Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024)
GCA_043250625.1
n/a n/a 15,735
(2.44 %)
50,184
(6.16 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
0
(0 %)
471
(0.01 %)
203
(100.00 %)
1,781,283
(37.65 %)
444,047
(7.93 %)
4,765,080
(37.01 %)
6
(0.00 %)
706,869
(5.97 %)
39,918
(2.01 %)
18,319
(0.92 %)
2 alligator pipefish (LvHL_M 2021)
GCF_019802595.1
54,226
(11.15 %)
n/a 13,427
(2.67 %)
46,903
(5.94 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
144
(0.00 %)
143
(100.00 %)
1,200,994
(30.62 %)
143,062
(2.20 %)
3,921,676
(38.03 %)
0
(0 %)
164,363
(2.07 %)
67,978
(8.92 %)
47,265
(3.34 %)
3 allis shad
GCF_017589495.1
48,507
(8.47 %)
n/a 15,371
(2.28 %)
58,686
(5.84 %)
n/a 42.99
(99.91 %)
0
(0 %)
1,541
(0.09 %)
1,095
(100.00 %)
1,190,406
(9.30 %)
1,205,679
(11.28 %)
3,960,328
(38.81 %)
0
(0 %)
936,797
(6.49 %)
36,494
(1.83 %)
23,714
(1.20 %)
4 Amazon molly
GCF_000485575.1
56,958
(11.69 %)
n/a 15,117
(2.64 %)
30,114
(6.60 %)
n/a 39.16
(95.38 %)
27,073
(4.64 %)
36,429
(4.64 %)
31,058
(95.36 %)
346,461
(2.03 %)
188,557
(1.44 %)
5,139,633
(26.01 %)
848
(0.07 %)
161,806
(7.35 %)
35,229
(1.82 %)
27,404
(1.38 %)
5 amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021)
GCF_021018895.1
47,198
(13.10 %)
n/a 15,500
(3.14 %)
41,230
(6.67 %)
n/a 40.79
(99.99 %)
0
(0 %)
150
(0.01 %)
31
(100.00 %)
1,230,524
(26.57 %)
398,694
(5.41 %)
4,106,609
(25.60 %)
0
(0 %)
335,552
(3.38 %)
15,656
(0.99 %)
12,171
(0.69 %)
6 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1
n/a n/a 15,901
(2.25 %)
61,133
(6.37 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,411
(100.00 %)
2,043,181
(23.64 %)
1,141,539
(11.35 %)
3,668,314
(38.60 %)
0
(0 %)
805,945
(6.00 %)
40,218
(2.14 %)
24,243
(1.22 %)
7 American shad (primary hap 2021)
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
n/a 16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
76,974
(8.55 %)
43.18
(99.45 %)
0
(0 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
14
(0.00 %)
934,014
(6.61 %)
42,699
(2.23 %)
25,608
(1.23 %)
8 Andian cavefish (hap1 2023 genbank)
GCA_030014385.1
n/a n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,920
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
9 Andian cavefish (hap1 2023 refseq)
GCF_030014385.1
42,881
(5.97 %)
n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,939
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
10 annual killifish
GCF_001266775.1
38,517
(8.87 %)
n/a 14,027
(2.45 %)
27,798
(5.86 %)
n/a 39.29
(80.23 %)
138,584
(19.83 %)
1,025,519
(19.94 %)
168,368
(80.17 %)
349,927
(2.63 %)
296,826
(3.18 %)
5,039,517
(28.69 %)
2,323
(0.21 %)
261,101
(1.92 %)
26,364
(1.18 %)
17,566
(0.78 %)
11 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1
n/a n/a 16,678
(0.56 %)
151,361
(4.03 %)
n/a 44.57
(99.91 %)
0
(0 %)
15,113
(0.09 %)
5,983
(100.00 %)
12,251,532
(51.73 %)
3,521,157
(17.69 %)
10,051,020
(68.37 %)
71
(0.00 %)
5,101,423
(13.15 %)
494,595
(10.52 %)
74,823
(1.04 %)
12 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1
n/a n/a 17,318
(1.49 %)
80,097
(5.79 %)
n/a 43.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11,436
(100.00 %)
5,482,467
(36.71 %)
1,454,729
(18.84 %)
6,756,226
(47.56 %)
0
(0 %)
1,722,514
(9.86 %)
92,057
(3.50 %)
34,309
(1.32 %)
13 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1
n/a n/a 17,342
(1.44 %)
78,914
(5.48 %)
n/a 43.57
(99.96 %)
0
(0 %)
3,179
(0.04 %)
1,901
(100.00 %)
5,980,457
(37.18 %)
1,633,782
(21.76 %)
6,279,725
(52.83 %)
12
(0.00 %)
2,013,978
(10.83 %)
104,688
(3.57 %)
33,790
(1.15 %)
14 Antarctic spiny plunderfish (primary hap 2020)
GCA_902827135.1
n/a n/a 14,859
(1.97 %)
60,431
(5.73 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
0
(0 %)
1,039
(0.01 %)
1,541
(100.00 %)
461,253
(3.08 %)
434,124
(6.81 %)
3,499,945
(42.99 %)
6
(0.00 %)
656,220
(6.54 %)
60,941
(3.20 %)
13,823
(0.61 %)
15 Arctic char
GCF_002910315.2
67,196
(4.99 %)
n/a 23,967
(1.55 %)
45,775
(3.69 %)
n/a 43.16
(93.25 %)
1,447
(0.01 %)
1,718,015
(6.84 %)
16,700
(99.99 %)
1,011,348
(4.06 %)
1,666,148
(10.50 %)
10,597,529
(44.77 %)
5,986
(0.15 %)
2,192,365
(6.51 %)
76,282
(1.94 %)
25,064
(0.53 %)
16 Arctic char (CBP00131 primary hap 2024)
GCA_036784965.1
n/a n/a 22,376
(1.44 %)
97,559
(4.71 %)
n/a 43.37
(99.97 %)
3,235
(0.03 %)
3,235
(0.03 %)
4,404
(99.97 %)
999,920
(4.22 %)
1,630,911
(26.08 %)
7,875,105
(58.08 %)
17
(0.00 %)
1,400,966
(4.23 %)
70,947
(2.59 %)
16,782
(0.35 %)
17 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1
n/a n/a 14,032
(2.44 %)
39,770
(4.92 %)
n/a 38.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,617
(100.00 %)
1,808,149
(37.98 %)
583,449
(10.56 %)
4,203,368
(40.67 %)
0
(0 %)
559,424
(5.24 %)
24,867
(2.06 %)
14,134
(0.93 %)
18 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1
n/a n/a 15,455
(2.53 %)
40,077
(4.90 %)
86,346
(8.45 %)
38.90
(99.98 %)
0
(0 %)
795
(0.02 %)
241
(100.00 %)
2,045,691
(38.70 %)
669,975
(11.72 %)
4,638,765
(42.07 %)
1
(0.00 %)
693,282
(5.96 %)
28,277
(1.93 %)
15,766
(0.94 %)
19 Arkansas darter
GCF_013103735.1
51,282
(9.79 %)
n/a 14,588
(2.90 %)
42,306
(6.27 %)
n/a 40.52
(99.50 %)
0
(0 %)
35,052
(0.52 %)
4,664
(100.00 %)
418,294
(3.29 %)
331,380
(3.74 %)
4,153,309
(26.60 %)
762
(0.03 %)
207,110
(1.75 %)
15,489
(0.95 %)
10,148
(0.62 %)
20 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1
n/a n/a 17,862
(2.29 %)
70,667
(5.50 %)
n/a 40.01
(100.00 %)
0
(0 %)
327
(0.00 %)
179
(100.00 %)
2,876,989
(50.39 %)
700,511
(9.88 %)
5,977,913
(44.08 %)
2
(0.00 %)
1,066,043
(6.53 %)
104,320
(8.02 %)
23,254
(0.86 %)
21 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1
n/a n/a 18,025
(2.28 %)
71,255
(5.50 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
0
(0 %)
318
(0.00 %)
341
(100.00 %)
2,884,301
(50.42 %)
702,464
(9.98 %)
5,989,299
(44.18 %)
2
(0.00 %)
1,090,542
(6.63 %)
105,945
(8.03 %)
23,683
(0.88 %)
22 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1
50,315
(9.13 %)
n/a 16,526
(2.73 %)
38,780
(6.64 %)
72,662
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
0
(0 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
504,673
(3.06 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
0
(0 %)
157,330
(1.72 %)
88,517
(10.73 %)
67,281
(4.98 %)
23 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2
n/a n/a 16,053
(2.73 %)
74,777
(7.26 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,351
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
0
(0 %)
142,849
(1.57 %)
85,546
(10.82 %)
65,542
(5.07 %)
24 Asian redtail catfish (EC202008001 2021)
GCF_019097595.1
51,017
(10.40 %)
n/a 15,549
(2.60 %)
42,858
(5.39 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
0
(0 %)
107
(0.00 %)
73
(100.00 %)
1,718,992
(31.80 %)
749,009
(14.09 %)
4,206,758
(37.30 %)
0
(0 %)
1,161,068
(7.86 %)
19,230
(1.16 %)
12,900
(0.65 %)
25 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924715.1
n/a n/a 15,722
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
0
(0 %)
468
(0.01 %)
120
(100.00 %)
1,608,686
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,115
(27.80 %)
3
(0.00 %)
390,196
(3.88 %)
14,488
(0.90 %)
9,706
(0.46 %)
26 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924715.1
54,426
(12.09 %)
n/a 15,720
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
0
(0 %)
468
(0.01 %)
119
(100.00 %)
1,608,682
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,078
(27.80 %)
3
(0.00 %)
390,196
(3.88 %)
14,488
(0.90 %)
9,706
(0.46 %)
27 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1
51,642
(11.92 %)
n/a 14,055
(2.62 %)
36,761
(8.42 %)
68,438
(9.50 %)
45.64
(96.48 %)
0
(0 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
790,946
(10.54 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
4
(0.00 %)
741,285
(7.34 %)
97,133
(7.82 %)
51,623
(3.50 %)
28 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1
n/a n/a 13,366
(2.68 %)
66,599
(9.29 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,727
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
0
(0 %)
635,348
(7.05 %)
87,167
(8.03 %)
47,003
(3.66 %)
29 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
n/a 14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
69,662
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
0
(0 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
0
(0 %)
240,110
(3.16 %)
31,325
(2.25 %)
20,749
(1.34 %)
30 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1
n/a n/a 16,554
(3.01 %)
54,832
(7.45 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,008
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
0
(0 %)
297,396
(3.46 %)
36,868
(2.33 %)
24,401
(1.38 %)
31 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2
50,946
(10.35 %)
n/a 16,394
(2.60 %)
61,637
(7.20 %)
n/a 44.16
(99.89 %)
1,963
(0.11 %)
1,990
(0.11 %)
3,687
(99.89 %)
1,269,688
(11.71 %)
1,318,661
(13.43 %)
3,732,801
(32.49 %)
2
(0.00 %)
1,134,686
(8.55 %)
35,959
(1.97 %)
21,835
(1.09 %)
32 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2
n/a n/a 15,331
(2.42 %)
52,370
(6.91 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
0
(0 %)
74
(0.00 %)
1,049
(100.00 %)
1,454,631
(18.29 %)
383,946
(4.34 %)
4,363,016
(32.69 %)
0
(0 %)
445,382
(4.43 %)
56,416
(3.08 %)
20,355
(1.02 %)
33 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2
n/a n/a 15,262
(2.42 %)
51,857
(6.86 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
222
(0.00 %)
153
(100.00 %)
1,454,219
(18.25 %)
384,609
(4.72 %)
4,338,083
(32.80 %)
5
(0.00 %)
449,712
(4.53 %)
56,553
(3.08 %)
20,550
(1.04 %)
34 Atlantic mackerel (primary hap 2023 genbank)
GCA_963691925.1
n/a n/a 15,291
(2.56 %)
43,206
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
666
(100.00 %)
1,496,244
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,761
(29.92 %)
9
(0.00 %)
555,075
(5.00 %)
13,309
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
35 Atlantic mackerel (primary hap 2023 refseq)
GCF_963691925.1
34,357
(8.10 %)
n/a 15,289
(2.56 %)
43,205
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
665
(100.00 %)
1,496,240
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,726
(29.93 %)
9
(0.00 %)
555,074
(5.00 %)
13,308
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
36 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1
112,906
(5.61 %)
n/a 28,077
(1.40 %)
115,207
(3.75 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
1,300,611
(4.84 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
0
(0 %)
3,295,334
(6.78 %)
77,089
(1.86 %)
20,127
(0.31 %)
37 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1
109,794
(5.45 %)
n/a 26,968
(1.35 %)
202,772
(19.11 %)
n/a 43.10
(88.27 %)
9,418
(0.03 %)
138,207
(11.73 %)
241,570
(99.97 %)
1,628,119
(9.46 %)
2,496,917
(19.18 %)
10,390,780
(51.80 %)
602
(0.04 %)
n/a 79,791
(1.60 %)
18,955
(0.25 %)
38 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1
60,214
(14.44 %)
n/a 14,860
(3.40 %)
50,921
(8.07 %)
76,242
(9.93 %)
43.38
(100.00 %)
0
(0 %)
51
(0.00 %)
127
(100.00 %)
449,865
(5.00 %)
299,255
(7.03 %)
3,274,219
(25.77 %)
0
(0 %)
378,660
(3.73 %)
67,338
(7.00 %)
43,189
(3.43 %)
39 Australian ruff (RE-2024a hap1 2024)
GCA_042242115.1
n/a n/a 15,457
(2.72 %)
38,472
(5.59 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
0
(0 %)
91
(0.00 %)
625
(100.00 %)
476,492
(3.25 %)
242,097
(6.02 %)
4,286,693
(33.41 %)
1
(0.00 %)
310,636
(3.76 %)
9,322
(0.80 %)
6,756
(0.33 %)
40 Australian ruff (RE-2024a hap2 2024)
GCA_042242135.1
n/a n/a 15,534
(2.50 %)
39,464
(5.26 %)
n/a 39.77
(100.00 %)
0
(0 %)
98
(0.00 %)
552
(100.00 %)
498,493
(3.22 %)
271,314
(7.61 %)
4,161,752
(38.16 %)
2
(0.00 %)
436,316
(4.99 %)
9,637
(0.93 %)
6,725
(0.31 %)
41 ballan wrasse (2016)
GCF_900080235.1
42,362
(9.30 %)
n/a 16,129
(2.44 %)
33,854
(5.87 %)
n/a 40.89
(99.98 %)
0
(0 %)
257
(0.02 %)
13,466
(100.00 %)
503,078
(3.93 %)
321,407
(5.60 %)
4,329,412
(30.36 %)
5
(0.00 %)
563,079
(4.68 %)
21,221
(1.07 %)
11,680
(0.58 %)
42 ballan wrasse (primary hap 2024 genbank)
GCA_963930695.1
n/a n/a 15,142
(2.66 %)
43,601
(6.21 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
1
(0.00 %)
815
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,221,802
(30.10 %)
290,738
(7.79 %)
4,164,845
(30.34 %)
4
(0.00 %)
525,923
(5.43 %)
17,126
(0.94 %)
10,131
(0.54 %)
43 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1
48,592
(12.09 %)
n/a 15,140
(2.66 %)
43,304
(6.14 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
815
(0.02 %)
815
(0.02 %)
946
(99.98 %)
1,221,797
(30.10 %)
290,736
(7.79 %)
4,164,799
(30.34 %)
4
(0.00 %)
525,920
(5.43 %)
17,126
(0.94 %)
10,131
(0.54 %)
44 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1
n/a n/a 15,211
(3.23 %)
41,620
(7.14 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
2,393
(100.00 %)
785,178
(17.57 %)
249,148
(8.36 %)
3,391,653
(26.49 %)
0
(0 %)
274,110
(3.20 %)
13,787
(0.93 %)
9,087
(0.56 %)
45 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
n/a 15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
0
(0 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
1
(0.00 %)
297,814
(3.49 %)
15,089
(0.96 %)
9,304
(0.55 %)
46 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1
n/a n/a 15,122
(1.44 %)
65,809
(4.50 %)
n/a 41.23
(99.74 %)
0
(0 %)
293
(0.26 %)
331
(100.00 %)
2,545,429
(50.53 %)
451,939
(5.50 %)
5,807,705
(42.18 %)
0
(0 %)
863,582
(6.37 %)
94,695
(3.92 %)
37,528
(1.27 %)
47 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1
n/a n/a 15,024
(1.45 %)
65,141
(4.53 %)
n/a 41.23
(99.52 %)
0
(0 %)
373
(0.48 %)
196
(100.00 %)
2,509,508
(50.53 %)
441,892
(5.11 %)
6,245,443
(38.22 %)
2
(0.00 %)
822,138
(6.12 %)
93,198
(3.82 %)
36,988
(1.26 %)
48 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1
n/a n/a 26,794
(3.15 %)
76,434
(5.64 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
8,035
(100.00 %)
4,084,361
(52.18 %)
538,411
(4.25 %)
7,659,980
(38.94 %)
0
(0 %)
450,884
(2.88 %)
58,008
(2.90 %)
19,160
(0.57 %)
49 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1
n/a n/a 31,876
(3.30 %)
85,063
(5.65 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
0
(0 %)
108
(0.00 %)
92
(100.00 %)
4,839,533
(52.47 %)
646,636
(4.57 %)
8,240,279
(42.13 %)
2
(0.00 %)
569,819
(3.17 %)
71,384
(3.04 %)
22,137
(0.56 %)
50 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2
53,646
(13.68 %)
n/a 16,073
(3.06 %)
44,214
(6.63 %)
n/a 40.76
(98.88 %)
0
(0 %)
674
(1.12 %)
2,997
(100.00 %)
986,469
(19.78 %)
237,272
(4.32 %)
3,983,840
(23.58 %)
0
(0 %)
251,048
(3.40 %)
16,237
(1.03 %)
9,089
(0.52 %)
51 beardfish (hap1 2025)
GCA_047511565.1
n/a n/a 15,938
(3.00 %)
52,921
(7.52 %)
n/a 43.38
(99.98 %)
0
(0 %)
752
(0.02 %)
327
(100.00 %)
993,554
(11.81 %)
755,389
(11.75 %)
3,469,352
(30.25 %)
8
(0.00 %)
770,561
(6.90 %)
68,008
(5.51 %)
40,885
(2.43 %)
52 beardfish (hap2 2025)
GCA_047511595.1
n/a n/a 15,940
(3.02 %)
51,682
(7.42 %)
n/a 43.31
(99.98 %)
1
(0.00 %)
756
(0.02 %)
200
(100.00 %)
986,717
(11.69 %)
754,642
(11.91 %)
3,459,958
(30.32 %)
9
(0.00 %)
762,386
(6.77 %)
67,732
(5.27 %)
40,872
(2.45 %)
53 bicolor damselfish
GCF_000690725.1
32,951
(8.67 %)
n/a 15,181
(2.55 %)
31,420
(5.94 %)
n/a 41.66
(93.68 %)
36,242
(6.34 %)
44,409
(6.34 %)
42,059
(93.66 %)
351,453
(2.61 %)
180,113
(1.20 %)
5,016,154
(23.41 %)
554
(0.03 %)
96,483
(1.91 %)
46,423
(2.30 %)
31,358
(1.43 %)
54 black goby (alternate hap 2023)
GCA_951799965.1
n/a n/a 14,534
(2.11 %)
56,906
(6.41 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,523
(100.00 %)
2,445,373
(45.07 %)
452,878
(9.46 %)
4,195,077
(39.49 %)
0
(0 %)
841,978
(6.49 %)
77,592
(4.86 %)
50,068
(2.69 %)
55 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1
n/a n/a 14,455
(2.06 %)
56,488
(6.31 %)
n/a 42.10
(99.99 %)
0
(0 %)
636
(0.01 %)
298
(100.00 %)
3,230,397
(55.09 %)
494,440
(10.43 %)
4,359,169
(40.46 %)
2
(0.00 %)
950,976
(6.99 %)
81,684
(4.81 %)
45,797
(2.02 %)
56 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1
n/a n/a 31,847
(2.01 %)
153,565
(6.53 %)
n/a 41.78
(99.99 %)
639
(0.00 %)
639
(0.00 %)
63,422
(100.00 %)
2,786,840
(18.28 %)
1,016,389
(7.50 %)
8,844,631
(26.90 %)
18
(0.00 %)
1,160,777
(4.13 %)
130,556
(4.42 %)
82,861
(2.07 %)
57 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 refseq)
GCF_022577435.1
42,351
(12.09 %)
n/a 14,988
(3.02 %)
47,106
(6.98 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
234
(0.00 %)
234
(0.00 %)
463
(100.00 %)
1,017,142
(18.99 %)
360,899
(8.75 %)
3,761,447
(28.91 %)
0
(0 %)
469,043
(4.64 %)
48,360
(4.43 %)
30,659
(2.06 %)
58 black rockcod
GCF_000735185.1
35,176
(8.54 %)
n/a 12,601
(2.15 %)
42,589
(6.13 %)
n/a 40.62
(97.93 %)
33,914
(2.08 %)
59,164
(2.09 %)
72,571
(97.92 %)
268,591
(2.71 %)
238,334
(3.18 %)
3,425,479
(29.48 %)
174
(0.01 %)
164,483
(1.70 %)
31,009
(2.11 %)
14,188
(1.03 %)
59 black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023)
GCF_030273125.1
43,392
(8.45 %)
n/a 15,522
(2.13 %)
48,255
(5.50 %)
n/a 38.69
(100.00 %)
0
(0 %)
341
(0.00 %)
92
(100.00 %)
1,651,919
(22.26 %)
782,601
(7.55 %)
5,398,047
(38.87 %)
2
(0.00 %)
810,395
(6.16 %)
24,508
(1.19 %)
12,928
(0.57 %)
60 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1
n/a n/a 15,274
(2.92 %)
51,453
(7.45 %)
n/a 43.07
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,239,364
(29.69 %)
354,703
(9.63 %)
3,006,556
(30.35 %)
2
(0.00 %)
588,441
(7.05 %)
53,503
(4.48 %)
28,830
(1.72 %)
61 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1
n/a n/a 15,043
(2.96 %)
50,860
(7.54 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
366
(0.01 %)
109
(100.00 %)
1,210,142
(29.44 %)
340,820
(9.19 %)
2,986,750
(29.89 %)
0
(0 %)
547,550
(6.92 %)
52,010
(4.20 %)
28,373
(1.72 %)
62 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1
44,847
(11.30 %)
n/a 15,364
(2.86 %)
51,122
(6.88 %)
n/a 39.48
(99.99 %)
0
(0 %)
89
(0.01 %)
415
(100.00 %)
1,160,519
(28.33 %)
183,082
(4.75 %)
4,354,804
(27.83 %)
4
(0.00 %)
435,884
(4.37 %)
40,207
(2.97 %)
32,779
(2.13 %)
63 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1
n/a n/a 17,403
(2.99 %)
45,903
(5.38 %)
n/a 38.64
(99.99 %)
0
(0 %)
709
(0.01 %)
673
(100.00 %)
2,141,901
(35.77 %)
482,931
(17.18 %)
4,297,133
(46.82 %)
4
(0.00 %)
991,826
(7.99 %)
41,889
(2.32 %)
19,281
(0.97 %)
64 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1
n/a n/a 17,486
(2.97 %)
46,833
(5.41 %)
n/a 38.79
(99.99 %)
0
(0 %)
720
(0.01 %)
413
(100.00 %)
2,165,269
(36.18 %)
490,692
(17.84 %)
4,251,333
(47.54 %)
10
(0.00 %)
1,058,863
(8.47 %)
42,744
(2.37 %)
19,312
(0.98 %)
65 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1
48,916
(10.27 %)
n/a 15,574
(2.62 %)
44,035
(5.21 %)
n/a 39.80
(98.04 %)
0
(0 %)
171
(1.96 %)
43
(100.00 %)
2,180,806
(45.14 %)
625,260
(6.63 %)
5,137,199
(35.52 %)
1
(0.00 %)
571,071
(4.17 %)
31,164
(1.89 %)
20,363
(1.02 %)
66 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1
36,881
(7.40 %)
n/a 15,408
(2.38 %)
27,235
(5.59 %)
n/a 40.42
(89.87 %)
0
(0 %)
53,539
(10.15 %)
12,952
(100.00 %)
867,639
(16.39 %)
195,137
(1.62 %)
5,293,484
(23.10 %)
124
(0.05 %)
97,164
(2.26 %)
21,238
(1.02 %)
14,191
(0.64 %)
67 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1
57,860
(9.04 %)
n/a 15,494
(1.98 %)
57,878
(5.63 %)
56,939
(8.11 %)
40.66
(99.97 %)
0
(0 %)
723
(0.03 %)
304
(100.00 %)
1,055,724
(20.14 %)
324,841
(3.27 %)
5,000,753
(32.08 %)
4
(0.00 %)
594,081
(5.09 %)
32,357
(1.59 %)
17,357
(0.80 %)
68 blue whiting (primary hap 2024)
GCA_964030765.1
n/a n/a 13,097
(2.93 %)
55,097
(8.76 %)
n/a 45.82
(99.88 %)
0
(0 %)
3,055
(0.12 %)
3,832
(100.00 %)
1,337,604
(32.27 %)
749,185
(17.27 %)
2,363,606
(35.06 %)
7
(0.00 %)
596,931
(7.20 %)
78,815
(8.25 %)
42,300
(3.48 %)
69 bluestreak cleaner wrasse (JK-2023 2023)
GCA_030710495.1
n/a n/a 14,996
(2.68 %)
44,244
(6.44 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
2
(0.00 %)
211
(0.00 %)
59
(100.00 %)
1,619,681
(30.07 %)
337,749
(4.31 %)
4,541,709
(29.20 %)
4
(0.00 %)
273,269
(2.99 %)
14,576
(0.85 %)
10,610
(0.55 %)
70 bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023)
GCF_030265055.1
63,345
(14.83 %)
n/a 14,387
(3.54 %)
43,563
(7.96 %)
n/a 41.68
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
57
(100.00 %)
842,739
(18.67 %)
356,558
(12.86 %)
2,720,911
(41.08 %)
0
(0 %)
847,608
(10.65 %)
40,187
(4.66 %)
29,700
(2.69 %)
71 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1
n/a n/a 12,494
(1.93 %)
44,967
(5.14 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,174
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
0
(0 %)
344,768
(3.42 %)
23,532
(1.46 %)
12,368
(0.66 %)
72 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2
n/a n/a 14,499
(1.97 %)
51,213
(5.47 %)
n/a 38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
442
(100.00 %)
731,731
(4.21 %)
471,623
(4.92 %)
5,974,055
(42.88 %)
0
(0 %)
455,138
(4.01 %)
29,052
(1.48 %)
14,673
(0.63 %)
73 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1
n/a n/a 13,882
(2.27 %)
45,919
(5.98 %)
n/a 39.50
(99.99 %)
0
(0 %)
45
(0.01 %)
3,194
(100.00 %)
803,073
(13.60 %)
258,404
(4.19 %)
4,674,614
(28.36 %)
0
(0 %)
339,851
(3.09 %)
15,524
(1.02 %)
9,057
(0.56 %)
74 Boeseman's rainbowfish (primary hap 2021)
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
n/a 15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
0
(0 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
1
(0.00 %)
441,845
(3.68 %)
18,525
(1.10 %)
10,661
(0.59 %)
75 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1
n/a n/a 16,964
(1.77 %)
67,673
(5.93 %)
n/a 42.61
(99.97 %)
28
(0.00 %)
1,785
(0.03 %)
979
(100.00 %)
4,285,965
(30.73 %)
1,222,431
(20.69 %)
6,105,881
(46.99 %)
11
(0.00 %)
1,356,343
(8.48 %)
73,543
(3.28 %)
32,534
(1.37 %)
76 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1
n/a n/a 12,424
(1.95 %)
46,550
(6.00 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,619
(100.00 %)
789,207
(14.61 %)
348,482
(20.98 %)
3,447,241
(38.72 %)
0
(0 %)
1,174,378
(8.68 %)
27,035
(4.16 %)
12,167
(0.85 %)
77 bonti-bonti (primary hap 2022)
GCA_933228915.1
n/a n/a 14,929
(1.93 %)
55,343
(5.90 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
0
(0 %)
1,329
(0.03 %)
146
(100.00 %)
998,246
(14.90 %)
443,155
(22.40 %)
4,319,947
(40.01 %)
2
(0.00 %)
1,529,147
(9.19 %)
34,018
(4.16 %)
15,066
(0.86 %)
78 bony fish B.hirsutus (HB-005 2024)
GCF_040956055.1
24,050
(11.30 %)
n/a 14,596
(4.48 %)
52,760
(11.00 %)
n/a 44.75
(99.96 %)
0
(0 %)
1,486
(0.04 %)
1,370
(100.00 %)
471,281
(10.94 %)
181,798
(7.38 %)
2,008,576
(24.90 %)
13
(0.00 %)
259,160
(4.57 %)
46,438
(14.87 %)
34,692
(4.88 %)
79 bony fish P.dabryanus (BB 2023)
GCF_030506205.1
86,420
(8.25 %)
n/a 22,100
(2.28 %)
59,296
(4.66 %)
n/a 38.32
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
610
(100.00 %)
3,555,303
(40.49 %)
538,181
(9.64 %)
6,137,303
(50.16 %)
0
(0 %)
1,400,924
(8.09 %)
71,533
(4.06 %)
19,783
(0.63 %)
80 bony fish S.pulcher (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCF_022749685.1
37,003
(8.79 %)
n/a 15,275
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
186
(100.00 %)
1,369,180
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,024
(31.90 %)
0
(0 %)
387,124
(4.11 %)
27,133
(1.64 %)
12,517
(0.55 %)
81 bony fish T.vachellii (PV-2020 2023)
GCF_030014155.1
43,278
(10.19 %)
n/a 15,613
(2.96 %)
39,340
(5.77 %)
n/a 39.31
(99.98 %)
0
(0 %)
291
(0.02 %)
78
(100.00 %)
1,563,305
(33.23 %)
689,312
(9.96 %)
3,954,578
(35.31 %)
1
(0.00 %)
844,788
(7.26 %)
20,152
(1.50 %)
10,778
(0.73 %)
82 bowfin (hap1 2024 refseq)
GCF_036373705.1
55,474
(7.85 %)
n/a 13,848
(1.83 %)
27,055
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
97
(0.00 %)
389
(100.00 %)
953,492
(13.69 %)
387,699
(7.91 %)
4,552,359
(37.72 %)
4
(0.00 %)
613,799
(6.38 %)
46,301
(2.99 %)
26,437
(1.15 %)
83 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1
n/a n/a 13,813
(1.89 %)
27,088
(4.55 %)
n/a 40.60
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
297
(100.00 %)
886,999
(13.24 %)
358,077
(7.37 %)
4,625,277
(36.22 %)
0
(0 %)
529,249
(5.78 %)
43,764
(2.79 %)
26,363
(1.18 %)
84 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1
n/a n/a 17,999
(1.60 %)
76,655
(5.58 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
10,799
(100.00 %)
5,994,257
(39.29 %)
1,126,685
(10.35 %)
6,996,991
(46.02 %)
0
(0 %)
1,131,145
(6.97 %)
71,016
(3.36 %)
27,805
(1.08 %)
85 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1
n/a n/a 17,865
(1.56 %)
76,506
(5.59 %)
n/a 42.15
(99.96 %)
0
(0 %)
2,704
(0.04 %)
676
(100.00 %)
6,391,921
(39.62 %)
1,227,487
(11.70 %)
6,669,558
(49.73 %)
11
(0.00 %)
1,301,019
(7.83 %)
76,828
(3.96 %)
26,877
(0.90 %)
86 broad-nosed pipefish (Sweden RoL2023-S1 2023)
GCF_033458585.1
49,639
(15.87 %)
n/a 13,630
(3.98 %)
43,263
(9.12 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
495
(100.00 %)
727,223
(20.88 %)
290,624
(20.53 %)
1,369,709
(43.82 %)
0
(0 %)
347,124
(7.41 %)
51,671
(14.43 %)
34,210
(4.62 %)
87 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1
92,568
(6.87 %)
n/a 26,875
(1.47 %)
114,101
(4.26 %)
n/a 43.70
(99.83 %)
0
(0 %)
4,299
(0.17 %)
2,721
(100.00 %)
5,005,012
(52.10 %)
2,055,293
(26.66 %)
9,701,968
(57.04 %)
69
(0.00 %)
4,551,597
(10.95 %)
89,897
(2.49 %)
20,734
(0.38 %)
88 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1
49,205
(8.52 %)
n/a 15,634
(1.92 %)
53,710
(4.99 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
0
(0 %)
205
(0.00 %)
26
(100.00 %)
632,147
(3.01 %)
371,482
(3.01 %)
6,438,110
(31.32 %)
1
(0.00 %)
370,750
(2.74 %)
26,136
(0.96 %)
10,272
(0.37 %)
89 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1
47,805
(10.97 %)
n/a 14,997
(2.72 %)
25,504
(5.86 %)
n/a 40.51
(84.10 %)
61,073
(15.93 %)
61,073
(15.93 %)
69,067
(84.07 %)
311,174
(3.20 %)
125,534
(0.72 %)
4,461,288
(20.25 %)
965
(0.08 %)
34,584
(0.52 %)
17,722
(0.91 %)
12,829
(0.64 %)
90 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1
52,584
(12.38 %)
n/a 15,229
(2.54 %)
47,264
(5.92 %)
n/a 40.68
(89.05 %)
0
(0 %)
32,418
(10.97 %)
7,421
(100.00 %)
812,382
(17.52 %)
158,486
(1.12 %)
4,571,794
(23.61 %)
710
(0.05 %)
88,277
(2.15 %)
22,763
(1.21 %)
14,293
(0.75 %)
91 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1
n/a n/a 15,228
(3.42 %)
41,322
(7.36 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,592
(100.00 %)
972,098
(18.43 %)
155,031
(1.41 %)
3,452,400
(21.36 %)
0
(0 %)
85,576
(1.51 %)
15,255
(1.12 %)
10,648
(0.72 %)
92 butterfish (primary hap 2021)
GCF_020382885.2
52,828
(14.10 %)
n/a 15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
0
(0 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
1
(0.00 %)
96,783
(1.70 %)
15,574
(1.13 %)
10,807
(0.72 %)
93 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1
n/a n/a 14,403
(2.47 %)
61,860
(7.37 %)
n/a 43.15
(99.96 %)
0
(0 %)
1,625
(0.04 %)
525
(100.00 %)
959,651
(12.16 %)
517,137
(13.14 %)
3,775,081
(32.47 %)
9
(0.00 %)
784,659
(7.82 %)
81,881
(6.68 %)
50,317
(3.10 %)
94 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1
n/a n/a 19,842
(2.16 %)
72,007
(6.04 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
2,679
(0.02 %)
2,679
(0.02 %)
15,877
(99.98 %)
1,911,945
(24.70 %)
364,933
(8.56 %)
6,201,042
(32.00 %)
26
(0.00 %)
834,109
(8.34 %)
39,114
(1.56 %)
17,823
(0.57 %)
95 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1
n/a n/a 15,277
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
179
(100.00 %)
1,369,186
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,065
(31.90 %)
0
(0 %)
469,842
(4.88 %)
27,134
(1.64 %)
12,518
(0.55 %)
96 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
n/a 14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
0
(0 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
0
(0 %)
452,303
(4.62 %)
20,453
(1.39 %)
10,802
(0.65 %)
97 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1
n/a n/a 15,980
(2.79 %)
53,680
(6.62 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,656
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
0
(0 %)
386,762
(3.56 %)
20,338
(1.21 %)
10,996
(0.60 %)
98 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3
59,187
(10.70 %)
n/a 15,782
(2.57 %)
45,562
(5.15 %)
n/a 39.82
(99.35 %)
0
(0 %)
100
(0.65 %)
137
(100.00 %)
2,257,240
(46.82 %)
671,926
(8.67 %)
5,043,664
(36.53 %)
0
(0 %)
696,803
(4.91 %)
34,284
(2.16 %)
22,417
(1.13 %)
99 cherry salmon (Uvic2021 2024)
GCF_036934945.1
80,307
(5.31 %)
n/a 27,171
(1.38 %)
123,048
(4.00 %)
n/a 44.12
(99.94 %)
1,043
(0.00 %)
4,047
(0.06 %)
18,306
(100.00 %)
1,207,353
(5.23 %)
2,779,869
(27.93 %)
11,429,057
(55.56 %)
21
(0.00 %)
6,696,647
(13.29 %)
83,137
(1.99 %)
20,398
(0.34 %)
100 chevron butterflyfish (hap1 2024)
GCA_039877785.1
n/a n/a 15,255
(2.94 %)
48,037
(7.05 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
0
(0 %)
49
(0.00 %)
37
(100.00 %)
465,710
(3.82 %)
254,015
(3.62 %)
3,657,999
(23.28 %)
1
(0.00 %)
186,571
(2.20 %)
30,971
(2.02 %)
18,241
(1.05 %)
101 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1
n/a n/a 15,116
(2.91 %)
47,839
(7.01 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
71
(100.00 %)
463,848
(3.80 %)
254,561
(4.23 %)
3,654,295
(24.08 %)
2
(0.00 %)
196,606
(2.28 %)
30,593
(1.99 %)
17,996
(1.03 %)
102 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1
61,496
(12.33 %)
n/a 15,296
(2.30 %)
50,818
(6.10 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
0
(0 %)
942
(0.00 %)
823
(100.00 %)
920,881
(19.96 %)
193,629
(1.36 %)
4,724,179
(28.98 %)
1
(0.00 %)
184,981
(2.73 %)
28,565
(1.65 %)
15,987
(0.90 %)
103 Chinese cavefish (2022)
GCF_024868665.1
48,058
(11.91 %)
n/a 16,738
(3.72 %)
46,295
(6.80 %)
n/a 39.61
(98.56 %)
0
(0 %)
9,510
(1.45 %)
1,039
(100.00 %)
1,469,931
(44.44 %)
188,838
(2.34 %)
3,624,116
(35.94 %)
299
(0.05 %)
177,963
(3.81 %)
44,615
(5.01 %)
16,470
(0.98 %)
104 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1
49,677
(9.64 %)
n/a 15,266
(2.70 %)
40,151
(5.21 %)
n/a 38.75
(99.82 %)
0
(0 %)
597
(0.18 %)
286
(100.00 %)
772,209
(6.45 %)
630,039
(7.45 %)
4,729,261
(37.48 %)
0
(0 %)
607,904
(5.63 %)
24,310
(1.76 %)
15,715
(0.95 %)
105 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2
89,005
(6.31 %)
n/a 26,613
(1.64 %)
77,184
(3.14 %)
n/a 39.08
(100.00 %)
0
(0 %)
224
(0.00 %)
353
(100.00 %)
9,298,177
(59.91 %)
977,119
(3.49 %)
13,499,422
(52.38 %)
0
(0 %)
882,883
(2.63 %)
100,309
(2.90 %)
18,261
(0.24 %)
106 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1
81,340
(5.14 %)
n/a 27,462
(1.53 %)
54,538
(3.80 %)
n/a 43.55
(97.26 %)
1,916
(0.01 %)
272,151
(2.76 %)
15,944
(99.99 %)
1,207,194
(4.55 %)
2,524,408
(13.75 %)
12,127,831
(47.56 %)
4,183
(0.05 %)
2,790,142
(6.34 %)
87,959
(2.02 %)
29,706
(0.70 %)
107 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1
92,383
(5.73 %)
n/a 26,372
(1.57 %)
107,059
(4.12 %)
157,582
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,313
(0.01 %)
2,334
(0.01 %)
9,978
(99.99 %)
1,483,168
(7.79 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,888
(54.54 %)
10
(0.00 %)
5,031,483
(11.16 %)
62,726
(1.40 %)
17,444
(0.31 %)
108 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1
n/a n/a 15,165
(2.44 %)
46,105
(6.16 %)
n/a 39.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,163
(100.00 %)
1,546,066
(27.08 %)
537,737
(9.87 %)
4,485,153
(30.70 %)
0
(0 %)
726,611
(6.01 %)
14,774
(0.81 %)
8,304
(0.43 %)
109 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1
34,390
(6.95 %)
n/a 15,348
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
0
(0 %)
1,572
(0.08 %)
360
(100.00 %)
1,669,322
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,373
(32.38 %)
3
(0.00 %)
927,880
(7.23 %)
16,290
(0.85 %)
8,913
(0.42 %)
110 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1
76,338
(6.27 %)
n/a 23,186
(1.70 %)
90,881
(4.14 %)
n/a 43.06
(95.36 %)
2,844
(0.02 %)
242,238
(4.66 %)
28,109
(99.98 %)
1,143,292
(6.07 %)
1,487,818
(12.14 %)
8,992,314
(46.24 %)
3,734
(0.11 %)
2,132,411
(5.90 %)
51,797
(1.25 %)
15,414
(0.35 %)
111 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1
205,915
(6.68 %)
n/a 26,582
(1.42 %)
119,437
(4.14 %)
120,379
(5.87 %)
43.89
(99.99 %)
3,405
(0.01 %)
3,433
(0.01 %)
17,480
(99.99 %)
1,160,500
(5.63 %)
2,584,312
(31.72 %)
10,621,107
(55.67 %)
8
(0.00 %)
6,422,106
(12.88 %)
68,538
(1.53 %)
20,126
(0.36 %)
112 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1
n/a n/a 14,940
(3.51 %)
39,688
(7.41 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
0
(0 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,993
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
0
(0 %)
150,484
(2.39 %)
10,131
(0.86 %)
7,444
(0.57 %)
113 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3
n/a n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
67,055
(11.68 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
633,883
(15.28 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,008
(21.31 %)
0
(0 %)
169,790
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
114 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1
53,567
(9.24 %)
n/a 15,685
(2.23 %)
33,477
(5.63 %)
n/a 39.47
(99.94 %)
0
(0 %)
1,406
(0.06 %)
6,405
(100.00 %)
431,950
(2.92 %)
381,394
(4.84 %)
4,952,343
(31.95 %)
20
(0.00 %)
378,594
(2.99 %)
23,543
(1.15 %)
15,582
(0.70 %)
115 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1
53,912
(11.11 %)
n/a 15,702
(2.37 %)
47,805
(5.50 %)
n/a 39.59
(99.98 %)
0
(0 %)
1,454
(0.02 %)
354
(100.00 %)
1,346,903
(35.25 %)
401,782
(5.36 %)
4,891,035
(31.59 %)
10
(0.00 %)
410,292
(3.79 %)
23,489
(1.28 %)
17,390
(0.95 %)
116 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2
100,850
(6.58 %)
n/a 27,072
(1.56 %)
50,811
(3.95 %)
125,873
(5.26 %)
43.55
(99.98 %)
395
(0.00 %)
5,631
(0.02 %)
4,482
(100.00 %)
1,491,966
(6.88 %)
2,135,217
(25.52 %)
10,152,659
(54.74 %)
5
(0.00 %)
4,738,432
(11.52 %)
65,662
(1.36 %)
18,054
(0.31 %)
117 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1
n/a n/a 18,114
(2.63 %)
66,549
(6.11 %)
n/a 38.62
(99.99 %)
7
(0.00 %)
685
(0.01 %)
215
(100.00 %)
2,639,968
(48.46 %)
659,243
(7.55 %)
5,950,358
(40.47 %)
3
(0.00 %)
963,199
(6.67 %)
62,337
(3.61 %)
19,726
(0.79 %)
118 common carp (R8XR3 2021)
GCA_905221575.1
n/a n/a 30,973
(3.47 %)
83,657
(5.95 %)
n/a 37.06
(100.00 %)
0
(0 %)
372
(0.00 %)
674
(100.00 %)
3,324,121
(41.45 %)
707,134
(4.72 %)
8,110,561
(39.08 %)
3
(0.00 %)
600,903
(3.39 %)
44,388
(1.60 %)
23,824
(0.66 %)
119 common carp (SPL01 2021)
GCF_018340385.1
91,210
(7.89 %)
n/a 31,041
(2.89 %)
89,244
(5.01 %)
n/a 37.11
(99.53 %)
0
(0 %)
26,351
(0.48 %)
6,701
(100.00 %)
1,634,612
(6.00 %)
919,239
(3.97 %)
10,192,037
(38.56 %)
0
(0 %)
703,885
(3.08 %)
52,638
(1.62 %)
30,904
(0.80 %)
120 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1
36,211
(8.34 %)
n/a 14,995
(2.62 %)
50,844
(6.89 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
0
(0 %)
275
(0.01 %)
338
(100.00 %)
1,186,799
(32.17 %)
307,864
(16.34 %)
3,562,802
(35.00 %)
2
(0.00 %)
481,477
(5.21 %)
41,657
(2.72 %)
22,630
(1.29 %)
121 common dace (hap1.1 2025)
GCA_965113295.1
n/a n/a 18,484
(2.43 %)
69,931
(5.95 %)
n/a 39.03
(99.98 %)
0
(0 %)
1,202
(0.02 %)
876
(100.00 %)
938,148
(4.74 %)
828,944
(9.34 %)
5,833,273
(42.65 %)
14
(0.00 %)
987,377
(7.00 %)
78,182
(4.87 %)
26,569
(1.15 %)
122 common seadragon (TA_2022b 2022)
GCF_024500385.1
60,947
(12.28 %)
n/a 13,706
(2.67 %)
42,956
(5.71 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
196
(0.00 %)
1,259
(100.00 %)
1,417,848
(37.47 %)
173,323
(3.85 %)
3,968,694
(40.23 %)
3
(0.00 %)
319,133
(3.25 %)
70,253
(6.29 %)
38,941
(2.56 %)
123 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1
n/a n/a 14,904
(2.99 %)
43,194
(7.09 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,318
(100.00 %)
1,128,080
(18.77 %)
328,975
(8.35 %)
3,952,898
(31.64 %)
0
(0 %)
410,353
(4.52 %)
26,979
(2.08 %)
15,469
(0.95 %)
124 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1
55,359
(12.02 %)
n/a 14,844
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
242
(100.00 %)
1,149,243
(19.12 %)
342,238
(9.71 %)
3,906,753
(32.84 %)
2
(0.00 %)
440,509
(5.18 %)
27,772
(2.71 %)
15,561
(0.92 %)
125 common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024)
GCA_964263955.1
n/a n/a 29,103
(1.36 %)
124,287
(3.94 %)
n/a 43.87
(99.96 %)
0
(0 %)
5,995
(0.04 %)
11,150
(100.00 %)
1,655,140
(4.68 %)
1,843,550
(17.63 %)
9,367,555
(61.56 %)
26
(0.00 %)
4,094,607
(11.22 %)
112,654
(3.84 %)
19,454
(0.27 %)
126 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1
n/a n/a 25,968
(1.48 %)
104,922
(4.18 %)
n/a 43.67
(99.96 %)
4,689
(0.04 %)
4,689
(0.04 %)
8,669
(99.96 %)
1,320,339
(4.08 %)
1,364,334
(15.61 %)
7,674,742
(61.10 %)
11
(0.00 %)
2,973,556
(10.43 %)
94,019
(3.82 %)
16,046
(0.28 %)
127 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1
n/a n/a 5,231
(0.27 %)
47,644
(1.48 %)
n/a 44.62
(99.99 %)
144
(0.01 %)
144
(0.01 %)
21,561
(99.99 %)
2,803,873
(49.20 %)
655,416
(2.69 %)
7,558,550
(67.05 %)
0
(0 %)
912,917
(5.74 %)
181,626
(10.52 %)
19,591
(0.39 %)
128 convict blenny (primary hap 2021)
GCA_020510985.1
n/a n/a n/a 134,417
(1.50 %)
n/a 44.52
(99.13 %)
0
(0 %)
2,580
(0.87 %)
512
(100.00 %)
9,062,541
(49.33 %)
2,097,650
(2.66 %)
3,092
(99.13 %)
5
(0.00 %)
3,135,536
(6.36 %)
568,042
(10.14 %)
0
(0.00 %)
129 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1
n/a n/a 13,622
(2.81 %)
43,285
(6.93 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,125
(100.00 %)
1,741,373
(32.89 %)
182,926
(2.01 %)
3,659,106
(21.68 %)
1
(0.00 %)
138,669
(1.93 %)
27,693
(1.89 %)
19,848
(1.23 %)
130 copperband butterflyfish (primary hap 2021)
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
n/a 15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
61,755
(8.99 %)
42.57
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
1
(0.00 %)
158,516
(2.15 %)
29,106
(1.85 %)
19,302
(1.11 %)
131 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1
n/a n/a 14,740
(2.91 %)
45,483
(7.26 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
0
(0 %)
1,379
(0.04 %)
395
(100.00 %)
936,676
(24.41 %)
306,192
(9.29 %)
3,495,456
(28.75 %)
2
(0.00 %)
463,889
(5.20 %)
29,142
(2.35 %)
16,622
(1.09 %)
132 Corydoras catfish unclassified (C115 2021)
GCA_019802505.1
n/a n/a 14,695
(2.68 %)
51,799
(6.37 %)
n/a 42.12
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,080
(100.00 %)
1,969,654
(37.02 %)
663,295
(11.19 %)
3,764,275
(45.19 %)
0
(0 %)
1,764,080
(12.85 %)
67,226
(8.43 %)
47,724
(3.53 %)
133 crested bigscale (hap1.1 2025)
GCA_964638095.1
n/a n/a 17,935
(1.34 %)
104,307
(6.12 %)
n/a 44.53
(99.96 %)
142
(0.00 %)
2,975
(0.04 %)
2,930
(100.00 %)
5,608,839
(57.44 %)
1,825,932
(20.35 %)
6,375,759
(51.18 %)
16
(0.00 %)
2,419,022
(10.51 %)
149,374
(4.78 %)
37,609
(1.23 %)
134 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1
n/a n/a 4,509
(3.03 %)
16,936
(7.22 %)
n/a 38.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,713
(100.00 %)
430,197
(46.38 %)
101,926
(7.54 %)
1,077,239
(32.21 %)
0
(0 %)
149,644
(6.00 %)
10,612
(4.11 %)
3,661
(0.96 %)
135 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1
90,094
(6.75 %)
n/a 29,386
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
0
(0 %)
832
(0.01 %)
277
(100.00 %)
3,481,382
(45.81 %)
802,773
(6.54 %)
8,190,783
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,003,533
(5.09 %)
83,696
(3.82 %)
26,039
(0.81 %)
136 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1
51,190
(10.37 %)
n/a 15,144
(2.59 %)
43,207
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.98 %)
0
(0 %)
570
(0.02 %)
324
(100.00 %)
1,435,625
(29.39 %)
330,276
(12.54 %)
4,196,830
(33.83 %)
1
(0.00 %)
689,646
(5.54 %)
19,310
(1.01 %)
11,155
(0.57 %)
137 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1
n/a n/a 14,861
(2.74 %)
42,996
(6.34 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
0
(0 %)
31
(0.01 %)
1,476
(100.00 %)
1,373,727
(30.17 %)
220,572
(4.38 %)
4,176,936
(27.32 %)
0
(0 %)
274,559
(2.86 %)
17,129
(1.04 %)
8,648
(0.51 %)
138 cunner (primary hap 2021)
GCA_020745685.1
n/a n/a 15,192
(2.74 %)
43,564
(6.38 %)
n/a 41.31
(99.41 %)
0
(0 %)
283
(0.59 %)
64
(100.00 %)
1,419,667
(30.50 %)
243,024
(4.81 %)
4,334,690
(27.65 %)
2
(0.00 %)
297,510
(2.95 %)
17,974
(1.06 %)
9,021
(0.52 %)
139 Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020)
GCF_015846415.1
49,108
(12.72 %)
n/a 16,501
(4.06 %)
40,671
(7.11 %)
n/a 38.77
(100.00 %)
116
(0.00 %)
116
(0.00 %)
167
(100.00 %)
1,213,719
(40.21 %)
134,299
(3.43 %)
3,676,403
(30.98 %)
0
(0 %)
240,696
(3.68 %)
29,879
(3.18 %)
13,593
(0.92 %)
140 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1
n/a 47,476
(8.36 %)
16,341
(3.18 %)
41,545
(5.47 %)
n/a 38.57
(98.69 %)
8,366
(1.31 %)
8,366
(1.31 %)
36,005
(98.69 %)
300,659
(2.50 %)
212,357
(6.15 %)
4,267,143
(35.05 %)
53
(0.01 %)
572,127
(5.71 %)
23,311
(2.18 %)
10,121
(0.71 %)
141 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1
n/a n/a 15,965
(3.73 %)
37,421
(5.87 %)
n/a 38.52
(94.12 %)
18,487
(5.88 %)
18,487
(5.88 %)
29,831
(94.12 %)
251,333
(2.28 %)
132,120
(1.41 %)
4,061,554
(28.83 %)
1,201
(0.07 %)
63,401
(0.80 %)
16,871
(1.57 %)
9,058
(0.64 %)
142 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
n/a 15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
0
(0 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
4
(0.00 %)
383,250
(3.60 %)
32,973
(1.28 %)
9,764
(0.33 %)
143 delta smelt
GCF_021917145.1
41,807
(14.97 %)
n/a 14,549
(4.09 %)
44,849
(9.74 %)
n/a 44.99
(99.92 %)
0
(0 %)
1,474
(0.08 %)
376
(100.00 %)
387,882
(5.57 %)
383,522
(9.22 %)
1,814,696
(32.48 %)
5
(0.00 %)
335,886
(5.91 %)
28,299
(3.33 %)
15,642
(1.48 %)
144 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2
n/a n/a 14,119
(3.95 %)
47,988
(8.57 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,660
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
0
(0 %)
175,500
(3.05 %)
50,830
(8.72 %)
41,064
(4.69 %)
145 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2
n/a n/a 16,559
(3.78 %)
58,823
(8.66 %)
74,128
(10.47 %)
43.69
(99.18 %)
0
(0 %)
464
(0.82 %)
461
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,284
(4.61 %)
2,948,738
(28.79 %)
0
(0 %)
306,165
(4.31 %)
64,661
(9.49 %)
52,867
(4.93 %)
146 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1
n/a n/a 16,788
(2.12 %)
50,338
(4.68 %)
n/a 41.27
(98.12 %)
0
(0 %)
641
(1.88 %)
182
(100.00 %)
2,709,759
(34.74 %)
798,364
(14.84 %)
5,418,190
(36.02 %)
1
(0.00 %)
1,397,111
(8.85 %)
30,055
(1.31 %)
21,119
(0.80 %)
147 dorado (hap2 2023)
GCA_030463535.1
n/a n/a 16,799
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
0
(0 %)
726
(0.85 %)
104
(100.00 %)
2,693,928
(34.60 %)
805,807
(14.65 %)
5,615,731
(36.69 %)
2
(0.00 %)
1,425,798
(8.96 %)
30,083
(1.31 %)
21,157
(0.81 %)
148 double-spotted pufferfish T.bimaculatus (TB-2018 2019)
GCA_004026145.2
n/a 20,142
(10.63 %)
14,760
(4.56 %)
56,353
(11.37 %)
n/a 45.56
(99.97 %)
0
(0 %)
1,033
(0.03 %)
1,158
(100.00 %)
292,029
(9.69 %)
192,568
(5.53 %)
1,623,924
(22.71 %)
2
(0.00 %)
336,852
(6.81 %)
51,743
(9.31 %)
39,457
(5.10 %)
149 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1
51,353
(12.50 %)
n/a 13,736
(3.19 %)
50,537
(7.64 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
0
(0 %)
79
(0.00 %)
213
(100.00 %)
986,789
(36.30 %)
235,862
(13.25 %)
2,323,084
(41.85 %)
0
(0 %)
428,926
(7.18 %)
68,121
(17.75 %)
37,525
(4.04 %)
150 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5
n/a n/a 15,552
(2.29 %)
52,465
(6.26 %)
86,437
(9.40 %)
41.07
(99.87 %)
115
(0.00 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
1,309,350
(35.93 %)
217,916
(1.89 %)
4,547,434
(30.78 %)
2
(0.00 %)
212,425
(2.79 %)
33,005
(1.88 %)
15,205
(0.74 %)
151 eastern happy (primary hap 2024)
GCA_964374335.1
n/a n/a 15,554
(2.13 %)
55,328
(6.30 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
31
(100.00 %)
933,060
(24.43 %)
252,509
(4.84 %)
4,460,314
(32.70 %)
1
(0.00 %)
344,099
(4.07 %)
34,184
(2.09 %)
17,316
(0.94 %)
152 electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020)
GCA_013347915.1
n/a n/a 12,020
(3.63 %)
38,881
(7.31 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,629
(100.00 %)
429,509
(7.66 %)
432,260
(11.41 %)
2,049,609
(24.32 %)
0
(0 %)
486,181
(6.19 %)
35,597
(4.37 %)
27,662
(2.94 %)
153 electric eel (fEleEle1 primary hap 2020)
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
n/a 15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
54,541
(8.42 %)
42.49
(98.20 %)
0
(0 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
1
(0.00 %)
629,918
(5.96 %)
44,501
(3.93 %)
34,390
(2.63 %)
154 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1
40,618
(11.48 %)
n/a 15,837
(3.85 %)
23,074
(6.63 %)
n/a 42.56
(96.95 %)
0
(0 %)
119,361
(3.09 %)
8,786
(100.00 %)
519,014
(5.41 %)
516,718
(6.65 %)
3,020,801
(21.49 %)
1,953
(0.21 %)
261,654
(3.62 %)
41,947
(3.71 %)
33,441
(2.64 %)
155 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1
82,153
(9.98 %)
n/a 16,513
(2.13 %)
79,047
(6.37 %)
n/a 44.15
(99.99 %)
0
(0 %)
234
(0.01 %)
1,425
(100.00 %)
923,543
(11.79 %)
425,650
(9.45 %)
3,525,237
(34.97 %)
0
(0 %)
812,868
(7.46 %)
91,552
(5.39 %)
61,344
(2.61 %)
156 emerald rockcod
GCF_902827165.1
44,179
(8.48 %)
n/a 15,275
(2.20 %)
57,830
(6.43 %)
63,731
(6.65 %)
40.94
(99.99 %)
0
(0 %)
932
(0.01 %)
864
(100.00 %)
460,185
(3.64 %)
399,729
(6.87 %)
3,533,188
(40.09 %)
6
(0.00 %)
642,666
(6.28 %)
52,191
(2.51 %)
13,014
(0.62 %)
157 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1
n/a n/a 17,920
(3.03 %)
59,697
(6.61 %)
n/a 39.13
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
4,949
(100.00 %)
2,285,870
(44.17 %)
480,649
(10.13 %)
4,833,803
(39.56 %)
0
(0 %)
820,249
(6.21 %)
57,737
(4.15 %)
23,311
(1.22 %)
158 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1
n/a n/a 17,661
(3.01 %)
58,218
(6.54 %)
n/a 39.21
(99.98 %)
0
(0 %)
881
(0.02 %)
125
(100.00 %)
2,346,939
(44.27 %)
502,415
(11.23 %)
4,890,830
(40.45 %)
0
(0 %)
873,838
(6.63 %)
60,482
(4.22 %)
24,091
(1.23 %)
159 European anchovy (BLACKSEA-1 2023)
GCF_034702125.1
48,154
(5.87 %)
n/a 15,415
(1.33 %)
77,712
(5.08 %)
n/a 44.45
(99.99 %)
0
(0 %)
9,202
(0.02 %)
1,922
(100.00 %)
4,406,534
(31.73 %)
2,331,293
(15.35 %)
6,863,540
(50.47 %)
15
(0.00 %)
1,701,493
(7.18 %)
80,927
(2.32 %)
27,462
(0.84 %)
160 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1
n/a n/a 17,416
(2.74 %)
60,936
(6.02 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
7,437
(100.00 %)
2,377,147
(47.98 %)
578,235
(8.27 %)
5,267,308
(40.22 %)
0
(0 %)
872,083
(6.16 %)
50,909
(3.45 %)
17,892
(0.86 %)
161 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1
n/a n/a 18,028
(2.64 %)
64,206
(6.04 %)
n/a 38.73
(99.99 %)
0
(0 %)
588
(0.01 %)
106
(100.00 %)
2,649,943
(48.88 %)
666,129
(9.08 %)
5,751,610
(41.56 %)
5
(0.00 %)
1,113,756
(7.21 %)
58,471
(3.64 %)
19,602
(0.84 %)
162 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1
54,631
(7.46 %)
n/a 17,072
(1.89 %)
34,801
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
0
(0 %)
1,009
(0.02 %)
380
(100.00 %)
761,522
(5.99 %)
913,306
(13.25 %)
5,767,879
(35.48 %)
3
(0.00 %)
1,603,437
(8.94 %)
120,990
(6.12 %)
81,342
(2.93 %)
163 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1
n/a n/a 14,690
(3.17 %)
48,422
(7.90 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,915
(100.00 %)
1,138,190
(26.31 %)
249,865
(4.72 %)
3,352,038
(25.55 %)
0
(0 %)
232,419
(3.75 %)
36,828
(3.13 %)
27,093
(1.88 %)
164 European flounder (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316205.1
n/a n/a 14,753
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
109
(100.00 %)
1,160,784
(27.06 %)
251,985
(5.23 %)
3,353,121
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,297
(3.81 %)
37,130
(2.79 %)
27,432
(1.88 %)
165 European flounder (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316205.1
48,969
(12.45 %)
n/a 14,751
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
108
(100.00 %)
1,160,781
(27.06 %)
251,983
(5.23 %)
3,353,086
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,298
(3.81 %)
37,129
(2.79 %)
27,431
(1.88 %)
166 European perch
GCF_010015445.1
55,605
(8.20 %)
n/a 15,430
(2.07 %)
55,499
(5.43 %)
n/a 40.90
(99.97 %)
0
(0 %)
801
(0.03 %)
303
(100.00 %)
684,094
(5.16 %)
634,788
(7.48 %)
5,182,241
(37.07 %)
0
(0 %)
746,988
(5.12 %)
44,049
(1.94 %)
15,321
(0.71 %)
167 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1
n/a n/a 14,619
(2.94 %)
50,389
(7.92 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
3,222
(100.00 %)
430,112
(3.88 %)
299,581
(6.89 %)
3,182,258
(27.97 %)
0
(0 %)
330,159
(4.99 %)
40,094
(3.66 %)
20,637
(1.37 %)
168 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1
46,468
(10.51 %)
n/a 14,818
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
0
(0 %)
1,072
(0.03 %)
355
(100.00 %)
476,314
(3.63 %)
520,729
(13.27 %)
3,283,360
(33.55 %)
2
(0.00 %)
525,277
(6.36 %)
47,050
(4.45 %)
21,878
(1.29 %)
169 European seabass (2021)
GCF_905237075.1
62,457
(13.08 %)
n/a 15,582
(2.89 %)
44,472
(6.56 %)
69,435
(12.92 %)
40.38
(99.85 %)
0
(0 %)
272
(0.15 %)
303
(100.00 %)
1,210,970
(24.30 %)
278,140
(4.02 %)
4,343,442
(26.18 %)
1
(0.00 %)
309,168
(3.42 %)
15,975
(0.93 %)
10,409
(0.57 %)
170 European smelt (primary hap 2023 genbank)
GCA_963692335.1
n/a n/a 15,640
(3.79 %)
50,248
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
30
(0.00 %)
2,462
(0.10 %)
1,038
(100.00 %)
1,648,435
(31.35 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,832
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
171 European smelt (primary hap 2023 refseq)
GCF_963692335.1
46,762
(14.07 %)
n/a 15,639
(3.79 %)
50,238
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
0
(0 %)
2,462
(0.10 %)
1,007
(100.00 %)
1,648,428
(31.34 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,793
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
172 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1
n/a n/a 16,181
(2.44 %)
63,544
(7.17 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
0
(0 %)
1,501
(0.04 %)
387
(100.00 %)
2,109,362
(31.42 %)
1,300,159
(14.91 %)
3,634,744
(35.44 %)
6
(0.00 %)
1,178,448
(8.78 %)
35,552
(1.87 %)
19,823
(1.00 %)
173 fathead minnow
GCF_016745375.1
57,312
(8.34 %)
n/a 18,039
(3.02 %)
52,431
(6.01 %)
n/a 38.45
(86.78 %)
0
(0 %)
5,594
(13.23 %)
911
(100.00 %)
657,027
(4.09 %)
444,571
(6.23 %)
4,902,960
(35.69 %)
5
(0.00 %)
807,051
(7.17 %)
49,361
(2.78 %)
20,934
(0.93 %)
174 flathead mullet
GCF_022458985.1
48,689
(12.71 %)
n/a 14,908
(3.00 %)
45,084
(6.96 %)
75,582
(11.23 %)
41.90
(99.97 %)
0
(0 %)
445
(0.04 %)
24
(100.00 %)
469,841
(3.23 %)
207,738
(2.31 %)
3,955,233
(24.74 %)
0
(0 %)
232,148
(2.99 %)
45,885
(3.03 %)
31,971
(1.87 %)
175 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1
n/a n/a 17,494
(2.06 %)
62,257
(5.73 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,986
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
0
(0 %)
240,032
(2.50 %)
26,445
(1.22 %)
12,638
(0.48 %)
176 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
n/a 15,434
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
0
(0 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
0
(0 %)
227,442
(2.84 %)
24,130
(1.26 %)
11,082
(0.48 %)
177 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1
n/a n/a 13,745
(2.58 %)
50,416
(6.72 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
5,171
(100.00 %)
442,646
(4.09 %)
276,927
(5.42 %)
3,741,267
(26.25 %)
0
(0 %)
406,474
(4.11 %)
28,827
(2.28 %)
19,731
(1.36 %)
178 freshwater garfish (primary hap 2020)
GCA_014839995.1
n/a n/a 14,625
(2.57 %)
52,879
(6.72 %)
n/a 41.41
(98.98 %)
0
(0 %)
1,373
(1.02 %)
410
(100.00 %)
492,828
(4.29 %)
318,631
(5.94 %)
3,977,536
(27.41 %)
0
(0 %)
521,102
(4.91 %)
32,390
(2.33 %)
21,612
(1.34 %)
179 giant grouper
GCF_005281545.1
45,328
(7.65 %)
n/a 15,661
(1.91 %)
53,910
(4.91 %)
n/a 41.26
(96.40 %)
0
(0 %)
23,415
(3.61 %)
4,201
(100.00 %)
604,763
(2.71 %)
357,944
(2.52 %)
6,501,327
(30.28 %)
1,632
(0.21 %)
237,713
(2.85 %)
26,431
(0.91 %)
9,943
(0.35 %)
180 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1
n/a n/a 13,090
(2.37 %)
48,927
(6.41 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,758
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
0
(0 %)
201,169
(2.33 %)
38,368
(2.40 %)
20,092
(1.12 %)
181 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2
n/a n/a 15,752
(2.45 %)
56,395
(6.58 %)
n/a 41.94
(99.96 %)
0
(0 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
1,474,134
(29.50 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,691
(25.69 %)
0
(0 %)
355,475
(3.53 %)
47,327
(2.41 %)
29,914
(1.44 %)
182 golden-line barbel
GCF_001515645.1
74,071
(6.71 %)
n/a 29,486
(2.77 %)
55,545
(5.32 %)
n/a 37.54
(89.58 %)
136,797
(10.45 %)
136,894
(10.45 %)
168,074
(89.55 %)
1,118,646
(5.04 %)
718,426
(6.54 %)
9,092,306
(37.16 %)
3,220
(0.35 %)
778,152
(11.46 %)
70,606
(1.91 %)
26,998
(0.64 %)
183 goldfish
GCF_003368295.1
116,745
(8.75 %)
n/a 35,097
(2.94 %)
68,251
(6.12 %)
n/a 37.48
(99.99 %)
2,247
(0.01 %)
2,247
(0.01 %)
8,463
(99.99 %)
1,693,800
(5.39 %)
916,195
(5.01 %)
9,731,118
(40.19 %)
0
(0 %)
1,030,815
(4.89 %)
66,585
(2.06 %)
27,619
(0.65 %)
184 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1
67,810
(11.16 %)
n/a 18,195
(3.27 %)
48,459
(5.67 %)
n/a 37.48
(99.98 %)
0
(0 %)
150
(0.02 %)
31
(100.00 %)
654,416
(3.33 %)
429,734
(3.77 %)
5,501,085
(40.21 %)
1
(0.00 %)
413,986
(3.73 %)
26,282
(1.58 %)
15,753
(0.76 %)
185 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1
36,344
(7.09 %)
n/a 14,512
(1.92 %)
45,809
(4.61 %)
n/a 39.76
(99.63 %)
0
(0 %)
3,407
(0.37 %)
600
(100.00 %)
2,662,894
(54.47 %)
803,911
(10.32 %)
5,763,692
(48.31 %)
3
(0.00 %)
1,131,797
(6.83 %)
53,808
(2.65 %)
23,231
(1.00 %)
186 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1
25,822
(5.19 %)
n/a 14,212
(1.97 %)
27,894
(4.68 %)
n/a 39.49
(93.15 %)
92,327
(6.89 %)
92,327
(6.89 %)
108,947
(93.11 %)
552,368
(5.00 %)
742,395
(8.07 %)
5,901,720
(42.46 %)
146
(0.03 %)
487,419
(6.15 %)
44,972
(1.97 %)
19,348
(0.76 %)
187 greater amberjack
GCF_002260705.1
33,756
(9.11 %)
n/a 15,336
(2.93 %)
22,220
(6.07 %)
n/a 40.86
(99.17 %)
0
(0 %)
9,742
(0.82 %)
34,656
(100.00 %)
573,770
(4.04 %)
368,800
(3.72 %)
4,449,534
(24.71 %)
371
(0.04 %)
251,784
(3.33 %)
15,850
(0.98 %)
10,738
(0.58 %)
188 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1
n/a n/a 15,483
(3.45 %)
47,484
(7.95 %)
n/a 44.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,805
(100.00 %)
1,400,150
(23.78 %)
738,163
(17.35 %)
2,460,977
(35.90 %)
0
(0 %)
605,154
(7.13 %)
20,794
(2.09 %)
11,413
(0.80 %)
189 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1
n/a n/a 16,553
(3.15 %)
51,766
(7.37 %)
n/a 44.75
(99.95 %)
61
(0.00 %)
1,752
(0.05 %)
1,085
(100.00 %)
1,674,762
(26.07 %)
900,455
(18.62 %)
2,849,256
(39.22 %)
0
(0 %)
824,383
(7.94 %)
26,022
(2.30 %)
13,322
(0.79 %)
190 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1
n/a n/a 10,795
(5.59 %)
33,380
(12.07 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,376
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
0
(0 %)
64,742
(2.40 %)
34,104
(12.82 %)
25,350
(6.24 %)
191 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
n/a 13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
37,563
(15.76 %)
43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
0
(0 %)
112,918
(3.25 %)
46,327
(10.97 %)
32,897
(5.93 %)
192 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1
n/a n/a 13,412
(4.76 %)
45,946
(11.50 %)
n/a 44.34
(99.99 %)
0
(0 %)
95
(0.01 %)
251
(100.00 %)
494,547
(20.10 %)
204,804
(10.66 %)
1,444,044
(34.08 %)
0
(0 %)
208,543
(5.33 %)
47,904
(17.47 %)
32,381
(5.25 %)
193 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1
n/a n/a 13,681
(4.93 %)
45,034
(11.64 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,533
(100.00 %)
460,038
(18.47 %)
163,838
(7.90 %)
1,681,190
(29.08 %)
0
(0 %)
141,147
(3.92 %)
47,523
(15.60 %)
33,138
(6.10 %)
194 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1
n/a n/a 13,432
(2.10 %)
50,930
(6.39 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,952
(100.00 %)
2,495,763
(38.80 %)
473,105
(6.27 %)
3,444,123
(38.56 %)
0
(0 %)
474,250
(4.43 %)
35,298
(1.94 %)
13,822
(0.66 %)
195 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1
n/a n/a 15,028
(2.35 %)
50,436
(6.30 %)
n/a 41.10
(99.97 %)
0
(0 %)
1,188
(0.03 %)
1,568
(100.00 %)
2,688,222
(39.74 %)
549,362
(7.60 %)
3,564,661
(40.05 %)
4
(0.00 %)
605,421
(5.26 %)
37,043
(1.94 %)
11,494
(0.60 %)
196 green swordtail
GCF_003331165.1
52,602
(11.81 %)
n/a 14,955
(2.58 %)
47,115
(6.33 %)
n/a 39.09
(99.71 %)
185
(0.00 %)
661
(0.29 %)
272
(100.00 %)
328,469
(2.10 %)
162,178
(2.35 %)
4,801,050
(28.86 %)
1
(0.00 %)
227,225
(3.22 %)
37,217
(2.39 %)
25,655
(1.36 %)
197 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1
n/a n/a 14,752
(2.74 %)
58,725
(8.49 %)
n/a 43.13
(99.98 %)
3
(0.00 %)
553
(0.02 %)
322
(100.00 %)
1,860,845
(35.64 %)
378,045
(9.39 %)
3,208,482
(30.12 %)
0
(0 %)
450,213
(5.20 %)
66,857
(4.99 %)
44,052
(2.67 %)
198 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1
n/a n/a 16,645
(1.92 %)
62,533
(4.55 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
7,253
(100.00 %)
5,166,731
(67.78 %)
750,850
(11.35 %)
5,903,440
(54.20 %)
0
(0 %)
1,408,406
(7.28 %)
90,235
(5.58 %)
15,520
(0.51 %)
199 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1
n/a n/a 17,136
(1.90 %)
63,611
(4.50 %)
n/a 39.74
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,046
(0.01 %)
233
(100.00 %)
5,662,029
(68.75 %)
825,757
(11.99 %)
6,236,024
(55.15 %)
4
(0.00 %)
1,606,132
(7.98 %)
99,559
(5.68 %)
16,304
(0.51 %)
200 Gulf pipefish (Florida 2022)
GCF_024217435.2
53,176
(17.83 %)
n/a 13,439
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
495
(100.00 %)
644,597
(20.82 %)
180,309
(16.78 %)
1,339,434
(43.63 %)
0
(0 %)
465,900
(9.76 %)
51,080
(18.49 %)
31,396
(4.21 %)
201 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1
58,587
(18.27 %)
n/a 13,442
(4.00 %)
41,565
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
253,033
(3.86 %)
180,311
(16.78 %)
1,339,521
(43.63 %)
0
(0 %)
465,901
(9.76 %)
51,080
(18.49 %)
31,396
(4.21 %)
202 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4
n/a n/a 13,441
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
644,601
(20.82 %)
180,310
(16.78 %)
1,339,461
(43.63 %)
0
(0 %)
465,902
(9.76 %)
51,080
(18.49 %)
31,396
(4.21 %)
203 guppy
GCF_000633615.1
48,290
(11.24 %)
n/a 14,436
(2.72 %)
44,759
(6.24 %)
n/a 39.33
(90.86 %)
37,376
(9.16 %)
458,354
(9.22 %)
40,143
(90.84 %)
340,480
(2.43 %)
167,943
(1.50 %)
4,695,380
(25.63 %)
1,124
(0.10 %)
71,291
(1.20 %)
35,188
(1.91 %)
26,043
(1.36 %)
204 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1
n/a n/a 15,058
(2.50 %)
46,340
(5.85 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
2,131
(100.00 %)
1,642,351
(37.42 %)
389,169
(5.43 %)
4,687,710
(35.55 %)
0
(0 %)
541,909
(4.77 %)
34,408
(1.75 %)
16,136
(0.80 %)
205 honeycomb rockfish (primary hap 2020)
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
n/a 15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
63,546
(8.88 %)
40.77
(99.83 %)
0
(0 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
1
(0.00 %)
627,017
(5.28 %)
37,878
(1.84 %)
15,343
(0.71 %)
206 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1
74,585
(6.94 %)
n/a 30,802
(3.11 %)
57,655
(5.63 %)
n/a 37.18
(91.91 %)
150,790
(8.11 %)
150,790
(8.11 %)
314,962
(91.89 %)
1,147,234
(4.93 %)
708,513
(4.77 %)
9,080,512
(35.95 %)
1,724
(0.23 %)
n/a 63,217
(1.71 %)
29,804
(0.74 %)
207 humphead wrasse
GCF_018320785.1
42,229
(6.60 %)
n/a 15,287
(1.66 %)
47,025
(4.13 %)
n/a 39.53
(100.00 %)
0
(0 %)
284
(0.00 %)
46
(100.00 %)
447,458
(2.27 %)
310,170
(4.65 %)
8,002,463
(32.97 %)
1
(0.00 %)
473,364
(2.54 %)
12,252
(0.38 %)
8,635
(0.26 %)
208 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1
n/a n/a 14,412
(3.70 %)
41,944
(8.58 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
0
(0 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,774
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
0
(0 %)
195,444
(3.94 %)
15,419
(1.38 %)
8,375
(0.73 %)
209 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2
n/a n/a 15,339
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
57,867
(10.10 %)
42.38
(98.08 %)
0
(0 %)
1,523
(1.92 %)
157
(100.00 %)
346,399
(3.02 %)
163,524
(3.00 %)
2,755,274
(25.07 %)
0
(0 %)
235,504
(4.25 %)
17,931
(1.47 %)
9,749
(0.74 %)
210 Indian medaka
GCF_002922805.2
49,295
(10.27 %)
n/a 14,591
(2.49 %)
52,982
(6.37 %)
n/a 39.04
(94.83 %)
0
(0 %)
51,550
(5.20 %)
8,493
(100.00 %)
319,151
(2.20 %)
208,690
(2.67 %)
5,412,546
(33.29 %)
180
(0.02 %)
209,477
(2.14 %)
40,721
(2.36 %)
28,619
(1.60 %)
211 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1
41,583
(6.91 %)
n/a 18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
74,968
(7.01 %)
43.02
(99.97 %)
0
(0 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
0
(0 %)
319,481
(2.18 %)
78,561
(3.69 %)
58,460
(2.33 %)
212 Japanese flounder
GCF_001970005.1
37,838
(12.25 %)
n/a 14,521
(3.39 %)
30,773
(7.34 %)
n/a 41.64
(81.04 %)
0
(0 %)
40,314
(18.97 %)
9,525
(100.00 %)
332,322
(2.84 %)
164,916
(1.16 %)
3,476,344
(17.36 %)
317
(0.14 %)
34,362
(0.47 %)
21,768
(1.42 %)
15,778
(0.96 %)
213 Japanese flounder (ysfri-2021 2022)
GCF_024713975.1
60,200
(14.08 %)
n/a 14,987
(3.26 %)
42,919
(7.40 %)
n/a 41.54
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
25
(100.00 %)
850,797
(19.88 %)
308,390
(6.45 %)
3,329,304
(26.55 %)
0
(0 %)
204,034
(3.13 %)
23,373
(1.76 %)
16,725
(1.15 %)
214 Japanese medaka
GCF_002234675.1
50,526
(10.32 %)
n/a 14,325
(2.50 %)
27,912
(6.71 %)
91,652
(11.67 %)
40.84
(99.93 %)
0
(0 %)
491
(0.07 %)
25
(100.00 %)
384,317
(4.42 %)
163,041
(3.07 %)
4,631,750
(34.91 %)
2
(0.00 %)
257,543
(3.04 %)
41,215
(2.89 %)
23,967
(1.50 %)
215 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1
42,877
(8.61 %)
n/a 15,188
(2.40 %)
41,262
(7.86 %)
58,418
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
0
(0 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
667,122
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
0
(0 %)
422,332
(3.88 %)
121,464
(9.36 %)
77,061
(4.51 %)
216 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1
n/a n/a 15,945
(2.17 %)
101,825
(8.93 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
0
(0 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,228
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
0
(0 %)
541,432
(4.29 %)
138,484
(9.55 %)
86,420
(4.60 %)
217 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1
n/a n/a 14,960
(2.23 %)
74,436
(6.65 %)
n/a 43.94
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,370
(100.00 %)
1,620,688
(23.00 %)
902,057
(13.66 %)
4,547,953
(39.90 %)
0
(0 %)
892,097
(6.41 %)
129,990
(12.07 %)
77,992
(4.35 %)
218 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1
n/a n/a 14,906
(2.33 %)
72,029
(6.72 %)
n/a 43.92
(99.98 %)
0
(0 %)
887
(0.02 %)
191
(100.00 %)
1,609,654
(22.82 %)
897,264
(13.58 %)
4,548,467
(39.80 %)
11
(0.00 %)
875,374
(6.46 %)
129,147
(11.75 %)
77,287
(4.33 %)
219 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1
45,779
(8.57 %)
n/a 15,561
(1.99 %)
53,188
(5.12 %)
n/a 41.32
(97.02 %)
0
(0 %)
48,394
(2.99 %)
4,563
(100.00 %)
574,889
(2.73 %)
367,135
(2.64 %)
6,420,280
(29.10 %)
2,337
(0.06 %)
244,886
(1.72 %)
28,979
(1.07 %)
10,901
(0.40 %)
220 kelp perch (BFR_SWC_R1_liver_20210118 2023)
GCF_029030835.1
40,680
(11.49 %)
n/a 14,847
(3.17 %)
46,307
(7.10 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,003
(100.00 %)
967,639
(17.54 %)
319,567
(5.43 %)
3,743,006
(26.82 %)
0
(0 %)
263,733
(2.32 %)
47,481
(4.63 %)
30,351
(2.16 %)
221 Korean giant-fin mudskipper (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1
n/a n/a 13,470
(2.34 %)
42,799
(5.73 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,414
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
0
(0 %)
475,330
(4.51 %)
34,522
(2.54 %)
17,280
(0.96 %)
222 Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3
33,236
(8.44 %)
n/a 14,601
(2.46 %)
44,145
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
701
(0.95 %)
122
(100.00 %)
1,755,227
(42.93 %)
551,482
(7.22 %)
4,887,087
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,179
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
22,350
(1.21 %)
223 lake trout
GCF_016432855.1
65,012
(4.57 %)
n/a 26,528
(1.53 %)
112,119
(4.47 %)
76,885
(3.80 %)
43.50
(99.99 %)
0
(0 %)
3,264
(0.01 %)
4,121
(100.00 %)
1,387,896
(5.81 %)
1,797,785
(19.28 %)
9,643,314
(54.44 %)
2
(0.00 %)
3,778,575
(10.18 %)
85,419
(2.52 %)
19,617
(0.38 %)
224 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1
78,867
(4.31 %)
n/a 27,579
(1.38 %)
113,850
(3.63 %)
n/a 44.18
(100.00 %)
0
(0 %)
1,716
(0.00 %)
6,355
(100.00 %)
1,729,029
(6.03 %)
1,781,307
(15.24 %)
9,311,548
(61.16 %)
0
(0 %)
4,057,370
(10.85 %)
126,142
(4.04 %)
18,712
(0.30 %)
225 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1
87,246
(4.53 %)
n/a 28,366
(1.38 %)
117,266
(3.71 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
0
(0 %)
1,159
(0.00 %)
7,334
(100.00 %)
1,768,537
(6.02 %)
1,793,716
(15.51 %)
9,525,312
(61.13 %)
0
(0 %)
4,153,782
(10.89 %)
126,485
(3.95 %)
18,425
(0.28 %)
226 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1
n/a n/a 17,851
(1.28 %)
83,249
(5.18 %)
n/a 42.69
(99.97 %)
36
(0.00 %)
2,397
(0.03 %)
709
(100.00 %)
7,797,173
(37.37 %)
1,593,818
(10.64 %)
7,610,300
(54.05 %)
15
(0.00 %)
1,726,634
(9.03 %)
127,942
(3.84 %)
34,520
(0.93 %)
227 large yellow croaker
GCF_000972845.2
49,914
(11.76 %)
n/a 15,365
(3.00 %)
26,101
(6.66 %)
n/a 41.34
(99.67 %)
0
(0 %)
7,424
(0.33 %)
9,998
(100.00 %)
478,685
(3.50 %)
306,063
(3.37 %)
4,199,578
(24.80 %)
65
(0.01 %)
319,923
(3.93 %)
28,138
(2.09 %)
16,153
(1.01 %)
228 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1
n/a n/a 15,841
(2.36 %)
79,276
(8.51 %)
n/a 46.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,761
(100.00 %)
2,935,570
(42.17 %)
1,208,602
(21.28 %)
3,157,730
(42.63 %)
0
(0 %)
1,448,522
(11.27 %)
88,759
(6.30 %)
47,311
(2.77 %)
229 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1
n/a n/a 16,376
(2.19 %)
82,947
(7.99 %)
n/a 46.31
(99.94 %)
144
(0.00 %)
2,631
(0.06 %)
1,522
(100.00 %)
3,333,323
(43.58 %)
1,553,932
(25.91 %)
3,393,507
(46.78 %)
9
(0.00 %)
1,764,517
(12.32 %)
99,668
(6.39 %)
51,378
(2.60 %)
230 largemouth bass (2-A1 2021)
GCA_019677235.1
n/a n/a 15,790
(2.31 %)
50,332
(5.65 %)
n/a 40.87
(99.96 %)
0
(0 %)
672
(0.04 %)
202
(100.00 %)
464,845
(2.71 %)
255,513
(3.69 %)
5,124,388
(29.65 %)
2
(0.00 %)
390,854
(3.63 %)
25,920
(1.67 %)
12,277
(0.62 %)
231 largemouth bass (LMB-PRFRI aquatic 2020)
GCF_014851395.1
55,170
(9.49 %)
n/a 16,635
(2.18 %)
56,707
(5.52 %)
n/a 40.86
(99.85 %)
0
(0 %)
2,909
(0.15 %)
4,753
(100.00 %)
497,281
(2.60 %)
269,495
(3.70 %)
5,496,732
(29.60 %)
0
(0 %)
430,490
(4.27 %)
28,733
(1.66 %)
13,319
(0.61 %)
232 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1
n/a n/a 8,132
(2.11 %)
25,878
(4.67 %)
n/a 38.55
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,088
(100.00 %)
260,789
(2.73 %)
158,564
(2.12 %)
3,023,128
(27.39 %)
0
(0 %)
71,421
(1.44 %)
9,678
(1.02 %)
7,876
(0.74 %)
233 largescale foureyes (primary hap 2020)
GCA_014839685.1
n/a n/a 14,774
(2.18 %)
42,858
(4.83 %)
58,247
(6.94 %)
38.54
(99.96 %)
0
(0 %)
107
(0.04 %)
33
(100.00 %)
506,950
(2.73 %)
305,170
(2.13 %)
6,194,879
(29.85 %)
0
(0 %)
131,664
(1.39 %)
17,881
(0.94 %)
14,233
(0.68 %)
234 leafy seadragon (BA_2022a 2022)
GCF_024500275.1
46,242
(10.23 %)
n/a 13,712
(2.62 %)
43,369
(5.56 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
0
(0 %)
76
(0.00 %)
1,537
(100.00 %)
1,406,779
(35.37 %)
202,983
(7.44 %)
3,933,128
(41.19 %)
0
(0 %)
436,408
(4.31 %)
70,560
(7.78 %)
39,027
(2.50 %)
235 lemon sole (primary hap 2024)
GCA_964266715.1
n/a n/a 14,961
(2.55 %)
52,234
(6.83 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
20
(0.00 %)
409
(0.01 %)
1,601
(100.00 %)
1,233,052
(39.33 %)
366,741
(18.98 %)
3,296,338
(36.77 %)
1
(0.00 %)
538,414
(6.03 %)
44,712
(2.85 %)
31,908
(1.76 %)
236 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1
38,671
(7.52 %)
n/a 15,538
(2.18 %)
57,480
(5.26 %)
n/a 39.54
(98.22 %)
0
(0 %)
3,611
(1.77 %)
94,260
(100.00 %)
629,451
(3.42 %)
385,539
(3.83 %)
6,343,655
(29.35 %)
123
(0.00 %)
240,147
(1.70 %)
27,018
(1.26 %)
18,061
(0.78 %)
237 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1
n/a n/a 15,487
(0.88 %)
85,135
(3.39 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
6,593
(100.00 %)
5,572,163
(49.59 %)
1,052,072
(6.02 %)
7,246,646
(62.69 %)
0
(0 %)
2,503,507
(8.71 %)
157,768
(4.38 %)
14,966
(0.28 %)
238 lesser salmon catfish (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1
53,323
(3.35 %)
n/a 15,955
(0.92 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
6,041,262
(71.88 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
16,535
(0.37 %)
239 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1
n/a n/a 13,792
(2.19 %)
51,353
(6.60 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,620
(100.00 %)
2,536,362
(38.05 %)
513,115
(7.50 %)
3,542,854
(37.60 %)
0
(0 %)
576,452
(5.21 %)
31,814
(1.79 %)
14,668
(0.71 %)
240 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1
n/a n/a 13,908
(2.19 %)
50,634
(6.50 %)
n/a 41.22
(99.97 %)
84
(0.00 %)
1,017
(0.03 %)
701
(100.00 %)
2,698,640
(39.19 %)
577,328
(8.51 %)
3,615,231
(39.17 %)
5
(0.00 %)
691,324
(6.04 %)
33,251
(1.82 %)
14,917
(0.69 %)
241 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1
n/a n/a 15,269
(2.44 %)
52,449
(6.28 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
606
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,879,201
(31.40 %)
449,901
(9.89 %)
4,248,556
(33.21 %)
1
(0.00 %)
727,189
(5.72 %)
43,864
(3.01 %)
19,108
(1.01 %)
242 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1
n/a n/a 15,033
(2.98 %)
51,296
(7.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
2,700
(100.00 %)
1,099,919
(28.68 %)
314,919
(9.57 %)
2,620,601
(30.23 %)
0
(0 %)
539,835
(6.99 %)
49,248
(4.19 %)
27,196
(1.69 %)
243 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1
n/a n/a 15,060
(2.89 %)
50,064
(7.31 %)
n/a 41.88
(99.98 %)
0
(0 %)
589
(0.02 %)
534
(100.00 %)
1,116,427
(28.18 %)
315,489
(13.14 %)
2,598,812
(33.21 %)
2
(0.00 %)
680,706
(7.88 %)
50,192
(3.82 %)
27,472
(1.61 %)
244 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1
n/a n/a 14,632
(3.51 %)
40,441
(7.51 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
0
(0 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,742
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
0
(0 %)
96,734
(1.60 %)
16,302
(1.34 %)
11,802
(0.89 %)
245 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2
n/a n/a 14,975
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
n/a 41.43
(99.89 %)
0
(0 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
772,309
(14.49 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,473
(21.79 %)
0
(0 %)
109,664
(1.83 %)
16,807
(1.33 %)
12,095
(0.89 %)
246 longspined bullhead (.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1
n/a n/a 15,027
(3.10 %)
51,137
(7.71 %)
n/a 42.22
(99.99 %)
0
(0 %)
242
(0.01 %)
27
(100.00 %)
452,844
(4.81 %)
417,308
(9.63 %)
3,262,282
(28.51 %)
2
(0.00 %)
530,802
(5.05 %)
55,527
(4.38 %)
34,004
(2.27 %)
247 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1
n/a n/a 15,137
(3.09 %)
52,499
(7.75 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,778
(100.00 %)
448,166
(4.67 %)
416,181
(8.95 %)
3,288,388
(27.99 %)
0
(0 %)
521,897
(4.93 %)
55,747
(4.41 %)
34,235
(2.29 %)
248 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1
n/a n/a 12,848
(3.32 %)
43,711
(8.09 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,698
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
0
(0 %)
569,405
(6.42 %)
45,916
(5.21 %)
28,531
(2.48 %)
249 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1
n/a n/a 14,944
(3.23 %)
50,328
(8.09 %)
n/a 42.82
(99.97 %)
0
(0 %)
954
(0.03 %)
232
(100.00 %)
1,034,598
(25.93 %)
434,819
(13.21 %)
2,907,371
(30.18 %)
3
(0.00 %)
701,025
(6.86 %)
55,066
(5.20 %)
33,554
(2.42 %)
250 lumpfish (v1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
n/a 14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
0
(0 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
1
(0.00 %)
655,785
(6.31 %)
53,321
(5.09 %)
32,722
(2.40 %)
251 lyretail cichlid
GCF_000239395.1
38,260
(10.03 %)
n/a 14,804
(2.69 %)
23,751
(5.79 %)
n/a 40.44
(80.94 %)
109,098
(19.10 %)
109,100
(19.10 %)
118,181
(80.90 %)
695,696
(14.49 %)
119,381
(1.10 %)
4,539,429
(19.49 %)
5,040
(0.39 %)
62,939
(1.53 %)
18,098
(0.91 %)
13,389
(0.65 %)
252 Malawi cichlid R.sp.'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1
n/a n/a 15,501
(2.18 %)
54,090
(6.20 %)
n/a 41.17
(99.99 %)
0
(0 %)
422
(0.01 %)
82
(100.00 %)
1,727,328
(38.16 %)
259,351
(4.71 %)
4,381,278
(33.25 %)
2
(0.00 %)
338,853
(3.90 %)
35,281
(1.93 %)
14,746
(0.71 %)
253 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1
64,831
(12.89 %)
n/a 15,283
(2.75 %)
43,349
(6.02 %)
n/a 40.35
(100.00 %)
0
(0 %)
93
(0.00 %)
65
(100.00 %)
441,324
(3.38 %)
206,420
(2.54 %)
4,582,841
(27.41 %)
2
(0.00 %)
240,418
(2.41 %)
15,999
(1.17 %)
10,104
(0.58 %)
254 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2
49,016
(12.41 %)
n/a 14,186
(3.08 %)
55,502
(8.05 %)
n/a 43.27
(100.00 %)
0
(0 %)
19
(0.00 %)
97
(100.00 %)
321,832
(4.91 %)
114,318
(16.04 %)
2,300,636
(32.10 %)
0
(0 %)
595,385
(7.08 %)
46,312
(5.05 %)
34,383
(3.14 %)
255 mangrove rivulus
GCF_001649575.2
46,200
(11.83 %)
n/a 14,522
(2.87 %)
46,641
(6.86 %)
n/a 40.03
(94.31 %)
0
(0 %)
32,278
(5.70 %)
300
(100.00 %)
345,678
(2.32 %)
146,263
(1.33 %)
4,718,292
(27.30 %)
277
(0.09 %)
65,776
(1.14 %)
39,541
(2.69 %)
29,543
(1.76 %)
256 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1
n/a n/a 14,564
(1.72 %)
71,604
(6.41 %)
n/a 41.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,737
(100.00 %)
1,662,251
(42.29 %)
439,119
(12.96 %)
3,776,125
(45.00 %)
0
(0 %)
888,556
(6.68 %)
56,507
(2.83 %)
15,006
(0.71 %)
257 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1
n/a n/a 15,070
(1.79 %)
71,367
(6.50 %)
n/a 41.46
(99.92 %)
0
(0 %)
4,157
(0.08 %)
943
(100.00 %)
1,717,591
(42.63 %)
474,348
(12.30 %)
4,011,319
(44.93 %)
3
(0.00 %)
n/a 59,531
(2.83 %)
15,998
(0.74 %)
258 Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023)
GCF_029220125.1
44,363
(10.91 %)
n/a 14,032
(2.80 %)
60,400
(8.09 %)
n/a 43.84
(99.86 %)
0
(0 %)
974
(0.14 %)
200
(100.00 %)
1,157,953
(36.57 %)
569,832
(12.19 %)
2,864,996
(37.65 %)
2
(0.00 %)
856,247
(8.38 %)
98,423
(9.53 %)
55,625
(4.11 %)
259 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2
47,018
(6.00 %)
n/a 16,516
(1.68 %)
33,920
(4.24 %)
n/a 38.00
(96.73 %)
0
(0 %)
621
(3.27 %)
2,415
(100.00 %)
1,125,511
(6.89 %)
1,113,607
(11.76 %)
8,546,053
(42.44 %)
2
(0.02 %)
1,620,405
(7.32 %)
44,933
(1.77 %)
26,268
(0.85 %)
260 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1
71,254
(7.50 %)
n/a 16,674
(1.63 %)
52,903
(4.12 %)
101,896
(6.64 %)
38.24
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,155,823
(4.90 %)
1,363,316
(12.23 %)
7,667,721
(47.23 %)
0
(0 %)
1,394,951
(7.13 %)
48,358
(1.88 %)
24,894
(0.73 %)
261 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1
n/a 27,999
(3.29 %)
16,698
(1.62 %)
62,818
(5.14 %)
74,339
(6.58 %)
38.41
(99.99 %)
0
(0 %)
334
(0.01 %)
195
(100.00 %)
1,194,830
(5.04 %)
1,460,981
(11.81 %)
7,590,179
(47.66 %)
2
(0.00 %)
1,437,937
(7.51 %)
50,533
(2.46 %)
25,088
(0.72 %)
262 milkfish (2019)
GCF_902362185.1
30,812
(7.61 %)
n/a 16,869
(3.41 %)
21,377
(6.58 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
0
(0 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
958,774
(8.18 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
2
(0.01 %)
611,774
(5.32 %)
22,089
(1.27 %)
14,000
(0.76 %)
263 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1
n/a n/a 16,565
(3.38 %)
42,094
(6.75 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,392
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
0
(0 %)
595,219
(5.37 %)
21,531
(1.27 %)
13,616
(0.75 %)
264 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1
n/a n/a 17,701
(1.62 %)
73,433
(5.69 %)
n/a 42.20
(99.98 %)
14
(0.00 %)
1,398
(0.02 %)
388
(100.00 %)
6,438,444
(40.32 %)
1,202,669
(11.51 %)
7,055,665
(47.04 %)
6
(0.00 %)
1,343,489
(8.04 %)
74,954
(3.44 %)
26,325
(0.98 %)
265 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1
n/a n/a 15,176
(3.17 %)
47,458
(7.48 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
0
(0 %)
927
(0.02 %)
486
(100.00 %)
1,167,409
(26.98 %)
438,114
(8.08 %)
3,351,987
(27.25 %)
3
(0.00 %)
441,989
(4.98 %)
45,298
(3.39 %)
29,915
(1.90 %)
266 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1
n/a n/a 14,480
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
0
(0 %)
936
(0.02 %)
725
(100.00 %)
1,101,582
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,480
(27.08 %)
5
(0.00 %)
417,783
(4.94 %)
42,657
(3.44 %)
28,222
(1.89 %)
267 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCF_023349555.1
40,276
(12.25 %)
n/a 14,478
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
936
(0.02 %)
936
(0.02 %)
1,660
(99.98 %)
1,101,578
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,428
(27.08 %)
5
(0.00 %)
417,783
(4.94 %)
42,657
(3.44 %)
28,222
(1.89 %)
268 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1
53,087
(12.11 %)
n/a 14,672
(2.71 %)
27,552
(6.74 %)
n/a 39.02
(99.85 %)
0
(0 %)
229
(0.15 %)
68
(100.00 %)
305,761
(2.11 %)
134,157
(2.14 %)
4,687,726
(28.26 %)
0
(0 %)
131,318
(1.99 %)
33,082
(2.28 %)
23,755
(1.34 %)
269 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1
41,183
(7.38 %)
39,253
(6.58 %)
14,602
(1.92 %)
57,194
(5.03 %)
35,597
(6.40 %)
40.58
(91.29 %)
110,543
(8.75 %)
123,625
(8.75 %)
120,723
(91.25 %)
447,158
(2.19 %)
235,336
(1.39 %)
6,518,990
(26.03 %)
877
(0.07 %)
150,526
(1.93 %)
54,589
(2.39 %)
39,256
(1.65 %)
270 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2
56,612
(6.89 %)
n/a 15,361
(1.60 %)
69,801
(5.20 %)
n/a 40.76
(99.88 %)
0
(0 %)
2,820
(0.12 %)
1,031
(100.00 %)
636,480
(2.75 %)
392,130
(3.32 %)
7,023,777
(32.98 %)
8
(0.00 %)
517,617
(4.36 %)
81,101
(3.45 %)
45,801
(1.71 %)
271 New Zealand spotty (alternate hap 2019 genbank)
GCA_009762545.1
n/a n/a 13,566
(2.17 %)
40,774
(5.21 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,659
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
0
(0 %)
456,905
(3.99 %)
16,368
(0.83 %)
7,034
(0.33 %)
272 New Zealand spotty (primary hap 2019 genbank)
GCA_009762535.1
n/a n/a 14,609
(2.22 %)
43,262
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
468
(100.00 %)
519,324
(4.65 %)
393,329
(5.54 %)
4,522,265
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,988
(4.42 %)
18,302
(0.85 %)
8,002
(0.35 %)
273 New Zealand spotty (primary hap refseq)
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
n/a 14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,987
(4.42 %)
18,299
(0.85 %)
7,999
(0.35 %)
274 Nile tilapia
GCF_001858045.2
77,384
(10.86 %)
n/a 15,599
(1.99 %)
32,839
(6.04 %)
n/a 40.73
(99.99 %)
0
(0 %)
551
(0.01 %)
2,460
(100.00 %)
600,869
(5.40 %)
291,105
(3.17 %)
4,958,128
(31.15 %)
1
(0.00 %)
496,471
(4.91 %)
32,038
(1.81 %)
17,948
(0.88 %)
275 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1
n/a n/a 13,050
(3.93 %)
44,650
(10.12 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,934
(100.00 %)
512,583
(14.83 %)
156,305
(8.46 %)
2,005,803
(27.09 %)
0
(0 %)
153,928
(3.57 %)
59,674
(9.19 %)
38,546
(4.50 %)
276 ninespine stickleback (NSP_V7 2020)
GCF_902500615.1
51,166
(15.31 %)
n/a 14,765
(3.99 %)
49,191
(9.80 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
0
(0 %)
341
(0.01 %)
1,667
(100.00 %)
380,357
(3.60 %)
188,301
(6.29 %)
2,422,266
(25.70 %)
1
(0.00 %)
285,108
(4.45 %)
72,584
(9.69 %)
45,847
(4.62 %)
277 ninespine stickleback (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316345.1
n/a n/a 14,600
(3.83 %)
49,927
(9.98 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
175
(100.00 %)
599,088
(14.68 %)
186,747
(10.27 %)
2,273,942
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
278 ninespine stickleback (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316345.1
57,816
(15.11 %)
n/a 14,598
(3.83 %)
49,473
(9.87 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
174
(100.00 %)
599,085
(14.68 %)
186,746
(10.27 %)
2,273,889
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
279 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1
51,073
(7.42 %)
n/a 15,809
(2.17 %)
43,728
(4.54 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 48
(100.00 %)
2,472,286
(44.73 %)
560,123
(5.68 %)
6,203,876
(38.64 %)
0
(0 %)
436,624
(3.73 %)
42,187
(2.72 %)
22,226
(1.23 %)
280 northern cavefish (hap1 2024)
GCA_046255685.1
n/a n/a 14,295
(2.22 %)
50,623
(6.07 %)
n/a 42.09
(99.99 %)
0
(0 %)
466
(0.01 %)
892
(100.00 %)
1,941,831
(49.35 %)
650,256
(17.85 %)
3,210,410
(44.77 %)
0
(0 %)
978,430
(8.94 %)
55,251
(4.79 %)
22,975
(1.21 %)
281 northern cavefish (hap2 2024)
GCA_046255725.1
n/a n/a 14,542
(2.12 %)
51,650
(5.81 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
0
(0 %)
484
(0.01 %)
667
(100.00 %)
2,014,967
(51.82 %)
755,698
(19.90 %)
3,290,098
(47.08 %)
2
(0.00 %)
1,137,534
(9.59 %)
57,881
(4.66 %)
23,926
(1.32 %)
282 northern pike
GCF_004634155.1
66,389
(9.11 %)
n/a 16,778
(2.37 %)
27,040
(5.41 %)
n/a 42.29
(99.99 %)
97
(0.00 %)
584
(0.01 %)
908
(100.00 %)
1,065,458
(31.14 %)
531,451
(7.80 %)
4,677,366
(33.26 %)
2
(0.00 %)
661,503
(5.13 %)
44,793
(2.82 %)
22,750
(1.05 %)
283 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1
n/a n/a 11,782
(2.41 %)
40,748
(5.68 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
0
(0 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,818
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
0
(0 %)
427,649
(4.54 %)
29,687
(2.57 %)
15,714
(1.07 %)
284 northern pike (primary hap 2020 refseq)
GCF_011004845.1
63,733
(9.28 %)
n/a 16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,941
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
0
(0 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
1
(0.00 %)
602,569
(4.43 %)
42,910
(2.52 %)
22,099
(1.02 %)
285 northern snakehead (prfri 2023)
GCF_033026475.1
61,639
(13.32 %)
n/a 15,131
(2.87 %)
35,444
(5.74 %)
n/a 39.76
(100.00 %)
0
(0 %)
52
(0.00 %)
291
(100.00 %)
830,033
(26.45 %)
152,304
(8.77 %)
3,778,846
(29.39 %)
0
(0 %)
257,843
(3.63 %)
8,436
(0.70 %)
6,325
(0.37 %)
286 ocellated dragonet (captive hap1 2024)
GCA_044231665.1
n/a n/a 13,787
(3.68 %)
60,819
(10.07 %)
n/a 45.42
(100.00 %)
1
(0.00 %)
99
(0.00 %)
108
(100.00 %)
259,874
(3.38 %)
94,885
(3.76 %)
2,302,967
(21.04 %)
2
(0.00 %)
145,739
(2.25 %)
58,433
(13.25 %)
46,364
(6.81 %)
287 ocellated dragonet (captive hap2 2024)
GCA_044231645.1
n/a n/a 13,709
(3.65 %)
60,517
(9.98 %)
n/a 45.43
(100.00 %)
0
(0 %)
111
(0.00 %)
129
(100.00 %)
272,479
(3.57 %)
101,623
(4.29 %)
2,384,412
(21.91 %)
0
(0 %)
158,467
(2.41 %)
58,256
(13.22 %)
45,677
(6.65 %)
288 Old Calabar mormyrid (PKING1 2018)
GCF_002872115.1
61,915
(11.48 %)
n/a 15,987
(2.73 %)
33,963
(6.66 %)
n/a 43.93
(92.03 %)
0
(0 %)
49,579
(7.99 %)
4,666
(100.00 %)
348,463
(2.27 %)
314,129
(2.95 %)
4,259,711
(20.83 %)
2,738
(0.27 %)
166,566
(1.74 %)
76,846
(4.18 %)
58,953
(2.91 %)
289 old wife E.armatus (hap1 2024)
GCF_043641665.1
32,231
(8.81 %)
n/a 15,382
(3.41 %)
41,015
(7.24 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
114
(0.00 %)
136
(100.00 %)
1,143,877
(18.90 %)
219,801
(2.87 %)
3,652,133
(23.09 %)
3
(0.00 %)
154,745
(1.82 %)
19,721
(1.34 %)
13,176
(0.82 %)
290 old wife E.armatus (hap2 2024)
GCA_043640875.1
n/a n/a 15,360
(3.42 %)
41,012
(7.26 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
94
(100.00 %)
438,416
(3.46 %)
219,275
(2.83 %)
3,623,998
(22.85 %)
4
(0.00 %)
154,824
(1.82 %)
19,710
(1.32 %)
13,334
(0.83 %)
291 orangethroat darter
GCF_008692095.1
55,448
(8.29 %)
n/a 15,000
(2.25 %)
49,918
(5.41 %)
n/a 40.91
(99.57 %)
0
(0 %)
101,221
(0.47 %)
3,119
(100.00 %)
566,915
(3.75 %)
509,018
(6.60 %)
5,142,090
(31.18 %)
204
(0.00 %)
644,640
(5.47 %)
26,702
(1.46 %)
14,294
(0.76 %)
292 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
n/a 15,761
(1.50 %)
31,563
(4.00 %)
59,905
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
0
(0 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,257,250
(5.57 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
0
(0 %)
1,304,958
(6.34 %)
29,320
(0.87 %)
15,066
(0.43 %)
293 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1
n/a n/a 14,018
(1.51 %)
45,251
(3.61 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,393
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
1
(0.00 %)
888,596
(5.23 %)
22,522
(0.77 %)
12,193
(0.40 %)
294 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1
68,779
(8.54 %)
n/a 17,223
(2.28 %)
49,697
(5.11 %)
n/a 38.10
(99.99 %)
0
(0 %)
614
(0.01 %)
358
(100.00 %)
2,925,549
(40.35 %)
402,676
(5.35 %)
5,933,365
(45.71 %)
2
(0.00 %)
792,756
(5.74 %)
56,843
(3.18 %)
21,760
(0.91 %)
295 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1
40,001
(9.36 %)
n/a 14,904
(2.72 %)
24,732
(5.87 %)
n/a 40.60
(84.20 %)
60,817
(15.83 %)
60,817
(15.83 %)
68,050
(84.17 %)
306,171
(3.27 %)
124,292
(0.75 %)
4,414,831
(20.66 %)
1,574
(0.10 %)
36,249
(0.53 %)
18,455
(0.96 %)
13,214
(0.68 %)
296 Pacific cod (2023)
GCF_031168955.1
49,417
(13.66 %)
n/a 13,542
(2.89 %)
64,214
(9.77 %)
n/a 45.55
(99.92 %)
0
(0 %)
4,826
(0.09 %)
24
(100.00 %)
1,117,561
(38.30 %)
685,851
(13.38 %)
2,330,116
(34.15 %)
16
(0.00 %)
539,494
(6.49 %)
87,761
(8.68 %)
51,521
(4.16 %)
297 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1
48,776
(12.61 %)
n/a 14,747
(3.15 %)
45,075
(7.30 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
219
(0.00 %)
120
(100.00 %)
410,917
(4.22 %)
246,500
(4.66 %)
3,680,698
(25.23 %)
0
(0 %)
251,625
(3.22 %)
31,508
(2.30 %)
20,928
(1.36 %)
298 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2
46,684
(12.50 %)
n/a 14,862
(3.15 %)
45,824
(7.30 %)
n/a 42.17
(99.95 %)
0
(0 %)
1,131
(0.05 %)
53
(100.00 %)
407,699
(3.94 %)
247,330
(3.84 %)
3,838,896
(24.75 %)
2
(0.00 %)
279,152
(3.23 %)
31,782
(2.27 %)
21,208
(1.36 %)
299 Pacific saury (AMF1-May2022 2023)
GCF_033807715.1
54,344
(6.52 %)
n/a 15,214
(1.67 %)
74,345
(6.13 %)
n/a 41.49
(99.96 %)
0
(0 %)
900
(0.04 %)
759
(100.00 %)
805,776
(5.16 %)
849,901
(11.48 %)
4,645,552
(43.92 %)
1
(0.00 %)
1,333,479
(8.06 %)
106,026
(5.14 %)
39,496
(1.50 %)
300 panther danio (primary hap 2020)
GCF_903798145.1
40,657
(5.52 %)
n/a 17,858
(2.46 %)
42,119
(3.16 %)
n/a 36.32
(98.82 %)
0
(0 %)
1,821
(1.18 %)
342
(100.00 %)
3,973,354
(56.67 %)
940,639
(7.81 %)
8,701,639
(50.54 %)
3
(0.00 %)
1,057,465
(5.16 %)
29,684
(1.18 %)
10,646
(0.30 %)
301 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1
n/a n/a 15,421
(1.80 %)
62,324
(6.15 %)
n/a 42.79
(99.90 %)
4,955
(0.10 %)
4,955
(0.10 %)
4,978
(99.90 %)
4,032,523
(34.18 %)
982,411
(16.51 %)
5,189,655
(46.47 %)
55
(0.01 %)
1,303,532
(10.00 %)
64,543
(3.14 %)
28,282
(1.35 %)
302 parallel lanternfish (primary hap 2024)
GCA_964188405.1
n/a n/a 16,917
(1.64 %)
72,190
(5.85 %)
n/a 42.91
(99.96 %)
0
(0 %)
2,729
(0.04 %)
24
(100.00 %)
4,976,327
(35.08 %)
1,258,755
(18.52 %)
6,268,804
(48.21 %)
12
(0.00 %)
1,744,372
(10.22 %)
81,193
(3.23 %)
34,135
(1.37 %)
303 Patagonian blennie (Puerto Natales JMC-PN-2008 2024)
GCF_036324505.1
42,701
(12.59 %)
n/a 14,986
(3.15 %)
46,289
(7.75 %)
n/a 40.99
(99.97 %)
0
(0 %)
380
(0.03 %)
27
(100.00 %)
1,031,762
(25.30 %)
219,393
(4.63 %)
3,436,780
(25.57 %)
0
(0 %)
225,847
(2.56 %)
16,570
(1.12 %)
10,155
(0.63 %)
304 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1
n/a n/a 15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
0
(0 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
975,354
(15.76 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,904
(35.09 %)
1
(0.00 %)
865,727
(6.60 %)
49,121
(3.07 %)
20,467
(0.93 %)
305 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1
n/a n/a 15,317
(2.02 %)
61,647
(6.35 %)
n/a 41.37
(99.99 %)
135
(0.01 %)
135
(0.01 %)
469
(99.99 %)
981,519
(15.40 %)
319,637
(12.45 %)
3,706,473
(36.77 %)
0
(0 %)
952,761
(6.98 %)
50,353
(2.98 %)
20,537
(0.91 %)
306 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1
n/a n/a 16,729
(3.56 %)
56,451
(8.61 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
11
(0.00 %)
11
(0.00 %)
5,701
(100.00 %)
1,153,359
(18.94 %)
829,887
(14.54 %)
2,793,018
(28.79 %)
0
(0 %)
721,904
(6.97 %)
49,469
(4.32 %)
33,228
(2.53 %)
307 peladilla (primary hap 2021)
GCA_017639675.1
n/a n/a 13,829
(3.83 %)
41,932
(8.64 %)
n/a 45.01
(98.24 %)
0
(0 %)
1,158
(1.77 %)
41
(100.00 %)
930,246
(18.49 %)
660,569
(13.71 %)
2,316,198
(27.66 %)
6
(0.00 %)
537,418
(6.48 %)
41,023
(4.40 %)
27,287
(2.49 %)
308 pencil smelt N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1
n/a n/a 17,996
(2.00 %)
89,591
(7.93 %)
n/a 45.22
(99.94 %)
0
(0 %)
3,299
(0.06 %)
1,177
(100.00 %)
2,828,457
(30.93 %)
1,676,413
(19.87 %)
4,137,400
(48.69 %)
14
(0.00 %)
1,929,538
(11.96 %)
78,669
(4.37 %)
29,960
(1.34 %)
309 picturesque dragonet (SynPic1 hap1 2024)
GCA_044231685.1
n/a n/a 13,827
(3.46 %)
53,000
(8.90 %)
n/a 43.38
(100.00 %)
9
(0.00 %)
122
(0.00 %)
364
(100.00 %)
222,800
(3.83 %)
105,428
(7.84 %)
2,500,710
(25.24 %)
1
(0.00 %)
280,578
(4.01 %)
41,125
(5.45 %)
32,953
(3.58 %)
310 picturesque dragonet (SynPic1 hap2 2024)
GCA_044231675.1
n/a n/a 13,816
(3.52 %)
52,689
(9.01 %)
n/a 43.48
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
300
(100.00 %)
223,762
(3.25 %)
105,291
(6.28 %)
2,579,336
(24.55 %)
0
(0 %)
233,535
(3.55 %)
41,114
(5.50 %)
32,452
(3.61 %)
311 pike-perch
GCF_008315115.2
65,418
(8.54 %)
n/a 15,731
(2.23 %)
52,240
(5.69 %)
n/a 40.87
(99.98 %)
0
(0 %)
711
(0.02 %)
337
(100.00 %)
629,999
(5.16 %)
567,578
(7.41 %)
4,697,709
(36.49 %)
3
(0.00 %)
784,659
(5.34 %)
39,666
(1.93 %)
12,855
(0.60 %)
312 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
n/a 15,738
(2.42 %)
26,691
(5.69 %)
57,069
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
0
(0 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,063,888
(5.90 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
0
(0 %)
374,590
(3.12 %)
41,636
(2.04 %)
21,488
(0.92 %)
313 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1
n/a n/a 15,563
(2.38 %)
54,264
(6.19 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,418
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
0
(0 %)
338,770
(2.89 %)
40,331
(2.02 %)
21,223
(0.93 %)
314 pink salmon
GCF_021184085.1
91,127
(4.89 %)
n/a 27,187
(1.37 %)
124,120
(3.88 %)
n/a 44.28
(99.96 %)
3,528
(0.01 %)
5,213
(0.04 %)
22,556
(99.99 %)
1,343,135
(0.00 %)
2,906,520
(28.95 %)
10,882,087
(57.26 %)
21
(0.00 %)
6,152,465
(12.38 %)
97,805
(3.04 %)
20,791
(0.34 %)
315 ploughfish
GCF_902827175.1
50,551
(7.66 %)
n/a 14,699
(1.83 %)
66,348
(6.06 %)
62,492
(5.74 %)
41.52
(99.98 %)
0
(0 %)
1,569
(0.02 %)
2,618
(100.00 %)
467,937
(3.05 %)
412,361
(6.64 %)
3,498,382
(45.08 %)
10
(0.00 %)
623,734
(5.21 %)
73,879
(3.55 %)
14,738
(0.64 %)
316 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1
n/a n/a 14,050
(2.77 %)
63,249
(8.86 %)
n/a 45.41
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,970
(100.00 %)
708,455
(9.71 %)
797,241
(15.67 %)
2,785,159
(33.18 %)
0
(0 %)
613,051
(6.69 %)
78,151
(7.95 %)
45,924
(3.34 %)
317 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1
n/a n/a 14,126
(2.81 %)
61,907
(8.75 %)
n/a 45.67
(99.94 %)
0
(0 %)
1,810
(0.06 %)
616
(100.00 %)
753,034
(10.17 %)
850,189
(15.72 %)
2,888,555
(33.70 %)
7
(0.00 %)
642,528
(6.84 %)
80,883
(8.43 %)
46,894
(3.34 %)
318 predatory carp (Z2021 2022)
GCF_024489055.1
56,688
(7.63 %)
n/a 17,670
(2.67 %)
54,522
(5.25 %)
n/a 37.95
(100.00 %)
0
(0 %)
181
(0.00 %)
51
(100.00 %)
3,087,358
(61.37 %)
553,846
(7.14 %)
6,036,124
(43.52 %)
2
(0.00 %)
738,916
(5.65 %)
47,942
(3.56 %)
13,183
(0.50 %)
319 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
n/a 14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
0
(0 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
3
(0.00 %)
1,746,915
(7.91 %)
172,199
(5.45 %)
18,080
(0.31 %)
320 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1
n/a n/a 10,944
(0.64 %)
59,123
(2.21 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,336
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
0
(0 %)
1,101,423
(6.43 %)
125,285
(5.42 %)
13,610
(0.32 %)
321 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1
n/a n/a 15,639
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
0
(0 %)
1,907
(0.07 %)
365
(100.00 %)
1,655,350
(30.53 %)
511,512
(12.09 %)
2,015,264
(35.19 %)
4
(0.00 %)
468,697
(7.41 %)
32,410
(4.33 %)
18,662
(1.57 %)
322 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCF_038355195.1
39,606
(12.43 %)
n/a 15,641
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
0
(0 %)
1,907
(0.07 %)
366
(100.00 %)
1,655,356
(30.53 %)
511,513
(12.09 %)
2,015,303
(35.19 %)
4
(0.00 %)
468,697
(7.41 %)
32,410
(4.33 %)
18,662
(1.57 %)
323 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2
119,284
(6.51 %)
n/a 27,513
(1.62 %)
109,524
(4.38 %)
138,073
(5.21 %)
43.45
(99.74 %)
196
(0.00 %)
486
(0.26 %)
939
(100.00 %)
1,537,455
(7.32 %)
2,083,211
(23.10 %)
10,092,840
(53.71 %)
5
(0.00 %)
4,526,931
(11.46 %)
73,586
(2.16 %)
18,220
(0.32 %)
324 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1
79,299
(6.41 %)
78,807
(5.45 %)
25,179
(1.70 %)
98,339
(4.18 %)
115,853
(5.33 %)
42.67
(88.52 %)
7,839
(0.04 %)
427,894
(11.54 %)
139,800
(99.96 %)
1,332,141
(5.52 %)
1,604,760
(8.18 %)
9,451,984
(44.00 %)
31,141
(1.22 %)
1,638,788
(9.94 %)
56,604
(1.05 %)
14,470
(0.23 %)
325 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1
71,991
(5.94 %)
n/a 27,195
(1.88 %)
81,269
(3.63 %)
n/a 39.59
(99.96 %)
0
(0 %)
1,873
(0.04 %)
1,746
(100.00 %)
7,035,382
(51.89 %)
1,021,269
(5.98 %)
12,768,853
(46.85 %)
1
(0.00 %)
1,492,285
(4.74 %)
109,185
(4.70 %)
33,199
(0.66 %)
326 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1
n/a n/a 15,655
(3.01 %)
47,717
(6.87 %)
n/a 40.98
(95.57 %)
0
(0 %)
11,577
(4.42 %)
34,462
(100.00 %)
470,579
(3.16 %)
231,051
(1.91 %)
4,345,700
(23.24 %)
1,006
(0.10 %)
102,380
(1.25 %)
20,149
(1.25 %)
12,381
(0.71 %)
327 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1
n/a n/a 4,539
(2.01 %)
14,061
(4.35 %)
n/a 40.48
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,751
(100.00 %)
759,605
(49.59 %)
161,693
(7.99 %)
1,684,737
(29.93 %)
0
(0 %)
232,319
(5.07 %)
7,525
(1.31 %)
4,853
(0.81 %)
328 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1
47,129
(6.06 %)
n/a 17,089
(1.80 %)
33,378
(4.02 %)
n/a 40.45
(97.38 %)
42,102
(2.59 %)
62,964
(2.59 %)
325,620
(97.41 %)
898,445
(4.81 %)
863,000
(6.48 %)
7,757,382
(34.74 %)
2,457
(0.19 %)
n/a 34,329
(1.24 %)
22,250
(0.80 %)
329 red-bellied piranha (primary hap 2020)
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
n/a 16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
76,011
(5.65 %)
40.58
(99.17 %)
0
(0 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
2
(0.00 %)
1,005,141
(5.14 %)
33,087
(1.38 %)
20,822
(0.79 %)
330 reedfish (2021)
GCF_900747795.2
44,479
(2.01 %)
n/a 13,108
(0.46 %)
23,157
(1.29 %)
n/a 39.37
(99.18 %)
0
(0 %)
1,431
(0.82 %)
169
(100.00 %)
8,636,520
(39.34 %)
1,069,643
(2.91 %)
19,980,572
(47.52 %)
17
(0.00 %)
1,256,071
(2.69 %)
89,023
(1.13 %)
22,697
(0.30 %)
331 reedfish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900700845.2
n/a n/a 9,950
(0.37 %)
31,611
(1.22 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
38,598
(100.00 %)
1,300,565
(2.57 %)
685,834
(2.21 %)
14,691,576
(45.66 %)
0
(0 %)
588,794
(1.83 %)
63,365
(1.11 %)
17,365
(0.32 %)
332 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1
56,261
(13.18 %)
n/a 14,197
(2.71 %)
45,193
(6.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
157
(100.00 %)
941,095
(17.66 %)
238,999
(5.27 %)
4,283,692
(41.06 %)
0
(0 %)
191,618
(2.49 %)
43,014
(4.07 %)
25,748
(1.58 %)
333 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2
25,353
(3.88 %)
n/a 14,334
(1.56 %)
137,348
(9.74 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
0
(0 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
635,526
(3.14 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
7,501
(0.17 %)
424,697
(2.96 %)
52,308
(2.11 %)
22,130
(0.71 %)
334 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2
n/a n/a 27,928
(1.66 %)
110,791
(4.44 %)
n/a 43.36
(96.90 %)
0
(0 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
4,690,842
(57.30 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,763
(52.37 %)
2
(0.00 %)
3,475,805
(8.76 %)
70,821
(1.77 %)
19,956
(0.39 %)
335 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1
n/a n/a 18,165
(2.73 %)
62,580
(6.00 %)
n/a 38.74
(100.00 %)
6
(0.00 %)
6
(0.00 %)
4,612
(100.00 %)
2,483,904
(48.29 %)
584,363
(7.55 %)
5,582,076
(40.38 %)
0
(0 %)
923,875
(6.53 %)
60,229
(3.53 %)
19,604
(0.82 %)
336 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1
n/a n/a 18,132
(2.65 %)
63,523
(6.01 %)
n/a 38.80
(99.99 %)
1
(0.00 %)
471
(0.01 %)
86
(100.00 %)
2,613,900
(48.90 %)
625,102
(8.21 %)
5,738,444
(41.24 %)
1
(0.00 %)
1,070,552
(7.36 %)
65,328
(3.68 %)
20,458
(0.81 %)
337 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2
n/a n/a 15,291
(3.29 %)
45,865
(7.56 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,165
(100.00 %)
1,131,154
(25.69 %)
269,583
(5.08 %)
3,371,712
(24.64 %)
0
(0 %)
249,009
(3.21 %)
36,810
(2.68 %)
27,636
(1.84 %)
338 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2
n/a n/a 15,181
(3.34 %)
44,153
(7.53 %)
51,135
(7.40 %)
42.31
(99.98 %)
0
(0 %)
418
(0.02 %)
101
(100.00 %)
1,121,704
(25.48 %)
269,467
(4.88 %)
3,358,709
(24.69 %)
5
(0.00 %)
255,676
(3.48 %)
36,987
(3.02 %)
28,368
(1.91 %)
339 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1
52,554
(8.81 %)
n/a 17,664
(3.05 %)
48,403
(5.24 %)
n/a 36.06
(83.93 %)
0
(0 %)
5,144
(16.07 %)
2,870
(100.00 %)
2,600,095
(49.94 %)
683,499
(4.34 %)
6,000,462
(35.96 %)
5
(0.00 %)
444,046
(3.07 %)
33,741
(1.62 %)
19,239
(0.70 %)
340 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1
n/a n/a 15,434
(2.01 %)
44,991
(4.63 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
192
(0.00 %)
302
(100.00 %)
2,506,810
(40.54 %)
613,867
(8.67 %)
5,070,851
(48.32 %)
1
(0.00 %)
1,210,760
(8.82 %)
46,071
(2.57 %)
27,461
(1.23 %)
341 rouch bullseye (RE-2024b hap1 2024 refseq)
GCF_042242105.1
32,256
(9.05 %)
n/a 15,283
(3.03 %)
44,299
(6.93 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
87
(0.00 %)
441
(100.00 %)
1,115,191
(21.73 %)
271,391
(5.93 %)
3,651,073
(24.53 %)
2
(0.00 %)
299,227
(3.11 %)
19,771
(1.39 %)
13,537
(0.81 %)
342 rough bullseye (RE-2024b hap2 2024)
GCA_042242125.1
n/a n/a 14,475
(2.89 %)
44,413
(7.11 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
0
(0 %)
93
(0.00 %)
84
(100.00 %)
1,762,151
(30.90 %)
262,291
(5.80 %)
3,580,461
(24.37 %)
10
(0.00 %)
296,317
(3.16 %)
19,851
(1.40 %)
14,202
(0.86 %)
343 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1
n/a n/a 17,895
(2.55 %)
64,448
(5.84 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
0
(0 %)
418
(0.01 %)
110
(100.00 %)
2,661,155
(49.83 %)
673,071
(10.59 %)
5,755,954
(42.48 %)
1
(0.00 %)
1,108,306
(7.28 %)
66,952
(4.46 %)
21,217
(0.87 %)
344 rudd (fScaEry2.hap1.1 2024)
GCA_964197995.1
n/a n/a 18,254
(2.38 %)
68,852
(5.71 %)
n/a 39.02
(99.99 %)
4
(0.00 %)
836
(0.01 %)
759
(100.00 %)
2,854,977
(51.13 %)
754,287
(11.81 %)
5,942,764
(44.17 %)
2
(0.00 %)
1,392,734
(8.61 %)
72,686
(4.52 %)
23,184
(0.94 %)
345 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1
34,548
(9.49 %)
n/a 15,280
(3.00 %)
46,259
(6.95 %)
n/a 40.45
(99.99 %)
719
(0.01 %)
723
(0.01 %)
8,212
(99.99 %)
1,335,152
(28.19 %)
415,384
(6.53 %)
3,948,379
(27.81 %)
2
(0.00 %)
416,856
(4.21 %)
22,854
(1.61 %)
17,357
(1.05 %)
346 sailfin molly
GCF_001443285.1
53,986
(11.41 %)
n/a 15,048
(2.71 %)
33,482
(6.71 %)
n/a 39.18
(83.41 %)
36,637
(16.61 %)
41,735
(16.61 %)
54,623
(83.39 %)
357,919
(2.18 %)
189,502
(1.23 %)
4,873,063
(22.51 %)
1,755
(0.81 %)
87,954
(1.83 %)
34,138
(1.62 %)
26,570
(1.23 %)
347 sansaifugu (HTHZ2018 2019)
GCF_003711565.1
56,010
(20.10 %)
n/a 13,998
(4.84 %)
48,737
(11.56 %)
n/a 45.63
(99.99 %)
0
(0 %)
250
(0.01 %)
868
(100.00 %)
304,980
(15.98 %)
171,631
(4.98 %)
1,616,965
(21.60 %)
1
(0.00 %)
257,565
(5.29 %)
48,338
(9.79 %)
36,513
(5.09 %)
348 sardine (primary hap 2023 genbank)
GCA_963854185.1
n/a n/a 16,071
(2.33 %)
64,180
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
241
(100.00 %)
1,503,111
(11.74 %)
1,507,024
(15.48 %)
4,027,638
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,853
(8.48 %)
68,874
(3.56 %)
38,590
(1.78 %)
349 sardine (primary hap 2023 refseq)
GCF_963854185.1
48,146
(9.15 %)
n/a 16,069
(2.33 %)
64,178
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
240
(100.00 %)
1,503,108
(11.74 %)
1,507,022
(15.48 %)
4,027,614
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,852
(8.48 %)
68,873
(3.56 %)
38,589
(1.78 %)
350 scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023)
GCF_030265065.1
51,270
(7.00 %)
n/a 13,854
(1.32 %)
48,980
(3.46 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
0
(0 %)
9
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,805,346
(21.21 %)
512,153
(12.76 %)
6,260,589
(63.96 %)
0
(0 %)
859,332
(5.23 %)
96,908
(3.65 %)
37,320
(1.36 %)
351 Senegalese sole
GCF_019176455.1
46,446
(12.02 %)
n/a 15,155
(3.15 %)
43,828
(7.31 %)
n/a 40.92
(99.99 %)
0
(0 %)
662
(0.01 %)
1,937
(100.00 %)
522,618
(4.22 %)
317,280
(4.23 %)
4,040,245
(28.25 %)
1
(0.00 %)
268,721
(3.11 %)
26,946
(1.79 %)
16,377
(1.03 %)
352 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1
n/a n/a 14,728
(2.46 %)
62,094
(7.09 %)
n/a 42.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,847
(100.00 %)
939,151
(11.90 %)
472,983
(7.68 %)
4,326,183
(28.40 %)
0
(0 %)
486,310
(4.09 %)
64,290
(4.16 %)
42,087
(2.28 %)
353 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1
n/a n/a 15,032
(2.44 %)
62,625
(6.97 %)
n/a 42.07
(99.98 %)
0
(0 %)
598
(0.02 %)
847
(100.00 %)
967,197
(11.85 %)
498,286
(8.15 %)
4,397,828
(28.96 %)
9
(0.00 %)
531,478
(4.46 %)
65,744
(4.06 %)
42,870
(2.25 %)
354 sharptooth jobfish (hap1 2024)
GCA_045363895.1
n/a n/a 15,800
(1.77 %)
51,791
(4.52 %)
n/a 39.82
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
283
(100.00 %)
777,839
(3.19 %)
459,791
(3.90 %)
7,958,604
(35.17 %)
0
(0 %)
375,713
(2.47 %)
21,711
(0.94 %)
12,537
(0.40 %)
355 sharptooth jobfish (hap2 2024)
GCA_045363885.1
n/a n/a 15,879
(1.78 %)
51,774
(4.52 %)
n/a 39.81
(100.00 %)
0
(0 %)
76
(0.00 %)
172
(100.00 %)
778,842
(3.19 %)
462,247
(3.82 %)
7,956,116
(35.13 %)
1
(0.00 %)
374,216
(2.38 %)
21,587
(0.91 %)
12,357
(0.42 %)
356 sheepshead minnow
GCF_000732505.1
37,879
(7.01 %)
n/a 14,749
(2.02 %)
25,480
(4.66 %)
n/a 38.19
(86.93 %)
101,700
(13.10 %)
113,210
(13.10 %)
110,959
(86.90 %)
363,397
(1.88 %)
195,191
(1.43 %)
6,444,762
(27.47 %)
3,240
(0.30 %)
136,313
(1.74 %)
18,269
(0.66 %)
10,928
(0.41 %)
357 shortfin molly
GCF_001443325.1
54,473
(11.42 %)
n/a 15,104
(2.72 %)
33,717
(6.74 %)
n/a 39.23
(84.81 %)
32,496
(15.20 %)
37,507
(15.20 %)
50,598
(84.80 %)
328,347
(2.03 %)
172,112
(1.18 %)
4,876,942
(22.80 %)
1,876
(0.89 %)
88,660
(1.88 %)
34,271
(1.66 %)
26,703
(1.25 %)
358 Siamese fighting fish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1
n/a n/a 14,510
(4.12 %)
60,058
(10.77 %)
n/a 45.51
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,705
(100.00 %)
249,671
(3.68 %)
182,366
(4.87 %)
1,939,533
(22.55 %)
0
(0 %)
223,835
(4.10 %)
72,474
(13.55 %)
56,347
(7.50 %)
359 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4
59,278
(19.85 %)
n/a 14,594
(4.32 %)
55,265
(10.96 %)
n/a 45.31
(99.99 %)
0
(0 %)
321
(0.01 %)
36
(100.00 %)
384,203
(19.38 %)
175,898
(4.39 %)
1,946,630
(23.16 %)
2
(0.00 %)
209,905
(4.10 %)
70,331
(13.13 %)
54,790
(7.31 %)
360 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2
n/a n/a 14,737
(4.05 %)
61,568
(10.70 %)
n/a 45.50
(100.00 %)
108
(0.00 %)
108
(0.00 %)
3,872
(100.00 %)
392,585
(19.23 %)
190,741
(5.09 %)
1,994,824
(23.20 %)
0
(0 %)
245,925
(4.39 %)
74,259
(13.49 %)
57,619
(7.42 %)
361 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1
131,166
(9.80 %)
n/a 29,612
(2.99 %)
81,338
(5.43 %)
n/a 37.63
(99.92 %)
0
(0 %)
2,597
(0.08 %)
51
(100.00 %)
3,277,259
(45.05 %)
801,192
(7.96 %)
7,910,205
(42.51 %)
3
(0.00 %)
1,037,130
(5.68 %)
60,236
(2.18 %)
20,870
(0.55 %)
362 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1
n/a n/a 13,661
(1.11 %)
75,418
(4.21 %)
n/a 45.01
(99.96 %)
0
(0 %)
3,120
(0.04 %)
1,059
(100.00 %)
4,634,757
(53.53 %)
1,006,319
(17.13 %)
5,273,732
(51.16 %)
14
(0.00 %)
1,782,741
(8.47 %)
145,115
(7.59 %)
66,645
(2.19 %)
363 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1
34,018
(4.17 %)
n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
0
(0 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
17
(0.00 %)
1,796,705
(8.53 %)
143,632
(7.43 %)
65,914
(2.15 %)
364 smallmouth bass
GCF_021292245.1
55,919
(9.40 %)
n/a 15,509
(2.37 %)
49,387
(5.61 %)
n/a 40.72
(99.65 %)
0
(0 %)
34,581
(0.36 %)
15,020
(100.00 %)
445,979
(2.50 %)
249,630
(2.49 %)
5,071,015
(28.28 %)
3,470
(0.39 %)
278,594
(4.93 %)
23,875
(1.36 %)
11,538
(0.57 %)
365 snake pipefish (RoL-2023_Sb 2023)
GCF_033978785.1
57,883
(4.39 %)
n/a 15,654
(1.03 %)
72,123
(3.58 %)
n/a 38.64
(100.00 %)
0
(0 %)
2,564
(0.00 %)
424
(100.00 %)
3,149,025
(23.73 %)
1,621,410
(19.58 %)
7,534,195
(67.22 %)
1
(0.00 %)
4,080,159
(14.37 %)
122,765
(3.07 %)
51,511
(1.21 %)
366 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2
75,628
(6.10 %)
n/a 24,075
(1.71 %)
98,364
(4.30 %)
n/a 43.37
(96.15 %)
1,903
(0.01 %)
25,658
(3.85 %)
36,660
(99.99 %)
949,725
(3.53 %)
1,465,583
(10.82 %)
8,853,884
(48.52 %)
872
(0.04 %)
1,715,998
(5.18 %)
62,850
(1.45 %)
16,671
(0.36 %)
367 sockeye salmon (Pitt River 2024)
GCF_034236695.1
80,798
(5.59 %)
n/a 26,218
(1.35 %)
116,746
(3.87 %)
n/a 44.03
(99.93 %)
1,058
(0.00 %)
4,351
(0.07 %)
12,436
(100.00 %)
6,356,046
(54.95 %)
2,840,516
(31.41 %)
10,575,179
(57.52 %)
9
(0.00 %)
6,694,579
(13.15 %)
77,648
(1.61 %)
19,825
(0.33 %)
368 South Georgia icefish
GCF_902827115.1
41,307
(6.47 %)
n/a 14,776
(1.79 %)
68,734
(6.16 %)
61,643
(5.52 %)
42.07
(99.94 %)
0
(0 %)
2,461
(0.06 %)
1,563
(100.00 %)
498,451
(3.42 %)
474,032
(7.20 %)
3,613,731
(45.83 %)
19
(0.00 %)
763,187
(8.62 %)
88,984
(4.31 %)
17,905
(0.76 %)
369 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1
n/a n/a 15,727
(2.61 %)
43,177
(5.74 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 895
(100.00 %)
1,590,386
(33.53 %)
246,800
(2.86 %)
5,173,834
(26.85 %)
0
(0 %)
323,596
(3.31 %)
14,473
(0.87 %)
9,723
(0.47 %)
370 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
n/a 15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
0
(0 %)
326,254
(3.37 %)
14,097
(0.88 %)
8,860
(0.42 %)
371 southern platyfish
GCF_002775205.1
46,367
(11.15 %)
n/a 14,674
(2.66 %)
28,368
(6.82 %)
n/a 38.97
(99.53 %)
0
(0 %)
156
(0.47 %)
102
(100.00 %)
323,402
(2.76 %)
146,477
(2.33 %)
4,741,552
(28.27 %)
0
(0 %)
190,964
(2.71 %)
34,667
(2.13 %)
24,564
(1.37 %)
372 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1
74,317
(6.97 %)
n/a 30,906
(3.19 %)
55,474
(5.66 %)
n/a 37.28
(92.69 %)
168,741
(7.34 %)
168,741
(7.34 %)
254,423
(92.66 %)
1,129,104
(5.02 %)
730,197
(4.59 %)
8,910,005
(36.97 %)
1,220
(0.18 %)
542,313
(6.57 %)
64,238
(1.79 %)
28,032
(0.71 %)
373 spangled emperor (hap1 2024)
GCA_045362495.1
n/a n/a 15,554
(1.75 %)
58,641
(5.19 %)
n/a 40.59
(100.00 %)
0
(0 %)
196
(0.00 %)
226
(100.00 %)
682,449
(3.01 %)
409,809
(4.43 %)
7,114,584
(28.98 %)
6
(0.00 %)
539,832
(3.67 %)
37,214
(1.53 %)
18,727
(0.64 %)
374 spangled emperor (hap2 2024)
GCA_045362485.1
n/a n/a 15,490
(1.77 %)
57,993
(5.20 %)
n/a 40.57
(100.00 %)
0
(0 %)
244
(0.00 %)
151
(100.00 %)
677,985
(3.03 %)
408,391
(4.33 %)
7,184,861
(29.15 %)
4
(0.00 %)
529,035
(3.52 %)
36,602
(1.46 %)
18,481
(0.64 %)
375 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1
57,720
(10.03 %)
n/a 15,810
(2.14 %)
58,218
(5.77 %)
n/a 40.33
(99.99 %)
0
(0 %)
871
(0.01 %)
81
(100.00 %)
1,505,948
(35.31 %)
346,542
(4.71 %)
5,210,329
(31.65 %)
0
(0 %)
506,956
(4.12 %)
36,529
(1.65 %)
21,732
(0.92 %)
376 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1
38,931
(8.84 %)
n/a 15,624
(2.29 %)
35,942
(5.59 %)
n/a 40.01
(85.05 %)
0
(0 %)
209,115
(15.01 %)
30,414
(100.00 %)
372,901
(2.33 %)
278,854
(1.99 %)
5,622,334
(22.61 %)
3,125
(0.18 %)
147,444
(1.33 %)
25,079
(0.95 %)
17,741
(0.66 %)
377 spotted green pufferfish (2004)
GCA_000180735.1
n/a 193,449
(10.86 %)
13,641
(5.13 %)
57,982
(13.46 %)
n/a 46.43
(91.24 %)
18,974
(8.76 %)
18,974
(8.76 %)
44,686
(91.24 %)
252,877
(4.38 %)
159,939
(3.51 %)
1,689,462
(18.66 %)
20
(0.00 %)
119,601
(3.94 %)
51,580
(13.42 %)
39,946
(6.79 %)
378 spotted tilapia (v1 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.1
46,818
(8.35 %)
n/a 14,938
(2.04 %)
55,475
(6.12 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
23
(0.00 %)
792
(100.00 %)
505,488
(2.57 %)
269,742
(4.14 %)
4,697,020
(30.74 %)
0
(0 %)
395,431
(3.97 %)
30,399
(1.90 %)
16,887
(0.82 %)
379 spotted tilapia (v2 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.2
48,380
(8.37 %)
n/a 15,470
(2.04 %)
57,237
(6.11 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
24
(0.00 %)
791
(100.00 %)
523,070
(2.57 %)
277,554
(4.08 %)
4,872,723
(30.67 %)
0
(0 %)
404,433
(3.93 %)
31,383
(1.89 %)
17,453
(0.82 %)
380 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1
110,154
(7.62 %)
n/a 25,364
(1.76 %)
40,715
(4.06 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
0
(0 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
10
(0.00 %)
1,593,747
(6.87 %)
64,522
(2.85 %)
21,984
(0.89 %)
381 sterlet (v2 paternal hap 2022)
GCA_902713435.2
n/a n/a 24,717
(1.73 %)
40,151
(4.13 %)
74,807
(5.54 %)
40.09
(99.99 %)
0
(0 %)
475
(0.01 %)
1,517
(100.00 %)
1,844,596
(9.77 %)
1,119,340
(9.88 %)
9,372,934
(41.58 %)
8
(0.00 %)
1,582,556
(6.83 %)
65,007
(2.74 %)
17,761
(0.38 %)
382 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1
n/a n/a 16,177
(4.18 %)
40,160
(7.35 %)
n/a 39.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,237
(100.00 %)
1,208,781
(38.02 %)
121,854
(7.96 %)
2,956,942
(32.61 %)
0
(0 %)
310,772
(4.79 %)
27,787
(3.58 %)
14,364
(1.06 %)
383 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1
n/a n/a 16,419
(3.98 %)
40,677
(7.21 %)
n/a 39.69
(99.97 %)
0
(0 %)
825
(0.03 %)
100
(100.00 %)
1,324,513
(39.84 %)
143,170
(9.30 %)
3,000,881
(34.30 %)
1
(0.00 %)
392,291
(5.75 %)
30,130
(3.71 %)
15,123
(1.03 %)
384 stone moroko (DD20220531a primary hap 2022)
GCF_024679245.1
59,497
(6.82 %)
n/a 17,172
(2.25 %)
57,383
(4.85 %)
n/a 39.18
(99.99 %)
0
(0 %)
497
(0.01 %)
81
(100.00 %)
4,750,810
(63.58 %)
649,426
(10.14 %)
6,511,384
(46.74 %)
4
(0.00 %)
1,041,545
(6.23 %)
74,723
(4.45 %)
16,230
(0.62 %)
385 straightnose pipefish (RoL-2023_Sa 2023)
GCF_033978795.1
56,498
(4.86 %)
n/a 14,602
(1.00 %)
64,279
(2.96 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
0
(0 %)
1,172
(0.00 %)
473
(100.00 %)
2,984,285
(27.54 %)
1,402,691
(20.35 %)
7,915,062
(67.02 %)
0
(0 %)
4,017,415
(14.33 %)
140,374
(3.90 %)
46,995
(1.10 %)
386 striated frogfish (MH-2024 2024)
GCF_040054535.1
45,220
(12.66 %)
n/a 14,509
(3.35 %)
46,221
(7.95 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
0
(0 %)
18
(0.00 %)
42
(100.00 %)
791,570
(25.79 %)
305,491
(6.68 %)
3,000,938
(29.61 %)
0
(0 %)
272,583
(3.30 %)
36,818
(4.17 %)
23,466
(2.10 %)
387 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1
n/a n/a 15,871
(2.85 %)
42,287
(5.51 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
3,274
(100.00 %)
1,826,752
(37.53 %)
592,022
(6.69 %)
4,899,884
(32.33 %)
0
(0 %)
491,621
(3.91 %)
17,357
(1.25 %)
12,560
(0.74 %)
388 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1
53,860
(11.99 %)
n/a 16,033
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
0
(0 %)
236
(0.51 %)
58
(100.00 %)
1,870,234
(37.80 %)
605,570
(6.82 %)
5,059,429
(32.43 %)
2
(0.00 %)
531,388
(4.26 %)
17,919
(1.29 %)
12,796
(0.75 %)
389 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1
50,044
(9.61 %)
n/a 15,665
(2.76 %)
41,398
(5.35 %)
n/a 38.86
(99.98 %)
0
(0 %)
463
(0.02 %)
150
(100.00 %)
777,186
(5.69 %)
603,962
(6.24 %)
5,141,987
(32.41 %)
0
(0 %)
499,249
(4.08 %)
17,264
(1.20 %)
11,793
(0.66 %)
390 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1
40,992
(9.44 %)
n/a 15,295
(2.91 %)
20,865
(5.31 %)
n/a 38.71
(97.32 %)
0
(0 %)
23,755
(2.69 %)
567
(100.00 %)
693,498
(4.75 %)
489,286
(3.69 %)
4,849,313
(30.04 %)
22
(0.00 %)
189,512
(1.66 %)
15,076
(0.95 %)
10,761
(0.60 %)
391 striped sea-bass
GCF_004916995.1
32,103
(10.78 %)
n/a 14,422
(3.07 %)
38,188
(6.41 %)
n/a 40.19
(99.19 %)
0
(0 %)
73,335
(0.86 %)
630
(100.00 %)
365,581
(2.59 %)
142,967
(0.99 %)
4,151,813
(22.73 %)
371
(0.01 %)
25,024
(0.35 %)
13,730
(0.95 %)
10,471
(0.69 %)
392 Sumatra barb
GCF_018831695.1
54,947
(11.16 %)
n/a 18,745
(3.98 %)
49,520
(6.36 %)
n/a 38.24
(99.95 %)
0
(0 %)
5,075
(0.05 %)
1,122
(100.00 %)
638,783
(6.33 %)
357,159
(7.71 %)
4,520,846
(32.46 %)
16
(0.00 %)
624,611
(5.29 %)
46,339
(3.96 %)
34,160
(2.01 %)
393 swamp eel
GCF_001952655.1
43,831
(10.64 %)
n/a 14,741
(2.98 %)
20,099
(5.80 %)
n/a 40.90
(92.01 %)
51,257
(8.01 %)
51,257
(8.01 %)
71,879
(91.99 %)
266,195
(1.84 %)
95,726
(1.16 %)
3,596,747
(21.95 %)
26
(0.02 %)
54,721
(1.57 %)
7,065
(0.42 %)
5,103
(0.29 %)
394 swordfish
GCF_016859285.1
47,986
(9.92 %)
n/a 15,208
(2.84 %)
42,556
(5.91 %)
n/a 40.69
(99.97 %)
0
(0 %)
449
(0.03 %)
1,482
(100.00 %)
484,543
(3.59 %)
230,762
(3.41 %)
4,496,150
(23.94 %)
0
(0 %)
203,746
(2.18 %)
27,129
(2.10 %)
20,905
(1.34 %)
395 tambaqui
GCF_904425465.1
46,601
(6.55 %)
n/a 17,150
(1.88 %)
50,327
(4.03 %)
n/a 39.33
(100.00 %)
0
(0 %)
420
(0.00 %)
1,269
(100.00 %)
753,112
(4.00 %)
676,948
(5.71 %)
8,317,676
(35.32 %)
3
(0.00 %)
679,968
(3.78 %)
25,784
(0.92 %)
17,476
(0.58 %)
396 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1
n/a n/a 14,720
(2.58 %)
45,918
(6.44 %)
n/a 40.37
(99.99 %)
0
(0 %)
454
(0.01 %)
188
(100.00 %)
1,242,704
(17.37 %)
518,293
(15.23 %)
3,986,694
(40.18 %)
1
(0.00 %)
670,254
(6.56 %)
51,441
(3.53 %)
22,258
(1.30 %)
397 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1
n/a n/a 15,347
(2.73 %)
50,294
(7.25 %)
n/a 42.30
(99.98 %)
30
(0.00 %)
610
(0.02 %)
393
(100.00 %)
1,157,324
(26.70 %)
229,196
(4.33 %)
3,694,790
(27.54 %)
1
(0.00 %)
385,033
(4.63 %)
38,929
(2.20 %)
24,476
(1.25 %)
398 three-spined stickleback
GCF_016920845.1
50,181
(16.09 %)
n/a 14,935
(3.99 %)
53,773
(9.96 %)
n/a 44.66
(99.24 %)
0
(0 %)
3,125
(0.76 %)
2,937
(100.00 %)
368,987
(9.09 %)
160,564
(2.89 %)
2,308,841
(21.91 %)
4
(0.00 %)
148,689
(2.94 %)
80,336
(11.49 %)
57,087
(5.92 %)
399 three-spined stickleback (hap1 2024)
GCA_964276395.1
n/a n/a 14,939
(3.72 %)
56,284
(10.07 %)
n/a 44.71
(99.99 %)
3
(0.00 %)
331
(0.01 %)
133
(100.00 %)
573,569
(20.53 %)
206,699
(9.01 %)
2,335,009
(27.29 %)
7
(0.00 %)
213,153
(3.82 %)
84,009
(12.41 %)
57,803
(5.54 %)
400 three-spined stickleback (hap2 2024)
GCA_964276385.1
n/a n/a 13,591
(3.79 %)
50,693
(10.19 %)
n/a 44.72
(99.99 %)
309
(0.01 %)
309
(0.01 %)
479
(99.99 %)
505,547
(19.86 %)
181,092
(8.75 %)
2,117,454
(27.02 %)
3
(0.00 %)
218,946
(4.51 %)
75,434
(12.33 %)
51,737
(5.53 %)
401 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1
n/a n/a 13,912
(1.87 %)
62,727
(6.28 %)
n/a 42.90
(99.99 %)
0
(0 %)
894
(0.01 %)
755
(100.00 %)
1,981,480
(37.86 %)
652,950
(27.50 %)
3,680,829
(47.75 %)
2
(0.00 %)
1,877,326
(11.62 %)
96,414
(8.01 %)
44,593
(2.17 %)
402 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437365.1
n/a n/a 14,276
(1.78 %)
66,576
(6.32 %)
n/a 42.96
(99.99 %)
0
(0 %)
794
(0.01 %)
820
(100.00 %)
2,127,818
(38.86 %)
708,255
(30.28 %)
3,809,452
(49.66 %)
2
(0.00 %)
2,111,836
(12.18 %)
101,682
(8.04 %)
46,739
(2.13 %)
403 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2
47,024
(13.33 %)
n/a 13,806
(3.76 %)
52,367
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.08 %)
22,977
(6.92 %)
22,977
(6.92 %)
55,891
(93.08 %)
356,857
(3.66 %)
155,338
(3.36 %)
2,806,278
(24.56 %)
111
(0.08 %)
112,464
(5.32 %)
61,010
(7.71 %)
45,318
(4.17 %)
404 tongue sole
GCF_000523025.1
45,186
(16.40 %)
n/a 14,186
(3.98 %)
20,816
(8.22 %)
n/a 40.82
(94.88 %)
33,269
(5.14 %)
33,269
(5.14 %)
62,912
(94.86 %)
423,833
(4.34 %)
235,739
(3.33 %)
3,085,031
(24.78 %)
78
(0.05 %)
83,655
(2.37 %)
17,094
(1.42 %)
11,360
(0.88 %)
405 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3
n/a n/a 13,635
(4.82 %)
48,723
(11.83 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
0
(0 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,793
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
0
(0 %)
206,265
(4.46 %)
46,936
(9.72 %)
35,741
(5.19 %)
406 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2
53,479
(18.31 %)
n/a 14,527
(4.79 %)
28,597
(10.65 %)
55,587
(14.38 %)
45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
281,011
(10.36 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,756
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,975
(9.63 %)
37,920
(5.08 %)
407 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3
n/a n/a 14,527
(4.79 %)
51,181
(11.72 %)
n/a 45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
325,077
(14.03 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,754
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,975
(9.63 %)
37,920
(5.08 %)
408 trahira (v2 hap2 2024)
GCA_029633875.2
n/a n/a 15,041
(2.01 %)
42,180
(4.38 %)
n/a 41.03
(96.21 %)
143
(1.35 %)
792
(3.79 %)
594
(98.65 %)
1,069,159
(7.06 %)
653,554
(15.46 %)
4,921,631
(38.75 %)
7
(0.00 %)
1,141,429
(7.56 %)
26,440
(2.18 %)
11,688
(0.47 %)
409 trahira (v1 hap1 2024 refseq)
GCF_029633855.1
55,764
(7.71 %)
n/a 17,259
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
0
(0 %)
989
(5.49 %)
598
(100.00 %)
2,407,637
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,475
(37.52 %)
3
(0.00 %)
1,264,118
(7.29 %)
29,012
(2.12 %)
12,979
(0.45 %)
410 trahira (v2 hap1 2024 genbank)
GCA_029633855.2
n/a n/a 17,256
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
0
(0 %)
989
(5.49 %)
597
(100.00 %)
2,407,631
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,418
(37.52 %)
3
(0.00 %)
1,264,125
(7.29 %)
29,012
(2.12 %)
12,979
(0.45 %)
411 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1
n/a n/a 14,816
(3.44 %)
49,680
(8.16 %)
n/a 43.40
(99.97 %)
0
(0 %)
805
(0.03 %)
108
(100.00 %)
808,348
(19.20 %)
301,230
(7.15 %)
3,267,772
(25.91 %)
4
(0.00 %)
311,531
(3.41 %)
66,132
(6.90 %)
41,801
(3.31 %)
412 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1
57,285
(14.93 %)
n/a 14,887
(3.52 %)
49,403
(8.32 %)
87,351
(14.65 %)
43.54
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28
(100.00 %)
455,017
(0.00 %)
297,185
(5.03 %)
3,312,612
(24.33 %)
0
(0 %)
273,238
(2.64 %)
65,633
(7.08 %)
41,821
(3.38 %)
413 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1
40,373
(7.85 %)
n/a 14,339
(2.08 %)
84,906
(20.47 %)
57,218
(6.01 %)
42.51
(68.98 %)
63,014
(31.03 %)
85,562
(31.04 %)
68,911
(68.97 %)
392,114
(2.78 %)
307,607
(2.09 %)
4,777,941
(27.62 %)
528
(0.12 %)
221,213
(1.41 %)
61,105
(2.15 %)
17,725
(0.62 %)
414 turquoise killifish (GRZ-AD 2024)
GCF_043380555.1
56,976
(5.74 %)
n/a 14,604
(1.25 %)
72,207
(4.35 %)
n/a 44.51
(100.00 %)
0
(0 %)
369
(0.00 %)
304
(100.00 %)
2,858,575
(46.12 %)
660,603
(29.65 %)
4,283,242
(61.88 %)
7
(0.00 %)
2,835,016
(13.43 %)
118,966
(11.71 %)
17,862
(0.51 %)
415 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1
54,488
(6.75 %)
n/a 14,227
(1.27 %)
69,161
(4.33 %)
n/a 44.33
(93.22 %)
0
(0 %)
3,093
(6.78 %)
2,681
(100.00 %)
2,760,581
(47.64 %)
635,213
(25.56 %)
4,136,925
(56.55 %)
8
(0.00 %)
2,533,340
(11.75 %)
110,696
(10.50 %)
17,579
(0.49 %)
416 walking catfish (CIFAMagur01 2020)
GCA_013621035.1
n/a 23,712
(3.37 %)
15,895
(2.18 %)
46,934
(4.73 %)
n/a 39.83
(99.95 %)
0
(0 %)
605
(0.05 %)
3,484
(100.00 %)
1,061,538
(6.25 %)
611,618
(5.19 %)
5,978,835
(37.11 %)
3
(0.00 %)
510,982
(4.22 %)
54,666
(3.50 %)
24,478
(1.06 %)
417 walleye pollock (NIFS_2021 2022)
GCF_026213295.1
49,084
(12.15 %)
n/a 14,241
(2.71 %)
70,653
(9.29 %)
n/a 45.59
(99.96 %)
0
(0 %)
2,816
(0.04 %)
168
(100.00 %)
1,274,742
(38.63 %)
797,757
(14.11 %)
2,725,416
(34.38 %)
8
(0.00 %)
658,410
(7.33 %)
95,149
(8.09 %)
57,122
(4.03 %)
418 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1
n/a n/a 14,197
(3.33 %)
44,782
(7.70 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,294
(100.00 %)
396,279
(4.74 %)
275,154
(5.76 %)
2,933,132
(29.41 %)
0
(0 %)
277,720
(3.27 %)
35,104
(4.08 %)
21,634
(1.95 %)
419 warty frogfish (primary hap 2020)
GCA_013358685.1
n/a n/a 14,494
(3.34 %)
45,310
(7.77 %)
n/a 41.86
(99.87 %)
0
(0 %)
219
(0.13 %)
155
(100.00 %)
413,753
(4.95 %)
290,313
(6.11 %)
3,010,996
(29.71 %)
3
(0.00 %)
305,411
(3.51 %)
36,840
(4.18 %)
22,433
(1.95 %)
420 western mosquitofish
GCF_019740435.1
54,029
(12.31 %)
n/a 14,667
(2.80 %)
44,358
(6.62 %)
n/a 38.94
(97.42 %)
0
(0 %)
181
(2.58 %)
37
(100.00 %)
348,476
(2.56 %)
158,728
(2.21 %)
4,604,959
(26.85 %)
0
(0 %)
174,331
(2.27 %)
30,624
(1.94 %)
23,348
(1.33 %)
421 western speckled dace (OS25496 2023)
GCF_029890125.1
46,203
(5.36 %)
n/a 16,945
(2.57 %)
65,343
(6.35 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 930
(100.00 %)
2,528,154
(48.24 %)
549,447
(8.24 %)
5,157,802
(41.42 %)
0
(0 %)
921,640
(6.77 %)
84,874
(6.05 %)
24,156
(1.14 %)
422 White Sands pupfish
GCF_016077235.1
46,084
(6.27 %)
n/a 14,817
(1.71 %)
52,055
(4.88 %)
n/a 39.01
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,003
(100.00 %)
489,894
(2.67 %)
304,277
(3.91 %)
6,371,712
(38.05 %)
0
(0 %)
457,693
(3.60 %)
41,820
(1.75 %)
13,011
(0.56 %)
423 wolf-eel
GCF_004355925.1
43,625
(14.00 %)
n/a 14,930
(3.24 %)
31,372
(7.30 %)
n/a 42.10
(92.86 %)
23,085
(7.15 %)
23,891
(7.15 %)
33,400
(92.85 %)
379,343
(3.26 %)
244,853
(2.39 %)
3,432,622
(22.07 %)
476
(0.06 %)
108,255
(0.97 %)
30,581
(2.04 %)
19,275
(1.18 %)
424 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1
n/a n/a 14,753
(3.49 %)
49,516
(8.47 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
0
(0 %)
222
(0.00 %)
171
(100.00 %)
458,382
(5.18 %)
420,718
(8.01 %)
3,146,054
(25.71 %)
0
(0 %)
390,050
(4.18 %)
69,817
(7.20 %)
44,403
(3.53 %)
425 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1
n/a n/a 14,847
(3.48 %)
50,136
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
0
(0 %)
219
(0.00 %)
443
(100.00 %)
461,903
(5.20 %)
422,251
(8.03 %)
3,180,804
(25.81 %)
1
(0.00 %)
392,635
(4.18 %)
70,183
(7.15 %)
44,599
(3.52 %)
426 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 primary hap 2022)
GCF_023055335.1
42,410
(12.47 %)
n/a 14,845
(3.48 %)
50,132
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
219
(0.00 %)
219
(0.00 %)
661
(100.00 %)
461,895
(5.20 %)
422,249
(8.03 %)
3,180,722
(25.81 %)
1
(0.00 %)
392,632
(4.18 %)
70,181
(7.15 %)
44,597
(3.52 %)
427 worm pipefish (RoL_2023-P1 2023)
GCF_033978685.1
73,681
(3.43 %)
n/a 25,892
(1.02 %)
114,154
(3.30 %)
n/a 39.45
(100.00 %)
0
(0 %)
146
(0.00 %)
630
(100.00 %)
4,795,312
(24.37 %)
2,093,730
(16.74 %)
13,132,465
(67.32 %)
0
(0 %)
5,394,148
(11.91 %)
248,526
(4.59 %)
79,895
(1.28 %)
428 Wuchang bream
GCF_018812025.1
68,768
(8.86 %)
n/a 18,247
(2.62 %)
57,323
(5.24 %)
n/a 37.64
(99.83 %)
0
(0 %)
1,281
(0.17 %)
243
(100.00 %)
801,110
(0.00 %)
559,399
(5.04 %)
6,340,567
(43.09 %)
2
(0.00 %)
715,866
(5.11 %)
45,067
(2.52 %)
19,912
(0.78 %)
429 Yangtze koukloug (SWU-2019 2020)
GCF_012432095.1
63,925
(10.50 %)
n/a 17,502
(3.25 %)
52,519
(5.86 %)
n/a 37.23
(99.62 %)
0
(0 %)
617
(0.38 %)
353
(100.00 %)
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(50.34 %)
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(3.28 %)
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1
(0.00 %)
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(3.77 %)
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(2.00 %)
14,248
(0.64 %)
430 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1
64,819
(11.15 %)
n/a 15,680
(2.87 %)
41,108
(5.68 %)
n/a 39.49
(99.94 %)
0
(0 %)
817
(0.06 %)
517
(100.00 %)
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(9.42 %)
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(35.45 %)
2
(0.00 %)
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(7.02 %)
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(1.72 %)
12,238
(0.75 %)
431 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1
54,374
(10.66 %)
n/a 15,584
(2.85 %)
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n/a 39.55
(99.11 %)
0
(0 %)
1,760
(0.89 %)
663
(100.00 %)
883,218
(10.65 %)
797,020
(11.09 %)
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(35.46 %)
4
(0.00 %)
749,315
(6.20 %)
24,238
(1.72 %)
12,253
(0.76 %)
432 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1
47,108
(7.77 %)
n/a 15,458
(2.26 %)
28,572
(5.62 %)
n/a 40.84
(99.95 %)
0
(0 %)
831
(0.05 %)
268
(100.00 %)
620,402
(4.92 %)
540,302
(7.26 %)
4,770,842
(35.92 %)
0
(0 %)
688,524
(4.84 %)
35,251
(1.63 %)
13,218
(0.63 %)
433 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1
n/a n/a 814
(1.87 %)
3,814
(6.84 %)
n/a 42.36
(99.98 %)
0
(0 %)
80
(0.02 %)
349
(100.00 %)
38,000
(5.03 %)
29,516
(7.35 %)
232,988
(20.37 %)
0
(0 %)
46,752
(6.67 %)
2,289
(2.07 %)
1,621
(1.32 %)
434 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
n/a 15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
84,160
(11.62 %)
42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
0
(0 %)
188,182
(2.04 %)
31,005
(1.79 %)
19,757
(1.03 %)
435 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1
n/a n/a 15,959
(2.63 %)
43,025
(5.73 %)
n/a 39.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 640
(100.00 %)
1,427,221
(28.44 %)
257,108
(3.15 %)
5,197,531
(26.91 %)
0
(0 %)
350,223
(3.66 %)
13,909
(0.83 %)
10,650
(0.55 %)
436 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
n/a 15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
1
(0.00 %)
375,976
(3.80 %)
14,420
(0.88 %)
9,087
(0.42 %)
437 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2
40,935
(9.94 %)
n/a 15,673
(2.75 %)
53,235
(6.33 %)
n/a 40.72
(97.79 %)
0
(0 %)
33,661
(2.21 %)
98,345
(100.00 %)
1,337,427
(24.48 %)
522,121
(4.83 %)
4,649,096
(25.00 %)
308
(0.03 %)
357,663
(3.10 %)
16,819
(0.86 %)
11,638
(0.57 %)
438 zebra mbuna
GCF_000238955.4
51,012
(8.37 %)
n/a 15,901
(2.10 %)
32,136
(6.12 %)
n/a 41.16
(99.99 %)
0
(0 %)
641
(0.01 %)
1,690
(100.00 %)
565,771
(6.22 %)
253,037
(2.53 %)
4,679,743
(31.57 %)
0
(0 %)
324,855
(3.54 %)
36,689
(2.00 %)
18,156
(0.99 %)
439 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1
n/a n/a 6,365
(2.41 %)
16,467
(3.26 %)
n/a 36.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,719
(100.00 %)
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(59.43 %)
323,062
(10.58 %)
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(45.46 %)
0
(0 %)
366,878
(5.24 %)
14,563
(1.98 %)
3,786
(0.32 %)
440 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1
n/a n/a 17,774
(2.54 %)
44,221
(3.24 %)
n/a 36.52
(99.87 %)
20,876
(0.14 %)
20,876
(0.14 %)
20,901
(99.86 %)
4,138,008
(61.22 %)
894,145
(6.79 %)
9,494,379
(47.68 %)
393
(0.01 %)
781,563
(4.38 %)
42,482
(2.03 %)
8,815
(0.26 %)
441 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1
n/a n/a 17,535
(2.50 %)
44,169
(3.34 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
0
(0 %)
712
(0.01 %)
1,252
(100.00 %)
3,891,854
(61.07 %)
927,173
(7.78 %)
8,621,517
(50.27 %)
1
(0.00 %)
941,178
(4.90 %)
44,554
(2.12 %)
10,153
(0.30 %)
442 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2
n/a n/a 17,692
(2.51 %)
43,578
(3.27 %)
n/a 36.56
(99.99 %)
0
(0 %)
1,352
(0.01 %)
755
(100.00 %)
3,937,397
(60.86 %)
936,258
(7.76 %)
8,732,369
(50.44 %)
0
(0 %)
933,928
(4.81 %)
44,812
(2.09 %)
10,558
(0.30 %)
443 zebrafish (WGS:CALUEM01 primary hap 2022)
GCA_944039275.1
n/a n/a 18,065
(2.46 %)
44,526
(3.30 %)
n/a 37.08
(99.99 %)
0
(0 %)
381
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,804,769
(44.04 %)
954,645
(10.72 %)
8,694,743
(51.88 %)
4
(0.00 %)
1,207,649
(5.79 %)
44,936
(2.02 %)
11,380
(0.33 %)
444 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6
65,219
(5.63 %)
n/a 22,246
(2.54 %)
51,134
(7.13 %)
n/a 36.60
(99.72 %)
17,105
(0.27 %)
20,258
(0.28 %)
34,617
(99.73 %)
4,595,932
(57.92 %)
1,077,677
(6.47 %)
10,772,232
(49.45 %)
127
(0.00 %)
942,199
(4.23 %)
53,471
(2.06 %)
12,486
(0.29 %)
445 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1
n/a n/a 1,204
(2.88 %)
4,065
(7.13 %)
n/a 41.24
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 1,437
(100.00 %)
26,319
(3.19 %)
14,209
(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
0
(0 %)
22,258
(4.87 %)
1,253
(1.49 %)
988
(1.13 %)
446 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2
44,988
(12.00 %)
n/a 15,037
(3.35 %)
40,235
(7.28 %)
60,496
(9.39 %)
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(97.76 %)
0
(0 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
348,230
(2.87 %)
157,728
(2.01 %)
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(23.44 %)
0
(0 %)
175,881
(3.08 %)
12,807
(1.08 %)
8,703
(0.67 %)
447 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3
n/a n/a 15,036
(3.35 %)
40,234
(7.28 %)
n/a 40.66
(97.76 %)
0
(0 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
671,614
(20.98 %)
157,728
(2.01 %)
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(23.44 %)
0
(0 %)
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TOTALS:total assembly count 447

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Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 221 assemblies assembly stats track stats
Mammals 641 assemblies assembly stats track stats
Birds 414 assemblies assembly stats track stats
Fishes 447 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 291 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1128 assemblies assembly stats track stats
Plants 309 assemblies assembly stats track stats
Fungi 920 assemblies assembly stats track stats
Viruses 291 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 112 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 541 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1067 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 778 assemblies assembly stats track stats