VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of alternate/haplotype assemblies)

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Abyssinian ground-hornbill (alternate hap 2019)
GCA_009769595.1
n/a n/a 11,948
(1.86 %)
22,509
(2.24 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,527
(100.00 %)
361,147
(5.36 %)
125,372
(0.75 %)
5,917,083
(18.51 %)
0
(0 %)
53,587
(0.56 %)
38,787
(3.82 %)
33,644
(2.37 %)
2 adder (hap2 2024)
GCA_964194405.1
n/a n/a 12,344
(1.22 %)
17,320
(1.89 %)
n/a 41.00
(99.99 %)
908
(0.01 %)
908
(0.01 %)
1,256
(99.99 %)
3,221,370
(48.42 %)
681,209
(5.18 %)
6,734,253
(44.26 %)
2
(0.00 %)
n/a 99,366
(4.44 %)
20,272
(0.89 %)
3 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1
n/a n/a 2,101
(1.18 %)
5,350
(2.76 %)
n/a 43.70
(99.99 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
4,811
(100.00 %)
103,373
(4.27 %)
58,480
(3.90 %)
895,535
(27.44 %)
0
(0 %)
59,204
(2.84 %)
10,399
(2.84 %)
3,340
(1.02 %)
4 African hunting dog (LycPic1hap1 2024)
GCA_040955645.1
n/a n/a 18,688
(1.61 %)
19,670
(1.44 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
1
(0.00 %)
82
(0.00 %)
86
(100.00 %)
4,281,139
(31.62 %)
959,378
(2.78 %)
12,859,760
(32.95 %)
1
(0.00 %)
632,917
(1.70 %)
49,122
(2.32 %)
45,729
(1.55 %)
5 African ostrich (bStrCam1hap2 2024)
GCA_040807015.1
n/a n/a 13,036
(1.56 %)
32,740
(2.89 %)
n/a 45.71
(100.00 %)
0
(0 %)
82
(0.00 %)
250
(100.00 %)
651,979
(9.34 %)
459,653
(10.08 %)
4,547,348
(28.27 %)
0
(0 %)
835,180
(5.97 %)
49,261
(10.50 %)
34,040
(2.42 %)
6 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1
n/a n/a 18,845
(1.07 %)
22,426
(1.10 %)
n/a 41.34
(99.85 %)
169
(0.15 %)
169
(0.15 %)
1,253
(99.85 %)
4,406,744
(29.55 %)
925,868
(4.71 %)
15,966,881
(50.49 %)
0
(0 %)
1,248,627
(2.71 %)
68,531
(1.61 %)
23,142
(0.47 %)
7 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1
n/a n/a 19,066
(1.48 %)
22,356
(1.48 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
287
(100.00 %)
3,908,607
(31.48 %)
664,931
(5.23 %)
11,892,191
(41.08 %)
1
(0.00 %)
994,645
(2.87 %)
76,453
(2.43 %)
66,568
(1.61 %)
8 American alligator (2023 genbank)
GCA_030867065.1
n/a n/a 14,487
(0.97 %)
20,444
(1.61 %)
n/a 45.04
(99.81 %)
136
(0.19 %)
136
(0.19 %)
806
(99.81 %)
3,380,365
(43.12 %)
560,127
(2.00 %)
12,524,244
(32.47 %)
1
(0.00 %)
370,300
(1.41 %)
50,852
(2.67 %)
30,117
(1.71 %)
9 American flamingo (alternate hap 2019)
GCA_009819805.1
n/a n/a 12,384
(1.73 %)
23,611
(2.05 %)
n/a 43.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,529
(100.00 %)
496,877
(7.22 %)
162,522
(0.74 %)
6,684,675
(20.14 %)
0
(0 %)
75,413
(0.70 %)
51,895
(5.89 %)
50,715
(3.23 %)
10 American mink (hap2 2024)
GCA_964106205.1
n/a n/a 18,890
(1.43 %)
21,684
(1.33 %)
n/a 42.35
(99.98 %)
2,849
(0.02 %)
2,849
(0.02 %)
3,200
(99.98 %)
4,158,563
(30.22 %)
786,430
(5.25 %)
13,845,377
(37.58 %)
10
(0.00 %)
1,137,591
(2.93 %)
64,307
(2.75 %)
53,505
(1.79 %)
11 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1
n/a n/a 16,911
(1.23 %)
21,107
(1.43 %)
n/a 44.43
(100.00 %)
6
(0.00 %)
375
(0.00 %)
6,123
(100.00 %)
1,808,768
(10.42 %)
561,106
(21.05 %)
10,283,513
(45.97 %)
16
(0.00 %)
2,348,969
(6.68 %)
54,919
(1.33 %)
26,689
(0.79 %)
12 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1
n/a n/a 15,901
(2.25 %)
61,133
(6.37 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,411
(100.00 %)
2,043,181
(23.64 %)
1,141,539
(11.35 %)
3,668,314
(38.60 %)
0
(0 %)
805,945
(6.00 %)
40,218
(2.14 %)
24,243
(1.22 %)
13 amphioxus (hap1 2024)
GCA_035149815.1
n/a n/a 5,253
(0.98 %)
41,226
(12.64 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
65
(100.00 %)
126,311
(1.61 %)
178,951
(7.87 %)
2,137,821
(27.19 %)
1
(0.00 %)
268,231
(4.56 %)
44,152
(5.26 %)
29,152
(2.99 %)
14 Anna's hummingbird (alternate hap BGI_N300 2018)
GCA_003957575.1
n/a n/a 11,084
(1.90 %)
19,321
(2.14 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
3,803
(100.00 %)
475,493
(7.41 %)
223,791
(1.37 %)
5,585,250
(20.30 %)
0
(0 %)
113,614
(1.01 %)
14,903
(1.46 %)
13,444
(1.06 %)
15 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1
n/a n/a 17,318
(1.49 %)
80,097
(5.79 %)
n/a 43.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11,436
(100.00 %)
5,482,467
(36.71 %)
1,454,729
(18.84 %)
6,756,226
(47.56 %)
0
(0 %)
1,722,514
(9.86 %)
92,057
(3.50 %)
34,309
(1.32 %)
16 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1
n/a n/a 17,085
(1.73 %)
19,317
(1.59 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
0
(0 %)
210
(0.00 %)
173
(100.00 %)
2,818,446
(29.44 %)
316,646
(8.90 %)
11,192,133
(31.47 %)
1
(0.00 %)
1,151,809
(3.75 %)
52,135
(1.67 %)
44,943
(1.23 %)
17 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1
n/a n/a 14,032
(2.44 %)
39,770
(4.92 %)
n/a 38.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,617
(100.00 %)
1,808,149
(37.98 %)
583,449
(10.56 %)
4,203,368
(40.67 %)
0
(0 %)
559,424
(5.24 %)
24,867
(2.06 %)
14,134
(0.93 %)
18 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2
n/a n/a 16,053
(2.73 %)
74,777
(7.26 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,351
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
0
(0 %)
142,849
(1.57 %)
85,546
(10.82 %)
65,542
(5.07 %)
19 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1
n/a n/a 17,906
(1.18 %)
21,966
(1.14 %)
n/a 41.14
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,361
(100.00 %)
3,818,524
(29.72 %)
533,426
(3.22 %)
14,381,781
(47.30 %)
0
(0 %)
613,432
(1.61 %)
50,264
(1.15 %)
21,331
(0.51 %)
20 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1
n/a n/a 18,969
(1.75 %)
20,207
(1.36 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
3
(0.00 %)
79
(0.00 %)
262
(100.00 %)
3,650,963
(38.06 %)
355,322
(2.63 %)
14,837,952
(31.37 %)
1
(0.00 %)
267,829
(0.92 %)
37,174
(1.87 %)
37,977
(1.58 %)
21 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1
n/a n/a 13,366
(2.68 %)
66,599
(9.29 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,727
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
0
(0 %)
635,348
(7.05 %)
87,167
(8.03 %)
47,003
(3.66 %)
22 Atlantic hagfish (MG_SS 2024)
GCF_040869285.1
46,374
(1.72 %)
n/a 7,719
(0.19 %)
59,788
(2.68 %)
n/a 44.23
(99.94 %)
0
(0 %)
4,876
(0.06 %)
4,270
(100.00 %)
2,094,143
(3.54 %)
3,212,025
(29.83 %)
8,998,320
(75.15 %)
43
(0.00 %)
n/a 408,391
(12.65 %)
60,671
(0.82 %)
23 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1
n/a n/a 16,554
(3.01 %)
54,832
(7.45 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,008
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
0
(0 %)
297,396
(3.46 %)
36,868
(2.33 %)
24,401
(1.38 %)
24 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2
n/a n/a 15,331
(2.42 %)
52,370
(6.91 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
0
(0 %)
74
(0.00 %)
1,049
(100.00 %)
1,454,631
(18.29 %)
383,946
(4.34 %)
4,363,016
(32.69 %)
0
(0 %)
445,382
(4.43 %)
56,416
(3.08 %)
20,355
(1.02 %)
25 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1
n/a n/a 11,960
(0.40 %)
25,618
(1.25 %)
n/a 42.94
(99.99 %)
0
(0 %)
1,633
(0.01 %)
1,412
(100.00 %)
7,453,535
(49.31 %)
686,063
(13.00 %)
19,985,605
(50.32 %)
8
(0.00 %)
3,309,683
(5.86 %)
86,138
(2.16 %)
30,350
(0.41 %)
26 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024)
GCA_964270935.1
n/a n/a 17,961
(1.59 %)
20,087
(1.36 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
917
(0.01 %)
917
(0.01 %)
1,796
(99.99 %)
3,626,392
(35.51 %)
824,778
(7.32 %)
11,499,904
(39.18 %)
3
(0.00 %)
1,314,679
(4.17 %)
74,348
(3.46 %)
40,100
(1.09 %)
27 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1
n/a n/a 13,505
(1.03 %)
18,978
(1.47 %)
n/a 45.32
(99.98 %)
0
(0 %)
26
(0.02 %)
3,482
(100.00 %)
6,880,857
(41.88 %)
1,099,932
(7.47 %)
8,156,735
(56.68 %)
0
(0 %)
4,129,545
(10.90 %)
70,515
(2.88 %)
41,464
(1.12 %)
28 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3
n/a n/a 16,280
(0.07 %)
186,628
(1.11 %)
n/a 46.01
(99.99 %)
0
(0 %)
184,422
(0.01 %)
27,157
(100.00 %)
28,291,633
(68.19 %)
7,299,053
(4.96 %)
211,579
(99.99 %)
189
(0.00 %)
n/a 2,388,998
(5.24 %)
429,355
(0.66 %)
29 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1
n/a n/a 15,211
(3.23 %)
41,620
(7.14 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
2,393
(100.00 %)
785,178
(17.57 %)
249,148
(8.36 %)
3,391,653
(26.49 %)
0
(0 %)
274,110
(3.20 %)
13,787
(0.93 %)
9,087
(0.56 %)
30 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1
n/a n/a 15,024
(1.45 %)
65,141
(4.53 %)
n/a 41.23
(99.52 %)
0
(0 %)
373
(0.48 %)
196
(100.00 %)
2,509,508
(50.53 %)
441,892
(5.11 %)
6,245,443
(38.22 %)
2
(0.00 %)
822,138
(6.12 %)
93,198
(3.82 %)
36,988
(1.26 %)
31 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1
n/a n/a 26,794
(3.15 %)
76,434
(5.64 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
8,035
(100.00 %)
4,084,361
(52.18 %)
538,411
(4.25 %)
7,659,980
(38.94 %)
0
(0 %)
450,884
(2.88 %)
58,008
(2.90 %)
19,160
(0.57 %)
32 Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021)
GCA_015227815.3
n/a n/a 11,132
(1.94 %)
20,993
(2.40 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
2,476
(100.00 %)
550,072
(10.78 %)
282,378
(2.00 %)
5,634,117
(20.43 %)
0
(0 %)
161,076
(1.17 %)
30,305
(2.79 %)
25,208
(1.64 %)
33 basking shark (sCetMax3.hap2.1 2024)
GCA_964194165.1
n/a n/a 13,515
(0.42 %)
21,374
(1.06 %)
n/a 44.47
(99.99 %)
2,740
(0.01 %)
2,740
(0.01 %)
6,569
(99.99 %)
6,483,403
(66.87 %)
1,041,828
(9.99 %)
21,142,745
(50.24 %)
31
(0.00 %)
4,014,149
(6.09 %)
107,555
(1.88 %)
26,392
(0.67 %)
34 bats A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1
n/a n/a 17,124
(1.63 %)
18,342
(1.54 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
56
(0.00 %)
187
(100.00 %)
2,597,378
(26.81 %)
332,733
(4.43 %)
10,957,327
(33.52 %)
2
(0.00 %)
406,013
(1.59 %)
63,688
(2.22 %)
49,331
(1.50 %)
35 bird A.albertisi (hap2 2024)
GCA_039906465.1
n/a n/a 12,101
(1.93 %)
21,258
(2.30 %)
n/a 42.52
(99.99 %)
0
(0 %)
344
(0.01 %)
525
(100.00 %)
412,944
(6.30 %)
232,333
(2.21 %)
5,715,517
(21.35 %)
7
(0.00 %)
210,485
(1.75 %)
20,873
(2.13 %)
17,066
(0.97 %)
36 bird E.chinensis (hap1 2024)
GCA_039878515.1
n/a n/a 12,607
(2.39 %)
22,429
(2.59 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
0
(0 %)
331
(0.01 %)
425
(100.00 %)
521,486
(5.26 %)
266,418
(2.40 %)
5,305,054
(20.63 %)
0
(0 %)
184,194
(1.95 %)
19,590
(2.16 %)
16,404
(1.36 %)
37 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024)
GCA_043290065.1
n/a n/a 19,814
(0.63 %)
20,140
(0.63 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
1
(0.00 %)
723
(0.00 %)
315
(100.00 %)
3,657,357
(14.24 %)
1,158,716
(2.84 %)
22,924,986
(64.53 %)
6
(0.00 %)
n/a 46,774
(0.90 %)
21,729
(0.30 %)
38 black rhinoceros (alternate hap 2021)
GCA_020826835.1
n/a n/a 19,000
(1.37 %)
22,547
(1.26 %)
n/a 41.56
(99.97 %)
0
(0 %)
178
(0.03 %)
1,199
(100.00 %)
4,340,245
(37.22 %)
564,468
(8.07 %)
14,384,523
(40.40 %)
0
(0 %)
941,914
(2.51 %)
44,971
(1.16 %)
34,023
(0.74 %)
39 black-capped chickadee (hap2 2023)
GCA_030490855.1
n/a n/a 11,495
(1.90 %)
22,202
(2.49 %)
n/a 42.77
(99.94 %)
0
(0 %)
240
(0.06 %)
157
(100.00 %)
560,436
(11.20 %)
441,102
(7.11 %)
5,126,888
(23.42 %)
1
(0.00 %)
485,675
(2.99 %)
35,457
(2.90 %)
20,157
(1.24 %)
40 black-headed gull (Kunming 2023)
GCA_030820635.1
n/a n/a 12,902
(1.75 %)
23,180
(2.09 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
297
(100.00 %)
498,044
(5.37 %)
199,557
(4.44 %)
6,843,616
(23.12 %)
3
(0.00 %)
184,280
(1.44 %)
42,444
(3.62 %)
37,532
(1.85 %)
41 black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023)
GCA_028501385.1
n/a n/a 12,650
(1.68 %)
22,959
(2.02 %)
n/a 44.62
(99.95 %)
0
(0 %)
223
(0.05 %)
733
(100.00 %)
483,413
(5.25 %)
221,284
(9.35 %)
6,264,499
(27.26 %)
4
(0.00 %)
646,822
(3.82 %)
42,776
(4.88 %)
36,156
(1.75 %)
42 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1
n/a n/a 15,274
(2.92 %)
51,453
(7.45 %)
n/a 43.07
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,239,364
(29.69 %)
354,703
(9.63 %)
3,006,556
(30.35 %)
2
(0.00 %)
588,441
(7.05 %)
53,503
(4.48 %)
28,830
(1.72 %)
43 blackcap (alternate hap 2019)
GCA_009819715.1
n/a n/a 11,586
(1.87 %)
22,618
(2.41 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,566
(100.00 %)
473,456
(5.97 %)
308,518
(2.29 %)
5,987,640
(19.64 %)
0
(0 %)
201,989
(1.45 %)
25,451
(2.38 %)
21,377
(1.34 %)
44 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1
n/a n/a 17,403
(2.99 %)
45,903
(5.38 %)
n/a 38.64
(99.99 %)
0
(0 %)
709
(0.01 %)
673
(100.00 %)
2,141,901
(35.77 %)
482,931
(17.18 %)
4,297,133
(46.82 %)
4
(0.00 %)
991,826
(7.99 %)
41,889
(2.32 %)
19,281
(0.97 %)
45 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1
n/a n/a 17,838
(1.54 %)
21,389
(1.35 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,198
(100.00 %)
3,542,727
(35.35 %)
650,369
(8.86 %)
10,971,320
(41.15 %)
0
(0 %)
1,286,122
(4.20 %)
62,389
(1.68 %)
34,595
(0.95 %)
46 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2
n/a n/a 16,997
(1.82 %)
20,609
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
10,999
(100.00 %)
3,126,800
(43.49 %)
454,452
(1.23 %)
9,916,868
(33.63 %)
0
(0 %)
296,938
(1.19 %)
55,436
(1.85 %)
38,786
(1.50 %)
47 blue-and-yellow macaw (hap2 2023)
GCA_028858555.1
n/a n/a 13,216
(1.69 %)
23,855
(2.07 %)
n/a 43.30
(99.92 %)
0
(0 %)
130
(0.08 %)
274
(100.00 %)
746,174
(21.96 %)
291,116
(9.91 %)
5,424,976
(28.69 %)
1
(0.00 %)
907,315
(4.95 %)
26,750
(2.02 %)
20,655
(1.17 %)
48 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1
n/a n/a 12,494
(1.93 %)
44,967
(5.14 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,174
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
0
(0 %)
344,768
(3.42 %)
23,532
(1.46 %)
12,368
(0.66 %)
49 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1
n/a n/a 13,882
(2.27 %)
45,919
(5.98 %)
n/a 39.50
(99.99 %)
0
(0 %)
45
(0.01 %)
3,194
(100.00 %)
803,073
(13.60 %)
258,404
(4.19 %)
4,674,614
(28.36 %)
0
(0 %)
339,851
(3.09 %)
15,524
(1.02 %)
9,057
(0.56 %)
50 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1
n/a n/a 12,424
(1.95 %)
46,550
(6.00 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,619
(100.00 %)
789,207
(14.61 %)
348,482
(20.98 %)
3,447,241
(38.72 %)
0
(0 %)
1,174,378
(8.68 %)
27,035
(4.16 %)
12,167
(0.85 %)
51 rough bullseye (RE-2024b hap2 2024)
GCA_042242125.1
n/a n/a 14,475
(2.89 %)
44,413
(7.11 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
0
(0 %)
93
(0.00 %)
84
(100.00 %)
1,762,151
(30.90 %)
262,291
(5.80 %)
3,580,461
(24.37 %)
10
(0.00 %)
296,317
(3.16 %)
19,851
(1.40 %)
14,202
(0.86 %)
52 Bornean orangutan (v2 AG05252 alternate hap 2024)
GCA_028885525.2
n/a n/a 19,761
(1.78 %)
20,268
(1.16 %)
n/a 40.95
(99.70 %)
0
(0 %)
10
(0.30 %)
33
(100.00 %)
5,201,908
(53.67 %)
980,696
(9.42 %)
15,105,351
(41.63 %)
0
(0 %)
2,340,777
(4.18 %)
41,454
(1.11 %)
28,219
(0.76 %)
53 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1
n/a n/a 17,791
(1.12 %)
22,667
(1.29 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
106
(0.00 %)
106
(0.00 %)
2,898
(100.00 %)
6,293,452
(41.30 %)
1,076,688
(17.94 %)
8,553,272
(57.13 %)
1
(0.00 %)
6,983,927
(14.02 %)
31,102
(1.31 %)
23,419
(0.57 %)
54 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1
n/a n/a 17,612
(1.68 %)
22,099
(1.91 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
25
(0.00 %)
541
(0.01 %)
365
(100.00 %)
2,748,918
(17.16 %)
827,542
(4.51 %)
8,832,809
(39.20 %)
2
(0.00 %)
1,074,853
(3.77 %)
26,416
(1.35 %)
22,242
(0.81 %)
55 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1
n/a n/a 17,954
(1.51 %)
19,994
(1.30 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
0
(0 %)
240
(0.00 %)
800
(100.00 %)
3,723,164
(34.96 %)
809,880
(11.02 %)
11,359,211
(41.42 %)
2
(0.00 %)
1,554,419
(4.60 %)
60,067
(1.55 %)
36,564
(0.95 %)
56 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1
n/a n/a 13,813
(1.89 %)
27,088
(4.55 %)
n/a 40.60
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
297
(100.00 %)
886,999
(13.24 %)
358,077
(7.37 %)
4,625,277
(36.22 %)
0
(0 %)
529,249
(5.78 %)
43,764
(2.79 %)
26,363
(1.18 %)
57 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1
n/a n/a 17,999
(1.60 %)
76,655
(5.58 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
10,799
(100.00 %)
5,994,257
(39.29 %)
1,126,685
(10.35 %)
6,996,991
(46.02 %)
0
(0 %)
1,131,145
(6.97 %)
71,016
(3.36 %)
27,805
(1.08 %)
58 Brazilian merganser (hap2 2024)
GCA_036850655.1
n/a n/a 12,578
(1.76 %)
23,066
(2.06 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
0
(0 %)
244
(0.00 %)
720
(100.00 %)
773,452
(7.75 %)
522,491
(10.88 %)
5,592,104
(31.80 %)
0
(0 %)
820,340
(5.03 %)
33,981
(4.60 %)
26,728
(1.37 %)
59 Brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1
n/a n/a 12,479
(1.04 %)
16,886
(1.81 %)
n/a 41.00
(100.00 %)
0
(0 %)
172
(0.00 %)
41
(100.00 %)
1,249,920
(6.94 %)
941,401
(5.42 %)
8,402,482
(44.77 %)
1
(0.00 %)
1,126,727
(4.44 %)
37,299
(1.02 %)
14,196
(0.37 %)
60 budgerigar (paternal hap 2020)
GCA_012275275.1
n/a n/a 13,127
(1.94 %)
22,492
(2.30 %)
n/a 41.84
(98.98 %)
0
(0 %)
737
(1.02 %)
330
(100.00 %)
505,478
(9.66 %)
231,633
(2.15 %)
5,778,405
(20.30 %)
0
(0 %)
277,857
(1.78 %)
20,205
(1.61 %)
17,519
(1.14 %)
61 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1
n/a n/a 15,228
(3.42 %)
41,322
(7.36 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,592
(100.00 %)
972,098
(18.43 %)
155,031
(1.41 %)
3,452,400
(21.36 %)
0
(0 %)
85,576
(1.51 %)
15,255
(1.12 %)
10,648
(0.72 %)
62 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2
n/a n/a 18,319
(1.81 %)
18,772
(1.48 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,096
(100.00 %)
3,724,021
(42.91 %)
488,356
(1.26 %)
10,891,276
(33.15 %)
0
(0 %)
395,508
(1.40 %)
44,467
(1.57 %)
41,289
(1.38 %)
63 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2
n/a n/a 12,041
(1.42 %)
15,226
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
15,046
(100.00 %)
2,939,291
(43.50 %)
544,849
(1.76 %)
7,650,345
(32.74 %)
0
(0 %)
294,817
(1.43 %)
39,099
(2.44 %)
34,631
(1.88 %)
64 Caribbean electric ray (hap1 2024 genbank)
GCA_036971445.1
n/a n/a 11,967
(0.44 %)
20,851
(1.23 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,443
(0.01 %)
596
(100.00 %)
4,902,656
(34.96 %)
1,040,893
(17.82 %)
16,403,253
(54.79 %)
2
(0.00 %)
3,888,884
(8.11 %)
113,936
(1.69 %)
22,323
(0.31 %)
65 carmine bee-eater (alternate hap 2019)
GCA_009819585.1
n/a n/a 12,381
(1.76 %)
28,865
(2.78 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,296
(100.00 %)
542,765
(7.77 %)
204,389
(1.06 %)
6,415,832
(21.53 %)
0
(0 %)
133,280
(1.22 %)
31,638
(2.54 %)
23,845
(1.27 %)
66 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1
n/a n/a 15,980
(2.79 %)
53,680
(6.62 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,656
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
0
(0 %)
386,762
(3.56 %)
20,338
(1.21 %)
10,996
(0.60 %)
67 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1
n/a n/a 15,116
(2.91 %)
47,839
(7.01 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
71
(100.00 %)
463,848
(3.80 %)
254,561
(4.23 %)
3,654,295
(24.08 %)
2
(0.00 %)
196,606
(2.28 %)
30,593
(1.99 %)
17,996
(1.03 %)
68 chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022)
GCA_027408205.1
n/a n/a 11,740
(2.36 %)
21,473
(2.56 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
2,263
(100.00 %)
551,116
(10.78 %)
241,638
(4.43 %)
4,973,260
(21.77 %)
0
(0 %)
285,039
(2.53 %)
21,151
(2.71 %)
18,001
(1.56 %)
69 chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022)
GCA_027408225.1
n/a n/a 13,037
(2.20 %)
23,550
(2.37 %)
n/a 42.31
(99.81 %)
0
(0 %)
460
(0.19 %)
252
(100.00 %)
681,166
(12.04 %)
381,093
(7.09 %)
5,610,806
(24.65 %)
3
(0.00 %)
489,064
(3.62 %)
25,664
(2.75 %)
21,023
(1.48 %)
70 chicken (Huxu 2023)
GCA_024206055.2
n/a n/a 13,405
(2.26 %)
24,435
(2.45 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
41
(100.00 %)
704,190
(12.54 %)
502,701
(5.74 %)
5,731,097
(23.50 %)
0
(0 %)
573,152
(3.69 %)
27,781
(2.90 %)
22,282
(1.53 %)
71 chicken white leghorn layer X broiler (v2 broiler haplotype 2021 2021)
GCF_016699485.2
74,716
(9.14 %)
n/a 13,128
(2.33 %)
23,484
(2.48 %)
72,013
(9.34 %)
42.20
(99.68 %)
463
(0.32 %)
463
(0.32 %)
677
(99.68 %)
697,827
(12.53 %)
290,892
(2.63 %)
5,887,021
(21.30 %)
1
(0.00 %)
268,636
(2.17 %)
24,469
(2.59 %)
20,885
(1.55 %)
72 chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022)
GCA_027408255.1
n/a n/a 11,339
(2.33 %)
20,588
(2.51 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,684
(100.00 %)
537,847
(10.84 %)
217,964
(3.81 %)
4,879,985
(21.43 %)
0
(0 %)
236,343
(2.20 %)
19,653
(2.66 %)
17,140
(1.52 %)
73 chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023)
GCA_027557775.1
n/a n/a 12,855
(2.22 %)
23,147
(2.37 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
566
(0.26 %)
246
(100.00 %)
672,973
(12.00 %)
342,156
(6.53 %)
5,690,712
(23.98 %)
5
(0.00 %)
438,910
(3.29 %)
24,413
(2.63 %)
20,581
(1.48 %)
74 chimpanzee (v2 AG18354 alternate hap 2024)
GCA_028858805.2
n/a n/a 19,981
(1.80 %)
20,886
(1.18 %)
n/a 40.63
(99.83 %)
0
(0 %)
5
(0.17 %)
23
(100.00 %)
5,080,229
(48.83 %)
937,411
(11.36 %)
14,905,102
(42.22 %)
0
(0 %)
3,051,376
(5.48 %)
46,330
(1.11 %)
28,554
(0.78 %)
75 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1
n/a n/a 18,538
(1.34 %)
21,724
(1.27 %)
n/a 41.09
(99.48 %)
0
(0 %)
190
(0.52 %)
700
(100.00 %)
3,362,899
(34.48 %)
678,384
(4.11 %)
12,024,241
(39.52 %)
7
(0.00 %)
1,198,886
(3.98 %)
48,960
(1.19 %)
34,434
(0.79 %)
76 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1
n/a n/a 15,165
(2.44 %)
46,105
(6.16 %)
n/a 39.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,163
(100.00 %)
1,546,066
(27.08 %)
537,737
(9.87 %)
4,485,153
(30.70 %)
0
(0 %)
726,611
(6.01 %)
14,774
(0.81 %)
8,304
(0.43 %)
77 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1
n/a n/a 14,940
(3.51 %)
39,688
(7.41 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
0
(0 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,993
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
0
(0 %)
150,484
(2.39 %)
10,131
(0.86 %)
7,444
(0.57 %)
78 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1
n/a n/a 16,430
(1.52 %)
21,057
(1.44 %)
n/a 41.79
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 10,377
(100.00 %)
3,845,437
(33.39 %)
794,587
(2.14 %)
10,765,695
(33.40 %)
0
(0 %)
461,307
(1.56 %)
56,375
(2.45 %)
47,473
(1.74 %)
79 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1
n/a n/a 13,999
(1.21 %)
18,145
(2.02 %)
n/a 44.85
(100.00 %)
0
(0 %)
286
(0.00 %)
827
(100.00 %)
844,126
(6.57 %)
462,086
(2.56 %)
8,237,807
(37.72 %)
0
(0 %)
573,955
(2.91 %)
30,098
(0.96 %)
16,208
(0.52 %)
80 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1
n/a n/a 18,537
(1.77 %)
20,619
(1.44 %)
n/a 41.42
(98.08 %)
0
(0 %)
868
(1.92 %)
1,166
(100.00 %)
3,997,801
(45.93 %)
609,838
(1.85 %)
12,400,272
(34.53 %)
1
(0.00 %)
649,569
(1.73 %)
64,630
(1.84 %)
42,623
(1.32 %)
81 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1
n/a n/a 14,863
(0.75 %)
15,426
(0.89 %)
n/a 39.41
(100.00 %)
313
(0.00 %)
313
(0.00 %)
12,446
(100.00 %)
5,846,769
(38.56 %)
987,917
(1.99 %)
16,764,356
(40.14 %)
0
(0 %)
345,940
(1.13 %)
13,303
(0.35 %)
10,338
(0.23 %)
82 common buzzard (bButBut1.hap2.1 2024)
GCA_964188375.1
n/a n/a 13,593
(1.72 %)
24,541
(2.09 %)
n/a 43.49
(99.99 %)
471
(0.01 %)
471
(0.01 %)
929
(99.99 %)
439,011
(4.19 %)
247,629
(8.40 %)
6,711,875
(25.06 %)
4
(0.00 %)
284,874
(1.81 %)
49,141
(4.61 %)
34,440
(1.72 %)
83 common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021)
GCA_017976305.1
n/a n/a 12,464
(1.91 %)
24,623
(2.50 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
505,582
(10.93 %)
292,484
(2.48 %)
6,061,828
(21.38 %)
0
(0 %)
303,976
(1.80 %)
24,010
(1.80 %)
19,613
(1.10 %)
84 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1
n/a n/a 13,073
(0.44 %)
43,036
(1.95 %)
n/a 44.07
(100.00 %)
14
(0.00 %)
14
(0.00 %)
12,033
(100.00 %)
1,489,788
(2.18 %)
2,621,157
(9.04 %)
17,154,926
(55.44 %)
0
(0 %)
3,161,179
(6.09 %)
581,115
(7.68 %)
54,845
(0.65 %)
85 common moorhen (bGalChl1.hap2.1 2024)
GCA_964237395.1
n/a n/a 12,745
(1.75 %)
23,052
(2.18 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
536
(0.01 %)
536
(0.01 %)
931
(99.99 %)
483,812
(5.59 %)
210,131
(3.30 %)
6,332,994
(22.33 %)
3
(0.00 %)
308,952
(2.24 %)
26,285
(2.20 %)
21,379
(1.23 %)
86 common myna (bArcTri1 alternate hap 2023)
GCA_027559525.1
n/a n/a 10,692
(1.77 %)
20,925
(2.29 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,221
(100.00 %)
328,602
(4.16 %)
604,057
(8.02 %)
5,233,128
(25.06 %)
0
(0 %)
479,200
(3.38 %)
25,210
(3.70 %)
18,123
(1.22 %)
87 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1
n/a n/a 15,974
(1.72 %)
20,563
(1.66 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
10,459
(100.00 %)
2,634,333
(23.76 %)
703,674
(2.65 %)
8,909,525
(33.95 %)
0
(0 %)
343,235
(1.37 %)
50,430
(2.54 %)
45,982
(1.75 %)
88 common pochard (bAytFer1.hap2.1 2024)
GCA_964211795.1
n/a n/a 12,828
(1.96 %)
23,534
(2.35 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
405
(0.01 %)
405
(0.01 %)
767
(99.99 %)
725,169
(7.34 %)
472,156
(5.81 %)
5,786,296
(25.35 %)
16
(0.00 %)
412,441
(2.96 %)
30,917
(2.80 %)
26,828
(1.51 %)
89 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1
n/a n/a 14,904
(2.99 %)
43,194
(7.09 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,318
(100.00 %)
1,128,080
(18.77 %)
328,975
(8.35 %)
3,952,898
(31.64 %)
0
(0 %)
410,353
(4.52 %)
26,979
(2.08 %)
15,469
(0.95 %)
90 common swift (bApuApu2 alternate hap 2021)
GCA_020740585.1
n/a n/a 11,653
(1.89 %)
19,731
(2.20 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
1,697
(100.00 %)
443,384
(6.09 %)
185,968
(1.18 %)
5,916,553
(20.88 %)
0
(0 %)
109,215
(0.89 %)
18,864
(1.75 %)
15,032
(0.87 %)
91 common tern (alternate hap 2019)
GCA_009819645.1
n/a n/a 12,773
(1.79 %)
24,751
(2.23 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,235
(100.00 %)
549,460
(7.58 %)
204,051
(1.02 %)
6,880,566
(20.70 %)
0
(0 %)
116,485
(1.17 %)
47,352
(3.95 %)
42,123
(2.18 %)
92 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1
n/a n/a 12,074
(0.39 %)
46,329
(1.82 %)
n/a 44.48
(99.99 %)
156
(0.01 %)
156
(0.01 %)
24,351
(99.99 %)
1,186,360
(1.65 %)
2,279,941
(13.33 %)
14,665,548
(61.48 %)
2
(0.00 %)
4,594,926
(9.74 %)
405,097
(4.49 %)
61,648
(0.70 %)
93 common vampire bat (HL8 alternate hap 2022)
GCA_022682395.1
n/a n/a 17,520
(1.75 %)
18,995
(1.67 %)
n/a 42.89
(99.99 %)
0
(0 %)
580
(0.01 %)
430
(100.00 %)
2,597,497
(28.17 %)
356,620
(2.88 %)
10,797,225
(31.23 %)
25
(0.00 %)
271,481
(1.34 %)
61,931
(2.30 %)
43,396
(1.30 %)
94 common vampire bat (HL8 alternate hap 2022)
GCA_022682395.2
n/a n/a 17,485
(1.76 %)
18,907
(1.66 %)
n/a 42.87
(99.99 %)
0
(0 %)
576
(0.01 %)
429
(100.00 %)
2,592,246
(28.20 %)
352,985
(2.87 %)
10,737,944
(31.11 %)
25
(0.00 %)
264,293
(1.29 %)
61,125
(2.28 %)
42,729
(1.28 %)
95 common wall lizard (hap2 2024)
GCA_964188365.1
n/a n/a 13,838
(1.39 %)
19,262
(2.35 %)
n/a 44.17
(99.99 %)
734
(0.01 %)
734
(0.01 %)
825
(99.99 %)
815,808
(4.07 %)
494,366
(4.53 %)
6,739,651
(37.84 %)
6
(0.00 %)
648,489
(3.96 %)
113,458
(3.63 %)
19,621
(0.77 %)
96 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1
n/a n/a 25,968
(1.48 %)
104,922
(4.18 %)
n/a 43.67
(99.96 %)
4,689
(0.04 %)
4,689
(0.04 %)
8,669
(99.96 %)
1,320,339
(4.08 %)
1,364,334
(15.61 %)
7,674,742
(61.10 %)
11
(0.00 %)
2,973,556
(10.43 %)
94,019
(3.82 %)
16,046
(0.28 %)
97 common yellowthroat (alternate hap 2019)
GCA_009764545.1
n/a n/a 10,611
(1.77 %)
21,125
(2.21 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
4,976
(100.00 %)
422,889
(5.99 %)
294,928
(2.71 %)
5,928,421
(19.76 %)
0
(0 %)
245,763
(1.64 %)
21,397
(1.91 %)
17,659
(1.14 %)
98 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1
n/a n/a 5,231
(0.27 %)
47,644
(1.48 %)
n/a 44.62
(99.99 %)
144
(0.01 %)
144
(0.01 %)
21,561
(99.99 %)
2,803,873
(49.20 %)
655,416
(2.69 %)
7,558,550
(67.05 %)
0
(0 %)
912,917
(5.74 %)
181,626
(10.52 %)
19,591
(0.39 %)
99 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1
n/a n/a 13,622
(2.81 %)
43,285
(6.93 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,125
(100.00 %)
1,741,373
(32.89 %)
182,926
(2.01 %)
3,659,106
(21.68 %)
1
(0.00 %)
138,669
(1.93 %)
27,693
(1.89 %)
19,848
(1.23 %)
100 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1
n/a n/a 14,955
(0.23 %)
n/a n/a 45.61
(99.80 %)
2,431
(0.20 %)
2,431
(0.20 %)
5,958
(99.80 %)
20,007,151
(76.28 %)
5,951,819
(19.40 %)
5,958
(99.80 %)
49
(0.00 %)
n/a 991,009
(4.86 %)
91,447
(0.54 %)
101 Cory's shearwater (bCalBor7.hap2.1 2024)
GCA_964196065.1
n/a n/a 12,750
(1.85 %)
23,191
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.99 %)
477
(0.01 %)
477
(0.01 %)
726
(99.99 %)
403,846
(4.59 %)
252,125
(3.30 %)
6,206,493
(22.07 %)
2
(0.00 %)
286,848
(2.45 %)
41,821
(4.50 %)
38,197
(2.23 %)
102 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1
n/a n/a 13,192
(1.36 %)
19,293
(2.32 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,936
(100.00 %)
808,341
(4.31 %)
467,532
(2.91 %)
6,418,809
(38.02 %)
0
(0 %)
518,786
(3.19 %)
107,080
(3.15 %)
17,213
(0.72 %)
103 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1
n/a n/a 4,509
(3.03 %)
16,936
(7.22 %)
n/a 38.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,713
(100.00 %)
430,197
(46.38 %)
101,926
(7.54 %)
1,077,239
(32.21 %)
0
(0 %)
149,644
(6.00 %)
10,612
(4.11 %)
3,661
(0.96 %)
104 cuckoo roller (hap1 2023)
GCA_034619455.1
n/a n/a 13,157
(1.67 %)
30,413
(2.59 %)
n/a 43.53
(100.00 %)
18
(0.00 %)
290
(0.00 %)
353
(100.00 %)
609,076
(8.83 %)
331,584
(6.01 %)
5,966,458
(23.99 %)
1
(0.00 %)
520,291
(3.07 %)
45,694
(7.05 %)
36,809
(2.18 %)
105 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1
n/a n/a 14,861
(2.74 %)
42,996
(6.34 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
0
(0 %)
31
(0.01 %)
1,476
(100.00 %)
1,373,727
(30.17 %)
220,572
(4.38 %)
4,176,936
(27.32 %)
0
(0 %)
274,559
(2.86 %)
17,129
(1.04 %)
8,648
(0.51 %)
106 Dalmatian pelican (alternate hap 2023)
GCA_030449815.1
n/a n/a 12,766
(1.68 %)
26,055
(2.18 %)
n/a 43.44
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,284
(100.00 %)
607,561
(13.23 %)
239,649
(4.41 %)
6,086,519
(23.21 %)
0
(0 %)
260,915
(1.93 %)
38,398
(5.49 %)
35,285
(2.09 %)
107 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1
n/a n/a 18,895
(1.78 %)
24,235
(1.81 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,930
(100.00 %)
2,813,870
(23.75 %)
718,406
(5.18 %)
9,977,320
(37.24 %)
0
(0 %)
609,378
(2.37 %)
62,910
(2.66 %)
55,962
(1.97 %)
108 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2
n/a n/a 14,119
(3.95 %)
47,988
(8.57 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,660
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
0
(0 %)
175,500
(3.05 %)
50,830
(8.72 %)
41,064
(4.69 %)
109 diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023)
GCA_027887205.1
n/a n/a 15,081
(1.08 %)
19,115
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.98 %)
0
(0 %)
127
(0.02 %)
59
(100.00 %)
4,093,707
(46.36 %)
404,046
(1.70 %)
11,113,266
(33.78 %)
1
(0.01 %)
405,600
(1.68 %)
111,129
(2.68 %)
30,307
(0.82 %)
110 Domestic goose (bAnsAns1.hap2.1 2024)
GCA_964211785.1
n/a n/a 12,473
(1.84 %)
22,849
(2.21 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
754
(0.01 %)
754
(0.01 %)
1,135
(99.99 %)
594,136
(5.06 %)
375,813
(7.54 %)
5,497,978
(26.76 %)
11
(0.00 %)
630,693
(4.47 %)
39,164
(4.55 %)
34,203
(2.32 %)
111 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1
n/a n/a 16,788
(2.12 %)
50,338
(4.68 %)
n/a 41.27
(98.12 %)
0
(0 %)
641
(1.88 %)
182
(100.00 %)
2,709,759
(34.74 %)
798,364
(14.84 %)
5,418,190
(36.02 %)
1
(0.00 %)
1,397,111
(8.85 %)
30,055
(1.31 %)
21,119
(0.80 %)
112 Downy woodpecker (alternate hap 2020)
GCA_014839825.1
n/a n/a 11,732
(1.74 %)
22,080
(2.25 %)
n/a 45.44
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,342
(100.00 %)
921,959
(20.95 %)
334,804
(3.26 %)
5,352,773
(31.27 %)
0
(0 %)
702,756
(4.12 %)
24,105
(1.81 %)
19,021
(1.21 %)
113 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1
n/a n/a 18,538
(1.23 %)
20,775
(1.09 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
0
(0 %)
89
(0.00 %)
167
(100.00 %)
4,455,227
(33.01 %)
444,021
(1.73 %)
14,946,847
(47.37 %)
1
(0.00 %)
504,439
(1.27 %)
29,828
(0.79 %)
24,008
(0.54 %)
114 East African grey crowned-crane (alternate hap 2020)
GCA_011004865.1
n/a n/a 11,799
(1.88 %)
22,122
(2.30 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
971
(100.00 %)
457,930
(6.40 %)
150,544
(0.85 %)
6,074,490
(20.16 %)
0
(0 %)
65,996
(0.78 %)
33,323
(3.81 %)
32,972
(2.41 %)
115 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1
n/a n/a 13,632
(0.43 %)
35,630
(1.52 %)
n/a 46.77
(99.99 %)
0
(0 %)
1,773
(0.01 %)
590
(100.00 %)
1,759,193
(1.98 %)
2,013,186
(16.21 %)
16,138,898
(60.55 %)
17
(0.00 %)
5,811,499
(9.67 %)
614,432
(5.85 %)
72,993
(0.75 %)
116 electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020)
GCA_013347915.1
n/a n/a 12,020
(3.63 %)
38,881
(7.31 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,629
(100.00 %)
429,509
(7.66 %)
432,260
(11.41 %)
2,049,609
(24.32 %)
0
(0 %)
486,181
(6.19 %)
35,597
(4.37 %)
27,662
(2.94 %)
117 emu (hap2 2024)
GCA_036417515.1
n/a n/a 12,839
(1.57 %)
24,113
(1.98 %)
n/a 44.40
(100.00 %)
4
(0.00 %)
101
(0.00 %)
242
(100.00 %)
657,460
(14.23 %)
397,600
(8.84 %)
4,824,789
(26.94 %)
0
(0 %)
967,271
(6.15 %)
48,081
(7.49 %)
39,730
(2.99 %)
118 epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021)
GCA_020745765.1
n/a n/a 12,650
(0.38 %)
20,614
(1.06 %)
n/a 42.75
(97.99 %)
0
(0 %)
3,552
(2.01 %)
4,000
(100.00 %)
9,489,793
(70.34 %)
976,827
(6.97 %)
21,183,330
(44.32 %)
1
(0.00 %)
3,092,395
(4.62 %)
42,917
(1.08 %)
13,522
(0.16 %)
119 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1
n/a n/a 13,583
(1.65 %)
15,403
(1.46 %)
n/a 41.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,327
(100.00 %)
3,139,035
(40.57 %)
480,111
(1.29 %)
9,106,061
(31.93 %)
0
(0 %)
342,175
(1.40 %)
39,139
(2.25 %)
38,863
(2.02 %)
120 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1
n/a n/a 19,332
(1.42 %)
22,424
(1.40 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
0
(0 %)
27
(0.00 %)
726
(100.00 %)
4,362,536
(31.74 %)
801,232
(4.02 %)
13,893,672
(37.73 %)
1
(0.00 %)
1,089,255
(2.94 %)
65,806
(4.13 %)
53,831
(1.83 %)
121 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2
n/a n/a 19,268
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
41,043
(1.93 %)
42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,417,203
(31.72 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,720
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,257
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
54,563
(1.83 %)
122 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap2.1 2024)
GCA_964273585.1
n/a n/a 13,051
(1.80 %)
24,815
(2.25 %)
n/a 42.33
(99.99 %)
0
(0 %)
683
(0.01 %)
584
(100.00 %)
482,819
(5.02 %)
292,761
(7.61 %)
6,282,928
(25.46 %)
9
(0.00 %)
449,304
(2.98 %)
35,630
(3.58 %)
31,844
(1.85 %)
123 Eurasian curlew (hap2 2024)
GCA_964059295.1
n/a n/a 12,728
(1.78 %)
23,645
(2.18 %)
n/a 43.53
(99.99 %)
693
(0.01 %)
693
(0.01 %)
1,504
(99.99 %)
544,959
(6.24 %)
393,773
(4.49 %)
5,839,698
(24.52 %)
33
(0.00 %)
281,233
(2.53 %)
35,759
(3.26 %)
26,342
(1.23 %)
124 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1
n/a n/a 17,920
(3.03 %)
59,697
(6.61 %)
n/a 39.13
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
4,949
(100.00 %)
2,285,870
(44.17 %)
480,649
(10.13 %)
4,833,803
(39.56 %)
0
(0 %)
820,249
(6.21 %)
57,737
(4.15 %)
23,311
(1.22 %)
125 Eurasian nightjar (alternate hap 2021)
GCA_907165095.1
n/a n/a 12,266
(1.90 %)
22,091
(2.30 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
0
(0 %)
25
(0.00 %)
2,502
(100.00 %)
458,278
(5.64 %)
212,205
(1.54 %)
6,032,224
(21.16 %)
0
(0 %)
151,625
(1.15 %)
21,942
(1.89 %)
19,235
(1.33 %)
126 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1
n/a n/a 12,437
(1.51 %)
12,702
(1.22 %)
n/a 40.06
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
10,657
(100.00 %)
2,303,176
(35.38 %)
353,996
(1.49 %)
7,218,556
(31.67 %)
0
(0 %)
194,541
(1.24 %)
24,268
(1.07 %)
22,754
(0.97 %)
127 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1
n/a n/a 9,910
(1.59 %)
11,315
(1.31 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,506
(100.00 %)
2,052,338
(42.25 %)
316,084
(1.64 %)
6,222,460
(33.12 %)
0
(0 %)
291,189
(1.91 %)
27,057
(1.96 %)
26,047
(1.75 %)
128 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1
n/a n/a 16,761
(1.66 %)
19,715
(1.37 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
105
(0.00 %)
105
(0.00 %)
16,473
(100.00 %)
3,118,266
(26.44 %)
829,463
(2.82 %)
9,700,482
(31.37 %)
0
(0 %)
353,652
(1.44 %)
14,146
(0.57 %)
12,571
(0.45 %)
129 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1
n/a n/a 17,416
(2.74 %)
60,936
(6.02 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
7,437
(100.00 %)
2,377,147
(47.98 %)
578,235
(8.27 %)
5,267,308
(40.22 %)
0
(0 %)
872,083
(6.16 %)
50,909
(3.45 %)
17,892
(0.86 %)
130 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1
n/a n/a 14,690
(3.17 %)
48,422
(7.90 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,915
(100.00 %)
1,138,190
(26.31 %)
249,865
(4.72 %)
3,352,038
(25.55 %)
0
(0 %)
232,419
(3.75 %)
36,828
(3.13 %)
27,093
(1.88 %)
131 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1
n/a n/a 14,220
(1.16 %)
21,979
(2.19 %)
n/a 44.64
(99.68 %)
0
(0 %)
177
(0.32 %)
381
(100.00 %)
1,169,660
(6.57 %)
432,998
(2.45 %)
8,403,791
(39.55 %)
1
(0.00 %)
711,098
(3.13 %)
82,695
(2.80 %)
33,414
(0.92 %)
132 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1
n/a n/a 15,419
(1.50 %)
21,175
(1.51 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 12,043
(100.00 %)
2,952,218
(30.62 %)
538,508
(2.18 %)
9,303,303
(34.20 %)
0
(0 %)
511,888
(2.10 %)
47,810
(2.50 %)
39,732
(1.82 %)
133 European mole (hap2 2024)
GCA_964194205.1
n/a n/a 18,064
(1.69 %)
19,764
(1.59 %)
n/a 42.07
(99.99 %)
1,040
(0.01 %)
1,040
(0.01 %)
1,396
(99.99 %)
2,567,492
(23.34 %)
570,250
(2.16 %)
10,485,959
(33.56 %)
30
(0.00 %)
702,644
(2.60 %)
46,213
(3.27 %)
42,349
(2.41 %)
134 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1
n/a n/a 14,619
(2.94 %)
50,389
(7.92 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
3,222
(100.00 %)
430,112
(3.88 %)
299,581
(6.89 %)
3,182,258
(27.97 %)
0
(0 %)
330,159
(4.99 %)
40,094
(3.66 %)
20,637
(1.37 %)
135 European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017845.1
n/a n/a 14,971
(1.00 %)
20,099
(1.61 %)
n/a 44.79
(99.77 %)
0
(0 %)
130
(0.23 %)
156
(100.00 %)
1,536,611
(12.44 %)
471,903
(2.16 %)
11,129,943
(35.50 %)
1
(0.00 %)
522,759
(2.15 %)
138,047
(2.94 %)
31,391
(0.73 %)
136 European robin (alternate hap 2021)
GCA_903797565.2
n/a n/a 11,359
(1.98 %)
21,437
(2.45 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
0
(0 %)
18
(0.00 %)
3,668
(100.00 %)
346,477
(2.88 %)
283,542
(2.49 %)
5,597,130
(19.71 %)
0
(0 %)
200,268
(1.37 %)
22,977
(2.32 %)
18,454
(1.24 %)
137 European shag (alternate hap 2023)
GCA_949628205.1
n/a n/a 11,681
(1.64 %)
22,195
(2.04 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,752
(100.00 %)
363,092
(4.61 %)
347,630
(2.63 %)
5,664,392
(21.56 %)
0
(0 %)
227,084
(1.83 %)
32,162
(3.60 %)
24,702
(1.39 %)
138 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1
n/a n/a 17,506
(1.26 %)
25,527
(1.52 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,699
(100.00 %)
2,400,784
(15.19 %)
1,062,793
(3.20 %)
13,284,496
(41.93 %)
0
(0 %)
768,770
(2.06 %)
77,009
(2.86 %)
75,481
(2.15 %)
139 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1
n/a n/a 18,364
(1.79 %)
20,379
(1.63 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,256
(100.00 %)
3,049,618
(22.22 %)
852,708
(4.50 %)
10,501,392
(33.34 %)
0
(0 %)
706,136
(2.67 %)
17,629
(0.60 %)
15,048
(0.47 %)
140 European starfish (alternate hap 2019)
GCA_902459445.1
n/a n/a 3,860
(0.82 %)
23,866
(8.36 %)
n/a 38.77
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
3,969
(100.00 %)
123,986
(1.40 %)
146,247
(6.44 %)
2,404,792
(37.16 %)
0
(0 %)
262,804
(5.18 %)
14,304
(1.48 %)
7,081
(0.79 %)
141 European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021)
GCA_901699165.2
n/a n/a 11,276
(1.79 %)
21,210
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,334
(100.00 %)
426,785
(4.89 %)
182,446
(0.97 %)
6,038,491
(20.24 %)
0
(0 %)
110,767
(1.11 %)
29,692
(2.35 %)
26,119
(1.59 %)
142 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1
n/a n/a 18,692
(1.72 %)
22,021
(1.36 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
10,863
(100.00 %)
4,055,957
(36.08 %)
1,513,576
(9.53 %)
11,306,811
(39.67 %)
0
(0 %)
1,995,176
(5.07 %)
20,865
(0.55 %)
15,533
(0.39 %)
143 Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021)
GCA_017639475.1
n/a n/a 11,836
(1.83 %)
21,119
(2.12 %)
n/a 42.78
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
1,147
(100.00 %)
443,887
(6.00 %)
149,233
(0.76 %)
6,328,128
(20.72 %)
0
(0 %)
76,306
(0.71 %)
37,413
(3.59 %)
34,823
(2.10 %)
144 false killer whale (hap2 2024)
GCA_039906525.1
n/a n/a 17,866
(1.45 %)
21,079
(1.46 %)
n/a 42.37
(99.08 %)
0
(0 %)
133
(0.92 %)
416
(100.00 %)
3,852,502
(34.98 %)
1,112,185
(16.42 %)
11,435,533
(44.17 %)
1
(0.00 %)
1,686,603
(5.16 %)
75,215
(4.36 %)
39,963
(0.98 %)
145 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap2.1 2024)
GCA_964270875.1
n/a n/a 13,804
(1.42 %)
19,450
(2.39 %)
n/a 43.73
(99.99 %)
795
(0.01 %)
795
(0.01 %)
937
(99.99 %)
782,998
(3.95 %)
448,089
(3.61 %)
6,735,032
(36.83 %)
3
(0.00 %)
546,833
(3.23 %)
81,312
(2.54 %)
18,612
(0.77 %)
146 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1
n/a n/a 2,936
(0.15 %)
17,722
(1.38 %)
n/a 38.51
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 13,751
(100.00 %)
919,882
(3.50 %)
1,443,294
(10.50 %)
7,705,012
(57.28 %)
0
(0 %)
2,148,861
(9.45 %)
74,669
(1.25 %)
7,295
(0.13 %)
147 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1
n/a n/a 14,224
(0.69 %)
22,406
(1.57 %)
n/a 40.75
(99.89 %)
0
(0 %)
1,383
(0.12 %)
914
(100.00 %)
1,300,452
(3.37 %)
1,495,355
(10.56 %)
13,385,401
(44.67 %)
1
(0.00 %)
2,540,687
(7.06 %)
64,121
(0.88 %)
13,021
(0.20 %)
148 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1
n/a n/a 17,494
(2.06 %)
62,257
(5.73 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,986
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
0
(0 %)
240,032
(2.50 %)
26,445
(1.22 %)
12,638
(0.48 %)
149 Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035715.1
n/a n/a 14,392
(0.90 %)
17,909
(1.50 %)
n/a 42.86
(99.84 %)
213
(0.16 %)
213
(0.16 %)
836
(99.84 %)
1,440,070
(7.19 %)
620,131
(2.54 %)
10,919,950
(45.21 %)
2
(0.00 %)
523,070
(2.35 %)
47,933
(1.03 %)
18,609
(0.43 %)
150 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1
n/a n/a 13,745
(2.58 %)
50,416
(6.72 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
5,171
(100.00 %)
442,646
(4.09 %)
276,927
(5.42 %)
3,741,267
(26.25 %)
0
(0 %)
406,474
(4.11 %)
28,827
(2.28 %)
19,731
(1.36 %)
151 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1
n/a n/a 12,821
(0.47 %)
30,612
(1.44 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,651
(100.00 %)
1,139,595
(1.64 %)
1,170,215
(3.77 %)
17,091,511
(52.44 %)
0
(0 %)
995,544
(2.57 %)
235,170
(4.50 %)
33,394
(0.50 %)
152 garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020)
GCA_014839765.1
n/a n/a 12,359
(1.95 %)
23,228
(2.46 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 775
(100.00 %)
485,213
(6.08 %)
333,505
(2.21 %)
6,358,327
(19.87 %)
0
(0 %)
180,073
(1.19 %)
26,594
(2.34 %)
22,492
(1.32 %)
153 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1
n/a n/a 14,254
(0.94 %)
23,016
(2.00 %)
n/a 45.13
(99.95 %)
0
(0 %)
61
(0.05 %)
298
(100.00 %)
1,230,357
(13.08 %)
350,230
(2.85 %)
11,854,314
(33.03 %)
2
(0.00 %)
335,615
(1.39 %)
39,919
(1.95 %)
26,198
(0.77 %)
154 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1
n/a n/a 12,198
(0.42 %)
23,127
(1.17 %)
n/a 42.85
(98.49 %)
0
(0 %)
1,742
(1.51 %)
1,558
(100.00 %)
7,431,472
(52.41 %)
716,951
(7.28 %)
19,456,793
(50.99 %)
9
(0.01 %)
2,419,836
(4.27 %)
91,414
(1.45 %)
65,413
(0.90 %)
155 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1
n/a n/a 13,090
(2.37 %)
48,927
(6.41 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,758
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
0
(0 %)
201,169
(2.33 %)
38,368
(2.40 %)
20,092
(1.12 %)
156 golden eagle (v1.4 alternate hap 2021)
GCA_902153765.2
n/a n/a 9,172
(1.85 %)
16,917
(2.12 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,855
(100.00 %)
377,153
(8.49 %)
117,959
(0.78 %)
4,418,970
(18.34 %)
0
(0 %)
37,962
(0.63 %)
27,767
(3.57 %)
25,543
(2.23 %)
157 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1
n/a n/a 13,359
(0.95 %)
19,347
(1.51 %)
n/a 44.27
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,736
(100.00 %)
1,404,513
(13.79 %)
334,726
(2.35 %)
9,735,007
(33.33 %)
0
(0 %)
468,758
(1.89 %)
61,680
(2.32 %)
18,869
(0.54 %)
158 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1
n/a n/a 13,758
(1.02 %)
16,909
(1.62 %)
n/a 41.53
(99.01 %)
19
(0.99 %)
19
(0.99 %)
52
(99.01 %)
1,069,189
(6.12 %)
410,262
(1.25 %)
11,390,195
(32.28 %)
0
(0 %)
233,593
(0.96 %)
60,835
(1.92 %)
23,191
(0.77 %)
159 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1
n/a n/a 12,662
(0.70 %)
15,124
(0.89 %)
n/a 37.74
(100.00 %)
24
(0.00 %)
24
(0.00 %)
8,086
(100.00 %)
4,098,004
(25.33 %)
806,470
(2.98 %)
16,244,072
(43.39 %)
0
(0 %)
n/a 24,879
(0.67 %)
15,867
(0.39 %)
160 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1
n/a n/a 17,156
(1.53 %)
18,190
(1.33 %)
n/a 40.25
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
9,510
(100.00 %)
3,455,580
(34.94 %)
530,053
(1.56 %)
10,927,458
(32.64 %)
0
(0 %)
323,766
(1.34 %)
38,976
(1.13 %)
37,317
(1.05 %)
161 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1
n/a n/a 12,760
(1.57 %)
14,423
(1.42 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,537
(100.00 %)
2,725,227
(31.66 %)
616,862
(3.40 %)
8,041,744
(32.68 %)
0
(0 %)
465,446
(1.97 %)
32,293
(2.35 %)
29,871
(1.57 %)
162 great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024)
GCA_038363175.2
n/a n/a 16,978
(1.61 %)
18,544
(1.54 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
0
(0 %)
54
(0.00 %)
312
(100.00 %)
2,601,985
(26.67 %)
331,187
(4.87 %)
10,884,729
(33.93 %)
1
(0.00 %)
458,782
(1.76 %)
63,610
(2.71 %)
49,165
(1.49 %)
163 great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020)
GCA_013368595.1
n/a n/a 11,630
(1.85 %)
20,866
(2.20 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
1,395
(100.00 %)
421,187
(9.08 %)
159,172
(0.96 %)
5,602,689
(22.75 %)
0
(0 %)
169,408
(1.60 %)
29,548
(2.77 %)
25,299
(1.70 %)
164 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1
n/a n/a 20
(0.30 %)
63
(2.06 %)
n/a 45.02
(99.98 %)
0
(0 %)
28
(0.02 %)
39
(100.00 %)
8,165
(60.43 %)
2,740
(27.09 %)
15,863
(31.63 %)
0
(0 %)
16,359
(15.02 %)
167
(5.51 %)
65
(0.61 %)
165 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1
n/a n/a 15,483
(3.45 %)
47,484
(7.95 %)
n/a 44.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,805
(100.00 %)
1,400,150
(23.78 %)
738,163
(17.35 %)
2,460,977
(35.90 %)
0
(0 %)
605,154
(7.13 %)
20,794
(2.09 %)
11,413
(0.80 %)
166 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1
n/a n/a 14,896
(1.85 %)
18,939
(1.59 %)
n/a 40.69
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
13,426
(100.00 %)
2,426,330
(34.43 %)
418,341
(1.36 %)
8,763,234
(27.86 %)
0
(0 %)
108,521
(0.55 %)
24,370
(1.08 %)
22,940
(1.00 %)
167 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1
n/a n/a 10,795
(5.59 %)
33,380
(12.07 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,376
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
0
(0 %)
64,742
(2.40 %)
34,104
(12.82 %)
25,350
(6.24 %)
168 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1
n/a n/a 13,412
(4.76 %)
45,946
(11.50 %)
n/a 44.34
(99.99 %)
0
(0 %)
95
(0.01 %)
251
(100.00 %)
494,547
(20.10 %)
204,804
(10.66 %)
1,444,044
(34.08 %)
0
(0 %)
208,543
(5.33 %)
47,904
(17.47 %)
32,381
(5.25 %)
169 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1
n/a n/a 13,681
(4.93 %)
45,034
(11.64 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,533
(100.00 %)
460,038
(18.47 %)
163,838
(7.90 %)
1,681,190
(29.08 %)
0
(0 %)
141,147
(3.92 %)
47,523
(15.60 %)
33,138
(6.10 %)
170 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1
n/a n/a 13,432
(2.10 %)
50,930
(6.39 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,952
(100.00 %)
2,495,763
(38.80 %)
473,105
(6.27 %)
3,444,123
(38.56 %)
0
(0 %)
474,250
(4.43 %)
35,298
(1.94 %)
13,822
(0.66 %)
171 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2
n/a n/a 13,635
(1.05 %)
19,414
(1.61 %)
n/a 44.16
(99.95 %)
60
(0.05 %)
60
(0.05 %)
6,797
(99.95 %)
3,221,668
(44.97 %)
275,275
(1.28 %)
9,802,895
(32.14 %)
2
(0.00 %)
394,278
(1.72 %)
45,469
(1.48 %)
25,997
(0.89 %)
172 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1
n/a n/a 19,129
(1.37 %)
24,628
(1.24 %)
n/a 41.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 14,442
(100.00 %)
3,892,130
(35.74 %)
874,864
(15.70 %)
11,484,916
(45.69 %)
0
(0 %)
2,048,708
(5.99 %)
73,507
(1.72 %)
41,124
(0.98 %)
173 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1
n/a n/a 16,645
(1.92 %)
62,533
(4.55 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
7,253
(100.00 %)
5,166,731
(67.78 %)
750,850
(11.35 %)
5,903,440
(54.20 %)
0
(0 %)
1,408,406
(7.28 %)
90,235
(5.58 %)
15,520
(0.51 %)
174 gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020)
GCA_015220155.1
n/a n/a 6,534
(1.74 %)
12,152
(1.97 %)
n/a 42.70
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,370
(100.00 %)
179,674
(3.19 %)
76,165
(0.79 %)
2,908,228
(16.85 %)
0
(0 %)
20,525
(0.41 %)
11,838
(2.15 %)
9,707
(1.04 %)
175 Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022)
GCA_026419925.1
n/a n/a 11,838
(1.64 %)
24,014
(2.16 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,969
(100.00 %)
405,109
(3.51 %)
220,222
(6.17 %)
4,708,177
(25.30 %)
0
(0 %)
436,752
(2.86 %)
58,446
(5.44 %)
28,571
(1.65 %)
176 Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021)
GCA_020740675.1
n/a n/a 7,477
(1.92 %)
14,094
(2.40 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,762
(100.00 %)
296,732
(12.20 %)
135,408
(4.08 %)
3,123,655
(20.92 %)
0
(0 %)
142,659
(1.84 %)
23,288
(3.74 %)
13,506
(1.30 %)
177 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1
n/a n/a 11,130
(1.23 %)
22,071
(1.36 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 31,856
(100.00 %)
2,958,239
(41.25 %)
788,242
(4.52 %)
6,056,268
(41.88 %)
0
(0 %)
532,149
(2.74 %)
36,143
(1.96 %)
23,949
(1.02 %)
178 hemichordates Saccoglossus (HW-2024a hap2 2024)
GCA_040954595.1
n/a n/a 4,919
(1.33 %)
34,873
(16.02 %)
n/a 39.72
(99.96 %)
0
(0 %)
254
(0.04 %)
56
(100.00 %)
84,495
(1.58 %)
118,073
(13.23 %)
1,301,514
(28.77 %)
3
(0.00 %)
317,532
(8.60 %)
20,511
(4.03 %)
15,567
(2.64 %)
179 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1
n/a n/a 20,391
(1.63 %)
20,668
(1.37 %)
n/a 41.62
(100.00 %)
0
(0 %)
83
(0.00 %)
545
(100.00 %)
3,778,764
(35.17 %)
563,345
(3.63 %)
13,524,869
(35.56 %)
0
(0 %)
369,754
(1.46 %)
48,164
(1.90 %)
44,065
(1.33 %)
180 hoatzin (hap2 2023)
GCA_030867165.1
n/a n/a 12,349
(1.54 %)
27,206
(2.21 %)
n/a 45.91
(100.00 %)
212
(0.00 %)
212
(0.00 %)
535
(100.00 %)
529,757
(21.69 %)
235,999
(14.32 %)
4,845,810
(31.86 %)
0
(0 %)
1,017,817
(5.90 %)
53,781
(5.77 %)
44,601
(2.35 %)
181 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1
n/a n/a 15,058
(2.50 %)
46,340
(5.85 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
2,131
(100.00 %)
1,642,351
(37.42 %)
389,169
(5.43 %)
4,687,710
(35.55 %)
0
(0 %)
541,909
(4.77 %)
34,408
(1.75 %)
16,136
(0.80 %)
182 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1
n/a n/a 15,006
(0.28 %)
22,481
(0.80 %)
n/a 45.05
(99.53 %)
225
(0.03 %)
2,781
(0.47 %)
2,532
(99.97 %)
1,344,546
(5.76 %)
2,364,825
(28.34 %)
5,088
(99.53 %)
5
(0.00 %)
14,350,128
(14.12 %)
89,340
(2.10 %)
82,092
(1.20 %)
183 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1
n/a n/a 16,789
(1.65 %)
18,017
(1.36 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
210
(0.00 %)
821
(100.00 %)
3,146,381
(34.68 %)
430,664
(5.91 %)
13,246,059
(32.62 %)
0
(0 %)
714,785
(2.15 %)
37,293
(2.80 %)
35,249
(2.66 %)
184 hourglass treefrog (maternal 2023 genbank)
GCA_027789725.1
n/a n/a 14,359
(0.89 %)
32,575
(2.67 %)
n/a 43.88
(95.18 %)
788
(4.82 %)
788
(4.82 %)
3,358
(95.18 %)
922,807
(2.38 %)
1,744,603
(15.45 %)
10,318,168
(48.47 %)
0
(0 %)
3,525,571
(8.67 %)
244,270
(5.02 %)
29,547
(0.61 %)
185 house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022)
GCA_027406555.1
n/a n/a 12,027
(1.89 %)
23,973
(2.49 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
385,230
(3.05 %)
398,497
(5.70 %)
5,772,203
(22.69 %)
0
(0 %)
478,308
(3.12 %)
28,740
(2.98 %)
21,451
(1.28 %)
186 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1
n/a n/a 661
(0.88 %)
720
(0.54 %)
n/a 38.59
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,806
(100.00 %)
97,279
(72.21 %)
40,071
(55.89 %)
208,928
(64.94 %)
0
(0 %)
239,612
(15.41 %)
506
(0.31 %)
327
(0.20 %)
187 house sparrow (hap2 2024)
GCA_036417895.1
n/a n/a 12,201
(1.59 %)
24,721
(2.19 %)
n/a 44.46
(100.00 %)
0
(0 %)
182
(0.00 %)
482
(100.00 %)
629,688
(12.73 %)
644,409
(14.12 %)
5,103,050
(31.93 %)
0
(0 %)
899,607
(5.60 %)
33,424
(2.42 %)
23,096
(1.05 %)
188 human (mHomSap3 WGS:JACSEX01 2021)
GCA_016695395.2
n/a n/a 20,401
(1.92 %)
20,682
(1.21 %)
n/a 40.87
(99.64 %)
0
(0 %)
1,217
(0.36 %)
950
(100.00 %)
5,350,025
(52.32 %)
1,006,502
(4.68 %)
15,969,368
(38.50 %)
5
(0.00 %)
1,469,922
(2.89 %)
50,826
(1.08 %)
27,969
(0.75 %)
189 human (WGS:JACSEW01 2021 alternate hap)
GCA_016700455.2
n/a n/a 19,667
(1.95 %)
20,065
(1.23 %)
n/a 40.96
(99.60 %)
0
(0 %)
1,172
(0.40 %)
994
(100.00 %)
5,086,372
(51.37 %)
932,450
(3.67 %)
15,152,141
(37.48 %)
3
(0.00 %)
1,198,599
(2.54 %)
49,325
(1.10 %)
27,202
(0.77 %)
190 Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022)
GCA_027474345.1
n/a n/a 11,806
(1.66 %)
21,429
(1.97 %)
n/a 43.73
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,343
(100.00 %)
508,803
(10.25 %)
162,918
(5.44 %)
6,029,969
(24.67 %)
0
(0 %)
224,585
(1.75 %)
27,953
(3.83 %)
24,431
(1.47 %)
191 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2
n/a n/a 19,096
(1.59 %)
20,674
(1.34 %)
n/a 41.99
(99.75 %)
0
(0 %)
277
(0.25 %)
1,435
(100.00 %)
5,290,422
(47.51 %)
478,946
(1.94 %)
12,568,313
(41.15 %)
0
(0 %)
1,196,258
(3.44 %)
45,850
(1.37 %)
36,573
(1.00 %)
192 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1
n/a n/a 14,412
(3.70 %)
41,944
(8.58 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
0
(0 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,774
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
0
(0 %)
195,444
(3.94 %)
15,419
(1.38 %)
8,375
(0.73 %)
193 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1
n/a n/a 17,858
(2.43 %)
32,738
(5.46 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
4,333
(100.00 %)
583,632
(3.71 %)
418,411
(3.74 %)
5,198,155
(21.50 %)
1
(0.00 %)
276,314
(1.94 %)
76,879
(3.71 %)
57,281
(2.37 %)
194 Italian wall lizard (rPodSic1.hap2.1 2024)
GCA_964188395.1
n/a n/a 13,696
(1.37 %)
19,278
(2.32 %)
n/a 44.15
(99.99 %)
690
(0.01 %)
690
(0.01 %)
842
(99.99 %)
763,893
(4.21 %)
451,861
(6.69 %)
6,696,380
(38.71 %)
4
(0.00 %)
740,272
(4.24 %)
98,815
(3.65 %)
19,565
(0.77 %)
195 Japanese sawshark (hap2 2024)
GCA_044704965.1
n/a n/a 14,833
(0.26 %)
30,853
(0.75 %)
n/a 47.12
(99.98 %)
0
(0 %)
5,953
(0.02 %)
5,626
(100.00 %)
1,238,549
(4.06 %)
2,718,867
(21.85 %)
11,579
(99.98 %)
42
(0.00 %)
7,882,680
(7.20 %)
518,286
(6.88 %)
502,936
(6.32 %)
196 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1
n/a n/a 15,945
(2.17 %)
101,825
(8.93 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
0
(0 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,228
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
0
(0 %)
541,432
(4.29 %)
138,484
(9.55 %)
86,420
(4.60 %)
197 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1
n/a n/a 14,960
(2.23 %)
74,436
(6.65 %)
n/a 43.94
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,370
(100.00 %)
1,620,688
(23.00 %)
902,057
(13.66 %)
4,547,953
(39.90 %)
0
(0 %)
892,097
(6.41 %)
129,990
(12.07 %)
77,992
(4.35 %)
198 kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023)
GCA_027595965.1
n/a n/a 8,732
(1.74 %)
16,473
(2.17 %)
n/a 45.10
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,819
(100.00 %)
314,902
(10.49 %)
133,061
(10.84 %)
3,656,435
(25.68 %)
0
(0 %)
519,192
(4.55 %)
32,592
(5.25 %)
26,472
(3.09 %)
199 kakapo (Jane alternate hap 2019)
GCA_004011185.1
n/a n/a 3,256
(1.65 %)
6,220
(1.98 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
3,728
(100.00 %)
127,817
(7.83 %)
53,447
(1.21 %)
1,502,789
(18.09 %)
0
(0 %)
44,014
(1.40 %)
5,487
(1.71 %)
4,787
(1.19 %)
200 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1
n/a n/a 14,982
(1.50 %)
19,185
(1.30 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 12,410
(100.00 %)
2,752,892
(35.61 %)
589,217
(10.15 %)
8,371,032
(41.11 %)
0
(0 %)
1,464,220
(5.92 %)
57,347
(3.41 %)
30,003
(1.05 %)
201 king vulture (hap2 2024)
GCA_037950955.1
n/a n/a 12,764
(1.49 %)
23,033
(1.77 %)
n/a 44.67
(100.00 %)
0
(0 %)
128
(0.00 %)
140
(100.00 %)
432,536
(3.01 %)
230,315
(20.91 %)
4,960,923
(35.56 %)
0
(0 %)
872,545
(4.75 %)
86,907
(3.76 %)
31,074
(1.47 %)
202 Korean giant-fin mudskipper (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1
n/a n/a 13,470
(2.34 %)
42,799
(5.73 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,414
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
0
(0 %)
475,330
(4.51 %)
34,522
(2.54 %)
17,280
(0.96 %)
203 lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023)
GCA_028017155.1
n/a n/a 10,584
(1.75 %)
19,112
(2.09 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,892
(100.00 %)
363,564
(3.53 %)
235,220
(7.22 %)
5,072,834
(23.83 %)
0
(0 %)
224,788
(1.89 %)
24,909
(2.64 %)
22,061
(1.41 %)
204 lance-tailed manakin (alternate hap 2020)
GCA_009829205.1
n/a n/a 12,282
(1.85 %)
23,867
(2.36 %)
n/a 42.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,269
(100.00 %)
472,384
(7.01 %)
237,680
(1.65 %)
6,121,661
(19.48 %)
0
(0 %)
146,408
(1.08 %)
25,589
(2.05 %)
21,299
(1.17 %)
205 lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022)
GCA_023634305.1
n/a n/a 12,458
(1.70 %)
22,259
(2.05 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,090
(100.00 %)
413,301
(3.46 %)
189,449
(5.28 %)
5,962,597
(22.07 %)
0
(0 %)
384,018
(2.74 %)
31,611
(2.72 %)
19,364
(0.92 %)
206 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1
n/a n/a 15,841
(2.36 %)
79,276
(8.51 %)
n/a 46.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,761
(100.00 %)
2,935,570
(42.17 %)
1,208,602
(21.28 %)
3,157,730
(42.63 %)
0
(0 %)
1,448,522
(11.27 %)
88,759
(6.30 %)
47,311
(2.77 %)
207 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1
n/a n/a 8,132
(2.11 %)
25,878
(4.67 %)
n/a 38.55
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,088
(100.00 %)
260,789
(2.73 %)
158,564
(2.12 %)
3,023,128
(27.39 %)
0
(0 %)
71,421
(1.44 %)
9,678
(1.02 %)
7,876
(0.74 %)
208 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1
n/a n/a 13,155
(1.15 %)
22,239
(2.06 %)
n/a 41.01
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
6,800
(100.00 %)
1,155,093
(7.75 %)
707,777
(4.25 %)
7,071,611
(44.00 %)
0
(0 %)
701,636
(4.02 %)
104,556
(4.39 %)
22,349
(0.88 %)
209 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2
n/a n/a 11,035
(1.05 %)
16,064
(1.50 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
7
(0.00 %)
7
(0.00 %)
9,006
(100.00 %)
2,685,200
(47.08 %)
208,060
(1.19 %)
7,184,246
(33.31 %)
0
(0 %)
442,748
(2.46 %)
25,133
(1.42 %)
15,054
(0.75 %)
210 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1
n/a n/a 17,777
(1.27 %)
19,232
(1.28 %)
n/a 42.13
(92.75 %)
0
(0 %)
2,875
(7.25 %)
508
(100.00 %)
6,476,967
(33.93 %)
999,133
(2.78 %)
11,809,834
(40.52 %)
1
(0.00 %)
1,062,479
(2.36 %)
29,872
(0.82 %)
21,704
(0.51 %)
211 lesser horseshoe bat (hap2 2024)
GCA_964194215.1
n/a n/a 18,875
(1.72 %)
21,166
(1.58 %)
n/a 41.18
(99.99 %)
1,648
(0.01 %)
1,648
(0.01 %)
2,727
(99.99 %)
3,160,659
(34.00 %)
696,130
(6.23 %)
11,662,645
(34.26 %)
8
(0.00 %)
1,288,588
(3.71 %)
36,176
(1.80 %)
28,160
(0.89 %)
212 lesser kestrel (alternate hap 2021)
GCA_017639645.1
n/a n/a 12,578
(1.83 %)
22,257
(2.16 %)
n/a 42.51
(98.97 %)
0
(0 %)
258
(1.03 %)
551
(100.00 %)
431,717
(3.61 %)
201,876
(1.38 %)
6,620,060
(19.16 %)
0
(0 %)
121,154
(0.99 %)
27,552
(2.26 %)
21,049
(1.02 %)
213 lesser noctule (mNycLei1.hap2.1 2024)
GCA_964264895.1
n/a n/a 17,557
(1.64 %)
22,484
(1.74 %)
n/a 43.06
(99.98 %)
1,563
(0.02 %)
1,563
(0.02 %)
2,898
(99.98 %)
2,999,553
(21.19 %)
1,122,371
(10.04 %)
9,331,392
(40.02 %)
7
(0.00 %)
1,542,388
(4.66 %)
61,834
(2.95 %)
59,536
(1.92 %)
214 lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023)
GCA_028389885.1
n/a n/a 10,465
(1.71 %)
19,083
(2.16 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 910
(100.00 %)
520,125
(6.78 %)
251,547
(4.21 %)
5,321,207
(21.53 %)
0
(0 %)
171,609
(1.68 %)
34,698
(5.69 %)
30,309
(2.73 %)
215 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1
n/a n/a 15,487
(0.88 %)
85,135
(3.39 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
6,593
(100.00 %)
5,572,163
(49.59 %)
1,052,072
(6.02 %)
7,246,646
(62.69 %)
0
(0 %)
2,503,507
(8.71 %)
157,768
(4.38 %)
14,966
(0.28 %)
216 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1
n/a n/a 13,792
(2.19 %)
51,353
(6.60 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,620
(100.00 %)
2,536,362
(38.05 %)
513,115
(7.50 %)
3,542,854
(37.60 %)
0
(0 %)
576,452
(5.21 %)
31,814
(1.79 %)
14,668
(0.71 %)
217 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1
n/a n/a 15,033
(2.98 %)
51,296
(7.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
2,700
(100.00 %)
1,099,919
(28.68 %)
314,919
(9.57 %)
2,620,601
(30.23 %)
0
(0 %)
539,835
(6.99 %)
49,248
(4.19 %)
27,196
(1.69 %)
218 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1
n/a n/a 14,632
(3.51 %)
40,441
(7.51 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
0
(0 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,742
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
0
(0 %)
96,734
(1.60 %)
16,302
(1.34 %)
11,802
(0.89 %)
219 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap2.1 2024)
GCA_964188325.1
n/a n/a 13,653
(1.34 %)
19,764
(2.32 %)
n/a 44.23
(99.99 %)
817
(0.01 %)
817
(0.01 %)
1,444
(99.99 %)
857,503
(4.68 %)
507,819
(4.16 %)
6,632,822
(39.41 %)
4
(0.00 %)
653,978
(4.13 %)
103,858
(4.10 %)
19,626
(0.75 %)
220 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap2.1 2024)
GCA_964251985.1
n/a n/a 13,817
(1.35 %)
21,024
(2.50 %)
n/a 43.77
(99.99 %)
811
(0.01 %)
811
(0.01 %)
1,458
(99.99 %)
890,080
(4.42 %)
526,749
(3.38 %)
7,001,691
(37.94 %)
9
(0.00 %)
538,033
(3.26 %)
89,526
(2.96 %)
20,250
(0.75 %)
221 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap2.1 2024)
GCA_964234825.1
n/a n/a 13,759
(1.39 %)
19,452
(2.34 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
754
(0.01 %)
754
(0.01 %)
954
(99.99 %)
768,595
(5.31 %)
448,816
(5.54 %)
6,722,284
(37.88 %)
3
(0.00 %)
638,565
(3.67 %)
82,575
(2.83 %)
19,444
(0.76 %)
222 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap2.2 2024)
GCA_964106635.2
n/a n/a 13,828
(1.41 %)
19,048
(2.34 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
1,365
(0.02 %)
1,365
(0.02 %)
1,548
(99.98 %)
803,451
(4.16 %)
440,340
(2.30 %)
6,774,254
(37.14 %)
34
(0.00 %)
471,503
(3.14 %)
89,229
(3.04 %)
18,652
(0.77 %)
223 long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022)
GCA_023637925.1
n/a n/a 12,264
(2.01 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 40.99
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 230
(100.00 %)
498,393
(5.07 %)
266,700
(1.49 %)
6,131,743
(20.45 %)
0
(0 %)
94,007
(0.79 %)
15,809
(1.43 %)
13,620
(0.94 %)
224 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1
n/a n/a 15,137
(3.09 %)
52,499
(7.75 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,778
(100.00 %)
448,166
(4.67 %)
416,181
(8.95 %)
3,288,388
(27.99 %)
0
(0 %)
521,897
(4.93 %)
55,747
(4.41 %)
34,235
(2.29 %)
225 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1
n/a n/a 12,848
(3.32 %)
43,711
(8.09 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,698
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
0
(0 %)
569,405
(6.42 %)
45,916
(5.21 %)
28,531
(2.48 %)
226 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1
n/a n/a 14,944
(3.23 %)
50,328
(8.09 %)
n/a 42.82
(99.97 %)
0
(0 %)
954
(0.03 %)
232
(100.00 %)
1,034,598
(25.93 %)
434,819
(13.21 %)
2,907,371
(30.18 %)
3
(0.00 %)
701,025
(6.86 %)
55,066
(5.20 %)
33,554
(2.42 %)
227 Macqueen's bustard (paternal 2024)
GCA_036418225.1
n/a n/a 11,814
(1.80 %)
23,161
(2.38 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
343
(100.00 %)
586,864
(13.28 %)
184,036
(5.91 %)
5,606,205
(25.25 %)
0
(0 %)
453,525
(2.87 %)
42,560
(7.71 %)
29,282
(2.77 %)
228 maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021)
GCA_017639665.1
n/a n/a 10,658
(1.74 %)
18,941
(1.98 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
4,278
(100.00 %)
326,479
(4.02 %)
141,715
(0.74 %)
5,600,372
(19.59 %)
0
(0 %)
41,184
(0.48 %)
27,330
(3.35 %)
26,330
(2.05 %)
229 mallard (hap2 2024)
GCA_964188335.1
n/a n/a 12,715
(1.89 %)
24,338
(2.42 %)
n/a 42.70
(99.99 %)
485
(0.01 %)
485
(0.01 %)
972
(99.99 %)
795,168
(13.44 %)
445,147
(7.71 %)
5,728,430
(26.21 %)
53
(0.00 %)
572,559
(4.02 %)
35,679
(3.13 %)
26,930
(1.43 %)
230 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1
n/a n/a 14,564
(1.72 %)
71,604
(6.41 %)
n/a 41.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,737
(100.00 %)
1,662,251
(42.29 %)
439,119
(12.96 %)
3,776,125
(45.00 %)
0
(0 %)
888,556
(6.68 %)
56,507
(2.83 %)
15,006
(0.71 %)
231 Mauritius kestrel (alternate hap 2023)
GCA_963210275.1
n/a n/a 4,774
(1.89 %)
8,695
(2.32 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,259
(100.00 %)
135,092
(3.67 %)
112,042
(8.63 %)
1,739,144
(22.50 %)
0
(0 %)
103,391
(2.09 %)
12,908
(3.26 %)
7,476
(1.06 %)
232 Mauritius parakeet (alternate hap 2023)
GCA_963243765.1
n/a n/a 8,873
(1.81 %)
16,175
(2.24 %)
n/a 42.92
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,130
(100.00 %)
331,293
(6.89 %)
161,393
(5.94 %)
3,516,196
(24.86 %)
0
(0 %)
323,514
(3.25 %)
16,659
(1.74 %)
13,876
(1.32 %)
233 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1
n/a n/a 10,549
(1.13 %)
20,171
(2.08 %)
n/a 41.02
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
9,587
(100.00 %)
889,533
(7.84 %)
565,831
(6.37 %)
5,968,624
(41.74 %)
0
(0 %)
615,578
(4.07 %)
73,632
(3.80 %)
21,339
(1.17 %)
234 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1
n/a n/a 19,001
(1.82 %)
20,271
(1.68 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
143
(100.00 %)
3,141,368
(21.37 %)
898,900
(4.24 %)
11,475,531
(32.14 %)
0
(0 %)
862,918
(2.64 %)
22,186
(0.75 %)
16,985
(0.48 %)
235 Merriam's long-tongued bat (hap2 2024)
GCA_039656995.1
n/a n/a 18,105
(1.68 %)
20,751
(1.60 %)
n/a 42.18
(100.00 %)
0
(0 %)
45
(0.00 %)
71
(100.00 %)
2,994,788
(29.48 %)
415,375
(1.07 %)
11,752,432
(32.88 %)
3
(0.00 %)
316,278
(1.25 %)
65,597
(4.38 %)
57,841
(3.85 %)
236 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1
n/a n/a 13,824
(0.44 %)
23,296
(1.27 %)
n/a 41.86
(99.99 %)
0
(0 %)
2,009
(0.01 %)
656
(100.00 %)
1,860,053
(2.17 %)
2,751,941
(10.76 %)
24,252,866
(53.00 %)
11
(0.00 %)
4,329,852
(7.13 %)
157,012
(1.21 %)
15,742
(0.15 %)
237 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1
n/a n/a 15,425
(0.94 %)
20,005
(1.48 %)
n/a 44.46
(95.51 %)
1,790
(4.49 %)
1,790
(4.49 %)
4,782
(95.51 %)
1,404,726
(11.28 %)
453,302
(2.47 %)
11,996,092
(34.08 %)
3
(0.00 %)
712,154
(2.19 %)
77,167
(2.14 %)
23,282
(0.51 %)
238 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1
n/a n/a 16,565
(3.38 %)
42,094
(6.75 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,392
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
0
(0 %)
595,219
(5.37 %)
21,531
(1.27 %)
13,616
(0.75 %)
239 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1
n/a n/a 20,412
(1.46 %)
27,421
(1.34 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
21,272
(100.00 %)
3,811,435
(36.24 %)
959,712
(10.27 %)
12,159,896
(41.30 %)
0
(0 %)
1,298,777
(4.12 %)
69,852
(1.62 %)
42,454
(1.09 %)
240 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1
n/a n/a 16,419
(0.77 %)
17,219
(0.89 %)
n/a 39.03
(100.00 %)
33
(0.00 %)
33
(0.00 %)
9,959
(100.00 %)
6,332,360
(29.69 %)
1,065,454
(2.09 %)
17,908,986
(42.25 %)
0
(0 %)
1,232,672
(2.38 %)
13,856
(0.35 %)
11,596
(0.23 %)
241 mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021)
GCA_009769485.2
n/a n/a 10,145
(1.98 %)
18,617
(2.30 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
14
(0.00 %)
14
(0.00 %)
5,640
(100.00 %)
533,330
(9.11 %)
213,518
(1.29 %)
4,813,886
(20.16 %)
0
(0 %)
52,896
(0.73 %)
25,667
(3.86 %)
24,229
(2.21 %)
242 Natterer's bat (mMyoNat1.hap2.1 2024)
GCA_964212025.1
n/a n/a 18,275
(1.81 %)
21,799
(1.80 %)
n/a 43.28
(99.99 %)
1,387
(0.01 %)
1,387
(0.01 %)
1,706
(99.99 %)
2,833,193
(23.73 %)
705,278
(5.10 %)
9,802,564
(36.67 %)
5
(0.00 %)
596,875
(2.28 %)
61,024
(2.68 %)
55,279
(1.95 %)
243 Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023)
GCA_027579665.1
n/a n/a 11,687
(1.78 %)
24,169
(2.43 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,834
(100.00 %)
414,780
(3.26 %)
491,012
(10.03 %)
5,570,475
(26.24 %)
0
(0 %)
495,689
(3.67 %)
29,485
(4.55 %)
21,361
(1.22 %)
244 New Caledonian crow (alternate hap 2019)
GCA_009651025.1
n/a n/a 11,097
(1.99 %)
20,436
(2.45 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 894
(100.00 %)
377,050
(6.03 %)
178,064
(1.53 %)
5,305,126
(19.49 %)
0
(0 %)
132,677
(1.13 %)
26,107
(2.52 %)
20,600
(1.37 %)
245 New Zealand spotty (alternate hap 2019 genbank)
GCA_009762545.1
n/a n/a 13,566
(2.17 %)
40,774
(5.21 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,659
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
0
(0 %)
456,905
(3.99 %)
16,368
(0.83 %)
7,034
(0.33 %)
246 Nicobar pigeon (hap2 2024)
GCA_036010745.1
n/a n/a 13,270
(1.84 %)
24,753
(2.28 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
118
(0.00 %)
226
(100.00 %)
675,092
(12.72 %)
313,111
(3.64 %)
6,547,843
(23.22 %)
1
(0.00 %)
382,235
(2.71 %)
37,728
(3.88 %)
31,602
(1.56 %)
247 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023)
GCA_030445055.1
n/a n/a 19,429
(1.06 %)
22,396
(1.07 %)
n/a 40.96
(99.27 %)
0
(0 %)
845
(0.73 %)
594
(100.00 %)
4,369,568
(32.83 %)
673,707
(1.55 %)
18,586,102
(42.41 %)
5
(0.00 %)
558,255
(1.38 %)
131,852
(2.78 %)
71,325
(1.75 %)
248 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023)
GCA_030445055.2
n/a n/a 19,350
(1.07 %)
22,207
(1.07 %)
n/a 40.97
(99.27 %)
0
(0 %)
823
(0.73 %)
588
(100.00 %)
4,330,716
(32.85 %)
661,966
(1.52 %)
18,302,021
(42.22 %)
5
(0.00 %)
542,125
(1.36 %)
130,245
(2.79 %)
70,861
(1.76 %)
249 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1
n/a n/a 13,050
(3.93 %)
44,650
(10.12 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,934
(100.00 %)
512,583
(14.83 %)
156,305
(8.46 %)
2,005,803
(27.09 %)
0
(0 %)
153,928
(3.57 %)
59,674
(9.19 %)
38,546
(4.50 %)
250 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1
n/a n/a 15,210
(1.55 %)
18,316
(1.43 %)
n/a 41.06
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,051
(100.00 %)
3,911,633
(40.55 %)
565,546
(1.54 %)
10,853,726
(32.61 %)
0
(0 %)
378,575
(1.36 %)
40,925
(1.35 %)
26,837
(0.96 %)
251 North Atlantic right whale (hap1 2023)
GCA_028571275.1
n/a n/a 18,699
(1.61 %)
20,354
(1.28 %)
n/a 41.64
(99.84 %)
0
(0 %)
385
(0.16 %)
947
(100.00 %)
3,815,900
(43.46 %)
718,935
(11.38 %)
11,928,210
(42.25 %)
2
(0.00 %)
1,117,252
(3.44 %)
85,881
(1.90 %)
41,289
(1.19 %)
252 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1
n/a n/a 19,541
(1.47 %)
21,516
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
363
(0.17 %)
779
(100.00 %)
1,361,117
(2.23 %)
836,632
(13.12 %)
12,597,969
(44.00 %)
11
(0.00 %)
1,395,565
(3.89 %)
93,862
(1.92 %)
40,806
(0.95 %)
253 North Island brown kiwi (hap2 2024)
GCA_036417975.1
n/a n/a 13,664
(1.44 %)
37,696
(2.80 %)
n/a 44.42
(100.00 %)
0
(0 %)
155
(0.00 %)
349
(100.00 %)
760,455
(8.84 %)
626,528
(6.85 %)
5,029,822
(30.45 %)
1
(0.00 %)
604,936
(3.67 %)
54,278
(9.43 %)
41,382
(3.03 %)
254 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1
n/a n/a 18,343
(1.80 %)
23,253
(1.77 %)
n/a 43.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
4,899
(100.00 %)
1,174,241
(2.96 %)
825,170
(5.11 %)
9,889,579
(36.12 %)
0
(0 %)
598,356
(2.10 %)
76,164
(3.52 %)
59,778
(2.27 %)
255 northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024)
GCA_039880925.1
n/a n/a 18,305
(1.49 %)
22,534
(1.56 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
282
(100.00 %)
3,783,543
(30.10 %)
656,592
(4.68 %)
11,353,707
(40.26 %)
0
(0 %)
877,118
(2.58 %)
92,041
(3.01 %)
72,323
(1.87 %)
256 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1
n/a n/a 19,537
(1.44 %)
27,826
(1.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 23,401
(100.00 %)
3,634,923
(35.56 %)
672,860
(11.00 %)
11,175,398
(41.72 %)
0
(0 %)
1,941,411
(5.36 %)
62,007
(1.94 %)
36,247
(0.95 %)
257 northern gannet (hap1 2023)
GCA_031468805.1
n/a n/a 13,367
(1.65 %)
24,403
(2.00 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
263
(0.00 %)
829
(100.00 %)
498,574
(4.51 %)
273,984
(5.20 %)
5,544,122
(27.29 %)
25
(0.00 %)
496,388
(3.06 %)
34,879
(3.83 %)
24,416
(1.00 %)
258 northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022)
GCA_929447715.1
n/a n/a 12,115
(1.73 %)
22,764
(2.15 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
4,484
(100.00 %)
417,395
(3.68 %)
231,908
(7.24 %)
5,424,533
(24.05 %)
0
(0 %)
253,718
(2.12 %)
35,691
(4.26 %)
29,357
(1.67 %)
259 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1
n/a n/a 11,782
(2.41 %)
40,748
(5.68 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
0
(0 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,818
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
0
(0 %)
427,649
(4.54 %)
29,687
(2.57 %)
15,714
(1.07 %)
260 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1
n/a n/a 3,096
(1.64 %)
2,450
(1.02 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
3,156
(100.00 %)
517,347
(50.76 %)
157,701
(3.90 %)
1,502,752
(34.14 %)
0
(0 %)
157,923
(4.57 %)
1,806
(0.40 %)
1,380
(0.31 %)
261 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1
n/a n/a 13,421
(1.31 %)
17,659
(2.08 %)
n/a 40.15
(99.66 %)
93
(0.34 %)
93
(0.34 %)
158
(99.66 %)
733,358
(2.95 %)
403,552
(3.04 %)
7,746,871
(29.97 %)
0
(0 %)
294,855
(1.92 %)
34,363
(2.08 %)
21,752
(1.10 %)
262 orange-tipped seq squirt (alternate hap 2023)
GCA_963082865.1
n/a n/a 167
(2.38 %)
431
(15.83 %)
n/a 36.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 70
(100.00 %)
885
(7.97 %)
855
(38.55 %)
9,941
(42.25 %)
0
(0 %)
7,944
(22.20 %)
24
(10.92 %)
127
(13.03 %)
263 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1
n/a n/a 14,018
(1.51 %)
45,251
(3.61 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,393
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
1
(0.00 %)
888,596
(5.23 %)
22,522
(0.77 %)
12,193
(0.40 %)
264 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1
n/a n/a 7,223
(0.52 %)
11,927
(1.11 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
76
(0.00 %)
76
(0.00 %)
4,081
(100.00 %)
988,792
(3.99 %)
1,766,202
(10.24 %)
9,974,001
(52.99 %)
0
(0 %)
1,733,898
(6.80 %)
64,462
(1.33 %)
4,213
(0.08 %)
265 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2
n/a n/a 18,116
(1.63 %)
23,608
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
38
(0.00 %)
10,895
(100.00 %)
3,002,448
(29.46 %)
375,226
(0.79 %)
11,824,034
(29.65 %)
0
(0 %)
140,328
(0.57 %)
67,718
(4.23 %)
70,109
(3.93 %)
266 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1
n/a n/a 13,365
(1.26 %)
17,388
(1.98 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
99
(0.00 %)
99
(0.00 %)
279
(100.00 %)
726,428
(2.81 %)
331,756
(2.05 %)
7,184,711
(33.57 %)
2
(0.00 %)
316,815
(2.51 %)
51,973
(2.70 %)
19,565
(0.92 %)
267 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1
n/a n/a 15,421
(1.80 %)
62,324
(6.15 %)
n/a 42.79
(99.90 %)
4,955
(0.10 %)
4,955
(0.10 %)
4,978
(99.90 %)
4,032,523
(34.18 %)
982,411
(16.51 %)
5,189,655
(46.47 %)
55
(0.01 %)
1,303,532
(10.00 %)
64,543
(3.14 %)
28,282
(1.35 %)
268 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1
n/a n/a 16,729
(3.56 %)
56,451
(8.61 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
11
(0.00 %)
11
(0.00 %)
5,701
(100.00 %)
1,153,359
(18.94 %)
829,887
(14.54 %)
2,793,018
(28.79 %)
0
(0 %)
721,904
(6.97 %)
49,469
(4.32 %)
33,228
(2.53 %)
269 peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022)
GCA_023634185.1
n/a n/a 12,529
(1.75 %)
24,654
(2.25 %)
n/a 42.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,745
(100.00 %)
517,204
(7.95 %)
218,606
(4.15 %)
6,216,533
(21.16 %)
0
(0 %)
237,835
(2.15 %)
26,313
(2.41 %)
19,163
(0.91 %)
270 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501915.1
n/a n/a 21,977
(1.55 %)
31,925
(2.52 %)
n/a 39.40
(99.99 %)
0
(0 %)
1,072
(0.01 %)
1,183
(100.00 %)
825,817
(1.86 %)
1,047,172
(7.89 %)
12,996,911
(44.48 %)
3
(0.00 %)
1,701,385
(5.28 %)
99,118
(1.26 %)
15,547
(0.21 %)
271 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1
n/a n/a 18,794
(1.72 %)
21,421
(1.40 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,750
(100.00 %)
4,001,442
(39.37 %)
547,894
(2.75 %)
13,870,563
(34.33 %)
0
(0 %)
585,313
(2.32 %)
40,162
(1.31 %)
39,090
(1.18 %)
272 pig-tailed macaque (mMacNem1hap2 2024)
GCA_043161795.1
n/a n/a 19,859
(1.78 %)
20,597
(1.19 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
0
(0 %)
232
(0.00 %)
233
(100.00 %)
5,125,011
(53.00 %)
956,928
(9.12 %)
14,621,759
(41.68 %)
3
(0.00 %)
2,124,372
(4.63 %)
96,199
(1.55 %)
29,958
(0.79 %)
273 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1
n/a n/a 15,563
(2.38 %)
54,264
(6.19 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,418
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
0
(0 %)
338,770
(2.89 %)
40,331
(2.02 %)
21,223
(0.93 %)
274 pink pigeon (alternate hap 2023)
GCA_963082445.1
n/a n/a 10,425
(1.96 %)
20,219
(2.49 %)
n/a 42.52
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,277
(100.00 %)
344,711
(4.99 %)
225,902
(3.41 %)
4,563,425
(21.61 %)
0
(0 %)
303,874
(2.37 %)
28,391
(3.74 %)
24,938
(2.03 %)
275 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2
n/a n/a 10,906
(1.98 %)
19,820
(4.33 %)
n/a 40.04
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,516
(100.00 %)
390,896
(3.25 %)
482,493
(7.83 %)
4,361,670
(34.36 %)
0
(0 %)
491,019
(5.12 %)
52,508
(3.70 %)
21,519
(1.51 %)
276 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2
n/a n/a 13,244
(1.26 %)
19,241
(1.68 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
25
(0.00 %)
25
(0.00 %)
5,868
(100.00 %)
4,420,884
(51.59 %)
513,006
(3.13 %)
7,749,797
(49.18 %)
0
(0 %)
994,720
(3.65 %)
81,538
(8.24 %)
68,267
(3.13 %)
277 plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021)
GCA_020745805.1
n/a n/a 11,774
(1.90 %)
20,857
(2.20 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
749
(100.00 %)
356,053
(4.37 %)
157,695
(0.93 %)
5,995,637
(19.60 %)
0
(0 %)
70,223
(0.74 %)
30,478
(4.03 %)
30,200
(2.16 %)
278 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1
n/a n/a 14,050
(2.77 %)
63,249
(8.86 %)
n/a 45.41
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,970
(100.00 %)
708,455
(9.71 %)
797,241
(15.67 %)
2,785,159
(33.18 %)
0
(0 %)
613,051
(6.69 %)
78,151
(7.95 %)
45,924
(3.34 %)
279 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1
n/a n/a 10,944
(0.64 %)
59,123
(2.21 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,336
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
0
(0 %)
1,101,423
(6.43 %)
125,285
(5.42 %)
13,610
(0.32 %)
280 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1
n/a n/a 17,253
(1.51 %)
18,507
(1.35 %)
n/a 40.91
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
38
(100.00 %)
3,466,835
(27.96 %)
585,261
(1.91 %)
11,364,898
(40.65 %)
2
(0.00 %)
726,868
(2.39 %)
50,527
(1.37 %)
32,436
(0.84 %)
281 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1
n/a n/a 13,892
(0.57 %)
32,011
(1.64 %)
n/a 44.93
(100.00 %)
16
(0.00 %)
685
(0.00 %)
843
(100.00 %)
1,042,636
(2.00 %)
1,430,690
(16.22 %)
14,621,029
(53.91 %)
19
(0.00 %)
4,063,379
(8.75 %)
503,166
(8.84 %)
49,100
(0.82 %)
282 pygmy chimpanzee (paternal 2024)
GCA_028858825.2
n/a n/a 20,282
(1.77 %)
21,509
(1.17 %)
n/a 40.46
(99.84 %)
0
(0 %)
7
(0.16 %)
38
(100.00 %)
5,163,745
(50.07 %)
970,057
(12.58 %)
15,047,429
(42.91 %)
0
(0 %)
3,587,013
(6.37 %)
47,029
(1.08 %)
28,919
(0.75 %)
283 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1
n/a n/a 18,550
(1.51 %)
20,491
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
0
(0 %)
138
(0.01 %)
391
(100.00 %)
3,860,112
(33.83 %)
820,375
(9.58 %)
12,159,196
(41.59 %)
2
(0.00 %)
1,346,279
(3.87 %)
106,168
(2.78 %)
50,294
(1.44 %)
284 razorbill (alternate hap 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658355.1
n/a n/a 12,937
(1.75 %)
24,253
(2.09 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,309
(100.00 %)
562,549
(7.14 %)
210,852
(1.04 %)
7,264,995
(20.26 %)
0
(0 %)
100,265
(0.74 %)
40,926
(2.91 %)
36,166
(1.76 %)
285 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1
n/a n/a 18,817
(1.29 %)
21,916
(1.20 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
0
(0 %)
22
(0.00 %)
4,021
(100.00 %)
3,279,005
(20.48 %)
472,706
(21.87 %)
11,466,609
(50.26 %)
0
(0 %)
3,624,599
(9.05 %)
128,858
(2.07 %)
39,577
(0.84 %)
286 red fox (hap2 2024)
GCA_964106925.2
n/a n/a 19,517
(1.57 %)
20,105
(1.37 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
0
(0 %)
1,819
(0.02 %)
350
(100.00 %)
4,487,839
(31.79 %)
1,010,106
(2.64 %)
13,838,711
(33.07 %)
17
(0.00 %)
695,908
(1.88 %)
51,373
(2.26 %)
46,876
(1.53 %)
287 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1
n/a n/a 4,539
(2.01 %)
14,061
(4.35 %)
n/a 40.48
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,751
(100.00 %)
759,605
(49.59 %)
161,693
(7.99 %)
1,684,737
(29.93 %)
0
(0 %)
232,319
(5.07 %)
7,525
(1.31 %)
4,853
(0.81 %)
288 red-billed tropicbird (paternal hap 2024)
GCA_964289755.1
n/a n/a 11,989
(1.71 %)
21,527
(2.03 %)
n/a 43.19
(99.98 %)
1,072
(0.02 %)
1,072
(0.02 %)
1,572
(99.98 %)
383,852
(5.39 %)
164,123
(3.45 %)
5,859,520
(24.45 %)
20
(0.00 %)
189,600
(1.73 %)
48,825
(5.37 %)
42,685
(3.12 %)
289 red-crested turaco (alternate hap 2019)
GCA_009764505.1
n/a n/a 11,247
(1.70 %)
23,705
(2.27 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,476
(100.00 %)
482,817
(8.51 %)
153,169
(0.81 %)
5,919,109
(21.87 %)
0
(0 %)
121,371
(1.16 %)
39,766
(3.41 %)
32,044
(2.04 %)
290 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020)
GCA_015220175.1
n/a n/a 11,434
(1.65 %)
21,710
(2.11 %)
n/a 46.12
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
2,748
(100.00 %)
859,899
(15.52 %)
319,622
(3.85 %)
5,367,970
(34.63 %)
0
(0 %)
960,530
(5.66 %)
23,381
(1.81 %)
19,537
(1.27 %)
291 red-legged seriema (alternate hap 2019)
GCA_009819485.1
n/a n/a 10,131
(1.78 %)
19,775
(2.21 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,840
(100.00 %)
366,591
(6.01 %)
117,928
(0.90 %)
5,340,048
(18.90 %)
0
(0 %)
66,176
(0.68 %)
26,293
(2.86 %)
24,338
(1.93 %)
292 red-throated loon (hap1 2023)
GCA_030936125.1
n/a n/a 13,357
(1.64 %)
29,603
(2.35 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
260
(0.00 %)
260
(0.00 %)
3,225
(100.00 %)
549,694
(8.44 %)
246,171
(10.46 %)
5,258,356
(27.36 %)
2
(0.00 %)
671,693
(3.75 %)
39,810
(3.37 %)
34,456
(1.67 %)
293 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1
25,173
(40.74 %)
n/a 13,218
(1.71 %)
28,120
(2.39 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
9
(0.00 %)
249
(0.00 %)
1,195
(100.00 %)
544,427
(8.81 %)
223,674
(5.77 %)
6,669,469
(23.63 %)
3
(0.00 %)
398,605
(2.64 %)
38,306
(3.37 %)
35,069
(1.78 %)
294 reedfish (v3 alternate hap 2021)
GCA_900700845.3
n/a n/a 11,382
(0.41 %)
28,399
(1.33 %)
n/a 39.39
(99.99 %)
17
(0.01 %)
17
(0.01 %)
17,099
(99.99 %)
6,708,926
(37.23 %)
883,916
(2.81 %)
16,745,782
(46.94 %)
0
(0 %)
963,655
(2.45 %)
74,951
(1.15 %)
20,227
(0.32 %)
295 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1
n/a n/a 19,396
(1.48 %)
21,693
(1.26 %)
n/a 41.62
(97.80 %)
0
(0 %)
131
(2.20 %)
1,039
(100.00 %)
3,973,936
(35.55 %)
987,571
(11.66 %)
12,473,459
(42.11 %)
1
(0.00 %)
1,271,959
(3.79 %)
74,971
(1.64 %)
44,274
(1.06 %)
296 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1
59,888
(43.60 %)
n/a 19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
0
(0 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
4
(0.00 %)
1,071,329
(3.37 %)
73,126
(1.69 %)
43,865
(1.11 %)
297 rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021)
GCA_016880875.1
n/a n/a 9,867
(1.89 %)
19,635
(2.52 %)
n/a 42.54
(100.00 %)
0
(0 %)
20
(0.00 %)
2,879
(100.00 %)
394,769
(10.00 %)
186,556
(1.91 %)
4,428,687
(19.09 %)
0
(0 %)
192,997
(1.66 %)
15,730
(1.88 %)
12,474
(0.91 %)
298 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 alternate hap 2024)
GCA_040937895.1
n/a n/a 26,401
(0.36 %)
90,909
(1.63 %)
n/a 44.93
(100.00 %)
19
(0.00 %)
19
(0.00 %)
14,096
(100.00 %)
4,036,529
(2.70 %)
6,299,339
(18.78 %)
14,096
(100.00 %)
1
(0.00 %)
13,301,439
(10.32 %)
1,426,030
(6.65 %)
1,371,517
(5.63 %)
299 ring-tailed lemur (mLemCat1 alternate hap 2021)
GCA_020740595.1
n/a n/a 18,683
(1.98 %)
21,178
(1.55 %)
n/a 41.29
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
312
(100.00 %)
3,400,356
(36.84 %)
511,707
(7.13 %)
13,027,744
(33.21 %)
0
(0 %)
889,687
(2.62 %)
50,614
(1.83 %)
47,997
(1.60 %)
300 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1
n/a n/a 18,165
(2.73 %)
62,580
(6.00 %)
n/a 38.74
(100.00 %)
6
(0.00 %)
6
(0.00 %)
4,612
(100.00 %)
2,483,904
(48.29 %)
584,363
(7.55 %)
5,582,076
(40.38 %)
0
(0 %)
923,875
(6.53 %)
60,229
(3.53 %)
19,604
(0.82 %)
301 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2
n/a n/a 15,291
(3.29 %)
45,865
(7.56 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,165
(100.00 %)
1,131,154
(25.69 %)
269,583
(5.08 %)
3,371,712
(24.64 %)
0
(0 %)
249,009
(3.21 %)
36,810
(2.68 %)
27,636
(1.84 %)
302 rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024)
GCA_036010775.2
n/a n/a 12,450
(1.75 %)
23,660
(2.21 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
23
(0.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
2
(0.00 %)
1,046,187
(5.37 %)
33,479
(3.29 %)
29,158
(1.73 %)
303 rock pigeon (racing homer maternal 2024)
GCA_036010775.1
n/a n/a 12,450
(1.75 %)
25,274
(2.35 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
23
(0.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
2
(0.00 %)
1,046,190
(5.37 %)
33,479
(3.29 %)
29,158
(1.73 %)
304 rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022)
GCA_023344045.1
n/a n/a 12,090
(2.36 %)
21,910
(2.57 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,212
(100.00 %)
585,577
(10.45 %)
202,342
(1.61 %)
5,390,780
(20.38 %)
0
(0 %)
122,512
(1.28 %)
19,210
(2.23 %)
17,189
(1.48 %)
305 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1
n/a n/a 15,434
(2.01 %)
44,991
(4.63 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
192
(0.00 %)
302
(100.00 %)
2,506,810
(40.54 %)
613,867
(8.67 %)
5,070,851
(48.32 %)
1
(0.00 %)
1,210,760
(8.82 %)
46,071
(2.57 %)
27,461
(1.23 %)
306 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1
n/a n/a 13,845
(0.96 %)
23,108
(1.86 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,128
(100.00 %)
2,008,682
(10.16 %)
1,718,408
(7.36 %)
9,467,451
(52.99 %)
0
(0 %)
1,513,596
(5.45 %)
140,557
(4.65 %)
29,439
(0.71 %)
307 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1
n/a n/a 12,606
(0.83 %)
22,421
(1.62 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,543
(100.00 %)
2,080,172
(11.19 %)
1,814,619
(9.22 %)
8,889,119
(57.36 %)
0
(0 %)
1,825,733
(6.19 %)
145,328
(4.63 %)
28,523
(0.67 %)
308 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1
n/a n/a 17,895
(2.55 %)
64,448
(5.84 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
0
(0 %)
418
(0.01 %)
110
(100.00 %)
2,661,155
(49.83 %)
673,071
(10.59 %)
5,755,954
(42.48 %)
1
(0.00 %)
1,108,306
(7.28 %)
66,952
(4.46 %)
21,217
(0.87 %)
309 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1
n/a n/a 13,727
(0.84 %)
24,896
(2.06 %)
n/a 42.95
(99.51 %)
0
(0 %)
973
(0.49 %)
2,266
(100.00 %)
729,332
(2.15 %)
1,402,564
(24.45 %)
8,156,596
(55.96 %)
4
(0.00 %)
3,523,739
(10.10 %)
175,180
(3.64 %)
18,584
(0.40 %)
310 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1
n/a n/a 18,509
(1.54 %)
22,514
(1.36 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,427
(100.00 %)
3,675,922
(35.75 %)
950,374
(10.49 %)
11,670,399
(40.31 %)
0
(0 %)
1,395,810
(4.32 %)
63,587
(3.15 %)
40,331
(1.09 %)
311 Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022)
GCA_023634115.1
n/a n/a 12,258
(1.66 %)
25,579
(2.30 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
4,162
(100.00 %)
506,343
(6.77 %)
182,589
(7.22 %)
5,435,776
(23.60 %)
0
(0 %)
383,493
(2.65 %)
29,420
(2.47 %)
19,384
(0.92 %)
312 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023)
GCA_027887135.1
n/a n/a 12,826
(1.74 %)
26,019
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,054
(100.00 %)
482,850
(3.37 %)
523,437
(10.15 %)
6,386,315
(26.20 %)
0
(0 %)
535,497
(3.35 %)
32,734
(4.25 %)
23,206
(1.19 %)
313 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1
n/a n/a 14,039
(1.09 %)
19,528
(1.85 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
31
(0.00 %)
31
(0.00 %)
122
(100.00 %)
1,307,065
(5.31 %)
672,219
(3.50 %)
9,949,858
(39.30 %)
0
(0 %)
671,520
(3.09 %)
83,890
(3.97 %)
26,657
(0.80 %)
314 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1
n/a n/a 14,226
(1.28 %)
25,396
(2.33 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
12,662
(100.00 %)
1,001,433
(5.27 %)
445,157
(1.79 %)
7,227,826
(34.26 %)
0
(0 %)
365,558
(2.38 %)
80,300
(2.76 %)
22,848
(0.87 %)
315 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1
n/a n/a 14,077
(0.47 %)
36,608
(1.60 %)
n/a 43.86
(99.99 %)
0
(0 %)
2,097
(0.01 %)
2,802
(100.00 %)
1,819,971
(2.73 %)
2,865,173
(16.12 %)
15,335,602
(63.85 %)
14
(0.00 %)
6,125,585
(10.74 %)
651,438
(8.09 %)
43,492
(0.45 %)
316 Schreibers' long-fingered bat (hap2 2024)
GCA_964145185.1
n/a n/a 17,115
(2.05 %)
19,972
(1.93 %)
n/a 42.62
(99.99 %)
1,137
(0.01 %)
1,137
(0.01 %)
1,305
(99.99 %)
2,445,695
(27.61 %)
386,295
(4.40 %)
9,657,997
(29.32 %)
2
(0.00 %)
458,566
(1.76 %)
56,451
(2.93 %)
50,746
(2.02 %)
317 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1
n/a n/a 6,180
(0.71 %)
31,191
(4.14 %)
n/a 48.30
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
4,064
(100.00 %)
1,494,745
(38.42 %)
891,392
(20.02 %)
4,259,383
(49.70 %)
0
(0 %)
2,135,388
(12.73 %)
147,499
(35.87 %)
97,808
(5.62 %)
318 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1
n/a n/a 14,728
(2.46 %)
62,094
(7.09 %)
n/a 42.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,847
(100.00 %)
939,151
(11.90 %)
472,983
(7.68 %)
4,326,183
(28.40 %)
0
(0 %)
486,310
(4.09 %)
64,290
(4.16 %)
42,087
(2.28 %)
319 sharpnose sevengill shark (hap2 2024)
GCA_035084135.1
n/a n/a 12,603
(0.52 %)
23,419
(1.42 %)
n/a 44.36
(99.99 %)
1,695
(0.01 %)
1,695
(0.01 %)
2,889
(99.99 %)
559,171
(2.08 %)
973,228
(15.01 %)
11,768,442
(55.69 %)
2
(0.00 %)
3,991,721
(8.15 %)
108,468
(3.25 %)
22,750
(0.36 %)
320 siamang (Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.3
n/a n/a 19,572
(1.70 %)
20,107
(1.11 %)
n/a 40.45
(99.93 %)
0
(0 %)
3
(0.07 %)
40
(100.00 %)
5,057,491
(55.54 %)
869,279
(15.07 %)
14,090,400
(46.04 %)
0
(0 %)
1,893,854
(4.08 %)
87,907
(1.41 %)
26,874
(0.68 %)
321 siamang (v2 Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.2
n/a n/a 19,572
(1.70 %)
20,107
(1.11 %)
n/a 40.45
(99.93 %)
0
(0 %)
3
(0.07 %)
40
(100.00 %)
5,057,491
(55.54 %)
869,279
(15.07 %)
14,090,400
(46.04 %)
0
(0 %)
2,292,373
(4.98 %)
87,907
(1.41 %)
26,874
(0.68 %)
322 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2
n/a n/a 14,737
(4.05 %)
61,568
(10.70 %)
n/a 45.50
(100.00 %)
108
(0.00 %)
108
(0.00 %)
3,872
(100.00 %)
392,585
(19.23 %)
190,741
(5.09 %)
1,994,824
(23.20 %)
0
(0 %)
245,925
(4.39 %)
74,259
(13.49 %)
57,619
(7.42 %)
323 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap2.1 2024)
GCA_964106785.1
n/a n/a 13,756
(1.40 %)
19,148
(2.33 %)
n/a 43.77
(99.99 %)
0
(0 %)
783
(0.01 %)
127
(100.00 %)
790,266
(3.86 %)
448,558
(4.00 %)
6,780,108
(37.51 %)
3
(0.00 %)
534,737
(3.25 %)
86,165
(2.71 %)
18,444
(0.74 %)
324 slow loris (alternate hap 2022)
GCA_027406535.1
n/a n/a 21,660
(1.50 %)
22,771
(1.32 %)
n/a 40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,485
(100.00 %)
4,275,926
(39.13 %)
533,324
(1.57 %)
13,459,597
(39.86 %)
0
(0 %)
855,097
(2.22 %)
35,720
(0.78 %)
21,807
(0.55 %)
325 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2
n/a n/a 11,589
(0.31 %)
32,603
(1.10 %)
n/a 47.54
(100.00 %)
6
(0.00 %)
6
(0.00 %)
26,655
(100.00 %)
1,346,532
(1.83 %)
1,273,326
(5.35 %)
19,727,443
(51.55 %)
0
(0 %)
2,678,114
(4.31 %)
427,693
(8.25 %)
27,178
(0.30 %)
326 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1
n/a n/a 13,661
(1.11 %)
75,418
(4.21 %)
n/a 45.01
(99.96 %)
0
(0 %)
3,120
(0.04 %)
1,059
(100.00 %)
4,634,757
(53.53 %)
1,006,319
(17.13 %)
5,273,732
(51.16 %)
14
(0.00 %)
1,782,741
(8.47 %)
145,115
(7.59 %)
66,645
(2.19 %)
327 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1
n/a n/a 9,086
(0.58 %)
20,468
(1.57 %)
n/a 42.65
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 10,892
(100.00 %)
315,695
(1.23 %)
320,148
(1.73 %)
8,305,059
(38.33 %)
0
(0 %)
382,745
(1.57 %)
37,147
(1.43 %)
15,419
(0.42 %)
328 snake N.helvetica (rNatHel1.hap2.1 2024)
GCA_964273795.1
n/a n/a 11,975
(1.14 %)
16,941
(1.86 %)
n/a 41.42
(99.98 %)
1,674
(0.02 %)
1,674
(0.02 %)
2,176
(99.98 %)
1,088,721
(8.03 %)
743,110
(5.43 %)
7,446,281
(43.88 %)
11
(0.00 %)
634,247
(3.33 %)
96,764
(4.19 %)
20,864
(0.74 %)
329 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1
n/a n/a 17,590
(1.81 %)
21,597
(1.85 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,717
(100.00 %)
2,734,555
(21.46 %)
795,752
(6.56 %)
9,601,735
(36.35 %)
0
(0 %)
660,443
(2.50 %)
62,524
(3.25 %)
60,391
(2.11 %)
330 South Island takahe (alternate hap 2021)
GCA_020801775.1
n/a n/a 12,655
(1.70 %)
n/a n/a 43.63
(99.16 %)
0
(0 %)
238
(0.84 %)
178
(100.00 %)
554,912
(9.42 %)
230,808
(4.34 %)
6,406,358
(24.83 %)
0
(0 %)
352,693
(2.60 %)
22,941
(1.98 %)
19,559
(1.17 %)
331 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1
n/a n/a 15,727
(2.61 %)
43,177
(5.74 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 895
(100.00 %)
1,590,386
(33.53 %)
246,800
(2.86 %)
5,173,834
(26.85 %)
0
(0 %)
323,596
(3.31 %)
14,473
(0.87 %)
9,723
(0.47 %)
332 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1
n/a n/a 20,179
(1.21 %)
24,249
(1.19 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
7,866
(100.00 %)
3,953,031
(35.88 %)
531,111
(1.14 %)
16,354,874
(39.96 %)
0
(0 %)
425,622
(1.30 %)
59,907
(1.35 %)
35,916
(0.80 %)
333 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1
n/a n/a 22,897
(1.23 %)
27,007
(1.18 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
70
(0.00 %)
70
(0.00 %)
12,050
(100.00 %)
4,502,020
(38.27 %)
576,759
(1.02 %)
17,143,050
(40.65 %)
0
(0 %)
450,196
(1.59 %)
51,339
(1.15 %)
40,459
(0.82 %)
334 Sowerby's beaked whale (hap2 2024)
GCA_964148845.1
n/a n/a 18,591
(1.46 %)
21,588
(1.27 %)
n/a 42.00
(99.99 %)
974
(0.01 %)
974
(0.01 %)
2,126
(99.99 %)
3,961,403
(34.20 %)
742,897
(9.73 %)
10,832,739
(43.68 %)
2
(0.00 %)
2,951,041
(7.25 %)
70,803
(2.85 %)
37,380
(0.90 %)
335 speckled mousebird (bColStr4 hap2 2023)
GCA_028858625.2
n/a n/a 12,332
(1.76 %)
22,895
(2.24 %)
n/a 42.74
(99.53 %)
0
(0 %)
136
(0.47 %)
242
(100.00 %)
521,023
(11.26 %)
304,406
(7.39 %)
5,319,571
(25.46 %)
0
(0 %)
589,925
(3.69 %)
27,299
(2.35 %)
19,827
(1.22 %)
336 speckled mousebird (hap2 2023)
GCA_028858625.1
n/a n/a 13,169
(1.74 %)
26,896
(2.47 %)
n/a 42.62
(99.56 %)
0
(0 %)
151
(0.44 %)
243
(100.00 %)
570,907
(11.75 %)
317,226
(6.96 %)
5,854,600
(25.51 %)
0
(0 %)
605,114
(3.54 %)
28,905
(2.31 %)
21,335
(1.22 %)
337 spotted gar (fLepOcu1hap1 2024)
GCA_040954845.1
n/a n/a 13,777
(1.63 %)
24,910
(4.29 %)
n/a 40.54
(100.00 %)
0
(0 %)
76
(0.00 %)
831
(100.00 %)
1,218,814
(33.09 %)
230,177
(10.66 %)
5,685,909
(34.46 %)
0
(0 %)
606,189
(4.68 %)
52,438
(3.69 %)
36,888
(1.75 %)
338 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1
n/a n/a 10,920
(1.26 %)
14,403
(2.60 %)
n/a 43.46
(99.96 %)
0
(0 %)
2,088
(0.04 %)
1,042
(100.00 %)
3,325,883
(44.48 %)
604,780
(8.87 %)
5,926,808
(44.92 %)
2
(0.00 %)
1,077,982
(5.77 %)
64,249
(4.00 %)
11,419
(0.43 %)
339 starry smooth-hound (sMusAst1.hap2.1 2024)
GCA_964214025.1
n/a n/a 12,414
(0.43 %)
22,037
(1.15 %)
n/a 45.49
(99.98 %)
3,505
(0.02 %)
3,505
(0.02 %)
7,908
(99.98 %)
1,083,980
(2.93 %)
1,065,586
(9.57 %)
13,986,241
(53.49 %)
32
(0.00 %)
3,881,332
(7.02 %)
105,379
(3.46 %)
14,226
(0.18 %)
340 sterlet (paternal hap 2022)
GCA_902713435.2
n/a n/a 24,717
(1.73 %)
40,151
(4.13 %)
74,807
(5.54 %)
40.09
(99.99 %)
0
(0 %)
475
(0.01 %)
1,517
(100.00 %)
1,844,596
(9.77 %)
1,119,340
(9.88 %)
9,372,934
(41.58 %)
8
(0.00 %)
1,582,556
(6.83 %)
65,007
(2.74 %)
17,761
(0.38 %)
341 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1
n/a n/a 16,177
(4.18 %)
40,160
(7.35 %)
n/a 39.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,237
(100.00 %)
1,208,781
(38.02 %)
121,854
(7.96 %)
2,956,942
(32.61 %)
0
(0 %)
310,772
(4.79 %)
27,787
(3.58 %)
14,364
(1.06 %)
342 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1
n/a n/a 15,871
(2.85 %)
42,287
(5.51 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
3,274
(100.00 %)
1,826,752
(37.53 %)
592,022
(6.69 %)
4,899,884
(32.33 %)
0
(0 %)
491,621
(3.91 %)
17,357
(1.25 %)
12,560
(0.74 %)
343 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1
n/a n/a 18,204
(1.54 %)
21,036
(1.34 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,464
(100.00 %)
3,767,720
(35.65 %)
1,102,723
(10.92 %)
11,794,617
(40.96 %)
0
(0 %)
1,492,009
(4.69 %)
67,537
(3.57 %)
41,008
(1.09 %)
344 Sumatran orangutan (v2 AG06213 alternate hap 2024)
GCA_028885685.2
n/a n/a 19,884
(1.79 %)
20,383
(1.18 %)
n/a 40.95
(99.75 %)
0
(0 %)
10
(0.25 %)
48
(100.00 %)
5,192,176
(53.57 %)
950,166
(9.22 %)
15,240,038
(41.74 %)
0
(0 %)
2,007,170
(3.80 %)
41,928
(1.16 %)
29,154
(0.81 %)
345 Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021)
GCA_020746095.1
n/a n/a 11,628
(1.91 %)
21,635
(2.31 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
17
(0.00 %)
1,535
(100.00 %)
421,231
(6.57 %)
146,070
(1.11 %)
5,727,350
(21.91 %)
0
(0 %)
105,678
(1.04 %)
37,752
(3.68 %)
32,944
(2.17 %)
346 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1
n/a n/a 14,713
(1.06 %)
18,602
(1.60 %)
n/a 44.58
(100.00 %)
0
(0 %)
290
(0.00 %)
366
(100.00 %)
1,352,115
(12.17 %)
388,630
(1.94 %)
10,550,154
(33.42 %)
0
(0 %)
470,790
(2.03 %)
113,023
(3.09 %)
33,031
(0.84 %)
347 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020)
GCA_009819505.2
n/a n/a 13,403
(1.85 %)
27,669
(2.52 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
704,976
(13.16 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
0
(0 %)
505,741
(2.66 %)
49,076
(3.54 %)
23,486
(1.21 %)
348 swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023)
GCA_028019105.1
n/a n/a 12,160
(1.83 %)
24,622
(2.46 %)
n/a 43.37
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 862
(100.00 %)
383,634
(3.06 %)
527,550
(8.40 %)
5,916,654
(24.97 %)
0
(0 %)
665,809
(4.29 %)
31,261
(3.21 %)
22,337
(1.23 %)
349 Swift parrot (hap2 2024)
GCA_037157625.1
n/a n/a 11,928
(1.78 %)
20,879
(2.12 %)
n/a 42.78
(99.75 %)
0
(0 %)
122
(0.25 %)
413
(100.00 %)
481,463
(6.65 %)
359,572
(7.59 %)
5,094,615
(26.27 %)
2
(0.00 %)
449,659
(3.37 %)
23,296
(2.08 %)
20,233
(1.32 %)
350 tailed frog (A.truei hap2 2024)
GCA_040206675.1
n/a n/a 14,405
(0.55 %)
41,584
(1.88 %)
n/a 44.89
(99.97 %)
0
(0 %)
6,023
(0.03 %)
2,779
(100.00 %)
1,770,524
(4.86 %)
3,429,564
(18.94 %)
15,718,939
(55.22 %)
37
(0.00 %)
5,484,397
(11.18 %)
441,543
(6.61 %)
73,027
(0.90 %)
351 tammar wallaby (mMacEug1 alternate hap 2023)
GCA_028389975.1
n/a n/a 11,133
(0.77 %)
13,869
(0.98 %)
n/a 38.63
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
14,285
(100.00 %)
3,114,522
(26.10 %)
661,874
(3.02 %)
11,667,649
(38.41 %)
0
(0 %)
320,252
(1.29 %)
12,393
(0.46 %)
7,824
(0.29 %)
352 tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023)
GCA_028020675.1
n/a n/a 11,432
(1.95 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
911
(100.00 %)
470,125
(9.51 %)
140,846
(3.57 %)
5,002,695
(22.08 %)
0
(0 %)
231,594
(1.85 %)
22,424
(2.33 %)
19,010
(1.39 %)
353 tawny owl (hap2 2023)
GCA_031877785.1
n/a n/a 12,367
(1.72 %)
21,445
(2.03 %)
n/a 42.53
(99.88 %)
0
(0 %)
206
(0.12 %)
184
(100.00 %)
392,959
(4.59 %)
235,300
(7.72 %)
6,437,772
(24.82 %)
0
(0 %)
298,804
(2.06 %)
27,952
(2.71 %)
25,864
(1.43 %)
354 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1
n/a n/a 5,885
(0.35 %)
24,457
(1.45 %)
n/a 44.61
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
21,995
(100.00 %)
553,415
(2.65 %)
761,469
(4.53 %)
6,043,769
(57.75 %)
0
(0 %)
1,079,506
(5.75 %)
159,552
(5.54 %)
20,611
(0.66 %)
355 three-spined stickleback (hap2 2024)
GCA_964276385.1
n/a n/a 13,591
(3.79 %)
50,693
(10.19 %)
n/a 44.72
(99.99 %)
309
(0.01 %)
309
(0.01 %)
479
(99.99 %)
505,547
(19.86 %)
181,092
(8.75 %)
2,117,454
(27.02 %)
3
(0.00 %)
218,946
(4.51 %)
75,434
(12.33 %)
51,737
(5.53 %)
356 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1
n/a n/a 12,516
(0.44 %)
17,465
(1.05 %)
n/a 44.66
(99.65 %)
1,203
(0.35 %)
1,203
(0.35 %)
2,136
(99.65 %)
8,278,458
(59.68 %)
903,434
(18.42 %)
14,975,344
(48.25 %)
2
(0.00 %)
4,704,292
(7.66 %)
48,378
(1.60 %)
15,577
(0.38 %)
357 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1
n/a n/a 12,197
(0.36 %)
33,747
(1.15 %)
n/a 43.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
23,871
(100.00 %)
1,453,442
(1.57 %)
1,309,062
(3.23 %)
17,953,416
(52.19 %)
0
(0 %)
1,274,743
(3.12 %)
326,452
(3.86 %)
38,711
(0.39 %)
358 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3
n/a n/a 13,635
(4.82 %)
48,723
(11.83 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
0
(0 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,793
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
0
(0 %)
206,265
(4.46 %)
46,936
(9.72 %)
35,741
(5.19 %)
359 tourmaline sunangel (hap2 2024)
GCA_036172335.1
n/a n/a 11,697
(2.00 %)
19,544
(2.34 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
0
(0 %)
370
(0.01 %)
200
(100.00 %)
480,724
(5.14 %)
292,213
(3.66 %)
5,608,823
(21.79 %)
2
(0.00 %)
199,789
(1.65 %)
17,191
(1.69 %)
14,460
(1.07 %)
360 trahira (v1 hap1 2023)
GCA_029633855.1
n/a n/a 16,039
(2.06 %)
44,287
(4.38 %)
n/a 40.99
(92.91 %)
0
(0 %)
867
(7.09 %)
597
(100.00 %)
2,228,831
(30.95 %)
687,495
(13.85 %)
5,309,097
(36.70 %)
2
(0.01 %)
1,157,952
(7.09 %)
27,070
(2.09 %)
12,077
(0.44 %)
361 tufted duck (alternate hap 2019)
GCA_009819845.1
n/a n/a 12,117
(2.03 %)
21,464
(2.36 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
780
(100.00 %)
732,317
(7.82 %)
353,660
(1.57 %)
6,119,549
(21.70 %)
0
(0 %)
66,459
(0.74 %)
27,920
(2.56 %)
25,192
(1.55 %)
362 Tungara frog (aEngPut4 2024)
GCA_040894015.1
n/a n/a 13,192
(0.88 %)
29,242
(2.52 %)
n/a 43.08
(100.00 %)
0
(0 %)
507
(0.00 %)
819
(100.00 %)
736,700
(2.60 %)
1,165,044
(20.79 %)
8,671,642
(52.60 %)
3
(0.00 %)
1,462,012
(5.01 %)
207,553
(4.71 %)
22,911
(0.46 %)
363 tunicate S.clava (kaStyClav1.hap2.1 2024)
GCA_964204955.1
n/a n/a 3,537
(0.78 %)
12,938
(7.13 %)
n/a 36.53
(100.00 %)
26
(0.00 %)
26
(0.00 %)
269
(100.00 %)
91,318
(3.44 %)
79,330
(9.47 %)
2,208,574
(39.20 %)
2
(0.00 %)
400,110
(11.12 %)
6,157
(5.53 %)
1,067
(0.10 %)
364 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1
n/a n/a 13,456
(0.33 %)
47,486
(1.34 %)
n/a 44.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
27,233
(100.00 %)
1,968,437
(1.91 %)
1,716,136
(3.97 %)
25,847,315
(43.76 %)
0
(0 %)
1,707,112
(2.84 %)
523,234
(6.59 %)
83,004
(0.82 %)
365 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1
n/a n/a 9,367
(1.66 %)
11,297
(1.30 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,470
(100.00 %)
1,708,360
(43.81 %)
267,584
(1.67 %)
5,373,410
(33.52 %)
0
(0 %)
245,754
(1.84 %)
29,783
(1.94 %)
21,396
(1.51 %)
366 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1
n/a n/a 14,197
(3.33 %)
44,782
(7.70 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,294
(100.00 %)
396,279
(4.74 %)
275,154
(5.76 %)
2,933,132
(29.41 %)
0
(0 %)
277,720
(3.27 %)
35,104
(4.08 %)
21,634
(1.95 %)
367 western capercaillie (alternate hap 2023)
GCA_951394355.1
n/a n/a 11,226
(2.33 %)
20,526
(2.54 %)
n/a 41.53
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,463
(100.00 %)
436,894
(5.48 %)
209,008
(1.73 %)
4,790,071
(20.27 %)
0
(0 %)
86,858
(1.22 %)
17,864
(2.58 %)
16,116
(1.50 %)
368 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1
n/a n/a 14,370
(1.06 %)
24,297
(1.27 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
26,601
(100.00 %)
3,360,923
(19.59 %)
1,043,098
(3.92 %)
8,511,380
(53.68 %)
0
(0 %)
1,216,984
(4.33 %)
23,321
(0.97 %)
17,608
(0.60 %)
369 western lowland gorilla (paternal KB3781 2024)
GCA_028885475.2
n/a n/a 20,265
(1.62 %)
40,901
(1.63 %)
n/a 40.53
(99.94 %)
0
(0 %)
2
(0.06 %)
24
(100.00 %)
5,171,525
(50.35 %)
1,002,906
(19.45 %)
15,064,682
(47.42 %)
0
(0 %)
n/a 64,337
(1.17 %)
29,235
(0.71 %)
370 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1
n/a n/a 13,101
(0.94 %)
24,980
(1.75 %)
n/a 41.02
(99.93 %)
19
(0.07 %)
19
(0.07 %)
13,642
(99.93 %)
1,410,212
(7.70 %)
1,080,385
(4.56 %)
9,112,844
(43.96 %)
0
(0 %)
886,410
(3.61 %)
91,606
(2.53 %)
24,845
(0.74 %)
371 whiskered bat (hap2 2024)
GCA_964195625.1
n/a n/a 18,681
(1.83 %)
21,523
(1.79 %)
n/a 43.13
(99.99 %)
1,414
(0.01 %)
1,414
(0.01 %)
1,741
(99.99 %)
2,849,223
(24.50 %)
688,594
(4.80 %)
9,968,980
(36.80 %)
9
(0.00 %)
650,767
(2.46 %)
64,365
(2.68 %)
52,706
(1.84 %)
372 whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021)
GCA_020745695.1
n/a n/a 11,632
(1.83 %)
20,659
(2.18 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,405
(100.00 %)
553,633
(11.80 %)
147,999
(0.81 %)
5,825,472
(20.55 %)
0
(0 %)
89,546
(1.06 %)
20,481
(1.61 %)
16,521
(1.13 %)
373 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1
n/a n/a 17,639
(1.50 %)
25,684
(1.35 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 25,619
(100.00 %)
3,039,324
(36.05 %)
637,912
(8.02 %)
9,746,398
(38.98 %)
0
(0 %)
811,711
(3.51 %)
56,325
(3.33 %)
35,586
(1.15 %)
374 white-crowned manakin (hap2 2024)
GCA_036250135.1
n/a n/a 12,135
(1.94 %)
21,591
(2.38 %)
n/a 42.49
(99.99 %)
0
(0 %)
307
(0.01 %)
595
(100.00 %)
375,468
(3.93 %)
263,979
(3.93 %)
5,786,346
(21.36 %)
0
(0 %)
353,429
(2.50 %)
25,275
(2.50 %)
20,066
(1.10 %)
375 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022)
GCA_947461935.1
n/a n/a 7,755
(1.71 %)
16,331
(2.39 %)
n/a 43.66
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,971
(100.00 %)
304,566
(13.21 %)
116,307
(6.64 %)
3,407,853
(22.91 %)
0
(0 %)
142,427
(1.75 %)
34,573
(4.56 %)
18,414
(1.62 %)
376 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1
n/a n/a 12,198
(1.10 %)
18,494
(1.29 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
26
(0.00 %)
26
(0.00 %)
14,841
(100.00 %)
1,725,021
(17.81 %)
802,415
(4.26 %)
8,321,474
(45.72 %)
0
(0 %)
653,092
(2.79 %)
15,669
(0.79 %)
13,175
(0.55 %)
377 white-tufted-ear marmoset (maternal 2020)
GCA_011078405.1
n/a n/a 21,684
(1.92 %)
21,053
(1.29 %)
n/a 40.97
(99.58 %)
0
(0 %)
1,068
(0.42 %)
216
(100.00 %)
5,099,933
(50.01 %)
797,450
(2.45 %)
15,059,591
(37.67 %)
1
(0.00 %)
1,026,612
(2.27 %)
36,133
(0.92 %)
26,329
(0.73 %)
378 whooping crane (paternal hap 2023)
GCA_028858595.1
n/a n/a 13,284
(1.87 %)
23,528
(2.20 %)
n/a 42.47
(99.50 %)
0
(0 %)
586
(0.50 %)
395
(100.00 %)
569,940
(8.69 %)
162,569
(0.98 %)
7,021,319
(20.20 %)
1
(0.00 %)
186,281
(0.89 %)
38,582
(3.77 %)
37,390
(2.40 %)
379 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205305.1
n/a n/a 16,306
(0.23 %)
45,587
(0.94 %)
n/a 38.94
(99.99 %)
6,811
(0.01 %)
6,811
(0.01 %)
10,308
(99.99 %)
4,195,244
(3.50 %)
7,201,985
(14.20 %)
10,308
(99.99 %)
64
(0.00 %)
2,258,072
(1.80 %)
412,512
(1.53 %)
403,504
(1.46 %)
380 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap2 2024)
GCA_039720425.1
n/a n/a 12,079
(1.50 %)
21,895
(1.84 %)
n/a 44.31
(100.00 %)
0
(0 %)
138
(0.00 %)
2,468
(100.00 %)
514,155
(7.08 %)
298,648
(19.26 %)
3,943,979
(37.27 %)
0
(0 %)
1,068,366
(5.88 %)
27,272
(1.79 %)
18,908
(1.05 %)
381 yellow-legged gull (bLarMic1.1_alternate_haplotype 2024)
GCA_964199725.1
n/a n/a 12,692
(1.61 %)
24,720
(2.07 %)
n/a 44.79
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,673
(100.00 %)
486,967
(5.03 %)
248,816
(10.71 %)
6,176,494
(29.58 %)
0
(0 %)
541,267
(4.20 %)
44,101
(6.72 %)
36,321
(1.69 %)
382 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1
n/a n/a 16,320
(1.03 %)
20,318
(1.13 %)
n/a 40.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,169
(100.00 %)
2,911,332
(23.50 %)
347,110
(4.57 %)
17,256,419
(44.04 %)
0
(0 %)
683,195
(1.71 %)
28,674
(0.68 %)
24,228
(0.50 %)
383 yellow-throated sandgrouse (alternate hap 2019)
GCA_009769505.1
n/a n/a 11,788
(1.85 %)
23,306
(2.45 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,958
(100.00 %)
467,960
(6.96 %)
182,645
(0.99 %)
6,050,545
(20.78 %)
0
(0 %)
88,543
(0.80 %)
26,357
(2.20 %)
23,111
(1.43 %)
384 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1
n/a n/a 814
(1.87 %)
3,814
(6.84 %)
n/a 42.36
(99.98 %)
0
(0 %)
80
(0.02 %)
349
(100.00 %)
38,000
(5.03 %)
29,516
(7.35 %)
232,988
(20.37 %)
0
(0 %)
46,752
(6.67 %)
2,289
(2.07 %)
1,621
(1.32 %)
385 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1
n/a n/a 15,959
(2.63 %)
43,025
(5.73 %)
n/a 39.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 640
(100.00 %)
1,427,221
(28.44 %)
257,108
(3.15 %)
5,197,531
(26.91 %)
0
(0 %)
350,223
(3.66 %)
13,909
(0.83 %)
10,650
(0.55 %)
386 zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020)
GCA_009859025.1
n/a n/a 10,734
(1.84 %)
19,978
(2.21 %)
n/a 41.07
(99.99 %)
0
(0 %)
16
(0.01 %)
4,677
(100.00 %)
436,071
(7.44 %)
217,580
(1.43 %)
5,800,691
(19.24 %)
0
(0 %)
96,414
(0.71 %)
19,512
(1.90 %)
16,561
(1.08 %)
387 zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021)
GCA_003957525.2
n/a n/a 11,213
(2.01 %)
21,533
(2.54 %)
n/a 41.92
(100.00 %)
0
(0 %)
10
(0.00 %)
1,646
(100.00 %)
470,860
(9.54 %)
387,943
(3.32 %)
5,428,128
(20.68 %)
0
(0 %)
254,906
(1.64 %)
23,838
(2.47 %)
18,868
(1.23 %)
388 zebra finch (v3 Blue55 maternal 2020)
GCA_008822115.3
n/a n/a 11,950
(2.00 %)
22,828
(2.51 %)
n/a 42.06
(98.45 %)
0
(0 %)
583
(1.55 %)
206
(100.00 %)
494,110
(9.54 %)
347,933
(2.80 %)
5,875,448
(20.29 %)
0
(0 %)
249,341
(1.71 %)
27,387
(2.57 %)
20,823
(1.23 %)
389 zebra finch (Blue55 paternal W 2020)
GCF_008822105.2
50,407
(7.20 %)
n/a 12,470
(1.95 %)
23,352
(2.42 %)
n/a 41.81
(97.98 %)
0
(0 %)
857
(2.02 %)
205
(100.00 %)
529,829
(9.55 %)
357,586
(2.56 %)
6,359,599
(20.12 %)
3
(0.00 %)
246,785
(1.53 %)
27,755
(2.36 %)
21,477
(1.19 %)
390 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1
n/a n/a 6,365
(2.41 %)
16,467
(3.26 %)
n/a 36.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,719
(100.00 %)
1,317,027
(59.43 %)
323,062
(10.58 %)
3,014,570
(45.46 %)
0
(0 %)
366,878
(5.24 %)
14,563
(1.98 %)
3,786
(0.32 %)
391 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1
n/a n/a 17,535
(2.50 %)
44,169
(3.34 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
0
(0 %)
712
(0.01 %)
1,252
(100.00 %)
3,891,854
(61.07 %)
927,173
(7.78 %)
8,621,517
(50.27 %)
1
(0.00 %)
941,178
(4.90 %)
44,554
(2.12 %)
10,153
(0.30 %)
392 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2
n/a n/a 17,692
(2.51 %)
43,578
(3.27 %)
n/a 36.56
(99.99 %)
0
(0 %)
1,352
(0.01 %)
755
(100.00 %)
3,937,397
(60.86 %)
936,258
(7.76 %)
8,732,369
(50.44 %)
0
(0 %)
933,928
(4.81 %)
44,812
(2.09 %)
10,558
(0.30 %)
393 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1
n/a n/a 1,204
(2.88 %)
4,065
(7.13 %)
n/a 41.24
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 1,437
(100.00 %)
26,319
(3.19 %)
14,209
(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
0
(0 %)
22,258
(4.87 %)
1,253
(1.49 %)
988
(1.13 %)
TOTALS:total assembly count 393

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies