,650
(9.45 %)
3,525,237
(34.97 %)
0
(0 %)
812,868
(7.46 %)
91,552
(5.39 %)
61,344
(2.61 %)
147 emerald rockcod
GCF_902827165.1
44,179
(8.48 %)
n/a 15,275
(2.20 %)
57,830
(6.43 %)
63,731
(6.65 %)
40.94
(99.99 %)
0
(0 %)
932
(0.01 %)
864
(100.00 %)
460,185
(3.64 %)
399,729
(6.87 %)
3,533,188
(40.09 %)
6
(0.00 %)
642,666
(6.28 %)
52,191
(2.51 %)
13,014
(0.62 %)
148 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1
n/a n/a 17,920
(3.03 %)
59,697
(6.61 %)
n/a 39.13
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
4,949
(100.00 %)
2,285,870
(44.17 %)
480,649
(10.13 %)
4,833,803
(39.56 %)
0
(0 %)
820,249
(6.21 %)
57,737
(4.15 %)
23,311
(1.22 %)
149 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1
n/a n/a 17,661
(3.01 %)
58,218
(6.54 %)
n/a 39.21
(99.98 %)
0
(0 %)
881
(0.02 %)
125
(100.00 %)
2,346,939
(44.27 %)
502,415
(11.23 %)
4,890,830
(40.45 %)
0
(0 %)
873,838
(6.63 %)
60,482
(4.22 %)
24,091
(1.23 %)
150 European anchovy (BLACKSEA-1 2023)
GCF_034702125.1
48,154
(5.87 %)
n/a 15,415
(1.33 %)
77,712
(5.08 %)
n/a 44.45
(99.99 %)
0
(0 %)
9,202
(0.02 %)
1,922
(100.00 %)
4,406,534
(31.73 %)
2,331,293
(15.35 %)
6,863,540
(50.47 %)
15
(0.00 %)
1,701,493
(7.18 %)
80,927
(2.32 %)
27,462
(0.84 %)
151 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1
n/a n/a 17,416
(2.74 %)
60,936
(6.02 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
7,437
(100.00 %)
2,377,147
(47.98 %)
578,235
(8.27 %)
5,267,308
(40.22 %)
0
(0 %)
872,083
(6.16 %)
50,909
(3.45 %)
17,892
(0.86 %)
152 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1
n/a n/a 18,028
(2.64 %)
64,206
(6.04 %)
n/a 38.73
(99.99 %)
0
(0 %)
588
(0.01 %)
106
(100.00 %)
2,649,943
(48.88 %)
666,129
(9.08 %)
5,751,610
(41.56 %)
5
(0.00 %)
1,113,756
(7.21 %)
58,471
(3.64 %)
19,602
(0.84 %)
153 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1
n/a n/a 14,690
(3.17 %)
48,422
(7.90 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,915
(100.00 %)
1,138,190
(26.31 %)
249,865
(4.72 %)
3,352,038
(25.55 %)
0
(0 %)
232,419
(3.75 %)
36,828
(3.13 %)
27,093
(1.88 %)
154 European flounder (primary hap 2023)
GCA_949316205.1
n/a n/a 14,753
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
109
(100.00 %)
1,160,784
(27.06 %)
251,985
(5.23 %)
3,353,121
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,297
(3.81 %)
37,130
(2.79 %)
27,432
(1.88 %)
155 European flounder (primary hap 2023)
GCF_949316205.1
48,969
(12.45 %)
n/a 14,751
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
108
(100.00 %)
1,160,781
(27.06 %)
251,983
(5.23 %)
3,353,086
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,298
(3.81 %)
37,129
(2.79 %)
27,431
(1.88 %)
156 European perch
GCF_010015445.1
55,605
(8.20 %)
n/a 15,430
(2.07 %)
55,499
(5.43 %)
n/a 40.90
(99.97 %)
0
(0 %)
801
(0.03 %)
303
(100.00 %)
684,094
(5.16 %)
634,788
(7.48 %)
5,182,241
(37.07 %)
0
(0 %)
746,988
(5.12 %)
44,049
(1.94 %)
15,321
(0.71 %)
157 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1
n/a n/a 14,619
(2.94 %)
50,389
(7.92 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
3,222
(100.00 %)
430,112
(3.88 %)
299,581
(6.89 %)
3,182,258
(27.97 %)
0
(0 %)
330,159
(4.99 %)
40,094
(3.66 %)
20,637
(1.37 %)
158 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1
46,468
(10.51 %)
n/a 14,818
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
0
(0 %)
1,072
(0.03 %)
355
(100.00 %)
476,314
(3.63 %)
520,729
(13.27 %)
3,283,360
(33.55 %)
2
(0.00 %)
525,277
(6.36 %)
47,050
(4.45 %)
21,878
(1.29 %)
159 European seabass (2021)
GCF_905237075.1
62,457
(13.08 %)
n/a 15,582
(2.89 %)
44,472
(6.56 %)
69,435
(12.92 %)
40.38
(99.85 %)
0
(0 %)
272
(0.15 %)
303
(100.00 %)
1,210,970
(24.30 %)
278,140
(4.02 %)
4,343,442
(26.18 %)
1
(0.00 %)
309,168
(3.42 %)
15,975
(0.93 %)
10,409
(0.57 %)
160 European smelt (primary hap 2023)
GCA_963692335.1
n/a n/a 15,640
(3.79 %)
50,248
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
30
(0.00 %)
2,462
(0.10 %)
1,038
(100.00 %)
1,648,435
(31.35 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,832
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
161 European smelt (primary hap 2023)
GCF_963692335.1
46,762
(14.07 %)
n/a 15,639
(3.79 %)
50,238
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
0
(0 %)
2,462
(0.10 %)
1,007
(100.00 %)
1,648,428
(31.34 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,793
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
162 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1
n/a n/a 16,181
(2.44 %)
63,544
(7.17 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
0
(0 %)
1,501
(0.04 %)
387
(100.00 %)
2,109,362
(31.42 %)
1,300,159
(14.91 %)
3,634,744
(35.44 %)
6
(0.00 %)
1,178,448
(8.78 %)
35,552
(1.87 %)
19,823
(1.00 %)
163 fathead minnow
GCF_016745375.1
57,312
(8.34 %)
n/a 18,039
(3.02 %)
52,431
(6.01 %)
n/a 38.45
(86.78 %)
0
(0 %)
5,594
(13.23 %)
911
(100.00 %)
657,027
(4.09 %)
444,571
(6.23 %)
4,902,960
(35.69 %)
5
(0.00 %)
807,051
(7.17 %)
49,361
(2.78 %)
20,934
(0.93 %)
164 flathead mullet
GCF_022458985.1
48,689
(12.71 %)
n/a 14,908
(3.00 %)
45,084
(6.96 %)
75,582
(11.23 %)
41.90
(99.97 %)
0
(0 %)
445
(0.04 %)
24
(100.00 %)
469,841
(3.23 %)
207,738
(2.31 %)
3,955,233
(24.74 %)
0
(0 %)
232,148
(2.99 %)
45,885
(3.03 %)
31,971
(1.87 %)
165 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1
n/a n/a 17,494
(2.06 %)
62,257
(5.73 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,986
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
0
(0 %)
240,032
(2.50 %)
26,445
(1.22 %)
12,638
(0.48 %)
166 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
n/a 15,434
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
0
(0 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
0
(0 %)
227,442
(2.84 %)
24,130
(1.26 %)
11,082
(0.48 %)
167 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1
n/a n/a 13,745
(2.58 %)
50,416
(6.72 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
5,171
(100.00 %)
442,646
(4.09 %)
276,927
(5.42 %)
3,741,267
(26.25 %)
0
(0 %)
406,474
(4.11 %)
28,827
(2.28 %)
19,731
(1.36 %)
168 freshwater garfish (fXenCan1 primary hap 2020)
GCA_014839995.1
n/a n/a 14,625
(2.57 %)
52,879
(6.72 %)
n/a 41.41
(98.98 %)
0
(0 %)
1,373
(1.02 %)
410
(100.00 %)
492,828
(4.29 %)
318,631
(5.94 %)
3,977,536
(27.41 %)
0
(0 %)
521,102
(4.91 %)
32,390
(2.33 %)
21,612
(1.34 %)
169 giant grouper
GCF_005281545.1
45,328
(7.65 %)
n/a 15,661
(1.91 %)
53,910
(4.91 %)
n/a 41.26
(96.40 %)
0
(0 %)
23,415
(3.61 %)
4,201
(100.00 %)
604,763
(2.71 %)
357,944
(2.52 %)
6,501,327
(30.28 %)
1,632
(0.21 %)
237,713
(2.85 %)
26,431
(0.91 %)
9,943
(0.35 %)
170 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1
n/a n/a 13,090
(2.37 %)
48,927
(6.41 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,758
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
0
(0 %)
201,169
(2.33 %)
38,368
(2.40 %)
20,092
(1.12 %)
171 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2
n/a n/a 15,752
(2.45 %)
56,395
(6.58 %)
n/a 41.94
(99.96 %)
0
(0 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
1,474,134
(29.50 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,691
(25.69 %)
0
(0 %)
355,475
(3.53 %)
47,327
(2.41 %)
29,914
(1.44 %)
172 golden-line barbel
GCF_001515645.1
74,071
(6.71 %)
n/a 29,486
(2.77 %)
55,545
(5.32 %)
n/a 37.54
(89.58 %)
136,797
(10.45 %)
136,894
(10.45 %)
168,074
(89.55 %)
1,118,646
(5.04 %)
718,426
(6.54 %)
9,092,306
(37.16 %)
3,220
(0.35 %)
778,152
(11.46 %)
70,606
(1.91 %)
26,998
(0.64 %)
173 goldfish
GCF_003368295.1
116,745
(8.75 %)
n/a 35,097
(2.94 %)
68,251
(6.12 %)
n/a 37.48
(99.99 %)
2,247
(0.01 %)
2,247
(0.01 %)
8,463
(99.99 %)
1,693,800
(5.39 %)
916,195
(5.01 %)
9,731,118
(40.19 %)
0
(0 %)
1,030,815
(4.89 %)
66,585
(2.06 %)
27,619
(0.65 %)
174 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1
67,810
(11.16 %)
n/a 18,195
(3.27 %)
48,459
(5.67 %)
n/a 37.48
(99.98 %)
0
(0 %)
150
(0.02 %)
31
(100.00 %)
654,416
(3.33 %)
429,734
(3.77 %)
5,501,085
(40.21 %)
1
(0.00 %)
413,986
(3.73 %)
26,282
(1.58 %)
15,753
(0.76 %)
175 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1
36,344
(7.09 %)
n/a 14,512
(1.92 %)
45,809
(4.61 %)
n/a 39.76
(99.63 %)
0
(0 %)
3,407
(0.37 %)
600
(100.00 %)
2,662,894
(54.47 %)
803,911
(10.32 %)
5,763,692
(48.31 %)
3
(0.00 %)
1,131,797
(6.83 %)
53,808
(2.65 %)
23,231
(1.00 %)
176 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1
25,822
(5.19 %)
n/a 14,212
(1.97 %)
27,894
(4.68 %)
n/a 39.49
(93.15 %)
92,327
(6.89 %)
92,327
(6.89 %)
108,947
(93.11 %)
552,368
(5.00 %)
742,395
(8.07 %)
5,901,720
(42.46 %)
146
(0.03 %)
487,419
(6.15 %)
44,972
(1.97 %)
19,348
(0.76 %)
177 greater amberjack
GCF_002260705.1
33,756
(9.11 %)
n/a 15,336
(2.93 %)
22,220
(6.07 %)
n/a 40.86
(99.17 %)
0
(0 %)
9,742
(0.82 %)
34,656
(100.00 %)
573,770
(4.04 %)
368,800
(3.72 %)
4,449,534
(24.71 %)
371
(0.04 %)
251,784
(3.33 %)
15,850
(0.98 %)
10,738
(0.58 %)
178 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1
n/a n/a 15,483
(3.45 %)
47,484
(7.95 %)
n/a 44.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,805
(100.00 %)
1,400,150
(23.78 %)
738,163
(17.35 %)
2,460,977
(35.90 %)
0
(0 %)
605,154
(7.13 %)
20,794
(2.09 %)
11,413
(0.80 %)
179 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1
n/a n/a 16,553
(3.15 %)
51,766
(7.37 %)
n/a 44.75
(99.95 %)
61
(0.00 %)
1,752
(0.05 %)
1,085
(100.00 %)
1,674,762
(26.07 %)
900,455
(18.62 %)
2,849,256
(39.22 %)
0
(0 %)
824,383
(7.94 %)
26,022
(2.30 %)
13,322
(0.79 %)
180 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1
n/a n/a 10,795
(5.59 %)
33,380
(12.07 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,376
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
0
(0 %)
64,742
(2.40 %)
34,104
(12.82 %)
25,350
(6.24 %)
181 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
n/a 13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
37,563
(15.76 %)
43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
0
(0 %)
112,918
(3.25 %)
46,327
(10.97 %)
32,897
(5.93 %)
182 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1
n/a n/a 13,412
(4.76 %)
45,946
(11.50 %)
n/a 44.34
(99.99 %)
0
(0 %)
95
(0.01 %)
251
(100.00 %)
494,547
(20.10 %)
204,804
(10.66 %)
1,444,044
(34.08 %)
0
(0 %)
208,543
(5.33 %)
47,904
(17.47 %)
32,381
(5.25 %)
183 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1
n/a n/a 13,681
(4.93 %)
45,034
(11.64 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,533
(100.00 %)
460,038
(18.47 %)
163,838
(7.90 %)
1,681,190
(29.08 %)
0
(0 %)
141,147
(3.92 %)
47,523
(15.60 %)
33,138
(6.10 %)
184 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1
n/a n/a 13,432
(2.10 %)
50,930
(6.39 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,952
(100.00 %)
2,495,763
(38.80 %)
473,105
(6.27 %)
3,444,123
(38.56 %)
0
(0 %)
474,250
(4.43 %)
35,298
(1.94 %)
13,822
(0.66 %)
185 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1
n/a n/a 15,028
(2.35 %)
50,436
(6.30 %)
n/a 41.10
(99.97 %)
0
(0 %)
1,188
(0.03 %)
1,568
(100.00 %)
2,688,222
(39.74 %)
549,362
(7.60 %)
3,564,661
(40.05 %)
4
(0.00 %)
605,421
(5.26 %)
37,043
(1.94 %)
11,494
(0.60 %)
186 green swordtail
GCF_003331165.1
52,602
(11.81 %)
n/a 14,955
(2.58 %)
47,115
(6.33 %)
n/a 39.09
(99.71 %)
185
(0.00 %)
661
(0.29 %)
272
(100.00 %)
328,469
(2.10 %)
162,178
(2.35 %)
4,801,050
(28.86 %)
1
(0.00 %)
227,225
(3.22 %)
37,217
(2.39 %)
25,655
(1.36 %)
187 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1
n/a n/a 14,752
(2.74 %)
58,725
(8.49 %)
n/a 43.13
(99.98 %)
3
(0.00 %)
553
(0.02 %)
322
(100.00 %)
1,860,845
(35.64 %)
378,045
(9.39 %)
3,208,482
(30.12 %)
0
(0 %)
450,213
(5.20 %)
66,857
(4.99 %)
44,052
(2.67 %)
188 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1
n/a n/a 16,645
(1.92 %)
62,533
(4.55 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
7,253
(100.00 %)
5,166,731
(67.78 %)
750,850
(11.35 %)
5,903,440
(54.20 %)
0
(0 %)
1,408,406
(7.28 %)
90,235
(5.58 %)
15,520
(0.51 %)
189 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1
n/a n/a 17,136
(1.90 %)
63,611
(4.50 %)
n/a 39.74
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,046
(0.01 %)
233
(100.00 %)
5,662,029
(68.75 %)
825,757
(11.99 %)
6,236,024
(55.15 %)
4
(0.00 %)
1,606,132
(7.98 %)
99,559
(5.68 %)
16,304
(0.51 %)
190 Gulf pipefish (Florida 2022)
GCF_024217435.2
53,176
(17.83 %)
n/a 13,439
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
495
(100.00 %)
644,597
(20.82 %)
180,309
(16.78 %)
1,339,434
(43.63 %)
0
(0 %)
465,900
(9.76 %)
51,080
(18.49 %)
31,396
(4.21 %)
191 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1
58,587
(18.27 %)
n/a 13,442
(4.00 %)
41,565
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
253,033
(3.86 %)
180,311
(16.78 %)
1,339,521
(43.63 %)
0
(0 %)
465,901
(9.76 %)
51,080
(18.49 %)
31,396
(4.21 %)
192 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4
n/a n/a 13,441
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
644,601
(20.82 %)
180,310
(16.78 %)
1,339,461
(43.63 %)
0
(0 %)
465,902
(9.76 %)
51,080
(18.49 %)
31,396
(4.21 %)
193 guppy
GCF_000633615.1
48,290
(11.24 %)
n/a 14,436
(2.72 %)
44,759
(6.24 %)
n/a 39.33
(90.86 %)
37,376
(9.16 %)
458,354
(9.22 %)
40,143
(90.84 %)
340,480
(2.43 %)
167,943
(1.50 %)
4,695,380
(25.63 %)
1,124
(0.10 %)
71,291
(1.20 %)
35,188
(1.91 %)
26,043
(1.36 %)
194 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1
n/a n/a 15,058
(2.50 %)
46,340
(5.85 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
2,131
(100.00 %)
1,642,351
(37.42 %)
389,169
(5.43 %)
4,687,710
(35.55 %)
0
(0 %)
541,909
(4.77 %)
34,408
(1.75 %)
16,136
(0.80 %)
195 honeycomb rockfish (fSebUmb1 primary hap 2020)
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
n/a 15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
63,546
(8.88 %)
40.77
(99.83 %)
0
(0 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
1
(0.00 %)
627,017
(5.28 %)
37,878
(1.84 %)
15,343
(0.71 %)
196 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1
74,585
(6.94 %)
n/a 30,802
(3.11 %)
57,655
(5.63 %)
n/a 37.18
(91.91 %)
150,790
(8.11 %)
150,790
(8.11 %)
314,962
(91.89 %)
1,147,234
(4.93 %)
708,513
(4.77 %)
9,080,512
(35.95 %)
1,724
(0.23 %)
n/a 63,217
(1.71 %)
29,804
(0.74 %)
197 humphead wrasse
GCF_018320785.1
42,229
(6.60 %)
n/a 15,287
(1.66 %)
47,025
(4.13 %)
n/a 39.53
(100.00 %)
0
(0 %)
284
(0.00 %)
46
(100.00 %)
447,458
(2.27 %)
310,170
(4.65 %)
8,002,463
(32.97 %)
1
(0.00 %)
473,364
(2.54 %)
12,252
(0.38 %)
8,635
(0.26 %)
198 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1
n/a n/a 14,412
(3.70 %)
41,944
(8.58 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
0
(0 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,774
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
0
(0 %)
195,444
(3.94 %)
15,419
(1.38 %)
8,375
(0.73 %)
199 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2
n/a n/a 15,339
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
57,867
(10.10 %)
42.38
(98.08 %)
0
(0 %)
1,523
(1.92 %)
157
(100.00 %)
346,399
(3.02 %)
163,524
(3.00 %)
2,755,274
(25.07 %)
0
(0 %)
235,504
(4.25 %)
17,931
(1.47 %)
9,749
(0.74 %)
200 Indian medaka
GCF_002922805.2
49,295
(10.27 %)
n/a 14,591
(2.49 %)
52,982
(6.37 %)
n/a 39.04
(94.83 %)
0
(0 %)
51,550
(5.20 %)
8,493
(100.00 %)
319,151
(2.20 %)
208,690
(2.67 %)
5,412,546
(33.29 %)
180
(0.02 %)
209,477
(2.14 %)
40,721
(2.36 %)
28,619
(1.60 %)
201 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1
41,583
(6.91 %)
n/a 18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
74,968
(7.01 %)
43.02
(99.97 %)
0
(0 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
0
(0 %)
319,481
(2.18 %)
78,561
(3.69 %)
58,460
(2.33 %)
202 Japanese flounder
GCF_001970005.1
37,838
(12.25 %)
n/a 14,521
(3.39 %)
30,773
(7.34 %)
n/a 41.64
(81.04 %)
0
(0 %)
40,314
(18.97 %)
9,525
(100.00 %)
332,322
(2.84 %)
164,916
(1.16 %)
3,476,344
(17.36 %)
317
(0.14 %)
34,362
(0.47 %)
21,768
(1.42 %)
15,778
(0.96 %)
203 Japanese flounder (ysfri-2021 2022)
GCF_024713975.1
60,200
(14.08 %)
n/a 14,987
(3.26 %)
42,919
(7.40 %)
n/a 41.54
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
25
(100.00 %)
850,797
(19.88 %)
308,390
(6.45 %)
3,329,304
(26.55 %)
0
(0 %)
204,034
(3.13 %)
23,373
(1.76 %)
16,725
(1.15 %)
204 Japanese medaka
GCF_002234675.1
50,526
(10.32 %)
n/a 14,325
(2.50 %)
27,912
(6.71 %)
91,652
(11.67 %)
40.84
(99.93 %)
0
(0 %)
491
(0.07 %)
25
(100.00 %)
384,317
(4.42 %)
163,041
(3.07 %)
4,631,750
(34.91 %)
2
(0.00 %)
257,543
(3.04 %)
41,215
(2.89 %)
23,967
(1.50 %)
205 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1
42,877
(8.61 %)
n/a 15,188
(2.40 %)
41,262
(7.86 %)
58,418
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
0
(0 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
667,122
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
0
(0 %)
422,332
(3.88 %)
121,464
(9.36 %)
77,061
(4.51 %)
206 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1
n/a n/a 15,945
(2.17 %)
101,825
(8.93 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
0
(0 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,228
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
0
(0 %)
541,432
(4.29 %)
138,484
(9.55 %)
86,420
(4.60 %)
207 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1
n/a n/a 14,960
(2.23 %)
74,436
(6.65 %)
n/a 43.94
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,370
(100.00 %)
1,620,688
(23.00 %)
902,057
(13.66 %)
4,547,953
(39.90 %)
0
(0 %)
892,097
(6.41 %)
129,990
(12.07 %)
77,992
(4.35 %)
208 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1
n/a n/a 14,906
(2.33 %)
72,029
(6.72 %)
n/a 43.92
(99.98 %)
0
(0 %)
887
(0.02 %)
191
(100.00 %)
1,609,654
(22.82 %)
897,264
(13.58 %)
4,548,467
(39.80 %)
11
(0.00 %)
875,374
(6.46 %)
129,147
(11.75 %)
77,287
(4.33 %)
209 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1
45,779
(8.57 %)
n/a 15,561
(1.99 %)
53,188
(5.12 %)
n/a 41.32
(97.02 %)
0
(0 %)
48,394
(2.99 %)
4,563
(100.00 %)
574,889
(2.73 %)
367,135
(2.64 %)
6,420,280
(29.10 %)
2,337
(0.06 %)
244,886
(1.72 %)
28,979
(1.07 %)
10,901
(0.40 %)
210 kelp perch (BFR_SWC_R1_liver_20210118 2023)
GCF_029030835.1
40,680
(11.49 %)
n/a 14,847
(3.17 %)
46,307
(7.10 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,003
(100.00 %)
967,639
(17.54 %)
319,567
(5.43 %)
3,743,006
(26.82 %)
0
(0 %)
263,733
(2.32 %)
47,481
(4.63 %)
30,351
(2.16 %)
211 lake trout
GCF_016432855.1
65,012
(4.57 %)
n/a 26,528
(1.53 %)
112,119
(4.47 %)
76,885
(3.80 %)
43.50
(99.99 %)
0
(0 %)
3,264
(0.01 %)
4,121
(100.00 %)
1,387,896
(5.81 %)
1,797,785
(19.28 %)
9,643,314
(54.44 %)
2
(0.00 %)
3,778,575
(10.18 %)
85,419
(2.52 %)
19,617
(0.38 %)
212 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1
78,867
(4.31 %)
n/a 27,579
(1.38 %)
113,850
(3.63 %)
n/a 44.18
(100.00 %)
0
(0 %)
1,716
(0.00 %)
6,355
(100.00 %)
1,729,029
(6.03 %)
1,781,307
(15.24 %)
9,311,548
(61.16 %)
0
(0 %)
4,057,370
(10.85 %)
126,142
(4.04 %)
18,712
(0.30 %)
213 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1
87,246
(4.53 %)
n/a 28,366
(1.38 %)
117,266
(3.71 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
0
(0 %)
1,159
(0.00 %)
7,334
(100.00 %)
1,768,537
(6.02 %)
1,793,716
(15.51 %)
9,525,312
(61.13 %)
0
(0 %)
4,153,782
(10.89 %)
126,485
(3.95 %)
18,425
(0.28 %)
214 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1
n/a n/a 17,851
(1.28 %)
83,249
(5.18 %)
n/a 42.69
(99.97 %)
36
(0.00 %)
2,397
(0.03 %)
709
(100.00 %)
7,797,173
(37.37 %)
1,593,818
(10.64 %)
7,610,300
(54.05 %)
15
(0.00 %)
1,726,634
(9.03 %)
127,942
(3.84 %)
34,520
(0.93 %)
215 large yellow croaker
GCF_000972845.2
49,914
(11.76 %)
n/a 15,365
(3.00 %)
26,101
(6.66 %)
n/a 41.34
(99.67 %)
0
(0 %)
7,424
(0.33 %)
9,998
(100.00 %)
478,685
(3.50 %)
306,063
(3.37 %)
4,199,578
(24.80 %)
65
(0.01 %)
319,923
(3.93 %)
28,138
(2.09 %)
16,153
(1.01 %)
216 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1
n/a n/a 15,841
(2.36 %)
79,276
(8.51 %)
n/a 46.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,761
(100.00 %)
2,935,570
(42.17 %)
1,208,602
(21.28 %)
3,157,730
(42.63 %)
0
(0 %)
1,448,522
(11.27 %)
88,759
(6.30 %)
47,311
(2.77 %)
217 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1
n/a n/a 16,376
(2.19 %)
82,947
(7.99 %)
n/a 46.31
(99.94 %)
144
(0.00 %)
2,631
(0.06 %)
1,522
(100.00 %)
3,333,323
(43.58 %)
1,553,932
(25.91 %)
3,393,507
(46.78 %)
9
(0.00 %)
1,764,517
(12.32 %)
99,668
(6.39 %)
51,378
(2.60 %)
218 largemouth bass (2-A1 2021)
GCA_019677235.1
n/a n/a 15,790
(2.31 %)
50,332
(5.65 %)
n/a 40.87
(99.96 %)
0
(0 %)
672
(0.04 %)
202
(100.00 %)
464,845
(2.71 %)
255,513
(3.69 %)
5,124,388
(29.65 %)
2
(0.00 %)
390,854
(3.63 %)
25,920
(1.67 %)
12,277
(0.62 %)
219 largemouth bass (LMB-PRFRI aquatic 2020)
GCF_014851395.1
55,170
(9.49 %)
n/a 16,635
(2.18 %)
56,707
(5.52 %)
n/a 40.86
(99.85 %)
0
(0 %)
2,909
(0.15 %)
4,753
(100.00 %)
497,281
(2.60 %)
269,495
(3.70 %)
5,496,732
(29.60 %)
0
(0 %)
430,490
(4.27 %)
28,733
(1.66 %)
13,319
(0.61 %)
220 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1
n/a n/a 8,132
(2.11 %)
25,878
(4.67 %)
n/a 38.55
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,088
(100.00 %)
260,789
(2.73 %)
158,564
(2.12 %)
3,023,128
(27.39 %)
0
(0 %)
71,421
(1.44 %)
9,678
(1.02 %)
7,876
(0.74 %)
221 largescale foureyes (fAnaAna1 primary hap 2020)
GCA_014839685.1
n/a n/a 14,774
(2.18 %)
42,858
(4.83 %)
58,247
(6.94 %)
38.54
(99.96 %)
0
(0 %)
107
(0.04 %)
33
(100.00 %)
506,950
(2.73 %)
305,170
(2.13 %)
6,194,879
(29.85 %)
0
(0 %)
131,664
(1.39 %)
17,881
(0.94 %)
14,233
(0.68 %)
222 leafy seadragon (BA_2022a 2022)
GCF_024500275.1
46,242
(10.23 %)
n/a 13,712
(2.62 %)
43,369
(5.56 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
0
(0 %)
76
(0.00 %)
1,537
(100.00 %)
1,406,779
(35.37 %)
202,983
(7.44 %)
3,933,128
(41.19 %)
0
(0 %)
436,408
(4.31 %)
70,560
(7.78 %)
39,027
(2.50 %)
223 lemon sole (primary hap 2024)
GCA_964266715.1
n/a n/a 14,961
(2.55 %)
52,234
(6.83 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
20
(0.00 %)
409
(0.01 %)
1,601
(100.00 %)
1,233,052
(39.33 %)
366,741
(18.98 %)
3,296,338
(36.77 %)
1
(0.00 %)
538,414
(6.03 %)
44,712
(2.85 %)
31,908
(1.76 %)
224 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1
38,671
(7.52 %)
n/a 15,538
(2.18 %)
57,480
(5.26 %)
n/a 39.54
(98.22 %)
0
(0 %)
3,611
(1.77 %)
94,260
(100.00 %)
629,451
(3.42 %)
385,539
(3.83 %)
6,343,655
(29.35 %)
123
(0.00 %)
240,147
(1.70 %)
27,018
(1.26 %)
18,061
(0.78 %)
225 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1
n/a n/a 15,487
(0.88 %)
85,135
(3.39 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
6,593
(100.00 %)
5,572,163
(49.59 %)
1,052,072
(6.02 %)
7,246,646
(62.69 %)
0
(0 %)
2,503,507
(8.71 %)
157,768
(4.38 %)
14,966
(0.28 %)
226 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1
53,323
(3.35 %)
n/a 15,955
(0.92 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
6,041,262
(71.88 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
16,535
(0.37 %)
227 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1
n/a n/a 13,792
(2.19 %)
51,353
(6.60 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,620
(100.00 %)
2,536,362
(38.05 %)
513,115
(7.50 %)
3,542,854
(37.60 %)
0
(0 %)
576,452
(5.21 %)
31,814
(1.79 %)
14,668
(0.71 %)
228 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1
n/a n/a 13,908
(2.19 %)
50,634
(6.50 %)
n/a 41.22
(99.97 %)
84
(0.00 %)
1,017
(0.03 %)
701
(100.00 %)
2,698,640
(39.19 %)
577,328
(8.51 %)
3,615,231
(39.17 %)
5
(0.00 %)
691,324
(6.04 %)
33,251
(1.82 %)
14,917
(0.69 %)
229 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1
n/a n/a 15,269
(2.44 %)
52,449
(6.28 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
606
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,879,201
(31.40 %)
449,901
(9.89 %)
4,248,556
(33.21 %)
1
(0.00 %)
727,189
(5.72 %)
43,864
(3.01 %)
19,108
(1.01 %)
230 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1
n/a n/a 15,033
(2.98 %)
51,296
(7.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
2,700
(100.00 %)
1,099,919
(28.68 %)
314,919
(9.57 %)
2,620,601
(30.23 %)
0
(0 %)
539,835
(6.99 %)
49,248
(4.19 %)
27,196
(1.69 %)
231 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1
n/a n/a 15,060
(2.89 %)
50,064
(7.31 %)
n/a 41.88
(99.98 %)
0
(0 %)
589
(0.02 %)
534
(100.00 %)
1,116,427
(28.18 %)
315,489
(13.14 %)
2,598,812
(33.21 %)
2
(0.00 %)
680,706
(7.88 %)
50,192
(3.82 %)
27,472
(1.61 %)
232 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1
n/a n/a 14,632
(3.51 %)
40,441
(7.51 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
0
(0 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,742
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
0
(0 %)
96,734
(1.60 %)
16,302
(1.34 %)
11,802
(0.89 %)
233 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2
n/a n/a 14,975
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
n/a 41.43
(99.89 %)
0
(0 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
772,309
(14.49 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,473
(21.79 %)
0
(0 %)
109,664
(1.83 %)
16,807
(1.33 %)
12,095
(0.89 %)
234 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1
n/a n/a 15,137
(3.09 %)
52,499
(7.75 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,778
(100.00 %)
448,166
(4.67 %)
416,181
(8.95 %)
3,288,388
(27.99 %)
0
(0 %)
521,897
(4.93 %)
55,747
(4.41 %)
34,235
(2.29 %)
235 longspined bullhead (fTauBub2.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1
n/a n/a 15,027
(3.10 %)
51,137
(7.71 %)
n/a 42.22
(99.99 %)
0
(0 %)
242
(0.01 %)
27
(100.00 %)
452,844
(4.81 %)
417,308
(9.63 %)
3,262,282
(28.51 %)
2
(0.00 %)
530,802
(5.05 %)
55,527
(4.38 %)
34,004
(2.27 %)
236 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1
n/a n/a 12,848
(3.32 %)
43,711
(8.09 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,698
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
0
(0 %)
569,405
(6.42 %)
45,916
(5.21 %)
28,531
(2.48 %)
237 lumpfish (primary hap v1 2019 refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
n/a 14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
0
(0 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
1
(0.00 %)
655,785
(6.31 %)
53,321
(5.09 %)
32,722
(2.40 %)
238 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1
n/a n/a 14,944
(3.23 %)
50,328
(8.09 %)
n/a 42.82
(99.97 %)
0
(0 %)
954
(0.03 %)
232
(100.00 %)
1,034,598
(25.93 %)
434,819
(13.21 %)
2,907,371
(30.18 %)
3
(0.00 %)
701,025
(6.86 %)
55,066
(5.20 %)
33,554
(2.42 %)
239 lyretail cichlid
GCF_000239395.1
38,260
(10.03 %)
n/a 14,804
(2.69 %)
23,751
(5.79 %)
n/a 40.44
(80.94 %)
109,098
(19.10 %)
109,100
(19.10 %)
118,181
(80.90 %)
695,696
(14.49 %)
119,381
(1.10 %)
4,539,429
(19.49 %)
5,040
(0.39 %)
62,939
(1.53 %)
18,098
(0.91 %)
13,389
(0.65 %)
240 Malawi cichlid R.sp.'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1
n/a n/a 15,501
(2.18 %)
54,090
(6.20 %)
n/a 41.17
(99.99 %)
0
(0 %)
422
(0.01 %)
82
(100.00 %)
1,727,328
(38.16 %)
259,351
(4.71 %)
4,381,278
(33.25 %)
2
(0.00 %)
338,853
(3.90 %)
35,281
(1.93 %)
14,746
(0.71 %)
241 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1
64,831
(12.89 %)
n/a 15,283
(2.75 %)
43,349
(6.02 %)
n/a 40.35
(100.00 %)
0
(0 %)
93
(0.00 %)
65
(100.00 %)
441,324
(3.38 %)
206,420
(2.54 %)
4,582,841
(27.41 %)
2
(0.00 %)
240,418
(2.41 %)
15,999
(1.17 %)
10,104
(0.58 %)
242 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2
49,016
(12.41 %)
n/a 14,186
(3.08 %)
55,502
(8.05 %)
n/a 43.27
(100.00 %)
0
(0 %)
19
(0.00 %)
97
(100.00 %)
321,832
(4.91 %)
114,318
(16.04 %)
2,300,636
(32.10 %)
0
(0 %)
595,385
(7.08 %)
46,312
(5.05 %)
34,383
(3.14 %)
243 mangrove rivulus
GCF_001649575.2
46,200
(11.83 %)
n/a 14,522
(2.87 %)
46,641
(6.86 %)
n/a 40.03
(94.31 %)
0
(0 %)
32,278
(5.70 %)
300
(100.00 %)
345,678
(2.32 %)
146,263
(1.33 %)
4,718,292
(27.30 %)
277
(0.09 %)
65,776
(1.14 %)
39,541
(2.69 %)
29,543
(1.76 %)
244 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1
n/a n/a 14,564
(1.72 %)
71,604
(6.41 %)
n/a 41.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,737
(100.00 %)
1,662,251
(42.29 %)
439,119
(12.96 %)
3,776,125
(45.00 %)
0
(0 %)
888,556
(6.68 %)
56,507
(2.83 %)
15,006
(0.71 %)
245 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1
n/a n/a 15,070
(1.79 %)
71,367
(6.50 %)
n/a 41.46
(99.92 %)
0
(0 %)
4,157
(0.08 %)
943
(100.00 %)
1,717,591
(42.63 %)
474,348
(12.30 %)
4,011,319
(44.93 %)
3
(0.00 %)
n/a 59,531
(2.83 %)
15,998
(0.74 %)
246 Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023)
GCF_029220125.1
44,363
(10.91 %)
n/a 14,032
(2.80 %)
60,400
(8.09 %)
n/a 43.84
(99.86 %)
0
(0 %)
974
(0.14 %)
200
(100.00 %)
1,157,953
(36.57 %)
569,832
(12.19 %)
2,864,996
(37.65 %)
2
(0.00 %)
856,247
(8.38 %)
98,423
(9.53 %)
55,625
(4.11 %)
247 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2
47,018
(6.00 %)
n/a 16,516
(1.68 %)
33,920
(4.24 %)
n/a 38.00
(96.73 %)
0
(0 %)
621
(3.27 %)
2,415
(100.00 %)
1,125,511
(6.89 %)
1,113,607
(11.76 %)
8,546,053
(42.44 %)
2
(0.02 %)
1,620,405
(7.32 %)
44,933
(1.77 %)
26,268
(0.85 %)
248 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1
71,254
(7.50 %)
n/a 16,674
(1.63 %)
52,903
(4.12 %)
101,896
(6.64 %)
38.24
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,155,823
(4.90 %)
1,363,316
(12.23 %)
7,667,721
(47.23 %)
0
(0 %)
1,394,951
(7.13 %)
48,358
(1.88 %)
24,894
(0.73 %)
249 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1
n/a 27,999
(3.29 %)
16,698
(1.62 %)
62,818
(5.14 %)
74,339
(6.58 %)
38.41
(99.99 %)
0
(0 %)
334
(0.01 %)
195
(100.00 %)
1,194,830
(5.04 %)
1,460,981
(11.81 %)
7,590,179
(47.66 %)
2
(0.00 %)
1,437,937
(7.51 %)
50,533
(2.46 %)
25,088
(0.72 %)
250 milkfish (2019)
GCF_902362185.1
30,812
(7.61 %)
n/a 16,869
(3.41 %)
21,377
(6.58 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
0
(0 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
958,774
(8.18 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
2
(0.01 %)
611,774
(5.32 %)
22,089
(1.27 %)
14,000
(0.76 %)
251 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1
n/a n/a 16,565
(3.38 %)
42,094
(6.75 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,392
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
0
(0 %)
595,219
(5.37 %)
21,531
(1.27 %)
13,616
(0.75 %)
252 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1
n/a n/a 17,701
(1.62 %)
73,433
(5.69 %)
n/a 42.20
(99.98 %)
14
(0.00 %)
1,398
(0.02 %)
388
(100.00 %)
6,438,444
(40.32 %)
1,202,669
(11.51 %)
7,055,665
(47.04 %)
6
(0.00 %)
1,343,489
(8.04 %)
74,954
(3.44 %)
26,325
(0.98 %)
253 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1
n/a n/a 15,176
(3.17 %)
47,458
(7.48 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
0
(0 %)
927
(0.02 %)
486
(100.00 %)
1,167,409
(26.98 %)
438,114
(8.08 %)
3,351,987
(27.25 %)
3
(0.00 %)
441,989
(4.98 %)
45,298
(3.39 %)
29,915
(1.90 %)
254 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1
n/a n/a 14,480
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
0
(0 %)
936
(0.02 %)
725
(100.00 %)
1,101,582
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,480
(27.08 %)
5
(0.00 %)
417,783
(4.94 %)
42,657
(3.44 %)
28,222
(1.89 %)
255 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCF_023349555.1
40,276
(12.25 %)
n/a 14,478
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
936
(0.02 %)
936
(0.02 %)
1,660
(99.98 %)
1,101,578
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,428
(27.08 %)
5
(0.00 %)
417,783
(4.94 %)
42,657
(3.44 %)
28,222
(1.89 %)
256 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1
53,087
(12.11 %)
n/a 14,672
(2.71 %)
27,552
(6.74 %)
n/a 39.02
(99.85 %)
0
(0 %)
229
(0.15 %)
68
(100.00 %)
305,761
(2.11 %)
134,157
(2.14 %)
4,687,726
(28.26 %)
0
(0 %)
131,318
(1.99 %)
33,082
(2.28 %)
23,755
(1.34 %)
257 mudskipper P.magnuspinnatus (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1
n/a n/a 13,470
(2.34 %)
42,799
(5.73 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,414
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
0
(0 %)
475,330
(4.51 %)
34,522
(2.54 %)
17,280
(0.96 %)
258 mudskipper P.magnuspinnatus (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3
33,236
(8.44 %)
n/a 14,601
(2.46 %)
44,145
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
701
(0.95 %)
122
(100.00 %)
1,755,227
(42.93 %)
551,482
(7.22 %)
4,887,087
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,179
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
22,350
(1.21 %)
259 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1
41,183
(7.38 %)
39,253
(6.58 %)
14,602
(1.92 %)
57,194
(5.03 %)
35,597
(6.40 %)
40.58
(91.29 %)
110,543
(8.75 %)
123,625
(8.75 %)
120,723
(91.25 %)
447,158
(2.19 %)
235,336
(1.39 %)
6,518,990
(26.03 %)
877
(0.07 %)
150,526
(1.93 %)
54,589
(2.39 %)
39,256
(1.65 %)
260 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2
56,612
(6.89 %)
n/a 15,361
(1.60 %)
69,801
(5.20 %)
n/a 40.76
(99.88 %)
0
(0 %)
2,820
(0.12 %)
1,031
(100.00 %)
636,480
(2.75 %)
392,130
(3.32 %)
7,023,777
(32.98 %)
8
(0.00 %)
517,617
(4.36 %)
81,101
(3.45 %)
45,801
(1.71 %)
261 New Zealand spotty (2019)
GCA_009762535.1
n/a n/a 14,609
(2.22 %)
43,262
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
468
(100.00 %)
519,324
(4.65 %)
393,329
(5.54 %)
4,522,265
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,988
(4.42 %)
18,302
(0.85 %)
8,002
(0.35 %)
262 New Zealand spotty (alternate hap 2019)
GCA_009762545.1
n/a n/a 13,566
(2.17 %)
40,774
(5.21 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,659
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
0
(0 %)
456,905
(3.99 %)
16,368
(0.83 %)
7,034
(0.33 %)
263 Nile tilapia
GCF_001858045.2
77,384
(10.86 %)
n/a 15,599
(1.99 %)
32,839
(6.04 %)
n/a 40.73
(99.99 %)
0
(0 %)
551
(0.01 %)
2,460
(100.00 %)
600,869
(5.40 %)
291,105
(3.17 %)
4,958,128
(31.15 %)
1
(0.00 %)
496,471
(4.91 %)
32,038
(1.81 %)
17,948
(0.88 %)
264 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1
n/a n/a 13,050
(3.93 %)
44,650
(10.12 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,934
(100.00 %)
512,583
(14.83 %)
156,305
(8.46 %)
2,005,803
(27.09 %)
0
(0 %)
153,928
(3.57 %)
59,674
(9.19 %)
38,546
(4.50 %)
265 ninespine stickleback (NSP_V7 2020)
GCF_902500615.1
51,166
(15.31 %)
n/a 14,765
(3.99 %)
49,191
(9.80 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
0
(0 %)
341
(0.01 %)
1,667
(100.00 %)
380,357
(3.60 %)
188,301
(6.29 %)
2,422,266
(25.70 %)
1
(0.00 %)
285,108
(4.45 %)
72,584
(9.69 %)
45,847
(4.62 %)
266 ninespine stickleback (primary hap 2023)
GCA_949316345.1
n/a n/a 14,600
(3.83 %)
49,927
(9.98 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
175
(100.00 %)
599,088
(14.68 %)
186,747
(10.27 %)
2,273,942
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
267 ninespine stickleback (primary hap 2023)
GCF_949316345.1
57,816
(15.11 %)
n/a 14,598
(3.83 %)
49,473
(9.87 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
174
(100.00 %)
599,085
(14.68 %)
186,746
(10.27 %)
2,273,889
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
268 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1
51,073
(7.42 %)
n/a 15,809
(2.17 %)
43,728
(4.54 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 48
(100.00 %)
2,472,286
(44.73 %)
560,123
(5.68 %)
6,203,876
(38.64 %)
0
(0 %)
436,624
(3.73 %)
42,187
(2.72 %)
22,226
(1.23 %)
269 northern pike
GCF_004634155.1
66,389
(9.11 %)
n/a 16,778
(2.37 %)
27,040
(5.41 %)
n/a 42.29
(99.99 %)
97
(0.00 %)
584
(0.01 %)
908
(100.00 %)
1,065,458
(31.14 %)
531,451
(7.80 %)
4,677,366
(33.26 %)
2
(0.00 %)
661,503
(5.13 %)
44,793
(2.82 %)
22,750
(1.05 %)
270 northern pike (2020 refseq)
GCF_011004845.1
63,733
(9.28 %)
n/a 16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,941
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
0
(0 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
1
(0.00 %)
602,569
(4.43 %)
42,910
(2.52 %)
22,099
(1.02 %)
271 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1
n/a n/a 11,782
(2.41 %)
40,748
(5.68 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
0
(0 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,818
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
0
(0 %)
427,649
(4.54 %)
29,687
(2.57 %)
15,714
(1.07 %)
272 northern snakehead (prfri 2023)
GCF_033026475.1
61,639
(13.32 %)
n/a 15,131
(2.87 %)
35,444
(5.74 %)
n/a 39.76
(100.00 %)
0
(0 %)
52
(0.00 %)
291
(100.00 %)
830,033
(26.45 %)
152,304
(8.77 %)
3,778,846
(29.39 %)
0
(0 %)
257,843
(3.63 %)
8,436
(0.70 %)
6,325
(0.37 %)
273 Old Calabar mormyrid
GCF_002872115.1
61,915
(11.48 %)
n/a 15,987
(2.73 %)
33,963
(6.66 %)
n/a 43.93
(92.03 %)
0
(0 %)
49,579
(7.99 %)
4,666
(100.00 %)
348,463
(2.27 %)
314,129
(2.95 %)
4,259,711
(20.83 %)
2,738
(0.27 %)
166,566
(1.74 %)
76,846
(4.18 %)
58,953
(2.91 %)
274 orangethroat darter
GCF_008692095.1
55,448
(8.29 %)
n/a 15,000
(2.25 %)
49,918
(5.41 %)
n/a 40.91
(99.57 %)
0
(0 %)
101,221
(0.47 %)
3,119
(100.00 %)
566,915
(3.75 %)
509,018
(6.60 %)
5,142,090
(31.18 %)
204
(0.00 %)
644,640
(5.47 %)
26,702
(1.46 %)
14,294
(0.76 %)
275 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
n/a 15,761
(1.50 %)
31,563
(4.00 %)
59,905
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
0
(0 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,257,250
(5.57 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
0
(0 %)
1,304,958
(6.34 %)
29,320
(0.87 %)
15,066
(0.43 %)
276 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1
n/a n/a 14,018
(1.51 %)
45,251
(3.61 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,393
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
1
(0.00 %)
888,596
(5.23 %)
22,522
(0.77 %)
12,193
(0.40 %)
277 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1
68,779
(8.54 %)
n/a 17,223
(2.28 %)
49,697
(5.11 %)
n/a 38.10
(99.99 %)
0
(0 %)
614
(0.01 %)
358
(100.00 %)
2,925,549
(40.35 %)
402,676
(5.35 %)
5,933,365
(45.71 %)
2
(0.00 %)
792,756
(5.74 %)
56,843
(3.18 %)
21,760
(0.91 %)
278 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1
40,001
(9.36 %)
n/a 14,904
(2.72 %)
24,732
(5.87 %)
n/a 40.60
(84.20 %)
60,817
(15.83 %)
60,817
(15.83 %)
68,050
(84.17 %)
306,171
(3.27 %)
124,292
(0.75 %)
4,414,831
(20.66 %)
1,574
(0.10 %)
36,249
(0.53 %)
18,455
(0.96 %)
13,214
(0.68 %)
279 Pacific cod (2023)
GCF_031168955.1
49,417
(13.66 %)
n/a 13,542
(2.89 %)
64,214
(9.77 %)
n/a 45.55
(99.92 %)
0
(0 %)
4,826
(0.09 %)
24
(100.00 %)
1,117,561
(38.30 %)
685,851
(13.38 %)
2,330,116
(34.15 %)
16
(0.00 %)
539,494
(6.49 %)
87,761
(8.68 %)
51,521
(4.16 %)
280 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1
48,776
(12.61 %)
n/a 14,747
(3.15 %)
45,075
(7.30 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
219
(0.00 %)
120
(100.00 %)
410,917
(4.22 %)
246,500
(4.66 %)
3,680,698
(25.23 %)
0
(0 %)
251,625
(3.22 %)
31,508
(2.30 %)
20,928
(1.36 %)
281 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2
46,684
(12.50 %)
n/a 14,862
(3.15 %)
45,824
(7.30 %)
n/a 42.17
(99.95 %)
0
(0 %)
1,131
(0.05 %)
53
(100.00 %)
407,699
(3.94 %)
247,330
(3.84 %)
3,838,896
(24.75 %)
2
(0.00 %)
279,152
(3.23 %)
31,782
(2.27 %)
21,208
(1.36 %)
282 Pacific saury (AMF1-May2022 2023)
GCF_033807715.1
54,344
(6.52 %)
n/a 15,214
(1.67 %)
74,345
(6.13 %)
n/a 41.49
(99.96 %)
0
(0 %)
900
(0.04 %)
759
(100.00 %)
805,776
(5.16 %)
849,901
(11.48 %)
4,645,552
(43.92 %)
1
(0.00 %)
1,333,479
(8.06 %)
106,026
(5.14 %)
39,496
(1.50 %)
283 panther danio (primary hap 2020)
GCF_903798145.1
40,657
(5.52 %)
n/a 17,858
(2.46 %)
42,119
(3.16 %)
n/a 36.32
(98.82 %)
0
(0 %)
1,821
(1.18 %)
342
(100.00 %)
3,973,354
(56.67 %)
940,639
(7.81 %)
8,701,639
(50.54 %)
3
(0.00 %)
1,057,465
(5.16 %)
29,684
(1.18 %)
10,646
(0.30 %)
284 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1
n/a n/a 15,421
(1.80 %)
62,324
(6.15 %)
n/a 42.79
(99.90 %)
4,955
(0.10 %)
4,955
(0.10 %)
4,978
(99.90 %)
4,032,523
(34.18 %)
982,411
(16.51 %)
5,189,655
(46.47 %)
55
(0.01 %)
1,303,532
(10.00 %)
64,543
(3.14 %)
28,282
(1.35 %)
285 parallel lanternfish (primary hap 2024)
GCA_964188405.1
n/a n/a 16,917
(1.64 %)
72,190
(5.85 %)
n/a 42.91
(99.96 %)
0
(0 %)
2,729
(0.04 %)
24
(100.00 %)
4,976,327
(35.08 %)
1,258,755
(18.52 %)
6,268,804
(48.21 %)
12
(0.00 %)
1,744,372
(10.22 %)
81,193
(3.23 %)
34,135
(1.37 %)
286 Patagonian blennie (Puerto Natales JMC-PN-2008 2024)
GCF_036324505.1
42,701
(12.59 %)
n/a 14,986
(3.15 %)
46,289
(7.75 %)
n/a 40.99
(99.97 %)
0
(0 %)
380
(0.03 %)
27
(100.00 %)
1,031,762
(25.30 %)
219,393
(4.63 %)
3,436,780
(25.57 %)
0
(0 %)
225,847
(2.56 %)
16,570
(1.12 %)
10,155
(0.63 %)
287 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1
n/a n/a 15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
0
(0 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
975,354
(15.76 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,904
(35.09 %)
1
(0.00 %)
865,727
(6.60 %)
49,121
(3.07 %)
20,467
(0.93 %)
288 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1
n/a n/a 15,317
(2.02 %)
61,647
(6.35 %)
n/a 41.37
(99.99 %)
135
(0.01 %)
135
(0.01 %)
469
(99.99 %)
981,519
(15.40 %)
319,637
(12.45 %)
3,706,473
(36.77 %)
0
(0 %)
952,761
(6.98 %)
50,353
(2.98 %)
20,537
(0.91 %)
289 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1
n/a n/a 16,729
(3.56 %)
56,451
(8.61 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
11
(0.00 %)
11
(0.00 %)
5,701
(100.00 %)
1,153,359
(18.94 %)
829,887
(14.54 %)
2,793,018
(28.79 %)
0
(0 %)
721,904
(6.97 %)
49,469
(4.32 %)
33,228
(2.53 %)
290 peladilla (fAplTae1 primary hap 2021)
GCA_017639675.1
n/a n/a 13,829
(3.83 %)
41,932
(8.64 %)
n/a 45.01
(98.24 %)
0
(0 %)
1,158
(1.77 %)
41
(100.00 %)
930,246
(18.49 %)
660,569
(13.71 %)
2,316,198
(27.66 %)
6
(0.00 %)
537,418
(6.48 %)
41,023
(4.40 %)
27,287
(2.49 %)
291 pencil smelt N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1
n/a n/a 17,996
(2.00 %)
89,591
(7.93 %)
n/a 45.22
(99.94 %)
0
(0 %)
3,299
(0.06 %)
1,177
(100.00 %)
2,828,457
(30.93 %)
1,676,413
(19.87 %)
4,137,400
(48.69 %)
14
(0.00 %)
1,929,538
(11.96 %)
78,669
(4.37 %)
29,960
(1.34 %)
292 pike-perch
GCF_008315115.2
65,418
(8.54 %)
n/a 15,731
(2.23 %)
52,240
(5.69 %)
n/a 40.87
(99.98 %)
0
(0 %)
711
(0.02 %)
337
(100.00 %)
629,999
(5.16 %)
567,578
(7.41 %)
4,697,709
(36.49 %)
3
(0.00 %)
784,659
(5.34 %)
39,666
(1.93 %)
12,855
(0.60 %)
293 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
n/a 15,738
(2.42 %)
26,691
(5.69 %)
57,069
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
0
(0 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,063,888
(5.90 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
0
(0 %)
374,590
(3.12 %)
41,636
(2.04 %)
21,488
(0.92 %)
294 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1
n/a n/a 15,563
(2.38 %)
54,264
(6.19 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,418
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
0
(0 %)
338,770
(2.89 %)
40,331
(2.02 %)
21,223
(0.93 %)
295 pink salmon
GCF_021184085.1
91,127
(4.89 %)
n/a 27,187
(1.37 %)
124,120
(3.88 %)
n/a 44.28
(99.96 %)
3,528
(0.01 %)
5,213
(0.04 %)
22,556
(99.99 %)
1,343,135
(0.00 %)
2,906,520
(28.95 %)
10,882,087
(57.26 %)
21
(0.00 %)
6,152,465
(12.38 %)
97,805
(3.04 %)
20,791
(0.34 %)
296 ploughfish
GCF_902827175.1
50,551
(7.66 %)
n/a 14,699
(1.83 %)
66,348
(6.06 %)
62,492
(5.74 %)
41.52
(99.98 %)
0
(0 %)
1,569
(0.02 %)
2,618
(100.00 %)
467,937
(3.05 %)
412,361
(6.64 %)
3,498,382
(45.08 %)
10
(0.00 %)
623,734
(5.21 %)
73,879
(3.55 %)
14,738
(0.64 %)
297 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1
n/a n/a 14,050
(2.77 %)
63,249
(8.86 %)
n/a 45.41
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,970
(100.00 %)
708,455
(9.71 %)
797,241
(15.67 %)
2,785,159
(33.18 %)
0
(0 %)
613,051
(6.69 %)
78,151
(7.95 %)
45,924
(3.34 %)
298 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1
n/a n/a 14,126
(2.81 %)
61,907
(8.75 %)
n/a 45.67
(99.94 %)
0
(0 %)
1,810
(0.06 %)
616
(100.00 %)
753,034
(10.17 %)
850,189
(15.72 %)
2,888,555
(33.70 %)
7
(0.00 %)
642,528
(6.84 %)
80,883
(8.43 %)
46,894
(3.34 %)
299 predatory carp (Z2021 2022)
GCF_024489055.1
56,688
(7.63 %)
n/a 17,670
(2.67 %)
54,522
(5.25 %)
n/a 37.95
(100.00 %)
0
(0 %)
181
(0.00 %)
51
(100.00 %)
3,087,358
(61.37 %)
553,846
(7.14 %)
6,036,124
(43.52 %)
2
(0.00 %)
738,916
(5.65 %)
47,942
(3.56 %)
13,183
(0.50 %)
300 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
n/a 14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
0
(0 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
3
(0.00 %)
1,746,915
(7.91 %)
172,199
(5.45 %)
18,080
(0.31 %)
301 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1
n/a n/a 10,944
(0.64 %)
59,123
(2.21 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,336
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
0
(0 %)
1,101,423
(6.43 %)
125,285
(5.42 %)
13,610
(0.32 %)
302 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1
n/a n/a 15,639
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
0
(0 %)
1,907
(0.07 %)
365
(100.00 %)
1,655,350
(30.53 %)
511,512
(12.09 %)
2,015,264
(35.19 %)
4
(0.00 %)
468,697
(7.41 %)
32,410
(4.33 %)
18,662
(1.57 %)
303 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCF_038355195.1
39,606
(12.43 %)
n/a 15,641
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
0
(0 %)
1,907
(0.07 %)
366
(100.00 %)
1,655,356
(30.53 %)
511,513
(12.09 %)
2,015,303
(35.19 %)
4
(0.00 %)
468,697
(7.41 %)
32,410
(4.33 %)
18,662
(1.57 %)
304 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2
119,284
(6.51 %)
n/a 27,513
(1.62 %)
109,524
(4.38 %)
138,073
(5.21 %)
43.45
(99.74 %)
196
(0.00 %)
486
(0.26 %)
939
(100.00 %)
1,537,455
(7.32 %)
2,083,211
(23.10 %)
10,092,840
(53.71 %)
5
(0.00 %)
4,526,931
(11.46 %)
73,586
(2.16 %)
18,220
(0.32 %)
305 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1
79,299
(6.41 %)
78,807
(5.45 %)
25,179
(1.70 %)
98,339
(4.18 %)
115,853
(5.33 %)
42.67
(88.52 %)
7,839
(0.04 %)
427,894
(11.54 %)
139,800
(99.96 %)
1,332,141
(5.52 %)
1,604,760
(8.18 %)
9,451,984
(44.00 %)
31,141
(1.22 %)
1,638,788
(9.94 %)
56,604
(1.05 %)
14,470
(0.23 %)
306 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1
71,991
(5.94 %)
n/a 27,195
(1.88 %)
81,269
(3.63 %)
n/a 39.59
(99.96 %)
0
(0 %)
1,873
(0.04 %)
1,746
(100.00 %)
7,035,382
(51.89 %)
1,021,269
(5.98 %)
12,768,853
(46.85 %)
1
(0.00 %)
1,492,285
(4.74 %)
109,185
(4.70 %)
33,199
(0.66 %)
307 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1
n/a n/a 15,655
(3.01 %)
47,717
(6.87 %)
n/a 40.98
(95.57 %)
0
(0 %)
11,577
(4.42 %)
34,462
(100.00 %)
470,579
(3.16 %)
231,051
(1.91 %)
4,345,700
(23.24 %)
1,006
(0.10 %)
102,380
(1.25 %)
20,149
(1.25 %)
12,381
(0.71 %)
308 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1
n/a n/a 4,539
(2.01 %)
14,061
(4.35 %)
n/a 40.48
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,751
(100.00 %)
759,605
(49.59 %)
161,693
(7.99 %)
1,684,737
(29.93 %)
0
(0 %)
232,319
(5.07 %)
7,525
(1.31 %)
4,853
(0.81 %)
309 red-bellied piranha (fPygNat1 primary hap 2020)
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
n/a 16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
76,011
(5.65 %)
40.58
(99.17 %)
0
(0 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
2
(0.00 %)
1,005,141
(5.14 %)
33,087
(1.38 %)
20,822
(0.79 %)
310 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1
47,129
(6.06 %)
n/a 17,089
(1.80 %)
33,378
(4.02 %)
n/a 40.45
(97.38 %)
42,102
(2.59 %)
62,964
(2.59 %)
325,620
(97.41 %)
898,445
(4.81 %)
863,000
(6.48 %)
7,757,382
(34.74 %)
2,457
(0.19 %)
n/a 34,329
(1.24 %)
22,250
(0.80 %)
311 reedfish (2021)
GCF_900747795.2
44,479
(2.01 %)
n/a 13,108
(0.46 %)
23,157
(1.29 %)
n/a 39.37
(99.18 %)
0
(0 %)
1,431
(0.82 %)
169
(100.00 %)
8,636,520
(39.34 %)
1,069,643
(2.91 %)
19,980,572
(47.52 %)
17
(0.00 %)
1,256,071
(2.69 %)
89,023
(1.13 %)
22,697
(0.30 %)
312 reedfish (alternate hap)
GCA_900700845.2
n/a n/a 9,950
(0.37 %)
31,611
(1.22 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
38,598
(100.00 %)
1,300,565
(2.57 %)
685,834
(2.21 %)
14,691,576
(45.66 %)
0
(0 %)
588,794
(1.83 %)
63,365
(1.11 %)
17,365
(0.32 %)
313 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1
56,261
(13.18 %)
n/a 14,197
(2.71 %)
45,193
(6.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
157
(100.00 %)
941,095
(17.66 %)
238,999
(5.27 %)
4,283,692
(41.06 %)
0
(0 %)
191,618
(2.49 %)
43,014
(4.07 %)
25,748
(1.58 %)
314 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2
25,353
(3.88 %)
n/a 14,334
(1.56 %)
137,348
(9.74 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
0
(0 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
635,526
(3.14 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
7,501
(0.17 %)
424,697
(2.96 %)
52,308
(2.11 %)
22,130
(0.71 %)
315 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2
n/a n/a 27,928
(1.66 %)
110,791
(4.44 %)
n/a 43.36
(96.90 %)
0
(0 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
4,690,842
(57.30 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,763
(52.37 %)
2
(0.00 %)
3,475,805
(8.76 %)
70,821
(1.77 %)
19,956
(0.39 %)
316 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1
n/a n/a 18,165
(2.73 %)
62,580
(6.00 %)
n/a 38.74
(100.00 %)
6
(0.00 %)
6
(0.00 %)
4,612
(100.00 %)
2,483,904
(48.29 %)
584,363
(7.55 %)
5,582,076
(40.38 %)
0
(0 %)
923,875
(6.53 %)
60,229
(3.53 %)
19,604
(0.82 %)
317 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1
n/a n/a 18,132
(2.65 %)
63,523
(6.01 %)
n/a 38.80
(99.99 %)
1
(0.00 %)
471
(0.01 %)
86
(100.00 %)
2,613,900
(48.90 %)
625,102
(8.21 %)
5,738,444
(41.24 %)
1
(0.00 %)
1,070,552
(7.36 %)
65,328
(3.68 %)
20,458
(0.81 %)
318 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2
n/a n/a 15,291
(3.29 %)
45,865
(7.56 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,165
(100.00 %)
1,131,154
(25.69 %)
269,583
(5.08 %)
3,371,712
(24.64 %)
0
(0 %)
249,009
(3.21 %)
36,810
(2.68 %)
27,636
(1.84 %)
319 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2
n/a n/a 15,181
(3.34 %)
44,153
(7.53 %)
51,135
(7.40 %)
42.31
(99.98 %)
0
(0 %)
418
(0.02 %)
101
(100.00 %)
1,121,704
(25.48 %)
269,467
(4.88 %)
3,358,709
(24.69 %)
5
(0.00 %)
255,676
(3.48 %)
36,987
(3.02 %)
28,368
(1.91 %)
320 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1
52,554
(8.81 %)
n/a 17,664
(3.05 %)
48,403
(5.24 %)
n/a 36.06
(83.93 %)
0
(0 %)
5,144
(16.07 %)
2,870
(100.00 %)
2,600,095
(49.94 %)
683,499
(4.34 %)
6,000,462
(35.96 %)
5
(0.00 %)
444,046
(3.07 %)
33,741
(1.62 %)
19,239
(0.70 %)
321 Rosablanca catfish (hap1 2023)
GCA_030014385.1
n/a n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,920
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
322 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1
n/a n/a 15,434
(2.01 %)
44,991
(4.63 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
192
(0.00 %)
302
(100.00 %)
2,506,810
(40.54 %)
613,867
(8.67 %)
5,070,851
(48.32 %)
1
(0.00 %)
1,210,760
(8.82 %)
46,071
(2.57 %)
27,461
(1.23 %)
323 rough bullseye P.klunzingeri (RE-2024b hap1 2024)
GCA_042242105.1
n/a n/a 14,592
(2.84 %)
44,299
(6.93 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
87
(0.00 %)
442
(100.00 %)
1,764,545
(30.13 %)
271,391
(5.93 %)
3,651,092
(24.53 %)
2
(0.00 %)
299,227
(3.11 %)
19,771
(1.39 %)
14,337
(0.85 %)
324 rough bullseye P.klunzingeri (RE-2024b hap2 2024)
GCA_042242125.1
n/a n/a 14,475
(2.89 %)
44,413
(7.11 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
0
(0 %)
93
(0.00 %)
84
(100.00 %)
1,762,151
(30.90 %)
262,291
(5.80 %)
3,580,461
(24.37 %)
10
(0.00 %)
296,317
(3.16 %)
19,851
(1.40 %)
14,202
(0.86 %)
325 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1
n/a n/a 17,895
(2.55 %)
64,448
(5.84 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
0
(0 %)
418
(0.01 %)
110
(100.00 %)
2,661,155
(49.83 %)
673,071
(10.59 %)
5,755,954
(42.48 %)
1
(0.00 %)
1,108,306
(7.28 %)
66,952
(4.46 %)
21,217
(0.87 %)
326 rudd (fScaEry2.hap1.1 2024)
GCA_964197995.1
n/a n/a 18,254
(2.38 %)
68,852
(5.71 %)
n/a 39.02
(99.99 %)
4
(0.00 %)
836
(0.01 %)
759
(100.00 %)
2,854,977
(51.13 %)
754,287
(11.81 %)
5,942,764
(44.17 %)
2
(0.00 %)
1,392,734
(8.61 %)
72,686
(4.52 %)
23,184
(0.94 %)
327 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1
34,548
(9.49 %)
n/a 15,280
(3.00 %)
46,259
(6.95 %)
n/a 40.45
(99.99 %)
719
(0.01 %)
723
(0.01 %)
8,212
(99.99 %)
1,335,152
(28.19 %)
415,384
(6.53 %)
3,948,379
(27.81 %)
2
(0.00 %)
416,856
(4.21 %)
22,854
(1.61 %)
17,357
(1.05 %)
328 sailfin molly
GCF_001443285.1
53,986
(11.41 %)
n/a 15,048
(2.71 %)
33,482
(6.71 %)
n/a 39.18
(83.41 %)
36,637
(16.61 %)
41,735
(16.61 %)
54,623
(83.39 %)
357,919
(2.18 %)
189,502
(1.23 %)
4,873,063
(22.51 %)
1,755
(0.81 %)
87,954
(1.83 %)
34,138
(1.62 %)
26,570
(1.23 %)
329 sansaifugu (HTHZ2018 2019)
GCF_003711565.1
56,010
(20.10 %)
n/a 13,998
(4.84 %)
48,737
(11.56 %)
n/a 45.63
(99.99 %)
0
(0 %)
250
(0.01 %)
868
(100.00 %)
304,980
(15.98 %)
171,631
(4.98 %)
1,616,965
(21.60 %)
1
(0.00 %)
257,565
(5.29 %)
48,338
(9.79 %)
36,513
(5.09 %)
330 sardine (primary hap 2023)
GCA_963854185.1
n/a n/a 16,071
(2.33 %)
64,180
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
241
(100.00 %)
1,503,111
(11.74 %)
1,507,024
(15.48 %)
4,027,638
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,853
(8.48 %)
68,874
(3.56 %)
38,590
(1.78 %)
331 sardine (primary hap 2023)
GCF_963854185.1
48,146
(9.15 %)
n/a 16,069
(2.33 %)
64,178
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
240
(100.00 %)
1,503,108
(11.74 %)
1,507,022
(15.48 %)
4,027,614
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,852
(8.48 %)
68,873
(3.56 %)
38,589
(1.78 %)
332 scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023)
GCF_030265065.1
51,270
(7.00 %)
n/a 13,854
(1.32 %)
48,980
(3.46 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
0
(0 %)
9
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,805,346
(21.21 %)
512,153
(12.76 %)
6,260,589
(63.96 %)
0
(0 %)
859,332
(5.23 %)
96,908
(3.65 %)
37,320
(1.36 %)
333 Senegalese sole
GCF_019176455.1
46,446
(12.02 %)
n/a 15,155
(3.15 %)
43,828
(7.31 %)
n/a 40.92
(99.99 %)
0
(0 %)
662
(0.01 %)
1,937
(100.00 %)
522,618
(4.22 %)
317,280
(4.23 %)
4,040,245
(28.25 %)
1
(0.00 %)
268,721
(3.11 %)
26,946
(1.79 %)
16,377
(1.03 %)
334 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1
n/a n/a 14,728
(2.46 %)
62,094
(7.09 %)
n/a 42.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,847
(100.00 %)
939,151
(11.90 %)
472,983
(7.68 %)
4,326,183
(28.40 %)
0
(0 %)
486,310
(4.09 %)
64,290
(4.16 %)
42,087
(2.28 %)
335 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1
n/a n/a 15,032
(2.44 %)
62,625
(6.97 %)
n/a 42.07
(99.98 %)
0
(0 %)
598
(0.02 %)
847
(100.00 %)
967,197
(11.85 %)
498,286
(8.15 %)
4,397,828
(28.96 %)
9
(0.00 %)
531,478
(4.46 %)
65,744
(4.06 %)
42,870
(2.25 %)
336 sheepshead minnow
GCF_000732505.1
37,879
(7.01 %)
n/a 14,749
(2.02 %)
25,480
(4.66 %)
n/a 38.19
(86.93 %)
101,700
(13.10 %)
113,210
(13.10 %)
110,959
(86.90 %)
363,397
(1.88 %)
195,191
(1.43 %)
6,444,762
(27.47 %)
3,240
(0.30 %)
136,313
(1.74 %)
18,269
(0.66 %)
10,928
(0.41 %)
337 shortfin molly
GCF_001443325.1
54,473
(11.42 %)
n/a 15,104
(2.72 %)
33,717
(6.74 %)
n/a 39.23
(84.81 %)
32,496
(15.20 %)
37,507
(15.20 %)
50,598
(84.80 %)
328,347
(2.03 %)
172,112
(1.18 %)
4,876,942
(22.80 %)
1,876
(0.89 %)
88,660
(1.88 %)
34,271
(1.66 %)
26,703
(1.25 %)
338 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4
59,278
(19.85 %)
n/a 14,594
(4.32 %)
55,265
(10.96 %)
n/a 45.31
(99.99 %)
0
(0 %)
321
(0.01 %)
36
(100.00 %)
384,203
(19.38 %)
175,898
(4.39 %)
1,946,630
(23.16 %)
2
(0.00 %)
209,905
(4.10 %)
70,331
(13.13 %)
54,790
(7.31 %)
339 Siamese fighting fish (v5.1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1
n/a n/a 14,510
(4.12 %)
60,058
(10.77 %)
n/a 45.51
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,705
(100.00 %)
249,671
(3.68 %)
182,366
(4.87 %)
1,939,533
(22.55 %)
0
(0 %)
223,835
(4.10 %)
72,474
(13.55 %)
56,347
(7.50 %)
340 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2
n/a n/a 14,737
(4.05 %)
61,568
(10.70 %)
n/a 45.50
(100.00 %)
108
(0.00 %)
108
(0.00 %)
3,872
(100.00 %)
392,585
(19.23 %)
190,741
(5.09 %)
1,994,824
(23.20 %)
0
(0 %)
245,925
(4.39 %)
74,259
(13.49 %)
57,619
(7.42 %)
341 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1
131,166
(9.80 %)
n/a 29,612
(2.99 %)
81,338
(5.43 %)
n/a 37.63
(99.92 %)
0
(0 %)
2,597
(0.08 %)
51
(100.00 %)
3,277,259
(45.05 %)
801,192
(7.96 %)
7,910,205
(42.51 %)
3
(0.00 %)
1,037,130
(5.68 %)
60,236
(2.18 %)
20,870
(0.55 %)
342 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1
n/a n/a 13,661
(1.11 %)
75,418
(4.21 %)
n/a 45.01
(99.96 %)
0
(0 %)
3,120
(0.04 %)
1,059
(100.00 %)
4,634,757
(53.53 %)
1,006,319
(17.13 %)
5,273,732
(51.16 %)
14
(0.00 %)
1,782,741
(8.47 %)
145,115
(7.59 %)
66,645
(2.19 %)
343 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1
34,018
(4.17 %)
n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
0
(0 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
17
(0.00 %)
1,796,705
(8.53 %)
143,632
(7.43 %)
65,914
(2.15 %)
344 smallmouth bass
GCF_021292245.1
55,919
(9.40 %)
n/a 15,509
(2.37 %)
49,387
(5.61 %)
n/a 40.72
(99.65 %)
0
(0 %)
34,581
(0.36 %)
15,020
(100.00 %)
445,979
(2.50 %)
249,630
(2.49 %)
5,071,015
(28.28 %)
3,470
(0.39 %)
278,594
(4.93 %)
23,875
(1.36 %)
11,538
(0.57 %)
345 snake pipefish (RoL-2023_Sb 2023)
GCF_033978785.1
57,883
(4.39 %)
n/a 15,654
(1.03 %)
72,123
(3.58 %)
n/a 38.64
(100.00 %)
0
(0 %)
2,564
(0.00 %)
424
(100.00 %)
3,149,025
(23.73 %)
1,621,410
(19.58 %)
7,534,195
(67.22 %)
1
(0.00 %)
4,080,159
(14.37 %)
122,765
(3.07 %)
51,511
(1.21 %)
346 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2
75,628
(6.10 %)
n/a 24,075
(1.71 %)
98,364
(4.30 %)
n/a 43.37
(96.15 %)
1,903
(0.01 %)
25,658
(3.85 %)
36,660
(99.99 %)
949,725
(3.53 %)
1,465,583
(10.82 %)
8,853,884
(48.52 %)
872
(0.04 %)
1,715,998
(5.18 %)
62,850
(1.45 %)
16,671
(0.36 %)
347 sockeye salmon (Pitt River 2024)
GCF_034236695.1
80,798
(5.59 %)
n/a 26,218
(1.35 %)
116,746
(3.87 %)
n/a 44.03
(99.93 %)
1,058
(0.00 %)
4,351
(0.07 %)
12,436
(100.00 %)
6,356,046
(54.95 %)
2,840,516
(31.41 %)
10,575,179
(57.52 %)
9
(0.00 %)
6,694,579
(13.15 %)
77,648
(1.61 %)
19,825
(0.33 %)
348 South Georgia icefish
GCF_902827115.1
41,307
(6.47 %)
n/a 14,776
(1.79 %)
68,734
(6.16 %)
61,643
(5.52 %)
42.07
(99.94 %)
0
(0 %)
2,461
(0.06 %)
1,563
(100.00 %)
498,451
(3.42 %)
474,032
(7.20 %)
3,613,731
(45.83 %)
19
(0.00 %)
763,187
(8.62 %)
88,984
(4.31 %)
17,905
(0.76 %)
349 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1
n/a n/a 15,727
(2.61 %)
43,177
(5.74 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 895
(100.00 %)
1,590,386
(33.53 %)
246,800
(2.86 %)
5,173,834
(26.85 %)
0
(0 %)
323,596
(3.31 %)
14,473
(0.87 %)
9,723
(0.47 %)
350 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
n/a 15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
0
(0 %)
326,254
(3.37 %)
14,097
(0.88 %)
8,860
(0.42 %)
351 southern platyfish
GCF_002775205.1
46,367
(11.15 %)
n/a 14,674
(2.66 %)
28,368
(6.82 %)
n/a 38.97
(99.53 %)
0
(0 %)
156
(0.47 %)
102
(100.00 %)
323,402
(2.76 %)
146,477
(2.33 %)
4,741,552
(28.27 %)
0
(0 %)
190,964
(2.71 %)
34,667
(2.13 %)
24,564
(1.37 %)
352 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1
74,317
(6.97 %)
n/a 30,906
(3.19 %)
55,474
(5.66 %)
n/a 37.28
(92.69 %)
168,741
(7.34 %)
168,741
(7.34 %)
254,423
(92.66 %)
1,129,104
(5.02 %)
730,197
(4.59 %)
8,910,005
(36.97 %)
1,220
(0.18 %)
542,313
(6.57 %)
64,238
(1.79 %)
28,032
(0.71 %)
353 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1
57,720
(10.03 %)
n/a 15,810
(2.14 %)
58,218
(5.77 %)
n/a 40.33
(99.99 %)
0
(0 %)
871
(0.01 %)
81
(100.00 %)
1,505,948
(35.31 %)
346,542
(4.71 %)
5,210,329
(31.65 %)
0
(0 %)
506,956
(4.12 %)
36,529
(1.65 %)
21,732
(0.92 %)
354 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1
38,931
(8.84 %)
n/a 15,624
(2.29 %)
35,942
(5.59 %)
n/a 40.01
(85.05 %)
0
(0 %)
209,115
(15.01 %)
30,414
(100.00 %)
372,901
(2.33 %)
278,854
(1.99 %)
5,622,334
(22.61 %)
3,125
(0.18 %)
147,444
(1.33 %)
25,079
(0.95 %)
17,741
(0.66 %)
355 spotted green pufferfish (2004)
GCA_000180735.1
n/a 193,449
(10.86 %)
13,641
(5.13 %)
57,982
(13.46 %)
n/a 46.43
(91.24 %)
18,974
(8.76 %)
18,974
(8.76 %)
44,686
(91.24 %)
252,877
(4.38 %)
159,939
(3.51 %)
1,689,462
(18.66 %)
20
(0.00 %)
119,601
(3.94 %)
51,580
(13.42 %)
39,946
(6.79 %)
356 spotted tilapia (v1 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.1
46,818
(8.35 %)
n/a 14,938
(2.04 %)
55,475
(6.12 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
23
(0.00 %)
792
(100.00 %)
505,488
(2.57 %)
269,742
(4.14 %)
4,697,020
(30.74 %)
0
(0 %)
395,431
(3.97 %)
30,399
(1.90 %)
16,887
(0.82 %)
357 spotted tilapia (v2 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.2
48,380
(8.37 %)
n/a 15,470
(2.04 %)
57,237
(6.11 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
24
(0.00 %)
791
(100.00 %)
523,070
(2.57 %)
277,554
(4.08 %)
4,872,723
(30.67 %)
0
(0 %)
404,433
(3.93 %)
31,383
(1.89 %)
17,453
(0.82 %)
358 sterlet (maternal 2020)
GCA_902713425.1
n/a n/a 22,306
(1.80 %)
33,366
(4.09 %)
n/a 39.56
(99.99 %)
0
(0 %)
402
(0.01 %)
245
(100.00 %)
1,126,738
(3.36 %)
889,853
(6.73 %)
8,766,715
(39.22 %)
4
(0.00 %)
1,059,859
(5.24 %)
51,356
(1.84 %)
13,633
(0.35 %)
359 sterlet (paternal 2020)
GCA_902713435.1
n/a n/a 22,718
(1.81 %)
34,093
(4.15 %)
57,768
(4.88 %)
39.60
(100.00 %)
0
(0 %)
422
(0.01 %)
224
(100.00 %)
1,145,503
(3.39 %)
912,936
(6.84 %)
8,839,174
(39.17 %)
4
(0.00 %)
1,099,124
(5.35 %)
52,560
(1.82 %)
14,166
(0.36 %)
360 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1
n/a n/a 16,177
(4.18 %)
40,160
(7.35 %)
n/a 39.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,237
(100.00 %)
1,208,781
(38.02 %)
121,854
(7.96 %)
2,956,942
(32.61 %)
0
(0 %)
310,772
(4.79 %)
27,787
(3.58 %)
14,364
(1.06 %)
361 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1
n/a n/a 16,419
(3.98 %)
40,677
(7.21 %)
n/a 39.69
(99.97 %)
0
(0 %)
825
(0.03 %)
100
(100.00 %)
1,324,513
(39.84 %)
143,170
(9.30 %)
3,000,881
(34.30 %)
1
(0.00 %)
392,291
(5.75 %)
30,130
(3.71 %)
15,123
(1.03 %)
362 stone moroko (DD20220531a primary hap 2022)
GCF_024679245.1
59,497
(6.82 %)
n/a 17,172
(2.25 %)
57,383
(4.85 %)
n/a 39.18
(99.99 %)
0
(0 %)
497
(0.01 %)
81
(100.00 %)
4,750,810
(63.58 %)
649,426
(10.14 %)
6,511,384
(46.74 %)
4
(0.00 %)
1,041,545
(6.23 %)
74,723
(4.45 %)
16,230
(0.62 %)
363 straightnose pipefish (RoL-2023_Sa 2023)
GCF_033978795.1
56,498
(4.86 %)
n/a 14,602
(1.00 %)
64,279
(2.96 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
0
(0 %)
1,172
(0.00 %)
473
(100.00 %)
2,984,285
(27.54 %)
1,402,691
(20.35 %)
7,915,062
(67.02 %)
0
(0 %)
4,017,415
(14.33 %)
140,374
(3.90 %)
46,995
(1.10 %)
364 striated frogfish (MH-2024 2024)
GCF_040054535.1
45,220
(12.66 %)
n/a 14,509
(3.35 %)
46,221
(7.95 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
0
(0 %)
18
(0.00 %)
42
(100.00 %)
791,570
(25.79 %)
305,491
(6.68 %)
3,000,938
(29.61 %)
0
(0 %)
272,583
(3.30 %)
36,818
(4.17 %)
23,466
(2.10 %)
365 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1
n/a n/a 15,871
(2.85 %)
42,287
(5.51 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
3,274
(100.00 %)
1,826,752
(37.53 %)
592,022
(6.69 %)
4,899,884
(32.33 %)
0
(0 %)
491,621
(3.91 %)
17,357
(1.25 %)
12,560
(0.74 %)
366 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1
53,860
(11.99 %)
n/a 16,033
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
0
(0 %)
236
(0.51 %)
58
(100.00 %)
1,870,234
(37.80 %)
605,570
(6.82 %)
5,059,429
(32.43 %)
2
(0.00 %)
531,388
(4.26 %)
17,919
(1.29 %)
12,796
(0.75 %)
367 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1
50,044
(9.61 %)
n/a 15,665
(2.76 %)
41,398
(5.35 %)
n/a 38.86
(99.98 %)
0
(0 %)
463
(0.02 %)
150
(100.00 %)
777,186
(5.69 %)
603,962
(6.24 %)
5,141,987
(32.41 %)
0
(0 %)
499,249
(4.08 %)
17,264
(1.20 %)
11,793
(0.66 %)
368 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1
40,992
(9.44 %)
n/a 15,295
(2.91 %)
20,865
(5.31 %)
n/a 38.71
(97.32 %)
0
(0 %)
23,755
(2.69 %)
567
(100.00 %)
693,498
(4.75 %)
489,286
(3.69 %)
4,849,313
(30.04 %)
22
(0.00 %)
189,512
(1.66 %)
15,076
(0.95 %)
10,761
(0.60 %)
369 striped sea-bass
GCF_004916995.1
32,103
(10.78 %)
n/a 14,422
(3.07 %)
38,188
(6.41 %)
n/a 40.19
(99.19 %)
0
(0 %)
73,335
(0.86 %)
630
(100.00 %)
365,581
(2.59 %)
142,967
(0.99 %)
4,151,813
(22.73 %)
371
(0.01 %)
25,024
(0.35 %)
13,730
(0.95 %)
10,471
(0.69 %)
370 Sumatra barb
GCF_018831695.1
54,947
(11.16 %)
n/a 18,745
(3.98 %)
49,520
(6.36 %)
n/a 38.24
(99.95 %)
0
(0 %)
5,075
(0.05 %)
1,122
(100.00 %)
638,783
(6.33 %)
357,159
(7.71 %)
4,520,846
(32.46 %)
16
(0.00 %)
624,611
(5.29 %)
46,339
(3.96 %)
34,160
(2.01 %)
371 swamp eel
GCF_001952655.1
43,831
(10.64 %)
n/a 14,741
(2.98 %)
20,099
(5.80 %)
n/a 40.90
(92.01 %)
51,257
(8.01 %)
51,257
(8.01 %)
71,879
(91.99 %)
266,195
(1.84 %)
95,726
(1.16 %)
3,596,747
(21.95 %)
26
(0.02 %)
54,721
(1.57 %)
7,065
(0.42 %)
5,103
(0.29 %)
372 swordfish
GCF_016859285.1
47,986
(9.92 %)
n/a 15,208
(2.84 %)
42,556
(5.91 %)
n/a 40.69
(99.97 %)
0
(0 %)
449
(0.03 %)
1,482
(100.00 %)
484,543
(3.59 %)
230,762
(3.41 %)
4,496,150
(23.94 %)
0
(0 %)
203,746
(2.18 %)
27,129
(2.10 %)
20,905
(1.34 %)
373 tambaqui
GCF_904425465.1
46,601
(6.55 %)
n/a 17,150
(1.88 %)
50,327
(4.03 %)
n/a 39.33
(100.00 %)
0
(0 %)
420
(0.00 %)
1,269
(100.00 %)
753,112
(4.00 %)
676,948
(5.71 %)
8,317,676
(35.32 %)
3
(0.00 %)
679,968
(3.78 %)
25,784
(0.92 %)
17,476
(0.58 %)
374 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1
n/a n/a 14,720
(2.58 %)
45,918
(6.44 %)
n/a 40.37
(99.99 %)
0
(0 %)
454
(0.01 %)
188
(100.00 %)
1,242,704
(17.37 %)
518,293
(15.23 %)
3,986,694
(40.18 %)
1
(0.00 %)
670,254
(6.56 %)
51,441
(3.53 %)
22,258
(1.30 %)
375 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1
n/a n/a 15,347
(2.73 %)
50,294
(7.25 %)
n/a 42.30
(99.98 %)
30
(0.00 %)
610
(0.02 %)
393
(100.00 %)
1,157,324
(26.70 %)
229,196
(4.33 %)
3,694,790
(27.54 %)
1
(0.00 %)
385,033
(4.63 %)
38,929
(2.20 %)
24,476
(1.25 %)
376 three-spined stickleback
GCF_016920845.1
50,181
(16.09 %)
n/a 14,935
(3.99 %)
53,773
(9.96 %)
n/a 44.66
(99.24 %)
0
(0 %)
3,125
(0.76 %)
2,937
(100.00 %)
368,987
(9.09 %)
160,564
(2.89 %)
2,308,841
(21.91 %)
4
(0.00 %)
148,689
(2.94 %)
80,336
(11.49 %)
57,087
(5.92 %)
377 three-spined stickleback (hap1 2024)
GCA_964276395.1
n/a n/a 14,939
(3.72 %)
56,284
(10.07 %)
n/a 44.71
(99.99 %)
3
(0.00 %)
331
(0.01 %)
133
(100.00 %)
573,569
(20.53 %)
206,699
(9.01 %)
2,335,009
(27.29 %)
7
(0.00 %)
213,153
(3.82 %)
84,009
(12.41 %)
57,803
(5.54 %)
378 three-spined stickleback (hap2 2024)
GCA_964276385.1
n/a n/a 13,591
(3.79 %)
50,693
(10.19 %)
n/a 44.72
(99.99 %)
309
(0.01 %)
309
(0.01 %)
479
(99.99 %)
505,547
(19.86 %)
181,092
(8.75 %)
2,117,454
(27.02 %)
3
(0.00 %)
218,946
(4.51 %)
75,434
(12.33 %)
51,737
(5.53 %)
379 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1
n/a n/a 13,912
(1.87 %)
62,727
(6.28 %)
n/a 42.90
(99.99 %)
0
(0 %)
894
(0.01 %)
755
(100.00 %)
1,981,480
(37.86 %)
652,950
(27.50 %)
3,680,829
(47.75 %)
2
(0.00 %)
1,877,326
(11.62 %)
96,414
(8.01 %)
44,593
(2.17 %)
380 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437365.1
n/a n/a 14,276
(1.78 %)
66,576
(6.32 %)
n/a 42.96
(99.99 %)
0
(0 %)
794
(0.01 %)
820
(100.00 %)
2,127,818
(38.86 %)
708,255
(30.28 %)
3,809,452
(49.66 %)
2
(0.00 %)
2,111,836
(12.18 %)
101,682
(8.04 %)
46,739
(2.13 %)
381 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2
47,024
(13.33 %)
n/a 13,806
(3.76 %)
52,367
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.08 %)
22,977
(6.92 %)
22,977
(6.92 %)
55,891
(93.08 %)
356,857
(3.66 %)
155,338
(3.36 %)
2,806,278
(24.56 %)
111
(0.08 %)
112,464
(5.32 %)
61,010
(7.71 %)
45,318
(4.17 %)
382 tongue sole
GCF_000523025.1
45,186
(16.40 %)
n/a 14,186
(3.98 %)
20,816
(8.22 %)
n/a 40.82
(94.88 %)
33,269
(5.14 %)
33,269
(5.14 %)
62,912
(94.86 %)
423,833
(4.34 %)
235,739
(3.33 %)
3,085,031
(24.78 %)
78
(0.05 %)
83,655
(2.37 %)
17,094
(1.42 %)
11,360
(0.88 %)
383 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3
n/a n/a 13,635
(4.82 %)
48,723
(11.83 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
0
(0 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,793
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
0
(0 %)
206,265
(4.46 %)
46,936
(9.72 %)
35,741
(5.19 %)
384 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2
53,479
(18.31 %)
n/a 14,527
(4.79 %)
28,597
(10.65 %)
55,587
(14.38 %)
45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
281,011
(10.36 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,756
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,975
(9.63 %)
37,920
(5.08 %)
385 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3
n/a n/a 14,527
(4.79 %)
51,181
(11.72 %)
n/a 45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
325,077
(14.03 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,754
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,975
(9.63 %)
37,920
(5.08 %)
386 trahira (fHopMal1hap1 2024)
GCF_029633855.1
55,764
(7.71 %)
n/a 17,259
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
0
(0 %)
989
(5.49 %)
598
(100.00 %)
2,407,637
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,475
(37.52 %)
3
(0.00 %)
1,264,118
(7.29 %)
29,012
(2.12 %)
12,979
(0.45 %)
387 trahira (hap2 2023)
GCA_029633875.1
n/a n/a 16,216
(2.00 %)
45,209
(4.32 %)
n/a 41.03
(96.02 %)
0
(0 %)
907
(3.98 %)
452
(100.00 %)
2,280,303
(30.80 %)
708,327
(15.59 %)
5,394,248
(39.01 %)
7
(0.00 %)
1,246,906
(7.61 %)
28,386
(2.18 %)
12,439
(0.46 %)
388 trahira (v2 hap1 2024)
GCA_029633855.2
n/a n/a 17,256
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
0
(0 %)
989
(5.49 %)
597
(100.00 %)
2,407,631
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,418
(37.52 %)
3
(0.00 %)
1,264,125
(7.29 %)
29,012
(2.12 %)
12,979
(0.45 %)
389 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1
n/a n/a 14,816
(3.44 %)
49,680
(8.16 %)
n/a 43.40
(99.97 %)
0
(0 %)
805
(0.03 %)
108
(100.00 %)
808,348
(19.20 %)
301,230
(7.15 %)
3,267,772
(25.91 %)
4
(0.00 %)
311,531
(3.41 %)
66,132
(6.90 %)
41,801
(3.31 %)
390 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1
57,285
(14.93 %)
n/a 14,887
(3.52 %)
49,403
(8.32 %)
87,351
(14.65 %)
43.54
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28
(100.00 %)
455,017
(0.00 %)
297,185
(5.03 %)
3,312,612
(24.33 %)
0
(0 %)
273,238
(2.64 %)
65,633
(7.08 %)
41,821
(3.38 %)
391 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1
40,373
(7.85 %)
n/a 14,339
(2.08 %)
84,906
(20.47 %)
57,218
(6.01 %)
42.51
(68.98 %)
63,014
(31.03 %)
85,562
(31.04 %)
68,911
(68.97 %)
392,114
(2.78 %)
307,607
(2.09 %)
4,777,941
(27.62 %)
528
(0.12 %)
221,213
(1.41 %)
61,105
(2.15 %)
17,725
(0.62 %)
392 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1
54,488
(6.75 %)
n/a 14,227
(1.27 %)
69,161
(4.33 %)
n/a 44.33
(93.22 %)
0
(0 %)
3,093
(6.78 %)
2,681
(100.00 %)
2,760,581
(47.64 %)
635,213
(25.56 %)
4,136,925
(56.55 %)
8
(0.00 %)
2,533,340
(11.75 %)
110,696
(10.50 %)
17,579
(0.49 %)
393 walking catfish (CIFAMagur01 2020)
GCA_013621035.1
n/a 23,712
(3.37 %)
15,895
(2.18 %)
46,934
(4.73 %)
n/a 39.83
(99.95 %)
0
(0 %)
605
(0.05 %)
3,484
(100.00 %)
1,061,538
(6.25 %)
611,618
(5.19 %)
5,978,835
(37.11 %)
3
(0.00 %)
510,982
(4.22 %)
54,666
(3.50 %)
24,478
(1.06 %)
394 walleye pollock (NIFS_2021 2022)
GCF_026213295.1
49,084
(12.15 %)
n/a 14,241
(2.71 %)
70,653
(9.29 %)
n/a 45.59
(99.96 %)
0
(0 %)
2,816
(0.04 %)
168
(100.00 %)
1,274,742
(38.63 %)
797,757
(14.11 %)
2,725,416
(34.38 %)
8
(0.00 %)
658,410
(7.33 %)
95,149
(8.09 %)
57,122
(4.03 %)
395 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1
n/a n/a 14,197
(3.33 %)
44,782
(7.70 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,294
(100.00 %)
396,279
(4.74 %)
275,154
(5.76 %)
2,933,132
(29.41 %)
0
(0 %)
277,720
(3.27 %)
35,104
(4.08 %)
21,634
(1.95 %)
396 warty frogfish (fAntMac1 primary hap 2020)
GCA_013358685.1
n/a n/a 14,494
(3.34 %)
45,310
(7.77 %)
n/a 41.86
(99.87 %)
0
(0 %)
219
(0.13 %)
155
(100.00 %)
413,753
(4.95 %)
290,313
(6.11 %)
3,010,996
(29.71 %)
3
(0.00 %)
305,411
(3.51 %)
36,840
(4.18 %)
22,433
(1.95 %)
397 western mosquitofish
GCF_019740435.1
54,029
(12.31 %)
n/a 14,667
(2.80 %)
44,358
(6.62 %)
n/a 38.94
(97.42 %)
0
(0 %)
181
(2.58 %)
37
(100.00 %)
348,476
(2.56 %)
158,728
(2.21 %)
4,604,959
(26.85 %)
0
(0 %)
174,331
(2.27 %)
30,624
(1.94 %)
23,348
(1.33 %)
398 western speckled dace (OS25496 2023)
GCF_029890125.1
46,203
(5.36 %)
n/a 16,945
(2.57 %)
65,343
(6.35 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 930
(100.00 %)
2,528,154
(48.24 %)
549,447
(8.24 %)
5,157,802
(41.42 %)
0
(0 %)
921,640
(6.77 %)
84,874
(6.05 %)
24,156
(1.14 %)
399 White Sands pupfish
GCF_016077235.1
46,084
(6.27 %)
n/a 14,817
(1.71 %)
52,055
(4.88 %)
n/a 39.01
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,003
(100.00 %)
489,894
(2.67 %)
304,277
(3.91 %)
6,371,712
(38.05 %)
0
(0 %)
457,693
(3.60 %)
41,820
(1.75 %)
13,011
(0.56 %)
400 wolf-eel
GCF_004355925.1
43,625
(14.00 %)
n/a 14,930
(3.24 %)
31,372
(7.30 %)
n/a 42.10
(92.86 %)
23,085
(7.15 %)
23,891
(7.15 %)
33,400
(92.85 %)
379,343
(3.26 %)
244,853
(2.39 %)
3,432,622
(22.07 %)
476
(0.06 %)
108,255
(0.97 %)
30,581
(2.04 %)
19,275
(1.18 %)
401 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1
n/a n/a 14,753
(3.49 %)
49,516
(8.47 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
0
(0 %)
222
(0.00 %)
171
(100.00 %)
458,382
(5.18 %)
420,718
(8.01 %)
3,146,054
(25.71 %)
0
(0 %)
390,050
(4.18 %)
69,817
(7.20 %)
44,403
(3.53 %)
402 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1
n/a n/a 14,847
(3.48 %)
50,136
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
0
(0 %)
219
(0.00 %)
443
(100.00 %)
461,903
(5.20 %)
422,251
(8.03 %)
3,180,804
(25.81 %)
1
(0.00 %)
392,635
(4.18 %)
70,183
(7.15 %)
44,599
(3.52 %)
403 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 primary hap 2022)
GCF_023055335.1
42,410
(12.47 %)
n/a 14,845
(3.48 %)
50,132
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
219
(0.00 %)
219
(0.00 %)
661
(100.00 %)
461,895
(5.20 %)
422,249
(8.03 %)
3,180,722
(25.81 %)
1
(0.00 %)
392,632
(4.18 %)
70,181
(7.15 %)
44,597
(3.52 %)
404 worm pipefish (RoL_2023-P1 2023)
GCF_033978685.1
73,681
(3.43 %)
n/a 25,892
(1.02 %)
114,154
(3.30 %)
n/a 39.45
(100.00 %)
0
(0 %)
146
(0.00 %)
630
(100.00 %)
4,795,312
(24.37 %)
2,093,730
(16.74 %)
13,132,465
(67.32 %)
0
(0 %)
5,394,148
(11.91 %)
248,526
(4.59 %)
79,895
(1.28 %)
405 Wuchang bream
GCF_018812025.1
68,768
(8.86 %)
n/a 18,247
(2.62 %)
57,323
(5.24 %)
n/a 37.64
(99.83 %)
0
(0 %)
1,281
(0.17 %)
243
(100.00 %)
801,110
(0.00 %)
559,399
(5.04 %)
6,340,567
(43.09 %)
2
(0.00 %)
715,866
(5.11 %)
45,067
(2.52 %)
19,912
(0.78 %)
406 Yangtze koukloug (SWU-2019 2020)
GCF_012432095.1
63,925
(10.50 %)
n/a 17,502
(3.25 %)
52,519
(5.86 %)
n/a 37.23
(99.62 %)
0
(0 %)
617
(0.38 %)
353
(100.00 %)
2,297,102
(50.34 %)
368,423
(3.28 %)
5,171,389
(38.98 %)
1
(0.00 %)
338,882
(3.77 %)
32,824
(2.00 %)
14,248
(0.64 %)
407 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1
64,819
(11.15 %)
n/a 15,680
(2.87 %)
41,108
(5.68 %)
n/a 39.49
(99.94 %)
0
(0 %)
817
(0.06 %)
517
(100.00 %)
839,496
(9.42 %)
756,396
(11.12 %)
4,051,149
(35.45 %)
2
(0.00 %)
834,149
(7.02 %)
24,342
(1.72 %)
12,238
(0.75 %)
408 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1
54,374
(10.66 %)
n/a 15,584
(2.85 %)
22,598
(5.58 %)
n/a 39.55
(99.11 %)
0
(0 %)
1,760
(0.89 %)
663
(100.00 %)
883,218
(10.65 %)
797,020
(11.09 %)
4,092,065
(35.46 %)
4
(0.00 %)
749,315
(6.20 %)
24,238
(1.72 %)
12,253
(0.76 %)
409 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1
47,108
(7.77 %)
n/a 15,458
(2.26 %)
28,572
(5.62 %)
n/a 40.84
(99.95 %)
0
(0 %)
831
(0.05 %)
268
(100.00 %)
620,402
(4.92 %)
540,302
(7.26 %)
4,770,842
(35.92 %)
0
(0 %)
688,524
(4.84 %)
35,251
(1.63 %)
13,218
(0.63 %)
410 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1
n/a n/a 814
(1.87 %)
3,814
(6.84 %)
n/a 42.36
(99.98 %)
0
(0 %)
80
(0.02 %)
349
(100.00 %)
38,000
(5.03 %)
29,516
(7.35 %)
232,988
(20.37 %)
0
(0 %)
46,752
(6.67 %)
2,289
(2.07 %)
1,621
(1.32 %)
411 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
n/a 15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
84,160
(11.62 %)
42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
0
(0 %)
188,182
(2.04 %)
31,005
(1.79 %)
19,757
(1.03 %)
412 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1
n/a n/a 15,959
(2.63 %)
43,025
(5.73 %)
n/a 39.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 640
(100.00 %)
1,427,221
(28.44 %)
257,108
(3.15 %)
5,197,531
(26.91 %)
0
(0 %)
350,223
(3.66 %)
13,909
(0.83 %)
10,650
(0.55 %)
413 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
n/a 15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
1
(0.00 %)
375,976
(3.80 %)
14,420
(0.88 %)
9,087
(0.42 %)
414 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2
40,935
(9.94 %)
n/a 15,673
(2.75 %)
53,235
(6.33 %)
n/a 40.72
(97.79 %)
0
(0 %)
33,661
(2.21 %)
98,345
(100.00 %)
1,337,427
(24.48 %)
522,121
(4.83 %)
4,649,096
(25.00 %)
308
(0.03 %)
357,663
(3.10 %)
16,819
(0.86 %)
11,638
(0.57 %)
415 Zealand spotty
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
n/a 14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,987
(4.42 %)
18,299
(0.85 %)
7,999
(0.35 %)
416 zebra mbuna
GCF_000238955.4
51,012
(8.37 %)
n/a 15,901
(2.10 %)
32,136
(6.12 %)
n/a 41.16
(99.99 %)
0
(0 %)
641
(0.01 %)
1,690
(100.00 %)
565,771
(6.22 %)
253,037
(2.53 %)
4,679,743
(31.57 %)
0
(0 %)
324,855
(3.54 %)
36,689
(2.00 %)
18,156
(0.99 %)
417 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1
n/a n/a 6,365
(2.41 %)
16,467
(3.26 %)
n/a 36.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,719
(100.00 %)
1,317,027
(59.43 %)
323,062
(10.58 %)
3,014,570
(45.46 %)
0
(0 %)
366,878
(5.24 %)
14,563
(1.98 %)
3,786
(0.32 %)
418 zebrafish (fDanRer4 primary hap 2022)
GCA_944039275.1
n/a n/a 18,065
(2.46 %)
44,526
(3.30 %)
n/a 37.08
(99.99 %)
0
(0 %)
381
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,804,769
(44.04 %)
954,645
(10.72 %)
8,694,743
(51.88 %)
4
(0.00 %)
1,207,649
(5.79 %)
44,936
(2.02 %)
11,380
(0.33 %)
419 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1
n/a n/a 17,774
(2.54 %)
44,221
(3.24 %)
n/a 36.52
(99.87 %)
20,876
(0.14 %)
20,876
(0.14 %)
20,901
(99.86 %)
4,138,008
(61.22 %)
894,145
(6.79 %)
9,494,379
(47.68 %)
393
(0.01 %)
781,563
(4.38 %)
42,482
(2.03 %)
8,815
(0.26 %)
420 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1
n/a n/a 17,535
(2.50 %)
44,169
(3.34 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
0
(0 %)
712
(0.01 %)
1,252
(100.00 %)
3,891,854
(61.07 %)
927,173
(7.78 %)
8,621,517
(50.27 %)
1
(0.00 %)
941,178
(4.90 %)
44,554
(2.12 %)
10,153
(0.30 %)
421 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2
n/a n/a 17,692
(2.51 %)
43,578
(3.27 %)
n/a 36.56
(99.99 %)
0
(0 %)
1,352
(0.01 %)
755
(100.00 %)
3,937,397
(60.86 %)
936,258
(7.76 %)
8,732,369
(50.44 %)
0
(0 %)
933,928
(4.81 %)
44,812
(2.09 %)
10,558
(0.30 %)
422 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6
65,219
(5.63 %)
n/a 22,246
(2.54 %)
51,134
(7.13 %)
n/a 36.60
(99.72 %)
17,105
(0.27 %)
20,258
(0.28 %)
34,617
(99.73 %)
4,595,932
(57.92 %)
1,077,677
(6.47 %)
10,772,232
(49.45 %)
127
(0.00 %)
942,199
(4.23 %)
53,471
(2.06 %)
12,486
(0.29 %)
423 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1
n/a n/a 1,204
(2.88 %)
4,065
(7.13 %)
n/a 41.24
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 1,437
(100.00 %)
26,319
(3.19 %)
14,209
(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
0
(0 %)
22,258
(4.87 %)
1,253
(1.49 %)
988
(1.13 %)
424 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2
44,988
(12.00 %)
n/a 15,037
(3.35 %)
40,235
(7.28 %)
60,496
(9.39 %)
40.66
(97.76 %)
0
(0 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
348,230
(2.87 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,025
(23.44 %)
0
(0 %)
175,881
(3.08 %)
12,807
(1.08 %)
8,703
(0.67 %)
425 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3
n/a n/a 15,036
(3.35 %)
40,234
(7.28 %)
n/a 40.66
(97.76 %)
0
(0 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
671,614
(20.98 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,040
(23.44 %)
0
(0 %)
175,881
(3.08 %)
12,807
(1.08 %)
8,703
(0.67 %)
TOTALS:total assembly count 425

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 221 assemblies assembly stats track stats
Mammals 608 assemblies assembly stats track stats
Birds 399 assemblies assembly stats track stats
Fishes 425 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 279 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1111 assemblies assembly stats track stats
Plants 305 assemblies assembly stats track stats
Fungi 912 assemblies assembly stats track stats
Viruses 287 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 107 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 527 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1060 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 775 assemblies assembly stats track stats