Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024 refseq)
GCF_043250625.1
59,397
(10.47 %)
n/a 15,453
(2.37 %)
50,184
(6.16 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
0
(0 %)
472
(0.01 %)
204
(100.00 %)
529,455
(3.89 %)
444,047
(7.93 %)
4,765,018
(37.01 %)
6
(0.00 %)
706,869
(5.97 %)
39,918
(2.01 %)
16,191
(0.73 %)
2 alewife (anadromous, Long Island Sound Yale_2024_CS 2024)
GCF_046254945.1
51,219
(7.63 %)
n/a 15,894
(1.91 %)
68,940
(6.15 %)
n/a 43.01
(99.98 %)
0
(0 %)
1,061
(0.02 %)
329
(100.00 %)
3,296,957
(52.37 %)
1,419,758
(14.07 %)
4,202,787
(42.59 %)
9
(0.00 %)
1,173,538
(7.51 %)
48,047
(2.20 %)
26,432
(1.01 %)
3 alligator pipefish (LvHL_M 2021)
GCF_019802595.1
54,226
(11.15 %)
n/a 13,427
(2.67 %)
46,903
(5.94 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
144
(0.00 %)
143
(100.00 %)
1,200,994
(30.62 %)
143,062
(2.20 %)
3,921,676
(38.03 %)
0
(0 %)
164,363
(2.07 %)
67,978
(8.92 %)
47,265
(3.34 %)
4 allis shad
GCF_017589495.1
48,520
(8.47 %)
n/a 15,371
(2.28 %)
58,686
(5.84 %)
n/a 42.99
(99.91 %)
0
(0 %)
1,541
(0.09 %)
1,095
(100.00 %)
1,190,406
(9.30 %)
1,205,679
(11.28 %)
3,960,328
(38.81 %)
0
(0 %)
936,797
(6.49 %)
36,494
(1.83 %)
23,714
(1.20 %)
5 Amazon molly
GCF_000485575.1
56,958
(11.69 %)
n/a 15,117
(2.64 %)
30,114
(6.60 %)
n/a 39.16
(95.38 %)
27,073
(4.64 %)
36,429
(4.64 %)
31,058
(95.36 %)
346,461
(2.03 %)
188,557
(1.44 %)
5,139,633
(26.01 %)
848
(0.07 %)
161,806
(7.35 %)
35,229
(1.82 %)
27,404
(1.38 %)
6 amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021)
GCF_021018895.1
47,198
(13.10 %)
n/a 15,500
(3.14 %)
41,230
(6.67 %)
n/a 40.79
(99.99 %)
0
(0 %)
150
(0.01 %)
31
(100.00 %)
1,230,524
(26.57 %)
398,694
(5.41 %)
4,106,609
(25.60 %)
0
(0 %)
335,552
(3.38 %)
15,656
(0.99 %)
12,171
(0.69 %)
7 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1
n/a n/a 15,901
(2.25 %)
61,133
(6.37 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,411
(100.00 %)
2,043,181
(23.64 %)
1,141,539
(11.35 %)
3,668,314
(38.60 %)
0
(0 %)
805,945
(6.00 %)
40,218
(2.14 %)
24,243
(1.22 %)
8 American shad (primary hap 2021)
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
n/a 16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
76,974
(8.55 %)
43.18
(99.45 %)
0
(0 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
14
(0.00 %)
934,014
(6.61 %)
42,699
(2.23 %)
25,608
(1.23 %)
9 Andian cavefish (hap1 2023 genbank)
GCA_030014385.1
n/a n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,920
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
10 Andian cavefish (hap1 2023 refseq)
GCF_030014385.1
42,881
(5.97 %)
n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,939
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
11 annual killifish
GCF_001266775.1
38,517
(8.87 %)
n/a 14,027
(2.45 %)
27,798
(5.86 %)
n/a 39.29
(80.23 %)
138,584
(19.83 %)
1,025,519
(19.94 %)
168,368
(80.17 %)
349,927
(2.63 %)
296,826
(3.18 %)
5,039,517
(28.69 %)
2,323
(0.21 %)
261,101
(1.92 %)
26,364
(1.18 %)
17,566
(0.78 %)
12 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1
n/a n/a 16,678
(0.56 %)
151,361
(4.03 %)
n/a 44.57
(99.91 %)
0
(0 %)
15,113
(0.09 %)
5,983
(100.00 %)
12,251,532
(51.73 %)
3,521,157
(17.69 %)
10,051,020
(68.37 %)
71
(0.00 %)
5,101,423
(13.15 %)
494,595
(10.52 %)
74,823
(1.04 %)
13 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1
n/a n/a 17,318
(1.49 %)
80,097
(5.79 %)
n/a 43.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11,436
(100.00 %)
5,482,467
(36.71 %)
1,454,729
(18.84 %)
6,756,226
(47.56 %)
0
(0 %)
1,722,514
(9.86 %)
92,057
(3.50 %)
34,309
(1.32 %)
14 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1
n/a n/a 17,342
(1.44 %)
78,914
(5.48 %)
n/a 43.57
(99.96 %)
0
(0 %)
3,179
(0.04 %)
1,901
(100.00 %)
5,980,457
(37.18 %)
1,633,782
(21.76 %)
6,279,725
(52.83 %)
12
(0.00 %)
2,013,978
(10.83 %)
104,688
(3.57 %)
33,790
(1.15 %)
15 Antarctic spiny plunderfish (primary hap 2020)
GCA_902827135.1
n/a n/a 14,859
(1.97 %)
60,431
(5.73 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
0
(0 %)
1,039
(0.01 %)
1,541
(100.00 %)
461,253
(3.08 %)
434,124
(6.81 %)
3,499,945
(42.99 %)
6
(0.00 %)
656,220
(6.54 %)
60,941
(3.20 %)
13,823
(0.61 %)
16 Arctic char (2024)
GCF_045679555.1
101,825
(6.80 %)
n/a 26,394
(1.53 %)
107,089
(4.26 %)
n/a 43.53
(99.98 %)
0
(0 %)
3,854
(0.02 %)
939
(100.00 %)
1,090,104
(4.07 %)
1,787,017
(23.51 %)
9,220,961
(56.45 %)
77
(0.00 %)
3,631,994
(9.77 %)
78,798
(2.30 %)
19,082
(0.35 %)
17 Arctic char (CBP00131 primary hap 2024)
GCA_036784965.1
n/a n/a 22,376
(1.44 %)
97,559
(4.71 %)
n/a 43.37
(99.97 %)
3,235
(0.03 %)
3,235
(0.03 %)
4,404
(99.97 %)
999,920
(4.22 %)
1,630,911
(26.08 %)
7,875,105
(58.08 %)
17
(0.00 %)
1,400,966
(4.23 %)
70,947
(2.59 %)
16,782
(0.35 %)
18 Arctic char (IW2-2015 2018)
GCF_002910315.2
72,597
(5.72 %)
n/a 23,967
(1.55 %)
45,775
(3.69 %)
n/a 43.16
(93.25 %)
1,447
(0.01 %)
1,718,015
(6.84 %)
16,700
(99.99 %)
1,011,348
(4.06 %)
1,666,148
(10.50 %)
10,597,529
(44.77 %)
5,986
(0.15 %)
2,192,365
(6.51 %)
76,282
(1.94 %)
25,064
(0.53 %)
19 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1
n/a n/a 14,032
(2.44 %)
39,770
(4.92 %)
n/a 38.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,617
(100.00 %)
1,808,149
(37.98 %)
583,449
(10.56 %)
4,203,368
(40.67 %)
0
(0 %)
559,424
(5.24 %)
24,867
(2.06 %)
14,134
(0.93 %)
20 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1
n/a n/a 15,455
(2.53 %)
40,077
(4.90 %)
86,346
(8.45 %)
38.90
(99.98 %)
0
(0 %)
795
(0.02 %)
241
(100.00 %)
2,045,691
(38.70 %)
669,975
(11.72 %)
4,638,765
(42.07 %)
1
(0.00 %)
693,282
(5.96 %)
28,277
(1.93 %)
15,766
(0.94 %)
21 Arkansas darter
GCF_013103735.1
51,282
(9.79 %)
n/a 14,588
(2.90 %)
42,306
(6.27 %)
n/a 40.52
(99.50 %)
0
(0 %)
35,052
(0.52 %)
4,664
(100.00 %)
418,294
(3.29 %)
331,380
(3.74 %)
4,153,309
(26.60 %)
762
(0.03 %)
207,110
(1.75 %)
15,489
(0.95 %)
10,148
(0.62 %)
22 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1
n/a n/a 17,862
(2.29 %)
70,667
(5.50 %)
n/a 40.01
(100.00 %)
0
(0 %)
327
(0.00 %)
179
(100.00 %)
2,876,989
(50.39 %)
700,511
(9.88 %)
5,977,913
(44.08 %)
2
(0.00 %)
1,066,043
(6.53 %)
104,320
(8.02 %)
23,254
(0.86 %)
23 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1
n/a n/a 18,025
(2.28 %)
71,255
(5.50 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
0
(0 %)
318
(0.00 %)
341
(100.00 %)
2,884,301
(50.42 %)
702,464
(9.98 %)
5,989,299
(44.18 %)
2
(0.00 %)
1,090,542
(6.63 %)
105,945
(8.03 %)
23,683
(0.88 %)
24 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1
50,328
(9.13 %)
n/a 16,526
(2.73 %)
38,780
(6.64 %)
72,662
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
0
(0 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
504,673
(3.06 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
0
(0 %)
157,330
(1.72 %)
88,517
(10.73 %)
67,281
(4.98 %)
25 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2
n/a n/a 16,053
(2.73 %)
74,777
(7.26 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,351
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
0
(0 %)
142,849
(1.57 %)
85,546
(10.82 %)
65,542
(5.07 %)
26 Asian redtail catfish (EC202008001 2021)
GCF_019097595.1
51,030
(10.40 %)
n/a 15,549
(2.60 %)
42,858
(5.39 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
0
(0 %)
107
(0.00 %)
73
(100.00 %)
1,718,992
(31.80 %)
749,009
(14.09 %)
4,206,758
(37.30 %)
0
(0 %)
1,161,068
(7.86 %)
19,230
(1.16 %)
12,900
(0.65 %)
27 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924715.1
n/a n/a 15,722
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
0
(0 %)
468
(0.01 %)
120
(100.00 %)
1,608,686
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,115
(27.80 %)
3
(0.00 %)
390,196
(3.88 %)
14,488
(0.90 %)
9,706
(0.46 %)
28 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924715.1
54,426
(12.09 %)
n/a 15,720
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
0
(0 %)
468
(0.01 %)
119
(100.00 %)
1,608,682
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,078
(27.80 %)
3
(0.00 %)
390,196
(3.88 %)
14,488
(0.90 %)
9,706
(0.46 %)
29 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1
51,642
(11.92 %)
n/a 14,055
(2.62 %)
36,761
(8.42 %)
68,438
(9.50 %)
45.64
(96.48 %)
0
(0 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
790,946
(10.54 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
4
(0.00 %)
741,285
(7.34 %)
97,133
(7.82 %)
51,623
(3.50 %)
30 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1
n/a n/a 13,366
(2.68 %)
66,599
(9.29 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,727
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
0
(0 %)
635,348
(7.05 %)
87,167
(8.03 %)
47,003
(3.66 %)
31 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
n/a 14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
69,662
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
0
(0 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
0
(0 %)
240,110
(3.16 %)
31,325
(2.25 %)
20,749
(1.34 %)
32 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1
n/a n/a 16,554
(3.01 %)
54,832
(7.45 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,008
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
0
(0 %)
297,396
(3.46 %)
36,868
(2.33 %)
24,401
(1.38 %)
33 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2
50,946
(10.35 %)
n/a 16,394
(2.60 %)
61,637
(7.20 %)
n/a 44.16
(99.89 %)
1,963
(0.11 %)
1,990
(0.11 %)
3,687
(99.89 %)
1,269,688
(11.71 %)
1,318,661
(13.43 %)
3,732,801
(32.49 %)
2
(0.00 %)
1,134,686
(8.55 %)
35,959
(1.97 %)
21,835
(1.09 %)
34 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2
n/a n/a 15,331
(2.42 %)
52,370
(6.91 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
0
(0 %)
74
(0.00 %)
1,049
(100.00 %)
1,454,631
(18.29 %)
383,946
(4.34 %)
4,363,016
(32.69 %)
0
(0 %)
445,382
(4.43 %)
56,416
(3.08 %)
20,355
(1.02 %)
35 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2
n/a n/a 15,262
(2.42 %)
51,857
(6.86 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
222
(0.00 %)
153
(100.00 %)
1,454,219
(18.25 %)
384,609
(4.72 %)
4,338,083
(32.80 %)
5
(0.00 %)
449,712
(4.53 %)
56,553
(3.08 %)
20,550
(1.04 %)
36 Atlantic mackerel (primary hap 2023 genbank)
GCA_963691925.1
n/a n/a 15,291
(2.56 %)
43,206
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
666
(100.00 %)
1,496,244
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,761
(29.92 %)
9
(0.00 %)
555,075
(5.00 %)
13,309
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
37 Atlantic mackerel (primary hap 2023 refseq)
GCF_963691925.1
34,357
(8.10 %)
n/a 15,289
(2.56 %)
43,205
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
665
(100.00 %)
1,496,240
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,726
(29.93 %)
9
(0.00 %)
555,074
(5.00 %)
13,308
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
38 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1
112,904
(5.61 %)
n/a 28,077
(1.40 %)
115,207
(3.75 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
1,300,611
(4.84 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
0
(0 %)
3,295,334
(6.78 %)
77,089
(1.86 %)
20,127
(0.31 %)
39 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1
109,781
(5.45 %)
n/a 26,968
(1.35 %)
202,772
(19.11 %)
n/a 43.10
(88.27 %)
9,418
(0.03 %)
138,207
(11.73 %)
241,570
(99.97 %)
1,628,119
(9.46 %)
2,496,917
(19.18 %)
10,390,780
(51.80 %)
602
(0.04 %)
n/a 79,791
(1.60 %)
18,955
(0.25 %)
40 Atlantic silverside (fMenMen1 hap1 2025)
GCA_048628825.1
n/a n/a 14,247
(3.16 %)
47,091
(7.94 %)
n/a 42.17
(99.99 %)
21
(0.00 %)
867
(0.02 %)
478
(100.00 %)
352,705
(4.33 %)
432,013
(10.15 %)
2,954,922
(28.67 %)
13
(0.00 %)
641,504
(7.18 %)
41,876
(4.47 %)
27,639
(2.13 %)
41 Atlantic silverside (fMenMen1 hap2 2025)
GCA_048544195.1
n/a n/a 14,127
(3.23 %)
45,606
(7.98 %)
n/a 42.03
(99.99 %)
0
(0 %)
804
(0.01 %)
567
(100.00 %)
333,253
(4.04 %)
384,132
(9.16 %)
2,977,533
(27.98 %)
11
(0.00 %)
553,953
(6.58 %)
40,432
(4.35 %)
26,981
(2.14 %)
42 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1
60,214
(14.44 %)
n/a 14,860
(3.40 %)
50,921
(8.07 %)
76,242
(9.93 %)
43.38
(100.00 %)
0
(0 %)
51
(0.00 %)
127
(100.00 %)
449,865
(5.00 %)
299,255
(7.03 %)
3,274,219
(25.77 %)
0
(0 %)
378,660
(3.73 %)
67,338
(7.00 %)
43,189
(3.43 %)
43 Australian ruff (RE-2024a hap1 2024)
GCA_042242115.1
n/a n/a 15,457
(2.72 %)
38,472
(5.59 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
0
(0 %)
91
(0.00 %)
625
(100.00 %)
476,492
(3.25 %)
242,097
(6.02 %)
4,286,693
(33.41 %)
1
(0.00 %)
310,636
(3.76 %)
9,322
(0.80 %)
6,756
(0.33 %)
44 Australian ruff (RE-2024a hap2 2024)
GCA_042242135.1
n/a n/a 15,534
(2.50 %)
39,464
(5.26 %)
n/a 39.77
(100.00 %)
0
(0 %)
98
(0.00 %)
552
(100.00 %)
498,493
(3.22 %)
271,314
(7.61 %)
4,161,752
(38.16 %)
2
(0.00 %)
436,316
(4.99 %)
9,637
(0.93 %)
6,725
(0.31 %)
45 ballan wrasse (2016)
GCF_900080235.1
42,362
(9.30 %)
n/a 16,129
(2.44 %)
33,854
(5.87 %)
n/a 40.89
(99.98 %)
0
(0 %)
257
(0.02 %)
13,466
(100.00 %)
503,078
(3.93 %)
321,407
(5.60 %)
4,329,412
(30.36 %)
5
(0.00 %)
563,079
(4.68 %)
21,221
(1.07 %)
11,680
(0.58 %)
46 ballan wrasse (primary hap 2024 genbank)
GCA_963930695.1
n/a n/a 15,142
(2.66 %)
43,601
(6.21 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
1
(0.00 %)
815
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,221,802
(30.10 %)
290,738
(7.79 %)
4,164,845
(30.34 %)
4
(0.00 %)
525,923
(5.43 %)
17,126
(0.94 %)
10,131
(0.54 %)
47 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1
48,592
(12.09 %)
n/a 15,140
(2.66 %)
43,304
(6.14 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
815
(0.02 %)
815
(0.02 %)
946
(99.98 %)
1,221,797
(30.10 %)
290,736
(7.79 %)
4,164,799
(30.34 %)
4
(0.00 %)
525,920
(5.43 %)
17,126
(0.94 %)
10,131
(0.54 %)
48 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1
n/a n/a 15,211
(3.23 %)
41,620
(7.14 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
2,393
(100.00 %)
785,178
(17.57 %)
249,148
(8.36 %)
3,391,653
(26.49 %)
0
(0 %)
274,110
(3.20 %)
13,787
(0.93 %)
9,087
(0.56 %)
49 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
n/a 15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
0
(0 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
1
(0.00 %)
297,814
(3.49 %)
15,089
(0.96 %)
9,304
(0.55 %)
50 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1
n/a n/a 15,122
(1.44 %)
65,809
(4.50 %)
n/a 41.23
(99.74 %)
0
(0 %)
293
(0.26 %)
331
(100.00 %)
2,545,429
(50.53 %)
451,939
(5.50 %)
5,807,705
(42.18 %)
0
(0 %)
863,582
(6.37 %)
94,695
(3.92 %)
37,528
(1.27 %)
51 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1
n/a n/a 15,024
(1.45 %)
65,141
(4.53 %)
n/a 41.23
(99.52 %)
0
(0 %)
373
(0.48 %)
196
(100.00 %)
2,509,508
(50.53 %)
441,892
(5.11 %)
6,245,443
(38.22 %)
2
(0.00 %)
822,138
(6.12 %)
93,198
(3.82 %)
36,988
(1.26 %)
52 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1
n/a n/a 26,794
(3.15 %)
76,434
(5.64 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
8,035
(100.00 %)
4,084,361
(52.18 %)
538,411
(4.25 %)
7,659,980
(38.94 %)
0
(0 %)
450,884
(2.88 %)
58,008
(2.90 %)
19,160
(0.57 %)
53 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1
n/a n/a 31,876
(3.30 %)
85,063
(5.65 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
0
(0 %)
108
(0.00 %)
92
(100.00 %)
4,839,533
(52.47 %)
646,636
(4.57 %)
8,240,279
(42.13 %)
2
(0.00 %)
569,819
(3.17 %)
71,384
(3.04 %)
22,137
(0.56 %)
54 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2
53,657
(13.68 %)
n/a 16,073
(3.06 %)
44,214
(6.63 %)
n/a 40.76
(98.88 %)
0
(0 %)
674
(1.12 %)
2,997
(100.00 %)
986,469
(19.78 %)
237,272
(4.32 %)
3,983,840
(23.58 %)
0
(0 %)
251,048
(3.40 %)
16,237
(1.03 %)
9,089
(0.52 %)
55 beardfish (hap1 2025)
GCA_047511565.1
n/a n/a 15,938
(3.00 %)
52,921
(7.52 %)
n/a 43.38
(99.98 %)
0
(0 %)
752
(0.02 %)
327
(100.00 %)
993,554
(11.81 %)
755,389
(11.75 %)
3,469,352
(30.25 %)
8
(0.00 %)
770,561
(6.90 %)
68,008
(5.51 %)
40,885
(2.43 %)
56 beardfish (hap2 2025)
GCA_047511595.1
n/a n/a 15,940
(3.02 %)
51,682
(7.42 %)
n/a 43.31
(99.98 %)
1
(0.00 %)
756
(0.02 %)
200
(100.00 %)
986,717
(11.69 %)
754,642
(11.91 %)
3,459,958
(30.32 %)
9
(0.00 %)
762,386
(6.77 %)
67,732
(5.27 %)
40,872
(2.45 %)
57 Bermuda beardfish (OG660 hap1 2025)
GCA_048537225.1
n/a n/a 15,950
(2.82 %)
53,175
(7.04 %)
n/a 42.97
(99.99 %)
0
(0 %)
481
(0.01 %)
846
(100.00 %)
1,017,817
(12.34 %)
764,426
(15.65 %)
3,524,564
(32.87 %)
4
(0.00 %)
953,480
(7.90 %)
60,800
(4.43 %)
35,606
(1.84 %)
58 Bermuda beardfish (OG660 hap2 2025)
GCA_048537235.1
n/a n/a 15,811
(2.85 %)
52,254
(7.09 %)
n/a 43.06
(99.99 %)
0
(0 %)
508
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,002,378
(12.22 %)
753,750
(14.96 %)
3,479,721
(32.11 %)
4
(0.00 %)
919,899
(7.67 %)
60,513
(4.18 %)
35,349
(1.87 %)
59 bicolor damselfish
GCF_000690725.1
32,951
(8.67 %)
n/a 15,181
(2.55 %)
31,420
(5.94 %)
n/a 41.66
(93.68 %)
36,242
(6.34 %)
44,409
(6.34 %)
42,059
(93.66 %)
351,453
(2.61 %)
180,113
(1.20 %)
5,016,154
(23.41 %)
554
(0.03 %)
96,483
(1.91 %)
46,423
(2.30 %)
31,358
(1.43 %)
60 bight redfish (hap1 2025)
GCA_048128805.1
n/a n/a 16,025
(2.63 %)
53,351
(6.76 %)
n/a 42.47
(99.98 %)
43
(0.00 %)
699
(0.02 %)
322
(100.00 %)
995,401
(9.22 %)
626,617
(9.80 %)
4,302,378
(31.80 %)
10
(0.00 %)
535,484
(4.68 %)
38,231
(2.50 %)
23,342
(1.21 %)
61 bight redfish (hap2 2025)
GCA_048129085.1
n/a n/a 15,902
(2.63 %)
52,639
(6.71 %)
n/a 42.44
(99.98 %)
0
(0 %)
680
(0.02 %)
204
(100.00 %)
989,039
(9.11 %)
628,091
(9.80 %)
4,315,800
(31.97 %)
6
(0.00 %)
536,070
(4.56 %)
37,729
(2.33 %)
23,055
(1.18 %)
62 bight redfish (2022)
GCF_026898505.1
34,914
(7.61 %)
n/a 16,015
(2.73 %)
54,287
(6.76 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,310
(100.00 %)
996,609
(9.55 %)
631,344
(6.03 %)
4,456,094
(29.17 %)
0
(0 %)
434,368
(3.10 %)
37,522
(2.03 %)
22,702
(1.12 %)
63 black goby (alternate hap 2023)
GCA_951799965.1
n/a n/a 14,534
(2.11 %)
56,906
(6.41 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,523
(100.00 %)
2,445,373
(45.07 %)
452,878
(9.46 %)
4,195,077
(39.49 %)
0
(0 %)
841,978
(6.49 %)
77,592
(4.86 %)
50,068
(2.69 %)
64 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1
n/a n/a 14,455
(2.06 %)
56,488
(6.31 %)
n/a 42.10
(99.99 %)
0
(0 %)
636
(0.01 %)
298
(100.00 %)
3,230,397
(55.09 %)
494,440
(10.43 %)
4,359,169
(40.46 %)
2
(0.00 %)
950,976
(6.99 %)
81,684
(4.81 %)
45,797
(2.02 %)
65 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1
n/a n/a 31,847
(2.01 %)
153,565
(6.53 %)
n/a 41.78
(99.99 %)
639
(0.00 %)
639
(0.00 %)
63,422
(100.00 %)
2,786,840
(18.28 %)
1,016,389
(7.50 %)
8,844,631
(26.90 %)
18
(0.00 %)
1,160,777
(4.13 %)
130,556
(4.42 %)
82,861
(2.07 %)
66 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 refseq)
GCF_022577435.1
42,351
(12.09 %)
n/a 14,988
(3.02 %)
47,106
(6.98 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
234
(0.00 %)
234
(0.00 %)
463
(100.00 %)
1,017,142
(18.99 %)
360,899
(8.75 %)
3,761,447
(28.91 %)
0
(0 %)
469,043
(4.64 %)
48,360
(4.43 %)
30,659
(2.06 %)
67 black porgy (SG-2024 2024)
GCA_041753875.1
n/a n/a 15,257
(2.73 %)
47,477
(6.62 %)
n/a 42.03
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 24
(100.00 %)
488,582
(3.19 %)
254,655
(4.13 %)
4,385,401
(24.08 %)
0
(0 %)
311,552
(3.23 %)
32,461
(1.90 %)
20,388
(1.03 %)
68 black rockcod
GCF_000735185.1
34,978
(8.49 %)
n/a 12,601
(2.15 %)
42,589
(6.13 %)
n/a 40.62
(97.93 %)
33,914
(2.08 %)
59,164
(2.09 %)
72,571
(97.92 %)
268,591
(2.71 %)
238,334
(3.18 %)
3,425,479
(29.48 %)
174
(0.01 %)
164,483
(1.70 %)
31,009
(2.11 %)
14,188
(1.03 %)
69 black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023)
GCF_030273125.1
43,392
(8.45 %)
n/a 15,522
(2.13 %)
48,255
(5.50 %)
n/a 38.69
(100.00 %)
0
(0 %)
341
(0.00 %)
92
(100.00 %)
1,651,919
(22.26 %)
782,601
(7.55 %)
5,398,047
(38.87 %)
2
(0.00 %)
810,395
(6.16 %)
24,508
(1.19 %)
12,928
(0.57 %)
70 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1
n/a n/a 15,274
(2.92 %)
51,453
(7.45 %)
n/a 43.07
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,239,364
(29.69 %)
354,703
(9.63 %)
3,006,556
(30.35 %)
2
(0.00 %)
588,441
(7.05 %)
53,503
(4.48 %)
28,830
(1.72 %)
71 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1
n/a n/a 15,043
(2.96 %)
50,860
(7.54 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
366
(0.01 %)
109
(100.00 %)
1,210,142
(29.44 %)
340,820
(9.19 %)
2,986,750
(29.89 %)
0
(0 %)
547,550
(6.92 %)
52,010
(4.20 %)
28,373
(1.72 %)
72 blackspot tuskfish (SL-2024 2025)
GCA_047301625.1
n/a n/a 15,085
(2.21 %)
48,479
(5.71 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
43
(100.00 %)
499,447
(3.15 %)
285,392
(5.12 %)
5,443,017
(30.00 %)
0
(0 %)
339,248
(2.90 %)
23,550
(1.23 %)
11,868
(0.48 %)
73 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1
44,847
(11.30 %)
n/a 15,364
(2.86 %)
51,122
(6.88 %)
n/a 39.48
(99.99 %)
0
(0 %)
89
(0.01 %)
415
(100.00 %)
1,160,519
(28.33 %)
183,082
(4.75 %)
4,354,804
(27.83 %)
4
(0.00 %)
435,884
(4.37 %)
40,207
(2.97 %)
32,779
(2.13 %)
74 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1
n/a n/a 17,403
(2.99 %)
45,903
(5.38 %)
n/a 38.64
(99.99 %)
0
(0 %)
709
(0.01 %)
673
(100.00 %)
2,141,901
(35.77 %)
482,931
(17.18 %)
4,297,133
(46.82 %)
4
(0.00 %)
991,826
(7.99 %)
41,889
(2.32 %)
19,281
(0.97 %)
75 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1
n/a n/a 17,486
(2.97 %)
46,833
(5.41 %)
n/a 38.79
(99.99 %)
0
(0 %)
720
(0.01 %)
413
(100.00 %)
2,165,269
(36.18 %)
490,692
(17.84 %)
4,251,333
(47.54 %)
10
(0.00 %)
1,058,863
(8.47 %)
42,744
(2.37 %)
19,312
(0.98 %)
76 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1
48,929
(10.27 %)
n/a 15,574
(2.62 %)
44,035
(5.21 %)
n/a 39.80
(98.04 %)
0
(0 %)
171
(1.96 %)
43
(100.00 %)
2,180,806
(45.14 %)
625,260
(6.63 %)
5,137,199
(35.52 %)
1
(0.00 %)
571,071
(4.17 %)
31,164
(1.89 %)
20,363
(1.02 %)
77 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1
36,881
(7.40 %)
n/a 15,408
(2.38 %)
27,235
(5.59 %)
n/a 40.42
(89.87 %)
0
(0 %)
53,539
(10.15 %)
12,952
(100.00 %)
867,639
(16.39 %)
195,137
(1.62 %)
5,293,484
(23.10 %)
124
(0.05 %)
97,164
(2.26 %)
21,238
(1.02 %)
14,191
(0.64 %)
78 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1
57,860
(9.04 %)
n/a 15,494
(1.98 %)
57,878
(5.63 %)
56,939
(8.11 %)
40.66
(99.97 %)
0
(0 %)
723
(0.03 %)
304
(100.00 %)
1,055,724
(20.14 %)
324,841
(3.27 %)
5,000,753
(32.08 %)
4
(0.00 %)
594,081
(5.09 %)
32,357
(1.59 %)
17,357
(0.80 %)
79 blue whiting (primary hap 2024)
GCA_964030765.1
n/a n/a 13,097
(2.93 %)
55,097
(8.76 %)
n/a 45.82
(99.88 %)
0
(0 %)
3,055
(0.12 %)
3,832
(100.00 %)
1,337,604
(32.27 %)
749,185
(17.27 %)
2,363,606
(35.06 %)
7
(0.00 %)
596,931
(7.20 %)
78,815
(8.25 %)
42,300
(3.48 %)
80 bluestreak cleaner wrasse (JK-2023 2023)
GCA_030710495.1
n/a n/a 14,996
(2.68 %)
44,244
(6.44 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
2
(0.00 %)
211
(0.00 %)
59
(100.00 %)
1,619,681
(30.07 %)
337,749
(4.31 %)
4,541,709
(29.20 %)
4
(0.00 %)
273,269
(2.99 %)
14,576
(0.85 %)
10,610
(0.55 %)
81 bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023)
GCF_030265055.1
63,345
(14.83 %)
n/a 14,387
(3.54 %)
43,563
(7.96 %)
n/a 41.68
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
57
(100.00 %)
842,739
(18.67 %)
356,558
(12.86 %)
2,720,911
(41.08 %)
0
(0 %)
847,608
(10.65 %)
40,187
(4.66 %)
29,700
(2.69 %)
82 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1
n/a n/a 12,494
(1.93 %)
44,967
(5.14 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,174
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
0
(0 %)
344,768
(3.42 %)
23,532
(1.46 %)
12,368
(0.66 %)
83 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2
n/a n/a 14,499
(1.97 %)
51,213
(5.47 %)
n/a 38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
442
(100.00 %)
731,731
(4.21 %)
471,623
(4.92 %)
5,974,055
(42.88 %)
0
(0 %)
455,138
(4.01 %)
29,052
(1.48 %)
14,673
(0.63 %)
84 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1
n/a n/a 13,882
(2.27 %)
45,919
(5.98 %)
n/a 39.50
(99.99 %)
0
(0 %)
45
(0.01 %)
3,194
(100.00 %)
803,073
(13.60 %)
258,404
(4.19 %)
4,674,614
(28.36 %)
0
(0 %)
339,851
(3.09 %)
15,524
(1.02 %)
9,057
(0.56 %)
85 Boeseman's rainbowfish (primary hap 2021)
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
n/a 15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
0
(0 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
1
(0.00 %)
441,845
(3.68 %)
18,525
(1.10 %)
10,661
(0.59 %)
86 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1
n/a n/a 16,964
(1.77 %)
67,673
(5.93 %)
n/a 42.61
(99.97 %)
28
(0.00 %)
1,785
(0.03 %)
979
(100.00 %)
4,285,965
(30.73 %)
1,222,431
(20.69 %)
6,105,881
(46.99 %)
11
(0.00 %)
1,356,343
(8.48 %)
73,543
(3.28 %)
32,534
(1.37 %)
87 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1
n/a n/a 12,424
(1.95 %)
46,550
(6.00 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,619
(100.00 %)
789,207
(14.61 %)
348,482
(20.98 %)
3,447,241
(38.72 %)
0
(0 %)
1,174,378
(8.68 %)
27,035
(4.16 %)
12,167
(0.85 %)
88 bonti-bonti (primary hap 2022)
GCA_933228915.1
n/a n/a 14,929
(1.93 %)
55,343
(5.90 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
0
(0 %)
1,329
(0.03 %)
146
(100.00 %)
998,246
(14.90 %)
443,155
(22.40 %)
4,319,947
(40.01 %)
2
(0.00 %)
1,529,147
(9.19 %)
34,018
(4.16 %)
15,066
(0.86 %)
89 bony fish B.hirsutus (HB-005 2024)
GCF_040956055.1
24,050
(11.30 %)
n/a 14,596
(4.48 %)
52,760
(11.00 %)
n/a 44.75
(99.96 %)
0
(0 %)
1,486
(0.04 %)
1,370
(100.00 %)
471,281
(10.94 %)
181,798
(7.38 %)
2,008,576
(24.90 %)
13
(0.00 %)
259,160
(4.57 %)
46,438
(14.87 %)
34,692
(4.88 %)
90 bony fish P.dabryanus (BB 2023)
GCF_030506205.1
86,420
(8.25 %)
n/a 22,100
(2.28 %)
59,296
(4.66 %)
n/a 38.32
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
610
(100.00 %)
3,555,303
(40.49 %)
538,181
(9.64 %)
6,137,303
(50.16 %)
0
(0 %)
1,400,924
(8.09 %)
71,533
(4.06 %)
19,783
(0.63 %)
91 bony fish R.nasutus (DBWJ_T2T 2025)
GCA_048301585.1
n/a n/a 17,715
(2.98 %)
44,183
(4.64 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
70
(100.00 %)
613,768
(4.88 %)
440,668
(11.76 %)
5,264,302
(45.25 %)
0
(0 %)
759,216
(5.63 %)
39,351
(3.96 %)
13,535
(0.57 %)
92 bony fish S.pulcher (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCF_022749685.1
37,003
(8.79 %)
n/a 15,275
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
186
(100.00 %)
1,369,180
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,024
(31.90 %)
0
(0 %)
387,124
(4.11 %)
27,133
(1.64 %)
12,517
(0.55 %)
93 bony fish T.vachellii (PV-2020 2023)
GCF_030014155.1
43,278
(10.19 %)
n/a 15,613
(2.96 %)
39,340
(5.77 %)
n/a 39.31
(99.98 %)
0
(0 %)
291
(0.02 %)
78
(100.00 %)
1,563,305
(33.23 %)
689,312
(9.96 %)
3,954,578
(35.31 %)
1
(0.00 %)
844,788
(7.26 %)
20,152
(1.50 %)
10,778
(0.73 %)
94 bowfin (hap1 2024 refseq)
GCF_036373705.1
55,474
(7.85 %)
n/a 13,848
(1.83 %)
27,055
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
97
(0.00 %)
389
(100.00 %)
953,492
(13.69 %)
387,699
(7.91 %)
4,552,359
(37.72 %)
4
(0.00 %)
613,799
(6.38 %)
46,301
(2.99 %)
26,437
(1.15 %)
95 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1
n/a n/a 13,813
(1.89 %)
27,088
(4.55 %)
n/a 40.60
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
297
(100.00 %)
886,999
(13.24 %)
358,077
(7.37 %)
4,625,277
(36.22 %)
0
(0 %)
529,249
(5.78 %)
43,764
(2.79 %)
26,363
(1.18 %)
96 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1
n/a n/a 17,999
(1.60 %)
76,655
(5.58 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
10,799
(100.00 %)
5,994,257
(39.29 %)
1,126,685
(10.35 %)
6,996,991
(46.02 %)
0
(0 %)
1,131,145
(6.97 %)
71,016
(3.36 %)
27,805
(1.08 %)
97 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1
n/a n/a 17,865
(1.56 %)
76,506
(5.59 %)
n/a 42.15
(99.96 %)
0
(0 %)
2,704
(0.04 %)
676
(100.00 %)
6,391,921
(39.62 %)
1,227,487
(11.70 %)
6,669,558
(49.73 %)
11
(0.00 %)
1,301,019
(7.83 %)
76,828
(3.96 %)
26,877
(0.90 %)
98 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap1 2025)
GCA_048301445.1
n/a n/a 13,406
(4.62 %)
41,458
(10.33 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
3
(0.00 %)
78
(0.00 %)
155
(100.00 %)
205,224
(2.93 %)
217,943
(13.58 %)
1,368,592
(36.56 %)
0
(0 %)
232,608
(6.06 %)
48,018
(12.44 %)
32,621
(5.13 %)
99 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap2 2025)
GCA_048301605.1
n/a n/a 13,414
(4.78 %)
41,481
(10.68 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
1
(0.00 %)
90
(0.00 %)
126
(100.00 %)
203,521
(2.96 %)
200,308
(11.44 %)
1,413,994
(34.72 %)
1
(0.00 %)
209,781
(5.38 %)
47,578
(12.59 %)
32,428
(5.23 %)
100 broad-nosed pipefish (Sweden RoL2023-S1 2023)
GCF_033458585.1
49,639
(15.87 %)
n/a 13,630
(3.98 %)
43,263
(9.12 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
495
(100.00 %)
727,223
(20.88 %)
290,624
(20.53 %)
1,369,709
(43.82 %)
0
(0 %)
347,124
(7.41 %)
51,671
(14.43 %)
34,210
(4.62 %)
101 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1
92,568
(6.87 %)
n/a 26,875
(1.47 %)
114,101
(4.26 %)
n/a 43.70
(99.83 %)
0
(0 %)
4,299
(0.17 %)
2,721
(100.00 %)
5,005,012
(52.10 %)
2,055,293
(26.66 %)
9,701,968
(57.04 %)
69
(0.00 %)
4,551,597
(10.95 %)
89,897
(2.49 %)
20,734
(0.38 %)
102 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1
49,218
(8.52 %)
n/a 15,634
(1.92 %)
53,710
(4.99 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
0
(0 %)
205
(0.00 %)
26
(100.00 %)
632,147
(3.01 %)
371,482
(3.01 %)
6,438,110
(31.32 %)
1
(0.00 %)
370,750
(2.74 %)
26,136
(0.96 %)
10,272
(0.37 %)
103 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1
47,805
(10.97 %)
n/a 14,997
(2.72 %)
25,504
(5.86 %)
n/a 40.51
(84.10 %)
61,073
(15.93 %)
61,073
(15.93 %)
69,067
(84.07 %)
311,174
(3.20 %)
125,534
(0.72 %)
4,461,288
(20.25 %)
965
(0.08 %)
34,584
(0.52 %)
17,722
(0.91 %)
12,829
(0.64 %)
104 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1
52,584
(12.38 %)
n/a 15,229
(2.54 %)
47,264
(5.92 %)
n/a 40.68
(89.05 %)
0
(0 %)
32,418
(10.97 %)
7,421
(100.00 %)
812,382
(17.52 %)
158,486
(1.12 %)
4,571,794
(23.61 %)
710
(0.05 %)
88,277
(2.15 %)
22,763
(1.21 %)
14,293
(0.75 %)
105 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1
n/a n/a 15,228
(3.42 %)
41,322
(7.36 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,592
(100.00 %)
972,098
(18.43 %)
155,031
(1.41 %)
3,452,400
(21.36 %)
0
(0 %)
85,576
(1.51 %)
15,255
(1.12 %)
10,648
(0.72 %)
106 butterfish (primary hap 2021)
GCF_020382885.2
52,841
(14.10 %)
n/a 15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
0
(0 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
1
(0.00 %)
96,783
(1.70 %)
15,574
(1.13 %)
10,807
(0.72 %)
107 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1
n/a n/a 14,403
(2.47 %)
61,860
(7.37 %)
n/a 43.15
(99.96 %)
0
(0 %)
1,625
(0.04 %)
525
(100.00 %)
959,651
(12.16 %)
517,137
(13.14 %)
3,775,081
(32.47 %)
9
(0.00 %)
784,659
(7.82 %)
81,881
(6.68 %)
50,317
(3.10 %)
108 California grunion (hap1 2024)
GCF_036924035.1
48,842
(7.86 %)
n/a 15,030
(2.11 %)
47,569
(5.39 %)
n/a 41.54
(100.00 %)
0
(0 %)
223
(0.00 %)
296
(100.00 %)
362,601
(2.31 %)
342,827
(15.91 %)
3,359,060
(39.76 %)
4
(0.00 %)
1,552,055
(14.43 %)
28,098
(1.96 %)
12,616
(0.58 %)
109 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1
n/a n/a 19,842
(2.16 %)
72,007
(6.04 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
2,679
(0.02 %)
2,679
(0.02 %)
15,877
(99.98 %)
1,911,945
(24.70 %)
364,933
(8.56 %)
6,201,042
(32.00 %)
26
(0.00 %)
834,109
(8.34 %)
39,114
(1.56 %)
17,823
(0.57 %)
110 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1
n/a n/a 15,277
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
179
(100.00 %)
1,369,186
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,065
(31.90 %)
0
(0 %)
469,842
(4.88 %)
27,134
(1.64 %)
12,518
(0.55 %)
111 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
n/a 14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
0
(0 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
0
(0 %)
452,303
(4.62 %)
20,453
(1.39 %)
10,802
(0.65 %)
112 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1
n/a n/a 15,980
(2.79 %)
53,680
(6.62 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,656
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
0
(0 %)
386,762
(3.56 %)
20,338
(1.21 %)
10,996
(0.60 %)
113 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3
59,187
(10.70 %)
n/a 15,782
(2.57 %)
45,562
(5.15 %)
n/a 39.82
(99.35 %)
0
(0 %)
100
(0.65 %)
137
(100.00 %)
2,257,240
(46.82 %)
671,926
(8.67 %)
5,043,664
(36.53 %)
0
(0 %)
696,803
(4.91 %)
34,284
(2.16 %)
22,417
(1.13 %)
114 cherry salmon (Uvic2021 2024)
GCF_036934945.1
80,307
(5.31 %)
n/a 27,171
(1.38 %)
123,048
(4.00 %)
n/a 44.12
(99.94 %)
1,043
(0.00 %)
4,047
(0.06 %)
18,306
(100.00 %)
1,207,353
(5.23 %)
2,779,869
(27.93 %)
11,429,057
(55.56 %)
21
(0.00 %)
6,696,647
(13.29 %)
83,137
(1.99 %)
20,398
(0.34 %)
115 chevron butterflyfish (hap1 2024 refseq)
GCF_039877785.1
38,623
(10.62 %)
n/a 15,604
(3.07 %)
48,037
(7.05 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
0
(0 %)
49
(0.00 %)
36
(100.00 %)
1,224,649
(24.57 %)
254,015
(3.62 %)
3,657,926
(23.28 %)
1
(0.00 %)
186,571
(2.20 %)
30,971
(2.02 %)
21,708
(1.31 %)
116 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1
n/a n/a 15,116
(2.91 %)
47,839
(7.01 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
71
(100.00 %)
463,848
(3.80 %)
254,561
(4.23 %)
3,654,295
(24.08 %)
2
(0.00 %)
196,606
(2.28 %)
30,593
(1.99 %)
17,996
(1.03 %)
117 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1
61,496
(12.33 %)
n/a 15,296
(2.30 %)
50,818
(6.10 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
0
(0 %)
942
(0.00 %)
823
(100.00 %)
920,881
(19.96 %)
193,629
(1.36 %)
4,724,179
(28.98 %)
1
(0.00 %)
184,981
(2.73 %)
28,565
(1.65 %)
15,987
(0.90 %)
118 Chinaman-leatherjacket (Tasmania G7.1 2024)
GCF_046127955.1
46,411
(11.83 %)
n/a 14,102
(3.02 %)
52,239
(7.87 %)
n/a 45.59
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 396
(100.00 %)
809,090
(6.75 %)
459,997
(7.66 %)
2,973,747
(37.71 %)
0
(0 %)
314,406
(3.96 %)
124,869
(12.74 %)
67,736
(4.66 %)
119 chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128725.1
n/a n/a 15,739
(1.88 %)
46,290
(4.42 %)
n/a 39.31
(100.00 %)
3
(0.00 %)
70
(0.00 %)
89
(100.00 %)
663,559
(2.79 %)
371,107
(3.14 %)
7,519,173
(32.84 %)
1
(0.00 %)
254,294
(1.89 %)
17,824
(0.70 %)
12,286
(0.46 %)
120 chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128715.1
n/a n/a 15,611
(1.87 %)
46,283
(4.42 %)
n/a 39.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
72
(0.00 %)
61
(100.00 %)
663,907
(2.82 %)
372,676
(3.23 %)
7,551,541
(33.03 %)
2
(0.00 %)
259,177
(1.98 %)
17,757
(0.80 %)
12,222
(0.44 %)
121 Chinese cavefish (2022)
GCF_024868665.1
48,071
(11.91 %)
n/a 16,738
(3.72 %)
46,295
(6.80 %)
n/a 39.61
(98.56 %)
0
(0 %)
9,510
(1.45 %)
1,039
(100.00 %)
1,469,931
(44.44 %)
188,838
(2.34 %)
3,624,116
(35.94 %)
299
(0.05 %)
177,963
(3.81 %)
44,615
(5.01 %)
16,470
(0.98 %)
122 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1
49,690
(9.64 %)
n/a 15,266
(2.70 %)
40,151
(5.21 %)
n/a 38.75
(99.82 %)
0
(0 %)
597
(0.18 %)
286
(100.00 %)
772,209
(6.45 %)
630,039
(7.45 %)
4,729,261
(37.48 %)
0
(0 %)
607,904
(5.63 %)
24,310
(1.76 %)
15,715
(0.95 %)
123 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2
89,018
(6.31 %)
n/a 26,613
(1.64 %)
77,184
(3.14 %)
n/a 39.08
(100.00 %)
0
(0 %)
224
(0.00 %)
353
(100.00 %)
9,298,177
(59.91 %)
977,119
(3.49 %)
13,499,422
(52.38 %)
0
(0 %)
882,883
(2.63 %)
100,309
(2.90 %)
18,261
(0.24 %)
124 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1
81,327
(5.14 %)
n/a 27,462
(1.53 %)
54,538
(3.80 %)
n/a 43.55
(97.26 %)
1,916
(0.01 %)
272,151
(2.76 %)
15,944
(99.99 %)
1,207,194
(4.55 %)
2,524,408
(13.75 %)
12,127,831
(47.56 %)
4,183
(0.05 %)
2,790,142
(6.34 %)
87,959
(2.02 %)
29,706
(0.70 %)
125 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1
92,370
(5.73 %)
n/a 26,372
(1.57 %)
107,059
(4.12 %)
157,582
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,313
(0.01 %)
2,334
(0.01 %)
9,978
(99.99 %)
1,483,168
(7.79 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,888
(54.54 %)
10
(0.00 %)
5,031,483
(11.16 %)
62,726
(1.40 %)
17,444
(0.31 %)
126 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1
n/a n/a 15,165
(2.44 %)
46,105
(6.16 %)
n/a 39.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,163
(100.00 %)
1,546,066
(27.08 %)
537,737
(9.87 %)
4,485,153
(30.70 %)
0
(0 %)
726,611
(6.01 %)
14,774
(0.81 %)
8,304
(0.43 %)
127 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1
34,390
(6.95 %)
n/a 15,348
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
0
(0 %)
1,572
(0.08 %)
360
(100.00 %)
1,669,322
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,373
(32.38 %)
3
(0.00 %)
927,880
(7.23 %)
16,290
(0.85 %)
8,913
(0.42 %)
128 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1
76,338
(6.27 %)
n/a 23,186
(1.70 %)
90,881
(4.14 %)
n/a 43.06
(95.36 %)
2,844
(0.02 %)
242,238
(4.66 %)
28,109
(99.98 %)
1,143,292
(6.07 %)
1,487,818
(12.14 %)
8,992,314
(46.24 %)
3,734
(0.11 %)
2,132,411
(5.90 %)
51,797
(1.25 %)
15,414
(0.35 %)
129 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1
205,598
(6.68 %)
n/a 26,582
(1.42 %)
119,437
(4.14 %)
120,379
(5.87 %)
43.89
(99.99 %)
3,405
(0.01 %)
3,433
(0.01 %)
17,480
(99.99 %)
1,160,500
(5.63 %)
2,584,312
(31.72 %)
10,621,107
(55.67 %)
8
(0.00 %)
6,422,106
(12.88 %)
68,538
(1.53 %)
20,126
(0.36 %)
130 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1
n/a n/a 14,940
(3.51 %)
39,688
(7.41 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
0
(0 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,993
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
0
(0 %)
150,484
(2.39 %)
10,131
(0.86 %)
7,444
(0.57 %)
131 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3
n/a n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
67,055
(11.68 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
633,883
(15.28 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,008
(21.31 %)
0
(0 %)
169,790
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
132 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1
53,580
(9.24 %)
n/a 15,685
(2.23 %)
33,477
(5.63 %)
n/a 39.47
(99.94 %)
0
(0 %)
1,406
(0.06 %)
6,405
(100.00 %)
431,950
(2.92 %)
381,394
(4.84 %)
4,952,343
(31.95 %)
20
(0.00 %)
378,594
(2.99 %)
23,543
(1.15 %)
15,582
(0.70 %)
133 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1
53,925
(11.11 %)
n/a 15,702
(2.37 %)
47,805
(5.50 %)
n/a 39.59
(99.98 %)
0
(0 %)
1,454
(0.02 %)
354
(100.00 %)
1,346,903
(35.25 %)
401,782
(5.36 %)
4,891,035
(31.59 %)
10
(0.00 %)
410,292
(3.79 %)
23,489
(1.28 %)
17,390
(0.95 %)
134 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2
100,863
(6.58 %)
n/a 27,072
(1.56 %)
50,811
(3.95 %)
125,873
(5.26 %)
43.55
(99.98 %)
395
(0.00 %)
5,631
(0.02 %)
4,482
(100.00 %)
1,491,966
(6.88 %)
2,135,217
(25.52 %)
10,152,659
(54.74 %)
5
(0.00 %)
4,738,432
(11.52 %)
65,662
(1.36 %)
18,054
(0.31 %)
135 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1
n/a n/a 18,114
(2.63 %)
66,549
(6.11 %)
n/a 38.62
(99.99 %)
7
(0.00 %)
685
(0.01 %)
215
(100.00 %)
2,639,968
(48.46 %)
659,243
(7.55 %)
5,950,358
(40.47 %)
3
(0.00 %)
963,199
(6.67 %)
62,337
(3.61 %)
19,726
(0.79 %)
136 common carp (R8XR3 2021)
GCA_905221575.1
n/a n/a 30,973
(3.47 %)
83,657
(5.95 %)
n/a 37.06
(100.00 %)
0
(0 %)
372
(0.00 %)
674
(100.00 %)
3,324,121
(41.45 %)
707,134
(4.72 %)
8,110,561
(39.08 %)
3
(0.00 %)
600,903
(3.39 %)
44,388
(1.60 %)
23,824
(0.66 %)
137 common carp (SPL01 2021)
GCF_018340385.1
91,197
(7.89 %)
n/a 31,041
(2.89 %)
89,244
(5.01 %)
n/a 37.11
(99.53 %)
0
(0 %)
26,351
(0.48 %)
6,701
(100.00 %)
1,634,612
(6.00 %)
919,239
(3.97 %)
10,192,037
(38.56 %)
0
(0 %)
703,885
(3.08 %)
52,638
(1.62 %)
30,904
(0.80 %)
138 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1
36,211
(8.34 %)
n/a 14,995
(2.62 %)
50,844
(6.89 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
0
(0 %)
275
(0.01 %)
338
(100.00 %)
1,186,799
(32.17 %)
307,864
(16.34 %)
3,562,802
(35.00 %)
2
(0.00 %)
481,477
(5.21 %)
41,657
(2.72 %)
22,630
(1.29 %)
139 common dace (hap1.1 2025)
GCA_965113295.1
n/a n/a 18,484
(2.43 %)
69,931
(5.95 %)
n/a 39.03
(99.98 %)
0
(0 %)
1,202
(0.02 %)
876
(100.00 %)
938,148
(4.74 %)
828,944
(9.34 %)
5,833,273
(42.65 %)
14
(0.00 %)
987,377
(7.00 %)
78,182
(4.87 %)
26,569
(1.15 %)
140 common dace (hap2.1 2025)
GCA_965113325.1
n/a n/a 17,904
(2.46 %)
68,908
(5.96 %)
n/a 38.98
(99.98 %)
0
(0 %)
1,147
(0.02 %)
530
(100.00 %)
3,428,827
(55.24 %)
796,220
(8.80 %)
5,775,180
(41.93 %)
12
(0.00 %)
946,973
(6.77 %)
77,105
(4.67 %)
16,582
(0.62 %)
141 common seabream (hap1.1 2025)
GCA_965226575.1
n/a n/a 15,435
(2.40 %)
54,036
(6.66 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
0
(0 %)
536
(0.01 %)
576
(100.00 %)
495,544
(2.96 %)
454,601
(9.69 %)
4,614,163
(29.34 %)
3
(0.00 %)
380,594
(3.48 %)
29,859
(1.71 %)
17,482
(0.84 %)
142 common seabream (hap2.1 2025)
GCA_965225695.1
n/a n/a 15,519
(2.52 %)
53,533
(6.93 %)
n/a 41.68
(99.99 %)
535
(0.01 %)
535
(0.01 %)
784
(99.99 %)
472,383
(2.92 %)
337,781
(6.08 %)
4,705,623
(26.82 %)
4
(0.00 %)
333,852
(3.19 %)
29,198
(1.68 %)
17,256
(0.88 %)
143 common seadragon (TA_2022b 2022)
GCF_024500385.1
60,947
(12.28 %)
n/a 13,706
(2.67 %)
42,956
(5.71 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
196
(0.00 %)
1,259
(100.00 %)
1,417,848
(37.47 %)
173,323
(3.85 %)
3,968,694
(40.23 %)
3
(0.00 %)
319,133
(3.25 %)
70,253
(6.29 %)
38,941
(2.56 %)
144 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1
n/a n/a 14,904
(2.99 %)
43,194
(7.09 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,318
(100.00 %)
1,128,080
(18.77 %)
328,975
(8.35 %)
3,952,898
(31.64 %)
0
(0 %)
410,353
(4.52 %)
26,979
(2.08 %)
15,469
(0.95 %)
145 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1
55,359
(12.02 %)
n/a 14,844
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
242
(100.00 %)
1,149,243
(19.12 %)
342,238
(9.71 %)
3,906,753
(32.84 %)
2
(0.00 %)
440,509
(5.18 %)
27,772
(2.71 %)
15,561
(0.92 %)
146 common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024)
GCA_964263955.1
n/a n/a 29,103
(1.36 %)
124,287
(3.94 %)
n/a 43.87
(99.96 %)
0
(0 %)
5,995
(0.04 %)
11,150
(100.00 %)
1,655,140
(4.68 %)
1,843,550
(17.63 %)
9,367,555
(61.56 %)
26
(0.00 %)
4,094,607
(11.22 %)
112,654
(3.84 %)
19,454
(0.27 %)
147 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1
n/a n/a 25,968
(1.48 %)
104,922
(4.18 %)
n/a 43.67
(99.96 %)
4,689
(0.04 %)
4,689
(0.04 %)
8,669
(99.96 %)
1,320,339
(4.08 %)
1,364,334
(15.61 %)
7,674,742
(61.10 %)
11
(0.00 %)
2,973,556
(10.43 %)
94,019
(3.82 %)
16,046
(0.28 %)
148 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1
n/a n/a 5,231
(0.27 %)
47,644
(1.48 %)
n/a 44.62
(99.99 %)
144
(0.01 %)
144
(0.01 %)
21,561
(99.99 %)
2,803,873
(49.20 %)
655,416
(2.69 %)
7,558,550
(67.05 %)
0
(0 %)
912,917
(5.74 %)
181,626
(10.52 %)
19,591
(0.39 %)
149 convict blenny (primary hap 2021)
GCA_020510985.1
n/a n/a n/a 134,417
(1.50 %)
n/a 44.52
(99.13 %)
0
(0 %)
2,580
(0.87 %)
512
(100.00 %)
9,062,541
(49.33 %)
2,097,650
(2.66 %)
20,502,207
(74.78 %)
5
(0.00 %)
3,135,536
(6.36 %)
568,042
(10.14 %)
0
(0.00 %)
150 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1
n/a n/a 13,622
(2.81 %)
43,285
(6.93 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,125
(100.00 %)
1,741,373
(32.89 %)
182,926
(2.01 %)
3,659,106
(21.68 %)
1
(0.00 %)
138,669
(1.93 %)
27,693
(1.89 %)
19,848
(1.23 %)
151 copperband butterflyfish (primary hap 2021)
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
n/a 15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
61,755
(8.99 %)
42.57
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
1
(0.00 %)
158,516
(2.15 %)
29,106
(1.85 %)
19,302
(1.11 %)
152 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1
n/a n/a 14,740
(2.91 %)
45,483
(7.26 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
0
(0 %)
1,379
(0.04 %)
395
(100.00 %)
936,676
(24.41 %)
306,192
(9.29 %)
3,495,456
(28.75 %)
2
(0.00 %)
463,889
(5.20 %)
29,142
(2.35 %)
16,622
(1.09 %)
153 Corydoras catfish unclassified (C115 2021)
GCA_019802505.1
n/a n/a 14,695
(2.68 %)
51,799
(6.37 %)
n/a 42.12
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,080
(100.00 %)
1,969,654
(37.02 %)
663,295
(11.19 %)
3,764,275
(45.19 %)
0
(0 %)
1,764,080
(12.85 %)
67,226
(8.43 %)
47,724
(3.53 %)
154 crested bigscale (hap1.1 2025)
GCA_964638095.1
n/a n/a 17,935
(1.34 %)
104,307
(6.12 %)
n/a 44.53
(99.96 %)
142
(0.00 %)
2,975
(0.04 %)
2,930
(100.00 %)
5,608,839
(57.44 %)
1,825,932
(20.35 %)
6,375,759
(51.18 %)
16
(0.00 %)
2,419,022
(10.51 %)
149,374
(4.78 %)
37,609
(1.23 %)
155 crested bigscale (hap2.1 2025)
GCA_964638665.1
n/a n/a 17,775
(1.43 %)
100,017
(6.38 %)
n/a 44.59
(99.96 %)
2,894
(0.04 %)
2,894
(0.04 %)
4,301
(99.96 %)
5,332,080
(56.26 %)
1,737,704
(18.88 %)
6,064,583
(49.72 %)
13
(0.00 %)
2,194,072
(10.21 %)
141,258
(4.70 %)
36,413
(1.08 %)
156 crested weedfish (hap1 OG76 2025)
GCA_049082185.1
n/a n/a 14,740
(2.96 %)
58,554
(8.04 %)
n/a 44.56
(99.96 %)
0
(0 %)
1,180
(0.04 %)
793
(100.00 %)
711,944
(7.44 %)
537,707
(8.17 %)
3,418,045
(29.92 %)
5
(0.00 %)
354,340
(3.87 %)
95,750
(8.49 %)
51,515
(3.32 %)
157 crested weedfish (hap2 OG76 2025)
GCA_049082045.1
n/a n/a 13,849
(3.08 %)
53,198
(8.16 %)
n/a 44.70
(99.96 %)
0
(0 %)
1,089
(0.04 %)
513
(100.00 %)
649,032
(7.21 %)
483,451
(7.55 %)
3,155,766
(28.97 %)
4
(0.00 %)
299,506
(3.64 %)
88,490
(8.53 %)
48,341
(3.42 %)
158 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1
n/a n/a 4,509
(3.03 %)
16,936
(7.22 %)
n/a 38.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,713
(100.00 %)
430,197
(46.38 %)
101,926
(7.54 %)
1,077,239
(32.21 %)
0
(0 %)
149,644
(6.00 %)
10,612
(4.11 %)
3,661
(0.96 %)
159 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1
90,094
(6.75 %)
n/a 29,386
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
0
(0 %)
832
(0.01 %)
277
(100.00 %)
3,481,382
(45.81 %)
802,773
(6.54 %)
8,190,783
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,003,533
(5.09 %)
83,696
(3.82 %)
26,039
(0.81 %)
160 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1
51,190
(10.37 %)
n/a 15,144
(2.59 %)
43,207
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.98 %)
0
(0 %)
570
(0.02 %)
324
(100.00 %)
1,435,625
(29.39 %)
330,276
(12.54 %)
4,196,830
(33.83 %)
1
(0.00 %)
689,646
(5.54 %)
19,310
(1.01 %)
11,155
(0.57 %)
161 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1
n/a n/a 14,861
(2.74 %)
42,996
(6.34 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
0
(0 %)
31
(0.01 %)
1,476
(100.00 %)
1,373,727
(30.17 %)
220,572
(4.38 %)
4,176,936
(27.32 %)
0
(0 %)
274,559
(2.86 %)
17,129
(1.04 %)
8,648
(0.51 %)
162 cunner (primary hap 2021)
GCA_020745685.1
n/a n/a 15,192
(2.74 %)
43,564
(6.38 %)
n/a 41.31
(99.41 %)
0
(0 %)
283
(0.59 %)
64
(100.00 %)
1,419,667
(30.50 %)
243,024
(4.81 %)
4,334,690
(27.65 %)
2
(0.00 %)
297,510
(2.95 %)
17,974
(1.06 %)
9,021
(0.52 %)
163 Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020)
GCF_015846415.1
49,121
(12.72 %)
n/a 16,501
(4.06 %)
40,671
(7.11 %)
n/a 38.77
(100.00 %)
116
(0.00 %)
116
(0.00 %)
167
(100.00 %)
1,213,719
(40.21 %)
134,299
(3.43 %)
3,676,403
(30.98 %)
0
(0 %)
240,696
(3.68 %)
29,879
(3.18 %)
13,593
(0.92 %)
164 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1
n/a 47,476
(8.36 %)
16,341
(3.18 %)
41,545
(5.47 %)
n/a 38.57
(98.69 %)
8,366
(1.31 %)
8,366
(1.31 %)
36,005
(98.69 %)
300,659
(2.50 %)
212,357
(6.15 %)
4,267,143
(35.05 %)
53
(0.01 %)
572,127
(5.71 %)
23,311
(2.18 %)
10,121
(0.71 %)
165 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1
n/a n/a 15,965
(3.73 %)
37,421
(5.87 %)
n/a 38.52
(94.12 %)
18,487
(5.88 %)
18,487
(5.88 %)
29,831
(94.12 %)
251,333
(2.28 %)
132,120
(1.41 %)
4,061,554
(28.83 %)
1,201
(0.07 %)
63,401
(0.80 %)
16,871
(1.57 %)
9,058
(0.64 %)
166 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
n/a 15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
0
(0 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
4
(0.00 %)
383,250
(3.60 %)
32,973
(1.28 %)
9,764
(0.33 %)
167 delta smelt
GCF_021917145.1
41,807
(14.97 %)
n/a 14,549
(4.09 %)
44,849
(9.74 %)
n/a 44.99
(99.92 %)
0
(0 %)
1,474
(0.08 %)
376
(100.00 %)
387,882
(5.57 %)
383,522
(9.22 %)
1,814,696
(32.48 %)
5
(0.00 %)
335,886
(5.91 %)
28,299
(3.33 %)
15,642
(1.48 %)
168 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2
n/a n/a 14,119
(3.95 %)
47,988
(8.57 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,660
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
0
(0 %)
175,500
(3.05 %)
50,830
(8.72 %)
41,064
(4.69 %)
169 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2
n/a n/a 16,559
(3.78 %)
58,823
(8.66 %)
74,128
(10.47 %)
43.69
(99.18 %)
0
(0 %)
464
(0.82 %)
461
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,284
(4.61 %)
2,948,738
(28.79 %)
0
(0 %)
306,165
(4.31 %)
64,661
(9.49 %)
52,867
(4.93 %)
170 doctor fish G.rufa (2025)
GCF_049309525.1
56,413
(6.01 %)
n/a 18,728
(2.09 %)
57,498
(4.48 %)
n/a 37.04
(99.47 %)
0
(0 %)
14,924
(0.54 %)
1,000
(100.00 %)
928,901
(3.56 %)
923,200
(13.04 %)
6,338,918
(52.94 %)
152
(0.01 %)
1,451,360
(8.57 %)
64,694
(3.55 %)
22,284
(0.71 %)
171 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1
n/a n/a 16,788
(2.12 %)
50,338
(4.68 %)
n/a 41.27
(98.12 %)
0
(0 %)
641
(1.88 %)
182
(100.00 %)
2,709,759
(34.74 %)
798,364
(14.84 %)
5,418,190
(36.02 %)
1
(0.00 %)
1,397,111
(8.85 %)
30,055
(1.31 %)
21,119
(0.80 %)
172 dorado (hap2 2023 refseq)
GCF_030463535.1
45,512
(7.65 %)
n/a 16,797
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
0
(0 %)
726
(0.85 %)
103
(100.00 %)
871,278
(4.83 %)
805,806
(14.65 %)
5,615,217
(36.69 %)
2
(0.00 %)
1,425,793
(8.96 %)
30,083
(1.31 %)
21,157
(0.81 %)
173 double-spotted pufferfish T.bimaculatus (TB-2018 2019)
GCA_004026145.2
n/a 20,142
(10.63 %)
14,760
(4.56 %)
56,353
(11.37 %)
n/a 45.56
(99.97 %)
0
(0 %)
1,033
(0.03 %)
1,158
(100.00 %)
292,029
(9.69 %)
192,568
(5.53 %)
1,623,924
(22.71 %)
2
(0.00 %)
336,852
(6.81 %)
51,743
(9.31 %)
39,457
(5.10 %)
174 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1
51,366
(12.50 %)
n/a 13,736
(3.19 %)
50,537
(7.64 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
0
(0 %)
79
(0.00 %)
213
(100.00 %)
986,789
(36.30 %)
235,862
(13.25 %)
2,323,084
(41.85 %)
0
(0 %)
428,926
(7.18 %)
68,121
(17.75 %)
37,525
(4.04 %)
175 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5
n/a n/a 15,552
(2.29 %)
52,465
(6.26 %)
86,437
(9.40 %)
41.07
(99.87 %)
115
(0.00 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
1,309,350
(35.93 %)
217,916
(1.89 %)
4,547,434
(30.78 %)
2
(0.00 %)
212,425
(2.79 %)
33,005
(1.88 %)
15,205
(0.74 %)
176 eastern happy (primary hap 2024)
GCA_964374335.1
n/a n/a 15,554
(2.13 %)
55,328
(6.30 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
31
(100.00 %)
933,060
(24.43 %)
252,509
(4.84 %)
4,460,314
(32.70 %)
1
(0.00 %)
344,099
(4.07 %)
34,184
(2.09 %)
17,316
(0.94 %)
177 electric eel (alternate hap 2020)
GCA_013347915.1
n/a n/a 12,020
(3.63 %)
38,881
(7.31 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,629
(100.00 %)
429,509
(7.66 %)
432,260
(11.41 %)
2,049,609
(24.32 %)
0
(0 %)
486,181
(6.19 %)
35,597
(4.37 %)
27,662
(2.94 %)
178 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1
40,618
(11.48 %)
n/a 15,837
(3.85 %)
23,074
(6.63 %)
n/a 42.56
(96.95 %)
0
(0 %)
119,361
(3.09 %)
8,786
(100.00 %)
519,014
(5.41 %)
516,718
(6.65 %)
3,020,801
(21.49 %)
1,953
(0.21 %)
261,654
(3.62 %)
41,947
(3.71 %)
33,441
(2.64 %)
179 electric eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
n/a 15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
54,541
(8.42 %)
42.49
(98.20 %)
0
(0 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
1
(0.00 %)
629,918
(5.96 %)
44,501
(3.93 %)
34,390
(2.63 %)
180 electric eel (QZ-2024a 2024)
GCA_041902795.1
n/a n/a 16,358
(2.62 %)
62,068
(6.39 %)
n/a 41.74
(99.75 %)
0
(0 %)
49
(0.25 %)
460
(100.00 %)
701,679
(6.15 %)
756,011
(21.53 %)
2,660,355
(42.28 %)
0
(0 %)
1,091,071
(11.13 %)
50,381
(3.85 %)
36,095
(1.97 %)
181 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1
82,153
(9.98 %)
n/a 16,513
(2.13 %)
79,047
(6.37 %)
n/a 44.15
(99.99 %)
0
(0 %)
234
(0.01 %)
1,425
(100.00 %)
923,543
(11.79 %)
425,650
(9.45 %)
3,525,237
(34.97 %)
0
(0 %)
812,868
(7.46 %)
91,552
(5.39 %)
61,344
(2.61 %)
182 emerald rockcod
GCF_902827165.1
44,179
(8.48 %)
n/a 15,275
(2.20 %)
57,830
(6.43 %)
63,731
(6.65 %)
40.94
(99.99 %)
0
(0 %)
932
(0.01 %)
864
(100.00 %)
460,185
(3.64 %)
399,729
(6.87 %)
3,533,188
(40.09 %)
6
(0.00 %)
642,666
(6.28 %)
52,191
(2.51 %)
13,014
(0.62 %)
183 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1
n/a n/a 17,920
(3.03 %)
59,697
(6.61 %)
n/a 39.13
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
4,949
(100.00 %)
2,285,870
(44.17 %)
480,649
(10.13 %)
4,833,803
(39.56 %)
0
(0 %)
820,249
(6.21 %)
57,737
(4.15 %)
23,311
(1.22 %)
184 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1
n/a n/a 17,661
(3.01 %)
58,218
(6.54 %)
n/a 39.21
(99.98 %)
0
(0 %)
881
(0.02 %)
125
(100.00 %)
2,346,939
(44.27 %)
502,415
(11.23 %)
4,890,830
(40.45 %)
0
(0 %)
873,838
(6.63 %)
60,482
(4.22 %)
24,091
(1.23 %)
185 European anchovy (BLACKSEA-1 2023)
GCF_034702125.1
48,154
(5.87 %)
n/a 15,415
(1.33 %)
77,712
(5.08 %)
n/a 44.45
(99.99 %)
0
(0 %)
9,202
(0.02 %)
1,922
(100.00 %)
4,406,534
(31.73 %)
2,331,293
(15.35 %)
6,863,540
(50.47 %)
15
(0.00 %)
1,701,493
(7.18 %)
80,927
(2.32 %)
27,462
(0.84 %)
186 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1
n/a n/a 17,416
(2.74 %)
60,936
(6.02 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
7,437
(100.00 %)
2,377,147
(47.98 %)
578,235
(8.27 %)
5,267,308
(40.22 %)
0
(0 %)
872,083
(6.16 %)
50,909
(3.45 %)
17,892
(0.86 %)
187 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1
n/a n/a 18,028
(2.64 %)
64,206
(6.04 %)
n/a 38.73
(99.99 %)
0
(0 %)
588
(0.01 %)
106
(100.00 %)
2,649,943
(48.88 %)
666,129
(9.08 %)
5,751,610
(41.56 %)
5
(0.00 %)
1,113,756
(7.21 %)
58,471
(3.64 %)
19,602
(0.84 %)
188 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1
54,631
(7.46 %)
n/a 17,072
(1.89 %)
34,801
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
0
(0 %)
1,009
(0.02 %)
380
(100.00 %)
761,522
(5.99 %)
913,306
(13.25 %)
5,767,879
(35.48 %)
3
(0.00 %)
1,603,437
(8.94 %)
120,990
(6.12 %)
81,342
(2.93 %)
189 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1
n/a n/a 14,690
(3.17 %)
48,422
(7.90 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,915
(100.00 %)
1,138,190
(26.31 %)
249,865
(4.72 %)
3,352,038
(25.55 %)
0
(0 %)
232,419
(3.75 %)
36,828
(3.13 %)
27,093
(1.88 %)
190 European flounder (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316205.1
n/a n/a 14,753
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
109
(100.00 %)
1,160,784
(27.06 %)
251,985
(5.23 %)
3,353,121
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,297
(3.81 %)
37,130
(2.79 %)
27,432
(1.88 %)
191 European flounder (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316205.1
48,969
(12.45 %)
n/a 14,751
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
108
(100.00 %)
1,160,781
(27.06 %)
251,983
(5.23 %)
3,353,086
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,298
(3.81 %)
37,129
(2.79 %)
27,431
(1.88 %)
192 European perch
GCF_010015445.1
55,605
(8.20 %)
n/a 15,430
(2.07 %)
55,499
(5.43 %)
n/a 40.90
(99.97 %)
0
(0 %)
801
(0.03 %)
303
(100.00 %)
684,094
(5.16 %)
634,788
(7.48 %)
5,182,241
(37.07 %)
0
(0 %)
746,988
(5.12 %)
44,049
(1.94 %)
15,321
(0.71 %)
193 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1
n/a n/a 14,619
(2.94 %)
50,389
(7.92 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
3,222
(100.00 %)
430,112
(3.88 %)
299,581
(6.89 %)
3,182,258
(27.97 %)
0
(0 %)
330,159
(4.99 %)
40,094
(3.66 %)
20,637
(1.37 %)
194 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1
46,467
(10.51 %)
n/a 14,818
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
0
(0 %)
1,072
(0.03 %)
355
(100.00 %)
476,314
(3.63 %)
520,729
(13.27 %)
3,283,360
(33.55 %)
2
(0.00 %)
525,277
(6.36 %)
47,050
(4.45 %)
21,878
(1.29 %)
195 European seabass (2021)
GCF_905237075.1
62,470
(13.08 %)
n/a 15,582
(2.89 %)
44,472
(6.56 %)
69,435
(12.92 %)
40.38
(99.85 %)
0
(0 %)
272
(0.15 %)
303
(100.00 %)
1,210,970
(24.30 %)
278,140
(4.02 %)
4,343,442
(26.18 %)
1
(0.00 %)
309,168
(3.42 %)
15,975
(0.93 %)
10,409
(0.57 %)
196 European smelt (primary hap 2023 genbank)
GCA_963692335.1
n/a n/a 15,640
(3.79 %)
50,248
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
30
(0.00 %)
2,462
(0.10 %)
1,038
(100.00 %)
1,648,435
(31.35 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,832
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
197 European smelt (primary hap 2023 refseq)
GCF_963692335.1
46,762
(14.07 %)
n/a 15,639
(3.79 %)
50,238
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
0
(0 %)
2,462
(0.10 %)
1,007
(100.00 %)
1,648,428
(31.34 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,793
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
198 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1
n/a n/a 16,181
(2.44 %)
63,544
(7.17 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
0
(0 %)
1,501
(0.04 %)
387
(100.00 %)
2,109,362
(31.42 %)
1,300,159
(14.91 %)
3,634,744
(35.44 %)
6
(0.00 %)
1,178,448
(8.78 %)
35,552
(1.87 %)
19,823
(1.00 %)
199 fathead minnow
GCF_016745375.1
57,312
(8.34 %)
n/a 18,039
(3.02 %)
52,431
(6.01 %)
n/a 38.45
(86.78 %)
0
(0 %)
5,594
(13.23 %)
911
(100.00 %)
657,027
(4.09 %)
444,571
(6.23 %)
4,902,960
(35.69 %)
5
(0.00 %)
807,051
(7.17 %)
49,361
(2.78 %)
20,934
(0.93 %)
200 flathead mullet
GCF_022458985.1
48,689
(12.71 %)
n/a 14,908
(3.00 %)
45,084
(6.96 %)
75,582
(11.23 %)
41.90
(99.97 %)
0
(0 %)
445
(0.04 %)
24
(100.00 %)
469,841
(3.23 %)
207,738
(2.31 %)
3,955,233
(24.74 %)
0
(0 %)
232,148
(2.99 %)
45,885
(3.03 %)
31,971
(1.87 %)
201 flavescent peacock cichlid (primary hap 2025)
GCA_965226115.1
n/a n/a 15,528
(2.10 %)
55,124
(6.16 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
0
(0 %)
31
(0.00 %)
23
(100.00 %)
946,588
(24.66 %)
252,409
(5.14 %)
4,403,110
(33.26 %)
2
(0.00 %)
319,693
(3.93 %)
35,478
(2.07 %)
17,725
(0.97 %)
202 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1
n/a n/a 17,494
(2.06 %)
62,257
(5.73 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,986
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
0
(0 %)
240,032
(2.50 %)
26,445
(1.22 %)
12,638
(0.48 %)
203 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
n/a 15,434
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
0
(0 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
0
(0 %)
227,442
(2.84 %)
24,130
(1.26 %)
11,082
(0.48 %)
204 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1
n/a n/a 13,745
(2.58 %)
50,416
(6.72 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
5,171
(100.00 %)
442,646
(4.09 %)
276,927
(5.42 %)
3,741,267
(26.25 %)
0
(0 %)
406,474
(4.11 %)
28,827
(2.28 %)
19,731
(1.36 %)
205 freshwater garfish (primary hap 2020)
GCA_014839995.1
n/a n/a 14,625
(2.57 %)
52,879
(6.72 %)
n/a 41.41
(98.98 %)
0
(0 %)
1,373
(1.02 %)
410
(100.00 %)
492,828
(4.29 %)
318,631
(5.94 %)
3,977,536
(27.41 %)
0
(0 %)
521,102
(4.91 %)
32,390
(2.33 %)
21,612
(1.34 %)
206 giant grouper (Andai001 2019)
GCF_005281545.1
45,328
(7.65 %)
n/a 15,661
(1.91 %)
53,910
(4.91 %)
n/a 41.26
(96.40 %)
0
(0 %)
23,415
(3.61 %)
4,201
(100.00 %)
604,763
(2.71 %)
357,944
(2.52 %)
6,501,327
(30.28 %)
1,632
(0.21 %)
237,713
(2.85 %)
26,431
(0.91 %)
9,943
(0.35 %)
207 giant grouper (andai-2023 2024)
GCA_041903045.1
n/a n/a 15,652
(1.85 %)
56,048
(5.08 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
0
(0 %)
7
(0.00 %)
176
(100.00 %)
640,534
(2.88 %)
384,479
(4.59 %)
6,438,939
(33.27 %)
0
(0 %)
443,481
(3.30 %)
28,221
(1.10 %)
10,419
(0.37 %)
208 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1
n/a n/a 13,090
(2.37 %)
48,927
(6.41 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,758
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
0
(0 %)
201,169
(2.33 %)
38,368
(2.40 %)
20,092
(1.12 %)
209 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2
n/a n/a 15,752
(2.45 %)
56,395
(6.58 %)
n/a 41.94
(99.96 %)
0
(0 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
1,474,134
(29.50 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,691
(25.69 %)
0
(0 %)
355,475
(3.53 %)
47,327
(2.41 %)
29,914
(1.44 %)
210 golden-line barbel
GCF_001515645.1
74,257
(6.73 %)
n/a 29,486
(2.77 %)
55,545
(5.32 %)
n/a 37.54
(89.58 %)
136,797
(10.45 %)
136,894
(10.45 %)
168,074
(89.55 %)
1,118,646
(5.04 %)
718,426
(6.54 %)
9,092,306
(37.16 %)
3,220
(0.35 %)
778,152
(11.46 %)
70,606
(1.91 %)
26,998
(0.64 %)
211 goldfish
GCF_003368295.1
116,745
(8.75 %)
n/a 35,097
(2.94 %)
68,251
(6.12 %)
n/a 37.48
(99.99 %)
2,247
(0.01 %)
2,247
(0.01 %)
8,463
(99.99 %)
1,693,800
(5.39 %)
916,195
(5.01 %)
9,731,118
(40.19 %)
0
(0 %)
1,030,815
(4.89 %)
66,585
(2.06 %)
27,619
(0.65 %)
212 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1
67,821
(11.16 %)
n/a 18,195
(3.27 %)
48,459
(5.67 %)
n/a 37.48
(99.98 %)
0
(0 %)
150
(0.02 %)
31
(100.00 %)
654,416
(3.33 %)
429,734
(3.77 %)
5,501,085
(40.21 %)
1
(0.00 %)
413,986
(3.73 %)
26,282
(1.58 %)
15,753
(0.76 %)
213 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1
36,357
(7.09 %)
n/a 14,512
(1.92 %)
45,809
(4.61 %)
n/a 39.76
(99.63 %)
0
(0 %)
3,407
(0.37 %)
600
(100.00 %)
2,662,894
(54.47 %)
803,911
(10.32 %)
5,763,692
(48.31 %)
3
(0.00 %)
1,131,797
(6.83 %)
53,808
(2.65 %)
23,231
(1.00 %)
214 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1
25,835
(5.19 %)
n/a 14,212
(1.97 %)
27,894
(4.68 %)
n/a 39.49
(93.15 %)
92,327
(6.89 %)
92,327
(6.89 %)
108,947
(93.11 %)
552,368
(5.00 %)
742,395
(8.07 %)
5,901,720
(42.46 %)
146
(0.03 %)
487,419
(6.15 %)
44,972
(1.97 %)
19,348
(0.76 %)
215 greater amberjack
GCF_002260705.1
33,769
(9.11 %)
n/a 15,336
(2.93 %)
22,220
(6.07 %)
n/a 40.86
(99.17 %)
0
(0 %)
9,742
(0.82 %)
34,656
(100.00 %)
573,770
(4.04 %)
368,800
(3.72 %)
4,449,534
(24.71 %)
371
(0.04 %)
251,784
(3.33 %)
15,850
(0.98 %)
10,738
(0.58 %)
216 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1
n/a n/a 15,483
(3.45 %)
47,484
(7.95 %)
n/a 44.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,805
(100.00 %)
1,400,150
(23.78 %)
738,163
(17.35 %)
2,460,977
(35.90 %)
0
(0 %)
605,154
(7.13 %)
20,794
(2.09 %)
11,413
(0.80 %)
217 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1
n/a n/a 16,553
(3.15 %)
51,766
(7.37 %)
n/a 44.75
(99.95 %)
61
(0.00 %)
1,752
(0.05 %)
1,085
(100.00 %)
1,674,762
(26.07 %)
900,455
(18.62 %)
2,849,256
(39.22 %)
0
(0 %)
824,383
(7.94 %)
26,022
(2.30 %)
13,322
(0.79 %)
218 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1
n/a n/a 10,795
(5.59 %)
33,380
(12.07 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,376
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
0
(0 %)
64,742
(2.40 %)
34,104
(12.82 %)
25,350
(6.24 %)
219 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
n/a 13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
37,563
(15.76 %)
43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
0
(0 %)
112,918
(3.25 %)
46,327
(10.97 %)
32,897
(5.93 %)
220 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1
n/a n/a 13,412
(4.76 %)
45,946
(11.50 %)
n/a 44.34
(99.99 %)
0
(0 %)
95
(0.01 %)
251
(100.00 %)
494,547
(20.10 %)
204,804
(10.66 %)
1,444,044
(34.08 %)
0
(0 %)
208,543
(5.33 %)
47,904
(17.47 %)
32,381
(5.25 %)
221 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1
n/a n/a 13,681
(4.93 %)
45,034
(11.64 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,533
(100.00 %)
460,038
(18.47 %)
163,838
(7.90 %)
1,681,190
(29.08 %)
0
(0 %)
141,147
(3.92 %)
47,523
(15.60 %)
33,138
(6.10 %)
222 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1
n/a n/a 13,432
(2.10 %)
50,930
(6.39 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,952
(100.00 %)
2,495,763
(38.80 %)
473,105
(6.27 %)
3,444,123
(38.56 %)
0
(0 %)
474,250
(4.43 %)
35,298
(1.94 %)
13,822
(0.66 %)
223 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1
n/a n/a 15,028
(2.35 %)
50,436
(6.30 %)
n/a 41.10
(99.97 %)
0
(0 %)
1,188
(0.03 %)
1,568
(100.00 %)
2,688,222
(39.74 %)
549,362
(7.60 %)
3,564,661
(40.05 %)
4
(0.00 %)
605,421
(5.26 %)
37,043
(1.94 %)
11,494
(0.60 %)
224 green swordtail
GCF_003331165.1
52,602
(11.81 %)
n/a 14,955
(2.58 %)
47,115
(6.33 %)
n/a 39.09
(99.71 %)
185
(0.00 %)
661
(0.29 %)
272
(100.00 %)
328,469
(2.10 %)
162,178
(2.35 %)
4,801,050
(28.86 %)
1
(0.00 %)
227,225
(3.22 %)
37,217
(2.39 %)
25,655
(1.36 %)
225 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1
n/a n/a 14,752
(2.74 %)
58,725
(8.49 %)
n/a 43.13
(99.98 %)
3
(0.00 %)
553
(0.02 %)
322
(100.00 %)
1,860,845
(35.64 %)
378,045
(9.39 %)
3,208,482
(30.12 %)
0
(0 %)
450,213
(5.20 %)
66,857
(4.99 %)
44,052
(2.67 %)
226 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1
n/a n/a 16,645
(1.92 %)
62,533
(4.55 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
7,253
(100.00 %)
5,166,731
(67.78 %)
750,850
(11.35 %)
5,903,440
(54.20 %)
0
(0 %)
1,408,406
(7.28 %)
90,235
(5.58 %)
15,520
(0.51 %)
227 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1
n/a n/a 17,136
(1.90 %)
63,611
(4.50 %)
n/a 39.74
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,046
(0.01 %)
233
(100.00 %)
5,662,029
(68.75 %)
825,757
(11.99 %)
6,236,024
(55.15 %)
4
(0.00 %)
1,606,132
(7.98 %)
99,559
(5.68 %)
16,304
(0.51 %)
228 Gulf pipefish (Florida 2022)
GCF_024217435.2
53,176
(17.83 %)
n/a 13,439
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
495
(100.00 %)
644,597
(20.82 %)
180,309
(16.78 %)
1,339,434
(43.63 %)
0
(0 %)
465,900
(9.76 %)
51,080
(18.49 %)
31,396
(4.21 %)
229 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1
58,583
(18.27 %)
n/a 13,442
(4.00 %)
41,565
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
253,033
(3.86 %)
180,311
(16.78 %)
1,339,521
(43.63 %)
0
(0 %)
465,901
(9.76 %)
51,080
(18.49 %)
31,396
(4.21 %)
230 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4
n/a n/a 13,441
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
644,601
(20.82 %)
180,310
(16.78 %)
1,339,461
(43.63 %)
0
(0 %)
465,902
(9.76 %)
51,080
(18.49 %)
31,396
(4.21 %)
231 guppy
GCF_000633615.1
48,303
(11.25 %)
n/a 14,436
(2.72 %)
44,759
(6.24 %)
n/a 39.33
(90.86 %)
37,376
(9.16 %)
458,354
(9.22 %)
40,143
(90.84 %)
340,480
(2.43 %)
167,943
(1.50 %)
4,695,380
(25.63 %)
1,124
(0.10 %)
71,291
(1.20 %)
35,188
(1.91 %)
26,043
(1.36 %)
232 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1
n/a n/a 15,058
(2.50 %)
46,340
(5.85 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
2,131
(100.00 %)
1,642,351
(37.42 %)
389,169
(5.43 %)
4,687,710
(35.55 %)
0
(0 %)
541,909
(4.77 %)
34,408
(1.75 %)
16,136
(0.80 %)
233 honeycomb rockfish (primary hap 2020)
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
n/a 15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
63,546
(8.88 %)
40.77
(99.83 %)
0
(0 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
1
(0.00 %)
627,017
(5.28 %)
37,878
(1.84 %)
15,343
(0.71 %)
234 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1
74,598
(6.94 %)
n/a 30,802
(3.11 %)
57,655
(5.63 %)
n/a 37.18
(91.91 %)
150,790
(8.11 %)
150,790
(8.11 %)
314,962
(91.89 %)
1,147,234
(4.93 %)
708,513
(4.77 %)
9,080,512
(35.95 %)
1,724
(0.23 %)
n/a 63,217
(1.71 %)
29,804
(0.74 %)
235 humphead wrasse
GCF_018320785.1
42,229
(6.60 %)
n/a 15,287
(1.66 %)
47,025
(4.13 %)
n/a 39.53
(100.00 %)
0
(0 %)
284
(0.00 %)
46
(100.00 %)
447,458
(2.27 %)
310,170
(4.65 %)
8,002,463
(32.97 %)
1
(0.00 %)
473,364
(2.54 %)
12,252
(0.38 %)
8,635
(0.26 %)
236 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1
n/a n/a 14,412
(3.70 %)
41,944
(8.58 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
0
(0 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,774
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
0
(0 %)
195,444
(3.94 %)
15,419
(1.38 %)
8,375
(0.73 %)
237 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2
n/a n/a 15,339
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
57,867
(10.10 %)
42.38
(98.08 %)
0
(0 %)
1,523
(1.92 %)
157
(100.00 %)
346,399
(3.02 %)
163,524
(3.00 %)
2,755,274
(25.07 %)
0
(0 %)
235,504
(4.25 %)
17,931
(1.47 %)
9,749
(0.74 %)
238 Indian medaka
GCF_002922805.2
49,295
(10.27 %)
n/a 14,591
(2.49 %)
52,982
(6.37 %)
n/a 39.04
(94.83 %)
0
(0 %)
51,550
(5.20 %)
8,493
(100.00 %)
319,151
(2.20 %)
208,690
(2.67 %)
5,412,546
(33.29 %)
180
(0.02 %)
209,477
(2.14 %)
40,721
(2.36 %)
28,619
(1.60 %)
239 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1
41,570
(6.90 %)
n/a 18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
74,968
(7.01 %)
43.02
(99.97 %)
0
(0 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
0
(0 %)
319,481
(2.18 %)
78,561
(3.69 %)
58,460
(2.33 %)
240 Japanese flounder
GCF_001970005.1
37,838
(12.25 %)
n/a 14,521
(3.39 %)
30,773
(7.34 %)
n/a 41.64
(81.04 %)
0
(0 %)
40,314
(18.97 %)
9,525
(100.00 %)
332,322
(2.84 %)
164,916
(1.16 %)
3,476,344
(17.36 %)
317
(0.14 %)
34,362
(0.47 %)
21,768
(1.42 %)
15,778
(0.96 %)
241 Japanese flounder (ysfri-2021 2022)
GCF_024713975.1
60,200
(14.08 %)
n/a 14,987
(3.26 %)
42,919
(7.40 %)
n/a 41.54
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
25
(100.00 %)
850,797
(19.88 %)
308,390
(6.45 %)
3,329,304
(26.55 %)
0
(0 %)
204,034
(3.13 %)
23,373
(1.76 %)
16,725
(1.15 %)
242 Japanese medaka
GCF_002234675.1
50,526
(10.32 %)
n/a 14,325
(2.50 %)
27,912
(6.71 %)
91,652
(11.67 %)
40.84
(99.93 %)
0
(0 %)
491
(0.07 %)
25
(100.00 %)
384,317
(4.42 %)
163,041
(3.07 %)
4,631,750
(34.91 %)
2
(0.00 %)
257,543
(3.04 %)
41,215
(2.89 %)
23,967
(1.50 %)
243 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1
42,877
(8.61 %)
n/a 15,188
(2.40 %)
41,262
(7.86 %)
58,418
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
0
(0 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
667,122
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
0
(0 %)
422,332
(3.88 %)
121,464
(9.36 %)
77,061
(4.51 %)
244 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1
n/a n/a 15,945
(2.17 %)
101,825
(8.93 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
0
(0 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,228
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
0
(0 %)
541,432
(4.29 %)
138,484
(9.55 %)
86,420
(4.60 %)
245 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1
n/a n/a 14,960
(2.23 %)
74,436
(6.65 %)
n/a 43.94
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,370
(100.00 %)
1,620,688
(23.00 %)
902,057
(13.66 %)
4,547,953
(39.90 %)
0
(0 %)
892,097
(6.41 %)
129,990
(12.07 %)
77,992
(4.35 %)
246 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1
n/a n/a 14,906
(2.33 %)
72,029
(6.72 %)
n/a 43.92
(99.98 %)
0
(0 %)
887
(0.02 %)
191
(100.00 %)
1,609,654
(22.82 %)
897,264
(13.58 %)
4,548,467
(39.80 %)
11
(0.00 %)
875,374
(6.46 %)
129,147
(11.75 %)
77,287
(4.33 %)
247 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1
45,790
(8.57 %)
n/a 15,561
(1.99 %)
53,188
(5.12 %)
n/a 41.32
(97.02 %)
0
(0 %)
48,394
(2.99 %)
4,563
(100.00 %)
574,889
(2.73 %)
367,135
(2.64 %)
6,420,280
(29.10 %)
2,337
(0.06 %)
244,886
(1.72 %)
28,979
(1.07 %)
10,901
(0.40 %)
248 kelp perch (BFR_SWC_R1_liver_20210118 2023)
GCF_029030835.1
40,680
(11.49 %)
n/a 14,847
(3.17 %)
46,307
(7.10 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,003
(100.00 %)
967,639
(17.54 %)
319,567
(5.43 %)
3,743,006
(26.82 %)
0
(0 %)
263,733
(2.32 %)
47,481
(4.63 %)
30,351
(2.16 %)
249 Korean giant-fin mudskipper (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1
n/a n/a 13,470
(2.34 %)
42,799
(5.73 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,414
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
0
(0 %)
475,330
(4.51 %)
34,522
(2.54 %)
17,280
(0.96 %)
250 Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3
33,236
(8.44 %)
n/a 14,601
(2.46 %)
44,145
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
701
(0.95 %)
122
(100.00 %)
1,755,227
(42.93 %)
551,482
(7.22 %)
4,887,087
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,179
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
22,350
(1.21 %)
251 lake trout
GCF_016432855.1
65,012
(4.57 %)
n/a 26,528
(1.53 %)
112,119
(4.47 %)
76,885
(3.80 %)
43.50
(99.99 %)
0
(0 %)
3,264
(0.01 %)
4,121
(100.00 %)
1,387,896
(5.81 %)
1,797,785
(19.28 %)
9,643,314
(54.44 %)
2
(0.00 %)
3,778,575
(10.18 %)
85,419
(2.52 %)
19,617
(0.38 %)
252 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1
78,867
(4.31 %)
n/a 27,579
(1.38 %)
113,850
(3.63 %)
n/a 44.18
(100.00 %)
0
(0 %)
1,716
(0.00 %)
6,355
(100.00 %)
1,729,029
(6.03 %)
1,781,307
(15.24 %)
9,311,548
(61.16 %)
0
(0 %)
4,057,370
(10.85 %)
126,142
(4.04 %)
18,712
(0.30 %)
253 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1
87,259
(4.53 %)
n/a 28,366
(1.38 %)
117,266
(3.71 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
0
(0 %)
1,159
(0.00 %)
7,334
(100.00 %)
1,768,537
(6.02 %)
1,793,716
(15.51 %)
9,525,312
(61.13 %)
0
(0 %)
4,153,782
(10.89 %)
126,485
(3.95 %)
18,425
(0.28 %)
254 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1
n/a n/a 17,851
(1.28 %)
83,249
(5.18 %)
n/a 42.69
(99.97 %)
36
(0.00 %)
2,397
(0.03 %)
709
(100.00 %)
7,797,173
(37.37 %)
1,593,818
(10.64 %)
7,610,300
(54.05 %)
15
(0.00 %)
1,726,634
(9.03 %)
127,942
(3.84 %)
34,520
(0.93 %)
255 large yellow croaker
GCF_000972845.2
49,927
(11.76 %)
n/a 15,365
(3.00 %)
26,101
(6.66 %)
n/a 41.34
(99.67 %)
0
(0 %)
7,424
(0.33 %)
9,998
(100.00 %)
478,685
(3.50 %)
306,063
(3.37 %)
4,199,578
(24.80 %)
65
(0.01 %)
319,923
(3.93 %)
28,138
(2.09 %)
16,153
(1.01 %)
256 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1
n/a n/a 15,841
(2.36 %)
79,276
(8.51 %)
n/a 46.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,761
(100.00 %)
2,935,570
(42.17 %)
1,208,602
(21.28 %)
3,157,730
(42.63 %)
0
(0 %)
1,448,522
(11.27 %)
88,759
(6.30 %)
47,311
(2.77 %)
257 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1
n/a n/a 16,376
(2.19 %)
82,947
(7.99 %)
n/a 46.31
(99.94 %)
144
(0.00 %)
2,631
(0.06 %)
1,522
(100.00 %)
3,333,323
(43.58 %)
1,553,932
(25.91 %)
3,393,507
(46.78 %)
9
(0.00 %)
1,764,517
(12.32 %)
99,668
(6.39 %)
51,378
(2.60 %)
258 largemouth bass (2-A1 2021)
GCA_019677235.1
n/a n/a 15,790
(2.31 %)
50,332
(5.65 %)
n/a 40.87
(99.96 %)
0
(0 %)
672
(0.04 %)
202
(100.00 %)
464,845
(2.71 %)
255,513
(3.69 %)
5,124,388
(29.65 %)
2
(0.00 %)
390,854
(3.63 %)
25,920
(1.67 %)
12,277
(0.62 %)
259 largemouth bass (LMB-PRFRI aquatic 2020)
GCF_014851395.1
55,170
(9.49 %)
n/a 16,635
(2.18 %)
56,707
(5.52 %)
n/a 40.86
(99.85 %)
0
(0 %)
2,909
(0.15 %)
4,753
(100.00 %)
497,281
(2.60 %)
269,495
(3.70 %)
5,496,732
(29.60 %)
0
(0 %)
430,490
(4.27 %)
28,733
(1.66 %)
13,319
(0.61 %)
260 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1
n/a n/a 8,132
(2.11 %)
25,878
(4.67 %)
n/a 38.55
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,088
(100.00 %)
260,789
(2.73 %)
158,564
(2.12 %)
3,023,128
(27.39 %)
0
(0 %)
71,421
(1.44 %)
9,678
(1.02 %)
7,876
(0.74 %)
261 largescale foureyes (primary hap 2020)
GCA_014839685.1
n/a n/a 14,774
(2.18 %)
42,858
(4.83 %)
58,247
(6.94 %)
38.54
(99.96 %)
0
(0 %)
107
(0.04 %)
33
(100.00 %)
506,950
(2.73 %)
305,170
(2.13 %)
6,194,879
(29.85 %)
0
(0 %)
131,664
(1.39 %)
17,881
(0.94 %)
14,233
(0.68 %)
262 leafy seadragon (BA_2022a 2022)
GCF_024500275.1
46,242
(10.23 %)
n/a 13,712
(2.62 %)
43,369
(5.56 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
0
(0 %)
76
(0.00 %)
1,537
(100.00 %)
1,406,779
(35.37 %)
202,983
(7.44 %)
3,933,128
(41.19 %)
0
(0 %)
436,408
(4.31 %)
70,560
(7.78 %)
39,027
(2.50 %)
263 lemon sole (primary hap 2024)
GCA_964266715.1
n/a n/a 14,961
(2.55 %)
52,234
(6.83 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
20
(0.00 %)
409
(0.01 %)
1,601
(100.00 %)
1,233,052
(39.33 %)
366,741
(18.98 %)
3,296,338
(36.77 %)
1
(0.00 %)
538,414
(6.03 %)
44,712
(2.85 %)
31,908
(1.76 %)
264 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1
38,671
(7.52 %)
n/a 15,538
(2.18 %)
57,480
(5.26 %)
n/a 39.54
(98.22 %)
0
(0 %)
3,611
(1.77 %)
94,260
(100.00 %)
629,451
(3.42 %)
385,539
(3.83 %)
6,343,655
(29.35 %)
123
(0.00 %)
240,147
(1.70 %)
27,018
(1.26 %)
18,061
(0.78 %)
265 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1
n/a n/a 15,487
(0.88 %)
85,135
(3.39 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
6,593
(100.00 %)
5,572,163
(49.59 %)
1,052,072
(6.02 %)
7,246,646
(62.69 %)
0
(0 %)
2,503,507
(8.71 %)
157,768
(4.38 %)
14,966
(0.28 %)
266 lesser salmon catfish (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1
53,323
(3.35 %)
n/a 15,955
(0.92 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
6,041,262
(71.88 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
16,535
(0.37 %)
267 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1
n/a n/a 13,792
(2.19 %)
51,353
(6.60 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,620
(100.00 %)
2,536,362
(38.05 %)
513,115
(7.50 %)
3,542,854
(37.60 %)
0
(0 %)
576,452
(5.21 %)
31,814
(1.79 %)
14,668
(0.71 %)
268 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1
n/a n/a 13,908
(2.19 %)
50,634
(6.50 %)
n/a 41.22
(99.97 %)
84
(0.00 %)
1,017
(0.03 %)
701
(100.00 %)
2,698,640
(39.19 %)
577,328
(8.51 %)
3,615,231
(39.17 %)
5
(0.00 %)
691,324
(6.04 %)
33,251
(1.82 %)
14,917
(0.69 %)
269 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1
n/a n/a 15,269
(2.44 %)
52,449
(6.28 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
606
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,879,201
(31.40 %)
449,901
(9.89 %)
4,248,556
(33.21 %)
1
(0.00 %)
727,189
(5.72 %)
43,864
(3.01 %)
19,108
(1.01 %)
270 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1
n/a n/a 15,033
(2.98 %)
51,296
(7.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
2,700
(100.00 %)
1,099,919
(28.68 %)
314,919
(9.57 %)
2,620,601
(30.23 %)
0
(0 %)
539,835
(6.99 %)
49,248
(4.19 %)
27,196
(1.69 %)
271 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1
n/a n/a 15,060
(2.89 %)
50,064
(7.31 %)
n/a 41.88
(99.98 %)
0
(0 %)
589
(0.02 %)
534
(100.00 %)
1,116,427
(28.18 %)
315,489
(13.14 %)
2,598,812
(33.21 %)
2
(0.00 %)
680,706
(7.88 %)
50,192
(3.82 %)
27,472
(1.61 %)
272 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1
n/a n/a 14,632
(3.51 %)
40,441
(7.51 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
0
(0 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,742
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
0
(0 %)
96,734
(1.60 %)
16,302
(1.34 %)
11,802
(0.89 %)
273 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2
n/a n/a 14,975
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
n/a 41.43
(99.89 %)
0
(0 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
772,309
(14.49 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,473
(21.79 %)
0
(0 %)
109,664
(1.83 %)
16,807
(1.33 %)
12,095
(0.89 %)
274 longspined bullhead (.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1
n/a n/a 15,027
(3.10 %)
51,137
(7.71 %)
n/a 42.22
(99.99 %)
0
(0 %)
242
(0.01 %)
27
(100.00 %)
452,844
(4.81 %)
417,308
(9.63 %)
3,262,282
(28.51 %)
2
(0.00 %)
530,802
(5.05 %)
55,527
(4.38 %)
34,004
(2.27 %)
275 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1
n/a n/a 15,137
(3.09 %)
52,499
(7.75 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,778
(100.00 %)
448,166
(4.67 %)
416,181
(8.95 %)
3,288,388
(27.99 %)
0
(0 %)
521,897
(4.93 %)
55,747
(4.41 %)
34,235
(2.29 %)
276 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1
n/a n/a 12,848
(3.32 %)
43,711
(8.09 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,698
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
0
(0 %)
569,405
(6.42 %)
45,916
(5.21 %)
28,531
(2.48 %)
277 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1
n/a n/a 14,944
(3.23 %)
50,328
(8.09 %)
n/a 42.82
(99.97 %)
0
(0 %)
954
(0.03 %)
232
(100.00 %)
1,034,598
(25.93 %)
434,819
(13.21 %)
2,907,371
(30.18 %)
3
(0.00 %)
701,025
(6.86 %)
55,066
(5.20 %)
33,554
(2.42 %)
278 lumpfish (v1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
n/a 14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
0
(0 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
1
(0.00 %)
655,785
(6.31 %)
53,321
(5.09 %)
32,722
(2.40 %)
279 lyretail cichlid
GCF_000239395.1
38,273
(10.03 %)
n/a 14,804
(2.69 %)
23,751
(5.79 %)
n/a 40.44
(80.94 %)
109,098
(19.10 %)
109,100
(19.10 %)
118,181
(80.90 %)
695,696
(14.49 %)
119,381
(1.10 %)
4,539,429
(19.49 %)
5,040
(0.39 %)
62,939
(1.53 %)
18,098
(0.91 %)
13,389
(0.65 %)
280 Malawi cichlid R.sp.'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1
n/a n/a 15,501
(2.18 %)
54,090
(6.20 %)
n/a 41.17
(99.99 %)
0
(0 %)
422
(0.01 %)
82
(100.00 %)
1,727,328
(38.16 %)
259,351
(4.71 %)
4,381,278
(33.25 %)
2
(0.00 %)
338,853
(3.90 %)
35,281
(1.93 %)
14,746
(0.71 %)
281 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1
64,831
(12.89 %)
n/a 15,283
(2.75 %)
43,349
(6.02 %)
n/a 40.35
(100.00 %)
0
(0 %)
93
(0.00 %)
65
(100.00 %)
441,324
(3.38 %)
206,420
(2.54 %)
4,582,841
(27.41 %)
2
(0.00 %)
240,418
(2.41 %)
15,999
(1.17 %)
10,104
(0.58 %)
282 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2
49,029
(12.41 %)
n/a 14,186
(3.08 %)
55,502
(8.05 %)
n/a 43.27
(100.00 %)
0
(0 %)
19
(0.00 %)
97
(100.00 %)
321,832
(4.91 %)
114,318
(16.04 %)
2,300,636
(32.10 %)
0
(0 %)
595,385
(7.08 %)
46,312
(5.05 %)
34,383
(3.14 %)
283 mangrove rivulus
GCF_001649575.2
46,187
(11.82 %)
n/a 14,522
(2.87 %)
46,641
(6.86 %)
n/a 40.03
(94.31 %)
0
(0 %)
32,278
(5.70 %)
300
(100.00 %)
345,678
(2.32 %)
146,263
(1.33 %)
4,718,292
(27.30 %)
277
(0.09 %)
65,776
(1.14 %)
39,541
(2.69 %)
29,543
(1.76 %)
284 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1
n/a n/a 14,564
(1.72 %)
71,604
(6.41 %)
n/a 41.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,737
(100.00 %)
1,662,251
(42.29 %)
439,119
(12.96 %)
3,776,125
(45.00 %)
0
(0 %)
888,556
(6.68 %)
56,507
(2.83 %)
15,006
(0.71 %)
285 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1
n/a n/a 15,070
(1.79 %)
71,367
(6.50 %)
n/a 41.46
(99.92 %)
0
(0 %)
4,157
(0.08 %)
943
(100.00 %)
1,717,591
(42.63 %)
474,348
(12.30 %)
4,011,319
(44.93 %)
3
(0.00 %)
n/a 59,531
(2.83 %)
15,998
(0.74 %)
286 Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023)
GCF_029220125.1
44,376
(10.91 %)
n/a 14,032
(2.80 %)
60,400
(8.09 %)
n/a 43.84
(99.86 %)
0
(0 %)
974
(0.14 %)
200
(100.00 %)
1,157,953
(36.57 %)
569,832
(12.19 %)
2,864,996
(37.65 %)
2
(0.00 %)
856,247
(8.38 %)
98,423
(9.53 %)
55,625
(4.11 %)
287 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2
47,018
(6.00 %)
n/a 16,516
(1.68 %)
33,920
(4.24 %)
n/a 38.00
(96.73 %)
0
(0 %)
621
(3.27 %)
2,415
(100.00 %)
1,125,511
(6.89 %)
1,113,607
(11.76 %)
8,546,053
(42.44 %)
2
(0.02 %)
1,620,405
(7.32 %)
44,933
(1.77 %)
26,268
(0.85 %)
288 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1
71,254
(7.50 %)
n/a 16,674
(1.63 %)
52,903
(4.12 %)
101,896
(6.64 %)
38.24
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,155,823
(4.90 %)
1,363,316
(12.23 %)
7,667,721
(47.23 %)
0
(0 %)
1,394,951
(7.13 %)
48,358
(1.88 %)
24,894
(0.73 %)
289 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1
n/a 27,999
(3.29 %)
16,698
(1.62 %)
62,818
(5.14 %)
74,339
(6.58 %)
38.41
(99.99 %)
0
(0 %)
334
(0.01 %)
195
(100.00 %)
1,194,830
(5.04 %)
1,460,981
(11.81 %)
7,590,179
(47.66 %)
2
(0.00 %)
1,437,937
(7.51 %)
50,533
(2.46 %)
25,088
(0.72 %)
290 Midas cichlid (2014)
GCA_000751415.1
n/a n/a 15,067
(2.44 %)
45,263
(5.54 %)
n/a 40.74
(92.95 %)
617,558
(7.14 %)
617,558
(7.14 %)
624,195
(92.86 %)
867,309
(14.82 %)
199,669
(1.16 %)
5,215,762
(25.14 %)
799
(0.04 %)
65,413
(0.78 %)
13,920
(0.64 %)
9,746
(0.44 %)
291 milkfish (2019)
GCF_902362185.1
30,812
(7.61 %)
n/a 16,869
(3.41 %)
21,377
(6.58 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
0
(0 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
958,774
(8.18 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
2
(0.01 %)
611,774
(5.32 %)
22,089
(1.27 %)
14,000
(0.76 %)
292 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1
n/a n/a 16,565
(3.38 %)
42,094
(6.75 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,392
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
0
(0 %)
595,219
(5.37 %)
21,531
(1.27 %)
13,616
(0.75 %)
293 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1
n/a n/a 17,701
(1.62 %)
73,433
(5.69 %)
n/a 42.20
(99.98 %)
14
(0.00 %)
1,398
(0.02 %)
388
(100.00 %)
6,438,444
(40.32 %)
1,202,669
(11.51 %)
7,055,665
(47.04 %)
6
(0.00 %)
1,343,489
(8.04 %)
74,954
(3.44 %)
26,325
(0.98 %)
294 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1
n/a n/a 15,176
(3.17 %)
47,458
(7.48 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
0
(0 %)
927
(0.02 %)
486
(100.00 %)
1,167,409
(26.98 %)
438,114
(8.08 %)
3,351,987
(27.25 %)
3
(0.00 %)
441,989
(4.98 %)
45,298
(3.39 %)
29,915
(1.90 %)
295 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1
n/a n/a 14,480
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
0
(0 %)
936
(0.02 %)
725
(100.00 %)
1,101,582
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,480
(27.08 %)
5
(0.00 %)
417,783
(4.94 %)
42,657
(3.44 %)
28,222
(1.89 %)
296 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCF_023349555.1
40,276
(12.25 %)
n/a 14,478
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
936
(0.02 %)
936
(0.02 %)
1,660
(99.98 %)
1,101,578
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,428
(27.08 %)
5
(0.00 %)
417,783
(4.94 %)
42,657
(3.44 %)
28,222
(1.89 %)
297 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1
53,100
(12.11 %)
n/a 14,672
(2.71 %)
27,552
(6.74 %)
n/a 39.02
(99.85 %)
0
(0 %)
229
(0.15 %)
68
(100.00 %)
305,761
(2.11 %)
134,157
(2.14 %)
4,687,726
(28.26 %)
0
(0 %)
131,318
(1.99 %)
33,082
(2.28 %)
23,755
(1.34 %)
298 mormyrid electric fish (MSU_618 2025)
GCF_048594095.1
77,155
(10.70 %)
n/a 16,413
(2.24 %)
85,893
(7.33 %)
n/a 43.96
(100.00 %)
0
(0 %)
249
(0.00 %)
407
(100.00 %)
447,893
(2.43 %)
464,565
(9.46 %)
3,801,201
(29.32 %)
5
(0.00 %)
630,085
(5.94 %)
93,225
(5.54 %)
66,518
(3.04 %)
299 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1
41,183
(7.38 %)
39,253
(6.58 %)
14,602
(1.92 %)
57,194
(5.03 %)
35,597
(6.40 %)
40.58
(91.29 %)
110,543
(8.75 %)
123,625
(8.75 %)
120,723
(91.25 %)
447,158
(2.19 %)
235,336
(1.39 %)
6,518,990
(26.03 %)
877
(0.07 %)
150,526
(1.93 %)
54,589
(2.39 %)
39,256
(1.65 %)
300 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2
56,612
(6.89 %)
n/a 15,361
(1.60 %)
69,801
(5.20 %)
n/a 40.76
(99.88 %)
0
(0 %)
2,820
(0.12 %)
1,031
(100.00 %)
636,480
(2.75 %)
392,130
(3.32 %)
7,023,777
(32.98 %)
8
(0.00 %)
517,617
(4.36 %)
81,101
(3.45 %)
45,801
(1.71 %)
301 New Zealand spotty (alternate hap 2019 genbank)
GCA_009762545.1
n/a n/a 13,566
(2.17 %)
40,774
(5.21 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,659
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
0
(0 %)
456,905
(3.99 %)
16,368
(0.83 %)
7,034
(0.33 %)
302 New Zealand spotty (primary hap 2019 genbank)
GCA_009762535.1
n/a n/a 14,609
(2.22 %)
43,262
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
468
(100.00 %)
519,324
(4.65 %)
393,329
(5.54 %)
4,522,265
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,988
(4.42 %)
18,302
(0.85 %)
8,002
(0.35 %)
303 New Zealand spotty (primary hap refseq)
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
n/a 14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,987
(4.42 %)
18,299
(0.85 %)
7,999
(0.35 %)
304 Nile tilapia
GCF_001858045.2
77,397
(10.87 %)
n/a 15,599
(1.99 %)
32,839
(6.04 %)
n/a 40.73
(99.99 %)
0
(0 %)
551
(0.01 %)
2,460
(100.00 %)
600,869
(5.40 %)
291,105
(3.17 %)
4,958,128
(31.15 %)
1
(0.00 %)
496,471
(4.91 %)
32,038
(1.81 %)
17,948
(0.88 %)
305 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1
n/a n/a 13,050
(3.93 %)
44,650
(10.12 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,934
(100.00 %)
512,583
(14.83 %)
156,305
(8.46 %)
2,005,803
(27.09 %)
0
(0 %)
153,928
(3.57 %)
59,674
(9.19 %)
38,546
(4.50 %)
306 ninespine stickleback (NSP_V7 2020)
GCF_902500615.1
51,166
(15.31 %)
n/a 14,765
(3.99 %)
49,191
(9.80 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
0
(0 %)
341
(0.01 %)
1,667
(100.00 %)
380,357
(3.60 %)
188,301
(6.29 %)
2,422,266
(25.70 %)
1
(0.00 %)
285,108
(4.45 %)
72,584
(9.69 %)
45,847
(4.62 %)
307 ninespine stickleback (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316345.1
n/a n/a 14,600
(3.83 %)
49,927
(9.98 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
175
(100.00 %)
599,088
(14.68 %)
186,747
(10.27 %)
2,273,942
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
308 ninespine stickleback (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316345.1
57,816
(15.11 %)
n/a 14,598
(3.83 %)
49,473
(9.87 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
174
(100.00 %)
599,085
(14.68 %)
186,746
(10.27 %)
2,273,889
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
309 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1
51,085
(7.42 %)
n/a 15,809
(2.17 %)
43,728
(4.54 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 48
(100.00 %)
2,472,286
(44.73 %)
560,123
(5.68 %)
6,203,876
(38.64 %)
0
(0 %)
436,624
(3.73 %)
42,187
(2.72 %)
22,226
(1.23 %)
310 North African catfish (Netherlands MV-2021 alternate hap 2022)
GCA_024256465.1
n/a n/a 15,704
(2.16 %)
43,094
(4.57 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
6
(0.00 %)
115
(0.01 %)
104
(100.00 %)
1,034,605
(5.50 %)
566,093
(5.52 %)
6,229,176
(38.50 %)
0
(0 %)
411,376
(3.47 %)
41,022
(2.53 %)
19,339
(0.83 %)
311 North African catfish (Netherlands MV-2021 primary hap 2022)
GCA_024256435.1
n/a n/a 15,762
(2.12 %)
43,732
(4.51 %)
n/a 38.98
(100.00 %)
159
(0.00 %)
180
(0.00 %)
278
(100.00 %)
1,071,044
(5.64 %)
581,680
(6.16 %)
6,228,783
(39.01 %)
0
(0 %)
442,882
(3.77 %)
42,159
(2.70 %)
19,632
(0.84 %)
312 northern cavefish (hap1 2024)
GCA_046255685.1
n/a n/a 14,295
(2.22 %)
50,623
(6.07 %)
n/a 42.09
(99.99 %)
0
(0 %)
466
(0.01 %)
892
(100.00 %)
1,941,831
(49.35 %)
650,256
(17.85 %)
3,210,410
(44.77 %)
0
(0 %)
978,430
(8.94 %)
55,251
(4.79 %)
22,975
(1.21 %)
313 northern cavefish (hap2 2024)
GCA_046255725.1
n/a n/a 14,542
(2.12 %)
51,650
(5.81 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
0
(0 %)
484
(0.01 %)
667
(100.00 %)
2,014,967
(51.82 %)
755,698
(19.90 %)
3,290,098
(47.08 %)
2
(0.00 %)
1,137,534
(9.59 %)
57,881
(4.66 %)
23,926
(1.32 %)
314 northern pike
GCF_004634155.1
66,376
(9.11 %)
n/a 16,778
(2.37 %)
27,040
(5.41 %)
n/a 42.29
(99.99 %)
97
(0.00 %)
584
(0.01 %)
908
(100.00 %)
1,065,458
(31.14 %)
531,451
(7.80 %)
4,677,366
(33.26 %)
2
(0.00 %)
661,503
(5.13 %)
44,793
(2.82 %)
22,750
(1.05 %)
315 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1
n/a n/a 11,782
(2.41 %)
40,748
(5.68 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
0
(0 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,818
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
0
(0 %)
427,649
(4.54 %)
29,687
(2.57 %)
15,714
(1.07 %)
316 northern pike (primary hap 2020 refseq)
GCF_011004845.1
63,720
(9.28 %)
n/a 16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,941
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
0
(0 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
1
(0.00 %)
602,569
(4.43 %)
42,910
(2.52 %)
22,099
(1.02 %)
317 northern snakehead (prfri 2023)
GCF_033026475.1
61,639
(13.32 %)
n/a 15,131
(2.87 %)
35,444
(5.74 %)
n/a 39.76
(100.00 %)
0
(0 %)
52
(0.00 %)
291
(100.00 %)
830,033
(26.45 %)
152,304
(8.77 %)
3,778,846
(29.39 %)
0
(0 %)
257,843
(3.63 %)
8,436
(0.70 %)
6,325
(0.37 %)
318 ocellated dragonet (captive hap1 2024)
GCA_044231665.1
n/a n/a 13,787
(3.68 %)
60,819
(10.07 %)
n/a 45.42
(100.00 %)
1
(0.00 %)
99
(0.00 %)
108
(100.00 %)
259,874
(3.38 %)
94,885
(3.76 %)
2,302,967
(21.04 %)
2
(0.00 %)
145,739
(2.25 %)
58,433
(13.25 %)
46,364
(6.81 %)
319 ocellated dragonet (captive hap2 2024)
GCA_044231645.1
n/a n/a 13,709
(3.65 %)
60,517
(9.98 %)
n/a 45.43
(100.00 %)
0
(0 %)
111
(0.00 %)
129
(100.00 %)
272,479
(3.57 %)
101,623
(4.29 %)
2,384,412
(21.91 %)
0
(0 %)
158,467
(2.41 %)
58,256
(13.22 %)
45,677
(6.65 %)
320 Old Calabar mormyrid (PKING1 2018)
GCF_002872115.1
61,915
(11.48 %)
n/a 15,987
(2.73 %)
33,963
(6.66 %)
n/a 43.93
(92.03 %)
0
(0 %)
49,579
(7.99 %)
4,666
(100.00 %)
348,463
(2.27 %)
314,129
(2.95 %)
4,259,711
(20.83 %)
2,738
(0.27 %)
166,566
(1.74 %)
76,846
(4.18 %)
58,953
(2.91 %)
321 old wife E.armatus (hap1 2024)
GCF_043641665.1
32,231
(8.81 %)
n/a 15,382
(3.41 %)
41,015
(7.24 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
114
(0.00 %)
136
(100.00 %)
1,143,877
(18.90 %)
219,801
(2.87 %)
3,652,133
(23.09 %)
3
(0.00 %)
154,745
(1.82 %)
19,721
(1.34 %)
13,176
(0.82 %)
322 old wife E.armatus (hap2 2024)
GCA_043640875.1
n/a n/a 15,360
(3.42 %)
41,012
(7.26 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
94
(100.00 %)
438,416
(3.46 %)
219,275
(2.83 %)
3,623,998
(22.85 %)
4
(0.00 %)
154,824
(1.82 %)
19,710
(1.32 %)
13,334
(0.83 %)
323 orangethroat darter
GCF_008692095.1
55,448
(8.29 %)
n/a 15,000
(2.25 %)
49,918
(5.41 %)
n/a 40.91
(99.57 %)
0
(0 %)
101,221
(0.47 %)
3,119
(100.00 %)
566,915
(3.75 %)
509,018
(6.60 %)
5,142,090
(31.18 %)
204
(0.00 %)
644,640
(5.47 %)
26,702
(1.46 %)
14,294
(0.76 %)
324 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
n/a 15,761
(1.50 %)
31,563
(4.00 %)
59,905
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
0
(0 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,257,250
(5.57 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
0
(0 %)
1,304,958
(6.34 %)
29,320
(0.87 %)
15,066
(0.43 %)
325 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1
n/a n/a 14,018
(1.51 %)
45,251
(3.61 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,393
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
1
(0.00 %)
888,596
(5.23 %)
22,522
(0.77 %)
12,193
(0.40 %)
326 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1
68,792
(8.54 %)
n/a 17,223
(2.28 %)
49,697
(5.11 %)
n/a 38.10
(99.99 %)
0
(0 %)
614
(0.01 %)
358
(100.00 %)
2,925,549
(40.35 %)
402,676
(5.35 %)
5,933,365
(45.71 %)
2
(0.00 %)
792,756
(5.74 %)
56,843
(3.18 %)
21,760
(0.91 %)
327 oriental weatherfish (2024)
GCF_027580225.2
72,545
(8.62 %)
n/a 17,655
(2.31 %)
50,007
(4.93 %)
n/a 38.17
(100.00 %)
0
(0 %)
110
(0.00 %)
61
(100.00 %)
446,769
(2.37 %)
424,953
(7.13 %)
6,268,308
(45.46 %)
0
(0 %)
918,484
(6.24 %)
53,150
(3.31 %)
20,975
(0.86 %)
328 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap1 2025)
GCA_048544215.1
n/a n/a 14,679
(2.30 %)
51,447
(6.15 %)
n/a 44.09
(99.99 %)
0
(0 %)
1,177
(0.01 %)
180
(100.00 %)
1,452,983
(14.50 %)
1,649,878
(17.81 %)
4,184,643
(38.57 %)
5
(0.00 %)
1,240,109
(8.81 %)
36,016
(2.07 %)
20,732
(1.08 %)
329 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap2 2025)
GCA_048544225.1
n/a n/a 15,600
(2.30 %)
54,714
(6.21 %)
n/a 43.99
(99.99 %)
0
(0 %)
1,132
(0.01 %)
184
(100.00 %)
1,505,689
(14.07 %)
1,691,834
(17.30 %)
4,407,291
(38.23 %)
5
(0.00 %)
1,262,019
(8.51 %)
38,205
(2.14 %)
21,645
(1.07 %)
330 oyster pompano (Australia AG129_WGS33_773 2025)
GCF_046630095.1
60,285
(14.61 %)
n/a 15,290
(2.96 %)
42,088
(6.53 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 150
(100.00 %)
534,470
(3.96 %)
267,099
(3.88 %)
4,094,899
(24.75 %)
0
(0 %)
174,208
(2.68 %)
14,784
(1.60 %)
9,402
(0.55 %)
331 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1
40,001
(9.36 %)
n/a 14,904
(2.72 %)
24,732
(5.87 %)
n/a 40.60
(84.20 %)
60,817
(15.83 %)
60,817
(15.83 %)
68,050
(84.17 %)
306,171
(3.27 %)
124,292
(0.75 %)
4,414,831
(20.66 %)
1,574
(0.10 %)
36,249
(0.53 %)
18,455
(0.96 %)
13,214
(0.68 %)
332 Pacific cod (2023)
GCF_031168955.1
49,430
(13.67 %)
n/a 13,542
(2.89 %)
64,214
(9.77 %)
n/a 45.55
(99.92 %)
0
(0 %)
4,826
(0.09 %)
24
(100.00 %)
1,117,561
(38.30 %)
685,851
(13.38 %)
2,330,116
(34.15 %)
16
(0.00 %)
539,494
(6.49 %)
87,761
(8.68 %)
51,521
(4.16 %)
333 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1
48,776
(12.61 %)
n/a 14,747
(3.15 %)
45,075
(7.30 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
219
(0.00 %)
120
(100.00 %)
410,917
(4.22 %)
246,500
(4.66 %)
3,680,698
(25.23 %)
0
(0 %)
251,625
(3.22 %)
31,508
(2.30 %)
20,928
(1.36 %)
334 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2
46,697
(12.50 %)
n/a 14,862
(3.15 %)
45,824
(7.30 %)
n/a 42.17
(99.95 %)
0
(0 %)
1,131
(0.05 %)
53
(100.00 %)
407,699
(3.94 %)
247,330
(3.84 %)
3,838,896
(24.75 %)
2
(0.00 %)
279,152
(3.23 %)
31,782
(2.27 %)
21,208
(1.36 %)
335 Pacific saury (AMF1-May2022 2023)
GCF_033807715.1
54,344
(6.52 %)
n/a 15,214
(1.67 %)
74,345
(6.13 %)
n/a 41.49
(99.96 %)
0
(0 %)
900
(0.04 %)
759
(100.00 %)
805,776
(5.16 %)
849,901
(11.48 %)
4,645,552
(43.92 %)
1
(0.00 %)
1,333,479
(8.06 %)
106,026
(5.14 %)
39,496
(1.50 %)
336 panther danio (primary hap 2020)
GCF_903798145.1
40,657
(5.52 %)
n/a 17,858
(2.46 %)
42,119
(3.16 %)
n/a 36.32
(98.82 %)
0
(0 %)
1,821
(1.18 %)
342
(100.00 %)
3,973,354
(56.67 %)
940,639
(7.81 %)
8,701,639
(50.54 %)
3
(0.00 %)
1,057,465
(5.16 %)
29,684
(1.18 %)
10,646
(0.30 %)
337 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1
n/a n/a 15,421
(1.80 %)
62,324
(6.15 %)
n/a 42.79
(99.90 %)
4,955
(0.10 %)
4,955
(0.10 %)
4,978
(99.90 %)
4,032,523
(34.18 %)
982,411
(16.51 %)
5,189,655
(46.47 %)
55
(0.01 %)
1,303,532
(10.00 %)
64,543
(3.14 %)
28,282
(1.35 %)
338 parallel lanternfish (primary hap 2024)
GCA_964188405.1
n/a n/a 16,917
(1.64 %)
72,190
(5.85 %)
n/a 42.91
(99.96 %)
0
(0 %)
2,729
(0.04 %)
24
(100.00 %)
4,976,327
(35.08 %)
1,258,755
(18.52 %)
6,268,804
(48.21 %)
12
(0.00 %)
1,744,372
(10.22 %)
81,193
(3.23 %)
34,135
(1.37 %)
339 Patagonian blennie (Puerto Natales JMC-PN-2008 2024)
GCF_036324505.1
42,701
(12.59 %)
n/a 14,986
(3.15 %)
46,289
(7.75 %)
n/a 40.99
(99.97 %)
0
(0 %)
380
(0.03 %)
27
(100.00 %)
1,031,762
(25.30 %)
219,393
(4.63 %)
3,436,780
(25.57 %)
0
(0 %)
225,847
(2.56 %)
16,570
(1.12 %)
10,155
(0.63 %)
340 pejerrey (hap1 2023 genbank)
GCA_027942865.1
n/a n/a 15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
0
(0 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
975,354
(15.76 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,904
(35.09 %)
1
(0.00 %)
865,727
(6.60 %)
49,121
(3.07 %)
20,467
(0.93 %)
341 pejerrey (hap1 2023 refseq)
GCF_027942865.1
47,443
(8.28 %)
n/a 15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
0
(0 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
440,063
(2.87 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,808
(35.09 %)
1
(0.00 %)
865,731
(6.60 %)
49,121
(3.07 %)
20,467
(0.93 %)
342 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1
n/a n/a 15,317
(2.02 %)
61,647
(6.35 %)
n/a 41.37
(99.99 %)
135
(0.01 %)
135
(0.01 %)
469
(99.99 %)
981,519
(15.40 %)
319,637
(12.45 %)
3,706,473
(36.77 %)
0
(0 %)
952,761
(6.98 %)
50,353
(2.98 %)
20,537
(0.91 %)
343 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1
n/a n/a 16,729
(3.56 %)
56,451
(8.61 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
11
(0.00 %)
11
(0.00 %)
5,701
(100.00 %)
1,153,359
(18.94 %)
829,887
(14.54 %)
2,793,018
(28.79 %)
0
(0 %)
721,904
(6.97 %)
49,469
(4.32 %)
33,228
(2.53 %)
344 peladilla (primary hap 2021)
GCA_017639675.1
n/a n/a 13,829
(3.83 %)
41,932
(8.64 %)
n/a 45.01
(98.24 %)
0
(0 %)
1,158
(1.77 %)
41
(100.00 %)
930,246
(18.49 %)
660,569
(13.71 %)
2,316,198
(27.66 %)
6
(0.00 %)
537,418
(6.48 %)
41,023
(4.40 %)
27,287
(2.49 %)
345 pencil smelt N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1
n/a n/a 17,996
(2.00 %)
89,591
(7.93 %)
n/a 45.22
(99.94 %)
0
(0 %)
3,299
(0.06 %)
1,177
(100.00 %)
2,828,457
(30.93 %)
1,676,413
(19.87 %)
4,137,400
(48.69 %)
14
(0.00 %)
1,929,538
(11.96 %)
78,669
(4.37 %)
29,960
(1.34 %)
346 picturesque dragonet (SynPic1 hap1 2024)
GCA_044231685.1
n/a n/a 13,827
(3.46 %)
53,000
(8.90 %)
n/a 43.38
(100.00 %)
9
(0.00 %)
122
(0.00 %)
364
(100.00 %)
222,800
(3.83 %)
105,428
(7.84 %)
2,500,710
(25.24 %)
1
(0.00 %)
280,578
(4.01 %)
41,125
(5.45 %)
32,953
(3.58 %)
347 picturesque dragonet (SynPic1 hap2 2024)
GCA_044231675.1
n/a n/a 13,816
(3.52 %)
52,689
(9.01 %)
n/a 43.48
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
300
(100.00 %)
223,762
(3.25 %)
105,291
(6.28 %)
2,579,336
(24.55 %)
0
(0 %)
233,535
(3.55 %)
41,114
(5.50 %)
32,452
(3.61 %)
348 pike-perch
GCF_008315115.2
65,418
(8.54 %)
n/a 15,731
(2.23 %)
52,240
(5.69 %)
n/a 40.87
(99.98 %)
0
(0 %)
711
(0.02 %)
337
(100.00 %)
629,999
(5.16 %)
567,578
(7.41 %)
4,697,709
(36.49 %)
3
(0.00 %)
784,659
(5.34 %)
39,666
(1.93 %)
12,855
(0.60 %)
349 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
n/a 15,738
(2.42 %)
26,691
(5.69 %)
57,069
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
0
(0 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,063,888
(5.90 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
0
(0 %)
374,590
(3.12 %)
41,636
(2.04 %)
21,488
(0.92 %)
350 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1
n/a n/a 15,563
(2.38 %)
54,264
(6.19 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,418
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
0
(0 %)
338,770
(2.89 %)
40,331
(2.02 %)
21,223
(0.93 %)
351 pink cusk-eel (Tasmania CSIRO-AG114 2024)
GCF_046128005.1
40,370
(14.18 %)
n/a 14,305
(3.83 %)
42,250
(9.00 %)
n/a 44.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 598
(100.00 %)
544,423
(6.21 %)
349,202
(8.94 %)
2,573,015
(26.48 %)
0
(0 %)
304,436
(4.82 %)
39,781
(3.80 %)
23,165
(1.89 %)
352 pink salmon
GCF_021184085.1
91,140
(4.89 %)
n/a 27,187
(1.37 %)
124,120
(3.88 %)
n/a 44.28
(99.96 %)
3,528
(0.01 %)
5,213
(0.04 %)
22,556
(99.99 %)
1,343,135
(0.00 %)
2,906,520
(28.95 %)
10,882,087
(57.26 %)
21
(0.00 %)
6,152,465
(12.38 %)
97,805
(3.04 %)
20,791
(0.34 %)
353 ploughfish
GCF_902827175.1
50,551
(7.66 %)
n/a 14,699
(1.83 %)
66,348
(6.06 %)
62,492
(5.74 %)
41.52
(99.98 %)
0
(0 %)
1,569
(0.02 %)
2,618
(100.00 %)
467,937
(3.05 %)
412,361
(6.64 %)
3,498,382
(45.08 %)
10
(0.00 %)
623,734
(5.21 %)
73,879
(3.55 %)
14,738
(0.64 %)
354 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1
n/a n/a 14,050
(2.77 %)
63,249
(8.86 %)
n/a 45.41
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,970
(100.00 %)
708,455
(9.71 %)
797,241
(15.67 %)
2,785,159
(33.18 %)
0
(0 %)
613,051
(6.69 %)
78,151
(7.95 %)
45,924
(3.34 %)
355 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1
n/a n/a 14,126
(2.81 %)
61,907
(8.75 %)
n/a 45.67
(99.94 %)
0
(0 %)
1,810
(0.06 %)
616
(100.00 %)
753,034
(10.17 %)
850,189
(15.72 %)
2,888,555
(33.70 %)
7
(0.00 %)
642,528
(6.84 %)
80,883
(8.43 %)
46,894
(3.34 %)
356 pond loach (2024)
GCF_030506205.2
63,171
(8.66 %)
n/a 17,091
(2.42 %)
45,877
(5.02 %)
n/a 38.27
(99.98 %)
0
(0 %)
1,120
(0.02 %)
220
(100.00 %)
409,390
(2.50 %)
390,110
(8.52 %)
5,401,936
(44.65 %)
0
(0 %)
924,447
(7.32 %)
52,115
(4.00 %)
17,962
(0.80 %)
357 predatory carp (Z2021 2022)
GCF_024489055.1
56,688
(7.63 %)
n/a 17,670
(2.67 %)
54,522
(5.25 %)
n/a 37.95
(100.00 %)
0
(0 %)
181
(0.00 %)
51
(100.00 %)
3,087,358
(61.37 %)
553,846
(7.14 %)
6,036,124
(43.52 %)
2
(0.00 %)
738,916
(5.65 %)
47,942
(3.56 %)
13,183
(0.50 %)
358 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
n/a 14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
0
(0 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
3
(0.00 %)
1,746,915
(7.91 %)
172,199
(5.45 %)
18,080
(0.31 %)
359 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1
n/a n/a 10,944
(0.64 %)
59,123
(2.21 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,336
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
0
(0 %)
1,101,423
(6.43 %)
125,285
(5.42 %)
13,610
(0.32 %)
360 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1
n/a n/a 15,639
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
0
(0 %)
1,907
(0.07 %)
365
(100.00 %)
1,655,350
(30.53 %)
511,512
(12.09 %)
2,015,264
(35.19 %)
4
(0.00 %)
468,697
(7.41 %)
32,410
(4.33 %)
18,662
(1.57 %)
361 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCF_038355195.1
39,606
(12.43 %)
n/a 15,641
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
0
(0 %)
1,907
(0.07 %)
366
(100.00 %)
1,655,356
(30.53 %)
511,513
(12.09 %)
2,015,303
(35.19 %)
4
(0.00 %)
468,697
(7.41 %)
32,410
(4.33 %)
18,662
(1.57 %)
362 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2
119,271
(6.51 %)
n/a 27,513
(1.62 %)
109,524
(4.38 %)
138,073
(5.21 %)
43.45
(99.74 %)
196
(0.00 %)
486
(0.26 %)
939
(100.00 %)
1,537,455
(7.32 %)
2,083,211
(23.10 %)
10,092,840
(53.71 %)
5
(0.00 %)
4,526,931
(11.46 %)
73,586
(2.16 %)
18,220
(0.32 %)
363 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1
79,286
(6.41 %)
78,807
(5.45 %)
25,179
(1.70 %)
98,339
(4.18 %)
115,853
(5.33 %)
42.67
(88.52 %)
7,839
(0.04 %)
427,894
(11.54 %)
139,800
(99.96 %)
1,332,141
(5.52 %)
1,604,760
(8.18 %)
9,451,984
(44.00 %)
31,141
(1.22 %)
1,638,788
(9.94 %)
56,604
(1.05 %)
14,470
(0.23 %)
364 Rankin cod (hap1 2025)
GCA_048129235.1
n/a n/a 15,661
(1.94 %)
54,906
(5.30 %)
n/a 41.36
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
386
(100.00 %)
591,994
(2.64 %)
396,424
(6.16 %)
6,144,028
(31.24 %)
0
(0 %)
569,694
(4.19 %)
24,792
(1.05 %)
12,339
(0.46 %)
365 Rankin cod (hap2 2025)
GCA_048129065.1
n/a n/a 15,830
(2.03 %)
54,183
(5.34 %)
n/a 41.30
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
199
(100.00 %)
2,922,062
(42.12 %)
374,226
(5.08 %)
6,124,255
(30.17 %)
2
(0.00 %)
488,334
(3.77 %)
24,493
(0.98 %)
12,327
(0.46 %)
366 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1
72,004
(5.94 %)
n/a 27,195
(1.88 %)
81,269
(3.63 %)
n/a 39.59
(99.96 %)
0
(0 %)
1,873
(0.04 %)
1,746
(100.00 %)
7,035,382
(51.89 %)
1,021,269
(5.98 %)
12,768,853
(46.85 %)
1
(0.00 %)
1,492,285
(4.74 %)
109,185
(4.70 %)
33,199
(0.66 %)
367 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1
n/a n/a 15,655
(3.01 %)
47,717
(6.87 %)
n/a 40.98
(95.57 %)
0
(0 %)
11,577
(4.42 %)
34,462
(100.00 %)
470,579
(3.16 %)
231,051
(1.91 %)
4,345,700
(23.24 %)
1,006
(0.10 %)
102,380
(1.25 %)
20,149
(1.25 %)
12,381
(0.71 %)
368 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1
n/a n/a 4,539
(2.01 %)
14,061
(4.35 %)
n/a 40.48
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,751
(100.00 %)
759,605
(49.59 %)
161,693
(7.99 %)
1,684,737
(29.93 %)
0
(0 %)
232,319
(5.07 %)
7,525
(1.31 %)
4,853
(0.81 %)
369 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1
47,129
(6.06 %)
n/a 17,089
(1.80 %)
33,378
(4.02 %)
n/a 40.45
(97.38 %)
42,102
(2.59 %)
62,964
(2.59 %)
325,620
(97.41 %)
898,445
(4.81 %)
863,000
(6.48 %)
7,757,382
(34.74 %)
2,457
(0.19 %)
n/a 34,329
(1.24 %)
22,250
(0.80 %)
370 red-bellied piranha (primary hap 2020)
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
n/a 16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
76,011
(5.65 %)
40.58
(99.17 %)
0
(0 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
2
(0.00 %)
1,005,141
(5.14 %)
33,087
(1.38 %)
20,822
(0.79 %)
371 redfish (Tasmania AG114_WGS23_722 - 3 2025)
GCF_046629955.1
37,802
(8.56 %)
n/a 16,430
(2.60 %)
56,127
(6.62 %)
n/a 42.14
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,232
(100.00 %)
1,061,195
(9.52 %)
653,833
(5.90 %)
4,595,588
(30.15 %)
0
(0 %)
442,552
(3.60 %)
38,922
(2.20 %)
23,086
(1.11 %)
372 red seabream (2024)
GCF_040436345.1
36,326
(8.73 %)
n/a 15,416
(2.51 %)
50,764
(6.70 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
0
(0 %)
278
(0.00 %)
25
(100.00 %)
474,006
(3.07 %)
322,892
(6.05 %)
4,847,143
(26.99 %)
4
(0.00 %)
360,084
(3.51 %)
23,370
(1.27 %)
14,635
(0.74 %)
373 reedfish (2021)
GCF_900747795.2
44,478
(2.01 %)
n/a 13,108
(0.46 %)
23,157
(1.29 %)
n/a 39.37
(99.18 %)
0
(0 %)
1,431
(0.82 %)
169
(100.00 %)
8,636,520
(39.34 %)
1,069,643
(2.91 %)
19,980,572
(47.52 %)
17
(0.00 %)
1,256,071
(2.69 %)
89,023
(1.13 %)
22,697
(0.30 %)
374 reedfish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900700845.2
n/a n/a 9,950
(0.37 %)
31,611
(1.22 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
38,598
(100.00 %)
1,300,565
(2.57 %)
685,834
(2.21 %)
14,691,576
(45.66 %)
0
(0 %)
588,794
(1.83 %)
63,365
(1.11 %)
17,365
(0.32 %)
375 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1
56,261
(13.18 %)
n/a 14,197
(2.71 %)
45,193
(6.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
157
(100.00 %)
941,095
(17.66 %)
238,999
(5.27 %)
4,283,692
(41.06 %)
0
(0 %)
191,618
(2.49 %)
43,014
(4.07 %)
25,748
(1.58 %)
376 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2
25,353
(3.88 %)
n/a 14,334
(1.56 %)
137,348
(9.74 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
0
(0 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
635,526
(3.14 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
7,501
(0.17 %)
424,697
(2.96 %)
52,308
(2.11 %)
22,130
(0.71 %)
377 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2
n/a n/a 27,928
(1.66 %)
110,791
(4.44 %)
n/a 43.36
(96.90 %)
0
(0 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
4,690,842
(57.30 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,763
(52.37 %)
2
(0.00 %)
3,475,805
(8.76 %)
70,821
(1.77 %)
19,956
(0.39 %)
378 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1
n/a n/a 18,165
(2.73 %)
62,580
(6.00 %)
n/a 38.74
(100.00 %)
6
(0.00 %)
6
(0.00 %)
4,612
(100.00 %)
2,483,904
(48.29 %)
584,363
(7.55 %)
5,582,076
(40.38 %)
0
(0 %)
923,875
(6.53 %)
60,229
(3.53 %)
19,604
(0.82 %)
379 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1
n/a n/a 18,132
(2.65 %)
63,523
(6.01 %)
n/a 38.80
(99.99 %)
1
(0.00 %)
471
(0.01 %)
86
(100.00 %)
2,613,900
(48.90 %)
625,102
(8.21 %)
5,738,444
(41.24 %)
1
(0.00 %)
1,070,552
(7.36 %)
65,328
(3.68 %)
20,458
(0.81 %)
380 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2
n/a n/a 15,291
(3.29 %)
45,865
(7.56 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,165
(100.00 %)
1,131,154
(25.69 %)
269,583
(5.08 %)
3,371,712
(24.64 %)
0
(0 %)
249,009
(3.21 %)
36,810
(2.68 %)
27,636
(1.84 %)
381 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2
n/a n/a 15,181
(3.34 %)
44,153
(7.53 %)
51,135
(7.40 %)
42.31
(99.98 %)
0
(0 %)
418
(0.02 %)
101
(100.00 %)
1,121,704
(25.48 %)
269,467
(4.88 %)
3,358,709
(24.69 %)
5
(0.00 %)
255,676
(3.48 %)
36,987
(3.02 %)
28,368
(1.91 %)
382 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1
52,514
(8.81 %)
n/a 17,664
(3.05 %)
48,403
(5.24 %)
n/a 36.06
(83.93 %)
0
(0 %)
5,144
(16.07 %)
2,870
(100.00 %)
2,600,095
(49.94 %)
683,499
(4.34 %)
6,000,462
(35.96 %)
5
(0.00 %)
444,046
(3.07 %)
33,741
(1.62 %)
19,239
(0.70 %)
383 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1
n/a n/a 15,434
(2.01 %)
44,991
(4.63 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
192
(0.00 %)
302
(100.00 %)
2,506,810
(40.54 %)
613,867
(8.67 %)
5,070,851
(48.32 %)
1
(0.00 %)
1,210,760
(8.82 %)
46,071
(2.57 %)
27,461
(1.23 %)
384 rouch bullseye (RE-2024b hap1 2024 refseq)
GCF_042242105.1
32,256
(9.05 %)
n/a 15,283
(3.03 %)
44,299
(6.93 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
87
(0.00 %)
441
(100.00 %)
1,115,191
(21.73 %)
271,391
(5.93 %)
3,651,073
(24.53 %)
2
(0.00 %)
299,227
(3.11 %)
19,771
(1.39 %)
13,537
(0.81 %)
385 rough bullseye (RE-2024b hap2 2024)
GCA_042242125.1
n/a n/a 14,475
(2.89 %)
44,413
(7.11 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
0
(0 %)
93
(0.00 %)
84
(100.00 %)
1,762,151
(30.90 %)
262,291
(5.80 %)
3,580,461
(24.37 %)
10
(0.00 %)
296,317
(3.16 %)
19,851
(1.40 %)
14,202
(0.86 %)
386 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1
n/a n/a 17,895
(2.55 %)
64,448
(5.84 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
0
(0 %)
418
(0.01 %)
110
(100.00 %)
2,661,155
(49.83 %)
673,071
(10.59 %)
5,755,954
(42.48 %)
1
(0.00 %)
1,108,306
(7.28 %)
66,952
(4.46 %)
21,217
(0.87 %)
387 rudd (fScaEry2.hap1.1 2024)
GCA_964197995.1
n/a n/a 18,254
(2.38 %)
68,852
(5.71 %)
n/a 39.02
(99.99 %)
4
(0.00 %)
836
(0.01 %)
759
(100.00 %)
2,854,977
(51.13 %)
754,287
(11.81 %)
5,942,764
(44.17 %)
2
(0.00 %)
1,392,734
(8.61 %)
72,686
(4.52 %)
23,184
(0.94 %)
388 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1
34,548
(9.49 %)
n/a 15,280
(3.00 %)
46,259
(6.95 %)
n/a 40.45
(99.99 %)
719
(0.01 %)
723
(0.01 %)
8,212
(99.99 %)
1,335,152
(28.19 %)
415,384
(6.53 %)
3,948,379
(27.81 %)
2
(0.00 %)
416,856
(4.21 %)
22,854
(1.61 %)
17,357
(1.05 %)
389 sailfin molly
GCF_001443285.1
53,986
(11.41 %)
n/a 15,048
(2.71 %)
33,482
(6.71 %)
n/a 39.18
(83.41 %)
36,637
(16.61 %)
41,735
(16.61 %)
54,623
(83.39 %)
357,919
(2.18 %)
189,502
(1.23 %)
4,873,063
(22.51 %)
1,755
(0.81 %)
87,954
(1.83 %)
34,138
(1.62 %)
26,570
(1.23 %)
390 salamanderfish (hap1 2025)
GCA_049190665.1
n/a n/a 15,661
(2.59 %)
68,929
(8.14 %)
n/a 45.02
(99.96 %)
0
(0 %)
1,365
(0.04 %)
2,987
(100.00 %)
2,234,544
(43.47 %)
1,192,255
(16.84 %)
3,383,827
(41.37 %)
24
(0.00 %)
1,076,867
(10.26 %)
108,808
(9.86 %)
61,891
(4.06 %)
391 salamanderfish (hap2 2025)
GCA_049190655.1
n/a n/a 15,427
(2.54 %)
67,522
(7.97 %)
n/a 44.96
(99.96 %)
0
(0 %)
1,366
(0.04 %)
1,559
(100.00 %)
2,195,227
(44.71 %)
1,219,658
(17.45 %)
3,319,218
(42.93 %)
30
(0.00 %)
1,133,060
(10.77 %)
108,314
(9.71 %)
61,087
(3.93 %)
392 sansaifugu (HTHZ2018 2019)
GCF_003711565.1
56,023
(20.10 %)
n/a 13,998
(4.84 %)
48,737
(11.56 %)
n/a 45.63
(99.99 %)
0
(0 %)
250
(0.01 %)
868
(100.00 %)
304,980
(15.98 %)
171,631
(4.98 %)
1,616,965
(21.60 %)
1
(0.00 %)
257,565
(5.29 %)
48,338
(9.79 %)
36,513
(5.09 %)
393 sardine (primary hap 2023 genbank)
GCA_963854185.1
n/a n/a 16,071
(2.33 %)
64,180
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
241
(100.00 %)
1,503,111
(11.74 %)
1,507,024
(15.48 %)
4,027,638
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,853
(8.48 %)
68,874
(3.56 %)
38,590
(1.78 %)
394 sardine (primary hap 2023 refseq)
GCF_963854185.1
48,146
(9.15 %)
n/a 16,069
(2.33 %)
64,178
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
240
(100.00 %)
1,503,108
(11.74 %)
1,507,022
(15.48 %)
4,027,614
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,852
(8.48 %)
68,873
(3.56 %)
38,589
(1.78 %)
395 scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023)
GCF_030265065.1
51,267
(7.00 %)
n/a 13,854
(1.32 %)
48,980
(3.46 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
0
(0 %)
9
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,805,346
(21.21 %)
512,153
(12.76 %)
6,260,589
(63.96 %)
0
(0 %)
859,332
(5.23 %)
96,908
(3.65 %)
37,320
(1.36 %)
396 sea stickleback (SK-2024b hap1 2025)
GCA_048126635.1
n/a n/a 14,310
(4.44 %)
47,336
(10.19 %)
n/a 44.83
(99.99 %)
0
(0 %)
241
(0.01 %)
38
(100.00 %)
446,827
(13.86 %)
192,599
(8.52 %)
2,033,160
(22.85 %)
1
(0.00 %)
175,997
(3.04 %)
61,012
(13.03 %)
47,420
(5.99 %)
397 sea stickleback (SK-2024b hap2 2025)
GCA_048127205.1
n/a n/a 14,237
(4.44 %)
46,701
(10.13 %)
n/a 44.75
(99.99 %)
0
(0 %)
276
(0.01 %)
52
(100.00 %)
413,494
(14.42 %)
189,429
(8.99 %)
1,996,715
(23.13 %)
3
(0.00 %)
178,781
(3.14 %)
60,252
(12.60 %)
46,667
(5.92 %)
398 Senegalese sole
GCF_019176455.1
46,446
(12.02 %)
n/a 15,155
(3.15 %)
43,828
(7.31 %)
n/a 40.92
(99.99 %)
0
(0 %)
662
(0.01 %)
1,937
(100.00 %)
522,618
(4.22 %)
317,280
(4.23 %)
4,040,245
(28.25 %)
1
(0.00 %)
268,721
(3.11 %)
26,946
(1.79 %)
16,377
(1.03 %)
399 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1
n/a n/a 14,728
(2.46 %)
62,094
(7.09 %)
n/a 42.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,847
(100.00 %)
939,151
(11.90 %)
472,983
(7.68 %)
4,326,183
(28.40 %)
0
(0 %)
486,310
(4.09 %)
64,290
(4.16 %)
42,087
(2.28 %)
400 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1
n/a n/a 15,032
(2.44 %)
62,625
(6.97 %)
n/a 42.07
(99.98 %)
0
(0 %)
598
(0.02 %)
847
(100.00 %)
967,197
(11.85 %)
498,286
(8.15 %)
4,397,828
(28.96 %)
9
(0.00 %)
531,478
(4.46 %)
65,744
(4.06 %)
42,870
(2.25 %)
401 sharptooth jobfish (hap1 2024)
GCA_045363895.1
n/a n/a 15,800
(1.77 %)
51,791
(4.52 %)
n/a 39.82
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
283
(100.00 %)
777,839
(3.19 %)
459,791
(3.90 %)
7,958,604
(35.17 %)
0
(0 %)
375,713
(2.47 %)
21,711
(0.94 %)
12,537
(0.40 %)
402 sharptooth jobfish (hap2 2024)
GCA_045363885.1
n/a n/a 15,879
(1.78 %)
51,774
(4.52 %)
n/a 39.81
(100.00 %)
0
(0 %)
76
(0.00 %)
172
(100.00 %)
778,842
(3.19 %)
462,247
(3.82 %)
7,956,116
(35.13 %)
1
(0.00 %)
374,216
(2.38 %)
21,587
(0.91 %)
12,357
(0.42 %)
403 sheepshead minnow
GCF_000732505.1
37,892
(7.02 %)
n/a 14,749
(2.02 %)
25,480
(4.66 %)
n/a 38.19
(86.93 %)
101,700
(13.10 %)
113,210
(13.10 %)
110,959
(86.90 %)
363,397
(1.88 %)
195,191
(1.43 %)
6,444,762
(27.47 %)
3,240
(0.30 %)
136,313
(1.74 %)
18,269
(0.66 %)
10,928
(0.41 %)
404 shortfin molly
GCF_001443325.1
54,473
(11.42 %)
n/a 15,104
(2.72 %)
33,717
(6.74 %)
n/a 39.23
(84.81 %)
32,496
(15.20 %)
37,507
(15.20 %)
50,598
(84.80 %)
328,347
(2.03 %)
172,112
(1.18 %)
4,876,942
(22.80 %)
1,876
(0.89 %)
88,660
(1.88 %)
34,271
(1.66 %)
26,703
(1.25 %)
405 Siamese fighting fish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1
n/a n/a 14,510
(4.12 %)
60,058
(10.77 %)
n/a 45.51
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,705
(100.00 %)
249,671
(3.68 %)
182,366
(4.87 %)
1,939,533
(22.55 %)
0
(0 %)
223,835
(4.10 %)
72,474
(13.55 %)
56,347
(7.50 %)
406 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4
59,291
(19.85 %)
n/a 14,594
(4.32 %)
55,265
(10.96 %)
n/a 45.31
(99.99 %)
0
(0 %)
321
(0.01 %)
36
(100.00 %)
384,203
(19.38 %)
175,898
(4.39 %)
1,946,630
(23.16 %)
2
(0.00 %)
209,905
(4.10 %)
70,331
(13.13 %)
54,790
(7.31 %)
407 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2
n/a n/a 14,737
(4.05 %)
61,568
(10.70 %)
n/a 45.50
(100.00 %)
108
(0.00 %)
108
(0.00 %)
3,872
(100.00 %)
392,585
(19.23 %)
190,741
(5.09 %)
1,994,824
(23.20 %)
0
(0 %)
245,925
(4.39 %)
74,259
(13.49 %)
57,619
(7.42 %)
408 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1
131,179
(9.80 %)
n/a 29,612
(2.99 %)
81,338
(5.43 %)
n/a 37.63
(99.92 %)
0
(0 %)
2,597
(0.08 %)
51
(100.00 %)
3,277,259
(45.05 %)
801,192
(7.96 %)
7,910,205
(42.51 %)
3
(0.00 %)
1,037,130
(5.68 %)
60,236
(2.18 %)
20,870
(0.55 %)
409 silver spinyfin (hap1 2025)
GCA_048569125.1
n/a n/a 16,906
(1.39 %)
115,931
(7.77 %)
n/a 44.10
(99.96 %)
0
(0 %)
3,365
(0.04 %)
5,504
(100.00 %)
4,606,608
(53.63 %)
1,428,326
(25.54 %)
4,395,832
(51.22 %)
36
(0.00 %)
3,286,557
(14.58 %)
166,807
(7.52 %)
42,772
(1.63 %)
410 silver spinyfin (hap2 2025)
GCA_048569135.1
n/a n/a 17,409
(1.14 %)
146,413
(8.24 %)
n/a 44.20
(99.96 %)
3,473
(0.04 %)
3,473
(0.04 %)
8,068
(99.96 %)
2,051,529
(14.72 %)
1,808,246
(28.36 %)
4,967,915
(54.93 %)
30
(0.00 %)
4,408,195
(15.89 %)
208,486
(7.83 %)
55,331
(1.50 %)
411 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1
n/a n/a 13,661
(1.11 %)
75,418
(4.21 %)
n/a 45.01
(99.96 %)
0
(0 %)
3,120
(0.04 %)
1,059
(100.00 %)
4,634,757
(53.53 %)
1,006,319
(17.13 %)
5,273,732
(51.16 %)
14
(0.00 %)
1,782,741
(8.47 %)
145,115
(7.59 %)
66,645
(2.19 %)
412 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1
34,018
(4.17 %)
n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
0
(0 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
17
(0.00 %)
1,796,705
(8.53 %)
143,632
(7.43 %)
65,914
(2.15 %)
413 smallmouth bass
GCF_021292245.1
55,932
(9.40 %)
n/a 15,509
(2.37 %)
49,387
(5.61 %)
n/a 40.72
(99.65 %)
0
(0 %)
34,581
(0.36 %)
15,020
(100.00 %)
445,979
(2.50 %)
249,630
(2.49 %)
5,071,015
(28.28 %)
3,470
(0.39 %)
278,594
(4.93 %)
23,875
(1.36 %)
11,538
(0.57 %)
414 snake pipefish (RoL-2023_Sb 2023)
GCF_033978785.1
57,883
(4.39 %)
n/a 15,654
(1.03 %)
72,123
(3.58 %)
n/a 38.64
(100.00 %)
0
(0 %)
2,564
(0.00 %)
424
(100.00 %)
3,149,025
(23.73 %)
1,621,410
(19.58 %)
7,534,195
(67.22 %)
1
(0.00 %)
4,080,159
(14.37 %)
122,765
(3.07 %)
51,511
(1.21 %)
415 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2
75,641
(6.10 %)
n/a 24,075
(1.71 %)
98,364
(4.30 %)
n/a 43.37
(96.15 %)
1,903
(0.01 %)
25,658
(3.85 %)
36,660
(99.99 %)
949,725
(3.53 %)
1,465,583
(10.82 %)
8,853,884
(48.52 %)
872
(0.04 %)
1,715,998
(5.18 %)
62,850
(1.45 %)
16,671
(0.36 %)
416 sockeye salmon (Pitt River 2024)
GCF_034236695.1
80,798
(5.59 %)
n/a 26,218
(1.35 %)
116,746
(3.87 %)
n/a 44.03
(99.93 %)
1,058
(0.00 %)
4,351
(0.07 %)
12,436
(100.00 %)
6,356,046
(54.95 %)
2,840,516
(31.41 %)
10,575,179
(57.52 %)
9
(0.00 %)
6,694,579
(13.15 %)
77,648
(1.61 %)
19,825
(0.33 %)
417 South Georgia icefish (v2 primary hap 2022)
GCF_902827115.2
42,862
(7.09 %)
n/a 14,776
(1.80 %)
68,955
(6.18 %)
n/a 42.07
(99.90 %)
0
(0 %)
2,603
(0.11 %)
1,563
(100.00 %)
512,600
(3.45 %)
473,958
(7.19 %)
3,590,436
(45.74 %)
20
(0.00 %)
757,296
(8.57 %)
88,970
(4.31 %)
17,944
(0.76 %)
418 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1
n/a n/a 15,727
(2.61 %)
43,177
(5.74 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 895
(100.00 %)
1,590,386
(33.53 %)
246,800
(2.86 %)
5,173,834
(26.85 %)
0
(0 %)
323,596
(3.31 %)
14,473
(0.87 %)
9,723
(0.47 %)
419 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
n/a 15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
0
(0 %)
326,254
(3.37 %)
14,097
(0.88 %)
8,860
(0.42 %)
420 southern platyfish
GCF_002775205.1
46,380
(11.15 %)
n/a 14,674
(2.66 %)
28,368
(6.82 %)
n/a 38.97
(99.53 %)
0
(0 %)
156
(0.47 %)
102
(100.00 %)
323,402
(2.76 %)
146,477
(2.33 %)
4,741,552
(28.27 %)
0
(0 %)
190,964
(2.71 %)
34,667
(2.13 %)
24,564
(1.37 %)
421 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1
74,330
(6.97 %)
n/a 30,906
(3.19 %)
55,474
(5.66 %)
n/a 37.28
(92.69 %)
168,741
(7.34 %)
168,741
(7.34 %)
254,423
(92.66 %)
1,129,104
(5.02 %)
730,197
(4.59 %)
8,910,005
(36.97 %)
1,220
(0.18 %)
542,313
(6.57 %)
64,238
(1.79 %)
28,032
(0.71 %)
422 spangled emperor (hap1 2024)
GCA_045362495.1
n/a n/a 15,554
(1.75 %)
58,641
(5.19 %)
n/a 40.59
(100.00 %)
0
(0 %)
196
(0.00 %)
226
(100.00 %)
682,449
(3.01 %)
409,809
(4.43 %)
7,114,584
(28.98 %)
6
(0.00 %)
539,832
(3.67 %)
37,214
(1.53 %)
18,727
(0.64 %)
423 spangled emperor (hap2 2024)
GCA_045362485.1
n/a n/a 15,490
(1.77 %)
57,993
(5.20 %)
n/a 40.57
(100.00 %)
0
(0 %)
244
(0.00 %)
151
(100.00 %)
677,985
(3.03 %)
408,391
(4.33 %)
7,184,861
(29.15 %)
4
(0.00 %)
529,035
(3.52 %)
36,602
(1.46 %)
18,481
(0.64 %)
424 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1
57,656
(10.03 %)
n/a 15,810
(2.14 %)
58,218
(5.77 %)
n/a 40.33
(99.99 %)
0
(0 %)
871
(0.01 %)
81
(100.00 %)
1,505,948
(35.31 %)
346,542
(4.71 %)
5,210,329
(31.65 %)
0
(0 %)
506,956
(4.12 %)
36,529
(1.65 %)
21,732
(0.92 %)
425 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1
38,931
(8.84 %)
n/a 15,624
(2.29 %)
35,942
(5.59 %)
n/a 40.01
(85.05 %)
0
(0 %)
209,115
(15.01 %)
30,414
(100.00 %)
372,901
(2.33 %)
278,854
(1.99 %)
5,622,334
(22.61 %)
3,125
(0.18 %)
147,444
(1.33 %)
25,079
(0.95 %)
17,741
(0.66 %)
426 spotted green pufferfish (2004)
GCA_000180735.1
n/a 193,449
(10.86 %)
13,641
(5.13 %)
57,982
(13.46 %)
n/a 46.43
(91.24 %)
18,974
(8.76 %)
18,974
(8.76 %)
44,686
(91.24 %)
252,877
(4.38 %)
159,939
(3.51 %)
1,689,462
(18.66 %)
20
(0.00 %)
119,601
(3.94 %)
51,580
(13.42 %)
39,946
(6.79 %)
427 spotted sea bass (ZS-2023 2023)
GCA_031216445.1
n/a n/a 15,425
(3.14 %)
43,414
(6.98 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 109
(100.00 %)
447,804
(3.49 %)
241,876
(3.25 %)
3,757,088
(26.25 %)
0
(0 %)
249,394
(3.97 %)
23,346
(2.49 %)
17,158
(1.22 %)
428 spotted tilapia (v1 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.1
46,818
(8.35 %)
n/a 14,938
(2.04 %)
55,475
(6.12 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
23
(0.00 %)
792
(100.00 %)
505,488
(2.57 %)
269,742
(4.14 %)
4,697,020
(30.74 %)
0
(0 %)
395,431
(3.97 %)
30,399
(1.90 %)
16,887
(0.82 %)
429 spotted tilapia (v2 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.2
48,380
(8.37 %)
n/a 15,470
(2.04 %)
57,237
(6.11 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
24
(0.00 %)
791
(100.00 %)
523,070
(2.57 %)
277,554
(4.08 %)
4,872,723
(30.67 %)
0
(0 %)
404,433
(3.93 %)
31,383
(1.89 %)
17,453
(0.82 %)
430 spotted wolffish (MPS153535 2025)
GCF_050575085.1
49,857
(11.48 %)
n/a 15,196
(3.01 %)
47,823
(7.37 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
328
(100.00 %)
430,253
(4.48 %)
288,471
(10.10 %)
3,247,212
(28.89 %)
0
(0 %)
435,377
(5.22 %)
36,945
(3.24 %)
21,843
(1.32 %)
431 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1
110,167
(7.62 %)
n/a 25,364
(1.76 %)
40,715
(4.06 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
0
(0 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
10
(0.00 %)
1,593,747
(6.87 %)
64,522
(2.85 %)
21,984
(0.89 %)
432 sterlet (v2 paternal hap 2022)
GCA_902713435.2
n/a n/a 24,717
(1.73 %)
40,151
(4.13 %)
74,807
(5.54 %)
40.09
(99.99 %)
0
(0 %)
475
(0.01 %)
1,517
(100.00 %)
1,844,596
(9.77 %)
1,119,340
(9.88 %)
9,372,934
(41.58 %)
8
(0.00 %)
1,582,556
(6.83 %)
65,007
(2.74 %)
17,761
(0.38 %)
433 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1
n/a n/a 16,177
(4.18 %)
40,160
(7.35 %)
n/a 39.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,237
(100.00 %)
1,208,781
(38.02 %)
121,854
(7.96 %)
2,956,942
(32.61 %)
0
(0 %)
310,772
(4.79 %)
27,787
(3.58 %)
14,364
(1.06 %)
434 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1
n/a n/a 16,419
(3.98 %)
40,677
(7.21 %)
n/a 39.69
(99.97 %)
0
(0 %)
825
(0.03 %)
100
(100.00 %)
1,324,513
(39.84 %)
143,170
(9.30 %)
3,000,881
(34.30 %)
1
(0.00 %)
392,291
(5.75 %)
30,130
(3.71 %)
15,123
(1.03 %)
435 stone moroko (DD20220531a primary hap 2022)
GCF_024679245.1
59,497
(6.82 %)
n/a 17,172
(2.25 %)
57,383
(4.85 %)
n/a 39.18
(99.99 %)
0
(0 %)
497
(0.01 %)
81
(100.00 %)
4,750,810
(63.58 %)
649,426
(10.14 %)
6,511,384
(46.74 %)
4
(0.00 %)
1,041,545
(6.23 %)
74,723
(4.45 %)
16,230
(0.62 %)
436 straightnose pipefish (RoL-2023_Sa 2023)
GCF_033978795.1
56,498
(4.86 %)
n/a 14,602
(1.00 %)
64,279
(2.96 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
0
(0 %)
1,172
(0.00 %)
473
(100.00 %)
2,984,285
(27.54 %)
1,402,691
(20.35 %)
7,915,062
(67.02 %)
0
(0 %)
4,017,415
(14.33 %)
140,374
(3.90 %)
46,995
(1.10 %)
437 striated frogfish (MH-2024 2024)
GCF_040054535.1
45,220
(12.66 %)
n/a 14,509
(3.35 %)
46,221
(7.95 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
0
(0 %)
18
(0.00 %)
42
(100.00 %)
791,570
(25.79 %)
305,491
(6.68 %)
3,000,938
(29.61 %)
0
(0 %)
272,583
(3.30 %)
36,818
(4.17 %)
23,466
(2.10 %)
438 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1
n/a n/a 15,871
(2.85 %)
42,287
(5.51 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
3,274
(100.00 %)
1,826,752
(37.53 %)
592,022
(6.69 %)
4,899,884
(32.33 %)
0
(0 %)
491,621
(3.91 %)
17,357
(1.25 %)
12,560
(0.74 %)
439 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1
53,859
(11.99 %)
n/a 16,033
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
0
(0 %)
236
(0.51 %)
58
(100.00 %)
1,870,234
(37.80 %)
605,570
(6.82 %)
5,059,429
(32.43 %)
2
(0.00 %)
531,388
(4.26 %)
17,919
(1.29 %)
12,796
(0.75 %)
440 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1
50,044
(9.61 %)
n/a 15,665
(2.76 %)
41,398
(5.35 %)
n/a 38.86
(99.98 %)
0
(0 %)
463
(0.02 %)
150
(100.00 %)
777,186
(5.69 %)
603,962
(6.24 %)
5,141,987
(32.41 %)
0
(0 %)
499,249
(4.08 %)
17,264
(1.20 %)
11,793
(0.66 %)
441 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1
40,992
(9.44 %)
n/a 15,295
(2.91 %)
20,865
(5.31 %)
n/a 38.71
(97.32 %)
0
(0 %)
23,755
(2.69 %)
567
(100.00 %)
693,498
(4.75 %)
489,286
(3.69 %)
4,849,313
(30.04 %)
22
(0.00 %)
189,512
(1.66 %)
15,076
(0.95 %)
10,761
(0.60 %)
442 striped sea-bass
GCF_004916995.1
32,103
(10.78 %)
n/a 14,422
(3.07 %)
38,188
(6.41 %)
n/a 40.19
(99.19 %)
0
(0 %)
73,335
(0.86 %)
630
(100.00 %)
365,581
(2.59 %)
142,967
(0.99 %)
4,151,813
(22.73 %)
371
(0.01 %)
25,024
(0.35 %)
13,730
(0.95 %)
10,471
(0.69 %)
443 Sumatra barb
GCF_018831695.1
54,947
(11.16 %)
n/a 18,745
(3.98 %)
49,520
(6.36 %)
n/a 38.24
(99.95 %)
0
(0 %)
5,075
(0.05 %)
1,122
(100.00 %)
638,783
(6.33 %)
357,159
(7.71 %)
4,520,846
(32.46 %)
16
(0.00 %)
624,611
(5.29 %)
46,339
(3.96 %)
34,160
(2.01 %)
444 swamp eel
GCF_001952655.1
43,831
(10.64 %)
n/a 14,741
(2.98 %)
20,099
(5.80 %)
n/a 40.90
(92.01 %)
51,257
(8.01 %)
51,257
(8.01 %)
71,879
(91.99 %)
266,195
(1.84 %)
95,726
(1.16 %)
3,596,747
(21.95 %)
26
(0.02 %)
54,721
(1.57 %)
7,065
(0.42 %)
5,103
(0.29 %)
445 swordfish
GCF_016859285.1
47,986
(9.92 %)
n/a 15,208
(2.84 %)
42,556
(5.91 %)
n/a 40.69
(99.97 %)
0
(0 %)
449
(0.03 %)
1,482
(100.00 %)
484,543
(3.59 %)
230,762
(3.41 %)
4,496,150
(23.94 %)
0
(0 %)
203,746
(2.18 %)
27,129
(2.10 %)
20,905
(1.34 %)
446 tambaqui
GCF_904425465.1
46,601
(6.55 %)
n/a 17,150
(1.88 %)
50,327
(4.03 %)
n/a 39.33
(100.00 %)
0
(0 %)
420
(0.00 %)
1,269
(100.00 %)
753,112
(4.00 %)
676,948
(5.71 %)
8,317,676
(35.32 %)
3
(0.00 %)
679,968
(3.78 %)
25,784
(0.92 %)
17,476
(0.58 %)
447 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1
n/a n/a 14,720
(2.58 %)
45,918
(6.44 %)
n/a 40.37
(99.99 %)
0
(0 %)
454
(0.01 %)
188
(100.00 %)
1,242,704
(17.37 %)
518,293
(15.23 %)
3,986,694
(40.18 %)
1
(0.00 %)
670,254
(6.56 %)
51,441
(3.53 %)
22,258
(1.30 %)
448 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1
n/a n/a 15,347
(2.73 %)
50,294
(7.25 %)
n/a 42.30
(99.98 %)
30
(0.00 %)
610
(0.02 %)
393
(100.00 %)
1,157,324
(26.70 %)
229,196
(4.33 %)
3,694,790
(27.54 %)
1
(0.00 %)
385,033
(4.63 %)
38,929
(2.20 %)
24,476
(1.25 %)
449 threadfin butterflyfish (fChaAug3hap1 2025)
GCF_051107435.1
44,089
(11.63 %)
n/a 15,141
(2.93 %)
45,805
(6.86 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
19
(0.00 %)
187
(100.00 %)
1,201,894
(23.61 %)
240,001
(6.49 %)
3,662,205
(24.22 %)
0
(0 %)
205,079
(2.49 %)
26,438
(2.03 %)
16,870
(0.95 %)
450 three-spined stickleback
GCF_016920845.1
50,181
(16.09 %)
n/a 14,935
(3.99 %)
53,773
(9.96 %)
n/a 44.66
(99.24 %)
0
(0 %)
3,125
(0.76 %)
2,937
(100.00 %)
368,987
(9.09 %)
160,564
(2.89 %)
2,308,841
(21.91 %)
4
(0.00 %)
148,689
(2.94 %)
80,336
(11.49 %)
57,087
(5.92 %)
451 three-spined stickleback (hap1 2024)
GCA_964276395.1
n/a n/a 14,939
(3.72 %)
56,284
(10.07 %)
n/a 44.71
(99.99 %)
3
(0.00 %)
331
(0.01 %)
133
(100.00 %)
573,569
(20.53 %)
206,699
(9.01 %)
2,335,009
(27.29 %)
7
(0.00 %)
213,153
(3.82 %)
84,009
(12.41 %)
57,803
(5.54 %)
452 three-spined stickleback (hap2 2024)
GCA_964276385.1
n/a n/a 13,591
(3.79 %)
50,693
(10.19 %)
n/a 44.72
(99.99 %)
309
(0.01 %)
309
(0.01 %)
479
(99.99 %)
505,547
(19.86 %)
181,092
(8.75 %)
2,117,454
(27.02 %)
3
(0.00 %)
218,946
(4.51 %)
75,434
(12.33 %)
51,737
(5.53 %)
453 threespot wrasse (MK-OKI-2021-1 2023)
GCF_033239565.1
40,418
(8.77 %)
n/a 15,124
(2.26 %)
46,507
(5.67 %)
n/a 40.89
(99.99 %)
0
(0 %)
117
(0.01 %)
228
(100.00 %)
539,144
(3.57 %)
361,249
(6.62 %)
5,059,734
(33.65 %)
0
(0 %)
318,904
(2.96 %)
22,689
(1.57 %)
10,994
(0.50 %)
454 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1
n/a n/a 13,912
(1.87 %)
62,727
(6.28 %)
n/a 42.90
(99.99 %)
0
(0 %)
894
(0.01 %)
755
(100.00 %)
1,981,480
(37.86 %)
652,950
(27.50 %)
3,680,829
(47.75 %)
2
(0.00 %)
1,877,326
(11.62 %)
96,414
(8.01 %)
44,593
(2.17 %)
455 tidewater goby (DKJ021-1_Fhap1 2022 refseq)
GCF_026437365.1
43,108
(6.07 %)
n/a 14,279
(1.78 %)
65,726
(6.14 %)
n/a 42.96
(99.99 %)
0
(0 %)
794
(0.01 %)
821
(100.00 %)
411,442
(6.11 %)
708,255
(30.28 %)
3,809,301
(49.66 %)
2
(0.00 %)
2,111,823
(12.18 %)
101,682
(8.04 %)
46,739
(2.13 %)
456 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2
47,037
(13.33 %)
n/a 13,806
(3.76 %)
52,367
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.08 %)
22,977
(6.92 %)
22,977
(6.92 %)
55,891
(93.08 %)
356,857
(3.66 %)
155,338
(3.36 %)
2,806,278
(24.56 %)
111
(0.08 %)
112,464
(5.32 %)
61,010
(7.71 %)
45,318
(4.17 %)
457 tongue sole
GCF_000523025.1
45,186
(16.40 %)
n/a 14,186
(3.98 %)
20,816
(8.22 %)
n/a 40.82
(94.88 %)
33,269
(5.14 %)
33,269
(5.14 %)
62,912
(94.86 %)
423,833
(4.34 %)
235,739
(3.33 %)
3,085,031
(24.78 %)
78
(0.05 %)
83,655
(2.37 %)
17,094
(1.42 %)
11,360
(0.88 %)
458 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3
n/a n/a 13,635
(4.82 %)
48,723
(11.83 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
0
(0 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,793
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
0
(0 %)
206,265
(4.46 %)
46,936
(9.72 %)
35,741
(5.19 %)
459 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2
53,489
(18.32 %)
n/a 14,527
(4.79 %)
28,597
(10.65 %)
55,587
(14.38 %)
45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
281,011
(10.36 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,756
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,975
(9.63 %)
37,920
(5.08 %)
460 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3
n/a n/a 14,527
(4.79 %)
51,181
(11.72 %)
n/a 45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
325,077
(14.03 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,754
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,975
(9.63 %)
37,920
(5.08 %)
461 trahira (v2 hap2 2024)
GCA_029633875.2
n/a n/a 15,041
(2.01 %)
42,180
(4.38 %)
n/a 41.03
(96.21 %)
143
(1.35 %)
792
(3.79 %)
594
(98.65 %)
1,069,159
(7.06 %)
653,554
(15.46 %)
4,921,631
(38.75 %)
7
(0.00 %)
1,141,429
(7.56 %)
26,440
(2.18 %)
11,688
(0.47 %)
462 trahira (v1 hap1 2024 refseq)
GCF_029633855.1
55,764
(7.71 %)
n/a 17,259
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
0
(0 %)
989
(5.49 %)
598
(100.00 %)
2,407,637
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,475
(37.52 %)
3
(0.00 %)
1,264,118
(7.29 %)
29,012
(2.12 %)
12,979
(0.45 %)
463 trahira (v2 hap1 2024 genbank)
GCA_029633855.2
n/a n/a 17,256
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
0
(0 %)
989
(5.49 %)
597
(100.00 %)
2,407,631
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,418
(37.52 %)
3
(0.00 %)
1,264,125
(7.29 %)
29,012
(2.12 %)
12,979
(0.45 %)
464 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301465.1
n/a n/a 14,730
(2.84 %)
50,956
(7.07 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
179
(0.00 %)
161
(100.00 %)
548,208
(5.35 %)
356,364
(7.30 %)
3,448,877
(26.01 %)
2
(0.00 %)
449,816
(4.07 %)
26,685
(1.80 %)
17,280
(1.06 %)
465 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301475.1
n/a n/a 14,680
(2.80 %)
50,753
(6.99 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
0
(0 %)
187
(0.00 %)
248
(100.00 %)
559,722
(5.35 %)
382,817
(8.57 %)
3,423,208
(26.76 %)
2
(0.00 %)
478,555
(4.32 %)
26,739
(1.77 %)
17,190
(1.04 %)
466 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1
n/a n/a 14,816
(3.44 %)
49,680
(8.16 %)
n/a 43.40
(99.97 %)
0
(0 %)
805
(0.03 %)
108
(100.00 %)
808,348
(19.20 %)
301,230
(7.15 %)
3,267,772
(25.91 %)
4
(0.00 %)
311,531
(3.41 %)
66,132
(6.90 %)
41,801
(3.31 %)
467 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1
57,298
(14.93 %)
n/a 14,887
(3.52 %)
49,403
(8.32 %)
87,351
(14.65 %)
43.54
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28
(100.00 %)
455,017
(0.00 %)
297,185
(5.03 %)
3,312,612
(24.33 %)
0
(0 %)
273,238
(2.64 %)
65,633
(7.08 %)
41,821
(3.38 %)
468 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1
40,386
(7.85 %)
n/a 14,339
(2.08 %)
84,906
(20.47 %)
57,218
(6.01 %)
42.51
(68.98 %)
63,014
(31.03 %)
85,562
(31.04 %)
68,911
(68.97 %)
392,114
(2.78 %)
307,607
(2.09 %)
4,777,941
(27.62 %)
528
(0.12 %)
221,213
(1.41 %)
61,105
(2.15 %)
17,725
(0.62 %)
469 turquoise killifish (GRZ-AD 2024)
GCF_043380555.1
56,976
(5.74 %)
n/a 14,604
(1.25 %)
72,207
(4.35 %)
n/a 44.51
(100.00 %)
0
(0 %)
369
(0.00 %)
304
(100.00 %)
2,858,575
(46.12 %)
660,603
(29.65 %)
4,283,242
(61.88 %)
7
(0.00 %)
2,835,016
(13.43 %)
118,966
(11.71 %)
17,862
(0.51 %)
470 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1
54,501
(6.75 %)
n/a 14,227
(1.27 %)
69,161
(4.33 %)
n/a 44.33
(93.22 %)
0
(0 %)
3,093
(6.78 %)
2,681
(100.00 %)
2,760,581
(47.64 %)
635,213
(25.56 %)
4,136,925
(56.55 %)
8
(0.00 %)
2,533,340
(11.75 %)
110,696
(10.50 %)
17,579
(0.49 %)
471 walking catfish (CIFAMagur01 2020)
GCA_013621035.1
n/a 23,712
(3.37 %)
15,895
(2.18 %)
46,934
(4.73 %)
n/a 39.83
(99.95 %)
0
(0 %)
605
(0.05 %)
3,484
(100.00 %)
1,061,538
(6.25 %)
611,618
(5.19 %)
5,978,835
(37.11 %)
3
(0.00 %)
510,982
(4.22 %)
54,666
(3.50 %)
24,478
(1.06 %)
472 walleye pollock (NIFS_2021 2022)
GCF_026213295.1
49,084
(12.15 %)
n/a 14,241
(2.71 %)
70,653
(9.29 %)
n/a 45.59
(99.96 %)
0
(0 %)
2,816
(0.04 %)
168
(100.00 %)
1,274,742
(38.63 %)
797,757
(14.11 %)
2,725,416
(34.38 %)
8
(0.00 %)
658,410
(7.33 %)
95,149
(8.09 %)
57,122
(4.03 %)
473 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1
n/a n/a 14,197
(3.33 %)
44,782
(7.70 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,294
(100.00 %)
396,279
(4.74 %)
275,154
(5.76 %)
2,933,132
(29.41 %)
0
(0 %)
277,720
(3.27 %)
35,104
(4.08 %)
21,634
(1.95 %)
474 warty frogfish (primary hap 2020)
GCA_013358685.1
n/a n/a 14,494
(3.34 %)
45,310
(7.77 %)
n/a 41.86
(99.87 %)
0
(0 %)
219
(0.13 %)
155
(100.00 %)
413,753
(4.95 %)
290,313
(6.11 %)
3,010,996
(29.71 %)
3
(0.00 %)
305,411
(3.51 %)
36,840
(4.18 %)
22,433
(1.95 %)
475 western mosquitofish
GCF_019740435.1
54,016
(12.31 %)
n/a 14,667
(2.80 %)
44,358
(6.62 %)
n/a 38.94
(97.42 %)
0
(0 %)
181
(2.58 %)
37
(100.00 %)
348,476
(2.56 %)
158,728
(2.21 %)
4,604,959
(26.85 %)
0
(0 %)
174,331
(2.27 %)
30,624
(1.94 %)
23,348
(1.33 %)
476 western speckled dace (OS25496 2023)
GCF_029890125.1
46,203
(5.36 %)
n/a 16,945
(2.57 %)
65,343
(6.35 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 930
(100.00 %)
2,528,154
(48.24 %)
549,447
(8.24 %)
5,157,802
(41.42 %)
0
(0 %)
921,640
(6.77 %)
84,874
(6.05 %)
24,156
(1.14 %)
477 westslope cutthroat trout (Uvic-CL-2024 2024)
GCF_045791955.1
85,126
(5.62 %)
n/a 27,822
(1.58 %)
113,187
(4.31 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
1,381
(0.01 %)
1,381
(0.01 %)
4,647
(99.99 %)
1,200,605
(4.82 %)
2,237,797
(24.56 %)
10,339,252
(54.27 %)
19
(0.00 %)
4,842,427
(11.62 %)
70,550
(1.65 %)
18,857
(0.33 %)
478 White Sands pupfish
GCF_016077235.1
46,084
(6.27 %)
n/a 14,817
(1.71 %)
52,055
(4.88 %)
n/a 39.01
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,003
(100.00 %)
489,894
(2.67 %)
304,277
(3.91 %)
6,371,712
(38.05 %)
0
(0 %)
457,693
(3.60 %)
41,820
(1.75 %)
13,011
(0.56 %)
479 wolf-eel
GCF_004355925.1
43,638
(14.00 %)
n/a 14,930
(3.24 %)
31,372
(7.30 %)
n/a 42.10
(92.86 %)
23,085
(7.15 %)
23,891
(7.15 %)
33,400
(92.85 %)
379,343
(3.26 %)
244,853
(2.39 %)
3,432,622
(22.07 %)
476
(0.06 %)
108,255
(0.97 %)
30,581
(2.04 %)
19,275
(1.18 %)
480 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1
n/a n/a 14,753
(3.49 %)
49,516
(8.47 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
0
(0 %)
222
(0.00 %)
171
(100.00 %)
458,382
(5.18 %)
420,718
(8.01 %)
3,146,054
(25.71 %)
0
(0 %)
390,050
(4.18 %)
69,817
(7.20 %)
44,403
(3.53 %)
481 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1
n/a n/a 14,847
(3.48 %)
50,136
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
0
(0 %)
219
(0.00 %)
443
(100.00 %)
461,903
(5.20 %)
422,251
(8.03 %)
3,180,804
(25.81 %)
1
(0.00 %)
392,635
(4.18 %)
70,183
(7.15 %)
44,599
(3.52 %)
482 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 primary hap 2022)
GCF_023055335.1
42,410
(12.47 %)
n/a 14,845
(3.48 %)
50,132
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
219
(0.00 %)
219
(0.00 %)
661
(100.00 %)
461,895
(5.20 %)
422,249
(8.03 %)
3,180,722
(25.81 %)
1
(0.00 %)
392,632
(4.18 %)
70,181
(7.15 %)
44,597
(3.52 %)
483 worm pipefish (v2.1 RoL_2023-P12025)
GCF_033978685.3
47,694
(3.96 %)
n/a 14,177
(1.01 %)
59,392
(2.97 %)
n/a 39.43
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
230
(100.00 %)
1,246,897
(5.46 %)
1,548,619
(19.15 %)
6,596,258
(69.80 %)
0
(0 %)
4,368,770
(16.69 %)
148,788
(5.04 %)
41,773
(1.01 %)
484 Wuchang bream
GCF_018812025.1
68,781
(8.86 %)
n/a 18,247
(2.62 %)
57,323
(5.24 %)
n/a 37.64
(99.83 %)
0
(0 %)
1,281
(0.17 %)
243
(100.00 %)
801,110
(0.00 %)
559,399
(5.04 %)
6,340,567
(43.09 %)
2
(0.00 %)
715,866
(5.11 %)
45,067
(2.52 %)
19,912
(0.78 %)
485 Yangtze koukloug (SWU-2019 2020)
GCF_012432095.1
63,938
(10.50 %)
n/a 17,502
(3.25 %)
52,519
(5.86 %)
n/a 37.23
(99.62 %)
0
(0 %)
617
(0.38 %)
353
(100.00 %)
2,297,102
(50.34 %)
368,423
(3.28 %)
5,171,389
(38.98 %)
1
(0.00 %)
338,882
(3.77 %)
32,824
(2.00 %)
14,248
(0.64 %)
486 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129025.1
n/a n/a 15,641
(1.95 %)
52,141
(5.13 %)
n/a 40.61
(100.00 %)
0
(0 %)
17
(0.00 %)
250
(100.00 %)
607,010
(2.66 %)
288,837
(3.91 %)
6,785,488
(31.37 %)
1
(0.00 %)
392,218
(2.89 %)
39,560
(1.65 %)
18,423
(0.65 %)
487 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129055.1
n/a n/a 15,666
(1.88 %)
53,049
(5.01 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
29
(0.00 %)
324
(100.00 %)
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(2.64 %)
305,809
(5.18 %)
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(33.41 %)
2
(0.00 %)
551,663
(3.78 %)
45,863
(1.88 %)
18,859
(0.64 %)
488 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1
64,819
(11.15 %)
n/a 15,680
(2.87 %)
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n/a 39.49
(99.94 %)
0
(0 %)
817
(0.06 %)
517
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2
(0.00 %)
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12,238
(0.75 %)
489 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1
54,374
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n/a 15,584
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12,253
(0.76 %)
490 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1
47,121
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n/a 15,458
(2.26 %)
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(5.62 %)
n/a 40.84
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0
(0 %)
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0
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491 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1
n/a n/a 814
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3,814
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(5.03 %)
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(20.37 %)
0
(0 %)
46,752
(6.67 %)
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(2.07 %)
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(1.32 %)
492 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
n/a 15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
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(11.62 %)
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(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
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(100.00 %)
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(3.43 %)
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(2.64 %)
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(22.81 %)
0
(0 %)
188,182
(2.04 %)
31,005
(1.79 %)
19,757
(1.03 %)
493 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1
n/a n/a 15,959
(2.63 %)
43,025
(5.73 %)
n/a 39.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 640
(100.00 %)
1,427,221
(28.44 %)
257,108
(3.15 %)
5,197,531
(26.91 %)
0
(0 %)
350,223
(3.66 %)
13,909
(0.83 %)
10,650
(0.55 %)
494 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
n/a 15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
1
(0.00 %)
375,976
(3.80 %)
14,420
(0.88 %)
9,087
(0.42 %)
495 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2
40,948
(9.95 %)
n/a 15,673
(2.75 %)
53,235
(6.33 %)
n/a 40.72
(97.79 %)
0
(0 %)
33,661
(2.21 %)
98,345
(100.00 %)
1,337,427
(24.48 %)
522,121
(4.83 %)
4,649,096
(25.00 %)
308
(0.03 %)
357,663
(3.10 %)
16,819
(0.86 %)
11,638
(0.57 %)
496 zebra mbuna (Mazinzi reef 2018)
GCF_000238955.4
51,025
(8.37 %)
n/a 15,901
(2.10 %)
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(6.12 %)
n/a 41.16
(99.99 %)
0
(0 %)
641
(0.01 %)
1,690
(100.00 %)
565,771
(6.22 %)
253,037
(2.53 %)
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(31.57 %)
0
(0 %)
324,855
(3.54 %)
36,689
(2.00 %)
18,156
(0.99 %)
497 zebra mbuna (NMK-2024a 2024)
GCF_041146795.1
64,053
(10.53 %)
n/a 15,646
(2.13 %)
55,412
(6.16 %)
n/a 41.21
(98.83 %)
0
(0 %)
155
(1.17 %)
63
(100.00 %)
1,445,623
(39.84 %)
261,983
(5.12 %)
4,357,683
(32.79 %)
1
(0.00 %)
331,778
(3.81 %)
35,968
(2.14 %)
15,313
(0.73 %)
498 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1
n/a n/a 6,365
(2.41 %)
16,467
(3.26 %)
n/a 36.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,719
(100.00 %)
1,317,027
(59.43 %)
323,062
(10.58 %)
3,014,570
(45.46 %)
0
(0 %)
366,878
(5.24 %)
14,563
(1.98 %)
3,786
(0.32 %)
499 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1
n/a n/a 17,774
(2.54 %)
44,221
(3.24 %)
n/a 36.52
(99.87 %)
20,876
(0.14 %)
20,876
(0.14 %)
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(99.86 %)
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(61.22 %)
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(6.79 %)
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(47.68 %)
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(0.01 %)
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(4.38 %)
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(2.03 %)
8,815
(0.26 %)
500 zebrafish (GRCz12tu Tuebingen 2025)
GCF_049306965.1
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(8.09 %)
n/a 18,033
(2.41 %)
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(3.23 %)
n/a 37.14
(100.00 %)
0
(0 %)
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(0.00 %)
26
(100.00 %)
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(60.58 %)
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(12.22 %)
8,736,108
(52.67 %)
336
(0.01 %)
1,300,497
(6.05 %)
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(2.03 %)
11,257
(0.30 %)
501 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1
n/a n/a 17,535
(2.50 %)
44,169
(3.34 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
0
(0 %)
712
(0.01 %)
1,252
(100.00 %)
3,891,854
(61.07 %)
927,173
(7.78 %)
8,621,517
(50.27 %)
1
(0.00 %)
941,178
(4.90 %)
44,554
(2.12 %)
10,153
(0.30 %)
502 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2
n/a n/a 17,692
(2.51 %)
43,578
(3.27 %)
n/a 36.56
(99.99 %)
0
(0 %)
1,352
(0.01 %)
755
(100.00 %)
3,937,397
(60.86 %)
936,258
(7.76 %)
8,732,369
(50.44 %)
0
(0 %)
933,928
(4.81 %)
44,812
(2.09 %)
10,558
(0.30 %)
503 zebrafish (WGS:CALUEM01 primary hap 2022)
GCA_944039275.1
n/a n/a 18,065
(2.46 %)
44,526
(3.30 %)
n/a 37.08
(99.99 %)
0
(0 %)
381
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,804,769
(44.04 %)
954,645
(10.72 %)
8,694,743
(51.88 %)
4
(0.00 %)
1,207,649
(5.79 %)
44,936
(2.02 %)
11,380
(0.33 %)
504 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6
72,965
(6.43 %)
n/a 22,246
(2.54 %)
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(7.13 %)
n/a 36.60
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(0.27 %)
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(0.28 %)
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(99.73 %)
4,595,932
(57.92 %)
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(6.47 %)
10,772,232
(49.45 %)
127
(0.00 %)
942,199
(4.23 %)
53,471
(2.06 %)
12,486
(0.29 %)
505 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1
n/a n/a 1,204
(2.88 %)
4,065
(7.13 %)
n/a 41.24
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 1,437
(100.00 %)
26,319
(3.19 %)
14,209
(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
0
(0 %)
22,258
(4.87 %)
1,253
(1.49 %)
988
(1.13 %)
506 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2
45,001
(12.01 %)
n/a 15,037
(3.35 %)
40,235
(7.28 %)
60,496
(9.39 %)
40.66
(97.76 %)
0
(0 %)
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(2.24 %)
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(100.00 %)
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(2.87 %)
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(2.01 %)
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(23.44 %)
0
(0 %)
175,881
(3.08 %)
12,807
(1.08 %)
8,703
(0.67 %)
507 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3
n/a n/a 15,036
(3.35 %)
40,234
(7.28 %)
n/a 40.66
(97.76 %)
0
(0 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
671,614
(20.98 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,040
(23.44 %)
0
(0 %)
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TOTALS:total assembly count 507

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Primates 602 assemblies assembly stats track stats
Mammals 695 assemblies assembly stats track stats
Birds 451 assemblies assembly stats track stats
Fishes 507 assemblies assembly stats track stats
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Invertebrates 1469 assemblies assembly stats track stats
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Archaea 2622 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 21463 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 687 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5058 assemblies assembly stats track stats