VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of alternate/haplotype assemblies)

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Abyssinian ground-hornbill
GCA_009769595.1
n/a n/a 11,948
(1.86 %)
22,509
(2.24 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,527
(100.00 %)
361,147
(5.36 %)
125,372
(0.75 %)
5,917,083
(18.51 %)
0
(0 %)
53,587
(0.56 %)
38,787
(3.82 %)
33,644
(2.37 %)
2 Aeolian wall lizard (La Canna islet rPodRaf1 alternate hap 2022)
GCA_027172095.1
n/a n/a 2,101
(1.18 %)
5,350
(2.76 %)
n/a 43.70
(99.99 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
4,811
(100.00 %)
103,373
(4.27 %)
58,480
(3.90 %)
895,535
(27.44 %)
0
(0 %)
59,204
(2.84 %)
10,399
(2.84 %)
3,340
(1.02 %)
3 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1
n/a n/a 18,845
(1.07 %)
22,426
(1.10 %)
n/a 41.34
(99.85 %)
169
(0.15 %)
169
(0.15 %)
1,253
(99.85 %)
4,406,744
(29.55 %)
925,868
(4.71 %)
15,966,881
(50.49 %)
0
(0 %)
1,248,627
(2.71 %)
68,531
(1.61 %)
23,142
(0.47 %)
4 American flamingo
GCA_009819805.1
n/a n/a 12,384
(1.73 %)
23,611
(2.05 %)
n/a 43.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,529
(100.00 %)
496,877
(7.22 %)
162,522
(0.74 %)
6,684,675
(20.14 %)
0
(0 %)
75,413
(0.70 %)
51,895
(5.89 %)
50,715
(3.23 %)
5 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1
n/a n/a 15,901
(2.25 %)
61,133
(6.37 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,411
(100.00 %)
2,043,181
(23.64 %)
1,141,539
(11.35 %)
3,668,314
(38.60 %)
0
(0 %)
805,945
(6.00 %)
40,218
(2.14 %)
24,243
(1.22 %)
6 American pika (hap2 mOchPri1 2023)
GCA_030435715.1
n/a n/a 16,911
(1.23 %)
21,107
(1.43 %)
n/a 44.43
(100.00 %)
6
(0.00 %)
375
(0.00 %)
6,123
(100.00 %)
1,808,768
(10.42 %)
561,106
(21.05 %)
10,283,513
(45.97 %)
16
(0.00 %)
2,348,969
(6.68 %)
54,919
(1.33 %)
26,689
(0.79 %)
7 American alligator (2023 genbank)
GCA_030867065.1
n/a n/a 14,487
(0.97 %)
20,444
(1.61 %)
n/a 45.04
(99.81 %)
136
(0.19 %)
136
(0.19 %)
806
(99.81 %)
3,380,365
(43.12 %)
560,127
(2.00 %)
12,524,244
(32.47 %)
1
(0.00 %)
370,300
(1.41 %)
50,852
(2.67 %)
30,117
(1.71 %)
8 amphioxus (hap1 2024)
GCA_035149815.1
n/a n/a 5,253
(0.98 %)
41,226
(12.64 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
65
(100.00 %)
126,311
(1.61 %)
178,951
(7.87 %)
2,137,821
(27.19 %)
1
(0.00 %)
268,231
(4.56 %)
44,152
(5.26 %)
29,152
(2.99 %)
9 Anna's hummingbird
GCA_003957575.1
n/a n/a 11,084
(1.90 %)
19,321
(2.14 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
3,803
(100.00 %)
475,493
(7.41 %)
223,791
(1.37 %)
5,585,250
(20.30 %)
0
(0 %)
113,614
(1.01 %)
14,903
(1.46 %)
13,444
(1.06 %)
10 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1
n/a n/a 17,318
(1.49 %)
80,097
(5.79 %)
n/a 43.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11,436
(100.00 %)
5,482,467
(36.71 %)
1,454,729
(18.84 %)
6,756,226
(47.56 %)
0
(0 %)
1,722,514
(9.86 %)
92,057
(3.50 %)
34,309
(1.32 %)
11 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1
n/a n/a 17,085
(1.73 %)
19,317
(1.59 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
0
(0 %)
210
(0.00 %)
173
(100.00 %)
2,818,446
(29.44 %)
316,646
(8.90 %)
11,192,133
(31.47 %)
1
(0.00 %)
1,151,809
(3.75 %)
52,135
(1.67 %)
44,943
(1.23 %)
12 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1
n/a n/a 14,032
(2.44 %)
39,770
(4.92 %)
n/a 38.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,617
(100.00 %)
1,808,149
(37.98 %)
583,449
(10.56 %)
4,203,368
(40.67 %)
0
(0 %)
559,424
(5.24 %)
24,867
(2.06 %)
14,134
(0.93 %)
13 Asian bonytongue
GCA_900964985.2
n/a n/a 16,053
(2.73 %)
74,777
(7.26 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,351
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
0
(0 %)
142,849
(1.57 %)
85,546
(10.82 %)
65,542
(5.07 %)
14 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1
n/a n/a 17,906
(1.18 %)
21,966
(1.14 %)
n/a 41.14
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,361
(100.00 %)
3,818,524
(29.72 %)
533,426
(3.22 %)
14,381,781
(47.30 %)
0
(0 %)
613,432
(1.61 %)
50,264
(1.15 %)
21,331
(0.51 %)
15 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1
n/a n/a 18,969
(1.75 %)
20,207
(1.36 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
3
(0.00 %)
79
(0.00 %)
262
(100.00 %)
3,650,963
(38.06 %)
355,322
(2.63 %)
14,837,952
(31.37 %)
1
(0.00 %)
267,829
(0.92 %)
37,174
(1.87 %)
37,977
(1.58 %)
16 Atlantic halibut
GCA_009819745.1
n/a n/a 16,554
(3.01 %)
54,832
(7.45 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,008
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
0
(0 %)
297,396
(3.46 %)
36,868
(2.33 %)
24,401
(1.38 %)
17 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1
n/a n/a 11,960
(0.40 %)
25,618
(1.25 %)
n/a 42.94
(99.99 %)
0
(0 %)
1,633
(0.01 %)
1,412
(100.00 %)
7,453,535
(49.31 %)
686,063
(13.00 %)
19,985,605
(50.32 %)
8
(0.00 %)
3,309,683
(5.86 %)
86,138
(2.16 %)
30,350
(0.41 %)
18 Atlantic cod
GCA_902167395.1
n/a n/a 13,366
(2.68 %)
66,599
(9.29 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,727
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
0
(0 %)
635,348
(7.05 %)
87,167
(8.03 %)
47,003
(3.66 %)
19 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2
n/a n/a 15,331
(2.42 %)
52,370
(6.91 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
0
(0 %)
74
(0.00 %)
1,049
(100.00 %)
1,454,631
(18.29 %)
383,946
(4.34 %)
4,363,016
(32.69 %)
0
(0 %)
445,382
(4.43 %)
56,416
(3.08 %)
20,355
(1.02 %)
20 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1
n/a n/a 13,505
(1.03 %)
18,978
(1.47 %)
n/a 45.32
(99.98 %)
0
(0 %)
26
(0.02 %)
3,482
(100.00 %)
6,880,857
(41.88 %)
1,099,932
(7.47 %)
8,156,735
(56.68 %)
0
(0 %)
4,129,545
(10.90 %)
70,515
(2.88 %)
41,464
(1.12 %)
21 banded archerfish (fToxJac2 alternate hap 2021)
GCA_017976295.1
n/a n/a 15,211
(3.23 %)
41,620
(7.14 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
2,393
(100.00 %)
785,178
(17.57 %)
249,148
(8.36 %)
3,391,653
(26.49 %)
0
(0 %)
274,110
(3.20 %)
13,787
(0.93 %)
9,087
(0.56 %)
22 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1
n/a n/a 26,794
(3.15 %)
76,434
(5.64 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
8,035
(100.00 %)
4,084,361
(52.18 %)
538,411
(4.25 %)
7,659,980
(38.94 %)
0
(0 %)
450,884
(2.88 %)
58,008
(2.90 %)
19,160
(0.57 %)
23 Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021)
GCA_015227815.3
n/a n/a 11,132
(1.94 %)
20,993
(2.40 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
2,476
(100.00 %)
550,072
(10.78 %)
282,378
(2.00 %)
5,634,117
(20.43 %)
0
(0 %)
161,076
(1.17 %)
30,305
(2.79 %)
25,208
(1.64 %)
24 black rhinoceros (alternate hap 2021)
GCA_020826835.1
n/a n/a 19,000
(1.37 %)
22,547
(1.26 %)
n/a 41.56
(99.97 %)
0
(0 %)
178
(0.03 %)
1,199
(100.00 %)
4,340,245
(37.22 %)
564,468
(8.07 %)
14,384,523
(40.40 %)
0
(0 %)
941,914
(2.51 %)
44,971
(1.16 %)
34,023
(0.74 %)
25 black-capped chickadee (hap2 2023)
GCA_030490855.1
n/a n/a 11,495
(1.90 %)
22,202
(2.49 %)
n/a 42.77
(99.94 %)
0
(0 %)
240
(0.06 %)
157
(100.00 %)
560,436
(11.20 %)
441,102
(7.11 %)
5,126,888
(23.42 %)
1
(0.00 %)
485,675
(2.99 %)
35,457
(2.90 %)
20,157
(1.24 %)
26 black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023)
GCA_028501385.1
n/a n/a 12,650
(1.68 %)
22,959
(2.02 %)
n/a 44.62
(99.95 %)
0
(0 %)
223
(0.05 %)
733
(100.00 %)
483,413
(5.25 %)
221,284
(9.35 %)
6,264,499
(27.26 %)
4
(0.00 %)
646,822
(3.82 %)
42,776
(4.88 %)
36,156
(1.75 %)
27 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1
n/a n/a 15,274
(2.92 %)
51,453
(7.45 %)
n/a 43.07
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,239,364
(29.69 %)
354,703
(9.63 %)
3,006,556
(30.35 %)
2
(0.00 %)
588,441
(7.05 %)
53,503
(4.48 %)
28,830
(1.72 %)
28 blackcap
GCA_009819715.1
n/a n/a 11,586
(1.87 %)
22,618
(2.41 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,566
(100.00 %)
473,456
(5.97 %)
308,518
(2.29 %)
5,987,640
(19.64 %)
0
(0 %)
201,989
(1.45 %)
25,451
(2.38 %)
21,377
(1.34 %)
29 black-headed gull (Kunming 2023)
GCA_030820635.1
n/a n/a 12,902
(1.75 %)
23,180
(2.09 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
297
(100.00 %)
498,044
(5.37 %)
199,557
(4.44 %)
6,843,616
(23.12 %)
3
(0.00 %)
184,280
(1.44 %)
42,444
(3.62 %)
37,532
(1.85 %)
30 Blainville's beaked whale (mMesDen1 alternate hap 2022)
GCA_025094165.1
n/a n/a 17,838
(1.54 %)
21,389
(1.35 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,198
(100.00 %)
3,542,727
(35.35 %)
650,369
(8.86 %)
10,971,320
(41.15 %)
0
(0 %)
1,286,122
(4.20 %)
62,389
(1.68 %)
34,595
(0.95 %)
31 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2
n/a n/a 16,997
(1.82 %)
20,609
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
10,999
(100.00 %)
3,126,800
(43.49 %)
454,452
(1.23 %)
9,916,868
(33.63 %)
0
(0 %)
296,938
(1.19 %)
55,436
(1.85 %)
38,786
(1.50 %)
32 blue-and-yellow macaw (hap2 2023)
GCA_028858555.1
n/a n/a 13,216
(1.69 %)
23,855
(2.07 %)
n/a 43.30
(99.92 %)
0
(0 %)
130
(0.08 %)
274
(100.00 %)
746,174
(21.96 %)
291,116
(9.91 %)
5,424,976
(28.69 %)
1
(0.00 %)
907,315
(4.95 %)
26,750
(2.02 %)
20,655
(1.17 %)
33 blunt-snouted clingfish
GCA_900650505.1
n/a n/a 12,494
(1.93 %)
44,967
(5.14 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,174
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
0
(0 %)
344,768
(3.42 %)
23,532
(1.46 %)
12,368
(0.66 %)
34 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1
n/a n/a 13,882
(2.27 %)
45,919
(5.98 %)
n/a 39.50
(99.99 %)
0
(0 %)
45
(0.01 %)
3,194
(100.00 %)
803,073
(13.60 %)
258,404
(4.19 %)
4,674,614
(28.36 %)
0
(0 %)
339,851
(3.09 %)
15,524
(1.02 %)
9,057
(0.56 %)
35 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1
n/a n/a 12,424
(1.95 %)
46,550
(6.00 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,619
(100.00 %)
789,207
(14.61 %)
348,482
(20.98 %)
3,447,241
(38.72 %)
0
(0 %)
1,174,378
(8.68 %)
27,035
(4.16 %)
12,167
(0.85 %)
36 Bornean orangutan (AG05252 alternate hap 2023)
GCA_028885525.1
n/a n/a 19,820
(1.76 %)
20,399
(1.15 %)
n/a 40.98
(99.88 %)
36
(0.12 %)
36
(0.12 %)
251
(99.88 %)
5,232,617
(54.01 %)
1,003,539
(10.19 %)
14,858,575
(42.10 %)
0
(0 %)
2,511,941
(4.39 %)
42,467
(1.24 %)
29,563
(0.80 %)
37 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1
n/a n/a 17,791
(1.12 %)
22,667
(1.29 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
106
(0.00 %)
106
(0.00 %)
2,898
(100.00 %)
6,293,452
(41.30 %)
1,076,688
(17.94 %)
8,553,272
(57.13 %)
1
(0.00 %)
6,983,927
(14.02 %)
31,102
(1.31 %)
23,419
(0.57 %)
38 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1
n/a n/a 17,612
(1.68 %)
22,099
(1.91 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
25
(0.00 %)
541
(0.01 %)
365
(100.00 %)
2,748,918
(17.16 %)
827,542
(4.51 %)
8,832,809
(39.20 %)
2
(0.00 %)
1,074,853
(3.77 %)
26,416
(1.35 %)
22,242
(0.81 %)
39 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1
n/a n/a 17,954
(1.51 %)
19,994
(1.30 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
0
(0 %)
240
(0.00 %)
800
(100.00 %)
3,723,164
(34.96 %)
809,880
(11.02 %)
11,359,211
(41.42 %)
2
(0.00 %)
1,554,419
(4.60 %)
60,067
(1.55 %)
36,564
(0.95 %)
40 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1
n/a n/a 13,813
(1.89 %)
27,088
(4.55 %)
n/a 40.60
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
297
(100.00 %)
886,999
(13.24 %)
358,077
(7.37 %)
4,625,277
(36.22 %)
0
(0 %)
529,249
(5.78 %)
43,764
(2.79 %)
26,363
(1.18 %)
41 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1
n/a n/a 17,999
(1.60 %)
76,655
(5.58 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
10,799
(100.00 %)
5,994,257
(39.29 %)
1,126,685
(10.35 %)
6,996,991
(46.02 %)
0
(0 %)
1,131,145
(6.97 %)
71,016
(3.36 %)
27,805
(1.08 %)
42 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1
n/a n/a 15,228
(3.42 %)
41,322
(7.36 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,592
(100.00 %)
972,098
(18.43 %)
155,031
(1.41 %)
3,452,400
(21.36 %)
0
(0 %)
85,576
(1.51 %)
15,255
(1.12 %)
10,648
(0.72 %)
43 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2
n/a n/a 18,319
(1.81 %)
18,772
(1.48 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,096
(100.00 %)
3,724,021
(42.91 %)
488,356
(1.26 %)
10,891,276
(33.15 %)
0
(0 %)
395,508
(1.40 %)
44,467
(1.57 %)
41,289
(1.38 %)
44 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2
n/a n/a 12,041
(1.42 %)
15,226
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
15,046
(100.00 %)
2,939,291
(43.50 %)
544,849
(1.76 %)
7,650,345
(32.74 %)
0
(0 %)
294,817
(1.43 %)
39,099
(2.44 %)
34,631
(1.88 %)
45 carmine bee-eater
GCA_009819585.1
n/a n/a 12,381
(1.76 %)
28,865
(2.78 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,296
(100.00 %)
542,765
(7.77 %)
204,389
(1.06 %)
6,415,832
(21.53 %)
0
(0 %)
133,280
(1.22 %)
31,638
(2.54 %)
23,845
(1.27 %)
46 channel bull blenny
GCA_900634435.1
n/a n/a 15,980
(2.79 %)
53,680
(6.62 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,656
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
0
(0 %)
386,762
(3.56 %)
20,338
(1.21 %)
10,996
(0.60 %)
47 chicken (Huxu 2023)
GCA_024206055.2
n/a n/a 13,405
(2.26 %)
24,435
(2.45 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
41
(100.00 %)
704,190
(12.54 %)
502,701
(5.74 %)
5,731,097
(23.50 %)
0
(0 %)
573,152
(3.69 %)
27,781
(2.90 %)
22,282
(1.53 %)
48 chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022)
GCA_027408205.1
n/a n/a 11,740
(2.36 %)
21,473
(2.56 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
2,263
(100.00 %)
551,116
(10.78 %)
241,638
(4.43 %)
4,973,260
(21.77 %)
0
(0 %)
285,039
(2.53 %)
21,151
(2.71 %)
18,001
(1.56 %)
49 chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022)
GCA_027408225.1
n/a n/a 13,037
(2.20 %)
23,550
(2.37 %)
n/a 42.31
(99.81 %)
0
(0 %)
460
(0.19 %)
252
(100.00 %)
681,166
(12.04 %)
381,093
(7.09 %)
5,610,806
(24.65 %)
3
(0.00 %)
489,064
(3.62 %)
25,664
(2.75 %)
21,023
(1.48 %)
50 chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022)
GCA_027408255.1
n/a n/a 11,339
(2.33 %)
20,588
(2.51 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,684
(100.00 %)
537,847
(10.84 %)
217,964
(3.81 %)
4,879,985
(21.43 %)
0
(0 %)
236,343
(2.20 %)
19,653
(2.66 %)
17,140
(1.52 %)
51 chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023)
GCA_027557775.1
n/a n/a 12,855
(2.22 %)
23,147
(2.37 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
566
(0.26 %)
246
(100.00 %)
672,973
(12.00 %)
342,156
(6.53 %)
5,690,712
(23.98 %)
5
(0.00 %)
438,910
(3.29 %)
24,413
(2.63 %)
20,581
(1.48 %)
52 chicken (matHap)
GCF_016699485.2
74,716
(9.14 %)
n/a 13,128
(2.33 %)
23,484
(2.48 %)
72,013
(9.34 %)
42.20
(99.68 %)
463
(0.32 %)
463
(0.32 %)
677
(99.68 %)
697,827
(12.53 %)
290,892
(2.63 %)
5,887,021
(21.30 %)
1
(0.00 %)
268,636
(2.17 %)
24,469
(2.59 %)
20,885
(1.55 %)
53 chicken (patHap)
GCF_016700215.1
55,865
(8.86 %)
n/a 12,310
(2.41 %)
22,056
(2.57 %)
n/a 42.20
(99.65 %)
254
(0.35 %)
254
(0.35 %)
509
(99.65 %)
604,452
(10.76 %)
232,416
(2.03 %)
5,541,059
(20.23 %)
2
(0.00 %)
203,559
(1.88 %)
22,185
(2.62 %)
19,239
(1.58 %)
54 chimpanzee (AG18354 alternate hap 2023)
GCA_028858805.1
n/a n/a 20,001
(1.79 %)
21,230
(1.19 %)
n/a 40.62
(99.78 %)
22
(0.22 %)
22
(0.22 %)
141
(99.78 %)
5,092,768
(48.83 %)
946,933
(11.75 %)
14,844,947
(42.39 %)
0
(0 %)
3,140,392
(5.61 %)
47,662
(1.21 %)
29,340
(0.82 %)
55 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1
n/a n/a 18,538
(1.34 %)
21,724
(1.27 %)
n/a 41.09
(99.48 %)
0
(0 %)
190
(0.52 %)
700
(100.00 %)
3,362,899
(34.48 %)
678,384
(4.11 %)
12,024,241
(39.52 %)
7
(0.00 %)
1,198,886
(3.98 %)
48,960
(1.19 %)
34,434
(0.79 %)
56 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1
n/a n/a 15,165
(2.44 %)
46,105
(6.16 %)
n/a 39.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,163
(100.00 %)
1,546,066
(27.08 %)
537,737
(9.87 %)
4,485,153
(30.70 %)
0
(0 %)
726,611
(6.01 %)
14,774
(0.81 %)
8,304
(0.43 %)
57 climbing perch
GCA_900650485.1
n/a n/a 14,940
(3.51 %)
39,688
(7.41 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
0
(0 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,993
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
0
(0 %)
150,484
(2.39 %)
10,131
(0.86 %)
7,444
(0.57 %)
58 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1
n/a n/a 16,430
(1.52 %)
21,057
(1.44 %)
n/a 41.79
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 10,377
(100.00 %)
3,845,437
(33.39 %)
794,587
(2.14 %)
10,765,695
(33.40 %)
0
(0 %)
461,307
(1.56 %)
56,375
(2.45 %)
47,473
(1.74 %)
59 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1
n/a n/a 13,999
(1.21 %)
18,145
(2.02 %)
n/a 44.85
(100.00 %)
0
(0 %)
286
(0.00 %)
827
(100.00 %)
844,126
(6.57 %)
462,086
(2.56 %)
8,237,807
(37.72 %)
0
(0 %)
573,955
(2.91 %)
30,098
(0.96 %)
16,208
(0.52 %)
60 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1
n/a n/a 14,863
(0.75 %)
15,426
(0.89 %)
n/a 39.41
(100.00 %)
313
(0.00 %)
313
(0.00 %)
12,446
(100.00 %)
5,846,769
(38.56 %)
987,917
(1.99 %)
16,764,356
(40.14 %)
0
(0 %)
345,940
(1.13 %)
13,303
(0.35 %)
10,338
(0.23 %)
61 common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021)
GCA_017976305.1
n/a n/a 12,464
(1.91 %)
24,623
(2.50 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
505,582
(10.93 %)
292,484
(2.48 %)
6,061,828
(21.38 %)
0
(0 %)
303,976
(1.80 %)
24,010
(1.80 %)
19,613
(1.10 %)
62 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1
n/a n/a 13,073
(0.44 %)
43,036
(1.95 %)
n/a 44.07
(100.00 %)
14
(0.00 %)
14
(0.00 %)
12,033
(100.00 %)
1,489,788
(2.18 %)
2,621,157
(9.04 %)
17,154,926
(55.44 %)
0
(0 %)
3,161,179
(6.09 %)
581,115
(7.68 %)
54,845
(0.65 %)
63 common myna (bArcTri1 alternate hap 2023)
GCA_027559525.1
n/a n/a 10,692
(1.77 %)
20,925
(2.29 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,221
(100.00 %)
328,602
(4.16 %)
604,057
(8.02 %)
5,233,128
(25.06 %)
0
(0 %)
479,200
(3.38 %)
25,210
(3.70 %)
18,123
(1.22 %)
64 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1
n/a n/a 15,974
(1.72 %)
20,563
(1.66 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
10,459
(100.00 %)
2,634,333
(23.76 %)
703,674
(2.65 %)
8,909,525
(33.95 %)
0
(0 %)
343,235
(1.37 %)
50,430
(2.54 %)
45,982
(1.75 %)
65 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1
n/a n/a 14,904
(2.99 %)
43,194
(7.09 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,318
(100.00 %)
1,128,080
(18.77 %)
328,975
(8.35 %)
3,952,898
(31.64 %)
0
(0 %)
410,353
(4.52 %)
26,979
(2.08 %)
15,469
(0.95 %)
66 common swift (bApuApu2 alternate hap 2021)
GCA_020740585.1
n/a n/a 11,653
(1.89 %)
19,731
(2.20 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
1,697
(100.00 %)
443,384
(6.09 %)
185,968
(1.18 %)
5,916,553
(20.88 %)
0
(0 %)
109,215
(0.89 %)
18,864
(1.75 %)
15,032
(0.87 %)
67 common tern
GCA_009819645.1
n/a n/a 12,773
(1.79 %)
24,751
(2.23 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,235
(100.00 %)
549,460
(7.58 %)
204,051
(1.02 %)
6,880,566
(20.70 %)
0
(0 %)
116,485
(1.17 %)
47,352
(3.95 %)
42,123
(2.18 %)
68 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1
n/a n/a 12,074
(0.39 %)
46,329
(1.82 %)
n/a 44.48
(99.99 %)
156
(0.01 %)
156
(0.01 %)
24,351
(99.99 %)
1,186,360
(1.65 %)
2,279,941
(13.33 %)
14,665,548
(61.48 %)
2
(0.00 %)
4,594,926
(9.74 %)
405,097
(4.49 %)
61,648
(0.70 %)
69 common vampire bat (HL8 alternate hap 2022)
GCA_022682395.1
n/a n/a 17,520
(1.75 %)
18,995
(1.67 %)
n/a 42.89
(99.99 %)
0
(0 %)
580
(0.01 %)
430
(100.00 %)
2,597,497
(28.17 %)
356,620
(2.88 %)
10,797,225
(31.23 %)
25
(0.00 %)
271,481
(1.34 %)
61,931
(2.30 %)
43,396
(1.30 %)
70 common yellowthroat
GCA_009764545.1
n/a n/a 10,611
(1.77 %)
21,125
(2.21 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
4,976
(100.00 %)
422,889
(5.99 %)
294,928
(2.71 %)
5,928,421
(19.76 %)
0
(0 %)
245,763
(1.64 %)
21,397
(1.91 %)
17,659
(1.14 %)
71 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1
n/a n/a 5,231
(0.27 %)
47,644
(1.48 %)
n/a 44.62
(99.99 %)
144
(0.01 %)
144
(0.01 %)
21,561
(99.99 %)
2,803,873
(49.20 %)
655,416
(2.69 %)
7,558,550
(67.05 %)
0
(0 %)
912,917
(5.74 %)
181,626
(10.52 %)
19,591
(0.39 %)
72 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1
n/a n/a 13,622
(2.81 %)
43,285
(6.93 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,125
(100.00 %)
1,741,373
(32.89 %)
182,926
(2.01 %)
3,659,106
(21.68 %)
1
(0.00 %)
138,669
(1.93 %)
27,693
(1.89 %)
19,848
(1.23 %)
73 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1
n/a n/a 14,955
(0.23 %)
n/a n/a 45.61
(99.80 %)
2,431
(0.20 %)
2,431
(0.20 %)
5,958
(99.80 %)
20,007,151
(76.28 %)
5,951,819
(19.40 %)
5,958
(99.80 %)
49
(0.00 %)
n/a 991,009
(4.86 %)
91,447
(0.54 %)
74 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1
n/a n/a 13,192
(1.36 %)
19,293
(2.32 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,936
(100.00 %)
808,341
(4.31 %)
467,532
(2.91 %)
6,418,809
(38.02 %)
0
(0 %)
518,786
(3.19 %)
107,080
(3.15 %)
17,213
(0.72 %)
75 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1
n/a n/a 4,509
(3.03 %)
16,936
(7.22 %)
n/a 38.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,713
(100.00 %)
430,197
(46.38 %)
101,926
(7.54 %)
1,077,239
(32.21 %)
0
(0 %)
149,644
(6.00 %)
10,612
(4.11 %)
3,661
(0.96 %)
76 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1
n/a n/a 14,861
(2.74 %)
42,996
(6.34 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
0
(0 %)
31
(0.01 %)
1,476
(100.00 %)
1,373,727
(30.17 %)
220,572
(4.38 %)
4,176,936
(27.32 %)
0
(0 %)
274,559
(2.86 %)
17,129
(1.04 %)
8,648
(0.51 %)
77 Dalmatian pelican (alternate hap 2023)
GCA_030449815.1
n/a n/a 12,766
(1.68 %)
26,055
(2.18 %)
n/a 43.44
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,284
(100.00 %)
607,561
(13.23 %)
239,649
(4.41 %)
6,086,519
(23.21 %)
0
(0 %)
260,915
(1.93 %)
38,398
(5.49 %)
35,285
(2.09 %)
78 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1
n/a n/a 18,895
(1.78 %)
24,235
(1.81 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,930
(100.00 %)
2,813,870
(23.75 %)
718,406
(5.18 %)
9,977,320
(37.24 %)
0
(0 %)
609,378
(2.37 %)
62,910
(2.66 %)
55,962
(1.97 %)
79 denticle herring
GCA_900700345.2
n/a n/a 14,119
(3.95 %)
47,988
(8.57 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,660
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
0
(0 %)
175,500
(3.05 %)
50,830
(8.72 %)
41,064
(4.69 %)
80 diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023)
GCA_027887205.1
n/a n/a 15,081
(1.08 %)
19,115
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.98 %)
0
(0 %)
127
(0.02 %)
59
(100.00 %)
4,093,707
(46.36 %)
404,046
(1.70 %)
11,113,266
(33.78 %)
1
(0.01 %)
405,600
(1.68 %)
111,129
(2.68 %)
30,307
(0.82 %)
81 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1
n/a n/a 16,788
(2.12 %)
50,338
(4.68 %)
n/a 41.27
(98.12 %)
0
(0 %)
641
(1.88 %)
182
(100.00 %)
2,709,759
(34.74 %)
798,364
(14.84 %)
5,418,190
(36.02 %)
1
(0.00 %)
1,397,111
(8.85 %)
30,055
(1.31 %)
21,119
(0.80 %)
82 Downy woodpecker (bDryPub1 alternate hap 2020)
GCA_014839825.1
n/a n/a 11,732
(1.74 %)
22,080
(2.25 %)
n/a 45.44
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,342
(100.00 %)
921,959
(20.95 %)
334,804
(3.26 %)
5,352,773
(31.27 %)
0
(0 %)
702,756
(4.12 %)
24,105
(1.81 %)
19,021
(1.21 %)
83 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1
n/a n/a 18,538
(1.23 %)
20,775
(1.09 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
0
(0 %)
89
(0.00 %)
167
(100.00 %)
4,455,227
(33.01 %)
444,021
(1.73 %)
14,946,847
(47.37 %)
1
(0.00 %)
504,439
(1.27 %)
29,828
(0.79 %)
24,008
(0.54 %)
84 East African grey crowned-crane
GCA_011004865.1
n/a n/a 11,799
(1.88 %)
22,122
(2.30 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
971
(100.00 %)
457,930
(6.40 %)
150,544
(0.85 %)
6,074,490
(20.16 %)
0
(0 %)
65,996
(0.78 %)
33,323
(3.81 %)
32,972
(2.41 %)
85 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1
n/a n/a 13,632
(0.43 %)
35,630
(1.52 %)
n/a 46.77
(99.99 %)
0
(0 %)
1,773
(0.01 %)
590
(100.00 %)
1,759,193
(1.98 %)
2,013,186
(16.21 %)
16,138,898
(60.55 %)
17
(0.00 %)
5,811,499
(9.67 %)
614,432
(5.85 %)
72,993
(0.75 %)
86 electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020)
GCA_013347915.1
n/a n/a 12,020
(3.63 %)
38,881
(7.31 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,629
(100.00 %)
429,509
(7.66 %)
432,260
(11.41 %)
2,049,609
(24.32 %)
0
(0 %)
486,181
(6.19 %)
35,597
(4.37 %)
27,662
(2.94 %)
87 epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021)
GCA_020745765.1
n/a n/a 12,650
(0.38 %)
20,614
(1.06 %)
n/a 42.75
(97.99 %)
0
(0 %)
3,552
(2.01 %)
4,000
(100.00 %)
9,489,793
(70.34 %)
976,827
(6.97 %)
21,183,330
(44.32 %)
1
(0.00 %)
3,092,395
(4.62 %)
42,917
(1.08 %)
13,522
(0.16 %)
88 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1
n/a n/a 13,583
(1.65 %)
15,403
(1.46 %)
n/a 41.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,327
(100.00 %)
3,139,035
(40.57 %)
480,111
(1.29 %)
9,106,061
(31.93 %)
0
(0 %)
342,175
(1.40 %)
39,139
(2.25 %)
38,863
(2.02 %)
89 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1
n/a n/a 9,910
(1.59 %)
11,315
(1.31 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,506
(100.00 %)
2,052,338
(42.25 %)
316,084
(1.64 %)
6,222,460
(33.12 %)
0
(0 %)
291,189
(1.91 %)
27,057
(1.96 %)
26,047
(1.75 %)
90 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1
n/a n/a 12,437
(1.51 %)
12,702
(1.22 %)
n/a 40.06
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
10,657
(100.00 %)
2,303,176
(35.38 %)
353,996
(1.49 %)
7,218,556
(31.67 %)
0
(0 %)
194,541
(1.24 %)
24,268
(1.07 %)
22,754
(0.97 %)
91 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1
n/a n/a 16,761
(1.66 %)
19,715
(1.37 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
105
(0.00 %)
105
(0.00 %)
16,473
(100.00 %)
3,118,266
(26.44 %)
829,463
(2.82 %)
9,700,482
(31.37 %)
0
(0 %)
353,652
(1.44 %)
14,146
(0.57 %)
12,571
(0.45 %)
92 Eurasian nightjar (alternate hap 2021)
GCA_907165095.1
n/a n/a 12,266
(1.90 %)
22,091
(2.30 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
0
(0 %)
25
(0.00 %)
2,502
(100.00 %)
458,278
(5.64 %)
212,205
(1.54 %)
6,032,224
(21.16 %)
0
(0 %)
151,625
(1.15 %)
21,942
(1.89 %)
19,235
(1.33 %)
93 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2
n/a n/a 19,268
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
41,043
(1.93 %)
42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,417,203
(31.72 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,720
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,257
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
54,563
(1.83 %)
94 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1
n/a n/a 19,332
(1.42 %)
22,424
(1.40 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
0
(0 %)
27
(0.00 %)
726
(100.00 %)
4,362,536
(31.74 %)
801,232
(4.02 %)
13,893,672
(37.73 %)
1
(0.00 %)
1,089,255
(2.94 %)
65,806
(4.13 %)
53,831
(1.83 %)
95 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1
n/a n/a 17,920
(3.03 %)
59,697
(6.61 %)
n/a 39.13
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
4,949
(100.00 %)
2,285,870
(44.17 %)
480,649
(10.13 %)
4,833,803
(39.56 %)
0
(0 %)
820,249
(6.21 %)
57,737
(4.15 %)
23,311
(1.22 %)
96 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1
n/a n/a 17,506
(1.26 %)
25,527
(1.52 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,699
(100.00 %)
2,400,784
(15.19 %)
1,062,793
(3.20 %)
13,284,496
(41.93 %)
0
(0 %)
768,770
(2.06 %)
77,009
(2.86 %)
75,481
(2.15 %)
97 European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017845.1
n/a n/a 14,971
(1.00 %)
20,099
(1.61 %)
n/a 44.79
(99.77 %)
0
(0 %)
130
(0.23 %)
156
(100.00 %)
1,536,611
(12.44 %)
471,903
(2.16 %)
11,129,943
(35.50 %)
1
(0.00 %)
522,759
(2.15 %)
138,047
(2.94 %)
31,391
(0.73 %)
98 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1
n/a n/a 14,220
(1.16 %)
21,979
(2.19 %)
n/a 44.64
(99.68 %)
0
(0 %)
177
(0.32 %)
381
(100.00 %)
1,169,660
(6.57 %)
432,998
(2.45 %)
8,403,791
(39.55 %)
1
(0.00 %)
711,098
(3.13 %)
82,695
(2.80 %)
33,414
(0.92 %)
99 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1
n/a n/a 15,419
(1.50 %)
21,175
(1.51 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 12,043
(100.00 %)
2,952,218
(30.62 %)
538,508
(2.18 %)
9,303,303
(34.20 %)
0
(0 %)
511,888
(2.10 %)
47,810
(2.50 %)
39,732
(1.82 %)
100 European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021)
GCA_901699165.2
n/a n/a 11,276
(1.79 %)
21,210
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,334
(100.00 %)
426,785
(4.89 %)
182,446
(0.97 %)
6,038,491
(20.24 %)
0
(0 %)
110,767
(1.11 %)
29,692
(2.35 %)
26,119
(1.59 %)
101 European starfish
GCA_902459445.1
n/a n/a 3,860
(0.82 %)
23,866
(8.36 %)
n/a 38.77
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
3,969
(100.00 %)
123,986
(1.40 %)
146,247
(6.44 %)
2,404,792
(37.16 %)
0
(0 %)
262,804
(5.18 %)
14,304
(1.48 %)
7,081
(0.79 %)
102 European robin (alternate hap 2021)
GCA_903797565.2
n/a n/a 11,359
(1.98 %)
21,437
(2.45 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
0
(0 %)
18
(0.00 %)
3,668
(100.00 %)
346,477
(2.88 %)
283,542
(2.49 %)
5,597,130
(19.71 %)
0
(0 %)
200,268
(1.37 %)
22,977
(2.32 %)
18,454
(1.24 %)
103 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1
n/a n/a 18,692
(1.72 %)
22,021
(1.36 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
10,863
(100.00 %)
4,055,957
(36.08 %)
1,513,576
(9.53 %)
11,306,811
(39.67 %)
0
(0 %)
1,995,176
(5.07 %)
20,865
(0.55 %)
15,533
(0.39 %)
104 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1
n/a n/a 14,619
(2.94 %)
50,389
(7.92 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
3,222
(100.00 %)
430,112
(3.88 %)
299,581
(6.89 %)
3,182,258
(27.97 %)
0
(0 %)
330,159
(4.99 %)
40,094
(3.66 %)
20,637
(1.37 %)
105 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1
n/a n/a 14,690
(3.17 %)
48,422
(7.90 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,915
(100.00 %)
1,138,190
(26.31 %)
249,865
(4.72 %)
3,352,038
(25.55 %)
0
(0 %)
232,419
(3.75 %)
36,828
(3.13 %)
27,093
(1.88 %)
106 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1
n/a n/a 17,416
(2.74 %)
60,936
(6.02 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
7,437
(100.00 %)
2,377,147
(47.98 %)
578,235
(8.27 %)
5,267,308
(40.22 %)
0
(0 %)
872,083
(6.16 %)
50,909
(3.45 %)
17,892
(0.86 %)
107 European shag (alternate hap 2023)
GCA_949628205.1
n/a n/a 11,681
(1.64 %)
22,195
(2.04 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,752
(100.00 %)
363,092
(4.61 %)
347,630
(2.63 %)
5,664,392
(21.56 %)
0
(0 %)
227,084
(1.83 %)
32,162
(3.60 %)
24,702
(1.39 %)
108 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1
n/a n/a 18,364
(1.79 %)
20,379
(1.63 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,256
(100.00 %)
3,049,618
(22.22 %)
852,708
(4.50 %)
10,501,392
(33.34 %)
0
(0 %)
706,136
(2.67 %)
17,629
(0.60 %)
15,048
(0.47 %)
109 Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021)
GCA_017639475.1
n/a n/a 11,836
(1.83 %)
21,119
(2.12 %)
n/a 42.78
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
1,147
(100.00 %)
443,887
(6.00 %)
149,233
(0.76 %)
6,328,128
(20.72 %)
0
(0 %)
76,306
(0.71 %)
37,413
(3.59 %)
34,823
(2.10 %)
110 fire-bellied toad (aBomBom1 alternate hap 2023)
GCA_027579415.1
n/a n/a 2,936
(0.15 %)
17,722
(1.38 %)
n/a 38.51
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 13,751
(100.00 %)
919,882
(3.50 %)
1,443,294
(10.50 %)
7,705,012
(57.28 %)
0
(0 %)
2,148,861
(9.45 %)
74,669
(1.25 %)
7,295
(0.13 %)
111 flier cichlid
GCA_007364235.1
n/a n/a 17,494
(2.06 %)
62,257
(5.73 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,986
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
0
(0 %)
240,032
(2.50 %)
26,445
(1.22 %)
12,638
(0.48 %)
112 Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035715.1
n/a n/a 14,392
(0.90 %)
17,909
(1.50 %)
n/a 42.86
(99.84 %)
213
(0.16 %)
213
(0.16 %)
836
(99.84 %)
1,440,070
(7.19 %)
620,131
(2.54 %)
10,919,950
(45.21 %)
2
(0.00 %)
523,070
(2.35 %)
47,933
(1.03 %)
18,609
(0.43 %)
113 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1
n/a n/a 13,745
(2.58 %)
50,416
(6.72 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
5,171
(100.00 %)
442,646
(4.09 %)
276,927
(5.42 %)
3,741,267
(26.25 %)
0
(0 %)
406,474
(4.11 %)
28,827
(2.28 %)
19,731
(1.36 %)
114 Gaboon caecilian
GCA_902459495.1
n/a n/a 12,821
(0.47 %)
30,612
(1.44 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,651
(100.00 %)
1,139,595
(1.64 %)
1,170,215
(3.77 %)
17,091,511
(52.44 %)
0
(0 %)
995,544
(2.57 %)
235,170
(4.50 %)
33,394
(0.50 %)
115 garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020)
GCA_014839765.1
n/a n/a 12,359
(1.95 %)
23,228
(2.46 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 775
(100.00 %)
485,213
(6.08 %)
333,505
(2.21 %)
6,358,327
(19.87 %)
0
(0 %)
180,073
(1.19 %)
26,594
(2.34 %)
22,492
(1.32 %)
116 Gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1
n/a n/a 14,254
(0.94 %)
23,016
(2.00 %)
n/a 45.13
(99.95 %)
0
(0 %)
61
(0.05 %)
298
(100.00 %)
1,230,357
(13.08 %)
350,230
(2.85 %)
11,854,314
(33.03 %)
2
(0.00 %)
335,615
(1.39 %)
39,919
(1.95 %)
26,198
(0.77 %)
117 giant manta (sMobBir1 2023)
GCA_030035685.1
n/a n/a 12,198
(0.42 %)
23,127
(1.17 %)
n/a 42.85
(98.49 %)
0
(0 %)
1,742
(1.51 %)
1,558
(100.00 %)
7,431,472
(52.41 %)
716,951
(7.28 %)
19,456,793
(50.99 %)
9
(0.01 %)
2,419,836
(4.27 %)
91,414
(1.45 %)
65,413
(0.90 %)
118 gilthead seabream
GCA_900880695.1
n/a n/a 13,090
(2.37 %)
48,927
(6.41 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,758
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
0
(0 %)
201,169
(2.33 %)
38,368
(2.40 %)
20,092
(1.12 %)
119 golden eagle (v1.4 alternate hap 2021)
GCA_902153765.2
n/a n/a 9,172
(1.85 %)
16,917
(2.12 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,855
(100.00 %)
377,153
(8.49 %)
117,959
(0.78 %)
4,418,970
(18.34 %)
0
(0 %)
37,962
(0.63 %)
27,767
(3.57 %)
25,543
(2.23 %)
120 Goodes thornscrub tortoise
GCA_007399395.1
n/a n/a 13,359
(0.95 %)
19,347
(1.51 %)
n/a 44.27
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,736
(100.00 %)
1,404,513
(13.79 %)
334,726
(2.35 %)
9,735,007
(33.33 %)
0
(0 %)
468,758
(1.89 %)
61,680
(2.32 %)
18,869
(0.54 %)
121 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1
n/a n/a 13,758
(1.02 %)
16,909
(1.62 %)
n/a 41.53
(99.01 %)
19
(0.99 %)
19
(0.99 %)
52
(99.01 %)
1,069,189
(6.12 %)
410,262
(1.25 %)
11,390,195
(32.28 %)
0
(0 %)
233,593
(0.96 %)
60,835
(1.92 %)
23,191
(0.77 %)
122 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1
n/a n/a 12,662
(0.70 %)
15,124
(0.89 %)
n/a 37.74
(100.00 %)
24
(0.00 %)
24
(0.00 %)
8,086
(100.00 %)
4,098,004
(25.33 %)
806,470
(2.98 %)
16,244,072
(43.39 %)
0
(0 %)
n/a 24,879
(0.67 %)
15,867
(0.39 %)
123 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1
n/a n/a 17,156
(1.53 %)
18,190
(1.33 %)
n/a 40.25
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
9,510
(100.00 %)
3,455,580
(34.94 %)
530,053
(1.56 %)
10,927,458
(32.64 %)
0
(0 %)
323,766
(1.34 %)
38,976
(1.13 %)
37,317
(1.05 %)
124 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1
n/a n/a 12,760
(1.57 %)
14,423
(1.42 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,537
(100.00 %)
2,725,227
(31.66 %)
616,862
(3.40 %)
8,041,744
(32.68 %)
0
(0 %)
465,446
(1.97 %)
32,293
(2.35 %)
29,871
(1.57 %)
125 great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020)
GCA_013368595.1
n/a n/a 11,630
(1.85 %)
20,866
(2.20 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
1,395
(100.00 %)
421,187
(9.08 %)
159,172
(0.96 %)
5,602,689
(22.75 %)
0
(0 %)
169,408
(1.60 %)
29,548
(2.77 %)
25,299
(1.70 %)
126 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1
n/a n/a 20
(0.30 %)
63
(2.06 %)
n/a 45.02
(99.98 %)
0
(0 %)
28
(0.02 %)
39
(100.00 %)
8,165
(60.43 %)
2,740
(27.09 %)
15,863
(31.63 %)
0
(0 %)
16,359
(15.02 %)
167
(5.51 %)
65
(0.61 %)
127 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1
n/a n/a 14,896
(1.85 %)
18,939
(1.59 %)
n/a 40.69
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
13,426
(100.00 %)
2,426,330
(34.43 %)
418,341
(1.36 %)
8,763,234
(27.86 %)
0
(0 %)
108,521
(0.55 %)
24,370
(1.08 %)
22,940
(1.00 %)
128 greater pipefish
GCA_901709685.1
n/a n/a 10,795
(5.59 %)
33,380
(12.07 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,376
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
0
(0 %)
64,742
(2.40 %)
34,104
(12.82 %)
25,350
(6.24 %)
129 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1
n/a n/a 13,681
(4.93 %)
45,034
(11.64 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,533
(100.00 %)
460,038
(18.47 %)
163,838
(7.90 %)
1,681,190
(29.08 %)
0
(0 %)
141,147
(3.92 %)
47,523
(15.60 %)
33,138
(6.10 %)
130 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1
n/a n/a 13,412
(4.76 %)
45,946
(11.50 %)
n/a 44.34
(99.99 %)
0
(0 %)
95
(0.01 %)
251
(100.00 %)
494,547
(20.10 %)
204,804
(10.66 %)
1,444,044
(34.08 %)
0
(0 %)
208,543
(5.33 %)
47,904
(17.47 %)
32,381
(5.25 %)
131 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1
n/a n/a 13,432
(2.10 %)
50,930
(6.39 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,952
(100.00 %)
2,495,763
(38.80 %)
473,105
(6.27 %)
3,444,123
(38.56 %)
0
(0 %)
474,250
(4.43 %)
35,298
(1.94 %)
13,822
(0.66 %)
132 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1
n/a n/a 15,483
(3.45 %)
47,484
(7.95 %)
n/a 44.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,805
(100.00 %)
1,400,150
(23.78 %)
738,163
(17.35 %)
2,460,977
(35.90 %)
0
(0 %)
605,154
(7.13 %)
20,794
(2.09 %)
11,413
(0.80 %)
133 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2
n/a n/a 13,635
(1.05 %)
19,414
(1.61 %)
n/a 44.16
(99.95 %)
60
(0.05 %)
60
(0.05 %)
6,797
(99.95 %)
3,221,668
(44.97 %)
275,275
(1.28 %)
9,802,895
(32.14 %)
2
(0.00 %)
394,278
(1.72 %)
45,469
(1.48 %)
25,997
(0.89 %)
134 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1
n/a n/a 19,129
(1.37 %)
24,628
(1.24 %)
n/a 41.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 14,442
(100.00 %)
3,892,130
(35.74 %)
874,864
(15.70 %)
11,484,916
(45.69 %)
0
(0 %)
2,048,708
(5.99 %)
73,507
(1.72 %)
41,124
(0.98 %)
135 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1
n/a n/a 16,645
(1.92 %)
62,533
(4.55 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
7,253
(100.00 %)
5,166,731
(67.78 %)
750,850
(11.35 %)
5,903,440
(54.20 %)
0
(0 %)
1,408,406
(7.28 %)
90,235
(5.58 %)
15,520
(0.51 %)
136 gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020)
GCA_015220155.1
n/a n/a 6,534
(1.74 %)
12,152
(1.97 %)
n/a 42.70
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,370
(100.00 %)
179,674
(3.19 %)
76,165
(0.79 %)
2,908,228
(16.85 %)
0
(0 %)
20,525
(0.41 %)
11,838
(2.15 %)
9,707
(1.04 %)
137 Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022)
GCA_026419925.1
n/a n/a 11,838
(1.64 %)
24,014
(2.16 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,969
(100.00 %)
405,109
(3.51 %)
220,222
(6.17 %)
4,708,177
(25.30 %)
0
(0 %)
436,752
(2.86 %)
58,446
(5.44 %)
28,571
(1.65 %)
138 Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021)
GCA_020740675.1
n/a n/a 7,477
(1.92 %)
14,094
(2.40 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,762
(100.00 %)
296,732
(12.20 %)
135,408
(4.08 %)
3,123,655
(20.92 %)
0
(0 %)
142,659
(1.84 %)
23,288
(3.74 %)
13,506
(1.30 %)
139 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1
n/a n/a 11,130
(1.23 %)
22,071
(1.36 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 31,856
(100.00 %)
2,958,239
(41.25 %)
788,242
(4.52 %)
6,056,268
(41.88 %)
0
(0 %)
532,149
(2.74 %)
36,143
(1.96 %)
23,949
(1.02 %)
140 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1
n/a n/a 20,391
(1.63 %)
20,668
(1.37 %)
n/a 41.62
(100.00 %)
0
(0 %)
83
(0.00 %)
545
(100.00 %)
3,778,764
(35.17 %)
563,345
(3.63 %)
13,524,869
(35.56 %)
0
(0 %)
369,754
(1.46 %)
48,164
(1.90 %)
44,065
(1.33 %)
141 hoatzin (hap2 2023)
GCA_030867165.1
n/a n/a 12,349
(1.54 %)
27,206
(2.21 %)
n/a 45.91
(100.00 %)
212
(0.00 %)
212
(0.00 %)
535
(100.00 %)
529,757
(21.69 %)
235,999
(14.32 %)
4,845,810
(31.86 %)
0
(0 %)
1,017,817
(5.90 %)
53,781
(5.77 %)
44,601
(2.35 %)
142 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1
n/a n/a 15,058
(2.50 %)
46,340
(5.85 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
2,131
(100.00 %)
1,642,351
(37.42 %)
389,169
(5.43 %)
4,687,710
(35.55 %)
0
(0 %)
541,909
(4.77 %)
34,408
(1.75 %)
16,136
(0.80 %)
143 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1
n/a n/a 15,006
(0.28 %)
22,481
(0.80 %)
n/a 45.05
(99.53 %)
225
(0.03 %)
2,781
(0.47 %)
2,532
(99.97 %)
1,344,546
(5.76 %)
2,364,825
(28.34 %)
5,088
(99.53 %)
5
(0.00 %)
14,350,128
(14.12 %)
89,340
(2.10 %)
82,092
(1.20 %)
144 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1
n/a n/a 16,789
(1.65 %)
18,017
(1.36 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
210
(0.00 %)
821
(100.00 %)
3,146,381
(34.68 %)
430,664
(5.91 %)
13,246,059
(32.62 %)
0
(0 %)
714,785
(2.15 %)
37,293
(2.80 %)
35,249
(2.66 %)
145 hourglass treefrog (maternal 2023)
GCA_027789725.1
n/a n/a 14,359
(0.89 %)
32,575
(2.67 %)
n/a 43.88
(95.18 %)
788
(4.82 %)
788
(4.82 %)
3,358
(95.18 %)
922,807
(2.38 %)
1,744,603
(15.45 %)
10,318,168
(48.47 %)
0
(0 %)
3,525,571
(8.67 %)
244,270
(5.02 %)
29,547
(0.61 %)
146 house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022)
GCA_027406555.1
n/a n/a 12,027
(1.89 %)
23,973
(2.49 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
385,230
(3.05 %)
398,497
(5.70 %)
5,772,203
(22.69 %)
0
(0 %)
478,308
(3.12 %)
28,740
(2.98 %)
21,451
(1.28 %)
147 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1
n/a n/a 661
(0.88 %)
720
(0.54 %)
n/a 38.59
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,806
(100.00 %)
97,279
(72.21 %)
40,071
(55.89 %)
208,928
(64.94 %)
0
(0 %)
239,612
(15.41 %)
506
(0.31 %)
327
(0.20 %)
148 house sparrow (hap2 2024)
GCA_036417895.1
n/a n/a 12,201
(1.59 %)
24,721
(2.19 %)
n/a 44.46
(100.00 %)
0
(0 %)
182
(0.00 %)
482
(100.00 %)
629,688
(12.73 %)
644,409
(14.12 %)
5,103,050
(31.93 %)
0
(0 %)
899,607
(5.60 %)
33,424
(2.42 %)
23,096
(1.05 %)
149 human (mHomSap3 WGS:JACSEX01 2021)
GCA_016695395.2
n/a n/a 20,401
(1.92 %)
20,682
(1.21 %)
n/a 40.87
(99.64 %)
0
(0 %)
1,217
(0.36 %)
950
(100.00 %)
5,350,025
(52.32 %)
1,006,502
(4.68 %)
15,969,368
(38.50 %)
5
(0.00 %)
1,469,922
(2.89 %)
50,826
(1.08 %)
27,969
(0.75 %)
150 human (WGS:JACSEW01 2021 alternate hap)
GCA_016700455.2
n/a n/a 19,667
(1.95 %)
20,065
(1.23 %)
n/a 40.96
(99.60 %)
0
(0 %)
1,172
(0.40 %)
994
(100.00 %)
5,086,372
(51.37 %)
932,450
(3.67 %)
15,152,141
(37.48 %)
3
(0.00 %)
1,198,599
(2.54 %)
49,325
(1.10 %)
27,202
(0.77 %)
151 Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022)
GCA_027474345.1
n/a n/a 11,806
(1.66 %)
21,429
(1.97 %)
n/a 43.73
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,343
(100.00 %)
508,803
(10.25 %)
162,918
(5.44 %)
6,029,969
(24.67 %)
0
(0 %)
224,585
(1.75 %)
27,953
(3.83 %)
24,431
(1.47 %)
152 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2
n/a n/a 19,096
(1.59 %)
20,674
(1.34 %)
n/a 41.99
(99.75 %)
0
(0 %)
277
(0.25 %)
1,435
(100.00 %)
5,290,422
(47.51 %)
478,946
(1.94 %)
12,568,313
(41.15 %)
0
(0 %)
1,196,258
(3.44 %)
45,850
(1.37 %)
36,573
(1.00 %)
153 Indian glassy fish
GCA_900651595.1
n/a n/a 14,412
(3.70 %)
41,944
(8.58 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
0
(0 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,774
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
0
(0 %)
195,444
(3.94 %)
15,419
(1.38 %)
8,375
(0.73 %)
154 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1
n/a n/a 17,858
(2.43 %)
32,738
(5.46 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
4,333
(100.00 %)
583,632
(3.71 %)
418,411
(3.74 %)
5,198,155
(21.50 %)
1
(0.00 %)
276,314
(1.94 %)
76,879
(3.71 %)
57,281
(2.37 %)
155 jewelled blenny
GCA_902148835.1
n/a n/a 15,945
(2.17 %)
101,825
(8.93 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
0
(0 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,228
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
0
(0 %)
541,432
(4.29 %)
138,484
(9.55 %)
86,420
(4.60 %)
156 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1
n/a n/a 14,960
(2.23 %)
74,436
(6.65 %)
n/a 43.94
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,370
(100.00 %)
1,620,688
(23.00 %)
902,057
(13.66 %)
4,547,953
(39.90 %)
0
(0 %)
892,097
(6.41 %)
129,990
(12.07 %)
77,992
(4.35 %)
157 kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023)
GCA_027595965.1
n/a n/a 8,732
(1.74 %)
16,473
(2.17 %)
n/a 45.10
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,819
(100.00 %)
314,902
(10.49 %)
133,061
(10.84 %)
3,656,435
(25.68 %)
0
(0 %)
519,192
(4.55 %)
32,592
(5.25 %)
26,472
(3.09 %)
158 kakapo (Jane alternate hap 2019)
GCA_004011185.1
n/a n/a 3,256
(1.65 %)
6,220
(1.98 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
3,728
(100.00 %)
127,817
(7.83 %)
53,447
(1.21 %)
1,502,789
(18.09 %)
0
(0 %)
44,014
(1.40 %)
5,487
(1.71 %)
4,787
(1.19 %)
159 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1
n/a n/a 14,982
(1.50 %)
19,185
(1.30 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 12,410
(100.00 %)
2,752,892
(35.61 %)
589,217
(10.15 %)
8,371,032
(41.11 %)
0
(0 %)
1,464,220
(5.92 %)
57,347
(3.41 %)
30,003
(1.05 %)
160 Korean giant-fin mudskipper
GCA_009829135.1
n/a n/a 13,470
(2.34 %)
42,799
(5.73 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,414
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
0
(0 %)
475,330
(4.51 %)
34,522
(2.54 %)
17,280
(0.96 %)
161 lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023)
GCA_028017155.1
n/a n/a 10,584
(1.75 %)
19,112
(2.09 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,892
(100.00 %)
363,564
(3.53 %)
235,220
(7.22 %)
5,072,834
(23.83 %)
0
(0 %)
224,788
(1.89 %)
24,909
(2.64 %)
22,061
(1.41 %)
162 lance-tailed manakin
GCA_009829205.1
n/a n/a 12,282
(1.85 %)
23,867
(2.36 %)
n/a 42.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,269
(100.00 %)
472,384
(7.01 %)
237,680
(1.65 %)
6,121,661
(19.48 %)
0
(0 %)
146,408
(1.08 %)
25,589
(2.05 %)
21,299
(1.17 %)
163 lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022)
GCA_023634305.1
n/a n/a 12,458
(1.70 %)
22,259
(2.05 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,090
(100.00 %)
413,301
(3.46 %)
189,449
(5.28 %)
5,962,597
(22.07 %)
0
(0 %)
384,018
(2.74 %)
31,611
(2.72 %)
19,364
(0.92 %)
164 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1
n/a n/a 15,841
(2.36 %)
79,276
(8.51 %)
n/a 46.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,761
(100.00 %)
2,935,570
(42.17 %)
1,208,602
(21.28 %)
3,157,730
(42.63 %)
0
(0 %)
1,448,522
(11.27 %)
88,759
(6.30 %)
47,311
(2.77 %)
165 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1
n/a n/a 8,132
(2.11 %)
25,878
(4.67 %)
n/a 38.55
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,088
(100.00 %)
260,789
(2.73 %)
158,564
(2.12 %)
3,023,128
(27.39 %)
0
(0 %)
71,421
(1.44 %)
9,678
(1.02 %)
7,876
(0.74 %)
166 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1
n/a n/a 13,155
(1.15 %)
22,239
(2.06 %)
n/a 41.01
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
6,800
(100.00 %)
1,155,093
(7.75 %)
707,777
(4.25 %)
7,071,611
(44.00 %)
0
(0 %)
701,636
(4.02 %)
104,556
(4.39 %)
22,349
(0.88 %)
167 leatherback sea turtle
GCA_009762595.1
n/a n/a 10,857
(1.01 %)
15,585
(1.46 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,982
(100.00 %)
1,090,219
(15.03 %)
206,192
(1.19 %)
7,154,939
(33.03 %)
0
(0 %)
432,559
(2.40 %)
25,155
(1.42 %)
14,585
(0.57 %)
168 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2
n/a n/a 11,035
(1.05 %)
16,064
(1.50 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
7
(0.00 %)
7
(0.00 %)
9,006
(100.00 %)
2,685,200
(47.08 %)
208,060
(1.19 %)
7,184,246
(33.31 %)
0
(0 %)
442,748
(2.46 %)
25,133
(1.42 %)
15,054
(0.75 %)
169 lesser kestrel (alternate hap 2021)
GCA_017639645.1
n/a n/a 12,578
(1.83 %)
22,257
(2.16 %)
n/a 42.51
(98.97 %)
0
(0 %)
258
(1.03 %)
551
(100.00 %)
431,717
(3.61 %)
201,876
(1.38 %)
6,620,060
(19.16 %)
0
(0 %)
121,154
(0.99 %)
27,552
(2.26 %)
21,049
(1.02 %)
170 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1
n/a n/a 17,777
(1.27 %)
19,232
(1.28 %)
n/a 42.13
(92.75 %)
0
(0 %)
2,875
(7.25 %)
508
(100.00 %)
6,476,967
(33.93 %)
999,133
(2.78 %)
11,809,834
(40.52 %)
1
(0.00 %)
1,062,479
(2.36 %)
29,872
(0.82 %)
21,704
(0.51 %)
171 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1
n/a n/a 15,487
(0.88 %)
85,135
(3.39 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
6,593
(100.00 %)
5,572,163
(49.59 %)
1,052,072
(6.02 %)
7,246,646
(62.69 %)
0
(0 %)
2,503,507
(8.71 %)
157,768
(4.38 %)
14,966
(0.28 %)
172 lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023)
GCA_028389885.1
n/a n/a 10,465
(1.71 %)
19,083
(2.16 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 910
(100.00 %)
520,125
(6.78 %)
251,547
(4.21 %)
5,321,207
(21.53 %)
0
(0 %)
171,609
(1.68 %)
34,698
(5.69 %)
30,309
(2.73 %)
173 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1
n/a n/a 13,792
(2.19 %)
51,353
(6.60 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,620
(100.00 %)
2,536,362
(38.05 %)
513,115
(7.50 %)
3,542,854
(37.60 %)
0
(0 %)
576,452
(5.21 %)
31,814
(1.79 %)
14,668
(0.71 %)
174 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1
n/a n/a 15,033
(2.98 %)
51,296
(7.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
2,700
(100.00 %)
1,099,919
(28.68 %)
314,919
(9.57 %)
2,620,601
(30.23 %)
0
(0 %)
539,835
(6.99 %)
49,248
(4.19 %)
27,196
(1.69 %)
175 live sharksucker
GCA_900963505.1
n/a n/a 14,632
(3.51 %)
40,441
(7.51 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
0
(0 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,742
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
0
(0 %)
96,734
(1.60 %)
16,302
(1.34 %)
11,802
(0.89 %)
176 long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022)
GCA_023637925.1
n/a n/a 12,264
(2.01 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 40.99
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 230
(100.00 %)
498,393
(5.07 %)
266,700
(1.49 %)
6,131,743
(20.45 %)
0
(0 %)
94,007
(0.79 %)
15,809
(1.43 %)
13,620
(0.94 %)
177 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1
n/a n/a 15,137
(3.09 %)
52,499
(7.75 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,778
(100.00 %)
448,166
(4.67 %)
416,181
(8.95 %)
3,288,388
(27.99 %)
0
(0 %)
521,897
(4.93 %)
55,747
(4.41 %)
34,235
(2.29 %)
178 lumpfish
GCA_009769515.1
n/a n/a 12,848
(3.32 %)
43,711
(8.09 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,698
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
0
(0 %)
569,405
(6.42 %)
45,916
(5.21 %)
28,531
(2.48 %)
179 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1
n/a n/a 14,944
(3.23 %)
50,328
(8.09 %)
n/a 42.82
(99.97 %)
0
(0 %)
954
(0.03 %)
232
(100.00 %)
1,034,598
(25.93 %)
434,819
(13.21 %)
2,907,371
(30.18 %)
3
(0.00 %)
701,025
(6.86 %)
55,066
(5.20 %)
33,554
(2.42 %)
180 Macqueen's bustard (paternal 2024)
GCA_036418225.1
n/a n/a 11,814
(1.80 %)
23,161
(2.38 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
343
(100.00 %)
586,864
(13.28 %)
184,036
(5.91 %)
5,606,205
(25.25 %)
0
(0 %)
453,525
(2.87 %)
42,560
(7.71 %)
29,282
(2.77 %)
181 maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021)
GCA_017639665.1
n/a n/a 10,658
(1.74 %)
18,941
(1.98 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
4,278
(100.00 %)
326,479
(4.02 %)
141,715
(0.74 %)
5,600,372
(19.59 %)
0
(0 %)
41,184
(0.48 %)
27,330
(3.35 %)
26,330
(2.05 %)
182 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1
n/a n/a 14,564
(1.72 %)
71,604
(6.41 %)
n/a 41.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,737
(100.00 %)
1,662,251
(42.29 %)
439,119
(12.96 %)
3,776,125
(45.00 %)
0
(0 %)
888,556
(6.68 %)
56,507
(2.83 %)
15,006
(0.71 %)
183 Mauritius kestrel (alternate hap 2023)
GCA_963210275.1
n/a n/a 4,774
(1.89 %)
8,695
(2.32 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,259
(100.00 %)
135,092
(3.67 %)
112,042
(8.63 %)
1,739,144
(22.50 %)
0
(0 %)
103,391
(2.09 %)
12,908
(3.26 %)
7,476
(1.06 %)
184 Mauritius parakeet (alternate hap 2023)
GCA_963243765.1
n/a n/a 8,873
(1.81 %)
16,175
(2.24 %)
n/a 42.92
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,130
(100.00 %)
331,293
(6.89 %)
161,393
(5.94 %)
3,516,196
(24.86 %)
0
(0 %)
323,514
(3.25 %)
16,659
(1.74 %)
13,876
(1.32 %)
185 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1
n/a n/a 10,549
(1.13 %)
20,171
(2.08 %)
n/a 41.02
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
9,587
(100.00 %)
889,533
(7.84 %)
565,831
(6.37 %)
5,968,624
(41.74 %)
0
(0 %)
615,578
(4.07 %)
73,632
(3.80 %)
21,339
(1.17 %)
186 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1
n/a n/a 15,425
(0.94 %)
20,005
(1.48 %)
n/a 44.46
(95.51 %)
1,790
(4.49 %)
1,790
(4.49 %)
4,782
(95.51 %)
1,404,726
(11.28 %)
453,302
(2.47 %)
11,996,092
(34.08 %)
3
(0.00 %)
712,154
(2.19 %)
77,167
(2.14 %)
23,282
(0.51 %)
187 milkfish
GCA_902362175.1
n/a n/a 16,565
(3.38 %)
42,094
(6.75 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,392
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
0
(0 %)
595,219
(5.37 %)
21,531
(1.27 %)
13,616
(0.75 %)
188 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1
n/a n/a 20,412
(1.46 %)
27,421
(1.34 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
21,272
(100.00 %)
3,811,435
(36.24 %)
959,712
(10.27 %)
12,159,896
(41.30 %)
0
(0 %)
1,298,777
(4.12 %)
69,852
(1.62 %)
42,454
(1.09 %)
189 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1
n/a n/a 16,419
(0.77 %)
17,219
(0.89 %)
n/a 39.03
(100.00 %)
33
(0.00 %)
33
(0.00 %)
9,959
(100.00 %)
6,332,360
(29.69 %)
1,065,454
(2.09 %)
17,908,986
(42.25 %)
0
(0 %)
1,232,672
(2.38 %)
13,856
(0.35 %)
11,596
(0.23 %)
190 mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021)
GCA_009769485.2
n/a n/a 10,145
(1.98 %)
18,617
(2.30 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
14
(0.00 %)
14
(0.00 %)
5,640
(100.00 %)
533,330
(9.11 %)
213,518
(1.29 %)
4,813,886
(20.16 %)
0
(0 %)
52,896
(0.73 %)
25,667
(3.86 %)
24,229
(2.21 %)
191 Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023)
GCA_027579665.1
n/a n/a 11,687
(1.78 %)
24,169
(2.43 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,834
(100.00 %)
414,780
(3.26 %)
491,012
(10.03 %)
5,570,475
(26.24 %)
0
(0 %)
495,689
(3.67 %)
29,485
(4.55 %)
21,361
(1.22 %)
192 New Caledonian crow
GCA_009651025.1
n/a n/a 11,097
(1.99 %)
20,436
(2.45 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 894
(100.00 %)
377,050
(6.03 %)
178,064
(1.53 %)
5,305,126
(19.49 %)
0
(0 %)
132,677
(1.13 %)
26,107
(2.52 %)
20,600
(1.37 %)
193 New Zealand spotty
GCA_009762545.1
n/a n/a 13,566
(2.17 %)
40,774
(5.21 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,659
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
0
(0 %)
456,905
(3.99 %)
16,368
(0.83 %)
7,034
(0.33 %)
194 Nicobar pigeon (hap2 2024)
GCA_036010745.1
n/a n/a 13,270
(1.84 %)
24,753
(2.28 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
118
(0.00 %)
226
(100.00 %)
675,092
(12.72 %)
313,111
(3.64 %)
6,547,843
(23.22 %)
1
(0.00 %)
382,235
(2.71 %)
37,728
(3.88 %)
31,602
(1.56 %)
195 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023)
GCA_030445055.1
n/a n/a 19,429
(1.06 %)
22,396
(1.07 %)
n/a 40.96
(99.27 %)
0
(0 %)
845
(0.73 %)
594
(100.00 %)
4,369,568
(32.83 %)
673,707
(1.55 %)
18,586,102
(42.41 %)
5
(0.00 %)
558,255
(1.38 %)
131,852
(2.78 %)
71,325
(1.75 %)
196 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1
n/a n/a 13,050
(3.93 %)
44,650
(10.12 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,934
(100.00 %)
512,583
(14.83 %)
156,305
(8.46 %)
2,005,803
(27.09 %)
0
(0 %)
153,928
(3.57 %)
59,674
(9.19 %)
38,546
(4.50 %)
197 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1
n/a n/a 15,210
(1.55 %)
18,316
(1.43 %)
n/a 41.06
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,051
(100.00 %)
3,911,633
(40.55 %)
565,546
(1.54 %)
10,853,726
(32.61 %)
0
(0 %)
378,575
(1.36 %)
40,925
(1.35 %)
26,837
(0.96 %)
198 North Atlantic right whale (mEubGla1 hap2 2023)
GCA_028564815.1
n/a n/a 19,541
(1.47 %)
21,516
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
363
(0.17 %)
779
(100.00 %)
1,361,117
(2.23 %)
836,632
(13.12 %)
12,597,969
(44.00 %)
11
(0.00 %)
1,395,565
(3.89 %)
93,862
(1.92 %)
40,806
(0.95 %)
199 North Atlantic right whale (hap1 2023)
GCA_028571275.1
n/a n/a 18,699
(1.61 %)
20,354
(1.28 %)
n/a 41.64
(99.84 %)
0
(0 %)
385
(0.16 %)
947
(100.00 %)
3,815,900
(43.46 %)
718,935
(11.38 %)
11,928,210
(42.25 %)
2
(0.00 %)
1,117,252
(3.44 %)
85,881
(1.90 %)
41,289
(1.19 %)
200 North Island brown kiwi (hap2 2024)
GCA_036417975.1
n/a n/a 13,664
(1.44 %)
37,696
(2.80 %)
n/a 44.42
(100.00 %)
0
(0 %)
155
(0.00 %)
349
(100.00 %)
760,455
(8.84 %)
626,528
(6.85 %)
5,029,822
(30.45 %)
1
(0.00 %)
604,936
(3.67 %)
54,278
(9.43 %)
41,382
(3.03 %)
201 northern pike
GCA_011004835.1
n/a n/a 11,782
(2.41 %)
40,748
(5.68 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
0
(0 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,818
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
0
(0 %)
427,649
(4.54 %)
29,687
(2.57 %)
15,714
(1.07 %)
202 northern gannet (hap1 2023)
GCA_031468805.1
n/a n/a 13,367
(1.65 %)
24,403
(2.00 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
263
(0.00 %)
829
(100.00 %)
498,574
(4.51 %)
273,984
(5.20 %)
5,544,122
(27.29 %)
25
(0.00 %)
496,388
(3.06 %)
34,879
(3.83 %)
24,416
(1.00 %)
203 northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022)
GCA_929447715.1
n/a n/a 12,115
(1.73 %)
22,764
(2.15 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
4,484
(100.00 %)
417,395
(3.68 %)
231,908
(7.24 %)
5,424,533
(24.05 %)
0
(0 %)
253,718
(2.12 %)
35,691
(4.26 %)
29,357
(1.67 %)
204 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1
n/a n/a 19,537
(1.44 %)
27,826
(1.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 23,401
(100.00 %)
3,634,923
(35.56 %)
672,860
(11.00 %)
11,175,398
(41.72 %)
0
(0 %)
1,941,411
(5.36 %)
62,007
(1.94 %)
36,247
(0.95 %)
205 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1
n/a n/a 18,343
(1.80 %)
23,253
(1.77 %)
n/a 43.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
4,899
(100.00 %)
1,174,241
(2.96 %)
825,170
(5.11 %)
9,889,579
(36.12 %)
0
(0 %)
598,356
(2.10 %)
76,164
(3.52 %)
59,778
(2.27 %)
206 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1
n/a n/a 3,096
(1.64 %)
2,450
(1.02 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
3,156
(100.00 %)
517,347
(50.76 %)
157,701
(3.90 %)
1,502,752
(34.14 %)
0
(0 %)
157,923
(4.57 %)
1,806
(0.40 %)
1,380
(0.31 %)
207 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1
n/a n/a 13,421
(1.31 %)
17,659
(2.08 %)
n/a 40.15
(99.66 %)
93
(0.34 %)
93
(0.34 %)
158
(99.66 %)
733,358
(2.95 %)
403,552
(3.04 %)
7,746,871
(29.97 %)
0
(0 %)
294,855
(1.92 %)
34,363
(2.08 %)
21,752
(1.10 %)
208 orange-tipped seq squirt (alternate hap 2023)
GCA_963082865.1
n/a n/a 167
(2.38 %)
431
(15.83 %)
n/a 36.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 70
(100.00 %)
885
(7.97 %)
855
(38.55 %)
9,941
(42.25 %)
0
(0 %)
7,944
(22.20 %)
24
(10.92 %)
127
(13.03 %)
209 orbiculate cardinalfish
GCA_902148825.1
n/a n/a 14,018
(1.51 %)
45,251
(3.61 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,393
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
1
(0.00 %)
888,596
(5.23 %)
22,522
(0.77 %)
12,193
(0.40 %)
210 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1
n/a n/a 7,223
(0.52 %)
11,927
(1.11 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
76
(0.00 %)
76
(0.00 %)
4,081
(100.00 %)
988,792
(3.99 %)
1,766,202
(10.24 %)
9,974,001
(52.99 %)
0
(0 %)
1,733,898
(6.80 %)
64,462
(1.33 %)
4,213
(0.08 %)
211 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2
n/a n/a 18,116
(1.63 %)
23,608
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
38
(0.00 %)
10,895
(100.00 %)
3,002,448
(29.46 %)
375,226
(0.79 %)
11,824,034
(29.65 %)
0
(0 %)
140,328
(0.57 %)
67,718
(4.23 %)
70,109
(3.93 %)
212 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1
n/a n/a 13,365
(1.26 %)
17,388
(1.98 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
99
(0.00 %)
99
(0.00 %)
279
(100.00 %)
726,428
(2.81 %)
331,756
(2.05 %)
7,184,711
(33.57 %)
2
(0.00 %)
316,815
(2.51 %)
51,973
(2.70 %)
19,565
(0.92 %)
213 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1
n/a n/a 16,729
(3.56 %)
56,451
(8.61 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
11
(0.00 %)
11
(0.00 %)
5,701
(100.00 %)
1,153,359
(18.94 %)
829,887
(14.54 %)
2,793,018
(28.79 %)
0
(0 %)
721,904
(6.97 %)
49,469
(4.32 %)
33,228
(2.53 %)
214 peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022)
GCA_023634185.1
n/a n/a 12,529
(1.75 %)
24,654
(2.25 %)
n/a 42.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,745
(100.00 %)
517,204
(7.95 %)
218,606
(4.15 %)
6,216,533
(21.16 %)
0
(0 %)
237,835
(2.15 %)
26,313
(2.41 %)
19,163
(0.91 %)
215 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1
n/a n/a 18,794
(1.72 %)
21,421
(1.40 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,750
(100.00 %)
4,001,442
(39.37 %)
547,894
(2.75 %)
13,870,563
(34.33 %)
0
(0 %)
585,313
(2.32 %)
40,162
(1.31 %)
39,090
(1.18 %)
216 pinecone soldierfish
GCA_902148815.1
n/a n/a 15,563
(2.38 %)
54,264
(6.19 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,418
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
0
(0 %)
338,770
(2.89 %)
40,331
(2.02 %)
21,223
(0.93 %)
217 pink pigeon (alternate hap 2023)
GCA_963082445.1
n/a n/a 10,425
(1.96 %)
20,219
(2.49 %)
n/a 42.52
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,277
(100.00 %)
344,711
(4.99 %)
225,902
(3.41 %)
4,563,425
(21.61 %)
0
(0 %)
303,874
(2.37 %)
28,391
(3.74 %)
24,938
(2.03 %)
218 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2
n/a n/a 10,906
(1.98 %)
19,820
(4.33 %)
n/a 40.04
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,516
(100.00 %)
390,896
(3.25 %)
482,493
(7.83 %)
4,361,670
(34.36 %)
0
(0 %)
491,019
(5.12 %)
52,508
(3.70 %)
21,519
(1.51 %)
219 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2
n/a n/a 13,244
(1.26 %)
19,241
(1.68 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
25
(0.00 %)
25
(0.00 %)
5,868
(100.00 %)
4,420,884
(51.59 %)
513,006
(3.13 %)
7,749,797
(49.18 %)
0
(0 %)
994,720
(3.65 %)
81,538
(8.24 %)
68,267
(3.13 %)
220 plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021)
GCA_020745805.1
n/a n/a 11,774
(1.90 %)
20,857
(2.20 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
749
(100.00 %)
356,053
(4.37 %)
157,695
(0.93 %)
5,995,637
(19.60 %)
0
(0 %)
70,223
(0.74 %)
30,478
(4.03 %)
30,200
(2.16 %)
221 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1
n/a n/a 14,050
(2.77 %)
63,249
(8.86 %)
n/a 45.41
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,970
(100.00 %)
708,455
(9.71 %)
797,241
(15.67 %)
2,785,159
(33.18 %)
0
(0 %)
613,051
(6.69 %)
78,151
(7.95 %)
45,924
(3.34 %)
222 prehistoric monster fish
GCA_902500245.1
n/a n/a 10,944
(0.64 %)
59,123
(2.21 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,336
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
0
(0 %)
1,101,423
(6.43 %)
125,285
(5.42 %)
13,610
(0.32 %)
223 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1
n/a n/a 13,892
(0.57 %)
32,011
(1.64 %)
n/a 44.93
(100.00 %)
16
(0.00 %)
685
(0.00 %)
843
(100.00 %)
1,042,636
(2.00 %)
1,430,690
(16.22 %)
14,621,029
(53.91 %)
19
(0.00 %)
4,063,379
(8.75 %)
503,166
(8.84 %)
49,100
(0.82 %)
224 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1
n/a n/a 18,550
(1.51 %)
20,491
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
0
(0 %)
138
(0.01 %)
391
(100.00 %)
3,860,112
(33.83 %)
820,375
(9.58 %)
12,159,196
(41.59 %)
2
(0.00 %)
1,346,279
(3.87 %)
106,168
(2.78 %)
50,294
(1.44 %)
225 razorbill
GCA_008658355.1
n/a n/a 12,937
(1.75 %)
24,253
(2.09 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,309
(100.00 %)
562,549
(7.14 %)
210,852
(1.04 %)
7,264,995
(20.26 %)
0
(0 %)
100,265
(0.74 %)
40,926
(2.91 %)
36,166
(1.76 %)
226 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1
n/a n/a 18,817
(1.29 %)
21,916
(1.20 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
0
(0 %)
22
(0.00 %)
4,021
(100.00 %)
3,279,005
(20.48 %)
472,706
(21.87 %)
11,466,609
(50.26 %)
0
(0 %)
3,624,599
(9.05 %)
128,858
(2.07 %)
39,577
(0.84 %)
227 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1
n/a n/a 4,539
(2.01 %)
14,061
(4.35 %)
n/a 40.48
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,751
(100.00 %)
759,605
(49.59 %)
161,693
(7.99 %)
1,684,737
(29.93 %)
0
(0 %)
232,319
(5.07 %)
7,525
(1.31 %)
4,853
(0.81 %)
228 red-crested turaco
GCA_009764505.1
n/a n/a 11,247
(1.70 %)
23,705
(2.27 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,476
(100.00 %)
482,817
(8.51 %)
153,169
(0.81 %)
5,919,109
(21.87 %)
0
(0 %)
121,371
(1.16 %)
39,766
(3.41 %)
32,044
(2.04 %)
229 Red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020)
GCA_015220175.1
n/a n/a 11,434
(1.65 %)
21,710
(2.11 %)
n/a 46.12
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
2,748
(100.00 %)
859,899
(15.52 %)
319,622
(3.85 %)
5,367,970
(34.63 %)
0
(0 %)
960,530
(5.66 %)
23,381
(1.81 %)
19,537
(1.27 %)
230 red-legged seriema
GCA_009819485.1
n/a n/a 10,131
(1.78 %)
19,775
(2.21 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,840
(100.00 %)
366,591
(6.01 %)
117,928
(0.90 %)
5,340,048
(18.90 %)
0
(0 %)
66,176
(0.68 %)
26,293
(2.86 %)
24,338
(1.93 %)
231 red-throated loon (hap1 2023)
GCA_030936125.1
n/a n/a 13,357
(1.64 %)
29,603
(2.35 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
260
(0.00 %)
260
(0.00 %)
3,225
(100.00 %)
549,694
(8.44 %)
246,171
(10.46 %)
5,258,356
(27.36 %)
2
(0.00 %)
671,693
(3.75 %)
39,810
(3.37 %)
34,456
(1.67 %)
232 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1
n/a n/a 13,218
(1.71 %)
28,120
(2.39 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
9
(0.00 %)
249
(0.00 %)
1,195
(100.00 %)
544,427
(8.81 %)
223,674
(5.77 %)
6,669,469
(23.63 %)
3
(0.00 %)
398,605
(2.64 %)
38,306
(3.37 %)
35,069
(1.78 %)
233 reedfish
GCA_900700845.2
n/a n/a 9,950
(0.37 %)
31,611
(1.22 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
38,598
(100.00 %)
1,300,565
(2.57 %)
685,834
(2.21 %)
14,691,576
(45.66 %)
0
(0 %)
588,794
(1.83 %)
63,365
(1.11 %)
17,365
(0.32 %)
234 reedfish (alternate hap 2021)
GCA_900700845.3
n/a n/a 11,382
(0.41 %)
28,399
(1.33 %)
n/a 39.39
(99.99 %)
17
(0.01 %)
17
(0.01 %)
17,099
(99.99 %)
6,708,926
(37.23 %)
883,916
(2.81 %)
16,745,782
(46.94 %)
0
(0 %)
963,655
(2.45 %)
74,951
(1.15 %)
20,227
(0.32 %)
235 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1
n/a n/a 19,396
(1.48 %)
21,693
(1.26 %)
n/a 41.62
(97.80 %)
0
(0 %)
131
(2.20 %)
1,039
(100.00 %)
3,973,936
(35.55 %)
987,571
(11.66 %)
12,473,459
(42.11 %)
1
(0.00 %)
1,271,959
(3.79 %)
74,971
(1.64 %)
44,274
(1.06 %)
236 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1
n/a n/a 19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
0
(0 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
4
(0.00 %)
1,071,329
(3.37 %)
73,126
(1.69 %)
43,865
(1.11 %)
237 rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021)
GCA_016880875.1
n/a n/a 9,867
(1.89 %)
19,635
(2.52 %)
n/a 42.54
(100.00 %)
0
(0 %)
20
(0.00 %)
2,879
(100.00 %)
394,769
(10.00 %)
186,556
(1.91 %)
4,428,687
(19.09 %)
0
(0 %)
192,997
(1.66 %)
15,730
(1.88 %)
12,474
(0.91 %)
238 ring-tailed lemur (mLemCat1 alternate hap 2021)
GCA_020740595.1
n/a n/a 18,683
(1.98 %)
21,178
(1.55 %)
n/a 41.29
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
312
(100.00 %)
3,400,356
(36.84 %)
511,707
(7.13 %)
13,027,744
(33.21 %)
0
(0 %)
889,687
(2.62 %)
50,614
(1.83 %)
47,997
(1.60 %)
239 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1
n/a n/a 18,165
(2.73 %)
62,580
(6.00 %)
n/a 38.74
(100.00 %)
6
(0.00 %)
6
(0.00 %)
4,612
(100.00 %)
2,483,904
(48.29 %)
584,363
(7.55 %)
5,582,076
(40.38 %)
0
(0 %)
923,875
(6.53 %)
60,229
(3.53 %)
19,604
(0.82 %)
240 rock pigeon (racing homer maternal 2024)
GCA_036010775.1
n/a n/a 12,450
(1.75 %)
25,274
(2.35 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
23
(0.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
2
(0.00 %)
1,046,190
(5.37 %)
33,479
(3.29 %)
29,158
(1.73 %)
241 rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022)
GCA_023344045.1
n/a n/a 12,090
(2.36 %)
21,910
(2.57 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,212
(100.00 %)
585,577
(10.45 %)
202,342
(1.61 %)
5,390,780
(20.38 %)
0
(0 %)
122,512
(1.28 %)
19,210
(2.23 %)
17,189
(1.48 %)
242 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2
n/a n/a 15,291
(3.29 %)
45,865
(7.56 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,165
(100.00 %)
1,131,154
(25.69 %)
269,583
(5.08 %)
3,371,712
(24.64 %)
0
(0 %)
249,009
(3.21 %)
36,810
(2.68 %)
27,636
(1.84 %)
243 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1
n/a n/a 15,434
(2.01 %)
44,991
(4.63 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
192
(0.00 %)
302
(100.00 %)
2,506,810
(40.54 %)
613,867
(8.67 %)
5,070,851
(48.32 %)
1
(0.00 %)
1,210,760
(8.82 %)
46,071
(2.57 %)
27,461
(1.23 %)
244 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1
n/a n/a 12,606
(0.83 %)
22,421
(1.62 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,543
(100.00 %)
2,080,172
(11.19 %)
1,814,619
(9.22 %)
8,889,119
(57.36 %)
0
(0 %)
1,825,733
(6.19 %)
145,328
(4.63 %)
28,523
(0.67 %)
245 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1
n/a n/a 13,845
(0.96 %)
23,108
(1.86 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,128
(100.00 %)
2,008,682
(10.16 %)
1,718,408
(7.36 %)
9,467,451
(52.99 %)
0
(0 %)
1,513,596
(5.45 %)
140,557
(4.65 %)
29,439
(0.71 %)
246 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1
n/a n/a 13,727
(0.84 %)
24,896
(2.06 %)
n/a 42.95
(99.51 %)
0
(0 %)
973
(0.49 %)
2,266
(100.00 %)
729,332
(2.15 %)
1,402,564
(24.45 %)
8,156,596
(55.96 %)
4
(0.00 %)
3,523,739
(10.10 %)
175,180
(3.64 %)
18,584
(0.40 %)
247 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1
n/a n/a 18,509
(1.54 %)
22,514
(1.36 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,427
(100.00 %)
3,675,922
(35.75 %)
950,374
(10.49 %)
11,670,399
(40.31 %)
0
(0 %)
1,395,810
(4.32 %)
63,587
(3.15 %)
40,331
(1.09 %)
248 siamang (v2 Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.2
n/a n/a 19,572
(1.70 %)
20,107
(1.11 %)
n/a 40.45
(99.93 %)
0
(0 %)
3
(0.07 %)
40
(100.00 %)
5,057,491
(55.54 %)
869,279
(15.07 %)
14,090,400
(46.04 %)
0
(0 %)
2,292,373
(4.98 %)
87,907
(1.41 %)
26,874
(0.68 %)
249 Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022)
GCA_023634115.1
n/a n/a 12,258
(1.66 %)
25,579
(2.30 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
4,162
(100.00 %)
506,343
(6.77 %)
182,589
(7.22 %)
5,435,776
(23.60 %)
0
(0 %)
383,493
(2.65 %)
29,420
(2.47 %)
19,384
(0.92 %)
250 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023)
GCA_027887135.1
n/a n/a 12,826
(1.74 %)
26,019
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,054
(100.00 %)
482,850
(3.37 %)
523,437
(10.15 %)
6,386,315
(26.20 %)
0
(0 %)
535,497
(3.35 %)
32,734
(4.25 %)
23,206
(1.19 %)
251 sand lizard
GCA_009819545.1
n/a n/a 14,226
(1.28 %)
25,396
(2.33 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
12,662
(100.00 %)
1,001,433
(5.27 %)
445,157
(1.79 %)
7,227,826
(34.26 %)
0
(0 %)
365,558
(2.38 %)
80,300
(2.76 %)
22,848
(0.87 %)
252 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1
n/a n/a 14,077
(0.47 %)
36,608
(1.60 %)
n/a 43.86
(99.99 %)
0
(0 %)
2,097
(0.01 %)
2,802
(100.00 %)
1,819,971
(2.73 %)
2,865,173
(16.12 %)
15,335,602
(63.85 %)
14
(0.00 %)
6,125,585
(10.74 %)
651,438
(8.09 %)
43,492
(0.45 %)
253 sea lamprey
GCA_010993595.1
n/a n/a 6,180
(0.71 %)
31,191
(4.14 %)
n/a 48.30
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
4,064
(100.00 %)
1,494,745
(38.42 %)
891,392
(20.02 %)
4,259,383
(49.70 %)
0
(0 %)
2,135,388
(12.73 %)
147,499
(35.87 %)
97,808
(5.62 %)
254 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1
n/a n/a 14,728
(2.46 %)
62,094
(7.09 %)
n/a 42.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,847
(100.00 %)
939,151
(11.90 %)
472,983
(7.68 %)
4,326,183
(28.40 %)
0
(0 %)
486,310
(4.09 %)
64,290
(4.16 %)
42,087
(2.28 %)
255 sharpnose sevengill shark (hap2 2024)
GCA_035084135.1
n/a n/a 12,603
(0.52 %)
23,419
(1.42 %)
n/a 44.36
(99.99 %)
1,695
(0.01 %)
1,695
(0.01 %)
2,889
(99.99 %)
559,171
(2.08 %)
973,228
(15.01 %)
11,768,442
(55.69 %)
2
(0.00 %)
3,991,721
(8.15 %)
108,468
(3.25 %)
22,750
(0.36 %)
256 Siamese fighting fish
GCA_900651605.1
n/a n/a 14,510
(4.12 %)
60,058
(10.77 %)
n/a 45.51
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,705
(100.00 %)
249,671
(3.68 %)
182,366
(4.87 %)
1,939,533
(22.55 %)
0
(0 %)
223,835
(4.10 %)
72,474
(13.55 %)
56,347
(7.50 %)
257 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2
n/a n/a 14,737
(4.05 %)
61,568
(10.70 %)
n/a 45.50
(100.00 %)
108
(0.00 %)
108
(0.00 %)
3,872
(100.00 %)
392,585
(19.23 %)
190,741
(5.09 %)
1,994,824
(23.20 %)
0
(0 %)
245,925
(4.39 %)
74,259
(13.49 %)
57,619
(7.42 %)
258 slow loris (mNycCou1 alternate hap 2022)
GCA_027406535.1
n/a n/a 21,660
(1.50 %)
22,771
(1.32 %)
n/a 40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,485
(100.00 %)
4,275,926
(39.13 %)
533,324
(1.57 %)
13,459,597
(39.86 %)
0
(0 %)
855,097
(2.22 %)
35,720
(0.78 %)
21,807
(0.55 %)
259 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2
n/a n/a 11,589
(0.31 %)
32,603
(1.10 %)
n/a 47.54
(100.00 %)
6
(0.00 %)
6
(0.00 %)
26,655
(100.00 %)
1,346,532
(1.83 %)
1,273,326
(5.35 %)
19,727,443
(51.55 %)
0
(0 %)
2,678,114
(4.31 %)
427,693
(8.25 %)
27,178
(0.30 %)
260 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1
n/a n/a 13,661
(1.11 %)
75,418
(4.21 %)
n/a 45.01
(99.96 %)
0
(0 %)
3,120
(0.04 %)
1,059
(100.00 %)
4,634,757
(53.53 %)
1,006,319
(17.13 %)
5,273,732
(51.16 %)
14
(0.00 %)
1,782,741
(8.47 %)
145,115
(7.59 %)
66,645
(2.19 %)
261 smalltooth sawfish
GCA_009764485.1
n/a n/a 9,086
(0.58 %)
20,468
(1.57 %)
n/a 42.65
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 10,892
(100.00 %)
315,695
(1.23 %)
320,148
(1.73 %)
8,305,059
(38.33 %)
0
(0 %)
382,745
(1.57 %)
37,147
(1.43 %)
15,419
(0.42 %)
262 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1
n/a n/a 17,590
(1.81 %)
21,597
(1.85 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,717
(100.00 %)
2,734,555
(21.46 %)
795,752
(6.56 %)
9,601,735
(36.35 %)
0
(0 %)
660,443
(2.50 %)
62,524
(3.25 %)
60,391
(2.11 %)
263 South Island takahe (alternate hap 2021)
GCA_020801775.1
n/a n/a 12,655
(1.70 %)
n/a n/a 43.63
(99.16 %)
0
(0 %)
238
(0.84 %)
178
(100.00 %)
554,912
(9.42 %)
230,808
(4.34 %)
6,406,358
(24.83 %)
0
(0 %)
352,693
(2.60 %)
22,941
(1.98 %)
19,559
(1.17 %)
264 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1
n/a n/a 22,897
(1.23 %)
27,007
(1.18 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
70
(0.00 %)
70
(0.00 %)
12,050
(100.00 %)
4,502,020
(38.27 %)
576,759
(1.02 %)
17,143,050
(40.65 %)
0
(0 %)
450,196
(1.59 %)
51,339
(1.15 %)
40,459
(0.82 %)
265 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1
n/a n/a 20,179
(1.21 %)
24,249
(1.19 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
7,866
(100.00 %)
3,953,031
(35.88 %)
531,111
(1.14 %)
16,354,874
(39.96 %)
0
(0 %)
425,622
(1.30 %)
59,907
(1.35 %)
35,916
(0.80 %)
266 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1
n/a n/a 15,727
(2.61 %)
43,177
(5.74 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 895
(100.00 %)
1,590,386
(33.53 %)
246,800
(2.86 %)
5,173,834
(26.85 %)
0
(0 %)
323,596
(3.31 %)
14,473
(0.87 %)
9,723
(0.47 %)
267 speckled mousebird (hap2 2023)
GCA_028858625.1
n/a n/a 13,169
(1.74 %)
26,896
(2.47 %)
n/a 42.62
(99.56 %)
0
(0 %)
151
(0.44 %)
243
(100.00 %)
570,907
(11.75 %)
317,226
(6.96 %)
5,854,600
(25.51 %)
0
(0 %)
605,114
(3.54 %)
28,905
(2.31 %)
21,335
(1.22 %)
268 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1
n/a n/a 10,920
(1.26 %)
14,403
(2.60 %)
n/a 43.46
(99.96 %)
0
(0 %)
2,088
(0.04 %)
1,042
(100.00 %)
3,325,883
(44.48 %)
604,780
(8.87 %)
5,926,808
(44.92 %)
2
(0.00 %)
1,077,982
(5.77 %)
64,249
(4.00 %)
11,419
(0.43 %)
269 sterlet (fAciRut3.2 2022)
GCA_902713435.2
n/a n/a 24,717
(1.73 %)
40,151
(4.13 %)
74,807
(5.54 %)
40.09
(99.99 %)
0
(0 %)
475
(0.01 %)
1,517
(100.00 %)
1,844,596
(9.77 %)
1,119,340
(9.88 %)
9,372,934
(41.58 %)
8
(0.00 %)
1,582,556
(6.83 %)
65,007
(2.74 %)
17,761
(0.38 %)
270 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1
n/a n/a 16,177
(4.18 %)
40,160
(7.35 %)
n/a 39.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,237
(100.00 %)
1,208,781
(38.02 %)
121,854
(7.96 %)
2,956,942
(32.61 %)
0
(0 %)
310,772
(4.79 %)
27,787
(3.58 %)
14,364
(1.06 %)
271 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1
n/a n/a 15,871
(2.85 %)
42,287
(5.51 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
3,274
(100.00 %)
1,826,752
(37.53 %)
592,022
(6.69 %)
4,899,884
(32.33 %)
0
(0 %)
491,621
(3.91 %)
17,357
(1.25 %)
12,560
(0.74 %)
272 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1
n/a n/a 18,204
(1.54 %)
21,036
(1.34 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,464
(100.00 %)
3,767,720
(35.65 %)
1,102,723
(10.92 %)
11,794,617
(40.96 %)
0
(0 %)
1,492,009
(4.69 %)
67,537
(3.57 %)
41,008
(1.09 %)
273 Sumatran orangutan (v2 AG06213 alternate hap 2024)
GCA_028885685.2
n/a n/a 19,884
(1.79 %)
20,383
(1.18 %)
n/a 40.95
(99.75 %)
0
(0 %)
10
(0.25 %)
48
(100.00 %)
5,192,176
(53.57 %)
950,166
(9.22 %)
15,240,038
(41.74 %)
0
(0 %)
2,007,170
(3.80 %)
41,928
(1.16 %)
29,154
(0.81 %)
274 Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021)
GCA_020746095.1
n/a n/a 11,628
(1.91 %)
21,635
(2.31 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
17
(0.00 %)
1,535
(100.00 %)
421,231
(6.57 %)
146,070
(1.11 %)
5,727,350
(21.91 %)
0
(0 %)
105,678
(1.04 %)
37,752
(3.68 %)
32,944
(2.17 %)
275 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1
n/a n/a 14,713
(1.06 %)
18,602
(1.60 %)
n/a 44.58
(100.00 %)
0
(0 %)
290
(0.00 %)
366
(100.00 %)
1,352,115
(12.17 %)
388,630
(1.94 %)
10,550,154
(33.42 %)
0
(0 %)
470,790
(2.03 %)
113,023
(3.09 %)
33,031
(0.84 %)
276 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020)
GCA_009819505.2
n/a n/a 13,403
(1.85 %)
27,669
(2.52 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
704,976
(13.16 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
0
(0 %)
505,741
(2.66 %)
49,076
(3.54 %)
23,486
(1.21 %)
277 swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023)
GCA_028019105.1
n/a n/a 12,160
(1.83 %)
24,622
(2.46 %)
n/a 43.37
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 862
(100.00 %)
383,634
(3.06 %)
527,550
(8.40 %)
5,916,654
(24.97 %)
0
(0 %)
665,809
(4.29 %)
31,261
(3.21 %)
22,337
(1.23 %)
278 tammar wallaby (mMacEug1 alternate hap 2023)
GCA_028389975.1
n/a n/a 11,133
(0.77 %)
13,869
(0.98 %)
n/a 38.63
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
14,285
(100.00 %)
3,114,522
(26.10 %)
661,874
(3.02 %)
11,667,649
(38.41 %)
0
(0 %)
320,252
(1.29 %)
12,393
(0.46 %)
7,824
(0.29 %)
279 tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023)
GCA_028020675.1
n/a n/a 11,432
(1.95 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
911
(100.00 %)
470,125
(9.51 %)
140,846
(3.57 %)
5,002,695
(22.08 %)
0
(0 %)
231,594
(1.85 %)
22,424
(2.33 %)
19,010
(1.39 %)
280 tawny owl (hap2 2023)
GCA_031877785.1
n/a n/a 12,367
(1.72 %)
21,445
(2.03 %)
n/a 42.53
(99.88 %)
0
(0 %)
206
(0.12 %)
184
(100.00 %)
392,959
(4.59 %)
235,300
(7.72 %)
6,437,772
(24.82 %)
0
(0 %)
298,804
(2.06 %)
27,952
(2.71 %)
25,864
(1.43 %)
281 thorny skate
GCA_010909745.1
n/a n/a 5,885
(0.35 %)
24,457
(1.45 %)
n/a 44.61
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
21,995
(100.00 %)
553,415
(2.65 %)
761,469
(4.53 %)
6,043,769
(57.75 %)
0
(0 %)
1,079,506
(5.75 %)
159,552
(5.54 %)
20,611
(0.66 %)
282 tiger shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1
n/a n/a 12,516
(0.44 %)
17,465
(1.05 %)
n/a 44.66
(99.65 %)
1,203
(0.35 %)
1,203
(0.35 %)
2,136
(99.65 %)
8,278,458
(59.68 %)
903,434
(18.42 %)
14,975,344
(48.25 %)
2
(0.00 %)
4,704,292
(7.66 %)
48,378
(1.60 %)
15,577
(0.38 %)
283 tiny Cayenne caecilian
GCA_901765105.1
n/a n/a 12,197
(0.36 %)
33,747
(1.15 %)
n/a 43.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
23,871
(100.00 %)
1,453,442
(1.57 %)
1,309,062
(3.23 %)
17,953,416
(52.19 %)
0
(0 %)
1,274,743
(3.12 %)
326,452
(3.86 %)
38,711
(0.39 %)
284 torafugu
GCA_901000745.3
n/a n/a 13,635
(4.82 %)
48,723
(11.83 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
0
(0 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,793
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
0
(0 %)
206,265
(4.46 %)
46,936
(9.72 %)
35,741
(5.19 %)
285 tourmaline sunangel (hap2 2024)
GCA_036172335.1
n/a n/a 11,697
(2.00 %)
19,544
(2.34 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
0
(0 %)
370
(0.01 %)
200
(100.00 %)
480,724
(5.14 %)
292,213
(3.66 %)
5,608,823
(21.79 %)
2
(0.00 %)
199,789
(1.65 %)
17,191
(1.69 %)
14,460
(1.07 %)
286 trahira (hap1 2023)
GCA_029633855.1
n/a n/a 16,039
(2.06 %)
44,287
(4.38 %)
n/a 40.99
(92.91 %)
0
(0 %)
867
(7.09 %)
597
(100.00 %)
2,228,831
(30.95 %)
687,495
(13.85 %)
5,309,097
(36.70 %)
2
(0.01 %)
1,157,952
(7.09 %)
27,070
(2.09 %)
12,077
(0.44 %)
287 tufted duck
GCA_009819845.1
n/a n/a 12,117
(2.03 %)
21,464
(2.36 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
780
(100.00 %)
732,317
(7.82 %)
353,660
(1.57 %)
6,119,549
(21.70 %)
0
(0 %)
66,459
(0.74 %)
27,920
(2.56 %)
25,192
(1.55 %)
288 two-lined caecilian
GCA_901001175.1
n/a n/a 13,456
(0.33 %)
47,486
(1.34 %)
n/a 44.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
27,233
(100.00 %)
1,968,437
(1.91 %)
1,716,136
(3.97 %)
25,847,315
(43.76 %)
0
(0 %)
1,707,112
(2.84 %)
523,234
(6.59 %)
83,004
(0.82 %)
289 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1
n/a n/a 9,367
(1.66 %)
11,297
(1.30 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,470
(100.00 %)
1,708,360
(43.81 %)
267,584
(1.67 %)
5,373,410
(33.52 %)
0
(0 %)
245,754
(1.84 %)
29,783
(1.94 %)
21,396
(1.51 %)
290 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1
n/a n/a 14,197
(3.33 %)
44,782
(7.70 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,294
(100.00 %)
396,279
(4.74 %)
275,154
(5.76 %)
2,933,132
(29.41 %)
0
(0 %)
277,720
(3.27 %)
35,104
(4.08 %)
21,634
(1.95 %)
291 Western terrestrial garter snake
GCA_009769695.1
n/a n/a 13,101
(0.94 %)
24,980
(1.75 %)
n/a 41.02
(99.93 %)
19
(0.07 %)
19
(0.07 %)
13,642
(99.93 %)
1,410,212
(7.70 %)
1,080,385
(4.56 %)
9,112,844
(43.96 %)
0
(0 %)
886,410
(3.61 %)
91,606
(2.53 %)
24,845
(0.74 %)
292 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1
n/a n/a 14,370
(1.06 %)
24,297
(1.27 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
26,601
(100.00 %)
3,360,923
(19.59 %)
1,043,098
(3.92 %)
8,511,380
(53.68 %)
0
(0 %)
1,216,984
(4.33 %)
23,321
(0.97 %)
17,608
(0.60 %)
293 western capercaillie (alternate hap 2023)
GCA_951394355.1
n/a n/a 11,226
(2.33 %)
20,526
(2.54 %)
n/a 41.53
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,463
(100.00 %)
436,894
(5.48 %)
209,008
(1.73 %)
4,790,071
(20.27 %)
0
(0 %)
86,858
(1.22 %)
17,864
(2.58 %)
16,116
(1.50 %)
294 whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021)
GCA_020745695.1
n/a n/a 11,632
(1.83 %)
20,659
(2.18 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,405
(100.00 %)
553,633
(11.80 %)
147,999
(0.81 %)
5,825,472
(20.55 %)
0
(0 %)
89,546
(1.06 %)
20,481
(1.61 %)
16,521
(1.13 %)
295 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1
n/a n/a 17,639
(1.50 %)
25,684
(1.35 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 25,619
(100.00 %)
3,039,324
(36.05 %)
637,912
(8.02 %)
9,746,398
(38.98 %)
0
(0 %)
811,711
(3.51 %)
56,325
(3.33 %)
35,586
(1.15 %)
296 white-crowned manakin (hap2 2024)
GCA_036250135.1
n/a n/a 12,135
(1.94 %)
21,591
(2.38 %)
n/a 42.49
(99.99 %)
0
(0 %)
307
(0.01 %)
595
(100.00 %)
375,468
(3.93 %)
263,979
(3.93 %)
5,786,346
(21.36 %)
0
(0 %)
353,429
(2.50 %)
25,275
(2.50 %)
20,066
(1.10 %)
297 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022)
GCA_947461935.1
n/a n/a 7,755
(1.71 %)
16,331
(2.39 %)
n/a 43.66
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,971
(100.00 %)
304,566
(13.21 %)
116,307
(6.64 %)
3,407,853
(22.91 %)
0
(0 %)
142,427
(1.75 %)
34,573
(4.56 %)
18,414
(1.62 %)
298 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1
n/a n/a 12,198
(1.10 %)
18,494
(1.29 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
26
(0.00 %)
26
(0.00 %)
14,841
(100.00 %)
1,725,021
(17.81 %)
802,415
(4.26 %)
8,321,474
(45.72 %)
0
(0 %)
653,092
(2.79 %)
15,669
(0.79 %)
13,175
(0.55 %)
299 white-tufted-ear marmoset (v1.2 paternal 2021)
GCA_011100535.2
n/a n/a 21,014
(1.91 %)
20,671
(1.30 %)
n/a 41.00
(99.58 %)
0
(0 %)
994
(0.42 %)
1,217
(100.00 %)
4,785,940
(47.16 %)
804,242
(3.32 %)
14,427,732
(38.00 %)
1
(0.00 %)
1,201,179
(2.61 %)
36,057
(0.95 %)
33,049
(0.84 %)
300 whooping crane (paternal hap 2023)
GCA_028858595.1
n/a n/a 13,284
(1.87 %)
23,528
(2.20 %)
n/a 42.47
(99.50 %)
0
(0 %)
586
(0.50 %)
395
(100.00 %)
569,940
(8.69 %)
162,569
(0.98 %)
7,021,319
(20.20 %)
1
(0.00 %)
186,281
(0.89 %)
38,582
(3.77 %)
37,390
(2.40 %)
301 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1
n/a n/a 16,320
(1.03 %)
20,318
(1.13 %)
n/a 40.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,169
(100.00 %)
2,911,332
(23.50 %)
347,110
(4.57 %)
17,256,419
(44.04 %)
0
(0 %)
683,195
(1.71 %)
28,674
(0.68 %)
24,228
(0.50 %)
302 yellow-throated sandgrouse
GCA_009769505.1
n/a n/a 11,788
(1.85 %)
23,306
(2.45 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,958
(100.00 %)
467,960
(6.96 %)
182,645
(0.99 %)
6,050,545
(20.78 %)
0
(0 %)
88,543
(0.80 %)
26,357
(2.20 %)
23,111
(1.43 %)
303 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1
n/a n/a 814
(1.87 %)
3,814
(6.84 %)
n/a 42.36
(99.98 %)
0
(0 %)
80
(0.02 %)
349
(100.00 %)
38,000
(5.03 %)
29,516
(7.35 %)
232,988
(20.37 %)
0
(0 %)
46,752
(6.67 %)
2,289
(2.07 %)
1,621
(1.32 %)
304 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1
n/a n/a 15,959
(2.63 %)
43,025
(5.73 %)
n/a 39.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 640
(100.00 %)
1,427,221
(28.44 %)
257,108
(3.15 %)
5,197,531
(26.91 %)
0
(0 %)
350,223
(3.66 %)
13,909
(0.83 %)
10,650
(0.55 %)
305 zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021)
GCA_003957525.2
n/a n/a 11,213
(2.01 %)
21,533
(2.54 %)
n/a 41.92
(100.00 %)
0
(0 %)
10
(0.00 %)
1,646
(100.00 %)
470,860
(9.54 %)
387,943
(3.32 %)
5,428,128
(20.68 %)
0
(0 %)
254,906
(1.64 %)
23,838
(2.47 %)
18,868
(1.23 %)
306 zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020)
GCA_009859025.1
n/a n/a 10,734
(1.84 %)
19,978
(2.21 %)
n/a 41.07
(99.99 %)
0
(0 %)
16
(0.01 %)
4,677
(100.00 %)
436,071
(7.44 %)
217,580
(1.43 %)
5,800,691
(19.24 %)
0
(0 %)
96,414
(0.71 %)
19,512
(1.90 %)
16,561
(1.08 %)
307 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2
n/a n/a 17,692
(2.51 %)
43,578
(3.27 %)
n/a 36.56
(99.99 %)
0
(0 %)
1,352
(0.01 %)
755
(100.00 %)
3,937,397
(60.86 %)
936,258
(7.76 %)
8,732,369
(50.44 %)
0
(0 %)
933,928
(4.81 %)
44,812
(2.09 %)
10,558
(0.30 %)
308 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1
n/a n/a 17,535
(2.50 %)
44,169
(3.34 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
0
(0 %)
712
(0.01 %)
1,252
(100.00 %)
3,891,854
(61.07 %)
927,173
(7.78 %)
8,621,517
(50.27 %)
1
(0.00 %)
941,178
(4.90 %)
44,554
(2.12 %)
10,153
(0.30 %)
309 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1
n/a n/a 6,365
(2.41 %)
16,467
(3.26 %)
n/a 36.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,719
(100.00 %)
1,317,027
(59.43 %)
323,062
(10.58 %)
3,014,570
(45.46 %)
0
(0 %)
366,878
(5.24 %)
14,563
(1.98 %)
3,786
(0.32 %)
310 zig-zag eel
GCA_900700395.1
n/a n/a 1,204
(2.88 %)
4,065
(7.13 %)
n/a 41.24
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 1,437
(100.00 %)
26,319
(3.19 %)
14,209
(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
0
(0 %)
22,258
(4.87 %)
1,253
(1.49 %)
988
(1.13 %)
TOTALS:total assembly count 310

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies