VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

VGP logo

This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of legacy/superseded assemblies)

See also: hub access, assembly statistics


Data resource links

NOTE: Click on the column headers to sort the table by that column
The link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base AGP
gap		 all
gaps		 assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 gap
Overlap		 tandem
Dups		 cpg
unmasked		 cpg
island
1 African grass rat (paternal X 2020 refseq)
GCF_011762505.1		 45,963
(2.46 %)		 n/a 20,878
(1.99 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 0
(0 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,595
(100.00 %)		 4,939,557
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,429
(32.71 %)		 2
(0.00 %)		 1,065,249
(2.09 %)		 17,767
(0.51 %)		 16,852
(0.46 %)
2 African grass rat (v1 paternal X 2020 genbank)
GCA_011762505.1		 45,963
(36.56 %)		 n/a 20,933
(2.00 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 0
(0 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 4,940,083
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,540
(32.71 %)		 2
(0.00 %)		 1,027,357
(2.09 %)		 17,767
(0.51 %)		 16,848
(0.46 %)
3 African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank)
GCA_011762505.2		 n/a n/a 19,637
(1.95 %)		 19,610
(1.43 %)		 n/a 41.39
(99.19 %)		 0
(0 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 5,399,465
(42.90 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,540
(32.71 %)		 2
(0.00 %)		 979,697
(2.05 %)		 17,767
(0.51 %)		 15,566
(0.42 %)
4 African savanna elephant (hap2 2023 genbank)
GCA_030014295.1		 n/a n/a 18,981
(1.10 %)		 22,759
(1.12 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 0
(0 %)		 231
(0.10 %)		 880
(100.00 %)		 4,426,756
(29.95 %)		 832,908
(4.08 %)		 16,118,910
(49.47 %)		 1
(0.00 %)		 1,082,958
(2.38 %)		 62,315
(1.49 %)		 23,783
(0.48 %)
5 Andian cavefish (hap1 2023 genbank)
GCA_030014385.1		 n/a n/a 15,802
(1.97 %)		 47,186
(4.62 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 198
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 2,616,870
(40.73 %)		 658,784
(9.71 %)		 5,197,126
(48.95 %)		 0
(0 %)		 1,328,920
(9.28 %)		 48,344
(2.62 %)		 28,666
(1.27 %)
6 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2		 n/a n/a 12,258
(1.95 %)		 20,580
(2.26 %)		 n/a 41.49
(98.48 %)		 0
(0 %)		 429
(1.52 %)		 160
(100.00 %)		 535,315
(7.95 %)		 262,056
(1.51 %)		 6,092,351
(20.84 %)		 0
(0 %)		 152,105
(1.27 %)		 17,130
(1.48 %)		 15,125
(1.04 %)
7 Arabian camel (paternal hap 2024 genbank)
GCA_036321535.1		 n/a n/a 18,080
(1.66 %)		 20,345
(1.52 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 0
(0 %)		 195
(0.00 %)		 172
(100.00 %)		 3,040,473
(29.22 %)		 343,482
(10.93 %)		 11,797,012
(33.50 %)		 2
(0.00 %)		 1,611,842
(4.73 %)		 55,428
(1.61 %)		 47,478
(1.18 %)
8 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924715.1		 n/a n/a 15,722
(2.57 %)		 43,026
(5.68 %)		 n/a 39.77
(99.99 %)		 0
(0 %)		 468
(0.01 %)		 120
(100.00 %)		 1,608,686
(33.02 %)		 253,749
(4.14 %)		 5,181,115
(27.80 %)		 3
(0.00 %)		 390,196
(3.88 %)		 14,488
(0.90 %)		 9,706
(0.46 %)
9 Atlantic halibut (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819705.1		 52,117
(66.34 %)		 n/a 14,960
(3.20 %)		 45,365
(7.48 %)		 69,625
(10.94 %)		 42.21
(99.43 %)		 0
(0 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,421
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,979
(24.13 %)		 0
(0 %)		 240,110
(3.16 %)		 31,325
(2.25 %)		 20,749
(1.34 %)
10 Atlantic mackerel (primary hap 2023 genbank)
GCA_963691925.1		 n/a n/a 15,291
(2.56 %)		 43,206
(5.92 %)		 n/a 39.78
(99.96 %)		 0
(0 %)		 1,489
(0.04 %)		 666
(100.00 %)		 1,496,244
(26.83 %)		 395,543
(8.92 %)		 4,523,761
(29.92 %)		 9
(0.00 %)		 555,075
(5.00 %)		 13,309
(0.75 %)		 8,372
(0.43 %)
11 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1		 60,922
(45.62 %)		 n/a 12,545
(0.38 %)		 29,428
(1.34 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,990
(100.00 %)		 8,579,105
(49.81 %)		 831,224
(15.75 %)		 21,718,213
(51.79 %)		 9
(0.00 %)		 4,445,293
(7.00 %)		 105,821
(2.42 %)		 35,197
(0.42 %)
12 ballan wrasse (primary hap 2024 genbank)
GCA_963930695.1		 n/a n/a 15,142
(2.66 %)		 43,601
(6.21 %)		 n/a 40.59
(99.98 %)		 1
(0.00 %)		 815
(0.02 %)		 133
(100.00 %)		 1,221,802
(30.10 %)		 290,738
(7.79 %)		 4,164,845
(30.34 %)		 4
(0.00 %)		 525,923
(5.43 %)		 17,126
(0.94 %)		 10,131
(0.54 %)
13 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 genbank)
GCA_036971685.1		 n/a n/a 13,319
(1.60 %)		 25,993
(2.05 %)		 n/a 43.83
(99.41 %)		 0
(0 %)		 219
(0.59 %)		 453
(100.00 %)		 700,173
(13.18 %)		 457,546
(13.85 %)		 4,523,003
(31.73 %)		 2
(0.00 %)		 1,089,353
(5.57 %)		 42,686
(7.00 %)		 31,415
(1.62 %)
14 barn swallow (v2 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.1		 43,374
(5.14 %)		 n/a 12,385
(1.88 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 0
(0 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 579,928
(6.20 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 0
(0 %)		 237,664
(1.56 %)		 36,546
(2.82 %)		 29,760
(1.66 %)
15 barn swallow (v3 primary hap 2021 genbank)
GCA_015227805.3		 n/a n/a 12,395
(1.89 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 0
(0 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 664,757
(13.92 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 0
(0 %)		 237,664
(1.56 %)		 36,548
(2.85 %)		 29,760
(1.66 %)
16 Bellinger river turtle (v1 BRST_UC0152H_USYD 2024)
GCA_040894355.1		 n/a n/a 14,732
(1.14 %)		 18,988
(1.77 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 0
(0 %)		 57
(0.00 %)		 129
(100.00 %)		 1,130,950
(11.22 %)		 213,212
(1.80 %)		 11,049,280
(26.48 %)		 1
(0.00 %)		 312,478
(1.26 %)		 53,923
(2.09 %)		 34,762
(1.11 %)
17 black rhinoceros (primary hap 2021 genbank)
GCA_020826845.1		 56,255
(36.51 %)		 n/a 18,774
(1.38 %)		 22,346
(1.26 %)		 n/a 41.59
(99.95 %)		 0
(0 %)		 215
(0.05 %)		 1,075
(100.00 %)		 4,200,385
(36.22 %)		 548,030
(8.34 %)		 14,347,639
(40.14 %)		 2
(0.00 %)		 984,722
(2.61 %)		 43,525
(1.14 %)		 33,963
(0.76 %)
18 black-headed gull (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924245.1		 n/a n/a 13,244
(1.58 %)		 25,111
(1.96 %)		 n/a 44.66
(99.99 %)		 0
(0 %)		 462
(0.01 %)		 729
(100.00 %)		 516,350
(4.84 %)		 268,175
(14.83 %)		 5,880,256
(31.31 %)		 1
(0.00 %)		 746,095
(4.07 %)		 45,313
(4.92 %)		 37,372
(1.57 %)
19 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1		 51,115
(48.16 %)		 n/a 13,211
(1.67 %)		 24,108
(1.99 %)		 n/a 44.40
(99.94 %)		 0
(0 %)		 283
(0.06 %)		 716
(100.00 %)		 521,275
(5.36 %)		 236,727
(8.62 %)		 5,684,588
(26.70 %)		 8
(0.00 %)		 651,836
(3.67 %)		 45,318
(4.71 %)		 36,668
(1.67 %)
20 blackcap (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819655.1		 n/a n/a 12,378
(1.92 %)		 22,970
(2.37 %)		 n/a 42.00
(98.88 %)		 0
(0 %)		 413
(1.12 %)		 189
(100.00 %)		 506,242
(6.14 %)		 330,354
(2.12 %)		 6,410,567
(19.76 %)		 0
(0 %)		 190,210
(1.30 %)		 26,838
(2.34 %)		 22,667
(1.33 %)
21 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 genbank)
GCA_025265405.1		 47,540
(38.02 %)		 n/a 19,042
(1.52 %)		 20,766
(1.27 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 0
(0 %)		 97
(0.03 %)		 73
(100.00 %)		 3,964,035
(35.29 %)		 765,957
(8.74 %)		 12,128,162
(41.78 %)		 1
(0.00 %)		 1,795,618
(5.01 %)		 70,851
(1.80 %)		 37,949
(0.93 %)
22 blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019)
GCA_008658375.1		 n/a n/a 17,285
(1.80 %)		 21,295
(1.43 %)		 n/a 41.22
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 12,574
(100.00 %)		 3,196,354
(43.47 %)		 467,194
(1.26 %)		 10,176,588
(33.66 %)		 0
(0 %)		 306,308
(1.20 %)		 56,916
(1.85 %)		 39,871
(1.51 %)
23 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2		 n/a n/a 19,164
(1.81 %)		 20,546
(1.41 %)		 34,210
(1.86 %)		 40.88
(98.91 %)		 0
(0 %)		 936
(1.09 %)		 130
(100.00 %)		 3,999,202
(44.22 %)		 581,540
(1.22 %)		 12,900,977
(34.62 %)		 2
(0.00 %)		 424,951
(1.36 %)		 67,189
(1.73 %)		 46,700
(1.41 %)
24 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1		 47,312
(59.52 %)		 n/a 14,496
(1.97 %)		 28,873
(5.58 %)		 60,981
(6.13 %)		 38.27
(98.47 %)		 0
(0 %)		 1,160
(1.53 %)		 441
(100.00 %)		 731,730
(4.21 %)		 471,620
(4.92 %)		 5,974,002
(42.88 %)		 0
(0 %)		 455,135
(4.01 %)		 29,050
(1.48 %)		 14,672
(0.63 %)
25 blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq)
GCF_900634775.1		 47,312
(7.12 %)		 n/a 14,496
(1.97 %)		 28,873
(5.58 %)		 60,981
(6.13 %)		 38.27
(98.47 %)		 0
(0 %)		 1,160
(1.53 %)		 441
(100.00 %)		 731,730
(4.21 %)		 471,620
(4.92 %)		 5,974,002
(42.88 %)		 0
(0 %)		 455,135
(4.01 %)		 29,050
(1.48 %)		 14,672
(0.63 %)
26 Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028885525.1		 n/a n/a 19,820
(1.76 %)		 20,399
(1.15 %)		 n/a 40.98
(99.88 %)		 36
(0.12 %)		 36
(0.12 %)		 251
(99.88 %)		 5,232,617
(54.01 %)		 1,003,539
(10.19 %)		 14,858,575
(42.10 %)		 0
(0 %)		 2,511,941
(4.39 %)		 42,467
(1.24 %)		 29,563
(0.80 %)
27 Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023 refseq)
GCF_028885625.1		 81,966
(2.93 %)		 n/a 20,794
(1.72 %)		 21,307
(1.13 %)		 n/a 41.13
(99.86 %)		 39
(0.14 %)		 39
(0.14 %)		 1,593
(99.86 %)		 5,651,267
(54.21 %)		 1,155,151
(9.33 %)		 16,242,823
(42.82 %)		 0
(0 %)		 2,513,241
(4.25 %)		 52,294
(2.02 %)		 36,160
(1.02 %)
28 bowfin (hap1 2024 genbank)
GCA_036373705.1		 n/a n/a 13,851
(1.83 %)		 27,058
(4.43 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 0
(0 %)		 97
(0.00 %)		 390
(100.00 %)		 953,497
(13.69 %)		 387,700
(7.91 %)		 4,552,410
(37.72 %)		 4
(0.00 %)		 613,799
(6.38 %)		 46,301
(2.99 %)		 26,437
(1.15 %)
29 brown anole (maternal hap 2024 genbank)
GCA_037176765.1		 n/a n/a 14,463
(1.05 %)		 20,625
(1.90 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 0
(0 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 0
(0 %)		 1,512,000
(5.23 %)		 44,738
(1.08 %)		 17,370
(0.40 %)
30 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1		 32,026
(47.01 %)		 n/a 13,250
(1.87 %)		 23,063
(2.25 %)		 26,324
(3.11 %)		 41.80
(99.72 %)		 0
(0 %)		 284
(0.28 %)		 865
(100.00 %)		 539,059
(10.20 %)		 279,511
(3.12 %)		 5,874,608
(22.08 %)		 1
(0.00 %)		 324,823
(2.05 %)		 21,155
(1.61 %)		 17,590
(1.10 %)
31 California sea lion (alternate hap 2019)
GCA_009762295.1		 n/a n/a 18,348
(1.81 %)		 18,692
(1.47 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,093
(100.00 %)		 3,722,619
(42.89 %)		 488,086
(1.26 %)		 10,893,132
(33.14 %)		 0
(0 %)		 393,471
(1.40 %)		 44,449
(1.57 %)		 41,300
(1.38 %)
32 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1		 n/a n/a 21,020
(1.79 %)		 20,045
(1.39 %)		 45,176
(2.15 %)		 41.40
(99.28 %)		 0
(0 %)		 122
(0.72 %)		 43
(100.00 %)		 4,529,949
(43.67 %)		 589,962
(1.24 %)		 13,266,465
(33.77 %)		 0
(0 %)		 491,959
(1.43 %)		 51,989
(1.50 %)		 48,284
(1.32 %)
33 Canada lynx (alternate hap LIC74 2019)
GCA_007474575.1		 n/a n/a 12,029
(1.42 %)		 15,171
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(0.00 %)		 15,036
(100.00 %)		 2,937,491
(43.50 %)		 544,410
(1.76 %)		 7,641,565
(32.72 %)		 0
(0 %)		 294,221
(1.43 %)		 39,082
(2.44 %)		 34,616
(1.88 %)
34 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1		 50,094
(2.69 %)		 n/a 18,283
(1.66 %)		 19,326
(1.35 %)		 38,985
(1.96 %)		 41.70
(99.88 %)		 0
(0 %)		 848
(0.12 %)		 66
(100.00 %)		 5,016,399
(43.75 %)		 904,986
(1.75 %)		 13,476,288
(34.20 %)		 0
(0 %)		 572,992
(1.64 %)		 66,822
(2.52 %)		 60,494
(2.02 %)
35 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1		 40,788
(61.50 %)		 n/a 14,472
(3.02 %)		 24,012
(6.59 %)		 60,720
(10.43 %)		 40.96
(99.58 %)		 0
(0 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 420,697
(5.49 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 0
(0 %)		 452,303
(4.62 %)		 20,453
(1.39 %)		 10,802
(0.65 %)
36 chevron butterflyfish (hap1 2024 genbank)
GCA_039877785.1		 n/a n/a 15,255
(2.94 %)		 48,037
(7.05 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 0
(0 %)		 49
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 465,710
(3.82 %)		 254,015
(3.62 %)		 3,657,999
(23.28 %)		 1
(0.00 %)		 186,571
(2.20 %)		 30,971
(2.02 %)		 18,241
(1.05 %)
37 chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028858805.1		 n/a n/a 20,001
(1.79 %)		 21,230
(1.19 %)		 n/a 40.62
(99.78 %)		 22
(0.22 %)		 22
(0.22 %)		 141
(99.78 %)		 5,092,768
(48.83 %)		 946,933
(11.75 %)		 14,844,947
(42.39 %)		 0
(0 %)		 3,140,392
(5.61 %)		 47,662
(1.21 %)		 29,340
(0.82 %)
38 chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023 refseq)
GCF_028858775.1		 111,282
(4.36 %)		 n/a 20,990
(1.75 %)		 21,705
(1.15 %)		 n/a 40.94
(99.90 %)		 29
(0.10 %)		 29
(0.10 %)		 1,500
(99.90 %)		 5,581,205
(50.06 %)		 1,158,792
(10.59 %)		 15,972,274
(43.09 %)		 0
(0 %)		 3,093,549
(5.27 %)		 61,901
(2.29 %)		 38,043
(1.17 %)
39 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2		 42,746
(63.74 %)		 n/a 15,239
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 63,908
(10.45 %)		 40.40
(99.35 %)		 0
(0 %)		 266
(0.65 %)		 50
(100.00 %)		 324,479
(2.66 %)		 130,248
(1.89 %)		 3,324,960
(21.31 %)		 0
(0 %)		 169,785
(2.72 %)		 10,500
(0.87 %)		 7,574
(0.57 %)
40 climbing perch (v1.2 2018 refseq)
GCF_900324465.2		 42,746
(13.53 %)		 n/a 15,241
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 63,908
(10.45 %)		 40.40
(99.35 %)		 0
(0 %)		 266
(0.65 %)		 51
(100.00 %)		 324,324
(2.66 %)		 130,249
(1.89 %)		 3,325,009
(21.31 %)		 0
(0 %)		 169,785
(2.72 %)		 10,500
(0.87 %)		 7,574
(0.57 %)
41 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1		 67,207
(45.84 %)		 n/a 18,772
(1.77 %)		 20,527
(1.42 %)		 35,815
(1.58 %)		 41.44
(99.74 %)		 0
(0 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,067,521
(46.14 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,896
(35.29 %)		 1
(0.00 %)		 597,652
(1.78 %)		 65,551
(1.90 %)		 43,161
(1.35 %)
42 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1		 37,661
(35.20 %)		 n/a 18,681
(0.81 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 0
(0 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,697
(38.92 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,301
(40.56 %)		 0
(0 %)		 455,834
(1.17 %)		 17,762
(0.38 %)		 13,986
(0.24 %)
43 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1		 50,206
(57.28 %)		 n/a 13,179
(1.84 %)		 25,859
(2.41 %)		 n/a 42.18
(99.58 %)		 0
(0 %)		 296
(0.42 %)		 151
(100.00 %)		 521,043
(9.61 %)		 310,469
(2.36 %)		 6,712,849
(21.76 %)		 0
(0 %)		 326,521
(1.83 %)		 25,267
(1.71 %)		 20,672
(1.05 %)
44 common spadefoot toad (primary hap 2024 genbank)
GCA_036172605.1		 n/a n/a 14,564
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 349
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 1,677,382
(3.51 %)		 3,229,435
(13.31 %)		 15,027,089
(51.43 %)		 12
(0.00 %)		 3,799,247
(9.03 %)		 282,389
(3.86 %)		 79,263
(0.96 %)
45 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1		 39,986
(53.94 %)		 n/a 12,277
(1.88 %)		 20,379
(2.16 %)		 n/a 41.95
(99.84 %)		 0
(0 %)		 256
(0.16 %)		 109
(100.00 %)		 533,758
(8.66 %)		 199,748
(1.12 %)		 6,353,957
(21.19 %)		 1
(0.00 %)		 113,872
(0.91 %)		 20,393
(1.74 %)		 16,313
(0.88 %)
46 common vampire bat (v1 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.1		 n/a n/a 17,520
(1.75 %)		 18,995
(1.67 %)		 n/a 42.89
(99.99 %)		 0
(0 %)		 580
(0.01 %)		 430
(100.00 %)		 2,597,497
(28.17 %)		 356,620
(2.88 %)		 10,797,225
(31.23 %)		 25
(0.00 %)		 271,481
(1.34 %)		 61,931
(2.30 %)		 43,396
(1.30 %)
47 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1		 58,054
(45.51 %)		 n/a 18,280
(1.71 %)		 19,514
(1.59 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 0
(0 %)		 611
(0.01 %)		 572
(100.00 %)		 2,761,820
(28.38 %)		 427,940
(3.89 %)		 11,250,492
(32.57 %)		 37
(0.00 %)		 360,489
(1.62 %)		 70,700
(2.48 %)		 44,288
(1.24 %)
48 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.1		 58,054
(3.40 %)		 n/a 18,280
(1.71 %)		 19,515
(1.59 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 0
(0 %)		 611
(0.01 %)		 573
(100.00 %)		 2,761,826
(28.38 %)		 427,942
(3.89 %)		 11,250,529
(32.57 %)		 37
(0.00 %)		 360,489
(1.62 %)		 70,701
(2.48 %)		 44,289
(1.24 %)
49 corroboree frog (hap2 2023 genbank)
GCA_028390025.1		 n/a n/a n/a 54,346
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 0
(0 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 18,782,633
(75.22 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 5,826
(99.76 %)		 23
(0.00 %)		 n/a 990,274
(4.84 %)		 90,184
(0.51 %)
50 Cory's shearwater (hap1.1 2024)
GCA_964195595.1		 n/a n/a 13,703
(1.71 %)		 26,310
(2.10 %)		 n/a 43.29
(99.99 %)		 59
(0.00 %)		 525
(0.01 %)		 414
(100.00 %)		 479,045
(5.03 %)		 336,466
(4.95 %)		 5,910,298
(24.89 %)		 4
(0.00 %)		 487,078
(3.38 %)		 48,046
(4.19 %)		 40,252
(2.00 %)
51 Cory's shearwater (hap2.1 2024)
GCA_964196065.1		 n/a n/a 12,750
(1.85 %)		 23,191
(2.16 %)		 n/a 43.03
(99.99 %)		 477
(0.01 %)		 477
(0.01 %)		 726
(99.99 %)		 403,846
(4.59 %)		 252,125
(3.30 %)		 6,206,493
(22.07 %)		 2
(0.00 %)		 286,848
(2.45 %)		 41,821
(4.50 %)		 38,197
(2.23 %)
52 denticle herring (v1 2019)
GCF_900700375.1		 59,645
(12.74 %)		 n/a 16,556
(3.78 %)		 37,861
(8.42 %)		 72,719
(10.66 %)		 43.69
(99.18 %)		 0
(0 %)		 464
(0.82 %)		 460
(100.00 %)		 403,512
(3.23 %)		 224,282
(4.61 %)		 2,948,671
(28.79 %)		 0
(0 %)		 306,165
(4.31 %)		 64,661
(9.49 %)		 52,867
(4.93 %)
53 dorado (hap2 2023 genbank)
GCA_030463535.1		 n/a n/a 16,799
(2.11 %)		 50,411
(4.67 %)		 n/a 41.29
(99.15 %)		 0
(0 %)		 726
(0.85 %)		 104
(100.00 %)		 2,693,928
(34.60 %)		 805,807
(14.65 %)		 5,615,731
(36.69 %)		 2
(0.00 %)		 1,425,798
(8.96 %)		 30,083
(1.31 %)		 21,157
(0.81 %)
54 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1		 25,483
(48.39 %)		 n/a 12,405
(1.70 %)		 23,073
(2.18 %)		 n/a 45.31
(99.66 %)		 0
(0 %)		 187
(0.34 %)		 181
(100.00 %)		 1,008,118
(21.51 %)		 378,537
(3.38 %)		 5,846,717
(32.04 %)		 0
(0 %)		 791,076
(4.25 %)		 26,005
(1.75 %)		 19,919
(1.16 %)
55 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1		 57,615
(9.59 %)		 n/a 15,348
(2.22 %)		 28,518
(6.29 %)		 42,170
(8.31 %)		 41.07
(99.87 %)		 115
(0.00 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 527,486
(5.98 %)		 217,915
(1.89 %)		 4,547,443
(30.78 %)		 2
(0.00 %)		 212,425
(2.79 %)		 33,005
(1.88 %)		 16,748
(0.95 %)
56 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1		 n/a n/a 13,181
(1.74 %)		 24,708
(2.10 %)		 33,433
(3.99 %)		 42.41
(100.00 %)		 0
(0 %)		 512
(0.00 %)		 802
(100.00 %)		 504,527
(4.38 %)		 259,276
(2.59 %)		 7,105,965
(19.15 %)		 8
(0.00 %)		 316,149
(1.79 %)		 41,784
(5.52 %)		 41,105
(3.30 %)
57 epaulette shark (2021 genbank)
GCA_020745735.1		 43,156
(39.58 %)		 n/a 12,439
(0.39 %)		 19,520
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 0
(0 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,963
(100.00 %)		 9,211,963
(69.93 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,613
(43.88 %)		 0
(0 %)		 2,903,274
(4.44 %)		 41,682
(1.08 %)		 13,048
(0.16 %)
58 Eurasian red squirrel (v1.1 2019)
GCA_902686455.1		 n/a n/a 21,298
(1.58 %)		 21,024
(1.36 %)		 36,645
(1.54 %)		 40.08
(94.33 %)		 0
(0 %)		 1,177
(5.67 %)		 638
(100.00 %)		 4,680,964
(35.76 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,991,981
(31.49 %)		 5
(0.00 %)		 419,662
(1.29 %)		 48,159
(1.04 %)		 45,455
(0.95 %)
59 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1		 45,658
(2.52 %)		 n/a 19,724
(1.77 %)		 19,069
(1.47 %)		 34,561
(2.01 %)		 42.15
(99.74 %)		 0
(0 %)		 872
(0.26 %)		 216
(100.00 %)		 4,098,151
(26.75 %)		 1,088,237
(2.91 %)		 12,853,776
(32.42 %)		 5
(0.00 %)		 518,686
(1.69 %)		 19,000
(0.58 %)		 16,851
(0.46 %)
60 European flounder (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316205.1		 n/a n/a 14,753
(3.17 %)		 47,618
(7.81 %)		 n/a 42.59
(99.98 %)		 0
(0 %)		 482
(0.02 %)		 109
(100.00 %)		 1,160,784
(27.06 %)		 251,985
(5.23 %)		 3,353,121
(26.00 %)		 1
(0.00 %)		 252,297
(3.81 %)		 37,130
(2.79 %)		 27,432
(1.88 %)
61 European pond turtle (hap1 2023 genbank)
GCA_028017835.1		 n/a n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 0
(0 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 5
(0.00 %)		 495,884
(2.08 %)		 136,002
(2.92 %)		 30,671
(0.72 %)
62 European smelt (primary hap 2023 genbank)
GCA_963692335.1		 n/a n/a 15,640
(3.79 %)		 50,248
(9.36 %)		 n/a 45.42
(99.90 %)		 30
(0.00 %)		 2,462
(0.10 %)		 1,038
(100.00 %)		 1,648,435
(31.35 %)		 508,368
(13.05 %)		 1,992,832
(35.86 %)		 7
(0.00 %)		 485,262
(7.75 %)		 33,284
(4.05 %)		 19,052
(1.58 %)
63 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1		 n/a n/a 11,276
(1.79 %)		 21,238
(2.15 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,333
(100.00 %)		 466,567
(7.08 %)		 182,345
(0.97 %)		 6,037,183
(20.24 %)		 0
(0 %)		 110,549
(1.11 %)		 29,648
(2.35 %)		 26,084
(1.59 %)
64 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1		 n/a n/a 12,415
(1.77 %)		 23,484
(2.17 %)		 n/a 41.84
(99.67 %)		 0
(0 %)		 894
(0.33 %)		 357
(100.00 %)		 539,737
(7.60 %)		 227,500
(1.16 %)		 6,768,805
(21.05 %)		 4
(0.00 %)		 181,333
(1.65 %)		 34,729
(2.65 %)		 30,692
(1.70 %)
65 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1		 54,113
(34.13 %)		 n/a 19,960
(1.65 %)		 19,954
(1.25 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,129
(0.01 %)		 498
(100.00 %)		 4,863,656
(37.41 %)		 1,795,997
(8.95 %)		 13,681,786
(40.58 %)		 17
(0.00 %)		 2,516,599
(5.37 %)		 23,961
(0.53 %)		 17,318
(0.36 %)
66 false killer whale (hap1 2024 genbank)
GCA_039906515.1		 n/a n/a 18,718
(1.50 %)		 20,929
(1.32 %)		 n/a 42.08
(99.90 %)		 0
(0 %)		 123
(0.10 %)		 439
(100.00 %)		 3,958,932
(35.76 %)		 1,002,329
(11.61 %)		 12,193,131
(41.85 %)		 3
(0.00 %)		 1,441,777
(4.23 %)		 79,158
(3.74 %)		 41,701
(1.03 %)
67 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2		 n/a n/a 15,436
(2.15 %)		 26,448
(5.90 %)		 64,657
(6.60 %)		 41.23
(98.19 %)		 0
(0 %)		 744
(1.81 %)		 189
(100.00 %)		 1,014,141
(16.95 %)		 287,037
(2.21 %)		 5,305,987
(30.67 %)		 0
(0 %)		 227,443
(2.84 %)		 24,130
(1.26 %)		 11,082
(0.48 %)
68 Florida worm lizard (hap2 2023 genbank)
GCA_030035675.1		 n/a n/a 14,331
(0.90 %)		 17,854
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 1
(0.00 %)		 242
(0.28 %)		 78
(100.00 %)		 1,426,833
(7.17 %)		 616,690
(2.63 %)		 10,819,054
(45.31 %)		 1
(0.00 %)		 531,662
(2.36 %)		 47,454
(1.03 %)		 18,400
(0.42 %)
69 Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank)
GCA_902459505.1		 54,713
(61.19 %)		 n/a 14,267
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 0
(0 %)		 433
(0.15 %)		 163
(100.00 %)		 1,311,113
(1.64 %)		 1,364,596
(3.83 %)		 19,589,738
(52.85 %)		 3
(0.00 %)		 1,182,977
(2.68 %)		 270,923
(4.52 %)		 38,622
(0.50 %)
70 Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_902459505.1		 54,713
(1.72 %)		 n/a 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 0
(0 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,310,970
(1.64 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,802
(52.85 %)		 3
(0.00 %)		 1,182,977
(2.68 %)		 270,923
(4.52 %)		 38,622
(0.50 %)
71 giant manta (hap1 2023 genbank)
GCA_030028105.1		 n/a n/a 12,432
(0.38 %)		 24,821
(1.16 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 0
(0 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 7,913,208
(49.68 %)		 969,352
(14.22 %)		 20,235,210
(54.42 %)		 17
(0.00 %)		 4,636,724
(7.12 %)		 110,678
(1.74 %)		 30,504
(0.36 %)
72 gilthead seabream (v1 2019)
GCF_900880675.1		 59,027
(10.96 %)		 n/a 15,412
(2.36 %)		 31,802
(6.47 %)		 73,197
(7.97 %)		 41.94
(99.96 %)		 0
(0 %)		 1,050
(0.04 %)		 176
(100.00 %)		 531,360
(3.04 %)		 305,809
(3.03 %)		 4,701,694
(25.69 %)		 0
(0 %)		 355,475
(3.53 %)		 47,327
(2.41 %)		 23,697
(1.07 %)
73 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1		 55,164
(5.86 %)		 n/a 13,226
(1.87 %)		 23,033
(2.15 %)		 25,921
(3.22 %)		 42.11
(99.61 %)		 0
(0 %)		 191
(0.39 %)		 142
(100.00 %)		 519,341
(5.86 %)		 180,990
(0.79 %)		 7,005,531
(19.25 %)		 1
(0.00 %)		 53,053
(0.51 %)		 37,343
(3.12 %)		 34,701
(1.97 %)
74 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1		 n/a n/a 9,334
(1.82 %)		 17,594
(2.12 %)		 n/a 42.53
(99.93 %)		 0
(0 %)		 39
(0.07 %)		 3,860
(100.00 %)		 356,284
(6.03 %)		 123,430
(0.80 %)		 4,417,887
(19.25 %)		 0
(0 %)		 53,254
(0.85 %)		 28,919
(3.52 %)		 25,970
(2.20 %)
75 great cormorant (primary hap 2024 genbank)
GCA_963921805.1		 n/a n/a 13,434
(1.76 %)		 30,619
(3.17 %)		 n/a 43.47
(99.99 %)		 0
(0 %)		 493
(0.01 %)		 351
(100.00 %)		 556,740
(10.18 %)		 303,279
(3.45 %)		 6,599,611
(22.65 %)		 1
(0.00 %)		 355,900
(2.29 %)		 38,341
(5.45 %)		 31,913
(1.57 %)
76 great fruit-eating bat (v1 hap1 2024)
GCA_038363095.1		 n/a n/a 18,022
(1.56 %)		 20,018
(1.52 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 0
(0 %)		 81
(0.00 %)		 419
(100.00 %)		 2,827,417
(26.82 %)		 371,479
(4.97 %)		 11,603,093
(34.64 %)		 1
(0.00 %)		 522,672
(1.87 %)		 71,574
(2.28 %)		 54,020
(1.50 %)
77 great potoo (primary hap 2020 genbank)
GCA_013368605.1		 n/a n/a 13,116
(1.77 %)		 23,657
(2.10 %)		 n/a 42.67
(99.51 %)		 0
(0 %)		 243
(0.49 %)		 191
(100.00 %)		 514,142
(9.71 %)		 210,381
(1.13 %)		 6,501,989
(23.95 %)		 0
(0 %)		 244,232
(1.92 %)		 35,785
(2.69 %)		 29,281
(1.64 %)
78 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2		 53,353
(46.77 %)		 n/a 18,647
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 0
(0 %)		 158
(0.36 %)		 135
(100.00 %)		 3,301,020
(34.99 %)		 564,790
(1.35 %)		 12,217,069
(29.39 %)		 0
(0 %)		 171,202
(0.67 %)		 32,445
(1.06 %)		 30,625
(0.98 %)
79 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1		 53,352
(3.13 %)		 n/a 18,647
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 0
(0 %)		 158
(0.36 %)		 134
(100.00 %)		 3,300,836
(34.99 %)		 564,789
(1.35 %)		 12,217,020
(29.39 %)		 0
(0 %)		 171,202
(0.67 %)		 32,445
(1.06 %)		 30,627
(0.98 %)
80 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1		 n/a n/a 13,467
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 n/a 43.46
(100.00 %)		 0
(0 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,442
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 0
(0 %)		 112,918
(3.25 %)		 46,340
(13.40 %)		 32,897
(5.93 %)
81 greater sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850765.1		 n/a n/a 18,322
(1.40 %)		 21,049
(1.35 %)		 n/a 41.71
(98.73 %)		 102
(0.41 %)		 468
(1.27 %)		 359
(99.59 %)		 4,247,148
(29.53 %)		 1,031,385
(2.50 %)		 12,465,194
(43.30 %)		 3
(0.00 %)		 1,113,639
(2.95 %)		 101,620
(2.01 %)		 44,590
(1.04 %)
82 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1		 56,917
(3.63 %)		 n/a 14,729
(1.06 %)		 17,439
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 0
(0 %)		 294
(0.56 %)		 99
(100.00 %)		 1,641,730
(15.08 %)		 304,356
(1.25 %)		 11,136,918
(31.96 %)		 0
(0 %)		 429,794
(1.68 %)		 49,035
(1.44 %)		 26,943
(0.68 %)
83 grey whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_028021215.1		 n/a n/a 19,288
(1.38 %)		 21,791
(1.21 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 0
(0 %)		 279
(0.00 %)		 704
(100.00 %)		 4,116,900
(35.85 %)		 966,065
(16.74 %)		 12,154,173
(46.39 %)		 3
(0.00 %)		 2,154,240
(5.67 %)		 77,011
(1.59 %)		 42,884
(0.96 %)
84 harbor porpoise (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924675.1		 n/a n/a 18,529
(1.58 %)		 20,583
(1.34 %)		 n/a 41.72
(99.99 %)		 2
(0.00 %)		 966
(0.01 %)		 442
(100.00 %)		 3,760,716
(36.18 %)		 888,368
(7.18 %)		 12,379,240
(39.04 %)		 4
(0.00 %)		 1,410,168
(3.71 %)		 71,530
(2.69 %)		 40,160
(1.06 %)
85 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v1 hap1 2024)
GCA_040954625.1		 n/a n/a 4,944
(1.30 %)		 35,031
(15.53 %)		 n/a 39.72
(99.96 %)		 0
(0 %)		 254
(0.04 %)		 77
(100.00 %)		 87,841
(1.67 %)		 119,697
(13.20 %)		 1,309,907
(29.40 %)		 5
(0.00 %)		 336,770
(8.96 %)		 21,623
(4.17 %)		 15,834
(2.51 %)
86 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v1 hap2 2024)
GCA_040954595.1		 n/a n/a 4,919
(1.33 %)		 34,873
(16.02 %)		 n/a 39.72
(99.96 %)		 0
(0 %)		 254
(0.04 %)		 56
(100.00 %)		 84,495
(1.58 %)		 118,073
(13.23 %)		 1,301,514
(28.77 %)		 3
(0.00 %)		 317,532
(8.60 %)		 20,511
(4.03 %)		 15,567
(2.64 %)
87 hourglass treefrog (paternal 2023 genbank)
GCA_027789765.1		 n/a n/a 14,058
(0.89 %)		 31,050
(2.69 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 0
(0 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 3
(0.00 %)		 3,539,111
(9.05 %)		 235,277
(5.56 %)		 28,414
(0.63 %)
88 house finch (primary hap 2022 genbank)
GCA_027477595.1		 43,228
(49.63 %)		 n/a 12,700
(1.83 %)		 24,567
(2.38 %)		 n/a 42.91
(99.02 %)		 0
(0 %)		 295
(0.98 %)		 183
(100.00 %)		 440,379
(3.17 %)		 463,164
(6.37 %)		 6,300,100
(23.47 %)		 1
(0.00 %)		 573,829
(3.39 %)		 30,897
(2.53 %)		 22,852
(1.24 %)
89 house sparrow (hap1 2024 genbank)
GCA_036417665.1		 n/a n/a 12,831
(1.61 %)		 26,124
(2.26 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 0
(0 %)		 202
(0.00 %)		 334
(100.00 %)		 647,396
(12.37 %)		 646,615
(14.14 %)		 5,906,524
(30.36 %)		 2
(0.00 %)		 873,292
(5.23 %)		 36,193
(2.91 %)		 24,212
(1.05 %)
90 Indian glassy fish (v1 2019)
GCF_900634625.1		 44,096
(12.32 %)		 n/a 15,337
(3.60 %)		 23,988
(7.92 %)		 60,224
(10.41 %)		 42.38
(98.08 %)		 0
(0 %)		 1,523
(1.92 %)		 156
(100.00 %)		 346,406
(3.02 %)		 163,522
(3.00 %)		 2,755,229
(25.07 %)		 0
(0 %)		 235,504
(4.25 %)		 17,930
(1.47 %)		 9,748
(0.74 %)
91 Japanese sawshark (hap1 2024 genbank)
GCA_044704955.1		 n/a n/a 14,672
(0.28 %)		 30,181
(0.79 %)		 n/a 47.02
(99.98 %)		 0
(0 %)		 5,985
(0.02 %)		 4,317
(100.00 %)		 1,167,498
(3.08 %)		 2,399,496
(18.16 %)		 10,302
(99.98 %)		 38
(0.00 %)		 5,044,826
(4.94 %)		 503,637
(6.56 %)		 489,893
(6.05 %)
92 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2		 49,757
(54.33 %)		 n/a 13,112
(1.92 %)		 17,637
(2.48 %)		 n/a 41.97
(99.08 %)		 0
(0 %)		 373
(0.92 %)		 90
(100.00 %)		 507,072
(7.85 %)		 208,180
(1.08 %)		 6,258,178
(20.50 %)		 0
(0 %)		 165,532
(1.34 %)		 22,278
(1.77 %)		 19,230
(1.21 %)
93 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1		 29,504
(53.56 %)		 n/a 14,221
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 41,384
(6.20 %)		 40.22
(99.05 %)		 0
(0 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,338
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,148
(38.97 %)		 5
(0.00 %)		 523,224
(4.75 %)		 37,287
(2.58 %)		 18,380
(0.95 %)
94 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1		 29,517
(6.48 %)		 n/a 14,243
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 41,421
(6.20 %)		 40.22
(99.05 %)		 0
(0 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,274
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,142
(38.97 %)		 5
(0.00 %)		 523,224
(4.75 %)		 37,287
(2.58 %)		 18,380
(0.95 %)
95 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023638135.1		 48,561
(51.20 %)		 n/a 12,862
(1.69 %)		 21,562
(1.92 %)		 n/a 43.03
(99.83 %)		 0
(0 %)		 158
(0.17 %)		 397
(100.00 %)		 439,975
(3.77 %)		 203,640
(6.96 %)		 6,921,438
(23.57 %)		 2
(0.00 %)		 479,269
(2.67 %)		 32,398
(2.65 %)		 19,870
(0.89 %)
96 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1		 n/a n/a 14,572
(1.03 %)		 16,165
(1.42 %)		 n/a 43.36
(99.74 %)		 0
(0 %)		 558
(0.26 %)		 55
(100.00 %)		 1,631,923
(15.09 %)		 303,440
(1.14 %)		 11,122,938
(34.12 %)		 1
(0.00 %)		 664,235
(2.49 %)		 35,505
(1.37 %)		 19,641
(0.51 %)
97 leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019)
GCA_009762595.1		 n/a n/a 10,857
(1.01 %)		 15,585
(1.46 %)		 n/a 43.54
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 8,982
(100.00 %)		 1,090,219
(15.03 %)		 206,192
(1.19 %)		 7,154,939
(33.03 %)		 0
(0 %)		 432,559
(2.40 %)		 25,155
(1.42 %)		 14,585
(0.57 %)
98 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2		 62,576
(3.50 %)		 n/a 14,610
(1.03 %)		 16,359
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 0
(0 %)		 667
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,637,236
(15.13 %)		 304,730
(1.14 %)		 11,121,967
(34.21 %)		 3
(0.00 %)		 670,755
(2.51 %)		 35,485
(1.36 %)		 19,615
(0.51 %)
99 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1		 47,420
(5.64 %)		 n/a 13,097
(1.80 %)		 22,203
(2.07 %)		 n/a 42.30
(99.66 %)		 0
(0 %)		 298
(0.34 %)		 291
(100.00 %)		 516,498
(5.58 %)		 210,236
(1.26 %)		 7,133,927
(19.19 %)		 1
(0.00 %)		 132,959
(0.79 %)		 27,558
(2.21 %)		 21,862
(1.03 %)
100 lesser noctule (v1 hap1 2024)
GCA_964264875.1		 n/a n/a 18,260
(1.53 %)		 23,046
(1.60 %)		 n/a 43.05
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,662
(0.01 %)		 1,281
(100.00 %)		 3,246,021
(21.13 %)		 1,298,965
(12.06 %)		 9,752,193
(42.90 %)		 10
(0.00 %)		 2,023,792
(5.54 %)		 66,137
(2.85 %)		 61,169
(1.82 %)
101 lesser noctule (v1 hap2 2024)
GCA_964264895.1		 n/a n/a 17,557
(1.64 %)		 22,484
(1.74 %)		 n/a 43.06
(99.98 %)		 1,563
(0.02 %)		 1,563
(0.02 %)		 2,898
(99.98 %)		 2,999,553
(21.19 %)		 1,122,371
(10.04 %)		 9,331,392
(40.02 %)		 7
(0.00 %)		 1,542,388
(4.66 %)		 61,834
(2.95 %)		 59,536
(1.92 %)
102 lesser rhea (primary hap 2023 genbank)
GCA_028389875.1		 39,024
(47.65 %)		 n/a 13,358
(1.72 %)		 23,870
(2.13 %)		 n/a 42.45
(99.89 %)		 0
(0 %)		 128
(0.11 %)		 179
(100.00 %)		 674,141
(6.73 %)		 329,122
(5.34 %)		 6,820,211
(22.78 %)		 1
(0.00 %)		 266,226
(1.85 %)		 45,073
(5.83 %)		 38,575
(2.59 %)
103 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850995.1		 n/a n/a 18,322
(1.42 %)		 21,350
(1.39 %)		 n/a 41.84
(99.24 %)		 178
(0.49 %)		 573
(0.76 %)		 345
(99.51 %)		 4,224,340
(28.69 %)		 1,030,574
(2.60 %)		 12,591,928
(42.30 %)		 1
(0.00 %)		 1,128,543
(2.95 %)		 98,189
(2.06 %)		 48,427
(1.15 %)
104 lesser salmon catfish (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579695.1		 53,323
(53.05 %)		 n/a 15,841
(0.90 %)		 85,700
(3.30 %)		 n/a 42.44
(99.43 %)		 0
(0 %)		 334
(0.57 %)		 38
(100.00 %)		 5,905,868
(49.76 %)		 1,126,468
(6.51 %)		 7,609,180
(62.74 %)		 11
(0.00 %)		 2,750,473
(9.00 %)		 166,630
(4.38 %)		 15,646
(0.27 %)
105 live sharksucker (v1 2019)
GCF_900963305.1		 40,255
(11.91 %)		 n/a 14,975
(3.53 %)		 22,304
(7.09 %)		 56,266
(9.51 %)		 41.43
(99.89 %)		 0
(0 %)		 140
(0.11 %)		 38
(100.00 %)		 448,828
(3.61 %)		 146,353
(1.65 %)		 3,204,476
(21.79 %)		 0
(0 %)		 109,664
(1.83 %)		 16,807
(1.33 %)		 12,095
(0.89 %)
106 long-finned pilot whale (v1 primary hap 2023)
GCF_963455315.1		 61,797
(2.84 %)		 n/a 18,712
(1.51 %)		 20,920
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,084
(0.01 %)		 993
(100.00 %)		 4,125,420
(35.62 %)		 1,577,899
(12.03 %)		 12,347,226
(42.01 %)		 10
(0.00 %)		 1,284,155
(3.89 %)		 71,821
(5.51 %)		 41,663
(1.04 %)
107 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 genbank)
GCA_963455315.2		 n/a n/a 18,726
(1.51 %)		 20,948
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 2
(0.00 %)		 1,084
(0.01 %)		 995
(100.00 %)		 4,125,459
(35.62 %)		 1,577,896
(12.03 %)		 12,347,226
(42.01 %)		 10
(0.00 %)		 1,284,155
(3.89 %)		 71,822
(5.51 %)		 41,663
(1.04 %)
108 long-tailed hermit (v1 PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1		 n/a n/a 12,328
(2.02 %)		 20,312
(2.34 %)		 n/a 41.00
(99.63 %)		 141
(0.37 %)		 141
(0.37 %)		 211
(99.63 %)		 497,506
(5.06 %)		 265,815
(1.51 %)		 6,045,702
(20.10 %)		 0
(0 %)		 100,035
(0.84 %)		 15,922
(1.43 %)		 13,768
(0.94 %)
109 lumpfish (primary hap 2019 genbank)
GCA_009769545.1		 41,612
(58.17 %)		 n/a 14,748
(3.32 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,721
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 0
(0 %)		 347
(1.78 %)		 49
(100.00 %)		 478,416
(6.02 %)		 421,634
(11.07 %)		 2,928,668
(27.98 %)		 1
(0.00 %)		 655,785
(6.31 %)		 53,323
(5.09 %)		 32,724
(2.40 %)
110 mimic poison frog (primary hap 2023 genbank)
GCA_032444005.1		 n/a n/a 14,957
(0.34 %)		 n/a n/a 44.95
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,686
(100.00 %)		 1,716,760
(1.89 %)		 4,088,695
(23.45 %)		 2,437
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 10,590,500
(14.66 %)		 n/a n/a
111 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1		 n/a n/a 10,083
(1.97 %)		 18,350
(2.23 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(0.00 %)		 5,616
(100.00 %)		 485,827
(7.06 %)		 212,892
(1.28 %)		 4,756,962
(19.95 %)		 0
(0 %)		 53,808
(0.72 %)		 25,670
(3.87 %)		 24,319
(2.23 %)
112 mute swan (v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1		 n/a n/a 12,973
(1.97 %)		 22,300
(2.18 %)		 n/a 41.92
(99.06 %)		 0
(0 %)		 446
(0.94 %)		 181
(100.00 %)		 688,720
(7.65 %)		 301,358
(1.34 %)		 6,775,217
(21.21 %)		 1
(0.00 %)		 78,646
(0.75 %)		 31,271
(3.60 %)		 29,996
(2.02 %)
113 Natterer's bat (hap1.1 2024)
GCA_964212035.1		 n/a n/a 19,180
(1.72 %)		 22,635
(1.71 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,620
(0.02 %)		 343
(100.00 %)		 3,081,500
(24.27 %)		 797,071
(5.37 %)		 10,372,159
(38.30 %)		 18
(0.00 %)		 729,559
(2.57 %)		 64,460
(2.57 %)		 57,628
(1.87 %)
114 Natterer's bat (hap2.1 2024)
GCA_964212025.1		 n/a n/a 18,275
(1.81 %)		 21,799
(1.80 %)		 n/a 43.28
(99.99 %)		 1,387
(0.01 %)		 1,387
(0.01 %)		 1,706
(99.99 %)		 2,833,193
(23.73 %)		 705,278
(5.10 %)		 9,802,564
(36.67 %)		 5
(0.00 %)		 596,875
(2.28 %)		 61,024
(2.68 %)		 55,279
(1.95 %)
115 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579445.1		 31,033
(46.15 %)		 n/a 12,385
(1.72 %)		 24,339
(2.24 %)		 n/a 43.01
(99.57 %)		 0
(0 %)		 215
(0.43 %)		 77
(100.00 %)		 479,994
(3.33 %)		 443,098
(9.18 %)		 6,350,593
(25.82 %)		 5
(0.00 %)		 478,923
(3.35 %)		 31,693
(3.88 %)		 22,817
(1.16 %)
116 New Zealand spotty (primary hap 2019 genbank)
GCA_009762535.1		 n/a n/a 14,609
(2.22 %)		 43,262
(5.33 %)		 60,241
(8.02 %)		 40.86
(98.32 %)		 0
(0 %)		 1,135
(1.69 %)		 468
(100.00 %)		 519,324
(4.65 %)		 393,329
(5.54 %)		 4,522,265
(33.34 %)		 4
(0.00 %)		 548,988
(4.42 %)		 18,302
(0.85 %)		 8,002
(0.35 %)
117 Nicobar pigeon (hap1 2024 genbank)
GCA_036013445.1		 n/a n/a 13,359
(1.72 %)		 24,921
(2.13 %)		 n/a 44.64
(100.00 %)		 0
(0 %)		 117
(0.00 %)		 807
(100.00 %)		 705,078
(18.28 %)		 342,299
(9.55 %)		 6,410,095
(28.06 %)		 0
(0 %)		 778,929
(4.34 %)		 38,589
(9.40 %)		 31,814
(1.47 %)
118 nine-banded armadillo (v1 hap1 2023)
GCA_030445055.1		 n/a n/a 19,429
(1.06 %)		 22,396
(1.07 %)		 n/a 40.96
(99.27 %)		 0
(0 %)		 845
(0.73 %)		 594
(100.00 %)		 4,369,568
(32.83 %)		 673,707
(1.55 %)		 18,586,102
(42.41 %)		 5
(0.00 %)		 558,255
(1.38 %)		 131,852
(2.78 %)		 71,325
(1.75 %)
119 nine-banded armadillo (v1 hap2 2023)
GCF_030445035.1		 69,043
(2.70 %)		 n/a 20,516
(1.05 %)		 n/a n/a 41.00
(99.68 %)		 0
(0 %)		 771
(0.32 %)		 539
(100.00 %)		 4,656,325
(32.86 %)		 726,574
(1.99 %)		 19,585,522
(43.65 %)		 4
(0.00 %)		 720,053
(1.59 %)		 140,990
(2.86 %)		 76,550
(1.81 %)
120 ninespine stickleback (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316345.1		 n/a n/a 14,600
(3.83 %)		 49,927
(9.98 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 0
(0 %)		 738
(0.03 %)		 175
(100.00 %)		 599,088
(14.68 %)		 186,747
(10.27 %)		 2,273,942
(28.36 %)		 3
(0.00 %)		 183,869
(3.64 %)		 70,136
(9.39 %)		 45,059
(4.62 %)
121 North Island brown kiwi (hap1 2024 genbank)
GCA_036417845.1		 n/a n/a 13,670
(1.52 %)		 33,383
(2.64 %)		 n/a 44.01
(100.00 %)		 0
(0 %)		 170
(0.00 %)		 409
(100.00 %)		 713,271
(8.42 %)		 603,937
(6.25 %)		 5,379,113
(27.65 %)		 1
(0.00 %)		 501,455
(3.32 %)		 50,913
(9.74 %)		 40,971
(3.07 %)
122 northern goshawk (v1 primary hap 2022 refseq)
GCF_929443795.1		 50,663
(4.74 %)		 n/a 13,528
(1.65 %)		 24,595
(1.99 %)		 n/a 43.78
(100.00 %)		 0
(0 %)		 183
(0.00 %)		 454
(100.00 %)		 521,768
(3.86 %)		 325,987
(9.82 %)		 5,542,269
(27.30 %)		 4
(0.00 %)		 458,030
(3.08 %)		 43,070
(4.44 %)		 32,753
(1.47 %)
123 northern pike (primary hap 2020 genbank)
GCA_011004845.1		 63,720
(60.35 %)		 n/a 16,616
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 82,918
(8.82 %)		 42.22
(99.89 %)		 0
(0 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 1,039,521
(30.93 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,094
(32.91 %)		 1
(0.00 %)		 602,569
(4.43 %)		 42,910
(2.52 %)		 22,099
(1.02 %)
124 northern pintail (primary hap 2024 genbank)
GCA_963932015.1		 n/a n/a 13,218
(1.88 %)		 23,888
(2.27 %)		 n/a 42.56
(99.99 %)		 0
(0 %)		 631
(0.01 %)		 395
(100.00 %)		 734,763
(5.74 %)		 422,947
(7.08 %)		 6,491,165
(25.88 %)		 10
(0.00 %)		 474,751
(3.08 %)		 34,601
(2.98 %)		 28,080
(1.42 %)
125 pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019)
GCA_004115245.1		 n/a n/a 18,118
(1.63 %)		 23,536
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,873
(100.00 %)		 3,001,130
(29.46 %)		 375,042
(0.79 %)		 11,813,971
(29.64 %)		 0
(0 %)		 140,066
(0.57 %)		 67,712
(4.23 %)		 70,108
(3.94 %)
126 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1		 35,529
(2.39 %)		 n/a 18,185
(1.70 %)		 20,184
(1.64 %)		 41,094
(3.29 %)		 42.38
(98.92 %)		 0
(0 %)		 831
(1.08 %)		 141
(100.00 %)		 3,072,951
(30.02 %)		 385,608
(0.80 %)		 12,060,365
(30.47 %)		 1
(0.00 %)		 173,548
(0.73 %)		 64,081
(4.30 %)		 66,821
(4.05 %)
127 Papuan ground boa (hap2 2024 genbank)
GCA_035149785.1		 n/a n/a 13,390
(1.26 %)		 17,496
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 101
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 728,574
(2.82 %)		 348,605
(2.13 %)		 7,199,124
(33.55 %)		 1
(0.00 %)		 318,788
(2.43 %)		 51,807
(2.69 %)		 19,758
(0.92 %)
128 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1		 49,100
(50.44 %)		 n/a 13,025
(1.67 %)		 24,167
(2.02 %)		 n/a 42.65
(99.69 %)		 0
(0 %)		 232
(0.31 %)		 124
(100.00 %)		 586,316
(11.83 %)		 335,214
(8.05 %)		 7,038,700
(24.65 %)		 0
(0 %)		 405,444
(2.46 %)		 26,085
(2.25 %)		 20,023
(0.87 %)
129 Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409185.1		 n/a n/a 20,384
(1.64 %)		 22,124
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 0
(0 %)		 116
(0.00 %)		 131
(100.00 %)		 4,492,423
(39.31 %)		 627,842
(4.79 %)		 15,561,515
(36.57 %)		 2
(0.00 %)		 n/a 45,336
(1.27 %)		 44,264
(1.15 %)
130 pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 genbank)
GCA_043159975.1		 n/a n/a 20,768
(1.76 %)		 21,550
(1.18 %)		 n/a 41.04
(100.00 %)		 0
(0 %)		 260
(0.00 %)		 362
(100.00 %)		 5,387,919
(53.48 %)		 1,027,640
(9.31 %)		 15,407,988
(41.73 %)		 1
(0.00 %)		 1,792,632
(3.77 %)		 99,854
(1.52 %)		 30,686
(0.78 %)
131 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3		 n/a n/a 14,805
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 0
(0 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,101,303
(51.62 %)		 578,617
(2.89 %)		 9,113,847
(48.93 %)		 0
(0 %)		 1,130,252
(3.59 %)		 87,861
(7.92 %)		 74,107
(2.86 %)
132 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1		 45,404
(55.83 %)		 n/a 14,654
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 57,391
(2.04 %)		 41.99
(99.49 %)		 0
(0 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,311,131
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 3
(0.00 %)		 1,623,656
(7.33 %)		 172,199
(5.45 %)		 18,080
(0.31 %)
133 Puerto Rican coqui (hap1 2024 genbank)
GCA_035609145.1		 n/a n/a 13,881
(0.57 %)		 32,313
(1.67 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 659
(0.00 %)		 963
(100.00 %)		 1,044,181
(1.98 %)		 1,442,189
(16.51 %)		 14,710,175
(54.00 %)		 6
(0.00 %)		 4,070,195
(8.73 %)		 501,931
(8.81 %)		 49,483
(0.82 %)
134 pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023)
GCF_029289425.1		 84,858
(3.73 %)		 n/a 20,765
(1.73 %)		 22,666
(1.18 %)		 n/a 40.49
(99.96 %)		 0
(0 %)		 8
(0.04 %)		 443
(100.00 %)		 5,487,575
(50.65 %)		 1,054,555
(12.79 %)		 15,952,698
(43.80 %)		 0
(0 %)		 3,830,835
(6.42 %)		 53,329
(1.37 %)		 27,996
(0.60 %)
135 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank)
GCA_026419965.1		 56,261
(41.31 %)		 n/a 18,495
(1.55 %)		 20,718
(1.32 %)		 n/a 42.05
(99.81 %)		 0
(0 %)		 143
(0.19 %)		 580
(100.00 %)		 3,817,653
(34.51 %)		 758,297
(7.42 %)		 12,196,926
(39.96 %)		 0
(0 %)		 1,197,918
(3.53 %)		 101,353
(2.90 %)		 50,216
(1.47 %)
136 rabbit (primary hap 2024 genbank)
GCA_964237555.1		 n/a n/a 19,386
(1.31 %)		 22,863
(1.35 %)		 n/a 44.02
(99.98 %)		 0
(0 %)		 2,276
(0.02 %)		 222
(100.00 %)		 4,099,590
(21.20 %)		 1,062,902
(3.78 %)		 13,416,878
(41.72 %)		 5
(0.00 %)		 1,560,079
(3.77 %)		 116,524
(2.66 %)		 74,863
(1.94 %)
137 red-fronted tinkerbird (primary hap 2020 genbank)
GCA_015220805.1		 n/a n/a 12,345
(1.60 %)		 23,206
(2.02 %)		 n/a 45.96
(99.53 %)		 0
(0 %)		 307
(0.47 %)		 253
(100.00 %)		 1,082,064
(22.90 %)		 378,866
(4.28 %)		 6,003,548
(35.88 %)		 0
(0 %)		 1,148,448
(6.01 %)		 26,519
(1.76 %)		 21,399
(1.21 %)
138 reedfish (2019)
GCF_900747795.1		 40,545
(1.73 %)		 n/a 13,154
(0.46 %)		 24,028
(1.29 %)		 34,856
(1.34 %)		 39.44
(93.75 %)		 0
(0 %)		 5,614
(6.25 %)		 1,885
(100.00 %)		 1,834,613
(2.79 %)		 1,018,031
(2.36 %)		 20,081,632
(44.56 %)		 4
(0.00 %)		 1,039,686
(2.44 %)		 88,254
(1.06 %)		 22,510
(0.28 %)
139 reedfish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900700845.2		 n/a n/a 9,950
(0.37 %)		 31,611
(1.22 %)		 n/a 39.44
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 5
(0.00 %)		 38,598
(100.00 %)		 1,300,565
(2.57 %)		 685,834
(2.21 %)		 14,691,576
(45.66 %)		 0
(0 %)		 588,794
(1.83 %)		 63,365
(1.11 %)		 17,365
(0.32 %)
140 river trout (v1 2019)
GCF_901001165.1		 102,772
(6.02 %)		 n/a 27,413
(1.62 %)		 51,424
(4.17 %)		 121,979
(5.28 %)		 43.36
(96.90 %)		 0
(0 %)		 3,941
(3.10 %)		 1,441
(100.00 %)		 1,438,988
(5.72 %)		 1,789,507
(15.87 %)		 9,819,761
(52.37 %)		 2
(0.00 %)		 3,428,195
(8.64 %)		 70,821
(1.77 %)		 18,627
(0.33 %)
141 rock pigeon (v1 racing homer maternal hap 2024)
GCA_036010775.1		 n/a n/a 12,450
(1.75 %)		 25,274
(2.35 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 23
(0.00 %)		 192
(0.00 %)		 673
(100.00 %)		 586,422
(10.85 %)		 392,341
(12.38 %)		 5,521,172
(28.56 %)		 2
(0.00 %)		 1,046,190
(5.37 %)		 33,479
(3.29 %)		 29,158
(1.73 %)
142 rock pigeon (v1 racing homer paternal W 2024)
GCA_036013475.1		 n/a n/a 13,145
(1.66 %)		 28,883
(2.53 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 0
(0 %)		 248
(0.00 %)		 870
(100.00 %)		 656,923
(11.76 %)		 412,678
(12.92 %)		 6,047,578
(29.90 %)		 0
(0 %)		 1,266,126
(5.89 %)		 36,847
(3.12 %)		 31,114
(1.65 %)
143 rock pigeon (v2 racing homer 2024 genbank)
GCA_036013475.2		 n/a n/a 13,146
(1.66 %)		 25,463
(2.12 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 0
(0 %)		 249
(0.00 %)		 870
(100.00 %)		 656,969
(11.76 %)		 412,670
(12.92 %)		 6,047,584
(29.90 %)		 0
(0 %)		 1,266,456
(5.89 %)		 36,847
(3.12 %)		 31,115
(1.65 %)
144 rough bullseye (RE-2024b hap1 2024 genbank)
GCA_042242105.1		 n/a n/a 14,592
(2.84 %)		 44,299
(6.93 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 87
(0.00 %)		 442
(100.00 %)		 1,764,545
(30.13 %)		 271,391
(5.93 %)		 3,651,092
(24.53 %)		 2
(0.00 %)		 299,227
(3.11 %)		 19,771
(1.39 %)		 14,337
(0.85 %)
145 royal ground snake (hap1 2023 genbank)
GCA_031021105.1		 n/a n/a 13,327
(0.96 %)		 20,347
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 1,983,903
(10.40 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,707
(53.44 %)		 11
(0.00 %)		 1,523,664
(5.77 %)		 130,852
(4.47 %)		 27,815
(0.70 %)
146 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1		 46,746
(40.70 %)		 n/a 18,625
(1.49 %)		 20,451
(1.28 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 0
(0 %)		 968
(0.01 %)		 631
(100.00 %)		 4,020,682
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,818
(42.64 %)		 0
(0 %)		 1,785,427
(5.07 %)		 66,179
(3.91 %)		 41,466
(1.03 %)
147 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1		 46,746
(2.39 %)		 n/a 18,624
(1.49 %)		 20,662
(1.31 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 0
(0 %)		 968
(0.01 %)		 630
(100.00 %)		 4,020,676
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,748
(42.64 %)		 0
(0 %)		 1,785,427
(5.07 %)		 66,179
(3.91 %)		 41,466
(1.03 %)
148 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1		 50,290
(50.75 %)		 n/a 12,971
(1.67 %)		 23,351
(2.02 %)		 n/a 43.15
(99.70 %)		 0
(0 %)		 258
(0.30 %)		 282
(100.00 %)		 548,087
(7.21 %)		 201,482
(8.55 %)		 7,030,761
(24.94 %)		 0
(0 %)		 469,777
(2.60 %)		 31,791
(2.57 %)		 20,215
(0.89 %)
149 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887145.1		 27,528
(42.80 %)		 n/a 12,832
(1.69 %)		 25,514
(2.23 %)		 n/a 43.50
(99.76 %)		 0
(0 %)		 363
(0.24 %)		 282
(100.00 %)		 541,958
(3.43 %)		 566,692
(13.38 %)		 6,205,274
(28.98 %)		 1
(0.00 %)		 651,029
(4.07 %)		 35,549
(5.05 %)		 23,802
(1.15 %)
150 San Diegan tiger whiptail (v1.0 HBS 135688 primary hap 2022)
GCA_023333525.1		 n/a n/a 10,727
(1.18 %)		 14,669
(1.99 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 39
(0.00 %)		 113
(100.00 %)		 741,937
(6.29 %)		 448,194
(5.60 %)		 7,227,870
(36.97 %)		 0
(0 %)		 769,111
(3.76 %)		 42,621
(2.15 %)		 17,889
(0.90 %)
151 San Diego alligator lizard (v1.0 HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1		 n/a n/a 14,075
(1.15 %)		 19,587
(1.99 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 23
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 1,577,744
(7.81 %)		 774,690
(3.78 %)		 9,248,062
(40.42 %)		 0
(0 %)		 832,326
(3.45 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,587
(0.82 %)
152 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 genbank)
GCA_023053635.2		 n/a n/a 14,093
(1.15 %)		 19,338
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 35
(100.00 %)		 1,577,751
(7.81 %)		 774,117
(3.78 %)		 9,248,069
(40.42 %)		 1
(0.00 %)		 823,656
(3.44 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,586
(0.82 %)
153 sardine (primary hap 2023 genbank)
GCA_963854185.1		 n/a n/a 16,071
(2.33 %)		 64,180
(7.08 %)		 n/a 44.44
(99.96 %)		 0
(0 %)		 1,654
(0.04 %)		 241
(100.00 %)		 1,503,111
(11.74 %)		 1,507,024
(15.48 %)		 4,027,638
(37.52 %)		 11
(0.00 %)		 1,188,853
(8.48 %)		 68,874
(3.56 %)		 38,590
(1.78 %)
154 Schreibers' long-fingered bat (v1 hap1 2024)
GCA_964146895.1		 n/a n/a 17,882
(1.96 %)		 21,291
(1.88 %)		 n/a 42.53
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,322
(0.01 %)		 265
(100.00 %)		 2,639,522
(28.12 %)		 453,024
(5.66 %)		 10,206,715
(31.11 %)		 6
(0.00 %)		 673,573
(2.67 %)		 59,363
(2.86 %)		 53,151
(1.93 %)
155 Schreibers' long-fingered bat (v1 hap2 2024)
GCA_964145185.1		 n/a n/a 17,115
(2.05 %)		 19,972
(1.93 %)		 n/a 42.62
(99.99 %)		 1,137
(0.01 %)		 1,137
(0.01 %)		 1,305
(99.99 %)		 2,445,695
(27.61 %)		 386,295
(4.40 %)		 9,657,997
(29.32 %)		 2
(0.00 %)		 458,566
(1.76 %)		 56,451
(2.93 %)		 50,746
(2.02 %)
156 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1		 n/a n/a 6,180
(0.71 %)		 31,191
(4.14 %)		 n/a 48.30
(100.00 %)		 0
(0 %)		 11
(0.00 %)		 4,064
(100.00 %)		 1,494,745
(38.42 %)		 891,392
(20.02 %)		 4,259,383
(49.70 %)		 0
(0 %)		 2,135,388
(12.73 %)		 147,499
(35.87 %)		 97,808
(5.62 %)
157 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1		 41,241
(6.50 %)		 n/a 7,638
(0.70 %)		 36,336
(4.06 %)		 83,714
(10.03 %)		 48.31
(98.62 %)		 0
(0 %)		 930
(1.38 %)		 1,434
(100.00 %)		 1,920,851
(39.36 %)		 1,194,165
(21.47 %)		 5,320,620
(50.50 %)		 4
(0.00 %)		 2,982,736
(13.77 %)		 178,590
(35.88 %)		 120,128
(5.32 %)
158 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 genbank)
GCF_035084215.1		 51,418
(2.53 %)		 n/a 12,778
(0.49 %)		 24,541
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,879
(100.00 %)		 597,115
(2.28 %)		 1,112,121
(17.97 %)		 12,108,003
(57.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,823,993
(9.23 %)		 117,585
(3.42 %)		 24,151
(0.35 %)
159 siamang (v1 Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1		 79,118
(2.62 %)		 n/a 20,139
(1.70 %)		 21,232
(1.14 %)		 n/a 40.62
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 606
(100.00 %)		 5,278,880
(55.89 %)		 946,219
(14.68 %)		 14,395,605
(46.26 %)		 0
(0 %)		 2,376,584
(4.99 %)		 95,573
(1.75 %)		 30,053
(0.74 %)
160 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.2		 105,373
(3.05 %)		 n/a 20,434
(1.69 %)		 21,357
(1.12 %)		 n/a 40.42
(99.97 %)		 0
(0 %)		 2
(0.03 %)		 27
(100.00 %)		 5,354,446
(55.80 %)		 935,620
(14.70 %)		 14,917,515
(46.01 %)		 0
(0 %)		 2,398,386
(4.90 %)		 92,243
(1.42 %)		 27,998
(0.68 %)
161 siamang (v2 Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.2		 n/a n/a 19,572
(1.70 %)		 20,107
(1.11 %)		 n/a 40.45
(99.93 %)		 0
(0 %)		 3
(0.07 %)		 40
(100.00 %)		 5,057,491
(55.54 %)		 869,279
(15.07 %)		 14,090,400
(46.04 %)		 0
(0 %)		 2,292,373
(4.98 %)		 87,907
(1.41 %)		 26,874
(0.68 %)
162 Siamese fighting fish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1		 n/a n/a 14,510
(4.12 %)		 60,058
(10.77 %)		 n/a 45.51
(100.00 %)		 0
(0 %)		 2
(0.00 %)		 3,705
(100.00 %)		 249,671
(3.68 %)		 182,366
(4.87 %)		 1,939,533
(22.55 %)		 0
(0 %)		 223,835
(4.10 %)		 72,474
(13.55 %)		 56,347
(7.50 %)
163 Siamese fighting fish (v2 primary hap 2019)
GCF_900634795.2		 54,389
(16.95 %)		 n/a 14,745
(4.21 %)		 34,348
(10.09 %)		 62,673
(13.02 %)		 45.30
(99.99 %)		 0
(0 %)		 328
(0.01 %)		 70
(100.00 %)		 252,955
(3.51 %)		 184,269
(4.62 %)		 2,010,934
(23.88 %)		 0
(0 %)		 232,426
(4.41 %)		 72,126
(13.08 %)		 55,959
(7.25 %)
164 Siamese fighting fish (v3 primary hap 2020)
GCF_900634795.3		 54,864
(17.78 %)		 n/a 14,745
(4.20 %)		 56,808
(10.87 %)		 69,466
(16.34 %)		 45.30
(99.99 %)		 0
(0 %)		 328
(0.01 %)		 70
(100.00 %)		 255,550
(3.51 %)		 184,269
(4.62 %)		 2,010,934
(23.88 %)		 0
(0 %)		 232,435
(4.41 %)		 72,126
(13.08 %)		 55,959
(7.25 %)
165 Skyros wall lizard (v1 hap1 2024)
GCA_964106915.1		 n/a n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 0
(0 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 7
(0.00 %)		 598,615
(3.50 %)		 93,005
(2.80 %)		 19,317
(0.73 %)
166 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1		 55,762
(1.62 %)		 n/a 12,597
(0.36 %)		 23,987
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 0
(0 %)		 7,146
(1.52 %)		 646
(100.00 %)		 1,185,832
(1.72 %)		 1,448,620
(6.25 %)		 20,884,767
(51.41 %)		 10
(0.00 %)		 3,334,926
(4.99 %)		 456,658
(8.18 %)		 31,096
(0.32 %)
167 smalltooth sawfish (v2 primary hap 2019 genbank)
GCA_009764475.1		 n/a n/a 11,828
(0.66 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 0
(0 %)		 698
(0.91 %)		 173
(100.00 %)		 405,021
(1.14 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,302
(38.19 %)		 0
(0 %)		 471,290
(1.50 %)		 45,398
(1.34 %)		 18,572
(0.38 %)
168 song sparrow (primary hap 2024 genbank)
GCA_035770615.1		 n/a n/a 12,940
(1.39 %)		 26,698
(1.87 %)		 n/a 44.96
(99.93 %)		 0
(0 %)		 299
(0.07 %)		 354
(100.00 %)		 515,857
(3.07 %)		 681,436
(15.73 %)		 5,004,880
(39.23 %)		 1
(0.00 %)		 1,925,221
(9.14 %)		 47,269
(3.90 %)		 25,118
(0.99 %)
169 speckled mousebird (hap1 2023 genbank)
GCA_028858725.1		 n/a n/a 11,956
(1.78 %)		 25,177
(2.60 %)		 n/a 42.38
(99.48 %)		 0
(0 %)		 143
(0.52 %)		 189
(100.00 %)		 523,056
(12.47 %)		 243,547
(3.72 %)		 5,408,003
(23.43 %)		 1
(0.00 %)		 397,635
(2.78 %)		 25,552
(2.34 %)		 19,232
(1.18 %)
170 speckled mousebird (v1 hap2 2023)
GCA_028858625.1		 n/a n/a 13,169
(1.74 %)		 26,896
(2.47 %)		 n/a 42.62
(99.56 %)		 0
(0 %)		 151
(0.44 %)		 243
(100.00 %)		 570,907
(11.75 %)		 317,226
(6.96 %)		 5,854,600
(25.51 %)		 0
(0 %)		 605,114
(3.54 %)		 28,905
(2.31 %)		 21,335
(1.22 %)
171 sterlet (v1 paternal hap 2020)
GCA_902713435.1		 n/a n/a 22,718
(1.81 %)		 34,093
(4.15 %)		 57,768
(4.88 %)		 39.60
(100.00 %)		 0
(0 %)		 422
(0.01 %)		 224
(100.00 %)		 1,145,503
(3.39 %)		 912,936
(6.84 %)		 8,839,174
(39.17 %)		 4
(0.00 %)		 1,099,124
(5.35 %)		 52,560
(1.82 %)		 14,166
(0.36 %)
172 Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1		 98,046
(3.46 %)		 n/a 21,162
(1.68 %)		 21,714
(1.13 %)		 n/a 41.13
(99.79 %)		 59
(0.21 %)		 59
(0.21 %)		 2,670
(99.79 %)		 5,730,768
(55.05 %)		 1,175,314
(11.19 %)		 16,323,507
(44.05 %)		 0
(0 %)		 2,553,363
(4.41 %)		 55,799
(2.08 %)		 39,159
(1.10 %)
173 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1		 n/a n/a 13,403
(1.85 %)		 27,456
(2.48 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 0
(0 %)		 13
(0.00 %)		 3,601
(100.00 %)		 497,374
(5.78 %)		 649,859
(4.89 %)		 6,740,713
(22.65 %)		 0
(0 %)		 505,741
(2.66 %)		 49,076
(3.54 %)		 23,486
(1.21 %)
174 Swainson's thrush (v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1		 40,128
(5.45 %)		 n/a 13,016
(1.88 %)		 24,787
(2.41 %)		 30,064
(2.94 %)		 42.48
(98.86 %)		 0
(0 %)		 428
(1.14 %)		 161
(100.00 %)		 483,978
(5.85 %)		 589,859
(4.32 %)		 6,708,638
(22.44 %)		 1
(0.00 %)		 449,585
(2.41 %)		 49,404
(3.53 %)		 22,206
(1.16 %)
175 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018845.1		 29,544
(46.92 %)		 n/a 12,375
(1.75 %)		 24,577
(2.31 %)		 n/a 43.08
(99.89 %)		 0
(0 %)		 236
(0.11 %)		 40
(100.00 %)		 419,473
(3.09 %)		 439,909
(7.61 %)		 6,077,743
(24.47 %)		 1
(0.00 %)		 578,723
(3.93 %)		 32,064
(3.27 %)		 22,996
(1.19 %)
176 tammar wallaby (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028372415.1		 n/a n/a 17,652
(0.77 %)		 15,774
(0.88 %)		 n/a 38.73
(99.81 %)		 0
(0 %)		 515
(0.19 %)		 315
(100.00 %)		 5,836,160
(26.14 %)		 1,193,709
(2.72 %)		 22,682,658
(39.52 %)		 4
(0.00 %)		 566,172
(1.21 %)		 23,629
(0.48 %)		 14,785
(0.29 %)
177 thorny skate (v1 CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1		 45,969
(2.40 %)		 n/a 11,433
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 32,017
(1.87 %)		 44.30
(92.54 %)		 0
(0 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 865,711
(2.57 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 26
(0.00 %)		 1,634,657
(4.98 %)		 242,676
(4.73 %)		 31,030
(0.57 %)
178 thorny skate (v1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank)
GCA_010909765.1		 45,969
(46.35 %)		 n/a 11,434
(0.60 %)		 26,342
(1.72 %)		 32,017
(1.87 %)		 44.30
(92.54 %)		 0
(0 %)		 3,753
(7.46 %)		 958
(100.00 %)		 866,598
(2.58 %)		 1,176,350
(3.79 %)		 9,964,083
(52.25 %)		 26
(0.00 %)		 1,634,657
(4.98 %)		 242,676
(4.73 %)		 31,030
(0.57 %)
179 tiny Cayenne caecilian (v1 2019)
GCF_901765095.1		 41,333
(1.27 %)		 n/a 14,569
(0.43 %)		 30,499
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 0
(0 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,835,191
(1.59 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,145
(52.43 %)		 5
(0.00 %)		 1,513,727
(3.00 %)		 414,828
(3.91 %)		 47,796
(0.38 %)
180 tourmaline sunangel (hap1 2024 genbank)
GCA_036169615.1		 n/a n/a 12,509
(1.97 %)		 21,020
(2.33 %)		 n/a 41.63
(99.99 %)		 0
(0 %)		 437
(0.01 %)		 131
(100.00 %)		 532,267
(5.46 %)		 332,284
(2.69 %)		 6,084,978
(21.20 %)		 0
(0 %)		 215,264
(1.71 %)		 19,080
(1.72 %)		 15,764
(1.09 %)
181 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2		 53,479
(18.31 %)		 n/a 14,527
(4.79 %)		 28,597
(10.65 %)		 55,587
(14.38 %)		 45.67
(99.04 %)		 0
(0 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 281,011
(10.36 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,756
(20.86 %)		 1
(0.02 %)		 281,981
(5.43 %)		 49,975
(9.63 %)		 37,920
(5.08 %)
182 trahira (v1 hap1 2024 refseq)
GCF_029633855.1		 55,764
(7.71 %)		 n/a 17,259
(2.05 %)		 47,792
(4.36 %)		 n/a 40.99
(94.51 %)		 0
(0 %)		 989
(5.49 %)		 598
(100.00 %)		 2,407,637
(30.93 %)		 742,073
(14.33 %)		 5,715,475
(37.52 %)		 3
(0.00 %)		 1,264,118
(7.29 %)		 29,012
(2.12 %)		 12,979
(0.45 %)
183 Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 genbank)
GCA_040894005.1		 n/a n/a 13,678
(0.88 %)		 29,720
(2.41 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 436
(0.00 %)		 961
(100.00 %)		 734,036
(2.54 %)		 1,217,326
(21.42 %)		 8,925,883
(52.53 %)		 6
(0.00 %)		 691,991
(2.19 %)		 211,590
(5.08 %)		 23,983
(0.47 %)
184 two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_901001135.1		 56,617
(1.50 %)		 n/a 14,448
(0.38 %)		 40,572
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 0
(0 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,263,606
(1.94 %)		 2,036,108
(4.34 %)		 29,400,958
(44.09 %)		 9
(0.01 %)		 2,193,249
(3.24 %)		 602,912
(6.66 %)		 94,935
(0.82 %)
185 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 genbank)
GCA_026979565.1		 n/a n/a 12,819
(1.94 %)		 24,247
(2.44 %)		 n/a 42.23
(99.98 %)		 0
(0 %)		 458
(0.02 %)		 178
(100.00 %)		 616,749
(11.96 %)		 411,917
(3.56 %)		 6,385,102
(20.91 %)		 6
(0.00 %)		 306,942
(1.90 %)		 37,940
(2.83 %)		 24,967
(1.41 %)
186 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1		 61,103
(44.10 %)		 n/a 18,126
(1.16 %)		 21,345
(1.28 %)		 n/a 42.00
(99.97 %)		 0
(0 %)		 3,760
(0.03 %)		 1,175
(100.00 %)		 4,891,344
(19.68 %)		 1,507,933
(3.81 %)		 12,571,193
(54.50 %)		 7
(0.00 %)		 1,975,693
(4.67 %)		 32,667
(0.90 %)		 24,067
(0.56 %)
187 western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023)
GCF_029281585.1		 101,242
(3.18 %)		 n/a 20,994
(1.57 %)		 41,945
(1.53 %)		 n/a 40.59
(99.85 %)		 0
(0 %)		 38
(0.15 %)		 637
(100.00 %)		 5,526,927
(51.16 %)		 1,080,693
(20.38 %)		 15,929,020
(48.46 %)		 0
(0 %)		 5,690,867
(9.25 %)		 76,432
(1.35 %)		 30,764
(0.70 %)
188 western lowland gorilla (v2.1 KB3781 2024 refseq)
GCF_029281585.2		 98,428
(2.94 %)		 n/a 21,013
(1.59 %)		 50,697
(1.83 %)		 n/a 40.49
(99.94 %)		 0
(0 %)		 2
(0.06 %)		 26
(100.00 %)		 5,462,311
(50.79 %)		 1,060,267
(19.55 %)		 15,870,229
(47.77 %)		 0
(0 %)		 5,140,568
(8.53 %)		 69,745
(1.19 %)		 30,648
(0.70 %)
189 white leghorn X broiler chicken (v1 leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1		 55,865
(8.86 %)		 n/a 12,310
(2.41 %)		 22,056
(2.57 %)		 n/a 42.20
(99.65 %)		 254
(0.35 %)		 254
(0.35 %)		 509
(99.65 %)		 604,452
(10.76 %)		 232,416
(2.03 %)		 5,541,059
(20.23 %)		 2
(0.00 %)		 203,559
(1.88 %)		 22,185
(2.62 %)		 19,239
(1.58 %)
190 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1		 59,982
(41.87 %)		 n/a 18,737
(1.57 %)		 20,767
(1.34 %)		 n/a 41.91
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,070
(0.01 %)		 410
(100.00 %)		 3,820,566
(36.21 %)		 922,103
(8.43 %)		 12,304,360
(39.74 %)		 2
(0.00 %)		 1,117,804
(3.60 %)		 68,551
(3.58 %)		 41,698
(1.09 %)
191 white-crowned manakin (hap1 2024 genbank)
GCA_036250125.1		 n/a n/a 12,807
(1.82 %)		 25,568
(2.46 %)		 n/a 42.66
(99.99 %)		 0
(0 %)		 323
(0.01 %)		 697
(100.00 %)		 429,646
(4.10 %)		 293,431
(3.59 %)		 6,059,494
(21.89 %)		 0
(0 %)		 366,430
(2.74 %)		 29,574
(2.42 %)		 21,946
(1.07 %)
192 white-tailed eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_947461875.1		 n/a n/a 13,735
(1.76 %)		 28,993
(2.53 %)		 n/a 43.15
(99.99 %)		 0
(0 %)		 424
(0.01 %)		 188
(100.00 %)		 585,276
(12.89 %)		 291,289
(6.10 %)		 6,474,027
(23.66 %)		 0
(0 %)		 312,204
(2.16 %)		 54,851
(4.05 %)		 31,757
(1.50 %)
193 white-throated dipper (primary hap 2023 genbank)
GCA_963662255.1		 n/a n/a 12,856
(1.79 %)		 23,827
(2.25 %)		 n/a 42.82
(99.99 %)		 0
(0 %)		 658
(0.01 %)		 278
(100.00 %)		 431,536
(3.38 %)		 345,533
(10.59 %)		 5,840,462
(26.59 %)		 1
(0.00 %)		 617,894
(3.85 %)		 29,711
(3.56 %)		 21,555
(1.20 %)
194 white-tufted-ear marmoset (v1 paternal hap 2020)
GCA_011100535.1		 n/a n/a 20,939
(1.94 %)		 20,416
(1.31 %)		 n/a 41.04
(99.58 %)		 0
(0 %)		 788
(0.42 %)		 336
(100.00 %)		 4,869,007
(49.39 %)		 746,577
(2.68 %)		 14,347,286
(37.59 %)		 0
(0 %)		 1,026,338
(2.34 %)		 35,222
(0.94 %)		 25,795
(0.75 %)
195 yellow-bellied marmot (hap1 2025 genbank)
GCA_047511675.1		 n/a n/a 19,503
(1.44 %)		 20,301
(1.35 %)		 n/a 39.90
(100.00 %)		 0
(0 %)		 330
(0.00 %)		 814
(100.00 %)		 4,038,897
(29.07 %)		 978,915
(3.28 %)		 14,404,740
(34.97 %)		 4
(0.00 %)		 446,138
(1.44 %)		 36,674
(1.05 %)		 27,659
(0.61 %)
196 zebra finch (alternate hap Black17 2018)
GCA_003957525.1		 n/a n/a 11,340
(1.85 %)		 22,921
(2.37 %)		 n/a 41.73
(99.98 %)		 45
(0.01 %)		 45
(0.01 %)		 5,381
(99.99 %)		 480,647
(8.44 %)		 365,668
(2.89 %)		 5,859,698
(20.27 %)		 0
(0 %)		 235,418
(1.48 %)		 24,649
(2.35 %)		 19,753
(1.21 %)
197 zebra finch (Blue55 female 2020 genbank)
GCA_009859065.2		 n/a n/a 12,796
(1.92 %)		 24,658
(2.44 %)		 n/a 41.91
(98.03 %)		 0
(0 %)		 789
(1.97 %)		 541
(100.00 %)		 554,338
(9.67 %)		 339,851
(2.27 %)		 6,613,146
(20.04 %)		 1
(0.00 %)		 220,583
(1.45 %)		 28,678
(2.32 %)		 22,455
(1.18 %)
198 zebra finch (v1 Black17 2019 refseq)
GCF_003957565.1		 51,472
(7.16 %)		 n/a 13,211
(2.02 %)		 17,812
(2.70 %)		 38,655
(7.10 %)		 42.04
(99.78 %)		 0
(0 %)		 312
(0.22 %)		 135
(100.00 %)		 535,521
(8.50 %)		 550,118
(4.01 %)		 6,519,872
(21.47 %)		 1
(0.00 %)		 381,676
(2.04 %)		 30,053
(2.58 %)		 22,898
(1.24 %)
199 zebra finch (v1 Black17 male 2019 genbank)
GCA_003957565.2		 n/a n/a 13,212
(2.02 %)		 25,117
(2.57 %)		 38,655
(7.10 %)		 42.04
(99.78 %)		 0
(0 %)		 312
(0.22 %)		 135
(100.00 %)		 535,521
(8.50 %)		 550,118
(4.01 %)		 6,519,872
(21.47 %)		 1
(0.00 %)		 381,676
(2.04 %)		 30,053
(2.58 %)		 22,898
(1.24 %)
200 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2		 44,988
(12.00 %)		 n/a 15,037
(3.35 %)		 40,235
(7.28 %)		 60,496
(9.39 %)		 40.66
(97.76 %)		 0
(0 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 348,230
(2.87 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,025
(23.44 %)		 0
(0 %)		 175,881
(3.08 %)		 12,807
(1.08 %)		 8,703
(0.67 %)
TOTALS:total assembly count 200

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies