Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub accessassembly statistics


Data resource links

NOTE: Click on the column headers to sort the table by that column
The link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 alligator pipefish (LvHL_M 2021)
GCF_019802595.1
54,226
(11.15 %)
n/a 13,427
(2.67 %)
46,903
(5.94 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
144
(0.00 %)
143
(100.00 %)
1,200,994
(30.62 %)
143,062
(2.20 %)
3,921,676
(38.03 %)
0
(0 %)
164,363
(2.07 %)
67,978
(8.92 %)
47,265
(3.34 %)
2 allis shad
GCF_017589495.1
48,507
(8.47 %)
n/a 15,371
(2.28 %)
58,686
(5.84 %)
n/a 42.99
(99.91 %)
0
(0 %)
1,541
(0.09 %)
1,095
(100.00 %)
1,190,406
(9.30 %)
1,205,679
(11.28 %)
3,960,328
(38.81 %)
0
(0 %)
936,797
(6.49 %)
36,494
(1.83 %)
23,714
(1.20 %)
3 Amazon molly
GCF_000485575.1
56,958
(11.69 %)
n/a 15,117
(2.64 %)
30,114
(6.60 %)
n/a 39.16
(95.38 %)
27,073
(4.64 %)
36,429
(4.64 %)
31,058
(95.36 %)
346,461
(2.03 %)
188,557
(1.44 %)
5,139,633
(26.01 %)
848
(0.07 %)
161,806
(7.35 %)
35,229
(1.82 %)
27,404
(1.38 %)
4 amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021)
GCF_021018895.1
47,198
(13.10 %)
n/a 15,500
(3.14 %)
41,230
(6.67 %)
n/a 40.79
(99.99 %)
0
(0 %)
150
(0.01 %)
31
(100.00 %)
1,230,524
(26.57 %)
398,694
(5.41 %)
4,106,609
(25.60 %)
0
(0 %)
335,552
(3.38 %)
15,656
(0.99 %)
12,171
(0.69 %)
5 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1
n/a n/a 15,901
(2.25 %)
61,133
(6.37 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,411
(100.00 %)
2,043,181
(23.64 %)
1,141,539
(11.35 %)
3,668,314
(38.60 %)
0
(0 %)
805,945
(6.00 %)
40,218
(2.14 %)
24,243
(1.22 %)
6 American shad (fAloSap1 primary hap 2021)
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
n/a 16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
76,974
(8.55 %)
43.18
(99.45 %)
0
(0 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
14
(0.00 %)
934,014
(6.61 %)
42,699
(2.23 %)
25,608
(1.23 %)
7 Andian cavefish (hap1 2023)
GCF_030014385.1
42,881
(5.97 %)
n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,939
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
8 annual killifish
GCF_001266775.1
38,517
(8.87 %)
n/a 14,027
(2.45 %)
27,798
(5.86 %)
n/a 39.29
(80.23 %)
138,584
(19.83 %)
1,025,519
(19.94 %)
168,368
(80.17 %)
349,927
(2.63 %)
296,826
(3.18 %)
5,039,517
(28.69 %)
2,323
(0.21 %)
261,101
(1.92 %)
26,364
(1.18 %)
17,566
(0.78 %)
9 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1
n/a n/a 16,678
(0.56 %)
151,361
(4.03 %)
n/a 44.57
(99.91 %)
0
(0 %)
15,113
(0.09 %)
5,983
(100.00 %)
12,251,532
(51.73 %)
3,521,157
(17.69 %)
10,051,020
(68.37 %)
71
(0.00 %)
5,101,423
(13.15 %)
494,595
(10.52 %)
74,823
(1.04 %)
10 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1
n/a n/a 17,318
(1.49 %)
80,097
(5.79 %)
n/a 43.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11,436
(100.00 %)
5,482,467
(36.71 %)
1,454,729
(18.84 %)
6,756,226
(47.56 %)
0
(0 %)
1,722,514
(9.86 %)
92,057
(3.50 %)
34,309
(1.32 %)
11 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1
n/a n/a 17,342
(1.44 %)
78,914
(5.48 %)
n/a 43.57
(99.96 %)
0
(0 %)
3,179
(0.04 %)
1,901
(100.00 %)
5,980,457
(37.18 %)
1,633,782
(21.76 %)
6,279,725
(52.83 %)
12
(0.00 %)
2,013,978
(10.83 %)
104,688
(3.57 %)
33,790
(1.15 %)
12 Arctic char
GCF_002910315.2
67,196
(4.99 %)
n/a 23,967
(1.55 %)
45,775
(3.69 %)
n/a 43.16
(93.25 %)
1,447
(0.01 %)
1,718,015
(6.84 %)
16,700
(99.99 %)
1,011,348
(4.06 %)
1,666,148
(10.50 %)
10,597,529
(44.77 %)
5,986
(0.15 %)
2,192,365
(6.51 %)
76,282
(1.94 %)
25,064
(0.53 %)
13 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1
n/a n/a 14,032
(2.44 %)
39,770
(4.92 %)
n/a 38.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,617
(100.00 %)
1,808,149
(37.98 %)
583,449
(10.56 %)
4,203,368
(40.67 %)
0
(0 %)
559,424
(5.24 %)
24,867
(2.06 %)
14,134
(0.93 %)
14 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1
n/a n/a 15,455
(2.53 %)
40,077
(4.90 %)
86,346
(8.45 %)
38.90
(99.98 %)
0
(0 %)
795
(0.02 %)
241
(100.00 %)
2,045,691
(38.70 %)
669,975
(11.72 %)
4,638,765
(42.07 %)
1
(0.00 %)
693,282
(5.96 %)
28,277
(1.93 %)
15,766
(0.94 %)
15 Arkansas darter
GCF_013103735.1
51,282
(9.79 %)
n/a 14,588
(2.90 %)
42,306
(6.27 %)
n/a 40.52
(99.50 %)
0
(0 %)
35,052
(0.52 %)
4,664
(100.00 %)
418,294
(3.29 %)
331,380
(3.74 %)
4,153,309
(26.60 %)
762
(0.03 %)
207,110
(1.75 %)
15,489
(0.95 %)
10,148
(0.62 %)
16 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1
n/a n/a 17,862
(2.29 %)
70,667
(5.50 %)
n/a 40.01
(100.00 %)
0
(0 %)
327
(0.00 %)
179
(100.00 %)
2,876,989
(50.39 %)
700,511
(9.88 %)
5,977,913
(44.08 %)
2
(0.00 %)
1,066,043
(6.53 %)
104,320
(8.02 %)
23,254
(0.86 %)
17 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1
n/a n/a 18,025
(2.28 %)
71,255
(5.50 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
0
(0 %)
318
(0.00 %)
341
(100.00 %)
2,884,301
(50.42 %)
702,464
(9.98 %)
5,989,299
(44.18 %)
2
(0.00 %)
1,090,542
(6.63 %)
105,945
(8.03 %)
23,683
(0.88 %)
18 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1
50,315
(9.13 %)
n/a 16,526
(2.73 %)
38,780
(6.64 %)
72,662
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
0
(0 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
504,673
(3.06 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
0
(0 %)
157,330
(1.72 %)
88,517
(10.73 %)
67,281
(4.98 %)
19 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2
n/a n/a 16,053
(2.73 %)
74,777
(7.26 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,351
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
0
(0 %)
142,849
(1.57 %)
85,546
(10.82 %)
65,542
(5.07 %)
20 Asian redtail catfish (EC202008001 2021)
GCF_019097595.1
51,017
(10.40 %)
n/a 15,549
(2.60 %)
42,858
(5.39 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
0
(0 %)
107
(0.00 %)
73
(100.00 %)
1,718,992
(31.80 %)
749,009
(14.09 %)
4,206,758
(37.30 %)
0
(0 %)
1,161,068
(7.86 %)
19,230
(1.16 %)
12,900
(0.65 %)
21 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024)
GCA_963924715.1
n/a n/a 15,722
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
0
(0 %)
468
(0.01 %)
120
(100.00 %)
1,608,686
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,115
(27.80 %)
3
(0.00 %)
390,196
(3.88 %)
14,488
(0.90 %)
9,706
(0.46 %)
22 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1
51,642
(11.92 %)
n/a 14,055
(2.62 %)
36,761
(8.42 %)
68,438
(9.50 %)
45.64
(96.48 %)
0
(0 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
790,946
(10.54 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
4
(0.00 %)
741,285
(7.34 %)
97,133
(7.82 %)
51,623
(3.50 %)
23 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1
n/a n/a 13,366
(2.68 %)
66,599
(9.29 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,727
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
0
(0 %)
635,348
(7.05 %)
87,167
(8.03 %)
47,003
(3.66 %)
24 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
n/a 14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
69,662
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
0
(0 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
0
(0 %)
240,110
(3.16 %)
31,325
(2.25 %)
20,749
(1.34 %)
25 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1
n/a n/a 16,554
(3.01 %)
54,832
(7.45 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,008
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
0
(0 %)
297,396
(3.46 %)
36,868
(2.33 %)
24,401
(1.38 %)
26 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2
50,946
(10.35 %)
n/a 16,394
(2.60 %)
61,637
(7.20 %)
n/a 44.16
(99.89 %)
1,963
(0.11 %)
1,990
(0.11 %)
3,687
(99.89 %)
1,269,688
(11.71 %)
1,318,661
(13.43 %)
3,732,801
(32.49 %)
2
(0.00 %)
1,134,686
(8.55 %)
35,959
(1.97 %)
21,835
(1.09 %)
27 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2
n/a n/a 15,331
(2.42 %)
52,370
(6.91 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
0
(0 %)
74
(0.00 %)
1,049
(100.00 %)
1,454,631
(18.29 %)
383,946
(4.34 %)
4,363,016
(32.69 %)
0
(0 %)
445,382
(4.43 %)
56,416
(3.08 %)
20,355
(1.02 %)
28 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2
n/a n/a 15,262
(2.42 %)
51,857
(6.86 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
222
(0.00 %)
153
(100.00 %)
1,454,219
(18.25 %)
384,609
(4.72 %)
4,338,083
(32.80 %)
5
(0.00 %)
449,712
(4.53 %)
56,553
(3.08 %)
20,550
(1.04 %)
29 Atlantic mackerel (primary hap 2023)
GCA_963691925.1
n/a n/a 15,291
(2.56 %)
43,206
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
666
(100.00 %)
1,496,244
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,761
(29.92 %)
9
(0.00 %)
555,075
(5.00 %)
13,309
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
30 Atlantic mackerel (primary hap 2023)
GCF_963691925.1
34,357
(8.10 %)
n/a 15,289
(2.56 %)
43,205
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
665
(100.00 %)
1,496,240
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,726
(29.93 %)
9
(0.00 %)
555,074
(5.00 %)
13,308
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
31 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1
112,906
(5.61 %)
n/a 28,077
(1.40 %)
115,207
(3.75 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
1,300,611
(4.84 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
0
(0 %)
3,295,334
(6.78 %)
77,089
(1.86 %)
20,127
(0.31 %)
32 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1
109,794
(5.45 %)
n/a 26,968
(1.35 %)
202,772
(19.11 %)
n/a 43.10
(88.27 %)
9,418
(0.03 %)
138,207
(11.73 %)
241,570
(99.97 %)
1,628,119
(9.46 %)
2,496,917
(19.18 %)
10,390,780
(51.80 %)
602
(0.04 %)
n/a 79,791
(1.60 %)
18,955
(0.25 %)
33 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1
60,214
(14.44 %)
n/a 14,860
(3.40 %)
50,921
(8.07 %)
76,242
(9.93 %)
43.38
(100.00 %)
0
(0 %)
51
(0.00 %)
127
(100.00 %)
449,865
(5.00 %)
299,255
(7.03 %)
3,274,219
(25.77 %)
0
(0 %)
378,660
(3.73 %)
67,338
(7.00 %)
43,189
(3.43 %)
34 ballan wrasse (2016)
GCF_900080235.1
42,362
(9.30 %)
n/a 16,129
(2.44 %)
33,854
(5.87 %)
n/a 40.89
(99.98 %)
0
(0 %)
257
(0.02 %)
13,466
(100.00 %)
503,078
(3.93 %)
321,407
(5.60 %)
4,329,412
(30.36 %)
5
(0.00 %)
563,079
(4.68 %)
21,221
(1.07 %)
11,680
(0.58 %)
35 ballan wrasse (primary hap 2024 genbank)
GCA_963930695.1
n/a n/a 15,142
(2.66 %)
43,601
(6.21 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
1
(0.00 %)
815
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,221,802
(30.10 %)
290,738
(7.79 %)
4,164,845
(30.34 %)
4
(0.00 %)
525,923
(5.43 %)
17,126
(0.94 %)
10,131
(0.54 %)
36 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1
48,592
(12.09 %)
n/a 15,140
(2.66 %)
43,304
(6.14 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
815
(0.02 %)
815
(0.02 %)
946
(99.98 %)
1,221,797
(30.10 %)
290,736
(7.79 %)
4,164,799
(30.34 %)
4
(0.00 %)
525,920
(5.43 %)
17,126
(0.94 %)
10,131
(0.54 %)
37 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1
n/a n/a 15,211
(3.23 %)
41,620
(7.14 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
2,393
(100.00 %)
785,178
(17.57 %)
249,148
(8.36 %)
3,391,653
(26.49 %)
0
(0 %)
274,110
(3.20 %)
13,787
(0.93 %)
9,087
(0.56 %)
38 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
n/a 15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
0
(0 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
1
(0.00 %)
297,814
(3.49 %)
15,089
(0.96 %)
9,304
(0.55 %)
39 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1
n/a n/a 15,122
(1.44 %)
65,809
(4.50 %)
n/a 41.23
(99.74 %)
0
(0 %)
293
(0.26 %)
331
(100.00 %)
2,545,429
(50.53 %)
451,939
(5.50 %)
5,807,705
(42.18 %)
0
(0 %)
863,582
(6.37 %)
94,695
(3.92 %)
37,528
(1.27 %)
40 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1
n/a n/a 15,024
(1.45 %)
65,141
(4.53 %)
n/a 41.23
(99.52 %)
0
(0 %)
373
(0.48 %)
196
(100.00 %)
2,509,508
(50.53 %)
441,892
(5.11 %)
6,245,443
(38.22 %)
2
(0.00 %)
822,138
(6.12 %)
93,198
(3.82 %)
36,988
(1.26 %)
41 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1
n/a n/a 26,794
(3.15 %)
76,434
(5.64 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
8,035
(100.00 %)
4,084,361
(52.18 %)
538,411
(4.25 %)
7,659,980
(38.94 %)
0
(0 %)
450,884
(2.88 %)
58,008
(2.90 %)
19,160
(0.57 %)
42 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1
n/a n/a 31,876
(3.30 %)
85,063
(5.65 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
0
(0 %)
108
(0.00 %)
92
(100.00 %)
4,839,533
(52.47 %)
646,636
(4.57 %)
8,240,279
(42.13 %)
2
(0.00 %)
569,819
(3.17 %)
71,384
(3.04 %)
22,137
(0.56 %)
43 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2
53,646
(13.68 %)
n/a 16,073
(3.06 %)
44,214
(6.63 %)
n/a 40.76
(98.88 %)
0
(0 %)
674
(1.12 %)
2,997
(100.00 %)
986,469
(19.78 %)
237,272
(4.32 %)
3,983,840
(23.58 %)
0
(0 %)
251,048
(3.40 %)
16,237
(1.03 %)
9,089
(0.52 %)
44 bicolor damselfish
GCF_000690725.1
32,951
(8.67 %)
n/a 15,181
(2.55 %)
31,420
(5.94 %)
n/a 41.66
(93.68 %)
36,242
(6.34 %)
44,409
(6.34 %)
42,059
(93.66 %)
351,453
(2.61 %)
180,113
(1.20 %)
5,016,154
(23.41 %)
554
(0.03 %)
96,483
(1.91 %)
46,423
(2.30 %)
31,358
(1.43 %)
45 double-spotted pufferfish T.bimaculatus (TB-2018 2019)
GCA_004026145.2
n/a 20,142
(10.63 %)
14,760
(4.56 %)
56,353
(11.37 %)
n/a 45.56
(99.97 %)
0
(0 %)
1,033
(0.03 %)
1,158
(100.00 %)
292,029
(9.69 %)
192,568
(5.53 %)
1,623,924
(22.71 %)
2
(0.00 %)
336,852
(6.81 %)
51,743
(9.31 %)
39,457
(5.10 %)
46 black goby (alternate hap 2023)
GCA_951799965.1
n/a n/a 14,534
(2.11 %)
56,906
(6.41 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,523
(100.00 %)
2,445,373
(45.07 %)
452,878
(9.46 %)
4,195,077
(39.49 %)
0
(0 %)
841,978
(6.49 %)
77,592
(4.86 %)
50,068
(2.69 %)
47 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1
n/a n/a 14,455
(2.06 %)
56,488
(6.31 %)
n/a 42.10
(99.99 %)
0
(0 %)
636
(0.01 %)
298
(100.00 %)
3,230,397
(55.09 %)
494,440
(10.43 %)
4,359,169
(40.46 %)
2
(0.00 %)
950,976
(6.99 %)
81,684
(4.81 %)
45,797
(2.02 %)
48 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1
n/a n/a 31,847
(2.01 %)
153,565
(6.53 %)
n/a 41.78
(99.99 %)
639
(0.00 %)
639
(0.00 %)
63,422
(100.00 %)
2,786,840
(18.28 %)
1,016,389
(7.50 %)
8,844,631
(26.90 %)
18
(0.00 %)
1,160,777
(4.13 %)
130,556
(4.42 %)
82,861
(2.07 %)
49 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022)
GCA_022577435.1
n/a n/a 14,991
(3.02 %)
47,106
(6.98 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
0
(0 %)
234
(0.00 %)
230
(100.00 %)
1,017,149
(18.99 %)
360,899
(8.75 %)
3,761,526
(28.91 %)
0
(0 %)
469,043
(4.64 %)
48,360
(4.43 %)
30,659
(2.05 %)
50 black rockcod
GCF_000735185.1
35,176
(8.54 %)
n/a 12,601
(2.15 %)
42,589
(6.13 %)
n/a 40.62
(97.93 %)
33,914
(2.08 %)
59,164
(2.09 %)
72,571
(97.92 %)
268,591
(2.71 %)
238,334
(3.18 %)
3,425,479
(29.48 %)
174
(0.01 %)
164,483
(1.70 %)
31,009
(2.11 %)
14,188
(1.03 %)
51 black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023)
GCF_030273125.1
43,392
(8.45 %)
n/a 15,522
(2.13 %)
48,255
(5.50 %)
n/a 38.69
(100.00 %)
0
(0 %)
341
(0.00 %)
92
(100.00 %)
1,651,919
(22.26 %)
782,601
(7.55 %)
5,398,047
(38.87 %)
2
(0.00 %)
810,395
(6.16 %)
24,508
(1.19 %)
12,928
(0.57 %)
52 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1
n/a n/a 15,274
(2.92 %)
51,453
(7.45 %)
n/a 43.07
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,239,364
(29.69 %)
354,703
(9.63 %)
3,006,556
(30.35 %)
2
(0.00 %)
588,441
(7.05 %)
53,503
(4.48 %)
28,830
(1.72 %)
53 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1
n/a n/a 15,043
(2.96 %)
50,860
(7.54 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
366
(0.01 %)
109
(100.00 %)
1,210,142
(29.44 %)
340,820
(9.19 %)
2,986,750
(29.89 %)
0
(0 %)
547,550
(6.92 %)
52,010
(4.20 %)
28,373
(1.72 %)
54 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1
44,847
(11.30 %)
n/a 15,364
(2.86 %)
51,122
(6.88 %)
n/a 39.48
(99.99 %)
0
(0 %)
89
(0.01 %)
415
(100.00 %)
1,160,519
(28.33 %)
183,082
(4.75 %)
4,354,804
(27.83 %)
4
(0.00 %)
435,884
(4.37 %)
40,207
(2.97 %)
32,779
(2.13 %)
55 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1
n/a n/a 17,403
(2.99 %)
45,903
(5.38 %)
n/a 38.64
(99.99 %)
0
(0 %)
709
(0.01 %)
673
(100.00 %)
2,141,901
(35.77 %)
482,931
(17.18 %)
4,297,133
(46.82 %)
4
(0.00 %)
991,826
(7.99 %)
41,889
(2.32 %)
19,281
(0.97 %)
56 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1
n/a n/a 17,486
(2.97 %)
46,833
(5.41 %)
n/a 38.79
(99.99 %)
0
(0 %)
720
(0.01 %)
413
(100.00 %)
2,165,269
(36.18 %)
490,692
(17.84 %)
4,251,333
(47.54 %)
10
(0.00 %)
1,058,863
(8.47 %)
42,744
(2.37 %)
19,312
(0.98 %)
57 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1
48,916
(10.27 %)
n/a 15,574
(2.62 %)
44,035
(5.21 %)
n/a 39.80
(98.04 %)
0
(0 %)
171
(1.96 %)
43
(100.00 %)
2,180,806
(45.14 %)
625,260
(6.63 %)
5,137,199
(35.52 %)
1
(0.00 %)
571,071
(4.17 %)
31,164
(1.89 %)
20,363
(1.02 %)
58 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1
36,881
(7.40 %)
n/a 15,408
(2.38 %)
27,235
(5.59 %)
n/a 40.42
(89.87 %)
0
(0 %)
53,539
(10.15 %)
12,952
(100.00 %)
867,639
(16.39 %)
195,137
(1.62 %)
5,293,484
(23.10 %)
124
(0.05 %)
97,164
(2.26 %)
21,238
(1.02 %)
14,191
(0.64 %)
59 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1
57,860
(9.04 %)
n/a 15,494
(1.98 %)
57,878
(5.63 %)
56,939
(8.11 %)
40.66
(99.97 %)
0
(0 %)
723
(0.03 %)
304
(100.00 %)
1,055,724
(20.14 %)
324,841
(3.27 %)
5,000,753
(32.08 %)
4
(0.00 %)
594,081
(5.09 %)
32,357
(1.59 %)
17,357
(0.80 %)
60 bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023)
GCF_030265055.1
63,345
(14.83 %)
n/a 14,387
(3.54 %)
43,563
(7.96 %)
n/a 41.68
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
57
(100.00 %)
842,739
(18.67 %)
356,558
(12.86 %)
2,720,911
(41.08 %)
0
(0 %)
847,608
(10.65 %)
40,187
(4.66 %)
29,700
(2.69 %)
61 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1
n/a n/a 12,494
(1.93 %)
44,967
(5.14 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,174
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
0
(0 %)
344,768
(3.42 %)
23,532
(1.46 %)
12,368
(0.66 %)
62 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2
n/a n/a 14,499
(1.97 %)
51,213
(5.47 %)
n/a 38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
442
(100.00 %)
731,731
(4.21 %)
471,623
(4.92 %)
5,974,055
(42.88 %)
0
(0 %)
455,138
(4.01 %)
29,052
(1.48 %)
14,673
(0.63 %)
63 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1
n/a n/a 13,882
(2.27 %)
45,919
(5.98 %)
n/a 39.50
(99.99 %)
0
(0 %)
45
(0.01 %)
3,194
(100.00 %)
803,073
(13.60 %)
258,404
(4.19 %)
4,674,614
(28.36 %)
0
(0 %)
339,851
(3.09 %)
15,524
(1.02 %)
9,057
(0.56 %)
64 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 primary hap 2021)
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
n/a 15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
0
(0 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
1
(0.00 %)
441,845
(3.68 %)
18,525
(1.10 %)
10,661
(0.59 %)
65 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1
n/a n/a 16,964
(1.77 %)
67,673
(5.93 %)
n/a 42.61
(99.97 %)
28
(0.00 %)
1,785
(0.03 %)
979
(100.00 %)
4,285,965
(30.73 %)
1,222,431
(20.69 %)
6,105,881
(46.99 %)
11
(0.00 %)
1,356,343
(8.48 %)
73,543
(3.28 %)
32,534
(1.37 %)
66 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1
n/a n/a 12,424
(1.95 %)
46,550
(6.00 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,619
(100.00 %)
789,207
(14.61 %)
348,482
(20.98 %)
3,447,241
(38.72 %)
0
(0 %)
1,174,378
(8.68 %)
27,035
(4.16 %)
12,167
(0.85 %)
67 bonti-bonti (fTelBon1 primary hap 2022)
GCA_933228915.1
n/a n/a 14,929
(1.93 %)
55,343
(5.90 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
0
(0 %)
1,329
(0.03 %)
146
(100.00 %)
998,246
(14.90 %)
443,155
(22.40 %)
4,319,947
(40.01 %)
2
(0.00 %)
1,529,147
(9.19 %)
34,018
(4.16 %)
15,066
(0.86 %)
68 bony fish N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1
n/a n/a 17,996
(2.00 %)
89,591
(7.93 %)
n/a 45.22
(99.94 %)
0
(0 %)
3,299
(0.06 %)
1,177
(100.00 %)
2,828,457
(30.93 %)
1,676,413
(19.87 %)
4,137,400
(48.69 %)
14
(0.00 %)
1,929,538
(11.96 %)
78,669
(4.37 %)
29,960
(1.34 %)
69 bony fish P.dabryanus (BB 2023)
GCF_030506205.1
86,420
(8.25 %)
n/a 22,100
(2.28 %)
59,296
(4.66 %)
n/a 38.32
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
610
(100.00 %)
3,555,303
(40.49 %)
538,181
(9.64 %)
6,137,303
(50.16 %)
0
(0 %)
1,400,924
(8.09 %)
71,533
(4.06 %)
19,783
(0.63 %)
70 bony fish R.sp. 'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1
n/a n/a 15,501
(2.18 %)
54,090
(6.20 %)
n/a 41.17
(99.99 %)
0
(0 %)
422
(0.01 %)
82
(100.00 %)
1,727,328
(38.16 %)
259,351
(4.71 %)
4,381,278
(33.25 %)
2
(0.00 %)
338,853
(3.90 %)
35,281
(1.93 %)
14,746
(0.71 %)
71 bony fish T.vachellii (PV-2020 2023)
GCF_030014155.1
43,278
(10.19 %)
n/a 15,613
(2.96 %)
39,340
(5.77 %)
n/a 39.31
(99.98 %)
0
(0 %)
291
(0.02 %)
78
(100.00 %)
1,563,305
(33.23 %)
689,312
(9.96 %)
3,954,578
(35.31 %)
1
(0.00 %)
844,788
(7.26 %)
20,152
(1.50 %)
10,778
(0.73 %)
72 bowfin (hap1 2024)
GCA_036373705.1
n/a n/a 13,851
(1.83 %)
27,058
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
97
(0.00 %)
390
(100.00 %)
953,497
(13.69 %)
387,700
(7.91 %)
4,552,410
(37.72 %)
4
(0.00 %)
613,799
(6.38 %)
46,301
(2.99 %)
26,437
(1.15 %)
73 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1
n/a n/a 17,999
(1.60 %)
76,655
(5.58 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
10,799
(100.00 %)
5,994,257
(39.29 %)
1,126,685
(10.35 %)
6,996,991
(46.02 %)
0
(0 %)
1,131,145
(6.97 %)
71,016
(3.36 %)
27,805
(1.08 %)
74 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1
n/a n/a 17,865
(1.56 %)
76,506
(5.59 %)
n/a 42.15
(99.96 %)
0
(0 %)
2,704
(0.04 %)
676
(100.00 %)
6,391,921
(39.62 %)
1,227,487
(11.70 %)
6,669,558
(49.73 %)
11
(0.00 %)
1,301,019
(7.83 %)
76,828
(3.96 %)
26,877
(0.90 %)
75 broad-nosed pipefish (Sweden RoL2023-S1 2023)
GCF_033458585.1
49,639
(15.87 %)
n/a 13,630
(3.98 %)
43,263
(9.12 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
495
(100.00 %)
727,223
(20.88 %)
290,624
(20.53 %)
1,369,709
(43.82 %)
0
(0 %)
347,124
(7.41 %)
51,671
(14.43 %)
34,210
(4.62 %)
76 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1
92,568
(6.87 %)
n/a 26,875
(1.47 %)
114,101
(4.26 %)
n/a 43.70
(99.83 %)
0
(0 %)
4,299
(0.17 %)
2,721
(100.00 %)
5,005,012
(52.10 %)
2,055,293
(26.66 %)
9,701,968
(57.04 %)
69
(0.00 %)
4,551,597
(10.95 %)
89,897
(2.49 %)
20,734
(0.38 %)
77 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1
49,205
(8.52 %)
n/a 15,634
(1.92 %)
53,710
(4.99 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
0
(0 %)
205
(0.00 %)
26
(100.00 %)
632,147
(3.01 %)
371,482
(3.01 %)
6,438,110
(31.32 %)
1
(0.00 %)
370,750
(2.74 %)
26,136
(0.96 %)
10,272
(0.37 %)
78 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1
47,805
(10.97 %)
n/a 14,997
(2.72 %)
25,504
(5.86 %)
n/a 40.51
(84.10 %)
61,073
(15.93 %)
61,073
(15.93 %)
69,067
(84.07 %)
311,174
(3.20 %)
125,534
(0.72 %)
4,461,288
(20.25 %)
965
(0.08 %)
34,584
(0.52 %)
17,722
(0.91 %)
12,829
(0.64 %)
79 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1
52,584
(12.38 %)
n/a 15,229
(2.54 %)
47,264
(5.92 %)
n/a 40.68
(89.05 %)
0
(0 %)
32,418
(10.97 %)
7,421
(100.00 %)
812,382
(17.52 %)
158,486
(1.12 %)
4,571,794
(23.61 %)
710
(0.05 %)
88,277
(2.15 %)
22,763
(1.21 %)
14,293
(0.75 %)
80 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1
n/a n/a 15,228
(3.42 %)
41,322
(7.36 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,592
(100.00 %)
972,098
(18.43 %)
155,031
(1.41 %)
3,452,400
(21.36 %)
0
(0 %)
85,576
(1.51 %)
15,255
(1.12 %)
10,648
(0.72 %)
81 butterfish (fScaArg1 primary hap 2021)
GCF_020382885.2
52,828
(14.10 %)
n/a 15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
0
(0 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
1
(0.00 %)
96,783
(1.70 %)
15,574
(1.13 %)
10,807
(0.72 %)
82 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1
n/a n/a 14,403
(2.47 %)
61,860
(7.37 %)
n/a 43.15
(99.96 %)
0
(0 %)
1,625
(0.04 %)
525
(100.00 %)
959,651
(12.16 %)
517,137
(13.14 %)
3,775,081
(32.47 %)
9
(0.00 %)
784,659
(7.82 %)
81,881
(6.68 %)
50,317
(3.10 %)
83 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1
n/a n/a 19,842
(2.16 %)
72,007
(6.04 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
2,679
(0.02 %)
2,679
(0.02 %)
15,877
(99.98 %)
1,911,945
(24.70 %)
364,933
(8.56 %)
6,201,042
(32.00 %)
26
(0.00 %)
834,109
(8.34 %)
39,114
(1.56 %)
17,823
(0.57 %)
84 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1
n/a n/a 15,277
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
179
(100.00 %)
1,369,186
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,065
(31.90 %)
0
(0 %)
469,842
(4.88 %)
27,134
(1.64 %)
12,518
(0.55 %)
85 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
n/a 14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
0
(0 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
0
(0 %)
452,303
(4.62 %)
20,453
(1.39 %)
10,802
(0.65 %)
86 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1
n/a n/a 15,980
(2.79 %)
53,680
(6.62 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,656
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
0
(0 %)
386,762
(3.56 %)
20,338
(1.21 %)
10,996
(0.60 %)
87 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3
59,187
(10.70 %)
n/a 15,782
(2.57 %)
45,562
(5.15 %)
n/a 39.82
(99.35 %)
0
(0 %)
100
(0.65 %)
137
(100.00 %)
2,257,240
(46.82 %)
671,926
(8.67 %)
5,043,664
(36.53 %)
0
(0 %)
696,803
(4.91 %)
34,284
(2.16 %)
22,417
(1.13 %)
88 cherry salmon (Uvic2021 2024)
GCF_036934945.1
80,307
(5.31 %)
n/a 27,171
(1.38 %)
123,048
(4.00 %)
n/a 44.12
(99.94 %)
1,043
(0.00 %)
4,047
(0.06 %)
18,306
(100.00 %)
1,207,353
(5.23 %)
2,779,869
(27.93 %)
11,429,057
(55.56 %)
21
(0.00 %)
6,696,647
(13.29 %)
83,137
(1.99 %)
20,398
(0.34 %)
89 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1
61,496
(12.33 %)
n/a 15,296
(2.30 %)
50,818
(6.10 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
0
(0 %)
942
(0.00 %)
823
(100.00 %)
920,881
(19.96 %)
193,629
(1.36 %)
4,724,179
(28.98 %)
1
(0.00 %)
184,981
(2.73 %)
28,565
(1.65 %)
15,987
(0.90 %)
90 Chinese cavefish (2022)
GCF_024868665.1
48,058
(11.91 %)
n/a 16,738
(3.72 %)
46,295
(6.80 %)
n/a 39.61
(98.56 %)
0
(0 %)
9,510
(1.45 %)
1,039
(100.00 %)
1,469,931
(44.44 %)
188,838
(2.34 %)
3,624,116
(35.94 %)
299
(0.05 %)
177,963
(3.81 %)
44,615
(5.01 %)
16,470
(0.98 %)
91 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1
49,677
(9.64 %)
n/a 15,266
(2.70 %)
40,151
(5.21 %)
n/a 38.75
(99.82 %)
0
(0 %)
597
(0.18 %)
286
(100.00 %)
772,209
(6.45 %)
630,039
(7.45 %)
4,729,261
(37.48 %)
0
(0 %)
607,904
(5.63 %)
24,310
(1.76 %)
15,715
(0.95 %)
92 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2
89,005
(6.31 %)
n/a 26,613
(1.64 %)
77,184
(3.14 %)
n/a 39.08
(100.00 %)
0
(0 %)
224
(0.00 %)
353
(100.00 %)
9,298,177
(59.91 %)
977,119
(3.49 %)
13,499,422
(52.38 %)
0
(0 %)
882,883
(2.63 %)
100,309
(2.90 %)
18,261
(0.24 %)
93 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1
81,340
(5.14 %)
n/a 27,462
(1.53 %)
54,538
(3.80 %)
n/a 43.55
(97.26 %)
1,916
(0.01 %)
272,151
(2.76 %)
15,944
(99.99 %)
1,207,194
(4.55 %)
2,524,408
(13.75 %)
12,127,831
(47.56 %)
4,183
(0.05 %)
2,790,142
(6.34 %)
87,959
(2.02 %)
29,706
(0.70 %)
94 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1
92,383
(5.73 %)
n/a 26,372
(1.57 %)
107,059
(4.12 %)
157,582
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,313
(0.01 %)
2,334
(0.01 %)
9,978
(99.99 %)
1,483,168
(7.79 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,888
(54.54 %)
10
(0.00 %)
5,031,483
(11.16 %)
62,726
(1.40 %)
17,444
(0.31 %)
95 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1
n/a n/a 15,165
(2.44 %)
46,105
(6.16 %)
n/a 39.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,163
(100.00 %)
1,546,066
(27.08 %)
537,737
(9.87 %)
4,485,153
(30.70 %)
0
(0 %)
726,611
(6.01 %)
14,774
(0.81 %)
8,304
(0.43 %)
96 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1
34,390
(6.95 %)
n/a 15,348
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
0
(0 %)
1,572
(0.08 %)
360
(100.00 %)
1,669,322
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,373
(32.38 %)
3
(0.00 %)
927,880
(7.23 %)
16,290
(0.85 %)
8,913
(0.42 %)
97 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1
76,338
(6.27 %)
n/a 23,186
(1.70 %)
90,881
(4.14 %)
n/a 43.06
(95.36 %)
2,844
(0.02 %)
242,238
(4.66 %)
28,109
(99.98 %)
1,143,292
(6.07 %)
1,487,818
(12.14 %)
8,992,314
(46.24 %)
3,734
(0.11 %)
2,132,411
(5.90 %)
51,797
(1.25 %)
15,414
(0.35 %)
98 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1
205,915
(6.68 %)
n/a 26,582
(1.42 %)
119,437
(4.14 %)
120,379
(5.87 %)
43.89
(99.99 %)
3,405
(0.01 %)
3,433
(0.01 %)
17,480
(99.99 %)
1,160,500
(5.63 %)
2,584,312
(31.72 %)
10,621,107
(55.67 %)
8
(0.00 %)
6,422,106
(12.88 %)
68,538
(1.53 %)
20,126
(0.36 %)
99 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1
n/a n/a 14,940
(3.51 %)
39,688
(7.41 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
0
(0 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,993
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
0
(0 %)
150,484
(2.39 %)
10,131
(0.86 %)
7,444
(0.57 %)
100 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3
n/a n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
67,055
(11.68 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
633,883
(15.28 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,008
(21.31 %)
0
(0 %)
169,790
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
101 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1
53,567
(9.24 %)
n/a 15,685
(2.23 %)
33,477
(5.63 %)
n/a 39.47
(99.94 %)
0
(0 %)
1,406
(0.06 %)
6,405
(100.00 %)
431,950
(2.92 %)
381,394
(4.84 %)
4,952,343
(31.95 %)
20
(0.00 %)
378,594
(2.99 %)
23,543
(1.15 %)
15,582
(0.70 %)
102 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1
53,912
(11.11 %)
n/a 15,702
(2.37 %)
47,805
(5.50 %)
n/a 39.59
(99.98 %)
0
(0 %)
1,454
(0.02 %)
354
(100.00 %)
1,346,903
(35.25 %)
401,782
(5.36 %)
4,891,035
(31.59 %)
10
(0.00 %)
410,292
(3.79 %)
23,489
(1.28 %)
17,390
(0.95 %)
103 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2
100,850
(6.58 %)
n/a 27,072
(1.56 %)
50,811
(3.95 %)
125,873
(5.26 %)
43.55
(99.98 %)
395
(0.00 %)
5,631
(0.02 %)
4,482
(100.00 %)
1,491,966
(6.88 %)
2,135,217
(25.52 %)
10,152,659
(54.74 %)
5
(0.00 %)
4,738,432
(11.52 %)
65,662
(1.36 %)
18,054
(0.31 %)
104 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1
n/a n/a 18,114
(2.63 %)
66,549
(6.11 %)
n/a 38.62
(99.99 %)
7
(0.00 %)
685
(0.01 %)
215
(100.00 %)
2,639,968
(48.46 %)
659,243
(7.55 %)
5,950,358
(40.47 %)
3
(0.00 %)
963,199
(6.67 %)
62,337
(3.61 %)
19,726
(0.79 %)
105 common carp SPL01 (2021)
GCF_018340385.1
91,210
(7.89 %)
n/a 31,041
(2.89 %)
89,244
(5.01 %)
n/a 37.11
(99.53 %)
0
(0 %)
26,351
(0.48 %)
6,701
(100.00 %)
1,634,612
(6.00 %)
919,239
(3.97 %)
10,192,037
(38.56 %)
0
(0 %)
703,885
(3.08 %)
52,638
(1.62 %)
30,904
(0.80 %)
106 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1
36,211
(8.34 %)
n/a 14,995
(2.62 %)
50,844
(6.89 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
0
(0 %)
275
(0.01 %)
338
(100.00 %)
1,186,799
(32.17 %)
307,864
(16.34 %)
3,562,802
(35.00 %)
2
(0.00 %)
481,477
(5.21 %)
41,657
(2.72 %)
22,630
(1.29 %)
107 common seadragon (TA_2022b 2022)
GCF_024500385.1
60,947
(12.28 %)
n/a 13,706
(2.67 %)
42,956
(5.71 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
196
(0.00 %)
1,259
(100.00 %)
1,417,848
(37.47 %)
173,323
(3.85 %)
3,968,694
(40.23 %)
3
(0.00 %)
319,133
(3.25 %)
70,253
(6.29 %)
38,941
(2.56 %)
108 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1
n/a n/a 14,904
(2.99 %)
43,194
(7.09 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,318
(100.00 %)
1,128,080
(18.77 %)
328,975
(8.35 %)
3,952,898
(31.64 %)
0
(0 %)
410,353
(4.52 %)
26,979
(2.08 %)
15,469
(0.95 %)
109 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1
55,359
(12.02 %)
n/a 14,844
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
242
(100.00 %)
1,149,243
(19.12 %)
342,238
(9.71 %)
3,906,753
(32.84 %)
2
(0.00 %)
440,509
(5.18 %)
27,772
(2.71 %)
15,561
(0.92 %)
110 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1
n/a n/a 5,231
(0.27 %)
47,644
(1.48 %)
n/a 44.62
(99.99 %)
144
(0.01 %)
144
(0.01 %)
21,561
(99.99 %)
2,803,873
(49.20 %)
655,416
(2.69 %)
7,558,550
(67.05 %)
0
(0 %)
912,917
(5.74 %)
181,626
(10.52 %)
19,591
(0.39 %)
111 convict blenny (fPhoLeu1 primary hap 2021)
GCA_020510985.1
n/a n/a n/a 134,417
(1.50 %)
n/a 44.52
(99.13 %)
0
(0 %)
2,580
(0.87 %)
512
(100.00 %)
9,062,541
(49.33 %)
2,097,650
(2.66 %)
3,092
(99.13 %)
5
(0.00 %)
3,135,536
(6.36 %)
568,042
(10.14 %)
0
(0.00 %)
112 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1
n/a n/a 13,622
(2.81 %)
43,285
(6.93 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,125
(100.00 %)
1,741,373
(32.89 %)
182,926
(2.01 %)
3,659,106
(21.68 %)
1
(0.00 %)
138,669
(1.93 %)
27,693
(1.89 %)
19,848
(1.23 %)
113 copperband butterflyfish (fCheRos1 primary hap 2021)
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
n/a 15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
61,755
(8.99 %)
42.57
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
1
(0.00 %)
158,516
(2.15 %)
29,106
(1.85 %)
19,302
(1.11 %)
114 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1
n/a n/a 14,740
(2.91 %)
45,483
(7.26 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
0
(0 %)
1,379
(0.04 %)
395
(100.00 %)
936,676
(24.41 %)
306,192
(9.29 %)
3,495,456
(28.75 %)
2
(0.00 %)
463,889
(5.20 %)
29,142
(2.35 %)
16,622
(1.09 %)
115 Corydoras catfish unclassified (C115 2021)
GCA_019802505.1
n/a n/a 14,695
(2.68 %)
51,799
(6.37 %)
n/a 42.12
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,080
(100.00 %)
1,969,654
(37.02 %)
663,295
(11.19 %)
3,764,275
(45.19 %)
0
(0 %)
1,764,080
(12.85 %)
67,226
(8.43 %)
47,724
(3.53 %)
116 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1
n/a n/a 4,509
(3.03 %)
16,936
(7.22 %)
n/a 38.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,713
(100.00 %)
430,197
(46.38 %)
101,926
(7.54 %)
1,077,239
(32.21 %)
0
(0 %)
149,644
(6.00 %)
10,612
(4.11 %)
3,661
(0.96 %)
117 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1
90,094
(6.75 %)
n/a 29,386
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
0
(0 %)
832
(0.01 %)
277
(100.00 %)
3,481,382
(45.81 %)
802,773
(6.54 %)
8,190,783
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,003,533
(5.09 %)
83,696
(3.82 %)
26,039
(0.81 %)
118 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1
51,190
(10.37 %)
n/a 15,144
(2.59 %)
43,207
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.98 %)
0
(0 %)
570
(0.02 %)
324
(100.00 %)
1,435,625
(29.39 %)
330,276
(12.54 %)
4,196,830
(33.83 %)
1
(0.00 %)
689,646
(5.54 %)
19,310
(1.01 %)
11,155
(0.57 %)
119 cunner (fRauAds1 primary hap 2021)
GCA_020745685.1
n/a n/a 15,192
(2.74 %)
43,564
(6.38 %)
n/a 41.31
(99.41 %)
0
(0 %)
283
(0.59 %)
64
(100.00 %)
1,419,667
(30.50 %)
243,024
(4.81 %)
4,334,690
(27.65 %)
2
(0.00 %)
297,510
(2.95 %)
17,974
(1.06 %)
9,021
(0.52 %)
120 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1
n/a n/a 14,861
(2.74 %)
42,996
(6.34 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
0
(0 %)
31
(0.01 %)
1,476
(100.00 %)
1,373,727
(30.17 %)
220,572
(4.38 %)
4,176,936
(27.32 %)
0
(0 %)
274,559
(2.86 %)
17,129
(1.04 %)
8,648
(0.51 %)
121 Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020)
GCF_015846415.1
49,108
(12.72 %)
n/a 16,501
(4.06 %)
40,671
(7.11 %)
n/a 38.77
(100.00 %)
116
(0.00 %)
116
(0.00 %)
167
(100.00 %)
1,213,719
(40.21 %)
134,299
(3.43 %)
3,676,403
(30.98 %)
0
(0 %)
240,696
(3.68 %)
29,879
(3.18 %)
13,593
(0.92 %)
122 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1
n/a 47,476
(8.36 %)
16,341
(3.18 %)
41,545
(5.47 %)
n/a 38.57
(98.69 %)
8,366
(1.31 %)
8,366
(1.31 %)
36,005
(98.69 %)
300,659
(2.50 %)
212,357
(6.15 %)
4,267,143
(35.05 %)
53
(0.01 %)
572,127
(5.71 %)
23,311
(2.18 %)
10,121
(0.71 %)
123 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1
n/a n/a 15,965
(3.73 %)
37,421
(5.87 %)
n/a 38.52
(94.12 %)
18,487
(5.88 %)
18,487
(5.88 %)
29,831
(94.12 %)
251,333
(2.28 %)
132,120
(1.41 %)
4,061,554
(28.83 %)
1,201
(0.07 %)
63,401
(0.80 %)
16,871
(1.57 %)
9,058
(0.64 %)
124 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
n/a 15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
0
(0 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
4
(0.00 %)
383,250
(3.60 %)
32,973
(1.28 %)
9,764
(0.33 %)
125 delta smelt
GCF_021917145.1
41,807
(14.97 %)
n/a 14,549
(4.09 %)
44,849
(9.74 %)
n/a 44.99
(99.92 %)
0
(0 %)
1,474
(0.08 %)
376
(100.00 %)
387,882
(5.57 %)
383,522
(9.22 %)
1,814,696
(32.48 %)
5
(0.00 %)
335,886
(5.91 %)
28,299
(3.33 %)
15,642
(1.48 %)
126 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2
n/a n/a 14,119
(3.95 %)
47,988
(8.57 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,660
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
0
(0 %)
175,500
(3.05 %)
50,830
(8.72 %)
41,064
(4.69 %)
127 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2
n/a n/a 16,559
(3.78 %)
58,823
(8.66 %)
74,128
(10.47 %)
43.69
(99.18 %)
0
(0 %)
464
(0.82 %)
461
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,284
(4.61 %)
2,948,738
(28.79 %)
0
(0 %)
306,165
(4.31 %)
64,661
(9.49 %)
52,867
(4.93 %)
128 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1
n/a n/a 16,788
(2.12 %)
50,338
(4.68 %)
n/a 41.27
(98.12 %)
0
(0 %)
641
(1.88 %)
182
(100.00 %)
2,709,759
(34.74 %)
798,364
(14.84 %)
5,418,190
(36.02 %)
1
(0.00 %)
1,397,111
(8.85 %)
30,055
(1.31 %)
21,119
(0.80 %)
129 dorado (hap2 2023)
GCA_030463535.1
n/a n/a 16,799
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
0
(0 %)
726
(0.85 %)
104
(100.00 %)
2,693,928
(34.60 %)
805,807
(14.65 %)
5,615,731
(36.69 %)
2
(0.00 %)
1,425,798
(8.96 %)
30,083
(1.31 %)
21,157
(0.81 %)
130 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1
51,353
(12.50 %)
n/a 13,736
(3.19 %)
50,537
(7.64 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
0
(0 %)
79
(0.00 %)
213
(100.00 %)
986,789
(36.30 %)
235,862
(13.25 %)
2,323,084
(41.85 %)
0
(0 %)
428,926
(7.18 %)
68,121
(17.75 %)
37,525
(4.04 %)
131 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5
n/a n/a 15,552
(2.29 %)
52,465
(6.26 %)
86,437
(9.40 %)
41.07
(99.87 %)
115
(0.00 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
1,309,350
(35.93 %)
217,916
(1.89 %)
4,547,434
(30.78 %)
2
(0.00 %)
212,425
(2.79 %)
33,005
(1.88 %)
15,205
(0.74 %)
132 electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020)
GCA_013347915.1
n/a n/a 12,020
(3.63 %)
38,881
(7.31 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,629
(100.00 %)
429,509
(7.66 %)
432,260
(11.41 %)
2,049,609
(24.32 %)
0
(0 %)
486,181
(6.19 %)
35,597
(4.37 %)
27,662
(2.94 %)
133 electric eel (fEleEle1 primary hap 2020)
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
n/a 15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
54,541
(8.42 %)
42.49
(98.20 %)
0
(0 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
1
(0.00 %)
629,918
(5.96 %)
44,501
(3.93 %)
34,390
(2.63 %)
134 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1
40,618
(11.48 %)
n/a 15,837
(3.85 %)
23,074
(6.63 %)
n/a 42.56
(96.95 %)
0
(0 %)
119,361
(3.09 %)
8,786
(100.00 %)
519,014
(5.41 %)
516,718
(6.65 %)
3,020,801
(21.49 %)
1,953
(0.21 %)
261,654
(3.62 %)
41,947
(3.71 %)
33,441
(2.64 %)
135 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1
82,153
(9.98 %)
n/a 16,513
(2.13 %)
79,047
(6.37 %)
n/a 44.15
(99.99 %)
0
(0 %)
234
(0.01 %)
1,425
(100.00 %)
923,543
(11.79 %)
425,650
(9.45 %)
3,525,237
(34.97 %)
0
(0 %)
812,868
(7.46 %)
91,552
(5.39 %)
61,344
(2.61 %)
136 emerald rockcod
GCF_902827165.1
44,179
(8.48 %)
n/a 15,275
(2.20 %)
57,830
(6.43 %)
63,731
(6.65 %)
40.94
(99.99 %)
0
(0 %)
932
(0.01 %)
864
(100.00 %)
460,185
(3.64 %)
399,729
(6.87 %)
3,533,188
(40.09 %)
6
(0.00 %)
642,666
(6.28 %)
52,191
(2.51 %)
13,014
(0.62 %)
137 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1
n/a n/a 17,920
(3.03 %)
59,697
(6.61 %)
n/a 39.13
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
4,949
(100.00 %)
2,285,870
(44.17 %)
480,649
(10.13 %)
4,833,803
(39.56 %)
0
(0 %)
820,249
(6.21 %)
57,737
(4.15 %)
23,311
(1.22 %)
138 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1
n/a n/a 17,661
(3.01 %)
58,218
(6.54 %)
n/a 39.21
(99.98 %)
0
(0 %)
881
(0.02 %)
125
(100.00 %)
2,346,939
(44.27 %)
502,415
(11.23 %)
4,890,830
(40.45 %)
0
(0 %)
873,838
(6.63 %)
60,482
(4.22 %)
24,091
(1.23 %)
139 European anchovy (BLACKSEA-1 2023)
GCF_034702125.1
48,154
(5.87 %)
n/a 15,415
(1.33 %)
77,712
(5.08 %)
n/a 44.45
(99.99 %)
0
(0 %)
9,202
(0.02 %)
1,922
(100.00 %)
4,406,534
(31.73 %)
2,331,293
(15.35 %)
6,863,540
(50.47 %)
15
(0.00 %)
1,701,493
(7.18 %)
80,927
(2.32 %)
27,462
(0.84 %)
140 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1
n/a n/a 17,416
(2.74 %)
60,936
(6.02 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
7,437
(100.00 %)
2,377,147
(47.98 %)
578,235
(8.27 %)
5,267,308
(40.22 %)
0
(0 %)
872,083
(6.16 %)
50,909
(3.45 %)
17,892
(0.86 %)
141 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1
n/a n/a 18,028
(2.64 %)
64,206
(6.04 %)
n/a 38.73
(99.99 %)
0
(0 %)
588
(0.01 %)
106
(100.00 %)
2,649,943
(48.88 %)
666,129
(9.08 %)
5,751,610
(41.56 %)
5
(0.00 %)
1,113,756
(7.21 %)
58,471
(3.64 %)
19,602
(0.84 %)
142 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1
n/a n/a 14,690
(3.17 %)
48,422
(7.90 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,915
(100.00 %)
1,138,190
(26.31 %)
249,865
(4.72 %)
3,352,038
(25.55 %)
0
(0 %)
232,419
(3.75 %)
36,828
(3.13 %)
27,093
(1.88 %)
143 European flounder (primary hap 2023)
GCA_949316205.1
n/a n/a 14,753
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
109
(100.00 %)
1,160,784
(27.06 %)
251,985
(5.23 %)
3,353,121
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,297
(3.81 %)
37,130
(2.79 %)
27,432
(1.88 %)
144 European flounder (primary hap 2023)
GCF_949316205.1
48,969
(12.45 %)
n/a 14,751
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
108
(100.00 %)
1,160,781
(27.06 %)
251,983
(5.23 %)
3,353,086
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,298
(3.81 %)
37,129
(2.79 %)
27,431
(1.88 %)
145 European perch
GCF_010015445.1
55,605
(8.20 %)
n/a 15,430
(2.07 %)
55,499
(5.43 %)
n/a 40.90
(99.97 %)
0
(0 %)
801
(0.03 %)
303
(100.00 %)
684,094
(5.16 %)
634,788
(7.48 %)
5,182,241
(37.07 %)
0
(0 %)
746,988
(5.12 %)
44,049
(1.94 %)
15,321
(0.71 %)
146 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1
n/a n/a 14,619
(2.94 %)
50,389
(7.92 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
3,222
(100.00 %)
430,112
(3.88 %)
299,581
(6.89 %)
3,182,258
(27.97 %)
0
(0 %)
330,159
(4.99 %)
40,094
(3.66 %)
20,637
(1.37 %)
147 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1
46,468
(10.51 %)
n/a 14,818
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
0
(0 %)
1,072
(0.03 %)
355
(100.00 %)
476,314
(3.63 %)
520,729
(13.27 %)
3,283,360
(33.55 %)
2
(0.00 %)
525,277
(6.36 %)
47,050
(4.45 %)
21,878
(1.29 %)
148 European seabass (2021)
GCF_905237075.1
62,457
(13.08 %)
n/a 15,582
(2.89 %)
44,472
(6.56 %)
69,435
(12.92 %)
40.38
(99.85 %)
0
(0 %)
272
(0.15 %)
303
(100.00 %)
1,210,970
(24.30 %)
278,140
(4.02 %)
4,343,442
(26.18 %)
1
(0.00 %)
309,168
(3.42 %)
15,975
(0.93 %)
10,409
(0.57 %)
149 European smelt (primary hap 2023)
GCA_963692335.1
n/a n/a 15,640
(3.79 %)
50,248
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
30
(0.00 %)
2,462
(0.10 %)
1,038
(100.00 %)
1,648,435
(31.35 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,832
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
150 European smelt (primary hap 2023)
GCF_963692335.1
46,762
(14.07 %)
n/a 15,639
(3.79 %)
50,238
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
0
(0 %)
2,462
(0.10 %)
1,007
(100.00 %)
1,648,428
(31.34 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,793
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
151 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1
n/a n/a 16,181
(2.44 %)
63,544
(7.17 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
0
(0 %)
1,501
(0.04 %)
387
(100.00 %)
2,109,362
(31.42 %)
1,300,159
(14.91 %)
3,634,744
(35.44 %)
6
(0.00 %)
1,178,448
(8.78 %)
35,552
(1.87 %)
19,823
(1.00 %)
152 fathead minnow
GCF_016745375.1
57,312
(8.34 %)
n/a 18,039
(3.02 %)
52,431
(6.01 %)
n/a 38.45
(86.78 %)
0
(0 %)
5,594
(13.23 %)
911
(100.00 %)
657,027
(4.09 %)
444,571
(6.23 %)
4,902,960
(35.69 %)
5
(0.00 %)
807,051
(7.17 %)
49,361
(2.78 %)
20,934
(0.93 %)
153 flathead mullet
GCF_022458985.1
48,689
(12.71 %)
n/a 14,908
(3.00 %)
45,084
(6.96 %)
75,582
(11.23 %)
41.90
(99.97 %)
0
(0 %)
445
(0.04 %)
24
(100.00 %)
469,841
(3.23 %)
207,738
(2.31 %)
3,955,233
(24.74 %)
0
(0 %)
232,148
(2.99 %)
45,885
(3.03 %)
31,971
(1.87 %)
154 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1
n/a n/a 17,494
(2.06 %)
62,257
(5.73 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,986
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
0
(0 %)
240,032
(2.50 %)
26,445
(1.22 %)
12,638
(0.48 %)
155 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
n/a 15,434
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
0
(0 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
0
(0 %)
227,442
(2.84 %)
24,130
(1.26 %)
11,082
(0.48 %)
156 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1
n/a n/a 13,745
(2.58 %)
50,416
(6.72 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
5,171
(100.00 %)
442,646
(4.09 %)
276,927
(5.42 %)
3,741,267
(26.25 %)
0
(0 %)
406,474
(4.11 %)
28,827
(2.28 %)
19,731
(1.36 %)
157 freshwater garfish (fXenCan1 primary hap 2020)
GCA_014839995.1
n/a n/a 14,625
(2.57 %)
52,879
(6.72 %)
n/a 41.41
(98.98 %)
0
(0 %)
1,373
(1.02 %)
410
(100.00 %)
492,828
(4.29 %)
318,631
(5.94 %)
3,977,536
(27.41 %)
0
(0 %)
521,102
(4.91 %)
32,390
(2.33 %)
21,612
(1.34 %)
158 giant grouper
GCF_005281545.1
45,328
(7.65 %)
n/a 15,661
(1.91 %)
53,910
(4.91 %)
n/a 41.26
(96.40 %)
0
(0 %)
23,415
(3.61 %)
4,201
(100.00 %)
604,763
(2.71 %)
357,944
(2.52 %)
6,501,327
(30.28 %)
1,632
(0.21 %)
237,713
(2.85 %)
26,431
(0.91 %)
9,943
(0.35 %)
159 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1
n/a n/a 13,090
(2.37 %)
48,927
(6.41 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,758
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
0
(0 %)
201,169
(2.33 %)
38,368
(2.40 %)
20,092
(1.12 %)
160 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2
n/a n/a 15,752
(2.45 %)
56,395
(6.58 %)
n/a 41.94
(99.96 %)
0
(0 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
1,474,134
(29.50 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,691
(25.69 %)
0
(0 %)
355,475
(3.53 %)
47,327
(2.41 %)
29,914
(1.44 %)
161 golden-line barbel
GCF_001515645.1
74,071
(6.71 %)
n/a 29,486
(2.77 %)
55,545
(5.32 %)
n/a 37.54
(89.58 %)
136,797
(10.45 %)
136,894
(10.45 %)
168,074
(89.55 %)
1,118,646
(5.04 %)
718,426
(6.54 %)
9,092,306
(37.16 %)
3,220
(0.35 %)
778,152
(11.46 %)
70,606
(1.91 %)
26,998
(0.64 %)
162 goldfish
GCF_003368295.1
116,745
(8.75 %)
n/a 35,097
(2.94 %)
68,251
(6.12 %)
n/a 37.48
(99.99 %)
2,247
(0.01 %)
2,247
(0.01 %)
8,463
(99.99 %)
1,693,800
(5.39 %)
916,195
(5.01 %)
9,731,118
(40.19 %)
0
(0 %)
1,030,815
(4.89 %)
66,585
(2.06 %)
27,619
(0.65 %)
163 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1
67,810
(11.16 %)
n/a 18,195
(3.27 %)
48,459
(5.67 %)
n/a 37.48
(99.98 %)
0
(0 %)
150
(0.02 %)
31
(100.00 %)
654,416
(3.33 %)
429,734
(3.77 %)
5,501,085
(40.21 %)
1
(0.00 %)
413,986
(3.73 %)
26,282
(1.58 %)
15,753
(0.76 %)
164 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1
36,344
(7.09 %)
n/a 14,512
(1.92 %)
45,809
(4.61 %)
n/a 39.76
(99.63 %)
0
(0 %)
3,407
(0.37 %)
600
(100.00 %)
2,662,894
(54.47 %)
803,911
(10.32 %)
5,763,692
(48.31 %)
3
(0.00 %)
1,131,797
(6.83 %)
53,808
(2.65 %)
23,231
(1.00 %)
165 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1
25,822
(5.19 %)
n/a 14,212
(1.97 %)
27,894
(4.68 %)
n/a 39.49
(93.15 %)
92,327
(6.89 %)
92,327
(6.89 %)
108,947
(93.11 %)
552,368
(5.00 %)
742,395
(8.07 %)
5,901,720
(42.46 %)
146
(0.03 %)
487,419
(6.15 %)
44,972
(1.97 %)
19,348
(0.76 %)
166 greater amberjack
GCF_002260705.1
33,756
(9.11 %)
n/a 15,336
(2.93 %)
22,220
(6.07 %)
n/a 40.86
(99.17 %)
0
(0 %)
9,742
(0.82 %)
34,656
(100.00 %)
573,770
(4.04 %)
368,800
(3.72 %)
4,449,534
(24.71 %)
371
(0.04 %)
251,784
(3.33 %)
15,850
(0.98 %)
10,738
(0.58 %)
167 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1
n/a n/a 15,483
(3.45 %)
47,484
(7.95 %)
n/a 44.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,805
(100.00 %)
1,400,150
(23.78 %)
738,163
(17.35 %)
2,460,977
(35.90 %)
0
(0 %)
605,154
(7.13 %)
20,794
(2.09 %)
11,413
(0.80 %)
168 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1
n/a n/a 16,553
(3.15 %)
51,766
(7.37 %)
n/a 44.75
(99.95 %)
61
(0.00 %)
1,752
(0.05 %)
1,085
(100.00 %)
1,674,762
(26.07 %)
900,455
(18.62 %)
2,849,256
(39.22 %)
0
(0 %)
824,383
(7.94 %)
26,022
(2.30 %)
13,322
(0.79 %)
169 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1
n/a n/a 10,795
(5.59 %)
33,380
(12.07 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,376
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
0
(0 %)
64,742
(2.40 %)
34,104
(12.82 %)
25,350
(6.24 %)
170 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
n/a 13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
37,563
(15.76 %)
43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
0
(0 %)
112,918
(3.25 %)
46,327
(10.97 %)
32,897
(5.93 %)
171 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1
n/a n/a 13,412
(4.76 %)
45,946
(11.50 %)
n/a 44.34
(99.99 %)
0
(0 %)
95
(0.01 %)
251
(100.00 %)
494,547
(20.10 %)
204,804
(10.66 %)
1,444,044
(34.08 %)
0
(0 %)
208,543
(5.33 %)
47,904
(17.47 %)
32,381
(5.25 %)
172 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1
n/a n/a 13,681
(4.93 %)
45,034
(11.64 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,533
(100.00 %)
460,038
(18.47 %)
163,838
(7.90 %)
1,681,190
(29.08 %)
0
(0 %)
141,147
(3.92 %)
47,523
(15.60 %)
33,138
(6.10 %)
173 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1
n/a n/a 13,432
(2.10 %)
50,930
(6.39 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,952
(100.00 %)
2,495,763
(38.80 %)
473,105
(6.27 %)
3,444,123
(38.56 %)
0
(0 %)
474,250
(4.43 %)
35,298
(1.94 %)
13,822
(0.66 %)
174 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1
n/a n/a 15,028
(2.35 %)
50,436
(6.30 %)
n/a 41.10
(99.97 %)
0
(0 %)
1,188
(0.03 %)
1,568
(100.00 %)
2,688,222
(39.74 %)
549,362
(7.60 %)
3,564,661
(40.05 %)
4
(0.00 %)
605,421
(5.26 %)
37,043
(1.94 %)
11,494
(0.60 %)
175 green swordtail
GCF_003331165.1
52,602
(11.81 %)
n/a 14,955
(2.58 %)
47,115
(6.33 %)
n/a 39.09
(99.71 %)
185
(0.00 %)
661
(0.29 %)
272
(100.00 %)
328,469
(2.10 %)
162,178
(2.35 %)
4,801,050
(28.86 %)
1
(0.00 %)
227,225
(3.22 %)
37,217
(2.39 %)
25,655
(1.36 %)
176 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1
n/a n/a 14,752
(2.74 %)
58,725
(8.49 %)
n/a 43.13
(99.98 %)
3
(0.00 %)
553
(0.02 %)
322
(100.00 %)
1,860,845
(35.64 %)
378,045
(9.39 %)
3,208,482
(30.12 %)
0
(0 %)
450,213
(5.20 %)
66,857
(4.99 %)
44,052
(2.67 %)
177 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1
n/a n/a 16,645
(1.92 %)
62,533
(4.55 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
7,253
(100.00 %)
5,166,731
(67.78 %)
750,850
(11.35 %)
5,903,440
(54.20 %)
0
(0 %)
1,408,406
(7.28 %)
90,235
(5.58 %)
15,520
(0.51 %)
178 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1
n/a n/a 17,136
(1.90 %)
63,611
(4.50 %)
n/a 39.74
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,046
(0.01 %)
233
(100.00 %)
5,662,029
(68.75 %)
825,757
(11.99 %)
6,236,024
(55.15 %)
4
(0.00 %)
1,606,132
(7.98 %)
99,559
(5.68 %)
16,304
(0.51 %)
179 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1
58,587
(18.27 %)
n/a 13,442
(4.00 %)
41,565
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
253,033
(3.86 %)
180,311
(16.78 %)
1,339,521
(43.63 %)
0
(0 %)
465,901
(9.76 %)
51,080
(18.49 %)
31,396
(4.21 %)
180 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4
n/a n/a 13,441
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
644,601
(20.82 %)
180,310
(16.78 %)
1,339,461
(43.63 %)
0
(0 %)
465,902
(9.76 %)
51,080
(18.49 %)
31,396
(4.21 %)
181 guppy
GCF_000633615.1
48,290
(11.24 %)
n/a 14,436
(2.72 %)
44,759
(6.24 %)
n/a 39.33
(90.86 %)
37,376
(9.16 %)
458,354
(9.22 %)
40,143
(90.84 %)
340,480
(2.43 %)
167,943
(1.50 %)
4,695,380
(25.63 %)
1,124
(0.10 %)
71,291
(1.20 %)
35,188
(1.91 %)
26,043
(1.36 %)
182 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1
n/a n/a 15,058
(2.50 %)
46,340
(5.85 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
2,131
(100.00 %)
1,642,351
(37.42 %)
389,169
(5.43 %)
4,687,710
(35.55 %)
0
(0 %)
541,909
(4.77 %)
34,408
(1.75 %)
16,136
(0.80 %)
183 honeycomb rockfish (fSebUmb1 primary hap 2020)
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
n/a 15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
63,546
(8.88 %)
40.77
(99.83 %)
0
(0 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
1
(0.00 %)
627,017
(5.28 %)
37,878
(1.84 %)
15,343
(0.71 %)
184 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1
74,585
(6.94 %)
n/a 30,802
(3.11 %)
57,655
(5.63 %)
n/a 37.18
(91.91 %)
150,790
(8.11 %)
150,790
(8.11 %)
314,962
(91.89 %)
1,147,234
(4.93 %)
708,513
(4.77 %)
9,080,512
(35.95 %)
1,724
(0.23 %)
n/a 63,217
(1.71 %)
29,804
(0.74 %)
185 humphead wrasse
GCF_018320785.1
42,229
(6.60 %)
n/a 15,287
(1.66 %)
47,025
(4.13 %)
n/a 39.53
(100.00 %)
0
(0 %)
284
(0.00 %)
46
(100.00 %)
447,458
(2.27 %)
310,170
(4.65 %)
8,002,463
(32.97 %)
1
(0.00 %)
473,364
(2.54 %)
12,252
(0.38 %)
8,635
(0.26 %)
186 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1
n/a n/a 14,412
(3.70 %)
41,944
(8.58 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
0
(0 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,774
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
0
(0 %)
195,444
(3.94 %)
15,419
(1.38 %)
8,375
(0.73 %)
187 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2
n/a n/a 15,339
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
57,867
(10.10 %)
42.38
(98.08 %)
0
(0 %)
1,523
(1.92 %)
157
(100.00 %)
346,399
(3.02 %)
163,524
(3.00 %)
2,755,274
(25.07 %)
0
(0 %)
235,504
(4.25 %)
17,931
(1.47 %)
9,749
(0.74 %)
188 Indian medaka
GCF_002922805.2
49,295
(10.27 %)
n/a 14,591
(2.49 %)
52,982
(6.37 %)
n/a 39.04
(94.83 %)
0
(0 %)
51,550
(5.20 %)
8,493
(100.00 %)
319,151
(2.20 %)
208,690
(2.67 %)
5,412,546
(33.29 %)
180
(0.02 %)
209,477
(2.14 %)
40,721
(2.36 %)
28,619
(1.60 %)
189 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1
41,583
(6.91 %)
n/a 18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
74,968
(7.01 %)
43.02
(99.97 %)
0
(0 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
0
(0 %)
319,481
(2.18 %)
78,561
(3.69 %)
58,460
(2.33 %)
190 Japanese flounder
GCF_001970005.1
37,838
(12.25 %)
n/a 14,521
(3.39 %)
30,773
(7.34 %)
n/a 41.64
(81.04 %)
0
(0 %)
40,314
(18.97 %)
9,525
(100.00 %)
332,322
(2.84 %)
164,916
(1.16 %)
3,476,344
(17.36 %)
317
(0.14 %)
34,362
(0.47 %)
21,768
(1.42 %)
15,778
(0.96 %)
191 Japanese medaka
GCF_002234675.1
50,526
(10.32 %)
n/a 14,325
(2.50 %)
27,912
(6.71 %)
91,652
(11.67 %)
40.84
(99.93 %)
0
(0 %)
491
(0.07 %)
25
(100.00 %)
384,317
(4.42 %)
163,041
(3.07 %)
4,631,750
(34.91 %)
2
(0.00 %)
257,543
(3.04 %)
41,215
(2.89 %)
23,967
(1.50 %)
192 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1
42,877
(8.61 %)
n/a 15,188
(2.40 %)
41,262
(7.86 %)
58,418
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
0
(0 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
667,122
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
0
(0 %)
422,332
(3.88 %)
121,464
(9.36 %)
77,061
(4.51 %)
193 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1
n/a n/a 15,945
(2.17 %)
101,825
(8.93 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
0
(0 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,228
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
0
(0 %)
541,432
(4.29 %)
138,484
(9.55 %)
86,420
(4.60 %)
194 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1
n/a n/a 14,960
(2.23 %)
74,436
(6.65 %)
n/a 43.94
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,370
(100.00 %)
1,620,688
(23.00 %)
902,057
(13.66 %)
4,547,953
(39.90 %)
0
(0 %)
892,097
(6.41 %)
129,990
(12.07 %)
77,992
(4.35 %)
195 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1
n/a n/a 14,906
(2.33 %)
72,029
(6.72 %)
n/a 43.92
(99.98 %)
0
(0 %)
887
(0.02 %)
191
(100.00 %)
1,609,654
(22.82 %)
897,264
(13.58 %)
4,548,467
(39.80 %)
11
(0.00 %)
875,374
(6.46 %)
129,147
(11.75 %)
77,287
(4.33 %)
196 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1
45,779
(8.57 %)
n/a 15,561
(1.99 %)
53,188
(5.12 %)
n/a 41.32
(97.02 %)
0
(0 %)
48,394
(2.99 %)
4,563
(100.00 %)
574,889
(2.73 %)
367,135
(2.64 %)
6,420,280
(29.10 %)
2,337
(0.06 %)
244,886
(1.72 %)
28,979
(1.07 %)
10,901
(0.40 %)
197 lake trout
GCF_016432855.1
65,012
(4.57 %)
n/a 26,528
(1.53 %)
112,119
(4.47 %)
76,885
(3.80 %)
43.50
(99.99 %)
0
(0 %)
3,264
(0.01 %)
4,121
(100.00 %)
1,387,896
(5.81 %)
1,797,785
(19.28 %)
9,643,314
(54.44 %)
2
(0.00 %)
3,778,575
(10.18 %)
85,419
(2.52 %)
19,617
(0.38 %)
198 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1
78,867
(4.31 %)
n/a 27,579
(1.38 %)
113,850
(3.63 %)
n/a 44.18
(100.00 %)
0
(0 %)
1,716
(0.00 %)
6,355
(100.00 %)
1,729,029
(6.03 %)
1,781,307
(15.24 %)
9,311,548
(61.16 %)
0
(0 %)
4,057,370
(10.85 %)
126,142
(4.04 %)
18,712
(0.30 %)
199 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1
87,246
(4.53 %)
n/a 28,366
(1.38 %)
117,266
(3.71 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
0
(0 %)
1,159
(0.00 %)
7,334
(100.00 %)
1,768,537
(6.02 %)
1,793,716
(15.51 %)
9,525,312
(61.13 %)
0
(0 %)
4,153,782
(10.89 %)
126,485
(3.95 %)
18,425
(0.28 %)
200 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1
n/a n/a 17,851
(1.28 %)
83,249
(5.18 %)
n/a 42.69
(99.97 %)
36
(0.00 %)
2,397
(0.03 %)
709
(100.00 %)
7,797,173
(37.37 %)
1,593,818
(10.64 %)
7,610,300
(54.05 %)
15
(0.00 %)
1,726,634
(9.03 %)
127,942
(3.84 %)
34,520
(0.93 %)
201 large yellow croaker
GCF_000972845.2
49,914
(11.76 %)
n/a 15,365
(3.00 %)
26,101
(6.66 %)
n/a 41.34
(99.67 %)
0
(0 %)
7,424
(0.33 %)
9,998
(100.00 %)
478,685
(3.50 %)
306,063
(3.37 %)
4,199,578
(24.80 %)
65
(0.01 %)
319,923
(3.93 %)
28,138
(2.09 %)
16,153
(1.01 %)
202 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1
n/a n/a 15,841
(2.36 %)
79,276
(8.51 %)
n/a 46.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,761
(100.00 %)
2,935,570
(42.17 %)
1,208,602
(21.28 %)
3,157,730
(42.63 %)
0
(0 %)
1,448,522
(11.27 %)
88,759
(6.30 %)
47,311
(2.77 %)
203 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1
n/a n/a 16,376
(2.19 %)
82,947
(7.99 %)
n/a 46.31
(99.94 %)
144
(0.00 %)
2,631
(0.06 %)
1,522
(100.00 %)
3,333,323
(43.58 %)
1,553,932
(25.91 %)
3,393,507
(46.78 %)
9
(0.00 %)
1,764,517
(12.32 %)
99,668
(6.39 %)
51,378
(2.60 %)
204 largemouth bass
GCF_014851395.1
55,170
(9.49 %)
n/a 16,635
(2.18 %)
56,707
(5.52 %)
n/a 40.86
(99.85 %)
0
(0 %)
2,909
(0.15 %)
4,753
(100.00 %)
497,281
(2.60 %)
269,495
(3.70 %)
5,496,732
(29.60 %)
0
(0 %)
430,490
(4.27 %)
28,733
(1.66 %)
13,319
(0.61 %)
205 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1
n/a n/a 8,132
(2.11 %)
25,878
(4.67 %)
n/a 38.55
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,088
(100.00 %)
260,789
(2.73 %)
158,564
(2.12 %)
3,023,128
(27.39 %)
0
(0 %)
71,421
(1.44 %)
9,678
(1.02 %)
7,876
(0.74 %)
206 largescale foureyes (fAnaAna1 primary hap 2020)
GCA_014839685.1
n/a n/a 14,774
(2.18 %)
42,858
(4.83 %)
58,247
(6.94 %)
38.54
(99.96 %)
0
(0 %)
107
(0.04 %)
33
(100.00 %)
506,950
(2.73 %)
305,170
(2.13 %)
6,194,879
(29.85 %)
0
(0 %)
131,664
(1.39 %)
17,881
(0.94 %)
14,233
(0.68 %)
207 leafy seadragon (BA_2022a 2022)
GCF_024500275.1
46,242
(10.23 %)
n/a 13,712
(2.62 %)
43,369
(5.56 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
0
(0 %)
76
(0.00 %)
1,537
(100.00 %)
1,406,779
(35.37 %)
202,983
(7.44 %)
3,933,128
(41.19 %)
0
(0 %)
436,408
(4.31 %)
70,560
(7.78 %)
39,027
(2.50 %)
208 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1
38,671
(7.52 %)
n/a 15,538
(2.18 %)
57,480
(5.26 %)
n/a 39.54
(98.22 %)
0
(0 %)
3,611
(1.77 %)
94,260
(100.00 %)
629,451
(3.42 %)
385,539
(3.83 %)
6,343,655
(29.35 %)
123
(0.00 %)
240,147
(1.70 %)
27,018
(1.26 %)
18,061
(0.78 %)
209 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1
n/a n/a 15,487
(0.88 %)
85,135
(3.39 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
6,593
(100.00 %)
5,572,163
(49.59 %)
1,052,072
(6.02 %)
7,246,646
(62.69 %)
0
(0 %)
2,503,507
(8.71 %)
157,768
(4.38 %)
14,966
(0.28 %)
210 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1
53,323
(3.35 %)
n/a 15,955
(0.92 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
6,041,262
(71.88 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
16,535
(0.37 %)
211 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1
n/a n/a 13,792
(2.19 %)
51,353
(6.60 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,620
(100.00 %)
2,536,362
(38.05 %)
513,115
(7.50 %)
3,542,854
(37.60 %)
0
(0 %)
576,452
(5.21 %)
31,814
(1.79 %)
14,668
(0.71 %)
212 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1
n/a n/a 13,908
(2.19 %)
50,634
(6.50 %)
n/a 41.22
(99.97 %)
84
(0.00 %)
1,017
(0.03 %)
701
(100.00 %)
2,698,640
(39.19 %)
577,328
(8.51 %)
3,615,231
(39.17 %)
5
(0.00 %)
691,324
(6.04 %)
33,251
(1.82 %)
14,917
(0.69 %)
213 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1
n/a n/a 15,269
(2.44 %)
52,449
(6.28 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
606
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,879,201
(31.40 %)
449,901
(9.89 %)
4,248,556
(33.21 %)
1
(0.00 %)
727,189
(5.72 %)
43,864
(3.01 %)
19,108
(1.01 %)
214 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1
n/a n/a 15,033
(2.98 %)
51,296
(7.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
2,700
(100.00 %)
1,099,919
(28.68 %)
314,919
(9.57 %)
2,620,601
(30.23 %)
0
(0 %)
539,835
(6.99 %)
49,248
(4.19 %)
27,196
(1.69 %)
215 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1
n/a n/a 15,060
(2.89 %)
50,064
(7.31 %)
n/a 41.88
(99.98 %)
0
(0 %)
589
(0.02 %)
534
(100.00 %)
1,116,427
(28.18 %)
315,489
(13.14 %)
2,598,812
(33.21 %)
2
(0.00 %)
680,706
(7.88 %)
50,192
(3.82 %)
27,472
(1.61 %)
216 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1
n/a n/a 14,632
(3.51 %)
40,441
(7.51 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
0
(0 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,742
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
0
(0 %)
96,734
(1.60 %)
16,302
(1.34 %)
11,802
(0.89 %)
217 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2
n/a n/a 14,975
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
n/a 41.43
(99.89 %)
0
(0 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
772,309
(14.49 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,473
(21.79 %)
0
(0 %)
109,664
(1.83 %)
16,807
(1.33 %)
12,095
(0.89 %)
218 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1
n/a n/a 15,137
(3.09 %)
52,499
(7.75 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,778
(100.00 %)
448,166
(4.67 %)
416,181
(8.95 %)
3,288,388
(27.99 %)
0
(0 %)
521,897
(4.93 %)
55,747
(4.41 %)
34,235
(2.29 %)
219 longspined bullhead (fTauBub2.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1
n/a n/a 15,027
(3.10 %)
51,137
(7.71 %)
n/a 42.22
(99.99 %)
0
(0 %)
242
(0.01 %)
27
(100.00 %)
452,844
(4.81 %)
417,308
(9.63 %)
3,262,282
(28.51 %)
2
(0.00 %)
530,802
(5.05 %)
55,527
(4.38 %)
34,004
(2.27 %)
220 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1
n/a n/a 12,848
(3.32 %)
43,711
(8.09 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,698
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
0
(0 %)
569,405
(6.42 %)
45,916
(5.21 %)
28,531
(2.48 %)
221 lumpfish (primary hap v1 2019 refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
n/a 14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
0
(0 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
1
(0.00 %)
655,785
(6.31 %)
53,321
(5.09 %)
32,722
(2.40 %)
222 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1
n/a n/a 14,944
(3.23 %)
50,328
(8.09 %)
n/a 42.82
(99.97 %)
0
(0 %)
954
(0.03 %)
232
(100.00 %)
1,034,598
(25.93 %)
434,819
(13.21 %)
2,907,371
(30.18 %)
3
(0.00 %)
701,025
(6.86 %)
55,066
(5.20 %)
33,554
(2.42 %)
223 lyretail cichlid
GCF_000239395.1
38,260
(10.03 %)
n/a 14,804
(2.69 %)
23,751
(5.79 %)
n/a 40.44
(80.94 %)
109,098
(19.10 %)
109,100
(19.10 %)
118,181
(80.90 %)
695,696
(14.49 %)
119,381
(1.10 %)
4,539,429
(19.49 %)
5,040
(0.39 %)
62,939
(1.53 %)
18,098
(0.91 %)
13,389
(0.65 %)
224 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1
64,831
(12.89 %)
n/a 15,283
(2.75 %)
43,349
(6.02 %)
n/a 40.35
(100.00 %)
0
(0 %)
93
(0.00 %)
65
(100.00 %)
441,324
(3.38 %)
206,420
(2.54 %)
4,582,841
(27.41 %)
2
(0.00 %)
240,418
(2.41 %)
15,999
(1.17 %)
10,104
(0.58 %)
225 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2
49,016
(12.41 %)
n/a 14,186
(3.08 %)
55,502
(8.05 %)
n/a 43.27
(100.00 %)
0
(0 %)
19
(0.00 %)
97
(100.00 %)
321,832
(4.91 %)
114,318
(16.04 %)
2,300,636
(32.10 %)
0
(0 %)
595,385
(7.08 %)
46,312
(5.05 %)
34,383
(3.14 %)
226 mangrove rivulus
GCF_001649575.2
46,200
(11.83 %)
n/a 14,522
(2.87 %)
46,641
(6.86 %)
n/a 40.03
(94.31 %)
0
(0 %)
32,278
(5.70 %)
300
(100.00 %)
345,678
(2.32 %)
146,263
(1.33 %)
4,718,292
(27.30 %)
277
(0.09 %)
65,776
(1.14 %)
39,541
(2.69 %)
29,543
(1.76 %)
227 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1
n/a n/a 14,564
(1.72 %)
71,604
(6.41 %)
n/a 41.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,737
(100.00 %)
1,662,251
(42.29 %)
439,119
(12.96 %)
3,776,125
(45.00 %)
0
(0 %)
888,556
(6.68 %)
56,507
(2.83 %)
15,006
(0.71 %)
228 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1
n/a n/a 15,070
(1.79 %)
71,367
(6.50 %)
n/a 41.46
(99.92 %)
0
(0 %)
4,157
(0.08 %)
943
(100.00 %)
1,717,591
(42.63 %)
474,348
(12.30 %)
4,011,319
(44.93 %)
3
(0.00 %)
n/a 59,531
(2.83 %)
15,998
(0.74 %)
229 Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023)
GCF_029220125.1
44,363
(10.91 %)
n/a 14,032
(2.80 %)
60,400
(8.09 %)
n/a 43.84
(99.86 %)
0
(0 %)
974
(0.14 %)
200
(100.00 %)
1,157,953
(36.57 %)
569,832
(12.19 %)
2,864,996
(37.65 %)
2
(0.00 %)
856,247
(8.38 %)
98,423
(9.53 %)
55,625
(4.11 %)
230 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2
47,018
(6.00 %)
n/a 16,516
(1.68 %)
33,920
(4.24 %)
n/a 38.00
(96.73 %)
0
(0 %)
621
(3.27 %)
2,415
(100.00 %)
1,125,511
(6.89 %)
1,113,607
(11.76 %)
8,546,053
(42.44 %)
2
(0.02 %)
1,620,405
(7.32 %)
44,933
(1.77 %)
26,268
(0.85 %)
231 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1
71,254
(7.50 %)
n/a 16,674
(1.63 %)
52,903
(4.12 %)
101,896
(6.64 %)
38.24
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,155,823
(4.90 %)
1,363,316
(12.23 %)
7,667,721
(47.23 %)
0
(0 %)
1,394,951
(7.13 %)
48,358
(1.88 %)
24,894
(0.73 %)
232 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1
n/a 27,999
(3.29 %)
16,698
(1.62 %)
62,818
(5.14 %)
74,339
(6.58 %)
38.41
(99.99 %)
0
(0 %)
334
(0.01 %)
195
(100.00 %)
1,194,830
(5.04 %)
1,460,981
(11.81 %)
7,590,179
(47.66 %)
2
(0.00 %)
1,437,937
(7.51 %)
50,533
(2.46 %)
25,088
(0.72 %)
233 milkfish (2019)
GCF_902362185.1
30,812
(7.61 %)
n/a 16,869
(3.41 %)
21,377
(6.58 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
0
(0 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
958,774
(8.18 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
2
(0.01 %)
611,774
(5.32 %)
22,089
(1.27 %)
14,000
(0.76 %)
234 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1
n/a n/a 16,565
(3.38 %)
42,094
(6.75 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,392
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
0
(0 %)
595,219
(5.37 %)
21,531
(1.27 %)
13,616
(0.75 %)
235 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1
n/a n/a 17,701
(1.62 %)
73,433
(5.69 %)
n/a 42.20
(99.98 %)
14
(0.00 %)
1,398
(0.02 %)
388
(100.00 %)
6,438,444
(40.32 %)
1,202,669
(11.51 %)
7,055,665
(47.04 %)
6
(0.00 %)
1,343,489
(8.04 %)
74,954
(3.44 %)
26,325
(0.98 %)
236 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1
n/a n/a 15,176
(3.17 %)
47,458
(7.48 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
0
(0 %)
927
(0.02 %)
486
(100.00 %)
1,167,409
(26.98 %)
438,114
(8.08 %)
3,351,987
(27.25 %)
3
(0.00 %)
441,989
(4.98 %)
45,298
(3.39 %)
29,915
(1.90 %)
237 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1
n/a n/a 14,480
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
0
(0 %)
936
(0.02 %)
725
(100.00 %)
1,101,582
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,480
(27.08 %)
5
(0.00 %)
417,783
(4.94 %)
42,657
(3.44 %)
28,222
(1.89 %)
238 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1
53,087
(12.11 %)
n/a 14,672
(2.71 %)
27,552
(6.74 %)
n/a 39.02
(99.85 %)
0
(0 %)
229
(0.15 %)
68
(100.00 %)
305,761
(2.11 %)
134,157
(2.14 %)
4,687,726
(28.26 %)
0
(0 %)
131,318
(1.99 %)
33,082
(2.28 %)
23,755
(1.34 %)
239 mudskipper P.magnuspinnatus (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1
n/a n/a 13,470
(2.34 %)
42,799
(5.73 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,414
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
0
(0 %)
475,330
(4.51 %)
34,522
(2.54 %)
17,280
(0.96 %)
240 mudskipper P.magnuspinnatus (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3
33,236
(8.44 %)
n/a 14,601
(2.46 %)
44,145
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
701
(0.95 %)
122
(100.00 %)
1,755,227
(42.93 %)
551,482
(7.22 %)
4,887,087
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,179
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
22,350
(1.21 %)
241 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1
41,183
(7.38 %)
39,253
(6.58 %)
14,602
(1.92 %)
57,194
(5.03 %)
35,597
(6.40 %)
40.58
(91.29 %)
110,543
(8.75 %)
123,625
(8.75 %)
120,723
(91.25 %)
447,158
(2.19 %)
235,336
(1.39 %)
6,518,990
(26.03 %)
877
(0.07 %)
150,526
(1.93 %)
54,589
(2.39 %)
39,256
(1.65 %)
242 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2
56,612
(6.89 %)
n/a 15,361
(1.60 %)
69,801
(5.20 %)
n/a 40.76
(99.88 %)
0
(0 %)
2,820
(0.12 %)
1,031
(100.00 %)
636,480
(2.75 %)
392,130
(3.32 %)
7,023,777
(32.98 %)
8
(0.00 %)
517,617
(4.36 %)
81,101
(3.45 %)
45,801
(1.71 %)
243 New Zealand spotty (2019)
GCA_009762535.1
n/a n/a 14,609
(2.22 %)
43,262
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
468
(100.00 %)
519,324
(4.65 %)
393,329
(5.54 %)
4,522,265
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,988
(4.42 %)
18,302
(0.85 %)
8,002
(0.35 %)
244 New Zealand spotty (alternate hap 2019)
GCA_009762545.1
n/a n/a 13,566
(2.17 %)
40,774
(5.21 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,659
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
0
(0 %)
456,905
(3.99 %)
16,368
(0.83 %)
7,034
(0.33 %)
245 Nile tilapia
GCF_001858045.2
77,384
(10.86 %)
n/a 15,599
(1.99 %)
32,839
(6.04 %)
n/a 40.73
(99.99 %)
0
(0 %)
551
(0.01 %)
2,460
(100.00 %)
600,869
(5.40 %)
291,105
(3.17 %)
4,958,128
(31.15 %)
1
(0.00 %)
496,471
(4.91 %)
32,038
(1.81 %)
17,948
(0.88 %)
246 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1
n/a n/a 13,050
(3.93 %)
44,650
(10.12 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,934
(100.00 %)
512,583
(14.83 %)
156,305
(8.46 %)
2,005,803
(27.09 %)
0
(0 %)
153,928
(3.57 %)
59,674
(9.19 %)
38,546
(4.50 %)
247 ninespine stickleback (NSP_V7 2020)
GCF_902500615.1
51,166
(15.31 %)
n/a 14,765
(3.99 %)
49,191
(9.80 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
0
(0 %)
341
(0.01 %)
1,667
(100.00 %)
380,357
(3.60 %)
188,301
(6.29 %)
2,422,266
(25.70 %)
1
(0.00 %)
285,108
(4.45 %)
72,584
(9.69 %)
45,847
(4.62 %)
248 ninespine stickleback (primary hap 2023)
GCA_949316345.1
n/a n/a 14,600
(3.83 %)
49,927
(9.98 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
175
(100.00 %)
599,088
(14.68 %)
186,747
(10.27 %)
2,273,942
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
249 ninespine stickleback (primary hap 2023)
GCF_949316345.1
57,816
(15.11 %)
n/a 14,598
(3.83 %)
49,473
(9.87 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
174
(100.00 %)
599,085
(14.68 %)
186,746
(10.27 %)
2,273,889
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
250 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1
51,073
(7.42 %)
n/a 15,809
(2.17 %)
43,728
(4.54 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 48
(100.00 %)
2,472,286
(44.73 %)
560,123
(5.68 %)
6,203,876
(38.64 %)
0
(0 %)
436,624
(3.73 %)
42,187
(2.72 %)
22,226
(1.23 %)
251 northern pike
GCF_004634155.1
66,389
(9.11 %)
n/a 16,778
(2.37 %)
27,040
(5.41 %)
n/a 42.29
(99.99 %)
97
(0.00 %)
584
(0.01 %)
908
(100.00 %)
1,065,458
(31.14 %)
531,451
(7.80 %)
4,677,366
(33.26 %)
2
(0.00 %)
661,503
(5.13 %)
44,793
(2.82 %)
22,750
(1.05 %)
252 northern pike (2020 refseq)
GCF_011004845.1
63,733
(9.28 %)
n/a 16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,941
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
0
(0 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
1
(0.00 %)
602,569
(4.43 %)
42,910
(2.52 %)
22,099
(1.02 %)
253 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1
n/a n/a 11,782
(2.41 %)
40,748
(5.68 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
0
(0 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,818
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
0
(0 %)
427,649
(4.54 %)
29,687
(2.57 %)
15,714
(1.07 %)
254 Old Calabar mormyrid
GCF_002872115.1
61,915
(11.48 %)
n/a 15,987
(2.73 %)
33,963
(6.66 %)
n/a 43.93
(92.03 %)
0
(0 %)
49,579
(7.99 %)
4,666
(100.00 %)
348,463
(2.27 %)
314,129
(2.95 %)
4,259,711
(20.83 %)
2,738
(0.27 %)
166,566
(1.74 %)
76,846
(4.18 %)
58,953
(2.91 %)
255 orangethroat darter
GCF_008692095.1
55,448
(8.29 %)
n/a 15,000
(2.25 %)
49,918
(5.41 %)
n/a 40.91
(99.57 %)
0
(0 %)
101,221
(0.47 %)
3,119
(100.00 %)
566,915
(3.75 %)
509,018
(6.60 %)
5,142,090
(31.18 %)
204
(0.00 %)
644,640
(5.47 %)
26,702
(1.46 %)
14,294
(0.76 %)
256 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
n/a 15,761
(1.50 %)
31,563
(4.00 %)
59,905
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
0
(0 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,257,250
(5.57 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
0
(0 %)
1,304,958
(6.34 %)
29,320
(0.87 %)
15,066
(0.43 %)
257 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1
n/a n/a 14,018
(1.51 %)
45,251
(3.61 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,393
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
1
(0.00 %)
888,596
(5.23 %)
22,522
(0.77 %)
12,193
(0.40 %)
258 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1
68,779
(8.54 %)
n/a 17,223
(2.28 %)
49,697
(5.11 %)
n/a 38.10
(99.99 %)
0
(0 %)
614
(0.01 %)
358
(100.00 %)
2,925,549
(40.35 %)
402,676
(5.35 %)
5,933,365
(45.71 %)
2
(0.00 %)
792,756
(5.74 %)
56,843
(3.18 %)
21,760
(0.91 %)
259 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1
40,001
(9.36 %)
n/a 14,904
(2.72 %)
24,732
(5.87 %)
n/a 40.60
(84.20 %)
60,817
(15.83 %)
60,817
(15.83 %)
68,050
(84.17 %)
306,171
(3.27 %)
124,292
(0.75 %)
4,414,831
(20.66 %)
1,574
(0.10 %)
36,249
(0.53 %)
18,455
(0.96 %)
13,214
(0.68 %)
260 Pacific cod (2023)
GCF_031168955.1
49,417
(13.66 %)
n/a 13,542
(2.89 %)
64,214
(9.77 %)
n/a 45.55
(99.92 %)
0
(0 %)
4,826
(0.09 %)
24
(100.00 %)
1,117,561
(38.30 %)
685,851
(13.38 %)
2,330,116
(34.15 %)
16
(0.00 %)
539,494
(6.49 %)
87,761
(8.68 %)
51,521
(4.16 %)
261 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1
48,776
(12.61 %)
n/a 14,747
(3.15 %)
45,075
(7.30 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
219
(0.00 %)
120
(100.00 %)
410,917
(4.22 %)
246,500
(4.66 %)
3,680,698
(25.23 %)
0
(0 %)
251,625
(3.22 %)
31,508
(2.30 %)
20,928
(1.36 %)
262 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2
46,684
(12.50 %)
n/a 14,862
(3.15 %)
45,824
(7.30 %)
n/a 42.17
(99.95 %)
0
(0 %)
1,131
(0.05 %)
53
(100.00 %)
407,699
(3.94 %)
247,330
(3.84 %)
3,838,896
(24.75 %)
2
(0.00 %)
279,152
(3.23 %)
31,782
(2.27 %)
21,208
(1.36 %)
263 Pacific saury (AMF1-May2022 2023)
GCF_033807715.1
54,344
(6.52 %)
n/a 15,214
(1.67 %)
74,345
(6.13 %)
n/a 41.49
(99.96 %)
0
(0 %)
900
(0.04 %)
759
(100.00 %)
805,776
(5.16 %)
849,901
(11.48 %)
4,645,552
(43.92 %)
1
(0.00 %)
1,333,479
(8.06 %)
106,026
(5.14 %)
39,496
(1.50 %)
264 panther danio (primary hap 2020)
GCF_903798145.1
40,657
(5.52 %)
n/a 17,858
(2.46 %)
42,119
(3.16 %)
n/a 36.32
(98.82 %)
0
(0 %)
1,821
(1.18 %)
342
(100.00 %)
3,973,354
(56.67 %)
940,639
(7.81 %)
8,701,639
(50.54 %)
3
(0.00 %)
1,057,465
(5.16 %)
29,684
(1.18 %)
10,646
(0.30 %)
265 Patagonian blennie (Puerto Natales JMC-PN-2008 2024)
GCF_036324505.1
42,701
(12.59 %)
n/a 14,986
(3.15 %)
46,289
(7.75 %)
n/a 40.99
(99.97 %)
0
(0 %)
380
(0.03 %)
27
(100.00 %)
1,031,762
(25.30 %)
219,393
(4.63 %)
3,436,780
(25.57 %)
0
(0 %)
225,847
(2.56 %)
16,570
(1.12 %)
10,155
(0.63 %)
266 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1
n/a n/a 15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
0
(0 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
975,354
(15.76 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,904
(35.09 %)
1
(0.00 %)
865,727
(6.60 %)
49,121
(3.07 %)
20,467
(0.93 %)
267 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1
n/a n/a 15,317
(2.02 %)
61,647
(6.35 %)
n/a 41.37
(99.99 %)
135
(0.01 %)
135
(0.01 %)
469
(99.99 %)
981,519
(15.40 %)
319,637
(12.45 %)
3,706,473
(36.77 %)
0
(0 %)
952,761
(6.98 %)
50,353
(2.98 %)
20,537
(0.91 %)
268 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1
n/a n/a 16,729
(3.56 %)
56,451
(8.61 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
11
(0.00 %)
11
(0.00 %)
5,701
(100.00 %)
1,153,359
(18.94 %)
829,887
(14.54 %)
2,793,018
(28.79 %)
0
(0 %)
721,904
(6.97 %)
49,469
(4.32 %)
33,228
(2.53 %)
269 peladilla (fAplTae1 primary hap 2021)
GCA_017639675.1
n/a n/a 13,829
(3.83 %)
41,932
(8.64 %)
n/a 45.01
(98.24 %)
0
(0 %)
1,158
(1.77 %)
41
(100.00 %)
930,246
(18.49 %)
660,569
(13.71 %)
2,316,198
(27.66 %)
6
(0.00 %)
537,418
(6.48 %)
41,023
(4.40 %)
27,287
(2.49 %)
270 pike-perch
GCF_008315115.2
65,418
(8.54 %)
n/a 15,731
(2.23 %)
52,240
(5.69 %)
n/a 40.87
(99.98 %)
0
(0 %)
711
(0.02 %)
337
(100.00 %)
629,999
(5.16 %)
567,578
(7.41 %)
4,697,709
(36.49 %)
3
(0.00 %)
784,659
(5.34 %)
39,666
(1.93 %)
12,855
(0.60 %)
271 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
n/a 15,738
(2.42 %)
26,691
(5.69 %)
57,069
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
0
(0 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,063,888
(5.90 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
0
(0 %)
374,590
(3.12 %)
41,636
(2.04 %)
21,488
(0.92 %)
272 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1
n/a n/a 15,563
(2.38 %)
54,264
(6.19 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,418
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
0
(0 %)
338,770
(2.89 %)
40,331
(2.02 %)
21,223
(0.93 %)
273 pink salmon
GCF_021184085.1
91,127
(4.89 %)
n/a 27,187
(1.37 %)
124,120
(3.88 %)
n/a 44.28
(99.96 %)
3,528
(0.01 %)
5,213
(0.04 %)
22,556
(99.99 %)
1,343,135
(0.00 %)
2,906,520
(28.95 %)
10,882,087
(57.26 %)
21
(0.00 %)
6,152,465
(12.38 %)
97,805
(3.04 %)
20,791
(0.34 %)
274 ploughfish
GCF_902827175.1
50,551
(7.66 %)
n/a 14,699
(1.83 %)
66,348
(6.06 %)
62,492
(5.74 %)
41.52
(99.98 %)
0
(0 %)
1,569
(0.02 %)
2,618
(100.00 %)
467,937
(3.05 %)
412,361
(6.64 %)
3,498,382
(45.08 %)
10
(0.00 %)
623,734
(5.21 %)
73,879
(3.55 %)
14,738
(0.64 %)
275 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1
n/a n/a 14,050
(2.77 %)
63,249
(8.86 %)
n/a 45.41
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,970
(100.00 %)
708,455
(9.71 %)
797,241
(15.67 %)
2,785,159
(33.18 %)
0
(0 %)
613,051
(6.69 %)
78,151
(7.95 %)
45,924
(3.34 %)
276 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1
n/a n/a 14,126
(2.81 %)
61,907
(8.75 %)
n/a 45.67
(99.94 %)
0
(0 %)
1,810
(0.06 %)
616
(100.00 %)
753,034
(10.17 %)
850,189
(15.72 %)
2,888,555
(33.70 %)
7
(0.00 %)
642,528
(6.84 %)
80,883
(8.43 %)
46,894
(3.34 %)
277 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
n/a 14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
0
(0 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
3
(0.00 %)
1,746,915
(7.91 %)
172,199
(5.45 %)
18,080
(0.31 %)
278 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1
n/a n/a 10,944
(0.64 %)
59,123
(2.21 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,336
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
0
(0 %)
1,101,423
(6.43 %)
125,285
(5.42 %)
13,610
(0.32 %)
279 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1
n/a n/a 15,639
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
0
(0 %)
1,907
(0.07 %)
365
(100.00 %)
1,655,350
(30.53 %)
511,512
(12.09 %)
2,015,264
(35.19 %)
4
(0.00 %)
468,697
(7.41 %)
32,410
(4.33 %)
18,662
(1.57 %)
280 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2
119,284
(6.51 %)
n/a 27,513
(1.62 %)
109,524
(4.38 %)
138,073
(5.21 %)
43.45
(99.74 %)
196
(0.00 %)
486
(0.26 %)
939
(100.00 %)
1,537,455
(7.32 %)
2,083,211
(23.10 %)
10,092,840
(53.71 %)
5
(0.00 %)
4,526,931
(11.46 %)
73,586
(2.16 %)
18,220
(0.32 %)
281 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1
79,299
(6.41 %)
78,807
(5.45 %)
25,179
(1.70 %)
98,339
(4.18 %)
115,853
(5.33 %)
42.67
(88.52 %)
7,839
(0.04 %)
427,894
(11.54 %)
139,800
(99.96 %)
1,332,141
(5.52 %)
1,604,760
(8.18 %)
9,451,984
(44.00 %)
31,141
(1.22 %)
1,638,788
(9.94 %)
56,604
(1.05 %)
14,470
(0.23 %)
282 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1
71,991
(5.94 %)
n/a 27,195
(1.88 %)
81,269
(3.63 %)
n/a 39.59
(99.96 %)
0
(0 %)
1,873
(0.04 %)
1,746
(100.00 %)
7,035,382
(51.89 %)
1,021,269
(5.98 %)
12,768,853
(46.85 %)
1
(0.00 %)
1,492,285
(4.74 %)
109,185
(4.70 %)
33,199
(0.66 %)
283 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1
n/a n/a 15,655
(3.01 %)
47,717
(6.87 %)
n/a 40.98
(95.57 %)
0
(0 %)
11,577
(4.42 %)
34,462
(100.00 %)
470,579
(3.16 %)
231,051
(1.91 %)
4,345,700
(23.24 %)
1,006
(0.10 %)
102,380
(1.25 %)
20,149
(1.25 %)
12,381
(0.71 %)
284 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1
n/a n/a 4,539
(2.01 %)
14,061
(4.35 %)
n/a 40.48
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,751
(100.00 %)
759,605
(49.59 %)
161,693
(7.99 %)
1,684,737
(29.93 %)
0
(0 %)
232,319
(5.07 %)
7,525
(1.31 %)
4,853
(0.81 %)
285 red-bellied piranha (fPygNat1 primary hap 2020)
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
n/a 16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
76,011
(5.65 %)
40.58
(99.17 %)
0
(0 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
2
(0.00 %)
1,005,141
(5.14 %)
33,087
(1.38 %)
20,822
(0.79 %)
286 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1
47,129
(6.06 %)
n/a 17,089
(1.80 %)
33,378
(4.02 %)
n/a 40.45
(97.38 %)
42,102
(2.59 %)
62,964
(2.59 %)
325,620
(97.41 %)
898,445
(4.81 %)
863,000
(6.48 %)
7,757,382
(34.74 %)
2,457
(0.19 %)
n/a 34,329
(1.24 %)
22,250
(0.80 %)
287 reedfish (2021)
GCF_900747795.2
44,479
(2.01 %)
n/a 13,108
(0.46 %)
23,157
(1.29 %)
n/a 39.37
(99.18 %)
0
(0 %)
1,431
(0.82 %)
169
(100.00 %)
8,636,520
(39.34 %)
1,069,643
(2.91 %)
19,980,572
(47.52 %)
17
(0.00 %)
1,256,071
(2.69 %)
89,023
(1.13 %)
22,697
(0.30 %)
288 reedfish (alternate hap)
GCA_900700845.2
n/a n/a 9,950
(0.37 %)
31,611
(1.22 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
38,598
(100.00 %)
1,300,565
(2.57 %)
685,834
(2.21 %)
14,691,576
(45.66 %)
0
(0 %)
588,794
(1.83 %)
63,365
(1.11 %)
17,365
(0.32 %)
289 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1
56,261
(13.18 %)
n/a 14,197
(2.71 %)
45,193
(6.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
157
(100.00 %)
941,095
(17.66 %)
238,999
(5.27 %)
4,283,692
(41.06 %)
0
(0 %)
191,618
(2.49 %)
43,014
(4.07 %)
25,748
(1.58 %)
290 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2
25,353
(3.88 %)
n/a 14,334
(1.56 %)
137,348
(9.74 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
0
(0 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
635,526
(3.14 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
7,501
(0.17 %)
424,697
(2.96 %)
52,308
(2.11 %)
22,130
(0.71 %)
291 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2
n/a n/a 27,928
(1.66 %)
110,791
(4.44 %)
n/a 43.36
(96.90 %)
0
(0 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
4,690,842
(57.30 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,763
(52.37 %)
2
(0.00 %)
3,475,805
(8.76 %)
70,821
(1.77 %)
19,956
(0.39 %)
292 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1
n/a n/a 18,165
(2.73 %)
62,580
(6.00 %)
n/a 38.74
(100.00 %)
6
(0.00 %)
6
(0.00 %)
4,612
(100.00 %)
2,483,904
(48.29 %)
584,363
(7.55 %)
5,582,076
(40.38 %)
0
(0 %)
923,875
(6.53 %)
60,229
(3.53 %)
19,604
(0.82 %)
293 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1
n/a n/a 18,132
(2.65 %)
63,523
(6.01 %)
n/a 38.80
(99.99 %)
1
(0.00 %)
471
(0.01 %)
86
(100.00 %)
2,613,900
(48.90 %)
625,102
(8.21 %)
5,738,444
(41.24 %)
1
(0.00 %)
1,070,552
(7.36 %)
65,328
(3.68 %)
20,458
(0.81 %)
294 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2
n/a n/a 15,291
(3.29 %)
45,865
(7.56 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,165
(100.00 %)
1,131,154
(25.69 %)
269,583
(5.08 %)
3,371,712
(24.64 %)
0
(0 %)
249,009
(3.21 %)
36,810
(2.68 %)
27,636
(1.84 %)
295 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2
n/a n/a 15,181
(3.34 %)
44,153
(7.53 %)
51,135
(7.40 %)
42.31
(99.98 %)
0
(0 %)
418
(0.02 %)
101
(100.00 %)
1,121,704
(25.48 %)
269,467
(4.88 %)
3,358,709
(24.69 %)
5
(0.00 %)
255,676
(3.48 %)
36,987
(3.02 %)
28,368
(1.91 %)
296 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1
52,554
(8.81 %)
n/a 17,664
(3.05 %)
48,403
(5.24 %)
n/a 36.06
(83.93 %)
0
(0 %)
5,144
(16.07 %)
2,870
(100.00 %)
2,600,095
(49.94 %)
683,499
(4.34 %)
6,000,462
(35.96 %)
5
(0.00 %)
444,046
(3.07 %)
33,741
(1.62 %)
19,239
(0.70 %)
297 Rosablanca catfish (hap1 2023)
GCA_030014385.1
n/a n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,920
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
298 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1
n/a n/a 15,434
(2.01 %)
44,991
(4.63 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
192
(0.00 %)
302
(100.00 %)
2,506,810
(40.54 %)
613,867
(8.67 %)
5,070,851
(48.32 %)
1
(0.00 %)
1,210,760
(8.82 %)
46,071
(2.57 %)
27,461
(1.23 %)
299 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1
34,548
(9.49 %)
n/a 15,280
(3.00 %)
46,259
(6.95 %)
n/a 40.45
(99.99 %)
719
(0.01 %)
723
(0.01 %)
8,212
(99.99 %)
1,335,152
(28.19 %)
415,384
(6.53 %)
3,948,379
(27.81 %)
2
(0.00 %)
416,856
(4.21 %)
22,854
(1.61 %)
17,357
(1.05 %)
300 sailfin molly
GCF_001443285.1
53,986
(11.41 %)
n/a 15,048
(2.71 %)
33,482
(6.71 %)
n/a 39.18
(83.41 %)
36,637
(16.61 %)
41,735
(16.61 %)
54,623
(83.39 %)
357,919
(2.18 %)
189,502
(1.23 %)
4,873,063
(22.51 %)
1,755
(0.81 %)
87,954
(1.83 %)
34,138
(1.62 %)
26,570
(1.23 %)
301 sansaifugu (HTHZ2018 2019)
GCF_003711565.1
56,010
(20.10 %)
n/a 13,998
(4.84 %)
48,737
(11.56 %)
n/a 45.63
(99.99 %)
0
(0 %)
250
(0.01 %)
868
(100.00 %)
304,980
(15.98 %)
171,631
(4.98 %)
1,616,965
(21.60 %)
1
(0.00 %)
257,565
(5.29 %)
48,338
(9.79 %)
36,513
(5.09 %)
302 sardine (primary hap 2023)
GCA_963854185.1
n/a n/a 16,071
(2.33 %)
64,180
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
241
(100.00 %)
1,503,111
(11.74 %)
1,507,024
(15.48 %)
4,027,638
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,853
(8.48 %)
68,874
(3.56 %)
38,590
(1.78 %)
303 sardine (primary hap 2023)
GCF_963854185.1
48,146
(9.15 %)
n/a 16,069
(2.33 %)
64,178
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
240
(100.00 %)
1,503,108
(11.74 %)
1,507,022
(15.48 %)
4,027,614
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,852
(8.48 %)
68,873
(3.56 %)
38,589
(1.78 %)
304 scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023)
GCF_030265065.1
51,270
(7.00 %)
n/a 13,854
(1.32 %)
48,980
(3.46 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
0
(0 %)
9
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,805,346
(21.21 %)
512,153
(12.76 %)
6,260,589
(63.96 %)
0
(0 %)
859,332
(5.23 %)
96,908
(3.65 %)
37,320
(1.36 %)
305 Senegalese sole
GCF_019176455.1
46,446
(12.02 %)
n/a 15,155
(3.15 %)
43,828
(7.31 %)
n/a 40.92
(99.99 %)
0
(0 %)
662
(0.01 %)
1,937
(100.00 %)
522,618
(4.22 %)
317,280
(4.23 %)
4,040,245
(28.25 %)
1
(0.00 %)
268,721
(3.11 %)
26,946
(1.79 %)
16,377
(1.03 %)
306 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1
n/a n/a 14,728
(2.46 %)
62,094
(7.09 %)
n/a 42.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,847
(100.00 %)
939,151
(11.90 %)
472,983
(7.68 %)
4,326,183
(28.40 %)
0
(0 %)
486,310
(4.09 %)
64,290
(4.16 %)
42,087
(2.28 %)
307 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1
n/a n/a 15,032
(2.44 %)
62,625
(6.97 %)
n/a 42.07
(99.98 %)
0
(0 %)
598
(0.02 %)
847
(100.00 %)
967,197
(11.85 %)
498,286
(8.15 %)
4,397,828
(28.96 %)
9
(0.00 %)
531,478
(4.46 %)
65,744
(4.06 %)
42,870
(2.25 %)
308 sheepshead minnow
GCF_000732505.1
37,879
(7.01 %)
n/a 14,749
(2.02 %)
25,480
(4.66 %)
n/a 38.19
(86.93 %)
101,700
(13.10 %)
113,210
(13.10 %)
110,959
(86.90 %)
363,397
(1.88 %)
195,191
(1.43 %)
6,444,762
(27.47 %)
3,240
(0.30 %)
136,313
(1.74 %)
18,269
(0.66 %)
10,928
(0.41 %)
309 shortfin molly
GCF_001443325.1
54,473
(11.42 %)
n/a 15,104
(2.72 %)
33,717
(6.74 %)
n/a 39.23
(84.81 %)
32,496
(15.20 %)
37,507
(15.20 %)
50,598
(84.80 %)
328,347
(2.03 %)
172,112
(1.18 %)
4,876,942
(22.80 %)
1,876
(0.89 %)
88,660
(1.88 %)
34,271
(1.66 %)
26,703
(1.25 %)
310 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4
59,278
(19.85 %)
n/a 14,594
(4.32 %)
55,265
(10.96 %)
n/a 45.31
(99.99 %)
0
(0 %)
321
(0.01 %)
36
(100.00 %)
384,203
(19.38 %)
175,898
(4.39 %)
1,946,630
(23.16 %)
2
(0.00 %)
209,905
(4.10 %)
70,331
(13.13 %)
54,790
(7.31 %)
311 Siamese fighting fish (v5.1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1
n/a n/a 14,510
(4.12 %)
60,058
(10.77 %)
n/a 45.51
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,705
(100.00 %)
249,671
(3.68 %)
182,366
(4.87 %)
1,939,533
(22.55 %)
0
(0 %)
223,835
(4.10 %)
72,474
(13.55 %)
56,347
(7.50 %)
312 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2
n/a n/a 14,737
(4.05 %)
61,568
(10.70 %)
n/a 45.50
(100.00 %)
108
(0.00 %)
108
(0.00 %)
3,872
(100.00 %)
392,585
(19.23 %)
190,741
(5.09 %)
1,994,824
(23.20 %)
0
(0 %)
245,925
(4.39 %)
74,259
(13.49 %)
57,619
(7.42 %)
313 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1
131,166
(9.80 %)
n/a 29,612
(2.99 %)
81,338
(5.43 %)
n/a 37.63
(99.92 %)
0
(0 %)
2,597
(0.08 %)
51
(100.00 %)
3,277,259
(45.05 %)
801,192
(7.96 %)
7,910,205
(42.51 %)
3
(0.00 %)
1,037,130
(5.68 %)
60,236
(2.18 %)
20,870
(0.55 %)
314 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1
n/a n/a 13,661
(1.11 %)
75,418
(4.21 %)
n/a 45.01
(99.96 %)
0
(0 %)
3,120
(0.04 %)
1,059
(100.00 %)
4,634,757
(53.53 %)
1,006,319
(17.13 %)
5,273,732
(51.16 %)
14
(0.00 %)
1,782,741
(8.47 %)
145,115
(7.59 %)
66,645
(2.19 %)
315 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1
34,018
(4.17 %)
n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
0
(0 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
17
(0.00 %)
1,796,705
(8.53 %)
143,632
(7.43 %)
65,914
(2.15 %)
316 smallmouth bass
GCF_021292245.1
55,919
(9.40 %)
n/a 15,509
(2.37 %)
49,387
(5.61 %)
n/a 40.72
(99.65 %)
0
(0 %)
34,581
(0.36 %)
15,020
(100.00 %)
445,979
(2.50 %)
249,630
(2.49 %)
5,071,015
(28.28 %)
3,470
(0.39 %)
278,594
(4.93 %)
23,875
(1.36 %)
11,538
(0.57 %)
317 snake pipefish (RoL-2023_Sb 2023)
GCF_033978785.1
57,883
(4.39 %)
n/a 15,654
(1.03 %)
72,123
(3.58 %)
n/a 38.64
(100.00 %)
0
(0 %)
2,564
(0.00 %)
424
(100.00 %)
3,149,025
(23.73 %)
1,621,410
(19.58 %)
7,534,195
(67.22 %)
1
(0.00 %)
4,080,159
(14.37 %)
122,765
(3.07 %)
51,511
(1.21 %)
318 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2
75,628
(6.10 %)
n/a 24,075
(1.71 %)
98,364
(4.30 %)
n/a 43.37
(96.15 %)
1,903
(0.01 %)
25,658
(3.85 %)
36,660
(99.99 %)
949,725
(3.53 %)
1,465,583
(10.82 %)
8,853,884
(48.52 %)
872
(0.04 %)
1,715,998
(5.18 %)
62,850
(1.45 %)
16,671
(0.36 %)
319 sockeye salmon (Pitt River 2024)
GCF_034236695.1
80,798
(5.59 %)
n/a 26,218
(1.35 %)
116,746
(3.87 %)
n/a 44.03
(99.93 %)
1,058
(0.00 %)
4,351
(0.07 %)
12,436
(100.00 %)
6,356,046
(54.95 %)
2,840,516
(31.41 %)
10,575,179
(57.52 %)
9
(0.00 %)
6,694,579
(13.15 %)
77,648
(1.61 %)
19,825
(0.33 %)
320 South Georgia icefish
GCF_902827115.1
41,307
(6.47 %)
n/a 14,776
(1.79 %)
68,734
(6.16 %)
61,643
(5.52 %)
42.07
(99.94 %)
0
(0 %)
2,461
(0.06 %)
1,563
(100.00 %)
498,451
(3.42 %)
474,032
(7.20 %)
3,613,731
(45.83 %)
19
(0.00 %)
763,187
(8.62 %)
88,984
(4.31 %)
17,905
(0.76 %)
321 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1
n/a n/a 15,727
(2.61 %)
43,177
(5.74 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 895
(100.00 %)
1,590,386
(33.53 %)
246,800
(2.86 %)
5,173,834
(26.85 %)
0
(0 %)
323,596
(3.31 %)
14,473
(0.87 %)
9,723
(0.47 %)
322 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
n/a 15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
0
(0 %)
326,254
(3.37 %)
14,097
(0.88 %)
8,860
(0.42 %)
323 southern platyfish
GCF_002775205.1
46,367
(11.15 %)
n/a 14,674
(2.66 %)
28,368
(6.82 %)
n/a 38.97
(99.53 %)
0
(0 %)
156
(0.47 %)
102
(100.00 %)
323,402
(2.76 %)
146,477
(2.33 %)
4,741,552
(28.27 %)
0
(0 %)
190,964
(2.71 %)
34,667
(2.13 %)
24,564
(1.37 %)
324 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1
74,317
(6.97 %)
n/a 30,906
(3.19 %)
55,474
(5.66 %)
n/a 37.28
(92.69 %)
168,741
(7.34 %)
168,741
(7.34 %)
254,423
(92.66 %)
1,129,104
(5.02 %)
730,197
(4.59 %)
8,910,005
(36.97 %)
1,220
(0.18 %)
542,313
(6.57 %)
64,238
(1.79 %)
28,032
(0.71 %)
325 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1
57,720
(10.03 %)
n/a 15,810
(2.14 %)
58,218
(5.77 %)
n/a 40.33
(99.99 %)
0
(0 %)
871
(0.01 %)
81
(100.00 %)
1,505,948
(35.31 %)
346,542
(4.71 %)
5,210,329
(31.65 %)
0
(0 %)
506,956
(4.12 %)
36,529
(1.65 %)
21,732
(0.92 %)
326 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1
38,931
(8.84 %)
n/a 15,624
(2.29 %)
35,942
(5.59 %)
n/a 40.01
(85.05 %)
0
(0 %)
209,115
(15.01 %)
30,414
(100.00 %)
372,901
(2.33 %)
278,854
(1.99 %)
5,622,334
(22.61 %)
3,125
(0.18 %)
147,444
(1.33 %)
25,079
(0.95 %)
17,741
(0.66 %)
327 spotted green pufferfish (2004)
GCA_000180735.1
n/a 193,449
(10.86 %)
13,641
(5.13 %)
57,982
(13.46 %)
n/a 46.43
(91.24 %)
18,974
(8.76 %)
18,974
(8.76 %)
44,686
(91.24 %)
252,877
(4.38 %)
159,939
(3.51 %)
1,689,462
(18.66 %)
20
(0.00 %)
119,601
(3.94 %)
51,580
(13.42 %)
39,946
(6.79 %)
328 spotted tilapia (v1 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.1
46,818
(8.35 %)
n/a 14,938
(2.04 %)
55,475
(6.12 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
23
(0.00 %)
792
(100.00 %)
505,488
(2.57 %)
269,742
(4.14 %)
4,697,020
(30.74 %)
0
(0 %)
395,431
(3.97 %)
30,399
(1.90 %)
16,887
(0.82 %)
329 spotted tilapia (v2 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.2
48,380
(8.37 %)
n/a 15,470
(2.04 %)
57,237
(6.11 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
24
(0.00 %)
791
(100.00 %)
523,070
(2.57 %)
277,554
(4.08 %)
4,872,723
(30.67 %)
0
(0 %)
404,433
(3.93 %)
31,383
(1.89 %)
17,453
(0.82 %)
330 sterlet (maternal 2020)
GCA_902713425.1
n/a n/a 22,306
(1.80 %)
33,366
(4.09 %)
n/a 39.56
(99.99 %)
0
(0 %)
402
(0.01 %)
245
(100.00 %)
1,126,738
(3.36 %)
889,853
(6.73 %)
8,766,715
(39.22 %)
4
(0.00 %)
1,059,859
(5.24 %)
51,356
(1.84 %)
13,633
(0.35 %)
331 sterlet (paternal 2020)
GCA_902713435.1
n/a n/a 22,718
(1.81 %)
34,093
(4.15 %)
57,768
(4.88 %)
39.60
(100.00 %)
0
(0 %)
422
(0.01 %)
224
(100.00 %)
1,145,503
(3.39 %)
912,936
(6.84 %)
8,839,174
(39.17 %)
4
(0.00 %)
1,099,124
(5.35 %)
52,560
(1.82 %)
14,166
(0.36 %)
332 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1
n/a n/a 16,177
(4.18 %)
40,160
(7.35 %)
n/a 39.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,237
(100.00 %)
1,208,781
(38.02 %)
121,854
(7.96 %)
2,956,942
(32.61 %)
0
(0 %)
310,772
(4.79 %)
27,787
(3.58 %)
14,364
(1.06 %)
333 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1
n/a n/a 16,419
(3.98 %)
40,677
(7.21 %)
n/a 39.69
(99.97 %)
0
(0 %)
825
(0.03 %)
100
(100.00 %)
1,324,513
(39.84 %)
143,170
(9.30 %)
3,000,881
(34.30 %)
1
(0.00 %)
392,291
(5.75 %)
30,130
(3.71 %)
15,123
(1.03 %)
334 straightnose pipefish (RoL-2023_Sa 2023)
GCF_033978795.1
56,498
(4.86 %)
n/a 14,602
(1.00 %)
64,279
(2.96 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
0
(0 %)
1,172
(0.00 %)
473
(100.00 %)
2,984,285
(27.54 %)
1,402,691
(20.35 %)
7,915,062
(67.02 %)
0
(0 %)
4,017,415
(14.33 %)
140,374
(3.90 %)
46,995
(1.10 %)
335 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1
n/a n/a 15,871
(2.85 %)
42,287
(5.51 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
3,274
(100.00 %)
1,826,752
(37.53 %)
592,022
(6.69 %)
4,899,884
(32.33 %)
0
(0 %)
491,621
(3.91 %)
17,357
(1.25 %)
12,560
(0.74 %)
336 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1
53,860
(11.99 %)
n/a 16,033
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
0
(0 %)
236
(0.51 %)
58
(100.00 %)
1,870,234
(37.80 %)
605,570
(6.82 %)
5,059,429
(32.43 %)
2
(0.00 %)
531,388
(4.26 %)
17,919
(1.29 %)
12,796
(0.75 %)
337 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1
50,044
(9.61 %)
n/a 15,665
(2.76 %)
41,398
(5.35 %)
n/a 38.86
(99.98 %)
0
(0 %)
463
(0.02 %)
150
(100.00 %)
777,186
(5.69 %)
603,962
(6.24 %)
5,141,987
(32.41 %)
0
(0 %)
499,249
(4.08 %)
17,264
(1.20 %)
11,793
(0.66 %)
338 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1
40,992
(9.44 %)
n/a 15,295
(2.91 %)
20,865
(5.31 %)
n/a 38.71
(97.32 %)
0
(0 %)
23,755
(2.69 %)
567
(100.00 %)
693,498
(4.75 %)
489,286
(3.69 %)
4,849,313
(30.04 %)
22
(0.00 %)
189,512
(1.66 %)
15,076
(0.95 %)
10,761
(0.60 %)
339 striped sea-bass
GCF_004916995.1
32,103
(10.78 %)
n/a 14,422
(3.07 %)
38,188
(6.41 %)
n/a 40.19
(99.19 %)
0
(0 %)
73,335
(0.86 %)
630
(100.00 %)
365,581
(2.59 %)
142,967
(0.99 %)
4,151,813
(22.73 %)
371
(0.01 %)
25,024
(0.35 %)
13,730
(0.95 %)
10,471
(0.69 %)
340 Sumatra barb
GCF_018831695.1
54,947
(11.16 %)
n/a 18,745
(3.98 %)
49,520
(6.36 %)
n/a 38.24
(99.95 %)
0
(0 %)
5,075
(0.05 %)
1,122
(100.00 %)
638,783
(6.33 %)
357,159
(7.71 %)
4,520,846
(32.46 %)
16
(0.00 %)
624,611
(5.29 %)
46,339
(3.96 %)
34,160
(2.01 %)
341 swamp eel
GCF_001952655.1
43,831
(10.64 %)
n/a 14,741
(2.98 %)
20,099
(5.80 %)
n/a 40.90
(92.01 %)
51,257
(8.01 %)
51,257
(8.01 %)
71,879
(91.99 %)
266,195
(1.84 %)
95,726
(1.16 %)
3,596,747
(21.95 %)
26
(0.02 %)
54,721
(1.57 %)
7,065
(0.42 %)
5,103
(0.29 %)
342 swordfish
GCF_016859285.1
47,986
(9.92 %)
n/a 15,208
(2.84 %)
42,556
(5.91 %)
n/a 40.69
(99.97 %)
0
(0 %)
449
(0.03 %)
1,482
(100.00 %)
484,543
(3.59 %)
230,762
(3.41 %)
4,496,150
(23.94 %)
0
(0 %)
203,746
(2.18 %)
27,129
(2.10 %)
20,905
(1.34 %)
343 tambaqui
GCF_904425465.1
46,601
(6.55 %)
n/a 17,150
(1.88 %)
50,327
(4.03 %)
n/a 39.33
(100.00 %)
0
(0 %)
420
(0.00 %)
1,269
(100.00 %)
753,112
(4.00 %)
676,948
(5.71 %)
8,317,676
(35.32 %)
3
(0.00 %)
679,968
(3.78 %)
25,784
(0.92 %)
17,476
(0.58 %)
344 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1
n/a n/a 14,720
(2.58 %)
45,918
(6.44 %)
n/a 40.37
(99.99 %)
0
(0 %)
454
(0.01 %)
188
(100.00 %)
1,242,704
(17.37 %)
518,293
(15.23 %)
3,986,694
(40.18 %)
1
(0.00 %)
670,254
(6.56 %)
51,441
(3.53 %)
22,258
(1.30 %)
345 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1
n/a n/a 15,347
(2.73 %)
50,294
(7.25 %)
n/a 42.30
(99.98 %)
30
(0.00 %)
610
(0.02 %)
393
(100.00 %)
1,157,324
(26.70 %)
229,196
(4.33 %)
3,694,790
(27.54 %)
1
(0.00 %)
385,033
(4.63 %)
38,929
(2.20 %)
24,476
(1.25 %)
346 three-spined stickleback
GCF_016920845.1
50,181
(16.09 %)
n/a 14,935
(3.99 %)
53,773
(9.96 %)
n/a 44.66
(99.24 %)
0
(0 %)
3,125
(0.76 %)
2,937
(100.00 %)
368,987
(9.09 %)
160,564
(2.89 %)
2,308,841
(21.91 %)
4
(0.00 %)
148,689
(2.94 %)
80,336
(11.49 %)
57,087
(5.92 %)
347 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1
n/a n/a 13,912
(1.87 %)
62,727
(6.28 %)
n/a 42.90
(99.99 %)
0
(0 %)
894
(0.01 %)
755
(100.00 %)
1,981,480
(37.86 %)
652,950
(27.50 %)
3,680,829
(47.75 %)
2
(0.00 %)
1,877,326
(11.62 %)
96,414
(8.01 %)
44,593
(2.17 %)
348 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437365.1
n/a n/a 14,276
(1.78 %)
66,576
(6.32 %)
n/a 42.96
(99.99 %)
0
(0 %)
794
(0.01 %)
820
(100.00 %)
2,127,818
(38.86 %)
708,255
(30.28 %)
3,809,452
(49.66 %)
2
(0.00 %)
2,111,836
(12.18 %)
101,682
(8.04 %)
46,739
(2.13 %)
349 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2
47,024
(13.33 %)
n/a 13,806
(3.76 %)
52,367
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.08 %)
22,977
(6.92 %)
22,977
(6.92 %)
55,891
(93.08 %)
356,857
(3.66 %)
155,338
(3.36 %)
2,806,278
(24.56 %)
111
(0.08 %)
112,464
(5.32 %)
61,010
(7.71 %)
45,318
(4.17 %)
350 tongue sole
GCF_000523025.1
45,186
(16.40 %)
n/a 14,186
(3.98 %)
20,816
(8.22 %)
n/a 40.82
(94.88 %)
33,269
(5.14 %)
33,269
(5.14 %)
62,912
(94.86 %)
423,833
(4.34 %)
235,739
(3.33 %)
3,085,031
(24.78 %)
78
(0.05 %)
83,655
(2.37 %)
17,094
(1.42 %)
11,360
(0.88 %)
351 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3
n/a n/a 13,635
(4.82 %)
48,723
(11.83 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
0
(0 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,793
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
0
(0 %)
206,265
(4.46 %)
46,936
(9.72 %)
35,741
(5.19 %)
352 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2
53,479
(18.31 %)
n/a 14,527
(4.79 %)
28,597
(10.65 %)
55,587
(14.38 %)
45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
281,011
(10.36 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,756
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,975
(9.63 %)
37,920
(5.08 %)
353 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3
n/a n/a 14,527
(4.79 %)
51,181
(11.72 %)
n/a 45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
325,077
(14.03 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,754
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,975
(9.63 %)
37,920
(5.08 %)
354 trahira (hap1 2023)
GCA_029633855.1
n/a n/a 16,039
(2.06 %)
44,287
(4.38 %)
n/a 40.99
(92.91 %)
0
(0 %)
867
(7.09 %)
597
(100.00 %)
2,228,831
(30.95 %)
687,495
(13.85 %)
5,309,097
(36.70 %)
2
(0.01 %)
1,157,952
(7.09 %)
27,070
(2.09 %)
12,077
(0.44 %)
355 trahira (hap2 2023)
GCA_029633875.1
n/a n/a 16,216
(2.00 %)
45,209
(4.32 %)
n/a 41.03
(96.02 %)
0
(0 %)
907
(3.98 %)
452
(100.00 %)
2,280,303
(30.80 %)
708,327
(15.59 %)
5,394,248
(39.01 %)
7
(0.00 %)
1,246,906
(7.61 %)
28,386
(2.18 %)
12,439
(0.46 %)
356 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1
n/a n/a 14,816
(3.44 %)
49,680
(8.16 %)
n/a 43.40
(99.97 %)
0
(0 %)
805
(0.03 %)
108
(100.00 %)
808,348
(19.20 %)
301,230
(7.15 %)
3,267,772
(25.91 %)
4
(0.00 %)
311,531
(3.41 %)
66,132
(6.90 %)
41,801
(3.31 %)
357 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1
57,285
(14.93 %)
n/a 14,887
(3.52 %)
49,403
(8.32 %)
87,351
(14.65 %)
43.54
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28
(100.00 %)
455,017
(0.00 %)
297,185
(5.03 %)
3,312,612
(24.33 %)
0
(0 %)
273,238
(2.64 %)
65,633
(7.08 %)
41,821
(3.38 %)
358 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1
40,373
(7.85 %)
n/a 14,339
(2.08 %)
84,906
(20.47 %)
57,218
(6.01 %)
42.51
(68.98 %)
63,014
(31.03 %)
85,562
(31.04 %)
68,911
(68.97 %)
392,114
(2.78 %)
307,607
(2.09 %)
4,777,941
(27.62 %)
528
(0.12 %)
221,213
(1.41 %)
61,105
(2.15 %)
17,725
(0.62 %)
359 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1
54,488
(6.75 %)
n/a 14,227
(1.27 %)
69,161
(4.33 %)
n/a 44.33
(93.22 %)
0
(0 %)
3,093
(6.78 %)
2,681
(100.00 %)
2,760,581
(47.64 %)
635,213
(25.56 %)
4,136,925
(56.55 %)
8
(0.00 %)
2,533,340
(11.75 %)
110,696
(10.50 %)
17,579
(0.49 %)
360 walking catfish (CIFAMagur01 2020)
GCA_013621035.1
n/a 23,712
(3.37 %)
15,895
(2.18 %)
46,934
(4.73 %)
n/a 39.83
(99.95 %)
0
(0 %)
605
(0.05 %)
3,484
(100.00 %)
1,061,538
(6.25 %)
611,618
(5.19 %)
5,978,835
(37.11 %)
3
(0.00 %)
510,982
(4.22 %)
54,666
(3.50 %)
24,478
(1.06 %)
361 walleye pollock (NIFS_2021 2022)
GCF_026213295.1
49,084
(12.15 %)
n/a 14,241
(2.71 %)
70,653
(9.29 %)
n/a 45.59
(99.96 %)
0
(0 %)
2,816
(0.04 %)
168
(100.00 %)
1,274,742
(38.63 %)
797,757
(14.11 %)
2,725,416
(34.38 %)
8
(0.00 %)
658,410
(7.33 %)
95,149
(8.09 %)
57,122
(4.03 %)
362 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1
n/a n/a 14,197
(3.33 %)
44,782
(7.70 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,294
(100.00 %)
396,279
(4.74 %)
275,154
(5.76 %)
2,933,132
(29.41 %)
0
(0 %)
277,720
(3.27 %)
35,104
(4.08 %)
21,634
(1.95 %)
363 warty frogfish (fAntMac1 primary hap 2020)
GCA_013358685.1
n/a n/a 14,494
(3.34 %)
45,310
(7.77 %)
n/a 41.86
(99.87 %)
0
(0 %)
219
(0.13 %)
155
(100.00 %)
413,753
(4.95 %)
290,313
(6.11 %)
3,010,996
(29.71 %)
3
(0.00 %)
305,411
(3.51 %)
36,840
(4.18 %)
22,433
(1.95 %)
364 western mosquitofish
GCF_019740435.1
54,029
(12.31 %)
n/a 14,667
(2.80 %)
44,358
(6.62 %)
n/a 38.94
(97.42 %)
0
(0 %)
181
(2.58 %)
37
(100.00 %)
348,476
(2.56 %)
158,728
(2.21 %)
4,604,959
(26.85 %)
0
(0 %)
174,331
(2.27 %)
30,624
(1.94 %)
23,348
(1.33 %)
365 western speckled dace (OS25496 2023)
GCF_029890125.1
46,203
(5.36 %)
n/a 16,945
(2.57 %)
65,343
(6.35 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 930
(100.00 %)
2,528,154
(48.24 %)
549,447
(8.24 %)
5,157,802
(41.42 %)
0
(0 %)
921,640
(6.77 %)
84,874
(6.05 %)
24,156
(1.14 %)
366 White Sands pupfish
GCF_016077235.1
46,084
(6.27 %)
n/a 14,817
(1.71 %)
52,055
(4.88 %)
n/a 39.01
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,003
(100.00 %)
489,894
(2.67 %)
304,277
(3.91 %)
6,371,712
(38.05 %)
0
(0 %)
457,693
(3.60 %)
41,820
(1.75 %)
13,011
(0.56 %)
367 wolf-eel
GCF_004355925.1
43,625
(14.00 %)
n/a 14,930
(3.24 %)
31,372
(7.30 %)
n/a 42.10
(92.86 %)
23,085
(7.15 %)
23,891
(7.15 %)
33,400
(92.85 %)
379,343
(3.26 %)
244,853
(2.39 %)
3,432,622
(22.07 %)
476
(0.06 %)
108,255
(0.97 %)
30,581
(2.04 %)
19,275
(1.18 %)
368 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1
n/a n/a 14,753
(3.49 %)
49,516
(8.47 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
0
(0 %)
222
(0.00 %)
171
(100.00 %)
458,382
(5.18 %)
420,718
(8.01 %)
3,146,054
(25.71 %)
0
(0 %)
390,050
(4.18 %)
69,817
(7.20 %)
44,403
(3.53 %)
369 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1
n/a n/a 14,847
(3.48 %)
50,136
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
0
(0 %)
219
(0.00 %)
443
(100.00 %)
461,903
(5.20 %)
422,251
(8.03 %)
3,180,804
(25.81 %)
1
(0.00 %)
392,635
(4.18 %)
70,183
(7.15 %)
44,599
(3.52 %)
370 worm pipefish (RoL_2023-P1 2023)
GCF_033978685.1
73,681
(3.43 %)
n/a 25,892
(1.02 %)
114,154
(3.30 %)
n/a 39.45
(100.00 %)
0
(0 %)
146
(0.00 %)
630
(100.00 %)
4,795,312
(24.37 %)
2,093,730
(16.74 %)
13,132,465
(67.32 %)
0
(0 %)
5,394,148
(11.91 %)
248,526
(4.59 %)
79,895
(1.28 %)
371 Wuchang bream
GCF_018812025.1
68,768
(8.86 %)
n/a 18,247
(2.62 %)
57,323
(5.24 %)
n/a 37.64
(99.83 %)
0
(0 %)
1,281
(0.17 %)
243
(100.00 %)
801,110
(0.00 %)
559,399
(5.04 %)
6,340,567
(43.09 %)
2
(0.00 %)
715,866
(5.11 %)
45,067
(2.52 %)
19,912
(0.78 %)
372 Yangtze koukloug (SWU-2019 2020)
GCF_012432095.1
63,925
(10.50 %)
n/a 17,502
(3.25 %)
52,519
(5.86 %)
n/a 37.23
(99.62 %)
0
(0 %)
617
(0.38 %)
353
(100.00 %)
2,297,102
(50.34 %)
368,423
(3.28 %)
5,171,389
(38.98 %)
1
(0.00 %)
338,882
(3.77 %)
32,824
(2.00 %)
14,248
(0.64 %)
373 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1
64,819
(11.15 %)
n/a 15,680
(2.87 %)
41,108
(5.68 %)
n/a 39.49
(99.94 %)
0
(0 %)
817
(0.06 %)
517
(100.00 %)
839,496
(9.42 %)
756,396
(11.12 %)
4,051,149
(35.45 %)
2
(0.00 %)
834,149
(7.02 %)
24,342
(1.72 %)
12,238
(0.75 %)
374 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1
54,374
(10.66 %)
n/a 15,584
(2.85 %)
22,598
(5.58 %)
n/a 39.55
(99.11 %)
0
(0 %)
1,760
(0.89 %)
663
(100.00 %)
883,218
(10.65 %)
797,020
(11.09 %)
4,092,065
(35.46 %)
4
(0.00 %)
749,315
(6.20 %)
24,238
(1.72 %)
12,253
(0.76 %)
375 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1
47,108
(7.77 %)
n/a 15,458
(2.26 %)
28,572
(5.62 %)
n/a 40.84
(99.95 %)
0
(0 %)
831
(0.05 %)
268
(100.00 %)
620,402
(4.92 %)
540,302
(7.26 %)
4,770,842
(35.92 %)
0
(0 %)
688,524
(4.84 %)
35,251
(1.63 %)
13,218
(0.63 %)
376 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1
n/a n/a 814
(1.87 %)
3,814
(6.84 %)
n/a 42.36
(99.98 %)
0
(0 %)
80
(0.02 %)
349
(100.00 %)
38,000
(5.03 %)
29,516
(7.35 %)
232,988
(20.37 %)
0
(0 %)
46,752
(6.67 %)
2,289
(2.07 %)
1,621
(1.32 %)
377 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
n/a 15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
84,160
(11.62 %)
42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
0
(0 %)
188,182
(2.04 %)
31,005
(1.79 %)
19,757
(1.03 %)
378 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1
n/a n/a 15,959
(2.63 %)
43,025
(5.73 %)
n/a 39.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 640
(100.00 %)
1,427,221
(28.44 %)
257,108
(3.15 %)
5,197,531
(26.91 %)
0
(0 %)
350,223
(3.66 %)
13,909
(0.83 %)
10,650
(0.55 %)
379 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
n/a 15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
1
(0.00 %)
375,976
(3.80 %)
14,420
(0.88 %)
9,087
(0.42 %)
380 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2
40,935
(9.94 %)
n/a 15,673
(2.75 %)
53,235
(6.33 %)
n/a 40.72
(97.79 %)
0
(0 %)
33,661
(2.21 %)
98,345
(100.00 %)
1,337,427
(24.48 %)
522,121
(4.83 %)
4,649,096
(25.00 %)
308
(0.03 %)
357,663
(3.10 %)
16,819
(0.86 %)
11,638
(0.57 %)
381 Zealand spotty
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
n/a 14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,987
(4.42 %)
18,299
(0.85 %)
7,999
(0.35 %)
382 zebra mbuna
GCF_000238955.4
51,012
(8.37 %)
n/a 15,901
(2.10 %)
32,136
(6.12 %)
n/a 41.16
(99.99 %)
0
(0 %)
641
(0.01 %)
1,690
(100.00 %)
565,771
(6.22 %)
253,037
(2.53 %)
4,679,743
(31.57 %)
0
(0 %)
324,855
(3.54 %)
36,689
(2.00 %)
18,156
(0.99 %)
383 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1
n/a n/a 6,365
(2.41 %)
16,467
(3.26 %)
n/a 36.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,719
(100.00 %)
1,317,027
(59.43 %)
323,062
(10.58 %)
3,014,570
(45.46 %)
0
(0 %)
366,878
(5.24 %)
14,563
(1.98 %)
3,786
(0.32 %)
384 zebrafish (fDanRer4 primary hap 2022)
GCA_944039275.1
n/a n/a 18,065
(2.46 %)
44,526
(3.30 %)
n/a 37.08
(99.99 %)
0
(0 %)
381
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,804,769
(44.04 %)
954,645
(10.72 %)
8,694,743
(51.88 %)
4
(0.00 %)
1,207,649
(5.79 %)
44,936
(2.02 %)
11,380
(0.33 %)
385 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1
n/a n/a 17,774
(2.54 %)
44,221
(3.24 %)
n/a 36.52
(99.87 %)
20,876
(0.14 %)
20,876
(0.14 %)
20,901
(99.86 %)
4,138,008
(61.22 %)
894,145
(6.79 %)
9,494,379
(47.68 %)
393
(0.01 %)
781,563
(4.38 %)
42,482
(2.03 %)
8,815
(0.26 %)
386 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1
n/a n/a 17,535
(2.50 %)
44,169
(3.34 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
0
(0 %)
712
(0.01 %)
1,252
(100.00 %)
3,891,854
(61.07 %)
927,173
(7.78 %)
8,621,517
(50.27 %)
1
(0.00 %)
941,178
(4.90 %)
44,554
(2.12 %)
10,153
(0.30 %)
387 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2
n/a n/a 17,692
(2.51 %)
43,578
(3.27 %)
n/a 36.56
(99.99 %)
0
(0 %)
1,352
(0.01 %)
755
(100.00 %)
3,937,397
(60.86 %)
936,258
(7.76 %)
8,732,369
(50.44 %)
0
(0 %)
933,928
(4.81 %)
44,812
(2.09 %)
10,558
(0.30 %)
388 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6
65,219
(5.63 %)
n/a 22,246
(2.54 %)
51,134
(7.13 %)
n/a 36.60
(99.72 %)
17,105
(0.27 %)
20,258
(0.28 %)
34,617
(99.73 %)
4,595,932
(57.92 %)
1,077,677
(6.47 %)
10,772,232
(49.45 %)
127
(0.00 %)
942,199
(4.23 %)
53,471
(2.06 %)
12,486
(0.29 %)
389 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1
n/a n/a 1,204
(2.88 %)
4,065
(7.13 %)
n/a 41.24
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 1,437
(100.00 %)
26,319
(3.19 %)
14,209
(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
0
(0 %)
22,258
(4.87 %)
1,253
(1.49 %)
988
(1.13 %)
390 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2
44,988
(12.00 %)
n/a 15,037
(3.35 %)
40,235
(7.28 %)
60,496
(9.39 %)
40.66
(97.76 %)
0
(0 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
348,230
(2.87 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,025
(23.44 %)
0
(0 %)
175,881
(3.08 %)
12,807
(1.08 %)
8,703
(0.67 %)
391 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3
n/a n/a 15,036
(3.35 %)
40,234
(7.28 %)
n/a 40.66
(97.76 %)
0
(0 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
671,614
(20.98 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,040
(23.44 %)
0
(0 %)
175,881
(3.08 %)
12,807
(1.08 %)
8,703
(0.67 %)
TOTALS:total assembly count 391

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 215 assemblies assembly stats track stats
Mammals 538 assemblies assembly stats track stats
Birds 356 assemblies assembly stats track stats
Fishes 391 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 222 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 717 assemblies assembly stats track stats
Plants 299 assemblies assembly stats track stats
Fungi 662 assemblies assembly stats track stats
Viruses 281 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 103 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 442 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 882 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats