VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of legacy/superseded assemblies)

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base AGP
gap		 all
gaps		 assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 gap
Overlap		 tandem
Dups		 cpg
unmasked		 cpg
island
1 African grass rat (paternal X 2020 refseq)
GCF_011762505.1		 45,963
(2.46 %)		 n/a 20,878
(1.99 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 0
(0 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,595
(100.00 %)		 4,939,557
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,429
(32.71 %)		 2
(0.00 %)		 1,065,249
(2.09 %)		 17,767
(0.51 %)		 16,852
(0.46 %)
2 African grass rat (v1 paternal X 2020 genbank)
GCA_011762505.1		 45,963
(36.56 %)		 n/a 20,933
(2.00 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 0
(0 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 4,940,083
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,540
(32.71 %)		 2
(0.00 %)		 1,027,357
(2.09 %)		 17,767
(0.51 %)		 16,848
(0.46 %)
3 African savanna elephant (hap2 2023 genbank)
GCA_030014295.1		 n/a n/a 18,981
(1.10 %)		 22,759
(1.12 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 0
(0 %)		 231
(0.10 %)		 880
(100.00 %)		 4,426,756
(29.95 %)		 832,908
(4.08 %)		 16,118,910
(49.47 %)		 1
(0.00 %)		 1,082,958
(2.38 %)		 62,315
(1.49 %)		 23,783
(0.48 %)
4 Andian cavefish (hap1 2023 genbank)
GCA_030014385.1		 n/a n/a 15,802
(1.97 %)		 47,186
(4.62 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 0
(0 %)		 198
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 2,616,870
(40.73 %)		 658,784
(9.71 %)		 5,197,126
(48.95 %)		 0
(0 %)		 1,328,920
(9.28 %)		 48,344
(2.62 %)		 28,666
(1.27 %)
5 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2		 n/a n/a 12,258
(1.95 %)		 20,580
(2.26 %)		 n/a 41.49
(98.48 %)		 0
(0 %)		 429
(1.52 %)		 160
(100.00 %)		 535,315
(7.95 %)		 262,056
(1.51 %)		 6,092,351
(20.84 %)		 0
(0 %)		 152,105
(1.27 %)		 17,130
(1.48 %)		 15,125
(1.04 %)
6 Arabian camel (paternal hap 2024 genbank)
GCA_036321535.1		 n/a n/a 18,080
(1.66 %)		 20,345
(1.52 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 0
(0 %)		 195
(0.00 %)		 172
(100.00 %)		 3,040,473
(29.22 %)		 343,482
(10.93 %)		 11,797,012
(33.50 %)		 2
(0.00 %)		 1,611,842
(4.73 %)		 55,428
(1.61 %)		 47,478
(1.18 %)
7 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924715.1		 n/a n/a 15,722
(2.57 %)		 43,026
(5.68 %)		 n/a 39.77
(99.99 %)		 0
(0 %)		 468
(0.01 %)		 120
(100.00 %)		 1,608,686
(33.02 %)		 253,749
(4.14 %)		 5,181,115
(27.80 %)		 3
(0.00 %)		 390,196
(3.88 %)		 14,488
(0.90 %)		 9,706
(0.46 %)
8 Atlantic halibut (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819705.1		 52,117
(66.34 %)		 n/a 14,960
(3.20 %)		 45,365
(7.48 %)		 69,625
(10.94 %)		 42.21
(99.43 %)		 0
(0 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,421
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,979
(24.13 %)		 0
(0 %)		 240,110
(3.16 %)		 31,325
(2.25 %)		 20,749
(1.34 %)
9 Atlantic mackerel (primary hap 2023 genbank)
GCA_963691925.1		 n/a n/a 15,291
(2.56 %)		 43,206
(5.92 %)		 n/a 39.78
(99.96 %)		 0
(0 %)		 1,489
(0.04 %)		 666
(100.00 %)		 1,496,244
(26.83 %)		 395,543
(8.92 %)		 4,523,761
(29.92 %)		 9
(0.00 %)		 555,075
(5.00 %)		 13,309
(0.75 %)		 8,372
(0.43 %)
10 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1		 60,922
(45.62 %)		 n/a 12,545
(0.38 %)		 29,428
(1.34 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,990
(100.00 %)		 8,579,105
(49.81 %)		 831,224
(15.75 %)		 21,718,213
(51.79 %)		 9
(0.00 %)		 4,445,293
(7.00 %)		 105,821
(2.42 %)		 35,197
(0.42 %)
11 ballan wrasse (primary hap 2024 genbank)
GCA_963930695.1		 n/a n/a 15,142
(2.66 %)		 43,601
(6.21 %)		 n/a 40.59
(99.98 %)		 1
(0.00 %)		 815
(0.02 %)		 133
(100.00 %)		 1,221,802
(30.10 %)		 290,738
(7.79 %)		 4,164,845
(30.34 %)		 4
(0.00 %)		 525,923
(5.43 %)		 17,126
(0.94 %)		 10,131
(0.54 %)
12 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 genbank)
GCA_036971685.1		 n/a n/a 13,319
(1.60 %)		 25,993
(2.05 %)		 n/a 43.83
(99.41 %)		 0
(0 %)		 219
(0.59 %)		 453
(100.00 %)		 700,173
(13.18 %)		 457,546
(13.85 %)		 4,523,003
(31.73 %)		 2
(0.00 %)		 1,089,353
(5.57 %)		 42,686
(7.00 %)		 31,415
(1.62 %)
13 barn swallow (v2 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.1		 43,374
(5.14 %)		 n/a 12,385
(1.88 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 0
(0 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 579,928
(6.20 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 0
(0 %)		 237,664
(1.56 %)		 36,546
(2.82 %)		 29,760
(1.66 %)
14 barn swallow (v3 primary hap 2021 genbank)
GCA_015227805.3		 n/a n/a 12,395
(1.89 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 0
(0 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 664,757
(13.92 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 0
(0 %)		 237,664
(1.56 %)		 36,548
(2.85 %)		 29,760
(1.66 %)
15 black rhinoceros (primary hap 2021 genbank)
GCA_020826845.1		 56,255
(36.51 %)		 n/a 18,774
(1.38 %)		 22,346
(1.26 %)		 n/a 41.59
(99.95 %)		 0
(0 %)		 215
(0.05 %)		 1,075
(100.00 %)		 4,200,385
(36.22 %)		 548,030
(8.34 %)		 14,347,639
(40.14 %)		 2
(0.00 %)		 984,722
(2.61 %)		 43,525
(1.14 %)		 33,963
(0.76 %)
16 black-headed gull (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924245.1		 n/a n/a 13,244
(1.58 %)		 25,111
(1.96 %)		 n/a 44.66
(99.99 %)		 0
(0 %)		 462
(0.01 %)		 729
(100.00 %)		 516,350
(4.84 %)		 268,175
(14.83 %)		 5,880,256
(31.31 %)		 1
(0.00 %)		 746,095
(4.07 %)		 45,313
(4.92 %)		 37,372
(1.57 %)
17 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1		 51,115
(48.16 %)		 n/a 13,211
(1.67 %)		 24,108
(1.99 %)		 n/a 44.40
(99.94 %)		 0
(0 %)		 283
(0.06 %)		 716
(100.00 %)		 521,275
(5.36 %)		 236,727
(8.62 %)		 5,684,588
(26.70 %)		 8
(0.00 %)		 651,836
(3.67 %)		 45,318
(4.71 %)		 36,668
(1.67 %)
18 blackcap (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819655.1		 n/a n/a 12,378
(1.92 %)		 22,970
(2.37 %)		 n/a 42.00
(98.88 %)		 0
(0 %)		 413
(1.12 %)		 189
(100.00 %)		 506,242
(6.14 %)		 330,354
(2.12 %)		 6,410,567
(19.76 %)		 0
(0 %)		 190,210
(1.30 %)		 26,838
(2.34 %)		 22,667
(1.33 %)
19 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 genbank)
GCA_025265405.1		 47,540
(38.02 %)		 n/a 19,042
(1.52 %)		 20,766
(1.27 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 0
(0 %)		 97
(0.03 %)		 73
(100.00 %)		 3,964,035
(35.29 %)		 765,957
(8.74 %)		 12,128,162
(41.78 %)		 1
(0.00 %)		 1,795,618
(5.01 %)		 70,851
(1.80 %)		 37,949
(0.93 %)
20 blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019)
GCA_008658375.1		 n/a n/a 17,285
(1.80 %)		 21,295
(1.43 %)		 n/a 41.22
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 12,574
(100.00 %)		 3,196,354
(43.47 %)		 467,194
(1.26 %)		 10,176,588
(33.66 %)		 0
(0 %)		 306,308
(1.20 %)		 56,916
(1.85 %)		 39,871
(1.51 %)
21 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2		 n/a n/a 19,164
(1.81 %)		 20,546
(1.41 %)		 34,210
(1.86 %)		 40.88
(98.91 %)		 0
(0 %)		 936
(1.09 %)		 130
(100.00 %)		 3,999,202
(44.22 %)		 581,540
(1.22 %)		 12,900,977
(34.62 %)		 2
(0.00 %)		 424,951
(1.36 %)		 67,189
(1.73 %)		 46,700
(1.41 %)
22 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1		 47,312
(59.52 %)		 n/a 14,496
(1.97 %)		 28,873
(5.58 %)		 60,981
(6.13 %)		 38.27
(98.47 %)		 0
(0 %)		 1,160
(1.53 %)		 441
(100.00 %)		 731,730
(4.21 %)		 471,620
(4.92 %)		 5,974,002
(42.88 %)		 0
(0 %)		 455,135
(4.01 %)		 29,050
(1.48 %)		 14,672
(0.63 %)
23 blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq)
GCF_900634775.1		 47,312
(7.12 %)		 n/a 14,496
(1.97 %)		 28,873
(5.58 %)		 60,981
(6.13 %)		 38.27
(98.47 %)		 0
(0 %)		 1,160
(1.53 %)		 441
(100.00 %)		 731,730
(4.21 %)		 471,620
(4.92 %)		 5,974,002
(42.88 %)		 0
(0 %)		 455,135
(4.01 %)		 29,050
(1.48 %)		 14,672
(0.63 %)
24 Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028885525.1		 n/a n/a 19,820
(1.76 %)		 20,399
(1.15 %)		 n/a 40.98
(99.88 %)		 36
(0.12 %)		 36
(0.12 %)		 251
(99.88 %)		 5,232,617
(54.01 %)		 1,003,539
(10.19 %)		 14,858,575
(42.10 %)		 0
(0 %)		 2,511,941
(4.39 %)		 42,467
(1.24 %)		 29,563
(0.80 %)
25 Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023 refseq)
GCF_028885625.1		 81,966
(2.93 %)		 n/a 20,794
(1.72 %)		 21,307
(1.13 %)		 n/a 41.13
(99.86 %)		 39
(0.14 %)		 39
(0.14 %)		 1,593
(99.86 %)		 5,651,267
(54.21 %)		 1,155,151
(9.33 %)		 16,242,823
(42.82 %)		 0
(0 %)		 2,513,241
(4.25 %)		 52,294
(2.02 %)		 36,160
(1.02 %)
26 bowfin (hap1 2024 genbank)
GCA_036373705.1		 n/a n/a 13,851
(1.83 %)		 27,058
(4.43 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 0
(0 %)		 97
(0.00 %)		 390
(100.00 %)		 953,497
(13.69 %)		 387,700
(7.91 %)		 4,552,410
(37.72 %)		 4
(0.00 %)		 613,799
(6.38 %)		 46,301
(2.99 %)		 26,437
(1.15 %)
27 brown anole (maternal hap 2024 genbank)
GCA_037176765.1		 n/a n/a 14,463
(1.05 %)		 20,625
(1.90 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 0
(0 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 0
(0 %)		 1,512,000
(5.23 %)		 44,738
(1.08 %)		 17,370
(0.40 %)
28 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1		 32,026
(47.01 %)		 n/a 13,250
(1.87 %)		 23,063
(2.25 %)		 26,324
(3.11 %)		 41.80
(99.72 %)		 0
(0 %)		 284
(0.28 %)		 865
(100.00 %)		 539,059
(10.20 %)		 279,511
(3.12 %)		 5,874,608
(22.08 %)		 1
(0.00 %)		 324,823
(2.05 %)		 21,155
(1.61 %)		 17,590
(1.10 %)
29 California sea lion (alternate hap 2019)
GCA_009762295.1		 n/a n/a 18,348
(1.81 %)		 18,692
(1.47 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,093
(100.00 %)		 3,722,619
(42.89 %)		 488,086
(1.26 %)		 10,893,132
(33.14 %)		 0
(0 %)		 393,471
(1.40 %)		 44,449
(1.57 %)		 41,300
(1.38 %)
30 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1		 n/a n/a 21,020
(1.79 %)		 20,045
(1.39 %)		 45,176
(2.15 %)		 41.40
(99.28 %)		 0
(0 %)		 122
(0.72 %)		 43
(100.00 %)		 4,529,949
(43.67 %)		 589,962
(1.24 %)		 13,266,465
(33.77 %)		 0
(0 %)		 491,959
(1.43 %)		 51,989
(1.50 %)		 48,284
(1.32 %)
31 Canada lynx (alternate hap LIC74 2019)
GCA_007474575.1		 n/a n/a 12,029
(1.42 %)		 15,171
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(0.00 %)		 15,036
(100.00 %)		 2,937,491
(43.50 %)		 544,410
(1.76 %)		 7,641,565
(32.72 %)		 0
(0 %)		 294,221
(1.43 %)		 39,082
(2.44 %)		 34,616
(1.88 %)
32 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1		 50,094
(2.69 %)		 n/a 18,283
(1.66 %)		 19,326
(1.35 %)		 38,985
(1.96 %)		 41.70
(99.88 %)		 0
(0 %)		 848
(0.12 %)		 66
(100.00 %)		 5,016,399
(43.75 %)		 904,986
(1.75 %)		 13,476,288
(34.20 %)		 0
(0 %)		 572,992
(1.64 %)		 66,822
(2.52 %)		 60,494
(2.02 %)
33 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1		 40,788
(61.50 %)		 n/a 14,472
(3.02 %)		 24,012
(6.59 %)		 60,720
(10.43 %)		 40.96
(99.58 %)		 0
(0 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 420,697
(5.49 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 0
(0 %)		 452,303
(4.62 %)		 20,453
(1.39 %)		 10,802
(0.65 %)
34 chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028858805.1		 n/a n/a 20,001
(1.79 %)		 21,230
(1.19 %)		 n/a 40.62
(99.78 %)		 22
(0.22 %)		 22
(0.22 %)		 141
(99.78 %)		 5,092,768
(48.83 %)		 946,933
(11.75 %)		 14,844,947
(42.39 %)		 0
(0 %)		 3,140,392
(5.61 %)		 47,662
(1.21 %)		 29,340
(0.82 %)
35 chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023 refseq)
GCF_028858775.1		 111,282
(4.36 %)		 n/a 20,990
(1.75 %)		 21,705
(1.15 %)		 n/a 40.94
(99.90 %)		 29
(0.10 %)		 29
(0.10 %)		 1,500
(99.90 %)		 5,581,205
(50.06 %)		 1,158,792
(10.59 %)		 15,972,274
(43.09 %)		 0
(0 %)		 3,093,549
(5.27 %)		 61,901
(2.29 %)		 38,043
(1.17 %)
36 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2		 42,746
(63.74 %)		 n/a 15,239
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 63,908
(10.45 %)		 40.40
(99.35 %)		 0
(0 %)		 266
(0.65 %)		 50
(100.00 %)		 324,479
(2.66 %)		 130,248
(1.89 %)		 3,324,960
(21.31 %)		 0
(0 %)		 169,785
(2.72 %)		 10,500
(0.87 %)		 7,574
(0.57 %)
37 climbing perch (v1.2 2018 refseq)
GCF_900324465.2		 42,746
(13.53 %)		 n/a 15,241
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 63,908
(10.45 %)		 40.40
(99.35 %)		 0
(0 %)		 266
(0.65 %)		 51
(100.00 %)		 324,324
(2.66 %)		 130,249
(1.89 %)		 3,325,009
(21.31 %)		 0
(0 %)		 169,785
(2.72 %)		 10,500
(0.87 %)		 7,574
(0.57 %)
38 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1		 67,207
(45.84 %)		 n/a 18,772
(1.77 %)		 20,527
(1.42 %)		 35,815
(1.58 %)		 41.44
(99.74 %)		 0
(0 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,067,521
(46.14 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,896
(35.29 %)		 1
(0.00 %)		 597,652
(1.78 %)		 65,551
(1.90 %)		 43,161
(1.35 %)
39 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1		 37,661
(35.20 %)		 n/a 18,681
(0.81 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 0
(0 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,697
(38.92 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,301
(40.56 %)		 0
(0 %)		 455,834
(1.17 %)		 17,762
(0.38 %)		 13,986
(0.24 %)
40 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1		 50,206
(57.28 %)		 n/a 13,179
(1.84 %)		 25,859
(2.41 %)		 n/a 42.18
(99.58 %)		 0
(0 %)		 296
(0.42 %)		 151
(100.00 %)		 521,043
(9.61 %)		 310,469
(2.36 %)		 6,712,849
(21.76 %)		 0
(0 %)		 326,521
(1.83 %)		 25,267
(1.71 %)		 20,672
(1.05 %)
41 common spadefoot toad (primary hap 2024 genbank)
GCA_036172605.1		 n/a n/a 14,564
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 349
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 1,677,382
(3.51 %)		 3,229,435
(13.31 %)		 15,027,089
(51.43 %)		 12
(0.00 %)		 3,799,247
(9.03 %)		 282,389
(3.86 %)		 79,263
(0.96 %)
42 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1		 39,986
(53.94 %)		 n/a 12,277
(1.88 %)		 20,379
(2.16 %)		 n/a 41.95
(99.84 %)		 0
(0 %)		 256
(0.16 %)		 109
(100.00 %)		 533,758
(8.66 %)		 199,748
(1.12 %)		 6,353,957
(21.19 %)		 1
(0.00 %)		 113,872
(0.91 %)		 20,393
(1.74 %)		 16,313
(0.88 %)
43 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1		 58,054
(45.51 %)		 n/a 18,280
(1.71 %)		 19,514
(1.59 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 0
(0 %)		 611
(0.01 %)		 572
(100.00 %)		 2,761,820
(28.38 %)		 427,940
(3.89 %)		 11,250,492
(32.57 %)		 37
(0.00 %)		 360,489
(1.62 %)		 70,700
(2.48 %)		 44,288
(1.24 %)
44 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.1		 58,054
(3.40 %)		 n/a 18,280
(1.71 %)		 19,515
(1.59 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 0
(0 %)		 611
(0.01 %)		 573
(100.00 %)		 2,761,826
(28.38 %)		 427,942
(3.89 %)		 11,250,529
(32.57 %)		 37
(0.00 %)		 360,489
(1.62 %)		 70,701
(2.48 %)		 44,289
(1.24 %)
45 corroboree frog (hap2 2023 genbank)
GCA_028390025.1		 n/a n/a n/a 54,346
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 0
(0 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 18,782,633
(75.22 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 5,826
(99.76 %)		 23
(0.00 %)		 n/a 990,274
(4.84 %)		 90,184
(0.51 %)
46 denticle herring (v1 2019)
GCF_900700375.1		 59,645
(12.74 %)		 n/a 16,556
(3.78 %)		 37,861
(8.42 %)		 72,719
(10.66 %)		 43.69
(99.18 %)		 0
(0 %)		 464
(0.82 %)		 460
(100.00 %)		 403,512
(3.23 %)		 224,282
(4.61 %)		 2,948,671
(28.79 %)		 0
(0 %)		 306,165
(4.31 %)		 64,661
(9.49 %)		 52,867
(4.93 %)
47 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1		 25,483
(48.39 %)		 n/a 12,405
(1.70 %)		 23,073
(2.18 %)		 n/a 45.31
(99.66 %)		 0
(0 %)		 187
(0.34 %)		 181
(100.00 %)		 1,008,118
(21.51 %)		 378,537
(3.38 %)		 5,846,717
(32.04 %)		 0
(0 %)		 791,076
(4.25 %)		 26,005
(1.75 %)		 19,919
(1.16 %)
48 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1		 57,615
(9.59 %)		 n/a 15,348
(2.22 %)		 28,518
(6.29 %)		 42,170
(8.31 %)		 41.07
(99.87 %)		 115
(0.00 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 527,486
(5.98 %)		 217,915
(1.89 %)		 4,547,443
(30.78 %)		 2
(0.00 %)		 212,425
(2.79 %)		 33,005
(1.88 %)		 16,748
(0.95 %)
49 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1		 n/a n/a 13,181
(1.74 %)		 24,708
(2.10 %)		 33,433
(3.99 %)		 42.41
(100.00 %)		 0
(0 %)		 512
(0.00 %)		 802
(100.00 %)		 504,527
(4.38 %)		 259,276
(2.59 %)		 7,105,965
(19.15 %)		 8
(0.00 %)		 316,149
(1.79 %)		 41,784
(5.52 %)		 41,105
(3.30 %)
50 epaulette shark (2021 genbank)
GCA_020745735.1		 43,156
(39.58 %)		 n/a 12,439
(0.39 %)		 19,520
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 0
(0 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,963
(100.00 %)		 9,211,963
(69.93 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,613
(43.88 %)		 0
(0 %)		 2,903,274
(4.44 %)		 41,682
(1.08 %)		 13,048
(0.16 %)
51 Eurasian red squirrel (v1.1 2019)
GCA_902686455.1		 n/a n/a 21,298
(1.58 %)		 21,024
(1.36 %)		 36,645
(1.54 %)		 40.08
(94.33 %)		 0
(0 %)		 1,177
(5.67 %)		 638
(100.00 %)		 4,680,964
(35.76 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,991,981
(31.49 %)		 5
(0.00 %)		 419,662
(1.29 %)		 48,159
(1.04 %)		 45,455
(0.95 %)
52 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1		 45,658
(2.52 %)		 n/a 19,724
(1.77 %)		 19,069
(1.47 %)		 34,561
(2.01 %)		 42.15
(99.74 %)		 0
(0 %)		 872
(0.26 %)		 216
(100.00 %)		 4,098,151
(26.75 %)		 1,088,237
(2.91 %)		 12,853,776
(32.42 %)		 5
(0.00 %)		 518,686
(1.69 %)		 19,000
(0.58 %)		 16,851
(0.46 %)
53 European flounder (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316205.1		 n/a n/a 14,753
(3.17 %)		 47,618
(7.81 %)		 n/a 42.59
(99.98 %)		 0
(0 %)		 482
(0.02 %)		 109
(100.00 %)		 1,160,784
(27.06 %)		 251,985
(5.23 %)		 3,353,121
(26.00 %)		 1
(0.00 %)		 252,297
(3.81 %)		 37,130
(2.79 %)		 27,432
(1.88 %)
54 European pond turtle (hap1 2023 genbank)
GCA_028017835.1		 n/a n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 0
(0 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 5
(0.00 %)		 495,884
(2.08 %)		 136,002
(2.92 %)		 30,671
(0.72 %)
55 European smelt (primary hap 2023 genbank)
GCA_963692335.1		 n/a n/a 15,640
(3.79 %)		 50,248
(9.36 %)		 n/a 45.42
(99.90 %)		 30
(0.00 %)		 2,462
(0.10 %)		 1,038
(100.00 %)		 1,648,435
(31.35 %)		 508,368
(13.05 %)		 1,992,832
(35.86 %)		 7
(0.00 %)		 485,262
(7.75 %)		 33,284
(4.05 %)		 19,052
(1.58 %)
56 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1		 n/a n/a 11,276
(1.79 %)		 21,238
(2.15 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 3,333
(100.00 %)		 466,567
(7.08 %)		 182,345
(0.97 %)		 6,037,183
(20.24 %)		 0
(0 %)		 110,549
(1.11 %)		 29,648
(2.35 %)		 26,084
(1.59 %)
57 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1		 n/a n/a 12,415
(1.77 %)		 23,484
(2.17 %)		 n/a 41.84
(99.67 %)		 0
(0 %)		 894
(0.33 %)		 357
(100.00 %)		 539,737
(7.60 %)		 227,500
(1.16 %)		 6,768,805
(21.05 %)		 4
(0.00 %)		 181,333
(1.65 %)		 34,729
(2.65 %)		 30,692
(1.70 %)
58 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1		 54,113
(34.13 %)		 n/a 19,960
(1.65 %)		 19,954
(1.25 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,129
(0.01 %)		 498
(100.00 %)		 4,863,656
(37.41 %)		 1,795,997
(8.95 %)		 13,681,786
(40.58 %)		 17
(0.00 %)		 2,516,599
(5.37 %)		 23,961
(0.53 %)		 17,318
(0.36 %)
59 false killer whale (hap1 2024 genbank)
GCA_039906515.1		 n/a n/a 18,718
(1.50 %)		 20,929
(1.32 %)		 n/a 42.08
(99.90 %)		 0
(0 %)		 123
(0.10 %)		 439
(100.00 %)		 3,958,932
(35.76 %)		 1,002,329
(11.61 %)		 12,193,131
(41.85 %)		 3
(0.00 %)		 1,441,777
(4.23 %)		 79,158
(3.74 %)		 41,701
(1.03 %)
60 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2		 n/a n/a 15,436
(2.15 %)		 26,448
(5.90 %)		 64,657
(6.60 %)		 41.23
(98.19 %)		 0
(0 %)		 744
(1.81 %)		 189
(100.00 %)		 1,014,141
(16.95 %)		 287,037
(2.21 %)		 5,305,987
(30.67 %)		 0
(0 %)		 227,443
(2.84 %)		 24,130
(1.26 %)		 11,082
(0.48 %)
61 Florida worm lizard (hap2 2023 genbank)
GCA_030035675.1		 n/a n/a 14,331
(0.90 %)		 17,854
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 1
(0.00 %)		 242
(0.28 %)		 78
(100.00 %)		 1,426,833
(7.17 %)		 616,690
(2.63 %)		 10,819,054
(45.31 %)		 1
(0.00 %)		 531,662
(2.36 %)		 47,454
(1.03 %)		 18,400
(0.42 %)
62 Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank)
GCA_902459505.1		 54,713
(61.19 %)		 n/a 14,267
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 0
(0 %)		 433
(0.15 %)		 163
(100.00 %)		 1,311,113
(1.64 %)		 1,364,596
(3.83 %)		 19,589,738
(52.85 %)		 3
(0.00 %)		 1,182,977
(2.68 %)		 270,923
(4.52 %)		 38,622
(0.50 %)
63 gilthead seabream (v1 2019)
GCF_900880675.1		 59,027
(10.96 %)		 n/a 15,412
(2.36 %)		 31,802
(6.47 %)		 73,197
(7.97 %)		 41.94
(99.96 %)		 0
(0 %)		 1,050
(0.04 %)		 176
(100.00 %)		 531,360
(3.04 %)		 305,809
(3.03 %)		 4,701,694
(25.69 %)		 0
(0 %)		 355,475
(3.53 %)		 47,327
(2.41 %)		 23,697
(1.07 %)
64 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1		 55,164
(5.86 %)		 n/a 13,226
(1.87 %)		 23,033
(2.15 %)		 25,921
(3.22 %)		 42.11
(99.61 %)		 0
(0 %)		 191
(0.39 %)		 142
(100.00 %)		 519,341
(5.86 %)		 180,990
(0.79 %)		 7,005,531
(19.25 %)		 1
(0.00 %)		 53,053
(0.51 %)		 37,343
(3.12 %)		 34,701
(1.97 %)
65 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1		 n/a n/a 9,334
(1.82 %)		 17,594
(2.12 %)		 n/a 42.53
(99.93 %)		 0
(0 %)		 39
(0.07 %)		 3,860
(100.00 %)		 356,284
(6.03 %)		 123,430
(0.80 %)		 4,417,887
(19.25 %)		 0
(0 %)		 53,254
(0.85 %)		 28,919
(3.52 %)		 25,970
(2.20 %)
66 great cormorant (primary hap 2024 genbank)
GCA_963921805.1		 n/a n/a 13,434
(1.76 %)		 30,619
(3.17 %)		 n/a 43.47
(99.99 %)		 0
(0 %)		 493
(0.01 %)		 351
(100.00 %)		 556,740
(10.18 %)		 303,279
(3.45 %)		 6,599,611
(22.65 %)		 1
(0.00 %)		 355,900
(2.29 %)		 38,341
(5.45 %)		 31,913
(1.57 %)
67 great fruit-eating bat (v1 hap1 2024)
GCA_038363095.1		 n/a n/a 18,022
(1.56 %)		 20,018
(1.52 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 0
(0 %)		 81
(0.00 %)		 419
(100.00 %)		 2,827,417
(26.82 %)		 371,479
(4.97 %)		 11,603,093
(34.64 %)		 1
(0.00 %)		 522,672
(1.87 %)		 71,574
(2.28 %)		 54,020
(1.50 %)
68 great potoo (primary hap 2020 genbank)
GCA_013368605.1		 n/a n/a 13,116
(1.77 %)		 23,657
(2.10 %)		 n/a 42.67
(99.51 %)		 0
(0 %)		 243
(0.49 %)		 191
(100.00 %)		 514,142
(9.71 %)		 210,381
(1.13 %)		 6,501,989
(23.95 %)		 0
(0 %)		 244,232
(1.92 %)		 35,785
(2.69 %)		 29,281
(1.64 %)
69 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2		 53,353
(46.77 %)		 n/a 18,647
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 0
(0 %)		 158
(0.36 %)		 135
(100.00 %)		 3,301,020
(34.99 %)		 564,790
(1.35 %)		 12,217,069
(29.39 %)		 0
(0 %)		 171,202
(0.67 %)		 32,445
(1.06 %)		 30,625
(0.98 %)
70 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1		 53,352
(3.13 %)		 n/a 18,647
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 0
(0 %)		 158
(0.36 %)		 134
(100.00 %)		 3,300,836
(34.99 %)		 564,789
(1.35 %)		 12,217,020
(29.39 %)		 0
(0 %)		 171,202
(0.67 %)		 32,445
(1.06 %)		 30,627
(0.98 %)
71 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1		 n/a n/a 13,467
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 n/a 43.46
(100.00 %)		 0
(0 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,442
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 0
(0 %)		 112,918
(3.25 %)		 46,340
(13.40 %)		 32,897
(5.93 %)
72 greater sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850765.1		 n/a n/a 18,322
(1.40 %)		 21,049
(1.35 %)		 n/a 41.71
(98.73 %)		 102
(0.41 %)		 468
(1.27 %)		 359
(99.59 %)		 4,247,148
(29.53 %)		 1,031,385
(2.50 %)		 12,465,194
(43.30 %)		 3
(0.00 %)		 1,113,639
(2.95 %)		 101,620
(2.01 %)		 44,590
(1.04 %)
73 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1		 56,917
(3.63 %)		 n/a 14,729
(1.06 %)		 17,439
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 0
(0 %)		 294
(0.56 %)		 99
(100.00 %)		 1,641,730
(15.08 %)		 304,356
(1.25 %)		 11,136,918
(31.96 %)		 0
(0 %)		 429,794
(1.68 %)		 49,035
(1.44 %)		 26,943
(0.68 %)
74 grey whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_028021215.1		 n/a n/a 19,288
(1.38 %)		 21,791
(1.21 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 0
(0 %)		 279
(0.00 %)		 704
(100.00 %)		 4,116,900
(35.85 %)		 966,065
(16.74 %)		 12,154,173
(46.39 %)		 3
(0.00 %)		 2,154,240
(5.67 %)		 77,011
(1.59 %)		 42,884
(0.96 %)
75 harbor porpoise (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924675.1		 n/a n/a 18,529
(1.58 %)		 20,583
(1.34 %)		 n/a 41.72
(99.99 %)		 2
(0.00 %)		 966
(0.01 %)		 442
(100.00 %)		 3,760,716
(36.18 %)		 888,368
(7.18 %)		 12,379,240
(39.04 %)		 4
(0.00 %)		 1,410,168
(3.71 %)		 71,530
(2.69 %)		 40,160
(1.06 %)
76 hourglass treefrog (paternal 2023 genbank)
GCA_027789765.1		 n/a n/a 14,058
(0.89 %)		 31,050
(2.69 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 0
(0 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 3
(0.00 %)		 3,539,111
(9.05 %)		 235,277
(5.56 %)		 28,414
(0.63 %)
77 house finch (primary hap 2022 genbank)
GCA_027477595.1		 43,228
(49.63 %)		 n/a 12,700
(1.83 %)		 24,567
(2.38 %)		 n/a 42.91
(99.02 %)		 0
(0 %)		 295
(0.98 %)		 183
(100.00 %)		 440,379
(3.17 %)		 463,164
(6.37 %)		 6,300,100
(23.47 %)		 1
(0.00 %)		 573,829
(3.39 %)		 30,897
(2.53 %)		 22,852
(1.24 %)
78 house sparrow (hap1 2024 genbank)
GCA_036417665.1		 n/a n/a 12,831
(1.61 %)		 26,124
(2.26 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 0
(0 %)		 202
(0.00 %)		 334
(100.00 %)		 647,396
(12.37 %)		 646,615
(14.14 %)		 5,906,524
(30.36 %)		 2
(0.00 %)		 873,292
(5.23 %)		 36,193
(2.91 %)		 24,212
(1.05 %)
79 Indian glassy fish (v1 2019)
GCF_900634625.1		 44,096
(12.32 %)		 n/a 15,337
(3.60 %)		 23,988
(7.92 %)		 60,224
(10.41 %)		 42.38
(98.08 %)		 0
(0 %)		 1,523
(1.92 %)		 156
(100.00 %)		 346,406
(3.02 %)		 163,522
(3.00 %)		 2,755,229
(25.07 %)		 0
(0 %)		 235,504
(4.25 %)		 17,930
(1.47 %)		 9,748
(0.74 %)
80 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2		 49,757
(54.33 %)		 n/a 13,112
(1.92 %)		 17,637
(2.48 %)		 n/a 41.97
(99.08 %)		 0
(0 %)		 373
(0.92 %)		 90
(100.00 %)		 507,072
(7.85 %)		 208,180
(1.08 %)		 6,258,178
(20.50 %)		 0
(0 %)		 165,532
(1.34 %)		 22,278
(1.77 %)		 19,230
(1.21 %)
81 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1		 29,504
(53.56 %)		 n/a 14,221
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 41,384
(6.20 %)		 40.22
(99.05 %)		 0
(0 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,338
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,148
(38.97 %)		 5
(0.00 %)		 523,224
(4.75 %)		 37,287
(2.58 %)		 18,380
(0.95 %)
82 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1		 29,517
(6.48 %)		 n/a 14,243
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 41,421
(6.20 %)		 40.22
(99.05 %)		 0
(0 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,274
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,142
(38.97 %)		 5
(0.00 %)		 523,224
(4.75 %)		 37,287
(2.58 %)		 18,380
(0.95 %)
83 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023638135.1		 48,561
(51.20 %)		 n/a 12,862
(1.69 %)		 21,562
(1.92 %)		 n/a 43.03
(99.83 %)		 0
(0 %)		 158
(0.17 %)		 397
(100.00 %)		 439,975
(3.77 %)		 203,640
(6.96 %)		 6,921,438
(23.57 %)		 2
(0.00 %)		 479,269
(2.67 %)		 32,398
(2.65 %)		 19,870
(0.89 %)
84 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1		 n/a n/a 14,572
(1.03 %)		 16,165
(1.42 %)		 n/a 43.36
(99.74 %)		 0
(0 %)		 558
(0.26 %)		 55
(100.00 %)		 1,631,923
(15.09 %)		 303,440
(1.14 %)		 11,122,938
(34.12 %)		 1
(0.00 %)		 664,235
(2.49 %)		 35,505
(1.37 %)		 19,641
(0.51 %)
85 leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019)
GCA_009762595.1		 n/a n/a 10,857
(1.01 %)		 15,585
(1.46 %)		 n/a 43.54
(100.00 %)		 0
(0 %)		 n/a 8,982
(100.00 %)		 1,090,219
(15.03 %)		 206,192
(1.19 %)		 7,154,939
(33.03 %)		 0
(0 %)		 432,559
(2.40 %)		 25,155
(1.42 %)		 14,585
(0.57 %)
86 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2		 62,576
(3.50 %)		 n/a 14,610
(1.03 %)		 16,359
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 0
(0 %)		 667
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,637,236
(15.13 %)		 304,730
(1.14 %)		 11,121,967
(34.21 %)		 3
(0.00 %)		 670,755
(2.51 %)		 35,485
(1.36 %)		 19,615
(0.51 %)
87 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1		 47,420
(5.64 %)		 n/a 13,097
(1.80 %)		 22,203
(2.07 %)		 n/a 42.30
(99.66 %)		 0
(0 %)		 298
(0.34 %)		 291
(100.00 %)		 516,498
(5.58 %)		 210,236
(1.26 %)		 7,133,927
(19.19 %)		 1
(0.00 %)		 132,959
(0.79 %)		 27,558
(2.21 %)		 21,862
(1.03 %)
88 lesser rhea (primary hap 2023 genbank)
GCA_028389875.1		 39,024
(47.65 %)		 n/a 13,358
(1.72 %)		 23,870
(2.13 %)		 n/a 42.45
(99.89 %)		 0
(0 %)		 128
(0.11 %)		 179
(100.00 %)		 674,141
(6.73 %)		 329,122
(5.34 %)		 6,820,211
(22.78 %)		 1
(0.00 %)		 266,226
(1.85 %)		 45,073
(5.83 %)		 38,575
(2.59 %)
89 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850995.1		 n/a n/a 18,322
(1.42 %)		 21,350
(1.39 %)		 n/a 41.84
(99.24 %)		 178
(0.49 %)		 573
(0.76 %)		 345
(99.51 %)		 4,224,340
(28.69 %)		 1,030,574
(2.60 %)		 12,591,928
(42.30 %)		 1
(0.00 %)		 1,128,543
(2.95 %)		 98,189
(2.06 %)		 48,427
(1.15 %)
90 lesser salmon catfish (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579695.1		 53,323
(53.05 %)		 n/a 15,841
(0.90 %)		 85,700
(3.30 %)		 n/a 42.44
(99.43 %)		 0
(0 %)		 334
(0.57 %)		 38
(100.00 %)		 5,905,868
(49.76 %)		 1,126,468
(6.51 %)		 7,609,180
(62.74 %)		 11
(0.00 %)		 2,750,473
(9.00 %)		 166,630
(4.38 %)		 15,646
(0.27 %)
91 live sharksucker (v1 2019)
GCF_900963305.1		 40,255
(11.91 %)		 n/a 14,975
(3.53 %)		 22,304
(7.09 %)		 56,266
(9.51 %)		 41.43
(99.89 %)		 0
(0 %)		 140
(0.11 %)		 38
(100.00 %)		 448,828
(3.61 %)		 146,353
(1.65 %)		 3,204,476
(21.79 %)		 0
(0 %)		 109,664
(1.83 %)		 16,807
(1.33 %)		 12,095
(0.89 %)
92 lumpfish (primary hap 2019 genbank)
GCA_009769545.1		 41,612
(58.17 %)		 n/a 14,748
(3.32 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,721
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 0
(0 %)		 347
(1.78 %)		 49
(100.00 %)		 478,416
(6.02 %)		 421,634
(11.07 %)		 2,928,668
(27.98 %)		 1
(0.00 %)		 655,785
(6.31 %)		 53,323
(5.09 %)		 32,724
(2.40 %)
93 mimic poison frog (primary hap 2023 genbank)
GCA_032444005.1		 n/a n/a 14,957
(0.34 %)		 n/a n/a 44.95
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,686
(100.00 %)		 1,716,760
(1.89 %)		 4,088,695
(23.45 %)		 2,437
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 10,590,500
(14.66 %)		 n/a n/a
94 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1		 n/a n/a 10,083
(1.97 %)		 18,350
(2.23 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(0.00 %)		 5,616
(100.00 %)		 485,827
(7.06 %)		 212,892
(1.28 %)		 4,756,962
(19.95 %)		 0
(0 %)		 53,808
(0.72 %)		 25,670
(3.87 %)		 24,319
(2.23 %)
95 mute swan (v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1		 n/a n/a 12,973
(1.97 %)		 22,300
(2.18 %)		 n/a 41.92
(99.06 %)		 0
(0 %)		 446
(0.94 %)		 181
(100.00 %)		 688,720
(7.65 %)		 301,358
(1.34 %)		 6,775,217
(21.21 %)		 1
(0.00 %)		 78,646
(0.75 %)		 31,271
(3.60 %)		 29,996
(2.02 %)
96 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579445.1		 31,033
(46.15 %)		 n/a 12,385
(1.72 %)		 24,339
(2.24 %)		 n/a 43.01
(99.57 %)		 0
(0 %)		 215
(0.43 %)		 77
(100.00 %)		 479,994
(3.33 %)		 443,098
(9.18 %)		 6,350,593
(25.82 %)		 5
(0.00 %)		 478,923
(3.35 %)		 31,693
(3.88 %)		 22,817
(1.16 %)
97 New Zealand spotty (primary hap 2019 genbank)
GCA_009762535.1		 n/a n/a 14,609
(2.22 %)		 43,262
(5.33 %)		 60,241
(8.02 %)		 40.86
(98.32 %)		 0
(0 %)		 1,135
(1.69 %)		 468
(100.00 %)		 519,324
(4.65 %)		 393,329
(5.54 %)		 4,522,265
(33.34 %)		 4
(0.00 %)		 548,988
(4.42 %)		 18,302
(0.85 %)		 8,002
(0.35 %)
98 Nicobar pigeon (hap1 2024 genbank)
GCA_036013445.1		 n/a n/a 13,359
(1.72 %)		 24,921
(2.13 %)		 n/a 44.64
(100.00 %)		 0
(0 %)		 117
(0.00 %)		 807
(100.00 %)		 705,078
(18.28 %)		 342,299
(9.55 %)		 6,410,095
(28.06 %)		 0
(0 %)		 778,929
(4.34 %)		 38,589
(9.40 %)		 31,814
(1.47 %)
99 ninespine stickleback (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316345.1		 n/a n/a 14,600
(3.83 %)		 49,927
(9.98 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 0
(0 %)		 738
(0.03 %)		 175
(100.00 %)		 599,088
(14.68 %)		 186,747
(10.27 %)		 2,273,942
(28.36 %)		 3
(0.00 %)		 183,869
(3.64 %)		 70,136
(9.39 %)		 45,059
(4.62 %)
100 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1		 n/a n/a 19,541
(1.47 %)		 21,516
(1.25 %)		 n/a 41.69
(99.83 %)		 0
(0 %)		 363
(0.17 %)		 779
(100.00 %)		 1,361,117
(2.23 %)		 836,632
(13.12 %)		 12,597,969
(44.00 %)		 11
(0.00 %)		 1,395,565
(3.89 %)		 93,862
(1.92 %)		 40,806
(0.95 %)
101 North Island brown kiwi (hap1 2024 genbank)
GCA_036417845.1		 n/a n/a 13,670
(1.52 %)		 33,383
(2.64 %)		 n/a 44.01
(100.00 %)		 0
(0 %)		 170
(0.00 %)		 409
(100.00 %)		 713,271
(8.42 %)		 603,937
(6.25 %)		 5,379,113
(27.65 %)		 1
(0.00 %)		 501,455
(3.32 %)		 50,913
(9.74 %)		 40,971
(3.07 %)
102 northern pike (primary hap 2020 genbank)
GCA_011004845.1		 63,720
(60.35 %)		 n/a 16,616
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 82,918
(8.82 %)		 42.22
(99.89 %)		 0
(0 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 1,039,521
(30.93 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,094
(32.91 %)		 1
(0.00 %)		 602,569
(4.43 %)		 42,910
(2.52 %)		 22,099
(1.02 %)
103 northern pintail (primary hap 2024 genbank)
GCA_963932015.1		 n/a n/a 13,218
(1.88 %)		 23,888
(2.27 %)		 n/a 42.56
(99.99 %)		 0
(0 %)		 631
(0.01 %)		 395
(100.00 %)		 734,763
(5.74 %)		 422,947
(7.08 %)		 6,491,165
(25.88 %)		 10
(0.00 %)		 474,751
(3.08 %)		 34,601
(2.98 %)		 28,080
(1.42 %)
104 pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019)
GCA_004115245.1		 n/a n/a 18,118
(1.63 %)		 23,536
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,873
(100.00 %)		 3,001,130
(29.46 %)		 375,042
(0.79 %)		 11,813,971
(29.64 %)		 0
(0 %)		 140,066
(0.57 %)		 67,712
(4.23 %)		 70,108
(3.94 %)
105 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1		 35,529
(2.39 %)		 n/a 18,185
(1.70 %)		 20,184
(1.64 %)		 41,094
(3.29 %)		 42.38
(98.92 %)		 0
(0 %)		 831
(1.08 %)		 141
(100.00 %)		 3,072,951
(30.02 %)		 385,608
(0.80 %)		 12,060,365
(30.47 %)		 1
(0.00 %)		 173,548
(0.73 %)		 64,081
(4.30 %)		 66,821
(4.05 %)
106 Papuan ground boa (hap2 2024 genbank)
GCA_035149785.1		 n/a n/a 13,390
(1.26 %)		 17,496
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 0
(0 %)		 101
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 728,574
(2.82 %)		 348,605
(2.13 %)		 7,199,124
(33.55 %)		 1
(0.00 %)		 318,788
(2.43 %)		 51,807
(2.69 %)		 19,758
(0.92 %)
107 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1		 49,100
(50.44 %)		 n/a 13,025
(1.67 %)		 24,167
(2.02 %)		 n/a 42.65
(99.69 %)		 0
(0 %)		 232
(0.31 %)		 124
(100.00 %)		 586,316
(11.83 %)		 335,214
(8.05 %)		 7,038,700
(24.65 %)		 0
(0 %)		 405,444
(2.46 %)		 26,085
(2.25 %)		 20,023
(0.87 %)
108 Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409185.1		 n/a n/a 20,384
(1.64 %)		 22,124
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 0
(0 %)		 116
(0.00 %)		 131
(100.00 %)		 4,492,423
(39.31 %)		 627,842
(4.79 %)		 15,561,515
(36.57 %)		 2
(0.00 %)		 n/a 45,336
(1.27 %)		 44,264
(1.15 %)
109 pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 genbank)
GCA_043159975.1		 n/a n/a 20,768
(1.76 %)		 21,550
(1.18 %)		 n/a 41.04
(100.00 %)		 0
(0 %)		 260
(0.00 %)		 362
(100.00 %)		 5,387,919
(53.48 %)		 1,027,640
(9.31 %)		 15,407,988
(41.73 %)		 1
(0.00 %)		 1,792,632
(3.77 %)		 99,854
(1.52 %)		 30,686
(0.78 %)
110 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3		 n/a n/a 14,805
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 0
(0 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,101,303
(51.62 %)		 578,617
(2.89 %)		 9,113,847
(48.93 %)		 0
(0 %)		 1,130,252
(3.59 %)		 87,861
(7.92 %)		 74,107
(2.86 %)
111 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1		 45,404
(55.83 %)		 n/a 14,654
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 57,391
(2.04 %)		 41.99
(99.49 %)		 0
(0 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,311,131
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 3
(0.00 %)		 1,623,656
(7.33 %)		 172,199
(5.45 %)		 18,080
(0.31 %)
112 pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023)
GCF_029289425.1		 84,858
(3.73 %)		 n/a 20,765
(1.73 %)		 22,666
(1.18 %)		 n/a 40.49
(99.96 %)		 0
(0 %)		 8
(0.04 %)		 443
(100.00 %)		 5,487,575
(50.65 %)		 1,054,555
(12.79 %)		 15,952,698
(43.80 %)		 0
(0 %)		 3,830,835
(6.42 %)		 53,329
(1.37 %)		 27,996
(0.60 %)
113 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank)
GCA_026419965.1		 56,261
(41.31 %)		 n/a 18,495
(1.55 %)		 20,718
(1.32 %)		 n/a 42.05
(99.81 %)		 0
(0 %)		 143
(0.19 %)		 580
(100.00 %)		 3,817,653
(34.51 %)		 758,297
(7.42 %)		 12,196,926
(39.96 %)		 0
(0 %)		 1,197,918
(3.53 %)		 101,353
(2.90 %)		 50,216
(1.47 %)
114 red-fronted tinkerbird (primary hap 2020 genbank)
GCA_015220805.1		 n/a n/a 12,345
(1.60 %)		 23,206
(2.02 %)		 n/a 45.96
(99.53 %)		 0
(0 %)		 307
(0.47 %)		 253
(100.00 %)		 1,082,064
(22.90 %)		 378,866
(4.28 %)		 6,003,548
(35.88 %)		 0
(0 %)		 1,148,448
(6.01 %)		 26,519
(1.76 %)		 21,399
(1.21 %)
115 reedfish (2019)
GCF_900747795.1		 40,545
(1.73 %)		 n/a 13,154
(0.46 %)		 24,028
(1.29 %)		 34,856
(1.34 %)		 39.44
(93.75 %)		 0
(0 %)		 5,614
(6.25 %)		 1,885
(100.00 %)		 1,834,613
(2.79 %)		 1,018,031
(2.36 %)		 20,081,632
(44.56 %)		 4
(0.00 %)		 1,039,686
(2.44 %)		 88,254
(1.06 %)		 22,510
(0.28 %)
116 reedfish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900700845.2		 n/a n/a 9,950
(0.37 %)		 31,611
(1.22 %)		 n/a 39.44
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 5
(0.00 %)		 38,598
(100.00 %)		 1,300,565
(2.57 %)		 685,834
(2.21 %)		 14,691,576
(45.66 %)		 0
(0 %)		 588,794
(1.83 %)		 63,365
(1.11 %)		 17,365
(0.32 %)
117 river trout (v1 2019)
GCF_901001165.1		 102,772
(6.02 %)		 n/a 27,413
(1.62 %)		 51,424
(4.17 %)		 121,979
(5.28 %)		 43.36
(96.90 %)		 0
(0 %)		 3,941
(3.10 %)		 1,441
(100.00 %)		 1,438,988
(5.72 %)		 1,789,507
(15.87 %)		 9,819,761
(52.37 %)		 2
(0.00 %)		 3,428,195
(8.64 %)		 70,821
(1.77 %)		 18,627
(0.33 %)
118 rock pigeon (v1 racing homer paternal W 2024)
GCA_036013475.1		 n/a n/a 13,145
(1.66 %)		 28,883
(2.53 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 0
(0 %)		 248
(0.00 %)		 870
(100.00 %)		 656,923
(11.76 %)		 412,678
(12.92 %)		 6,047,578
(29.90 %)		 0
(0 %)		 1,266,126
(5.89 %)		 36,847
(3.12 %)		 31,114
(1.65 %)
119 rock pigeon (v2 racing homer 2024 genbank)
GCA_036013475.2		 n/a n/a 13,146
(1.66 %)		 25,463
(2.12 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 0
(0 %)		 249
(0.00 %)		 870
(100.00 %)		 656,969
(11.76 %)		 412,670
(12.92 %)		 6,047,584
(29.90 %)		 0
(0 %)		 1,266,456
(5.89 %)		 36,847
(3.12 %)		 31,115
(1.65 %)
120 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1		 46,746
(40.70 %)		 n/a 18,625
(1.49 %)		 20,451
(1.28 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 0
(0 %)		 968
(0.01 %)		 631
(100.00 %)		 4,020,682
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,818
(42.64 %)		 0
(0 %)		 1,785,427
(5.07 %)		 66,179
(3.91 %)		 41,466
(1.03 %)
121 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1		 46,746
(2.39 %)		 n/a 18,624
(1.49 %)		 20,662
(1.31 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 0
(0 %)		 968
(0.01 %)		 630
(100.00 %)		 4,020,676
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,748
(42.64 %)		 0
(0 %)		 1,785,427
(5.07 %)		 66,179
(3.91 %)		 41,466
(1.03 %)
122 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1		 50,290
(50.75 %)		 n/a 12,971
(1.67 %)		 23,351
(2.02 %)		 n/a 43.15
(99.70 %)		 0
(0 %)		 258
(0.30 %)		 282
(100.00 %)		 548,087
(7.21 %)		 201,482
(8.55 %)		 7,030,761
(24.94 %)		 0
(0 %)		 469,777
(2.60 %)		 31,791
(2.57 %)		 20,215
(0.89 %)
123 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887145.1		 27,528
(42.80 %)		 n/a 12,832
(1.69 %)		 25,514
(2.23 %)		 n/a 43.50
(99.76 %)		 0
(0 %)		 363
(0.24 %)		 282
(100.00 %)		 541,958
(3.43 %)		 566,692
(13.38 %)		 6,205,274
(28.98 %)		 1
(0.00 %)		 651,029
(4.07 %)		 35,549
(5.05 %)		 23,802
(1.15 %)
124 San Diego alligator lizard (v1.0 HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1		 n/a n/a 14,075
(1.15 %)		 19,587
(1.99 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 23
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 1,577,744
(7.81 %)		 774,690
(3.78 %)		 9,248,062
(40.42 %)		 0
(0 %)		 832,326
(3.45 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,587
(0.82 %)
125 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 genbank)
GCA_023053635.2		 n/a n/a 14,093
(1.15 %)		 19,338
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 0
(0 %)		 73
(0.00 %)		 35
(100.00 %)		 1,577,751
(7.81 %)		 774,117
(3.78 %)		 9,248,069
(40.42 %)		 1
(0.00 %)		 823,656
(3.44 %)		 80,183
(2.48 %)		 27,586
(0.82 %)
126 sardine (primary hap 2023 genbank)
GCA_963854185.1		 n/a n/a 16,071
(2.33 %)		 64,180
(7.08 %)		 n/a 44.44
(99.96 %)		 0
(0 %)		 1,654
(0.04 %)		 241
(100.00 %)		 1,503,111
(11.74 %)		 1,507,024
(15.48 %)		 4,027,638
(37.52 %)		 11
(0.00 %)		 1,188,853
(8.48 %)		 68,874
(3.56 %)		 38,590
(1.78 %)
127 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 genbank)
GCF_035084215.1		 51,418
(2.53 %)		 n/a 12,778
(0.49 %)		 24,541
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,879
(100.00 %)		 597,115
(2.28 %)		 1,112,121
(17.97 %)		 12,108,003
(57.48 %)		 2
(0.00 %)		 4,823,993
(9.23 %)		 117,585
(3.42 %)		 24,151
(0.35 %)
128 siamang (v1 Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1		 79,118
(2.62 %)		 n/a 20,139
(1.70 %)		 21,232
(1.14 %)		 n/a 40.62
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1
(0.00 %)		 606
(100.00 %)		 5,278,880
(55.89 %)		 946,219
(14.68 %)		 14,395,605
(46.26 %)		 0
(0 %)		 2,376,584
(4.99 %)		 95,573
(1.75 %)		 30,053
(0.74 %)
129 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.2		 105,373
(3.05 %)		 n/a 20,434
(1.69 %)		 21,357
(1.12 %)		 n/a 40.42
(99.97 %)		 0
(0 %)		 2
(0.03 %)		 27
(100.00 %)		 5,354,446
(55.80 %)		 935,620
(14.70 %)		 14,917,515
(46.01 %)		 0
(0 %)		 2,398,386
(4.90 %)		 92,243
(1.42 %)		 27,998
(0.68 %)
130 Siamese fighting fish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1		 n/a n/a 14,510
(4.12 %)		 60,058
(10.77 %)		 n/a 45.51
(100.00 %)		 0
(0 %)		 2
(0.00 %)		 3,705
(100.00 %)		 249,671
(3.68 %)		 182,366
(4.87 %)		 1,939,533
(22.55 %)		 0
(0 %)		 223,835
(4.10 %)		 72,474
(13.55 %)		 56,347
(7.50 %)
131 Siamese fighting fish (v2 primary hap 2019)
GCF_900634795.2		 54,389
(16.95 %)		 n/a 14,745
(4.21 %)		 34,348
(10.09 %)		 62,673
(13.02 %)		 45.30
(99.99 %)		 0
(0 %)		 328
(0.01 %)		 70
(100.00 %)		 252,955
(3.51 %)		 184,269
(4.62 %)		 2,010,934
(23.88 %)		 0
(0 %)		 232,426
(4.41 %)		 72,126
(13.08 %)		 55,959
(7.25 %)
132 Siamese fighting fish (v3 primary hap 2020)
GCF_900634795.3		 54,864
(17.78 %)		 n/a 14,745
(4.20 %)		 56,808
(10.87 %)		 69,466
(16.34 %)		 45.30
(99.99 %)		 0
(0 %)		 328
(0.01 %)		 70
(100.00 %)		 255,550
(3.51 %)		 184,269
(4.62 %)		 2,010,934
(23.88 %)		 0
(0 %)		 232,435
(4.41 %)		 72,126
(13.08 %)		 55,959
(7.25 %)
133 Skyros wall lizard (v1 hap1 2024)
GCA_964106915.1		 n/a n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 0
(0 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 7
(0.00 %)		 598,615
(3.50 %)		 93,005
(2.80 %)		 19,317
(0.73 %)
134 smalltooth sawfish (v2 primary hap 2019 genbank)
GCA_009764475.1		 n/a n/a 11,828
(0.66 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 0
(0 %)		 698
(0.91 %)		 173
(100.00 %)		 405,021
(1.14 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,302
(38.19 %)		 0
(0 %)		 471,290
(1.50 %)		 45,398
(1.34 %)		 18,572
(0.38 %)
135 song sparrow (primary hap 2024 genbank)
GCA_035770615.1		 n/a n/a 12,940
(1.39 %)		 26,698
(1.87 %)		 n/a 44.96
(99.93 %)		 0
(0 %)		 299
(0.07 %)		 354
(100.00 %)		 515,857
(3.07 %)		 681,436
(15.73 %)		 5,004,880
(39.23 %)		 1
(0.00 %)		 1,925,221
(9.14 %)		 47,269
(3.90 %)		 25,118
(0.99 %)
136 speckled mousebird (hap1 2023 genbank)
GCA_028858725.1		 n/a n/a 11,956
(1.78 %)		 25,177
(2.60 %)		 n/a 42.38
(99.48 %)		 0
(0 %)		 143
(0.52 %)		 189
(100.00 %)		 523,056
(12.47 %)		 243,547
(3.72 %)		 5,408,003
(23.43 %)		 1
(0.00 %)		 397,635
(2.78 %)		 25,552
(2.34 %)		 19,232
(1.18 %)
137 sterlet (v1 paternal hap 2020)
GCA_902713435.1		 n/a n/a 22,718
(1.81 %)		 34,093
(4.15 %)		 57,768
(4.88 %)		 39.60
(100.00 %)		 0
(0 %)		 422
(0.01 %)		 224
(100.00 %)		 1,145,503
(3.39 %)		 912,936
(6.84 %)		 8,839,174
(39.17 %)		 4
(0.00 %)		 1,099,124
(5.35 %)		 52,560
(1.82 %)		 14,166
(0.36 %)
138 Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1		 98,046
(3.46 %)		 n/a 21,162
(1.68 %)		 21,714
(1.13 %)		 n/a 41.13
(99.79 %)		 59
(0.21 %)		 59
(0.21 %)		 2,670
(99.79 %)		 5,730,768
(55.05 %)		 1,175,314
(11.19 %)		 16,323,507
(44.05 %)		 0
(0 %)		 2,553,363
(4.41 %)		 55,799
(2.08 %)		 39,159
(1.10 %)
139 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1		 n/a n/a 13,403
(1.85 %)		 27,456
(2.48 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 0
(0 %)		 13
(0.00 %)		 3,601
(100.00 %)		 497,374
(5.78 %)		 649,859
(4.89 %)		 6,740,713
(22.65 %)		 0
(0 %)		 505,741
(2.66 %)		 49,076
(3.54 %)		 23,486
(1.21 %)
140 Swainson's thrush (v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1		 40,128
(5.45 %)		 n/a 13,016
(1.88 %)		 24,787
(2.41 %)		 30,064
(2.94 %)		 42.48
(98.86 %)		 0
(0 %)		 428
(1.14 %)		 161
(100.00 %)		 483,978
(5.85 %)		 589,859
(4.32 %)		 6,708,638
(22.44 %)		 1
(0.00 %)		 449,585
(2.41 %)		 49,404
(3.53 %)		 22,206
(1.16 %)
141 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018845.1		 29,544
(46.92 %)		 n/a 12,375
(1.75 %)		 24,577
(2.31 %)		 n/a 43.08
(99.89 %)		 0
(0 %)		 236
(0.11 %)		 40
(100.00 %)		 419,473
(3.09 %)		 439,909
(7.61 %)		 6,077,743
(24.47 %)		 1
(0.00 %)		 578,723
(3.93 %)		 32,064
(3.27 %)		 22,996
(1.19 %)
142 thorny skate (v1 CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1		 45,969
(2.40 %)		 n/a 11,433
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 32,017
(1.87 %)		 44.30
(92.54 %)		 0
(0 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 865,711
(2.57 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 26
(0.00 %)		 1,634,657
(4.98 %)		 242,676
(4.73 %)		 31,030
(0.57 %)
143 thorny skate (v1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank)
GCA_010909765.1		 45,969
(46.35 %)		 n/a 11,434
(0.60 %)		 26,342
(1.72 %)		 32,017
(1.87 %)		 44.30
(92.54 %)		 0
(0 %)		 3,753
(7.46 %)		 958
(100.00 %)		 866,598
(2.58 %)		 1,176,350
(3.79 %)		 9,964,083
(52.25 %)		 26
(0.00 %)		 1,634,657
(4.98 %)		 242,676
(4.73 %)		 31,030
(0.57 %)
144 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2		 53,479
(18.31 %)		 n/a 14,527
(4.79 %)		 28,597
(10.65 %)		 55,587
(14.38 %)		 45.67
(99.04 %)		 0
(0 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 281,011
(10.36 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,756
(20.86 %)		 1
(0.02 %)		 281,981
(5.43 %)		 49,975
(9.63 %)		 37,920
(5.08 %)
145 trahira (v1 hap1 2024 refseq)
GCF_029633855.1		 55,764
(7.71 %)		 n/a 17,259
(2.05 %)		 47,792
(4.36 %)		 n/a 40.99
(94.51 %)		 0
(0 %)		 989
(5.49 %)		 598
(100.00 %)		 2,407,637
(30.93 %)		 742,073
(14.33 %)		 5,715,475
(37.52 %)		 3
(0.00 %)		 1,264,118
(7.29 %)		 29,012
(2.12 %)		 12,979
(0.45 %)
146 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 genbank)
GCA_026979565.1		 n/a n/a 12,819
(1.94 %)		 24,247
(2.44 %)		 n/a 42.23
(99.98 %)		 0
(0 %)		 458
(0.02 %)		 178
(100.00 %)		 616,749
(11.96 %)		 411,917
(3.56 %)		 6,385,102
(20.91 %)		 6
(0.00 %)		 306,942
(1.90 %)		 37,940
(2.83 %)		 24,967
(1.41 %)
147 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1		 61,103
(44.10 %)		 n/a 18,126
(1.16 %)		 21,345
(1.28 %)		 n/a 42.00
(99.97 %)		 0
(0 %)		 3,760
(0.03 %)		 1,175
(100.00 %)		 4,891,344
(19.68 %)		 1,507,933
(3.81 %)		 12,571,193
(54.50 %)		 7
(0.00 %)		 1,975,693
(4.67 %)		 32,667
(0.90 %)		 24,067
(0.56 %)
148 western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023)
GCF_029281585.1		 101,242
(3.18 %)		 n/a 20,994
(1.57 %)		 41,945
(1.53 %)		 n/a 40.59
(99.85 %)		 0
(0 %)		 38
(0.15 %)		 637
(100.00 %)		 5,526,927
(51.16 %)		 1,080,693
(20.38 %)		 15,929,020
(48.46 %)		 0
(0 %)		 5,690,867
(9.25 %)		 76,432
(1.35 %)		 30,764
(0.70 %)
149 white leghorn X broiler chicken (v1 leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1		 55,865
(8.86 %)		 n/a 12,310
(2.41 %)		 22,056
(2.57 %)		 n/a 42.20
(99.65 %)		 254
(0.35 %)		 254
(0.35 %)		 509
(99.65 %)		 604,452
(10.76 %)		 232,416
(2.03 %)		 5,541,059
(20.23 %)		 2
(0.00 %)		 203,559
(1.88 %)		 22,185
(2.62 %)		 19,239
(1.58 %)
150 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1		 59,982
(41.87 %)		 n/a 18,737
(1.57 %)		 20,767
(1.34 %)		 n/a 41.91
(99.99 %)		 0
(0 %)		 1,070
(0.01 %)		 410
(100.00 %)		 3,820,566
(36.21 %)		 922,103
(8.43 %)		 12,304,360
(39.74 %)		 2
(0.00 %)		 1,117,804
(3.60 %)		 68,551
(3.58 %)		 41,698
(1.09 %)
151 white-crowned manakin (hap1 2024 genbank)
GCA_036250125.1		 n/a n/a 12,807
(1.82 %)		 25,568
(2.46 %)		 n/a 42.66
(99.99 %)		 0
(0 %)		 323
(0.01 %)		 697
(100.00 %)		 429,646
(4.10 %)		 293,431
(3.59 %)		 6,059,494
(21.89 %)		 0
(0 %)		 366,430
(2.74 %)		 29,574
(2.42 %)		 21,946
(1.07 %)
152 white-tailed eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_947461875.1		 n/a n/a 13,735
(1.76 %)		 28,993
(2.53 %)		 n/a 43.15
(99.99 %)		 0
(0 %)		 424
(0.01 %)		 188
(100.00 %)		 585,276
(12.89 %)		 291,289
(6.10 %)		 6,474,027
(23.66 %)		 0
(0 %)		 312,204
(2.16 %)		 54,851
(4.05 %)		 31,757
(1.50 %)
153 white-throated dipper (primary hap 2023 genbank)
GCA_963662255.1		 n/a n/a 12,856
(1.79 %)		 23,827
(2.25 %)		 n/a 42.82
(99.99 %)		 0
(0 %)		 658
(0.01 %)		 278
(100.00 %)		 431,536
(3.38 %)		 345,533
(10.59 %)		 5,840,462
(26.59 %)		 1
(0.00 %)		 617,894
(3.85 %)		 29,711
(3.56 %)		 21,555
(1.20 %)
154 white-tufted-ear marmoset (v1 paternal hap 2020)
GCA_011100535.1		 n/a n/a 20,939
(1.94 %)		 20,416
(1.31 %)		 n/a 41.04
(99.58 %)		 0
(0 %)		 788
(0.42 %)		 336
(100.00 %)		 4,869,007
(49.39 %)		 746,577
(2.68 %)		 14,347,286
(37.59 %)		 0
(0 %)		 1,026,338
(2.34 %)		 35,222
(0.94 %)		 25,795
(0.75 %)
155 zebra finch (alternate hap Black17 2018)
GCA_003957525.1		 n/a n/a 11,340
(1.85 %)		 22,921
(2.37 %)		 n/a 41.73
(99.98 %)		 45
(0.01 %)		 45
(0.01 %)		 5,381
(99.99 %)		 480,647
(8.44 %)		 365,668
(2.89 %)		 5,859,698
(20.27 %)		 0
(0 %)		 235,418
(1.48 %)		 24,649
(2.35 %)		 19,753
(1.21 %)
156 zebra finch (Blue55 female 2020 genbank)
GCA_009859065.2		 n/a n/a 12,796
(1.92 %)		 24,658
(2.44 %)		 n/a 41.91
(98.03 %)		 0
(0 %)		 789
(1.97 %)		 541
(100.00 %)		 554,338
(9.67 %)		 339,851
(2.27 %)		 6,613,146
(20.04 %)		 1
(0.00 %)		 220,583
(1.45 %)		 28,678
(2.32 %)		 22,455
(1.18 %)
157 zebra finch (v1 Black17 2019 refseq)
GCF_003957565.1		 51,472
(7.16 %)		 n/a 13,211
(2.02 %)		 17,812
(2.70 %)		 38,655
(7.10 %)		 42.04
(99.78 %)		 0
(0 %)		 312
(0.22 %)		 135
(100.00 %)		 535,521
(8.50 %)		 550,118
(4.01 %)		 6,519,872
(21.47 %)		 1
(0.00 %)		 381,676
(2.04 %)		 30,053
(2.58 %)		 22,898
(1.24 %)
158 zebra finch (v1 Black17 male 2019 genbank)
GCA_003957565.2		 n/a n/a 13,212
(2.02 %)		 25,117
(2.57 %)		 38,655
(7.10 %)		 42.04
(99.78 %)		 0
(0 %)		 312
(0.22 %)		 135
(100.00 %)		 535,521
(8.50 %)		 550,118
(4.01 %)		 6,519,872
(21.47 %)		 1
(0.00 %)		 381,676
(2.04 %)		 30,053
(2.58 %)		 22,898
(1.24 %)
159 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2		 44,988
(12.00 %)		 n/a 15,037
(3.35 %)		 40,235
(7.28 %)		 60,496
(9.39 %)		 40.66
(97.76 %)		 0
(0 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 348,230
(2.87 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,025
(23.44 %)		 0
(0 %)		 175,881
(3.08 %)		 12,807
(1.08 %)		 8,703
(0.67 %)
TOTALS:total assembly count 159

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies