Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024)
GCA_043250625.1
n/a n/a 15,735
(2.44 %)
50,184
(6.16 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
0
(0 %)
471
(0.01 %)
203
(100.00 %)
1,781,283
(37.65 %)
444,047
(7.93 %)
4,765,080
(37.01 %)
6
(0.00 %)
706,869
(5.97 %)
39,918
(2.01 %)
18,319
(0.92 %)
2 alligator pipefish (LvHL_M 2021)
GCF_019802595.1
54,226
(11.15 %)
n/a 13,427
(2.67 %)
46,903
(5.94 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
144
(0.00 %)
143
(100.00 %)
1,200,994
(30.62 %)
143,062
(2.20 %)
3,921,676
(38.03 %)
0
(0 %)
164,363
(2.07 %)
67,978
(8.92 %)
47,265
(3.34 %)
3 allis shad
GCF_017589495.1
48,507
(8.47 %)
n/a 15,371
(2.28 %)
58,686
(5.84 %)
n/a 42.99
(99.91 %)
0
(0 %)
1,541
(0.09 %)
1,095
(100.00 %)
1,190,406
(9.30 %)
1,205,679
(11.28 %)
3,960,328
(38.81 %)
0
(0 %)
936,797
(6.49 %)
36,494
(1.83 %)
23,714
(1.20 %)
4 Amazon molly
GCF_000485575.1
56,958
(11.69 %)
n/a 15,117
(2.64 %)
30,114
(6.60 %)
n/a 39.16
(95.38 %)
27,073
(4.64 %)
36,429
(4.64 %)
31,058
(95.36 %)
346,461
(2.03 %)
188,557
(1.44 %)
5,139,633
(26.01 %)
848
(0.07 %)
161,806
(7.35 %)
35,229
(1.82 %)
27,404
(1.38 %)
5 amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021)
GCF_021018895.1
47,198
(13.10 %)
n/a 15,500
(3.14 %)
41,230
(6.67 %)
n/a 40.79
(99.99 %)
0
(0 %)
150
(0.01 %)
31
(100.00 %)
1,230,524
(26.57 %)
398,694
(5.41 %)
4,106,609
(25.60 %)
0
(0 %)
335,552
(3.38 %)
15,656
(0.99 %)
12,171
(0.69 %)
6 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1
n/a n/a 15,901
(2.25 %)
61,133
(6.37 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,411
(100.00 %)
2,043,181
(23.64 %)
1,141,539
(11.35 %)
3,668,314
(38.60 %)
0
(0 %)
805,945
(6.00 %)
40,218
(2.14 %)
24,243
(1.22 %)
7 American shad (primary hap 2021)
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
n/a 16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
76,974
(8.55 %)
43.18
(99.45 %)
0
(0 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
14
(0.00 %)
934,014
(6.61 %)
42,699
(2.23 %)
25,608
(1.23 %)
8 Andian cavefish (hap1 2023 genbank)
GCA_030014385.1
n/a n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,920
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
9 Andian cavefish (hap1 2023 refseq)
GCF_030014385.1
42,881
(5.97 %)
n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
0
(0 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
0
(0 %)
1,328,939
(9.28 %)
48,344
(2.62 %)
28,666
(1.27 %)
10 annual killifish
GCF_001266775.1
38,517
(8.87 %)
n/a 14,027
(2.45 %)
27,798
(5.86 %)
n/a 39.29
(80.23 %)
138,584
(19.83 %)
1,025,519
(19.94 %)
168,368
(80.17 %)
349,927
(2.63 %)
296,826
(3.18 %)
5,039,517
(28.69 %)
2,323
(0.21 %)
261,101
(1.92 %)
26,364
(1.18 %)
17,566
(0.78 %)
11 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1
n/a n/a 16,678
(0.56 %)
151,361
(4.03 %)
n/a 44.57
(99.91 %)
0
(0 %)
15,113
(0.09 %)
5,983
(100.00 %)
12,251,532
(51.73 %)
3,521,157
(17.69 %)
10,051,020
(68.37 %)
71
(0.00 %)
5,101,423
(13.15 %)
494,595
(10.52 %)
74,823
(1.04 %)
12 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1
n/a n/a 17,318
(1.49 %)
80,097
(5.79 %)
n/a 43.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11,436
(100.00 %)
5,482,467
(36.71 %)
1,454,729
(18.84 %)
6,756,226
(47.56 %)
0
(0 %)
1,722,514
(9.86 %)
92,057
(3.50 %)
34,309
(1.32 %)
13 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1
n/a n/a 17,342
(1.44 %)
78,914
(5.48 %)
n/a 43.57
(99.96 %)
0
(0 %)
3,179
(0.04 %)
1,901
(100.00 %)
5,980,457
(37.18 %)
1,633,782
(21.76 %)
6,279,725
(52.83 %)
12
(0.00 %)
2,013,978
(10.83 %)
104,688
(3.57 %)
33,790
(1.15 %)
14 Antarctic spiny plunderfish (primary hap 2020)
GCA_902827135.1
n/a n/a 14,859
(1.97 %)
60,431
(5.73 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
0
(0 %)
1,039
(0.01 %)
1,541
(100.00 %)
461,253
(3.08 %)
434,124
(6.81 %)
3,499,945
(42.99 %)
6
(0.00 %)
656,220
(6.54 %)
60,941
(3.20 %)
13,823
(0.61 %)
15 Arctic char (2024)
GCF_045679555.1
101,825
(6.80 %)
n/a 26,394
(1.53 %)
107,089
(4.26 %)
n/a 43.53
(99.98 %)
0
(0 %)
3,854
(0.02 %)
939
(100.00 %)
1,090,104
(4.07 %)
1,787,017
(23.51 %)
9,220,961
(56.45 %)
77
(0.00 %)
3,631,994
(9.77 %)
78,798
(2.30 %)
19,082
(0.35 %)
16 Arctic char (CBP00131 primary hap 2024)
GCA_036784965.1
n/a n/a 22,376
(1.44 %)
97,559
(4.71 %)
n/a 43.37
(99.97 %)
3,235
(0.03 %)
3,235
(0.03 %)
4,404
(99.97 %)
999,920
(4.22 %)
1,630,911
(26.08 %)
7,875,105
(58.08 %)
17
(0.00 %)
1,400,966
(4.23 %)
70,947
(2.59 %)
16,782
(0.35 %)
17 Arctic char (IW2-2015 2018)
GCF_002910315.2
67,196
(4.99 %)
n/a 23,967
(1.55 %)
45,775
(3.69 %)
n/a 43.16
(93.25 %)
1,447
(0.01 %)
1,718,015
(6.84 %)
16,700
(99.99 %)
1,011,348
(4.06 %)
1,666,148
(10.50 %)
10,597,529
(44.77 %)
5,986
(0.15 %)
2,192,365
(6.51 %)
76,282
(1.94 %)
25,064
(0.53 %)
18 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1
n/a n/a 14,032
(2.44 %)
39,770
(4.92 %)
n/a 38.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,617
(100.00 %)
1,808,149
(37.98 %)
583,449
(10.56 %)
4,203,368
(40.67 %)
0
(0 %)
559,424
(5.24 %)
24,867
(2.06 %)
14,134
(0.93 %)
19 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1
n/a n/a 15,455
(2.53 %)
40,077
(4.90 %)
86,346
(8.45 %)
38.90
(99.98 %)
0
(0 %)
795
(0.02 %)
241
(100.00 %)
2,045,691
(38.70 %)
669,975
(11.72 %)
4,638,765
(42.07 %)
1
(0.00 %)
693,282
(5.96 %)
28,277
(1.93 %)
15,766
(0.94 %)
20 Arkansas darter
GCF_013103735.1
51,282
(9.79 %)
n/a 14,588
(2.90 %)
42,306
(6.27 %)
n/a 40.52
(99.50 %)
0
(0 %)
35,052
(0.52 %)
4,664
(100.00 %)
418,294
(3.29 %)
331,380
(3.74 %)
4,153,309
(26.60 %)
762
(0.03 %)
207,110
(1.75 %)
15,489
(0.95 %)
10,148
(0.62 %)
21 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1
n/a n/a 17,862
(2.29 %)
70,667
(5.50 %)
n/a 40.01
(100.00 %)
0
(0 %)
327
(0.00 %)
179
(100.00 %)
2,876,989
(50.39 %)
700,511
(9.88 %)
5,977,913
(44.08 %)
2
(0.00 %)
1,066,043
(6.53 %)
104,320
(8.02 %)
23,254
(0.86 %)
22 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1
n/a n/a 18,025
(2.28 %)
71,255
(5.50 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
0
(0 %)
318
(0.00 %)
341
(100.00 %)
2,884,301
(50.42 %)
702,464
(9.98 %)
5,989,299
(44.18 %)
2
(0.00 %)
1,090,542
(6.63 %)
105,945
(8.03 %)
23,683
(0.88 %)
23 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1
50,315
(9.13 %)
n/a 16,526
(2.73 %)
38,780
(6.64 %)
72,662
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
0
(0 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
504,673
(3.06 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
0
(0 %)
157,330
(1.72 %)
88,517
(10.73 %)
67,281
(4.98 %)
24 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2
n/a n/a 16,053
(2.73 %)
74,777
(7.26 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,351
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
0
(0 %)
142,849
(1.57 %)
85,546
(10.82 %)
65,542
(5.07 %)
25 Asian redtail catfish (EC202008001 2021)
GCF_019097595.1
51,017
(10.40 %)
n/a 15,549
(2.60 %)
42,858
(5.39 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
0
(0 %)
107
(0.00 %)
73
(100.00 %)
1,718,992
(31.80 %)
749,009
(14.09 %)
4,206,758
(37.30 %)
0
(0 %)
1,161,068
(7.86 %)
19,230
(1.16 %)
12,900
(0.65 %)
26 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924715.1
n/a n/a 15,722
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
0
(0 %)
468
(0.01 %)
120
(100.00 %)
1,608,686
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,115
(27.80 %)
3
(0.00 %)
390,196
(3.88 %)
14,488
(0.90 %)
9,706
(0.46 %)
27 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924715.1
54,426
(12.09 %)
n/a 15,720
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
0
(0 %)
468
(0.01 %)
119
(100.00 %)
1,608,682
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,078
(27.80 %)
3
(0.00 %)
390,196
(3.88 %)
14,488
(0.90 %)
9,706
(0.46 %)
28 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1
51,642
(11.92 %)
n/a 14,055
(2.62 %)
36,761
(8.42 %)
68,438
(9.50 %)
45.64
(96.48 %)
0
(0 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
790,946
(10.54 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
4
(0.00 %)
741,285
(7.34 %)
97,133
(7.82 %)
51,623
(3.50 %)
29 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1
n/a n/a 13,366
(2.68 %)
66,599
(9.29 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,727
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
0
(0 %)
635,348
(7.05 %)
87,167
(8.03 %)
47,003
(3.66 %)
30 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
n/a 14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
69,662
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
0
(0 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
0
(0 %)
240,110
(3.16 %)
31,325
(2.25 %)
20,749
(1.34 %)
31 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1
n/a n/a 16,554
(3.01 %)
54,832
(7.45 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,008
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
0
(0 %)
297,396
(3.46 %)
36,868
(2.33 %)
24,401
(1.38 %)
32 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2
50,946
(10.35 %)
n/a 16,394
(2.60 %)
61,637
(7.20 %)
n/a 44.16
(99.89 %)
1,963
(0.11 %)
1,990
(0.11 %)
3,687
(99.89 %)
1,269,688
(11.71 %)
1,318,661
(13.43 %)
3,732,801
(32.49 %)
2
(0.00 %)
1,134,686
(8.55 %)
35,959
(1.97 %)
21,835
(1.09 %)
33 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2
n/a n/a 15,331
(2.42 %)
52,370
(6.91 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
0
(0 %)
74
(0.00 %)
1,049
(100.00 %)
1,454,631
(18.29 %)
383,946
(4.34 %)
4,363,016
(32.69 %)
0
(0 %)
445,382
(4.43 %)
56,416
(3.08 %)
20,355
(1.02 %)
34 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2
n/a n/a 15,262
(2.42 %)
51,857
(6.86 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
0
(0 %)
222
(0.00 %)
153
(100.00 %)
1,454,219
(18.25 %)
384,609
(4.72 %)
4,338,083
(32.80 %)
5
(0.00 %)
449,712
(4.53 %)
56,553
(3.08 %)
20,550
(1.04 %)
35 Atlantic mackerel (primary hap 2023 genbank)
GCA_963691925.1
n/a n/a 15,291
(2.56 %)
43,206
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
666
(100.00 %)
1,496,244
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,761
(29.92 %)
9
(0.00 %)
555,075
(5.00 %)
13,309
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
36 Atlantic mackerel (primary hap 2023 refseq)
GCF_963691925.1
34,357
(8.10 %)
n/a 15,289
(2.56 %)
43,205
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
0
(0 %)
1,489
(0.04 %)
665
(100.00 %)
1,496,240
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,726
(29.93 %)
9
(0.00 %)
555,074
(5.00 %)
13,308
(0.75 %)
8,372
(0.43 %)
37 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1
112,906
(5.61 %)
n/a 28,077
(1.40 %)
115,207
(3.75 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
1,300,611
(4.84 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
0
(0 %)
3,295,334
(6.78 %)
77,089
(1.86 %)
20,127
(0.31 %)
38 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1
109,794
(5.45 %)
n/a 26,968
(1.35 %)
202,772
(19.11 %)
n/a 43.10
(88.27 %)
9,418
(0.03 %)
138,207
(11.73 %)
241,570
(99.97 %)
1,628,119
(9.46 %)
2,496,917
(19.18 %)
10,390,780
(51.80 %)
602
(0.04 %)
n/a 79,791
(1.60 %)
18,955
(0.25 %)
39 Atlantic silverside (fMenMen1 2025)
GCA_048544195.1
n/a n/a 14,127
(3.23 %)
45,606
(7.98 %)
n/a 42.03
(99.99 %)
0
(0 %)
804
(0.01 %)
567
(100.00 %)
333,253
(4.04 %)
384,132
(9.16 %)
2,977,533
(27.98 %)
11
(0.00 %)
553,953
(6.58 %)
40,432
(4.35 %)
26,981
(2.14 %)
40 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1
60,214
(14.44 %)
n/a 14,860
(3.40 %)
50,921
(8.07 %)
76,242
(9.93 %)
43.38
(100.00 %)
0
(0 %)
51
(0.00 %)
127
(100.00 %)
449,865
(5.00 %)
299,255
(7.03 %)
3,274,219
(25.77 %)
0
(0 %)
378,660
(3.73 %)
67,338
(7.00 %)
43,189
(3.43 %)
41 Australian ruff (RE-2024a hap1 2024)
GCA_042242115.1
n/a n/a 15,457
(2.72 %)
38,472
(5.59 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
0
(0 %)
91
(0.00 %)
625
(100.00 %)
476,492
(3.25 %)
242,097
(6.02 %)
4,286,693
(33.41 %)
1
(0.00 %)
310,636
(3.76 %)
9,322
(0.80 %)
6,756
(0.33 %)
42 Australian ruff (RE-2024a hap2 2024)
GCA_042242135.1
n/a n/a 15,534
(2.50 %)
39,464
(5.26 %)
n/a 39.77
(100.00 %)
0
(0 %)
98
(0.00 %)
552
(100.00 %)
498,493
(3.22 %)
271,314
(7.61 %)
4,161,752
(38.16 %)
2
(0.00 %)
436,316
(4.99 %)
9,637
(0.93 %)
6,725
(0.31 %)
43 ballan wrasse (2016)
GCF_900080235.1
42,362
(9.30 %)
n/a 16,129
(2.44 %)
33,854
(5.87 %)
n/a 40.89
(99.98 %)
0
(0 %)
257
(0.02 %)
13,466
(100.00 %)
503,078
(3.93 %)
321,407
(5.60 %)
4,329,412
(30.36 %)
5
(0.00 %)
563,079
(4.68 %)
21,221
(1.07 %)
11,680
(0.58 %)
44 ballan wrasse (primary hap 2024 genbank)
GCA_963930695.1
n/a n/a 15,142
(2.66 %)
43,601
(6.21 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
1
(0.00 %)
815
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,221,802
(30.10 %)
290,738
(7.79 %)
4,164,845
(30.34 %)
4
(0.00 %)
525,923
(5.43 %)
17,126
(0.94 %)
10,131
(0.54 %)
45 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1
48,592
(12.09 %)
n/a 15,140
(2.66 %)
43,304
(6.14 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
815
(0.02 %)
815
(0.02 %)
946
(99.98 %)
1,221,797
(30.10 %)
290,736
(7.79 %)
4,164,799
(30.34 %)
4
(0.00 %)
525,920
(5.43 %)
17,126
(0.94 %)
10,131
(0.54 %)
46 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1
n/a n/a 15,211
(3.23 %)
41,620
(7.14 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
2,393
(100.00 %)
785,178
(17.57 %)
249,148
(8.36 %)
3,391,653
(26.49 %)
0
(0 %)
274,110
(3.20 %)
13,787
(0.93 %)
9,087
(0.56 %)
47 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
n/a 15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
0
(0 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
1
(0.00 %)
297,814
(3.49 %)
15,089
(0.96 %)
9,304
(0.55 %)
48 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1
n/a n/a 15,122
(1.44 %)
65,809
(4.50 %)
n/a 41.23
(99.74 %)
0
(0 %)
293
(0.26 %)
331
(100.00 %)
2,545,429
(50.53 %)
451,939
(5.50 %)
5,807,705
(42.18 %)
0
(0 %)
863,582
(6.37 %)
94,695
(3.92 %)
37,528
(1.27 %)
49 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1
n/a n/a 15,024
(1.45 %)
65,141
(4.53 %)
n/a 41.23
(99.52 %)
0
(0 %)
373
(0.48 %)
196
(100.00 %)
2,509,508
(50.53 %)
441,892
(5.11 %)
6,245,443
(38.22 %)
2
(0.00 %)
822,138
(6.12 %)
93,198
(3.82 %)
36,988
(1.26 %)
50 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1
n/a n/a 26,794
(3.15 %)
76,434
(5.64 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
8,035
(100.00 %)
4,084,361
(52.18 %)
538,411
(4.25 %)
7,659,980
(38.94 %)
0
(0 %)
450,884
(2.88 %)
58,008
(2.90 %)
19,160
(0.57 %)
51 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1
n/a n/a 31,876
(3.30 %)
85,063
(5.65 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
0
(0 %)
108
(0.00 %)
92
(100.00 %)
4,839,533
(52.47 %)
646,636
(4.57 %)
8,240,279
(42.13 %)
2
(0.00 %)
569,819
(3.17 %)
71,384
(3.04 %)
22,137
(0.56 %)
52 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2
53,646
(13.68 %)
n/a 16,073
(3.06 %)
44,214
(6.63 %)
n/a 40.76
(98.88 %)
0
(0 %)
674
(1.12 %)
2,997
(100.00 %)
986,469
(19.78 %)
237,272
(4.32 %)
3,983,840
(23.58 %)
0
(0 %)
251,048
(3.40 %)
16,237
(1.03 %)
9,089
(0.52 %)
53 beardfish (hap1 2025)
GCA_047511565.1
n/a n/a 15,938
(3.00 %)
52,921
(7.52 %)
n/a 43.38
(99.98 %)
0
(0 %)
752
(0.02 %)
327
(100.00 %)
993,554
(11.81 %)
755,389
(11.75 %)
3,469,352
(30.25 %)
8
(0.00 %)
770,561
(6.90 %)
68,008
(5.51 %)
40,885
(2.43 %)
54 beardfish (hap2 2025)
GCA_047511595.1
n/a n/a 15,940
(3.02 %)
51,682
(7.42 %)
n/a 43.31
(99.98 %)
1
(0.00 %)
756
(0.02 %)
200
(100.00 %)
986,717
(11.69 %)
754,642
(11.91 %)
3,459,958
(30.32 %)
9
(0.00 %)
762,386
(6.77 %)
67,732
(5.27 %)
40,872
(2.45 %)
55 Bermuda beardfish (OG660 hap1 2025)
GCA_048537225.1
n/a n/a 15,950
(2.82 %)
53,175
(7.04 %)
n/a 42.97
(99.99 %)
0
(0 %)
481
(0.01 %)
846
(100.00 %)
1,017,817
(12.34 %)
764,426
(15.65 %)
3,524,564
(32.87 %)
4
(0.00 %)
953,480
(7.90 %)
60,800
(4.43 %)
35,606
(1.84 %)
56 Bermuda beardfish (OG660 hap2 2025)
GCA_048537235.1
n/a n/a 15,811
(2.85 %)
52,254
(7.09 %)
n/a 43.06
(99.99 %)
0
(0 %)
508
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,002,378
(12.22 %)
753,750
(14.96 %)
3,479,721
(32.11 %)
4
(0.00 %)
919,899
(7.67 %)
60,513
(4.18 %)
35,349
(1.87 %)
57 bicolor damselfish
GCF_000690725.1
32,951
(8.67 %)
n/a 15,181
(2.55 %)
31,420
(5.94 %)
n/a 41.66
(93.68 %)
36,242
(6.34 %)
44,409
(6.34 %)
42,059
(93.66 %)
351,453
(2.61 %)
180,113
(1.20 %)
5,016,154
(23.41 %)
554
(0.03 %)
96,483
(1.91 %)
46,423
(2.30 %)
31,358
(1.43 %)
58 bight redfish (hap1 2025)
GCA_048128805.1
n/a n/a 16,025
(2.63 %)
53,351
(6.76 %)
n/a 42.47
(99.98 %)
43
(0.00 %)
699
(0.02 %)
322
(100.00 %)
995,401
(9.22 %)
626,617
(9.80 %)
4,302,378
(31.80 %)
10
(0.00 %)
535,484
(4.68 %)
38,231
(2.50 %)
23,342
(1.21 %)
59 bight redfish (hap2 2025)
GCA_048129085.1
n/a n/a 15,902
(2.63 %)
52,639
(6.71 %)
n/a 42.44
(99.98 %)
0
(0 %)
680
(0.02 %)
204
(100.00 %)
989,039
(9.11 %)
628,091
(9.80 %)
4,315,800
(31.97 %)
6
(0.00 %)
536,070
(4.56 %)
37,729
(2.33 %)
23,055
(1.18 %)
60 black goby (alternate hap 2023)
GCA_951799965.1
n/a n/a 14,534
(2.11 %)
56,906
(6.41 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,523
(100.00 %)
2,445,373
(45.07 %)
452,878
(9.46 %)
4,195,077
(39.49 %)
0
(0 %)
841,978
(6.49 %)
77,592
(4.86 %)
50,068
(2.69 %)
61 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1
n/a n/a 14,455
(2.06 %)
56,488
(6.31 %)
n/a 42.10
(99.99 %)
0
(0 %)
636
(0.01 %)
298
(100.00 %)
3,230,397
(55.09 %)
494,440
(10.43 %)
4,359,169
(40.46 %)
2
(0.00 %)
950,976
(6.99 %)
81,684
(4.81 %)
45,797
(2.02 %)
62 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1
n/a n/a 31,847
(2.01 %)
153,565
(6.53 %)
n/a 41.78
(99.99 %)
639
(0.00 %)
639
(0.00 %)
63,422
(100.00 %)
2,786,840
(18.28 %)
1,016,389
(7.50 %)
8,844,631
(26.90 %)
18
(0.00 %)
1,160,777
(4.13 %)
130,556
(4.42 %)
82,861
(2.07 %)
63 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 refseq)
GCF_022577435.1
42,351
(12.09 %)
n/a 14,988
(3.02 %)
47,106
(6.98 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
234
(0.00 %)
234
(0.00 %)
463
(100.00 %)
1,017,142
(18.99 %)
360,899
(8.75 %)
3,761,447
(28.91 %)
0
(0 %)
469,043
(4.64 %)
48,360
(4.43 %)
30,659
(2.06 %)
64 black rockcod
GCF_000735185.1
35,176
(8.54 %)
n/a 12,601
(2.15 %)
42,589
(6.13 %)
n/a 40.62
(97.93 %)
33,914
(2.08 %)
59,164
(2.09 %)
72,571
(97.92 %)
268,591
(2.71 %)
238,334
(3.18 %)
3,425,479
(29.48 %)
174
(0.01 %)
164,483
(1.70 %)
31,009
(2.11 %)
14,188
(1.03 %)
65 black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023)
GCF_030273125.1
43,392
(8.45 %)
n/a 15,522
(2.13 %)
48,255
(5.50 %)
n/a 38.69
(100.00 %)
0
(0 %)
341
(0.00 %)
92
(100.00 %)
1,651,919
(22.26 %)
782,601
(7.55 %)
5,398,047
(38.87 %)
2
(0.00 %)
810,395
(6.16 %)
24,508
(1.19 %)
12,928
(0.57 %)
66 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1
n/a n/a 15,274
(2.92 %)
51,453
(7.45 %)
n/a 43.07
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,239,364
(29.69 %)
354,703
(9.63 %)
3,006,556
(30.35 %)
2
(0.00 %)
588,441
(7.05 %)
53,503
(4.48 %)
28,830
(1.72 %)
67 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1
n/a n/a 15,043
(2.96 %)
50,860
(7.54 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
0
(0 %)
366
(0.01 %)
109
(100.00 %)
1,210,142
(29.44 %)
340,820
(9.19 %)
2,986,750
(29.89 %)
0
(0 %)
547,550
(6.92 %)
52,010
(4.20 %)
28,373
(1.72 %)
68 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1
44,847
(11.30 %)
n/a 15,364
(2.86 %)
51,122
(6.88 %)
n/a 39.48
(99.99 %)
0
(0 %)
89
(0.01 %)
415
(100.00 %)
1,160,519
(28.33 %)
183,082
(4.75 %)
4,354,804
(27.83 %)
4
(0.00 %)
435,884
(4.37 %)
40,207
(2.97 %)
32,779
(2.13 %)
69 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1
n/a n/a 17,403
(2.99 %)
45,903
(5.38 %)
n/a 38.64
(99.99 %)
0
(0 %)
709
(0.01 %)
673
(100.00 %)
2,141,901
(35.77 %)
482,931
(17.18 %)
4,297,133
(46.82 %)
4
(0.00 %)
991,826
(7.99 %)
41,889
(2.32 %)
19,281
(0.97 %)
70 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1
n/a n/a 17,486
(2.97 %)
46,833
(5.41 %)
n/a 38.79
(99.99 %)
0
(0 %)
720
(0.01 %)
413
(100.00 %)
2,165,269
(36.18 %)
490,692
(17.84 %)
4,251,333
(47.54 %)
10
(0.00 %)
1,058,863
(8.47 %)
42,744
(2.37 %)
19,312
(0.98 %)
71 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1
48,916
(10.27 %)
n/a 15,574
(2.62 %)
44,035
(5.21 %)
n/a 39.80
(98.04 %)
0
(0 %)
171
(1.96 %)
43
(100.00 %)
2,180,806
(45.14 %)
625,260
(6.63 %)
5,137,199
(35.52 %)
1
(0.00 %)
571,071
(4.17 %)
31,164
(1.89 %)
20,363
(1.02 %)
72 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1
36,881
(7.40 %)
n/a 15,408
(2.38 %)
27,235
(5.59 %)
n/a 40.42
(89.87 %)
0
(0 %)
53,539
(10.15 %)
12,952
(100.00 %)
867,639
(16.39 %)
195,137
(1.62 %)
5,293,484
(23.10 %)
124
(0.05 %)
97,164
(2.26 %)
21,238
(1.02 %)
14,191
(0.64 %)
73 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1
57,860
(9.04 %)
n/a 15,494
(1.98 %)
57,878
(5.63 %)
56,939
(8.11 %)
40.66
(99.97 %)
0
(0 %)
723
(0.03 %)
304
(100.00 %)
1,055,724
(20.14 %)
324,841
(3.27 %)
5,000,753
(32.08 %)
4
(0.00 %)
594,081
(5.09 %)
32,357
(1.59 %)
17,357
(0.80 %)
74 blue whiting (primary hap 2024)
GCA_964030765.1
n/a n/a 13,097
(2.93 %)
55,097
(8.76 %)
n/a 45.82
(99.88 %)
0
(0 %)
3,055
(0.12 %)
3,832
(100.00 %)
1,337,604
(32.27 %)
749,185
(17.27 %)
2,363,606
(35.06 %)
7
(0.00 %)
596,931
(7.20 %)
78,815
(8.25 %)
42,300
(3.48 %)
75 bluestreak cleaner wrasse (JK-2023 2023)
GCA_030710495.1
n/a n/a 14,996
(2.68 %)
44,244
(6.44 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
2
(0.00 %)
211
(0.00 %)
59
(100.00 %)
1,619,681
(30.07 %)
337,749
(4.31 %)
4,541,709
(29.20 %)
4
(0.00 %)
273,269
(2.99 %)
14,576
(0.85 %)
10,610
(0.55 %)
76 bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023)
GCF_030265055.1
63,345
(14.83 %)
n/a 14,387
(3.54 %)
43,563
(7.96 %)
n/a 41.68
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
57
(100.00 %)
842,739
(18.67 %)
356,558
(12.86 %)
2,720,911
(41.08 %)
0
(0 %)
847,608
(10.65 %)
40,187
(4.66 %)
29,700
(2.69 %)
77 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1
n/a n/a 12,494
(1.93 %)
44,967
(5.14 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,174
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
0
(0 %)
344,768
(3.42 %)
23,532
(1.46 %)
12,368
(0.66 %)
78 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2
n/a n/a 14,499
(1.97 %)
51,213
(5.47 %)
n/a 38.27
(98.47 %)
0
(0 %)
1,160
(1.53 %)
442
(100.00 %)
731,731
(4.21 %)
471,623
(4.92 %)
5,974,055
(42.88 %)
0
(0 %)
455,138
(4.01 %)
29,052
(1.48 %)
14,673
(0.63 %)
79 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1
n/a n/a 13,882
(2.27 %)
45,919
(5.98 %)
n/a 39.50
(99.99 %)
0
(0 %)
45
(0.01 %)
3,194
(100.00 %)
803,073
(13.60 %)
258,404
(4.19 %)
4,674,614
(28.36 %)
0
(0 %)
339,851
(3.09 %)
15,524
(1.02 %)
9,057
(0.56 %)
80 Boeseman's rainbowfish (primary hap 2021)
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
n/a 15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
0
(0 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
1
(0.00 %)
441,845
(3.68 %)
18,525
(1.10 %)
10,661
(0.59 %)
81 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1
n/a n/a 16,964
(1.77 %)
67,673
(5.93 %)
n/a 42.61
(99.97 %)
28
(0.00 %)
1,785
(0.03 %)
979
(100.00 %)
4,285,965
(30.73 %)
1,222,431
(20.69 %)
6,105,881
(46.99 %)
11
(0.00 %)
1,356,343
(8.48 %)
73,543
(3.28 %)
32,534
(1.37 %)
82 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1
n/a n/a 12,424
(1.95 %)
46,550
(6.00 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,619
(100.00 %)
789,207
(14.61 %)
348,482
(20.98 %)
3,447,241
(38.72 %)
0
(0 %)
1,174,378
(8.68 %)
27,035
(4.16 %)
12,167
(0.85 %)
83 bonti-bonti (primary hap 2022)
GCA_933228915.1
n/a n/a 14,929
(1.93 %)
55,343
(5.90 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
0
(0 %)
1,329
(0.03 %)
146
(100.00 %)
998,246
(14.90 %)
443,155
(22.40 %)
4,319,947
(40.01 %)
2
(0.00 %)
1,529,147
(9.19 %)
34,018
(4.16 %)
15,066
(0.86 %)
84 bony fish B.hirsutus (HB-005 2024)
GCF_040956055.1
24,050
(11.30 %)
n/a 14,596
(4.48 %)
52,760
(11.00 %)
n/a 44.75
(99.96 %)
0
(0 %)
1,486
(0.04 %)
1,370
(100.00 %)
471,281
(10.94 %)
181,798
(7.38 %)
2,008,576
(24.90 %)
13
(0.00 %)
259,160
(4.57 %)
46,438
(14.87 %)
34,692
(4.88 %)
85 bony fish P.dabryanus (BB 2023)
GCF_030506205.1
86,420
(8.25 %)
n/a 22,100
(2.28 %)
59,296
(4.66 %)
n/a 38.32
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
610
(100.00 %)
3,555,303
(40.49 %)
538,181
(9.64 %)
6,137,303
(50.16 %)
0
(0 %)
1,400,924
(8.09 %)
71,533
(4.06 %)
19,783
(0.63 %)
86 bony fish S.pulcher (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCF_022749685.1
37,003
(8.79 %)
n/a 15,275
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
186
(100.00 %)
1,369,180
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,024
(31.90 %)
0
(0 %)
387,124
(4.11 %)
27,133
(1.64 %)
12,517
(0.55 %)
87 bony fish T.vachellii (PV-2020 2023)
GCF_030014155.1
43,278
(10.19 %)
n/a 15,613
(2.96 %)
39,340
(5.77 %)
n/a 39.31
(99.98 %)
0
(0 %)
291
(0.02 %)
78
(100.00 %)
1,563,305
(33.23 %)
689,312
(9.96 %)
3,954,578
(35.31 %)
1
(0.00 %)
844,788
(7.26 %)
20,152
(1.50 %)
10,778
(0.73 %)
88 bowfin (hap1 2024 refseq)
GCF_036373705.1
55,474
(7.85 %)
n/a 13,848
(1.83 %)
27,055
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
0
(0 %)
97
(0.00 %)
389
(100.00 %)
953,492
(13.69 %)
387,699
(7.91 %)
4,552,359
(37.72 %)
4
(0.00 %)
613,799
(6.38 %)
46,301
(2.99 %)
26,437
(1.15 %)
89 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1
n/a n/a 13,813
(1.89 %)
27,088
(4.55 %)
n/a 40.60
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
297
(100.00 %)
886,999
(13.24 %)
358,077
(7.37 %)
4,625,277
(36.22 %)
0
(0 %)
529,249
(5.78 %)
43,764
(2.79 %)
26,363
(1.18 %)
90 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1
n/a n/a 17,999
(1.60 %)
76,655
(5.58 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
10,799
(100.00 %)
5,994,257
(39.29 %)
1,126,685
(10.35 %)
6,996,991
(46.02 %)
0
(0 %)
1,131,145
(6.97 %)
71,016
(3.36 %)
27,805
(1.08 %)
91 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1
n/a n/a 17,865
(1.56 %)
76,506
(5.59 %)
n/a 42.15
(99.96 %)
0
(0 %)
2,704
(0.04 %)
676
(100.00 %)
6,391,921
(39.62 %)
1,227,487
(11.70 %)
6,669,558
(49.73 %)
11
(0.00 %)
1,301,019
(7.83 %)
76,828
(3.96 %)
26,877
(0.90 %)
92 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap1 2025)
GCA_048301445.1
n/a n/a 13,406
(4.62 %)
41,458
(10.33 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
3
(0.00 %)
78
(0.00 %)
155
(100.00 %)
205,224
(2.93 %)
217,943
(13.58 %)
1,368,592
(36.56 %)
0
(0 %)
232,608
(6.06 %)
48,018
(12.44 %)
32,621
(5.13 %)
93 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap2 2025)
GCA_048301605.1
n/a n/a 13,414
(4.78 %)
41,481
(10.68 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
1
(0.00 %)
90
(0.00 %)
126
(100.00 %)
203,521
(2.96 %)
200,308
(11.44 %)
1,413,994
(34.72 %)
1
(0.00 %)
209,781
(5.38 %)
47,578
(12.59 %)
32,428
(5.23 %)
94 broad-nosed pipefish (Sweden RoL2023-S1 2023)
GCF_033458585.1
49,639
(15.87 %)
n/a 13,630
(3.98 %)
43,263
(9.12 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
495
(100.00 %)
727,223
(20.88 %)
290,624
(20.53 %)
1,369,709
(43.82 %)
0
(0 %)
347,124
(7.41 %)
51,671
(14.43 %)
34,210
(4.62 %)
95 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1
92,568
(6.87 %)
n/a 26,875
(1.47 %)
114,101
(4.26 %)
n/a 43.70
(99.83 %)
0
(0 %)
4,299
(0.17 %)
2,721
(100.00 %)
5,005,012
(52.10 %)
2,055,293
(26.66 %)
9,701,968
(57.04 %)
69
(0.00 %)
4,551,597
(10.95 %)
89,897
(2.49 %)
20,734
(0.38 %)
96 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1
49,205
(8.52 %)
n/a 15,634
(1.92 %)
53,710
(4.99 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
0
(0 %)
205
(0.00 %)
26
(100.00 %)
632,147
(3.01 %)
371,482
(3.01 %)
6,438,110
(31.32 %)
1
(0.00 %)
370,750
(2.74 %)
26,136
(0.96 %)
10,272
(0.37 %)
97 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1
47,805
(10.97 %)
n/a 14,997
(2.72 %)
25,504
(5.86 %)
n/a 40.51
(84.10 %)
61,073
(15.93 %)
61,073
(15.93 %)
69,067
(84.07 %)
311,174
(3.20 %)
125,534
(0.72 %)
4,461,288
(20.25 %)
965
(0.08 %)
34,584
(0.52 %)
17,722
(0.91 %)
12,829
(0.64 %)
98 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1
52,584
(12.38 %)
n/a 15,229
(2.54 %)
47,264
(5.92 %)
n/a 40.68
(89.05 %)
0
(0 %)
32,418
(10.97 %)
7,421
(100.00 %)
812,382
(17.52 %)
158,486
(1.12 %)
4,571,794
(23.61 %)
710
(0.05 %)
88,277
(2.15 %)
22,763
(1.21 %)
14,293
(0.75 %)
99 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1
n/a n/a 15,228
(3.42 %)
41,322
(7.36 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,592
(100.00 %)
972,098
(18.43 %)
155,031
(1.41 %)
3,452,400
(21.36 %)
0
(0 %)
85,576
(1.51 %)
15,255
(1.12 %)
10,648
(0.72 %)
100 butterfish (primary hap 2021)
GCF_020382885.2
52,828
(14.10 %)
n/a 15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
0
(0 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
1
(0.00 %)
96,783
(1.70 %)
15,574
(1.13 %)
10,807
(0.72 %)
101 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1
n/a n/a 14,403
(2.47 %)
61,860
(7.37 %)
n/a 43.15
(99.96 %)
0
(0 %)
1,625
(0.04 %)
525
(100.00 %)
959,651
(12.16 %)
517,137
(13.14 %)
3,775,081
(32.47 %)
9
(0.00 %)
784,659
(7.82 %)
81,881
(6.68 %)
50,317
(3.10 %)
102 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1
n/a n/a 19,842
(2.16 %)
72,007
(6.04 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
2,679
(0.02 %)
2,679
(0.02 %)
15,877
(99.98 %)
1,911,945
(24.70 %)
364,933
(8.56 %)
6,201,042
(32.00 %)
26
(0.00 %)
834,109
(8.34 %)
39,114
(1.56 %)
17,823
(0.57 %)
103 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1
n/a n/a 15,277
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
179
(100.00 %)
1,369,186
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,065
(31.90 %)
0
(0 %)
469,842
(4.88 %)
27,134
(1.64 %)
12,518
(0.55 %)
104 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
n/a 14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
0
(0 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
0
(0 %)
452,303
(4.62 %)
20,453
(1.39 %)
10,802
(0.65 %)
105 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1
n/a n/a 15,980
(2.79 %)
53,680
(6.62 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,656
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
0
(0 %)
386,762
(3.56 %)
20,338
(1.21 %)
10,996
(0.60 %)
106 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3
59,187
(10.70 %)
n/a 15,782
(2.57 %)
45,562
(5.15 %)
n/a 39.82
(99.35 %)
0
(0 %)
100
(0.65 %)
137
(100.00 %)
2,257,240
(46.82 %)
671,926
(8.67 %)
5,043,664
(36.53 %)
0
(0 %)
696,803
(4.91 %)
34,284
(2.16 %)
22,417
(1.13 %)
107 cherry salmon (Uvic2021 2024)
GCF_036934945.1
80,307
(5.31 %)
n/a 27,171
(1.38 %)
123,048
(4.00 %)
n/a 44.12
(99.94 %)
1,043
(0.00 %)
4,047
(0.06 %)
18,306
(100.00 %)
1,207,353
(5.23 %)
2,779,869
(27.93 %)
11,429,057
(55.56 %)
21
(0.00 %)
6,696,647
(13.29 %)
83,137
(1.99 %)
20,398
(0.34 %)
108 chevron butterflyfish (hap1 2024 refseq)
GCF_039877785.1
38,623
(10.62 %)
n/a 15,604
(3.07 %)
48,037
(7.05 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
0
(0 %)
49
(0.00 %)
36
(100.00 %)
1,224,649
(24.57 %)
254,015
(3.62 %)
3,657,926
(23.28 %)
1
(0.00 %)
186,571
(2.20 %)
30,971
(2.02 %)
21,708
(1.31 %)
109 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1
n/a n/a 15,116
(2.91 %)
47,839
(7.01 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
71
(100.00 %)
463,848
(3.80 %)
254,561
(4.23 %)
3,654,295
(24.08 %)
2
(0.00 %)
196,606
(2.28 %)
30,593
(1.99 %)
17,996
(1.03 %)
110 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1
61,496
(12.33 %)
n/a 15,296
(2.30 %)
50,818
(6.10 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
0
(0 %)
942
(0.00 %)
823
(100.00 %)
920,881
(19.96 %)
193,629
(1.36 %)
4,724,179
(28.98 %)
1
(0.00 %)
184,981
(2.73 %)
28,565
(1.65 %)
15,987
(0.90 %)
111 Chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128725.1
n/a n/a 15,739
(1.88 %)
46,290
(4.42 %)
n/a 39.31
(100.00 %)
3
(0.00 %)
70
(0.00 %)
89
(100.00 %)
663,559
(2.79 %)
371,107
(3.14 %)
7,519,173
(32.84 %)
1
(0.00 %)
254,294
(1.89 %)
17,824
(0.70 %)
12,286
(0.46 %)
112 Chinese cavefish (2022)
GCF_024868665.1
48,058
(11.91 %)
n/a 16,738
(3.72 %)
46,295
(6.80 %)
n/a 39.61
(98.56 %)
0
(0 %)
9,510
(1.45 %)
1,039
(100.00 %)
1,469,931
(44.44 %)
188,838
(2.34 %)
3,624,116
(35.94 %)
299
(0.05 %)
177,963
(3.81 %)
44,615
(5.01 %)
16,470
(0.98 %)
113 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1
49,677
(9.64 %)
n/a 15,266
(2.70 %)
40,151
(5.21 %)
n/a 38.75
(99.82 %)
0
(0 %)
597
(0.18 %)
286
(100.00 %)
772,209
(6.45 %)
630,039
(7.45 %)
4,729,261
(37.48 %)
0
(0 %)
607,904
(5.63 %)
24,310
(1.76 %)
15,715
(0.95 %)
114 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2
89,005
(6.31 %)
n/a 26,613
(1.64 %)
77,184
(3.14 %)
n/a 39.08
(100.00 %)
0
(0 %)
224
(0.00 %)
353
(100.00 %)
9,298,177
(59.91 %)
977,119
(3.49 %)
13,499,422
(52.38 %)
0
(0 %)
882,883
(2.63 %)
100,309
(2.90 %)
18,261
(0.24 %)
115 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1
81,340
(5.14 %)
n/a 27,462
(1.53 %)
54,538
(3.80 %)
n/a 43.55
(97.26 %)
1,916
(0.01 %)
272,151
(2.76 %)
15,944
(99.99 %)
1,207,194
(4.55 %)
2,524,408
(13.75 %)
12,127,831
(47.56 %)
4,183
(0.05 %)
2,790,142
(6.34 %)
87,959
(2.02 %)
29,706
(0.70 %)
116 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1
92,383
(5.73 %)
n/a 26,372
(1.57 %)
107,059
(4.12 %)
157,582
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,313
(0.01 %)
2,334
(0.01 %)
9,978
(99.99 %)
1,483,168
(7.79 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,888
(54.54 %)
10
(0.00 %)
5,031,483
(11.16 %)
62,726
(1.40 %)
17,444
(0.31 %)
117 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1
n/a n/a 15,165
(2.44 %)
46,105
(6.16 %)
n/a 39.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,163
(100.00 %)
1,546,066
(27.08 %)
537,737
(9.87 %)
4,485,153
(30.70 %)
0
(0 %)
726,611
(6.01 %)
14,774
(0.81 %)
8,304
(0.43 %)
118 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1
34,390
(6.95 %)
n/a 15,348
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
0
(0 %)
1,572
(0.08 %)
360
(100.00 %)
1,669,322
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,373
(32.38 %)
3
(0.00 %)
927,880
(7.23 %)
16,290
(0.85 %)
8,913
(0.42 %)
119 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1
76,338
(6.27 %)
n/a 23,186
(1.70 %)
90,881
(4.14 %)
n/a 43.06
(95.36 %)
2,844
(0.02 %)
242,238
(4.66 %)
28,109
(99.98 %)
1,143,292
(6.07 %)
1,487,818
(12.14 %)
8,992,314
(46.24 %)
3,734
(0.11 %)
2,132,411
(5.90 %)
51,797
(1.25 %)
15,414
(0.35 %)
120 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1
205,915
(6.68 %)
n/a 26,582
(1.42 %)
119,437
(4.14 %)
120,379
(5.87 %)
43.89
(99.99 %)
3,405
(0.01 %)
3,433
(0.01 %)
17,480
(99.99 %)
1,160,500
(5.63 %)
2,584,312
(31.72 %)
10,621,107
(55.67 %)
8
(0.00 %)
6,422,106
(12.88 %)
68,538
(1.53 %)
20,126
(0.36 %)
121 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1
n/a n/a 14,940
(3.51 %)
39,688
(7.41 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
0
(0 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,993
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
0
(0 %)
150,484
(2.39 %)
10,131
(0.86 %)
7,444
(0.57 %)
122 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3
n/a n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
67,055
(11.68 %)
40.40
(99.35 %)
0
(0 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
633,883
(15.28 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,008
(21.31 %)
0
(0 %)
169,790
(2.72 %)
10,500
(0.87 %)
7,574
(0.57 %)
123 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1
53,567
(9.24 %)
n/a 15,685
(2.23 %)
33,477
(5.63 %)
n/a 39.47
(99.94 %)
0
(0 %)
1,406
(0.06 %)
6,405
(100.00 %)
431,950
(2.92 %)
381,394
(4.84 %)
4,952,343
(31.95 %)
20
(0.00 %)
378,594
(2.99 %)
23,543
(1.15 %)
15,582
(0.70 %)
124 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1
53,912
(11.11 %)
n/a 15,702
(2.37 %)
47,805
(5.50 %)
n/a 39.59
(99.98 %)
0
(0 %)
1,454
(0.02 %)
354
(100.00 %)
1,346,903
(35.25 %)
401,782
(5.36 %)
4,891,035
(31.59 %)
10
(0.00 %)
410,292
(3.79 %)
23,489
(1.28 %)
17,390
(0.95 %)
125 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2
100,850
(6.58 %)
n/a 27,072
(1.56 %)
50,811
(3.95 %)
125,873
(5.26 %)
43.55
(99.98 %)
395
(0.00 %)
5,631
(0.02 %)
4,482
(100.00 %)
1,491,966
(6.88 %)
2,135,217
(25.52 %)
10,152,659
(54.74 %)
5
(0.00 %)
4,738,432
(11.52 %)
65,662
(1.36 %)
18,054
(0.31 %)
126 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1
n/a n/a 18,114
(2.63 %)
66,549
(6.11 %)
n/a 38.62
(99.99 %)
7
(0.00 %)
685
(0.01 %)
215
(100.00 %)
2,639,968
(48.46 %)
659,243
(7.55 %)
5,950,358
(40.47 %)
3
(0.00 %)
963,199
(6.67 %)
62,337
(3.61 %)
19,726
(0.79 %)
127 common carp (R8XR3 2021)
GCA_905221575.1
n/a n/a 30,973
(3.47 %)
83,657
(5.95 %)
n/a 37.06
(100.00 %)
0
(0 %)
372
(0.00 %)
674
(100.00 %)
3,324,121
(41.45 %)
707,134
(4.72 %)
8,110,561
(39.08 %)
3
(0.00 %)
600,903
(3.39 %)
44,388
(1.60 %)
23,824
(0.66 %)
128 common carp (SPL01 2021)
GCF_018340385.1
91,210
(7.89 %)
n/a 31,041
(2.89 %)
89,244
(5.01 %)
n/a 37.11
(99.53 %)
0
(0 %)
26,351
(0.48 %)
6,701
(100.00 %)
1,634,612
(6.00 %)
919,239
(3.97 %)
10,192,037
(38.56 %)
0
(0 %)
703,885
(3.08 %)
52,638
(1.62 %)
30,904
(0.80 %)
129 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1
36,211
(8.34 %)
n/a 14,995
(2.62 %)
50,844
(6.89 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
0
(0 %)
275
(0.01 %)
338
(100.00 %)
1,186,799
(32.17 %)
307,864
(16.34 %)
3,562,802
(35.00 %)
2
(0.00 %)
481,477
(5.21 %)
41,657
(2.72 %)
22,630
(1.29 %)
130 common dace (hap1.1 2025)
GCA_965113295.1
n/a n/a 18,484
(2.43 %)
69,931
(5.95 %)
n/a 39.03
(99.98 %)
0
(0 %)
1,202
(0.02 %)
876
(100.00 %)
938,148
(4.74 %)
828,944
(9.34 %)
5,833,273
(42.65 %)
14
(0.00 %)
987,377
(7.00 %)
78,182
(4.87 %)
26,569
(1.15 %)
131 common seadragon (TA_2022b 2022)
GCF_024500385.1
60,947
(12.28 %)
n/a 13,706
(2.67 %)
42,956
(5.71 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
196
(0.00 %)
1,259
(100.00 %)
1,417,848
(37.47 %)
173,323
(3.85 %)
3,968,694
(40.23 %)
3
(0.00 %)
319,133
(3.25 %)
70,253
(6.29 %)
38,941
(2.56 %)
132 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1
n/a n/a 14,904
(2.99 %)
43,194
(7.09 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,318
(100.00 %)
1,128,080
(18.77 %)
328,975
(8.35 %)
3,952,898
(31.64 %)
0
(0 %)
410,353
(4.52 %)
26,979
(2.08 %)
15,469
(0.95 %)
133 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1
55,359
(12.02 %)
n/a 14,844
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
242
(100.00 %)
1,149,243
(19.12 %)
342,238
(9.71 %)
3,906,753
(32.84 %)
2
(0.00 %)
440,509
(5.18 %)
27,772
(2.71 %)
15,561
(0.92 %)
134 common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024)
GCA_964263955.1
n/a n/a 29,103
(1.36 %)
124,287
(3.94 %)
n/a 43.87
(99.96 %)
0
(0 %)
5,995
(0.04 %)
11,150
(100.00 %)
1,655,140
(4.68 %)
1,843,550
(17.63 %)
9,367,555
(61.56 %)
26
(0.00 %)
4,094,607
(11.22 %)
112,654
(3.84 %)
19,454
(0.27 %)
135 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1
n/a n/a 25,968
(1.48 %)
104,922
(4.18 %)
n/a 43.67
(99.96 %)
4,689
(0.04 %)
4,689
(0.04 %)
8,669
(99.96 %)
1,320,339
(4.08 %)
1,364,334
(15.61 %)
7,674,742
(61.10 %)
11
(0.00 %)
2,973,556
(10.43 %)
94,019
(3.82 %)
16,046
(0.28 %)
136 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1
n/a n/a 5,231
(0.27 %)
47,644
(1.48 %)
n/a 44.62
(99.99 %)
144
(0.01 %)
144
(0.01 %)
21,561
(99.99 %)
2,803,873
(49.20 %)
655,416
(2.69 %)
7,558,550
(67.05 %)
0
(0 %)
912,917
(5.74 %)
181,626
(10.52 %)
19,591
(0.39 %)
137 convict blenny (primary hap 2021)
GCA_020510985.1
n/a n/a n/a 134,417
(1.50 %)
n/a 44.52
(99.13 %)
0
(0 %)
2,580
(0.87 %)
512
(100.00 %)
9,062,541
(49.33 %)
2,097,650
(2.66 %)
3,092
(99.13 %)
5
(0.00 %)
3,135,536
(6.36 %)
568,042
(10.14 %)
0
(0.00 %)
138 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1
n/a n/a 13,622
(2.81 %)
43,285
(6.93 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,125
(100.00 %)
1,741,373
(32.89 %)
182,926
(2.01 %)
3,659,106
(21.68 %)
1
(0.00 %)
138,669
(1.93 %)
27,693
(1.89 %)
19,848
(1.23 %)
139 copperband butterflyfish (primary hap 2021)
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
n/a 15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
61,755
(8.99 %)
42.57
(100.00 %)
0
(0 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
1
(0.00 %)
158,516
(2.15 %)
29,106
(1.85 %)
19,302
(1.11 %)
140 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1
n/a n/a 14,740
(2.91 %)
45,483
(7.26 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
0
(0 %)
1,379
(0.04 %)
395
(100.00 %)
936,676
(24.41 %)
306,192
(9.29 %)
3,495,456
(28.75 %)
2
(0.00 %)
463,889
(5.20 %)
29,142
(2.35 %)
16,622
(1.09 %)
141 Corydoras catfish unclassified (C115 2021)
GCA_019802505.1
n/a n/a 14,695
(2.68 %)
51,799
(6.37 %)
n/a 42.12
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,080
(100.00 %)
1,969,654
(37.02 %)
663,295
(11.19 %)
3,764,275
(45.19 %)
0
(0 %)
1,764,080
(12.85 %)
67,226
(8.43 %)
47,724
(3.53 %)
142 crested bigscale (hap1.1 2025)
GCA_964638095.1
n/a n/a 17,935
(1.34 %)
104,307
(6.12 %)
n/a 44.53
(99.96 %)
142
(0.00 %)
2,975
(0.04 %)
2,930
(100.00 %)
5,608,839
(57.44 %)
1,825,932
(20.35 %)
6,375,759
(51.18 %)
16
(0.00 %)
2,419,022
(10.51 %)
149,374
(4.78 %)
37,609
(1.23 %)
143 crested bigscale (hap2.1 2025)
GCA_964638665.1
n/a n/a 17,775
(1.43 %)
100,017
(6.38 %)
n/a 44.59
(99.96 %)
2,894
(0.04 %)
2,894
(0.04 %)
4,301
(99.96 %)
5,332,080
(56.26 %)
1,737,704
(18.88 %)
6,064,583
(49.72 %)
13
(0.00 %)
2,194,072
(10.21 %)
141,258
(4.70 %)
36,413
(1.08 %)
144 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1
n/a n/a 4,509
(3.03 %)
16,936
(7.22 %)
n/a 38.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,713
(100.00 %)
430,197
(46.38 %)
101,926
(7.54 %)
1,077,239
(32.21 %)
0
(0 %)
149,644
(6.00 %)
10,612
(4.11 %)
3,661
(0.96 %)
145 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1
90,094
(6.75 %)
n/a 29,386
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
0
(0 %)
832
(0.01 %)
277
(100.00 %)
3,481,382
(45.81 %)
802,773
(6.54 %)
8,190,783
(44.41 %)
1
(0.00 %)
1,003,533
(5.09 %)
83,696
(3.82 %)
26,039
(0.81 %)
146 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1
51,190
(10.37 %)
n/a 15,144
(2.59 %)
43,207
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.98 %)
0
(0 %)
570
(0.02 %)
324
(100.00 %)
1,435,625
(29.39 %)
330,276
(12.54 %)
4,196,830
(33.83 %)
1
(0.00 %)
689,646
(5.54 %)
19,310
(1.01 %)
11,155
(0.57 %)
147 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1
n/a n/a 14,861
(2.74 %)
42,996
(6.34 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
0
(0 %)
31
(0.01 %)
1,476
(100.00 %)
1,373,727
(30.17 %)
220,572
(4.38 %)
4,176,936
(27.32 %)
0
(0 %)
274,559
(2.86 %)
17,129
(1.04 %)
8,648
(0.51 %)
148 cunner (primary hap 2021)
GCA_020745685.1
n/a n/a 15,192
(2.74 %)
43,564
(6.38 %)
n/a 41.31
(99.41 %)
0
(0 %)
283
(0.59 %)
64
(100.00 %)
1,419,667
(30.50 %)
243,024
(4.81 %)
4,334,690
(27.65 %)
2
(0.00 %)
297,510
(2.95 %)
17,974
(1.06 %)
9,021
(0.52 %)
149 Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020)
GCF_015846415.1
49,108
(12.72 %)
n/a 16,501
(4.06 %)
40,671
(7.11 %)
n/a 38.77
(100.00 %)
116
(0.00 %)
116
(0.00 %)
167
(100.00 %)
1,213,719
(40.21 %)
134,299
(3.43 %)
3,676,403
(30.98 %)
0
(0 %)
240,696
(3.68 %)
29,879
(3.18 %)
13,593
(0.92 %)
150 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1
n/a 47,476
(8.36 %)
16,341
(3.18 %)
41,545
(5.47 %)
n/a 38.57
(98.69 %)
8,366
(1.31 %)
8,366
(1.31 %)
36,005
(98.69 %)
300,659
(2.50 %)
212,357
(6.15 %)
4,267,143
(35.05 %)
53
(0.01 %)
572,127
(5.71 %)
23,311
(2.18 %)
10,121
(0.71 %)
151 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1
n/a n/a 15,965
(3.73 %)
37,421
(5.87 %)
n/a 38.52
(94.12 %)
18,487
(5.88 %)
18,487
(5.88 %)
29,831
(94.12 %)
251,333
(2.28 %)
132,120
(1.41 %)
4,061,554
(28.83 %)
1,201
(0.07 %)
63,401
(0.80 %)
16,871
(1.57 %)
9,058
(0.64 %)
152 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
n/a 15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
0
(0 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
4
(0.00 %)
383,250
(3.60 %)
32,973
(1.28 %)
9,764
(0.33 %)
153 delta smelt
GCF_021917145.1
41,807
(14.97 %)
n/a 14,549
(4.09 %)
44,849
(9.74 %)
n/a 44.99
(99.92 %)
0
(0 %)
1,474
(0.08 %)
376
(100.00 %)
387,882
(5.57 %)
383,522
(9.22 %)
1,814,696
(32.48 %)
5
(0.00 %)
335,886
(5.91 %)
28,299
(3.33 %)
15,642
(1.48 %)
154 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2
n/a n/a 14,119
(3.95 %)
47,988
(8.57 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,660
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
0
(0 %)
175,500
(3.05 %)
50,830
(8.72 %)
41,064
(4.69 %)
155 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2
n/a n/a 16,559
(3.78 %)
58,823
(8.66 %)
74,128
(10.47 %)
43.69
(99.18 %)
0
(0 %)
464
(0.82 %)
461
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,284
(4.61 %)
2,948,738
(28.79 %)
0
(0 %)
306,165
(4.31 %)
64,661
(9.49 %)
52,867
(4.93 %)
156 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1
n/a n/a 16,788
(2.12 %)
50,338
(4.68 %)
n/a 41.27
(98.12 %)
0
(0 %)
641
(1.88 %)
182
(100.00 %)
2,709,759
(34.74 %)
798,364
(14.84 %)
5,418,190
(36.02 %)
1
(0.00 %)
1,397,111
(8.85 %)
30,055
(1.31 %)
21,119
(0.80 %)
157 dorado (hap2 2023)
GCA_030463535.1
n/a n/a 16,799
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
0
(0 %)
726
(0.85 %)
104
(100.00 %)
2,693,928
(34.60 %)
805,807
(14.65 %)
5,615,731
(36.69 %)
2
(0.00 %)
1,425,798
(8.96 %)
30,083
(1.31 %)
21,157
(0.81 %)
158 double-spotted pufferfish T.bimaculatus (TB-2018 2019)
GCA_004026145.2
n/a 20,142
(10.63 %)
14,760
(4.56 %)
56,353
(11.37 %)
n/a 45.56
(99.97 %)
0
(0 %)
1,033
(0.03 %)
1,158
(100.00 %)
292,029
(9.69 %)
192,568
(5.53 %)
1,623,924
(22.71 %)
2
(0.00 %)
336,852
(6.81 %)
51,743
(9.31 %)
39,457
(5.10 %)
159 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1
51,353
(12.50 %)
n/a 13,736
(3.19 %)
50,537
(7.64 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
0
(0 %)
79
(0.00 %)
213
(100.00 %)
986,789
(36.30 %)
235,862
(13.25 %)
2,323,084
(41.85 %)
0
(0 %)
428,926
(7.18 %)
68,121
(17.75 %)
37,525
(4.04 %)
160 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5
n/a n/a 15,552
(2.29 %)
52,465
(6.26 %)
86,437
(9.40 %)
41.07
(99.87 %)
115
(0.00 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
1,309,350
(35.93 %)
217,916
(1.89 %)
4,547,434
(30.78 %)
2
(0.00 %)
212,425
(2.79 %)
33,005
(1.88 %)
15,205
(0.74 %)
161 eastern happy (primary hap 2024)
GCA_964374335.1
n/a n/a 15,554
(2.13 %)
55,328
(6.30 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
0
(0 %)
40
(0.00 %)
31
(100.00 %)
933,060
(24.43 %)
252,509
(4.84 %)
4,460,314
(32.70 %)
1
(0.00 %)
344,099
(4.07 %)
34,184
(2.09 %)
17,316
(0.94 %)
162 electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020)
GCA_013347915.1
n/a n/a 12,020
(3.63 %)
38,881
(7.31 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,629
(100.00 %)
429,509
(7.66 %)
432,260
(11.41 %)
2,049,609
(24.32 %)
0
(0 %)
486,181
(6.19 %)
35,597
(4.37 %)
27,662
(2.94 %)
163 electric eel (fEleEle1 primary hap 2020)
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
n/a 15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
54,541
(8.42 %)
42.49
(98.20 %)
0
(0 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
1
(0.00 %)
629,918
(5.96 %)
44,501
(3.93 %)
34,390
(2.63 %)
164 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1
40,618
(11.48 %)
n/a 15,837
(3.85 %)
23,074
(6.63 %)
n/a 42.56
(96.95 %)
0
(0 %)
119,361
(3.09 %)
8,786
(100.00 %)
519,014
(5.41 %)
516,718
(6.65 %)
3,020,801
(21.49 %)
1,953
(0.21 %)
261,654
(3.62 %)
41,947
(3.71 %)
33,441
(2.64 %)
165 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1
82,153
(9.98 %)
n/a 16,513
(2.13 %)
79,047
(6.37 %)
n/a 44.15
(99.99 %)
0
(0 %)
234
(0.01 %)
1,425
(100.00 %)
923,543
(11.79 %)
425,650
(9.45 %)
3,525,237
(34.97 %)
0
(0 %)
812,868
(7.46 %)
91,552
(5.39 %)
61,344
(2.61 %)
166 emerald rockcod
GCF_902827165.1
44,179
(8.48 %)
n/a 15,275
(2.20 %)
57,830
(6.43 %)
63,731
(6.65 %)
40.94
(99.99 %)
0
(0 %)
932
(0.01 %)
864
(100.00 %)
460,185
(3.64 %)
399,729
(6.87 %)
3,533,188
(40.09 %)
6
(0.00 %)
642,666
(6.28 %)
52,191
(2.51 %)
13,014
(0.62 %)
167 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1
n/a n/a 17,920
(3.03 %)
59,697
(6.61 %)
n/a 39.13
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
4,949
(100.00 %)
2,285,870
(44.17 %)
480,649
(10.13 %)
4,833,803
(39.56 %)
0
(0 %)
820,249
(6.21 %)
57,737
(4.15 %)
23,311
(1.22 %)
168 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1
n/a n/a 17,661
(3.01 %)
58,218
(6.54 %)
n/a 39.21
(99.98 %)
0
(0 %)
881
(0.02 %)
125
(100.00 %)
2,346,939
(44.27 %)
502,415
(11.23 %)
4,890,830
(40.45 %)
0
(0 %)
873,838
(6.63 %)
60,482
(4.22 %)
24,091
(1.23 %)
169 European anchovy (BLACKSEA-1 2023)
GCF_034702125.1
48,154
(5.87 %)
n/a 15,415
(1.33 %)
77,712
(5.08 %)
n/a 44.45
(99.99 %)
0
(0 %)
9,202
(0.02 %)
1,922
(100.00 %)
4,406,534
(31.73 %)
2,331,293
(15.35 %)
6,863,540
(50.47 %)
15
(0.00 %)
1,701,493
(7.18 %)
80,927
(2.32 %)
27,462
(0.84 %)
170 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1
n/a n/a 17,416
(2.74 %)
60,936
(6.02 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
7,437
(100.00 %)
2,377,147
(47.98 %)
578,235
(8.27 %)
5,267,308
(40.22 %)
0
(0 %)
872,083
(6.16 %)
50,909
(3.45 %)
17,892
(0.86 %)
171 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1
n/a n/a 18,028
(2.64 %)
64,206
(6.04 %)
n/a 38.73
(99.99 %)
0
(0 %)
588
(0.01 %)
106
(100.00 %)
2,649,943
(48.88 %)
666,129
(9.08 %)
5,751,610
(41.56 %)
5
(0.00 %)
1,113,756
(7.21 %)
58,471
(3.64 %)
19,602
(0.84 %)
172 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1
54,631
(7.46 %)
n/a 17,072
(1.89 %)
34,801
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
0
(0 %)
1,009
(0.02 %)
380
(100.00 %)
761,522
(5.99 %)
913,306
(13.25 %)
5,767,879
(35.48 %)
3
(0.00 %)
1,603,437
(8.94 %)
120,990
(6.12 %)
81,342
(2.93 %)
173 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1
n/a n/a 14,690
(3.17 %)
48,422
(7.90 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,915
(100.00 %)
1,138,190
(26.31 %)
249,865
(4.72 %)
3,352,038
(25.55 %)
0
(0 %)
232,419
(3.75 %)
36,828
(3.13 %)
27,093
(1.88 %)
174 European flounder (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316205.1
n/a n/a 14,753
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
109
(100.00 %)
1,160,784
(27.06 %)
251,985
(5.23 %)
3,353,121
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,297
(3.81 %)
37,130
(2.79 %)
27,432
(1.88 %)
175 European flounder (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316205.1
48,969
(12.45 %)
n/a 14,751
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
0
(0 %)
482
(0.02 %)
108
(100.00 %)
1,160,781
(27.06 %)
251,983
(5.23 %)
3,353,086
(26.00 %)
1
(0.00 %)
252,298
(3.81 %)
37,129
(2.79 %)
27,431
(1.88 %)
176 European perch
GCF_010015445.1
55,605
(8.20 %)
n/a 15,430
(2.07 %)
55,499
(5.43 %)
n/a 40.90
(99.97 %)
0
(0 %)
801
(0.03 %)
303
(100.00 %)
684,094
(5.16 %)
634,788
(7.48 %)
5,182,241
(37.07 %)
0
(0 %)
746,988
(5.12 %)
44,049
(1.94 %)
15,321
(0.71 %)
177 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1
n/a n/a 14,619
(2.94 %)
50,389
(7.92 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
3,222
(100.00 %)
430,112
(3.88 %)
299,581
(6.89 %)
3,182,258
(27.97 %)
0
(0 %)
330,159
(4.99 %)
40,094
(3.66 %)
20,637
(1.37 %)
178 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1
46,468
(10.51 %)
n/a 14,818
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
0
(0 %)
1,072
(0.03 %)
355
(100.00 %)
476,314
(3.63 %)
520,729
(13.27 %)
3,283,360
(33.55 %)
2
(0.00 %)
525,277
(6.36 %)
47,050
(4.45 %)
21,878
(1.29 %)
179 European seabass (2021)
GCF_905237075.1
62,457
(13.08 %)
n/a 15,582
(2.89 %)
44,472
(6.56 %)
69,435
(12.92 %)
40.38
(99.85 %)
0
(0 %)
272
(0.15 %)
303
(100.00 %)
1,210,970
(24.30 %)
278,140
(4.02 %)
4,343,442
(26.18 %)
1
(0.00 %)
309,168
(3.42 %)
15,975
(0.93 %)
10,409
(0.57 %)
180 European smelt (primary hap 2023 genbank)
GCA_963692335.1
n/a n/a 15,640
(3.79 %)
50,248
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
30
(0.00 %)
2,462
(0.10 %)
1,038
(100.00 %)
1,648,435
(31.35 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,832
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
181 European smelt (primary hap 2023 refseq)
GCF_963692335.1
46,762
(14.07 %)
n/a 15,639
(3.79 %)
50,238
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
0
(0 %)
2,462
(0.10 %)
1,007
(100.00 %)
1,648,428
(31.34 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,793
(35.86 %)
7
(0.00 %)
485,262
(7.75 %)
33,284
(4.05 %)
19,052
(1.58 %)
182 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1
n/a n/a 16,181
(2.44 %)
63,544
(7.17 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
0
(0 %)
1,501
(0.04 %)
387
(100.00 %)
2,109,362
(31.42 %)
1,300,159
(14.91 %)
3,634,744
(35.44 %)
6
(0.00 %)
1,178,448
(8.78 %)
35,552
(1.87 %)
19,823
(1.00 %)
183 fathead minnow
GCF_016745375.1
57,312
(8.34 %)
n/a 18,039
(3.02 %)
52,431
(6.01 %)
n/a 38.45
(86.78 %)
0
(0 %)
5,594
(13.23 %)
911
(100.00 %)
657,027
(4.09 %)
444,571
(6.23 %)
4,902,960
(35.69 %)
5
(0.00 %)
807,051
(7.17 %)
49,361
(2.78 %)
20,934
(0.93 %)
184 flathead mullet
GCF_022458985.1
48,689
(12.71 %)
n/a 14,908
(3.00 %)
45,084
(6.96 %)
75,582
(11.23 %)
41.90
(99.97 %)
0
(0 %)
445
(0.04 %)
24
(100.00 %)
469,841
(3.23 %)
207,738
(2.31 %)
3,955,233
(24.74 %)
0
(0 %)
232,148
(2.99 %)
45,885
(3.03 %)
31,971
(1.87 %)
185 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1
n/a n/a 17,494
(2.06 %)
62,257
(5.73 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,986
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
0
(0 %)
240,032
(2.50 %)
26,445
(1.22 %)
12,638
(0.48 %)
186 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
n/a 15,434
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
0
(0 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
0
(0 %)
227,442
(2.84 %)
24,130
(1.26 %)
11,082
(0.48 %)
187 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1
n/a n/a 13,745
(2.58 %)
50,416
(6.72 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
5,171
(100.00 %)
442,646
(4.09 %)
276,927
(5.42 %)
3,741,267
(26.25 %)
0
(0 %)
406,474
(4.11 %)
28,827
(2.28 %)
19,731
(1.36 %)
188 freshwater garfish (primary hap 2020)
GCA_014839995.1
n/a n/a 14,625
(2.57 %)
52,879
(6.72 %)
n/a 41.41
(98.98 %)
0
(0 %)
1,373
(1.02 %)
410
(100.00 %)
492,828
(4.29 %)
318,631
(5.94 %)
3,977,536
(27.41 %)
0
(0 %)
521,102
(4.91 %)
32,390
(2.33 %)
21,612
(1.34 %)
189 giant grouper
GCF_005281545.1
45,328
(7.65 %)
n/a 15,661
(1.91 %)
53,910
(4.91 %)
n/a 41.26
(96.40 %)
0
(0 %)
23,415
(3.61 %)
4,201
(100.00 %)
604,763
(2.71 %)
357,944
(2.52 %)
6,501,327
(30.28 %)
1,632
(0.21 %)
237,713
(2.85 %)
26,431
(0.91 %)
9,943
(0.35 %)
190 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1
n/a n/a 13,090
(2.37 %)
48,927
(6.41 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,758
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
0
(0 %)
201,169
(2.33 %)
38,368
(2.40 %)
20,092
(1.12 %)
191 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2
n/a n/a 15,752
(2.45 %)
56,395
(6.58 %)
n/a 41.94
(99.96 %)
0
(0 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
1,474,134
(29.50 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,691
(25.69 %)
0
(0 %)
355,475
(3.53 %)
47,327
(2.41 %)
29,914
(1.44 %)
192 golden-line barbel
GCF_001515645.1
74,071
(6.71 %)
n/a 29,486
(2.77 %)
55,545
(5.32 %)
n/a 37.54
(89.58 %)
136,797
(10.45 %)
136,894
(10.45 %)
168,074
(89.55 %)
1,118,646
(5.04 %)
718,426
(6.54 %)
9,092,306
(37.16 %)
3,220
(0.35 %)
778,152
(11.46 %)
70,606
(1.91 %)
26,998
(0.64 %)
193 goldfish
GCF_003368295.1
116,745
(8.75 %)
n/a 35,097
(2.94 %)
68,251
(6.12 %)
n/a 37.48
(99.99 %)
2,247
(0.01 %)
2,247
(0.01 %)
8,463
(99.99 %)
1,693,800
(5.39 %)
916,195
(5.01 %)
9,731,118
(40.19 %)
0
(0 %)
1,030,815
(4.89 %)
66,585
(2.06 %)
27,619
(0.65 %)
194 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1
67,810
(11.16 %)
n/a 18,195
(3.27 %)
48,459
(5.67 %)
n/a 37.48
(99.98 %)
0
(0 %)
150
(0.02 %)
31
(100.00 %)
654,416
(3.33 %)
429,734
(3.77 %)
5,501,085
(40.21 %)
1
(0.00 %)
413,986
(3.73 %)
26,282
(1.58 %)
15,753
(0.76 %)
195 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1
36,344
(7.09 %)
n/a 14,512
(1.92 %)
45,809
(4.61 %)
n/a 39.76
(99.63 %)
0
(0 %)
3,407
(0.37 %)
600
(100.00 %)
2,662,894
(54.47 %)
803,911
(10.32 %)
5,763,692
(48.31 %)
3
(0.00 %)
1,131,797
(6.83 %)
53,808
(2.65 %)
23,231
(1.00 %)
196 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1
25,822
(5.19 %)
n/a 14,212
(1.97 %)
27,894
(4.68 %)
n/a 39.49
(93.15 %)
92,327
(6.89 %)
92,327
(6.89 %)
108,947
(93.11 %)
552,368
(5.00 %)
742,395
(8.07 %)
5,901,720
(42.46 %)
146
(0.03 %)
487,419
(6.15 %)
44,972
(1.97 %)
19,348
(0.76 %)
197 greater amberjack
GCF_002260705.1
33,756
(9.11 %)
n/a 15,336
(2.93 %)
22,220
(6.07 %)
n/a 40.86
(99.17 %)
0
(0 %)
9,742
(0.82 %)
34,656
(100.00 %)
573,770
(4.04 %)
368,800
(3.72 %)
4,449,534
(24.71 %)
371
(0.04 %)
251,784
(3.33 %)
15,850
(0.98 %)
10,738
(0.58 %)
198 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1
n/a n/a 15,483
(3.45 %)
47,484
(7.95 %)
n/a 44.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,805
(100.00 %)
1,400,150
(23.78 %)
738,163
(17.35 %)
2,460,977
(35.90 %)
0
(0 %)
605,154
(7.13 %)
20,794
(2.09 %)
11,413
(0.80 %)
199 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1
n/a n/a 16,553
(3.15 %)
51,766
(7.37 %)
n/a 44.75
(99.95 %)
61
(0.00 %)
1,752
(0.05 %)
1,085
(100.00 %)
1,674,762
(26.07 %)
900,455
(18.62 %)
2,849,256
(39.22 %)
0
(0 %)
824,383
(7.94 %)
26,022
(2.30 %)
13,322
(0.79 %)
200 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1
n/a n/a 10,795
(5.59 %)
33,380
(12.07 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,376
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
0
(0 %)
64,742
(2.40 %)
34,104
(12.82 %)
25,350
(6.24 %)
201 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
n/a 13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
37,563
(15.76 %)
43.46
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
0
(0 %)
112,918
(3.25 %)
46,327
(10.97 %)
32,897
(5.93 %)
202 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1
n/a n/a 13,412
(4.76 %)
45,946
(11.50 %)
n/a 44.34
(99.99 %)
0
(0 %)
95
(0.01 %)
251
(100.00 %)
494,547
(20.10 %)
204,804
(10.66 %)
1,444,044
(34.08 %)
0
(0 %)
208,543
(5.33 %)
47,904
(17.47 %)
32,381
(5.25 %)
203 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1
n/a n/a 13,681
(4.93 %)
45,034
(11.64 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,533
(100.00 %)
460,038
(18.47 %)
163,838
(7.90 %)
1,681,190
(29.08 %)
0
(0 %)
141,147
(3.92 %)
47,523
(15.60 %)
33,138
(6.10 %)
204 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1
n/a n/a 13,432
(2.10 %)
50,930
(6.39 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,952
(100.00 %)
2,495,763
(38.80 %)
473,105
(6.27 %)
3,444,123
(38.56 %)
0
(0 %)
474,250
(4.43 %)
35,298
(1.94 %)
13,822
(0.66 %)
205 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1
n/a n/a 15,028
(2.35 %)
50,436
(6.30 %)
n/a 41.10
(99.97 %)
0
(0 %)
1,188
(0.03 %)
1,568
(100.00 %)
2,688,222
(39.74 %)
549,362
(7.60 %)
3,564,661
(40.05 %)
4
(0.00 %)
605,421
(5.26 %)
37,043
(1.94 %)
11,494
(0.60 %)
206 green swordtail
GCF_003331165.1
52,602
(11.81 %)
n/a 14,955
(2.58 %)
47,115
(6.33 %)
n/a 39.09
(99.71 %)
185
(0.00 %)
661
(0.29 %)
272
(100.00 %)
328,469
(2.10 %)
162,178
(2.35 %)
4,801,050
(28.86 %)
1
(0.00 %)
227,225
(3.22 %)
37,217
(2.39 %)
25,655
(1.36 %)
207 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1
n/a n/a 14,752
(2.74 %)
58,725
(8.49 %)
n/a 43.13
(99.98 %)
3
(0.00 %)
553
(0.02 %)
322
(100.00 %)
1,860,845
(35.64 %)
378,045
(9.39 %)
3,208,482
(30.12 %)
0
(0 %)
450,213
(5.20 %)
66,857
(4.99 %)
44,052
(2.67 %)
208 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1
n/a n/a 16,645
(1.92 %)
62,533
(4.55 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
7,253
(100.00 %)
5,166,731
(67.78 %)
750,850
(11.35 %)
5,903,440
(54.20 %)
0
(0 %)
1,408,406
(7.28 %)
90,235
(5.58 %)
15,520
(0.51 %)
209 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1
n/a n/a 17,136
(1.90 %)
63,611
(4.50 %)
n/a 39.74
(99.99 %)
2
(0.00 %)
1,046
(0.01 %)
233
(100.00 %)
5,662,029
(68.75 %)
825,757
(11.99 %)
6,236,024
(55.15 %)
4
(0.00 %)
1,606,132
(7.98 %)
99,559
(5.68 %)
16,304
(0.51 %)
210 Gulf pipefish (Florida 2022)
GCF_024217435.2
53,176
(17.83 %)
n/a 13,439
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
495
(100.00 %)
644,597
(20.82 %)
180,309
(16.78 %)
1,339,434
(43.63 %)
0
(0 %)
465,900
(9.76 %)
51,080
(18.49 %)
31,396
(4.21 %)
211 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1
58,587
(18.27 %)
n/a 13,442
(4.00 %)
41,565
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
253,033
(3.86 %)
180,311
(16.78 %)
1,339,521
(43.63 %)
0
(0 %)
465,901
(9.76 %)
51,080
(18.49 %)
31,396
(4.21 %)
212 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4
n/a n/a 13,441
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
644,601
(20.82 %)
180,310
(16.78 %)
1,339,461
(43.63 %)
0
(0 %)
465,902
(9.76 %)
51,080
(18.49 %)
31,396
(4.21 %)
213 guppy
GCF_000633615.1
48,290
(11.24 %)
n/a 14,436
(2.72 %)
44,759
(6.24 %)
n/a 39.33
(90.86 %)
37,376
(9.16 %)
458,354
(9.22 %)
40,143
(90.84 %)
340,480
(2.43 %)
167,943
(1.50 %)
4,695,380
(25.63 %)
1,124
(0.10 %)
71,291
(1.20 %)
35,188
(1.91 %)
26,043
(1.36 %)
214 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1
n/a n/a 15,058
(2.50 %)
46,340
(5.85 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
2,131
(100.00 %)
1,642,351
(37.42 %)
389,169
(5.43 %)
4,687,710
(35.55 %)
0
(0 %)
541,909
(4.77 %)
34,408
(1.75 %)
16,136
(0.80 %)
215 honeycomb rockfish (primary hap 2020)
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
n/a 15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
63,546
(8.88 %)
40.77
(99.83 %)
0
(0 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
1
(0.00 %)
627,017
(5.28 %)
37,878
(1.84 %)
15,343
(0.71 %)
216 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1
74,585
(6.94 %)
n/a 30,802
(3.11 %)
57,655
(5.63 %)
n/a 37.18
(91.91 %)
150,790
(8.11 %)
150,790
(8.11 %)
314,962
(91.89 %)
1,147,234
(4.93 %)
708,513
(4.77 %)
9,080,512
(35.95 %)
1,724
(0.23 %)
n/a 63,217
(1.71 %)
29,804
(0.74 %)
217 humphead wrasse
GCF_018320785.1
42,229
(6.60 %)
n/a 15,287
(1.66 %)
47,025
(4.13 %)
n/a 39.53
(100.00 %)
0
(0 %)
284
(0.00 %)
46
(100.00 %)
447,458
(2.27 %)
310,170
(4.65 %)
8,002,463
(32.97 %)
1
(0.00 %)
473,364
(2.54 %)
12,252
(0.38 %)
8,635
(0.26 %)
218 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1
n/a n/a 14,412
(3.70 %)
41,944
(8.58 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
0
(0 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,774
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
0
(0 %)
195,444
(3.94 %)
15,419
(1.38 %)
8,375
(0.73 %)
219 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2
n/a n/a 15,339
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
57,867
(10.10 %)
42.38
(98.08 %)
0
(0 %)
1,523
(1.92 %)
157
(100.00 %)
346,399
(3.02 %)
163,524
(3.00 %)
2,755,274
(25.07 %)
0
(0 %)
235,504
(4.25 %)
17,931
(1.47 %)
9,749
(0.74 %)
220 Indian medaka
GCF_002922805.2
49,295
(10.27 %)
n/a 14,591
(2.49 %)
52,982
(6.37 %)
n/a 39.04
(94.83 %)
0
(0 %)
51,550
(5.20 %)
8,493
(100.00 %)
319,151
(2.20 %)
208,690
(2.67 %)
5,412,546
(33.29 %)
180
(0.02 %)
209,477
(2.14 %)
40,721
(2.36 %)
28,619
(1.60 %)
221 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1
41,583
(6.91 %)
n/a 18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
74,968
(7.01 %)
43.02
(99.97 %)
0
(0 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
0
(0 %)
319,481
(2.18 %)
78,561
(3.69 %)
58,460
(2.33 %)
222 Japanese flounder
GCF_001970005.1
37,838
(12.25 %)
n/a 14,521
(3.39 %)
30,773
(7.34 %)
n/a 41.64
(81.04 %)
0
(0 %)
40,314
(18.97 %)
9,525
(100.00 %)
332,322
(2.84 %)
164,916
(1.16 %)
3,476,344
(17.36 %)
317
(0.14 %)
34,362
(0.47 %)
21,768
(1.42 %)
15,778
(0.96 %)
223 Japanese flounder (ysfri-2021 2022)
GCF_024713975.1
60,200
(14.08 %)
n/a 14,987
(3.26 %)
42,919
(7.40 %)
n/a 41.54
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
25
(100.00 %)
850,797
(19.88 %)
308,390
(6.45 %)
3,329,304
(26.55 %)
0
(0 %)
204,034
(3.13 %)
23,373
(1.76 %)
16,725
(1.15 %)
224 Japanese medaka
GCF_002234675.1
50,526
(10.32 %)
n/a 14,325
(2.50 %)
27,912
(6.71 %)
91,652
(11.67 %)
40.84
(99.93 %)
0
(0 %)
491
(0.07 %)
25
(100.00 %)
384,317
(4.42 %)
163,041
(3.07 %)
4,631,750
(34.91 %)
2
(0.00 %)
257,543
(3.04 %)
41,215
(2.89 %)
23,967
(1.50 %)
225 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1
42,877
(8.61 %)
n/a 15,188
(2.40 %)
41,262
(7.86 %)
58,418
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
0
(0 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
667,122
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
0
(0 %)
422,332
(3.88 %)
121,464
(9.36 %)
77,061
(4.51 %)
226 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1
n/a n/a 15,945
(2.17 %)
101,825
(8.93 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
0
(0 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,228
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
0
(0 %)
541,432
(4.29 %)
138,484
(9.55 %)
86,420
(4.60 %)
227 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1
n/a n/a 14,960
(2.23 %)
74,436
(6.65 %)
n/a 43.94
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,370
(100.00 %)
1,620,688
(23.00 %)
902,057
(13.66 %)
4,547,953
(39.90 %)
0
(0 %)
892,097
(6.41 %)
129,990
(12.07 %)
77,992
(4.35 %)
228 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1
n/a n/a 14,906
(2.33 %)
72,029
(6.72 %)
n/a 43.92
(99.98 %)
0
(0 %)
887
(0.02 %)
191
(100.00 %)
1,609,654
(22.82 %)
897,264
(13.58 %)
4,548,467
(39.80 %)
11
(0.00 %)
875,374
(6.46 %)
129,147
(11.75 %)
77,287
(4.33 %)
229 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1
45,779
(8.57 %)
n/a 15,561
(1.99 %)
53,188
(5.12 %)
n/a 41.32
(97.02 %)
0
(0 %)
48,394
(2.99 %)
4,563
(100.00 %)
574,889
(2.73 %)
367,135
(2.64 %)
6,420,280
(29.10 %)
2,337
(0.06 %)
244,886
(1.72 %)
28,979
(1.07 %)
10,901
(0.40 %)
230 kelp perch (BFR_SWC_R1_liver_20210118 2023)
GCF_029030835.1
40,680
(11.49 %)
n/a 14,847
(3.17 %)
46,307
(7.10 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,003
(100.00 %)
967,639
(17.54 %)
319,567
(5.43 %)
3,743,006
(26.82 %)
0
(0 %)
263,733
(2.32 %)
47,481
(4.63 %)
30,351
(2.16 %)
231 Korean giant-fin mudskipper (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1
n/a n/a 13,470
(2.34 %)
42,799
(5.73 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,414
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
0
(0 %)
475,330
(4.51 %)
34,522
(2.54 %)
17,280
(0.96 %)
232 Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3
33,236
(8.44 %)
n/a 14,601
(2.46 %)
44,145
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
0
(0 %)
701
(0.95 %)
122
(100.00 %)
1,755,227
(42.93 %)
551,482
(7.22 %)
4,887,087
(38.97 %)
5
(0.00 %)
523,179
(4.75 %)
37,287
(2.58 %)
22,350
(1.21 %)
233 lake trout
GCF_016432855.1
65,012
(4.57 %)
n/a 26,528
(1.53 %)
112,119
(4.47 %)
76,885
(3.80 %)
43.50
(99.99 %)
0
(0 %)
3,264
(0.01 %)
4,121
(100.00 %)
1,387,896
(5.81 %)
1,797,785
(19.28 %)
9,643,314
(54.44 %)
2
(0.00 %)
3,778,575
(10.18 %)
85,419
(2.52 %)
19,617
(0.38 %)
234 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1
78,867
(4.31 %)
n/a 27,579
(1.38 %)
113,850
(3.63 %)
n/a 44.18
(100.00 %)
0
(0 %)
1,716
(0.00 %)
6,355
(100.00 %)
1,729,029
(6.03 %)
1,781,307
(15.24 %)
9,311,548
(61.16 %)
0
(0 %)
4,057,370
(10.85 %)
126,142
(4.04 %)
18,712
(0.30 %)
235 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1
87,246
(4.53 %)
n/a 28,366
(1.38 %)
117,266
(3.71 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
0
(0 %)
1,159
(0.00 %)
7,334
(100.00 %)
1,768,537
(6.02 %)
1,793,716
(15.51 %)
9,525,312
(61.13 %)
0
(0 %)
4,153,782
(10.89 %)
126,485
(3.95 %)
18,425
(0.28 %)
236 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1
n/a n/a 17,851
(1.28 %)
83,249
(5.18 %)
n/a 42.69
(99.97 %)
36
(0.00 %)
2,397
(0.03 %)
709
(100.00 %)
7,797,173
(37.37 %)
1,593,818
(10.64 %)
7,610,300
(54.05 %)
15
(0.00 %)
1,726,634
(9.03 %)
127,942
(3.84 %)
34,520
(0.93 %)
237 large yellow croaker
GCF_000972845.2
49,914
(11.76 %)
n/a 15,365
(3.00 %)
26,101
(6.66 %)
n/a 41.34
(99.67 %)
0
(0 %)
7,424
(0.33 %)
9,998
(100.00 %)
478,685
(3.50 %)
306,063
(3.37 %)
4,199,578
(24.80 %)
65
(0.01 %)
319,923
(3.93 %)
28,138
(2.09 %)
16,153
(1.01 %)
238 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1
n/a n/a 15,841
(2.36 %)
79,276
(8.51 %)
n/a 46.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,761
(100.00 %)
2,935,570
(42.17 %)
1,208,602
(21.28 %)
3,157,730
(42.63 %)
0
(0 %)
1,448,522
(11.27 %)
88,759
(6.30 %)
47,311
(2.77 %)
239 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1
n/a n/a 16,376
(2.19 %)
82,947
(7.99 %)
n/a 46.31
(99.94 %)
144
(0.00 %)
2,631
(0.06 %)
1,522
(100.00 %)
3,333,323
(43.58 %)
1,553,932
(25.91 %)
3,393,507
(46.78 %)
9
(0.00 %)
1,764,517
(12.32 %)
99,668
(6.39 %)
51,378
(2.60 %)
240 largemouth bass (2-A1 2021)
GCA_019677235.1
n/a n/a 15,790
(2.31 %)
50,332
(5.65 %)
n/a 40.87
(99.96 %)
0
(0 %)
672
(0.04 %)
202
(100.00 %)
464,845
(2.71 %)
255,513
(3.69 %)
5,124,388
(29.65 %)
2
(0.00 %)
390,854
(3.63 %)
25,920
(1.67 %)
12,277
(0.62 %)
241 largemouth bass (LMB-PRFRI aquatic 2020)
GCF_014851395.1
55,170
(9.49 %)
n/a 16,635
(2.18 %)
56,707
(5.52 %)
n/a 40.86
(99.85 %)
0
(0 %)
2,909
(0.15 %)
4,753
(100.00 %)
497,281
(2.60 %)
269,495
(3.70 %)
5,496,732
(29.60 %)
0
(0 %)
430,490
(4.27 %)
28,733
(1.66 %)
13,319
(0.61 %)
242 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1
n/a n/a 8,132
(2.11 %)
25,878
(4.67 %)
n/a 38.55
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,088
(100.00 %)
260,789
(2.73 %)
158,564
(2.12 %)
3,023,128
(27.39 %)
0
(0 %)
71,421
(1.44 %)
9,678
(1.02 %)
7,876
(0.74 %)
243 largescale foureyes (primary hap 2020)
GCA_014839685.1
n/a n/a 14,774
(2.18 %)
42,858
(4.83 %)
58,247
(6.94 %)
38.54
(99.96 %)
0
(0 %)
107
(0.04 %)
33
(100.00 %)
506,950
(2.73 %)
305,170
(2.13 %)
6,194,879
(29.85 %)
0
(0 %)
131,664
(1.39 %)
17,881
(0.94 %)
14,233
(0.68 %)
244 leafy seadragon (BA_2022a 2022)
GCF_024500275.1
46,242
(10.23 %)
n/a 13,712
(2.62 %)
43,369
(5.56 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
0
(0 %)
76
(0.00 %)
1,537
(100.00 %)
1,406,779
(35.37 %)
202,983
(7.44 %)
3,933,128
(41.19 %)
0
(0 %)
436,408
(4.31 %)
70,560
(7.78 %)
39,027
(2.50 %)
245 lemon sole (primary hap 2024)
GCA_964266715.1
n/a n/a 14,961
(2.55 %)
52,234
(6.83 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
20
(0.00 %)
409
(0.01 %)
1,601
(100.00 %)
1,233,052
(39.33 %)
366,741
(18.98 %)
3,296,338
(36.77 %)
1
(0.00 %)
538,414
(6.03 %)
44,712
(2.85 %)
31,908
(1.76 %)
246 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1
38,671
(7.52 %)
n/a 15,538
(2.18 %)
57,480
(5.26 %)
n/a 39.54
(98.22 %)
0
(0 %)
3,611
(1.77 %)
94,260
(100.00 %)
629,451
(3.42 %)
385,539
(3.83 %)
6,343,655
(29.35 %)
123
(0.00 %)
240,147
(1.70 %)
27,018
(1.26 %)
18,061
(0.78 %)
247 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1
n/a n/a 15,487
(0.88 %)
85,135
(3.39 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
6,593
(100.00 %)
5,572,163
(49.59 %)
1,052,072
(6.02 %)
7,246,646
(62.69 %)
0
(0 %)
2,503,507
(8.71 %)
157,768
(4.38 %)
14,966
(0.28 %)
248 lesser salmon catfish (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1
53,323
(3.35 %)
n/a 15,955
(0.92 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
0
(0 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
6,041,262
(71.88 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
11
(0.00 %)
2,750,473
(9.00 %)
166,630
(4.38 %)
16,535
(0.37 %)
249 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1
n/a n/a 13,792
(2.19 %)
51,353
(6.60 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,620
(100.00 %)
2,536,362
(38.05 %)
513,115
(7.50 %)
3,542,854
(37.60 %)
0
(0 %)
576,452
(5.21 %)
31,814
(1.79 %)
14,668
(0.71 %)
250 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1
n/a n/a 13,908
(2.19 %)
50,634
(6.50 %)
n/a 41.22
(99.97 %)
84
(0.00 %)
1,017
(0.03 %)
701
(100.00 %)
2,698,640
(39.19 %)
577,328
(8.51 %)
3,615,231
(39.17 %)
5
(0.00 %)
691,324
(6.04 %)
33,251
(1.82 %)
14,917
(0.69 %)
251 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1
n/a n/a 15,269
(2.44 %)
52,449
(6.28 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
0
(0 %)
606
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,879,201
(31.40 %)
449,901
(9.89 %)
4,248,556
(33.21 %)
1
(0.00 %)
727,189
(5.72 %)
43,864
(3.01 %)
19,108
(1.01 %)
252 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1
n/a n/a 15,033
(2.98 %)
51,296
(7.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
2,700
(100.00 %)
1,099,919
(28.68 %)
314,919
(9.57 %)
2,620,601
(30.23 %)
0
(0 %)
539,835
(6.99 %)
49,248
(4.19 %)
27,196
(1.69 %)
253 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1
n/a n/a 15,060
(2.89 %)
50,064
(7.31 %)
n/a 41.88
(99.98 %)
0
(0 %)
589
(0.02 %)
534
(100.00 %)
1,116,427
(28.18 %)
315,489
(13.14 %)
2,598,812
(33.21 %)
2
(0.00 %)
680,706
(7.88 %)
50,192
(3.82 %)
27,472
(1.61 %)
254 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1
n/a n/a 14,632
(3.51 %)
40,441
(7.51 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
0
(0 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,742
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
0
(0 %)
96,734
(1.60 %)
16,302
(1.34 %)
11,802
(0.89 %)
255 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2
n/a n/a 14,975
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
n/a 41.43
(99.89 %)
0
(0 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
772,309
(14.49 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,473
(21.79 %)
0
(0 %)
109,664
(1.83 %)
16,807
(1.33 %)
12,095
(0.89 %)
256 longspined bullhead (.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1
n/a n/a 15,027
(3.10 %)
51,137
(7.71 %)
n/a 42.22
(99.99 %)
0
(0 %)
242
(0.01 %)
27
(100.00 %)
452,844
(4.81 %)
417,308
(9.63 %)
3,262,282
(28.51 %)
2
(0.00 %)
530,802
(5.05 %)
55,527
(4.38 %)
34,004
(2.27 %)
257 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1
n/a n/a 15,137
(3.09 %)
52,499
(7.75 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,778
(100.00 %)
448,166
(4.67 %)
416,181
(8.95 %)
3,288,388
(27.99 %)
0
(0 %)
521,897
(4.93 %)
55,747
(4.41 %)
34,235
(2.29 %)
258 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1
n/a n/a 12,848
(3.32 %)
43,711
(8.09 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,698
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
0
(0 %)
569,405
(6.42 %)
45,916
(5.21 %)
28,531
(2.48 %)
259 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1
n/a n/a 14,944
(3.23 %)
50,328
(8.09 %)
n/a 42.82
(99.97 %)
0
(0 %)
954
(0.03 %)
232
(100.00 %)
1,034,598
(25.93 %)
434,819
(13.21 %)
2,907,371
(30.18 %)
3
(0.00 %)
701,025
(6.86 %)
55,066
(5.20 %)
33,554
(2.42 %)
260 lumpfish (v1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
n/a 14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
0
(0 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
1
(0.00 %)
655,785
(6.31 %)
53,321
(5.09 %)
32,722
(2.40 %)
261 lyretail cichlid
GCF_000239395.1
38,260
(10.03 %)
n/a 14,804
(2.69 %)
23,751
(5.79 %)
n/a 40.44
(80.94 %)
109,098
(19.10 %)
109,100
(19.10 %)
118,181
(80.90 %)
695,696
(14.49 %)
119,381
(1.10 %)
4,539,429
(19.49 %)
5,040
(0.39 %)
62,939
(1.53 %)
18,098
(0.91 %)
13,389
(0.65 %)
262 Malawi cichlid R.sp.'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1
n/a n/a 15,501
(2.18 %)
54,090
(6.20 %)
n/a 41.17
(99.99 %)
0
(0 %)
422
(0.01 %)
82
(100.00 %)
1,727,328
(38.16 %)
259,351
(4.71 %)
4,381,278
(33.25 %)
2
(0.00 %)
338,853
(3.90 %)
35,281
(1.93 %)
14,746
(0.71 %)
263 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1
64,831
(12.89 %)
n/a 15,283
(2.75 %)
43,349
(6.02 %)
n/a 40.35
(100.00 %)
0
(0 %)
93
(0.00 %)
65
(100.00 %)
441,324
(3.38 %)
206,420
(2.54 %)
4,582,841
(27.41 %)
2
(0.00 %)
240,418
(2.41 %)
15,999
(1.17 %)
10,104
(0.58 %)
264 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2
49,016
(12.41 %)
n/a 14,186
(3.08 %)
55,502
(8.05 %)
n/a 43.27
(100.00 %)
0
(0 %)
19
(0.00 %)
97
(100.00 %)
321,832
(4.91 %)
114,318
(16.04 %)
2,300,636
(32.10 %)
0
(0 %)
595,385
(7.08 %)
46,312
(5.05 %)
34,383
(3.14 %)
265 mangrove rivulus
GCF_001649575.2
46,200
(11.83 %)
n/a 14,522
(2.87 %)
46,641
(6.86 %)
n/a 40.03
(94.31 %)
0
(0 %)
32,278
(5.70 %)
300
(100.00 %)
345,678
(2.32 %)
146,263
(1.33 %)
4,718,292
(27.30 %)
277
(0.09 %)
65,776
(1.14 %)
39,541
(2.69 %)
29,543
(1.76 %)
266 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1
n/a n/a 14,564
(1.72 %)
71,604
(6.41 %)
n/a 41.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,737
(100.00 %)
1,662,251
(42.29 %)
439,119
(12.96 %)
3,776,125
(45.00 %)
0
(0 %)
888,556
(6.68 %)
56,507
(2.83 %)
15,006
(0.71 %)
267 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1
n/a n/a 15,070
(1.79 %)
71,367
(6.50 %)
n/a 41.46
(99.92 %)
0
(0 %)
4,157
(0.08 %)
943
(100.00 %)
1,717,591
(42.63 %)
474,348
(12.30 %)
4,011,319
(44.93 %)
3
(0.00 %)
n/a 59,531
(2.83 %)
15,998
(0.74 %)
268 Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023)
GCF_029220125.1
44,363
(10.91 %)
n/a 14,032
(2.80 %)
60,400
(8.09 %)
n/a 43.84
(99.86 %)
0
(0 %)
974
(0.14 %)
200
(100.00 %)
1,157,953
(36.57 %)
569,832
(12.19 %)
2,864,996
(37.65 %)
2
(0.00 %)
856,247
(8.38 %)
98,423
(9.53 %)
55,625
(4.11 %)
269 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2
47,018
(6.00 %)
n/a 16,516
(1.68 %)
33,920
(4.24 %)
n/a 38.00
(96.73 %)
0
(0 %)
621
(3.27 %)
2,415
(100.00 %)
1,125,511
(6.89 %)
1,113,607
(11.76 %)
8,546,053
(42.44 %)
2
(0.02 %)
1,620,405
(7.32 %)
44,933
(1.77 %)
26,268
(0.85 %)
270 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1
71,254
(7.50 %)
n/a 16,674
(1.63 %)
52,903
(4.12 %)
101,896
(6.64 %)
38.24
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,155,823
(4.90 %)
1,363,316
(12.23 %)
7,667,721
(47.23 %)
0
(0 %)
1,394,951
(7.13 %)
48,358
(1.88 %)
24,894
(0.73 %)
271 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1
n/a 27,999
(3.29 %)
16,698
(1.62 %)
62,818
(5.14 %)
74,339
(6.58 %)
38.41
(99.99 %)
0
(0 %)
334
(0.01 %)
195
(100.00 %)
1,194,830
(5.04 %)
1,460,981
(11.81 %)
7,590,179
(47.66 %)
2
(0.00 %)
1,437,937
(7.51 %)
50,533
(2.46 %)
25,088
(0.72 %)
272 milkfish (2019)
GCF_902362185.1
30,812
(7.61 %)
n/a 16,869
(3.41 %)
21,377
(6.58 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
0
(0 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
958,774
(8.18 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
2
(0.01 %)
611,774
(5.32 %)
22,089
(1.27 %)
14,000
(0.76 %)
273 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1
n/a n/a 16,565
(3.38 %)
42,094
(6.75 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,392
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
0
(0 %)
595,219
(5.37 %)
21,531
(1.27 %)
13,616
(0.75 %)
274 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1
n/a n/a 17,701
(1.62 %)
73,433
(5.69 %)
n/a 42.20
(99.98 %)
14
(0.00 %)
1,398
(0.02 %)
388
(100.00 %)
6,438,444
(40.32 %)
1,202,669
(11.51 %)
7,055,665
(47.04 %)
6
(0.00 %)
1,343,489
(8.04 %)
74,954
(3.44 %)
26,325
(0.98 %)
275 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1
n/a n/a 15,176
(3.17 %)
47,458
(7.48 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
0
(0 %)
927
(0.02 %)
486
(100.00 %)
1,167,409
(26.98 %)
438,114
(8.08 %)
3,351,987
(27.25 %)
3
(0.00 %)
441,989
(4.98 %)
45,298
(3.39 %)
29,915
(1.90 %)
276 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1
n/a n/a 14,480
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
0
(0 %)
936
(0.02 %)
725
(100.00 %)
1,101,582
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,480
(27.08 %)
5
(0.00 %)
417,783
(4.94 %)
42,657
(3.44 %)
28,222
(1.89 %)
277 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCF_023349555.1
40,276
(12.25 %)
n/a 14,478
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
936
(0.02 %)
936
(0.02 %)
1,660
(99.98 %)
1,101,578
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,428
(27.08 %)
5
(0.00 %)
417,783
(4.94 %)
42,657
(3.44 %)
28,222
(1.89 %)
278 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1
53,087
(12.11 %)
n/a 14,672
(2.71 %)
27,552
(6.74 %)
n/a 39.02
(99.85 %)
0
(0 %)
229
(0.15 %)
68
(100.00 %)
305,761
(2.11 %)
134,157
(2.14 %)
4,687,726
(28.26 %)
0
(0 %)
131,318
(1.99 %)
33,082
(2.28 %)
23,755
(1.34 %)
279 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1
41,183
(7.38 %)
39,253
(6.58 %)
14,602
(1.92 %)
57,194
(5.03 %)
35,597
(6.40 %)
40.58
(91.29 %)
110,543
(8.75 %)
123,625
(8.75 %)
120,723
(91.25 %)
447,158
(2.19 %)
235,336
(1.39 %)
6,518,990
(26.03 %)
877
(0.07 %)
150,526
(1.93 %)
54,589
(2.39 %)
39,256
(1.65 %)
280 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2
56,612
(6.89 %)
n/a 15,361
(1.60 %)
69,801
(5.20 %)
n/a 40.76
(99.88 %)
0
(0 %)
2,820
(0.12 %)
1,031
(100.00 %)
636,480
(2.75 %)
392,130
(3.32 %)
7,023,777
(32.98 %)
8
(0.00 %)
517,617
(4.36 %)
81,101
(3.45 %)
45,801
(1.71 %)
281 New Zealand spotty (alternate hap 2019 genbank)
GCA_009762545.1
n/a n/a 13,566
(2.17 %)
40,774
(5.21 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,659
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
0
(0 %)
456,905
(3.99 %)
16,368
(0.83 %)
7,034
(0.33 %)
282 New Zealand spotty (primary hap 2019 genbank)
GCA_009762535.1
n/a n/a 14,609
(2.22 %)
43,262
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
468
(100.00 %)
519,324
(4.65 %)
393,329
(5.54 %)
4,522,265
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,988
(4.42 %)
18,302
(0.85 %)
8,002
(0.35 %)
283 New Zealand spotty (primary hap refseq)
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
n/a 14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
0
(0 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
4
(0.00 %)
548,987
(4.42 %)
18,299
(0.85 %)
7,999
(0.35 %)
284 Nile tilapia
GCF_001858045.2
77,384
(10.86 %)
n/a 15,599
(1.99 %)
32,839
(6.04 %)
n/a 40.73
(99.99 %)
0
(0 %)
551
(0.01 %)
2,460
(100.00 %)
600,869
(5.40 %)
291,105
(3.17 %)
4,958,128
(31.15 %)
1
(0.00 %)
496,471
(4.91 %)
32,038
(1.81 %)
17,948
(0.88 %)
285 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1
n/a n/a 13,050
(3.93 %)
44,650
(10.12 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,934
(100.00 %)
512,583
(14.83 %)
156,305
(8.46 %)
2,005,803
(27.09 %)
0
(0 %)
153,928
(3.57 %)
59,674
(9.19 %)
38,546
(4.50 %)
286 ninespine stickleback (NSP_V7 2020)
GCF_902500615.1
51,166
(15.31 %)
n/a 14,765
(3.99 %)
49,191
(9.80 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
0
(0 %)
341
(0.01 %)
1,667
(100.00 %)
380,357
(3.60 %)
188,301
(6.29 %)
2,422,266
(25.70 %)
1
(0.00 %)
285,108
(4.45 %)
72,584
(9.69 %)
45,847
(4.62 %)
287 ninespine stickleback (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316345.1
n/a n/a 14,600
(3.83 %)
49,927
(9.98 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
175
(100.00 %)
599,088
(14.68 %)
186,747
(10.27 %)
2,273,942
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
288 ninespine stickleback (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316345.1
57,816
(15.11 %)
n/a 14,598
(3.83 %)
49,473
(9.87 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
0
(0 %)
738
(0.03 %)
174
(100.00 %)
599,085
(14.68 %)
186,746
(10.27 %)
2,273,889
(28.36 %)
3
(0.00 %)
183,869
(3.64 %)
70,136
(9.39 %)
45,059
(4.62 %)
289 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1
51,073
(7.42 %)
n/a 15,809
(2.17 %)
43,728
(4.54 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 48
(100.00 %)
2,472,286
(44.73 %)
560,123
(5.68 %)
6,203,876
(38.64 %)
0
(0 %)
436,624
(3.73 %)
42,187
(2.72 %)
22,226
(1.23 %)
290 northern cavefish (hap1 2024)
GCA_046255685.1
n/a n/a 14,295
(2.22 %)
50,623
(6.07 %)
n/a 42.09
(99.99 %)
0
(0 %)
466
(0.01 %)
892
(100.00 %)
1,941,831
(49.35 %)
650,256
(17.85 %)
3,210,410
(44.77 %)
0
(0 %)
978,430
(8.94 %)
55,251
(4.79 %)
22,975
(1.21 %)
291 northern cavefish (hap2 2024)
GCA_046255725.1
n/a n/a 14,542
(2.12 %)
51,650
(5.81 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
0
(0 %)
484
(0.01 %)
667
(100.00 %)
2,014,967
(51.82 %)
755,698
(19.90 %)
3,290,098
(47.08 %)
2
(0.00 %)
1,137,534
(9.59 %)
57,881
(4.66 %)
23,926
(1.32 %)
292 northern pike
GCF_004634155.1
66,389
(9.11 %)
n/a 16,778
(2.37 %)
27,040
(5.41 %)
n/a 42.29
(99.99 %)
97
(0.00 %)
584
(0.01 %)
908
(100.00 %)
1,065,458
(31.14 %)
531,451
(7.80 %)
4,677,366
(33.26 %)
2
(0.00 %)
661,503
(5.13 %)
44,793
(2.82 %)
22,750
(1.05 %)
293 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1
n/a n/a 11,782
(2.41 %)
40,748
(5.68 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
0
(0 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,818
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
0
(0 %)
427,649
(4.54 %)
29,687
(2.57 %)
15,714
(1.07 %)
294 northern pike (primary hap 2020 refseq)
GCF_011004845.1
63,733
(9.28 %)
n/a 16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,941
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
0
(0 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
1
(0.00 %)
602,569
(4.43 %)
42,910
(2.52 %)
22,099
(1.02 %)
295 northern snakehead (prfri 2023)
GCF_033026475.1
61,639
(13.32 %)
n/a 15,131
(2.87 %)
35,444
(5.74 %)
n/a 39.76
(100.00 %)
0
(0 %)
52
(0.00 %)
291
(100.00 %)
830,033
(26.45 %)
152,304
(8.77 %)
3,778,846
(29.39 %)
0
(0 %)
257,843
(3.63 %)
8,436
(0.70 %)
6,325
(0.37 %)
296 ocellated dragonet (captive hap1 2024)
GCA_044231665.1
n/a n/a 13,787
(3.68 %)
60,819
(10.07 %)
n/a 45.42
(100.00 %)
1
(0.00 %)
99
(0.00 %)
108
(100.00 %)
259,874
(3.38 %)
94,885
(3.76 %)
2,302,967
(21.04 %)
2
(0.00 %)
145,739
(2.25 %)
58,433
(13.25 %)
46,364
(6.81 %)
297 ocellated dragonet (captive hap2 2024)
GCA_044231645.1
n/a n/a 13,709
(3.65 %)
60,517
(9.98 %)
n/a 45.43
(100.00 %)
0
(0 %)
111
(0.00 %)
129
(100.00 %)
272,479
(3.57 %)
101,623
(4.29 %)
2,384,412
(21.91 %)
0
(0 %)
158,467
(2.41 %)
58,256
(13.22 %)
45,677
(6.65 %)
298 Old Calabar mormyrid (PKING1 2018)
GCF_002872115.1
61,915
(11.48 %)
n/a 15,987
(2.73 %)
33,963
(6.66 %)
n/a 43.93
(92.03 %)
0
(0 %)
49,579
(7.99 %)
4,666
(100.00 %)
348,463
(2.27 %)
314,129
(2.95 %)
4,259,711
(20.83 %)
2,738
(0.27 %)
166,566
(1.74 %)
76,846
(4.18 %)
58,953
(2.91 %)
299 old wife E.armatus (hap1 2024)
GCF_043641665.1
32,231
(8.81 %)
n/a 15,382
(3.41 %)
41,015
(7.24 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
0
(0 %)
114
(0.00 %)
136
(100.00 %)
1,143,877
(18.90 %)
219,801
(2.87 %)
3,652,133
(23.09 %)
3
(0.00 %)
154,745
(1.82 %)
19,721
(1.34 %)
13,176
(0.82 %)
300 old wife E.armatus (hap2 2024)
GCA_043640875.1
n/a n/a 15,360
(3.42 %)
41,012
(7.26 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
94
(100.00 %)
438,416
(3.46 %)
219,275
(2.83 %)
3,623,998
(22.85 %)
4
(0.00 %)
154,824
(1.82 %)
19,710
(1.32 %)
13,334
(0.83 %)
301 orangethroat darter
GCF_008692095.1
55,448
(8.29 %)
n/a 15,000
(2.25 %)
49,918
(5.41 %)
n/a 40.91
(99.57 %)
0
(0 %)
101,221
(0.47 %)
3,119
(100.00 %)
566,915
(3.75 %)
509,018
(6.60 %)
5,142,090
(31.18 %)
204
(0.00 %)
644,640
(5.47 %)
26,702
(1.46 %)
14,294
(0.76 %)
302 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
n/a 15,761
(1.50 %)
31,563
(4.00 %)
59,905
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
0
(0 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,257,250
(5.57 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
0
(0 %)
1,304,958
(6.34 %)
29,320
(0.87 %)
15,066
(0.43 %)
303 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1
n/a n/a 14,018
(1.51 %)
45,251
(3.61 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,393
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
1
(0.00 %)
888,596
(5.23 %)
22,522
(0.77 %)
12,193
(0.40 %)
304 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1
68,779
(8.54 %)
n/a 17,223
(2.28 %)
49,697
(5.11 %)
n/a 38.10
(99.99 %)
0
(0 %)
614
(0.01 %)
358
(100.00 %)
2,925,549
(40.35 %)
402,676
(5.35 %)
5,933,365
(45.71 %)
2
(0.00 %)
792,756
(5.74 %)
56,843
(3.18 %)
21,760
(0.91 %)
305 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap1 2025)
GCA_048544215.1
n/a n/a 14,679
(2.30 %)
51,447
(6.15 %)
n/a 44.09
(99.99 %)
0
(0 %)
1,177
(0.01 %)
180
(100.00 %)
1,452,983
(14.50 %)
1,649,878
(17.81 %)
4,184,643
(38.57 %)
5
(0.00 %)
1,240,109
(8.81 %)
36,016
(2.07 %)
20,732
(1.08 %)
306 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap2 2025)
GCA_048544225.1
n/a n/a 15,600
(2.30 %)
54,714
(6.21 %)
n/a 43.99
(99.99 %)
0
(0 %)
1,132
(0.01 %)
184
(100.00 %)
1,505,689
(14.07 %)
1,691,834
(17.30 %)
4,407,291
(38.23 %)
5
(0.00 %)
1,262,019
(8.51 %)
38,205
(2.14 %)
21,645
(1.07 %)
307 oyster pompano (Australia AG129_WGS33_773 2025)
GCF_046630095.1
60,285
(14.61 %)
n/a 15,290
(2.96 %)
42,088
(6.53 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 150
(100.00 %)
534,470
(3.96 %)
267,099
(3.88 %)
4,094,899
(24.75 %)
0
(0 %)
174,208
(2.68 %)
14,784
(1.60 %)
9,402
(0.55 %)
308 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1
40,001
(9.36 %)
n/a 14,904
(2.72 %)
24,732
(5.87 %)
n/a 40.60
(84.20 %)
60,817
(15.83 %)
60,817
(15.83 %)
68,050
(84.17 %)
306,171
(3.27 %)
124,292
(0.75 %)
4,414,831
(20.66 %)
1,574
(0.10 %)
36,249
(0.53 %)
18,455
(0.96 %)
13,214
(0.68 %)
309 Pacific cod (2023)
GCF_031168955.1
49,417
(13.66 %)
n/a 13,542
(2.89 %)
64,214
(9.77 %)
n/a 45.55
(99.92 %)
0
(0 %)
4,826
(0.09 %)
24
(100.00 %)
1,117,561
(38.30 %)
685,851
(13.38 %)
2,330,116
(34.15 %)
16
(0.00 %)
539,494
(6.49 %)
87,761
(8.68 %)
51,521
(4.16 %)
310 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1
48,776
(12.61 %)
n/a 14,747
(3.15 %)
45,075
(7.30 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
0
(0 %)
219
(0.00 %)
120
(100.00 %)
410,917
(4.22 %)
246,500
(4.66 %)
3,680,698
(25.23 %)
0
(0 %)
251,625
(3.22 %)
31,508
(2.30 %)
20,928
(1.36 %)
311 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2
46,684
(12.50 %)
n/a 14,862
(3.15 %)
45,824
(7.30 %)
n/a 42.17
(99.95 %)
0
(0 %)
1,131
(0.05 %)
53
(100.00 %)
407,699
(3.94 %)
247,330
(3.84 %)
3,838,896
(24.75 %)
2
(0.00 %)
279,152
(3.23 %)
31,782
(2.27 %)
21,208
(1.36 %)
312 Pacific saury (AMF1-May2022 2023)
GCF_033807715.1
54,344
(6.52 %)
n/a 15,214
(1.67 %)
74,345
(6.13 %)
n/a 41.49
(99.96 %)
0
(0 %)
900
(0.04 %)
759
(100.00 %)
805,776
(5.16 %)
849,901
(11.48 %)
4,645,552
(43.92 %)
1
(0.00 %)
1,333,479
(8.06 %)
106,026
(5.14 %)
39,496
(1.50 %)
313 panther danio (primary hap 2020)
GCF_903798145.1
40,657
(5.52 %)
n/a 17,858
(2.46 %)
42,119
(3.16 %)
n/a 36.32
(98.82 %)
0
(0 %)
1,821
(1.18 %)
342
(100.00 %)
3,973,354
(56.67 %)
940,639
(7.81 %)
8,701,639
(50.54 %)
3
(0.00 %)
1,057,465
(5.16 %)
29,684
(1.18 %)
10,646
(0.30 %)
314 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1
n/a n/a 15,421
(1.80 %)
62,324
(6.15 %)
n/a 42.79
(99.90 %)
4,955
(0.10 %)
4,955
(0.10 %)
4,978
(99.90 %)
4,032,523
(34.18 %)
982,411
(16.51 %)
5,189,655
(46.47 %)
55
(0.01 %)
1,303,532
(10.00 %)
64,543
(3.14 %)
28,282
(1.35 %)
315 parallel lanternfish (primary hap 2024)
GCA_964188405.1
n/a n/a 16,917
(1.64 %)
72,190
(5.85 %)
n/a 42.91
(99.96 %)
0
(0 %)
2,729
(0.04 %)
24
(100.00 %)
4,976,327
(35.08 %)
1,258,755
(18.52 %)
6,268,804
(48.21 %)
12
(0.00 %)
1,744,372
(10.22 %)
81,193
(3.23 %)
34,135
(1.37 %)
316 Patagonian blennie (Puerto Natales JMC-PN-2008 2024)
GCF_036324505.1
42,701
(12.59 %)
n/a 14,986
(3.15 %)
46,289
(7.75 %)
n/a 40.99
(99.97 %)
0
(0 %)
380
(0.03 %)
27
(100.00 %)
1,031,762
(25.30 %)
219,393
(4.63 %)
3,436,780
(25.57 %)
0
(0 %)
225,847
(2.56 %)
16,570
(1.12 %)
10,155
(0.63 %)
317 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1
n/a n/a 15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
0
(0 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
975,354
(15.76 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,904
(35.09 %)
1
(0.00 %)
865,727
(6.60 %)
49,121
(3.07 %)
20,467
(0.93 %)
318 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1
n/a n/a 15,317
(2.02 %)
61,647
(6.35 %)
n/a 41.37
(99.99 %)
135
(0.01 %)
135
(0.01 %)
469
(99.99 %)
981,519
(15.40 %)
319,637
(12.45 %)
3,706,473
(36.77 %)
0
(0 %)
952,761
(6.98 %)
50,353
(2.98 %)
20,537
(0.91 %)
319 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1
n/a n/a 16,729
(3.56 %)
56,451
(8.61 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
11
(0.00 %)
11
(0.00 %)
5,701
(100.00 %)
1,153,359
(18.94 %)
829,887
(14.54 %)
2,793,018
(28.79 %)
0
(0 %)
721,904
(6.97 %)
49,469
(4.32 %)
33,228
(2.53 %)
320 peladilla (primary hap 2021)
GCA_017639675.1
n/a n/a 13,829
(3.83 %)
41,932
(8.64 %)
n/a 45.01
(98.24 %)
0
(0 %)
1,158
(1.77 %)
41
(100.00 %)
930,246
(18.49 %)
660,569
(13.71 %)
2,316,198
(27.66 %)
6
(0.00 %)
537,418
(6.48 %)
41,023
(4.40 %)
27,287
(2.49 %)
321 pencil smelt N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1
n/a n/a 17,996
(2.00 %)
89,591
(7.93 %)
n/a 45.22
(99.94 %)
0
(0 %)
3,299
(0.06 %)
1,177
(100.00 %)
2,828,457
(30.93 %)
1,676,413
(19.87 %)
4,137,400
(48.69 %)
14
(0.00 %)
1,929,538
(11.96 %)
78,669
(4.37 %)
29,960
(1.34 %)
322 picturesque dragonet (SynPic1 hap1 2024)
GCA_044231685.1
n/a n/a 13,827
(3.46 %)
53,000
(8.90 %)
n/a 43.38
(100.00 %)
9
(0.00 %)
122
(0.00 %)
364
(100.00 %)
222,800
(3.83 %)
105,428
(7.84 %)
2,500,710
(25.24 %)
1
(0.00 %)
280,578
(4.01 %)
41,125
(5.45 %)
32,953
(3.58 %)
323 picturesque dragonet (SynPic1 hap2 2024)
GCA_044231675.1
n/a n/a 13,816
(3.52 %)
52,689
(9.01 %)
n/a 43.48
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
300
(100.00 %)
223,762
(3.25 %)
105,291
(6.28 %)
2,579,336
(24.55 %)
0
(0 %)
233,535
(3.55 %)
41,114
(5.50 %)
32,452
(3.61 %)
324 pike-perch
GCF_008315115.2
65,418
(8.54 %)
n/a 15,731
(2.23 %)
52,240
(5.69 %)
n/a 40.87
(99.98 %)
0
(0 %)
711
(0.02 %)
337
(100.00 %)
629,999
(5.16 %)
567,578
(7.41 %)
4,697,709
(36.49 %)
3
(0.00 %)
784,659
(5.34 %)
39,666
(1.93 %)
12,855
(0.60 %)
325 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
n/a 15,738
(2.42 %)
26,691
(5.69 %)
57,069
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
0
(0 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,063,888
(5.90 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
0
(0 %)
374,590
(3.12 %)
41,636
(2.04 %)
21,488
(0.92 %)
326 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1
n/a n/a 15,563
(2.38 %)
54,264
(6.19 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,418
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
0
(0 %)
338,770
(2.89 %)
40,331
(2.02 %)
21,223
(0.93 %)
327 pink salmon
GCF_021184085.1
91,127
(4.89 %)
n/a 27,187
(1.37 %)
124,120
(3.88 %)
n/a 44.28
(99.96 %)
3,528
(0.01 %)
5,213
(0.04 %)
22,556
(99.99 %)
1,343,135
(0.00 %)
2,906,520
(28.95 %)
10,882,087
(57.26 %)
21
(0.00 %)
6,152,465
(12.38 %)
97,805
(3.04 %)
20,791
(0.34 %)
328 ploughfish
GCF_902827175.1
50,551
(7.66 %)
n/a 14,699
(1.83 %)
66,348
(6.06 %)
62,492
(5.74 %)
41.52
(99.98 %)
0
(0 %)
1,569
(0.02 %)
2,618
(100.00 %)
467,937
(3.05 %)
412,361
(6.64 %)
3,498,382
(45.08 %)
10
(0.00 %)
623,734
(5.21 %)
73,879
(3.55 %)
14,738
(0.64 %)
329 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1
n/a n/a 14,050
(2.77 %)
63,249
(8.86 %)
n/a 45.41
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,970
(100.00 %)
708,455
(9.71 %)
797,241
(15.67 %)
2,785,159
(33.18 %)
0
(0 %)
613,051
(6.69 %)
78,151
(7.95 %)
45,924
(3.34 %)
330 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1
n/a n/a 14,126
(2.81 %)
61,907
(8.75 %)
n/a 45.67
(99.94 %)
0
(0 %)
1,810
(0.06 %)
616
(100.00 %)
753,034
(10.17 %)
850,189
(15.72 %)
2,888,555
(33.70 %)
7
(0.00 %)
642,528
(6.84 %)
80,883
(8.43 %)
46,894
(3.34 %)
331 predatory carp (Z2021 2022)
GCF_024489055.1
56,688
(7.63 %)
n/a 17,670
(2.67 %)
54,522
(5.25 %)
n/a 37.95
(100.00 %)
0
(0 %)
181
(0.00 %)
51
(100.00 %)
3,087,358
(61.37 %)
553,846
(7.14 %)
6,036,124
(43.52 %)
2
(0.00 %)
738,916
(5.65 %)
47,942
(3.56 %)
13,183
(0.50 %)
332 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
n/a 14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
0
(0 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
3
(0.00 %)
1,746,915
(7.91 %)
172,199
(5.45 %)
18,080
(0.31 %)
333 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1
n/a n/a 10,944
(0.64 %)
59,123
(2.21 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,336
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
0
(0 %)
1,101,423
(6.43 %)
125,285
(5.42 %)
13,610
(0.32 %)
334 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1
n/a n/a 15,639
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
0
(0 %)
1,907
(0.07 %)
365
(100.00 %)
1,655,350
(30.53 %)
511,512
(12.09 %)
2,015,264
(35.19 %)
4
(0.00 %)
468,697
(7.41 %)
32,410
(4.33 %)
18,662
(1.57 %)
335 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCF_038355195.1
39,606
(12.43 %)
n/a 15,641
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
0
(0 %)
1,907
(0.07 %)
366
(100.00 %)
1,655,356
(30.53 %)
511,513
(12.09 %)
2,015,303
(35.19 %)
4
(0.00 %)
468,697
(7.41 %)
32,410
(4.33 %)
18,662
(1.57 %)
336 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2
119,284
(6.51 %)
n/a 27,513
(1.62 %)
109,524
(4.38 %)
138,073
(5.21 %)
43.45
(99.74 %)
196
(0.00 %)
486
(0.26 %)
939
(100.00 %)
1,537,455
(7.32 %)
2,083,211
(23.10 %)
10,092,840
(53.71 %)
5
(0.00 %)
4,526,931
(11.46 %)
73,586
(2.16 %)
18,220
(0.32 %)
337 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1
79,299
(6.41 %)
78,807
(5.45 %)
25,179
(1.70 %)
98,339
(4.18 %)
115,853
(5.33 %)
42.67
(88.52 %)
7,839
(0.04 %)
427,894
(11.54 %)
139,800
(99.96 %)
1,332,141
(5.52 %)
1,604,760
(8.18 %)
9,451,984
(44.00 %)
31,141
(1.22 %)
1,638,788
(9.94 %)
56,604
(1.05 %)
14,470
(0.23 %)
338 Rankin cod (hap1 2025)
GCA_048129235.1
n/a n/a 15,661
(1.94 %)
54,906
(5.30 %)
n/a 41.36
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
386
(100.00 %)
591,994
(2.64 %)
396,424
(6.16 %)
6,144,028
(31.24 %)
0
(0 %)
569,694
(4.19 %)
24,792
(1.05 %)
12,339
(0.46 %)
339 Rankin cod (hap2 2025)
GCA_048129065.1
n/a n/a 15,830
(2.03 %)
54,183
(5.34 %)
n/a 41.30
(100.00 %)
0
(0 %)
33
(0.00 %)
199
(100.00 %)
2,922,062
(42.12 %)
374,226
(5.08 %)
6,124,255
(30.17 %)
2
(0.00 %)
488,334
(3.77 %)
24,493
(0.98 %)
12,327
(0.46 %)
340 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1
71,991
(5.94 %)
n/a 27,195
(1.88 %)
81,269
(3.63 %)
n/a 39.59
(99.96 %)
0
(0 %)
1,873
(0.04 %)
1,746
(100.00 %)
7,035,382
(51.89 %)
1,021,269
(5.98 %)
12,768,853
(46.85 %)
1
(0.00 %)
1,492,285
(4.74 %)
109,185
(4.70 %)
33,199
(0.66 %)
341 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1
n/a n/a 15,655
(3.01 %)
47,717
(6.87 %)
n/a 40.98
(95.57 %)
0
(0 %)
11,577
(4.42 %)
34,462
(100.00 %)
470,579
(3.16 %)
231,051
(1.91 %)
4,345,700
(23.24 %)
1,006
(0.10 %)
102,380
(1.25 %)
20,149
(1.25 %)
12,381
(0.71 %)
342 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1
n/a n/a 4,539
(2.01 %)
14,061
(4.35 %)
n/a 40.48
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,751
(100.00 %)
759,605
(49.59 %)
161,693
(7.99 %)
1,684,737
(29.93 %)
0
(0 %)
232,319
(5.07 %)
7,525
(1.31 %)
4,853
(0.81 %)
343 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1
47,129
(6.06 %)
n/a 17,089
(1.80 %)
33,378
(4.02 %)
n/a 40.45
(97.38 %)
42,102
(2.59 %)
62,964
(2.59 %)
325,620
(97.41 %)
898,445
(4.81 %)
863,000
(6.48 %)
7,757,382
(34.74 %)
2,457
(0.19 %)
n/a 34,329
(1.24 %)
22,250
(0.80 %)
344 red-bellied piranha (primary hap 2020)
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
n/a 16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
76,011
(5.65 %)
40.58
(99.17 %)
0
(0 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
2
(0.00 %)
1,005,141
(5.14 %)
33,087
(1.38 %)
20,822
(0.79 %)
345 reedfish (2021)
GCF_900747795.2
44,479
(2.01 %)
n/a 13,108
(0.46 %)
23,157
(1.29 %)
n/a 39.37
(99.18 %)
0
(0 %)
1,431
(0.82 %)
169
(100.00 %)
8,636,520
(39.34 %)
1,069,643
(2.91 %)
19,980,572
(47.52 %)
17
(0.00 %)
1,256,071
(2.69 %)
89,023
(1.13 %)
22,697
(0.30 %)
346 reedfish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900700845.2
n/a n/a 9,950
(0.37 %)
31,611
(1.22 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
38,598
(100.00 %)
1,300,565
(2.57 %)
685,834
(2.21 %)
14,691,576
(45.66 %)
0
(0 %)
588,794
(1.83 %)
63,365
(1.11 %)
17,365
(0.32 %)
347 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1
56,261
(13.18 %)
n/a 14,197
(2.71 %)
45,193
(6.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
157
(100.00 %)
941,095
(17.66 %)
238,999
(5.27 %)
4,283,692
(41.06 %)
0
(0 %)
191,618
(2.49 %)
43,014
(4.07 %)
25,748
(1.58 %)
348 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2
25,353
(3.88 %)
n/a 14,334
(1.56 %)
137,348
(9.74 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
0
(0 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
635,526
(3.14 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
7,501
(0.17 %)
424,697
(2.96 %)
52,308
(2.11 %)
22,130
(0.71 %)
349 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2
n/a n/a 27,928
(1.66 %)
110,791
(4.44 %)
n/a 43.36
(96.90 %)
0
(0 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
4,690,842
(57.30 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,763
(52.37 %)
2
(0.00 %)
3,475,805
(8.76 %)
70,821
(1.77 %)
19,956
(0.39 %)
350 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1
n/a n/a 18,165
(2.73 %)
62,580
(6.00 %)
n/a 38.74
(100.00 %)
6
(0.00 %)
6
(0.00 %)
4,612
(100.00 %)
2,483,904
(48.29 %)
584,363
(7.55 %)
5,582,076
(40.38 %)
0
(0 %)
923,875
(6.53 %)
60,229
(3.53 %)
19,604
(0.82 %)
351 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1
n/a n/a 18,132
(2.65 %)
63,523
(6.01 %)
n/a 38.80
(99.99 %)
1
(0.00 %)
471
(0.01 %)
86
(100.00 %)
2,613,900
(48.90 %)
625,102
(8.21 %)
5,738,444
(41.24 %)
1
(0.00 %)
1,070,552
(7.36 %)
65,328
(3.68 %)
20,458
(0.81 %)
352 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2
n/a n/a 15,291
(3.29 %)
45,865
(7.56 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,165
(100.00 %)
1,131,154
(25.69 %)
269,583
(5.08 %)
3,371,712
(24.64 %)
0
(0 %)
249,009
(3.21 %)
36,810
(2.68 %)
27,636
(1.84 %)
353 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2
n/a n/a 15,181
(3.34 %)
44,153
(7.53 %)
51,135
(7.40 %)
42.31
(99.98 %)
0
(0 %)
418
(0.02 %)
101
(100.00 %)
1,121,704
(25.48 %)
269,467
(4.88 %)
3,358,709
(24.69 %)
5
(0.00 %)
255,676
(3.48 %)
36,987
(3.02 %)
28,368
(1.91 %)
354 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1
52,554
(8.81 %)
n/a 17,664
(3.05 %)
48,403
(5.24 %)
n/a 36.06
(83.93 %)
0
(0 %)
5,144
(16.07 %)
2,870
(100.00 %)
2,600,095
(49.94 %)
683,499
(4.34 %)
6,000,462
(35.96 %)
5
(0.00 %)
444,046
(3.07 %)
33,741
(1.62 %)
19,239
(0.70 %)
355 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1
n/a n/a 15,434
(2.01 %)
44,991
(4.63 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
192
(0.00 %)
302
(100.00 %)
2,506,810
(40.54 %)
613,867
(8.67 %)
5,070,851
(48.32 %)
1
(0.00 %)
1,210,760
(8.82 %)
46,071
(2.57 %)
27,461
(1.23 %)
356 rouch bullseye (RE-2024b hap1 2024 refseq)
GCF_042242105.1
32,256
(9.05 %)
n/a 15,283
(3.03 %)
44,299
(6.93 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
87
(0.00 %)
441
(100.00 %)
1,115,191
(21.73 %)
271,391
(5.93 %)
3,651,073
(24.53 %)
2
(0.00 %)
299,227
(3.11 %)
19,771
(1.39 %)
13,537
(0.81 %)
357 rough bullseye (RE-2024b hap2 2024)
GCA_042242125.1
n/a n/a 14,475
(2.89 %)
44,413
(7.11 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
0
(0 %)
93
(0.00 %)
84
(100.00 %)
1,762,151
(30.90 %)
262,291
(5.80 %)
3,580,461
(24.37 %)
10
(0.00 %)
296,317
(3.16 %)
19,851
(1.40 %)
14,202
(0.86 %)
358 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1
n/a n/a 17,895
(2.55 %)
64,448
(5.84 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
0
(0 %)
418
(0.01 %)
110
(100.00 %)
2,661,155
(49.83 %)
673,071
(10.59 %)
5,755,954
(42.48 %)
1
(0.00 %)
1,108,306
(7.28 %)
66,952
(4.46 %)
21,217
(0.87 %)
359 rudd (fScaEry2.hap1.1 2024)
GCA_964197995.1
n/a n/a 18,254
(2.38 %)
68,852
(5.71 %)
n/a 39.02
(99.99 %)
4
(0.00 %)
836
(0.01 %)
759
(100.00 %)
2,854,977
(51.13 %)
754,287
(11.81 %)
5,942,764
(44.17 %)
2
(0.00 %)
1,392,734
(8.61 %)
72,686
(4.52 %)
23,184
(0.94 %)
360 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1
34,548
(9.49 %)
n/a 15,280
(3.00 %)
46,259
(6.95 %)
n/a 40.45
(99.99 %)
719
(0.01 %)
723
(0.01 %)
8,212
(99.99 %)
1,335,152
(28.19 %)
415,384
(6.53 %)
3,948,379
(27.81 %)
2
(0.00 %)
416,856
(4.21 %)
22,854
(1.61 %)
17,357
(1.05 %)
361 sailfin molly
GCF_001443285.1
53,986
(11.41 %)
n/a 15,048
(2.71 %)
33,482
(6.71 %)
n/a 39.18
(83.41 %)
36,637
(16.61 %)
41,735
(16.61 %)
54,623
(83.39 %)
357,919
(2.18 %)
189,502
(1.23 %)
4,873,063
(22.51 %)
1,755
(0.81 %)
87,954
(1.83 %)
34,138
(1.62 %)
26,570
(1.23 %)
362 sansaifugu (HTHZ2018 2019)
GCF_003711565.1
56,010
(20.10 %)
n/a 13,998
(4.84 %)
48,737
(11.56 %)
n/a 45.63
(99.99 %)
0
(0 %)
250
(0.01 %)
868
(100.00 %)
304,980
(15.98 %)
171,631
(4.98 %)
1,616,965
(21.60 %)
1
(0.00 %)
257,565
(5.29 %)
48,338
(9.79 %)
36,513
(5.09 %)
363 sardine (primary hap 2023 genbank)
GCA_963854185.1
n/a n/a 16,071
(2.33 %)
64,180
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
241
(100.00 %)
1,503,111
(11.74 %)
1,507,024
(15.48 %)
4,027,638
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,853
(8.48 %)
68,874
(3.56 %)
38,590
(1.78 %)
364 sardine (primary hap 2023 refseq)
GCF_963854185.1
48,146
(9.15 %)
n/a 16,069
(2.33 %)
64,178
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
0
(0 %)
1,654
(0.04 %)
240
(100.00 %)
1,503,108
(11.74 %)
1,507,022
(15.48 %)
4,027,614
(37.52 %)
11
(0.00 %)
1,188,852
(8.48 %)
68,873
(3.56 %)
38,589
(1.78 %)
365 scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023)
GCF_030265065.1
51,270
(7.00 %)
n/a 13,854
(1.32 %)
48,980
(3.46 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
0
(0 %)
9
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,805,346
(21.21 %)
512,153
(12.76 %)
6,260,589
(63.96 %)
0
(0 %)
859,332
(5.23 %)
96,908
(3.65 %)
37,320
(1.36 %)
366 sea stickleback (SK-2024b hap1 2025)
GCA_048126635.1
n/a n/a 14,310
(4.44 %)
47,336
(10.19 %)
n/a 44.83
(99.99 %)
0
(0 %)
241
(0.01 %)
38
(100.00 %)
446,827
(13.86 %)
192,599
(8.52 %)
2,033,160
(22.85 %)
1
(0.00 %)
175,997
(3.04 %)
61,012
(13.03 %)
47,420
(5.99 %)
367 sea stickleback (SK-2024b hap2 2025)
GCA_048127205.1
n/a n/a 14,237
(4.44 %)
46,701
(10.13 %)
n/a 44.75
(99.99 %)
0
(0 %)
276
(0.01 %)
52
(100.00 %)
413,494
(14.42 %)
189,429
(8.99 %)
1,996,715
(23.13 %)
3
(0.00 %)
178,781
(3.14 %)
60,252
(12.60 %)
46,667
(5.92 %)
368 Senegalese sole
GCF_019176455.1
46,446
(12.02 %)
n/a 15,155
(3.15 %)
43,828
(7.31 %)
n/a 40.92
(99.99 %)
0
(0 %)
662
(0.01 %)
1,937
(100.00 %)
522,618
(4.22 %)
317,280
(4.23 %)
4,040,245
(28.25 %)
1
(0.00 %)
268,721
(3.11 %)
26,946
(1.79 %)
16,377
(1.03 %)
369 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1
n/a n/a 14,728
(2.46 %)
62,094
(7.09 %)
n/a 42.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,847
(100.00 %)
939,151
(11.90 %)
472,983
(7.68 %)
4,326,183
(28.40 %)
0
(0 %)
486,310
(4.09 %)
64,290
(4.16 %)
42,087
(2.28 %)
370 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1
n/a n/a 15,032
(2.44 %)
62,625
(6.97 %)
n/a 42.07
(99.98 %)
0
(0 %)
598
(0.02 %)
847
(100.00 %)
967,197
(11.85 %)
498,286
(8.15 %)
4,397,828
(28.96 %)
9
(0.00 %)
531,478
(4.46 %)
65,744
(4.06 %)
42,870
(2.25 %)
371 sharptooth jobfish (hap1 2024)
GCA_045363895.1
n/a n/a 15,800
(1.77 %)
51,791
(4.52 %)
n/a 39.82
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
283
(100.00 %)
777,839
(3.19 %)
459,791
(3.90 %)
7,958,604
(35.17 %)
0
(0 %)
375,713
(2.47 %)
21,711
(0.94 %)
12,537
(0.40 %)
372 sharptooth jobfish (hap2 2024)
GCA_045363885.1
n/a n/a 15,879
(1.78 %)
51,774
(4.52 %)
n/a 39.81
(100.00 %)
0
(0 %)
76
(0.00 %)
172
(100.00 %)
778,842
(3.19 %)
462,247
(3.82 %)
7,956,116
(35.13 %)
1
(0.00 %)
374,216
(2.38 %)
21,587
(0.91 %)
12,357
(0.42 %)
373 sheepshead minnow
GCF_000732505.1
37,879
(7.01 %)
n/a 14,749
(2.02 %)
25,480
(4.66 %)
n/a 38.19
(86.93 %)
101,700
(13.10 %)
113,210
(13.10 %)
110,959
(86.90 %)
363,397
(1.88 %)
195,191
(1.43 %)
6,444,762
(27.47 %)
3,240
(0.30 %)
136,313
(1.74 %)
18,269
(0.66 %)
10,928
(0.41 %)
374 shortfin molly
GCF_001443325.1
54,473
(11.42 %)
n/a 15,104
(2.72 %)
33,717
(6.74 %)
n/a 39.23
(84.81 %)
32,496
(15.20 %)
37,507
(15.20 %)
50,598
(84.80 %)
328,347
(2.03 %)
172,112
(1.18 %)
4,876,942
(22.80 %)
1,876
(0.89 %)
88,660
(1.88 %)
34,271
(1.66 %)
26,703
(1.25 %)
375 Siamese fighting fish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1
n/a n/a 14,510
(4.12 %)
60,058
(10.77 %)
n/a 45.51
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,705
(100.00 %)
249,671
(3.68 %)
182,366
(4.87 %)
1,939,533
(22.55 %)
0
(0 %)
223,835
(4.10 %)
72,474
(13.55 %)
56,347
(7.50 %)
376 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4
59,278
(19.85 %)
n/a 14,594
(4.32 %)
55,265
(10.96 %)
n/a 45.31
(99.99 %)
0
(0 %)
321
(0.01 %)
36
(100.00 %)
384,203
(19.38 %)
175,898
(4.39 %)
1,946,630
(23.16 %)
2
(0.00 %)
209,905
(4.10 %)
70,331
(13.13 %)
54,790
(7.31 %)
377 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2
n/a n/a 14,737
(4.05 %)
61,568
(10.70 %)
n/a 45.50
(100.00 %)
108
(0.00 %)
108
(0.00 %)
3,872
(100.00 %)
392,585
(19.23 %)
190,741
(5.09 %)
1,994,824
(23.20 %)
0
(0 %)
245,925
(4.39 %)
74,259
(13.49 %)
57,619
(7.42 %)
378 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1
131,166
(9.80 %)
n/a 29,612
(2.99 %)
81,338
(5.43 %)
n/a 37.63
(99.92 %)
0
(0 %)
2,597
(0.08 %)
51
(100.00 %)
3,277,259
(45.05 %)
801,192
(7.96 %)
7,910,205
(42.51 %)
3
(0.00 %)
1,037,130
(5.68 %)
60,236
(2.18 %)
20,870
(0.55 %)
379 silver spinyfin (hap1 2025)
GCA_048569125.1
n/a n/a 16,906
(1.39 %)
115,931
(7.77 %)
n/a 44.10
(99.96 %)
0
(0 %)
3,365
(0.04 %)
5,504
(100.00 %)
4,606,608
(53.63 %)
1,428,326
(25.54 %)
4,395,832
(51.22 %)
36
(0.00 %)
3,286,557
(14.58 %)
166,807
(7.52 %)
42,772
(1.63 %)
380 silver spinyfin (hap2 2025)
GCA_048569135.1
n/a n/a 17,409
(1.14 %)
146,413
(8.24 %)
n/a 44.20
(99.96 %)
3,473
(0.04 %)
3,473
(0.04 %)
8,068
(99.96 %)
2,051,529
(14.72 %)
1,808,246
(28.36 %)
4,967,915
(54.93 %)
30
(0.00 %)
4,408,195
(15.89 %)
208,486
(7.83 %)
55,331
(1.50 %)
381 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1
n/a n/a 13,661
(1.11 %)
75,418
(4.21 %)
n/a 45.01
(99.96 %)
0
(0 %)
3,120
(0.04 %)
1,059
(100.00 %)
4,634,757
(53.53 %)
1,006,319
(17.13 %)
5,273,732
(51.16 %)
14
(0.00 %)
1,782,741
(8.47 %)
145,115
(7.59 %)
66,645
(2.19 %)
382 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1
34,018
(4.17 %)
n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
0
(0 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
17
(0.00 %)
1,796,705
(8.53 %)
143,632
(7.43 %)
65,914
(2.15 %)
383 smallmouth bass
GCF_021292245.1
55,919
(9.40 %)
n/a 15,509
(2.37 %)
49,387
(5.61 %)
n/a 40.72
(99.65 %)
0
(0 %)
34,581
(0.36 %)
15,020
(100.00 %)
445,979
(2.50 %)
249,630
(2.49 %)
5,071,015
(28.28 %)
3,470
(0.39 %)
278,594
(4.93 %)
23,875
(1.36 %)
11,538
(0.57 %)
384 snake pipefish (RoL-2023_Sb 2023)
GCF_033978785.1
57,883
(4.39 %)
n/a 15,654
(1.03 %)
72,123
(3.58 %)
n/a 38.64
(100.00 %)
0
(0 %)
2,564
(0.00 %)
424
(100.00 %)
3,149,025
(23.73 %)
1,621,410
(19.58 %)
7,534,195
(67.22 %)
1
(0.00 %)
4,080,159
(14.37 %)
122,765
(3.07 %)
51,511
(1.21 %)
385 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2
75,628
(6.10 %)
n/a 24,075
(1.71 %)
98,364
(4.30 %)
n/a 43.37
(96.15 %)
1,903
(0.01 %)
25,658
(3.85 %)
36,660
(99.99 %)
949,725
(3.53 %)
1,465,583
(10.82 %)
8,853,884
(48.52 %)
872
(0.04 %)
1,715,998
(5.18 %)
62,850
(1.45 %)
16,671
(0.36 %)
386 sockeye salmon (Pitt River 2024)
GCF_034236695.1
80,798
(5.59 %)
n/a 26,218
(1.35 %)
116,746
(3.87 %)
n/a 44.03
(99.93 %)
1,058
(0.00 %)
4,351
(0.07 %)
12,436
(100.00 %)
6,356,046
(54.95 %)
2,840,516
(31.41 %)
10,575,179
(57.52 %)
9
(0.00 %)
6,694,579
(13.15 %)
77,648
(1.61 %)
19,825
(0.33 %)
387 South Georgia icefish (v2 primary hap 2022)
GCF_902827115.2
42,862
(7.09 %)
n/a 14,776
(1.80 %)
68,955
(6.18 %)
n/a 42.07
(99.90 %)
0
(0 %)
2,603
(0.11 %)
1,563
(100.00 %)
512,600
(3.45 %)
473,958
(7.19 %)
3,590,436
(45.74 %)
20
(0.00 %)
757,296
(8.57 %)
88,970
(4.31 %)
17,944
(0.76 %)
388 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1
n/a n/a 15,727
(2.61 %)
43,177
(5.74 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 895
(100.00 %)
1,590,386
(33.53 %)
246,800
(2.86 %)
5,173,834
(26.85 %)
0
(0 %)
323,596
(3.31 %)
14,473
(0.87 %)
9,723
(0.47 %)
389 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
n/a 15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
0
(0 %)
326,254
(3.37 %)
14,097
(0.88 %)
8,860
(0.42 %)
390 southern platyfish
GCF_002775205.1
46,367
(11.15 %)
n/a 14,674
(2.66 %)
28,368
(6.82 %)
n/a 38.97
(99.53 %)
0
(0 %)
156
(0.47 %)
102
(100.00 %)
323,402
(2.76 %)
146,477
(2.33 %)
4,741,552
(28.27 %)
0
(0 %)
190,964
(2.71 %)
34,667
(2.13 %)
24,564
(1.37 %)
391 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1
74,317
(6.97 %)
n/a 30,906
(3.19 %)
55,474
(5.66 %)
n/a 37.28
(92.69 %)
168,741
(7.34 %)
168,741
(7.34 %)
254,423
(92.66 %)
1,129,104
(5.02 %)
730,197
(4.59 %)
8,910,005
(36.97 %)
1,220
(0.18 %)
542,313
(6.57 %)
64,238
(1.79 %)
28,032
(0.71 %)
392 spangled emperor (hap1 2024)
GCA_045362495.1
n/a n/a 15,554
(1.75 %)
58,641
(5.19 %)
n/a 40.59
(100.00 %)
0
(0 %)
196
(0.00 %)
226
(100.00 %)
682,449
(3.01 %)
409,809
(4.43 %)
7,114,584
(28.98 %)
6
(0.00 %)
539,832
(3.67 %)
37,214
(1.53 %)
18,727
(0.64 %)
393 spangled emperor (hap2 2024)
GCA_045362485.1
n/a n/a 15,490
(1.77 %)
57,993
(5.20 %)
n/a 40.57
(100.00 %)
0
(0 %)
244
(0.00 %)
151
(100.00 %)
677,985
(3.03 %)
408,391
(4.33 %)
7,184,861
(29.15 %)
4
(0.00 %)
529,035
(3.52 %)
36,602
(1.46 %)
18,481
(0.64 %)
394 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1
57,720
(10.03 %)
n/a 15,810
(2.14 %)
58,218
(5.77 %)
n/a 40.33
(99.99 %)
0
(0 %)
871
(0.01 %)
81
(100.00 %)
1,505,948
(35.31 %)
346,542
(4.71 %)
5,210,329
(31.65 %)
0
(0 %)
506,956
(4.12 %)
36,529
(1.65 %)
21,732
(0.92 %)
395 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1
38,931
(8.84 %)
n/a 15,624
(2.29 %)
35,942
(5.59 %)
n/a 40.01
(85.05 %)
0
(0 %)
209,115
(15.01 %)
30,414
(100.00 %)
372,901
(2.33 %)
278,854
(1.99 %)
5,622,334
(22.61 %)
3,125
(0.18 %)
147,444
(1.33 %)
25,079
(0.95 %)
17,741
(0.66 %)
396 spotted green pufferfish (2004)
GCA_000180735.1
n/a 193,449
(10.86 %)
13,641
(5.13 %)
57,982
(13.46 %)
n/a 46.43
(91.24 %)
18,974
(8.76 %)
18,974
(8.76 %)
44,686
(91.24 %)
252,877
(4.38 %)
159,939
(3.51 %)
1,689,462
(18.66 %)
20
(0.00 %)
119,601
(3.94 %)
51,580
(13.42 %)
39,946
(6.79 %)
397 spotted tilapia (v1 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.1
46,818
(8.35 %)
n/a 14,938
(2.04 %)
55,475
(6.12 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
23
(0.00 %)
792
(100.00 %)
505,488
(2.57 %)
269,742
(4.14 %)
4,697,020
(30.74 %)
0
(0 %)
395,431
(3.97 %)
30,399
(1.90 %)
16,887
(0.82 %)
398 spotted tilapia (v2 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.2
48,380
(8.37 %)
n/a 15,470
(2.04 %)
57,237
(6.11 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
24
(0.00 %)
791
(100.00 %)
523,070
(2.57 %)
277,554
(4.08 %)
4,872,723
(30.67 %)
0
(0 %)
404,433
(3.93 %)
31,383
(1.89 %)
17,453
(0.82 %)
399 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1
110,154
(7.62 %)
n/a 25,364
(1.76 %)
40,715
(4.06 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
0
(0 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
10
(0.00 %)
1,593,747
(6.87 %)
64,522
(2.85 %)
21,984
(0.89 %)
400 sterlet (v2 paternal hap 2022)
GCA_902713435.2
n/a n/a 24,717
(1.73 %)
40,151
(4.13 %)
74,807
(5.54 %)
40.09
(99.99 %)
0
(0 %)
475
(0.01 %)
1,517
(100.00 %)
1,844,596
(9.77 %)
1,119,340
(9.88 %)
9,372,934
(41.58 %)
8
(0.00 %)
1,582,556
(6.83 %)
65,007
(2.74 %)
17,761
(0.38 %)
401 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1
n/a n/a 16,177
(4.18 %)
40,160
(7.35 %)
n/a 39.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,237
(100.00 %)
1,208,781
(38.02 %)
121,854
(7.96 %)
2,956,942
(32.61 %)
0
(0 %)
310,772
(4.79 %)
27,787
(3.58 %)
14,364
(1.06 %)
402 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1
n/a n/a 16,419
(3.98 %)
40,677
(7.21 %)
n/a 39.69
(99.97 %)
0
(0 %)
825
(0.03 %)
100
(100.00 %)
1,324,513
(39.84 %)
143,170
(9.30 %)
3,000,881
(34.30 %)
1
(0.00 %)
392,291
(5.75 %)
30,130
(3.71 %)
15,123
(1.03 %)
403 stone moroko (DD20220531a primary hap 2022)
GCF_024679245.1
59,497
(6.82 %)
n/a 17,172
(2.25 %)
57,383
(4.85 %)
n/a 39.18
(99.99 %)
0
(0 %)
497
(0.01 %)
81
(100.00 %)
4,750,810
(63.58 %)
649,426
(10.14 %)
6,511,384
(46.74 %)
4
(0.00 %)
1,041,545
(6.23 %)
74,723
(4.45 %)
16,230
(0.62 %)
404 straightnose pipefish (RoL-2023_Sa 2023)
GCF_033978795.1
56,498
(4.86 %)
n/a 14,602
(1.00 %)
64,279
(2.96 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
0
(0 %)
1,172
(0.00 %)
473
(100.00 %)
2,984,285
(27.54 %)
1,402,691
(20.35 %)
7,915,062
(67.02 %)
0
(0 %)
4,017,415
(14.33 %)
140,374
(3.90 %)
46,995
(1.10 %)
405 striated frogfish (MH-2024 2024)
GCF_040054535.1
45,220
(12.66 %)
n/a 14,509
(3.35 %)
46,221
(7.95 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
0
(0 %)
18
(0.00 %)
42
(100.00 %)
791,570
(25.79 %)
305,491
(6.68 %)
3,000,938
(29.61 %)
0
(0 %)
272,583
(3.30 %)
36,818
(4.17 %)
23,466
(2.10 %)
406 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1
n/a n/a 15,871
(2.85 %)
42,287
(5.51 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
3,274
(100.00 %)
1,826,752
(37.53 %)
592,022
(6.69 %)
4,899,884
(32.33 %)
0
(0 %)
491,621
(3.91 %)
17,357
(1.25 %)
12,560
(0.74 %)
407 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1
53,860
(11.99 %)
n/a 16,033
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
0
(0 %)
236
(0.51 %)
58
(100.00 %)
1,870,234
(37.80 %)
605,570
(6.82 %)
5,059,429
(32.43 %)
2
(0.00 %)
531,388
(4.26 %)
17,919
(1.29 %)
12,796
(0.75 %)
408 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1
50,044
(9.61 %)
n/a 15,665
(2.76 %)
41,398
(5.35 %)
n/a 38.86
(99.98 %)
0
(0 %)
463
(0.02 %)
150
(100.00 %)
777,186
(5.69 %)
603,962
(6.24 %)
5,141,987
(32.41 %)
0
(0 %)
499,249
(4.08 %)
17,264
(1.20 %)
11,793
(0.66 %)
409 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1
40,992
(9.44 %)
n/a 15,295
(2.91 %)
20,865
(5.31 %)
n/a 38.71
(97.32 %)
0
(0 %)
23,755
(2.69 %)
567
(100.00 %)
693,498
(4.75 %)
489,286
(3.69 %)
4,849,313
(30.04 %)
22
(0.00 %)
189,512
(1.66 %)
15,076
(0.95 %)
10,761
(0.60 %)
410 striped sea-bass
GCF_004916995.1
32,103
(10.78 %)
n/a 14,422
(3.07 %)
38,188
(6.41 %)
n/a 40.19
(99.19 %)
0
(0 %)
73,335
(0.86 %)
630
(100.00 %)
365,581
(2.59 %)
142,967
(0.99 %)
4,151,813
(22.73 %)
371
(0.01 %)
25,024
(0.35 %)
13,730
(0.95 %)
10,471
(0.69 %)
411 Sumatra barb
GCF_018831695.1
54,947
(11.16 %)
n/a 18,745
(3.98 %)
49,520
(6.36 %)
n/a 38.24
(99.95 %)
0
(0 %)
5,075
(0.05 %)
1,122
(100.00 %)
638,783
(6.33 %)
357,159
(7.71 %)
4,520,846
(32.46 %)
16
(0.00 %)
624,611
(5.29 %)
46,339
(3.96 %)
34,160
(2.01 %)
412 swamp eel
GCF_001952655.1
43,831
(10.64 %)
n/a 14,741
(2.98 %)
20,099
(5.80 %)
n/a 40.90
(92.01 %)
51,257
(8.01 %)
51,257
(8.01 %)
71,879
(91.99 %)
266,195
(1.84 %)
95,726
(1.16 %)
3,596,747
(21.95 %)
26
(0.02 %)
54,721
(1.57 %)
7,065
(0.42 %)
5,103
(0.29 %)
413 swordfish
GCF_016859285.1
47,986
(9.92 %)
n/a 15,208
(2.84 %)
42,556
(5.91 %)
n/a 40.69
(99.97 %)
0
(0 %)
449
(0.03 %)
1,482
(100.00 %)
484,543
(3.59 %)
230,762
(3.41 %)
4,496,150
(23.94 %)
0
(0 %)
203,746
(2.18 %)
27,129
(2.10 %)
20,905
(1.34 %)
414 tambaqui
GCF_904425465.1
46,601
(6.55 %)
n/a 17,150
(1.88 %)
50,327
(4.03 %)
n/a 39.33
(100.00 %)
0
(0 %)
420
(0.00 %)
1,269
(100.00 %)
753,112
(4.00 %)
676,948
(5.71 %)
8,317,676
(35.32 %)
3
(0.00 %)
679,968
(3.78 %)
25,784
(0.92 %)
17,476
(0.58 %)
415 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1
n/a n/a 14,720
(2.58 %)
45,918
(6.44 %)
n/a 40.37
(99.99 %)
0
(0 %)
454
(0.01 %)
188
(100.00 %)
1,242,704
(17.37 %)
518,293
(15.23 %)
3,986,694
(40.18 %)
1
(0.00 %)
670,254
(6.56 %)
51,441
(3.53 %)
22,258
(1.30 %)
416 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1
n/a n/a 15,347
(2.73 %)
50,294
(7.25 %)
n/a 42.30
(99.98 %)
30
(0.00 %)
610
(0.02 %)
393
(100.00 %)
1,157,324
(26.70 %)
229,196
(4.33 %)
3,694,790
(27.54 %)
1
(0.00 %)
385,033
(4.63 %)
38,929
(2.20 %)
24,476
(1.25 %)
417 three-spined stickleback
GCF_016920845.1
50,181
(16.09 %)
n/a 14,935
(3.99 %)
53,773
(9.96 %)
n/a 44.66
(99.24 %)
0
(0 %)
3,125
(0.76 %)
2,937
(100.00 %)
368,987
(9.09 %)
160,564
(2.89 %)
2,308,841
(21.91 %)
4
(0.00 %)
148,689
(2.94 %)
80,336
(11.49 %)
57,087
(5.92 %)
418 three-spined stickleback (hap1 2024)
GCA_964276395.1
n/a n/a 14,939
(3.72 %)
56,284
(10.07 %)
n/a 44.71
(99.99 %)
3
(0.00 %)
331
(0.01 %)
133
(100.00 %)
573,569
(20.53 %)
206,699
(9.01 %)
2,335,009
(27.29 %)
7
(0.00 %)
213,153
(3.82 %)
84,009
(12.41 %)
57,803
(5.54 %)
419 three-spined stickleback (hap2 2024)
GCA_964276385.1
n/a n/a 13,591
(3.79 %)
50,693
(10.19 %)
n/a 44.72
(99.99 %)
309
(0.01 %)
309
(0.01 %)
479
(99.99 %)
505,547
(19.86 %)
181,092
(8.75 %)
2,117,454
(27.02 %)
3
(0.00 %)
218,946
(4.51 %)
75,434
(12.33 %)
51,737
(5.53 %)
420 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1
n/a n/a 13,912
(1.87 %)
62,727
(6.28 %)
n/a 42.90
(99.99 %)
0
(0 %)
894
(0.01 %)
755
(100.00 %)
1,981,480
(37.86 %)
652,950
(27.50 %)
3,680,829
(47.75 %)
2
(0.00 %)
1,877,326
(11.62 %)
96,414
(8.01 %)
44,593
(2.17 %)
421 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437365.1
n/a n/a 14,276
(1.78 %)
66,576
(6.32 %)
n/a 42.96
(99.99 %)
0
(0 %)
794
(0.01 %)
820
(100.00 %)
2,127,818
(38.86 %)
708,255
(30.28 %)
3,809,452
(49.66 %)
2
(0.00 %)
2,111,836
(12.18 %)
101,682
(8.04 %)
46,739
(2.13 %)
422 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2
47,024
(13.33 %)
n/a 13,806
(3.76 %)
52,367
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.08 %)
22,977
(6.92 %)
22,977
(6.92 %)
55,891
(93.08 %)
356,857
(3.66 %)
155,338
(3.36 %)
2,806,278
(24.56 %)
111
(0.08 %)
112,464
(5.32 %)
61,010
(7.71 %)
45,318
(4.17 %)
423 tongue sole
GCF_000523025.1
45,186
(16.40 %)
n/a 14,186
(3.98 %)
20,816
(8.22 %)
n/a 40.82
(94.88 %)
33,269
(5.14 %)
33,269
(5.14 %)
62,912
(94.86 %)
423,833
(4.34 %)
235,739
(3.33 %)
3,085,031
(24.78 %)
78
(0.05 %)
83,655
(2.37 %)
17,094
(1.42 %)
11,360
(0.88 %)
424 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3
n/a n/a 13,635
(4.82 %)
48,723
(11.83 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
0
(0 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,793
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
0
(0 %)
206,265
(4.46 %)
46,936
(9.72 %)
35,741
(5.19 %)
425 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2
53,479
(18.31 %)
n/a 14,527
(4.79 %)
28,597
(10.65 %)
55,587
(14.38 %)
45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
281,011
(10.36 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,756
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,975
(9.63 %)
37,920
(5.08 %)
426 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3
n/a n/a 14,527
(4.79 %)
51,181
(11.72 %)
n/a 45.67
(99.04 %)
0
(0 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
325,077
(14.03 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,754
(20.86 %)
1
(0.02 %)
281,981
(5.43 %)
49,975
(9.63 %)
37,920
(5.08 %)
427 trahira (v2 hap2 2024)
GCA_029633875.2
n/a n/a 15,041
(2.01 %)
42,180
(4.38 %)
n/a 41.03
(96.21 %)
143
(1.35 %)
792
(3.79 %)
594
(98.65 %)
1,069,159
(7.06 %)
653,554
(15.46 %)
4,921,631
(38.75 %)
7
(0.00 %)
1,141,429
(7.56 %)
26,440
(2.18 %)
11,688
(0.47 %)
428 trahira (v1 hap1 2024 refseq)
GCF_029633855.1
55,764
(7.71 %)
n/a 17,259
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
0
(0 %)
989
(5.49 %)
598
(100.00 %)
2,407,637
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,475
(37.52 %)
3
(0.00 %)
1,264,118
(7.29 %)
29,012
(2.12 %)
12,979
(0.45 %)
429 trahira (v2 hap1 2024 genbank)
GCA_029633855.2
n/a n/a 17,256
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
0
(0 %)
989
(5.49 %)
597
(100.00 %)
2,407,631
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,418
(37.52 %)
3
(0.00 %)
1,264,125
(7.29 %)
29,012
(2.12 %)
12,979
(0.45 %)
430 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301465.1
n/a n/a 14,730
(2.84 %)
50,956
(7.07 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
179
(0.00 %)
161
(100.00 %)
548,208
(5.35 %)
356,364
(7.30 %)
3,448,877
(26.01 %)
2
(0.00 %)
449,816
(4.07 %)
26,685
(1.80 %)
17,280
(1.06 %)
431 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301475.1
n/a n/a 14,680
(2.80 %)
50,753
(6.99 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
0
(0 %)
187
(0.00 %)
248
(100.00 %)
559,722
(5.35 %)
382,817
(8.57 %)
3,423,208
(26.76 %)
2
(0.00 %)
478,555
(4.32 %)
26,739
(1.77 %)
17,190
(1.04 %)
432 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1
n/a n/a 14,816
(3.44 %)
49,680
(8.16 %)
n/a 43.40
(99.97 %)
0
(0 %)
805
(0.03 %)
108
(100.00 %)
808,348
(19.20 %)
301,230
(7.15 %)
3,267,772
(25.91 %)
4
(0.00 %)
311,531
(3.41 %)
66,132
(6.90 %)
41,801
(3.31 %)
433 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1
57,285
(14.93 %)
n/a 14,887
(3.52 %)
49,403
(8.32 %)
87,351
(14.65 %)
43.54
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 28
(100.00 %)
455,017
(0.00 %)
297,185
(5.03 %)
3,312,612
(24.33 %)
0
(0 %)
273,238
(2.64 %)
65,633
(7.08 %)
41,821
(3.38 %)
434 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1
40,373
(7.85 %)
n/a 14,339
(2.08 %)
84,906
(20.47 %)
57,218
(6.01 %)
42.51
(68.98 %)
63,014
(31.03 %)
85,562
(31.04 %)
68,911
(68.97 %)
392,114
(2.78 %)
307,607
(2.09 %)
4,777,941
(27.62 %)
528
(0.12 %)
221,213
(1.41 %)
61,105
(2.15 %)
17,725
(0.62 %)
435 turquoise killifish (GRZ-AD 2024)
GCF_043380555.1
56,976
(5.74 %)
n/a 14,604
(1.25 %)
72,207
(4.35 %)
n/a 44.51
(100.00 %)
0
(0 %)
369
(0.00 %)
304
(100.00 %)
2,858,575
(46.12 %)
660,603
(29.65 %)
4,283,242
(61.88 %)
7
(0.00 %)
2,835,016
(13.43 %)
118,966
(11.71 %)
17,862
(0.51 %)
436 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1
54,488
(6.75 %)
n/a 14,227
(1.27 %)
69,161
(4.33 %)
n/a 44.33
(93.22 %)
0
(0 %)
3,093
(6.78 %)
2,681
(100.00 %)
2,760,581
(47.64 %)
635,213
(25.56 %)
4,136,925
(56.55 %)
8
(0.00 %)
2,533,340
(11.75 %)
110,696
(10.50 %)
17,579
(0.49 %)
437 walking catfish (CIFAMagur01 2020)
GCA_013621035.1
n/a 23,712
(3.37 %)
15,895
(2.18 %)
46,934
(4.73 %)
n/a 39.83
(99.95 %)
0
(0 %)
605
(0.05 %)
3,484
(100.00 %)
1,061,538
(6.25 %)
611,618
(5.19 %)
5,978,835
(37.11 %)
3
(0.00 %)
510,982
(4.22 %)
54,666
(3.50 %)
24,478
(1.06 %)
438 walleye pollock (NIFS_2021 2022)
GCF_026213295.1
49,084
(12.15 %)
n/a 14,241
(2.71 %)
70,653
(9.29 %)
n/a 45.59
(99.96 %)
0
(0 %)
2,816
(0.04 %)
168
(100.00 %)
1,274,742
(38.63 %)
797,757
(14.11 %)
2,725,416
(34.38 %)
8
(0.00 %)
658,410
(7.33 %)
95,149
(8.09 %)
57,122
(4.03 %)
439 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1
n/a n/a 14,197
(3.33 %)
44,782
(7.70 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,294
(100.00 %)
396,279
(4.74 %)
275,154
(5.76 %)
2,933,132
(29.41 %)
0
(0 %)
277,720
(3.27 %)
35,104
(4.08 %)
21,634
(1.95 %)
440 warty frogfish (primary hap 2020)
GCA_013358685.1
n/a n/a 14,494
(3.34 %)
45,310
(7.77 %)
n/a 41.86
(99.87 %)
0
(0 %)
219
(0.13 %)
155
(100.00 %)
413,753
(4.95 %)
290,313
(6.11 %)
3,010,996
(29.71 %)
3
(0.00 %)
305,411
(3.51 %)
36,840
(4.18 %)
22,433
(1.95 %)
441 western mosquitofish
GCF_019740435.1
54,029
(12.31 %)
n/a 14,667
(2.80 %)
44,358
(6.62 %)
n/a 38.94
(97.42 %)
0
(0 %)
181
(2.58 %)
37
(100.00 %)
348,476
(2.56 %)
158,728
(2.21 %)
4,604,959
(26.85 %)
0
(0 %)
174,331
(2.27 %)
30,624
(1.94 %)
23,348
(1.33 %)
442 western speckled dace (OS25496 2023)
GCF_029890125.1
46,203
(5.36 %)
n/a 16,945
(2.57 %)
65,343
(6.35 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 930
(100.00 %)
2,528,154
(48.24 %)
549,447
(8.24 %)
5,157,802
(41.42 %)
0
(0 %)
921,640
(6.77 %)
84,874
(6.05 %)
24,156
(1.14 %)
443 westslope cutthroat trout (Uvic-CL-2024 2024)
GCF_045791955.1
85,126
(5.62 %)
n/a 27,822
(1.58 %)
113,187
(4.31 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
1,381
(0.01 %)
1,381
(0.01 %)
4,647
(99.99 %)
1,200,605
(4.82 %)
2,237,797
(24.56 %)
10,339,252
(54.27 %)
19
(0.00 %)
4,842,427
(11.62 %)
70,550
(1.65 %)
18,857
(0.33 %)
444 White Sands pupfish
GCF_016077235.1
46,084
(6.27 %)
n/a 14,817
(1.71 %)
52,055
(4.88 %)
n/a 39.01
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,003
(100.00 %)
489,894
(2.67 %)
304,277
(3.91 %)
6,371,712
(38.05 %)
0
(0 %)
457,693
(3.60 %)
41,820
(1.75 %)
13,011
(0.56 %)
445 wolf-eel
GCF_004355925.1
43,625
(14.00 %)
n/a 14,930
(3.24 %)
31,372
(7.30 %)
n/a 42.10
(92.86 %)
23,085
(7.15 %)
23,891
(7.15 %)
33,400
(92.85 %)
379,343
(3.26 %)
244,853
(2.39 %)
3,432,622
(22.07 %)
476
(0.06 %)
108,255
(0.97 %)
30,581
(2.04 %)
19,275
(1.18 %)
446 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1
n/a n/a 14,753
(3.49 %)
49,516
(8.47 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
0
(0 %)
222
(0.00 %)
171
(100.00 %)
458,382
(5.18 %)
420,718
(8.01 %)
3,146,054
(25.71 %)
0
(0 %)
390,050
(4.18 %)
69,817
(7.20 %)
44,403
(3.53 %)
447 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1
n/a n/a 14,847
(3.48 %)
50,136
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
0
(0 %)
219
(0.00 %)
443
(100.00 %)
461,903
(5.20 %)
422,251
(8.03 %)
3,180,804
(25.81 %)
1
(0.00 %)
392,635
(4.18 %)
70,183
(7.15 %)
44,599
(3.52 %)
448 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 primary hap 2022)
GCF_023055335.1
42,410
(12.47 %)
n/a 14,845
(3.48 %)
50,132
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
219
(0.00 %)
219
(0.00 %)
661
(100.00 %)
461,895
(5.20 %)
422,249
(8.03 %)
3,180,722
(25.81 %)
1
(0.00 %)
392,632
(4.18 %)
70,181
(7.15 %)
44,597
(3.52 %)
449 worm pipefish (RoL_2023-P1 2023)
GCF_033978685.1
73,681
(3.43 %)
n/a 25,892
(1.02 %)
114,154
(3.30 %)
n/a 39.45
(100.00 %)
0
(0 %)
146
(0.00 %)
630
(100.00 %)
4,795,312
(24.37 %)
2,093,730
(16.74 %)
13,132,465
(67.32 %)
0
(0 %)
5,394,148
(11.91 %)
248,526
(4.59 %)
79,895
(1.28 %)
450 Wuchang bream
GCF_018812025.1
68,768
(8.86 %)
n/a 18,247
(2.62 %)
57,323
(5.24 %)
n/a 37.64
(99.83 %)
0
(0 %)
1,281
(0.17 %)
243
(100.00 %)
801,110
(0.00 %)
559,399
(5.04 %)
6,340,567
(43.09 %)
2
(0.00 %)
715,866
(5.11 %)
45,067
(2.52 %)
19,912
(0.78 %)
451 Yangtze koukloug (SWU-2019 2020)
GCF_012432095.1
63,925
(10.50 %)
n/a 17,502
(3.25 %)
52,519
(5.86 %)
n/a 37.23
(99.62 %)
0
(0 %)
617
(0.38 %)
353
(100.00 %)
2,297,102
(50.34 %)
368,423
(3.28 %)
5,171,389
(38.98 %)
1
(0.00 %)
338,882
(3.77 %)
32,824
(2.00 %)
14,248
(0.64 %)
452 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129025.1
n/a n/a 15,641
(1.95 %)
52,141
(5.13 %)
n/a 40.61
(100.00 %)
0
(0 %)
17
(0.00 %)
250
(100.00 %)
607,010
(2.66 %)
288,837
(3.91 %)
6,785,488
(31.37 %)
1
(0.00 %)
392,218
(2.89 %)
39,560
(1.65 %)
18,423
(0.65 %)
453 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129055.1
n/a n/a 15,666
(1.88 %)
53,049
(5.01 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
29
(0.00 %)
324
(100.00 %)
620,903
(2.64 %)
305,809
(5.18 %)
6,707,330
(33.41 %)
2
(0.00 %)
551,663
(3.78 %)
45,863
(1.88 %)
18,859
(0.64 %)
454 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1
64,819
(11.15 %)
n/a 15,680
(2.87 %)
41,108
(5.68 %)
n/a 39.49
(99.94 %)
0
(0 %)
817
(0.06 %)
517
(100.00 %)
839,496
(9.42 %)
756,396
(11.12 %)
4,051,149
(35.45 %)
2
(0.00 %)
834,149
(7.02 %)
24,342
(1.72 %)
12,238
(0.75 %)
455 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1
54,374
(10.66 %)
n/a 15,584
(2.85 %)
22,598
(5.58 %)
n/a 39.55
(99.11 %)
0
(0 %)
1,760
(0.89 %)
663
(100.00 %)
883,218
(10.65 %)
797,020
(11.09 %)
4,092,065
(35.46 %)
4
(0.00 %)
749,315
(6.20 %)
24,238
(1.72 %)
12,253
(0.76 %)
456 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1
47,108
(7.77 %)
n/a 15,458
(2.26 %)
28,572
(5.62 %)
n/a 40.84
(99.95 %)
0
(0 %)
831
(0.05 %)
268
(100.00 %)
620,402
(4.92 %)
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(7.26 %)
4,770,842
(35.92 %)
0
(0 %)
688,524
(4.84 %)
35,251
(1.63 %)
13,218
(0.63 %)
457 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1
n/a n/a 814
(1.87 %)
3,814
(6.84 %)
n/a 42.36
(99.98 %)
0
(0 %)
80
(0.02 %)
349
(100.00 %)
38,000
(5.03 %)
29,516
(7.35 %)
232,988
(20.37 %)
0
(0 %)
46,752
(6.67 %)
2,289
(2.07 %)
1,621
(1.32 %)
458 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
n/a 15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
84,160
(11.62 %)
42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
0
(0 %)
188,182
(2.04 %)
31,005
(1.79 %)
19,757
(1.03 %)
459 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1
n/a n/a 15,959
(2.63 %)
43,025
(5.73 %)
n/a 39.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 640
(100.00 %)
1,427,221
(28.44 %)
257,108
(3.15 %)
5,197,531
(26.91 %)
0
(0 %)
350,223
(3.66 %)
13,909
(0.83 %)
10,650
(0.55 %)
460 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
n/a 15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
0
(0 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
1
(0.00 %)
375,976
(3.80 %)
14,420
(0.88 %)
9,087
(0.42 %)
461 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2
40,935
(9.94 %)
n/a 15,673
(2.75 %)
53,235
(6.33 %)
n/a 40.72
(97.79 %)
0
(0 %)
33,661
(2.21 %)
98,345
(100.00 %)
1,337,427
(24.48 %)
522,121
(4.83 %)
4,649,096
(25.00 %)
308
(0.03 %)
357,663
(3.10 %)
16,819
(0.86 %)
11,638
(0.57 %)
462 zebra mbuna
GCF_000238955.4
51,012
(8.37 %)
n/a 15,901
(2.10 %)
32,136
(6.12 %)
n/a 41.16
(99.99 %)
0
(0 %)
641
(0.01 %)
1,690
(100.00 %)
565,771
(6.22 %)
253,037
(2.53 %)
4,679,743
(31.57 %)
0
(0 %)
324,855
(3.54 %)
36,689
(2.00 %)
18,156
(0.99 %)
463 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1
n/a n/a 6,365
(2.41 %)
16,467
(3.26 %)
n/a 36.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,719
(100.00 %)
1,317,027
(59.43 %)
323,062
(10.58 %)
3,014,570
(45.46 %)
0
(0 %)
366,878
(5.24 %)
14,563
(1.98 %)
3,786
(0.32 %)
464 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1
n/a n/a 17,774
(2.54 %)
44,221
(3.24 %)
n/a 36.52
(99.87 %)
20,876
(0.14 %)
20,876
(0.14 %)
20,901
(99.86 %)
4,138,008
(61.22 %)
894,145
(6.79 %)
9,494,379
(47.68 %)
393
(0.01 %)
781,563
(4.38 %)
42,482
(2.03 %)
8,815
(0.26 %)
465 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1
n/a n/a 17,535
(2.50 %)
44,169
(3.34 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
0
(0 %)
712
(0.01 %)
1,252
(100.00 %)
3,891,854
(61.07 %)
927,173
(7.78 %)
8,621,517
(50.27 %)
1
(0.00 %)
941,178
(4.90 %)
44,554
(2.12 %)
10,153
(0.30 %)
466 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2
n/a n/a 17,692
(2.51 %)
43,578
(3.27 %)
n/a 36.56
(99.99 %)
0
(0 %)
1,352
(0.01 %)
755
(100.00 %)
3,937,397
(60.86 %)
936,258
(7.76 %)
8,732,369
(50.44 %)
0
(0 %)
933,928
(4.81 %)
44,812
(2.09 %)
10,558
(0.30 %)
467 zebrafish (WGS:CALUEM01 primary hap 2022)
GCA_944039275.1
n/a n/a 18,065
(2.46 %)
44,526
(3.30 %)
n/a 37.08
(99.99 %)
0
(0 %)
381
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,804,769
(44.04 %)
954,645
(10.72 %)
8,694,743
(51.88 %)
4
(0.00 %)
1,207,649
(5.79 %)
44,936
(2.02 %)
11,380
(0.33 %)
468 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6
65,219
(5.63 %)
n/a 22,246
(2.54 %)
51,134
(7.13 %)
n/a 36.60
(99.72 %)
17,105
(0.27 %)
20,258
(0.28 %)
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(99.73 %)
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(57.92 %)
1,077,677
(6.47 %)
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(49.45 %)
127
(0.00 %)
942,199
(4.23 %)
53,471
(2.06 %)
12,486
(0.29 %)
469 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1
n/a n/a 1,204
(2.88 %)
4,065
(7.13 %)
n/a 41.24
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 1,437
(100.00 %)
26,319
(3.19 %)
14,209
(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
0
(0 %)
22,258
(4.87 %)
1,253
(1.49 %)
988
(1.13 %)
470 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2
44,988
(12.00 %)
n/a 15,037
(3.35 %)
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(7.28 %)
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(9.39 %)
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(97.76 %)
0
(0 %)
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(2.24 %)
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(100.00 %)
348,230
(2.87 %)
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(23.44 %)
0
(0 %)
175,881
(3.08 %)
12,807
(1.08 %)
8,703
(0.67 %)
471 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3
n/a n/a 15,036
(3.35 %)
40,234
(7.28 %)
n/a 40.66
(97.76 %)
0
(0 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
671,614
(20.98 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,040
(23.44 %)
0
(0 %)
175,881
(3.08 %)
12,807
(1.08 %)
8,703
(0.67 %)
TOTALS:total assembly count 471

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