VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of alternate/haplotype assemblies)

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Abyssinian ground-hornbill
GCA_009769595.1
n/a n/a 11,935
(1.85 %)
17,161
(2.52 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,527
(100.00 %)
361,144
(5.36 %)
125,372
(0.75 %)
5,917,083
(18.51 %)
0
(0 %)
53,587
(0.56 %)
38,782
(3.72 %)
33,644
(2.37 %)
2 American flamingo
GCA_009819805.1
n/a n/a 12,369
(1.73 %)
22,102
(2.60 %)
n/a 43.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,529
(100.00 %)
496,874
(7.22 %)
162,522
(0.74 %)
6,684,675
(20.14 %)
0
(0 %)
75,415
(0.70 %)
51,873
(5.47 %)
50,711
(3.16 %)
3 Anna's hummingbird
GCA_003957575.1
n/a n/a 11,080
(1.90 %)
14,722
(2.29 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
3,803
(100.00 %)
475,490
(7.41 %)
223,791
(1.37 %)
5,585,250
(20.30 %)
0
(0 %)
113,614
(1.01 %)
14,903
(1.46 %)
13,444
(1.06 %)
4 Asian bonytongue
GCA_900964985.2
n/a n/a 16,056
(2.72 %)
38,888
(6.61 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,348
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
0
(0 %)
142,861
(1.57 %)
85,543
(10.71 %)
65,542
(5.07 %)
5 Atlantic cod
GCA_902167395.1
n/a n/a 13,366
(2.68 %)
37,289
(8.62 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,724
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
0
(0 %)
635,355
(7.05 %)
87,167
(8.03 %)
47,003
(3.66 %)
6 Atlantic halibut
GCA_009819745.1
n/a n/a 16,556
(3.00 %)
34,725
(7.12 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,005
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
0
(0 %)
297,397
(3.46 %)
36,868
(2.33 %)
24,401
(1.38 %)
7 European turtle dove
GCA_901699165.1
n/a n/a 11,266
(1.79 %)
17,283
(2.48 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,333
(100.00 %)
466,564
(7.08 %)
182,345
(0.97 %)
6,037,183
(20.24 %)
0
(0 %)
110,549
(1.11 %)
29,648
(2.35 %)
26,084
(1.59 %)
8 blackcap
GCA_009819715.1
n/a n/a 11,575
(1.86 %)
17,228
(2.55 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,566
(100.00 %)
473,453
(5.97 %)
308,518
(2.29 %)
5,987,640
(19.64 %)
0
(0 %)
201,989
(1.45 %)
25,451
(2.38 %)
21,377
(1.34 %)
9 Blue whale
GCA_008658375.1
n/a n/a 17,268
(1.79 %)
21,293
(1.43 %)
n/a 41.22
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 12,574
(100.00 %)
3,196,351
(43.47 %)
467,194
(1.26 %)
10,176,588
(33.66 %)
0
(0 %)
306,308
(1.20 %)
56,916
(1.85 %)
39,871
(1.51 %)
10 blunt-snouted clingfish
GCA_900650505.1
n/a n/a 12,498
(1.92 %)
29,443
(5.22 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,171
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
0
(0 %)
344,768
(3.42 %)
23,532
(1.46 %)
12,368
(0.66 %)
11 Korean giant-fin mudskipper
GCA_009829135.1
n/a n/a 13,492
(2.34 %)
26,853
(5.82 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,411
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
0
(0 %)
475,329
(4.51 %)
34,522
(2.54 %)
17,280
(0.96 %)
12 channel bull blenny
GCA_900634435.1
n/a n/a 15,971
(2.79 %)
36,711
(6.53 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,653
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
0
(0 %)
386,762
(3.56 %)
20,338
(1.21 %)
10,996
(0.60 %)
13 prehistoric monster fish
GCA_902500245.1
n/a n/a 10,952
(0.64 %)
33,472
(2.20 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,333
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
0
(0 %)
1,101,426
(6.43 %)
125,285
(5.42 %)
13,610
(0.32 %)
14 tiny Cayenne caecilian
GCA_901765105.1
n/a n/a 12,190
(0.36 %)
33,739
(1.15 %)
n/a 43.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
23,871
(100.00 %)
1,453,439
(1.57 %)
1,309,062
(3.23 %)
17,953,416
(52.19 %)
0
(0 %)
1,274,743
(3.12 %)
326,452
(3.86 %)
38,711
(0.39 %)
15 Gaboon caecilian
GCA_902459495.1
n/a n/a 12,817
(0.47 %)
30,608
(1.44 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,651
(100.00 %)
1,139,592
(1.64 %)
1,170,215
(3.77 %)
17,091,511
(52.44 %)
0
(0 %)
995,546
(2.57 %)
235,170
(4.50 %)
33,394
(0.50 %)
16 California sea lion
GCA_009762295.1
n/a n/a 18,329
(1.80 %)
18,692
(1.47 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,093
(100.00 %)
3,722,616
(42.89 %)
488,086
(1.26 %)
10,893,132
(33.14 %)
0
(0 %)
393,471
(1.40 %)
44,449
(1.57 %)
41,300
(1.38 %)
17 Canada lynx
GCA_007474575.1
n/a n/a 12,021
(1.41 %)
15,193
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
15,036
(100.00 %)
2,937,488
(43.50 %)
544,410
(1.76 %)
7,641,565
(32.72 %)
0
(0 %)
294,221
(1.43 %)
39,082
(2.44 %)
34,616
(1.88 %)
18 carmine bee-eater
GCA_009819585.1
n/a n/a 12,368
(1.75 %)
21,365
(2.81 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,296
(100.00 %)
542,762
(7.77 %)
204,389
(1.06 %)
6,415,832
(21.53 %)
0
(0 %)
133,280
(1.22 %)
31,638
(2.54 %)
23,845
(1.27 %)
19 chicken (matHap)
GCF_016699485.2
74,716
(9.14 %)
n/a 13,128
(2.33 %)
23,484
(2.48 %)
n/a 42.20
(99.68 %)
463
(0.32 %)
463
(0.32 %)
677
(99.68 %)
697,827
(12.53 %)
290,892
(2.63 %)
5,887,021
(21.30 %)
1
(0.00 %)
268,636
(2.17 %)
24,469
(2.59 %)
20,885
(1.55 %)
20 chicken (patHap)
GCF_016700215.1
55,865
(8.86 %)
n/a 12,310
(2.41 %)
22,056
(2.57 %)
n/a 42.20
(99.65 %)
254
(0.35 %)
254
(0.35 %)
509
(99.65 %)
604,452
(10.76 %)
232,416
(2.03 %)
5,541,059
(20.23 %)
2
(0.00 %)
203,559
(1.88 %)
22,185
(2.62 %)
19,239
(1.58 %)
21 climbing perch
GCA_900650485.1
n/a n/a 14,954
(3.50 %)
24,316
(7.31 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
0
(0 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,990
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
0
(0 %)
150,484
(2.39 %)
10,131
(0.86 %)
7,444
(0.57 %)
22 common brushtail
GCA_011100645.1
n/a n/a 14,854
(0.75 %)
15,755
(0.91 %)
n/a 39.41
(100.00 %)
313
(0.00 %)
313
(0.00 %)
12,446
(100.00 %)
5,846,766
(38.56 %)
987,917
(1.99 %)
16,764,356
(40.14 %)
0
(0 %)
345,940
(1.13 %)
13,303
(0.35 %)
10,338
(0.23 %)
23 common tern
GCA_009819645.1
n/a n/a 12,766
(1.79 %)
18,154
(2.47 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,235
(100.00 %)
549,457
(7.58 %)
204,051
(1.02 %)
6,880,566
(20.70 %)
0
(0 %)
116,485
(1.17 %)
47,340
(3.68 %)
42,123
(2.18 %)
24 common yellowthroat
GCA_009764545.1
n/a n/a 10,599
(1.76 %)
16,440
(2.36 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
4,976
(100.00 %)
422,886
(5.99 %)
294,928
(2.71 %)
5,928,421
(19.76 %)
0
(0 %)
245,763
(1.64 %)
21,397
(1.91 %)
17,659
(1.14 %)
25 denticle herring
GCA_900700345.2
n/a n/a 14,126
(3.94 %)
32,057
(8.36 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,657
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
0
(0 %)
175,500
(3.05 %)
50,830
(8.72 %)
41,064
(4.69 %)
26 East African grey crowned-crane
GCA_011004865.1
n/a n/a 11,782
(1.88 %)
18,687
(2.68 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
971
(100.00 %)
457,927
(6.40 %)
150,544
(0.85 %)
6,074,490
(20.16 %)
0
(0 %)
65,996
(0.78 %)
33,314
(3.59 %)
32,969
(2.35 %)
27 ermine
GCA_009829165.1
n/a n/a 13,589
(1.64 %)
15,403
(1.46 %)
n/a 41.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,327
(100.00 %)
3,139,032
(40.57 %)
480,111
(1.29 %)
9,106,061
(31.93 %)
0
(0 %)
342,175
(1.40 %)
39,138
(2.20 %)
38,862
(2.01 %)
28 Eurasian red squirrel
GCA_902685485.1
n/a n/a 12,427
(1.50 %)
13,159
(1.26 %)
n/a 40.06
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
10,657
(100.00 %)
2,303,173
(35.38 %)
353,996
(1.49 %)
7,218,556
(31.67 %)
0
(0 %)
194,542
(1.24 %)
24,268
(1.07 %)
22,754
(0.97 %)
29 European starfish
GCA_902459445.1
n/a n/a 3,893
(0.82 %)
23,860
(8.36 %)
n/a 38.77
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
3,969
(100.00 %)
123,983
(1.40 %)
146,247
(6.44 %)
2,404,792
(37.16 %)
0
(0 %)
262,803
(5.18 %)
14,304
(1.48 %)
7,081
(0.79 %)
30 flier cichlid
GCA_007364235.1
n/a n/a 17,508
(2.06 %)
36,756
(5.66 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,983
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
0
(0 %)
240,032
(2.50 %)
26,445
(1.22 %)
12,638
(0.48 %)
31 gilthead seabream
GCA_900880695.1
n/a n/a 13,105
(2.37 %)
31,089
(6.36 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,755
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
0
(0 %)
201,169
(2.33 %)
38,368
(2.40 %)
20,092
(1.12 %)
32 golden eagle
GCA_902153765.1
n/a n/a 9,330
(1.81 %)
14,414
(2.43 %)
n/a 42.53
(99.93 %)
0
(0 %)
39
(0.07 %)
3,860
(100.00 %)
356,281
(6.03 %)
123,430
(0.80 %)
4,417,887
(19.25 %)
0
(0 %)
53,252
(0.85 %)
28,919
(3.52 %)
25,970
(2.20 %)
33 Goodes thornscrub tortoise
GCA_007399395.1
n/a n/a 13,364
(0.95 %)
19,373
(1.51 %)
n/a 44.27
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,736
(100.00 %)
1,404,510
(13.79 %)
334,726
(2.35 %)
9,735,007
(33.33 %)
0
(0 %)
468,759
(1.89 %)
61,680
(2.32 %)
18,869
(0.54 %)
34 greater horseshoe bat
GCA_004115295.1
n/a n/a 14,884
(1.84 %)
18,926
(1.59 %)
n/a 40.69
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
13,426
(100.00 %)
2,426,327
(34.43 %)
418,341
(1.36 %)
8,763,234
(27.86 %)
0
(0 %)
108,521
(0.55 %)
24,370
(1.08 %)
22,940
(1.00 %)
35 greater pipefish
GCA_901709685.1
n/a n/a 10,807
(5.59 %)
23,520
(12.24 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,373
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
0
(0 %)
64,720
(2.40 %)
34,098
(12.19 %)
25,350
(6.24 %)
36 Indian glassy fish
GCA_900651595.1
n/a n/a 14,424
(3.70 %)
23,986
(8.00 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
0
(0 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,771
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
0
(0 %)
195,439
(3.94 %)
15,419
(1.38 %)
8,375
(0.73 %)
37 jewelled blenny
GCA_902148835.1
n/a n/a 15,955
(2.17 %)
48,017
(7.54 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
0
(0 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,225
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
0
(0 %)
541,449
(4.29 %)
138,484
(9.55 %)
86,420
(4.60 %)
38 Kakapo
GCA_004011185.1
n/a n/a 3,251
(1.65 %)
5,389
(2.18 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
3,728
(100.00 %)
127,814
(7.83 %)
53,447
(1.21 %)
1,502,789
(18.09 %)
0
(0 %)
44,014
(1.40 %)
5,487
(1.71 %)
4,787
(1.19 %)
39 lance-tailed manakin
GCA_009829205.1
n/a n/a 12,270
(1.85 %)
18,043
(2.51 %)
n/a 42.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,269
(100.00 %)
472,381
(7.01 %)
237,680
(1.65 %)
6,121,661
(19.48 %)
0
(0 %)
146,408
(1.08 %)
25,589
(2.05 %)
21,299
(1.17 %)
40 leatherback sea turtle
GCA_009762595.1
n/a n/a 10,850
(1.00 %)
15,583
(1.46 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,982
(100.00 %)
1,090,216
(15.03 %)
206,192
(1.19 %)
7,154,939
(33.03 %)
0
(0 %)
432,559
(2.40 %)
25,155
(1.42 %)
14,585
(0.57 %)
41 lesser kestrel (patHap)
GCF_017639655.1
47,420
(5.64 %)
n/a 13,097
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
0
(0 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,498
(5.58 %)
210,236
(1.26 %)
7,133,927
(19.19 %)
1
(0.00 %)
132,959
(0.79 %)
27,558
(2.21 %)
21,862
(1.03 %)
42 live sharksucker
GCA_900963505.1
n/a n/a 14,633
(3.50 %)
23,105
(7.10 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
0
(0 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,739
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
0
(0 %)
96,734
(1.60 %)
16,302
(1.34 %)
11,802
(0.89 %)
43 lumpfish
GCA_009769515.1
n/a n/a 12,850
(3.32 %)
28,938
(7.88 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,695
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
0
(0 %)
569,405
(6.42 %)
45,916
(5.21 %)
28,531
(2.48 %)
44 milkfish
GCA_902362175.1
n/a n/a 16,569
(3.37 %)
22,769
(6.61 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,389
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
0
(0 %)
595,218
(5.37 %)
21,531
(1.27 %)
13,616
(0.75 %)
45 mute swan
GCA_009769485.1
n/a n/a 10,070
(1.97 %)
14,255
(2.46 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
5,616
(100.00 %)
485,824
(7.06 %)
212,892
(1.28 %)
4,756,962
(19.95 %)
0
(0 %)
53,808
(0.72 %)
25,662
(3.69 %)
24,319
(2.23 %)
46 New Caledonian crow
GCA_009651025.1
n/a n/a 11,089
(1.99 %)
15,330
(2.65 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 894
(100.00 %)
377,047
(6.03 %)
178,064
(1.53 %)
5,305,126
(19.49 %)
0
(0 %)
132,677
(1.13 %)
26,106
(2.51 %)
20,600
(1.37 %)
47 New Zealand spotty
GCA_009762545.1
n/a n/a 13,586
(2.17 %)
24,175
(5.10 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,656
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
0
(0 %)
456,906
(3.99 %)
16,368
(0.83 %)
7,034
(0.33 %)
48 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1
n/a n/a 3,096
(1.64 %)
2,450
(1.02 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
3,156
(100.00 %)
517,347
(50.76 %)
157,701
(3.90 %)
1,502,752
(34.14 %)
0
(0 %)
157,923
(4.57 %)
1,806
(0.40 %)
1,380
(0.31 %)
49 northern pike
GCA_011004835.1
n/a n/a 11,792
(2.41 %)
21,365
(5.51 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
0
(0 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,815
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
0
(0 %)
427,649
(4.54 %)
29,687
(2.57 %)
15,714
(1.07 %)
50 orbiculate cardinalfish
GCA_902148825.1
n/a n/a 14,030
(1.51 %)
30,797
(3.85 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,390
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
1
(0.00 %)
888,604
(5.23 %)
22,522
(0.77 %)
12,193
(0.40 %)
51 pale spear-nosed bat
GCA_004115245.1
n/a n/a 18,137
(1.62 %)
23,531
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
38
(0.00 %)
10,873
(100.00 %)
3,001,127
(29.46 %)
375,042
(0.79 %)
11,813,971
(29.64 %)
0
(0 %)
140,066
(0.57 %)
67,665
(3.67 %)
70,083
(3.63 %)
52 pinecone soldierfish
GCA_902148815.1
n/a n/a 15,562
(2.38 %)
28,491
(5.70 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,415
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
0
(0 %)
338,771
(2.89 %)
40,331
(2.02 %)
21,223
(0.93 %)
53 platypus
GCA_004115175.2
n/a n/a 13,224
(1.25 %)
19,300
(1.68 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
25
(0.00 %)
25
(0.00 %)
5,868
(100.00 %)
4,420,881
(51.59 %)
513,006
(3.13 %)
7,749,797
(49.18 %)
0
(0 %)
994,720
(3.65 %)
81,474
(7.32 %)
68,267
(3.13 %)
54 razorbill
GCA_008658355.1
n/a n/a 12,926
(1.74 %)
18,313
(2.36 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,309
(100.00 %)
562,546
(7.14 %)
210,852
(1.04 %)
7,264,995
(20.26 %)
0
(0 %)
100,265
(0.74 %)
40,925
(2.86 %)
36,165
(1.74 %)
55 red-crested turaco
GCA_009764505.1
n/a n/a 11,230
(1.70 %)
19,839
(2.60 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,476
(100.00 %)
482,814
(8.51 %)
153,169
(0.81 %)
5,919,109
(21.87 %)
0
(0 %)
121,371
(1.16 %)
39,761
(3.33 %)
32,043
(2.02 %)
56 red-legged seriema
GCA_009819485.1
n/a n/a 10,125
(1.77 %)
16,337
(2.56 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,840
(100.00 %)
366,588
(6.01 %)
117,928
(0.90 %)
5,340,048
(18.90 %)
0
(0 %)
66,176
(0.68 %)
26,292
(2.86 %)
24,338
(1.93 %)
57 reedfish
GCA_900700845.2
n/a n/a 9,953
(0.37 %)
31,519
(1.22 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
38,598
(100.00 %)
1,300,562
(2.57 %)
685,834
(2.21 %)
14,691,576
(45.66 %)
0
(0 %)
588,793
(1.83 %)
63,365
(1.11 %)
17,365
(0.32 %)
58 sand lizard
GCA_009819545.1
n/a n/a 14,227
(1.28 %)
25,839
(2.36 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
12,662
(100.00 %)
1,001,430
(5.27 %)
445,157
(1.79 %)
7,227,826
(34.26 %)
0
(0 %)
365,558
(2.38 %)
80,300
(2.76 %)
22,848
(0.87 %)
59 sea lamprey
GCA_010993595.1
n/a n/a 6,199
(0.70 %)
31,191
(4.14 %)
n/a 48.30
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
4,064
(100.00 %)
1,494,742
(38.42 %)
891,392
(20.02 %)
4,259,383
(49.70 %)
0
(0 %)
2,135,409
(12.73 %)
147,398
(32.95 %)
97,808
(5.62 %)
60 Siamese fighting fish
GCA_900651605.1
n/a n/a 14,505
(4.12 %)
36,022
(9.79 %)
n/a 45.51
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,705
(100.00 %)
249,668
(3.68 %)
182,366
(4.87 %)
1,939,533
(22.55 %)
0
(0 %)
223,837
(4.10 %)
72,474
(13.55 %)
56,347
(7.50 %)
61 smalltooth sawfish
GCA_009764485.1
n/a n/a 9,081
(0.58 %)
20,783
(1.60 %)
n/a 42.65
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 10,892
(100.00 %)
315,692
(1.23 %)
320,148
(1.73 %)
8,305,059
(38.33 %)
0
(0 %)
382,745
(1.57 %)
37,147
(1.43 %)
15,419
(0.42 %)
62 South Island takahe (VGP alternate 2021)
GCA_020801775.1
n/a n/a 12,655
(1.70 %)
n/a n/a 43.63
(99.16 %)
0
(0 %)
238
(0.84 %)
178
(100.00 %)
554,912
(9.42 %)
230,808
(4.34 %)
6,406,358
(24.83 %)
0
(0 %)
352,693
(2.60 %)
22,941
(1.98 %)
19,559
(1.17 %)
63 Swainson's thrush
GCA_009819505.1
n/a n/a 13,406
(1.85 %)
20,402
(2.61 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
497,371
(5.78 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
0
(0 %)
505,749
(2.66 %)
49,076
(3.54 %)
23,486
(1.21 %)
64 thorny skate
GCA_010909745.1
n/a n/a 5,898
(0.35 %)
24,499
(1.46 %)
n/a 44.61
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
21,995
(100.00 %)
553,412
(2.65 %)
761,469
(4.53 %)
6,043,769
(57.75 %)
0
(0 %)
1,079,460
(5.75 %)
159,552
(5.54 %)
20,611
(0.66 %)
65 torafugu
GCA_901000745.3
n/a n/a 13,654
(4.82 %)
28,421
(10.82 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
0
(0 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,790
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
0
(0 %)
206,262
(4.46 %)
46,931
(9.34 %)
35,741
(5.19 %)
66 tufted duck
GCA_009819845.1
n/a n/a 12,108
(2.02 %)
15,241
(2.53 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
780
(100.00 %)
732,314
(7.82 %)
353,660
(1.57 %)
6,119,549
(21.70 %)
0
(0 %)
66,459
(0.74 %)
27,919
(2.56 %)
25,192
(1.55 %)
67 two-lined caecilian
GCA_901001175.1
n/a n/a 13,451
(0.33 %)
47,476
(1.34 %)
n/a 44.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
27,233
(100.00 %)
1,968,434
(1.91 %)
1,716,136
(3.97 %)
25,847,315
(43.76 %)
0
(0 %)
1,707,107
(2.84 %)
523,234
(6.59 %)
83,004
(0.82 %)
68 vaquita
GCA_008692045.1
n/a n/a 9,345
(1.66 %)
11,443
(1.32 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,470
(100.00 %)
1,708,357
(43.81 %)
267,584
(1.67 %)
5,373,410
(33.52 %)
0
(0 %)
245,753
(1.84 %)
29,783
(1.94 %)
21,396
(1.51 %)
69 Western terrestrial garter snake
GCA_009769695.1
n/a n/a 13,104
(0.93 %)
25,268
(1.76 %)
n/a 41.02
(99.93 %)
19
(0.07 %)
19
(0.07 %)
13,642
(99.93 %)
1,410,209
(7.70 %)
1,080,385
(4.56 %)
9,112,844
(43.96 %)
0
(0 %)
886,409
(3.61 %)
91,606
(2.53 %)
24,845
(0.74 %)
70 yellow-throated sandgrouse
GCA_009769505.1
n/a n/a 11,777
(1.85 %)
17,357
(2.58 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,958
(100.00 %)
467,957
(6.96 %)
182,645
(0.99 %)
6,050,545
(20.78 %)
0
(0 %)
88,543
(0.80 %)
26,357
(2.20 %)
23,111
(1.43 %)
71 zebra finch
GCA_003957525.1
n/a n/a 11,327
(1.85 %)
18,898
(2.67 %)
n/a 41.73
(99.98 %)
45
(0.01 %)
45
(0.01 %)
5,381
(99.99 %)
480,644
(8.44 %)
365,668
(2.89 %)
5,859,698
(20.27 %)
0
(0 %)
235,412
(1.48 %)
24,648
(2.34 %)
19,753
(1.21 %)
72 zebra finch
GCA_009859025.1
n/a n/a 10,723
(1.83 %)
15,206
(2.34 %)
n/a 41.07
(99.99 %)
0
(0 %)
16
(0.01 %)
4,677
(100.00 %)
436,068
(7.44 %)
217,580
(1.43 %)
5,800,691
(19.24 %)
0
(0 %)
96,414
(0.71 %)
19,512
(1.90 %)
16,561
(1.08 %)
73 zig-zag eel
GCA_900700395.1
n/a n/a 1,206
(2.88 %)
2,741
(6.48 %)
n/a 41.24
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 1,437
(100.00 %)
26,316
(3.19 %)
14,209
(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
0
(0 %)
22,258
(4.87 %)
1,253
(1.49 %)
988
(1.13 %)
TOTALS:total assembly count 73

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies