VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of alternate/haplotype assemblies)

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq ncbiGene xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base AGP
gap
all
gaps
assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
gap
Overlap
tandem
Dups
cpg
unmasked
cpg
island
1 Abyssinian ground-hornbill (alternate hap 2019)
GCA_009769595.1
n/a n/a 11,948
(1.86 %)
22,509
(2.24 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,527
(100.00 %)
361,147
(5.36 %)
125,372
(0.75 %)
5,917,083
(18.51 %)
0
(0 %)
53,587
(0.56 %)
38,787
(3.82 %)
33,644
(2.37 %)
2 adder (hap2 2024)
GCA_964194405.1
n/a n/a 12,344
(1.22 %)
17,320
(1.89 %)
n/a 41.00
(99.99 %)
908
(0.01 %)
908
(0.01 %)
1,256
(99.99 %)
3,221,370
(48.42 %)
681,209
(5.18 %)
6,734,253
(44.26 %)
2
(0.00 %)
n/a 99,366
(4.44 %)
20,272
(0.89 %)
3 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1
n/a n/a 2,101
(1.18 %)
5,350
(2.76 %)
n/a 43.70
(99.99 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
4,811
(100.00 %)
103,373
(4.27 %)
58,480
(3.90 %)
895,535
(27.44 %)
0
(0 %)
59,204
(2.84 %)
10,399
(2.84 %)
3,340
(1.02 %)
4 African hunting dog (LycPic1hap1 2024)
GCA_040955645.1
n/a n/a 18,688
(1.61 %)
19,670
(1.44 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
1
(0.00 %)
82
(0.00 %)
86
(100.00 %)
4,281,139
(31.62 %)
959,378
(2.78 %)
12,859,760
(32.95 %)
1
(0.00 %)
632,917
(1.70 %)
49,122
(2.32 %)
45,729
(1.55 %)
5 African ostrich (bStrCam1hap2 2024)
GCA_040807015.1
n/a n/a 13,036
(1.56 %)
32,740
(2.89 %)
n/a 45.71
(100.00 %)
0
(0 %)
82
(0.00 %)
250
(100.00 %)
651,979
(9.34 %)
459,653
(10.08 %)
4,547,348
(28.27 %)
0
(0 %)
835,180
(5.97 %)
49,261
(10.50 %)
34,040
(2.42 %)
6 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1
n/a n/a 18,845
(1.07 %)
22,426
(1.10 %)
n/a 41.34
(99.85 %)
169
(0.15 %)
169
(0.15 %)
1,253
(99.85 %)
4,406,744
(29.55 %)
925,868
(4.71 %)
15,966,881
(50.49 %)
0
(0 %)
1,248,627
(2.71 %)
68,531
(1.61 %)
23,142
(0.47 %)
7 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1
n/a n/a 19,066
(1.48 %)
22,356
(1.48 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
75
(0.00 %)
287
(100.00 %)
3,908,607
(31.48 %)
664,931
(5.23 %)
11,892,191
(41.08 %)
1
(0.00 %)
994,645
(2.87 %)
76,453
(2.43 %)
66,568
(1.61 %)
8 Amazon manatee (hap1 2025)
GCA_046562985.1
n/a n/a 17,917
(1.26 %)
20,499
(1.11 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
0
(0 %)
377
(0.00 %)
550
(100.00 %)
5,812,915
(56.93 %)
431,488
(2.57 %)
14,336,638
(47.98 %)
1
(0.00 %)
593,346
(1.52 %)
33,775
(0.84 %)
28,206
(0.66 %)
9 American alligator (2023 genbank)
GCA_030867065.1
n/a n/a 14,487
(0.97 %)
20,444
(1.61 %)
n/a 45.04
(99.81 %)
136
(0.19 %)
136
(0.19 %)
806
(99.81 %)
3,380,365
(43.12 %)
560,127
(2.00 %)
12,524,244
(32.47 %)
1
(0.00 %)
370,300
(1.41 %)
50,852
(2.67 %)
30,117
(1.71 %)
10 American beaver (hap2 2025)
GCA_047511605.1
n/a n/a 19,144
(1.44 %)
18,959
(1.23 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
1
(0.00 %)
194
(0.00 %)
229
(100.00 %)
3,981,637
(35.85 %)
561,691
(2.26 %)
14,374,940
(35.03 %)
6
(0.00 %)
576,331
(1.99 %)
23,386
(0.80 %)
22,058
(0.72 %)
11 American flamingo (alternate hap 2019)
GCA_009819805.1
n/a n/a 12,384
(1.73 %)
23,611
(2.05 %)
n/a 43.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,529
(100.00 %)
496,877
(7.22 %)
162,522
(0.74 %)
6,684,675
(20.14 %)
0
(0 %)
75,413
(0.70 %)
51,895
(5.89 %)
50,715
(3.23 %)
12 American mink (hap2 2024)
GCA_964106205.1
n/a n/a 18,890
(1.43 %)
21,684
(1.33 %)
n/a 42.35
(99.98 %)
2,849
(0.02 %)
2,849
(0.02 %)
3,200
(99.98 %)
4,158,563
(30.22 %)
786,430
(5.25 %)
13,845,377
(37.58 %)
10
(0.00 %)
1,137,591
(2.93 %)
64,307
(2.75 %)
53,505
(1.79 %)
13 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1
n/a n/a 16,911
(1.23 %)
21,107
(1.43 %)
n/a 44.43
(100.00 %)
6
(0.00 %)
375
(0.00 %)
6,123
(100.00 %)
1,808,768
(10.42 %)
561,106
(21.05 %)
10,283,513
(45.97 %)
16
(0.00 %)
2,348,969
(6.68 %)
54,919
(1.33 %)
26,689
(0.79 %)
14 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1
n/a n/a 15,901
(2.25 %)
61,133
(6.37 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,411
(100.00 %)
2,043,181
(23.64 %)
1,141,539
(11.35 %)
3,668,314
(38.60 %)
0
(0 %)
805,945
(6.00 %)
40,218
(2.14 %)
24,243
(1.22 %)
15 amphioxus (hap1 2024)
GCA_035149815.1
n/a n/a 5,253
(0.98 %)
41,226
(12.64 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
0
(0 %)
81
(0.00 %)
65
(100.00 %)
126,311
(1.61 %)
178,951
(7.87 %)
2,137,821
(27.19 %)
1
(0.00 %)
268,231
(4.56 %)
44,152
(5.26 %)
29,152
(2.99 %)
16 Anna's hummingbird (alternate hap BGI_N300 2018)
GCA_003957575.1
n/a n/a 11,084
(1.90 %)
19,321
(2.14 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
3,803
(100.00 %)
475,493
(7.41 %)
223,791
(1.37 %)
5,585,250
(20.30 %)
0
(0 %)
113,614
(1.01 %)
14,903
(1.46 %)
13,444
(1.06 %)
17 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1
n/a n/a 17,318
(1.49 %)
80,097
(5.79 %)
n/a 43.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 11,436
(100.00 %)
5,482,467
(36.71 %)
1,454,729
(18.84 %)
6,756,226
(47.56 %)
0
(0 %)
1,722,514
(9.86 %)
92,057
(3.50 %)
34,309
(1.32 %)
18 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1
n/a n/a 17,085
(1.73 %)
19,317
(1.59 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
0
(0 %)
210
(0.00 %)
173
(100.00 %)
2,818,446
(29.44 %)
316,646
(8.90 %)
11,192,133
(31.47 %)
1
(0.00 %)
1,151,809
(3.75 %)
52,135
(1.67 %)
44,943
(1.23 %)
19 Arctic ground squirrel (hap2 2024)
GCA_045843765.1
n/a n/a 18,385
(1.31 %)
19,099
(1.34 %)
n/a 39.97
(100.00 %)
0
(0 %)
590
(0.00 %)
2,307
(100.00 %)
4,314,945
(35.63 %)
820,736
(6.65 %)
14,490,422
(35.95 %)
2
(0.00 %)
1,426,241
(3.70 %)
31,201
(0.78 %)
25,818
(0.56 %)
20 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1
n/a n/a 14,032
(2.44 %)
39,770
(4.92 %)
n/a 38.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,617
(100.00 %)
1,808,149
(37.98 %)
583,449
(10.56 %)
4,203,368
(40.67 %)
0
(0 %)
559,424
(5.24 %)
24,867
(2.06 %)
14,134
(0.93 %)
21 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2
n/a n/a 16,053
(2.73 %)
74,777
(7.26 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,351
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
0
(0 %)
142,849
(1.57 %)
85,546
(10.82 %)
65,542
(5.07 %)
22 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1
n/a n/a 17,906
(1.18 %)
21,966
(1.14 %)
n/a 41.14
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,361
(100.00 %)
3,818,524
(29.72 %)
533,426
(3.22 %)
14,381,781
(47.30 %)
0
(0 %)
613,432
(1.61 %)
50,264
(1.15 %)
21,331
(0.51 %)
23 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1
n/a n/a 18,969
(1.75 %)
20,207
(1.36 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
3
(0.00 %)
79
(0.00 %)
262
(100.00 %)
3,650,963
(38.06 %)
355,322
(2.63 %)
14,837,952
(31.37 %)
1
(0.00 %)
267,829
(0.92 %)
37,174
(1.87 %)
37,977
(1.58 %)
24 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1
n/a n/a 13,366
(2.68 %)
66,599
(9.29 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,727
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
0
(0 %)
635,348
(7.05 %)
87,167
(8.03 %)
47,003
(3.66 %)
25 Atlantic hagfish (MG_SS 2024)
GCF_040869285.1
46,374
(1.72 %)
n/a 7,719
(0.19 %)
59,788
(2.68 %)
n/a 44.23
(99.94 %)
0
(0 %)
4,876
(0.06 %)
4,270
(100.00 %)
2,094,143
(3.54 %)
3,212,025
(29.83 %)
8,998,320
(75.15 %)
43
(0.00 %)
n/a 408,391
(12.65 %)
60,671
(0.82 %)
26 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1
n/a n/a 16,554
(3.01 %)
54,832
(7.45 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
0
(0 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,008
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
0
(0 %)
297,396
(3.46 %)
36,868
(2.33 %)
24,401
(1.38 %)
27 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2
n/a n/a 15,331
(2.42 %)
52,370
(6.91 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
0
(0 %)
74
(0.00 %)
1,049
(100.00 %)
1,454,631
(18.29 %)
383,946
(4.34 %)
4,363,016
(32.69 %)
0
(0 %)
445,382
(4.43 %)
56,416
(3.08 %)
20,355
(1.02 %)
28 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1
n/a n/a 11,960
(0.40 %)
25,618
(1.25 %)
n/a 42.94
(99.99 %)
0
(0 %)
1,633
(0.01 %)
1,412
(100.00 %)
7,453,535
(49.31 %)
686,063
(13.00 %)
19,985,605
(50.32 %)
8
(0.00 %)
3,309,683
(5.86 %)
86,138
(2.16 %)
30,350
(0.41 %)
29 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024)
GCA_964270935.1
n/a n/a 17,961
(1.59 %)
20,087
(1.36 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
917
(0.01 %)
917
(0.01 %)
1,796
(99.99 %)
3,626,392
(35.51 %)
824,778
(7.32 %)
11,499,904
(39.18 %)
3
(0.00 %)
1,314,679
(4.17 %)
74,348
(3.46 %)
40,100
(1.09 %)
30 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1
n/a n/a 13,505
(1.03 %)
18,978
(1.47 %)
n/a 45.32
(99.98 %)
0
(0 %)
26
(0.02 %)
3,482
(100.00 %)
6,880,857
(41.88 %)
1,099,932
(7.47 %)
8,156,735
(56.68 %)
0
(0 %)
4,129,545
(10.90 %)
70,515
(2.88 %)
41,464
(1.12 %)
31 Australian ruff (RE-2024a hap1 2024)
GCA_042242115.1
n/a n/a 15,457
(2.72 %)
38,472
(5.59 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
0
(0 %)
91
(0.00 %)
625
(100.00 %)
476,492
(3.25 %)
242,097
(6.02 %)
4,286,693
(33.41 %)
1
(0.00 %)
310,636
(3.76 %)
9,322
(0.80 %)
6,756
(0.33 %)
32 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3
n/a n/a 16,280
(0.07 %)
186,628
(1.11 %)
n/a 46.01
(99.99 %)
0
(0 %)
184,422
(0.01 %)
27,157
(100.00 %)
28,291,633
(68.19 %)
7,299,053
(4.96 %)
211,579
(99.99 %)
189
(0.00 %)
n/a 2,388,998
(5.24 %)
429,355
(0.66 %)
33 band-tailed pigeon (v2 hap2 2025)
GCA_036971685.2
n/a n/a 12,277
(1.73 %)
24,050
(2.22 %)
n/a 43.61
(99.61 %)
0
(0 %)
64
(0.39 %)
441
(100.00 %)
468,593
(5.54 %)
342,626
(9.43 %)
5,110,790
(27.39 %)
0
(0 %)
646,906
(4.40 %)
38,807
(6.05 %)
29,198
(1.74 %)
34 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1
n/a n/a 15,211
(3.23 %)
41,620
(7.14 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
2,393
(100.00 %)
785,178
(17.57 %)
249,148
(8.36 %)
3,391,653
(26.49 %)
0
(0 %)
274,110
(3.20 %)
13,787
(0.93 %)
9,087
(0.56 %)
35 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1
n/a n/a 15,024
(1.45 %)
65,141
(4.53 %)
n/a 41.23
(99.52 %)
0
(0 %)
373
(0.48 %)
196
(100.00 %)
2,509,508
(50.53 %)
441,892
(5.11 %)
6,245,443
(38.22 %)
2
(0.00 %)
822,138
(6.12 %)
93,198
(3.82 %)
36,988
(1.26 %)
36 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1
n/a n/a 26,794
(3.15 %)
76,434
(5.64 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
8,035
(100.00 %)
4,084,361
(52.18 %)
538,411
(4.25 %)
7,659,980
(38.94 %)
0
(0 %)
450,884
(2.88 %)
58,008
(2.90 %)
19,160
(0.57 %)
37 Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021)
GCA_015227815.3
n/a n/a 11,132
(1.94 %)
20,993
(2.40 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
2,476
(100.00 %)
550,072
(10.78 %)
282,378
(2.00 %)
5,634,117
(20.43 %)
0
(0 %)
161,076
(1.17 %)
30,305
(2.79 %)
25,208
(1.64 %)
38 basking shark (sCetMax3.hap2.1 2024)
GCA_964194165.1
n/a n/a 13,515
(0.42 %)
21,374
(1.06 %)
n/a 44.47
(99.99 %)
2,740
(0.01 %)
2,740
(0.01 %)
6,569
(99.99 %)
6,483,403
(66.87 %)
1,041,828
(9.99 %)
21,142,745
(50.24 %)
31
(0.00 %)
4,014,149
(6.09 %)
107,555
(1.88 %)
26,392
(0.67 %)
39 bat A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1
n/a n/a 17,124
(1.63 %)
18,342
(1.54 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
0
(0 %)
56
(0.00 %)
187
(100.00 %)
2,597,378
(26.81 %)
332,733
(4.43 %)
10,957,327
(33.52 %)
2
(0.00 %)
406,013
(1.59 %)
63,688
(2.22 %)
49,331
(1.50 %)
40 bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024)
GCA_043727955.1
n/a n/a 19,354
(1.74 %)
21,367
(1.51 %)
n/a 41.48
(100.00 %)
15
(0.00 %)
190
(0.00 %)
265
(100.00 %)
3,860,506
(38.95 %)
722,335
(7.13 %)
11,994,816
(35.77 %)
1
(0.00 %)
1,149,103
(3.65 %)
44,562
(1.21 %)
35,219
(1.01 %)
41 beardfish (hap2 2025)
GCA_047511595.1
n/a n/a 15,940
(3.02 %)
51,682
(7.42 %)
n/a 43.31
(99.98 %)
1
(0.00 %)
756
(0.02 %)
200
(100.00 %)
986,717
(11.69 %)
754,642
(11.91 %)
3,459,958
(30.32 %)
9
(0.00 %)
762,386
(6.77 %)
67,732
(5.27 %)
40,872
(2.45 %)
42 bird A.albertisi (hap2 2024)
GCA_039906465.1
n/a n/a 12,101
(1.93 %)
21,258
(2.30 %)
n/a 42.52
(99.99 %)
0
(0 %)
344
(0.01 %)
525
(100.00 %)
412,944
(6.30 %)
232,333
(2.21 %)
5,715,517
(21.35 %)
7
(0.00 %)
210,485
(1.75 %)
20,873
(2.13 %)
17,066
(0.97 %)
43 bird E.chinensis (hap1 2024)
GCA_039878515.1
n/a n/a 12,607
(2.39 %)
22,429
(2.59 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
0
(0 %)
331
(0.01 %)
425
(100.00 %)
521,486
(5.26 %)
266,418
(2.40 %)
5,305,054
(20.63 %)
0
(0 %)
184,194
(1.95 %)
19,590
(2.16 %)
16,404
(1.36 %)
44 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024)
GCA_043290065.1
n/a n/a 19,814
(0.63 %)
20,140
(0.63 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
1
(0.00 %)
723
(0.00 %)
315
(100.00 %)
3,657,357
(14.24 %)
1,158,716
(2.84 %)
22,924,986
(64.53 %)
6
(0.00 %)
n/a 46,774
(0.90 %)
21,729
(0.30 %)
45 black rhinoceros (alternate hap 2021)
GCA_020826835.1
n/a n/a 19,000
(1.37 %)
22,547
(1.26 %)
n/a 41.56
(99.97 %)
0
(0 %)
178
(0.03 %)
1,199
(100.00 %)
4,340,245
(37.22 %)
564,468
(8.07 %)
14,384,523
(40.40 %)
0
(0 %)
941,914
(2.51 %)
44,971
(1.16 %)
34,023
(0.74 %)
46 black-capped chickadee (hap2 2023)
GCA_030490855.1
n/a n/a 11,495
(1.90 %)
22,202
(2.49 %)
n/a 42.77
(99.94 %)
0
(0 %)
240
(0.06 %)
157
(100.00 %)
560,436
(11.20 %)
441,102
(7.11 %)
5,126,888
(23.42 %)
1
(0.00 %)
485,675
(2.99 %)
35,457
(2.90 %)
20,157
(1.24 %)
47 black-headed gull (Kunming 2023)
GCA_030820635.1
n/a n/a 12,902
(1.75 %)
23,180
(2.09 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
0
(0 %)
149
(0.00 %)
297
(100.00 %)
498,044
(5.37 %)
199,557
(4.44 %)
6,843,616
(23.12 %)
3
(0.00 %)
184,280
(1.44 %)
42,444
(3.62 %)
37,532
(1.85 %)
48 black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023)
GCA_028501385.1
n/a n/a 12,650
(1.68 %)
22,959
(2.02 %)
n/a 44.62
(99.95 %)
0
(0 %)
223
(0.05 %)
733
(100.00 %)
483,413
(5.25 %)
221,284
(9.35 %)
6,264,499
(27.26 %)
4
(0.00 %)
646,822
(3.82 %)
42,776
(4.88 %)
36,156
(1.75 %)
49 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1
n/a n/a 15,274
(2.92 %)
51,453
(7.45 %)
n/a 43.07
(99.99 %)
0
(0 %)
373
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,239,364
(29.69 %)
354,703
(9.63 %)
3,006,556
(30.35 %)
2
(0.00 %)
588,441
(7.05 %)
53,503
(4.48 %)
28,830
(1.72 %)
50 blackcap (alternate hap 2019)
GCA_009819715.1
n/a n/a 11,586
(1.87 %)
22,618
(2.41 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,566
(100.00 %)
473,456
(5.97 %)
308,518
(2.29 %)
5,987,640
(19.64 %)
0
(0 %)
201,989
(1.45 %)
25,451
(2.38 %)
21,377
(1.34 %)
51 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1
n/a n/a 17,403
(2.99 %)
45,903
(5.38 %)
n/a 38.64
(99.99 %)
0
(0 %)
709
(0.01 %)
673
(100.00 %)
2,141,901
(35.77 %)
482,931
(17.18 %)
4,297,133
(46.82 %)
4
(0.00 %)
991,826
(7.99 %)
41,889
(2.32 %)
19,281
(0.97 %)
52 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1
n/a n/a 17,838
(1.54 %)
21,389
(1.35 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,198
(100.00 %)
3,542,727
(35.35 %)
650,369
(8.86 %)
10,971,320
(41.15 %)
0
(0 %)
1,286,122
(4.20 %)
62,389
(1.68 %)
34,595
(0.95 %)
53 blue jay (hap2 2024)
GCA_046129645.1
n/a n/a 12,260
(1.70 %)
24,683
(2.22 %)
n/a 44.48
(99.99 %)
0
(0 %)
333
(0.01 %)
309
(100.00 %)
878,243
(23.54 %)
375,593
(6.42 %)
4,946,505
(29.07 %)
1
(0.00 %)
485,371
(4.00 %)
43,182
(4.25 %)
23,048
(1.12 %)
54 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2
n/a n/a 16,997
(1.82 %)
20,609
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
10,999
(100.00 %)
3,126,800
(43.49 %)
454,452
(1.23 %)
9,916,868
(33.63 %)
0
(0 %)
296,938
(1.19 %)
55,436
(1.85 %)
38,786
(1.50 %)
55 blue-and-yellow macaw (hap2 2023)
GCA_028858555.1
n/a n/a 13,216
(1.69 %)
23,855
(2.07 %)
n/a 43.30
(99.92 %)
0
(0 %)
130
(0.08 %)
274
(100.00 %)
746,174
(21.96 %)
291,116
(9.91 %)
5,424,976
(28.69 %)
1
(0.00 %)
907,315
(4.95 %)
26,750
(2.02 %)
20,655
(1.17 %)
56 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1
n/a n/a 12,494
(1.93 %)
44,967
(5.14 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,174
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
0
(0 %)
344,768
(3.42 %)
23,532
(1.46 %)
12,368
(0.66 %)
57 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1
n/a n/a 13,882
(2.27 %)
45,919
(5.98 %)
n/a 39.50
(99.99 %)
0
(0 %)
45
(0.01 %)
3,194
(100.00 %)
803,073
(13.60 %)
258,404
(4.19 %)
4,674,614
(28.36 %)
0
(0 %)
339,851
(3.09 %)
15,524
(1.02 %)
9,057
(0.56 %)
58 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1
n/a n/a 12,424
(1.95 %)
46,550
(6.00 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,619
(100.00 %)
789,207
(14.61 %)
348,482
(20.98 %)
3,447,241
(38.72 %)
0
(0 %)
1,174,378
(8.68 %)
27,035
(4.16 %)
12,167
(0.85 %)
59 Bornean orangutan (v2 AG05252 alternate hap 2024)
GCA_028885525.2
n/a n/a 19,761
(1.78 %)
20,268
(1.16 %)
n/a 40.95
(99.70 %)
0
(0 %)
10
(0.30 %)
33
(100.00 %)
5,201,908
(53.67 %)
980,696
(9.42 %)
15,105,351
(41.63 %)
0
(0 %)
2,340,777
(4.18 %)
41,454
(1.11 %)
28,219
(0.76 %)
60 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1
n/a n/a 17,791
(1.12 %)
22,667
(1.29 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
106
(0.00 %)
106
(0.00 %)
2,898
(100.00 %)
6,293,452
(41.30 %)
1,076,688
(17.94 %)
8,553,272
(57.13 %)
1
(0.00 %)
6,983,927
(14.02 %)
31,102
(1.31 %)
23,419
(0.57 %)
61 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1
n/a n/a 17,612
(1.68 %)
22,099
(1.91 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
25
(0.00 %)
541
(0.01 %)
365
(100.00 %)
2,748,918
(17.16 %)
827,542
(4.51 %)
8,832,809
(39.20 %)
2
(0.00 %)
1,074,853
(3.77 %)
26,416
(1.35 %)
22,242
(0.81 %)
62 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1
n/a n/a 17,954
(1.51 %)
19,994
(1.30 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
0
(0 %)
240
(0.00 %)
800
(100.00 %)
3,723,164
(34.96 %)
809,880
(11.02 %)
11,359,211
(41.42 %)
2
(0.00 %)
1,554,419
(4.60 %)
60,067
(1.55 %)
36,564
(0.95 %)
63 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1
n/a n/a 13,813
(1.89 %)
27,088
(4.55 %)
n/a 40.60
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
297
(100.00 %)
886,999
(13.24 %)
358,077
(7.37 %)
4,625,277
(36.22 %)
0
(0 %)
529,249
(5.78 %)
43,764
(2.79 %)
26,363
(1.18 %)
64 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1
n/a n/a 17,999
(1.60 %)
76,655
(5.58 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
10,799
(100.00 %)
5,994,257
(39.29 %)
1,126,685
(10.35 %)
6,996,991
(46.02 %)
0
(0 %)
1,131,145
(6.97 %)
71,016
(3.36 %)
27,805
(1.08 %)
65 Brazilian merganser (hap2 2024)
GCA_036850655.1
n/a n/a 12,578
(1.76 %)
23,066
(2.06 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
0
(0 %)
244
(0.00 %)
720
(100.00 %)
773,452
(7.75 %)
522,491
(10.88 %)
5,592,104
(31.80 %)
0
(0 %)
820,340
(5.03 %)
33,981
(4.60 %)
26,728
(1.37 %)
66 Brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1
n/a n/a 12,479
(1.04 %)
16,886
(1.81 %)
n/a 41.00
(100.00 %)
0
(0 %)
172
(0.00 %)
41
(100.00 %)
1,249,920
(6.94 %)
941,401
(5.42 %)
8,402,482
(44.77 %)
1
(0.00 %)
1,126,727
(4.44 %)
37,299
(1.02 %)
14,196
(0.37 %)
67 budgerigar (paternal hap 2020)
GCA_012275275.1
n/a n/a 13,127
(1.94 %)
22,492
(2.30 %)
n/a 41.84
(98.98 %)
0
(0 %)
737
(1.02 %)
330
(100.00 %)
505,478
(9.66 %)
231,633
(2.15 %)
5,778,405
(20.30 %)
0
(0 %)
277,857
(1.78 %)
20,205
(1.61 %)
17,519
(1.14 %)
68 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1
n/a n/a 15,228
(3.42 %)
41,322
(7.36 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,592
(100.00 %)
972,098
(18.43 %)
155,031
(1.41 %)
3,452,400
(21.36 %)
0
(0 %)
85,576
(1.51 %)
15,255
(1.12 %)
10,648
(0.72 %)
69 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2
n/a n/a 18,319
(1.81 %)
18,772
(1.48 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,096
(100.00 %)
3,724,021
(42.91 %)
488,356
(1.26 %)
10,891,276
(33.15 %)
0
(0 %)
395,508
(1.40 %)
44,467
(1.57 %)
41,289
(1.38 %)
70 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2
n/a n/a 12,041
(1.42 %)
15,226
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
5
(0.00 %)
5
(0.00 %)
15,046
(100.00 %)
2,939,291
(43.50 %)
544,849
(1.76 %)
7,650,345
(32.74 %)
0
(0 %)
294,817
(1.43 %)
39,099
(2.44 %)
34,631
(1.88 %)
71 Caribbean electric ray (hap1 2024 genbank)
GCA_036971445.1
n/a n/a 11,967
(0.44 %)
20,851
(1.23 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
0
(0 %)
1,443
(0.01 %)
596
(100.00 %)
4,902,656
(34.96 %)
1,040,893
(17.82 %)
16,403,253
(54.79 %)
2
(0.00 %)
3,888,884
(8.11 %)
113,936
(1.69 %)
22,323
(0.31 %)
72 carmine bee-eater (alternate hap 2019)
GCA_009819585.1
n/a n/a 12,381
(1.76 %)
28,865
(2.78 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,296
(100.00 %)
542,765
(7.77 %)
204,389
(1.06 %)
6,415,832
(21.53 %)
0
(0 %)
133,280
(1.22 %)
31,638
(2.54 %)
23,845
(1.27 %)
73 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1
n/a n/a 15,980
(2.79 %)
53,680
(6.62 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,656
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
0
(0 %)
386,762
(3.56 %)
20,338
(1.21 %)
10,996
(0.60 %)
74 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1
n/a n/a 15,116
(2.91 %)
47,839
(7.01 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
0
(0 %)
43
(0.00 %)
71
(100.00 %)
463,848
(3.80 %)
254,561
(4.23 %)
3,654,295
(24.08 %)
2
(0.00 %)
196,606
(2.28 %)
30,593
(1.99 %)
17,996
(1.03 %)
75 chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022)
GCA_027408205.1
n/a n/a 11,740
(2.36 %)
21,473
(2.56 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
2,263
(100.00 %)
551,116
(10.78 %)
241,638
(4.43 %)
4,973,260
(21.77 %)
0
(0 %)
285,039
(2.53 %)
21,151
(2.71 %)
18,001
(1.56 %)
76 chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022)
GCA_027408225.1
n/a n/a 13,037
(2.20 %)
23,550
(2.37 %)
n/a 42.31
(99.81 %)
0
(0 %)
460
(0.19 %)
252
(100.00 %)
681,166
(12.04 %)
381,093
(7.09 %)
5,610,806
(24.65 %)
3
(0.00 %)
489,064
(3.62 %)
25,664
(2.75 %)
21,023
(1.48 %)
77 chicken (Huxu 2023)
GCA_024206055.2
n/a n/a 13,405
(2.26 %)
24,435
(2.45 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
41
(100.00 %)
704,190
(12.54 %)
502,701
(5.74 %)
5,731,097
(23.50 %)
0
(0 %)
573,152
(3.69 %)
27,781
(2.90 %)
22,282
(1.53 %)
78 chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022)
GCA_027408255.1
n/a n/a 11,339
(2.33 %)
20,588
(2.51 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,684
(100.00 %)
537,847
(10.84 %)
217,964
(3.81 %)
4,879,985
(21.43 %)
0
(0 %)
236,343
(2.20 %)
19,653
(2.66 %)
17,140
(1.52 %)
79 chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023)
GCA_027557775.1
n/a n/a 12,855
(2.22 %)
23,147
(2.37 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
0
(0 %)
566
(0.26 %)
246
(100.00 %)
672,973
(12.00 %)
342,156
(6.53 %)
5,690,712
(23.98 %)
5
(0.00 %)
438,910
(3.29 %)
24,413
(2.63 %)
20,581
(1.48 %)
80 chicken white leghorn layer X broiler (v2 broiler haplotype 2021 2021)
GCF_016699485.2
74,716
(9.14 %)
n/a 13,128
(2.33 %)
23,484
(2.48 %)
72,013
(9.34 %)
42.20
(99.68 %)
463
(0.32 %)
463
(0.32 %)
677
(99.68 %)
697,827
(12.53 %)
290,892
(2.63 %)
5,887,021
(21.30 %)
1
(0.00 %)
268,636
(2.17 %)
24,469
(2.59 %)
20,885
(1.55 %)
81 chimpanzee (v2 AG18354 alternate hap 2024)
GCA_028858805.2
n/a n/a 19,981
(1.80 %)
20,886
(1.18 %)
n/a 40.63
(99.83 %)
0
(0 %)
5
(0.17 %)
23
(100.00 %)
5,080,229
(48.83 %)
937,411
(11.36 %)
14,905,102
(42.22 %)
0
(0 %)
3,051,376
(5.48 %)
46,330
(1.11 %)
28,554
(0.78 %)
82 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1
n/a n/a 18,538
(1.34 %)
21,724
(1.27 %)
n/a 41.09
(99.48 %)
0
(0 %)
190
(0.52 %)
700
(100.00 %)
3,362,899
(34.48 %)
678,384
(4.11 %)
12,024,241
(39.52 %)
7
(0.00 %)
1,198,886
(3.98 %)
48,960
(1.19 %)
34,434
(0.79 %)
83 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1
n/a n/a 15,165
(2.44 %)
46,105
(6.16 %)
n/a 39.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,163
(100.00 %)
1,546,066
(27.08 %)
537,737
(9.87 %)
4,485,153
(30.70 %)
0
(0 %)
726,611
(6.01 %)
14,774
(0.81 %)
8,304
(0.43 %)
84 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1
n/a n/a 14,940
(3.51 %)
39,688
(7.41 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
0
(0 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,993
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
0
(0 %)
150,484
(2.39 %)
10,131
(0.86 %)
7,444
(0.57 %)
85 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1
n/a n/a 16,430
(1.52 %)
21,057
(1.44 %)
n/a 41.79
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 10,377
(100.00 %)
3,845,437
(33.39 %)
794,587
(2.14 %)
10,765,695
(33.40 %)
0
(0 %)
461,307
(1.56 %)
56,375
(2.45 %)
47,473
(1.74 %)
86 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1
n/a n/a 13,999
(1.21 %)
18,145
(2.02 %)
n/a 44.85
(100.00 %)
0
(0 %)
286
(0.00 %)
827
(100.00 %)
844,126
(6.57 %)
462,086
(2.56 %)
8,237,807
(37.72 %)
0
(0 %)
573,955
(2.91 %)
30,098
(0.96 %)
16,208
(0.52 %)
87 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1
n/a n/a 18,537
(1.77 %)
20,619
(1.44 %)
n/a 41.42
(98.08 %)
0
(0 %)
868
(1.92 %)
1,166
(100.00 %)
3,997,801
(45.93 %)
609,838
(1.85 %)
12,400,272
(34.53 %)
1
(0.00 %)
649,569
(1.73 %)
64,630
(1.84 %)
42,623
(1.32 %)
88 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1
n/a n/a 14,863
(0.75 %)
15,426
(0.89 %)
n/a 39.41
(100.00 %)
313
(0.00 %)
313
(0.00 %)
12,446
(100.00 %)
5,846,769
(38.56 %)
987,917
(1.99 %)
16,764,356
(40.14 %)
0
(0 %)
345,940
(1.13 %)
13,303
(0.35 %)
10,338
(0.23 %)
89 common buzzard (bButBut1.hap2.1 2024)
GCA_964188375.1
n/a n/a 13,593
(1.72 %)
24,541
(2.09 %)
n/a 43.49
(99.99 %)
471
(0.01 %)
471
(0.01 %)
929
(99.99 %)
439,011
(4.19 %)
247,629
(8.40 %)
6,711,875
(25.06 %)
4
(0.00 %)
284,874
(1.81 %)
49,141
(4.61 %)
34,440
(1.72 %)
90 common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021)
GCA_017976305.1
n/a n/a 12,464
(1.91 %)
24,623
(2.50 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
8
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
505,582
(10.93 %)
292,484
(2.48 %)
6,061,828
(21.38 %)
0
(0 %)
303,976
(1.80 %)
24,010
(1.80 %)
19,613
(1.10 %)
91 common dace (hap1.1 2025)
GCA_965113295.1
n/a n/a 18,484
(2.43 %)
69,931
(5.95 %)
n/a 39.03
(99.98 %)
0
(0 %)
1,202
(0.02 %)
876
(100.00 %)
938,148
(4.74 %)
828,944
(9.34 %)
5,833,273
(42.65 %)
14
(0.00 %)
987,377
(7.00 %)
78,182
(4.87 %)
26,569
(1.15 %)
92 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1
n/a n/a 13,073
(0.44 %)
43,036
(1.95 %)
n/a 44.07
(100.00 %)
14
(0.00 %)
14
(0.00 %)
12,033
(100.00 %)
1,489,788
(2.18 %)
2,621,157
(9.04 %)
17,154,926
(55.44 %)
0
(0 %)
3,161,179
(6.09 %)
581,115
(7.68 %)
54,845
(0.65 %)
93 common moorhen (bGalChl1.hap2.1 2024)
GCA_964237395.1
n/a n/a 12,745
(1.75 %)
23,052
(2.18 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
536
(0.01 %)
536
(0.01 %)
931
(99.99 %)
483,812
(5.59 %)
210,131
(3.30 %)
6,332,994
(22.33 %)
3
(0.00 %)
308,952
(2.24 %)
26,285
(2.20 %)
21,379
(1.23 %)
94 common myna (bArcTri1 alternate hap 2023)
GCA_027559525.1
n/a n/a 10,692
(1.77 %)
20,925
(2.29 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,221
(100.00 %)
328,602
(4.16 %)
604,057
(8.02 %)
5,233,128
(25.06 %)
0
(0 %)
479,200
(3.38 %)
25,210
(3.70 %)
18,123
(1.22 %)
95 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1
n/a n/a 15,974
(1.72 %)
20,563
(1.66 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
10,459
(100.00 %)
2,634,333
(23.76 %)
703,674
(2.65 %)
8,909,525
(33.95 %)
0
(0 %)
343,235
(1.37 %)
50,430
(2.54 %)
45,982
(1.75 %)
96 common pochard (bAytFer1.hap2.1 2024)
GCA_964211795.1
n/a n/a 12,828
(1.96 %)
23,534
(2.35 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
405
(0.01 %)
405
(0.01 %)
767
(99.99 %)
725,169
(7.34 %)
472,156
(5.81 %)
5,786,296
(25.35 %)
16
(0.00 %)
412,441
(2.96 %)
30,917
(2.80 %)
26,828
(1.51 %)
97 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1
n/a n/a 14,904
(2.99 %)
43,194
(7.09 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,318
(100.00 %)
1,128,080
(18.77 %)
328,975
(8.35 %)
3,952,898
(31.64 %)
0
(0 %)
410,353
(4.52 %)
26,979
(2.08 %)
15,469
(0.95 %)
98 common swift (bApuApu2 alternate hap 2021)
GCA_020740585.1
n/a n/a 11,653
(1.89 %)
19,731
(2.20 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
1,697
(100.00 %)
443,384
(6.09 %)
185,968
(1.18 %)
5,916,553
(20.88 %)
0
(0 %)
109,215
(0.89 %)
18,864
(1.75 %)
15,032
(0.87 %)
99 common tern (alternate hap 2019)
GCA_009819645.1
n/a n/a 12,773
(1.79 %)
24,751
(2.23 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,235
(100.00 %)
549,460
(7.58 %)
204,051
(1.02 %)
6,880,566
(20.70 %)
0
(0 %)
116,485
(1.17 %)
47,352
(3.95 %)
42,123
(2.18 %)
100 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1
n/a n/a 12,074
(0.39 %)
46,329
(1.82 %)
n/a 44.48
(99.99 %)
156
(0.01 %)
156
(0.01 %)
24,351
(99.99 %)
1,186,360
(1.65 %)
2,279,941
(13.33 %)
14,665,548
(61.48 %)
2
(0.00 %)
4,594,926
(9.74 %)
405,097
(4.49 %)
61,648
(0.70 %)
101 common vampire bat (HL8 alternate hap 2022)
GCA_022682395.1
n/a n/a 17,520
(1.75 %)
18,995
(1.67 %)
n/a 42.89
(99.99 %)
0
(0 %)
580
(0.01 %)
430
(100.00 %)
2,597,497
(28.17 %)
356,620
(2.88 %)
10,797,225
(31.23 %)
25
(0.00 %)
271,481
(1.34 %)
61,931
(2.30 %)
43,396
(1.30 %)
102 common vampire bat (HL8 alternate hap 2022)
GCA_022682395.2
n/a n/a 17,485
(1.76 %)
18,907
(1.66 %)
n/a 42.87
(99.99 %)
0
(0 %)
576
(0.01 %)
429
(100.00 %)
2,592,246
(28.20 %)
352,985
(2.87 %)
10,737,944
(31.11 %)
25
(0.00 %)
264,293
(1.29 %)
61,125
(2.28 %)
42,729
(1.28 %)
103 common wall lizard (hap2 2024)
GCA_964188365.1
n/a n/a 13,838
(1.39 %)
19,262
(2.35 %)
n/a 44.17
(99.99 %)
734
(0.01 %)
734
(0.01 %)
825
(99.99 %)
815,808
(4.07 %)
494,366
(4.53 %)
6,739,651
(37.84 %)
6
(0.00 %)
648,489
(3.96 %)
113,458
(3.63 %)
19,621
(0.77 %)
104 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1
n/a n/a 25,968
(1.48 %)
104,922
(4.18 %)
n/a 43.67
(99.96 %)
4,689
(0.04 %)
4,689
(0.04 %)
8,669
(99.96 %)
1,320,339
(4.08 %)
1,364,334
(15.61 %)
7,674,742
(61.10 %)
11
(0.00 %)
2,973,556
(10.43 %)
94,019
(3.82 %)
16,046
(0.28 %)
105 common yellowthroat (alternate hap 2019)
GCA_009764545.1
n/a n/a 10,611
(1.77 %)
21,125
(2.21 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
4,976
(100.00 %)
422,889
(5.99 %)
294,928
(2.71 %)
5,928,421
(19.76 %)
0
(0 %)
245,763
(1.64 %)
21,397
(1.91 %)
17,659
(1.14 %)
106 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1
n/a n/a 5,231
(0.27 %)
47,644
(1.48 %)
n/a 44.62
(99.99 %)
144
(0.01 %)
144
(0.01 %)
21,561
(99.99 %)
2,803,873
(49.20 %)
655,416
(2.69 %)
7,558,550
(67.05 %)
0
(0 %)
912,917
(5.74 %)
181,626
(10.52 %)
19,591
(0.39 %)
107 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1
n/a n/a 13,622
(2.81 %)
43,285
(6.93 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,125
(100.00 %)
1,741,373
(32.89 %)
182,926
(2.01 %)
3,659,106
(21.68 %)
1
(0.00 %)
138,669
(1.93 %)
27,693
(1.89 %)
19,848
(1.23 %)
108 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1
n/a n/a 14,955
(0.23 %)
n/a n/a 45.61
(99.80 %)
2,431
(0.20 %)
2,431
(0.20 %)
5,958
(99.80 %)
20,007,151
(76.28 %)
5,951,819
(19.40 %)
5,958
(99.80 %)
49
(0.00 %)
n/a 991,009
(4.86 %)
91,447
(0.54 %)
109 Cory's shearwater (bCalBor7.hap2.1 2024)
GCA_964196065.1
n/a n/a 12,750
(1.85 %)
23,191
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.99 %)
477
(0.01 %)
477
(0.01 %)
726
(99.99 %)
403,846
(4.59 %)
252,125
(3.30 %)
6,206,493
(22.07 %)
2
(0.00 %)
286,848
(2.45 %)
41,821
(4.50 %)
38,197
(2.23 %)
110 crested bigscale (hap2.1 2025)
GCA_964638665.1
n/a n/a 17,775
(1.43 %)
100,017
(6.38 %)
n/a 44.59
(99.96 %)
2,894
(0.04 %)
2,894
(0.04 %)
4,301
(99.96 %)
5,332,080
(56.26 %)
1,737,704
(18.88 %)
6,064,583
(49.72 %)
13
(0.00 %)
2,194,072
(10.21 %)
141,258
(4.70 %)
36,413
(1.08 %)
111 crested eagle (hap1 2024)
GCA_045345505.1
n/a n/a 12,782
(1.65 %)
24,376
(2.35 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
0
(0 %)
105
(0.00 %)
548
(100.00 %)
675,525
(20.31 %)
325,345
(11.43 %)
5,483,869
(28.16 %)
0
(0 %)
643,247
(4.20 %)
52,371
(8.51 %)
30,804
(1.52 %)
112 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1
n/a n/a 13,192
(1.36 %)
19,293
(2.32 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,936
(100.00 %)
808,341
(4.31 %)
467,532
(2.91 %)
6,418,809
(38.02 %)
0
(0 %)
518,786
(3.19 %)
107,080
(3.15 %)
17,213
(0.72 %)
113 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1
n/a n/a 4,509
(3.03 %)
16,936
(7.22 %)
n/a 38.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,713
(100.00 %)
430,197
(46.38 %)
101,926
(7.54 %)
1,077,239
(32.21 %)
0
(0 %)
149,644
(6.00 %)
10,612
(4.11 %)
3,661
(0.96 %)
114 cuckoo roller (hap1 2023)
GCA_034619455.1
n/a n/a 13,157
(1.67 %)
30,413
(2.59 %)
n/a 43.53
(100.00 %)
18
(0.00 %)
290
(0.00 %)
353
(100.00 %)
609,076
(8.83 %)
331,584
(6.01 %)
5,966,458
(23.99 %)
1
(0.00 %)
520,291
(3.07 %)
45,694
(7.05 %)
36,809
(2.18 %)
115 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1
n/a n/a 14,861
(2.74 %)
42,996
(6.34 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
0
(0 %)
31
(0.01 %)
1,476
(100.00 %)
1,373,727
(30.17 %)
220,572
(4.38 %)
4,176,936
(27.32 %)
0
(0 %)
274,559
(2.86 %)
17,129
(1.04 %)
8,648
(0.51 %)
116 Dalmatian pelican (alternate hap 2023)
GCA_030449815.1
n/a n/a 12,766
(1.68 %)
26,055
(2.18 %)
n/a 43.44
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 7,284
(100.00 %)
607,561
(13.23 %)
239,649
(4.41 %)
6,086,519
(23.21 %)
0
(0 %)
260,915
(1.93 %)
38,398
(5.49 %)
35,285
(2.09 %)
117 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1
n/a n/a 18,895
(1.78 %)
24,235
(1.81 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,930
(100.00 %)
2,813,870
(23.75 %)
718,406
(5.18 %)
9,977,320
(37.24 %)
0
(0 %)
609,378
(2.37 %)
62,910
(2.66 %)
55,962
(1.97 %)
118 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2
n/a n/a 14,119
(3.95 %)
47,988
(8.57 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,660
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
0
(0 %)
175,500
(3.05 %)
50,830
(8.72 %)
41,064
(4.69 %)
119 diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023)
GCA_027887205.1
n/a n/a 15,081
(1.08 %)
19,115
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.98 %)
0
(0 %)
127
(0.02 %)
59
(100.00 %)
4,093,707
(46.36 %)
404,046
(1.70 %)
11,113,266
(33.78 %)
1
(0.01 %)
405,600
(1.68 %)
111,129
(2.68 %)
30,307
(0.82 %)
120 Domestic goose (bAnsAns1.hap2.1 2024)
GCA_964211785.1
n/a n/a 12,473
(1.84 %)
22,849
(2.21 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
754
(0.01 %)
754
(0.01 %)
1,135
(99.99 %)
594,136
(5.06 %)
375,813
(7.54 %)
5,497,978
(26.76 %)
11
(0.00 %)
630,693
(4.47 %)
39,164
(4.55 %)
34,203
(2.32 %)
121 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1
n/a n/a 16,788
(2.12 %)
50,338
(4.68 %)
n/a 41.27
(98.12 %)
0
(0 %)
641
(1.88 %)
182
(100.00 %)
2,709,759
(34.74 %)
798,364
(14.84 %)
5,418,190
(36.02 %)
1
(0.00 %)
1,397,111
(8.85 %)
30,055
(1.31 %)
21,119
(0.80 %)
122 Downy woodpecker (alternate hap 2020)
GCA_014839825.1
n/a n/a 11,732
(1.74 %)
22,080
(2.25 %)
n/a 45.44
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
1,342
(100.00 %)
921,959
(20.95 %)
334,804
(3.26 %)
5,352,773
(31.27 %)
0
(0 %)
702,756
(4.12 %)
24,105
(1.81 %)
19,021
(1.21 %)
123 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1
n/a n/a 18,538
(1.23 %)
20,775
(1.09 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
0
(0 %)
89
(0.00 %)
167
(100.00 %)
4,455,227
(33.01 %)
444,021
(1.73 %)
14,946,847
(47.37 %)
1
(0.00 %)
504,439
(1.27 %)
29,828
(0.79 %)
24,008
(0.54 %)
124 East African grey crowned-crane (alternate hap 2020)
GCA_011004865.1
n/a n/a 11,799
(1.88 %)
22,122
(2.30 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
971
(100.00 %)
457,930
(6.40 %)
150,544
(0.85 %)
6,074,490
(20.16 %)
0
(0 %)
65,996
(0.78 %)
33,323
(3.81 %)
32,972
(2.41 %)
125 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1
n/a n/a 13,632
(0.43 %)
35,630
(1.52 %)
n/a 46.77
(99.99 %)
0
(0 %)
1,773
(0.01 %)
590
(100.00 %)
1,759,193
(1.98 %)
2,013,186
(16.21 %)
16,138,898
(60.55 %)
17
(0.00 %)
5,811,499
(9.67 %)
614,432
(5.85 %)
72,993
(0.75 %)
126 electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020)
GCA_013347915.1
n/a n/a 12,020
(3.63 %)
38,881
(7.31 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,629
(100.00 %)
429,509
(7.66 %)
432,260
(11.41 %)
2,049,609
(24.32 %)
0
(0 %)
486,181
(6.19 %)
35,597
(4.37 %)
27,662
(2.94 %)
127 elegant crested-tinamou (YG026_01 alternate hap 2025)
GCA_047922975.1
n/a n/a 12,085
(2.00 %)
23,151
(2.57 %)
n/a 44.31
(100.00 %)
0
(0 %)
184
(0.00 %)
359
(100.00 %)
416,542
(4.17 %)
324,013
(7.62 %)
5,021,818
(23.94 %)
14
(0.00 %)
345,908
(2.75 %)
44,588
(10.08 %)
43,436
(3.46 %)
128 emu (hap2 2024)
GCA_036417515.1
n/a n/a 12,839
(1.57 %)
24,113
(1.98 %)
n/a 44.40
(100.00 %)
4
(0.00 %)
101
(0.00 %)
242
(100.00 %)
657,460
(14.23 %)
397,600
(8.84 %)
4,824,789
(26.94 %)
0
(0 %)
967,271
(6.15 %)
48,081
(7.49 %)
39,730
(2.99 %)
129 epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021)
GCA_020745765.1
n/a n/a 12,650
(0.38 %)
20,614
(1.06 %)
n/a 42.75
(97.99 %)
0
(0 %)
3,552
(2.01 %)
4,000
(100.00 %)
9,489,793
(70.34 %)
976,827
(6.97 %)
21,183,330
(44.32 %)
1
(0.00 %)
3,092,395
(4.62 %)
42,917
(1.08 %)
13,522
(0.16 %)
130 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1
n/a n/a 13,583
(1.65 %)
15,403
(1.46 %)
n/a 41.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,327
(100.00 %)
3,139,035
(40.57 %)
480,111
(1.29 %)
9,106,061
(31.93 %)
0
(0 %)
342,175
(1.40 %)
39,139
(2.25 %)
38,863
(2.02 %)
131 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1
n/a n/a 19,332
(1.42 %)
22,424
(1.40 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
0
(0 %)
27
(0.00 %)
726
(100.00 %)
4,362,536
(31.74 %)
801,232
(4.02 %)
13,893,672
(37.73 %)
1
(0.00 %)
1,089,255
(2.94 %)
65,806
(4.13 %)
53,831
(1.83 %)
132 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2
n/a n/a 19,268
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
41,043
(1.93 %)
42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,417,203
(31.72 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,720
(38.08 %)
1
(0.00 %)
1,177,257
(3.11 %)
66,524
(3.95 %)
54,563
(1.83 %)
133 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap2.1 2024)
GCA_964273585.1
n/a n/a 13,051
(1.80 %)
24,815
(2.25 %)
n/a 42.33
(99.99 %)
0
(0 %)
683
(0.01 %)
584
(100.00 %)
482,819
(5.02 %)
292,761
(7.61 %)
6,282,928
(25.46 %)
9
(0.00 %)
449,304
(2.98 %)
35,630
(3.58 %)
31,844
(1.85 %)
134 Eurasian curlew (hap2 2024)
GCA_964059295.1
n/a n/a 12,728
(1.78 %)
23,645
(2.18 %)
n/a 43.53
(99.99 %)
693
(0.01 %)
693
(0.01 %)
1,504
(99.99 %)
544,959
(6.24 %)
393,773
(4.49 %)
5,839,698
(24.52 %)
33
(0.00 %)
281,233
(2.53 %)
35,759
(3.26 %)
26,342
(1.23 %)
135 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1
n/a n/a 17,920
(3.03 %)
59,697
(6.61 %)
n/a 39.13
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
4,949
(100.00 %)
2,285,870
(44.17 %)
480,649
(10.13 %)
4,833,803
(39.56 %)
0
(0 %)
820,249
(6.21 %)
57,737
(4.15 %)
23,311
(1.22 %)
136 Eurasian nightjar (alternate hap 2021)
GCA_907165095.1
n/a n/a 12,266
(1.90 %)
22,091
(2.30 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
0
(0 %)
25
(0.00 %)
2,502
(100.00 %)
458,278
(5.64 %)
212,205
(1.54 %)
6,032,224
(21.16 %)
0
(0 %)
151,625
(1.15 %)
21,942
(1.89 %)
19,235
(1.33 %)
137 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1
n/a n/a 12,437
(1.51 %)
12,702
(1.22 %)
n/a 40.06
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
10,657
(100.00 %)
2,303,176
(35.38 %)
353,996
(1.49 %)
7,218,556
(31.67 %)
0
(0 %)
194,541
(1.24 %)
24,268
(1.07 %)
22,754
(0.97 %)
138 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1
n/a n/a 9,910
(1.59 %)
11,315
(1.31 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,506
(100.00 %)
2,052,338
(42.25 %)
316,084
(1.64 %)
6,222,460
(33.12 %)
0
(0 %)
291,189
(1.91 %)
27,057
(1.96 %)
26,047
(1.75 %)
139 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1
n/a n/a 16,761
(1.66 %)
19,715
(1.37 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
105
(0.00 %)
105
(0.00 %)
16,473
(100.00 %)
3,118,266
(26.44 %)
829,463
(2.82 %)
9,700,482
(31.37 %)
0
(0 %)
353,652
(1.44 %)
14,146
(0.57 %)
12,571
(0.45 %)
140 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1
n/a n/a 17,416
(2.74 %)
60,936
(6.02 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
7,437
(100.00 %)
2,377,147
(47.98 %)
578,235
(8.27 %)
5,267,308
(40.22 %)
0
(0 %)
872,083
(6.16 %)
50,909
(3.45 %)
17,892
(0.86 %)
141 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1
n/a n/a 14,690
(3.17 %)
48,422
(7.90 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,915
(100.00 %)
1,138,190
(26.31 %)
249,865
(4.72 %)
3,352,038
(25.55 %)
0
(0 %)
232,419
(3.75 %)
36,828
(3.13 %)
27,093
(1.88 %)
142 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1
n/a n/a 14,220
(1.16 %)
21,979
(2.19 %)
n/a 44.64
(99.68 %)
0
(0 %)
177
(0.32 %)
381
(100.00 %)
1,169,660
(6.57 %)
432,998
(2.45 %)
8,403,791
(39.55 %)
1
(0.00 %)
711,098
(3.13 %)
82,695
(2.80 %)
33,414
(0.92 %)
143 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1
n/a n/a 15,419
(1.50 %)
21,175
(1.51 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 12,043
(100.00 %)
2,952,218
(30.62 %)
538,508
(2.18 %)
9,303,303
(34.20 %)
0
(0 %)
511,888
(2.10 %)
47,810
(2.50 %)
39,732
(1.82 %)
144 European mole (hap2 2024)
GCA_964194205.1
n/a n/a 18,064
(1.69 %)
19,764
(1.59 %)
n/a 42.07
(99.99 %)
1,040
(0.01 %)
1,040
(0.01 %)
1,396
(99.99 %)
2,567,492
(23.34 %)
570,250
(2.16 %)
10,485,959
(33.56 %)
30
(0.00 %)
702,644
(2.60 %)
46,213
(3.27 %)
42,349
(2.41 %)
145 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1
n/a n/a 14,619
(2.94 %)
50,389
(7.92 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
3,222
(100.00 %)
430,112
(3.88 %)
299,581
(6.89 %)
3,182,258
(27.97 %)
0
(0 %)
330,159
(4.99 %)
40,094
(3.66 %)
20,637
(1.37 %)
146 European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017845.1
n/a n/a 14,971
(1.00 %)
20,099
(1.61 %)
n/a 44.79
(99.77 %)
0
(0 %)
130
(0.23 %)
156
(100.00 %)
1,536,611
(12.44 %)
471,903
(2.16 %)
11,129,943
(35.50 %)
1
(0.00 %)
522,759
(2.15 %)
138,047
(2.94 %)
31,391
(0.73 %)
147 European robin (alternate hap 2021)
GCA_903797565.2
n/a n/a 11,359
(1.98 %)
21,437
(2.45 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
0
(0 %)
18
(0.00 %)
3,668
(100.00 %)
346,477
(2.88 %)
283,542
(2.49 %)
5,597,130
(19.71 %)
0
(0 %)
200,268
(1.37 %)
22,977
(2.32 %)
18,454
(1.24 %)
148 European shag (alternate hap 2023)
GCA_949628205.1
n/a n/a 11,681
(1.64 %)
22,195
(2.04 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,752
(100.00 %)
363,092
(4.61 %)
347,630
(2.63 %)
5,664,392
(21.56 %)
0
(0 %)
227,084
(1.83 %)
32,162
(3.60 %)
24,702
(1.39 %)
149 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1
n/a n/a 17,506
(1.26 %)
25,527
(1.52 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,699
(100.00 %)
2,400,784
(15.19 %)
1,062,793
(3.20 %)
13,284,496
(41.93 %)
0
(0 %)
768,770
(2.06 %)
77,009
(2.86 %)
75,481
(2.15 %)
150 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1
n/a n/a 18,364
(1.79 %)
20,379
(1.63 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,256
(100.00 %)
3,049,618
(22.22 %)
852,708
(4.50 %)
10,501,392
(33.34 %)
0
(0 %)
706,136
(2.67 %)
17,629
(0.60 %)
15,048
(0.47 %)
151 European starfish (alternate hap 2019)
GCA_902459445.1
n/a n/a 3,860
(0.82 %)
23,866
(8.36 %)
n/a 38.77
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
3,969
(100.00 %)
123,986
(1.40 %)
146,247
(6.44 %)
2,404,792
(37.16 %)
0
(0 %)
262,804
(5.18 %)
14,304
(1.48 %)
7,081
(0.79 %)
152 European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021)
GCA_901699165.2
n/a n/a 11,276
(1.79 %)
21,210
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,334
(100.00 %)
426,785
(4.89 %)
182,446
(0.97 %)
6,038,491
(20.24 %)
0
(0 %)
110,767
(1.11 %)
29,692
(2.35 %)
26,119
(1.59 %)
153 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1
n/a n/a 18,692
(1.72 %)
22,021
(1.36 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
10,863
(100.00 %)
4,055,957
(36.08 %)
1,513,576
(9.53 %)
11,306,811
(39.67 %)
0
(0 %)
1,995,176
(5.07 %)
20,865
(0.55 %)
15,533
(0.39 %)
154 Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021)
GCA_017639475.1
n/a n/a 11,836
(1.83 %)
21,119
(2.12 %)
n/a 42.78
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
1,147
(100.00 %)
443,887
(6.00 %)
149,233
(0.76 %)
6,328,128
(20.72 %)
0
(0 %)
76,306
(0.71 %)
37,413
(3.59 %)
34,823
(2.10 %)
155 fallow deer (paternal hap SK-2024 2025)
GCA_048127045.1
n/a n/a 18,238
(1.57 %)
20,307
(1.42 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
78
(0.00 %)
242
(0.00 %)
388
(100.00 %)
4,244,450
(35.89 %)
405,446
(2.83 %)
12,211,643
(38.55 %)
0
(0 %)
937,470
(2.69 %)
52,418
(1.36 %)
34,784
(0.91 %)
156 false killer whale (hap2 2024)
GCA_039906525.1
n/a n/a 17,866
(1.45 %)
21,079
(1.46 %)
n/a 42.37
(99.08 %)
0
(0 %)
133
(0.92 %)
416
(100.00 %)
3,852,502
(34.98 %)
1,112,185
(16.42 %)
11,435,533
(44.17 %)
1
(0.00 %)
1,686,603
(5.16 %)
75,215
(4.36 %)
39,963
(0.98 %)
157 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap2.1 2024)
GCA_964270875.1
n/a n/a 13,804
(1.42 %)
19,450
(2.39 %)
n/a 43.73
(99.99 %)
795
(0.01 %)
795
(0.01 %)
937
(99.99 %)
782,998
(3.95 %)
448,089
(3.61 %)
6,735,032
(36.83 %)
3
(0.00 %)
546,833
(3.23 %)
81,312
(2.54 %)
18,612
(0.77 %)
158 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1
n/a n/a 2,936
(0.15 %)
17,722
(1.38 %)
n/a 38.51
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 13,751
(100.00 %)
919,882
(3.50 %)
1,443,294
(10.50 %)
7,705,012
(57.28 %)
0
(0 %)
2,148,861
(9.45 %)
74,669
(1.25 %)
7,295
(0.13 %)
159 flatback sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152195.1
n/a 25,064
(1.90 %)
14,229
(1.06 %)
16,514
(1.49 %)
n/a 43.97
(100.00 %)
261
(0.00 %)
261
(0.00 %)
322
(100.00 %)
4,567,737
(43.65 %)
288,964
(1.17 %)
10,681,579
(32.83 %)
2
(0.00 %)
394,529
(1.77 %)
47,249
(1.62 %)
22,587
(0.73 %)
160 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1
n/a n/a 14,224
(0.69 %)
22,406
(1.57 %)
n/a 40.75
(99.89 %)
0
(0 %)
1,383
(0.12 %)
914
(100.00 %)
1,300,452
(3.37 %)
1,495,355
(10.56 %)
13,385,401
(44.67 %)
1
(0.00 %)
2,540,687
(7.06 %)
64,121
(0.88 %)
13,021
(0.20 %)
161 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1
n/a n/a 17,494
(2.06 %)
62,257
(5.73 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,986
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
0
(0 %)
240,032
(2.50 %)
26,445
(1.22 %)
12,638
(0.48 %)
162 Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035715.1
n/a n/a 14,392
(0.90 %)
17,909
(1.50 %)
n/a 42.86
(99.84 %)
213
(0.16 %)
213
(0.16 %)
836
(99.84 %)
1,440,070
(7.19 %)
620,131
(2.54 %)
10,919,950
(45.21 %)
2
(0.00 %)
523,070
(2.35 %)
47,933
(1.03 %)
18,609
(0.43 %)
163 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1
n/a n/a 13,745
(2.58 %)
50,416
(6.72 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
5,171
(100.00 %)
442,646
(4.09 %)
276,927
(5.42 %)
3,741,267
(26.25 %)
0
(0 %)
406,474
(4.11 %)
28,827
(2.28 %)
19,731
(1.36 %)
164 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1
n/a n/a 12,821
(0.47 %)
30,612
(1.44 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,651
(100.00 %)
1,139,595
(1.64 %)
1,170,215
(3.77 %)
17,091,511
(52.44 %)
0
(0 %)
995,544
(2.57 %)
235,170
(4.50 %)
33,394
(0.50 %)
165 garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020)
GCA_014839765.1
n/a n/a 12,359
(1.95 %)
23,228
(2.46 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 775
(100.00 %)
485,213
(6.08 %)
333,505
(2.21 %)
6,358,327
(19.87 %)
0
(0 %)
180,073
(1.19 %)
26,594
(2.34 %)
22,492
(1.32 %)
166 Geoffroy's bat (hap2.1 2025)
GCA_965115945.1
n/a n/a 18,718
(1.71 %)
20,961
(1.62 %)
n/a 42.29
(99.98 %)
1,597
(0.02 %)
1,597
(0.02 %)
2,101
(99.98 %)
3,662,405
(37.72 %)
717,069
(7.80 %)
10,298,372
(39.22 %)
11
(0.00 %)
842,144
(3.02 %)
56,300
(2.26 %)
45,967
(1.45 %)
167 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1
n/a n/a 14,254
(0.94 %)
23,016
(2.00 %)
n/a 45.13
(99.95 %)
0
(0 %)
61
(0.05 %)
298
(100.00 %)
1,230,357
(13.08 %)
350,230
(2.85 %)
11,854,314
(33.03 %)
2
(0.00 %)
335,615
(1.39 %)
39,919
(1.95 %)
26,198
(0.77 %)
168 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1
n/a n/a 12,198
(0.42 %)
23,127
(1.17 %)
n/a 42.85
(98.49 %)
0
(0 %)
1,742
(1.51 %)
1,558
(100.00 %)
7,431,472
(52.41 %)
716,951
(7.28 %)
19,456,793
(50.99 %)
9
(0.01 %)
2,419,836
(4.27 %)
91,414
(1.45 %)
65,413
(0.90 %)
169 giant South American river turtle (hap1 2024)
GCA_045364785.1
n/a n/a 14,628
(0.85 %)
18,382
(1.34 %)
n/a 44.78
(100.00 %)
0
(0 %)
260
(0.00 %)
2,039
(100.00 %)
1,254,940
(9.13 %)
434,666
(6.73 %)
12,070,445
(35.52 %)
1
(0.00 %)
1,002,897
(2.92 %)
51,563
(1.91 %)
16,484
(0.36 %)
170 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1
n/a n/a 13,090
(2.37 %)
48,927
(6.41 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,758
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
0
(0 %)
201,169
(2.33 %)
38,368
(2.40 %)
20,092
(1.12 %)
171 golden eagle (v1.4 alternate hap 2021)
GCA_902153765.2
n/a n/a 9,172
(1.85 %)
16,917
(2.12 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
3,855
(100.00 %)
377,153
(8.49 %)
117,959
(0.78 %)
4,418,970
(18.34 %)
0
(0 %)
37,962
(0.63 %)
27,767
(3.57 %)
25,543
(2.23 %)
172 golden parakeet (hap2 2024)
GCA_045519325.1
n/a n/a 12,035
(1.69 %)
21,430
(2.05 %)
n/a 43.38
(100.00 %)
0
(0 %)
132
(0.00 %)
267
(100.00 %)
447,782
(6.26 %)
211,075
(11.12 %)
4,868,563
(29.39 %)
0
(0 %)
716,927
(4.36 %)
24,821
(1.87 %)
18,862
(1.18 %)
173 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1
n/a n/a 13,359
(0.95 %)
19,347
(1.51 %)
n/a 44.27
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,736
(100.00 %)
1,404,513
(13.79 %)
334,726
(2.35 %)
9,735,007
(33.33 %)
0
(0 %)
468,758
(1.89 %)
61,680
(2.32 %)
18,869
(0.54 %)
174 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1
n/a n/a 13,758
(1.02 %)
16,909
(1.62 %)
n/a 41.53
(99.01 %)
19
(0.99 %)
19
(0.99 %)
52
(99.01 %)
1,069,189
(6.12 %)
410,262
(1.25 %)
11,390,195
(32.28 %)
0
(0 %)
233,593
(0.96 %)
60,835
(1.92 %)
23,191
(0.77 %)
175 gray seal (hap2.1 2025)
GCA_964656465.1
n/a n/a 19,222
(1.73 %)
20,205
(1.41 %)
n/a 41.54
(99.99 %)
1,110
(0.01 %)
1,110
(0.01 %)
1,233
(99.99 %)
4,236,942
(34.95 %)
601,409
(1.99 %)
13,226,667
(34.03 %)
5
(0.00 %)
598,973
(1.85 %)
57,067
(1.82 %)
54,058
(1.64 %)
176 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1
n/a n/a 12,662
(0.70 %)
15,124
(0.89 %)
n/a 37.74
(100.00 %)
24
(0.00 %)
24
(0.00 %)
8,086
(100.00 %)
4,098,004
(25.33 %)
806,470
(2.98 %)
16,244,072
(43.39 %)
0
(0 %)
n/a 24,879
(0.67 %)
15,867
(0.39 %)
177 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1
n/a n/a 17,156
(1.53 %)
18,190
(1.33 %)
n/a 40.25
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
9,510
(100.00 %)
3,455,580
(34.94 %)
530,053
(1.56 %)
10,927,458
(32.64 %)
0
(0 %)
323,766
(1.34 %)
38,976
(1.13 %)
37,317
(1.05 %)
178 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1
n/a n/a 12,760
(1.57 %)
14,423
(1.42 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,537
(100.00 %)
2,725,227
(31.66 %)
616,862
(3.40 %)
8,041,744
(32.68 %)
0
(0 %)
465,446
(1.97 %)
32,293
(2.35 %)
29,871
(1.57 %)
179 great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024)
GCA_038363175.2
n/a n/a 16,978
(1.61 %)
18,544
(1.54 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
0
(0 %)
54
(0.00 %)
312
(100.00 %)
2,601,985
(26.67 %)
331,187
(4.87 %)
10,884,729
(33.93 %)
1
(0.00 %)
458,782
(1.76 %)
63,610
(2.71 %)
49,165
(1.49 %)
180 great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020)
GCA_013368595.1
n/a n/a 11,630
(1.85 %)
20,866
(2.20 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
0
(0 %)
14
(0.00 %)
1,395
(100.00 %)
421,187
(9.08 %)
159,172
(0.96 %)
5,602,689
(22.75 %)
0
(0 %)
169,408
(1.60 %)
29,548
(2.77 %)
25,299
(1.70 %)
181 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1
n/a n/a 20
(0.30 %)
63
(2.06 %)
n/a 45.02
(99.98 %)
0
(0 %)
28
(0.02 %)
39
(100.00 %)
8,165
(60.43 %)
2,740
(27.09 %)
15,863
(31.63 %)
0
(0 %)
16,359
(15.02 %)
167
(5.51 %)
65
(0.61 %)
182 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1
n/a n/a 15,483
(3.45 %)
47,484
(7.95 %)
n/a 44.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,805
(100.00 %)
1,400,150
(23.78 %)
738,163
(17.35 %)
2,460,977
(35.90 %)
0
(0 %)
605,154
(7.13 %)
20,794
(2.09 %)
11,413
(0.80 %)
183 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1
n/a n/a 14,896
(1.85 %)
18,939
(1.59 %)
n/a 40.69
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
13,426
(100.00 %)
2,426,330
(34.43 %)
418,341
(1.36 %)
8,763,234
(27.86 %)
0
(0 %)
108,521
(0.55 %)
24,370
(1.08 %)
22,940
(1.00 %)
184 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1
n/a n/a 10,795
(5.59 %)
33,380
(12.07 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,376
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
0
(0 %)
64,742
(2.40 %)
34,104
(12.82 %)
25,350
(6.24 %)
185 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1
n/a n/a 13,412
(4.76 %)
45,946
(11.50 %)
n/a 44.34
(99.99 %)
0
(0 %)
95
(0.01 %)
251
(100.00 %)
494,547
(20.10 %)
204,804
(10.66 %)
1,444,044
(34.08 %)
0
(0 %)
208,543
(5.33 %)
47,904
(17.47 %)
32,381
(5.25 %)
186 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1
n/a n/a 13,681
(4.93 %)
45,034
(11.64 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,533
(100.00 %)
460,038
(18.47 %)
163,838
(7.90 %)
1,681,190
(29.08 %)
0
(0 %)
141,147
(3.92 %)
47,523
(15.60 %)
33,138
(6.10 %)
187 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1
n/a n/a 13,432
(2.10 %)
50,930
(6.39 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,952
(100.00 %)
2,495,763
(38.80 %)
473,105
(6.27 %)
3,444,123
(38.56 %)
0
(0 %)
474,250
(4.43 %)
35,298
(1.94 %)
13,822
(0.66 %)
188 greater scaup (hap2 2025)
GCA_965140925.1
n/a n/a 12,299
(2.00 %)
22,405
(2.37 %)
n/a 41.92
(99.99 %)
572
(0.01 %)
572
(0.01 %)
1,031
(99.99 %)
790,499
(12.43 %)
402,414
(3.15 %)
5,715,255
(22.73 %)
29
(0.00 %)
211,668
(1.91 %)
29,339
(2.75 %)
26,138
(1.56 %)
189 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2
n/a n/a 13,635
(1.05 %)
19,414
(1.61 %)
n/a 44.16
(99.95 %)
60
(0.05 %)
60
(0.05 %)
6,797
(99.95 %)
3,221,668
(44.97 %)
275,275
(1.28 %)
9,802,895
(32.14 %)
2
(0.00 %)
394,278
(1.72 %)
45,469
(1.48 %)
25,997
(0.89 %)
190 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1
n/a n/a 19,129
(1.37 %)
24,628
(1.24 %)
n/a 41.83
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 14,442
(100.00 %)
3,892,130
(35.74 %)
874,864
(15.70 %)
11,484,916
(45.69 %)
0
(0 %)
2,048,708
(5.99 %)
73,507
(1.72 %)
41,124
(0.98 %)
191 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1
n/a n/a 16,645
(1.92 %)
62,533
(4.55 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
7,253
(100.00 %)
5,166,731
(67.78 %)
750,850
(11.35 %)
5,903,440
(54.20 %)
0
(0 %)
1,408,406
(7.28 %)
90,235
(5.58 %)
15,520
(0.51 %)
192 gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020)
GCA_015220155.1
n/a n/a 6,534
(1.74 %)
12,152
(1.97 %)
n/a 42.70
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,370
(100.00 %)
179,674
(3.19 %)
76,165
(0.79 %)
2,908,228
(16.85 %)
0
(0 %)
20,525
(0.41 %)
11,838
(2.15 %)
9,707
(1.04 %)
193 Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022)
GCA_026419925.1
n/a n/a 11,838
(1.64 %)
24,014
(2.16 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,969
(100.00 %)
405,109
(3.51 %)
220,222
(6.17 %)
4,708,177
(25.30 %)
0
(0 %)
436,752
(2.86 %)
58,446
(5.44 %)
28,571
(1.65 %)
194 Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021)
GCA_020740675.1
n/a n/a 7,477
(1.92 %)
14,094
(2.40 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,762
(100.00 %)
296,732
(12.20 %)
135,408
(4.08 %)
3,123,655
(20.92 %)
0
(0 %)
142,659
(1.84 %)
23,288
(3.74 %)
13,506
(1.30 %)
195 hawksbill sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152285.1
n/a 25,779
(1.85 %)
14,843
(1.02 %)
18,006
(1.54 %)
n/a 44.04
(99.88 %)
132
(0.12 %)
132
(0.12 %)
173
(99.88 %)
1,288,292
(12.14 %)
318,803
(2.15 %)
11,148,397
(34.07 %)
1
(0.00 %)
573,455
(2.17 %)
46,922
(1.41 %)
25,789
(0.63 %)
196 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1
n/a n/a 11,130
(1.23 %)
22,071
(1.36 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 31,856
(100.00 %)
2,958,239
(41.25 %)
788,242
(4.52 %)
6,056,268
(41.88 %)
0
(0 %)
532,149
(2.74 %)
36,143
(1.96 %)
23,949
(1.02 %)
197 hemichordates Saccoglossus (HW-2024a hap2 2024)
GCA_040954595.1
n/a n/a 4,919
(1.33 %)
34,873
(16.02 %)
n/a 39.72
(99.96 %)
0
(0 %)
254
(0.04 %)
56
(100.00 %)
84,495
(1.58 %)
118,073
(13.23 %)
1,301,514
(28.77 %)
3
(0.00 %)
317,532
(8.60 %)
20,511
(4.03 %)
15,567
(2.64 %)
198 herring gull (hap2 2024)
GCA_964417125.1
n/a n/a 12,602
(1.69 %)
23,925
(2.13 %)
n/a 44.52
(99.99 %)
456
(0.01 %)
456
(0.01 %)
989
(99.99 %)
483,098
(5.09 %)
245,440
(9.57 %)
6,076,469
(27.75 %)
6
(0.00 %)
468,109
(3.13 %)
42,842
(5.92 %)
36,129
(1.71 %)
199 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1
n/a n/a 20,391
(1.63 %)
20,668
(1.37 %)
n/a 41.62
(100.00 %)
0
(0 %)
83
(0.00 %)
545
(100.00 %)
3,778,764
(35.17 %)
563,345
(3.63 %)
13,524,869
(35.56 %)
0
(0 %)
369,754
(1.46 %)
48,164
(1.90 %)
44,065
(1.33 %)
200 hoatzin (hap2 2023)
GCA_030867165.1
n/a n/a 12,349
(1.54 %)
27,206
(2.21 %)
n/a 45.91
(100.00 %)
212
(0.00 %)
212
(0.00 %)
535
(100.00 %)
529,757
(21.69 %)
235,999
(14.32 %)
4,845,810
(31.86 %)
0
(0 %)
1,017,817
(5.90 %)
53,781
(5.77 %)
44,601
(2.35 %)
201 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1
n/a n/a 15,058
(2.50 %)
46,340
(5.85 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
0
(0 %)
21
(0.00 %)
2,131
(100.00 %)
1,642,351
(37.42 %)
389,169
(5.43 %)
4,687,710
(35.55 %)
0
(0 %)
541,909
(4.77 %)
34,408
(1.75 %)
16,136
(0.80 %)
202 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1
n/a n/a 15,006
(0.28 %)
22,481
(0.80 %)
n/a 45.05
(99.53 %)
225
(0.03 %)
2,781
(0.47 %)
2,532
(99.97 %)
1,344,546
(5.76 %)
2,364,825
(28.34 %)
5,088
(99.53 %)
5
(0.00 %)
14,350,128
(14.12 %)
89,340
(2.10 %)
82,092
(1.20 %)
203 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1
n/a n/a 16,789
(1.65 %)
18,017
(1.36 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
210
(0.00 %)
821
(100.00 %)
3,146,381
(34.68 %)
430,664
(5.91 %)
13,246,059
(32.62 %)
0
(0 %)
714,785
(2.15 %)
37,293
(2.80 %)
35,249
(2.66 %)
204 hourglass treefrog (maternal 2023 genbank)
GCA_027789725.1
n/a n/a 14,359
(0.89 %)
32,575
(2.67 %)
n/a 43.88
(95.18 %)
788
(4.82 %)
788
(4.82 %)
3,358
(95.18 %)
922,807
(2.38 %)
1,744,603
(15.45 %)
10,318,168
(48.47 %)
0
(0 %)
3,525,571
(8.67 %)
244,270
(5.02 %)
29,547
(0.61 %)
205 house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022)
GCA_027406555.1
n/a n/a 12,027
(1.89 %)
23,973
(2.49 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
385,230
(3.05 %)
398,497
(5.70 %)
5,772,203
(22.69 %)
0
(0 %)
478,308
(3.12 %)
28,740
(2.98 %)
21,451
(1.28 %)
206 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1
n/a n/a 661
(0.88 %)
720
(0.54 %)
n/a 38.59
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,806
(100.00 %)
97,279
(72.21 %)
40,071
(55.89 %)
208,928
(64.94 %)
0
(0 %)
239,612
(15.41 %)
506
(0.31 %)
327
(0.20 %)
207 house sparrow (hap2 2024)
GCA_036417895.1
n/a n/a 12,201
(1.59 %)
24,721
(2.19 %)
n/a 44.46
(100.00 %)
0
(0 %)
182
(0.00 %)
482
(100.00 %)
629,688
(12.73 %)
644,409
(14.12 %)
5,103,050
(31.93 %)
0
(0 %)
899,607
(5.60 %)
33,424
(2.42 %)
23,096
(1.05 %)
208 human (GRCh38.p14 2022)
GCF_000001405.40
188,352
(5.12 %)
n/a 23,474
(1.98 %)
28,557
(1.86 %)
n/a 41.05
(95.10 %)
829
(4.90 %)
1,270
(4.90 %)
46,502
(95.10 %)
5,910,293
(52.77 %)
1,047,827
(4.59 %)
17,068,934
(36.82 %)
12
(0.00 %)
1,423,169
(2.56 %)
57,427
(1.07 %)
31,985
(0.75 %)
209 human (mHomSap3 WGS:JACSEX01 2021)
GCA_016695395.2
n/a n/a 20,401
(1.92 %)
20,682
(1.21 %)
n/a 40.87
(99.64 %)
0
(0 %)
1,217
(0.36 %)
950
(100.00 %)
5,350,025
(52.32 %)
1,006,502
(4.68 %)
15,969,368
(38.50 %)
5
(0.00 %)
1,469,922
(2.89 %)
50,826
(1.08 %)
27,969
(0.75 %)
210 human (WGS:JACSEW01 2021 alternate hap)
GCA_016700455.2
n/a n/a 19,667
(1.95 %)
20,065
(1.23 %)
n/a 40.96
(99.60 %)
0
(0 %)
1,172
(0.40 %)
994
(100.00 %)
5,086,372
(51.37 %)
932,450
(3.67 %)
15,152,141
(37.48 %)
3
(0.00 %)
1,198,599
(2.54 %)
49,325
(1.10 %)
27,202
(0.77 %)
211 Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022)
GCA_027474345.1
n/a n/a 11,806
(1.66 %)
21,429
(1.97 %)
n/a 43.73
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,343
(100.00 %)
508,803
(10.25 %)
162,918
(5.44 %)
6,029,969
(24.67 %)
0
(0 %)
224,585
(1.75 %)
27,953
(3.83 %)
24,431
(1.47 %)
212 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2
n/a n/a 19,096
(1.59 %)
20,674
(1.34 %)
n/a 41.99
(99.75 %)
0
(0 %)
277
(0.25 %)
1,435
(100.00 %)
5,290,422
(47.51 %)
478,946
(1.94 %)
12,568,313
(41.15 %)
0
(0 %)
1,196,258
(3.44 %)
45,850
(1.37 %)
36,573
(1.00 %)
213 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1
n/a n/a 14,412
(3.70 %)
41,944
(8.58 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
0
(0 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,774
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
0
(0 %)
195,444
(3.94 %)
15,419
(1.38 %)
8,375
(0.73 %)
214 Indian roofed turtle (hap1 2024)
GCA_045781095.1
n/a n/a 14,623
(1.04 %)
18,405
(1.58 %)
n/a 44.24
(100.00 %)
0
(0 %)
205
(0.00 %)
629
(100.00 %)
1,283,544
(11.43 %)
298,912
(1.85 %)
10,728,482
(32.52 %)
1
(0.00 %)
413,036
(2.00 %)
72,908
(2.13 %)
26,854
(0.71 %)
215 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1
n/a n/a 17,858
(2.43 %)
32,738
(5.46 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
4,333
(100.00 %)
583,632
(3.71 %)
418,411
(3.74 %)
5,198,155
(21.50 %)
1
(0.00 %)
276,314
(1.94 %)
76,879
(3.71 %)
57,281
(2.37 %)
216 Italian wall lizard (rPodSic1.hap2.1 2024)
GCA_964188395.1
n/a n/a 13,696
(1.37 %)
19,278
(2.32 %)
n/a 44.15
(99.99 %)
690
(0.01 %)
690
(0.01 %)
842
(99.99 %)
763,893
(4.21 %)
451,861
(6.69 %)
6,696,380
(38.71 %)
4
(0.00 %)
740,272
(4.24 %)
98,815
(3.65 %)
19,565
(0.77 %)
217 jaguar (hap2 2025)
GCA_046562875.1
n/a n/a 18,867
(1.64 %)
20,784
(1.40 %)
n/a 41.76
(100.00 %)
0
(0 %)
200
(0.00 %)
85
(100.00 %)
4,977,843
(41.75 %)
982,064
(2.10 %)
13,365,332
(34.16 %)
3
(0.00 %)
459,794
(1.37 %)
66,000
(2.75 %)
59,529
(2.25 %)
218 Japanese sawshark (hap2 2024)
GCA_044704965.1
n/a n/a 14,833
(0.26 %)
30,853
(0.75 %)
n/a 47.12
(99.98 %)
0
(0 %)
5,953
(0.02 %)
5,626
(100.00 %)
1,238,549
(4.06 %)
2,718,867
(21.85 %)
11,579
(99.98 %)
42
(0.00 %)
7,882,680
(7.20 %)
518,286
(6.88 %)
502,936
(6.32 %)
219 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1
n/a n/a 15,945
(2.17 %)
101,825
(8.93 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
0
(0 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,228
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
0
(0 %)
541,432
(4.29 %)
138,484
(9.55 %)
86,420
(4.60 %)
220 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1
n/a n/a 14,960
(2.23 %)
74,436
(6.65 %)
n/a 43.94
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,370
(100.00 %)
1,620,688
(23.00 %)
902,057
(13.66 %)
4,547,953
(39.90 %)
0
(0 %)
892,097
(6.41 %)
129,990
(12.07 %)
77,992
(4.35 %)
221 kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023)
GCA_027595965.1
n/a n/a 8,732
(1.74 %)
16,473
(2.17 %)
n/a 45.10
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,819
(100.00 %)
314,902
(10.49 %)
133,061
(10.84 %)
3,656,435
(25.68 %)
0
(0 %)
519,192
(4.55 %)
32,592
(5.25 %)
26,472
(3.09 %)
222 kakapo (Jane alternate hap 2019)
GCA_004011185.1
n/a n/a 3,256
(1.65 %)
6,220
(1.98 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
3,728
(100.00 %)
127,817
(7.83 %)
53,447
(1.21 %)
1,502,789
(18.09 %)
0
(0 %)
44,014
(1.40 %)
5,487
(1.71 %)
4,787
(1.19 %)
223 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1
n/a n/a 14,982
(1.50 %)
19,185
(1.30 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 12,410
(100.00 %)
2,752,892
(35.61 %)
589,217
(10.15 %)
8,371,032
(41.11 %)
0
(0 %)
1,464,220
(5.92 %)
57,347
(3.41 %)
30,003
(1.05 %)
224 king vulture (hap2 2024)
GCA_037950955.1
n/a n/a 12,764
(1.49 %)
23,033
(1.77 %)
n/a 44.67
(100.00 %)
0
(0 %)
128
(0.00 %)
140
(100.00 %)
432,536
(3.01 %)
230,315
(20.91 %)
4,960,923
(35.56 %)
0
(0 %)
872,545
(4.75 %)
86,907
(3.76 %)
31,074
(1.47 %)
225 Korean giant-fin mudskipper (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1
n/a n/a 13,470
(2.34 %)
42,799
(5.73 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,414
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
0
(0 %)
475,330
(4.51 %)
34,522
(2.54 %)
17,280
(0.96 %)
226 lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023)
GCA_028017155.1
n/a n/a 10,584
(1.75 %)
19,112
(2.09 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,892
(100.00 %)
363,564
(3.53 %)
235,220
(7.22 %)
5,072,834
(23.83 %)
0
(0 %)
224,788
(1.89 %)
24,909
(2.64 %)
22,061
(1.41 %)
227 lance-tailed manakin (alternate hap 2020)
GCA_009829205.1
n/a n/a 12,282
(1.85 %)
23,867
(2.36 %)
n/a 42.20
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,269
(100.00 %)
472,384
(7.01 %)
237,680
(1.65 %)
6,121,661
(19.48 %)
0
(0 %)
146,408
(1.08 %)
25,589
(2.05 %)
21,299
(1.17 %)
228 lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022)
GCA_023634305.1
n/a n/a 12,458
(1.70 %)
22,259
(2.05 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,090
(100.00 %)
413,301
(3.46 %)
189,449
(5.28 %)
5,962,597
(22.07 %)
0
(0 %)
384,018
(2.74 %)
31,611
(2.72 %)
19,364
(0.92 %)
229 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1
n/a n/a 15,841
(2.36 %)
79,276
(8.51 %)
n/a 46.35
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,761
(100.00 %)
2,935,570
(42.17 %)
1,208,602
(21.28 %)
3,157,730
(42.63 %)
0
(0 %)
1,448,522
(11.27 %)
88,759
(6.30 %)
47,311
(2.77 %)
230 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1
n/a n/a 8,132
(2.11 %)
25,878
(4.67 %)
n/a 38.55
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,088
(100.00 %)
260,789
(2.73 %)
158,564
(2.12 %)
3,023,128
(27.39 %)
0
(0 %)
71,421
(1.44 %)
9,678
(1.02 %)
7,876
(0.74 %)
231 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1
n/a n/a 13,155
(1.15 %)
22,239
(2.06 %)
n/a 41.01
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
6,800
(100.00 %)
1,155,093
(7.75 %)
707,777
(4.25 %)
7,071,611
(44.00 %)
0
(0 %)
701,636
(4.02 %)
104,556
(4.39 %)
22,349
(0.88 %)
232 least weasel (hap2.1 2025)
GCA_964662095.1
n/a n/a 18,255
(1.29 %)
22,201
(1.27 %)
n/a 42.68
(99.98 %)
2,709
(0.02 %)
2,709
(0.02 %)
4,948
(99.98 %)
4,268,233
(27.47 %)
787,850
(6.40 %)
12,592,088
(42.54 %)
17
(0.00 %)
2,083,429
(5.88 %)
62,416
(2.34 %)
51,317
(1.55 %)
233 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2
n/a n/a 11,035
(1.05 %)
16,064
(1.50 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
7
(0.00 %)
7
(0.00 %)
9,006
(100.00 %)
2,685,200
(47.08 %)
208,060
(1.19 %)
7,184,246
(33.31 %)
0
(0 %)
442,748
(2.46 %)
25,133
(1.42 %)
15,054
(0.75 %)
234 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1
n/a n/a 17,777
(1.27 %)
19,232
(1.28 %)
n/a 42.13
(92.75 %)
0
(0 %)
2,875
(7.25 %)
508
(100.00 %)
6,476,967
(33.93 %)
999,133
(2.78 %)
11,809,834
(40.52 %)
1
(0.00 %)
1,062,479
(2.36 %)
29,872
(0.82 %)
21,704
(0.51 %)
235 lesser horseshoe bat (hap2 2024)
GCA_964194215.1
n/a n/a 18,875
(1.72 %)
21,166
(1.58 %)
n/a 41.18
(99.99 %)
1,648
(0.01 %)
1,648
(0.01 %)
2,727
(99.99 %)
3,160,659
(34.00 %)
696,130
(6.23 %)
11,662,645
(34.26 %)
8
(0.00 %)
1,288,588
(3.71 %)
36,176
(1.80 %)
28,160
(0.89 %)
236 lesser kestrel (alternate hap 2021)
GCA_017639645.1
n/a n/a 12,578
(1.83 %)
22,257
(2.16 %)
n/a 42.51
(98.97 %)
0
(0 %)
258
(1.03 %)
551
(100.00 %)
431,717
(3.61 %)
201,876
(1.38 %)
6,620,060
(19.16 %)
0
(0 %)
121,154
(0.99 %)
27,552
(2.26 %)
21,049
(1.02 %)
237 lesser noctule (hap2 2024)
GCA_964264895.1
n/a n/a 17,557
(1.64 %)
22,484
(1.74 %)
n/a 43.06
(99.98 %)
1,563
(0.02 %)
1,563
(0.02 %)
2,898
(99.98 %)
2,999,553
(21.19 %)
1,122,371
(10.04 %)
9,331,392
(40.02 %)
7
(0.00 %)
1,542,388
(4.66 %)
61,834
(2.95 %)
59,536
(1.92 %)
238 lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023)
GCA_028389885.1
n/a n/a 10,465
(1.71 %)
19,083
(2.16 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 910
(100.00 %)
520,125
(6.78 %)
251,547
(4.21 %)
5,321,207
(21.53 %)
0
(0 %)
171,609
(1.68 %)
34,698
(5.69 %)
30,309
(2.73 %)
239 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1
n/a n/a 15,487
(0.88 %)
85,135
(3.39 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
6,593
(100.00 %)
5,572,163
(49.59 %)
1,052,072
(6.02 %)
7,246,646
(62.69 %)
0
(0 %)
2,503,507
(8.71 %)
157,768
(4.38 %)
14,966
(0.28 %)
240 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1
n/a n/a 13,792
(2.19 %)
51,353
(6.60 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,620
(100.00 %)
2,536,362
(38.05 %)
513,115
(7.50 %)
3,542,854
(37.60 %)
0
(0 %)
576,452
(5.21 %)
31,814
(1.79 %)
14,668
(0.71 %)
241 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1
n/a n/a 15,033
(2.98 %)
51,296
(7.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
2,700
(100.00 %)
1,099,919
(28.68 %)
314,919
(9.57 %)
2,620,601
(30.23 %)
0
(0 %)
539,835
(6.99 %)
49,248
(4.19 %)
27,196
(1.69 %)
242 little owl (hap2.1 2025)
GCA_965140185.1
n/a n/a 13,316
(1.72 %)
23,607
(2.06 %)
n/a 42.88
(99.99 %)
552
(0.01 %)
552
(0.01 %)
1,212
(99.99 %)
673,616
(14.62 %)
427,083
(4.58 %)
6,784,709
(22.52 %)
4
(0.00 %)
307,196
(2.48 %)
33,432
(6.74 %)
29,105
(1.51 %)
243 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1
n/a n/a 14,632
(3.51 %)
40,441
(7.51 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
0
(0 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,742
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
0
(0 %)
96,734
(1.60 %)
16,302
(1.34 %)
11,802
(0.89 %)
244 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap2 2025)
GCA_047715955.1
n/a n/a 13,631
(0.79 %)
18,935
(1.32 %)
n/a 44.98
(100.00 %)
0
(0 %)
120
(0.00 %)
82
(100.00 %)
1,037,146
(4.72 %)
933,676
(6.26 %)
9,009,528
(56.65 %)
1
(0.00 %)
1,759,246
(6.36 %)
246,553
(10.79 %)
19,416
(0.34 %)
245 lizards D.cf. smithi (hap2 2024)
GCA_046126825.1
n/a n/a 12,359
(0.99 %)
16,644
(1.66 %)
n/a 45.69
(100.00 %)
6
(0.00 %)
197
(0.00 %)
726
(100.00 %)
1,109,222
(8.21 %)
607,835
(4.09 %)
9,080,052
(42.56 %)
8
(0.00 %)
670,217
(2.85 %)
158,727
(6.84 %)
21,844
(0.57 %)
246 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap2.1 2024)
GCA_964188325.1
n/a n/a 13,653
(1.34 %)
19,764
(2.32 %)
n/a 44.23
(99.99 %)
817
(0.01 %)
817
(0.01 %)
1,444
(99.99 %)
857,503
(4.68 %)
507,819
(4.16 %)
6,632,822
(39.41 %)
4
(0.00 %)
653,978
(4.13 %)
103,858
(4.10 %)
19,626
(0.75 %)
247 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap2.1 2024)
GCA_964251985.1
n/a n/a 13,817
(1.35 %)
21,024
(2.50 %)
n/a 43.77
(99.99 %)
811
(0.01 %)
811
(0.01 %)
1,458
(99.99 %)
890,080
(4.42 %)
526,749
(3.38 %)
7,001,691
(37.94 %)
9
(0.00 %)
538,033
(3.26 %)
89,526
(2.96 %)
20,250
(0.75 %)
248 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap2.1 2024)
GCA_964234825.1
n/a n/a 13,759
(1.39 %)
19,452
(2.34 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
754
(0.01 %)
754
(0.01 %)
954
(99.99 %)
768,595
(5.31 %)
448,816
(5.54 %)
6,722,284
(37.88 %)
3
(0.00 %)
638,565
(3.67 %)
82,575
(2.83 %)
19,444
(0.76 %)
249 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap2.2 2024)
GCA_964106635.2
n/a n/a 13,828
(1.41 %)
19,048
(2.34 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
1,365
(0.02 %)
1,365
(0.02 %)
1,548
(99.98 %)
803,451
(4.16 %)
440,340
(2.30 %)
6,774,254
(37.14 %)
34
(0.00 %)
471,503
(3.14 %)
89,229
(3.04 %)
18,652
(0.77 %)
250 lizards P.vaucheri (hap2.1 2025)
GCA_965113305.1
n/a n/a 13,794
(1.32 %)
19,189
(2.22 %)
n/a 44.16
(99.99 %)
0
(0 %)
852
(0.01 %)
151
(100.00 %)
841,282
(5.59 %)
483,392
(6.01 %)
6,750,191
(40.39 %)
6
(0.00 %)
792,951
(4.56 %)
101,153
(3.51 %)
19,899
(0.74 %)
251 loggerhead turtle (hap2 2025)
GCA_965140275.1
n/a 26,024
(1.93 %)
14,889
(1.04 %)
17,867
(1.54 %)
n/a 44.11
(99.97 %)
52
(0.03 %)
52
(0.03 %)
85
(99.97 %)
1,300,553
(12.44 %)
332,623
(1.45 %)
10,721,628
(34.40 %)
1
(0.00 %)
604,146
(2.41 %)
53,746
(1.50 %)
25,360
(0.62 %)
252 long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022)
GCA_023637925.1
n/a n/a 12,264
(2.01 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 40.99
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 230
(100.00 %)
498,393
(5.07 %)
266,700
(1.49 %)
6,131,743
(20.45 %)
0
(0 %)
94,007
(0.79 %)
15,809
(1.43 %)
13,620
(0.94 %)
253 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1
n/a n/a 15,137
(3.09 %)
52,499
(7.75 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,778
(100.00 %)
448,166
(4.67 %)
416,181
(8.95 %)
3,288,388
(27.99 %)
0
(0 %)
521,897
(4.93 %)
55,747
(4.41 %)
34,235
(2.29 %)
254 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1
n/a n/a 12,848
(3.32 %)
43,711
(8.09 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,698
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
0
(0 %)
569,405
(6.42 %)
45,916
(5.21 %)
28,531
(2.48 %)
255 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1
n/a n/a 14,944
(3.23 %)
50,328
(8.09 %)
n/a 42.82
(99.97 %)
0
(0 %)
954
(0.03 %)
232
(100.00 %)
1,034,598
(25.93 %)
434,819
(13.21 %)
2,907,371
(30.18 %)
3
(0.00 %)
701,025
(6.86 %)
55,066
(5.20 %)
33,554
(2.42 %)
256 Macqueen's bustard (paternal 2024)
GCA_036418225.1
n/a n/a 11,814
(1.80 %)
23,161
(2.38 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
0
(0 %)
84
(0.00 %)
343
(100.00 %)
586,864
(13.28 %)
184,036
(5.91 %)
5,606,205
(25.25 %)
0
(0 %)
453,525
(2.87 %)
42,560
(7.71 %)
29,282
(2.77 %)
257 maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021)
GCA_017639665.1
n/a n/a 10,658
(1.74 %)
18,941
(1.98 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
5
(0.00 %)
4,278
(100.00 %)
326,479
(4.02 %)
141,715
(0.74 %)
5,600,372
(19.59 %)
0
(0 %)
41,184
(0.48 %)
27,330
(3.35 %)
26,330
(2.05 %)
258 mallard (hap2 2024)
GCA_964188335.1
n/a n/a 12,715
(1.89 %)
24,338
(2.42 %)
n/a 42.70
(99.99 %)
485
(0.01 %)
485
(0.01 %)
972
(99.99 %)
795,168
(13.44 %)
445,147
(7.71 %)
5,728,430
(26.21 %)
53
(0.00 %)
572,559
(4.02 %)
35,679
(3.13 %)
26,930
(1.43 %)
259 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1
n/a n/a 14,564
(1.72 %)
71,604
(6.41 %)
n/a 41.49
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 8,737
(100.00 %)
1,662,251
(42.29 %)
439,119
(12.96 %)
3,776,125
(45.00 %)
0
(0 %)
888,556
(6.68 %)
56,507
(2.83 %)
15,006
(0.71 %)
260 Mauritius kestrel (alternate hap 2023)
GCA_963210275.1
n/a n/a 4,774
(1.89 %)
8,695
(2.32 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,259
(100.00 %)
135,092
(3.67 %)
112,042
(8.63 %)
1,739,144
(22.50 %)
0
(0 %)
103,391
(2.09 %)
12,908
(3.26 %)
7,476
(1.06 %)
261 Mauritius parakeet (alternate hap 2023)
GCA_963243765.1
n/a n/a 8,873
(1.81 %)
16,175
(2.24 %)
n/a 42.92
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,130
(100.00 %)
331,293
(6.89 %)
161,393
(5.94 %)
3,516,196
(24.86 %)
0
(0 %)
323,514
(3.25 %)
16,659
(1.74 %)
13,876
(1.32 %)
262 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1
n/a n/a 10,549
(1.13 %)
20,171
(2.08 %)
n/a 41.02
(100.00 %)
12
(0.00 %)
12
(0.00 %)
9,587
(100.00 %)
889,533
(7.84 %)
565,831
(6.37 %)
5,968,624
(41.74 %)
0
(0 %)
615,578
(4.07 %)
73,632
(3.80 %)
21,339
(1.17 %)
263 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1
n/a n/a 19,001
(1.82 %)
20,271
(1.68 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
0
(0 %)
53
(0.00 %)
143
(100.00 %)
3,141,368
(21.37 %)
898,900
(4.24 %)
11,475,531
(32.14 %)
0
(0 %)
862,918
(2.64 %)
22,186
(0.75 %)
16,985
(0.48 %)
264 Merriam's long-tongued bat (hap2 2024)
GCA_039656995.1
n/a n/a 18,105
(1.68 %)
20,751
(1.60 %)
n/a 42.18
(100.00 %)
0
(0 %)
45
(0.00 %)
71
(100.00 %)
2,994,788
(29.48 %)
415,375
(1.07 %)
11,752,432
(32.88 %)
3
(0.00 %)
316,278
(1.25 %)
65,597
(4.38 %)
57,841
(3.85 %)
265 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1
n/a n/a 13,824
(0.44 %)
23,296
(1.27 %)
n/a 41.86
(99.99 %)
0
(0 %)
2,009
(0.01 %)
656
(100.00 %)
1,860,053
(2.17 %)
2,751,941
(10.76 %)
24,252,866
(53.00 %)
11
(0.00 %)
4,329,852
(7.13 %)
157,012
(1.21 %)
15,742
(0.15 %)
266 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1
n/a n/a 15,425
(0.94 %)
20,005
(1.48 %)
n/a 44.46
(95.51 %)
1,790
(4.49 %)
1,790
(4.49 %)
4,782
(95.51 %)
1,404,726
(11.28 %)
453,302
(2.47 %)
11,996,092
(34.08 %)
3
(0.00 %)
712,154
(2.19 %)
77,167
(2.14 %)
23,282
(0.51 %)
267 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1
n/a n/a 16,565
(3.38 %)
42,094
(6.75 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
0
(0 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,392
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
0
(0 %)
595,219
(5.37 %)
21,531
(1.27 %)
13,616
(0.75 %)
268 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1
n/a n/a 20,412
(1.46 %)
27,421
(1.34 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
21,272
(100.00 %)
3,811,435
(36.24 %)
959,712
(10.27 %)
12,159,896
(41.30 %)
0
(0 %)
1,298,777
(4.12 %)
69,852
(1.62 %)
42,454
(1.09 %)
269 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1
n/a n/a 16,419
(0.77 %)
17,219
(0.89 %)
n/a 39.03
(100.00 %)
33
(0.00 %)
33
(0.00 %)
9,959
(100.00 %)
6,332,360
(29.69 %)
1,065,454
(2.09 %)
17,908,986
(42.25 %)
0
(0 %)
1,232,672
(2.38 %)
13,856
(0.35 %)
11,596
(0.23 %)
270 mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021)
GCA_009769485.2
n/a n/a 10,145
(1.98 %)
18,617
(2.30 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
14
(0.00 %)
14
(0.00 %)
5,640
(100.00 %)
533,330
(9.11 %)
213,518
(1.29 %)
4,813,886
(20.16 %)
0
(0 %)
52,896
(0.73 %)
25,667
(3.86 %)
24,229
(2.21 %)
271 Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_964656075.1
n/a n/a 17,899
(1.71 %)
20,808
(1.69 %)
n/a 42.15
(99.98 %)
1,832
(0.02 %)
1,832
(0.02 %)
2,485
(99.98 %)
3,637,576
(31.92 %)
930,013
(11.25 %)
9,967,930
(39.61 %)
9
(0.00 %)
910,240
(3.07 %)
56,237
(2.62 %)
55,739
(1.82 %)
272 Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024)
GCA_963693515.1
n/a 19,038
(1.68 %)
17,944
(1.86 %)
20,545
(1.83 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
1
(0.00 %)
263
(0.00 %)
154
(100.00 %)
3,628,328
(34.57 %)
838,723
(4.04 %)
10,155,601
(35.22 %)
1
(0.00 %)
545,765
(1.88 %)
56,332
(2.92 %)
56,107
(1.97 %)
273 Natterer's bat (mMyoNat1.hap2.1 2024)
GCA_964212025.1
n/a n/a 18,275
(1.81 %)
21,799
(1.80 %)
n/a 43.28
(99.99 %)
1,387
(0.01 %)
1,387
(0.01 %)
1,706
(99.99 %)
2,833,193
(23.73 %)
705,278
(5.10 %)
9,802,564
(36.67 %)
5
(0.00 %)
596,875
(2.28 %)
61,024
(2.68 %)
55,279
(1.95 %)
274 Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023)
GCA_027579665.1
n/a n/a 11,687
(1.78 %)
24,169
(2.43 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,834
(100.00 %)
414,780
(3.26 %)
491,012
(10.03 %)
5,570,475
(26.24 %)
0
(0 %)
495,689
(3.67 %)
29,485
(4.55 %)
21,361
(1.22 %)
275 New Caledonian crow (alternate hap 2019)
GCA_009651025.1
n/a n/a 11,097
(1.99 %)
20,436
(2.45 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 894
(100.00 %)
377,050
(6.03 %)
178,064
(1.53 %)
5,305,126
(19.49 %)
0
(0 %)
132,677
(1.13 %)
26,107
(2.52 %)
20,600
(1.37 %)
276 New Zealand spotty (alternate hap 2019 genbank)
GCA_009762545.1
n/a n/a 13,566
(2.17 %)
40,774
(5.21 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,659
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
0
(0 %)
456,905
(3.99 %)
16,368
(0.83 %)
7,034
(0.33 %)
277 Nicobar pigeon (hap2 2024)
GCA_036010745.1
n/a n/a 13,270
(1.84 %)
24,753
(2.28 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
118
(0.00 %)
226
(100.00 %)
675,092
(12.72 %)
313,111
(3.64 %)
6,547,843
(23.22 %)
1
(0.00 %)
382,235
(2.71 %)
37,728
(3.88 %)
31,602
(1.56 %)
278 nine-banded armadillo (hap1 2023)
GCA_030445055.1
n/a n/a 19,429
(1.06 %)
22,396
(1.07 %)
n/a 40.96
(99.27 %)
0
(0 %)
845
(0.73 %)
594
(100.00 %)
4,369,568
(32.83 %)
673,707
(1.55 %)
18,586,102
(42.41 %)
5
(0.00 %)
558,255
(1.38 %)
131,852
(2.78 %)
71,325
(1.75 %)
279 nine-banded armadillo (hap1 2023)
GCA_030445055.2
n/a n/a 19,350
(1.07 %)
22,207
(1.07 %)
n/a 40.97
(99.27 %)
0
(0 %)
823
(0.73 %)
588
(100.00 %)
4,330,716
(32.85 %)
661,966
(1.52 %)
18,302,021
(42.22 %)
5
(0.00 %)
542,125
(1.36 %)
130,245
(2.79 %)
70,861
(1.76 %)
280 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1
n/a n/a 13,050
(3.93 %)
44,650
(10.12 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,934
(100.00 %)
512,583
(14.83 %)
156,305
(8.46 %)
2,005,803
(27.09 %)
0
(0 %)
153,928
(3.57 %)
59,674
(9.19 %)
38,546
(4.50 %)
281 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1
n/a n/a 15,210
(1.55 %)
18,316
(1.43 %)
n/a 41.06
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
5,051
(100.00 %)
3,911,633
(40.55 %)
565,546
(1.54 %)
10,853,726
(32.61 %)
0
(0 %)
378,575
(1.36 %)
40,925
(1.35 %)
26,837
(0.96 %)
282 North Atlantic right whale (hap1 2023)
GCA_028571275.1
n/a n/a 18,699
(1.61 %)
20,354
(1.28 %)
n/a 41.64
(99.84 %)
0
(0 %)
385
(0.16 %)
947
(100.00 %)
3,815,900
(43.46 %)
718,935
(11.38 %)
11,928,210
(42.25 %)
2
(0.00 %)
1,117,252
(3.44 %)
85,881
(1.90 %)
41,289
(1.19 %)
283 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1
n/a n/a 19,541
(1.47 %)
21,516
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
0
(0 %)
363
(0.17 %)
779
(100.00 %)
1,361,117
(2.23 %)
836,632
(13.12 %)
12,597,969
(44.00 %)
11
(0.00 %)
1,395,565
(3.89 %)
93,862
(1.92 %)
40,806
(0.95 %)
284 North Island brown kiwi (hap2 2024)
GCA_036417975.1
n/a n/a 13,664
(1.44 %)
37,696
(2.80 %)
n/a 44.42
(100.00 %)
0
(0 %)
155
(0.00 %)
349
(100.00 %)
760,455
(8.84 %)
626,528
(6.85 %)
5,029,822
(30.45 %)
1
(0.00 %)
604,936
(3.67 %)
54,278
(9.43 %)
41,382
(3.03 %)
285 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1
n/a n/a 18,343
(1.80 %)
23,253
(1.77 %)
n/a 43.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
4,899
(100.00 %)
1,174,241
(2.96 %)
825,170
(5.11 %)
9,889,579
(36.12 %)
0
(0 %)
598,356
(2.10 %)
76,164
(3.52 %)
59,778
(2.27 %)
286 northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024)
GCA_039880925.1
n/a n/a 18,305
(1.49 %)
22,534
(1.56 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
0
(0 %)
80
(0.00 %)
282
(100.00 %)
3,783,543
(30.10 %)
656,592
(4.68 %)
11,353,707
(40.26 %)
0
(0 %)
877,118
(2.58 %)
92,041
(3.01 %)
72,323
(1.87 %)
287 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1
n/a n/a 19,537
(1.44 %)
27,826
(1.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 23,401
(100.00 %)
3,634,923
(35.56 %)
672,860
(11.00 %)
11,175,398
(41.72 %)
0
(0 %)
1,941,411
(5.36 %)
62,007
(1.94 %)
36,247
(0.95 %)
288 northern cavefish (hap2 2024)
GCA_046255725.1
n/a n/a 14,542
(2.12 %)
51,650
(5.81 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
0
(0 %)
484
(0.01 %)
667
(100.00 %)
2,014,967
(51.82 %)
755,698
(19.90 %)
3,290,098
(47.08 %)
2
(0.00 %)
1,137,534
(9.59 %)
57,881
(4.66 %)
23,926
(1.32 %)
289 northern gannet (hap1 2023)
GCA_031468805.1
n/a n/a 13,367
(1.65 %)
24,403
(2.00 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
0
(0 %)
263
(0.00 %)
829
(100.00 %)
498,574
(4.51 %)
273,984
(5.20 %)
5,544,122
(27.29 %)
25
(0.00 %)
496,388
(3.06 %)
34,879
(3.83 %)
24,416
(1.00 %)
290 northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022)
GCA_929447715.1
n/a n/a 12,115
(1.73 %)
22,764
(2.15 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
0
(0 %)
2
(0.00 %)
4,484
(100.00 %)
417,395
(3.68 %)
231,908
(7.24 %)
5,424,533
(24.05 %)
0
(0 %)
253,718
(2.12 %)
35,691
(4.26 %)
29,357
(1.67 %)
291 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1
n/a n/a 11,782
(2.41 %)
40,748
(5.68 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
0
(0 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,818
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
0
(0 %)
427,649
(4.54 %)
29,687
(2.57 %)
15,714
(1.07 %)
292 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1
n/a n/a 3,096
(1.64 %)
2,450
(1.02 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
3,156
(100.00 %)
517,347
(50.76 %)
157,701
(3.90 %)
1,502,752
(34.14 %)
0
(0 %)
157,923
(4.57 %)
1,806
(0.40 %)
1,380
(0.31 %)
293 ocellated dragonet (captive hap2 2024)
GCA_044231645.1
n/a n/a 13,709
(3.65 %)
60,517
(9.98 %)
n/a 45.43
(100.00 %)
0
(0 %)
111
(0.00 %)
129
(100.00 %)
272,479
(3.57 %)
101,623
(4.29 %)
2,384,412
(21.91 %)
0
(0 %)
158,467
(2.41 %)
58,256
(13.22 %)
45,677
(6.65 %)
294 old wife E.armatus (hap2 2024)
GCA_043640875.1
n/a n/a 15,360
(3.42 %)
41,012
(7.26 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
0
(0 %)
100
(0.00 %)
94
(100.00 %)
438,416
(3.46 %)
219,275
(2.83 %)
3,623,998
(22.85 %)
4
(0.00 %)
154,824
(1.82 %)
19,710
(1.32 %)
13,334
(0.83 %)
295 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1
n/a n/a 13,421
(1.31 %)
17,659
(2.08 %)
n/a 40.15
(99.66 %)
93
(0.34 %)
93
(0.34 %)
158
(99.66 %)
733,358
(2.95 %)
403,552
(3.04 %)
7,746,871
(29.97 %)
0
(0 %)
294,855
(1.92 %)
34,363
(2.08 %)
21,752
(1.10 %)
296 orange-tipped seq squirt (alternate hap 2023)
GCA_963082865.1
n/a n/a 167
(2.38 %)
431
(15.83 %)
n/a 36.74
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 70
(100.00 %)
885
(7.97 %)
855
(38.55 %)
9,941
(42.25 %)
0
(0 %)
7,944
(22.20 %)
24
(10.92 %)
127
(13.03 %)
297 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1
n/a n/a 14,018
(1.51 %)
45,251
(3.61 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,393
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
1
(0.00 %)
888,596
(5.23 %)
22,522
(0.77 %)
12,193
(0.40 %)
298 Pacific ridley (hap2 2025)
GCA_965140255.1
n/a 24,067
(1.82 %)
14,883
(1.03 %)
17,736
(1.52 %)
n/a 44.14
(99.96 %)
76
(0.04 %)
76
(0.04 %)
115
(99.96 %)
1,337,786
(12.39 %)
317,205
(2.38 %)
10,851,496
(34.73 %)
1
(0.00 %)
652,074
(2.60 %)
47,955
(1.47 %)
25,100
(0.62 %)
299 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1
n/a n/a 7,223
(0.52 %)
11,927
(1.11 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
76
(0.00 %)
76
(0.00 %)
4,081
(100.00 %)
988,792
(3.99 %)
1,766,202
(10.24 %)
9,974,001
(52.99 %)
0
(0 %)
1,733,898
(6.80 %)
64,462
(1.33 %)
4,213
(0.08 %)
300 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2
n/a n/a 18,116
(1.63 %)
23,608
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
38
(0.00 %)
10,895
(100.00 %)
3,002,448
(29.46 %)
375,226
(0.79 %)
11,824,034
(29.65 %)
0
(0 %)
140,328
(0.57 %)
67,718
(4.23 %)
70,109
(3.93 %)
301 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1
n/a n/a 13,365
(1.26 %)
17,388
(1.98 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
99
(0.00 %)
99
(0.00 %)
279
(100.00 %)
726,428
(2.81 %)
331,756
(2.05 %)
7,184,711
(33.57 %)
2
(0.00 %)
316,815
(2.51 %)
51,973
(2.70 %)
19,565
(0.92 %)
302 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1
n/a n/a 15,421
(1.80 %)
62,324
(6.15 %)
n/a 42.79
(99.90 %)
4,955
(0.10 %)
4,955
(0.10 %)
4,978
(99.90 %)
4,032,523
(34.18 %)
982,411
(16.51 %)
5,189,655
(46.47 %)
55
(0.01 %)
1,303,532
(10.00 %)
64,543
(3.14 %)
28,282
(1.35 %)
303 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1
n/a n/a 16,729
(3.56 %)
56,451
(8.61 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
11
(0.00 %)
11
(0.00 %)
5,701
(100.00 %)
1,153,359
(18.94 %)
829,887
(14.54 %)
2,793,018
(28.79 %)
0
(0 %)
721,904
(6.97 %)
49,469
(4.32 %)
33,228
(2.53 %)
304 peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022)
GCA_023634185.1
n/a n/a 12,529
(1.75 %)
24,654
(2.25 %)
n/a 42.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,745
(100.00 %)
517,204
(7.95 %)
218,606
(4.15 %)
6,216,533
(21.16 %)
0
(0 %)
237,835
(2.15 %)
26,313
(2.41 %)
19,163
(0.91 %)
305 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501915.1
n/a n/a 21,977
(1.55 %)
31,925
(2.52 %)
n/a 39.40
(99.99 %)
0
(0 %)
1,072
(0.01 %)
1,183
(100.00 %)
825,817
(1.86 %)
1,047,172
(7.89 %)
12,996,911
(44.48 %)
3
(0.00 %)
1,701,385
(5.28 %)
99,118
(1.26 %)
15,547
(0.21 %)
306 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1
n/a n/a 18,794
(1.72 %)
21,421
(1.40 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,750
(100.00 %)
4,001,442
(39.37 %)
547,894
(2.75 %)
13,870,563
(34.33 %)
0
(0 %)
585,313
(2.32 %)
40,162
(1.31 %)
39,090
(1.18 %)
307 picturesque dragonet (SynPic1 hap1 2024)
GCA_044231685.1
n/a n/a 13,827
(3.46 %)
53,000
(8.90 %)
n/a 43.38
(100.00 %)
9
(0.00 %)
122
(0.00 %)
364
(100.00 %)
222,800
(3.83 %)
105,428
(7.84 %)
2,500,710
(25.24 %)
1
(0.00 %)
280,578
(4.01 %)
41,125
(5.45 %)
32,953
(3.58 %)
308 pig-tailed macaque (mMacNem1hap2 2024)
GCA_043161795.1
n/a n/a 19,859
(1.78 %)
20,597
(1.19 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
0
(0 %)
232
(0.00 %)
233
(100.00 %)
5,125,011
(53.00 %)
956,928
(9.12 %)
14,621,759
(41.68 %)
3
(0.00 %)
2,124,372
(4.63 %)
96,199
(1.55 %)
29,958
(0.79 %)
309 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1
n/a n/a 15,563
(2.38 %)
54,264
(6.19 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
0
(0 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,418
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
0
(0 %)
338,770
(2.89 %)
40,331
(2.02 %)
21,223
(0.93 %)
310 pink pigeon (alternate hap 2023)
GCA_963082445.1
n/a n/a 10,425
(1.96 %)
20,219
(2.49 %)
n/a 42.52
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,277
(100.00 %)
344,711
(4.99 %)
225,902
(3.41 %)
4,563,425
(21.61 %)
0
(0 %)
303,874
(2.37 %)
28,391
(3.74 %)
24,938
(2.03 %)
311 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2
n/a n/a 10,906
(1.98 %)
19,820
(4.33 %)
n/a 40.04
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,516
(100.00 %)
390,896
(3.25 %)
482,493
(7.83 %)
4,361,670
(34.36 %)
0
(0 %)
491,019
(5.12 %)
52,508
(3.70 %)
21,519
(1.51 %)
312 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2
n/a n/a 13,244
(1.26 %)
19,241
(1.68 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
25
(0.00 %)
25
(0.00 %)
5,868
(100.00 %)
4,420,884
(51.59 %)
513,006
(3.13 %)
7,749,797
(49.18 %)
0
(0 %)
994,720
(3.65 %)
81,538
(8.24 %)
68,267
(3.13 %)
313 plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021)
GCA_020745805.1
n/a n/a 11,774
(1.90 %)
20,857
(2.20 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
0
(0 %)
4
(0.00 %)
749
(100.00 %)
356,053
(4.37 %)
157,695
(0.93 %)
5,995,637
(19.60 %)
0
(0 %)
70,223
(0.74 %)
30,478
(4.03 %)
30,200
(2.16 %)
314 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1
n/a n/a 14,050
(2.77 %)
63,249
(8.86 %)
n/a 45.41
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,970
(100.00 %)
708,455
(9.71 %)
797,241
(15.67 %)
2,785,159
(33.18 %)
0
(0 %)
613,051
(6.69 %)
78,151
(7.95 %)
45,924
(3.34 %)
315 pool frog (hap2 2025)
GCA_965119315.1
n/a n/a 14,335
(0.34 %)
39,545
(1.24 %)
n/a 43.73
(99.99 %)
2,703
(0.01 %)
2,703
(0.01 %)
3,680
(99.99 %)
2,706,037
(2.56 %)
3,712,706
(12.97 %)
23,911,913
(60.10 %)
18
(0.00 %)
6,326,504
(8.24 %)
553,381
(4.05 %)
47,813
(0.35 %)
316 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1
n/a n/a 10,944
(0.64 %)
59,123
(2.21 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,336
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
0
(0 %)
1,101,423
(6.43 %)
125,285
(5.42 %)
13,610
(0.32 %)
317 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1
n/a n/a 17,253
(1.51 %)
18,507
(1.35 %)
n/a 40.91
(100.00 %)
0
(0 %)
39
(0.00 %)
38
(100.00 %)
3,466,835
(27.96 %)
585,261
(1.91 %)
11,364,898
(40.65 %)
2
(0.00 %)
726,868
(2.39 %)
50,527
(1.37 %)
32,436
(0.84 %)
318 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1
n/a n/a 13,892
(0.57 %)
32,011
(1.64 %)
n/a 44.93
(100.00 %)
16
(0.00 %)
685
(0.00 %)
843
(100.00 %)
1,042,636
(2.00 %)
1,430,690
(16.22 %)
14,621,029
(53.91 %)
19
(0.00 %)
4,063,379
(8.75 %)
503,166
(8.84 %)
49,100
(0.82 %)
319 pygmy chimpanzee (paternal 2024)
GCA_028858825.2
n/a n/a 20,282
(1.77 %)
21,509
(1.17 %)
n/a 40.46
(99.84 %)
0
(0 %)
7
(0.16 %)
38
(100.00 %)
5,163,745
(50.07 %)
970,057
(12.58 %)
15,047,429
(42.91 %)
0
(0 %)
3,587,013
(6.37 %)
47,029
(1.08 %)
28,919
(0.75 %)
320 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1
n/a n/a 18,550
(1.51 %)
20,491
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
0
(0 %)
138
(0.01 %)
391
(100.00 %)
3,860,112
(33.83 %)
820,375
(9.58 %)
12,159,196
(41.59 %)
2
(0.00 %)
1,346,279
(3.87 %)
106,168
(2.78 %)
50,294
(1.44 %)
321 razorbill (alternate hap 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658355.1
n/a n/a 12,937
(1.75 %)
24,253
(2.09 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,309
(100.00 %)
562,549
(7.14 %)
210,852
(1.04 %)
7,264,995
(20.26 %)
0
(0 %)
100,265
(0.74 %)
40,926
(2.91 %)
36,166
(1.76 %)
322 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1
n/a n/a 18,817
(1.29 %)
21,916
(1.20 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
0
(0 %)
22
(0.00 %)
4,021
(100.00 %)
3,279,005
(20.48 %)
472,706
(21.87 %)
11,466,609
(50.26 %)
0
(0 %)
3,624,599
(9.05 %)
128,858
(2.07 %)
39,577
(0.84 %)
323 red fox (hap2 2024)
GCA_964106925.2
n/a n/a 19,517
(1.57 %)
20,105
(1.37 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
0
(0 %)
1,819
(0.02 %)
350
(100.00 %)
4,487,839
(31.79 %)
1,010,106
(2.64 %)
13,838,711
(33.07 %)
17
(0.00 %)
695,908
(1.88 %)
51,373
(2.26 %)
46,876
(1.53 %)
324 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1
n/a n/a 4,539
(2.01 %)
14,061
(4.35 %)
n/a 40.48
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,751
(100.00 %)
759,605
(49.59 %)
161,693
(7.99 %)
1,684,737
(29.93 %)
0
(0 %)
232,319
(5.07 %)
7,525
(1.31 %)
4,853
(0.81 %)
325 red-billed tropicbird (paternal hap 2024)
GCA_964289755.1
n/a n/a 11,989
(1.71 %)
21,527
(2.03 %)
n/a 43.19
(99.98 %)
1,072
(0.02 %)
1,072
(0.02 %)
1,572
(99.98 %)
383,852
(5.39 %)
164,123
(3.45 %)
5,859,520
(24.45 %)
20
(0.00 %)
189,600
(1.73 %)
48,825
(5.37 %)
42,685
(3.12 %)
326 red-crested turaco (alternate hap 2019)
GCA_009764505.1
n/a n/a 11,247
(1.70 %)
23,705
(2.27 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,476
(100.00 %)
482,817
(8.51 %)
153,169
(0.81 %)
5,919,109
(21.87 %)
0
(0 %)
121,371
(1.16 %)
39,766
(3.41 %)
32,044
(2.04 %)
327 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020)
GCA_015220175.1
n/a n/a 11,434
(1.65 %)
21,710
(2.11 %)
n/a 46.12
(100.00 %)
0
(0 %)
12
(0.00 %)
2,748
(100.00 %)
859,899
(15.52 %)
319,622
(3.85 %)
5,367,970
(34.63 %)
0
(0 %)
960,530
(5.66 %)
23,381
(1.81 %)
19,537
(1.27 %)
328 red-legged seriema (alternate hap 2019)
GCA_009819485.1
n/a n/a 10,131
(1.78 %)
19,775
(2.21 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,840
(100.00 %)
366,591
(6.01 %)
117,928
(0.90 %)
5,340,048
(18.90 %)
0
(0 %)
66,176
(0.68 %)
26,293
(2.86 %)
24,338
(1.93 %)
329 red-throated loon (hap1 2023)
GCA_030936125.1
n/a n/a 13,357
(1.64 %)
29,603
(2.35 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
260
(0.00 %)
260
(0.00 %)
3,225
(100.00 %)
549,694
(8.44 %)
246,171
(10.46 %)
5,258,356
(27.36 %)
2
(0.00 %)
671,693
(3.75 %)
39,810
(3.37 %)
34,456
(1.67 %)
330 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1
25,173
(40.74 %)
n/a 13,218
(1.71 %)
28,120
(2.39 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
9
(0.00 %)
249
(0.00 %)
1,195
(100.00 %)
544,427
(8.81 %)
223,674
(5.77 %)
6,669,469
(23.63 %)
3
(0.00 %)
398,605
(2.64 %)
38,306
(3.37 %)
35,069
(1.78 %)
331 reedfish (v3 alternate hap 2021)
GCA_900700845.3
n/a n/a 11,382
(0.41 %)
28,399
(1.33 %)
n/a 39.39
(99.99 %)
17
(0.01 %)
17
(0.01 %)
17,099
(99.99 %)
6,708,926
(37.23 %)
883,916
(2.81 %)
16,745,782
(46.94 %)
0
(0 %)
963,655
(2.45 %)
74,951
(1.15 %)
20,227
(0.32 %)
332 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1
n/a n/a 19,396
(1.48 %)
21,693
(1.26 %)
n/a 41.62
(97.80 %)
0
(0 %)
131
(2.20 %)
1,039
(100.00 %)
3,973,936
(35.55 %)
987,571
(11.66 %)
12,473,459
(42.11 %)
1
(0.00 %)
1,271,959
(3.79 %)
74,971
(1.64 %)
44,274
(1.06 %)
333 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1
59,888
(43.60 %)
n/a 19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
0
(0 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
4
(0.00 %)
1,071,329
(3.37 %)
73,126
(1.69 %)
43,865
(1.11 %)
334 rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021)
GCA_016880875.1
n/a n/a 9,867
(1.89 %)
19,635
(2.52 %)
n/a 42.54
(100.00 %)
0
(0 %)
20
(0.00 %)
2,879
(100.00 %)
394,769
(10.00 %)
186,556
(1.91 %)
4,428,687
(19.09 %)
0
(0 %)
192,997
(1.66 %)
15,730
(1.88 %)
12,474
(0.91 %)
335 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 alternate hap 2024)
GCA_040937895.1
n/a n/a 26,401
(0.36 %)
90,909
(1.63 %)
n/a 44.93
(100.00 %)
19
(0.00 %)
19
(0.00 %)
14,096
(100.00 %)
4,036,529
(2.70 %)
6,299,339
(18.78 %)
14,096
(100.00 %)
1
(0.00 %)
13,301,439
(10.32 %)
1,426,030
(6.65 %)
1,371,517
(5.63 %)
336 ring-tailed lemur (mLemCat1 alternate hap 2021)
GCA_020740595.1
n/a n/a 18,683
(1.98 %)
21,178
(1.55 %)
n/a 41.29
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
312
(100.00 %)
3,400,356
(36.84 %)
511,707
(7.13 %)
13,027,744
(33.21 %)
0
(0 %)
889,687
(2.62 %)
50,614
(1.83 %)
47,997
(1.60 %)
337 Risso's dolphin (hap2.1 2024)
GCA_964374185.1
n/a n/a 18,061
(1.68 %)
20,080
(1.36 %)
n/a 41.97
(99.99 %)
1,073
(0.01 %)
1,073
(0.01 %)
2,135
(99.99 %)
3,948,427
(43.52 %)
848,222
(8.00 %)
11,527,950
(38.76 %)
3
(0.00 %)
1,133,241
(3.81 %)
70,117
(3.31 %)
50,095
(2.07 %)
338 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1
n/a n/a 18,165
(2.73 %)
62,580
(6.00 %)
n/a 38.74
(100.00 %)
6
(0.00 %)
6
(0.00 %)
4,612
(100.00 %)
2,483,904
(48.29 %)
584,363
(7.55 %)
5,582,076
(40.38 %)
0
(0 %)
923,875
(6.53 %)
60,229
(3.53 %)
19,604
(0.82 %)
339 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2
n/a n/a 15,291
(3.29 %)
45,865
(7.56 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,165
(100.00 %)
1,131,154
(25.69 %)
269,583
(5.08 %)
3,371,712
(24.64 %)
0
(0 %)
249,009
(3.21 %)
36,810
(2.68 %)
27,636
(1.84 %)
340 rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024)
GCA_036010775.2
n/a n/a 12,450
(1.75 %)
23,660
(2.21 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
23
(0.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
2
(0.00 %)
1,046,187
(5.37 %)
33,479
(3.29 %)
29,158
(1.73 %)
341 rock pigeon (racing homer maternal 2024)
GCA_036010775.1
n/a n/a 12,450
(1.75 %)
25,274
(2.35 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
23
(0.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
2
(0.00 %)
1,046,190
(5.37 %)
33,479
(3.29 %)
29,158
(1.73 %)
342 rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022)
GCA_023344045.1
n/a n/a 12,090
(2.36 %)
21,910
(2.57 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,212
(100.00 %)
585,577
(10.45 %)
202,342
(1.61 %)
5,390,780
(20.38 %)
0
(0 %)
122,512
(1.28 %)
19,210
(2.23 %)
17,189
(1.48 %)
343 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1
n/a n/a 15,434
(2.01 %)
44,991
(4.63 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
0
(0 %)
192
(0.00 %)
302
(100.00 %)
2,506,810
(40.54 %)
613,867
(8.67 %)
5,070,851
(48.32 %)
1
(0.00 %)
1,210,760
(8.82 %)
46,071
(2.57 %)
27,461
(1.23 %)
344 rough bullseye (RE-2024b hap2 2024)
GCA_042242125.1
n/a n/a 14,475
(2.89 %)
44,413
(7.11 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
0
(0 %)
93
(0.00 %)
84
(100.00 %)
1,762,151
(30.90 %)
262,291
(5.80 %)
3,580,461
(24.37 %)
10
(0.00 %)
296,317
(3.16 %)
19,851
(1.40 %)
14,202
(0.86 %)
345 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1
n/a n/a 13,845
(0.96 %)
23,108
(1.86 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,128
(100.00 %)
2,008,682
(10.16 %)
1,718,408
(7.36 %)
9,467,451
(52.99 %)
0
(0 %)
1,513,596
(5.45 %)
140,557
(4.65 %)
29,439
(0.71 %)
346 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1
n/a n/a 12,606
(0.83 %)
22,421
(1.62 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,543
(100.00 %)
2,080,172
(11.19 %)
1,814,619
(9.22 %)
8,889,119
(57.36 %)
0
(0 %)
1,825,733
(6.19 %)
145,328
(4.63 %)
28,523
(0.67 %)
347 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1
n/a n/a 17,895
(2.55 %)
64,448
(5.84 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
0
(0 %)
418
(0.01 %)
110
(100.00 %)
2,661,155
(49.83 %)
673,071
(10.59 %)
5,755,954
(42.48 %)
1
(0.00 %)
1,108,306
(7.28 %)
66,952
(4.46 %)
21,217
(0.87 %)
348 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1
n/a n/a 13,727
(0.84 %)
24,896
(2.06 %)
n/a 42.95
(99.51 %)
0
(0 %)
973
(0.49 %)
2,266
(100.00 %)
729,332
(2.15 %)
1,402,564
(24.45 %)
8,156,596
(55.96 %)
4
(0.00 %)
3,523,739
(10.10 %)
175,180
(3.64 %)
18,584
(0.40 %)
349 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1
n/a n/a 18,509
(1.54 %)
22,514
(1.36 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
7,427
(100.00 %)
3,675,922
(35.75 %)
950,374
(10.49 %)
11,670,399
(40.31 %)
0
(0 %)
1,395,810
(4.32 %)
63,587
(3.15 %)
40,331
(1.09 %)
350 Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022)
GCA_023634115.1
n/a n/a 12,258
(1.66 %)
25,579
(2.30 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
4,162
(100.00 %)
506,343
(6.77 %)
182,589
(7.22 %)
5,435,776
(23.60 %)
0
(0 %)
383,493
(2.65 %)
29,420
(2.47 %)
19,384
(0.92 %)
351 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023)
GCA_027887135.1
n/a n/a 12,826
(1.74 %)
26,019
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,054
(100.00 %)
482,850
(3.37 %)
523,437
(10.15 %)
6,386,315
(26.20 %)
0
(0 %)
535,497
(3.35 %)
32,734
(4.25 %)
23,206
(1.19 %)
352 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1
n/a n/a 14,039
(1.09 %)
19,528
(1.85 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
31
(0.00 %)
31
(0.00 %)
122
(100.00 %)
1,307,065
(5.31 %)
672,219
(3.50 %)
9,949,858
(39.30 %)
0
(0 %)
671,520
(3.09 %)
83,890
(3.97 %)
26,657
(0.80 %)
353 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1
n/a n/a 14,226
(1.28 %)
25,396
(2.33 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
12,662
(100.00 %)
1,001,433
(5.27 %)
445,157
(1.79 %)
7,227,826
(34.26 %)
0
(0 %)
365,558
(2.38 %)
80,300
(2.76 %)
22,848
(0.87 %)
354 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1
n/a n/a 14,077
(0.47 %)
36,608
(1.60 %)
n/a 43.86
(99.99 %)
0
(0 %)
2,097
(0.01 %)
2,802
(100.00 %)
1,819,971
(2.73 %)
2,865,173
(16.12 %)
15,335,602
(63.85 %)
14
(0.00 %)
6,125,585
(10.74 %)
651,438
(8.09 %)
43,492
(0.45 %)
355 Schreibers' long-fingered bat (hap2 2024)
GCA_964145185.1
n/a n/a 17,115
(2.05 %)
19,972
(1.93 %)
n/a 42.62
(99.99 %)
1,137
(0.01 %)
1,137
(0.01 %)
1,305
(99.99 %)
2,445,695
(27.61 %)
386,295
(4.40 %)
9,657,997
(29.32 %)
2
(0.00 %)
458,566
(1.76 %)
56,451
(2.93 %)
50,746
(2.02 %)
356 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1
n/a n/a 6,180
(0.71 %)
31,191
(4.14 %)
n/a 48.30
(100.00 %)
0
(0 %)
11
(0.00 %)
4,064
(100.00 %)
1,494,745
(38.42 %)
891,392
(20.02 %)
4,259,383
(49.70 %)
0
(0 %)
2,135,388
(12.73 %)
147,499
(35.87 %)
97,808
(5.62 %)
357 sea stickleback (SK-2024b hap2 2025)
GCA_048127205.1
n/a n/a 14,237
(4.44 %)
46,701
(10.13 %)
n/a 44.75
(99.99 %)
0
(0 %)
276
(0.01 %)
52
(100.00 %)
413,494
(14.42 %)
189,429
(8.99 %)
1,996,715
(23.13 %)
3
(0.00 %)
178,781
(3.14 %)
60,252
(12.60 %)
46,667
(5.92 %)
358 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1
n/a n/a 14,728
(2.46 %)
62,094
(7.09 %)
n/a 42.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
3,847
(100.00 %)
939,151
(11.90 %)
472,983
(7.68 %)
4,326,183
(28.40 %)
0
(0 %)
486,310
(4.09 %)
64,290
(4.16 %)
42,087
(2.28 %)
359 sharpnose sevengill shark (hap2 2024)
GCA_035084135.1
n/a n/a 12,603
(0.52 %)
23,419
(1.42 %)
n/a 44.36
(99.99 %)
1,695
(0.01 %)
1,695
(0.01 %)
2,889
(99.99 %)
559,171
(2.08 %)
973,228
(15.01 %)
11,768,442
(55.69 %)
2
(0.00 %)
3,991,721
(8.15 %)
108,468
(3.25 %)
22,750
(0.36 %)
360 sharptooth jobfish (hap2 2024)
GCA_045363885.1
n/a n/a 15,879
(1.78 %)
51,774
(4.52 %)
n/a 39.81
(100.00 %)
0
(0 %)
76
(0.00 %)
172
(100.00 %)
778,842
(3.19 %)
462,247
(3.82 %)
7,956,116
(35.13 %)
1
(0.00 %)
374,216
(2.38 %)
21,587
(0.91 %)
12,357
(0.42 %)
361 siamang (Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.3
n/a n/a 19,572
(1.70 %)
20,107
(1.11 %)
n/a 40.45
(99.93 %)
0
(0 %)
3
(0.07 %)
40
(100.00 %)
5,057,491
(55.54 %)
869,279
(15.07 %)
14,090,400
(46.04 %)
0
(0 %)
1,893,854
(4.08 %)
87,907
(1.41 %)
26,874
(0.68 %)
362 siamang (v2 Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.2
n/a n/a 19,572
(1.70 %)
20,107
(1.11 %)
n/a 40.45
(99.93 %)
0
(0 %)
3
(0.07 %)
40
(100.00 %)
5,057,491
(55.54 %)
869,279
(15.07 %)
14,090,400
(46.04 %)
0
(0 %)
2,292,373
(4.98 %)
87,907
(1.41 %)
26,874
(0.68 %)
363 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2
n/a n/a 14,737
(4.05 %)
61,568
(10.70 %)
n/a 45.50
(100.00 %)
108
(0.00 %)
108
(0.00 %)
3,872
(100.00 %)
392,585
(19.23 %)
190,741
(5.09 %)
1,994,824
(23.20 %)
0
(0 %)
245,925
(4.39 %)
74,259
(13.49 %)
57,619
(7.42 %)
364 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap2.1 2024)
GCA_964106785.1
n/a n/a 13,756
(1.40 %)
19,148
(2.33 %)
n/a 43.77
(99.99 %)
0
(0 %)
783
(0.01 %)
127
(100.00 %)
790,266
(3.86 %)
448,558
(4.00 %)
6,780,108
(37.51 %)
3
(0.00 %)
534,737
(3.25 %)
86,165
(2.71 %)
18,444
(0.74 %)
365 slow loris (alternate hap 2022)
GCA_027406535.1
n/a n/a 21,660
(1.50 %)
22,771
(1.32 %)
n/a 40.88
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 6,485
(100.00 %)
4,275,926
(39.13 %)
533,324
(1.57 %)
13,459,597
(39.86 %)
0
(0 %)
855,097
(2.22 %)
35,720
(0.78 %)
21,807
(0.55 %)
366 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2
n/a n/a 11,589
(0.31 %)
32,603
(1.10 %)
n/a 47.54
(100.00 %)
6
(0.00 %)
6
(0.00 %)
26,655
(100.00 %)
1,346,532
(1.83 %)
1,273,326
(5.35 %)
19,727,443
(51.55 %)
0
(0 %)
2,678,114
(4.31 %)
427,693
(8.25 %)
27,178
(0.30 %)
367 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1
n/a n/a 13,661
(1.11 %)
75,418
(4.21 %)
n/a 45.01
(99.96 %)
0
(0 %)
3,120
(0.04 %)
1,059
(100.00 %)
4,634,757
(53.53 %)
1,006,319
(17.13 %)
5,273,732
(51.16 %)
14
(0.00 %)
1,782,741
(8.47 %)
145,115
(7.59 %)
66,645
(2.19 %)
368 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1
n/a n/a 9,086
(0.58 %)
20,468
(1.57 %)
n/a 42.65
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 10,892
(100.00 %)
315,695
(1.23 %)
320,148
(1.73 %)
8,305,059
(38.33 %)
0
(0 %)
382,745
(1.57 %)
37,147
(1.43 %)
15,419
(0.42 %)
369 snake N.helvetica (rNatHel1.hap2.1 2024)
GCA_964273795.1
n/a n/a 11,975
(1.14 %)
16,941
(1.86 %)
n/a 41.42
(99.98 %)
1,674
(0.02 %)
1,674
(0.02 %)
2,176
(99.98 %)
1,088,721
(8.03 %)
743,110
(5.43 %)
7,446,281
(43.88 %)
11
(0.00 %)
634,247
(3.33 %)
96,764
(4.19 %)
20,864
(0.74 %)
370 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1
n/a n/a 17,590
(1.81 %)
21,597
(1.85 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
2,717
(100.00 %)
2,734,555
(21.46 %)
795,752
(6.56 %)
9,601,735
(36.35 %)
0
(0 %)
660,443
(2.50 %)
62,524
(3.25 %)
60,391
(2.11 %)
371 South Island takahe (alternate hap 2021)
GCA_020801775.1
n/a n/a 12,655
(1.70 %)
n/a n/a 43.63
(99.16 %)
0
(0 %)
238
(0.84 %)
178
(100.00 %)
554,912
(9.42 %)
230,808
(4.34 %)
6,406,358
(24.83 %)
0
(0 %)
352,693
(2.60 %)
22,941
(1.98 %)
19,559
(1.17 %)
372 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1
n/a n/a 15,727
(2.61 %)
43,177
(5.74 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 895
(100.00 %)
1,590,386
(33.53 %)
246,800
(2.86 %)
5,173,834
(26.85 %)
0
(0 %)
323,596
(3.31 %)
14,473
(0.87 %)
9,723
(0.47 %)
373 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1
n/a n/a 20,179
(1.21 %)
24,249
(1.19 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
4
(0.00 %)
4
(0.00 %)
7,866
(100.00 %)
3,953,031
(35.88 %)
531,111
(1.14 %)
16,354,874
(39.96 %)
0
(0 %)
425,622
(1.30 %)
59,907
(1.35 %)
35,916
(0.80 %)
374 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1
n/a n/a 22,897
(1.23 %)
27,007
(1.18 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
70
(0.00 %)
70
(0.00 %)
12,050
(100.00 %)
4,502,020
(38.27 %)
576,759
(1.02 %)
17,143,050
(40.65 %)
0
(0 %)
450,196
(1.59 %)
51,339
(1.15 %)
40,459
(0.82 %)
375 Sowerby's beaked whale (hap2 2024)
GCA_964148845.1
n/a n/a 18,591
(1.46 %)
21,588
(1.27 %)
n/a 42.00
(99.99 %)
974
(0.01 %)
974
(0.01 %)
2,126
(99.99 %)
3,961,403
(34.20 %)
742,897
(9.73 %)
10,832,739
(43.68 %)
2
(0.00 %)
2,951,041
(7.25 %)
70,803
(2.85 %)
37,380
(0.90 %)
376 spangled emperor (hap2 2024)
GCA_045362485.1
n/a n/a 15,490
(1.77 %)
57,993
(5.20 %)
n/a 40.57
(100.00 %)
0
(0 %)
244
(0.00 %)
151
(100.00 %)
677,985
(3.03 %)
408,391
(4.33 %)
7,184,861
(29.15 %)
4
(0.00 %)
529,035
(3.52 %)
36,602
(1.46 %)
18,481
(0.64 %)
377 speckled mousebird (bColStr4 hap2 2023)
GCA_028858625.2
n/a n/a 12,332
(1.76 %)
22,895
(2.24 %)
n/a 42.74
(99.53 %)
0
(0 %)
136
(0.47 %)
242
(100.00 %)
521,023
(11.26 %)
304,406
(7.39 %)
5,319,571
(25.46 %)
0
(0 %)
589,925
(3.69 %)
27,299
(2.35 %)
19,827
(1.22 %)
378 speckled mousebird (hap2 2023)
GCA_028858625.1
n/a n/a 13,169
(1.74 %)
26,896
(2.47 %)
n/a 42.62
(99.56 %)
0
(0 %)
151
(0.44 %)
243
(100.00 %)
570,907
(11.75 %)
317,226
(6.96 %)
5,854,600
(25.51 %)
0
(0 %)
605,114
(3.54 %)
28,905
(2.31 %)
21,335
(1.22 %)
379 spotted gar (fLepOcu1hap1 2024)
GCA_040954845.1
n/a n/a 13,777
(1.63 %)
24,910
(4.29 %)
n/a 40.54
(100.00 %)
0
(0 %)
76
(0.00 %)
831
(100.00 %)
1,218,814
(33.09 %)
230,177
(10.66 %)
5,685,909
(34.46 %)
0
(0 %)
606,189
(4.68 %)
52,438
(3.69 %)
36,888
(1.75 %)
380 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1
n/a n/a 10,920
(1.26 %)
14,403
(2.60 %)
n/a 43.46
(99.96 %)
0
(0 %)
2,088
(0.04 %)
1,042
(100.00 %)
3,325,883
(44.48 %)
604,780
(8.87 %)
5,926,808
(44.92 %)
2
(0.00 %)
1,077,982
(5.77 %)
64,249
(4.00 %)
11,419
(0.43 %)
381 starry smooth-hound (sMusAst1.hap2.1 2024)
GCA_964214025.1
n/a n/a 12,414
(0.43 %)
22,037
(1.15 %)
n/a 45.49
(99.98 %)
3,505
(0.02 %)
3,505
(0.02 %)
7,908
(99.98 %)
1,083,980
(2.93 %)
1,065,586
(9.57 %)
13,986,241
(53.49 %)
32
(0.00 %)
3,881,332
(7.02 %)
105,379
(3.46 %)
14,226
(0.18 %)
382 sterlet (v2 paternal hap 2022)
GCA_902713435.2
n/a n/a 24,717
(1.73 %)
40,151
(4.13 %)
74,807
(5.54 %)
40.09
(99.99 %)
0
(0 %)
475
(0.01 %)
1,517
(100.00 %)
1,844,596
(9.77 %)
1,119,340
(9.88 %)
9,372,934
(41.58 %)
8
(0.00 %)
1,582,556
(6.83 %)
65,007
(2.74 %)
17,761
(0.38 %)
383 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1
n/a n/a 16,177
(4.18 %)
40,160
(7.35 %)
n/a 39.58
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,237
(100.00 %)
1,208,781
(38.02 %)
121,854
(7.96 %)
2,956,942
(32.61 %)
0
(0 %)
310,772
(4.79 %)
27,787
(3.58 %)
14,364
(1.06 %)
384 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1
n/a n/a 15,871
(2.85 %)
42,287
(5.51 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
3,274
(100.00 %)
1,826,752
(37.53 %)
592,022
(6.69 %)
4,899,884
(32.33 %)
0
(0 %)
491,621
(3.91 %)
17,357
(1.25 %)
12,560
(0.74 %)
385 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1
n/a n/a 18,204
(1.54 %)
21,036
(1.34 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 3,464
(100.00 %)
3,767,720
(35.65 %)
1,102,723
(10.92 %)
11,794,617
(40.96 %)
0
(0 %)
1,492,009
(4.69 %)
67,537
(3.57 %)
41,008
(1.09 %)
386 Sumatran orangutan (v2 AG06213 alternate hap 2024)
GCA_028885685.2
n/a n/a 19,884
(1.79 %)
20,383
(1.18 %)
n/a 40.95
(99.75 %)
0
(0 %)
10
(0.25 %)
48
(100.00 %)
5,192,176
(53.57 %)
950,166
(9.22 %)
15,240,038
(41.74 %)
0
(0 %)
2,007,170
(3.80 %)
41,928
(1.16 %)
29,154
(0.81 %)
387 Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021)
GCA_020746095.1
n/a n/a 11,628
(1.91 %)
21,635
(2.31 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
17
(0.00 %)
1,535
(100.00 %)
421,231
(6.57 %)
146,070
(1.11 %)
5,727,350
(21.91 %)
0
(0 %)
105,678
(1.04 %)
37,752
(3.68 %)
32,944
(2.17 %)
388 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1
n/a n/a 14,713
(1.06 %)
18,602
(1.60 %)
n/a 44.58
(100.00 %)
0
(0 %)
290
(0.00 %)
366
(100.00 %)
1,352,115
(12.17 %)
388,630
(1.94 %)
10,550,154
(33.42 %)
0
(0 %)
470,790
(2.03 %)
113,023
(3.09 %)
33,031
(0.84 %)
389 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020)
GCA_009819505.2
n/a n/a 13,403
(1.85 %)
27,669
(2.52 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
0
(0 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
704,976
(13.16 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
0
(0 %)
505,741
(2.66 %)
49,076
(3.54 %)
23,486
(1.21 %)
390 swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023)
GCA_028019105.1
n/a n/a 12,160
(1.83 %)
24,622
(2.46 %)
n/a 43.37
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 862
(100.00 %)
383,634
(3.06 %)
527,550
(8.40 %)
5,916,654
(24.97 %)
0
(0 %)
665,809
(4.29 %)
31,261
(3.21 %)
22,337
(1.23 %)
391 Swift parrot (hap2 2024)
GCA_037157625.1
n/a n/a 11,928
(1.78 %)
20,879
(2.12 %)
n/a 42.78
(99.75 %)
0
(0 %)
122
(0.25 %)
413
(100.00 %)
481,463
(6.65 %)
359,572
(7.59 %)
5,094,615
(26.27 %)
2
(0.00 %)
449,659
(3.37 %)
23,296
(2.08 %)
20,233
(1.32 %)
392 tailed frog (A.truei hap2 2024)
GCA_040206675.1
n/a n/a 14,405
(0.55 %)
41,584
(1.88 %)
n/a 44.89
(99.97 %)
0
(0 %)
6,023
(0.03 %)
2,779
(100.00 %)
1,770,524
(4.86 %)
3,429,564
(18.94 %)
15,718,939
(55.22 %)
37
(0.00 %)
5,484,397
(11.18 %)
441,543
(6.61 %)
73,027
(0.90 %)
393 tammar wallaby (mMacEug1 alternate hap 2023)
GCA_028389975.1
n/a n/a 11,133
(0.77 %)
13,869
(0.98 %)
n/a 38.63
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
14,285
(100.00 %)
3,114,522
(26.10 %)
661,874
(3.02 %)
11,667,649
(38.41 %)
0
(0 %)
320,252
(1.29 %)
12,393
(0.46 %)
7,824
(0.29 %)
394 tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023)
GCA_028020675.1
n/a n/a 11,432
(1.95 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
911
(100.00 %)
470,125
(9.51 %)
140,846
(3.57 %)
5,002,695
(22.08 %)
0
(0 %)
231,594
(1.85 %)
22,424
(2.33 %)
19,010
(1.39 %)
395 tawny owl (hap2 2023)
GCA_031877785.1
n/a n/a 12,367
(1.72 %)
21,445
(2.03 %)
n/a 42.53
(99.88 %)
0
(0 %)
206
(0.12 %)
184
(100.00 %)
392,959
(4.59 %)
235,300
(7.72 %)
6,437,772
(24.82 %)
0
(0 %)
298,804
(2.06 %)
27,952
(2.71 %)
25,864
(1.43 %)
396 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1
n/a n/a 5,885
(0.35 %)
24,457
(1.45 %)
n/a 44.61
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(0.00 %)
21,995
(100.00 %)
553,415
(2.65 %)
761,469
(4.53 %)
6,043,769
(57.75 %)
0
(0 %)
1,079,506
(5.75 %)
159,552
(5.54 %)
20,611
(0.66 %)
397 three-spined stickleback (hap2 2024)
GCA_964276385.1
n/a n/a 13,591
(3.79 %)
50,693
(10.19 %)
n/a 44.72
(99.99 %)
309
(0.01 %)
309
(0.01 %)
479
(99.99 %)
505,547
(19.86 %)
181,092
(8.75 %)
2,117,454
(27.02 %)
3
(0.00 %)
218,946
(4.51 %)
75,434
(12.33 %)
51,737
(5.53 %)
398 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1
n/a n/a 12,197
(0.36 %)
33,747
(1.15 %)
n/a 43.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
23,871
(100.00 %)
1,453,442
(1.57 %)
1,309,062
(3.23 %)
17,953,416
(52.19 %)
0
(0 %)
1,274,743
(3.12 %)
326,452
(3.86 %)
38,711
(0.39 %)
399 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3
n/a n/a 13,635
(4.82 %)
48,723
(11.83 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
0
(0 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,793
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
0
(0 %)
206,265
(4.46 %)
46,936
(9.72 %)
35,741
(5.19 %)
400 tourmaline sunangel (hap2 2024)
GCA_036172335.1
n/a n/a 11,697
(2.00 %)
19,544
(2.34 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
0
(0 %)
370
(0.01 %)
200
(100.00 %)
480,724
(5.14 %)
292,213
(3.66 %)
5,608,823
(21.79 %)
2
(0.00 %)
199,789
(1.65 %)
17,191
(1.69 %)
14,460
(1.07 %)
401 trahira (v1 hap1 2023)
GCA_029633855.1
n/a n/a 16,039
(2.06 %)
44,287
(4.38 %)
n/a 40.99
(92.91 %)
0
(0 %)
867
(7.09 %)
597
(100.00 %)
2,228,831
(30.95 %)
687,495
(13.85 %)
5,309,097
(36.70 %)
2
(0.01 %)
1,157,952
(7.09 %)
27,070
(2.09 %)
12,077
(0.44 %)
402 trahira (v2 hap2 2024)
GCA_029633875.2
n/a n/a 15,041
(2.01 %)
42,180
(4.38 %)
n/a 41.03
(96.21 %)
143
(1.35 %)
792
(3.79 %)
594
(98.65 %)
1,069,159
(7.06 %)
653,554
(15.46 %)
4,921,631
(38.75 %)
7
(0.00 %)
1,141,429
(7.56 %)
26,440
(2.18 %)
11,688
(0.47 %)
403 True's beaked whale (hap2.1 2024)
GCA_964341485.1
n/a n/a 19,313
(1.40 %)
22,642
(1.25 %)
n/a 42.03
(99.99 %)
1,073
(0.01 %)
1,073
(0.01 %)
2,457
(99.99 %)
4,540,507
(37.61 %)
826,104
(12.82 %)
11,296,445
(45.25 %)
8
(0.00 %)
3,246,098
(7.56 %)
80,840
(2.24 %)
38,974
(0.87 %)
404 tufted duck (alternate hap 2019)
GCA_009819845.1
n/a n/a 12,117
(2.03 %)
21,464
(2.36 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
780
(100.00 %)
732,317
(7.82 %)
353,660
(1.57 %)
6,119,549
(21.70 %)
0
(0 %)
66,459
(0.74 %)
27,920
(2.56 %)
25,192
(1.55 %)
405 Tungara frog (aEngPut4 2024)
GCA_040894015.1
n/a n/a 13,192
(0.88 %)
29,242
(2.52 %)
n/a 43.08
(100.00 %)
0
(0 %)
507
(0.00 %)
819
(100.00 %)
736,700
(2.60 %)
1,165,044
(20.79 %)
8,671,642
(52.60 %)
3
(0.00 %)
1,462,012
(5.01 %)
207,553
(4.71 %)
22,911
(0.46 %)
406 tunicate S.clava (kaStyClav1.hap2.1 2024)
GCA_964204955.1
n/a n/a 3,537
(0.78 %)
12,938
(7.13 %)
n/a 36.53
(100.00 %)
26
(0.00 %)
26
(0.00 %)
269
(100.00 %)
91,318
(3.44 %)
79,330
(9.47 %)
2,208,574
(39.20 %)
2
(0.00 %)
400,110
(11.12 %)
6,157
(5.53 %)
1,067
(0.10 %)
407 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1
n/a n/a 13,456
(0.33 %)
47,486
(1.34 %)
n/a 44.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2
(0.00 %)
27,233
(100.00 %)
1,968,437
(1.91 %)
1,716,136
(3.97 %)
25,847,315
(43.76 %)
0
(0 %)
1,707,112
(2.84 %)
523,234
(6.59 %)
83,004
(0.82 %)
408 Tyrrhenian wall lizard (hap2 2025)
GCA_965153305.1
n/a n/a 13,496
(1.42 %)
18,862
(2.37 %)
n/a 43.96
(99.99 %)
0
(0 %)
983
(0.01 %)
306
(100.00 %)
780,565
(4.36 %)
422,625
(4.27 %)
6,551,041
(36.66 %)
9
(0.00 %)
570,142
(3.57 %)
89,693
(2.97 %)
18,244
(0.76 %)
409 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1
n/a n/a 9,367
(1.66 %)
11,297
(1.30 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
9,470
(100.00 %)
1,708,360
(43.81 %)
267,584
(1.67 %)
5,373,410
(33.52 %)
0
(0 %)
245,754
(1.84 %)
29,783
(1.94 %)
21,396
(1.51 %)
410 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1
n/a n/a 14,197
(3.33 %)
44,782
(7.70 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 2,294
(100.00 %)
396,279
(4.74 %)
275,154
(5.76 %)
2,933,132
(29.41 %)
0
(0 %)
277,720
(3.27 %)
35,104
(4.08 %)
21,634
(1.95 %)
411 western capercaillie (alternate hap 2023)
GCA_951394355.1
n/a n/a 11,226
(2.33 %)
20,526
(2.54 %)
n/a 41.53
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 5,463
(100.00 %)
436,894
(5.48 %)
209,008
(1.73 %)
4,790,071
(20.27 %)
0
(0 %)
86,858
(1.22 %)
17,864
(2.58 %)
16,116
(1.50 %)
412 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1
n/a n/a 14,370
(1.06 %)
24,297
(1.27 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
26,601
(100.00 %)
3,360,923
(19.59 %)
1,043,098
(3.92 %)
8,511,380
(53.68 %)
0
(0 %)
1,216,984
(4.33 %)
23,321
(0.97 %)
17,608
(0.60 %)
413 western lowland gorilla (paternal KB3781 2024)
GCA_028885475.2
n/a n/a 20,265
(1.62 %)
40,901
(1.63 %)
n/a 40.53
(99.94 %)
0
(0 %)
2
(0.06 %)
24
(100.00 %)
5,171,525
(50.35 %)
1,002,906
(19.45 %)
15,064,682
(47.42 %)
0
(0 %)
n/a 64,337
(1.17 %)
29,235
(0.71 %)
414 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1
n/a n/a 13,101
(0.94 %)
24,980
(1.75 %)
n/a 41.02
(99.93 %)
19
(0.07 %)
19
(0.07 %)
13,642
(99.93 %)
1,410,212
(7.70 %)
1,080,385
(4.56 %)
9,112,844
(43.96 %)
0
(0 %)
886,410
(3.61 %)
91,606
(2.53 %)
24,845
(0.74 %)
415 whiskered bat (hap2 2024)
GCA_964195625.1
n/a n/a 18,681
(1.83 %)
21,523
(1.79 %)
n/a 43.13
(99.99 %)
1,414
(0.01 %)
1,414
(0.01 %)
1,741
(99.99 %)
2,849,223
(24.50 %)
688,594
(4.80 %)
9,968,980
(36.80 %)
9
(0.00 %)
650,767
(2.46 %)
64,365
(2.68 %)
52,706
(1.84 %)
416 whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021)
GCA_020745695.1
n/a n/a 11,632
(1.83 %)
20,659
(2.18 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
0
(0 %)
1
(0.00 %)
2,405
(100.00 %)
553,633
(11.80 %)
147,999
(0.81 %)
5,825,472
(20.55 %)
0
(0 %)
89,546
(1.06 %)
20,481
(1.61 %)
16,521
(1.13 %)
417 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1
n/a n/a 17,639
(1.50 %)
25,684
(1.35 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 25,619
(100.00 %)
3,039,324
(36.05 %)
637,912
(8.02 %)
9,746,398
(38.98 %)
0
(0 %)
811,711
(3.51 %)
56,325
(3.33 %)
35,586
(1.15 %)
418 white-crowned manakin (hap2 2024)
GCA_036250135.1
n/a n/a 12,135
(1.94 %)
21,591
(2.38 %)
n/a 42.49
(99.99 %)
0
(0 %)
307
(0.01 %)
595
(100.00 %)
375,468
(3.93 %)
263,979
(3.93 %)
5,786,346
(21.36 %)
0
(0 %)
353,429
(2.50 %)
25,275
(2.50 %)
20,066
(1.10 %)
419 white-rumped munia (paternal hap 2024)
GCA_046129705.1
n/a n/a 12,130
(1.67 %)
29,443
(2.72 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
0
(0 %)
228
(0.00 %)
202
(100.00 %)
420,085
(3.06 %)
494,379
(10.27 %)
5,496,878
(27.56 %)
0
(0 %)
694,220
(4.56 %)
36,269
(5.17 %)
22,893
(1.12 %)
420 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022)
GCA_947461935.1
n/a n/a 7,755
(1.71 %)
16,331
(2.39 %)
n/a 43.66
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,971
(100.00 %)
304,566
(13.21 %)
116,307
(6.64 %)
3,407,853
(22.91 %)
0
(0 %)
142,427
(1.75 %)
34,573
(4.56 %)
18,414
(1.62 %)
421 white-throated sparrow (hap2 2025)
GCA_047774235.1
n/a n/a 12,395
(1.71 %)
31,476
(3.12 %)
n/a 43.97
(100.00 %)
0
(0 %)
246
(0.00 %)
150
(100.00 %)
412,959
(3.07 %)
653,654
(9.08 %)
5,548,210
(27.13 %)
0
(0 %)
935,032
(5.89 %)
38,640
(2.84 %)
23,466
(1.19 %)
422 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1
n/a n/a 12,198
(1.10 %)
18,494
(1.29 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
26
(0.00 %)
26
(0.00 %)
14,841
(100.00 %)
1,725,021
(17.81 %)
802,415
(4.26 %)
8,321,474
(45.72 %)
0
(0 %)
653,092
(2.79 %)
15,669
(0.79 %)
13,175
(0.55 %)
423 white-tufted-ear marmoset (maternal 2020)
GCA_011078405.1
n/a n/a 21,684
(1.92 %)
21,053
(1.29 %)
n/a 40.97
(99.58 %)
0
(0 %)
1,068
(0.42 %)
216
(100.00 %)
5,099,933
(50.01 %)
797,450
(2.45 %)
15,059,591
(37.67 %)
1
(0.00 %)
1,026,612
(2.27 %)
36,133
(0.92 %)
26,329
(0.73 %)
424 whooping crane (paternal hap 2023)
GCA_028858595.1
n/a n/a 13,284
(1.87 %)
23,528
(2.20 %)
n/a 42.47
(99.50 %)
0
(0 %)
586
(0.50 %)
395
(100.00 %)
569,940
(8.69 %)
162,569
(0.98 %)
7,021,319
(20.20 %)
1
(0.00 %)
186,281
(0.89 %)
38,582
(3.77 %)
37,390
(2.40 %)
425 Xingu scale-backed antbird (hap2 2024)
GCA_045364805.1
n/a n/a 12,157
(1.85 %)
22,615
(2.35 %)
n/a 43.36
(99.99 %)
0
(0 %)
533
(0.01 %)
743
(100.00 %)
575,863
(14.81 %)
371,492
(6.11 %)
5,580,275
(23.05 %)
3
(0.00 %)
577,013
(3.67 %)
28,593
(3.34 %)
17,849
(1.01 %)
426 yellow-bellied marmot (hap2 2025)
GCA_047512175.1
n/a n/a 18,677
(1.51 %)
19,370
(1.40 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
0
(0 %)
307
(0.00 %)
329
(100.00 %)
3,694,109
(28.05 %)
793,102
(2.43 %)
13,585,913
(33.39 %)
4
(0.00 %)
351,043
(1.26 %)
33,990
(1.02 %)
26,212
(0.65 %)
427 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205305.1
n/a n/a 16,306
(0.23 %)
45,587
(0.94 %)
n/a 38.94
(99.99 %)
6,811
(0.01 %)
6,811
(0.01 %)
10,308
(99.99 %)
4,195,244
(3.50 %)
7,201,985
(14.20 %)
10,308
(99.99 %)
64
(0.00 %)
2,258,072
(1.80 %)
412,512
(1.53 %)
403,504
(1.46 %)
428 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap2 2024)
GCA_039720425.1
n/a n/a 12,079
(1.50 %)
21,895
(1.84 %)
n/a 44.31
(100.00 %)
0
(0 %)
138
(0.00 %)
2,468
(100.00 %)
514,155
(7.08 %)
298,648
(19.26 %)
3,943,979
(37.27 %)
0
(0 %)
1,068,366
(5.88 %)
27,272
(1.79 %)
18,908
(1.05 %)
429 yellow-legged gull (bLarMic1.1_alternate_haplotype 2024)
GCA_964199725.1
n/a n/a 12,692
(1.61 %)
24,720
(2.07 %)
n/a 44.79
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,673
(100.00 %)
486,967
(5.03 %)
248,816
(10.71 %)
6,176,494
(29.58 %)
0
(0 %)
541,267
(4.20 %)
44,101
(6.72 %)
36,321
(1.69 %)
430 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1
n/a n/a 16,320
(1.03 %)
20,318
(1.13 %)
n/a 40.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1
(0.00 %)
4,169
(100.00 %)
2,911,332
(23.50 %)
347,110
(4.57 %)
17,256,419
(44.04 %)
0
(0 %)
683,195
(1.71 %)
28,674
(0.68 %)
24,228
(0.50 %)
431 yellow-throated sandgrouse (alternate hap 2019)
GCA_009769505.1
n/a n/a 11,788
(1.85 %)
23,306
(2.45 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 1,958
(100.00 %)
467,960
(6.96 %)
182,645
(0.99 %)
6,050,545
(20.78 %)
0
(0 %)
88,543
(0.80 %)
26,357
(2.20 %)
23,111
(1.43 %)
432 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1
n/a n/a 814
(1.87 %)
3,814
(6.84 %)
n/a 42.36
(99.98 %)
0
(0 %)
80
(0.02 %)
349
(100.00 %)
38,000
(5.03 %)
29,516
(7.35 %)
232,988
(20.37 %)
0
(0 %)
46,752
(6.67 %)
2,289
(2.07 %)
1,621
(1.32 %)
433 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1
n/a n/a 15,959
(2.63 %)
43,025
(5.73 %)
n/a 39.71
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 640
(100.00 %)
1,427,221
(28.44 %)
257,108
(3.15 %)
5,197,531
(26.91 %)
0
(0 %)
350,223
(3.66 %)
13,909
(0.83 %)
10,650
(0.55 %)
434 zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020)
GCA_009859025.1
n/a n/a 10,734
(1.84 %)
19,978
(2.21 %)
n/a 41.07
(99.99 %)
0
(0 %)
16
(0.01 %)
4,677
(100.00 %)
436,071
(7.44 %)
217,580
(1.43 %)
5,800,691
(19.24 %)
0
(0 %)
96,414
(0.71 %)
19,512
(1.90 %)
16,561
(1.08 %)
435 zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021)
GCA_003957525.2
n/a n/a 11,213
(2.01 %)
21,533
(2.54 %)
n/a 41.92
(100.00 %)
0
(0 %)
10
(0.00 %)
1,646
(100.00 %)
470,860
(9.54 %)
387,943
(3.32 %)
5,428,128
(20.68 %)
0
(0 %)
254,906
(1.64 %)
23,838
(2.47 %)
18,868
(1.23 %)
436 zebra finch (Blue55 paternal W 2020)
GCF_008822105.2
50,407
(7.20 %)
n/a 12,470
(1.95 %)
23,352
(2.42 %)
n/a 41.81
(97.98 %)
0
(0 %)
857
(2.02 %)
205
(100.00 %)
529,829
(9.55 %)
357,586
(2.56 %)
6,359,599
(20.12 %)
3
(0.00 %)
246,785
(1.53 %)
27,755
(2.36 %)
21,477
(1.19 %)
437 zebra finch (v3 Blue55 maternal 2020)
GCA_008822115.3
n/a n/a 11,950
(2.00 %)
22,828
(2.51 %)
n/a 42.06
(98.45 %)
0
(0 %)
583
(1.55 %)
206
(100.00 %)
494,110
(9.54 %)
347,933
(2.80 %)
5,875,448
(20.29 %)
0
(0 %)
249,341
(1.71 %)
27,387
(2.57 %)
20,823
(1.23 %)
438 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1
n/a n/a 12,516
(0.44 %)
17,465
(1.05 %)
n/a 44.66
(99.65 %)
1,203
(0.35 %)
1,203
(0.35 %)
2,136
(99.65 %)
8,278,458
(59.68 %)
903,434
(18.42 %)
14,975,344
(48.25 %)
2
(0.00 %)
4,704,292
(7.66 %)
48,378
(1.60 %)
15,577
(0.38 %)
439 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1
n/a n/a 6,365
(2.41 %)
16,467
(3.26 %)
n/a 36.72
(100.00 %)
0
(0 %)
n/a 4,719
(100.00 %)
1,317,027
(59.43 %)
323,062
(10.58 %)
3,014,570
(45.46 %)
0
(0 %)
366,878
(5.24 %)
14,563
(1.98 %)
3,786
(0.32 %)
440 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1
n/a n/a 17,535
(2.50 %)
44,169
(3.34 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
0
(0 %)
712
(0.01 %)
1,252
(100.00 %)
3,891,854
(61.07 %)
927,173
(7.78 %)
8,621,517
(50.27 %)
1
(0.00 %)
941,178
(4.90 %)
44,554
(2.12 %)
10,153
(0.30 %)
441 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2
n/a n/a 17,692
(2.51 %)
43,578
(3.27 %)
n/a 36.56
(99.99 %)
0
(0 %)
1,352
(0.01 %)
755
(100.00 %)
3,937,397
(60.86 %)
936,258
(7.76 %)
8,732,369
(50.44 %)
0
(0 %)
933,928
(4.81 %)
44,812
(2.09 %)
10,558
(0.30 %)
442 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1
n/a n/a 1,204
(2.88 %)
4,065
(7.13 %)
n/a 41.24
(99.99 %)
0
(0 %)
n/a 1,437
(100.00 %)
26,319
(3.19 %)
14,209
(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
0
(0 %)
22,258
(4.87 %)
1,253
(1.49 %)
988
(1.13 %)
TOTALS:total assembly count 442

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
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